JP7414106B2 - Protein with immunoglobulin binding activity - Google Patents
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Landscapes
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Description
本発明は、免疫グロブリン吸着剤のリガンドタンパク質として利用可能な、免疫グロブ
リン結合活性を有するタンパク質に関する。より詳しくは、本発明は、従来の免疫グロブ
リン吸着剤よりも温和なpH条件で抗体の溶出が可能な免疫グロブリン吸着剤のリガンド
タンパク質として利用可能な、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質に関する。
The present invention relates to a protein having immunoglobulin binding activity that can be used as a ligand protein for an immunoglobulin adsorbent. More specifically, the present invention relates to a protein having immunoglobulin-binding activity that can be used as a ligand protein for an immunoglobulin adsorbent that can elute antibodies under milder pH conditions than conventional immunoglobulin adsorbents.
抗体医薬は生体内の免疫機能を担う分子である抗体(免疫グロブリン)を利用した医薬
である。抗体医薬は抗体が有する可変領域の多様性により標的分子に対し高い特異性と親
和性をもって結合する。そのため抗体医薬は副作用が少なく、また、近年では適応疾患が
広がってきていることもあり市場が急速に拡大している。
Antibody medicines are medicines that utilize antibodies (immunoglobulins), which are molecules responsible for immune functions in living bodies. Antibody drugs bind to target molecules with high specificity and affinity due to the diversity of the antibody's variable regions. As a result, antibody drugs have few side effects, and the market for them is rapidly expanding as the range of diseases for which they are applicable has expanded in recent years.
抗体医薬の製造は培養工程と精製工程を含み、培養工程では生産性を向上させるために
抗体産生細胞の改質や培養条件の最適化が図られている。また、精製工程では粗精製とし
てアフィニティークロマトグラフィーが採用され、その後の中間精製、最終精製、および
ウイルス除去を経て製剤化される。
The production of antibody drugs includes a culture process and a purification process, and in the culture process, antibody-producing cells are modified and culture conditions are optimized to improve productivity. In the purification process, affinity chromatography is employed for crude purification, followed by intermediate purification, final purification, and virus removal to form a formulation.
粗精製として実施するアフィニティークロマトグラフィーでは抗体分子を特異的に認識
するアフィニティー担体が用いられる。前記担体で用いられるリガンドタンパク質として
、抗体(免疫グロブリン)に結合する性質を有した、ブドウ球菌(Staphyloco
ccus)属細菌由来Protein Aが多く用いられている。しかしながら、Pro
tein Aは抗体のFc領域に特異的に結合するタンパク質であるため、シングルチェ
ーンFv(scFv)、Fab、F(ab’)2、IgAおよび二重特異性T細胞誘導(
BiTE)抗体といったFc領域を有しない抗体の精製には適用できなかった。一方、F
inegoldia属細菌由来Protein Lは、免疫グロブリンのκ軽鎖に結合す
るタンパク質であるため、Protein Lをリガンドタンパク質とすることで、前述
したProtein Aでは精製できない、Fc領域を有しない抗体の精製も可能となる
。
Affinity chromatography, which is performed as a crude purification, uses an affinity carrier that specifically recognizes antibody molecules. The ligand protein used in the carrier is Staphylococcus spp., which has the property of binding to antibodies (immunoglobulins).
Protein A derived from bacteria of the genus Ccus is often used. However, Pro
Since tein A is a protein that specifically binds to the Fc region of antibodies, it can be used for single chain Fv (scFv), Fab, F(ab') 2 , IgA and bispecific T cell induction (
It could not be applied to the purification of antibodies that do not have an Fc region, such as antibodies (BiTE). On the other hand, F
Protein L derived from bacteria belonging to the inegoldia genus is a protein that binds to the κ light chain of immunoglobulins, so by using Protein L as a ligand protein, it is also possible to purify antibodies that do not have an Fc region, which cannot be purified with the aforementioned Protein A. becomes.
抗体医薬の精製工程では、中性pH条件下で抗体分子をアフィニティー担体に吸着させ
た後、酸性pH条件下で抗体分子を前記担体から溶出させる工程を含むが、当該酸性pH
条件は抗体分子にダメージを与え、凝集の原因となるため、溶出時のpHは高い(つまり
中性に近い)ほうが好ましい。
The antibody drug purification process includes a step of adsorbing antibody molecules to an affinity carrier under neutral pH conditions and then eluting the antibody molecules from the carrier under acidic pH conditions.
Since these conditions damage antibody molecules and cause aggregation, it is preferable that the pH at the time of elution is high (that is, close to neutral).
抗体溶出pHを高める方法として、フレキシブルなアミノ酸残基を有したオリゴペプチ
ドを免疫グロブリン結合性タンパク質に挿入する方法(非特許文献1)や、免疫グロブリ
ン結合性タンパク質中の特定アミノ酸残基をヒスチジン残基に置換する方法(特許文献1
)が知られている。しかしながら、これらの文献に記載の方法では免疫グロブリン結合性
タンパク質の化学的安定性が低下することが報告されている。そのため、化学的安定性を
低下させることなく、抗体溶出pHが高い(すなわち温和なpH条件での抗体溶出が可能
な)免疫グロブリン結合性タンパク質が求められている。
As a method to increase the antibody elution pH, there is a method of inserting an oligopeptide having flexible amino acid residues into an immunoglobulin-binding protein (Non-Patent Document 1), and a method of inserting a specific amino acid residue in an immunoglobulin-binding protein into a histidine residue. Method of substituting groups (Patent Document 1
)It has been known. However, it has been reported that the methods described in these documents reduce the chemical stability of immunoglobulin-binding proteins. Therefore, there is a need for an immunoglobulin-binding protein that has a high antibody elution pH (that is, allows antibody elution under mild pH conditions) without reducing chemical stability.
本発明の課題は、従来の免疫グロブリン吸着剤よりも温和なpH条件で抗体溶出が可能
な免疫グロブリン吸着剤のリガンドタンパク質として利用可能な、免疫グロブリン結合活
性を有するタンパク質を提供することにある。
An object of the present invention is to provide a protein with immunoglobulin binding activity that can be used as a ligand protein for an immunoglobulin adsorbent that allows antibody elution under milder pH conditions than conventional immunoglobulin adsorbents.
本発明者らは、前記課題を解決するため鋭意検討した結果、Finegoldia属細
菌由来Protein L(FpL)の免疫グロブリン結合ドメインにおける抗体溶出特
性に関与したアミノ酸残基を特定し、当該アミノ酸残基を他の特定のアミノ酸残基に置換
することで、前記課題を解決できることを見出し、本発明を完成するに至った。
As a result of intensive studies to solve the above problems, the present inventors identified amino acid residues involved in antibody elution characteristics in the immunoglobulin binding domain of Protein L (FpL) derived from Finegoldia bacteria, and The present inventors have discovered that the above problem can be solved by substituting other specific amino acid residues, and have completed the present invention.
すなわち、本発明は以下の態様を包含する:
[1]
Finegoldia属細菌由来Protein Lの免疫グロブリン結合ドメインの
アミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の(1)から(
11)より選択される1つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有
するタンパク質;
(1)配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基がグルタミンに置換
(2)配列番号1の13番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(3)配列番号1の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンまたはイソロイシ
ンに置換
(4)配列番号1の6番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(5)配列番号1の8番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
(6)配列番号1の15番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(7)配列番号1の23番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニン
またはロイシンに置換
(8)配列番号1の34番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、
フェニルアラニン、ロイシンおよびバリンのいずれかに置換
(9)配列番号1の38番目のリジンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
(10)配列番号1の50番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置
換
(11)配列番号1の53番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換。
[2]
以下の(a)から(c)のいずれかに記載のタンパク質である、[1]に記載のタンパ
ク質:
(a)配列番号1または5に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列におい
て、少なくとも前記(1)から(11)より選択される1つ以上のアミノ酸置換を有し、
かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質;
(b)配列番号1または5に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列におい
て、少なくとも前記(1)から(11)より選択される1つ以上のアミノ酸置換を有し、
さらに前記(1)から(11)以外に1もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ
酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を
有するタンパク質;
(c)配列番号1または5に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と70%以上の相同
性を有するアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記(1
)から(11)より選択される1つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合
活性を有するタンパク質。
[3]
さらに、少なくとも以下の(i)から(liii)より選択される1つ以上のアミノ酸
置換を有する、[1]または[2]に記載のタンパク質:
(i)配列番号1の50番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
(ii)配列番号1の1番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバ
リンに置換
(iii)配列番号1の3番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
(iv)配列番号1の4番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリ
シンに置換
(v)配列番号1の5番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(vi)配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(vii)配列番号1の8番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
(viii)配列番号1の9番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(ix)配列番号1の17番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニ
ンに置換
(x)配列番号1の21番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
(xi)配列番号1の27番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたは
アルギニンに置換
(xii)配列番号1の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
(xiii)配列番号1の31番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置
換
(xiv)配列番号1の36番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xv)配列番号1の41番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
(xvi)配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたは
グリシンに置換
(xvii)配列番号1の49番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニン
またはイソロイシンに置換
(xviii)配列番号1の50番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、
リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
(xix)配列番号1の51番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(xx)配列番号1の52番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシ
ンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
(xxi)配列番号1の53番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニン
に置換
(xxii)配列番号1の54番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシン
またはメチオニンに置換
(xxiii)配列番号1の62番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジ
ン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
(xxiv)配列番号1の65番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに
置換
(xxv)配列番号1の69番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
(xxvi)配列番号1の2番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプ
ロリンに置換
(xxvii)配列番号1の3番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置
換
(xxviii)配列番号1の5番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンま
たはアルギニンに置換
(xxix)配列番号1の27番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リ
ジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
(xxx)配列番号1の32番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシン
に置換
(xxxi)配列番号1の38番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xxxii)配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイ
シンに置換、
(xxxiii)配列番号1の47番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニン
またはアルギニンに置換
(xxxiv)配列番号1の52番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラ
ギンに置換
(xxxv)配列番号1の2番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xxxvi)配列番号1の5番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギ
ン酸に置換
(xxxvii)配列番号1の6番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまた
はスレオニンに置換
(xxxviii)配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置
換
(xxxix)配列番号1の14番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xl)配列番号1の23番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまた
はバリンに置換
(xli)配列番号1の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに
置換
(xlii)配列番号1の31番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに
置換
(xliii)配列番号1の33番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラ
ギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
(xliv)配列番号1の35番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置
換
(xlv)配列番号1の36番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
(xlvi)配列番号1の37番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置
換
(xlvii)配列番号1の41番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシン
またはチロシンに置換
(xlviii)配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチ
ジンまたはアルギニンに置換
(xlviv)配列番号1の52番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシン
またはチロシンに置換
(l)配列番号1の60番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
(li)配列番号1の64番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
(lii)配列番号1の66番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(liii)配列番号1の69番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたは
バリンに置換。
[4]
さらに、少なくとも以下の(I)から(VII)より選択される1つ以上のリジン残基
がリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸残基に置換した、[
1]から[3]のいずれかに記載のタンパク質:
(I)配列番号1の7番目に相当するリジン残基
(II)配列番号1の13番目に相当するリジン残基
(III)配列番号1の22番目に相当するリジン残基
(IV)配列番号1の29番目に相当するリジン残基
(V)配列番号1の38番目に相当するリジン残基
(VI)配列番号1の48番目に相当するリジン残基
(VII)配列番号1の67番目に相当するリジン残基。
[5]
さらに、配列番号1の49番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン
酸への置換、配列番号1の6番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、
配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換
、配列番号1の49番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列
番号1の62番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号
1の23番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、および
配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換
より選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、[1]から[4]のいずれかに記載の
タンパク質。
[6]
少なくとも以下の(X)または(Y)のアミノ酸置換を有する、[1]から[5]のい
ずれかに記載のタンパク質:
(X)配列番号1の4番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、
配列番号1の6番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号1の
7番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号1の13番目、2
2番目、48番目および67番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換
、配列番号1の23番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、
配列番号1の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番
号1の38番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号1の
44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号1の4
9番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号1の
50番目および62番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配
列番号1の53番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換なら
びに配列番号1の69番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換;
(Y)配列番号1の4番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、
配列番号1の6番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号1の
7番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号1の13番目、2
2番目および67番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号
1の23番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号1
の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号1の38
番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号1の44番目の
アスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号1の48番目のリ
ジンに相当するアミノ酸残基のヒスチジンへの置換、配列番号1の49番目のグルタミン
酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号1の50番目および62
番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号1の53番目
のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換、配列番号1の64番目
のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のロイシンへの置換ならびに配列番号1の69番
目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換。
[7]
配列番号207または212に記載のアミノ酸配列を含む、[1]から[6]のいずれ
かに記載のタンパク質。
[8]
[1]から[7]のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
[9]
[8]に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
[10]
以下の(A)または(B)を含む、遺伝子組換え宿主:
(A)[1]から[7]のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(B)[1]から[7]のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを
含む発現ベクター。
[11]
宿主がエシェリヒア・コリ(Escherichia coli)である、[10]に
記載の遺伝子組換え宿主。
[12]
[1]から[7]のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む
遺伝子組換え宿主または該ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを含む遺伝子組換え宿主
を培養し該タンパク質を発現させる工程と、発現した前記タンパク質を回収する工程とを
含む、免疫グロブリン結合性タンパク質の製造方法。
[13]
宿主がエシェリヒア・コリ(Escherichia coli)である、[12]に
記載の製造方法。
[14]
不溶性担体と、当該不溶性担体に固定化した[1]から[7]のいずれかに記載のタン
パク質とを含む、免疫グロブリン吸着剤。
[15]
[14]に記載の吸着剤を充填したカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加し当該免
疫グロブリンを前記吸着剤に吸着させる工程と、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを
pH変化で溶出させる工程とを含む、前記溶液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法。
[16]
前記pH変化が、pHの低下である、[15]に記載の方法。
That is, the present invention includes the following aspects:
[1]
Contains the amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain of Protein L derived from Finegoldia bacteria, provided that the amino acid sequence contains at least the following (1) to (
11) A protein having one or more amino acid substitutions selected from the following and having immunoglobulin binding activity;
(1) The amino acid residue corresponding to the 7th lysine of SEQ ID NO: 1 is replaced with glutamine (2) The amino acid residue corresponding to the 13th lysine of SEQ ID NO: 1 is replaced with valine (3) 29 of SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 6th lysine is replaced with valine or isoleucine (4) The amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 is replaced with alanine (5) The 8th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 is replaced The amino acid residue is replaced with arginine (6) The amino acid residue corresponding to the 15th asparagine in SEQ ID NO: 1 is replaced with valine (7) The amino acid residue corresponding to the 23rd isoleucine in SEQ ID NO: 1 is replaced with phenylalanine or leucine. Substitution (8) The amino acid residue corresponding to the 34th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is aspartic acid,
Replacement with phenylalanine, leucine, or valine (9) Replacement of the amino acid residue corresponding to lysine at position 38 of SEQ ID NO: 1 with leucine (10) Replacement of the amino acid residue corresponding to asparagine at position 50 of SEQ ID NO: 1 with methionine Substitution (11) The amino acid residue corresponding to tyrosine at position 53 of SEQ ID NO: 1 was substituted with serine.
[2]
The protein according to [1], which is a protein according to any one of the following (a) to (c):
(a) comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 5, provided that the amino acid sequence has at least one or more amino acid substitutions selected from (1) to (11) above;
and a protein having immunoglobulin binding activity;
(b) comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 5, provided that the amino acid sequence has at least one or more amino acid substitutions selected from (1) to (11) above;
Furthermore, a protein that contains substitution, deletion, insertion, and/or addition of one or several amino acid residues at one or several positions other than the above (1) to (11), and has immunoglobulin binding activity. ;
(c) Contains an amino acid sequence having 70% or more homology with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 5 or a partial sequence thereof, provided that, in the amino acid sequence, at least the above (1)
A protein having one or more amino acid substitutions selected from (11) from ) and having immunoglobulin binding activity.
[3]
Furthermore, the protein according to [1] or [2], which has at least one or more amino acid substitutions selected from the following (i) to (liii):
(i) The amino acid residue corresponding to the 50th asparagine in SEQ ID NO: 1 is replaced with tyrosine (ii) The amino acid residue corresponding to the 1st glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with glycine or valine (iii) SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 3rd proline in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine (iv) The amino acid residue corresponding to the 4th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with lysine or glycine (v) The 5th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with lysine or glycine. The corresponding amino acid residue is replaced with valine (vi) The amino acid residue corresponding to the 7th lysine of SEQ ID NO: 1 is replaced with alanine (vii) The amino acid residue corresponding to the 8th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 is replaced with glycine. Substitution (viii) The amino acid residue corresponding to the 9th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with valine (ix) The amino acid residue corresponding to the 17th isoleucine in SEQ ID NO: 1 is replaced with phenylalanine (x) The amino acid residue corresponding to the 17th isoleucine in SEQ ID NO: 1 is replaced with phenylalanine. The amino acid residue corresponding to the 21st glycine is replaced with arginine (xi) The amino acid residue corresponding to the 27th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with glycine or arginine (xii) Corresponds to the 29th lysine in SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 31st threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with proline (xiii) The amino acid residue corresponding to the 36th threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with leucine (xiv) The amino acid residue corresponding to the 36th threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with alanine (xv) The amino acid residue corresponding to the 41st alanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine (xvi) The amino acid residue corresponding to the 44th asparagine in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine or glycine (xvii) SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine or isoleucine (xviii) The amino acid residue corresponding to the 50th asparagine in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine,
Substituted with either lysine or aspartic acid (xix) The amino acid residue corresponding to glycine at position 51 of SEQ ID NO: 1 was substituted with valine (xx) The amino acid residue corresponding to glutamic acid at position 52 of SEQ ID NO: 1 was replaced with valine, Replacement with either glycine or aspartic acid (xxi) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 53rd tyrosine of SEQ ID NO: 1 with phenylalanine (xxii) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 54th threonine of SEQ ID NO: 1 with isoleucine or Replaced with methionine (xxiii) The amino acid residue corresponding to asparagine at position 62 of SEQ ID NO: 1 is replaced with either histidine, arginine, leucine, methionine, or tryptophan (xxiv) The amino acid residue corresponding to asparagine at position 65 of SEQ ID NO: 1 The residue is replaced with tyrosine (xxv) The amino acid residue corresponding to the 69th alanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine (xxvi) The amino acid residue corresponding to the 2nd threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine or proline. (xxvii) The amino acid residue corresponding to the 3rd proline in SEQ ID NO: 1 is replaced with arginine (xxviii) The amino acid residue corresponding to the 5th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with lysine or arginine (xxix) SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 27th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with either valine, lysine or isoleucine (xxx) The amino acid residue corresponding to the 32nd phenylalanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with leucine (xxxi) The amino acid residue corresponding to the 38th lysine is replaced with alanine (xxxii), the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 is replaced with isoleucine,
(xxxiii) The amino acid residue corresponding to the 47th alanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine or arginine (xxxiv) The amino acid residue corresponding to the 52nd glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with asparagine (xxxv) SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the second threonine is replaced with alanine (xxxvi) The amino acid residue corresponding to the fifth glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with aspartic acid (xxxvii) The sixth proline in SEQ ID NO: 1 is replaced. The amino acid residue corresponding to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 is replaced with proline (xxxix) The amino acid residue corresponding to the 14th valine in SEQ ID NO: 1 is replaced with alanine. (xl) The amino acid residue corresponding to the 23rd isoleucine in SEQ ID NO: 1 is replaced with arginine or valine (xli) The amino acid residue corresponding to the 29th lysine in SEQ ID NO: 1 is replaced with phenylalanine (xlii) Sequence The amino acid residue corresponding to the 31st threonine in number 1 is replaced with methionine (xliii) The amino acid residue corresponding to the 33rd glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with either aspartic acid, glycine, or valine (xliv) Sequence The amino acid residue corresponding to the 35th alanine in number 1 is replaced with threonine (xlv) The amino acid residue corresponding to the 36th threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine (xlvi) The 37th alanine in SEQ ID NO: 1 The corresponding amino acid residue is replaced with threonine (xlvii) The amino acid residue corresponding to the 41st alanine of SEQ ID NO: 1 is replaced with isoleucine or tyrosine (xlviii) The amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 is replaced Replacement with histidine or arginine (xlviv) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 52nd glutamic acid of SEQ ID NO: 1 with leucine or tyrosine (l) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 60th glycine of SEQ ID NO: 1 with arginine ( li) The amino acid residue corresponding to isoleucine at position 64 of SEQ ID NO: 1 is replaced with leucine (lii) The amino acid residue corresponding to isoleucine at position 66 of SEQ ID NO: 1 is replaced with valine (liii) Position 69 of SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to alanine is replaced with leucine or valine.
[4]
Furthermore, at least one or more lysine residues selected from the following (I) to (VII) are substituted with a basic amino acid other than lysine or an amino acid residue having a hydroxy group, [
Protein according to any one of [1] to [3]:
(I) Lysine residue corresponding to position 7 of SEQ ID NO: 1 (II) Lysine residue corresponding to position 13 of SEQ ID NO: 1 (III) Lysine residue corresponding to position 22 of SEQ ID NO: 1 (IV) SEQ ID NO: Lysine residue corresponding to position 29 of SEQ ID NO: 1 (V) Lysine residue corresponding to position 38 of SEQ ID NO: 1 (VI) Lysine residue corresponding to position 48 of SEQ ID NO: 1 (VII) Position 67 of SEQ ID NO: 1 Corresponding lysine residue.
[5]
Furthermore, substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 with aspartic acid, substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 with serine,
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 with aspartic acid, substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 with valine, and substitution of the 62nd asparagine of SEQ ID NO: 1 with valine. Substitution of the corresponding amino acid residue with tyrosine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 23rd asparagine of SEQ ID NO: 1 with aspartic acid, and substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 with aspartic acid. The protein according to any one of [1] to [4], which has one or more amino acid substitutions selected from the following.
[6]
The protein according to any one of [1] to [5], having at least the following (X) or (Y) amino acid substitutions:
(X) Substitution of the amino acid residue corresponding to the fourth glutamic acid of SEQ ID NO: 1 with glycine,
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 with serine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 7th lysine of SEQ ID NO: 1 with alanine, 13th and 2 of SEQ ID NO: 1
Substitution of the amino acid residues corresponding to the 2nd, 48th and 67th lysines with arginine, substitution of the amino acid residues corresponding to the 23rd isoleucine of SEQ ID NO: 1 with arginine,
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 29th lysine of SEQ ID NO: 1 with isoleucine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 38th lysine of SEQ ID NO: 1 with glutamic acid, corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 Substitution of the amino acid residue with arginine, SEQ ID NO: 1-4
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 9th glutamic acid with aspartic acid, substitution of the amino acid residue corresponding to the 50th and 62nd asparagine of SEQ ID NO: 1 with tyrosine, corresponding to the 53rd tyrosine of SEQ ID NO: 1 Substitution of the amino acid residue corresponding to phenylalanine and substitution of the amino acid residue corresponding to alanine at position 69 of SEQ ID NO: 1 with valine;
(Y) Substitution of the amino acid residue corresponding to the fourth glutamic acid of SEQ ID NO: 1 with glycine,
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 with serine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 7th lysine of SEQ ID NO: 1 with alanine, 13th and 2 of SEQ ID NO: 1
Substitution of the amino acid residues corresponding to the 2nd and 67th lysines with arginine, substitution of the amino acid residues corresponding to the 23rd isoleucine of SEQ ID NO: 1 with arginine, SEQ ID NO: 1
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 29th lysine with isoleucine, 38 of SEQ ID NO: 1
substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th lysine with glutamic acid; substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 with arginine; substitution of the amino acid residue corresponding to the 48th lysine of SEQ ID NO: 1 with arginine; Substitution with histidine, substitution of the amino acid residue corresponding to glutamic acid at position 49 of SEQ ID NO: 1 with aspartic acid, positions 50 and 62 of SEQ ID NO: 1
Substitution of the amino acid residue corresponding to the 53rd asparagine with tyrosine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 53rd tyrosine of SEQ ID NO: 1 with phenylalanine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 64th isoleucine of SEQ ID NO: 1 Substitution with leucine and substitution of the amino acid residue corresponding to alanine at position 69 of SEQ ID NO: 1 with valine.
[7]
The protein according to any one of [1] to [6], comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 207 or 212.
[8]
A polynucleotide encoding the protein according to any one of [1] to [7].
[9]
An expression vector comprising the polynucleotide according to [8].
[10]
A genetically modified host comprising the following (A) or (B):
(A) a polynucleotide encoding the protein according to any one of [1] to [7];
(B) An expression vector comprising a polynucleotide encoding the protein according to any one of [1] to [7].
[11]
The genetically modified host according to [10], wherein the host is Escherichia coli.
[12]
A step of culturing a genetically recombinant host containing a polynucleotide encoding the protein according to any one of [1] to [7] or an expression vector containing the polynucleotide to express the protein; A method for producing an immunoglobulin-binding protein, the method comprising the step of recovering the expressed protein.
[13]
The production method according to [12], wherein the host is Escherichia coli.
[14]
An immunoglobulin adsorbent comprising an insoluble carrier and the protein according to any one of [1] to [7] immobilized on the insoluble carrier.
[15]
A step of adding a solution containing immunoglobulin to the column packed with the adsorbent described in [14] to adsorb the immunoglobulin to the adsorbent, and a step of eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent by changing the pH. A method for separating immunoglobulins contained in the solution, comprising:
[16]
The method according to [15], wherein the pH change is a decrease in pH.
本発明のタンパク質は、Finegoldia属由来のプロテインLの免疫グロブリン
結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、抗体溶出特性が
向上したアミノ酸置換を少なくとも一つ有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有すること
を特徴としている。不溶性担体と当該不溶性担体に固定化した本発明のタンパク質とを含
む本発明の免疫グロブリン吸着剤によれば、従来の免疫グロブリン吸着剤と比較し、温和
なpH条件で免疫グロブリン(抗体)を溶出できることから、高品質の免疫グロブリンが
得られる。
The protein of the present invention comprises the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of protein L derived from the genus Finegoldia, but has at least one amino acid substitution in the amino acid sequence that improves antibody elution properties, and has immunoglobulin-binding activity. It is characterized by having According to the immunoglobulin adsorbent of the present invention, which includes an insoluble carrier and the protein of the present invention immobilized on the insoluble carrier, immunoglobulin (antibody) can be eluted under mild pH conditions compared to conventional immunoglobulin adsorbents. As a result, high quality immunoglobulin can be obtained.
以下、本発明を詳細に説明する。 The present invention will be explained in detail below.
本発明のタンパク質は、特定の免疫グロブリン結合性タンパク質である。本明細書にお
いて「免疫グロブリン結合性タンパク質」とは、免疫グロブリンに対する結合性を有する
タンパク質を意味する。すなわち、本発明のタンパク質は、特定の免疫グロブリンに対す
る結合性を有する。本発明のタンパク質は、具体的には、免疫グロブリンのκ軽鎖に対す
る結合性を有するものであってもよい。本明細書では、免疫グロブリンに対する結合性を
、「免疫グロブリン結合活性」または「抗体結合活性」ともいう。免疫グロブリン結合活
性は、例えば、ELISA(Enzyme-Linked ImmunoSorbent
Assay)法で測定できる。ELISA法は、例えば、実施例に記載の条件で実施で
きる。
The proteins of the invention are specific immunoglobulin binding proteins. As used herein, the term "immunoglobulin-binding protein" refers to a protein that has the ability to bind to immunoglobulins. That is, the protein of the present invention has binding properties to specific immunoglobulins. Specifically, the protein of the present invention may have the ability to bind to the κ light chain of immunoglobulin. In this specification, binding to immunoglobulin is also referred to as "immunoglobulin binding activity" or "antibody binding activity." Immunoglobulin binding activity can be measured, for example, by ELISA (Enzyme-Linked ImmunoSorbent).
It can be measured by the Assay method. The ELISA method can be carried out, for example, under the conditions described in the Examples.
本発明のタンパク質は、Finegoldia属細菌由来Protein L(「Fp
L」ともいう)の免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ
酸配列において、特定位置におけるアミノ酸置換を有したタンパク質である。以降、本明
細書において、FpLの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列であって、特定位置
におけるアミノ酸置換を有さないものを「非改変型アミノ酸配列」ともいい、FpLの免
疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列であって、特定位置におけるアミノ酸置換を有
するものを「改変型アミノ酸配列」ともいう。すなわち、改変型アミノ酸配列は、特定位
置におけるアミノ酸置換を有すること以外は非改変型アミノ酸配列と同一のアミノ酸配列
であってよい。また、本発明のタンパク質は、例えば、特定位置におけるアミノ酸置換を
有すること以外は非改変型アミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であって
よい。また、本発明のタンパク質は、例えば、改変型アミノ酸配列を含むタンパク質であ
ってよい。非改変型アミノ酸配列は、天然に見出されるアミノ酸配列であってもよく、そ
うでなくてもよい。非改変型アミノ酸配列は、例えば、所望の性質を有するように改変さ
れていてもよい。非改変型アミノ酸配列は、例えば、特定位置におけるアミノ酸置換以外
のアミノ酸置換を有していてもよい。
The protein of the present invention is Protein L (“Fp
It is a protein that contains the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of the immunoglobulin-binding domain (also referred to as "L"), but has amino acid substitutions at specific positions in the amino acid sequence. Hereinafter, in this specification, the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of FpL that does not have amino acid substitutions at specific positions is also referred to as the "unmodified amino acid sequence", and the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of FpL A sequence having an amino acid substitution at a specific position is also referred to as a "modified amino acid sequence." That is, the modified amino acid sequence may be the same amino acid sequence as the non-modified amino acid sequence except for having an amino acid substitution at a specific position. Furthermore, the protein of the present invention may be, for example, a protein that includes an amino acid sequence that is the same as an unmodified amino acid sequence except for having an amino acid substitution at a specific position. Furthermore, the protein of the present invention may be, for example, a protein containing a modified amino acid sequence. The unmodified amino acid sequence may or may not be an amino acid sequence found in nature. An unmodified amino acid sequence may be modified to have desired properties, for example. The unmodified amino acid sequence may have, for example, amino acid substitutions other than amino acid substitutions at specific positions.
FpLの由来であるFinegoldia属細菌としては、Finegoldia m
agnaが挙げられる。Finegoldia magna由来Protein Lの免
疫グロブリン結合ドメインとしては、
ドメインB1(配列番号38(GenBank No.AAA25612)の104番目
から173番目までのアミノ酸残基)、
ドメインB2(配列番号38の176番目から245番目までのアミノ酸残基)、
ドメインB3(配列番号38の248番目から317番目までのアミノ酸残基)、
ドメインB4(配列番号38の320番目から389番目までのアミノ酸残基)、
ドメインB5(配列番号38の393番目から462番目までのアミノ酸残基)、
ドメインC1(配列番号39(GenBank No.AAA67503)の249番目
から317番目までのアミノ酸残基)、
ドメインC2(配列番号39の320番目から389番目までのアミノ酸残基)、
ドメインC3(配列番号39の394番目から463番目までのアミノ酸残基:配列番号
1)、および
ドメインC4(配列番号39の468番目から537番目までのアミノ酸残基:配列番号
5)が挙げられる。
The Finegoldia bacteria from which FpL is derived include Finegoldia m.
Examples include agna. The immunoglobulin binding domain of Finegoldia magna-derived Protein L is as follows:
Domain B1 (amino acid residues from 104th to 173rd of SEQ ID NO: 38 (GenBank No. AAA25612)),
Domain B2 (amino acid residues from position 176 to position 245 of SEQ ID NO: 38),
Domain B3 (amino acid residues from position 248 to position 317 of SEQ ID NO: 38),
Domain B4 (amino acid residues from position 320 to position 389 of SEQ ID NO: 38),
Domain B5 (amino acid residues from position 393 to position 462 of SEQ ID NO: 38),
Domain C1 (amino acid residues from 249th to 317th of SEQ ID NO: 39 (GenBank No. AAA67503)),
Domain C2 (amino acid residues from position 320 to position 389 of SEQ ID NO: 39),
Examples include domain C3 (amino acid residues 394th to 463rd of SEQ ID NO: 39: SEQ ID NO: 1) and domain C4 (amino acid residues 468th to 537th of SEQ ID NO: 39: SEQ ID NO: 5).
本明細書において非改変型アミノ酸配列とは、
(A)前述したFpLの免疫グロブリン結合ドメインの全アミノ酸配列であってもよく、
(B)免疫グロブリンへの結合活性を有している限り、前記ドメインの部分アミノ酸配列
であってもよい。
As used herein, the unmodified amino acid sequence is
(A) It may be the entire amino acid sequence of the above-mentioned immunoglobulin binding domain of FpL,
(B) It may be a partial amino acid sequence of the domain as long as it has immunoglobulin-binding activity.
なお、前記(B)に関して、FpLの免疫グロブリン結合ドメインは四つのβシートと
一つのαヘリックス、それらをつなぐループ部分とN末端ループ領域で構成されているが
、N末端ループ領域など、免疫グロブリンへの結合とは無関係の領域のアミノ酸残基は欠
損してもよい。具体例として、FpLのドメインC3(配列番号1)のN末端ループ領域
に相当する、1番目のグルタミン酸から9番目のグルタミン酸までのアミノ酸残基を欠損
させても免疫グロブリン結合能を有していることが知られている(Housden N.
G.et.al.Biochemical Society Transaction,
2003,31,716-718)。すなわち、前記(B)における部分アミノ酸配列は
、少なくとも免疫グロブリンへの結合部位のアミノ酸配列を含んでいればよいといえる。
すなわち、前記(B)における部分アミノ酸配列としては、免疫グロブリンへの結合部位
のアミノ酸配列を含む部分配列が挙げられる。
Regarding (B) above, the immunoglobulin-binding domain of FpL is composed of four β-sheets, one α-helix, a loop connecting them, and an N-terminal loop region. Amino acid residues in regions unrelated to binding to may be deleted. As a specific example, even if the amino acid residues from the 1st glutamic acid to the 9th glutamic acid, which correspond to the N-terminal loop region of domain C3 (SEQ ID NO: 1) of FpL, are deleted, it still has immunoglobulin binding ability. It is known that (Housden N.
G. etc. al. Biochemical Society Transaction,
2003, 31, 716-718). That is, it is sufficient that the partial amino acid sequence in (B) above includes at least the amino acid sequence of the binding site to immunoglobulin.
That is, the partial amino acid sequence in (B) above includes a partial sequence including the amino acid sequence of a binding site to immunoglobulin.
本明細書における改変型アミノ酸配列として、具体的には、配列番号1に記載のアミノ
酸配列など、前述した免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列において特定位置にお
けるアミノ酸置換を有するアミノ酸配列が挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質と
して、具体的には、配列番号1に記載のアミノ酸配列など、前述した免疫グロブリン結合
ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、特定位置におけるア
ミノ酸置換を有するタンパク質が挙げられる。言い換えると、本発明のタンパク質は、例
えば、特定位置におけるアミノ酸置換を有すること以外は配列番号1に記載のアミノ酸配
列など、前述した免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含
むタンパク質であってよい。
The modified amino acid sequence herein specifically includes an amino acid sequence having an amino acid substitution at a specific position in the amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain described above, such as the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. That is, the protein of the present invention specifically includes a protein that includes the above-described amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain, such as the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, but has an amino acid substitution at a specific position in the amino acid sequence. Can be mentioned. In other words, the protein of the present invention is a protein that includes an amino acid sequence that is identical to the amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain described above, such as the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, except for having an amino acid substitution at a specific position. It's fine.
本明細書において、タンパク質がアミノ酸配列を含むことを、「タンパク質がアミノ酸
配列からなるアミノ酸残基を含む」ともいい、タンパク質またはアミノ酸配列がアミノ酸
置換を有することを、「タンパク質またはアミノ酸配列においてアミノ酸置換が生じる」
ともいう。またタンパク質またはアミノ酸配列を構成するアミノ酸を、「アミノ酸残基」
ともいう。
In this specification, the fact that a protein includes an amino acid sequence is also referred to as "the protein contains amino acid residues consisting of an amino acid sequence", and the fact that a protein or amino acid sequence has an amino acid substitution is also referred to as "an amino acid substitution in a protein or amino acid sequence". will occur.”
Also called. Also, the amino acids that make up a protein or amino acid sequence are called "amino acid residues".
Also called.
本発明のタンパク質は、温和なpH条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タン
パク質であってよい。本発明のタンパク質は、具体的には、改変型アミノ酸配列を有しな
い(例えば非改変型アミノ酸配列からなる)免疫グロブリン結合性タンパク質と比較して
温和なpH条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。本発
明のタンパク質は、具体的には、特定位置におけるアミノ酸置換を有しない免疫グロブリ
ン結合性タンパク質と比較して温和なpH条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性
タンパク質であってよい。言い換えると、本発明のタンパク質は、特定位置におけるアミ
ノ酸置換を有することにより温和なpH条件で抗体溶出が可能となった免疫グロブリン結
合性タンパク質であってよい。また、言い換えると、特定位置におけるアミノ酸置換は、
温和なpH条件で免疫グロブリン結合性タンパク質からの抗体溶出を可能とするものであ
ってよい。
The protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions. Specifically, the protein of the present invention is an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions compared to an immunoglobulin-binding protein that does not have a modified amino acid sequence (for example, consists of an unmodified amino acid sequence). It may be a natural protein. Specifically, the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions compared to immunoglobulin-binding proteins that do not have amino acid substitutions at specific positions. In other words, the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that has amino acid substitutions at specific positions and thus enables antibody elution under mild pH conditions. In other words, amino acid substitution at a specific position is
It may be possible to elute antibodies from immunoglobulin-binding proteins under mild pH conditions.
「温和なpH条件」とは、中性に近いpH条件を意味してよい。すなわち、「温和な条
件で抗体溶出が可能」とは、中性に近いpH条件で抗体溶出が可能であることを意味して
よい。また、典型的な抗体の溶出pHは酸性であり得るため、「温和な条件で抗体溶出が
可能」とは、抗体の溶出pHが増大していることを意味してもよい。抗体の溶出pHは、
例えば、実施例に記載の条件で測定できる。
"Mild pH conditions" may mean pH conditions close to neutrality. That is, "antibody elution is possible under mild conditions" may mean that antibody elution is possible under near-neutral pH conditions. Furthermore, since typical antibody elution pH can be acidic, "antibody elution is possible under mild conditions" may mean that the antibody elution pH is increased. The elution pH of the antibody is
For example, it can be measured under the conditions described in Examples.
前記特定位置におけるアミノ酸置換は、具体的には、Lys7Gln(この表記は、配
列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基がグルタミンに置換されていることを
表す;以下、他のアミノ酸置換についても同様に解釈するものとする)、Lys13Va
l、Lys29Val、Lys29Ile、Pro6Ala、Glu8Arg、Asn1
5Val、Ile23Phe、Ile23Leu、Glu34Asp、Glu34Phe
、Glu34Leu、Glu34Val、Lys38Leu、Asn50MetおよびT
yr53Serから選ばれる少なくとも1つ以上のアミノ酸置換を含む。
Specifically, the amino acid substitution at the specific position is Lys7Gln (this notation indicates that the amino acid residue corresponding to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 is substituted with glutamine; hereinafter, other amino acid substitutions shall be interpreted in the same manner), Lys13Va
l, Lys29Val, Lys29Ile, Pro6Ala, Glu8Arg, Asn1
5Val, Ile23Phe, Ile23Leu, Glu34Asp, Glu34Phe
, Glu34Leu, Glu34Val, Lys38Leu, Asn50Met and T
Contains at least one or more amino acid substitutions selected from yr53Ser.
言い換えると、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、少なくとも、
(1)Lys7Gln
(2)Lys13Val
(3)Lys29ValまたはLys29Ile
(4)Pro6Ala
(5)Glu8Arg
(6)Asn15Val
(7)Ile23PheまたはIle23Leu
(8)Glu34Asp、Glu34Phe、Glu34LeuおよびGlu34Val
のいずれか
(9)Lys38Leu
(10)Asn50Met
(11)Tyr53Ser
より選択される1つ以上のアミノ酸置換を含む。本発明のタンパク質は、例えば、前記(
1)から(11)より選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つまた
は9つのアミノ酸置換を有してよいし、10個以上のアミノ酸置換を有してもよい。
In other words, the amino acid substitution at the specific position is at least
(1) Lys7Gln
(2) Lys13Val
(3) Lys29Val or Lys29Ile
(4) Pro6Ala
(5) Glu8Arg
(6) Asn15Val
(7) Ile23Phe or Ile23Leu
(8) Glu34Asp, Glu34Phe, Glu34Leu and Glu34Val
Any (9) Lys38Leu
(10) Asn50Met
(11) Tyr53Ser
one or more amino acid substitutions selected from The protein of the present invention is, for example, the above (
may have one, two, three, four, five, six, seven, eight or nine amino acid substitutions selected from 1) to (11), or 10 or more amino acids May have substitutions.
なお、本発明のタンパク質が2つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有する場合、それら
アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記(1)から(11)より選択される1つ以
上のアミノ酸置換を含む限り、特に制限されない。
In addition, when the protein of the present invention has two or more amino acid substitutions, the combination of these amino acid substitutions is particularly suitable as long as it includes at least one or more amino acid substitutions selected from (1) to (11) above. Not restricted.
アミノ酸置換の組み合わせの一態様として、
Pro6AlaおよびLys29Ileのアミノ酸置換;
Glu8ArgおよびLys29Ileのアミノ酸置換;
Ile23PheおよびLys29Ileのアミノ酸置換;
Ile23LeuおよびLys29Ileのアミノ酸置換;
Lys29IleおよびLys38Leuのアミノ酸置換;
Lys29IleおよびAsn50Metのアミノ酸置換;
Lys59IleおよびTyr53Serのアミノ酸置換;
Asn15ValおよびLys29Ileのアミノ酸置換;
Lys29IleおよびGlu34Aspのアミノ酸置換;
Lys29IleおよびGlu34Pheのアミノ酸置換;
Lys29IleおよびGlu34Leuのアミノ酸置換;
Lys29IleおよびGlu34Valのアミノ酸置換;
があげられる。
As one aspect of the combination of amino acid substitutions,
Amino acid substitutions in Pro6Ala and Lys29Ile;
Amino acid substitutions of Glu8Arg and Lys29Ile;
Amino acid substitutions of Ile23Phe and Lys29Ile;
Amino acid substitutions of Ile23Leu and Lys29Ile;
Amino acid substitutions of Lys29Ile and Lys38Leu;
Amino acid substitutions of Lys29Ile and Asn50Met;
Amino acid substitutions of Lys59Ile and Tyr53Ser;
Amino acid substitutions of Asn15Val and Lys29Ile;
Amino acid substitutions in Lys29Ile and Glu34Asp;
Amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Phe;
Amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Leu;
Amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Val;
can be given.
また前記特定位置におけるアミノ酸置換は、さらに、以下の(i)から(liii)よ
り選択される1つ以上のアミノ酸置換を含んでいてよい。すなわち、本発明のタンパク質
が有するアミノ酸置換の組み合わせの別態様として、少なくとも前記(1)から(11)
より選択される1つ以上のアミノ酸置換と、少なくとも以下の(i)から(liii)よ
り選択される1つ以上のアミノ酸置換との組み合わせもあげられる。
(i)配列番号1の50番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換(
ii)配列番号1の1番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリ
ンに置換
(iii)配列番号1の3番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
(iv)配列番号1の4番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリ
シンに置換
(v)配列番号1の5番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(vi)配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(vii)配列番号1の8番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
(viii)配列番号1の9番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(ix)配列番号1の17番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニ
ンに置換
(x)配列番号1の21番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
(xi)配列番号1の27番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたは
アルギニンに置換
(xii)配列番号1の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
(xiii)配列番号1の31番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置
換
(xiv)配列番号1の36番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xv)配列番号1の41番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
(xvi)配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたは
グリシンに置換
(xvii)配列番号1の49番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニン
またはイソロイシンに置換
(xviii)配列番号1の50番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、
リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
(xix)配列番号1の51番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(xx)配列番号1の52番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシ
ンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
(xxi)配列番号1の53番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニン
に置換
(xxii)配列番号1の54番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシン
またはメチオニンに置換
(xxiii)配列番号1の62番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジ
ン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
(xxiv)配列番号1の65番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに
置換
(xxv)配列番号1の69番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
(xxvi)配列番号1の2番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプ
ロリンに置換
(xxvii)配列番号1の3番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置
換
(xxviii)配列番号1の5番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンま
たはアルギニンに置換
(xxix)配列番号1の27番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リ
ジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
(xxx)配列番号1の32番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシン
に置換
(xxxi)配列番号1の38番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xxxii)配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイ
シンに置換、
(xxxiii)配列番号1の47番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニン
またはアルギニンに置換
(xxxiv)配列番号1の52番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラ
ギンに置換
(xxxv)配列番号1の2番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xxxvi)配列番号1の5番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギ
ン酸に置換
(xxxvii)配列番号1の6番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまた
はスレオニンに置換
(xxxviii)配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置
換
(xxxix)配列番号1の14番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
(xl)配列番号1の23番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまた
はバリンに置換
(xli)配列番号1の29番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに
置換
(xlii)配列番号1の31番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに
置換
(xliii)配列番号1の33番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラ
ギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
(xliv)配列番号1の35番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置
換
(xlv)配列番号1の36番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
(xlvi)配列番号1の37番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置
換
(xlvii)配列番号1の41番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシン
またはチロシンに置換
(xlviii)配列番号1の44番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチ
ジンまたはアルギニンに置換
(xlviv)配列番号1の52番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシン
またはチロシンに置換
(l)配列番号1の60番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
(li)配列番号1の64番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
(lii)配列番号1の66番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
(liii)配列番号1の69番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたは
バリンに置換。
Furthermore, the amino acid substitution at the specific position may further include one or more amino acid substitutions selected from (i) to (liii) below. That is, as another embodiment of the combination of amino acid substitutions that the protein of the present invention has, at least the above (1) to (11)
Also included is a combination of one or more amino acid substitutions selected from the above and one or more amino acid substitutions selected from at least the following (i) to (liii).
(i) The amino acid residue corresponding to the 50th asparagine in SEQ ID NO: 1 is replaced with tyrosine (
ii) The amino acid residue corresponding to the first glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with glycine or valine. (iii) The amino acid residue corresponding to the third proline in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine. (iv) The amino acid residue corresponding to the third proline in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine. The amino acid residue corresponding to the 4th glutamic acid is replaced with lysine or glycine (v) The amino acid residue corresponding to the 5th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with valine (vi) Corresponds to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 (vii) The amino acid residue corresponding to the 8th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with glycine (viii) The amino acid residue corresponding to the 9th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with valine. (ix) The amino acid residue corresponding to the 17th isoleucine in SEQ ID NO: 1 is replaced with phenylalanine (x) The amino acid residue corresponding to the 21st glycine in SEQ ID NO: 1 is replaced with arginine (xi) 27 in SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 29th glutamic acid is replaced with glycine or arginine (xii) The amino acid residue corresponding to the 29th lysine of SEQ ID NO: 1 is replaced with proline (xiii) The 31st threonine of SEQ ID NO: 1 is replaced The amino acid residue is replaced with leucine (xiv) The amino acid residue corresponding to the 36th threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with alanine (xv) The amino acid residue corresponding to the 41st alanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine ( xvi) The amino acid residue corresponding to asparagine at position 44 of SEQ ID NO: 1 is replaced with serine or glycine (xvii) The amino acid residue corresponding to glutamic acid at position 49 of SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine or isoleucine (xviii) SEQ ID NO: The amino acid residue corresponding to the 50th asparagine in 1 is serine,
Substituted with either lysine or aspartic acid (xix) The amino acid residue corresponding to glycine at position 51 of SEQ ID NO: 1 was substituted with valine (xx) The amino acid residue corresponding to glutamic acid at position 52 of SEQ ID NO: 1 was replaced with valine, Replacement with either glycine or aspartic acid (xxi) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 53rd tyrosine of SEQ ID NO: 1 with phenylalanine (xxii) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 54th threonine of SEQ ID NO: 1 with isoleucine or Replaced with methionine (xxiii) The amino acid residue corresponding to asparagine at position 62 of SEQ ID NO: 1 is replaced with either histidine, arginine, leucine, methionine, or tryptophan (xxiv) The amino acid residue corresponding to asparagine at position 65 of SEQ ID NO: 1 The residue is replaced with tyrosine (xxv) The amino acid residue corresponding to the 69th alanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine (xxvi) The amino acid residue corresponding to the 2nd threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine or proline. (xxvii) The amino acid residue corresponding to the 3rd proline in SEQ ID NO: 1 is replaced with arginine (xxviii) The amino acid residue corresponding to the 5th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with lysine or arginine (xxix) SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the 27th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with either valine, lysine or isoleucine (xxx) The amino acid residue corresponding to the 32nd phenylalanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with leucine (xxxi) The amino acid residue corresponding to the 38th lysine is replaced with alanine (xxxii), the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 is replaced with isoleucine,
(xxxiii) The amino acid residue corresponding to the 47th alanine in SEQ ID NO: 1 is replaced with threonine or arginine (xxxiv) The amino acid residue corresponding to the 52nd glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with asparagine (xxxv) SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to the second threonine is replaced with alanine (xxxvi) The amino acid residue corresponding to the fifth glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with aspartic acid (xxxvii) The sixth proline in SEQ ID NO: 1 is replaced. The amino acid residue corresponding to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 is replaced with proline (xxxix) The amino acid residue corresponding to the 14th valine in SEQ ID NO: 1 is replaced with alanine. (xl) The amino acid residue corresponding to the 23rd isoleucine in SEQ ID NO: 1 is replaced with arginine or valine (xli) The amino acid residue corresponding to the 29th lysine in SEQ ID NO: 1 is replaced with phenylalanine (xlii) Sequence The amino acid residue corresponding to the 31st threonine in number 1 is replaced with methionine (xliii) The amino acid residue corresponding to the 33rd glutamic acid in SEQ ID NO: 1 is replaced with either aspartic acid, glycine, or valine (xliv) Sequence The amino acid residue corresponding to the 35th alanine in number 1 is replaced with threonine (xlv) The amino acid residue corresponding to the 36th threonine in SEQ ID NO: 1 is replaced with serine (xlvi) The 37th alanine in SEQ ID NO: 1 The corresponding amino acid residue is replaced with threonine (xlvii) The amino acid residue corresponding to the 41st alanine of SEQ ID NO: 1 is replaced with isoleucine or tyrosine (xlviii) The amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 is replaced with isoleucine or tyrosine (xlviii) Replacement with histidine or arginine (xlviv) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 52nd glutamic acid of SEQ ID NO: 1 with leucine or tyrosine (l) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 60th glycine of SEQ ID NO: 1 with arginine ( li) The amino acid residue corresponding to isoleucine at position 64 of SEQ ID NO: 1 is replaced with leucine (lii) The amino acid residue corresponding to isoleucine at position 66 of SEQ ID NO: 1 is replaced with valine (liii) Position 69 of SEQ ID NO: 1 The amino acid residue corresponding to alanine is replaced with leucine or valine.
なお、前記(i)から(liii)のアミノ酸置換の内、同位置のアミノ酸置換は同時
には選択されない。例えば、前記(iii)のアミノ酸置換と前記(xxvii)のアミ
ノ酸置換は同時には選択されない。
Note that among the amino acid substitutions (i) to (liii) above, amino acid substitutions at the same position are not selected at the same time. For example, the amino acid substitution (iii) above and the amino acid substitution (xxvii) above are not selected at the same time.
一態様において、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、前記(i)から(liii)
より選択される1つ以上のアミノ酸置換を含んでいてよい。
In one aspect, the amino acid substitution at the specific position is in (i) to (liii) above.
may contain one or more amino acid substitutions selected from
前記(1)から(11)より選択される1つ以上のアミノ酸置換と前記(i)から(l
iii)より選択される1つ以上のアミノ酸置換との組み合わせを有した、本発明のタン
パク質は、アルカリ安定性も向上し得る点で好ましい。特に、前記(1)から(11)よ
り選択される1つ以上のアミノ酸置換と少なくとも前記(i)のアミノ酸置換との組み合
わせを有した、本発明のタンパク質は、温和なpH条件での抗体溶出が可能で、かつアル
カリ安定性も向上しているため、より好ましい。
One or more amino acid substitutions selected from (1) to (11) above and (i) to (l)
The protein of the present invention having a combination with one or more amino acid substitutions selected from iii) is preferred in that the alkali stability can also be improved. In particular, the protein of the present invention having a combination of one or more amino acid substitutions selected from (1) to (11) above and at least the amino acid substitution (i) above can be used for antibody elution under mild pH conditions. It is more preferable because it is possible to do this and has improved alkali stability.
「アルカリ安定性」とは、アルカリ条件における失活に対する耐性を意味してよい。ア
ルカリ安定性の向上は、例えば、アルカリ処理後の残存活性の向上として測定できる。こ
こでいう「活性」とは、免疫グロブリン結合活性を意味する。アルカリ処理は、例えば、
実施例に記載の条件で実施できる。
"Alkaline stability" may mean resistance to deactivation in alkaline conditions. Improved alkali stability can be measured, for example, as an increase in residual activity after alkali treatment. "Activity" here means immunoglobulin binding activity. Alkaline treatment is, for example,
It can be carried out under the conditions described in the Examples.
本発明のタンパク質は、例えば、前記(i)から(liii)に記載のアミノ酸置換か
ら選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つまたは9つのアミノ酸置
換を有してよいし、10個以上のアミノ酸置換を有してもよい。本発明のタンパク質は、
例えば、少なくとも、前記(i)のアミノ酸置換を有してよい。ただし、
(1)Lys7Glnのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(vi)および前記(xx
xviii)のアミノ酸置換は選択できず、
(3)Lys29ValまたはLys29Ileのアミノ酸置換を選択した場合は、前記
(xii)および前記(xli)のアミノ酸置換は選択できず、
(4)Pro6Alaのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(xxxvii)のアミノ
酸置換は選択できず、
(5)Glu8Argのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(vii)のアミノ酸置換
は選択できず、
(7)Ile23PheまたはIle23Leuのアミノ酸置換を選択した場合は、前記
(xl)のアミノ酸置換は選択できず、
(9)Lys38Leuのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(i)および前記(xx
xi)のアミノ酸置換は選択できず、
(10)Asp50Metのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(xviii)のアミ
ノ酸置換は選択できず、
(11)Tyr53Serのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(xxi)のアミノ酸
置換は選択できない。
The protein of the present invention has, for example, one, two, three, four, five, six, seven, eight or nine amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions described in (i) to (liii) above. It may have one amino acid substitution, or it may have ten or more amino acid substitutions. The protein of the present invention is
For example, it may have at least the amino acid substitution described in (i) above. however,
(1) If Lys7Gln amino acid substitution is selected, the above (vi) and the above (xx
xviii) amino acid substitution cannot be selected,
(3) If Lys29Val or Lys29Ile amino acid substitution is selected, the above (xii) and above (xli) amino acid substitutions cannot be selected,
(4) If the amino acid substitution of Pro6Ala is selected, the amino acid substitution of (xxxvii) above cannot be selected,
(5) If the amino acid substitution of Glu8Arg is selected, the amino acid substitution of (vii) above cannot be selected,
(7) If the amino acid substitution of Ile23Phe or Ile23Leu is selected, the amino acid substitution of (xl) above cannot be selected,
(9) When choosing the amino acid substitution of Lys38Leu, the above (i) and the above (xx
xi) Amino acid substitution cannot be selected,
(10) If the amino acid substitution of Asp50Met is selected, the amino acid substitution of (xviii) above cannot be selected,
(11) If the Tyr53Ser amino acid substitution is selected, the amino acid substitution (xxi) above cannot be selected.
アミノ酸置換の組み合わせの別態様の具体例として、
Lys7AlaおよびLys29Ileのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50TyrおよびGlu52Glyのアミノ
酸置換;
Lys7Ala、Glu9Val、Lys29Ile、Asn50TyrおよびGlu5
2Glyのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびTyr
53Pheのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびThr
54Metのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびAla
69Thrのアミノ酸置換;
Glu1Val、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52G
lyおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52G
lyおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびTyr53Pheのアミ
ノ酸置換;
Lys7Ala、Gly21Arg、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52
GlyおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52AspおよびTyr
53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52A
spおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52A
sp、Tyr53PheおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Glu8Gly、Lys29Ile、Glu33Va
l、Asn50Tyr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Arg、Lys29Ile、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Ala41Ile、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Ala41Tyr、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52L
euおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52V
alおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Pro6Ala、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Ty
r、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Glu8Gly、Lys29Ile、Asn50Ty
r、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Glu8Arg、Lys29Ile、Asn50Ty
r、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Gly21Arg、Lys29Ile、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Phe、Lys29Ile、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Leu、Lys29Ile、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Glu33Val、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Lys38Leu、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44His、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44Arg、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Lys48His、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Met、Glu52A
spおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52T
yrおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52A
spおよびTyr53Serのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52V
al、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52L
eu、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Tyr53P
heおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Val14Ala、Lys29Ile、Asn50T
yr、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Gly21Arg、Lys29Ile、Asn50T
yr、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44Arg、Asn50T
yr、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44His、Asn50T
yr、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Glu52T
yr、Tyr53PheおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Tyr53P
he、Gly60ArgおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn50Tyr、Tyr53P
he、Ile64LeuおよびAla67Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Arg、Lys29Ile、Asn44A
rg、Asn50Tyr、Tyr53PheおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Arg、Lys29Ile、Asn44H
is、Asn50Tyr、Tyr53PheおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Arg、Lys29Ile、Asn50T
yr、Tyr53Phe、Ile64LeuおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44Arg、Asn50T
yr、Tyr53Phe、Ile64LeuおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44His、Asn50T
yr、Tyr53Phe、Ile64LeuおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Ile23Arg、Lys29Ile、Asn44A
rg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Ile64LeuおよびAla69Val
のアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Asn44His、Asn50T
yr、Tyr53Phe、Ile64LeuおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Asn15Val、Lys29Ile、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Glu34Asp、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Glu34Phe、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Glu34Leu、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys29Ile、Glu34Val、Asn50T
yr、Glu52AspおよびTyr53Pheのアミノ酸置換;
があげられる。
As a specific example of another embodiment of the combination of amino acid substitutions,
Amino acid substitutions of Lys7Ala and Lys29Ile;
Amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr and Glu52Gly;
Lys7Ala, Glu9Val, Lys29Ile, Asn50Tyr and Glu5
Amino acid substitution of 2Gly;
Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52Gly and Tyr
Amino acid substitution of 53Phe;
Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52Gly and Thr
Amino acid substitution of 54Met;
Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52Gly and Ala
Amino acid substitution at 69Thr;
Glu1Val, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52G
Amino acid substitutions of ly and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52G
Amino acid substitutions of ly and Tyr53Phe;
Amino acid substitutions of Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52Gly and Tyr53Phe;
Lys7Ala, Gly21Arg, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52
Gly and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52Asp and Tyr
Amino acid substitution of 53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52A
sp and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52A
sp, Tyr53Phe and Ala69Val amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Glu8Gly, Lys29Ile, Glu33Va
l, Asn50Tyr, Glu52Asp and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Arg, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Ala41Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Ala41Tyr, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52L
Amino acid substitution of eu and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52V
Amino acid substitutions of al and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Pro6Ala, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Ty
r, Glu52Asp and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Glu8Gly, Lys29Ile, Asn50Ty
r, Glu52Asp and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Glu8Arg, Lys29Ile, Asn50Ty
r, Glu52Asp and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Gly21Arg, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Phe, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Leu, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Glu33Val, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Lys38Leu, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44His, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44Arg, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Lys48His, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Met, Glu52A
sp and Tyr53Phe amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52T
Amino acid substitutions of yr and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52A
sp and Tyr53Ser amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52V
amino acid substitutions of al, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52L
Amino acid substitutions of eu, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Tyr53P
Amino acid substitution of he and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Val14Ala, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Gly21Arg, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44Arg, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44His, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Glu52T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Tyr53P
amino acid substitutions of he, Gly60Arg and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn50Tyr, Tyr53P
amino acid substitutions of he, Ile64Leu and Ala67Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Arg, Lys29Ile, Asn44A
rg, Asn50Tyr, Tyr53Phe and Ala69Val amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Arg, Lys29Ile, Asn44H
is, Asn50Tyr, Tyr53Phe and Ala69Val amino acid substitutions;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Arg, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe, Ile64Leu and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44Arg, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe, Ile64Leu and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44His, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe, Ile64Leu and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Ile23Arg, Lys29Ile, Asn44A
rg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Ile64Leu and Ala69Val
Amino acid substitution of;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Asn44His, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Tyr53Phe, Ile64Leu and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Asn15Val, Lys29Ile, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Glu34Asp, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Glu34Phe, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Glu34Leu, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys29Ile, Glu34Val, Asn50T
Amino acid substitutions of yr, Glu52Asp and Tyr53Phe;
can be given.
また、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、さらに、以下の(I)から(VII)よ
り選択される1つ以上のリジン(Lys)残基のリジン以外の塩基性アミノ酸(アルギニ
ン(Arg)もしくはヒスチジン(His))またはヒドロキシ基を有するアミノ酸(セ
リン(Ser)、スレオニン(Thr)もしくはチロシン(Tyr))への置換を含んで
いてよい。すなわち、本発明のタンパク質が有するアミノ酸置換の組み合わせのさらに別
の態様として、少なくとも前記(1)から(11)より選択される1つ以上のアミノ酸置
換と、少なくとも以下の(I)から(VII)より選択される1つ以上のリジン(Lys
)残基のリジン以外の塩基性アミノ酸(アルギニン(Arg)もしくはヒスチジン(Hi
s))またはヒドロキシ基を有するアミノ酸(セリン(Ser)、スレオニン(Thr)
もしくはチロシン(Tyr))への置換との組み合わせも挙げられる。
(I)配列番号1の7番目に相当するリジン残基
(II)配列番号1の13番目に相当するリジン残基
(III)配列番号1の22番目に相当するリジン残基
(IV)配列番号1の29番目に相当するリジン残基
(V)配列番号1の38番目に相当するリジン残基
(VI)配列番号1の48番目に相当するリジン残基
(VII)配列番号1の67番目に相当するリジン残基
In addition, the amino acid substitution at the specific position may further include basic amino acids other than lysine (arginine (Arg) or histidine (Lys)) of one or more lysine (Lys) residues selected from (I) to (VII) below. (His)) or an amino acid having a hydroxy group (serine (Ser), threonine (Thr) or tyrosine (Tyr)). That is, as yet another embodiment of the combination of amino acid substitutions that the protein of the present invention has, at least one or more amino acid substitutions selected from (1) to (11) above, and at least the following (I) to (VII) one or more lysines (Lys) selected from
) residues of basic amino acids other than lysine (arginine (Arg) or histidine (Hi
s)) or amino acids with hydroxy groups (serine (Ser), threonine (Thr)
Alternatively, a combination with substitution with tyrosine (Tyr) may also be mentioned.
(I) Lysine residue corresponding to position 7 of SEQ ID NO: 1 (II) Lysine residue corresponding to position 13 of SEQ ID NO: 1 (III) Lysine residue corresponding to position 22 of SEQ ID NO: 1 (IV) SEQ ID NO: Lysine residue corresponding to position 29 of SEQ ID NO: 1 (V) Lysine residue corresponding to position 38 of SEQ ID NO: 1 (VI) Lysine residue corresponding to position 48 of SEQ ID NO: 1 (VII) Position 67 of SEQ ID NO: 1 Corresponding lysine residue
本発明のタンパク質は、前記(I)から(VII)より選択される1つ、2つ、3つ、
4つ、5つまたは6つのリジン残基の置換を有してよく、さらに前記(i)から(lii
i)より選択される1つ以上のアミノ酸置換を有してもよい。ただし、
(1)Lys7Glnのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(I)のリジン残基の置換
は選択できず、
(2)Lys13Valのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(II)のリジン残基の
置換は選択できず、
(3)Lys29ValまたはLys29Ileのアミノ酸置換を選択した場合は、前記
(IV)のリジン残基の置換は選択できず、
(9)Lys38Leuのアミノ酸置換を選択した場合は、前記(V)のリジン残基の置
換は選択できない。
The proteins of the present invention include one, two, three selected from (I) to (VII) above,
may have substitutions of 4, 5 or 6 lysine residues, further comprising (i) to (lii)
i) may have one or more amino acid substitutions selected from however,
(1) If the Lys7Gln amino acid substitution is selected, the above (I) lysine residue substitution cannot be selected,
(2) If the amino acid substitution of Lys13Val is selected, the substitution of the lysine residue in (II) above cannot be selected,
(3) If Lys29Val or Lys29Ile amino acid substitution is selected, the above (IV) lysine residue substitution cannot be selected,
(9) If the amino acid substitution of Lys38Leu is selected, the substitution of the lysine residue in (V) above cannot be selected.
なお、塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸に置換されたリジン残基以
外のリジン残基(すなわち、前記(I)~(VII)のリジン残基の内の選択されなかっ
たもの)については、未置換(リジン残基)のままでもよいし、塩基性アミノ酸およびヒ
ドロキシ基を有するアミノ酸以外のアミノ酸に置換されてもよい。後者の例としては、リ
ジン残基のグルタミンまたはイソロイシンへの置換や、前述したLys13Val、Ly
s29ValおよびLys38Leuのアミノ酸置換が挙げられる。
In addition, regarding lysine residues other than lysine residues substituted with basic amino acids or amino acids having a hydroxyl group (i.e., those not selected from the lysine residues in (I) to (VII) above), It may remain unsubstituted (lysine residue) or may be substituted with an amino acid other than a basic amino acid or an amino acid having a hydroxyl group. Examples of the latter include substitution of lysine residues with glutamine or isoleucine, and the above-mentioned Lys13Val, Lys
Includes amino acid substitutions of s29Val and Lys38Leu.
アミノ酸置換の組み合わせのさらに別の態様の具体例として、
Lys7Gln、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Arg、Lys48
ArgおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Arg、Lys13Val、Lys22Arg、Lys29Arg、Lys48
ArgおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Arg、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Val、Lys48
ArgおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Arg、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Ile、Lys48
ArgおよびLys67Argのアミノ酸置換;
があげられる。
As a specific example of yet another embodiment of the combination of amino acid substitutions,
Lys7Gln, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Arg, Lys48
Amino acid substitution of Arg and Lys67Arg;
Lys7Arg, Lys13Val, Lys22Arg, Lys29Arg, Lys48
Amino acid substitution of Arg and Lys67Arg;
Lys7Arg, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Val, Lys48
Amino acid substitution of Arg and Lys67Arg;
Lys7Arg, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys48
Amino acid substitution of Arg and Lys67Arg;
can be given.
また、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、前記(i)から(liii)より選択さ
れる1つ以上のアミノ酸置換と前記(I)から(VII)より選択される1つ以上のリジ
ン(Lys)残基のリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸へ
の置換との組み合わせを含んでいてもよい。すなわち、本発明のタンパク質が有するアミ
ノ酸置換の組み合わせのさらにまた別の態様として、少なくとも前記(1)から(11)
より選択される1つ以上のアミノ酸置換と、少なくとも前記(i)から(liii)より
選択される1つ以上のアミノ酸置換と、少なくとも前記(I)から(VII)より選択さ
れる1つ以上のリジン(Lys)残基のリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基
を有するアミノ酸への置換との組み合わせも挙げられる。
Furthermore, the amino acid substitution at the specific position includes one or more amino acid substitutions selected from (i) to (liii) above and one or more lysine (Lys) residues selected from (I) to (VII) above. It may also include a combination with substitution of a basic amino acid other than lysine or an amino acid having a hydroxy group. That is, as yet another embodiment of the combination of amino acid substitutions that the protein of the present invention has, at least the above (1) to (11)
one or more amino acid substitutions selected from at least one of the above (i) to (liii), and one or more amino acid substitutions selected from at least the above (I) to (VII). Also included is a combination of substitution of a lysine (Lys) residue with a basic amino acid other than lysine or an amino acid having a hydroxy group.
アミノ酸置換の組み合わせのさらにまた別の態様の具体例として
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys29Ile、Lys38Arg、Lys48
ArgおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys29Ile、Lys38Arg、Lys48
Arg、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Glu9Val、Lys29Ile、Lys38Arg、Lys48A
rg、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Ile、Lys38
Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびLys67Ar
gのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys29Ile、Lys38Arg、Lys48
Arg、Asn50Tyr、Glu52Gly、Tyr53PheおよびLys67Ar
gのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys29Ile、Lys38Arg、Lys48
rg、Asn50Tyr、Glu52Gly、Thr54MetおよびLys67Arg
のアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys29Ile、Lys38Arg、Lys48
rg、Asn50Tyr、Glu52Gly、Lys67ArgおよびAla69Thr
のアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Ile、Lys38
Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Gly、Tyr53Pheお
よびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu1Val、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys38Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Gly、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys38Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Gly、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Ser、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Ile、Lys38
Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Gly、Tyr53Pheお
よびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Gly21Arg、Lys22Arg、Lys29
Ile、Lys38Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Gly、
Tyr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Ile、Lys38
Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Tyr53Pheお
よびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Tyr53Pheおよ
びLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Glu8Gly、Lys13Arg、Lys22Ar
g、Lys29Ile、Glu33Val、Lys48Arg、Asn50Tyr、Gl
u52Asp、Tyr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23A
rg、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Ala41Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Ala41Tyr、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Leu、Tyr53Pheおよ
びLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Val、Tyr53Pheおよ
びLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Pro6Ala、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Ar
g、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Ty
r53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Glu8Gly、Lys13Arg、Lys22Ar
g、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Ty
r53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Glu8Arg、Lys13Arg、Lys22Ar
g、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Ty
r53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Gly21Arg、Lys22A
rg、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23P
he、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23L
eu、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Glu33Val、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys38His、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys38Leu、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44His、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44His、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Met、Glu52Asp、Tyr53Pheおよ
びLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Tyr、Tyr53Pheおよ
びLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Tyr53Serおよ
びLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Val、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Leu、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Lys67Argおよ
びAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Val14Ala、Lys22A
rg、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Gly21Arg、Lys22A
rg、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44His、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Tyr、Tyr53Phe、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Gly60Arg、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Ile64Leu、L
ys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23A
rg、Lys29Ile、Asn44Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、T
yr53Phe、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23A
rg、Lys29Ile、Asn44His、Lys48Arg、Asn50Tyr、T
yr53Phe、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23A
rg、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、I
le64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44Arg、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、I
le64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44His、Lys48Arg、Asn50Tyr、Tyr53Phe、I
Ile64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile23A
rg、Lys29Ile、Asn44Arg、Lys48His、Asn50Tyr、T
yr53Phe、Ile64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ
酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Asn44His、Lys48His、Asn50Tyr、Tyr53Phe、I
le64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Asn15Val、Lys22A
rg、Lys29Ile、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Glu34Asp、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Glu3Phe、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、Ty
r53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Glu34Leu、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29I
le、Glu34Val、Lys48Arg、Asn50Tyr、Glu52Asp、T
yr53PheおよびLys67Argのアミノ酸置換;
があげられる。
Specific examples of yet another combination of amino acid substitutions include Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48
Amino acid substitution of Arg and Lys67Arg;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48
Amino acid substitutions of Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly and Lys67Arg;
Lys7Ala, Glu9Val, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48A
rg, Asn50Tyr, Glu52Gly and Lys67Arg amino acid substitutions;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38
Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly and Lys67Ar
Amino acid substitution of g;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48
Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly, Tyr53Phe and Lys67Ar
Amino acid substitution of g;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48
rg, Asn50Tyr, Glu52Gly, Thr54Met and Lys67Arg
Amino acid substitution of;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48
rg, Asn50Tyr, Glu52Gly, Lys67Arg and Ala69Thr
Amino acid substitution of;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38
Amino acid substitutions of Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu1Val, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Lys7Ser, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38
Amino acid substitutions of Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Lys7Ala, Lys13Arg, Gly21Arg, Lys22Arg, Lys29
Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly,
Amino acid substitutions of Tyr53Phe and Lys67Arg;
Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38
Amino acid substitutions of Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Glu8Gly, Lys13Arg, Lys22Ar
g, Lys29Ile, Glu33Val, Lys48Arg, Asn50Tyr, Gl
Amino acid substitutions of u52Asp, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23A
rg, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Ala41Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Ala41Tyr, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Leu, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Val, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Pro6Ala, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Ar
g, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Ty
Amino acid substitutions of r53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Glu8Gly, Lys13Arg, Lys22Ar
g, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Ty
Amino acid substitutions of r53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Glu8Arg, Lys13Arg, Lys22Ar
g, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Ty
Amino acid substitutions of r53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Gly21Arg, Lys22A
rg, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23P
he, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23L
eu, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Glu33Val, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys38His, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys38Leu, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44His, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44His, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Met, Glu52Asp, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Tyr, Tyr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Tyr53Ser and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Val, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Leu, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
amino acid substitutions of le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Val14Ala, Lys22A
rg, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Gly21Arg, Lys22A
rg, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44His, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Tyr, Tyr53Phe, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Gly60Arg, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Ile64Leu, L
Amino acid substitutions of ys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23A
rg, Lys29Ile, Asn44Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, T
Amino acid substitutions of yr53Phe, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23A
rg, Lys29Ile, Asn44His, Lys48Arg, Asn50Tyr, T
Amino acid substitutions of yr53Phe, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23A
rg, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, I
Amino acid substitutions of le64Leu, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, I
Amino acid substitutions of le64Leu, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44His, Lys48Arg, Asn50Tyr, Tyr53Phe, I
Amino acid substitutions of Ile64Leu, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile23A
rg, Lys29Ile, Asn44Arg, Lys48His, Asn50Tyr, T
Amino acid substitutions of yr53Phe, Ile64Leu, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Asn44His, Lys48His, Asn50Tyr, Tyr53Phe, I
Amino acid substitutions of le64Leu, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Asn15Val, Lys22A
rg, Lys29Ile, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Glu34Asp, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Glu3Phe, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Ty
Amino acid substitutions of r53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Glu34Leu, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29I
le, Glu34Val, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, T
Amino acid substitutions of yr53Phe and Lys67Arg;
can be given.
なお、本発明のタンパク質は、少なくとも1つの他のアミノ酸置換をさらに有してもよ
い。他のアミノ酸置換としては、Glu49Asp、Pro6Ser、Asn44Asp
、Glu49Val、Asn62Tyr、Ile23Thr、Ala41Argが挙げら
れる。他のアミノ酸置換は、例えば、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性
を向上させるものであってよい。例えば、Asn44Asp、Glu49Val、Asn
62Tyr、Ile23Thr、およびAla41Argのアミノ酸置換は、いずれも、
免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させるものであり得る。本発明
のタンパク質は、例えば、前記他のアミノ酸置換を1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、また
は6つ有してよい。すなわち、改変型アミノ酸配列としては、上記例示した非改変型アミ
ノ酸配列(例えば配列番号1に記載のアミノ酸配列)において前記特定位置におけるアミ
ノ酸置換およびGlu49AspやPro6Serなど他のアミノ酸置換を有するアミノ
酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、上記例示した非改変型ア
ミノ酸配列(例えば配列番号1に記載のアミノ酸配列)を含み、ただし当該アミノ酸配列
において、前記特定位置におけるアミノ酸置換およびGlu49AspやPro6Ser
など他のアミノ酸置換を有するタンパク質も挙げられる。言い換えると、本発明のタンパ
ク質は、例えば、前記特定位置におけるアミノ酸置換およびGlu49AspやPro6
Serなど他のアミノ酸置換を有すること以外は上記例示した非改変型アミノ酸配列(例
えば配列番号1に記載のアミノ酸配列)と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であって
もよい。なお、前記他のアミノ酸置換として例示したGlu49AspやPro6Ser
は、subgroupに関係なく免疫グロブリンのκ軽鎖に結合可能な、アミノ酸置換で
ある。
Note that the protein of the present invention may further have at least one other amino acid substitution. Other amino acid substitutions include Glu49Asp, Pro6Ser, Asn44Asp
, Glu49Val, Asn62Tyr, Ile23Thr, and Ala41Arg. Other amino acid substitutions may, for example, improve the alkaline stability of the immunoglobulin binding protein. For example, Asn44Asp, Glu49Val, Asn
The amino acid substitutions of 62Tyr, Ile23Thr, and Ala41Arg are all
It may improve the alkaline stability of immunoglobulin binding proteins. The protein of the invention may have, for example, one, two, three, four, five, or six of the other amino acid substitutions. That is, examples of modified amino acid sequences include amino acid sequences having amino acid substitutions at the specific positions and other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser in the non-modified amino acid sequences exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1). It will be done. That is, the protein of the present invention includes the unmodified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1), but in the amino acid sequence, amino acid substitutions at the specific positions and Glu49Asp and Pro6Ser
Also included are proteins with other amino acid substitutions, such as. In other words, the protein of the present invention includes, for example, amino acid substitutions at the specific positions and Glu49Asp and Pro6.
It may be a protein containing the same amino acid sequence as the unmodified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1) except for having other amino acid substitutions such as Ser. In addition, Glu49Asp and Pro6Ser, which were exemplified as other amino acid substitutions,
is an amino acid substitution that can bind to the kappa light chain of immunoglobulins regardless of subgroup.
前記他のアミノ酸置換を含むアミノ酸置換の組み合わせとしては、上記例示したアミノ
酸置換の組み合わせにおいてさらに前記他のアミノ酸置換を1つ、2つ、3つ、4つ、5
つ、または6つ含む組み合わせが挙げられる。前記他のアミノ酸置換を含むアミノ酸置換
の組み合わせとしては、特に、上記例示したアミノ酸置換の組み合わせにおいてさらに少
なくともAsn62Tyrのアミノ酸置換を含む組み合わせが挙げられる。
The combinations of amino acid substitutions including the other amino acid substitutions include 1, 2, 3, 4, 5 other amino acid substitutions in the above-exemplified combinations of amino acid substitutions.
Examples include combinations containing one or six. Examples of combinations of amino acid substitutions that include other amino acid substitutions include combinations that further include at least the amino acid substitution of Asn62Tyr in the combinations of amino acid substitutions exemplified above.
前記他のアミノ酸置換をさらに有した、本発明のタンパク質の一例として、以下のタン
パク質があげられる。前記タンパク質を不溶性担体に固定化して得られる本発明の免疫グ
ロブリン吸着剤は、従来の免疫グロブリン吸着剤と比較し、κ軽鎖を有する免疫グロブリ
ン(抗体)を、subgroupに関係なく、温和なpH条件で溶出できる点で好ましい
。
配列番号1に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Glu4G
ly、Pro6Ser、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile
23Arg、Lys29Ile、Lys38Glu、Asn44Arg、Lys48Ar
g、Glu49Asp、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Asn62Tyr、Ly
s67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タン
パク質(配列番号207に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質)
。
配列番号1に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Glu4G
ly、Pro6Ser、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Arg、Ile
23Arg、Lys29Ile、Lys38Glu、Asn44Arg、Lys48Hi
s、Glu49Asp、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Asn62Tyr、Il
e64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換を有する免疫グ
ロブリン結合性タンパク質(配列番号212に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン
結合性タンパク質)。
Examples of proteins of the present invention that further have the above-mentioned other amino acid substitutions include the following proteins. The immunoglobulin adsorbent of the present invention, which is obtained by immobilizing the protein on an insoluble carrier, can absorb immunoglobulins (antibodies) having κ light chains at a mild pH, regardless of the subgroup, in comparison with conventional immunoglobulin adsorbents. This is preferable because it can be eluted under certain conditions.
Contains the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that in the amino acid sequence, Glu4G
ly, Pro6Ser, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile
23Arg, Lys29Ile, Lys38Glu, Asn44Arg, Lys48Ar
g, Glu49Asp, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Asn62Tyr, Ly
Immunoglobulin-binding protein having amino acid substitutions of s67Arg and Ala69Val (immunoglobulin-binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 207)
.
Contains the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that in the amino acid sequence, Glu4G
ly, Pro6Ser, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Ile
23Arg, Lys29Ile, Lys38Glu, Asn44Arg, Lys48Hi
s, Glu49Asp, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Asn62Tyr, Il
An immunoglobulin-binding protein having amino acid substitutions of e64Leu, Lys67Arg and Ala69Val (an immunoglobulin-binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 212).
言い換えると、本発明のタンパク質が有するアミノ酸置換の一例として、以下のものが
挙げられる:
Glu4Gly、Pro6Ser、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Ar
g、Ile23Arg、Lys29Ile、Lys38Glu、Asn44Arg、Ly
s48Arg、Glu49Asp、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Asn62T
yr、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換;
Glu4Gly、Pro6Ser、Lys7Ala、Lys13Arg、Lys22Ar
g、Ile23Arg、Lys29Ile、Lys38Glu、Asn44Arg、Ly
s48His、Glu49Asp、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Asn62T
yr、Ile64Leu、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換。
In other words, examples of amino acid substitutions that the protein of the present invention has include the following:
Glu4Gly, Pro6Ser, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Ar
g, Ile23Arg, Lys29Ile, Lys38Glu, Asn44Arg, Ly
s48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Asn62T
Amino acid substitutions of yr, Lys67Arg and Ala69Val;
Glu4Gly, Pro6Ser, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Ar
g, Ile23Arg, Lys29Ile, Lys38Glu, Asn44Arg, Ly
s48His, Glu49Asp, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Asn62T
Amino acid substitutions of yr, Ile64Leu, Lys67Arg and Ala69Val.
本明細書では、配列番号1に記載のアミノ酸配列において上記例示したアミノ酸置換(
すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のGlu49AspやPro6S
erなど他のアミノ酸置換)を有するアミノ酸配列を、「配列番号1由来置換アミノ酸配
列」ともいう。配列番号1由来置換アミノ酸配列は、言い換えると、上記例示したアミノ
酸置換(すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のGlu49AspやP
ro6Serなど他のアミノ酸置換)が生じた配列番号1に記載のアミノ酸配列である。
また、配列番号1由来置換アミノ酸配列は、言い換えると、上記例示したアミノ酸置換(
すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のGlu49AspやPro6S
erなど他のアミノ酸置換)を有すること以外は配列番号1に記載のアミノ酸配列と同一
のアミノ酸配列である。配列番号1由来置換アミノ酸配列は、本明細書における改変型ア
ミノ酸配列の一例である。
In this specification, the above-exemplified amino acid substitutions (
That is, amino acid substitution at the specific position and any Glu49Asp or Pro6S
An amino acid sequence having other amino acid substitutions such as er is also referred to as a "substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1." In other words, the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO.
This is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 with other amino acid substitutions such as ro6Ser.
In other words, the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is the amino acid substitution (
That is, amino acid substitution at the specific position and any Glu49Asp or Pro6S
The amino acid sequence is the same as the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, except that it has other amino acid substitutions such as er. The substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is an example of a modified amino acid sequence in this specification.
本明細書における改変型アミノ酸配列としては、上記例示した改変型アミノ酸配列(例
えば配列番号1由来置換アミノ酸配列)のバリアント(variant)配列も挙げられ
る。すなわち、本発明のタンパク質としては、上記例示した改変型アミノ酸配列(例えば
配列番号1由来置換アミノ酸配列)のバリアント配列を含み、かつ、免疫グロブリン結合
活性を有するタンパク質も挙げられる。以下、配列番号1由来置換アミノ酸配列のバリア
ント配列の場合を例示して説明するが、当該説明は任意の改変型アミノ酸配列のバリアン
ト配列にも準用できる。
The modified amino acid sequences used herein include variant sequences of the modified amino acid sequences exemplified above (for example, substituted amino acid sequences derived from SEQ ID NO: 1). That is, the protein of the present invention includes a protein that includes a variant sequence of the above-exemplified modified amino acid sequence (eg, substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1) and has immunoglobulin binding activity. Hereinafter, the case of a variant sequence of a substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 will be explained as an example, but the explanation can be applied mutatis mutandis to a variant sequence of any modified amino acid sequence.
配列番号1由来置換アミノ酸配列のバリアント配列は、前記特定位置におけるアミノ酸
置換が残存するように(すなわち、本発明のタンパク質が前記特定位置におけるアミノ酸
置換を有するように)設定されるものとする。また、配列番号1由来置換アミノ酸配列の
バリアント配列は、Glu49AspやPro6Serなど他のアミノ酸置換が残存する
ように(すなわち、本発明のタンパク質がGlu49AspやPro6Serなど他のア
ミノ酸置換を有するように)設定されてもよい。また、配列番号1由来置換アミノ酸配列
のバリアント配列は、例えば、上記例示したアミノ酸置換(すなわち前記特定位置におけ
るアミノ酸置換および任意のGlu49AspやPro6Serなど他のアミノ酸置換)
から選択される、配列番号1由来置換アミノ酸配列が有さない1つ以上のアミノ酸置換を
追加的に有していてもよい。例えば、配列番号1由来置換アミノ酸配列がGlu49As
pやPro6Serなど他のアミノ酸置換を有さない場合に、配列番号1由来置換アミノ
酸配列のバリアント配列が前記他のアミノ酸置換を有していてもよい。
The variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 shall be set so that the amino acid substitution at the specific position remains (that is, the protein of the present invention has the amino acid substitution at the specific position). In addition, the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is set so that other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser remain (that is, the protein of the present invention has other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser). You can. In addition, variant sequences of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 include, for example, the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and other amino acid substitutions such as arbitrary Glu49Asp and Pro6Ser).
The substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 may additionally have one or more amino acid substitutions selected from SEQ ID NO: 1-derived substituted amino acid sequence. For example, the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is Glu49As
In the case where there is no other amino acid substitution such as p or Pro6Ser, the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 may have the other amino acid substitution.
配列番号1由来置換アミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号1由来置換アミ
ノ酸配列において、1もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠
失、挿入、および/または付加を含むアミノ酸配列が挙げられる。すなわち、本発明のタ
ンパク質は、免疫グロブリン結合活性を有する限り、上記例示したアミノ酸置換(すなわ
ち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のGlu49AspやPro6Serな
ど他のアミノ酸置換)に加えて、さらに、配列番号1に記載のアミノ酸配列において、1
もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/ま
たは付加を含んでいてもよい。すなわち、本発明のタンパク質としては、配列番号1に記
載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、上記例示したアミノ酸置換
(すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のGlu49AspやPro6
Serなど他のアミノ酸置換)を有し、さらに1もしくは数個の位置での1もしくは数個
のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加を含み、かつ、免疫グロブリン
結合活性を有するタンパク質も挙げられる。言い換えると、本発明のタンパク質は、例え
ば、上記例示したアミノ酸置換(すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意
のGlu49AspやPro6Serなど他のアミノ酸置換)を有し、さらに1もしくは
数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加
を含むこと以外は配列番号1と同一のアミノ酸配列を含み、かつ、免疫グロブリン結合活
性を有するタンパク質であってもよい。なお、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、
および/または付加は、前記特定位置におけるアミノ酸置換が残存するように選択される
ものとする。すなわち、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加は
、例えば、前記特定位置以外の位置に生じてよい。また、上記のアミノ酸残基の置換、欠
失、挿入、および/または付加は、前記他のアミノ酸置換が残存するように選択されても
よい。すなわち、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加は、例え
ば、前記他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。また、上記のアミノ酸残基の置換
、欠失、挿入、および/または付加は、例えば、上記例示したアミノ酸置換から選択され
る、配列番号1由来置換アミノ酸配列が有さない1つ以上のアミノ酸置換を含んでいても
よい。前記「1もしくは数個」とは、アミノ酸残基のタンパク質の立体構造における位置
やアミノ酸残基の種類によっても異なるが、具体的には、例えば、1から20個、1から
10個、1から9個、1から8個、1から7個、1から6個、1から5個、1から4個、
1から3個、1から2個、1個のいずれかを意味する。上記のアミノ酸残基の置換の一例
としては、物理的性質および/または化学的性質が類似したアミノ酸間で置換が生じる保
守的置換が挙げられる。保守的置換の場合、一般に、置換が生じているものと置換が生じ
ていないものとの間でタンパク質の機能が維持されることが当業者において知られている
。保守的置換の一例としては、グリシンとアラニン間、セリンとプロリン間、またはグル
タミン酸とアラニン間での置換が挙げられる(タンパク質の構造と機能,メディカル・サ
イエンス・インターナショナル社,9,2005)。また、上記のアミノ酸残基の置換、
欠失、挿入、および/または付加には、例えば、タンパク質またはそれをコードする遺伝
子が由来する微生物の個体差や種の違いに基づく場合などの天然に生じる変異(ミュータ
ント(mutant)またはバリアント)によって生じるものも含まれる。
Variant sequences of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 include substitutions, deletions, insertions, and/or additions of one or several amino acid residues at one or several positions in the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1. Examples include amino acid sequences containing. That is, as long as the protein of the present invention has immunoglobulin binding activity, in addition to the amino acid substitutions exemplified above (i.e., the amino acid substitutions at the specific positions and any other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser), SEQ ID NO. In the amino acid sequence described in 1
or may contain substitutions, deletions, insertions, and/or additions of one or several amino acid residues at several positions. That is, the protein of the present invention includes the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, but in the amino acid sequence, the amino acid substitutions exemplified above (i.e., the amino acid substitutions at the specific positions and any Glu49Asp or Pro6
other amino acid substitutions, such as Ser), and further contains substitutions, deletions, insertions, and/or additions of one or more amino acid residues at one or more positions, and has no immunoglobulin binding activity. Also included are proteins that have. In other words, the protein of the present invention has, for example, the amino acid substitution exemplified above (i.e., the amino acid substitution at the specific position and any other amino acid substitution such as Glu49Asp or Pro6Ser), and further has one or more amino acid substitutions at one or several positions. Alternatively, it may be a protein that contains the same amino acid sequence as SEQ ID NO: 1 except for the substitution, deletion, insertion, and/or addition of several amino acid residues, and has immunoglobulin binding activity. In addition, substitutions, deletions, insertions, etc. of the above amino acid residues,
and/or the addition shall be selected such that the amino acid substitution at said specific position remains. That is, the above-mentioned substitution, deletion, insertion, and/or addition of amino acid residues may occur, for example, at positions other than the above-mentioned specific positions. Furthermore, the above amino acid residue substitutions, deletions, insertions, and/or additions may be selected such that the other amino acid substitutions remain. That is, the above amino acid residue substitutions, deletions, insertions, and/or additions may occur, for example, at positions other than the other amino acid substitutions. In addition, the substitution, deletion, insertion, and/or addition of the above amino acid residues may be, for example, one or more amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions exemplified above that are not present in the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1. May contain. The above-mentioned "one or several" varies depending on the position of the amino acid residue in the three-dimensional structure of the protein and the type of amino acid residue, but specifically, for example, 1 to 20, 1 to 10, 1 to 10. 9 pieces, 1 to 8 pieces, 1 to 7 pieces, 1 to 6 pieces, 1 to 5 pieces, 1 to 4 pieces,
It means 1 to 3, 1 to 2, or 1. An example of the above amino acid residue substitutions includes conservative substitutions in which amino acids with similar physical and/or chemical properties are substituted. It is known by those skilled in the art that in the case of conservative substitutions, the protein function is generally maintained between the protein in which the substitution has occurred and the protein in which the substitution has not occurred. Examples of conservative substitutions include substitutions between glycine and alanine, serine and proline, or glutamic acid and alanine (Protein Structure and Function, Medical Science International, Inc., 9, 2005). In addition, substitution of the above amino acid residues,
Deletions, insertions, and/or additions may be caused by naturally occurring mutations (mutants or variants), for example, due to individual differences or species differences in the microorganism from which the protein or the gene encoding it is derived. It also includes things that occur.
また、配列番号1由来置換アミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号1由来置
換アミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発
明のタンパク質としては、配列番号1に記載のアミノ酸配列において上記例示したアミノ
酸置換(すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でGlu49AspやP
ro6Serなど他のアミノ酸置換)を有するアミノ酸配列に対して高い相同性を有する
アミノ酸配列を含み、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。
なお、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、前記特定位置におけるアミ
ノ酸置換が残存するように選択されるものとする。すなわち、上記のような相同性の範囲
でのアミノ酸配列の変化は、例えば、前記特定位置以外の位置に生じてよい。また、上記
のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、他のアミノ酸置換が残存するように選
択されてもよい。すなわち、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、例え
ば、他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。また、上記のような相同性の範囲での
アミノ酸配列の変化は、例えば、上記例示したアミノ酸置換から選択される、配列番号1
由来置換アミノ酸配列が有さない1つ以上のアミノ酸置換を含んでいてもよい。前記「相
同性」とは、類似性(similarity)または同一性(identity)を意味
してよく、特に同一性を意味してもよい。「アミノ酸配列に対する相同性」とは、アミノ
酸配列全体に対する相同性を意味する。前記「高い相同性」とは、70%以上、80%以
上、90%以上、または95%以上の相同性を意味してよい。アミノ酸配列間の「同一性
」とは、それらアミノ酸配列における種類が同一であるアミノ酸残基の比率を意味する(
実験医学 2013年2月号 Vol.31 No.3、羊土社)。アミノ酸配列間の「
類似性」とは、それらアミノ酸配列における種類が同一であるアミノ酸残基の比率と側鎖
の性質が類似したアミノ酸残基の比率の合計を意味する(実験医学 2013年2月号
Vol.31 No.3、羊土社)。側鎖の性質が類似したアミノ酸残基については上述
の通りである。アミノ酸配列の相同性は、BLAST(Basic Local Ali
gnment Search Tool)やFASTA等のアラインメントプログラム(
alignment program)を利用して決定できる。
Variant sequences of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 also include amino acid sequences that have high homology to the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1. That is, the protein of the present invention includes the amino acid substitutions exemplified above in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 (i.e., amino acid substitutions at the specific positions and optionally Glu49Asp and P
Also included are proteins that contain an amino acid sequence that has high homology to an amino acid sequence that has other amino acid substitutions such as ro6Ser, and have immunoglobulin binding activity.
Note that changes in the amino acid sequence within the range of homology as described above are selected such that the amino acid substitution at the specific position remains. That is, a change in the amino acid sequence within the range of homology as described above may occur, for example, at a position other than the specific position. Furthermore, changes in the amino acid sequence within the range of homology as described above may be selected such that other amino acid substitutions remain. That is, changes in the amino acid sequence within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than other amino acid substitutions. In addition, changes in the amino acid sequence within the range of homology as described above may be made, for example, in SEQ ID NO: 1 selected from the amino acid substitutions exemplified above.
It may contain one or more amino acid substitutions that the derived substituted amino acid sequence does not have. The term "homology" may mean similarity or identity, and in particular may mean identity. "Homology to an amino acid sequence" means homology to the entire amino acid sequence. The above-mentioned "high homology" may mean a homology of 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more. "Identity" between amino acid sequences refers to the proportion of amino acid residues of the same type in those amino acid sequences (
Experimental Medicine February 2013 Vol. 31 No. 3, Yodosha). between the amino acid sequences.
"Similarity" means the sum of the ratio of amino acid residues that are the same in their amino acid sequences and the ratio of amino acid residues that have similar side chain properties (Jikken Igaku February 2013 issue)
Vol. 31 No. 3, Yodosha). Amino acid residues with similar side chain properties are as described above. Amino acid sequence homology was determined using BLAST (Basic Local Ali
gnment Search Tool) and alignment programs such as FASTA (
alignment program).
また、改変型アミノ酸配列としては、上記例示したバリアント配列において、さらに、
上記例示したアミノ酸置換(すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でG
lu49AspやPro6Serなど他のアミノ酸置換)から選択される1つ以上のアミ
ノ酸置換を有するアミノ酸配列も挙げられる。例えば、改変型アミノ酸配列は、少なくと
も前記特定位置におけるアミノ酸置換を有するバリアント配列において、さらに他のアミ
ノ酸置換を有するアミノ酸配列であってよい。
In addition, as modified amino acid sequences, in the variant sequences exemplified above, further:
The amino acid substitutions exemplified above (i.e., amino acid substitutions at the specific positions and optionally G
Also included are amino acid sequences having one or more amino acid substitutions selected from lu49Asp and other amino acid substitutions such as Pro6Ser. For example, the modified amino acid sequence may be a variant sequence that has an amino acid substitution at least at the specific position, and an amino acid sequence that also has other amino acid substitutions.
また、非改変型アミノ酸配列としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列(例えば配
列番号1に記載のアミノ酸配列)のバリアント配列も挙げられる。すなわち、改変型アミ
ノ酸配列としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列(例えば配列番号1に記載のアミ
ノ酸配列)のバリアント配列において、上記例示したアミノ酸置換(すなわち前記特定位
置におけるアミノ酸置換および任意でGlu49AspやPro6Serなど他のアミノ
酸置換)を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、
上記例示した非改変型アミノ酸配列(例えば配列番号1に記載のアミノ酸配列)のバリア
ント配列を含み、ただし当該バリアント配列において、上記例示したアミノ酸置換(すな
わち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でGlu49AspやPro6Ser
など他のアミノ酸置換)を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げ
られる。言い換えると本発明のタンパク質は、例えば、上記例示したアミノ酸置換を有す
ること以外は上記例示した非改変型アミノ酸配列(例えば配列番号1に記載のアミノ酸配
列)のバリアント配列と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であってもよい。なお、上
記例示した非改変型アミノ酸配列(例えば配列番号1に記載のアミノ酸配列)のバリアン
ト配列は、Finegoldia属細菌において実際に存在していてもよく、いなくても
よい。すなわち、「Finegoldia属細菌由来Protein Lの免疫グロブリ
ン結合ドメインのアミノ酸配列(FpLの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列)
」とは、Finegoldia属細菌に実際に存在するProtein Lの免疫グロブ
リン結合ドメインのアミノ酸配列に限られず、同アミノ酸配列のバリアント配列であって
Finegoldia属細菌に実際に存在しない(すなわち仮想の)アミノ酸配列も包含
する。以下、配列番号1に記載のアミノ酸配列のバリアント配列の場合を例示して説明す
るが、当該説明は任意の非改変型アミノ酸配列のバリアント配列にも準用できる。
Further, examples of the unmodified amino acid sequence include variant sequences of the unmodified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1). That is, the modified amino acid sequence includes the above-exemplified amino acid substitution (i.e., the amino acid substitution at the specific position and optionally the Glu49Asp and other amino acid substitutions such as Pro6Ser and Pro6Ser. That is, the protein of the present invention is
Contains a variant sequence of the unmodified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1), but in the variant sequence, the amino acid substitutions exemplified above (i.e., amino acid substitutions at the specific positions and optionally Glu49Asp or Pro6Ser) are included.
Also included are proteins that have other amino acid substitutions, such as, and have immunoglobulin binding activity. In other words, the protein of the present invention is, for example, a protein containing the same amino acid sequence as a variant sequence of the unmodified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1) except for having the amino acid substitutions exemplified above. It may be. Note that the variant sequence of the non-modified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1) may or may not actually exist in a bacterium belonging to the genus Finegoldia. That is, "the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of Protein L derived from a bacterium belonging to the genus Finegoldia (the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of FpL)"
” is not limited to the amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain of Protein L that actually exists in bacteria of the genus Finegoldia, but also a variant sequence of the same amino acid sequence that does not actually exist in bacteria of the genus Finegoldia (i.e., a hypothetical) amino acid sequence. Also includes. Hereinafter, a case of a variant sequence of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 will be explained as an example, but the explanation can be applied mutatis mutandis to a variant sequence of any non-modified amino acid sequence.
配列番号1に記載のアミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号1に記載のアミ
ノ酸配列において、1もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠
失、挿入、および/または付加を含むアミノ酸配列が挙げられる。すなわち、本発明のタ
ンパク質としては、配列番号1に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列に
おいて、1もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、
および/または付加を含み、さらに上記例示したアミノ酸置換(すなわち前記特定位置に
おけるアミノ酸置換および任意でGlu49AspやPro6Serなど他のアミノ酸置
換)を有し、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。上記のア
ミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加は、例えば、前記特定位置以外の位
置に生じてよい。また、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および/または付加は
、例えば、他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。
Variant sequences of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 include substitutions, deletions, and insertions of one or several amino acid residues at one or several positions in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. or an amino acid sequence containing an addition. That is, the protein of the present invention includes the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, but in the amino acid sequence, substitution, deletion, or insertion of one or several amino acid residues at one or several positions,
and/or addition, and further has the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and optionally other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser), and also has immunoglobulin binding activity. The above-mentioned substitutions, deletions, insertions, and/or additions of amino acid residues may occur, for example, at positions other than the above-mentioned specific positions. Furthermore, the above-mentioned substitutions, deletions, insertions, and/or additions of amino acid residues may occur, for example, at positions other than the other amino acid substitutions.
配列番号1に記載のアミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号1に記載のアミ
ノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタ
ンパク質としては、配列番号1に記載のアミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ
酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列(配列番号1に記載のアミノ酸配列に対して高い
相同性を有するアミノ酸配列)において、上記例示したアミノ酸置換(すなわち前記特定
位置におけるアミノ酸置換および任意でGlu49AspやPro6Serなどの他のア
ミノ酸置換)を有し、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。
上記のような相同性の範囲でのアミノ酸残基の変化は、例えば、前記特定位置以外の位置
に生じてよい。また、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸残基の変化は、例えば、他
のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。
Variant sequences of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 also include amino acid sequences that have high homology to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. That is, the protein of the present invention includes an amino acid sequence that has high homology to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that the protein contains an amino acid sequence that has high homology to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. Also included are proteins that have the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and optionally other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser) in the amino acid sequence) and have immunoglobulin binding activity.
Changes in amino acid residues within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than the specific positions. Furthermore, changes in amino acid residues within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than other amino acid substitutions.
その他、配列番号1に記載のアミノ酸配列のバリアント配列については、配列番号1由
来置換アミノ酸配列のバリアント配列についての記載を準用できる。
In addition, regarding the variant sequence of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, the description regarding the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 can be applied mutatis mutandis.
本明細書において「配列番号1に記載のアミノ酸配列におけるX番目のアミノ酸」とは
、配列番号1に記載のアミノ酸配列のN末端から数えてX位の位置に存在するアミノ酸を
意味する。特定のアミノ酸配列における「配列番号1に記載のアミノ酸配列におけるX番
目のアミノ酸に相当するアミノ酸残基」とは、当該特定のアミノ酸配列におけるアミノ酸
残基であって、当該特定のアミノ酸配列と配列番号1のアミノ酸配列とのアライメント(
alignment)において配列番号1に示すアミノ酸配列におけるX番目のアミノ酸
と同一の位置に配列されるアミノ酸残基を意味する。例えば、Lys7Glnのアミノ酸
置換の場合、特定のアミノ酸配列における「配列番号1の7番目のリジンに相当するアミ
ノ酸残基」とは、当該特定のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基であって、当該特定のア
ミノ酸配列と配列番号1のアミノ酸配列とのアラインメントにおいて配列番号1に示すア
ミノ酸配列における7番目のリジンと同一の位置に配列されるアミノ酸残基を意味する。
なお、配列番号1に記載のアミノ酸配列における「配列番号1に記載のアミノ酸配列にお
けるX番目のアミノ酸に相当するアミノ酸残基」とは、配列番号1に記載のアミノ酸配列
におけるX番目のアミノ酸そのものを意味する。すなわち、上記例示したアミノ酸置換(
すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意で他のアミノ酸置換)の位置は、
必ずしも本発明のタンパク質における絶対的な位置を示すものではなく、配列番号1に記
載のアミノ酸配列に基づく相対的な位置を示すものである。すなわち、例えば、本発明の
タンパク質が、上記例示したアミノ酸置換の位置よりもN末端側にアミノ酸残基の挿入、
欠失、または付加を含む場合、それに応じて当該アミノ酸置換の絶対的な位置は変動し得
る。本発明のタンパク質における上記例示したアミノ酸置換の位置は、例えば、前記ドメ
インのアミノ酸配列と配列番号1に記載のアミノ酸配列とのアラインメントで特定できる
。アラインメントは、例えば、BLASTやFASTA等のアラインメントプログラムを
利用して実施できる。配列番号1に記載のアミノ酸配列のバリアント配列等の任意のアミ
ノ酸配列における上記例示したアミノ酸置換の位置についても同様である。また、上記例
示したアミノ酸置換(すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でGlu4
9AspやPro6Serなど他のアミノ酸置換)の置換前のアミノ酸残基は、配列番号
1に記載のアミノ酸配列における置換前のアミノ酸残基の種類を示すものであって、配列
番号1に記載のアミノ酸配列以外の非改変型アミノ酸配列においては保存されていてもよ
く、保存されていなくてもよい。
As used herein, "the X-th amino acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1" means the amino acid present at position X counting from the N-terminus of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. In a specific amino acid sequence, "the amino acid residue corresponding to the X-th amino acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1" refers to the amino acid residue in the specific amino acid sequence, and the specific amino acid sequence and SEQ ID NO. Alignment with the amino acid sequence of 1 (
It means an amino acid residue arranged at the same position as the X-th amino acid in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in alignment). For example, in the case of Lys7Gln amino acid substitution, the "amino acid residue corresponding to the 7th lysine of SEQ ID NO: 1" in a specific amino acid sequence is the amino acid residue in the specific amino acid sequence, and the specific amino acid Refers to the amino acid residue arranged at the same position as the 7th lysine in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the alignment of the sequence and the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1.
In addition, in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, "the amino acid residue corresponding to the X-th amino acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1" refers to the X-th amino acid itself in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. means. That is, the amino acid substitutions exemplified above (
That is, the position of the amino acid substitution at said specific position and optionally other amino acid substitution) is
It does not necessarily indicate an absolute position in the protein of the present invention, but a relative position based on the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. That is, for example, the protein of the present invention may include insertion of an amino acid residue on the N-terminal side of the amino acid substitution position exemplified above,
If deletions or additions are involved, the absolute position of the amino acid substitution may vary accordingly. The position of the amino acid substitution exemplified above in the protein of the present invention can be identified, for example, by alignment of the amino acid sequence of the domain and the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. Alignment can be performed, for example, using an alignment program such as BLAST or FASTA. The same applies to the positions of amino acid substitutions exemplified above in any amino acid sequence such as a variant sequence of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. In addition, the amino acid substitutions exemplified above (i.e., amino acid substitutions at the specific positions and optionally Glu4
The amino acid residue before substitution (other amino acid substitutions such as 9Asp and Pro6Ser) indicates the type of amino acid residue before substitution in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, and the amino acid residue before substitution in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. It may or may not be conserved in other non-modified amino acid sequences.
本発明のタンパク質は、改変型アミノ酸配列を1個のみ含んでいてもよく、改変型アミ
ノ酸配列を複数個含んでいてもよい。本発明のタンパク質は、例えば、改変型アミノ酸配
列を2個以上、3個以上、4個以上、または5個以上含んでいてもよく、10個以下、7
個以下、5個以下、4個以下、3個以下、または2個以下含んでいてもよく、それらの矛
盾しない組み合わせの個数含んでいてもよい。本発明のタンパク質が複数個の改変型アミ
ノ酸配列を含む場合、それら複数個の改変型アミノ酸配列のアミノ酸配列は同一であって
もよく、そうでなくてもよい。それら複数個の改変型アミノ酸配列は、直接連結(直結)
させた態様であってもよいし、適切なリンカー(例えば、5以上25以下のアミノ酸残基
からなるオリゴペプチド)を介して連結させた態様であってもよい。
The protein of the present invention may contain only one modified amino acid sequence, or may contain multiple modified amino acid sequences. The protein of the present invention may contain, for example, 2 or more, 3 or more, 4 or more, or 5 or more modified amino acid sequences, and 10 or less, 7 or more modified amino acid sequences.
The number may be less than or equal to 5, less than or equal to 4, less than or equal to 3, or less than or equal to 2, or may contain any consistent combination thereof. When the protein of the present invention includes multiple modified amino acid sequences, the amino acid sequences of the multiple modified amino acid sequences may or may not be the same. These multiple modified amino acid sequences are directly connected (directly connected)
They may be connected via an appropriate linker (for example, an oligopeptide consisting of 5 or more and 25 or less amino acid residues).
本発明のタンパク質は、改変型アミノ酸配列からなるものであってもよく、他のアミノ
酸配列をさらに含んでいてもよい。すなわち、本発明のタンパク質は、例えば、そのN末
端側またはC末端側に他のアミノ酸配列をさらに含んでいてもよい。言い換えると、本発
明のタンパク質においては、例えば、改変型アミノ酸配列のN末端側またはC末端側に、
他のアミノ酸配列が付加されていてもよい。他のアミノ酸配列としては、オリゴペプチド
があげられる。他のアミノ酸配列として用いられるオリゴペプチドとしては、前記リンカ
ー以外のオリゴペプチドがあげられる。他のアミノ酸配列は、本発明のタンパク質の免疫
グロブリン結合活性や安定性を損なわない限り、特に制限されない。例えば、他のアミノ
酸配列の種類や長さは、本発明のタンパク質の免疫グロブリン結合性や安定性を損なわな
い限り、特に制限されない。
The protein of the present invention may consist of a modified amino acid sequence or may further contain other amino acid sequences. That is, the protein of the present invention may further include other amino acid sequences, for example, on its N-terminal side or C-terminal side. In other words, in the protein of the present invention, for example, on the N-terminal side or C-terminal side of the modified amino acid sequence,
Other amino acid sequences may be added. Other amino acid sequences include oligopeptides. Examples of oligopeptides used as other amino acid sequences include oligopeptides other than the linker described above. Other amino acid sequences are not particularly limited as long as they do not impair the immunoglobulin binding activity or stability of the protein of the present invention. For example, the type and length of other amino acid sequences are not particularly limited as long as they do not impair the immunoglobulin binding properties or stability of the protein of the present invention.
本発明のタンパク質は、例えば、選択した免疫グロブリン結合ドメインに加えて、他の
免疫グロブリン結合ドメインの一部を含んでいてもよい。例えば、本発明のタンパク質が
FpLのドメインC3の改変型アミノ酸配列を含む場合、本発明のタンパク質は、さらに
、FpLのドメインC3のN末端側領域(ドメインC1、ドメインC2)の一部を含んで
いてもよく、FpLのドメインC3のC末端側領域(ドメインC4)の一部を含んでいて
もよい。
The proteins of the invention may, for example, contain portions of other immunoglobulin binding domains in addition to the selected immunoglobulin binding domain. For example, when the protein of the present invention contains a modified amino acid sequence of domain C3 of FpL, the protein of the present invention further contains a part of the N-terminal region (domain C1, domain C2) of domain C3 of FpL. It may contain a part of the C-terminal region (domain C4) of domain C3 of FpL.
本発明のタンパク質は、例えば、そのN末端側またはC末端側に、目的物を特異的に検
出または分離する目的で有用なオリゴペプチドを含んでいてもよい。そのようなオリゴペ
プチドとしては、ポリヒスチジンやポリアルギニンが挙げられる。また本発明のタンパク
質は、例えば、そのN末端側またはC末端側に、本発明のタンパク質をクロマトグラフィ
ー用の支持体等の固相に固定化する際に有用なオリゴペプチドを含んでいてもよい。その
ようなオリゴペプチドとしては、リジンやシステインを含むオリゴペプチドが挙げられる
。
The protein of the present invention may contain, for example, at its N-terminus or C-terminus, an oligopeptide useful for specifically detecting or separating a target substance. Such oligopeptides include polyhistidine and polyarginine. Furthermore, the protein of the present invention may contain, for example, at its N-terminus or C-terminus, an oligopeptide useful when immobilizing the protein of the present invention on a solid phase such as a support for chromatography. . Such oligopeptides include oligopeptides containing lysine and cysteine.
本発明のタンパク質が上記のような他のアミノ酸配列を含む場合、本発明のタンパク質
は、例えば、あらかじめ他のアミノ酸配列を含む形態で製造されてもよいし、別途製造さ
れた上記のような他のアミノ酸配列が付加されてもよい。本発明のタンパク質が上記のよ
うな他のアミノ酸配列を含む場合、典型的には、本発明のタンパク質は、上記のような他
のアミノ酸配列を含む本発明のタンパク質の全長アミノ酸配列をコードするポリヌクレオ
チドから発現させることで製造できる。すなわち、例えば、他のアミノ酸配列をコードす
るポリヌクレオチドと本発明のタンパク質(例えば他のアミノ酸配列を含まないもの)を
コードするポリヌクレオチドとを、他のアミノ酸配列が本発明のタンパク質のN末端側ま
たはC末端側に付加されるように連結し、本発明のタンパク質を発現させてもよい。また
例えば、化学的に合成した他のアミノ酸配列を本発明のタンパク質(例えば他のアミノ酸
配列を含まないもの)のN末端側またはC末端側に化学的に結合させてもよい。
When the protein of the present invention contains another amino acid sequence as described above, the protein of the present invention may be manufactured in advance in a form containing the other amino acid sequence, for example, or may be prepared in a form containing the other amino acid sequence separately manufactured. The amino acid sequence may be added. When the protein of the present invention includes other amino acid sequences as described above, the protein of the present invention typically comprises a polypeptide encoding the full-length amino acid sequence of the protein of the present invention that includes the other amino acid sequences as described above. It can be produced by expressing it from nucleotides. That is, for example, a polynucleotide encoding another amino acid sequence and a polynucleotide encoding the protein of the present invention (e.g., one that does not contain the other amino acid sequence) may be connected to a polynucleotide encoding the protein of the present invention, such that the other amino acid sequence is on the N-terminal side of the protein of the present invention. Alternatively, the protein of the present invention may be expressed by linking so as to be added to the C-terminal side. For example, another chemically synthesized amino acid sequence may be chemically bonded to the N-terminus or C-terminus of the protein of the present invention (for example, one that does not contain other amino acid sequences).
本発明のタンパク質は、例えば、本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドか
ら発現させることで製造できる。本明細書では、本発明のタンパク質をコードするポリヌ
クレオチドを、「本発明のポリヌクレオチド」ともいう。本発明のポリヌクレオチドは、
具体的には、本発明のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド
であってよい。
The protein of the present invention can be produced, for example, by expressing it from a polynucleotide encoding the protein of the present invention. In this specification, a polynucleotide encoding the protein of the present invention is also referred to as a "polynucleotide of the present invention." The polynucleotide of the present invention is
Specifically, it may be a polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding the protein of the present invention.
本発明のポリヌクレオチドは、例えば、化学合成法やPCR法等によるDNA増幅法で
取得できる。DNA増幅法は、例えば、本発明のタンパク質をコードするヌクレオチド配
列といった、増幅すべきヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを鋳型とし実施できる
。鋳型とするポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質を発現する生物のゲノムDNA、
本発明のタンパク質のcDNA、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターが例示できる
。
The polynucleotide of the present invention can be obtained, for example, by chemical synthesis, PCR, or other DNA amplification methods. The DNA amplification method can be carried out using, for example, a polynucleotide containing a nucleotide sequence to be amplified, such as a nucleotide sequence encoding a protein of the present invention, as a template. The polynucleotide used as a template is genomic DNA of an organism expressing the protein of the present invention,
Examples include vectors containing the cDNA of the protein of the present invention and the polynucleotide of the present invention.
本発明のポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は、例えば、本発明のタンパク質のアミ
ノ酸配列からの変換で設計できる。アミノ酸配列からヌクレオチド配列に変換する際には
、標準のコドンテーブルを使用できるが、本発明のポリヌクレオチドで形質転換する宿主
におけるコドンの使用頻度を考慮して変換するのが好ましい。一例として、宿主がEsc
herichia coli(大腸菌)の場合は、アルギニン(Arg)ではAGA/A
GG/CGG/CGAが、イソロイシン(Ile)ではATAが、ロイシン(Leu)で
はCTAが、グリシン(Gly)ではGGAが、プロリン(Pro)ではCCCが、それ
ぞれ使用頻度が少ないため(いわゆるレアコドンであるため)、それらのコドンを避ける
ように変換してよい。コドンの使用頻度の解析は公的データベース(例えば、かずさDN
A研究所のウェブサイトにあるCodon Usage Databaseなど)を利用
することでも可能である。
The nucleotide sequence of the polynucleotide of the present invention can be designed, for example, by conversion from the amino acid sequence of the protein of the present invention. When converting an amino acid sequence into a nucleotide sequence, a standard codon table can be used, but it is preferable to perform the conversion in consideration of the codon usage frequency in the host to be transformed with the polynucleotide of the present invention. As an example, if the host is Esc
In the case of herichia coli, AGA/A for arginine (Arg)
GG/CGG/CGA, ATA for isoleucine (Ile), CTA for leucine (Leu), GGA for glycine (Gly), and CCC for proline (Pro) are used less frequently (so-called rare codons). ), you may convert to avoid those codons. Analysis of codon usage frequency can be performed using public databases (e.g., Kazusa DN
This is also possible by using Codon Usage Database, etc. available on the website of Research Institute A.
本発明のポリヌクレオチドは、当該ポリヌクレオチドの全長を一括取得してもよく、当
該ポリヌクレオチドの部分配列からなるポリヌクレオチドを取得後連結することで取得し
てもよい。上記のような本発明のポリヌクレオチドを取得する手法についての説明は、そ
の全長配列を一括して取得する場合に限られず、その部分配列を取得する場合にも準用で
きる。
The polynucleotide of the present invention may be obtained by obtaining the entire length of the polynucleotide at once, or by ligating polynucleotides consisting of partial sequences of the polynucleotide after obtaining them. The above description of the method for obtaining the polynucleotide of the present invention is not limited to the case where the full-length sequence thereof is obtained all at once, but can also be applied mutatis mutandis to the case where the partial sequence thereof is obtained.
なお、本発明のポリヌクレオチドは、任意のポリペプチドのアミノ酸配列をコードする
ポリヌクレオチドと連結し、融合型アミノ酸配列をコードするように設計してもよい。
Note that the polynucleotide of the present invention may be designed to be linked to a polynucleotide encoding the amino acid sequence of any polypeptide to encode a fused amino acid sequence.
本発明のタンパク質は、例えば、本発明のポリヌクレオチドを含む遺伝子組換え宿主(
以下、単に「本発明遺伝子組換え宿主」ともいう)を培養し前記タンパク質を発現させた
後、発現した前記タンパク質を回収することで製造できる。本発明の遺伝子組換え宿主は
、例えば、本発明のポリヌクレオチドを用いて宿主を形質転換することで得られる。宿主
は、本発明のポリヌクレオチドで形質転換されることで本発明のタンパク質を発現可能な
ものであれば特に制限されない。宿主の例として、動物細胞、昆虫細胞、微生物が挙げら
れる。このうち動物細胞としては、COS細胞、CHO(Chinese Hamste
r Ovary)細胞、Hela細胞、NIH3T3細胞、HEK293細胞が、昆虫細
胞としては、Sf9細胞、BTI-TN-5B1-4細胞が、微生物としては、酵母や細
菌が、それぞれ例示できる。さらに酵母としては、Saccharomyces cer
evisiae等のSaccharomyces属酵母、Pichia Pastori
s等のPichia属酵母、Schizosaccharomyces pombe等の
Schizosaccharomyces属酵母が、細菌としては、大腸菌(Esche
richia coli)等のEscherichia属細菌が挙げられる。大腸菌とし
ては、JM109株、BL21(DE3)株が挙げられる。なお、酵母や大腸菌を宿主と
して用いると生産性の面で好ましく、大腸菌を宿主として用いるとさらに好ましい。
The protein of the present invention can be used, for example, in a genetically modified host (
It can be produced by culturing the protein (hereinafter also simply referred to as "the genetically modified host of the present invention") and expressing the protein, and then collecting the expressed protein. The genetically modified host of the present invention can be obtained, for example, by transforming a host using the polynucleotide of the present invention. The host is not particularly limited as long as it can express the protein of the present invention by being transformed with the polynucleotide of the present invention. Examples of hosts include animal cells, insect cells, and microorganisms. Among these, animal cells include COS cells and CHO (Chinese Hamste
Examples of insect cells include Sf9 cells and BTI-TN-5B1-4 cells, and examples of microorganisms include yeast and bacteria. Furthermore, as a yeast, Saccharomyces cer
Yeasts of the genus Saccharomyces such as Evisiae, Pichia Pastori
Yeasts of the genus Pichia such as S, yeasts of the genus Schizosaccharomyces such as Schizosaccharomyces pombe, and as bacteria, Escherichia coli (Esche.
Bacteria belonging to the genus Escherichia, such as (richia coli), can be mentioned. Examples of E. coli include JM109 strain and BL21 (DE3) strain. Note that it is preferable to use yeast or E. coli as a host in terms of productivity, and it is more preferable to use E. coli as a host.
本発明の遺伝子組換え宿主において、本発明のポリヌクレオチドは、発現可能に保持さ
れていればよい。具体的には、本発明のポリヌクレオチドは、前記宿主で機能するプロモ
ーターの制御下で発現するように保持されていればよい。前記宿主が大腸菌の場合、宿主
で機能するプロモーターの一例として、trpプロモーター、tacプロモーター、tr
cプロモーター、lacプロモーター、T7プロモーター、recAプロモーター、lp
pプロモーターが挙げられる。
In the genetically recombinant host of the present invention, the polynucleotide of the present invention only needs to be maintained so that it can be expressed. Specifically, the polynucleotide of the present invention may be maintained so as to be expressed under the control of a promoter that functions in the host. When the host is E. coli, examples of promoters that function in the host include trp promoter, tac promoter, tr
c promoter, lac promoter, T7 promoter, recA promoter, lp
Examples include the p promoter.
また本発明の遺伝子組換え宿主において、本発明のポリヌクレオチドは、ゲノムDNA
外で自律複製するベクター上に存在していてよい。すなわち、本発明のポリヌクレオチド
を含む発現ベクター(以下、単に「本発明の発現ベクター」ともいう)で宿主を形質転換
して本発明の遺伝子組換え宿主を作製してもよい。本発明の発現ベクターは、例えば、発
現ベクターの適切な位置に本発明のポリヌクレオチドを挿入して得られる。なお、発現ベ
クターは、形質転換する宿主内で安定に存在し複製できるものであれば特に制限されない
。前記宿主が大腸菌の場合、発現ベクターとしては、pETプラスミドベクター、pUC
プラスミドベクター、pTrcプラスミドベクターが例示できる。なお、本発明の発現ベ
クターは、抗生物質耐性遺伝子等の選択マーカーを備えていてよい。また、前記適切な位
置とは、発現ベクターの複製機能、選択マーカー、伝達性に関わる領域を破壊しない位置
を意味する。前記発現ベクターに本発明のポリヌクレオチドを挿入する際は、発現に必要
なプロモーター等の機能性ポリヌクレオチドに連結された状態で挿入すると好ましい。
Furthermore, in the genetically modified host of the present invention, the polynucleotide of the present invention is derived from genomic DNA.
It may exist on a vector that autonomously replicates outside. That is, the genetically modified host of the present invention may be produced by transforming a host with an expression vector containing the polynucleotide of the present invention (hereinafter also simply referred to as "the expression vector of the present invention"). The expression vector of the present invention can be obtained, for example, by inserting the polynucleotide of the present invention into an appropriate position of the expression vector. Note that the expression vector is not particularly limited as long as it can stably exist and replicate within the host to be transformed. When the host is E. coli, expression vectors include pET plasmid vector, pUC
Examples include plasmid vectors and pTrc plasmid vectors. Note that the expression vector of the present invention may include a selection marker such as an antibiotic resistance gene. Furthermore, the above-mentioned appropriate position means a position that does not destroy regions related to the replication function, selection marker, and transmissibility of the expression vector. When inserting the polynucleotide of the present invention into the expression vector, it is preferably inserted while linked to a functional polynucleotide such as a promoter necessary for expression.
また本発明の遺伝子組換え宿主において、本発明のポリヌクレオチドは、ゲノムDNA
上に導入されてもよい。ゲノムDNAへの本発明のポリヌクレオチドの導入は、例えば、
相同組み換えによる遺伝子導入法を利用して実施できる。相同組み換えによる遺伝子導入
法としては、Red-driven integration法(Datsenko,K
.A,and Wanner,B.L.,Proc.Natl.Acad.Sci.US
A.,97:6640-6645(2000))等の直鎖状DNAを用いる方法、温度感
受性複製起点を含むベクターを用いる方法、宿主内で機能する複製起点を持たないベクタ
ーを用いる方法、ファージを用いたtransduction法が例示できる。
Furthermore, in the genetically modified host of the present invention, the polynucleotide of the present invention is derived from genomic DNA.
may be introduced above. Introduction of the polynucleotide of the present invention into genomic DNA can be carried out, for example, by
It can be carried out using a gene introduction method using homologous recombination. As a gene introduction method using homologous recombination, Red-driven integration method (Datsenko, K.
.. A. and Wanner, B. L. , Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.
A. , 97:6640-6645 (2000)), a method using a vector containing a temperature-sensitive origin of replication, a method using a vector that does not have an origin of replication that functions within the host, a method using a phage. An example is the transduction method.
本発明の発現ベクター等のポリヌクレオチドを用いた宿主の形質転換は、例えば、当業
者が通常用いる方法で実施できる。例えば、宿主として大腸菌を選択した場合は、コンピ
テントセル法、ヒートショック法、エレクトロポレーション法等で形質転換すればよい。
形質転換後に適切な方法で本発明のポリヌクレオチドを含む宿主をスクリーニングするこ
とで、本発明の遺伝子組換え宿主を取得できる。
Transformation of a host using a polynucleotide such as an expression vector of the present invention can be carried out, for example, by a method commonly used by those skilled in the art. For example, if Escherichia coli is selected as a host, transformation may be performed using the competent cell method, heat shock method, electroporation method, or the like.
The genetically modified host of the present invention can be obtained by screening hosts containing the polynucleotide of the present invention by an appropriate method after transformation.
なお、各種微生物において利用可能な発現ベクターやプロモーター等の遺伝子工学的手
法に関する情報は、例えば「微生物学基礎講座8 遺伝子工学、共立出版、1987年」
などの公知文献を利用し、取得すればよい。
For information on genetic engineering methods such as expression vectors and promoters that can be used in various microorganisms, see, for example, "Basic Microbiology Course 8 Genetic Engineering," Kyoritsu Shuppan, 1987.
It can be obtained using publicly known documents such as .
本発明の遺伝子組換え宿主が本発明の発現ベクターを含む場合、本発明の遺伝子組換え
宿主から本発明の発現ベクターを調製できる。例えば、本発明の遺伝子組換え宿主を培養
して得られる培養物からアルカリ抽出法またはQIAprep Spin Minipr
ep kit(QIAGEN社製)等の市販の抽出キットを用いて本発明の発現ベクター
を調製できる。
When the genetically modified host of the present invention contains the expression vector of the present invention, the expression vector of the present invention can be prepared from the genetically modified host of the present invention. For example, a culture obtained by culturing the genetically modified host of the present invention may be subjected to an alkaline extraction method or QIAprep Spin Minipr.
The expression vector of the present invention can be prepared using a commercially available extraction kit such as ep kit (manufactured by QIAGEN).
本発明の遺伝子組換え宿主を培養することで、本発明のタンパク質を発現できる。また
、本発明の遺伝子組換え宿主を培養することで、本発明のタンパク質を発現させ、発現し
た前記タンパク質を回収することで、本発明のタンパク質を製造できる。すなわち、本明
細書は、本発明の遺伝子組換え宿主を培養することで本発明のタンパク質を発現させる工
程と、発現された前記タンパク質を回収する工程とを含む、本発明のタンパク質の製造方
法を開示する。培地組成や培養条件は、宿主の種類や本発明のタンパク質の特性等の諸条
件に応じて適宜設定すればよい。培地組成や培養条件は、例えば、宿主が増殖でき、かつ
、本発明のタンパク質を発現可能な条件に設定すればよい。培地は、例えば、炭素源、窒
素源、無機塩、その他の各種有機成分や無機成分を適宜含む培地を使用できる。具体的に
は、宿主が大腸菌の場合、必要な栄養源を補ったLB(Luria-Bertani)培
地(トリプトン1%(w/v)、酵母エキス0.5%(w/v)、1%(w/v)NaC
l)が好ましい培地の一例として挙げられる。なお、本発明の発現ベクターの導入の有無
により、本発明の遺伝子組換え宿主を選択的に増殖させるために、培地に当該発現ベクタ
ーに含まれる抗生物質耐性遺伝子に対応した抗生物質を添加して培養すると好ましい。例
えば、当該発現ベクターがカナマイシン耐性遺伝子を含んでいる場合は培地にカナマイシ
ンを添加すればよい。本発明のポリヌクレオチドがゲノムDNA上に導入されている場合
も同様である。また、培地は、グルタチオン、システイン、シスタチン、チオグリコレー
トおよびジチオスレイトールからなる群から選択される一種類以上の還元剤を含んでいて
もよい。また培地は、グリシン等の前記形質転換体から培養液へのタンパク質分泌を促す
試薬を含んでいてもよい。例えば、宿主が大腸菌の場合、培地に対してグリシンを2%(
w/v)以下で添加すると好ましい。培養温度は、例えば、宿主が大腸菌の場合、一般に
10℃以上40℃以下、好ましくは20℃以上37℃以下、より好ましくは25℃前後で
ある。培地のpHは、例えば、宿主が大腸菌の場合、pH6.8以上pH7.4以下、好
ましくはpH7.0前後である。また、本発明のタンパク質を誘導性のプロモーターの制
御下で発現する場合は、本発明のタンパク質が良好に発現できるように誘導をかけると好
ましい。発現誘導には、例えば、プロモーターの種類に応じた誘導剤を用いることができ
る。誘導剤としては、IPTG(Isopropyl-β-D-thiogalacto
pyranoside)を例示できる。宿主が大腸菌の場合、例えば、培養液の濁度(6
00nmにおける吸光度)が約0.5から1.0となったときに適当量のIPTGを添加
し、引き続き培養することで、本発明のタンパク質の発現を誘導できる。IPTGの添加
濃度は、例えば、0.005mM以上1.0mM以下、好ましくは0.01mM以上0.
5mM以下である。IPTG誘導等の発現誘導は、例えば、当該技術分野において周知の
条件で行なえる。
The protein of the present invention can be expressed by culturing the genetically modified host of the present invention. Furthermore, the protein of the present invention can be produced by culturing the genetically modified host of the present invention to express the protein of the present invention and collecting the expressed protein. That is, this specification describes a method for producing the protein of the present invention, which includes a step of expressing the protein of the present invention by culturing a genetically modified host of the present invention, and a step of recovering the expressed protein. Disclose. The medium composition and culture conditions may be appropriately set depending on various conditions such as the type of host and the characteristics of the protein of the present invention. The medium composition and culture conditions may be set, for example, to conditions that allow the host to proliferate and express the protein of the present invention. As the medium, for example, a medium containing a carbon source, a nitrogen source, an inorganic salt, and other various organic components and inorganic components as appropriate can be used. Specifically, when the host is E. coli, LB (Luria-Bertani) medium supplemented with necessary nutrients (tryptone 1% (w/v), yeast extract 0.5% (w/v), 1% ( w/v) NaC
l) is mentioned as an example of a preferable medium. In addition, in order to selectively propagate the genetically modified host of the present invention depending on whether or not the expression vector of the present invention is introduced, an antibiotic corresponding to the antibiotic resistance gene contained in the expression vector is added to the culture medium. It is preferable to culture it. For example, if the expression vector contains a kanamycin resistance gene, kanamycin may be added to the medium. The same applies when the polynucleotide of the present invention is introduced onto genomic DNA. The medium may also contain one or more reducing agents selected from the group consisting of glutathione, cysteine, cystatin, thioglycolate, and dithiothreitol. The medium may also contain a reagent such as glycine that promotes protein secretion from the transformant into the culture medium. For example, if the host is E. coli, add 2% glycine (
w/v) or less. For example, when the host is E. coli, the culture temperature is generally 10°C or higher and 40°C or lower, preferably 20°C or higher and 37°C or lower, and more preferably around 25°C. For example, when the host is E. coli, the pH of the medium is between pH 6.8 and pH 7.4, preferably around pH 7.0. Further, when the protein of the present invention is expressed under the control of an inducible promoter, it is preferable to induce the protein of the present invention so that the protein can be expressed well. For expression induction, for example, an inducer depending on the type of promoter can be used. As an inducer, IPTG (Isopropyl-β-D-thiogalacto
An example of this is pyranoside. When the host is E. coli, for example, the turbidity of the culture solution (6
Expression of the protein of the present invention can be induced by adding an appropriate amount of IPTG when the absorbance (absorbance at 00 nm) is about 0.5 to 1.0 and continuing culturing. The concentration of IPTG to be added is, for example, 0.005mM or more and 1.0mM or less, preferably 0.01mM or more and 0.01mM or more and 0.01mM or more and 1.0mM or less, for example.
It is 5mM or less. Expression induction such as IPTG induction can be performed, for example, under conditions well known in the art.
本発明のタンパク質は、その発現形態に適した方法で培養物から分離し回収すればよい
。なお、本明細書において「培養物」とは、培養で得られた培養液の全体またはその一部
を意味する。当該一部は、本発明のタンパク質を含む部分であれば特に制限されない。当
該一部としては、培養された本発明の形質転換体の細胞や培養後の培地(すなわち培養上
清)などが挙げられる。例えば、本発明のタンパク質が培養上清に蓄積する場合、細胞を
遠心分離操作で分離し、得られる培養上清から本発明のタンパク質を回収すればよい。ま
た、本発明のタンパク質が細胞内(ペリプラズムを含む)に蓄積する場合、細胞を遠心分
離操作で回収後、酵素処理剤や界面活性剤等を添加して細胞を破砕し、当該破砕物から本
発明のタンパク質を回収すればよい。前述した培養上清や細胞破砕物からの、本発明のタ
ンパク質の回収は、例えば、タンパク質の分離精製に用いられる公知の方法で実施できる
。前記回収方法の一例として、硫安分画、イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマト
グラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、等電点
沈殿が挙げられる。
The protein of the present invention may be isolated and recovered from the culture by a method suitable for its expression form. In addition, in this specification, "culture" means the whole culture solution obtained by culture|cultivation or a part thereof. The part is not particularly limited as long as it contains the protein of the present invention. Examples of the part include cultured cells of the transformant of the present invention and the culture medium after culture (ie, culture supernatant). For example, when the protein of the present invention accumulates in the culture supernatant, the cells may be separated by centrifugation and the protein of the present invention may be recovered from the resulting culture supernatant. In addition, when the protein of the present invention accumulates within cells (including the periplasm), after collecting the cells by centrifugation, add an enzyme treatment agent, a surfactant, etc. to disrupt the cells, and then extract the protein from the disrupted product. The protein of the invention may be recovered. The protein of the present invention can be recovered from the culture supernatant or cell lysate described above by, for example, a known method used for protein separation and purification. Examples of the recovery method include ammonium sulfate fractionation, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, affinity chromatography, gel filtration chromatography, and isoelectric precipitation.
本発明のタンパク質は、例えば、免疫グロブリン(抗体)の分離または分析に使用でき
る。前記目的で使用する際は、例えば、不溶性担体と当該不溶性担体に固定化した本発明
のタンパク質とを含む免疫グロブリン吸着剤(以下、単に「本発明の免疫グロブリン吸着
剤」ともいう)の態様で使用できる。なお、本明細書において、「免疫グロブリンの分離
」とは、夾雑物質共存下の溶液からの免疫グロブリンの分離に限らず、構造、性質、また
は活性等に基づく免疫グロブリン間の分離も含む。不溶性担体は、水溶液に対して不溶性
の担体であれば特に制限されない。不溶性担体としては、アガロース、アルギネート(ア
ルギン酸塩)、カラゲナン、キチン、セルロース、デキストリン、デキストラン、デンプ
ン等の多糖質を原料とした担体や、ポリビニルアルコール、ポリメタクレート、ポリ(2
-ヒドロキシエチルメタクリレート)、ポリウレタン等の合成高分子を原料とした担体や
、シリカ等のセラミックスを原料とした担体が例示できる。中でも、多糖質を原料とした
担体や合成高分子を原料とした担体が不溶性担体として好ましい。前記好ましい担体の一
例として、トヨパール(東ソー社製)等のヒドロキシ基を導入したポリメタクリレートゲ
ル、Sepharose(Cytiva社製)等のアガロースゲル、セルファイン(JN
C社製)等のセルロースゲルが挙げられる。不溶性担体の形状は特に制限されない。不溶
性担体は、例えば、カラムに充填できる形状であってよい。不溶性担体は、例えば、粒状
物または非粒状物であってよい。また、不溶性担体は、例えば、多孔性または非多孔性で
あってもよい。
The protein of the present invention can be used, for example, in the separation or analysis of immunoglobulins (antibodies). When used for the above purpose, for example, in the form of an immunoglobulin adsorbent (hereinafter also simply referred to as "immunoglobulin adsorbent of the present invention") comprising an insoluble carrier and the protein of the present invention immobilized on the insoluble carrier. Can be used. In this specification, "separation of immunoglobulins" is not limited to separation of immunoglobulins from a solution in the presence of contaminants, but also includes separation of immunoglobulins based on structure, property, activity, etc. The insoluble carrier is not particularly limited as long as it is insoluble in an aqueous solution. Examples of insoluble carriers include carriers made from polysaccharides such as agarose, alginate, carrageenan, chitin, cellulose, dextrin, dextran, and starch, as well as polyvinyl alcohol, polymethacrylate, and poly(2).
Examples include carriers made from synthetic polymers such as -hydroxyethyl methacrylate) and polyurethane, and carriers made from ceramics such as silica. Among these, carriers made from polysaccharides and carriers made from synthetic polymers are preferred as insoluble carriers. Examples of the preferable carriers include polymethacrylate gels with introduced hydroxyl groups such as Toyopearl (manufactured by Tosoh Corporation), agarose gels such as Sepharose (manufactured by Cytiva Corporation), and Cellufine (JN
Examples include cellulose gels such as those manufactured by Company C). The shape of the insoluble carrier is not particularly limited. The insoluble carrier may be in a form that can be packed into a column, for example. Insoluble carriers may be, for example, particulate or non-particulate. Insoluble carriers may also be porous or non-porous, for example.
本発明における分離または分析対象の免疫グロブリン(抗体)は、本発明のタンパク質
が結合性を有するものであれば、特に制限されない。免疫グロブリンは、具体的には、κ
軽鎖を有するものであってよい。免疫グロブリンは、κ軽鎖に加えて、Fc領域等の他の
領域を含んでいてもよく、いなくてもよい。免疫グロブリンは、例えば、シングルチェー
ンFv(scFv)、Fab、F(ab’)2、IgA、二重特異性T細胞誘導(BiT
E)抗体等の、Fc領域を有しないものであってもよい。免疫グロブリンは、モノクロー
ナル抗体であってもよく、ポリクローナル抗体であってもよい。免疫グロブリンは、例え
ば、IgG、IgM、IgA、IgD、およびIgEのいずれであってもよい。IgGは
、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4のいずれであってもよい。免
疫グロブリンの由来は、特に制限されない。免疫グロブリンは、単一の生物に由来するも
のであってもよく、2種またはそれ以上の生物の組み合わせに由来するものであってもよ
い。免疫グロブリンとしては、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、それらのバリアント
(例えばアミノ酸置換体)があげられる。また、免疫グロブリンとしては、二重特異性抗
体(バイスペシフィック抗体)、κ軽鎖と他のタンパク質との融合抗体、κ軽鎖と薬物と
の複合体(ADC)等の人工的に構造改変した抗体もあげられる。なお、「免疫グロブリ
ン」には、抗体医薬も包含される。
The immunoglobulin (antibody) to be separated or analyzed in the present invention is not particularly limited as long as it has binding properties to the protein of the present invention. Immunoglobulin is specifically κ
It may have a light chain. In addition to the kappa light chain, immunoglobulins may or may not contain other regions such as an Fc region. Immunoglobulins include, for example, single chain Fv (scFv), Fab, F(ab') 2 , IgA, bispecific T cell induction (BiT
E) It may be something that does not have an Fc region, such as an antibody. The immunoglobulin may be a monoclonal antibody or a polyclonal antibody. The immunoglobulin may be, for example, any of IgG, IgM, IgA, IgD, and IgE. IgG may be, for example, any of IgG1, IgG2, IgG3, and IgG4. The origin of immunoglobulin is not particularly limited. Immunoglobulins may be derived from a single organism or a combination of two or more organisms. Examples of immunoglobulins include chimeric antibodies, humanized antibodies, human antibodies, and variants thereof (eg, amino acid substitution products). In addition, as immunoglobulins, artificially structurally modified antibodies such as bispecific antibodies, fusion antibodies of κ light chain and other proteins, and complexes of κ light chain and drug (ADC), etc. Antibodies can also be given. Note that "immunoglobulin" also includes antibody drugs.
本発明のタンパク質は、例えば、共有結合により不溶性担体に固定化してもよい。具体
例として、不溶性担体が有する活性基を介して、本発明のタンパク質と不溶性担体とを共
有結合させることで、不溶性担体に前記タンパク質を固定化できる。すなわち、前記不溶
性担体は、その表面などに活性基を有していてよい。前記活性基の一例として、N-ヒド
ロキシコハク酸イミド(NHS)活性化エステル基、エポキシ基、カルボキシ基、マレイ
ミド基、ハロアセチル基、トレシル基、ホルミル基、ハロアセトアミドが挙げられる。活
性基を有する不溶性担体としては、例えば、活性基を有する市販の不溶性担体をそのまま
用いてもよいし、不溶性担体に活性基を導入して用いてもよい。活性基を有する市販の担
体としては、TOYOPEARL AF-Epoxy-650M、TOYOPEARL
AF-Tresyl-650M(いずれも東ソー社製)、HiTrap NHS-act
ivated HP Columns、NHS-activated Sepharos
e 4 Fast Flow、Epoxy-activated Sepharose
6B(いずれもCytiva社製)、SulfoLink Coupling Resi
n(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)が例示できる。
The protein of the present invention may be immobilized on an insoluble carrier by, for example, a covalent bond. As a specific example, the protein of the present invention can be covalently bonded to the insoluble carrier via an active group that the insoluble carrier has, thereby immobilizing the protein on the insoluble carrier. That is, the insoluble carrier may have active groups on its surface. Examples of the active group include N-hydroxysuccinimide (NHS) activated ester group, epoxy group, carboxy group, maleimide group, haloacetyl group, tresyl group, formyl group, and haloacetamide. As the insoluble carrier having an active group, for example, a commercially available insoluble carrier having an active group may be used as is, or an active group may be introduced into the insoluble carrier. Commercially available carriers having active groups include TOYOPEARL AF-Epoxy-650M, TOYOPEARL
AF-Tresyl-650M (both manufactured by Tosoh Corporation), HiTrap NHS-act
activated HP Columns, NHS-activated Sepharos
e 4 Fast Flow, Epoxy-activated Sepharose
6B (all manufactured by Cytiva), SulfoLink Coupling Resi
An example is n (manufactured by Thermo Fisher Scientific).
担体表面に活性基を導入する方法としては、担体表面に存在するヒドロキシ基、エポキ
シ基、カルボキシ基、アミノ基等に対して2個以上の活性部位を有する化合物の一方を反
応させる方法が例示できる。
Examples of methods for introducing active groups onto the surface of the carrier include a method in which one of the compounds having two or more active sites is reacted with a hydroxy group, epoxy group, carboxy group, amino group, etc. present on the surface of the carrier. .
担体表面に存在するヒドロキシ基やアミノ基にエポキシ基を導入する化合物としては、
エピクロロヒドリン、エタンジオールジグリシジルエーテル、ブタンジオールジグリシジ
ルエーテル、ヘキサンジオールジグリシジルエーテルを例示できる。
Compounds that introduce epoxy groups into hydroxy groups and amino groups on the surface of the carrier include:
Examples include epichlorohydrin, ethanediol diglycidyl ether, butanediol diglycidyl ether, and hexanediol diglycidyl ether.
また、担体表面に存在するエポキシ基にカルボキシ基を導入する化合物としては、2-
メルカプト酢酸、3-メルカプトプロピオン酸、4-メルカプト酪酸、6-メルカプト酪
酸、グリシン、3-アミノプロピオン酸、4-アミノ酪酸、6-アミノヘキサン酸を例示
できる。
In addition, as a compound that introduces a carboxyl group into the epoxy group present on the surface of the carrier, 2-
Examples include mercaptoacetic acid, 3-mercaptopropionic acid, 4-mercaptobutyric acid, 6-mercaptobutyric acid, glycine, 3-aminopropionic acid, 4-aminobutyric acid, and 6-aminohexanoic acid.
また、担体表面に存在するヒドロキシ基、エポキシ基、カルボキシ基、アミノ基にマレ
イミド基を導入する化合物としては、N-(ε-マレイミドカプロン酸)ヒドラジド、N
-(ε-マレイミドプロピオン酸)ヒドラジド、4-(4-N-マレイミドフェニル)酢
酸ヒドラジド、2-アミノマレイミド、3-アミノマレイミド、4-アミノマレイミド、
6-アミノマレイミド、1-(4-アミノフェニル)マレイミド、1-(3-アミノフェ
ニル)マレイミド、4-(マレイミド)フェニルイソシアナート、2-マレイミド酢酸、
3-マレイミドプロピオン酸、4-マレイミド酪酸、6-マレイミドヘキサン酸、N-(
α-マレイミドアセトキシ)スクシンイミドエステル、(m-マレイミドベンゾイル)N
-ヒドロキシスクシンイミドエステル、スクシンイミジル-4-(マレイミドメチル)シ
クロヘキサン-1-カルボニル-(6-アミノヘキサン酸)、スクシンイミジル-4-(
マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボン酸、(p-マレイミドベンゾイル)N
-ヒドロキシスクシンイミドエステル、(m-マレイミドベンゾイル)N-ヒドロキシス
クシンイミドエステルを例示できる。
Compounds that introduce maleimide groups into hydroxy groups, epoxy groups, carboxy groups, and amino groups present on the surface of the carrier include N-(ε-maleimidocaproic acid) hydrazide, N-
-(ε-maleimidopropionic acid) hydrazide, 4-(4-N-maleimidophenyl)acetic acid hydrazide, 2-aminomaleimide, 3-aminomaleimide, 4-aminomaleimide,
6-aminomaleimide, 1-(4-aminophenyl)maleimide, 1-(3-aminophenyl)maleimide, 4-(maleimido)phenylisocyanate, 2-maleimidoacetic acid,
3-maleimidopropionic acid, 4-maleimidobutyric acid, 6-maleimidohexanoic acid, N-(
α-maleimidoacetoxy)succinimide ester, (m-maleimidobenzoyl)N
-Hydroxysuccinimide ester, succinimidyl-4-(maleimidomethyl)cyclohexane-1-carbonyl-(6-aminohexanoic acid), succinimidyl-4-(
maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylic acid, (p-maleimidobenzoyl)N
Examples include -hydroxysuccinimide ester and (m-maleimidobenzoyl)N-hydroxysuccinimide ester.
また、担体表面に存在するヒドロキシ基やアミノ基にハロアセチル基を導入する化合物
としては、クロロ酢酸、ブロモ酢酸、ヨード酢酸、クロロ酢酸クロリド、ブロモ酢酸クロ
リド、ブロモ酢酸ブロミド、クロロ酢酸無水物、ブロモ酢酸無水物、ヨード酢酸無水物、
2-(ヨードアセトアミド)酢酸-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル、3-(ブロ
モアセトアミド)プロピオン酸-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル、4-(ヨード
アセチル)アミノ安息香酸-N-ヒドロキシスクシンイミドエステルを例示できる。
Compounds that introduce haloacetyl groups into hydroxy groups and amino groups present on the surface of the carrier include chloroacetic acid, bromoacetic acid, iodoacetic acid, chloroacetic acid chloride, bromoacetic acid chloride, bromoacetic acid bromide, chloroacetic anhydride, and bromoacetic acid. anhydride, iodoacetic anhydride,
Examples include 2-(iodoacetamido)acetic acid-N-hydroxysuccinimide ester, 3-(bromoacetamido)propionic acid-N-hydroxysuccinimide ester, and 4-(iodoacetyl)aminobenzoic acid-N-hydroxysuccinimide ester.
また、担体表面に活性基を導入する方法としては、担体表面に存在するヒドロキシ基や
アミノ基にω-アルケニルアルカングリシジルエーテルを反応させた後、ハロゲン化剤で
ω-アルケニル部位をハロゲン化することで活性化する方法も例示できる。ω-アルケニ
ルアルカングリシジルエーテルとしては、アリルグリシジルエーテル、3-ブテニルグリ
シジルエーテル、4-ペンテニルグリシジルエーテルを例示できる。ハロゲン化剤として
は、N-クロロスクシンイミド、N-ブロモスクシンイミド、N-ヨードスクシンイミド
を例示できる。
In addition, a method for introducing active groups onto the carrier surface is to react ω-alkenyl alkane glycidyl ether with hydroxy groups and amino groups present on the carrier surface, and then halogenate the ω-alkenyl moiety with a halogenating agent. An example of this is a method of activating. Examples of the ω-alkenyl alkane glycidyl ether include allyl glycidyl ether, 3-butenyl glycidyl ether, and 4-pentenyl glycidyl ether. Examples of the halogenating agent include N-chlorosuccinimide, N-bromosuccinimide, and N-iodosuccinimide.
また、担体表面に活性基を導入する方法としては、担体表面に存在するカルボキシ基に
対して縮合剤と添加剤を用いて活性基を導入する方法も例示できる。縮合剤としては、1
-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDC)、ジシクロヘ
キシルカルボジアミド、カルボニルジイミダゾールを例示できる。添加剤としては、N-
ヒドロキシコハク酸イミド(NHS)、4-ニトロフェノール、1-ヒドロキシベンズト
リアゾールを例示できる。
Furthermore, as a method for introducing active groups onto the surface of the carrier, a method of introducing active groups into carboxy groups present on the surface of the carrier using a condensing agent and an additive can also be exemplified. As a condensing agent, 1
Examples include -ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide (EDC), dicyclohexylcarbodiamide, and carbonyldiimidazole. As an additive, N-
Examples include hydroxysuccinimide (NHS), 4-nitrophenol, and 1-hydroxybenztriazole.
本発明のタンパク質の不溶性担体への固定化は、例えば、緩衝液中で実施できる。緩衝
液としては、酢酸緩衝液、リン酸緩衝液、MES(2-Morpholinoethan
esulfonic acid)緩衝液、HEPES(4-(2-Hydroxyeth
yl)-1-piperazineethanesulfonic acid)緩衝液、
トリス緩衝液、ホウ酸緩衝液を例示できる。固定化させるときの反応温度は、例えば、活
性基の反応性や本発明のタンパク質の安定性等の諸条件に応じて適宜設定できる。固定化
させるときの反応温度は、例えば、5℃以上50℃以下であってよく、好ましくは10℃
以上35℃以下である。
The protein of the present invention can be immobilized on an insoluble carrier, for example, in a buffer. Buffers include acetate buffer, phosphate buffer, MES (2-Morpholinoethane
esulfonic acid) buffer, HEPES (4-(2-Hydroxyeth)
yl)-1-piperazineethanesulfonic acid) buffer,
Examples include Tris buffer and borate buffer. The reaction temperature during immobilization can be appropriately set depending on various conditions such as the reactivity of the active group and the stability of the protein of the present invention. The reaction temperature during immobilization may be, for example, 5°C or higher and 50°C or lower, preferably 10°C.
The temperature is above 35°C.
本発明の免疫グロブリン吸着剤は、例えば、前記吸着剤を充填したカラムの態様にする
ことで、免疫グロブリン(抗体)の分離に使用できる。例えば、本発明の免疫グロブリン
吸着剤を充填したカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加して当該免疫グロブリンを前
記吸着剤に吸着させ、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させることで、免疫グ
ロブリンを分離できる。すなわち、本明細書は、本発明の免疫グロブリン吸着剤を充填し
たカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加して当該免疫グロブリンを前記吸着剤に吸着
させる工程と、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程とを含む、前記溶
液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法を開示する。免疫グロブリンを含む溶液は、例
えば、ポンプ等の送液手段を用いてカラムに添加できる。なお、免疫グロブリンを含む溶
液は、カラムに添加する前に予め適切な緩衝液を用いて溶媒置換してよい。また、免疫グ
ロブリンを含む溶液をカラムに添加する前に、適切な緩衝液を用いてカラムを平衡化して
よい。カラムの平衡化により、例えば、免疫グロブリンをより高純度に分離できると期待
される。溶媒置換や平衡化に用いる緩衝液としては、リン酸緩衝液、酢酸緩衝液、MES
緩衝液が例示できる。そのような緩衝液には、例えば、さらに、1mM以上1000mM
以下の塩化ナトリウム等の無機塩を添加してもよい。溶媒置換に用いる緩衝液と平衡化に
用いる緩衝液は、同一であってもよく、同一でなくてもよい。また、免疫グロブリンを含
む溶液のカラムへの通液後に夾雑物質等の免疫グロブリン以外の成分がカラムに残存して
いる場合、免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出する前に、そのような
成分をカラムから除去してよい。免疫グロブリン以外の成分は、例えば、適切な緩衝液を
用いてカラムから除去できる。免疫グロブリン以外の成分の除去に用いる緩衝液について
は、例えば、溶媒置換や平衡化に用いる緩衝液についての記載を準用できる。
The immunoglobulin adsorbent of the present invention can be used for separating immunoglobulins (antibodies) by, for example, forming a column filled with the above-mentioned adsorbent. For example, by adding a solution containing immunoglobulin to a column filled with the immunoglobulin adsorbent of the present invention, the immunoglobulin is adsorbed to the adsorbent, and the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent is eluted. can be separated. That is, the present specification describes a step of adding a solution containing an immunoglobulin to a column filled with the immunoglobulin adsorbent of the present invention to adsorb the immunoglobulin to the adsorbent, and a step of adsorbing the immunoglobulin to the adsorbent. Disclosed is a method for separating immunoglobulin contained in the solution, the method comprising the step of elution. A solution containing immunoglobulin can be added to the column using a liquid delivery means such as a pump, for example. Note that the solution containing immunoglobulin may be solvent-substituted in advance using an appropriate buffer before being added to the column. The column may also be equilibrated with a suitable buffer before adding the immunoglobulin-containing solution to the column. It is expected that, for example, immunoglobulins can be separated with higher purity by column equilibration. Buffers used for solvent replacement and equilibration include phosphate buffer, acetate buffer, and MES.
An example is a buffer solution. Such a buffer solution may further contain, for example, 1mM or more and 1000mM
The following inorganic salts such as sodium chloride may be added. The buffer used for solvent replacement and the buffer used for equilibration may or may not be the same. In addition, if components other than immunoglobulin such as contaminants remain in the column after a solution containing immunoglobulin is passed through the column, such components should be removed before eluting the immunoglobulin adsorbed to the immunoglobulin adsorbent. Components may be removed from the column. Components other than immunoglobulins can be removed from the column using, for example, a suitable buffer. Regarding the buffer used for removing components other than immunoglobulin, for example, the description regarding the buffer used for solvent replacement and equilibration can be applied mutatis mutandis.
免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンは、例えば、免疫グロブリンとリガン
ド(本発明のタンパク質)との相互作用を弱めることで溶出できる。免疫グロブリンとリ
ガンド(本発明のタンパク質)との相互作用を弱める手段としては、pH変化、カウンタ
ーペプチドの添加、温度上昇、塩濃度変化が例示できる。免疫グロブリンとリガンド(本
発明のタンパク質)との相互作用を弱める手段としては、特に、pH変化が例示できる。
すなわち、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程としては、特に、前記
吸着剤に吸着した免疫グロブリンをpH変化で溶出させる工程が例示できる。pH変化と
しては、pHの低下が例示できる。pHの低下としては、緩衝液によるpHの低下が例示
できる。免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンは、具体的には、例えば、適切
な溶出液を用いて溶出できる。溶出液としては、溶媒置換や平衡化に用いる緩衝液よりも
酸性側の緩衝液が挙げられる。前記酸性側の緩衝液としては、クエン酸緩衝液、グリシン
塩酸緩衝液、酢酸緩衝液を例示できる。すなわち、前記酸性側の緩衝液を利用することで
、pHを低下させることができる。溶出液のpHは、例えば、免疫グロブリンの機能(抗
原への結合性等)を損なわない範囲で設定できる。なお、免疫グロブリン吸着剤に吸着し
た免疫グロブリンの溶出を緩衝液によるpHの低下で行なう場合、リガンドとして本発明
のタンパク質を用いると、天然型FpLの免疫グロブリン結合ドメインなど非改変型アミ
ノ酸配列からなる免疫グロブリン結合性タンパク質をリガンドとして用いた場合と比較し
、よりpHの高い(中性に近い)条件で免疫グロブリンを溶出できる。すなわち、本発明
の免疫グロブリン吸着剤によれば、非改変型アミノ酸配列からなる免疫グロブリン結合性
タンパク質をリガンドとした免疫グロブリン吸着剤と比較し、より温和なpH条件(すな
わち中性に近い条件)で免疫グロブリン(抗体)を溶出できる。溶出液のpHは、例えば
、2.5以上、2.6以上、2.7以上、2.8以上、2.9以上、2.95以上、3以
上、3.05以上、3.1以上、3.15以上、または3.2以上であってもよく、4以
下、3.5以下、3.3以下、3.2以下、3.1以下、または3以下であってもよく、
それらの矛盾しない組み合わせであってもよい。溶出液のpHは、具体的には、例えば、
2.5以上4以下、2.8以上4以下、2.95以上4以下、3以上4以下、または3.
05以上4以下であってもよい。
The immunoglobulin adsorbed to the immunoglobulin adsorbent can be eluted, for example, by weakening the interaction between the immunoglobulin and the ligand (the protein of the present invention). Examples of means for weakening the interaction between immunoglobulin and the ligand (protein of the present invention) include pH change, addition of a counter peptide, temperature increase, and salt concentration change. A particular example of a means for weakening the interaction between immunoglobulin and the ligand (protein of the present invention) is pH change.
That is, the step of eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent can be particularly exemplified by the step of eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent by changing the pH. An example of the pH change is a decrease in pH. An example of the decrease in pH is a decrease in pH due to a buffer solution. Specifically, the immunoglobulin adsorbed to the immunoglobulin adsorbent can be eluted using, for example, an appropriate elution solution. Examples of the eluate include buffers that are more acidic than the buffers used for solvent replacement and equilibration. Examples of the acidic buffer include citrate buffer, glycine-hydrochloride buffer, and acetate buffer. That is, by using the acidic buffer solution, the pH can be lowered. The pH of the eluate can be set, for example, within a range that does not impair immunoglobulin functions (antigen binding, etc.). In addition, when the immunoglobulin adsorbed to the immunoglobulin adsorbent is eluted by lowering the pH with a buffer solution, when the protein of the present invention is used as a ligand, it is possible to elute the immunoglobulin adsorbed to the immunoglobulin adsorbent by lowering the pH using a buffer solution. Compared to the case where an immunoglobulin-binding protein is used as a ligand, immunoglobulins can be eluted under conditions of higher pH (closer to neutrality). That is, according to the immunoglobulin adsorbent of the present invention, a milder pH condition (i.e., near-neutral condition) is achieved compared to an immunoglobulin adsorbent using an immunoglobulin-binding protein having an unmodified amino acid sequence as a ligand. Immunoglobulins (antibodies) can be eluted with The pH of the eluate is, for example, 2.5 or higher, 2.6 or higher, 2.7 or higher, 2.8 or higher, 2.9 or higher, 2.95 or higher, 3 or higher, 3.05 or higher, 3.1 or higher. , 3.15 or more, or 3.2 or more, and may be 4 or less, 3.5 or less, 3.3 or less, 3.2 or less, 3.1 or less, or 3 or less,
It may be a non-contradictory combination thereof. Specifically, the pH of the eluate is, for example,
2.5 or more and 4 or less, 2.8 or more and 4 or less, 2.95 or more and 4 or less, 3 or more and 4 or less, or 3.
It may be 05 or more and 4 or less.
前述した方法で免疫グロブリン(抗体)を分離することで、分離された免疫グロブリン
が得られる。すなわち、免疫グロブリンの分離方法は、その一態様において、免疫グロブ
リンの製造方法であってよく、具体的には、分離された免疫グロブリンの製造方法であっ
てよい。免疫グロブリンは、例えば、免疫グロブリンを含有する溶出画分として得られる
。すなわち、溶出された免疫グロブリンを含む画分を分取できる。画分の分取は、例えば
、常法により行なえばよい。画分を分取する方法としては、一定の時間ごとや、一定の容
量ごとに回収容器を交換する方法や、溶出液のクロマトグラムの形状に合わせて回収容器
を換える方法や、オートサンプラー等の自動フラクションコレクター等で画分を分取する
方法が挙げられる。さらに、免疫グロブリンを含む画分から免疫グロブリンを回収するこ
ともできる。免疫グロブリンを含む画分からの免疫グロブリンの回収は、例えば、タンパ
ク質の分離精製に用いられる公知の方法により行なえばよい。
By separating immunoglobulins (antibodies) using the method described above, separated immunoglobulins can be obtained. That is, in one embodiment, the method for isolating immunoglobulin may be a method for producing immunoglobulin, and specifically, it may be a method for producing isolated immunoglobulin. Immunoglobulin is obtained, for example, as an elution fraction containing immunoglobulin. That is, a fraction containing eluted immunoglobulin can be collected. Fractions may be collected, for example, by a conventional method. Methods for separating fractions include changing the collection container at fixed time intervals or fixed volume intervals, changing the collection container according to the shape of the chromatogram of the eluate, and using an autosampler etc. Examples include a method of separating fractions using an automatic fraction collector or the like. Furthermore, immunoglobulins can also be recovered from fractions containing immunoglobulins. Immunoglobulin can be recovered from the immunoglobulin-containing fraction by, for example, a known method used for protein separation and purification.
以下、実施例および比較例を用いて本発明をさらに具体的に説明するが、本発明はこれ
ら例に限定されるものではない。なお、参考例は本発明を構成しない。
Hereinafter, the present invention will be explained in more detail using Examples and Comparative Examples, but the present invention is not limited to these Examples. Note that the reference examples do not constitute the present invention.
比較例1 天然型Protein L免疫グロブリン結合性ドメインC3(FpL_C
3)の調製
(1)FpL_C3発現ベクターの作製
(1-1)配列番号1に記載のアミノ酸配列からなるFinegoldia属菌(Fi
negoldia magna)由来のProtein L(以下、FpL)の免疫グロ
ブリン結合ドメインC3(GenBank No.AAA67503(配列番号39)の
394番目から463番目までのアミノ酸残基、以下「FpL_C3」とも表記)のアミ
ノ酸配列をコードするポリヌクレオチド(配列番号2)を合成した。なお、合成する際、
5’末端側には制限酵素NcoIの認識配列(5’-CCATGG-3’)を、3’末端
側にはヒスチジン6残基をコードするヌクレオチド配列(5’-CATCACCACCA
TCACCAC-3’;配列番号40)、終止コドンおよび制限酵素HindIIIの認
識配列(5’-AAGCTT-3’)を、それぞれ付加している。
Comparative Example 1 Natural Protein L immunoglobulin binding domain C3 (FpL_C
3) Preparation (1) Preparation of FpL_C3 expression vector (1-1) Finegoldia spp. (Fi
Amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain C3 (amino acid residues 394th to 463rd of GenBank No. AAA67503 (SEQ ID NO: 39), hereinafter also referred to as "FpL_C3") of Protein L (hereinafter referred to as FpL) derived from S. negoldia magna A polynucleotide (SEQ ID NO: 2) encoding was synthesized. In addition, when synthesizing,
The 5' end contains a recognition sequence for the restriction enzyme NcoI (5'-CCATGG-3'), and the 3' end contains a nucleotide sequence encoding 6 histidine residues (5'-CATCACCACCA).
TCACCAC-3'; SEQ ID NO: 40), a termination codon, and a recognition sequence for the restriction enzyme HindIII (5'-AAGCTT-3'), respectively.
(1-2)合成により得た配列番号2を含むポリヌクレオチドを制限酵素NcoIおよ
びHindIIIで処理後、アガロースゲル電気泳動により目的物のサイズのバンドを確
認した。目的バンドを切り出したのち、QIAquick Gel Extractio
n kit(QIAGEN社製)によりポリヌクレオチドを精製した。
(1-2) After treating the synthetically obtained polynucleotide containing SEQ ID NO: 2 with restriction enzymes NcoI and HindIII, a band of the desired size was confirmed by agarose gel electrophoresis. After cutting out the desired band, use QIAquick Gel Extractio.
The polynucleotide was purified using n kit (manufactured by QIAGEN).
(1-3)(1-2)で得たポリヌクレオチドと、予め制限酵素NcoIとHindI
IIで消化したプラスミドpET-26bをDNA Ligation Kit(タカラ
バイオ社製)を用いてライゲーションを行なった。当該ライゲーション産物を用いて大腸
菌BL21(DE3)株を形質転換し、50μg/mLのカナマイシンを含むLB(Lu
ria-Bertani)プレート培地で培養(37℃、16時間)した。
(1-3) The polynucleotide obtained in (1-2) and the restriction enzymes NcoI and HindI
Plasmid pET-26b digested with II was ligated using a DNA Ligation Kit (manufactured by Takara Bio Inc.). E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the ligation product, and LB (Lu
ria-Bertani) plate medium (37°C, 16 hours).
(1-4)(1-3)で取得した形質転換体(遺伝子組換え大腸菌)を選択し、50μ
g/mLのカナマイシンを含むLB培地にて培養後、QIAprep Spin Min
iprep kit(QIAGEN社製)による精製で、配列番号1に記載のFpL_C
3を発現可能なベクター(pET-FpL_C3と命名)を取得した。
(1-4) Select the transformant (genetically modified E. coli) obtained in (1-3), and
After culturing in LB medium containing g/mL kanamycin, QIAprep Spin Min
FpL_C described in SEQ ID NO: 1 was purified using iprep kit (manufactured by QIAGEN).
A vector capable of expressing 3 (named pET-FpL_C3) was obtained.
(1-5)(1-4)で取得した発現ベクターpET-FpL_C3のうち、FpL_
C3をコードするポリヌクレオチドおよびその周辺領域について、チェーンターミネータ
法に基づくBig Dye Terminator Cycle Sequencing
ready Reaction kit(サーモフィッシャーサイエンティフィック社
製)を用いてサイクルシークエンス反応に供し、全自動DNAシークエンサーABI P
rism 3700 DNA analyzer(サーモフィッシャーサイエンティフィ
ック社製)にてヌクレオチド配列を解析した。なお、当該解析の際、配列番号3(5’-
TAATACGACTCACTATAGGG-3’)または配列番号4(5’-TATG
CTAGTTATTGCTCAG-3’)に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドをシ
ークエンス用プライマーとして使用した。
(1-5) Of the expression vector pET-FpL_C3 obtained in (1-4), FpL_
Big Dye Terminator Cycle Sequencing based on the chain terminator method for the polynucleotide encoding C3 and its surrounding region
A cycle sequencing reaction was performed using a ready reaction kit (manufactured by Thermo Fisher Scientific), and a fully automatic DNA sequencer ABI P
The nucleotide sequence was analyzed using Rism 3700 DNA analyzer (manufactured by Thermo Fisher Scientific). In addition, during this analysis, SEQ ID NO: 3 (5'-
TAATACGACTCACTATAGGG-3') or SEQ ID NO: 4 (5'-TATG
An oligonucleotide consisting of the sequence described in CTAGTTATTGCTCAG-3') was used as a sequencing primer.
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3に、FpL_C3(配列番号1)
をコードするポリヌクレオチド(配列番号2)が挿入されていることを確認した。
As a result of sequence analysis, expression vector pET-FpL_C3 contains FpL_C3 (SEQ ID NO: 1).
It was confirmed that the polynucleotide (SEQ ID NO: 2) encoding the above was inserted.
(2)FpL_C3の調製
(2-1)50μg/mLのカナマイシンを含む2×YT液体培地(トリプトン 1.
6%(w/v)、酵母エキス 1%(w/v)、塩化ナトリウム 0.5%(w/v))
2mLに、(1)で作製したpET-FpL_C3を含む遺伝子組換え大腸菌を接種し、
前培養した(30℃、16時間)。
(2) Preparation of FpL_C3 (2-1) 2×YT liquid medium containing 50 μg/mL kanamycin (tryptone 1.
6% (w/v), yeast extract 1% (w/v), sodium chloride 0.5% (w/v))
Inoculate 2 mL with the recombinant E. coli containing pET-FpL_C3 prepared in (1),
Preculture was performed (30°C, 16 hours).
(2-2)前培養後の培養液200μLを、50μg/mLのカナマイシンを含む2×
YT液体培地20mLに接種し、37℃で1.5時間から2時間培養後、0.05MのI
PTG(Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside)
を4μL加えて、さらに20℃で終夜振とう培養した。
(2-2) 200 μL of the culture solution after pre-culture was mixed with 2×
After inoculating 20 mL of YT liquid medium and culturing at 37°C for 1.5 to 2 hours, 0.05M I
PTG (Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside)
4 μL was added to the mixture, and the culture was further incubated with shaking at 20° C. overnight.
(2-3)培養終了後、遠心分離により培養菌体を回収し、BugBuster Pr
otein Extraction Reagent(メルクミリポア社製)を用いてタ
ンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し
、清澄化した。
(2-3) After the completion of culture, collect the cultured bacteria by centrifugation, and use BugBuster Pr
A protein extract was prepared using Otein Extraction Reagent (manufactured by Merck Millipore). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2-4)あらかじめ0.5MのNaClと0.02Mイミダゾールとを含む0.05Mトリス緩衝液(pH7.5)(以下、洗浄緩衝液Bと表記)で平衡化したNi-NTA
Sepharose 6 Fast Flow(Cytiva社製)を充填したカラムに、(2-3)で清澄化した上清を添加し、前記カラムに充填した担体の10倍量の洗浄緩衝液Bで洗浄後、0.5MのNaClと0.5Mイミダゾールとを含む0.05Mトリス緩衝液(pH7.5)を通液することで、FpL_C3に相当する画分を回収した。
(2-4) Ni-NTA equilibrated in advance with 0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing 0.5M NaCl and 0.02M imidazole (hereinafter referred to as washing buffer B )
The supernatant clarified in (2-3) was added to a column filled with Sepharose 6 Fast Flow (manufactured by Cytiva), and washed with washing buffer B in an amount 10 times the amount of the carrier packed in the column. A fraction corresponding to FpL_C3 was collected by passing 0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing .5M NaCl and 0.5M imidazole.
(2-5)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれるFpL_
C3を定量した。またSDS-PAGE(SDS-ポリアクリルアミド電気泳動)も実施
し、FpL_C3が純度よく精製されていることを確認した。
(2-5) Measure the absorbance of the collected fraction with a spectrophotometer, and determine the FpL_ contained in the fraction.
C3 was quantified. SDS-PAGE (SDS-polyacrylamide electrophoresis) was also performed, and it was confirmed that FpL_C3 was purified to a high degree of purity.
実施例1 Protein L免疫グロブリン結合性ドメインC4(FpL_C4)ア
ミノ酸置換体の作製
(1)FpL_C4リジン置換体の調製
(1-1)配列番号5に記載のアミノ酸配列からなるFpLの免疫グロブリン結合ドメ
インC4(GenBank No.AAA67503(配列番号39)の468番目から
537番目までのアミノ酸残基、以下「FpL_C4」とも表記)が有する全てのリジン
残基(具体的には配列番号5の7番目、13番目、22番目、29番目、48番目および
67番目のリジン残基)をアルギニン残基に置換した免疫グロブリン結合性タンパク質(
配列番号6、以下「FpL_C4KR」とも表記)をコードするポリヌクレオチド(配列
番号7)を合成した。なお、合成する際、5’末端側に制限酵素NcoIの認識配列(5
’-CCATGG-3’)を、3’末端側にヒスチジン6残基をコードするヌクレオチド
配列(配列番号40)、終止コドンおよび制限酵素HindIIIの認識配列(5’-A
AGCTT-3’)を、それぞれ付加している。
Example 1 Preparation of Protein L immunoglobulin binding domain C4 (FpL_C4) amino acid substitution product (1) Preparation of FpL_C4 lysine substitution product (1-1) FpL immunoglobulin binding domain C4 consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5 (Amino acid residues 468th to 537th of GenBank No. AAA67503 (SEQ ID NO: 39), hereinafter also referred to as "FpL_C4") have all lysine residues (specifically, the 7th and 13th residues of SEQ ID NO: 5). , 22nd, 29th, 48th and 67th lysine residues) are replaced with arginine residues (immunoglobulin-binding protein (
A polynucleotide (SEQ ID NO: 7) encoding SEQ ID NO: 6 (hereinafter also referred to as "FpL_C4KR") was synthesized. When synthesizing, a recognition sequence for the restriction enzyme NcoI (5
'-CCATGG-3'), a nucleotide sequence encoding 6 histidine residues at the 3' end (SEQ ID NO: 40), a stop codon and a restriction enzyme HindIII recognition sequence (5'-A
AGCTT-3') were added to each.
(1-2)比較例1(1-2)と同様の方法で、(1-1)で合成したポリヌクレオチ
ドを精製した。
(1-2) The polynucleotide synthesized in (1-1) was purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-2).
(1-3)比較例1(1-3)と同様の方法で、(1-2)で得たポリヌクレオチドと
予め制限酵素NcoIとHindIIIで消化したプラスミドpET-26bとをライゲ
ーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し
、培養した。
(1-3) In the same manner as Comparative Example 1 (1-3), after ligating the polynucleotide obtained in (1-2) with plasmid pET-26b that had been previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII, the ligation E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the product and cultured.
(1-4)(1-3)で取得した形質転換体を、比較例1(1-4)と同様の方法で培
養およびプラスミド精製を行ない、発現ベクター(pET-FpL_C4KRと命名)を
取得後、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、比較例1(1-5)と同様の方
法で行なった。
(1-4) The transformant obtained in (1-3) was cultured and plasmid purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-4) to obtain an expression vector (named pET-FpL_C4KR). The nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C4KRに、FpL_C4KR(配列
番号6)をコードするポリヌクレオチド(配列番号7)が挿入されていることを確認した
。
As a result of sequence analysis, it was confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 7) encoding FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6) was inserted into the expression vector pET-FpL_C4KR.
(1-5)pET-FpL_C4KRを含む形質転換体から、比較例1(2)と同様の
方法で、精製されたFpL_C4KRを調製した。
(1-5) Purified FpL_C4KR was prepared from a transformant containing pET-FpL_C4KR in the same manner as in Comparative Example 1 (2).
(2)FpL_C4KRへの変異導入およびライブラリ作製
(2-1)(1)で取得したpET-FpL_C4KRを鋳型として、7番目、13番
目、22番目および29番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。
プライマーは、22c-Trick法(Sabrina Kille他,ACS Syn
thetic Biology,2013,2,83-92)に倣い、変異導入箇所に適
切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバースPCRができるように設計
した(配列番号8から31)。これらのプライマーを一箇所の置換につき6本一組として
、表1および表2の組成で混合し、PCR Primer混合液(Forward/Re
verse primer mix)を調製した。
(2) Mutation introduction to FpL_C4KR and library construction (2-1) Using pET-FpL_C4KR obtained in (1) as a template, create a library of saturated substitutions for the 7th, 13th, 22nd, and 29th amino acid residues. Created.
The primers used were the 22c-Trick method (Sabrina Kille et al., ACS Syn
Thetic Biology, 2013, 2, 83-92), appropriate mixed bases were placed at the site of mutation introduction, and it was designed to perform inverse PCR centered on the site of mutation introduction (SEQ ID NOS: 8 to 31). These primers were mixed as a set of 6 for each substitution in the composition shown in Tables 1 and 2, and a PCR Primer mixture solution (Forward/Re
Verse primer mix) was prepared.
(2-2)実施例1で作製したpET-FpL_C4KRを鋳型としてインバースPC
Rによる部位特異的変異導入を行なった。インバースPCRは表3に示す組成の反応液を
調製後、当該反応液を98℃で2分間熱処理し、95℃で10秒間の第1ステップ、50
℃で5秒間の第2ステップ、72℃で6分の第3ステップを1サイクルとする反応を30
サイクル行ない、最後に72℃で7分間熱処理することで行なった。
(2-2) Inverse PC using pET-FpL_C4KR produced in Example 1 as a template
Site-directed mutagenesis was performed using R. Inverse PCR is performed by preparing a reaction solution with the composition shown in Table 3, heat-treating the reaction solution at 98°C for 2 minutes, performing a first step at 95°C for 10 seconds, and then
One cycle of the reaction consisted of a second step of 5 seconds at ℃ and a third step of 6 minutes at 72℃.
The test was carried out by cycling and finally heat-treated at 72° C. for 7 minutes.
(2-3)得られたPCR産物を精製後、当該精製物を用いて大腸菌BL21(DE3
)株を形質転換し、50μg/mLのカナマイシンを含むLBプレート培地で培養(37
℃、16時間)後、プレート上に形成したコロニーを飽和置換体ライブラリとした。
(2-3) After purifying the obtained PCR product, the purified product was used to generate E. coli BL21 (DE3
) strain was transformed and cultured in LB plate medium containing 50 μg/mL kanamycin (37
C, for 16 hours), the colonies formed on the plate were used as a saturated substitution library.
実施例2 FpL_C4KRアミノ酸置換体のスクリーニング
(1)実施例1(1)で作製したFpL_C4KRを発現可能な形質転換体、および実
施例1(2)で作製した飽和置換体ライブラリー(形質転換体)を、50μg/mLのカ
ナマイシンを含む2×YT液体培地250μLに接種し、96ディープウェルプレートを
用いて37℃で終夜振とう培養した。
Example 2 Screening for FpL_C4KR amino acid substitution product (1) Transformant capable of expressing FpL_C4KR prepared in Example 1 (1) and saturated substitution product library (transformant) prepared in Example 1 (2) was inoculated into 250 μL of 2×YT liquid medium containing 50 μg/mL kanamycin, and cultured with shaking at 37° C. overnight using a 96 deep well plate.
(2)培養後、50μg/mLのカナマイシン、0.3%(w/v)のグリシン、0.
01mMのIPTGを含む2×YT液体培地500μLに5μLの培養液を植え継ぎ、9
6ディープウェルプレートを用いてさらに20℃で終夜振とう培養した。
(2) After culturing, 50 μg/mL kanamycin, 0.3% (w/v) glycine, 0.
Subplant 5 μL of the culture solution into 500 μL of 2×YT liquid medium containing 01 mM IPTG, and
Using a 6 deep well plate, the cells were further cultured with shaking at 20°C overnight.
(3)培養後、遠心操作によって得られた培養上清と1.0M NaOHとを等量混合
し、38℃で15分間アルカリ処理を行なった。
(3) After culturing, equal amounts of the culture supernatant obtained by centrifugation and 1.0 M NaOH were mixed, and alkali treatment was performed at 38° C. for 15 minutes.
(4)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
下記に示すELISA法にて測定し、(3)のアルカリ処理を行なった時の免疫グロブリ
ン結合性タンパク質の抗体結合活性を、(3)のアルカリ処理を行わなかった時の免疫グ
ロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(4) The antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein after the alkali treatment was measured by the ELISA method shown below, and the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein when the alkali treatment of (3) was performed. The residual activity was calculated by dividing by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein when the alkali treatment in (3) was not performed.
(4-1)Tris-Buffered Saline(TBS)を用いて10μg/
mLに調製したヒト抗体(ガンマグロブリン製剤、化学及血清療法研究所製)を96ウェ
ルマイクロプレートの各ウェルに分注し固定化した(4℃、16時間)。固定化後、TB
Sを用いて2%(w/v)に調製したスキムミルク(ベクトン・ディッキンソン社製)を
用いてブロッキングした。
(4-1) Using Tris-Buffered Saline (TBS), 10 μg/
A human antibody (gamma globulin preparation, manufactured by Chemo and Serum Therapy Research Institute) prepared in mL was dispensed into each well of a 96-well microplate and immobilized (4° C., 16 hours). After fixation, TB
Blocking was performed using skim milk (manufactured by Becton Dickinson) prepared at 2% (w/v) using S.
(4-2)洗浄緩衝液(0.15M NaCl、0.05%(w/v) Tween 20(商品名)を含む0.05M Tris緩衝液(pH7.5)、以下「洗浄緩衝液A」とも表記)で96ウェルマイクロプレートの各ウェルを洗浄後、抗体結合活性を評価する免疫グロブリン結合性タンパク質を含む溶液を添加し、免疫グロブリン結合性タンパク質と固定化ガンマグロブリンとを反応させた(30℃、1時間)。 (4-2) Washing buffer (0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing 0.15M NaCl, 0.05% (w/v) Tween 20 (trade name) , hereinafter "Washing buffer A") After washing each well of a 96-well microplate with a 96-well microplate, a solution containing an immunoglobulin-binding protein to evaluate antibody binding activity was added, and the immunoglobulin-binding protein and immobilized gamma globulin were allowed to react (30 ℃, 1 hour).
(4-3)反応終了後、洗浄緩衝液Aで洗浄し、100ng/mLに希釈したAnti-6-His Antibody(BETHYL LABORATORIES社製)を100μL/well添加し反応させた(30℃、1時間)。 (4-3) After the reaction was completed , the well was washed with washing buffer A , and 100 μL/well of Anti-6-His Antibody (manufactured by BETHYL LABORATORIES) diluted to 100 ng/mL was added and reacted (30°C, 1 hour). ).
(4-4)反応終了後、洗浄緩衝液Aで洗浄し、TMB Peroxidase Substrate(KPL社製)を50μL/wellで添加した。次に1M リン酸を50μL/well添加することで反応を停止し、マイクロプレートリーダー(テカン社製)にて450nmの吸光度を測定した。 (4-4) After the reaction was completed , the well was washed with washing buffer A , and TMB Peroxidase Substrate (manufactured by KPL) was added at 50 μL/well. Next, the reaction was stopped by adding 50 μL/well of 1M phosphoric acid, and the absorbance at 450 nm was measured using a microplate reader (manufactured by Tecan).
(5)約500株の形質転換体を評価し、その中からFpL_C4KR(配列番号6)
と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転
換体を選択した。
(5) About 500 transformants were evaluated, and FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6) was selected from among them.
We selected transformants expressing immunoglobulin-binding proteins with improved alkaline stability compared to .
(6)(5)で選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Minip
rep kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(6) Cultivate the transformant selected in (5), QIAprep Spin Minip
An expression vector was prepared using a rep kit (manufactured by QIAGEN).
(7)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
(7) Analyze the nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin binding protein inserted into the obtained expression vector by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and identify the amino acid substitution site. did.
(8)(5)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、比
較例1(2-1)から(2-2)と同様の方法で培養し、比較例1(2-3)と同様の方
法でタンパク質抽出液を調製し、清澄化した。
(8) The transformant expressing the immunoglobulin binding protein selected in (5) was cultured in the same manner as in Comparative Example 1 (2-1) to (2-2). A protein extract was prepared and clarified in the same manner as in 3).
(9)(8)で清澄化したタンパク質抽出液を、比較例1(2-4)に記載の方法で精
製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(9) The protein extract clarified in (8) was purified by the method described in Comparative Example 1 (2-4), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding proteins was collected.
(10)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブ
リン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブ
リン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(10) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
実施例3 本発明のタンパク質の免疫グロブリン溶出pH評価
比較例1で作製したFpL_C3(配列番号1)、実施例1で作製したFpL_C4K
R(配列番号6)または実施例2で取得したFpL_C4KRアミノ酸置換体に結合した
免疫グロブリンを溶出可能なpH(以下、単に「溶出pH」とも表記)を以下の方法で測
定した。
Example 3 Immunoglobulin elution pH evaluation of the protein of the present invention FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) produced in Comparative Example 1, FpL_C4K produced in Example 1
The pH at which immunoglobulin bound to R (SEQ ID NO: 6) or the FpL_C4KR amino acid substituted product obtained in Example 2 can be eluted (hereinafter also simply referred to as "elution pH") was measured by the following method.
(1)免疫グロブリンを固定化した不溶性担体であるIgG Sepharose 6
Fast Flow(Cytiva社製)の50%(w/v)水スラリーを調製し、当
該スラリー0.5mLをTricorn 5/50カラム(内径5mm×長さ50mm:
Cytiva社製)に入れた後、ポンプで純水を送液することで、IgG Sephar
ose充填カラムを作製した。
(1) IgG Sepharose 6, an insoluble carrier with immobilized immunoglobulin
A 50% (w/v) water slurry of Fast Flow (manufactured by Cytiva) was prepared, and 0.5 mL of the slurry was applied to a Tricorn 5/50 column (inner diameter 5 mm x length 50 mm:
(manufactured by Cytiva) and then pumping pure water to the IgG
An ose-packed column was prepared.
(2)(1)で作製したIgG Sepharose充填カラムをAKTA AVAN
T 25(Cytiva社製)に設置した。前記カラムを0.1Mクエン酸緩衝液(pH
6.5)(以下A液)で平衡化し、0.1Mクエン酸緩衝液(pH2.2)(以下B液)
で洗浄後、A液で再度平衡化した。
(2) The IgG Sepharose packed column prepared in (1) was packed with AKTA AVAN.
It was installed in T25 (manufactured by Cytiva). The column was soaked in 0.1M citrate buffer (pH
6.5) (hereinafter referred to as solution A) and equilibrated with 0.1M citrate buffer (pH 2.2) (hereinafter referred to as solution B).
After washing with solution A, equilibration was carried out again.
(3)A液で1g/Lに調製した各免疫グロブリン結合性タンパク質溶液100μLを、IgG Sepharose充填カラムにアプライし、A液を5カラム体積分送液後、10分間でB液が0%から100%となるリニアグラジエント溶出でFpL_C3を溶出
させた。得られたクロマトグラムを解析し、最も吸光度が高くなる溶出位置でのpHを溶出pHとした。
(3) Apply 100 μL of each immunoglobulin-binding protein solution prepared to 1 g/L with Solution A to an IgG Sepharose-packed column, and after pumping 5 column volumes of Solution A, the concentration of Solution B from 0% to 0% in 10 minutes. FpL_C3 was eluted with a linear gradient elution of 100%. The obtained chromatogram was analyzed, and the pH at the elution position where the absorbance was highest was defined as the elution pH.
結果を表4に示す。配列番号6に記載のアミノ酸配列において、少なくともLys(A
rg)7Gln(この表記は配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基(配列
番号5では7番目のリジン)が一旦アルギニンに置換後、さらにグルタミンに置換されて
いることを表す;以下、他のアミノ酸置換についても同様に解釈するものとする)、Ly
s(Arg)13Val、Lys(Arg)22Thr、Lys(Arg)29Pro、
Lys(Arg)29ValおよびLys(Arg)29Ileより選択される1つ以上
のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型FpL_C3(配列
番号1)やFpL_C4KR(配列番号6)と比較し溶出pHが増大している、すなわち
免疫グロブリン結合性タンパク質に結合した免疫グロブリン(抗体)をより温和なpH条
件(すなわち中性に近い条件)で溶出できる、といえる。
The results are shown in Table 4. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 6, at least Lys(A
rg) 7Gln (This notation indicates that the amino acid residue corresponding to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 (7th lysine in SEQ ID NO: 5) is once substituted with arginine and then further substituted with glutamine; , other amino acid substitutions shall be interpreted similarly), Ly
s(Arg)13Val, Lys(Arg)22Thr, Lys(Arg)29Pro,
Immunoglobulin-binding proteins having one or more amino acid substitutions selected from Lys(Arg)29Val and Lys(Arg)29Ile were eluted compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) and FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6). It can be said that the pH is increased, that is, immunoglobulins (antibodies) bound to immunoglobulin-binding proteins can be eluted under milder pH conditions (that is, conditions close to neutrality).
参考例1
比較例1で作製した発現ベクターpET-FpL_C3のうち、免疫グロブリン結合性
タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分(配列番号2)にエラープローンPCRに
よりランダムに変異を導入した。
Reference example 1
In the expression vector pET-FpL_C3 prepared in Comparative Example 1, mutations were randomly introduced into the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 2) encoding an immunoglobulin-binding protein by error-prone PCR.
(1)比較例1で作製したpET-FpL_C3を鋳型DNAとして用い、エラープロ
ーンPCRを行なった。エラープローンPCRは表5に示す組成の反応液を調製後、当該
反応液を95℃で2分間熱処理し、95℃で30秒間の第1ステップ、50℃で30秒間
の第2ステップ、72℃で90秒間の第3ステップを1サイクルとする反応を30サイク
ル行ない、最後に72℃で7分間熱処理することで行なった。前記エラープローンPCR
によりFpL_C3をコードするポリヌクレオチド(配列番号2)に良好に変異が導入さ
れ、その平均変異導入率は1.6%であった。
(1) Error prone PCR was performed using pET-FpL_C3 prepared in Comparative Example 1 as template DNA. In error prone PCR, after preparing a reaction solution with the composition shown in Table 5, the reaction solution is heat-treated at 95°C for 2 minutes, followed by a first step of 30 seconds at 95°C, a second step of 30 seconds at 50°C, and a second step of 72°C. The reaction was carried out for 30 cycles, each cycle consisting of a third step of 90 seconds, and finally heat-treated at 72° C. for 7 minutes. Error prone PCR
Mutations were successfully introduced into the polynucleotide encoding FpL_C3 (SEQ ID NO: 2), and the average mutation introduction rate was 1.6%.
(2)得られたPCR産物を精製後、制限酵素NcoIとHindIIIで消化し、あ
らかじめ制限酵素NcoIとHindIIIで消化した発現ベクターpET-26bにラ
イゲーションした。
(2) The obtained PCR product was purified, digested with restriction enzymes NcoI and HindIII, and ligated to expression vector pET-26b, which had been previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII.
(3)ライゲーション反応終了後、反応液を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質
転換し、50μg/mLのカナマイシンを含むLBプレート培地で培養(37℃、16時
間)した後、プレート上に形成したコロニーをランダム変異体ライブラリとした。
(3) After the ligation reaction is completed, E. coli BL21 (DE3) strain is transformed using the reaction solution, cultured in LB plate medium containing 50 μg/mL kanamycin (37°C, 16 hours), and then formed on the plate. The resulting colonies were used as a random mutant library.
参考例2
(1)参考例1で作製したランダム変異体ライブラリ(形質転換体)または比較例1で
作製したFpL_C3(配列番号1)を発現する形質転換体を、実施例2(1)から(2
)と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例2(3)に
記載のアルカリ処理を行なった。
Reference example 2
(1) Random mutant library (transformants) prepared in Reference Example 1 or transformants expressing FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Comparative Example 1 were transferred from Example 2 (1) to (2
) The culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to the alkali treatment described in Example 2 (3).
(2)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkaline was determined by the ELISA method described in Example 2 (4). Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(3)約1600株の形質転換体を評価し、その中から天然型(アミノ酸置換がない)
FpL_C3(配列番号1)と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性
タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
(3) Approximately 1,600 transformants were evaluated, and natural type (no amino acid substitution) was selected from among them.
Transformants expressing an immunoglobulin binding protein with improved alkaline stability compared to FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) were selected.
(4)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(4) Cultivate the selected transformant and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(5)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を、比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド
配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
(5) The nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and amino acid substitution sites were determined. Identified.
(6)(5)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、そ
れぞれ50μg/mLのカナマイシンを含む2mLの2×YT液体培地に接種し、37℃
で終夜、好気的に振とう培養することで前培養を行なった。
(6) Each transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (5) was inoculated into 2 mL of 2×YT liquid medium containing 50 μg/mL of kanamycin, and incubated at 37°C.
Preculture was performed by aerobically shaking culture overnight.
(7)50μg/mLのカナマイシンを添加した20mLの2×YT液体培地に前培養
液を200μL接種し、37℃で好気的に振とう培養を行なった。
(7) 200 μL of the preculture solution was inoculated into 20 mL of 2×YT liquid medium supplemented with 50 μg/mL of kanamycin, and cultured with shaking aerobically at 37° C.
(8)培養開始から2時間後、培養温度を20℃に変更し、終濃度0.01mMとなる
ようIPTGを添加し、20℃で終夜、好気的に振とう培養した。
(8) Two hours after the start of the culture, the culture temperature was changed to 20°C, IPTG was added to a final concentration of 0.01mM, and cultured with shaking aerobically at 20°C overnight.
(9)培養終了後、遠心分離により集菌し、BugBuster Protein E
xtraction Reagent(メルク社製)を用いてタンパク質抽出液を調製し
た。
(9) After culturing, collect the bacteria by centrifugation and use BugBuster Protein E.
A protein extract was prepared using xtraction Reagent (manufactured by Merck & Co.).
(10)(9)で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗
体結合活性を、実施例2(4)に記載のELISA法を用いて測定した。
(10) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein in the protein extract prepared in (9) was measured using the ELISA method described in Example 2 (4).
(11)各タンパク質の濃度が等しくなるよう、TBSを用いて希釈した。希釈液を二
等分し、一方には0.2M NaOH(アルカリ処理)を、もう一方にはTBS(アルカ
リ未処理)を、それぞれ等量添加し混合後、25℃で5時間静置した。
(11) Each protein was diluted with TBS so that the concentration was equal. The diluted solution was divided into two equal parts, 0.2M NaOH (alkali treated) was added to one part, and TBS (not treated with alkali) was added to the other part in equal amounts. After mixing, the mixture was allowed to stand at 25°C for 5 hours.
(12)1Mトリス緩衝液(pH7.0)を4倍量加えた後、アルカリ処理(終濃度0
.1M NaOHで25℃、5時間処理)およびアルカリ未処理のタンパク質溶液の抗体
結合活性を、実施例2(4)に記載のELISA法によって測定した。アルカリ処理した
免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ未処理の免疫グロブリン結
合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価
した。
(12) After adding 4 times the amount of 1M Tris buffer (pH 7.0), alkaline treatment (final concentration 0)
.. The antibody binding activity of the protein solution (treated with 1M NaOH at 25° C. for 5 hours) and untreated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4). The residual activity was calculated by dividing the antibody binding activity of the alkali-treated immunoglobulin binding protein by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein that was not treated with alkali, and the alkali stability was evaluated.
結果を表6に示す。配列番号1に記載のアミノ酸配列において、少なくともPro3S
er(この表記は配列番号1の3番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
されていることを表す、以下同様)、Glu5Val、Glu8Gly、Ile17Ph
e、Glu27Gly、Ala41Thr、Asn44Ser、Glu49Val、As
n50Ser、Asn50Tyr、Asn50Lys、Asn50Asp、Glu52V
al、Glu52Gly、Thr54Ile、Asn62TyrおよびAsn65Tyr
より選択される1以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然
型FpL_C3(配列番号1)と比較しアルカリ安定性が向上しているといえる。
The results are shown in Table 6. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, at least Pro3S
er (this notation indicates that the amino acid residue corresponding to the third proline in SEQ ID NO: 1 is substituted with serine; the same applies hereinafter), Glu5Val, Glu8Gly, Ile17Ph
e, Glu27Gly, Ala41Thr, Asn44Ser, Glu49Val, As
n50Ser, Asn50Tyr, Asn50Lys, Asn50Asp, Glu52V
al, Glu52Gly, Thr54Ile, Asn62Tyr and Asn65Tyr
It can be said that an immunoglobulin-binding protein having one or more amino acid substitutions selected from the above has improved alkaline stability compared to natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1).
中でもAsn50TyrおよびGlu52Glyのアミノ酸置換を有した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質(配列番号47、FpL_C3 2aと命名)は、顕著なアルカリ安
定性向上を確認した(天然型FpL_C3:40%、FpL_C3 2a:94%)。G
lu52Gly単独のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質(配列番号
52)でのアルカリ安定性向上が顕著ではないことから(天然型FpL_C3:40%、
配列番号51:48%)、顕著なアルカリ安定性の向上をもたらすアミノ酸置換はAsn
50Tyrのほうであることが推測される。
Among them, an immunoglobulin-binding protein (SEQ ID NO: 47, named FpL_C3 2a) with amino acid substitutions of Asn50Tyr and Glu52Gly was confirmed to have significantly improved alkaline stability (natural FpL_C3: 40%, FpL_C3 2a: 94%). . G
Since the alkali stability improvement in the immunoglobulin binding protein (SEQ ID NO: 52) having a single amino acid substitution of lu52Gly was not remarkable (natural FpL_C3: 40%,
SEQ ID NO: 51:48%), the amino acid substitution that results in a marked improvement in alkaline stability is Asn
It is estimated that it is 50Tyr.
参考例3
(1)実施例1で取得した、pET-FpL_C4KRを鋳型として、7番目および2
9番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例
1(2)と同様、22c-Trick法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し
、変異導入箇所を中心としたインバースPCRができるように設計した(配列番号55か
ら66)。これらのプライマーを一箇所の置換につき6本一組として、表1および表7の
組成で混合し、PCR Primer混合液(Forward/Reverse pri
mer mix)を調製した。
Reference example 3
(1) Using pET-FpL_C4KR obtained in Example 1 as a template, the 7th and 2nd
A saturated substitution library for the 9th amino acid residue was created. As in Example 1 (2), the primers were designed in accordance with the 22c-Trick method, placing appropriate mixed bases at the mutation introduction site, and allowing inverse PCR to be performed centered on the mutation introduction site (SEQ ID NO: 55). 66). These primers were mixed as a set of six for each substitution in the compositions shown in Tables 1 and 7, and a PCR Primer mixture (Forward/Reverse primer
mer mix) was prepared.
(2)鋳型DNAとしてpET-FpL_C3を用いた他は、実施例1(2-2)と同
様な方法でインバースPCRを行なった。
(2) Inverse PCR was performed in the same manner as in Example 1 (2-2) except that pET-FpL_C3 was used as the template DNA.
(3)得られたPCR産物を精製後、反応液を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形
質転換し、50μg/mLのカナマイシンを含むLBプレート培地で培養(37℃、16
時間)した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
(3) After purifying the obtained PCR product, E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the reaction solution, and cultured in LB plate medium containing 50 μg/mL kanamycin (37°C, 16
The colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
参考例4
(1)実施例1で作製したFpL_C4KR(配列番号6)を発現する形質転換体およ
び参考例3で作製した部位特異的アミノ酸置換体ライブラリ(形質転換体)を実施例2(
1)から(2)と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施
例2(3)に記載のアルカリ処理を行なった。
Reference example 4
(1) The transformant expressing FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6) prepared in Example 1 and the site-specific amino acid substitution library (transformant) prepared in Reference Example 3 were used in Example 2 (
After culturing in the same manner as in 1) to (2), the culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to the alkali treatment described in Example 2 (3).
(2)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkaline was determined by the ELISA method described in Example 2 (4). Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(3)約200株の形質転換体を評価し、その中からFpL_C4KR(配列番号6)
と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転
換体を選択した。
(3) About 200 transformants were evaluated, and FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6) was selected from among them.
We selected transformants expressing immunoglobulin-binding proteins with improved alkaline stability compared to .
(4)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(4) Cultivate the selected transformant and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(5)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
(5) Analyze the nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin binding protein inserted into the obtained expression vector by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and identify the amino acid substitution site. did.
(6)(3)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または
参考例1で作製したFpL_C4KR(配列番号6)を発現する形質転換体を、参考例2
(6)から(8)と同様な方法で培養し、参考例2(9)と同様な方法でタンパク質抽出
液を調製した。
(6) A transformant expressing the immunoglobulin binding protein selected in (3) or a transformant expressing FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6) prepared in Reference Example 1 was transferred to Reference Example 2.
The cells were cultured in the same manner as in (6) to (8), and a protein extract was prepared in the same manner as in Reference Example 2 (9).
(7)(6)で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体
結合活性を、実施例2(4)に記載のELISA法を用いて測定した。
(7) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein in the protein extract prepared in (6) was measured using the ELISA method described in Example 2 (4).
(8)参考例2(11)に記載の方法でアルカリ処理後、参考例2(12)と同様な方
法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(8) After alkali treatment using the method described in Reference Example 2 (11), residual activity was calculated using the same method as in Reference Example 2 (12) to evaluate alkali stability.
(3)で選択した形質転換体が発現する免疫グロブリン結合性タンパク質(配列番号6
)に対するアミノ酸置換位置およびアルカリ処理したときの残存活性[%]をまとめた結
果を表8に示す。配列番号6に記載のアミノ酸配列において、少なくともLys(Arg
)7Ala(この表記は配列番号1の7番目のリジンに相当するアミノ酸残基(配列番号
5では7番目のリジン)が一旦アルギニンに置換後、さらにアラニンに置換されているこ
とを表す、以下同様)および/またはLys(Arg)29Proのアミノ酸置換を有し
た免疫グロブリン結合性タンパク質は、FpL_C4KR(配列番号6)と比較しアルカ
リ安定性が向上しているといえる。
Immunoglobulin binding protein (SEQ ID NO: 6) expressed by the transformant selected in (3)
Table 8 shows the results of amino acid substitution positions and residual activity [%] after alkali treatment. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 6, at least Lys(Arg
) 7Ala (This notation indicates that the amino acid residue corresponding to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 (the 7th lysine in SEQ ID NO: 5) is once substituted with arginine and then further substituted with alanine. The same applies hereinafter. ) and/or Lys(Arg)29Pro amino acid substitutions can be said to have improved alkaline stability compared to FpL_C4KR (SEQ ID NO: 6).
実施例4 FpL_C3アミノ酸置換体の作製
FpL_C3(配列番号1)が有するリジン残基(具体的には配列番号1の7番目、1
3番目、22番目、29番目、38番目、48番目および67番目のリジン残基)のうち
、
7番目のリジン残基をアラニン残基に、
13番目、38番目、48番目および67番目のリジン残基をアルギニン残基に、
22番目のリジン残基をグルタミン残基に、
29番目のリジン残基をイソロイシン残基に、
それぞれ置換した免疫グロブリン結合性タンパク質(配列番号69、以下「FpL_C3
KX」とも表記)に対し、参考例2で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質
のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換を集積した。具体的には、以下に示す免疫
グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
FpL_C3KXに対し、Asn50Tyr、Glu52GlyおよびAsn62Tyr
のアミノ酸置換を導入したタンパク質(FpL_C3KX 3aと命名)
Example 4 Preparation of FpL_C3 amino acid substitution product Lysine residues (specifically, 7th and 1st of SEQ ID NO: 1) of FpL_C3 (SEQ ID NO: 1)
3rd, 22nd, 29th, 38th, 48th and 67th lysine residue),
7th lysine residue to alanine residue,
13th, 38th, 48th and 67th lysine residues to arginine residues,
22nd lysine residue to glutamine residue,
29th lysine residue to isoleucine residue,
Each substituted immunoglobulin binding protein (SEQ ID NO: 69, hereinafter “FpL_C3
Amino acid substitutions that were revealed in Reference Example 2 and are involved in improving the alkaline stability of immunoglobulin-binding proteins were collected. Specifically, the immunoglobulin-binding protein shown below was designed and produced.
Asn50Tyr, Glu52Gly and Asn62Tyr for FpL_C3KX
Protein with amino acid substitution introduced (named FpL_C3KX 3a)
(1)pET26bおよびFpL_C3KX 3a(配列番号70)をコードするポリ
ヌクレオチド(配列番号71)を含む発現ベクターpET-FpL_C3KX 3aのヌ
クレオチド配列を設計し、以下の3領域に分割した。
(1) The nucleotide sequence of the expression vector pET-FpL_C3KX 3a containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 71) encoding pET26b and FpL_C3KX 3a (SEQ ID NO: 70) was designed and divided into the following three regions.
第一領域:pET26bのヌクレオチド配列、FpL_C3KX 3aの1番目から20
番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列(配列番号71の1番目から60
番目までのヌクレオチド配列)、FpL_C3KX 3aの53番目から70番目までの
アミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列(配列番号71の157番目から210番目
までのヌクレオチド配列)、ヒスチジン6残基をコードするヌクレオチド配列(配列番号
40)、終止コドンおよび制限酵素HindIIIの認識配列(5’-TAAGCTT-
3’)
First region: nucleotide sequence of pET26b, 1st to 20th of FpL_C3KX 3a
The nucleotide sequence encoding the amino acid residues up to 60th (from 1st to 60th of SEQ ID NO: 71)
Nucleotide sequence encoding amino acid residues 53 to 70 of FpL_C3KX 3a (nucleotide sequence 157 to 210 of SEQ ID NO: 71), nucleotide sequence encoding 6 histidine residues (SEQ ID NO: 40), termination codon and restriction enzyme HindIII recognition sequence (5'-TAAGCTT-
3')
第二領域:FpL_C3KX 3aの16番目から37番目までのアミノ酸残基をコード
するヌクレオチド配列(配列番号72[forward]および73[reverse]
に記載の配列からなるポリヌクレオチド)
Second region: Nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KX 3a (SEQ ID NO: 72 [forward] and 73 [reverse]
polynucleotide consisting of the sequence described in )
第三領域:FpL_C3KX 3aの33番目から57番目までのアミノ酸残基をコード
するヌクレオチド配列(配列番号74[forward]および75[reverse]
に記載の配列からなるポリヌクレオチド)
Third region: nucleotide sequence encoding amino acid residues 33rd to 57th of FpL_C3KX 3a (SEQ ID NO: 74 [forward] and 75 [reverse]
polynucleotide consisting of the sequence described in )
(2)インバースPCRにより、前記第一領域のポリヌクレオチドを調製した。インバ
ースPCRは、鋳型DNAとしてFpL_C4KR K7A(FpL_C4KRにLys
(Arg)7Alaのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番
号67)をコードするポリヌクレオチド(配列番号76)を含む発現ベクターpET-F
pL_C4KR K7Aを、PCR Forward Primerとして配列番号77
に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、PCR Reverse Primerと
して配列番号78に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドとして、表9に示す組成の反
応液を調製後、当該反応液を98℃で2分間熱処理し、95℃で10秒間の第1ステップ
、50℃で5秒間の第2ステップ、72℃で6分の第3ステップを1サイクルとする反応
を30サイクル行ない、最後に72℃で7分間熱処理することで行なった。
(2) A polynucleotide of the first region was prepared by inverse PCR. Inverse PCR uses FpL_C4KR K7A (Lys
Expression vector pET-F containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 76) encoding an immunoglobulin binding protein (SEQ ID NO: 67) into which the amino acid substitution of (Arg)7Ala has been introduced
pL_C4KR K7A as PCR Forward Primer with SEQ ID NO: 77
After preparing a reaction solution having the composition shown in Table 9 using the oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 78 as a PCR Reverse Primer, the reaction solution was heat-treated at 98° C. for 2 minutes. , a first step of 10 seconds at 95°C, a second step of 50°C for 5 seconds, and a third step of 6 minutes at 72°C are performed for 30 cycles, and finally heat treatment is performed at 72°C for 7 minutes. That's what I did.
(3)(2)で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに(1)で設計した
前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド(直接化学合成で作製)をNEBu
ilder(ニュー・イングランド・バイオラボ社製)を用いて連結した。なお、前記三
領域(ポリヌクレオチドとしては5種類)のポリヌクレオチドはそれぞれ、反応液中に0
.05pmolずつ混合した。
(3) The polynucleotide of the first region prepared in (2) and the polynucleotide of the second region and the third region designed in (1) (produced by direct chemical synthesis) were added to NEBu.
ilder (manufactured by New England Biolab). In addition, each of the polynucleotides of the three regions (5 types of polynucleotides) is present in the reaction solution at 0.
.. 05 pmol each were mixed.
(4)(2)で得られたポリヌクレオチドを比較例1(1-2)と同様な方法で精製し
、比較例1(1-3)と同様な方法で形質転換後、比較例1(1-4)と同様な方法で培
養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を比
較例1(1-5)と同様の方法で行なった。
(4) The polynucleotide obtained in (2) was purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-2), and transformed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-3). Culture and extraction of the expression vector were performed in the same manner as in 1-4), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3KX 3aにFpL_C3KX
3a(配列番号70)をコードするポリヌクレオチド(配列番号71)が挿入されている
ことを確認した。
As a result of sequence analysis, FpL_C3KX was found in the expression vector pET-FpL_C3KX 3a.
It was confirmed that the polynucleotide (SEQ ID NO: 71) encoding 3a (SEQ ID NO: 70) was inserted.
実施例5 FpL_C3KX 3aのアルカリ安定性評価
(1)比較例1で作製した天然型FpL_C3(配列番号1)、ならびに実施例4で作
製した変異型免疫グロブリン結合性タンパク質FpL_C3KX(配列番号69)および
FpL_C3KX 3a(配列番号70)のいずれかを発現する形質転換体を、比較例1
(2-1)から(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)に記載の方法でタ
ンパク質抽出液を調製した。
Example 5 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 3a (1) Natural type FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) produced in Comparative Example 1, and mutant immunoglobulin binding proteins FpL_C3KX (SEQ ID NO: 69) and FpL_C3KX produced in Example 4 3a (SEQ ID NO: 70) was transformed into Comparative Example 1
The cells were cultured in the same manner as in (2-1) and (2-2), and a protein extract was prepared in the manner described in Comparative Example 1 (2-3).
(2)(1)で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体
結合活性を、実施例2(4)に記載のELISA法を用いて測定した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein in the protein extract prepared in (1) was measured using the ELISA method described in Example 2 (4).
(3)処理に用いたNaOHの濃度を0.4M(終濃度0.2M)に、処理時間を15
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(3) The concentration of NaOH used in the treatment was 0.4M (final concentration 0.2M), and the treatment time was 15
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表10に示す。Asn50Tyr、Glu52GlyおよびAsn62Tyrの
アミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質(FpL_C3KX 3a)は、
FpL_C3KXと比較し、アルカリ安定性が向上しているといえる(FpL_C3KX
:10%、FpL_C3KX 3a:69%)。
The results are shown in Table 10. Immunoglobulin binding protein (FpL_C3KX 3a) with amino acid substitutions of Asn50Tyr, Glu52Gly and Asn62Tyr is
It can be said that the alkali stability is improved compared to FpL_C3KX (FpL_C3KX
:10%, FpL_C3KX 3a:69%).
実施例6 FpL_C3KX 3aアミノ酸置換体への変異導入およびライブラリ作製
FpL_C3KX 3aに対し、Vκ3との結合力を付与するアミノ酸置換であるGl
u49Aspのアミノ酸置換を導入した、変異型免疫グロブリン結合性タンパク質FpL
_C3KX 4h(配列番号79)を発現するベクターpET-FpL_C3KX 4h
のうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分(配列番号
80)に、参考例1と同様の方法でエラープローンPCRによりランダムに変異を導入し
、ライブラリを作製した。平均変異導入率は1.7%であった。
Example 6 Mutation introduction into FpL_C3KX 3a amino acid substitution product and library construction
Mutant immunoglobulin binding protein FpL with amino acid substitution of u49Asp introduced
Vector pET-FpL_C3KX 4h expressing _C3KX 4h (SEQ ID NO: 79)
Among them, mutations were randomly introduced into the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 80) encoding an immunoglobulin-binding protein by error-prone PCR in the same manner as in Reference Example 1 to prepare a library. The average mutation introduction rate was 1.7%.
実施例7 FpL_C3KX 4hアミノ酸置換体のスクリーニング
(1)実施例6で作製したランダム変異体ライブラリ(形質転換体)を、実施例2(1
)から(2)と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清を1.0M N
aOHと等量混合し、42℃で30分間、アルカリ処理を行なった。
Example 7 Screening for FpL_C3KX 4h amino acid substitution product (1) The random mutant library (transformant) prepared in Example 6 was screened in Example 2 (1
) to (2), and the culture supernatant obtained by centrifugation was diluted with 1.0 M N
It was mixed with aOH in equal amounts and subjected to alkali treatment at 42° C. for 30 minutes.
(2)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkaline was determined by the ELISA method described in Example 2 (4). Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(3)約900株の形質転換体を評価し、その中からアルカリ安定性向上免疫グロブリ
ン結合性タンパク質(FpL_C3KX 4h)と比較してアルカリ安定性が向上した免
疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
(3) Approximately 900 transformants were evaluated, and transformation was performed to express an immunoglobulin binding protein with improved alkaline stability compared to the alkaline stability improved immunoglobulin binding protein (FpL_C3KX 4h). I chose my body.
(4)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(4) Cultivate the selected transformant and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(5)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
(5) Analyze the nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and identify the amino acid mutation locations. Identified.
(6)FpL_C3KX 4h(配列番号79)または(5)で選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、比較例1(2-1)から(2-2)と同様
な方法で培養し、比較例1(2-3)と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記
抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
(6) A transformant expressing FpL_C3KX 4h (SEQ ID NO: 79) or the immunoglobulin binding protein selected in (5) was cultured in the same manner as in Comparative Example 1 (2-1) to (2-2). A protein extract was prepared in the same manner as in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(7)あらかじめ0.5MのNaClと0.02Mイミダゾールとを含む0.05Mトリス緩衝液(pH7.5)(洗浄緩衝液B)で平衡化したNi-NTA Sepharose 6 Fast Flow(Cytiva社製)を充填したカラムに、(6)で清澄化した上清を添加し、前記カラムに充填した担体の10倍量の洗浄緩衝液Bで洗浄後、0.5MのNaClと0.5Mイミダゾールとを含む0.05Mトリス緩衝液(pH7.5)を通液することで、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。 (7) Ni-NTA Sepharose 6 Fast Flow (manufactured by Cytiva) equilibrated in advance with 0.05M Tris buffer (pH 7.5) ( washing buffer B) containing 0.5M NaCl and 0.02M imidazole. The supernatant clarified in step (6) was added to the column filled with the above column, and after washing with washing buffer B in an amount 10 times the amount of the carrier packed in the column, 0.5M NaCl and 0.5M imidazole were added. A fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected by passing 0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing the solution.
(8)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(8) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding proteins contained in the fractions were quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(9)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理時間を15
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(9) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment time was 15
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表11に示す。配列番号79に記載のアミノ酸配列において、少なくともGlu
9Val、Tyr53Phe、Thr54MetおよびAla69Thrより選択される
1以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のFpL_C
3(配列番号1)よりアルカリ安定性が向上したFpL_C3KX 4h(配列番号79
)と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
The results are shown in Table 11. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 79, at least Glu
The immunoglobulin binding protein having one or more amino acid substitutions selected from 9Val, Tyr53Phe, Thr54Met and Ala69Thr is a native FpL_C
FpL_C3KX 4h (SEQ ID NO: 79) has improved alkali stability than 3 (SEQ ID NO: 1).
), it can be said that the alkali stability is improved.
なお、20mL培地で培養したときの精製収量を比較したところ、Lys(Gln)2
2Argのアミノ酸置換を導入することで、タンパク質精製収量が顕著に向上することを
確認した。以降、FpL_C3KX 4hにLys(Gln)22Argのアミノ酸置換
を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質をFpL_C3KX 4i(配列番号82)
と命名する。
In addition, when we compared the purification yield when cultured in 20 mL medium, we found that Lys(Gln)2
It was confirmed that the protein purification yield was significantly improved by introducing the 2Arg amino acid substitution. Hereinafter, an immunoglobulin-binding protein in which Lys(Gln)22Arg amino acid substitution was introduced into FpL_C3KX 4h was designated as FpL_C3KX 4i (SEQ ID NO: 82).
Name it.
実施例8 FpL_C3KX 4iアミノ酸置換集積体の作製
(1)FpL_C3KX 4iアミノ酸置換集積体の設計
実施例7で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に
関与するアミノ酸置換をFpL_C3KX 4i(配列番号82)に対し集積することで
、更なる安定性の向上を図った。具体的には、以下に示す免疫グロブリン結合性タンパク
質を設計し、作製した。
FpL_C3KX 4iに対し、Tyr53Pheのアミノ酸置換を導入したタンパク質
(配列番号86、FpL_C3KX 5eと命名)
Example 8 Preparation of FpL_C3KX 4i amino acid substitution assembly (1) Design of FpL_C3KX 4i amino acid substitution assembly By integrating with SEQ ID NO: 82), we aimed to further improve stability. Specifically, the immunoglobulin-binding protein shown below was designed and produced.
Protein with Tyr53Phe amino acid substitution introduced into FpL_C3KX 4i (SEQ ID NO: 86, named FpL_C3KX 5e)
(1)インバースPCRを用いた変異導入により、FpL_C3KX 5e(配列番号
86)をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。鋳型DNAと
してインバースPCRはFpL_C3KX 4i(配列番号82)をコードするポリヌク
レオチド(配列番号87)を含む発現ベクター(以下、「pET-FpL_C3KX 4
i」とも表記)を、PCR Forward Primerとして配列番号88に記載の
オリゴヌクレオチドを、PCR Reverse Primerとして配列番号89に記
載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例4(2)と同様な方法で行なった
。
(1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 86) was produced by introducing mutations using inverse PCR. Inverse PCR is performed using an expression vector (hereinafter referred to as "pET-FpL_C3KX 4
A method similar to Example 4 (2) except that the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 88 was used as the PCR Forward Primer, and the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 89 was used as the PCR Reverse Primer. I did it.
(2)得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素DpnIで処理後、制限酵素より
産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。
(2) The obtained polynucleotide was purified and treated with the restriction enzyme DpnI, and then the E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the restriction enzyme product.
(3)得られた形質転換体を参考例2(4)と同様な方法で培養および発現ベクター(
pET-FpL_C3KX 5eと命名)の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオ
チド配列の解析を比較例1(1-5)と同様の方法で行なった。
(3) The obtained transformant was cultured in the same manner as in Reference Example 2 (4), and the expression vector (
pET-FpL_C3KX 5e) was extracted, and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3KX 5eにFpL_C3KX
5e(配列番号86)をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
As a result of sequence analysis, FpL_C3KX was added to the expression vector pET-FpL_C3KX 5e.
It was confirmed that the polynucleotide encoding 5e (SEQ ID NO: 86) was inserted.
実施例9 FpL_C3KX 4hアミノ酸置換体のアルカリ安定性評価
(1)FpL_C3KX 4h(配列番号79)、実施例7で作製したFpL_C3K
X 4i(配列番号82)ならびに実施例8で作製したFpL_C3KX 5e(配列番
号89)のいずれかを発現する形質転換体を、比較例1(2-1)から(2-2)と同様
な方法で培養し、比較例1(2-3)と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記
抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
Example 9 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 4h amino acid substitution product (1) FpL_C3KX 4h (SEQ ID NO: 79), FpL_C3K produced in Example 7
Transformants expressing either X 4i (SEQ ID NO: 82) or FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 89) produced in Example 8 were treated in the same manner as in Comparative Examples 1 (2-1) to (2-2). A protein extract was prepared in the same manner as in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2)(1)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(2) The supernatant clarified in (1) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(3)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(3) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(4)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理温度を55
℃、処理時間を15分に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ
処理後、参考例2(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した
。
(4) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment temperature was 55%.
After alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the temperature and treatment time were 15 minutes, residual activity was calculated in the same manner as in Reference Example 2 (12), and alkali stability was determined. evaluated.
結果を表12に示す。実施例8で作製したFpL_C3KX 5e(配列番号86)は
天然型のFpL_C3(配列番号1)よりアルカリ安定性が向上したFpL_C3KX
4h(配列番号79)およびFpL_C3KX 4i(配列番号82)と比較しても、ア
ルカリ安定性が向上しているといえる(FpL_C3KX 4h:34%、FpL_C3
KX 4i:48%、FpL_C3KX 5e:73%)。
The results are shown in Table 12. FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 86) produced in Example 8 is FpL_C3KX with improved alkali stability than the natural type FpL_C3 (SEQ ID NO: 1).
4h (SEQ ID NO: 79) and FpL_C3KX 4i (SEQ ID NO: 82), it can be said that the alkali stability is improved (FpL_C3KX 4h: 34%, FpL_C3
KX 4i: 48%, FpL_C3KX 5e: 73%).
実施例10 FpL_C3KX 5eへの変異導入およびライブラリ作製
実施例8で作製した発現ベクターpET-FpL_C3KX 5eのうち、免疫グロブ
リン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分(配列番号90)に、参考例1
と同様の方法でエラープローンPCRによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製
した。平均変異導入率は1.9%であった。
Example 10 Mutation introduction into FpL_C3KX 5e and library construction Of the expression vector pET-FpL_C3KX 5e produced in Example 8, Reference Example 1 was added to the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 90) encoding an immunoglobulin binding protein.
Mutations were randomly introduced by error-prone PCR in the same manner as above to create a library. The average mutation introduction rate was 1.9%.
実施例11 FpL_C3KX 5eアミノ酸置換体のスクリーニング
(1)実施例10で作製したランダム変異体ライブラリ(形質転換体)を実施例2(1
)から(2)と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清を、実施例7(
1)に記載のアルカリ処理を行なった。
Example 11 Screening for FpL_C3KX 5e amino acid substitution product (1) The random mutant library (transformant) prepared in Example 10 was screened in Example 2 (1
) to (2), the culture supernatant obtained by centrifugation was added to Example 7 (
The alkali treatment described in 1) was performed.
(2)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkaline was determined by the ELISA method described in Example 2 (4). Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(3)約900株の形質転換体を評価し、その中からアルカリ安定性向上免疫グロブリ
ン結合性タンパク質(FpL_C3KX 5e)と比較してアルカリ安定性が向上した免
疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
(3) Approximately 900 transformants were evaluated, and transformation was performed to express an immunoglobulin binding protein with improved alkaline stability compared to the alkaline stability improved immunoglobulin binding protein (FpL_C3KX 5e). I chose my body.
(4)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(4) Cultivate the selected transformant and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(5)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
(5) Analyze the nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin binding protein inserted into the obtained expression vector by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and identify the amino acid mutation locations. Identified.
(6)(3)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または
実施例24で作製したFpL_C3KX 5e(配列番号86)を発現する形質転換体を
、比較例1(2-1)から(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)と同様
な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィル
ターに通し、清澄化した。
(6) A transformant expressing the immunoglobulin binding protein selected in (3) or a transformant expressing FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 86) prepared in Example 24 was transformed into Comparative Example 1 (2-1). The cells were cultured in the same manner as in (2-2), and a protein extract was prepared in the same manner as in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(7)(6)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(7) The supernatant clarified in (6) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(8)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(8) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding proteins contained in the fractions were quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(9)処理に用いたNaOHの濃度を2.0M(終濃度1.0M)に、処理時間を17
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(9) The concentration of NaOH used in the treatment was 2.0M (final concentration 1.0M), and the treatment time was 17
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表13に示す。配列番号86に記載のアミノ酸配列において、少なくともGlu
1Val、Glu4Gly、Gly21ArgおよびGlu(Gly)52Aspより選
択される1以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のF
pL_C3(配列番号1)よりアルカリ安定性が向上したFpL_C3KX 5e(配列
番号86)と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
The results are shown in Table 13. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 86, at least Glu
An immunoglobulin-binding protein having one or more amino acid substitutions selected from 1Val, Glu4Gly, Gly21Arg and Glu(Gly)52Asp is a native F
It can be said that the alkali stability is improved even when compared with FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 86), which has improved alkali stability than pL_C3 (SEQ ID NO: 1).
実施例12 FpL_C3KX 5eアミノ酸置換集積体作製(その2)
実施例10で明らかとなった免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に
関与するアミノ酸置換ならびにVκ3との結合力を付与するアミノ酸置換であるPro6
SerおよびLys(Arg)38GluをFpL_C3KX 5eに対し集積した。具
体的には、以下に示す免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作成した。
FpL_C3KX 5eに対し、Glu4Gly、Pro6Ser、Lys(Arg)3
8Glu、Glu(Gly)52Aspのアミノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号
96、FpL_C3KX 7dと命名)
Example 12 Preparation of FpL_C3KX 5e amino acid substitution aggregate (Part 2)
Pro6, which is an amino acid substitution that is involved in improving the alkaline stability of immunoglobulin-binding proteins as revealed in Example 10, and an amino acid substitution that imparts binding strength to Vκ3
Ser and Lys(Arg)38Glu were integrated to FpL_C3KX 5e. Specifically, the immunoglobulin-binding protein shown below was designed and created.
Glu4Gly, Pro6Ser, Lys(Arg)3 for FpL_C3KX 5e
8Glu, protein introduced with amino acid substitution of Glu(Gly)52Asp (SEQ ID NO: 96, named FpL_C3KX 7d)
(1)FpL_C3KX 7d(配列番号96)をコードするポリヌクレオチド(配列
番号97)を合成した。なお、合成する際、5’末端側には制限酵素NcoIの認識配列
(5’-CCATGG-3’)を、3’末端側にはヒスチジン6残基をコードするヌクレ
オチド配列(配列番号40)、終止コドンおよび制限酵素HindIIIの認識配列(5
’-AAGCTT-3’)を、それぞれ付加している。
(1) A polynucleotide (SEQ ID NO: 97) encoding FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) was synthesized. When synthesizing, a recognition sequence for the restriction enzyme NcoI (5'-CCATGG-3') is placed on the 5' end, and a nucleotide sequence encoding 6 histidine residues (SEQ ID NO: 40) is placed on the 3' end. Stop codon and restriction enzyme HindIII recognition sequence (5
'-AAGCTT-3') are added respectively.
(2)比較例1(1-2)と同様の方法で、(1)で合成したポリヌクレオチドを精製
した。
(2) The polynucleotide synthesized in (1) was purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-2).
(3)比較例1(1-3)と同様な方法で、(2)で得たポリヌクレオチドと予め制限
酵素NcoIとHindIIIで消化したプラスミドpET-26bとをライゲーション
後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、培養し
た。
(3) Using the same method as Comparative Example 1 (1-3), ligate the polynucleotide obtained in (2) with plasmid pET-26b that has been previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII, and then use the ligation product to Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed and cultured.
(4)得られた形質転換体を、比較例1(1-4)と同様な方法で培養およびプラスミ
ド精製を行ない、発現ベクター(pET-FpL_C3KX8aと命名)を取得後、当該
発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、比較例1(1-5)と同様の方法で行なった
。
(4) The obtained transformant was cultured and plasmid purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-4) to obtain an expression vector (named pET-FpL_C3KX8a), and the nucleotide sequence of the expression vector was The analysis was conducted in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3KX 7dにFpL_C3KX
7d(配列番号96)をコードするポリヌクレオチド(配列番号97)が挿入されている
ことを確認した。
As a result of sequence analysis, FpL_C3KX was added to the expression vector pET-FpL_C3KX 7d.
It was confirmed that the polynucleotide (SEQ ID NO: 97) encoding 7d (SEQ ID NO: 96) was inserted.
実施例13 FpL_C3KX 7dのアルカリ安定性評価
(1)実施例10で取得したFpL_C3KX 5e(配列番号86)および実施例1
2で取得したFpL_C3KX 7d(配列番号96)、のいずれかを発現する形質転換
体を、比較例1(2-1)から(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)に
記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフ
ィルターに通し、清澄化した。
Example 13 Alkali stability evaluation of FpL_C3KX 7d (1) FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 86) obtained in Example 10 and Example 1
A transformant expressing either FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) obtained in Comparative Example 1 (2-2) was cultured in the same manner as in Comparative Example 1 (2-1) to (2-2). A protein extract was prepared by the method described in -3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2)(1)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(2) The supernatant clarified in (1) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(3)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(3) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(4)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理時間を17
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(4) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment time was 17
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表14に示す。本実施例で評価したFpL_C3KX8a(配列番号96)は、
FpL_C3KX 5e(配列番号86)と比較し、残存活性が高くなっており、これら
変異型免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性が向上していることが確認され
た。
The results are shown in Table 14. FpL_C3KX8a (SEQ ID NO: 96) evaluated in this example,
It was confirmed that the residual activity was higher than that of FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 86), and the alkaline stability of these mutant immunoglobulin binding proteins was improved.
実施例14 FpL_C3KX 7dへの変異導入およびライブラリ作製(その1)
実施例12で作製したFpL_C3KX 7d(配列番号96)を発現するベクターp
ET-FpL_C3KX 7dのうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポ
リヌクレオチド部分(配列番号97)に、参考例1と同様の方法でエラープローンPCR
によりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は1.9%であ
った。
Example 14 Mutation introduction into FpL_C3KX 7d and library construction (Part 1)
Vector p expressing FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) produced in Example 12
ET-FpL_C3KX 7d, the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 97) encoding an immunoglobulin binding protein was subjected to error-prone PCR in the same manner as in Reference Example 1.
A library was created by randomly introducing mutations. The average mutation introduction rate was 1.9%.
実施例15 FpL_C3KX 7dアミノ酸置換体のスクリーニング(その1)
(1)実施例12で作製したpET-FpL_C3KX 7d(形質転換体)と実施例
13で作製したランダム変異体ライブラリ(形質転換体)を、実施例2(1)から(2)
と同様な方法で培養した。
Example 15 Screening for FpL_C3KX 7d amino acid substitution product (Part 1)
(1) The pET-FpL_C3KX 7d (transformant) prepared in Example 12 and the random mutant library (transformant) prepared in Example 13 were transferred from Example 2 (1) to (2).
It was cultured in the same manner.
(2)培養後、遠心操作によって得られた培養上清を1.0M NaOHと等量混合し
30分、58℃でアルカリ処理を行なった。
(2) After culturing, the culture supernatant obtained by centrifugation was mixed with an equal volume of 1.0 M NaOH and treated with alkali at 58° C. for 30 minutes.
(3)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(3) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was determined by the ELISA method described in Example 2 (4). Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(4)約1000株の形質転換体を評価し、その中からFpL_C3KX 7d(配列
番号96)と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現
する形質転換体を選択した。
(4) Approximately 1000 transformants were evaluated, and transformants expressing an immunoglobulin-binding protein with improved alkaline stability compared to FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) were selected from among them.
(5)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(5) Cultivate the selected transformants and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(6)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
(6) The nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and amino acid mutation locations were determined. Identified.
(7)(4)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または
実施例12で作製したpET-FpL_C3KX 7d(配列番号96)を発現する形質
転換体を、比較例1(1-1)から(1-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3
)と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清
をフィルターに通し、清澄化した。
(7) Comparative Example 1 (1- Comparative Example 1 (2-3) was cultured in the same manner as 1) to (1-2).
) A protein extract was prepared in a similar manner. The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(8)(7)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(8) The supernatant clarified in (7) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(9)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(9) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(10)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理時間を1
5時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例
2(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(10) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment time was 1.
After the alkali treatment was performed in the same manner as in Reference Example 2 (11), the residual activity was calculated in the same manner as in Reference Example 2 (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表15に示す。配列番号96に記載のアミノ酸配列において、少なくともGlu
8Val、Glu33ValおよびAla69Valより選択される1以上のアミノ酸置
換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のFpL_C3(配列番号1)よ
りアルカリ安定性が向上したFpL_C3KX 7d(配列番号96)と比較しても、ア
ルカリ安定性が向上しているといえる。
The results are shown in Table 15. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 96, at least Glu
The immunoglobulin-binding protein having one or more amino acid substitutions selected from 8Val, Glu33Val and Ala69Val was compared with FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96), which has improved alkaline stability than the natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). However, it can be said that the alkali stability is improved.
実施例16 FpL_C3KX 7dへの変異導入およびライブラリ作製(その2)
(1)実施例12で作製したFpL_C3KX 7d(配列番号96)を発現するベクタ
ーpET-FpL_C3KX 7dを鋳型として、23番目、41番目および52番目の
アミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例1(2)
と同様、22c-Trick法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導
入箇所を中心としたインバースPCRができるように設計した(配列番号100から10
5、107から112、ならびに115から120)。これらのプライマーを一箇所の置
換につき6本一組として、表1および表16の組成で混合し、PCR Primer混合
液(Forward/Reverse primer mix)を調製した。
Example 16 Mutation introduction into FpL_C3KX 7d and library construction (Part 2)
(1) Using the vector pET-FpL_C3KX 7d expressing FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) prepared in Example 12 as a template, a library of saturated substitution products for the 23rd, 41st, and 52nd amino acid residues was prepared. The primer is Example 1 (2)
Similarly, following the 22c-Trick method, an appropriate mixed base was placed at the mutation introduction site, and it was designed to perform inverse PCR centered on the mutation introduction site (SEQ ID NO: 100 to 10).
5, 107 to 112, and 115 to 120). These primers were mixed in sets of six for each substitution in the compositions shown in Tables 1 and 16 to prepare a PCR primer mixture (Forward/Reverse primer mix).
(2)pET-FpL_C3KX 7dを鋳型DNAとした他は、実施例2(2-2)
と同様な方法でインバースPCRによる部位特異的変異導入を行った。
(2) Example 2 (2-2) except that pET-FpL_C3KX 7d was used as the template DNA
Site-directed mutagenesis was performed by inverse PCR in the same manner as described above.
(3)得られたPCR産物を精製後、反応液を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形
質転換し、50μg/mLのカナマイシンを含むLBプレート培地で培養(37℃、16
時間)した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
(3) After purifying the obtained PCR product, E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the reaction solution, and cultured in LB plate medium containing 50 μg/mL kanamycin (37°C, 16
The colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
実施例17 FpL_C3KX8aアミノ酸置換体のスクリーニング(その2)
(1)実施例12で作製したpET-FpL_C3KX 7d(形質転換体)および実
施例16で作製したランダム変異体ライブラリ(形質転換体)で作製した部位特異的アミ
ノ酸置換体ライブラリ(形質転換体)を、実施例2(1)から(2)と同様な方法で培養
後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例15(2)に記載のアルカリ処理
を行なった。
Example 17 Screening for FpL_C3KX8a amino acid substitution products (Part 2)
(1) A site-specific amino acid substitution library (transformant) prepared using the pET-FpL_C3KX 7d (transformant) prepared in Example 12 and the random mutant library (transformant) prepared in Example 16. After culturing in the same manner as in Examples 2 (1) to (2), the culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to the alkali treatment described in Example 15 (2).
(2)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(3)約300株の形質転換体を評価し、その中からFpL_C3KX 7d(配列番
号96)と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現す
る形質転換体を選択した。
(3) Approximately 300 transformants were evaluated, and transformants expressing an immunoglobulin-binding protein with improved alkaline stability compared to FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) were selected from among them.
(4)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(4) Cultivate the selected transformant and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(5)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
(5) Analyze the nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and identify the amino acid mutation locations. Identified.
(6)(3)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または
実施例12で作製したFpL_C3KX 7d(配列番号96)を発現する形質転換体を
、比較例1(2-1)から(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)と同様
な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィル
ターに通し、清澄化した。
(6) A transformant expressing the immunoglobulin binding protein selected in (3) or a transformant expressing FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) prepared in Example 12 was transformed into Comparative Example 1 (2-1). The cells were cultured in the same manner as in (2-2), and a protein extract was prepared in the same manner as in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(7)(6)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(7) The supernatant clarified in (6) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(8)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(8) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding proteins contained in the fractions were quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(9)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理時間を15
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(9) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment time was 15
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表17に示す。配列番号96に記載のアミノ酸配列において、少なくともIle
23Arg、Ala41Ile、Ala41Tyr、Glu(Gly,Asp)52Le
u(この表記は配列番号1の7番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基が一旦グリシ
ンに置換し、さらにアスパラギン酸に置換後、ロイシンに置換されたことを表す、以下同
様)およびGlu(Gly,Asp)52Valのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン
結合性タンパク質は、天然型のFpL_C3よりアルカリ安定性が向上したFpL_C3
KX 7d(配列番号96)と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
The results are shown in Table 17. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 96, at least Ile
23Arg, Ala41Ile, Ala41Tyr, Glu(Gly, Asp)52Le
u (this notation indicates that the amino acid residue corresponding to the 7th glutamic acid in SEQ ID NO: 1 was first substituted with glycine, then substituted with aspartic acid, and then substituted with leucine; the same applies hereinafter) and Glu (Gly, Asp) The immunoglobulin-binding protein with the 52Val amino acid substitution is FpL_C3, which has improved alkaline stability than the natural type FpL_C3.
It can be said that the alkali stability is improved compared to KX 7d (SEQ ID NO: 96).
実施例18 FpL_C3KX 7dアミノ酸置換体の設計と作製
側鎖の性質が異なるアミノ酸残基への置換、またはドメイン間でアミノ酸配列が異なる
位置における他のドメインのアミノ酸残基への置換を導入する方法で取得した、酸溶出性
が向上したアミノ酸置換である、Pro(Ser)6Ala、Glu8Gly、Glu8
Arg、Gly21Arg、Ile23Phe、Ile23Leu、Glu33Val、
Lys(Arg,Glu)38His、Lys(Arg,Glu)38Leu、Asn4
4His、Asn44Arg、Lys(Arg)48His、Asn(Tyr)50Me
t、Glu(Gly,Asp)52Tyr、Tyr(Phe)53SerのいずれかをF
pL_C3KX 7dに対し集積した。
Example 18 Design and production of FpL_C3KX 7d amino acid substitution product A method of introducing substitutions with amino acid residues with different side chain properties or substitutions with amino acid residues of other domains at positions where the amino acid sequence differs between domains. The obtained amino acid substitutions with improved acid elution properties, Pro(Ser)6Ala, Glu8Gly, Glu8
Arg, Gly21Arg, Ile23Phe, Ile23Leu, Glu33Val,
Lys(Arg, Glu)38His, Lys(Arg, Glu)38Leu, Asn4
4His, Asn44Arg, Lys(Arg)48His, Asn(Tyr)50Me
t, Glu(Gly, Asp)52Tyr, Tyr(Phe)53Ser as F
It was accumulated against pL_C3KX 7d.
(1)鋳型DNAとしてFpL_C3KX 7d(配列番号96)をコードするポリヌ
クレオチド(配列番号97)を含む発現ベクターpET-FpL_C3KX 7dを、P
CR Forward PrimerおよびPCR Reverse Primerの組
み合わせとして表18の配列番号に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドの組み合わせ
を、それぞれ用いた他は実施例4(2)と同様な方法でインバースPCRを行なった。
(1) Expression vector pET-FpL_C3KX 7d containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 97) encoding FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96) as template DNA
Inverse PCR was performed in the same manner as in Example 4 (2), except that the combinations of oligonucleotides having the sequences listed in the SEQ ID NOs in Table 18 were used as the combinations of CR Forward Primer and PCR Reverse Primer.
(2)(1)で得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素DpnIで処理後、制限
酵素より産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。
(2) The polynucleotide obtained in (1) was purified and treated with the restriction enzyme DpnI, and the product was used to transform Escherichia coli BL21 (DE3) strain.
(3)得られた形質転換体を比較例1(1-4)と同様な方法で培養および発現ベクタ
ーの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を比較例1(1-5)と
同様の方法で行なった。結果、いずれの発現ベクターも(1)で得られたポリヌクレオチ
ドが挿入されていることを確認した。
(3) The obtained transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Comparative Example 1 (1-4), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed as in Comparative Example 1 (1-5). It was done in the same way. As a result, it was confirmed that the polynucleotide obtained in (1) was inserted into all expression vectors.
実施例19 FpL_C3KX 7dアミノ酸置換体の酸溶出性評価
(1)FpL_C3KX 7dおよび実施例18で作製したFpL_C3KX 7dア
ミノ酸置換体(計15種類)のいずれかを発現する形質転換体を、比較例1(2-1)か
ら(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)に記載の方法でタンパク質抽出
液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した
。
Example 19 Acid dissolution evaluation of FpL_C3KX 7d amino acid substituted product (1) Transformants expressing either FpL_C3KX 7d or the FpL_C3KX 7d amino acid substituted product prepared in Example 18 (15 types in total) were transformed into Comparative Example 1 ( The cells were cultured in the same manner as in 2-1) to (2-2), and a protein extract was prepared in the manner described in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2)(1)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(2) The supernatant clarified in (1) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(3)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(3) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(4)各タンパク質の濃度が等しくなるよう、TBSを用いて希釈した。希釈液を二等
分し、実施例2(4)に記載のELISA法(酸溶出性評価)によって、一方には0.0
5M クエン酸ナトリウム緩衝液(pH3.0)(酸処理)を、もう一方にはTBS(酸
未処理)を添加した際の抗体結合活性を測定した。酸処理した免疫グロブリン結合性タン
パク質の抗体結合活性を、酸未処理の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で
除することで残存活性を算出した。1より残存活性を減ずることで溶出率を算出し、酸溶
出性を評価した。
(4) Each protein was diluted with TBS so that the concentration was equal. The diluted solution was divided into two equal parts, and one part was treated with 0.0
Antibody binding activity was measured when 5M sodium citrate buffer (pH 3.0) (acid-treated) was added to one side, and TBS (unacid-treated) was added to the other. Residual activity was calculated by dividing the antibody binding activity of the acid-treated immunoglobulin binding protein by the antibody binding activity of the acid-untreated immunoglobulin binding protein. The elution rate was calculated by subtracting the residual activity from 1, and the acid elution property was evaluated.
結果を表19に示す。本実施例で評価したFpL_C3KX 7dアミノ酸置換体はいずれも天然型のFpL_C3(配列番号1)よりアルカリ安定性が向上したFpL_C3KX 7d(配列番号96)と比較し、溶出率が高くなっており、これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸による溶出性が向上していることが確認された。 The results are shown in Table 19. All of the FpL_C3KX 7d amino acid substitution products evaluated in this example had higher elution rates than FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 96), which has improved alkali stability than the natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). It was confirmed that the acid elution properties of these mutant immunoglobulin-binding proteins were improved.
実施例20 FpL_C3KX 7dアミノ酸置換集積体の作製
(1)FpL_C3KX 7dアミノ酸置換集積体の設計
実施例15および17で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ
安定性向上に関与するアミノ酸置換をFpL_C3KX 7d(配列番号96)に対し集
積することで、更なるアルカリ安定性の向上を図った。具体的には、以下の<a>から<
b>に示す2種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
(ac)FpL_C3KX 7dに対し、Glu(Gly,Asp)52ValおよびA
la69Valのアミノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号171、FpL_C3K
X 8aと命名)
(b)FpL_C3KX 7dに対し、Glu(Gly,Asp)52LeuおよびAl
a69Valのアミノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号174、FpL_C3KX
8bと命名)
Example 20 Preparation of FpL_C3KX 7d amino acid substitution assembly (1) Design of FpL_C3KX 7d amino acid substitution assembly By accumulating on 7d (SEQ ID NO: 96), we aimed to further improve the alkali stability. Specifically, from <a> to <
Two types of immunoglobulin-binding proteins shown in b> were designed and produced.
(ac) FpL_C3KX 7d, Glu(Gly, Asp)52Val and A
Protein with la69Val amino acid substitution introduced (SEQ ID NO: 171, FpL_C3K
(named X 8a)
(b) Glu(Gly,Asp)52Leu and Al for FpL_C3KX 7d
Protein with a69Val amino acid substitution introduced (SEQ ID NO: 174, FpL_C3KX
(named 8b)
(2)FpL_C3KX 7dアミノ酸置換集積体の作製
以下、前記<a>から<b>に示す2種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方
法について説明する。
(2) Preparation of FpL_C3KX 7d amino acid substitution aggregate Hereinafter, methods for producing the two types of immunoglobulin-binding proteins shown in <a> to <b> above will be described.
<a>FpL_C3KX 8a
<a-1>インバースPCRを用いた変異導入により、FpL_C3KX 8a(配列
番号271)をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバ
ースPCRは、鋳型DNAとしてFpL_C3KX 7d_A69V(FpL_C3KX
7dにAla69Valのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、
配列番号98)をコードするポリヌクレオチド(配列番号168)を含む発現ベクター(
以下、「pET-FpL_C3KX 7d_A69V」とも表記)を、PCR Forw
ard Primerとして配列番号169に記載のオリゴヌクレオチドを、PCR R
everse Primerとして配列番号170に記載のオリゴヌクレオチドを、それ
ぞれ用いた他は実施例4(2)と同様な方法で行なった。
<a>FpL_C3KX 8a
<a-1> A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 8a (SEQ ID NO: 271) was produced by introducing mutations using inverse PCR. Inverse PCR uses FpL_C3KX 7d_A69V (FpL_C3KX
an immunoglobulin-binding protein in which an amino acid substitution of Ala69Val is introduced into 7d;
An expression vector (SEQ ID NO: 98) containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 168) encoding
Hereinafter, also referred to as “pET-FpL_C3KX 7d_A69V”), PCR Forw
PCR R
The same method as in Example 4(2) was performed except that the oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 170 was used as the everse primer.
<a-2>得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素DpnIで処理後、制限酵素
より産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。
<a-2> The obtained polynucleotide was purified and treated with the restriction enzyme DpnI, and then the E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the restriction enzyme product.
<a-3>得られた形質転換体を比較例1(1-3)から(1-4)と同様な方法で培
養および発現ベクター(pET-FpL_C3KX 8aと命名)の抽出を行ない、当該
発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を比較例1(1-5)と同様の方法で行なった。
<a-3> The obtained transformant was cultured and the expression vector (named pET-FpL_C3KX 8a) was extracted in the same manner as in Comparative Example 1 (1-3) to (1-4). The nucleotide sequence of the vector was analyzed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3KX 8aにFpL_C3KX
8a(配列番号171)をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した
。
As a result of sequence analysis, FpL_C3KX was added to the expression vector pET-FpL_C3KX 8a.
It was confirmed that the polynucleotide encoding 8a (SEQ ID NO: 171) was inserted.
<b>FpL_C3KX 8b
<b-1>インバースPCRを用いた変異導入により、FpL_C3KX 8b(配列
番号174)をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。鋳型D
NAとしてインバースPCRは、鋳型DNAとしてpET-FpL_C3KX 7d_A
69Vを、PCR Forward Primerとして配列番号172に記載のオリゴ
ヌクレオチドを、PCR Reverse Primerとして配列番号173記載のオ
リゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例4(2)と同様な方法で行なった。
<b>FpL_C3KX 8b
<b-1> A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 8b (SEQ ID NO: 174) was produced by introducing mutations using inverse PCR. Mold D
Inverse PCR as NA, pET-FpL_C3KX 7d_A as template DNA
69V, the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 172 as the PCR Forward Primer, and the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 173 as the PCR Reverse Primer were used in the same manner as in Example 4(2).
<b-2>得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素DpnIで処理後、制限酵素
より産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。
<b-2> The obtained polynucleotide was purified and treated with the restriction enzyme DpnI, and then the E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the restriction enzyme product.
<b-3>得られた形質転換体を比較例1(1-3)から(1-4)と同様な方法で培
養および発現ベクター(pET-FpL_C3KX 8bと命名)の抽出を行ない、当該
発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を比較例1(1-5)と同様の方法で行なった。
<b-3> The obtained transformant was cultured and the expression vector (named pET-FpL_C3KX 8b) was extracted in the same manner as in Comparative Example 1 (1-3) to (1-4). The nucleotide sequence of the vector was analyzed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3KX 8bにFpL_C3KX
8b(配列番号174)をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した
。
As a result of sequence analysis, expression vector pET-FpL_C3KX 8b contained FpL_C3KX.
It was confirmed that the polynucleotide encoding 8b (SEQ ID NO: 174) was inserted.
実施例21 FpL_C3KX 7dアミノ酸置換集積体のアルカリ安定性評価
(1)実施例15で取得したFpL_C3KX 7d_A69V(配列番号98)、な
らびに実施例20で作製したFpL_C3KX 8a(配列番号171)およびFpL_
C3KX 8b(配列番号174)のいずれかを発現する形質転換体を、比較例1(2-
1)から(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)に記載の方法でタンパク
質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄
化した。
Example 21 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 7d amino acid substitution aggregate (1) FpL_C3KX 7d_A69V (SEQ ID NO: 98) obtained in Example 15, and FpL_C3KX 8a (SEQ ID NO: 171) and FpL_ produced in Example 20
A transformant expressing either C3KX 8b (SEQ ID NO: 174) was transformed into Comparative Example 1 (2-
The cells were cultured in the same manner as in 1) to (2-2), and a protein extract was prepared in the manner described in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2)(1)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(2) The supernatant clarified in (1) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(3)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(3) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(4)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理時間を15
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
(4) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment time was 15
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
結果を表20に示す。FpL_C3KX 8a(配列番号171)およびFpL_C3
KX 8b(配列番号174)は、FpL_C3KX8a_A69V(配列番号98)と
比較し、残存活性が高くなっており、これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質のア
ルカリ安定性が向上していることが確認された。
The results are shown in Table 20. FpL_C3KX 8a (SEQ ID NO: 171) and FpL_C3
It was confirmed that KX 8b (SEQ ID NO: 174) had higher residual activity than FpL_C3KX8a_A69V (SEQ ID NO: 98), and the alkaline stability of these mutant immunoglobulin binding proteins was improved.
実施例22 本発明の免疫グロブリン結合性タンパク質へのアミノ酸置換導入
側鎖の性質が異なるアミノ酸残基への置換、またはドメイン間でアミノ酸配列が異なる
位置における他のドメインのアミノ酸残基への置換を導入する方法で取得した、アルカリ
安定性が向上したアミノ酸置換である、Val14Ala、Gly21Arg、Ile2
3Thr、Ala41Arg、Asn44Asp、Asn44Arg、Asn44His
、Glu52Tyr、Gly60ArgおよびIle64LeuのいずれかをFpL_C
3KX 7e(配列番号175)に対し集積した。なおFpL_C3KX 7eは、天然
型FpL_C3(配列番号1)に対し、Glu4Gly、Pro6Ser、Lys7Al
a、Lys13Arg、Lys22Arg、Lys29Ile、Lys29Glu、Ly
s48Arg、Glu49Asp、Asn50Tyr、Tyr53Phe、Asn62T
yr、Lys67ArgおよびAla69Valのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質である。
Example 22 Introduction of amino acid substitutions into the immunoglobulin-binding protein of the present invention Substitutions with amino acid residues with different side chain properties or substitutions with amino acid residues of other domains at positions where the amino acid sequences differ between domains Val14Ala, Gly21Arg, Ile2, which are amino acid substitutions with improved alkali stability obtained by the method of introducing
3Thr, Ala41Arg, Asn44Asp, Asn44Arg, Asn44His
, Glu52Tyr, Gly60Arg and Ile64Leu to FpL_C
3KX 7e (SEQ ID NO: 175). Note that FpL_C3KX 7e has Glu4Gly, Pro6Ser, Lys7Al compared to natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1).
a, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys29Glu, Ly
s48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Tyr53Phe, Asn62T
It is an immunoglobulin-binding protein that introduces amino acid substitutions of yr, Lys67Arg, and Ala69Val.
(1)鋳型DNAとしてFpL_C3KX 7e(配列番号175)をコードするポリ
ヌクレオチド(配列番号176)を含む発現ベクター(以下、「pET-FpL_C3K
X 7e」とも表記)を、PCR Forward PrimerおよびPCR Rev
erse Primerの組み合わせとして表21の配列番号に記載の配列からなるオリ
ゴヌクレオチドの組み合わせを、それぞれ用いた他は実施例4(2)と同様な方法でイン
バースPCRを行なった。
(1) An expression vector (hereinafter referred to as "pET-FpL_C3K
X 7e”) as PCR Forward Primer and PCR Rev
Inverse PCR was carried out in the same manner as in Example 4(2), except that the combinations of oligonucleotides having the sequences shown in the sequence numbers in Table 21 were used as the combinations of the else primers.
(2)(1)で得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素DpnIで処理後、当該
制限酵素処理産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。
(2) The polynucleotide obtained in (1) was purified and treated with the restriction enzyme DpnI, and the E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the restriction enzyme treatment product.
(3)得られた形質転換体を比較例1(1-4)と同様な方法で培養および発現ベクタ
ーの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を比較例1(1-5)と
同様の方法で行なった。結果、いずれの発現ベクターも(1)で得られたポリヌクレオチ
ドが挿入されていることを確認した。
(3) The obtained transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Comparative Example 1 (1-4), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed as in Comparative Example 1 (1-5). It was done in the same way. As a result, it was confirmed that the polynucleotide obtained in (1) was inserted into all expression vectors.
実施例23 FpL_C3KX 7eアミノ酸置換体のアルカリ安定性評価
(1)FpL_C3KX 7eおよび実施例22で作製したFpL_C3KX 7eア
ミノ酸置換体(計10種類)のいずれかを発現する形質転換体を、比較例1(2-1)か
ら(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)に記載の方法でタンパク質抽出
液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した
。
Example 23 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 7e amino acid substituted product (1) Transformants expressing either FpL_C3KX 7e or FpL_C3KX 7e amino acid substituted product produced in Example 22 (10 types in total) were transformed into Comparative Example 1 ( The cells were cultured in the same manner as in 2-1) to (2-2), and a protein extract was prepared in the manner described in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2)(1)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(2) The supernatant clarified in (1) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(3)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(3) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(4)処理に用いたNaOHの濃度を1.0M(終濃度0.5M)に、処理時間を15
時間に、それぞれした他は、参考例2(11)と同様な方法でアルカリ処理後、参考例2
(12)と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
結果を表22に示す。本実施例で評価したFpL_C3KX 7eアミノ酸置換体はい
ずれも天然型のFpL_C3(配列番号1)よりアルカリ安定性が向上したFpL_C3
KX 7e(配列番号175)と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
(4) The concentration of NaOH used in the treatment was 1.0M (final concentration 0.5M), and the treatment time was 15
After the alkali treatment in the same manner as in Reference Example 2 (11), except that the time was changed, Reference Example 2
The residual activity was calculated in the same manner as in (12), and the alkali stability was evaluated.
The results are shown in Table 22. All of the FpL_C3KX 7e amino acid substituted products evaluated in this example are FpL_C3 with improved alkaline stability than the natural type FpL_C3 (SEQ ID NO: 1).
It can be said that the alkali stability is improved compared to KX 7e (SEQ ID NO: 175).
実施例24 本発明の免疫グロブリン結合性タンパク質へのアミノ酸置換の集積
(1)アミノ酸置換集積体の設計
実施例17および23で明らかになった免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安
定性向上に関与するアミノ酸置換、および/または実施例19で明らかになった免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の免疫グロブリン溶出性向上に関与するアミノ酸置換を、FpL
_C3KX 7e(配列番号175)に対し集積した。具体的には、以下の<c>から<
i>に示す7種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
<c>FpL_C3KX 7eに対し、Ile23ArgおよびAsn44Argのアミ
ノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号207、FpL_C3KX 9aと命名)
<d>FpL_C3KX 7eに対し、Ile23ArgおよびAsn44Hisのアミ
ノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号208、FpL_C3KX 9bと命名)
<e>FpL_C3KX 7eに対し、Ile23ArgおよびIle64Leuのアミ
ノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号209、FpL_C3KX 9cと命名)
<f>FpL_C3KX 7eに対し、Asn44ArgおよびIle64Leuのアミ
ノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号210、FpL_C3KX 9dと命名)
<g>FpL_C3KX 7eに対し、Asn44HisおよびIle64Leuのアミ
ノ酸置換を導入したタンパク質(配列番号211、FpL_C3KX 9eと命名)
<h>FpL_C3KX 7eに対し、Ile23Arg、Asn44Arg、Lys(
Arg)48HisおよびIle64Leuのアミノ酸置換を導入したタンパク質(配列
番号212、FpL_C3KX 10aと命名)
<i>FpL_C3KX 7eに対し、Ile23Arg、Asn44His、Lys(
Arg)48HisおよびIle64Leuのアミノ酸置換を導入したタンパク質(配列
番号213、FpL_C3KX 10bと命名)
Example 24 Accumulation of amino acid substitutions in the immunoglobulin binding protein of the present invention (1) Design of amino acid substitution accumulation Amino acids involved in improving the alkaline stability of the immunoglobulin binding protein revealed in Examples 17 and 23 FpL
_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175). Specifically, from <c> to <
Seven types of immunoglobulin-binding proteins shown in i> were designed and produced.
<c> Protein with amino acid substitutions of Ile23Arg and Asn44Arg introduced into FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 207, named FpL_C3KX 9a)
<d> Protein with amino acid substitutions of Ile23Arg and Asn44His introduced into FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 208, named FpL_C3KX 9b)
<e> Protein with amino acid substitutions of Ile23Arg and Ile64Leu introduced into FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 209, named FpL_C3KX 9c)
<f> Protein with Asn44Arg and Ile64Leu amino acid substitutions introduced into FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 210, named FpL_C3KX 9d)
<g> Protein with Asn44His and Ile64Leu amino acid substitutions introduced into FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 211, named FpL_C3KX 9e)
<h>For FpL_C3KX 7e, Ile23Arg, Asn44Arg, Lys(
Arg) Protein with amino acid substitutions of 48His and Ile64Leu introduced (SEQ ID NO: 212, named FpL_C3KX 10a)
<i>For FpL_C3KX 7e, Ile23Arg, Asn44His, Lys(
Arg) Protein with amino acid substitutions of 48His and Ile64Leu introduced (SEQ ID NO: 213, named FpL_C3KX 10b)
(2)FpL_C3KX 7eアミノ酸置換集積体の作製
以下、前記<c>から<i>に示す7種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法
について説明する。
(2) Preparation of FpL_C3KX 7e amino acid substitution assembly The method for producing the seven types of immunoglobulin binding proteins shown in <c> to <i> above will be described below.
<c>FpL_C3KX 9a
<c-1>FpL_C3KX 9a(配列番号207)をコードするポリヌクレオチド
(配列番号214)を合成した。なお、合成する際、5’末端側には制限酵素NcoIの
認識配列(5’-CCATGG-3’)を、3’末端側にはヒスチジン6残基をコードす
るヌクレオチド配列(配列番号40)、終止コドンおよび制限酵素HindIIIの認識
配列(5’-AAGCTT-3’)を、それぞれ付加している。
<c>FpL_C3KX 9a
A polynucleotide (SEQ ID NO: 214) encoding <c-1>FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 207) was synthesized. When synthesizing, a recognition sequence for the restriction enzyme NcoI (5'-CCATGG-3') is placed on the 5' end, and a nucleotide sequence encoding 6 histidine residues (SEQ ID NO: 40) is placed on the 3' end. A stop codon and a recognition sequence for the restriction enzyme HindIII (5'-AAGCTT-3') are respectively added.
<c-2>比較例1(1-2)と同様の方法で、<c-1>で合成したポリヌクレオチ
ドを精製した。
<c-2> The polynucleotide synthesized in <c-1> was purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-2).
<c-3>比較例1(1-3)と同様な方法で、<c-2>で得たポリヌクレオチドと
予め制限酵素NcoIとHindIIIで消化したプラスミドpET-26bとをライゲ
ーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し
、培養した。
<c-3> In the same manner as in Comparative Example 1 (1-3), the polynucleotide obtained in <c-2> and plasmid pET-26b previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII are ligated, and then the ligation is performed. E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the product and cultured.
<c-4>得られた形質転換体を、比較例1(1-4)と同様な方法で培養およびプラ
スミド精製を行ない、発現ベクター(pET-FpL_C3KX 9aと命名)を取得後
、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、比較例1(1-5)と同様の方法で行
なった。
<c-4> The obtained transformant was cultured and plasmid purified in the same manner as in Comparative Example 1 (1-4) to obtain an expression vector (named pET-FpL_C3KX 9a). The nucleotide sequence of was analyzed in the same manner as in Comparative Example 1 (1-5).
配列解析の結果、発現ベクターpET-FpL_C3KX 9aにFpL_C3KX
9a(配列番号207)をコードするポリヌクレオチド(配列番号214)が挿入されて
いることを確認した。
As a result of sequence analysis, FpL_C3KX was found in the expression vector pET-FpL_C3KX 9a.
It was confirmed that the polynucleotide (SEQ ID NO: 214) encoding 9a (SEQ ID NO: 207) was inserted.
<d>FpL_C3KX 9b
免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、FpL_C3
KX 9b(配列番号208)をコードするポリヌクレオチド(配列番号215)を用い
た他は、(a)と同様な方法で形質転換体および発現ベクター(pET-FpL_C3K
X 9bと命名)を取得した。発現ベクターpET-FpL_C3KX 9bのヌクレオ
チド配列解析の結果、pET-FpL_C3KX 9bにFpL_C3KX 9b(配列
番号208)をコードするポリヌクレオチド(配列番号215)が挿入されていることを
確認した。
<d>FpL_C3KX 9b
FpL_C3 as a polynucleotide encoding an immunoglobulin binding protein
Transformants and expression vector (pET-FpL_C3K
X 9b) was obtained. As a result of nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 9b, it was confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 215) encoding FpL_C3KX 9b (SEQ ID NO: 208) was inserted into pET-FpL_C3KX 9b.
<e>FpL_C3KX 9c
免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、FpL_C3
KX 9c(配列番号209)をコードするポリヌクレオチド(配列番号216)を用い
た他は、(a)と同様な方法で形質転換体および発現ベクター(pET-FpL_C3K
X 9cと命名)を取得した。発現ベクターpET-FpL_C3KX 9cのヌクレオ
チド配列解析の結果、pET-FpL_C3KX9eにFpL_C3KX 9c(配列番
号209)をコードするポリヌクレオチド(配列番号216)が挿入されていることを確
認した。
<e>FpL_C3KX 9c
FpL_C3 as a polynucleotide encoding an immunoglobulin binding protein
Transformants and expression vector (pET-FpL_C3K
X 9c) was obtained. As a result of nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 9c, it was confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 216) encoding FpL_C3KX 9c (SEQ ID NO: 209) was inserted into pET-FpL_C3KX9e.
<f>FpL_C3KX 9d
免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、FpL_C3
KX 9d(配列番号210)をコードするポリヌクレオチド(配列番号217)を用い
た他は、(a)と同様な方法で形質転換体および発現ベクター(pET-FpL_C3K
X 9dと命名)を取得した。発現ベクターpET-FpL_C3KX 9dのヌクレオ
チド配列解析の結果、pET-FpL_C3KX 9dにFpL_C3KX 9d(配列
番号210)をコードするポリヌクレオチド(配列番号217)が挿入されていることを
確認した。
<f>FpL_C3KX 9d
FpL_C3 as a polynucleotide encoding an immunoglobulin binding protein
Transformants and expression vector (pET-FpL_C3K
X 9d) was obtained. As a result of nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 9d, it was confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 217) encoding FpL_C3KX 9d (SEQ ID NO: 210) was inserted into pET-FpL_C3KX 9d.
<g>FpL_C3KX 9e
免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、FpL_C3
KX 9e(配列番号211)をコードするポリヌクレオチド(配列番号218)を用い
た他は、(a)と同様な方法で形質転換体および発現ベクター(pET-FpL_C3K
X 9eと命名)を取得した。発現ベクターpET-FpL_C3KX 9eのヌクレオ
チド配列解析の結果、pET-FpL_C3KX 9eにFpL_C3KX 9e(配列
番号211)をコードするポリヌクレオチド(配列番号218)が挿入されていることを
確認した。
<g>FpL_C3KX 9e
FpL_C3 as a polynucleotide encoding an immunoglobulin binding protein
Transformants and expression vector (pET-FpL_C3K
X 9e) was acquired. As a result of nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 9e, it was confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 218) encoding FpL_C3KX 9e (SEQ ID NO: 211) was inserted into pET-FpL_C3KX 9e.
<h>FpL_C3KX 10a
免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、FpL_C3
KX 10a(配列番号212)をコードするポリヌクレオチド(配列番号219)を用
いた他は、(a)と同様な方法で形質転換体および発現ベクター(pET-FpL_C3
KX 10aと命名)を取得した。発現ベクターpET-FpL_C3KX 10aのヌ
クレオチド配列解析の結果、pET-FpL_C3KX 10aにFpL_C3KX 1
0a(配列番号212)をコードするポリヌクレオチド(配列番号219)が挿入されて
いることを確認した。
<h>FpL_C3KX 10a
FpL_C3 as a polynucleotide encoding an immunoglobulin binding protein
Transformants and expression vector (pET-FpL_C3
KX 10a) was obtained. As a result of nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 10a, FpL_C3KX 1 was found in pET-FpL_C3KX 10a.
It was confirmed that the polynucleotide (SEQ ID NO: 219) encoding Oa (SEQ ID NO: 212) was inserted.
<i>FpL_C3KX 10b
免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、FpL_C3
KX 10b(配列番号213)をコードするポリヌクレオチド(配列番号220)を用
いた他は、(a)と同様な方法で形質転換体および発現ベクター(pET-FpL_C3
KX 10bと命名)を取得した。発現ベクターpET-FpL_C3KX 10bのヌ
クレオチド配列解析の結果、pET-FpL_C3KX 10bにFpL_C3KX 1
0b(配列番号213)をコードするポリヌクレオチド(配列番号220)が挿入されて
いることを確認した。
<i>FpL_C3KX 10b
FpL_C3 as a polynucleotide encoding an immunoglobulin binding protein
Transformants and expression vector (pET-FpL_C3
KX 10b) was obtained. As a result of nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 10b, FpL_C3KX 1 was found in pET-FpL_C3KX 10b.
It was confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 220) encoding 0b (SEQ ID NO: 213) was inserted.
実施例25 FpL_C3KX 8bアミノ酸置換体の酸溶出性評価
(1)FpL_C3KX 7e(配列番号175)ならびに実施例24で作製したFp
L_C3KX 9a(配列番号207)、FpL_C3KX 9b(配列番号208)、
FpL_C3KX 9c(配列番号209)、FpL_C3KX 9c(配列番号210
)、FpL_C3KX 9d(配列番号211)、FpL_C3KX 10a(配列番号
212)およびFpL_C3KX 10b(配列番号213)のいずれかを発現する形質
転換体を、比較例1(1-1)から(1-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3
)に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清
をフィルターに通し、清澄化した。
Example 25 Acid elution evaluation of FpL_C3KX 8b amino acid substitution product (1) FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175) and Fp produced in Example 24
L_C3KX 9a (SEQ ID NO: 207), FpL_C3KX 9b (SEQ ID NO: 208),
FpL_C3KX 9c (SEQ ID NO: 209), FpL_C3KX 9c (SEQ ID NO: 210
), FpL_C3KX 9d (SEQ ID NO: 211), FpL_C3KX 10a (SEQ ID NO: 212), and FpL_C3KX 10b (SEQ ID NO: 213) were transformed into Comparative Examples 1 (1-1) to (1-2). Comparative Example 1 (2-3
A protein extract was prepared by the method described in ). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(2)(1)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(2) The supernatant clarified in (1) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(3)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(3) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding protein contained in the fractions was quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(4)各タンパク質の濃度が等しくなるよう、TBSを用いて希釈した。希釈液を二等
分し、実施例2(4)に記載のELISA法(酸溶出性評価)によって、一方には0.0
5M クエン酸ナトリウム(NaOAc)緩衝液(pH3.2)で5分間酸処理し、もう
一方にはTBS(酸未処理)を添加した際の抗体結合活性を測定した。酸処理した免疫グ
ロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、酸未処理の免疫グロブリン結合性タンパク
質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。1より残存活性を減ずることで溶
出率を算出し、酸溶出性を評価した。
(4) Each protein was diluted with TBS so that the concentration was equal. The diluted solution was divided into two equal parts, and one part was treated with 0.0
Antibody binding activity was measured after acid treatment with 5M sodium citrate (NaOAc) buffer (pH 3.2) for 5 minutes and addition of TBS (no acid treatment) to the other side. Residual activity was calculated by dividing the antibody binding activity of the acid-treated immunoglobulin binding protein by the antibody binding activity of the acid-untreated immunoglobulin binding protein. The elution rate was calculated by subtracting the residual activity from 1, and the acid elution property was evaluated.
結果を表23に示す。FpL_C3KX 9a(配列番号207)、FpL_C3KX
9b(配列番号208)、FpL_C3KX 9c(配列番号209)、FpL_C3
KX 9d(配列番号210)、FpL_C3KX 9e(配列番号211)、FpL_
C3KX 10a(配列番号212)およびFpL_C3KX 10b(配列番号213
)は、FpL_C3KX 7e(配列番号175)と比較し、溶出率が高くなっており、
これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸による溶出性が向上していることが確
認された。中でもFpL_C3KX 9a(配列番号207)およびFpL_C3KX
10a(配列番号212)は、酸に対する溶出性が特に向上していることがわかる。
The results are shown in Table 23. FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 207), FpL_C3KX
9b (SEQ ID NO: 208), FpL_C3KX 9c (SEQ ID NO: 209), FpL_C3
KX 9d (SEQ ID NO: 210), FpL_C3KX 9e (SEQ ID NO: 211), FpL_
C3KX 10a (SEQ ID NO: 212) and FpL_C3KX 10b (SEQ ID NO: 213)
) has a higher elution rate compared to FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175),
It was confirmed that the acid elution properties of these mutant immunoglobulin-binding proteins were improved. Among them FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 207) and FpL_C3KX
It can be seen that 10a (SEQ ID NO: 212) has particularly improved acid dissolution properties.
実施例26 FpL_C3KX 7eへの変異導入およびライブラリ作製(その3)
(1)FpL_C3KX 7e(配列番号175)を発現するベクターpET-FpL
_C3KX 7eを鋳型として、15番目および34番目のアミノ酸残基に対する飽和置
換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例1(2)と同様、22c-Trick
法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバー
スPCRができるように設計した(配列番号221から232)。これらのプライマーを
一箇所の置換につき6本一組として、表1および表24の組成で混合し、PCR Pri
mer混合液(Forward/Reverse primer mix)を調製した。
Example 26 Mutation introduction into FpL_C3KX 7e and library construction (Part 3)
(1) Vector pET-FpL expressing FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175)
A saturated substitution library for the 15th and 34th amino acid residues was created using _C3KX 7e as a template. The primer was 22c-Trick as in Example 1 (2).
According to the method, an appropriate mixed base was placed at the site of mutation introduction, and it was designed to perform inverse PCR centered on the site of mutation introduction (SEQ ID NOS: 221 to 232). These primers were mixed as a set of 6 primers per substitution in Table 1 and Table 24, and PCR Pri
A mer mixture (Forward/Reverse primer mix) was prepared.
(2)pET-FpL_C3KX 7eを鋳型DNAとした他は、実施例2(2-2)
と同様な方法でインバースPCRによる部位特異的変異導入を行った。
(2) Example 2 (2-2) except that pET-FpL_C3KX 7e was used as the template DNA
Site-directed mutagenesis was performed by inverse PCR in the same manner as described above.
(3)得られたPCR産物を精製後、反応液を用いて大腸菌BL21(DE3)株を形
質転換し、50μg/mLのカナマイシンを含むLBプレート培地で培養(37℃、16
時間)した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
(3) After purifying the obtained PCR product, E. coli BL21 (DE3) strain was transformed using the reaction solution, and cultured in LB plate medium containing 50 μg/mL kanamycin (37°C, 16
The colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
実施例27 FpL_C3KX 7eアミノ酸置換体のスクリーニング(その3)
(1)pET-FpL_C3KX 7e(形質転換体)および実施例26で作製したラ
ンダム変異体ライブラリ(形質転換体)で作製した部位特異的アミノ酸置換体ライブラリ
(形質転換体)を、実施例2(1)から(2)と同様な方法で培養後、実施例15(2)
に記載のアルカリ処理を行なった。
Example 27 Screening for FpL_C3KX 7e amino acid substitution product (Part 3)
(1) A site-specific amino acid substitution library (transformant) prepared using pET-FpL_C3KX 7e (transformant) and the random mutant library (transformant) prepared in Example 26 was used in Example 2 (transformant). ) to Example 15 (2) after culturing in the same manner as (2).
The alkali treatment described in .
(2)アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を
実施例2(4)に記載のELISA法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロ
ブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブ
リン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
(2) The antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkali was measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein when treated with alkaline was determined by the ELISA method described in Example 2 (4). Residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin binding protein without alkali treatment.
(3)約200株の形質転換体を評価し、その中からFpL_C3KX 7e(配列番
号175)と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現
する形質転換体を選択した。
(3) Approximately 200 transformants were evaluated, and transformants expressing an immunoglobulin-binding protein with improved alkaline stability compared to FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175) were selected from among them.
(4)選択した形質転換体を培養し、QIAprep Spin Miniprep
kit(QIAGEN社製)を用いて発現ベクターを調製した。
(4) Cultivate the selected transformant and apply QIAprep Spin Miniprep.
An expression vector was prepared using a kit (manufactured by QIAGEN).
(5)得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードす
るポリヌクレオチド領域の配列を比較例1(1-5)に記載の方法によりヌクレオチド配
列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
(5) Analyze the nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector by the method described in Comparative Example 1 (1-5), and identify the amino acid mutation locations. Identified.
(6)(3)で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または
pET-FpL_C3KX 7e(配列番号175)を発現する形質転換体を、比較例1
(2-1)から(2-2)と同様な方法で培養し、比較例1(2-3)と同様な方法でタ
ンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し
、清澄化した。
(6) A transformant expressing the immunoglobulin binding protein selected in (3) or a transformant expressing pET-FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175) was used in Comparative Example 1.
Culture was performed in the same manner as in (2-1) to (2-2), and a protein extract was prepared in the same manner as in Comparative Example 1 (2-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
(7)(6)で清澄化した上清を、実施例7(7)に記載の方法で精製し、免疫グロブ
リン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
(7) The supernatant clarified in (6) was purified by the method described in Example 7 (7), and a fraction corresponding to immunoglobulin-binding protein was collected.
(8)回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリ
ン結合性タンパク質を定量した。またSDS-PAGEも実施し、選択した免疫グロブリ
ン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
(8) The absorbance of the collected fractions was measured using a spectrophotometer, and the immunoglobulin-binding proteins contained in the fractions were quantified. SDS-PAGE was also performed, and it was confirmed that the selected immunoglobulin-binding protein was purified to a high degree of purity.
(9)実施例25(4)と同様な方法で酸溶出性を評価した。 (9) Acid elubility was evaluated in the same manner as in Example 25 (4).
結果を表25に示す。配列番号175記載のアミノ酸配列において、少なくともAsn
15Val、Glu34Asp、Glu34Phe、Glu34LeuおよびGlu34
Valより選択される1以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は
FpL_C3KX 7e(配列番号175)と比較し、溶出率が高くなっており、これら
変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸による溶出性が向上していることが確認され
た。
The results are shown in Table 25. In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 175, at least Asn
15Val, Glu34Asp, Glu34Phe, Glu34Leu and Glu34
Immunoglobulin-binding proteins with one or more amino acid substitutions selected from Val have a higher elution rate than FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 175), and acid elution of these mutant immunoglobulin-binding proteins It was confirmed that the performance was improved.
Claims (10)
(A)請求項1に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド;
(B)請求項1に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター。 A genetically modified host comprising the following (A) or (B):
(A) a polynucleotide encoding the protein according to claim 1 ;
(B) An expression vector comprising a polynucleotide encoding the protein according to claim 1 .
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