JPWO2022187424A5

JPWO2022187424A5 -

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Publication number: JPWO2022187424A5
Application number: JP2023547793A
Authority: JP
Publication date: 2024-03-26

Description

本開示により包含されるこれらの態様及び他の態様は、以下で及び特許請求の範囲においてより詳細に記載される。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
（ｉ）標的タンパク質抗原のエピトープを含む断片抗原と、
（ｉｉ）Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）由来の補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドと、を含む、融合ポリペプチド。
（項目２）
前記補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドが、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの前記ＳｂｉのドメインＩＩＩ及びドメインＩＶの一方もしくは両方、またはその機能性断片もしくはバリアントであるか、またはそれを含む、項目１に記載の融合ポリペプチド。
（項目３）
前記断片抗原が、
（ｉ）前記標的タンパク質抗原のアミノ酸配列長と比較して、少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％、
（ｉｉ）前記標的タンパク質抗原のアミノ酸配列長の５０％以下、
（ｉｉｉ）約１０～３００アミノ酸残基、または
（ｉｖ）それらの組み合わせのアミノ酸配列長を有する、項目１または２に記載の融合ポリペプチド。
（項目４）
（ｉ）標的タンパク質抗原のエピトープを含む抗原バリアントまたは断片抗原バリアントと、
（ｉｉ）Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）由来の補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドと、を含む、融合ポリペプチド。
（項目５）
前記補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドが、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの前記ＳｂｉのドメインＩＩＩ及びドメインＩＶの一方もしくは両方、またはその機能的断片もしくはバリアントであるか、またはそれを含む、項目４に記載の融合ポリペプチド。
（項目６）
（ｉ）前記抗原バリアントまたは断片抗原バリアントのアミノ酸配列長が、前記標的タンパク質抗原のアミノ酸配列長と同一であるか、
（ｉｉ）前記抗原バリアントまたは断片抗原バリアントが、前記標的タンパク質抗原と比較して、少なくとも１つの修飾アミノ酸を含むか、
（ｉｉｉ）前記抗原バリアントまたは断片抗原バリアントが、前記標的タンパク質抗原と比較して、少なくとも１つのアミノ酸変異を含むか、または
（ｉｖ）それらの組み合わせである、項目４または５に記載の融合ポリペプチド。
（項目７）
前記修飾アミノ酸が、Ｎ結合型グリコシル化を含む、項目６に記載の融合ポリペプチド。
（項目８）
前記変異が、（ａ）特定の位置において、前記標的タンパク質抗原中のその位置に存在するアミノ酸とは異なるセリン、スレオニン、アラニン、またはアミノ酸を導入するか、（ｂ）ジスルフィド結合の形成を防止するか、または（ａ）及び（ｂ）の両方である、項目６に記載の融合ポリペプチド。
（項目９）
前記断片抗原が、インビボで発現されるとき、主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）分子に結合することを特徴とする、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目１０）
前記断片抗原が、インビボで発現されるとき、ＭＨＣ分子に結合しないことを特徴とする、項目１～９のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目１１）
前記ＭＨＣ分子が、ＭＨＣＩ分子もしくはＭＨＣＩＩ分子であるか、またはＭＨＣＩ分子もしくはＭＨＣＩＩ分子を含む、項目９または１０に記載の融合ポリペプチド。
（項目１２）
前記断片抗原が、インビボで発現されるとき、前記標的タンパク質抗原内の天然位置にあるときの前記断片抗原の三次元コンホメーションと実質的に同一の三次元コンホメーションに折り畳まれることを特徴とする、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目１３）
前記標的タンパク質抗原が、
（ｉ）ウイルス抗原、細菌抗原、真菌抗原、もしくはそれらの組み合わせから選択される感染症疾患抗原、または
（ｉｉ）がん抗原であるか、またはそれを含む、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目１４）
前記ウイルス抗原が、インフルエンザ抗原、もしくはコロナウイルスポリペプチドであるか、またはインフルエンザ抗原、もしくはコロナウイルスポリペプチドを含む、項目１３に記載の融合ポリペプチド。
（項目１５）
前記コロナウイルスポリペプチドが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２タンパク質であるか、またはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２タンパク質を含む、項目１４に記載の融合ポリペプチド。
（項目１６）
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２タンパク質が、スパイクタンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｓ）もしくはその断片、エンベロープタンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｅ）もしくはその断片、膜タンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｍ）もしくはその断片、ヌクレオカプシドタンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｎ）もしくはその断片、補助因子ポリペプチドもしくはその断片、またはそれらの任意の組み合わせであるか、またはそれらを含む、項目１５に記載の融合ポリペプチド。
（項目１７）
前記断片抗原、抗原バリアント、または断片抗原バリアントが、配列番号３、４、５、６、７、８、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、または３１のうちのいずれか１つのアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を有する、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目１８）
前記補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドが、
（ａ）配列番号９のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または１００％の同一性を有するＳｂｉドメインＩＩＩ、または
（ｂ）配列番号１０のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または１００％の同一性を有するＳｂｉドメインＩＶ、または
（ｃ）（ａ）及び（ｂ）の両方を含む、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目１９）
前記ＳｂｉドメインＩＩＩ及び前記ＳｂｉドメインＩＶが、連続しているか、またはリンカーによって分離されている、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目２０）
（ａ）及び（ｂ）が、ヌクレオチド配列によってコードされ、同じヌクレオチド配列または異なるヌクレオチド配列に配置される、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目２１）
（ｉ）（ａ）が、（ｂ）のＮ末端に配置されるか、または
（ｉｉ）（ａ）が、（ｂ）のＣ末端に配置され、
（ｉｉｉ）（ａ）及び（ｂ）が連続しているか、もしくはリンカーによって分離されているか、または
（ｉｖ）それらの組み合わせである、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目２２）
（ｉ）前記リンカーが、ペプチジルリンカーであり、
（ｉｉ）前記リンカーが、少なくとも６０％のグリシン及び／またはセリンを含むペプチジルリンカーであり、
（ｉｉｉ）前記リンカーが、Ｇｌｙ－Ｇｌｙ－Ｇｌｙ－Ｇｌｙ－Ｓｅｒ（Ｇｌｙ４－Ｓｅｒ）リンカー、またはヒスチジンリンカーから選択される、項目２１に記載の融合ポリペプチド。
（項目２３）
前記リンカーが、配列番号１１の配列を含む、項目２２に記載の融合ポリペプチド。
（項目２４）
前記ポリペプチドが、分泌ペプチドを更に含む、項目１～２３のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目２５）
前記分泌ペプチドが、配列番号１または配列番号２のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、または１００％の同一性を有するアミノ酸を含む、項目２４に記載の融合ポリペプチド。
（項目２６）
前記ポリペプチドが、配列番号１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、または４５のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目２７）
前記ポリペプチドが、ＲＮＡであるかもしくはＲＮＡを含むポリヌクレオチド、またはＤＮＡであるかもしくはＤＮＡを含むポリヌクレオチドによってコードされる、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド。
（項目２８）
項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチドをコードする、融合ポリヌクレオチド。
（項目２９）
（ｉ）標的タンパク質抗原のエピトープを含む断片抗原、及び
（ｉｉ）Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）由来の補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチド、をコードするヌクレオチド配列を含む、融合ポリヌクレオチド。
（項目３０）
（ｉ）標的タンパク質抗原のエピトープを含む抗原バリアントまたは断片抗原バリアント、及び
（ｉｉ）Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）由来の補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチド、をコードするヌクレオチド配列を含む、融合ポリヌクレオチド。
（項目３１）
前記ポリヌクレオチドが、ＲＮＡであるかもしくはＲＮＡを含むか、または前記ポリヌクレオチドが、ＤＮＡであるかもしくはＤＮＡを含む、項目２９または３０に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３２）
前記補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドが、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの前記ＳｂｉのドメインＩＩＩ及びドメインＩＶの一方もしくは両方、またはその機能性断片もしくはバリアントであるか、またはそれを含む、項目３１に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３３）
前記ポリヌクレオチドが、前記標的タンパク質抗原と比較して少なくとも１つの修飾アミノ酸を含む抗原バリアントまたは断片抗原バリアントをコードする、項目３２に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３４）
前記ポリヌクレオチドが、インビボで発現されるとき、主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）分子に結合することを特徴とする断片抗原をコードする、項目３２または３３に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３５）
前記ポリヌクレオチドが、インビボで発現されるとき、ＭＨＣ分子に結合しないことを特徴とする断片抗原をコードする、項目３２または３３に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３６）
前記標的タンパク質抗原が、
（ｉ）ウイルス抗原、細菌抗原、真菌抗原、もしくはそれらの組み合わせから選択される感染症疾患抗原、または
（ｉｉ）がん抗原であるか、またはそれを含む、先行項目のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３７）
前記ウイルス抗原が、インフルエンザ抗原もしくはコロナウイルスポリペプチドであるか、またはインフルエンザ抗原もしくはコロナウイルスポリペプチドを含む、項目３６に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３８）
前記コロナウイルスポリペプチドが、スパイクタンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｓ）もしくはその断片、エンベロープタンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｅ）もしくはその断片、膜タンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｍ）もしくはその断片、ヌクレオカプシドタンパク質（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｎ）もしくはその断片、補助因子ポリペプチドもしくはその断片、またはそれらの任意の組み合わせから選択されるＳＡＲＳーＣｏＶ－２タンパク質であるか、またはそれを含む、項目３７に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目３９）
（ａ）が、（ｂ）のＣ末端に配置される、項目２９～３８のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目４０）
（ａ）及び（ｂ）が、連続しているか、またはリンカーをコードするヌクレオチド配列によって分離されている、項目２９～３９のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目４１）
前記ポリヌクレオチドが、分泌ペプチドをコードするヌクレオチド配列を更に含む、項目２９～４０のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド。
（項目４２）
前記ポリヌクレオチドが、配列番号４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、または５４のうちのいずれか１つのヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の同一性を有する、項目２９～４１のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオド。
（項目４３）
項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
（項目４４）
前記発現ベクターが、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターまたはＲＮＡベクターから選択されるウイルスベクターを含む、項目４３に記載の発現ベクター。
（項目４５）
項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチドまたは項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチドを送達するための組成物。
（項目４６）
項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４３もしくは４４に記載の発現ベクターを送達する、薬学的組成物。
（項目４７）
作製方法であって、
標的タンパク質抗原のエピトープを含む断片抗原をコードする第１のヌクレオチド配列と、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）由来の補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列とを組み換えて結合し、前記第１のヌクレオチド配列及び前記第２のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを形成することを含む、前記方法。
（項目４８）
項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４３もしくは４４に記載の発現ベクターを含む、細胞。
（項目４９）
項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４３もしくは４４に記載の発現ベクター、または項目４６に記載の薬学的組成物、及び使用説明書を含む、キット。
（項目５０）
投与を必要とする対象に、少なくとも１回の用量の、項目４６に記載の薬学的組成物を投与することを含む、方法。
（項目５１）
前記少なくとも１回の用量が、
（ｉ）前記対象における前記断片抗原に対する免疫応答を誘導すること、
（ｉｉ）Ｔ細胞応答の誘導を低減しながら、Ｂ細胞を刺激すること、または
（ｉｉｉ）（ｉ）及び（ｉｉ）の両方に有効な量で投与される、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
対象に、
項目４６に記載の薬学的組成物の第１の用量、及び
項目４６に記載の薬学的組成物の第２の用量を投与することを含む、方法。
（項目５３）
前記第１の用量及び前記第２の用量が、同じ量または異なる量である、項目５２に記載の方法。
（項目５４）
投与を必要とする対象が、
標的タンパク質抗原をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドまたは前記ポリヌクレオチドによってコードされる標的タンパク質抗原を送達する薬学的組成物の第１の用量、及び
項目４６に記載の薬学的組成物の第２の用量を受けるように、項目６４に記載の薬学的組成物の用量を、前記投与を必要とする対象に投与することを含む、方法。
（項目５５）
投与を必要とする対象が、
項目６４に記載の薬学的組成物の第１の用量、及び
標的タンパク質抗原をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドまたは前記ポリヌクレオチドによってコードされる標的タンパク質抗原を送達する薬学的組成物の第２の用量を受けるように、項目６４に記載の薬学的組成物の用量を、前記投与を必要とする対象に投与することを含む、方法。
（項目５６）
投与を必要とする対象が、
（ｉ）標的タンパク質抗原と、（ｉｉ）Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）由来の補体Ｃ３ｄ結合ポリペプチドと、を含む融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド、または前記ポリヌクレオチドによってコードされる融合ポリペプチドを送達する、薬学的組成物の第１の用量、及び、
項目４６に記載の薬学的組成物の第２の用量を受けるように、項目６４に記載の薬学的組成物の用量を、前記投与を必要とする対象に投与することを含む、方法。
（項目５７）
前記第１の用量及び前記第２の用量が、少なくとも３日、４日、５日、６日、７日、２週間、３週間、または４週間間隔で投与される、項目５２～５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目５８）
抗原の免疫原性を増強する方法であって、投与を必要とする対象に、項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、または項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４６に記載の薬学的組成物を投与することを含む、前記方法。
（項目５９）
抗原に対する免疫応答を刺激する方法であって、投与を必要とする対象に、項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、または項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４６に記載の薬学的組成物を投与することを含む、前記方法。
（項目６０）
疾患を治療するか、または疾患の症状を改善する方法であって、投与を必要とする対象に、項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、または項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４６に記載の薬学的組成物を投与することを含む、前記方法。
（項目６１）
項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、または項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４６に記載の薬学的組成物を含む組成物であって、抗原の免疫原性を増強する、抗原に対する免疫応答を刺激する、または疾患を治療する、もしくは疾患の症状を改善することに使用する、前記組成物。
（項目６２）
抗原の免疫原性を増強する、抗原に対する免疫応答を刺激する、または疾患を治療する、もしくは疾患の症状を改善するための薬剤の調製における、項目１～２７のいずれか１項に記載の融合ポリペプチド、または項目２８～４２のいずれか１項に記載の融合ポリヌクレオチド、または項目４６に記載の薬学的組成物を含む組成物の使用。
（項目６３）
前記融合ポリペプチド、融合ポリヌクレオチドまたは薬学的組成物が、対象に投与される、項目６１に記載の使用のための組成物、または項目６２に記載の使用。
（項目６４）
前記対象が哺乳動物である、項目５２～６０のいずれか１項に記載の方法、項目６３に記載の使用のための組成物、または項目６３に記載の使用。
（項目６５）
単回用量、または複数回用量の前記融合ポリペプチド、融合ポリヌクレオチド、または薬学的組成物が、対象に投与される、項目５２～６０もしくは６４のいずれか１項に記載の方法、項目６３に記載の使用のための組成物、または項目６３に記載の使用。
（項目６６）
前記融合ポリヌクレオチド、融合ポリペプチド、または薬学的組成物の投与によって、体液性応答がもたらされる、項目５２～６０もしくは６４～６５のいずれか１項に記載の方法、項目６３に記載の使用のための組成物、または項目６３に記載の使用。
（項目６７）
Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）をコードするヌクレオチド配列、またはその断片を含む組換えポリヌクレオチド。
（項目６８）
Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）を含む、単離されたポリペプチド。
（項目６９）
項目６４に記載のポリヌクレオチド、または項目６８に記載のポリペプチドを送達する、薬学的組成物。
（項目７０）
投与を必要とする対象に、少なくとも１回の用量の、項目６９に記載の薬学的組成物を投与することを含む、方法。
（項目７１）
免疫原性組成物におけるアジュバントとしてのＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）の使用。
（項目７２）
免疫原性組成物におけるアジュバントとして使用するための、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓの免疫グロブリン結合タンパク質（Ｓｂｉ）。 These and other aspects encompassed by this disclosure are described in more detail below and in the claims.
In certain embodiments, for example, the following items are provided:
(Item 1)
(i) a fragment antigen comprising an epitope of a target protein antigen;
(ii) a complement C3d binding polypeptide derived from the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi);
(Item 2)
2. The fusion polypeptide of item 1, wherein the complement C3d binding polypeptide is or comprises one or both of domain III and domain IV of the Sbi of Staphylococcus aureus, or a functional fragment or variant thereof.
(Item 3)
The fragment antigen is
(i) at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 95% compared to the amino acid sequence length of said target protein antigen; ,
(ii) 50% or less of the amino acid sequence length of the target protein antigen;
(iii) about 10-300 amino acid residues, or
(iv) The fusion polypeptide according to item 1 or 2, having an amino acid sequence length of a combination thereof.
(Item 4)
(i) an antigenic variant or fragment antigenic variant comprising an epitope of a target protein antigen;
(ii) a complement C3d binding polypeptide derived from the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi);
(Item 5)
5. The fusion polypeptide of item 4, wherein the complement C3d binding polypeptide is or comprises one or both of domain III and domain IV of the Sbi of Staphylococcus aureus, or a functional fragment or variant thereof.
(Item 6)
(i) the amino acid sequence length of the antigen variant or fragment antigen variant is the same as the amino acid sequence length of the target protein antigen;
(ii) said antigenic variant or fragment antigenic variant comprises at least one modified amino acid compared to said target protein antigen;
(iii) said antigenic variant or fragment antigenic variant comprises at least one amino acid mutation compared to said target protein antigen, or
(iv) The fusion polypeptide according to item 4 or 5, which is a combination thereof.
(Item 7)
7. The fusion polypeptide of item 6, wherein the modified amino acid comprises N-linked glycosylation.
(Item 8)
The mutation (a) introduces a serine, threonine, alanine, or amino acid at a particular position that is different from the amino acid present at that position in the target protein antigen, or (b) prevents the formation of a disulfide bond. or both (a) and (b).
(Item 9)
Fusion polypeptide according to any one of the preceding items, characterized in that said fragment antigen binds major histocompatibility complex (MHC) molecules when expressed in vivo.
(Item 10)
Fusion polypeptide according to any one of items 1 to 9, characterized in that the fragment antigen does not bind to MHC molecules when expressed in vivo.
(Item 11)
11. The fusion polypeptide according to item 9 or 10, wherein the MHC molecule is or comprises an MHC I or MHC II molecule.
(Item 12)
The fragment antigen is characterized in that when expressed in vivo, it folds into a three-dimensional conformation that is substantially the same as the three-dimensional conformation of the fragment antigen when in its native position within the target protein antigen. A fusion polypeptide according to any one of the preceding items.
(Item 13)
The target protein antigen is
(i) an infectious disease antigen selected from a viral antigen, a bacterial antigen, a fungal antigen, or a combination thereof; or
(ii) A fusion polypeptide according to any one of the preceding items, which is or comprises a cancer antigen.
(Item 14)
14. The fusion polypeptide of item 13, wherein the viral antigen is or comprises an influenza antigen or a coronavirus polypeptide.
(Item 15)
15. The fusion polypeptide of item 14, wherein the coronavirus polypeptide is or comprises a SARS-CoV-2 protein.
(Item 16)
The SARS-CoV-2 protein may include spike protein (SARS-CoV-2S) or a fragment thereof, envelope protein (SARS-CoV-2E) or a fragment thereof, membrane protein (SARS-CoV-2M) or a fragment thereof, nucleocapsid protein. (SARS-CoV-2N) or a fragment thereof, a cofactor polypeptide or a fragment thereof, or any combination thereof.
(Item 17)
The fragment antigen, antigen variant, or fragment antigen variant is SEQ ID NO: 3, 4, 5, 6, 7, 8, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, or At least 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or A fusion polypeptide according to any one of the preceding items, having an amino acid sequence with 100% identity.
(Item 18)
The complement C3d binding polypeptide is
(a) at least 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9; Sbi domain III having, or
(b) at least 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10; Sbi domain IV having, or
(c) A fusion polypeptide according to any one of the preceding items, comprising both (a) and (b).
(Item 19)
Fusion polypeptide according to any one of the preceding items, wherein said Sbi domain III and said Sbi domain IV are contiguous or separated by a linker.
(Item 20)
Fusion polypeptide according to any one of the preceding items, wherein (a) and (b) are encoded by nucleotide sequences and are arranged in the same or different nucleotide sequences.
(Item 21)
(i) (a) is located at the N-terminus of (b), or
(ii) (a) is located at the C-terminus of (b);
(iii) (a) and (b) are consecutive or separated by a linker; or
(iv) A fusion polypeptide according to any one of the preceding items, which is a combination thereof.
(Item 22)
(i) the linker is a peptidyl linker;
(ii) the linker is a peptidyl linker containing at least 60% glycine and/or serine;
(iii) The fusion polypeptide according to item 21, wherein the linker is selected from a Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (Gly4-Ser) linker or a histidine linker.
(Item 23)
23. The fusion polypeptide of item 22, wherein said linker comprises the sequence of SEQ ID NO: 11.
(Item 24)
The fusion polypeptide according to any one of items 1 to 23, wherein said polypeptide further comprises a secreted peptide.
(Item 25)
25. The fusion polypeptide of item 24, wherein the secreted peptide comprises amino acids having at least 80%, 85%, 90%, or 100% identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2.
(Item 26)
The polypeptide is SEQ ID NO: 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, or At least 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity to the 45 amino acid sequence A fusion polypeptide according to any one of the preceding items.
(Item 27)
A fusion polypeptide according to any one of the preceding items, wherein said polypeptide is encoded by a polynucleotide that is or comprises RNA, or a polynucleotide that is or comprises DNA.
(Item 28)
A fusion polynucleotide encoding a fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27.
(Item 29)
(i) a fragment antigen containing an epitope of the target protein antigen, and
(ii) a fusion polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding a complement C3d binding polypeptide from the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi).
(Item 30)
(i) an antigenic variant or fragment antigenic variant comprising an epitope of the target protein antigen; and
(ii) a fusion polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding a complement C3d binding polypeptide from the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi).
(Item 31)
31. The fusion polynucleotide of item 29 or 30, wherein the polynucleotide is or comprises RNA, or the polynucleotide is or comprises DNA.
(Item 32)
32. The fusion polynucleotide of item 31, wherein the complement C3d binding polypeptide is or comprises one or both of domain III and domain IV of the Sbi of Staphylococcus aureus, or a functional fragment or variant thereof.
(Item 33)
33. The fusion polynucleotide of item 32, wherein said polynucleotide encodes an antigenic variant or fragment antigen variant comprising at least one modified amino acid compared to said target protein antigen.
(Item 34)
A fusion polynucleotide according to item 32 or 33, wherein said polynucleotide encodes a fragment antigen characterized in that it binds to major histocompatibility complex (MHC) molecules when expressed in vivo.
(Item 35)
Fusion polynucleotide according to item 32 or 33, encoding a fragment antigen characterized in that said polynucleotide does not bind to MHC molecules when expressed in vivo.
(Item 36)
The target protein antigen is
(i) an infectious disease antigen selected from a viral antigen, a bacterial antigen, a fungal antigen, or a combination thereof; or
(ii) A fusion polynucleotide according to any one of the preceding items, which is or comprises a cancer antigen.
(Item 37)
37. The fusion polynucleotide of item 36, wherein the viral antigen is or comprises an influenza antigen or a coronavirus polypeptide.
(Item 38)
The coronavirus polypeptide may include spike protein (SARS-CoV-2S) or a fragment thereof, envelope protein (SARS-CoV-2E) or a fragment thereof, membrane protein (SARS-CoV-2M) or a fragment thereof, nucleocapsid protein (SARS-CoV-2S) or a fragment thereof, - CoV-2N) or a fragment thereof, a cofactor polypeptide or a fragment thereof, or any combination thereof, or a fusion polynucleotide according to item 37. .
(Item 39)
A fusion polynucleotide according to any one of items 29 to 38, wherein (a) is located at the C-terminus of (b).
(Item 40)
Fusion polynucleotide according to any one of items 29 to 39, wherein (a) and (b) are contiguous or separated by a nucleotide sequence encoding a linker.
(Item 41)
41. The fusion polynucleotide of any one of items 29-40, wherein said polynucleotide further comprises a nucleotide sequence encoding a secreted peptide.
(Item 42)
the polynucleotide is at least 80%, 85%, 90%, 91% relative to the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NOs: 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, or 54; The fusion polynucleotide of any one of items 29-41, having an identity of 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100%.
(Item 43)
An expression vector comprising the fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42.
(Item 44)
44. The expression vector according to item 43, wherein the expression vector comprises a viral vector selected from a retroviral vector, an adenoviral vector, an adeno-associated viral vector or a lentiviral vector or an RNA vector.
(Item 45)
A composition for delivering a fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27 or a fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42.
(Item 46)
A pharmaceutical composition delivering a fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27, a fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42, or an expression vector according to items 43 or 44. .
(Item 47)
A manufacturing method,
recombinantly conjugating a first nucleotide sequence encoding a fragment antigen comprising an epitope of a target protein antigen and a second nucleotide sequence encoding a complement C3d binding polypeptide derived from the immunoglobulin binding protein (Sbi) of Staphylococcus aureus; and forming a polynucleotide comprising the first nucleotide sequence and the second nucleotide sequence.
(Item 48)
A cell comprising a fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27, a fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42, or an expression vector according to items 43 or 44.
(Item 49)
The fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27, the fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42, or the expression vector according to item 43 or 44, or the pharmaceutical agent according to item 46 A kit comprising a chemical composition and instructions for use.
(Item 50)
47. A method comprising administering at least one dose of the pharmaceutical composition of item 46 to a subject in need thereof.
(Item 51)
said at least one dose is
(i) inducing an immune response against the fragment antigen in the subject;
(ii) stimulating B cells while reducing induction of T cell responses; or
(iii) The method of item 50, wherein both (i) and (ii) are administered in an effective amount.
(Item 52)
To target,
a first dose of the pharmaceutical composition according to item 46, and
47. A method comprising administering a second dose of the pharmaceutical composition according to item 46.
(Item 53)
53. The method of item 52, wherein the first dose and the second dose are the same amount or different amounts.
(Item 54)
The subject requiring administration is
a first dose of a pharmaceutical composition that delivers a polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding a target protein antigen or a target protein antigen encoded by said polynucleotide; and
65. A method comprising administering a dose of the pharmaceutical composition of item 64 to a subject in need thereof such that the subject receives a second dose of the pharmaceutical composition of item 46.
(Item 55)
The subject requiring administration is
a first dose of the pharmaceutical composition according to item 64, and
of the pharmaceutical composition according to item 64, to receive a second dose of a polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding a target protein antigen or a pharmaceutical composition that delivers a target protein antigen encoded by said polynucleotide. A method comprising administering a dose to a subject in need thereof.
(Item 56)
The subject requiring administration is
A polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding a fusion polypeptide comprising (i) a target protein antigen and (ii) a complement C3d binding polypeptide derived from the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi), or said polynucleotide a first dose of a pharmaceutical composition that delivers a fusion polypeptide encoded by; and
65. A method comprising administering a dose of the pharmaceutical composition of item 64 to a subject in need thereof such that the subject receives a second dose of the pharmaceutical composition of item 46.
(Item 57)
Any of items 52-56, wherein the first dose and the second dose are administered at least 3 days, 4 days, 5 days, 6 days, 7 days, 2 weeks, 3 weeks, or 4 weeks apart. or the method described in paragraph 1.
(Item 58)
A method of enhancing the immunogenicity of an antigen, comprising administering to a subject in need thereof a fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27, or a fusion polypeptide according to any one of items 28 to 42. 47. The method comprising administering a fusion polynucleotide or a pharmaceutical composition according to item 46.
(Item 59)
A method of stimulating an immune response against an antigen, comprising administering to a subject in need thereof a fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27, or a fusion according to any one of items 28 to 42. 47. The method comprising administering a polynucleotide or a pharmaceutical composition according to item 46.
(Item 60)
A method of treating a disease or ameliorating symptoms of a disease, wherein the fusion polypeptide of any one of items 1 to 27 or any of items 28 to 42 is administered to a subject in need thereof. 47. The method comprising administering the fusion polynucleotide of item 1 or the pharmaceutical composition of item 46.
(Item 61)
A composition comprising the fusion polypeptide according to any one of items 1 to 27, or the fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42, or the pharmaceutical composition according to item 46, , the composition for use in enhancing the immunogenicity of an antigen, stimulating an immune response to an antigen, or treating a disease or ameliorating symptoms of a disease.
(Item 62)
A fusion according to any one of items 1 to 27 in the preparation of a medicament for enhancing the immunogenicity of an antigen, stimulating an immune response against an antigen, or treating a disease or ameliorating the symptoms of a disease. Use of a composition comprising a polypeptide, or a fusion polynucleotide according to any one of items 28 to 42, or a pharmaceutical composition according to item 46.
(Item 63)
A composition for use according to item 61, or a use according to item 62, wherein said fusion polypeptide, fusion polynucleotide or pharmaceutical composition is administered to a subject.
(Item 64)
The method according to any one of items 52 to 60, the composition for the use according to item 63, or the use according to item 63, wherein the subject is a mammal.
(Item 65)
63. The method of any one of items 52-60 or 64, wherein a single dose, or multiple doses of said fusion polypeptide, fusion polynucleotide, or pharmaceutical composition is administered to the subject. Composition for use as described or use as described in item 63.
(Item 66)
The method of any one of items 52-60 or 64-65, the use of item 63, wherein administration of the fusion polynucleotide, fusion polypeptide, or pharmaceutical composition results in a humoral response. or the use according to item 63.
(Item 67)
A recombinant polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi), or a fragment thereof.
(Item 68)
An isolated polypeptide comprising the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi).
(Item 69)
A pharmaceutical composition that delivers a polynucleotide according to item 64 or a polypeptide according to item 68.
(Item 70)
70. A method comprising administering at least one dose of the pharmaceutical composition of item 69 to a subject in need thereof.
(Item 71)
Use of Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi) as an adjuvant in an immunogenic composition.
(Item 72)
Immunoglobulin binding protein (Sbi) of Staphylococcus aureus for use as an adjuvant in immunogenic compositions.

Claims

(i) a fragment antigen , antigen variant, or fragment antigen variant comprising an epitope of a target protein antigen, said target protein antigen comprising:
(a) an infectious disease antigen selected from a viral antigen, or a bacterial antigen, or a combination thereof; or
(b) Cancer antigen
a fragment antigen, antigen variant, or fragment antigen variant that is or comprises ;
(ii) A fusion polynucleotide that is RNA and comprises a nucleotide sequence encoding a complement C3d binding polypeptide derived from the Staphylococcus aureus immunoglobulin binding protein (Sbi).

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein the complement C3d binding polypeptide is or comprises domain III and domain IV of the Sbi of Staphylococcus aureus, or a functional fragment or variant thereof.

2. The fusion polynucleotide of claim 1 , wherein the viral antigen is or comprises an influenza antigen or a coronavirus polypeptide.

The coronavirus polypeptide may include spike protein (SARS-CoV-2S) or a fragment thereof, envelope protein (SARS-CoV-2E) or a fragment thereof, membrane protein (SARS-CoV-2M) or a fragment thereof, nucleocapsid protein (SARS-CoV-2S) or a fragment thereof, -CoV-2N) or a fragment thereof, a cofactor polypeptide or a fragment thereof, or any combination thereof , or comprises a SARS-CoV-2 protein. The fusion polynucleotide described in.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein (i) and (ii) are consecutive.

2. The fusion polynucleotide of claim 1 , wherein the polynucleotide further comprises a nucleotide sequence encoding a secreted peptide.

(i) a fragment antigen , antigen variant, or fragment antigen variant comprising an epitope of a target protein antigen, said target protein antigen comprising:
(a) an infectious disease antigen selected from a viral antigen, or a bacterial antigen, or a combination thereof; or
(b) a fragment antigen, antigen variant, or fragment antigen variant that is or comprises a cancer antigen ; and (ii) a complement C3d binding polypeptide derived from the immunoglobulin binding protein (Sbi) of Staphylococcus aureus. comprising a nucleotide sequence encoding
A fusion polynucleotide, wherein the polynucleotide has at least 80% identity to the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NOs: 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, or 54 .

An expression vector comprising the fusion polynucleotide of claim 1.

2. The fusion polynucleotide of claim 1 , wherein the polynucleotide encodes an antigenic variant or fragment antigen variant comprising at least one modified amino acid compared to the target protein antigen.

2. The fusion polynucleotide of claim 1 , wherein said polynucleotide encodes a fragment antigen characterized by binding to major histocompatibility complex (MHC) molecules when expressed in vivo.

11. The fusion polynucleotide of claim 10, wherein the MHC molecule is or comprises an MHC I molecule.

characterized in that the fragment antigen, when expressed in vivo, folds into the same three-dimensional conformation as the three-dimensional conformation of the fragment antigen when in its native position within the target protein antigen; A fusion polynucleotide according to claim 1.

The fragment antigen is
(i) at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 95% compared to the amino acid sequence length of said target protein antigen; ,
(ii) 50% or less of the amino acid sequence length of the target protein antigen;
(iii) 10-300 amino acid residues, or
(iv) The fusion polynucleotide of claim 1 encoded by a polynucleotide having an amino acid sequence length of a combination thereof.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein (i) is located at the N-terminus of (ii).

8. The fusion polynucleotide of claim 7, wherein the polynucleotide is or comprises RNA.

A pharmaceutical composition comprising a fusion polynucleotide according to claim 1 .

A cell comprising the fusion polynucleotide of claim 1 .

5. The fusion polynucleotide of claim 4, wherein the SARS-CoV-2 protein comprises an RBD domain or a portion thereof.

The SARS-CoV-2 protein is any one of SEQ ID NOs: 3, 4, 5, 6, 7, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, or 31. 19. The fusion polynucleotide of claim 18, encoded by a fusion polynucleotide having at least 80% identity to one sequence.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein the complement C3d binding polypeptide is encoded by a fusion polynucleotide having at least 80% identity to the sequence SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 10.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein the fragment antigen, antigen variant, or fragment antigen variant further comprises an amino acid sequence derived from a second target protein antigen.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein (i) is located at the C-terminus of (ii).

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein (i) and (ii) are separated by a nucleotide sequence encoding a linker.

11. The fusion polynucleotide of claim 10, wherein the MHC molecule is or comprises an MHC II molecule.

4. The polynucleotide of claim 1, wherein the polynucleotide has at least 80% identity to a nucleotide sequence of any one of SEQ ID NOs: 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, or 54. The described fusion polynucleotide.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein the complement C3d binding polypeptide is or comprises domain III of the Sbi of Staphylococcus aureus, or a functional fragment or variant thereof.

2. The fusion polynucleotide of claim 1, wherein the complement C3d binding polypeptide is or comprises domain IV of the Sbi of Staphylococcus aureus, or a functional fragment or variant thereof.