RU2020115869A - Варианты корнулина (crnn) и их применение - Google Patents
Варианты корнулина (crnn) и их применение Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020115869A RU2020115869A RU2020115869A RU2020115869A RU2020115869A RU 2020115869 A RU2020115869 A RU 2020115869A RU 2020115869 A RU2020115869 A RU 2020115869A RU 2020115869 A RU2020115869 A RU 2020115869A RU 2020115869 A RU2020115869 A RU 2020115869A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cornulin
- seq
- protein
- nucleic acid
- loss
- Prior art date
Links
- 102100032202 Cornulin Human genes 0.000 title claims 105
- 101710148705 Cornulin Proteins 0.000 title claims 104
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims 85
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 77
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 66
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims 66
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 48
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims 30
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims 30
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 30
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 30
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims 23
- 208000017520 skin disease Diseases 0.000 claims 20
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 19
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 19
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 18
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 17
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 17
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims 14
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 12
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims 10
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims 9
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 8
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims 8
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 claims 6
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 5
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims 4
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims 4
- 108010008165 Etanercept Proteins 0.000 claims 4
- JAZBEHYOTPTENJ-JLNKQSITSA-N all-cis-5,8,11,14,17-icosapentaenoic acid Chemical group CC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O JAZBEHYOTPTENJ-JLNKQSITSA-N 0.000 claims 4
- 229960003735 brodalumab Drugs 0.000 claims 4
- 229960005135 eicosapentaenoic acid Drugs 0.000 claims 4
- JAZBEHYOTPTENJ-UHFFFAOYSA-N eicosapentaenoic acid Natural products CCC=CCC=CCC=CCC=CCC=CCCCC(O)=O JAZBEHYOTPTENJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 235000020673 eicosapentaenoic acid Nutrition 0.000 claims 4
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 claims 4
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 claims 4
- ZCCUUQDIBDJBTK-UHFFFAOYSA-N psoralen Chemical group C1=C2OC(=O)C=CC2=CC2=C1OC=C2 ZCCUUQDIBDJBTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N salicylic acid Chemical group OC(=O)C1=CC=CC=C1O YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 4
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 claims 4
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 claims 4
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 claims 4
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 claims 4
- 150000003722 vitamin derivatives Chemical class 0.000 claims 4
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 13-cis retinol Natural products OCC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- VXGRJERITKFWPL-UHFFFAOYSA-N 4',5'-Dihydropsoralen Natural products C1=C2OC(=O)C=CC2=CC2=C1OCC2 VXGRJERITKFWPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- MJZJYWCQPMNPRM-UHFFFAOYSA-N 6,6-dimethyl-1-[3-(2,4,5-trichlorophenoxy)propoxy]-1,6-dihydro-1,3,5-triazine-2,4-diamine Chemical group CC1(C)N=C(N)N=C(N)N1OCCCOC1=CC(Cl)=C(Cl)C=C1Cl MJZJYWCQPMNPRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N Cyclosporin A Chemical group CC[C@@H]1NC(=O)[C@H]([C@H](O)[C@H](C)C\C=C\C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C1=O PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N 0.000 claims 2
- 229930105110 Cyclosporin A Natural products 0.000 claims 2
- 108010036949 Cyclosporine Proteins 0.000 claims 2
- 201000004624 Dermatitis Diseases 0.000 claims 2
- 206010012438 Dermatitis atopic Diseases 0.000 claims 2
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 claims 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical group O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-BOOMUCAASA-N Vitamin A Natural products OC/C=C(/C)\C=C\C=C(\C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-BOOMUCAASA-N 0.000 claims 2
- 229930003316 Vitamin D Natural products 0.000 claims 2
- QYSXJUFSXHHAJI-XFEUOLMDSA-N Vitamin D3 Natural products C1(/[C@@H]2CC[C@@H]([C@]2(CCC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)=C/C=C1\C[C@@H](O)CCC1=C QYSXJUFSXHHAJI-XFEUOLMDSA-N 0.000 claims 2
- 229960002964 adalimumab Drugs 0.000 claims 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N all-trans-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N 0.000 claims 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 2
- 201000008937 atopic dermatitis Diseases 0.000 claims 2
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 claims 2
- 229960001265 ciclosporin Drugs 0.000 claims 2
- 239000003246 corticosteroid Substances 0.000 claims 2
- 229940010466 cosentyx Drugs 0.000 claims 2
- 229930182912 cyclosporin Natural products 0.000 claims 2
- 229940073621 enbrel Drugs 0.000 claims 2
- 229960000403 etanercept Drugs 0.000 claims 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims 2
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 claims 2
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 claims 2
- 229940048921 humira Drugs 0.000 claims 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims 2
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 claims 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 2
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N papa-hydroxy-benzoic acid Natural products OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 claims 2
- 230000004044 response Effects 0.000 claims 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 claims 2
- 229960004889 salicylic acid Drugs 0.000 claims 2
- 229960004540 secukinumab Drugs 0.000 claims 2
- 229940071598 stelara Drugs 0.000 claims 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims 2
- 229940060681 taltz Drugs 0.000 claims 2
- 229960003824 ustekinumab Drugs 0.000 claims 2
- 235000019155 vitamin A Nutrition 0.000 claims 2
- 239000011719 vitamin A Substances 0.000 claims 2
- 235000019166 vitamin D Nutrition 0.000 claims 2
- 239000011710 vitamin D Substances 0.000 claims 2
- 150000003710 vitamin D derivatives Chemical class 0.000 claims 2
- 229940045997 vitamin a Drugs 0.000 claims 2
- 229940046008 vitamin d Drugs 0.000 claims 2
- 230000004075 alteration Effects 0.000 claims 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 claims 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 claims 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/045—Hydroxy compounds, e.g. alcohols; Salts thereof, e.g. alcoholates
- A61K31/05—Phenols
- A61K31/06—Phenols the aromatic ring being substituted by nitro groups
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/185—Acids; Anhydrides, halides or salts thereof, e.g. sulfur acids, imidic, hydrazonic or hydroximic acids
- A61K31/19—Carboxylic acids, e.g. valproic acid
- A61K31/20—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having a carboxyl group bound to a chain of seven or more carbon atoms, e.g. stearic, palmitic, arachidic acids
- A61K31/202—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having a carboxyl group bound to a chain of seven or more carbon atoms, e.g. stearic, palmitic, arachidic acids having three or more double bonds, e.g. linolenic
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
- A61K31/365—Lactones
- A61K31/366—Lactones having six-membered rings, e.g. delta-lactones
- A61K31/37—Coumarins, e.g. psoralen
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
- A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
- A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/56—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids
- A61K31/57—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids substituted in position 17 beta by a chain of two carbon atoms, e.g. pregnane or progesterone
- A61K31/573—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids substituted in position 17 beta by a chain of two carbon atoms, e.g. pregnane or progesterone substituted in position 21, e.g. cortisone, dexamethasone, prednisone or aldosterone
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/04—Peptides having up to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- A61K38/12—Cyclic peptides, e.g. bacitracins; Polymyxins; Gramicidins S, C; Tyrocidins A, B or C
- A61K38/13—Cyclosporins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/177—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- A61K38/1793—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
- A61K39/39533—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals
- A61K39/3955—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals against proteinaceous materials, e.g. enzymes, hormones, lymphokines
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/536—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with immune complex formed in liquid phase
- G01N33/537—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with immune complex formed in liquid phase with separation of immune complex from unbound antigen or antibody
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Dermatology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
Claims (170)
1. кДНК, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую белок корнулин, усеченный по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
2. кДНК по п. 1, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
3. кДНК по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
4. кДНК по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
5. кДНК по п. 1, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 8 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности из SEQ ID NO: 8 и содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
6. кДНК по п. 1, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 10.
7. кДНК по любому из пп. 1-6, отличающаяся тем, что указанная кДНК содержит тимин в положении, соответствующем положению 205 в соответствии с SEQ ID NO: 6.
8. кДНК по п. 7, отличающаяся тем, что указанная кДНК содержит кодоны ACT и TGT в положениях, соответствующих положениям 202-204 и 205- 207 соответственно, в соответствии с SEQ ID NO: 6.
9. кДНК по п. 7, отличающаяся тем, что указанная кДНК содержит SEQ ID NO:6.
10. Вектор, содержащий кДНК по любому из пп. 1-9.
11. Вектор по п. 10, отличающийся тем, что указанный вектор представляет собой плазмиду.
12. Вектор по п. 10, отличающийся тем, что указанный вектор представляет собой вирус.
13. Клетка-хозяин, содержащая кДНК по любому из пп. 1-9.
14. Клетка-хозяин, содержащая вектор по любому из пп. 10-12.
15. Клетка-хозяин по п. 13 или 14, отличающаяся тем, что кДНК функционально связана с активным промотором в клетке-хозяине.
16. Клетка-хозяин по п. 15, отличающаяся тем, что указанный промотор представляет собой экзогенный промотор.
17. Клетка-хозяин по п. 15 или 16, отличающаяся тем, что указанный промотор представляет собой индуцибельный промотор.
18. Клетка-хозяин по любому из пп. 13-17, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой клетку млекопитающего.
19. Способ идентификации субъекта-человека, имеющего кожное заболевание или риск развития кожного заболевания, отличающийся тем, что указанный способ включает обнаружение в образце, полученном от субъекта, наличия или отсутствия: белка корнулина с потерей функции; и/или молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции; при этом присутствие белка корнулина с потерей функции и/или молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции, указывает на то, что у субъекта имеется кожное заболевание или существует риск развития кожного заболевания.
20. Способ по п. 19, отличающийся тем, что кожное заболевание представляет собой псориаз, экзему или атопический дерматит.
21. Способ по п. 19, отличающийся тем, что кожное заболевание представляет собой псориаз.
22. Способ по любому из пп. 19-21, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции представляет собой усеченный белок корнулин.
23. Способ по любому из пп. 19-22, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
24. Способ по любому из пп. 19-23, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8, и усекается по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что указанный усеченный белок корнулин содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
26. Способ по п. 24 или 25, отличающийся тем, что указанный усеченный белок корнулин содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
27. Способ по любому из пп. 19-26, отличающийся тем, что указанный способ представляет собой способ in vitro.
28. Способ по любому из пп. 19-27, отличающийся тем, что наличие или отсутствие белка корнулина с потерей функции в образце обнаруживают с помощью антитела, которое специфично для белка корнулина с потерей функции.
29. Способ по п. 28, отличающийся тем, что указанное антитело, которое специфично для белка корнулина с потерей функции, специфично для: i) цистеина в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO:8; или ii) эпитопа, созданного в белке корнулине с потерей функции из-за мутации со сдвигом рамки, которая приводит к цистеину в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
30. Способ по п. 28 или 29, отличающийся тем, что указанное обнаружение дополнительно включает сравнение реакции антитела, которое является специфичным для белка корнулина с потерей функции, с реакцией антитела, которое является специфичным для корнулина дикого типа.
31. Способ по любому из пп. 19-30, отличающийся тем, что наличие или отсутствие белка корнулина с потерей функции в образце обнаруживают с помощью иммуноферментного анализа (ИФА).
32. Способ по любому из пп. 19-30, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит SEQ ID NO: 8.
33. Способ по любому из пп. 19-27, отличающийся тем, что наличие или отсутствие молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции, в образце обнаруживают путем определения наличия мутации со сдвигом рамки в молекуле нуклеиновой кислоты, создающей кодон, кодирующий цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
34. Способ по любому из пп. 19-33, отличающийся тем, что этап обнаружения включает сиквенирование по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует белок корнулин с потерей функции, при этом сиквенированная молекула нуклеиновой кислоты кодирует белок корнулин, усеченный по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
35. Способ по п. 34, отличающийся тем, что сиквенированная часть молекулы нуклеиновой кислоты содержит множество положений, охватывающих кодон, кодирующий положение, соответствующее положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
36. Способ по п. 34 или 35, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает сиквенирование всей молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции.
37. Способ по любому из пп. 19-27, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает: амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует белок корнулин, при этом амплифицированная молекула нуклеиновой кислоты охватывает кодон, кодирующий аминокислоту, в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8; мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты с детектируемой меткой; приведение в контакт меченой молекулы нуклеиновой кислоты с подложкой, содержащей зонд, при этом указанный зонд содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая специфически гибридизуется в строгих условиях с последовательностью нуклеиновой кислоты, охватывающей кодон, кодирующий цистеин, в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8; и обнаружение обнаруживаемой метки.
38. Способ по п. 37, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты в образце представляет собой мРНК, и стадия обнаружения дополнительно включает обратную транскрипцию мРНК в кДНК до стадии амплификации.
39. Способ по любому из пп. 19-27, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает: приведение в контакт молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует белок корнулин, с зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом указанный зонд содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая специфически гибридизуется в строгих условиях с последовательностью нуклеиновой кислоты, охватывающей кодон, кодирующий цистеин, в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8; и обнаружение обнаруживаемой метки.
40. Способ по п. 39, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты присутствует в клетке, полученной от субъекта-человека.
41. Способ по любому из пп. 19-26 и 33-40, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок корнулин с потерей функции, представляет собой геномную ДНК.
42. Способ по п. 41, отличающийся тем, что геномная ДНК содержит SEQ ID NO: 2.
43. Способ по любому из пп. 19-26 и 33-40, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок корнулин с потерей функции, представляет собой мРНК.
44. Способ по п. 43, отличающийся тем, что мРНК содержит SEQ ID NO: 4.
45. Способ по любому из пп. 19-26 и 33-40, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок корнулин с потерей функции, представляет собой кДНК.
46. Способ по п. 45, отличающийся тем, что кДНК содержит SEQ ID NO: 6.
47. Способ диагностики кожного заболевания или выявления риска развития кожного заболевания у человека, включающий: обнаружение молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции, полученный от субъекта-человека; и/или обнаружение белка корнулина с потерей функции, полученного от субъекта-человека; и диагностирование у субъекта-человека кожного заболевания, если у субъекта имеется один или более симптомов кожного заболевания, или диагностирование у субъекта-человека риска развития кожного заболевания, если у субъекта нет одного или более симптомов кожного заболевания.
48. Способ по п. 47, отличающийся тем, что кожное заболевание представляет собой псориаз, экзему или атопический дерматит.
49. Способ по п. 47, отличающийся тем, что кожное заболевание представляет собой псориаз.
50. Способ по любому из пп. 47-49, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции представляет собой усеченный белок корнулин.
51. Способ по любому из пп. 47-50, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
52. Способ по любому из пп. 47-51, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8, и усекается по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
53. Способ по п. 52, отличающийся тем, что указанный усеченный белок корнулин содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
54. Способ по п. 52 или 53, отличающийся тем, что указанный усеченный белок корнулин содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
55. Способ по любому из пп. 47-54, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции обнаруживают с помощью антитела, которое специфично к белку корнулину с потерей функции.
56. Способ по п. 55, отличающийся тем, что указанное антитело, которое специфично для белка корнулина с потерей функции, специфично к: i) цистеину в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO:8; или ii) эпитопу, созданному в белке корнулине из-за мутации со сдвигом рамки, которая приводит к цистеину в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
57. Способ по п. 55 или 56, отличающийся тем, что обнаружение дополнительно включает сравнение реакции антитела, которое является специфичным для белка корнулина с потерей функции, с реакцией антитела, которое является специфичным для корнулина дикого типа.
58. Способ по любому из пп. 52-57, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции обнаруживают с помощью иммуноферментного анализа (ИФА).
59. Способ по любому из пп. 47-58, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит SEQ ID NO: 8.
60. Способ по пп. 47-54, отличающийся тем, что молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую белок корнулин с потерей функции, обнаруживают путем обнаружения мутации со сдвигом рамки в молекуле нуклеиновой кислоты, создающей кодон, кодирующий цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
61. Способ по любому из пп. 47-54 и п. 60, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает сиквенирование по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует белок корнулин с потерей функции.
62. Способ по п. 61, отличающийся тем, что сиквенированная часть молекулы нуклеиновой кислоты содержит множество положений, охватывающих кодон, кодирующий положение, соответствующее положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
63. Способ по любому из пп. 47-54 и 60-62, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает сиквенирование всей молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции.
64. Способ по любому из пп. 47-54 и 60-63, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает: амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует белок корнулин с потерей функции, при этом амплифицированная молекула нуклеиновой кислоты охватывает кодон, кодирующий аминокислоту, в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8; мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; приведение в контакт меченой молекулы нуклеиновой кислоты с подложкой, содержащей зонд, при этом указанный зонд содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая специфически гибридизуется в строгих условиях с последовательностью нуклеиновой кислоты, охватывающей кодон, кодирующий цистеин, в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8; и обнаружение обнаруживаемой метки.
65. Способ по п. 64, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты представляет собой мРНК, и указанный способ дополнительно включает обратную транскрипцию мРНК в кДНК до стадии амплификации.
66. Способ по любому из пп. 47-54 и 60-65, отличающийся тем, что стадия обнаружения включает: приведение в контакт молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует белок корнулин с потерей функции, с зондом, содержащим детектируемую метку, при этом указанный зонд содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая специфически гибридизуется в строгих условиях с последовательностью нуклеиновой кислоты, охватывающей кодон, кодирующий цистеин, в положении, соответствующем положению 69, в соответствии с SEQ ID NO: 8; и обнаружение обнаруживаемой метки.
67. Способ по п. 66, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты присутствует в клетке, полученной от субъекта-человека.
68. Способ по любому из пп. 47-54 и 60-67, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок корнулин с потерей функции, представляет собой геномную ДНК.
69. Способ по п. 68, отличающийся тем, что геномная ДНК содержит SEQ ID NO: 2.
70. Способ по любому из пп. 47-54 и 60-67, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок корнулин с потерей функции, представляет собой мРНК.
71. Способ по п. 70, отличающийся тем, что мРНК содержит SEQ ID NO: 4.
72. Способ по любому из пп. 47-54 и 60-67, отличающийся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок корнулин с потерей функции, представляет собой кДНК.
73. Способ по п. 72, отличающийся тем, что кДНК содержит SEQ ID NO: 6.
74. Способ по любому из пп. 47-73, отличающийся тем, что указанный способ дополнительно включает лечение субъекта агентом, эффективным для лечения конкретного кожного заболевания, когда у субъекта обнаружен белок корнулин с потерей функции и у субъекта диагностировано кожное заболевание.
75. Способ по п. 73, отличающийся тем, что указанный агент, эффективный для лечения кожного заболевания, содержит витамин.
76. Способ по п. 75, отличающийся тем, что указанный витамин представляет собой Витамин А или Витамин D.
77. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой салициловую кислоту.
78. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой эйкозапентаеновую кислоту (ЭПК).
79. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой кортикостероид.
80. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой псорален.
81. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой метотрексат.
82. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой циклоспорин.
83. Способ по п. 74, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой антитело.
84. Способ по п. 83, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой адалимумаб (Humira®).
85. Способ по п. 83, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой бродалумаб (Siliq®).
86. Способ по п. 83, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой этанерцепт (Enbrel®).
87. Способ по п. 83, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой иксекизумаб (Taltz®).
88. Способ по п. 83, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой секукинумаб (Cosentyx®).
89. Способ по п. 83, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой устекинумаб (Stelara®).
90. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую белок корнулин с потерей функции, или комплементарную последовательность нуклеиновой кислоты.
91. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 90, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции представляет собой усеченный белок корнулин.
92. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 90 или 91, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
93. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-92, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8, и усекается по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
94. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 93, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
95. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 93 или 94, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79, в соответствии с SEQ ID NO: 8.
96. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-95, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 8, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности из SEQ ID NO: 8 и содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
97. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-96, отличающаяся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 10.
98. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-97, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты содержит ДНК.
99. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 98, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты представляет собой геномную ДНК и содержит тимин в положении, соответствующем положению 3375 в соответствии с SEQ ID NO: 2.
100. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 99, отличающаяся тем, что геномная ДНК содержит SEQ ID NO: 2.
101. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 98, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты представляет собой кДНК и содержит тимин в положении, соответствующем положению 205 в соответствии с SEQ ID NO: 6.
102. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 101, отличающаяся тем, что кДНК содержит SEQ ID NO: 6.
103. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-97, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты содержит РНК.
104. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 103, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты представляет собой мРНК и содержит урацил в положении, соответствующем положению 205 в соответствии с SEQ ID NO: 4.
105. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п. 103 или 104, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты представляет собой мРНК и содержит кодоны ACU и UGU в положениях, соответствующих положениям 202-204 и 205-207 соответственно, в соответствии с SEQ ID NO: 4.
106. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 103-105, отличающаяся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты содержит SEQ ID NO: 4.
107. Вектор, содержащий выделенную молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-106.
108. Вектор по п. 107, отличающийся тем, что указанный вектор представляет собой плазмиду.
109. Вектор по п. 107, отличающийся тем, что указанный вектор представляет собой вирус.
110. Клетка-хозяин, содержащая выделенную молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп. 90-106.
111. Клетка-хозяин, содержащая вектор по любому из пп. 107-109.
112. Клетка-хозяин по п. 110 или 111, отличающаяся тем, что указанная последовательность нуклеиновой кислоты функционально связана с активным промотором в указанной клетке-хозяине.
113. Клетка-хозяин по п. 112, отличающаяся тем, что указанный промотор представляет собой экзогенный промотор.
114. Клетка-хозяин по п. 112 или 113, отличающаяся тем, что указанный промотор представляет собой индуцибельный промотор.
115. Клетка-хозяин по любому из пп. 110-114, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой клетку млекопитающего.
116. Выделенный или рекомбинантный полипептид, содержащий белок корнулин с потерей функции.
117. Выделенный или рекомбинантный полипептид по п. 116, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции представляет собой усеченный белок корнулин.
118. Выделенный или рекомбинантный полипептид по п. 116 или 117, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
119. Выделенный или рекомбинантный полипептид по любому из пп. 116-118, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8, и усекается по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
120. Выделенный или рекомбинантный полипептид по п. 119, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
121. Выделенный или рекомбинантный полипептид по п. 119 или 120, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79, в соответствии с SEQ ID NO: 8.
122. Выделенный или рекомбинантный полипептид по любому из пп. 116-121, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 8, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности из SEQ ID NO: 8 и содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
123. Выделенный или рекомбинантный полипептид по любому из пп. 116-122, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 10.
124. Выделенный или рекомбинантный полипептид по любому из пп. 116-123, отличающийся тем, что указанный полипептид слит с гетерологичным полипептидом.
125. Выделенный или рекомбинантный полипептид по п. 124, отличающийся тем, что гетерологичный полипептид содержит пептидный тэг для очистки, флуоресцентный белок или/и пептидный тэг для очистки, и флуоресцентный белок.
126. Выделенный или рекомбинантный полипептид по любому из пп. 116-123, отличающийся тем, что указанный полипептид связан с обнаруживаемой меткой.
127. Выделенный или рекомбинантный полипептид по п. 126, отличающийся тем, что обнаруживаемая метка представляет собой флуоресцентную метку или радиоактивную метку.
128. Композиция, содержащая выделенный или рекомбинантный полипептид по любому из пп. 116-127 и носитель.
129. Зонд или праймер, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую по меньшей мере около 15 нуклеотидов, которые специфически гибридизуются с молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую белок корнулин с потерей функции, имеющий цистеин в положении, соответствующем положению 69, в соответствии с SEQ ID NO: 8, и усекающийся по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8, или которая специфически гибридизуется с комплементарной последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции.
130. Зонд или праймер по п. 129, отличающиеся тем, что указанные зонд или праймер содержат ДНК.
131. Зонд или праймер по п. 129, отличающиеся тем, что указанные зонд или праймер содержат РНК.
132. Зонд или праймер по любому из пп. 129-131, отличающиеся тем, что указанные зонд или праймер специфически гибридизуются с частью молекулы нуклеиновой кислоты, охватывающей кодон, который кодирует цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
133. Зонд или праймер по любому из пп. 129-132, отличающиеся тем, что указанные зонд или праймер специфически гибридизуются с последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции, или ее комплементом в строгих условиях.
134. Зонд или праймер по любому из пп. 129-133, отличающиеся тем, что указанные зонд или праймер содержат метку.
135. Зонд или праймер по п. 134, отличающиеся тем, что метка представляет собой флуоресцентную метку, радиоактивную метку или биотин.
136. Подложка, содержащая субстрат, к которому прикреплен зонд по любому из пп. 129-133.
137. Подложка по п. 136, отличающаяся тем, что указанная подложка представляет собой микромассив.
138. Специфичный для изменения зонд или праймер, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, которая комплементарна последовательности нуклеиновой кислоты молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей белок корнулин с потерей функции, усеченный по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8, при этом указанные специфичные для изменения зонд или праймер содержат последовательность нуклеиновой кислоты, которая комплементарна части молекулы нуклеиновой кислоты, охватывающей кодон, который кодирует цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
139. Специфичные для изменения зонд или праймер по п. 138, отличающиеся тем, что указанные специфичные для изменения зонд или праймер содержат по меньшей мере около 15 нуклеотидов.
140. Агент для применения при лечении кожных заболеваний у субъекта-человека, имеющего белок корнулин с потерей функции.
141. Агент для применения по п. 140, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции представляет собой усеченный белок корнулин.
142. Агент для применения по п. 140 или 141, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
143. Агент для применения по любому из пп. 140-142, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8, и усекается по положению, соответствующему положению 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
144. Агент для применения по п. 143, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
145. Агент для применения по п. 143 или 144, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79, в соответствии с SEQ ID NO: 8.
146. Агент для применения по любому из пп. 140-145, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 8 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности из SEQ ID NO: 8 и содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
147. Агент для применения по любому из пп. 140-146, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность в соответствии с SEQ ID NO: 10.
148. Агент для применения по любому из пп. 140-147, отличающийся тем, что субъект-человек продемонстрировал положительный результат на белок корнулин с потерей функции и/или на молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую белок корнулин с потерей функции.
149. Агент для применения по любому из пп. 140-148, отличающийся тем, что лечение включает стадию определения того, имеет ли субъект-человек белок корнулин с потерей функции и/или молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую белок корнулин с потерей функции.
150. Агент для применения по любому из пп. 140-149, отличающийся тем, что субъект-человек идентифицирован как имеющий кожное заболевание или имеющий риск развития кожного заболевания с использованием любого способа, как определено в любом из пп. 1-69.
151. Агент для применения по любому из пп. 140-150, отличающийся тем, что субъект-человек идентифицирован как имеющий псориаз или риск развития псориаза.
152. Агент для применения по любому из пп. 140-151, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислоту, отличную от белка корнулина дикого типа, в любом из положений, соответствующих положениям 69-76, 78 и 79 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
153. Агент для применения по любому из пп. 140-152, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
154. Агент для применения по любому из пп. 140-153, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 10 в положениях, соответствующих положениям 69-79, в соответствии с SEQ ID NO: 8.
155. Агент для применения по любому из пп. 140-154, отличающийся тем, что указанный белок корнулин с потерей функции содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 8 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности из SEQ ID NO: 8 и содержит цистеин в положении, соответствующем положению 69 в соответствии с SEQ ID NO: 8.
156. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент содержит витамин.
157. Агент для применения по п. 156, отличающийся тем, что указанный витамин представляет собой Витамин А или Витамин D.
158. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой салициловую кислоту.
159. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой эйкозапентаеновую кислоту (ЭПК).
160. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой кортикостероид.
161. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой псорален.
162. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой метотрексат.
163. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой циклоспорин.
164. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанный агент представляет собой антитело.
165. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой адалимумаб (Humira®).
166. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой бродалумаб (Siliq®).
167. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой этанерцепт (Enbrel®).
168. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой иксекизумаб (Taltz®).
169. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой секукинумаб (Cosentyx®).
170. Агент для применения по любому из пп. 140-155, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой устекинумаб (Stelara®).
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201762572958P | 2017-10-16 | 2017-10-16 | |
US62/572,958 | 2017-10-16 | ||
PCT/US2018/055995 WO2019079238A1 (en) | 2017-10-16 | 2018-10-16 | CORNULIN VARIANTS (CRNN) AND USES THEREOF |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020115869A true RU2020115869A (ru) | 2021-11-19 |
RU2020115869A3 RU2020115869A3 (ru) | 2022-01-26 |
Family
ID=64110144
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2020115869A RU2020115869A (ru) | 2017-10-16 | 2018-10-16 | Варианты корнулина (crnn) и их применение |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US11098363B2 (ru) |
EP (1) | EP3697807A1 (ru) |
JP (1) | JP2021501601A (ru) |
KR (1) | KR20200065045A (ru) |
CN (1) | CN111315765A (ru) |
AU (1) | AU2018352234A1 (ru) |
CA (1) | CA3079167A1 (ru) |
IL (1) | IL273671A (ru) |
MX (1) | MX2020003565A (ru) |
RU (1) | RU2020115869A (ru) |
SG (1) | SG11202002822XA (ru) |
WO (1) | WO2019079238A1 (ru) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP4037481B1 (en) | 2019-10-03 | 2024-09-11 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | A crnn loss of function rodent model |
KR102742136B1 (ko) | 2020-05-29 | 2024-12-11 | 주식회사 엘지에너지솔루션 | 양극 스크랩을 이용한 활물질 재사용 방법 |
Family Cites Families (33)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4634665A (en) | 1980-02-25 | 1987-01-06 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials |
US5179017A (en) | 1980-02-25 | 1993-01-12 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials |
US4399216A (en) | 1980-02-25 | 1983-08-16 | The Trustees Of Columbia University | Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials |
US4751180A (en) | 1985-03-28 | 1988-06-14 | Chiron Corporation | Expression using fused genes providing for protein product |
US4935233A (en) | 1985-12-02 | 1990-06-19 | G. D. Searle And Company | Covalently linked polypeptide cell modulators |
US5294533A (en) | 1988-07-05 | 1994-03-15 | Baylor College Of Medicine | Antisense oligonucleotide antibiotics complementary to the macromolecular synthesis operon, methods of treating bacterial infections and methods for identification of bacteria |
US5135917A (en) | 1990-07-12 | 1992-08-04 | Nova Pharmaceutical Corporation | Interleukin receptor expression inhibiting antisense oligonucleotides |
US5271941A (en) | 1990-11-02 | 1993-12-21 | Cho Chung Yoon S | Antisense oligonucleotides of human regulatory subunit RI.sub.α of cAMP-dependent protein kinases |
US5786138A (en) | 1993-01-29 | 1998-07-28 | Board Of Supervisors Of Louisiana State University And Agricultural And Mechanical College | Hyperstabilizing antisense nucleic acid binding agents |
CA2164288A1 (en) | 1993-06-04 | 1994-12-22 | Barbara Ensoli | Method for treating kaposi's sarcoma with antisense oligonucleotides |
US5578716A (en) | 1993-12-01 | 1996-11-26 | Mcgill University | DNA methyltransferase antisense oligonucleotides |
US5641754A (en) | 1994-01-10 | 1997-06-24 | The Board Of Regents Of The University Of Nebraska | Antisense oligonucleotide compositions for selectively killing cancer cells |
EP0775204A1 (en) | 1994-08-09 | 1997-05-28 | Novartis AG | Antitumor antisense oligonucleotides |
US5856103A (en) | 1994-10-07 | 1999-01-05 | Board Of Regents The University Of Texas | Method for selectively ranking sequences for antisense targeting |
US5994320A (en) | 1995-02-06 | 1999-11-30 | Regents Of The University Of Minnesota | Antisense oligonucleotides and methods for treating central nervous system tumors |
IT1275862B1 (it) | 1995-03-03 | 1997-10-24 | Consiglio Nazionale Ricerche | Trascritto antisenso associato ad alcuni tipi di cellule tumorali ed oligodeossinucleotidi sintetici utili nella diagnosi e nel trattamento |
US6040296A (en) | 1995-06-07 | 2000-03-21 | East Carolina University | Specific antisense oligonucleotide composition & method for treatment of disorders associated with bronchoconstriction and lung inflammation |
AU7286696A (en) | 1995-10-13 | 1997-05-07 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Antisense oligomers |
SI9620122A (sl) | 1995-11-21 | 1999-04-30 | Icn Pharmaceuticals, Inc. | Inhibicija rasti tumorjev z antisense oligonukleotidi za IL-8 in za receptor za IL-8 |
WO1997029757A1 (en) | 1996-02-15 | 1997-08-21 | National Institutes Of Health | Rnase l activators and antisense oligonucleotides effective to treat rsv infections |
US5955590A (en) | 1996-07-15 | 1999-09-21 | Worcester Foundation For Biomedical Research | Conjugates of minor groove DNA binders with antisense oligonucleotides |
US6046004A (en) | 1997-02-27 | 2000-04-04 | Lorne Park Research, Inc. | Solution hybridization of nucleic acids with antisense probes having modified backbones |
JPH1142091A (ja) | 1997-07-25 | 1999-02-16 | Toagosei Co Ltd | アンチセンス核酸化合物 |
CA2248762A1 (en) | 1997-10-22 | 1999-04-22 | University Technologies International, Inc. | Antisense oligodeoxynucleotides regulating expression of tnf-.alpha. |
WO1999040189A2 (en) * | 1998-02-09 | 1999-08-12 | Genset | Cdnas encoding secreted proteins |
GB9805918D0 (en) * | 1998-03-19 | 1998-05-13 | Nycomed Amersham Plc | Sequencing by hybridisation |
US6007995A (en) | 1998-06-26 | 1999-12-28 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense inhibition of TNFR1 expression |
US6013522A (en) | 1999-02-23 | 2000-01-11 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense inhibition of human Smad1 expression |
US6025198A (en) | 1999-06-25 | 2000-02-15 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense modulation of Ship-2 expression |
US6033910A (en) | 1999-07-19 | 2000-03-07 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense inhibition of MAP kinase kinase 6 expression |
LT4289948T (lt) | 2012-05-25 | 2025-05-12 | The Regents Of The University Of California | Į rnr nukreipto tikslinio dnr modifikavimo ir į rnr nukreipto transkripcijos moduliavimo metodai ir kompozicijos |
KR102479178B1 (ko) | 2012-12-06 | 2022-12-19 | 시그마-알드리치 컴퍼니., 엘엘씨 | Crispr-기초된 유전체 변형과 조절 |
CN106620694B (zh) * | 2016-12-30 | 2019-12-27 | 西安交通大学 | Cornulin作为靶点在制备防治银屑病的药物中的应用 |
-
2018
- 2018-10-16 AU AU2018352234A patent/AU2018352234A1/en not_active Withdrawn
- 2018-10-16 WO PCT/US2018/055995 patent/WO2019079238A1/en active Application Filing
- 2018-10-16 CN CN201880072216.5A patent/CN111315765A/zh not_active Withdrawn
- 2018-10-16 CA CA3079167A patent/CA3079167A1/en active Pending
- 2018-10-16 MX MX2020003565A patent/MX2020003565A/es unknown
- 2018-10-16 SG SG11202002822XA patent/SG11202002822XA/en unknown
- 2018-10-16 JP JP2020542053A patent/JP2021501601A/ja not_active Withdrawn
- 2018-10-16 RU RU2020115869A patent/RU2020115869A/ru unknown
- 2018-10-16 US US16/161,331 patent/US11098363B2/en active Active
- 2018-10-16 KR KR1020207013082A patent/KR20200065045A/ko not_active Withdrawn
- 2018-10-16 EP EP18797344.1A patent/EP3697807A1/en not_active Withdrawn
-
2020
- 2020-03-29 IL IL273671A patent/IL273671A/en unknown
-
2021
- 2021-07-19 US US17/378,900 patent/US20220017964A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
MX2020003565A (es) | 2020-10-08 |
JP2021501601A (ja) | 2021-01-21 |
WO2019079238A1 (en) | 2019-04-25 |
US11098363B2 (en) | 2021-08-24 |
SG11202002822XA (en) | 2020-04-29 |
CN111315765A (zh) | 2020-06-19 |
IL273671A (en) | 2020-05-31 |
KR20200065045A (ko) | 2020-06-08 |
EP3697807A1 (en) | 2020-08-26 |
AU2018352234A1 (en) | 2020-04-23 |
RU2020115869A3 (ru) | 2022-01-26 |
CA3079167A1 (en) | 2019-04-25 |
US20190112663A1 (en) | 2019-04-18 |
US20220017964A1 (en) | 2022-01-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Zhou et al. | Mapping cell type-specific transcriptional enhancers using high affinity, lineage-specific Ep300 bioChIP-seq | |
Wu et al. | Vascular endothelial growth factor aggravates cerebral ischemia and reperfusion-induced blood-brain-barrier disruption through regulating LOC102640519/HOXC13/ZO-1 signaling | |
Singh et al. | Gene expression changes in peripheral blood mononuclear cells from multiple sclerosis patients undergoing β-interferon therapy | |
Ouellette et al. | Peptide localization and gene structure of cryptdin 4, a differentially expressed mouse Paneth cell α-defensin | |
Wei et al. | Comparative single-cell profiling reveals distinct cardiac resident macrophages essential for zebrafish heart regeneration | |
JP2015528295A5 (ru) | ||
RU2020115869A (ru) | Варианты корнулина (crnn) и их применение | |
WO2003007699A2 (en) | Transcription factors of cereals | |
JP2010068810A (ja) | 単球由来核酸および関連する組成物ならびに方法 | |
Banday et al. | Replication-dependent histone genes are actively transcribed in differentiating and aging retinal neurons | |
Kallin et al. | Cloning of a growth arrest-specific and transforming growth factor β-regulated gene, TI 1, from an epithelial cell line | |
Shaheduzzaman et al. | Effects of HIV-1 Nef on cellular gene expression profiles | |
Wang et al. | CC chemokine ligand 19 might act as the main bursal T cell chemoattractant factor during IBDV infection | |
NZ540669A (en) | Methods and kits for diagnosing and treating B-cell chronic lymphocytic leukemia (B-CLL) | |
CN113699156B (zh) | Pd-1核酸适配体、其筛选方法及应用 | |
KR101692545B1 (ko) | 중증 아벨리노 각막이상증과 관련된 돌연변이 및 그 용도 | |
Shu et al. | An RNA‑sequencing study identifies candidate genes for angiotensin II‑induced cardiac remodeling | |
JP2021501601A5 (ru) | ||
US9873890B2 (en) | Nucleic acid molecules encoding enzymes that confer disease resistance in jute | |
WO2018030459A1 (ja) | 膵がんでのcldn18-arhgap6融合遺伝子又はcldn18-arhgap26融合遺伝子の検出 | |
US20080248958A1 (en) | System for pulling out regulatory elements in vitro | |
JPWO2002050269A1 (ja) | アレルギー性疾患の検査方法 | |
US20160185835A1 (en) | Immune system mediator | |
IL272940B1 (en) | Single immunoglobulin interleukin-1 receptor related (sigirr) variants and uses thereof | |
Suzuki et al. | Molecular cloning and characterization of Nop25, a novel nucleolar RNA binding protein, highly conserved in vertebrate species |