TW202434726A

TW202434726A - 具內部插入位進化腺嘌呤去胺及rna引導之核酸酶融合蛋白及其使用方法

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Publication number: TW202434726A
Application number: TW112142724A
Authority: TW
Inventors: 麥可柯伊雷; 亞歷山卓布萊勒克羅雷; 泰德Ｄ艾力奇; 塞勒姆法哈姆; 德魯凱爾索; 奧利弗亞德里安皮卡; 盧卡斯菲瑞拉里貝羅; 萊恩里克斯; 莎拉康頓
Original assignee: 美商生命編輯治療學公司
Priority date: 2022-11-04
Filing date: 2023-11-06
Publication date: 2024-09-01
Also published as: WO2024095245A3; WO2024095245A2; WO2024095245A9; IL320573A; AU2023374241A1

Abstract

提供了包括用於核酸的靶向編輯的去胺酶的組成物以及方法。也提供了用於將異源多肽定位至標的DNA分子並用於核酸的靶向編輯的的組成物以及方法。提供了包括RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽的融合蛋白以及包括DNA結合多肽以及去胺酶的融合蛋白。異源多肽可以是先導編輯多肽或鹼基編輯多肽。組成物也包括編碼去胺酶或融合蛋白的核酸分子。也提供了包括編碼去胺酶或融合蛋白的核酸分子的載體以及宿主細胞。

Description

具內部插入位進化腺嘌呤去胺及　RNA引導之核酸酶融合蛋白及其使用方法

相關申請案之相互引用

本申請案主張2022年11月4日提出的美國臨時專利申請案No.63/382,344以及2023年2月17日提出的美國臨時專利申請案No.63/485,642的優先權，每一個臨時專利申請案藉由引用完全併入本文。對作為XML檔以電子方式提交的序列表的引用

本申請案包含序列表，該序列表已經由USPTO專利中心以xml格式提出、且以此方式藉由引用以其整體併入。於2023年11月5日創建的該xml複本被命名為L103438_1330TW_Seq_List.xml、且大小為1154 KB。

本發明與分子生物學及基因編輯領域有關。

靶向基因組編輯或修飾正迅速成為基礎及應用研究的重要工具。最初的方法涉及例如大範圍核酸酶（meganuclease）、鋅指融合蛋白或TALEN之類的工程核酸酶，這需要產生具有對每一種特定標的序列專一的工程化、可程式化、序列專一的DNA結合結構域的嵌合核酸酶。RNA引導的核酸酶（RGN）（例如，成簇規律間隔的短迴文重複子(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats，CRISPR)-關聯（Cas）的CRISPR-Cas)細菌系統的CRISPR-Cas蛋白）藉由將核酸酶與引導RNA（引導RNA與特定標的序列專一性雜合）複合而允許專一性序列（specific sequence）的靶向。相較於為每一個標的序列產生嵌合核酸酶，產生標的專一性引導RNA的成本更低且更有效。此種RNA引導的核酸酶可用於經由序列專一性、雙股斷裂的引入來編輯基因組，該斷裂經由易錯的非同源末側連結（NHEJ）被修復，以在專一性基因組位置引入突變。

此外，RGN對於靶向的DNA編輯方法是有用的。允許用於將特定修飾引入基因組DNA的核酸序列的靶向編輯（例如靶向剪切）能夠用更加細微的方法來研究基因功能及基因表現。RGN也可用於產生嵌合蛋白，該嵌合蛋白利用RGN的 RNA引導活性與DNA修飾酶（例如去胺酶）結合以用於靶向鹼基編輯。靶向編輯可用於靶向人類遺傳疾病或在農作物的基因組中引入農藝學上有益的突變。基因組編輯工具的發展為基於基因編輯的哺乳動物療法及農業生物技術提供了新方法。

提供了用於將異源多核苷酸定位至標的DNA分子並修飾標的DNA分子的組成物以及方法。提供的組成物包括去胺酶多肽以及融合蛋白，融合蛋白包括RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽(例如去胺酶)。異源多肽可以是先導編輯多肽或鹼基編輯多肽。包括鹼基編輯多肽的融合蛋白在本文中也稱為鹼基編輯器。因此，在一些實施方式中，鹼基編輯器包括核酸分子結合多肽(例如，DNA結合多肽)以及去胺酶多肽。在一些實施方式中，鹼基編輯器包括其中插入有去胺酶的RGN。在一些實施方式中，與親代鹼基編輯器相較下，包括其中插入有去胺酶多肽的RGN的鹼基編輯器表現出改善的編輯活性及/或移位的編輯窗。在一些實施方式中，親代鹼基編輯器包括與RGN的胺基末端融合的去胺酶。也提供了編碼所揭露的去胺酶多肽以及融合蛋白的核酸分子、包括該核酸分子的載體、以及包括該去胺酶多肽或融合蛋白、核酸分子、或載體的細胞。

提供一種包括所揭露的融合蛋白(或編碼該融合蛋白的核酸分子)以及一或更多引導RNA(或編碼該引導RNA的一或更多核酸分子)以用於將異源多肽或去胺酶定位至標的DNA分子的系統、以及包括該系統的細胞。用於定位異源多肽或去胺酶及/或修飾標的DNA分子的方法包括將所揭露的系統遞送至標的DNA分子或包括該標的DNA分子的細胞。

提供了一種醫藥組成物，該醫藥組成物包括目前揭露的去胺酶以及融合蛋白、編碼該去胺酶以及融合蛋白的核酸分子(或包括該核酸分子的載體或細胞)、或系統(或包括該系統的細胞)。用於治療患有疾病、病症或症狀或處於發展疾病、病症或症狀風險的個體的方法包括向該個體投予目前揭露的融合蛋白、編碼該融合蛋白的核酸分子(或包括該核酸分子的載體或細胞)、系統(或包括該系統的細胞)、或醫藥組成物。在一些實施方式中，疾病、病症或症狀與因果突變相關且治療包括校正因果突變。

得益於前述描述中呈現的教導，本發明所屬領域中具有通常知識者將想到本文闡述的本發明的許多修飾以及其他實施方式。因此，應理解，本發明不限於所揭露的具體實施方式，並且該修飾以及其他實施方式旨在被包括在所附申請專利範圍的範圍內。儘管本文使用了特定用語，但這些用語僅以通用以及描述性的含義被使用而不是出於限制的目的。 I. 概述

本揭露內容提供了包括例如DNA結合多肽之類的核酸分子結合多肽以及去胺酶多肽的融合蛋白以及去胺酶。在某些實施方式中，DNA結合多肽是序列專一性的DNA結合多肽，因為DNA結合多肽以比結合至隨機背景序列更高的頻率結合至標的序列。在一些實施方式中，DNA結合多肽是或衍生自大範圍核酸酶、鋅指融合蛋白、或TALEN。在一些實施方式中，融合蛋白包括RNA引導的DNA結合多肽以及去胺酶多肽。在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽是RNA引導的核酸酶(RGN)，例如與引導RNA(也稱為gRNA)結合的CRISPR-Cas(例如Cas9)多肽，引導RNA進而經由股雜交而結合標的核酸序列。

本揭露內容也提供包括RGN以及被插入該RGN內的至少一異源多肽的融合蛋白(以及編碼該融合蛋白的核酸分子)。異源多肽可被插入在RGN的表面位置內(例如，緊接在RGN的表面上的胺基酸殘基之後)。目前揭露的融合蛋白可包括具有鹼基編輯多肽或先導編輯多肽的RGN，其中一些與端對端融合蛋白相較下表現出改進的編輯活性及/或移位的編輯窗。

用語「蛋白質」、「胜肽」及「多肽」在本文中可被互換地使用、並指藉由胜肽（醯胺）鍵被連結在一起的胺基酸殘基的聚合物。所述用語指任何大小、結構或功能的蛋白質、胜肽或多肽。通常，蛋白質、胜肽或多肽將是至少三個胺基酸長。蛋白質、胜肽或多肽可指單獨的蛋白質或蛋白質的聚集。例如，藉由添加例如碳水化合物基團、羥基基團、磷酸鹽基團、法尼基（farnesyl）基團、異法尼基基團、脂肪酸基團、用於共軛、官能化、或其他修飾及類似者的連接子之類的化學實體，蛋白質、胜肽或多肽中的一或更多胺基酸可被修飾。蛋白質、胜肽或多肽亦可為單一分子、或可為多分子複合物。蛋白質、胜肽或多肽可以僅僅是天然存在的蛋白質或胜肽的片斷。蛋白質、胜肽或多肽可以是天然存在的、重組的或合成的、或其任何組合。

如本文中使用的用語「融合蛋白」指包括來自至少二個不同蛋白的蛋白結構域的雜合多肽。融合蛋白可包括一個以上的不同結構域，例如，RGN以及去胺酶。本發明的融合蛋白包括目前揭露的去胺酶以及被插入RGN的胺基酸序列內的核酸分子結合多肽或異源蛋白(例如，去胺酶)，在某些情況下，其可以破壞RGN蛋白內的結構域。於一些實施方式中，融合蛋白在與核酸（例如，RNA）的複合物中或與核酸（例如，RNA）締合。

被插入根據本發明的RGN的異源多肽可以是鹼基編輯多肽，例如去胺酶多肽或其活性變異體或片段，鹼基編輯多肽直接化學修飾(例如，去胺)核鹼基，導致從一個核鹼基轉化為另一個核鹼基。去胺酶對核鹼基的去胺作用可導致各自的殘基處的點突變，這在本文中稱為「核酸編輯」、或「鹼基編輯」。包括RNA引導的核酸酶(RGN)多肽以及去胺酶的融合蛋白因此可用於核酸序列的靶向編輯。

目前揭露的融合蛋白可包括與先導編輯多肽融合的RGN。先導編輯是一種多功能且精確的基因組編輯方法，其使用與聚合酶關聯作用的核酸可編程DNA結合蛋白而直接將新遺傳資訊寫入指定的DNA位點(描述於例如US 11,447,770B1；WO2021072328；WO2021226558；WO2020156575；WO2021042047；US11193123；每一個藉由引用以其整體併入本文)。先導編輯系統使用為切口酶的RGN，並且以先導編輯(PE)引導RNA (「PEgRNA」)編程該系統。

目前揭露的融合蛋白可用於在體外DNA的靶向編輯，例如用於產生基因修飾的細胞。這些基因修飾的細胞可以是植物細胞或動物細胞。此類融合蛋白也可用於例如在從個體獲得的細胞(隨後被重新引入相同或另一個體)中引入靶向突變，例如用於離體校正哺乳動物細胞中的遺傳缺陷；以及用於引入靶向突變，例如，遺傳缺陷的校正、或在對哺乳動物個體中疾病相關基因中引入去活化突變。此類融合蛋白也可用於在植物細胞中引入靶向突變，例如用於引入有益的或農藝學上有價值的性狀或等位基因。

本文提供的任何融合蛋白可以藉由本領域已知的任何方法產生。例如，本文提供的蛋白質可以經由重組蛋白表現及純化來產生，其特別適合用於包括胜肽連接子的融合蛋白。用於重組蛋白表現及純化的方法是眾所周知的、並且包括Green及Sambrook的 Molecular Cloning: A Laboratory Manual(第 4 版，冷泉港實驗室出版社，冷泉港，紐約(2012))所描述的那些，其藉由引用以其整體被併入本文。 II. 核酸分子結合多肽

本揭露內容的一些態樣提供包括核酸分子結合多肽及去胺酶多肽的融合蛋白。儘管本發明考量了與RNA分子的結合及RNA分子的靶向編輯，但於一些實施方式中，融合蛋白的核酸分子結合多肽為DNA結合多肽。此類融合蛋白有用於DNA在體外、離體地或體內的靶向編輯。這些融合蛋白在哺乳動物細胞中是有活性的且有用於DNA分子的靶向編輯。

在一些實施方式中，目前揭露的融合蛋白包括DNA結合多肽。如本文中使用的，用語「DNA結合多肽」指能夠結合至DNA的任何多肽。在某些實施方式中，目前揭露的融合蛋白的DNA結合多肽部分結合至雙股DNA。在一些實施方式中，DNA結合多肽以序列專一性方式結合至DNA。如本文中使用的，用語「序列專一性」或「序列專一性方式」指與特定核苷酸序列的選擇性交互作用。

當二個多核苷酸序列在嚴格條件下彼此雜合時，可認為該二個多核苷酸序列實質上互補。同樣地，如果DNA結合多肽在嚴格條件下結合至其序列，則認為DNA結合多肽以序列專一性方式結合至特定標的序列。「嚴格條件」或「嚴格雜合條件」旨在指二個多核苷酸序列（或多肽結合至其專一性標的序列）將彼此結合的可偵測程度高於其他序列（例如，至少比背景高2倍）的條件。嚴格條件為序列相依的、且在不同情況下將會不同。通常，嚴格條件將是這樣的條件，其中：在pH 7.0至8.3，鹽類濃度小於1.5 M Na離子，通常約0.01至1.0 M Na離子濃度（或其它鹽類），且針對短序列（例如，10至50個核苷酸），溫度為至少30°C，而針對長序列（例如，大於50個核苷酸），溫度為至少60°C。利用添加例如甲醯胺之類的去穩定劑亦可達到嚴格條件。範例性的低嚴格條件包括在37℃下與30至35％甲醯胺、1 M NaCl、1％SDS（十二烷基硫酸鈉）的緩衝溶液的雜合、以及在50至55℃下以1X至2X SSC（20X SSC = 3.0 M NaCl/0.3 M檸檬酸三鈉）洗滌。範例性的中等嚴格條件包括在37°C下於40至45％甲醯胺、1.0 M NaCl、1％ SDS中雜合、以及在55至60°C下以0.5X至1X SSC洗滌。範例性的高嚴格條件包括在37°C下於50％甲醯胺、1 M NaCl、1％ SDS中雜合、以及在60至65°C下以0.1X SSC洗滌。可選地，洗滌緩衝液可包括約0.1％至約1％的SDS。雜合持續時間一般小於約24小時，通常約4至約12小時。洗滌時間的持續時間至少為足以達到平衡的時間長度。

Tm為50％的互補標的序列與完全匹配的序列雜合的溫度（於所界定的離子強度以及pH下）。對於DNA-DNA雜合體，Tm可以從Meinkoth以及Wahl (1984) Anal. Biochem. 138：267-284的等式：Tm = 81.5°C + 16.6 (log M) + 0.41 (%GC) - 0.61 (甲醯胺% (% form)) - 500/L大致估計；其中M為單價陽離子的莫耳濃度，％GC為鳥苷以及胞嘧啶核苷酸於該DNA中的百分比，甲醯胺%為雜合溶液中的甲醯胺百分比，及L為鹼基對中的雜合體的長度。一般而言，嚴格條件被選擇為比在所界定的離子強度以及pH下的特定序列及其補體的熱熔點（Tm）低約5°C。然而，極度嚴格條件可採用在比熱熔點（Tm）低1、2、3或4°C下的雜合及/或洗滌；中等嚴格條件可採用在比熱熔點（Tm）低6、7、8、9或10°C下的雜合及/或洗滌；低嚴格條件可採用在比該熱熔點（Tm）低11、12、13、14、15或20°C下的雜合及/或洗滌。本領域中具有通常知識者將明白，使用該等式、雜合及洗滌組成物以及期望的Tm，雜合及/或洗滌溶液的嚴格性的變化被固有地描述了。核酸雜合的廣泛指南可在Tijssen (1993) Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology—Hybridization with Nucleic Acid Probes，第I部分，第2章(Elsevier，紐約)；以及Ausubel等人編輯(1995) Current Protocols in Molecular Biology，第2章(Greene Publishing and Wiley-Interscience，紐約)中得到。參見Sambrook等人(1989) Molecular Cloning：A Laboratory Manual (第 2 版，冷泉港實驗室出版社，Plainview，紐約)。

在某些實施方式中，序列專一性DNA結合多肽是RNA引導的DNA結合多肽（RGDBP）。如本文中使用的，用語「RNA引導的DNA結合多肽」以及「RGDBP」指經由關聯RNA分子與標的DNA序列的雜合能夠結合至DNA的多肽。

在一些實施方式中，融合蛋白的DNA結合多肽是核酸酶，例如，序列專一性核酸酶。如本文中使用的，用語「核酸酶」指催化核酸分子中的核苷酸之間的磷酸二酯鍵的剪切的酶。在一些實施方式中，DNA結合多肽是核酸內切酶，其能夠剪切核酸分子內的核苷酸之間的磷酸二酯鍵，而於某些實施方式中，DNA結合多肽是核酸外切酶，其能夠剪切核酸分子的任一端（5'或3'）處的核苷酸。在一些實施方式中，序列專一性核酸酶從由大範圍核酸酶、鋅指核酸酶、TAL效應子DNA結合結構域核酸酶融合蛋白（TALEN）及RNA引導的核酸酶（RGN）或其變異體（其中核酸酶活性已被降低或抑制）組成的群組選出。

如本文中使用的，用語「大範圍核酸酶」或「歸巢核酸內切酶」指結合雙股DNA內的12至40 bp長度的辨識位點的核酸內切酶。大範圍核酸酶的非限制性實例是屬於包括保留胺基酸模體LAGLIDADG（SEQ ID NO：700）的LAGLIDADG家族的那些大範圍核酸酶。用語「大範圍核酸酶」可指二聚或單鏈大範圍核酸酶。

如本文中使用的，用語「鋅指核酸酶」或「ZFN」指包括鋅指DNA結合結構域及核酸酶結構域的嵌合蛋白。

如本文中使用的，用語「TAL效應子DNA結合結構域核酸酶融合蛋白」或「TALEN」指包括TAL效應子DNA結合結構域及核酸酶結構域的嵌合蛋白。

於某些實施方式中，DNA結合多肽是能夠在雙股DNA分子內產生單股區域的DNA結合多肽。單股區域的實例是R環內包括的單股環，該R環為包括單股DNA的區域的三股核酸結構，該單股DNA的區域被形成於由互補股與單股RNA或DNA分子的雜合導致的雙股DNA分子內。R環的單股區域內的腺嘌呤或與R環的單股區域相鄰的腺嘌呤可藉由對單股核酸（例如，ssDNA）具有活性的腺嘌呤去胺酶而被去胺。在這些實施方式的一些實施方式中，能夠在雙股DNA分子內產生R環的DNA結合多肽是RNA引導的DNA結合多肽或RGN核酸酶。如本文中使用的，用語「RNA引導的核酸酶」或「RGN」指具有核酸酶活性的RNA引導的DNA結合多肽。RGN是所考慮的「RNA引導的」，因為引導RNA與RNA引導的核酸酶形成複合物以將RNA引導的核酸酶導向結合至標的序列，並且在一些實施方式中，在標的序列處引入單股或雙股斷裂。

儘管RGN能夠在結合後立即剪切標的序列，但用語RGN也涵蓋能夠結合至但不剪切標的序列的無核酸酶活性的RGN。用語「剪切（「cleave」或「cleavage」）」指雙股標的序列(例如，標的DNA序列)的一股或兩股的主鏈內的至少一個磷酸二酯鍵的水解（其可以在標的DNA 序列內導致單股或雙股斷裂）。RGN對標的序列的剪切可導致單股或雙股斷裂。僅能夠剪切雙股標的核酸分子的單股的RGN在本文中稱為切口酶。此類 RGN 具有單一功能的核酸酶結構域。RGN切口酶可以是天然剪切雙股核酸分子的兩股的RGN蛋白或是天然存在的切口酶，其已在一個或多個核酸酶結構域內突變，使得這些突變的結構域的核酸酶活性降低或消除，以成為切口酶。

RNA引導的核酸酶（RGN）允許在基因組內的單一位點的靶向操作、且在基因靶向的背景下有用於治療及研究應用。在各種生物體（包括哺乳動物）中，藉由刺激非同源端連結或同源重組，RNA引導的核酸酶已被用於基因組工程。RGN包括CRISPR-Cas蛋白（其是藉由引導RNA（gRNA）作為成簇規律間隔的短迴文重複序列（CRISPR）RNA引導的核酸酶系統的部分而被導向至標的序列的RNA引導的核酸酶）、或其活性變異體或片段。

此揭露內容的一些態樣提供融合蛋白，該融合蛋白包括RNA引導的DNA結合多肽及去胺酶多肽（例如，腺嘌呤去胺酶多肽）。在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽為RNA引導的核酸酶（RGN）。在另外的實施方式中，RNA引導的核酸酶為天然存在的CRISPR-Cas蛋白或其活性變異體或片段。CRISPR-Cas系統被分類為1類或2類系統。2類系統包括單一效應子核酸酶、且包括II、V及VI型。1類及2類系統被細分為型（I、II、III、IV、V、VI型），而且一些型被進一步細分為子型（例如，II-A型、II-B型、II-C型、V-A型、V-B型）。

於某些實施方式中，RGN為天然存在的II型CRISPR-Cas蛋白或其活性變異體或片段。如本文中使用的，用語「II型CRISPR-Cas蛋白」、「II型CRISPR-Cas效應子蛋白」或「II型RNA引導的核酸酶」指需要反式活化的RNA（tracrRNA）且包括二個核酸酶結構域（即，RuvC及HNH）的RGN，每一個核酸酶結構域負責剪切雙股DNA分子的單股。於一些實施方式中，本發明提供一種融合蛋白，其包括與Cas9蛋白（例如 化膿鏈球菌Cas9（SpCas9））融合的目前揭露的去胺酶（其序列如SEQ ID NO：415所示）、或SpCas9切口酶，其被描述於美國專利號第10,000,772號及第8,697,359號中，這些美國專利中的每一者藉由引用以其整體被併入本文。於一些實施方式中，本發明提供一種融合蛋白，其包括與 嗜熱鏈球菌Cas9（StCas9）融合的目前揭露的去胺酶（其序列如SEQ ID NO：701所示）、或StCas9切口酶，其被揭露於美國專利號10,113,167中，該美國專利藉由引用以其整體被併入本文。於一些實施方式中，本發明提供一種融合蛋白，其包括與 金黃色葡萄球菌Cas9（SaCas9）融合的目前揭露的去胺酶（其如SEQ ID NO：702所示）、或SaCas9切口酶，其被揭露於美國專利號9,752,132中，該美國專利藉由引用以其整體被併入本文。

於一些實施方式中，CRISPR-Cas蛋白是天然存在的V型CRISPR-Cas蛋白或其活性變異體或片段。如本文使用的，用語「V型CRISPR-Cas蛋白」、「V型CRISPR-Cas效應子蛋白」或「V型RNA引導的核酸酶」指剪切dsDNA並包括單一RuvC核酸酶結構域或分段型RuvC核酸酶結構域並且缺少HNH結構域的RGN （Zetsche等人2015， Celldoi:10.1016/j.cell.2015.09.038；Shmakov等人2017， Nat Rev Microbioldoi:10.1038/nrmicro.2016.184；Yan等人2018， Sciencedoi:10.1126/science.aav7271；Harrington等人2018， Sciencedoi:10.1126/science.aav4294）。於一些實施方式中，目前揭露的融合蛋白包括Cas12（例如，Cas12a）。應注意，Cas12a亦被稱為Cpf1、且不需要tracrRNA，雖然例如Cas12b之類的其他V型CRISPR-Cas蛋白確實需要tracrRNA。大多數V型效應子亦可靶向ssDNA（單股DNA），而常常沒有PAM需求（Zetsche等人2015；Yan等人2018；Harrington等人2018）。用語「V型CRISPR-Cas蛋白」及「V型RGN」涵蓋包括分段型RuvC核酸酶結構域的唯一RGN，例如WO 2021/138247中揭露的那些，各申請案的內容藉由引用以其整體被併入本文。於一些實施方式中，本發明提供一種融合蛋白，該融合蛋白包括與 法朗西斯菌（Francisella novicida）Cas12a（FnCas12a）（其序列如SEQ ID NO：703所示且被揭露於美國專利號9,790,490中，該美國專利藉由引用以其整體被併入本文）或美國專利號9,790,490中揭露的FnCas12a的核酸酶不活化的突變體中的任一者融合的目前揭露的去胺酶。

於一些實施方式中，CRISPR-Cas蛋白是天然存在的VI型CRISPR-Cas蛋白或其活性變異體或片段。如本文使用，用語「VI型CRISPR-Cas蛋白」、「VI型CRISPR-Cas效應子蛋白」或「VI型RGN」指不需要tracrRNA並包括剪切RNA的二個HEPN結構域的CRISPR-Cas效應子蛋白。於一些實施方式中，本發明提供一種包括與Cas13融合的目前揭露的去胺酶的融合蛋白。

在一些實施例中，目前揭露的融合蛋白包括RGN、或其切口酶或無核酸酶活性的變異體，其為國際申請公開號WO 2019/236566、WO 2020/139783、WO 2021/030344、WO 2021/138247、WO 2021/231437 、或WO 2021/217002、或2023年8月12日申請的國際申請案第PCT/IB2023/058160 號所揭露者，這些申請案中的每一者均藉由引用以其整體併入本文。

於一些實施方式中，目前揭露的融合蛋白包括表1中所列、及/或如SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699所示的RGN或切口酶、或其無核酸酶活性的變異體。亦提供了可與表1的每一個RGN一起使用的引導RNA序列（crRNA重複以及tracrRNA序列）以及共通PAM序列。於某些實施方式中，融合蛋白包括表1中所列、及/或如SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699所示的RGN的活性變異體（能夠以RNA引導的方式與核酸分子結合的活性變異體），該活性變異體與表1中所列、及/或如SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699所示的胺基酸序列中的任一者具有介於80%與99%之間或更高序列一致性（包括但不限於約或超過約80%、約81%、約82%、約83%、約84%、約85%、約86%、約87%、約88%、約89%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、或更高）。在一些實施方式中，融合蛋白包括與表1中揭露的、及/或如SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699所示的RGN胺基酸序列具有至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高序列一致性的RGN。於其他實施方式中，融合蛋白包括列於表1中的RGN的片段，例如相差少至1-15個胺基酸殘基、少至1-10個（例如，6-10個）、少至5個、少至4個、少至3個、少至2個或少至1個胺基酸殘基的片段。於具體實施方式中，RGN包括N端或C端截短，該截短可至少包括從多肽的N端或C端缺失1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60個胺基酸或更多個胺基酸。於一些實施方式中，RGN包括內部缺失，該內部缺失可至少包括1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60個胺基酸或更多個胺基酸的缺失。表1. RNA引導的核酸酶的非限制性實例

RGN 名稱	RGN SEQ ID NO:	crRNA 重複序列	tracrRNA	PAM
APG05083.1	60	432	433	434
APG07433.1	1	416	417	418
APG07513.1	435	436	437	438
APG08290.1	57	439	440	441
APG05459.1	58	442	443	444
APG04583.1	61	445	446	447
APG01688.1	62	448	449	450
APG00969	63	451	452	453
APG03128	64	454	455	456
APG09748	140	457	458	459
APG00771	65	460	461	462
APG02789	141	463	464	465
APG09106	142	466	467	468
APG05733.1	66	469	470	471
APG06207.1	67	472	473	474
APG01647.1	68	475	476	477
APG08032.1	69	478	479	480
APG05712.1	70	481	482	483
APG01658.1	71	484	485	486
APG06498.1	72	487	488	489
APG09106.1	142	466	467	468
APG09882.1	73	493	494	495
APG02675.1	74	496	497	498
APG01405.1	75	499	500	501
APG06250.1	76	502	503	504
APG06877.1	77	505	506	507
APG09053.1	78	508	509	510
APG04293.1	79	511	512	513
APG01308.1	80	514	515	516
APG06646.1	81	517	518	519
APG09624	144	520	521	ND
APG05405	146	522	523	ND
APG06622	82	524	525	526
APG02787	83	527	528	529
APG06248	84	530	531	532
APG06007	85	533	534	535
APG02874	86	536	537	538
APG03850	87	539	540	541
APG07553	88	542	543	544
APG03031	89	545	546	547
APG09208	90	548	549	550
APG05586	2	419	420	421
APG08770	91	551	552	553
APG08167	92	554	555	556
APG01604	3	422	423	424
APG03021	93	557	558	559
APG06015	94	560	561	562
APG09344	95	563	564	565
APG07991	96	566	567	568
APG01868	97	569	570	571
APG02998	98	572	573	574
APG09298	99	419	420	421
APG06251	100	419	420	421
APG03066	101	419	420	421
APG01560	102	419	420	421
APG02777	103	419	420	421
APG05761	104	419	420	421
APG02479	105	419	420	421
APG08385	106	419	420	421
APG09217	107	419	420	421
APG06657	108	419	420	421
APG05586	171	419	420	421
APG07433.1 缺失變異體	575	416	417	418
APG08290.1 缺失變異體	576	439	440	441
LPG10134	109	163	175	NGG
LPG10136	110	164	176	NNNNCC
LPG10138	111	165	177	NNNNC
LPG10139	112	166	178	NNNNC
LPG10141	113	167	179	NGGNR
LPG10145	4	168	180	NNGG
LPG10146	114	169	181	NNRNNAY
LPG10147	115	170	182	NNAAAT
LPG10150	116	171	183	NNRRWC
LPG10155	117	172	184	NNAAAT
LPG10159	118	173	185	NRAAR
LPG10160	119	174	186	NAAT
LPG10165	120	187	208	nnnnGRRA
LPG10166	121	188	209	nnnAAC、nnnAAA、nnnCAC、nnnnCAC
LPG10167	122	189	210	nnnnCC
LPG10168	123	190	211	nnnnCC
LPG10169	124	191	212	nnGAA
LPG10171	125	192	213	nnnnGnnA
LPG10186	126	193	214	nVG
LPG10190	127	194	215	nnnnCCD、nnnnCTG
LPG10191	128	195	216	nnAHAAY
LPG10194	129	196	217	VGGNR
LPG10195	130	197	218	NNRA
LPG10196	131	198	219	NNNYTT
LPG10197	132	199	220	nnAAA
LPG10198	133	200	221	nnnnCMAA
LPG10200	134	201	222	nGR
LPG10203	135	202	223	nnnnGGG
LPG10204	136	203	224	nnnnGTG、nnnnGCGA
LPG10205	137	204 or 205	225 or 226	nnnnGTG、nnnnGCGA
LPG10207	138	206	227	nnnnCC
LPG10208	139	207	228	nnnnGTG、nnnnGCGA

* ND：未測定

本發明揭露的融合蛋白的RGN組成可以是APG07433.1（揭露於國際專利公開號WO 2019/236566，其藉由引用以其整體併入本文；且如SEQ ID NO：1所示)、APG05586 (揭露於國際專利公開號WO 2021/217002，其藉由引用以其整體併入本文；且如SEQ ID NO：2所示)、APG01604 (揭露於國際專利公開號WO 2021/217002，其藉由引用以其整體併入本文；且如SEQ ID NO：3所示)、LPG10145 (揭露於國際專利公開號WO 2023/139557，其藉由引用以其整體併入本文；且如SEQ ID NO：4所示)、LPG10196 (揭露於2023年8月12日申請的國際申請案第PCT/IB2023/058160號，其藉由引用以其整體併入本文；且如SEQ ID NO：131所示)；或其活性片段或變異體（能夠以RNA引導的方式與核酸分子結合者），例如其切口酶變異體。

RGN可以與SEQ NO：1、2、3、4、以及131中的任一者具有介於80%與99%之間或更高的序列一致性(保留RGN活性)，包括但不限於至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高。在某些實施方式中，融合蛋白包括與SEQ NO：1、2、3、4、以及131中的任一者具有80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或更高序列一致性(保留RGN活性)的RGN。此融合蛋白可包括如SEQ ID NO：1、2、3、4、以及131中任一者所示的RGN的活性片段，例如與SEQ ID NO：1、2、3、4、以及131中的任一者相差少至1-15個胺基酸殘基、少至1-10個（例如6-10個）、少至5個、少至4個、少至3個、少至2個、或少至1個胺基酸殘基的活性片段。於某些實施方式中，活性RGN片段包括N端或C端截短，該截短可至少包括從SEQ ID NO：1、2、3、4、以及131中任一者所示的多肽的N端或C端的1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60個胺基酸或更多個胺基酸的缺失。在一些實施方式中，活性RGN變異體或片段包括內部缺失，該內部缺失可至少包括SEQ ID NO：1、2、3、4、以及131中任一者的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60個胺基酸或更多個胺基酸的缺失。RGN的活性片段可以包括SEQ ID NO：1、2、3、4、以及131中任一者所示的胺基酸序列的至少50、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050或更多個連續胺基酸殘基。

於一些實施方式中，融合蛋白的RGN是包括突變（例如，D10A突變，其中胺基酸編號基於如SEQ ID NO：415所示的化膿鏈球菌Cas9序列）的RGN切口酶，該突變使得RGN能夠僅剪切核酸雙螺旋的非鹼基編輯的標的股（包括PAM並與gRNA鹼基配對的股）。包括D10A突變、或等效突變的切口酶具有不活化的RuvC核酸酶結構域並剪切靶向股。D10A切口酶不能剪切DNA的非靶向股，亦即，期望鹼基編輯的股。於這些實施方式中，RGN使標的股有切口，而互補的非標的股由去胺酶修飾。使用經修飾的非標的股作為模板，細胞的DNA修復機制可修復有切口的標的股，從而將突變引入DNA中。

因此，於一些實施方式中，切口酶包括不活化的RuvC結構域。RuvC結構域具有RNase H折疊結構（參見，例如，Nishimasu等人(2014) Cell 156(5)：935-949，其藉由引用以其整體被併入）。RGN的RuvC結構域常常是分段型RuvC結構域，其在線性胺基酸序列中包括二個或更多非相鄰區域。例如，化膿鏈球菌Cas9的RuvC結構域包括SEQ ID NO：415的胺基酸殘基1-59、718-769及909-1098。不活化其核酸酶活性的RuvC結構域內的突變的非限制性實例是D10A突變，該D10A突變使分段型RuvC核酸酶結構域中的第一天冬胺酸殘基突變。nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示）是如SEQ ID NO：1所示、且被描述於WO 2019/236566（藉由引用以其整體被併入本文）中的APG07433.1的切口酶變異體(帶有不活化的RuvC結構域)。nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示）是APG05586（如SEQ ID NO：2所示）的切口酶變異體（帶有不活化的RuvC結構域）。nAPG01604（如SEQ ID NO：51所示）是APG01604（如SEQ ID NO：3所示）的切口酶變異體（帶有不活化的RuvC結構域）。nLPG10145（如SEQ ID NO：52所示）是LPG10145（如SEQ ID NO：4所示）的切口酶變異體（帶有不活化的RuvC結構域）。nLPG10196（如SEQ ID NO：698所示）是LPG10196（如SEQ ID NO：131所示）的切口酶變異體（帶有不活化的RuvC結構域）。

在一些實施方式中，融合蛋白的RGN是包括使RGN能夠僅剪切核酸雙螺旋的非標的股（不包括PAM且不與gRNA鹼基配對的股）的突變(例如，H840A突變，其中胺基酸編號基於如SEQ ID NO：415所示的化膿鏈球菌Cas9序列)的RGN切口酶。於這些實施方式中的一些實施方式中，切口酶包括不活化的HNH核酸酶結構域。RGN的HNH核酸酶結構域具有ββα金屬折疊（參見，例如，Nishimasu等人2014）。例如，化膿鏈球菌Cas9的HNH核酸酶結構域包括SEQ ID NO：415的胺基酸殘基775-908。不活化其核酸酶活性的HNH結構域內的突變的非限制性實例為使HNH核酸酶結構域的第一組胺酸突變的H840A突變。帶有不活化的HNH結構域的RGN作用於非標的股上。nAPG07433.1（如SEQ ID NO：56所示）是如SEQ ID NO：1所示、且被描述於WO 2019/236566（藉由引用以其整體被併入本文）中的APG07433.1的切口酶變異體（帶有不活化的HNH結構域）。nAPG05586（如SEQ ID NO：53所示）是APG05586（如SEQ ID NO：2所示）的切口酶變異體（帶有不活化的HNH結構域）。nAPG01604（如SEQ ID NO：54所示）是APG01604（如SEQ ID NO：3所示）的切口酶變異體（帶有不活化的HNH結構域）。nLPG10145（如SEQ ID NO：55所示）是LPG10145（如SEQ ID NO：4所示）的切口酶變異體（帶有不活化的HNH結構域）。nLPG10196（如SEQ ID NO：699所示）是LPG10196（如SEQ ID NO：131所示）的切口酶變異體（帶有不活化的HNH結構域）。

用於不活化RGN的RuvC及/或HNH結構域的方法為本領域中已知的、且通常包括使分段型RuvC結構域內的第一天冬胺酸及/或HNH結構域的第一組胺酸突變。通常，天冬胺酸殘基或組胺酸殘基被突變為丙胺酸。RuvC域內的、可被突變為不活化該結構域的核酸酶活性的其他胺基酸殘基包括Glu762、His983及Asp986（通常情況下為丙胺酸），其中胺基酸編號基於如SEQ ID NO：415所示的化膿鏈球菌Cas9序列。HNH結構域內、可被突變的其他胺基酸殘基包括D839及N863（通常情況下為丙胺酸），其中胺基酸編號基於如SEQ ID NO：415所示的化膿鏈球菌Cas9序列。

除非另有說明，當使用命名法「n」後接核酸酶的名稱時，這是指其中 RuvC 結構域已被不活化的切口酶（例如，帶有D10A突變）。

在一些實施方式中，融合蛋白包括保留切口酶活性的RGN切口酶，該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698、以及699中任一者具有約60%至約99.5%一致性的胺基酸序列。在一些實施方式中，保留切口酶活性的RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698、以及699中任一者具有至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或至少99.5%一致性的胺基酸序列。

在一些實施方式中，融合蛋白包括RGN切口酶，RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698、以及699中任一者具有80%與99%之間或更高（包括但不限於至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高）序列一致性的胺基酸序列。

在一些實施方式中，融合蛋白的RGN是無核酸酶活性的。如本文使用的，已被突變而變成核酸酶不活化的或「無」核酸酶「活性」的RGN蛋白可被稱為RNA引導的DNA結合多肽或核酸酶不活化的RGN或無核酸酶活性的RGN。用於產生核酸酶不活化的RGN的方法為為本領域中已知的、且通常包括使RGN的唯一核酸酶結構域或所有核酸酶結構域突變，以使（多個）核酸酶結構域不活化。在RGN僅包括單一核酸結構酶域（例如，RuvC結構域）的那些實施方式中，核酸酶不活化的變異體將在RuvC結構域內具有導致RuvC核酸酶結構域不活化的至少一個突變。在RGN包括一個以上的核酸酶結構域（例如RuvC結構域及HNH結構域）的那些實施方式中，RuvC結構域及HNH結構域中的每一者內的至少一個突變使兩者的核酸酶結構域不活化。

一個範例性的適合的核酸酶不活化的RGN是D10A/H840A Cas9突變體（參見，例如，Qi等人， Cell. 2013；152(5)：1173-83，其整體內容藉由引用被併入本文）。另外，其他已知的RNA引導的核酸酶（RGN）的適合的核酸酶不活化的變異體可被測定。

其他另外的範例性的適合的核酸酶不活化的RGN變異體包括但不限於D10A/D839A/H840A、以及D10A/D839A/H840A/N863A突變體結構域（參見，例如，Mali等人， Nature Biotechnology. 2013；31(9)：833-838，其整體內容藉由引用被併入本文）。

基於本揭露內容及本領域中的知識，被突變為切口酶或不活化的核酸酶的其他的適合的RGN蛋白對於本領域中具有通常知識者是明顯的（例如舉例而言PCT公開號WO 2019/236566中揭露的RGN，其藉由引用以其整體被併入本文）且在此揭露內容的範圍內。

本領域中用於將突變引入胺基酸序列（例如PCR介導的誘變及定點誘變（site-directed mutagenesis））中的已知的任何方法可被用於產生切口酶或無核酸酶活性的RGN。參見，例如，美國公開號2014/0068797及美國專利號9,790,490；其每一者藉由引用以其整體被併入本文。

包括RGN的本發明的融合蛋白利用結合至融合蛋白的RGN組成並將融合蛋白引導至標的序列的引導RNA。用語「引導RNA」指與標的核苷酸序列具有足夠互補性以與標的序列雜交並引導關聯的RGN與標的核苷酸序列的序列專一性結合的核苷酸序列。更具體地，當標的核苷酸序列如DNA的情況是雙股時，標的核苷酸序列由標的股(其包括PAM序列)以及非標的股組成。在這些實施方式中，引導RNA與雙股標的序列(例如，標的DNA序列)的非標的股具有足夠的互補性，使得引導RNA與非標的股雜交並引導關聯的RGN引導的核酸酶(RGN) 與標的序列（例如標的 DNA 序列）的序列專一性結合。因此，在一些實施方式中，除了引導RNA中尿嘧啶(U)取代了胸苷(T)之外，引導RNA包括與標的股的序列相同的間隔子。

引導RNA是可與RGN結合並引導RGN與特定標的核苷酸序列結合、且在RGN具有切口酶或核酸酶活性的那些範例中也剪切標的核苷酸序列的一或更多RNA分子（通常，一或兩種）。引導RNA包括CRISPR RNA (crRNA)並且在一些實施方式中包括反式活化的CRISPR RNA (tracrRNA)。在一些實施方式中，引導RNA的一部分包括DNA核苷酸。在某些實施方式中，引導RNA包括人工、非天然存在的核苷酸類似物或一或多個核苷酸被化學修飾（包括2023年8月25日申請的國際申請案第PCT/IB2023/058418號中所述的修飾，該申請案藉由引用以其整體被併入本文）。

CRISPR RNA包括間隔序列及CRISPR重複序列。「間隔序列」是與所關注的標的序列的非標的股直接雜交的核苷酸序列。間隔序列被工程化為與所關注的標的序列完全地或部分地互補。於各種實施方式中，間隔序列包括約8個核苷酸至約30個核苷酸或更多個核苷酸。例如，間隔序列的長度可以是約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，間隔序列的長度是8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，間隔序列的長度是約10至約26個核苷酸、或長度是約12至約30個核苷酸。在一些實施方式中，間隔序列的長度是約30個核苷酸。在一些實施方式中，間隔序列的長度是30個核苷酸。在一些實施方式中，當使用適合的比對演算法進行最佳比對時，間隔序列與其對應的標的序列之間的互補性程度在50%與99%之間或更高，包括但不限於約或大於約50%、約60%、約70%、約75%、約80%、約81%、約82%、約83%、約84%、約85%、約86%、約87%、約88%、約89%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或更高。在一些實施方式中，當使用適合的比對演算法進行最佳比對時，間隔序列與其對應的標的序列之間的互補性程度為50%、60%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高。在一些實施方式中，間隔序列不含使用本領域中已知的任何適合的多核苷酸折疊演算法可預測的次級結構，多核苷酸折疊演算法包括但不限於mFold（參見，例如，Zuker及Stiegler（1981） Nucleic Acids Res. 9：133-148）及RNAfold（參見，例如，Gruber等人（2008） Cell106(1)：23-24）。

CRISPR RNA重複序列包括核苷酸序列，該核苷酸序列獨自地或者與雜交的tracrRNA配合形成由RGN分子辨識的結構。在各種實施方式中，CRISPR RNA重複序列包括約8個核苷酸至約30個核苷酸或更多個核苷酸。在一些實施方式中，CRISPR RNA重複序列包括8個核苷酸至30個核苷酸或更多個核苷酸。例如，CRISPR重複序列的長度可為約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，CRISPR重複序列的長度為8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，當使用適合的比對演算法進行最佳比對時，CRISPR重複序列與其對應的tracrRNA序列之間的互補性程度為50%與99%之間或更高，包括但不限於約或超過約50%、約60%、約70%、約75%、約80%、約81%、約82%、約83%、約84%、約85%、約86%、約87%、約88%、約89%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、或更高。在一些實施方式中，CRISPR重複序列與其對應的tracrRNA序列之間的互補性程度為50%、60%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或更高。

在一些實施方式中，引導RNA進一步包括tracrRNA分子。反式活化的CRISPR RNA或tracrRNA分子包括核苷酸序列，該核苷酸序列包括具有與crRNA的CRISPR重複序列雜交的足夠互補性的區域，其在本文中被稱為抗重複區域。在一些實施方式中，tracrRNA分子進一步包括具有次級結構（例如，莖-環）的區域、或在與其對應的crRNA雜交時形成次級結構。在一些實施方式中，與CRISPR重複序列完全地或部分地互補的tracrRNA的區域在分子的5'端且該tracrRNA的3'端包括次級結構。此次級結構區域一般包括被發現與該抗重複序列相鄰、包括連接（nexus）髮夾的數個髮夾結構。該tracrRNA的3'端處常常存在端髮夾，其結構及數量可變，但常常包括富含GC的Rho獨立轉錄終止子髮夾，其後是3'端處的一串U。參見，例如，Briner等人（2014） Molecular Cell56：333-339、Briner及Barrangou（2016） Cold Spring Harb Protoc；doi：10.1101/pdb.top090902及美國公開號2017/0275648，其每一者藉由引用以其整體被併入本文。

在各種實施方式中，與CRISPR重複序列完全地或部分地互補的tracrRNA的抗重複區域包括約6個核苷酸至約30個核苷酸或更多個核苷酸。例如，tracrRNA抗重複序列與CRISPR重複序列之間的鹼基配對區域的長度可為約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，tracrRNA抗重複序列與CRISPR重複序列之間的鹼基配對區域的長度可為6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，與CRISPR重複序列完全地或部分地互補的tracrRNA的抗重複區域的長度為約10個核苷酸。在一些實施方式中，與CRISPR重複序列完全地或部分地互補的tracrRNA的抗重複區域的長度為10個核苷酸。在一些實施方式中，當使用適合的比對演算法進行最佳比對時，CRISPR重複序列與其對應的tracrRNA抗重複序列之間的互補性程度在約50%與約99%之間，包括但不限於約或超過約50%、約60%、約70%、約75%、約80%、約81%、約82%、約83%、約84%、約85%、約86%、約87%、約88%、約89%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、或更高。在一些實施方式中，當使用適合的比對演算法進行最佳比對時，CRISPR重複序列與其對應的tracrRNA抗重複序列之間的互補性程度為至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高。

在各種實施方式中，整個tracrRNA包括約60個核苷酸至超過約210個核苷酸。在一些實施方式中，整個tracrRNA包括60個核苷酸至多於210個核苷酸。例如，tracrRNA的長度可以為約60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95、約100、約105、約110、約115、約120、約125、約130、約135、約140、約150、約160、約170、約180、約190、約200、約210或更多個核苷酸。在一些實施方式中，tracrRNA的長度為60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、150、160、170、180、190、200、210或更多個核苷酸。在一些實施方式中，tracrRNA的長度為約100至約200個核苷酸，包括約95、約96、約97、約98、約99、約100、約105、約106、約107、約108、約109、以及約100個核苷酸。在一些實施方式中，tracrRNA的長度為100至110個核苷酸，包括95、96、97、98、99、100、105、106、107、108、109、以及110個核苷酸。

引導RNA與RNA引導的DNA結合多肽或RNA引導的核酸酶、或包括前述的融合蛋白形成複合物，以將RNA引導的核酸酶、或包括前述的融合蛋白引導至與標的序列結合。如果引導RNA與RGN複合，則所結合的RGN在標的序列處引入單股或雙股斷裂。在標的序列已被剪切後，斷裂可以被修復，使得標的序列的DNA序列在修復過程期間被修飾。本文提供了用於使用（被連結至鹼基編輯多肽（例如，去胺酶）或先導編輯多肽的、是不活化的核酸酶或切口酶的）RNA引導的核酸酶的突變型變異體修飾宿主細胞的DNA中的標的序列的方法。於其中核酸酶活性被不活化或被顯著降低的RNA引導的核酸酶的突變型變異體可被稱為RNA引導的DNA結合多肽（RGDBP），因為該多肽能夠結合至但不一定剪切標的序列。只能剪切雙股核酸分子的單股的RNA引導的核酸酶在本文中被稱為切口酶。

標的核苷酸序列由RNA引導的DNA結合多肽（例如，RGN）結合、並與關聯於RGDBP的引導RNA（例如，RGN）雜交。如果RGDBP擁有核酸酶活性（即，為RGN）（涵蓋為切口酶的活性），則標的序列可隨後被剪切。

引導RNA可為單引導RNA或雙引導RNA系統。單引導RNA包括單RNA分子上的crRNA及可選地tracrRNA，而雙引導RNA系統包括存在於二個相異RNA分子上的crRNA及tracrRNA，其經由crRNA的CRISPR重複序列的至少一部分及可與crRNA的CRISPR重複序列完全地或部分地互補的tracrRNA的至少一部分而彼此雜交。在引導RNA為單引導RNA的那些實施方式中的一些實施方式中，crRNA以及可選地tracrRNA由連結子核苷酸序列分開。

目前揭露的融合蛋白的RGN組成的適合的crRNA重複序列、tracrRNA以及引導RNA序列被揭露於國際專利公開號WO 2019/236566、WO 2021/030344、WO 2020/139783、WO 2021/217002、WO 2021中/138247、WO 2021/231437、WO 2023/139557、以及2023 年 8 月 12 日申請的PCT國際申請案第PCT/IB2023/058160 號，各申請案均藉由引用以其整體被併入、及/或在表 1 中提供。

通常，為避免次級結構於連結子核苷酸序列的核苷酸內的形成或避免包括連結子核苷酸序列的核苷酸的次級結構的形成，crRNA 與 tracrRNA 之間的連結子核苷酸序列為不包括互補鹼基的連結子核苷酸序列。在一些實施方式中，crRNA與tracrRNA之間的連結子核苷酸序列的長度為至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12個、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，crRNA與tracrRNA之間的連結子核苷酸序列的長度為3、4、5、6、7、8、9、10、11、12個、或更多個核苷酸。在一些實施方式中，單引導RNA的連結子核苷酸序列的長度為至少4個核苷酸。在一些實施方式中，單引導RNA的連結子核苷酸序列的長度為4個核苷酸。

在某些實施方式中，引導RNA可作為RNA分子而被引入標的細胞、胞器或胚胎中。引導RNA可以在體外被轉錄或被化學合成。在一些實施方式中，編碼引導RNA的核苷酸序列被引入細胞、胞器或胚胎中。在一些實施方式中，編碼引導RNA的核苷酸序列可操作地連接至啟動子（例如，RNA聚合酶III啟動子）。啟動子可以是天然啟動子或與編碼核苷酸序列的-引導RNA異源。在一些實施方式中，啟動子從2021年6月10日申請的國際申請案第PCT/US2022/032940號揭露的啟動子中的任一者選出，該申請案藉由引用以其整體被併入本文。

在各種實施方式中，如本文所述，引導RNA可作為核糖核蛋白複合物而被引入標的細胞、胞器或胚胎中，其中引導RNA與RNA引導的核酸酶多肽結合。

引導RNA經由引導RNA與標的核苷酸序列的雜交而將關聯的RGDBP (例如，RGN)引導至所關注的特定標的核苷酸序列。標的核苷酸序列可包括DNA、RNA或二者的組合、且可以是單股或雙股的。標的核苷酸序列可以是基因組DNA（即，染色體DNA）、質體DNA或RNA分子（例如，傳訊RNA、核醣體RNA、轉移RNA、微RNA、短小干擾RNA）。標的核苷酸序列可在體外或在細胞中藉由RNA引導的DNA結合多肽被結合（且在一些實施方式中被剪切）。由RGDBP (例如，RGN)靶向的染色體序列可以是核、色素體或粒線體染色體序列。在一些實施方式中，標的核苷酸序列於標的基因組中是唯一的。

在一些實施方式中，標的核苷酸序列與前間隔序列鄰近模體（PAM）相鄰。PAM一般在距標的核苷酸序列約1至約10個核苷酸內，包括距標的核苷酸序列約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、或約10個核苷酸。在一些實施方式中，PAM在距標的核苷酸序列1至10個核苷酸內，包括距標的核苷酸序列1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10個核苷酸。除非另有陳述，PAM與標的核苷酸序列緊鄰、或在其5'或3'端。在一些實施方式中，PAM是標的序列的3'。一般而言，PAM是約2-6個核苷酸的共通序列、但在一些實施方式中長度為1、2、3、4、5、6、7、8、9、或更多個核苷酸。

目前揭露的融合蛋白的RGN成分的適合的PAM序列於國際專利公開號WO 2019/236566、WO 2021/030344、WO 2020/139783、WO 2021/217002、WO 2021/138247、WO 2021/231437、WO 2023/139557、以及2023 年 8 月 12 日申請的 PCT國際申請案第PCT/IB2023/058160 號（各申請案均藉由引用以其整體併入）中揭露、及/或在表 1 中提供。

PAM限制給定的RGDBP（例如，RGN）可靶向哪些序列，因為其PAM需要鄰近標的核苷酸序列。在辨識其對應的PAM序列時，RGN可剪切特定剪切位點處的標的核苷酸序列。如本文使用的，剪切位點是由標的核苷酸序列內的二個特定核苷酸組成，其之間的核苷酸序列由RGN剪切。剪切位點可包括5'或3'方向上從PAM起的第1及第2、第2及第3、第3及第4、第4及第5、第5及第6、第7及第8、或第8及第9個核苷酸。因為RGN可剪切標的核苷酸序列，導致交錯的端，所以，在一些實施方式中，基於多核苷酸的正（+）股上的二個核苷酸距PAM的距離及該多核苷酸的負（-）股上的二個核苷酸距該PAM的距離來定義該剪切位點。

RGDBP及RGN可被用於將融合多肽、多核苷酸或小分子酬載遞送至特定基因組位置。

在其中融合蛋白包括做為DNA結合成分的大範圍核酸酶的那些實施方式中，標的序列可包括由四個鹼基對分開的一對反向的9鹼基對「半位點」。在單鏈大範圍核酸酶的情況中，蛋白質的N端結構域接觸第一半位點，以及蛋白質的C端結構域接觸第二半位點。由大範圍核酸酶的剪切產生四個鹼基對3'突出。在DNA結合多肽包括緊密TALEN的那些實施方式中，辨識序列包括由I-TevI結構域辨識的第一CNNNGN序列、其後為長度為4-16鹼基對的非專一性間隔子、其後為由TAL效應子結構域（此序列通常情況下具有5' T鹼基）辨識的長度為16-22 bp的第二序列。在融合蛋白的DNA結合多肽成分包括鋅指的那些實施方式中，典型地，DNA結合結構域辨識包括由2-10個鹼基對分開的一對九個鹼基對「半位點」的18 bp辨識序列，且由核酸酶的剪切產生可變長度（往往四個鹼基對）的鈍端或5'突出。 III. 去胺酶

本發明的一些態樣提供了腺嘌呤去胺酶，其經由先前揭露的腺嘌呤去胺酶LPG50148（本文中如SEQ ID NO：5所示，沒有其起始甲硫胺酸)的定向演化及最佳化而產生，腺嘌呤去胺酶LPG50148揭露於國際申請案第WO 2022/056254號，該申請案藉由引用以其整體併入本文。這些演化的腺嘌呤去胺酶如SEQ ID NO：6、300-414、596-598、以及720-723所示（同樣，沒有起始甲硫胺酸）。

用語「去胺酶」指催化去胺反應的酶。本發明的去胺酶為核鹼基去胺酶，及用語「去胺酶」及「核鹼基去胺酶」在本文中被可互換地使用。去胺酶可為天然存在的去胺酶或其活性片段或變異體。去胺酶可在例如ssDNA或ssRNA之類的單股核酸上或例如dsDNA或dsRNA之類的雙股核酸上是活化的。在一些實施方式中，去胺酶只能對ssDNA去胺但對dsDNA沒有作用。

本發明的去胺酶可用於編輯DNA或RNA分子、以及可用作單獨的去胺酶或作為融合蛋白的成分。在一些實施方式中，去胺酶可用於編輯ssDNA或ssRNA分子。腺嘌呤、腺苷或去氧腺苷的去胺產生肌苷，其被聚合酶處理為鳥嘌呤。

迄今，尚無已知的天然存在的、使 DNA 中的腺嘌呤去胺的腺嘌呤去胺酶。已採用多種方法來演化以及最佳化作用於tRNA 蛋白的腺嘌呤去胺酶（ADAT），使其對哺乳動物細胞中的DNA 分子具有活性（Gaudelli 等人，2017；Koblan, L. W. 等人，2018， Nat Biotechnol36, 843-846； Richter, M.F.等人，2020， Nat Biotechnol，doi：10.1038/s41587-020-0562-8，每一者都藉由引用以其整體併入本文）。

在一些實施方式中，目前揭露的腺嘌呤去胺酶與催化胞嘧啶、胞苷或去氧胞苷的水解去胺為尿嘧啶的胞嘧啶去胺酶結合使用，例如國際申請案號WO 2020/189783 及 WO 2022/204093 及美國申請公開號2022/0145296中揭露的那些，各申請案均藉由引用以其整體併入本文。

目前揭露的去胺酶或其活性變異體或片段可以作為去胺酶-DNA結合多肽融合物的一部分被引入細胞中、及/或可以與DNA結合多肽-去胺酶融合物共表現，以增加在標的DNA分子中引入期望的A＞N（其中N是C、T或G）突變（例如A＞G突變）的效率。

目前揭露的去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性、以及具有表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者。在一些實施方式中，去胺酶具有與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、or 100%一致性的胺基酸序列、以及具有表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者。在一些實施方式中，去胺酶包括從SEQ ID NOs: 303、319、366、375、406、596、597、以及720選出的胺基酸序列。此類融合蛋白的非限制性範例在本文的範例部分中描述。

去胺酶可與SEQ ID NO：5具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高序列一致性，其中去胺酶具有以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或 D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。

在一些實施方式中，去胺酶具有： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u)在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。

在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N；在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R；以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W。在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W；在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W；以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L。在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A；以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y；在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L；在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G；在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L；在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的F；以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W；以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。在一些實施方式中，去胺酶包括的胺基酸序列具有：在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L；在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E；在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W；以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。

在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：303的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：319的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：365的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：375的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：406的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：596的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：597的胺基酸序列。在一些實施方式中，去胺酶包括SEQ ID NO：720的胺基酸序列。

在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：303的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：319的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：365的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：375的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：406的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：596的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：597的胺基酸序列組成。在一些實施方式中，去胺酶由SEQ ID NO：720的胺基酸序列組成。

與親代LPG50148去胺酶相較時，本發明的去胺酶可具有改善的去胺酶活性。改善的去胺酶活性可以藉由本領域中已知的任何方法來測量，以測量單獨的核鹼基（例如，腺嘌呤）或與DNA結合多肽（例如，RGN）融合時的去胺作用。

本文揭露的去胺酶可具有比親代LPG50148去胺酶高1.1倍至10倍、1.1倍至20倍、1.1倍至30倍或更高的核鹼基去胺效率，包括但不限於約1.1倍、約1.5倍、約2倍、約2.5倍、約3倍、約3.5倍、約4倍、約4.5倍、約5倍、約5.5倍、約6倍、約6.5倍、約7倍、約7.5倍、約8倍、約8.5倍、約9倍、約9.5倍、約10倍、約11倍、約12倍、約13倍、約15倍、約16倍、約17倍、約18倍、約19倍、約20倍、約21倍、約22倍、約23倍、約24倍、約25倍、約26倍、約27倍、約28倍、約29倍、以及約30倍。 IV. 異源多肽

在一些實施方式中，目前揭露的融合蛋白包括被插入RGN內的異源多肽。異源多肽是非天然結合至RGN蛋白的任何多肽。在一些實施方式中，異源多肽包括具有生物活性的蛋白質結構域。異源多肽可包括可偵測標記、可選擇標記、或純化標籤。在一些實施方式中，異源多肽是鹼基編輯多肽（例如，去胺酶）或先導編輯多肽。 A.先導編輯多肽

目前揭露的融合蛋白的異源多肽可以是先導編輯多肽，例如反轉錄酶。

先導編輯是一種多功能且精確的基因組編輯方法，該方法使用與聚合酶關聯作用的核酸可編程DNA結合蛋白將新的遺傳資訊直接寫入指定的DNA位點（描述於例如US 11,447,770B1；WO2021072328；WO2021226558；WO2020156575；WO2021042047；US11193123；每一者藉由引用以其整體併入本文）。先導編輯系統使用是切口酶的RGN（通常，其中HNH結構域已不活化者），並且該系統用先導編輯（PE）引導RNA（「PEgRNA」）而被編程。PEgRNA 是一種引導 RNA，該引導 RNA既指定標的序列且用被工程化至引導 RNA（例如，在引導RNA的內部部分、或5' 或 3' 端）上的延伸的方式提供用於聚合含有編輯的替換股的模板。RGN 切口酶/先導編輯多肽融合物由 PEgRNA 引導至標的序列、並對要被編輯序列的上游以及 PAM 上游的標的股進行切口，在標的股上產生3'瓣。pegRNA 包括與標的股的3' 瓣互補的先導結合位點（PBS）。在一些實施方式中，PBS 的長度至少約5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、或50個核苷酸。在某些實施方式中，pegRNA包括長度至少5（例如，至少5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、28、19、或20）個核苷酸的PBS 。在一些實施方式中，pegRNA可包括長度至少8個核苷酸的PBS。PBS與標的股的3'瓣的雜交允許使用PEgRNA 的延伸作為模板聚合含有該編輯的替換股。PEgRNA的延伸可以從RNA或DNA形成。在RNA延伸的情況下，先導編輯器的聚合酶可以是RNA相依的DNA聚合酶（例如反轉錄酶）。在DNA延伸的情況下，先導編輯器的聚合酶可以是DNA相依的DNA聚合酶。

含有期望的編輯（例如，單一核鹼基取代）的替換股與要被編輯的標的序列的標的股共用相同的序列（除了其包括期望的編輯之外）。經由 DNA 修復及/或複製機制，標的序列的標的股被新合成的、含有期望的編輯的替換股替換。在一些情況下，先導編輯可被認為是一種「搜尋-及-替換」基因組編輯技術，因為先導編輯器不僅搜尋並定位要被編輯的期望標的序列、而且同時編碼替換股（該替換股含有代替標的序列的對應標的股而被安裝的期望編輯）。因此，在一些實施方式中，可用於目前揭露的組成物及方法的引導RNA包括延伸，該延伸包括用於先導編輯的編輯模板。在一些實施方式中，可以與RGN融合的先導編輯多肽包括DNA聚合酶（例如，RNA相依的DNA聚合酶）。在某些實施方式中，DNA聚合酶是反轉錄酶。在某些實施方案中，RGN是切口酶，例如其中HNH結構域已不活化的切口酶。 B. 鹼基編輯多肽

目前揭露的融合蛋白的異源多肽可以是鹼基編輯多肽，例如去胺酶。

在一些實施方式中，目前揭露的的融合蛋白的去胺酶成分（其中去胺酶被插入RGN中）是SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中的任一者，包括本文揭露的那些去胺酶（SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723）、或其活性片段或變異體。去胺酶成分可以與SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者具有80%與99%之間或更高序列一致性（其保留去胺酶活性），包括但不限於至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高。融合蛋白可包括如SEQ ID NO:5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者所示的去胺酶的活性片段，例如與SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者相差少至1-15個去胺酸殘基、少至1-10個（例如6-10）、少至5、少至4、少至3、少至2、或少至1個胺基酸殘基的活性片段。在一些實施方式中，被插入RGN中的去胺酶與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性且具有表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。在一些實施方式中，去胺酶具有與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%一致性的胺基酸序列且具有表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。

在某些實施方式中，活性去胺酶片段包括N端或C端截短，該N端或C端截短可包括從SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者所示的多肽的N端或C端至少1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60 個胺基酸或更多胺基酸的缺失。融合蛋白可包括與去胺酶被衍生自的親代去胺酶相較下缺少第一個以及最後一個胺基酸殘基的該去胺酶，其中保留了去胺酶活性。融合蛋白可包括缺少SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者的第一個以及最後一個胺基酸殘基的去胺酶，其中保留了去胺酶活性。在一些實施方式中，活性去胺酶變異體包括內部缺失，該內部缺失可包括至少SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60個胺基酸或更多胺基酸的缺失。去胺酶的活性片段可以包括SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者所示的胺基酸序列的至少50、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050個或更多個連續胺基酸殘基。

在一些實施方式中，目前揭露的融合蛋白的去胺酶成分（其中去胺酶被插入RGN中)是SEQ ID No：303、319、365、375、406、597、以及720中任一者或其活性變異體或片段。

「鹼基編輯器」是包括與去胺酶可操作地連接的RGN的融合蛋白，使得當與引導RNA結合時，該融合蛋白能夠使標的核酸序列（或鄰近標的核酸序列）的核鹼基去胺。鹼基編輯器的RGN通常包括RGN切口酶（通常是具有不活化的RuvC結構域的RGN切口酶）或不具有核酸酶活性的無活性的RGN。其中去胺酶已被插入RGN內的鹼基編輯器融合蛋白在本文中被稱為「鑲嵌(inlaid)鹼基編輯器」。

目前揭露的融合蛋白可包括腺嘌呤去酶，例如本文所揭露的那些（例如，5、6、248-414、596、597、以及720-723）。包括RGN以及腺嘌呤去胺酶的鹼基編輯器在本文中被稱為「基於A的編輯器」、「腺嘌呤鹼基編輯器」、或「ABE」並且可以用於核酸序列的靶向編輯。迄今，尚無使DNA中的腺嘌呤去胺的已知的天然存在的腺嘌呤去胺酶。已採用多種方法來進化及最佳化作用於tRNA的腺嘌呤去胺酶（ADAT）蛋白，使其對哺乳動物細胞中的 DNA 分子是有活性的（Gaudelli等人，2017；Koblan, L. W.等人，2018， Nat Biotechnol36, 843-846；Richter, M. F.等人，2020， Nat Biotechnol, doi：10.1038/s41587-020-0562-8，其每一者藉由引用以其整體併入本文）。

可用於本發明的腺嘌呤去胺酶的非限制性範例包括但不限於PCT國際公開號WO 2022/056254中揭露的那些、以及SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723或其活性變異體或片段。

腺嘌呤鹼基編輯器（ABE）包括 RGN以及腺嘌呤去胺酶。ABE經由DNA標的分子上的腺嘌呤去胺為肌苷而作用（Gaudelli, N. M.等人，2017）。肌苷被聚合酶辨識為鳥嘌呤、並允許在肌苷對面的互補DNA股上併入胞嘧啶。在去胺後的一回合複製之後，基因組中會發生A：T 到G：C 鹼基對變化。在一些實施方式中，融合蛋白的腺嘌呤去胺酶或其活性變異體或片段在DNA分子中引入A＞N突變，其中N是C、G、或T。在進一步的實施方式中，它們在DNA分子中引入A＞ G突變。

在一些實施方式中，包括其中插入有去胺酶的RGN的目前揭露的融合蛋白可以包括胞嘧啶去胺酶，該胞嘧啶去胺酶催化了將胞嘧啶、胞苷、或去氧胞苷水解去胺為尿嘧啶。胞嘧啶去胺酶可以作用於 DNA 或 RNA、且通常作用於單股核酸分子上。在一些實施方式中，胞嘧啶去胺酶是脂蛋白元B mRNA 編輯複合物 (APOBEC) 家族去胺酶。在一些實施方式中，胞嘧啶去胺酶是APOBEC1家族去胺酶。在一些實施方式中，胞嘧啶去胺酶是一活化誘導的胞嘧啶去胺酶（AID）。在一些實施方式中，胞嘧啶去胺酶是ACF1/ASE去胺酶。

包括RGN以及胞嘧啶去胺酶的融合蛋白在本文中被稱為「C鹼基編輯器」、「胞嘧啶鹼基編輯器」或「CBE」。CBE 可以將胞嘧啶轉化為尿嘧啶，尿嘧啶隨後經由DNA 複製或修復被轉化為胸腺嘧啶。在一些實施方式中，CBE 將胞嘧啶轉化為鳥嘌呤或將胞嘧啶轉化為腺嘌呤。不受任何理論或作用機制的束縛，相信藉由胞嘧啶鹼基編輯器將胞嘧啶轉化為鳥嘌呤或腺嘌呤是由於在尿嘧啶殘基的鹼基切除式修復期間胞嘧啶去胺為尿嘧啶以及尿嘧啶DNA糖基化酶隨後的活性。在一些實施方式中，融合蛋白的胞嘧啶去胺酶或其活性變異體或片段在DNA分子中引入C＞N突變，其中N是A、G、或T。在進一步的實施方式中，它們在DNA分子中引入C＞G或C＞A突變。

可用於本發明的胞嘧啶去胺酶的非限制性範例包括但不限於PCT國際公開號WO 2020/139783、以及WO 2022/204093中揭露的那些以及SEQ ID NO：229-247或其活性變異體或片段。

RGN-去胺酶融合蛋白結合至的標的序列內或鄰近的腺嘌呤或胞嘧啶的突變率可以使用本領域已知的任何方法來測量，包括聚合酶連鎖反應(PCR)、限制性片段長度多型性(RFLP)、或 DNA 定序。 V. 融合蛋白

本發明提供各種類型的融合蛋白。本領域中具有通常知識者將瞭解，任何時候蛋白質與另一蛋白質融合時，C端蛋白質的N端甲硫胺酸(Met)可以選擇性地從序列中省略。因此，如本文使用的，提及與另一胺基酸序列融合的給定胺基酸序列明確包括具有或任選不具有N端Met的此類序列，無論此類序列是否包括序列表中的N端Met 。

本發明的一些態樣涉及包括被插入RGN內的異源多肽的融合蛋白。異源多肽可以被插入RGN的表面（即，被插入表面胺基酸殘基之間或表面環內的胺基酸殘基之間)。

異源多肽可被插入連接子結構域2、楔形（WED）結構域、RuvC結構域、HNH結構域、Rec-2結構域、或PAM相互作用（PI）結構域內。在一些實施方式中，RuvC結構域是RuvCIII結構域。 Rec 或辨識葉片藉由感測核酸來介導經由多個 Rec 結構域（例如 Rec1-3）的核酸結合、調節 HNH 構象轉變、並將催化 HNH 結構域鎖定在剪切位點。楔形結構域負責辨識引導RNA支架。RGN 內的結構域的非限制性範例包括：來自胺基酸殘基1-54的RuvC-I；來自胺基酸殘基55-83的BH；來自胺基酸殘基84-244的REC1；來自胺基酸殘基245-462的REC2；來自胺基酸殘基463-521的RuvC-II；來自胺基酸殘基522-552的L1；來自胺基酸殘基553-672的HNH；來自胺基酸殘基673-685的L2；來自胺基酸殘基686-833的RuvC-III；來自胺基酸殘基834-938的WED；以及來自胺基酸殘基939-1071的PI；全部參考如SEQ ID NO:1所示的APG07433.1。APG05586（如SEQ ID NO：2所示）具有下列結構域：來自胺基酸殘基1-33的RuvC-I；來自胺基酸殘基34-71的BH；來自胺基酸殘基72-232的REC1；來自胺基酸殘基233-468的REC2；來自胺基酸殘基469-517的RuvC-II；來自胺基酸殘基518-552的L1；來自胺基酸殘基553-672的HNH；來自胺基酸殘基673-687的L2；來自胺基酸殘基688-837的RuvC-III；來自胺基酸殘基838-998的WED；以及來自胺基酸殘基999-1150的PI。LPG10145（如SEQ ID NO：4所示）具有下列結構域：來自胺基酸殘基1-42的RuvC-I；來自胺基酸殘基43-79的BH；來自胺基酸殘基80-236的REC1；來自胺基酸殘基237-476的REC2；來自胺基酸殘基477-524的RuvC-II；來自胺基酸殘基525-560的L1；來自胺基酸殘基561-676的HNH；來自胺基酸殘基677-690的L2；來自胺基酸殘基691-828的RuvC-III；來自胺基酸殘基829-976的WED；以及來自胺基酸殘基977-1130的PI。APG01604（如SEQ ID NO：3所示）具有下列結構域：來自胺基酸殘基1-40的RuvC-I；來自胺基酸殘基41-74的BH；來自胺基酸殘基75-223的REC1；來自胺基酸殘基224-430的REC2；來自胺基酸殘基431-483的RuvC-II；來自胺基酸殘基484-516的L1；來自胺基酸殘基517-631的HNH；來自胺基酸殘基632-651的L2；來自胺基酸殘基652-775的RuvC-III；來自胺基酸殘基776-909的WED；以及來自胺基酸殘基910-1052的PI。

PAM 相互作用結構域是與 PAM 序列結合的結構域。RGN 蛋白的一般結構域可以經由與具有定義結構域的 RGN 蛋白的結構比較來確定。

在其中融合蛋白包括與SEQ ID NO：1或49具有至少90%序列一致性的RGN的那些實施方式中，異源多肽(例如，去胺酶)可被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置。

在其中融合蛋白包括與SEQ ID NO：2或50具有至少90%序列一致性的RGN的那些實施方式中，異源多肽可被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 v) 與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置。

在其中融合蛋白包括與SEQ ID NO：3或51具有至少90%序列一致性的RGN的那些實施方式中，異源多肽可被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 iii) 與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置。

在其中融合蛋白包括與SEQ ID NO：4或52具有至少90%序列一致性的RGN的那些實施方式中，異源多肽可被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置。

在其中融合蛋白包括與SEQ ID NO：131或698具有至少90%序列一致性的RGN的那些實施方式中，異源多肽可被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 ii) 與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。

本發明的融合蛋白可包括鹼基編輯器融合蛋白，其中異源多肽是去胺酶且去胺酶被插入RGN內，例如RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN。在一些實施方式中，鹼基編輯器融合蛋白的RGN組成包括RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN，RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN與SEQ ID NO：49-52以及698中的任一者具有約60%至約99.5%一致性。在一些實施方式中，RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN包括與SEQ ID NO：49-52以及698中任一者具有至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或至少99.5%一致性的胺基酸序列。

在一些實施方式中，鹼基編輯器融合蛋白包括RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN，其包括與SEQ ID NO：49-52以及698中任一者具有80%與99%之間或更高序列一致性的胺基酸序列，包括但不限於至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高。

本發明的融合蛋白可以包括鹼基編輯器融合蛋白（其中異源多肽是去胺酶且去胺酶被插入RGN內，例如RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN)，其中，與包括融合至RGN的胺基末端的去胺酶的親代鹼基編輯器相較，鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。改善的編輯活性可以藉由本領域已知的任何方法來測量。

相較於親代端對端融合蛋白，本文揭露的鹼基編輯器融合蛋白在編輯上可以具有1.1倍至10倍、1.1倍至20倍、1.1倍至30倍或更高的效率，包括但不限於約1.1倍、約1.5倍、約2倍、約2.5倍、約3倍、約3.5倍、約4倍、約4.5倍、約5倍、約5.5倍、約6倍、約6.5倍、約7倍、約7.5倍、約8倍、約8.5倍、約9倍、約9.5倍、約10倍、約11倍、約12倍、約13倍、約15倍、約16倍、約17倍、約18倍、約19倍、約20倍、約21倍、約22倍、約23倍、約24倍、約25倍、約26倍、約27倍、約28倍、約29-fold、以及約30倍。

鹼基編輯器融合蛋白與標的序列的結合導致與標的序列鄰近的核苷酸的修飾。由去胺酶修飾的與標的序列鄰近的核鹼基可以是距標的序列的5'或3'端1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17 、18 、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、或100個鹼基對。可以使用鹼基編輯器融合蛋白（例如，與去胺酶融合的RGN）編輯的全部核苷酸範圍，通常表示為核苷酸與PAM 序列的距離（例如，來自PAM序列的上游位置8及22的核苷酸，即，5'）在本文中被稱為特定鹼基編輯器融合蛋白的「編輯窗」。編輯窗可以是例如PAM序列5'或3'的1-100個鹼基對，包括但不限於PAM 序列的5' 或3'的5-50、5-25、8-22、10-20、或10-21鹼基對。

鑲嵌鹼基編輯器融合蛋白的非限制性範例包括： a) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的LPG50274/LPG50148.2.76（如SEQ ID NO：375所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：599所示的序列； b) 被插入nLPG10145（如SEQ ID NO：52所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的LPG50274/LPG50148.2.76（如SEQ ID NO：375所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：600所示的序列； c) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的LPG50221/LPG50148.2.20（如SEQ ID NO：319所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：602所示的序列； d) 被插入nLPG10145（如SEQ ID NO：52所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的LPG50221/LPG50148.2.20（如SEQ ID NO：319所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：603所示的序列； e) 被插入nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的LPG50274/LPG50148.2.76（如SEQ ID NO：375所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：606所示的序列； f) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後的LPG50274/LPG50148.2.76（如SEQ ID NO：375所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：610所示的序列； g) 被插入nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的LPG50221/LPG50148.2.20（如SEQ ID NO：319所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：612所示的序列； h) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的LPG50324（如SEQ ID NO：597所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：614所示的序列； i) LPG50221/LPG50148.2.20（如SEQ ID NO：319所示）或其活性變異體或片段，被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後，例如SEQ ID NO：615所示的序列； j) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後的LPG50319/LPG50148.2.107（如SEQ ID NO：406所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：617所示的序列； k) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後的LPG50324（如SEQ ID NO：597所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：619所示的序列； l) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後的LPG50320（如SEQ ID NO：596所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：620所示的序列； m) 被插入nLPG10145（如SEQ ID NO：52所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的LPG50319/LPG50148.2.107（如SEQ ID NO：406所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：621所示的序列； n) 被插入nLPG10145（如SEQ ID NO：52所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的LPG50324（如SEQ ID NO：597所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：622所示的序列； o) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的LPG50319/LPG50148.2.107（如SEQ ID NO：406所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：623所示的序列； p) 被插入nLPG10145（如SEQ ID NO：52所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的LPG50320（如SEQ ID NO：596所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：624所示的序列； q) 被插入nAPG05586（如SEQ ID NO：50所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的LPG50320（如SEQ ID NO：596所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：626所示的序列； r) 被插入nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的LPG50319/LPG50148.2.107（如SEQ ID NO：406所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：630所示的序列； s) 被插入nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的LPG50320（如SEQ ID NO：596所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：631所示的序列；以及 t) 被插入nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的LPG50324（如SEQ ID NO：597所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：632所示的序列。

本發明的融合蛋白可以包括鹼基編輯器融合蛋白（其中異源多肽是去胺酶且去胺酶被插入RGN（例如RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN）內），其中，當與包括與RGN胺基末端融合的去胺酶的親代鹼基編輯器相較時，鹼基編輯器融合蛋白具有移位的編輯窗。編輯窗可以被移位為比親代鹼基編輯器更窄或更寬。當與親代端對端融合蛋白相較時，移位的編輯窗是一種更寬或更窄（例如，相差1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、 17、 18、19、20或更多個核苷酸）的編輯窗，及/或，當與親代端對端融合蛋白相較時，編輯窗在標的分子的5'或3'方向上移動，例如在5'或3'方向上移動1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或更多個核苷酸。

在一些實施方式中，融合蛋白包括異源多肽與RGN之間的一或更多個胜肽連接子。本領域中具有通常知識者將理解，每當蛋白質與另一蛋白質融合時，可以選擇性地將連接子添加至序列中。因此，如本文中使用的，提及給定融合蛋白明確包括具有或可選地不具有連接子的此類序列，無論此類序列是否被列為具有連接子。去胺酶與RGN之間的連接子可以確定融合蛋白的編輯窗。可以採用範圍從非常靈活的(GGGGS) _n 以及(G) _n 形式的連接子到(EAAAK) _n 以及(XP) _n 形式的更剛性的連接子的各種連接子長度及靈活性，以實現用於特定應用的去胺酶活性的最佳長度以及剛性。如本文使用的用語「胜肽連接子」指連接兩個多肽的胜肽。在一些實施方式中，連接子連接RNA 引導的核酸酶與去胺酶。在一些實施方式中，連接子連接無活性的RGN或不活化的 RGN與去胺酶。在一些實施方式中，連接子的長度為3-100個胺基酸，例如長度為3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、30-35、35-40、40-45、45-50、50-60、60-70、70-80、80-90、90-100、100-150、或150-200個胺基酸。也考慮了更長或更短的連接子。在一些實施方式中，較短的連接子較佳用以減少融合蛋白或其編碼序列的整體大小或長度。RGN與被插入其中的異源多肽之間的胜肽連接子的非限制性範例包括GGS、SGG、以及GSSG（如SEQ ID NO：733所示）。連接子可以位於被插入的異源多肽的N端、C端或兩者處。

在一些實施方式中，RGN以及被插入其中的異源多肽彼此直接融合，其間沒有連接子序列。

本發明的另一個態樣涉及包括與本發明的去胺酶（例如，SEQ ID NO：6、300-414、596-598、以及720-723或其活性片段或變異體）可操作地連接的DNA結合多肽的融合蛋白。在一些實施方式中，與本發明的去胺酶融合的DNA結合多肽（例如，核酸酶不活化的RGN或切口酶RGN）可以被靶向核酸分子（即，標的核酸分子）的特定位置（在一些實施方式中，其是特定的基因組基因座），以改變期望序列的表現。在一些實施方式中，融合蛋白與標的序列的結合導致核鹼基的去胺，從而導致從一種核鹼基轉化為另一種核鹼基。在一些實施方式中，融合蛋白與標的序列的結合導致與標的序列鄰近的核鹼基的去胺。

本揭露內容的一些態樣提供了融合蛋白，其包括(i) DNA結合多肽（例如，核酸酶不活化的或切口酶RGN多肽）；(ii)去胺酶多肽；以及可選的(iii)第二去胺酶。第二去胺酶可以是與第一去胺酶相同的去胺酶或可以是不同的去胺酶。在一些實施方式中，第一去胺酶以及第二去胺酶都是本發明的腺嘌呤去胺酶。

本揭露內容提供了各種構型的融合蛋白。在一些實施方式中，融合蛋白是端對端融合，其中去胺酶多肽融合至DNA結合多肽（例如，RGN多肽）的N端或者去胺酶多肽融合至DNA結合多肽（例如，RGN多肽）的C端。

端對端鹼基編輯器融合蛋白的非限制性範例包括了包括與本文中的範例中使用的端對端融合蛋白中任一者的切口酶或其活性變異體或片段的N端融合的去胺酶或其活性變異體或片段的那些，包括但不限於： a) 與nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段的N端融合的LPG50221/LPG50148.2.20（如SEQ ID NO：319所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：578、579、或634所示的序列； b) 與nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段的N端融合的LPG50274/LPG50148.2.76（如SEQ ID NO：375所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：594、598、或638所示的序列； c) 與nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段的N端融合的LPG50319/LPG50148.2.107（如SEQ ID NO：406所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：588或616所示的序列； d) 與nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段的N端融合的LPG50320（如SEQ ID NO：596所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：593或636所示的序列；以及 e) 與nAPG07433.1（如SEQ ID NO：49所示)或其活性變異體或片段的N端融合的LPG50324（如SEQ ID NO：597所示）或其活性變異體或片段，例如SEQ ID NO：637所示的序列。

在一些實施方式中，端對端去胺酶以及DNA結合多肽（例如RNA引導的DNA結合多肽）經由連接子彼此融合。如本文使用的用語「連接子」指連接兩個分子或部分的化學基團或分子，例如核酸酶的結合結構域以及剪切結構域。在一些實施方式中，連接子連接 RNA 引導的核酸酶與去胺酶。在一些實施方式中，連接子連接無活性的或不活化的 RGN與去胺酶。在另外的實施方式中，連接子連接兩個去胺酶。在一些實施方式中，連接子連接 RNA 引導的核酸酶與USP。在一些實施方式中，連接子連接去胺酶與USP。在某些實施方式中，連接子將RNA引導的核酸酶-去胺酶融合物與USP連接。通常，連接子位於兩個基團、分子或其他部分之間或側翼、並經由共價鍵而被連接到每個基團、分子或其他部分，因此連接兩者。在一些實施方式中，連接子是一個胺基酸或多個胺基酸（例如，胜肽或蛋白質）。在一些實施方式中，連接子是有機分子、基團、聚合物或化學部分。在一些實施方式中，連接子的長度為3-100個胺基酸，例如長度為3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、30-35、35-40、40-45、45-50、50-60、60-70、70-80、80-90、90-100、100-150、或150-200個胺基酸。也考慮了更長或更短的連接子。在一些實施方式中，較短的接連接子較佳用以減少融合蛋白或其編碼序列的整體大小或長度。

在一些實施方式中，端對端融合中的去胺酶與DNA結合多肽之間的連接子包括SEQ ID NO：704、705、以及707-712中的任一者。額外的適合的連接子模體以及連接子構型對於本領域中具有通常知識者而言將是明顯的。在一些實施方式中，適合的連接子模體以及構型包括 Chen等人，2013（ Adv Drug Deliv Rev. 65(10)：1357-69中描述的那些，其整體內容藉由引用併入本文）。額外的適合的連接子序列對於本領域中具有通常知識者而言將是明顯的。在一些實施方式中，連接子序列包括如SEQ ID NO：233或234所示的胺基酸序列。

在一些實施方式中，本文提供的範例性融合蛋白的一般架構包括以下結構：[NH ₂]-[去胺酶]-[DBP]-[COOH]；[NH ₂]-[DBP]-[去胺酶]-[COOH]；[NH ₂]-[DBP]-[去胺酶]-[去胺酶]-[COOH]；[NH ₂]-[去胺酶]-[DBP]-[去胺酶]-[COOH]；或[NH ₂]-[去胺酶]-[去胺酶]-[DBP]-[COOH]，其中DBP是DNA結合多肽，NH ₂是融合蛋白的N端以及COOH是融合蛋白的C端。在一些實施方式中，融合蛋白包括兩個以上去胺酶多肽。

在某些實施方式中，本文提供的範例性融合蛋白的一般架構包括以下結構：[NH ₂]-[去胺酶]-[RGN]-[COOH]；[NH ₂]-[RGN]-[去胺酶]-[COOH]；[NH ₂]-[RGN]-[去胺酶]-[去胺酶]-[COOH]；[NH ₂]-[去胺酶]-[RGN]-[去胺酶]-[COOH]；或[NH ₂]-[去胺酶]-[去胺酶]-[RGN]-[COOH]，其中NH ₂是融合蛋白的N端以及COOH是融合蛋白的C端。在一些實施方式中，融合蛋白包括兩個以上去胺酶多肽。

在一些實施方式中，融合蛋白包括以下結構：[NH ₂]-[去胺酶]-[核酸酶不活化的RGN]-[COOH]；[NH ₂]-[去胺酶]-[去胺酶]-[核酸酶不活化的RGN]-[COOH]；[NH ₂]-[核酸酶不活化的RGN]-[去胺酶]-[COOH]；[NH ₂]-[去胺酶]-[核酸酶不活化的RGN]-[去胺酶]-[COOH]；或[NH ₂]-[核酸酶不活化的RGN]-[去胺酶]-[去胺酶]-[COOH]。應理解，「核酸酶不活化的RGN」表示任何RGN，包括已突變為核酸酶不活化的任何CRISPR-Cas蛋白。在一些實施方式中，融合蛋白包括兩個以上去胺酶多肽。

在一些實施方式中，融合蛋白包括以下結構：[NH ₂]-[去胺酶]-[RGN 切口酶]-[COOH]；[NH ₂]-[去胺酶]-[去胺酶]-[RGN切口酶]-[COOH]；[NH ₂]-[RGN切口酶]-[去胺酶]-[COOH]；[NH ₂]-[去胺酶]-[RGN切口酶]-[去胺酶]-[COOH]；或[NH ₂]-[RGN切口酶]-[去胺酶]-[去胺酶]-[COOH]。應理解，「RGN切口酶」代表任何RGN，包括已被突變為活化的切口酶的任何CRISPR-Cas蛋白。

在一些實施方式中，本文提供的融合蛋白包括去胺酶的全長序列。在一些實施方式中，然而，本文提供的融合蛋白不包括去胺酶的全長序列但僅包括其片段。

在一些實施方式中，本發明的融合蛋白包括DNA結合多肽（例如，RGN）以及去胺酶，其中去胺酶具有與SEQ ID NO：6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性的胺基酸序列。

在一些實施方式中，本發明的融合蛋白包括DNA結合多肽（例如，RGN）以及去胺酶，其中去胺酶具有與SEQ ID NO：6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性的胺基酸序列且具有表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。在一些實施方式中，本發明的融合蛋白包括DNA結合多肽（例如，RGN）以及去胺酶，其中去胺酶具有與SEQ ID NO：6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100% 一致性的胺基酸序列且具有表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。此類融合蛋白的範例在本文的範例部分中描述。

在一些實施方式中，融合蛋白包括一種去胺酶多肽。在一些實施方式中，融合蛋白包括直接或經由胜肽連接子可操作地連接的至少二去胺酶多肽。在一些實施方式中，融合蛋白包括一種去胺酶多肽，且第二去胺酶多肽與該融合蛋白共表現。

在一些實施方式中，在上述一般架構中使用的「-」表示存在可選的連接子序列。在一些實施方式中，本文提供的融合蛋白不包括連接子序列。在一些實施方式中，存在可選的連接子序列中的至少一者。

可以存在於目前揭露的去胺酶或融合蛋白上的其他範例性特徵是定位序列，例如核定位序列、細胞質定位序列、輸出序列(例如核輸出序列)、或其他定位序列、以及可用於融合蛋白的溶解、純化或檢測的序列標籤。本文提供的適合的定位訊號序列以及用於蛋白質標籤的序列包括但不限於生物素羧化酶載體蛋白(BCCP)標籤、myc-標籤、鈣調蛋白-標籤、FLAG-標籤(例如3XFLAG-標籤) 、血球凝集素(HA)-標籤、多組胺酸標籤(也稱為組胺酸標籤或His 標籤)、麥芽糖結合蛋白(MBP)-標籤、nus-標籤、麩胱甘肽-S-轉移酶(GST)-標籤、綠色螢光蛋白(GFP)-標籤、硫氧還原蛋白-標籤、S-標籤、Softag (例如Softag 1、Softag 3)、streptag、生物素連接酶標籤、FlAsH標籤、V5標籤以及SBP-標籤。額外的適合的序列對於本領域中具有通常知識者而言是明顯的。

目前揭露的組成物以及方法可以利用包括至少一核定位訊號(NLS)的去胺酶或融合蛋白以增強去胺酶或融合蛋白向細胞核的運輸。核定位訊號是本領域已知的並且通常包括一段鹼性胺基酸（參見例如Lange等人， J. Biol. Chem. (2007) 282:5101-5105）。在一些實施方式中，去胺酶或融合蛋白包括2、3、4、5、6或更多個核定位訊號。核定位訊號可以是異源NLS。可用於目前揭露的RGN的核定位訊號的非限制性範例是SV40大T-抗原、核質蛋白、c-Myc的核定位訊號（參見例如Ray等人(2015) Bioconjug Chem26(6)：1004-7）、POLD1 DNA 聚合酶δ1、作用於 RNA 的活性腺苷去胺酶（ADAR2）、與RNA聚合酶 II相互作用的相互作用物1（Interacts with RNA polymerase II 1，Iwr1）（Czeko E. 等人，Mol Cell 2011，其藉由引用以其整體併入）、以及OpT（美國公開號2020/0109382，其藉由引用以其整體併入）。在實施方式中，RGN包括如SEQ ID NO：430、431、以及713-718中任一者所示的NLS序列。去胺酶或融合蛋白可包括其N端、C端、或N端及C端兩者處的一或更多個NLS序列。例如，去胺酶或融合蛋白可包括N端區域處的兩個NLS序列以及C端區域處的四個NLS序列。在一些實施方式中，去胺酶或融合蛋白包括N端處的SV40 NLS（例如，如SEQ ID NO：430所示的序列）以及其C端處的核質蛋白NLS（例如，如SEQ ID NO: 431所示的序列）。在一些實施方式中，去胺酶或融合蛋白包括其N端以及其C端處的c-Myc啟動子（例如，如SEQ ID NO：718所示的序列)。

當NLS被附接在去胺酶或融合蛋白的N端、C端或兩者處時，可以存在NLS連接子蛋白以將去胺酶或融合蛋白與NLS分開。這樣的NLS連接子蛋白可以是長度為1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、或更多個胺基酸。在一些實施方式中，NLS 連接子蛋白的長度為至少 1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、或至少8 個胺基酸。在一些實施方式中，NLS與去胺酶或融合蛋白之間的NLS連接子蛋白具有如SEQ ID NO：706、719、或728所示的序列。在一些實施方式中，去胺酶或融合蛋白包括其N端處的c-Myc啟動子（例如，如SEQ ID NO：718所示的序列）（其藉由具有如SEQ ID NO：728所示的序列的NLS連接子蛋白而與去胺酶或融合蛋白分開）、以及其C端處的c-Myc啟動子（例如，如SEQ ID NO：718所示的序列）（其藉由具有如SEQ ID NO：728所示的序列的NLS連接子蛋白而與去胺酶或融合蛋白分開）。

在一些實施方式中，目前揭露的組成物以及方法利用包括至少一細胞穿透結構域的去胺酶或融合蛋白，細胞穿透結構域促進去胺酶或融合蛋白的細胞攝取。細胞穿透結構域是本領域已知的並且通常包括一段帶正電荷的胺基酸殘基（即，聚陽離子細胞穿透結構域）、交替的極性胺基酸殘基及非極性胺基酸殘基（即，雙性細胞穿透結構域）、或疏水性胺基酸殘基（即，疏水性細胞穿透結構域）（參見例如Milletti F. (2012) Drug Discov Today17：850-860）。細胞穿透結構域的非限制性範例是來自人類免疫缺陷病毒1的反式活化轉錄活化蛋白（TAT）。

核定位訊號及/或細胞穿透結構域可以位於去胺酶或融合蛋白的N端、C端及/或內部位置。 VI. 編碼去胺酶、融合蛋白及 / 或 gRNA 的核苷酸

本揭露內容提供了編碼目前揭露的去胺酶、融合蛋白或gRNA的多核苷酸。在一些實施方式中，多核苷酸編碼包括去胺酶以及DNA結合多肽的融合蛋白，例如大範圍核酸酶、鋅指融合蛋白、或TALEN。本揭露內容也提供了編碼包括去胺酶以及RNA引導的DNA結合多肽（RGDBP）的融合蛋白的多核苷酸。此類的RNA引導的DNA結合多肽可以是RGN或RGN變異體。蛋白質變異體可以是核酸酶不活化的或切口酶。RGN可以是CRISPR-Cas蛋白或其活性變異體或片段。CRISPR-Cas核酸酶的例子是本領域眾所周知的，並且類似的對應突變可以產生也是切口酶或核酸酶不活化的突變變異體。

本發明的實施方式提供了編碼融合蛋白的多核苷酸，融合蛋白包括本文所述的RGDBP（例如，RGN）以及去胺酶。在一些實施方式中，第二個多核苷酸編碼 RGDBP 用於靶向所關注的核苷酸序列所需的引導 RNA。在一些實施方式中，引導RNA以及融合蛋白由相同的多核苷酸編碼。

在一些實施方式中，引導RNA以及融合蛋白由相同的多核苷酸編碼。在其他實施方式中，引導RNA以及融合蛋白由兩個單獨的多核苷酸編碼。

用語「多核苷酸」的使用並不旨在將本揭露內容限制於包括DNA的多核苷酸，儘管考慮了此類DNA多核苷酸。本領域中具有通常知識者將認識到，多核苷酸可包含核糖核苷酸(RNA) (例如，mRNA)以及核糖核苷酸與去氧核糖核苷酸的組合。此類去氧核糖核苷酸以及核糖核苷酸包括天然存在的分子以及合成的類似物。本文揭露的多核苷酸也涵蓋所有形式的序列，包括但不限於單股形式、雙股形式、莖-及-環結構、環狀形式（例如，包括環狀RNA）等。

本發明的一種實施方式是包括編碼與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性的去胺酶的序列的核酸分子。本發明的一種實施方式是包括編碼與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有約50%至約100%一致性以及具有表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者的去胺酶的序列的核酸分子。本發明的一種實施方式是包括編碼與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100% 一致性以及具有表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者的去胺酶的序列的核酸分子，其中核酸分子編碼具有去胺酶活性的去胺酶。核酸分子也可包括異源啟動子或終止子。核酸分子可以編碼融合蛋白，其中編碼的去胺酶可操作地連接至DNA結合多肽、以及可選的第二去胺酶。在一些實施方式中，核酸分子編碼融合蛋白，其中編碼的去胺酶可操作地連接至RGN以及可選的第二去胺酶。

在一些實施方式中，包括編碼本發明的去胺酶或融合蛋白的多核苷酸的核酸分子針對在所關注的生物體中表現被密碼子最佳化。「密碼子最佳化」編碼序列是其密碼子使用頻率被設計為模擬特定宿主細胞的較佳密碼子使用頻率或轉錄條件的多核苷酸編碼序列。由於在核酸層級上一或更多個密碼子的改變增強了特定宿主細胞或生物體中的表現，使得轉譯的胺基酸序列不改變。核酸分子可以全部或部分地被密碼子最佳化。密碼子表以及提供用於廣泛的生物體的較佳資訊的其他參考文獻在本領域是可取得的（參見例如Campbell及Gowri (1990) Plant Physiol.92：1-11，關於植物較佳的密碼子使用）。本領域中用於合成植物較佳基因的方法是可得的。參見例如美國專利號5,380,831、以及5,436,391、以及Murray等人(1989) Nucleic Acids Res.17：477-498，藉由引用併入本文。

在一些實施方式中，編碼本文描述的去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的多核苷酸被提供在用於體外表現或在所關注的細胞、胞器、胚胎或生物體中表現的表現匣中。匣可包括5'及3'調節序列，該5'及3'調節序列可操作地連接至編碼本文提供的允許多核苷酸表現的去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的多核苷酸。匣可附加地含有至少一額外基因或基因元素，以被共轉形至生物體內。倘若包括額外基因或元素，則該組成可操作地被連接。用語「可操作地連結」旨在意指二或多個元素之間的功能性連接。例如，啟動子與所關注的編碼區域（例如，對去胺酶、RGN、及/或gRNA編碼的區域）之間的可操作地連接為允許所關注的編碼區域表現的功能性連接。可操作地連接的元素可以是連續的或非連續的。當用於指二個蛋白編碼區域的連結時，藉由可操作地被連接意指編碼區域在相同的讀框中。在一些實施方式中，附加的（一或多個）基因或（一或多個）元素被提供在多個表現匣上。例如，編碼目前揭露的去胺酶或融合蛋白的核苷酸序列可存在於一個表現匣上，而編碼gRNA的核苷酸序列可在單獨的表現匣上。另一個範例可具有在第一表現匣上單獨地編碼目前揭露的去胺酶的核苷酸序列、編碼包括去胺酶的融合蛋白的第二表現匣、及在第三表現匣上編碼gRNA的核苷酸序列。此種表現匣被提供有多個限制性位點及/或重組位點，以用於使多核苷酸的插入受調節區域的轉錄調節。亦可存在包括可選擇的標記基因的表現匣。

表現匣可包括5'-3'轉錄方向上的轉錄、轉錄的（且在一些實施方式中，轉譯的）起始區域（即，啟動子）、本發明的去胺酶編碼多核苷酸、本發明的融合蛋白編碼的多核苷酸、以及於所關注的生物體中起作用的轉錄的（而於一些實施方式中，轉譯的）終止區域（即，終止區域）。可用於本發明中的啟動子能夠引導或驅動編碼序列在宿主細胞中的表現。調節區域（例如，啟動子、轉錄調節區域、及轉譯終止區域）可與宿主細胞或彼此為內源的或異源的。如本文使用的，關於序列的「異源」為源自外來物種的序列，或者，如果來自相同物種，則為藉由蓄意的人為干預從其在組成物及/或基因組基因座中的天然形式被實質上修飾的序列。如本文使用的，如本文使用的，嵌合基因包括與轉錄起始區域可操作地連結的編碼序列，該轉錄起始區域與編碼序列是異源的。

合宜的終止區域可從 根癌農桿菌（ A. tumefaciens）的Ti質體獲得，例如，章魚肉鹼（octopine）合成酶及胭脂鹼（nopaline）合成酶終止區域。亦參見Guerineau等人(1991) Mol. Gen. Genet.262：141-144；Proudfoot (1991) Cell64：671-674；Sanfacon等人(1991) Genes Dev.5:141-149；Mogen等人(1990) Plant Cell2：1261-1272；Munroe等人(1990) Gene91：151-158；Ballas等人(1989) Nucleic Acids Res.17：7891-7903；以及Joshi等人(1987) Nucleic Acids Res.15：9627-9639。

附加的調節訊號包括但不限於轉錄起始開始位點操作子、活化子、增強子、其他調節元素、核醣體結合位點、起始密碼子、終止訊號及類似者。參見例如美國專利號5,039,523以及4,853,331；EPO 0480762A2；Sambrook等人(1992) Molecular Cloning：A Laboratory Manual, ed. Maniatis等人(冷泉港實驗室出版社，冷泉港，紐約)，此後稱“Sambrook 11”；Davis等人編輯(1980) Advanced Bacterial Genetics (冷泉港實驗室出版社)，紐約冷泉港，及其中引用的參考文獻。

在製備表現匣時，可操作各種DNA片段，以在適合的取向上及適當的情況下於適合的讀框中對DNA序列進行提供。為此，可以採用轉接子或連接子來連結DNA片段，或者可涉及其他操作以對合宜的限制性位點、移除多餘的DNA、移除限制性位點及類似者進行提供。為此目的，可涉及體外誘變、引子修復、限制、貼合（annealing）、重新取代（例如，轉位（transition）及置換（transversion））。

很多啟動子可被用於本發明的實施。可基於期望結果來選擇啟動子。核酸可與構成型、誘導型、生長階段特定、細胞類型特定、組織較佳、組織特定的或其他的啟動子結合，以用於所關注的生物體中的表現。參見，例如，WO 99/43838中以及美國專利號8,575,425；7,790,846；8,147,856；8,586832；7,772,369；7,534,939；6,072,050；5,659,026；5,608,149；5,608,144；5,604,121；5,569,597；5,466,785；5,399,680；5,268,463；5,608,142；以及6,177,611中所示的啟動子；其藉由引用併入本文。

對於在植物中的表現，構成型啟動子亦包括CaMV 35S啟動子(Odell等人(1985) Nature313：810-812)；水稻肌動蛋白(McElroy等人(1990) Plant Cell2：163-171)；泛蛋白(Christensen等人(1989) Plant Mol. Biol.12：619-632以及Christensen等人(1992) Plant Mol. Biol.18：675-689)；pEMU (Last等人(1991) Theor. Appl. Genet.81：581-588)；以及MAS (Velten等人(1984) EMBO J.3：2723-2730)。

誘導型啟動子的範例為可由缺氧或冷應激誘導的Adh1啟動子、可由熱應激誘導的Hsp70啟動子、可由光誘導的PPDK啟動子及PEP羧酶（pepcarboxylase）啟動子。同樣有用的為化學誘導的啟動子，例如，安全劑誘導的In2-2啟動子（美國專利號5,364,780）、生長素誘導的且是營養層特定的但在癒合組織中亦有活性的Axig1啟動子（PCT US01/22169）、類固醇反應性啟動子（參見，例如，Schena等人(1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA88：10421-10425以及McNellis等人(1998) Plant J. 14(2)：247-257中的雌激素誘導的ERE啟動子以及糖皮質激素誘導型啟動子）、及四環素誘導型以及四環素阻抑型啟動子（參見例如Gatz等人(1991) Mol. Gen. Genet. 227：229-237、以及美國專利號5,814,618以及5,789,156），其藉由引用併入本文。

在一些實施方式中，可運用組織特定或組織較佳的啟動子來靶向特定組織內的表現構築體的表現。在某些實施方式中，組織特定或組織較佳的啟動子在植物組織中是有活性的。在植物中受發育控制的啟動子的實例包括例如葉、根、果實、種子或花之類的某些組織中較佳地啟動轉錄的啟動子。「組織特定的」啟動子是僅在某些組織中啟動轉錄的啟動子。與基因的構成型表現不同，組織特定的表現是數種基因調節相互作用等級的結果。因此，來自同源或密切相關的植物物種的啟動子可較佳地用於在特定組織中實現轉殖基因的有效且可靠的表現。在一些實施方式中，表現包括組織較佳的啟動子。「組織較佳的」啟動子為較佳地在、但不一定完全在或僅在某些組織中啟動轉錄的啟動子。

在一些實施方式中，編碼本文描述的去胺酶或融合蛋白的核酸分子包括細胞類型特定的啟動子。「細胞類型特定的」啟動子是主要在一或多個器官中的某些細胞類型中驅動表現的啟動子。例如，植物細胞的一些實例（其中在植物中起作用的細胞類型特定的啟動子可以是主要活性的）包括BETL細胞、根、葉中的維管細胞、柄細胞及莖細胞。核酸分子也可包括細胞類型較佳的啟動子。「細胞類型較佳的」啟動子是主要驅動大部分在、但不一定完全在或僅在一或多個器官中的某些細胞類型中的表現的啟動子。例如，植物細胞（其中在植物中起作用的細胞類型較佳的啟動子可以是有較佳活性的）的一些實例包括BETL細胞、根、葉中的維管細胞、柄細胞及莖細胞。

在一些實施方式中，編碼去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的核酸序列例如可操作地連接至由噬菌體RNA聚合酶辨識的啟動子序列，以用於體外mRNA合成。在此類實施方式中，可以純化體外轉錄的RNA以用於本文描述的方法中。例如，啟動子序列可以是T7、T3、或SP6啟動子序列或T7、T3、或SP6啟動子序列的變異體。在此類實施方式中，可以純化表現的蛋白質及/或RNA以用於本文描述的基因組修飾方法中。

在某些實施方式中，編碼去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的多核苷酸被連接至多腺苷酸化訊號（例如，SV40 polyA訊號以及在植物中起作用的其他訊號）及/或至少一轉錄終止序列。在一些實施方式中，如本文他處所述，編碼去胺酶或融合蛋白的序列被連接至編碼至少一核定位訊號、至少一細胞穿透結構域及/或能夠將蛋白質運輸至特定次細胞位置的至少一訊號肽的序列。

在一些實施方式中，編碼去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的多核苷酸存在於一個載體或多個載體中。「載體」指用於將核酸轉移、遞送或引入宿主細胞中的多核苷酸組成物。適合的載體包括質體載體、噬菌粒、黏質體、人工/微型染色體、轉位子以及病毒載體（例如，慢病毒載體、腺相關病毒載體、桿狀病毒載體）。在一些實施方式中，載體包括附加的表現控制序列（例如，增強子序列、Kozak序列、多腺苷酸化序列、轉錄終止序列）、選擇性標記序列（例如，抗生素抗性基因）、複製起點及類似者。附加的資訊可在 “Current Protocols in Molecular Biology” Ausubel等人、John Wiley & Sons，紐約，2003；或“Molecular Cloning: A Laboratory Manual” Sambrook & Russell，冷泉港出版社,冷泉港,N.Y. , 第3版, 2001中找到。

在一些實施方式中，載體包括用於轉形的細胞（transformed cell）的選擇的選擇性標記基因。對於轉形的細胞或組織的選擇運用選擇性標記基因。標記基因包括：編碼抗生素抗性的基因，例如編碼新黴素磷酸轉移酶II（NEO）以及潮黴素磷酸轉移酶（HPT）的基因；以及對例如草銨膦(glufosinate ammonium)、溴苯腈、咪唑啉酮及2,4-二氯苯氧乙酸鹽（2,4- D）之類的除草化合物賦予抗性的基因。

在一些實施方式中，包括編碼融合蛋白的序列的表現匣或載體進一步包括編碼gRNA的序列。在一些實施方式中，編碼gRNA的（多個）序列可操作地被連結至至少一個轉錄控制序列，以用於gRNA於所關注的生物體或宿主細胞中的表現。例如，編碼gRNA的多核苷酸可操作地被連結至由RNA聚合酶III (Pol III)辨識的啟動子序列。適合的Pol III啟動子的實例包括但不限於哺乳動物U6、U3、H1以及7SL RNA啟動子、水稻U6及U3啟動子、以及2022年6月10日申請的PCT國際申請案號PCT/US2022/032940中揭露的啟動子，該國際申請案藉由引用以其整體併入本文。

如所指出的，包括編碼去胺酶、融合蛋白、及/或gRNA的核苷酸序列的表現構築體可被用於轉形所關注的生物體。用於轉形的方法涉及將核苷酸構築體引入所關注的生物體中。藉由「引入」旨在以使構築體進入宿主細胞內部的方式將核苷酸構築體引至宿主細胞。本發明的方法不需要一種只是核苷酸構築體進入宿主生物體的至少一個細胞內部而將核苷酸構築體引至宿主生物體的特定方法。在一些實施方式中，編碼去胺酶或融合蛋白的mRNA被引入宿主細胞中。在融合蛋白包括RGN的一些實施方式中，編碼融合蛋白的mRNA被引入細胞中，以及gRNA被引入細胞中。宿主細胞可以是真核細胞或原核細胞。在一些實施方式中，真核宿主細胞是植物細胞、哺乳動物細胞或昆蟲細胞。用於將核苷酸構築體引入植物及其他宿主細胞中的方法為本領域中已知，包括但不限於穩定轉形方法、瞬時轉形方法、以及病毒介導方法。

此等方法得到轉形的生物體，例如植物，包括：整株植物、以及植物器官（例如，葉、莖、根等）、種子、植物細胞、繁殖體、胚胎及其後代。植物細胞可被分化、或可不被分化（例如，癒合組織、懸浮培養細胞、原生質體、葉細胞、根細胞、韌皮部細胞、花粉）。

「基因轉殖的生物體」或「轉形的生物體」或「經穩定轉形的」生物體或細胞或組織指已併入或整合了編碼本發明的去胺酶或融合蛋白的多核苷酸的生物體。應該認識到，其他外源或內源核酸序列或DNA片段亦可被併入宿主細胞中。農桿菌及基因槍（biolistic）介導的轉形仍然為用於植物細胞的轉形主要採用的二種方法。然而，宿主細胞的轉形可藉由感染、轉染、顯微注射、電穿孔、顯微投影、基因槍或粒子轟擊、電穿孔、二氧化矽/碳纖維、超音波介導的、PEG介導的、磷酸鈣共沉澱、聚陽離子DMSO技術、DEAE聚葡醣（dextran）程序、及病毒介導的、脂質體介導的以及類似者執行。編碼去胺酶、融合蛋白、及/或gRNA的多核苷酸的病毒介導的引入包括反轉錄病毒、慢病毒、腺病毒、及腺相關病毒介導的引入及表現、以及花椰菜嵌紋病毒（例如，花椰菜嵌紋病毒（cauliflower mosaic virus））、雙生病毒（例如，豆科金色黃花葉嵌紋病毒（bean golden yellow mosaic virus）或玉蜀黍條班病毒（maize streak virus））、以及RNA植物病毒（例如，煙草嵌紋病毒）的使用。

轉形操作流程以及用於將多肽或多核苷酸序列引入植物中的操作流程可隨針對轉形所靶向的宿主細胞的類型（例如，單子葉植物或雙子葉植物細胞）而不同。用於轉形的方法為本領域中已知、且包括美國專利號：8,575,425；7,692,068；8,802,934；7,541,517中闡述的那些方法；這些專利中的每一者藉由引用被併入本文。亦參見Rakoczy-Trojanowska, M. (2002) Cell Mol Biol Lett.7：849-858；Jones等人(2005) Plant Methods1：5；Rivera等人(2012) Physics of Life Reviews9：308-345；Bartlett等人(2008) Plant Methods4：1-12；Bates, G.W. (1999) Methods in Molecular Biology111：359-366；Binns及Thomashow (1988) Microbiology42：575-606中的 Annual Reviews；Christou, P. (1992) The Plant Journal2：275-281；Christou, P. (1995) Euphytica85：13-27；Tzfira等人(2004) TRENDS in Genetics20：375-383；Yao等人(2006) Journal of Experimental Botany57：3737-3746；Zupan及Zambryski (1995) Plant Physiology107：1041-1047；Jones等人(2005) Plant Methods1：5。

轉形可導致核酸至細胞中的穩定或暫時引入。「穩定轉形」旨在表示被引入宿主細胞中的核苷酸構築體整合至該宿主細胞的基因組中、且能夠被其後代遺傳。「暫時性轉形」旨在表示多核苷酸被引入宿主細胞中而不整合至宿主細胞的基因組中。

用於葉綠體轉形的方法為本領域中已知。參見例如Svab等人(1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA87：8526-8530；Svab及Maliga (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA90：913-917；Svab及Maliga (1993) EMBO J.12：601-606。該方法依賴含有選擇性標記的DNA的粒子槍遞送以及經由同源重組而將DNA靶向至質體基因組。此外，色素體轉形可藉由核編碼的及質體導向的RNA聚合酶的組織較佳的表現來轉錄活化（transactivation）沉默質體攜帶的轉殖基因來完成。McBride等人(1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA91：7301-7305中已報導了此系統。

已經被轉形的細胞可按照傳統方式生長成基因轉殖生物體，例如，植物。參見例如McCormick等人(1986) Plant Cell Reports5：81-84。然後，可以使這些植物生長、並用相同的轉形的品系或不同品系授粉，且辨識出具有去胺酶或融合蛋白多核苷酸的所得雜合體。可生長二代或多代以確保穩定維持並遺傳去胺酶或融合蛋白多核苷酸、以及接著收穫種子以確保去胺酶或融合蛋白多核苷酸的存在。以此方式，本發明提供具有穩定地併入其基因組中的本發明的核苷酸構築體（例如，本發明的表現匣）的轉形的種子（亦稱為「基因轉殖種子」）。

在一些實施方式中，可將已轉形的細胞引入生物體中。這些細胞可已源自生物體，其中細胞以離體方法被轉形。

本文提供的序列可被用於任何植物物種的轉形，包括但不限於單子葉植物及雙子葉植物。所關注的植物的實例包括但不限於玉蜀黍（玉米）、高粱、小麥、向日葵、番茄、十字花科植物、胡椒、馬鈴薯、棉花、水稻、大豆、甜菜、甘蔗、煙草、大麥、及油菜、蕓苔屬物種(Brassica sp.)、苜蓿、黑麥、小米、紅花、花生、甘藷、木薯、咖啡、椰子、鳳梨、柑橘樹、可可、茶、香蕉、鱷梨、無花果、番石榴、芒果、橄欖、木瓜、腰果、澳洲胡桃、杏仁、燕麥、蔬菜、觀賞植物以及針葉樹。

蔬菜包括但不限於：番茄、萵苣、綠豆、皇帝豆、豌豆、以及例如胡瓜(cucumber)、網紋甜瓜(cantaloupe)及洋香瓜(musk melon)之類的黃瓜(Curcumis)屬的成員。觀賞植物包括但不限於杜鵑花、繡球花、芙蓉、玫瑰、鬱金香、水仙、矮牽牛、康乃馨、猩猩木以及菊花。較佳地，本發明的植物為農作物（例如，玉米、高粱、小麥、向日葵、番茄、十字花科植物、胡椒、馬鈴薯、棉花、水稻、大豆、甜菜、甘蔗、煙草、大麥、油菜等）。

如本文所使用的用語「植物」包括植物細胞、植物原生質體、植物可再生所自的植物細胞組織培養物、植物癒傷組織、植物塊、及在植物或植物的例如胚胎、花粉、胚珠、種子、葉子、花、枝、果實、仁、穗、玉米穗軸、殼、莖、根、根尖、花藥以及類似者之類的部分中是完整的植物細胞。穀物旨在表達出於種植或繁殖物種之外的目的而由商業種植者生產的成熟種子。再生植物的子代、變異體以及突變體亦被包括在本發明的範圍內，前提條件是此等部分包括所引入的多核苷酸。進一步提供了保持了本文揭露的序列的經處理的植物產品或副產物，例如，包括豆粕。

在一些實施方式中，編碼去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的多核苷酸被用於轉形任何真核物種，包括但不限於動物（例如，哺乳動物、昆蟲、魚類、鳥類、以及爬蟲類物）、真菌、變形蟲、藻類、以及酵母。在一些實施方式中，編碼去胺酶、融合蛋白及/或gRNA的多核苷酸被用於轉形任何原核物種，包括但不限於古生菌以及細菌（例如，芽孢桿菌屬（ Bacillus spp.）、克雷伯氏菌屬（ Klebsiella spp.）、鏈黴菌屬（ Streptomyces spp.）、根瘤菌屬（ Rhizobium spp.）、埃希氏菌屬（ Escherichia spp.）、假單胞菌屬（ Pseudomonas spp.）、沙門氏菌屬（ Salmonella spp.）、志賀氏桿菌屬（ Shigella spp.）、弧菌屬（ Vibrio spp.）、耶爾森菌屬（ Yersinia spp.）、支原體菌屬（ Mycoplasma spp.）、農桿菌屬（ Agrobacterium）、乳酸乳桿菌屬（ Lactobacillus spp.）。

在一些實施方式中，傳統的基於病毒以及非病毒的基因轉移方法被用於將核酸引入哺乳動物細胞或標的組織中。此種方法可被用於將編碼本發明的去胺酶或融合蛋白及可選地gRNA的核酸投予培養中的細胞或宿主生物體中的細胞。非病毒載體遞送系統包括DNA質體、RNA（例如，本文描述的載體的轉錄本）、裸核酸、以及與例如脂質體之類的遞送載子複合的核酸。病毒載體遞送系統包括DNA及RNA病毒，其在遞送至細胞後具有附加型或整合的基因組。非限制性實例包括運用花椰菜嵌紋病毒（例如，花椰菜嵌紋病毒）、雙生病毒（例如，豆科金色黃花葉嵌紋病毒或玉蜀黍條班病毒）、以及RNA植物病毒（例如，煙草嵌紋病毒）的載體。有關基因療法程序的綜述，參見Anderson， Science256: 808- 813 (1992)；Nabel & Feigner， TIBTECH11：211-217 (1993)；Mitani & Caskey， TIBTECH11：162-166 (1993)；Dillon， TIBTECH11：167-175 (1993)；Miller， Nature357：455-460 (1992)；Van Brunt， Biotechnology6(10)：1149-1154 (1988)；Vigne， Restorative Neurology and Neuroscience8：35-36 (1995)；Kremer & Perricaudet， British Medical Bulletin51(1)：31-44 (1995)；Haddada等人，in Current Topics in Microbiology and Immunology，Doerfler以及Bohm (編者) (1995)；以及Yu等人， Gene Therapy1：13-26 (1994)。

核酸的非病毒遞送方法包括脂質體轉染、農桿菌介導的轉形、核轉染、顯微注射、基因槍、病毒體、脂質體、免疫脂質體、聚陽離子或脂質：核酸共軛物、裸DNA、人工病毒粒子、以及DNA的試劑增強攝取。例如，美國專利號5,049,386、4,946,787及4,897,355中描述了脂質體轉染，且脂質體轉染試劑是市售的（例如，Transfectam ™及Lipofectin™）。適合用於多核苷酸的有效受體辨識脂質體轉染（receptor-recognition lipofection）的陽離子及中性脂質包括Feigner的WO 91/17424；WO 91/16024中的那些陽離子以及中性脂質。遞送可為至細胞（例如，在體外或離體地投予）或標的組織（例如，體內投予）。例如免疫脂質複合物之類的包括靶向的脂質體的脂質：核酸複合物的製備為本領域中具有通常知識者所熟知（參見例如Crystal， Science270：404-410 (1995)；Blaese等人， Cancer Gene Ther.2：291- 297 (1995)；Behr等人， Bioconjugate Chem.5：382-389 (1994)；Remy等人， Bioconjugate Chem.5：647-654 (1994)；Gao等人， Gene Therapy2：710-722 (1995)；Ahmad等人， Cancer Res.52：4817-4820 (1992)；美國專利號4,186,183、4,217,344、4,235,871、4,261,975、4,485,054、4,501,728、4,774,085、4,837,028、以及4,946,787）。

使用基於RNA或DNA病毒的系統來遞送核酸利用高度進化的過程將病毒靶向至體內的特定細胞並將病毒酬載運輸至細胞核。病毒載體可被直接投予患者（體內），或者病毒載體可被用於體外處理細胞，並且可選地將經修飾的細胞投予患者（離體）。傳統的基於病毒的系統可包括用於基因轉移的反轉錄病毒、慢病毒、腺病毒、腺相關及單純皰疹病毒載體。用反轉錄病毒、慢病毒、及腺相關病毒基因轉移方法，在宿主基因組中的整合是可能的，常常導致所插入的轉殖基因的長期表現。此外，在許多不同細胞類型及標的組織中已經觀察到高轉導效率。

反轉錄病毒的向性可藉由併入外來套膜蛋白而被改變，從而擴展標的細胞的潛在標的族群。慢病毒載體為能夠轉導或感染非分裂細胞且通常產生高病毒力價的反轉錄病毒載體。因此，反轉錄病毒基因轉移系統的選擇將依賴於標的組織。反轉錄病毒載體由順式作用長端重複序列構成，順式作用長端重複序列具有達6-10 kb外來序列的包裝能力。最小順式作用LTR足夠用於載體的複製以及包裝，然後，使用其將期望的基因整合至標的細胞中，以提供永久轉殖基因表現。廣泛使用的反轉錄病毒載體包括基於小鼠白血病病毒（MuLV）、長臂猿白血病病毒（GaLV）、猿猴免疫不全病毒（SIV）、人免疫不全病毒（HIV）、及其組合的那些載體（參見例如 Buchscher等人， J. Virol.66：2731-2739 (1992)；Johann等人， J. Virol.66：1635-1640 (1992)；Sommnerfelt等人， Virol.176：58-59 (1990)；Wilson等人， J. Virol.63：2374-2378 (1989)；Miller等人， J. Virol.65：2220-2224 (1991)；PCT/US94/05700)。

在暫時性表現較佳的應用中，可使用基於腺病毒的系統。基於腺病毒的載體在許多細胞類型中能夠有非常高的轉導效率、且不需要細胞分裂。使用這樣的載體，已經獲得了高力價及高表現水準。此載體可在相對簡單的系統中被大量產生。腺相關病毒（“AAV”）載體亦可例如在核酸以及胜肽的體外生產中、以及在體內及離體基因療法程序中利用目標核酸轉導細胞（參見，例如West等人， Virology160：38-47 (1987)；美國專利號4,797,368；WO 93/24641；Katin， Human Gene Therapy5：793-801 (1994)；Muzyczka， J. Clin. Invest.94：1351 (1994)。重組AAV載體的構築被描述於許多出版物中，包括美國專利號5,173,414；Tratschin等人， Mol. Cell. Biol.5：3251-3260 (1985)；Tratschin等人， Mol. Cell. Biol.4：2072-2081 (1984)；Hermonat & Muzyczka, PNAS81：6466-6470 (1984)；以及Samulski等人， J. Virol.63：03822-3828 (1989)。包裝細胞通常用於形成能夠感染宿主細胞的病毒顆粒。此種細胞包括包裝腺病毒的293細胞以及包裝反轉錄病毒的ψJ2細胞或PA317細胞。

基因療法中使用的病毒載體通常藉由產生將核酸載體包裝於病毒顆粒內的細胞株而產生。載體通常含有用於包裝且隨後整合至宿主內所需的最小病毒序列，其他病毒序列由用於要表現的（多個）多核苷酸的表現匣替代。缺失的病毒功能通常由該包裝細胞株以反式提供。例如，基因療法中使用的AAV載體通常僅具有包裝及整合至宿主基因組中所需的來自AAV基因組的ITR序列。病毒DNA被包裝於細胞株中，該細胞株含有編碼其他AAV基因（即，rep和cap）但缺少ITR序列的輔助質體（helper plasmid）。

亦可用腺病毒作為輔助體來感染細胞株。輔助病毒促進AAV載體的複製及來自輔助質體的AAV基因的表現。由於缺少ITR序列，因此輔助質體沒有被大量包裝。腺病毒的污染可藉由例如熱處理而被降低，腺病毒對熱處理比對AAV更敏感。用於將核酸遞送至細胞的其他方法為本領域中具有通常知識者已知的。參見例如US20030087817，其藉由引用併入本文。

理想的是，本發明的融合蛋白的編碼序列以及用於融合蛋白靶向的對應的引導RNA可全部被包裝於單AAV載體中。一般而言，所接受的AAV載體的大小限制為4.7 kb，但是可考量較大的大小，但代價是降低的包裝效率。為了確保融合蛋白及其對應的引導RNA二者的表現匣可裝進AAV載體中，可使用RGN的活性缺失變異體。除了使胺基酸序列縮短且因此使融合蛋白的RGN及/或去胺酶的編碼序列縮短，連接RGN與去胺酶的胜肽連結子亦可被縮短或移除。最後，經由缺失分析以確定對將起作用的每一者要求的最小大小，例如啟動子、增強子及/或終止子的基因元素亦可被工程化。本發明亦教導經由體內AAV載體遞送將該融合蛋白用於靶向的鹼基編輯的方法。

在一些實施方式中，用本文描述的一或多個載體暫時地或非暫時地轉染宿主細胞。在一些實施方式中，細胞在其天然存在於個體中時被轉染。在一些實施方式中，被轉染的細胞取自個體。

在一些實施方式中，被轉染的細胞為真核細胞。在一些實施方式中，真核細胞為動物細胞（例如，哺乳動物、昆蟲、魚類、鳥類、及爬蟲類）。在一些實施方式中，被轉染的細胞為人類細胞。在一些實施方式中，被轉染的細胞為造血源的細胞，例如，免疫細胞（亦即，先天性或適應性免疫系統的細胞），包括但不限於：B細胞、T細胞、自然殺手（NK）細胞、富潛能幹細胞、誘導的富潛能幹細胞、嵌合抗原受體T（CAR-T）細胞、單核細胞、巨噬細胞、及樹突細胞。被轉染的細胞可以是同種異體細胞（例如同種異體T細胞）或自體細胞（例如自體T細胞）。

在一些實施方式中，細胞從取自個體的細胞（例如細胞株）取得。在一些實施方式中，細胞或細胞株為原核的。在一些實施方式中，細胞或細胞株為真核的。在另外的實施方式中，細胞或細胞株從昆蟲、禽類、植物或真菌物種取得。在一些實施方式中，細胞或細胞株可以是哺乳動物，舉例而言，例如人、猴、小鼠、牛、豬、山羊、倉鼠、大鼠、貓或狗。用於組織培養的多種細胞株為本領域中已知。細胞株的實例包括但不限於C8161、CCRF-CEM、MOLT、mIMCD-3、NHDF、HeLaS3、Huhl、Huh4、Huh7、HUVEC、HASMC、HEKn、HEKa、MiaPaCell、Panel、PC-3、TFl、CTLL-2、CIR、Rat6、CVI、RPTE、AlO、T24、182、A375、ARH-77、Calul、SW480、SW620、SKOV3、SK-UT、CaCo2、P388Dl、SEM-K2、WEHI- 231、HB56、TIB55、lurkat, 145.01 、LRMB、Bcl-1、BC-3、IC21、DLD2、Raw264.7、NRK、NRK-52E、MRC5、MEF、Hep G2、HeLa B、HeLa T4. COS、COS-1、COS-6、COS-M6A、BS-C-1猴腎上皮細胞、BALB/3T3小鼠胚胎纖維母細胞、3T3 Swiss、3T3-Ll、132-d5人胎兒纖維母細胞；10.1小鼠纖維母細胞、293-T、3T3、721、9L、A2780、A2780ADR、A2780cis、A172、A20、A253、A431、A-549、ALC、B16、B35、BCP-I細胞、BEAS-2B、bEnd.3、BHK-21、BR 293、BxPC3、C3H-10Tl/2、C6/36、Cal-27、CHO、CHO-7、CHO-IR、CHO-Kl、CHO-K2、CHO-T、CHO Dhfr-/-、COR-L23、COR-L23/CPR、COR-L235010、CORL23/ R23、COS-7、COV-434、CML Tl、CMT、CT26、D17、DH82、DU145、DuCaP、EL4、EM2、EM3、EMT6/AR1、EMT6/AR10.0、FM3、H1299、H69、HB54、HB55、HCA2、HEK-293、HeLa、Hepalclc7、HL-60、HMEC、HT-29、lurkat、 lY細胞、K562細胞、Ku812、KCL22、KGl、KYOl、LNCap、Ma-Mel 1-48、MC-38、MCF-7、MCF-l0A、MDA-MB-231、MDA-MB-468、MDA-MB-435、MDCKII、MDCKII、MOR/0.2R、MONO-MAC 6、MTD-lA、MyEnd、NCI-H69/CPR、NCI-H69/LX10、NCI-H69/LX20、NCI-H69/LX4、NIH-3T3、NALM-1、NW-145、OPCN/OPCT cell lines、Peer、PNT-lA/ PNT 2、RenCa、RIN-5F、RMA/RMAS、Saos-2細胞、Sf-9、SkBr3、T2、T-47D、T84、THPl細胞株、U373、U87、U937、VcaP、Vero細胞、WM39、WT-49、X63、YAC-1、YAR、及其基因轉殖品種。細胞株可從本領域中具有通常知識者已知的多種來源（參見，例如美國典型菌種保存中心(American Type Culture Collection，ATCC) (馬納沙斯， Va.)) 獲得。

在一些實施方式中，用本文描述的一或多個載體轉染的細胞被用於建立包括一或多個載體取得的序列（vector-derived sequence）的新細胞株。在一些實施方式中，用本發明的融合蛋白及可選地gRNA、或用本發明的核糖核蛋白複合物暫時轉染的並經由融合蛋白或核糖核蛋白複合物的活性所修飾的細胞被用於建立包括含有修飾但缺少任何其他外源序列的細胞的新細胞株。在一些實施方式中，用本文描述的一或多個載體暫時或非暫時轉染的細胞或自此種細胞取得的細胞株被用於評估一或多個測試化合物。

在一些實施方式中，本文描述的一或多個載體被用於產生非人類的基因轉殖動物或基因轉殖植物。在一些實施方式中，基因轉殖動物是昆蟲。在另外的實施方式中，昆蟲是害蟲，例如蚊子或壁蝨。在一些實施方式中，昆蟲是植物害蟲，例如玉蜀黍根蟲或秋季行軍蟲。在一些實施方式中，基因轉殖動物是鳥類，例如雞、火雞、鵝或鴨。在一些實施方式中，基因轉殖動物是哺乳動物，例如人、小鼠、大鼠、倉鼠、猴、猿、兔子、豬、牛、馬、山羊、羊、貓或狗。 VII. 多肽及多核苷酸的變異體及片段

本揭露內容提供了對 DNA分子有活性的去胺酶以及包括去胺酶的融合蛋白、以及包括RGN以及異源多肽(例如，去胺酶)的融合蛋白。RGN可包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699、其活性變異體或片段、以及編碼其的多核苷酸中的任一者。去胺酶可包括SEQ ID NO：6、229-414、596、597、以及720-723、其活性變異體或片段、以及編碼其的多核苷酸中的任一者。

儘管與所關注的多核苷酸或多肽相較下可改變變異體或片段的活性，但變異體以及片段應保持所關注的多核苷酸或多肽的功能性。例如，當與所關注的多核苷酸或多肽相較時，變異體或片段可具有增加的活性、降低的活性、不同的活性譜或活性的任何其他改變。

如果具有腺嘌呤去胺酶活性的本發明的去胺酶的片段及變異體為進一步包括DNA結合多肽或其片段的融合蛋白的部分，則它們將保持該活性。

具有鹼基編輯活性的本發明的融合蛋白的片段以及變異體（例如包括去胺酶的片段或變異體的融合蛋白片段及變異體、或包括DNA結合多肽（例如，RGN)的片段或變異體的融合蛋白片段及變異體）將保留該活性。

用語「片段」指本發明的多核苷酸或多肽序列的一部分。「片段」或「生物活性部分」包括多核苷酸，該多核苷酸包括足夠數量的連續核苷酸，以保持生物活性。「片段」或「生物活性部分」包括多肽，該多肽包括足夠數量的連續胺基酸殘基，以保持生物活性。本文揭露的去胺酶或RGN的片段包括由於替代的下游開始位點的使用而比全長序列短的那些。在一些實施方式中，RGN或去胺酶的生物活性部分是包括例如包括例如SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、或更多個連續胺基酸殘基的多肽、或其變異體。在一些實施方式中，RGN或去胺酶的生物活性部分是包括例如SEQ ID NO：5、6、229-414、596、597、以及720-723中任一者的10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、或更多個連續胺基酸殘基的多肽、或其變異體。此類生物活性部分可藉由重組技術而被製備且針對活性而被評估。

一般來說，「變異體」旨在意指基本上類似的序列。對於多核苷酸，變異體包括天然多核苷酸內的一或多個內部分位點處的一或多個核苷酸的缺失及/或添加及/或於天然多核苷酸中的一或多個位點處的一或多個核苷酸的取代。如本文使用的，「天然」或「野生型」多核苷酸或多肽分別包括天然存在的核苷酸序列或胺基酸序列。對於多核苷酸，保留式變異體包括因為遺傳密碼的簡併性（degeneracy）而編碼所關注的基因的天然胺基酸序列的那些序列。例如可使用眾所周知的分子生物學技術來鑑定（例如，利用聚合酶連鎖反應(PCR)以及雜交技術）的天然存在的對偶基因變異體如以下概述。變異體多核苷酸亦包括合成取得的多核苷酸，例如藉由使用定點誘變產生的但其仍然編碼所關注的多肽或多核苷酸的那些多核苷酸。本文揭露的特定多核苷酸的變異體與如藉由本文別處描述的序列比對程式及參數所確定的那個特定多核苷酸將具有約40%至約99%或更高序列一致性。一般而言，本文揭露的特定多核苷酸的變異體與如藉由本文別處描述的序列比對程式及參數所確定的那個特定多核苷酸將具有至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或更高序列一致性。

本文揭露的特定多核苷酸(即，參考多核苷酸)的變異體也可以藉由比較由變異體多核苷酸編碼的多肽與由參考多核苷酸編碼的多肽之間的序列一致性百分比而被評估。可使用本文別處描述的序列比對程式及參數來計算任何兩個多肽之間的序列一致性百分比。當本文揭露的任何給定的多核苷酸對藉由比較它們編碼的兩個多肽共有的序列一致性百分比來評估時，兩個編碼的多肽之間的序列一致性百分比為約40%至約99%或更高的序列一致性、以及在一些實施方式中為至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或更高序列一致性。

在一些實施方式中，目前揭露的多核苷酸編碼去胺酶，該去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者的胺基酸序列具有至少約40%至約99%或更高一致性的胺基酸序列，其中該去胺酶包括表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。在一些實施方式中，目前揭露的多核苷酸編碼去胺酶，該去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者的胺基酸序列具有至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或更高一致性的胺基酸序列，其中該去胺酶包括表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。

本發明的腺嘌呤去胺酶的生物活性變異體可相差少至1-15個胺基酸殘基、少至1-10個（例如，6-10個）、少至5個、少至4個、少至3個、少至2個或少至1個胺基酸殘基。在具體實施方式中，多肽包括N端或C端截短，該截短可包括從多肽的N端或C端至少缺失5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60 個胺基酸或更多個胺基酸。在一些實施方式中，多肽包括內部缺失，該內部缺失可包括至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60個胺基酸或更多個胺基酸的缺失。

應該認識到，可對本文提供的RGN以及去胺酶進行修飾，從而產生變異體蛋白及多核苷酸。人為設計的變化可經由定點誘變技術的應用而被引入。在一些實施方式中，在結構上及/或功能上與本文揭露的序列有關的天然的、未知的或尚未鑑定的多核苷酸及/或多肽亦可被認為落入本發明的範圍內。可在不改變作為腺嘌呤去胺酶的多肽的功能的非保留區域中進行保留式胺基酸取代。

變異體多核苷酸及蛋白質亦涵蓋從例如DNA混排（DNA shuffling）之類的誘變及重組發生（recombinogenic）程序得到的序列及蛋白質。用此種程序，操縱一或多個不同的RGN或去胺酶，以產生具有期望特性的新去胺酶。以這種方式，重組多核苷酸庫是從包括序列區域的相關序列多核苷酸的族群產生的，該序列區域具有實質的序列一致性且可在體外或體內同源地重組。例如，使用這種方法，編碼所關注域的序列模體可在本文提供的序列與其他後續辨識的基因之間混排，以獲得對具有所關注的改良特性（例如在酵素的情況中，增加的K _m）的蛋白質編碼的新基因。此種DNA混排的策略為本領域已知的。例如，參見Stemmer (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA91：10747-10751；Stemmer (1994) Nature370：389-391；Crameri 等人(1997) Nature Biotech. 15：436-438；Moore等人(1997) J. Mol. Biol. 272：336-347；Zhang等人 (1997)P roc. Natl. Acad. Sci. USA94：4504-4509；Crameri等人(1998) Nature391：288-291；以及美國專利號5,605,793及5,837,458。「混排的」核酸為藉由混排程序（例如本文闡述的任何混排程序）產生的核酸。混排的核酸為藉由例如以人工方式及可選地遞迴方式（物理地或虛擬地）重組二或多個核酸（或字符串）而產生的。一般而言，混排過程中使用一或多個篩選步驟來辨識所關注的核酸；這個篩選步驟可在任何重組步驟之前或之後進行。在一些（但不是全部）混排實施方式中，期望在選擇之前進行多輪重組，以增加要篩選的池的多樣性。可選地，重組及選擇的整個過程遞迴地重複。根據上下文，混排可指重組及選擇的整個過程，或者替代地，可僅指該整個過程的重組部分。

如本文使用的，在二個多核苷酸或多肽序列的上下文中，「序列一致性」或「一致性」是指：當在指定的比較窗上針對最大對應性進行比對時，是相同的二個序列中的殘基。應該認識到，不同的殘基位置通常藉由保留式胺基酸取代而不同，其中胺基酸殘基針對具有類似化學性質（例如，電荷或疏水性）的其他胺基酸殘基而被取代，且因此不改變分子的功能性質。藉有此種保留式取代而不同的蛋白質序列被稱為具有「序列相似性」或「相似性」。用於測量序列相似性的手段為本領域中具有通常知識者熟知的。通常，這涉及將保留式取代計為部分誤配而非完全誤配。因此，例如，當相同胺基酸的評分為1，而對非保留式取代的評分為零時，對保留式取代的評分為0與1之間的計分。例如，如在程式PC/GENE（Intelligenetics，Mountain View，California）中實施的那樣，計算保留式取代的計分。

如本文使用的，「序列一致性百分比」指藉由在比較窗上比較兩個最佳比對的序列所確定的值，其中，與用於該兩個序列的最佳比對的參考序列（不包括添加或缺失）相較，比較窗中的多核苷酸序列的部分可包括添加或缺失（亦即，缺口）。藉由確定在兩個序列中出現相同核酸鹼基或胺基酸殘基的位置的數目以求得匹配位置的數目、將匹配位置的數目除以比較窗中的位置總數、以及將該結果乘以100以求得序列一致性百分比來計算該百分比。

除非另有說明，否則本文提供的序列一致性/相似性值指使用利用以下參數的GAP版本10獲得的值：使用GAP權重50及長度權重3以及nwsgapdna.cmp計分矩陣的核苷酸序列的一致性%及相似性%；使用GAP權重8及長度權重2以及BLOSUM62計分矩陣的胺基酸序列的一致性%及相似性%；或其任何等效程式。「等效程式」指：對於所涉及的任何二個序列，當與GAP版本10產生的對應比對相較時，產生具有一致的核苷酸或胺基酸殘基匹配及一致的序列一致性百分比的比對的任何序列比較程式。

當為了進行相似性計分使用界定的胺基酸取代矩陣（例如，BLOSUM62）、缺口存在罰分（gap existence penalty）及缺口延伸罰分（gap extension penalty）比對二個序列以達到那個序列對可能的最高分數時，該二個序列被「最佳比對」。胺基酸取代矩陣及其在量化兩個序列之間的相似性中的使用是本領域熟知的、且被描述於例如Dayhoff等人(1978) “A model of evolutionary change in proteins (蛋白質中的演化變遷模型)”中；“Atlas of Protein Sequence and Structure (蛋白質序列及結構圖集)”，卷5，補充3 (M. O. Dayhoff編輯)，第345-352頁；Natl. Biomed. Res. Found.，Washington, D.C.；及Henikoff等人 (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA89：10915-10919中。BLOSUM62矩陣常常被用作序列比對操作流程中的預設計分取代矩陣。缺口存在罰分是針對單一胺基酸缺口在其中一個比對序列中的引入而使用的，而缺口延伸罰分是針對被插入已經打開的缺口內的每一個另外的空胺基酸位置而使用的。藉由比對開始與結束的每個序列的胺基酸位置、以及任選地藉由在一個或兩個序列中插入一個或多個間隔來達到最高可能計分來定義比對。儘管可以手動完成最佳比對及計分，但是該過程可藉由使用電腦實施的比對演算法（例如Altschul等人在（1997） Nucleic Acids Res. 25：3389-3402中所述、並在美國國家生物技術資訊中心網站（www.ncbi.nlm.nih.gov）上向公眾開放的間隔的BLAST 2.0）促進了該流程。可以使用例如經由www.ncbi.nlm.nih.gov可得的以及Altschul等人在(1997) Nucleic Acids Res. 25：3389-3402中描述的PSI-BLAST來準備包括多重比對的最佳比對。

關於與參考序列最佳比對的胺基酸序列，在比對中，胺基酸殘基「對應於」參考序列中殘基與之配對的位置。該「位置」由數字標示，該數字基於其相對於N端的位置依序辨識參考序列中的每一個胺基酸。由於在確定最佳比對時必須考慮的缺失、插入、截短、融合等，通常藉由簡單地從N端開始計數確定的測試序列中的胺基酸殘基數目將不必與參考序列中其對應位置的數目相同。例如，在所比對的測試序列中有缺失的情況中，將沒有與參考序列中缺失位點的位置對應的胺基酸。在所比對的參考序列中有插入的情況下，該插入將不對應於參考序列中的任何胺基酸位置。在截短或融合的情況中，參考序列或所比對的序列中可以有不與對應的序列中的任何胺基酸對應的胺基酸段（stretch）。 VIII. 抗體

亦涵蓋針對去胺酶、融合蛋白、或包括本發明的去胺酶的核糖核蛋白（包括具有如SEQ ID NO：6、300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的胺基酸序列的去胺酶、或其活性變異體或片段）的抗體。用於產生抗體的方法為本領域熟知的（參見，例如Harlow及Lane (1988) Antibodies：A Laboratory Manual (抗體：實驗室手冊)，冷泉港實驗室，冷泉港，紐約（Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.）；及美國專利號6,265號）。這些抗體可被用於套組中，以用於本文描述的核糖核蛋白、去胺酶或融合蛋白的檢測及分離。因此，本揭露內容提供包括專一性結合至本文描述的多肽或核糖核蛋白的抗體的套組，該多肽或核糖核蛋白包括例如包括與SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少85%一致性的序列的多肽，其中該去胺酶包括表2、4、6、以及19中任一者所示的胺基酸殘基中的至少一者。 IX. 用於結合及 / 或修飾所關注的標的序列的系統以及核糖核蛋白複合物及其製造方法

本揭露內容提供一種靶向核酸序列及修飾標的核酸序列的系統。在一些實施方式中，該系統將異源多肽靶向核酸序列且可以修飾標的核酸序列。在其中異源多肽包括鹼基編輯多肽(例如，去胺酶)或先導編輯多肽的那些實施方式中，鹼基編輯多肽(例如，去胺酶)或先導編輯多肽融合至RGN(例如，RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN)負責修飾靶向的核酸序列。引導RNA與所關注的標的序列雜交且亦與融合蛋白的RGN組成形成複合物，從而引導融合蛋白與標的序列結合。

在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽，例如RGN (例如，RGN切口酶或核酸酶不活化的RGN)，並且gRNA負責將核糖核蛋白複合物靶向所關注的核酸序列以及與RGDBP融合的去胺酶多肽負責修飾所靶向的核酸序列。在其中去胺酶是腺嘌呤去胺酶的那些實施方式中，鹼基編輯器修飾A＞N。在一些實施方式中，腺嘌呤去胺酶轉化A＞G。引導RNA與所關注的標的序列雜交且亦與RNA引導的DNA結合多肽形成複合物，從而將RNA引導的DNA結合多肽導向與標的序列結合。RNA引導的DNA結合多肽是亦包括例如本文描述的去胺酶之類的去胺酶的融合蛋白的部分。在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽是RGN，例如，Cas9。RNA引導的DNA結合多肽的其他實例包括RGN，例如，國際專利申請公開號WO 2019/236566及WO 2020/139783中描述的那些RGN，這些專利申請案的每一者藉由引用以其整體併入。在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽是II型CRISPR-Cas多肽或其活性變異體或片段。在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽是V型CRISPR-Cas多肽或其活性變異體或片段。在一些實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽為VI型CRISPR-Cas多肽。在一些實施方式中，融合蛋白的DNA結合多肽不要求RNA引導，例如，鋅指核酸酶、TALEN或大範圍核酸酶多肽。在一些實施方式中， DNA結合多肽的核酸酶活性已部分地或完全地不活化。於另外的實施方式中，RNA引導的DNA結合多肽包括RGN的胺基酸序列（舉例而言，例如APG07433.1 (SEQ ID NO：1)）、或其活性變異體或片段（例如切口酶nAPG07433.1 (SEQ ID NO：49)）。

在一些實施方式中，本文提供的用於結合及修飾所關注的標的序列的系統是核糖核蛋白複合物，其是與至少一種蛋白質（即，融合蛋白）結合的至少一個RNA分子。本文提供的核糖核蛋白複合物包括作為RNA組成的至少一引導RNA以及作為蛋白質組成的融合蛋白，融合蛋白包括RNA引導的DNA結合多肽(例如，RGN)以及被插入其中的異源多肽(例如，去胺酶)。在一些實施方式中，核糖核蛋白複合物從已用編碼融合蛋白以及引導RNA的多核苷酸轉化並在允許融合蛋白以及引導RNA表現的條件下培養的細胞或生物體中純化。

提供用於製造去胺酶、融合蛋白或融合蛋白核糖核蛋白複合物的方法。此類方法包括：在去胺酶或融合蛋白（以及在一些實施方式中，引導RNA）被表現的條件下，培養包括編碼去胺酶、融合蛋白的核苷酸序列以及在一些實施方式中編碼引導RNA的核苷酸序列的細胞。然後，可從所培養的細胞的溶胞產物純化去胺酶、融合蛋白或融合核糖核蛋白。

用於從生物樣本的溶胞產物純化去胺酶、融合蛋白或融合核糖核蛋白複合物的方法為本領域已知的（例如，粒徑篩析及/或親和性層析法、2D-PAGE、HPLC、反相層析法、免疫沉澱法）。在特定的方法中，去胺酶或融合蛋白為重組地產生的且包括有助於其純化的純化標籤，其包括但不限於：麩胱甘肽-S-轉移酶（GST）、幾丁質結合蛋白（CBP）、麥芽糖結合蛋白、硫氧化還原蛋白（TRX）、聚（NANP）、串聯親和純化（TAP）標籤、myc、AcV5、AU1、AU5、E、ECS、E2、FLAG、HA、nus、Softag 1、Softag 3、Strep、SBP、Glu-Glu、HSV、KT3、S、S1、T7、V5、VSV-G、6xHis、生物素羧基載體蛋白（BCCP）及鈣調蛋白。一般而言，所標記的去胺酶、融合蛋白或融合核糖核蛋白複合物是使用免疫沉澱法或本領域已知的其他類似方法純化的。

「分離的」或「純化的」多肽或其生物活性部分實質上或基本上不含在其天然存在的環境中發現的、正常情況下與多肽相伴或相互作用的組成。因此，當藉由重組技術被產生時，分離的或純化的多肽實質上不含其他細胞物質或培養基，或當被化學合成時，實質上不含化學前驅物或其他化學品。實質上不含細胞物質的蛋白質包括具有少於30％、少於20％、少於10％、少於5％或少於1％（以乾重計）的污染蛋白質的蛋白質製劑。當重組地產生本發明的蛋白質或其生物活性部分時，最佳培養基呈現少於30％、少於20％、少於10％、少於5％或少於1％（以乾重計）的化學前驅物或所關注的非蛋白質化學品。

本文提供的用於結合及/或剪切所關注的標的序列的特定方法涉及使用體外組裝的核糖核蛋白複合物。核糖核蛋白複合物的體外組裝可使用本領域已知的方法執行，其中在允許RGDBP（例如，RGN）融合蛋白與引導RNA結合的條件下使包括RGDBP（例如，RGN）的融合蛋白與引導RNA接觸。如本文中所使用的「接觸（contact、contacting、contacted）」指在適合進行期望反應的條件下將期望反應的組成放在一起。RGDBP（例如，RGN）融合蛋白可從生物樣本、細胞溶胞產物或培養基純化、經由體外轉譯產生、或化學合成。引導RNA可從生物樣本、細胞溶胞產物或培養基中純化、在體外轉譯、或化學合成。可使RGDBP（例如，RGN）融合蛋白以及引導RNA在溶液（例如，緩衝鹽溶液）中接觸以允許核糖核蛋白複合物的體外組裝。 X. 用於將異源多肽定位至標的 DNA 分子或修飾標的 DNA 分子的方法

本揭露內容提供用於將異源多肽(例如，去胺酶)定位至所關注的標的核酸分子(例如，標的DNA分子)或修飾標的核酸分子的方法。該方法包括將目前揭露的融合蛋白或編碼該融合蛋白的多核苷酸遞送至標的序列或包括標的序列的細胞、胞器或胚胎。在某些實施方式中，該方法包括將包括至少一引導RNA或編碼該至少一引導RNA的多核苷酸、以及至少一目前揭露的融合蛋白的系統遞送至標的序列或包括標的序列的細胞、胞器或胚胎。

在一些實施方式中，該些方法包括使DNA分子與(a)融合蛋白；以及(b)將(a)的融合蛋白靶向DNA分子的標的核苷酸序列的gRNA接觸；其中DNA分子以有效量且在適合 RGBDP（例如 RGN）組成與標的序列結合的條件下與融合蛋白及gRNA接觸。

標的DNA分子可包括與疾病或病症關聯的序列，且其中因果突變內至少一核鹼基的編輯可導致與疾病或病症無關聯的序列。在一些實施方式中，疾病或病症影響動物。於另外的實施方式中，疾病或病症影響哺乳動物，例如，人、牛、馬、狗、貓、山羊、羊、豬、猴、大鼠、小鼠或倉鼠。在一些實施方式中，標的DNA序列駐留於農作物的對偶基因中，其中所關注的性狀的特定對偶基因導致較低農藝價值的植物。在此區域內的至少一核鹼基的編輯導致改良植物的性狀並增加植物的農藝價值的對偶基因。

在遞送編碼引導RNA及/或融合蛋白的多核苷酸之後，細胞或胚胎可接著在其中引導RNA及/或融合蛋白被表現的條件下被培養。在各種實施方式中，該方法包括使標的序列與包括gRNA及融合蛋白的核糖核蛋白複合物接觸。在某些實施方式中，該方法包括將本發明的核糖核蛋白複合物引入包括標的序列的細胞、胞器或胚胎中。本發明的核糖核蛋白複合物可以是已從生物樣本被純化、重組地產生且隨後純化、或如本文所描述的體外組裝的核糖核蛋白複合物。在其中與標的序列或細胞、胞器或胚胎接觸的核糖核蛋白複合物已經在體外被組裝的那些實施方式中，該方法可進一步包括在與標的序列、細胞、胞器或胚胎接觸之前複合物的體外組裝。

可使用本領域中已知的、包括但不限於電穿孔的任何方法將本發明的純化的或體外組裝的核糖核蛋白複合物引入細胞、胞器或胚胎中。在一些實施方式中，使用本領域中已知的任何方法（例如，電穿孔）將融合蛋白（或編碼該融合蛋白的多核苷酸）以及編碼或包含引導RNA的多核苷酸引入細胞、胞器或胚胎中。

在遞送至或接觸標的序列或包括標的序列的細胞、胞器或胚胎時，引導RNA將融合蛋白導向以序列專一性方式與標的序列結合。在其中融合蛋白包括鹼基編輯多肽(例如，去胺酶)或先導編輯多肽的那些情況下，隨後可以修飾標的序列。

在其中融合蛋白是鹼基編輯器（即，包括例如去胺酶之類的鹼基編輯多肽）的一些實施方式中，融合蛋白與標的序列的結合導致與標的序列相鄰的核苷酸的修飾。與標的序列相鄰的、由去胺酶修飾的核苷酸可以是從標的序列的5’或3’端的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、或100個鹼基對。可以使用鹼基編輯器融合蛋白（例如，與去胺酶融合的RGN）編輯的核苷酸的全部範圍（通常表示為核苷酸與PAM 序列的距離(例如，PAM序列上游（即5'）的位置8以及22處的核苷酸）在本文中被稱為特定鹼基編輯器融合蛋白的「編輯窗」。編輯窗可以是例如PAM序列的5'或3'的1-100個鹼基對，包括但不限於PAM序列的5'或3'的5-50、5-25、8-22、10-20、或10-21個鹼基對。包括腺嘌呤去胺酶（例如本文揭露的那些）以及RNA引導的DNA結合多肽（例如，RGN)的融合蛋白可以將靶向的A＞N突變引入靶向的DNA分子中。在一些實施方式中，融合蛋白將靶向的A＞G 突變引入靶向的DNA 分子中。

測量融合蛋白與標的序列的結合的方法是本領域已知的、並且包括染色質免疫沉澱測定、凝膠遷移率移位測定法、DNA下拉測定法（DNA Pull-down assay）、報導子測定法、微盤捕獲及檢測測定法。同樣地，測量標的序列的剪切或修飾的方法是本領域已知的、並且包括體外或體內剪切測定法，其中使用PCR、定序或凝膠電泳（有或沒有適合的標記(例如，放射性同位素、螢光物質)附接至標的序列，以促進降解產物的檢測）來確認剪切。在一些實施方式中，使用切口觸發的指數擴增反應(NTEXPAR)測定法（參見，例如Zhang等人(2016) Chem. Sci.7：4951-4957）。可使用Surveyor測定法來評估體內剪切（Guschin等人(2010) Methods Mol Biol649：247-256）。

測量鹼基編輯器融合蛋白或先導編輯器融合蛋白的鹼基編輯活性的方法是本領域已知的、並且包括本文描述的那些以及在與鹼基編輯器或先導編輯器接觸後標的核酸分子的任何形式的序列分析（例如，有或沒有附接適合標記的PCR、定序或凝膠電泳）。當與包括親代LPG50148去胺酶的類似鹼基編輯器融合蛋白相較時，包括本文揭露的去胺酶的鹼基編輯器融合蛋白可表現出改善的編輯活性（即，改善的編輯效率或減少的RNA編輯）、更大的編輯窗或兩者。包括本發明的去胺酶（例如SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723、或其活性變異體或片段(包括表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者)）的第一鹼基編輯器融合蛋白的鹼基編輯效率與包括親代LPG50148去胺酶以及與第一鹼基編輯器融合蛋白相同的DNA結合多肽（例如，RGN）的第二鹼基編輯器融合蛋白相較下可以具有1.1倍至10倍、1.1倍至20倍、1.1倍至30倍、或更高的編輯效率，包括但不限於約1.1倍、約1.5倍、約2倍、約2.5倍、約3倍、約3.5倍、約4倍、約4.5倍、約5倍、約5.5倍、約6倍、約6.5倍、約7倍、約7.5倍、約8倍、約8.5倍、約9倍、約9.5倍、約10倍、約11倍、約12倍、約13倍、約15倍、約16倍、約17倍、約18倍、約19倍、約20倍、約21倍、約22倍、約23倍、約24倍、約25倍、約26倍、約27倍、約28倍、約29倍、以及約30倍。當與包括親代LPG50148去胺酶的類似鹼基編輯器融合蛋白相較時，包括本發明的去胺酶的鹼基編輯器融合蛋白可表現出減少的RNA編輯。包括本發明的去胺酶的第一鹼基編輯器融合蛋白可以表現的RNA編輯率為包括親代LPG50148去胺酶以及與第一鹼基編輯器融合蛋白相同的DNA結合多肽（例如，RGN）的第二鹼基編輯器融合蛋白的約1 %至約99%，包括但不限於約1%、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、以及約99%。

包括本發明的去胺酶（例如SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723、或其活性變異體或片段(包括表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者)）的第一鹼基編輯器融合蛋白的編輯窗可以比包括親代LPG50148去胺酶及與第一鹼基編輯器融合蛋白相同的DNA結合蛋白（例如，RGN）的第二鹼基編輯器融合蛋白的編輯窗的一側或兩側長至少一個核苷酸，包括比親代鹼基編輯器編輯窗的一側或兩側長1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或更多個核苷酸。

在一些實施方式中，該方法涉及使用融合蛋白，其中RGDBP（例如，RGN）與多於一種引導RNA複合。該多於一種引導RNA可以靶向單一基因的不同區域或可以靶向多個基因。這種多重靶向使融合蛋白的去胺酶或先導編輯多肽能夠修飾核酸，從而在所關注的標的核酸分子（例如，基因組）中引入多個突變。

在其中該方法涉及使用RNA引導的核酸酶（RGN）（例如切口酶RGN (即，僅能夠剪切雙股多核苷酸(例如nAPG07433.1 (SEQ ID NO：49)）的單股的一些實施方式中，該方法可以包括引入兩種不同的RGN或RGN變異體，其靶向相同或重疊的標的序列並剪切多核苷酸的不同股。例如，可以將僅剪切雙股多核苷酸的正(+)股的RGN切口酶與僅剪切雙股多核苷酸的負(-)股的第二RGN切口酶一起引入。在一些實施方式中，提供了兩種不同的融合蛋白，其中每一種融合蛋白包括具有不同PAM辨識序列的不同RGN，使得可以靶向更大多樣性的核苷酸序列進行突變。

本領域中具有通常知識者將瞭解，任何目前揭露的方法都可以用於靶向單一標的序列或多個標的序列。因此，方法包括使用包括單一RGDBP（例如，RGN）與多個不同引導RNA結合的融合蛋白，其可以靶向單一基因及/或多個基因內的多個不同序列。本文也涵蓋其中將多種不同的引導RNA與多種不同的RGN融合蛋白結合引入的方法。這些引導RNA以及引導RNA/融合蛋白系統可以靶向單一基因及/或多個基因內的多個不同序列。

在一些實施方式中，包括RNA引導的DNA結合多肽（例如，RGN）以及異源多肽（例如，去胺酶）的融合蛋白可用於在靶向的基因或所關注的基因的靶向的區域中產生突變。在一些實施方式中，本發明的融合蛋白可用於靶向的基因或所關注的靶向的基因的區域的飽和誘變，隨後進行高通量正向遺傳篩選，以鑑定新穎的突變及/或表型。在一些實施方式中，本文描述的融合蛋白可用於在靶向的基因組位置中產生突變，其可以包括或不包括編碼DNA序列。藉由上述的靶向的誘變產生的細胞株庫也可用於研究基因功能或基因表現 XI. 標的多核苷酸

在一種態樣中，本發明提供修飾真核細胞中的標的多核苷酸的方法，其可以是體內、離體或體外。在一些實施方式中，該方法包括從人類或非人類動物或植物（包括微藻類）中取樣細胞或細胞群以及修飾該細胞或該些細胞。培養可以在離體的任何階段發生。甚至可以將該細胞或該些細胞重新引入人類、非人類動物或植物（包括微藻類）中。

使用天然變異性，植物育種者針對例如產量、品質、均勻性、耐寒性以及對害蟲的抗性之類的期望品質結合了大多數有用的基因。這些期望品質亦包括生長、日長偏好、溫度要求、花或生殖發育的起始日期、脂肪酸含量、抗蟲性、抗病性、線蟲抗性、真菌抗性、除草劑抗性、對各種環境因素（包括乾旱、熱、潮濕、寒冷、風及包括高鹽度的不利土壤條件）的耐受性。這些有用基因的來源包括本地或外來品種、原生種（heirloom variety）、野生植物近源種、以及例如以誘變劑處理植物材料的誘導突變。使用本發明，向植物育種者提供誘導突變的新工具。據此，本領域中具有通常知識者可採用本發明以誘導有用基因的增加，同時比先前的誘變劑更精確，且因此加速並改良植物育種計劃。

本發明的融合蛋白的標的多核苷酸可以是對真核細胞是內源或外源的任何多核苷酸。例如，標的多核苷酸可以是存在於真核細胞的細胞核中的多核苷酸。在一些實施方式中，標的多核苷酸為編碼基因產物（例如，蛋白質）的序列或非編碼序列（例如，調節多核苷酸或垃圾DNA（junk DNA））。在一些實施方式中，本發明的融合蛋白的標的序列與PAM（前間隔序列鄰近模體）關聯；亦即，RNA引導的DNA結合多肽（例如，RGN）辨識的短序列。PAM的精確序列以及長度要求取決於所使用的RNA引導的DNA結合多肽而不同，但PAM通常是與前間隔序列（亦即，標的序列）相鄰的2-5個鹼基對序列。

本發明的融合蛋白的標的多核苷酸可包括許多疾病關聯的基因及多核苷酸、以及傳訊生化路徑關聯的基因及多核苷酸。標的多核苷酸的實例包括與傳訊生化路徑關聯的序列，例如，傳訊生化路徑關聯的基因或多核苷酸。標的多核苷酸的實例包括疾病關聯的基因或多核苷酸。「疾病關聯的」基因或多核苷酸指：與非疾病控制的組織或細胞相較下，在從患病組織取得的細胞中以異常水準或以異常形式產生轉錄或轉譯產物的任何基因或多核苷酸。其可以是一種變得以異常高水準表現的基因；其可以是一種變得以異常低水準表現的基因，其中改變的表現與疾病的發生及/或進展相關。疾病關聯的基因亦指是疾病病因的直接原因或與引起疾病病因的基因具有連鎖不平衡（例如因果突變）的突變或遺傳變異的基因。轉錄或轉譯產物可為已知的或未知的，且可進一步處於正常或異常水準。

使用目前揭露的方法及組成物可靶向的疾病關聯基因的非限制性實例可從全球資訊網上找到的約翰•霍普金斯大學（馬里蘭州巴爾的摩）麥考斯克–納森斯遺傳醫學研究所（McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine）以及美國國家醫學圖書館（馬里蘭州貝塞斯達）（National Library of Medicine（Bethesda, Md.））國家生物技術資訊中心（National Center for Biotechnology Information）找到。

在一些實施方式中，該些方法包括使包括標的DNA序列的DNA分子與本發明的融合蛋白接觸，其中DNA分子以有效量且在適合標的DNA分子的修飾的條件下與融合蛋白接觸。在某些實施方式中，該些方法包括使包括標的DNA序列的DNA分子與(a)本發明的RGN融合蛋白；以及(b)將(a)的融合蛋白靶向DNA股的標的核苷酸序列的gRNA接觸；其中DNA分子以有效量且在適合至少一核鹼基的去胺的條件下與融合蛋白及gRNA接觸。在一些實施方式中，標的DNA序列包括與疾病或病症關聯的序列，且其中核鹼基的去胺導致與疾病或病症無關聯的序列。在一些實施方式中，標的DNA序列存在於農作物的對偶基因中，其中所關注的性狀的特定對偶基因導致較低農藝價值的植物。核鹼基的去胺導致改良性狀並增加植物的農藝價值的對偶基因。

在一些實施方式中，標的DNA序列包括與疾病或病症關聯的點突變，且其中突變體鹼基的去胺導致與疾病或病症無關聯的序列。在一些實施方式中，去胺校正了與疾病或病症關聯的序列中的點突變。

在一些實施方式中，與疾病或病症關聯的序列編碼蛋白質，且去胺或先導編輯將終止密碼子（stop codon）引入與疾病或病症關聯的序列中，導致編碼的蛋白質的截短。在一些實施方式中，接觸是在易患有、患有或診斷患有疾病或病症的個體體內進行。在一些實施方式中，疾病或病症為與基因組中的點突變或單鹼基突變關聯的疾病。在一些實施方式中，疾病為基因疾病、癌症、代謝疾病或溶體儲積症。 XII. 醫藥組成物及治療方法

本文提供了治療有此需要的個體中的疾病的方法。該方法包括對有此需要的個體投予目前揭露的融合蛋白或編碼該融合蛋白的多核苷酸、gRNA或編碼該gRNA的多核苷酸、目前揭露的融合蛋白系統、或由這些組成物中的任一者修飾的或包括這些組成物中的任一者的細胞。

在一些實施方式中，治療包括藉由對有此需要的個體投予目前揭露的融合蛋白、gRNA、或目前揭露的融合蛋白系統、或編碼該融合蛋白、gRNA、或目前揭露的融合蛋白系統的（多個）多核苷酸的體內基因編輯。在一些實施方式中，治療包括其中細胞被用目前揭露的融合蛋白、gRNA、或目前揭露的融合蛋白系統或編碼該融合蛋白、gRNA、或目前揭露的融合蛋白系統的（多個）多核苷酸進行離體基因修飾的離體基因編輯、以及接著將經修飾的細胞投予個體。在一些實施方式中，經基因修飾的細胞源自接著被投予經修飾的細胞的個體，並且所移植的細胞在本文中被稱為自體的。在一些實施方式中，經基因修飾的細胞源自與被投予經修飾的細胞的個體（亦即，受體）屬相同物種的不同個體（亦即，供體），並且所移植的細胞在本文中被稱為異體的。在本文描述的一些實例中，細胞在對需要治療的個體投予之前可先於培養中被擴增。

於一些實施方式中，要用目前揭露的組成物治療的疾病為可用免疫療法（例如，用嵌合抗原受體（CAR）T細胞）治療的疾病。此類疾病包括但不限於癌症。

在一些實施方式中，標的序列的修飾（例如，去胺）導致基因缺陷的校正或導致引起基因產物功能喪失的點突變的校正。在一些實施方式中，基因缺陷與疾病或病症（例如，溶體儲積症或代謝疾病（舉例而言，例如第I型糖尿病））關聯。因此，在一些實施方式中，要用目前揭露的組成物治療的疾病與被突變的序列（亦即，該序列對於疾病或病症是因果的或對於與疾病或病症關聯的症狀是因果的）關聯，以治療疾病或病症、或與疾病或病症關聯的症狀的降低。

在一些實施方式中，要用目前揭露的組成物治療的疾病與因果突變關聯。如本文使用的，「因果突變」指對個體中疾病或病症的嚴重性或出現有貢獻的基因組中的特定核苷酸、多個核苷酸或核苷酸序列。因果突變的校正導致由疾病或病症引起的至少一個症狀的改善。在一些實施方式中，因果突變的校正導致由疾病或病症引起的至少一個症狀的改善。在一些實施方式中，因果突變與由本文揭露的融合蛋白的RGDBP（例如，RGN）辨識的PAM位點相鄰。因果突變可以用融合蛋白來校正。疾病關聯的基因及突變的非限制性實例可從在全球資訊網上取得的約翰•霍普金斯大學（麻省巴爾的摩）麥考斯克–納森斯遺傳醫學研究所（McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine, Johns Hopkins University（Baltimore, Md.））及美國國家醫學圖書館（麻省貝塞斯達）的國家生物技術資訊中心（National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine（Bethesda, Md.））取得。

在一些實施方式中，本文提供的方法用於將去活化點突變引入對與疾病或病症關聯的基因產物進行編碼的基因或對偶基因中。例如，在一些實施方式中，本文提供採用融合蛋白將去活化點突變引入致癌基因（例如，在增生性疾病的治療中）中的方法。在一些實施方式中，去活化突變可在編碼序列中產生過早終止密碼子，這導致截短的基因產物（例如，缺少全長蛋白的功能的截短的蛋白）的表現。在一些實施方式中，本文提供的方法的目的為經由基因組編輯來恢復功能不良性基因的功能。本文提供的融合蛋白可對例如藉由在人類細胞培養中校正疾病關聯突變的體外基於基因編輯的人類療法有效。本領域中具有通常知識者應該瞭解，本文提供的融合蛋白（例如，包括RNA引導的DNA結合多肽及腺嘌呤去胺酶多肽的融合蛋白）可被用於校正任何單點A＞G突變。突變體A至G的去胺導致突變的校正。

如本文中使用的，「治療」或「處理」、或「緩和」或「改善」可被互換地使用。這些用語指用於獲得有益或期望結果的方法，有益結果或期望結果包括但不限於治療性益處及/或預防性益處。藉由治療性益處意味著對治療中的一或更多疾病、病症或症狀中的任何治療相關改善或對治療中的一或更多疾病、病症或症狀上的效果。對於預防性益處，組成物可被投予處於特定疾病、病症或症狀的發展風險中的個體、或被投予報告疾病的一或更多生理症狀的個體，即使該疾病、病症或症狀可能尚未呈現徵兆。

用語「有效量」或「治療有效量」指足以達到有益或期望結果的藥劑量。治療有效量可取決於下列中的一或更多者而變化：被治療的個體及疾病病症、個體的重量及年齡、疾病病症的嚴重性、投予方式及類似者，本領域中具有通常知識者可容易地對此做出確定。特定劑量可取決於下列中的一或更多者而變化：所選的特定藥劑、要遵循的給藥方案、是否與其他化合物組合地投予、投予時機及其被運載的遞送系統。

用語「投予」指藉由導致所引入的活性成分至少部分地定位於期望位點（例如，受傷或修復的位點）處的方法或途徑以將活性成分置於個體內，使得產生（一或多個）期望效用。在其中細胞被投予的那些實施方式中，可藉由導致遞送至個體中的期望位置的任何適合途徑投予該細胞，其中至少一部分所移植的細胞或該細胞的組成維持存活。投予至個體後的細胞的存活期可短至幾小時（例如，二十四小時）、至幾天、至長至若干年、甚或患者的生命期，亦即，長期植入。例如，於本文描述的一些態樣中，光受體細胞或視網膜前驅細胞的有效量是經由系統投予途徑（例如腹膜內或靜脈內途徑）投予。

在一些實施方式中，投予包括藉由病毒遞送的投予。在一些實施方式中，投予包括藉由電穿孔的投予。在一些實施方式中，投予包括藉由奈米顆粒遞送的投予。在一些實施方式中，投予包括藉由脂質體遞送的投予。在一些實施方式中，投予包括藉由脂質奈米顆粒（LNP）遞送的投予。在一些實施方式中，LNP或其脂質組成描述於WO2022173531、WO2022150485或2023年3月28日申請的第63/492,537號美國臨時申請案中，其每一者的內容均藉由引用以其整體併入本文。任何有效的投予途徑均可用於投予有效量的本文描述的醫藥組成物。在一些實施方式中，投予包括藉由從由以下組成的群組選出的方法的投予：靜脈內地、皮下地、肌肉內地、口服地、經直腸地、藉由氣溶膠、非經口地、經眼地、經肺地、經皮地、經陰道地、經耳地、經鼻地及藉由外部投予、或其任何組合。於一些實施方式中，對於細胞的遞送，使用藉由注射或灌注的投予。

如本文中使用的，用語「個體」指期望對其進行診斷、治療或療法的任何個體。於一些實施方式中，個體為動物。於一些實施方式中，個體為哺乳動物。於一些實施方式中，個體為人類。人類可以是成人、青少年、兒童或嬰兒。

治療效力可由熟練的臨床醫師確定。然而，如果疾病或病症的症候或症狀的任何一個或全部是以有益方式被改變（例如，至少減少10%）、或其他臨床上接受的疾病的症狀或標記被改良或改善，則該治療被認為「有效治療」。亦可藉由個體未發生如藉由住院評估的惡化、或不需要醫學介入（例如，疾病的進展被停止或至少減慢）來測量效力。測量這些指標的方法為本領域中具有通常知識者所知。治療包括：(1)抑制疾病，例如，遏止或減慢症狀的進展；或(2)減緩疾病，例如，引起症狀消退；以及(3)預防或降低症狀發展的可能性。

提供醫藥組成物，該醫藥組成物包括目前揭露的融合蛋白或編碼該融合蛋白的多核苷酸、目前揭露的系統、或包括該融合蛋白、編碼該融合蛋白的多核苷酸或該系統中的任一者的細胞、以及藥學上可接受的載體。

如本文中使用的，「藥學上可接受的載體」指不對生物體引起明顯刺激且不消除該活性成分(例如，去胺酶或融合蛋白或編碼去胺酶或融合蛋白的核酸分子)的活性及特性的材料。載體必須具有足夠高的純度及足夠低的毒性，以使其適合投予正被治療的個體。該載體可為惰性的、或其可具有醫藥效益。在一些實施方式中，藥學上可接受的載體包括適合對人類或其他脊椎動物投予的一或更多相容固體或液體填充劑、稀釋劑或封裝物質。在一些實施方式中，醫藥組成物包括為非天然發生的藥學上可接受的載體。在一些實施方式中，未發現該藥學上可接受的載體在本質上與該活性成分在一起、且因此是異源的。

目前揭露的方法中使用的醫藥組成物可以用提供適合的轉移、遞送、耐受性及類似者的適合的載體、賦形劑及其他藥劑調配。眾多適合的調配物為本領域中具有通常知識者已知的。參見，例如Remington, The Science and Practice of Pharmacy（第21版，2005）。非限制性實例包括：無菌稀釋劑，例如注射用水、食鹽水溶液、不揮發性油、聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他合成溶劑；抗菌劑，例如，苯甲醇或對羥苯甲酸甲酯；抗氧化劑，例如，抗壞血酸或亞硫酸氫鈉；螯合劑，例如，乙二胺四乙酸；緩衝液，例如，醋酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽；以及用於滲壓性調節的藥劑，例如，氯化鈉或葡萄糖。靜脈內地投予的特定載體為生理食鹽水或磷酸鹽緩衝鹽水（PBS）。經口或非口服使用的醫藥組成物可被製備為適合供給某個劑量的活性成分的單位劑量的劑型。此類單位劑量的劑型例如包括錠劑、丸劑、膠囊、注射劑（安瓿）、栓劑等。這些組成物亦可含有包括保存劑、潤濕劑、乳化劑、及分散劑的佐劑。藉由各種抗菌劑及抗真菌劑（例如，對羥苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸、及類似者）可確保防止微生物的作用。亦可期望包括等滲劑，例如，糖、氯化鈉及類似物。藉由使用延遲吸收的藥劑（例如，單硬脂酸鋁（aluminum monostearate）及明膠）可引起可注射藥品劑型的延長吸收。

在其中包括目前揭露的融合蛋白、系統、或編碼該融合蛋白、系統的多核苷酸的細胞或以目前揭露的融合蛋白、系統、或編碼該融合蛋白、系統的多核苷酸的細胞被投予個體的一些實施方式中，細胞與藥學上可接受的載體一起作為懸浮劑被投予。本領域中具有通常知識者將認識到要用於細胞組成物中的藥學上可接受的載體將不包括實質上干擾要被遞送至該個體的細胞的生存力的量的緩衝液、化合物、冷凍保存劑、保存劑、或其他製劑。包括細胞的調配物可包括例如允許維持細胞膜完整性的滲透壓緩衝液、且可選地包括投予時維持細胞生存力或增強植入的營養素。這樣的調配物及懸浮劑為本領域中具有通常知識者已知、及/或使用例行實驗可被調適成與本文揭露的細胞一起使用。

細胞組成物亦可被乳化為或呈現為脂質體組成物，前提是該乳化程序不會不利地影響細胞生存力。細胞及任何其他活性成分可以與藥學上可接受且與活性成分相容的賦形劑、並以適合在本文描述的治療方法中使用的量混合。

細胞組成物中包括的附加劑可包括其中的組成的藥學上可接受的鹽。藥學上可接受的鹽包括例如與例如鹽酸或磷酸之類的無機酸、或與例如醋酸、酒石酸、苯乙醇酸以及類似者之類的有機酸形成的（與多肽的自由胺基基團形成的）酸加成鹽。與自由羧基基團形成的鹽亦可例如衍生自例如鈉、鉀、銨、鈣或鐵的氫氧化物之類的無機鹼、以及例如異丙胺、三甲胺、2-乙胺乙醇、組胺酸、普魯卡因以及類似者之類的有機鹼。 XIII. 包括多核苷酸基因修飾的細胞

本文提供了包括已使用由融合蛋白介導的過程修飾的所關注的標的核酸分子（選擇性地具有如本文描述的gRNA）的細胞以及生物體。

在一些實施方式中，融合蛋白包括去胺酶多肽、或其活性變異體或片段，去胺酶多肽包括SEQ ID NO：5、6、300-414、596-598、以及720-723中的任一者的胺基酸序列，活性變異體或片段包括表2、4、6、以及19中任一者中所示的胺基酸殘基的至少一者。在一些實施方式中，融合蛋白包括去胺酶，該去胺酶包括與：5、6、300-414、596-598、以及720-723中的任一者具有約50%至約99%一致性或更高一致性的胺基酸序列。在一些實施方式中，融合蛋白包括去胺酶，該去胺酶包括與：5、6、300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少 50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%一致性的胺基酸序列。在一些實施方式中，融合蛋白包括去胺酶以及DNA結合多肽（例如RNA引導的DNA結合多肽）。在另外的實施方式中，融合蛋白包括去胺酶以及RGN或其變異體，例如APG07433.1（SEQ ID NO：1）或其切口酶變異體nAPG07433.1（SEQ ID NO：49）。在一些實施方式中，融合蛋白包括去胺酶以及Cas9或其變異體，例如dCas9或切口酶Cas9。在一些實施方式中，融合蛋白包括II型CRISPR-Cas多肽的核酸酶不活化的或切口酶變異體。在一些實施方式中，融合蛋白包括V型CRISPR-Cas多肽的核酸酶不活化的或切口酶變異體。在一些實施方式中，融合蛋白包括VI型CRISPR-Cas多肽的核酸酶不活化的或切口酶變異體。

修飾的細胞可以是真核細胞（例如，哺乳動物、植物、昆蟲、鳥類細胞）或原核細胞。也提供了包括已藉由利用如本文描述的融合蛋白的方法修飾的至少一核苷酸序列的胞器及胚胎。基因修飾的細胞、生物體、胞器以及胚胎對於該修飾的核苷酸序列可以是異源的或同源的。由融合蛋白引入的突變可導致改變的表現（上調或下調）、不活化或改變的蛋白質產物或整合的序列的表現。在其中突變導致基因的不活化或非功能性蛋白質產物的表現的那些情況下，基因修飾的細胞、生物體、胞器或胚胎被稱為「敲除」。敲除表型可以是缺失突變（即，至少一個核苷酸的缺失）、插入突變（即，至少一個核苷酸的插入）、或無意義突變（即，至少一個核苷酸的取代，使得引入終止密碼子）的結果。

在一些實施方式中，由融合蛋白引入的突變導致變異體蛋白質產物的產生。表現的變異體蛋白質產物可具有至少一胺基酸取代及/或至少一胺基酸的添加或缺失。與野生型蛋白質相較下，變異體蛋白質產物可以表現出修飾的特徵或活性，包括但不限於改變的酵素活性或基質專一性。

在一些實施方式中，由融合蛋白引入的突變導致改變的蛋白質表現模式。作為非限制性實例，控制蛋白質產物表現的調節區域中的突變可導致蛋白質產物的過度表現或下調或改變的組織或暫時表現模式。

已經被修飾的細胞可按照傳統方式生長成生物體，例如，植物。參見，例如McCormick等人(1986) Plant Cell Reports5：81-84。然後，可使這些植物生長、並以相同修飾品系或不同品系授粉，且所得的雜交種具有基因修飾。本發明提供基因修飾的種子。再生植物的子代、變異體以及突變體亦被包括在本發明的範圍內，前提是這些部分包括基因修飾。進一步提供了保持了基因修飾的經加工的植物產物或副產物，包括例如豆粕。

本文提供的方法可用於任何植物物種的修飾，植物物種包括但不限於單子葉植物及雙子葉植物。所關注的植物的實例包括但不限於：玉蜀黍（玉米）、高粱、小麥、向日葵、番茄、十字花科植物、胡椒、馬鈴薯、棉花、水稻、大豆、甜菜、甘蔗、煙草、大麥、及油菜、蕓苔屬物種、苜蓿、黑麥、小米、紅花、花生、甘藷、木薯、咖啡、椰子、鳳梨、柑橘樹、可可、茶、香蕉、鱷梨、無花果、番石榴、芒果、橄欖、木瓜、腰果、澳洲胡桃、杏仁、燕麥、蔬菜、觀賞植物以及針葉樹。

蔬菜包括但不限於：番茄、萵苣、綠豆、皇帝豆、豌豆、及例如胡瓜、網紋甜瓜及洋香瓜的黃瓜屬的成員。觀賞植物包括但不限於：杜鵑花、繡球花、芙蓉、玫瑰、鬱金香、水仙、矮牽牛、康乃馨、猩猩木及菊花。較佳地，本發明的植物為農作物（例如，玉米、高粱、小麥、向日葵、番茄、十字花科植物、胡椒、馬鈴薯、棉花、水稻、大豆、甜菜、甘蔗、煙草、大麥、油菜等）。

本文提供的方法亦可被用於基因修飾任何原核物種，包括但不限於：古生菌及細菌（例如，芽孢桿菌屬、克雷伯氏菌屬、鏈黴菌屬、根瘤菌屬、埃希氏菌屬、假單胞菌屬、沙門氏菌屬、志賀氏桿菌屬、弧菌屬、耶爾森菌屬、支原體菌屬、農桿菌屬、乳酸乳桿菌屬）。

本文提供的方法可用於基因修飾任何真核物種或來自真核物種的細胞，包括但不限於：動物（例如，哺乳動物、昆蟲、魚類、鳥類、及爬蟲類物）、真菌、變形蟲、藻類、及酵母。在一些實施方式中，目前揭露的方法修飾的細胞包括造血源的細胞，例如免疫細胞（亦即，先天性或適應性免疫系統的細胞），包括但不限於B細胞、T細胞、自然殺手（NK）細胞、富潛能幹細胞、經誘導的富潛能幹細胞、嵌合抗原受體T（CAR-T）細胞、單核細胞、巨噬細胞、以及樹突細胞。

已修飾的細胞可被引入生物體中。在自體細胞移植的情況中，這些細胞可源自相同生物體（例如，人），其中該細胞以離體方法被修飾。在一些實施方式中，在異體細胞移植的情況中，該細胞源自相同物種內的另一個生物體（例如，另一個人）。 XIV. 套組

此揭露內容的一些態樣提供包括本發明的去胺酶或融合蛋白的套組。在某些實施方式中，本揭露內容提供包括融合蛋白以及引導RNA的套組。此外，在一些實施方式中，套組包括適合的試劑、緩衝液、及/或使用融合蛋白例如體外或體內DNA或RNA編輯的說明。在一些實施方式中，套組包括關於用於核苷酸序列的靶向編輯的適合的gRNA的設計及使用的說明。

冠詞「一（a）」及「一（an）」在本文中用於指冠詞的一或多於一個（即，至少一個）的語法對象。作為實例，「一多肽」意指一或多個多肽。

說明書中提及的所有出版物及專利申請案表明本揭露內容所屬領域中具有通常知識者的層次。所有出版物及專利申請案藉由引用被併入本文，如同每一個單獨出版物或專利申請案被具體且單獨地表明藉由引用而被併入本文。

雖然為了清楚理解的目的已用說明及實例頗詳細地描述了前述發明，但顯然可在所附申請專利範圍的範圍內實踐某些變化及修飾。

非限制性實施方式包括： 1. 一種融合蛋白，其包括RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 2. 實施方式1的融合蛋白，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 3. 實施方式1的融合蛋白，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的胺基酸序列。 4. 實施方式1的融合蛋白，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 5. 實施方式1的融合蛋白，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 6. 實施方式1的融合蛋白，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者的胺基酸序列。 7. 實施方式1-6中任一實施方式的融合蛋白，其中該異源多肽被插入該RGN的連接子結構域2、楔形結構域、RuvC結構域、HNH結構域、Rec-2結構域或PAM交互作用結構域內。 8. 實施方式7的融合蛋白，其中該RuvC結構域是RuvCIII結構域。 9. 實施方式1-8中任一實施方式的融合蛋白，其中： a) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； b)該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 v) 與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； c)該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 iii) 與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； d)該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 e)該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i)與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 ii)與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。 10. 實施方式1-9中任一實施方式的融合蛋白，其中該異源多肽包括鹼基編輯多肽或先導編輯多肽。 11. 實施方式10的融合蛋白，其中該先導編輯多肽包括DNA聚合酶。 12. 實施方式10的融合蛋白，其中該先導編輯多肽是反轉錄酶。 13. 實施方式10的融合蛋白，其中該鹼基編輯多肽包括去胺酶。 14. 實施方式13的融合蛋白，其中該去胺酶是胞嘧啶去胺酶或腺嘌呤去胺酶。 15. 實施方式13或14的融合蛋白，其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。 16. 實施方式13-15的融合蛋白，其中該至少一異源多肽被被插入在RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後，該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列： a)與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b)與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c)與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d)與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e)與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f)與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的編輯窗。 17. 實施方式13-16中任一實施方式的融合蛋白，其中，與該去胺酶被衍生自的親代去胺酶相較，該去胺酶缺少第一個胺基酸殘基及最後一個胺基酸殘基。 18. 實施方式13-17中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶包括腺嘌呤去胺酶以及該融合蛋白為腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。 19. 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 20. 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 21. 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的胺基酸序列。 22. 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 23. 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 24. 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5或6的胺基酸序列。 25. 實施方式18的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO:8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 26. 實施方式18的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 27. 實施方式18的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的胺基酸序列。 28. 實施方式18的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO:8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 29. 實施方式18的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白對SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 30. 實施方式18的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者所示的胺基酸序列。 31. 實施方式1-30中任一實施方式的融合蛋白，其中該RGN是切口酶或核酸酶不活化的RGN。 32. 實施方式31的融合蛋白，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列並且保留切口酶活性。 33. 實施方式31的融合蛋白，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的該胺基酸序列。 34. 實施方式1-33中任一實施方式的融合蛋白，其中該RGN以及該異源多肽彼此直接融合，其間沒有連接子序列。 35. 實施方式1-34中任一實施方式的融合蛋白，其中融合蛋白更包括至少一核定位訊號(NLS)。 36. 一種核糖核蛋白 (RNP) 複合物，包括實施方式1-35以及232-243中任一實施方式的融合蛋白以及與融合蛋白結合的引導RNA。 37. 一種核酸分子，其包括編碼融合蛋白的多核苷酸，其中該融合蛋白包括RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 38. 實施方式37的核酸分子，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 39. 實施方式37的核酸分子，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的胺基酸序列。 40. 實施方式37的核酸分子，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、57-139中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 41. 實施方式37的核酸分子，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、57-139中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 42. 實施方式37的核酸分子，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、57-139中任一者的胺基酸序列。 43. 實施方式1-6中任一實施方式的核酸分子，其中該異源多肽被插入該RGN的連接子結構域2、楔形結構域、RuvC結構域、HNH結構域、Rec-2結構域或PAM交互作用結構域內。 44. 實施方式7的核酸分子，其中該RuvC結構域是RuvCIII結構域。 45. 實施方式37-44中任一實施方式的核酸分子，其中： a) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i)與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； ii)與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； iii)與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； iv)與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； v)與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； vi)與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； vii)與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 viii)與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； b) 該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i)與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； ii)與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； iii)與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； iv)與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 v)與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； c)該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i)與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； ii)與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 iii)與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； d)該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i)與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； ii)與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； iii)與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； iv)與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； v)與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； vi)與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； vii)與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 viii)與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 e) 該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： i)與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 ii)與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。 46. 實施方式45的核酸分子，其中該異源多肽包括鹼基編輯多肽或先導編輯多肽。 47. 實施方式46的核酸分子，其中該先導編輯多肽包括DNA聚合酶。 48. 實施方式46的核酸分子，其中該先導編輯多肽包括反轉錄酶。 49. 實施方式46中任一實施方式的核酸分子，其中該鹼基編輯多肽包括去胺酶。 50. 實施方式49的核酸分子，其中該去胺酶是胞嘧啶去胺酶或腺嘌呤去胺酶。 51. 實施方式49或50的核酸分子，其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。 52. 實施方式49-51中任一實施方式的核酸分子，其中該至少一異源多肽被插入在包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： a) 與SEQ ID NO：1的位置671對應的胺基酸位置； b) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的編輯窗。 53. 實施方式49-52中任一實施方式的核酸分子，其中，與該去胺酶被衍生自的親代去胺酶相較，該去胺酶缺少第一個胺基酸殘基及最後一個胺基酸殘基。 54. 實施方式49-53中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括腺嘌呤去胺酶且是腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。 55. 實施方式54的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 56. 實施方式54的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 57. 實施方式54的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的胺基酸序列。 58. 實施方式54的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 59. 實施方式54的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 60. 實施方式54的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5或6的胺基酸序列。 61. 實施方式54的核酸分子，其中該融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 62. 實施方式54的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 63. 實施方式54的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的胺基酸序列。 64. 實施方式54的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 65. 實施方式54的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 66. 實施方式54的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者所示的胺基酸序列。 67. 實施方式37-66中任一實施方式的核酸分子，其中該RGN是切口酶或核酸酶不活化的RGN。 68. 實施方式67的核酸分子，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列並且保留切口酶活性。 69. 實施方式67的核酸分子，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的胺基酸序列。 70. 實施方式37-69中任一實施方式的核酸分子，其中該RGN以及該異源多肽彼此直接融合，其間沒有連接子序列。 71. 實施方式37-70中任一實施方式的核酸分子，其中融合蛋白更包括至少一核定位訊號(NLS)。 72. 實施方式37-71中任一實施方式的核酸分子，其中核酸分子針對在真核細胞中的表現被密碼子最佳化。 73. 實施方式37-71中任一實施方式的核酸分子，其中核酸分子針對在原核細胞中的表現被密碼子最佳化。 74. 一種載體，其包括實施方式37-73以及244-255中任一實施方式的核酸分子。 75. 實施方式74的載體，更包括編碼能夠與該RGN的標的序列的非標的股雜交的引導RNA的至少一核苷酸序列。 76. 實施方式74的載體，其中引導RNA為單引導RNA (sgRNA)。 77. 實施方式74的載體，其中引導RNA為雙引導RNA。 78. 一種細胞，其包括實施方式1-35以及232-243中任一實施方式的融合蛋白或實施方式36的RNP複合物。 79. 一種細胞，其包括實施方式1-35以及232-243中任一實施方式的融合蛋白，其中該細胞更包括引導RNA。 80. 一種細胞，其包括實施方式37-73以及244-255中任一實施方式的核酸分子。 81. 一種細胞，其包括實施方式74-77中任一實施方式的載體。 82. 實施方式78-81中任一實施方式的細胞，其中該細胞是原核細胞。 83. 實施方式78-81中任一實施方式的細胞，其中該細胞是真核細胞。 84. 實施方式83的細胞，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 85. 實施方式84的細胞，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 86. 實施方式85的細胞，其中人類細胞是免疫細胞。 87. 實施方式86的細胞，其中免疫細胞是幹細胞。 88. 實施方式87的細胞，其中幹細胞是經誘導的富潛能幹細胞。 89. 實施方式83的細胞，其中真核細胞是昆蟲細胞或鳥類細胞。 90. 實施方式83的細胞，其中真核細胞是真菌細胞。 91. 實施方式83的細胞，其中真核細胞是植物細胞。 92. 一種植物，其包括實施方式91的細胞。 93. 一種種子，其包括實施方式91的細胞。 94. 一種醫藥組成物，其包括藥學上可接受的載體以及實施方式1-35以及232-243中任一實施方式的融合蛋白、實施方式36的RNP複合物、實施方式37-73以及244-255中任一實施方式的核酸分子、實施方式74-77中任一實施方式的載體74-77、或實施方式84-88中任一實施方式的細胞。 95. 一種用於製備融合蛋白的方法，包括在其中該融合蛋白被表現的條件下培養實施方式78-91中任一實施方式的細胞。 96. 一種用於製備融合蛋白的方法，包括將實施方式37-73以及237-243中任一實施方式的核酸分子或實施方式74-77中任一實施方式的載體引入細胞中、以及在其中融合蛋白被表現的條件下培養該細胞。 97. 實施方式95或96的方法，更包括純化該融合蛋白。 98. 一種用於製備RGN融合核糖核蛋白複合物的方法，包括將實施方式37-73以及237-243中任一實施方式的核酸分子以及包括編碼引導RNA的表現匣的核酸分子、或實施方式74-77中任一實施方式的載體引入細胞中、以及在其中融合蛋白及gRNA被表現並形成RGN 融合核糖核蛋白複合物的條件下培養該細胞。 99. 實施方式98的方法，更包括純化該RGN融合核糖核蛋白複合物。 100. 一種用於將異源多肽定位至包括標的DNA序列的標的DNA分子的系統，該系統包括： a) 一融合蛋白、或編碼該融合蛋白的一核苷酸序列，其中該融合蛋白包括一RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽；其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列；以及 b) 能夠與該標的DNA序列的一非標的股雜交的一或更多引導RNA或編碼該一或更多引導RNA的一或更多核苷酸序列；以及其中該一或更多引導RNA能夠與融合蛋白形成複合物，以引導該融合蛋白結合至該標的DNA序列。 101. 實施方式100的系統，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 102. 實施方式100的系統，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的胺基酸序列。 103. 實施方式100的系統，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 104. 實施方式100的系統，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 105. 實施方式100的系統，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者的胺基酸序列。 106. 實施方式100-105中任一實施方式的系統，其中該異源多肽被插入該RGN的連接子結構域2、楔形結構域、RuvC結構域、HNH結構域、Rec-2結構域或PAM交互作用結構域內。 107. 實施方式106的系統，其中該RuvC結構域是RuvCIII結構域。 108. 實施方式100-107中任一實施方式的系統，其中： i) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： A.與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； B.與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； C.與SEQ ID NO：1的位置671對應的胺基酸位置； D.與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； E.與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； F.與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； G.與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 H.與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； ii)該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： A.與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； B.與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； C.與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； D.與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 E.與SEQ ID NO：2的位置992對應的胺基酸位置； iii)該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： A.與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； B.與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 C.與SEQ ID NO：3的位置對應744的胺基酸位置； iv)該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： A.與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； B.與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； C.與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； D.與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； E.與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； F.與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； G.與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 H.與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 v)該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： A.與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 B.與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。 109. 實施方式100-108中任一實施方式的系統，其中該異源多肽包括鹼基編輯多肽或先導編輯多肽。 110. 實施方式109的系統，其中該先導編輯多肽包括DNA聚合酶。 111. 實施方式109的系統，其中該先導編輯多肽包括反轉錄酶。 112. 實施方式109的系統，其中該鹼基編輯多肽包括去胺酶。 113. 實施方式112的系統，其中該去胺酶是胞嘧啶去胺酶或腺嘌呤去胺酶。 114. 實施方式112或113的系統，其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。 115. 實施方式112-114中任一實施方式的系統，其中該至少一異源多肽被插入在包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： a)與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b)與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c)與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d)與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e)與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f)與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的編輯窗。 116. 實施方式112-115中任一實施方式的系統，其中，與該去胺酶被衍生自的親代去胺酶相較，該去胺酶缺少第一個胺基酸殘基及最後一個胺基酸殘基。 117. 實施方式112-116中任一實施方式的系統，其中該去胺酶包括腺嘌呤去胺酶以及該融合蛋白為腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。 118. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 119. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 120. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的胺基酸序列。 121. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 122. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 123. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5或6的胺基酸序列。 124. 實施方式117的系統，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 125. 實施方式117的系統，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 126. 實施方式117的系統，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的胺基酸序列。 127. 實施方式117的系統，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 128. 實施方式117的系統，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 129. 實施方式117的系統，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者所示的胺基酸序列。 130. 實施方式100-129中任一實施方式的系統，其中該RGN是切口酶或核酸酶不活化的RGN。 131. 實施方式130的系統，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列並且保留切口酶活性。 132. 實施方式130的系統，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的該胺基酸序列。 133. 實施方式100-132中任一實施方式的系統，其中該RGN以及該異源多肽彼此直接融合，其間沒有連接子序列。 134. 實施方式100-133中任一實施方式的系統，其中融合蛋白更包括至少一核定位訊號(NLS)。 135. 實施方式100-134中任一實施方式的系統，其中編碼融合蛋白的核苷酸序列針對在真核細胞中的表現被密碼子最佳化。 136. 實施方式100-135中任一實施方式的系統，其中編碼一或更多引導RNA的該核苷酸序列以及編碼融合蛋白的該核苷酸序列中的至少一者可操作地連接至與該核苷酸序列異源的啟動子。 137. 實施方式100-136中任一實施方式的系統，其中標的DNA序列是真核標的DNA序列。 138. 實施方式100-137中任一實施方式的系統，其中標的DNA序列被定位為與被RGN辨識的原型間隔子相鄰模體(PAM)相鄰。 139. 實施方式100-138中任一實施方式的系統，其中編碼一或更多引導RNA的核苷酸序列以及編碼融合蛋白的核苷酸序列位於一個載體上。 140. 一種細胞，其包括實施方式100-139以及256-267中任一實施方式的系統。 141. 實施方式140的細胞，其中該細胞是真核細胞。 142. 實施方式141的細胞，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 143. 實施方式142的細胞，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 144. 實施方式143的細胞，其中人類細胞是免疫細胞。 145. 實施方式144的細胞，其中免疫細胞是幹細胞。 146. 實施方式145的細胞，其中幹細胞是經誘導的富潛能幹細胞。 147. 實施方式141的細胞，其中真核細胞是昆蟲細胞。 148. 實施方式141的細胞，其中真核細胞是植物細胞。 149. 一種包括實施方式148的細胞的植物。 150. 一種包括實施方式148的細胞的種子。 151. 實施方式140的細胞，其中該細胞是原核細胞。 152. 一種醫藥組成物，其包括藥學上可接受的載體以及實施方式100-139以及256-267中任一實施方式的系統或實施方式142-146中任一實施方式的細胞。 153. 一種用於將異源多肽定位至包括標的DNA序列的標的DNA分子的方法，該方法包括將實施方式100-139以及256-267中任一實施方式的系統遞送至該標的DNA分子或包括標的DNA分子的細胞。 154. 一種用於修飾包括標的DNA序列的標的DNA分子的方法，該方法包括將實施方式100-139以及256-267中任一實施方式的系統遞送至該標的DNA分子或包括標的DNA分子的細胞。 155. 實施方式154的方法，其中該去胺酶包括腺嘌呤去胺酶以及其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內至少一核苷酸的A＞N突變，其中N為C、G、或T。 156. 實施方式155的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內至少一核苷酸的A＞G突變。 157. 一種用於將異源多肽定位至包括標的DNA序列的標的DNA分子的方法，包括： a) 在適合形成該核糖核苷酸複合物的條件下，藉由結合下列，在體外組裝核糖核苷酸複合物： i) 能夠與該標的DNA序列的一非標的股雜交的一或更多指導RNA；以及 ii) 融合蛋白，其包括RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列；以及 b) 將該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的細胞與體外組裝的核糖核苷酸複合物接觸；其中一或更多引導RNA與標的DNA序列的非標的股雜交，從而引導該融合蛋白與該標的DNA序列結合。 158. 實施方式157的方法，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 159. 實施方式157的方法，其中該RGN包括具有SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中的任一者的該胺基酸序列的胺基酸序列。 160. 實施方式157的方法，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者至少90%序列一致性。 161. 實施方式157的方法，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 162. 實施方式157的方法，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4以及57-139中任一者的胺基酸序列。 163. 實施方式157-162中任一實施方式的方法，其中該異源多肽被插入該RGN的連接子結構域2、楔形結構域、RuvC結構域、HNH結構域、Rec-2結構域、或PAM交互作用結構域內。 164. 實施方式163的方法，其中該RuvC結構域是RuvCIII結構域。 165. 實施方式157-164中任一實施方式的方法，其中： a) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： I)與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； II)與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； III)與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； IV)與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； V)與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； VI)與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； VII)與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 VIII)與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； b)該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： I)與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； II)與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； III)與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； IV)與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 V)與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； c)該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： I)與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； II)與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置； III)與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； d)該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： I)與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； II)與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； III)與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； IV)與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； V)與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； VI)與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； VII)與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 VIII)與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 e)該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： I)與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 II)與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。 166. 實施方式157-165中任一實施方式的方法，其中該異源多肽包括鹼基編輯多肽或先導編輯多肽以及其中該方法更包括修飾該標的DNA分子以產生修飾的標的DNA分子。 167. 實施方式166的方法，其中標的DNA分子包括針對疾病或病症的因果突變以及其中標的 DNA 分子的修飾校正該因果突變。 168. 實施方式167的方法，其中因果突變的校正包括校正無意義突變。 169. 實施方式166-168中任一實施方式的方法，其中該先導編輯多肽包括DNA聚合酶。 170. 實施方式166-168中任一實施方式的方法，其中該先導編輯多肽包括反轉錄酶。 171. 實施方式166-168中任一實施方式的方法，其中該鹼基編輯多肽包括去胺酶。 172. 實施方式171的方法，其中該去胺酶是胞嘧啶去胺酶或腺嘌呤去胺酶。 173. 實施方式171或172的方法，其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。 174. 實施方式171-173中任一實施方式的方法，其中該至少一異源多肽被插入在包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的胺基酸位置之後： a)與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b)與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c)與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d)與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e)與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f)與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的胺基末端融合的該去胺酶的親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的編輯窗。 175. 實施方式171-174中任一實施方式的方法，其中，與該去胺酶被衍生自的親代去胺酶相較，該去胺酶缺少第一個胺基酸殘基及最後一個胺基酸殘基。 176. 實施方式171-175中任一實施方式的方法，其中該去胺酶包括腺嘌呤去胺酶以及該融合蛋白為腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。 177. 實施方式176式的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 178. 實施方式176的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 179. 實施方式176的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的胺基酸序列。 180. 實施方式176的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 181. 實施方式176的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5或6具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 182. 實施方式176的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5或6的胺基酸序列。 183. 實施方式176的方法，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 184. 實施方式176的方法，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 185. 實施方式176的方法，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的胺基酸序列。 186. 實施方式176的方法，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 187. 實施方式176的方法，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與親代ABE鹼基編輯器相較被移位的編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。 188. 實施方式176的方法，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者所示的胺基酸序列。 189. 實施方式176-188中任一實施方式的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內至少一核苷酸的A＞N突變，其中N為C、G、或T。 190. 實施方式189的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內至少一核苷酸的A＞G突變。 191. 實施方式157-190中任一實施方式的方法，其中該RGN是切口酶或核酸酶不活化的RGN。 192. 實施方式191的方法，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列並且保留切口酶活性。 193. 實施方式191的方法，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的胺基酸序列。 194. 實施方式157-193中任一實施方式的方法，其中該RGN以及該異源多肽彼此直接融合，其間沒有連接子序列。 195. 實施方式157-194中任一實施方式的方法，其中融合蛋白更包括至少一核定位訊號(NLS)。 196. 實施方式157-195中任一實施方式的方法，其中融合蛋白針對在真核細胞中的表現被密碼子最佳化。 197. 實施方式157-196中任一實施方式的方法，其中編碼一或更多引導RNA的該核苷酸序列以及編碼融合蛋白的該核苷酸序列中的至少一者可操作地連接至與該核苷酸序列異源的啟動子。 198. 實施方式157-197中任一實施方式的方法，其中標的DNA序列是真核標的DNA序列。 199. 實施方式157-198中任一實施方式的方法，其中標的DNA序列被定位為與被RGN辨識的原型間隔子相鄰模體(PAM)相鄰。 200. 實施方式157-199中任一實施方式的方法，其中編碼一或更多引導RNA的核苷酸序列以及編碼融合蛋白的核苷酸序列位於一個載體上。 201. 實施方式157-200中任一實施方式的方法，其中標的DNA序列是真核標的DNA序列。 202. 實施方式157-201中任一實施方式的方法，其中標的DNA 分子在細胞內。 203. 實施方式202的方法，其中該細胞是真核細胞。 204. 實施方式203的方法，其中真核細胞是植物細胞。 205. 實施方式203的方法，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 206. 實施方式205的方法，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 207. 實施方式206的方法，其中人類細胞是免疫細胞。 208. 實施方式207的方法，其中免疫細胞是幹細胞。 209. 實施方式208的方法，其中幹細胞是經誘導的富潛能幹細胞。 210. 實施方式203的方法，其中真核細胞是昆蟲細胞。 211. 實施方式202的方法，其中該細胞是原核細胞。 212. 實施方式202-211中任一實施方式的方法，更包括選擇包括該修飾的標的DNA分子的細胞。 213. 一種細胞，其包括根據實施方式212的方法的修飾的標的DNA分子。 214. 實施方式213的細胞，其中該細胞是真核細胞。 215. 實施方式214的細胞，其中真核細胞是植物細胞。 216. 一種包括實施方式215的細胞的植物。 217. 一種包括實施方式215的細胞的種子。 218. 實施方式214的細胞，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 219. 實施方式218的細胞，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 220. 實施方式219的細胞，其中人類細胞是免疫細胞。 221. 實施方式220的細胞，其中免疫細胞是幹細胞。 222. 實施方式221的細胞，其中幹細胞是經誘導的富潛能幹細胞。 223. 實施方式214的細胞，其中真核細胞是昆蟲細胞。 224. 實施方式213的細胞，其中該細胞是原核細胞。 225. 一種醫藥組成物，其包括實施方式218-222中任一實施方式的細胞、以及藥學上可接受的載體。 226. 一種用於治療患有或有風險進展疾病、病症或症狀的個體的方法，該方法包括：將實施方式1-35以及232-243中任一實施方式的融合蛋白、實施方式36的RNP複合物、實施方式37-73以及244-255中任一實施方式的核酸分子、實施方式74-77中任一實施方式的載體、實施方式84-88、142-146、以及218-222中任一實施方式的細胞、實施方式100-139以及256-267中任一實施方式的系統、或實施方式94、152、以及225中任一實施方式的醫藥組成物投予至該個體。 227. 實施方式226的方法，其中該疾病與因果突變相關聯以及該治療包括校正該因果突變。 228. 一種實施方式1-35及232-243中任一實施方式的融合蛋白、實施方式36的RNP複合物、實施方式37-73及244-255中任一實施方式的核酸分子、實施方式74-77中任一實施方式的載體、實施方式84-88、142-146、及218-222中任一實施方式的細胞、或實施方式100-139及256-267中任一實施方式的系統用於治療患有或有風險發展疾病、病症或病況的個體中的該疾病、病症或病況的用途。 229. 實施方式228的用途，其中該疾病與因果突變相關聯以及該治療包括校正該因果突變。 230. 一種實施方式1-35及232-243中任一實施方式的融合蛋白、實施方式36的RNP複合物、實施方式37-73及244-255中任一實施方式的核酸分子、實施方式74-77中任一實施方式的載體、實施方式84-88、142-146、及218-222中任一實施方式的細胞、或實施方式100-139及256-267中任一實施方式的系統用於製造有用於治療疾病、病症或病況的藥物的用途。 231. 實施方式230的用途，其中該疾病與因果突變相關聯以及有效量的該藥物校正該因果突變。 232 實施方式18的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C；在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 233. 實施方式232的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 234. 實施方式232的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u)在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 235. 實施方式232的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 236. 實施方式232、234、以及235中任一實施方式的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 237. 實施方式232-236中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 238. 實施方式232-236中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 239. 實施方式232-236中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的胺基酸序列。 240. 實施方式232-239中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 241. 實施方式232-239中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 242. 實施方式232-239中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 243. 實施方式242的融合蛋白，其中融合蛋白具有SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的序列。 244. 實施方式54的核酸分子，，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 245. 實施方式244的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 246. 實施方式244的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u)在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 247. 實施方式244的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 248. 實施方式244、246、以及247中任一實施方式的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 249. 實施方式244-248中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 250. 實施方式244-248中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 251. 實施方式244-248中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的胺基酸序列。 252. 實施方式244-248中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 253. 實施方式244-248中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 254. 實施方式244-248中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 255. 實施方式254的核酸分子，其中融合蛋白具有SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的序列。 256. 實施方式117的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 257. 實施方式256的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y；； h) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 258. 實施方式256的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u)在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W,在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W,在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W,在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W,在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W,在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 259. 實施方式256的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 260. 實施方式256、258、以及259中任一實施方式的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 261. 實施方式256-260中任一實施方式的系統，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 262. 實施方式256-260中任一實施方式的系統，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 263. 實施方式256-260中任一實施方式的系統，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的胺基酸序列。 264. 實施方式256-263中任一實施方式的系統，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 265. 實施方式256-263中任一實施方式的系統，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 266. 實施方式256-263中任一實施方式的系統，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 267. 實施方式266的系統，其中融合蛋白具有SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的序列。 268. 實施方式176的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 269. 實施方式268的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 270. 實施方式268的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u)在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh)在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 271. 實施方式268的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn)在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 272. 實施方式268、270、以及272中任一實施方式的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f)在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i)在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m)在與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 273. 實施方式268-272中任一實施方式的方法，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 274. 實施方式268-272中任一實施方式的方法，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 275. 實施方式268-272中任一實施方式的方法，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的胺基酸序列。 276. 實施方式268-272中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 277. 實施方式268-272中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：4069具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； o) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； p) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； q) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； r) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； s) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後；以及 t) 融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後。 278. 實施方式268-272中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； b) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； c) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； d) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； e) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； f) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； g) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後； h) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後； i) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； j) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； k) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； l) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置之後； m) 融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後； n) 去胺酶具有如SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的融合蛋白； o)去胺酶具有如SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列，且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的融合蛋白； p)去胺酶具有如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列，且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置之後的融合蛋白； q) 去胺酶具有如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列，且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置之後的融合蛋白； r)去胺酶具有如SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列，且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的融合蛋白； s)去胺酶具有如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列，且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的融合蛋白；以及 t)去胺酶具有如SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列，且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置之後的融合蛋白。 279. 實施方式268的方法，其中融合蛋白具有如SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626以及630-632中任一者所示的序列。

以及 1. 一種去胺酶，包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列，以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 2. 實施方式1的去胺酶，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或 W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 3. 實施方式1的去胺酶，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j)與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) a與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) a與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 4. 實施方式1或3的去胺酶，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 5. 實施方式1、3及4中任一實施方式的去胺酶，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 6. 實施方式1-5中任一實施方式的去胺酶，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 7. 實施方式1-5中任一實施方式的去胺酶，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 8. 實施方式1-5中任一實施方式的去胺酶，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 9. 實施方式1-8中任一實施方式的去胺酶，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。 10. 實施方式1-9中任一實施方式的去胺酶，其中去胺酶是腺嘌呤去胺酶。 11. 一種核酸分子，包括編碼與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的去胺酶的多核苷酸，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I or L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg)與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 12. 實施方式11的核酸分子，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 13. 實施方式11的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) a與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) a與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 14. 實施方式11或13的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 15. 實施方式11、13及14中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 16. 實施方式11-15中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 17. 實施方式11-15中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 18. 實施方式中任一實施方式的核酸分子11-15，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 19. 實施方式11-18中任一實施方式的核酸分子，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。 20. 實施方式11-19中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶是腺嘌呤去胺酶。 21. 實施方式11-20中任一實施方式的核酸分子，進一步包括可操作地與多核苷酸連接的異源啟動子。 22. 一種載體，包括實施方式11-21中任一實施方式的核酸分子。 23. 一種細胞，包括實施方式1-10中任一實施方式的去胺酶、實施方式11-21中任一實施方式的核酸分子、或實施方式22的載體。 24. 一種藥物組成物，包括藥學上可接受的載體及實施方式1-10中任一實施方式的去胺酶、實施方式11-21中任一實施方式的核酸分子、或實施方式22的載體。 25. 一種用於製造去胺酶的方法，包括將實施方式11-21中任一實施方式的核酸分子或實施方式22的載體引入細胞中、以及在表現去胺酶的條件下培養細胞。 26. 實施方式25的方法，進一步包括純化該去胺酶。 27. 一種融合蛋白，包括DNA結合多肽及與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的去胺酶，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 28. 實施方式27的融合蛋白，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 29. 實施方式27的融合蛋白，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 30. 實施方式27或29的融合蛋白，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 31. 實施方式27、29及30中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 32. 實施方式27-31中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 33. 實施方式27-31中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 34. 實施方式27-31中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 35. 實施方式27-34中任一實施方式的融合蛋白，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，去胺酶具有改善的去胺酶活性。 36. 實施方式27-35中任一實施方式的融合蛋白，其中該去胺酶是腺嘌呤去胺酶。 37. 實施方式27-36中任一實施方式的融合蛋白，其中該DNA結合多肽是大範圍核酸酶、鋅指融合蛋白、或TALEN。 38. 實施方式27-36中任一實施方式的融合蛋白，其中該DNA結合多肽是RNA引導的DNA結合多肽。 39. 實施方式38的融合蛋白，其中RNA引導的DNA結合多肽是RNA引導的核酸酶(RGN)多肽。 40. 實施方式39的融合蛋白，其中該RGN是II型CRISPR-Cas多肽。 41. 實施方式39的融合蛋白，其中該RGN是V型CRISPR-Cas多肽。 42. 實施方式39-41中任一實施方式的融合蛋白，其中該RGN是RGN切口酶。 43. 實施方式39的融合蛋白，其中該RGN是Cas9、CasX、CasY、Cpfl、C2cl、C2c2、C2c3、GeoCas9、CjCas9、Casl2a、Casl2b、Casl2g、Casl2h、Casl2i、Casl3b、Casl3c、Casl3d、Casl4、Csn2、xCas9、SpCas9-NG、LbCasl2a、AsCasl2a、Cas9-KKH、循環排列的Cas9、Argonaute (Ago)、SmacCas9、或Spy-macCas9結構域。 44.實施方式39的融合蛋白，其中該RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 45.實施方式42的融合蛋白，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52及698中任一者所示的胺基酸序列。 46. 實施方式27-45中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白進一步包括至少一核定位訊號(NLS)。 47. 實施方式27-31中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 48. 實施方式27-31中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 49. 實施方式27-31中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合。 50. 實施方式47-49中任一實施方式的融合蛋白，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、及729中任一者所示的序列。 51. 一種核糖核蛋白(RNP)複合物，包括實施方式38-50中任一實施方式的融合蛋白及與融合蛋白結合的引導RNA。 52. 一種核酸分子，包括編碼融合蛋白的多核苷酸，該融合蛋白包括DNA結合多肽及去胺酶，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 53. 實施方式52的核酸分子，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 54. 實施方式52的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 55. 實施方式52或54的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 56. 實施方式52、54及55中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 57. 實施方式52-56中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 58. 實施方式52-56中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 59. 實施方式52-56中任一實施方式的核酸分子，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 60. 實施方式52-59中任一實施方式的核酸分子，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，較去胺酶具有改善的去胺酶活性。 61. 實施方式52-60中任一實施方式的核酸分子，其中去胺酶是腺嘌呤去胺酶。 62. 實施方式52-61中任一實施方式的核酸分子，其中DNA結合多肽是大範圍核酸酶、鋅指融合蛋白、或TALEN。 63. 實施方式52-61中任一實施方式的核酸分子，其中DNA結合多肽是RNA引導的DNA結合多肽。 64. 實施方式63的核酸分子，其中RNA引導的DNA結合多肽是RNA引導的核酸酶(RGN)多肽。 65. 實施方式64的核酸分子，其中該RGN是II型CRISPR-Cas多肽。 66. 實施方式64的核酸分子，其中該RGN是V型CRISPR-Cas多肽。 67. 實施方式64-66中任一實施方式的核酸分子，其中該RGN是RGN切口酶。 68. 實施方式的核酸分子64，其中 RGN多肽是Cas9、CasX、CasY、Cpfl、C2cl、C2c2、C2c3、GeoCas9、CjCas9、Casl2a、Casl2b、Casl2g、Casl2h、Casl2i、Casl3b、Casl3c、Casl3d、Casl4、Csn2、xCas9、SpCas9-NG、LbCasl2a、AsCasl2a、Cas9-KKH、循環排列的Cas9、Argonaute (Ago)、SmacCas9、或Spy-macCas9結構域。 69. 實施方式64的核酸分子，其中該RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 70. 實施方式67的核酸分子，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52及698中任一者所示的胺基酸序列。 71. 實施方式52-70中任一實施方式的核酸分子，其中融合蛋白進一步包括至少一核定位訊號(NLS)。 72. 實施方式中任一實施方式的核酸分子52-56，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 73. 實施方式52-56中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 74. 實施方式52-56中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合。 75. 實施方式72-74中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、及729中任一者所示的序列。 76. 實施方式52-75中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白針對在真核細胞中的表現而被密碼子最佳化。 77. 實施方式52-75中任一實施方式的核酸分子，其中該融合蛋白針對在原核細胞中的表現而被密碼子最佳化。 78. 一種載體，包括實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子。 79. 一種載體，包括實施方式64-75中任一實施方式的核酸分子，進一步包括編碼能夠與標的序列的非標的股雜交的引導RNA的至少一核苷酸序列。 80. 實施方式79的載體，其中引導RNA是單引導RNA (sgRNA)。 81. 實施方式79的載體，其中引導RNA是雙引導RNA (sgRNA)。 82. 一種細胞，包括實施方式27-50中任一實施方式的融合蛋白或實施方式51的RNP複合物。 83. 一種細胞，包括實施方式27-50中任一實施方式的融合蛋白，其中該細胞近一步包括引導RNA。 84. 一種細胞，包括實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子。 85. 一種細胞，包括實施方式78-81中任一實施方式的載體。 86. 實施方式82-85中任一實施方式的細胞，其中該細胞是原核細胞。 87. 實施方式82-85中任一實施方式的細胞，其中該細胞是真核細胞。 88. 實施方式87的細胞，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 89. 實施方式88的細胞，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 90. 實施方式89的細胞，其中人類細胞是免疫細胞。 91. 實施方式90的細胞，其中免疫細胞是幹細胞。 92. 實施方式91的細胞，其中幹細胞是誘導的多潛能幹細胞。 93. 實施方式87的細胞，其中真核細胞是昆蟲或鳥類細胞。 94. 實施方式87的細胞，其中真核細胞是真菌細胞。 95. 實施方式87的細胞，其中真核細胞是植物細胞。 96. 一種植物，包括實施方式95的細胞。 97. 一種種子，包括實施方式95的細胞。 98. 一種藥物組成物，包括藥學上可接受的載體、以及實施方式27-50中任一實施方式的融合蛋白、實施方式51的RNP複合物、實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子、實施方式78-81中任一實施方式的載體、或實施方式88-92中任一實施方式的細胞。 99. 一種用於製造融合蛋白的方法，包括在其中融合蛋白表現的條件下培養實施方式82-95中任一實施方式的細胞。 100. 一種用於製造融合蛋白的方法，包括將實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子或實施方式78-81中任一實施方式的載體引入細胞中、以及在其中融合蛋白表現的條件下培養細胞。 101. 實施方式99或100的方法，進一步包括純化融合蛋白。 102. 一種用於製造RGN融合核糖核蛋白複合物的方法，包括將實施方式63-70及72-75中任一者的核酸分子與包括編碼引導RNA的表現匣的核酸分子、或實施方式79-81中任一實施方式的載體引入細胞中、以及在其中融合蛋白與gRNA被表現並形成RGN融合核糖核蛋白複合物的條件下培養細胞。 103. 實施方式102的方法，進一步包括純化RGN融合核糖核蛋白複合物。 104. 一種用於修飾包括標的DNA序列的標的DNA分子的系統，該系統包括： a) 包括RNA引導的核酸酶多肽及去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列、或編碼該融合蛋白的核苷酸序列，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： i) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； ii) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； iii) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； iv) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； vi) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； vii) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； viii) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； ix) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； x) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； xi) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； xii) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； xiii) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； xiv) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； xv) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； xvi) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； xvii)與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； xviii) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； xix) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； xx) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； xxi) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； xxii)與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； xxiii) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； xxiv) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； xxv)與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； xxvi) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； xxvii) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； xxviii) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； xxix) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； xxx)與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； xxxi) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； xxxii) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； xxxiii) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； xxxiv) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xxxv) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； xxxvi) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； xxxvii) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 xxxviii) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H；以及 b) 能夠與該標的DNA序列的非標的股雜交的一或更多引導RNA、或編碼該一或更多引導RNA的一或更多核苷酸序列；以及其中該一或更多引導RNA能夠與融合蛋白形成複合物以引導融合蛋白與標的DNA序列結合並修飾標的DNA序列。 105. 實施方式104的系統，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 106. 實施方式104的系統，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 107. 實施方式104或106的系統，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 108. 實施方式104、106及107中任一項的系統，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 109. 實施方式104-108中任一項的系統，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 110. 實施方式104-108中任一項的系統，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 111. 實施方式104-108中任一項的系統，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 112. 實施方式104-111中任一項的系統，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。 113. 實施方式104-111中任一項的系統，其中該去胺酶是腺嘌呤去胺酶。 114. 實施方式104-113中任一項的系統，其中編碼該一或更多引導RNA的該核苷酸序列及編碼該融合蛋白的該核苷酸序列中的至少一者可操作地連接至與該核苷酸序列異源的啟動子。 115. 實施方式104-114中任一項的系統，其中標的DNA序列是真核標的DNA序列。 116. 實施方式104-115中任一項的系統，其中標的DNA序列被定位為與被RGN辨識的前間隔序列鄰近模體(PAM)相鄰。 117. 實施方式104-116中任一項的系統，其中融合蛋白的RGN是II型CRISPR-Cas多肽。 118. 實施方式104-116中任一項的系統，其中融合蛋白的RGN是V型CRISPR-Cas多肽。 119. 實施方式104-116中任一項的系統，其中該RGN是Cas9、CasX、CasY、Cpfl、C2cl、C2c2、C2c3、GeoCas9、CjCas9、Casl2a、Casl2b、Casl2g、Casl2h、Casl2i、Casl3b、Casl3c、Casl3d、Casl4、Csn2、xCas9、SpCas9-NG、LbCasl2a、AsCasl2a、Cas9-KKH、循環排列的Cas9、Argonaute (Ago)、SmacCas9、或Spy-macCas9結構域。 120. 實施方式104-116中任一項的系統，其中融合蛋白的RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 121. 實施方式104-116中任一項的系統，其中融合蛋白的RGN是RGN切口酶。 122. 實施方式121的系統，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52及698中任一者所示的胺基酸序列。 123. 實施方式104-122中任一項的系統，其中融合蛋白包括一或更多核定位訊號。 124. 實施方式104-108中任一項的系統，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 125. 實施方式104-108中任一實施方式的系統，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 126. 實施方式104-108中任一項的系統，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合。 127. 實施方式124-126中任一項的系統，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、及729中任一者所示的序列。 128. 實施方式104-127中任一項的系統，其中該融合蛋白針對在真核細胞中的表現而被密碼子最佳化。 129. 實施方式104-128中任一項的系統，其中編碼該一或更多引導RNA的核苷酸序列及編碼融合蛋白的該核苷酸序列位於一個載體上。 130. 一種細胞，包括實施方式104-129中任一實施方式的系統。 131. 實施方式130的細胞，其中該細胞是真核細胞。 132. 實施方式131的細胞，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 133. 實施方式132的細胞，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 134. 實施方式133的細胞，其中人類細胞是免疫細胞。 135. 實施方式134的細胞，其中免疫細胞是幹細胞。 136. 實施方式135的細胞，其中幹細胞是誘導的多潛能幹細胞。 137. 實施方式131的細胞，其中真核細胞是昆蟲細胞。 138. 實施方式131的細胞，其中真核細胞是植物細胞。 139. 一種植物，包括實施方式138的細胞。 140. 一種種子，包括實施方式138的細胞。 141. 實施方式130的細胞，其中該細胞是原核細胞。 142. 一種藥物組成物，包括藥學上可接受的載體、以及實施方式104-129中任一實施方式的系統或實施方式132-136中任一實施方式的細胞。 143. 一種用於修飾包括標的DNA序列的標的DNA分子的方法，該方法包括將根據實施方式104-129中任一實施方式的系統遞送至該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的細胞。 144. 實施方式143的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內的至少一核苷酸的A＞N突變，其中N是C、G或T。 145. 實施方式144的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內的至少一核苷酸的A＞G突變。 146. 一種用於修飾包括標的序列的標的DNA分子的方法，包括： a) 在適於形成RGN去胺酶核糖核苷酸複合物的條件下藉由結合： i) 能夠與標的DNA序列的非標的股雜交的一或更多引導RNA；以及 ii) 包括RNA引導的核酸酶多肽(RGN)及至少一去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的胺基酸序列；以在體外組裝該RGN去胺酶核糖核苷酸複合物；其中該去胺酶具有下列胺基酸殘基中的至少一者： A) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； B) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； C) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； D) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； E) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； F) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； G) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； H) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； I) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； J) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； K) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； L) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； M) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； N) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； O) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； P) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； Q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； R) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； S) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； T) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； U) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； V) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； W) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； X) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； Y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； Z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； AA) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； BB) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； CC) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； DD) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； EE) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； FF) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； GG) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； HH) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； II) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； JJ) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； KK) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 LL) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H；以及 b) 使該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的細胞與在體外組裝的RGN去胺酶核糖核苷酸複合物接觸；其中該一或更多引導RNA與標的DNA序列的非標的股雜交，從而引導該融合蛋白與該標的DNA序列結合且發生標的DNA分子的修飾。 147. 實施方式146的方法，其中該去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 148. 實施方式146的方法，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 149. 實施方式146或148的方法，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 150. 實施方式146、148及149中任一實施方式的方法，其中該去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 151. 實施方式146-150中任一實施方式的方法，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的胺基酸序列。 152. 實施方式146-150中任一實施方式的方法，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 153. 實施方式中任一實施方式的方法146-150，其中該去胺酶具有SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 154. 實施方式中任一實施方式的方法146-153，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。 155. 實施方式146-154中任一實施方式的方法，其中該去胺酶是腺嘌呤去胺酶。 156. 實施方式146-155中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白的RGN是II型CRISPR-Cas多肽。 157. 實施方式146-155中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白的RGN是V型CRISPR-Cas多肽。 158. 實施方式146-155中任一實施方式的方法，其中該RGN是Cas9、CasX、CasY、Cpfl、C2cl、C2c2、C2c3、GeoCas9、CjCas9、Casl2a、Casl2b、Casl2g、Casl2h、Casl2i、Casl3b、Casl3c、Casl3d、Casl4、Csn2、xCas9、SpCas9-NG、LbCasl2a、AsCasl2a、Cas9-KKH、循環排列的Cas9、Argonaute (Ago)、SmacCas9、或Spy-macCas9結構域。 159. 實施方式146-155中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白的RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、及699中任一者具有至少95%序列一致性的胺基酸序列。 160. 實施方式146-155中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白的RGN是RGN切口酶。 161. 實施方式160的方法，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52及698中任一者所示的胺基酸序列。 162. 實施方式146-161中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白包括一或更多核定位訊號。 163. 實施方式146-162中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 164. 實施方式146-162中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少95%序列一致性的胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少95%序列一致性的胺基酸序列的RGN的N端融合。 165. 實施方式146-162中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白選自由下列組成的群組： a) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； b) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； c) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； d) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； e) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合； f) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸的RGN的N端融合； g) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的胺基酸序列的RGN的N端融合。 166. 實施方式163-165中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、及729中任一者所示的序列。 167. 實施方式146-166中任一實施方式的方法，其中該融合蛋白針對在真核細胞中的表現而被密碼子最佳化。 168. 實施方式146-167中任一實施方式的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內的至少一核苷酸的A＞N突變，其中N是C、G或T。 169. 實施方式168的方法，其中該修飾的標的DNA分子包括該標的DNA分子內的至少一核苷酸的A＞G 突變。 170. 實施方式146-169中任一實施方式的方法，其中該標的DNA序列是真核標的DNA序列。 171. 實施方式146-170中任一實施方式的方法，其中該標的DNA序列被定位為與前間隔序列鄰近模體(PAM)相鄰。 172. 實施方式146-171中任一實施方式的方法，其中該標的DNA分子包括關於疾病或病症的因果突變，且其中標的DNA分子的修飾校正因果突變。 173. 實施方式的方法172，其中因果突變的校正包括校正無意義突變。 174. 實施方式146-173中任一實施方式的方法，其中標的DNA分子是在細胞內。 175. 實施方式174的方法，其中該細胞是真核細胞。 176. 實施方式175的方法，其中真核細胞是植物細胞。 177. 實施方式175的方法，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 178. 實施方式177的方法，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 179. 實施方式178的方法，其中人類細胞是免疫細胞。 180. 實施方式179的方法，其中免疫細胞是幹細胞。 181. 實施方式180的方法，其中幹細胞是誘導的多潛能幹細胞。 182. 實施方式175的方法，其中真核細胞是昆蟲細胞。 183. 實施方式174的方法，其中該細胞是原核細胞。 184. 實施方式174-183中任一實施方式的方法，進一步包括選則包括該修飾的DNA分子的細胞。 185. 一種細胞，包括根據實施方式184的方法的修飾的標的DNA序列。 186. 實施方式185的細胞，其中該細胞是真核細胞。 187. 實施方式186的細胞，其中真核細胞是植物細胞。 188. 一種植物，包括實施方式187的細胞。 189. 一種種子，包括實施方式187的細胞。 190. 實施方式187的細胞，其中真核細胞是哺乳動物細胞。 191. 實施方式190的細胞，其中哺乳動物細胞是人類細胞。 192. 實施方式191的細胞，其中人類細胞是免疫細胞。 193. 實施方式192的細胞，其中免疫細胞是幹細胞。 194. 實施方式193的細胞，其中幹細胞是誘導的多潛能幹細胞。 195. 實施方式186的細胞，其中真核細胞是昆蟲細胞。 196. 實施方式185的細胞，其中該細胞是原核細胞。 197. 一種藥物組成物，包括實施方式190-194中任一實施方式的細胞、以及藥學上可接受的載體。 198. 一種組成物，包括： a) 包括DNA結合多肽及第一腺嘌呤去胺酶的融合蛋白、或編碼該融合蛋白的胺基酸分子；以及 b) 與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的第二腺嘌呤去胺酶；或編碼該去胺酶的胺基酸分子，其中第二去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： i) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； ii) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； iii) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； iv) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； vi) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； vii) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； viii) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； ix) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； x) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； xi) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； xii) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； xiii) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； xiv) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； xv) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； xvi) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； xvii)與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； xviii) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； xix) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； xx) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； xxi) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； xxii)與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； xxiii) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； xxiv) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； xxv)與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； xxvi) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； xxvii) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； xxviii) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； xxix) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； xxx)與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； xxxi) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； xxxii) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； xxxiii) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； xxxiv) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xxxv) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； xxxvi) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； xxxvii) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 xxxviii) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 199.實施方式198的組成物，其中該第二去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 200. 實施方式的組成物198，其中該第二去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 201. 實施方式198或200的組成物，其中該第二去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 202. 實施方式198、200及201中任一實施方式的組成物，其中該第二去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 203. 實施方式198-202中任一實施方式的組成物，其中該第二腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有至少90%序列一致性。 204. 實施方式198-202中任一實施方式的組成物，其中該第二腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有95%序列一致性。 205. 實施方式198-202中任一實施方式的組成物，其中該第二腺嘌呤去胺酶具有SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 206. 實施方式198-205中任一實施方式的組成物，其中第一腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 207.實施方式206的組成物，其中該第一去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 208.實施方式206的組成物，其中該第一去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 209.實施方式206或的組成物，其中該第一去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 210. 實施方式206、208或209中任一實施方式的組成物，其中該第一去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 211. 實施方式206-210中任一實施方式的組成物，其中該第一腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：300-414、596、597及598、720-723中任一者具有至少90%序列一致性。 212. 實施方式206-210中任一實施方式的組成物，其中該第一腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者具有95%序列一致性。 213. 實施方式206-210中任一實施方式的組成物，其中該第一腺嘌呤去胺酶具有SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 214. 實施方式198-213中任一實施方式的組成物，其中該DNA結合多肽是大範圍核酸酶、鋅指融合蛋白、或TALEN。 215. 實施方式198-213中任一實施方式的組成物，其中該DNA結合多肽是RNA引導的DNA結合多肽。 216. 實施方式215的組成物，其中該RNA引導的DNA結合多肽是RNA引導的核酸酶(RGN)多肽。 217. 實施方式216的組成物，其中該RGN是RGN切口酶。 218. 一種載體，包括編碼融合蛋白的第一胺基酸分子及編碼第二去胺酶的第二胺基酸分子，其中該融合蛋白包括DNA結合多肽及第一腺嘌呤去胺酶，且其中該第二腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性，以及其中該第二腺嘌呤去胺酶具有下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 219. 實施方式218的載體，其中第二去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 220. 實施方式218的載體，其中該第二去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 221. 實施方式218或220的載體，其中該第二去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 222. 實施方式218、220及221中任一實施方式的載體，其中該第二去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 223. 實施方式218-222中任一實施方式的載體，其中該第二腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：5具有至少90%序列一致性。 224. 實施方式218-222中任一實施方式的載體，其中該第二腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：5具有至少95%序列一致性。 225. 實施方式218-222中任一實施方式的載體，其中該第二腺嘌呤去胺酶具有SEQ ID No：300-414、596-598、及720-723中任一者的胺基酸序列。 226. 實施方式218-225中任一實施方式的載體，其中該第一腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； g) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A或M； h) 與SEQ ID NO：5的位置72對應的位置處的H； i) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、Y、或D； j) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； k) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； m) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； o) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； p) 與SEQ ID NO：5的位置120對應的位置處的F； q) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的E、T、A、G、或V； r) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的I或H； s) 與SEQ ID NO：5的位置125對應的位置處的K； t) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； u) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； v) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； w) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； x) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； y) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； aa) 與SEQ ID NO：5的位置148對應的位置處的K； bb) 與SEQ ID NO：5的位置151對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； dd) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ee) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R或V； ff) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； gg) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； hh) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ii) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； jj) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W、H、V、或A； kk) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R；以及 ll) 與SEQ ID NO：5的位置166對應的位置處的H。 227. 實施方式226的載體，其中該第一去胺酶包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 與SEQ ID NO：5的位置2對應的位置處的C； b) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的F或C； c) 與SEQ ID NO：5的位置23對應的位置處的Q； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N； e) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A； g) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、A、Q、或Y； h) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； j) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； k) 與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H； l) 與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L； m) 與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I或L； n) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A或G； o) 與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H； p) 與SEQ ID NO：5的位置126對應的位置處的A； q) 與SEQ ID NO：5的位置135對應的位置處的H； r) 與SEQ ID NO：5的位置137對應的位置處的V； s) 與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y； t) 與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L； u) 與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的K或A； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、Q、L、或M； w) 與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E或R； x) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； y) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； z) 與SEQ ID NO：5的位置157對應的位置處的F； aa) 與SEQ ID NO：5的位置158對應的位置處的R； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； cc) 與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D或W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的A或W；以及 ee) 與SEQ ID NO：5的位置165對應的位置處的R。 228. 實施方式226的載體，其中該第一去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； e) 與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及位置162處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； l) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； m) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； n) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； o) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； p) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； t) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； u) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； v) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； w) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； x) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； y) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； z) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； aa) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； bb) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； dd) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； ee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ff) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； gg) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； hh) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ii) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； jj) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； kk) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； ll) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； mm) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； nn) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； oo) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； pp) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； qq) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； rr) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ss) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； tt) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； uu) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V； vv) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； ww) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； xx) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； yy) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； zz) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aaa) 與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bbb) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ccc) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； ddd) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； eee) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； fff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的V、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； ggg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； hhh) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； iii) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jjj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； kkk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； lll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mmm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； nnn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ooo) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ppp) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； qqq) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； rrr) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； sss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ttt) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； uuu) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； vvv) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H；或 www) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S。 229. 實施方式226或228的載體，其中該第一去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N及與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q； b) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； c) 與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q及與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R； d) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； g) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； i) 與位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置46對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的M、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； j) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； l) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； n) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A； p) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； q) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； r) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； s) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； t) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M； u) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； v) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； w) 與SEQ ID NO：5的位置40對應的位置處的L、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； x) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M； y) 與SEQ ID NO：5的位置105對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； z) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q； aa) 與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； bb) 與SEQ ID NO：5的位置159對應的位置處的Q、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； cc) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； dd) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ee) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； ff) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； gg) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G； hh) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ii) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； jj) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； kk) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； ll) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； mm) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； nn) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； oo) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； pp) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； qq) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； rr) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； ss) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； tt) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； uu) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 vv) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 230. 實施方式226、228及229中任一實施方式的載體，其中該第一去胺酶包括： a) 與SEQ ID NO：5的位置35對應的位置處的N、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的W； b) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； c) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； d) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、及與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W； e) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的M、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的W； f) 與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； g) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、及與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L； h) 與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A及與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S； i) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置109對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的E、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； j) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； k) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的I、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的Q、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； l) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D； m) 與SEQ ID NO：5的位置22對應的位置處的C、與SEQ ID NO：5的位置68對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置76對應的位置處的G、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置108對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置117對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置122對應的位置處的H、與SEQ ID NO：5的位置138對應的位置處的Y、與SEQ ID NO：5的位置139對應的位置處的L、與SEQ ID NO：5的位置142對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置145對應的位置處的A、與SEQ ID NO：5的位置153對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置156對應的位置處的R、與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D、及與SEQ ID NO：5的位置162對應的位置處的H； n) 與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S；或 o) 與SEQ ID NO：5的位置75對應的位置處的W、與SEQ ID NO：5的位置81對應的位置處的S、與SEQ ID NO：5的位置155對應的位置處的W、及與SEQ ID NO：5的位置160對應的位置處的D。 231. 實施方式226-230中任一實施方式的載體，其中該第一腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723具有至少90%序列一致性。 232. 實施方式226-230中任一實施方式的載體，其中該第一腺嘌呤去胺酶與SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723具有至少95%序列一致性。 233. 實施方式226-230中任一實施方式的載體，其中該第一腺嘌呤去胺酶具有SEQ ID NO：300-414、596-598、及720-723的胺基酸序列。 234. 實施方式218-233中任一實施方式的載體，其中該DNA結合多肽是大範圍核酸酶、鋅指融合蛋白、或TALEN。 235. 實施方式218-233中任一實施方式的載體，其中該DNA結合多肽是RNA引導的DNA結合多肽。 236. 實施方式235的載體，其中該RNA引導的DNA結合多肽是RNA引導的核酸酶(RGN)多肽。 237. 實施方式236的載體，其中該RGN是RGN切口酶。 238. 一種細胞，包括實施方式186-205中任一實施方式的組成物或實施方式218-237中任一實施方式的載體。 239. 一種藥物組成物，包括藥學上可接受的載體、以及實施方式198-217中任一實施方式的組成物、實施方式218-237中任一實施方式的載體、或實施方式238的細胞。 240. 一種用於治療具有疾病、病症或症狀或處於發展疾病、病症或症狀風險中的個體的方法，方法包括：將實施方式27-50中任一實施方式的融合蛋白、實施方式51的RNP複合物、實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子、實施方式78-81及218-237中任一實施方式的載體、實施方式88-92、132-136、190-194、及238中任一實施方式的細胞、實施方式104-129中任一實施方式的系統、實施方式196-217中任一實施方式的組成物、或實施方式98、142、197及239中任一實施方式的藥物組成物投予至個體。 241. 實施方式240的方法，其中疾病與因果突變相關聯，且治療包括校正因果突變。 242. 一種實施方式27-50中任一實施方式的融合蛋白、實施方式51的RNP複合物、實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子、實施方式78-81及218-237中任一實施方式的載體、實施方式88-92、132-136、190-194、及238中任一實施方式的細胞、實施方式104-129中任一實施方式的系統、或實施方式196-217中任一實施方式的組成物用於治療具有疾病、病症或症狀或處於發展疾病、病症或症狀風險中的個體中的疾病、病症或症狀的用途。 243. 實施方式242的用途，其中該疾病與因果突變相關聯，且該治療包括校正該因果突變。 244. 一種實施方式27-50中任一實施方式的融合蛋白、實施方式51的RNP複合物、實施方式52-77中任一實施方式的核酸分子、實施方式78-81及218-237中任一實施方式的載體、實施方式88-92、132-136、190-194、及238中任一實施方式的細胞、實施方式104-129中任一實施方式的系統、或實施方式196-217中任一實施方式的組成物用於製造有用於治療疾病、病症或症狀的藥物的用途。 245. 實施方式244的用途，其中該疾病與因果突變相關聯，且該藥物的有效量校正該因果突變。

提供以下範例是為了說明而不是限制。實驗範例 1 ：鑲嵌 (Inlaid) 鹼基編輯器是實用的且一些鑲嵌 (Inlaid) 鹼基編輯器在編輯窗中展現移位

親代腺嘌呤鹼基編輯器(ABE；LPG50148-nAPG07433.1)由LPG50148 (如SEQ ID NO：5所示、且最初揭露於WO 2022/056254中，WO 2022/056254藉由引用以其整體被併入本文)及具有D11A 突變的APG07433.1的切口酶版本(如SEQ ID NO：49所示，且最初揭露於WO 2019/236566中，WO 2019/236566藉由引用以其整體被併入本文)之間的端對端融合產生，且之間具有連接子(如SEQ ID NO：705所示的L32 連接子序列)。具有被插入nAPG07433.1的LPG50148構築體如圖1A所示。基於結構分析選擇插入位置，以將去胺酶活性位點定位至標準的編輯窗之外的鹼基。

LPG50148 (減去起始甲硫胺酸(如SEQ ID NO：5所示)、以及在N端側翼具有短GGS連接子且在C端側翼具有SGG連接子)緊接在nAPG07433.1中的下列胺基酸殘基(根據 SEQ ID NO：1編號)之後被插入：S772 (被稱為LPG20002，其序列如SEQ ID NO：8所示)、S775 (被稱為LPG20003，其序列如SEQ ID NO：9所示)、K778 (被稱為LPG20004，其序列如SEQ ID NO：10所示)、E900 (被稱為LPG20005，其序列如SEQ ID NO：11所示)、G910 (被稱為LPG20006，其序列如SEQ ID NO：12所示)、R30 (被稱為LPG20007，其序列如SEQ ID NO：13所示)、T642 (被稱為LPG20008，其序列如SEQ ID NO：14所示)、R670 (被稱為LPG20009，其序列如SEQ ID NO：15所示)、D737 (被稱為LPG20010，其序列如SEQ ID NO：16所示)及A802 (被稱為LPG20011，其序列如SEQ ID NO：17所示)。

也進行結構域取代策略，其中LPG50148去胺酶取代nAPG07433.1 HNH結構域。此融合蛋白在本文中被稱為LPG20001、且如SEQ ID NO：428所示。鹼基編輯器在N端及C端處與NLS序列融合。

對於每個鑲嵌鹼基編輯器(IBE)及HNH取代蛋白，測量人類細胞中的編輯效率。IBE、HNH取代蛋白及引導RNA作為編碼該IBE、HNH取代蛋白及引導RNA的質體被遞送至HEK293T細胞中。

圖2B所示的結果顯示：對於LPG20002-LPG20004，編輯窗的位置19-22之間的編輯效率顯著下降，而位置6-9之間的編輯效率增加。LPG20008-LPG20010也顯示位置19-22之間的編輯效率下降、而位置6-9之間的編輯效率增加(圖3)。因此，這些新工程化的鹼基編輯器在接近 PAM的編輯窗中展現特殊的移位。對於結構域取代策略，LPG20001顯示幾乎無編輯(資料未顯示)。去胺酶也被插入其中HNH 結構域缺失的nAPG07433.1蛋白中，且這些蛋白也顯示非常低的編輯(資料未顯示)。此外，去胺酶被插入核酸酶不活化的APG07433.1中的幾個位置。在細胞中進行測試時，這些IBE (LPG20134-LPG20138)也顯示幾乎無編輯(資料未顯示)。

選擇具有改變的編輯窗及最高編輯效率的兩個構築體(LPG20002及LPG20008)進行額外研究。這些構築體的位置A6-A9顯示較高的編輯、小於端對端融合，且總編輯效率與親代ABE (圖4)相當。範例 2 ：鑲嵌鹼基編輯器內的連接子的缺失

鑲嵌鹼基編輯器 LPG20002及LPG20008展現廣的編輯窗(圖2B及圖3)，其是對靶向剪接位點的基因剔除的重要特徵。然而，需要更集中的窗來校正特定突變。為了降低編輯窗的寬度，假設刪除LPG50148與nAPG07433.1之間的GGS連接子可以降低構形彈性，產生更集中的去胺作用。來自LPG20002的N端、C端或兩者的連接子被刪除(圖5A)。具有被刪除的胺基端連接子的LPG20002如SEQ ID NO：18所示、且於本文中稱為LPG20012。具有被刪除羧基端連接子的LPG20002如SEQ ID NO：19所示，且本文稱為LPG20013。除了刪除兩連接子之外，LPG50148也在如SEQ ID NO：20所示的構築體(LPG20014)中的每端被截短單一胺基酸。IBE及引導RNA作為編碼該IBE及引導RNA的質體被遞送至HEK293T細胞中。

如預期的，LPG20002在連接子缺失之後仍是有活性的(圖5B)，證明GGS連接子是非必要的。然而，雖然連接子缺失不會降低用於LPG20002的編輯窗寬度(圖5C)，但這些缺失會減小蛋白質大小，這有助於AAV遞送。範例 3 ：鑲嵌鹼基編輯器的治療潛力

藉由編輯遺傳性ATTR類澱粉變性剪接位點及剔除β2微球蛋白(B2M)基因證明鑲嵌鹼基編輯器的治療潛力(圖6)。遺傳性ATTR類澱粉變性是由運甲狀腺素蛋白(TTR)基因內的突變引起，其導致不穩定且容易錯誤折疊的異常TTR蛋白，形成以類澱粉蛋白沉積在體內的各個器官及組織中的聚集體。ABE剪接位點靶向是剔除肝臟中TTR產生的策略。在這些研究中，LPG20002或親代ABE與引導RNA作為編碼該LPG20002或親代ABE與引導RNA的質體經由核轉染被遞送至HEK293T細胞中。對於編輯TTR基因的外顯子 1中的共通剪接供體序列，LPG20002顯示的編輯比親代ABE高23.3倍，顯示此應用的治療潛力(圖6A)。

同種異體幹細胞是校正細胞功能障礙的有效來源。然而，免疫排斥的風險限制了這些細胞的臨床使用。B2M 剔除是繞過此限制的策略。因此，評估IBE剔除B2M基因的效率。IBE及親代ABE作為mRNA且引導RNA作為RNA分子以經由核轉染被遞送至T細胞中。如圖6B所示，LPG20002顯示的效率比親代ABE高 ~2.5倍。此外，LPG20002的第二版本(如SEQ ID NO：21所示的LPG20015)以V81S變異體取代野生型LPG50148 (產生如SEQ ID NO：6所示的LPG50208)而產生。此LPG20015顯示的剔除 B2M效率比親代高 ~4倍(圖6B)。範例 4 ： nAPG05586 鑲嵌 鹼基編輯器

親代腺嘌呤鹼基編輯器(ABE；LPG50208-nAPG05586)由LPG50208 (具有V81S 突變的LPG50148；如SEQ ID NO：6所示)與具有D7A突變的APG05586的切口酶版本(如SEQ ID NO：50所示、且最初揭露於WO 2021/217002中，WO 2021/217002藉由引用以其整體被併入本文)之間的端對端融合產生，且之間具有連接子(如SEQ ID NO：705所示的L32 連接子序列)。基於結構分析選擇用於IBE的插入位置。

緊接在nAPG05586中的下列胺基酸殘基(根據 SEQ ID NO：2編號)之後插入LPG50208：G342 (Rec-2結構域內)； D518 (RuvC-2與L1之間的邊緣殘基)；Q630 (HNH結構域)；R661 (HNH結構域)；F678 (L-2連接子)；D736 (RuvC-3結構域)；E778 (RuvC-3結構域)；D788 (RuvC-3結構域)；K922 (WED結構域)；以及G1109 (PI結構域)。nAPG05586 G342 IBE (於本文中稱為LPG20016)、D518 IBE (於本文中稱為LPG20017)、Q630 IBE (於本文中稱為LPG20018)、R661 IBE (於本文中稱為LPG20019)、F678 IBE (於本文中稱為LPG20020)、D736 IBE (於本文中稱為LPG20021)、E778 IBE (於本文中稱為LPG20022)、D788 IBE (於本文中稱為LPG20023)、K922 IBE (於本文中稱為LPG20024)及G1109 IBE (於本文中稱為LPG20025)的序列分別如SEQ ID NO：23-32所示。鹼基編輯器在N端及C端處與NLS序列融合。

對於每個nAPG05586 IBE，用已知考慮到APG05586編輯的四個引導(3個靶向B2M及1個靶向TRAC)來測量人類細胞中的編輯效率。IBE及引導RNA作為編碼該IBE及引導RNA的質體被遞送至HEK293T細胞中。

緊接在F678、D736、E778、D788及K922殘基後具有插入的nAPG05586 IBE的編輯率比親代ABE高，K922 IBE具有最大活性(參見圖7A)。其餘的IBE具有比親代ABE低的活性。

圖7B提供每個nAPG05586 IBE在編輯窗(5-24)內的每個腺嘌呤位置的編輯率，位置5-7、9 (也被nAPG05586 E778 IBE高度編輯)及位置24被nAPG05586 F678 IBE編輯最大，以及在位置23處被nAPG05586 F678 IBE編輯最高最大。位置8及10被nAPG05586 G736 IBE編輯最多。位置21及22被nAPG05586 D788 IBE編輯最多，且位置18及23處的最高平均編輯活性是由nAPG05586 D788 IBE進行。位置12-16被nAPG05586 K922 IBE編輯最大，且位置11處的最高平均編輯率及位置18處的最高最大活性是由nAPG05586 K922 IBE進行。範例 5 ： nAPG01604 鑲嵌 鹼基編輯器

親代腺嘌呤鹼基編輯器(ABE；LPG50208-nAPG01604)由LPG50208 (具有V81S 突變的LPG50148；如SEQ ID NO：6所示)及具有D10A突變的APG01604的切口酶版本(如SEQ ID NO：51所示、且最初揭露於WO 2021/217002中，WO 2021/217002藉由引用以其整體被併入本文) 之間的端對端融合產生，且之間具有連接子(L32 連接子序列，如SEQ ID NO：705所示)。基於結構分析選擇IBE的插入位置。

與LPG50208類似但具有額外的A137V突變的LPG50318 (如SEQ ID NO：598所示)緊接在nAPG01604中的下列胺基酸殘基(在N端及C端側翼具有GSSG連接子) (根據 SEQ ID NO：3編號)之後被插入：G597 (被稱為LPG20027或鑲嵌1.1)、S631 (被稱為LPG20028或鑲嵌2.1)、K725 (被稱為LPG20029或鑲嵌3.1)、K739 (被稱為LPG20030或鑲嵌4.1)及V744 (被稱為LPG20031或鑲嵌5.1)。LPG20027、LPG20028、LPG20029、LPG20030及LPG20031的序列分別如SEQ ID NO：34-38所示。鹼基編輯器在N端及C端處與NLS序列融合。

對於每個nAPG01604鑲嵌，使用已知考慮到APG01604編輯的四個引導(3個靶向B2M及1個靶向的TRAC)來測量人類細胞中的編輯效率。IBE及引導RNA作為編碼它們的質體被遞送至HEK293T細胞中。

LPG20029、LPG20030及LPG20031具有比端對端ABE更大的編輯活性，LPG20027及LPG20028展現比端對端ABE低的編輯活性(參見圖8A)。

圖8B提供每個nAPG01604 IBE在編輯窗內腺嘌呤位置5-17處的編輯率，其中排除在這些實驗中未被任何nAPG01604 IBE編輯的位置9。位置8被LPG20029 (鑲嵌3.1；K725)編輯最多。位置6、7及12-14被LPG20030 (鑲嵌4.1；K739) 編輯最多，且位置 16處的最高平均活性是由LPG20030 (鑲嵌4.1；K739)。位置5、10、11、15及17被LPG20031 (鑲嵌5.1；V744)編輯最多，且位置 16處的最高最大活性是由LPG20031 (鑲嵌5.1；V744)。範例 6 ： nLPG10145 鑲嵌 鹼基編輯器

親代腺嘌呤鹼基編輯器(ABE；LPG50208-nLPG10145)由LPG50208 (具有V81S 突變的LPG50148；如SEQ ID NO：6所示)及具有D16A突變的LPG10145的切口酶版本(如SEQ ID NO：52所示、且最初揭露於WO 2023/139557中，WO 2023/139557藉由引用以其整體被併入本文)之間的端對端融合產生。基於結構分析選擇IBE的插入位置。

LPG50208 (SEQ ID NO：6，在N端側翼具有短SGG連接子且在C端側翼具有GGS)緊接在nLPG10145中的下列胺基酸殘基(根據 SEQ ID NO：4編號) 之後被插入：G347 (Rec-2 結構域內)、D524 (RuvC-2與L1之間的邊緣殘基)、Q640 (HNH結構域)、R666 (HNH結構域)、D680 (L-2連接子)、N740 (RuvC-3結構域)、S785 (RuvC-3結構域)、P910 (WED結構域)及G1077 (PI結構域)。LPG10145 G347 IBE (於本文中稱為LPG20032)、D524 IBE (於本文中稱為LPG20033)、Q640 IBE (本文稱為LPG20034)、R666 IBE (於本文中稱為LPG20035)、D680 IBE (於本文中稱為LPG20036)、N740 IBE (於本文中稱為LPG20037)、S785 IBE (於本文中稱為LPG20038)、P910 IBE (本文稱為LPG20039)及G1077 IBE (於本文中稱為LPG20040)的序列分別如SEQ ID NO：40-48所示。

對於每個nLPG10145 IBE，使用已知考慮到LPG10145編輯的四個引導(3個靶向B2M及1個靶向TRAC)來測量人類細胞中的編輯效率。IBE及引導RNA作為編碼該IBE及引導RNA的質體被遞送至HEK293T細胞中。

大部分的nLPG10145 IBE具有比親代ABE大的編輯活性，P910 IBE證明ABE編輯的最高等級(參見圖9A)。Q640 IBE是具有比親代ABE低的活性的唯一測試的LPG10145 IBE。

圖9B提供每個nLPG10145 IBE在編輯窗(5-24)內每個腺嘌呤位置處的編輯率，排除在這些實驗中未被任何nLPG10145 IBE編輯的位置13、16、17、19及23。位置 4被nLPG10145 D680 IBE編輯最多，且位置 18處的最高最大活性及位置21處的最高平均活性由nLPG10145 D680 IBE進行。位置 5被nLPG10145 R666 IBE編輯最多，且位置 6處的最高平均活性由nLPG10145 R666 IBE進行。位置20及22被nLPG10145 S785 IBE編輯最多，且位置 18處的最高平均編輯活性由nLPG10145 S785 IBE進行。位置 24被nLPG10145 D524 IBE編輯最大，且位置 25被nLPG10145 G347 IBE編輯最大。位置 21處的最高最大活性由nLPG10145 G347 IBE進行。位置8-12、14及15被nLPG10145 P910 IBE編輯最多，且位置 6處的最高最大活性由nLPG10145 P910 IBE進行。範例 7 ：腺苷鹼基編輯器 (ABE) 的定向進化以識別具有改善的編輯效率的 ABE

親代ABE (LPG50148-dAPG07433.1)由LPG50148 (如SEQ ID NO：5所示，沒有起始甲硫胺酸，最初揭露於WO 2022/056254，WO 2022/056254藉由引用以其整體被併入本文)與APG07433.1的核酸酶不活化版本(帶有D11A及H604A突變以使RuvC及HNH核酸酶結構域皆不活化) (揭露於WO 2019/236566，WO 2019/236566藉由引用以其整體被併入本文)之間的端對端融合產生。親代LPG50148-dAPG07433.1 ABE用於細菌測定，而LPG50148-nAPG07433.1 ABE用作下述的人類細胞測定中的親代ABE (LPG50148與APG07433.1的D11A 切口酶版本融合)。

為了工程化具有改善活性的第二代ABE，在大腸桿菌中建立能夠定向進化的疊代回合(iterative round)的康黴素選擇系統(圖10A)。此系統基於在康黴素抗性基因內引入終止密碼子使其不活化並使大腸桿菌系胞對康黴素治療敏感。可以靶向ABE變異體庫以編輯終止密碼子內的A鹼基，因此將其轉化成有意義密碼子，其中康黴素抗性基因被重新活化以允許表現活性ABE的任何大腸桿菌細胞存活。這些變異體接著被定序以識別有益的突變，將其提升至在人類細胞中測試。

為了了解可以引導進一步定向進化回合的序列功能關係，設計深度突變的掃描庫，其中LPG50148的每個殘基突變成所有可能的20個胺基酸。使用康黴素選擇系統，使用不同序列上下文 (TAT、CAC及TAG)及增加的嚴格性來進行選擇步驟(圖10B)。在富集步驟後，我們確認藉由增加的抗生素抗性 (MICkan)測得的變異體顯示高至8倍活性改良。定序這些變異體，並識別突變。接著使選自單突變變異體庫的變異體進行人類細胞評估。接下來，在人類細胞中結合並重新評估具有最高人類細胞編輯活性的前導突變(lead mutation)。

當對TAT序列上下文進行在細菌中的選擇時，在富集步驟後識別出32個單突變(表2)。將單突變併入人類密碼子最佳化的LPG50148-nAPG07433.1融合構築體中。藉由在八個內源性基因體位點處編輯 HEK293T 細胞來評估ABE中的這些進化的去胺酶的表現。將顯示最高平均倍數變化的單突變(表3)進行結合並測試以識別最佳比對(top hit)：變異體LPG50148.2.20 (變異體20)、LPG50148.2.60 (變異體60)、LPG50148.2.67 (變異體67)及LPG50148.2.68 (變異體68)，與親代ABE相較下，這些變異體顯示在前間隔序列中的典型位置(A5-A7)處的高約1.6倍的編輯且在非典型位置(A3-A4及A8-A10)處的高約四倍的編輯(圖11)。表 2 ： TAT 單突變

LPG50148 ABE 變異體	SEQ ID NO	與 SEQ ID NO ： 5 (LPG50148) 相關的突變
LPG50148.2.1	300	L35N
LPG50148.2.2	301	R46Q
LPG50148.2.3	302	V68M
LPG50148.2.4	303	V81S
LPG50148.2.5	304	S108H
LPG50148.2.6	305	N121T
LPG50148.2.7	306	F155W
LPG50148.2.8	307	N156R
LPG50148.2.9	308	L162W
LPG50148.2.10	309	L162H
LPG50148.2.25	324	M117I
LPG50148.2.26	325	P138Y
LPG50148.2.27	326	I75W
LPG50148.2.28	327	A160D
LPG50148.2.29	328	M125K
LPG50148.2.30	329	N126A
LPG50148.2.31	330	Q158R
LPG50148.2.32	331	E139L
LPG50148.2.33	332	C145A
LPG50148.2.34	333	L162V
LPG50148.2.35	334	N121E
LPG50148.2.36	335	L120F
LPG50148.2.37	336	P151Q
LPG50148.2.38	337	Y148K
LPG50148.2.39	338	G142K
LPG50148.2.40	339	I165R
LPG50148.2.41	340	N166H
LPG50148.2.42	341	N2C
LPG50148.2.43	342	D23Q
LPG50148.2.44	343	G135H
LPG50148.2.45	344	L137V
LPG50148.2.46	345	L162A

表 3 ： TAT 結合的突變

LPG50148 ABE 變異體	SEQ ID NO	與 SEQ ID NO ： 5 (LPG50148) 相關的突變
LPG50148.2.11	310	L35N、L162W
LPG50148.2.12	311	L35N、R46Q
LPG50148.2.13	312	V81S、N156R、
LPG50148.2.14	313	R46Q、N156R
LPG50148.2.15	314	N156R、L162W
LPG50148.2.16	315	L35N、V81S、L162W
LPG50148.2.17	316	L35N、R46Q、L162W
LPG50148.2.18	317	F155W、N156R、L162W
LPG50148.2.19	318	L35N、N156R、L162W
LPG50148.2.20	319	L35N、V81S、N156R、L162W
LPG50148.2.21	320	V68M、S108H、N156R、L162W
LPG50148.2.22	321	R46Q、V68M、S108H、N156R、L162W
LPG50148.2.23	322	V68M、V81S、S108H、N156R、L162W
LPG50148.2.24	323	L35N、R46Q、V68M、V81S、S108H、F155W、N156R、L162W
LPG50148.2.56	355	V81S、F155W
LPG50148.2.57	356	I75W、V81S
LPG50148.2.58	357	V81S、A160D
LPG50148.2.59	358	V81S、C145A
LPG50148.2.60	359	I75W、F155W
LPG50148.2.61	360	F155W、A60D
LPG50148.2.62	361	C145A、F155W
LPG50148.2.63	362	I75W、A160D
LPG50148.2.64	363	I75W、C145A
LPG50148.2.65	364	C145A、A160D
LPG50148.2.66	365	I75W、V81S、F155W
LPG50148.2.67	366	V81S、F155W、A160D
LPG50148.2.68	367	V81S、C145A、F155W
LPG50148.2.69	368	I75W、V81S、A160D
LPG50148.2.70	369	I75W、V81S、C145A
LPG50148.2.71	370	V81S、C145A、A160D
LPG50148.2.72	371	I75W、F155W、A160D
LPG50148.2.73	372	I75W、C145A、F155W
LPG50148.2.74	373	C145A、F155W、A160D
LPG50148.2.75	374	I75W、C145A、A160D
LPG50148.2.76	375	I75W、V81S、F155W、A160D
LPG50148.2.77	376	I75W、V81S、C145A、F155W
LPG50148.2.78	377	V81S、C145A、F155W、A160D
LPG50148.2.79	378	I75W、V81S、C145A、A160D
LPG50148.2.80	379	I75W、C145A、F155W、A160D
LPG50148.2.81	380	I75W、V81S、C145A、F155W、A160D

當對CAC 序列上下文進行在細菌中的選擇時，在富集步驟後識別出9個單突變(表4)。將單突變併入人類密碼子最佳化的LPG50148-nAPG07433.1融合構築體中。藉由在八個內源性基因體位點處編輯 HEK293T 細胞來評估ABE中的這些進化的去胺酶的表現。將顯示最高平均倍數變化的單突變(表5)進行結合並測試以識別最佳比對：變異體LPG50148.2.106 (變異體106)及LPG50148.2.107 (變異體107) (圖11)。表 4 ： CAC 單突變 表 5 ： CAC 結合的突變

當對TAG 序列上下文進行在細菌中的選擇時，在富集步驟後識別出6個單突變(表6)。將單突變併入人類密碼子最佳化的LPG50148-nAPG07433.1融合構築體中。藉由在三個內源性基因體位點處編輯 HEK293T 細胞來評估ABE中的這些進化的去胺酶的表現。將顯示最高平均倍數變化的單突變(表7)進行結合並測試以識別最佳比對：變異體LPG50148.2.88 (變異體88)及LPG50148.2.103 (變異體103) (圖11)。表 6 ： TAG 單突變 表 7 ： TAG 結合的突變

此外，當作為mRNA構築體被遞送時，進化的LPG50148 ABE變異體LPG50148編號20、60、67、68及69能夠在人類細胞中編輯，其顯示編輯高達~80%且與親代ABE相較下平均改善~1.6 倍(圖12)。

接下來，為了識別具有最強健活性及最高專一性的第二代ABE，藉由一組全面的標的將進化的LPG50148 ABE變異體編號20、60、67、68、103、106及107進行特徵化(表8)。對於所有變異體，觀察到鹼基編輯效率的強健改善(圖13A)。對於所有測試的變異體，平均插入缺失頻率及A至T/C轉換僅略高於背景(0-1%)。包括LPG50148變異體LPG50148.20、LPG50148.67及LPG50148.103的ABE在四十八個基因體位點之間的編輯效率顯著地勝過親代ABE (圖13B)。對於94%的測試的引導，變異體20顯示改善(高達5倍) (表8)。表 8 ：跨 48 個基因體位點的質體遞送後， HEK293T 細胞中的所有 ABE 構築體的 總 A 至 G 置換 (%) 。

與親代ABE (10-21)相較，ABE變異體20、67及103顯示較大的最佳窗(非標的股上PAM 序列的5'端的8-22個核苷酸)，加寬了有效的A鹼基編輯的靶向範圍(圖14)。

此資料集的詳盡分析提供與較佳的5'-NA-3'及5'-AN-3'編輯上下文相關的細節。對於5'NA，對於變異體60為TA＞CA＞＞AA＞GA，且對於所有其他構築體為TA＞CA＞＞GA＞AA。對於所有變異體，5'-AN-3'顯示下列偏好AC＞AT＞＞AG＞AA。

針對TAG上下文，變體67顯示較高編輯，而在所有其他序列上下文下變異體20進行更好(圖15)。

總而言之，這些結果表明更有效的ABE已經由親代ABE (LPG50148-nAPG07433.1)的去胺酶的定向進化而被開發。範例 8 ：植物細胞中 基因編輯活性的證明

使用改寫自Li等人, 2013 ( Nat. Biotech.31:688-691)的操作流程在植物細胞中證明本發明的RGN去胺酶融合蛋白的鹼基編輯活性。簡言之，使用PEG介導的轉化將表現載體引入本塞姆氏煙草( Nicotiana benthamiana)葉肉原生質體中，表現載體包括能夠在植物細胞中表現可操作地連接至SV40核定位訊號(SEQ ID NO：430)的RGN去胺酶融合蛋白的表現匣，以及編碼靶向側翼有合適PAM 序列的植物 PDS基因中的一或更多位點的引導RNA的第二表現匣。轉化的原生質體在黑暗中培養達36小時。使用DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen)從原生質體分離基因體DNA。將RGN標的位點側翼的基因體區域進行PCR擴增，將產物純化，以及在Illumina MiSeq上使用次世代定序分析純化的PCR產物。通常，每個擴增子產生100,000個250 bp的配對端讀段(read) (2 x 100,000個讀段)。使用CRISPResso (Pinello, et al. 2016 Nature Biotech, 34:695-697)分析讀段以計算編輯率。針對特定腺嘌呤突變的引入或INDEL形成，分析輸出比對。範例 9 ：藉由 mRNA 遞送至初代小鼠肝細胞的具有改善的編輯工作的鑲嵌鹼基編輯器

範例 9.1：一小瓶初代小鼠肝細胞在37 °C熱水浴中解凍，並以每孔10k細胞的密度置於平板培養基 (Williams E培養基+胎牛血清+ 雞尾酒A+地塞米松(dexamethasone)；Thermo Fisher)中。在培養箱中4-6小時(37 °C，5% CO2)後，使用Lipofectamine MessengerMAX及2%胎牛血清、以mRNA及sgRNA (1：3 ng比例)脂質轉染細胞。編碼LPG20046 (與nAPG07433.1的N端融合的LPG50148.2.76；如SEQ ID NO：577所示)、LPG20047 (與nAPG07433.1的N端融合的LPG50148.2.20；如SEQ ID NO：578所示)、LPG20123 (插入在nAPG07433.1的S772之後的LPG50148.2.76；如SEQ ID NO：580所示)、或LPG20124 (插入在nAPG07433.1的S772之後的LPG50148.2.20；如SEQ ID NO：579所示)的傳訊RNA與引導RNA一起遞送。第二天，將培養基換成維持培養基(Williams E培養基+雞尾酒B + 地塞米松Thermo Fisher)，並將細胞再培養3天，之後萃取基因體DNA以進行次世代序列(NGS)分析。藉由取得整個標的序列的每個位置處的A至G轉換率來計算標的HAO1基因中的每個位置的鹼基編輯率。結果顯示於表9-13中。表 9 ： LPG50148.2.20 與 nAPG07433.1 的 N 端融合 (LPG20047 ； SEQ ID NO ： 578) 與縮短長度及全長的引導 RNA 的鹼基編輯

SGN	標的中的位置	平均 BE 率
SGN001432	A10	41.1
SGN001432	A3	0.15
SGN001432	A1	0.05
SGN001433	A16	54.05
SGN001433	A9	51.25
SGN001433	A7	4.5
SGN001434	A18	36.35
SGN001434	A11	39
SGN001434	A9	24.85
SGN001434	A2	0
SGN001435	A22	30.95
SGN001435	A15	47.5
SGN001435	A13	44.45
SGN001435	A6	6
SGN008382	A10	43.35
SGN008382	A3	0.15
SGN008382	A1	0
SGN008383	A16	60
SGN008383	A9	65.6
SGN008383	A7	3.85
SGN008384	A18	28.05
SGN008384	A11	32.3
SGN008384	A9	22.1
SGN008384	A2	0
SGN008385	A22	32.95
SGN008385	A15	49.15
SGN008385	A13	43.95
SGN008385	A6	2.7

SGN001432、SGN001433、SGN001434、及SGN001435包含APG07433.1 核酸酶的全長骨架(如SEQ ID NO：693所示)。SGN008382、SGN008383、SGN008384、及SGN008385包含縮短的APG07433.1骨架(如SEQ ID NO：694所示)。當使用具有縮短骨架的SGN時，包含N端融合的LPG50148.2.20與nAPG07433.1的鹼基編輯器在幾個標的的相似位置處保留高度編輯。表 10 ： LPG50148.2.76 與 nAPG07433.1 的 N 端融合 (LPG20046 ； SEQ ID NO ： 577) 與縮短長度及全長的引導 RNA 的鹼基編輯

SGN	位置	平均 BE 率
SGN001432	A10	59.6
SGN001432	A3	0.5
SGN001432	A1	0.05
SGN001433	A16	56.05
SGN001433	A9	53.9
SGN001433	A7	13.9
SGN001434	A18	35.05
SGN001434	A11	39.7
SGN001434	A9	37.05
SGN001434	A2	0
SGN001435	A22	36
SGN001435	A15	40.7
SGN001435	A13	41.85
SGN001435	A6	10.2
SGN008382	A10	67.35
SGN008382	A3	0.35
SGN008382	A1	0.1
SGN008383	A16	62.75
SGN008383	A9	61.85
SGN008383	A7	16.4
SGN008384	A18	38.6
SGN008384	A11	44.65
SGN008384	A9	42.8
SGN008384	A2	0
SGN008385	A22	42.2
SGN008385	A15	48.9
SGN008385	A13	49.4
SGN008385	A6	14

SGN001432、SGN001433、SGN001434、及SGN001435包含 APG07433.1 核酸酶的全長骨架(如SEQ ID NO：693所示)。SGN008382、SGN008383、SGN008384、及SGN008385包含縮短的APG07433.1骨架(如SEQ ID NO：694所示)。當使用具有縮短骨架的SGN時，包含N端融合的LPG50148.2.76與nAPG07433.1的鹼基編輯器在幾個標的的相似位置處保留高度編輯。表 11 ：於 nAPG07433.1 中的 LPG50148.2.20 鑲嵌融合 (LPG20124 ； SEQ ID NO ： 579) 與縮短長度及全長的引導 RNA 的鹼基編輯

SGN	位置	平均 BE 率
SGN001432	A10	33.8
SGN001432	A3	0.05
SGN001432	A1	0
SGN001433	A16	29.05
SGN001433	A9	42
SGN001433	A7	12
SGN001434	A18	16.25
SGN001434	A11	22.85
SGN001434	A9	16.1
SGN001434	A2	0
SGN001435	A22	12.1
SGN001435	A15	42.35
SGN001435	A13	36.75
SGN001435	A6	18.05
SGN008382	A10	38.55
SGN008382	A3	0
SGN008382	A1	0
SGN008383	A16	11.5
SGN008383	A9	18.3
SGN008383	A7	5.8
SGN008384	A18	16.1
SGN008384	A11	22.55
SGN008384	A9	14.2
SGN008384	A2	0
SGN008385	A22	8.85
SGN008385	A15	40.8
SGN008385	A13	34.25
SGN008385	A6	16.8

表 12 ：於 nAPG07433.1 中的 LPG50148.2.76 鑲嵌融合 (LPG20123 ； SEQ ID NO ： 580) 與縮短長度及全長的引導 RNA 的鹼基編輯

SGN	位置	平均 BE 率
SGN001432	A10	31.1
SGN001432	A3	0.25
SGN001432	A1	0
SGN001433	A16	19.1
SGN001433	A9	21.95
SGN001433	A7	16.6
SGN001434	A18	19.95
SGN001434	A11	23.4
SGN001434	A9	18.25
SGN001434	A2	0
SGN001435	A22	38.1
SGN001435	A15	43.55
SGN001435	A13	46.2
SGN001435	A6	33
SGN008382	A10	46.55
SGN008382	A3	0.3
SGN008382	A1	0
SGN008383	A16	25.85
SGN008383	A9	28.9
SGN008383	A7	20.85
SGN008384	A18	28.1
SGN008384	A11	32.45
SGN008384	A9	26.55
SGN008384	A2	0
SGN008385	A22	44.35
SGN008385	A15	50.6
SGN008385	A13	52.7
SGN008385	A6	37.6

藉由鹼基編輯器的mRNA遞送觀察小鼠初代肝細胞中的有效編輯。改善的去胺酶的鑲嵌、N端及C端融合(資料未顯示)是有效的。對於一些標的，去胺酶的N端或C端融合具有比鑲嵌鹼基編輯器設計高的編輯率。此外，所測試的編輯器以縮短長度(M)及全長(F)的引導RNA骨架工作。範例 9.2：藉由PCR反應擴增用於製造mRNA的DNA模板。接著進行IVT (體外轉錄)反應，並隨後進行DNase I及ProK處理以移除DNA模板及酵素。接著，藉由基於平板的二氧化矽膜(plate-based silica membrane)純化mRNA。以mRNA遞送進行劑量反應。透過在小鼠初代肝細胞中經由脂質轉染遞送ABE mRNA及合成的引導RNA，觀察到有效的劑量依賴性編輯。80 ng的引導RNA SGN008393與不同量的mRNA共同轉染。圖16顯示以包括與nAPG07433.1的N端融合的進化的去胺酶LPG50148.2.20 (被稱為如SEQ ID NO：578所示的LPG20047)的鹼基編輯器在位置11處的鹼基編輯結果。LPG20047鹼基編輯器在鹼基編輯器構築體中mRNA劑量較低時是有活性的。範例 10 ：去胺酶 LPG50319 及 LPG50320 的產生，以及位點飽和誘變工程以產生改善的去胺酶 LPG50324

藉由結合範例7中先前描述的大腸桿菌篩選中觀察到的兩個頻繁有益的突變產生去胺酶LPG50319 (本文也稱為LPG50148.2.107且如SEQ ID NO：406所示)及LPG50320 (如SEQ ID NO：596所示)。兩者皆包含V81S突變及在大腸桿菌中對CAC上下文的平行選擇中識別出的第二突變。具體而言，相對於親代LPG50148去胺酶，LPG50319具有M117L (連同V81S)且LPG50320具有V68A (連同V81S)。

在後續進化回合期間，LPG50265 (也稱為LPG50148.2.67，如SEQ ID NO：366所示)用作新的親代去胺酶。經由位點飽和誘變(改變在第一回合中識別的四個熱點位置)以在LPG50265的上方產生組合庫。接著，在大腸桿菌中篩選該庫，導致在高嚴格條件下選擇去胺酶LPG50324 (如SEQ ID NO：597所示)。相對於如SEQ ID NO：5所示的親代LPG50148去胺酶，LPG50324具有七個突變(I75Y、V81S、M117L、N121G、C145L、F155W、及A160D)。

可以在圖17中找到定向進化方案。圖18顯示高於親代LPG50148的改善活性的LPG50324。使用Lipofectamine P3000轉染試劑在以4：1比例的鹼基編輯器質體(160 ng)及引導質體(40 ng)轉染的HEK293T細胞(10K細胞/反應)中進行圖17C中的實驗。LPG50148、LPG50265、LPG50321、LPG50322、LPG50323、及LPG50324的序列分別如SEQ ID NO：5、366、720、721、722、及597所示，且鹼基編輯器構築體分別命名為LPG50148_nAPG07433.1、LPG20130、LPG20126、LPG20127、LPG20128、及LPG20129，其包括與nAPG07433.1切口酶N端融合的去胺酶。在轉染48小時後收穫細胞，並使用QuickExtract DNA萃取溶液使收穫的細胞進行基因體DNA萃取。藉由PCR擴增sgRNA靶向的基因體區域，且隨後藉由NGS分析PCR擴增子以評估編輯效率。圖18的實驗在範例11中描述的初代人類肝細胞中進行。

使用mRNA遞送對人類初代T細胞中的幾個nAPG07433.1-ABE變異體進行鹼基編輯效率的分析。簡而言之，由兩位不同的科學家將單獨的六小瓶T細胞(供體-008)解凍、活化、並在三個獨立的燒瓶中培養。活化三天後，使用EO-115程序以P3溶液中的2 µg mRNA + 4 µg sgRNA對每條件30K個細胞進行核轉染。針對每個ABE變異體，對靶向五個不同基因的總共十個引導RNA進行測試。進行每條件三重複以評估再現性。核轉染四天後，收穫細胞，並使用QuickExtract進行基因體DNA萃取。中靶(on-target)及預測的脫靶(off-target)編輯藉由相關基因體座的PCR擴增確定、並藉由Illumina短讀段定序進行定序。

藉由取得整個引導中每個位置處的A至G轉換率及獲得單一位置處的最大編輯率來計算最大鹼基編輯率(最大BE率)。總腺嘌呤取代率(總A取代率)計算包含至少一腺嘌呤至鳥嘌呤編輯的讀段的百分比。

注意，LPG50148.2.4、LPG50148.2.20、LPG50148.2.24、LPG50148.2.27、LPG50148.2.60、LPG50148.2.67、LPG50148.2.68、LPG50148.2.76、LPG50148.2.103、LPG50148.2.106、及LPG50148.2.107在表14-18以及此範例與範例11-14中被引用為替代的名稱。替代的名稱列於表13中。表 13 ：各種 LPG50148 變異體的替代命名

LPG5014.2.__ 命名	替代命名
LPG50148.2.4	LPG50208
LPG50148.2.20	LPG50221
LPG50148.2.24	LPG50225
LPG50148.2.27	LPG50228
LPG50148.2.60	LPG50258
LPG50148.2.67	LPG50265
LPG50148.2.68	LPG50266
LPG50148.2.76	LPG50274
LPG50148.2.103	LPG50432
LPG50148.2.106	LPG50298
LPG50148.2.107	LPG50319

表 14 ：進化的去胺酶及不同的融合蛋白架構在 nAPG07433.1 上的表現

去胺酶	核酸酶	融合蛋白	融合類型	SGN	標的基因	最大 BE 率的平均	平均總 A 取代率
LPG50148	nAPG07433.1	LPG20048	N端	SGN001256	B2M	41.53	58.85
LPG50148	nAPG07433.1	LPG20048	N端	SGN001947	B2M	6.77	13.51
LPG50148	nAPG07433.1	LPG20048	N端	SGN001960	B2M	68.56	84.98
LPG50148	nAPG07433.1	LPG20048	N端	SGN002259	基因A	3.37	9.73
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LPG50228	nAPG07433.1	LPG20054	N端	SGN002352	基因C	5.93	16.10
LPG50228	nAPG07433.1	LPG20054	N端	SGN002364	基因C	11.30	22.60
LPG50228	nAPG07433.1	LPG20054	N端	SGN002372	基因D	92.93	92.90
LPG50228	nAPG07433.1	LPG20054	N端	SGN003707	B2M	59.07	85.55
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LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN002259	基因A	9.05	18.30
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN002336	基因B	20.69	29.30
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN002352	基因C	10.16	20.44
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN002364	基因C	17.88	30.49
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN002372	基因D	91.23	91.35
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN003707	B2M	66.88	89.93
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20050	N端	SGN004995	TRAC	63.01	79.26
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN001256	B2M	68.24	77.48
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN001947	B2M	25.92	41.71
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN001960	B2M	80.60	89.41
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN002259	基因A	10.87	21.96
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN002336	基因B	25.74	35.68
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN002352	基因C	14.94	29.13
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN002364	基因C	30.27	45.68
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN002372	基因D	92.44	92.48
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN003707	B2M	66.50	87.30
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20052	N端	SGN004995	TRAC	71.76	87.15
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN001256	B2M	30.63	41.77
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN001947	B2M	8.61	14.77
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN001960	B2M	47.26	56.96
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN002259	基因A	2.17	5.66
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN002336	基因B	13.70	15.70
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN002352	基因C	1.92	7.26
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN002364	基因C	6.74	10.08
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN002372	基因D	65.57	68.73
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN003707	B2M	65.74	77.06
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20044	鑲嵌642	SGN004995	TRAC	35.32	42.38
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN001256	B2M	51.13	67.01
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN001947	B2M	26.41	38.61
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN001960	B2M	62.45	76.35
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN002259	基因A	8.83	13.31
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN002336	基因B	41.31	42.73
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN002352	基因C	10.55	20.54
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN002364	基因C	13.06	19.86
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN002372	基因D	59.43	69.72
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN003707	B2M	54.69	78.24
LPG50208	nAPG07433.1	LPG20045	鑲嵌772	SGN004995	TRAC	23.91	36.30
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN001256	B2M	49.72	69.98
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN001947	B2M	16.43	27.75
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN001960	B2M	79.19	90.04
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN002259	基因A	8.02	16.08
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN002336	基因B	17.98	24.01
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN002352	基因C	8.59	17.19
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN002364	基因C	12.70	21.45
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN002372	基因D	93.64	94.06
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN003707	B2M	72.08	87.28
LPG50258	nAPG07433.1	LPG20055	N端	SGN004995	TRAC	58.38	73.39
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN001256	B2M	57.15	75.17
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN001947	B2M	18.53	26.03
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN001960	B2M	84.92	91.62
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN002259	基因A	4.78	11.81
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN002336	基因B	17.47	23.35
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN002352	基因C	12.52	20.04
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN002364	基因C	20.84	30.75
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN002372	基因D	93.50	93.87
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN003707	B2M	78.08	88.84
LPG50265	nAPG07433.1	LPG20056	N端	SGN004995	TRAC	60.61	74.03
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN001256	B2M	60.11	76.46
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN001947	B2M	21.46	30.74
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN001960	B2M	85.45	91.38
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN002259	基因A	6.64	14.43
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN002336	基因B	16.18	24.13
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN002352	基因C	13.47	21.35
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN002364	基因C	19.03	27.85
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN002372	基因D	92.69	92.98
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN003707	B2M	76.91	89.70
LPG50266	nAPG07433.1	LPG20057	N端	SGN004995	TRAC	63.19	77.50
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN001256	B2M	79.31	85.78
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN001947	B2M	45.61	64.55
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN001960	B2M	84.21	87.08
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN002259	基因A	20.63	32.57
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN002336	基因B	41.81	49.88
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN002352	基因C	26.46	38.98
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN002364	基因C	35.49	42.45
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN002372	基因D	88.66	89.07
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN003707	B2M	86.65	89.38
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20049	N端	SGN004995	TRAC	76.68	82.52

藉由在初代T細胞中的mRNA遞送，進化變異體證明活性平均增加達50%。一些架構具有引導特定功效，其指出特定標的序列與鹼基編輯器結構之間的關係存在且在實驗測試之前是不明顯的。表14的結果證明藉由在T細胞中的mRNA遞送的具有包括與nAPG07433.1的N端融合的LPG50274/LPG50148.2.76（平均排名最高）的LPG20049融合蛋白的進化的ABE變異體的A至G編輯活性增加達50%。範例 11 ：遞送至初代人類肝細胞的 mRNA 的進化 方法：

使用先前測試的鑲嵌及末端融合架構，將進化的去胺酶與RNA引導的核酸酶結合以產生不同的腺嘌呤鹼基編輯器。藉由PCR反應擴增用於製造mRNA的DNA模板。接著進行IVT (體外轉錄)反應、並隨後進行DNase I及ProK處理以移除DNA模板及酵素。接著藉由基於平板的二氧化矽膜純化mRNA。使用Lipofectamine MessengerMax轉染試劑、以ABE mRNA及引導RNA (ABE mRNA：112 ng；sgRNA：38 ng)轉染初代人類肝細胞。在轉染96小時後收穫細胞，並使用QuickExtract DNA萃取溶液使收穫的細胞進行基因體DNA萃取。藉由PCR擴增sgRNA靶向的基因體區域，且隨後藉由NGS分析PCR擴增子以評估編輯效率。藉由取得整個引導中每個位置處的腺嘌呤至鳥嘌呤的轉換率及獲得單一位置處的最大編輯率來計算最大鹼基編輯率(最大編輯)。表 15 ：初代人類肝細胞中具有不同融合結構的多個 RNA 引導的核酸酶中的進化去胺酶的鹼基編輯率

去胺酶	核酸酶	融合構築體	融合 SEQ ID NO	融合類型	基因	SGN	最大編輯
LPG50221	nAPG07433.1	LPG20047	578	N端	B2M	SGN003707	21
LPG50221	nAPG07433.1	LPG20073	612	鑲嵌772	B2M	SGN003707	26.3
LPG50221	nLPG10145	LPG20068	607	N端	B2M	SGN003018	21.9
LPG50221	nLPG10145	LPG20064	603	鑲嵌910	B2M	SGN003018	24.5
LPG50221	nAPG05586	LPG20072	611	N端	B2M	SGN003540	16.1
LPG50221	nAPG05586	LPG20076	615	鑲嵌678	B2M	SGN003540	13.7
LPG50221	nAPG05586	LPG20063	640	鑲嵌922	B2M	SGN003540	19.8
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20046	638	N端	B2M	SGN003707	20.8
LPG50274	nAPG07433.1	LPG20067	606	鑲嵌772	B2M	SGN003707	19.6
LPG50274	nLPG10145	LPG20074	613	N端	B2M	SGN003018	19.2
LPG50274	nLPG10145	LPG20062	600	鑲嵌910	B2M	SGN003018	22.7
LPG50274	nAPG05586	LPG20069	608	N端	B2M	SGN003540	16.2
LPG50274	nAPG05586	LPG20071	610	鑲嵌678	B2M	SGN003540	11.3
LPG50274	nAPG05586	LPG20061	642	鑲嵌922	B2M	SGN003540	16.4
LPG50319	nAPG07433.1	LPG20077	616	N端	B2M	SGN003707	28.3
LPG50319	nAPG07433.1	LPG20096	630	鑲嵌772	B2M	SGN003707	25.5
LPG50319	nLPG10145	LPG20094	628	N端	B2M	SGN003018	26.6
LPG50319	nLPG10145	LPG20087	621	鑲嵌910	B2M	SGN003018	42.8
LPG50319	nAPG05586	LPG20091	625	N端	B2M	SGN003540	21.6
LPG50319	nAPG05586	LPG20083	617	鑲嵌678	B2M	SGN003540	12.6
LPG50319	nAPG05586	LPG20089	623	鑲嵌922	B2M	SGN003540	19
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20065	636	N端	B2M	SGN003707	18.3
LPG50320	nAPG07433.1	LPG20097	631	鑲嵌772	B2M	SGN003707	22.4
LPG50320	nLPG10145	LPG20084	618	N端	B2M	SGN003018	31.9
LPG50320	nLPG10145	LPG20090	624	鑲嵌910	B2M	SGN003018	34.9
LPG50320	nAPG05586	LPG20093	627	N端	B2M	SGN003540	21.7
LPG50320	nAPG05586	LPG20086	620	鑲嵌678	B2M	SGN003540	13.8
LPG50320	nAPG05586	LPG20092	626	鑲嵌922	B2M	SGN003540	21.6
LPG50324	nAPG07433.1	LPG20066	637	N端	B2M	SGN003707	22.1
LPG50324	nAPG07433.1	LPG20098	632	鑲嵌772	B2M	SGN003707	19.5
LPG50324	nLPG10145	LPG20095	629	N端	B2M	SGN003018	20.3
LPG50324	nLPG10145	LPG20088	622	鑲嵌910	B2M	SGN003018	38.9
LPG50324	nAPG05586	LPG20070	609	N端	B2M	SGN003540	16.9
LPG50324	nAPG05586	LPG20085	619	鑲嵌678	B2M	SGN003540	17.4
LPG50324	nAPG05586	LPG20075	614	鑲嵌922	B2M	SGN003540	28

藉由鹼基編輯器的mRNA遞送觀察人類初代肝細胞中的有效編輯。改善的去胺酶的鑲嵌及N端融合對於3個獨特的核酸酶(nAPG07433.1、nAPG05586及nLPG10145)皆是有效的。範例 12 ： HepG2 細胞中的編輯

使用Lipofectamine MessengerMax轉染試劑以3：1比例的ABE mRNA及引導RNA (ABE mRNA：150 ng及sgRNA：50 ng)轉染HepG2細胞。在轉染48小時後收穫細胞，並使用QuickExtract DNA萃取溶液使收穫的細胞進行基因體DNA萃取。藉由PCR擴增sgRNA靶向的基因體區域，且隨後藉由NGS分析PCR擴增子以評估編輯效率。藉由取得整個引導中每個位置處的腺嘌呤至鳥嘌呤的轉換率、並獲得單一位置處的最大編輯率來計算最大鹼基編輯率(最大編輯)。表 16 ： HepG2 細胞中與 nAPG07433.1 的胺基端融合的進化的去胺酶的鹼基編輯率

去胺酶	融合構築體	融合類型	SGN	標的基因	平均最大 BE 率
LPG50148	LPG20048	N端	SGN003707	B2M	36.625
LPG50148	LPG20048	N端	SGN00AAAA	基因E	46.4125
LPG50148	LPG20048	N端	SGN008971	TRAC	15.975
LPG50221	LPG20051	N端	SGN003707	B2M	40.9
LPG50221	LPG20051	N端	SGN00AAAA	基因E	32.925
LPG50221	LPG20051	N端	SGN008971	TRAC	9.65
LPG50208	LPG20050	N端	SGN003707	B2M	54.65
LPG50208	LPG20050	N端	SGN00AAAA	基因E	53.675
LPG50208	LPG20050	N端	SGN008971	TRAC	18.05
LPG50320	LPG20065	N端	SGN003707	B2M	57.9
LPG50320	LPG20065	N端	SGN00AAAA	基因E	59
LPG50320	LPG20065	N端	SGN008971	TRAC	17.55
LPG50324	LPG20066	N端	SGN003707	B2M	59.9
LPG50324	LPG20066	N端	SGN00AAAA	基因E	54.775
LPG50324	LPG20066	N端	SGN008971	TRAC	11.45
LPG50274	LPG20046	N端	SGN003707	B2M	73.3
LPG50274	LPG20046	N端	SGN00AAAA	基因E	56.85
LPG50274	LPG20046	N端	SGN008971	TRAC	16.95

表 17 ： HepG2 細胞中具有不同融合結構的 nAPG05586 中的進化的去胺酶的鹼基編輯率

去胺酶	融合蛋白	融合類型	SGN	標的基因	平均 BE 最大值
LPG50221	LPG20076	鑲嵌678	SGN003486	TRAC	17.6
LPG50221	LPG20076	鑲嵌678	SGN003540	B2M	20.65
LPG50274	LPG20063	鑲嵌922	SGN003486	TRAC	37.3666667
LPG50274	LPG20063	鑲嵌922	SGN003540	B2M	44.2
LPG50221	LPG20071	鑲嵌678	SGN003486	TRAC	30.25
LPG50221	LPG20071	鑲嵌678	SGN003540	B2M	31.15
LPG50274	LPG20061	鑲嵌922	SGN003486	TRAC	54.0333333
LPG50274	LPG20061	鑲嵌922	SGN003540	B2M	67.6

用於nAPG05586及nAPG07433.1與前導去胺酶的鑲嵌構型能夠以mRNA遞送在HepG2細胞中編輯。範例 13 ： nLPG10196 N 端融合及具有進化去胺酶的鑲嵌鹼基編輯器功能

基於序列及結構分析，除了N端融合之外，還製備nLPG10196的四個鑲嵌構築體。表現及純化傳訊RNA以用於LPG10196鹼基編輯器構築體。簡而言之，用於製造mRNA的DNA模板是藉由PCR反應擴增。接著進行IVT (體外轉錄)反應、且接著進行DNase I以及ProK處理以移除DNA模板及酵素。接著藉由基於平盤的矽膠膜純化mRNA。針對鹼基編輯，以MessengerMax將150 ng mRNA以及50 ng sgRNA (合成的引導)脂質轉染到以10,000 細胞/孔接種的HEK293T細胞中。將細胞培養三天且接著萃取基因體DNA。使用PCR擴增來擴增感興趣的編輯區域並送至NGS定序。藉由取得整個引導中每個位置處的腺嘌呤至鳥嘌呤的轉換率、並獲得單一位置的最大編輯率來計算最大鹼基編輯率(Max BE Rate)。表 18 ：藉由 mRNA 遞送的 HEK293T 細胞中的 nLPG10196 鹼基編輯器功能

去胺酶	融合位置	融合蛋白	SGN	標的基因	平均最大 BE 率
LPG50221	N-端	LPG20099	SGN005326	TRAC	5.750%
LPG50221	N-端	LPG20099	SGN005329	B2M	0.000%
LPG50274	N-端	LPG20100	SGN005326	TRAC	3.034%
LPG50274	N-端	LPG20100	SGN005329	B2M	0.124%
LPG50324	N-端	LPG20101	SGN005326	TRAC	8.132%
LPG50324	N-端	LPG20101	SGN005329	B2M	0.080%
LPG50319	N-端	LPG20102	SGN005326	TRAC	5.996%
LPG50319	N-端	LPG20102	SGN005329	B2M	0.208%
LPG50274	鑲嵌T806	LPG20111	SGN005326	TRAC	3.018%
LPG50274	鑲嵌 T806	LPG20111	SGN005329	B2M	0.000%
LPG50274	鑲嵌 D700	LPG20120	SGN005326	TRAC	0.000%
LPG50274	鑲嵌 D700	LPG20120	SGN005329	B2M	0.000%
LPG50274	鑲嵌 I797	LPG20121	SGN005326	TRAC	0.057%
LPG50274	鑲嵌I797	LPG20121	SGN005329	B2M	0.000%
LPG50274	鑲嵌 G766	LPG20122	SGN005326	TRAC	4.263%

數個去胺酶作為融合至nLPG10196的N端。測試數個鑲嵌位置，但僅有兩個鑲嵌位置顯示對上述背景(LPG20122及LPG20111)的編輯，表示LPG10196對鑲嵌鹼基編輯器構築體具有位點特定要求。與具有所有測試的去胺酶的SGN005326相較，SGN005329處的N端融合顯示出更高的編輯。LPG10196 能夠利用進化的去胺酶進行鹼基編輯活動，但有影響鹼基編輯率的標的特定及去胺酶特定因素。範例 14 ： LPG50310 變異體的發現與評估

從第一輪選擇中鑑定出分佈在 28 個位置的 38 個有益突變。將這些突變合併38，以形成每個變異體有1-28個突變(平均19個突變)的庫。隨後，此庫接受更嚴格的選擇條件，利用 256-512µg /ml 的康黴素濃度以及兩個終止密碼子，以鑑定最有希望的變異體。其中，發現了一種特別富集的變體LPG50310 (如SEQ ID NO：723所示)，然後在哺乳動物細胞中對其進行評估。使用 Lipofectamine P3000 轉染試劑，在以 4:1 比例轉染鹼基編輯器質體 (160 ng)及引導質體 (40 ng) 的HEK293T細胞 (10K 細胞/反應)中進行評估。鹼基編輯器序列如SEQ ID NO：727所示並命名為LPG20125，其包含與nAPG07433.1切口酶的N端融合的LPG50310去胺酶。轉染後 48 小時收集細胞並使用 QuickExtract DNA 萃取溶液進行基因體 DNA 萃取。藉由PCR擴增sgRNA靶向的基因體區域，隨後藉由NGS分析PCR擴增子以評估編輯效率。結果顯示於圖19，其比較了使用sgRNA SGN00CCCC、SGN005430 及SGN005420 (每個分別靶向位置 A6、A9 及 A10 的一不同基因)編輯的鹼基編輯器LPG20130 (包含與nAPG07433.1的N端融合的LPG50265去胺酶)與LPG20125 (包含與nAPG07433.1的N端融合的LPG50310)。表 19. 目前揭露的進化的去胺酶內與親代 LPG50148 去胺酶 (SEQ ID NO: 5) 有關的其他突變

R22C	I75A	I75Q
I75Y	K109L	N121A
N121G	Y122H	G142A
C145Q	C145L	Q153E
Q153R

表 20. 申請案的序列

序列名稱	SEQ ID NO
APG07433.1	1
APG05586	2
APG01604	3
LPG10145	4
LPG50148 (減去起始甲硫胺酸)	5
LPG50148 V81S (減去起始甲硫胺酸)	6
LPG50148_nAPG07433.1_親代	7
nAPG07433.1_鑲嵌S772_LPG50148 (LPG20002)	8
nAPG07433.1_鑲嵌S775_LPG50148 (LPG20003)	9
nAPG07433.1_鑲嵌K778_LPG50148 (LPG20004)	10
nAPG07433.1_鑲嵌E900_LPG50148 (LPG20005)	11
nAPG07433.1_鑲嵌G910_LPG50148 (LPG20006)	12
nAPG07433.1_鑲嵌R30_LPG50148 (LPG20007)	13
nAPG07433.1_鑲嵌T642_LPG50148 (LPG20008)	14
nAPG07433.1_鑲嵌R670_LPG50148 (LPG20009)	15
nAPG07433.1_鑲嵌D737_LPG50148 (LPG20010)	16
nAPG07433.1_鑲嵌A802_LPG50148 (LPG20011)	17
nAPG07433.1鑲嵌S772_LPG50148 (delNterlinker/ LPG20012)	18
nAPG07433.1_鑲嵌S772LPG50148 (delCterlinker/ LPG20013)	19
nAPG07433.1鑲嵌S772LPG50148_del1aaNandC (nolinker/1aaNandC/ LPG20014)	20
nAPG07433.1_鑲嵌S772_LPG50148+V81S突變體 (LPG20015)	21
LPG50148+V81S _nAPG05586_親代	22
nAPG05586_鑲嵌G342_LPG50148+V81S (LPG20016)	23
nAPG05586_鑲嵌D518_LPG50148+V81S (LPG20017)	24
nAPG05586_鑲嵌Q630_LPG50148+V81S (LPG20018)	25
nAPG05586_鑲嵌R661_LPG50148+V81S (LPG20019)	26
nAPG05586_鑲嵌F678_LPG50148+V81S (LPG20020)	27
nAPG05586_鑲嵌D736_LPG50148+V81S (LPG20021)	28
nAPG05586_鑲嵌E778_LPG50148+V81S (LPG20022)	29
nAPG05586_鑲嵌D788_LPG50148+V81S (LPG20023)	30
nAPG05586_鑲嵌K922_LPG50148+V81S (LPG20024)	31
nAPG05586_鑲嵌G1109_LPG50148+V81S (LPG20025)	32
LPG50148+V81S _nAPG01604_親代	33
nAPG01604_鑲嵌G597_LPG50148+V81S+A137V (LPG20027)	34
nAPG01604_鑲嵌S631_LPG50148+V81S+A137V (LPG20028)	35
nAPG01604_鑲嵌K725_LPG50148+V81S+A137V (LPG20029)	36
nAPG01604_鑲嵌K739_LPG50148+V81S+A137V (LPG20030)	37
nAPG01604_鑲嵌V744_LPG50148+V81S+A137V (LPG20031)	38
LPG50148+V81S_nLPG10145_親代	39
nLPG10145_鑲嵌G347_LPG50148+V81S (LPG20032)	40
nLPG10145_鑲嵌D524_LPG50148+V81S (LPG20033)	41
nLPG10145_鑲嵌Q640_LPG50148+V81S (LPG20034)	42
nLPG10145_鑲嵌R666_LPG50148+V81S (LPG20035)	43
nLPG10145_鑲嵌D680_LPG50148+V81S (LPG20036)	44
nLPG10145_鑲嵌N740_LPG50148+V81S (LPG20037)	45
nLPG10145_鑲嵌S785_LPG50148+V81S (LPG20038)	46
nLPG10145_鑲嵌P910_LPG50148+V81S (LPG20039)	47
nLPG10145_鑲嵌G1077_LPG50148+V81S (LPG20040)	48
nAPG07433.1 (D11A)	49
nAPG05586 (D11A)	50
nAPG01604 (D11A)	51
nLPG10145 (D11A)	52
nAPG05586 (H840A)	53
nAPG01604 (H840A)	54
nLPG10145 (H840A)	55
nAPG07433.1 (H840A)	56
APG08290.1	57
APG05459.1	58
APG007513.1	59
APG05083.1	60
APG04583.1	61
APG01688.1	62
APG00969	63
APG03128	64
APG00771	65
APG05733	66
APG06207	67
APG01647	68
APG08032	69
APG05712	70
APG01658	71
APG06498	72
APG09882	73
APG02675	74
APG01405	75
APG06250	76
APG06877	77
APG09053	78
APG04293	79
APG01308	80
APG06646	81
APG06622	82
APG02787	83
APG06248	84
APG06007	85
APG02874	86
APG03850	87
APG07553	88
APG03031	89
APG09208	90
APG08770	91
APG08167	92
APG03021	93
APG06015	94
APG09344	95
APG07991	96
APG01868	97
APG02998	98
APG09298	99
APG06251	100
APG03066	101
APG01560	102
APG02777	103
APG05761	104
APG02479	105
APG08385	106
APG09217	107
APG06657	108
LPG10134	109
LPG10136	110
LPG10138	111
LPG10139	112
LPG10141	113
LPG10146	114
LPG10147	115
LPG10150	116
LPG10155	117
LPG10159	118
LPG10160	119
LPG10165	120
LPG10166	121
LPG10167	122
LPG10168	123
LPG10169	124
LPG10171	125
LPG10186	126
LPG10190	127
LPG10191	128
LPG10194	129
LPG10195	130
LPG10196	131
LPG10197	132
LPG10198	133
LPG10200	134
LPG10203	135
LPG10204	136
LPG10205	137
LPG10207	138
LPG10208	139
APG09748	140
APG02789	141
APG09106	142
APG07339	143
APG09624	144
APG03003	145
APG05405	146
APG09777	147
APG05680	148
APG02119	149
APG03285	150
APG04998	151
APG07078	152
APG06369	153
APG03847	154
APG05625	155
APG03759	156
APG05123	157
APG03524	158
APG07446	159
APG07641	160
APG01250	161
APG02261	162
LPG10134 crRNA 重複子	163
LPG10136 crRNA重複子	164
LPG10138 crRNA重複子	165
LPG10139 crRNA重複子	166
LPG10141 crRNA重複子	167
LPG10145 crRNA重複子	168
LPG10146 crRNA重複子	169
LPG10147 crRNA重複子	170
LPG10150 crRNA重複子	171
LPG10155 crRNA重複子	172
LPG10159 crRNA重複子	173
LPG10160 crRNA重複子	174
LPG10134 tracrRNA	175
LPG10136 tracrRNA	176
LPG10138 tracrRNA	177
LPG10139 tracrRNA	178
LPG10141 tracrRNA	179
LPG10145 tracrRNA	180
LPG10146 tracrRNA	181
LPG10147 tracrRNA	182
LPG10150 tracrRNA	183
LPG10155 tracrRNA	184
LPG10159 tracrRNA	185
LPG10160 tracrRNA	186
LPG10165 crRNA重複子	187
LPG10166 crRNA重複子	188
LPG10167 crRNA重複子	189
LPG10168 crRNA重複子	190
LPG10169 crRNA重複子	191
LPG10171 crRNA重複子	192
LPG10186 crRNA重複子	193
LPG10190 crRNA重複子	194
LPG10191 crRNA重複子	195
LPG10194 crRNA重複子	196
LPG10195 crRNA重複子	197
LPG10196 crRNA重複子	198
LPG10197 crRNA重複子	199
LPG10198 crRNA重複子	200
LPG10200 crRNA重複子	201
LPG10203 crRNA重複子	202
LPG10204 crRNA重複子	203
LPG10205 crRNA重複子	204
LPG10205 crRNA重複子2	205
LPG10207 crRNA重複子	206
LPG10208 crRNA重複子	207
LPG10165 tracrRNA	208
LPG10166 tracrRNA	209
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LPG10194 tracrRNA	217
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LPG10196 tracrRNA	219
LPG10197 tracrRNA	220
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LPG10200 tracrRNA	222
LPG10203 tracrRNA	223
LPG10204 tracrRNA	224
LPG10205 tracrRNA	225
LPG10205 tracrRNA2	226
LPG10207 tracrRNA	227
LPG10208 tracrRNA	228
APG05241	229
APG07280	230
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APG09980	233
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APG30126	240
APG30127	241
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APG09949	250
APG08196	251
APG06333	252
APG06489	253
APG08449	254
APG05174	255
APG09102	256
APG05723	257
LPG50140	258
LPG50141	259
LPG50142	260
LPG50143	261
LPG50144	262
LPG50145	263
LPG50146	264
LPG50147	265
LPG50149	266
LPG50150	267
LPG50151	268
LPG50152	269
LPG50153	270
LPG50154	271
LPG50155	272
LPG50156	273
LPG50157	274
LPG50158	275
LPG50159	276
LPG50160	277
LPG50161	278
LPG50162	279
LPG50163	280
LPG50164	281
LPG50165	282
LPG50166	283
LPG50167	284
LPG50168	285
LPG50169	286
LPG50170	287
LPG50171	288
LPG50172	289
LPG50173	290
LPG50174	291
LPG50175	292
LPG50176	293
LPG50177	294
LPG50178	295
LPG50179	296
LPG50180	297
LPG50181	298
LPG50182	299
LPG50148.2.1	300
LPG50148.2.2	301
LPG50148.2.3	302
LPG50148.2.4	303
LPG50148.2.5	304
LPG50148.2.6	305
LPG50148.2.7	306
LPG50148.2.8	307
LPG50148.2.9	308
LPG50148.2.10	309
LPG50148.2.11	310
LPG50148.2.12	311
LPG50148.2.13	312
LPG50148.2.14	313
LPG50148.2.15	314
LPG50148.2.16	315
LPG50148.2.17	316
LPG50148.2.18	317
LPG50148.2.19	318
LPG50148.2.20	319
LPG50148.2.21	320
LPG50148.2.22	321
LPG50148.2.23	322
LPG50148.2.24	323
LPG50148.2.25	324
LPG50148.2.26	325
LPG50148.2.27	326
LPG50148.2.28	327
LPG50148.2.29	328
LPG50148.2.30	329
LPG50148.2.31	330
LPG50148.2.32	331
LPG50148.2.33	332
LPG50148.2.34	333
LPG50148.2.35	334
LPG50148.2.36	335
LPG50148.2.37	336
LPG50148.2.38	337
LPG50148.2.39	338
LPG50148.2.40	339
LPG50148.2.41	340
LPG50148.2.42	341
LPG50148.2.43	342
LPG50148.2.44	343
LPG50148.2.45	344
LPG50148.2.46	345

LPG50148.2.47	346
LPG50148.2.48	347
LPG50148.2.49	348
LPG50148.2.50	349
LPG50148.2.51	350
LPG50148.2.52	351
LPG50148.2.53	352
LPG50148.2.54	353
LPG50148.2.55	354
LPG50148.2.56	355
LPG50148.2.57	356
LPG50148.2.58	357
LPG50148.2.59	358
LPG50148.2.60	359
LPG50148.2.61	360
LPG50148.2.62	361
LPG50148.2.63	362
LPG50148.2.64	363
LPG50148.2.65	364
LPG50148.2.66	365
LPG50148.2.67	366
LPG50148.2.68	367
LPG50148.2.69	368
LPG50148.2.70	369
LPG50148.2.71	370
LPG50148.2.72	371
LPG50148.2.73	372
LPG50148.2.74	373
LPG50148.2.75	374
LPG50148.2.76	375
LPG50148.2.77	376
LPG50148.2.78	377
LPG50148.2.79	378
LPG50148.2.80	379
LPG50148.2.81	380
LPG50148.2.82	381
LPG50148.2.83	382
LPG50148.2.84	383
LPG50148.2.85	384
LPG50148.2.86	385
LPG50148.2.87	386
LPG50148.2.88	387
LPG50148.2.89	388
LPG50148.2.90	389
LPG50148.2.91	390
LPG50148.2.92	391
LPG50148.2.93	392
LPG50148.2.94	393
LPG50148.2.95	394
LPG50148.2.96	395
LPG50148.2.97	396
LPG50148.2.98	397
LPG50148.2.99	398
LPG50148.2.100	399
LPG50148.2.101	400
LPG50148.2.102	401
LPG50148.2.103	402
LPG50148.2.104	403
LPG50148.2.105	404
LPG50148.2.106	405
LPG50148.2.107 (也稱為LPG50319)	406
LPG50148.2.108	407
LPG50148.2.109	408
LPG50148.2.110	409
LPG50148.2.111	410
LPG50148.2.112	411
LPG50148.2.113	412
LPG50148.2.114	413
LPG50148.2.115	414
化膿鏈球菌 ( Streptococcus pyogenes) Cas9	415
APG07433.1 crRNA重複子	416
APG07433.1 tracrRNA	417
APG07433.1 PAM	418
APG05586 crRNA重複子	419
APG05586 tracrRNA	420
APG05586 PAM	421
APG01604 crRNA重複子	422
APG01604 tracrRNA	423
APG01604 PAM	424
LPG10145 crRNA重複子	425
LPG10145 tracrRNA	426
LPG10145 PAM	427
nAPG07433.1_HNH取代_LPG50148 (LPG20001)	428
nAPG07433.1_鑲嵌S772LPG50148 (Nolinker/ LPG20041)	429
SV40 NLS	430
核質蛋白(Nucleoplasmin) NLS	431
APG05083.1 crRNA重複子	432
APG05083.1 tracrRNA	433
APG05083.1 PAM	434
APG07513.1	435
APG07513.1 crRNA重複子	436
APG07513.1 tracrRNA	437
APG07513.1 PAM	438
APG08290.1 crRNA重複子	439
APG08290.1 tracrRNA	440
APG08290.1 PAM	441
APG05459.1 crRNA重複子	442
APG05459.1 tracrRNA	443
APG05459.1 PAM	444
APG04583.1 crRNA重複子	445
APG04583.1 tracrRNA	446
APG04583.1 PAM	447
APG01688.1 crRNA重複子	448
APG01688.1 tracrRNA	449
APG01688.1 PAM	450
APG00969 crRNA重複子	451
APG00969 tracrRNA	452
APG00969 PAM	453
APG03128 crRNA重複子	454
APG03128 tracrRNA	455
APG03128 PAM	456
APG09748 crRNA重複子	457
APG09748 tracrRNA	458
APG09748 PAM	459
APG00771 crRNA重複子	460
APG00771 tracrRNA	461
APG00771 PAM	462
APG02789 crRNA重複子	463
APG02789 tracrRNA	464
APG02789 PAM	465
APG09106 crRNA重複子	466
APG09106 tracrRNA	467
APG09106 PAM	468
APG05733.1 crRNA重複子	469
APG05733.1 tracrRNA	470
APG05733.1 PAM	471
APG06207.1 crRNA重複子	472
APG06207.1 tracrRNA	473
APG06207.1 PAM	474
APG01647.1 crRNA重複子	475
APG01647.1 tracrRNA	476
APG01647.1 PAM	477
APG08032.1 crRNA重複子	478
APG08032.1 tracrRNA	479
APG08032.1 PAM	480
APG05712.1 crRNA重複子	481
APG05712.1 tracrRNA	482
APG05712.1 PAM	483
APG01658.1 crRNA重複子	484
APG01658.1 tracrRNA	485
APG01658.1 PAM	486
APG06498.1 crRNA重複子	487
APG06498.1 tracrRNA	488
APG06498.1 PAM	489
APG09106.1 crRNA重複子	490
APG09106.1 tracrRNA	491
APG09106.1 PAM	492
APG09882.1 crRNA重複子	493
APG09882.1 tracrRNA	494
APG09882.1 PAM	495
APG02675.1 crRNA重複子	496
APG02675.1 tracrRNA	497
APG02675.1 PAM	498
APG01405.1 crRNA重複子	499
APG01405.1 tracrRNA	500
APG01405.1 PAM	501
APG06250.1 crRNA重複子	502
APG06250.1 tracrRNA	503
APG06250.1 PAM	504
APG06877.1 crRNA重複子	505
APG06877.1 tracrRNA	506
APG06877.1 PAM	507
APG09053.1 crRNA重複子	508
APG09053.1 tracrRNA	509
APG09053.1 PAM	510
APG04293.1 crRNA重複子	511
APG04293.1 tracrRNA	512
APG04293.1 PAM	513
APG01308.1 crRNA重複子	514
APG01308.1 tracrRNA	515
APG01308.1 PAM	516
APG06646.1 crRNA重複子	517
APG06646.1 tracrRNA	518
APG06646.1 PAM	519
APG09624 crRNA重複子	520
APG09624 tracrRNA	521
APG05405 crRNA重複子	522
APG05405 tracrRNA	523
APG06622 crRNA重複子	524
APG06622 tracrRNA	525
APG06622 PAM	526
APG02787 crRNA重複子	527
APG02787 tracrRNA	528
APG02787 PAM	529
APG06248 crRNA重複子	530
APG06248 tracrRNA	531
APG06248 PAM	532
APG06007 crRNA重複子	533
APG06007 tracrRNA	534
APG06007 PAM	535
APG02874 crRNA重複子	536
APG02874 tracrRNA	537
APG02874 PAM	538
APG03850 crRNA重複子	539
APG03850 tracrRNA	540
APG03850 PAM	541
APG07553 crRNA重複子	542
APG07553 tracrRNA	543
APG07553 PAM	544
APG03031 crRNA重複子	545
APG03031 tracrRNA	546
APG03031 PAM	547
APG09208 crRNA重複子	548
APG09208 tracrRNA	549
APG09208 PAM	550
APG08770 crRNA重複子	551
APG08770 tracrRNA	552
APG08770 PAM	553
APG08167 crRNA重複子	554
APG08167 tracrRNA	555
APG08167 PAM	556
APG03021 crRNA重複子	557
APG03021 tracrRNA	558
APG03021 PAM	559
APG06015 crRNA重複子	560
APG06015 tracrRNA	561
APG06015 PAM	562
APG09344 crRNA重複子	563
APG09344 tracrRNA	564
APG09344 PAM	565
APG07991 crRNA重複子	566
APG07991 tracrRNA	567
APG07991 PAM	568
APG01868 crRNA重複子	569
APG01868 tracrRNA	570
APG01868 PAM	571
APG02998 crRNA重複子	572
APG02998 tracrRNA	573
APG02998 PAM	574
APG07433.1 缺失變異體	575
APG08290.1 缺失變異體	576
LPG20046	577
LPG20047	578
LPG20124	579
LPG20123	580
LPG20048	581
LPG20051	582
LPG20055	583
LPG20056	584
LPG20057	585
LPG20058	586
LPG20059	587
LPG20060	588
LPG20050	589
LPG20053	590
LPG20054	591
LPG20044	592
LPG20052	593
LPG20049	594
LPG20045	595
LPG50320	596
LPG50324	597
LPG50318	598
LPG20061	599
LPG20062	600
SGN008971 標的序列	601
LPG20063	602
LPG20064	603
LPG20065	604
LPG20066	605
LPG20067	606
LPG20068	607
LPG20069	608
LPG20070	609
LPG20071	610
LPG20072	611
LPG20073	612
LPG20074	613
LPG20075	614
LPG20076	615
LPG20077	616
LPG20083	617
LPG20084	618
LPG20085	619
LPG20086	620
LPG20087	621
LPG20088	622
LPG20089	623
LPG20090	624
LPG20091	625
LPG20092	626
LPG20093	627
LPG20094	628
LPG20095	629
LPG20096	630
LPG20097	631
LPG20098	632
LPG50318	633
無活性APG07433.1_鑲嵌S772_LPG50148 (LPG20134)	634
無活性APG07433.1_鑲嵌S775_LPG50148 (LPG20135)	635
無活性APG07433.1_鑲嵌K778_LPG50148 (LPG20136)	636
無活性APG07433.1_鑲嵌E900_LPG50148 (LPG20137)	637
無活性APG07433.1_鑲嵌G910_LPG50148 (LPG20138)	638
LPG20130	639
SGN002336	640
SGN002364	641
胜肽連接子	642
LPG20099	643
LPG20100	644
LPG20101	645
LPG20102	646
LPG20111	647
LPG20120	648
LPG20121	649
LPG20122	650
SGN001432	651
SGN001433	652
SGN001434	653
SGN001435	654
SGN008382	655
SGN008383	656
SGN008384	657
SGN008385	658
SGN008393	659
SGN001432 標的序列	660
SGN001433標的序列	661
SGN001434標的序列	662
SGN001435標的序列	663
SGN008382標的序列	664
SGN008383標的序列	665
SGN008384標的序列	666
SGN008385標的序列	667
SGN008393標的序列	668
SGN001256	669
SGN001947	670
SGN001960	671
SGN003707	672
SGN004995	673
SGN001256標的序列	674
SGN001947標的序列	675
SGN001960標的序列	676
SGN003707標的序列	677
SGN004995標的序列	678
SGN003018	679
SGN003540	680
SGN003018標的序列	681
SGN003540標的序列	682
SGN003486	683
SGN002352	684
SGN001881	685
SGN003486標的序列	686
SGN005430	687
SGN005420	688
SGN005326	689
SGN005329	690
SGN005326標的序列	691
SGN005329標的序列	692
全長APG07433.1骨架(F)	693
縮短的APG07433.1骨架(M)	694
APG05586骨架	695
縮短的LPG10145 骨架	696
縮短的 LPG10196骨架	697
nLPG10196 (D11A)	698
nLPG10196 (H840A)	699
LAGLIDADG	700
嗜熱鏈球菌( Streptococcus thermophilus) Cas9	701
金黃色葡萄球菌( Streptococcus aureus) Cas9	702
法朗西斯菌 ( Francisella novicida) Cas12a	703
L16 連接子序列	704
L32連接子序列	705
NLS 連接子	706
P(AP)3 連接子	707
(EAAAK)2 連接子	708
24A 連接子	709
24B 連接子	710
GS16 連接子	711
18x 連接子	712
POLD1 NLS	713
ADAR2 NLS	714
Iwr1 NLS	715
OpT NLS	716
SV40 二分的(Bipartite) NLS	717
c-Myc NLS	718
NLS連接子	719
LPG50321	720
LPG50322	721
LPG50323	722
LPG50310	723
LPG20126	724
LPG20127	725
LPG20128	726
LPG20125	727
NLS 連接子	728
LPG20129	729
SGN008971	730

ABE:親本腺嘌呤鹼基編輯器 TTR:運甲狀腺素蛋白

圖1描述了提高親代腺嘌呤鹼基編輯器LPG50148-nAPG07433.1的標準編輯窗外的鹼基處的編輯效率的合理設計方法。圖1A提供了線性鹼基編輯器的示意圖，其顯示作為LPG50148與nAPG07433.1之間的端對端融合的親本腺嘌呤鹼基編輯器(ABE)、以及其中LPG50148被插入nAPG07433.1內的內部鹼基編輯器。圖1B顯示了帶有插入點(藍色球體)的APG07433.1的結構模型。LPG50148(綠色)被插入在所顯示的位置之後。G910、V872以及E900插入位點在楔形結構域內；T642以及R670插入位點在HNH結構域內；D737、A802、S775、S772、K778以及R30插入位點在 RuvCIII 結構域內。圖2顯示了nAPG07433.1鑲嵌鹼基編輯器(IBE) LPG20002-LPG20006以及HNH取代LPG20001的編輯效率以及編輯窗。圖2A 提供了前5個設計的 nAPG07433.1 IBE 的總編輯效率，利用基因組標靶、針對A至G取代的總百分比對這些 IBE進行了測試。圖2B顯示了LPG20001-LPG20006 的編輯窗。熱圖提供每個位置的編輯百分比。這些列代表五個單獨的引導(從上到下：SGN001681、SGN001062、SGN000968、SGN000754以及SGN001064)。位置1-25表示原型間隔子內第1個至第25個標的腺嘌呤的位置，其中位置1是PAM的第一個腺嘌呤5'。圖3顯示了nAPG07433.1 IBE (LPG20007-LPG20011)的編輯效率以及編輯窗。熱圖提供每個位置的編輯百分比。這些列代表四個單獨的引導(從上到下：SGN001062、SGN000968、SGN000754以及SGN001064)。圖4描述了nAPG07433.1 IBE 2及8。圖 4A 提供了nAPG07433.1 IBE 2 (S772)及8 (T642)插入點的結構表示。圖4B描繪了LPG20002及LPG20008與親代ABE相較的示意性結構域組織。圖 4C 顯示了：與親代 ABE 相較，LPG20002以及LPG20008 對於三個標的位點(SGN001947、SGN001064 以及SGN000909)的平均編輯效率。圖5顯示了對帶有缺失的連接子的nAPG07433.1 IBE2的評估。圖5A描繪了將截短的LPG50148插入nAPG07433.1中以及N端連接子、C端連接子或兩個連接子的缺失以創造nAPG07433.1 IBE2變異體。圖 5B顯示了使用四個基因組標靶測試的所有 LPG20002變異體的總編輯效率(A至G取代的百分比)。圖5C提供了顯示每個位置的編輯百分比的熱圖。這些列代表四個單獨的標的位點(從上到下：SGN001062、SGN001064、SGN000754以及SGN000968)。圖6顯示了工程化的IBE的治療潛力。圖6A提供了作為基因敲除策略的運甲狀腺素蛋白(TTR)基因中的外顯子1中剪接供體的破壞的結果。經由核轉染將質體遞送至HEK細胞中。圖6B顯示使用LPG20002變異體以減少β2-微球蛋白(B2M) 表面呈現。mRNA經由核轉染遞送至T 細胞中。圖7顯示了nAPG05586 IBE 的編輯活性。圖7A提供了：經由核轉染將編碼IBE及引導RNA的質體遞送至HEK293T細胞後，具有四個引導RNA的nAPG05586 IBE跨編輯窗(腺嘌呤 5-24)的平均編輯率。圖7B提供了每個nAPG05586 IBE的編輯窗內每一腺嘌呤位置處的編輯率。圖8顯示了nAPG01604 IBE的編輯活性。圖8A提供了：經由核轉染將編碼IBE及引導RNA的質體遞送至HEK293T細胞後，具有四個引導RNA的nAPG01604 IBE跨編輯窗(腺嘌呤5-19)的平均編輯率。圖8B提供了每個nAPG01604 IBE編輯窗內每一腺嘌呤位置處的編輯率。圖9顯示了nLPG10145 IBE 的編輯活性。圖9A提供了：經由核轉染將編碼IBE及引導RNA的質體遞送至HEK293T細胞後，具有四個引導RNA的LPG10145 IBE跨編輯窗(腺嘌呤4-25)的平均編輯率。圖9B提供了每個nLPG10145 IBE 編輯窗內每一腺嘌呤位置處的編輯率。圖10A及圖10B描繪了用於鑑定比親本ABE (LPG50148融合至dAPG07433.1)具有更大活性的腺嘌呤鹼基編輯器變異體的定向演化策略的第一步驟。圖10A顯示LPG50148 腺苷去胺酶變異體以及APG07433.1 RNA 引導的核酸酶的核酸酶不活化版本的端對端融合蛋白，其在大腸桿菌中表現、並將康黴素抗性基因中的終止密碼子轉換為有義密碼子以賦予抵抗力。圖10B展示了演化的ABE如何富集那些比親代ABE具有更強編輯活性的ABE。以與dAPG07433.1融合的突變體LPG50148庫轉化含有標的質體的大腸桿菌。為了在高濃度的康黴素中生長，細胞需要以高於親代ABE的編輯效率修復抗生素抗性基因(KanR*)。這些選擇是針對三個序列上下文(context)：TAT、CAC 或 TAG單獨進行的。在富集步驟後，鑑定出具有高達八倍改進的變異體。圖11顯示了用於鑑定比親本ABE具有更高活性的腺嘌呤鹼基編輯器變異體的完整定向演化策略。在細菌中選擇其活性比親代ABE高出達8倍、具有單點突變的ABE變異體，然後在人類HEK293T細胞中的第一輪人類細胞篩選中進行評估。在對TAT 或CAC 序列上下文進行的選擇中鑑定出的單點突變體在八個內源基因組位點處進行評估，而在對TAG 序列上下文進行的選擇中鑑定出的單點突變體在四個內源基因組位點處進行評估。顯示最高平均倍數變化的單突變被組合以產生最高命中：針對TAT，20 (具有L35N、V81S、N156R、以及L162W突變的LPG50148，如SEQ ID NO：319所示)、60 (具有I75W以及F155W突變的LPG50148，如SEQ ID NO：359所示)、67 (具有 V81S、F155W以及A160D 突變的 LPG50148，如 SEQ ID NO：366 所示)、以及68 (具有 V81S、C145A以及F155W 突變的 LPG50148，如 SEQ ID NO：367 所示)；針對CAC，106 (具有D76G以及V81S突變的LPG50148，如SEQ ID NO：405所示)以及107 (具有V81S以及M117L突變的LPG50148，如SEQ ID NO：406所示)；以及，針對TAG，88 (具有I40L以及V105M突變的LPG50148，如SEQ ID NO：387所示)以及103 (具有V81S、C145M以及A160W突變的LPG50148，如SEQ ID NO：402所示)。圖12展示了：當ABE作為mRNA被遞送時，與親代ABE相較下，演化的ABE變異體LPG50148.2.20、LPG50148.2.60、LPG50148.2.67、LPG50148.2.68、以及LPG50148.2.69的更高編輯效率。圖13提供了演化ABE變異體LPG50148.2.20、LPG50148.2.60、LPG50148.2.67、LPG50148.2.68、LPG50148.2.103、LPG50148.2.106、以及LPG20107 的穩健性測試的結果。圖13A顯示了總 A-T替換超過 20% 編輯的引導(來自 48 個基因組位點)的百分比。圖13B顯示了所有基因組位點的平均A至G取代。有三種顯著效應：變異體 LPG50148.2.20 (p≤0.001)、LPG50148.2.103 (p＜0.001)以及LPG50148.2.67 (p=0.01)。圖14展示了演化的 ABE 變異體中的三個的最佳編輯窗的變化。此圖顯示了親代 ABE以及三個演化的 ABE 變異體LPG50148.2.20、LPG50148.2.67以及 LPG50148.2.103表示按位置顯示編輯器活性窗的A-T取代。數字表明PAM序列上游的原型間隔子內的位置。最佳視窗是≥最大編輯的30%。圖15顯示了多個演化的ABE變異體(LPG50148.2.20、LPG50148.2.60、LPG50148.2.67、LPG50148.2.68、LPG50148.2.103、LPG50148.2.106、以及LPG50148.2.107)以及親代ABE 的不同序列上下文內的A至G編輯。編輯百分比反映了跨48個基因組位點的每一個上下文的中位數值。圖16提供了在原代小鼠肝細胞中使用LPG20047在SGN008393的標的序列中的位置11處的A至G轉化的百分比。圖17顯示了基於第二代去胺酶的第三代去胺酶的工程化，當與nAPG07433.1的N端融合時，針對多個標靶提供更高水平的A至G編輯。圖18顯示了與 nAPG07433.1融合的第三代鹼基編輯器LPG50324的改進性能。圖19顯示：當與nAPG07433.1融合時，在具有質體遞送的HEK293T細胞中，相對於LPG50265去胺酶，利用LPG50310去胺酶的改進的編輯。

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Claims

一種融合蛋白，其包括一RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項1所述的融合蛋白，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的該胺基酸序列。
如請求項1或請求項2所述的融合蛋白，其中該異源多肽被插入該RGN的一連接子結構域2、一楔形結構域、一RuvC結構域、一HNH結構域、一Rec-2結構域或一PAM交互作用結構域內。
如請求項1至請求項3中任一項所述的融合蛋白，其中： a) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； b) 該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 v) 與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； c) 該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 iii) 與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； d) 該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 e) 該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 ii) 與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。
如請求項1至請求項4中任一項所述的融合蛋白，其中該異源多肽包括一鹼基編輯多肽或一先導編輯多肽。
請求項5所述的融合蛋白，其中該鹼基編輯多肽包括一去胺酶。
如請求項6所述的融合蛋白，其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。
如請求項6或請求項7所述的融合蛋白，其中該至少一異源多肽被被插入在一RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後，該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列： a) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的一編輯窗。
如請求項6至請求項8中任一項所述的融合蛋白，其中，與該去胺酶被衍生自的一親代去胺酶相較，該去胺酶缺少該第一及最後一個胺基酸殘基。
請求項6至請求項9中任一項所述的融合蛋白，其中該去胺酶包括一腺嘌呤去胺酶以及該融合蛋白是一腺嘌呤鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。
如請求項10所述的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項10所述的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的該胺基酸序列。
如請求項10所述的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項10所述的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項10所述的融合蛋白，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與一親代ABE鹼基編輯器相較被移位的一編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的該胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。
如請求項1至請求項15中任一項所述的融合蛋白，其中該RGN是一切口酶或一核酸酶不活化的RGN。
如請求項16所述的融合蛋白，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列並且保留切口酶活性。
如請求項16所述的融合蛋白，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的該胺基酸序列。
一種核糖核蛋白(RNP)複合物，其包括如請求項1至請求項18、請求項110以及請求項111中任一項所述的融合蛋白以及與該融合蛋白結合的一引導RNA。
一種核酸分子，其包括編碼一融合蛋白的一多核苷酸，其中該融合蛋白包括一RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項20所述的核酸分子，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的該胺基酸序列。
如請求項20或請求項21所述的核酸分子，其中該異源多肽被插入該RGN的一連接子結構域2、一楔形結構域、一RuvC結構域、一HNH結構域、一Rec-2結構域或一PAM交互作用結構域內。
如請求項20至請求項22中任一項所述的核酸分子，其中： a) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； b) 該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 v) 與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； c) 該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 iii) 與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； d) 該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； ii) 與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； iii) 與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； iv) 與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； v) 與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； vi) 與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； vii) 與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 viii) 與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 e) 該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： i) 與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 ii) 與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。
如請求項20至請求項23中任一項所述的核酸分子，其中該異源多肽包括一鹼基編輯多肽或一先導編輯多肽。
如請求項24所述的核酸分子，其中該鹼基編輯多肽包括一去胺酶。
如請求項25所述的核酸分子，其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。
如請求項25或請求項26所述的核酸分子，其中該至少一異源多肽被插入在包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： a) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中該鹼基編輯器融合蛋白具有與一親代鹼基編輯器相較被移位的一編輯窗，該親代鹼基編輯器包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶。
如請求項25至請求項27中任一項所述的核酸分子，其中，與該去胺酶被衍生自的一親代去胺酶相較，該去胺酶缺少該第一及最後一個胺基酸殘基。
如請求項25至請求項28中任一項所述的核酸分子，其中該去胺酶包括一腺嘌呤去胺酶且是一腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。
如請求項29所述的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項29所述的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的該胺基酸序列。
如請求項29所述的核酸分子，其中該融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項29所述的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項29所述的核酸分子，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與一親代ABE鹼基編輯器相較被移位的一編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的該胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。
如請求項20至請求項34中任一項所述的核酸分子，其中該RGN是一切口酶或一核酸酶不活化的RGN。
如請求項35所述的核酸分子，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列並且保留切口酶活性。
如請求項35所述的核酸分子，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的該胺基酸序列。
一種載體，其包括如請求項20至請求項37、以及請求項120至請求項126中任一項所述的核酸分子。
如請求項38所述的載體，更包括編碼能夠與該RGN的一標的序列的一非標的股雜交的一引導RNA的至少一核苷酸序列。
一種細胞，其包括如請求項1至請求項18以及請求項113至請求項119中任一請求項所述的融合蛋白或如請求項19所述的RNP複合物。
一種細胞，其包括如請求項1至請求項18以及請求項113至請求項119中任一請求項所述的融合蛋白，其中該細胞更包括一引導RNA。
一種細胞，其包括如請求項20至請求項37以及請求項120至請求項126中任一請求項所述的核酸分子或如請求項38或請求項39所述的載體。
如請求項40至請求項42中任一項所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞。
如請求項40至請求項42中任一項所述的細胞，其中該細胞是一植物細胞。
一種植物或種子，其包括如請求項44所述的細胞。
一種醫藥組成物，其包括一藥學上可接受的載體以及如請求項1至請求項18及請求項113至請求項119中任一項所述的融合蛋白、如請求項19所述的RNP複合物、如請求項20至請求項37以及請求項120至請求項126中任一項所述的核酸分子、如請求項38或請求項39所述的載體、或如請求項38所述的細胞。
一種用於製備一RGN融合核糖核蛋白複合物的方法，包括將如請求項20至請求項37以及請求項120至請求項126中任一項所述的核酸分子以及包括編碼一引導RNA的一表現盒的一核酸分子、或如請求項38或請求項39所述的載體引入一細胞中，以及在其中該融合蛋白及該gRNA被表現並形成一RGN 融合核糖核蛋白複合物的條件下培養該細胞。
一種用於將一異源多肽定位至包括一標的DNA序列的一標的DNA分子的系統，該系統包括： a) 一融合蛋白、或編碼該融合蛋白的一核苷酸序列，其中該融合蛋白包括一RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽；其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列；以及 b) 能夠與該標的DNA序列的一非標的股雜交的一或更多引導RNA或編碼該一或更多引導RNA 其中該一或更多引導RNA能夠與該融合蛋白形成一複合物，以引導該融合蛋白結合至該標的DNA序列。
如請求項48所述的系統，其中該RGN包括SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的該胺基酸序列。
如請求項48或請求項49所述的系統，其中該異源多肽被插入該RGN的一連接子結構域2、一楔形結構域、一RuvC結構域、一HNH結構域、一Rec-2結構域或一PAM交互作用結構域內。
如請求項48至請求項50中任一項所述的系統，其中： i) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： A. 與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； B. 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； C. 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； D. 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； E. 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； F. 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； G. 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 H. 與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； ii) 該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： A. 與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； B. 與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； C. 與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； D. 與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 E. 與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； iii) 該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： A. 與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； B. 與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置；以及 C. 與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； iv) 該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： A. 與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； B. 與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； C. 與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； D. 與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； E. 與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； F. 與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； G. 與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 H. 與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 v) 該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： A. 與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 B. 與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。
如請求項48至請求項51中任一項所述的系統，其中該異源多肽包括一鹼基編輯多肽或一先導編輯多肽。
如請求項52所述的系統，其中該鹼基編輯多肽包括一去胺酶。
如請求項53所述的系統，其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。
如請求項53或請求項54所述的系統，其中該至少一異源多肽被插入在包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： a) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的一編輯窗。
如請求項53至請求項55中任一項所述的系統，其中，與該去胺酶被衍生自的一親代去胺酶相較，該去胺酶缺少該第一及最後一個胺基酸殘基。
如請求項53至請求項56中任一項所述的系統，其中該去胺酶包括一腺嘌呤去胺酶以及該融合蛋白為一腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。
如請求項57所述的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項57所述的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的該胺基酸序列。
如請求項57所述的系統，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項57所述的系統，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項57所述的系統，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與一親代ABE鹼基編輯器相較被移位的一編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的該胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。
如請求項48至請求項62中任一項所述的系統，其中該RGN是一切口酶或一核酸酶不活化的RGN。
如請求項63所述的系統，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列並且保留切口酶活性。
如請求項63所述的系統，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的該胺基酸序列。
如請求項48至請求項65中任一項所述的系統，其中編碼該一或更多引導RNA的該核苷酸序列以及編碼該融合蛋白的該核苷酸序列中的至少一者可操作地連接至與該核苷酸序列異源的一啟動子。
如請求項48至請求項66中任一項所述的系統，其中該標的DNA序列是一真核標的DNA序列。
如請求項48至請求項67中任一項所述的系統，其中該標的DNA序列被定位為與被該RGN辨識的一原型間隔子相鄰模體(PAM)相鄰。
如請求項48至請求項68中任一項所述的系統，其中編碼該一或更多引導RNA的核苷酸序列以及編碼一融合蛋白的該核苷酸序列位於一個載體上。
一種細胞，其包括如請求項48至請求項69、請求項117、以及請求項118中任一項所述的系統。
如請求項70所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞。
如請求項70所述的細胞，其中該細胞是一植物細胞。
一種植物或種子，其包括如請求項72所述的細胞。
一種醫藥組成物，其包括一藥學上可接受的載體以及如請求項48至如請求項69以及請求項127至請求項133中任一項所述的系統、或如請求項71所述的細胞。
一種用於將一異源多肽定位至包括一標的DNA序列的一標的DNA分子的方法，該方法包括將如請求項48至請求項69以及請求項127至請求項133中任一項所述的一系統遞送至該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的一細胞。
一種用於修飾包括一標的DNA序列的一標的DNA分子的方法，該方法包括將如請求項48至請求項69以及請求項127至請求項133中任一項所述的一系統遞送至該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的一細胞。
一種用於將一異源多肽定位至包括一標的DNA序列的一標的DNA分子的方法，包括： a) 在適合形成一核糖核苷酸複合物的條件下，藉由結合下列，體外組裝該核糖核苷酸複合物： i) 能夠與該標的DNA序列的一非標的股雜交的一或更多引導RNA；以及 ii) 一融合蛋白，其包括一RNA引導的核酸酶(RGN)以及被插入其中的至少一異源多肽，其中該RGN包括與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列；以及 b) 將該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的一細胞與該體外組裝的核糖核苷酸複合物接觸；其中該一或更多引導RNA與該標的DNA序列的一非標的股雜交，從而引導該融合蛋白與該標的DNA序列結合。
請求項77所述的方法，其中該RGN包括具有SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者的該胺基酸序列的一胺基酸序列。
如請求項77或請求項78所述的方法，其中該異源多肽被插入該RGN的一連接子結構域2、一楔形結構域、一RuvC結構域、一HNH結構域、一Rec-2結構域或一PAM交互作用結構域內。
如請求項77至請求項79中任一項所述的方法，其中： a) 該RGN包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： I) 與SEQ ID NO：1的位置30對應的胺基酸位置； II) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； III) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； IV) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； V) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； VI) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置； VII) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及 VIII) 與SEQ ID NO：1的位置802對應的胺基酸位置； b) 該RGN包括與SEQ ID NO：2具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： I) 與SEQ ID NO：2的位置678對應的胺基酸位置； II) 與SEQ ID NO：2的位置736對應的胺基酸位置； III) 與SEQ ID NO：2的位置778對應的胺基酸位置； IV) 與SEQ ID NO：2的位置788對應的胺基酸位置；以及 V) 與SEQ ID NO：2的位置922對應的胺基酸位置； c) 該RGN包括與SEQ ID NO：3具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： I) 與SEQ ID NO：3的位置725對應的胺基酸位置； II) 與SEQ ID NO：3的位置739對應的胺基酸位置； III) 與SEQ ID NO：3的位置744對應的胺基酸位置； d) 該RGN包括與SEQ ID NO：4具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： I) 與SEQ ID NO：4的位置347對應的胺基酸位置； II) 與SEQ ID NO：4的位置524對應的胺基酸位置； III) 與SEQ ID NO：4的位置666對應的胺基酸位置； IV) 與SEQ ID NO：4的位置680對應的胺基酸位置； V) 與SEQ ID NO：4的位置740對應的胺基酸位置； VI) 與SEQ ID NO：4的位置785對應的胺基酸位置； VII) 與SEQ ID NO：4的位置910對應的胺基酸位置；以及 VIII) 與SEQ ID NO：4的位置1077對應的胺基酸位置；或 e) 該RGN包括與SEQ ID NO：131具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列以及該至少一異源多肽被插入在該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： I) 與SEQ ID NO：131的位置766對應的胺基酸位置；以及 II) 與SEQ ID NO：131的位置806對應的胺基酸位置。
如請求項77至請求項80中任一項所述的方法，其中該異源多肽包括一鹼基編輯多肽或一先導編輯多肽以及其中該方法更包括修飾該標的DNA分子以產生一修飾的標的DNA分子。
如請求項81所述的方法，其中該標的DNA分子包括針對一疾病或病症的一因果突變以及其中該標的 DNA 分子的修飾校正該因果突變。
如請求項82所述的方法，其中該因果突變的該校正包括校正一無意義突變。
如請求項81至請求項83中任一項所述的方法，其中該鹼基編輯多肽包括一去胺酶。
如請求項84所述的方法，其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有改善的編輯活性。
如請求項84或請求項85所述的方法，其中該至少一異源多肽被插入在包括與SEQ ID NO：1具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內緊接在從由下列組成的群組選出的該胺基酸位置之後： a) 與SEQ ID NO：1的位置642對應的胺基酸位置； b) 與SEQ ID NO：1的位置670對應的胺基酸位置； c) 與SEQ ID NO：1的位置737對應的胺基酸位置； d) 與SEQ ID NO：1的位置772對應的胺基酸位置； e) 與SEQ ID NO：1的位置775對應的胺基酸位置；以及 f) 與SEQ ID NO：1的位置778對應的胺基酸位置；以及其中該融合蛋白是一鹼基編輯器融合蛋白，以及其中，與包括與該RGN的該胺基末端融合的該去胺酶的一親代鹼基編輯器相較，該鹼基編輯器融合蛋白具有被移位的一編輯窗。
如請求項84至請求項86中任一項所述的方法，其中，與該去胺酶被衍生自的一親代去胺酶相較，該去胺酶缺少該第一及最後一個胺基酸殘基。
如請求項84至請求項87中任一項所述的方法，其中該去胺酶包括一腺嘌呤去胺酶以及該融合蛋白為一腺苷鹼基編輯器(ABE)融合蛋白。
如請求項88所述的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項88所述的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括SEQ ID NO：5、6、248-414、596、597、以及720-723中任一者的該胺基酸序列。
如請求項88所述的方法，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項88所述的方法，其中該ABE融合蛋白包括SEQ ID NO：8-10、13-21、27-31、36-38、40-41、43-48、647、以及650中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項88所述的方法，其中該ABE融合蛋白包括與SEQ ID NO：8-10以及14-16中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列，以及其中該ABE融合蛋白具有與一親代ABE鹼基編輯器相較被移位的一編輯窗，該親代ABE鹼基編輯器包括與該RGN的該胺基末端融合的該腺嘌呤去胺酶。
如請求項77至請求項93中任一項所述的方法，其中該RGN是一切口酶或一核酸酶不活化的RGN。
如請求項94所述的方法，其中該RGN切口酶包括與SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列並且保留切口酶活性。
如請求項94所述的方法，其中該RGN切口酶包括SEQ ID NO：49-56、698以及699中任一者的該胺基酸序列。
如請求項77至請求項96中任一項所述的方法，其中編碼該一或更多引導RNA的該核苷酸序列以及編碼該融合蛋白的該核苷酸序列中的至少一者可操作地連接至與該核苷酸序列異源的一啟動子。
如請求項77至請求項97中任一項所述的方法，其中該標的DNA序列是一真核標的DNA序列。
如請求項77至請求項98中任一項所述的方法，其中該標的DNA序列被定位為與被該RGN辨識的一原型間隔子相鄰模體(PAM)相鄰。
如請求項77至請求項99中任一項所述的方法，其中該標的DNA 分子在一細胞內。
如請求項100所述的方法，更包括選擇包括該修飾的標的DNA分子的一細胞。
一種細胞，其包括如請求項101所述方法的一修飾的標的DNA分子。
如請求項102所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞。
如請求項102所述的細胞，其中該細胞是一植物細胞。
一種植物或一種種子，其包括如請求項104所述的細胞。
一種醫藥組成物，其包括如請求項103所述的細胞、以及一藥學上可接受的載體。
一種用於治療患有或有風險進展一疾病、病症或症狀的一個體的方法，該方法包括：將如請求項1至請求項18以及請求項113至請求項119中任一項所述的融合蛋白、如請求項19所述的RNP複合物、如請求項20至請求項37以及請求項120至請求項126中任一項所述的核酸分子、如請求項38或請求項39所述的載體、如請求項43、請求項71、以及請求項103中任一項所述的細胞、如請求項48至請求項69以及請求項127至請求項133中任一項所述的系統、或如請求項46、請求項74、以及請求項106中任一項所述的醫藥組成物投予至該個體。
如請求項107所述的方法，其中該疾病與一因果突變相關聯以及該治療包括校正該因果突變。
一種如請求項1至請求項18以及請求項113至請求項119中任一項所述的融合蛋白、如請求項19所述的RNP複合物、如請求項20至請求項37以及請求項120至請求項126中任一項所述的核酸分子、如請求項38或請求項39所述的載體、如請求項43、請求項71、以及請求項103中任一項所述的細胞、或如請求項48至請求項69以及請求項127至請求項133中任一項所述的系統用於治療患有或有風險進展一疾病、病症或症狀的一個體中的該疾病、病症或症狀的用途。
如請求項109所述的用途，其中該疾病與一因果突變相關聯以及該治療包括校正該因果突變。
一種如請求項1至請求項18以及請求項113至請求項119中任一項所述的融合蛋白、如請求項19所述的RNP複合物、如請求項20至請求項37以及請求項120至請求項126中任一項所述的核酸分子、如請求項38或請求項39所述的載體、如請求項43、請求項71、以及請求項103中任一項所述的細胞、或如請求項48至請求項69以及請求項127至請求項133中任一項所述的系統用於製造有用於治療一疾病、病症或症狀的一藥劑的用途。
如請求項111所述的用途，其中該疾病與一因果突變相關聯以及一有效量的該藥物校正該因果突變。
如請求項10所述的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項113所述的融合蛋白，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項113或請求項114所述的融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項113或請求項114所述的融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項113或請求項114所述的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項113或請求項114所述的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項118所述的融合蛋白，其中該融合蛋白具有SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的該序列。
如請求項29所述的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項120所述的核酸分子，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項120或請求項121所述的核酸分子，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項120或請求項121所述的核酸分子，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項120或請求項121所述的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項120或請求項121所述的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項125所述的核酸分子，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的該序列。
如請求項57所述的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項127所述的系統，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項127或請求項128所述的系統，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項127或請求項128所述的系統，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項127或請求項128所述的系統，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項127或請求項128所述的系統，a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項132所述的系統，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的該序列。
如請求項88所述的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項134所述的方法，其中該腺嘌呤去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項134或請求項135所述的方法，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項134或請求項135所述的方法，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項134或請求項135所述的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：52具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：50具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有與 SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且被插入在具有與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項134或請求項135所述的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； b) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； c) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； d) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； e) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； f) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； g) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； h) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； i) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； j) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； k) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； l) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置678對應的一胺基酸位置之後； m) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； n) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； o) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； p) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：52所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：4的位置910對應的一胺基酸位置之後； q) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：50所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：2的位置922對應的一胺基酸位置之後； r) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後； s) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後；以及 t) 一融合蛋白，其中該去胺酶具有如 SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且被插入在具有如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的該RGN內與SEQ ID NO：1的位置772對應的一胺基酸位置之後。
如請求項139所述的方法，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：599、600、602、603、606、610、612、614、615、617、619-624、626、以及630-632中任一者所示的該序列。
一種去胺酶，其包括與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列、以及包括下列胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項141所述的去胺酶，其中該去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項141或請求項142所述的去胺酶，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項141或請求項142所述的去胺酶，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者的一胺基酸序列。
如請求項141至請求項144中任一項所述的去胺酶，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。
如請求項141至請求項145中任一項所述的去胺酶，其中該去胺酶是一腺嘌呤去胺酶。
一種核酸分子，其包括編碼與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一去胺酶的一多肽，其中該去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H；; i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項147所述的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk)在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項147或請求項148所述的核酸分子，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項147或請求項148所述的核酸分子，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者的一胺基酸序列。
如請求項147至請求項150中任一項所述的核酸分子，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。
如請求項147至請求項151中任一項所述的核酸分子，其中該去胺酶是一腺嘌呤去胺酶。
如請求項147至請求項152中任一項所述的核酸分子，更包括可操作地連接至該多核苷酸的一異源啟動子。
一種載體，其包括如請求項147至請求項153中任一項所述的核酸分子。
一種細胞，其包括如請求項141至請求項146中任一項所述的去胺酶、如請求項147至請求項153中任一項所述的核酸分子、或如請求項154所述的載體。
如請求項155所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞。
一種醫藥組成物，其包括一藥學上可接受的載體以及如請求項141至請求項146中任一項所述的去胺酶、如請求項147至請求項153中任一項所述的核酸分子、如請求項154所述的載體、或如請求項156所述的細胞。
一種融合蛋白，其包括一DNA結合多肽以及與SEQ ID NO：5具有至少85%的序列一致性的一去胺酶，其中該去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項158所述的融合蛋白，其中該去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項158或請求項159所述的融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項158或請求項159所述的融合蛋白，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者的一胺基酸序列。
如請求項158至請求項161中任一項所述的融合蛋白，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。
如請求項158至請求項162中任一項所述的融合蛋白，其中該去胺酶是一腺嘌呤去胺酶。
如請求項158至請求項163中任一項所述的融合蛋白，其中該DNA結合多肽是一RNA引導的核酸酶(RGN)多肽。
如請求項164所述的融合蛋白，其中該RGN是一RGN切口酶。
如請求項164所述的融合蛋白，其中該RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項165所述的融合蛋白，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52以及698中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項158或請求項159所述的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項158或請求項159所述的融合蛋白，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項158或請求項159所述的融合蛋白，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、以及729中任一者所示的該序列。
一種核糖核蛋白(RNP)複合物，其包括如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白以及與該融合蛋白結合的一引導RNA。
一種核酸分子，其包括編碼一融合蛋白的一多核苷酸，該融合蛋白包括一DNA結合多肽以及一去胺酶，其中該去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： a) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； b) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； c) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； d) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； e) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； f) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； g) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； h) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； i) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； j) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； k) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； l) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； m) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； n) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； o) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； p) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； r) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； s) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； t) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； u) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； v) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； w) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； x) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； gg)在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 ll) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H。
如請求項172所述的核酸分子，其中該去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W ； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項172或請求項173所述的核酸分子，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項172或請求項173所述的核酸分子，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者的一胺基酸序列。
如請求項172至請求項175中任一項所述的核酸分子，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。
如請求項172至請求項176中任一項所述的核酸分子，其中該去胺酶是一腺嘌呤去胺酶。
如請求項172至請求項177中任一項所述的核酸分子，其中該DNA結合多肽是一RNA引導的核酸酶(RGN)多肽。
如請求項178所述的核酸分子，其中該RGN是一RGN切口酶。
如請求項178所述的核酸分子，其中該RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項179所述的核酸分子，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52以及698中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項172或請求項173所述的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項172或請求項173所述的核酸分子，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO： 596所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項172或請求項173所述的核酸分子，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、以及729中任一者所示的該序列。
一種載體，其包括如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子。
一種包括如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子的載體，更包括編碼能夠與一標的序列的一非標的股雜交的一引導RNA的至少一核苷酸序列。
一種細胞，其包括如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白或如請求項171所述的RNP複合物。
一種包括如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白的細胞，其中該細胞更包括一引導RNA。
一種細胞，其包括如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子。
一種細胞，其包括如請求項185或請求項186所述的載體。
如請求項187至請求項190中任一項所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞。
如請求項187至請求項190中任一項所述的細胞，其中該細胞是一植物細胞。
一種植物或一種種子，其包括如請求項192所述的細胞。
一種醫藥組成物，其包括一藥學上可接受的載體以及如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白、如請求項171所述的RNP複合物、如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子、如請求項185或請求項186所述的載體、或如請求項191所述的細胞。
一種用於製備一RGN融合核糖核蛋白複合物的方法，包括將如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子或如請求項185所述的載體以及包括編碼一引導RNA的一表現盒的一核酸分子、或如請求項186所述的載體引入一細胞中、以及在其中該融合蛋白及該gRNA被表現並形成一RGN 融合核糖核蛋白複合物的條件下培養該細胞。
一種用於修飾包括一標的DNA序列的一標的DNA分子的系統，該系統包括： a) 包括一RNA引導的核酸酶多肽以及一去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列、或編碼該融合蛋白的一核苷酸序列，其中該去胺酶包括以下胺基酸殘基中的至少一者： i) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； iv) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； v) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； vi) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； vii) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； viii) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； ix) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； xi) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； xii) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； xiii) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； xiv) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； xv) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； xvi) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； xvii) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； xviii) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； xix) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； xxi) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； xxii) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； xxiii) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； xxiv) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； xxv) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； xxvi) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； xxvii) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； xxviii) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； xxix) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； xxx) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； xxxi) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； xxxii) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； xxxiii) 在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； xxxiv) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xxxv) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； xxxvi) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； xxxvii) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 xxxviii) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H；以及 b) 能夠與該標的DNA序列的一非標的股雜交的一或更多引導RNA或編碼該一或更多引導RNA的一或更多核苷酸序列；以及其中該一或更多引導RNA能夠與該融合蛋白形成一複合物，以引導該融合蛋白結合至該標的DNA序列以及修飾該標的DNA分子。
如請求項196所述的系統，其中該去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的位置處的A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項196或請求項197所述的系統，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項196或請求項197所述的系統，其中該去胺酶包括SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者的一胺基酸序列。
如請求項196至請求項199中任一項所述的系統，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。
如請求項196至請求項200中任一項所述的系統，其中該去胺酶是一腺嘌呤去胺酶。
如請求項196至請求項201中任一項所述的系統，其中編碼該一或更多引導RNA的該核苷酸序列以及編碼該融合蛋白的該核苷酸序列中的至少一者可操作地連接至與該核苷酸序列異源的一啟動子。
如請求項196至請求項202中任一項所述的系統，其中該標的DNA序列是一真核標的DNA序列。
如請求項196至請求項203中任一項所述的系統，其中該標的DNA序列被定位為與被該RGN辨識的一原型間隔子相鄰模體(PAM)相鄰。
如請求項196至請求項204中任一項所述的系統，其中該融合蛋白的該RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項196至請求項205中任一項所述的系統，其中該融合蛋白的該RGN是一RGN切口酶。
如請求項206所述的系統，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52以及698中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項196或請求項197所述的系統，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項196或請求項197所述的系統，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項196或請求項197所述的系統，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、以及729中任一者所示的該序列。
一種細胞，其包括如請求項196至請求項210中任一項所述的系統。
如請求項211所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞
如請求項211所述的細胞，其中該細胞是一植物細胞。
一種植物或一種種子，其包括如請求項213所述的細胞。
一種醫藥組成物，其包括一藥學上可接受的載體以及如請求項196至請求項210中任一項所述的系統或如請求項212所述的細胞。
一種用於修飾包括一標的DNA序列的一標的DNA分子的方法，該方法包括將如請求項196至請求項210中任一項所述的一系統遞送至該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的一細胞。
一種用於修飾包括一標的序列的一標的DNA分子的方法，包括： a) 在適合形成一RGN-去胺酶核糖核苷酸複合物的條件下，藉由結合下列，體外組裝該RGN-去胺酶核糖核苷酸複合物： i) 能夠與該標的DNA序列的一非標的股雜交的一或更多引導RNA；以及 ii) 包括一RNA引導的核酸酶多肽(RGN)、以及至少一去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶具有與SEQ ID NO：5具有至少85%序列一致性的一胺基酸序列；其中該去胺酶具有以下胺基酸殘基中的至少一者： A) 在與SEQ ID NO：5的位置2對應的一位置處的一C； B) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一F或C； C) 在與SEQ ID NO：5的位置23對應的一位置處的一Q； D) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N； E) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L； F) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； G) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A或M； H) 在與SEQ ID NO：5的位置72對應的一位置處的一H； I) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、A、Q、Y、或D； J) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； K) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； L) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； M) 在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H； N) 在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L； O) 在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I或L； P) 在與SEQ ID NO：5的位置120對應的一位置處的一F； Q) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一E、T、A、G、或V； R) 在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一I或H； S) 在與SEQ ID NO：5的位置125對應的一位置處的一K； T) 在與SEQ ID NO：5的位置126對應的一位置處的一A； U) 在與SEQ ID NO：5的位置135對應的一位置處的一H； V) 在與SEQ ID NO：5的位置137對應的一位置處的一V； W) 在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y； X) 在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L； Y) 在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一K或A； Z) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、Q、L、或M； AA) 在與SEQ ID NO：5的位置148對應的一位置處的一K； BB) 在與SEQ ID NO：5的位置151對應的一位置處的一Q； CC) 在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E或R； DD) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； EE) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R或V； FF) 在與SEQ ID NO：5的位置157對應的一位置處的一F； GG) 在與SEQ ID NO：5的位置158對應的一位置處的一R； HH) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； II) 在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D或W； JJ) 在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W、H、V、或A； KK) 在與SEQ ID NO：5的位置165對應的一位置處的一R；以及 LL) 在與SEQ ID NO：5的位置166對應的一位置處的一H；以及 b) 將該標的DNA分子或包括該標的DNA分子的一細胞與該體外組裝的RGN-去胺酶核糖核苷酸複合物接觸；其中該一或更多引導RNA與該標的DNA序列的一非標的股雜交，從而引導該融合蛋白與該標的DNA序列結合，以及該標的DNA分子的修飾發生。
如請求項217所述的方法，其中該去胺酶包括： a) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； b) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N以及在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q； c) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； d) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q以及在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R； e) 在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； f) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； g) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； h) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； i) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； j) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； k) 在與SEQ ID NO：5的位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； l) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； m) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； n) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； o) 在與SEQ ID NO：5的位置46對應的一位置處的一Q、與位置35對應的一位置處的一N、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一M、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一W； p) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； q) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； r) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； s) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； t) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； u) 在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； v) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； w) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； x) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； y) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； z) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； aa) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； bb) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； cc) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； dd) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A； ee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ff) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； gg) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； hh) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ii) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； jj) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； kk) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W； ll) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； mm) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； nn) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； oo) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； pp) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M； qq) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； rr) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ss) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； tt) 在與SEQ ID NO：5的位置40對應的一位置處的一L、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； uu) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V； vv) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； ww) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； xx) 在與SEQ ID NO：5的位置105對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； yy) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M； zz) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； aaa) 在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； bbb) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ccc) 在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； ddd) 在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； eee) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一M、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一W； fff) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一V、以及在與SEQ ID NO：5的位置159對應的一位置處的一Q； ggg) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； hhh) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； iii) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； jjj) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G； kkk) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； lll) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； mmm) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S； nnn) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ooo) 在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； ppp) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； qqq) 在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、以及在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L； rrr) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置109對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一E、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； sss) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； ttt) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一I、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一Q、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； uuu) 在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置121對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、以及在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D； vvv) 在與SEQ ID NO：5的位置22對應的一位置處的一C、在與SEQ ID NO：5的位置68對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置75對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置76對應的一位置處的一G、在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S、在與SEQ ID NO：5的位置108對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置117對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置122對應的一位置處的一H、在與SEQ ID NO：5的位置138對應的一位置處的一Y、在與SEQ ID NO：5的位置139對應的一位置處的一L、在與SEQ ID NO：5的位置142對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置145對應的一位置處的一A、在與SEQ ID NO：5的位置153對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置155對應的一位置處的一W、在與SEQ ID NO：5的位置156對應的一位置處的一R、在與SEQ ID NO：5的位置160對應的一位置處的一D、以及在與SEQ ID NO：5的位置162對應的一位置處的一H；或 www) 在與SEQ ID NO：5的位置81對應的一位置處的一S。
如請求項217或請求項218所述的方法，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項217或請求項218所述的方法，其中該去胺酶具有SEQ ID NO：300-414、596-598、以及720-723中任一者的該胺基酸序列。
如請求項217至請求項220中任一項所述的方法，其中，當與SEQ ID NO：5相較時，該去胺酶具有改善的去胺酶活性。
如請求項217至請求項221中任一項所述的方法，其中該去胺酶是一腺嘌呤去胺酶。
如請求項217至請求項222中任一項所述的方法，其中該融合蛋白的該RGN具有與SEQ ID NO：1-4、49-162、435、575、576、698、以及699中任一者具有至少95%序列一致性的一胺基酸序列。
如請求項217至請求項222中任一項所述的方法，其中該融合蛋白的該RGN是一RGN切口酶。
如請求項224所述的方法，其中該RGN切口酶具有如SEQ ID NO：49-52以及698中任一者所示的該胺基酸序列。
如請求項217或請求項218所述的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：319具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：375具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：406具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：596具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：597具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：303具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：366具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括與SEQ ID NO：720具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列、且與包括與SEQ ID NO：49具有至少90%序列一致性的一胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項217或請求項218所述的方法，其中該融合蛋白從由以下組成的群組選出： a) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：319所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； b) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：375所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； c) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：406所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； d) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：596所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； e) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：597所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； f) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：303所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合； g) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：366所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合；以及 h) 包括該去胺酶的一融合蛋白，其中該去胺酶包括如SEQ ID NO：720所示的該胺基酸序列、且與包括如SEQ ID NO：49所示的該胺基酸序列的一RGN的該N端融合。
如請求項217或請求項218所述的方法，其中該融合蛋白具有如SEQ ID NO：577、578、582、584、588、593、594、604、605、616、以及729中任一者所示的該序列。
如請求項217至請求項228中任一項所述的方法，其中該標的DNA序列是一真核標的DNA序列。
如請求項217至請求項229中任一項所述的方法，其中該標的DNA序列被定位為與一原型間隔子相鄰模體(PAM)相鄰。
如請求項217至請求項230中任一項所述的方法，其中該標的DNA分子包括針對一疾病或病症的一因果突變以及其中該目標 DNA 分子的修飾校正該因果突變。
如請求項231所述的方法，其中該因果突變的該校正包括校正一無意義突變。
如請求項217至請求項232中任一項所述的方法，其中該標的DNA 分子在一細胞內。
如請求項233所述的方法，更包括選擇包括該修飾的DNA分子的一細胞。
一種細胞，其包括如請求項234所述的方法的一修飾的標的DNA序列。
如請求項235所述的細胞，其中該細胞是一哺乳動物細胞。
如請求項235所述的細胞，其中該細胞是一植物細胞。
一種植物或一種種子，其包括如請求項237所述的細胞。
一種醫藥組成物，其包括如請求項236所述的細胞、以及一藥學上可接受的載體。
一種用於治療患有或有風險進展一疾病、病症或症狀的一個體的方法，該方法包括：將如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白、如請求項171所述的RNP複合物、如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子、如請求項185或請求項186所述的載體、如請求項191、請求項212、以及請求項236中任一項所述的細胞、如請求項196至請求項210中任一項所述的系統、或如請求項194、請求項215、以及請求項239中任一項所述的醫藥組成物投予至該個體。
如請求項240所述的方法，其中該疾病與一因果突變相關聯以及該治療包括校正該因果突變。
一種如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白、如請求項171所述的RNP複合物、如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子、如請求項185或請求項186所述的載體、如請求項191、請求項212、以及請求項236中任一項所述的細胞、或如請求項196至請求項210中任一項所述的系統用於治療患有或有風險發展一疾病、病症或症狀病況的一個體中的該疾病、病症或症狀的用途。
如請求項242所述的用途，其中該疾病與一因果突變相關聯以及該治療包括校正該因果突變。
如請求項158至請求項170中任一項所述的融合蛋白、如請求項171所述的RNP複合物、如請求項172至請求項184中任一項所述的核酸分子、如請求項185或請求項186所述的載體、如請求項191、請求項212、以及請求項236中任一項所述的細胞、或如請求項196至請求項210中任一項所述的系統用於製造有用於治療一疾病、病症或症狀的一藥劑的用途。
如請求項244所述的用途，其中該疾病與一因果突變相關聯以及一有效量的該藥物校正該因果突變。