본 발명자들은 암 세포의 세포막에서 유래하는 CD98로서, 아미노산 수송체 활성을 갖는 단백질과의 복합체 형태인 CD98에 대해 특이적 결합능을 갖는 항체를 얻는 것에 성공하여, 해당 항체가 암 세포의 증식을 억제하는 작용을 갖기 때문에 의약 조성물의 활성 성분, 보다 구체적으로는 종양의 예방 또는 치료제의 활성 성분으로서 유용하다는 지견을 얻었다. 본 발명은 이러한 지견에 기초한 것이다.
따라서, 본 발명은 암 세포의 세포막에서 유래하는 CD98로서, 아미노산 수송체 활성을 갖는 단백질과의 복합체 형태인 CD98에 대해 특이적 결합능을 갖는 인간 항체 및 그의 기능적 단편의 제공을 목적으로 하고 있다.
또한, 본 발명은, 상기한 본 발명에 따른 인간 항체 및 그의 기능적 단편을 활성 성분으로 하는 의약 조성물 또는 종양의 예방 또는 치료제의 제공을 다른 목적으로 하고 있다.
본 발명에 따른 인간 항체 및 그의 기능적 단편은, 암 세포의 세포막에서 유래하는 CD98로서, 아미노산 수송체 활성을 갖는 단백질과의 복합체 형태인 CD98에 대해 특이적 결합능을 갖는 것을 특징으로 한다.
또한, 본 발명에 따른 의약 조성물 또는 종양의 예방 또는 치료제는, 상기 본 발명에 따른 인간 항체 및 그의 기능적 단편을 활성 성분으로서 포함한다.
이하, 실시예에 의해 본 발명을 더욱 상세히 설명하지만, 본 발명은 이들 실시예에 기재된 양태로 한정되지 않는다.
실시예 1: 인간 CD98 또는 인간 LAT1 발현 벡터의 제조
인간 CD98(hCD98, GenBank/EMBL/DDBJ accession no. AB018010; 서열 번호 65) 및 인간 LAT1(hLAT1, GenBank/EMBL/DDBJ accession no. AB018009; 서열 번호 67)의 DNA를 포함하는 플라스미드 벡터 pcDNA3.1-hCD98 및 pcDNA3.1-hLAT1을 각각 주형으로 사용하여 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)을 행하였다. 완전 길이의 인간 CD98 cDNA의 5' 말단에 EcoRI 서열을, 그의 3' 말단에 NotI 서열과 종지 코돈을 부가하기 위해, 프라이머 5'-CCG GAA TTC CCA CCA TGA GCC AGG ACA CCG AGG TGG ATA TGA-3'(서열 번호 59) 및 5'-AAG GAA AAA AGC GGC CGC TCA TCA GGC CGC GTA GGG GAA GCG GAG CAG CAG-3'(서열 번호 60)를 사용하고, KOD-Plus DNA 폴리머라제(도요보사 제조) 및 hCD98 cDNA(약 20 ng)를 주형으로 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초 및 68 ℃ 1분 30초간 30사이클의 PCR 반응을 행하였다. 수식된 hCD98 서열을 EcoRI-NotI 단편으로서 단리하고, 동일한 효소로 개열된 pTracer-EF/Bsd 벡터(인비트로젠사 제조)에 결찰(ligate)하였다. 얻어진 플라스미드를 주형으로 사용하고 CD98 v2 U(5'-AGT CTC TTG CAA TCG GCT AAG AAG AAG AGC ATC CGT GTC ATT CTG-3'(서열 번호 61)) 프라이머와 CD98 v2 L(5'-CAG AAT GAC ACG GAT GCT CTT CTT CTT AGC CGA TTG CAA GAG ACT-3'(서열 번호 62)) 프라이머를 사용하여, hCD98 DNA의 591과 594번째(서열 번호 65에 있어서의 702번째 및 705번째)의 A를 G로 변경하였다. 얻어진 플라스미드로부터 EcoRI-hCD98-NotI 단편을 제조하고, 동일한 효소로 개열된 pEF6myc-His/Bsd(인비트로젠사 제조) 벡터에 연결하였다. 얻어진 플라스미드를 pEF6/hCD98로 명명하였다.
동일한 방법으로, 완전 길이의 인간 LAT1 cDNA의 5' 말단에 EcoRI 서열을, 그의 3' 말단에 KpnI 서열을 부가하기 위해, 프라이머 5'-CCG GAA TTC CCA CCA TGG CGG GTG CGG GCC CGA AGC GGC-3'(서열 번호 63) 및 5'-CGG GGT ACC GTC TCC TGG GGG ACC ACC TGC ATG AGC TTC-3'(서열 번호 64)를 사용하고, KOD-Plus DNA 폴리머라제 및 hLAT1cDNA(약 20 ng)를 주형으로 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초 및 68 ℃ 1분 30초간 30사이클의 PCR 반응을 행하였다. 수식된 hLAT1 서열을 EcoRI-KpnI 단편으로서 단리하고, 동일한 효소로 개열된 pEGFP-N1(클론테크사 제조) 벡터에 결찰하였다. 또한, 얻어진 플라스미드를 EcoRI-NotI 단편으로서 단리하고, 동일한 효소로 개열된 pEF1V5His/Neo(인비트로젠사 제조) 벡터에 결찰하였다. 얻어진 플라스미드를 pEF1/hLAT1-EGFP로 명명하였다.
실시예 2: hCD98 / hLAT1 발현 세포의 제조
hCD98/hLAT1 발현 세포는, 실시예 1에서 제조된 발현 벡터 pEF6/hCD98 및 pEF1/hLAT1-EGFP(hLAT1-E)를 인비트로젠사 제조의 리포펙타민과 플러스 시약을 사용하여, Colon 26(CT26) 세포와 L929 세포(American Type Culture Collection No. CCL-1)에 도입하여 제조하였다. 유전자 도입은 메뉴얼에 기재된 방법에 따라 행하였다. 트랜스제닉 세포를 세포 배양용 플레이트(6웰 플레이트, 벡톤 디킨슨사 제조)에, 37 ℃에서 5 % 탄산 가스하에 24 시간 동안 배양한 후, CT26 세포주의 경우 블라스티시딘(5 ㎍/mL)과 G418(500 ㎍/mL) 포함 배지에서, L929 세포주의 경우 블라스티시딘(5 ㎍/mL)과 G418(1 ㎎/mL) 포함 배지에서 추가로 3일간 배양하였다. 이어서, RPE 형광-표지 마우스 항-인간 CD98 항체(벡톤 디킨슨사 제조, Ca. No. 556076)를 사용한 FACS Vantage에 의해 hLAT1-E와 CD98 양성 세포를 분리하였다. 동일한 방법으로, hCD98 발현 L929 세포 또는 hLAT1-E 발현 L929 세포를 제조하였다.
실시예 3: 인간 항체 생산 마우스의 제조
면역화에 사용한 마우스는, 내인성 Ig 중쇄 및 κ 경쇄 양자의 파괴에 대하여 동종접합체이고, 인간 Ig 중쇄 유전자좌를 포함하는 14번 염색체 단편(SC20) 및 인간 Ig κ쇄 트랜스 유전자(KCo5)를 동시에 보유하는 유전적 배경을 가진다. 이 마우스는 인간 Ig 중쇄 유전자좌를 갖는 계통 A의 마우스와, 인간 Ig κ쇄 트랜스 유전자를 갖는 계통 B의 마우스의 교배에 의해 제조하였다. 계통 A의 마우스는, 내인성 Ig 중쇄 및 κ 경쇄 양자의 파괴에 대하여 동종접합체이며, 자손 전달 가능한 14번 염색체 단편(SC20)을 보유하고, 예를 들면 도미즈까 등의 보고(Tomizuka et al., Proc Natl Acad Sci USA ., 2000, Vol 97:722)에 기재되어 있다. 또한, 계통 B의 마우스는 내인성 Ig 중쇄 및 κ 경쇄 양자의 파괴에 대하여 동종접합체이며, 인간 Ig κ쇄 트랜스 유전자(KCo5)를 보유하는 트랜스제닉 마우스이고, 예를 들면 피쉬윌드(Fishwild) 등의 보고(Nat Biotechnol ., 1996, Vol 14:845)에 기재되어 있다.
계통 A의 수컷 마우스와 계통 B의 암컷 마우스, 또는 계통 A의 암컷 마우스와 계통 B의 수컷 마우스의 교배에 의해 얻어지는 자손 마우스를 도미즈까 등의 보고(Tomizuka et al., Proc Natl Acad Sci USA ., 2000, Vol 97:722)에 기재된 방법으로 분석하고, 혈청 중에 인간 Ig 중쇄 및 κ 경쇄가 동시에 검출되는 개체(인간 항체 생산 마우스)를 선발하여(Ishida & Lonberg, IBC's 11th Antibody Engineering, Abstract, 2000; Ishida, I. et al., Cloning & Stem Cells 4, 85-96(2002)), 이하의 면역화 실험에 사용하였다. 면역화 실험에는, 상기 마우스의 유전적 배경을 변경한 마우스 등(이시다 이사오(2002) 실험 의학 20, 6846851)도 사용하였다.
실시예 4: 인간 모노클로날 항체의 제조
모노클로날 항체는, 예를 들어, "단클론 항체 실험 조작 입문" (안도 다미에 등 저작, 고단샤 발행 1991)에 기재된 일반적인 방법에 따라 제조하였다.
면역원인 hCD98/hLAT1로서, 실시예 2에서 제조한 hCD98/hLAT1-E 발현 CT26 세포, 및 hCD98 발현이 확인된 인간 대장암 세포주 Colo205 세포를 사용하였다.
면역화를 위한 동물은, 실시예 3에서 제조한 인간 면역 글로불린을 생산하는 인간 항체 생산 마우스를 사용하였다.
hCD98/hLAT1-E 발현 CT26 세포를 사용하는 경우, 5×106 개의 세포를 RIBI 보조제(코릭사(Corixa)사 제조)와 혼합하여 복강 내에 초회 면역화하였다. 초회 면역화로부터 7일 및 24일째에 마우스 1 마리 당 5×106 개의 세포를 복강 내에 추가(booster) 면역화하였다. 또한, 이하에 설명하는 췌장 세포의 취득 3일 전에 세포를 동일한 방법으로 면역화하였다.
Colo205 세포를 사용한 경우, 5×106 개의 세포를 복강 내에 초회 면역화하였다. 초회 면역화로부터 14일째에 마우스 1 마리 당 5×106 개의 세포를 복강 내에 추가 면역화하고, 3일 후에 이하에 설명하는 췌장 세포를 얻었다.
면역화된 마우스로부터 췌장을 외과적으로 얻고, 회수한 췌장 세포를 마우스 미엘로마 SP2/0(ATCC No. CRL1581) 세포와 5:1의 비로 혼합하고, 융합제로서 폴리에틸렌글리콜 1500(로슈사 제조)을 사용하여 세포를 융합시켜, 다수의 하이브리도마를 제조하였다. 하이브리도마는, 10 %의 소 태아 혈청(Fetal Calf Serum, FCS)과 히포크산틴(H), 아미노프테린(A) 및 티미딘(T)을 함유하는 HAT 함유 DMEM 배지(기브코(Gibco)사 제조) 중에서 배양하여 선택하였다. 또한, HT 함유 DMEM 배지를 사용하여 한계 희석법에 의해 단일 클론으로 하였다. 배양에, 96웰 마이크로타이터 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)를 사용하였다. 목적으로 하는 인간 모노클로날 항체를 생산하는 하이브리도마 클론의 선택(스크리닝) 및 각각의 하이브리도마가 생산되는 인간 모노클로날 항체의 특성화는, 후술하는 형광 활성화 셀 소터(FACS)를 이용해 측정함으로써 행하였다.
인간 모노클로날 항체 생산 하이브리도마의 스크리닝은 이하와 같이 행하였다. 즉, 이하에 설명하는 FACS 분석에 의해, 인간 면역 글로불린 μ쇄(hIgμ), γ쇄(hIgγ) 및 인간 면역 글로불린 경쇄 κ(hIgκ)를 포함하고, hCD98/hLAT1-E 발현 CT26 세포에 대해 특이적인 반응성을 갖는 인간 모노클로날 항체를 생산하는 하이브리도마를 200개 이상 얻었다.
본 명세서에서의 실시예에서는, 결과를 나타낸 표 또는 도면 중에 있어서, 인간 모노클로날 항체를 생산하는 하이브리도마 클론을 기호를 사용하여 각각 명명하였다. 이하의 하이브리도마 클론은 단일 클론을 나타낸다. 4-35-14(C2), 4-32-9(K3), 7-95-8, 10-60-7, 3-69-6, 5-80-1(이상, hCD98/hLAT1-E 발현 CT26 세포가 면역원인 클론), 1-40-1(이상 Colo205 세포를 면역원으로 하는 클론).
실시예 5: 각 모노클로날 항체의 서브 클래스 동정
실시예 4에서 얻은 각 모노클로날 항체의 서브 클래스를 FACS 분석에 의해 동정하였다. 2×106 개/㎖의 Colo205 세포를 1 mM EDTA, 0.1 % NaN3, 5 % FCS 함유 PBS의 SB(염색 완충액)에 현탁시켰다. 세포 현탁액을 96웰 환저 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)에 50 ㎕/웰로 분주(分注)하였다. 또한, 실시예 4에서 배양한 하이브리도마의 배양 상청(50 ㎕)을 거기에 첨가하여 교반하고, 빙온하에 30분간 반응시킨 후, 원심 분리(2000 rpm, 4 ℃, 2분)하여 상청을 제거하였다. 펠릿을 100 ㎕/웰의 SB로 1회 세정한 후, FITC 형광 표지된 토끼 항-인간 Igμ F(ab')2 항체(다코 사이토메이션사 제조)를 SB로 50배 희석하거나, 또는 RPE 형광-표지 염소 항-인간 Igγ F(ab')2 항체(서던 바이오테크사 제조)를 SB로 200배 희석하거나, 또는 RPE 형광-표지 토끼 항-인간 Igκ F(ab')2 항체(다코 사이토메이션사 제조)를 SB로 200배 희석하여 거기에 첨가하고, 빙온 하에 30분간 반응시켰다. SB로 1회 세정한 후, 세포를 300 ㎕의 SB에 현탁하여, FACS(FACSCan, 벡톤 디킨슨사 제조)로 항체의 결합을 나타내는 형광 강도를 측정하였다. 얻어진 항체의 일부 결과를 표 1에 나타낸다. C2는 중쇄가 μ쇄이고, 경쇄가 κ쇄이고, K3, 3-69-6, 7-95-8, 10-60-7, 1-40-1 및 5-80-1은 모두 중쇄가 γ쇄이고, 경쇄가 κ쇄였다.
실시예 6: 모노클로날 항체를 코딩하는 유전자의 제조 및 재조합 항체 발현 벡터의 구축
C2, K3, 7-95-8, 10-60-7, 3-69-6 및 1-40-1의 각 항체 유전자의 클로닝과 발현 벡터의 구축을 이하에 기술하는 방법에 따라 실시하였다.
(1) 항체 유전자의 cDNA 클로닝과 발현 벡터의 제조
하이브리도마를 10 % FCS 함유 DMEM 배지(기브코사 제조)에서 배양하고, 원심 분리에 의해 세포를 모은 후, 이소젠(ISOGEN; 닛본 진사 제조)을 첨가하여 취급 설명서에 따라 전체 RNA를 추출하였다. 항체 cDNA의 가변 영역의 클로닝은, 스마트 레이스(SMART RACE) cDNA 증폭 키트(클론테크사 제조)를 사용하여, 첨부된 설명서에 따라 행하였다.
5 ㎍의 전체 RNA를 주형으로 사용하여, 제1 스트랜드 cDNA를 제조하였다.
(a) 제1 스트랜드 cDNA의 합성
전체 RNA 5 ㎍/3 ㎕, 5' CDS 1 ㎕ 및 SMART oligo 1 ㎕를 포함하는 조성을 가지는 반응액을 70 ℃에서 2분간 배양한 후, 5x 완충제 2 ㎕, DTT 1 ㎕, dNTP 믹스 1 ㎕, 슈퍼스크립트(Superscript) II 1 ㎕를 첨가하여 반응 혼합물을 42 ℃에서 15 시간 동안 배양하였다. 또한, 100 ㎕의 트리신 완충제를 첨가한 후, 생성된 혼합물을 72 ℃에서 7분간 배양하여, 제1 스트랜드 cDNA를 얻었다.
(b) PCR에 의한 중쇄 유전자 및 경쇄 유전자의 증폭 및 재조합 항체 발현 벡터의 구축
cDNA의 증폭에는, 도요보사의 KOD-Plus cDNA를 사용하였다.
cDNA 15 ㎕, 10x KOD-Plus 완충제 5 ㎕, dNTP 믹스 5 ㎕, KOD-Plus 1 ㎕, 25 mM MgSO4 3 ㎕, 프라이머 1 및 프라이머 2의 조성을 가지는 반응액을 재증류수로 최종 용량 50 ㎕로 제조하여 PCR에 사용하였다.
K3, 1-40-1, 3-69-6 및 C2에 대하여 구체적으로 실험예를 나타내면, 이하와 같다.
K3
경쇄의 증폭을 위해, UMP와 hk-2(5'-GTT GAA GCT CTT TGT GAC GGG CGA GC-3'(서열 번호 1)) 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 5초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 5초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분간의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 5초, 68 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 25회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 hk5(5'-AGG CAC ACA ACA GAG GCA GTT CCA GAT TTC-3'(서열 번호 2)) 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트(퀴아젠사 제조)에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터(인비트로젠사 제조)에 결찰하여, 첨부 설명서에 따라 서브 클로닝하였다. 이어서, T3(5'-ATT AAC CCT CAC TAA AGG GA-3'(서열 번호 3))과 hk5를 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 DNPL15Bglp(5'-AGA GAG AGA GAT CTC TCA CCA TGG AAG CCC CAG CTC AGC TTC TCT-3'(서열 번호 4))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 경쇄 유전자를 주형으로 사용하고 DNPL15Bglp와 202LR(5'-AGA GAG AGA GCG TAC GTT TAA TCT CCA GTC GTG TCC CTT GGC-3'(서열 번호 5)) 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 400 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트(퀴아젠사 제조)에 의해 정제하였다. 증폭된 경쇄 cDNA 단편을 BglII 및 BsiWI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val Lark 벡터(IDEC Pharmaceuticals, N5KG1(미국 특허 제6001358호의 변형 벡터)에 도입하였다. 이렇게 얻은 벡터를 N5KG1-Val K3L로 명명하였다.
중쇄의 증폭을 위해, UMP와 IgG1p(5'-TCT TGT CCA CCT TGG TGT TGC TGG GCT TGT G-3'(서열 번호 6)) 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 5초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 5초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 5초, 68 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 25회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 IgG2p(5'-TGC ACG CCG CTG GTC AGG GCG CCT GAG TTC C-3'(서열 번호 7))를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, T3과 hh2(5'-GCT GGA GGG CAC GGT CAC CAC GCT G-3'(서열 번호 8))를 프라이머로 사용하여, 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 K3HcSalI(5'-AGA GAG AGA GGT CGA CCA CCA TGG GGT CAA CCG CCA TCC TCG CCC TCC TC-3'(서열 번호 9))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 중쇄 유전자를 주형으로 사용하고 K3HcSalI와 F24HNhe(5'-AGA GAG AGA GGC TAG CTG AGG AGA CGG TGA CCA GGG TTC-3'(서열 번호 10))를 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 450 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 중쇄 cDNA 단편을 SalI 및 NheI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val K3L에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val K3IgG1로 명명하였다. N5KG1-Val K3IgG1을 후술하는 자유형 293 세포에 도입시켜 얻은 재조합체 K3 항체가 K3 하이브리도마에서 유래하는 항체와 동일한지 여부는, hCD98/hLAT1 발현 세포주에 대한 결합 활성을 조사하여 확인하였다.
1-40-1
중쇄의 증폭을 위해, UMP와 IgG1p 프라이머를 사용하여 94 ℃ 5초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 5초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 5초, 68 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 25회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 IgG2p 프라이머를 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, T3과 hh2를 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 205HP5SalI(5'-AGA GAG AGA GGT CGA CCA CCA TGG AGT TTG GGC TGA GCT GGG TTT-3'(서열 번호 11))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 중쇄 유전자를 주형으로 사용하고 205HP5SalI와 F24Hnhe 프라이머를 사용하여 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 450 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 중쇄 cDNA 단편을 SalI 및 NheI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val Lark 벡터에 도입하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val 1-40-1H로 명명하였다.
경쇄의 증폭을 위해, UMP와 hk-2 프라이머를 사용하여 94 ℃ 5초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 5초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 5초, 68 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 25회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 hk5를 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, T3과 hk5를 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 A27RN202(5'-AGA GAG AGA GCG TAC GTT TGA TTT CCA CCT TGG TCC CTT GGC-3'(서열 번호 12))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 경쇄 유전자를 주형으로 사용하고 DNPL15Bglp와 A27RN202를 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 2 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 400 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 경쇄 cDNA 단편을 BglII 및 BsiWI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val 1-40-1H 벡터에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val 1-40-1IgG1로 명명하였다. N5KG1-Val 1-40-1IgG1을 후술하는 자유형 293 세포에 도입시켜 얻은 재조합체 1-40-1 항체가 1-40-1 하이브리도마에서 유래하는 항체와 동일한지 여부는, hCD98/hLAT1 발현 세포주에 대한 결합 활성을 조사하여 확인하였다.
3-69-6
경쇄의 증폭을 위해, UMP와 hk-2 프라이머를 사용하여 94 ℃ 15초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 15초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 15초, 68 ℃ 15초, 72 ℃ 3분의 사이클을 25회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 2 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 hk5를 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, M13 정방향(-20) 프라이머(5'-GTA AAA CGA CGG CCA G-3'(서열 번호 13)), M13 역방향 프라이머(5'-CAG GAA ACA GCT ATG AC-3'(서열 번호 14))와 hk5(5'-AGG CACACA ACA GAG GCAG TTCCAGA TTT C-3'(서열 번호 2))를 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 A27_F(5'-AGA GAG AGA GAT CTC TCA CCA TGG AAA CCC CAG CGCAGC TTC TCT TC-3'(서열 번호 15))와 39_20_L3Bsi(5'-AGA GAG AGA GCG TAC GTT TGA TCT CCA GCT TGG TCC CCT G-3'(서열 번호 16))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 경쇄 유전자를 주형으로 사용하고 A27_F와 39_20_L3Bsi를 사용하여, 94 ℃ 30초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 400 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 경쇄 cDNA 단편을 BglII 및 BsiWI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val Lark 벡터에 도입하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val 3-69-6L로 명명하였다.
중쇄의 증폭을 위해, UMP와 IgG1p(5'-TCT TGT CCA CCT TGG TGT TGC TGG GCT TGT G-3'(서열 번호 6)) 프라이머를 사용하여 94 ℃ 15초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 15초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 15초, 68 ℃ 15초, 72 ℃ 3분의 사이클을 30회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 2 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 IgG2p(IgG1.3.4)(5'-TGC ACG CCG CTG GTCAGG GCG CCT GAG TTC C-3'(서열 번호 7))를 사용하여 94 ℃ 30초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4 Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, M13F, M13R과 IgG2p를 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 Z3HP5Sal(5'-AGA GAG AGA GGT CGA CCCACCATG GAC TGG AGCATC CTT TT-3'(서열 번호 17))와 F24HNhe(5'-AGA GAG AGA GGC TAG CTG AGG AGA CGG TGA CCA GGG TTC-3'(서열 번호 10))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 중쇄 유전자를 주형으로 사용하고 Z3HP5SalF와 F24HNhe를 사용하여, 94 ℃ 30초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 450 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 중쇄 cDNA 단편을 SalI 및 NheI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val 3-69-6L 벡터에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val 3-69-6IgG1로 명명하였다. N5KG1-Val 3-69-6IgG1을 후술하는 자유형 293 세포에 형질감염시켜 얻은 재조합체 3-69-6 항체가 3-69-6 하이브리도마에서 유래하는 항체와 동일한지 여부는, hCD98/hLAT1 발현 세포주에 대한 결합 활성을 조사하여 확인하였다.
C2IgG1
하이브리도마 생산 C2의 서브 클래스는 IgM이기 때문에, 동일한 생식 계열에서 유래하는 IgG로부터 상정되는 가변 영역을 포함하도록 설계한 프라이머를 사용한 PCR에 의해 C2 항체 가변 영역을 단리하였다(C2 IgG1).
경쇄의 증폭을 위해, UMP와 hk-2 프라이머를 사용하여 94 ℃ 5초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 이어서 94 ℃ 5초, 70 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 5회 반복하고, 추가로 94 ℃ 5초, 68 ℃ 10초, 72 ℃ 3분의 사이클을 25회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 hk5를 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, M13F, M13R과 hk5를 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 C2-1 Lc Bgl IIF(5'-AGA GAG AGA GAT CTC TCA CCA TGG AAA CCC CAG CGCAGC TTC TCT TC-3'(서열 번호 18))와 C2-1 Lc BsiWI R(5'-AGA GAG AGA GCG TAC GTT TGA TAT CCA CTT TGG TCC CAG GG-3'(서열 번호 19))을 합성하고, pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 경쇄 유전자를 주형으로 사용하고 C2-1 Lc Bgl II F와 C2-1 Lc BsiWI R을 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 400 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 경쇄 cDNA 단편을 BglII 및 BsiWI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val Lark 벡터에 도입하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val C2L로 명명하였다.
중쇄의 증폭을 위해, UMP와 M655R(5'-GGC GAA GAC CCG GAT GGC TAT GTC-3'(서열 번호 20)) 프라이머를 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 M393R(5'-AAA CCC GTG GCC TGG CAG ATG AGC-3'(서열 번호 21))를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, M13 정방향(-20) 프라이머(5'-GTA AAA CGA CGG CCA G-3'(서열 번호 13)), M13 역방향 프라이머(5'-CAG GAA ACA GCT ATG AC-3'(서열 번호 14))와 M393R을 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 C2hcSalIF(5'-AGA GAG AGA GGT CGA CCA CCA TGA AGCACC TGT GGT TCT TCC TCC TGC T-3'(서열 번호 22))와 C2hcNheI(5'-AGA GAG AGA GGC TAG CTG AGG AGA CGG TGA CCA GGG TTC CCT GG-3'(서열 번호 58))를 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 중쇄 유전자를 주형으로 사용하고 C2hcSalIF와 C2hcNheI를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 30초의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 약 450 bp의 단편을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 증폭된 중쇄 cDNA 단편을 SalI 및 NheI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 N5KG1-Val C2L 벡터에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val C2IgG1로 명명하였다.
C2IgG1NS
상술한 바와 같이 클로닝한 C2IgG1 유전자에 있어서 중쇄의 프레임 영역에 본래의 생식 계열에서는 관찰되지 않는 돌연변이가 발생하였다. 따라서, 본래의 생식 계열의 서열을 갖는 C2의 가변 영역 서열을 이하의 방법에 의해 단리하였다.
상기에서 얻어진 벡터 N5KG1-Val C2IgG1을 주형으로서 사용하고, C2hc NS F(5'-CGT CCA AGA ACC AGT TCT CCC TGA AGC TGA-3'(서열 번호 23)) 프라이머와 C2hc NS R(5'-TCA GCT TCA GGG AGA ACT GGT TCT TGG ACG-3'(서열 번호 24)) 프라이머를 사용하여, C2 항체 중쇄의 290과 299번째의 G와 T를 각각 A와 C로 변경하고, N5KG1-Val C2IgG1NS를 제조하였다. N5KG1-Val C2IgG1과 N5KG1-Val C2IgG1NS를 후술하는 자유형 293 세포에 각각 도입시켜 얻은 재조합체 C2IgG1과 C2IgG1NS 항체가 C2 하이브리도마에서 유래하는 IgM 항체와 특이성이 동일한지 여부는, hCD98/hLAT1 발현 세포주에 대한 결합 활성을 조사하여 확인하였다. C2IgG1과 C2IgG1NS의 결합 활성은 거의 동일하였다.
C2Ig
μ
G1
상술한 C2IgG1에 사용한 방법을 사용하는 경우 중쇄와 경쇄의 결합 부위의 형태가 본래의 IgM과 상이해질 가능성이 있기 때문에, 이하의 서열 전환을 행하였다. 즉, IgG의 γ쇄와 IgM의 μ쇄의 CH1 불변 영역에 있는 공통 서열(GCL 서열)로부터 가변 영역측에 인접하는 26개의 아미노산을 μ쇄 서열로 사용하고, GCL 서열로부터 불변 영역측 모든 아미노산을 γ쇄로 변환하였다(C2 IgμG1). 이상의 서열 전환을 이하의 방법에 의해 행하였다.
C2 cDNA의 중쇄의 증폭을 위해, UMP와 M655R 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 또한, 이 반응액의 5배 희석액 1 ㎕를 주형으로 사용하고, NUMP와 M393R을 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 30회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, 증폭된 PCR 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 pCR4 Blunt-TOPO 벡터에 결찰하여 서브 클로닝하였다. 이어서, M13 정방향(-20) 프라이머(5'-GTA AAA CGA CGG CCA G-3'(서열 번호 13)), M13 역방향 프라이머(5'-CAG GAA ACA GCT ATG AC-3'(서열 번호 14))와 M393R을 프라이머로 사용하여 염기 서열을 결정하였다. 서열 정보를 기초로 C2hcSalIF(5'-AGA GAG AGA GGT CGA CCA CCA TGA AGCACC TGT GGT TCT TCC TCC TGC T-3'(서열 번호 22))와 Mu-GCL-감마 L(5'-CAC CGG TTC GGG GAA GTA GTC CTT GAC GAG GCA GCA AAC GGC CAC GCT GCT CGT-3'(서열 번호 25))을 합성하였다. pCR4Blunt-TOPO 벡터로 서브 클로닝된 중쇄 유전자를 주형으로 사용하고 C2hcSalIF와 Mu-GCL-감마 L을 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭 산물을 C2Vμ로 명명하였다. 이어서, N5KG1-Val Lark 벡터를 주형으로 사용하고 Mu-GCL-감마 U(5'-ACG AGCAGC GTG GCC GTT GGC TGC CTC GTCAAG GAC TAC TTC CCC GAA CCG GTG-3'(서열 번호 26))와 hIgG1 BamHI L(5'-CGC GGA TCC TCA TCA TTT ACC CGG AGA CAG GGA GAG GCT-3'(서열 번호 27))를 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 90초의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭 산물을 Cγ1로 명명하였다. C2Vμ과 Cγ1의 3배 희석액을 각 5 ㎕ 넣고, 프라이머 없이 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 2분의 사이클을 3회 반복하였다. 이 반응액을 99 ℃에서 5분간 가열한 후 10배 희석하였다. 5 ㎕를 주형으로 사용하고 C2hcSalIF와 hIgG1 BamHI L을 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 2분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭 산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭 cDNA 단편을 SalI 및 SmaI로 소화하고, 소화된 산물을 동일한 효소로 개열된 상기 C2 경쇄 유전자를 포함하는 N5KG1-Val Lark 벡터에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 벡터를 N5KG1-Val C2IgμG1로 명명하였다. C2IgμG1 항체의 결합 활성은, N5KG1-Val C2IgμG1을 후술하는 자유형 293 세포에 유전자 도입시켜 얻은 재조합체의 hCD98/hLAT1 발현 세포주에 대한 결합 활성을 조사하여 확인하였다.
K3, 1-40-1 및 3-69-6의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 DNA 서열, 및 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 아미노산 서열은, 각각 이하의 서열 번호의 서열이었다.
<K3 중쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 28)
<K3 중쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 29)
<K3 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 30)
<K3 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 31)
<1-40-1 중쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 32)
<1-40-1 중쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 33)
<1-40-1 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 34)
<1-40-1 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 35)
<3-69-6 중쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 36)
<3-69-6 중쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 37)
<3-69-6 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 38)
<3-69-6 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 39)
C2 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 DNA 서열, 및 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 아미노산 서열을 각각 이하에 나타낸다.
<C2IgG1 중쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 40)
<C2IgG1 중쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 41)
<C2IgG1NS 중쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 42)
<C2IgG1NS 중쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 43)
<C2IgμG1 중쇄 가변 영역으로부터 인간 IgG1과의 결합 부위 핵산 서열>(서열 번호 44)
<C2IgμG1 중쇄 가변 영역으로부터 인간 IgG1과의 결합 부위 아미노산 서열>(서열 번호 45)
<C2IgG1과 C2IgμG1의 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 46)
<C2IgG1과 C2IgμG1의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 47)
상기 각 항체 서열 중, K3 및 C2IgG1의 경쇄 가변 영역과 중쇄 가변 영역(즉, 서열 번호 28 및 30 및 서열 번호 40 및 46의 서열의 핵산)을 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 도입하고, 생성물을 독립 행정 법인 산업 기술 종합 연구소 특허 생물 기탁 센터에 기탁하여, 각각 FERM BP-10552(식별을 위한 표시: K3/pCR4) 및 FERM BP-10551(식별을 위한 표시: C2IgG1/pCR4)의 기탁 번호가 부여되었다.
상기 각 항체 가변 영역은 중쇄 및 경쇄 뿐만 아니라 결합 및 단리에 사용하는 제한 효소 인식 서열을 포함하고 있다. 각 항체의 경쇄 가변 영역은 BglII 및 BsiWI 제한 효소를 사용하여 단리할 수 있고, 중쇄 가변 영역은 SalI 및 NheI 제한 효소를 사용하여 단리할 수 있다. 이하에 pCR4Blunt-TOPO 벡터에 삽입한 각 항체 가변 영역과 제한 효소 인식 부위 등을 포함한 유전자 서열을 나타낸다.
<K3/pCR4>(서열 번호 48)
<C2IgG1/pCR4>(서열 번호 49)
실시예 7: 재조합형 항체의 제조
실시예 6에서 구축한 재조합형 항체 발현 벡터를 숙주 세포에 도입하여, 재조합형 항체 발현 세포를 제조하였다. 발현을 위한 숙주 세포로서 CHO 세포의 dhfr 결손주(ATCC CRL-9096)를 사용하였다. 숙주 세포로의 벡터의 도입은 전기 천공에 의해 실시하였다. 항체 발현 벡터 약 2 ㎍을 제한 효소로 선상화하고, Bio-Rad electrophoreter를 사용하여 350 V, 500 μF의 조건으로 4×106개의 CHO 세포에 유전자를 도입하고, 세포를 96 웰 컬쳐 플레이트에 파종하였다. 발현 벡터의 선택 마커에 대응하는 약제를 첨가하여 세포의 배양을 계속하였다. 콜로니의 출현을 확인한 후, 실시예 4에 나타낸 방법에 의해 항체 발현주를 선별하였다. 선별한 세포로부터의 항체 정제는, 실시예 8에 따라 행하였다. 또한, 재조합형 항체 발현 벡터를 첨부 설명서에 따라 자유형 293 세포(인비트로젠사 제조)에 도입하여, 재조합형 항체를 발현시켰다.
실시예 8: 항체의 정제
인간 IgG 항체를 포함하는 하이브리도마 배양 상청의 제조는, 이하의 방법으로 행하였다. 항체 생산 하이브리도마를 소 인슐린(5 ㎍/㎖, 기브코사 제조), 인간 트랜스페린(5 ㎍/㎖, 기브코사 제조), 에탄올아민(0.01 mM, 시그마사 제조) 및 아셀레늄산나트륨(2.5×10-5 mM, 시그마사 제조) 함유 eRDF 배지(교꾸또 세이야꾸사 제조)에 순화하였다. 하이브리도마를 조직 배양 플라스크에서 배양하고, 하이브리도마의 생존율이 90 %가 된 시점에 배양 상청을 회수하였다. 회수한 상청을 10 ㎛와 0.2 ㎛의 필터(겔만 사이언스사 제조)로 여과하여, 하이브리도마 등의 잡배물을 제거하였다. 항체를 포함하는 배양 상청을, 단백질 A(아머샴)를 사용하고 흡착 완충액으로서 PBS, 용출 완충액으로서 20 mM 시트르산나트륨 완충액(pH 3.0)을 사용하여 친화성 정제하였다. 용출 분획은 50 mM 인산나트륨 완충액(pH 7.0)을 첨가하여 pH 6.0 부근으로 조정하였다. 제조된 항체 용액은, 투석막(10,000 커트, 스펙트럼 래보러토리즈사 제조)을 사용하여 PBS로 치환하고, 공경 0.22 ㎛의 막필터 MILLEX-GV(밀리포어사 제조)로 여과 멸균하여, 정제 항체를 얻었다. 정제 항체의 농도는 280 ㎚의 흡광도를 측정하여, 측정된 값을 1.45 최적 밀도에서 1 ㎎/㎖로 전환하였다.
실시예 9: 각 모노클로날 항체의 특이성
실시예 4에서 얻은 각 모노클로날 항체의 반응성의 검토를 실시예 5에 명기한 FACS 분석과 동일한 방법으로 행하였다. 실시예 2에서 제조한 세포주를 염색 완충액(SB)을 사용하여 2×106/㎖로 제조하고, 그 세포 현탁액을 96웰 환저 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)에 50 ㎕/웰로 분주하였다. 실시예 4 내지 실시예 8에서 제조한 각 재조합체 항체를 SB로 5 ㎍/㎖로 제조하고, 50 ㎕를 각 웰에 첨가하여 교반하였다. 음성 대조군은, KM 마우스로 제조한 항디니트로페닐(DNP) 인간 IgG1 항체를 사용하였다. 빙온하에 30분간 반응시킨 후, 혼합물을 원심 분리(2000 rpm, 4 ℃, 2분)하여 상청을 제거하였다. 펠릿을 100 ㎕/웰의 SB로 1회 세정한 후, 200배 희석한 RPE 형광-표지 토끼 항-인간 Igκ F(ab')2 항체(다코 사이토메이션사 제조)를 50 ㎕/웰로 첨가하고, 생성된 용액을 빙온하에 30분간 반응시켰다. SB로 1회 세정한 후, 생성된 펠렛을 300 ㎕의 SB에 현탁하고, FACS로 항체의 결합을 나타내는 형광 강도를 측정하였다.
그 결과, 모든 항체가 hCD98/hLAT1-E 발현 CT26 세포(도 1) 또는 hCD98/hLAT1-E 발현 L929 세포(도 2)에 대하여 강한 결합 활성을 가졌으며, 한편 CT26 세포 및 L929 세포에 대한 결합 활성은 관찰되지 않았다. 또한, 어떠한 항체도 hLAT1-E 발현 L929 세포에는 결합하지 않았으나, hCD98 발현 L929 세포에는 결합하였다. 따라서, C2, K3, 7-95-8, 10-60-7, 3-69-6 및 1-40-1 항체의 결합 부위는 hCD98에 위치한다는 것을 알 수 있었다(도 2).
실시예 10: 각 모노클로날 항체의 항원 결합에 관계된 hCD98 단백질의 영역
각 모노클로날 항체의 결합에 중요한 hCD98 분자의 영역을 검토하였다.
우선, 튜니카마이신 처리된 K562 세포주에 대한 반응성을 조사하였다. 2×105 개의 K562 세포를 6웰 플레이트에 파종하고(4 ㎖/웰), 5 ㎍/㎖의 튜니카마이신(시그마사 제조) 존재/비존재 하에 72 시간 동안 37 ℃에서 5 % CO2하에 배양하였다. 이 조건 하에서, 본래 분자량이 약 80 KDa인 hCD98가, N-결합 탄화수소 쇄가 제거된 후의 이론값인 약 60 kDa가 된다는 것을 웨스턴 블롯으로 확인하였다. 배양 후, 세포를 회수하여 2×106/㎖의 세포주를 염색 완충액(SB)에 현탁시켰다. 세포 현탁액을 96-웰 환저 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)에 50 ㎕/웰로 분주하였다. SB로 5 ㎍/mL로 제조된 각 재조합체 항체를 50 ㎕/웰 첨가하고, 빙온하에 30분간 반응시켰다. 음성 대조군은 항-DNP 인간 IgG1 항체를 사용하였다. SB로 1회 세정한 후, RPE 형광-표지 염소 항-인간 Igγ F(ab')2 항체(서던 바이오테크사 제조)를 SB로 200배 희석하여 첨가하고, 혼합물을 빙온하에 30분간 배양하였다. SB로 1회 세정한 후, 세포를 300 ㎕의 FACS 완충액에 현탁하고, FACS로 항체의 결합을 나타내는 형광 강도를 측정하였다.
그 결과, 어떠한 항체에 대해서도 튜니카마이신 비처리 K562 세포보다 처리 세포에 대한 결합 활성이 저하되지 않았다(도 3). 이상의 결과로부터, 각 항체의 결합 부위는 N-결합 탄화수소 쇄가 아니라는 것을 알 수 있었으며, 이들 모노클로날 항체는 hCD98의 항체라는 것이 강하게 시사되었다. 또한, 각 모노클로날 항체의 결합에 중요한 hCD98의 영역을 실시예 11에서 검토하였다.
실시예 11: 각 항체의 결합 반응에 중요한 인간 CD98 단백질의 영역
각 항체는 마우스 CD98(mCD98)에 교차 반응성을 나타내지 않기 때문에, mCD98과 hCD98을 인공적으로 결합한 키메라 CD98을 이용하여, 각 항체의 결합 반응에 중요한 인간 CD98 단백질의 영역을 검토하였다.
키메라 CD98은 이하와 같이 제조하였다. mCD98과 hCD98의 서열 정보로부터, EcoRI hCD98U(5'-CCG GAA TTC cCa cCa TGA GCC AGG ACA CCG AGG TGG ATA TGA-3'(서열 번호 50)), NotI hCD98(5'-AAG GAA AAA AGC GGC CGC TCA TCA GGC CGC GTA GGG GAA GCG GAG CAG CAG-3'(서열 번호 51)), EcoRI mCD98(5'-CCG GAA TTC CCA CCA TGA GCC AGG ACA CCG AAG TGG ACA TGA AA-3'(서열 번호 52)), NotI mCD98L(5'-AAG GAA AAA AGC GGC CGC TCA TCA GGC CAC AAA GGG GAA CTG TAA CAG CA-3'(서열 번호 53)), cCD98 D2-F(5'-TCA TTC TGG ACC TTA CTC CCA ACT ACC-3'(서열 번호 54)), cCD98 D2-R(5'-GGT AGT TGG GAG TAA GGT CCA GAA TGA-3'(서열 번호 55)), cCD98 D3-F(5'-TGC TCT TCA CCC TGC CAG GGA CCC CTG TTT T-3'(서열 번호 56)), cCD98 D3-R(5'-AAA ACA GGG GTC CCT GGC AGG GTG AAG AGC A-3'(서열 번호 57))을 합성하였다. PCR을 행할 때 주형으로서 사용한 것은, mCD98(GenBank/EMBL/DDBJ accession no. U25708) 및 인간 CD98을 코딩하는 cDNA를 보유하는 플라스미드 벡터 pcDNA3.1-mCD98 및 실시예 1에서 제조한 pEF6/hCD98이다.
cDNA의 증폭에는, 도요보사의 KOD-Plus를 사용하였다. cDNA 15 ㎕, 10x KOD-Plus 완충액 5 ㎕, dNTP 믹스 5 ㎕, KOD-Plus 1 ㎕, 25 mM MgSO4 3 ㎕, F 프라이머 및 R 프라이머의 조성을 가지는 반응액을 재증류수로 최종 용량 50 ㎕로 제조하여, PCR에 사용하였다.
cDNA1과 F 프라이머 1과 R 프라이머 1, 또는 cDNA2와 F 프라이머 2와 R 프라이머 2를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 90초(94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 50초)의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭산물을 각각 P1, P2로 명명하였다. 이어서, P1과 P2의 2 내지 3배 희석액을 각 5 ㎕ 넣고, 프라이머 없이 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 2분의 사이클을 3회 반복하였다. 이 반응액을 99 ℃에서 5분간 가열한 후 5 내지 10배 희석하였다. 이 용액의 5 ㎕를 주형으로 사용하고 F 프라이머 1과 R 프라이머 2를 사용하여, 94 ℃ 15초, 60(55 ℃) ℃ 30초, 68 ℃ 2분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다.
키메라 CD98-1, 키메라 CD98-2 및 키메라 CD98-3은, 각각 이하의 (cDNA1:F 프라이머 1:R 프라이머 1; 및 cDNA2:F 프라이머 2:R 프라이머 2)의 조합 (pEF6/hCD98:EcoRIhCD98U:cCD98D2-R; 및 pcDNA3.1-mCD98:cCD98D2-F:NotImCD98L), (pEF6/hCD98:EcoRIhCD98U:cCD98D3-R; 및 pcDNA3.1-mCD98:cCD98D3-F:NotImCD98L), (pcDNA3.1-mCD98:EcoRImCD98U:cCD98D2-R; 및 pEF6/hCD98:cCD98D2-F:NotIhCD98L)를 이용하여 제조하였다. 각 PCR 증폭 cDNA 단편을 EcoRI 및 NotI로 소화하고, 동일한 효소로 개열된 pEF6myc-His/Bsd 벡터(인비트로젠사 제조)에 결찰하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 실시예 2와 동일한 방법으로 각 벡터를 실시예 1에서 제조한 pEF1/hLAT1-EGFP 벡터와 함께 L929 세포에서 발현시키고, 실시예 10과 동일한 방법의 FACS 분석으로 각 FITC-표지 항체의 결합을 조사하였다. 그 결과(도 4), K3, 7-95-8, 10-60-7 및 3-69-6 항체는, 시판된 FITC-표지 항-인간 CD98 항체(클론 UM7F8, 벡톤 디킨슨사 제조 Ca. No. 556076)와 마찬가지로, 키메라 CD98-3을 발현하는 L929 세포에만 결합하기 때문에, hCD98의 372번 아미노산 잔기로부터 530번 아미노산 잔기의 영역이 이들 항체의 결합에 중요하다는 것이 시사되었다. 한편, C2 항체와 1-40-1 중화 항체는 키메라 CD98-2에만 강하게 결합하기 때문에, hCD98의 104번 아미노산 잔기 내지 371번 아미노산 잔기가 이들 항체의 결합에 중요하다는 것을 알 수 있었다.
실시예 12: 각 모노클로날 항체의 아미노산 흡수 억제 활성
모노클로날 항체가 인간 방광암 세포주 T24 세포의 아미노산의 흡수에 영향을 주는지를, 기질로서 류신을 사용하여, 기질의 흡수 실험을 가나이 등(Kanail et al.)의 방법(Kim et al., Biochim . Biophys . Acta 1565: 112-122, 2002)에 준하여 이하와 같이 행하였다. 1×105 개의 T24 세포주를 24-구멍 배양 플레이트에 파종하고, 10 % FCS를 함유하는 MEM 배지(시그마 알드리치사 제조)에서 37 ℃, 5 % CO2하에 2일간 배양하였다. 배양 후 배지를 제거하고, 200 ㎍/mL의 항체를 포함하는 HBSS(-(Na+-결여)를 0.25 mL/웰 첨가하고, 세포를 37 ℃에서 5 % CO2하에 추가로 10분간 배양하였다. C2, K3, 7-95-8, 10-60-7, 3-69-6, 1-40-1 및 항-DNP 인간 항체는 재조합체 항체를 사용하고, 5-80-1은 하이브리도마에서 유래하는 항체를 사용하였다. 그 후, 상청을 제거하고, 1 μM의 14C-Leu(모라베크 바이오케미컬즈사 제조)를 포함하는 HBSS(-)(Na+-결여)를 0.5 mL/웰 첨가하여 세포를 1분간 배양하였다. 빙냉 HBSS(-)(Na+-결여) 용액으로 3회 세정한 후, 0.1 N 수산화나트륨을 0.5 mL/웰 첨가하고 세포를 회수하였다. 회수된 용액 중의 14C-Leu량은, 액체 섬광 계수기 모델 LSC-5100(ALOKA사 제조)으로 측정하였다. 각 세포의 14C-Leu 흡수량은, 회수한 용액 중의 단백질 농도를 BCA법으로 측정하고, 단백질량으로 표준화하였다. 그 결과(도 5), 1-40-1, K3, C2IgG1, 10-60-7 및 3-69-6은, 대조군 항체(DNP 인간 항체)에 비해 유의하게 류신의 흡수를 억제하였다. 이하의 실험은, 유의하게 류신의 흡수를 억제한 1-40-1, K3, C2IgG1, 10-60-7 및 3-69-6을 사용하여 실시하였다.
실시예 13: 각 모노클로날 항체의 항- hCD98 / hLAT1 항체의 형광 표지
각 항체의 형광 표지화는 이하의 방법으로 행하였다. 형광 물질인 플루오레세인 이소티오시아네이트(FITC, 시그마사 제조)를 부속 설명서에 따라, 실시예 4 내지 실시예 8에서 제조한 각 재조합체 항체에 결합시켰다. 200 mM의 탄산나트륨 완충액(pH 8.3 내지 8.5) 중 1 내지 2 ㎎/㎖의 항체에, 디메틸포름아미드에 용해한 FITC를 항체 분자의 20 내지 40배량 첨가하고, 혼합물을 교반하면서 실온에서 2 내지 3 시간 동안 반응시켰다. PBS로 평형화한 겔 여과 칼럼(NAP5, 아머샴 파마시아 바이오테크사 제조)에 혼합액을 가하여 항체에 미결합된 FITC를 제거하였다. 이 조건 하에서, 항체 1 분자에 약 3개의 FITC가 결합하였다. 형광 표지된 항체는 모두 hCD98의 발현이 확인된 인간 대장암 세포주 DLD-1 세포주에 결합하였다.
실시예 14: 각 모노클로날 항체의 인간 말초혈에서 유래하는 T 세포, B세포, 단구 세포와 정상 인간 대동맥 내피 세포( HAEC )로의 반응성
단구 세포, 활성화 T 세포, 배양한 정상 내피 세포에서는 CD98이 발현된다고 알려져 있다. 따라서, 각 항체의 인간 말초혈에서 유래하는 T 세포, B 세포 및 단구 세포와 인간 대동맥 내피 세포(HAEC)에 대한 반응성을 조사하였다. 인간 말초혈에서 유래하는 세포는 이하의 방법으로 제조하였다. 1 ㎖ 헤파린(노보사 제조) 함유 인간 말초혈 10 ㎖를 PBS로 2배로 희석하고, 20 ㎖의 Ficoll-Paque PLUS 액(아머샴 파마시아 바이오테크사 제조) 위에 중층하여, 1500 rpm으로 30분간 원심 q분리한 후 세포를 회수하였다. PBS로 2회 세정하여 단핵구 세포를 제조하였다. 일부의 단핵구 세포는, 10 ㎍/㎖의 피토헤마글루티닌(시그마사 제조, PHA), 10 % FCS, 0.1 mM 비필수 아미노산 용액(기브코사 제조), 5.5×10-6 M 2-메르캅토에탄올(기브코사 제조) 및 페니실린/스트렙토마이신/글루타민(기브코사 제조) 함유 RPMI 배지(기브코사 제조)에서 5 % CO2, 37 ℃하에 72 시간 동안 배양하였다. PHA 자극에 의해 인간 말초혈에서 유래하는 T 세포 및 B 세포에 활성화 마커인 CD25 발현이 관찰되었다(FITC-표지 항-인간 CD25 항체(벡톤 디킨슨사 제조 Ca. 555431)를 사용한 FACS 분석). 제조된 각 세포는 염색 완충액(SB)에 2×106/㎖로 현탁시키고, 세포 현탁액을 96-웰 환저 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)에 50 ㎕/웰로 분주하였다. 실시예 13에서 제조된 각각의 FITC-표지 항체를 5 ㎍/㎖의 농도로 항-인간 CD3 항체(벡톤 디킨슨사 제조 Ca. No. 555340), 항-인간 CD14 항체(벡톤 디킨슨사 제조 Ca. No. 347497) 또는 항-인간 CD19 항체(이뮤노테크사 제조 Ca. No. IM1285)와 함께 빙온하에 30분간 반응시켰다. 양성 대조군으로서 시판된 FITC-표지 항-인간 CD98 항체(클론 UM7F8)를, 음성 대조군은 FITC-표지 항-DNP 인간 IgG1 항체를 사용하였다. SB로 1회 세정한 후, 생성물을 300 ㎕의 FACS 완충액에 현탁하고, FACS로 각 항체의 반응성을 조사하였다.
그 결과, C2IgG1 이외의 항체는 UM7F8과 유사한 결합 양식을 나타내었으며, 따라서, 단구 세포, 활성화 T 세포 및 활성화 B 세포에 유의하게 결합하였다(도 6 및 도 7). 한편, C2IgG1은 어떠한 세포에 대해서도 유의한 결합은 관찰되지 않았다(도 6 및 도 7).
HAEC(캠브렉스사 제조)는 첨부 설명서에 따라 배양하고, 계대수가 4회 이내인 세포를 사용하였다. 배양한 HAEC에 대한 C2IgG1, K3, 7-95-8, 10-60-7, 3-69-6 및 1-40-1 항체의 반응성을 상기와 동일한 방법으로 조사하였다. 3.2 ng/㎖ 내지 50 ㎍/㎖의 농도로 각 항체 반응시킨 결과, K3, 7-95-8, 10-60-7, 3-69-6 및 1-40-1은 HAEC에 결합했지만, C2IgG1은 HAEC에 결합하지 않았다(도 8).
한편, 항체들을 동일한 조건하에 인간 대장암 세포주 DLD-1에 반응시키면, 모든 항체가 특정 조건하(본 실시예에서는, 3 ㎍/㎖ 이하의 항체 농도)에서는 UM7F8보다 DLD-1 암 세포에 대한 특이성이 높다는 것을 알 수 있었다(도 8). 특히 C2IgG1은, 암 특이성이 높은 항체라는 것이 강하게 시사되었다. 이하의 실험은 C2IgG1, K3 및 3-69-6을 사용하여 실시하였다.
실시예 15: 암 세포주에 대한 각 모노클로날 항체의 반응성
C2IgG1, K3 및 3-69-6의 대장암 세포주(DLD-1), 폐암 세포주(H226), 전립선 암 세포주(DU145), 흑색종 세포주(G361, SKMEL28, CRL1579), 비호지킨 림프종 세포주(Ramos), 방광암 세포주(T24), 유방암 세포주(MCF, MDA-MB-231), 췌장암 세포주(HS766T), 다발성 골수종 세포주(IM9), 적아구계 백혈병 세포주(K562, 도 3 참조)에 대한 각 항체의 반응성의 검토를 실시예 9와 동일한 방법의 FACS 분석으로 행하였다. 세포주를 염색 완충액(SB)로 2×106/㎖로 세포 현탁액을 제조하고, 96웰 환저 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)에 50 ㎕/웰로 분주하였다. 5 ㎍/㎖로 제조된 항체 또는 FITC-표지 항체를 50 ㎕/웰 첨가하고, 빙온하에 30분간 반응시켰다. 음성 대조군은 항-DNP 인간 IgG1 항체 또는 FITC-표지 항-DNP 인간 IgG1 항체를 사용하였다. SB로 1회 세정한 후, RPE 형광-표지 염소 항-인간 Igγ F(ab')2 항체(서던 바이오테크 사 제조)를 SB로 200배 희석한 것 50 ㎕를 첨가하고, 혼합물을 빙온하에 30분간 배양하였다. FITC-표지 항체의 경우에는, 이 조작을 생략하였다. SB로 1회 세정한 후, 생성물을 300 ㎕의 FACS 완충액에 현탁하고, FACS로 각 세포의 평균 형광 강도를 측정하였다.
그 결과, 모든 항체가 각 암 세포주에 대해 결합 활성을 갖는다는 것을 알 수 있었다(도 9 및 도 10). 또한, 모든 항체가 Colo205, SW480, SW620, LOVO, LS180 및 HT29의 인간 대장암 세포주에 강하게 결합하였다.
실시예 16: 마우스 암 모델에서의 K3 , C2IgG1 및 3-69-6의 항종양 효과
실시예 4 내지 실시예 8에서 제조된 재조합체 모노클로날 항체 K3, C2IgG1 및 3-69-6의 항종양 효과를, 이하에 기재하는 방법에 따라 마우스 암 모델을 사용하여 검토하였다. 개
5주령의 Balb/c 누드 마우스(닛본 구레아(주)사로부터 구입)를 각 개체의 체중을 기준으로 5 마리를 1군으로서 나누었다. 100 ㎕의 PBS에 5×106 개의 대장암 세포 Colo205와 5 ㎍의 항체를 혼합한 것을 복부 피하에 이식하였다. 이식 후 2일째, 4일째, 6일째에 100 ㎍/100 ㎕로 용매(1 % 마우스 혈청 함유 PBS)에 용해시킨 항체를 마우스 복강 내에 투여하고, 종양의 크기를 측정하였다. 항체의 음성 대조군으로서 용매를 사용하였다.
상기 실험 결과는, 도 11에 도시된 바와 같다. 도면 중의 각 절선은 개별 마우스의 데이터를 나타낸다. 대조군은, 5일째에는 모든 개체에서 암 세포주의 생착이 관찰되었으며, 12일째의 종양의 평균 부피(장경×단경×단경×0.5로 산출)±SE는 165.55±31.71 ㎣였다. 한편, C2IgG1군은 1 개체만 대조군과 동일하게 종양 증식을 나타내었지만(12일째에 종양괴가 169.44 ㎣), 다른 개체는 C2IgG1 항체 투여에 의해 강한 항종양 활성이 관찰되었다. 28일째의 대조군의 종양괴의 평균 부피±SE는 1977.64±442.04이고, C2IgG1 항체 투여군은 775.31±622.47로, C2IgG1 항체는 유의하게 Cdo205 암 세포에서 유래하는 종양의 증식을 억제하였다(p<0.01). K3군과 3-69-6군은 모든 개체에서 30일 이상 경과하여도 암의 생착은 관찰되지 않았다. 평균 체중은 대조군에서만 저하되었다(이식 30일째에는 K3군보다 약 20 % 저하).
이들 결과로부터, K3, C2IgG1 및 3-69-6은 암 세포 증식 억제 활성을 갖는 다는 것을 발견하였다.
실시예 17: 마우스 동계 담암 모델에서의 C2IgG1 모노클로날 항체의 항종양 효과
실시예 4 내지 실시예 8에서 제조된 재조합체 모노클로날 항체 C2IgG1의 항종양 효과를 이하에 기재하는 방법에 따라 마우스 동계 암 모델을 사용하여 검토하였다.
실시예 2에서 제조한 hCD98/hLAT1-E 발현 CT26 세포 5×106 개를 이식한 Balb/c(암컷)를 종양의 부피로부터 5 마리씩 2군으로 나누었다. 종양 부피가 약 90 ㎣(장경×단경×단경×0.5로 산출)로 증가한 시점(0일째)과, 3일째, 5일째에 100 ㎍/100 ㎕의 용매(1 % 마우스 혈청 함유 PBS) 중의 C2IgG1을 마우스 복강 내에 투여하였다. 대조군은 용매를 투여하였다. 그 결과, C2IgG1은 유의하게 생착 종양의 증식을 강하게 억제하는 활성이 있다는 것이 관찰되었다(도 12).
실시예 18: C2IgG1 및 K3 항체의 원숭이 세포로의 교차 반응성
C2IgG1 및 K3의 원숭이 세포(COS-7 세포)로의 교차 반응성을 FACS 분석으로 조사하였다. 2×106/㎖의 세포를 염색 완충액(SB)에 현탁시켰다. 세포 현탁액을 96-웰 환저 플레이트(벡톤 디킨슨사 제조)에 50 ㎕/웰로 분주하였다. SB로 5 ㎍/mL로 제조된 항체를 50 ㎕ 첨가하고, 생성물을 빙온하에 30분간 반응시켰다. 음성 대조군은 DNP 인간 IgG1 항체를 사용하였다. SB로 1회 세정한 후, SB로 200배 희석한 RPE 형광-표지 염소 항-인간 Igγ F(ab')2 항체(서던 바이오테크 사 제조)를 50 ㎕/웰 첨가하고, 빙온하에 30분간 반응시켰다. SB로 1회 세정한 후, 생성물을 300 ㎕의 FACS 완충액에 현탁하고, FACS로 항체의 결합을 나타내는 형광 강도를 측정하였다. 그 결과, 두 항체 모두 COS-7 세포주에 결합하였고, C2IgG1 및 K3이 원숭이 세포에 교차 반응성을 갖는 항체라는 것을 알 수 있었다(도 13).
실시예 19: 마우스 담암 모델에 대한 C2IgG1의 효과
C2IgG1의 항종양 활성을 이하에 기재하는 방법에 따라 마우스 담암 모델을 사용하여 검토하였다.
6주령의 Balb/c-SCID 마우스(닛본 구레아(주)사로부터 구입)의 배부 피하에, 버킷 림프종 세포주 Ramos(ATCC로부터 구입)를 3×106/마우스 개체로 이식하였다. 이식 13일 후 생착한 종양의 크기를 측정하여, 종양의 크기가 30 내지 140 ㎣인 담암 마우스를 6 마리 1군으로서 나누었다. 복강 내에, C2IgG1을 100 ㎎/마우스 개체(200 ㎖의 PBS에 용해한 것)를 3회/주로 투여하였다. 양성 대조군으로서 리툭시맵(젠야꾸 고교 가부시끼가이샤)을, 음성 대조군으로서 PBS를 사용하였다. 종양 부피 및 체중을 주 3회 측정하였다. 종양괴의 장경, 단경, 높이를 측정하여, (장경)×(단경)×(높이)÷ 2의 값을 종양 부피로 하였다.
결과를 도 14에 나타낸다. C2IgG1 투여에 의해, 종양 이식 후 16일째부터 유의한 종양 증식 억제 효과가 관찰되었다.
실시예 20: C2IgG1NS 아미노산 개변체
C2IgG1 및 C2IgG1NS는 모두 재조합 항체를 제조했을 때 응집체 함량이 높다. 따라서, 서열 번호 47로 표시되는 C2IgG1NS의 경쇄 가변 영역 서열에 있어서, 번역 개시 코돈 ATG에 상당하는 5번째 M(메티오닌)을 1번 위치 아미노산으로 하고, 그로부터 계산하여 117번째의 I(이소류신)를 다른 아미노산으로 치환한 개변체의 제조를 행하였다.
C2IgG1NS
/
I117N
벡터의 제조
경쇄 117번 위치 이소류신을 아스파라긴으로 치환한 C2IgG1NS/I117N을 제조하는 것을 목적으로서, 실시예 6에서 제조한 N5KG1-Val C2IgGlNS 벡터를 주형으로 사용하여 Gene EditorTM in vitro Site-Directed Mutagenesis System(프로메가사 No. Q9280)을 사용한 부위 특이적 돌연변이 도입법에 의해, 아미노산 치환체를 코딩하는 각종 돌연변이 DNA를 제조하였다.
변이 도입용 올리고뉴클레오티드(5' 말단 인산화 종료)로서, C2NS Lc 117I/HYND-p:(5'-TCAGTATGGT AGCTCACCTN ATTTCACTTT CGGCCCTGGG ACC-3'(N=AㆍTㆍGㆍC)(서열 번호69))를 사용하였다. 목적으로 하는 변이 도입용 올리고뉴클레오티드와 상기 키트 부속의 Selection Oligonucleotide를 주형 DNA와 어닐링시켜 변이 도입쇄를 합성한 후, GeneEditorTM Antibiotic Selection Mix 존재하에서는 변이체만이 증식한다는 사실을 이용하여 돌연변이체를 선택하였다. 보다 구체적으로는, dsDNA 템플릿을 알칼리 조건하에(0.2 M NaOH, 0.2 mM EDTA(최종 농도)) 실온에서 5분간 배양한 후, 2 M 아세트산암모늄(pH 4.6)을 10분의 1 용량 첨가하여 중화한 후 주형을 에탄올 침전에 의해 회수하였다. 알칼리 변성 처리한 주형 DNA에, 변이 도입용 올리고뉴클레오티드와 새로운 항생 물질 내성 획득용 Selection Oligonucleotide(Bottom Select Oligo, 5' 말단 인산화 5'-CCGCGAGACC CACCCTTGGA GGCTCCAGAT TTATC-3'(서열 번호 85)) 및 키트 첨부의 어닐링 완충제를 첨가한 후, 75 ℃에서 5분간 보온하고, 37 ℃로 천천히 낮춤으로써 어닐링을 행하였다. 이어서, 변이쇄의 합성 및 결찰을 위해, 키트 부속의 Synthesis 10x 완충액, T4 DNA 폴리머라제 및 T4 DNA 리가아제를 첨가하여, 37 ℃에서 90분간 반응을 행하였다. GeneEditorTM Antibiotic Selection Mix 존재하에 컴피턴트셀 BMH 71-18 mutS로 형질 전환하여 배양한 형질 전환체 대장균으로부터 플라스미드 DNA를 제조하고, 그 DNA를 전기 천공법에 의해 ElectroMAX. DH10B Cells(인비트로젠사 No. 18290-015)에 형질 전환한 후, GeneEditorTM Antibiotic Selection Mix를 포함하는 LB 플레이트에 파종하였다. 플레이트에 생성된 형질 전환체를 배양하고, 플라스미드 DNA를 정제하여 DNA 염기 서열을 해석하였다. DNA 염기 서열의 결과, 목적으로 하는 아미노산 변이가 도입된 C2IgG1NS 이변체의 발현 벡터를 얻었다. 얻어진 1 아미노산 치환 변이체 단백질을 발현하는 플라스미드 DNA를 N5KG1-Val C2IgG1NS/I117N 벡터로 명명하였다.
C2IgG1NS/I117C 벡터의 제조
경쇄 117번 위치 이소류신을 시스테인으로 치환한 C2IgG1NS/I117C를 제조하는 것을 목적으로서, 실시예 6에서 제조한 N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로서 GeneEditorTM in vitro Site-Directed Mutagenesis System(프로메가사 No. Q9280)을 사용한 부위 특이적 돌연변이 도입법에 의해, 아미노산 치환체를 코딩하는 각종 돌연변이 DNA를 제조하였다.
변이 도입용 올리고뉴클레오티드(5' 말단 인산화 종료)로서, C2NS Lc 117I/GRC-p(5'-TCAGTATGGT AGCTCACCTB GTTTCACTTT CGGCCCTGGG ACC-3'(B=CㆍGㆍT)(서열 번호 70))를 사용하였다. 목적으로 하는 변이 도입용 올리고뉴클레오티드와 상기 키트 부속의 Selection Oligonucleotide를 주형 DNA와 어닐링시켜 변이 도입쇄를 합성한 후, GeneEditorTM Antibiotic Selection Mix 존재하에서는 변이체만이 증식한다는 사실을 이용하여 돌연변이체를 선택하였다. 보다 구체적으로는, dsDNA 템플릿을 알칼리 조건하에(0.2 M NaOH, 0.2 mM EDTA(최종 농도)) 실온에서 5분간 배양한 후, 2 M 아세트산암모늄(pH 4.6)을 10분의 1 용량 첨가하여 중화한 후 주형을 에탄올 침전에 의해 회수하였다. 알칼리 변성 처리한 주형 DNA에 변이 도입용 올리고뉴클레오티드와 새로운 항생 물질 내성 획득용 Selection Oligonucleotide(Bottom Select Oligo, 5' 말단 인산화 5'-CCGCGAGACC CACCCTTGGA GGCTCCAGAT TTATC-3'(서열 번호 85)) 및 키트 첨부의 어닐링 완충제를 첨가한 후, 75 ℃에서 5분간 보온하고, 37 ℃로 천천히 낮춤으로써 어닐링을 행하였다. 이어서, 변이쇄의 합성 및 결찰을 위해, 키트 부속의 Synthesis 10x 완충액, T4 DNA 폴리머라제 및 T4 DNA 리가아제를 첨가하고, 37 ℃에서 90분간 반응을 행하였다. GeneEditorTM Antibiotic Selection Mix 존재하에 컴피턴트셀 BMH 71-18 mutS로 형질 전환하여 배양한 형질 전환체 대장균으로부터 플라스미드 DNA를 제조하고, 그 DNA를 전기 천공법에 의해, ElectroMAX. DH10B Cells(인비트로젠사 No. 18290-015)에 형질 전환한 후, GeneEditorTM Atibiotic Selection Mix를 포함하는 LB 플레이트에 파종하였다. 플레이트에 생성된 형질 전환체를 배양하고, 플라스미드 DNA를 정제하여 DNA 염기 서열을 분석하였다. DNA 염기 서열의 결과, 목적으로 하는 아미노산 변이가 도입된 C2IgG1NS 변이체의 발현 벡터를 얻었다. 얻어진 1 아미노산 치환을 가진 변이체 단백질을 발현하는 플라스미드 DNA를 N5KG1-Val C2IgG1NS/I117C 벡터로 명명하였다.
C2IgG1NS
/117
IL
벡터의 제조
경쇄 117번 위치 이소류신을 류신으로 치환한 C2IgG1NS/I117L을, 실시예 6에서 제조한 N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로 사용하여 이하의 방법에 의해 제조하였다.
DNA의 증폭에는, 도요보사의 KOD-Plus를 사용하였다. cDNA 1 ㎕, 10×KOD-Plus 완충액 5 ㎕, dNTP 믹스 5 ㎕, KOD-Plus 1 ㎕, 25 mM MgSO4 2 ㎕, F 프라이머 및 R 프라이머의 조성을 가지는 반응액을 재증류수로 최종 용량 50 ㎕로 제조하여, PCR에 사용하였다.
C2NS Lc 117IL R(5'-GGTCCCAGGG CCGAAAGTGA ATAGAGGTGA GCTACCATAC TGCTG-3'(서열 번호 71))을 합성하고, C2NS Lc 117IL R과 C2-1 Lc Bgl IIF(5'-AGA GAG AGA GAT CTC TCA CCA TGG AAA CCC CAG CGCAGC TTCTCT TC-3'(서열 번호 18))를 사용하여, N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭산물을 C2NSI117L-F로 명명하였다. 이어서, C2NS Lc 117IL F(5'-GCAGTATGGT AGCTCACCTC TATTCACTTT CGGCCCTGGG ACC-3'(서열 번호 72))와 C2NS EcoRI R(5'-CCGGAATTCA ACACTCTCCC CTGTTGAAGC TCTTTGTGAC GG-3'(서열 번호 73))를 사용하여, N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로서 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭산물을 C2NSI117L-R로 명명하였다. 이어서 C2NSI117L-F와 C2NSI117L-R의 2배 희석액을 각 5 ㎕ 넣고, 프라이머 없이 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 60초의 사이클을 3회 반복하였다. 이 반응액을 99 ℃에서 5분간 가열한 후 5배 희석하고, 이 용액의 5 ㎕를 주형으로 사용하고 C2-1 Lc Bgl II F 프라이머와 C2NS EcoRI R 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 60초의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭 cDNA 단편을 BglII 및 EcoRI로 소화하고, 동일한 효소로 개열된 상기 C2 중쇄 유전자를 포함하는 N5KG1-Val Lark 벡터에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 1 아미노산 치환 변이체 단백질을 발현하는 플라스미드 DNA를 N5KG1-Val C2IgG1NS/I117L 벡터로 명명하였다.
C2IgG1NS/117IM 벡터의 제조
경쇄 117번 위치 이소류신을 메티오닌으로 치환한 C2IgG1NS/I117M을 실시예 6에서 제조한 N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로 사용하여 이하의 방법에 의해 제조하였다.
DNA의 증폭에는, 도요보사의 KOD-Plus를 사용하였다. cDNA 1 ㎕, 10×KOD-Plus 완충액 5 ㎕, dNTP 믹스 5 ㎕, KOD-Plus 1 ㎕, 25 mM MgSO4 2 ㎕, F 프라이머 및 R 프라이머의 조성을 가지는 반응액을 재증류수로 최종 용량 50 ㎕로 제조하여, PCR에 사용하였다.
C2NS Lc 117IM R(5'-GGTCCCAGGG CCGAAAGTGA ACATAGGTGA GCTACCATAC TGCTG-3'(서열 번호 74))을 합성하고, C2NS Lc 117IM R과 C2-1 Lc Bgl IIF(5'-AGA GAG AGA GAT CTC TCA CCA TGG AAA CCC CAG CGCAGC TTC TCT TC-3'(서열 번호 18))를 사용하여, N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭산물을 C2NSI117M-F로 명명하였다. 이어서, C2NS Lc 117IM F(5'-GCAGTATGGT AGCTCACCTA TGTTCACTTT CGGCCCTGGG ACC-3'(서열 번호 75))와 C2NS EcoRI R(5'-CCGGAATTCA ACACTCTCCC CTGTTGAAGC TCTTTGTGAC GG-3'(서열 번호 76))를 사용하여, N5KG1-Val C2IgG1NS 벡터를 주형으로 사용하여 94 ℃ 15초, 60 ℃ 30초, 68 ℃ 1분의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭산물을 C2NSI117M-R로 명명하였다. 이어서, C2NSI117M-F와 C2NSI117M-R의 2배 희석액을 각 5 ㎕ 넣고, 프라이머 없이 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 60초의 사이클을 3회 반복하였다. 이 반응액을 99 ℃에서 5분간 가열한 후 5배 희석하고, 이 용액 5 ㎕를 주형으로 사용하고 C2-1 Lc Bgl II F 프라이머와 C2NS EcoRI R 프라이머를 사용하여, 94 ℃ 15초, 55 ℃ 30초, 68 ℃ 60초의 사이클을 25회 반복하였다. 이 반응액을 0.8 % 아가로스 겔 전기 영동에 사용하여, PCR 증폭산물을 QIA 퀵 겔 추출 키트에 의해 정제하였다. 이 PCR 증폭 cDNA 단편을 BglII 및 EcoRI로 소화하고, 동일한 효소로 개열된 상기 C2 중쇄 유전자를 포함하는 N5KG1-Val Lark 벡터에 도입하였다. 삽입 부분의 DNA 염기 서열을 결정하여, PCR에 의해 증폭하여 삽입한 서열이 주형으로 사용한 유전자 서열과 동일하다는 것을 확인하였다. 얻어진 1 아미노산 치환을 가지는 변이체 단백질을 발현하는 플라스미드 DNA를 N5KG1-Val C2IgG1NS/I117M 벡터로 명명하였다.
C2IgG1NS 아미노산 개변체의 제조
실시예 7에서 나타낸 방법에 의해, C2IgG1NS/I117L 벡터, C2IgG1NS/I117M 벡터, C2IgG1NS/I117N, C2IgG1NS/I117C 벡터를 첨부 설명서에 따라 자유형 293 세포(인비트로젠사 제조)에 도입하여, 재조합형 항체를 발현시켰다. 항체의 정제는 실시예 8에 나타낸 방법을 일부 개량하여 행하였다. 6일째의 배양 상청을 회수하고, Steriflip-GP(밀리포어, SCGP00525)로 여과함으로써 세포 등의 잡배물을 제거하였다. 항체를 포함하는 배양 상청을, 단백질 A(아머샴)를 사용하고 흡착 완충액으로서 PBS를, 용출 완충액으로서 20 mM 시트르산나트륨 완충액(pH 3.4)을 사용하여 친화성 정제하였다. 용출 분획은 200 mM 인산나트륨 완충액(pH 7.0)을 첨가하여 pH 약 5.5로 조정하였다. 제조된 항체 용액은 비바스핀 6(10 KMW cut 비바사이언스, VS0601)을 사용하여 3000 rpm에서 농축하고, 추가로 PBS를 첨가하여 혼합물을 원심분리함으로써 PBS로 치환된 정제 항체를 얻었다. 정제 항체의 농도는 280 ㎚의 흡광도를 측정하여, 1 ㎎/㎖를 1.45 최적 밀도로서 산출하였다.
C2IgG1NS 아미노산 개변체의 응집체 함유율의 측정
얻어진 아미노산 개변 항체 10 ㎍(0.1 ㎎/㎖)을 사용하여, 각 정제 항체의 응집체 함유율을 측정하였다.
항체 용액의 응집체 함유율은, 고속 액체 크로마토그래프 장치(시마즈사 제조) 및 TSK-G3000SW 칼럼(도소사 제조)과 용매로서 20 mM 인산나트륨, 500 mM NaCl pH 7.0을 사용하여 분석을 행하였다. 용출 위치를 겔 여과 HPLC용 분자량 마커(오리엔탈 고보사)(Cat No. 40403701)와 비교함으로써, 항체 단백질의 단량체와 응집체의 피크를 동정하여, 각각의 피크 면적으로부터 응집체의 함유율을 산출하였다.
결과를 도 15에 나타낸다. 도 15에 따르면, 상술한 아미노산의 변이에 의해 응집체 함유율이 감소된다는 것을 나타낸다.
C2IgG1NS 아미노산 개변체의 응집체 함량의 측정
실시예 14 및 15의 방법에 따라, C2IgG1NS 아미노산 개변체의 종양 세포주, 인간 CD98/인간 LAT1 강제 발현주 및 HAEC에 대한 반응성을 FACS에 의해 분석하였다.
결과를 도 16A 및 도 16B에 나타낸다. 상술한 아미노산 개변 항체, 특히 C2IgG1NS/I117L은, 인간 CD98과 LAT1을 강제 발현시킨 L929 세포에 결합하고, 비처리한 L929에 대해서는 결합하지 않았다(도 16A). 또한, 이들 아미노산 개변 항체는 HAEC에 결합하지 않고, colo205, Ramos 및 DLD-1과 같은 각종 암 세포에 대하여 결합성을 나타내었다(도 16B).
이들의 결과는 도 2A 및 도 8에 도시된 C2IgG1의 결합 특성과 유사하기 때문에, 상술한 아미노산 개변 항체, 특히 C2IgG1NS/I117L은 응집체 함유율이 낮고, 암 세포에 대하여 C2IgG1과 유사한 결합 특이성을 갖고, C2IgG1과 유사한 항종양 활성을 기대할 수 있는 항체라고 할 수 있다.
<C2IgG1NS 아미노산 개변체의 중쇄 가변 영역 아미노산 서열(C2IgG1 중쇄 가변 영역 아미노산 서열과 동일)>(서열 번호 43)
<C2IgG1NS 아미노산 개변체의 중쇄 가변 영역 핵산 서열(C2IgG1NS 중쇄 가변 영역 핵산 서열과 동일)>(서열 번호 42)
<C2IgG1NS/117IL의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 77)
<C2IgG1NS/117IL의 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 78)
<C2IgG1NS/117IM의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 79)
<C2IgG1NS/117IM의 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 80)
<C2IgG1NS/117IN의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 81)
<C2IgG1NS/117IN의 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 82)
<C2IgG1NS/117IC의 경쇄 가변 영역 아미노산 서열>(서열 번호 83)
<C2IgG1NS/117IC의 경쇄 가변 영역 핵산 서열>(서열 번호 84)