RU2162857C2 - Димер "клеверного" пептида - Google Patents
Димер "клеверного" пептида Download PDFInfo
- Publication number
- RU2162857C2 RU2162857C2 RU97104484/13A RU97104484A RU2162857C2 RU 2162857 C2 RU2162857 C2 RU 2162857C2 RU 97104484/13 A RU97104484/13 A RU 97104484/13A RU 97104484 A RU97104484 A RU 97104484A RU 2162857 C2 RU2162857 C2 RU 2162857C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- clover
- peptide
- itf
- rat
- human
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 115
- 241000219793 Trifolium Species 0.000 title claims abstract description 85
- 239000000539 dimer Substances 0.000 title claims abstract description 45
- 101100481012 Homo sapiens TFF3 gene Proteins 0.000 claims abstract description 49
- 101100424932 Rattus norvegicus Tff3 gene Proteins 0.000 claims abstract description 44
- 239000000178 monomer Substances 0.000 claims abstract description 28
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims abstract description 15
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 9
- 230000035876 healing Effects 0.000 claims abstract description 8
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 claims abstract description 6
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims abstract description 5
- 208000008469 Peptic Ulcer Diseases 0.000 claims abstract description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims abstract description 4
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 claims abstract description 3
- 208000011906 peptic ulcer disease Diseases 0.000 claims abstract 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 23
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 15
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 12
- 108010088412 Trefoil Factor-1 Proteins 0.000 claims description 9
- 102000008817 Trefoil Factor-1 Human genes 0.000 claims description 9
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 claims 2
- 230000009854 mucosal lesion Effects 0.000 claims 2
- 230000003902 lesion Effects 0.000 claims 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 claims 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 abstract description 43
- 101000889443 Homo sapiens Trefoil factor 1 Proteins 0.000 abstract description 27
- 230000006378 damage Effects 0.000 abstract description 16
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 12
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 abstract description 6
- 208000014674 injury Diseases 0.000 abstract description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 42
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 29
- 102100039175 Trefoil factor 1 Human genes 0.000 description 25
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 24
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 20
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 19
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 19
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 19
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- UZGKAASZIMOAMU-UHFFFAOYSA-N 124177-85-1 Chemical compound NP(=O)=O UZGKAASZIMOAMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 13
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 12
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 10
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 10
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 10
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 10
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 9
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 9
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 9
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 9
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 9
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 9
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 9
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 8
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 8
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 8
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 8
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 8
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 8
- 241000228245 Aspergillus niger Species 0.000 description 7
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 7
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 7
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 7
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical group SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 6
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 6
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 6
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 5
- 240000006439 Aspergillus oryzae Species 0.000 description 5
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 5
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 5
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 5
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 5
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 4
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 4
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 4
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 4
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 description 4
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 4
- 229940024171 alpha-amylase Drugs 0.000 description 4
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 4
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 4
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 4
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 4
- CGIGDMFJXJATDK-UHFFFAOYSA-N indomethacin Chemical compound CC1=C(CC(O)=O)C2=CC(OC)=CC=C2N1C(=O)C1=CC=C(Cl)C=C1 CGIGDMFJXJATDK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 4
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 description 3
- 102100022624 Glucoamylase Human genes 0.000 description 3
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 3
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 3
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 3
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 3
- 241000235403 Rhizomucor miehei Species 0.000 description 3
- 208000007107 Stomach Ulcer Diseases 0.000 description 3
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 3
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 3
- -1 aromatic amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 3
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 3
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 3
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 1-monostearoylglycerol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)CO VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IZHVBANLECCAGF-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3-(octadecanoyloxy)propyl octadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC IZHVBANLECCAGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KFDVPJUYSDEJTH-UHFFFAOYSA-N 4-ethenylpyridine Chemical compound C=CC1=CC=NC=C1 KFDVPJUYSDEJTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100034042 Alcohol dehydrogenase 1C Human genes 0.000 description 2
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 2
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 2
- 241000351920 Aspergillus nidulans Species 0.000 description 2
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 101000796894 Coturnix japonica Alcohol dehydrogenase 1 Proteins 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000780463 Homo sapiens Alcohol dehydrogenase 1C Proteins 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000235347 Schizosaccharomyces pombe Species 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010007389 Trefoil Factors Proteins 0.000 description 2
- 102000007641 Trefoil Factors Human genes 0.000 description 2
- 241000223259 Trichoderma Species 0.000 description 2
- IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N WHWLQLKPGQPMY Chemical group C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CNC=N1 IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 2
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000002921 anti-spasmodic effect Effects 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000000812 cholinergic antagonist Substances 0.000 description 2
- 239000011162 core material Substances 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 230000000447 dimerizing effect Effects 0.000 description 2
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 230000004890 epithelial barrier function Effects 0.000 description 2
- 210000005081 epithelial layer Anatomy 0.000 description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 2
- 101150021650 gluA gene Proteins 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 2
- 238000010874 in vitro model Methods 0.000 description 2
- 229960000905 indomethacin Drugs 0.000 description 2
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 2
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 2
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 239000001788 mono and diglycerides of fatty acids Substances 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 210000000664 rectum Anatomy 0.000 description 2
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 2
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000012439 solid excipient Substances 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 2
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- TUQOTMZNTHZOKS-UHFFFAOYSA-N tributylphosphine Chemical compound CCCCP(CCCC)CCCC TUQOTMZNTHZOKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 2
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- 101150084750 1 gene Proteins 0.000 description 1
- LDVVTQMJQSCDMK-UHFFFAOYSA-N 1,3-dihydroxypropan-2-yl formate Chemical group OCC(CO)OC=O LDVVTQMJQSCDMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CYDQOEWLBCCFJZ-UHFFFAOYSA-N 4-(4-fluorophenyl)oxane-4-carboxylic acid Chemical compound C=1C=C(F)C=CC=1C1(C(=O)O)CCOCC1 CYDQOEWLBCCFJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 5,8-dihydroxy-2-methoxy-6-methyl-7-(2-oxopropyl)naphthalene-1,4-dione Chemical compound CC1=C(CC(C)=O)C(O)=C2C(=O)C(OC)=CC(=O)C2=C1O UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 5-oxo-L-proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000215068 Acacia senegal Species 0.000 description 1
- 101800002326 Adipokinetic hormone Proteins 0.000 description 1
- 229910002012 Aerosil® Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004580 Aspartic Acid Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010017640 Aspartic Acid Proteases Proteins 0.000 description 1
- 101710082738 Aspartic protease 3 Proteins 0.000 description 1
- 241001513093 Aspergillus awamori Species 0.000 description 1
- 241000228257 Aspergillus sp. Species 0.000 description 1
- 101150071434 BAR1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108091005658 Basic proteases Proteins 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101100280051 Brucella abortus biovar 1 (strain 9-941) eryH gene Proteins 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000005367 Carboxypeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010006303 Carboxypeptidases Proteins 0.000 description 1
- 241000193163 Clostridioides difficile Species 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 description 1
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 description 1
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-M Formate Chemical compound [O-]C=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 description 1
- 241000223221 Fusarium oxysporum Species 0.000 description 1
- 208000018522 Gastrointestinal disease Diseases 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 229920000084 Gum arabic Polymers 0.000 description 1
- 101100295959 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) arcB gene Proteins 0.000 description 1
- 241000125500 Hedypnois rhagadioloides Species 0.000 description 1
- 241000167880 Hirundinidae Species 0.000 description 1
- 101000741885 Homo sapiens Protection of telomeres protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000801742 Homo sapiens Triosephosphate isomerase Proteins 0.000 description 1
- 108010000521 Human Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- 241001135569 Human adenovirus 5 Species 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 description 1
- 108700001097 Insect Genes Proteins 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 1
- 241000235649 Kluyveromyces Species 0.000 description 1
- 241001138401 Kluyveromyces lactis Species 0.000 description 1
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241000235087 Lachancea kluyveri Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 241000255777 Lepidoptera Species 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241000255908 Manduca sexta Species 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-N Metaphosphoric acid Chemical compound OP(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000168 Microcrystalline cellulose Polymers 0.000 description 1
- 101100235161 Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) lerI gene Proteins 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 241000221960 Neurospora Species 0.000 description 1
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 101100378536 Ovis aries ADRB1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 1
- 101710182846 Polyhedrin Proteins 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 102100038745 Protection of telomeres protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000015634 Rectal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- 101100319895 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) YAP3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100160515 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) YPS1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000235346 Schizosaccharomyces Species 0.000 description 1
- 108091058545 Secretory proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000040739 Secretory proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 101710084578 Short neurotoxin 1 Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 101150033985 TPI gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- 241000223258 Thermomyces lanuginosus Species 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 101710182532 Toxin a Proteins 0.000 description 1
- 241000255993 Trichoplusia ni Species 0.000 description 1
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 description 1
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 description 1
- 102100033598 Triosephosphate isomerase Human genes 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 241000269368 Xenopus laevis Species 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000205 acacia gum Substances 0.000 description 1
- 235000010489 acacia gum Nutrition 0.000 description 1
- 230000001133 acceleration Effects 0.000 description 1
- 108010048241 acetamidase Proteins 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 235000010419 agar Nutrition 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 238000012867 alanine scanning Methods 0.000 description 1
- 101150069003 amdS gene Proteins 0.000 description 1
- 238000003277 amino acid sequence analysis Methods 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 101150008194 argB gene Proteins 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 210000004082 barrier epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 239000006172 buffering agent Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- OSGAYBCDTDRGGQ-UHFFFAOYSA-L calcium sulfate Chemical compound [Ca+2].[O-]S([O-])(=O)=O OSGAYBCDTDRGGQ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000012292 cell migration Effects 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 239000012461 cellulose resin Substances 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- ZNEWHQLOPFWXOF-UHFFFAOYSA-N coenzyme M Chemical compound OS(=O)(=O)CCS ZNEWHQLOPFWXOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940075614 colloidal silicon dioxide Drugs 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 102000038379 digestive enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108091007734 digestive enzymes Proteins 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 208000000718 duodenal ulcer Diseases 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 239000006167 equilibration buffer Substances 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 239000007888 film coating Substances 0.000 description 1
- 238000009501 film coating Methods 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 210000001156 gastric mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 201000005917 gastric ulcer Diseases 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 229940074045 glyceryl distearate Drugs 0.000 description 1
- 229940075507 glyceryl monostearate Drugs 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 235000010979 hydroxypropyl methyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 229920003088 hydroxypropyl methyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 208000028774 intestinal disease Diseases 0.000 description 1
- 210000005026 intestinal epithelial barrier Anatomy 0.000 description 1
- 210000004347 intestinal mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000010829 isocratic elution Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 238000004989 laser desorption mass spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 230000002045 lasting effect Effects 0.000 description 1
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 101150039489 lysZ gene Proteins 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 229960004635 mesna Drugs 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 235000019813 microcrystalline cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 239000008108 microcrystalline cellulose Substances 0.000 description 1
- 229940016286 microcrystalline cellulose Drugs 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 101150095344 niaD gene Proteins 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Polymers 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 108010056579 pancreatic spasmolytic polypeptide Proteins 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 230000009268 pathologic speech processing Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 239000001814 pectin Substances 0.000 description 1
- 235000010987 pectin Nutrition 0.000 description 1
- 229920001277 pectin Polymers 0.000 description 1
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 229920002704 polyhistidine Polymers 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 208000032207 progressive 1 supranuclear palsy Diseases 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 101150054232 pyrG gene Proteins 0.000 description 1
- 229940079889 pyrrolidonecarboxylic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 206010038038 rectal cancer Diseases 0.000 description 1
- 201000001275 rectum cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 235000002020 sage Nutrition 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001540 sodium lactate Substances 0.000 description 1
- 235000011088 sodium lactate Nutrition 0.000 description 1
- 229940005581 sodium lactate Drugs 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 1
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 1
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 1
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 1
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000012222 talc Nutrition 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 101150080369 tpiA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
- A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
Изобретение касается димеров "клеверных" пептидов. "Клеверный" пептид содержит единственный домен в форме клеверного листа и представляет собой ITF человека или ITF крысы или pS2 человека или pS2 крысы. Пептид находится в форме димера, в котором два идентичных мономера соединены дисульфидной связью между двумя остатками цистеина. Молекулярный вес пептида около 13000. Культивируют подходящую клетку-хозяина, трансформированную ДНК, кодирующей ITF человека или крысы или pS2 человека или крысы и отделяют димерную форму от мономерной. Фармацевтическая композиция включает "клеверный" пептид и фармацевтически приемлемый разбавитель. Изобретение позволяет на основе димерных форм "клеверных" пептидов получать лекарства, используемые для заживления повреждений слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта, например пептической язвы. 11 с. и 4 з.п. ф-лы, 9 ил., 2 табл.
Description
Изобретение касается димеров "клеверных" пептидов, способов получения димеров "клеверных" пептидов, фармацевтических составов, включающих димеры "клеверных пептидов", и их применения для лечения желудочно-кишечных расстройств.
"Клеверные" пептиды образуют семейство пептидов, обнаруживаемых в основном в желудочно-кишечном тракте. "Клеверные" пептиды млекопитающих содержат один или более характерных доменов в форме клеверного листа [1], каждый из которых собран из аминокислотной последовательности, состоящей из 38 или 39 аминокислотных остатков, в которой 6 остатков полуцистина соединены в сочетании 1-5, 2-4 и 3-6, образуя таким образом характерную структуру в виде клеверного листа.
Известные к настоящему времени "клеверные" пептиды млекопитающих содержат или один, или два домена в форме клеверного листа (см. обзоры [3-5]), в то время как для лягушки Xenopus laevis описаны пептиды и белки, содержащие один [6], два [7], четыре [8] или шесть [9] доменов в форме клеверного листа. "Клеверными" пептидами млекопитающих, содержащими один домен, являются связанный с раком молочной железы pS2-пептид, известный к настоящему времени для человека [10, 11] и мыши [12], и кишечный "клеверный" фактор (ITF) человека [13, 14] и крысы [15, 16]. Для человека [17], свиньи [18] и мыши [17] описан спазмолитический полипептид (SP), содержащий два домена в форме клеверного листа. У людей все три "клеверных" пептида - hpS2, hITF и hSP - экспрессируются в норме в желудочно-кишечном тракте: hSP и hpS2 - в эпителиальном слое слизистой оболочки желудка [17, 19], a hITF - в эпителиальном слое слизистой оболочки тонкой и толстой кишки [13].
Физиологическая роль "клеверных" пептидов не очень хорошо выяснена. Сообщалось об усилении экспрессии "клеверных" пептидов в желудочно-кишечном тракте для ряда состояний, связанных с повреждением слизистой оболочки, таких как воспаление кишечника [20-22], язва желудка и двенадцатиперстной кишки [20, 23, 24]. На основании этих данных была предложена репаративная функция "клеверных" пептидов (например, в [22]). Недавно авторами работ [25-27] было получено доказательство ускорения восстановления поврежденной эпителиальной слизистой оболочки в результате действия "клеверных" пептидов. Механизм, с помощью которого "клеверные" пептиды способствуют выполнению их репаративной функции, может заключаться в образовании сшивок между муциновыми гликопротеинами с формированием вязкоупругого гелевого слоя, устойчивого к действию ферментов пищеварения [3, 28].
Клонирование однодоменного "клеверного" фактора кишечника крысы и человека и его применение для лечения повреждений желудочно-кишечного тракта описаны [29].
Обнаружена возможность получения димеров "клеверных" факторов, имеющих только один домен в форме клеверного листа и обладающих интересными фармакологическими свойствами.
В соответствии с этим настоящее изобретение касается "клеверного" пептида, содержащего единственный домен в форме клеверного листа и существующего в виде димера.
Как отмечено выше, предполагают, что "клеверные" пептиды способствуют заживлению пептических язв и других повреждений, относящихся к слизистой оболочке, благодаря стабилизации слизистого слоя кишечного тракта. Механизм подобной стабилизации в настоящее время не известен. Тем не менее рентгено-структурный анализ (ср. [28]) панкреатического спазмолитического полипептида (PSP) свиньи, образующего два домена в форме клеверного листа, показал, что большинство имеющихся в наличии аминокислотных остатков принимают участие в формировании щели шириной 8-10 обнаруживаемой в каждом таком домене. Предварительные эксперименты показали, что эта щель способна вмещать часть олигосахаридной цепи, например углевода, связанного с муциновым гликопротеином. Если это так, то PSP с двумя подобными щелями могут сшивать молекулы муцинов друг с другом, помогая им образовывать защитный гель, покрывающий эпителий слизистой оболочки. Сейчас неизвестно, образуют ли in vivo димеры для осуществления схожей функции однодоменные "клеверные" пептиды (такие, как IFT и pS2) или у них другой механизм действия. Тем не менее в настоящее время считается, что димеры таких "клеверных" пептидов действительно могут сшивать молекулы муцинов, являясь поэтому активной формой этих пептидов.
Другой аспект настоящего изобретения касается способа получения димера "клеверного" пептида, содержащего единичный домен в форме клеверного листа, способ, включающий культивирование соответствующих клеток-хозяев, трансформированных ДНК с последовательностью, кодирующей "клеверный" пептид, содержащий один домен в форме клеверного листа, в условиях, позволяющих наработку пептида, и выделение из культуры образующегося димера "клеверного" пептида.
Следующий аспект настоящего изобретения касается фармацевтических составов, включающих димер "клеверного" пептида, содержащий единственный домен в форме клеверного листа, совместно с фармацевтически приемлемым разбавителем или носителем.
Еще один аспект настоящего изобретения касается применения димера "клеверного" пептида, содержащего один домен в форме клеверного листа, в качестве лекарства и использования димера "клеверного" пептида, содержащего один домен в форме клеверного листа, для получения лекарства с целью профилактики и лечения желудочно-кишечных расстройств.
Димером "клеверного" фактора может быть, в частности, димер кишечного "клеверного" фактора (ITF) или пептида, связанного с раком молочной железы (pS2).
В частности, "клеверным" фактором является человеческий ITF, последовательность аминокислот мономера которого выглядит следующим образом:
ZEYVGLSANQCAVPAKDRVDCGYPHVTPKECNNRGCCFDSRIPGVPWCFKPLQEAECTF, где Z представляет собой остаток Glu, Gln или pyrGlu, или его гомолог, способный димеризоваться и проявляющий схожую активность;
или человеческий pS2, последовательность аминокислот мономера которого выглядит следующим образом:
ZAQTETCTVAPRERQNCGFPGVTPSQCANKGCCFDDTVRGVPWCFYPNTIDVPPEEECEF,
где Z представляет собой остаток Glu, Gln или pyrGlu, или его гомолог, способный димеризоваться и проявляющий схожую активность.
ZEYVGLSANQCAVPAKDRVDCGYPHVTPKECNNRGCCFDSRIPGVPWCFKPLQEAECTF, где Z представляет собой остаток Glu, Gln или pyrGlu, или его гомолог, способный димеризоваться и проявляющий схожую активность;
или человеческий pS2, последовательность аминокислот мономера которого выглядит следующим образом:
ZAQTETCTVAPRERQNCGFPGVTPSQCANKGCCFDDTVRGVPWCFYPNTIDVPPEEECEF,
где Z представляет собой остаток Glu, Gln или pyrGlu, или его гомолог, способный димеризоваться и проявляющий схожую активность.
Гомологи ITF и pS2 охватывают пептиды с тем же самым характером расположения остатков цистеина и дисульфидных связей (фиг. 1) и определенной степенью гомологии (в смысле либо идентичности аминокислотных остатков в соответствующих положениях, либо наличия консервативных замен) в петлях 1, 2 и 3. Гомология аминокислотной последовательности в области петель может варьировать в интервале от 1 до 10 аминокислотных остатков, а число аминокислотных остатков в каждой петле (кроме остатков цистеина) - от 7 до 12, предпочтительно - от 9 до 10.
Гомологи ITF и pS2 могут содержать одну или более аминокислотных замен, делеций или вставок. Преимущественная природа этих изменений такова, что они не влияют в значительной мере на сворачиваемость и активность белка. Размер небольших делеций обычно составляет от 1 до 3 аминокислотных остатков в области петель и от 1 до 10 аминокислотных остатков в N- и C-концевых областях; возможны одиночные амино- и карбоксиконцевые добавки, такие как аминоконцевой остаток метионина, небольшой линкерный пептид до 10 аминокислотных остатков или небольшая добавка, облегчающая очистку, такая как полигистидиновый тракт, антигенный эпитоп или связывающий домен (общие принципы см. в [30] ). Примерами консервативных замен могут быть замены в рамках группы основных аминокислот (например, аргинина, лизина, гистидина), кислых аминокислот (например, глутаминовой и аспарагиновой аминокислот), полярных аминокислот (например, глутамина и аспарагина), гидрофобных аминокислот (например, лейцина, изолейцина, валина), ароматических аминокислот (например, фенилаланина, триптофана, тирозина) и аминокислот с небольшим размером бокового радикала (например, глицина, аланина, серина, треонина, метионина).
Для специалистов в данной области должно быть очевидным, что подобные замены могут быть проведены вне областей, отвечающих за функцию молекулы, в результате чего получается по-прежнему активный полипептид. Существенные для активности настоящих "клеверных" пептидов аминокислоты могут быть идентифицированы в соответствии с известными специалистам методиками, такими как сайт-специфический и аланин-сканирующий мутагенез [31]. В последнем случае мутации вводят в каждый из аминокислотных остатков молекулы и получаемые мутантные молекулы проверяют на биологическую активность (например, на заживление слизистой оболочки, защиту слизистой оболочки, заживление язвы желудка) с целью идентификации тех аминокислотных остатков, которые отвечают за активность молекулы.
Возможен аллельный вариант гомолога, т.е. альтернативная форма гена, которая получается в результате мутации, или измененный пептид, кодируемый мутантным геном, но обладающий по существу такой же активностью как настоящий пептид. Следовательно, мутации могут быть "молчащие" (никаких изменений в кодируемом пептиде) или могут кодировать пептид с измененной аминокислотной последовательностью.
Гомологом настоящего "клеверного" пептида кроме этого может быть видовой гомолог, т.е. полипептид со схожей активностью, происходящий из другого вида, например из мыши, крысы, кролика, коровы, свиньи или лягушки.
В предпочтительном воплощении димер "клеверного" пептида по изобретению имеет значение молекулярного веса приблизительно 13000. Димер состоит из двух мономерных "клеверных" пептидов, связанных дисульфидной связью между двумя остатками цистеина в положении 57 для ITF-подобных мономеров или в положении 58 для рS2-подобных мономеров.
Предпочтительным является получение димера "клеверного" пептида с помощью технологии рекомбинантной ДНК. С этой целью последовательность ДНК, кодирующая "клеверный" пептид, может быть выделена посредством создания библиотеки геномной или кДНК и поиска в соответствии со стандартными методиками с помощью гибридизации с синтетическими олигонуклеотидными зондами [32] последовательности ДНК, кодирующей пептид целиком или частично. Предпочтительной в рамках настоящего изобретения является кодирующая пептид последовательность ДНК человеческого происхождения, т.е. из библиотеки геномной ДНК или кДНК человека.
Последовательность ДНК, кодирующую "клеверный" пептид, также можно получить путем химического синтеза с помощью традиционных стандартных методов, например фосфоамида(и)тного метода, описанного в [33], или метода, изложенного в [34]. В соответствии с фосфоамида(и)тным методом олигонуклеотиды синтезируются, например, в автоматическом ДНК-синтезаторе, затем очищаются, отжигаются, лигируются и клонируются в подходящих векторах.
Последовательность ДНК также может быть получена с помощью полимеразной цепной реакции с применением специфических праймеров, как, например, описано в [35, 36] или упомянутой выше работе [32].
Последовательность ДНК, кодирующую "клеверный" пептид, обычно вводят в рекомбинантный вектор, представляющий собой любой из векторов, пригодных для проведения процедур с рекомбинантной ДНК, и выбор вектора часто зависит от природы клетки-хозяина, в которую он должен быть введен. Так, данный вектор может быть автономно реплицирующимся вектором, например существуя вне хромосомы и реплицируясь независимо от хромосомальной репликации, т.е. быть плазмидой. С другой стороны, вектором может быть один из тех векторов, которые, попадая в клетку-хозяина, интегрируются в геном клетки-хозяина и реплицируются совместно с хромосомой(ами), в которую они интегрированы.
Предпочтительно, чтобы вектор являлся экспрессируемым вектором, в котором последовательность ДНК, кодирующая "клеверный" пептид, оперативно соединена с дополнительными участками, необходимыми для транскрипции ДНК. В общем случае экспрессируемый вектор происходит из плазмидной или вирусной ДНК или содержит элементы обоих. Термин "операбельно соединена" означает, что участки организованы таким образом, что функционируют во взаимодействии друг с другом для выполнения предназначенных целей, т.е. транскрипция начинается на промоторе и проходит на всем участке ДНК, кодирующем полипептид.
Промотором может быть любая последовательность ДНК, демонстрирующая транскрипционную активность в выбранной клетке-хозяине, происходящая из генов, кодирующих белки как гомологичные, так и гетерологичные клетке-хозяину.
Примерами подходящих для проведения транскрипции ДНК, кодирующей "клеверные" пептиды, в клетках млекопитающих промоторов являются промотор SV40 [37] , промотор МТ-1 (промотор гена металлотионеина) [38] или главный поздний промотор аденовируса 2.
Примером соответствующего промотора для использования в клетках насекомых является полиэдриновый промотор [39, 40], P10-промотор [41], промотор основного белка вируса полиэдроза Autoqrapha californica [42] , промотор "быстрого" раннего гена 1 бакуловируса [43, 44] или промотор замедленного раннего гена бакуловируса 39К [43, 44].
Соответствующими промоторами для использования в дрожжевых клетках-хозяевах являются промоторы дрожжевых гликолитических генов [45, 46], или генов алкогольдегидрогеназы [47], или TRI1- [48], или ADH2-4с-промоторы [49] .
Примерами подходящих для использования в нитчатых грибах как клетках-хозяевах промоторов являются, например, ADH3-промотор [50] или tpiA-промотор. В качестве примеров других полезных промоторов можно привести промоторы генов ТАКА-амилазы из A. oryzae, аспарагиновой протеиназы из Rhizomucor miehei, нейтральной α-амилазы из A. niger, кислотостабильной α-амилазы из A. niger, глюкоамилазы (gluA) из A. niger или A. awamori, липазы из Rhizomucor miehei, щелочной протеазы из A. oryzae, триозофосфатизомеразы из A. oryzae или ацетамидазы из A. nidulans. Предпочтительными являются промоторы генов ТАКА-амилазы и gluA. Соответствующие промоторы указаны, например, в [51] и [52].
Последовательность ДНК, кодирующая "клеверный" пептид, кроме того, при необходимости может быть оперативно связана с подходящим терминатором, таким как терминатор гена гормона роста человека [53], или, когда в качестве клеток-хозяев используются грибы, терминаторы TPI1 [46] или ADH3 [50]. Вектор также может включать такие элементы, как полиаденилатные сигналы (например, из Elb-области SV40 или аденовируса 5), последовательности, усиливающие транскрипцию (например, энхансер SV40), и последовательности, усиливающие трансляцию (такие, например, как кодирующие РНКы аденовируса VA).
Рекомбинантный вектор также может включать последовательность ДНК, дающую возможность вектору реплицироваться в рассматриваемой клетке-хозяине. Примером подобной последовательности (когда клеткой-хозяином является клетка млекопитающего) является ориджин репликации SV40.
Когда клеткой-хозяином является дрожжевая клетка, соответствующими последовательностями, дающими возможность вектору реплицироваться, являются гены репликации REP 1-3 и ориджин репликации дрожжевой плазмиды 2μ.
Вектор также может содержать селективный маркер, например ген, продукт которого дополняет дефект клетки-хозяина, такой как ген дегидрофолатредуктазы (DHFR) или TPI-ген Schizosaccharomyces pombe (описанный в [54]), либо ген, придающий устойчивость к лекарствам, например ампициллину, канамицину, тетрациклину, хлорамфениколу, неомицину, гигромицину или метотрексату. Для нитчатых грибов селективные маркеры включают amdS, pyrG, argB, niaD или sC.
Вектор также может содержать селективный маркер, например ген, продукт которого дополняет дефект клетки-хозяина, такой как ген дегидрофолатредуктазы (DHFR) или TPI-ген Schizosaccharomyces pombe (описанный в [54]), либо ген, придающий устойчивость к лекарствам, например ампициллину, канамицину, тетрациклину, хлорамфениколу, неомицину, гигромицину или метотрексату. Для нитчатых грибов селективные маркеры включают amdS, pyrG, argB, niaD или sC.
Для того чтобы направить "клеверный" пептид, описанный в настоящем изобретении, по секреторному пути клетки-хозяина, в рекомбинантный вектор может быть введена секреторная сигнальная последовательность (известная также как лидерная последовательность, предпропоследовательность или предпоследовательность). Секреторная сигнальная последовательность присоединяется к последовательности ДНК, кодирующей "клеверный" пептид, в корректной рамке считывания. Обычно сигнальная последовательность располагается с 5'-конца последовательности ДНК, кодирующей пептид. В качестве секреторной сигнальной последовательности может применяться сигнальная последовательность, в норме ассоциированная с данным пептидом, либо последовательность гена, кодирующего другой секреторный белок.
Для секреции из дрожжевых клеток секреторная сигнальная последовательность может кодировать любой сигнальный пептид, обеспечивающий эффективное направление экспрессированного "клеверного" пептида в секреторный путь клетки. Сигнальным пептидом может быть от природы имеющийся сигнальный пептид (либо его функциональная часть) или синтетический пептид. Было установлено, что соответствующими сигнальными пептидами являются сигнальный пептид α-фактора [54], сигнальный пептид амилазы слюны мыши [55], модифицированный сигнальный пептид карбоксипептидазы [56] , сигнальный пептид BAR1 дрожжей [57] или сигнальный пептид дрожжевой аспарагиновой протеазы 3 (YAP3) [57].
Кроме этого, для эффективной секреции в дрожжах между сигнальной последовательностью и последовательностью ДНК, кодирующей "клеверный" пептид, может быть введена последовательность, кодирующая лидерный пептид. Функция лидерного пептида заключается в том, что он позволяет экспрессированному пептиду направляться из эндоплазматического ретикулума в комплекс Гольджи и далее в секреторные визикулы для секреции в культуральную среду (т.е. направляет экспорт "клеверного" пептида через клеточную стенку или по меньшей мере через клеточную мембрану в периплазматическое пространство дрожжевой клетки). В качестве лидерного пептида может выступать лидерный пептид дрожжевого α-фактора (его использование описано, например, в [54, 59-63]). С другой стороны, лидерный пептид может быть искусственным, иными словами не природным. Синтетический лидерный пептид может, например, быть сконструирован как описано в [64] или [65].
С целью использования в нитчатых грибах сигнальный пептид можно удобно получать из гена, кодирующего амилазу или глюкоамилазу из Aspergillus sp., гена, кодирующего липазу или протеазу из Rhizomucor miehei или липазу из Humicola lanuginosa. Предпочтительным является сигнальный пептид гена, кодирующего ТАКА-амилазу из A. oryzae, нейтральную α-амилазу из A. niger, кислотостабильную α-амилазу из A. niger или глюкоамилазу из А. niger. Соответствующие сигнальные пептиды описаны в [51] и [66].
Для использования в клетках насекомых такой сигнальный пептид может быть получен на основе гена насекомого (ср. [67]), как, например, сигнальный пептид предшественника адипокинетического гормона чешуекрылого Manduca sexta (ср. [68]).
Методики, применяемые для лигирования последовательностей ДНК, кодирующих "клеверный" пептид, промотор и, возможно, терминатор и/или секреторную сигнальную последовательность, соответственно, и введения их в подходящие векторы, содержащие информацию, необходимую для репликации, хорошо известны специалистам в данной области (ср., например, [32]).
Клетка-хозяин, в которую вводят последовательность ДНК, кодирующую "клеверный" пептид, может представлять собой любую клетку, способную продуцировать данный пептид в димерной форме, включая клетки дрожжей, грибов и высших эукариотов.
Примерами соответствующих клеточных линий млекопитающих являются клеточные линии COS (АТСС CRL 1650), ВНК (АТСС CRL 1632, АТСС CCL 10), CHL (АТСС CCL 39) или СНО (АТСС CCL 61). Способы трансфекции клеток млекопитающих и экспрессии введенных в них последовательностей ДНК описаны в работах [69-75] .
Примеры соответствующих дрожжевых клеток включают клетки Saccharomyces spp. или Schizosaccharomyces spp., в особенности штаммы Saccharomyces cerevisiae или Saccharomyces kluyveri. Способы трансформации дрожжевых клеток гетерологичной ДНК и продуцирования в них гетерологичных полипептидов описаны, например, в [38, 54, 76-78], каждый из которых, таким образом, приведен в ссылках. Трансформированные клетки отбирают по фенотипу, определяемому по селективному маркеру, обычно по устойчивости к лекарственному препарату или способности расти в отсутствии определенного компонента питательной среды, например лейцина. Предпочтительным для использования в дрожжах является вектор РОТ1, описанный в [76]. Последовательности ДНК, кодирующей "клеверный" пептид, может предшествовать сигнальная последовательность, а возможно и лидерная последовательность, как, например, описано выше. Другими примерами соответствующих дрожжевых клеток являются штаммы Kluyveromyces, такие как К. lactis, Hansenula, например H. polymorpha, или Pichiа, например P.pastoris (cp. [79, 80]).
Примерами других грибных клеток являются клетки нитчатых грибов, например Aspergillus spp., Neurospora spp., Fusarium spp. или Trichoderma spp., в особенности A. oryzae, A. nidulans или A. niger. Применение Aspergillus spp. для экспрессии белков описано, например, в [51, 81, 82]. Трансформация F. oxysporum может, например, быть проведена, как описано в [83], a Trichoderma spp. - как в [84].
Когда в качестве клетки-хозяина используется клетка нитчатого гриба, она может быть трансформирована сконструированной по настоящему изобретению ДНК посредством интеграции последней в хромосому клетки-хозяина для получения рекомбинантной клетки-хозяина. Как правило, считается, что подобная интеграция имеет то преимущество, что введенная последовательность ДНК будет более стабильно поддерживаться в клетке. Интеграция сконструированных последовательностей ДНК в хромосому клетки-хозяина может быть осуществлена в соответствии с общепринятыми способами, например посредством гомологичной или гетерологичной рекомбинации.
Трансформация клеток насекомых и продукция в них гетерологичных полипептидов может быть осуществлена, как описано в патентах [39, 42-44, 85], включенных здесь в список литературы. В качестве клеточных линий насекомых, используемых как клетки-хозяева, подходит клеточная линия Lepidoptera, например клетки Spodoptera frugiperda или клетки Trichoplusia ni (ср. [86]). Для культивирования подходят условия, описанные, например, в [87] или [88] либо в любой из вышеупомянутых ссылок.
Подвергнутые трансформации или трансфекции описанные выше клетки-хозяева далее культивируют в соответствующей питательной среде в условиях, допускающих экспрессию "клеверного" пептида, после чего образовавшийся пептид полностью или частично может быть выделен из культуры в димерной форме. В качестве среды культивирования можно использовать любую общепринятую среду, пригодную для роста клеток-хозяев, например минимальную или комплексную среду, содержащую соответствующие добавки. Подходящие среды являются коммерчески доступными или их можно приготовить в соответствии с опубликованными рецептами (например, в соответствии с каталогами American Type Culture Collection). Продуцируемый клетками "клеверный" пептид далее может быть выделен из культуральной среды с помощью общепринятых методик, включающих отделение клеток-хозяев от среды посредством центрифугирования или фильтрования, осаждение белковых компонентов супернатанта или фильтрата с помощью соли, например сульфата аммония, очистку с использованием разнообразных хроматографических методик, например ионообменной хроматографии, гель-фильтрации, аффинной хроматографии или им подобных в зависимости от типа рассматриваемого полипептида.
Димер "клеверного" пептида можно вводить в фармацевтический состав по изобретению согласно любому из устоявшихся методов приготовления фармацевтических составов, например, как описано в [89]. Такой состав может быть изготовлен в пригодной для систематических инъекций или инфузий форме и таким образом может включать стерильную воду или изотонический раствор соли либо глюкозы. Составы можно стерилизовать с помощью стандартных методик стерилизации, хорошо известных специалистам в данной области. Полученные водные растворы можно сразу упаковать для использования или профильтровать в асептических условиях и высушить лиофильно; лиофилизованный препарат перед введением смешивают со стерильным водным раствором. Фармацевтический состав может содержать фармацевтически приемлемые добавочные вещества, необходимые для приближения к физиологическим условиям, такие как забуферивающие агенты, регулирующие тонус вещества и им подобные, например ацетат натрия, лактат натрия, хлорид натрия, хлорид калия, хлорид кальция и т.д.
Фармацевтический состав по настоящему изобретению также может быть адаптирован для назального, трансдермального и ректального введения. Фармацевтически приемлемый наполнитель или разбавитель, используемый в составе, может представлять собой любой традиционный твердый наполнитель. Примерами твердых наполнителей являются лактоза, терра альба, сахароза, тальк, желатин, агар, пектин, аравийская камедь, стеарат магния и стеариновая кислота. Подобным же образом наполнитель или разбавитель может включать любой известный специалистам способствующий выведению материал, такой как глицерилмоностеарат или глицерилдистеарат, один либо в смеси с парафином. Содержание твердого наполнителя будет широко варьировать, однако обычно будет находиться в интервале от 25 мг до 1 г.
Концентрация "клеверного" пептида в таком составе может изменяться в широких пределах, например от приблизительно 5% до приблизительно 100% по весу. Предпочтительная концентрация лежит в области 50-100% по весу. Стандартная доза для такого состава обычно может содержать от приблизительно 1 мг до приблизительно 200 мг, предпочтительно от приблизительно 25 мг до приблизительно 75 мг, в частности приблизительно 50 мг пептида.
Согласно указанному выше считается, что представляемый в данном изобретении димер "клеверного" пептида является активной формой указанного пептида. В связи с этим предполагается, что он будет полезным в случае применения его с целью предупреждения или лечения заболеваний желудочно-кишечного тракта. Более конкретно предполагается использование его для лечения желудочных или пептических язв, воспалительных заболеваний кишечника, болезни Крона или повреждений кишечного тракта, вызванных радиационной терапией, бактериальными либо другими инфекциями и т.д. Доза полипептида, вводимого пациенту, будет изменяться в зависимости от типа и тяжести состояния лечащегося, но обычно лежит в интервале 0,1-1,0 мг/кг веса тела.
Дальнейшие детали настоящего изобретения описываются в примере со ссылками на прилагаемые чертежи, где
Фиг. 1 - предполагаемая структура кишечного "клеверного" фактора (ITF) человека. Первичная аминокислотная последовательность взята из работы [14], а дисульфидные связи расставлены исходя из гомологии с PSP и pS2 [2].
Фиг. 1 - предполагаемая структура кишечного "клеверного" фактора (ITF) человека. Первичная аминокислотная последовательность взята из работы [14], а дисульфидные связи расставлены исходя из гомологии с PSP и pS2 [2].
Фиг. 2 - обращенно-фазная ВЭЖХ супернатанта из дрожжевого штамма HW756, экспрессирующего ITF крысы, на колонке Vydac 214ТР54.
Фиг. 3 - ионообменная хроматография частично очищенного ITF человека на колонке с Fast Flow SP-Сефарозой. Количество мономера и димера ITF человека определяли с помощью аналитической ВЭЖХ. Окрашенные прямоугольники указывают фракции, собранные для дальнейшей очистки мономерной и димерной форм. Пунктирная линия соответствует концентрации NaCl в элюирующем растворителе.
Фиг. 4 - обращенно-фазная ВЭЖХ очищенных димера ITF крысы (А), мономера ITF человека (В) и димера ITF человека (С) на колонке Vydac 214ТР54 C4. Пунктирная линия показывает концентрацию ацетонитрила в элюирующем растворителе.
Фиг. 5 - масс-спектры очищенных ITF крысы (димера) (А), ITF человека (мономера) (В) и ITF человека (димера) (С).
Фиг. 6 - структура димерной формы ITF человека.
Фиг. 7 - рестрикционная карта плазмиды KFN 1003.
Фиг. 8 - конструкция плазмиды pHW756.
Фиг. 9 - конструкция плазмиды pHW1066.
Пример 1
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Клонирование ITF крысы (rITF) и ITF человека (hITF)
Клонирование ITF крысы и человека выполняли, как описано в [15, 16, 29] (rITF) и [13, 14] (hITF).
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Клонирование ITF крысы (rITF) и ITF человека (hITF)
Клонирование ITF крысы и человека выполняли, как описано в [15, 16, 29] (rITF) и [13, 14] (hITF).
Конструирование плазмид, экспрессирующих rITF и hITF
Согласно схемам, приведенным на фиг.7 - 9, были сконструированы экспрессирующие плазмиды pHW756 для секреции ITF крысы и pHW1066 для секреции ITF человека. Экспрессирующий дрожжевой вектор рКFN1003 (описан в [90]) представляет собой производную плазмиды СРОТ [91]. Он содержит в качестве селективного маркера TPI-ген Schizosaccharomyces pombe (РОТ) [53], промотор три-озофосфатизомеразы S. cerevisiae (ТРI) и терминатор, контролирующий экспрессию [46].
Согласно схемам, приведенным на фиг.7 - 9, были сконструированы экспрессирующие плазмиды pHW756 для секреции ITF крысы и pHW1066 для секреции ITF человека. Экспрессирующий дрожжевой вектор рКFN1003 (описан в [90]) представляет собой производную плазмиды СРОТ [91]. Он содержит в качестве селективного маркера TPI-ген Schizosaccharomyces pombe (РОТ) [53], промотор три-озофосфатизомеразы S. cerevisiae (ТРI) и терминатор, контролирующий экспрессию [46].
Ген ITF крысы первоначально клонировали в Bluescript II KS(-) (Stratagene), из которого его размножали в соответствии с фиг. 8. Вспомогательный вектор pSX54, обеспечивающий полезные для клонирования сайты, составлен из pUC18 и pDN1050 [92]. Синтетический ДНК-линкер Ncol-PflM1 имеет следующую последовательность нуклеотидов:
1858: 5'-CATGGCTGAAAGATTGGAAAAGAGACAAGAGTTCGTTGGTTTGTCTCCATCCC AATGT-3' 58 н.п.
1858: 5'-CATGGCTGAAAGATTGGAAAAGAGACAAGAGTTCGTTGGTTTGTCTCCATCCC AATGT-3' 58 н.п.
1862: 5'-TTGGGATGGAGACAAACCAACGAACTCTTGTCTCTTTTCCAATCTTTCAGC - 3' 51 н. п.
Линкер кодирует 8 C-концевых аминокислот лидерной последовательности, как описано в [93], с несколькими изменениями в выборе кодонов, а N-концевая часть гена ITF крысы имеет следующую последовательность: QEFVGLSPSQC. Сигнальная и лидерная аминокислотные последовательности описаны там же:
MKAVFLVLSLIGFCWAQPVTGDESSVEIPEESLIIAENTTLANVAMAERLEKR.
MKAVFLVLSLIGFCWAQPVTGDESSVEIPEESLIIAENTTLANVAMAERLEKR.
Ген человеческого ITF клонировали в PUC19 и размножали в соответствии с фиг. 9. Синтетический ДНК-линкер Ncol-BsaAl имеет следующую последовательность:
2292: 5'-CATGGCTGAAAGATTGGAAAAGAGAGAAGAATAC-3' 34 н.п.
2292: 5'-CATGGCTGAAAGATTGGAAAAGAGAGAAGAATAC-3' 34 н.п.
2287: 5'-GTATTCTTCTCTCTTTTCCAATCTTTCAGC-3' 30 н.п.
Линкер кодирует 8 C-концевых аминокислот лидерной последовательности, как описано для конструкции rITF, а тремя N-концевыми аминокислотами гена hITF являются EEY. Сигнальная и лидерная последовательности такие же, как и ранее.
Экспрессирующими плазмидами трансформировали штамм S.cerevisiae MT 663 (E2-7B X E11-36 a/α , δtpi/δtpi, pep 4-3/pep 4-3) с селекцией по росту на глюкозе в качестве единственного источника углерода.
Дрожжевые трансформанты, экспрессирующие ITF крысы и человека, были названы HW756 и HW1066 соответственно.
Ферментации
Описанные выше трансформанты культивировали в течение 72 ч при 30oC в дрожжевой пептон-декстрозной (YPD) среде [94], дополненной дрожжевым экстрактом (60 г/л). По окончании ферментаций были достигнуты значения оптических плотностей при 660 нм, равные 153 и 232 для HW756 (rITF) и HW1066 (hITF) соответственно. По окончании ферментации pH подводили до 2,5 с помощью 1 M фосфорной кислоты и дрожжевые клетки удаляли центрифугированием при 3000 об/мин в течение 15 мин.
Описанные выше трансформанты культивировали в течение 72 ч при 30oC в дрожжевой пептон-декстрозной (YPD) среде [94], дополненной дрожжевым экстрактом (60 г/л). По окончании ферментаций были достигнуты значения оптических плотностей при 660 нм, равные 153 и 232 для HW756 (rITF) и HW1066 (hITF) соответственно. По окончании ферментации pH подводили до 2,5 с помощью 1 M фосфорной кислоты и дрожжевые клетки удаляли центрифугированием при 3000 об/мин в течение 15 мин.
Очистка рекомбинантного rITF
Концентрацию rITF в дрожжевой ферментационной питательной среде и фракциях, полученных во время очистки, измеряли с помощью аналитической ВЭЖХ. Аликвоты (обычно 50-200 мкл) наносили на C4 ВЭЖХ-колонку (0,46 x 25 см) Vydac 214TP54 для обращенно-фазной хроматографии, уравновешенную 0,1% (v/v) TFA в 15% (v/v) ацетонитриле, при 30oC и скорости потока 1,5 мл/мин. После 10 мин изократического элюирования концентрацию ацетонитрила в элюирующем растворителе увеличивали в течение 40 мин до 55%. Измеряли поглощение при 214 нм. Были обнаружены три пика, элюирующиеся с временами удерживания 26,5 мин, 27,3 мин и 28,2 мин (фиг. 2), представляющие собой димерные формы rITF. Количество пептидов определяли, используя калибровочный hSP-стандарт [93].
Концентрацию rITF в дрожжевой ферментационной питательной среде и фракциях, полученных во время очистки, измеряли с помощью аналитической ВЭЖХ. Аликвоты (обычно 50-200 мкл) наносили на C4 ВЭЖХ-колонку (0,46 x 25 см) Vydac 214TP54 для обращенно-фазной хроматографии, уравновешенную 0,1% (v/v) TFA в 15% (v/v) ацетонитриле, при 30oC и скорости потока 1,5 мл/мин. После 10 мин изократического элюирования концентрацию ацетонитрила в элюирующем растворителе увеличивали в течение 40 мин до 55%. Измеряли поглощение при 214 нм. Были обнаружены три пика, элюирующиеся с временами удерживания 26,5 мин, 27,3 мин и 28,2 мин (фиг. 2), представляющие собой димерные формы rITF. Количество пептидов определяли, используя калибровочный hSP-стандарт [93].
Уровень экспрессии рекомбинантного ITF крысы в данной дрожжевой системе составлял 113 мг/л.
С помощью центрифугирования из ферментера вместимостью 10 л было выделено 8,7 л ферментационного бульона. Для понижения проводимости супернатант был разбавлен 14,8 л дистиллированной воды. Образец наносили на колонку (5 x 42 см) с SP-Сефарозой Fast Flow (Pharmacia) при скорости потока 600 мл/ч. Перед использованием колонку уравновешивали 50 мМ формиатным буфером pH 3,7. ITF крысы элюировали с колонки 50 мМ муравьиной кислотой pH 3,7, содержащей 50 мМ NaCl. В процессе хроматографии при скорости потока 600 мл/ч отбирали фракции объемом по 100 мл, которые анализировали на содержание rITF. Фракции с предыдущей стадии, содержащие rITF, объединяли (2,3 л) и наносили на колонку (5 х 10 см) с Amberchrome (G-71). Перед использованием колонку уравновешивали 10 мМ аммоний-ацетатным буфером pH 4,8 при скорости потока 0,5 л/ч. После нанесения колонку промывали 0,5 л уравновешивающего буфера и элюировали 10 мМ аммоний-ацетатным буфером pH 4,8, содержащим 60% (v/v) этанола, при скорости потока 0,1 л/ч. Отбирали фракции, содержащие rITF, объемом 10 мл. Концентрацию этанола в объединенных фракциях повышали от 60% (v/v) до 87% (v/v) добавлением 2 объемов этанола (99,9%, v/v) и, охлаждая полученную смесь до температуры минус 25oC в течение 16 ч, осаждали rITF.
Осадок собирали центрифугированием в течение 1 ч при 10000 g и -25oC и перерастворяли при комнатной температуре в 130 мл 20 мМ муравьиной кислоты pH 3,0. Образец наносили на колонку (5 x 20 см) с SP-Сефарозой Fast Flow (Pharmacia) при скорости потока 50 мл/ч. Перед использованием колонку уравновешивали 20 мМ муравьиной кислотой pH 3,0. Пептиды элюировали с колонки с помощью линейного градиента, составленного из 1,5 л 50 мМ муравьиной кислоты pH 3,0 и 1,5 л муравьиной кислоты pH 3,0, содержащей 0,5 М NaCl. В процессе хроматографии при скорости потока 80 мл/ч отбирали фракции (10 мл), в которых измеряли оптическую плотность при длине волны 280 нм. В отобранных фракциях измеряли содержание rITF, после чего фракции, содержащие rITF, объединяли. Дальнейшую очистку ITF крысы проводили с помощью препаративной ВЭЖХ. Объединенные фракции (900 мл) наносили на препаративную С4 ВЭЖХ-колонку (2,2 x 25 см) Vydac 214TP1022, уравновешенную 0,1% (v/v) TFA. Пептиды элюировали при 25oC и скорости потока 5 мл/мин с помощью линейного градиента (540 мл), составленного из MeCN/H2O/TFA (10:89,9:0,1 v/v/v) и MeCN/H2O/TFA (65:34,9: 0,1 v/v/v). Регистрировали поглощение в ультрафиолетовой области при длине волны 280 нм, отбирали фракции объемом 10 мл и анализировали их на содержание rITF. Содержащие rITF фракции объединяли и полученный раствор уменьшали в объеме до 30% центрифугированием под вакуумом. Окончательное выделение rITF осуществляли лиофилизацией. Общее количество rITF, полученное из 8,7 л ферментационной среды, составило 236 мг, что соответствует общему 24% выходу по всем этапам очистки.
Очистка рекомбинантного hITF
Концентрацию hITF в дрожжевой ферментационной питательной среде и фракциях, полученных во время очистки, измеряли с помощью системы ВЭЖХ, идентичной описанной для rITF. Были обнаружены два пика, элюирующиеся с временами удерживания 21,2 мин и 27,1 мин (фиг. 2), представляющие собой по данным масс-спектрометрии и анализу последовательностей димерную и мономерную формы hITF. Уровень экспрессии рекомбинантного ITF человека в данной дрожжевой системе составил 90 мг/л.
Концентрацию hITF в дрожжевой ферментационной питательной среде и фракциях, полученных во время очистки, измеряли с помощью системы ВЭЖХ, идентичной описанной для rITF. Были обнаружены два пика, элюирующиеся с временами удерживания 21,2 мин и 27,1 мин (фиг. 2), представляющие собой по данным масс-спектрометрии и анализу последовательностей димерную и мономерную формы hITF. Уровень экспрессии рекомбинантного ITF человека в данной дрожжевой системе составил 90 мг/л.
С помощью центрифугирования из ферментера вместимостью 10 л было выделено 8,0 л ферментационного бульона. Образец диализовали против 3 смен (каждая длительностью 24 ч) по 40 л 10 мМ муравьиной кислоты pH 2,5. Образец наносили (0,25 л/ч) на колонку (5 x 40 см) с SP-Сефарозой Fast Flow (Pharmacia). Колонку промывали 5 л 20 мМ муравьиной кислоты, pH 2,5 и 5 л муравьиной кислоты pH 2,5, содержащей 1 М NaCl. Отбирали фракции объемом по 100 мл и анализировали их на содержание hITF (фиг. 3). С колонки были элюированы две формы hITF, одна из которых представляла мономерную форму (элюируется при 0,5 М NaCl), а другая - димер hITF (элюируется при 0,78 М NaCI). Фракции, соответствующие каждой из форм, объединяли по отдельности.
Каждую из двух объединенных фракций делили на три равные части (объемом примерно по 700 мл) и наносили на колонку C4 Vydac 214TP1022 (2,2 x 25 см), уравновешенную 0,1% (v/v) TFA. Пептиды элюировали при 25oС и скорости потока 4 мл/мин с помощью линейного градиента (540 мл), составленного из MeCN/H2O/TFA (10: 89,9: 0,1 v/v/v) и MeCN/H2O/TFA (65:34,9:0,1 v/v/v). Поглощение в ультрафиолетовой области регистрировали при длине волны 280 нм, отбирали фракции объемом 10 мл и анализировали их на содержание hITF.
Фракции, содержащие hITF (мономер) и hITF (димер) соответственно, объединяли и осаждали пептиды, добавляя этанол до концентрации 90% (v/v) и выдерживая смесь в течение 72 ч при -25oC. Осадок собирали центрифугированием и лиофилизовали. Общее количество, полученное из 8,0 л ферментационной среды, составило 256 мг для мономера hITF и 133 мг для димера hITF, что соответствует общему выходу по всем этапам очистки в 50% и 65% для мономерной и димерной форм соответственно.
Характеристика рекомбинантных rITF и hITF
После гидролиза в 6 М HCl в вакуумированных запаянных ампулах в течение 24, 48 и 96 ч образцы (50 мкг) были проанализированы на автоматическом аминокислотном анализаторе фирмы Beckman (Model 121 MB). Количество остатков полуцистина определяли в виде S-β-(4-пиридилэтил)производного после восстановления дисульфидных связей трибутилфосфином [95] с последующим взаимодействием с 4-винилпиридином [96] . Гидролиз образцов, обработанных 4-винилпиридином, проводили в 4 М метансульфоновой кислоте или 3 М меркаптоэтансульфоновой кислоте при 110oC в течение 24 ч, как описано ранее. Анализ аминокислотной последовательности проводили с помощью автоматической процедуры деградации по Эдману, используя газо-фазовый секвенатор Model 470А фирмы Applied Biosystems [97].
После гидролиза в 6 М HCl в вакуумированных запаянных ампулах в течение 24, 48 и 96 ч образцы (50 мкг) были проанализированы на автоматическом аминокислотном анализаторе фирмы Beckman (Model 121 MB). Количество остатков полуцистина определяли в виде S-β-(4-пиридилэтил)производного после восстановления дисульфидных связей трибутилфосфином [95] с последующим взаимодействием с 4-винилпиридином [96] . Гидролиз образцов, обработанных 4-винилпиридином, проводили в 4 М метансульфоновой кислоте или 3 М меркаптоэтансульфоновой кислоте при 110oC в течение 24 ч, как описано ранее. Анализ аминокислотной последовательности проводили с помощью автоматической процедуры деградации по Эдману, используя газо-фазовый секвенатор Model 470А фирмы Applied Biosystems [97].
Масс-спектрометрический анализ осуществляли на системе API III LC/MS/MS (Sciex, Thornhill, Ont., Canada). Тройной квадрупольный прибор, позволяющий определить значение отношения массы к заряду (m/z) в интервале до 2400, соединен с интерфейсом для пневмоэлектроспрея (называемого также ион-спреем) [98, 99] . Введение образца осуществляли с помощью шприцевого инфузионного насоса (Sage Instruments, Cambridge, MA) через вставной капилляр (внутр. д. 75 мкм) при скорости подачи жидкости 0,5-1 мкл/мин. Шкала m/z прибора была откалибрована с помощью однозарядных ионов аммониевого аддукта полипропиленгликолей (PPG) при единичном разрешении. Точность измерения масс обычно превосходит 0,02%.
На фиг. 4 показаны результаты аналитической ВЭЖХ для очищенных rITF (фиг. 4A) и hITF (фиг. 4B и 4C). Рекомбинантный rITF содержит смесь трех близких пептидов, для разделения которых не было предпринято никаких попыток. В результате масс-спектрометрического анализа были установлены три основных значения молекулярных весов - 13112,2; 13096,6 и 13078,8 (фиг. 5A). Расчетное значение молекулярного веса для мономерной формы ITF крысы, в которой Cys-57 имеет свободную -SH группу, составляет 6558,3. Расчетное значение молекулярного веса для димерной формы ITF крысы (например, с S-S мостиком между двумя Cys-57) составляет 13114,6. Из значений молекулярных весов, найденных для рекомбинантного ITF крысы, ясно, что все три пептида представляют собой димерную форму rITF. Для других "клеверных" пептидов, в которых N-концевым аминокислотным остатком является Gin, например PSP [17, 100], известно, что данный остаток имеет тенденцию к циклизации с образованием пирролидонкарбоновой кислоты (pyrGlu). Для ITF крысы, имеющего предсказанную N-концевую последовательность Gln-Glu-Phe-Val-Gly, разумно предположить, что N-концевой остаток Gln также способен циклизоваться с образованием pyrGlu. Подобное превращение будет приводить к уменьшению значения молекулярного веса ITF крысы (димер) на 17 (один pyrGlu) или 34 (два pyrGlu) единиц массы соответственно. Наблюдаемые значения молекулярных весов в 13096,6 и 13078,8 (фиг.5A) соответствуют димерной форме ITF крысы, в которой один и соответственно два N-концевых остатка Gln зациклизованы. Расчетные значения молекулярных весов для этих форм составляют 13097,6 и 13080,6, что находится в хорошем соответствии с экспериментально полученными величинами. Таким образом, из данных ВЭЖХ (фиг.4A) и масс-спектрометрического анализа (фиг. 5A) вытекает, что рекомбинантный ITF крысы включает 3 различные димерные формы: одну, содержащую 2 N-концевых Gln; одну - с 1 N-концевым Gln и 1 N-концевым pyrGlu; и одну - с 2 N-концевыми pyrGlu. В Таблице I приведен аминокислотный состав ITF крысы, находящийся в хорошем соответствии с ожидаемыми величинами.
фиг. 4B и 4C демонстрируют чистоту hITF (мономера) и hITF (димера) соответственно по данным аналитической ВЭЖХ. Димерная форма (фиг. 4C) выглядит относительно чистой, в то время как для мономерной (фиг. 4B) создается видимость загрязнения материалом, элюирующимся перед пептидом. Однако при рехроматографии материала основного пика получается аналогичный вид хроматограммы (данные не приводятся). По-видимому, это в большей степени указывает на нетипичное поведение hITF (мономера) при обращенно-фазной хроматографии, нежели на наличие примесей. Похожее поведение ранее мы наблюдали для высокоочищенного PSP свиньи, а также оно отмечалось для рекомбинантного hSP высокой степени очистки [93].
С помощью масс-спектрометрического анализа основного пика hITF (мономера) было установлено значение молекулярного веса, равное 6694,0 (фиг. 5B). Значение молекулярного веса, рассчитанное на основании аминокислотной последовательности (фиг. 1), составляет 6574,4 в предположении, что Cys-57 находится в -SH форме. Данные секвенирования (Табл. II) показывают наличие ожидаемой N-концевой последовательности: Glu-Glu-Tyr-Val-Gly-. Данные аминокислотного анализа (Табл. I) показывают ожидаемые величины за исключением наличия 7,3 (8) остатков цистеина. Наличие дополнительного остатка цистеина, соединенного с Cys-57, может увеличивать значение молекулярного веса до 6694,7, что очень близко к величине, найденной с помощью масс-спектрометрии (6694,0). Ввиду этого можно полагать, что в hITF (мономере) остаток Cys-57 связан дисульфидной связью с дополнительным остатком цистеина. Минорный пик (фиг. 5B) в масс-спектре может представлять собой другую производную Cys-57 или может быть обусловлен наличием в препарате примеси.
Расчетное значение молекулярного веса hITF (димера), в котором два мономера соединены дисульфидной связью между двумя остатками Cys-57, составляет 13146,8. Это значение находится в хорошем соответствии с величиной, определенной с помощью масс-спектрометрии (13147, фиг. 5C). Другой пик (13169) вероятно представляет собой Na+ аддукт hITF (димера). Результаты анализа аминокислотной последовательности (Табл. II) и состава (Табл. I) также находятся в хорошем соответствии с ожидаемыми величинами.
Пример 2
Оценка биологического действия димерного ITF с использованием in vitro модели эпителиального барьера (Heather Kindon et al., Trefoil Peptide Protection of Intestinal Epithelial Barrier Function; Gastroenterology 1995; 109 : 516-523)
ITF человека или крысы в димерной форме и/или гликопротеин добавляли к Transwell монослоям клеточной линии T84, полученной из раковой опухоли прямой кишки человека.
Оценка биологического действия димерного ITF с использованием in vitro модели эпителиального барьера (Heather Kindon et al., Trefoil Peptide Protection of Intestinal Epithelial Barrier Function; Gastroenterology 1995; 109 : 516-523)
ITF человека или крысы в димерной форме и/или гликопротеин добавляли к Transwell монослоям клеточной линии T84, полученной из раковой опухоли прямой кишки человека.
Интактный монослой пропускал менее 4% инертного маркера [3Н]маннита за 4 часа. В результате его обработки токсическими лецитин фитогемагглютинином (1 мг/мл), олеиновой кислотой (8 ммоль/л) и таурохлорной кислотой (12 ммоль/л) или токсином А из Clostridium difficile (0,7 мкг/мл) барьерная функция ослабевала и обработанный таким образом монослой пропускал 36%, 62% и 45% [3Н] маннита соответственно.
Добавление ITF человека (1-5 мкг/мкл) приводило к ослаблению повреждения целостности монослоя на величину вплоть до 52%. Защита усиливалась (до 95%) при одновременном присутствии муцинового гликопротеина прямой кишки человека.
Аналогичный эффект наблюдался, когда добавляли ITF крысы сам по себе или в присутствии муцинового гликопротеина прямой кишки человека.
Способность этих веществ обеспечивать некоторую защиту, когда они добавлены сами по себе, указывает на то, что защитные свойства присущи каждому из них и не являются результатом взаимодействия двух компонентов.
Концентрация как ITF, так и муцинового гликопротеина, использованная в этом исследовании, эквивалентна той, которая по оценкам имеет место на поверхности желудочно-кишечного тракта, следовательно, действие на такой модели эпителиального монослоя сравнимо с физиологическим, и можно сделать вывод, что ITF как человека, так и крысы, в сочетании с муциновыми гликопротеинами защищает слизистую оболочку желудочно-кишечного тракта от множества повреждений.
Пример 3
Влияние экзогенного ITF на экспериментальное повреждение желудка у крыс in vivo (Mark W. Babyatsky, Gastroenterology 1996, 110; 489-497)
Повреждение желудка индуцировали либо внутрижелудочным введением абсолютного этанола (1,0 мл), либо подкожным введением индометацина (20 мг/кг). В различных дозах (0,5, 1, 5 и 10 мг, каждая доза растворена в 1,0 мл дистиллированной воды) вводили димерный ITF крысы в различные моменты времени как до, так и после повреждения. В качестве контроля использовали носитель или бычий сывороточный альбумин. Затем крыс умерщвляли и исследовали повреждение желудка (макроскопически и гистологически). В результате введения ITF через рот наблюдался значительный защитный эффект по отношению к повреждениям, вызываемым как этанолом, так и индаметацином (P < 0,005).
Влияние экзогенного ITF на экспериментальное повреждение желудка у крыс in vivo (Mark W. Babyatsky, Gastroenterology 1996, 110; 489-497)
Повреждение желудка индуцировали либо внутрижелудочным введением абсолютного этанола (1,0 мл), либо подкожным введением индометацина (20 мг/кг). В различных дозах (0,5, 1, 5 и 10 мг, каждая доза растворена в 1,0 мл дистиллированной воды) вводили димерный ITF крысы в различные моменты времени как до, так и после повреждения. В качестве контроля использовали носитель или бычий сывороточный альбумин. Затем крыс умерщвляли и исследовали повреждение желудка (макроскопически и гистологически). В результате введения ITF через рот наблюдался значительный защитный эффект по отношению к повреждениям, вызываемым как этанолом, так и индаметацином (P < 0,005).
Пример 4
Получение рекомбинантного pS2 человека
Рекомбинантный pS2 человека в мономерной и димерной форме были получены в Escherichia coli с использованием рекомбинантной плазмиды для экспресии pEZZ18, кодирующей либо серин (для мономера), либо цистеин (для димера) в положении 58 этого белка (Chadwick MP, May FEB. Westley BR. Production and comparison of mature single domain "trefoil" peptides pNR-2/pS2 Cys58 and pNR- 2/pS2 Ser58. Biochem. J. 1995, 308; 1001-1007). Эта система экспрессии продуцирует составной белок, содержащий два искусственных домена: полученный из Staphylococcus aureus белок А и белок pS2. Рекомбинантные составные белки очищали с помощью аффинной хроматографии на lgG сефарозе и высвобождали белок pS2 путем расщепления фактором Ха. Затем мономер pS2 Ser58 очищали анионобменной хроматографией. Белок pS2 Cys58 обрабатывали цистеином, очищали ионобменной хроматографией, и димер очищали гель-фильтрацией. Молекулярные массы мономера и димера, измеренные с помощью масс-спектрометрии с лазерной десорбцией, составили 6645 и 13378 Да и хорошо согласуются с теоретическими 6674 и 13340 Да.
Получение рекомбинантного pS2 человека
Рекомбинантный pS2 человека в мономерной и димерной форме были получены в Escherichia coli с использованием рекомбинантной плазмиды для экспресии pEZZ18, кодирующей либо серин (для мономера), либо цистеин (для димера) в положении 58 этого белка (Chadwick MP, May FEB. Westley BR. Production and comparison of mature single domain "trefoil" peptides pNR-2/pS2 Cys58 and pNR- 2/pS2 Ser58. Biochem. J. 1995, 308; 1001-1007). Эта система экспрессии продуцирует составной белок, содержащий два искусственных домена: полученный из Staphylococcus aureus белок А и белок pS2. Рекомбинантные составные белки очищали с помощью аффинной хроматографии на lgG сефарозе и высвобождали белок pS2 путем расщепления фактором Ха. Затем мономер pS2 Ser58 очищали анионобменной хроматографией. Белок pS2 Cys58 обрабатывали цистеином, очищали ионобменной хроматографией, и димер очищали гель-фильтрацией. Молекулярные массы мономера и димера, измеренные с помощью масс-спектрометрии с лазерной десорбцией, составили 6645 и 13378 Да и хорошо согласуются с теоретическими 6674 и 13340 Да.
Пример 5
Оценка биологического действия димерного или мономерного pS2 человека с использованием in vitro и in vivo модели ранения и восстановления (Tania Marchbank et al., Dimerisation of human pS2..., Journal of pathology, vol. 185; 153-158 (1998))
Модель in vitro
Скорость миграции клеток к лидерному краю поврежденного монослоя клеточной линии НТ29 прямой кишки человека увеличивалась при добавлении димерного или мономерного pS2 (0,65-325 мкг/мл). Димерный pS2 оказывал более сильное действие, чем мономерный, во всех испытанных дозах.
Оценка биологического действия димерного или мономерного pS2 человека с использованием in vitro и in vivo модели ранения и восстановления (Tania Marchbank et al., Dimerisation of human pS2..., Journal of pathology, vol. 185; 153-158 (1998))
Модель in vitro
Скорость миграции клеток к лидерному краю поврежденного монослоя клеточной линии НТ29 прямой кишки человека увеличивалась при добавлении димерного или мономерного pS2 (0,65-325 мкг/мл). Димерный pS2 оказывал более сильное действие, чем мономерный, во всех испытанных дозах.
Модель in vivo
Действие димерного и мономерного pS2 человека (в мономерном Cys58 заменен на Ser58) сравнивали на модели заживления раны у крыс. Димерный pS2 в дозе 25 и 50 мкг/кг в час показал 50%-ное и 70%-ное восстановление повреждения желудка, индуцированного индометацином. Мономерный pS2 в той же дозе был значительно менее эффективным в восстановлении повреждения (примерно в половину).
Действие димерного и мономерного pS2 человека (в мономерном Cys58 заменен на Ser58) сравнивали на модели заживления раны у крыс. Димерный pS2 в дозе 25 и 50 мкг/кг в час показал 50%-ное и 70%-ное восстановление повреждения желудка, индуцированного индометацином. Мономерный pS2 в той же дозе был значительно менее эффективным в восстановлении повреждения (примерно в половину).
Согласно вышесказанному, можно сделать вывод, что pS2 восстанавливает повреждение желудка и имеет защитное и заживляющее действие, причем димерный pS2 более эффективен, чем мономерный.
Пример 6
Получение димера pS2 крысы
Тотальная РНК была экстрагирована из различных тканей крыс, в частности из желудка и кишечника. С помощью обратной транскриптазы и ПЦР с различными праймерами была получена однонитевая кДНК.
Получение димера pS2 крысы
Тотальная РНК была экстрагирована из различных тканей крыс, в частности из желудка и кишечника. С помощью обратной транскриптазы и ПЦР с различными праймерами была получена однонитевая кДНК.
С использованием полученной кДНК и плазмиды для экспрессии было осуществлено клонирование и экспрессия pS2 в E.coli, как описано в примере 4. Клонирование и экспрессия pS2 крысы в дрожжах осуществлялась так же, как описано для ITF человека и крысы в примере 1.
Пример 7
В связи с тем, что "клеверные" пептиды не разрушаются в пищеварительном тракте, одним из путей их введения является пероральный. Эти пептиды могут быть введены, например, в форме таблетки, капсулы или пилюли или суспендированы в растворе, таком как сироп, который проглатывает пациент. В альтернативном случае раствор, содержащий указанный пептид, может быть введен в виде желудочного промывания или в форме суппозитория. Фармацевтические композиции, содержащие соединение по изобретению, могут быть приготовлены по традиционным технологиям, например как описано в Remington: The Science and Practise of Pharmacy, 19th Ed., 1995.
В связи с тем, что "клеверные" пептиды не разрушаются в пищеварительном тракте, одним из путей их введения является пероральный. Эти пептиды могут быть введены, например, в форме таблетки, капсулы или пилюли или суспендированы в растворе, таком как сироп, который проглатывает пациент. В альтернативном случае раствор, содержащий указанный пептид, может быть введен в виде желудочного промывания или в форме суппозитория. Фармацевтические композиции, содержащие соединение по изобретению, могут быть приготовлены по традиционным технологиям, например как описано в Remington: The Science and Practise of Pharmacy, 19th Ed., 1995.
Типичная таблетка, которую готовят по традиционной технологии, имеет следующую пропись, мг;
Сердцевина:
Активное соединение (ITF димер человека) - 10
Коллоидный диоксид кремния (Aerosil) - 1,5
Микрокристаллическая целлюлоза (Avicel) - 70
Модифицированная целлюлозная смола (Ac-Di-Sol) - 7,5
Стеарат магния - Ad.
Сердцевина:
Активное соединение (ITF димер человека) - 10
Коллоидный диоксид кремния (Aerosil) - 1,5
Микрокристаллическая целлюлоза (Avicel) - 70
Модифицированная целлюлозная смола (Ac-Di-Sol) - 7,5
Стеарат магния - Ad.
Оболочка:
HPMC - 9
Mywacett 9-40 Т - 0,9
Сначала готовят сердцевинный материал таблеток, а затем его покрывают оболочкой. Mywacett представляет собой ацилированный моноглицерид, используемый для пленочного покрытия.
HPMC - 9
Mywacett 9-40 Т - 0,9
Сначала готовят сердцевинный материал таблеток, а затем его покрывают оболочкой. Mywacett представляет собой ацилированный моноглицерид, используемый для пленочного покрытия.
Claims (15)
1. "Клеверный" пептид, содержащий единственный домен в форме клеверного листа и представляющий собой ITF человека, при этом пептид находится в форме димера, в котором два идентичных мономера соединены дисульфидной связью между двумя остатками цистеина и который имеет молекулярный вес около 13000.
2. Пептид по п.1, в котором дисульфидная связь образована между двумя остатками цистеина, находящимися в положении 57 каждого мономера.
3. "Клеверный" пептид, содержащий единственный домен в форме клеверного листа и представляющий собой ITF крысы, при этом пептид находится в форме димера, в котором два идентичных мономера соединены дисульфидной связью между двумя остатками цистеина и который имеет молекулярный вес около 13000.
4. Пептид по п.3, в котором дисульфидная связь образована между двумя остатками цистеина, находящимися в положении 57 каждого мономера.
5. "Клеверный" пептид, содержащий единственный домен в форме клеверного листа и представляющий собой pS2 человека, при этом пептид находится в форме димера, в котором два идентичных мономера соединены дисульфидной связью между двумя остатками цистеина и который имеет молекулярный вес около 13000.
6. Пептид по п.5, в котором дисульфидная связь образована между двумя остатками цистеина, находящимися в положении 58 каждого мономера.
7. "Клеверный" пептид, содержащий единственный домен в форме клеверного листа и представляющий собой pS2 крысы, при этом пептид находится в форме димера, в котором два идентичных мономера соединены дисульфидной связью между двумя остатками цистеина и который имеет молекулярный вес около 13000.
8. Пептид по п.7, в котором дисульфидная связь образована между двумя остатками цистеина, находящимися в положении 58 каждого мономера.
9. "Клеверный" пептид по любому из пп.1, 3, 5 и 7 для применения в качестве лекарственного средства для заживления повреждений слизистой оболочки.
10. "Клеверный" пептид по любому из пп.1, 3, 5 и 7 для применения в приготовлении лекарственного средства для заживления повреждений слизистой оболочки.
11. Способ получения пептида по п.1 или 2, при котором культивируют подходящую клетку-хозяина, трансформированную ДНК-последовательностью, кодирующей ITF человека, в условиях, позволяющих наработку ITF, и отделяют димерную форму ITF человека от мономерной.
12. Способ получения пептида по п.3 или 4, при котором культивируют подходящую клетку-хозяина, трансформированную ДНК-последовательностью, кодирующей ITF крысы, в условиях, позволяющих наработку ITF, и отделяют димерную форму ITF крысы от мономерной.
13. Способ получения пептида по п.5 или 6, при котором культивируют подходящую клетку-хозяина, трансформированную ДНК-последовательностью, кодирующей pS2 человека, в условиях, позволяющих наработку pS2, и отделяют димерную форму pS2 человека от мономерной.
14. Способ получения пептида по п.7 или 8, при котором культивируют подходящую клетку-хозяина, трансформированную ДНК-последовательностью, кодирующей pS2 крысы, в условиях, позволяющих наработку pS2, и отделяют димерную форму pS2 крысы от мономерной.
15. Фармацевтическая композиция для заживления повреждений слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта, например пептической язвы, включающая в себя активный ингредиент и фармацевтически приемлемый разбавитель или носитель, отличающаяся тем, что в качестве активного ингредиента она содержит "клеверный" пептид по любому из пп.1 - 8.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DK98394 | 1994-08-26 | ||
DK0983/94 | 1994-08-26 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU97104484A RU97104484A (ru) | 1999-05-10 |
RU2162857C2 true RU2162857C2 (ru) | 2001-02-10 |
Family
ID=8099704
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU97104484/13A RU2162857C2 (ru) | 1994-08-26 | 1995-08-25 | Димер "клеверного" пептида |
Country Status (21)
Country | Link |
---|---|
EP (2) | EP0777687B1 (ru) |
JP (3) | JPH10504720A (ru) |
KR (1) | KR100255911B1 (ru) |
CN (1) | CN1070867C (ru) |
AT (1) | ATE329929T1 (ru) |
AU (1) | AU694796B2 (ru) |
BR (1) | BR9508773A (ru) |
CA (1) | CA2196876C (ru) |
CZ (2) | CZ289705B6 (ru) |
DE (1) | DE69535060T2 (ru) |
DK (1) | DK0777687T3 (ru) |
ES (1) | ES2267104T3 (ru) |
FI (1) | FI119989B (ru) |
HU (1) | HU226921B1 (ru) |
MX (1) | MX9701239A (ru) |
NO (1) | NO323642B1 (ru) |
PL (1) | PL184516B1 (ru) |
PT (1) | PT777687E (ru) |
RU (1) | RU2162857C2 (ru) |
UA (1) | UA68324C2 (ru) |
WO (1) | WO1996006861A1 (ru) |
Families Citing this family (16)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6221840B1 (en) * | 1991-02-14 | 2001-04-24 | The General Hospital Corporation | Intestinal trefoil proteins |
US6063755A (en) | 1991-02-14 | 2000-05-16 | The General Hospital Corporation | Intestinal trefoil proteins |
US6337195B1 (en) | 1995-06-06 | 2002-01-08 | Human Genome Sciences, Inc. | Colon specific genes and proteins |
US6525018B1 (en) | 1999-05-17 | 2003-02-25 | The General Hospital Corp. | Treating eye disorders using intestinal trefoil proteins |
US6426404B1 (en) | 1997-08-25 | 2002-07-30 | The General Hospital Corporation | Receptor for intestinal trefoil factor |
WO2001092528A2 (en) * | 2000-05-26 | 2001-12-06 | Diadexus, Inc. | Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating colon cancer |
EP1341817A2 (en) * | 2000-12-08 | 2003-09-10 | Novo Nordisk A/S | Tff peptides |
EP1842858A3 (en) * | 2001-04-24 | 2008-04-02 | The General Hospital Corporation | Methods and compositions for treating oral and esophageal lesions |
US7538082B2 (en) | 2001-04-24 | 2009-05-26 | The General Hospital Corporation | Methods and compositions for treating oral and esophageal lesions |
US20030166535A1 (en) * | 2001-04-24 | 2003-09-04 | Podolsky Daniel K. | Methods and compositions for treating oral and esophageal lesions |
EP1401481A1 (en) * | 2001-06-14 | 2004-03-31 | Novo Nordisk A/S | Mucosal repair by tff dimer peptides |
AU2003205555A1 (en) * | 2002-02-11 | 2003-09-04 | Novo Nordisk A/S | Management of mucosal viscosity by tff monomer peptides |
WO2003082196A2 (en) * | 2002-03-26 | 2003-10-09 | The General Hospital Corporation | Combination therapy using trefoil peptides |
JP4874811B2 (ja) | 2004-01-21 | 2012-02-15 | ノボ ノルディスク ヘルス ケア アクチェンゲゼルシャフト | ペプチドのトランスグルタミナーゼ媒介性の結合 |
RU2012156256A (ru) | 2010-06-04 | 2014-07-20 | ТРИФОЙЛИУМ АпС | Факторы трилистника (tff) для лечения хронических заболеваний легких |
CN102526702A (zh) * | 2010-12-23 | 2012-07-04 | 中国医学科学院基础医学研究所 | 小肽tff3治疗代谢综合征的用途 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0573544B1 (en) * | 1991-02-14 | 2002-05-29 | The General Hospital Corporation | Intestinal trefoil proteins |
-
1995
- 1995-08-25 ES ES95929783T patent/ES2267104T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-08-25 UA UA97020840A patent/UA68324C2/uk unknown
- 1995-08-25 EP EP95929783A patent/EP0777687B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-08-25 WO PCT/DK1995/000343 patent/WO1996006861A1/en active IP Right Grant
- 1995-08-25 AU AU33415/95A patent/AU694796B2/en not_active Ceased
- 1995-08-25 CZ CZ1997548A patent/CZ289705B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-08-25 JP JP8508422A patent/JPH10504720A/ja not_active Ceased
- 1995-08-25 MX MX9701239A patent/MX9701239A/es active IP Right Grant
- 1995-08-25 EP EP06115209A patent/EP1739091A1/en not_active Withdrawn
- 1995-08-25 KR KR1019970700968A patent/KR100255911B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1995-08-25 CA CA002196876A patent/CA2196876C/en not_active Expired - Fee Related
- 1995-08-25 BR BR9508773A patent/BR9508773A/pt not_active IP Right Cessation
- 1995-08-25 CN CN95194798A patent/CN1070867C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1995-08-25 DK DK95929783T patent/DK0777687T3/da active
- 1995-08-25 AT AT95929783T patent/ATE329929T1/de active
- 1995-08-25 PT PT95929783T patent/PT777687E/pt unknown
- 1995-08-25 PL PL95318785A patent/PL184516B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1995-08-25 RU RU97104484/13A patent/RU2162857C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1995-08-25 HU HU9801427A patent/HU226921B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1995-08-25 DE DE69535060T patent/DE69535060T2/de not_active Expired - Lifetime
-
1997
- 1997-02-25 NO NO19970844A patent/NO323642B1/no not_active IP Right Cessation
- 1997-02-25 FI FI970783A patent/FI119989B/fi not_active IP Right Cessation
-
1999
- 1999-10-13 CZ CZ19993618A patent/CZ289864B6/cs not_active IP Right Cessation
-
2001
- 2001-11-28 JP JP2001363220A patent/JP4156829B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-12-20 JP JP2006343522A patent/JP2007161720A/ja active Pending
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Thim, R. Digestion 55. - 1994, 353 - 360. Poulsom R., Wright N.A. Am.J. Physiol. 265. - 1993, G205 - G213. Hoffmann W., and Hauser F. Trends Biochem. Sci.7. - 1993, 239 - 243. * |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2162857C2 (ru) | Димер "клеверного" пептида | |
KR100611130B1 (ko) | 식욕억제펩티드로이루어진약학적조성물의사용 | |
KR101651703B1 (ko) | Fgf21 돌연변이체 및 이의 용도 | |
KR101699370B1 (ko) | 프로테아제 내성 인슐린 유사체 | |
US5912229A (en) | Use of a pharmaceutical composition comprising an appetite-suppressing peptide | |
KR100393508B1 (ko) | 인간 인터루킨 4의 안타고니스트 또는 부분적 아고니스트로서의 신규hIL-4 변이단백질 | |
US20050287640A1 (en) | Human spasmolytic polypeptide in glycosylated form | |
IE62422B1 (en) | Expression of humanproapolipoprotein a-i | |
JPH0780906B2 (ja) | Gm―csfの酸化型変異体 | |
JP2798573B2 (ja) | ヒト好中球エラスターゼ阻害活性を有する天然型ポリペプチドおよびそれを含有する医薬製剤 | |
FI104424B (fi) | Menetelmä onkostatiini M -mutantin valmistamiseksi | |
CN113144174A (zh) | 治疗高尿酸相关性疾病的药物 | |
JPH05202095A (ja) | 安定化生理活性ポリペプチド及びその用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20130826 |