SMC2

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
SMC2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4U4P

Идентификаторы
ПсевдонимыSMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, structural maintenance of chromosomes 2
Внешние IDOMIM: 605576 MGI: 106067 HomoloGene: 4705 GeneCards: SMC2
Расположение гена (человек)
9-я хромосома человека
Хр.9-я хромосома человека[1]
9-я хромосома человека
Расположение в геноме SMC2
Расположение в геноме SMC2
Локус9q31.1Начало104,094,260 bp[1]
Конец104,141,419 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
4-я хромосома мыши
Хр.4-я хромосома мыши[2]
4-я хромосома мыши
Расположение в геноме SMC2
Расположение в геноме SMC2
Локус4 B2|4 28.31 cMНачало52,439,243 bp[2]
Конец52,488,260 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • ventricular zone

  • secondary oocyte
Наибольшая экспрессия в
  • tail of embryo

  • primitive streak

  • maxillary prominence

  • fetal liver hematopoietic progenitor cell

  • mandibular prominence

  • migratory enteric neural crest cell
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10592

14211

Ensembl

ENSG00000136824

ENSMUSG00000028312

UniProt

O95347
Q05D74

Q8CG48

RefSeq (мРНК)

NM_001042550
NM_001042551
NM_001265602
NM_006444

NM_001301412
NM_008017

RefSeq (белок)

NP_001036015
NP_001036016
NP_001252531
NP_006435
NP_006435.2

NP_001288341
NP_032043

Локус (UCSC)Chr 9: 104.09 – 104.14 MbChr 4: 52.44 – 52.49 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

SMC2 или белок структурной поддержки хромосом номер два (англ. Structural maintenance of chromosomes protein 2), также известный как хромосом-ассоцированный полипептид E — белок, который у человека кодируется геном SMC2[5][6]. SMC2 входит в семейство SMC-белков и является основной субъединицей конденсина I и II, крупных белковых комплексов, участвующих в конденсации хромосом и их общей организации[7].

Несколько исследований показали, что SMC2 необходим для деления и пролиферации клеток[8][9].

Длина полипептидной цепи белка составляет 1197 аминокислот, а молекулярная масса — 135656 Да[10].

Структура

[править | править код]

Будучи одним из 6 эукариотических SMC-белков, SMC2 образует гетеродимер с SMC4 через их шарнирные домены. Образующийся гетеродимер функционирует как гибкое и динамичное ядро голокомплекса, который объединяется с другими регуляторными белками, не относящимися к SMC, образуя конденсин[7]. В конденсине I SMC2 объединяется с CAP-H, CAP-D2 и CAP-G. В конденсине II SMC2 образует комплексы с CAP-H2, CAP-D3 и CAP-G2. Субъединицы CAP-H и CAP-H2 относятся к клейзиновым белкам, аналогичным Scc1, который присутствует в когезине, а CAP-D2, CAP-G, CAP-D3 и CAP-G2 содержат структурные HEAT-повторы[11].

Структура голокомплекса белков конденсина, в котором представлены гетеродимер SMC-2/SMC-4 и дополнительные субъединицы. Также изображен клейзин (синий).

Функция

[править | править код]

SMC2 работает в составе конденсинового комплекса как регулятор транскрипции, уплотняя реплицированную ДНК перед митотическим делением за счёт сверхспирализации ДНК. SMC2 также участвует в расхождении сестринских хроматид перед анафазой[9].

Взаимодействия

[править | править код]

Показано, что SMC2 взаимодействует с DNMT3B[12].

Клиническое значение

[править | править код]

Синдром Корнелии де Ланге

[править | править код]

Мутации в гене SMC2 были связаны с различными заболеваниями человека, включая синдром Корнелии де Ланге (CdLS), который характеризуется аномалиями развития, когнитивными нарушениями и рядом физических аномалий[13]. Исследование показало, что делеция части длинного плеча 9-й хромосомы (9q31.1-q32) вызывает симптомы, схожие с теми, что наблюдаются у пациентов с CdLS[14]. Эта делеция перекрывает ген, кодирующий SMC2. С CdLS связано множество мутаций в различных генах, однако около 30 % случаев не были связаны ни с одним из известных генов[14]. Проводятся дополнительные исследования для выявления других причин этого синдрома.

Рак

[править | править код]

Другие исследования показали, что изменения в экспрессии гена SMC2 могут быть вовлечены в развитие и прогрессирование рака. Было установлено, что сверхэкспрессия SMC2 приводит к онкогенезу и злокачественным новообразованиям. В настоящее время некоторые исследования изучают ингибирование SMC2[15] как потенциальную терапевтическую мишень для лечения рака, поскольку ингибирование экспрессии или активности SMC2 может привести к индукции клеточной смерти в раковых клетках.

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136824 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028312 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Schmiesing J.A., Ball AR Jr, Gregson H.C., Alderton J.M., Zhou S., Yokomori K. Identification of two distinct human SMC protein complexes involved in mitotic chromosome dynamics (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — November (vol. 95, no. 22). — P. 12906—12911. — doi:10.1073/pnas.95.22.12906. — PMID 9789013. — PMC 23650.
  6. ↑ Entrez Gene: SMC2 structural maintenance of chromosomes 2. Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. ↑ 1 2 Eeftens, Jorine M.; Katan, Allard J.; Kschonsak, Marc; Hassler, Markus; de Wilde, Liza; Dief, Essam M.; Haering, Christian H.; Dekker, Cees (2016-03-01). "Condensin Smc2-Smc4 Dimers Are Flexible and Dynamic". Cell Reports (англ.). 14 (8): 1813—1818. doi:10.1016/j.celrep.2016.01.063. ISSN 2211-1247. PMC 4785793. PMID 26904946.
  8. ↑ Li, Xixi; Song, Guili; Zhao, Yasong; Ren, Jing; Li, Qing; Cui, Zongbin (September 2021). "Functions of SMC2 in the Development of Zebrafish Liver". Biomedicines (англ.). 9 (9): 1240. doi:10.3390/biomedicines9091240. ISSN 2227-9059. PMC 8465584. PMID 34572426.
  9. ↑ 1 2 Dávalos, Verónica; Súarez-López, Lucía; Castaño, Julio; Messent, Anthea; Abasolo, Ibane; Fernandez, Yolanda; Guerra-Moreno, Angel; Espín, Eloy; Armengol, Manel; Musulen, Eva; Ariza, Aurelio; Sayós, Joan; Arango, Diego; Schwartz, Simó (2012-12-21). "Human SMC2 Protein, a Core Subunit of Human Condensin Complex, Is a Novel Transcriptional Target of the WNT Signaling Pathway and a New Therapeutic Target *". Journal of Biological Chemistry (англ.). 287 (52): 43472—43481. doi:10.1074/jbc.M112.428466. ISSN 0021-9258. PMC 3527934. PMID 23095742.
  10. ↑ UniProt, O95347 (англ.). Дата обращения: 20 декабря 2023. Архивировано 20 декабря 2023 года.
  11. ↑ Losada, Ana; Hirano, Tatsuya (2005-06-01). "Dynamic molecular linkers of the genome: the first decade of SMC proteins". Genes & Development (англ.). 19 (11): 1269—1287. doi:10.1101/gad.1320505. ISSN 0890-9369. PMID 15937217.
  12. ↑ Geiman, Theresa M; Sankpal Umesh T., Robertson Andrea K., Chen Yue, Mazumdar Manjari, Heale Jason T., Schmiesing John A., Kim Wankee, Yokomori Kyoko, Zhao Yingming, Robertson Keith D. Isolation and characterization of a novel DNA methyltransferase complex linking DNMT3B with components of the mitotic chromosome condensation machinery (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — England, 2004. — Vol. 32, no. 9. — P. 2716—2729. — doi:10.1093/nar/gkh589. — PMID 15148359. — PMC 419596.
  13. ↑ Cornelia de Lange syndrome - About the Disease - Genetic and Rare Diseases Information Center. rarediseases.info.nih.gov. (10 апреля 2023). Дата обращения: 20 декабря 2023. Архивировано 15 мая 2021 года.
  14. ↑ 1 2 Cao, Ruixue; Pu, Tian; Fang, Shaohai; Long, Fei; Xie, Jing; Xu, Yuejuan; Chen, Sun; Sun, Kun; Xu, Rang (2015). "Patients Carrying 9q31.1-q32 Deletion Share Common Features with Cornelia de Lange Syndrome". Cellular Physiology and Biochemistry (неопр.). 35 (1): 270—280. doi:10.1159/000369694. ISSN 1015-8987. PMID 25591769. S2CID 41785465. Архивировано 18 апреля 2023. Дата обращения: 20 декабря 2023.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (неизвестный язык) (ссылка)
  15. ↑ Montero, Sara; Seras-Franzoso, Joaquin; Andrade, Fernanda; Martinez-Trucharte, Francesc; Vilar-Hernández, Mireia; Quesada, Manuel; Xandri, Helena; Arango, Diego; Abasolo, Ibane; Rafael, Diana; Schwartz, Simo (2020-02-21). "Intracellular Delivery of Anti-SMC2 Antibodies against Cancer Stem Cells". Pharmaceutics (англ.). 12 (2): 185. doi:10.3390/pharmaceutics12020185. ISSN 1999-4923. PMC 7076674. PMID 32098204.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=SMC2&oldid=139753966