KR102007926B1 - Nucleic acid molecules inserted expression regulation sequences and expression vector comprising nucleic acid molecules - Google Patents
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Abstract
본 발명은 내부리보솜결합부위(IRES)를 가지는 바이러스 또는 진핵세포 유래의 발현 조절 서열을 사용하여 관심 유전자를 발현시킬 수 있는 핵산 분자 및 상기 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터 및 이들의 응용에 관한 것이다. 본 발명의 핵산 분자를 사용하여, 관심유전자의 발현과 관련한 복잡한 캡핑(capping) 과정 없이 효율적으로 관심유전자를 발현시킬 수 있다. 본 발명에 따라 발현 조절 서열에 인접하게 다수의 아데노신 또는 티민이 연결된 핵산 분자를 사용하여, 목적하는 관심유전자를 효율적으로 발현시킬 수 있다. 본 발명에 따른 핵산 분자를 가지는 발현 시스템을 응용하여, 유전자 백신으로 활용하거나 질병 치료와 관련 있는 단백질 또는 펩타이드를 발현시키는 유전자 치료제 등으로 활용될 수 있을 것으로 기대된다. The present invention relates to a nucleic acid molecule capable of expressing a gene of interest using an expression control sequence derived from a virus or eukaryotic cell having an internal ribosomal binding site (IRES), an expression vector into which the nucleic acid molecule is inserted, and an application thereof. The nucleic acid molecules of the invention can be used to efficiently express a gene of interest without the complex capping process associated with expression of the gene of interest. According to the present invention, a nucleic acid molecule having a plurality of adenosine or thymine linked to an expression control sequence can be used to efficiently express a gene of interest. By applying an expression system having a nucleic acid molecule according to the present invention, it is expected to be used as a gene vaccine or as a gene therapy agent for expressing a protein or peptide related to disease treatment.
Description
본 발명은 핵산 분자에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 발현 효율이 향상된 핵산 분자, 이를 포함하는 발현 벡터 및 이의 응용에 관한 것이다.The present invention relates to a nucleic acid molecule, and more particularly, to a nucleic acid molecule with improved expression efficiency, an expression vector including the same, and an application thereof.
생명공학 기술이 발전하면서, 관심유전자(Gene Of Interest, GOI)를 효율적으로 발현시킬 수 있는 다양한 발현 시스템이 알려져 있다. 이러한 발현 시스템으로서 세포-기반 발현 시스템은 미생물이나 진핵세포의 발현 시스템을 이용하고, 세포를 함유하지 않는 발현 시스템은 정제된 RNA 중합효소, 리보솜, tRNA 및 리보뉴클레오티드를 사용하는 게 일반적이다. 특히, 진핵세포에서 유래한 단백질은 발현 이후에도 인산화, 메틸화, 글리코실화 등의 번역후 변형(post-translational modification)이 일어나는데, 미생물은 이러한 번역후 변형 기전을 가지고 있지 않기 때문에 진핵세포 유래의 단백질을 발현하고자 하는 경우에는 진핵세포 발현 시스템이 사용되고 있다.As biotechnology advances, various expression systems capable of efficiently expressing genes of interest (GOI) are known. As such an expression system, a cell-based expression system uses an expression system of microorganisms or eukaryotic cells, and an expression system containing no cells generally uses purified RNA polymerase, ribosomes, tRNAs and ribonucleotides. In particular, proteins derived from eukaryotic cells post-translational modification such as phosphorylation, methylation, and glycosylation occur even after expression, and microorganisms express proteins derived from eukaryotic cells because they do not have such mechanisms. If desired, eukaryotic cell expression systems are used.
진핵세포 유래의 발현 시스템을 이용하여 유전자 치료제나 유전자 백신 등으로 활용될 수 있다. 유전자 치료제의 경우에는 다양한 질병을 치료할 수 있는 펩타이드나 단백질을 암호화하는 열린해독틀(ORF)로 이루어지는 관심유전자를 발현 시스템 내에 삽입하고, 유전자 백신의 경우에는 항원으로 발현될 수 있는 펩타이드나 단백질을 암호화하는 열린해독틀로 이루어지는 관심유전자를 발현 시스템 내에 삽입한다. The expression system derived from eukaryotic cells can be used as a gene therapy agent or gene vaccine. In gene therapy products, a gene of interest consisting of an open reading frame (ORF) encoding a peptide or protein capable of treating various diseases is inserted into an expression system, and in the case of a gene vaccine, a peptide or protein that can be expressed as an antigen is encoded. The gene of interest consisting of an open reading frame is inserted into the expression system.
관심유전자를 효율적으로 발현시키기 위해서는 관심유전자의 전사(transcription)과 번역(translation)을 조절하는 서열을 사용하는 게 일반적이다. 통상적으로 전사 효율이 우수한 프로모터 등을 사용하여 전사 효율을 향상시킬 수 있으며, 관심유전자의 번역과 관련해서 진핵세포 특유의 캡핑(capping) 시스템을 사용한다. In order to efficiently express a gene of interest, it is common to use a sequence that regulates the transcription and translation of the gene of interest. In general, promoters having excellent transcriptional efficiency can be used to improve transcriptional efficiency, and eukaryotic cell-specific capping systems are used in connection with translation of the gene of interest.
구체적으로, 관심유전자(GOI)로부터 단백질 또는 펩타이드로의 효율적인 번역과 관련해서 사용된 캡핑 시스템은 관심유전자(GOI)의 5' 말단에 7-메틸-구아노신(7-methyl guanosine, m7G) 캡(5'cap) 구조를 가지고 있다. 진핵세포의 번역 조절 인자로 기능하는 eIF4A, eIF4E, eIF4G 등으로 구성되는 번역개시복합체(transcription initation complex)가 5' cap을 인식하여 5' cap 부위에 결합하여 캡핑 구조를 형성하면서 단백질로의 번역을 개시한다. 번역이 개시되는 부위에 캡핑 구조가 형성되면, 단백질 합성을 개시하는 동시에 nuclease의 작용으로부터 mRNA의 파괴를 방지한다. Specifically, the capping system used in connection with efficient translation from a gene of interest (GOI) to a protein or peptide is a 7-methyl guanosine (m 7 G) at the 5 'end of the gene of interest (GOI). It has a 5 'cap structure. Translation initation complex consisting of eIF4A, eIF4E, eIF4G, etc., which acts as a translational regulator of eukaryotic cells, recognizes the 5 'cap and binds to the 5' cap to form a capping structure while It starts. When the capping structure is formed at the site where translation is initiated, protein synthesis is initiated and the destruction of mRNA is prevented from the action of nuclease.
캡핑 구조를 가지는 핵산 분자를 제작하기 위한 IVT 과정은 pDNA(plasmid DNA)에 제한효소를 처리하여 선형화(linearization)시킨 후, 중합효소를 이용하여 제조한 mRNA에 m7G(5')-ppp-(5')G(regular cap analog라 함)를 붙여서 capped mRNA를 만들어 사용한다. 그러나 이러한 cap analog는 종종 반대 방향으로 결합하여 m7G nucleotide가 cap에 작용하지 못하게 되어, 만들어진 mRNA의 1/3 가량은 cap에 methylation이 없게 되고 이러한 mRNA는 단백질 합성을 할 수 없다. IVT process for preparing nucleic acid molecules having a capping structure was performed by linearizing by processing restriction enzymes on pDNA (plasmid DNA), followed by m 7 G (5 ')-ppp- (5 ') G (called regular cap analog) is attached to make capped mRNA. However, these cap analogs often bind in the opposite direction, preventing m 7 G nucleotides from acting on the cap, and about one-third of the mRNA produced has no methylation in the cap, and these mRNAs cannot synthesize protein.
이를 방지하기 위해서 cap analog 없이 먼저 IVT를 수행한 후 상업적으로 이용 가능한 vaccinia virus capping 효소를 사용하여 cap 반응을 수행하는 방법이 있으며, 이러한 cap의 역방향 반응을 막는 'anti-reverse' cap analog (ARCA)를 사용하여 단백질 합성을 유도한다(ARCA-capped mRNA) ARCA-capped mRNA는 regular cap analog-capped mRNA보다 두 배 이상의 효율로 단백질 합성이 일어나고, mRNA의 반감기 역시 긴 것으로 알려져 있다. 하지만, 이러한 인위적인 capping 반응이 요구되기 때문에, 관심유전자를 발현시키기 위한 비용이 크게 증가한다. 따라서 발현 시스템을 활용하여 유전자 백신이나 유전자 치료제로 활용되기 위해서 이를 개선하기 위한 방법이 요구되고 있다. To prevent this, there is a method that performs IVT without a cap analog, and then performs a cap reaction using a commercially available vaccinia virus capping enzyme, and an 'anti-reverse' cap analog (ARCA) that prevents the reverse reaction of the cap. Induces protein synthesis using (ARCA-capped mRNA) ARCA-capped mRNA is known to have twice the efficiency of protein synthesis than regular cap analog-capped mRNA and has a long half-life of mRNA. However, since such an artificial capping reaction is required, the cost for expressing the gene of interest is greatly increased. Therefore, there is a need for a method for improving the expression system to be used as a gene vaccine or gene therapy.
본 발명의 목적은 복잡하고 값비싼 공정 없이 목적하는 펩타이드 또는 단백질을 생체 내에서 효율적으로 발현시킬 수 있는 핵산 분자 및 이러한 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터와 같은 발현 시스템을 제공하고자 하는 것이다. It is an object of the present invention to provide an expression system such as a nucleic acid molecule capable of efficiently expressing a desired peptide or protein in vivo without complicated and expensive processes and an expression vector into which such nucleic acid molecule is inserted.
본 발명의 일 측면에 따르면, 본 발명은 내부리보솜결합부위(Internal Ribosomal Entry Site; IRES) 활성을 가지는 염기 서열을 포함하는 적어도 하나의 발현 조절 서열; 및 상기 발현 조절 서열과 작동 가능하게 연결되며, 단백질 또는 펩타이드를 암호화하는(encoding) 적어도 하나의 코딩 영역을 포함하고, 상기 적어도 하나의 발현 조절 서열에 인접하여 20 내지 400개의 아데노신 또는 티민이 연결되어 있는 핵산 분자를 제공한다. According to an aspect of the present invention, the present invention provides at least one expression control sequence comprising a base sequence having an internal ribosomal entry site (IRS) activity; And at least one coding region operably linked with the expression control sequence, the coding region encoding an protein or peptide, wherein 20 to 400 adenosine or thymine are linked adjacent to the at least one expression control sequence. Providing nucleic acid molecules.
일례로, 상기 적어도 하나의 발현 조절 서열은 5‘-비번역영역(5’untranslated Region; 5‘-UTR)을 형성할 수 있다. In one example, the at least one expression control sequence may form a 5'-untranslated region (5'-UTR).
이때, 상기 핵산 분자는 상기 5'-UTR의 3'쪽에 위치하는 3’-비번역영역(3‘-UTR)을 더욱 포함하며, 상기 코딩 영역은 상기 5'-UTR과 상기 3'-UTR 사이에 위치할 수 있다. In this case, the nucleic acid molecule further comprises a 3'-untranslated region (3'-UTR) located on the 3 'side of the 5'-UTR, the coding region is between the 5'-UTR and the 3'-UTR It can be located at
하나의 예시적인 실시형태에서, 상기 적어도 하나의 발현 조절 서열은 바이러스성 IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. In one exemplary embodiment, the at least one expression control sequence may comprise a viral IRES base sequence.
일례로, 상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스, 토가바이러스과(Togaviridae) 바이러스, 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae) 바이러스, 플라비바이러스과(Flaviridae) 바이러스, 레트로바이러스과(Retroviridae) 바이러스, 헤르페스바이러스과(Herpesviridae) 바이러스 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 바이러스에서 유래한 바이러스성 IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. In one example, the viral IRES base sequence is Picornaviridae virus, Togaviridae virus, Dicistroviridae virus, Flaviridae virus, Retroviridae virus, Herpes Viral IRES sequences derived from a virus selected from the group consisting of the herpesviridae virus and combinations thereof.
예를 들면, 상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스, 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae) 바이러스 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 바이러스에서 유래할 수 있다. For example, the viral IRES base sequence may be derived from a virus selected from the group consisting of the Picornaviridae virus, the Dicistroviridae virus, and combinations thereof.
이때, 상기 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스에서 유래한 상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 엔테로바이러스속(Enterovirus) 바이러스, 카디오바이러스속(Cardiovirus) 바이러스, 아프토바이러스속(Aptovirus) 바이러스, 헤파토바이러스속(Hepatovirus) 바이러스, 테스코바이러스속(Teschovirus) 바이러스 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 피코나바이러스과 바이러스에서 유래하고, 상기 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae) 바이러스에서 유래한 상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 크리파바이러스속(Cripavirus) 바이러스에서 유래한 것일 수 있다. At this time, the viral IRES base sequence derived from the Picornaviridae virus is Enterovirus virus, Cardiovirus virus, Aptovirus virus, Hepattovirus genus ( Hepatovirus virus, Teschovirus virus, and combinations thereof are selected from the group of piconaviruses virus selected from the group consisting of, and the viral IRES base sequence derived from the Dicistroviridae virus is Creepa It may be derived from a Cripavirus virus.
보다 구체적으로, 상기 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스에서 유래한 상기 IRES 염기 서열은 콕사키바이러스에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하고, 상기 디시스트로바이러스과 바이러스에서 유래한 상기 IRES 염기 서열은 귀뚜라미 마비바이러스(Cricket paralysis virus, CPV)에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. More specifically, the IRES nucleotide sequence derived from the Picornaviridae virus includes an IRES nucleotide sequence derived from coxsackievirus, and the IRES nucleotide sequence derived from the dyscivirus virus includes a cricket palsy virus ( Cricket paralysis virus (CPV) may include the IRES base sequence.
하나의 예시적인 실시형태에 따르면, 상기 코딩 영역은 항원 또는 이의 단편을 암호화하할 수 있다. According to one exemplary embodiment, the coding region may encode an antigen or fragment thereof.
다른 대안적인 실시형태에서, 상기 코딩 영역은 질병 치료를 위한 단백질 또는 이의 단편을 암호화할 수 있다. In another alternative embodiment, the coding region may encode a protein or fragment thereof for treating a disease.
다른 예시적인 실시형태에서, 상기 적어도 하나의 발현 조절 서열은 IRES의 염기 서열을 가지는 제 1 발현 조절 서열과, 상기 제 1 발현 조절 서열의 3'쪽에 위치하며 IRES의 염기 서열을 가지는 제 2 발현 조절 서열을 포함할 수 있다. In another exemplary embodiment, the at least one expression control sequence is a first expression control sequence having a base sequence of IRES and a second expression control located 3 ′ side of the first expression control sequence and having a base sequence of IRES Sequences may be included.
이때, 상기 코딩 영역은 상기 제 1 발현 조절 서열과 상기 제 2 발현 조절 서열 사이에 위치하는 제 1 코딩 영역과, 상기 제 2 발현 조절 서열의 3'쪽에 위치하는 제 2 코딩 영역을 포함할 수 있다. In this case, the coding region may include a first coding region located between the first expression control sequence and the second expression control sequence, and a second coding region located on the 3 'side of the second expression control sequence. .
필요에 따라, 상기 제 1 코딩 영역과 상기 제 2 코딩 영역은 상이한 펩타이드 또는 단백질을 암호화할 수 있다. If necessary, the first coding region and the second coding region may encode different peptides or proteins.
이때, 상기 제 1 발현 조절 서열과, 상기 제 2 발현 조절 중에서 선택되는 적어도 하나의 발현 조절 서열에 인접하여 20 내지 400개의 아데노신 또는 티민이 결합될 수 있다. In this case, 20 to 400 adenosine or thymine may be coupled to the first expression control sequence and at least one expression control sequence selected from the second expression control sequence.
예를 들어, 상기 제 1 발현 조절 서열에 인접하여 30 내지 100개의 아데노신이 결합될 수 있다. For example, 30 to 100 adenosine may be bound adjacent to the first expression control sequence.
하나의 예시적인 실시형태에서, 상기 제 1 발현 조절 서열은 콕사키바이러스B3(Coxsachie virus B3, CVB3) 또는 귀뚜라미 마비바이러스(Cricket paralysis virus, CPV)에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하고, 상기 제 2 발현 조절 서열은 뇌심근염 바이러스(Encephalomyocarditis virus, EMCV)에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. In one exemplary embodiment, the first expression control sequence comprises an IRES base sequence derived from Coxsachie virus B3 (CVB3) or Cricket paralysis virus (CPV), and wherein the second The expression control sequence may comprise an IRES base sequence derived from Enncephalomyocarditis virus (EMCV).
바람직하게는, 상기 핵산 분자는 상기 발현 조절 서열의 5’쪽에 위치하는 전사 조절 서열과, 상기 코딩 영역의 3’쪽에 위치하는 폴리아데노신(poly adenosine; 폴리 (A)) 서열을 더욱 포함할 수 있다. Preferably, the nucleic acid molecule may further comprise a transcriptional regulatory sequence located on the 5 'side of the expression control sequence and a poly adenosine (poly (A)) sequence located on the 3' side of the coding region. .
일례로, 상기 핵산 분자는 RNA일 수 있다. In one example, the nucleic acid molecule may be RNA.
본 발명의 다른 측면에서, 본 발명은 전술한 핵산 분자가 삽입된 재조합 발현 벡터를 제공한다. 일례로, 재조합 발현 벡터는 플라스미드에서 유래하건 것이거나, 바이러스에서 유래한 것일 수 있다. In another aspect of the invention, the invention provides a recombinant expression vector into which the above-described nucleic acid molecule is inserted. In one example, the recombinant expression vector may be from a plasmid or from a virus.
본 발명의 또 다른 측면에서, 본 발명은 전술한 핵산 분자를 생체에 주입하고, 상기 주입된 핵산 분자로부터 상기 단백질 또는 펩타이드를 발현하여 상기 단백질 또는 펩타이드를 제조하는 방법을 제공한다. In another aspect of the present invention, the present invention provides a method for preparing the protein or peptide by injecting the above-described nucleic acid molecule into a living body and expressing the protein or peptide from the injected nucleic acid molecule.
본 발명의 또 다른 측면에서, 본 발명은 전술한 재조합 유전자 벡터를 유전자 전달체로서 생체 내에 주입하고, 상기 유전자 전달체로부터 상기 단백질 또는 펩타이드를 발현하여 상기 단백질 또는 펩타이드를 제조하는 방법을 제공한다. In another aspect of the present invention, the present invention provides a method for preparing the protein or peptide by injecting the above-described recombinant gene vector in vivo as a gene carrier and expressing the protein or peptide from the gene carrier.
본 발명의 또 다른 측면에서, 본 발명은 전술한 핵산 분자 및/또는 재조합 발현 벡터로부터 발현되는 단백질 또는 펩타이드에 의하여 형질전환된 숙주 세포를 제공한다.In another aspect of the invention, the invention provides host cells transformed with proteins or peptides expressed from the above-described nucleic acid molecules and / or recombinant expression vectors.
본 발명에 따르면 관심 유전자, 즉 코딩 영역의 발현을 위하여 내부리보솜결합부위(IRES)를 가지는 적어도 하나의 발현 조절 서열을 가지고 있으며, 적어도 하나의 발현 조절에 인접하여 다수의 아데노신 또는 티민이 연결된 핵산 분자를 제시한다. According to the present invention, a nucleic acid molecule having at least one expression control sequence having an internal ribosomal binding site (IRES) for expression of a gene of interest, i. To present.
종래 캡핑 구조를 이용하여 관심 유전자를 효율적으로 발현시키기 위해서는 고가의 효소를 사용하여야 하는 문제가 발생하였으며, 하나의 발현 시스템에서 하나의 펩타이드나 단백질만을 발현할 수밖에 없었다. In order to efficiently express a gene of interest using a conventional capping structure, a problem of using expensive enzymes has arisen, and only one peptide or protein can be expressed in one expression system.
하지만, 본 발명에 따른 핵산 분자는 고가의 효소를 사용하지 않더라도 목적하는 펩타이드 또는 단백질을 생체 내에서 효율적으로 발현시킬 수 있다. 또한, 본 발명은 발현 조절 서열로서 IRES를 포함하고 있기 때문에, 필요에 따라 동일하거나 상이한 펩타이드 또는 단백질을 다른 종류의 IRES 서열과 작동적으로 연결시킴으로써, 하나의 핵산 분자 내에서 동시에 원하는 펩타이드 및 단백질을 발현할 수 있으며, 발현 효율을 증가시킬 수 있다. However, the nucleic acid molecule according to the present invention can efficiently express the desired peptide or protein in vivo even without using an expensive enzyme. In addition, since the present invention includes IRES as an expression control sequence, by operably linking the same or different peptides or proteins with other kinds of IRES sequences, the peptides and proteins desired at the same time in one nucleic acid molecule can be simultaneously linked. Can express and increase expression efficiency.
예를 들어, 코딩 영역에 생체 내에서 다양한 면역 반응을 유도하는 관심 유전자 서열을 도입한 본 발명의 핵산 분자 및/또는 이러한 핵산 분자가 삽입된 재조합 발현 벡터를 적용하여, 유전자 백신으로 활용될 수 있다. For example, a nucleic acid molecule of the present invention which introduces a gene sequence of interest that induces various immune responses in vivo to a coding region and / or a recombinant expression vector into which the nucleic acid molecule is inserted can be used as a gene vaccine. .
선택적으로, 코딩 영역에 다양한 질병의 치료와 관련된 펩타이드 및/또는 단백질을 암호화하는 관심유전자 서열을 도입함으로써, 유전자 치료제 등으로 활용될 수 있다. Alternatively, by introducing a gene sequence of interest that encodes a peptide and / or protein associated with the treatment of various diseases in the coding region, it may be utilized as a gene therapy agent or the like.
대안적인 실시형태에 따라, 본 발명의 핵산 분자는 RNA 형태로 제작되어 백신 형태로 응용될 수 있다. 본 발명에 따른 RNA 백신은 소량의 주형 DNA만으로 신속하게 제조, 생산할 수 있으며, 감염원을 직접 다룰 필요가 없어서 안정성이 확보될 수 있다.According to an alternative embodiment, the nucleic acid molecules of the invention can be made in RNA form and applied in the form of a vaccine. The RNA vaccine according to the present invention can be produced and produced quickly with only a small amount of template DNA, and stability can be secured because it does not need to deal directly with an infectious agent.
도 1은 본 발명의 예시적인 실시형태에 따라 하나의 관심 유전자를 효율적으로 발현시킬 수 있는 폴리뉴클레오티드 또는 핵산 분자의 구성을 개략적으로 나타낸 모식도이다.
도 2는 본 발명의 예시적인 실시형태에 따라 다수의 관심 유전자를 효율적으로 발현시킬 수 있는 폴리뉴클레오티드 또는 핵산 분자의 구성을 개략적으로 도시한 모식도이다.
도 3a 및 도 3b는 각각 본 발명의 예시적인 실시예에 따라 다양한 바이러스 유래의 IRES를 포함하는 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 결과를 나타낸 그래프이다. 도 3a는 A204 세포주에서 발현량을 측정한 것이고, 도 3b는 293T 세포주에서 발현량을 측정한 것을 나타낸다.
도 4a 및 도 4b는 각각 본 발명의 예시적인 실시예에 따라 다양한 진핵세포 유래의 IRES를 포함하는 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 결과를 나타낸 그래프이다. 도 4a는 A204 세포주에서 발현량을 측정한 것이고, 도 4b는 293T 세포주에서 발현량을 측정한 것을 나타낸다.
도 5는 발명의 예시적인 실시예에 따라 다양한 바이러스 유래의 IRES를 포함하는 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 다양한 진핵 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 결과를 나타낸 그래프로서, A204 세포주에서 발현량을 측정한 결과를 나타낸다.
도 6은 본 발명의 예시적인 실시예에 따라 합성된 다양한 바이러스 유래의 IRES를 포함하는 핵산 분자를 Nor10 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 결과를 나타낸 그래프이다.
도 7a 및 도 7b는 각각 본 발명의 예시적인 실시예에 따라 다양한 바이러스 유래의 IRES를 포함하는 핵산 분자를 다양한 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 결과를 나타낸 그래프이다. 도 7a는 A204 세포주에서 발현량을 측정한 것이고, 도 7b는 293T 세포주에서 발현량을 측정한 것을 나타낸다.
도 8은 본 발명의 예시적인 실시예에 따라 다수의 바이러스 유래의 IRES를 포함하는 핵산 분자를 다양한 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 결과를 나타낸 그래프로서, 293T 세포주에서 발현량을 측정한 것을 나타낸다.
도 9a 및 도 9b는 각각 본 발명의 예시적인 실시예에 따라 다수의 바이러스 유래의 IRES를 포함하는 핵산 분자를 다양한 세포주에 투여한 뒤, 관심 유전자의 발현량을 측정한 그래프이다. 도 9a는 293T 세포주에서 발현량을 측정한 것이고, 도 9b는 Nor10 세포주에서 발현량을 측정한 것을 나타낸다.1 is a schematic diagram showing the configuration of a polynucleotide or nucleic acid molecule capable of efficiently expressing one gene of interest according to an exemplary embodiment of the present invention.
FIG. 2 is a schematic diagram showing the configuration of a polynucleotide or nucleic acid molecule capable of efficiently expressing a plurality of genes of interest in accordance with exemplary embodiments of the present invention. FIG.
3A and 3B are graphs showing the results of measuring expression levels of genes of interest after administration of a nucleic acid molecule in the form of an RNA platform containing IRES from various viruses, respectively, according to an exemplary embodiment of the present invention. . 3A shows the expression level in the A204 cell line, and FIG. 3B shows the expression level in the 293T cell line.
4A and 4B are graphs showing the results of measuring the expression levels of genes of interest after administration of a nucleic acid molecule in the form of an RNA platform containing IRES derived from various eukaryotic cells, respectively, according to an exemplary embodiment of the present invention. to be. 4A shows the expression level in the A204 cell line, and FIG. 4B shows the expression level in the 293T cell line.
FIG. 5 is a graph showing a result of measuring the expression level of a gene of interest after administering a nucleic acid molecule in the form of an RNA platform including IRES from various viruses, according to an exemplary embodiment of the present invention. FIG. The result of measuring the expression amount in is shown.
6 is a graph showing the results of measuring expression levels of genes of interest after administration of a nucleic acid molecule comprising IRES derived from various viruses synthesized according to an exemplary embodiment of the present invention to a Nor10 cell line.
7A and 7B are graphs showing the results of measuring expression levels of genes of interest after administering nucleic acid molecules containing IRESs of various viruses, respectively, according to exemplary embodiments of the present invention to various cell lines. 7A shows the expression level in the A204 cell line, and FIG. 7B shows the expression level in the 293T cell line.
8 is a graph showing the results of measuring expression levels of genes of interest after administration of nucleic acid molecules comprising a plurality of virus-derived IRESs to various cell lines according to an exemplary embodiment of the present invention. Indicates that was measured.
9A and 9B are graphs showing the expression levels of genes of interest after administration of various cell lines with nucleic acid molecules comprising a plurality of virus-derived IRESs, respectively, according to an exemplary embodiment of the present invention. 9A shows the expression level in 293T cell line, and FIG. 9B shows the expression level in Nor10 cell line.
이하, 필요한 경우에 첨부하는 도면을 참조하면서 본 발명을 설명한다. EMBODIMENT OF THE INVENTION Hereinafter, this invention is demonstrated, referring drawings attached if needed.
용어의 정의Definition of Terms
본 명세서에서 용어 “아미노산”은 가장 넓은 의미로 사용되고, 자연-발생 L-아미노산 또는 잔기를 포함하는 것으로 의도된다. 자연-발생 아미노산에 대해 통상적으로 사용되는 1-문자 약어 및/또는 3-문자 약어가 본 명세서에 사용될 수 있다. 아미노산은 D-아미노산뿐만 아니라 화학적으로-변형된 아미노산, 예컨대 아미노산 유사체, 단백질에 통상적으로 혼입되지 않는 자연-발생 아미노산, 예컨대 노르류신, 및 아미노산의 특징인 것으로 당업계에 공지된 특성을 갖는 화학적으로-합성된 화합물을 포함한다. 예를 들어, 천연 Phe 또는 Pro와 동일한 펩타이드 화합물의 입체형태 제한을 허용하는 페닐알라닌 또는 프롤린의 유사체 또는 모방체가 아미노산의 정의 내에 포함된다. 이러한 유사체 및 모방체는 본 명세서에서 아미노산의 "기능적 균등물"로서 지칭된다. 아미노산의 다른 예는 문헌 [Roberts and Vellaccio, The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, Eds. Gross and Meiehofer, Vol. 5, p. 341(Academic Press, Inc.: N.Y. 1983)]에 열거되어 있다.The term "amino acid" is used herein in its broadest sense and is intended to include naturally-occurring L-amino acids or residues. One-letter abbreviations and / or three-letter abbreviations commonly used for naturally-occurring amino acids can be used herein. Amino acids are chemically possessing properties known in the art to be characteristic of not only D-amino acids but also chemically-modified amino acids such as amino acid analogs, naturally-occurring amino acids such as norleucine, and amino acids that are not commonly incorporated into proteins. Synthetic compounds. For example, within the definition of amino acids are analogs or mimetics of phenylalanine or proline that allow conformational limitations of the same peptide compounds as native Phe or Pro. Such analogs and mimetics are referred to herein as "functional equivalents" of amino acids. Other examples of amino acids are described in Roberts and Vellaccio, The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology, Eds. Gross and Meiehofer, Vol. 5, p. 341 (Academic Press, Inc .: N.Y. 1983).
예를 들어, 표준 고체-상 합성 기술에 의해 합성된 합성 펩타이드는 유전자에 의해 코딩되는 아미노산으로 제한되지 않으며, 이에 따라 주어진 아미노산에 대해 보다 광범위하게 다양한 치환을 허용한다. 유전자 코드에 의해 코딩되지 않은 아미노산은 본 명세서에서 "아미노산 유사체"로서 지칭되며, 예를 들어 WO 90/01940에 기재되어 있다. 예를 들어, 아미노산 유사체는 Glu 및 Asp에 대한 2-아미노 아디프산 (Aad); Glu 및 Asp에 대한 2-아미노피멜산 (Apm); Met, Leu 및 다른 지방족 아미노산에 대한 2-아미노부티르산 (Abu); Met, Leu 및 다른 지방족 아미노산에 대한 2-아미노헵탄산 (Ahe); Gly에 대한 2-아미노부티르산 (Aib); Val, Leu 및 Ile에 대한 시클로헥실알라닌 (Cha); Arg 및 Lys에 대한 호모아르기닌 (Har); Lys, Arg 및 His에 대한 2,3-디아미노프로피온산(Dap); Gly, Pro 및 Ala에 대한 N-에틸글리신 (EtGly); Gly, Pro 및 Ala에 대한 N-에틸글리신 (EtGly); Asn 및 Gln에 대한 N-에틸아스파라긴 (EtAsn); Lys에 대한 히드록시리신 (Hyl); Lys에 대한 알로히드록시리신 (AHyl); Pro, Ser 및 Thr에 대한 3-(및 4-)히드록시프롤린 (3Hyp, 4Hyp); Ile, Leu 및 Val에 대한 알로-이소류신(AIle); Arg에 대한 4-아미디노페닐알라닌; Gly, Pro 및 Ala에 대한 N-메틸글리신 (MeGly, 사르코신); Ile에 대한 N-메틸이소류신 (MeIle); Met 및 다른 지방족 아미노산에 대한 노르발린 (Nva); Met 및 다른 지방족 아미노산을 위한 노르류신 (Nle); Lys, Arg 및 His에 대한 오르니틴 (Orn); Thr, Asn및 Gln에 대한 시트룰린 (Cit) 및 메티오닌 술폭시드 (MSO); 및 Phe에 대한 N-메틸페닐알라닌 (MePhe), 트리메틸페닐알라닌, 할로-(F-, Cl-, Br- 또는 I-)페닐알라닌 또는 트리플루오릴페닐알라닌을 포함한다.For example, synthetic peptides synthesized by standard solid-phase synthesis techniques are not limited to amino acids encoded by genes, thus allowing a wider variety of substitutions for a given amino acid. Amino acids not encoded by the genetic code are referred to herein as "amino acid analogs" and are described, for example, in WO 90/01940. For example, amino acid analogs include 2-amino adipic acid (Aad) for Glu and Asp; 2-aminopimelic acid (Apm) for Glu and Asp; 2-aminobutyric acid (Abu) for Met, Leu and other aliphatic amino acids; 2-aminoheptanoic acid (Ahe) for Met, Leu and other aliphatic amino acids; 2-aminobutyric acid (Aib) for Gly; Cyclohexylalanine (Cha) for Val, Leu and Ile; Homoarginine (Har) for Arg and Lys; 2,3-diaminopropionic acid (Dap) for Lys, Arg and His; N-ethylglycine (EtGly) for Gly, Pro and Ala; N-ethylglycine (EtGly) for Gly, Pro and Ala; N-ethylasparagine (EtAsn) for Asn and Gln; Hydroxylysine (Hyl) for Lys; Allohydroxylysine (AHyl) for Lys; 3- (and 4-) hydroxyproline (3Hyp, 4Hyp) for Pro, Ser and Thr; Allo-isoleucine (AIle) for Ile, Leu and Val; 4-amidinophenylalanine for Arg; N-methylglycine (MeGly, Sarcosine) for Gly, Pro and Ala; N-methylisoleucine (MeIle) for Ile; Norvaline (Nva) for Met and other aliphatic amino acids; Norleucine (Nle) for Met and other aliphatic amino acids; Ornithine (Orn) for Lys, Arg and His; Citrulline (Cit) and methionine sulfoxide (MSO) for Thr, Asn and Gln; And N-methylphenylalanine (MePhe), trimethylphenylalanine, halo- (F-, Cl-, Br- or I-) phenylalanine or trifluorylphenylalanine for Phe.
본 명세서에서 용어 “펩타이드”는 자연적으로 존재하는 것으로부터 분리하였거나, 재조합 기술(recombinant technique)에 의하여 또는 화학적으로 합성된 단백질, 단백질 단편 및 펩타이드를 모두 포함한다. 예를 들어 본 발명의 펩타이드는 적어도 5개, 바람직하게는 10개의 아미노산으로 구성되어 있다.As used herein, the term “peptide” includes all proteins, protein fragments and peptides that have been separated from those present in nature, or synthesized by recombinant techniques or chemically synthesized. For example, the peptide of the present invention consists of at least 5, preferably 10 amino acids.
특정 실시양태에서, 화합물의 변이체, 예컨대 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 펩타이드 변이체가 제공된다. 본 명세서에서 “펩타이드 변이체(peptide variants)”란 하나 또는 그 이상의 아미노산이 펩타이드의 아미노산 서열에 치환(substitutions), 결실(deletions), 첨가(additions) 및/또는 삽입(insertions)되어 있으면서, 원래의 아미노산으로 구성된 펩타이드와 거의 동일한 생물학적 기능을 발휘하는 것을 말한다. 펩타이드 변이체는 원래의 펩타이드와 70% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 더욱 바람직하게는 95% 이상의 동일성(identity)을 가지고 있어야 한다. 이러한 치환체로서 “보존성”이라고 알려진 아미노산 치환제가 포함될 수 있다. 변이체는 또한 비보존성(nonconservative)의 변화를 포함할 수도 있다. 바람직한 구체예에서, 변이체 폴리펩타이드의 서열은 5개 또는 그 이하의 아미노산이 치환, 결실, 부가 또는 삽입됨으로서 원래의 서열과 달라진다. 변이체들은 또한 펩타이드의 면역원성(immunogenicity), 2차 구조(secondary structure) 및 수치료성(hydropathic nature)에 최소한의 영향을 주는 아미노산들의 결실 또는 부가에 의해 변화될 수 있다.In certain embodiments, variants of a compound are provided, such as peptide variants having one or more amino acid substitutions. As used herein, “peptide variants” refers to the original amino acid while one or more amino acids are substituted, deleted, added, and / or inserted into the amino acid sequence of the peptide. It is said to exert almost the same biological function as the peptide consisting of. Peptide variants should have at least 70% identity, preferably at least 90% and more preferably at least 95% identity with the original peptide. Such substituents may include amino acid substituents known as “conservatives”. Variants may also include changes in nonconservative. In a preferred embodiment, the sequence of the variant polypeptide differs from the original sequence by replacing, deleting, adding or inserting five or fewer amino acids. Variants may also be altered by deletion or addition of amino acids with minimal impact on the immunogenicity, secondary structure and hydropathic nature of the peptide.
“보존성” 치환이란 하나의 아미노산이 다른 아미노산으로 치환되었을 때에도 폴리펩타이드의 2차구조 및 수치료성(hydropathic nature) 등의 특성에 큰 변화가 없는 것을 의미한다. 아미노산 변이는 아미노산 곁사슬 치환체의 상대적 유사성, 예컨대 극성(polarity), 전하(charge), 수용성(solubility), 소수성(hydrophobicity), 친수성(hydrophilicity) 및/또는 양친화성(amphipathic nature) 등의 유사성을 기초로 하여 얻어질 수 있다.“Conservative” substitutions mean that even when one amino acid is substituted with another amino acid, there is no significant change in the properties such as the secondary structure and hydropathic nature of the polypeptide. Amino acid variations are based on the relative similarities of amino acid side chain substituents, such as polarity, charge, solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and / or amphipathic nature. Can be obtained.
예를 들어 아미노산은 공통적인 곁사슬 특성에 따라 ⅰ) 소수성(노르류신, 메티오닌, 알라닌, 발린, 류신, 이소류신) ⅱ) 중성 친수성(시스테인, 세린, 트레오닌, 아스파라진, 글루타민), ⅲ) 산성(아스파르트산, 글루탐산), ⅳ) 염기성(히스티딘, 리신, 아르기닌), ⅴ) 쇄 방향에 영향을 미치는 잔기 (글리신, 프롤린), ⅵ) 방향족 (트립토판, 티로신, 페닐알라닌)으로 분류될 수 있다. 보존적 치환은 이들 각각의 클래스 중 하나의 구성원을 동일한 클래스의 다른 구성원으로 교환하는 것을 수반할 것이다. For example, amino acids may be characterized by their common side chain properties: i) hydrophobicity (norleucine, methionine, alanine, valine, leucine, isoleucine); ii) neutral hydrophilicity (cysteine, serine, threonine, asparagine, glutamine), Acids, glutamic acid), iv) basic (histidine, lysine, arginine), iv) residues (glycine, proline) that affect the chain orientation, iii) aromatics (tryptophan, tyrosine, phenylalanine). Conservative substitutions will entail exchanging a member of one of each of these classes for another member of the same class.
아미노산 곁사슬 치환체의 크기, 모양 및 종류에 대한 분석에 의하여, 아르기닌, 리신과 히스티딘은 모두 양전하를 띤 잔기이고; 알라닌, 글리신과 세린은 유사한 크기를 갖으며; 페닐알라닌, 트립토판과 티로신은 유사한 모양을 갖는다는 것을 알 수 있다. 따라서 이러한 고려 사항에 기초하여, 아르기닌, 라이신과 히스티딘; 알라닌, 글리신과 세린; 그리고 페닐알라닌, 트립토판과 티로신은 생물학적으로 기능 균등물이라 할 수 있다.By analysis of the size, shape and type of amino acid side chain substituents, arginine, lysine and histidine are all positively charged residues; Alanine, glycine and serine have similar sizes; It can be seen that phenylalanine, tryptophan and tyrosine have a similar shape. Thus, based on these considerations, arginine, lysine and histidine; Alanine, glycine and serine; Phenylalanine, tryptophan, and tyrosine are biologically equivalent functions.
변이를 도입하는 데 있어서, 아미노산의 소수성 인덱스 (hydropathic idex)가 고려될 수 있다. 각각의 아미노산은 소수성과 전하에 따라 소수성 인덱스가 부여되어 있다: 이소류신 (+4.5); 발린 (+4.2); 류신 (+3.8); 페닐알라닌(+2.8); 시스테인/시스타인 (+2.5); 메티오닌 (+1.9); 알라닌 (+1.8); 글리신 (-0.4); 트레오닌(-0.7); 세린 (-0.8); 트립토판 (-0.9); 티로신 (-1.3); 프롤린 (-1.6); 히스티딘 (-3.2); 글루탐산 (-3.5); 글루타민 (-3.5); 아스파르트산 (-3.5); 아스파라긴 (-3.5); 라이신 (-3.9); 및 아르기닌 (-4.5).In introducing variants, hydropathic idex of amino acids can be considered. Each amino acid is assigned a hydrophobicity index depending on its hydrophobicity and charge: isoleucine (+4.5); Valine (+4.2); Leucine (+3.8); Phenylalanine (+2.8); Cysteine / cysteine (+2.5); Methionine (+1.9); Alanine (+1.8); Glycine (-0.4); Threonine (-0.7); Serine (-0.8); Tryptophan (-0.9); Tyrosine (-1.3); Proline (-1.6); Histidine (-3.2); Glutamic acid (-3.5); Glutamine (-3.5); Aspartic acid (-3.5); Asparagine (-3.5); Lysine (-3.9); And arginine (-4.5).
단백질의 상호적인 생물학적 기능(interactive biological function)을 부여하는 데 있어서 소수성 아미노산 인덱스는 매우 중요하다. 유사한 소수성 인덱스를 가지는 아미노산으로 치환하여야 유사한 생물학적 활성을 보유할 수 있다는 것은 공지된 사실이다. 소수성 인덱스를 참조하여 변이를 도입시키는 경우, 바람직하게는 ± 2 이내, 보다 바람직하게는 ± 1 이내, 보다 더 바람직하게는 ± 0.5 이내의 소수성 인덱스 차이를 나타내는 아미노산 사이에 치환을 한다. The hydrophobic amino acid index is very important in conferring the interactive biological function of proteins. It is known that substitution with amino acids having similar hydrophobicity indexes can retain similar biological activity. When introducing mutations with reference to the hydrophobicity index, substitutions are made between amino acids which exhibit a hydrophobicity index difference of preferably within ± 2, more preferably within ± 1, even more preferably within ± 0.5.
한편, 유사한 친수성 값(hydrophilicity value)을 가지는 아미노산 사이의 치환이 균등한 생물학적 활성을 갖는 단백질을 초래한다는 것도 잘 알려져 있다. 미국 특허 제4,554,101호에 개시된 바와 같이, 다음의 친수성 값이 각각의 아미노산 잔기에 부여되어 있다: 아르기닌 (+3.0); 리신 (+3.0); 아스파르트산(+3.0±1); 글루탐산(+3.0±1); 세린 (+0.3); 아스파라긴 (+0.2); 글루타민 (+0.2); 글리신 (0); 트레오닌 (-0.4); 프롤린 (-0.5 ± 1); 알라닌 (-0.5); 히스티딘 (-0.5); 시스테인 (-1.0); 메티오닌 (-1.3); 발린 (-1.5); 리신(-1.8); 이소류신 (-1.8); 티로신 (-2.3); 페닐알라닌 (-2.5); 트립토판 (-3.4). 친수성 값을 참조하여 변이를 도입시키는 경우, 바람직하게는 ± 2 이내, 보다 바람직하게는 ± 1 이내, 보다 더 바람직하게는 ± 0.5 이내의 친수성 값 차이를 나타내는 아미노산 사이에 치환을 한다. On the other hand, it is also well known that substitutions between amino acids having similar hydrophilicity values result in proteins with equivalent biological activity. As disclosed in US Pat. No. 4,554,101, the following hydrophilicity values are assigned to each amino acid residue: arginine (+3.0); Lysine (+3.0); Aspartic acid (+ 3.0 ± 1); Glutamic acid (+ 3.0 ± 1); Serine (+0.3); Asparagine (+0.2); Glutamine (+0.2); Glycine (0); Threonine (-0.4); Proline (-0.5 ± 1); Alanine (-0.5); Histidine (-0.5); Cysteine (-1.0); Methionine (-1.3); Valine (-1.5); Lysine (-1.8); Isoleucine (-1.8); Tyrosine (-2.3); Phenylalanine (-2.5); Tryptophan (-3.4). When introducing mutations with reference to hydrophilicity values, substitutions are made between amino acids which exhibit a hydrophilicity value difference of preferably within ± 2, more preferably within ± 1 and even more preferably within ± 0.5.
분자의 활성을 전체적으로 변경시키지 않는 단백질에서의 아미노산 교환은 당해 분야에 공지되어 있다(H.Neurath, R.L.Hill, The Proteins, Academic Press, New York, 1979). 가장 통상적으로 일어나는 교환은 아미노산 잔기 Ala/Ser, Val/Ile, Asp/Glu, Thr/Ser, Ala/Gly, Ala/Thr, Ser/Asn, Ala/Val, Ser/Gly, Thy/Phe, Ala/Pro, Lys/Arg, Asp/Asn, Leu/Ile, Leu/Val, Ala/Glu, Asp/Gly 간의 교환이다.Amino acid exchange in proteins that do not alter the activity of the molecule as a whole is known in the art (H. Neurode, R. L. Hill, The Proteins, Academic Press, New York, 1979). The most commonly occurring exchanges are amino acid residues Ala / Ser, Val / Ile, Asp / Glu, Thr / Ser, Ala / Gly, Ala / Thr, Ser / Asn, Ala / Val, Ser / Gly, Thy / Phe, Ala / Exchange between Pro, Lys / Arg, Asp / Asn, Leu / Ile, Leu / Val, Ala / Glu, Asp / Gly.
일반적으로, 본 명세서상에 언급되어 있는 펩타이드들(융합 단백질 포함) 및 폴리뉴클레오티드들은 분리된(isolated) 것이다. “분리된(isolated)” 펩타이드 또는 폴리뉴클레오티드란 원래의 환경으로부터 제거된 것이다. 예를 들어, 자연 상태로 존재하는 단백질은 그 상태에서 함께 존재하는 물질들 전부 혹은 일부를 제거함으로써 분리되는 것이다. 이러한 폴리펩타이드는 적어도 90% 이상의 순도를 지녀야 하며, 바람직하게는 95%, 더욱 바람직하게는 99% 이상의 순도를 가져야 한다. 폴리뉴클레오티드는 벡터 내에서 클로닝 시킴으로써 분리된다. In general, the peptides (including fusion proteins) and polynucleotides mentioned herein are isolated. An “isolated” peptide or polynucleotide is one that is removed from its original environment. For example, proteins that exist in nature are separated by removing some or all of the substances that exist together in that state. Such polypeptides should be at least 90% pure, preferably at least 95%, more preferably at least 99% pure. Polynucleotides are isolated by cloning in a vector.
펩타이드는 재조합 방법(recombinant means) 또는 화학적 합성을 통해 제조함으로써 분리될 수 있다. 본 명세서 상에 언급된 핵산 서열에 의해 암호화(encode)되는 재조합 펩타이드는 알려져 있는 많은 발현 벡터들 중 어느 것을 이용하든지 간에 공지의 방법으로 손쉽게 제조될 수 있다. 발현은 재조합 단백질을 암호화하는 DNA 서열을 포함하는 발현벡터로 형질전환된 적절한 숙주 세포(host cell) 내에서 시킬 수 있다. 적절한 숙주 세포에는 원핵세포들(prokaryotes), 효모(yeast) 및 진핵세포들(eukaryotes)이 포함된다. 일례로, 효모 또는 포유동물 세포주(Cos 또는 CHO 등의)와 같은 진핵생물 유래의 세포주를 숙주세포로 이용하는 것이 바람직하다. 재조합 단백질의 정제를 위해서는 먼저 수용성의 숙주/벡터 시스템에서 얻은, 배양액으로 분비된 재조합 단백질을 포함하는 상등액을 시판되는 필터를 이용하여 농축시킨다. 다음 단계로 상기에서 얻은 농축액을 친화 매트릭스(affinity matrix) 또는 이온교환수지(ion exchange resin) 등의 적절한 정제 매트릭스(purification matrix)를 이용하여 정제한다. 마지막으로 한 단계 또는 여러 단계의 역상(reverse phase) HPLC 를 수행함으로써 순수한 재조합 단백질을 얻을 수 있다.Peptides can be isolated by preparation through recombinant means or chemical synthesis. Recombinant peptides encoded by the nucleic acid sequences mentioned herein can be readily prepared by known methods using any of a number of known expression vectors. Expression can be carried out in an appropriate host cell transformed with an expression vector comprising a DNA sequence encoding the recombinant protein. Suitable host cells include prokaryotes, yeasts and eukaryotes. For example, it is preferable to use a cell line derived from a eukaryotes such as a yeast or mammalian cell line (such as Cos or CHO) as a host cell. For purification of the recombinant protein, the supernatant containing the recombinant protein secreted into the culture, first obtained in a water-soluble host / vector system, is concentrated using a commercially available filter. In the next step, the concentrate obtained above is purified using an appropriate purification matrix such as an affinity matrix or an ion exchange resin. Finally, pure recombinant protein can be obtained by performing one or several reverse phase HPLC.
본 명세서에 기재된 펩타이드 또는 단백질은 숙주 세포의 주변 세포질로 분비되고 그로부터 회수될 수 있다. 전형적으로, 펩타이드 및/또는 단백질의 회수는 일반적으로 삼투압 충격, 초음파처리 또는 용해와 같은 수단에 의해 미생물을 분쇄하는 것을 포함한다. 세포가 파괴되면, 세포 잔해 또는 전세포를 원심분리 또는 여과에 의해 제거할 수 있다. 펩타이드 및/또는 단백질은 예를 들어 친화성 수지 크로마토그래피에 의해 추가로 정제할 수 있다. 대안적으로, 펩타이드 및/또는 단백질을 배양 배지로 옮기고, 그로부터 단리할 수 있다. 세포를 배양물로부터 제거하고, 배양 상청액을 여과하고 농축하여 생산된 펩타이드 및/또는 단백질을 추가로 정제할 수 있다. 발현된 폴리펩타이드는 통상적으로 공지된 방법, 예컨대 면역친화성 또는 이온-교환 칼럼 상의 분별 증류; 에탄올 침전; 역상 HPLC; 실리카 또는 양이온 교환수지, 예컨대 DEAE 상의 크로마토그래피; 크로마토포커싱; SDS-PAGE; 황산암모늄 침전; 예를 들어 세파덱스 G-75를 사용하는 겔 여과; 소수성 친화도 수지, 매트릭스 상에 고정화된 적합한 항원을 사용하는 리간드 친화도 및 웨스턴 블롯 검정을 이용하여 추가로 단리 및 확인될 수 있다. Peptides or proteins described herein can be secreted into and recovered from the periplasm of the host cell. Typically, recovery of the peptides and / or proteins generally involves grinding the microorganisms by means such as osmotic shock, sonication or lysis. Once the cells are destroyed, cell debris or whole cells can be removed by centrifugation or filtration. Peptides and / or proteins can be further purified, for example, by affinity resin chromatography. Alternatively, peptides and / or proteins can be transferred to and isolated from the culture medium. The cells can be removed from the culture and the culture supernatant filtered and concentrated to further purify the peptides and / or proteins produced. Expressed polypeptides are commonly known methods such as fractional distillation on immunoaffinity or ion-exchange columns; Ethanol precipitation; Reverse phase HPLC; Chromatography on silica or cation exchange resins such as DEAE; Chromatofocusing; SDS-PAGE; Ammonium sulfate precipitation; Gel filtration using, for example, Sephadex G-75; It can be further isolated and identified using hydrophobic affinity resins, ligand affinity using suitable antigens immobilized on the matrix and Western blot assays.
아울러, 생산된 펩타이드는 추가의 검정 및 용도를 위해 실질적으로 균질한 제제를 수득하기 위해 정제될 수 있다. 당업계에 공지된 표준 단백질 정제 방법이 이용될 수 있다. 하기 절차는 적합한 정제 절차의 예이다: 면역친화성 또는 이온-교환 칼럼 상의 분별 증류, 에탄올 침전, 역상 HPLC, 실리카 또는 양이온-교환 수지, 예컨대 DEAE 상의 크로마토그래피, 크로마토포커싱, SDS-PAGE, 황산암모늄 침전, 및 예를 들어 세파덱스 G-75를 사용하는 겔여과.In addition, the peptides produced can be purified to obtain a substantially homogeneous formulation for further assays and uses. Standard protein purification methods known in the art can be used. The following procedures are examples of suitable purification procedures: fractional distillation on immunoaffinity or ion-exchange columns, ethanol precipitation, reverse phase HPLC, silica or cation-exchange resins, such as chromatography on DEAE, chromatographic focusing, SDS-PAGE, ammonium sulfate Precipitation, and gel filtration using, for example, Sephadex G-75.
본 명세서에서 “폴리뉴클레오티드” 또는 “핵산”은 교환 가능하게 사용되며, 임의 길이의 뉴클레오티드의 중합체를 지칭하고 DNA(예컨대 cDNA) 및 RNA 분자를 포괄적으로 포함한다. 핵산 분자의 구성 단위인 “뉴클레오티드”는 데옥시리보뉴클레오티드, 리보뉴클레오티드, 변형된 뉴클레오티드 또는 염기, 및/또는 그 유사체, 또는 DNA 또는 RNA 폴리머라제에 의해, 또는 합성 반응에 의해 중합체 내로 혼입될 수 있는 임의의 기질일 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오티드, 당 또는 염기가 변형된 유사체(analogue), 예컨대 메틸화 뉴클레오티드 및 그 유사체를 포함할 수 있다(Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York(1980); Uhlman 및 Peyman, Chemical Reviews, 90:543-584(1990)).As used herein, “polynucleotide” or “nucleic acid” is used interchangeably and refers to a polymer of nucleotides of any length and encompasses DNA (such as cDNA) and RNA molecules inclusively. The “nucleotide”, the constituent unit of a nucleic acid molecule, can be incorporated into a polymer by deoxyribonucleotides, ribonucleotides, modified nucleotides or bases, and / or analogs thereof, or by DNA or RNA polymerase, or by synthetic reactions. It can be any substrate. Polynucleotides can include analogs with modified nucleotides, sugars or bases, such as methylated nucleotides and analogs thereof (Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York (1980); Uhlman and Peyman, Chemical Reviews , 90: 543-584 (1990).
뉴클레오티드에서의 변이는 단백질에서 변이를 가져오지 않는 것도 있다. 이러한 핵산은 기능적으로 균등한 코돈 또는 동일한 아미노산을 코딩하는 코돈 (예를 들어, 코돈의 축퇴성에 의해, 아르기닌 또는 세린에 대한 코돈은 여섯 개이다), 또는 생물학적으로 균등한 아미노산을 코딩하는 코돈을 포함하는 핵산분자를 포함한다.Variations in nucleotides do not result in mutations in proteins. Such nucleic acids include functionally equivalent codons or codons that encode the same amino acid (eg, by degeneracy of the codon, six codons for arginine or serine), or codons that encode biologically equivalent amino acids. And nucleic acid molecules.
또한, 뉴클레오티드에서의 변이가 단백질 자체에 변화를 가져올 수도 있다. 단백질의 아미노산에 변화를 가져오는 변이인 경우에도 본 발명의 단백질과 거의 동일한 활성을 나타내는 것이 얻어질 수 있다.In addition, variations in nucleotides may result in changes in the protein itself. Even in the case of mutations that bring about changes in amino acids of proteins, those exhibiting almost the same activity as the proteins of the present invention can be obtained.
본 발명의 핵산 또는 폴리뉴클레오티드가 가지는 특징, 예를 들어 RNA 백신 및/또는 면역보강제로서의 효과를 갖는 범위에서, 본 발명의 펩타이드 및 핵산 분자는 서열목록에 기재된 아미노산 서열 또는 염기 서열에 한정되지 않는다는 것은 통상의 기술자에게 명확하다. 예를 들어, 본 발명의 재조합 단백질에 포함될 수 있는 생물학적 기능 균등물은 본 발명의 재조합 단백질과 균등한 생물학적 활성을 발휘하는 아미노산 서열의 변이를 가지는 펩타이드일 수 있다. To the extent that the nucleic acids or polynucleotides of the present invention have a feature, for example, as an RNA vaccine and / or an adjuvant, the peptides and nucleic acid molecules of the present invention are not limited to the amino acid sequences or base sequences described in the sequence listing. It is clear to the person skilled in the art. For example, the biological functional equivalents that may be included in the recombinant protein of the present invention may be a peptide having a variation in the amino acid sequence exerting an equivalent biological activity with the recombinant protein of the present invention.
상술한 생물학적 균등 활성을 갖는 변이를 고려한다면, 본 발명에 따른 펩타이드 및/또는 단백질을 코딩하는 핵산 분자는 서열목록에 기재된 서열과 실질적인 동일성(substantial identity)을 나타내는 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 상기의 실질적인 동일성은, 상기한 본 발명의 서열과 임의의 다른 서열을 최대한 대응되도록 얼라인하고, 당업계에서 통상적으로 이용되는 알고리즘을 이용하여 얼라인된 서열을 분석한 경우에, 최소 61%의 상동성, 보다 바람직하게는 70%의 상동성, 보다 더 바람직하게는 80%의 상동성, 가장 바람직하게는 90%의 상동성을 나타내는 서열을 의미한다. 서열비교를 위한 얼라인먼트 방법은 당업계에 공지되어 있다. Considering the above-described variations with biologically equivalent activity, nucleic acid molecules encoding peptides and / or proteins according to the present invention are also construed to include sequences that exhibit substantial identity with the sequences set forth in the Sequence Listing. The above substantial identity is at least 61% when the sequence of the present invention is aligned as closely as possible with any other sequence, and the aligned sequence is analyzed using algorithms commonly used in the art. By a sequence that shows homology, more preferably 70% homology, even more preferably 80% homology, and most preferably 90% homology. Alignment methods for sequence comparison are known in the art.
본 명세서에서 사용된 용어 “벡터”는 숙주세포에 전달이 가능하며 바람직하게는 하나 이상의 목적 유전자 또는 서열의 발현이 가능하도록 만들어진 구조물을 의미한다. 예를 들면 벡터에는 바이러스 벡터(viral vectors), DNA 또는 RNA 발현 벡터(expression vectors), 플라스미드(plasmid), 코스미드(cosmid) 또는 파지벡터(phage vectors), CCA(cationic condensing agents)와 연결된 DNA 또는 RNA 발현 벡터, 리포좀(liposomes)으로 포장된 DNA 또는 RNA 발현 벡터, 프로듀서 세포(producer cells)와 같은 특정 진핵세포(eukaryotic cells) 등이 포함된다. As used herein, the term “vector” refers to a construct that is capable of delivery to a host cell and preferably enables expression of one or more desired genes or sequences. For example, a vector may include viral vectors, DNA or RNA expression vectors, plasmids, cosmids or phage vectors, DNA linked to cationic condensing agents, or RNA expression vectors, DNA or RNA expression vectors packaged in liposomes, specific eukaryotic cells such as producer cells, and the like.
본 명세서에서 "발현 조절 서열(expression control/regulation sequence)" 또는 "발현 조절 요소(expression control/regulation element)"는 핵산의 전사(transcription) 및/또는 전사체 형태의 핵산으로부터 번역(translation)을 조절하는 핵산 서열을 의미할 수 있다. 한편, "전사 조절 서열(transcription control/regulation sequence)" 또는 "전사 조절 요소(trnacription control/regulation element)"는 핵산의 전사를 조절하는 핵산 서열을 의미한다. 전사 조절 서열은 구조 프로모터(constitutie promoter) 또는 유도 프로모터(inducible promoter)와 같은 프로모터 또는 인핸서(enhancer) 등이 있다. 또한, 전사체 형태의 핵산으로부터 단백질 또는 펩타이드로의 번역을 조절하는 핵산 서열에 대해서 "번역 조절 서열(translation control/regulation sequence)" 또는 "번역 조절 요소(translation control/regulation element)"라는 용어가 사용될 수 있다. 이들 발현 조절 서열/요소, 전사 조절 서열/요소 및/또는 번역 조절 서열/요소는 발현될 서열, 예를 들어 전사 또는 번역될 핵산 서열에 작동적으로 연결(operatively linked)되어 있다. As used herein, "expression control / regulation sequence" or "expression control / regulation element" refers to the transcription of nucleic acids and / or translation from nucleic acid in transcript form. It can mean a nucleic acid sequence. Meanwhile, "transcription control / regulation sequence" or "trnacription control / regulation element" refers to a nucleic acid sequence that regulates transcription of a nucleic acid. Transcriptional regulatory sequences include promoters such as constitutie promoters or inducible promoters or enhancers. In addition, the term "translation control / regulation sequence" or "translation control / regulation element" is used for nucleic acid sequences that control translation from transcript-type nucleic acids to proteins or peptides. Can be. These expression control sequences / elements, transcriptional regulatory sequences / elements and / or translational regulatory sequences / elements are operatively linked to the sequence to be expressed, eg, the nucleic acid sequence to be transcribed or translated.
본 명세서에서 용어"작동 가능하게 연결된(operatively linked)"은 핵산 발현 조절서열(예: 프로모터, 시그널 서열, 라이보좀 결합부위, 전사 종결서열 등)과 다른 핵산 서열 사이의 기능적인 결합을 의미하며, 이에 의해 상기 조절 서열은 상기 다른 핵산 서열의 전사 및/또는 해독을 조절하게 된다.As used herein, the term “operatively linked” refers to a functional binding between a nucleic acid expression control sequence (eg, promoter, signal sequence, ribosomal binding site, transcription termination sequence, etc.) and another nucleic acid sequence, The regulatory sequence thereby controls the transcription and / or translation of the other nucleic acid sequence.
핵산 분자Nucleic acid molecule
본 발명의 일 측면에 따르면, 본 발명은 코딩 영역을 구성하는 관심유전자(Gene Of Interest, GOI)를 발현시키기 위한 발현 조절 서열, 구체적으로 발현 조절 서열로서 내부리보솜결합부위(Internal Ribosomal Entry Site; IRES)의 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드(polynucleotide) 또는 핵산 분자에 관한 것이다. 도 1은 본 발명의 예시적인 실시형태에 따라 코딩 영역에 위치하는 하나의 관심유전자를 발현시킬 수 있는 폴리뉴클레오티드(polynucleotide) 또는 핵산 분자의 구성을 개략적으로 도시한 모식도이다. According to an aspect of the present invention, the present invention provides an expression control sequence for expressing a gene of interest (GOI) constituting a coding region, specifically an internal ribosomal entry site (IRES) as an expression control sequence. It relates to a polynucleotide or nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence of). 1 is a schematic diagram showing the configuration of a polynucleotide or nucleic acid molecule capable of expressing one gene of interest located in a coding region according to an exemplary embodiment of the present invention.
도 1에 도시한 바와 같이, 본 발명의 예시적인 실시형태에 따른 핵산 분자는 IRES 활성을 가지는 염기 서열을 포함하는 발현 조절 서열(expression control sequence, ECS로 표시)과, 상기 발현 조절 서열(ECS)과 작동 가능하게 연결되며, 펩타이드 또는 단백질을 암호화하는 관심유전자(GOI)의 열린해독틀(open reading frame; ORF)로 이루어진 코딩 영역(coding region, CR)을 포함할 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, 발현 조절 서열(ECS)은 IRES 서열을 포함하는 5'-비번역영역(5'Untranslated Region, 5'-UTR)을 형성할 수 있다. As shown in FIG. 1, a nucleic acid molecule according to an exemplary embodiment of the present invention includes an expression control sequence (expressed as ECS) including a nucleotide sequence having IRES activity, and the expression control sequence (ECS). It is operably linked to and may comprise a coding region (CR) consisting of an open reading frame (ORF) of a gene of interest (GOI) that encodes a peptide or protein. In one exemplary embodiment, an expression control sequence (ECS) can form a 5'-Untranslated Region (5'-UTR) comprising an IRES sequence.
일례로, 코딩 영역(CR)은 발현 조절 서열(ECS), 예를 들어 IRES 서열을 포함하는 5'-UTR의 3'쪽에 위치할 수 있다. 한편, 핵산 분자는 DNA 또는 RNA일 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, 본 발명에 따른 핵산 분자는 RNA 형태를 가질 수 있다. 핵산 분자가 RNA 형태인 경우, 코딩 영역(CR)은 관심유전자의 전사체 서열로 이루어질 수도 있다. In one example, the coding region (CR) may be located on the 3 'side of the 5'-UTR comprising an expression control sequence (ECS), eg, an IRES sequence. On the other hand, the nucleic acid molecule may be DNA or RNA. In one exemplary embodiment, the nucleic acid molecule according to the invention may have an RNA form. If the nucleic acid molecule is in RNA form, the coding region (CR) may consist of the transcript sequence of the gene of interest.
발현 조절 서열(ECS)은 열린해독틀 형태로 삽입되는 관심유전자(GOI)와 작동 가능하게 연결되는 IRES 염기 서열을 포함하고 있으며, IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR의 구조를 가질 수 있다. 5'-UTR은 관심유전자(GOI)의 단백질 및/또는 펩타이드로의 번역과 관련된 번역개시복합체(translational initiation complex)가 결합하는 영역이며, IRES는 2차 및 3차 구조를 복잡하게 형성하여 관심유전자(GOI)의 번역을 유도하는 cis-acting 염기 서열이다. The expression control sequence (ECS) includes an IRES base sequence operably linked to a gene of interest (GOI) inserted into an open reading frame, and may have a structure of 5′-UTR including an IRES base sequence. 5'-UTR is the region where the translational initiation complex associated with the translation of the gene of interest (GOI) into proteins and / or peptides is bound. IRES complexes the secondary and tertiary structures. Cis-acting base sequence that induces translation of (GOI).
하나의 예시적인 실시형태에서, IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS)은 바이러스에서 유래한(바이러스성) IRES 염기 서열 및/또는 진핵세포에서 유래한(진핵세포성) IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. 바이러스성 IRES 염기 서열 및/또는 진핵세포성 IRES 염기 서열을 포함하는 발현 조절 서열(ECS)은 바이러스성 IRES 염기 서열 및/또는 진핵세포성 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR 구조를 가질 수 있다. In one exemplary embodiment, an expression control sequence (ECS) having an IRES base sequence may comprise an IRES base sequence derived from a virus (viral) and / or an IRES base sequence derived from a eukaryotic cell (eukaryotic). Can be. An expression control sequence (ECS) comprising a viral IRES base sequence and / or a eukaryotic IRES base sequence may have a 5'-UTR structure comprising a viral IRES base sequence and / or a eukaryotic IRES base sequence. .
하나의 예시적인 실시형태에서, 바이러스성 IRES 염기 서열은 피코나바이러스과(Picornaviridae), 토가바이러스과(Togaviridae), 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae), 플라비바이러스과(Flaviridae), 레트로바이러스과(Retroviridae) 및/또는 헤르페스바이러스과(Herpesviridae)의 바이러스에서 유래한 것일 수 있다. In one exemplary embodiment, the viral IRES base sequence is Picornaviridae, Togaviridae, Dicistroviridae, Flaviridae, Retroviridae and / or It may be derived from the virus of the herpesviridae (Herpesviridae).
예를 들어, 피코나바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은 엔테로바이러스속(Enterovirus)에 속하는 바이러스, 카디오바이러스속(Cardiovirus)에 속하는 바이러스, 아프토바이러스속(Apthovirus)에 속하는 바이러스, 헤파토바이러스속(Hepatovirus)에 속하는 바이러스 및/또는 테스코바이러스속(Teschovirus)에 속하는 바이러스에 유래한 것일 수 있다. 일례로, 엔테로바이러스속에 속하는 바이러스는 엔테로바이러스 A 내지 엔테로바이러스 J 유형과, 리노바이러스(Rhinovirus) A 내지 리노바이러스 C형으로 분류되는 바이러스에서 유래할 수 있다. For example, the viral IRES nucleotide sequence belonging to the family of piconaviruses is a virus belonging to the genus Enterovirus, a virus belonging to the Cardiovirus, a virus belonging to the Aptovirus, and a hepattovirus genus. It may be derived from a virus belonging to (Hepatovirus) and / or a virus belonging to the genus Teschovirus (Teschovirus). In one example, the viruses belonging to the genus Enterovirus may be derived from viruses classified into enterovirus A to enterovirus J type, and rhinovirus A to rhinovirus C type.
비제한적인 실시형태에서, 피코나바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은 1) 엔테로바이러스속에서 유래한 폴리오바이러스(Poliovirus, PV), 리노바이러스(Rhinovirus, RV), 콕사키바이러스(Cossachievirus), 예를 들면, 콕사키바이러스B3(Coxsachie virus B3, CVB3), 엔테로바이러스71(Enterovirus71, EV71), 2) 카디오바이러스속(Cardiovirus)에 속하는 뇌심근염바이러스(Encephalomyocarditis virus, EMCV), 마우스뇌척수염바이러스(Theiler murine encephalomyelitis virus, TMEV), 3) 아프토바이러스속에 속하는 구제역 질병 바이러스(Foot-and-mouth disease virus, FMDV), 4) 헤파토바이러스속에 속하는 A형 간염바이러스(Hepatitis A Virus, HAV), 및/또는 5) 테스코바이러스속에 속하는 돼지테스코바이러스(Porcine teschovirus, PTV, 예를 들어 PTV-1) 및 이들의 조합을 들 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. In a non-limiting embodiment, the viral IRES base sequence belonging to the family of piconaviruses is 1) poliovirus (PV), rhinovirus (RV), cossachievirus, eg from the genus enteroviruses, eg For example, Coxsachie virus B3 (CVB3), Enterovirus 71 (Enterovirus 71, EV71), 2) Cardiovirus belonging to the cardiovirus (Encephalomyocarditis virus, EMCV), mouse encephalomyelitis virus (Theiler murine) encephalomyelitis virus (TMEV), 3) Foot-and-mouth disease virus (FMDV), 4) Hepatitis A Virus (HAV), and / or 5) Porcine teschovirus belonging to the genus Tesco virus (Porcine teschovirus, PTV, such as PTV-1) and combinations thereof, but the present invention is not limited thereto.
다른 선택적인 실시형태에서, 토가바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은 알파바이러스속(Alphavirus)에 속하는 신드비스 바이러스(Sindbis virus, SV)에서 유래할 수 있다. 또한, 디스스트로바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은, 예를 들어, 크리파바이러스속(Cripavirus)에 속하는 갈색날개노린재장내바이러스(Plautia stali intestine virus, PSIV), 귀뚜라미 마비바이러스(Cricket paralysis virus, CPV), 트리아토마바이러스(Triatoma virus), 및/또는 기장테두리진딧물바이러스(Rhopalosiphum padi virus, RXPD)에서 유래할 수 있다. In another alternative embodiment, the viral IRES base sequence belonging to the Togaviraceae family may be derived from Sindbis virus (SV) belonging to the genus Alphavirus. In addition, the viral IRES nucleotide sequence belonging to the Distrovirus family is, for example, Plautia stali intestine virus (PSIV), Cricket paralysis virus (CPV) belonging to the genus Cripavirus. ), Triatoma virus, and / or Rhopalosiphum padi virus (RPXD).
한편, 예시적인 실시형태에서, 플라비바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은 헤파시바이러스속(Hepacivirus)에 속하는 C형 간염바이러스(Hepatitis C virus, HCV), 플라비바이러스속(Flavivirus)에 속하는 일본뇌염바이러스(Japanese Encephalitis Virus, JEV), 페스티바이러스속(Pestivirus)에 속하는 돼지열병바이러스(Classical swine fever virus, CSFV) 및/또는 소바이러스성설사병바이러스(Bovine viral diarrhea virus, BVDV)에서 유래할 수 있다. 다른 예시적인 실시형태에서, 레트로바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은 감마레트로바이러스속(Gammaretrovirus)에 속하는 프렌드 마우스레트로바이러스(Friend murine leukemia virus, FMLV), 몰로니마우스레트로바이러스(Moloney murine leukemia virus, MMLV) 및/또는 알파레트로바이러스속(Alpharetrovirus)에 속하는 라우스육종바이러스(Rous sarcoma virus, RSV)에서 유래할 수 있다. 또한, 헤르페스바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열은 마디바이러스속(Mardivirus)에 속하는 마렉병바이러스(Marek's disease virus, MDV)에서 유래할 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. On the other hand, in an exemplary embodiment, the viral IRES base sequence belonging to the Flavivirus family is hepatitis C virus (HCV) belonging to the Hepacivirus, Japan belonging to the Flavivirus. It can be derived from Japanese Encephalitis Virus (JEV), Classic swine fever virus (CSFV) belonging to Pestivirus and / or Bovine viral diarrhea virus (BVDV). . In another exemplary embodiment, the viral IRES nucleotide sequence belonging to the family of retrovirals is Friend murine leukemia virus (FMLV), Moloney murine leukemia virus, belonging to the genus Gammaretrovirus, MMLV) and / or Rous sarcoma virus (RSV) belonging to the genus Alpharetrovirus. The viral IRES base sequence belonging to the herpesvirus family may be derived from Marek's disease virus (MDV) belonging to the genus Madardivirus, but the present invention is not limited thereto.
일례로, 바이러스성 IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS)은 피코나바이러스과(Picornaviridae) 및/또는 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae)에 속하는 바이러스에서 유래한 것일 수 있다. 일례로, 피코나바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS)은 엔테로바이러스속, 카디오바이러스속 또는 아프토바이러슥속에 속하는 바이러스에서 유래할 수 있으며, 특히 바람직하게는 엔테로바이러스속에 속하는 바이러스에서 유래할 수 있다. 예를 들어, 엔테로바이러스속에 속하는 IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS)은 CVB3와 같은 콕사키바이러스 등의 엔테로바이러스속의 바이러스에서 유래하거나, EMCV와 같은 카디오바이러스속의 바이러스에서 유래할 수 있다. In one example, the expression control sequence (ECS) having the viral IRES base sequence may be from a virus belonging to the family Picornaviridae and / or Dicystroiridae. In one example, an expression control sequence (ECS) having a viral IRES nucleotide sequence belonging to the family of piconaviruses may be derived from a virus belonging to the genus Enterovirus, Cardiovirus or Atovirus, and particularly preferably to the genus Enterovirus. May be derived from a belonging virus. For example, an expression control sequence (ECS) having an IRES base sequence belonging to the genus Enteroviruses may be derived from a virus of the genus Enteroviruses, such as a coxsackie virus such as CVB3, or may be derived from a virus of the genus Cardioviruses, such as EMCV.
또한, 디시스트로바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS)은 크리파바이러스속에 속하는 PSIV 또는 CPV에서 유래한 것일 수 있다. In addition, an expression control sequence (ECS) having a viral IRES nucleotide sequence belonging to the dyscirovirus family may be derived from PSIV or CPV belonging to the genus Creepavirus.
하나의 예시적인 실시형태에서, 발현 조절 서열(ECS)은 SV, CVB3, EMCV, JEV, CPV 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 바이러스 유래의 IRES 염기 서열을 가질 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. 일례로, 발현 조절 서열(ECS)은 SV에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호:1), CVB3에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호: 2), EMCV에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호: 3), JEV에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호:4) 및/또는 CPV에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호: 5)로 이루어질 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. In one exemplary embodiment, the expression control sequence (ECS) may have an IRES base sequence from a virus selected from the group consisting of SV, CVB3, EMCV, JEV, CPV, and combinations thereof, It is not limited. In one example, the expression control sequence (ECS) is a 5'-UTR (SEQ ID NO: 1) comprising an IRES base sequence derived from SV, and a 5'-UTR (SEQ ID NO: 1) comprising an IRES base sequence derived from CVB3. 2), 5'-UTR comprising an IRES nucleotide sequence derived from EMCV (SEQ ID NO: 3), 5'-UTR comprising an IRES nucleotide sequence derived from JEV (SEQ ID NO: 4) and / or 5'-UTR (SEQ ID NO: 5) comprising the IRES base sequence derived from CPV, but the present invention is not limited thereto.
다른 예시적인 실시형태에서, 진핵세포성 IRES 염기 서열은 진핵세포의 세포성 mRNA(cellular mRNA)에서 유래한 IRES 염기 서열을 가질 수 있다. 예시적인 실시형태에서 진핵세포성 IRES 염기 서열은 성장인자(growth factors), 전사인자(transcription factors), 번역인자(translation factors), 암유전자(oncogenes), 운반체/수용체(transporter/receptor), 세포계획사 활성제(Activators of apoptosis), 세포계획사 억제제(Inhibitors of apoptosis), 신경세포의 수상돌기에 국재화된 단백질/펩타이드류(Proteins localized in neuronal dendrites) 및/또는 다른 펩타이드/단백질과 관련된 IRES 염기 서열을 포함할 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. In other exemplary embodiments, the eukaryotic IRES base sequence may have an IRES base sequence derived from the cellular mRNA of the eukaryotic cell. In an exemplary embodiment, the eukaryotic IRES sequence is a growth factor, transcription factors, translation factors, oncogenes, transporter / receptor, cell plan. IRES sequences related to activators of apoptosis, inhibitors of apoptosis, proteins localized in neuronal dendrites and / or other peptides / proteins Although it may include, the present invention is not limited thereto.
일례로, IRES 염기 서열을 가지는 성장인자는 섬유아세포성장인자(Fibroblast growth factor, FGF, 예를 들어 FGF-1, FGF-2), 혈소판유래성장인자-B(Platelet-derived growth factor-B, PDGF-B), 혈관내피성장인자(Vascular endothelial growth factor, VEGF), 유사인슐린성장인자-2(Insulin-like groth factor-2, IGF-2) 등을 들 수 있다. For example, growth factors having an IRES nucleotide sequence may include fibroblast growth factor (FGF, for example, FGF-1, FGF-2), platelet-derived growth factor-B (PDGF). -B), Vascular endothelial growth factor (VEGF), Insulin-like groth factor-2 (IGF-2), and the like.
IRES 염기 서열을 가지는 전사인자는 안테나페디아(antennapedia, Antp), 울트라바이소랙스(Ultrabithorax, ubx), MYT-2, NF-κB 억제 인자(NF-κB repressing factor, NRF), 급성골수성백열병단백질-1(acute myelod leukemia 1 protein, AML1; Runt-related transcription factor 1, RUNX1) 등을 들 수 있다. Transcription factors with IRES sequences include antennapedia (antp), ultrarabirasax (ubx), MYT-2, NF-κB repressing factor (NRF), and acute myeloid leukemia protein. -1 (
IRES 염기 서열을 가지는 번역 인자는 진핵세포 번역개시 인자 4G(Eukaryotic initiation factor 4G, eIF4G), 진핵세포 번역개시인자 4GI(Eukarytoic initiation factor 4GI, eIF4GI), 진핵세포 번역개시 인자 4 감마-2(Eukaryotic transcription initiation factor 4 gamma 2, eIF4G2) 등을 들 수 있다. Translation factors having an IRES sequence include eukaryotic initiation factor 4G (eIF4G), eukarytoic initiation factor 4GI (eIF4GI), and eukaryotic
IRES 염기 서열을 가지는 암유전자는 c-myc, L-myc, p53 등을 들 수 있으며, IRES 염기 서열을 가지는 운반체/수용체는 양전하성 아미노산운반체(cationic amino acid transporter, 예를 들어 SLC7A1), 전압개폐칼륨통로(Voltage -gated potassium channel) 등을 들 수 있다. Cancer genes having an IRES sequence include c-myc, L-myc, and p53. Carriers / receptors having an IRES sequence include cationic amino acid transporters (eg, SLC7A1) Potassium channel (Voltage-gated potassium channel) and the like.
IRES 염기 서열을 가지는 세포계획사 활성제는 세포계획사프로테아제활성인자 1(Apoptotic protease activation factor 1, Apaf-1)을 들 수 있고, IRES 염기 서열을 가지는 세포계획사 억제제는 세포계획사X-연결억제제(X-linked inhibitor of apoptosis protein, XIAP), Bcl-2 등을 들 수 있다. 신경세포의 수상돌기에 국재화된 단백질/펩타이드류는 취약 정신 지체 단백질 1(fragile X mental retardation 1, FMR1), 활성제어세포골격연관단백질(Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, ARC), 미세소관연관단백질-2(Microtubule-associated protein 2, MAP2), 뉴로그라닌(neurogranin, RC3), 아밀로이드 전구체 단백질(Amyloid precursor protein) 등을 들 수 있다. Cytoplasmic activators with IRES sequences include Apoptotic Activation Factor 1 (Apopa-1), and cytoplasmic inhibitors with IRES sequences include cytoplasmic X-link inhibitors. (X-linked inhibitor of apoptosis protein, XIAP) and Bcl-2. Proteins / peptides localized to dendrites of neurons include fragile X mental retardation 1 (FMR1), activity-regulated cytoskeleton-associated protein (ARC), and microtubule associations. Protein-2 (Microtubule-associated
그 외에 진핵세포성 IRES 염기 서열은 면역글로불린중쇄결합단백질(Immnunoglubulin heavy chaing binding protein, BiP), 코넥신32(Connexin32), 코넥신43(connexin43), 아데노마노스폴리로시트코일(Adenomatous polyposis coil, APC), 오르니틴카르복실기제거효소(Ornithine decarboxylase), 저산소증유도성인자1-알파(Hypoxia-inducible factor 1-alpha, HIF1α) 등에서 유래한 IRES 염기 서열 등을 들 수 있다. In addition, eukaryotic IRES sequences include immunoglobulin heavy chaing binding protein (BiP), connexin32, connexin43, and adenomatous polyposis coils. ARES base sequence derived from APC), Ornithine decarboxylase, Hypoxia-inducible factor 1-alpha (HIF1α), and the like.
하나의 예시적인 실시형태에, 발현 조절 서열(ECS)은 eIF4G, FMR1, CN43 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 진핵세포 유래의 IRES 염기 서열을 가질 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. 일례로, 발현 조절 서열(ECS)은 eIF4G에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호: 6), FMR1에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호: 7) 및/또는 CN43에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR(서열식별번호: 8)로 이루어질 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. In one exemplary embodiment, the expression control sequence (ECS) may have an IRES base sequence derived from a eukaryotic cell selected from the group consisting of eIF4G, FMR1, CN43, and combinations thereof, but the invention is not so limited. . In one example, the expression control sequence (ECS) is a 5'-UTR (SEQ ID NO: 6) comprising an IRES base sequence derived from eIF4G, and a 5'-UTR (SEQ ID NO: 1) comprising an IRES base sequence derived from FMR1. : 7) and / or 5'-UTR (SEQ ID NO: 8) comprising the IRES base sequence derived from CN43, but the present invention is not limited thereto.
IRES는 독특한 2차 구조(secondary structure) 또는 3차 구조(tertiary structure)를 가지고 있으며, 번역에 필요한 특별한 번역 인자의 필요 유무 및 번역 개시 코돈의 위치 등을 기준으로 Group 1 내지 Group 4로 구분될 수 있다. 예를 들어, 바이러스에서 유래한 IRES는 1) 가장 간단한 구조이며, 번역 인자가 특별히 필요 없으며, 번역 개시 tRNA인 methyonyl-tRNA(Met-tRNAi)가 필요 없는, CPV 및 PSIV 등의 바이러스에서 유래한 IRES 구조인 Group 1, 2) eIF2, eIF3와 같은 원래의 번역 개시 인자 및 Met-tRNAi를 이용하며, 아프토바이러스속(Apthovirus)에 속하는 HCV, 테스코바이러스속(Teschovirus)에 속하는 PTV-1, 플라비바이러스속(Flavivirus)에 속하는 CSFV 등의 바이러스에서 유래한 IRES 구조인 Group 2, 3) eIFs, Met-tRNAi 이외에도 IRES trans-activating factors(ITAFs)를 필요로 하고, IRES의 3' 말단에서 번역을 개시하는, 아프토바이러스속에 속하는 FMDV나 카디오바이러스속(Cardiovirs)에 속하는 EMCV나 TMEV 등의 바이러스에서 유래한 IRES 구조인 Group 3, 4) IRES의 하류에 위치한 AUG 코돈에서 번역을 개시하며, 헤파토바이러스속(Hepatovirus)에 속하는 HAV, 엔테로바이러스속(Enterovirus)에 속하는 소아마비바이러스(PV), 리노바이러스(RV) 등의 바이러스에서 유래한 IRES 구조인 Group 4로 구분될 수 있다. 필요한 경우, 일부 바이러스에서 유래한 IRES의 5' 말단은 바이러스 단백질에서 유래한 Cap-유사 구조를 가지도록 변형될 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. IRES has a unique secondary or tertiary structure and can be classified into
한편, 본 발명에 따른 핵산 분자는 관심유전자(GOI)의 발현 효율을 증가시킬 수 있는 핵산 서열이 더욱 삽입될 수 있다. 일례로, 발현 조절 서열(ECS)에 인접하여 다수의 아데노신이나 티민이 삽입될 수 있는데, 도 1에서 발현 조절 서열(ECS)의 5'쪽에 다수의 아데노신(pMA)이 삽입된 것을 예시하고 있다. 이때, 다수의 아데노신(pMA)은 전사체 형태를 나타낸 것이므로, DNA 상태에서 핵산 분자는 발현 조절 서열(ECS)에 인접하여, 예를 들어, 발현 조절 서열(ECS)의 5'쪽에 다수의 티민(pMT)이 삽입되는 것으로 해석될 수도 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS)에 인접하여 20 내지 400개, 바람직하게는 30 내지 300개, 더욱 바람직하게는 30 내지 200개, 가장 바람직하게는 30 내지 100개의 연속적인 아데노신 또는 티민이 삽입될 수 있다.On the other hand, the nucleic acid molecule according to the present invention may be further inserted a nucleic acid sequence that can increase the expression efficiency of the gene of interest (GOI). In one example, multiple adenosine or thymine may be inserted adjacent to the expression control sequence (ECS), which illustrates the insertion of multiple adenosine (pMA) on the 5 'side of the expression control sequence (ECS). In this case, since adenosine (pMA) represents a transcript form, the nucleic acid molecule in the DNA state is adjacent to the expression control sequence (ECS), for example, on the 5 'side of the expression control sequence (ECS). pMT) may be interpreted as being inserted. In one exemplary embodiment, 20-400, preferably 30-300, more preferably 30-200, most preferably 30-, adjacent to an expression control sequence (ECS) having an IRES base sequence. 100 consecutive adenosine or thymine can be inserted.
이 경우, 발현 조절 서열(ECS)에 인접하여 다수의 아데노신 또는 티민이 삽입되지 않은 핵산 분자와 비교해서, 관심유전자(GOI)의 발현량이 증가하거나 동등한 수준을 유지할 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에 따르면, 다수의 아데노신 또는 티민이 인접하게 삽입되어 관심유전자(GOI)의 발현량이 증가하거나 동등한 수준을 유지할 수 있는 발현 조절 서열(ECS)은 전술한 바이러스성 IRES, 예를 들어, 피코나바이러스과(Picornaviridae), 토가바이러스과(Togaviridae), 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae), 플라비바이러스과(Flaviridae), 레트로바이러스과(Retroviridae) 및/또는 헤르페스바이러스과(Herpesviridae)의 바이러스에서 유래한 것일 수 있다.In this case, the amount of expression of the gene of interest (GOI) can be increased or maintained at an equivalent level compared to a nucleic acid molecule in which a plurality of adenosine or thymine is not inserted adjacent to the expression control sequence (ECS). According to one exemplary embodiment, an expression control sequence (ECS) wherein multiple adenosine or thymines can be inserted contiguously to increase or maintain the level of expression of a gene of interest (GOI) is described in the viral IRES described above. For example, it may be derived from the viruses of the Picornaviridae, the Togaviridae, the Dicistroviridae, the Flaviridae, the Retroviridae and / or the Herpesviridae. have.
한편, 코딩 영역(CR)은 단백질 또는 펩타이드로 발현될 수 있는 관심유전자(GOI)의 핵산 서열로 이루어질 수 있다. 발현 조절 서열(ECS)은 코딩 영역(CR)과 작동 가능하게 연결될 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서 코딩 영역(CR)은 발현 조절 서열(ECS)의 3'쪽에 위치할 수 있지만, 코딩 영역(CR)의 위치가 이에 한정되는 것은 아니다. On the other hand, the coding region (CR) may be composed of a nucleic acid sequence of the gene of interest (GOI) that can be expressed as a protein or peptide. The expression control sequence (ECS) may be operably linked with the coding region (CR). In one exemplary embodiment, the coding region (CR) may be located 3 'side of the expression control sequence (ECS), but the position of the coding region (CR) is not limited thereto.
하나의 예시적인 실시형태에서, 코딩 영역(CR)은 리포터 단백질/펩타이드, 마커 또는 선별 단백질/펩타이드를 암호화하는 열린해독틀(ORF)로 이루어질 수 있다. 예를 들어, 리포터 단백질 또는 펩타이드를 암호화할 수 있는 코딩 영역(CR)의 열린해독틀(ORF)은 레닐라 루시퍼라아제(Renilla luciferase; 예컨대, 서열식별번호: 19 또는 서열식별번호: 20) 및/또는 반딧불이 루시퍼라아제(Firefly luciferase; 예컨대, 서열식별번호: 21)와 같은 루시퍼라아제, 녹색형광 단백질(Green Fluorescent Protein, GFP), 향상된 녹색 형광 단백질(Enhanced Green Fluorescent Protein, EGFP) 및/또는 베타-갈락토시다아제를 암호화할 수 있다. 또한, 마커 또는 선별 단백질/펩타이드를 암호화하는 열린해독틀은 알파-글로빈, 갈락토키나아제 및/또는 잔틴 구아닌 포스포리보실 전이효소 등을 암호화하는 핵산 서열을 포함할 수 있다. 하지만, 그 외에도 다른 리포터 단백질/펩타이드 및/또는 마커 또는 선별 단백질/펩타이드를 암호화하는 열린해독틀이 코딩 영역(CR)으로 삽입될 수 있다. In one exemplary embodiment, the coding region (CR) may consist of an open reading frame (ORF) encoding a reporter protein / peptide, a marker or a selection protein / peptide. For example, an open reading frame (ORF) of a coding region (CR) capable of encoding a reporter protein or peptide may include Renilla luciferase (eg, SEQ ID NO: 19 or SEQ ID NO: 20) and And / or luciferase, such as Firefly luciferase (eg, SEQ ID NO: 21), Green Fluorescent Protein (GFP), Enhanced Green Fluorescent Protein (EGFP), and / or Beta-galactosidase can be encoded. In addition, the open reading frame encoding the marker or select protein / peptide may comprise nucleic acid sequences encoding alpha-globin, galactokinase and / or xanthine guanine phosphoribosyl transferase and the like. However, in addition, other reporter proteins / peptides and / or open reading frames encoding markers or selection proteins / peptides may be inserted into the coding region (CR).
다른 하나의 예시적인 실시형태에서, 코딩 영역(CR)은 항원, 이의 단편, 변이체 또는 유도체를 암호화하는 열린해독틀로 이루어질 수 있다. 항원으로서 예를 들어, 종양(tumour) 항원, 동물 항원, 초목 항원, 바이러스 항원, 박테리아 항원, 곰팡이 항원 및 원생동물 항원, 자가면역 항원 또는 알레르기 항원을 고려할 수 있다. 종양(tumour) 세포의 표면 항원 및 표면 항원, 특히, 바이러스 병원균, 박테리아 병원균, 곰팡이 병원균 또는 원생동물 병원균의, 분비된 형태가 바람직하다. In another exemplary embodiment, the coding region (CR) may consist of an open reading frame that encodes an antigen, fragment, variant or derivative thereof. As antigens, for example, tumor antigens, animal antigens, vegetative antigens, viral antigens, bacterial antigens, fungal and protozoan antigens, autoimmune antigens or allergens can be considered. Secreted forms of surface antigens and surface antigens of tumor cells, in particular viral pathogens, bacterial pathogens, fungal pathogens or protozoal pathogens, are preferred.
필요한 경우, 항원은, 예를 들어 본 발명에 따른 핵산 분자에 존재할 수도 있고, 적절한 담체(carrier)에 결합된 햅텐(haptene)으로 존재할 수 있다. 다른 항원 성분, 예를 들면, 비활성화되거나 약독화된 병원균이 또한 사용될 수 있다.If desired, the antigen may, for example, be present in the nucleic acid molecule according to the invention or in the form of a haptene bound to a suitable carrier. Other antigenic components, such as inactivated or attenuated pathogens, may also be used.
종양(tumour) 항원의 특정한 예는 그 중에서도 종양-특이성 표면 항원(TSSA)이며, 예를 들어 5T4, 707-AP, 9D7, AFP, AlbZIP HPG1, 알파-5-베타-1-인테그린, 알파-5-베타-6-인테그린, 알파-액티닌-4/m, 알파-메틸아실-코엔자임 A 라세미화 효소(racemase), ART-4, ARTC1/m, B7H4, BAGE-1, BCL-2, bcr/abl, 베타-카테닌/m, BING-4, BRCA1/m, BRCA2/m, CA 15-3/CA 27-29, CA 19-9, CA72-4, CA125, 칼레티큘린(calreticulin), CAMEL, CASP-8/m, 카텝신 B, 카텝신 L, CD19, CD20, CD22, CD25, CDE30, CD33, CD4, CD52, CD55, CD56, CD80, CDC27/m, CDK4/m, CDKN2A/m, CEA, CLCA2, CML28, CML66, COA-1/m, 코액토신(coactosin)-유사 단백질, 콜라주 XXIII, COX-2, CT-9/BRD6, Cten, 싸이클린 B1, 싸이클린 D1, cyp-B, CYPB1, DAM-10, DAM-6, DEK-CAN, EFTUD2/m, EGFR, ELF2/m, EMMPRIN, EpCam, EphA2, EphA3, ErbB3, ETV6-AML1, EZH2, FGF-5, FN, Frau-1, G250, GAGE-1, GAGE-2, GAGE-3, GAGE-4, GAGE-5, GAGE-6, GAGE7b, GAGE-8, GDEP, GnT-V, gp100, GPC3, GPNMB/m, HAGE, HAST-2, 헵신, Her2/neu, HERV-K-MEL, HLA-A*0201-R17I, HLA-A11/m, HLA-A2/m, HNE, 호메오박스 NKX3.1, HOM-TES-14/SCP-1, HOM-TES-85, HPV-E6, HPV-E7, HSP70-2M, HST-2, hTERT, iCE, IGF-1R, IL-13Ra2, IL-2R, IL-5, 미성숙 라미닌 수용체, 칼리크레인-2, 칼리크레인-4, Ki67, KIAA0205, KIAA0205/m, KK-LC-1, K-Ras/m, LAGE-A1, LDLR-FUT, MAGE-A1, MAGE-A2, MAGE-A3, MAGE-A4, MAGE-A6, MAGE-A9, MAGE-A10, MAGE-A12, MAGE-B1, MAGE-B2, MAGE-B3, MAGE-B4, MAGE-B5, MAGE-B6, MAGE-B10, MAGE-B16, MAGE-B17, MAGE-C1, MAGE-C2, MAGE-C3, MAGE-D1, MAGE-D2, MAGE-D4, MAGE-E1, MAGE-E2, MAGE-F1, MAGE-H1, MAGEL2, 마마글로빈 A, MART-1/멜란(melan)-A, MART-2, MART-2/m, 바탕질 단백질(matrix protein) 22, MC1R, M-CSF, ME1/m, 메소텔린, MG50/PXDN, MMP11, MN/CA IX-항원, MRP-3, MUC-1, MUC-2, MUM-1/m, MUM-2/m, MUM-3/m, myosin class I/m, NA88-A, N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라아제-V(글루코사미닐transferase-V), Neo-PAP, Neo-PAP/m, NFYC/m, NGEP, NMP22, NPM/ALK, N-Ras/m, NSE, NY-ESO-1, NY-ESO-B, OA1, OFA-iLRP, OGT, OGT/m, OS-9, OS-9/m, 오스테오칼신, 오스테오폰틴, p15, p190 minor bcr-abl, p53, p53/m, PAGE-4, PAI-1, PAI-2, PART-1, PATE, PDEF, Pim-1-키나아제, Pin-1, Pml/PAR알파, POTE, PRAME, PRDX5/m, 프로스테인, 프로테이나아제-3, PSA, PSCA, PSGR, PSM, PSMA, PTPRK/m, RAGE-1, RBAF600/m, RHAMM/CD168, RU1, RU2, S-100, SAGE, SART-1, SART-2, SART-3, SCC, SIRT2/m, Sp17, SSX-1, SSX-2/HOM-MEL-40, SSX-4, STAMP-1, STEAP, 서바이빈, 서바이빈-2B, SYT-SSX-1, SYT-SSX-2, TA-90, TAG-72, TARP, TEL-AML1, TGF베타, TGF베타RII, TGM-4, TPI/m, TRAG-3, TRG, TRP-1, TRP-2/6b, TRP/INT2, TRP-p8, 티로시나아제, UPA, VEGF, VEGFR-2/FLK-1 및 WT1이다. 종양(tumor) 항원의 계열은 본 발명의 목적, 예를 들면, 세포외 매트릭스(matrix) 구조 등에 영향을 미치는, 신혈관형성(neovascularization)에 관여하는 것으로 알려진 종양(tumor) 항원에 적당하다. 종양(tumor) 항원은 단백질 또는 펩타이드 항원으로서, 또는 종양(tumor) 항원 또는 이의 에피토프, 바람직하게 상기 종양(tumor) 항원을 인코딩하는 mRNA 또는 DNA로서, 약학 조성물에 제공될 수 있다.Specific examples of tumor antigens are, among others, tumor-specific surface antigens (TSSA), for example 5T4, 707-AP, 9D7, AFP, AlbZIP HPG1, alpha-5-beta-1-integrin, alpha-5 -Beta-6-integrin, alpha-actinine-4 / m, alpha-methylacyl-coenzyme A racemase, ART-4, ARTC1 / m, B7H4, BAGE-1, BCL-2, bcr / abl, beta-catenin / m, BING-4, BRCA1 / m, BRCA2 / m, CA 15-3 / CA 27-29, CA 19-9, CA72-4, CA125, calreticulin, CAMEL, CASP-8 / m, cathepsin B, cathepsin L, CD19, CD20, CD22, CD25, CDE30, CD33, CD4, CD52, CD55, CD56, CD80, CDC27 / m, CDK4 / m, CDKN2A / m, CEA, CLCA2, CML28, CML66, COA-1 / m, coactosin-like protein, collage XXIII, COX-2, CT-9 / BRD6, Cten, cyclin B1, cyclin D1, cyp-B, CYPB1, DAM -10, DAM-6, DEK-CAN, EFTUD2 / m, EGFR, ELF2 / m, EMMPRIN, EpCam, EphA2, EphA3, ErbB3, ETV6-AML1, EZH2, FGF-5, FN, Frau-1, G250, GAGE -1, GAGE-2, GAGE-3, GAGE-4, GAGE-5, GAGE-6, GAGE7b, GAGE-8, GDEP, GnT-V, gp100, GPC3, GPNMB / m, HA GE, HAST-2, Hepsin, Her2 / neu, HERV-K-MEL, HLA-A * 0201-R17I, HLA-A11 / m, HLA-A2 / m, HNE, Homeobox NKX3.1, HOM-TES -14 / SCP-1, HOM-TES-85, HPV-E6, HPV-E7, HSP70-2M, HST-2, hTERT, iCE, IGF-1R, IL-13Ra2, IL-2R, IL-5, immature Laminin receptor, kallikrein-2, kallikrein-4, Ki67, KIAA0205, KIAA0205 / m, KK-LC-1, K-Ras / m, LAGE-A1, LDLR-FUT, MAGE-A1, MAGE-A2, MAGE -A3, MAGE-A4, MAGE-A6, MAGE-A9, MAGE-A10, MAGE-A12, MAGE-B1, MAGE-B2, MAGE-B3, MAGE-B4, MAGE-B5, MAGE-B6, MAGE-B10 , MAGE-B16, MAGE-B17, MAGE-C1, MAGE-C2, MAGE-C3, MAGE-D1, MAGE-D2, MAGE-D4, MAGE-E1, MAGE-E2, MAGE-F1, MAGE-H1, MAGEL2 , Mamaglobin A, MART-1 / melan-A, MART-2, MART-2 / m, matrix protein 22, MC1R, M-CSF, ME1 / m, mesothelin, MG50 / PXDN, MMP11, MN / CA IX-antigen, MRP-3, MUC-1, MUC-2, MUM-1 / m, MUM-2 / m, MUM-3 / m, myosin class I / m, NA88-A , N-acetylglucosaminyltransferase-V (glucosaminyltransferase-V), Neo-PAP, Neo-PAP / m, NFYC / m, NGEP, NMP22, NPM / ALK, N-Ras / m, NSE , NY-ESO-1, NY-ESO-B, OA1, OFA-iLRP, OGT, OGT / m, OS-9, OS-9 / m, Osteocalcin, Osteopontin, p15, p190 minor bcr-abl, p53, p53 / m, PAGE-4, PAI-1, PAI-2, PART-1, PATE, PDEF, Pim-1-kinase, Pin-1, Pml / PARalpha, POTE, PRAME, PRDX5 / m, prostein, Proteinase-3, PSA, PSCA, PSGR, PSM, PSMA, PTPRK / m, RAGE-1, RBAF600 / m, RHAMM / CD168, RU1, RU2, S-100, SAGE, SART-1, SART-2 , SART-3, SCC, SIRT2 / m, Sp17, SSX-1, SSX-2 / HOM-MEL-40, SSX-4, STAMP-1, STEAP, Survivin, Survivin-2B, SYT-SSX -1, SYT-SSX-2, TA-90, TAG-72, TARP, TEL-AML1, TGFbeta, TGFbetaRII, TGM-4, TPI / m, TRAG-3, TRG, TRP-1, TRP- 2 / 6b, TRP / INT2, TRP-p8, tyrosinase, UPA, VEGF, VEGFR-2 / FLK-1 and WT1. The class of tumor antigens is suitable for tumor antigens known to be involved in neovascularization, affecting the purposes of the present invention, for example, extracellular matrix structures and the like. Tumor antigens may be provided in pharmaceutical compositions as protein or peptide antigens or as tumor antigens or epitopes thereof, preferably as mRNA or DNA encoding said tumor antigens.
예를 들어, 병원성 항원은 개체, 예를 들어 포유류 개체, 특히 인간에 의해 면역 반응을 유도하는 병원성 유기체로부터 유래될 수 있다. 일례로, 병원성 항원은 박테리아성, 바이러스성 또는 원생동물학적(다세포성) 병원성 유기체들로부터 유래될 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, 병원성 항원은 바이러스, 박테리아 또는 원생동물과 같은 유기체의 표면에 위치한 표면 항원(surface antigens), 예를 들어 단백질(또는 단백질의 단편, 예를 들어 표면 하원의 외부 일부분)일 수 있다. For example, pathogenic antigens may be derived from pathogenic organisms that induce an immune response by an individual, for example a mammalian individual, in particular a human. In one example, the pathogenic antigen may be derived from bacterial, viral or protozoan (multicellular) pathogenic organisms. In one exemplary embodiment, the pathogenic antigens are surface antigens, eg proteins (or fragments of proteins, eg, external portions of the surface house) located on the surface of an organism such as a virus, bacteria or protozoa. Can be.
하나의 예시적인 실시형태에서, 코딩 영역(CR)에 의해 암호화될 수 있는 병원성 항원들은 감염성 질병(infectious diseae)와 관련된 병원균으로부터 유래되는 단백질 또는 펩타이드 항원이다. 감염성 질병과 관련된 병원균의 비-제한적인 예는 다음과 같다: 아시네토박터 바우마니(Acinetobacter baumannii), 아나플라스마 속(Anaplasma genus), 아나플라스마 파고사이토필럼(Anaplasma phagocytophilum), 브라질 구충(Ancylostoma braziliense), 십이지장충(Ancylostoma duodenale), 용혈성 아카노박테리아균(Arcanobacterium haemolyticum), 아스카리스 룸브리코이데스(Ascaris lumbricoides), 아스퍼질러스 속(Aspergillus genus), 아스트로비리다에(Astroviridae), 바베시아 속(Babesia genus), 바실러스 앤스래시스(Bacillus anthracis), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 바르토넬라 헨셀라에(Bartonella henselae), BK 바이러스(BK virus), 블라스토시스티스 호미니스(Blastocystis hominis), 블라스토미세스 더마티티디스(Blastomyces dermatitidis), 보르데텔라 퍼터시스(Bordetella pertussis), 보렐리아 부르그도르페리(Borrelia burgdorferi), 보렐리아 속(Borrelia genus), 보렐리아 종들(Borrelia spp), 브루셀라 속(Brucella genus), 말레이 사상충(Brugia malayi), 분야비리대 과(Bunyaviridae family), 부르크홀데리아 세파시아(Burkholderia cepacia) 및 다른 부르크홀데리아 종들, 부르크홀데리아 말레이(Burkholderia mallei), 부르크홀데리아 슈도말레이(Burkholderia pseudomallei), 칼리시비리다에 과(Caliciviridae family), 캄필로박터 속(Campylobacter genus), 칸디다 알비칸스(Candida albicans), 칸디다 종들(Candida spp), 클라미디아 트라코마티스(Chlamydia trachomatis), 클라미도필라 뉴모니아(Chlamydophila pneumonia), 클라미도필라 프시타시(Chlamydophila psittaci), CJD 프리온(CJD prion), 간흡충(Clonorchis sinensis), 클로스트리듐 보툴리눔(Clostridium botulinum), 클로스트리듐 디피실레(Clostridium difficile), 클로스트리듐 퍼프린젠스(Clostridium perfringens), 클로스트리듐 퍼프린젠스(Clostridium perfringens), 클로스트리듐 종들(Clostridium spp), 클로스트리듐 테타니(Clostridium tetani), 콕시디오이데스 종들(Coccidioides spp), 코로나바이러스(coronaviruses), 코리네박테리움 디프테리아(Corynebacterium diphtheria), 콕시엘라 부르네티(Coxiella burnetii), 크리민 콩고 출혈열 바이러스(Crimean-Congo hemorrhagic fever virus), 크립토코커스 네오포르만스(Cryptococcus neoformans), 크립토스포리디움 속(Cryptosporidium genus), 거대세포바이러스(Cytomegalovirus (CMV)), 뎅기열 바이러스(Dengue viruses (DEN-1, DEN-2, DEN-3 및 DEN-4)), 이핵아메바(Dientamoeba fragilis), 에볼라바이러스(Ebolavirus (EBOV)), 에키노코쿠스(Echinococcus genus), 에를리키아 샤펜시스(Ehrlichia chaffeensis), 에를리키아 에인지(Ehrlichia ewingii), 에를리키아 속(Ehrlichia genus), 이질아메바(Entamoeba histolytica), 엔테로코쿠스 속(Enterococcus genus), 엔테로바이러스 속(Enterovirus genus), 엔테로바이러스(Enteroviruses), 주로 콕사키 A 바이러스 및 엔테로바이러스 71(Coxsackie A virus 및 Enterovirus 71 (EV71)), 에피더모파이톤 종들(Epidermophyton spp), 에프스타인-바바이러스(Epstein-Barr Virus (EBV)), 대장균 O157:H7, O111 및 O104:H4(Escherichia coli O157:H7, O111 and O104:H4), 파시올라 헤파티카(Fasciola hepatica) 및 파시올라 기간티카(Fasciola gigantica), FFI 프리온(FFI prion), 필라리오데아상과(Filarioidea superfamily), 플라비바이러스(Flaviviruses), 프란시셀라 툴라렌시스(Francisella tularensis), 푸소박테륨 속(Fusobacterium genus), 게오트리쿰 칸디둠(Geotrichum candidum), 기아르디아 인테스티날리스(Giardia intestinalis), 악구충 종들(Gnathostoma spp), GSS 프리온(GSS prion), 구아나리토 바이러스(Guanarito virus), 헤모필러스 듀크레이(Haemophilus ducreyi), 헤모필러스 인플루엔자(Haemophilus influenza), 헬리코박터 파이로리(Helicobacter pylori), 헤니파바이러스(Henipavirus (헨드라 바이러스 니파바이러스(Hendra virus Nipah virus)), A형 간염 바이러스(Hepatitis A Virus), B형 간염 바이러스(Hepatitis B Virus (HBV)), C형 간염 바이러스(Hepatitis C Virus (HCV)), D형 간염 바이러스(Hepatitis D Virus), E형 간염 바이러스(Hepatitis E Virus), 헤르페스 심플렉스 바이러스 1 및 2(Herpes simplex virus 1 and 2 (HSV-1 및 HSV-2)), 히스토플라스마 캅술라튬(Histoplasma capsulatum), HIV (인간 면역결핍 바이러스(Human immunodeficiency virus)), 호르테아 워넥키(Hortaea werneckii), 인간 보카바이러ㅣ스(Human bocavirus (HBoV)), 인간 헤르페스바이러스 6(Human herpesvirus 6 (HHV-6)) 및 인간 헤르페스바이러스 7(Human herpesvirus 7 (HHV-7)), 인간 메타뉴모바이러스(Human metapneumovirus (Hmpv)), 인유두종 바이러스(Human papillomavirus (HPV)), 인간 파라인플루엔자 바이러스(Human parainfluenza viruses (HPIV)), 일본 뇌염 바이러스(Japanese encephalitis virus), JC 바이러스(JC virus), 후닌 바이러스(Junin virus), 킨젤라 킨가에(Kingella kingae), 클렙시엘라 그래뉼로마티스(Klebsiella granulomatis), 쿠루 프리온(Kuru prion), 라사 바이러스(Lassa virus), 레지오넬라 뉴모필라(Legionella pneumophila), 리슈마니아 속(Leishmania genus), 렙토스피라 속(Leptospira genus), 리스테리아 모노사이토제니스(Listeria monocytogenes), 림프구성 맥락수막염 바이러스(Lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV)), 마츄포 바이러스(Machupo virus), 말라세지아 종들(Malassezia spp), 마부르크 바이러스(Marburg virus), 홍역 바이러스(Measles virus), 요코가와 흡충(Metagonimus yokagawai), 마이크로스포리디아 필룸(Microsporidia phylum), 중동호흡기증후군 코로나바이러스(Middle East respiratory syndrome coronavirus, MERS-CoV), 몰루스쿰 콘타기오숨 바이러스(Molluscum contagiosum virus (MCV)), 유행성이하선염 바이러스(Mumps virus), 미코박테리움 레프라에(Mycobacterium leprae) 및 미코박테리움 레프로마토시스(Mycobacterium lepromatosis), 미코박테리움 튜버큘로시스(Mycobacterium tuberculosis), 미코박테리움 울서란스(Mycobacterium ulcerans), 폐렴 미코플라스마(Mycoplasma pneumonia), 네글레리아 파울러리(Naegleria fowleri), 아메리카 구충(Necator americanus), 임균(Neisseria gonorrhoeae), 나이세리아 메닝지티디스(Neisseria meningitides), 노카디아 아스테로이드(Nocardia asteroids), 노카디아 종들(Nocardia spp), 온코세르카 볼부루스(Onchocerca volvulus), 오리엔티아 쯔쯔가무시(Orientia tsutsugamushi), 오르소믹소 바이러스과(Orthomyxoviridae family (인플루엔자(Influenza)), 브라질 파라콕시디오이디즈(Paracoccidioides brasiliensis), 폐흡충 종들(Paragonimus spp), 웨스터만 폐흡충(Paragonimus westermani), 파보바이러스 B19(Parvovirus B19), 파스튜렐라 속(Pasteurella genus), 플라스모디움 속(Plasmodium genus), 뉴모시스티스 지로베시(Pneumocystis jirovecii), 폴리오바이러스(Poliovirus), 광견병 바이러스(Rabies virus), 호흡기 세포 융합 바이러스(Respiratory syncytial virus(RSV)), 리노바이러스(Rhinovirus), 리노바이러스들(rhinoviruses), 리케치아 아카리(Rickettsia akari), 리케치아 속(Rickettsia genus), 리케치아 프로바제키(Rickettsia prowazekii), 리케치아 리케치(Rickettsia rickettsia), 리케치아 티피(Rickettsia typhi), 리프트 밸리 열 바이러스(Rift Valley fever virus), 로타바이러스(Rotavirus), 루벨라 바이러스(Rubella virus), 사비아 바이러스(Sabia virus), 살모넬라 속(Salmonella genus), 사콥테스 스카비에이(Sarcoptes scabiei), SARS 코로나바이러스(SARS coronavirus), 주혈흡충 속(Schistosoma genus), 쉬겔라 속(Shigella genus), 신 놈브레 바이러스(Sin Nombre virus), 한타바이러스(Hantavirus), 스포로트릭스 쉔키(Sporothrix schenckii), 스타필로코쿠스 속(Staphylococcus genus), 스타필로코쿠스 속(Staphylococcus genus), 스트렙토코쿠스 아갈락티아(Streptococcus agalactiae), 스트렙토코쿠스 뉴모니아(Streptococcus pneumonia), 스트렙토코쿠스 피오제네스(Streptococcus pyogenes), 스트롱일로이드 스 테콜라리스(Strongyloides stercoralis), 타이니아 속(Taenia genus), 타이니아 솔리움(Taenia solium), 진드기 매개 뇌염 바이러스(Tick-borne encephalitis virus (TBEV)), 개회충(Toxocara canis) 또는 고양이 회충(Toxocara cati), 톡소플라스마 곤디(Toxoplasma gondii), 트레포네마 팔리둠(Treponema pallidum), 트리키넬라 스피랄리스(Trichinella spiralis), 트리코모나스 바지날리스(Trichomonas vaginalis), 트리코파이톤 종들(Trichophyton spp), 트리쿠리스 트리치우라(Trichuris trichiura), 트리파노소마 브루세이(Trypanosoma brucei), 트리파노소마 크루지(Trypanosoma cruzi), 우레아플라즈마 우레알리티쿰(Ureaplasma urealyticum), 수두 대상 포진 바이러스(Varicella zoster virus (VZV)), 수두 대상 포진 바이러스(Varicella zoster virus (VZV)), 대두창(Variola major) 또는 소두창(Variola minor), vCJD 프리온(vCJD prion), 베네주엘라 이콰인 뇌염 바이러스(Venezuelan equine encephalitis virus), 비브리오 콜레라(Vibrio cholera), 웨스트 나일 바이러스(West Nile virus), 웨스턴 말 뇌염 바이러스(Western equine encephalitis virus), 반크로프트 사상충(Wuchereria bancrofti), 황열병 바이러스(Yellow fever virus), 여시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 여시니아 페스티스(Yersinia pestis), 여시니아 슈도투베르쿨로시스(Yersinia pseudotuberculosis) 및 지카바이러스(Zika virus). In one exemplary embodiment, the pathogenic antigens that can be encoded by the coding region (CR) are protein or peptide antigens derived from pathogens associated with infectious disease. Non-limiting examples of pathogens associated with infectious diseases include: Acinetobacter baumannii, Anaplasma genus, Anaplasma phagocytophilum, Ancylostoma braziliense , Ancylostoma duodenale, Hemolytic Acanobacterium haemolyticum, Ascaris lumbricoides, Aspergillus genus, Astroviridae, Babesia genus ), Bacillus anthracis, Bacillus cereus, Bartonella henselae, BK virus, Blastocystis hominis, Blastomyces Blastomyces dermatitidis, Bordetella pertussis, Borrelia burgdorferi, Borreli Borrelia genus, Borrelia spp, Brucella genus, Bruia malayi, Bunyaviridae family, Burkholderia cepacia and other Burkholderia cepacia Lia species, Burkholderia mallei, Burkholderia pseudomallei, Caliciviridae family, Campylobacter genus, Candida albicans, Candida Species spd, Chlamydia trachomatis, Chlamydophila pneumonia, Chlamydophila psittaci, CJD prion, CJD prion, Clolonchis sinensis Clostridium botulinum, Clostridium difficile, Clostridium perfringens, Clostridium perfringens dium perfringens, Clostridium spp, Clostridium tetani, Coccidioides spp, Coronaviruses, Corynebacterium diphtheria, Cocciella Conetella burnetii, Crimean-Congo hemorrhagic fever virus, Cryptococcus neoformans, Cryptosporidium genus, Cytomegalovirus (CMV), Dengue Viruses (DEN-1, DEN-2, DEN-3, and DEN-4), Dientamoeba fragilis, Ebolavirus (EBOV), Echinococcus genus, Erlichia Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia ewingii, Ehrlichia genus, Entamoeba histolytica, Enterococcus genus, Enterovirus genus terovirus genus, Enteroviruses, mainly Coxsackie A virus and Enterovirus 71 (EVox), Epidermophyton spp, Epstein-Barr Virus (EBV)), E. coli O157: H7, O111 and O104: H4 (Escherichia coli O157: H7, O111 and O104: H4), Fasciola hepatica and Fasciola gigantica, FFI prion (FFI prion), Filarioidea superfamily, Flaviviruses, Francisella tularensis, Fusobacterium genus, Geotrichum candidum ), Giardia intestinalis, Gnathostoma spp, GSS prion, Guanarito virus, Haemophilus ducreyi, Hemophil Haemophilus influenza, Helicobact Helicobacter pylori, Henipavirus (Hendra virus Nipah virus), Hepatitis A Virus, Hepatitis B Virus (HBV), Hepatitis C Hepatitis C Virus (HCV), Hepatitis D Virus, Hepatitis E Virus, Herpes simplex virus 1 and 2 (HSV-1 and HSV) -2)), histoplasma capsulatum, HIV (Human immunodeficiency virus), Hortaea werneckii, human Bocavirus (HBoV) ), Human herpesvirus 6 (HHV-6) and human herpesvirus 7 (HHV-7), human metapneumovirus (Hmpv), human papillomavirus ( HPV)), human parainfluenza virus (Human p) arainfluenza viruses (HPIV), Japanese encephalitis virus, JC virus, Jin virus, Junin virus, Kingella kingae, Klebsiella granulomatis, Kuru prion, Lassa virus, Legionella pneumophila, Leishmania genus, Leptospira genus, Listeria monocytogenes, Lymphoblastic meningitis Virus (Lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV)), Machupo virus (Machupo virus), Malassezia spp, Marburg virus, Measles virus, Yokogawa insects (Metagonimus yokagawai) , Microsporidia phylum, Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), Molucocum contagisum virus (Molluscum contagiosum virus (MCV)), mumps virus, Mycobacterium leprae and Mycobacterium lepromatosis, Mycobacterium tuberculosis , Mycobacterium ulcerans, Pneumonia Mycoplasma pneumonia, Naegleria fowleri, Necator americanus, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitidis meningitides ), Nocardia asteroids, Nocardia spp, Onchocerca volvulus, Orientia tsutsugamushi, Orthomyxoviridae family (Influenza), Paracoccidioides brasiliensis, Pararagonimus spp, and Pararagonimus westerma ni), Parvovirus B19, Pasteurella genus, Plasmodium genus, Pneumocystis jirovecii, Poliovirus, Rabies virus Respiratory syncytial virus (RSV), rhinovirus, rhinoviruses, Rickettsia akari, Rickettsia genus, Rickettsia prowazekii, Rickettsia rickettsia, Rickettsia typhi, Rift Valley fever virus, Rotavirus, Rubella virus, Sabia virus, Salmonella genus (Salmonella genus), Sarcoptes scabiei, SARS coronavirus, Schistosoma genus, Shigella genus, Shin Nombreva Sin Nombre virus, Hantavirus, Sporotrix rix schenckii, Staphylococcus genus, Staphylococcus genus, Streptococcus agalactia agalactiae, Streptococcus pneumonia, Streptococcus pyogenes, Strongyloides stercoralis, Taenia genus, Taenia solium ), Tick-borne encephalitis virus (TBEV), Toxocara canis or Toxocara cati, Toxoplasma gondii, Treponema pallidum, Trichy Trichinella spiralis, Trichomonas vaginalis, Trichophyton spp, Trichoris trichiura, Tripanoso Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, Ureaplasma urealyticum, Varicella zoster virus (VZV), Varicella zoster virus (VZV) ), Variola major or Variola minor, vCJD prion, Venezuelan equphalitis virus, Vibrio cholera, West Nile virus Western equine encephalitis virus, Wuchereria bancrofti, Yellow fever virus, Yersinia enterocolitica, Yersinia pestis, Ysinia pseudodo Tuberculosis (Yersinia pseudotuberculosis) and Zika virus.
이와 관련하여 특히 바람직한 것은 인플루엔자 바이러스, 호흡기 세포 융합 바이러스(RSV), 헤르페스 심플렉스바이러스 (HSV), 인유두종 바이러스 (HPV), 인간 면역결핍 바이러스 (HIV), 플라스모디움, 스타필로코쿠스 아우레우스, 뎅기열 바이러스, 클라미디아 트라코마티스, 거대세포바이러스 (CMV), B형 간염 바이러스 (HBV), 미코박테리움 튜버큘로시스, 광견병 바이러스, 황열병 바이러스, 중동호흡기증후군 코로나바이러스(MERS-CoV) 및/또는 지카바이러스로부터 선택된 병원균으로부터 유래한 항원들이다. Particularly preferred in this regard are influenza virus, respiratory cell fusion virus (RSV), herpes simplex virus (HSV), human papilloma virus (HPV), human immunodeficiency virus (HIV), plasmidum, Staphylococcus aureus, Dengue fever virus, Chlamydia trachomatis, cytomegalovirus (CMV), hepatitis B virus (HBV), mycobacterium tuberculosis, rabies virus, yellow fever virus, Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) and / or Zika virus Antigens derived from pathogens selected from.
즉, 하나의 예시적인 실시형태에서, 코딩 영역(CR)은 항원 등과 같이 생체 내에서 면역 반응을 유도할 수 있는 단백질 및/또는 펩타이드, 즉 면역성 단백질 및/또는 펩타이드를 암호화하는 관심유전자(GOI) 또는 관심유전자(GOI)의 전사체 서열로 이루어질 수 있다. 이에 따라, 본 발명에 따른 핵산 분자는 유전자 백신 등으로 기능할 수 있다. That is, in one exemplary embodiment, the coding region (CR) is a protein and / or peptide capable of inducing an immune response in vivo, such as an antigen, ie, a gene of interest (GOI) that encodes an immune protein and / or peptide. Or a transcript sequence of a gene of interest (GOI). Accordingly, the nucleic acid molecule according to the present invention can function as a gene vaccine or the like.
하나의 예시적인 실시형태에 따르면, 본 발명에 따른 핵산 분자가 RNA 형태를 가질 수 있다. 이때, 코딩 영역(CR)이 전술한 병원성 항원과 같이 생체 내에서 면역 반응을 유발할 수 있는 단백질 및/또는 펩타이드를 암호화하는 관심유전자(GOI)의 전사체 서열을 가지는 경우, 본 발명에 따른 핵산 분자는 RNA 백신으로 활용되어 생체 내에 직접 주입될 수 있다. 이러한 RNA 백신은 DNA 백신에 비하여 다음과 같은 이점을 가질 수 있다. According to one exemplary embodiment, the nucleic acid molecule according to the invention may have an RNA form. In this case, when the coding region (CR) has a transcript sequence of a gene of interest (GOI) that encodes a protein and / or peptide capable of inducing an immune response in vivo, such as the aforementioned pathogenic antigen, the nucleic acid molecule according to the present invention May be utilized as an RNA vaccine and injected directly in vivo. Such RNA vaccines may have the following advantages over DNA vaccines.
첫째, DNA 백신에 비하여 인체에 대한 안전성이 우수하다. RNA 백신은 그 특성상 DNA 백신처럼 mRNA로의 전사를 위해서 핵으로 들어가야 할 필요 없이 세포질 내에서 원하는 펩타이드 또는 단백질을 합성할 수 있으므로, RNA 백신은 DNA 백신에 비하여 생체에 대한 안전성이 우수하다. 즉, RNA 백신은 핵 내에서 숙주의 염색체 내로 끼어들어갈 가능성이 없으며, 숙주 세포에서 선별 생산하기 위해 사용하는 선별 마커인 항생제 저항 유전자가 RNA 백신 제작에 불필요하고, RNA는 DNA에 비하여 반감기가 짧기 때문에 장기 유전자 변형(presistenec genetic transformation)을 유도하지 ?는다. 즉, 일반적인 RNA 백신은 세포 안에 전달되어 단기간만 활성화되어 표적 펩타이드/단백질을 발현하고 수일 안에 효소학적 반응으로 파괴되지만, 최초 발현한 표적 펩타이드/단백질에 대한 특이적인 면역 반응은 남아 있다. First, the human body is safer than DNA vaccines. RNA vaccines, by their nature, can synthesize desired peptides or proteins in the cytoplasm without having to enter the nucleus for transcription into mRNA, so RNA vaccines are superior to DNA vaccines. In other words, RNA vaccines are unlikely to penetrate into the host chromosome in the nucleus, and antibiotic resistance genes, which are screening markers used for selective production in host cells, are unnecessary for RNA vaccine production, and RNA has a short half-life compared to DNA. It does not induce long term genetic transformation. That is, a general RNA vaccine is delivered into a cell and activated for a short time to express a target peptide / protein and break down by an enzymatic reaction in a few days, but specific immune responses to the originally expressed target peptide / protein remain.
둘째, RNA 백신은 상대적으로 DNA 백신에 비하여 적은 양을 사용하더라도 원하는 생체내 면역 반응을 유도할 수 있다. RNA 백신은 DNA 백신과 달리 핵으로 들어갈 필요가 없고, 세포막만을 통과하면 되기 때문에, RNA 백신은 DNA 백신보다 적은 양을 사용하더라도 같은 정도의 표적 펩타이드/단백질을 발현시킬 수 있다. 또한, RNA 자체가 면역보강제(adjuvant)로서 활용될 수 있다. Second, RNA vaccines can induce a desired in vivo immune response even with relatively small amounts compared to DNA vaccines. Because RNA vaccines do not need to enter the nucleus, unlike DNA vaccines, they only need to pass through the cell membrane, so RNA vaccines can express the same degree of target peptide / protein even with lesser amounts than DNA vaccines. In addition, RNA itself may be utilized as an adjuvant.
셋째, 모든 제작 공정을 인공적으로 제어할 수 있기 때문에, 생물학적 오염에 대한 위험 없이 소규모 GMP(good manufacturing practice) 생산 시설에서 안전하게 백신을 생산할 수 있다. 즉, RNA 백신은 소규모 GMP 실험실 수준의 시설만이 필요하며, 직접 감염원(바이러스 혹은 병원성 미생물)을 다루지 않아도 되기 때문에 신속하게 다양한 백신을 제조, 생산할 수 있다. Third, because all manufacturing processes can be artificially controlled, vaccines can be produced safely in small good manufacturing practice (GMP) facilities without the risk of biological contamination. In other words, RNA vaccines require only small-scale GMP laboratory-level facilities and do not have to deal directly with infectious agents (viruses or pathogenic microorganisms), enabling rapid production and production of various vaccines.
넷째, RNA 백신은 naked DNA 백신에 비하여 더욱 강한 면역 반응을 유도할 수 있다. 이는 RNA 백신의 스템-루프(stem-loop) 구조 및 RNA 자체 특성으로 인해 유도된 선천성 면역 반응과, 면역된 숙주 세포에서 발현된 표적 펩타이드/단백질에 의해 유도된 후천성 면역 반응이 상호 협력하여 나타내는 것으로 생각된다. 또한 RNA 백신 자체가 세포 내에서 복잡한 항원 복합체(complex antigen)을 생산하고 이것이 항원 제시 세포의 MHC(major histocompatiblity complex; 주조직적합성복합체) class Ⅱ에 접근하여 이상적인 백신으로 작용할 수 있다. Fourth, RNA vaccines can induce stronger immune responses than naked DNA vaccines. This indicates that the innate immune response induced by the stem-loop structure and RNA itself of the RNA vaccine and the acquired immune response induced by the target peptide / protein expressed in the immunized host cell are cooperatively represented. I think. In addition, the RNA vaccine itself produces a complex antigen within the cell, which can serve as an ideal vaccine by accessing the major histocompatiblity complex (MHC) class II of antigen presenting cells.
다섯째, RNA 백신은 기존 백신에 비하여 생산이 용이하다. 전술한 바와 같이, RNA 백신을 생산할 때 감염원을 직접 다룰 필요가 없으며, 대신 발현하고자 하는 감염원의 중화항체 유도 관련 부분(중화 epitope)의 핵산 서열만을 인공적으로 합성하고, 시험관내 전사(in vitro transcription, IVT)만으로 대량의 RNA 백신을 생산할 수 있다. 최근에는 IVT 반응과 관련된 시약, 특히 DNA-의존성 RNA 중합효소가 개선되어 소량의 DNA 주형(template)을 이용하여 대량의 RNA를 1~2주 안에 신속하게 생산할 수 있다. 또한, 면역 반응을 유도하고자 하는 다수의 항원을 동시에 제작하여 혼합한 후 면역할 수 있으며, 발현하고자 하는 항원의 유전자 길이에 특별한 제약이 없어 RNA 백신 제작의 응용성 및 간편성이 증가하였다. Fifth, RNA vaccines are easier to produce than conventional vaccines. As described above, when producing an RNA vaccine, there is no need to deal directly with an infectious agent, instead artificially synthesizing only the nucleic acid sequence of the neutralizing antibody inducing part of the infectious agent to be expressed (neutralizing epitope), and in vitro transcription, IVT) alone can produce large quantities of RNA vaccines. In recent years, reagents associated with IVT reactions, particularly DNA-dependent RNA polymerases, have been improved to enable rapid production of large amounts of RNA in a week or two using small amounts of DNA templates. In addition, it is possible to immunize after mixing a plurality of antigens to induce an immune response at the same time, there is no particular restriction on the gene length of the antigen to be expressed, the applicability and simplicity of RNA vaccine production increased.
본 발명의 핵산 분자는 발현 조절 서열(ECS)로서 이와 같은 복잡한 캡핑 과정이 필요 없는 IRES 염기 서열을 포함하고 있기 때문에, 캡핑 처리와 관련하여 제기되는 문제점을 해결할 수 있으며, 효율적으로 관심유전자(GOI)의 발현을 유도할 수 있다. Since the nucleic acid molecule of the present invention contains an IRES base sequence as an expression control sequence (ECS), which does not require such a complicated capping process, it can solve the problems caused by the capping process, and efficiently the gene of interest (GOI). Can induce expression.
다른 실시형태에서, 코딩 영역(CR)으로 질병 치료와 관련된 단백질 및/또는 펩타이드, 또는 이들의 단편을 암호화하는 관심유전자(GOI) 또는 관심유전자(GOI)의 전사체 서열이 삽입될 수 있다. 이에 따라, 본 발명에 따른 핵산 분자는 유전자 치료제로서 활용될 수 있다. 예시적인 실시형태에서, 질병 치료와 관련된 단백질 또는 펩타이드는 대사 또는 내분비 질환 치료에 사용되는 치료 단백질/펩타이드; 혈액 질환, 순환계 질환, 호흡계 질환, 암 또는 종양 질환, 감염성 질환 또는 면역 결핍증 치료에 사용되는 치료 단백질/펩타이드; 호르몬 대체 요법에 사용되는 치료 단백질/펩타이드; 체세포를 만능 줄기 세포 또는 전능 줄기 세포로 역분화하는데 사용되는 치료 단백질/펩타이드; 보조제 또는 면역 자극 단백질로부터 선택되는 치료 단백질/펩타이드 및/또는 항체를 포함할 수 있다. 질병 치료와 관련된 단백질 또는 펩타이드의 구체적인 예는 대한민국 공개특허 제2014-0125434호에 기재되어 있다. In another embodiment, a transcript sequence of a gene of interest (GOI) or a gene of interest (GOI) that encodes a protein and / or peptide, or fragment thereof, associated with disease treatment may be inserted into the coding region (CR). Accordingly, the nucleic acid molecule according to the present invention can be utilized as a gene therapy agent. In an exemplary embodiment, the protein or peptide associated with treating the disease is a therapeutic protein / peptide used to treat metabolic or endocrine diseases; Therapeutic proteins / peptides used to treat blood diseases, circulatory diseases, respiratory diseases, cancer or tumor diseases, infectious diseases or immunodeficiency; Therapeutic proteins / peptides used in hormone replacement therapy; Therapeutic proteins / peptides used to reverse differentiate somatic cells into pluripotent stem cells or pluripotent stem cells; Therapeutic proteins / peptides and / or antibodies selected from adjuvants or immune stimulating proteins. Specific examples of proteins or peptides associated with the treatment of diseases are described in Korean Patent Publication No. 2014-0125434.
일례로, 대사 또는 내분지 질환의 치료에 사용되는 단백질 또는 펩타이드는 산 스핑고마이엘리나제, 아디포타이드, 아갈시다제-베타, 알글루코시다제, 알파-갈락토시다제 A, 알파-글루코시다제, 알파-L-이듀로니다제, 알파-N-아세틸글루코사미니다제, 암피레귤린, 안지오포이에틴(Ang1, Ang2, Ang3, Ang4, ANGPTL2, ANGPTL3, ANGPTL4, ANGPTL5, ANGPTL6, ANGPTL7), 베타셀룰린, 베타-글루쿠로니다제, 골 형성 단백질 BMP(BMP1, BMP2, BMP3, BMP4, BMP5, BMP6, BMP7, BMP8a, BMP8b, BMP10, BMP15), CLN6 단백질, 상피 성장 인자(EGF), 에피젠, 에피레귤린, 섬유아세포 성장 인자(FGF, FGF-1, FGF-2, FGF-3, FGF-4, FGF-5, FGF-6, FGF-7, FGF-8, FGF-9, FGF-10, FGF-11, FGF-12, FGF-13, FGF-14, FGF-16, FGF-17, FGF-17, FGF-18, FGF-19, FGF-20, FGF-21, FGF-22, FGF-23), 갈설파제, 그렐린, 글루코세레브로시다제, GM-CSF, 헤파린-결합 EGF 유사 성장 인자(HB-EGF), 간세포 성장 인자 HGF, 헵시딘, 사람 알부민, 알부민 소실 증가, 이듀르설파제(이듀로네이트-2-설파타제), 인테그린 αVβ3, αVβ5 및 αVβ1, 이듀로네이트 설파타제, 라로니다제, N-아세틸갈락토사민-4-설파타제(rhASB; 갈설파제, 아릴설파타제 A(ARSA), 아릴설파타제 B (ARSB)), N-아세틸글루코사민-6-설파타제, 신경 성장 인자(NGF, 뇌 유래 신경영양인자(BDNF), 뉴로트로핀-3(NT-3), 뉴로트로핀 4/5(NT-4/5), 뉴레귤린(NRG1, NRG2, NRG3, NRG4), 뉴로필린(NRP-1, NRP-2), 오베스타틴, 혈소판 유래 성장 인자(PDGF (PDFF-A, PDGF-B, PDGF-C, PDGF-D), TGF 베타 수용체(엔도글린, TGF-베타 1 수용체, TGF-베타 2 수용체, TGF-베타 3 수용체), 트롬보포이에틴(THPO)(거핵구 성장 및 발달 인자(MGDF)), 종양 증식 인자(TGF (TGF-a, TGF-베타(TGF베타1, TGF베타2 및 TGF베타3))), VEGF(VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, VEGF-E, VEGF-F 및 PIGF), 네시리타이드, 트립신, 부신피질자극 호르몬(ACTH), 심방 나트륨이뇨펩티드(ANP), 콜레시스토키닌, 가스트린, 렙틴, 옥시토신, 소마토스타틴, 바소프레신(항이뇨 호르몬), 칼시토닌, 엑세나타이드, 성장 호르몬(GH), 소마토트로핀, 인슐린, 인슐린 유사 성장 인자 1(IGF-1), 메카서민 린파베이트, IGF-1 유사체, 메카서민, IGF-1 유사체, 페그비소만트, 프람린타이드, 테리파라타이드(사람 부갑상선 호르몬 잔기 1~34), 베카플러민, 디보터민-알파(골 형성 단백질 2), 히스트렐린 아세테이트(생식선 자극 호르몬 방출 호르몬; GnRH), 옥트레오타이드 및 팔리퍼민(각질 세포 성장 인자; KGF)를 포함할 수 있다. In one example, the protein or peptide used in the treatment of metabolic or endocrine disease is acid sphingomyelinase, adipotide, agalsidase-beta, alglucosidase, alpha-galactosidase A, alpha-glucose Cedarase, alpha-L-eduronidase, alpha-N-acetylglucosaminidase, ampyregulin, angiopoietin (Ang1, Ang2, Ang3, Ang4, ANGPTL2, ANGPTL3, ANGPTL4, ANGPTL5, ANGPTL6, ANGPTL7 ), Betacellulin, beta-glucuronidase, bone forming protein BMP (BMP1, BMP2, BMP3, BMP4, BMP5, BMP6, BMP7, BMP8a, BMP8b, BMP10, BMP15), CLN6 protein, epidermal growth factor (EGF) ), Epigen, epiregulin, fibroblast growth factor (FGF, FGF-1, FGF-2, FGF-3, FGF-4, FGF-5, FGF-6, FGF-7, FGF-8, FGF- 9, FGF-10, FGF-11, FGF-12, FGF-13, FGF-14, FGF-16, FGF-17, FGF-17, FGF-18, FGF-19, FGF-20, FGF-21, FGF-22, FGF-23), gallspase, ghrelin, glucocerebrosidase, GM-CSF, heparin-binding EGF-like growth factor (HB-EGF), hepatocytes Enteric Factor HGF, Hepcidin, Human Albumin, Increased Albumin Loss, Idursulfase (Eduronate-2-Sulfatase), Integrins αVβ3, αVβ5 and αVβ1, Irononate Sulfatase, Laronidase, N-acetylgalactto Samine-4-sulfatase (rhASB; galsulfase, arylsulfatase A (ARSA), arylsulfatase B (ARSB)), N-acetylglucosamine-6-sulfatase, nerve growth factor (NGF, brain derived neurotrophic factor ( BDNF), Neurotropin-3 (NT-3), Neurotropin 4/5 (NT-4 / 5), Neuroregulin (NRG1, NRG2, NRG3, NRG4), Neurophylline (NRP-1, NRP-2 ), Ovestatin, platelet-derived growth factor (PDGF (PDFF-A, PDGF-B, PDGF-C, PDGF-D), TGF beta receptors (endoglin, TGF-beta 1 receptor, TGF-beta 2 receptor, TGF- Beta 3 receptor), thrombopoietin (THPO) (megakaryotic growth and development factor (MGDF)), tumor growth factor (TGF (TGF-a, TGF-beta (TGFbeta1, TGFbeta2, and TGFbeta3)) ), VEGF (VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, VEGF-E, VEGF-F, and PIGF), neciridide, Lysine, corticosteroids (ACTH), atrial natriuretic peptide (ANP), cholecystokinin, gastrin, leptin, oxytocin, somatostatin, vasopressin (antidiuretic hormone), calcitonin, exenatide, growth hormone (GH), somatotrot Pin, insulin, insulin-like growth factor 1 (IGF-1), mechasermin linpabate, IGF-1 analogues, mechasamine, IGF-1 analogues, pegbisomants, pramlintide, teriparatide (human parathyroid hormone residues) 1-34), becaplamine, dibotermin-alpha (bone-forming protein 2), histerin acetate (gonadotropin releasing hormone; GnRH), octreotide and palipermin (keratin cell growth factor; KGF).
혈액 질환, 순환계 질환, 호흡계 질환, 암 또는 종양 질환, 감염성 질환 또는 면역 결핍증의 치료에 사용되는 펩타이드 또는 단백질은, 알테플라제(조직 플라스미노겐 활성 인자; tPA), 아니스트레플라제, 항트롬빈 III(AT-III), 비발리루딘, 다르베포에틴-알파, 드로트레코긴-알파(활성화된 단백질 C), 에리스로포이에틴, 에포에틴-알파, 에리스로포에틴, 에르스로포이에틴, 인자 IX, 인자 VIIa, 인자 VIII, 레피루딘, 단백질 C 농축물, 레테플라제(tPA의 결실 돌연 변이 단백질), 스트렙토키나제, 테넥테플라제, 유로키나제, 안지오스타틴, 항CD22 면역독소, 데니루킨 디프티톡스, 이뮤노시아닌, MPS(메탈로판스티뮬린), 아플리버셉트, 엔도스타틴, 콜라게나제, 사람 데옥시리보뉴클레아제 I, 도르나제, 히알루로니다제, 파페인, L-아스파라기나제, Peg-아스파라기나제, 라스부리카제, 사람 융모성 생식선 자극 호르몬(HCG), 사람 여포 자극 호르몬(FSH), 루트로핀-알파, 프로락틴, 알파-1-프로티나제 억제 인자, 락타제, 췌장 효소(리파제, 아밀라제, 프로테아제), 아데노신 디아미나제(소 페가데마제, PEG-ADA), 아바타셉트, 알레파셉트, 아나킨라, 에타너셉트, 인터루킨-1(IL-1) 수용체 길항제, 아나킨라, 티뮬린, TNF-알파 길항제, 엔푸비르타이드 및 티모신 α1를 포함할 수 있다. Peptides or proteins used in the treatment of blood diseases, circulatory disorders, respiratory disorders, cancer or tumor diseases, infectious diseases or immunodeficiency include alteplases (tissue plasminogen activating factor; tPA), anestreplases, antithrombin III (AT-III), vivalidin, darbepoetin-alpha, drotrecogin-alpha (activated protein C), erythropoietin, epoetin-alpha, erythropoietin, erthropoietin, factor IX, factor VIIa , Factor VIII, lepirudine, protein C concentrate, reteplase (deleted mutant protein of tPA), streptokinase, tennectease, urokinase, angiostatin, anti-CD22 immunotoxin, denirukine diphthytox, immunonocyanin , MPS (metallopanstimullin), aflibercept, endostatin, collagenase, human deoxyribonuclease I, dornase, hyaluronidase, papain, L-asparaginase, Peg-asparagi Naze, Lars Buricase, Human Chorionic Gonadotropin (HCG), Human Follicle Stimulating Hormone (FSH), Lutropin-alpha, Prolactin, Alpha-1-Protease Inhibitor, Lactase, Pancreatic Enzymes (Lipase, Amylase, Protease ), Adenosine deaminase (bovine pegasadese, PEG-ADA), Avatarcept, alefacept, anakinra, etanercept, interleukin-1 (IL-1) receptor antagonist, anakinra, timulline, TNF-alpha antagonist , Enfuvirtide and thymosin α1.
그 외에도, 사람 보조제 단백질, 특히 패턴 인지 수용체인 TLR1, TLR2, TLR3, TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10, TLR11; NOD1, NOD2, NOD3, NOD4, NOD5, NALP1, NALP2, NALP3, NALP4, NALP5, NALP6, NALP6, NALP7, NALP7, NALP8, NALP9, NALP10, NALP11, NALP12, NALP13, NALP14, IIPAF, NAIP, CIITA, RIG-I, MDA5 및 LGP2, 예를 들어 Trif 및 Cardif를 포함하는 어댑터 단백질을 포함하는 TLR 신호 전달의 신호 전달 물질; 소형-GTPase 신호 전달의 구성 성분(RhoA, Ras, Rac1, Cdc42, Rab 등), PIP 신호 전달의 구성 성분(PI3K, Src-키나제 등), MyD88-의존적 신호 전달의 구성 성분(MyD88, IRAK1, IRAK2, IRAK4, TIRAP, TRAF6 등), MyD88-독립적 신호 전달의 구성 성분(TICAM1, TICAM2, TRAF6, TBK1, IRF3, TAK1, IRAK1 등); 예를 들어 Akt, MEKK1, MKK1, MKK3, MKK4, MKK6, MKK7, ERK1, ERK2, GSK3, PKC 키나제, PKD 키나제, GSK3 키나제, JNK, p38MAPK, TAK1, IKK 및 TAK1를 포함하는 활성화된 키나제; 예를 들어 NF-κB, c-Fos, c-Jun, c-Myc, CREB, AP-1, Elk-1, ATF2, IRF-3, IRF-7, HSP10, HSP60, HSP65, HSP70, HSP75 및 HSP90와 같은 열 충격 단백질, gp96, 피브리노겐, 피브로넥틴의 Typ Ⅲ 반복 여분 도메인 A를 포함하는 활성화된 전사 인자; 또는 C1q, MBL, C1r, C1s, C2b, Bb, D, MASP-1, MASP-2, C4b, C3b, C5a, C3a, C4a, C5b, C6, C7, C8, C9, CR1, CR2, CR3, CR4, C1qR, C1INH, C4bp, MCP, DAF, H, I, P 및 CD59를 포함하는 보체계의 구성 성분, 또는 예를 들어 베타-데펜신, 세포 표면 단백질을 포함하는 유도성 표적 유전자; 또는 trif, flt-3 리간드, Gp96 또는 피브로넥틴, IL-1 알파, IL-1 베타, IL-2, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-12, IL-13, IL-15, IL-16, IL-17, IL-18, IL-21, IL-23, TNF알파, IFN알파, IFN베타, IFN감마, GM-CSF, G-CSF, M-CSF를 포함하는, 선청성 면역 반응을 유도하거나 증강시키는 시토킨을 포함하는 사람 보조제 단백질; IL-8, IP-10, MCP-1, MIP-1알파, RANTES, 에오탁신, CCL21을 포함하는 케모카인; IL-1, IL-6, IL-8, IL-12 및 TNF-알파를 포함하는, 대식 세포로부터 방출되는 시토킨; 그리고 IL-1R1 및 IL-1알파; 박테리아 (보조제) 단백질, 특히 Hsp60, Hsp70, Hsp90, Hsp100을 포함하는 박테리아 열 충격 단백질 또는 샤페론; 그람-음성 박테리아 유래 OmpA(외막 단백질); OmpF를 포함하는 박테리아 포린; 보르데텔라 페르투시스 유래 백일해 독소(PT), 보르데텔라 페르투시스 유래 백일해균 아데닐레이트 사이클라제 독소 CyaA 및 CyaC, 백일해 독소 유래 PT-9K/129G 돌연 변이체, 보르데텔라 페르투시스 유래 백일해균 아데닐레이트 사이클라제 독소 CyaA 및 CyaC, 파상풍 독소, 콜레라 독소(CT), 콜레라 독소 B 서브유닛, 콜레라 독소 유래 CTK63 돌연 변이체, CT 유래 CTE112K 돌연 변이체, 에스케리치아 콜라이 열 불안정 장내 독소(LT), 열 불안정 장내 독소 유래 B 서브유닛(LTB), LTK63와 LTR72을 포함하는, 독성이 감소된 에스케리치아 콜라이 열 불안정 장내 독소 돌연 변이체를 포함하는, 박테리아 독소; 페놀 가용성 모듈린; 헬리코박터 파일로리 유래 호중구 활성화 단백질(HP-NAP); 계면활성 단백질 D; 보렐리아 버그도르페리 유래 외표면 단백질 A 지단백, 마이코박테리움 투버큘로시스 유래 Ag38(38kDa 항원); 박테리아 섬모 유래 단백질; 비브리오 콜레라에 장내 독소 CT, 그람 음성 박테리아 선모 유래 필린, 그리고 계면활성 단백질 A 및 박테리아 플라젤린, 원생 동물 (보조제) 단백질, 특히 트리파노소마 크루지 유래 Tc52, 트리파노소마 곤디 유래 PFTG, 원생 동물 열충격 단백질, 레이슈마니아 종 유래 LeIF, 톡소플라즈마 곤디 유래 프로필링 유사 단백질, 바이러스 (보조제) 단백질, 특히 호흡기 세포 융합 바이러스 융합 당단백질(F-단백질), MMT 바이러스 유래 외피 단백질, 마우스 백혈병 바이러스 단백질, 야생형 홍역 바이러스의 헤마글루티닌 단백질, 진균 (보조제) 단백질, 특히 진균 면역 조절 단백질(FIP; LZ-8); 및 키홀 림펫 헤모시아닌(KLH), OspA를 포함하는, 보조제 또는 면역 자극 단백질로부터 선택되는 치료 단백질; 호르몬 대체 요법에 사용되는 치료 단백질, 특히 에스트로겐, 프로게스테론 또는 프로게스틴, 그리고 테스토스테론; 체세포를 만능 줄기 세포 또는 전능 줄기 세포로 역분화하는데 사용되는 치료 단백질, 특히 Oct-3/4, Sox 유전자 군(Sox1, Sox2, Sox3 및 Sox15), Klf 군(Klf1, Klf2, Klf4 및 Klf5), Myc 군(c-myc, L-myc 및 N-myc), Nanog 및 LIN28; 그리고 암 또는 종양 질환의 치료에 사용되는 항체들로부터 선택되는 치료 항체, 특히 131I-토시투모맵, 3F8, 8H9, 아바고보맵, 아데카투무맵, 아푸투주맵, 알라시주맵 피골, 알렘투주맵, 아마툭시맵, AME-133v, AMG 102, 아나투모맵 마페나톡스, 아폴리주맵, 바비툭시맵, 벡투모맵, 벨리무맵, 베바시주맵, 비바투주맵 메르탄신, 블리나투모맵, 브렌툭시맵 베도틴, 칸투주맵, 칸투주맵 메르탄신, 칸투주맵 라브탄신, 카프로맵 펜데타이드, 칼루맵, 카투막소맵, 세툭시맵, 시타투주맵 보가톡스, 식수투무맵, 클리바투주맵 테트락세탄, CNTO 328, CNTO 95, 코나투무맵, 다세투주맵, 달로투주맵, 데노수맵, 데투모맵, 드로지투맵, 에크로멕시맵, 에드레콜로맵, 엘로투주맵, 엘실리모맵, 에나바투주맵, 엔시툭시맵, 에프라투주맵, 에르투막소맵, 에르투막소맵, 에타라시주맵, 팔레투주맵, FBTA05, 피클라투주맵, 피기투무맵, 플란보투맵, 갈릭시맵, 갈릭시맵, 가니투맵, GC1008, 겜투주맵, 겜투주맵 오조가미신, 기렌툭시맵, 글렘바투무맵 베도틴, GS6624, HuC242-DM4, HuHMFG1, HuN901-DM1, 이브리투모맵, 이크루쿠맵, ID09C3, 인다툭시맵 라브탄신, 이노투주맵 오조가미신, 인테투무맵, 이필리무맵, 이라투무맵, 라베투주맵, 렉사투무맵, 린투주맵, 로보투주맵 메르탄신, 루카투무맵, 루밀릭시맵, 마파투무맵, 마투주맵, MDX-060, MEDI 522, 미투모맵, 모가물리주맵, MORab-003, MORab-009, 목세투모맵 파수도톡스, MT103, 나콜로맵 타페나톡스, 납투모맵 에스타페나톡스, 나르나투맵, 네시투무맵, 니모투주맵, 니모투주맵, 올라라투맵, 오나르투주맵, 오포르투주맵 모나톡스, 오레고보맵, 오레고보맵, PAM4, 파니투무맵, 파트리투맵, 펨투모맵, 페르투주맵, 프리투무맵, 라코투모맵, 라드레투맵, 라무시루맵, 릴로투무맵, 리툭시맵, 로바투무맵, 사말리주맵, SGN-30, SGN-40, 시브로투주맵, 실툭시맵, 타발루맵, 타카투주맵 테트락세탄, 타플리투모맵 팝톡스, 테나투모맵, 테프로투무맵, TGN1412, 티실리무맵(= 트레멜리무맵), 티가투주맵, TNX-650, 토시투모맵, 트라스투주맵, TRBS07, 트레멜리무맵, TRU-016, TRU-016, 투코투주맵 셀모루킨, 유블리툭시맵, 유렐루맵, 벨투주맵, 벨투주맵(IMMU-106), 볼로식시맵, 보투무맵, WX-G250, 잘루투무맵 및 자놀리무맵; 면역 질환의 치료에 사용되는 항체, 특히 에팔리주맵, 에프라투주맵, 에트롤리주맵, 폰톨리주맵, 익세키주맵, 메폴리주맵, 밀라투주맵, 풀링된 면역 글로불린, 프릴릭시맵, 리툭시맵, 론탈리주맵, 루플리주맵, 사릴루맵, 베돌리주맵, 비실리주맵, 레슬리주맵, 아달리무맵, 아셀리주맵, 아티누맵, 아틀리주맵, 버틸리무맵, 베실레소맵, BMS-945429, 브리아키누맵, 브로달루맵, 카나키누맵, 카나키누맵, 서톨리주맵 피골, 얼리주맵, 페자키누맵, 골리무맵, 고밀릭시맵, 인플릭시맵, 마브릴리무맵, 나탈리주맵, 오크렐리주맵, 오듈리모맵, 오파투무맵, 오조랄리주맵, 펙셀리주맵, 로벨리주맵, SBI-087, SBI-087, 세큐키누맵, 시루쿠맵, 탈리주맵, 토실리주맵, 토랄리주맵, TRU-015, TRU-016, 유스테키누맵, 유스테키누맵, 베팔리모맵, 졸리모맵 아리톡스, 시팔리무맵, 루밀릭시맵 등의 면역 글루불린; 감염성 질환의 치료에 사용되는 항체, 특히 아펠리모맵, CR6261, 에도바코맵, 에펀구맵, 엑스비비루맵, 펠비주맵, 포라비루맵, 이발리주맵, 리비비루맵, 모타비주맵, 네바쿠맵, 투비루맵, 얼톡사주맵, 바비툭시맵, 파기박시맵, 팔리비주맵, 파노바쿠맵, PRO 140, 라피비루맵, 락시바쿠맵, 레가비루맵, 세비루맵, 수비주맵 및 테피바주맵; 혈액 질환의 치료에 사용되는 항체, 특히 앱식시맵, 아토롤리무맵, 에쿨리주맵, 메폴리주맵 및 밀라투주맵; 면역 조절에 사용되는 항체, 특히 항흉선세포 글로불린, 바실릭시맵, 세델리주맵, 다클리주맵, 가빌리모맵, 이놀리모맵, 뮤로모냅-CD3, 뮤로모냅-CD3, 오듈리모맵 및 시플리주맵; 당뇨병의 치료에 사용되는 항체, 특히 게보키주맵, 오텔릭시주맵 및 테플리주맵; 알츠하이머병의 치료에 사용되는 항체, 특히 바피뉴주맵, 크레네주맵, 간테네루맵, 포네주맵, R1450 및 솔라네주맵; 천식의 치료에 사용되는 항체, 특히 벤랄리주맵, 에노키주맵, 켈릭시맵, 레브리키주맵, 오말리주맵, 옥셀루맵, 파스콜리주맵 및 트랄로키누맵; 그리고 다양한 질환의 치료에 사용되는 항체, 특히 블로소주맵, 카로Rx, 프레솔리무맵, 풀라누맵, 로모소주맵, 스타물루맵, 타네주맵 및 라니비주맵으로부터 선택되는 치료 단백질, 이의 단편, 변이체 또는 유도체를 포함할 수 있다.In addition, human adjuvant proteins, in particular TLR1, TLR2, TLR3, TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10, TLR11, which are pattern recognition receptors; NOD1, NOD2, NOD3, NOD4, NOD5, NALP1, NALP2, NALP3, NALP4, NALP5, NALP6, NALP6, NALP7, NALP7, NALP8, NALP9, NALP10, NALP11, NALP12, NALP13, NALP14, IIPAF, NAIP, CIITA, RIG- Signal transduction agents for TLR signal transduction, including adapter proteins including I, MDA5 and LGP2, such as Trif and Cardif; Components of small-GTPase signaling (RhoA, Ras, Rac1, Cdc42, Rab, etc.), components of PIP signaling (PI3K, Src-kinase, etc.), components of MyD88-dependent signaling (MyD88, IRAK1, IRAK2) , IRAK4, TIRAP, TRAF6, etc.), components of MyD88-independent signaling (TICAM1, TICAM2, TRAF6, TBK1, IRF3, TAK1, IRAK1, etc.); Activated kinases including, for example, Akt, MEKK1, MKK1, MKK3, MKK4, MKK6, MKK7, ERK1, ERK2, GSK3, PKC kinase, PKD kinase, GSK3 kinase, JNK, p38MAPK, TAK1, IKK and TAK1; For example NF-κB, c-Fos, c-Jun, c-Myc, CREB, AP-1, Elk-1, ATF2, IRF-3, IRF-7, HSP10, HSP60, HSP65, HSP70, HSP75 and HSP90 Activated transcription factors comprising a Typ III repeat extra domain A of a heat shock protein such as, gp96, fibrinogen, fibronectin; Or C1q, MBL, C1r, C1s, C2b, Bb, D, MASP-1, MASP-2, C4b, C3b, C5a, C3a, C4a, C5b, C6, C7, C8, C9, CR1, CR2, CR3, CR4 Inducible target genes comprising components of the complement system, including C1qR, C1INH, C4bp, MCP, DAF, H, I, P and CD59, or for example beta-defensin, cell surface proteins; Or trif, flt-3 ligand, Gp96 or fibronectin, IL-1 alpha, IL-1 beta, IL-2, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-12, IL-13, Including IL-15, IL-16, IL-17, IL-18, IL-21, IL-23, TNFalpha, IFNalpha, IFNbeta, IFNgamma, GM-CSF, G-CSF, M-CSF Human adjuvant proteins, including cytokines, which induce or enhance an auditory immune response; Chemokines including IL-8, IP-10, MCP-1, MIP-1alpha, RANTES, eotaxin, CCL21; Cytokines released from macrophages, including IL-1, IL-6, IL-8, IL-12 and TNF-alpha; And IL-1R1 and IL-1alpha; Bacterial heat shock proteins or chaperones, including bacterial (adjuvant) proteins, in particular Hsp60, Hsp70, Hsp90, Hsp100; Gram-negative bacteria-derived OmpA (external membrane protein); Bacterial porins, including OmpF; Bordetella pertussis-derived pertussis toxin (PT), Bordetella pertussis-derived pertussis adenylate cyclase toxin CyaA and CyaC, pertussis toxin-derived PT-9K / 129G mutant, Bordetella pertussis Derived pertussis adenylate cyclase toxin CyaA and CyaC, tetanus toxin, cholera toxin (CT), cholera toxin B subunit, cholera toxin-derived CTK63 mutant, CT-derived CTE112K mutant, Escherichia coli heat labile toxin (LT), bacterial toxins, including reduced toxicity Escherichia coli heat labile toxin toxin mutants, including heat labile enterotoxin derived B subunit (LTB), LTK63 and LTR72; Phenol soluble modulins; Helicobacter pylori derived neutrophil activating protein (HP-NAP); Surfactant protein D; Outer surface protein A lipoprotein derived from Borrelia bergdorferi, Ag38 (38kDa antigen) derived from Mycobacterium tuberculosis; Bacterial cilia derived proteins; Intestinal toxin CT, Gram-negative Bacterial Piline, and Surfactant Protein A and Bacterial Flagellin, Protozoan (Adjuvant) Proteins in Vibrio Cholerae LeIF from Mania species, profiling-like protein derived from Toxoplasma gondi, virus (adjuvant) protein, in particular respiratory cell fusion virus fusion glycoprotein (F-protein), MMT virus-derived envelope protein, mouse leukemia virus protein, wild type measles virus Magglutinin protein, fungal (adjuvant) protein, in particular fungal immune regulatory protein (FIP; LZ-8); And a therapeutic protein selected from adjuvants or immune stimulating proteins, including keyhole limpet hemocyanin (KLH), OspA; Therapeutic proteins used in hormone replacement therapy, in particular estrogen, progesterone or progestin, and testosterone; Therapeutic proteins used to dedifferentiate somatic cells into pluripotent stem cells or pluripotent stem cells, in particular Oct-3 / 4, the Sox family of genes (Sox1, Sox2, Sox3 and Sox15), the Klf group (Klf1, Klf2, Klf4 and Klf5), Myc family (c-myc, L-myc and N-myc), Nanog and LIN28; And therapeutic antibodies selected from antibodies used for the treatment of cancer or tumor diseases, in particular 131I-tocitumomab, 3F8, 8H9, abagobomap, adecatumumab, aputuzumab, alacizumab pigol, alemtuzumab, flax Tuximab, AME-133v, AMG 102, Anatomomap Mapenatox, Apolizumab, Bobituximab, Vectumomap, Belimumab, Bevacizumab, Vivatuzumab Mertansine, Brinatomomap, Bren Tuximab bedotin, cantuzu map, cantuzu map mertansine, cantuzu map rabtansin, capromap pendetide, kalumap, katumaksomap, cetuximab, sitatuzumab bogatox, drinking water tumamap, kibatuzumap tet Laxetane, CNTO 328, CNTO 95, Konatomu Map, Dasetuzuma Map, Dalo Tzu Map, Deno Su Map, De Tomo Map, Drozito Map, Ecromexi Map, Edre Colo Map, Elotuz Map, El Silimo Map , Enabatuzu Map, Encituximab, Epratuzu Map, Ertumaksomap, Ertumakso Map, Etarasiju Map, Arm Project map, FBTA05, Piclatuz map, Piggy to mu map, Flanvo tu map, Garlic map, Garlic sea map, Gany tu map, GC1008, Gem tuju map, Gem tuju map ozogamicin, Giren tuxima map, Glembatum mu map bedotin , GS6624, HuC242-DM4, HuHMFG1, HuN901-DM1, Ibritumomab, Icrucumab, ID09C3, Indatuximab Rabtansin, Inotuzumab Ozogamicin, Intetumumab, Ipilimumab, Iratumumab, Labetuzu Map, Lexatu Map, Lintuju Map, Robotuju Map Mertansin, Lucatu Map, Rumilixi Map, Mapatumu Map, Matuju Map, MDX-060, MEDI 522, Mitumo Map, Moga Physical Map, MORab-003 , MORab-009, Moxetomomap Fasudotox, MT103, Nacolomap Tapenatox, Naptumomap Estapenatox, Narnatumap, Nesitumumab, Nimotuzumab, Nimotuzumamap, Olatuumap, Onartu Main Map, Opportuz Map Monatox, Oregovo Map, Oregovo Map, PAM4, Panitum Map, Partitum Map, Femtumo Map, Pertuzuma Map, Freetomu Map, Laco-Tumo Map, Ladre Tuma Map, Lamusi Map, Lilo-Tumuma Map, Rituxima Map, Lova-Tumuma Map, Samalizu Map, SGN-30, SGN-40, Cibro-Tzu Map, Siltu Map, Tavalu Map, Taka Tuzumate Map Tetraxetane, Tapli Tumomap Poptox, Tenatumo Map, Teprotumum Map, TGN1412, Tishlimium Map (= Tremelimu Map), Tigatum Map, TNX-650, Tossi Tomo Map, Trastuz Map , TRBS07, Tremelimumab, TRU-016, TRU-016, Tucotuzumab Selmorukin, Eublituximab, Urelumab, Beltuzumab, Beltuzumab (IMMU-106), Bolosik Map, Botumumab, WX-G250, zalutumumab and zanolimumap; Antibodies used in the treatment of immune diseases, in particular epalizumab, epratuzumab, etrolizumab, pontolizumab, ixezizumab, mepolizumab, milatuzumab, pooled immunoglobulins, priximab, rituxima Map, rontali map, luplice map, salilu map, bedoliz map, visil map, lesley map, adali mu map, asselizu map, atinuma map, ateli map, butil mu map, besiliso map, BMS- 945429, Briakinumap, Brodalumap, Canakinumap, Canakinumap, Sutolizu Map Phigol, Alliju Map, Pezakinu Map, Golimu Map, Gomilicimab Map, Infliximab Map, Mabrilimu Map, Natalie Map, Okrelic Map , Odulimo Map, Opatumu Map, Ozo Liju Map, Pexel Ju Map, Lovel Iju Map, SBI-087, SBI-087, Sekyukinu Map, Shiruku Map, Taliju Map, Tosilli Ju Map, Tali Ju Map, TRU-015 , TRU-016, Eustekinumab, Eustekinumab, Bepalimob, Zolimomap Aritox, Cipalimumap, Rumilicsi Called immune glue and the like; Antibodies used in the treatment of infectious diseases, in particular Afelimomap, CR6261, Edobarcomap, Epungumap, Exbibimap, Pelbizumab, Porabirumap, Ivalizumab, Libibimap, Motabizumab, Nevakumap , Tobiru Map, Ultoksaju Map, Bobituxi Map, Pagi Box Map, Palivivi Map, Panovaku Map, PRO 140, Lapivir Map, Laksibak Map, Legaviru Map, Sebiru Map, Defizu Map and Tapeiva Main map; Antibodies used in the treatment of blood diseases, in particular absicimab, atorolimumab, eculizumab, mepolizumab and milatuzumab; Antibodies used in immunomodulation, in particular anti-thymocyte globulin, basiliximab, cedelizumab, daclijumab, gabilimomap, inolimomap, muromonab-CD3, muromonab-CD3, odulimomap and Siplizu map; Antibodies used in the treatment of diabetes, in particular gebokizumab, otelixizumab and teplizumab; Antibodies used in the treatment of Alzheimer's disease, in particular bapinizumab, crenezumab, gantenerumab, ponezumab, R1450 and solanezumab; Antibodies used in the treatment of asthma, in particular benralizumab, enokizoomap, kelicimap, lebrikizumab, omalizumab, oxelumab, paskolizumab and tralokinumab; And therapeutic proteins, fragments, variants or the like selected from antibodies used in the treatment of various diseases, in particular blozojumab, caroRx, presolumabuma, fulanumab, lomosojumab, stamulumab, tanezumab and ranibizumab. Derivatives may be included.
코딩 영역(CR)을 구성하는 열린해독틀의 길이는 제한이 없으며, 열린해독틀(ORF)의 길이에 따른 발현 효율은 본 발명에 따른 핵산 분자, 이를 이용한 재조합 발현 벡터 및 치료 또는 예방을 위한 핵산 백신 등의 개발에서 큰 고려 대상이 아니다. Codon usage는 보통 다양한 종에서 단백질/펩타이드 발현에 영향을 미칠 수 있으나, 인간의 codon usage bias는 보통 단백질/펩타이드 발현에 큰 영향을 미치지 않는다고 알려져 있으므로, 인간을 대상으로 하는 핵산 백신이나 유전자 치료제를 개발할 때 고려 대상이 아니다. 다만, 시작 코돈은 Kozak 서열을 가지고 있어야 하며, 종결 코돈 근처의 염기서열도 최적화할 필요가 있다. 필요한 경우, 발현하고자 하는 관심유전자(GOI) 또는 이의 전사체인 mRNA의 코돈 서열 중 세 번째 부분을 GC로 바꾸어 아미노산의 변화 없이 타켓 유전자의 GC%를 증가시켜 mRNA의 안정성을 높일수도 있다. The length of the open reading frame constituting the coding region (CR) is not limited, and the expression efficiency according to the length of the open reading frame (ORF) is determined by the nucleic acid molecule according to the present invention, a recombinant expression vector using the same, and a nucleic acid for treatment or prevention. This is not a big consideration in the development of vaccines. Codon usage can usually affect protein / peptide expression in various species, but human codon usage bias is not known to affect protein / peptide expression normally. Therefore, nucleic acid vaccines or gene therapies for humans can be developed. When not considered. However, the start codon must have a Kozak sequence and also need to optimize the sequences near the end codon. If necessary, the third portion of the codon sequence of the gene of interest (GOI) or transcript thereof to be expressed may be changed to GC to increase the stability of the mRNA by increasing the GC% of the target gene without changing the amino acid.
한편, 발현 조절 서열(ECS)로서 IRES 염기 서열을 포함하는 5'-UTR을 가지는 경우, 본 발명의 핵산 분자는 관심유전자(GOI)의 발현 효율을 향상시키기 위하여 3'-UTR을 더욱 포함할 수 있다. 이때, 코딩 영역(CR)은 5'-UTR과 3'-UTR 사이에 위치할 수 있다. 3'-UTR은 5'-UTR과 함께 관심유전자(GOI) 또는 이의 전사체의 번역 효율을 향상시키고, 전사체인 mRNA가 세포 내에서 파괴되지 않고 안정적으로 유지되는데 중요한 역할을 한다. On the other hand, when the 5'-UTR including the IRES base sequence as an expression control sequence (ECS), the nucleic acid molecule of the present invention may further include a 3'-UTR in order to improve the expression efficiency of the gene of interest (GOI). have. In this case, the coding region CR may be located between 5′-UTR and 3′-UTR. The 3'-UTR, together with the 5'-UTR, improves the translational efficiency of the gene of interest (GOI) or its transcript, and plays an important role in maintaining the transcript mRNA stable without being disrupted in the cell.
하나의 예시적인 실시형태에서, 3'-UTR로서 전술한 IRES 염기 서열을 가지는 바이러스성 및/또는 진핵세포성 유래의 5'-UTR과 동일한 바이러스 및/또는 진핵세포 유래의 3'-UTR을 사용할 수 있다. 이때, 3'-UTR은 전술한 IRES를 가지는 5'-UTR과 동일하거나 상이한 소스로부터 유래한 것일 수 있다. In one exemplary embodiment, the 3'-UTR derived from the same virus and / or eukaryotic cell as the 5'-UTR derived from the viral and / or eukaryotic cell having the aforementioned IRES base sequence as the 3'-UTR is used. Can be. In this case, the 3'-UTR may be derived from the same or different source than the 5'-UTR having the above-described IRES.
하나의 예시적인 실시형태에서, 바이러스성 3'-UTR은 바이러스성 IRES 염기 서열은 피코나바이러스과(Picornaviridae), 토가바이러스과(Togaviridae), 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae), 플라비바이러스과(Flaviridae), 레트로바이러스과(Retroviridae) 및/또는 헤르페스바이러스과(Herpesviridae)의 바이러스에서 유래한 것일 수 있다. In one exemplary embodiment, the viral 3′-UTR has a viral IRES base sequence of Picornaviridae, Togaviridae, Dicistroviridae, Flaviridae, retro It may be derived from a virus of the family Virtoviridae and / or Herpesviridae.
피코나바이러스과에 속하는 바이러스성 3'-UTR은 1) 엔테로바이러스속에서 유래한 PV, RV), 콕사키바이러스(Cossachievirus), 예를 들면, CVB3, EV71, 2) 카디오바이러스속(Cardiovirus)에 EMCV, TMEV, 3) 아프토바이러스속에 속하는 FMDV, 4) 헤파토바이러스속에 속하는 HAV), 및/또는 5) 테스코바이러스속에 속하는 PTV, 예를 들어 PTV-1 및 이들의 조합을 들 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. Viral 3'-UTR belonging to the family of piconaviruses is 1) PV, RV) derived from the enterovirus genus, Cossachievirus, for example, CVB3, EV71, 2) EMCV to Cardiovirus. , TMEV, 3) FMDV belonging to the genus Aptovirus, 4) HAV belonging to the genus Hepatovirus, and / or 5) PTVs belonging to the genus Tescovirus, for example PTV-1 and combinations thereof. This is not limited to this.
또한, 토가바이러스과에 속하는 바이러스성 3'-UTR은 SV에서 유래할 수 있고, 디스스트로바이러스과에 속하는 바이러스성 3-UTR은 크리파바이러스속(Cripavirus)에 속하는 PSIV, CPV, 트리아토마바이러스(Triatoma virus), 및/또는 RXPD에서 유래할 수 있다. 선택적인 실시형태에서, 플라비바이러스과에 속하는 바이러스성 3'-UTR은 헤파시바이러스속(Hepacivirus)에 속하는 HCV, 플라비바이러스속(Flavivirus)에 속하는 JEV, 페스티바이러스속(Pestivirus)에 속하는 CSFV 및/또는 BVDV에서 유래할 수 있다. 다른 예시적인 실시형태에서, 레트로바이러스과에 속하는 바이러스성 3'-UTR은 감마레트로바이러스속(Gammaretrovirus)에 속하는 FMLV, MMLV, 및/또는 알파레트로바이러스속(Alpharetrovirus)에 속하는 RSV에서 유래할 수 있다. 또한, 헤르페스바이러스과에 속하는 바이러스성 3-UTR은 마디바이러스속(Mardivirus)에 속하는 MDV에서 유래할 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. In addition, the viral 3′-UTR belonging to the Togavirus family can be derived from SV, and the viral 3-UTR belonging to the Distroviraceae family PSIV, CPV, Triatoma virus (Triatoma) belonging to the genus Cripavirus. virus), and / or RXPD. In an alternative embodiment, the viral 3′-UTR belonging to the Flavivirus family is HCV belonging to the Hepacivirus, JEV belonging to the Flavivirus, CSFV belonging to the Pestivirus and And / or from BVDV. In another exemplary embodiment, the viral 3′-UTR belonging to the Retroviraceae family may be from an RSV belonging to the FMLV, MMLV, and / or Alpharetrovirus belonging to the Gammmaretrovirus. In addition, viral 3-UTR belonging to the herpesvirus family may be derived from MDV belonging to the genus Madardivirus, but the present invention is not limited thereto.
하나의 예시적인 실시형태에서, 3'-UTR은 SV에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 10), CVB3에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 11), EMCV에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 12), JEV에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 13) 및/또는 CPV에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 14)로 이루어질 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. In one exemplary embodiment, the 3'-UTR is 3'-UTR (SEQ ID NO: 10) derived from SV, 3'-UTR (SEQ ID NO: 11) derived from CVB3, 3 derived from EMCV '-UTR (SEQ ID NO: 12), 3'-UTR (SEQ ID NO: 13) derived from JEV and / or 3'-UTR (SEQ ID NO: 14) derived from CPV, but The invention is not limited to this.
다른 예시적인 실시형태에서, 3'-UTR은 성장인자(growth factors), 전사인자(transcription factors), 번역인자(translation factors), 암유전자(oncogenes), 운반체/수용체(transporter/receptor), 세포계획사 활성제(Activators of apoptosis), 세포계획사 억제제(Inhibitors of apoptosis), 신경세포의 수상돌기에 국재화된 단백질/펩타이드류(Proteins localized in neuronal dendrites) 및/또는 다른 펩타이드/단백질에서 유래할 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. In another exemplary embodiment, the 3′-UTR is a growth factor, transcription factors, translation factors, oncogenes, transporter / receptor, cell plan. May be derived from activators of apoptosis, inhibitors of apoptosis, proteins localized in neuronal dendrites and / or other peptides / proteins However, the present invention is not limited to this.
하나의 예시적인 실시형태에서 3'-UTR은 eIF4G, FMR1, CN43 alc 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 진핵세포 유래의 3'-UTR일 수 있다. 일례로, 3'-UTR은 eIF4G에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 15), FMR1에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 16) 및/또는 CN43에서 유래한 3'-UTR(서열식별번호: 17)로 이루어질 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. In one exemplary embodiment the 3′-UTR may be a 3′-UTR from a eukaryotic cell selected from the group consisting of eIF4G, FMR1, CN43 alc combinations thereof. In one example, the 3'-UTR is a 3'-UTR derived from eIF4G (SEQ ID NO: 15), a 3'-UTR derived from FMR1 (SEQ ID NO: 16) and / or a 3'-UTR derived from CN43. (SEQ ID NO: 17), but the present invention is not limited thereto.
한편, 핵산 분자는 발현 조절 서열에 인접하여 폴리뉴클레오티드의 전사를 촉진하는 전사 조절 서열(Transcritpion control sequence, TCS)을 가질 수 있다. 일례로, 전사 조절 서열(TCS)은 발현 조절 서열(ECS)의 5'쪽에 위치할 수 있다. 이러한 전사 조절 서열(TCS)은 특별히 제한되는 것은 아니며, 설명의 중복을 피하기 위해서 후술하는 재조합 발현 벡터 부분에서 상세히 설명한다. Meanwhile, the nucleic acid molecule may have a transcription control control sequence (TCS) that promotes transcription of the polynucleotide adjacent to the expression control sequence. In one example, the transcriptional control sequence (TCS) may be located on the 5 'side of the expression control sequence (ECS). Such transcriptional regulatory sequences (TCS) are not particularly limited and will be described in detail in the section of recombinant expression vectors described below to avoid duplication of description.
그 외에도 핵산 분자는 전술한 발현 조절 서열(ECS), 코딩 영역(CR), 3'-UTR 및 전사 조절 서열(TCS) 이외에도 코딩 영역(ECS)에 존재하는 관심유전자(GOI)의 발현을 유도할 수 있는 핵산 서열이 삽입될 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, IRES 염기 서열을 가지는 발현 조절 서열(ECS, 예: IRES 염기 서열을 가지는 5'-UTR)과 코딩 영역(CR)의 개시 코돈 사이에 Kozak 서열이 삽입될 수 있다. 필요한 경우에, 발현 조절 서열(ECS)의 3'쪽에 downstream hairpin structur(DLP)가 위치할 수 있다. 일례로, 발현 조절 서열(ECS)로서 SV 유래의 5'-UTR(서열식별번호: 1)을 적용할 때, SV 유래의 DLP 핵산 서열(예: 서열식별번호: 9)이 5'-UTR과 코딩 영역 사이에 삽입될 수 있다. In addition, the nucleic acid molecule may induce the expression of genes of interest (GOI) present in the coding region (ECS) in addition to the expression control sequences (ECS), coding region (CR), 3′-UTR and transcriptional control sequences (TCS) described above. Nucleic acid sequences can be inserted. In one exemplary embodiment, a Kozak sequence may be inserted between an expression control sequence having an IRES base sequence (eg, 5'-UTR having an IRES base sequence) and an initiation codon of a coding region (CR). If necessary, the downstream hairpin structur (DLP) may be located 3 'side of the expression control sequence (ECS). For example, when the 5'-UTR derived from SV (SEQ ID NO: 1) is applied as an expression control sequence (ECS), the DLP nucleic acid sequence derived from SV (e.g., SEQ ID NO: 9) is selected from the 5'-UTR. It can be inserted between coding regions.
다른 선택적인 실시형태에서, 발현 조절 서열(ECS)의 3'쪽에 개시 코돈으로 작용할 수 있는 염기 서열(예: CCTGCT)이 삽입되고/삽입되거나, 발현 조절 서열(ECS)의 3'쪽에 관심유전자(GOI)의 발현 효율을 향상시킬 수 있는 인식 서열(예: ATGGCAGCTCAA) 등이 삽입될 수 있다. In another alternative embodiment, a base sequence (eg, CCTGCT) is inserted into the 3 'side of the expression control sequence (ECS) and / or inserted into the 3' side of the expression control sequence (ECS). A recognition sequence (eg, ATGGCAGCTCAA) and the like, which can improve the expression efficiency of GOI), may be inserted.
아울러, 코딩 영역(CR)의 3'쪽, 만약 3'-UTR이 사용되는 경우라면 3'-UTR의 3'쪽에 전사된 핵산 분자를 안정화시키면서, 코딩 영역(CR)에 존재하는 관심유전자(GOI)의 번역 효율을 더욱 향상시킬 수 있는 폴리아데노신(폴리 (A)) 서열이 더욱 삽입될 수 있다. 일례로, 폴리 (A) 서열은 대략 25개 내지 대략 400개, 바람직하게는 30개 내지 400개, 더욱 바람직하게는 50 내지 250개, 가장 바람직하게는 60 내지 250개의 아데노신 뉴클레오티드로 이루어진 핵산 서열일 수 있다. In addition, the gene of interest (GOI) present in the coding region (CR) is stabilized while stabilizing the nucleic acid molecule transcribed onto the 3 'side of the coding region (CR), if the 3'-UTR is used. ), A polyadenosine (poly (A)) sequence can be further inserted which can further improve the translation efficiency of In one example, the poly (A) sequence is a nucleic acid sequence consisting of approximately 25 to approximately 400, preferably 30 to 400, more preferably 50 to 250, most preferably 60 to 250 adenosine nucleotides Can be.
한편, 도 1에서는 하나의 발현 조절 서열과, 하나의 코딩 영역을 포함하는 핵산 분자를 도시하였다. 다른 실시형태에서, 본 발명의 핵산 분자는 IRES 염기 서열을 가지는 다수의 발현 조절 서열과, 어느 하나의 발현 조절 서열에 의하여 발현될 수 있는 단백질 및/또는 펩타이드를 암호화하는 다수의 코딩 영역을 포함할 수 있다. 도 2는 다수의 발현 조절 서열 및 다수의 코딩 영역을 포함하는 핵산 분자를 개략적으로 나타낸다. Meanwhile, FIG. 1 illustrates a nucleic acid molecule including one expression control sequence and one coding region. In other embodiments, the nucleic acid molecules of the invention will comprise a plurality of expression control sequences having an IRES base sequence and a plurality of coding regions encoding proteins and / or peptides that can be expressed by either expression control sequence. Can be. 2 schematically shows a nucleic acid molecule comprising a plurality of expression control sequences and a plurality of coding regions.
도 2에 도시한 바와 같이, 본 발명의 다른 실시형태에 따른 핵산 분자는 IRES 염기 서열을 가지는 제 1 발현 조절 서열(ECS 1; 예: 5'-UTR 1)과, 제 1 발현 조절 서열(ECS 1)의 3'쪽에 위치하는 제 2 발현 조절 서열(ECS2; 예: 5'-UTR 2)을 포함할 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, 상기 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)은 각각 전술한 바이러스성 IRES 염기 서열 및/또는 진핵세포성 IRES 염기 서열을 가지는 5'-UTR일 수 있다. 이때, 제 1 발현 발현 조절 서열(ECS 1)과 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)은 동일한 소스로부터 유래할 수도 있고, 상이한 소스로부터 유래할 수도 있다. As shown in FIG. 2, a nucleic acid molecule according to another embodiment of the present invention includes a first expression control sequence (
한편, 본 발명의 예시적인 실시형태에 따른 핵산 분자는 다수의 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2) 중 적어도 어느 하나의 발현 조절 서열에 인접하여, 예를 들어, 다수의 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2) 중에서 적어도 어느 하나의 발현 조절 서열의 5'쪽에 다수의 아데노신 또는 티민 서열이 삽입된다. 도 2에서는 전사 조절 서열(TCS)에 근접하게 위치하는 제 1 발현 조절 서열(ECS 1)의 5'쪽에 다수의 아데노신 또는 티민 서열이 삽입된 것을 도시하고 있다. 하지만 관심유전자(GOI 1, GOI 2)의 발현 효율을 향상시킬 수 있는 다수의 아데노신 또는 티민 서열은 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)의 5'쪽에 삽입될 수도 있고, 또는 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)의 5'쪽에 모두 삽입될 수도 있다.Meanwhile, a nucleic acid molecule according to an exemplary embodiment of the present invention is adjacent to, for example, a plurality of expression control sequences (ECS 1) of at least one of the plurality of expression control sequences (
하나의 예시적인 실시형태에서, 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및 제 2 발현 조절 서열(ECS 2) 중에서 적어도 하나는 바이러스에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. 보다 구체적으로, 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및/또는 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)는 피코나바이러스과(Picornaviridae), 토가바이러스과(Togaviridae), 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae), 플라비바이러스과(Flaviridae), 레트로바이러스과(Retroviridae) 및/또는 헤르페스바이러스과(Herpesviridae)의 바이러스에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함할 수 있다. In one exemplary embodiment, at least one of the first expression control sequence (ECS 1) and the second expression control sequence (ECS 2) may comprise an IRES base sequence derived from a virus. More specifically, the first expression control sequence (ECS 1) and / or the second expression control sequence (ECS 2) may be the piconaviridae family, Togaviridae family, the Dicistroviridae family, the Flavivirus family family. (Flaviridae), Retroviridae and / or Herpesviridae virus may include the IRES base sequence from.
다른 선택적인 실시형태에서, 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및/또는 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)는 진핵세포에서 유래한 IRES 염기 서열을 가질 수 있다. 바이러스성 IRES 염기 서열과, 진핵세포성 IRES 염기 서열의 종류 등에 대해서는 도 1을 참조하면서 설명한 것과 중복되므로 상세한 설명은 생략한다. In other alternative embodiments, the first expression control sequence (ECS 1) and / or the second expression control sequence (ECS 2) may have an IRES base sequence derived from a eukaryotic cell. Since the viral IRES base sequence, the type of eukaryotic IRES base sequence, and the like overlap with those described with reference to FIG. 1, detailed descriptions thereof will be omitted.
하나의 예시적인 실시형태에서, 바이러스성 IRES 염기 서열을 가지는 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및/또는 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)은 피코나바이러스과(Picornaviridae) 및/또는 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae)에 속하는 바이러스에서 유래한 것일 수 있다. 일례로, 피코나바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열을 가지는 제 1/제 2 발현 조절 서열(ECS 1/ECS 2) 중에서 적어도 하나는 엔테로바이러스속, 카디오바이러스속 또는 아프토바이러슥속에 속하는 바이러스에서 유래할 수 있으며, 특히 바람직하게는 엔테로바이러스속에 속하는 바이러스에서 유래할 수 있다. 예를 들어, 엔테로바이러스속에 속하는 IRES 염기 서열을 가지는 제 1/제 2 발현 조절 서열(ECS 1/ECS 2) 중에서 적어도 하나는 CVB3와 같은 콕사키바이러스 등의 엔테로바이러스속의 바이러스에서 유래하거나, EMCV와 같은 카디오바이러스속의 바이러스에서 유래할 수 있다. In one exemplary embodiment, the first expression control sequence (ECS 1) and / or the second expression control sequence (ECS 2) having the viral IRES base sequence is selected from the family of Picornaviridae and / or dysciroviruses ( It may be derived from a virus belonging to (Dicistroviridae). In one example, at least one of the first / second expression control sequences (
또한, 디시스트로바이러스과에 속하는 바이러스성 IRES 염기 서열을 가지는 제 1/제 2 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2) 중에서 적어도 하나는 크리파바이러스속에 속하는 PSIV 또는 CPV에서 유래한 것일 수 있다. In addition, at least one of the first / second expression control sequences (
한편, 예시적인 실시형태에서, 코딩 영역은 상기 제 1 발현 조절 서열(ECS 1)과 상기 제 2 발현 조절 서열(ECS 2) 사이에 위치하는 제 1 코딩 영역(CR 1)과, 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)의 3'쪽에 위치하는 제 2 코딩 영역(CR 2)을 포함할 수 있다. 일례로, 제 1 코딩 영역(CR 1)과 제 2 코딩 영역(CR 2)는 각각 제 1 관심유전자(GOI 1)과 제 2 관심유전자(GOI 2)의 열린해독틀로 이루어질 수 있다. 제 1 코딩 영역(GOI 1) 및 제 2 코딩 영역(GOI 2)은 전술한 리포터 단백질/펩타이드, 마커 또는 식별 단백질/펩타이드, 항원 및/또는 질병 치료와 관련된 단백질/펩타이드 등을 각각 암호화하는 관심유전자의 열린해독틀(ORF)로 이루어질 수 있다. On the other hand, in an exemplary embodiment, the coding region is a first coding region (CR 1) located between the first expression control sequence (ECS 1) and the second expression control sequence (ECS 2) and the second expression control It may comprise a second coding region (CR 2) located on the 3 'side of the sequence (ECS 2). For example, the first
하나의 예시적인 실시형태에 따르면, 제 1 코딩 영역(CR 1)은 제 1 발현 조절 서열(ECS 1; 예: 5'-UTR 1)과 작동 가능하게 연결되고, 제 2 코딩 영역(CR 2)은 제 2 발현 조절 서열(ECS 2; 예: 5'-UTR 2)과 작동 가능하게 연결될 수 있다. According to one exemplary embodiment, the first coding region (CR 1) is operably linked with a first expression control sequence (
제 1 코딩 영역(CR 1)을 구성하는 제 1 관심유전자(GOI 1)과, 제 2 코딩 영역(CR 2)을 구성하는 제 2 관심유전자(GOI 2)는 각각 상이한 단백질 또는 펩타이드를 암호화하는 열린해독틀로 이루어질 수 있다. 이 경우, 하나의 핵산 분자에서 상이한 단백질 또는 펩타이드를 발현할 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, 제 1 코딩 영역(CR 1)과 제 2 코딩 영역(CR 2)이 각각 상이한 항원 또는 이의 단편 등을 암호화하는 열린해독틀로 이루어진 경우, 본 발명에 따른 핵산 분자 또는 재조합 발현 벡터를 사용하여 상이한 항원을 발현할 수 있고, 다수의 질병을 예방하는 유전자 백신으로 활용될 수도 있다. The first gene of
다른 예시적인 실시형태에서, 제 1 코딩 영역(CR 1)과 제 2 코딩 영역(CR 2)이 각각 상이한 치료용 단백질 또는 펩타이드를 암호화하는 열린해독틀로 이루어진 경우, 본 발명에 따른 핵산 분자 또는 재조합 발현 벡터를 사용하여 상이한 질병을 치료하는데 활용될 수 있다. In another exemplary embodiment, when the first
도 1에서 설명한 것과 유사하게, 도 2에 도시된 다수의 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2)과 다수의 코딩 영역(CR1, CR 2)을 포함하는 핵산 분자는 관심유전자(GOI 1, GOI 2)의 발현을 향상시킬 수 있는 핵산 서열을 더욱 포함할 수 있다. 일례로, 제 1 발현 조절 서열(ECS 1) 및/또는 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)이 각각 IRES 염기 서열을 가지는 바이러스성 또는 진핵세포성 5'-UTR인 경우, 핵산 서열은 3'-UTR을 더욱 포함할 수 있다. 이때, 3'-UTR은 바람직하게는 제 2 코딩 영역(CR 2)의 3'쪽에 위치할 수 있다. 3'-UTR은 특별히 한정되지는 않지만, 도 1을 참조하면서 설명한 바 있는 바이러스성 및/또는 진핵세포성 3'-UTR을 사용할 수 있다. Similar to that described in FIG. 1, a nucleic acid molecule comprising a plurality of expression control sequences (
예를 들어, 3'-UTR은 제 1 발현 조절 서열(ECS 1)일 수 있는 5'-UTR 1 또는 제 2 발현 조절 서열(ECS 2)일 수 있는 5'-UTR 2에서 유래한 것을 사용할 수 있다. 하나의 예시적인 실시형태에서, 3'-UTR은 5'-UTR 1과 동일한 소스에서 유래한 것을 사용할 수 있지만, 본 발명이 이에 한정되지 않는다. For example, the 3'-UTR may be derived from a 5'-
그 외에도, 도 2에 도시된 핵산 분자는 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2)에 인접하게 위치하는 전사 조절 서열(TCE), 각각의 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2)에 각각 작동 가능하게 연결된 코딩 영역 사이(CR 1, CR 2)의 Kozak 서열을 포함할 수 있다. 아울러, 필요한 경우 각각의 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2)의 3'쪽에 각각 DLP 핵산 서열, 개시 코돈으로 작용할 수 있는 서열 및/또는 발현 효율을 향상시킬 수 있는 인식 서열 등이 삽입될 수 있다. 또한, 하나의 예시적인 실시형태에서, 제 2 코딩 영역(CR 2)의 3'쪽, 일례로 3'-UTR이 삽입된다면 3'-UTR의 3'쪽에 폴리 (A) 서열이 더욱 삽입될 수 있다. In addition, the nucleic acid molecules shown in FIG. 2 are operable to the transcriptional control sequences (TCE) located adjacent to the expression control sequences (
도 2에서 발현 조절 서열(ECS 1, ECS 2)과 코딩 영역(CR 1, CR 2)이 각각 2개로 구분된 것으로 도시하고 있으나, IRES 염기 조절 서열을 가지는 발현 조절 서열의 개수 및/또는 이들 발현 조절 서열과 작동 가능하게 연결되는 코딩 영역의 개수는 2개를 초과할 수 있다. In FIG. 2, the expression control sequences (
재조합 발현 벡터 및 응용Recombinant Expression Vectors and Applications
도 1 및 도 2에 도시된 핵산 분자는 벡터 내에 삽입될 수 있다. 벡터는 또한 본 발명의 핵산 분자와 연결된 발현 조절 서열(expression control sequence), 예를 들어 전사 조절 서열을 포함한다. 본 발명의 구체예에서, 벡터는 목적하는 단백질 또는 펩타이드를 암호화하는 핵산 분자를 포함할 수 있다. 이때, 핵산 분자는 다른 핵산과 결합하여 융합 단백질 또는 융합 펩타이드를 암호화할 수도 있다. 따라서, 본 발명의 다른 측면에 따르면, 본 발명은 전술한 본 발명의 핵산 분자가 삽입된 재조합 발현 벡터에 관한 것이다. The nucleic acid molecules shown in FIGS. 1 and 2 can be inserted into a vector. Vectors also include expression control sequences, eg, transcriptional control sequences, linked to nucleic acid molecules of the invention. In embodiments of the invention, the vector may comprise a nucleic acid molecule encoding a protein or peptide of interest. In this case, the nucleic acid molecule may bind to another nucleic acid to encode a fusion protein or a fusion peptide. Accordingly, according to another aspect of the present invention, the present invention relates to a recombinant expression vector into which the nucleic acid molecule of the present invention is inserted.
예를 들면 벡터에는 바이러스 벡터(viral vectors), DNA 또는 RNA 발현 벡터(expression vectors), 플라스미드(plasmid), 코스미드(cosmid) 또는 파지벡터(phage vectors), CCA(cationic condensing agents)와 연결된 DNA 또는 RNA 발현 벡터, 리포좀(liposomes)으로 포장된 DNA 또는 RNA 발현 벡터, 프로듀서 세포(producer cells)와 같은 특정 진핵세포(eukaryotic cells) 등이 포함된다. For example, a vector may include viral vectors, DNA or RNA expression vectors, plasmids, cosmids or phage vectors, DNA linked to cationic condensing agents, or RNA expression vectors, DNA or RNA expression vectors packaged in liposomes, specific eukaryotic cells such as producer cells, and the like.
예시적으로, 본 발명의 핵산 분자는 포유동물 세포내로 들어가서 발현되도록 조성되어 있다. 이러한 조성은 치료 목적에 사용하는 데에 특히 유용하다. 핵산 분자를 숙주 세포 내에서 발현시키는 데에는 많은 방법이 있으며 적절한 어느 방법도 사용 가능하다. 예를 들어, 본 발명에 따른 핵산 분자는 아데노바이러스(adenovirus), 아데노-연관 바이러스(adeno-associated virus), 레트로 바이러스(retrovirus), 백시니아(vaccinia) 또는 다른 폭스 바이러스(e.q., avian pox virus) 등의 바이러스 벡터에 삽입이 가능하다. Illustratively, the nucleic acid molecules of the present invention are formulated to enter into and express in mammalian cells. Such compositions are particularly useful for use for therapeutic purposes. There are many ways to express nucleic acid molecules in host cells, and any suitable method can be used. For example, the nucleic acid molecule according to the present invention may be adenovirus, adeno-associated virus, retrovirus, vaccinia or other pox virus (eq, avian pox virus). It can be inserted into such viral vectors.
하나의 예시적인 실시형태에 따르면, 전술한 핵산 분자를 적절한 벡터에 삽입한 뒤에 시험관내 전사(in vitro transcription, IVT)를 통하여 RNA 형태의 핵산 분자로 변형될 수 있다. According to one exemplary embodiment, the above-described nucleic acid molecule may be inserted into an appropriate vector and then modified into nucleic acid molecules in RNA form through in vitro transcription (IVT).
핵산 분자, 예컨대 DNA를 이러한 벡터에 삽입시키는 기술에 관해서는 이미 잘 알려져 있다. 레트로 바이러스 벡터에는 형질도입된 세포들의 확인 또는 선택을 쉽게 해 주는 선택 마커(selectable marker)에 대한 유전자 및/또는 특정한 타겟 세포에 대한 수용체 역할을 하는 리간드(ligand)를 암호화하는 유전자와 같은 타겟팅 부위(targeting moiety)를 부가적으로 삽입시킬 수 있다. 타겟팅은 또한 항체를 이용한 공지의 방법에 의해서도 이루어질 수 있다. Techniques for inserting nucleic acid molecules such as DNA into such vectors are well known. Retroviral vectors include targeting sites such as genes for selectable markers that facilitate the identification or selection of transduced cells and / or genes that encode ligands that act as receptors for specific target cells. can additionally insert a targeting moiety. Targeting can also be accomplished by known methods using antibodies.
입수 가능하고 당업계에 공지된 다수의 벡터를 본 발명의 목적에 사용할 수 있다. 적절한 벡터의 선택은 주로 벡터에 삽입되는 핵산 분자의 크기 및 벡터로 형질전환되는 특정한 숙주 세포에 따라 달라질 것이다. 각각의 벡터는 그의 기능(이종 폴리뉴클레오티드의 증폭 또는 발현, 또는 둘 다) 및 벡터가 존재하는 특정한 숙주 세포와의 상용성에 따라 다양한 성분을 함유한다. 벡터 성분은 일반적으로 복제 기점 (특히 벡터가 원핵세포에 삽입되는 경우), 선별 마커 유전자, 프로모터, 리보솜 결합 부위 (RBS), 신호 서열, 이종 핵산 삽입물 및 전사 종결 서열을 포함하나 이에 제한되지는 않는다.Many vectors available and known in the art can be used for the purposes of the present invention. Selection of the appropriate vector will depend primarily on the size of the nucleic acid molecule inserted into the vector and the particular host cell transformed with the vector. Each vector contains various components depending on its function (amplification or expression of heterologous polynucleotides, or both) and compatibility with the particular host cell in which the vector is present. Vector components generally include, but are not limited to, origin of replication (particularly when the vector is inserted into prokaryotic cells), selectable marker genes, promoters, ribosomal binding sites (RBS), signal sequences, heterologous nucleic acid inserts and transcription termination sequences. .
예를 들어, 본 발명에 따른 재조합 발현 벡터는 단백질 또는 펩타이드의 발현에 영향을 미칠 수 있는 발현 조절 서열, 예를 들어, 개시코돈, 종결코돈, 폴리아데닐화 시그널, 인핸서, 막 표적화 또는 분비를 위한 신호서열 등을 포함할 수 있다. 폴리아데닐화 시그널은 전사체의 안정성을 증가시키거나 세포질 수송을 용이하게 한다. 인핸서 서열은 프로모터에서 다양한 부위에 위치하여 인핸서 서열이 없을 때의 프로모터에 의한 전사 활성과 비교하여, 전사 활성을 증가시키는 핵산 염기서열이다. 신호서열에는 숙주가 에스케리키아(Escherichia) 속 균인 경우에는 PhoA 신호서열, OmpA 신호서열 등이, 숙주가 바실러스(Bacillus)속 균인 경우에는 α-아밀라아제 신호서열, 서브틸리신 신호서열 등이, 숙주가 효모인 경우에는 MF-α 신호서열, SUC2 신호서열 등이, 숙주가 동물세포인 경우에는 인슐린 신호서열, a-인터페론 신호서열, 항체 분자 신호서열 등을 이용할 수 있으나, 본 발명이 이에 제한되지 않는다. For example, recombinant expression vectors according to the present invention may be used for expression control sequences that may affect the expression of proteins or peptides, such as initiation codons, termination codons, polyadenylation signals, enhancers, membrane targeting or secretion. Signal sequence and the like. Polyadenylation signals increase the stability of transcripts or facilitate cellular transport. Enhancer sequences are nucleic acid sequences that are located at various sites in the promoter and increase transcriptional activity as compared to the transcriptional activity by the promoter in the absence of the enhancer sequence. The signal sequence includes PhoA signal sequence and OmpA signal sequence when the host is Escherichia spp., And α-amylase signal sequence and subtilisin signal sequence when the host is Bacillus sp . In the case of the yeast, MF-α signal sequence, SUC2 signal sequence, etc., if the host is an animal cell, insulin signal sequence, a-interferon signal sequence, antibody molecular signal sequence, etc. may be used, but the present invention is not limited thereto. Do not.
벡터의 한 유형은 벡터의 한 유형은 추가의 DNA 절편이 그 내부에 라이게이션될 수 있는 원형 이중 가닥 DNA 루프를 지칭하는 “플라스미드”이다. 또 다른 유형의 벡터는 파지 벡터이다. 또 다른 유형의 벡터는 추가의 DNA 절편이 바이러스 게놈 내로 라이게이션될 수 있는 바이러스 벡터이다. 특정 벡터는 그것이 도입된 숙주 세포 내에서 자율 복제가 가능하다 (예를 들어, 박테리아 복제 기점을 갖는 박테리아 벡터 및 에피솜 포유동물 벡터). 다른 벡터 (예를 들어, 비-에피솜 포유동물 벡터)는 숙주 세포 내로 도입시에 숙주 세포의 게놈 내로 통합될 수 있고, 이에 의해 숙주 게놈과 함께 복제된다. 또한, 특정 벡터는 벡터가 작동가능하게 연결된 유전자의 발현을 지시할 수 있다. 이러한 벡터가 본 명세에서 "재조합 발현 벡터" (또는 간단히, "재조합 벡터")로서 지칭된다. 일반적으로, 재조합 DNA 기술에 유용한 발현 벡터는 종종 플라스미드의 형태로 존재한다. One type of vector is a “plasmid” that refers to a circular double stranded DNA loop into which additional DNA segments can be ligated therein. Another type of vector is a phage vector. Another type of vector is a viral vector in which additional DNA segments can be ligated into the viral genome. Certain vectors are capable of autonomous replication in the host cell into which they are introduced (eg, bacterial vectors and episomal mammalian vectors with bacterial origins of replication). Other vectors (eg, non-episomal mammalian vectors) can be integrated into the genome of the host cell upon introduction into the host cell and thereby replicate with the host genome. In addition, certain vectors may direct expression of the gene to which the vector is operably linked. Such vectors are referred to herein as "recombinant expression vectors" (or simply, "recombinant vectors"). In general, expression vectors of utility in recombinant DNA techniques are often in the form of plasmids.
본 발명의 구체적인 실시형태에서, 핵산 분자는 바이러스 발현 시스템(백시니아 또는 다른 폭스 바이러스, 레트로 바이러스 또는 아데노바이러스)을 이용하여 숙주 세포로 삽입된다. 예시적으로, 바이러스 벡터에는 HIV, SIV, 설치류 레트로 바이러스(murine retroviruses), 기본 백혈병 바이러스(gibbon ape leukemia virus), AAVs(adeno-associate viruses) 및 아데노바이러스(adenoviruses) 등에서 유래된 레트로 바이러스 벡터가 포함되나 여기에 한정되는 것은 아니다(Miller et al., 1990, Mol. Cell Biol. 10:4239; J. Kolberg 1992, NIH Res. 4:43; Cornetta et al., 1991, Hum. Gene Ther. 2:215). 설치류 백혈병 바이러스(murine leukemia virus, MuLV), 기본 백혈병 바이러스(gibbon ape leukemia virus, GaLV), 에코트로픽 레트로바이러스(ecotropic retroviruses), SIV(simian immunodeficiency virus), HIV(human immunodeficiency virus) 등에서 유래된 레트로 바이러스 벡터들이 널리 사용되고 있다(Buchscher et al., 1992, J. Virol, 66(5):2731-2739; Johann et al., 1992, J. Virol. 66(5):1635-1640; Sommerfelt et al., 1990, Virol. 176:58-59; Wilson et al., 1989, J. Virol. 63:2374-2378; Miller et al., 1991, J. Virol. 65:2220-2224; Rosenberg and Fauci 1993 in Fundermental Immunology, Third Edition, W. E. Paul(ed.) Raven Press, Ltd., New York and the references therein; Miller et al., 1990, Mol. Cell. Biol. 10:4239; R. Kolberg 1992, J. NIH Res. 4:43;Cornetta et al., 1991, Hum. Gene Ther.2:215).In a specific embodiment of the invention, the nucleic acid molecule is inserted into a host cell using a virus expression system (vaccinia or other pox virus, retrovirus or adenovirus). Exemplary viral vectors include retroviral vectors derived from HIV, SIV, murine retroviruses, gibbon ape leukemia virus, adeno-associate viruses, and adenoviruses, and the like. But not limited thereto (Miller et al., 1990, Mol. Cell Biol. 10: 4239; J. Kolberg 1992, NIH Res. 4:43; Cornetta et al., 1991, Hum. Gene Ther. 2: 215). Retroviruses derived from rodent leukemia virus (MulVe), basic leukemia virus (GIBBON ape leukemia virus, GaLV), ecotropic retroviruses, simian immunodeficiency virus (SIV), human immunodeficiency virus (HIV), etc. Vectors are widely used (Buchscher et al., 1992, J. Virol, 66 (5): 2731-2739; Johann et al., 1992, J. Virol. 66 (5): 1635-1640; Sommerfelt et al. , 1990, Virol. 176: 58-59; Wilson et al., 1989, J. Virol. 63: 2374-2378; Miller et al., 1991, J. Virol. 65: 2220-2224; Rosenberg and Fauci 1993 in Fundermental Immunology, Third Edition, WE Paul (ed.) Raven Press, Ltd., New York and the references therein; Miller et al., 1990, Mol. Cell.Biol. 10: 4239; R. Kolberg 1992, J. NIH Res. 4:43; Cornetta et al., 1991, Hum. Gene Ther. 2: 215).
본 발명에 따른 벡터 시스템은 당업계에 공지된 다양한 방법을 통해 구축될 수 있으며, 이에 대한 구체적인 방법은 Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press(2001)에 개시되어 있으며, 이 문헌은 본 명세서에 참조로서 삽입된다. The vector system according to the present invention can be constructed through various methods known in the art, and specific methods thereof are disclosed in Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (2001). This document is incorporated herein by reference.
예를 들어, 본 발명의 벡터는 전형적으로 클로닝을 위한 벡터 또는 발현을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 또한, 본 발명의 벡터는 원핵세포 또는 진핵세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다. 본 발명의 핵산 분자가 원핵세포 유래이고, 배양의 편의성 등을 고려하여, 원핵세포를 숙주로 하는 것이 바람직하다. 본 발명의 벡터는 전형적으로 클로닝을 위한 벡터 또는 발현을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 이용될 수 있는 벡터는 당업계에서 종종 사용되는 플라스미드 (예: pSC101, ColE1, pBR322, pUC8/9, pHC79, pUC19, pET 등), 파지 (예: λgt4λB, λ-Charon, λΔz1, λGEM.TM.-11 및 M13 등) 또는 바이러스 (예: SV40 등)를 조작하여 제작될 수 있다. For example, a vector of the present invention can typically be constructed as a vector for cloning or a vector for expression. In addition, the vector of the present invention can be constructed using prokaryotic or eukaryotic cells as hosts. The nucleic acid molecule of the present invention is derived from prokaryotic cells, and it is preferable to use prokaryotic cells as a host in consideration of the convenience of culture. Vectors of the present invention can typically be constructed as vectors for cloning or vectors for expression. For example, vectors that can be used in the present invention include plasmids often used in the art (eg pSC101, ColE1, pBR322, pUC8 / 9, pHC79, pUC19, pET, etc.), phage (eg λgt4λB, λ-Charon , λΔz1, λGEM.TM.-11 and M13, etc.) or viruses (eg SV40, etc.).
구성적 또는 유도성 프로모터는 당업자에 의해 확인될 수 있는 특정한 상황의 필요에 따라 본 발명에 사용될 수 있다. 다양한 가능한 숙주 세포에 의해 인식되는 다수의 프로모터가 널리 공지되어 있다. 선택된 프로모터는 제한 효소 소화를 통해 공급원 핵산 분자로부터 프로모터를 제거하고 단리된 프로모터 서열을 선택 벡터 내로 삽입함으로써 적절한 관심유전자(GOI)의 열린해독틀(ORF)로 이루어진 코딩 영역(CR)을 가지는 핵산 분자에 작동가능하게 연결될 수 있다. 천연 프로모터 서열 및 다수의 이종 프로모터를 둘 다 사용하여 관심유전자(GOI)의 증폭 및/또는 발현을 지시할 수 있다. 그러나, 이종 프로모터는 일반적으로 천연 프로모터와 비교하여 발현된 관심유전자의 보다 큰 전사 및 보다 높은 수율을 허용하게 하기 때문에 바람직하다. Constitutive or inducible promoters can be used in the present invention depending on the needs of a particular situation that can be identified by one skilled in the art. Many promoters that are recognized by a variety of possible host cells are well known. The selected promoter is a nucleic acid molecule having a coding region (CR) consisting of an open reading frame (ORF) of the appropriate gene of interest (GOI) by removing the promoter from the source nucleic acid molecule via restriction enzyme digestion and inserting the isolated promoter sequence into the selection vector. Can be operatively connected. Both native promoter sequences and multiple heterologous promoters can be used to direct amplification and / or expression of the gene of interest (GOI). However, heterologous promoters are generally preferred because they allow for greater transcription and higher yield of the expressed gene of interest as compared to the native promoter.
예를 들어, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 원핵세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터(예컨대, tac 프로모터, lac 프로모터, lacUV5 프로모터, lpp 프로모터, pLλ 프로모터, pRλ프로모터, rac5 프로모터, amp 프로모터, recA 프로모터, SP6 프로모터, trp 프로모터 및 T7 프로모터 등), 번역을 개시하기 위한 IRES를 가지는 발현 조절 서열(ECS) 및 전사/번역 종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 숙주 세포로서 E. coli가 이용되는 경우, E. coli 트립토판 생합성 경로의 프로모터 및 오퍼레이터 부위 (Yanofsky, C., J.Bacteriol., 158:1018-1024(1984)) 그리고 파아지 λ의 좌향 프로모터 (pLλ 프로모터, Herskowitz, I. and Hagen, D., Ann. Rev. Genet., 14:399-445(1980))가 조절 부위로서 이용될 수 있다.For example, when the vector of the present invention is an expression vector and the prokaryotic cell is a host, a strong promoter capable of promoting transcription (for example, a tac promoter, a lac promoter, a lacUV5 promoter, an lpp promoter, a pLλ promoter, a pRλ promoter) , rac5 promoter, amp promoter, recA promoter, SP6 promoter, trp promoter and T7 promoter, etc.), expression control sequences (ECS) having an IRES to initiate translation, and transcription / translation termination sequences. When E. coli is used as the host cell, the promoter and operator site of the E. coli tryptophan biosynthetic pathway (Yanofsky, C., J. Bacteriol., 158: 1018-1024 (1984)) and the leftward promoter of phage λ (pLλ) Promoter, Herskowitz, I. and Hagen, D., Ann. Rev. Genet., 14: 399-445 (1980)) can be used as regulatory sites.
한편, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 진핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터 (예: 메탈로티오닌 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터 (예: 아데노바이러스 후기 프로모터, 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터, SV40 프로모터, 사이토메갈로바이러스 프로모터 및 HSV의 tk 프로모터) 또는 박테리오파지에서 유래한 프로모터(예: T7 프로모터, T3 프로모터, SM6 프로모터)가 이용될 수 있으며, 전사 종결 서열로서 폴리아데닐화 서열을 일반적으로 갖는다. On the other hand, when the vector of the present invention is an expression vector and the eukaryotic cell is a host, a promoter derived from the mammalian cell genome (for example, metallothionine promoter) or a promoter derived from a mammalian virus (for example, adeno) Late viral promoters, vaccinia virus 7.5K promoter, SV40 promoter, cytomegalovirus promoter and tk promoter of HSV) or promoters derived from bacteriophages (e.g., T7 promoter, T3 promoter, SM6 promoter) can be used and transcription termination It generally has a polyadenylation sequence as a sequence.
또한, 본 발명의 재조합 벡터가 복제 가능한 발현 벡터인 경우, 복제가 개시되는 특정 핵산 서열인 복제원점(replication origin)을 포함할 수 있다. 또한, 재조합 벡터는 선별 마커(selection marker)를 포함할 수 있다. 선별 마커는 벡터로 형질전환된 세포를 선별하기 위한 것으로, 약물 내성, 영양 요구성, 세포 독성제에 대한 내성 또는 표면 단백질의 발현과 같은 선택가능 표현형을 부여하는 마커들이 사용될 수 있다. 본 발명의 벡터는 선별 표지로서, 해당 기술분야에서 통상적으로 이용되는 항생제 내성 유전자를 포함하며, 예를 들어 암피실린, 겐타마이신, 카베니실린, 클로람페니콜, 스트렙토마이신, 카나마이신, 게네티신, 네오마이신 및 테트라사이클린에 대한 내성 유전자가 있다. 선별제(selective agent)로 처리된 환경에서 선별 마커를 발현하는 세포만 생존하므로 형질전환된 세포를 선별할 수 있다. 선별 마커의 대표적인 예로써, 영양 요구 마커(auxotrophic marker)인 ura4, leu1, his3 등을 들 수 있으나 상기 예에 의해 본 발명에서 사용될 수 있는 선별 마커의 종류가 제한되는 것은 아니다. In addition, when the recombinant vector of the present invention is a replicable expression vector, it may include a replication origin, which is a specific nucleic acid sequence from which replication is initiated. In addition, the recombinant vector may include a selection marker. The selection marker is for selecting cells transformed with the vector, and markers that confer a selectable phenotype such as drug resistance, nutritional demand, resistance to cytotoxic agents or expression of surface proteins can be used. Vectors of the present invention, as selection markers, include antibiotic resistance genes commonly used in the art and include, for example, ampicillin, gentamicin, carbenicillin, chloramphenicol, streptomycin, kanamycin, geneticin, neomycin and There is a resistance gene for tetracycline. Since only cells expressing a selection marker survive in an environment treated with a selective agent, transformed cells can be selected. Representative examples of the selection markers include ura4, leu1, his3, and the like, which are nutritional markers, but the types of the selection markers that can be used in the present invention are not limited by the above examples.
발현 벡터에 서브클론된 서열을 증폭시키는 여러 가지 시험관내 증폭 기법들(in vitroamplification techniques)이 알려져 있다. 이러한 기법에는 PCR(polymerase chain reaction), LCR(ligase chain reaction), Qβ-복제효소 증폭(replicase amplification) 및 다른 RNA 중합효소를 이용한 기법들이 있다(Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning-A Laboratory Manual(2nd Ed) 1-3; U.S. Patent No. 4,683,202; PCR protocols A Guide to Methods and Applications, Innis et al., eds. Academic Press Inc. San Diego, CA 1990. Improved methods of cloning in vitro amplified nucleic acids are described in U.S. Patent No. 5,426,039). Various in vitro amplification techniques are known for amplifying a subcloned sequence in an expression vector. Such techniques include polymerase chain reaction (PCR), ligand chain reaction (LCR), Qβ-replicase amplification, and other RNA polymerases (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning-A Laboratory Manual). (2nd Ed) 1-3; US Patent No. 4,683,202; PCR protocols A Guide to Methods and Applications, Innis et al., Eds.Academic Press Inc. San Diego, CA 1990. Improved methods of cloning in vitro amplified nucleic acids are described in US Patent No. 5,426,039.
또한, 본 발명은 본 발명의 재조합 발현 벡터로 형질전환된 숙주 세포를 제공한다. 형질전환된 숙주 세포는 본 발명에 따라 단백질 또는 펩타이드를 생산하는 방법에 이용될 수 있다. 상기 방법은 숙주 세포의 배양 및 생산된 단백질 또는 펩타이드를 회수하는(recovering) 공정을 포함한다. 회수된 단백질 또는 펩타이드는 배양 상등액으로부터 정제할 수 있다. The present invention also provides a host cell transformed with the recombinant expression vector of the present invention. Transformed host cells can be used in the methods of producing proteins or peptides in accordance with the present invention. The method includes culturing the host cell and recovering the produced protein or peptide. The recovered protein or peptide can be purified from the culture supernatant.
본 발명은 또한 전술한 핵산 분자의 코딩 영역을 구성하는 열린해독틀로부터 단백질 또는 펩타이드를 발현하도록 유전적으로 변형된 재조합 미생물(recombinant microorganism)을 제공한다. 상기 재조합 미생물은 백신 또는 유전자 치료제로 사용될 수 있다. 일례로, 상기 재조합 미생물은 생 약독화 백신(live attenuated vaccines)의 제조방법에 따라 제조가 가능하다.The present invention also provides a recombinant microorganism genetically modified to express a protein or peptide from an open reading frame constituting the coding region of a nucleic acid molecule described above. The recombinant microorganism may be used as a vaccine or gene therapy agent. In one example, the recombinant microorganism can be prepared according to the method for producing live attenuated vaccines.
본 발명의 벡터는 그로부터 발현되는 재조합 단백질 또는 펩타이드의 정제를 용이하게 하기 위하여, 다른 서열과 융합될 수도 있다. 융합되는 서열은 예컨대, 글루타티온 S-트랜스퍼라제(Pharmacia, USA), 말토스 결합 단백질 (NEB, USA), FLAG (IBI, USA) 및 6x His (hexahistidine; Quiagen, USA) 등이 있고, 가장 바람직하게는 6x His이다. 상기 정제를 위한 추가적인 서열 때문에, 숙주에서 발현된 단백질은 친화성 크로마토그래피를 통하여 신속하고, 용이하게 정제된다. 필요한 경우에 이들 재조합 단백질의 세포외 분비를 촉진할 수 있도록 Fc 절편을 코딩하는 서열이 융합될 수도 있다. Vectors of the invention may be fused with other sequences to facilitate purification of the recombinant protein or peptide expressed therefrom. Sequences to be fused include, for example, glutathione S-transferase (Pharmacia, USA), maltose binding protein (NEB, USA), FLAG (IBI, USA) and 6x His (hexahistidine; Quiagen, USA), and most preferably Is 6 × His. Because of the additional sequence for this purification, the protein expressed in the host is purified quickly and easily through affinity chromatography. If desired, sequences encoding Fc fragments may be fused to facilitate extracellular secretion of these recombinant proteins.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 융합 서열이 포함되어 있는 벡터에 의해 발현된 융합 단백질은 친화성 크로마토그래피에 의해 정제된다. 예컨대, 글루타티온-S-트랜스퍼라제가 융합된 경우에는 이 효소의 기질인 글루타티온을 이용할 수 있고, 6x His이 이용된 경우에는 Ni-NTA His-결합 레진 컬럼 (Novagen, USA)을 이용하여 소망하는 재조합 단백질을 신속하고 용이하게 얻을 수 있다. According to a preferred embodiment of the present invention, the fusion protein expressed by the vector containing the fusion sequence is purified by affinity chromatography. For example, when glutathione-S-transferase is fused, glutathione, which is a substrate of this enzyme, can be used, and when 6x His is used, a desired recombination is performed using a Ni-NTA His-binding resin column (Novagen, USA). Proteins can be obtained quickly and easily.
전술한 벡터를 안정되면서 연속적으로 클로닝 및 발현시킬 수 있는 숙주 세포는 당업계에 공지되어 어떠한 숙주 세포도 이용할 수 있으며, 예컨대, E. coli JM109, E. coli BL21(DE3), E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, 바실러스 서브틸리스, 바실러스 츄린겐시스와 같은 바실러스 속 균주, 그리고 살모넬라 티피무리움, 세라티아 마르세슨스 및 다양한 슈도모나스 종과 같은 장내균과 균주 등이 있다. 또한, 본 발명의 벡터를 진핵 세포에 형질전환시키는 경우에는 숙주 세포로서, 이스트 (Saccharomyce cerevisiae), 곤충 세포(예컨대 SF9 세포) 및 사람 세포 (예컨대, CHO 세포주 (Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN 및 MDCK 세포주) 등이 이용될 수 있다. Host cells capable of stably and continuously cloning and expressing the aforementioned vectors are known in the art and can be used with any host cell, for example E. coli JM109, E. coli BL21 (DE3), E. coli RR1, Bacillus sp. Strains such as E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, and Salmonella typhimurium, Serratia marsonsons, and various Pseudomonas species Enterobacteria and strains, such as. In addition, when transforming a vector of the present invention into eukaryotic cells, as host cells, yeast ( Saccharomyce cerevisiae ), insect cells (such as SF9 cells) and human cells (such as CHO cell lines (Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN and MDCK cell lines) and the like.
본 발명의 벡터는 세포를 세포내외(in vivo, ex vivo) 또는 시험관 내(in vitro)에서 유전적으로 변형시키는데 이용될 수 있다. 세포를 유전적으로 변형시키는 방법으로는 세포를 바이러스 벡터로 감염 또는 형질도입 시키는 방법, 인산칼슘 침전법(calcium phosphate precipitation), 수용체 세포(recipient cells)를 DNA를 포함하는 세균 프로토플라스트(bacterial protoplasts)와 융합시키는 방법, 수용체 세포에 DNA를 포함하고 있는 리포좀(liposome) 또는 미세소구(microspheres)를 처리하는 방법, 엔도사이토시스(DEAE dextran, receptor-mediated endocytosis), 일렉트로포레이션(electroporation), 마이크로인젝션(micro-injection) 등을 포함한 여러 가지 방법이 알려져 있다. The vectors of the present invention can be used to genetically modify cells in vitro, ex vivo or in vitro. Methods for genetically modifying cells include infection or transduction of cells with viral vectors, calcium phosphate precipitation, bacterial protoplasts containing DNA of receptor cells. Fusion methods, treatment of liposomes or microspheres containing DNA in receptor cells, DEAE dextran, receptor-mediated endocytosis, electroporation, microinjection Various methods are known, including micro-injection.
예를 들어 숙주 세포가 원핵세포인 경우, CaCl2 방법(Cohen, S.N. et al., Proc. Natl. Acac. Sci. USA, 9:2110-2114, 1973), 하나한 방법 (Hanahan, D., J. Mol. Biol., 166:557-580, 1983) 및/또는 전기 천공 방법 (Dower, W.J. et al., Nucleic. Acids Res., 16:6127-6145, 1988)) 등에 의해 실시될 수 있다. 또한, 숙주 세포가 진핵 세포인 경우에는, 미세 주입법(Capecchi, M.R., Cell, 22:479, 1980)), 칼슘 포스페이트 침전법(Graham, F.L. et al., Virology, 52:456, 11973), 전기 천공법 (Neumann, E. et al., EMBO J., 1:841, 1982), 리포좀-매개 형질감염법(Wong, T.K. et al., Gene, 10:87, 1980), DEAE-덱스트란 처리법(Gopal, Mol. Cell Biol., 5:1188-1190, 1985), 및 유전자 밤바드먼트 (Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 87:9568-9572, 1990) 등에 의해 벡터를 숙주 세포 내로 주입할 수 있다.For example, if the host cell is a prokaryotic cell, the CaCl 2 method (Cohen, SN et al., Proc. Natl. Acac. Sci. USA, 9: 2110-2114, 1973), one method (Hanahan, D., J. Mol. Biol., 166: 557-580, 1983) and / or electroporation methods (Dower, WJ et al., Nucleic. Acids Res., 16: 6127-6145, 1988) and the like. . In addition, when the host cell is a eukaryotic cell, micro-injection (Capecchi, MR, Cell, 22: 479, 1980), calcium phosphate precipitation method (Graham, FL et al., Virology, 52: 456, 11973), electricity Perforation (Neumann, E. et al., EMBO J., 1: 841, 1982), liposome-mediated transfection (Wong, TK et al., Gene, 10:87, 1980), DEAE-dextran treatment (Gopal, Mol. Cell Biol., 5: 1188-1190, 1985), and gene balm (Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 87: 9568-9572, 1990) and the like. May be injected into a host cell.
숙주 세포 내로 주입된 벡터는 숙주 세포 내에서 발현될 수 있으며, 이러한 경우에는 다량의 재조합 단백질 또는 재조합 펩타이드를 얻게 된다. 예를 들어, 상기 발현 벡터가 lac 프로모터를 포함하는 경우에는 숙주 세포에 IPTG를 처리하여 유전자 발현을 유도할 수 있다. Vectors injected into a host cell can be expressed in the host cell, in which case a large amount of recombinant protein or recombinant peptide is obtained. For example, when the expression vector contains a lac promoter, the host cell may be treated with IPTG to induce gene expression.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 전술한 핵산 분자의 약학적 유효량 및 약학적으로 허용되는 담체, 필요에 따라 적절한 면역보강제(adjuvant)를 포함하는 핵산 백신으로서의 약학적 조성물을 제공한다. 이 경우, 전술한 핵산 분자는 직접적으로 직접적으로 피대상체에 투여된다. According to another aspect of the present invention, the present invention provides a pharmaceutical composition as a nucleic acid vaccine comprising a pharmaceutically effective amount of the above-described nucleic acid molecule and a pharmaceutically acceptable carrier, if appropriate, appropriate adjuvant. In this case, the nucleic acid molecule described above is administered directly to the subject.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상술한 본 발명의 핵산 분자를 포함하는 유전자 전달체; 및 약학적으로 허용되는 담체를 포함하는 질병 치료제로서의 약학적 조성물을 제공한다. 이는 유전자 치료를 목적으로 하는 것이다. According to another aspect of the present invention, the present invention provides a gene carrier comprising a nucleic acid molecule of the present invention described above; And it provides a pharmaceutical composition as a therapeutic agent for diseases comprising a pharmaceutically acceptable carrier. This is for the purpose of gene therapy.
본 발명에 따른 핵산 분자 또는 핵산 분자가 삽입된 유전자 전달체를 포함하는 약학적 조성물(핵산 백신 및/또는 유전자 치료제)은 바람직하게 전신으로 투여된다. 그러한 약학적 조성물/백신의 투여 경로는 전형적으로 경구(oral), 피하내, 정맥내, 근육내, 관절내(intra-articular), 활액내(intra-synovial), 흉골내, 경막내(intrathecal), 간내(intrahepatic), 병변내(intralesional), 두개내(intracranial), 경피(transdermal), 진피내(intradermal), 폐내(intrapulmonal), 복강내(intraperitoneal), 심장내(intracardial), 동맥내(intraarterial), 설하 국소(sublingual topical) 및/또는비강내(intranasal) 경로를 포함한다. 선택적으로, 본 발명의 백신 또는 약학 조성물은 진피내(intradermal), 피하내 또는 근육내의 경로에 의해 투여될 수 있다. 따라서, 약학적 조성물/백신은 일반적으로 약학적 조성물에 대해, 상기 정의된 바와 같은 액체 또는 고체 형태로 바람직하게 제형화된다. Pharmaceutical compositions (nucleic acid vaccines and / or gene therapeutics) comprising a nucleic acid molecule or a gene carrier in which a nucleic acid molecule is inserted are preferably administered systemically. Routes of administration of such pharmaceutical compositions / vaccines are typically oral, subcutaneous, intravenous, intramuscular, intra-articular, intra-synovial, intrasternal, intrathecal , Intrahepatic, intralesional, intracranial, transdermal, intradermal, intrapulmonal, intraperitoneal, intracardial, intraarterial ), Sublingual topical and / or intranasal routes. Optionally, the vaccine or pharmaceutical composition of the present invention may be administered by intradermal, subcutaneous or intramuscular routes. Thus, pharmaceutical compositions / vaccines are generally formulated preferably in liquid or solid form as defined above for pharmaceutical compositions.
필요한 경우, 백신의 면역원성을 증강시킬 수 있도록 면역보강제가 약학적 조성물에 포함될 수 있다. 면역보강제는 본 발명에 따른 백신에 통합될 수 있다. 이러한 면역보강제 등의 보조 성분들은 면역원성(immunogenicity) 및 본 발명에 따른 백신의 약학적으로 활성있는 성분의 다른 성질에 따라서 선택된다.If necessary, an adjuvant may be included in the pharmaceutical composition to enhance the immunogenicity of the vaccine. Adjuvants can be incorporated into the vaccine according to the invention. Auxiliary components such as adjuvant are selected according to immunogenicity and other properties of the pharmaceutically active component of the vaccine according to the present invention.
본 발명의 핵산 분자 또는 재조합 발현 벡터와 같은 유전자 전달체는 임의의 적합한 수단, 예를 들어 경구, 국소 (협측 및 설하 포함), 직장, 질, 경피, 비경구, 피하, 복강내, 폐내, 피내, 경막내 및 경막외 및 비강내, 및 원하는 경우에 국부 치료, 병변내 투여를 위한 수단에 의해 투여될 수 있다. 비경구 주입은 근육내, 정맥내, 동맥내, 복강내 또는 피하 투여를 포함한다. Gene carriers, such as nucleic acid molecules or recombinant expression vectors of the invention, may be any suitable means, for example oral, topical (including buccal and sublingual), rectal, vaginal, transdermal, parenteral, subcutaneous, intraperitoneal, intrapulmonary, intradermal, Intradural and epidural and intranasal, and if desired, by topical treatment, by means for intralesional administration. Parenteral infusions include intramuscular, intravenous, intraarterial, intraperitoneal or subcutaneous administration.
본 발명에 따른 약학적 조성물은 임의의 편리한 투여 형태, 예를 들어 정제, 분말, 캡슐, 용액, 분산액, 현탁액, 시럽, 분무제, 좌제, 겔, 에멀젼, 패치 등으로 투여될 수 있다. 이러한 조성물은 제약 제제에 통상적인 성분, 예를 들어 희석제, 담체, pH 조정제, 감미제, 벌킹제 및 추가의 활성제를 함유할 수 있다.The pharmaceutical compositions according to the invention can be administered in any convenient dosage form, for example tablets, powders, capsules, solutions, dispersions, suspensions, syrups, sprays, suppositories, gels, emulsions, patches and the like. Such compositions may contain components conventional to pharmaceutical formulations, such as diluents, carriers, pH adjusters, sweeteners, bulking agents and additional active agents.
전형적인 제제는 본 발명의 핵산 분자 또는 유전자 전달체와, 담체 또는 부형제를 혼합하여 제조된다. 적합한 담체 및 부형제는 당업자에게 널리 공지되어 있고, 예를 들어 문헌 [Ansel, Howard C., et al., Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems. Philadelphia: Lippincott, Williams & Wilkins, 2004; Gennaro, Alfonso R., et al. Remington: The Science and Practice of Pharmacy. Philadelphia: Lippincott, Williams & Wilkins, 2000; 및 Rowe, Raymond C. Handbook of Pharmaceutical Excipients, Chicago, Pharmaceutical Press, 2005]에 상세히 기재되어 있다. Typical formulations are prepared by mixing the nucleic acid molecules or gene carriers of the invention with a carrier or excipient. Suitable carriers and excipients are well known to those skilled in the art and are described, for example, in Ansel, Howard C., et al., Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems. Philadelphia: Lippincott, Williams & Wilkins, 2004; Gennaro, Alfonso R., et al. Remington: The Science and Practice of Pharmacy. Philadelphia: Lippincott, Williams & Wilkins, 2000; And Rowe, Raymond C. Handbook of Pharmaceutical Excipients, Chicago, Pharmaceutical Press, 2005.
예를 들어, 약학적으로 허용되는 담체는 제제 시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.For example, pharmaceutically acceptable carriers are those commonly used in the preparation, such as lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, starch, acacia rubber, calcium phosphate, alginate, gelatin, calcium silicate, microcrystalline Sex cellulose, polyvinylpyrrolidone, cellulose, water, syrup, methyl cellulose, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil, and the like.
상기 제제는 또한 하나 이상의 완충제, 안정화제, 계면활성제, 습윤제, 윤활제, 유화제, 현탁화제, 보존제, 항산화제, 불투명화제, 활택제, 가공 보조제, 착색제, 감미제, 향료, 향미제, 희석제, 및 약물(즉, 본 발명의 유효 성분인 핵산 분자, 유전자 전달체 또는 이의 약학 조성물)의 멋진 외양을 제공하거나 제약 제품 (즉, 의약)의 제조에 도움이 되는 다른 공지된 첨가제를 포함할 수 있다. The formulations also contain one or more buffers, stabilizers, surfactants, wetting agents, lubricants, emulsifiers, suspending agents, preservatives, antioxidants, opacifiers, glidants, processing aids, colorants, sweeteners, flavorings, flavoring agents, diluents, and drugs (Ie, nucleic acid molecules, gene carriers or pharmaceutical compositions thereof, which are the active ingredients of the present invention) or may contain other known additives to aid in the manufacture of pharmaceutical products (ie, medicaments).
본 발명의 약학적 조성물은 당해 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다. The pharmaceutical compositions of the present invention may be prepared in unit dosage form by formulating with a pharmaceutically acceptable carrier and / or excipient according to methods which can be easily carried out by those skilled in the art. Or may be prepared by incorporating into a multi-dose container. In this case, the formulation may be in the form of a solution, suspension or emulsion in an oil or an aqueous medium, or may be in the form of extracts, powders, granules, tablets or capsules, and may further include a dispersant or stabilizer.
한편, 본 명세서에서 제제는 또한 치료할 특정한 적응증에 필요한 경우에는 하나 초과의 활성 화합물, 바람직하게는 서로 유해한 영향을 미치지 않는 보완적 활성을 갖는 화합물을 함유할 수 있다. 대안적으로 또는 추가로, 조성물은 그의 기능을 증진시키는 작용제, 예컨대 예를 들어 세포독성제, 시토카인, 화학요법제, 또는 성장-억제제, 또는 성장-증진제를 포함할 수 있다. 이러한 분자는 의도된 목적에 유효한 양으로 조합되어 적합하게 존재한다. On the other hand, the formulations herein may also contain more than one active compound, preferably compounds with complementary activities which do not adversely affect each other when necessary for the particular indication to be treated. Alternatively or additionally, the composition may comprise agents that enhance its function, such as, for example, cytotoxic agents, cytokines, chemotherapeutic agents, or growth-inhibiting agents, or growth-enhancing agents. Such molecules are suitably present in combination in amounts that are effective for the purpose intended.
또한, 관심유전자를 암호화하는 코딩 영역을 포함하는 본 발명의 핵산 분자를 포함하는 유전자 전달체가 약학적 조성물에 포함될 수 있다. 유전자 전달체는 목적의 핵산분자를 운반 및 발현시키기 위하여 제작된 것으로서, 운반 객체인 목적의 핵산 분자에 대한 상세한 내용은 위에 기재된 내용과의 중복기재를 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.In addition, gene carriers comprising a nucleic acid molecule of the invention comprising a coding region encoding a gene of interest may be included in a pharmaceutical composition. The gene carrier is designed to transport and express the nucleic acid molecule of interest, and details of the nucleic acid molecule of interest as a carrier object are omitted in order to avoid overlapping with the contents described above.
유전자 전달체를 제조하기 위해, 관심 유전자의 전사체는 적합한 발현 컨스트럭트(expression construct) 내에 존재하는 것이 바람직하다. 상기 발현 컨스트럭트에서, 관심유전자의 전사체는 프로모터에 작동 가능하게 연결되는 것이 바람직하다. 본 발명에 있어서, 관심유전자의 전사체에 결합된 프로모터는, 바람직하게는 동물세포, 보다 바람직하게는 포유동물 세포에서 작동하여 목적의 핵산분자의 전사를 조절할 수 있는 것으로서, 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터, 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터, 또는 박테리오파지에서 유래한 프로모터를 포함한다. 예를 들어, CMV(cytomegalo virus) 프로모터, 아데노바이러스 후기 프로모터, 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터, SV40 프로모터, HSV의 tk 프로모터, T7 프로모터, T3 프로모터, SM6 프로모터, RSV 프로모터, EF1 알파프로모터, 메탈로티오닌 프로모터, 베타-액틴 프로모터, 인간 IL-2 유전자의 프로모터, 인간 IFN 유전자의 프로모터, 인간 IL-4 유전자의 프로모터, 인간 림포톡신 유전자의 프로모터, 인간 GM-CSF 유전자의 프로모터, 암세포 특이적 프로모터 (예컨대, TERT 프로모터, PSA 프로모터, PSMA 프로모터, CEA 프로모터, E2F 프로모터 및 AFP 프로모터) 및 조직 특이적 프로모터 (예컨대, 알부민 프로모터)를 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 바람직하게는, 본 발명에 이용되는 발현 컨스트럭트는 폴리아네닐화 서열을 포함한다(예: 소성장 호르몬 터미네이터 및 SV40 유래 폴리 아데닐화 서열). To prepare a gene carrier, the transcript of the gene of interest is preferably present in a suitable expression construct. In the expression construct, the transcript of the gene of interest is preferably operably linked to a promoter. In the present invention, a promoter bound to a transcript of a gene of interest is preferably capable of controlling transcription of a nucleic acid molecule of interest by operating in an animal cell, more preferably a mammalian cell, which is derived from a mammalian virus. Promoters, promoters derived from the genome of mammalian cells, or promoters derived from bacteriophages. For example, CMV (cytomegalo virus) promoter, adenovirus late promoter, vaccinia virus 7.5K promoter, SV40 promoter, tk promoter of HSV, T7 promoter, T3 promoter, SM6 promoter, RSV promoter, EF1 alpha promoter, metallothio Nin promoter, beta-actin promoter, promoter of human IL-2 gene, promoter of human IFN gene, promoter of human IL-4 gene, promoter of human lymphotoxin gene, promoter of human GM-CSF gene, cancer cell specific promoter ( Such as, but not limited to, TERT promoter, PSA promoter, PSMA promoter, CEA promoter, E2F promoter and AFP promoter) and tissue specific promoters (eg, albumin promoter). Preferably, the expression construct used in the present invention comprises a polyaninylation sequence (eg, a glial growth hormone terminator and a SV40 derived poly adenylation sequence).
예를 들어, 본 발명에 따른 핵산 분자를 사용하여 RNA 백신으로 활용하고자 하는 경우, 선택적으로 발현 조절 서열(ECE)의 5'쪽에 IVT를 가능하게 하는 적절한 전사 조절 서열이 위치할 수 있다. 전술한 바와 같이, RNA 백신 등으로 활용될 수 있는 RNA 형태의 핵산 분자는 IVT 과정을 통해서 합성될 수 있기 때문에, 일반적인 생백신이나 사백신 제조에 사용되는 살아 있는 바이러스나 병원성 미생물을 직접 다룰 필요가 없으며, 재조합 단백질/펩타이드를 생산하기 위하여 반드시 사용해야 하는 효모, 대장균, 곤충 세포와 같은 숙주 세포의 배양 등이 불필요하다. For example, where a nucleic acid molecule according to the present invention is intended to be utilized as an RNA vaccine, an appropriate transcriptional regulatory sequence that enables IVT can optionally be located on the 5 'side of the expression regulatory sequence (ECE). As described above, the nucleic acid molecule in the form of RNA that can be utilized as an RNA vaccine, etc. can be synthesized through the IVT process, there is no need to deal directly with live viruses or pathogenic microorganisms used for the production of common live or dead vaccines, There is no need for culturing host cells such as yeast, E. coli, insect cells, etc., which must be used to produce recombinant proteins / peptides.
예를 들어, 본 발명에 따른 핵산 분자를 이용한 RNA 백신을 제조하기 위하여, DNA 형태로 플라스미드에 삽입된 폴리뉴클레오티드를 IVT 과정을 통해 mRNA 형태로 전사할 때, 제한효소 등으로 말단이 전달되어 선형화된 DNA를 주형으로 이용하여 RNA 중합효소(RNA polymerase)에 의해 RNA를 시험관에서 합성한다. 선형화된 DNA로부터 RNA로의 전사를 위해서 예를 들어 박테리오파지 등에서 유래한 프로모터 서열과 같은 전사 조절 서열이 5'-UTR의 5'쪽에 위치할 수 있다. 이러한 전사 조절 서열로서 T7 박테리오파지 유래의 프로모터 이외에도 T3 박테리오파지 유래의 프로모터, SP6 박테리오 파지 유래의 프로모터 등 선형화된 DNA 주형으로부터 mRNA를 전사할 수 있는 임의의 전사 조절 서열(TES)이 발현 조절 서열(ECS) 인근에 위치할 수 있다.For example, in order to prepare an RNA vaccine using a nucleic acid molecule according to the present invention, when a polynucleotide inserted into a plasmid in the form of DNA is transcribed into an mRNA form through an IVT process, the terminal is transferred to a restriction enzyme or the like and linearized. RNA is synthesized in vitro by RNA polymerase using DNA as a template. For transcription from linearized DNA to RNA, transcriptional regulatory sequences, such as, for example, promoter sequences derived from bacteriophages and the like, may be located on the 5 'side of the 5'-UTR. In addition to the promoter derived from T7 bacteriophage as such a transcriptional regulatory sequence, any transcriptional regulatory sequence (TES) capable of transcription of a mRNA from a linearized DNA template, such as a promoter derived from T3 bacteriophage or a promoter derived from SP6 bacteriophage, is expressed as an expression control sequence (ECS). It can be located nearby.
유전자 전달체는 다양한 형태로 제작할 수 있는 데, 플라스미드, 바이러스 벡터, 또는 플라스미드를 내포하는 리포좀 또는 니오좀의 형태로 제작할 수 있다. 일례로, 관심유전자의 전사체는 통상적인 유전자 치료에 이용되는 모든 유전자 전달 시스템에 적용될 수 있으며, 바람직하게는 플라스미드, 아데노바이러스 (Lockett LJ, et al., Clin. Cancer Res. 3:2075-2080, 1997)), 아데노-관련 바이러스 (Adeno-associated viruses: AAV, Lashford LS., et al., Gene Therapy Technologies, Applications and Regulations Ed. A. Meager, 1999), 레트로 바이러스 (Gunzburg WH, et al., Retroviral vectors. Gene Therapy Technologies, Applications and Regulations Ed. A. Meager, 1999), 렌티바이러스 (Wang G. et al.,J. Clin. Invest. 104(11):R55-62(1999)), 헤르페스 심플렉스 바이러스 (Chamber R., et al., Proc. Natl.Acad. Sci USA 92:1411-1415, 1995), 백시니아 바이러스 (Puhlmann M. et al., Human Gene Therapy 10:649-657, 1999)), 리포좀 (Methods in Molecular Biology, Vol 199, S.C. Basu and M. Basu (Eds.), Human Press 2002) 또는 니오좀에 적용될 수 있다.Gene carriers can be produced in a variety of forms, such as plasmids, viral vectors, or in the form of liposomes or niosomes containing plasmids. In one example, the transcript of the gene of interest can be applied to all gene delivery systems used in conventional gene therapy, preferably plasmids, adenoviruses (Lockett LJ, et al., Clin. Cancer Res. 3: 2075-2080). , 1997)), Adeno-associated viruses (AAV, Lashford LS., Et al., Gene Therapy Technologies, Applications and Regulations Ed.A. Meager, 1999), retroviruses (Gunzburg WH, et al. , Retroviral vectors.Gene Therapy Technologies, Applications and Regulations Ed.A. Meager, 1999), lentiviruses (Wang G. et al., J. Clin. Invest. 104 (11): R55-62 (1999)), herpes Simplex virus (Chamber R., et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA 92: 1411-1415, 1995), vaccinia virus (Puhlmann M. et al., Human Gene Therapy 10: 649-657, 1999 )), Liposomes (Methods in Molecular Biology, Vol 199, SC Basu and M. Basu (Eds.), Human Press 2002) or niosomes.
한편, 상술한 유전자 전달체를 세포내로 도입하는 방법은 당업계에 공지된 다양한 방법을 통해 실시될 수 있다. 본 발명에서, 유전자 전달체가 바이러스 벡터에 기초하여 제작된 경우에는, 당업계에 공지된 바이러스 감염 방법에 따라 실시된다. 바이러스 벡터를 이용한 숙주 세포의 감염은 상술한 인용문헌에 기재되어 있다. On the other hand, the method of introducing the above-described gene carrier into the cell can be carried out through various methods known in the art. In the present invention, when the gene carrier is produced based on a viral vector, it is carried out according to a virus infection method known in the art. Infection of host cells with viral vectors is described in the references cited above.
또한, 본 발명에서 유전자 전달 시스템이 내이키드(naked) 재조합 DNA 분자 또는 플라스미드인 경우에는, 미세 주입법(Capecchi, M.R., Cell, 22:479, 1980); 및 Harland와 Weintraub, J. Cell Biol. 101:1094-1099, 1985)), 칼슘 포스페이트 침전법 (Graham, F.L. et al.,Virology, 52:456, 1973); 및 Chen과 Okayama, Mol. Cell. Biol. 7:2745-2752, 1987), 전기 천공법 (Neumann, E. et al., EMBO J.,1:841, 1982; 및 Tur-Kaspa et al., Mol. Cell Biol., 6:716-718(1986)), 리포좀-매개 형질감염법 (Wong, T.K. et al., Gene, 10:87, 1980); Nicolau 및 Sene, Biochim. Biophys. Acta, 721:185-190, 1982; 및 Nicolau et al., Methods Enzymol., 149:157-176, 1987)), DEAE-덱스트란 처리법 (Gopal, Mol. Cell Biol., 5:1188-1190, 1985)), 및 유전자 밤바드먼트(Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 87:9568-9572, 1990)) 방법에 의해 유전자를 세포내로 이입시킬 수 있다.In addition, in the present invention, when the gene delivery system is a naked recombinant DNA molecule or plasmid, micro-injection method (Capecchi, M.R., Cell, 22: 479, 1980); And Harland and Weintraub, J. Cell Biol. 101: 1094-1099, 1985)), calcium phosphate precipitation (Graham, F.L. et al., Virology, 52: 456, 1973); And Chen and Okayama, Mol. Cell. Biol. 7: 2745-2752, 1987), electroporation (Neumann, E. et al., EMBO J., 1: 841, 1982; and Tur-Kaspa et al., Mol. Cell Biol., 6: 716-718 (1986)), liposome-mediated transfection (Wong, TK et al., Gene, 10:87, 1980); Nicolau and Sene, Biochim. Biophys. Acta, 721: 185-190, 1982; And Nicolau et al., Methods Enzymol., 149: 157-176, 1987)), DEAE-dextran treatment (Gopal, Mol. Cell Biol., 5: 1188-1190, 1985)), and gene bombardment ( Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 87: 9568-9572, 1990)) can be used to introduce the gene into the cell.
이하, 예시적인 실시형태를 통하여 본 발명을 설명하지만, 본 발명이 하기 실시예에 기재된 기술사상으로 한정되지 않는다. EMBODIMENT OF THE INVENTION Hereinafter, although this invention is demonstrated through exemplary embodiment, this invention is not limited to the technical idea described in the following Example.
실시예 1: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 1: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
신드비스 바이러스(Sindbis virus) 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR을 가지는 RNA 폴리뉴클레오티드를 제작하였다. 주형 DNA 서열은 다음과 같이 설계하였다. An RNA polynucleotide having a 5'-UTR having an IRES derived from Sindbis virus was prepared. The template DNA sequence was designed as follows.
5'- 제한효소 인식 서열(GGATCC) - T7 프로모터(서열식별번호:18) - SV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:1) - SV DLP structure 서열(서열식별번호:9) - 제한효소 인식 서열(GGATCC) - Kozak 서열(GACC) - GOI 유전자로서 Renilla Luciferase(R/L) 암호화 ORF 서열(서열식별번호:19) - 제한효소 인식서열(GAATTC) - SV 유래의 3'-UTR(서열식별번호:10) - 폴리아데노신 서열(50 Adenosines) - 제한효소 인식 서열(GCGGCCGC). 5'- restriction enzyme recognition sequence ( GGATCC ) -T7 promoter (SEQ ID NO: 18)-5'-UTR (SEQ ID NO: 1) having an IRES from SV-SV DLP structure sequence (SEQ ID NO: 9) - restriction enzyme recognition sequence (GGATCC) Kozak sequence (GACC) Renilla Luciferase (R / L) encrypted ORF sequences as GOI gene (SEQ ID NO: 19) restriction enzyme recognition sequence (GAATTC) of the SV-derived 3 ' UTR (SEQ ID NO: 10)-Polyadenosine Sequence (50 Adenosines) -Restriction Enzyme Recognition Sequence ( GCGGCCGC ).
주형 DNA를 pGH 벡터에 클로닝하고 제한효소로 linearization시켜, in vitro trasncrption(IVT)를 통해 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 확보하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pnon-SV-R/L'이라고 명명한다. The template DNA was cloned into a pGH vector and linearized with restriction enzymes to obtain nucleic acid molecules in the form of RNA platforms through in vitro trasncrption (IVT). A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present example is named 'pnon-SV-R / L' below.
실시예 2: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 2: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 CVB3 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:2)를 사용하고, 5'-UTR의 3'쪽에 발현 효율을 높일 수 있는 서열(ATGGCAGCTCAA)를 삽입하고, ORF의 3'에 제한효소 인식 서열(CCGCGGCGATCG)을 삽입하고, 3'-UTR로서 CVB3 유래의 3'-UTR(서열식별번호:11)을 사용하고, 5'-UTR의 5'쪽에 ARCA(anti-reverse cap analog)를 이용하여 capping을 한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 'pCAP-CVB3-R/L'이라고 명명한다.As the 5'-UTR of the template DNA, a 5'-UTR (SEQ ID NO: 2) having an IRES derived from CVB3 having no DLP structure sequence was used, and a sequence capable of improving expression efficiency on the 3 'side of the 5'-UTR ( ATGGCAGCTCAA) was inserted, the restriction enzyme recognition sequence ( CCGCGG CGATCG) was inserted at 3 'of ORF, and 3'-UTR derived from CVB3 (SEQ ID NO: 11) was used as 3'-UTR, and 5'-UTR was used. The nucleic acid molecules of the RNA platform were prepared by repeating the procedure of Example 1 except that capping was carried out using anti-reverse cap analog (ARCA) at 5 '. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this example is named 'pCAP-CVB3-R / L'.
실시예 3: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 3: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 EMCV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:3)를 사용하고, ORF의 3'에 제한효소 인식서열(GTCGACCGATCG)을 삽입하고, 3'-UTR로서 EMCV 유래의 3'-UTR(서열식별번호:12)을 사용한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pEMCV-R/L'이라고 명명한다.A 5'-UTR (SEQ ID NO: 3) having an IRES from EMCV without a DLP structure sequence was used as the 5'-UTR of the template DNA, and a restriction enzyme recognition sequence ( GTCGAC CGATCG) was inserted into 3 'of the ORF. Nucleic acid molecules of the RNA platform were prepared by repeating the procedure of Example 1, except that 3'-UTR (SEQ ID NO: 12) derived from EMCV was used as the 3'-UTR. The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present embodiment is named 'pEMCV-R / L' below.
실시예 4: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 4: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 JEV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:4)를 사용하고, ORF의 3'에 제한효소 인식서열(GTCGACCGATCG)을 삽입하고, 3'-UTR로서 JEV 유래의 3'-UTR(서열식별번호:13)을 사용하고, 5'-UTR의 5'쪽에 ARCA(anti-reverse cap analog)를 이용하여 capping을 한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCAP-JEV-R/L'이라고 명명한다.A 5'-UTR (SEQ ID NO: 4) having an IRES from JEV without a DLP structure sequence was used as the 5'-UTR of the template DNA, and a restriction enzyme recognition sequence ( GTCGAC CGATCG) was inserted into 3 'of the ORF. 3'-UTR derived from JEV (SEQ ID NO: 13) as 3'-UTR, except that 5'-UTR's capping using anti-reverse cap analog (ARCA) The procedure of Example 1 was repeated to prepare nucleic acid molecules of the RNA platform. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this Example is named 'pCAP-JEV-R / L' below.
실시예 5: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 5: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 CPV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:5)를 사용하고, 5'-UTR의 3'쪽에 CPV의 개시코돈으로 작용하는 서열(CCTGCT)를 삽입하고, GOI 유전자로서 서열식별번호:20의 R/L 암호화 ORF 서열을 사용하고, ORF의 3'쪽에 제한효소 인식 서열을 삽입하지 않고, 3'-UTR로서 CPV 유래의 3'-UTR(서열식별번호:14)을 사용한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCPV-R/L'이라고 명명한다.A 5'-UTR (SEQ ID NO: 5) having an IRES derived from CPV without a DLP structure sequence was used as the 5'-UTR of the template DNA, and the sequence acted as a start codon of CPV on the 3 'side of the 5'-UTR. (CCTGCT) was inserted, 3'-UTR derived from CPV as 3'-UTR without using the R / L coding ORF sequence of SEQ ID NO: 20 as the GOI gene, and the restriction enzyme recognition sequence inserted into the 3 'side of the ORF. The nucleic acid molecules of the RNA platform were prepared by repeating the procedure of Example 1 except using -UTR (SEQ ID NO: 14). A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present example is named 'pCPV-R / L' below.
비교예 1: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Comparative Example 1 Construction of Nucleic Acid Molecules on an RNA Platform
CureVac AG의 WO 2015/101414호에 개시된 cap-dependent한 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 주형 DNA의 5'-UTR로서 stem-loop구조를 가지는 rpl32 서열(서열식별번호:22)를 사용하고, 3'-UTR로서 histone stem-loop 구조를 가지는 서열(서열식별번호:23)을 사용한 것을 제외하고, 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 비교예 1에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCAP-curevac-R/L'이라고 명명한다.Nucleic acid molecules of the cap-dependent RNA platform disclosed in WO 2015/101414 to CureVac AG were constructed. The rpl32 sequence (SEQ ID NO: 22) having a stem-loop structure was used as the 5'-UTR of the template DNA, and the sequence (SEQ ID NO: 23) having the histone stem-loop structure was used as the 3'-UTR. Except for the procedure of Example 1, the nucleic acid molecules of the RNA platform were constructed. The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to Comparative Example 1 is referred to below as 'pCAP-curevac-R / L'.
실험예 1: 핵산 분자의 발현 효율 측정Experimental Example 1 Measurement of Expression Efficiency of Nucleic Acid Molecules
실시예 1 내지 실시예 5와, 비교예 1에서 각각 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 인간 근육 세포주(A204)와 인간 embryonic kidney 세포주(293T)에 각각 transfection하고, 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량을 측정하였다. 측정 결과를 도 3a 및 도 3b에 각각 나타낸다. 도 3a 및 도 3b에 나타낸 바와 같이, EMCV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR이 삽입된 핵산 분자(pEMCV-R/L)는 양성 컨트롤로 사용한 pCAP-curevac-R/L보다 높은 발현 효율을 갖고 있다. 또한, CPV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR이 삽입된 핵산 분자(pCPV-R/L)는 양성 컨트롤에 근접한 발현 효율을 갖고 있었으며, 나머지 바이러스 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR이 삽입된 핵산 분자는 양성 컨트롤보다는 낮지만 양호한 발현 효율을 갖고 있다. Nucleic acid molecules in the form of RNA platforms prepared in Examples 1 to 5 and Comparative Example 1, respectively, were transfected into human muscle cell line (A204) and human embryonic kidney cell line (293T), respectively. Expression level was measured. The measurement results are shown in FIGS. 3A and 3B, respectively. As shown in FIGS. 3A and 3B, the 5'-UTR-inserted nucleic acid molecule (pEMCV-R / L) having an IRES derived from EMCV has a higher expression efficiency than pCAP-curevac-R / L used as a positive control. have. In addition, the 5'-UTR-inserted nucleic acid molecule (pCPV-R / L) having an IRES derived from CPV had an expression efficiency close to that of the positive control, and the 5'-UTR-inserted nucleic acid having an IRES derived from the remaining viruses was found. Molecules are lower than positive controls but have good expression efficiency.
실시예 6: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 6: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
진핵세포에서 유래한 IRES를 가지는 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 eIF4G 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:6)를 사용하고, 5'-UTR의 3'쪽에 발현 효율을 높일 수 있는 서열(ATGTCTGGG)를 삽입하고, ORF의 3'쪽의 제한효소 인식 서열(GGCGCC)을 사용하고, 3'-UTR로서 eIF4G 유래의 3'-UTR(서열식별번호:15)를 사용한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'peIF4G-R/L'이라고 명명한다.Nucleic acid molecules of an RNA platform having IRES derived from eukaryotic cells were prepared. As a 5'-UTR of template DNA, a 5'-UTR (SEQ ID NO: 6) having an IRES derived from eIF4G without a DLP structure sequence was used, and a sequence capable of improving expression efficiency on the 3 'side of the 5'-UTR ( Example 1 except inserting 3'-UTR (SEQ ID NO: 15) derived from eIF4G as a 3'-UTR, using a 3'-restriction enzyme recognition sequence ( GGCGCC ) of the ORF. The procedure was repeated to prepare nucleic acid molecules of the RNA platform. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this example is named 'peIF4G-R / L' below.
실시예 7: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 7: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
진핵세포에서 유래한 IRES를 가지는 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 FMR1 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:7)를 사용하고, ORF의 3'쪽의 제한효소 인식 서열(CCGCGGGGCGCC)을 사용하고, 3'-UTR로서 FMR1 유래의 3'-UTR(서열식별번호:16)를 사용한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pFMR1--R/L'이라고 명명한다.Nucleic acid molecules of an RNA platform having IRES derived from eukaryotic cells were prepared. As 5'-UTR of template DNA, 5'-UTR (SEQ ID NO: 7) having an IRES derived from FMR1 without a DLP structure sequence was used, and a restriction enzyme recognition sequence ( CCGCGG GGCGCC) on the 3 'side of the ORF was used. The nucleic acid molecules of the RNA platform were prepared by repeating the procedure of Example 1, except that 3'-UTR (SEQ ID NO: 16) derived from FMR1 was used as the 3'-UTR. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present example is named 'pFMR1--R / L' below.
실시예 8: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 8: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
진핵세포에서 유래한 IRES를 가지는 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 주형 DNA의 5'-UTR로서 DLP structure 서열이 없는 CN43 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR(서열식별번호:8)를 사용하고, ORF의 3'쪽의 제한효소 인식 서열(GGCGCC)을 사용하고, 3'-UTR로서 CN43 유래의 3'-UTR(서열식별번호:17)를 사용한 것을 제외하고 실시예 1의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCN43-R/L'이라고 명명한다.Nucleic acid molecules of an RNA platform having IRES derived from eukaryotic cells were prepared. 5'-UTR (SEQ ID NO: 8) having an IRES from CN43 without a DLP structure sequence was used as the 5'-UTR of the template DNA, and the restriction enzyme recognition sequence ( GGCGCC ) on the 3 'side of the ORF was used. Nucleic acid molecules of the RNA platform were prepared by repeating the procedure of Example 1, except that 3'-UTR (SEQ ID NO: 17) derived from CN43 was used as the 3'-UTR. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this example is named 'pCN43-R / L' below.
실험예 2: 핵산 분자의 발현 효율 측정Experimental Example 2 Measurement of Expression Efficiency of Nucleic Acid Molecules
실시예 6 내지 실시예 8과, 비교예 1에서 각각 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 인간 근육 세포주(A204)와 인간 embryonic kidney 세포주(293T)에 각각 transfection하고, 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량을 측정하였다. 측정 결과를 도 4a 및 도 4b에 각각 나타낸다. 도 4a 및 도 4b에 나타낸 바와 같이, CN43 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR이 삽입된 핵산 분자(pCN43-R/L)는 양성 컨트롤로 사용된 pCAP-CureVac-R/L보다는 낮은 발현 효율을 가졌으나, 다른 2종류의 진핵세포 유래의 IRES 구조(FMR1, eIF4G)를 가지는 5'-UTR이 삽입된 핵산 분자에 비하여 높은 발현 양상을 보였다. 하지만, 실시예 6 내지 8에서 각각 제작된 핵산 분자는 모두 양호한 발현 효율을 보여주었다. Nucleic acid molecules in the form of RNA platforms prepared in Examples 6 to 8 and Comparative Example 1, respectively, were transfected into human muscle cell line (A204) and human embryonic kidney cell line (293T), respectively. Expression level was measured. The measurement results are shown in FIGS. 4A and 4B, respectively. As shown in FIGS. 4A and 4B, the 5'-UTR-inserted nucleic acid molecule (pCN43-R / L) having an IRES derived from CN43 has a lower expression efficiency than the pCAP-CureVac-R / L used as a positive control. However, the expression rate was higher than that of 5'-UTR inserted nucleic acid molecules having IRES structures (FMR1, eIF4G) derived from two other eukaryotic cells. However, all of the nucleic acid molecules produced in Examples 6 to 8 showed good expression efficiency.
실시예 9: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 9: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
ARCA를 이용하여 5' 말단에서의 capping 과정을 수행하지 않은 것을 제외하고 실시예 2의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCVB3-R/L'이라고 명명한다.The nucleic acid molecules of the RNA platform were prepared by repeating the procedure of Example 2 except that the capping process at the 5 ′ end was not performed using ARCA. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this example is named `` pCVB3-R / L '' below.
실시예 10: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 10 Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
5'-UTR의 5'쪽에 다수의 아데노신(pMA)가 삽입되도록 변형된 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. T7 프로모터와 CVB3 유래의 5'-UTR 사이, 즉, 즉, 5'-UTR의 5'쪽에 50개의 multiple adenosnine(pMA) 서열이 전사되도록 삽입한 것을 제외하고 실시예 9의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pMA-CVB3-R/L'이라고 명명한다.Nucleic acid molecules of an RNA platform modified to insert multiple adenosine (pMA) at the 5 'side of the 5'-UTR were constructed. The RNA platform was repeated by repeating the procedure of Example 9 except that 50 multiple adenosnine (pMA) sequences were inserted between the T7 promoter and the 5'-UTR derived from CVB3, ie, 5'-UTR 5 'side. Nucleic acid molecules were prepared. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this example is named `` pMA-CVB3-R / L '' below.
실시예 11: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 11: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
T7 프로모터와 CPV 유래의 5'-UTR 사이, 5'-UTR의 5' 쪽에 50개의 multiple adenosnine(pMA) 서열이 전사되도록 삽입한 것을 제외하고 실시예 5의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pMA-CPV-R/L'이라고 명명한다.The nucleic acid molecule of the RNA platform was repeated by repeating the procedure of Example 5 except that 50 multiple adenosnine (pMA) sequences were inserted between the T7 promoter and the 5'-UTR derived from CPV, on the 5 'side of the 5'-UTR. Produced. A nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to this example is referred to below as 'pMA-CPV-R / L'.
실시예 12: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 12 Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
T7 프로모터와 CN43 유래의 5'-UTR 사이, 즉, 5'-UTR의 5' 쪽에 50개의 multiple adenosnine(pMA) 서열이 전사되도록 삽입한 것을 제외하고 실시예 8의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pMA-CN43-R/L'이라고 명명한다.The nucleic acid of the RNA platform was repeated by repeating the procedure of Example 8 except that 50 multiple adenosnine (pMA) sequences were inserted between the T7 promoter and the 5'-UTR derived from CN43, ie 5'-UTR's 5 'side. Molecules were made. The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present embodiment is named 'pMA-CN43-R / L' below.
실험예 3: 핵산 분자의 발현 효율 측정Experimental Example 3: Measurement of Expression Efficiency of Nucleic Acid Molecules
실시예 2(pCAP-CVB3-R/L), 실시예 9(pCVB3-R/L), 실시예 10(pMA-CVB3-R/L), 실시예 11(pMA-CPV-R/L), 실시예 12(pMA-CN43-R/L)와 비교예 1에서 각각 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 인간 근육 세포주(A204) 또는 마우스 근육 세포주(Nor10)에 각각 transfection하고, 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량을 측정하였다. CVB3에서 유래한 IRES를 가지면서 변형된 핵산 분자를 사용하여 관심유전자(GOI)의 발현량에 대한 측정 결과를 도 5에 나타내며, 5'-UTR의 5'쪽에 pMA가 삽입된 핵산 분자에서 발현되는 관심유전자의 발현량에 대한 측정 결과를 도 6에 나타낸다. Example 2 (pCAP-CVB3-R / L), Example 9 (pCVB3-R / L), Example 10 (pMA-CVB3-R / L), Example 11 (pMA-CPV-R / L), Nucleic acid molecules in the form of RNA platform prepared in Example 12 (pMA-CN43-R / L) and Comparative Example 1, respectively, were transfected into human muscle cell line (A204) or mouse muscle cell line (Nor10), respectively, and used as a gene of interest. The expression level of Renilla luciferase was measured. The measurement result of the expression level of the gene of interest (GOI) using the modified nucleic acid molecule having an IRES derived from CVB3 is shown in FIG. 5 and expressed in the nucleic acid molecule having pMA inserted on the 5 'side of the 5'-UTR. The measurement results for the expression level of the gene of interest are shown in FIG. 6.
도 5에 도시한 바와 같이, pMA-CVB3-R/L 핵산 분자를 세포주에 주입한 경우, 아무런 변형을 하지 않은 CVB3-R/L 핵산 분자를 주입한 경우에 비하여 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량이 향상되었음을 알 수 있다. 또한, 도 6에 나타낸 바와 같이, IRES를 가지는 5'-UTR의 5'쪽에 다수의 아데노신을 삽입한 핵산 분자는 양성 컨트롤에 비하여 관심유전자의 발현양은 약간 낮았으나, 양호한 발현 효율을 보여주었다. As shown in FIG. 5, when the pMA-CVB3-R / L nucleic acid molecule was injected into the cell line, the Renilla luciferase was used as a gene of interest as compared to when the CVB3-R / L nucleic acid molecule was not modified. It can be seen that the expression level is improved. In addition, as shown in Figure 6, the nucleic acid molecule in which a large number of adenosine is inserted into the 5 'side of the 5'-UTR having the IRES was slightly lower than the positive control, but showed good expression efficiency.
실험예 4: 핵산 분자의 발현 효율 측정Experimental Example 4 Measurement of Expression Efficiency of Nucleic Acid Molecules
전술한 실험예 1 내지 3에서 상대적으로 발현 효율이 우수한 것으로 측정된 실시예 2(pCAP-CVB3-R/L), 실시예 5(pCPV-R/L), 실시예 8(pCN43-R/L)와 비교예 1에서 각각 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 인간 근육 세포주(A204) 및 인간 embryonic kidney 세포주(293T)에 각각 transfection하고, 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량을 측정하였다. 측정 결과를 도 7a 및 도 7b에 나타낸다. pCPV-R/L 핵산 분자는 양성 컨트롤로 사용한 pCureVac-R/L과 비슷하거나 약간 낮은 발현 효율을 보였으나, 다른 두종류의 IRES가 삽입된 핵산 분자(pCAP-CVB3-R/L, pCN43-R/L)보다는 높은 발현 양상을 보였다. 하지만, 다른 두 종류의 IRES 구조를 가지는 핵산 분자 역시 양호한 발현 효율을 보여주었다. Example 2 (pCAP-CVB3-R / L), Example 5 (pCPV-R / L), and Example 8 (pCN43-R / L) which were determined to have relatively high expression efficiency in Experimental Examples 1 to 3 described above. ) And the nucleic acid molecules of the RNA platform prepared in Comparative Example 1 were transfected into human muscle cell line (A204) and human embryonic kidney cell line (293T), respectively, and the expression levels of Renilla luciferase used as the gene of interest were measured. The measurement results are shown in FIGS. 7A and 7B. pCPV-R / L nucleic acid molecules showed similar or slightly lower expression efficiencies than pCureVac-R / L used as a positive control, but with two different types of IRES-inserted nucleic acid molecules (pCAP-CVB3-R / L, pCN43-R / L) was higher than the expression pattern. However, nucleic acid molecules with two other types of IRES structures also showed good expression efficiency.
실시예 13: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 13: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
2개의 상이한 IRES를 가지는 5-UTR이 적용된 RNA 핵산 분자를 제작하였다. 주형 DNA 서열은 다음과 같이 설계하였다. RNA nucleic acid molecules with 5-UTR applied with two different IRES were constructed. The template DNA sequence was designed as follows.
5'- 제한효소 인식 서열(GGATCC) - T7 프로모터(서열식별번호:19) - 제한효소 인식서열(GTTAAC) - 50개의 아데노신(pMA)으로 전사될 서열 - 제한효소 인식서열(GTTAAC) - 첫 번째 5'-UTR로서 CVB3 유래의 5'-UTR(서열식별번호:2) - 발현 효율 향상 서열(ATGGCAGCTCAA) - 제한효소 인식 서열(GTCGAC) - Kozak 서열(GACC) - 첫 번째 GOI 유전자로서, R/L 암호화 ORF 서열(서열식별번호: 20) - 두번째 5'-UTR로서 EMCV 유래의 5'-UTR(서열식별번호:3) - 두번째 GOI 유전자로서 R/L 암호화 ORF 서열(서열식별번호:19) - CVB3 유래의 3'-UTR(서열식별번호: 12) - 폴리아데노신 서열(50 Adenosines) - 제한효소 인식서열(GCGGCCGC). 5'- restriction enzyme recognition sequence (GGATCC)-T7 promoter (SEQ ID NO: 19)-restriction enzyme recognition sequence (GTTAAC)-sequence to be transcribed into 50 adenosine (pMA)-restriction enzyme recognition sequence (GTTAAC)-first 5'-UTR derived from CVB3 as 5'-UTR (SEQ ID NO: 2)-Expression efficiency enhancing sequence (ATGGCAGCTCAA)-Restriction enzyme recognition sequence ( GTCGAC ) -Kozak sequence (GACC)-First GOI gene, R / L coding ORF sequence (SEQ ID NO: 20)-5'-UTR from EMCV as the second 5'-UTR (SEQ ID NO: 3)-R / L coding ORF sequence as the second GOI gene (SEQ ID NO: 19) -3'-UTR from CVB3 (SEQ ID NO: 12)-polyadenosine sequence (50 Adenosines) -restriction enzyme recognition sequence ( GCGGCCGC ).
주형 DNA를 pGH 벡터에 클로닝하고 제한효소로 linearization시켜, in vitro trasncrption(IVT)를 통해 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 확보하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pMA-CVB3-R/L-EMCV-R/L'이라고 명명한다.The template DNA was cloned into a pGH vector and linearized with restriction enzymes to obtain nucleic acid molecules in the form of RNA platforms through in vitro trasncrption (IVT). The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present embodiment is named 'pMA-CVB3-R / L-EMCV-R / L' below.
실시예 14: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 14 Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
2개의 상이한 IRES를 가지는 5-UTR이 적용된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 제작하였다. 주형 DNA 서열은 다음과 같이 설계하였다. Nucleic acid molecules in the form of RNA platforms to which 5-UTRs with two different IRESs were applied were constructed. The template DNA sequence was designed as follows.
5'- 제한효소 인식 서열(GGATCC) - T7 프로모터(서열식별번호: 19) - 첫 번째 5'-UTR로서 CPV 유래의 5'-UTR(서열식별번호:5) - CPV의 개시코돈(CCTGCT) - 제한효소 인식서열(GAATTC) - 첫 번째 GOI 유전자로서, R/L 암호화 ORF 서열(서열식별번호:20) - 제한효소 인식서열(GAGCTC) - 두번째 5'-UTR로서 EMCV 유래의 5'-UTR(서열식별번호:3) - 제한효소 인식서열(GATATCGTCGACTTAATTAA) - Kozak 서열(GACC) - 두번째 GOI 유전자로서 R/L 암호화 ORF 서열(서열식별번호:19) - 제한효소 인식서열(CCGCGG) - CPV 유래의 3'-UTR(서열식별번호:14) - 폴리아데노신 서열(50 Adenosines) - 제한효소 인식서열(GCGGCCGC). 5'- restriction enzyme recognition sequence (GGATCC)-T7 promoter (SEQ ID NO: 19)-5'-UTR derived from CPV as the first 5'-UTR (SEQ ID NO: 5)-start codon of CPV (CCTGCT) Restriction enzyme recognition sequence ( GAATTC ) -first GOI gene, R / L encoding ORF sequence (SEQ ID NO: 20)-restriction enzyme recognition sequence ( GAGCTC )-second 5'-UTR, 5'-UTR derived from EMCV (SEQ ID NO: 3)-restriction enzyme recognition sequence (GATATCGTCGAC TTAATTAA ) -Kozak sequence (GACC)-R / L encoding ORF sequence as the second GOI gene (SEQ ID NO: 19) -restriction enzyme recognition sequence ( CCGCGG ) -
주형 DNA를 pGH 벡터에 클로닝하고 제한효소로 linearization시켜, in vitro trasncrption(IVT)를 통해 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 확보하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCPV-R/L-EMCV-R/L'이라고 명명한다.The template DNA was cloned into a pGH vector and linearized with restriction enzymes to obtain nucleic acid molecules in the form of RNA platforms through in vitro trasncrption (IVT). The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present embodiment is named 'pCPV-R / L-EMCV-R / L' below.
실시예 15: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 15 Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
두 번째 GOI 유전자로서 firefly luciferase(F/L)을 암호화하는 ORF 서열(서열식별번호:21)을 사용한 것을 제외하고 실시예 13의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pMA-CVB3-R/L-EMCV-F/L'이라고 명명한다.The nucleic acid molecule of the RNA platform was prepared by repeating the procedure of Example 13 except for using the ORF sequence (SEQ ID NO: 21) encoding firefly luciferase (F / L) as the second GOI gene. The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present embodiment is named 'pMA-CVB3-R / L-EMCV-F / L' below.
실시예 16: RNA 플랫폼의 핵산 분자 제작Example 16: Nucleic Acid Molecular Construction of RNA Platforms
두 번째 GOI 유전자로서 firefly luciferase(F/L)을 암호화하는 ORF 서열(서열식별번호: 21)을 사용한 것을 제외하고 실시예 14의 절차를 반복하여 RNA 플랫폼의 핵산 분자를 제작하였다. 본 실시예에 따라 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 이하에서 'pCPV-R/L-EMCV-F/L'이라고 명명한다.The nucleic acid molecule of the RNA platform was prepared by repeating the procedure of Example 14 except for using the ORF sequence (SEQ ID NO: 21) encoding firefly luciferase (F / L) as the second GOI gene. The nucleic acid molecule in the form of an RNA platform prepared according to the present embodiment is named 'pCPV-R / L-EMCV-F / L' below.
실험예 5: 핵산 분자의 발현 효율 측정Experimental Example 5: Measurement of Expression Efficiency of Nucleic Acid Molecules
실시예 13 및 실시예 14와 비교예 1에서 각각 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 인간 embryonic kidney 세포주(293T)에 각각 transfection하고, 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량을 측정하였다. 2개의 동일한 GOI(R/L)를 사용한 경우의 R/L의 발현량 측정 결과를 도 8에 나타낸다. 5'-UTR의 5'쪽에 다수의 아데노신이 삽입된 pMA-CVB3-R/L-EMCV-R/L 핵산 분자에서 가장 높은 발현 효율을 보였다. 또한, pCPV-R/L-EMCV-R/L 핵산 분자 역시 양성 컨트롤과 비교하였을 때, 약간 높거나 유사한 발현 효율을 보여주었다. Nucleic acid molecules in the form of RNA platforms prepared in Examples 13 and 14 and Comparative Example 1, respectively, were transfected into human embryonic kidney cell lines (293T), and expression levels of Renilla luciferase used as a gene of interest were measured. The result of measuring the expression level of R / L when two identical GOI (R / L) was used is shown in FIG. The highest expression efficiency was shown in the pMA-CVB3-R / L-EMCV-R / L nucleic acid molecule with multiple adenosine inserted on the 5 'side of the 5'-UTR. In addition, the pCPV-R / L-EMCV-R / L nucleic acid molecules also showed slightly higher or similar expression efficiencies when compared to positive controls.
계속해서, 실시예 5(pCVP-R/L) 및 실시예 16(pCVP-R/L-EMCV-F/L), 실시예 10(pMA-CVB3-R/L) 및 실시예 15(pMA-CVB3-R/L-EMCV-F/L)과, 비교예 1에서 각각 제작된 RNA 플랫폼 형태의 핵산 분자를 인간 embryonic kidney 세포주(293T) 및 마우스 근육 세포주(Nor10)에 각각 transfection하고, 관심유전자로 사용된 Renilla luciferase의 발현량 및 Firefly luciferase의 발현량을 비교하였다. 측정 결과를 도 9a 및 도 9b에 나타낸다. Subsequently, Example 5 (pCVP-R / L) and Example 16 (pCVP-R / L-EMCV-F / L), Example 10 (pMA-CVB3-R / L) and Example 15 (pMA- CVB3-R / L-EMCV-F / L) and nucleic acid molecules of the RNA platform form prepared in Comparative Example 1 were transfected into human embryonic kidney cell line (293T) and mouse muscle cell line (Nor10), respectively. The expression levels of Renilla luciferase and that of Firefly luciferase were compared. The measurement results are shown in Figs. 9A and 9B.
pCPV-R/L-EMCV-F/L 및 pMA-CVB3-R/L-EMCV-F/L 핵산 분자와 같이 상이한 IRES 염기 서열로부터 상이한 관심유전자를 발현시켰을 때의 R/L의 발현량과, pCPV-R/L 및 pMA-CVB3-R/L과 같이 하나의 관심유전자를 발현시켰을 때의 R/L의 발현량을 비교하며, R/L의 발현량은 크게 차이가 없었다. 하지만, EMCV 유래의 IRES를 가지는 5'-UTR에 의해 발현이 조절되는 F/L의 발현에서, pMA-CVB3-R/L-EMCV-F/L에서 pCPV-R/L-EMCV-F/L에 비하여 높게 발현되었다. 이러한 결과는 도 8에서 pMA-CVB3-R/L-EMCV-R/L 핵산 분자가 pCVP-R/L-EMCV-R/L 핵산 분자에 비하여 높은 R/L 발현 효율을 보이는 것과 관련이 있는 것으로 판단된다. Expression of R / L when different genes of interest are expressed from different IRES base sequences, such as pCPV-R / L-EMCV-F / L and pMA-CVB3-R / L-EMCV-F / L nucleic acid molecules, and pCPV When the expression of one gene of interest, such as -R / L and pMA-CVB3-R / L, the expression level of R / L was compared, the expression level of R / L was not significantly different. However, in expression of F / L whose expression is regulated by 5'-UTR with IRES from EMCV, pCPV-R / L-EMCV-F / L at pMA-CVB3-R / L-EMCV-F / L It was expressed higher than that. This result is related to the high R / L expression efficiency of pMA-CVB3-R / L-EMCV-R / L nucleic acid molecule in FIG. 8 compared to pCVP-R / L-EMCV-R / L nucleic acid molecule. Judging.
상기에서는 본 발명의 예시적인 실시형태 및 실시예에 기초하여 본 발명을 설명하였으나, 본 발명이 상기 실시형태 및 실시예에 기재된 기술사상으로 한정되는 것은 아니다. 오히려 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 전술한 실시형태 및 실시예를 토대로 다양한 변형과 변경을 용이하게 추고할 수 있다. 하지만, 이러한 변형과 변경은 모두 본 발명의 권리범위에 속한다는 점은, 첨부하는 청구범위에서 분명하다.The present invention has been described above based on exemplary embodiments and examples of the present invention, but the present invention is not limited to the technical idea described in the above embodiments and examples. Rather, those skilled in the art can easily make various modifications and changes based on the above-described embodiments and examples. However, it is apparent in the appended claims that all such modifications and variations fall within the scope of the present invention.
<110> THE CATHOLIC UNIVERSITY OF KOREA INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> NUCLEIC ACID MOLECULES INSERTED EXPRESSION REGULATION SEQUENCES AND EXPRESSION VECTOR COMPRISING NUCLEIC ACID MOLECULES <130> 2434 <160> 23 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 59 <212> DNA <213> Sindbis virus <400> 1 attgacggcg tagtacacac tattgaatca aacagccgac caattgcact accatcaca 59 <210> 2 <211> 742 <212> DNA <213> Coxsackievirus B <400> 2 ttaaaacagc ctgtgggttg atcccaccca cagggcctat tgggcgctag cactctggta 60 tcacggtacc tttgtgcgcc tgttttatat cccctccccc aactgtaact tagaagtaac 120 acactccgat caacagtcag cgtggcacac cagccatgtt ttgatcaagc acttctgtta 180 ccccggactg agtatcaata gactgctcac gcggttgaag gagaaagcgt tcgttatccg 240 gccaactact tcgaaaaacc cagtaacacc atagaggttg cagagtgttt cgctcagcac 300 taccccagtg tagaccaggc cgatgagtca ccgcattccc cacgggcgac cgtggcggtg 360 gctgcgttgg cggcctgcct atggggaaac ccataggacg ctctaataca gacatggtgc 420 gaagagtcta ttgagctagt tggtaatcct ccggcccctg aatgcggcta atcctaactg 480 cggacagcac 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gagatccaaa ccaaggagga aaggatatca 300 cagaggagat c 311 <210> 7 <211> 321 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 7 cagcgttgat cacgtgacgt ggtttcagtg tttacacccg cagcgggccg ggggttcggc 60 ctcagtcagg cgctcagctc cgtttcggtt tcacttccgg tggagggccg cctctgagcg 120 ggcggcgggc cgacggcgag cgcgggcggc ggcggtgacg gaggcgccgc tgccaggggg 180 cgtgcggcag cgcggcggcg gcggcggcgg cggcggcggc ggaggcggcg gcggcggcgg 240 cggcggcggc ggctgggcct cgagcgcccg cagcccacct ctcgggggcg ggctcccggc 300 gctagcaggg ctgaagagaa g 321 <210> 8 <211> 157 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 8 gcgtgaggaa agtaccaaac agcagcggag ttttaaactt taaatagaca ggtctgagtg 60 cctgaacttg ccttttcatt ttacttcatc ctccaaggag ttcaatcact tggcgtgact 120 tcactacttt taagcaaaag agtggtgccc aggcaac 157 <210> 9 <211> 143 <212> DNA <213> Sindbis virus <400> 9 atggagaagc cagtagtaaa cgtagacgta gacccccaga gtccgtttgt cgtgcaactg 60 caaaaaagct tcccgcaatt tgaggtagta gcacagcagg tcactccaaa tgaccatgct 120 aatgccagag cattttcgca tct 143 <210> 10 <211> 319 <212> DNA <213> Sindbis virus <400> 10 ccgctacgcc ccaatgatcc gaccagcaaa actcgatgta cttccgagga actgatgtgc 60 ataatgcatc aggctggtac attagatccc cgcttaccgc gggcaatata gcaacactaa 120 aaactcgatg tacttccgag gaagcgcagt gcataatgct gcgcagtgtt gccacataac 180 cactatatta accatttatc tagcggacgc caaaaactca atgtatttct gaggaagcgt 240 ggtgcataat gccacgcagc gtctgcataa cttttattat ttcttttatt aatcaacaaa 300 attttgtttt taacatttc 319 <210> 11 <211> 103 <212> DNA <213> Coxsackievirus B <400> 11 taaattagag acaatttgat ctgatttgaa ttggcttaac cctactgtac taaccgaact 60 agacaacggt gcagtagggg taaattctcc gcattcggtg cgg 103 <210> 12 <211> 123 <212> DNA <213> Encephalomyocarditis virus <400> 12 tagtgtagtc actggcacaa cgcgttaccc ggtaagccaa tcgggtatac acggtcgtca 60 tactgcagac agggttcttc tactttgcaa gatagtctag agtagtaaaa taaatagata 120 gag 123 <210> 13 <211> 585 <212> DNA <213> Japanese encephalitis virus <400> 13 tagtgtgatt taaagtagaa aagtagacta tgtaaataat gtaaatgaga aaatgcatgc 60 atatggagtc aggccagcaa aagctgccac cggatactgg gtagacggtg ctgtctgcgt 120 ctcagtccca ggaggactgg gttaacaaat ctgacaacag aaagtgagaa agccctcaga 180 accgtctcgg aagtaggtcc ctgctcactg gaagttgaaa gaccaacgtc aggccacaaa 240 tttgtgccac cccgctaggg ggtgcggcct gcgcagcccc aggaggactg ggttaccaaa 300 gccgttgagc ccccacggcc caagcctcgt ctaggatgca atagacgagg tgtaaggact 360 agaggttaga ggagaccccg tggaaacaac aatatgcggc ccaagccccc tcgaagctgt 420 agaggaggtg gaaggactag aggttagagg agaccccgca tttgcatcaa acagcatatt 480 gacacctggg aatagactgg gagatcttct gctctatctc aacatcagct actaggcaca 540 gagcgccgaa gtatgtagct ggtggtgagg aagaacacag gatct 585 <210> 14 <211> 221 <212> DNA <213> Cricket paralysis virus <400> 14 agacatgata agatacattg atgagtttgg acaaaccaca acaagaatgc agtgaaaaaa 60 atgctttatt tgtgaaattt gtgatgctat tgctttattt gtaaccatta taagctgcaa 120 taaacaagtt aacaacaaca attgcattca ttttatgttt caggttcagg gggagatgtg 180 ggaggttttt taaagcaagt aaaacctcta caaatgtggt a 221 <210> 15 <211> 456 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 tgaccacaac tgagggctgg tggggccggg gacctggagc cccatggaca cacagatggc 60 ccggctagcc gcctggactg caggggggcg gcagcagcgg cggtggcagt gggtgcctgt 120 agtgtgatgt gtctgaacta ataaagtggc tgaagaggca ggatggcttg gggctgcctg 180 ggcccccctc caggatgccg ccaggtgtcc ctctcctccc cctggggcac agagatatat 240 tatatataaa gtcttgaaat ttggtgtgtc ttggggtggg gaggggcacc aacgcctgcc 300 cctggggtcc ttttttttat tttctgaaaa tcactctcgg gactgccgtc ctcgctgctg 360 ggggcatatg ccccagcccc tgtaccaccc ctgctgttgc ctgggcaggg ggaagggggg 420 gcacggtgcc tgtaattatt aaacatgaat tcaatt 456 <210> 16 <211> 517 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 tgtgaaggac cttcactcta agatgttata tttttcttaa aaagtaactc ctagtagggg 60 taccactgaa tctgtacaga gccgtaaaaa ctgaagttct gcctctgatg tattttgtga 120 gtttgtttct ttgaattttc attttacagt tacttttcct tgcatacaaa caagcatata 180 aaatggcaac aaactgcaca tgatttcaca aatattaaaa agtcttttaa aaagtattgc 240 caaacattaa tgttgatttc tagttattta ttctgggaat gtatagtatt tgaaaacaga 300 aattggtacc ttgcacacat catctgtaag ctgtttggtt ttaaaatact gtagataatt 360 aaccaaggta gaatgacctt gtaatgtaac tgctcttggg caatattctc tgtacatatt 420 agcgacaaca gattggattt tatgttgaca tttgtttggt tatagtgcaa tatattttgt 480 atgcaagcag tttcaataaa gtttgatctt cctctgc 517 <210> 17 <211> 337 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 17 aattcagaca aggcccacag aataagattt tccatgcatt tgcaaatacg tatattcttt 60 ttccatccac ttgcacaata tcattaccat cactttttca tcattcctca gctactactc 120 acattcattt aatggtttct gtaaacattt ttaagacagt tgggatgtca cttaacattt 180 tttttttttg agctaaagtc agggaatcaa gccatgctta atatttaaca atcacttata 240 tgtgtgtcga agagtttgtt ttgtttgtca tgtattggta caagcagata cagtataaac 300 tcacaaacac agatttgaaa ataatgcaca tatggtg 337 <210> 18 <211> 18 <212> DNA <213> Bacteriophage T7 <400> 18 taatacgact cactatag 18 <210> 19 <211> 936 <212> DNA <213> Renilla reniformis <400> 19 atgacttcga aagtttatga tccagaacaa aggaaacgga tgataactgg tccgcagtgg 60 tgggccagat gtaaacaaat gaatgttctt gattcattta ttaattatta tgattcagaa 120 aaacatgcag aaaatgctgt tattttttta catggtaacg cggcctcttc ttatttatgg 180 cgacatgttg tgccacatat tgagccagta gcgcggtgta ttataccaga ccttattggt 240 atgggcaaat caggcaaatc tggtaatggt tcttataggt tacttgatca ttacaaatat 300 cttactgcat ggtttgaact tcttaattta ccaaagaaga tcatttttgt cggccatgat 360 tggggtgctt gtttggcatt tcattatagc tatgagcatc aagataagat caaagcaata 420 gttcacgctg aaagtgtagt agatgtgatt gaatcatggg atgaatggcc tgatattgaa 480 gaagatattg cgttgatcaa atctgaagaa ggagaaaaaa tggttttgga gaataacttc 540 ttcgtggaaa ccatgttgcc atcaaaaatc atgagaaagt tagaaccaga agaatttgca 600 gcatatcttg aaccattcaa agagaaaggt gaagttcgtc gtccaacatt atcatggcct 660 cgtgaaatcc cgttagtaaa aggtggtaaa cctgacgttg tacaaattgt taggaattat 720 aatgcttatc tacgtgcaag tgatgattta ccaaaaatgt ttattgaatc ggacccagga 780 ttcttttcca atgctattgt tgaaggtgcc aagaagtttc ctaatactga atttgtcaaa 840 gtaaaaggtc ttcatttttc gcaagaagat gcacctgatg aaatgggaaa atatatcaaa 900 tcgttcgttg agcgagttct caaaaatgaa caataa 936 <210> 20 <211> 933 <212> DNA <213> Renilla reniformis <400> 20 acttcgaaag tttatgatcc agaacaaagg aaacggatga taactggtcc gcagtggtgg 60 gccagatgta aacaaatgaa tgttcttgat tcatttatta attattatga ttcagaaaaa 120 catgcagaaa atgctgttat ttttttacat ggtaacgcgg cctcttctta tttatggcga 180 catgttgtgc cacatattga gccagtagcg cggtgtatta taccagacct tattggtatg 240 ggcaaatcag gcaaatctgg taatggttct tataggttac ttgatcatta caaatatctt 300 actgcatggt ttgaacttct taatttacca aagaagatca tttttgtcgg ccatgattgg 360 ggtgcttgtt tggcatttca ttatagctat gagcatcaag ataagatcaa agcaatagtt 420 cacgctgaaa gtgtagtaga tgtgattgaa tcatgggatg aatggcctga tattgaagaa 480 gatattgcgt tgatcaaatc tgaagaagga gaaaaaatgg ttttggagaa taacttcttc 540 gtggaaacca tgttgccatc aaaaatcatg agaaagttag aaccagaaga atttgcagca 600 tatcttgaac cattcaaaga gaaaggtgaa gttcgtcgtc caacattatc atggcctcgt 660 gaaatcccgt tagtaaaagg tggtaaacct gacgttgtac aaattgttag gaattataat 720 gcttatctac gtgcaagtga tgatttacca aaaatgttta ttgaatcgga cccaggattc 780 ttttccaatg ctattgttga aggtgccaag aagtttccta atactgaatt tgtcaaagta 840 aaaggtcttc atttttcgca agaagatgca cctgatgaaa tgggaaaata tatcaaatcg 900 ttcgttgagc gagttctcaa aaatgaacaa taa 933 <210> 21 <211> 1653 <212> DNA <213> Luciola cruciata <400> 21 atggaagatg ccaaaaacat taagaagggc ccagcgccat tctacccact cgaagacggg 60 accgccggcg agcagctgca caaagccatg aagcgctacg ccctggtgcc cggcaccatc 120 gcctttaccg acgcacatat cgaggtggac attacctacg ccgagtactt cgagatgagc 180 gttcggctgg cagaagctat gaagcgctat gggctgaata caaaccatcg gatcgtggtg 240 tgcagcgaga atagcttgca gttcttcatg cccgtgttgg gtgccctgtt catcggtgtg 300 gctgtggccc cagctaacga catctacaac gagcgcgagc tgctgaacag catgggcatc 360 agccagccca ccgtcgtatt cgtgagcaag aaagggctgc aaaagatcct caacgtgcaa 420 aagaagctac cgatcataca aaagatcatc atcatggata gcaagaccga ctaccagggc 480 ttccaaagca tgtacacctt cgtgacttcc catttgccac ccggcttcaa cgagtacgac 540 ttcgtgcccg agagcttcga ccgggacaaa accatcgccc tgatcatgaa cagtagtggc 600 agtaccggat tgcccaaggg cgtagcccta ccgcaccgca ccgcttgtgt ccgattcagt 660 catgcccgcg accccatctt cggcaaccag atcatccccg acaccgctat cctcagcgtg 720 gtgccatttc accacggctt cggcatgttc accacgctgg gctacttgat ctgcggcttt 780 cgggtcgtgc tcatgtaccg cttcgaggag gagctattct tgcgcagctt gcaagactat 840 aagattcaat ctgccctgct ggtgcccaca ctatttagct tcttcgctaa gagcactctc 900 atcgacaagt acgacctaag caacttgcac gagatcgcca gcggcggggc gccgctcagc 960 aaggaggtag gtgaggccgt ggccaaacgc ttccacctac caggcatccg ccagggctac 1020 ggcctgacag aaacaaccag cgccattctg atcacccccg aaggggacga caagcctggc 1080 gcagtaggca aggtggtgcc cttcttcgag gctaaggtgg tggacttgga caccggtaag 1140 acactgggtg tgaaccagcg cggcgagctg tgcgtccgtg gccccatgat catgagcggc 1200 tacgttaaca accccgaggc tacaaacgct ctcatcgaca aggacggctg gctgcacagc 1260 ggcgacatcg cctactggga cgaggacgag cacttcttca tcgtggaccg gctgaagagc 1320 ctgatcaaat acaagggcta ccaggtagcc ccagccgaac tggagagcat cctgctgcaa 1380 caccccaaca tcttcgacgc cggggtcgcc ggcctgcccg acgacgatgc cggcgagctg 1440 cccgccgcag tcgtcgtgct ggaacacggt aaaaccatga ccgagaagga gatcgtggac 1500 tatgtggcca gccaggttac aaccgccaag aagctgcgcg gtggtgttgt gttcgtggac 1560 gaggtgccta aaggactgac cggcaagttg gacgcccgca agatccgcga gattctcatt 1620 aaggccaaga agggcggcaa gatcgccgtg taa 1653 <210> 22 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RPL32 <400> 22 ggggcgctgc ctacggaggt ggcagccatc tccttctcgg catcaagctt gagg 54 <210> 23 <211> 211 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Histone stem-loop <400> 23 gactagtgtc cacctgtccc tcctgggctg ctggattgtc tcgttttcct gccaaataaa 60 caggatcagc gctttacaga tctaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaatgc atcccccccc cccccccccc cccccccccc 180 cccaaaggct cttttcagag ccaccagaat t 211 <110> THE CATHOLIC UNIVERSITY OF KOREA INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> NUCLEIC ACID MOLECULES INSERTED EXPRESSION REGULATION SEQUENCES AND EXPRESSION VECTOR COMPRISING NUCLEIC ACID MOLECULES <130> 2434 <160> 23 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 59 <212> DNA <213> Sindbis virus <400> 1 attgacggcg tagtacacac tattgaatca aacagccgac caattgcact accatcaca 59 <210> 2 <211> 742 <212> DNA <213> Coxsackievirus B <400> 2 ttaaaacagc ctgtgggttg atcccaccca cagggcctat tgggcgctag cactctggta 60 tcacggtacc tttgtgcgcc tgttttatat cccctccccc aactgtaact tagaagtaac 120 acactccgat caacagtcag cgtggcacac cagccatgtt ttgatcaagc acttctgtta 180 ccccggactg agtatcaata gactgctcac gcggttgaag gagaaagcgt tcgttatccg 240 gccaactact tcgaaaaacc cagtaacacc atagaggttg cagagtgttt cgctcagcac 300 taccccagtg tagaccaggc cgatgagtca ccgcattccc cacgggcgac cgtggcggtg 360 gctgcgttgg cggcctgcct atggggaaac ccataggacg ctctaataca gacatggtgc 420 gaagagtcta ttgagctagt tggtaatcct ccggcccctg aatgcggcta atcctaactg 480 cggacagcac accctcaaac cagagggcag tgtgtcgtaa cgggcaactc tgcagcggaa 540 ccgactactt tgggtgtccg tgtttcattt tattcctata ctggctgctt atggtgacaa 600 ttgagagatt gttaccatat agctattgga ttggccatcc ggtgtctaat agagctatta 660 tatatctctt tgttggattt ataccactta gcttgagaga ggttaaaaca ttacaattca 720 ttgttaaatt gaatacaaca aa 742 <210> 3 <211> 574 <212> DNA <213> Encephalomyocarditis virus <400> 3 cccctctccc tccccccccc ctaacgttac tggccgaagc cgcttggaat aaggccggtg 60 tgcgtttgtc tatatgttat tttccaccat attgccgtct tttggcaatg tgagggcccg 120 gaaacctggc cctgtcttct tgacgagcat tcctaggggt ctttcccctc tcgccaaagg 180 aatgcaaggt ctgttgaatg tcgtgaagga agcagttcct ctggaagctt cttgaagaca 240 aacaacgtct gtagcgaccc tttgcaggca gcggaacccc ccacctggcg acaggtgcct 300 ctgcggccaa aagccacgtg tataagatac acctgcaaag gcggcacaac cccagtgcca 360 cgttgtgagt tggatagttg tggaaagagt caaatggctc tcctcaagcg tattcaacaa 420 ggggctgaag gatgcccaga aggtacccca ttgtatggga tctgatctgg ggcctcggtg 480 cacatgcttt acatgtgttt agtcgaggtt aaaaaacgtc taggcccccc gaaccacggg 540 gacgtggttt tcctttgaaa aacacgatga taat 574 <210> 4 <211> 197 <212> DNA <213> Japanese encephalitis virus <400> 4 agaagtttat ctgtgtgaac ttcttggctt agtatcgttg agaagaatcg agagattagt 60 gcagtttaaa cagtttttta gaacggaaga taaccatgac taaaaaacca ggagggcccg 120 gtaaaaaccg ggctatcaat atgctgaaac gcggcctacc ccgcgtattc ccactagtgg 180 gagtgaagag ggtagta 197 <210> 5 <211> 189 <212> DNA <213> Cricket paralysis virus <400> 5 aaagcaaaaa tgtgatcttg cttgtaaata caattttgag aggttaataa attacaagta 60 gtgctatttt tgtatttagg ttagctattt agctttacgt tccaggatgc ctagtggcag 120 ccccacaata tccaggaagc cctctctgcg gtttttcaga ttaggtagtc gaaaaaccta 180 agaaattta 189 <210> 6 <211> 311 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 ggggtaggga tgagggaggg aggggcattg tgatgtacag ggctgctctg tgagatcaag 60 ggtctcttaa gggtgggagc tggggcaggg actacgagag cagccagatg ggctgaaagt 120 ggaactcaag gggtttctgg cacctaccta cctgcttccc gctggggggt ggggagttgg 180 cccagagtct taagattggg gcagggtgga gaggtgggct cttcctgctt cccactcatc 240 ttatagcttt ctttccccag atccgaattc gagatccaaa ccaaggagga aaggatatca 300 cagaggagat c 311 <210> 7 <211> 321 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 7 cagcgttgat cacgtgacgt ggtttcagtg tttacacccg cagcgggccg ggggttcggc 60 ctcagtcagg cgctcagctc cgtttcggtt tcacttccgg tggagggccg cctctgagcg 120 ggcggcgggc cgacggcgag cgcgggcggc ggcggtgacg gaggcgccgc tgccaggggg 180 cgtgcggcag cgcggcggcg gcggcggcgg cggcggcggc ggaggcggcg gcggcggcgg 240 cggcggcggc ggctgggcct cgagcgcccg cagcccacct ctcgggggcg ggctcccggc 300 gctagcaggg ctgaagagaa g 321 <210> 8 <211> 157 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 8 gcgtgaggaa agtaccaaac agcagcggag ttttaaactt taaatagaca ggtctgagtg 60 cctgaacttg ccttttcatt ttacttcatc ctccaaggag ttcaatcact tggcgtgact 120 tcactacttt taagcaaaag agtggtgccc aggcaac 157 <210> 9 <211> 143 <212> DNA <213> Sindbis virus <400> 9 atggagaagc cagtagtaaa cgtagacgta gacccccaga gtccgtttgt cgtgcaactg 60 caaaaaagct tcccgcaatt tgaggtagta gcacagcagg tcactccaaa tgaccatgct 120 aatgccagag cattttcgca tct 143 <210> 10 <211> 319 <212> DNA <213> Sindbis virus <400> 10 ccgctacgcc ccaatgatcc gaccagcaaa actcgatgta cttccgagga actgatgtgc 60 ataatgcatc aggctggtac attagatccc cgcttaccgc gggcaatata gcaacactaa 120 aaactcgatg tacttccgag gaagcgcagt gcataatgct gcgcagtgtt gccacataac 180 cactatatta accatttatc tagcggacgc caaaaactca atgtatttct gaggaagcgt 240 ggtgcataat gccacgcagc gtctgcataa cttttattat ttcttttatt aatcaacaaa 300 attttgtttt taacatttc 319 <210> 11 <211> 103 <212> DNA <213> Coxsackievirus B <400> 11 taaattagag acaatttgat ctgatttgaa ttggcttaac cctactgtac taaccgaact 60 agacaacggt gcagtagggg taaattctcc gcattcggtg cgg 103 <210> 12 <211> 123 <212> DNA <213> Encephalomyocarditis virus <400> 12 tagtgtagtc actggcacaa cgcgttaccc ggtaagccaa tcgggtatac acggtcgtca 60 tactgcagac agggttcttc tactttgcaa gatagtctag agtagtaaaa taaatagata 120 gag 123 <210> 13 <211> 585 <212> DNA <213> Japanese encephalitis virus <400> 13 tagtgtgatt taaagtagaa aagtagacta tgtaaataat gtaaatgaga aaatgcatgc 60 atatggagtc aggccagcaa aagctgccac cggatactgg gtagacggtg ctgtctgcgt 120 ctcagtccca ggaggactgg gttaacaaat ctgacaacag aaagtgagaa agccctcaga 180 accgtctcgg aagtaggtcc ctgctcactg gaagttgaaa gaccaacgtc aggccacaaa 240 tttgtgccac cccgctaggg ggtgcggcct gcgcagcccc aggaggactg ggttaccaaa 300 gccgttgagc ccccacggcc caagcctcgt ctaggatgca atagacgagg tgtaaggact 360 agaggttaga ggagaccccg tggaaacaac aatatgcggc ccaagccccc tcgaagctgt 420 agaggaggtg gaaggactag aggttagagg agaccccgca tttgcatcaa acagcatatt 480 gacacctggg aatagactgg gagatcttct gctctatctc aacatcagct actaggcaca 540 gagcgccgaa gtatgtagct ggtggtgagg aagaacacag gatct 585 <210> 14 <211> 221 <212> DNA <213> Cricket paralysis virus <400> 14 agacatgata agatacattg atgagtttgg acaaaccaca acaagaatgc agtgaaaaaa 60 atgctttatt tgtgaaattt gtgatgctat tgctttattt gtaaccatta taagctgcaa 120 taaacaagtt aacaacaaca attgcattca ttttatgttt caggttcagg gggagatgtg 180 ggaggttttt taaagcaagt aaaacctcta caaatgtggt a 221 <210> 15 <211> 456 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 tgaccacaac tgagggctgg tggggccggg gacctggagc cccatggaca cacagatggc 60 ccggctagcc gcctggactg caggggggcg gcagcagcgg cggtggcagt gggtgcctgt 120 agtgtgatgt gtctgaacta ataaagtggc tgaagaggca ggatggcttg gggctgcctg 180 ggcccccctc caggatgccg ccaggtgtcc ctctcctccc cctggggcac agagatatat 240 tatatataaa gtcttgaaat ttggtgtgtc ttggggtggg gaggggcacc aacgcctgcc 300 cctggggtcc ttttttttat tttctgaaaa tcactctcgg gactgccgtc ctcgctgctg 360 ggggcatatg ccccagcccc tgtaccaccc ctgctgttgc ctgggcaggg ggaagggggg 420 gcacggtgcc tgtaattatt aaacatgaat tcaatt 456 <210> 16 <211> 517 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 tgtgaaggac cttcactcta agatgttata tttttcttaa aaagtaactc ctagtagggg 60 taccactgaa tctgtacaga gccgtaaaaa ctgaagttct gcctctgatg tattttgtga 120 gtttgtttct ttgaattttc attttacagt tacttttcct tgcatacaaa caagcatata 180 aaatggcaac aaactgcaca tgatttcaca aatattaaaa agtcttttaa aaagtattgc 240 caaacattaa tgttgatttc tagttattta ttctgggaat gtatagtatt tgaaaacaga 300 aattggtacc ttgcacacat catctgtaag ctgtttggtt ttaaaatact gtagataatt 360 aaccaaggta gaatgacctt gtaatgtaac tgctcttggg caatattctc tgtacatatt 420 agcgacaaca gattggattt tatgttgaca tttgtttggt tatagtgcaa tatattttgt 480 atgcaagcag tttcaataaa gtttgatctt cctctgc 517 <210> 17 <211> 337 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 17 aattcagaca aggcccacag aataagattt tccatgcatt tgcaaatacg tatattcttt 60 ttccatccac ttgcacaata tcattaccat cactttttca tcattcctca gctactactc 120 acattcattt aatggtttct gtaaacattt ttaagacagt tgggatgtca cttaacattt 180 tttttttttg agctaaagtc agggaatcaa gccatgctta atatttaaca atcacttata 240 tgtgtgtcga agagtttgtt ttgtttgtca tgtattggta caagcagata cagtataaac 300 tcacaaacac agatttgaaa ataatgcaca tatggtg 337 <210> 18 <211> 18 <212> DNA <213> Bacteriophage T7 <400> 18 taatacgact cactatag 18 <210> 19 <211> 936 <212> DNA <213> Renilla reniformis <400> 19 atgacttcga aagtttatga tccagaacaa aggaaacgga tgataactgg tccgcagtgg 60 tgggccagat gtaaacaaat gaatgttctt gattcattta ttaattatta tgattcagaa 120 aaacatgcag aaaatgctgt tattttttta catggtaacg cggcctcttc ttatttatgg 180 cgacatgttg tgccacatat tgagccagta gcgcggtgta ttataccaga ccttattggt 240 atgggcaaat caggcaaatc tggtaatggt tcttataggt tacttgatca ttacaaatat 300 cttactgcat ggtttgaact tcttaattta ccaaagaaga tcatttttgt cggccatgat 360 tggggtgctt gtttggcatt tcattatagc tatgagcatc aagataagat caaagcaata 420 gttcacgctg aaagtgtagt agatgtgatt gaatcatggg atgaatggcc tgatattgaa 480 gaagatattg cgttgatcaa atctgaagaa ggagaaaaaa tggttttgga gaataacttc 540 ttcgtggaaa ccatgttgcc atcaaaaatc atgagaaagt tagaaccaga agaatttgca 600 gcatatcttg aaccattcaa agagaaaggt gaagttcgtc gtccaacatt atcatggcct 660 cgtgaaatcc cgttagtaaa aggtggtaaa cctgacgttg tacaaattgt taggaattat 720 aatgcttatc tacgtgcaag tgatgattta ccaaaaatgt ttattgaatc ggacccagga 780 ttcttttcca atgctattgt tgaaggtgcc aagaagtttc ctaatactga atttgtcaaa 840 gtaaaaggtc ttcatttttc gcaagaagat gcacctgatg aaatgggaaa atatatcaaa 900 tcgttcgttg agcgagttct caaaaatgaa caataa 936 <210> 20 <211> 933 <212> DNA <213> Renilla reniformis <400> 20 acttcgaaag tttatgatcc agaacaaagg aaacggatga taactggtcc gcagtggtgg 60 gccagatgta aacaaatgaa tgttcttgat tcatttatta attattatga ttcagaaaaa 120 catgcagaaa atgctgttat ttttttacat ggtaacgcgg cctcttctta tttatggcga 180 catgttgtgc cacatattga gccagtagcg cggtgtatta taccagacct tattggtatg 240 ggcaaatcag gcaaatctgg taatggttct tataggttac ttgatcatta caaatatctt 300 actgcatggt ttgaacttct taatttacca aagaagatca tttttgtcgg ccatgattgg 360 ggtgcttgtt tggcatttca ttatagctat gagcatcaag ataagatcaa agcaatagtt 420 cacgctgaaa gtgtagtaga tgtgattgaa tcatgggatg aatggcctga tattgaagaa 480 gatattgcgt tgatcaaatc tgaagaagga gaaaaaatgg ttttggagaa taacttcttc 540 gtggaaacca tgttgccatc aaaaatcatg agaaagttag aaccagaaga atttgcagca 600 tatcttgaac cattcaaaga gaaaggtgaa gttcgtcgtc caacattatc atggcctcgt 660 gaaatcccgt tagtaaaagg tggtaaacct gacgttgtac aaattgttag gaattataat 720 gcttatctac gtgcaagtga tgatttacca aaaatgttta ttgaatcgga cccaggattc 780 ttttccaatg ctattgttga aggtgccaag aagtttccta atactgaatt tgtcaaagta 840 aaaggtcttc atttttcgca agaagatgca cctgatgaaa tgggaaaata tatcaaatcg 900 ttcgttgagc gagttctcaa aaatgaacaa taa 933 <210> 21 <211> 1653 <212> DNA Lucia cruciata <400> 21 atggaagatg ccaaaaacat taagaagggc ccagcgccat tctacccact cgaagacggg 60 accgccggcg agcagctgca caaagccatg aagcgctacg ccctggtgcc cggcaccatc 120 gcctttaccg acgcacatat cgaggtggac attacctacg ccgagtactt cgagatgagc 180 gttcggctgg cagaagctat gaagcgctat gggctgaata caaaccatcg gatcgtggtg 240 tgcagcgaga atagcttgca gttcttcatg cccgtgttgg gtgccctgtt catcggtgtg 300 gctgtggccc cagctaacga catctacaac gagcgcgagc tgctgaacag catgggcatc 360 agccagccca ccgtcgtatt cgtgagcaag aaagggctgc aaaagatcct 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ggcgacatcg cctactggga cgaggacgag cacttcttca tcgtggaccg gctgaagagc 1320 ctgatcaaat acaagggcta ccaggtagcc ccagccgaac tggagagcat cctgctgcaa 1380 caccccaaca tcttcgacgc cggggtcgcc ggcctgcccg acgacgatgc cggcgagctg 1440 cccgccgcag tcgtcgtgct ggaacacggt aaaaccatga ccgagaagga gatcgtggac 1500 tatgtggcca gccaggttac aaccgccaag aagctgcgcg gtggtgttgt gttcgtggac 1560 gaggtgccta aaggactgac cggcaagttg gacgcccgca agatccgcga gattctcatt 1620 aaggccaaga agggcggcaa gatcgccgtg taa 1653 <210> 22 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RPL32 <400> 22 ggggcgctgc ctacggaggt ggcagccatc tccttctcgg catcaagctt gagg 54 <210> 23 <211> 211 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Histone stem-loop <400> 23 gactagtgtc cacctgtccc tcctgggctg ctggattgtc tcgttttcct gccaaataaa 60 caggatcagc gctttacaga tctaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaatgc atcccccccc cccccccccc cccccccccc 180 cccaaaggct cttttcagag ccaccagaat t 211
Claims (21)
상기 적어도 하나의 발현 조절 서열과 작동 가능하게 연결되며, 단백질 또는 펩타이드를 암호화하는(encoding) 적어도 하나의 코딩 영역을 포함하고,
상기 적어도 하나의 발현 조절 서열의 5' 상류(upstream) 쪽에 인접하여 20 내지 400개의 아데노신 또는 티민이 연결되어 있는 핵산 분자.
At least one expression control sequence comprising a nucleotide sequence having an Internal Ribosomal Entry Site (IRES) activity; And
At least one coding region operably linked with said at least one expression control sequence, encoding a protein or peptide,
20 to 400 adenosine or thymine linked adjacent to the 5 'upstream side of the at least one expression control sequence.
상기 적어도 하나의 발현 조절 서열은 5‘-비번역영역(5’untranslated Region; 5‘-UTR)을 형성하는 핵산 분자.
The method of claim 1,
Wherein said at least one expression control sequence forms a 5'-untranslated region (5'-UTR).
상기 핵산 분자는 상기 5'-UTR의 3' 하류(downstream) 쪽에 위치하는 3’-비번역영역(3‘-UTR)을 더욱 포함하며, 상기 코딩 영역은 상기 5'-UTR과 상기 3'-UTR 사이에 위치하는 핵산 분자.
The method of claim 2,
The nucleic acid molecule further comprises a 3'-untranslated region (3'-UTR) located 3 'downstream of the 5'-UTR, wherein the coding region comprises the 5'-UTR and the 3'-. Nucleic acid molecules located between UTRs.
상기 적어도 하나의 발현 조절 서열은 바이러스성 IRES 염기 서열을 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 1,
Wherein said at least one expression control sequence comprises a viral IRES base sequence.
상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스, 토가바이러스과(Togaviridae) 바이러스, 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae) 바이러스, 플라비바이러스과(Flaviridae) 바이러스, 레트로바이러스과(Retroviridae) 바이러스, 헤르페스바이러스과(Herpesviridae) 바이러스 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 바이러스에서 유래한 바이러스성 IRES 염기 서열을 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 4, wherein
The viral IRES base sequence is Piconaviridae virus, Togaviridae virus, Dicistroviridae virus, Flaviridae virus, Retroviridae virus, Herpesviridae A nucleic acid molecule comprising a viral IRES base sequence derived from a virus selected from the group consisting of a virus and combinations thereof.
상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스, 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae) 바이러스 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 바이러스에서 유래하는 핵산 분자.
The method of claim 4, wherein
The viral IRES nucleotide sequence is a nucleic acid molecule derived from a virus selected from the group consisting of Picornaviridae virus, Dicistroiridae virus and combinations thereof.
상기 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스에서 유래한 상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 엔테로바이러스속(Enterovirus) 바이러스, 카디오바이러스속(Cardiovirus) 바이러스, 아프토바이러스속(Aptovirus) 바이러스, 헤파토바이러스속(Hepatovirus) 바이러스, 테스코바이러스속(Teschovirus) 바이러스 및 이들의 조합으로 구성되는 군에서 선택되는 피코나바이러스과 바이러스에서 유래하고,
상기 디시스트로바이러스과(Dicistroviridae) 바이러스에서 유래한 상기 바이러스성 IRES 염기 서열은 크리파바이러스속(Cripavirus) 바이러스에서 유래하는 핵산 분자.
The method of claim 6,
The viral IRES nucleotide sequence derived from the Picornaviridae virus is Enterovirus virus, Cardiovirus virus, Aptovirus virus, Hepatovirus. Is derived from the family of piconaviruses selected from the group consisting of viruses, Teschovirus viruses and combinations thereof,
The viral IRES base sequence derived from the Dicistroviridae virus is a nucleic acid molecule derived from a Creepavirus virus.
상기 피코나바이러스과(Picornaviridae) 바이러스에서 유래한 상기 IRES 염기 서열은 콕사키바이러스에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하고,
상기 디시스트로바이러스과 바이러스에서 유래한 상기 IRES 염기 서열은 귀뚜라미 마비바이러스(Cricket paralysis virus, CPV)에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 7, wherein
The IRES base sequence derived from the Picornaviridae virus includes an IRES base sequence derived from coxsackievirus,
The IRES nucleotide sequence derived from the dyscivirus virus includes a IRES nucleotide sequence derived from Cricket paralysis virus (CPV).
상기 코딩 영역은 항원 또는 이의 단편을 암호화하는 핵산 분자.
The method of claim 1,
Said coding region is a nucleic acid molecule encoding an antigen or fragment thereof.
상기 코딩 영역은 질병 치료를 위한 단백질 또는 이의 단편을 암호화하는 핵산 분자.
The method of claim 1,
The coding region is a nucleic acid molecule encoding a protein or fragment thereof for treating a disease.
상기 적어도 하나의 발현 조절 서열은 IRES의 염기 서열을 가지는 제 1 발현 조절 서열과, 상기 제 1 발현 조절 서열의 3' 하류 쪽에 위치하며 IRES의 염기 서열을 가지는 제 2 발현 조절 서열을 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 1,
Wherein said at least one expression control sequence is a nucleic acid molecule comprising a first expression control sequence having a base sequence of IRES and a second expression control sequence located 3 ′ downstream of the first expression control sequence and having a base sequence of IRES .
상기 코딩 영역은 상기 제 1 발현 조절 서열과 상기 제 2 발현 조절 서열 사이에 위치하는 제 1 코딩 영역과, 상기 제 2 발현 조절 서열의 3' 하류 쪽에 위치하는 제 2 코딩 영역을 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 11,
Wherein said coding region comprises a first coding region located between said first expression control sequence and said second expression control sequence and a second coding region located 3 'downstream of said second expression control sequence.
상기 제 1 코딩 영역과 상기 제 2 코딩 영역은 상이한 펩타이드 또는 단백질을 암호화하는 핵산 분자.
The method of claim 12,
Wherein said first coding region and said second coding region encode different peptides or proteins.
상기 제 1 발현 조절 서열과, 상기 제 2 발현 조절 중에서 선택되는 적어도 하나의 발현 조절 서열의 5' 상류 쪽에 인접하여 20 내지 400개의 아데노신 또는 티민이 결합되어 있는 핵산 분자.
The method of claim 11,
20 to 400 adenosine or thymine bound adjacent to the 5 'upstream side of the first expression control sequence and at least one expression control sequence selected from the second expression control sequence.
상기 제 1 발현 조절 서열의 5' 상류 쪽에 인접하여 30 내지 100개의 아데노신 또는 티민이 결합되어 있는 핵산 분자.
The method of claim 11,
A nucleic acid molecule having 30 to 100 adenosine or thymine bound adjacent to the 5 'upstream side of the first expression control sequence.
상기 제 1 발현 조절 서열은 콕사키바이러스B3(Coxsachie virus B3, CVB3) 또는 귀뚜라미 마비바이러스(Cricket paralysis virus, CPV)에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하고, 상기 제 2 발현 조절 서열은 뇌심근염 바이러스(Encephalomyocarditis virus, EMCV)에서 유래한 IRES 염기 서열을 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 11,
The first expression control sequence comprises an IRES base sequence derived from Coxsachie virus B3 (CVB3) or Cricket paralysis virus (CPV), and the second expression control sequence is brain myocarditis virus ( A nucleic acid molecule comprising an IRES nucleotide sequence derived from Encephalomyocarditis virus (EMCV).
상기 핵산 분자는 상기 발현 조절 서열의 5’상류 쪽에 위치하는 전사 조절 서열과, 상기 코딩 영역의 3’하류 쪽에 위치하는 폴리아데노신(poly adenosine; 폴리 (A)) 서열을 더욱 포함하는 핵산 분자.
The method of claim 1,
The nucleic acid molecule further comprises a transcriptional regulatory sequence located 5 'upstream of the expression control sequence and a poly adenosine (poly (A)) sequence located 3' downstream of the coding region.
상기 핵산 분자는 RNA인 핵산 분자.
The method of claim 1,
Wherein said nucleic acid molecule is RNA.
The recombinant expression vector which inserted the nucleic acid molecule of any one of Claims 1-18.
A method for producing the protein or peptide by injecting the nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 18 into a living body other than the human body, and expressing the protein or peptide from the injected nucleic acid molecule.
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