TW202140485A

TW202140485A - 化合物及其用途

Info

Publication number: TW202140485A
Application number: TW110103460A
Authority: TW
Inventors: 薩賓Ｋ魯佩爾; 朝霞楊; 傑生Ｔ洛韋; 喬翰尼斯Ｈ福格特
Original assignee: 美商福宏治療公司
Priority date: 2020-01-29
Filing date: 2021-01-29
Publication date: 2021-11-01
Also published as: BR112022014968A2; JP2023512040A; TWI877297B; CN115052594B; AU2021214767A1; EP4096651A4; US20210230190A1; KR20220133259A; MX2022009308A; IL295101A; WO2021155225A1; US20240166668A1; US11851445B2; JP7639010B2; CN115052594A; EP4096651A1; CA3167746A1

Abstract

本揭示案特徵在於可用於治療BAF複合物相關病症之化合物。

Description

化合物及其用途

疾病可能會受到BAF複合物之影響。BRD9係BAF複合物之組成部分。本發明係關於用於治療BAF複合物相關疾病，諸如癌症及感染之有用組合物和方法。

含溴結構域之蛋白質9 (BRD9)係由5號染色體上之BRD9基因編碼的蛋白質。BRD9係BAF (BRG1或BRM相關因子)複合物(一種SWI/SNF ATP酶染色質重塑複合物)之組成部分，且屬於含溴結構域蛋白質之IV家族。BRD9存在於若干SWI/SNF ATP酶染色質重塑複合物中，且在多種癌細胞株中上調。因此，降低BRD9之水準及/或活性的藥劑可提供用於治療諸如癌症及感染之疾病及病症的新方法。本發明者已發現使細胞中之BRD9耗盡引起彼等細胞中SS18-SSX融合蛋白之耗盡。在超過95%滑膜肉瘤腫瘤中偵測到SS18-SSX融合蛋白，且通常係滑膜肉瘤中唯一的細胞遺傳學異常。此外，有證據表明，BAF複合物與細胞抗病毒活性有關。因此，降解BRD9之藥劑(例如化合物)可用於治療與BAF、BRD9及/或SS18-SSX有關之疾病(例如癌症或感染)。

本揭示案特徵在於可用於治療BAF相關病症(例如癌症或感染)之化合物及方法。

在一態樣中，本發明特徵在於一種具有表1中化合物D1、S-D1、R-D1及D2中之任一者之結構的化合物，或其醫藥學上可接受之鹽。

在一些實施例中，化合物具有化合物D1之結構，或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，化合物具有化合物S-D1之結構，或為其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，化合物具有化合物R-D1之結構，或為其醫藥學上可接受之鹽。在其他實施例中，化合物具有化合物D2之結構，或其醫藥學上可接受之鹽。

在一態樣中，本發明特徵在於具有表1中化合物D1之結構的化合物，或其醫藥學上可接受之鹽。

在一態樣中，本發明特徵在於具有表1中化合物S-D1之結構的化合物，或其醫藥學上可接受之鹽。

在一態樣中，本發明特徵在於具有表1中化合物R-D1之結構的化合物，或其醫藥學上可接受之鹽。

在另一態樣中，本發明特徵在於具有表1中化合物D2之結構的化合物，或其醫藥學上可接受之鹽。表1. 本發明之化合物

化合物編號	結構
D1
S-D1
R-D1
D2

在另一態樣中，本揭示案特徵在於一種醫藥組合物，其包括上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。

在一態樣中，本揭示案特徵在於一種抑制細胞中之BRD9之水準及/或活性的方法，該方法包括使該細胞與有效量之上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽或其醫藥組合物接觸。

在另一態樣中，本揭示案特徵在於一種降低細胞中之BRD9之水準及/或活性的方法，該方法包括使該細胞與有效量之上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽或其醫藥組合物接觸。

在一些實施例中，細胞為癌細胞。

在一些實施例中，癌症為惡性橫紋肌樣瘤、CD8+ T細胞淋巴瘤、子宮內膜癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、胰臟癌、食道癌、前列腺癌、腎細胞癌、黑色素瘤、結腸直腸癌、肉瘤(例如軟組織肉瘤、滑膜肉瘤、尤因氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、成人纖維肉瘤、腺泡狀軟組織肉瘤、血管肉瘤、透明細胞肉瘤、促纖維組織增生性小圓細胞腫瘤、上皮樣肉瘤、纖維黏液樣肉瘤、胃腸道基質瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi sarcoma)、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、惡性間葉瘤惡性外周神經鞘腫瘤、黏液纖維肉瘤、低級別橫紋肌肉瘤)、非小細胞肺癌(例如鱗狀或腺癌)、胃癌或乳癌。在一些實施例中，癌症為惡性橫紋肌樣瘤、CD8+ T細胞淋巴瘤、子宮內膜癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、胰臟癌、食道癌、前列腺癌、腎細胞癌、黑色素瘤或結腸直腸癌。在一些實施例中，癌症為肉瘤(例如滑膜肉瘤或尤因氏肉瘤)、非小細胞肺癌(例如鱗狀或腺癌)、胃癌或乳癌。在一些實施例中，癌症為肉瘤(例如滑膜肉瘤或尤因氏肉瘤)。在一些實施例中，肉瘤為滑膜肉瘤。

在一態樣中，本揭示案特徵在於一種治療有需要之個體之BAF複合物相關病症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽或其醫藥組合物。在一些實施例中，BAF複合物相關病症為癌症。在一些實施例中，BAF複合物相關病症為感染。

在另一態樣中，本揭示案特徵在於一種治療有需要之個體之SS18-SSX融合蛋白相關病症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽或其醫藥組合物。在一些實施例中，SS18-SSX融合蛋白相關病症為癌症。在一些實施例中，SS18-SSX融合蛋白相關病症為感染。在前述方法中之任一者之一些實施例中，SS18-SSX融合蛋白為SS18-SSX1融合蛋白、SS18-SSX2融合蛋白或SS18-SSX4融合蛋白。

在另一態樣中，本揭示案特徵在於一種治療有需要之個體之BRD9相關病症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽或其醫藥組合物。在一些實施例中，BRD9相關病症為癌症。在一些實施例中，BRD9相關病症為感染。

在一些實施例中，癌症為鱗狀細胞癌、基底細胞癌、腺癌、肝細胞癌及腎細胞癌；膀胱、腸、乳房、子宮頸、結腸、食道、頭、腎臟、肝臟、肺、頸部、卵巢、胰腺、前列腺及胃之癌症；白血病；良性及惡性淋巴瘤，尤其伯基特氏淋巴瘤及非霍奇金氏淋巴瘤；良性及惡性黑色素瘤；骨髓增生性疾病；肉瘤，包括尤因氏肉瘤、血管內皮瘤、卡波西氏肉瘤、脂肪肉瘤、肌肉瘤、外周神經上皮瘤、滑膜肉瘤、神經膠質瘤、星細胞瘤、寡樹突神經膠細胞瘤、室管膜瘤、膠質母細胞瘤、神經母細胞瘤、神經節細胞瘤、神經節神經膠質瘤、髓母細胞瘤、松果體細胞腫瘤、腦膜瘤、腦膜肉瘤、纖維神經瘤及許旺細胞瘤；腸癌、乳癌、前列腺癌、子宮頸癌、子宮癌、肺癌、卵巢癌、睪丸癌、甲狀腺癌、星細胞瘤、食道癌、胰臟癌、胃癌、肝癌、結腸癌、黑色素瘤；癌肉瘤、霍奇金氏病、威爾姆斯氏瘤及畸胎癌。可使用根據本發明之所揭示化合物治療的另外的癌症包括例如急性顆粒球性白血病、急性淋巴球性白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、腺癌、腺肉瘤、腎上腺癌、腎上腺皮質癌、肛門癌、退行性星細胞瘤、血管肉瘤、闌尾癌、星細胞瘤、基底細胞癌、B細胞淋巴瘤、膽管癌、膀胱癌、骨癌、骨髓癌、腸癌、腦癌、腦幹神經膠質瘤、乳癌、三(雌激素、黃體酮及HER-2)陰性乳癌、雙陰性乳癌(雌激素、黃體酮及HER-2中之兩者呈陰性)、單陰性(雌激素、黃體酮及HER-2中之一者呈陰性)、雌激素受體陽性HER2陰性乳癌、雌激素受體陰性乳癌、雌激素受體陽性乳癌、轉移性乳癌、管腔A型乳癌、管腔B型乳癌、Her2陰性乳癌、HER2陽性或陰性乳癌、黃體酮受體陰性乳癌、黃體酮受體陽性乳癌、復發性乳癌、類癌瘤腫瘤、子宮頸癌、膽管細胞癌、軟骨肉瘤、慢性淋巴球性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、結腸癌、結腸直腸癌、顱咽管瘤、皮膚淋巴瘤、皮膚黑色素瘤、彌漫性星細胞瘤、導管原位癌(DCIS)、子宮內膜癌、室管膜瘤、上皮樣肉瘤、食道癌、尤因氏肉瘤、肝外膽管癌、眼癌、輸卵管癌、纖維肉瘤、膽囊癌、胃癌、胃腸癌、胃腸道類癌、胃腸道基質瘤(GIST)、生殖細胞腫瘤多形性膠質母細胞瘤(GBM)、神經膠質瘤、毛細胞白血病、頭頸癌血管內皮瘤、霍奇金淋巴瘤、下嚥癌、浸潤性導管癌(IDC)、浸潤性小葉癌(ILC)、發炎性乳癌(IBC)、腸癌、肝內膽管癌、侵襲性/浸潤性乳癌、胰島細胞癌、頜癌、卡波西氏肉瘤、腎癌、喉癌、平滑肌肉瘤、軟腦膜轉移、白血病、唇癌、脂肪肉瘤、肝癌、小葉原位癌、低級別星細胞瘤、肺癌、淋巴結癌、淋巴瘤、男性乳癌、髓樣癌、髓母細胞瘤、黑色素瘤、腦膜瘤、默克爾細胞癌(Merkel cell carcinoma)、間葉性軟骨肉瘤、間葉瘤、間皮瘤轉移性乳癌、轉移性黑色素瘤轉移性鱗狀頸癌、混合性膠質細胞瘤、單胚層畸胎瘤、口腔癌膠樣癌、黏膜黑色素瘤、多發性骨髓瘤、蕈樣真菌病、骨髓發育不良症候群、鼻腔癌、鼻咽癌、頸癌、神經母細胞瘤、神經內分泌腫瘤(NET)、非霍奇金氏淋巴瘤、非小細胞肺癌(NSCLC)、燕麥細胞癌、眼癌、眼睛黑色素瘤、寡樹突神經膠細胞瘤、口癌、口腔癌、口咽癌、骨原性肉瘤、骨肉瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌卵巢生殖細胞腫瘤、卵巢原發性腹膜癌、卵巢性索基質腫瘤、佩吉特氏病(Paget's disease)、胰臟癌、乳頭狀癌、鼻竇癌、甲狀旁腺癌、骨盆癌、陰莖癌、外周神經癌、腹膜癌、咽癌、嗜鉻細胞瘤、毛細胞型星細胞瘤、松果體區腫瘤、松果體母細胞瘤、腦下垂體癌、原發性中樞神經系統(CNS)淋巴瘤、前列腺癌、直腸癌、腎細胞癌、腎盂癌、橫紋肌肉瘤、唾液腺癌、軟組織肉瘤、骨骼肉瘤、肉瘤、鼻竇癌、皮膚癌、小細胞肺癌(SCLC)、小腸癌、脊椎癌、脊柱癌、脊髓癌、鱗狀細胞癌、胃癌、滑膜肉瘤、T細胞淋巴瘤、睪丸癌、咽喉癌、胸腺瘤/胸腺癌、甲狀腺癌、舌癌、扁桃體癌、移行細胞癌、輸卵管癌、管狀癌、未診斷癌、輸尿管癌、尿道癌、子宮腺癌、子宮癌、子宮肉瘤、陰道癌、外陰癌、T細胞譜系急性淋巴母細胞性白血病(T-ALL)、T細胞譜系淋巴母細胞性淋巴瘤(T-LL)、外周T細胞淋巴瘤、成人T細胞白血病、前B ALL、前B淋巴瘤、大B細胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤(Burkitts lymphoma)、B細胞ALL、費城染色體(Philadelphia chromosome)陽性ALL、費城染色體陽性CML、幼年型骨髓單核球性白血病(JMML)、急性前髓細胞白血病(AML亞型)、大顆粒淋巴球性白血病、成人T細胞慢性白血病、彌漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤；黏膜相關之淋巴組織淋巴瘤(MALT)、小細胞淋巴球性淋巴瘤、縱隔大B細胞淋巴瘤、結節邊緣區B細胞淋巴瘤(NMZL)；脾邊緣區淋巴瘤(SMZL)；血管內大B細胞淋巴瘤；原發性滲出性淋巴瘤；或淋巴瘤樣肉芽腫病；B細胞前淋巴球白血病；未分類脾淋巴瘤/白血病、脾彌漫性紅髓小B細胞淋巴瘤；淋巴漿細胞性淋巴瘤；重鏈病(例如α重鏈病、γ重鏈病、μ重鏈病)、漿細胞骨髓瘤、骨孤立性漿細胞肉瘤；骨外漿細胞瘤；原發性皮膚濾泡中心淋巴瘤、富含T細胞/組織細胞之大B細胞淋巴瘤、與慢性發炎相關之DLBCL；老年人艾司坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus，EBV) + DLBCL；原發性縱隔(胸腺)大B細胞淋巴瘤、原發性皮膚DLBCL、腿型、ALK+大 B細胞淋巴瘤、漿母細胞性淋巴瘤；在HHV8相關之多中心卡斯爾門病(Castleman disease)中出現之大B細胞淋巴瘤；具有介於彌漫性大B細胞淋巴瘤中間之特徵的未分類B細胞淋巴瘤，或具有介於彌漫性大B細胞淋巴瘤與經典霍奇金氏淋巴瘤中間之特徵的未分類B細胞淋巴瘤。

在一些實施例中，感染為病毒感染(例如以下病毒感染：反轉錄病毒科(Retroviridae)，諸如慢病毒(例如人類免疫缺乏病毒(HIV)及δ反轉錄病毒(例如人類T細胞白血病病毒(HTLV-I)、人類T細胞白血病病毒II (HTLV-II))；肝去氧核糖核酸病毒科(Hepadnaviridae)(例如B型肝炎病毒(HBV))；黃病毒科(Flaviviridae)(例如C型肝炎病毒(HCV))；腺病毒科(Adenoviridae)(例如人類腺病毒)；疱疹病毒科(Herpesviridae) (例如人類巨細胞病毒(HCMV)、艾司坦-巴爾病毒、單純疱疹病毒1 (HSV-1)、單純疱疹病毒2 (HSV-2)、人類疱疹病毒6 (HHV-6)、疱疹病毒K*、CMV、水痘-帶狀疱疹病毒)；乳頭瘤病毒科(Papillomaviridae) (例如人類乳頭瘤病毒(HPV、HPV E1))；細小病毒科(Parvoviridae) (例如細小病毒B19)；多瘤病毒科(Polyomaviridae) (例如JC病毒及BK病毒)；副黏液病毒科(Paramyxoviridae) (例如麻疹病毒)；或披膜病毒科(Togaviridae) (例如風疹病毒))。在一些實施例中，病症為科芬西裡斯病(Coffin Siris)、神經纖維瘤(例如NF-1、NF-2或許旺鞘瘤(Schwannomatosis))或多發性腦膜瘤。在一態樣中，本揭示案特徵在於一種治療有需要之個體之癌症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之上述化合物中之任一者或其醫藥學上可接受之鹽或上述醫藥組合物中之任一者。

在另一態樣中，本揭示案特徵在於一種用於治療有需要之個體之病毒感染的方法。此方法包括向該個體投與有效量之上述化合物中之任一者，或其醫藥學上可接受之鹽，或上述醫藥組合物中之任一者。在一些實施例中，病毒感染為以下病毒感染：反轉錄病毒科，諸如慢病毒(例如人類免疫缺乏病毒(HIV)及δ反轉錄病毒(例如人類T細胞白血病病毒(HTLV-I)、人類T細胞白血病病毒II (HTLV-II))；肝去氧核糖核酸病毒科(例如B型肝炎病毒(HBV))、黃病毒科(例如C型肝炎病毒(HCV))、腺病毒科(例如人類腺病毒)、疱疹病毒科(例如人類巨細胞病毒(HCMV)、艾司坦-巴爾病毒、單純疱疹病毒1 (HSV-1)、單純疱疹病毒2 (HSV-2)、人類疱疹病毒6 (HHV-6)、疱疹病毒K*、CMV、水痘-帶狀疱疹病毒)、乳頭瘤病毒科(例如人類乳頭瘤病毒(HPV、HPV E1))、細小病毒科(例如細小病毒B19)、多瘤病毒科(例如JC病毒及BK病毒)、副黏液病毒科(例如麻疹病毒)、披膜病毒科(例如風疹病毒)。

在上述方法中之任一者之另一實施例中，該方法進一步包括向該個體投與另外的抗癌療法(例如化學治療劑或細胞毒性劑或放射線療法)。

在特定實施例中，另外的抗癌療法為：化學治療劑或細胞毒性劑(例如多柔比星(doxorubicin)或異環磷醯胺(ifosfamide))、誘導分化劑(例如視黃酸、維生素D、細胞介素)、激素藥劑、免疫學藥劑或抗血管生成劑。化學治療劑及細胞毒性劑包括(但不限於)烷基化劑、細胞毒性抗生素、抗代謝物、長春花生物鹼、依託泊苷(etoposide)及其他藥劑(例如太平洋紫杉醇(paclitaxel)、紫杉醇(taxol)、多烯紫杉醇(docetaxel)、泰索帝(taxotere)、順鉑(cis-platinum))。具有抗癌活性之另外化合物之清單可見於L. Brunton, B. Chabner及B. Knollman (編輯). Goodman and Gilman’s The Pharmacological Basis of Therapeutics, 第十二版, 2011, McGraw Hill Companies, New York, NY。

在特定實施例中，本發明之化合物及另外的抗癌療法及上述化合物或醫藥組合物中之任一者彼此在28天內(例如在21天、14天、10天、7天、5天、4天、3天、2天或1天內)或在24小時(例如12小時、6小時、3小時、2小時或1小時；或伴隨)內，各呈一同有效治療個體之量。化學術語

本文所述之化合物可具有一或多個不對稱碳原子且可呈光學純對映異構物、對映異構物之混合物(諸如外消旋體)、光學純非對映異構物、非對映異構物之混合物、非對映異構物外消旋體或非對映異構物外消旋體之混合物形式存在。光學活性形式可例如藉由解析外消旋體、藉由不對稱合成或不對稱層析法(利用對掌性吸附劑或溶析液之層析法)獲得。亦即，某些所揭示之化合物可呈多種立體異構形式存在。立體異構物為僅空間排列不同之化合物。對映異構物為鏡像不可重疊之立體異構物對，最通常係因為其含有用作對掌性中心之不對稱取代之碳原子。「對映異構物」意謂彼此呈鏡像且不可重疊之一對分子中的一者。非對映異構物為非鏡像相關之立體異構物，最通常係因為其含有兩個或更多個不對稱取代之碳原子且表示一或多個對掌性碳原子周圍之取代基的組態。化合物之對映異構物可例如藉由使用一或多種熟知之技術及方法，諸如對掌性層析法及基於其之分離方法自外消旋體分離對映異構物來製備。適用於自外消旋混合物分離本文所述之化合物之對映異構物的技術及/或方法可容易地藉由所屬領域之技術人員確定。「外消旋體」或「外消旋混合物」意謂含有兩種對映異構物之化合物，其中此類混合物不展現光學活性；亦即，其不使偏振光平面旋轉。「幾何異構物」意謂在與碳-碳雙鍵、環烷基環或橋接雙環系統相關之取代基原子之方向上不同的異構物。碳-碳雙鍵每一側之原子(除H以外)可呈E (取代基在碳-碳雙鍵之對側)或Z (取代基在同一側上取向)組態。「R」、「S」、「S*」、「R*」、「E」、「Z」、「順式」及「反式」指示相對于核心分子之組態。某些所揭示之化合物可呈阻轉異構物形式存在。阻轉異構物為由圍繞單鍵之旋轉受阻引起的立體異構物，其中旋轉之空間張力阻礙高至足以允許分離構形異構物。本文所述之化合物可藉由異構物特異性合成製成個別異構物，或自異構物混合物解析。習知解析技術包括使用光學活性酸形成異構物對之各異構物之游離鹼的鹽(接著分級結晶及游離鹼再生)，使用光學活性胺形成異構物對之各異構物之酸形式的鹽(接著分級結晶及游離酸再生)，使用光學純之酸、胺或醇形成異構物對之各異構物之酯或醯胺(接著層析分離及移除對掌性助劑)，或使用多種熟知之層析法解析起始物質或最終產物之異構物混合物。當所揭示之化合物之立體化學藉由結構命名或描繪時，所命名或描繪之立體異構物係相對於其他立體異構物按重量計至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%。當單一對映異構物藉由結構命名或描繪時，所描繪或命名之對映異構物係按重量計至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%光學純。當單一非對映異構物藉由結構命名或描繪時，所描繪或命名之非對映異構物係按重量計至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%純。光學純度百分比為對映異構物之重量與對映異構物之重量加其光學異構物之重量的比率。按重量計之非對映異構物純度為一種非對映異構物與所有非對映異構物之重量的比率。當所揭示之化合物之立體化學藉由結構命名或描繪時，所命名或描繪之立體異構物係相對於其他立體異構物按莫耳分數計至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%純。當單一對映異構物藉由結構命名或描繪時，所描繪或命名之對映異構物係按莫耳分數計至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%純。當單一非對映異構物藉由結構命名或描繪時，所描繪或命名之非對映異構物係按莫耳分數計至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%純。按莫耳分數計之純度百分比為對映異構物之莫耳數與對映異構物之莫耳數加其光學異構物之莫耳數的比率。類似地，按莫耳分數計之純度百分比為非對映異構物之莫耳數與非對映異構物之莫耳數加其異構物之莫耳數的比率。當在不指示立體化學下藉由結構命名或描繪所揭示之化合物且化合物具有至少一個對掌性中心時，應瞭解，名稱或結構涵蓋不含對應光學異構物之化合物之對映異構物、化合物之外消旋混合物或一種對映異構物相對於對應光學異構物富集之混合物。當在不指示立體化學下藉由結構命名或描繪所揭示之化合物且化合物具有兩個或更多個對掌性中心時，應瞭解，名稱或結構涵蓋不含其他非對映異構物之非對映異構物、不含其他非對映異構物對之許多非對映異構物、非對映異構物之混合物、非對映異構物對之混合物、一種非對映異構物相對於其他非對映異構物富集之非對映異構物之混合物或一或多種非對映異構物相對於其他非對映異構物富集之非對映異構物之混合物。本發明涵蓋所有此等形式。

本揭示案之化合物亦包括中間物或最終化合物中存在之原子之所有同位素。「同位素」係指具有相同原子序數但由於原子核中之中子數不同而引起質量數不同的原子。舉例而言，氫同位素包括氚及氘。

除非另有說明，本文中描繪之結構亦意謂包括不同之處僅在於存在一或多個同位素富集原子的化合物。可併入本發明化合物中之示例性同位素包括氫、磷、氮、氧、磷、硫、氟、氯及碘之同位素，諸如² H、³ H、¹¹ C、¹³ C、¹⁴ C、¹³ N、¹⁵ N、¹⁵ O、¹⁷ O、¹⁸ O、³² P、³³ P、³⁵ S、¹⁸ F、³⁶ Cl、¹²³ I及¹²⁵ I。同位素標記化合物(例如經³ H及¹⁴ C標記之化合物)可用於化合物或受質組織分佈分析中。氚化(亦即³ H)及碳14 (亦即¹⁴ C)同位素因其容易製備及可偵測性而為有用的。此外，經諸如氘(亦即² H)之較重同位素取代可提供由更大代謝穩定性產生的某些治療優點(例如活體內半衰期延長或劑量需求降低)。在一些實施例中，一或多個氫原子經² H或³ H置換，或者一或多個碳原子經¹³ C或¹⁴ C富集碳置換。諸如¹⁵ O、¹³ N、¹¹ C及¹⁸ F之正電子發射同位素可用於正電子發射斷層攝影(PET)研究中以檢查受質受體佔有率。同位素標記之化合物之製備為所屬領域之技術人員已知。舉例而言，同位素標記之化合物通常可藉由根據類似于針對本文所述之本發明化合物所揭示程式的程式，藉由用同位素標記試劑代替非同位素標記試劑來製備。

如所屬領域中已知，許多化學實體可採用多種不同固體形式，諸如非晶形式或結晶形式(例如多晶型物、水合物、溶劑合物)。在一些實施例中，本發明之化合物可呈任何此類形式，包括呈任何固體形式利用。在一些實施例中，本文中描述或描繪之化合物可呈水合物或溶劑合物形式提供或利用。

除非另外定義，否則本文中使用之所有技術及科學術語均具有與本發明所屬領域之一般技術人員通常所瞭解之含義相同的含義。本文中描述用於本揭示案中之方法及材料；亦可使用所屬領域中已知之其他合適方法及材料。材料、方法及實例僅係例示性的，且不意欲限制。本文中提到之所有公開案、專利申請案、專利、序列、資料庫登錄及其他參考文獻均以引用之方式整體併入本文中。萬一發生矛盾，將以包括定義在內之本說明書為準。定義

在本申請案，除非另外自上下文清楚，否則(i)術語「一」可理解為意謂「至少一種」；(ii)術語「或」可理解為意謂「及/或」；及(iii)術語「包括」可理解為涵蓋詳細列舉之組分或步驟，無論單獨還是連同一或多種另外的組分或步驟一起呈現。

如本文所用，術語「約」及「大約」係指比所述值高或低10%內的值。舉例而言，術語「約5 nM」指示4.5至5.5 nM之範圍。

如本文所用，術語「投與」係指向個體或系統投與組合物(例如如本文所述之化合物或包括如本文所述之化合物之製劑)。可藉由任何適當途徑投與動物個體(例如人類)。舉例而言，在一些實施例中，投與可經支氣管(包括藉由支氣管灌注)、經頰、經腸、皮間(interdermal)、動脈內、皮內、胃內、髓內、肌肉內、鼻內、腹膜內、鞘內、腫瘤內、靜脈內、心室內、經黏膜、經鼻、經口、經直腸、皮下、舌下、表面、經氣管(包括藉由氣管內灌注)、經皮、經陰道及經玻璃體。

如本文所用，術語「成人軟組織肉瘤」係指在通常青少年及成人個體(例如至少10歲、11歲、12歲、13歲、14歲、15歲、16歲、17歲、18歲或19歲之個體)中體內軟組織中顯現之肉瘤。成人軟組織肉瘤之非限制性實例包括(但不限於)滑膜肉瘤、纖維肉瘤、惡性纖維組織細胞瘤、皮膚纖維肉瘤、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、血管內皮瘤、卡波西氏肉瘤、淋巴管肉瘤、惡性外周神經鞘腫瘤/神經纖維肉瘤、骨外軟骨肉瘤、骨外骨肉瘤、骨外黏液樣軟骨肉瘤及骨外間葉性軟骨肉瘤。

如本文所用，術語「BAF複合物」係指人類細胞中之BRG1或HRBM相關因子複合物。

如本文所用，術語「BAF複合物相關病症」係指由BAF複合物之水準及/或活性引起或受其影響的病症。

如本文所用，術語「GBAF複合物」及「GBAF」係指人類細胞中SWI/SNF ATP酶染色質重塑複合物。GBAF複合物次單元可包括(但不限於) ACTB、ACTL6A、ACTL6B、BICRA、BICRAL、BRD9、SMARCA2、SMARCA4、SMARCC1、SMARCD1、SMARCD2、SMARCD3及SS18。術語「癌症」係指由惡性贅生性細胞增殖所引起之疾患，諸如腫瘤、贅生物、癌瘤、肉瘤、白血病及淋巴瘤。

如本文所用，術語「BRD9」係指含溴結構域蛋白質9，BAF (BRG1或BRM相關因子)複合物(一種SWI/SNF ATP酶染色質重塑複合物)之組成部分，且屬於含溴結構域蛋白質之IV家族。BRD9由BRD9 基因編碼，其核酸序列在SEQ ID NO: 1中示出。術語「BRD9」亦指野生型BRD9蛋白質之天然變異體，諸如蛋白質與SEQ ID NO: 2中所示之野生型BRD9之胺基酸序列具有至少85%序列一致性(例如85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.9%一致性或更多)。

如本文所用，術語「BRD9相關病症」係指由BRD9之水準及/或活性引起或受其影響的病症。術語「癌症」係指由惡性贅生性細胞增殖所引起之疾患，諸如腫瘤、贅生物、癌瘤、肉瘤、白血病及淋巴瘤。

如本文所用，「組合療法」或「組合投與」意謂兩種(或更多種)不同藥劑或治療作為界定用於特定疾病或疾患之治療方案的一部分投與個體。治療方案界定各藥劑之投與劑量及週期，使得單獨藥劑對個體之作用重疊。在一些實施例中，兩種或更多種藥劑之遞送係同時的或同時發生的，且藥劑可共同調配。在一些實施例中，兩種或更多種藥劑不共同調配，且作為指定方案之一部分以連續方式投與。在一些實施例中，兩種或更多種藥劑或治療組合投與使得症狀或與病症有關之其他參數減少，程度超過在單獨遞送之一種藥劑或治療下或在缺乏其他藥劑或治療下將觀測到的症狀或參數。兩種治療之作用可部分累加，整體累加，或超過累加(例如協同)。各治療劑之連續或基本上同時投與可藉由任何適當途徑實現，包括(但不限於)口服途徑、靜脈內途徑、肌肉內途徑及穿過黏膜組織直接吸收。治療劑可藉由相同途徑或藉由不同途徑投與。舉例而言，組合之治療劑可藉由靜脈內注射投與，而組合之第二治療劑可經口投與。

如本文所用，「本發明之化合物」及類似術語，無論是否明確指示，均係指可用於治療本文所述之BAF相關病症(例如癌症或感染)的化合物，例如化合物D1、化合物S-D1、化合物R-D1或化合物D2，以及其鹽(例如醫藥學上可接受之鹽)、溶劑合物、水合物、立體異構物(包括阻轉異構物)及互變異構物。所屬領域之技術人員將瞭解，本文所述之某些化合物可呈一或多種不同異構物(例如立體異構物、幾何異構物、阻轉異構物及互變異構物)或同位素(例如其中一或多個原子已經該原子之不同同位素取代，諸如氘取代氫)形式存在。除非另外指示或自上下文清楚，否則所描繪之結構可理解為代表個別或組合之任何此類異構物或同位素形式。本文所述之化合物可為不對稱的(例如具有一或多個立構中心)。除非另外指示，否則意欲諸如對映異構物及非對映異構物之所有立體異構物。含有經不對稱取代之碳原子的本揭示案之化合物可呈光學活性或外消旋形式分離。所屬領域中已知自光學活性之起始物質製備光學活性形式之方法，諸如藉由解析外消旋混合物或藉由立體選擇性合成。烯烴、C = N雙鍵及其類似物之許多幾何異構物亦可存在于本文所述之化合物中，且本揭示案中涵蓋所有此類穩定異構物。描述本揭示案之化合物之順式與反式幾何異構物且可呈異構物混合物或呈單獨異構物形式分離。在一些實施例中，本文中描繪之一或多種化合物可呈不同互變異構形式存在。如自上下文清楚，除非明確排除，否則提及此類化合物涵蓋所有此類互變異構形式。在一些實施例中，互變異構形式由單鍵與相鄰雙鍵交換及伴隨質子遷移產生。在某些實施例中，互變異構形式可為質子移變互變異構物，其為具有與參考形式相同之經驗式及總電荷的異構物質子化狀態。具有質子移變互變異構形式之部分的實例為酮-烯醇對、醯胺-亞胺酸對、內醯胺-內醯亞胺對、烯胺-亞胺酸對、烯胺-亞胺對及環狀形式，其中質子可佔據雜環系統之兩個或更多個位置，諸如1H-及3H-咪唑、1H-、2H-及4H-1,2,4-三唑、1H-及2H-異吲哚、以及1H-及2H-吡唑。在一些實施例中，互變異構形式可處於平衡中或藉由適當取代而在空間上鎖定成一種形式。在某些實施例中，互變異構形式由縮醛互變產生。

如本文所用，術語「降解劑」係指包括降解部分之小分子化合物，其中該化合物與蛋白質(例如BRD9)以引起蛋白質降解之方式相互作用，例如化合物之結合引起例如細胞或個體中蛋白質水準減少至少5%。

如本文所用，術語「降解部分」係指結合引起例如BRD9之蛋白質降解的部分。在一個實例中，該部分結合於代謝例如BRD9之蛋白質的蛋白酶或泛素連接酶。

「測定蛋白質水準」意謂藉由所屬領域中已知之方法直接或間接偵測蛋白質或編碼蛋白質之mRNA。「直接測定」意謂執行一種方法(例如對樣品執行分析或測試或「分析樣品」，如該術語在本文中定義時)以獲得物理實體或值。「間接測定」係指接受來自另一方或來源(例如直接獲得物理實體或值之第三方實驗室)之物理實體或值。量測蛋白質水準之方法一般包括(但不限於)西方墨點法、免疫墨點法、酶聯免疫吸附分析(ELISA)、放射免疫分析(RIA)、免疫沈澱、免疫螢光、表面電漿子共振、化學發光、螢光偏振、磷光、免疫組織化學分析、基質輔助雷射脫附/離子化飛行時間(MALDI-TOF)質譜法、液體層析(LC)-質譜法、微流式細胞術術、顯微術、螢光活化之細胞分選(FACS)及流式細胞術術，以及基於包括(但不限於)酶活性或與其他蛋白質搭配物之相互作用之蛋白質特性的分析。所屬領域中已知量測mRNA水準之方法。

如本文所用，術語本文所述之降低BRD9之水準及/或活性(例如細胞或個體中)之藥劑的「有效量」、「治療有效量」及「足夠量」係指當向包括人類之個體投與時足以實現有益或期望結果，包括臨床結果之量，因而，「有效量」或其同義詞視其應用之背景而定。舉例而言，在治療癌症之背景下，其為降低BRD9之水準及/或活性之藥劑與在不投與降低BRD9之水準及/或活性之藥劑下獲得之反應相比足以實現治療反應的量。與此類量對應的所給定的本文所述之降低BRD9之水準及/或活性之藥劑的量將視多種因素而變化，該等因素諸如所給定之藥劑、醫藥製劑、投藥途徑、疾病或病症類型、所治療之個體或宿主之特性(例如年齡、性別及/或體重)及其類似因素，然而可藉由所屬領域之技術人員按常規測定。此外，如本文所用，本揭示案之降低BRD9之水準及/或活性之藥劑的「治療有效量」為與對照物相比中個體中產生有益或期望結果之量。如本文中所定義，本揭示案之降低BRD9之水準及/或活性之藥劑的治療有效量容易藉由所屬領域之一般技術人員藉由所屬領域中已知之常規方法測定。可調整給藥方案以提供最佳治療反應。

如本文所用，術語「抑制劑」係指降低蛋白質(例如BRD9)之水準及/或活性之任何藥劑。抑制劑之非限制性實例包括小分子抑制劑、降解劑、抗體、酶或多核苷酸(例如siRNA)。

「水準」意謂蛋白質或編碼蛋白質之mRNA與參考相比之水準。參考可為如本文中定義之任何有用之參考。「降低水準」或「增加水準」之蛋白質意謂蛋白質水準與參考相比降低或增加(例如降低或增加約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、約100%、約150%、約200%、約300%、約400%、約500%或更多；與參考相比降低或增加超過約10%、約15%、約20%、約50%、約75%、約100%或約200%；降低或增加小於約0.01倍、約0.02倍、約0.1倍、約0.3倍、約0.5倍、約0.8倍或更小；或增加超過約1.2倍、約1.4倍、約1.5倍、約1.8倍、約2.0倍、約3.0倍、約3.5倍、約4.5倍、約5.0倍、約10倍、約15倍、約20倍、約30倍、約40倍、約50倍、約100倍、約1000倍或更多)。蛋白質水準可以相對於樣品中之總蛋白質或mRNA的品質/體積(例如g/dL、mg/mL、μg/mL、ng/mL)或百分比表述。

「調節BAF複合物之活性」意謂改變與BAF複合物(例如GBAF)有關之活性之水準，或相關下游效應。BAF複合物之活性水準可使用所屬領域中已知之任何方法，例如Kadoch等人, Cell 153:71-85 (2013)中所述之方法量測，該等方法以引用之方式併入本文中。

關於參考多核苷酸或多肽序列之「序列一致性百分比(%)」定義為在比對序列及必要時引入間隙以實現最大序列一致性百分比後，候選序列中與參考多核苷酸或多肽序列中之核酸或胺基酸一致之核酸或胺基酸的百分比。用於測定核酸或胺基酸序列一致性百分比之比對可用在所屬領域之技術人員能力範圍內之多種方式，例如使用公眾可獲得之電腦軟體，諸如BLAST、BLAST-2或Megalign軟體來實現。所屬領域之技術人員可確定用於比對序列之適當參數，包括實現所比較之全長序列上之最大比對所需的任何演算法。舉例而言，可使用序列比較電腦程式BLAST產生序列一致性百分比值。作為例證，所給定之核酸或胺基酸序列A相對於、與或對比所給定之核酸或胺基酸序列B的序列一致性百分比(其可替代地用短語表達為相對於、與或對比所給定之核酸或胺基酸序列B具有一定序列一致性百分比的A)如下計算： 100乘以(分數X/Y) 其中X為在序列比對程式(例如BLAST)對A及B進行比對中，藉由程式評分為一致匹配的核苷酸或胺基酸數目，且其中Y為B中核酸總數。應瞭解，在核酸或胺基酸序列A之長度與核酸或胺基酸序列B之長度不等的情況下，A對B之序列一致性百分比不等於B對A之序列一致性百分比。

如本文所用，「醫藥學上可接受之賦形劑」係指除本文所述之化合物以外(例如能夠使活性化合物懸浮或溶解之媒劑)且在患者中具有基本上無毒及非炎性之特性的任何成分。賦形劑可包括例如：抗黏著劑、抗氧化劑、黏合劑、包衣、壓縮助劑、崩解劑、染料(著色劑)、軟化劑、乳化劑、填充劑(稀釋劑)、成膜劑或包衣、調味劑、香料、助流劑(流動增強劑)、潤滑劑、防腐劑、印刷油墨、吸附劑、懸浮或分散劑、甜味劑及水合水。

如本文所用，術語「醫藥學上可接受之鹽」意謂本文所述之化合物中之任何化合物的任何醫藥學上可接受之鹽。舉例而言，本文所述之任何化合物之醫藥學上可接受之鹽包括在合理醫學判斷範圍內，適於與人類及動物之組織接觸使用，無過度毒性、刺激、過敏反應，且與合理益處/風險比相稱的鹽。醫藥學上可接受之鹽係所屬領域中所熟知的。舉例而言，醫藥學上可接受之鹽描述於以下中：Berge等人, J. Pharmaceutical Sciences 66:1-19, 1977及Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use, (P.H. Stahl及C.G. Wermuth編輯), Wiley-VCH, 2008。鹽可在本文所述之化合物之最終分離及純化期間當場製備，或藉由游離鹼基團與合適有機酸反應而單獨製備。本文所述之化合物可具有可離子化基團以便能夠製備成醫藥學上可接受之鹽。此等鹽可為涉及無機酸或有機酸之酸加成鹽，或在本文所述之化合物之酸性形式的情況下，鹽可自無機鹼或有機鹼製備。化合物常製備成呈醫藥學上可接受之酸或鹼之加成產物製備的醫藥學上可接受之鹽或呈醫藥學上可接受之鹽使用。合適的醫藥學上可接受之酸及鹼以及適當鹽之製備方法係所屬領域中熟知的。鹽可自包括無機酸及有機酸以及無機鹼及有機鹼的醫藥學上可接受之無毒酸及鹼製備。

如本文所用，術語「醫藥組合物」表示含有與醫藥學上可接受之賦形劑一起調配之本文所述之化合物且經政府管理機構批准作為用於治療哺乳動物之疾病之治療方案的一部分製造或出售的組合物。醫藥組合物可例如調配用於呈單位劑型(例如錠劑、膠囊、囊片、明膠膠囊或糖漿)口服；用於表面投與(例如呈乳膏、凝膠、洗劑或軟膏)；用於靜脈內投與(例如呈不含微粒栓子且於適合於靜脈內使用之溶劑系統中的無菌溶液)；或呈任何其他醫藥學上可接受之調配物。

「降低BRD9活性」意謂降低與BRD9有關之活性之水準或相關下游效應。抑制BRD9活性之一非限制性實例為降低細胞中BAF複合物(例如GBAF)之水準。BRD9之活性水準可使用所屬領域中已知之任何方法量測。在一些實施例中，降低BRD9活性之藥劑為小分子BRD9抑制劑。在一些實施例中，降低BRD9活性之藥劑為小分子BRD9降解劑。

「降低BRD9水準」意謂降低細胞或個體中BRD9之水準。BRD9之水準可使用所屬領域中已知之任何方法量測。

「參考」意謂用於比較蛋白質或mRNA水準之任何有用參考。參考可為用於達成比較目的之任何樣品、標準、標準曲線或水準。參考可為正常參考樣品或參考標準或水準。「參考樣品」可為例如對照物，例如預先確定之陰性對照值，諸如取自同一個體之「正常對照物」或先前樣品；來自正常健康個體之樣品，諸如正常細胞或正常組織；來自未患病之個體之樣品(例如細胞或組織)；來自經診斷患有疾病但未用本文所述之化合物治療之個體的樣品；來自已經本文所述之化合物治療之個體的樣品；或經純化在已知標準濃度下之蛋白質(例如本文所述之任一者)的樣品。「參考標準或水準」意謂源自於參考樣品之值或數值。「正常對照值」為指示非疾病病況之預測定值，例如在健康對照個體中預期之值。通常，正常對照值可表述為範圍(「介於X與Y之間」)、高閾值(「不高於X」)或低閾值(「不低於X」)。對特定生物標記物之測定值在正常對照值內的個體通常稱為在該生物標記物之「正常界限內」。正常參考標準或水準可為源自於未患疾病或病症(例如癌症)之正常個體的值或數值；已用本文所述之化合物治療的個體。在較佳實施例中，藉由以下標準中之至少一者，參考樣品、標準或水準與樣品受試樣品匹配：年齡、體重、性別、疾病階段及總體健康狀態。在正常參考範圍內的經純化蛋白質，例如本文所述之任一者之水準的標準曲線亦可用作參考。

如本文所用，術語「個體」係指根據本發明之組合物可投與以例如達成實驗、診斷、預防性及/或治療性目的之任何生物體。典型個體包括任何動物(例如哺乳動物，諸如小鼠、大鼠、兔、非人類靈長類動物及人類)。個體可尋求或需要治療，需要治療，正接受治療，將來接受治療，或為處於訓練有素之專業人員針對特定疾病或疾患進行照護下的人類或動物。

如本文所用，術語「SS18-SSX融合蛋白相關病症」係指由SS18-SSX融合蛋白之水準及/或活性引起或受其影響的病症。

如本文所用，術語「治療(treat/treated/treating)」意謂治療性治療與預防性或預防措施，其中目標係預防或減慢(減輕)不希望有之生理疾患、病症或疾病，或獲得有益或期望臨床結果。有益或期望臨床結果包括(但不限於)減輕症狀；降低疾患、病症或疾病之程度；疾患、病症或疾病之狀態穩定(亦即未惡化)；疾患、病症或疾病進展之發作延遲或減慢；改善疾患、病症或疾病病況或症狀緩解(無論部分還是總體)，無論可偵測還是不可偵測；改善至少一種可量測之物理參數，患者不一定可辨別；或疾患、病症或疾病改善或好轉。治療包括引起臨床顯著反應，無過度副作用水準。治療亦包括與未接受治療下預期存活期相比延長存活期。

如本文所用，術語「變異體」及「衍生物」可互換使用且係指本文所述之化合物、肽、蛋白質或其他物質之天然存在、合成及半合成類似物。本文所述之化合物、肽、蛋白質或其他物質的變異體或衍生物可保留或改善原始物質之生物活性。

本發明之一或多種實施例的細節在以下描述中闡明。本發明之其他特徵、物件及優點將自描述及自申請專利範圍中顯而易見。

本揭示案特徵在於可用於治療BAF相關病症(例如癌症及感染)之組合物及方法。本揭示案進一步特徵在於可用於在有需要之個體中抑制BRD9之水準及/或活性，例如用於治療諸如癌症(例如肉瘤)及感染(例如病毒感染)之病症的組合物及方法。化合物

本文所述之化合物降低細胞或個體中與BRD9有關之活性之水準或相關下游效應，或降低細胞或個體中之BRD9水準。本文所述之示例性化合物具有表1中化合物D1、S-D1、R-D1及D2之結構，或其醫藥學上可接受之鹽。醫藥用途

本文所述之化合物可用於本發明之方法中，且雖然不受理論束縛，但鹹信經由其調節BAF複合物之水準、狀態及/或活性的能力，例如藉由抑制哺乳動物中之細胞中BAF複合物內BRD9蛋白質之活性或水準，發揮其理想作用。

本發明之一態樣係關於治療與BRD9有關之病症，諸如有需要之個體之癌症的方法。在一些實施例中，化合物以有效產生以下中之一者(或更多者，例如兩者或更多者、三者或更多者、四者或更多者)的量及時間來投與：(a)減小腫瘤尺寸；(b)降低腫瘤生長速率；(c)增加腫瘤細胞死亡；(d)減慢腫瘤進展；(e)減少轉移數目；(f)降低轉移速率；(g)減少腫瘤復發；(h)增加個體存活率；及(i)增加個體之無進展存活期。

治療癌症可引起腫瘤尺寸或體積減小。舉例而言，在治療後，腫瘤尺寸相對於其在治療之前的尺寸減小5%或更大(例如10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更大)。腫瘤尺寸可藉由任何可複現之量測方式量測。舉例而言，腫瘤尺寸可量測為腫瘤直徑。

治療癌症可進一步引起腫瘤數目減少。舉例而言，在治療後，腫瘤數目相對於在治療之前的數目減少5%或更大(例如10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更大)。腫瘤數目可藉由任何可複現之量測方式量測，例如腫瘤數目可藉由計數肉眼可見或在指定放大率(例如2x、3x、4x、5x、10x或50x)下可見之腫瘤量測。

治療癌症可引起遠離原發腫瘤部位之其他組織或器官中轉移性結節之數目減少。舉例而言，在治療後，轉移性結節之數目相對於在治療之前的數目減少5%或更大(例如10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更大)。轉移性結節之數目可藉由任何可複現之量測方式量測。舉例而言，轉移性結節之數目可藉由計數肉眼可見或在指定放大率(例如2x、10x或50x)下可見之轉移性結節量測。

治療癌症可引起根據本發明治療之個體群體與未經治療之個體群體相比平均存活時間增加。舉例而言，平均存活時間增加超過30天(超過60天、90天或120天)。群體之平均存活時間增加可藉由任何可複現之方法量測。群體之平均存活時間增加可例如藉由計算群體在開始用本文所述之化合物治療之後的平均存活時長來量測。群體之平均存活時間增加亦可例如藉由計算群體在結束第一輪用本文所述化合物之醫藥學上可接受之鹽治療之後的平均存活時長來量測。

治療癌症亦可引起所治療個體之群體與未經治療之群體相比死亡率下降。舉例而言，死亡率下降超過2% (例如超過5%、10%或25%)。所治療個體之群體之死亡率下降可藉由任何可複現方法量測，例如藉由計算群體在開始用本文所述化合物之醫藥學上可接受之鹽治療之後每單位時間之疾病相關死亡之平均數目來量測。群體之死亡率下降亦可藉由計算群體在結束第一輪用本文所述化合物之醫藥學上可接受之鹽治療之後每單位時間之疾病相關死亡之平均數目來量測。組合療法

本發明之方法可單獨或與例如治療癌症或與癌症相關之症狀的其他藥劑的另外治療劑組合或與其他類型治療癌症之療法組合使用。在組合治療中，治療性化合物中之一或多者之劑量可自單獨投與時之標準劑量減少。舉例而言，劑量可憑經驗自藥物組合及排列確定，或可藉由等輻射分析推導(例如Black等人,Neurology 65:S3-S6 (2005))。在此情況下，化合物在組合時之劑量將提供治療作用。

在一些實施例中，第二治療劑為化學治療劑(例如細胞毒性劑或可用於治療癌症之其他化合物)。此等包括烷基化劑、抗代謝物、葉酸類似物、嘧啶類似物、嘌呤類似物及有關抑制劑、長春花生物鹼、表鬼臼毒素、抗生素、L-天冬醯胺酶、拓撲異構酶抑制劑、干擾素、鉑配位複合物、蒽二酮取代之脲、甲基肼衍生物、腎上腺皮質抑制劑、腎上腺皮質類固醇、助孕素、雌激素、抗雌激素、雄激素、抗雄激素及促性腺激素釋放激素類似物。亦包括5-氟尿嘧啶(5-FU)、甲醯四氫葉酸(leucovorin，LV)、依立替康(irenotecan)、奧沙利鉑(oxaliplatin)、卡培他濱(capecitabine)、太平洋紫杉醇及多烯紫杉醇。化學治療劑之非限制性實例包括烷基化劑，諸如噻替派(thiotepa)及環磷醯胺；烷基磺酸酯，諸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶，諸如苯佐替派(benzodopa)、卡巴醌(carboquone)、美妥替派(meturedopa)及烏瑞替派(uredopa)；乙烯亞胺及甲基蜜胺，包括六甲蜜胺(altretamine)、曲他胺(triethylenemelamine)、三伸乙基磷醯胺(trietylenephosphoramide)、三伸乙基硫代磷醯胺(triethiylenethiophosphoramide)及三羥甲基蜜胺(trimethylolomelamine)；多聚乙醯(acetogenin) (尤其布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone))；喜樹鹼(包括合成類似物拓撲替康(topotecan))；苔蘚蟲素(bryostatin)；卡利斯他汀(callystatin)；CC-1065 (包括其阿多來新(adozelesin)、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物)；念珠藻素(cryptophycin)(尤其念珠藻素1及念珠藻素8)；朵拉司他汀(dolastatin)；多米卡新(duocarmycin) (包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1)；艾榴塞洛素(eleutherobin)；水鬼蕉鹼(pancratistatin)；匍枝珊瑚醇(sarcodictyin)；海綿抑素(spongistatin)；氮芥類(nitrogen mustards)，諸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、膽磷醯胺(cholophosphamide)、雌氮芥(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、氮芥(mechlorethamine)、氮芥氧化物鹽酸鹽、美法侖(melphalan)、新恩比興(novembichin)、苯芥膽甾醇(phenesterine)、潑尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亞硝基脲，諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷莫司汀(ranimnustine)；抗生素，諸如烯二炔抗生素(例如卡奇黴素(calicheamicin)，尤其卡奇黴素γll及卡奇黴素γll (參見例如Agnew, Chem. Intl. Ed Engl. 33:183-186 (1994))；達內黴素(dynemicin)，包括達內黴素A；雙膦酸鹽(bisphosphonate)，諸如氯膦酸鹽(clodronate)；埃斯培拉黴素(esperamicin)；以及新制癌菌素髮色團及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團)、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放線菌素(actinomycin)、安麯黴素(authramycin)、氮雜絲胺酸(azaserine)、博萊黴素(bleomycin)、放線菌素C(cactinomycin)、卡拉比星(carabicin)、洋紅黴素(caminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycinis)、放線菌素D (dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-側氧基-L-正白胺酸、ADRIAMYCIN® (多柔比星(doxorubicin)，包括嗎啉基-多柔比星、氰基嗎啉基-多柔比星、2-吡咯啉基-多柔比星及去氧多柔比星)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊達比星(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycin) (諸如絲裂黴素C (mitomycin C))、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾加黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycins)、培洛黴素(peplomycin)、泊非黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、三鐵阿黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑菌素(streptonigrin)、鏈脲黴素(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)；抗代謝物，諸如甲胺喋呤(methotrexate)及5-氟尿嘧啶(5-FU)；葉酸類似物，諸如二甲葉酸(denopterin)、甲胺喋呤、喋羅呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤類似物，諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤(6-mercaptopurine)、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤(thioguanine)；嘧啶類似物，諸如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、雙去氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)；雄激素，諸如卡魯睪酮(calusterone)、屈他雄酮丙酸鹽(dromostanolone propionate)、表硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪內酯(testolactone)；抗腎上腺藥，諸如胺魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；葉酸補充劑，諸如亞葉酸(frolinic acid)；醋葡內酯(aceglatone)；醛磷醯胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；胺基乙醯丙酸(aminolevulinic acid)；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；倍曲布西(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；依達曲沙(edatraxate)；地磷醯胺(defofamine)；地美可辛(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；依洛尼塞(elfomithine)；依利醋銨乙酸鹽(elliptinium acetate)；埃坡黴素(epothilone)；依託格魯(etoglucid)；硝酸鎵；羥基脲(hydroxyurea)；蘑菇多糖(lentinan)；洛尼達寧(lonidainine)；美登素類(maytansinoids)，諸如美登素(maytansine)及安絲菌素(ansamitocin)；丙脒腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫皮達莫(mopidanmol)；二胺硝吖啶(nitraerine)；噴司他丁(pentostatin)；蛋胺氮芥(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；鬼臼酸(podophyllinic acid)；2-乙基醯肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK®多醣複合物(JHS Natural Products, Eugene, OR)；雷佐生(razoxane)；根黴素(rhizoxin)；西佐喃(sizofuran)；螺旋鍺(spirogermanium)；細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2',2''-三氯三乙胺；單端孢黴毒素(trichothecenes) (尤其T- 2毒素、瓦魯克林(verracurin A)、桿孢菌素A(roridin A)及蛇形菌素(anguidine))；烏拉坦(urethan)；長春地辛(vindesine)；達卡巴嗪(dacarbazine)；甘露莫司汀(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；加胞嘧啶(gacytosine)；阿糖胞苷(arabinoside，「Ara-C」)；環磷醯胺；噻替派(thiotepa)；紫杉烷類(taxoids)，例如TAXOL® (太平洋紫杉醇；Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, NJ)、ABRAXANE®無cremophor之白蛋白工程改造之太平洋紫杉醇奈米粒子調配物(American Pharmaceutical Partners, Schaumberg, IL)及TAXOTERE®多烯紫杉醇(Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France)；瘤可寧(chloranbucil)；GEMZAR®吉西他濱；6-硫代鳥嘌呤(6-thioguanine)；巰基嘌呤(mercaptopurine)；甲胺喋呤；鉑配位複合物，諸如順鉑、奧沙利鉑及卡鉑；長春花鹼；鉑；依託泊苷(etoposide，VP-16)；異環磷醯胺；米托蒽醌；長春新鹼；NAVELBINE®長春瑞濱(vinorelbine)；諾消靈(novantrone)；替尼泊苷(teniposide)；依達曲沙(edatrexate)；道諾黴素(daunomycin)；胺基喋呤(aminopterin)；希羅達(xeloda)；伊班膦酸鹽(ibandronate)；伊立替康(irinotecan)(例如CPT-11)；拓撲異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基]鳥胺酸(DMFO)；類視色素，諸如視黃酸；卡培他濱(capecitabine)；及以上任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。兩種或更多種化學治療劑可呈混合物形式使用以與本文所述之第一治療劑組合投與。所屬領域中已知組合化學療法之合適給藥方案且描述於例如Saltz等人,Proc. Am. Soc. Clin. Oncol . 18:233a (1999)，及Douillard等人,Lancet 355(9209):1041-1047 (2000)。

在一些實施例中，第二治療劑為DNA損傷劑(例如鉑基抗瘤劑、拓撲異構酶抑制劑、PARP抑制劑、烷基化抗瘤劑及電離輻射)。

可用作本發明之組合物及方法中之第二治療劑的鉑基抗瘤劑之實例為順鉑、卡鉑、奧沙利鉑、雙環鉑(dicycloplatin)、依他鉑(eptaplatin)、洛鉑(lobaplatin)、米鉑(miriplatin)、奈達鉑(nedaplatin)、四硝酸三鉑(triplatin tetranitrate)、苯奈鉑(phenanthrilplatin)、吡鉑(picoplatin)及沙曲鉑(satraplatin)。在一些實施例中，第二治療劑為順鉑且所治療癌症為睪丸癌、卵巢癌或膀胱癌(例如晚期膀胱癌)。在一些實施例中，第二治療劑為卡鉑且所治療癌症為卵巢癌、肺癌、頭頸癌、腦癌或神經母細胞瘤。在一些實施例中，第二治療劑為奧沙利鉑且所治療癌症為結腸直腸癌。在一些實施例中，第二治療劑為雙環鉑且所治療癌症為非小細胞肺癌或前列腺癌。在一些實施例中，第二治療劑為依他鉑且所治療癌症為胃癌。在一些實施例中，第二治療劑為洛鉑且所治療癌症為乳癌。在一些實施例中，第二治療劑為米鉑且所治療癌症為肝細胞癌。在一些實施例中，第二治療劑為奈達鉑且所治療癌症為鼻咽癌、食道癌、鱗狀細胞癌或子宮頸癌。在一些實施例中，第二治療劑為四硝酸三鉑且所治療癌症為肺癌(例如小細胞肺癌)或胰臟癌。在一些實施例中，第二治療劑為吡鉑且所治療癌症為肺癌(例如小細胞肺癌)、前列腺癌、膀胱癌或結腸直腸癌。在一些實施例中，第二治療劑為沙曲鉑且所治療癌症為前列腺癌、乳癌或肺癌。

可用作本發明之組合物及方法中之第二治療劑的拓撲異構酶抑制劑之實例為依託泊苷、替尼泊苷、多柔比星、道諾黴素、米托蒽醌、安吖啶、玫瑰樹鹼、伊立替康、拓撲替康、喜樹鹼及二氟替康(diflomotecan)。在一些實施例中，第二治療劑為依託泊苷且所治療癌症為肺癌(例如小細胞肺癌)或睪丸癌。在一些實施例中，第二治療劑為替尼泊苷且所治療癌症為急性淋巴母細胞性白血病(例如兒童急性淋巴母細胞性白血病)。在一些實施例中，第二治療劑為多柔比星且所治療癌症為急性淋巴母細胞性白血病、急性髓母細胞性白血病、霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、乳癌、威爾姆斯氏瘤、神經母細胞瘤、軟組織肉瘤、骨肉瘤、卵巢癌瘤、膀胱移行細胞癌、甲狀腺癌、胃癌或支氣管癌。在一些實施例中，第二治療劑為道諾黴素且所治療癌症為急性淋巴母細胞性白血病或急性骨髓性白血病。在一些實施例中，第二治療劑為米托蒽醌且所治療癌症為前列腺癌或急性非淋巴球性白血病。在一些實施例中，第二治療劑為安吖啶且所治療癌症為白血病(例如急性成人白血病)。在一些實施例中，第二治療劑為伊立替康且所治療癌症為結腸直腸癌。在一些實施例中，第二治療劑為拓撲替康且所治療癌症為肺癌(例如小細胞肺癌)。在一些實施例中，第二治療劑為二氟替康且所治療癌症為肺癌(例如小細胞肺癌)。

可用作本發明之組合物及方法中之第二治療劑的烷基化抗瘤劑之實例為環磷醯胺、尿嘧啶氮芥、美法侖、苯丁酸氮芥、異環磷醯胺、苯達莫司汀、卡莫司汀、洛莫司汀、氯脲菌素、福莫司汀、尼莫司汀、雷莫司汀、白消安、英丙舒凡、哌泊舒凡、萘氮芥、膽磷醯胺、雌氮芥、氮芥、氧化氮芥鹽酸鹽、新恩比興、苯芥膽甾醇、潑尼莫司汀、曲磷胺、丙卡巴肼、六甲蜜胺、達卡巴嗪、米托唑胺(mitozolomide)及替莫唑胺(temozolomide)。在一些實施例中，第二治療劑為環磷醯胺且所治療癌症為非霍奇金氏淋巴瘤。在一些實施例中，第二治療劑為美法侖且所治療癌症為多發性骨髓瘤、卵巢癌或黑色素瘤。在一些實施例中，第二治療劑為苯丁酸氮芥且所治療癌症為慢性淋巴球性白血病、惡性淋巴瘤(例如淋巴肉瘤、巨濾泡性淋巴瘤或霍奇金氏淋巴瘤)。在一些實施例中，第二治療劑為異環磷醯胺且所治療癌症為睪丸癌。在一些實施例中，第二治療劑為苯達莫司汀且所治療癌症為慢性淋巴球性白血病或非霍奇金氏淋巴瘤。在一些實施例中，第二治療劑為卡莫司汀且所治療癌症為腦癌(例如膠質母細胞瘤、腦幹神經膠質瘤、髓母細胞瘤、星細胞瘤、室管膜瘤或轉移性腦腫瘤)、多發性骨髓瘤、霍奇金氏病或非霍奇金氏淋巴瘤。在一些實施例中，第二治療劑為洛莫司汀且所治療癌症為腦癌或霍奇金氏淋巴瘤。在一些實施例中，第二治療劑為福莫司汀且所治療癌症為黑色素瘤。在一些實施例中，第二治療劑為尼莫司汀且所治療癌症為腦癌。在一些實施例中，第二治療劑為雷莫司汀且所治療癌症為慢性骨髓性白血病或真性紅血球增多症。在一些實施例中，第二治療劑為白消安且所治療癌症為慢性骨髓性白血病。在一些實施例中，第二治療劑為英丙舒凡且所治療癌症為肉瘤。在一些實施例中，第二治療劑為雌氮芥且所治療癌症為前列腺癌(例如前列腺癌)。在一些實施例中，第二治療劑為氮芥且所治療癌症為皮膚T細胞淋巴瘤。在一些實施例中，第二治療劑為曲磷胺且所治療癌症為肉瘤(例如軟組織肉瘤)。在一些實施例中，第二治療劑為丙卡巴肼且所治療癌症為霍奇金氏病。在一些實施例中，第二治療劑為六甲蜜胺且所治療癌症為卵巢癌。在一些實施例中，第二治療劑為達卡巴嗪且所治療癌症為黑色素瘤、霍奇金氏淋巴瘤或肉瘤。在一些實施例中，第二治療劑為替莫唑胺且所治療癌症為腦癌(例如星細胞瘤或膠質母細胞瘤)或肺癌(例如小細胞肺癌)。

可用作本發明之組合物及方法中之第二治療劑的PARP抑制劑之實例為尼拉帕尼(niraparib)、奧拉帕尼(olaparib)、盧卡帕尼(rucaparib)、他他拉唑帕尼(talazoparib)、維利帕尼(veliparib)、帕米帕利(pamiparib)、CK-102或E7016。有利地，本發明之化合物及DNA損傷劑可協同用以治療癌症。在一些實施例中，第二治療劑為尼拉帕尼且所治療癌症為卵巢癌(例如BRCA突變之卵巢癌)、輸卵管癌(例如BRCA突變之輸卵管癌)或原發性腹膜癌(例如BRCA突變之原發性腹膜癌)。在一些實施例中，第二治療劑為奧拉帕尼且所治療癌症為肺癌(例如小細胞肺癌)、卵巢癌(例如BRCA突變之卵巢癌)、乳癌(例如BRCA突變之乳癌)、輸卵管癌(例如BRCA突變之輸卵管癌)、原發性腹膜癌(例如BRCA突變之原發性腹膜癌)、前列腺癌(例如抗去勢性前列腺癌)或胰臟癌(例如胰腺癌)。在一些實施例中，第二治療劑為盧卡帕尼且所治療癌症為卵巢癌(例如BRCA突變之卵巢癌)、輸卵管癌(例如BRCA突變之輸卵管癌)或原發性腹膜癌(例如BRCA突變之原發性腹膜癌)。在一些實施例中，第二治療劑為他拉唑帕尼且所治療癌症為乳癌(例如BRCA突變之乳癌)。在一些實施例中，第二治療劑為維利帕尼且所治療癌症為肺癌(例如非小細胞肺癌)、黑色素瘤、乳癌、卵巢癌、前列腺癌或腦癌。在一些實施例中，第二治療劑為帕米帕利且所治療癌症為卵巢癌。在一些實施例中，第二治療劑為CK-102且所治療癌症為肺癌(例如非小細胞肺癌)。在一些實施例中，第二治療劑為E7016且所治療癌症為黑色素瘤。

不希望受理論束縛，本發明之化合物與DNA損傷劑之間的協同作用可歸因於DNA修復之BRD9必要性；BRD9之抑制可使癌症(例如癌細胞或癌組織)對DNA損傷劑敏感。

在一些實施例中，第二治療劑為JAK抑制劑(例如JAK1抑制劑)。可用作本發明之組合物及方法中之第二治療劑的JAK抑制劑之非限制性實例包括托法替尼(tofacitinib)、盧梭替尼(ruxolitinib)、奧拉替尼(oclacitinib)、巴瑞替尼(baricitinib)、培非替尼(peficitinib)、非德替尼(fedratinib)、烏帕替尼(upadacitinib)、菲格替尼(filgotinib)、賽度替尼(cerdulatinib)、甘多替尼(gandotinib)、來他替尼(lestaurtinib)、莫洛替尼(momelotinib)、派克替尼(pacritinib)、阿布羅替尼(abrocitinib)、索西替尼(solcitinib)、伊他替尼(itacitinib)或SHR0302。不希望受理論束縛，本發明之化合物與JAK抑制劑之間的協同作用可因其下調Foxp3+ Treg細胞之組合效應而為SAGA複合物之抑制劑。在一些實施例中，第二治療劑為盧梭替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如紅細胞增多症或骨髓纖維化)、卵巢癌、乳癌、胰臟癌。在一些實施例中，第二治療劑為非德替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如骨髓纖維化)。在一些實施例中，第二治療劑為賽度替尼且所治療癌症為淋巴瘤(例如外周T細胞淋巴瘤)。在一些實施例中，第二治療劑為甘多替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如紅細胞增多症或骨髓纖維化)。在一些實施例中，第二治療劑為來他替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如紅細胞增多症或骨髓纖維化)、白血病(例如急性骨髓性白血病)、胰臟癌、前列腺癌或神經母細胞瘤。在一些實施例中，第二治療劑為莫洛替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如紅細胞增多症或骨髓纖維化)或胰臟癌(例如胰臟導管腺癌)。在一些實施例中，第二治療劑為莫洛替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如紅細胞增多症或骨髓纖維化)。在一些實施例中，第二治療劑為莫洛替尼且所治療癌症為骨髓增生性贅生物(例如紅細胞增多症或骨髓纖維化)或胰臟癌(例如胰臟導管腺癌)。

在一些實施例中，第二治療劑為SAGA複合物或其組分之抑制劑。SAGA複合物抑制劑可為例如CCDC101、Tada2B、Tada3、Usp22、Tada1、Taf6l、Supt5、Supt20或其組合之抑制抗體或小分子抑制劑。不希望受理論束縛，本發明之化合物與SAGA複合物之抑制劑之間的協同作用可歸因於其下調Foxp3+ Treg細胞之組合效應。在一些實施例中，第二治療劑為作為用於癌症治療之生物製劑，諸如細胞介素(例如干擾素或介白素(例如IL-2))的治療劑。在一些實施方案中，生物製劑為抗血管生成劑，諸如抗VEGF劑，例如貝伐珠單抗(bevacizumab，AVASTIN®)。在一些實施方案中，生物製劑為對標靶有促效作用以刺激抗癌反應或拮抗對癌症有重要意義之抗原的基於免疫球蛋白之生物製劑，例如單株抗體(例如人類化抗體、完全人類抗體、Fc融合蛋白或其功能片段)。此類藥劑包括RITUXAN® (利妥昔單抗(rituximab))；ZENAPAX® (達利珠單抗(daclizumab))；SIMULECT® (巴厘昔單抗(basiliximab))；SYNAGIS® (帕利珠單抗(palivizumab))；REMICADE® (英夫利昔單抗(infliximab))；HERCEPTIN® (曲妥珠單抗(trastuzumab))；MYLOTARG® (吉奧單抗(gemtuzumab ozogamicin))；CAMPATH® (阿侖單抗(alemtuzumab))；ZEVALIN® (替伊莫單抗(ibritumomab tiuxetan))；HUMIRA® (阿達木單抗(adalimumab))；XOLAIR® (奧馬珠單抗(omalizumab))；BEXXAR® (托西莫單抗-I-131 (tositumomab-I-131))；RAPTIVA® (依法珠單抗(efalizumab))；ERBITUX® (西妥昔單抗(cetuximab))；AVASTIN® (貝伐珠單抗)；TYSABRI® (那他珠單抗(natalizumab))；ACTEMRA® (托珠單抗(tocilizumab))；VECTIBIX® (帕尼單抗(panitumumab))；LUCENTIS® (蘭尼單抗(ranibizumab))；SOLIRIS® (依庫珠單抗(eculizumab))；CIMZIA® (聚乙二醇結合之賽妥珠單抗(certolizumab pegol))；SIMPONI® (戈利木單抗(golimumab))；ILARIS® (卡那津單抗(canakinumab))；STELARA® (優特克單抗(ustekinumab))；ARZERRA® (奧法木單抗(ofatumumab))；PROLIA® (地諾單抗(denosumab))；NUMAX® (莫維珠單抗(motavizumab))；ABTHRAX® (瑞西巴庫單抗(raxibacumab))；BENLYSTA® (貝利單抗(belimumab))；YERVOY® (伊匹單抗(ipilimumab))；ADCETRIS® (維布妥昔單抗(brentuximab vedotin))；PERJETA® (帕妥珠單抗(pertuzumab))；KADCYLA® (美坦辛曲妥珠單抗(ado-trastuzumab emtansine))；及GAZYVA® (阿托珠單抗(obinutuzumab))。亦包括抗體藥物結合物。

第二藥劑可為作為非藥物治療之治療劑。舉例而言，第二治療劑為放射療法、冷凍療法、體溫過高及/或腫瘤組織之手術切除。

第二藥劑可為檢查點抑制劑。在一個實施例中，檢查點抑制劑為抑制抗體(例如單特異性抗體，諸如單株抗體)。抗體可為例如人類化或完全人類抗體。在一些實施例中，檢查點抑制劑為融合蛋白，例如Fc受體融合蛋白。在一些實施例中，檢查點抑制劑為與檢查點蛋白相互作用之藥劑，諸如抗體。在一些實施例中，檢查點抑制劑為與檢查點蛋白之配位體相互作用之藥劑，諸如抗體。在一些實施例中，檢查點抑制劑為CTLA-4抑制劑(例如抑制抗體或小分子抑制劑) (例如抗CTLA4抗體或融合蛋白，諸如伊匹單抗/YERVOY®或曲美目單抗)。在一些實施例中，檢查點抑制劑為PD-1抑制劑(例如抑制抗體或小分子抑制劑) (例如納武單抗/OPDIVO®；派姆單抗/KEYTRUDA®；匹利珠單抗/CT-011)。在一些實施例中，檢查點抑制劑為PDL1抑制劑(例如抑制抗體或小分子抑制劑) (例如MPDL3280A/RG7446；MEDI4736；MSB0010718C；BMS 936559)。在一些實施例中，檢查點抑制劑為PDL2抑制劑(例如抑制抗體或Fc融合物或小分子抑制劑) (例如PDL2/Ig融合蛋白，諸如AMP 224)。在一些實施例中，檢查點抑制劑為B7-H3 (例如MGA271)、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK 1、CHK2、A2aR、B-7家族配位體或其組合之抑制劑(例如抑制抗體或小分子抑制劑)。在一些實施例中，第二治療劑為伊匹單抗且所治療癌症為黑色素瘤、腎癌、肺癌(例如非小細胞肺癌或小細胞肺癌)或前列腺癌。在一些實施例中，第二治療劑為曲美目單抗且所治療癌症為黑色素瘤、間皮瘤或肺癌(例如非小細胞肺癌)。在一些實施例中，第二治療劑為納武單抗且所治療癌症為黑色素瘤、肺癌(例如非小細胞肺癌或小細胞肺癌)、腎癌、霍奇金氏淋巴瘤、頭頸癌(例如頭頸部鱗狀細胞癌)、尿路上皮癌、肝細胞癌或結腸直腸癌。在一些實施例中，第二治療劑為派姆單抗且所治療癌症為黑色素瘤、肺癌(例如非小細胞肺癌或小細胞肺癌)、霍奇金氏淋巴瘤、頭頸癌(例如頭頸部鱗狀細胞癌)、原發性縱隔大B細胞淋巴瘤、尿路上皮癌、肝細胞癌、高微衛星不穩定性癌、胃癌、食道癌、子宮頸癌、默克爾細胞癌(Merkel cell carcinoma)、腎癌或子宮內膜癌。在一些實施例中，第二治療劑為MPDL3280A且所治療癌症為肺癌(例如非小細胞肺癌或小細胞肺癌)、尿路上皮癌、肝細胞癌或乳癌。在一些實施例中，第二治療劑為MEDI4736且所治療癌症為肺癌(例如非小細胞肺癌或小細胞肺癌)或尿路上皮癌。在一些實施例中，第二治療劑為MSB0010718C且所治療癌症為尿路上皮癌。在一些實施例中，第二治療劑為MSB0010718C且所治療癌症為黑色素瘤、肺癌(例如非小細胞肺癌)、結腸直腸癌、腎臟癌、卵巢癌、胰臟癌、胃癌及乳癌。

有利地，本發明之化合物及檢查點抑制劑可協同用以治療癌症。不希望受理論束縛，本發明之化合物與檢查點抑制劑之間的協同作用可歸因於與BRD9抑制誘導之Foxp3+ Treg細胞下調相關的檢查點抑制劑功效增強。

在一些實施例中，抗癌療法為T細胞過繼轉移(ACT)療法。在一些實施例中，T細胞為活化T細胞。T細胞可經修飾以表現嵌合抗原受體(CAR)。經CAR修飾之T (CAR-T)細胞可藉由所屬領域中已知之任何方法產生。舉例而言，CAR-T細胞可藉由將編碼CAR之合適表現載體引入至T細胞中來產生。在T細胞擴增及基因修飾之前，自個體獲得T細胞來源。可自許多來源獲得T細胞，包括外周血單核細胞、骨髓、淋巴結組織、臍帶血、胸腺組織、來自感染部位之組織、腹水、胸腔積液、脾組織及腫瘤。在本發明之某些實施例中，可使用所屬領域中可利用之許多T細胞株。在一些實施例中，T細胞為自體同源T細胞。無論在T細胞進行基因修飾以表現理想蛋白質(例如CAR)之前還是之後，一般可使用如例如以下中所述之方法活化及擴增T細胞：美國專利6,352,694；6,534,055；6,905,680；6,692,964；5,858,358；6,887,466；6,905,681；7,144,575；7,067,318；7,172,869；7,232,566；7,175,843；5,883,223；6,905,874；6,797,514；6,867,041；及美國專利申請公開案第20060121005號。

在本文所述之組合實施例中之任一者中，第一及第二治療劑同時或以任一次序相繼投與。第一治療劑可在第二治療劑之前或之後長達1小時、長達2小時、長達3小時、長達4小時、長達5小時、長達6小時、長達7小時、長達8小時、長達9小時、長達10小時、長達11小時、長達12小時、長達13小時、14小時、長達16小時、長達17小時、長達18小時、長達19小時、長達20小時、長達21小時、長達22小時、長達23小時、長達24小時或長達1-7天、1-14天、1-21天或1-30天即刻投與。醫藥組合物

本文所述之醫藥組合物較佳配製成呈適合於活體內投與之生物學上相容形式的醫藥組合物用於投與人類個體。

本文所述之化合物可呈游離鹼、呈鹽、溶劑合物形式及呈前藥使用。所有形式均在本文所述之方法內。根據本發明之方法，如所屬領域之技術人員所瞭解，所述化合物或其鹽、溶劑合物或前藥可呈多種形式投與患者，視所選投藥途徑而定。本文所述之化合物可例如藉由經口、非經腸、經頰、舌下、經鼻、經直腸、貼片、泵、腫瘤內或經皮投與來投與，且醫藥組合物相應地調配。非經腸投與包括靜脈內、腹膜內、皮下、肌肉內、經上皮、經鼻、肺內、鞘內、經直腸及表面投與模式。非經腸投與可藉由在所選時間段內連續輸注進行。

本文所述之化合物可例如利用惰性稀釋劑或利用可吸收之可食用載劑經口投與，或其可裝入硬殼或軟殼明膠膠囊中，或其可壓縮成錠劑，或其可直接與食品合併。對於經口治療性投與而言，本文所述之化合物可與賦形劑合併，且呈可攝取之錠劑、口頰錠、糖衣錠、膠囊、酏劑、懸浮液、糖漿及糯米紙形式使用。本文所述之化合物亦可非經腸投與。本文所述之化合物之溶液可在適合與介面活性劑(諸如羥丙基纖維素)混合之水中製備。分散液亦可在丙三醇、液體聚乙二醇、DMSO及其混合物中在有或者沒有醇下以及油中製備。在正常儲存及使用條件下，此等製劑可含有防止微生物生長之防腐劑。用於選擇及製備合適調配物之習知程式及成分描述於例如Remington's Pharmaceutical Sciences (2012, 第22版)及The United States Pharmacopeia: The National Formulary (USP 41 NF36), 2018年出版。適合於可注射使用之醫藥形式包括無菌水溶液或分散液及臨用時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉劑。在所有情況下，形式必須無菌且必須為流體，達到容易經由注射器投與之程度。用於經鼻投與之組合物宜調配成氣溶膠、滴劑、凝膠及粉劑。氣溶膠調配物通常包括活性物質於生理學上可接受之水性或非水溶劑中的溶液或微懸浮液，且通常呈無菌形式以單劑或多劑之量呈現於密封容器中，該密封容器可採取藥筒或再裝品的形式供霧化裝置使用。可替代地，密封容器可為一體式噴散裝置，諸如單劑量經鼻吸入器或裝有意欲使用後拋棄之計量閥之氣溶膠噴散器。在劑型包括氣溶膠噴散器之情況下，其將含有推進劑，推進劑可為壓縮氣體，諸如壓縮空氣或有機推進劑，諸如氟氯烴。氣溶膠劑型亦可採取泵式噴霧器的形式。適合於經頰或舌下投與之組合物包括錠劑、口含錠及軟錠劑，其中活性成分與諸如糖、阿拉伯膠、黃芪膠、明膠及甘油之載劑一起調配。用於直腸投與之組合物宜呈含有習知栓劑鹼、諸如可可脂之栓劑形式。本文所述之化合物可經腫瘤內，例如呈腫瘤內注射物投與。腫瘤內注射直接注射至腫瘤血管中，且具體設想用於離散、實體、易接近之腫瘤。局部、區域或全身性投與亦可為適當的。本文所述之化合物宜藉由投與注射物或多個注射物至腫瘤，例如相隔大約1 cm時間間隔來接觸。在外科手術情況下，本發明可在手術前使用，以便使不宜手術之腫瘤進行切除術。適當時，亦可例如藉由將導管植入腫瘤中或腫瘤血管中來連續投與。

如本文中所示，本文所述之化合物可單獨或與醫藥學上可接受之載劑組合投與動物，例如人類，其中比例由化合物之溶解性及化學性質、所選擇之投藥途徑及標準醫藥實踐決定。劑量

本文所述之化合物及/或包括本文所述之化合物之組合物的劑量可視多種因素而變化，該等因素諸如化合物之藥效性；投與模式；接受者之年齡健康狀態及體重；症狀之性質及程度治療頻率及同時進行之治療之類型(若有)；及化合物在有待治療之動物中之清除率。所屬領域之技術人員可基於上述因素確定適當劑量。本文所述之化合物可最初以合適劑量投與，劑量可根據需要視臨床反應而進行調整。一般而言，當本文所述之化合物以例如介於0.05 mg與3000 mg (呈固體形式量測)之間的日劑量投與人類時可獲得令人滿意之結果。劑量範圍包括例如10-1000 mg (例如50-800 mg)之間。在一些實施例中，投與50、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950或1000 mg化合物。

可替代地，可使用患者體重來計算劑量。舉例而言，化合物或其醫藥組合物投與患者之劑量可在0.1-100 mg/kg範圍內。套組

本發明特徵亦在於套組，其包括(a)包括本文所述之降低細胞或個體中BRD9之水準及/或活性之藥劑的醫藥組合物，及(b)具有執行本文所述之方法中之任一者之說明書的包裝插頁。在一些實施例中，套組包括(a)包括本文所述之降低細胞或個體中BRD9之水準及/或活性之藥劑的醫藥組合物，(b)另外的治療劑(例如抗癌劑)，及(c)具有執行本文所述之方法中之任一者之說明書的包裝插頁。實例實例 1-BRD9 降解劑使 BRD9 蛋白質耗盡

以下實例證明用BRD9降解劑處理之滑膜肉瘤細胞中BRD9蛋白質之耗盡。

程序：將細胞用DMSO或BRD9降解劑化合物1 (亦稱dBRD9，參見Remillard等人,Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 56(21):5738-5743 (2017)；參見以下化合物1之結構)處理，劑量及時間點如所指示。

全細胞提取物藉由SDS-PAGE分級分離且根據製造商方案(Bio-Rad)使用轉移設備轉移至聚偏二氟乙烯膜。在與含5%脫脂乳之TBST (10 mM Tris pH 8.0、150 mM NaCl、0.5% Tween 20)一起培育60分鐘之後，將膜與針對BRD9 (1:1,000，Bethyl laboratory A303-781A)、GAPDH (1:5,000，Cell Signaling Technology)及/或MBP (1:1,000，BioRad)之抗體在4℃下培育隔夜。將膜洗滌三次，歷時10分鐘，且與結合辣根過氧化物酶(HRP，圖2-3)或IRDye (圖4，1:20,000，LI-COR)之抗小鼠或抗兔抗體一起培育至少1小時。將墨點用TBST洗滌三次，且根據製造商之方案用ECL系統顯影(圖2-3)或在Odyssey CLx成像系統上掃描(圖4)。

結果：用BRD9降解劑化合物1處理SYO1滑膜肉瘤細胞引起細胞中BRD9之劑量依賴性(圖1)及時間依賴性(圖2)耗盡。此外，如圖3中所示，在非滑膜肉瘤細胞株(293T)中複製化合物1對BRD9之耗盡且可持續至少5天。實例 2-BRD9 抑制劑及 BRD9 降解劑對滑膜細胞株之生長的抑制

以下實例證明BRD9降解劑及抑制劑選擇性地抑制滑膜肉瘤細胞之生長。程序：

將細胞用DMSO或BRD9降解劑化合物1以所指示濃度處理，且自第7天至第14天，藉由使用IncuCyte活細胞分析系統量測隨時間推移之匯合來監測增殖(圖4)。每3-4天更新生長培養基及化合物。

將細胞接種至12孔盤中，且用DMSO、1 μM BRD9抑制劑、化合物2 (亦稱BI-7273，參見Martin等人,J Med Chem. 59(10):4462-4475 (2016)；參見以下化合物2之結構)或1 μM BRD9降解劑化合物1處理。

針對各細胞株優化細胞數目。每3-5天更新生長培養基及化合物。在第11天將SYO1、Yamato、A549、293T及HS-SY-II細胞固定及染色。在第23天將ASKA細胞固定且染色。藉由與結晶紫溶液(0.5 g結晶紫、27 ml 37%甲醛、100 mL 10X PBS、10 mL甲醇、863 dH20至1L)培育30分鐘，接著用水洗滌3次且在室溫下乾燥培育盤至少24小時來進行染色。隨後在Odyssey CLx成像系統上掃描培育盤(圖5)。

將細胞接種至96孔超低簇盤(Costar，#_7007)中之200 μL完全培養基中且在第2天用DMSO、星形孢菌素(Staurosporin)或BRD9降解劑化合物1以所指示劑量處理(圖2C)。每5天更換培養基及化合物且在第14天使細胞群落成像。

結果： 如圖4、5及6所示，用BRD9抑制劑化合物2或BRD9降解劑化合物1處理滑膜肉瘤細胞株(SYO1、Yamato、HS-SY-II及ASKA)引起細胞生長之抑制，但未引起非滑膜對照癌細胞株(293T、A549、G401)之生長之抑制。實例 3-BRD9 降解劑及 BRD9 結合劑對滑膜細胞株之生長的選擇性抑制

以下實例證明BRD9降解劑及結合劑選擇性地抑制滑膜肉瘤細胞之生長。

程序： 將細胞接種至6孔或12孔盤中且每日用BRD9降解劑(化合物1)、溴結構域BRD9結合劑(化合物2)、E3連接酶結合劑(來那度胺)、DMSO或星形孢菌素(細胞殺死之陽性對照物)在所指示濃度下處理。針對各細胞株優化細胞數目。每5天更新生長培養基。至第14天，移除培養基，將細胞用PBS洗滌，且在室溫下使用500 μL於25% (v/v)甲醇中之0.005% (w/v)結晶紫溶液染色至少1小時。隨後在Odyssey CLx成像系統上掃描培育盤。

結果： 如圖7及8所示，用化合物1或化合物2處理滑膜肉瘤細胞株(SYO1、HS-SY-II及ASKA)引起細胞生長之抑制，但未引起非滑膜對照癌細胞株(RD、HCT116及Calu6)之生長之抑制。總體上，化合物1在所有滑膜細胞株中顯示最顯著之生長抑制。實例 4- 滑膜肉瘤細胞中細胞生長之抑制

以下實例展示BRD9降解劑在滑膜肉瘤細胞中抑制細胞生長且誘導細胞凋亡。

程序： 將SYO1細胞用DMSO、200 nM或1 μM之BRD9降解劑(化合物1)或200 nM E3連接酶結合劑(來那度胺)處理8或13天。每5天更新化合物。使用Click-iT™ Plus EdU流式細胞術分析(Invitrogen)執行細胞週期分析。使用膜聯蛋白V-FITC細胞凋亡偵測套組(Sigma A9210)執行細胞凋亡分析。根據製造商之方案執行分析。

結果： 如圖9-12所示，用化合物1處理8或13天引起細胞週期之S期中之細胞數目與DMSO及來那度胺相比減少。用化合物1處理8天亦引起早期及晚期細胞凋亡細胞數目與DMSO對照物相比增加。實例 5-SS18-SSX1-BAF 之組合物

以下實例展示作為含SS18-SSX之BAF複合物之組成部分的BRD9的鑒定。

程序： 使用慢病毒整合產生表現HA-SS18SSX1之穩定293T細胞株。含SS18-SSX1之BAF複合物進行親和力純化且隨後質譜分析揭露SS18-SSX1相互作用蛋白質。

結果： 如圖13所示，包括SS18-SSX融合蛋白之BAF複合物亦包括BRD9。針對ARID1A (95種肽)、ARID1B (77種肽)、SMARCC1 (69種肽)、SMARCD1 (41種肽)、SMARCD2 (37種肽)、DPF2 (32種肽)、SMARCD3 (26種肽)、ACTL6A (25種肽)、BRD9 (22種肽)、DPF1同功型2 (18種肽)、DPF3 (13種肽)及ACTL6B (6種肽)鑒定出超過5種獨特肽。實例 6- 製備 4-[6-( 氮雜環丁烷 -1- 基 )-2- 甲基 -1- 側氧基 -2,7- 萘啶 -4- 基 ]-2,6- 二甲氧基苯甲醛 ( 中間物 H)

步驟 1 ：製備 6- 氯 -4- 甲基吡啶 -3- 甲醯胺 ( 中間物 B)

向攪拌之6-氯-4-甲基吡啶-3-甲酸(20.00 g，116.564 mmol，1.00當量)及NH₄ Cl (62.35 g，1.17 mol，10.00當量)於二氯甲烷(DCM；400 mL)中之混合物中添加DIEA (22.60 g，174.846 mmol，3.00當量)。在攪拌5分鐘後，逐份添加HATU (66.48 g，174.846 mmol，1.50當量)。將所得混合物在室溫下攪拌3小時。將所得混合物減壓濃縮，且殘餘物藉由矽膠管柱層析法來純化，用1/1至3/2之石油醚/乙酸乙酯(PE/EtOAc)溶析，得到呈黃色固體狀之6-氯-4-甲基吡啶-3-甲醯胺(18.30 g，61.3%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 171。步驟 2 ：製備 6- 氯 -N-[(1E)-( 二甲基胺基 ) 亞甲基 ]-4- 甲基吡啶 -3- 甲醯胺 ( 中間物 C)

在80℃下在氮氣氛圍下向攪拌之6-氯-4-甲基吡啶-3-甲醯胺(18.30 g，107.268 mmol，1.00當量)及於2-甲基四氫呋喃(100 mL)中之混合物中添加DMF-DMA (19.17 g，160.903 mmol，1.50當量)，且再攪拌1小時。接著使混合物冷卻且濃縮，得到呈粗黃色固體狀之6-氯-N-[(1E)-(二甲基胺基)亞甲基]-4-甲基吡啶-3-甲醯胺(26.3 g，91.3%)，其未經進一步純化直接使用。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 226。步驟 3 ：製備 6- 氯 -2H-2,7- 萘啶 -1- 酮 ( 中間物 D)

向攪拌之6-氯-N-[(1E)-(二甲基胺基)亞甲基]-4-甲基吡啶-3-甲醯胺(26.30 g)於THF (170.00 mL)中之混合物中添加t-BuOK (174.00 mL，THF中1 mol/L)。將所得溶液在60℃下在氮氣氛圍下攪拌30分鐘。接著使混合物冷卻且減壓濃縮。將粗固體用飽和NaHCO₃ 溶液(100 mL)洗滌且收集，得到呈粉色固體狀之6-氯-2H-2,7-萘啶-1-酮(14.1 g，67.0%)，其未經進一步純化直接使用。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 181。步驟 4 ：製備 6- 氯 -2- 甲基 -2,7- 萘啶 -1- 酮 ( 中間物 E)

在0℃下向攪拌之6-氯-2H-2, 7-萘啶-1-酮(14.10 g，78.077 mmol，1.00當量)于無水THF (280.00 mL)中之混合物中逐份添加NaH (9.37 g，234.232 mmol，3.00當量，60%)。10分鐘後，在0℃下添加MeI (33.25 g，234.232 mmol，3.00當量)，且將混合物在0℃下攪拌10分鐘，且接著將混合物在室溫下攪拌12小時。將所得混合物減壓濃縮。將粗固體用水(100 mL)形成漿液，且過濾固體且收集，得到呈黃色固體狀之6-氯-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮(14.6 g，94.1%)，其未經進一步純化直接使用。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 195。步驟 5 ：製備 4-溴-6-氯-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮( 中間物 F)

向攪拌之6-氯-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮(8.00 g，41.106 mmol，1.00當量)於DMF (160.00 mL)中之混合物中添加NBS (8.78 g，49.327 mmol，1.20當量)，且將所得混合物在90℃下攪拌2小時。使反應混合物冷卻且用DCM (150 mL)稀釋且用水(3×100 mL)洗滌。將有機層乾燥且濃縮。接著將殘餘物用EtOAc (20 mL)形成漿液，且過濾漿液。將濾餅用EtOAc (20 mL)洗滌，得到呈白色固體狀之4-溴-6-氯-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮(6.32 g，55.7%)，其未經進一步純化直接使用。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 273。步驟 6 ：製備 6-( 氮雜環丁烷 -1- 基 )-4- 溴 -2- 甲基 -2,7- 萘啶 -1- 酮 ( 中間物 G)

向4-溴-6-氯-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮(5.00 g，18.281 mmol，1.00當量)及氮雜環丁烷鹽酸鹽(3.2 g，54.843 mmol，3當量)於DMSO (50.00 mL)中之溶液中添加K₂ CO₃ (12.6 g，91.404 mmol，5當量)。將所得溶液在130℃下攪拌2小時。使所得混合物冷卻且用水(100 mL)稀釋，且接著用EtOAc (3×100 mL)萃取。將合併之有機層用飽和NaCl溶液(3×50 mL)洗滌，經無水Na₂ SO₄ 乾燥，且減壓濃縮，得到呈灰色固體狀之6-(氮雜環丁烷-1-基)-4-溴-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮(3.7 g，68.8%)，其未經進一步純化直接使用。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 294。步驟 7 ：製備 4-[6-(氮雜環丁烷-1-基)-2-甲基-1-側氧基-2,7-萘啶-4-基]-2,6-二甲氧基苯甲醛( 中間物 H)

向6-(氮雜環丁烷-1-基)-4-溴-2-甲基-2,7-萘啶-1-酮(1.42 g，4.827 mmol，1.00當量)及4-甲醯基-3,5-二甲氧基苯基硼酸(1.52 g，7.241 mmol，1.5當量)於二噁烷(16.00 mL)及H₂ O (4.00 mL)中之溶液中添加Pd(dppf)Cl₂ (353.2 mg，0.483 mmol，0.1當量)及Cs₂ CO₃ (3.15 g，9.655 mmol，2當量)，且將所得溶液在70℃ 下攪拌2小時。使所得混合物冷卻且減壓濃縮。將殘餘物用水(30 mL)形成漿液且過濾，且收集濾餅。此固體進一步用MeOH (30 mL)形成漿液且過濾。收集固體，得到呈灰色固體狀之4-[6-(氮雜環丁烷-1-基)-2-甲基-1-側氧基-2,7-萘啶-4-基]-2,6-二甲氧基苯甲醛(1.42 g，77.5%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 380。實例 7- 製備 3-[1- 側氧基 -6-[7-( 哌啶 -4- 基甲基 )-2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -2- 基 ]-3H- 異吲哚 -2- 基 ] 哌啶 -2,6- 二酮 ( 中間物 P)

步驟 1 ：製備 5- 溴 -2-( 溴甲基 ) 苯甲酸甲酯 ( 中間物 J).

向攪拌之5-溴-2-甲基苯甲酸甲酯(50.00 g，218.271 mmol，1.00當量)於CCl₄ (500.00 mL)中之混合物中添加NBS (38.85 g，218.271 mmol，1.00當量)及BPO (5.59 g，21.827 mmol，0.10當量)。在80℃下攪拌隔夜後，混合物藉由矽膠管柱層析法來純化，用PE/EtOAc (50:1)溶析，得到呈黃色油狀之5-溴-2-(溴甲基)苯甲酸甲酯(67 g，74.75%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 307。步驟 2 ：製備 4-(6- 溴 -1- 側氧基 -3H- 異吲哚 -2- 基 )-4- 胺甲醯基丁酸第三丁酯 ( 中間物 K)

向攪拌之5-溴-2-(溴甲基)苯甲酸甲酯(67.00 g，217.554 mmol，1.00當量)及(4S)-4-胺基-4-胺甲醯基丁酸第三丁酯鹽酸鹽(62.32 g，261.070 mmol，1.20當量)於DMF (100.00 mL)中之混合物中添加DIEA (112.47 g，870.217 mmol，4當量)。在80℃下攪拌隔夜後，將混合物減壓濃縮。向殘餘物添加水(200 mL)且在室溫下攪拌1小時。將所得混合物過濾，向濾餅添加水(100 mL)且攪拌。沈澱固體藉由過濾來收集且用水(3×30 mL)洗滌。此產生呈灰白色固體狀之4-(6-溴-1-側氧基-3H-異吲哚-2-基)-4-胺甲醯基丁酸第三丁酯(55 g，60.46%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ =397。步驟 3 ：製備 2-[2-[4-( 第三丁氧基 )-1- 胺甲醯基 -4- 側氧基丁基 ]-3- 側氧基 -1H- 異吲哚 -5- 基 ]-2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -7- 甲酸第三丁酯 ( 中間物 L)

向攪拌之4-(6-溴-1-側氧基-3H-異吲哚-2-基)-4-胺甲醯基丁酸第三丁酯(10.00 g，25.172 mmol，1.00當量)及2,7-二氮雜螺[3.5] 壬烷-7-甲酸第三丁酯鹽酸鹽(8.60 g，32.723 mmol，1.30當量)於二噁烷(200.00 mL)中之溶液中添加Cs₂ CO₃ (24.60 g，75.516 mmol，3.00當量)及第3代RuPhos Palladacycle (2.11 g，2.517 mmol，0.10當量)。在100℃下在氮氣氛圍下攪拌隔夜後，將所得混合物在熱時過濾，且將濾餅用1,4-二噁烷(3×50 mL)洗滌。將濾液減壓濃縮，得到呈黑色固體狀之2-[2-[4-(第三丁氧基)-1-胺甲醯基-4-側氧基丁基]-3-側氧基-1H -異吲哚-5-基]-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(21 g，粗製物)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 543。步驟 4 ：製備 2-[2-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- 基 )-3- 側氧基 -1H- 異吲哚 -5- 基 ]-2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -7- 甲酸第三丁酯 ( 中間物 M)

向攪拌之2-[2-[(1S)-4-(第三丁氧基)-1-胺甲醯基-4-側氧基丁基]-3-側氧基-1H -異吲哚-5-基]-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(13.68 g，25.208 mmol，1.00當量)於THF (100.00 mL)中之混合物中添加含t-BuOK之THF (25.00 mL，25.000 mmol，0.99當量)。將所得混合物在室溫下攪拌2小時。將混合物用1 M HCl (水溶液)酸化至pH 6且接著用飽和NaHCO₃ (水溶液)中和至pH 7。所得混合物用EtOAc (3×200 mL)萃取。將合併之有機層減壓濃縮。此產生呈黃色固體狀之2-[2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-側氧基-1H -異吲哚-5-基]-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(7.8 g，59.43%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 469。步驟 5 ：製備 3-(6-[2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -2- 基 ]-1- 側氧基 -3H- 異吲哚 -2- 基 ) 哌啶 -2,6- 二酮 ( 中間物 N)

向攪拌之2-[2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-側氧基-1H -異吲哚-5-基]-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(7.80 g，16.647 mmol，1.00當量)於DCM (10.00 mL)中之混合物中添加三氟乙酸(TFA；5.00 mL)。在室溫下攪拌2小時後，所得混合物在真空下濃縮。此產生呈淡黃色固體狀之3-(6-[2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-2-基]-1-側氧基-3H -異吲哚-2-基)哌啶-2,6-二酮(6 g，92.93%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 369。步驟 6 ：製備 4-([2-[2-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- 基 )-3- 側氧基 -1H- 異吲哚 -5- 基 ]-2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -7- 基 ] 甲基 ) 哌啶 -1- 甲酸第三丁酯 ( 中間物 O)

在室溫下向攪拌之3-(6-[2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-2-基]-1-側氧基-3H -異吲哚-2-基)哌啶-2,6-二酮(4.00 g，8.685 mmol，1.00當量，80%)及4-甲醯基哌啶-1-甲酸第三丁酯(1.48 g，6.939 mmol，0.80當量)於DMF (20.00 mL)中之溶液中添加NaBH(OAc)₃ (3.68 g，17.363 mmol，2.00當量)。將所得混合物在室溫下攪拌2小時。在室溫下反應用水淬滅。所得混合物藉由逆相急驟層析法利用以下條件(管柱，C18矽膠；移動相，含CH₃ CN之水(0.1% FA)，40分鐘內0至100%梯度；偵測器，UV 254 nm)來純化。此產生呈深黃色固體狀之4-([2-[2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-側氧基-1H -異吲哚-5-基]-2,7-二氮雜螺 [3.5]壬烷-7-基]甲基)哌啶-1-甲酸第三丁酯(2.8 g，51.29%)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 566。步驟 7 ：製備 3-[1- 側氧基 -6-[7-( 哌啶 -4- 基甲基 )-2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -2- 基 ]-3H- 異吲哚 -2- 基 ] 哌啶 -2,6- 二酮 ( 中間物 P)

向攪拌之4-([2-[2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-側氧基-1H -異吲哚-5-基]-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-7-基]甲基)哌啶-1-甲酸第三丁酯(2.80 g，4.949 mmol，1.00當量)於DCM (5.00 mL)中之混合物中添加TFA (2.00 mL)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物減壓濃縮，得到呈黃色固體狀之3-[1-側氧基-6-[7-(哌啶-4-基甲基)-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-2-基]-3H -異吲哚-2-基]哌啶-2,6-二酮(3.9 g，粗製物)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 466。實例 8- 製備 3-[6-(7-[[1-([4-[6-( 氮雜環丁烷 -1- 基 )-2- 甲基 -1- 側氧基 -2,7- 萘啶 -4- 基 ]-2,6- 二甲氧基苯基 ] 甲基 ) 哌啶 -4- 基 ] 甲基 ]-2,7- 二氮雜螺 [3.5] 壬烷 -2- 基 )-1- 側氧基 -3H- 異吲哚 -2- 基 ] 哌啶 -2,6- 二酮 TFA 鹽 ( 化合物 D1 TFA 鹽 )

將3-[1-側氧基-6-[7-(哌啶-4-基甲基)-2,7-二氮雜螺[3.5]壬烷-2-基]-3H-異吲哚-2-基]哌啶-2,6-二酮(4.5 g，10.52 mmol，1.00當量)及4-[6-(氮雜環丁烷-1-基)-2-甲基-1-側氧基-2,7-萘啶-4-基]-2,6-二甲氧基苯甲醛(4.0 g，10.52 mmol，1.00當量)及異丙氧基鈦(IV) (3.0 g，10.52 mmol，1.00當量)於DMSO (100 mL)中之溶液在室溫下攪拌3小時。接著分批添加NaBH(OAc)₃ (8.92 g，42.08 mmol，4.00當量)至以上所得溶液中，且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。反應藉由添加水(30 mL)淬滅，且接著過濾溶液。濾餅用水及乙腈洗滌。接著濾液真空濃縮。粗產物藉由逆相急驟層析法利用以下條件(管柱：AQ C18 管柱，50 × 250 mm 10 µm；移動相A：水(TFA 0.1%)，移動相B：CAN；流速：100毫升/分鐘；梯度：35分鐘內5 B至25 B；254/220 nm)來純化。純溶離份蒸發至乾，得到呈白色固體狀之3-[6-(7-[[1-([4-[6-(氮雜環丁烷-1-基)-2-甲基-1-側氧基-2,7-萘啶-4-基]-2,6-二甲氧基苯基]甲基)哌啶-4-基]甲基]-2,7-二氮雜螺[3.5] 壬烷-2-基)-1-側氧基-3H-異吲哚-2-基]哌啶-2,6-二酮TFA鹽(3.2 g，32.3%)。¹ H NMR (400 MHz, DMSO-d6 ) δ 10.96 (s, 1H), 9.01 (s, 1H), 7.59 (s, 1H), 7.36 (d,J = 8.0 Hz, 1H), 6.72 (s, 2H), 6.68 (d,J = 8.1 Hz, 2H), 6.20 (s, 1H), 5.07 (dd,J = 13.3, 5.1 Hz, 1H), 4.35 – 4.13 (m, 2H), 4.06 – 3.95 (m, 4H), 3.80 (s, 6H), 3.57 (s, 4H), 3.47 (s, 5H), 2.97 – 2.75 (m, 3H), 2.70 – 2.55 (m, 1H), 2.44 – 2.16 (m, 7H), 2.13 – 1.88 (m, 5H), 1.80 – 1.67 (m, 4H), 1.61 (d,J = 12.4 Hz, 2H), 1.53 – 1.33 (m, 1H), 1.13 – 0.94 (m, 2H)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 829.55。

藉由超臨界流體層析在對掌性支撐物上來分離化合物D1之對映異構物以產生化合物S-D1及化合物R-D1。實例 9- 製備化合物 D2

與上述實例中所述之程序類似， 使用適當起始物質製備化合物D2。

化合物D2：¹ H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 10.98 (s, 1H), 9.02 (d,J = 0.7 Hz, 1H), 7.63 (d,J = 2.3 Hz, 1H), 7.41 (d,J = 8.8 Hz, 1H), 6.88 (s, 2H), 6.70 (h,J = 2.4 Hz, 2H), 6.24 (d,J = 6.0 Hz, 1H), 5.08 (dd,J = 13.2, 5.1 Hz, 1H), 4.41 – 4.14 (m, 4H), 4.04 (t,J = 7.4 Hz, 4H), 3.91 (s, 1H), 3.70 (d,J = 22.5 Hz, 4H), 3.50 (s, 3H), 3.45 (s, 1H), 3.22 (s, 1H), 3.14 – 2.82 (m, 6H), 2.60 (d,J = 16.2 Hz, 1H), 2.55 (s, 2H), 2.44 – 2.28 (m, 3H), 2.18 – 2.05 (m, 3H), 1.97 (t,J = 13.9 Hz, 5H), 1.51 (q,J = 12.2, 11.1 Hz, 2H)。LCMS (ESI) m/z: [M+H]⁺ = 835.45。實例 10 - SYO1 BRD9 NanoLuc 降解分析

此實例在基於細胞之降解分析中證明本揭示案之化合物降解Nanoluciferase-BRD9融合蛋白之能力。

程序： 產生表現3xFLAG-NLuc-BRD9之穩定SYO-1細胞株。在第0天，將細胞接種于384孔細胞培養盤之各孔中之30 μL培養基中。接種密度為8000個細胞/孔。在第1天，將細胞用30 nL DMSO或30 nL 3倍連續DMSO稀釋之化合物處理(10個點，一式兩份，1 μM為最終最高劑量)。隨後將培育盤在標準組織培養培育器中培育6小時且在室溫下平衡15分鐘。藉由添加15 μL新鮮製備之Nano-Glo螢光素酶分析試劑(Promega N1130)，震盪培育盤10分鐘且使用EnVision讀數器讀取生物發光來量測Nanoluciferase活性。

結果：使用下式計算抑制%：抑制% = 100 × (Lum_HC – Lum_樣品 ) / (Lum_HC –Lum_LC )。經DMSO處理之細胞用作高對照物(HC)且1 μM已知之BRD9降解劑標準處理之細胞用作低對照物(LC)。資料擬合成四參數非線性曲線擬合，以計算IC₅₀ (μM)值，如表2所示。如表2中之結果所示，許多本揭示案之化合物展現降解BRD9之IC₅₀ 值＜ 1 μM，此表明其用作降低BRD9之水準及/或活性之化合物及其治療BRD9相關病症之潛能。表2. SYO1 BRD9-NanoLuc降解

化合物編號	SYO1 BRD9-NanoLuc 降解 IC ₅₀ (nM)
D1	0.13
D2	0.18

實例 11- BRD9 之降解抑制滑膜肉瘤腫瘤在活體內之生長

方法： 將NOD SCID小鼠(Beijing Anikeeper Biotech, Beijing)在右側腰窩中皮下接種SYO-1人類雙相滑膜肉瘤腫瘤細胞(5×106)於100 μL具有10%胎牛血清(FBS)之達爾伯克改良伊格爾培養基(Dulbecco's Modified Eagle Medium，DMEM)中的單細胞懸浮液。當平均腫瘤尺寸達到約117 mm³ 時，將小鼠隨機化至對照組[10%二甲亞碸(DMSO)、40%聚乙二醇(PEG400)及50%水]或處理組D1。每日經由腹膜內(i.p.)途徑在3週過程中向小鼠給藥。所有劑量體積均根據mg/kg隨體重而調整。

結果： 如圖14所示，用1 mg/kg化合物D1處理引起腫瘤生長抑制。基於觀測到之體重變化%，所有處理均耐受性良好。實例 12- 化合物 D1 引起 BRD9 在活體內在滑膜肉瘤腫瘤中之降解

方法： 將小鼠用1 mg/kg D1 i.p.處理4週。然後對小鼠施以安樂死，且在最後一劑後8小時、72小時及168小時收集腫瘤。用具有蛋白酶及磷酸酶蛋白質抑制劑(Roche Applied Science # 04906837001及05892791001)之1x RIPA溶解緩衝液(Boston BioProducts，BP-115D)使腫瘤溶解。將同等量之溶解產物(30 μg)裝載於1X MOPS緩衝液中之4-12% Bis-Tris Midi蛋白質凝膠中；樣品在120 V下跑動120分鐘。在250 mA下將蛋白質轉移至具有TransBlot之膜，歷時150分鐘，且接著在室溫下用Odyssey阻斷緩衝液阻斷膜1小時。膜在冷室中與一級抗體雜交隔夜。使用Li-COR成像系統(Li-COR Biotechnology, Lincoln, Nebraska)獲得圖像。

表3展示偵測抗體資訊。表3

抗體	供應商	目錄號	物種	稀釋
BRD9	Bethyl, (Montgomery, TX)	A303-781A	兔	1:1000
GAPDH	CST, (Danvers, MA)	97166	小鼠	1:2000

結果：如圖15所示，用1 mg/kg化合物D1處理引起BRD9標靶完全降解，直至在給藥之後168小時。實例 13- 化合物 S-D1 及 R-D1 對滑膜肉瘤細胞之作用

方法 . 將滑膜肉瘤細胞以500-100k個細胞/孔塗鋪于6孔盤中且次日兩個時間點在37℃下用連續濃度之BRD9降解劑(10 nM最高濃度，1:3稀釋)處理。然後收穫細胞，用冷PBS洗滌，且在-80℃下冷凍成細胞團粒。藉由使經解凍之團塊再懸浮於1x RIPA溶解及提取緩衝液(Thermo Fisher，目錄號89900)中來製備溶解產物，該緩衝液具有無EDTA之1x Halt™蛋白酶及磷酸酶抑制劑混合物(Thermo Fisher，目錄號78441)及1:1000稀釋之Pierce™細胞溶解通用核酸酶25ku (Thermo Fisher，目錄號88700)。將溶解產物在冰上培育10分鐘，且接著在4℃下以最大速度(15,000 rpm)離心10分鐘。然後使用BCA蛋白質定量分析，對樣品之總蛋白進行分析，且用溶解緩衝液及1x NuPAGE™ LDS樣品緩衝液(4X) (Thermo Fisher，目錄號NP0007)及來自30X原液之1x DTT (Cell Signaling Technologies，目錄號14265S)稀釋至1 μg/μL。將具有20-25 ug總蛋白之樣品裝載至具有1x MES操作緩衝液之4-12% Bis-Tris Mini-Gel中且在150V下跑動45分鐘。使用Trans-Blot® Turbo™轉移系統(半乾)在25V下10分鐘(高MW設置)將凝膠轉移在硝化纖維素墨點上。將墨點在含5%乳之TBST中阻斷1小時且用BRD9抗體(SYO1，Bethyl Labs，目錄號A303-781A，1:750；及ASKA，Cell Signaling Technologies，目錄號71232S)及β-肌動蛋白抗體(Cell Signaling Technologies，目錄號3700，1:2000)在4℃下探測隔夜。次日，將墨點在TBST中洗滌3次且在室溫下在LiCOR Odyssey®阻斷緩衝液(TBS)中用1:5000 IRDye® 680LT山羊抗兔IgG二級抗體(LiCOR，目錄號926-68021)及1:10000 IRDye® 800CW山羊抗小鼠IgG二級抗體(LiCOR，目錄號926-32210)探測1小時。將墨點在TBST中洗滌3次且使用LiCOR Odyssey® CLx成像系統在700 nM及800 nM波長下掃描。使用同一機器中包括之同一分析程式定量西方墨點信號。藉由相對於β-肌動蛋白信號正規化來定量BRD9信號傳導，且所有樣品均相對於設為100%信號之DMSO正規化。

為評定細胞培養基中對映異構物1與對映異構物2之間的相互轉化，執行以下測試。將對映異構物1及對映異構物2 (各為DMSO中40 μM)以0.2 μM之最終濃度外加至細胞培養基(DMEM + Glutamax + 10% FBS)中且在37℃及5% CO₂ 下一式兩份培育。在指定時間點，獲取等分試樣(50 μL)且藉由添加150 μL含有0.1%甲酸之乙腈及內標準品來處理，以進行LC/MS-MS分析。使用對掌性特定分析法測定各樣品之對映異構物1及對映異構物2之峰面積。結果概述於下5表中。

結果 . 為評估兩種對映異構物之BRD9降解活性，使用兩種滑膜肉瘤細胞株(SYO-1及ASKA)進行降解劑處理及後續西方墨點實驗。在對映異構物2下觀測到顯著更有效之BRD9降解活性，其中與對映異構物1在SYO-1中處理1小時時間下的2.8 nM相比，經擬合之DC₅₀ 值為0.092 nM (圖16、17及18及表4)。對於對映異構物2，在30分鐘時，ASKA細胞之更顯著差異明顯，DC₅₀ 為0.34 nM，但對於對映異構物1，在相同時間點，直至10 μM，活性不可辯別(圖20、21及22及表4)。在ASKA中在2小時差異減少至約32倍，其中對映異構物1及對映異構物2之經擬合之DC₅₀ 值分別為0.38 nM及0.012 nM (表4)。在SYO1中。至6小時，差異進一步減少至大約3倍。在降解BRD9上，對映異構物2稍微比其外消旋母體化合物D1更佳，但在相同研究條件下總體相當(圖16及17)。對於所有三種化合物，在24小時，BRD9降解活性變得高度相似(圖19)。總之，在兩種滑膜肉瘤細胞株中在早期時間點，對映異構物2降解內源BRD9蛋白質更有效，而對映異構物1基本上無活性或具有大量降低之降解效力。然而，效力差異隨著時間推移而減小且至24小時基本上消失。表4.

細胞株	經擬合之DC₅₀ (nM)	對映異構物1	對映異構物2
ASKA	0.5小時	＞10	0.34
SYO-1	1小時	2.8	0.092
ASKA	2小時	0.38	0.012
SYO-1	6小時	0.066	0.023

報導沙利度胺或其他IMiD藥物及其衍生物中對掌性中心之差向異構作用。在物理或中性pH條件下對掌性中心中之酸性氫可能擾亂。為研究在此等降解劑之細胞分析條件下的對掌性穩定性，在細胞培養基中在37℃下執行對映異構物1及對映異構物2之時程研究。在時間0或0.5小時，在對映異構物1樣品中未偵測到對映異構物2。但在隨後時間點，偵測到大量對映異構物2，在2小時及6小時分別佔總數12%及30% (表5)。類似地，對映異構物2隨著時間推移轉化成對映異構物1，且在6小時，其有效濃度降低至63% (表5)。此等資料指示在細胞分析條件下差向異構速率相對較快，且表明對映異構物1之時間依賴性BRD9降解活性可能由轉化之對映異構物2引起。總體上，此等資料指示對映異構物2為降解細胞中之BRD9的活性對映異構物。表5.

時間(小時)	對映異構物1給藥	對映異構物2給藥
對映異構物2之平均峰面積比相比於對映異構物1峰面積比	對映異構物2 %	對映異構物1之平均峰面積比相比於對映異構物2峰面積比	對映異構物2 %
0	0.0	0.0	0.01	99
0.5	0.0	0.0	0.06	95
2	0.13	12	0.22	82
6	0.43	30	0.60	63

實例 14- 化合物 S-D1 及 R-D1 對滑膜肉瘤細胞之作用

方法 . SYO-1腫瘤細胞在活體外呈黏附細胞維持在補充有10%胎牛血清之達爾伯克改良之伊格爾培養基(DMEM)中37℃下含5% CO2之空氣的氛圍中。收穫在指數生長期生長之細胞且計數，以用於腫瘤接種。將BALB/c裸小鼠(Shanghai Lingchang biological science)在右側腰窩上皮下接種于0.1 mL磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)中(5×10⁶ )。當平均腫瘤尺寸達到499 mm³ 時，在腫瘤接種之後第19天開始處理(下表中所述)。處理資訊：

抗體	小鼠數目
媒劑對照物，磺丁基醚-β-環糊精(SBECD)，單劑量，10 ul/g	3
外消旋D1，0.5 mg/kg i.v.，單劑量，10 ul/g (20%SBECD)	12
對映異構物1，0.25 mg/kg i.v.，單劑量，10 ul/g (20%SBECD)	18
對映異構物2，0.25 mg/kg i.v.，單劑量，10 ul/g (20%SBECD)	18
對映異構物2，1 mg/kg i.v.，單劑量，10 ul/g (20%SBECD)	18

將小鼠用1 mg/kg外消旋D1 i.p.處理4週，對小鼠施以安樂死，且在最後一劑後1小時、4小時、8小時、24小時、48小時及72小時收集腫瘤。用具有蛋白酶及磷酸酶蛋白質抑制劑(Roche Applied Science # 04906837001及05892791001)之1x RIPA溶解緩衝液(Boston BioProducts，BP-115D)使腫瘤溶解。將同等量之溶解產物(30 μg)裝載於1X MOPS緩衝液中之4-12% Bis-Tris Midi蛋白質凝膠中；樣品在120 V下跑動120分鐘。在250 mA下將蛋白質轉移至具有TransBlot之膜(NC)，歷時150分鐘，接著在室溫下用Odyssey阻斷緩衝液阻斷膜1小時。膜在冷室中與一級抗體雜交隔夜。使用Li-COR成像系統(Li-COR Biotechnology, Lincoln, Nebraska)獲得圖像偵測抗體資訊：

結果 . 在SYO-1異種移植模型中評估對映異構物1、對映異構物2及外消旋化合物D1之藥效活性。對映異構物2證明顯著活性，藉由BRD9蛋白質水準使用西方墨點分析評定，圖23。對映異構物2在單一劑量之後直至72小時均降解BRD9。對映異構物1無活性，且不降解BRD9蛋白質。此等結果表明對映異構物2與外消旋化合物D1同等效力。其他實施例

本說明書中所提及之所有公開案、專利及專利申請案均以引用之方式整體併入本文中，其引用程度如同特別且個別地指示每篇個別公開案、專利或專利申請案以引用之方式整體併入一般。在發現本申請案中之術語在以引用之方式併入本文中之文獻中不同地定義的情況下，本文提供之定義將充當該術語之定義。

在本發明已結合其特定實施例來描述的情況下，應瞭解本發明能夠進行進一步修改且本申請案意欲涵蓋本發明之任何變體、用途或改變，該等變體、用途或改變一般遵循本發明之原理且包括在本發明所屬領域內之已知或慣常實踐內的自本揭示案之偏離，且可應用於以上闡述之基本特徵，且遵循在申請專利範圍之範疇內。

其他實施例在申請專利範圍內。

圖1為示出滑膜肉瘤細胞株(SYO1)中在BRD9降解劑存在下BRD9水準之劑量依賴性耗盡的圖像。圖2為示出滑膜肉瘤細胞株(SYO1)中在BRD9降解劑存在下在72小時內BRD9水準之持續抑制的圖像。圖3為示出兩種細胞株(293T及SYO1)中在BRD9降解劑存在下在5天內BRD9水準之持續抑制的圖像。圖4為示出與用CRISPR試劑治療之細胞中的水準相比，在滑膜肉瘤細胞株(SYO1及Yamato)中在BRD9降解劑存在下在7天內BRD9水準之持續抑制的圖像。圖5為示出在BRD9降解劑及BRD9抑制劑存在下對六種細胞株(SYO1、Yamato、A549、HS-SY-II、ASKA及293T)之細胞生長之作用的圖像。圖6為示出在BRD9降解劑存在下對兩種細胞株(SYO1及G401)之細胞生長之作用的圖像。圖7為示出在BRD9降解劑、BRD9結合劑及E3連接酶結合劑存在下對三種滑膜肉瘤細胞株(SYO1、HS-SY-II及ASKA)之細胞生長之作用的圖像。圖8為示出在BRD9降解劑、BRD9結合劑及E3連接酶結合劑存在下對三種非滑膜肉瘤細胞株(RD、HCT116及Calu6)之細胞生長之作用的圖像。圖9為示出在用DMSO、200 nM化合物1或1 μM化合物1處理8或13天之後多個細胞週期階段中SYO1之百分比的圖。圖10為示出在用DMSO、200 nM化合物1、1 μM化合物1或200 nM來那度胺(lenalidomide)處理8天之後多個細胞週期階段中SYO1細胞之百分比的一系列等高線圖。與各等高線圖相對應之數值見於以下表中。圖11為示出在用DMSO、200 nM化合物1、1 μM化合物1或200 nM來那度胺處理13天之後多個細胞週期階段中SYO1細胞之百分比的一系列等高線圖。與各等高線圖相對應之數值見於以下表中。圖12為示出在用DMSO、200 nM化合物1、1 μM化合物1或200 nM來那度胺處理8天之後早期及晚期細胞凋亡SYO1細胞之百分比的一系列等高線圖。與各等高線圖相對應之數值見於以下表中。圖13為示出包括SS18-SSX融合蛋白之BAF複合物中存在之蛋白質的圖。圖14為展示在SOY-1異種移植小鼠模型中化合物D1之功效的圖。用化合物D1處理引起腫瘤生長抑制。圖15為展示對照組及處理組(化合物D1)中之BRD9偵測之西方墨點法的圖像。用化合物D1處理引起BRD9抑制。圖16為展示在用DMSO、對映異構物1或外消旋化合物D1處理1小時或6小時之SYO-1細胞中之BRD9偵測的西方墨點法之圖像。圖17為展示在用DMSO、對映異構物2或外消旋化合物D1處理1小時或6小時之SYO-1細胞中之BRD9偵測的西方墨點法之圖像。圖18為展示與來自圖16及17中所示之西方墨點法圖像之BRD9亮帶強度資料點擬合的劑量反應曲線的圖。圖19為展示在用對映異構物1、對映異構物2或外消旋化合物D1處理24小時之SYO-1細胞中之BRD9偵測的西方墨點法之圖像。圖20為展示在ASKA細胞對照物及用對映異構物1或外消旋化合物D1處理0.5小時或2小時之ASKA細胞中之BRD9偵測的西方墨點法之圖像。圖21為展示在ASKA細胞對照物及用對映異構物2或外消旋化合物D1處理0.5小時或2小時之ASKA細胞中之BRD9偵測的西方墨點法之圖像。圖22為展示與來自圖20及21中所示之西方墨點法圖像之BRD9亮帶強度資料點擬合的劑量反應曲線的圖。圖23為展示在用對映異構物1、對映異構物2或外消旋化合物D1處理之SYO-1 Zenograft模型中之BRD9偵測的一系列西方墨點法之圖像。圖24為定量在圖23中所示之西方墨點法中觀測到之BRD9水準變化的橫條圖。

Claims

一種化合物，其具有以下結構：
化合物 D1 ，或
化合物 D2 ，或其醫藥學上可接受之鹽。
如請求項1之化合物，其中該化合物具有以下結構：
化合物 D1 ，或其醫藥學上可接受之鹽。
如請求項1或2之化合物，其中該化合物具有以下結構：
化合物 S-D1 ，或其醫藥學上可接受之鹽。
如請求項1或2之化合物，其中該化合物具有以下結構：
化合物 R-D1 ，或其醫藥學上可接受之鹽。
一種醫藥組合物，其包含具有以下結構之化合物：
化合物 D1 ，或
化合物 D2 ，或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。
如請求項5之醫藥組合物，其中該醫藥組合物包含具有以下結構之化合物：
，化合物 D1 或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。
如請求項6之醫藥組合物，其中該醫藥組合物包含具有以下結構之化合物：
，化合物 S-D1 或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。
如請求項6之醫藥組合物，其中該醫藥組合物包含具有以下結構之化合物：
，化合物 R-D1 或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。
一種抑制細胞中之BRD9水準之方法，該方法包括使該細胞與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物接觸。
一種抑制細胞中之BRD9活性之方法，該方法包括使該細胞與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物接觸。
如請求項9或10之方法，其中該細胞為癌細胞。
如請求項10之方法，其中該癌症為惡性橫紋肌樣瘤、CD8+ T細胞淋巴瘤、子宮內膜癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、胰臟癌、食道癌、前列腺癌、腎細胞癌、黑色素瘤、結腸直腸癌、肉瘤、非小細胞肺癌、胃癌或乳癌。
如請求項12之方法，其中該癌症為肉瘤。
如請求項13之方法，其中該肉瘤為軟組織肉瘤、滑膜肉瘤、尤因氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、成人纖維肉瘤、腺泡狀軟組織肉瘤、血管肉瘤、透明細胞肉瘤、促纖維組織增生性小圓細胞腫瘤、上皮樣肉瘤、纖維黏液樣肉瘤、胃腸道基質瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi sarcoma)、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、惡性間葉瘤惡性外周神經鞘腫瘤、黏液纖維肉瘤或低級別橫紋肌肉瘤。
如請求項14之方法，其中該肉瘤為滑膜肉瘤。
如請求項14之方法，其中該肉瘤為橫紋肌肉瘤。
一種治療有需要之個體之BAF複合物相關病症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物。
一種治療有需要之個體之SS18-SSX融合蛋白相關病症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物。
一種治療有需要之個體之BRD9相關病症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物。
如請求項17至19中任一項之方法，其中該病症為癌症。
一種治療有需要之個體之癌症的方法，該方法包括向該個體投與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物。
如請求項20或21之方法，其中該癌症為惡性橫紋肌樣瘤、CD8+ T細胞淋巴瘤、子宮內膜癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、胰臟癌、食道癌、前列腺癌、腎細胞癌、黑色素瘤、結腸直腸癌、肉瘤、非小細胞肺癌、胃癌或乳癌。
如請求項22之方法，其中該癌症為肉瘤。
如請求項23之方法，其中該肉瘤為軟組織肉瘤、滑膜肉瘤、尤因氏肉瘤、骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、成人纖維肉瘤、腺泡狀軟組織肉瘤、血管肉瘤、透明細胞肉瘤、促纖維組織增生性小圓細胞腫瘤、上皮樣肉瘤、纖維黏液樣肉瘤、胃腸道基質瘤、卡波西氏肉瘤、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、惡性間葉瘤惡性外周神經鞘腫瘤、黏液纖維肉瘤或低級別橫紋肌肉瘤。
如請求項24之方法，其中該肉瘤為滑膜肉瘤。
如請求項24之方法，其中該肉瘤為橫紋肌肉瘤。
如請求項17至19中任一項之方法，其中該病症為感染。
一種治療有需要之個體之感染的方法，該方法包括向該個體投與有效量之如請求項1至4中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項5至8中任一項之醫藥組合物。
如請求項27或28之方法，其中該感染為病毒感染。
如請求項29之方法，其中該病毒感染為反轉錄病毒科(Retroviridae)、肝去氧核糖核酸病毒科(Hepadnaviridae)、黃病毒科(Flaviviridae)、腺病毒科(Adenoviridae)、疱疹病毒科(Herpesviridae)、乳頭瘤病毒科(Papillomaviridae)、細小病毒科(Parvoviridae)、多瘤病毒科(Polyomaviridae)、副黏液病毒科(Paramyxoviridae)或披膜病毒科病毒(Togaviridae)之感染。
如請求項29或30之方法，其中該病毒感染為科芬西裡斯病(Coffin Siris)、神經纖維瘤或多發性腦膜瘤。