NGDN

NGDN
Ідентифікатори
Символи	NGDN, C14orf120, CANu1, LCP5, NGD, lpd-2, neuroguidin
Зовнішні ІД	OMIM: 610777 MGI: 1916216 HomoloGene: 44286 GeneCards: NGDN
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Філоподія • аксон • small-subunit processome • дендрит (нейробіологія) • cell projection • центромера • хромосома • клітинне ядро • ядерце • мітохондрія Біологічний процес • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25983	68966
Ensembl	ENSG00000129460	ENSMUSG00000022204
UniProt	Q8NEJ9	Q9DB96
RefSeq (мРНК)	NM_001042635 NM_015514	NM_026890
RefSeq (білок)	NP_001036100 NP_056329	NP_081166
Локус (UCSC)	Хр. 14: 23.47 – 23.51 Mb	Хр. 14: 55.25 – 55.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NGDN (англ. Neuroguidin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 315 амінокислот, а молекулярна маса — 35 894.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALGVLESD		LPSAVTLLKN		LQEQVMAVTA		QVKSLTQKVQ		AGAYPTEKGL
SFLEVKDQLL		LMYLMDLTHL		ILDKASGGSL		QGHDAVLRLV		EIRTVLEKLR
PLDQKLKYQI		DKLIKTAVTG		SLSENDPLRF		KPHPSNMMSK		LSSEDEEEDE
AEDDQSEASG		KKSVKGVSKK		YVPPRLVPVH		YDETEAEREK		KRLERAKRRA
LSSSVIRELK		EQYSDAPEEI		RDARHPHVTR		QSQEDQHRIN		YEESMMVRLS
VSKREKGRRK		RANVMSSQLH		SLTHFSDISA		LTGGTVHLDE		DQNPIKKRKK
IPQKGRKKKG		FRRRR

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках, хромосомах, центромерах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sihn C.R., Lee Y.S., Jeong J.S., Park K., Kim S.H. (2008). CANu1, a novel nucleolar protein, accumulated on centromere in response to DNA damage. Genes Cells. 13: 787—796. PMID 18547334 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01205.x

Див. також

• Хромосома 14