Kenteris var, liksom flera andra grekiska friidrottare, omgärdad av dopningsmisstankar, bland annat till följd av ytterst sparsamt tävlande utanför den grekiska statsgränsen. Inför hemma-OS 2004 var Kenteris favorit på 200 meter och hela Greklands stora hopp. Men Kenteris missade under uppmärksammade former en dopningskontroll tillsammans med Ekaterini Thánou efter en föregiven motorcykelolycka. Bilderna som kablades ut över världen på Kenteris från sjukhuset ledde dock till misstankar om att olyckan i själva verket var en bluff i syfte att undgå kontrollen. TV-bilderna visade en sängliggande Kenteris med löparskor påtagna, vilket är en ytterst ovanlig syn i fråga om en sjukhuspatient. Kenteris tilläts därför inte deltaga i OS och har senare stängts av för dopning.