RU2019142713A - Мультиплексная амплификация нуклеиновых кислот с введением концевых меток - Google Patents
Мультиплексная амплификация нуклеиновых кислот с введением концевых меток Download PDFInfo
- Publication number
- RU2019142713A RU2019142713A RU2019142713A RU2019142713A RU2019142713A RU 2019142713 A RU2019142713 A RU 2019142713A RU 2019142713 A RU2019142713 A RU 2019142713A RU 2019142713 A RU2019142713 A RU 2019142713A RU 2019142713 A RU2019142713 A RU 2019142713A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- strand
- binding site
- genomic dna
- transosome
- sequence
- Prior art date
Links
- 230000003321 amplification Effects 0.000 title claims 6
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 title claims 6
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 3
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title 1
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 30
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 27
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 24
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 claims 10
- 108010020764 Transposases Proteins 0.000 claims 10
- 102000008579 Transposases Human genes 0.000 claims 10
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 9
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 9
- 230000037452 priming Effects 0.000 claims 8
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 7
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 claims 4
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 claims 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims 4
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 claims 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims 2
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 claims 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 claims 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 2
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 claims 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 claims 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 1
- 108010012306 Tn5 transposase Proteins 0.000 claims 1
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 claims 1
- 108010009127 mu transposase Proteins 0.000 claims 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1082—Preparation or screening gene libraries by chromosomal integration of polynucleotide sequences, HR-, site-specific-recombination, transposons, viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
- C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/10—Nucleotidyl transfering
- C12Q2521/101—DNA polymerase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/50—Other enzymatic activities
- C12Q2521/507—Recombinase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
- C12Q2525/10—Modifications characterised by
- C12Q2525/155—Modifications characterised by incorporating/generating a new priming site
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2535/00—Reactions characterised by the assay type for determining the identity of a nucleotide base or a sequence of oligonucleotides
- C12Q2535/122—Massive parallel sequencing
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (50)
1. Способ амплификации ДНК, включающий
контактирование геномной ДНК с библиотекой транспосом, где каждая транспосома библиотеки, имеет две транспозазы и две транспозонные ДНК, в которой каждая транспозонная ДНК включает сайт связывания транспозазы и последовательность сайта связывания праймера, последовательность сайта связывания праймера, отличающуюся от сайта связывания праймера других членов библиотеки транспосом,
в котором библиотека транспосом связывается с целевыми местоположениями вдоль геномной ДНК, и транспозаза расщепляет геномную ДНК на множество двухцепочечных фрагментов геномной ДНК, представляющих библиотеку фрагментов геномной ДНК, где каждый двухцепочечный фрагмент геномной ДНК включает уникальную и/или отличающуюся последовательность сайта связывания праймера на каждом конце фрагмента геномной ДНК,
заполнение пробела между транспозонной ДНК и фрагментом геномной ДНК с образованием библиотеки продуктов удлинения фрагментов двухцепочечной геномной ДНК, имеющих уникальные и/или отличающиеся последовательности сайтов связывания праймеров на каждом конце, и
амплификацию продуктов удлинения двухцепочечных фрагментов геномной ДНК для получения ампликонов.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий секвенирование ампликонов.
3. Способ по п. 1, в котором каждая транспосома в библиотеке транспосом включает две отличающиеся последовательности сайта связывания праймеров.
4. Способ по п. 1, в котором каждая транспосома в библиотеке транспосом включает две идентичные последовательности сайта связывания праймеров в каждом транспозоне транспосомы, которые отличаются от последовательностей сайтов связывания праймеров других транспосом из данной библиотеки транспосом.
5. Способ по п. 1, в котором геномная ДНК представляет собой полную геномную ДНК, полученную из одиночной клетки.
6. Способ по п. 1, в котором транспозаза представляет собой транспозазу Tn5, транспозазу Mu, транспозазу Tn7 или транспозазу IS5.
7. Способ по п. 1, в котором ДНК транспозона включает двухцепочечный сайт связывания Tnp, размером 19 п.о., и выступ, при этом выступ включает уникальную и/или отличающуюся последовательность сайта связывания праймера на 5'-конце выступа.
8. Способ по п. 1, в котором связанные транспозазы удаляют из двухцепочечных фрагментов перед заполнением пробела и удлинением двухцепочечных фрагментов геномной ДНК.
9. Способ по п. 1, в котором геномную ДНК получают из пренатальной клетки.
10. Способ по п. 1, в котором геномную ДНК получают из раковой клетки.
11. Способ по п. 1, в котором геномную ДНК получают из циркулирующей в крови опухолевой клетки.
12. Способ по п. 1, в котором геномную ДНК получают из одиночной пренатальной клетки.
13. Способ по п. 1, в котором геномную ДНК получают из одиночной раковой клетки.
14. Способ по п. 1, в котором геномную ДНК получают из циркулирующей в крови одиночной опухолевой клетки.
15. Способ по п. 1, в котором геномная ДНК представляет собой продукт захвата конформации хроматина из одиночной клетки или небольшого образца.
16. Способ по п. 1, в котором геномная ДНК представляет собой нативный или фиксированный хроматин из одиночной клетки или незначительного количества образцов.
17. Способ по п. 1, в котором уникальная и отличающаяся последовательность сайта связывания праймера представляет собой специфический сайт связывания ПЦР-праймера.
18. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 1 до 100 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
19. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 1 до 10 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
20. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 5 до 50 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
21. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 30 до 100 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
22. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 15 до 25 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
23. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 100 до 1000 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
24. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 1000 до 10000 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
25. Способ по п. 1, в котором библиотека транспосом включает от 10000 до 100000 уникальных и отличающихся последовательностей сайта связывания праймера.
26. Способ по п. 1, в котором различные последовательности сайтов связывания праймеров ортогональны.
27. Способ создания ампликонов двухцепочечной ДНК, имеющих уникальные и/или отличающиеся последовательности сайтов праймирования на каждом конце, включающий
разделение целевой двухцепочечной ДНК, имеющей последовательность связывания с транспозазой и одинаковую последовательность сайта праймирования на каждом конце, на первую одинарную цепь и вторую цепь,
гибридизацию с первой цепью первого праймера, имеющего первую последовательность, комплементарную сайту связывания транспозазы, и вторую последовательность, не комплементарную последовательности сайта праймирования,
гибридизацию со второй цепью второго праймера, имеющего первую последовательность, комплементарную сайту связывания транспозазы, и вторую последовательность, комплементарную последовательности сайта праймирования,
удлинение первого праймера вдоль первой цепи и удлинение второго праймера вдоль второй цепи и
амплификацию продуктов удлинения для получения двухцепочечных ампликонов ДНК, имеющих уникальные и/или отличающиеся последовательности сайтов праймирования на каждом конце.
28. Способ амплификации двух цепей последовательности двухцепочечной нуклеиновой кислоты, имеющей разные сайты праймирования на каждом конце, включающий
разделение двухцепочечной последовательности нуклеиновой кислоты на первую цепь и вторую цепь,
амплификацию первой цепи в отсутствие второй цепи для создания ампликонов первой цепи,
амплификацию второй цепи в отсутствие первой цепи для создания ампликонов второй цепи,
секвенирование ампликонов первой цепи и
секвенирование ампликонов второй цепи.
29. Способ по п. 28, дополнительно включающий
отжиг 3'-конца первой цепи и второй цепи с праймерами, содержащими праймирующую область, которая комплементарна 3'-концу первой цепи и второй цепи, и первую адаптерную последовательность, синтезирующую комплементарные цепи ДНК-полимеразой, удаление избытка праймеров экзонуклеазой,
отжиг 3'-конца синтезированных комплементарных цепей первой цепи и второй цепи с праймерами, содержащими праймирующую область, которая комплементарна 3'-концу первой цепи и второй цепи, и вторую последовательность адаптера, синтезирующую комплементарные цепи ДНК-полимеразой, удаление избытка праймеров экзонуклеазой,
амплификацию целевых последовательностей с помощью ПЦР с праймерами, которые отжигают с первой последовательностью адаптера и второй последовательностью адаптера, чтобы создать ампликоны для первой цепи и второй цепи,
секвенирование ампликонов, чтобы отличить первую цепь от второй цепи,
при этом первый конец первой цепи помечен первым адаптером, а второй конец первой цепи помечен вторым адаптером,
при этом первый конец второй цепи помечен вторым адаптером, второй конец второй цепи помечен первым адаптером.
30. Способ по п. 15, в котором определение конформации хроматина происходит из диплоидного образца, и определяют информацию о гаплотипе каждого определенного контакта хроматина.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201762509981P | 2017-05-23 | 2017-05-23 | |
| US62/509,981 | 2017-05-23 | ||
| PCT/US2018/034162 WO2018217912A1 (en) | 2017-05-23 | 2018-05-23 | Multiplex end-tagging amplification of nucleic acids |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2019142713A true RU2019142713A (ru) | 2021-06-24 |
| RU2019142713A3 RU2019142713A3 (ru) | 2021-12-21 |
Family
ID=64395972
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2019142713A RU2019142713A (ru) | 2017-05-23 | 2018-05-23 | Мультиплексная амплификация нуклеиновых кислот с введением концевых меток |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US11530436B2 (ru) |
| EP (1) | EP3631054A4 (ru) |
| JP (1) | JP2020522243A (ru) |
| CN (1) | CN111356795B (ru) |
| AU (1) | AU2018273401A1 (ru) |
| CA (1) | CA3064709A1 (ru) |
| IL (1) | IL270825A (ru) |
| MX (1) | MX2019013993A (ru) |
| RU (1) | RU2019142713A (ru) |
| WO (1) | WO2018217912A1 (ru) |
Families Citing this family (31)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US8835358B2 (en) | 2009-12-15 | 2014-09-16 | Cellular Research, Inc. | Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse labels |
| US10941396B2 (en) | 2012-02-27 | 2021-03-09 | Becton, Dickinson And Company | Compositions and kits for molecular counting |
| AU2014312208B2 (en) | 2013-08-28 | 2019-07-25 | Becton, Dickinson And Company | Massively parallel single cell analysis |
| US10301677B2 (en) | 2016-05-25 | 2019-05-28 | Cellular Research, Inc. | Normalization of nucleic acid libraries |
| US10202641B2 (en) | 2016-05-31 | 2019-02-12 | Cellular Research, Inc. | Error correction in amplification of samples |
| AU2017331459B2 (en) | 2016-09-26 | 2023-04-13 | Becton, Dickinson And Company | Measurement of protein expression using reagents with barcoded oligonucleotide sequences |
| US10676779B2 (en) | 2017-06-05 | 2020-06-09 | Becton, Dickinson And Company | Sample indexing for single cells |
| WO2019084043A1 (en) | 2017-10-26 | 2019-05-02 | 10X Genomics, Inc. | METHODS AND SYSTEMS FOR NUCLEIC ACID PREPARATION AND CHROMATIN ANALYSIS |
| SG11202007686VA (en) | 2018-02-12 | 2020-09-29 | 10X Genomics Inc | Methods characterizing multiple analytes from individual cells or cell populations |
| EP4234717A3 (en) * | 2018-05-03 | 2023-11-01 | Becton, Dickinson and Company | High throughput multiomics sample analysis |
| US11932899B2 (en) | 2018-06-07 | 2024-03-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for characterizing nucleic acid molecules |
| WO2020028882A1 (en) | 2018-08-03 | 2020-02-06 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems to minimize barcode exchange |
| WO2020061529A1 (en) * | 2018-09-20 | 2020-03-26 | 13.8, Inc. | Methods for haplotyping with short read sequence technology |
| EP4471156A3 (en) | 2018-10-01 | 2025-02-26 | Becton, Dickinson and Company | Determining 5' transcript sequences |
| US11845983B1 (en) | 2019-01-09 | 2023-12-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for multiplexing of droplet based assays |
| WO2020154247A1 (en) | 2019-01-23 | 2020-07-30 | Cellular Research, Inc. | Oligonucleotides associated with antibodies |
| CN118979095A (zh) | 2019-02-12 | 2024-11-19 | 10X基因组学有限公司 | 用于加工核酸分子的方法 |
| US11467153B2 (en) | 2019-02-12 | 2022-10-11 | 10X Genomics, Inc. | Methods for processing nucleic acid molecules |
| CN120099139A (zh) | 2019-02-14 | 2025-06-06 | 贝克顿迪金森公司 | 杂合体靶向和全转录物组扩增 |
| CN114051534B (zh) | 2019-07-22 | 2025-02-21 | 贝克顿迪金森公司 | 单细胞染色质免疫沉淀测序测定 |
| WO2021034974A1 (en) * | 2019-08-19 | 2021-02-25 | Universal Sequencing Technology Corporation | Methods and compositions for tracking nucleic acid fragment origin for nucleic acid sequencing |
| CN114391043B (zh) * | 2019-10-25 | 2024-03-15 | 昌平国家实验室 | 哺乳动物dna的甲基化检测及分析 |
| US11773436B2 (en) | 2019-11-08 | 2023-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Using random priming to obtain full-length V(D)J information for immune repertoire sequencing |
| US11649497B2 (en) | 2020-01-13 | 2023-05-16 | Becton, Dickinson And Company | Methods and compositions for quantitation of proteins and RNA |
| EP4471155A3 (en) | 2020-01-29 | 2024-12-18 | Becton, Dickinson and Company | Barcoded wells for spatial mapping of single cells through sequencing |
| US12153043B2 (en) | 2020-02-25 | 2024-11-26 | Becton, Dickinson And Company | Bi-specific probes to enable the use of single-cell samples as single color compensation control |
| WO2021231779A1 (en) | 2020-05-14 | 2021-11-18 | Becton, Dickinson And Company | Primers for immune repertoire profiling |
| EP4158055B1 (en) | 2020-06-02 | 2024-03-27 | Becton, Dickinson and Company | Oligonucleotides and beads for 5 prime gene expression assay |
| US11932901B2 (en) | 2020-07-13 | 2024-03-19 | Becton, Dickinson And Company | Target enrichment using nucleic acid probes for scRNAseq |
| FR3116065B1 (fr) * | 2020-11-12 | 2024-11-29 | Innovative Diagnostics Genetics | Détection d’acides nucléiques dans un échantillon biologique |
| US11739443B2 (en) | 2020-11-20 | 2023-08-29 | Becton, Dickinson And Company | Profiling of highly expressed and lowly expressed proteins |
Family Cites Families (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| LT2963709T (lt) * | 2008-10-24 | 2017-09-25 | Epicentre Technologies Corporation | Transpozono galo kompozicijos ir nukleorūgščių modifikavimo būdai |
| US9080211B2 (en) | 2008-10-24 | 2015-07-14 | Epicentre Technologies Corporation | Transposon end compositions and methods for modifying nucleic acids |
| EP2630264A4 (en) * | 2010-10-22 | 2014-04-02 | Harvard College | Orthogonal amplification and assembly of nucleic acid sequences |
| US20130017978A1 (en) | 2011-07-11 | 2013-01-17 | Finnzymes Oy | Methods and transposon nucleic acids for generating a dna library |
| DK2970951T3 (da) * | 2013-03-13 | 2019-05-13 | Illumina Inc | Fremgangsmåder til nukleinsyresekventering |
| BR122022007092B8 (pt) * | 2014-02-18 | 2023-01-31 | Illumina Inc | Método para construir um perfil de dna, método para construir uma biblioteca de ácido nucléico, biblioteca de ácido nucléico, pluralidade de iniciadores e kit |
| CN107075509B (zh) * | 2014-05-23 | 2021-03-09 | 数字基因公司 | 通过数字化转座子的单倍体组测定 |
| CA2975739C (en) * | 2015-02-10 | 2022-12-06 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for analyzing cellular components |
| US9771575B2 (en) | 2015-06-19 | 2017-09-26 | Agilent Technologies, Inc. | Methods for on-array fragmentation and barcoding of DNA samples |
| CA2992717A1 (en) * | 2015-07-17 | 2017-01-26 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of amplifying nucleic acid sequences |
| CA3000762A1 (en) * | 2015-09-30 | 2017-04-06 | The General Hospital Corporation | Comprehensive in vitro reporting of cleavage events by sequencing (circle-seq) |
| CN108473984A (zh) * | 2015-11-04 | 2018-08-31 | 阿特雷卡公司 | 用于分析与单个细胞相关联的核酸的核酸条形码的组合组 |
| WO2018031631A1 (en) | 2016-08-10 | 2018-02-15 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of de novo assembly of barcoded genomic dna fragments |
| MX2019002376A (es) * | 2016-08-31 | 2019-06-20 | Harvard College | Metodos de amplificacion digital del genoma completo. |
-
2018
- 2018-05-23 WO PCT/US2018/034162 patent/WO2018217912A1/en not_active Application Discontinuation
- 2018-05-23 JP JP2019565253A patent/JP2020522243A/ja active Pending
- 2018-05-23 MX MX2019013993A patent/MX2019013993A/es unknown
- 2018-05-23 RU RU2019142713A patent/RU2019142713A/ru not_active Application Discontinuation
- 2018-05-23 CA CA3064709A patent/CA3064709A1/en active Pending
- 2018-05-23 US US16/615,872 patent/US11530436B2/en active Active
- 2018-05-23 EP EP18806436.4A patent/EP3631054A4/en not_active Withdrawn
- 2018-05-23 AU AU2018273401A patent/AU2018273401A1/en not_active Abandoned
- 2018-05-23 CN CN201880049397.XA patent/CN111356795B/zh active Active
-
2019
- 2019-11-21 IL IL270825A patent/IL270825A/en unknown
-
2022
- 2022-11-14 US US18/055,024 patent/US20230203563A1/en active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN111356795A (zh) | 2020-06-30 |
| MX2019013993A (es) | 2020-07-28 |
| EP3631054A1 (en) | 2020-04-08 |
| CA3064709A1 (en) | 2018-11-29 |
| US20200102598A1 (en) | 2020-04-02 |
| CN111356795B (zh) | 2024-04-26 |
| EP3631054A4 (en) | 2021-03-03 |
| WO2018217912A1 (en) | 2018-11-29 |
| AU2018273401A1 (en) | 2019-12-19 |
| US11530436B2 (en) | 2022-12-20 |
| JP2020522243A (ja) | 2020-07-30 |
| IL270825A (en) | 2020-01-30 |
| US20230203563A1 (en) | 2023-06-29 |
| RU2019142713A3 (ru) | 2021-12-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2019142713A (ru) | Мультиплексная амплификация нуклеиновых кислот с введением концевых меток | |
| RU2019108270A (ru) | Способы дискретной амплификации полного генома | |
| RU2018105835A (ru) | Способы амплификации последовательностей нуклеиновых кислот | |
| JP2022046466A5 (ru) | ||
| RU2400538C2 (ru) | Олигонуклеотид с двойственной специфичностью и способы, в которых он используется | |
| JP2015521468A5 (ru) | ||
| FI3872187T3 (fi) | Koostumuksia ja menetelmiä näytteiden identifioinnin parantamiseksi indeksoiduissa nukleiinihappokirjastoissa | |
| JP2015156872A5 (ru) | ||
| RU2014152883A (ru) | Способы и композиции для высокомультиплексной пцр | |
| RU2019138698A (ru) | Способы и композиции для днк-профилирования | |
| WO2013003630A3 (en) | Methods and compositions for enrichment of nucleic acids in mixtures of highly homologous sequences | |
| CN105087771B (zh) | 鉴定样品中微生物种类的方法及其试剂盒 | |
| JP2018514230A5 (ru) | ||
| RU2013118722A (ru) | Прямой захват, амплификация и секвенирование днк-мишени с использованием иммобилизированных праймеров | |
| WO1996006187A1 (en) | Nucleotide sequencing method | |
| JP2012509084A5 (ru) | ||
| EP2614154A1 (en) | Method for reducing adapter-dimer formation | |
| DK2376517T3 (da) | Transposon-ende-sammensætninger og fremgangsmåder til at modificere nukleinsyrer | |
| JP6971276B2 (ja) | クランプオリゴヌクレオチドを利用する核酸増幅方法 | |
| WO2019086531A1 (en) | Linear consensus sequencing | |
| EP3555316B1 (en) | Modified multiplex and multistep amplification reactions and reagents therefor | |
| GB2612412A (en) | Systems and methods for targeted nucleic acid capture | |
| US9212378B2 (en) | Method of amplifying DNA from RNA in a sample | |
| JP6940412B2 (ja) | Ｐｃｒ方法 | |
| JP2016527896A5 (ru) |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20220414 |