RU2792210C2 - New method for synthesis of amanitines - Google Patents
New method for synthesis of amanitines Download PDFInfo
- Publication number
- RU2792210C2 RU2792210C2 RU2020105484A RU2020105484A RU2792210C2 RU 2792210 C2 RU2792210 C2 RU 2792210C2 RU 2020105484 A RU2020105484 A RU 2020105484A RU 2020105484 A RU2020105484 A RU 2020105484A RU 2792210 C2 RU2792210 C2 RU 2792210C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cancer
- hydroxy
- group
- amanitin
- derivative
- Prior art date
Links
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title claims abstract description 31
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title claims abstract description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 22
- CIORWBWIBBPXCG-JZTFPUPKSA-N amanitin Chemical class O=C1N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N2CC(O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H](C(C)[C@@H](O)CO)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H]1CS(=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 CIORWBWIBBPXCG-JZTFPUPKSA-N 0.000 claims abstract description 81
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims abstract description 32
- 125000000430 tryptophan group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12 0.000 claims abstract description 30
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims abstract description 18
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 16
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 14
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 11
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 11
- JRCODGSPROVDTR-UHFFFAOYSA-N 8b-hydroxy-2,3,3a,4-tetrahydro-1h-pyrrolo[2,3-b]indole-2-carboxylic acid Chemical class C1=CC=C2C3(O)CC(C(=O)O)NC3NC2=C1 JRCODGSPROVDTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 9
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims abstract description 9
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims abstract description 9
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims abstract description 5
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 4
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims description 93
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 66
- -1 hydroxy-substituted 2-carboxy- 3a-hydroxy-1,2,3,3a,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole Chemical class 0.000 claims description 49
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 33
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims description 33
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 32
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 30
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 26
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 20
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims description 15
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 14
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 claims description 13
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 13
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims description 13
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 12
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims description 12
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 11
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 claims description 10
- 208000006990 cholangiocarcinoma Diseases 0.000 claims description 10
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 claims description 10
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 10
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 10
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 claims description 9
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 claims description 9
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 claims description 9
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 9
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 9
- 208000015634 Rectal Neoplasms Diseases 0.000 claims description 9
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 claims description 9
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 claims description 9
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 claims description 9
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 claims description 9
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 claims description 9
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 9
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims description 9
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 206010038038 rectal cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 201000001275 rectum cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000005549 heteroarylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 claims description 7
- LDCYZAJDBXYCGN-VIFPVBQESA-N 5-hydroxy-L-tryptophan Chemical compound C1=C(O)C=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 LDCYZAJDBXYCGN-VIFPVBQESA-N 0.000 claims description 6
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 claims description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 6
- 125000002993 cycloalkylene group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000006588 heterocycloalkylene group Chemical group 0.000 claims description 6
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 6
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims description 6
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical group 0.000 claims description 5
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 5
- 125000005439 maleimidyl group Chemical group C1(C=CC(N1*)=O)=O 0.000 claims description 5
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 claims description 5
- 150000003462 sulfoxides Chemical class 0.000 claims description 5
- NXANGIZFHQQBCC-VIFPVBQESA-N (2s)-2-amino-3-(6-hydroxy-1h-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound OC1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 NXANGIZFHQQBCC-VIFPVBQESA-N 0.000 claims description 4
- GVNVAWHJIKLAGL-UHFFFAOYSA-N 2-(cyclohexen-1-yl)cyclohexan-1-one Chemical compound O=C1CCCCC1C1=CCCCC1 GVNVAWHJIKLAGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 101150065749 Churc1 gene Proteins 0.000 claims description 4
- 102100038239 Protein Churchill Human genes 0.000 claims description 4
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 4
- 239000000969 carrier Substances 0.000 claims description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 4
- 125000004474 heteroalkylene group Chemical group 0.000 claims description 4
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 claims description 4
- QSHLMQDRPXXYEE-ZETCQYMHSA-N 4-hydroxy-L-tryptophan Chemical compound C1=CC(O)=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QSHLMQDRPXXYEE-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims description 3
- VQSRKJZICBNQJG-QMMMGPOBSA-N 7-hydroxy-L-tryptophan Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1O VQSRKJZICBNQJG-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 3
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 claims description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims description 3
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 claims description 3
- 150000003457 sulfones Chemical class 0.000 claims description 3
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 claims description 2
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 claims 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims 2
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 claims 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 abstract description 17
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 5
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 abstract 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 87
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 62
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 62
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 42
- 108010027164 Amanitins Proteins 0.000 description 41
- 231100000729 Amatoxin Toxicity 0.000 description 40
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 33
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 32
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 32
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 31
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 29
- WVHGJJRMKGDTEC-WCIJHFMNSA-N 2-[(1R,4S,8R,10S,13S,16S,27R,34S)-34-[(2S)-butan-2-yl]-8,22-dihydroxy-13-[(2R,3S)-3-hydroxybutan-2-yl]-2,5,11,14,27,30,33,36,39-nonaoxo-27lambda4-thia-3,6,12,15,25,29,32,35,38-nonazapentacyclo[14.12.11.06,10.018,26.019,24]nonatriaconta-18(26),19(24),20,22-tetraen-4-yl]acetamide Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H]1NC(=O)CNC(=O)[C@@H]2Cc3c([nH]c4cc(O)ccc34)[S@](=O)C[C@H](NC(=O)CNC1=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1C[C@H](O)C[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@H](C)O)C(=O)N2 WVHGJJRMKGDTEC-WCIJHFMNSA-N 0.000 description 28
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 25
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 25
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 25
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 108010014709 amatoxin Proteins 0.000 description 24
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 22
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 22
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 22
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 22
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 19
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 19
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 19
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 18
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 17
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 17
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 17
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 15
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 15
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 14
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 14
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 13
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 12
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 12
- 239000004007 alpha amanitin Substances 0.000 description 11
- 229960005502 α-amanitin Drugs 0.000 description 11
- 239000000047 product Substances 0.000 description 10
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 10
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 10
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 9
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 9
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 9
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 9
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 8
- 229940049595 antibody-drug conjugate Drugs 0.000 description 8
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 8
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 8
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 8
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 8
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 8
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 8
- RUDNHCHNENLLKM-UHFFFAOYSA-N ac1mj1v6 Chemical compound O=C1NC(CC(O)=O)C(=O)N2CC(O)CC2C(=O)NC(C(C)C(O)CO)C(=O)NC(C2)C(=O)NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NCC(=O)NC1CSC1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 RUDNHCHNENLLKM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 7
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 7
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 7
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 7
- 150000003568 thioethers Chemical class 0.000 description 7
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101800002638 Alpha-amanitin Proteins 0.000 description 6
- QMMFVYPAHWMCMS-UHFFFAOYSA-N Dimethyl sulfide Chemical compound CSC QMMFVYPAHWMCMS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 6
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000009572 RNA Polymerase II Human genes 0.000 description 6
- 108010009460 RNA Polymerase II Proteins 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- DKGAVHZHDRPRBM-UHFFFAOYSA-N Tert-Butanol Chemical compound CC(C)(C)O DKGAVHZHDRPRBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- CIORWBWIBBPXCG-SXZCQOKQSA-N alpha-amanitin Chemical compound O=C1N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N2C[C@H](O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@@H](O)CO)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H]1C[S@@](=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 CIORWBWIBBPXCG-SXZCQOKQSA-N 0.000 description 6
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 6
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 6
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 6
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 6
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 6
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 6
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 6
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 6
- UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N thiourea Chemical compound NC(N)=S UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 5
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 description 5
- 101000892862 Homo sapiens Glutamate carboxypeptidase 2 Proteins 0.000 description 5
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 5
- FXHOOIRPVKKKFG-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylacetamide Chemical compound CN(C)C(C)=O FXHOOIRPVKKKFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 5
- RXGJTYFDKOHJHK-UHFFFAOYSA-N S-deoxo-amaninamide Natural products CCC(C)C1NC(=O)CNC(=O)C2Cc3c(SCC(NC(=O)CNC1=O)C(=O)NC(CC(=O)N)C(=O)N4CC(O)CC4C(=O)NC(C(C)C(O)CO)C(=O)N2)[nH]c5ccccc35 RXGJTYFDKOHJHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- CIORWBWIBBPXCG-UHFFFAOYSA-N alpha-amanitin Natural products O=C1NC(CC(N)=O)C(=O)N2CC(O)CC2C(=O)NC(C(C)C(O)CO)C(=O)NC(C2)C(=O)NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NCC(=O)NC1CS(=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 CIORWBWIBBPXCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 5
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 150000003857 carboxamides Chemical class 0.000 description 5
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 5
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 5
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 5
- 239000002596 immunotoxin Substances 0.000 description 5
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 5
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 5
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 5
- 125000001570 methylene group Chemical group [H]C([H])([*:1])[*:2] 0.000 description 5
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 5
- 229920001481 poly(stearyl methacrylate) Polymers 0.000 description 5
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 5
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 5
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 5
- 238000006257 total synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 238000001644 13C nuclear magnetic resonance spectroscopy Methods 0.000 description 4
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N D-lysine Chemical compound NCCCC[C@@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 4
- SBJKKFFYIZUCET-JLAZNSOCSA-N Dehydro-L-ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(=O)C1=O SBJKKFFYIZUCET-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 4
- SBJKKFFYIZUCET-UHFFFAOYSA-N Dehydroascorbic acid Natural products OCC(O)C1OC(=O)C(=O)C1=O SBJKKFFYIZUCET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N Ethyl urethane Chemical compound CCOC(N)=O JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 description 4
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N Maleimide Chemical compound O=C1NC(=O)C=C1 PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 239000000611 antibody drug conjugate Substances 0.000 description 4
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 4
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 4
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 4
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 4
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 4
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 4
- 235000020960 dehydroascorbic acid Nutrition 0.000 description 4
- 239000011615 dehydroascorbic acid Substances 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 4
- 125000002228 disulfide group Chemical group 0.000 description 4
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 4
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 4
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 4
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 4
- 238000003818 flash chromatography Methods 0.000 description 4
- 238000007306 functionalization reaction Methods 0.000 description 4
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 4
- 238000005286 illumination Methods 0.000 description 4
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 4
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 4
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 4
- 238000007539 photo-oxidation reaction Methods 0.000 description 4
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 4
- 238000000039 preparative column chromatography Methods 0.000 description 4
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 4
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 4
- 229930187593 rose bengal Natural products 0.000 description 4
- AZJPTIGZZTZIDR-UHFFFAOYSA-L rose bengal Chemical compound [K+].[K+].[O-]C(=O)C1=C(Cl)C(Cl)=C(Cl)C(Cl)=C1C1=C2C=C(I)C(=O)C(I)=C2OC2=C(I)C([O-])=C(I)C=C21 AZJPTIGZZTZIDR-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 229940081623 rose bengal Drugs 0.000 description 4
- STRXNPAVPKGJQR-UHFFFAOYSA-N rose bengal A Natural products O1C(=O)C(C(=CC=C2Cl)Cl)=C2C21C1=CC(I)=C(O)C(I)=C1OC1=C(I)C(O)=C(I)C=C21 STRXNPAVPKGJQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 4
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000003107 substituted aryl group Chemical group 0.000 description 4
- KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N succinimide Chemical class O=C1CCC(=O)N1 KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 4
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 4
- DYHSDKLCOJIUFX-UHFFFAOYSA-N tert-butoxycarbonyl anhydride Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)OC(=O)OC(C)(C)C DYHSDKLCOJIUFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 4
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 4
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 4
- BOHCOUQZNDPURZ-ICNZIKDASA-N 2-[(1R,4S,8R,10S,13S,16S,27R,34S)-34-[(2S)-butan-2-yl]-13-[(2R,3R)-3,4-dihydroxybutan-2-yl]-8-hydroxy-2,5,11,14,27,30,33,36,39-nonaoxo-27lambda4-thia-3,6,12,15,25,29,32,35,38-nonazapentacyclo[14.12.11.06,10.018,26.019,24]nonatriaconta-18(26),19,21,23-tetraen-4-yl]acetamide Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H]1NC(=O)CNC(=O)[C@@H]2Cc3c([nH]c4ccccc34)[S@](=O)C[C@H](NC(=O)CNC1=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1C[C@H](O)C[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@@H](O)CO)C(=O)N2 BOHCOUQZNDPURZ-ICNZIKDASA-N 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100031940 Epithelial cell adhesion molecule Human genes 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PWKSKIMOESPYIA-BYPYZUCNSA-N L-N-acetyl-Cysteine Chemical compound CC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O PWKSKIMOESPYIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical group ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091006730 SLCO1B3 Proteins 0.000 description 3
- 102000015661 Solute Carrier Organic Anion Transporter Family Member 1B3 Human genes 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CHKFLBOLYREYDO-SHYZEUOFSA-N [[(2s,4r,5r)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@H](O)C[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 CHKFLBOLYREYDO-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000008139 complexing agent Substances 0.000 description 3
- IEQCUEXVAPAFMQ-SXZCQOKQSA-N g729ypp47l Chemical compound O=C1N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N2C[C@H](O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@@H](O)CO)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H]1C[S@@](=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 IEQCUEXVAPAFMQ-SXZCQOKQSA-N 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 3
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 3
- 239000007972 injectable composition Substances 0.000 description 3
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 108091008104 nucleic acid aptamers Proteins 0.000 description 3
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 3
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 3
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 3
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 3
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- ZGYICYBLPGRURT-UHFFFAOYSA-N tri(propan-2-yl)silicon Chemical compound CC(C)[Si](C(C)C)C(C)C ZGYICYBLPGRURT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JKHVDAUOODACDU-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-(2,5-dioxopyrrol-1-yl)propanoate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCN1C(=O)C=CC1=O JKHVDAUOODACDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZXSBHXZKWRIEIA-JTQLQIEISA-N (2s)-3-(4-acetylphenyl)-2-azaniumylpropanoate Chemical compound CC(=O)C1=CC=C(C[C@H](N)C(O)=O)C=C1 ZXSBHXZKWRIEIA-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 2
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JUIKUQOUMZUFQT-UHFFFAOYSA-N 2-bromoacetamide Chemical compound NC(=O)CBr JUIKUQOUMZUFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NEAQRZUHTPSBBM-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3,3-dimethyl-7-nitro-4h-isoquinolin-1-one Chemical compound C1=C([N+]([O-])=O)C=C2C(=O)N(O)C(C)(C)CC2=C1 NEAQRZUHTPSBBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BIKSKRPHKQWJCW-UHFFFAOYSA-N 3,4-dibromopyrrole-2,5-dione Chemical compound BrC1=C(Br)C(=O)NC1=O BIKSKRPHKQWJCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IUTPJBLLJJNPAJ-UHFFFAOYSA-N 3-(2,5-dioxopyrrol-1-yl)propanoic acid Chemical compound OC(=O)CCN1C(=O)C=CC1=O IUTPJBLLJJNPAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XMTQQYYKAHVGBJ-UHFFFAOYSA-N 3-(3,4-DICHLOROPHENYL)-1,1-DIMETHYLUREA Chemical compound CN(C)C(=O)NC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1 XMTQQYYKAHVGBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 2
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 2
- QCZXQEYEVLCQHL-UHFFFAOYSA-N Amanin Natural products O=C1NC(CC(O)=O)C(=O)N2CC(O)CC2C(=O)NC(C(C)C(O)CO)C(=O)NC(C2)C(=O)NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NCC(=O)NC1CS(=O)C1=C2C2=CC=CC=C2N1 QCZXQEYEVLCQHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710167800 Capsid assembly scaffolding protein Proteins 0.000 description 2
- 108010069514 Cyclic Peptides Proteins 0.000 description 2
- 102000001189 Cyclic Peptides Human genes 0.000 description 2
- GSNUFIFRDBKVIE-UHFFFAOYSA-N DMF Natural products CC1=CC=C(C)O1 GSNUFIFRDBKVIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OKKJLVBELUTLKV-MZCSYVLQSA-N Deuterated methanol Chemical compound [2H]OC([2H])([2H])[2H] OKKJLVBELUTLKV-MZCSYVLQSA-N 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 108010066687 Epithelial Cell Adhesion Molecule Proteins 0.000 description 2
- 102100028875 Formylglycine-generating enzyme Human genes 0.000 description 2
- 101710192607 Formylglycine-generating enzyme Proteins 0.000 description 2
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101000801255 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17 Proteins 0.000 description 2
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000010781 Interleukin-6 Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010038501 Interleukin-6 Receptors Proteins 0.000 description 2
- BGRDGMRNKXEXQD-UHFFFAOYSA-N Maleic hydrazide Chemical compound OC1=CC=C(O)N=N1 BGRDGMRNKXEXQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KFSLWBXXFJQRDL-UHFFFAOYSA-N Peracetic acid Chemical compound CC(=O)OO KFSLWBXXFJQRDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 101710130420 Probable capsid assembly scaffolding protein Proteins 0.000 description 2
- 101710204410 Scaffold protein Proteins 0.000 description 2
- 101710192761 Serine-type anaerobic sulfatase-maturating enzyme Proteins 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- PZBFGYYEXUXCOF-UHFFFAOYSA-N TCEP Chemical compound OC(=O)CCP(CCC(O)=O)CCC(O)=O PZBFGYYEXUXCOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100033726 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17 Human genes 0.000 description 2
- HSRXSKHRSXRCFC-WDSKDSINSA-N Val-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HSRXSKHRSXRCFC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- SORGEQQSQGNZFI-UHFFFAOYSA-N [azido(phenoxy)phosphoryl]oxybenzene Chemical compound C=1C=CC=CC=1OP(=O)(N=[N+]=[N-])OC1=CC=CC=C1 SORGEQQSQGNZFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 2
- 125000004414 alkyl thio group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 2
- BHELZAPQIKSEDF-UHFFFAOYSA-N allyl bromide Chemical compound BrCC=C BHELZAPQIKSEDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010004258 amaninamide Proteins 0.000 description 2
- BOHCOUQZNDPURZ-UHFFFAOYSA-N amaninamide Natural products O=C1NC(CC(N)=O)C(=O)N2CC(O)CC2C(=O)NC(C(C)C(O)CO)C(=O)NC(C2)C(=O)NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NCC(=O)NC1CS(=O)C1=C2C2=CC=CC=C2N1 BOHCOUQZNDPURZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000005110 aryl thio group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000852 azido group Chemical group *N=[N+]=[N-] 0.000 description 2
- IOJUPLGTWVMSFF-UHFFFAOYSA-N benzothiazole Chemical class C1=CC=C2SC=NC2=C1 IOJUPLGTWVMSFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004080 beta amanitin Substances 0.000 description 2
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 239000005388 borosilicate glass Substances 0.000 description 2
- ZMCUDHNSHCRDBT-UHFFFAOYSA-M caesium bicarbonate Chemical compound [Cs+].OC([O-])=O ZMCUDHNSHCRDBT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- FJDQFPXHSGXQBY-UHFFFAOYSA-L caesium carbonate Chemical compound [Cs+].[Cs+].[O-]C([O-])=O FJDQFPXHSGXQBY-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 229910000024 caesium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000001951 carbamoylamino group Chemical group C(N)(=O)N* 0.000 description 2
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 description 2
- 125000005392 carboxamide group Chemical group NC(=O)* 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 2
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 239000002826 coolant Substances 0.000 description 2
- 239000013058 crude material Substances 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 125000005724 cycloalkenylene group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- MKRTXPORKIRPDG-UHFFFAOYSA-N diphenylphosphoryl azide Chemical compound C=1C=CC=CC=1P(=O)(N=[N+]=[N-])C1=CC=CC=C1 MKRTXPORKIRPDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002270 dispersing agent Substances 0.000 description 2
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 2
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 2
- 150000002019 disulfides Chemical class 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000013583 drug formulation Substances 0.000 description 2
- 239000005293 duran Substances 0.000 description 2
- 239000002024 ethyl acetate extract Substances 0.000 description 2
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 2
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- 102000034238 globular proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091005896 globular proteins Proteins 0.000 description 2
- 125000000592 heterocycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N hydroxybenzotriazole Substances O=C1C=CC=C2NNN=C12 NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000468 ketone group Chemical group 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- QPJVMBTYPHYUOC-UHFFFAOYSA-N methyl benzoate Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1 QPJVMBTYPHYUOC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M methylene blue Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC2=[S+]C3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229960000907 methylthioninium chloride Drugs 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- CMWYAOXYQATXSI-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylformamide;piperidine Chemical compound CN(C)C=O.C1CCNCC1 CMWYAOXYQATXSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 2
- 210000004882 non-tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000010534 nucleophilic substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 2
- 229920001308 poly(aminoacid) Polymers 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 229920000193 polymethacrylate Polymers 0.000 description 2
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 2
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- ZDYVRSLAEXCVBX-UHFFFAOYSA-N pyridinium p-toluenesulfonate Chemical compound C1=CC=[NH+]C=C1.CC1=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C1 ZDYVRSLAEXCVBX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 239000012429 reaction media Substances 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 230000001235 sensitizing effect Effects 0.000 description 2
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 2
- GEHJYWRUCIMESM-UHFFFAOYSA-L sodium sulfite Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])=O GEHJYWRUCIMESM-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 235000010356 sorbitol Nutrition 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- 229960002317 succinimide Drugs 0.000 description 2
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- QCZXQEYEVLCQHL-HGJJDEFOSA-N viw95i76gy Chemical class O=C1N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N2C[C@H](O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@@H](O)CO)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]1C[S@@](=O)C1=C2C2=CC=CC=C2N1 QCZXQEYEVLCQHL-HGJJDEFOSA-N 0.000 description 2
- 239000003039 volatile agent Substances 0.000 description 2
- OFILNAORONITPV-ZUROAWGWSA-N ε-amanitin Chemical compound O=C1N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N2C[C@H](O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H]1CS(=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 OFILNAORONITPV-ZUROAWGWSA-N 0.000 description 2
- ZHXJPQBGJIAQEC-MGCNEYSASA-N (2R,3S,4S,5R)-2,3,4,5,6-pentahydroxyhexanoyl azide Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C(=O)N=[N+]=[N-] ZHXJPQBGJIAQEC-MGCNEYSASA-N 0.000 description 1
- AGGWFDNPHKLBBV-YUMQZZPRSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]-5-(carbamoylamino)pentanoic acid Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=O AGGWFDNPHKLBBV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- GAJBPZXIKZXTCG-VIFPVBQESA-N (2s)-2-amino-3-[4-(azidomethyl)phenyl]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(CN=[N+]=[N-])C=C1 GAJBPZXIKZXTCG-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- OSCCDBFHNMXNME-YUPRTTJUSA-N (4S)-4-hydroxy-L-isoleucine zwitterion Chemical group C[C@H](O)[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O OSCCDBFHNMXNME-YUPRTTJUSA-N 0.000 description 1
- YGOCXQYLEOWQNL-UHFFFAOYSA-N 1,2,4,8,8a,8b-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole Chemical group C12CC=CC=C2N=C2C1CCN2 YGOCXQYLEOWQNL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VXNZUUAINFGPBY-UHFFFAOYSA-N 1-Butene Chemical group CCC=C VXNZUUAINFGPBY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YZOXPLQWARQVEJ-UHFFFAOYSA-N 2-methylsulfonyl-1,3-benzothiazole Chemical compound C1=CC=C2SC(S(=O)(=O)C)=NC2=C1 YZOXPLQWARQVEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CMSAVMZVWQOUDM-UHFFFAOYSA-N 4,5-bis(pyridin-2-ylsulfanyl)-1,2-dihydropyridazine-3,6-dione Chemical compound N1=C(C=CC=C1)SC=1C(NNC(C=1SC1=NC=CC=C1)=O)=O CMSAVMZVWQOUDM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004042 4-aminobutyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])[H] 0.000 description 1
- HIQIXEFWDLTDED-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-1-piperidin-4-ylpyrrolidin-2-one Chemical compound O=C1CC(O)CN1C1CCNCC1 HIQIXEFWDLTDED-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HTDLSAGEOYDVSJ-UHFFFAOYSA-N 4-phenyloxadiazole Chemical class O1N=NC(C=2C=CC=CC=2)=C1 HTDLSAGEOYDVSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BHQUBONFIYNJDA-UHFFFAOYSA-N 5-nitro-1h-pyridine-2-thione Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=C(S)N=C1 BHQUBONFIYNJDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ROUFCTKIILEETD-UHFFFAOYSA-N 5-nitro-2-[(5-nitropyridin-2-yl)disulfanyl]pyridine Chemical compound N1=CC([N+](=O)[O-])=CC=C1SSC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=N1 ROUFCTKIILEETD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MARUHZGHZWCEQU-UHFFFAOYSA-N 5-phenyl-2h-tetrazole Chemical class C1=CC=CC=C1C1=NNN=N1 MARUHZGHZWCEQU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000134916 Amanita Species 0.000 description 1
- 241000948470 Amanita phalloides Species 0.000 description 1
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 101800001350 Beta-amanitin Proteins 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 208000011691 Burkitt lymphomas Diseases 0.000 description 1
- XOXGXQHGFSPLJR-UHFFFAOYSA-N CS(=O)(=O)C1=C(C=CC=C1)C1=NN=NN1 Chemical compound CS(=O)(=O)C1=C(C=CC=C1)C1=NN=NN1 XOXGXQHGFSPLJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282836 Camelus dromedarius Species 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 229920002134 Carboxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 102000004225 Cathepsin B Human genes 0.000 description 1
- 108090000712 Cathepsin B Proteins 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229910021591 Copper(I) chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 108010002156 Depsipeptides Proteins 0.000 description 1
- MYMOFIZGZYHOMD-UHFFFAOYSA-N Dioxygen Chemical compound O=O MYMOFIZGZYHOMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N Elaidinsaeure-aethylester Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 241000283073 Equus caballus Species 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 101000920667 Homo sapiens Epithelial cell adhesion molecule Proteins 0.000 description 1
- 238000006736 Huisgen cycloaddition reaction Methods 0.000 description 1
- 102000008100 Human Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108091006905 Human Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 229930194542 Keto Natural products 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical group CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- SCCQCCCXSLYFHJ-WHFBIAKZSA-N N,N-dihydroxy-L-isoleucine Chemical group CC[C@H](C)[C@H](N(O)O)C(O)=O SCCQCCCXSLYFHJ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- NFVNYBJCJGKVQK-ZDUSSCGKSA-N N-[(Tert-butoxy)carbonyl]-L-tryptophan Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)OC(C)(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 NFVNYBJCJGKVQK-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- GXLFYVWQXRNZON-UHFFFAOYSA-N O1N=NC(C=2C=CC=CC=2)=C1S(=O)(=O)C Chemical compound O1N=NC(C=2C=CC=CC=2)=C1S(=O)(=O)C GXLFYVWQXRNZON-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019483 Peanut oil Nutrition 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 241000009328 Perro Species 0.000 description 1
- MIDZLCFIAINOQN-WPRPVWTQSA-N Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 MIDZLCFIAINOQN-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-STQMWFEESA-N Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 239000004721 Polyphenylene oxide Substances 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 101000677856 Stenotrophomonas maltophilia (strain K279a) Actin-binding protein Smlt3054 Proteins 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 1
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 1
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 150000003869 acetamides Chemical class 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 125000004442 acylamino group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004423 acyloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005035 acylthio group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004453 alkoxycarbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005157 alkyl carboxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004644 alkyl sulfinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004390 alkyl sulfonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004656 alkyl sulfonylamino group Chemical group 0.000 description 1
- QCZXQEYEVLCQHL-MIBTZWEZSA-N amanin Chemical compound O=C1N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N2C[C@H](O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)[C@@H](O)CO)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H]1CS(=O)C1=C2C2=CC=CC=C2N1 QCZXQEYEVLCQHL-MIBTZWEZSA-N 0.000 description 1
- QQLVIKWYAVVKKF-XYDKGUIVSA-N amanullin Chemical compound O=C1N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N2C[C@H](O)C[C@H]2C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H]1CS(=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 QQLVIKWYAVVKKF-XYDKGUIVSA-N 0.000 description 1
- 125000003368 amide group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004397 aminosulfonyl group Chemical group NS(=O)(=O)* 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- 238000003782 apoptosis assay Methods 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 125000003435 aroyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005239 aroylamino group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005333 aroyloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- IEQCUEXVAPAFMQ-UHFFFAOYSA-N beta-amanitin Natural products O=C1NC(CC(O)=O)C(=O)N2CC(O)CC2C(=O)NC(C(C)C(O)CO)C(=O)NC(C2)C(=O)NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NCC(=O)NC1CS(=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 IEQCUEXVAPAFMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000023732 binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 229920002988 biodegradable polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000004621 biodegradable polymer Substances 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000003917 carbamoyl group Chemical group [H]N([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010948 carboxy methyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 239000008112 carboxymethyl-cellulose Substances 0.000 description 1
- 239000004359 castor oil Substances 0.000 description 1
- 235000019438 castor oil Nutrition 0.000 description 1
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 238000002742 combinatorial mutagenesis Methods 0.000 description 1
- OXBLHERUFWYNTN-UHFFFAOYSA-M copper(I) chloride Chemical compound [Cu]Cl OXBLHERUFWYNTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000004976 cyclobutylene group Chemical group 0.000 description 1
- 229940097362 cyclodextrins Drugs 0.000 description 1
- 125000004977 cycloheptylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005725 cyclohexenylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004956 cyclohexylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004979 cyclopentylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004980 cyclopropylene group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001944 cysteine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 238000006193 diazotization reaction Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 125000005678 ethenylene group Chemical group [H]C([*:1])=C([H])[*:2] 0.000 description 1
- 125000005677 ethinylene group Chemical group [*:2]C#C[*:1] 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N ethyl oleate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N 0.000 description 1
- 229940093471 ethyl oleate Drugs 0.000 description 1
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 1
- 208000021045 exocrine pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000010685 fatty oil Substances 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 1
- WVHGJJRMKGDTEC-UHFFFAOYSA-N gamma-amanitin Natural products O=C1NC(CC(N)=O)C(=O)N2CC(O)CC2C(=O)NC(C(C)C(C)O)C(=O)NC(C2)C(=O)NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NCC(=O)NC1CS(=O)C1=C2C2=CC=C(O)C=C2N1 WVHGJJRMKGDTEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N glycerol triricinoleate Natural products CCCCCC[C@@H](O)CC=CCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCC=CC[C@@H](O)CCCCCC)OC(=O)CCCCCCCC=CC[C@H](O)CCCCCC ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N 0.000 description 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 125000004438 haloalkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001475 halogen functional group Chemical group 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 1
- 239000008131 herbal destillate Substances 0.000 description 1
- 125000004475 heteroaralkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005368 heteroarylthio group Chemical group 0.000 description 1
- FHBSGPWHCCIQPG-UHFFFAOYSA-N hydroxy-methyl-oxo-sulfanylidene-$l^{6}-sulfane Chemical compound CS(S)(=O)=O FHBSGPWHCCIQPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N hydroxylamine group Chemical group NO AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001841 imino group Chemical group [H]N=* 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000741 isoleucyl group Chemical group [H]N([H])C(C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])C(=O)O* 0.000 description 1
- FZWBNHMXJMCXLU-BLAUPYHCSA-N isomaltotriose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O)O1 FZWBNHMXJMCXLU-BLAUPYHCSA-N 0.000 description 1
- 239000000644 isotonic solution Substances 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 238000001972 liquid chromatography-electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000012669 liquid formulation Substances 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 230000002132 lysosomal effect Effects 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- XNEFVTBPCXGIRX-UHFFFAOYSA-M methanesulfinate Chemical compound CS([O-])=O XNEFVTBPCXGIRX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000004530 micro-emulsion Substances 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000007040 multi-step synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- NELIAIPXAJJBKQ-UHFFFAOYSA-N n-iminoformamide Chemical compound N=NC=O NELIAIPXAJJBKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 1
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- VCWUYLHSTRIKLU-UHFFFAOYSA-N oxathiazepane-4,7-dione Chemical class C1CC(=O)OSNC1=O VCWUYLHSTRIKLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LDCYZAJDBXYCGN-UHFFFAOYSA-N oxitriptan Natural products C1=C(O)C=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 LDCYZAJDBXYCGN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 239000005022 packaging material Substances 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000000312 peanut oil Substances 0.000 description 1
- 125000005010 perfluoroalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940021222 peritoneal dialysis isotonic solution Drugs 0.000 description 1
- WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N phenyl(114C)methanol Chemical compound O[14CH2]C1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N 0.000 description 1
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 description 1
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 1
- 125000000843 phenylene group Chemical group C1(=C(C=CC=C1)*)* 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- ACVYVLVWPXVTIT-UHFFFAOYSA-M phosphinate Chemical compound [O-][PH2]=O ACVYVLVWPXVTIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical compound [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- LFGREXWGYUGZLY-UHFFFAOYSA-N phosphoryl Chemical group [P]=O LFGREXWGYUGZLY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920001983 poloxamer Polymers 0.000 description 1
- 229920000867 polyelectrolyte Polymers 0.000 description 1
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 1
- 229920000570 polyether Polymers 0.000 description 1
- 239000008389 polyethoxylated castor oil Substances 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 230000005522 programmed cell death Effects 0.000 description 1
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- WHMDPDGBKYUEMW-UHFFFAOYSA-N pyridine-2-thiol Chemical compound SC1=CC=CC=N1 WHMDPDGBKYUEMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 238000006798 ring closing metathesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229930195734 saturated hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000010265 sodium sulphite Nutrition 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 239000003549 soybean oil Substances 0.000 description 1
- 235000012424 soybean oil Nutrition 0.000 description 1
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- JDVPQXZIJDEHAN-UHFFFAOYSA-N succinamic acid Chemical class NC(=O)CCC(O)=O JDVPQXZIJDEHAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 125000000446 sulfanediyl group Chemical group *S* 0.000 description 1
- 125000005420 sulfonamido group Chemical group S(=O)(=O)(N*)* 0.000 description 1
- BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M sulfonate Chemical compound [O-]S(=O)=O BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- XTQHKBHJIVJGKJ-UHFFFAOYSA-N sulfur monoxide Chemical compound S=O XTQHKBHJIVJGKJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 1
- 239000002562 thickening agent Substances 0.000 description 1
- 125000004149 thio group Chemical group *S* 0.000 description 1
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N thioacetamide Natural products CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 125000003508 trans-4-hydroxy-L-proline group Chemical group 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006098 transglycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000005918 transglycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 125000002023 trifluoromethyl group Chemical group FC(F)(F)* 0.000 description 1
- 150000003673 urethanes Chemical class 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
Область техники, к которой относится настоящее изобретениеThe field of technology to which the present invention relates
Настоящее изобретение относится к новым способам синтеза производных аманитина, имеющих гидроксигруппу, присоединенную к центральному триптофановому фрагменту. Настоящее изобретение, кроме того, относится к новым производным аманитина, имеющим гидроксигруппу, присоединенную в положении 4', 5' или 7' центрального триптофанового фрагмента, новым конъюгатам таких производных аманитина и фармацевтическая композициям, включающим в себя такие конъюгаты.The present invention relates to novel methods for the synthesis of amanitin derivatives having a hydroxyl group attached to the central tryptophan moiety. The present invention further relates to novel amanitin derivatives having a hydroxy group attached at the 4', 5' or 7' position of the central tryptophan moiety, novel conjugates of such amanitin derivatives, and pharmaceutical compositions comprising such conjugates.
Предшествующий уровень техники настоящего изобретенияBackground of the Invention
Аматоксины представляют собой циклические пептиды, состоящие из 8 аминокислот, которые обнаружены в грибах Amanita phalloides (см. фиг. 1). Аматоксины специфически ингибируют ДНК-зависимую РНК-полимеразу II клеток млекопитающих и тем самым также транскрипцию и биосинтез белка поврежденных клеток. Ингибирование транскрипции в клетке вызывает прекращение роста и пролиферации. Хотя и не связан ковалентно, комплекс между аманитином и РНК-полимеразой II является очень прочным (KD=3 нМ). Диссоциация аманитина от фермента является очень медленным процессом, что делает восстановление поврежденной клетки маловероятным. Если ингибирование транскрипции длится слишком долго, клетка подвергается запрограммированной клеточной смерти (апоптозу).Amatoxins are 8 amino acid cyclic peptides found in the fungus Amanita phalloides (see FIG. 1). Amatoxins specifically inhibit the DNA-dependent RNA polymerase II of mammalian cells and thereby also the transcription and protein biosynthesis of damaged cells. Inhibition of transcription in a cell causes cessation of growth and proliferation. Although not covalently bound, the complex between amanitin and RNA polymerase II is very strong (K D =3 nM). The dissociation of amanitin from the enzyme is a very slow process, making repair of the damaged cell unlikely. If transcription inhibition lasts too long, the cell undergoes programmed cell death (apoptosis).
Применение аматоксинов в качестве цитотоксических фрагментов для противоопухолевой терапии уже исследовали в 1981 году путем связывания антитела против Thy 1,2 с α-аманитином с использованием линкера, присоединенного к индольному кольцу Trp (аминокислота 4; см. фиг. 1) через диазотирование (Davis & Preston, Science 213 (1981) 1385-1388). Davis и Preston идентифицировали сайт присоединения как положение 7'. Morris и Venton также продемонстрировали, что замещение в положении 7' дает производное, которое сохраняет цитотоксическую активность (Morris & Venton, Int. J. Peptide Protein Res. 21 (1983) 419-430).The use of amatoxins as cytotoxic moieties for antitumor therapy was already explored in 1981 by coupling an anti-Thy 1,2 antibody to α-amanitin using a linker attached to the indole ring of Trp (
В заявке на выдачу европейского патента № ЕР1859811 А1 (опубликованной 28 ноября 2007 года) описываются конъюгаты, в которых γ С-атом аматоксина аминокислоты 1 β-аманитина был непосредственно связан, т.е. без линкерной структуры, с альбумином или с моноклональным антителом НЕА125, ОКТ3 или РА-1. Более того, показан ингибирующий эффект этих конъюгатов в отношении пролиферации клеток рака молочной железы (MCF-7), клеток лимфомы Беркитта (Raji) и клеток Т-лимфомы (Jurkat). Предполагали применение линкеров, в том числе линкеров, включающих в себя элементы, такие как амид, сложный эфир, эфир, тиоэфир, дисульфид, мочевина, тиомочевина, углеводородные фрагменты и подобные, но такие конструкции фактически не были показаны и не было представлено больше подробностей, таких как сайты прикрепления на аматоксинах.European Patent Application No. EP1859811 A1 (published Nov. 28, 2007) describes conjugates in which the amatoxin γ atom of
В заявках на выдачу патентов WO 2010/115629 и WO 2010/115630 (обе опубликованные 14 октября 2010 года) описаны конъюгаты, в которых антитела, такие как антитела против ЕрСАМ, такие как гуманизированное антитело huHEA125, связаны с аматоксинами посредством (i) γ С-атома аминокислоты 1 аматоксина, (ii) 6' С-атома аминокислоты 4 аматоксина, или (iii) посредством δ С-атома аминокислоты 3 аматоксина, в каждом случае или непосредственно или посредством линкера между антителом и аматоксинами. Предполагаемые линкеры включают в себя элементы, такие как амид, сложный эфир, эфир, тиоэфир, дисульфид, мочевина, тиомочевина, углеводородные фрагменты и подобные. Более того, показаны ингибирующие эффекты таких конъюгатов в отношении пролиферации клеток рака молочной железы (клеточной линии MCF-7), карциномы поджелудочной железы (клеточной линии Capan-1), рака толстой кишки (клеточной линии Со1о205) и холангиокарциномы (клеточной линии OZ).Patent applications WO 2010/115629 and WO 2010/115630 (both published October 14, 2010) describe conjugates in which antibodies, such as anti-EpCAM antibodies, such as the humanized huHEA125 antibody, are linked to amatoxins via (i) γ C - atom of
В заявке на выдачу патентов WO 2012/119787 описывается, что связывающиеся с мишенью фрагменты могут быть присоединены к аматоксинам через линкеры по дополнительным сайтам присоединения на аминокислоте 4 триптофана, а именно в положениях 1'-N, без влияния на взаимодействие таких аматоксинов с их мишенью - ДНК-зависимой РНК-полимеразой II клеток млекопитающих.Patent application WO 2012/119787 describes that target-binding moieties can be attached to amatoxins via linkers at additional attachment sites on
В заявке на выдачу патентов WO 2014/009025 описывается полный синтез производных аманитина с использованием нового синтона для γ,δ-дигидроксиизолейцина в качестве одного из исходных материалов. Кроме того, в заявке на выдачу патентов РСТ/ЕР2016/078984 [опубликованной как WO 2017/089607] описывается полный синтез производных γ- и ε-аманитина с использованием легкодоступного (2S,3R,4S)-L-4-гидроксиизолейцина в качестве одного из исходных материалов. Тем не менее эти подходы и все другие полностью или частично синтетические подходы, применяемые до настоящего времени, заключаются во включении центрального триптофанового фрагмента в ядро аматоксина с использованием способа в соответствии с реакцией Savige-Fontana. В этом способе цис-2-карбокси-3а-гидрокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индол («Hpi») встраивают в линейную структуру предшественника аманитина. В катализируемой кислотой реакции сочетания Hpi-цистеина образуется аманитиновая кольцевая система с центральным триптофановым фрагментом.Patent application WO 2014/009025 describes the total synthesis of amanitin derivatives using a novel synthon for γ,δ-dihydroxyisoleucine as one of the starting materials. In addition, patent application PCT/EP2016/078984 [published as WO 2017/089607] describes the total synthesis of γ- and ε-amanitine derivatives using readily available (2S,3R,4S)-L-4-hydroxyisoleucine as one from source materials. However, these approaches and all other wholly or partially synthetic approaches used to date have been to incorporate a central tryptophan moiety into the amatoxin core using a method according to the Savige-Fontana reaction. In this method, cis-2-carboxy-3a-hydroxy-1,2,3,3a,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole ("Hpi") is inserted into the linear amanitin precursor structure. The acid-catalyzed Hpi-cysteine coupling reaction produces an amanitine ring system with a central tryptophan moiety.
Hpi, однако, не имеет никакого функционального фрагмента, присоединенного к фенильному кольцу индольного фрагмента в Hpi. Таким образом, аманитиновые продукты, полученные из способа в соответствии с реакцией Savige-Fontana, содержат центральный триптофановый фрагмент без каких-либо дополнительных заместителей. Встречающиеся в природе α-, β-, γ и ε-аманитины, однако, содержат центральный 6'-гидрокси-триптофановый фрагмент, и эту 6'-гидроксигруппу успешно использовали в качестве функциональной группы для функционализации аманитинов, например, путем присоединения нацеливающихся фрагментов, либо непосредственно, либо через линкеры (см., например, WO 2010/115629, WO 2010/115630 и WO 2012/041504). Таким образом, в случае синтетических аманитинов функционализация должна была быть выполнена (i) через γ С-атом аминокислоты 1 аматоксина, или (ii) через δ С-атом аминокислоты 3 аматоксина, как описано выше, или через атом азота триптофанового фрагмента, как описано в WO 2012/119787.Hpi, however, does not have any functional moiety attached to the phenyl ring of the indole moiety in Hpi. Thus, the amanitin products obtained from the Savige-Fontana method contain the central tryptophan moiety without any additional substituents. Naturally occurring α-, β-, γ and ε-amanitins, however, contain a central 6'-hydroxy-tryptophan moiety, and this 6'-hydroxy group has been successfully used as a functional group to functionalize amanitins, for example, by attaching targeting moieties, either directly or via linkers (see, for example, WO 2010/115629, WO 2010/115630 and WO 2012/041504). Thus, in the case of synthetic amanitins, the functionalization must have been performed (i) through the γ C atom of
Hpi может быть получен путем осуществления реагирования триптофана с перуксусной кислотой или фотохимически с синглетным кислородом. Однако до сих пор не было описано никаких производных с заместителями, присоединенными к фенильному кольцу индольного фрагмента Hpi.Hpi can be obtained by reacting tryptophan with peracetic acid or photochemically with singlet oxygen. However, no derivatives with substituents attached to the phenyl ring of the indole moiety Hpi have been described so far.
Хотя использование полностью синтетических путей для аматоксинов может обеспечить вариант поставки более крупных количеств аматоксинов, необходимых для терапевтических применений, и может обеспечить создание множества новых вариантов аматоксинов с использованием соответствующих исходных материалов в качестве строительных блоков, подходы, использовавшиеся ранее, были ограничены тем фактом, что нативная структура α-, β-, γ и/или ε-аманитина не могла быть получена, поскольку не мог быть включен 6'-гидроксифрагмент, присоединенный к триптофановому фрагменту в виде ядра, в таких аманитинах. Таким образом, варианты функционализации синтетических аманитинов до настоящего времени были довольно ограничены. Кроме того, было бы крайне желательно расширить диапазон вариантов, доступных для функционализации, поскольку такие факторы, как стерическое затруднение и реакционная способность, могут оказывать сильное влияние на реакционную способность, биологическую активность и/или стабильность синтетических аманитинов и их конъюгатов. Однако стабильность и эффективность конъюгатов, включающих в себя высокотоксические аманитины, имеют первостепенное значение для предполагаемого применения в качестве терапевтических молекул для введения людям.While the use of fully synthetic pathways for amatoxins may provide an option to supply larger amounts of amatoxins needed for therapeutic applications and may allow the creation of many new amatoxin variants using the appropriate starting materials as building blocks, previous approaches have been limited by the fact that the native structure of α-, β-, γ and/or ε-amanitin could not be obtained because the 6'-hydroxy moiety attached to the tryptophan moiety as a core could not be included in such amanitins. Thus, the options for the functionalization of synthetic amanitins have been rather limited so far. In addition, it would be highly desirable to expand the range of options available for functionalization, since factors such as steric hindrance and reactivity can greatly influence the reactivity, biological activity and/or stability of synthetic amanitins and their conjugates. However, the stability and efficacy of conjugates comprising highly toxic amanitins are of paramount importance for intended use as therapeutic molecules for administration to humans.
Цель настоящего изобретенияPurpose of the present invention
Таким образом, все еще сохраняется большая потребность в экономически эффективном и надежном способе синтеза аматоксинов с гидроксигруппой, присоединенной к фенильному кольцу центрального триптофанового фрагмента. В частности, существует острая необходимость в идентификации исходных материалов, которые могли бы быть использованы в установленной реакции Savige-Fontana и которые обеспечены таким образом, чтобы могли вызывать включение таких гидроксигрупп.Thus, there is still a great need for a cost-effective and reliable method for the synthesis of amatoxins with a hydroxy group attached to the phenyl ring of the central tryptophan moiety. In particular, there is a strong need to identify starting materials that could be used in the established Savige-Fontana reaction and that are provided in such a way that they can cause the incorporation of such hydroxyl groups.
Краткое раскрытие настоящего изобретенияBrief summary of the present invention
Настоящее изобретение основано на неожиданном наблюдении, что могут быть синтезированы варианты Hpi, которые позволяют введение гидроксильных групп в ходе синтеза производных аманитина.The present invention is based on the surprising observation that Hpi variants can be synthesized that allow the introduction of hydroxyl groups during the synthesis of amanitine derivatives.
Таким образом, согласно одному аспекту настоящее изобретение относится к гидрокси-замещенному производному 2-карбокси-3а-гидрокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола в соответствии с формулой IThus, according to one aspect, the present invention relates to a hydroxy-substituted derivative of 2-carboxy-3a-hydroxy-1,2,3,3a,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole in accordance with formula I
в которой R1 выбран из алкила, арила, гетероарила, замещенного алкила, замещенного арила и замещенного гетероарила;in which R1 is selected from alkyl, aryl, heteroaryl, substituted alkyl, substituted aryl and substituted heteroaryl;
P1 представляет собой водород или защитную группу, в частности, защитную группу, выбранную из Boc, PhCH2OCO-, СН2=CHCH2O-СО- и тритила;P 1 represents hydrogen or a protecting group, in particular a protecting group selected from Boc, PhCH 2 OCO-, CH 2 =CHCH 2 O-CO- and trityl;
Р2 представляет собой водород или защитную группу, в частности, защитную группу, в частности, защитную группу, выбранную из Boc, PhCH2OCO-, СН2=СНСН2О-СО- и тритила; иP 2 represents hydrogen or a protecting group, in particular a protecting group, in particular a protecting group selected from Boc, PhCH 2 OCO-, CH 2 =CHCH 2 O-CO- and trityl; And
R2 выбран из ОН, OR1 и полипептидной цепи, состоящей из 1-7 аминокислотных остатков.R2 is selected from OH, OR1 and a polypeptide chain consisting of 1-7 amino acid residues.
Согласно второму аспекту настоящее изобретение относится к способу синтеза линейного предшественника, включающего в себя восемь аминокислотных остатков производного аманитина, включающего в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, предусматривающему стадию использования гидрокси-замещенного производного 2-карбокси-3а-гидрокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола в соответствии с настоящим изобретением в пептидном синтезе указанного предшественника.According to a second aspect, the present invention relates to a method for the synthesis of a linear precursor comprising eight amino acid residues of an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan fragment, comprising the step of using a hydroxy-substituted derivative of 2-carboxy-3a-hydroxy-1,2,3,3a ,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole according to the present invention in the peptide synthesis of said precursor.
Согласно третьему аспекту настоящее изобретение относится к способу синтеза производного аманитина, включающего в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, предусматривающему стадии:According to a third aspect, the present invention relates to a process for the synthesis of an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety, comprising the steps of:
(i) инициирования или обеспечения образования связи между цистеиновым остатком и триптофановым фрагментом линейного предшественника в соответствии с настоящим изобретением; и(i) initiating or causing the formation of a bond between a cysteine residue and a tryptophan fragment of a linear precursor in accordance with the present invention; And
(ii) инициирования или обеспечения образования указанного производного аманитина путем осуществления реагирования N-концевого линейного предшественника в соответствии с настоящим изобретением с С-концом указанного предшественника.(ii) initiating or causing the formation of said amanitin derivative by reacting an N-terminal linear precursor according to the present invention with the C-terminus of said precursor.
Согласно четвертому аспекту настоящее изобретение относится к производному аманитина, включающему в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, который выбран из (i) S-дезокси-4'-гидрокси-аманина, 4'-гидрокси-аманина, S-дезокси-5'-гидрокси-аманина, 5'-гидрокси-аманина, S-дезокси-7'-гидрокси-аманина, 7'-гидрокси-аманина, (ii) S-дезокси-4'-гидрокси-аманинамида, 4'-гидрокси-аманинамида, S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида, 5'-гидрокси-аманинамида, S-дезокси-7'-гидрокси-аманинамида и 7'-гидрокси-аманинамида, (iii) производного аманитина в соответствии с (i), в котором фрагмент свободной карбоновой кислоты аминокислоты 1 превращается в сложный эфир карбоновой кислоты -C(=O)OR1 или во фрагмент -C(=O)NH-OR1, при этом R1 выбран из алкила, арила, гетероарила, замещенного алкила, замещенного арила и замещенного гетероарила.According to a fourth aspect, the present invention relates to an amanitine derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety which is selected from (i) S-deoxy-4'-hydroxy-amanin, 4'-hydroxy-amanin, S-deoxy-5'-hydroxy- amanine, 5'-hydroxy-amanin, S-deoxy-7'-hydroxy-amanin, 7'-hydroxy-amanin, (ii) S-deoxy-4'-hydroxy-amaninamide, 4'-hydroxy-amaninamide, S- deoxy-5'-hydroxy-amaninamide, 5'-hydroxy-amaninamide, S-deoxy-7'-hydroxy-amaninamide and 7'-hydroxy-amaninamide, (iii) an amanitin derivative according to (i), in which the moiety of the free carboxylic acid of
Согласно пятому аспекту настоящее изобретение относится к конъюгату, включающему в себя (а) производное аманитина, включающее в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент в соответствии с настоящим изобретением; (b) связывающийся с мишенью фрагмент и (с) необязательно линкер, связывающий указанное производное аманитина и указанный связывающийся с мишенью фрагмент.According to a fifth aspect, the present invention relates to a conjugate comprising (a) an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety according to the present invention; (b) a target-binding moiety; and (c) optionally a linker linking said amanitin derivative and said target-binding moiety.
Согласно шестому аспекту настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, включающей в себя аманитин в соответствии с настоящим изобретением или конъюгат в соответствии с настоящим изобретением.According to a sixth aspect, the present invention relates to a pharmaceutical composition comprising amanitin according to the present invention or a conjugate according to the present invention.
Согласно седьмому аспекту настоящее изобретение относится к производному аманитина в соответствии с настоящим изобретением, конъюгату в соответствии с настоящим изобретением или фармацевтической композиции в соответствии с настоящим изобретением для применения в лечении злокачественной опухоли у больного, в частности, при этом злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из рака молочной железы, рака поджелудочной железы, холангиокарциномы, рака толстой и прямой кишки, рака легкого, рака предстательной железы, рака яичника, рака желудка, рака почки, злокачественной меланомы, лейкоза и злокачественной лимфомы.According to a seventh aspect, the present invention relates to an amanitin derivative according to the present invention, a conjugate according to the present invention, or a pharmaceutical composition according to the present invention for use in the treatment of a cancer in a patient, in particular, the cancer is selected from the group consisting of of breast cancer, pancreatic cancer, cholangiocarcinoma, colon and rectal cancer, lung cancer, prostate cancer, ovarian cancer, gastric cancer, kidney cancer, malignant melanoma, leukemia and malignant lymphoma.
Согласно восьмому аспекту настоящее изобретение относится к конструкции, включающей в себя (а) производное аманитина в соответствии с настоящим изобретением и (b) линкерный фрагмент, несущий реакционноспособную группу Y для связывания указанного производного аманитина со связывающимся с мишенью фрагментом.According to an eighth aspect, the present invention relates to a construct comprising (a) an amanitine derivative according to the present invention and (b) a linker moiety bearing a Y reactive group for linking said amanitine derivative to a target-binding moiety.
Краткое описание графических материаловBrief description of graphic materials
На фиг. 1 показаны структурные формулы различных аматоксинов. Числа, выделенные жирным шрифтом (от 1 до 8), обозначают стандартную нумерацию восьми аминокислот, образующих аматоксин. Также показаны стандартные обозначения атомов в аминокислотах 1, 3 и 4 (греческие буквы от α до γ, греческие буквы от α до δ и цифры от 1' до 7', соответственно).In FIG. 1 shows the structural formulas of various amatoxins. The numbers in bold (from 1 to 8) indicate the standard numbering of the eight amino acids that form amatoxin. Also shown are the standard atomic designations in
На фиг. 2 показана структура соединения S-деокси-α-аманитина (HDP 30.0735) и α-аманитина.In FIG. 2 shows the structure of the compound S-deoxy-α-amanitin (HDP 30.0735) and α-amanitin.
На фиг. 3 показано, что Hpi (HDP 30.0079) образуется при одностадийном синтезе, исходя из Boc-L-триптофана.In FIG. 3 shows that Hpi (HDP 30.0079) is formed in a one-step synthesis starting from Boc-L-tryptophan.
На фиг. 4 показано, что соединение S-деокси-α-аманитина (HDP 30.0735) образуется путем твердофазного пептидного синтеза, включающего производное Hpi HDP 30.2555.In FIG. 4 shows that the compound S-deoxy-α-amanitin (HDP 30.0735) is formed by solid phase peptide synthesis involving the Hpi derivative HDP 30.2555.
На фиг. 5 показана цитотоксичность S-деокси-α-аманитина (HDP 30.0735) и S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида HDP 30.2548 в отношении клеток HEK293 и в отношении клеток HEK293 ОАТР1В3.In FIG. 5 shows the cytotoxicity of S-deoxy-α-amanitin (HDP 30.0735) and S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide HDP 30.2548 to HEK293 cells and to HEK293 OATP1B3 cells.
На фиг. 6 показана конструкция на основе S-деокси-α-аманитина (HDP 30.0735) с расщепляемым линкером, присоединенным к 6'-гидроксигруппе и концевой малеимидной группе в качестве примера реакционноспособные группа Y, для связывания указанной конструкции со связывающимся с мишенью фрагментом.In FIG. 6 shows an S-deoxy-α-amanitine (HDP 30.0735) construct with a cleavable linker attached to the 6'-hydroxy group and an exemplary Y reactive maleimide group to link the construct to a target-binding moiety.
На фиг. 7 показана альтернативная конструкция на основе S-деокси-α-аманитина (HDP 30.0735) с расщепляемым линкером, присоединенным к карбоксильной группе аминокислотного остатка 1 и концевой малеимидной группе в качестве примера реакционноспособной группы Y, для связывания указанной конструкции со связывающимся с мишенью фрагментом.In FIG. 7 shows an alternative construct based on S-deoxy-α-amanitin (HDP 30.0735) with a cleavable linker attached to the carboxyl group of
На фиг. 8 показано, что гидроксилированное производное Hpi HDP 30.2536 образуется при многостадийном синтезе, исходя из 5'-гидрокси-L-триптофана.In FIG. 8 shows that the hydroxylated Hpi derivative HDP 30.2536 is formed in a multi-step synthesis starting from 5'-hydroxy-L-tryptophan.
На фиг. 9 показано, что соединение предшественника аманитина HDP 30.2544 образуется путем твердофазного пептидного синтеза, включающего производное Hpi HDP 30.2536.In FIG. 9 shows that the amanitin precursor compound HDP 30.2544 is formed by solid phase peptide synthesis involving the Hpi derivative HDP 30.2536.
На фиг. 10 показано, что соединение производное аманитина HDP 30.2546 образуется путем замыкания кольца из предшественника аманитина HDP 30.2544.In FIG. 10 shows that the amanitin compound HDP 30.2546 is formed by ring closure from the amanitin precursor HDP 30.2544.
На фиг. 11 показано, что производное аманитина HDP 30.2548 (S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамид) образуется путем удаления защитных групп из производного аманитина HDP 30.2546.In FIG. 11 shows that the amanitin derivative HDP 30.2548 (S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide) is formed by deprotection of the amanitin derivative HDP 30.2546.
На фиг. 12 показана конструкция на основе производного аманитина HDP 30.2548 (S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида) с расщепляемым линкером, присоединенным к 5'-гидроксигруппе и концевой малеимидной группе в качестве примера реакционноспособной группы Y, для связывания указанной конструкции со связывающимся с мишенью фрагментом.In FIG. 12 shows a construct based on the amanitin derivative HDP 30.2548 (S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide) with a cleavable linker attached to the 5'-hydroxy group and a terminal maleimide group as an example of a reactive Y group to link said construct to a target-binding fragment.
На фиг. 13 показана цитотоксичность ADC HDP 30.2347, HDP 30.2371 и HDP 30.2602, нацеливающихся на А) HER-2/neu в клетках SKBR-3 (HER-2/neu+++) и в клетках JIMT-1 (HER-2/neu+), В) PSMA в клетках LnCap (PSMA+++) и в клетках 22rv1 (PSMA++), и С) CD19 в клетках Raji (CD19+++) и в клетках Nalm-6 (CD19++), по сравнению с ADC HDP 30.1699 (включающими в себя тот же расщепляемый линкер, что и HDP 30.2347, HDP 30.2371 и HDP 30.2602, но альфа-аманитин вместо описанных выше производных аманитина).In FIG. 13 shows the cytotoxicity of HDP 30.2347, HDP 30.2371 and HDP 30.2602 ADCs targeting A) HER-2/neu in SKBR-3 (HER-2/neu+++) cells and in JIMT-1 (HER-2/neu+) cells, B) PSMA in LnCap (PSMA+++) cells and 22rv1 (PSMA++) cells, and C) CD19 in Raji (CD19+++) cells and Nalm-6 (CD19++) cells, compared to ADC HDP 30.1699 (comprising the same cleavable linker, same as HDP 30.2347, HDP 30.2371 and HDP 30.2602, but alpha-amanitin instead of the amanitin derivatives described above).
Подробное раскрытие настоящего изобретенияDetailed disclosure of the present invention
Прежде чем настоящее изобретение будет подробно описано ниже, следует отметить, что настоящее изобретение не ограничивается конкретными методологией, протоколами и реагентами, описанными в настоящем документе, поскольку они могут варьироваться. Также следует отметить, что используемая в настоящем документе терминология предназначена исключительно для описания конкретных вариантов осуществления и не предназначена для ограничения объема настоящего изобретения, который будет ограничиваться только прилагаемой формулой изобретения. Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в настоящем документе, имеют те же значения, которые обычно понимаются специалистом в данной области.Before the present invention is described in detail below, it should be noted that the present invention is not limited to the specific methodology, protocols, and reagents described herein, as they may vary. It should also be noted that the terminology used herein is for the sole purpose of describing specific embodiments and is not intended to limit the scope of the present invention, which will be limited only by the appended claims. Unless otherwise indicated, all technical and scientific terms used in this document have the same meanings as commonly understood by a person skilled in the art.
В частности, термины, используемые в настоящем документе, определяют, как описано в "A multilingual glossary of biotechnological terms: (IUPAC Recommendations)", Leuenberger, H.G.W, Nagel, B. and Kölbl, H. eds. (1995), Helvetica Chimica Acta, CH-4010 Basel, Switzerland.In particular, the terms used herein are defined as described in "A multilingual glossary of biotechnological terms: (IUPAC Recommendations)", Leuenberger, H.G.W, Nagel, B. and Kölbl, H. eds. (1995), Helvetica Chimica Acta, CH-4010 Basel, Switzerland.
По всему настоящему описанию и следующей за ним формуле изобретения, если контекст не требует иного, будет подразумеваться, что слово «включать в себя» и такие варианты, как «включает в себя» и «включающий в себя», подразумевают включение указанного целого числа, композиции или стадии, или группы целых чисел, композиций или стадий, в то время как любые дополнительные целое число, композиция или стадия, или группа целых чисел, композиций или стадий также могут необязательно присутствовать, в том числе имеются варианты осуществления, в которых нет дополнительных целого числа, композиции или стадии, или группы целых чисел, композиций или стадий. В таких последних вариантах осуществления термин «включающий в себя» используют совместно с «состоящим из».Throughout this specification and the following claims, unless the context otherwise requires, the word "comprise" and variations such as "comprises" and "comprising" are intended to include the specified integer, compositions or steps, or groups of integers, compositions or steps, while any additional integer, composition or step, or group of integers, compositions or steps may also optionally be present, including embodiments in which there are no additional an integer, composition or stage, or a group of integers, compositions or stages. In such latter embodiments, the term "comprising" is used in conjunction with "consisting of".
Некоторые документы цитируется по всему тексту настоящего описания. Каждый из документов, цитируемых в настоящем документе (в том числе все патенты, заявки на выдачу патентов, научные публикации, спецификации производителя, инструкции, представления последовательностей в виде номеров доступа GenBank и т.д.), будь то выше или ниже, тем самым включен в качестве ссылки в полном своем объеме в той степени, в которой это возможно в рамках соответствующего патентного законодательства. Ничто в настоящем документе не должно быть истолковано как признание того, что изобретение не имеет права предшествовать такому раскрытию в силу наличия предшествующего изобретения.Some documents are cited throughout the text of this description. Each of the documents cited herein (including all patents, patent applications, scientific publications, manufacturer's specifications, instructions, sequence representations as GenBank Access Numbers, etc.), whether higher or lower, thereby incorporated by reference in its entirety to the extent possible under the relevant patent law. Nothing herein should be construed as an admission that the invention is not entitled to precede such disclosure by virtue of the existence of prior invention.
Далее будет описано настоящее изобретение. В следующих частях более подробно определяются различные аспекты настоящего изобретения. Каждый определенный таким образом аспект может быть объединен с любым другим аспектом или аспектами, если явно не указано иное. В частности, любой признак, указанный как предпочтительный или преимущественный, может быть объединен с любым другим признаком или признаками, указанными как предпочтительные или преимущественные.Next, the present invention will be described. In the following parts, various aspects of the present invention are defined in more detail. Each aspect thus defined may be combined with any other aspect or aspects, unless expressly stated otherwise. In particular, any feature indicated as being preferred or advantageous may be combined with any other feature or features indicated as being preferred or advantageous.
Настоящее изобретение основано на неожиданном наблюдении того, что могут быть синтезированы варианты Hpi, которые позволяют вводить гидроксильные группы в ходе синтеза производных аманитина.The present invention is based on the surprising observation that Hpi variants can be synthesized that allow the introduction of hydroxyl groups during the synthesis of amanitine derivatives.
Таким образом, согласно одному аспекту настоящее изобретение относится к гидрокси-замещенному производному 2-карбокси-3а-гидрокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола в соответствии с формулой IThus, according to one aspect, the present invention relates to a hydroxy-substituted derivative of 2-carboxy-3a-hydroxy-1,2,3,3a,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole in accordance with formula I
в которой R1 выбран из алкила, арила, гетероарила, замещенного алкила, замещенного арила и замещенного гетероарила;in which R1 is selected from alkyl, aryl, heteroaryl, substituted alkyl, substituted aryl and substituted heteroaryl;
P1 представляет собой водород или защитную группу;P 1 represents hydrogen or a protective group;
Р2 представляет собой водород или защитную группу; иR 2 represents hydrogen or a protective group; And
R2 выбран из ОН, OR1 и полипептидной цепи, состоящей из 1-7 аминокислотных остатков.R2 is selected from OH, OR1 and a polypeptide chain consisting of 1-7 amino acid residues.
В контексте настоящего изобретения термин «защитная группа» относится к группе, которая присоединяется к атому азота в положениях 1 или 8 центрального гексагидропирроло[2,3-b]индольного фрагмента для блокирования атома азота от осуществления реагирования с другими реактантами, используемыми для синтеза и/или для дальнейшей функционализации соединений в соответствии с формулой I. Рядовому специалисту в данной области хорошо известны различные защитные группы, которые доступны в уровне техники, которые могут быть присоединены к соответствующему атому азота при необходимости защиты атома азота и которые могут быть затем отщеплены, когда N-защита больше не требуется. Согласно конкретным вариантам осуществления для N-защиты используется N-ацилирующий реагент. Таким образом, согласно таким вариантам осуществления P1 и/или Р2 представляют собой ацильные группы. Согласно другим конкретным вариантам осуществления для N-защиты используется N-алкилирующий реагент. Таким образом, согласно таким вариантам осуществления Р1 и/или Р2 представляет собой алкильную группу.In the context of the present invention, the term "protecting group" refers to a group that attaches to the nitrogen atom at
Согласно конкретным вариантам осуществления защитная группа Р1 или Р2, если присутствует, независимо выбрана из Boc, PhCH2OCO-, СН2=СНСН2О-СО- и тритила.In specific embodiments, the protecting group P1 or P2, if present, is independently selected from Boc, PhCH 2 OCO-, CH 2 =CHCH 2 O-CO-, and trityl.
Согласно конкретному варианту осуществления гидроксигруппа в положении 3а и атом водорода в положении 8а находятся в цис-конфигурации относительно функциональной группы, присоединенной в положении 2. Согласно другому конкретному варианту осуществления гидроксигруппа в положении 3а и атом водорода в положении 8а находятся в транс-конфигурации относительно функциональной группы, присоединенной в положении 2. Согласно конкретному варианту осуществления амино-замещенное производное в соответствии с настоящим изобретением представляет собой смесь соединений с цис- и транс-конфигурацией.In a particular embodiment, the hydroxy group at position 3a and the hydrogen atom at position 8a are in cis configuration with respect to the functional group attached at
Согласно конкретному варианту осуществления заместитель R1-C(=O)-O-присоединяется в положении 4 в формуле I.In a specific embodiment, the R1-C(=O)-O-substituent is attached at
Согласно конкретному варианту осуществления заместитель R1-C(=O)-O-присоединяется в положении 5 в формуле I.In a specific embodiment, the substituent R1-C(=O)-O- is attached at
Согласно конкретному варианту осуществления заместитель R1-C(=O)-O-присоединяется в положении 6 в формуле I.In a specific embodiment, the R1-C(=O)-O-substituent is attached at
Согласно конкретному варианту осуществления заместитель R1-C(=O)-O-присоединяется в положении 7 в формуле I.In a specific embodiment, the R1-C(=O)-O-substituent is attached at
Согласно второму аспекту настоящее изобретение относится к способу синтеза линейного предшественника, включающего в себя восемь аминокислотных остатков производного аманитина, включающего в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, предусматривающему стадию использования гидрокси-замещенного производного 2-карбокси-3а-гидрокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола в соответствии с настоящим изобретением в пептидном синтезе указанного предшественника.According to a second aspect, the present invention relates to a method for the synthesis of a linear precursor comprising eight amino acid residues of an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan fragment, comprising the step of using a hydroxy-substituted derivative of 2-carboxy-3a-hydroxy-1,2,3,3a ,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole according to the present invention in the peptide synthesis of said precursor.
Согласно третьему аспекту настоящее изобретение относится к способу синтеза производного аманитина, включающего в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, предусматривающему стадии:According to a third aspect, the present invention relates to a process for the synthesis of an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety, comprising the steps of:
(i) инициирования или обеспечения образования связи между цистеиновым остатком и триптофановым фрагментом линейного предшественника в соответствии с настоящим изобретением; и(i) initiating or causing the formation of a bond between a cysteine residue and a tryptophan fragment of a linear precursor in accordance with the present invention; And
(ii) инициирования или обеспечения образования указанного производного аманитина путем осуществления реагирования N-концевого линейного предшественника в соответствии с настоящим изобретением с С-концом указанного предшественника.(ii) initiating or causing the formation of said amanitin derivative by reacting an N-terminal linear precursor according to the present invention with the C-terminus of said precursor.
Согласно дополнительным аспектам настоящее изобретение относится к отдельным предшественникам аманитина, синтезируемым, как показано в примерах, в частности, к соединениям HDP 30.2569, HDP 30.2572 и твердофазным промежуточным соединениям, синтезируемым в соответствии с [00145].According to additional aspects, the present invention relates to individual amanitin precursors synthesized as shown in the examples, in particular to compounds HDP 30.2569, HDP 30.2572 and solid phase intermediates synthesized in accordance with [00145].
Согласно конкретному варианту осуществления способ в соответствии с настоящим изобретением дополнительно предусматривает окисление атома серы цистеинового фрагмента с образованием сульфоксида или сульфона, в частности, сульфоксида.According to a particular embodiment, the method of the present invention further comprises oxidizing the sulfur atom of the cysteine moiety to form a sulfoxide or sulfone, in particular a sulfoxide.
Согласно четвертому аспекту настоящее изобретение относится к производному аманитина, включающему в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, который выбран из (i) S-дезокси-4'-гидрокси-аманина, 4'-гидрокси-аманина, S-дезокси-5'-гидрокси-аманина, 5'-гидрокси-аманина, S-дезокси-7'-гидрокси-аманина, 7'-гидрокси-аманина, (ii) S-дезокси-4'-гидрокси-аманинамида, 4'-гидрокси-аманинамида, S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида, 5'-гидрокси-аманинамида, S-дезокси-7'-гидрокси-аманинамида и 7'-гидрокси-аманинамида, (iii) производного аманитина в соответствии с (i), при этом фрагмент свободной карбоновой кислоты аминокислоты 1 превращается в сложный эфир карбоновой кислоты -C(=O)OR1 или во фрагмент -C(=O)NH-OR1, при этом R1 выбран из алкила, арила, гетероарила, замещенного алкила, замещенного арила и замещенного гетероарила.According to a fourth aspect, the present invention relates to an amanitine derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety which is selected from (i) S-deoxy-4'-hydroxy-amanin, 4'-hydroxy-amanin, S-deoxy-5'-hydroxy- amanine, 5'-hydroxy-amanin, S-deoxy-7'-hydroxy-amanin, 7'-hydroxy-amanin, (ii) S-deoxy-4'-hydroxy-amaninamide, 4'-hydroxy-amaninamide, S- deoxy-5'-hydroxy-amaninamide, 5'-hydroxy-amaninamide, S-deoxy-7'-hydroxy-amaninamide and 7'-hydroxy-amaninamide, (iii) amanitine derivative according to (i), wherein the moiety is free carboxylic acid of
Согласно конкретному варианту осуществления производное аманитина в соответствии с настоящим изобретением выбрано из S-дезокси-5'-гидрокси-аманина, 5'-гидрокси-аманина, S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида и 5'-гидрокси-аманинамида.In a specific embodiment, the amanitine derivative of the present invention is selected from S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide, 5'-hydroxy-amaninamide, S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide, and 5'-hydroxy-amaninamide.
Согласно пятому аспекту настоящее изобретение относится к конъюгату, включающему в себя (а) производное аманитина, включающее в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент в соответствии с настоящим изобретением; (b) связывающийся с мишенью фрагмент и (с) необязательно линкер, связывающий указанное производное аманитина и указанный связывающийся с мишенью фрагмент.According to a fifth aspect, the present invention relates to a conjugate comprising (a) an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety according to the present invention; (b) a target-binding moiety; and (c) optionally a linker linking said amanitin derivative and said target-binding moiety.
Согласно шестому аспекту настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, включающей в себя аманитин в соответствии с настоящим изобретением или конъюгат в соответствии с настоящим изобретением.According to a sixth aspect, the present invention relates to a pharmaceutical composition comprising amanitin according to the present invention or a conjugate according to the present invention.
Согласно седьмому аспекту настоящее изобретение относится к производному аманитина в соответствии с настоящим изобретением, конъюгату в соответствии с настоящим изобретением или фармацевтической композиции в соответствии с настоящим изобретением для применения в лечении злокачественной опухоли у больного, в частности, при этом злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из рака молочной железы, рака поджелудочной железы, холангиокарциномы, рака толстой и прямой кишки, рака легкого, рака предстательной железы, рака яичника, рака желудка, рака почки, злокачественной меланомы, лейкоза и злокачественной лимфомы.According to a seventh aspect, the present invention relates to an amanitin derivative according to the present invention, a conjugate according to the present invention, or a pharmaceutical composition according to the present invention for use in the treatment of a cancer in a patient, in particular, the cancer is selected from the group consisting of of breast cancer, pancreatic cancer, cholangiocarcinoma, colon and rectal cancer, lung cancer, prostate cancer, ovarian cancer, gastric cancer, kidney cancer, malignant melanoma, leukemia and malignant lymphoma.
Согласно восьмому аспекту настоящее изобретение относится к конструкции, включающей в себя (а) производное аманитина в соответствии с настоящим изобретением и (b) линкерный фрагмент, несущий реакционноспособную группу Y для связывания указанного производного аманитина со связывающимся с мишенью фрагментом.According to an eighth aspect, the present invention relates to a construct comprising (a) an amanitine derivative according to the present invention and (b) a linker moiety bearing a Y reactive group for linking said amanitine derivative to a target-binding moiety.
В контексте настоящего изобретения термин «аманитин» относится к конкретной группе аматоксинов. В контексте настоящего изобретения термин «аматоксин» включает в себя все циклические пептиды, состоящие из 8 аминокислот, выделяемые из рода Amanita и описанные у Wieland, Т. и Faulstich Н. (Wieland Т, Faulstich Н., CRC Crit Rev Biochem. 5 (1978) 185-260). В контексте настоящего изобретения термин «аманитины» относится к бициклической структуре, которая основана на остатке аспарагиновой кислоты или аспарагина в положении 1, пролиновом остатке, в частности, гидроксипролиновом остатке в положении 2, изолейцине, гидроксиизолейцине или дигидроксиизолейцине в положении 3, остатке гидрокситриптофана в положении 4, остатках глицина в положениях 5 и 7, остатке изолейцина в положении 6 и остатке цистеина в положении 8, в частности, к производному цистеина, которое окисляется до сульфоксидного или сульфонового производного (нумерацию и иллюстративные примеры аманитинов см. на фиг. 1), и, кроме того, включает в себя все ее химические производные; кроме того, все ее полусинтетические аналоги; кроме того, все ее синтетические аналоги, построенные из строительных блоков в соответствии с основной структурой натуральных соединений (циклических, из 8 аминокислот), кроме того, все синтетические или полусинтетические аналоги, включающие в себя негидроксилированные аминокислоты вместо гидроксилированных аминокислот (при условии, что по меньшей мере одна гидроксигруппа присутствует в фенильном кольце триптофанового фрагмента), кроме того, все синтетические или полусинтетические аналоги, при этом в каждом случае любое такое производное или аналог является функционально активным в отношении ингибирования РНК-полимеразы II млекопитающих.In the context of the present invention, the term "amanitin" refers to a particular group of amatoxins. In the context of the present invention, the term "amatoxin" includes all cyclic peptides consisting of 8 amino acids isolated from the genus Amanita and described by Wieland, T. and Faulstich H. (Wieland T, Faulstich H., CRC Crit Rev Biochem. 5 ( 1978) 185-260). In the context of the present invention, the term "amanithins" refers to a bicyclic structure which is based on an aspartic acid or asparagine residue at
Таким образом, в контексте настоящего изобретения термин «восемь аминокислотных остатков производного аманитина» относится к определенным аминокислотам, которые образуют бициклическую структуру аманитинового полипептида.Thus, in the context of the present invention, the term "eight amino acid residues of an amanitin derivative" refers to certain amino acids that form the bicyclic structure of an amanitin polypeptide.
Функционально аматоксины определяют как пептиды или депсипептиды, которые ингибируют РНК-полимеразу II млекопитающих. Предпочтительными аматоксинами являются таковые с функциональной группой (например, производное с карбоксильной группой или карбоновая кислота, такие как карбоксамид или гидроксамовая кислота, аминогруппой, гидроксигруппой, тиольной или тиолзахватывающей группой), которая может быть введена в реакцию с линкерными молекулами или связывающимися с мишенью фрагментами, определяемыми выше. Аматоксинами, которые особенно подходят для конъюгатов в соответствии с настоящим изобретением, являются ди-деокси варианты α-аманитина, β-аманитина, γ-аманитина, ε-аманитина, амануллина или амануллиновой кислоты, или моно-деокси варианты аманина, аманинамида, γ-аманина или γ-аманинамида, как показано на фиг. 1, а также их соли, химические производные, полусинтетические аналоги и синтетические аналоги.Functionally, amatoxins are defined as peptides or depsipeptides that inhibit mammalian RNA polymerase II. Preferred amatoxins are those with a functional group (for example, a derivative with a carboxyl group or a carboxylic acid, such as carboxamide or hydroxamic acid, an amino group, a hydroxy group, a thiol or thiol capturing group) that can be reacted with linker molecules or target-binding moieties, defined above. Amatoxins which are particularly suitable for the conjugates according to the present invention are the di-deoxy variants of α-amanitin, β-amanitin, γ-amanitin, ε-amanitin, amanullin or amanullic acid, or the mono-deoxy variants of amanin, amaninamide, γ- amanin or γ-amaninamide as shown in FIG. 1, as well as their salts, chemical derivatives, semi-synthetic analogues and synthetic analogues.
Согласно конкретному варианту осуществления гидрокси-замещенное производное, производное аманитина, включающее в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, и/или конъюгат в соответствии с настоящим изобретением характеризуются чистотой более чем 90%, в частности, более чем 95%, более конкретно более чем 98% или даже более чем 99%.In a specific embodiment, the hydroxy-substituted derivative, the amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety, and/or the conjugate of the present invention is greater than 90% pure, in particular greater than 95%, more particularly greater than 98% or even more than 99%.
В контексте настоящего изобретения термин «чистота» относится к суммарному количеству, например, присутствующих конъюгатов. Чистота более чем 90%, например, означает, что в 1 мг композиции, включающей в себя конъюгат в соответствии с настоящим изобретением, имеется более чем 90%, т.е. более чем 900 мкг, такого конъюгата. Остальная часть, т.е. примеси, может включать в себя непрореагировавший исходный материал и другие реактанты, растворители, продукты расщепления и/или побочные продукты.In the context of the present invention, the term "purity" refers to the total amount of, for example, conjugates present. A purity of more than 90%, for example, means that in 1 mg of a composition comprising a conjugate according to the present invention, there is more than 90%, i. e. more than 900 μg of such a conjugate. The rest, i.e. impurities may include unreacted starting material and other reactants, solvents, cleavage products and/or by-products.
Согласно конкретному варианту осуществления композиция, включающая в себя гидрокси-замещенное производное, производное аманитина, включающее в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, и/или конъюгат в соответствии с настоящим изобретением, включает в себя более чем 100 мг, в частности, более чем 500 мг, и более конкретно более чем 1 г такого гидрокси-замещенного производного, производного аманитина, включающего в себя гидроксилированный триптофановый фрагмент, и/или конъюгата. Таким образом, следовое количество, например, конъюгата в соответствии с настоящим изобретением, которое возможно может присутствовать в комплексных препаратах конъюгатов известного уровня техники, явно исключается.According to a specific embodiment, a composition comprising a hydroxy-substituted derivative, an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety, and/or a conjugate according to the present invention comprises more than 100 mg, in particular more than 500 mg, and more specifically, more than 1 g of such a hydroxy-substituted derivative, an amanitin derivative comprising a hydroxylated tryptophan moiety, and/or a conjugate. Thus, a trace amount of, for example, a conjugate according to the present invention, which may possibly be present in complex preparations of prior art conjugates, is explicitly excluded.
Используемый в настоящем документе термин «связывающийся с мишенью фрагмент» относится к любой молекуле или части молекулы, которая может специфически связываться с мишеневой молекулой или мишеневым эпитопом. Предпочтительными связывающимися с мишенью фрагментами в контексте настоящей заявки являются (i) антитела или их антигенсвязывающие фрагменты; (ii) подобные антителу белки и (iii) аптамеры нуклеиновой кислоты. «Связывающиеся с мишенью фрагменты», подходящие для применения в соответствии с настоящим изобретением, как правило, имеют молекулярную массу 40000 Да (40 кДа) или больше.As used herein, the term "target-binding fragment" refers to any molecule or portion of a molecule that can specifically bind to a target molecule or target epitope. Preferred target-binding fragments in the context of the present application are (i) antibodies or antigen-binding fragments thereof; (ii) antibody-like proteins; and (iii) nucleic acid aptamers. "Target-binding moieties" suitable for use in accordance with the present invention typically have a molecular weight of 40,000 Da (40 kDa) or greater.
Используемое в настоящем документе первое соединение (например, антитело) считается «специфически связывающимся» со вторым соединением (например, антигеном, таким как мишеневый белок), если оно характеризуется константой диссоциации KD с указанным вторым соединением 100 мкМ или меньше, в частности, 50 мкМ или меньше, в частности, 30 мкМ или меньше, в частности, 20 мкМ или меньше, в частности, 10 мкМ или меньше, в частности, 5 мкМ или меньше, более конкретно 1 мкМ или меньше, более конкретно 900 нМ или меньше, более конкретно 800 нМ или меньше, более конкретно 700 нМ или меньше, более конкретно 600 нМ или меньше, более конкретно 500 нМ или меньше, более конкретно 400 нМ или меньше, более конкретно 300 нМ или меньше, более конкретно 200 нМ или меньше, еще более конкретно 100 нМ или меньше, еще более конкретно 90 нМ или меньше, еще более конкретно 80 нМ или меньше, еще более конкретно 70 нМ или меньше, еще более конкретно 60 нМ или меньше, еще более конкретно 50 нМ или меньше, еще более конкретно 40 нМ или меньше, еще более конкретно 30 нМ или меньше, еще более конкретно 20 нМ или меньше и еще более конкретно 10 нМ или меньше.As used herein, a first compound (e.g., an antibody) is considered to "specifically bind" to a second compound (e.g., an antigen such as a target protein) if it has a dissociation constant K D with said second compound of 100 μM or less, in particular 50 µM or less, in particular 30 µM or less, in particular 20 µM or less, in particular 10 µM or less, in particular 5 µM or less, more specifically 1 µM or less, more specifically 900 nM or less, more specifically 800 nM or less, more specifically 700 nM or less, more specifically 600 nM or less, more specifically 500 nM or less, more specifically 400 nM or less, more specifically 300 nM or less, more specifically 200 nM or less, still more specifically 100 nM or less, even more specifically 90 nM or less, even more specifically 80 nM or less, even more specifically 70 nM or less, even more specifically 60 nM or less, even more specifically 50 nM or less, even more specifically 40 nM or less, even more specifically 30 nM or less, even more specifically 20 nM or less, and even more specifically 10 nM or less.
В контексте настоящей заявки термины «мишеневая молекула» и «мишеневый эпитоп», соответственно, относятся к антигену и эпитопу антигена, соответственно, которые специфически связываются связывающимся с мишенью фрагментом. В частности, мишеневая молекула представляет собой связанный с опухолью антиген, в частности, антиген или эпитоп, который присутствует на поверхности одного или нескольких типов опухолевых клеток в повышенной концентрацией и/или в другой стерической конфигурации по сравнению с поверхностью неопухолевых клеток. В частности, указанный антиген или эпитоп присутствует на поверхности одного или нескольких типов опухолевых клеток, но не на поверхности неопухолевых клеток. Согласно конкретным вариантам осуществления связывающийся с мишенью фрагмент специфически связывается с эпитопом антигена, выбранного из PSMA, CD 19, CD269, сиалила Lewisa, HER-2/neu и адгезивной молекулы эпителиальных клеток (ЕрСАМ). Согласно другим вариантам осуществления указанный антиген или эпитоп преимущественно экспрессируется на клетках, вовлеченных в аутоиммунные заболевания. Согласно таким конкретным вариантам осуществления связывающийся с мишенью фрагмент специфически связывается с эпитопом рецептора IL-6 (IL-6R).As used herein, the terms "target molecule" and "target epitope", respectively, refer to an antigen and an antigen epitope, respectively, that are specifically bound by a target-binding moiety. In particular, the target molecule is a tumor-associated antigen, in particular an antigen or epitope, which is present on the surface of one or more types of tumor cells in an increased concentration and/or in a different steric configuration compared to the surface of non-tumor cells. In particular, the specified antigen or epitope is present on the surface of one or more types of tumor cells, but not on the surface of non-tumor cells. In specific embodiments, the target-binding fragment specifically binds to an epitope of an antigen selected from PSMA, CD 19, CD269, Lewis a sialyl, HER-2/neu, and epithelial cell adhesion molecule (EpCAM). In other embodiments, said antigen or epitope is predominantly expressed on cells involved in autoimmune diseases. In such specific embodiments, the target-binding moiety specifically binds to an epitope of the IL-6 receptor (IL-6R).
Используемый в настоящем документе термин «антитело или его антигенсвязывающий фрагмент» относится к молекулам иммуноглобулина и иммунологически активным частям молекул иммуноглобулина, т.е. к молекулам, которые содержат антигенсвязывающий сайт, иммуноспецифически связывающий антиген. Таким образом, термин «его антигенсвязывающие фрагменты» относится к фрагменту антитела, включающему в себя по меньшей мере функциональный антигенсвязывающий домен. Также включены подобные иммуноглобулину белки, которые отбирают посредством методик, включающих в себя, например, фаговый дисплей, для специфического связывания с мишеневой молекулой, например, с мишеневым белком, выбранным из PSMA, CD19, CD269, сиалила Lewisa, HER-2/neu и ЕрСАМ. Молекулы иммуноглобулина в соответствии с настоящим изобретением могут быть любого типа (например, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY), класса (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2) или подкласса молекулы иммуноглобулина. «Антитела и их антигенсвязывающие фрагменты», подходящие для применения в соответствии с настоящим изобретением, включают в себя без ограничения поликлональные, моноклональные, одновалентные, биспецифические, гетероконъюгатные, мультиспецифические, человеческие, гуманизированные (в частности, CDR-привитые), деиммунизированные или химерные антитела, одноцепочечные антитела (например, scFv), Fab фрагменты, F(ab')2 фрагменты, фрагменты, полученные с помощью экспрессионной библиотеки Fab, диатела или тетратела (Holliger P. et al., Proc Natl Acad Sci USA. 90 (1993) 6444-8), нонотела, антиидиотипические (против Id) антитела (в том числе, например, антитела против Id против антител в соответствии с настоящим изобретением) и эпитопсвязывающие фрагменты любого из вышеуказанного.As used herein, the term "antibody or antigen-binding fragment thereof" refers to immunoglobulin molecules and immunologically active portions of immunoglobulin molecules, i.e. to molecules that contain an antigen-binding site that immunospecifically binds an antigen. Thus, the term "antigen-binding fragments thereof" refers to an antibody fragment that includes at least a functional antigen-binding domain. Also included are immunoglobulin-like proteins that are selected by techniques including, for example, phage display, for specific binding to a target molecule, for example, a target protein selected from PSMA, CD19, CD269, Lewis a sialyl, HER-2/neu and ErSAM. The immunoglobulin molecules of the present invention may be of any type (e.g., IgG, IgE, IgM, IgD, IgA, and IgY), class (e.g., IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, and IgA2) or subclass of the immunoglobulin molecule. "Antibodies and antigen-binding fragments thereof" suitable for use in accordance with the present invention include, without limitation, polyclonal, monoclonal, monovalent, bispecific, heteroconjugate, multispecific, human, humanized (particularly CDR-grafted), deimmunized, or chimeric antibodies. , single chain antibodies (e.g. scFv), Fab fragments, F(ab') 2 fragments, fragments generated with a Fab expression library, diabody or tetrabody (Holliger P. et al., Proc Natl Acad Sci USA. 90 (1993) 6444-8), nonotela, anti-idiotypic (anti-Id) antibodies (including, for example, anti-Id antibodies against antibodies according to the present invention), and epitope-binding fragments of any of the above.
Согласно некоторым вариантам осуществления антигенсвязывающие фрагменты представляют собой человеческие антигенсвязывающие фрагменты антител в соответствии с настоящим изобретением и включают в себя без ограничения Fab, Fab' и F(ab')2, Fd, одноцепочечные Fv (scFv), одноцепочечные антитела, дисульфид-связанные Fv (dsFv) и фрагменты, включающие в себя либо VL, либо VH домен. Антигенсвязывающие фрагменты антител, в том числе одноцепочечные антитела, могут включать в себя вариабельный домен(ы) отдельно или в комбинации с полными или частью следующих: шарнирная область, CL, CH1, СН2 и СН3 домены. Также в настоящее изобретение включены антигенсвязывающие фрагменты, также включающие в себя любую комбинацию вариабельного домена(ов) с шарнирной область., CL, CH1, СН2 и СН3 доменами.In some embodiments, antigen binding fragments are human antigen binding fragments of antibodies according to the present invention and include, but are not limited to, Fab, Fab' and F(ab') 2 , Fd, single chain Fv (scFv), single chain antibodies, disulfide-linked Fv (dsFv) and fragments that include either the VL or VH domain. Antigen binding fragments of antibodies, including single chain antibodies, may include variable domain(s) alone or in combination with all or part of the following: hinge, CL, CH1, CH2 and CH3 domains. Also included in the present invention are antigen binding fragments also comprising any combination of variable domain(s) with the hinge, CL, CH1, CH2 and CH3 domains.
Антитела, применимые в соответствии с настоящим изобретением, могут происходить от любого животного, в том числе от птиц и млекопитающих. В частности, источником антител является человек, грызун (например, мышь, крыса, морская свинка, или кролик), курица, свинья, овца, коза, верблюд, корова, лошадь, осел, кошка или собака. Особенно предпочтительным является происхождение антител от человека или мыши. Используемый в настоящем документе термин «человеческие антитела» включает в себя антитела, имеющие аминокислотную последовательность человеческого иммуноглобулина, и включает в себя антитела, выделенные из библиотек человеческого иммуноглобулина или из животных, трансгенных по одному или нескольким человеческим иммуноглобулинам, и которые не экспрессируют эндогенные иммуноглобулины, как описано, например, в патенте США №5939598 Kucherlapati и Jakobovits.Antibodies useful in accordance with the present invention may be derived from any animal, including birds and mammals. In particular, the antibody source is human, rodent (eg, mouse, rat, guinea pig, or rabbit), chicken, pig, sheep, goat, camel, cow, horse, donkey, cat, or dog. Particularly preferred is the origin of the antibodies from a human or a mouse. As used herein, the term "human antibodies" includes antibodies having the amino acid sequence of human immunoglobulin and includes antibodies isolated from human immunoglobulin libraries or from animals transgenic for one or more human immunoglobulins and which do not express endogenous immunoglobulins, as described, for example, in US patent No. 5939598 Kucherlapati and Jakobovits.
Термин «подобный антителу белок» относится к белку, который был создан методом генной инженерии (например, путем мутагенеза петель) для специфического связывания с мишеневой молекулой. Как правило, такой подобный антителу белок включает в себя по меньшей мере одну вариабельную пептидную петлю, присоединенную на оба конца белкового каркаса. Такое двойное структурное ограничение значительно усиливает аффинность связывания подобного антителу белка до уровней, сравнимых с таковыми антитела. Длина вариабельной пептидной петли, как правило, составляет 10-20 аминокислот. Каркасным белком может быть любой белок, имеющий свойства хорошей растворимости. В частности, каркасным белком является малый глобулярный белок. Подобные антителу белки включают в себя без ограничения аффитела, антикалины и сконструированные белки с анкириновыми повторами (обзор см. в Binz et al., Nat Biotechnol. 2005, 1257-68). Подобные антителу белки могут быть получены из больших библиотек мутантов, например, могут быть получены из больших библиотек фагового дисплея и могут быть выделены по аналогии с обычными антителами. Также подобные антителу связывающие белки могут быть получены путем комбинаторного мутагенеза поверхностно-выставленных остатков в глобулярных белках.The term "antibody-like protein" refers to a protein that has been genetically engineered (eg, by loop mutagenesis) to specifically bind to a target molecule. Typically, such an antibody-like protein includes at least one variable peptide loop attached to both ends of the protein backbone. This dual structural constraint greatly enhances the binding affinity of the antibody-like protein to levels comparable to those of the antibody. The length of the variable peptide loop, as a rule, is 10-20 amino acids. The scaffold protein can be any protein having good solubility properties. In particular, the scaffold protein is a small globular protein. Antibody-like proteins include, but are not limited to, affitels, anticalins, and engineered ankyrin repeat proteins (for a review, see Binz et al., Nat Biotechnol. 2005, 1257-68). Antibody-like proteins can be obtained from large mutant libraries, for example, can be obtained from large phage display libraries, and can be isolated in analogy to conventional antibodies. Also, antibody-like binding proteins can be obtained by combinatorial mutagenesis of surface-exposed residues in globular proteins.
Термин «аптамер нуклеиновой кислоты» относится к молекуле нуклеиновой кислоты, которая была создана методом генной инженерии посредством повторных циклов in vitro отбора или SELEX (систематической эволюции лигандов путем экспоненциального обогащения) для связывания с мишеневой молекулой (обзор см. в Brody and Gold, J Biotechnol. 74 (2000) 5-13). Аптамером нуклеиновой кислоты может быть молекула ДНК или РНК. Аптамеры могут содержать модификации, например, модифицированные нуклеотиды, такие как 2'-фтор-замещенные пиримидины.The term "nucleic acid aptamer" refers to a nucleic acid molecule that has been genetically engineered through repeated cycles of in vitro selection or SELEX (systematic ligand evolution by exponential enrichment) to bind to a target molecule (for a review, see Brody and Gold, J Biotechnol 74 (2000) 5-13). The nucleic acid aptamer can be a DNA or RNA molecule. Aptamers may contain modifications, for example, modified nucleotides such as 2'-fluoro-substituted pyrimidines.
Термин «линкер» в контексте настоящего изобретения относится к структуре, которая соединяет два компонента, каждый из которых присоединен к одному концу линкера. В случае, если линкер представляет собой связь, прямое связывание аматоксина с антителом может понизить способность аматоксина взаимодействовать с РНК-полимеразой II. Согласно конкретным вариантам осуществления линкер увеличивает расстояние между двумя компонентами и ослабляет стерическое взаимодействие между этими компонентами, как, например, в данном случае между антителом и аматоксином. Согласно конкретным вариантам осуществления линкер имеет непрерывную цепь от 1 до 30 атомов (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 атомов) в своем остове, т.е. длина линкера определяется как самое короткое соединение, измеренное числом атомов или связей между аматоксиновым фрагментом и антителом, при этом одна сторона остова линкера прореагировала с аматоксином, а другая сторона доступна для реакции или прореагировала с антителом. В контексте настоящего изобретения линкер, в частности, представляет собой С1-20-алкиленовую, C1-20-гетероалкиленовую, С2-20-алкениленовую, С2-20-гетероалкениленовую, С2-20-алкиниленовую, С2-20-гетероалкиниленовую, циклоалкиленовую, гетероциклоалкиленовую, ариленовую, гетероариленовую, аралкиленовую или гетероаралкиленовую группу, необязательно замещенную. Линкер может включать в себя один или несколько структурных элементов, таких как карбоксамид, сложный эфир, эфир, тиоэфир, дисульфид, мочевина, тиомочевина, углеводородные фрагменты и подобные. Линкер также может включать в себя комбинации двух или более из этих структурных элементов. Каждый из этих структурных элементов может быть представлен в линкере более чем один раз, например, два раза, три раза, четыре раза, пять раз или шесть раз. Согласно некоторым вариантам осуществления линкер может включать в себя дисульфидную связь. Следует учитывать, что линкер должен быть присоединен либо одной стадией, либо двумя или более последовательными стадиями к аматоксину и антителу. С этой целью данный линкер будет нести две группы, в частности, на проксимальном и дистальном концах, которые (i) могут образовывать ковалентную связь с группой, присутствующей в одном из компонентов, которые должны быть связаны, в частности, с активированной группой на аматоксине или связывающем мишень пептиде, или (ii) которые активируются или могут быть активированы для образования ковалентной связи с группой на аматоксине. Следовательно, предпочтительным является то, что химические группы находятся на дистальном и проксимальном конце линкера, что является результатом такой реакции сочетания, например, сложный эфир, эфир, уретан, пептидная связь и т.д.The term "linker" in the context of the present invention refers to a structure that connects two components, each of which is attached to one end of the linker. In case the linker is a bond, direct binding of the amatoxin to the antibody may decrease the ability of the amatoxin to interact with RNA polymerase II. In specific embodiments, the linker increases the distance between the two components and reduces the steric interaction between these components, such as in this case between the antibody and amatoxin. In specific embodiments, the linker has a continuous chain of 1 to 30 atoms (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 or 30 atoms) in its backbone, i.e. linker length is defined as the shortest connection, as measured by the number of atoms or bonds between the amatoxin moiety and the antibody, where one side of the linker backbone has reacted with the amatoxin and the other side is available for reaction or has reacted with the antibody. In the context of the present invention, the linker is in particular C 1-20 alkylene, C 1-20 heteroalkylene, C 2-20 alkenylene, C 2-20 heteroalkenylene, C 2-20 alkynylene, C 2-20 -heteroalkynylene, cycloalkylene, heterocycloalkylene, arylene, heteroarylene, aralkylene or heteroaralkylene group, optionally substituted. The linker may include one or more building blocks such as carboxamide, ester, ether, thioether, disulfide, urea, thiourea, hydrocarbon moieties, and the like. The linker may also include combinations of two or more of these building blocks. Each of these structural elements can be present in the linker more than once, for example, two times, three times, four times, five times or six times. In some embodiments, the linker may include a disulfide bond. It will be appreciated that the linker must be attached either in one step or in two or more successive steps to the amatoxin and the antibody. To this end, this linker will carry two groups, in particular at the proximal and distal ends, which (i) can form a covalent bond with a group present in one of the components to be linked, in particular to an activated group on the amatoxin or a target-binding peptide; or (ii) which are or can be activated to form a covalent bond with a group on the amatoxin. Therefore, it is preferred that the chemical groups are at the distal and proximal end of the linker as a result of such a coupling reaction, eg ester, ether, urethane, peptide bond, etc.
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L представляет собой линейную цепь от 1 до 20 атомов, независимо выбранных из С, О, N и S, в частности, от 2 до 18 атомов, более конкретно от 5 до 16 атомов и еще более конкретно от 6 до 15 атомов. Согласно конкретным вариантам осуществления по меньшей мере 60% атомов в линейной цепи являются атомами С. Согласно конкретным вариантам осуществления атомы в линейной цепи связаны одинарными связями.In particular embodiments, the linker L is a linear chain of 1 to 20 atoms independently selected from C, O, N, and S, in particular 2 to 18 atoms, more in particular 5 to 16 atoms, and even more in particular 6 to 15 atoms. In specific embodiments, at least 60% of the atoms in the linear chain are C atoms. In specific embodiments, the atoms in the linear chain are linked by single bonds.
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L представляет собой алкиленовую, гетероалкиленовую, алкениленовую, гетероалкениленовую, алкиниленовую, гетероалкиниленовую, циклоалкиленовую, гетероциклоалкиленовую, ариленовую, гетероариленовую, аралкиленовую или гетероаралкиленовую группу, включающую в себя от 1 до 4 гетероатомов, выбранных из N, О и S, при этом указанный линкер необязательно является замещенным.In specific embodiments, linker L is an alkylene, heteroalkylene, alkenylene, heteroalkenylene, alkynylene, heteroalkynylene, cycloalkylene, heterocycloalkylene, arylene, heteroarylene, aralkylene, or heteroaralkylene group comprising from 1 to 4 heteroatoms selected from N, O, and S, wherein said linker is optionally substituted.
Термин «алкилен» относится к двухвалентным прямоцепочечным насыщенным углеводородным группам, имеющим от 1 до 20 атомов углерода, в том числе к группам, имеющим от 1 до 10 атомов углерода. Согласно некоторым вариантам осуществления алкиленовые группы могут быть группами низшего алкилена. Термин «низший алкилен» относится к алкиленовым группам, имеющим от 1 до 6 атомов углерода, а согласно некоторым вариантам осуществления - от 1 до 5 или от 1 до 4 атомов углерода. Примеры алкиленовых групп включают в себя без ограничения метилен (-CH2-), этилен (-СН2-СН2-), н-пропилен, н-бутилен, н-пентилен и н-гексилен.The term "alkylene" refers to divalent straight chain saturated hydrocarbon groups having from 1 to 20 carbon atoms, including groups having from 1 to 10 carbon atoms. In some embodiments, the alkylene groups may be lower alkylene groups. The term "lower alkylene" refers to alkylene groups having from 1 to 6 carbon atoms, and in some embodiments from 1 to 5 or from 1 to 4 carbon atoms. Examples of alkylene groups include, without limitation, methylene (-CH 2 -), ethylene (-CH 2 -CH 2 -), n-propylene, n-butylene, n-pentylene, and n-hexylene.
Термин «алкенилен» относится к двухвалентным прямоцепочечным группам, имеющим от 2 до 20 атомов углерода, в которых по меньшей мере одна из связей углерод-углерод является двойной связью, тогда как другие связи могут быть одинарными связями или дополнительными двойными связями. Термин «алкинилен» в настоящем документе относится к группам, имеющим от 2 до 20 атомов углерода, в которых по меньшей мере одна из связей углерод-углерод является тройной связью, тогда как другие связи могут быть одинарными, двойными или дополнительными тройными связями. Примеры алкениленовых групп включают в себя этенилен (-СН=СН-), 1-пропенилен, 2-пропенилен, 1-бутенилен, 2-бутенилен, 3 бутенилен и подобные. Примеры алкиниленовых групп включают в себя этинилен, 1-пропинилен, 2-пропинилен и т д.The term "alkenylene" refers to divalent straight chain groups having 2 to 20 carbon atoms in which at least one of the carbon-carbon bonds is a double bond, while the other bonds may be single bonds or additional double bonds. The term "alkynylene" as used herein refers to groups having 2 to 20 carbon atoms in which at least one of the carbon-carbon bonds is a triple bond, while the other bonds may be single, double or additional triple bonds. Examples of alkenylene groups include ethenylene (-CH=CH-), 1-propenylene, 2-propenylene, 1-butenylene, 2-butenylene, 3-butenylene, and the like. Examples of alkynylene groups include ethynylene, 1-propynylene, 2-propynylene, etc.
Используемый в настоящем документе термин «циклоалкилен» относится к двухвалентному кольцу, являющемуся частью любой стабильной моноциклической или полициклической системы, в которой такое кольцо имеет от 3 до 12 атомов углерода, но не гетероатом, и в которой такое кольцо является полностью насыщенным, а термин «циклоалкенилен» относится к двухвалентному кольцу, являющемуся частью любой стабильной моноциклической или полициклической системы, в которой такое кольцо имеет от 3 до 12 атомов углерода, но не гетероатом, и в которой такое кольцо является по меньшей мере частично ненасыщенным (но исключая любое ариленовое кольцо). Примеры циклоалкиленов включают в себя без ограничения циклопропилен, циклобутилен, циклопентилен, циклогексилен и циклогептилен. Примеры циклоалкениленов включают в себя без ограничения циклопентенилен и циклогексенилен.As used herein, the term "cycloalkylene" refers to a divalent ring that is part of any stable monocyclic or polycyclic system in which such a ring has 3 to 12 carbon atoms but not a heteroatom, and in which such ring is fully saturated, and the term " "cycloalkenylene" refers to a divalent ring that is part of any stable monocyclic or polycyclic system in which such ring has 3 to 12 carbon atoms but not a heteroatom, and in which such ring is at least partially unsaturated (but excluding any arylene ring) . Examples of cycloalkylenes include, without limitation, cyclopropylene, cyclobutylene, cyclopentylene, cyclohexylene, and cycloheptylene. Examples of cycloalkenylenes include, without limitation, cyclopentenylene and cyclohexenylene.
Используемые в настоящем документе термины «гетероциклоалкилен» и «гетероциклоалкенилен» относятся к двухвалентному кольцу, являющемуся частью любой стабильной моноциклической или полициклической системы, в которой такое кольцо имеет от 3 до приблизительно 12 атомов, и в которой такое кольцо состоит из атомов углерода и по меньшей мере одного гетероатома, в частности, по меньшей мере одного гетероатома, независимо выбранного из группы, состоящей из N, О и S, при этом гетероциклоалкилен относится к такому кольцу, которое является полностью насыщенным, а гетероциклоалкенилен относится к такому кольцу, которое является по меньшей мере частично ненасыщенным (но исключая любое ариленовое или гетероариленовое кольцо).As used herein, the terms "heterocycloalkylene" and "heterocycloalkenylene" refer to a divalent ring that is part of any stable monocyclic or polycyclic system in which such a ring has from 3 to about 12 atoms, and in which such ring consists of carbon atoms and at least at least one heteroatom, in particular at least one heteroatom independently selected from the group consisting of N, O and S, wherein heterocycloalkylene refers to such a ring which is fully saturated and heterocycloalkenylene refers to such a ring which is at least least partially unsaturated (but excluding any arylene or heteroarylene ring).
Термин «арилен» означает двухвалентное кольцо или кольцевую систему, являющиеся частью любой стабильной моноциклической или полициклической системы, в которой такие кольцо или кольцевая система имеют от 3 до 20 атомов углерода, но не имеют гетероатом, при этом кольцо или кольцевая система состоит из ароматического фрагмента, как определяется правилом «4n+2» π-электронов, в том числе фенилена.The term "arylene" means a divalent ring or ring system that is part of any stable monocyclic or polycyclic system in which such a ring or ring system has from 3 to 20 carbon atoms, but no heteroatoms, while the ring or ring system consists of an aromatic moiety , as determined by the "4n+2" rule of π-electrons, including phenylene.
Используемый в настоящем документе, термин «гетероарилен» относится к двухвалентным кольцу или кольцевой системе, являющимся частью любой стабильной моноциклической или полициклической системы, в которой такие кольцо или кольцевая система имеют от 3 до 20 атомов, при этом кольцо или кольцевая система состоит из ароматического фрагмента, как определяется правилом «4n+2» π-электронов, и содержит атомы углерода и один или несколько гетероатомов азота, серы и/или кислорода.As used herein, the term "heteroarylene" refers to a divalent ring or ring system that is part of any stable monocyclic or polycyclic system in which such ring or ring system has from 3 to 20 atoms, and the ring or ring system consists of an aromatic moiety , as defined by the "4n+2" π-electron rule, and contains carbon atoms and one or more nitrogen, sulfur and/or oxygen heteroatoms.
В контексте настоящего изобретения термин «замещенный» означает указание того, что один или несколько водородов, присутствующих в остове линкера, замещаются с выбором из указанной группы(групп), при условии, что указанная нормальная валентность атома или таковая соответствующего атома группы, которая является замещенной, не превышается, и что замещение приводит к стабильному соединению. Термин «необязательно замещенный» означает, что линкер является либо незамещенным, либо замещенным, как определено в настоящем документе, одним или несколькими заместителями, определяемыми в настоящем документе. Когда заместителем является кето- (или оксо-, т.е. =O) группа, тио- или иминогруппа или подобные, то два водорода на линкерном остове заменяются. Иллюстративные заместители включают в себя, например, алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероциклоалкил, арил, гетероарил, аралкил, гетероаралкил, ацил, ароил, гетероароил, карбоксил, алкокси, арилокси, ацилокси, ароилокси, гетероароилокси, алкоксикарбонил, галоген, сложный (тио)эфир, циано, фосфорил, амино, имино, (тио)амидо, сульфгидрил, алкилтио, ацилтио, сульфонил, сульфат, сульфонат, сульфамоил, сульфонамидо, нитро, азидо, галогеналкил, в том числе перфторалкил (такой как трифторметил), галогеналкокси, алкилсульфанил, алкилсульфинил, ал кил сульфонил, алкилсульфониламино, арилсульфоноамино, фосфорил, фосфат, фосфонат, фосфинат, алкилкарбокси, алкилкарбоксиамид, оксо, гидрокси, меркапто, амино (необязательно моно- или дизамещенный, например, алкилом, арилом, или гетероарилом), имино, карбоксамид, карбамоил (необязательно моно- или дизамещенный, например, алкилом, арилом, или гетероарилом), амидино, аминосульфонил, ациламино, ароиламино, (тио)уреидо, (арилтио)уреидо, алкил(тио)уреидо, циклоалкил(тио)уреидо, арилокси, аралкокси или -O(СН2)n-ОН, -O(CH2)n-NH2, -O(СН2)nCOOH, -(СН2)nCOOH, -C(O)O(CH2)nR, -(CH2)nN(H)C(O)OR или -N(R)S(O)2R, в которых n равняется 1-4, и R независимо выбран из водорода, -алкила, -алкенила, -алкинила, -циклоалкила, -циклоалкенила, -(С-связанного-гетероциклоалкила), -(С-связанного-гетероциклоалкенила), -арила и -гетероарила, с возможностью множественных степеней замещения. Специалисту в данном области будет понятно, что заместители, такие как гетероциклоалкил, арил, гетероарил, алкил и т.д., или функциональные группы, такие как -ОН, -NHR и т.д., могут сами по себе быть замещены, если необходимо. Также специалисту в данной области понятно, что замещенные фрагменты сами по себе могут быть также замещены, если необходимо.In the context of the present invention, the term "substituted" means an indication that one or more hydrogens present in the backbone of the linker are substituted with a choice from the specified group(s), provided that the specified normal valency of the atom or that of the corresponding atom of the group that is substituted , is not exceeded, and that the substitution results in a stable connection. The term "optionally substituted" means that the linker is either unsubstituted or substituted, as defined herein, with one or more substituents as defined herein. When the substituent is a keto (or oxo, ie =O) group, a thio or imino group or the like, the two hydrogens on the linker backbone are replaced. Illustrative substituents include, for example, alkyl, alkenyl, alkynyl, cycloalkyl, heterocycloalkyl, aryl, heteroaryl, aralkyl, heteroaralkyl, acyl, aroyl, heteroaroyl, carboxyl, alkoxy, aryloxy, acyloxy, aroyloxy, heteroaroyloxy, alkoxycarbonyl, halogen, complex ( thio)ether, cyano, phosphoryl, amino, imino, (thio)amido, sulfhydryl, alkylthio, acylthio, sulfonyl, sulfate, sulfonate, sulfamoyl, sulfonamido, nitro, azido, haloalkyl, including perfluoroalkyl (such as trifluoromethyl), haloalkoxy , alkylsulfanyl, alkylsulfinyl, alkyl sulfonyl, alkylsulfonylamino, arylsulfonoamino, phosphoryl, phosphate, phosphonate, phosphinate, alkylcarboxy, alkylcarboxyamide, oxo, hydroxy, mercapto, amino (optionally mono- or disubstituted, e.g., alkyl, aryl, or heteroaryl), imino , carboxamide, carbamoyl (optionally mono- or disubstituted, for example, alkyl, aryl, or heteroaryl), amidino, aminosulfonyl, acylamino, aroylamino, (thio)ureido, (arylthio)ureido, alkyl(thio)y reido, cycloalkyl(thio)ureido, aryloxy, aralkoxy, or -O(CH 2 ) n -OH, -O(CH 2 ) n -NH 2 , -O(CH 2 ) n COOH, -(CH 2 ) n COOH, -C(O)O(CH 2 ) n R, -(CH 2 ) n N(H)C(O)OR or -N(R)S(O) 2 R, wherein n is 1-4, and R is independently selected from hydrogen, -alkyl, -alkenyl, -alkynyl, -cycloalkyl, -cycloalkenyl, -(C-linked-heterocycloalkyl), -(C-linked-heterocycloalkenyl), -aryl, and -heteroaryl, with the possibility of multiple degrees of substitution . One skilled in the art will appreciate that substituents such as heterocycloalkyl, aryl, heteroaryl, alkyl, etc., or functional groups such as -OH, -NHR, etc., may themselves be substituted if necessary. It will also be appreciated by those skilled in the art that substituted moieties themselves may also be substituted if desired.
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L включает в себя фрагмент, выбранный из одного из следующих фрагментов: дисульфидный (-S-S-), эфирный (-O-), тиоэфирный (-S-), аминовый (-NH-), сложноэфирный (-O-С(=O)- или -С(=O)-O-), карбоксамидный (-NH-C(=O)- или -C(=O)-NH-), уретановый (-NH-C(=O)-O- или -O-C(=O)-NH-) и мочевинный фрагмент (-NH-C(=O)-NH-).In specific embodiments, linker L includes a moiety selected from one of the following moieties: disulfide (-S-S-), ether (-O-), thioether (-S-), amine (-NH-), ester (-O -C(=O)- or -C(=O)-O-), carboxamide (-NH-C(=O)- or -C(=O)-NH-), urethane (-NH-C(= O)-O- or -O-C(=O)-NH-) and the urea moiety (-NH-C(=O)-NH-).
Согласно конкретным вариантам осуществления настоящего изобретения линкер L включает в себя число m групп, выбранный из перечня: алкиленовая, алкениленовая, алкиниленовая, циклоалкиленовая, гетероалкиленовая, гетероалкениленовая, гетероалкиниленовая, гетероциклоалкиленовая, ариленовая, гетероариленовая, аралкиленовая и гетероаралкиленовая группа, при этом каждая группа необязательно может быть независимо замещена, линкер, кроме того, включает в себя число n фрагментов, независимо выбранных из одного из следующих фрагментов: дисульфидный (-S-S-), эфирный (-O-), тиоэфирный (-S-), аминовый (-NH-), сложноэфирный (-O-С(=O)- или -С(=O)-O-), карбоксамидный (-NH-C(=O)- или -C(=O)-NH-), уретановый (-NH-C(=O)-O- или -O-C(=O)-NH-) и мочевинный фрагмент (-NH-C(=O)-NH-), при этом m=n+1. Согласно конкретным вариантам осуществления m равняется 2, и n равняется 1, или m равняется 3, и n равняется 2. Согласно конкретным вариантам осуществления линкер включает в себя 2 или 3 незамещенных алкиленовых группы и 1 или 2, соответственно, дисульфидных, эфирных, тиоэфирных, аминовых, сложноэфирных, карбоксамидовых, уретановых или мочевинных фрагмента, связывающих незамещенные алкиленовые группы.According to specific embodiments of the present invention, the linker L includes a number m of groups selected from the list: alkylene, alkenylene, alkynylene, cycloalkylene, heteroalkylene, heteroalkenylene, heteroalkynylene, heterocycloalkylene, arylene, heteroarylene, aralkylene and heteroaralkylene group, each group optionally be independently substituted, the linker further comprises a number n of moieties independently selected from one of the following moieties: disulfide (-S-S-), ether (-O-), thioether (-S-), amine (-NH- ), ester (-O-C(=O)- or -C(=O)-O-), carboxamide (-NH-C(=O)- or -C(=O)-NH-), urethane ( -NH-C(=O)-O- or -O-C(=O)-NH-) and urea fragment (-NH-C(=O)-NH-), while m=n+1. In specific embodiments, m is 2 and n is 1, or m is 3 and n is 2. In specific embodiments, the linker includes 2 or 3 unsubstituted alkylene groups and 1 or 2, respectively, disulfide, ether, thioether, amine, ester, carboxamide, urethane or urea moieties linking unsubstituted alkylene groups.
Согласно конкретному варианту осуществления линкер L не содержит гетероариленовую группу.In a specific embodiment, linker L does not contain a heteroarylene group.
Согласно конкретным вариантам осуществления атомы С в линейной цепи являются независимо частью необязательно замещенных метиленовых групп (-СН2-). Согласно таким конкретным вариантам осуществления необязательные заместители независимо выбраны из галогена и C1-6-алкила, в частности, метила.In specific embodiments, the C atoms in the straight chain are independently part of optionally substituted methylene groups (-CH 2 -). In such specific embodiments, the optional substituents are independently selected from halo and C 1-6 alkyl, in particular methyl.
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L представляет собой стабильной линкер.In specific embodiments, linker L is a stable linker.
В контексте настоящего изобретения термин «стабильной линкер» относится к линкеру, который является стабильным (i) в присутствии ферментов и (ii) во внутриклеточной восстановительной среде.In the context of the present invention, the term "stable linker" refers to a linker that is stable (i) in the presence of enzymes and (ii) in an intracellular reducing environment.
Согласно конкретным вариантам осуществления стабильный линкер не содержит (i) расщепляемую ферментом подструктуру и/или (ii) дисульфидную группу. Согласно таким конкретным вариантам осуществления линкер имеет в длину до 12 атомов, в частности, от 2 до 10, более конкретно от 4 до 9 и наиболее конкретно от 6 до 8 атомов.In specific embodiments, the stable linker does not contain (i) an enzyme-cleavable substructure and/or (ii) a disulfide group. In such specific embodiments, the linker is up to 12 atoms in length, in particular 2 to 10, more in particular 4 to 9, and most in particular 6 to 8 atoms.
Согласно другим конкретным вариантам осуществления линкер представляет собой расщепляемый линкер.In other specific embodiments, the linker is a cleavable linker.
В контексте настоящего изобретения термин «расщепляемый линкер» относится к (i) линкеру, который расщепляется ферментом, или (ii) восстанавливающемуся линкеру. Согласно конкретным вариантам осуществления термин относится исключительно к линкеру, который расщепляется ферментом (а не к восстанавливающемуся линкеру).In the context of the present invention, the term "cleavable linker" refers to (i) a linker that is cleavable by an enzyme, or (ii) a reducible linker. In specific embodiments, the term refers exclusively to a linker that is cleavable by an enzyme (and not to a reducible linker).
В контексте настоящего изобретения термин «линкер, который является расщепляемым … ферментом» относится к линкеру, который может быть расщеплен ферментом, в частности, лизосомальной пептидазой, такой как катепсин В, что приводит в результате к внутриклеточному высвобождению токсинового груза, конъюгированного с нацеливающимся антителом, после интернализации (см. Dubowchik et al., Bioconjug Chem. 13 (2002) 855-69). Согласно конкретным вариантам осуществления расщепляемый линкер включает в себя дипептид, выбранный из Phe-Lys, Val-Lys, Phe-Ala, Val-Ala, Phe-Cit и Val-Cit, в частности, при этом расщепляемый линкер дополнительно включает в себя п-аминобензиловый (РАВ) спейсер между дипептидами и аматоксином.In the context of the present invention, the term "linker that is cleavable ... by an enzyme" refers to a linker that can be cleaved by an enzyme, in particular a lysosomal peptidase such as cathepsin B, which results in the intracellular release of a toxin cargo conjugated to the targeting antibody, after internalization (see Dubowchik et al., Bioconjug Chem. 13 (2002) 855-69). In specific embodiments, the cleavable linker comprises a dipeptide selected from Phe-Lys, Val-Lys, Phe-Ala, Val-Ala, Phe-Cit, and Val-Cit, in particular, wherein the cleavable linker further comprises p- aminobenzyl (PAB) spacer between dipeptides and amatoxin.
Согласно таким конкретным вариантам осуществления расщепляемый линкер включает в себя структуру L1-L*-L2, в которой L* представляет собой п-аминобензиловый дипептидный фрагмент, L1 представляет собой часть линкера, которая соединяет L* с аматоксином, в частности, в которой L1 соединяется с L* через -NH- или -О- группу, в частности, группу -C(=O)-NH-,-C(=O)-NH-O- или -С(=O)-O-, и в которой L2 представляет собой часть линкера, которая соединяет L* со связывающимся с мишенью фрагментом, в частности, в которой L2 соединяется с L* через фрагмент -(СН2)m-, при этом m является целым числом, выбранным из 1-8, в частности, 1-5, или через фрагмент -(СН2-СН2О)n-, при этом n является целым числом, выбранным из 1-3, в частности, 1-2. Например, в случае расщепляемого линкера, включающего в себя дипептид Val-Ala, структура L1-L*-L2 является следующейAccording to such specific embodiments, the cleavable linker includes the structure L 1 -L*-L 2 in which L* is a p-aminobenzyl dipeptide fragment, L 1 is the part of the linker that connects L* to amatoxin, in particular, in which L 1 is connected to L* through -NH- or -O- group, in particular, the group -C (=O) -NH-, -C (=O) -NH-O- or -C (=O) - O-, and in which L 2 is the part of the linker that connects L* to the target-binding fragment, in particular, in which L 2 is connected to L* through the fragment -(CH 2 ) m -, while m is an integer selected from 1-8, in particular 1-5, or through the fragment -(CH 2 -CH 2 O) n -, while n is an integer selected from 1-3, in particular 1-2. For example, in the case of a cleavable linker comprising a Val-Ala dipeptide, the structure of L 1 -L*-L 2 is as follows
Согласно другим таким конкретным вариантам осуществления L* включает в себя дипептид Val-Lys и характеризуется следующей структуройIn other such specific embodiments, L* includes a Val-Lys dipeptide and has the following structure
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L1 представляет собой линейную цепь от 1 до 4 атомов, независимо выбранных из С, О, N и S, в частности, от 1 до 3 атомов, более конкретно от 1 до 2 атомов и конкретнее только 1 атома. Согласно конкретным вариантам осуществления по меньшей мере 50% атомов в линейной цепи являются атомами С. Согласно конкретным вариантам осуществления атомы в линейной цепи связаны одинарными связями. Согласно конкретному варианту осуществления L представляет собой группу -NH- или -О-, которая является частью аматоксина. Согласно конкретным вариантам осуществления L1 представляет собой группу -О-, происходящую из гидроксигруппы, присоединенной в положении 4', 5', 6' или 7' центрального триптофанового фрагмента. Согласно конкретным вариантам осуществления L1 представляет собой группу -О-, происходящую из гидроксильной группы, являющейся частью карбоновокислотной группы аминокислотного остатка 1 аманинового производного в соответствии с настоящим изобретением. Согласно конкретным вариантам осуществления L1 представляет собой группу -NH-, происходящую из аминогруппы, являющейся частью карбоксамидной группы аминокислотного остатка 1 аманинамидного производного в соответствии с настоящим изобретением. Согласно конкретным вариантам осуществления L1 представляет собой группу -О-, происходящую из гидроксильной группы, являющейся частью аминокислотного остатка 3 аманинового или аманинамидного производного в соответствии с настоящим изобретением.In specific embodiments, the L 1 linker is a linear chain of 1 to 4 atoms independently selected from C, O, N, and S, in particular 1 to 3 atoms, more in particular 1 to 2 atoms, and more specifically only 1 atom. In specific embodiments, at least 50% of the atoms in the linear chain are C atoms. In specific embodiments, the atoms in the linear chain are linked by single bonds. In a particular embodiment, L is a -NH- or -O- group which is part of the amatoxin. In specific embodiments, L1 is a -O- group derived from a hydroxy group attached at the 4', 5', 6', or 7' position of the central tryptophan moiety. In specific embodiments, L 1 is a -O- group derived from a hydroxyl group that is part of the carboxylic acid group of
В контексте настоящего изобретения термин «восстанавливающийся линкер» относится к линкеру, который может быть расщеплен во внутриклеточной восстанавливающей среде, в частности, к линкеру, который содержит дисульфидные группы, что приводит в результате к внутриклеточному высвобождению токсинового груза, конъюгированного со связывающимся с мишенью фрагментом, после интернализации с помощью внутриклеточной восстанавливающей среды (см. Shen et al., J. Biol. Chem. 260 (1985) 10905-10908). Согласно конкретным вариантам осуществления восстанавливающийся линкер включает в себя фрагментIn the context of the present invention, the term "reducing linker" refers to a linker that can be cleaved in an intracellular reducing environment, in particular, a linker that contains disulfide groups, which results in the intracellular release of a toxin cargo conjugated to a target-binding moiety, after internalization with intracellular recovery medium (see Shen et al., J. Biol. Chem. 260 (1985) 10905-10908). In specific embodiments, the reducible linker includes a moiety
в котором R1 - R4 независимо выбраны из Н и метила.in which R1 - R4 are independently selected from H and methyl.
Согласно таким конкретным вариантам осуществления такой расщепляемый линкер имеет в длину до 20 атомов, в частности, от 6 до 18, более конкретно от 8 до 16 и наиболее конкретно от 10 до 15 атомов. Согласно таким конкретным вариантам осуществления часть линкера, связывающего аматоксин в соответствии с настоящим изобретением и расщепляемую дисульфидную группу, представляет собой линейную цепь из 3 или 4 атомов, в частности, из 3 атомов С. Согласно конкретным вариантам осуществления 3 или 4 атома С в линейной цепи связаны одинарными связями. Согласно конкретным вариантам осуществления линкер представляет собой н-пропиленовую группу.In such specific embodiments, such a cleavable linker is up to 20 atoms in length, in particular 6 to 18, more in particular 8 to 16, and most in particular 10 to 15 atoms. In such specific embodiments, the portion of the linker linking the amatoxin of the present invention and the cleavable disulfide group is a linear chain of 3 or 4 atoms, in particular 3 C atoms. In specific embodiments, 3 or 4 C atoms in a linear chain linked by single bonds. In specific embodiments, the linker is an n-propylene group.
Согласно конкретным вариантам осуществления указанный линкер присутствует и присоединяется на одной стороне к гидроксильной группе, присоединенной к фенильному кольцу центрального триптофанового фрагмента, т.е. к 4', 5' или 7' гидроксизаместителю.In specific embodiments, said linker is present and attached on one side to the hydroxyl group attached to the phenyl ring of the central tryptophan moiety, i.e. to the 4', 5' or 7' hydroxy substituent.
Согласно другим конкретным вариантам осуществления указанный линкер присутствует и присоединяется на одной стороне в положении производного аманитина в соответствии с настоящим изобретением, при этом указанное положение выбраноIn other specific embodiments, said linker is present and attached on one side at the position of the amanitin derivative of the present invention, said position being selected.
(i) в случае S-дезокси-4'-гидрокси-аманинамида, 4'-гидрокси-аманинамида, S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида, 5'-гидрокси-аманинамида, S-дезокси-7'-гидрокси-аманинамида и 7'-гидрокси-аманинамида из атома азота карбоксамидной группы по γ С-атому аминокислоты 1 аматоксина (амидная связь);(i) in the case of S-deoxy-4'-hydroxy-amaninamide, 4'-hydroxy-amaninamide, S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide, 5'-hydroxy-amaninamide, S-deoxy-7'-hydroxy- amaninamide and 7'-hydroxy-amaninamide from the nitrogen atom of the carboxamide group at the γ C atom of
(ii) в случае S-дезокси-4'-гидрокси-аманина, 4'-гидрокси-аманина, S-дезокси-5'-гидрокси-аманина, 5'-гидрокси-аманина, S-дезокси-7'-гидрокси-аманина, Т-гидрокси-аманина из атома кислорода кислотной группы по γ С-атому аминокислоты 1 аматоксина (сложноэфирная связь);(ii) in the case of S-deoxy-4'-hydroxy-amanin, 4'-hydroxy-amanin, S-deoxy-5'-hydroxy-amanin, 5'-hydroxy-amanin, S-deoxy-7'-hydroxy- amanine, T-hydroxy-amanine from the oxygen atom of the acidic group at the γ C atom of
(iii) в случае производного аманитина в соответствии с настоящим изобретением, в котором фрагмент свободной карбоновой кислоты аминокислоты 1 был превращен во фрагмент -C(=O)NH-OR1, из атома кислорода группы гидроксамовой кислоты по γ С-атому аминокислоты 1 аматоксина;(iii) in the case of an amanitin derivative according to the present invention in which the free carboxylic acid moiety of
(iv) из атома кислорода гидроксигруппы по δ С-атому аминокислоты 3 аматоксина, в частности, через сложноэфирную связь, эфирную связь или уретановую связь; или(iv) from the oxygen atom of the hydroxy group at the δ C atom of the
(v) из азота кольца аминокислоты 4.(v) from the ring nitrogen of
Соединение линкера со связывающимся с мишенью фрагментом может быть достигнуто рядом способов, хорошо известных рядовому специалисту в данной области, в частности, в области конъюгатов антитело-лекарственное средство (ADC).Linking a linker to a target-binding moiety can be achieved by a number of methods well known to one of ordinary skill in the art, particularly in the art of antibody-drug conjugates (ADCs).
Согласно конкретным вариантам осуществления указанный линкер соединяется со связывающимся с мишенью фрагментом через мочевинный фрагмент (…-линкер-NH-С(=O)-NH-связывающийся с мишенью фрагмент). Согласно таким конкретным вариантам осуществления мочевинный фрагмент является результатом реакции первичного амина, первоначально присутствующего в связывающемся с мишенью фрагменте, такого как аминогруппа боковой цепи лизина, с производным карбаминовой кислоты … -линкер-NH-C(O)-Z, в котором Z представляет собой уходящую группу, которая может быть заменена первичным амином.In specific embodiments, said linker is coupled to the target-binding moiety via a urea moiety (...-linker-NH-C(=O)-NH-target-binding moiety). In such specific embodiments, the urea moiety is the result of the reaction of a primary amine originally present in the target-binding moiety, such as the amino group of a lysine side chain, with a carbamic acid derivative ... -linker-NH-C(O)-Z, wherein Z is a leaving group which may be replaced by a primary amine.
Согласно другим конкретным вариантам осуществления указанный линкер присутствует и соединяется со связывающимся с мишенью фрагментом через тиоэфирный фрагмент (…-линкер-S-связывающийся с мишенью фрагмент). Таким образом, согласно таким вариантам осуществления настоящее изобретение относится к конъюгату общей формулы:In other specific embodiments, said linker is present and coupled to the target-binding moiety via a thioether moiety (...-linker-S-target-binding moiety). Thus, according to such embodiments, the present invention relates to a conjugate of the general formula:
аманитин-L-X*-S-Tbm,amanitin-L-X*-S-Tbm,
в которой аманитин представляет собой производное аманитина в соответствии с настоящим изобретением, L представляет собой линкер, X* представляет собой фрагмент, полученный в результате соединения тиольной группы с тиол-реакционноспособной группой, S представляет собой атом серы указанной тиольной группы, в частности, тиольной группы остатка аминокислоты цистеина, и Tbm представляет собой связывающийся с мишенью фрагмент, в частности, антитело или функциональный фрагмент антитела, включающие в себя указанный остаток аминокислоты цистеина. Согласно конкретным вариантам осуществления указанный остаток аминокислоты цистеина (i) располагается в домене антитела, выбранном из CL, CH1, СН2 и СН3; (ii) располагается в положении, в котором последовательность зародышевой линии, демонстрирующая самую близкую гомологию с последовательностью указанного домена антитела, содержит аминокислотный остаток, отличный от цистеина; и (iii) располагается в положении, которое подвергается воздействию растворителя.in which amanitin is an amanitin derivative according to the present invention, L is a linker, X* is a moiety resulting from the combination of a thiol group with a thiol-reactive group, S is a sulfur atom of said thiol group, in particular a thiol group a cysteine amino acid residue, and Tbm is a target-binding fragment, in particular an antibody or a functional antibody fragment, comprising said cysteine amino acid residue. In specific embodiments, said cysteine amino acid residue (i) is located in an antibody domain selected from CL, CH1, CH2, and CH3; (ii) is located at a position in which the germline sequence showing the closest homology to the sequence of the specified antibody domain contains an amino acid residue other than cysteine; and (iii) located in a position that is exposed to the solvent.
В контексте настоящего изобретения термин «тиол-реакционноспособная группа» относится к группе, которая селективно реагирует с тиольной группой, например, свободного цистеина в антителе, в частности, при значении рН в диапазоне от 6,0 до 8,0, более конкретно при значении рН в диапазоне от 6,5 до 7,5. В частности, термин «селективно» означает, что менее чем 10% реакций сочетания молекулы, включающей в себя тиол-реакционноспособную группу, с антителом, включающим в себя по меньшей мере один остаток свободного цистеина, являются реакциями сочетания с остатками, не являющимися цистеиновыми, в антителе, такими как лизиновые остатки, в частности, менее чем 5%, более конкретно менее чем 2%. Согласно конкретным вариантам осуществления тиол-реакционноспособная группа выбрана из бромацетамида, йодацетамида, малеимида, малеимида, имеющего уходящую группу в положении 3, в частности, уходящую группу, выбранную из -Br и замещенного тиола (см., например, патент США №9295729), 1,2-дигидропиридазин-3,6-диона, имеющего уходящую группу в положении 4, в частности, уходящую группу, выбранную из -Br и замещенного тиола (см., например, патент США №9295729), метилсульфонилбензотиазола, метилсульфонилфенилтетразола, метилсульфонилфенилоксадиазола (см. Toda et al., Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 52 (2013) 12592-6), 3-арилпропионитрила (см. Kolodych et al, Bioconjugate Chem. 2015, 26, 197-200) и 5-нитро-пиридин-2-ил-дисульфида (…-L-S-S-(5-нитро-пиридин-2-ила).In the context of the present invention, the term "thiol-reactive group" refers to a group that selectively reacts with a thiol group, for example, free cysteine in an antibody, in particular at a pH value in the range from 6.0 to 8.0, more specifically at a value of pH in the range of 6.5 to 7.5. In particular, the term "selectively" means that less than 10% of the coupling reactions of a molecule comprising a thiol-reactive group with an antibody comprising at least one free cysteine residue are coupling reactions with non-cysteine residues, in the antibody, such as lysine residues, in particular less than 5%, more specifically less than 2%. In specific embodiments, the thiol-reactive group is selected from bromoacetamide, iodoacetamide, maleimide, maleimide having a leaving group at
Согласно конкретным вариантам осуществления указанные положение или функциональная группа, которые на одной стороне соединяются с линкером и которые могут непосредственно или опосредованно соединяться с положением или функциональной группой, присутствующими в связывающемся с мишенью фрагменте, представляют собой фрагмент, который может реагировать с двумя тиольными группами, присутствующими в одном связывающемся с мишенью фрагменте или в двух связывающихся с мишенью фрагментах. Согласно конкретным вариантам осуществления тиол-реакционноспособные группы представляют собой малеимид, имеющий две уходящие группы в положениях 3 и 4, в частности, выбранные из 3,4-диброммалеимида, 3,4-бис(арилтио)-малеимида, в частности, 3,4-дифенилтио-малеимида и 3,4-бис(гетероарилтио)-малеимида, в частности, 3,4-бис(2-пиридинил-сульфанил)-малеимида. Согласно другим конкретным вариантам осуществления тиол-реакционноспособные группы представляют собой 1,2-дигидропиридазин-3,6-дион, имеющий две уходящие группы в положениях 4 и 5, в частности, выбранный из 4,5-бром-1,2-дигидропиридазин-3,6-диона, 4,5-бис(арилтио)-1,2-дигидропиридазин-3,6-диона, в частности, 4,5-дифенилтио-1,2-дигидропирид азин-3,6-диона и 4,5 -бис(гетероарилтио)-1,2-дигидропирид азин-3,6-диона, в частности, 4,5-бис(2-пиридинил-сульфанил)-1,2-дигидропиридазин-3,6-диона.In particular embodiments, said position or functional group, which is connected to the linker on one side and which can be connected directly or indirectly to a position or functional group present in the target-binding moiety, is a moiety that can react with two thiol groups present in one target-binding fragment or in two target-binding fragments. In particular embodiments, the thiol-reactive groups are maleimide having two leaving groups at
Согласно конкретным вариантам осуществления фрагмент, получающийся в результате сочетания тиольной группы с тиол-реакционноспособной группой, выбран из тиол-замещенного ацетамида; тиол-замещенного сукцинимида; тиол-замещенной сукцинамовой кислоты; тиол-замещенного гетероарила, в частности, тиол-замещенного бензотиазола, тиол-замещенного фенилтетразола и тиол-замещенного фенилоксадиазола и дисульфида, в котором один атом серы происходит из цистеинового остатка антитела. Согласно конкретным вариантам осуществления фрагмент, получающийся в результате сочетания тиольной группы с тиол-реакционноспособной группой, представляет собой тиол-замещенный сукцинимид.In specific embodiments, the moiety resulting from the coupling of the thiol group with the thiol-reactive group is selected from thiol-substituted acetamide; thiol-substituted succinimide; thiol-substituted succinamic acid; thiol-substituted heteroaryl, in particular thiol-substituted benzothiazole, thiol-substituted phenyltetrazole and thiol-substituted phenyloxadiazole and a disulfide in which one sulfur atom comes from a cysteine residue of an antibody. In specific embodiments, the fragment resulting from the combination of the thiol group with the thiol-reactive group is a thiol-substituted succinimide.
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L во фрагменте L-X*-S, присутствующий в общей формуле абзаца [00101], выбран из следующей группы фрагментов:In specific embodiments, the linker L in the L-X*-S moiety present in the general formula of paragraph [00101] is selected from the following group of moieties:
(сторона аманитина) -(CH2)2-S-S-(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 2 -SS-(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)3-S-S-(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 3 -SS-(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)2-S-S-(CH2)3-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 2 -SS-(CH 2 ) 3 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)3-S-S-(CH2)3-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 3 -SS-(CH 2 ) 3 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)4-S-S-(CH2)4-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 4 -SS-(CH 2 ) 4 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)2-CMe2-S-S-(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 2 -CMe 2 -SS-(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)2-S-S-CMe2-(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 2 -SS-CMe 2 -(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -(CH2)3-S-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -(CH 2 ) 3 -SS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Cit-Val-CO(CH2)5-X-S- (сторона Tbm)(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Cit-Val-CO(CH 2 ) 5 -XS- (Tbm side)
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Ala-Val-CO(CH2)5-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Ala-Val-CO(CH 2 ) 5 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Ala-Val-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Ala-Val-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Ala-Phe-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Ala-Phe-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Lys-Phe-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Lys-Phe-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Cit-Phe-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Cit-Phe-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Val-Val-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Val-Val-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Ile-Val-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Ile-Val-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-His-Val-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-His-Val-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Met-Val-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Met-Val-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
(сторона аманитина) -CH2-C6H4-NH-Asn-Lys-CO(CH2)2-X-S- (сторона Tbm);(amanitin side) -CH 2 -C 6 H 4 -NH-Asn-Lys-CO(CH 2 ) 2 -XS- (Tbm side);
в которых -NH- и -СО-, фланкирующие дипептидные последовательности, представляют амино и карбонильные фрагменты линкера, образующие амидные связи с карбокси- и амино-концами дипептида, соответственно.in which -NH- and -CO- flanking the dipeptide sequences represent the amino and carbonyl fragments of the linker forming amide bonds with the carboxy and amino ends of the dipeptide, respectively.
В контексте настоящего изобретения термин «фрагмент, получающийся в результате сочетания тиольной группы с тиол-реакционноспособной группой» относится к структуре, которая образуется в результате (i) нуклеофильного замещения уходящей группы Y, присутствующей в тиол-реакционноспособной группе, атомом серы цистеинового остатка, например, бромацетамидная группа, йодацетамидная, 4,6-дихлор-1,3,5-триазин-2-иламиногруппа, алкилсульфон или гетероарилсульфон; (ii) добавления HS-группы цистеинового остатка к активированной двойной связи тиол-реакционноспособной группы, например, малеимид, или (iii) дисульфидного обмена активированного дисульфида или метантиосульфоната на атом серы цистеинового остатка, например, на пиридин-2-тиол, 5-нитропиридин-2-тиол или метансульфинат в качестве уходящей группы; или (iv) любой другой химической реакции, которая дает стабильную связь между атомом серы цистеинового остатка и реакционноспособным фрагментом, являющимся частью тиол-реакционноспособной группы.In the context of the present invention, the term "moiety resulting from the combination of a thiol group with a thiol-reactive group" refers to a structure that results from (i) nucleophilic substitution of a Y leaving group present on a thiol-reactive group with a sulfur atom of a cysteine residue, e.g. , bromoacetamide group, iodoacetamide, 4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-ylamino group, alkylsulfone or heteroarylsulfone; (ii) adding the HS group of the cysteine residue to an activated double bond of a thiol-reactive group, e.g., maleimide, or (iii) disulfide exchange of the activated disulfide or methanethiosulfonate with the sulfur atom of the cysteine residue, e.g., pyridine-2-thiol, 5-nitropyridine -2-thiol or methanesulfinate as leaving group; or (iv) any other chemical reaction that produces a stable bond between the sulfur atom of a cysteine residue and a reactive moiety that is part of a thiol-reactive group.
Первоначальный фрагмент, получающийся в результате сочетания тиольной группы, может быть необязательно далее дериватизирован, например, сукцинимидиловый тиоэфир, получающийся из малеимида, может быть гидролизован до тиоэфиров сукцинамовой кислоты со следующими общими структурамиThe initial fragment resulting from the coupling of the thiol group may optionally be further derivatized, for example, the succinimidyl thioester derived from maleimide may be hydrolyzed to succinamic acid thioesters with the following general structures
Согласно другим конкретным вариантам осуществления сайт-специфическое сочетание может быть достигнуто путем восстановления дисульфидного мостика, присутствующего в связывающемся с мишенью фрагменте, и путем осуществления реагирования двух цистеиновых остатков с мостиковым фрагментом X*, присутствующим в конструкции аманитин-L-X* (см. Badescu et al. Bridging disulfides for stable and defined antibody drug conjugates. Bioconjugate Chemistry. 25 (2014) 1124-1136).In other specific embodiments, site-specific coupling can be achieved by reducing the disulfide bridge present in the target-binding moiety and by reacting the two cysteine residues with the X* bridging moiety present in the amanitin-L-X* construct (see Badescu et al. Bridging disulfides for stable and defined antibody drug conjugates Bioconjugate Chemistry 25 (2014) 1124-1136.
Согласно подобному варианту осуществления сайт-специфическое сочетание может быть достигнуто путем восстановления дисульфидного мостика, присутствующего в связывающемся с мишенью фрагменте, и путем осуществления реагирования двух цистеиновых остатков с мостиковым фрагментом X*, присутствующим в конструкции аманитин-L-X*, в частности, в которой X* представляет собойIn such an embodiment, site-specific coupling can be achieved by reducing the disulfide bridge present in the target-binding moiety and by reacting the two cysteine residues with the X* bridging moiety present in the amanitin-L-X* construct, specifically in which X * represents
(см. Bryden et al., Bioconjug Chem, 25 (2014) 611-617; Schumacher et al., Org Biomol Chem, 2014, 7261-7269).(See Bryden et al., Bioconjug Chem, 25 (2014) 611-617; Schumacher et al., Org Biomol Chem, 2014, 7261-7269).
Согласно другому конкретному варианту осуществления сочетание достигают путем региоспецифического сочетания аминогруппы, присутствующей в линкере, с глутаминовым остатком, присутствующим в связывающемся с мишенью фрагменте, посредством трансаминазы, в частности, путем сочетания с глутамином Q295 антитела.According to another specific embodiment, the coupling is achieved by regiospecific coupling of the amino group present in the linker with the glutamine residue present in the target-binding moiety via transaminase, in particular by coupling with the glutamine Q295 antibody.
Согласно конкретному варианту осуществления сочетание достигают путем сайт-специфической конъюгации со связывающимися с мишенью фрагментами, включающими в себя N-гликановые боковые цепи. В частности, N-гликановая боковая цепь может быть разложена ферментативно, с последующим транс-гликозилированием с азидо-галактозой. С использованием клик-химии такой модифицированный связывающийся с мишенью фрагмент может быть соединен с соответствующим образом модифицированными конструкциями аманитин-L-X*, в которых X* представляет собой, например, дибензо-циклооксин (DIBO), или аналогичным фрагментом, включающим в себя тройную связь С-С. Например, конструкция аманитин-L-NH2 может быть соединена с DIBO-SE,In a specific embodiment, the coupling is achieved by site-specific conjugation to target-binding moieties that include N-glycan side chains. In particular, the N-glycan side chain can be degraded enzymatically, followed by trans-glycosylation with azido-galactose. Using click chemistry, such a modified target-binding moiety can be coupled to suitably modified amanitin-LX* constructs wherein X* is, for example, dibenzocyclooxine (DIBO), or a similar moiety including a C triple bond. -WITH. For example, the amanitin-L-NH 2 construct can be coupled to DIBO-SE,
путем нуклеофильного замещения гидроксисукцинимидного фрагмента. Полученная в результате DIBO-модифицированная линкерная конструкция затем может быть соединена с упомянутым выше азидопроизводным. Согласно альтернативному варианту осуществления связывающийся с мишенью фрагмент может быть модифицирован путем включения не встречающейся в природе аминокислоты, которая допускает клик-химию, в частности, путем включения пара-азидометил-L-фенилаланина (pAMF).by nucleophilic substitution of the hydroxysuccinimide moiety. The resulting DIBO-modified linker construct can then be coupled to the azido derivative mentioned above. In an alternative embodiment, the target-binding moiety can be modified by incorporating a non-naturally occurring amino acid that allows click chemistry, in particular by incorporating para-azidomethyl-L-phenylalanine (pAMF).
Согласно конкретным вариантам осуществления линкер L в -L-X* представляет собой линейную цепь из по меньшей мере 5, в частности, по меньшей мере 10, более конкретно от 10 до 20 атомов, независимо выбранных из С, О, N и S, в частности, от 10 до 18 атомов, более конкретно от 10 до 16 атомов и еще более конкретно от 10 до 15 атомов. Согласно конкретным вариантам осуществления по меньшей мере 60% атомов в линейной цепи являются атомами С. Согласно конкретным вариантам осуществления атомы в линейной цепи связываются одинарными связями.In particular embodiments, the L to -L-X* linker is a linear chain of at least 5, in particular at least 10, more in particular 10 to 20 atoms independently selected from C, O, N and S, in particular 10 to 18 atoms, more specifically 10 to 16 atoms, and even more specifically 10 to 15 atoms. In specific embodiments, at least 60% of the atoms in the linear chain are C atoms. In specific embodiments, the atoms in the linear chain are linked by single bonds.
Согласно альтернативным вариантам осуществления положение или функциональная группа, которые непосредственно или опосредованно могут быть присоединены к положению или функциональной группе, присутствующим в связывающемся с мишенью фрагменте, не представляют собой этинильную группу, или, в более широком смысле, не представляют собой алкинильную группу, или не представляют собой группу, которая может быть введена в реакцию с 1,3-диполем в 1,3-диполярном циклоприсоединении (клик-химии).In alternative embodiments, the position or functional group that can be directly or indirectly attached to the position or functional group present on the target-binding moiety is not an ethynyl group, or, more broadly, is not an alkynyl group, or is not are a group that can be reacted with a 1,3-dipole in a 1,3-dipolar cycloaddition (click chemistry).
Согласно другим конкретным вариантам осуществления сайт-специфическое сочетание конструкции аманитин-L-X* со связывающимся с мишенью фрагментом может быть достигнуто путем включения не встречающейся в природе аминокислоты, включающей в себя кетогруппу, в частности, п-ацетилфенилаланина (pAcPhe), в связывающийся с мишенью фрагмент, и путем осуществления реагирования такого модифицированного связывающегося с мишенью фрагмента с конструкцией аманитин-L-X*, в которой X* представляет собой гидроксиламиновый фрагмент.In other specific embodiments, the site-specific coupling of the amanitin-L-X* construct to the target-binding moiety can be achieved by incorporating a non-naturally occurring amino acid containing a keto group, in particular p-acetylphenylalanine (pAcPhe), into the target-binding moiety. , and by reacting such a modified target-binding moiety with an amanitin-L-X* construct wherein X* is a hydroxylamine moiety.
Согласно следующему варианту осуществления формильная группа может быть введена путем образующего формилглицин фермента (FGE), который является высокоселективным в отношении цистеиновой группы в распознавании последовательности CxPxR с образованием альдегидной метки. Такая альдегидная метка может быть введена в реакцию с соответствующей группой X*, присутствующей в конструкции аманитин-L-X*, в частности, в которой X* представляет собойIn a further embodiment, the formyl group can be introduced by a formylglycine generating enzyme (FGE) that is highly selective for the cysteine group in recognizing the CxPxR sequence to form an aldehyde tag. Such an aldehyde label can be reacted with the appropriate X* group present in the amanitin-L-X* construct, in particular where X* is
(см. Agarwal et al., Bioconjugate Chem 24 (2013) 846-851).(See Agarwal et al., Bioconjugate Chem 24 (2013) 846-851).
Согласно второму аспекту настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, включающей в себя конъюгат в соответствии с настоящим изобретением.According to a second aspect, the present invention relates to a pharmaceutical composition comprising a conjugate according to the present invention.
Согласно третьему аспекту настоящее изобретение относится к конъюгату в соответствии с настоящим изобретением для применения в лечении злокачественной опухоли у больного, в частности, при этом злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из рака молочной железы, рака поджелудочной железы, холангиокарциномы, рака толстой и прямой кишки, рака легкого, рака предстательной железы, рака яичника, рака желудка, рака почки, злокачественной меланомы, лейкоза и злокачественной лимфомы.According to a third aspect, the present invention relates to a conjugate according to the present invention for use in the treatment of a cancer in a patient, in particular, wherein the cancer is selected from the group consisting of breast cancer, pancreatic cancer, cholangiocarcinoma, colon and rectal cancer. , lung cancer, prostate cancer, ovarian cancer, gastric cancer, kidney cancer, malignant melanoma, leukemia, and malignant lymphoma.
Используемые в настоящем документе термины «лечить», «лечащий» или «лечение» заболевания или расстройства означает одно или несколько из следующего: (а) уменьшение тяжести расстройства; (b) ограничение или предупреждение развития характерных симптомов расстройства(расстройств), которое лечат; (с) ингибирование ухудшения характерных симптомов расстройства(расстройств), которое лечат; (d) ограничение или предупреждение рецидива расстройства(расстройств) у больных, которые ранее имели расстройство(а); и (е) ограничение или предупреждение рецидива симптомов у больных, которые ранее имели симптомы расстройства(расстройств).As used herein, the terms "treating", "treating" or "treating" a disease or disorder means one or more of the following: (a) reducing the severity of the disorder; (b) limiting or preventing the development of characteristic symptoms of the disorder(s) being treated; (c) inhibiting worsening of characteristic symptoms of the disorder(s) being treated; (d) limiting or preventing recurrence of the disorder(s) in patients who previously had the disorder(s); and (e) limiting or preventing the recurrence of symptoms in patients who previously had symptoms of the disorder(s).
Используемый в настоящем документе термин «лечение» может предусматривать введение конъюгата или фармацевтической композиции в соответствии с настоящим изобретением больному, при этом «введение» включает в себя in vivo введение, а также введение непосредственно в ткань ex vivo, например, в венозные трансплантаты.As used herein, the term "treatment" may include administration of a conjugate or pharmaceutical composition according to the present invention to a patient, where "administration" includes in vivo administration as well as administration directly to ex vivo tissue, such as venous grafts.
Согласно конкретным вариантам осуществления используют терапевтически эффективное количество конъюгата в соответствии с настоящим изобретением.In specific embodiments, a therapeutically effective amount of a conjugate according to the present invention is used.
Термин «терапевтически эффективное количество» представляет собой количество терапевтического средства, достаточное для достижения желаемой цели. Эффективное количество данного терапевтического средства будет варьировать в зависимости от факторов, таких как природа средства, путь введения, размер и вид животного, получающего терапевтическое средство, и цель введения. Эффективное количество в каждом отдельном случае может быть эмпирически определено специалистом в области техники в соответствии с установленными методами в уровне техники.The term "therapeutically effective amount" is an amount of a therapeutic agent sufficient to achieve the desired goal. The effective amount of a given therapeutic agent will vary depending on factors such as the nature of the agent, the route of administration, the size and species of the animal receiving the therapeutic agent, and the purpose of administration. The effective amount in each individual case can be empirically determined by a person skilled in the art in accordance with established methods in the prior art.
Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, включающей в себя производное аманитина в соответствии с настоящим изобретением или конъюгат в соответствии с настоящим изобретением производного аманитина со связывающимся с мишенью фрагментом и дополнительно включающей в себя один или несколько фармацевтически приемлемых разбавителей, носителей, вспомогательных средств, наполнителей, связывающих средств, смазывающих средств, глидантов, дезинтегрирующих средств, адсорбентов и/или консервантов.According to another aspect, the present invention relates to a pharmaceutical composition comprising an amanitin derivative according to the present invention or a conjugate according to the present invention of an amanitin derivative with a target-binding moiety, and further comprising one or more pharmaceutically acceptable diluents, carriers, auxiliaries , fillers, binders, lubricants, glidants, disintegrants, adsorbents and/or preservatives.
Термин «фармацевтически приемлемый» означает одобренный регуляторными органами Федерального или государственного правительства или перечисленный в Фармакопее США или другой общепринятой фармакопее для применения у животных и более конкретно у людей.The term "pharmaceutically acceptable" means approved by federal or state government regulators or listed in the USP or other generally accepted pharmacopoeia for use in animals, and more specifically in humans.
Согласно конкретным вариантам осуществления фармацевтическую композицию используют в форме системно вводимого лекарственного препарата. Она включает в себя парентеральные средства, которые включают в себя, среди прочего, инъекционные препараты и инфузии. Инъекционные препараты составляют или в форме ампул, или в виде так называемых готовых к применению инъекционных препаратов, например, готовых к применению шприцев или одноразовых шприцев, и, кроме этого, во флаконах с прокалываемой пробкой для многократного использования. Введение инъекционных препаратов может осуществляться в форме подкожного (s.c), внутримышечного (i.m.), внутривенного (i.v.) или внутрикожного (i.e.) применения. В частности, можно получать соответственно подходящие инъекционные составы в виде суспензии кристаллов, растворов, систем наночастиц или коллоидных диспергированных систем, таких как, например, гидрозоли.In specific embodiments, the pharmaceutical composition is used in the form of a systemically administered drug. It includes parenterals, which include but are not limited to injectables and infusions. The injectable preparations are either in the form of ampoules or in the form of so-called ready-to-use injectable preparations, for example ready-to-use syringes or disposable syringes, and furthermore in multi-use pierceable vials. Administration of injectable preparations may be in the form of subcutaneous (s.c), intramuscular (i.m.), intravenous (i.v.) or intradermal (i.e.) administration. In particular, suitably suitable injectable formulations can be prepared in the form of a suspension of crystals, solutions, nanoparticle systems or colloidal dispersed systems, such as, for example, hydrosols.
Инъекционные составы, кроме того, могут быть получены в виде концентратов, которые могут быть растворены или диспергированы в водных изотоничных разбавителях. Инфузия также может быть получена в форме изотонических растворов, жирных эмульсий, липосомных составов и микроэмульсий. Подобно инъекционным препаратам, инфузионные составы также могут быть получены в форме концентратов для разбавления. Инъекционные составы также могут применяться в форме постоянных инфузий или в стационарной или в амбулаторной терапии, например, с помощью мини-помп.Injectable formulations may also be prepared as concentrates which may be dissolved or dispersed in aqueous isotonic diluents. The infusion can also be given in the form of isotonic solutions, fatty emulsions, liposome formulations, and microemulsions. Like injectables, infusion formulations can also be prepared in the form of diluted concentrates. The injectable formulations may also be administered in the form of continuous infusions or in inpatient or outpatient therapy, for example with mini-pumps.
Можно добавлять парентеральные составы лекарственных средств, например, альбумин, плазму, расширитель, поверхностно-активные вещества, органические разбавители, вещества, влияющие на рН, комплексообразующие вещества или полимерные вещества, в частности, в виде веществ, для воздействия на адсорбцию конъюгата связывающегося с мишенью фрагмента и токсина в соответствии с настоящим изобретением белками или полимерами, или они могут быть добавлены с целью снижения адсорбции конъюгатов связывающегося с мишенью фрагмента и токсина в соответствии с настоящим изобретением к материалам, таким как инъекционные средства или упаковочные материалы, например, пластик или стекло.Parenteral drug formulations, e.g. albumin, plasma, dilator, surfactants, organic diluents, pH influencing agents, complexing agents or polymeric agents, can be added, particularly as agents to influence the adsorption of the target-binding conjugate. fragment and toxin of the present invention with proteins or polymers, or they may be added to reduce the adsorption of the targeting fragment and toxin conjugates of the present invention to materials such as injectables or packaging materials such as plastic or glass.
Производные аманитина в соответствии с настоящим изобретением, включающие в себя связывающийся с мишенью фрагмент, могут быть связаны с микроносителями или наночастицами в парентеральных препаратах, как, например, с мелкодиспергированными частицами на основе поли(мет)акрилатов, полилактатов, полигликолатов, полиаминокислот или полиэфируретанов. Парентеральные составы также могут быть модифицированы как препараты депо, например, на основе «системы доставки на основе множественных частиц», если конъюгаты связывающегося с мишенью фрагмента и токсина в соответствии с настоящим изобретением вводят в мелкодиспергированной, диспергированной и суспендированной форме, соответственно, или в виде суспензии кристаллов в лекарственном препарате или на основе «системы доставки на основе одной частицы», если конъюгат связывающегося с мишенью фрагмента и токсина в соответствии с настоящим изобретением заключают в состав, например, в таблетку или стержень, который впоследствии имплантируют. Такие имплантаты или лекарственные препараты депо в составах на основе одной частицы и множества частиц часто состоят из так называемых биоразлагаемых полимеров, как, например, сложные полиэфиры молочной кислоты и гликолевой кислоты, полиэфируретаны, полиаминокислоты, поли(мет)акрилаты или полисахариды.The amanitin derivatives of the present invention, comprising a target-binding moiety, can be coupled to microcarriers or nanoparticles in parenteral formulations, such as finely divided particles based on poly(meth)acrylates, polylactates, polyglycolates, polyamino acids, or polyetherurethanes. Parenteral formulations can also be modified as depot formulations, for example based on a "multiple particle delivery system" if the target-binding moiety-toxin conjugates of the present invention are administered in finely divided, dispersed and suspended form, respectively, or as a suspension of crystals in a drug formulation or based on a "single particle delivery system" if the target-binding fragment-toxin conjugate of the present invention is formulated into, for example, a tablet or rod, which is subsequently implanted. Such implants or depot drugs in single-particulate and multi-particulate formulations often consist of so-called biodegradable polymers such as, for example, polyesters of lactic acid and glycolic acid, polyether urethanes, polyamino acids, poly(meth)acrylates or polysaccharides.
Адъювантами и носителями, добавляемыми во время получения фармацевтических композиций в соответствии с настоящим изобретением, составляемых в виде парентеральных препаратов, предпочтительно являются aqua sterilisata (вода стерильная), вещества, влияющие на значение рН, как, например, органические или неорганические кислоты или основания, а также их соли, буферные вещества для регуляции значений рН, вещества для изотонизации, как, например, хлорид натрия, гидрокарбонат натрия, глюкоза и фруктоза, тенсиды и поверхностно-активные вещества, соответственно, и эмульгаторы, как, например, частичные сложные эфиры жирных кислот и полиоксиэтиленсорбитов (например, Tween®), или, например, сложные эфиры жирной кислоты и полиоксиэтиленов (например, Cremophor®), жирные масла, как, например, арахисовое масло, соевое масло или касторовое масло, синтетические сложные эфиры жирных кислот, как, например, этилолеат, изопропилмиристат и нейтральное масло (например, Miglyol), а также полимерные вспомогательные вещества, как, например, желатин, декстран, поливинилпирролидон, добавки, которые повышают растворимость органических растворителей, как, например, пропиленгликоль, этанол, N,N-диметилацетамид, пропиленгликоль или комплексообразующие вещества, как, например, цитрат и мочевина, консерванты, как, например, гидроксипропиловый сложный эфир и метиловый сложный эфир бензойной кислоты, бензиловый спирт, антиоксиданты, как, например, сульфит натрия, и стабилизаторы, как, например, EDTA.The adjuvants and carriers added during the preparation of the pharmaceutical compositions according to the invention formulated as parenteral preparations are preferably aqua sterilisata (sterile water), substances that affect the pH value, such as organic or inorganic acids or bases, and also their salts, pH buffering agents, isotonizing agents such as sodium chloride, sodium hydrogen carbonate, glucose and fructose, tensides and surfactants, respectively, and emulsifiers, such as partial fatty acid esters and polyoxyethylene sorbitols (eg Tween®) or, for example, fatty acid esters of polyoxyethylenes (eg Cremophor®), fatty oils such as, for example, peanut oil, soybean oil or castor oil, synthetic fatty acid esters, such as, e.g. ethyl oleate, isopropyl myristate and neutral oil (e.g. Miglyol) as well as polymer auxiliaries substances such as gelatin, dextran, polyvinylpyrrolidone, additives which increase the solubility of organic solvents such as propylene glycol, ethanol, N,N-dimethylacetamide, propylene glycol or complexing agents such as citrate and urea, preservatives, such as hydroxypropyl ester and benzoic acid methyl ester, benzyl alcohol, antioxidants such as sodium sulfite and stabilizers such as EDTA.
При составлении фармацевтических композиций в соответствии с настоящим изобретением в виде суспензий согласно предпочтительному варианту осуществления добавляют загустители для предупреждения оседания конъюгатов связывающегося с мишенью фрагмента и токсина в соответствии с настоящим изобретением или тенсиды и полиэлектролиты для обеспечения ресуспендируемости осадков и/или комплексообразующие средства, как, например, EDTA. Также можно получать комплексы активного ингредиента с различными полимерами. Примерами таких полимеров являются полиэтиленгликоль, полистирол, карбоксиметилцеллюлоза, Pluronics® или сложные эфиры жирных кислот и полиэтиленгликоль сорбита. Конъюгаты связывающегося с мишенью фрагмента и токсина в соответствии с настоящим изобретением также могут быть включены в жидкие составы в форме соединений включения, например, с циклодекстринами. Согласно конкретным вариантам осуществления диспергирующие средства могут быть добавлены в виде дополнительных вспомогательных веществ. Для получения лиофилизатов могут быть использованы диспергирующие средства, такие как маннит, декстран, сахароза, человеческий альбумин, лактоза, PVP или множества желатинов.When formulating pharmaceutical compositions according to the present invention as suspensions according to a preferred embodiment, thickeners are added to prevent settling of the target-binding moiety-toxin conjugates according to the present invention, or tensides and polyelectrolytes to ensure resuspendability of the precipitates and/or complexing agents, such as for example , EDTA. It is also possible to obtain complexes of the active ingredient with various polymers. Examples of such polymers are polyethylene glycol, polystyrene, carboxymethylcellulose, Pluronics® or fatty acid esters, and polyethylene glycol sorbitol. Target-binding moiety-toxin conjugates of the present invention may also be incorporated into liquid formulations in the form of inclusion compounds, for example with cyclodextrins. In particular embodiments, dispersants may be added as additional adjuvants. Dispersants such as mannitol, dextran, sucrose, human albumin, lactose, PVP, or a variety of gelatins can be used to prepare lyophilisates.
ПРИМЕРЫEXAMPLES
Далее настоящее изобретение объясняется более подробно неограничивающими примерами.Hereinafter, the present invention is explained in more detail by non-limiting examples.
А. Общий синтез S-дезокси-α-аманитина HDP 30.0735A. Total synthesis of S-deoxy-α-amanitine HDP 30.0735
1. Получение N-(трет-бутоксикарбонил)-L-6-ацетокси-триптофана HDP 30.25501. Preparation of N-(tert-butoxycarbonyl)-L-6-acetoxy-tryptophan HDP 30.2550
590,0 мг (2,68 ммоль) 6-гидрокси-L-триптофана (CAS: 13567-14-1) суспендировали в смеси 30 мл 1,4-диоксана/воды 1:1 (объем/объем). Под аргоном добавляли 2,68 мл (2,68 ммоль) 1 н. NaOH один раз при окружающей температуре. Полученный в результате желтый раствор затем обрабатывали 574,6 мкл (2,68 ммоль) ангидрида Boc (Boc2O) и взбалтывали в течение 24 часов при комнатной температуре. Раствор подкисляли 1 н. хлористоводородной кислотой до рН 2,4 и экстрагировали 3 раза с 25 мл этилацетата. Объединенные экстракты этилацетата промывали насыщенным раствором NaCl и сушили над MgSO4. Фильтрация и выпаривание досуха давали 785,0 мг неочищенного материала. Неочищенный N-Вос-6-гидрокси-L-триптофан растворяли в 4,91 мл (4,91 ммоль) 1 H. NaOH и обрабатывали 463,2 мл (500,3 мг, 4,90 ммоль) уксусного ангидрида. Реакционную смесь взбалтывали в течение 3 часов под аргоном и подкисляли 5% лимонной кислотой. Водную фазу экстрагировали три раза с помощью 25 мл этилацетата, промывали насыщенным раствором NaCl и сушили над MgSO4. Фильтрация и выпаривание давали 635 мг неочищенного твердого вещества.590.0 mg (2.68 mmol) of 6-hydroxy-L-tryptophan (CAS: 13567-14-1) were suspended in 30 ml of 1,4-dioxane/water 1:1 (v/v). 2.68 ml (2.68 mmol) of 1 N hydrochloric acid were added under argon. NaOH once at ambient temperature. The resulting yellow solution was then treated with 574.6 μl (2.68 mmol) Boc anhydride (Boc 2 O) and shaken for 24 hours at room temperature. The solution was acidified with 1 N. hydrochloric acid to pH 2.4 and was extracted 3 times with 25 ml of ethyl acetate. The combined ethyl acetate extracts were washed with saturated NaCl solution and dried over MgSO 4 . Filtration and evaporation to dryness gave 785.0 mg of crude material. The crude N-Boc-6-hydroxy-L-tryptophan was dissolved in 4.91 ml (4.91 mmol) 1 H. NaOH and treated with 463.2 ml (500.3 mg, 4.90 mmol) acetic anhydride. The reaction mixture was agitated for 3 hours under argon and acidified with 5% citric acid. The aqueous phase was extracted three times with 25 ml of ethyl acetate, washed with saturated NaCl solution and dried over MgSO 4 . Filtration and evaporation gave 635 mg of a crude solid.
Неочищенный продукт очищали с помощью флэш-хроматографии в колонке с 330 г силикагеля (длина волны выявления 254 нм) с градиентом CH2Cl2 + 1% уксусной кислоты - CH2Cl2/МеОН (15:1) + 1% уксусной кислоты и после выпаривания с толуолом получали 564,4 мг (выход 56%) белого порошка.The crude product was purified by flash chromatography on a 330 g silica gel column (detection wavelength 254 nm) with a gradient of CH 2 Cl 2 + 1% acetic acid - CH 2 Cl 2 /MeOH (15:1) + 1% acetic acid and after evaporation with toluene, 564.4 mg (56% yield) of a white powder were obtained.
MS (ESI-) - выявлено: 361,08 [М-Н]-; рассчитано: 362,15 (C18H22N2O6).MS (ESI - ) - revealed: 361.08 [M-H] - ; calculated: 362.15 (C 18 H 22 N 2 O 6 ).
2. Получение цис,транс-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-6-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола, цис-HDP 30.2555 и транс-HDP 30.2555 (цис,транс-6-ацетокси-Hpi)2. Preparation of cis,trans-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-6-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole, cis -HDP 30.2555 and trans-HDP 30.2555 (cis,trans-6-acetoxy-Hpi)
ФотоокислениеPhotooxidation
Фотоокисление осуществляли с натриевой лампой высокого давления 400 Вт (лампа Sinus X400, 230 В, 400 Вт; 55000 люмен на расстоянии 1,3 м) или, в качестве альтернативы, с вольфрам-галогеновой лампой (500 Вт). Использовали фильтрующий раствор (CuCl2-СаСО3), отсекающий свет с λ < 490 нм, для вольфрам-галогеновой лампы.Photooxidation was carried out with a 400 W high pressure sodium lamp (Sinus X400 lamp, 230 V, 400 W; 55,000 lumens at 1.3 m) or alternatively with a tungsten-halogen lamp (500 W). A filter solution (CuCl 2 -CaCO 3 ) was used, which cut off light with λ < 490 nm, for a tungsten-halogen lamp.
Использовали метиленовый синий или бенгальский розовый в качестве сенсибилизирующего красителя.Methylene blue or rose bengal was used as a sensitizing dye.
Реакцию осуществляли в 500-мл цилиндрическом реакционном сосуде с теплообменной рубашкой, сделанной из боросиликатного стекла DURAN®, с плоским дном и плоским лабораторным фланцем (DN) с двумя соединителями с нитью GL 18. Расстояние от лампы до реакционного сосуда составляло 15 см, а реакционная температура находилась в диапазоне 3-4°С.The reaction was carried out in a 500 ml cylindrical reaction vessel with a heat exchange jacket made of DURAN® borosilicate glass, with a flat bottom and a flat laboratory flange (DN) with two connectors with GL 18 thread. The distance from the lamp to the reaction vessel was 15 cm, and the reaction the temperature was in the range of 3-4°C.
Конечный продукт очищали на системе для флэш-хроматографии Teledyne ISCO с колонкой Silica Redi Sept Flash 330 г (№ по каталогу Teledyne ISCO 69-2203-330). Растворители CH2Cl2, СН3ОН, СН3СООН имели стандартную чистоту для HPLC или ВР.The final product was purified on a Teledyne ISCO flash chromatography system with a 330 g Silica Redi Sept Flash column (Teledyne ISCO part no. 69-2203-330). The solvents CH 2 Cl 2 , CH 3 OH, CH 3 COOH were of standard purity for HPLC or BP.
Сухой кислород (99,5% чистоты) барботировали через реакционную смесь со скоростью 2-4 л в минуту.Dry oxygen (99.5% pure) was bubbled through the reaction mixture at a rate of 2-4 liters per minute.
943,0 мг (2,60 ммоль) N-(трет-бутоксикарбонил)-L-6-ацетокси-триптофана HDP 30.2550 и 100 мг бенгальского розового растворяли в 500 мл метанола и охлаждали до 3°C с использованием криостата Хубера с гликолем/водой в качестве охлаждающей среды. Реакционный раствор освещали натриевой лампой высокого давления 400 Вт. В ходе освещения медленный поток кислорода барботировали через реакционный раствор. После 5 часов освещения окисление и охлаждение останавливали и реакционную среду обрабатывали 10 мл диметилсульфида. Смесь взбалтывали в течение 2 часов и выпаривали досуха с использованием роторного выпаривателя с температурой водяной бани 35°С. Темно-красный остаток дополнительно сушили в высоком вакууме до 1,20 г кристаллического твердого вещества. Неочищенный продукт очищали в колонке с 330 г силикагеля (длина волны выявления 254 нм) с градиентом CH2Cl2 + 5% уксусной кислоты - CH2Cl2/МеОН (30:1) + 5% уксусной кислоты. 380 мг цис-HDP 30.2555 и 290 мг транс-HDP 30.2555 элюировали и выпаривали совместно с толуолом. После лиофилизации в трет-бутаноле оба изомера получали в виде грязно-белых порошков.943.0 mg (2.60 mmol) of N-(tert-butoxycarbonyl)-L-6-acetoxy-tryptophan HDP 30.2550 and 100 mg of rose bengal were dissolved in 500 ml of methanol and cooled to 3°C using a Huber cryostat with glycol/ water as a cooling medium. The reaction solution was illuminated with a 400 W high pressure sodium lamp. During illumination, a slow stream of oxygen was bubbled through the reaction solution. After 5 hours of illumination, the oxidation and cooling were stopped and the reaction medium was treated with 10 ml of dimethyl sulfide. The mixture was shaken for 2 hours and evaporated to dryness using a rotary evaporator with a water bath temperature of 35°C. The dark red residue was further dried under high vacuum to 1.20 g of a crystalline solid. The crude product was purified on a 330 g silica gel column (detection wavelength 254 nm) with a gradient of CH 2 Cl 2 + 5% acetic acid - CH 2 Cl 2 /MeOH (30:1) + 5% acetic acid. 380 mg of cis-HDP 30.2555 and 290 mg of trans-HDP 30.2555 were eluted and co-evaporated with toluene. After lyophilization in tert-butanol, both isomers were obtained as off-white powders.
Цис-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-6-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индол (цис-HDP 30.2555)Cis-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-6-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole (cis-HDP 30.2555)
380 мг цис-HDP 30.2555, выход: 39%.380 mg cis-HDP 30.2555, yield: 39%.
1H-ЯМР (400 МГц, CD3OD, δ = ppm) 1 H-NMR (400 MHz, CD3OD, δ = ppm)
δ = 1,22, 1,44, 1,54 [s, 9H, С(СН3)3]; 2,23 (s, 3H, ОСОСН3); 2,46-2,63 (m, 2H, CH2); 4,14-4,29 (m, 1H, 2-H); 5,35 (s, 1H, 8a-H); 6,39-6,46 (m, 2H, 7-H, 5-H); 7,20-7,24 (m, 1H, 4-H).δ = 1.22, 1.44, 1.54 [s, 9H, C(CH 3 ) 3 ]; 2.23 (s, 3H, OCOCH 3 ); 2.46-2.63 (m, 2H, CH 2 ); 4.14-4.29 (m, 1H, 2-H); 5.35 (s, 1H, 8a-H); 6.39-6.46 (m, 2H, 7-H, 5-H); 7.20-7.24 (m, 1H, 4-H).
13С-ЯМР (100 МГц, CD3OD, δ = ppm) 13 C-NMR (100 MHz, CD 3 OD, δ = ppm)
δ = 20,93, 28,45, 31,12, 42,80, 61,12, 69,44, 82,21, 85,82, 87,93, 104,97, 112,98, 124,84, 129,42, 151,51, 154,04, 155,97, 171,34, 175,79.δ = 20.93, 28.45, 31.12, 42.80, 61.12, 69.44, 82.21, 85.82, 87.93, 104.97, 112.98, 124.84, 129.42, 151.51, 154.04, 155.97, 171.34, 175.79.
MS (ESI+) - выявлено: 378,92 [МН]+; рассчитано: 378,14 (C18H22N2O7).MS (ESI + ) - detected: 378.92 [MN] + ; calculated: 378.14 (C 18 H 22 N 2 O 7 ).
MS (ESI+) - выявлено: 401,17 [M+Na]+; рассчитано: 401,14 (C18H22N2NaO7).MS (ESI + ) - detected: 401.17 [M+Na] + ; calculated: 401.14 (C 18 H 22 N 2 NaO 7 ).
UV/VIS (СН3ОН): λmax = 296 нМ, 23 9 нМ, 215 нМ.UV/VIS (CH 3 OH): λ max = 296 nM, 239 nM, 215 nM.
λmin = 266 нМ, 227 нМ. λmin = 266 nM, 227 nM.
Транс-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-6-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индол (транс-HDP 30.2555)Trans-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-6-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole (trans-HDP 30.2555)
290 мг транс-HDP 30.2555, выход: 30%.290 mg trans-HDP 30.2555, yield: 30%.
1H-ЯМР (400 МГц, CD3OD, δ = ppm) 1 H-NMR (400 MHz, CD 3 OD, δ = ppm)
δ = 1,22, 1,45, 1,54 [s, 9H, С(СН3)3]; 2,22 (s, 3H, ОСОСН3); 2,55-2,73 (m, 2H, CH2); 4,51-4,57 (m, 1H, 2-H); 5,21-5,24 (s, 1H, 8a-H); 6,36-6,41 (m, 2H, 7-H, 5-H); 7,17- 7,18 (m, 1H, 4-H).δ = 1.22, 1.45, 1.54 [s, 9H, C(CH 3 ) 3 ]; 2.22 (s, 3H, OCOCH 3 ); 2.55-2.73 (m, 2H, CH 2 ); 4.51-4.57 (m, 1H, 2-H); 5.21-5.24 (s, 1H, 8a-H); 6.36-6.41 (m, 2H, 7-H, 5-H); 7.17-7.18 (m, 1H, 4-H).
13С-ЯМР (100 МГц, CD3OD, δ = ppm) 13 C-NMR (100 MHz, CD 3 OD, δ = ppm)
δ = 20,95, 28,50, 31,12, 42,47, 60,97, 69,44, 82,06, 84,84, 87,54, 104,74, 112,67, 125,03, 128,70, 152,31, 154,22, 156,00, 171,23, 174,67.δ = 20.95, 28.50, 31.12, 42.47, 60.97, 69.44, 82.06, 84.84, 87.54, 104.74, 112.67, 125.03, 128.70, 152.31, 154.22, 156.00, 171.23, 174.67.
MS (ESI+) - выявлено: 379,00 [MH]+; рассчитано: 378,14 (C18H22N2O7).MS (ESI + ) - detected: 379.00 [MH] + ; calculated: 378.14 (C 18 H 22 N 2 O 7 ).
MS (ESI+) - выявлено: 401,17 [M+Na]+; рассчитано: 401,14 (C18H22N2NaO7).MS (ESI + ) - detected: 401.17 [M+Na] + ; calculated: 401.14 (C 18 H 22 N 2 NaO 7 ).
MS (ESI+) - выявлено: 779,00 [M+Na]+; рассчитано: 779,28 (C36H44N4Na2O14).MS (ESI + ) - detected: 779.00 [M+Na] + ; calculated: 779.28 (C 36 H 44 N 4 Na 2 O 14 ).
UV/VIS (СН3ОН): λmax = 299 нМ, 241 нМ, 215 нМ.UV/VIS (CH 3 OH): λ max = 299 nM, 241 nM, 215 nM.
λmin = 268 нМ, 228 нМ. λmin = 268 nM, 228 nM.
3. Получение S-дезокси-α-аманитина HDP 30.07353. Preparation of S-deoxy-α-amanitine HDP 30.0735
Стадия 1. HDP 30.0013
FmocHypOH (10,0 г, 28,3 ммоль) суспендировали в 100 мл 80% МеОН и добавляли CS2CO3 (4,6 г, 14,1 ммоль). Суспензию взбалтывали при 50°С в течение 30 минут до полного растворения. Реакционную смесь концентрировали досуха и повторно растворяли в 100 мл DMF. Каплями добавляли аллилбромид (1,6 мл, 3,6 г, 29,7 ммоль) и реакционную смесь взбалтывали на протяжении ночи при комнатной температуре. DMF отгоняли и остаток растворяли в трет-бутилметиловом эфире. Осадки отфильтровывали и прозрачный раствор абсорбировали на целите перед колоночной хроматографией. Соединение очищали на 220 г силикагеля с градиентом н-гексана/этилацетата. Выход: 11,5 г, 100%.FmocHypOH (10.0 g, 28.3 mmol) was suspended in 100 ml of 80% MeOH and CS 2 CO 3 (4.6 g, 14.1 mmol) was added. The suspension was shaken at 50°C for 30 minutes until complete dissolution. The reaction mixture was concentrated to dryness and redissolved in 100 ml DMF. Allyl bromide (1.6 ml, 3.6 g, 29.7 mmol) was added dropwise and the reaction mixture was agitated overnight at room temperature. DMF was distilled off and the residue was dissolved in tert-butyl methyl ether. The precipitates were filtered off and the clear solution was absorbed onto celite before column chromatography. The compound was purified on 220 g silica gel with an n-hexane/ethyl acetate gradient. Yield: 11.5 g, 100%.
Стадия 2. HDP 30.0400
Добавляли HDP 30.0013 (5,0 г, 14,1 ммоль), пиридиния 4-толуолсульфонат (1,33 г, 5,3 ммоль) в суспензию 1,3-дигидро-2Н-пиран-2-ил-метоксиметиловой смолы (5,0 г, 1,0 ммоль/г THP-смолы) в 40 мл дихлопентана. Реакционную смесь взбалтывали при 80°С на протяжении ночи. После охлаждения смолу фильтровали и тщательно промывали дихлопентаном, диметилформамидом, ацетонитрилом, дихлорметаном и трет-бутилметиловым эфиром.HDP 30.0013 (5.0 g, 14.1 mmol), pyridinium 4-toluenesulfonate (1.33 g, 5.3 mmol) was added to a suspension of 1,3-dihydro-2H-pyran-2-yl-methoxymethyl resin (5 .0 g, 1.0 mmol/g THP resin) in 40 ml dichlopentane. The reaction mixture was shaken at 80° C. overnight. After cooling, the resin was filtered and thoroughly washed with dichlopentane, dimethylformamide, acetonitrile, dichloromethane and tert-butyl methyl ether.
Загрузка составляла 0,62 ммоль/г (при определении с помощью УФ-спектроскопии флуоренметильной группы после удаления защитной группы).The loading was 0.62 mmol/g (as determined by UV spectroscopy of the fluorenemethyl group after deprotection).
Стадия 3. HDP 30.2569 (твердофазный синтез)
Предварительная обработка смолыResin Pretreatment
HDP 30.0400 (0,31 г, 0,25 ммоль) обрабатывали с помощью N,N-диметилбарбитуровой кислоты (241 мг, 1,55 ммоль) и Pd(PPh3)4 (35 мг, 0,03 ммоль). Смолу встряхивали на протяжении ночи при комнатной температуре. После этого смолу тщательно промывали дихлорметаном, DMF, ацетонитрилом, дихлорметаном и трет-бутилметиловым эфиром и сушили при пониженном давлении.HDP 30.0400 (0.31 g, 0.25 mmol) was treated with N,N-dimethylbarbituric acid (241 mg, 1.55 mmol) and Pd(PPh 3 ) 4 (35 mg, 0.03 mmol). The resin was shaken overnight at room temperature. Thereafter, the resin was thoroughly washed with dichloromethane, DMF, acetonitrile, dichloromethane and tert-butyl methyl ether and dried under reduced pressure.
Процедура сочетанияCombination procedure
Все реактанты и реагенты растворяли в дихлорметане/DMF (1:1, объем/объем). HDP 30.0477 [см. WO 2014/009025] (102 мг, 0,30 ммоль) растворяли в 6,0 мл дихлорметана/N,N-диметилформамида и обрабатывали с помощью 4,0 мл 0,2 н. раствора PyBOP/HOBt и 2 мл DIEA (40% в DMF). После добавления 2,0 мл N,N-диметилформамида реакционную смесь нагревали до 50°С в течение 8 минут с помощью микроволнового излучения (20 Вт, микроволновой реактор СЕМ) и промывали N,N-диметилформамидом после сочетания.All reactants and reagents were dissolved in dichloromethane/DMF (1:1, v/v). HDP 30.0477 [see WO 2014/009025] (102 mg, 0.30 mmol) was dissolved in 6.0 ml of dichloromethane/N,N-dimethylformamide and treated with 4.0 ml of 0.2N. PyBOP/HOBt solution and 2 ml DIEA (40% in DMF). After adding 2.0 ml of N,N-dimethylformamide, the reaction mixture was heated to 50°C for 8 minutes using microwave radiation (20 W, CEM microwave reactor) and washed with N,N-dimethylformamide after coupling.
Удаление защитной группы FmocRemoving the Fmoc protecting group
Удаление защитной группы выполняли путем добавления 6,0 мл 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде при 50°С в течение 10 минут. Смолу промывали N,N-диметилформамидом (отсутствие удаления защитной группы после сочетания конечной аминокислоты).Deprotection was performed by adding 6.0 ml of 20% piperidine in N,N-dimethylformamide at 50° C. over 10 minutes. The resin was washed with N,N-dimethylformamide (no deprotection after final amino acid coupling).
Все другие аминокислоты сочетали согласно приведенному выше протоколу, взвешивания показаны ниже.All other amino acids were combined according to the above protocol, the weights are shown below.
После завершения смолу окончательно переносили в шприц с дном из фритты, промывали с помощью DCM и сушили при пониженном давлении.After completion, the resin was finally transferred to a frit-bottomed syringe, washed with DCM, and dried under reduced pressure.
Высвобождение смолы и образование В-кольцаResin release and B-ring formation
Раствор 5 мл TFA, 5 мл DCM плюс 10% МеОН аспирировали в смолу и встряхивали в течение 15 минут при окружающей температуре. Раствор распределяли в 50-мл реакционную колбу и смолу промывали с помощью TFA/DCM 1:1 плюс 10% МеОН один раз и выливали в ту же колбу. Реакционную колбу взбалтывали в течение 16 часов. Добавляли триизопропилсилан (0,5 мл) и реакционную смесь концентрировали в вакууме. Остаток растворяли в 500 мкл МеОН и пептид осаждали в 50 мл охлажденного до температуры льда ТВМЕ. После центрифугирования надосадочную жидкость декантировали, осадок промывали один раз с помощью 50 мл ТВМЕ и сушили при пониженном давлении.A solution of 5 ml TFA, 5 ml DCM plus 10% MeOH was aspirated into the resin and shaken for 15 minutes at ambient temperature. The solution was dispensed into a 50 ml reaction flask and the resin was washed with TFA/DCM 1:1 plus 10% MeOH once and poured into the same flask. The reaction flask was shaken for 16 hours. Triisopropylsilane (0.5 ml) was added and the reaction mixture was concentrated in vacuo. The residue was dissolved in 500 μl of MeOH and the peptide was precipitated in 50 ml of ice-cold TBME. After centrifugation, the supernatant was decanted, the pellet was washed once with 50 ml of TBME and dried under reduced pressure.
Осадок солюбилизировали в 2 мл метанола и очищали с помощью препаративной колоночной хроматографии с обращенной фазой. Метанол отгоняли при пониженном давлении и оставшуюся водную фазу сушили замораживанием.The precipitate was solubilized in 2 ml of methanol and purified by reverse phase preparative column chromatography. The methanol was distilled off under reduced pressure and the remaining aqueous phase was freeze-dried.
Выход: 136,5 мг, 62,5%.Yield: 136.5 mg, 62.5%.
MS (ESI+) - выявлено: 1047,4 [М+Н]+; рассчитано: 1047,4 (C45H63N10O17S).MS (ESI+) - detected: 1047.4 [M+H] + ; calculated: 1047.4 (C 45 H 63 N 10 O 17 S).
HPLC: 91,9% площади.HPLC: 91.9% area.
Стадия 4. Циклизация (образование А-кольца, HDP 30.2572)Step 4: Cyclization (A-ring formation, HDP 30.2572)
Приведенное выше высушенное замораживанием моноциклическое промежуточное соединение (136 мг, 130 мкмоль) растворяли в 16 мл DMF и обрабатывали дифенилфосфорилазидом (DPPA, 131 мкл, 1300 мкмоль, 10 эквив.) и диизопропилэтиламином (DIEA, 162 мкл, 1300 мкмоль, 10 эквив.). Реакционную смесь взбалтывали в течение 16 часов и гасили 500 мкл воды по завершении. За превращением наблюдали с помощью HPLC. Смесь концентрировали с помощью пониженного давления, повторно растворяли в 1 мл метанола и очищали с помощью препаративной колоночной хроматографии с обращенной фазой.The above freeze-dried monocyclic intermediate (136 mg, 130 µmol) was dissolved in 16 ml DMF and treated with diphenylphosphoryl azide (DPPA, 131 µl, 1300 µmol, 10 equiv.) and diisopropylethylamine (DIEA, 162 µl, 1300 µmol, 10 equiv.) . The reaction mixture was agitated for 16 hours and quenched with 500 μl of water upon completion. The transformation was monitored by HPLC. The mixture was concentrated under reduced pressure, redissolved in 1 ml of methanol and purified by reverse phase preparative column chromatography.
Выход: 55,3 мг, 41%.Yield: 55.3 mg, 41%.
MS (ESI+) - выявлено: 1029,33 [M+Na]+; рассчитано: 1030,10 (C45H61N10O16S).MS (ESI+) - detected: 1029.33 [M+Na] + ; calculated: 1030.10 (C 45 H 61 N 10 O 16 S).
HPLC: 99,2% площади.HPLC: 99.2% area.
Стадия 5. Удаление защитной группы ацетата (HDP 30.0735)Step 5: Deprotection of the acetate (HDP 30.0735)
[001] HDP 30.2572 (55,3 мг, 53,7 мкмоль) растворяли в 7 н. метанольном растворе NH3 (3,0 мл) и взбалтывали. Превращение проверяли с помощью HPLC/MS. После завершения (6-8 часов) реакционную смесь концентрировали в вакууме, повторно суспендировали в 100 мкл МеОН и очищали с помощью препаративной HPLC.[001] HDP 30.2572 (55.3 mg, 53.7 µmol) was dissolved in 7N. methanol solution of NH 3 (3.0 ml) and shaken. The conversion was checked using HPLC/MS. After completion (6-8 hours), the reaction mixture was concentrated in vacuo, resuspended in 100 μl of MeOH and purified using preparative HPLC.
Выход: 14,1 мг, 29%.Yield: 14.1 mg, 29%.
HPLC: 100%.HPLC: 100%.
MS (ESI+) выявлено: 903,3 [М+Н]+; рассчитано: 902,9 (C39H54N10O13S).MS (ESI+) detected: 903.3 [M+H] + ; calculated: 902.9 (C 39 H 54 N 10 O 13 S).
выявлено: 925,33 [M+Na]+.revealed: 925.33 [M+Na] + .
4. Получение 6'-((3-малеидопропанамидо)-Val-Ala-РАВ)-S-деокси-α-аманитина (HDP 30.2371)4. Preparation of 6'-((3-maleidopropanamido)-Val-Ala-PAB)-S-deoxy-α-amanitine (HDP 30.2371)
Стадия 1. HDP 30.2364
S-Дезокси-α-аманитин HDP 30.0735 (30 мг, 33,2 мкмоль) и HDP 30.1690 (WO 2016/142049, 78 мг, 133 мкмоль = 4,0 эквив.) растворяли в 1500 мкл сухого диметилацетамида (DMA). Добавляли 0,2 М раствор гидрокарбоната цезия в воде (199 мкл, 1,2 эквив.) одной порцией и смесь взбалтывали при комнатной температуре. Через 1,5 и 4 часа добавляли дополнительные порции по 99 мкл (0,6 эквив.) раствора карбоната цезия.S-Deoxy-α-amanitin HDP 30.0735 (30 mg, 33.2 µmol) and HDP 30.1690 (WO 2016/142049, 78 mg, 133 µmol = 4.0 equiv.) were dissolved in 1500 µl of dry dimethylacetamide (DMA). A 0.2 M solution of cesium hydrogen carbonate in water (199 µl, 1.2 equiv.) was added in one portion and the mixture was shaken at room temperature. After 1.5 and 4 hours, additional portions of 99 μl (0.6 equiv.) of cesium carbonate solution were added.
Через 18 часов растворитель выпаривали с помощью высокого вакуума.After 18 hours the solvent was evaporated using high vacuum.
Остаток растворяли в 400 мкл метанола и каплями добавляли в охлажденный до температуры льда МТВЕ (10 мл). После отстаивания при 0°С в течение 10 минут полученный в результате осадок выделяли с помощью центрифугирования (4 минуты, 4000 × g). Надосадочную жидкость отбрасывали, осадок повторно суспендировали в дополнительном МТВЕ (10 мл) и центрифугирование повторяли. Высушенный в вакууме неочищенного продукт растворяли в 400 мкл метанола и очищали с помощью препаративной HPLC в колонке Phenomenex Luna-C18(2) 10 мкм (250×21,2 мм) с градиентом 5% - 100% метанола в воде. Фракции продукта объединяли и приводили до 23 мг (70%) продукта в виде аморфного твердого вещества.The residue was dissolved in 400 μl of methanol and added dropwise to ice-cold MTBE (10 ml). After settling at 0° C. for 10 minutes, the resulting precipitate was isolated by centrifugation (4 minutes, 4000×g). The supernatant was discarded, the pellet was resuspended in additional MTBE (10 ml) and centrifugation was repeated. The vacuum dried crude product was dissolved in 400 μl methanol and purified by preparative HPLC on a Phenomenex Luna-C 18 (2) 10 μm (250 x 21.2 mm) column with a gradient of 5% - 100% methanol in water. The product fractions were combined and brought to 23 mg (70%) of the product as an amorphous solid.
MS (ESI+) [M+Na]+ - выявлено: 1430,58; рассчитано: 1430,65 (C65H97N13NaO18SSi).MS (ESI+) [M+Na] + - detected: 1430.58; calculated: 1430.65 (C 65 H 97 N 13 NaO 18 SSi).
Путем выпаривания раннего пика элюирования извлекали 5 мг (17%) исходного материала.By evaporating the early elution peak, 5 mg (17%) of starting material was recovered.
Стадия 2. HDP 30.2366
HDP 30.2364 (9,47 мг, 6,72 мкмоль) растворяли в 750 мкл трифторуксусной кислоты (TFA). Через 2 минуты летучие вещества удаляли in vacuo, остаток растворяли в 750 мкл воды и каплями добавляли 3% аммиак, пока не достигали рН 10 и осаждения.HDP 30.2364 (9.47 mg, 6.72 µmol) was dissolved in 750 µl of trifluoroacetic acid (TFA). After 2 minutes, the volatiles were removed in vacuo, the residue was dissolved in 750 μl of water and 3% ammonia was added dropwise until
Раствор сушили замораживанием и очищали с помощью препаративной HPLC последовательно (колонка Phenomenex Luna-C18(2), 10 мкм, 250×21,2 мм, градиента 5-100% метанола (0,05% TFA) в воде (0,05% TFA)) с получением 7,72 мг (89% на основе соли TFA) продукта.The solution was freeze dried and purified by preparative HPLC sequentially (Phenomenex Luna-C 18 (2), 10 µm, 250×21.2 mm, gradient 5-100% methanol (0.05% TFA) in water (0.05 % TFA)) to give 7.72 mg (89% based on TFA salt) of product.
MS (ESI+) [MH]+ - выявлено: 1178,42; рассчитано: 1178,53 (C54H76N13O15S).MS (ESI + ) [MH] + - detected: 1178.42; calculated: 1178.53 (C 54 H 76 N 13 O 15 S).
Стадия 3. HDP 30.2371
HDP 30.2366 (4,01 мг, 3,10 мкмоль) растворяли в 500 мкл сухого DMF.HDP 30.2366 (4.01 mg, 3.10 µmol) was dissolved in 500 µl dry DMF.
Сложный эфир 3-(малеимидо)пропионовой кислоты и N-гидроксисукцинимида (BMPS, 1,65 мг, 2 эквив.) растворяли в 100 мкл DMF с последующим добавлением 2,1 мкл DIPEA.An ester of 3-(maleimido)propionic acid and N-hydroxysuccinimide (BMPS, 1.65 mg, 2 equiv.) was dissolved in 100 μl of DMF followed by the addition of 2.1 μl of DIPEA.
После взбалтывания в течение 1 часа реакционную смесь капали в 10 мл охлажденного до температуры льда метил-трет-бутилового эфира. Пробирку держали на льду в течение 10 минут и центрифугировали при 4000 × g. Над осадочную жидкость удаляли и осадок промывали с помощью 10 мл свежего метил-трет-бутилового эфира.After shaking for 1 hour, the reaction mixture was dropped into 10 ml of ice-cold methyl tert-butyl ether. The tube was kept on ice for 10 minutes and centrifuged at 4000×g. The supernatant liquid was removed and the precipitate was washed with 10 ml of fresh methyl tert-butyl ether.
Высушенный в вакууме осадок очищали с помощью RP-18 HPLC с градиентом 5-100% метанола в воде. Чистые фракции выпаривали досуха и лиофилизировали из 1 мл трет-бутанола/воды с получением 2,70 мг (65%) продукта в виде бесцветного порошка.The vacuum dried precipitate was purified by RP-18 HPLC with a gradient of 5-100% methanol in water. The pure fractions were evaporated to dryness and lyophilized from 1 ml t-butanol/water to give 2.70 mg (65%) of the product as a colorless powder.
MS (ESI+) [MH]+ - выявлено: 1329,3; рассчитано: 1329,6 (C61H81N14O18S).MS (ESI+) [MH] + - detected: 1329.3; calculated: 1329.6 (C 61 H 81 N 14 O 18 S).
[M+Na]+ - выявлено: 1351,5; рассчитано: 1351,5 (C61H80N14NaO18S).[M+Na] + - revealed: 1351.5; calculated: 1351.5 (C 61 H 80 N 14 NaO 18 S).
В. Общий синтез S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида HDP 30.2548B. Total synthesis of S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide HDP 30.2548
1. Получение N-(трет-бутоксикарбонил)-L-5-ацетокси-триптофана HDP 30.25311. Obtaining N-(tert-butoxycarbonyl)-L-5-acetoxy-tryptophan HDP 30.2531
800,0 мг (3,63 ммоль) 5-гидрокси-L-триптофана (CAS: 4350-09-8) суспендировали в смеси 40 мл 1,4-диоксана/воды 1:1 (объем/объем). Под аргоном добавляли 3,64 мл (3,64 ммоль) 1 н. NaOH за один раз при окружающей температуре. Полученный в результате желтый раствор затем обрабатывали с помощью 779,0 мкл (794,0 мг, 3,63 ммоль) Boc ангидрида (Boc2O) и взбалтывали в течение 24 часов при комнатной температуре. Раствор подкисляли 1 н. хлористоводородной кислотой до рН 2,4 и экстрагировали 3 раза с помощью 35 мл этилацетата. Объединенные этилацетатные экстракты промывали насыщенным раствором NaCl и сушили над MgSO4. Фильтрация и выпаривание досуха давали 1,26 г неочищенного материала. Неочищенный N-Вос-6-гидрокси-L-триптофан растворяли в 7,87 мл (7,87 ммоль) 1 н. NaOH и обрабатывали с помощью 743,0 мкл (802,4 мг, 7,86 ммоль) уксусного ангидрида. Реакционную смесь взбалтывали в течение 3 часов под аргоном и подкисляли 5% лимонной кислотой. Водную фазу экстрагировали три раза с помощью 25 мл этилацетата, промывали насыщенным NaCl и сушили над MgSO4. Фильтровали и выпаривали.800.0 mg (3.63 mmol) of 5-hydroxy-L-tryptophan (CAS: 4350-09-8) were suspended in 40 ml of 1,4-dioxane/water 1:1 (v/v). Under argon, 3.64 ml (3.64 mmol) of 1 N hydrochloric acid were added. NaOH at a time at ambient temperature. The resulting yellow solution was then treated with 779.0 μl (794.0 mg, 3.63 mmol) Boc anhydride (Boc 2 O) and shaken for 24 hours at room temperature. The solution was acidified with 1 N. hydrochloric acid to pH 2.4 and extracted 3 times with 35 ml of ethyl acetate. The combined ethyl acetate extracts were washed with saturated NaCl solution and dried over MgSO 4 . Filtration and evaporation to dryness gave 1.26 g of crude material. The crude N-Boc-6-hydroxy-L-tryptophan was dissolved in 7.87 ml (7.87 mmol) 1N. NaOH and treated with 743.0 μl (802.4 mg, 7.86 mmol) of acetic anhydride. The reaction mixture was agitated for 3 hours under argon and acidified with 5% citric acid. The aqueous phase was extracted three times with 25 ml of ethyl acetate, washed with saturated NaCl and dried over MgSO 4 . Filtered and evaporated.
Неочищенное твердое вещество очищали с помощью флэш-хроматографии в колонке с 330 г силикагеля (длина волны выявления 254 нм) с градиентом CH2Cl2 + 1% уксусной кислоты - CH2Cl2/МеОН (15:1) + 1% уксусной кислоты и после совместного выпаривания с толуолом получали 1020,0 мг (выход 78%) белого порошка.The crude solid was purified by flash chromatography on a 330 g silica gel column (detection wavelength 254 nm) with a gradient of CH 2 Cl 2 + 1% acetic acid - CH 2 Cl 2 /MeOH (15:1) + 1% acetic acid and after coevaporation with toluene, 1020.0 mg (78% yield) of a white powder was obtained.
MS (ESI-) - выявлено: 361,08 [М-Н]-; рассчитано: 362,15 (C18H22N2O6).MS (ESI - ) - revealed: 361.08 [M-H] - ; calculated: 362.15 (C 18 H 22 N 2 O 6 ).
1H-ЯМР (400 МГц, CD3OD, δ = ppm). 1 H-NMR (400 MHz, CD 3 OD, δ=ppm).
δ = 1,39 (s, 9H, С(СН3)3); 2,27 (s, 3H, ОСОСН3); 3,08-3,31 (m, 2H, СН2); 4,39-4,41 (m, 1Н, 2-H); 6,81-6,83; 7,13; 7,24-7,26 (m, 2H, 6-Н, 7-Н); 7,30- 7,32 (1Н, 4-Н).δ = 1.39 (s, 9H, C(CH 3 ) 3 ); 2.27 (s, 3H, OCOCH 3 ); 3.08-3.31 (m, 2H, CH 2 ); 4.39-4.41 (m, 1H, 2-H); 6.81-6.83; 7.13; 7.24-7.26 (m, 2H, 6-H, 7-H); 7.30-7.32 (1H, 4-H).
2. Получение цис,транс-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-5-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола, цис-HDP 30.2536 и транс-HDP 30.2536 (цис,транс-5-ацетокси-Hpi)2. Preparation of cis,trans-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-5-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole, cis -HDP 30.2536 and trans-HDP 30.2536 (cis,trans-5-acetoxy-Hpi)
ФотоокислениеPhotooxidation
Фотоокисление осуществляли с натриевой лампой высокого давления 400 Вт (лампа Sirius X400, 230 В, 400 Вт; 55000 люмен на расстоянии 1,3 м) или, в качестве альтернативы, с вольфрам-галогеновой лампой (500 Вт). Использовали фильтрующий раствор (Cucl2-СаСО3), отсекающий свет с λ < 490 нм, для вольфрам-галогеновой лампы.Photooxidation was carried out with a 400 W high pressure sodium lamp (Sirius X400 lamp, 230 V, 400 W; 55,000 lumens at 1.3 m) or alternatively with a tungsten-halogen lamp (500 W). A filter solution (Cucl 2 -CaCO 3 ) was used, which cut off light with λ < 490 nm, for a tungsten-halogen lamp.
Использовали метиленовый синий или бенгальский розовый в качестве сенсибилизирующего красителя. Реакцию осуществляли в 500-мл цилиндрическом реакционном сосуде с теплообменной рубашкой, сделанной из боросиликатного стекла DURAN®, с плоским дном и плоским лабораторным фланцем (DN) с двумя соединителями с нитью GL 18. Расстояние от лампы до реакционного сосуда составляло 15 см, а реакционная температура находилась в диапазоне 3-4°С.Methylene blue or rose bengal was used as a sensitizing dye. The reaction was carried out in a 500 ml cylindrical reaction vessel with a heat exchange jacket made of DURAN® borosilicate glass, with a flat bottom and a flat laboratory flange (DN) with two connectors with GL 18 thread. The distance from the lamp to the reaction vessel was 15 cm, and the reaction the temperature was in the range of 3-4°C.
Конечный продукт очищали на системе для флэш-хроматографии Teledyne ISCO с колонкой Silica Redi Sept Flash 330 г (№ по каталогу Teledyne ISCO 69-2203-330). Растворители CH2Cl2, СН3ОН, СН3СООН имели стандартную чистоту для HPLC или ВР. Сухой кислород (99,5% чистоты) барботировали через реакционную смесь со скоростью 2-4 л в минуту.The final product was purified on a Teledyne ISCO flash chromatography system with a 330 g Silica Redi Sept Flash column (Teledyne ISCO part no. 69-2203-330). The solvents CH 2 Cl 2 , CH 3 OH, CH 3 COOH were of standard purity for HPLC or BP. Dry oxygen (99.5% pure) was bubbled through the reaction mixture at a rate of 2-4 liters per minute.
1,20 г (3,17 ммоль) N-(трет-бутоксикарбонил)-L-5-ацетокси-триптофана HDP 30.2531 и 100 мг бенгальского розового растворяли в 500 мл метанола и охлаждали до 3°C с использованием криостата Хубера с гликолем/водой в качестве охлаждающей среды. Реакционный раствор освещали натриевой лампой высокого давления 400 Вт. В ходе освещения медленный поток кислорода барботировали через реакционный раствор. После 4 часов освещения окисление и охлаждение останавливали и реакционную среду обрабатывали 20 мл диметилсульфида. Смесь взбалтывали в течение 2 часов и выпаривали досуха с использованием роторного выпаривателя с температурой водяной бани 35°С. Темно-красный остаток дополнительно сушили в высоком вакууме до кристаллического твердого вещества. Неочищенный продукт очищали в колонке с 330 г силикагеля (длина волны выявления 254 нм) с градиентом CH2Cl2 + 5% уксусной кислоты - CH2Cl2/MeOH (30:1) + 5% уксусной кислоты.1.20 g (3.17 mmol) of N-(tert-butoxycarbonyl)-L-5-acetoxy-tryptophan HDP 30.2531 and 100 mg of rose bengal were dissolved in 500 ml of methanol and cooled to 3°C using a Huber cryostat with glycol/ water as a cooling medium. The reaction solution was illuminated with a 400 W high pressure sodium lamp. During illumination, a slow stream of oxygen was bubbled through the reaction solution. After 4 hours of illumination, the oxidation and cooling were stopped and the reaction medium was treated with 20 ml of dimethyl sulfide. The mixture was shaken for 2 hours and evaporated to dryness using a rotary evaporator with a water bath temperature of 35°C. The dark red residue was further dried under high vacuum to a crystalline solid. The crude product was purified on a 330 g silica gel column (detection wavelength 254 nm) with a gradient of CH 2 Cl 2 + 5% acetic acid - CH 2 Cl 2 /MeOH (30:1) + 5% acetic acid.
178 мг цис-HDP 30.2536 и 132 мг транс-HDP 30.2536 элюировали и выпаривали совместно с толуолом. После лиофилизации в трет-бутаноле оба изомера получали в виде грязно-белых порошков.178 mg cis-HDP 30.2536 and 132 mg trans-HDP 30.2536 were eluted and co-evaporated with toluene. After lyophilization in tert-butanol, both isomers were obtained as off-white powders.
Цис-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-5-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индол (цис-HDP 30.2536)Cis-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-5-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole (cis-HDP 30.2536)
178 мг цис-HDP 30.2536 выход: 15%.178 mg cis-HDP 30.2536 yield: 15%.
1H-ЯМР (400 МГц, CD3OD, δ = ppm). 1 H-NMR (400 MHz, CD 3 OD, δ=ppm).
δ = 1,44, 1,54 (s, 9H, С(СН3)3); 2,23 (s, 3H, ОСОСН3); 2,45-2,62 (m, 2H, CH2); 4,18-4,33 (m, 1H, 2-H); 5,37 (s, 1H, 8a-H); 6,63-6,67; 6,82-6,84; (m, 2H, 7-Н, 6-Н); 6,96- 6,98 (m, 1Н, 4-Н).δ = 1.44, 1.54 (s, 9H, C(CH 3 ) 3 ); 2.23 (s, 3H, OCOCH 3 ); 2.45-2.62 (m, 2H, CH 2 ); 4.18-4.33 (m, 1H, 2-H); 5.37 (s, 1H, 8a-H); 6.63-6.67; 6.82-6.84; (m, 2H, 7-H, 6-H); 6.96-6.98 (m, 1H, 4-H).
13С-ЯМР (100 МГц, CD3OD, δ = ppm). 13 C-NMR (100 MHz, CD 3 OD, δ=ppm).
δ = 20,86, 28,46, 31,12, 42,81, 61,21, 82,14, 85,60, 111,49, 117,83, 123,98, 132,77, 144,99, 148,03, 156,07, 172,01, 175,89.δ = 20.86, 28.46, 31.12, 42.81, 61.21, 82.14, 85.60, 111.49, 117.83, 123.98, 132.77, 144.99, 148.03, 156.07, 172.01, 175.89.
MS (ESI+) - выявлено: 379,00 [МН]+; рассчитано: 378,14 (C18H22N2O7).MS (ESI + ) - detected: 379.00 [MN] + ; calculated: 378.14 (C 18 H 22 N 2 O 7 ).
MS (ESI+) - выявлено: 401,17 [M+Na]+; рассчитано: 401,14 (C18H22N2NaO7).MS (ESI + ) - detected: 401.17 [M+Na] + ; calculated: 401.14 (C 18 H 22 N 2 NaO 7 ).
MS (ESI-) - выявлено: 377,17 [M-H]-; рассчитано: 378,14 (C18H22N2O7).MS (ESI - ) - detected: 377.17 [MH] - ; calculated: 378.14 (C 18 H 22 N 2 O 7 ).
UV/VIS (СН3ОН): λmax = 299 нм, 242 нм, 207 нм.UV/VIS (CH 3 OH): λ max = 299 nm, 242 nm, 207 nm.
λmin = 270 нм, 222 нм. λmin = 270 nm, 222 nm.
Транс-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-5-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индол (транс-HDP 30.2536)Trans-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-5-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole (trans-HDP 30.2536)
132 мг транс-HDP 30.2536, выход: 11%.132 mg trans-HDP 30.2536, yield: 11%.
1H-ЯМР (400 МГц, CD3OD, δ = ppm). 1 H-NMR (400 MHz, CD 3 OD, δ=ppm).
δ = 1,47, 1,54 [s, 9H, С(СН3)3]; 2,21 (s, 3H, ОСОСН3); 2,50-2,70 (m, 2H, СН2); 4,51-4,56 (m, 1H, 2-H); 5,22-5,26 (s, 1H, 8a-H); 6,58-6,63; 6,80-6,81 (m, 6-H, 7-H); 6,92 (s, 1H, 4-H).δ = 1.47, 1.54 [s, 9H, C(CH 3 ) 3 ]; 2.21 (s, 3H, OCOCH 3 ); 2.50-2.70 (m, 2H, CH 2 ); 4.51-4.56 (m, 1H, 2-H); 5.22-5.26 (s, 1H, 8a-H); 6.58-6.63; 6.80-6.81 (m, 6-H, 7-H); 6.92 (s, 1H, 4-H).
13С-ЯМР (100 МГц, CD3OD, δ = ppm). 13 C-NMR (100 MHz, CD 3 OD, δ=ppm).
δ = 20,88, 28,50, 31,12, 42,60, 61,11, 82,05, 85,38, 111,26, 117,88, 124,07, 131,94 144,66, 148,95, 156,11, 172,01, 174,81.δ = 20.88, 28.50, 31.12, 42.60, 61.11, 82.05, 85.38, 111.26, 117.88, 124.07, 131.94 144.66, 148 .95, 156.11, 172.01, 174.81.
MS (ESI+) - выявлено: 379,00 [MH]+; рассчитано: 378,14 (C18H22N2O7).MS (ESI + ) - detected: 379.00 [MH] + ; calculated: 378.14 (C 18 H 22 N 2 O 7 ).
MS (ESI+) - выявлено: 401,17 [M+Na]+; рассчитано: 401,14 (C18H22N2NaO7).MS (ESI + ) - detected: 401.17 [M+Na] + ; calculated: 401.14 (C 18 H 22 N 2 NaO 7 ).
MS (ESI-) - выявлено: 377,17 [M-H]-; рассчитано: 378,14 (C18H22N2O7).MS (ESI - ) - detected: 377.17 [MH] - ; calculated: 378.14 (C 18 H 22 N 2 O 7 ).
UV/VIS (СН3ОН): λmax = 302 нм, 244 нм, 208 нм.UV/VIS (CH 3 OH): λ max = 302 nm, 244 nm, 208 nm.
λmin = 272 нм, 224 нм. λmin = 272 nm, 224 nm.
3. Получение S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида HDP 30.25483. Preparation of S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide HDP 30.2548
Стадия 1. HDP 30.0013
FmocHypOH (10,0 г, 28,3 ммоль) суспендировали в 100 мл 80% МеОН и добавляли Cs2CO3 (4,6 г, 14,1 ммоль). Суспензию взбалтывали при 50°С в течение 30 минут до полного растворения. Реакционную смесь концентрировали досуха и повторно растворяли в 100 мл DMF. Каплями добавляли аллилбромид (1,6 мл, 3,6 г, 29,7 ммоль) и реакционную смесь взбалтывали на протяжении ночи при комнатной температуре. DMF отгоняли и остаток растворяли в трет-бутилметиловом эфире. Осадки фильтровали и прозрачный раствор абсорбировали на целите перед колоночной хроматографией. Соединение очищали на 220 н силикагеля с градиентом н-гексана/этилацетата.FmocHypOH (10.0 g, 28.3 mmol) was suspended in 100 ml of 80% MeOH and Cs 2 CO 3 (4.6 g, 14.1 mmol) was added. The suspension was shaken at 50°C for 30 minutes until complete dissolution. The reaction mixture was concentrated to dryness and redissolved in 100 ml DMF. Allyl bromide (1.6 ml, 3.6 g, 29.7 mmol) was added dropwise and the reaction mixture was agitated overnight at room temperature. DMF was distilled off and the residue was dissolved in tert-butyl methyl ether. The precipitates were filtered and the clear solution was absorbed onto celite before column chromatography. The compound was purified on 220N silica gel with an n-hexane/ethyl acetate gradient.
Выход: 11,5 г, 100%.Yield: 11.5 g, 100%.
Стадия 2. HDP 30.0400
HDP 30.0013 (5,0 г, 14,1 ммоль), пиридиния 4-толуолсульфоната (1,33 г, 5,3 ммоль) добавляли в суспензию 1,3-дигидро-2Н-пиран-2-ил-метоксиметиловой смолы (5,0 г, 1,0 ммоль/г ТНР-смолы) в 40 мл дихлопентана. Реакционную смесь взбалтывали при 80°С на протяжении ночи. После охлаждения смолу фильтровали и тщательно промывали с помощью дихлопентана, диметилформамида, ацетонитрила, дихлорметана и трет-бутилметилового эфира.HDP 30.0013 (5.0 g, 14.1 mmol), pyridinium 4-toluenesulfonate (1.33 g, 5.3 mmol) was added to a suspension of 1,3-dihydro-2H-pyran-2-yl-methoxymethyl resin (5 .0 g, 1.0 mmol/g THP resin) in 40 ml of dichlopentane. The reaction mixture was shaken at 80° C. overnight. After cooling, the resin was filtered and washed thoroughly with dichlopentane, dimethylformamide, acetonitrile, dichloromethane and tert-butyl methyl ether.
Загрузка составляла 0,62 ммоль/г (при определении с помощью УФ-спектроскопии флуоренметильной группы после удаления защитной группы).The loading was 0.62 mmol/g (as determined by UV spectroscopy of the fluorenemethyl group after deprotection).
Стадия 3. HDP 30.2544 (твердофазный синтез)
Предварительная обработка смолыResin Pretreatment
HDP 30.0400 (0,31 г, 0,25 ммоль) обрабатывали с помощью N,N-диметилбарбитуровой кислоты (241 мг, 1,55 ммоль) и Pd(PPh3)4 (35 мг, 0,03 ммоль). Смолу встряхивали на протяжении ночи при комнатной температуре. После этого смолу тщательно промывали дихлорметаном, DMF, ацетонитрилом, дихлорметаном и трет-бутилметиловым эфиром и сушили при пониженном давлении.HDP 30.0400 (0.31 g, 0.25 mmol) was treated with N,N-dimethylbarbituric acid (241 mg, 1.55 mmol) and Pd(PPh 3 ) 4 (35 mg, 0.03 mmol). The resin was shaken overnight at room temperature. Thereafter, the resin was thoroughly washed with dichloromethane, DMF, acetonitrile, dichloromethane and tert-butyl methyl ether and dried under reduced pressure.
Процедура сочетанияCombination procedure
Все реактанты и реагенты растворяли в дихлорметане/DMF (1:1, объем/объем). HDP 30.0477 [см. WO 2014/009025] (102 мг, 0,30 ммоль) растворяли в 6,0 мл дихлорметана/N,N-диметилформамида и обрабатывали с помощью 4,0 мл 0,2 н. раствора PyBOP/HOBt и 2 мл DIEA (40% в DMF). После добавления 2,0 мл N,N-диметилформамида реакционную смесь нагревали до 50°С в течение 8 минут с помощью микроволнового излучения (20 Вт, микроволновой реактор СЕМ) и промывали N,N-диметилформамидом после сочетания.All reactants and reagents were dissolved in dichloromethane/DMF (1:1, v/v). HDP 30.0477 [see WO 2014/009025] (102 mg, 0.30 mmol) was dissolved in 6.0 ml of dichloromethane/N,N-dimethylformamide and treated with 4.0 ml of 0.2N. PyBOP/HOBt solution and 2 ml DIEA (40% in DMF). After adding 2.0 ml of N,N-dimethylformamide, the reaction mixture was heated to 50°C for 8 minutes using microwave radiation (20 W, CEM microwave reactor) and washed with N,N-dimethylformamide after coupling.
Удаление защитной группы FmocRemoving the Fmoc protecting group
Удаление защитной группы выполняли путем добавления 6,0 мл 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде при 50°С в течение 10 минут. Смолу промывали N,N-диметилформамидом (отсутствие удаления защитной группы после сочетания конечной аминокислоты).Deprotection was performed by adding 6.0 ml of 20% piperidine in N,N-dimethylformamide at 50° C. over 10 minutes. The resin was washed with N,N-dimethylformamide (no deprotection after final amino acid coupling).
Все другие аминокислоты сочетали согласно приведенному выше протоколу, взвешивания показаны ниже.All other amino acids were combined according to the above protocol, the weights are shown below.
После завершения смолу окончательно переносили в шприц с дном из фритты, промывали с помощью DCM и сушили при пониженном давлении.After completion, the resin was finally transferred to a frit-bottomed syringe, washed with DCM, and dried under reduced pressure.
Высвобождение смолы и образование В-кольцаResin release and B-ring formation
Раствор 5 мл TFA, 5 мл DCM плюс 10% МеОН аспирировали в смолу и встряхивали в течение 15 минут при окружающей температуре. Раствор распределяли в 50-мл реакционную колбу и смолу промывали с помощью TFA/DCM 1:1 плюс 10% МеОН один раз и выливали в ту же колбу. Реакционную колбу взбалтывали в течение 16 часов. Добавляли триизопропилсилан (0,5 мл) и реакционную смесь концентрировали в вакууме. Остаток растворяли в 500 мкл МеОН и пептид осаждали в 50 мл охлажденного до температуры льда ТВМЕ. После центрифугирования надосадочную жидкость декантировали, осадок промывали один раз с помощью 50 мл ТВМЕ и сушили при пониженном давлении.A solution of 5 ml TFA, 5 ml DCM plus 10% MeOH was aspirated into the resin and shaken for 15 minutes at ambient temperature. The solution was dispensed into a 50 ml reaction flask and the resin was washed with TFA/DCM 1:1 plus 10% MeOH once and poured into the same flask. The reaction flask was shaken for 16 hours. Triisopropylsilane (0.5 ml) was added and the reaction mixture was concentrated in vacuo. The residue was dissolved in 500 μl of MeOH and the peptide was precipitated in 50 ml of ice-cold TBME. After centrifugation, the supernatant was decanted, the pellet was washed once with 50 ml of TBME and dried under reduced pressure.
Осадок солюбилизировали в 2 мл метанола и очищали с помощью препаративной колоночной хроматографии с обращенной фазой. Метанол отгоняли при пониженном давлении и оставшуюся водную фазу сушили замораживанием.The precipitate was solubilized in 2 ml of methanol and purified by reverse phase preparative column chromatography. The methanol was distilled off under reduced pressure and the remaining aqueous phase was freeze-dried.
Выход: 75,1 мг, 35,9%.Yield: 75.1 mg, 35.9%.
MS (ESI+) - выявлено: 1047,4 [М+Н]+; рассчитано: 1047,4 (C45H63N10O17S).MS (ESI + ) - detected: 1047.4 [M+H] + ; calculated: 1047.4 (C 45 H 63 N 10 O 17 S).
HPLC: 99,3% площади.HPLC: 99.3% area.
Стадия 4. Циклизация (образование А-кольца, HDP 30.2546)Step 4: Cyclization (A-ring formation, HDP 30.2546)
Приведенное выше высушенное замораживанием моноциклическое промежуточное соединение (49,4 мг, 47,2 мкмоль) растворяли в 3 мл DMF и обрабатывали дифенилфосфорилазидом (DPPA, 13 мкл, 237 мкмоль, 5 эквив.) и диизопропилэтиламином (DIEA, 40 мкл, 237 мкмоль, 5 эквив.). Реакционную смесь взбалтывали в течение 16 часов и гасили 500 мкл воды по завершении. За превращением наблюдали с помощью HPLC. Смесь концентрировали с помощью пониженного давления, повторно растворяли в 1 мл метанола и очищали с помощью препаративной колоночной хроматографии с обращенной фазой.The above freeze-dried monocyclic intermediate (49.4 mg, 47.2 µmol) was dissolved in 3 ml DMF and treated with diphenylphosphoryl azide (DPPA, 13 µl, 237 µmol, 5 equiv.) and diisopropylethylamine (DIEA, 40 µl, 237 µmol, 5 equiv.). The reaction mixture was agitated for 16 hours and quenched with 500 μl of water upon completion. The transformation was monitored by HPLC. The mixture was concentrated under reduced pressure, redissolved in 1 ml of methanol and purified by reverse phase preparative column chromatography.
Выход: 32,5 мг, 67,9%.Yield: 32.5 mg, 67.9%.
MS (ESI+) - выявлено: [М+Н]+ 1029,33, [MH]+ 1051,3, [M+Na]+; рассчитано: 1029,39; 1051,42 (C45H61N10O16S; C45H60N10O16SNa).MS (ESI + ) - revealed: [M+H] + 1029.33, [MH] + 1051.3, [M+Na] + ; calculated: 1029.39; 1051.42 (C 45 H 61 N 10 O 16 S; C 45 H 60 N 10 O 16 SNa).
HPLC: 88,3% площади.HPLC: 88.3% area.
Стадия 5. Удаление защитной группы ацетата (HDP 30.2548)Step 5: Deprotection of the acetate (HDP 30.2548)
HDP 30.2546 (23,4 мг, 22,7 мкмоль) растворяли в 7 н. растворе метанола (2,3 мл) и взбалтывали. Превращение проверяли с помощью HPLC/MS. После завершения (6-8 часов) реакционную смесь концентрировали в вакууме, повторно суспендировали в 100 мкл МеОН и очищали с помощью препаративной HPLC.HDP 30.2546 (23.4 mg, 22.7 µmol) was dissolved in 7N. methanol solution (2.3 ml) and shaken. The conversion was checked using HPLC/MS. After completion (6-8 hours), the reaction mixture was concentrated in vacuo, resuspended in 100 μl of MeOH and purified using preparative HPLC.
Выход: 12,5 мг, 53,3%.Yield: 12.5 mg, 53.3%.
HPLC: 99%.HPLC: 99%.
MS (ESI+) выявлено: 903,4 [М+Н]+; рассчитано: 902,9 (C39H54N10O13S).MS (ESI + ) revealed: 903.4 [M+H] + ; calculated: 902.9 (C 39 H 54 N 10 O 13 S).
выявлено: 925,4 [M+Na]+.revealed: 925.4 [M+Na] + .
5. Получение 5'-((3-малеидопропанамидо)-Val-Aka-n-амининобензилокси)-S-деокси-аманинамида (HDP 30.2602)5. Preparation of 5'-((3-maleidopropanamido)-Val-Aka-n-amininobenzyloxy)-S-deoxy-amaninamide (HDP 30.2602)
Стадия 1. HDP 30.2563
S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамид HDP 30.2548 (9,66 мг, 10,7 мкмоль) и HDP 30.1690 (WO 2016/142049, 50,2 мг, 85,6 мкмоль = 8,0 эквив.) растворяли в 500 мкл сухого диметилацетамида (DMA). Добавляли 1,0 М раствор гидрокарбоната цезия в воде (17,12 мкл, 1,6 эквив.) одной порцией и смесь взбалтывали при комнатной температуре.S-deoxy-5'-hydroxy-amaninamide HDP 30.2548 (9.66 mg, 10.7 µmol) and HDP 30.1690 (WO 2016/142049, 50.2 mg, 85.6 µmol = 8.0 equiv) were dissolved in 500 µl dry dimethylacetamide (DMA). A 1.0 M solution of cesium hydrogen carbonate in water (17.12 μl, 1.6 equiv.) was added in one portion and the mixture was shaken at room temperature.
Через 1,5 часа добавляли дополнительные порции по 17,12 мкл (1,6 эквив.) раствора карбоната цезия.After 1.5 hours, additional portions of 17.12 μl (1.6 equiv.) of cesium carbonate solution were added.
Через 8 часов реакционную смесь нейтрализовали уксусной кислотой, пропускали через центрифужный фильтр (0,2 мкМ) и очищали с помощью HPLC в колонке Phenomenex Luna-C18(2) 10 мкм (250×21,2 мм) с градиентом (5-100%) ацетонитрила в воде. Фракции продукта объединяли и приводили до 4,00 мг (26%) продукта в виде аморфного твердого вещества.After 8 hours, the reaction mixture was neutralized with acetic acid, passed through a centrifuge filter (0.2 μM) and purified by HPLC on a Phenomenex Luna-C 18 (2) 10 μm (250×21.2 mm) column with a gradient of (5-100 %) acetonitrile in water. The product fractions were combined and brought to 4.00 mg (26%) of the product as an amorphous solid.
MS (ESI+) [M+Na]+ - выявлено: 1430,58; рассчитано: 1430,65 (C65H97N13NaO18SSi).MS (ESI + ) [M+Na] + - detected: 1430.58; calculated: 1430.65 (C 65 H 97 N 13 NaO 18 SSi).
Стадия 2. HDP 30.2378
HDP 30.2563 (7,53 мг, 5,34 мкмоль) растворяли в 500 мкл смеси трифторуксусной кислоты/воды/триизопропилсилана 95:5:5. Через 5 минут летучие вещества удаляли in vacuo, остаток растворяли в 1000 мкл воды и каплями добавляли 3% аммиак, пока не достигали рН 10 и осаждения.HDP 30.2563 (7.53 mg, 5.34 µmol) was dissolved in 500 µl of a mixture of trifluoroacetic acid/water/triisopropylsilane 95:5:5. After 5 minutes, the volatiles were removed in vacuo, the residue was dissolved in 1000 μl of water and 3% ammonia was added dropwise until
Раствор сушили замораживанием и очищали с помощью препаративной HPLC последовательно (колонка Phenomenex Luna-C18(2), 10 мкм, 250×21,2 мм, градиента 20-30% ацетонитрила в воде (0,05% TFA) за 16 минут с получением 3,95 мг (57% на основе соли TFA) продукта.The solution was freeze-dried and purified by preparative HPLC sequentially (Phenomenex Luna-C 18 (2) column, 10 µm, 250×21.2 mm, gradient 20-30% acetonitrile in water (0.05% TFA) over 16 minutes with yielding 3.95 mg (57% based on TFA salt) of product.
MS (ESF) [M+H]+ - выявлено: 1178,50; рассчитано: 1178,53 (C54H76N13O15S).MS (ESF) [M+H] + - detected: 1178.50; calculated: 1178.53 (C 54 H 76 N 13 O 15 S).
Стадия 3. HDP 30.2602
HDP 30.2578 (3,95 мг, 3,06 мкмоль) растворяли в 400 мкл сухого DMF.HDP 30.2578 (3.95 mg, 3.06 µmol) was dissolved in 400 µl dry DMF.
Сложный эфир 3-(малеимидо)пропионовой кислоты и N-гидроксисукцинимида (BMPS, 1,63 мг, 2 эквив.) растворяли в 81,4 мкл DMF с последующим добавлением 2,1 мкл (2 эквив.) DIPEA.An ester of 3-(maleimido)propionic acid and N-hydroxysuccinimide (BMPS, 1.63 mg, 2 equiv.) was dissolved in 81.4 μl of DMF followed by the addition of 2.1 μl (2 equiv.) of DIPEA.
После взбалтывания в течение 2 часов реакционную смесь пропускали через центрифужный фильтр (0,2 мкм) и очищали с помощью RP-18 HPLC с градиентом 5-70% ацетонитрила в воде + 0,05% TFA. Чистые фракции выпаривали досуха и лиофилизировали из 2 мл ацетонитрила/воды 1:1 с получением 2,73 мг (67%) продукта в виде бесцветного порошка.After agitation for 2 hours, the reaction mixture was passed through a centrifuge filter (0.2 μm) and purified using RP-18 HPLC with a gradient of 5-70% acetonitrile in water + 0.05% TFA. Pure fractions were evaporated to dryness and lyophilized from 2 ml of acetonitrile/water 1:1 to give 2.73 mg (67%) of the product as a colorless powder.
MS (ESI+) [M+H]+ - выявлено: 1329,33; рассчитано: 1329,56 (C61H81N14O18S).MS (ESI+) [M+H] + - detected: 1329.33; calculated: 1329.56 (C 61 H 81 N 14 O 18 S).
С. Общий синтез S-дезокси-4'-гидрокси-аманинамидаC. General synthesis of S-deoxy-4'-hydroxy-amaninamide
1. Схематический вид синтеза цис,транс-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-4-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола; цис- и транс (цис,транс-4-ацетокси-Hpi)1. Schematic view of the synthesis of cis,trans-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3а-hydroxy-4-acetoxy-1,2,3,3а,8,8а-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole ; cis- and trans (cis,trans-4-acetoxy-Hpi)
2. Схематический вид синтеза S-дезокси-4'-гидрокси-аманинамида2. Schematic view of the synthesis of S-deoxy-4'-hydroxy-amaninamide
D. Общий синтез S-дезокси-7'-гидрокси-аманинамидаD. Total synthesis of S-deoxy-7'-hydroxy-amaninamide
1. Синтез цис,транс-1-(трет-бутоксикарбонил)-2-карбокси-3а-гидрокси-4-ацетокси-1,2,3,3а,8,8а-гексагидропирроло[2,3-b]индола; (цис,транс-4-ацетокси-Hpi)1. Synthesis of cis,trans-1-(tert-butoxycarbonyl)-2-carboxy-3a-hydroxy-4-acetoxy-1,2,3,3a,8,8a-hexahydropyrrolo[2,3-b]indole; (cis,trans-4-acetoxy-Hpi)
Синтез цис,транс-7-ацетокси-Hpi выполняли аналогично синтезу цис,транс-4-ацетокси-Hpi, исходя из коммерчески доступного 7-гидрокси-L-триптофана вместо 4-гидрокси-L-триптофана.The synthesis of cis,trans-7-acetoxy-Hpi was performed similarly to the synthesis of cis,trans-4-acetoxy-Hpi, starting from commercially available 7-hydroxy-L-tryptophan instead of 4-hydroxy-L-tryptophan.
2. Схематический вид синтеза S-дезокси-7'-гидрокси-аманинамида2. Schematic view of the synthesis of S-deoxy-7'-hydroxy-amaninamide
Синтез S-дезокси-7'-гидрокси-аманинамида выполняли аналогично синтезу S-дезокси-4'-гидрокси-аманинамида с использованием цис,транс-7-ацетокси-Hpi вместо цис,транс-4-ацетокси-Hpi.The synthesis of S-deoxy-7'-hydroxy-amaninamide was performed similarly to the synthesis of S-deoxy-4'-hydroxy-amaninamide using cis,trans-7-acetoxy-Hpi instead of cis,trans-4-acetoxy-Hpi.
6. In vitro цитотоксичность S-дезокси-α-аманитина HDP 30.0735 и S-дезокси-5'-гидрокси-аманинамида HDP 30.25486. In vitro cytotoxicity of S-deoxy-α-amanitin HDP 30.0735 and S-deoxy-5'-hydroxy-amanitin HDP 30.2548
Анализ клеточной пролиферации с помощью BrdU на клетках HEK293 и HEK293 ОАТР1В3BrdU cell proliferation assay on HEK293 and HEK293 OATP1B3 cells
Планшеты с культурой клеток HEK293-ОАТР1В3 покрывали поли-D-лизином.HEK293-OATP1B3 cell culture plates were coated with poly-D-lysine.
Покрытие поли-D-лизиномCoating with poly-D-lysine
5 мг поли-D-лизина в 50 мл стерильной воды5 mg poly-D-lysine in 50 ml sterile water
○ 50 мкл в каждую лунку 96-луночного планшета;○ 50 µl per well of a 96-well plate;
○ инкубация в течение 1 часа при RT;○ 1 hour incubation at RT;
○ промывание лунок два раза 200 мкл стерильной воды;○ wash the wells twice with 200 µl of sterile water;
○ сушка по меньшей мере в течение 2 часов (RT).○ drying for at least 2 hours (RT).
Готовили черные 96-луночные планшеты с прозрачным дном с 2,0×103 клеток HEK293 и HEK293 ОАТР1В3/лунка и 90 мкл среды для выращивания на лунку, включающей в себя 10% FCS и добавки. Контроли: «холостой» готовили с 100 мкл среды без клеток, «фоновый» и «100%» готовили с клетками в 100 мкл среды.Black 96-well clear bottom plates were prepared with 2.0×10 3 HEK293 and HEK293 OATP1B3 cells/well and 90 μl of growth medium per well containing 10% FCS and supplements. Controls: “blank” was prepared with 100 µl of medium without cells, “background” and “100%” were prepared with cells in 100 µl of medium.
• Инкубация в течение 24 часов при 37°С и 5% CO2.• Incubation for 24 hours at 37°C and 5% CO 2 .
Схема разбавления HDP 30.0735, HDP 30.2548 и альфа-аманитина Исходные растворы разбавляли 1:1000 (разбавление 1:10 и 1:100) в среде:Dilution scheme for HDP 30.0735, HDP 30.2548 and alpha-amanitin Stock solutions were diluted 1:1000 (1:10 and 1:100 dilutions) in medium:
10 мкл исходного раствора производного аманитина (1,0×10-2 М) + 90 мкл PBS=100 мкл 1,0×10-3 М;10 µl stock solution of amanitin derivative (1.0×10 -2 M) + 90 µl PBS=100 µl 1.0×10 -3 M;
2 мкл разбавления + 198 мкл среды = 200 мкл 1×10-5 М.2 µl dilution + 198 µl medium = 200
Дополнительные разбавленияAdditional dilutions
А: 200 мкл 1,0×10-5 М;A: 200 µl 1.0×10 -5 M;
В: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора А (разбавление 1:5);B: 80 µl growth medium + 20 µl solution A (1:5 dilution);
С: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора В (разбавление 1:5);C: 80 µl growth medium + 20 µl solution B (1:5 dilution);
D: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора С (разбавление 1:5);D: 80 µl growth medium + 20 µl solution C (1:5 dilution);
Е: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора D (разбавление 1:5);E: 80 µl growth medium + 20 µl solution D (1:5 dilution);
F: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора Е (разбавление 1:5);F: 80 µl growth medium + 20 µl solution E (1:5 dilution);
G: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора F (разбавление 1:5);G: 80 µl growth medium + 20 µl solution F (1:5 dilution);
Н: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора G (разбавление 1:5).H: 80 µl growth medium + 20 µl solution G (1:5 dilution).
10 мкл каждого раствора добавляли в лунку в трех повторностях.10 μl of each solution was added to the well in triplicate.
Конечный объем: 100 мкл/лунка.Final volume: 100 µl/well.
Конечная доза: исходная 1×10-6 М; серии разбавлений 1:5.Final dose: initial 1×10 -6 M; dilution series 1:5.
• Инкубация в течение 96 часов при 37°С и 5% CO2.• Incubation for 96 hours at 37°C and 5% CO 2 .
• После 96 часов: анализ пролиферации Roche Cell, люминесцентный, в соответствии с инструкциями изготовителя.• After 96 hours: Roche Cell proliferation assay, fluorescent, according to the manufacturer's instructions.
• Концентрации ЕС50 определяли с помощью программного обеспечения для анализа данных Graphpad Prism 4.0.• EC 50 concentrations were determined using Graphpad Prism 4.0 data analysis software.
7. Синтез HDP 30.2347, HDP 2371 и конъюгатов 30.26027. Synthesis of HDP 30.2347, HDP 2371 and conjugates 30.2602
Пример. Синтез T-D265C-30.2371Example. Synthesis T-D265C-30.2371
10 мг Thiomab T-D265C в PBS буфере использовали для конъюгации HDP 30.2371.10 mg Thiomab T-D265C in PBS buffer was used to conjugate HDP 30.2371.
Доведение раствора антитела до 1 мМ EDTABringing the antibody solution to 1 mM EDTA
2 мл раствора антитела (10,0 мг) + 20 мкл 100 мМ EDTA, рН 8,0; количество антитела: 10 мг = 6,9×10-8 моль.2 ml antibody solution (10.0 mg) + 20
Удаление кэппирования цистеинов с помощью реакции антитела с 40 эквив. ТСЕР:Removal of cysteine capping by antibody reaction with 40 equiv. TSER:
- 2 мл раствора антитела (6,9×10-8 моль) + 55,2 мкл 50 мМ раствора ТСЕР (2,76×10-6 моль);- 2 ml of antibody solution (6.9×10 -8 mol) + 55.2 μl of 50 mM TCEP solution (2.76×10 -6 mol);
- инкубировали в течение 3 часов при 37°С на шейкере;- incubated for 3 hours at 37°C on a shaker;
- два последовательных диализа при 4°С в 2,0 л 1 × PBS, 1 мМ EDTA, рН 7,4, в кассетах для диализа Slide-A-Lyzer 20,000 MWCO, первый диализ - приблизительно 4 часа, второй диализ - на протяжении ночи.- two consecutive dialysis at 4°C in 2.0
Окисление с помощью реакции антитела с 20 эквив. дегидроаскорбиновой кислоты (dhAA):Oxidation by antibody reaction with 20 equiv. dehydroascorbic acid (dhAA):
- приблизительно 2 мл раствора антитела (6,9×10-8 моль) + 27,6 мкл свежего 50 мМ раствора dhAA (1,38×10-6 моль);- approximately 2 ml of antibody solution (6.9×10 -8 mol) + 27.6 µl of fresh 50 mM dhAA solution (1.38×10 -6 mol);
- инкубировали в течение 3 часов при RT не шейкере.- incubated for 3 hours at RT on a shaker.
Конъюгация с аманитином с использованием 6 эквив. HDP 30.2371 и гашение 25 эквив. N-ацетил-L-цистеина.Conjugation with amanitin using 6 equiv. HDP 30.2371 and blanking 25 equiv. N-acetyl-L-cysteine.
Солюбилизировали 2 мг HDP 30.2371 в 200 мкл DMSO = 10 мкг/мкл;
- приблизительно 2 мл раствора антитела (= 9,5 мг; 6,53×10-8 моль) + 52,1 мкл HDP 30.2371 (= 520,8 мкг; 3,92×10-7 моль);- approximately 2 ml of antibody solution (= 9.5 mg; 6.53×10 -8 mol) + 52.1 μl of HDP 30.2371 (= 520.8 μg; 3.92×10 -7 mol);
- инкубировали в течение 1 часа при RT;- incubated for 1 hour at RT;
- гасили путем добавления 16,3 мкл 100 мМ N-ацетил-L-цистеина (1,63×10-6 моль);- extinguished by adding 16.3 μl of 100 mm N-acetyl-L-cysteine (1.63×10 -6 mol);
- инкубировали в течение 15 минут при RT (или на протяжении ночи при 4°С);- incubated for 15 minutes at RT (or overnight at 4°C);
- очищали реакционную смесь с помощью колонок 1 × PD-10, уравновешенных с помощью 1 × PBS, рН 7,4; идентифицировали включающие белок фракции с помощью реагента Брэдфорда на парапленке и объединяли включающие белок фракции вместе;- purified the reaction
- диализ раствора антитела при 4°С на протяжении ночи в 2,0 л PBS, рН 7,4, и в кассетах для диализа Slide-A-Lyzer 20,000 MWCO;dialysis of the antibody solution at 4° C. overnight in 2.0 L of PBS, pH 7.4, and in Slide-A-Lyzer 20,000 MWCO dialysis cassettes;
- определение DAR с помощью анализа LC-ESI-MS.- DAR determination by LC-ESI-MS analysis.
Доводили концентрацию белка до 5,0 мг/мл (3,4×10-5 М) и доводили до стерильных состояний с помощью фильтрации. Хранили при 4°С.The protein concentration was brought to 5.0 mg/ml (3.4×10 -5 M) and brought to sterile conditions using filtration. Stored at 4°C.
Получали ADC с другим антителом или с другим производным аманитина, соответственно. Молекулярное количество антитела рассчитывали по MW соответствующего антитела. Количества линкерного токсина, ТСЕР, dhAA, N-ацетил-L-цистеина корректировали соответствующим образом, чтобы достичь соответствующих эквивалентов.Received ADC with a different antibody or with a different derivative of amanitin, respectively. The molecular amount of the antibody was calculated from the MW of the corresponding antibody. The amounts of linker toxin, TCEP, dhAA, N-acetyl-L-cysteine were adjusted accordingly to achieve appropriate equivalents.
8. In vitro цитотоксичность HDP 30.2347, HDP 2371 и конъюгатов 30.26028. In vitro cytotoxicity of HDP 30.2347, HDP 2371 and 30.2602 conjugates
Анализ клеточной пролиферации с помощью BrdU на клетках SKBR-3, JIMT-1, LnCap и 22rv1BrdU cell proliferation assay on SKBR-3, JIMT-1, LnCap and 22rv1 cells
Анализ выполняли, как описано выше (6) со следующими изменениями.The analysis was performed as described above (6) with the following modifications.
Планшеты с культурой клеток не покрывали поли-D-лизином.Cell culture plates were not coated with poly-D-lysine.
• Схема разбавления ADC.• ADC dilution scheme.
• Исходные растворы разбавляли до 1,0×10-6 М средой для выращивания.• Stock solutions were diluted to 1.0×10 -6 M with growth medium.
Дополнительные разбавленияAdditional dilutions
А: 100 мкл 1,0×10-6 М;A: 100 µl 1.0×10 -6 M;
В: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора А (разбавление 1:5);B: 80 µl growth medium + 20 µl solution A (1:5 dilution);
С: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора В (разбавление 1:5);C: 80 µl growth medium + 20 µl solution B (1:5 dilution);
D: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора С (разбавление 1:5);D: 80 µl growth medium + 20 µl solution C (1:5 dilution);
Е: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора D (разбавление 1:5);E: 80 µl growth medium + 20 µl solution D (1:5 dilution);
F: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора Е (разбавление 1:5);F: 80 µl growth medium + 20 µl solution E (1:5 dilution);
G: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора F (разбавление 1:5);G: 80 µl growth medium + 20 µl solution F (1:5 dilution);
Н: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора G (разбавление 1:5).H: 80 µl growth medium + 20 µl solution G (1:5 dilution).
• Добавляли 10 мкл каждого раствора в лунку в трех повторностях. Конечный объем: 100 мкл/лунка.• Add 10 µl of each solution per well in triplicate. Final volume: 100 µl/well.
Конечная доза: исходная 1×10-7 М; серии разбавлений 1:5.Final dose: initial 1×10 -7 M; dilution series 1:5.
Анализ WST-I на клетках Raji и клетках Nalm-6WST-I analysis on Raji cells and Nalm-6 cells
• Готовили 96-луночные планшеты с прозрачным F-образным дном с 2,0×103 клеток/лунка и 90 мкл соответствующей среды для выращивания на лунку, включающей в себя 10% FCS и добавки. Контроли: «холостой» готовили с 100 мкл среды без клеток;• 96-well F-bottom clear-bottom plates were prepared at 2.0 x 10 3 cells/well and 90 µl of appropriate growth medium per well containing 10% FCS and supplements. Controls: "blank" was prepared with 100 μl of medium without cells;
«только с клетками» готовили с клетками в 100 мкл среды."with cells only" was prepared with cells in 100 μl of medium.
• Инкубация в течение 24 часов при 37°С и 5% CO2.• Incubation for 24 hours at 37°C and 5% CO 2 .
• Схема Разбавления ADC:• ADC Dilution Scheme:
• Исходные растворы разбавляли до 1,0×10-6 М средой для выращивания.• Stock solutions were diluted to 1.0×10 -6 M with growth medium.
Дополнительные разбавленияAdditional dilutions
А: 100 мкл 1,0×10-6 М;A: 100 µl 1.0×10 -6 M;
В: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора А (разбавление 1:5);B: 80 µl growth medium + 20 µl solution A (1:5 dilution);
С: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора В (разбавление 1:5);C: 80 µl growth medium + 20 µl solution B (1:5 dilution);
D: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора С (разбавление 1:5);D: 80 µl growth medium + 20 µl solution C (1:5 dilution);
Е: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора D (разбавление 1:5);E: 80 µl growth medium + 20 µl solution D (1:5 dilution);
F: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора Е (разбавление 1:5);F: 80 µl growth medium + 20 µl solution E (1:5 dilution);
G: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора F (разбавление 1:5);G: 80 µl growth medium + 20 µl solution F (1:5 dilution);
Н: 80 мкл среды для выращивания + 20 мкл раствора G (разбавление 1:5).H: 80 µl growth medium + 20 µl solution G (1:5 dilution).
• 10 мкл каждого раствора добавляли в лунку в трех повторностях. Конечный объем: 100 мкл/лунка.• 10 µl of each solution was added to the well in triplicate. Final volume: 100 µl/well.
Конечная доза: исходная 1×10-7 М; серии разбавлений 1:5.Final dose: initial 1×10 -7 M; dilution series 1:5.
• Инкубация в течение 96 часов при 37°С и 5% CO2.• Incubation for 96 hours at 37°C and 5% CO 2 .
• После 96 часов: анализ пролиферации Roche Cell, люминесцентный, в соответствии с инструкциями изготовителя.• After 96 hours: Roche Cell proliferation assay, fluorescent, according to the manufacturer's instructions.
• Концентрации ЕС50 определяли с помощью программного обеспечения для анализа данных Graphpad Prism 4.0.• EC 50 concentrations were determined using Graphpad Prism 4.0 data analysis software.
Claims (36)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP17185182.7 | 2017-08-07 | ||
EP17185182 | 2017-08-07 | ||
PCT/EP2018/071268 WO2019030173A1 (en) | 2017-08-07 | 2018-08-06 | Novel method for synthesizing amanitins |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020105484A RU2020105484A (en) | 2021-08-05 |
RU2020105484A3 RU2020105484A3 (en) | 2021-09-13 |
RU2792210C2 true RU2792210C2 (en) | 2023-03-20 |
Family
ID=
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2014043403A1 (en) * | 2012-09-12 | 2014-03-20 | Agensys, Inc. | Amatoxin derivatives and cell-permeable conjugates thereof as inhibitors of rna polymerase |
RU2013145314A (en) * | 2011-03-10 | 2015-04-20 | Хайдельберг Фарма Гмбх | AMATOXIN CONJUGATES WITH IMPROVED CONNECTIONS |
RU2575854C2 (en) * | 2011-03-10 | 2016-02-20 | Хайдельберг Фарма Гмбх | Amatoxin conjugates with improved bonds |
RU2601411C2 (en) * | 2010-09-30 | 2016-11-10 | Хайдельберг Фарма Гмбх | Amatoxin-conjugates with improved linkers |
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2601411C2 (en) * | 2010-09-30 | 2016-11-10 | Хайдельберг Фарма Гмбх | Amatoxin-conjugates with improved linkers |
RU2013145314A (en) * | 2011-03-10 | 2015-04-20 | Хайдельберг Фарма Гмбх | AMATOXIN CONJUGATES WITH IMPROVED CONNECTIONS |
RU2575854C2 (en) * | 2011-03-10 | 2016-02-20 | Хайдельберг Фарма Гмбх | Amatoxin conjugates with improved bonds |
WO2014043403A1 (en) * | 2012-09-12 | 2014-03-20 | Agensys, Inc. | Amatoxin derivatives and cell-permeable conjugates thereof as inhibitors of rna polymerase |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
MASAKO NAKAGAWA ET AL., "DYE-SENSITIZED PHOTO-OXYGENATION OF TRYPTOPHAN", TETRAHEDRON, ELSEVIER SCIENCE PUBLISHERS, AMSTERDAM, NL, (19850101), vol. 41, no. 11, doi:10.1016/S0040-4020(01)96583-4, ISSN 0040-4020, pages 2125 - 2132. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7362714B2 (en) | Amanitin conjugate | |
US11702451B2 (en) | Method for synthesizing amanitins | |
US11926631B2 (en) | Method of treating cancer using amanitin derivatives | |
RU2792210C2 (en) | New method for synthesis of amanitines | |
HK40027101B (en) | Novel method for synthesizing amanitins | |
HK40027101A (en) | Novel method for synthesizing amanitins | |
HK40001730A (en) | Amanitin conjugates | |
HK40001730B (en) | Amanitin conjugates |