NL8701342A - Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen. - Google Patents
Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen. Download PDFInfo
- Publication number
- NL8701342A NL8701342A NL8701342A NL8701342A NL8701342A NL 8701342 A NL8701342 A NL 8701342A NL 8701342 A NL8701342 A NL 8701342A NL 8701342 A NL8701342 A NL 8701342A NL 8701342 A NL8701342 A NL 8701342A
- Authority
- NL
- Netherlands
- Prior art keywords
- glucose
- oligosaccharides
- lyase
- formula
- group
- Prior art date
Links
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 title claims description 22
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 title claims description 22
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 title claims description 10
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 title description 3
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 claims description 19
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 claims description 19
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 11
- 239000008103 glucose Substances 0.000 claims description 11
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 9
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 9
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 9
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 7
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 6
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 6
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 claims description 5
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 5
- 241000193752 Bacillus circulans Species 0.000 claims description 4
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 claims description 4
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 4
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 claims description 4
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 claims description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 4
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 claims description 3
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 claims description 2
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 claims description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 claims description 2
- 150000001242 acetic acid derivatives Chemical class 0.000 claims description 2
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 150000001340 alkali metals Chemical class 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 claims description 2
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 claims description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 claims description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 2
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 claims description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 claims description 2
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 150000004728 pyruvic acid derivatives Chemical class 0.000 claims description 2
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 claims description 2
- 229920002148 Gellan gum Polymers 0.000 description 24
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 14
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 14
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 7
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 6
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 6
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 5
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 5
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 5
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 239000012466 permeate Substances 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010022901 Heparin Lyase Proteins 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- 238000006845 Michael addition reaction Methods 0.000 description 2
- 229920002230 Pectic acid Polymers 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M acrylate group Chemical group C(C=C)(=O)[O-] NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 2
- AEMOLEFTQBMNLQ-BKBMJHBISA-N alpha-D-galacturonic acid Chemical compound O[C@H]1O[C@H](C(O)=O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-BKBMJHBISA-N 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 229940097043 glucuronic acid Drugs 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 2
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 2
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 2
- 108010087558 pectate lyase Proteins 0.000 description 2
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 2
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 229920002567 Chondroitin Polymers 0.000 description 1
- 108010026719 Chondroitin Lyases Proteins 0.000 description 1
- AEMOLEFTQBMNLQ-BZINKQHNSA-N D-Guluronic Acid Chemical compound OC1O[C@H](C(O)=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-BZINKQHNSA-N 0.000 description 1
- AEMOLEFTQBMNLQ-VANFPWTGSA-N D-mannopyranuronic acid Chemical compound OC1O[C@H](C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-VANFPWTGSA-N 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 description 1
- 108010029182 Pectin lyase Proteins 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 125000000218 acetic acid group Chemical group C(C)(=O)* 0.000 description 1
- 150000001252 acrylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-RSJOWCBRSA-N aldehydo-D-galacturonic acid Chemical compound O=C[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-RSJOWCBRSA-N 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-QTBDOELSSA-N aldehydo-D-glucuronic acid Chemical compound O=C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-QTBDOELSSA-N 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- AEMOLEFTQBMNLQ-UHFFFAOYSA-N beta-D-galactopyranuronic acid Natural products OC1OC(C(O)=O)C(O)C(O)C1O AEMOLEFTQBMNLQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- FAKRSMQSSFJEIM-RQJHMYQMSA-N captopril Chemical compound SC[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O FAKRSMQSSFJEIM-RQJHMYQMSA-N 0.000 description 1
- 229960000830 captopril Drugs 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 229920001429 chelating resin Polymers 0.000 description 1
- DLGJWSVWTWEWBJ-HGGSSLSASA-N chondroitin Chemical compound CC(O)=N[C@@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1OC1[C@H](O)[C@H](O)C=C(C(O)=O)O1 DLGJWSVWTWEWBJ-HGGSSLSASA-N 0.000 description 1
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000396 dipotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019797 dipotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000003118 drug derivative Substances 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 1
- 244000053095 fungal pathogen Species 0.000 description 1
- 235000010492 gellan gum Nutrition 0.000 description 1
- 239000000216 gellan gum Substances 0.000 description 1
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-LECHCGJUSA-N iduronic acid Chemical compound O=C[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-LECHCGJUSA-N 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 1
- 239000005022 packaging material Substances 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 229920001277 pectin Polymers 0.000 description 1
- 239000001814 pectin Substances 0.000 description 1
- 235000010987 pectin Nutrition 0.000 description 1
- 150000002972 pentoses Chemical class 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 108010004131 poly(beta-D-mannuronate) lyase Proteins 0.000 description 1
- 108091022901 polysaccharide lyase Proteins 0.000 description 1
- 102000020244 polysaccharide lyase Human genes 0.000 description 1
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004436 sodium atom Chemical group 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- RPACBEVZENYWOL-XFULWGLBSA-M sodium;(2r)-2-[6-(4-chlorophenoxy)hexyl]oxirane-2-carboxylate Chemical compound [Na+].C=1C=C(Cl)C=CC=1OCCCCCC[C@]1(C(=O)[O-])CO1 RPACBEVZENYWOL-XFULWGLBSA-M 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L sulfate group Chemical group S(=O)(=O)([O-])[O-] QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- -1 thiol compounds Chemical class 0.000 description 1
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 229930195735 unsaturated hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H3/00—Compounds containing only hydrogen atoms and saccharide radicals having only carbon, hydrogen, and oxygen atoms
- C07H3/06—Oligosaccharides, i.e. having three to five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/04—Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/8215—Microorganisms
- Y10S435/822—Microorganisms using bacteria or actinomycetales
- Y10S435/832—Bacillus
- Y10S435/835—Bacillus circulans
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
N.0. 34399
Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen*
De uitvinding heeft betrekking op bifunctionele oligosacchariden, 5 welke een eindstandige Δ4,5-uronzuurgroep aan de niet-reducerende kant bevatten.
Uit Applied Biochemistry and Biotechnology, 17 (1986), blz. 135-176 zijn velerlei polysaccharide-lyases bekend, welke de desbetreffende uronzuurhoudende polysacchariden in a4,5-uronzuurhoudende oligosacchari-10 den kunnen splitsen. Dergelijke lyases zijn veelal van microbiè'le oorsprong en zijn zowel uit pathogene als niet-pathogene bacteriën en fungi geïsoleerd. Voorbeelden van dergelijke lyases zijn o.a. heparine-, chondroitine-, pectine-, pectaat- en alginaat-lyases, welke de dienovereenkomstige substraten op specifieke plaatsen splitsen. Meer in het 15 bijzonder splitst bijvoorbeeld a) heparine-lyase de -r- 4)-ct-I>-GlcNS03( 6-SO4 )-(1-/-4)-ot-L-IdUA (2-SC>4)-(l— binding in heparine en b) pectaat-lyase, de — 4)-cp-I>-GalUA(l-/-4)-ot-]>-GalUA-(l— binding in pectaat, waarbij GICKSO3 2-deoxy-2-sulfamino-glycopyranose 20 IdüA idopyranosyluronzuur en
GalUA galactopyranosyluronzuur voorstellen.
De met behulp van de lyases verkregen onverzadigde oligosacchariden zijn interessante verbindingen op grond van de geïntroduceerde acrylaat-funktie aan de niet-reducerende kant van het oligosaccharide met intakt-25 lating van het reducerende einde. Door middel van deze acrylaatfunktie is het mogelijk via een Michael-additie velerlei nucleofiele groepen houdende verbindingen aan dergelijke Δ-4,5-uronzuurhoudende oligosacchariden te koppelen.
Uit het Amerikaanse octrooischrift 4.607.025 zijn bijvoorbeeld 30 farmacologisch aktieve verbindingen met een uronzuurstruktuur bekend. Deze verbindingen bezitten met voordeel de formule pOM COOQj
NHB OH
8701342 * 2 « waarin M een waterstofatoom of een SC^Mj^groep, waarin een kation voorstelt, B een waterstofatoom of een functionele groep zoals een acetyl- of sulfaatgroep, Qj een waterstofatoom, een alkylgroep met 1-4 koolstofatomen of een kation en Q een alkylgroep met 1-4 koolstof-5 atomen of een arylgroep voorstellen.
Verrassenderwijs is nu een microbieel lyase gevonden, waarmee liet mogelijk is in polysacchariden de glucose-glucuronzuur-binding te splitsen onder vorming van A4,5-glucuronzuurhoudende oligosacchariden. Als microbiè'le bron voor het lyase volgens de uitvinding kunnen bacteriën, 10 bacteriofagen, schimmels e.d. worden genoemd.
De uitvinding heeft derhalve op de eerste plaats betrekking op oligosacchariden met de formule 1 COORi
A
OH
20 waarin een waterstofatoom, een alkylgroep met 1-4 koolstofatomen of een alkalimetaal R2 een enkelvoudige binding of een tweewaardige, uit monosacchariden 25 opgebouwde rest en glc glucose voorstellen.
Als voorbeelden van het symbool R2 worden tweewaardige resten genoemd, welke opgebouwd zijn uit 1-5 monosacchariden, welke gekozen zijn uit de groep, bestaande uit glucose, mannose, galactose, arabinose, 30 fucose, xylose, rhamnose, uronzuren en derivaten daarvan zoals acetaten, pyruvaten, aminen en sulfaten.
Onder uronzuren worden glucuronzuur, galacturonzuur, iduronzuur, mannuronzuur en guluronzuur verstaan. Met voordeel stelt R£ een -glc-rha-rest voor, waarin rha het methylpentose rhamnose voorstelt.
35 Voorts stelt het symbool R^ met voordeel een waterstofatoom, een methylgroep of een natriumatoom voor.
Voorts heeft de uitvinding betrekking op een werkwijze voor het bereiden van de oligosacchariden met de formule 1 door het onderwerpen van een polysaccharide met de formule [glucuronzuur-R2-glucose]n, waar-40 bij n de waarde 2 of meer, bijvoorbeeld 2-5000, en R2 de bovenvermelde 870 1 34 2 -3 betekenis bezitten, aan de inwerking van het betreffende lyase, dat de * glucose-glucuronzuurbinding splitst en bij voorkeur gewonnen is uit een bacteriestam van het geslacht Bacillus. Met voordeel past men de stam Bacillus circulans toe, bij voorkeur de stam welke bij de National 5 Collection of Industrial Bacteria (NCIB), Schotland onder nummer NCIB 12482 is gedeponeerd.
Als polysaccharide met de formule [glucuronzuur-R2“glucose]n kan bijvoorbeeld het in de handel verkrijgbare "gelrite" met de formule [glucuronzuur-glucose-rhamnose-glucose]n worden toegepast, waarbij n 10 ongeveer de waarde 1500 bezit. Dit polysaccharide bezit o.a. het voordeel, dat op grond van de grote antigene determinant-werking van rhamno-se belangrijke farmacologische toepassingen van de op de hiervan afgeleide oligosacchariden volgens de uitvinding gebaseerde aktieve stoffen mogelijk zijn, welke aktieve stoffen op relatief eenvoudige wijze door 15 middel van de acrylaatfunktie van de j4,5~glucuronzuurrest kunnen worden bereid. Een ander voorbeeld van een bij de uitvinding toepasbaar polysaccharide is gellan gum, dat op de 6-plaats van een van de twee, in het tetrameer voorkomende glucoseresiduen geacetyleerd gelrite is (P.E.
Janson, B.Lindberg en P.A. Sandfort, Carbohydrate Research 124 (1983), 20 blz. 135-139).
De aktiviteit van het lyase volgens de uitvinding, dat de glucose-glucuronzuur-binding splitst kan worden gecontroleerd en gevolgd door de absorptietoename bij 229 nm. Deze absorptietoename is toe te schrijven aan het onder invloed van dit lyase ontstane geconjugeerde carboxy-25 alkeensysteem in het gevormde oligosaccharide met de bovenstaande formule 1.
In vervolg op de bovenstaande verwijzing naar aktieve verbindingen, kunnen op basis van de oligosacchariden volgens de uitvinding door middel van een Michael-additie velerlei werkzame verbindingen zoals glyco-30 proteinen en glycolipiden met de formule 2 2.
COORj 35 ) \ x (oh )——5 c
OH
40 worden bereid, waarin Rx, r2 en glc de Onvermelde betekenis 8701342 4 bezitten en X een R3O-, R3S-, R3NH- of R3N(R4)-groep voorstelt, waarbij R3 en R4 een al dan niet (poly)cyclische en/of mogelijkerwijs onverzadigde koolwaterstofrest, welke eventueel door een of meer heteroatomen is onderbroken, betekenen. Voorbeelden van met de 5 oligosacchariden volgens de uitvinding om te zetten verbindingen zijn thiolen, zoals cysteine en cysteinehoudende proteinen, alsook farmacologische thiolverbindingen zoals captopril en sparcomycine.
Door additie van proteïnen aan de oligosacchariden volgens de uitvinding worden dergelijke proteinen gemodificeerd, wat zijn invloed 10 heeft op de stabiliteit, oplosbaarheid (in geval van lipofiele eiwitten) en retentie in membraanreaktoren door de toename van de molmassa. Deze modificatie laat het reducerende einde van de saccharide intact in tegenstelling tot natuurlijke glycoproteinen, hetgeen deze artifiële glyco-conjugaten onverwachte eigenschappen verstrekt. Op dezelfde wijze 15 kunnen ook farmaca-derivaten worden gemodificeerd, wat leidt tot gewijzigde fysische eigenschappen (oplosbaarheid, grootte, lading enz.) of gewijzigde chemische eigenschappen (target-oriented farmaca) van de betreffende farmaca.
Voorts kunnen de oligosacchariden volgens de uitvinding bij de 20 bereiding van vaccins worden toegepast. Meer in het bijzonder kunnen daarbij geschikte celwanden (polysacchariden) van pathogene organismen met behulp van het onderhavige lyase worden gesplitst en de aldus verkregen oligosacchariden tot vaccins worden verwerkt* 25 De uitvinding wordt aan de hand van de onderstaande voorbeelden
toegelicht; deze voorbeelden dienen niet beperkend te worden uitgelegd. Voorbeeld I
Werkwijze voor de bereiding van het tetrameer: !4,5-glucuronzuur-glucose-rhamnose-glucose uit gelrite.
30
Trap 1. Bereiding van het gelrite-lyase.
Het organisme, dat voor de isolatie van dit enzym is gebruikt, is bij de National Collection of Industrial Bacteria te Schotland onder 35 nummer NCIB 12482 gedeponeerd. Dit organisme werd aëroob bij 30°C gekweekt op een G-medium met de onderstaande samenstelling: 870 1 342 5 *
Samenstelling G^medium:
Gelrite 5 g/1 K2HPO4 4 g/1 5 KH2PO4 1 g/1 (NH4)2 SO4 1 g/1
Mg SO4 . 7H20 0,5 g/1
NaCl 0,5 g/1 Eind pH * 7,0 10
Het celmateriaal voor de produktie van het gelrite-lyase werd ver-kregen door het bovenbedoelde micro-organisme (3% ent) te kweken op bovengenoemd G-medium in een geroerde reactor met een werkinhoud van 1,5 liter. Na een incubatietijd van ca. 18 uren werden de cellen gecentrifu-15 geerd (30 min bij 9000 x g).
De oligosacchariden en zouten in het supernatant werden van het enzym door middel van ultrafiltratie (PM10 filter in de "mini-tan" van
10 millipore) gescheiden. Dit leverde na enkele malen wassen met een 4mM
Tris, pH 7,8 oplossing een enzymoplossing van ca. 140 Units per liter 20 (U/l) op, die in bevroren toestand stabiel bleek te zijn.
De activiteit van het verkregen enzym gelrite-lyase werd gemeten aan de hand van extinctietoename bij 229 nm, veroorzaakt door de vorming van de Δ4,5ruronzuurgroep. De extinctiecoëfficiè’nt (E) van het tetra-
meer bedroeg op basis van NMR- en elementanalyse en gemeten bij een pH
-.1 *.1 25 van 7 ongeveer E229 5600 M cm .
Voor het meten van de gelrite-lyase-activiteit werd 100 /ul enzymoplossing toegevoegd aan een mengsel van 200 /ul 50 mM Tris-HCl, pH 7,8 500 /ul 2 g/1 gegeleerde Gelrite en 200 /ul water. Eén enzym-unit gaf een extinctie-verandering bij 229 nm van 5,6 per minuut.
30
Trap 2. Werkwijze voor de batch-gewijze bereiding van het onverzadigde tetrameer A4,5-glucuronzuur-glucose~rhamnose-glucose.
Voor de bereiding van 5,2 gram A4,5-tetrameer werd de gelrite-35 lyase-oplossing (totaal 8,1 units) gedurende 17 uren geïncubeerd bij 30°C met een gelrite-oplossing (2,0 g/1) in 4 mM Tris-HCl, pH 7,8.
De enzymdosering was zodanig, dat 2,5 units enzymactiviteit werd toegevoegd per gram gelrite. Het bleek, dat de extinctie (229 nm) van de 090 doorloop ongeveer 14 (theoretisch maximaal E 15) bedroeg.
40 Hierna werden enzym en ongereageerd gelrite met behulp van ultra- 8701342 t 6 filtratie (Cut-off 10.000) van elkaar gescheiden. Het enzym bleek nog 72% van de oorspronkelijke activiteit te bezitten en werd wederom met een verse gelrite-oplossing geïncubeerd (2,5 ü/g gelrite). Het ultrafil-traat van de eerste enzymomzetting werd gepooled met dat van de tweede 5 en de derde enzymomzetting. Op deze wijze werd eerst 3,2 gram gelrite omgezet en vervolgens 2 gram en 1 gram gelrite. Na de ultrafiltratie werd het tetrameer gezuiverd van positief geladen deeltjes zoals Tris, door het produkt over een Amberlite IR120 kolom te leiden (eluens H2O). Daar de pH van de doorloop ca. 3 was, werd de pH hiervan op 7 10 gesteld door toevoeging van 1 M NaOH, zodat het Na-zout verkregen werd. Na vriesdrogen was het drooggewicht 5,2 gram, hetgeen overeenkomt met een opbrengst van 83%. Het verkregen produkt bleek behalve het onverzadigd tetrameer enkele zouten te bevatten, maar geen octameer. De produk-tiesnelheid bedroeg op basis van de extinctie ongeveer 2 g/l/dag.
15 Bij toepassing van 20 g/1 gelrite en ca 5 enzymunits per gram gel rite bij 48°C kan de productiesnelheid verhoogd worden tot ca 290 g/l/dag.
Voorbeeld II
Werkwijze voor de bereiding van het onverzadigd tetrameer A4,5-glucu-20 ronzuur-glucose-rhamnose-glucose.
Trap 1. Bereiding van gelrite-lyase.
De werkwijze om het gelrite-lyase te bereiden is op dezelfde wijze 25 als in Voorbeeld I uitgevoerd.
Trap 2. De continue omzetting van gelrite in het onverzadigde tetrameer A4,5-glucuronzuur-glucose-rhamnose-glucose.
30 In deze trap werd 18,4 g gelrite in een reactor met een werkvolume van 4,6 1 door 134 units gelrite-lyase bij pH 7,8 (5 mM Tris-HCl) en 30°C omgezet. De vloeistof uit de reactor werd continu langs een ultrafiltratie unit (millipore mini-tan met PM 10 filter) gepompt. Gedurende de eerste 4 uren van de reactie werd het permeaat teruggevoerd totdat de 35 extinctie (229 nm) ongeveer 18 was. Hierna werd het substraat (4 g/1 gelrite in 5 mM Tris-HCl, pH 7,8) de reactor even snel ingepompt als het permeaat werd afgevoerd (D = 0,075 u"1). Nadat in totaal 32 gram gelrite in de reactor was gepompt, werd de toevoerpomp afgezet en werd de reactor via de ultrafiltratie-unit leeggepompt. De extinctie van het 40 permeaat bleek 18,4 te zijn, hetgeen met ongeveer 60% omzetting overeen- 870 1 3.42 / komt. Op deze wijze werd 26,8 gram produkt verkregen dat ongeveer 85% onverzadigd tetrameer en 5% onverzadigd octameer bevatte (op basis van extinctie).
De produktiesnelheid bedroeg 4,1 g/l/dag bij een gelrite'-concentra-tie van 4 g/1 en een enzymdosering van 4,2 ü/g gelrite.
870 1342
Claims (8)
1. Oligosacchariden, gekenmerkt door de formule 1 5 C00R|
10 OH waarin een waterstofatoom, een alkylgroep met 1-4 koolstofatomen of een alkalimetaal
15 R2 een enkelvoudige binding of een tweewaardige, uit monosacchariden opgebouwde rest en glc glucose voorstellen.
2. Oligosacchariden volgens conclusie 1, gekenmerkt door formule 1, waarin R^ de in conclusie 1 vermelde betekenis voor stelt en R£ een 20 rest met 1-5 monosacchariden, gekozen uit de groep bestaande uit glucor se, mannose, galactose, arabinose, fucose, xylose, rhamnose, uronzuren en derivaten daarvan zijnde acetaten, pyruvaten, aminen en sulfaten.
3. Oligosaccharide volgens conclusie 2, gekenmerkt door de formule 1, waarin R^ de in conclusie 1 vermelde betekenis bezit en R2 een 25 glc-rha-groep voorstelt.
4. Werkwijze voor het bereiden van oligosacchariden door middel van omzetten van polysacchariden met behulp van een lyase, met het kenmerk, dat men een polysaccharide met de formule [glucuronzuur-R2*--glucose]n, waarin n de waarde 2 of meer, bijvoorbeeld 2-5000 bezit en
30 R2 de in conclusie 1 of 2 vermelde betekenis bezit, omzet met een microbiè'el, de glucose-glucuronzuur-binding splitsend lyase.
5 X—<0H V-R2 —?lc OH waarin
10 Ri en R£ de in conclusie 1 of 2 vermelde betekenis bezitten en X een aktieve rest is, gekozen uit de groep bestaande uit R3OÏ·, R3S-, R3NH- en R3N(R4)-, waarbij R3 en R4 een al dan niet (poly)cyclische en/of mogelijkerwijs overzadigde koolwater»-stofrest, welke eventueel door een of meer heteroatomen is onder·-15 broken, voorstellen·
5. Werkwijze volgens conclusie 4, met het kenmerk, dat men een lyase toepast, dat geïsoleerd is uit de stam Bacillus circulans, gedeponeerd bij de National Collection of Industrial Bacteria onder 35 nummer NCIB 12482. 8701342 9
: 6« Verbindingen, gekenmerkt door de formule 2 COQRj Ί—o (2>
7. Lyase, dat de glucose-glucuronzuurrbinding splitst, geïsoleerd uit de bacteriestam Bacillus circulans, gedeponeerd bij de National Collection of Industrial Bacteria onder nummer NCIB 12482.
8. Bacillus circulans, gedeponeerd bij de National Collection of 20 Industrial Bacteria (NCIB), Schotland onder nummer NCIB 12482. **** 870 1 542
Priority Applications (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| NL8701342A NL8701342A (nl) | 1987-06-09 | 1987-06-09 | Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen. |
| EP88201121A EP0294879A3 (en) | 1987-06-09 | 1988-06-02 | Bifunctional oligosaccharides and also active compounds derived therefrom |
| US07/202,788 US4958016A (en) | 1987-06-09 | 1988-06-03 | Bifunctional oligosaccharides and also active compounds derived therefrom |
| JP63139585A JPH01104089A (ja) | 1987-06-09 | 1988-06-08 | 二官能性オリゴ糖類およびそれから誘導される活性化合物類 |
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| NL8701342A NL8701342A (nl) | 1987-06-09 | 1987-06-09 | Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen. |
| NL8701342 | 1987-06-09 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| NL8701342A true NL8701342A (nl) | 1989-01-02 |
Family
ID=19850117
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| NL8701342A NL8701342A (nl) | 1987-06-09 | 1987-06-09 | Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen. |
Country Status (4)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US4958016A (nl) |
| EP (1) | EP0294879A3 (nl) |
| JP (1) | JPH01104089A (nl) |
| NL (1) | NL8701342A (nl) |
Families Citing this family (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5169636A (en) * | 1988-03-17 | 1992-12-08 | Nippon Fine Chemical Co., Ltd. | Liposomes |
| NL8900119A (nl) * | 1989-01-19 | 1990-08-16 | Akzo Nv | Werkwijze voor het afsplitsen van (delta)4-onverzadigd uronzuur in glycosaminoglycaan fragmenten. |
| FR2687686B1 (fr) * | 1992-02-26 | 1994-05-27 | Sanofi Elf | Enzyme destinee a la fragmentation du n-acetylheparosane, obtention des preparations contenant cette enzyme et procedes de fragmentation utilisant cette enzyme. |
| DE4223613C2 (de) * | 1992-07-17 | 1994-07-21 | Zuckerindustrie Verein | Verfahren zur Herstellung von ungesättigten Uroniden aus pektinhaltigen Stoffen |
| US5580975A (en) * | 1993-07-23 | 1996-12-03 | Od Kikaku Co., Limited | Agent for keeping cut flowers fresh |
| US5770393A (en) * | 1997-04-01 | 1998-06-23 | Steris Corporation | Biological indicator for detection of early metabolic activity |
| US6268493B1 (en) | 1998-08-07 | 2001-07-31 | Center For The Application Of Molecular Biology To International Agriculture | Preparation of cellobiuronic acid from polysaccharide |
| EP2510105A4 (en) * | 2009-12-09 | 2013-08-07 | Virdia Ltd | VISCOUS COMPOSITIONS OF CARBOHYDRATE AND METHODS FOR PRODUCING THEM |
| US9410216B2 (en) | 2010-06-26 | 2016-08-09 | Virdia, Inc. | Sugar mixtures and methods for production and use thereof |
| IL207329A0 (en) | 2010-08-01 | 2010-12-30 | Robert Jansen | A method for refining a recycle extractant and for processing a lignocellulosic material and for the production of a carbohydrate composition |
| IL207945A0 (en) | 2010-09-02 | 2010-12-30 | Robert Jansen | Method for the production of carbohydrates |
| EP3401322B1 (en) | 2011-04-07 | 2022-06-08 | Virdia, LLC | Lignocellulose conversion processes and products |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2504535B1 (fr) * | 1981-04-28 | 1987-08-14 | Choay Sa | Disaccharides derives d'un acide uronique et d'une glucosamine et compositions pharmaceutiques les contenant pour le controle de la coagulation sanguine |
-
1987
- 1987-06-09 NL NL8701342A patent/NL8701342A/nl not_active Application Discontinuation
-
1988
- 1988-06-02 EP EP88201121A patent/EP0294879A3/en not_active Withdrawn
- 1988-06-03 US US07/202,788 patent/US4958016A/en not_active Expired - Fee Related
- 1988-06-08 JP JP63139585A patent/JPH01104089A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0294879A3 (en) | 1989-02-22 |
| JPH01104089A (ja) | 1989-04-21 |
| EP0294879A2 (en) | 1988-12-14 |
| US4958016A (en) | 1990-09-18 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| McIntosh et al. | Curdlan and other bacterial (1→ 3)-β-D-glucans | |
| Holst et al. | Structure, serological specificity, and synthesis of artificial glycoconjugates representing the genus-specific lipopolysaccharide epitope of Chlamydia spp | |
| Hirano et al. | N-acetylation in chitosan and the rate of its enzymic hydrolysis | |
| Carlson et al. | Polyuronic acids produced by Pseudomonas aeruginosa | |
| Sasaki et al. | Antitumor activity of carboxymethylglucans obtained by carboxymethylation of (1→ 3)-β-D-glucan from Alcaligenes faecalis var. myxogenes IFO 13140 | |
| US8415326B2 (en) | Pharmaceutical composition comprising chito-oligomers | |
| RU2099353C1 (ru) | N,о-сульфатированные гепарозаны, способ их получения и фармацевтическая композиция, обладающая антитромботической активностью | |
| NL8701342A (nl) | Bifunctionele oligosacchariden alsmede daarvan afgeleide aktieve verbindingen. | |
| JPH07504928A (ja) | 高分子グルクロン酸化合物，その製造方法及び用途，特にゲル化剤，粘度付与剤，湿気付与剤，安定剤，キレート化剤又は凝集剤としての用途 | |
| Datema et al. | The Hyphal Wall of Mucor mucedo: 2. Hexosamine‐Containing Polymers | |
| Vinogradov et al. | Structure of Proteus mirabilis 027 O‐specific polysaccharide containing amino acids and phosphoethanolamine | |
| Matora et al. | The application of bacterial enzymes for extraction of pectin from pumpkin and sugar beet | |
| KR101577127B1 (ko) | 다당의 제조 방법 | |
| EP0818469A2 (en) | Branched cyclodextrins and method for producing them | |
| Dengler et al. | Structure of the serine-containing capsular poly-saccharide K40 antigen from Escherichia coli O8: K40: H9 | |
| US6562600B1 (en) | Production of cyclic alternan tetrasaccharides from oligosaccharide substrates | |
| JP3650409B2 (ja) | 低分子量分岐β−１，３−グルカン及び分岐ラミナリオリゴ糖の製造方法 | |
| JP3955652B2 (ja) | 合成アミノ糖類誘導体及びその製造方法 | |
| Stacey | Macromolecules synthesised by micro-organisms | |
| JP3816554B2 (ja) | 新規分岐シクロデキストリンおよびその製造方法 | |
| Ferreira et al. | Structural studies of the extracellular polysaccharide elaborated by Azotobacter vinelandii strain 1484 | |
| Vinogradov et al. | The isolation, structure, and applications of the exocellular heteropolysaccharide glucuronoxylomannan produced by yellow brain mushroom Tremella mesenterica Ritz.: Fr.(Heterobasidiomycetes) | |
| CN1008369B (zh) | 制造水溶性铁葡聚糖的方法 | |
| JPH05271306A (ja) | 抗ウイルス性硫酸化多糖類 | |
| JP3826168B2 (ja) | 微生物由来の多糖類 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A1B | A search report has been drawn up | ||
| BV | The patent application has lapsed |