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JP6991977B2 - 修飾デンドリマーナノ粒子ワクチン送達用組成物及び方法 - Google Patents

修飾デンドリマーナノ粒子ワクチン送達用組成物及び方法 Download PDF

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JP6991977B2
JP6991977B2 JP2018534517A JP2018534517A JP6991977B2 JP 6991977 B2 JP6991977 B2 JP 6991977B2 JP 2018534517 A JP2018534517 A JP 2018534517A JP 2018534517 A JP2018534517 A JP 2018534517A JP 6991977 B2 JP6991977 B2 JP 6991977B2
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ロバート エス. ランジャー
ジャスデイヴ エス. チャハル
ヒッデ プローグ
デイヴィッド エー. カナー
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Description

関連出願の相互参照
本願は、その全体を本明細書に援用する、2015年9月23日に出願された、米国特許出願第62/222,515号の優先権を主張するものである。
連邦政府によって支援された研究又は開発に関する記載
本発明は、国立衛生研究所によってDaniel G.Anderson及びRobert S.Langerに授与されたNIH助成金番号CCNE6924942、並びに米軍によってDaniel G.Anderson及びRobert S.Langerに授与されたJoint Warfighter Medical Research Program助成金番号6930216に基づく政府支援によって成された。米国政府は、本発明における一定の権利を有する。
本発明は、一般に分子送達システムの分野に関し、より詳細には、核酸、抗原又は小分子を対象に送達して、疾患及び/又は病状を予防又は治療するためのデンドリマーナノ粒子に関する。
ワクチン接種は、依然として、感染症を防止する最も有効な方法である。世界保健機構(WHO:World Health Organization)の報告によれば、認可ワクチンは、現在、25の感染症を防止するのに、又は防止及び抑制に寄与するのに、利用可能である(非特許文献1)。
しかし、現行のペプチドワクチン抗原送達手法は、迅速な製造能力、並びに免疫応答のタイプ、持続期間及び効力に影響する関連工学パラメータが制限された技術に頼ることが多い。一部のワクチン戦略は、タンパク質抗原を有効に使用するものの、カスタムペプチドは、免疫原性を欠き大規模な免疫賦活を必要とすることが多く、インビトロスクリーニングツールとして最も有用であるかもしれない。
最近、RNAが魅力的な抗原ベクターとして出現した。mRNAがマウスモデルに使用され、短い(<30aa)新抗原配列の免疫療法の可能性を示した(非特許文献2)。しかし、免疫処置用ベクターとして、純粋なmRNAが、特に癌免疫療法の分野で研究され、様々な成功をおさめた。裸のmRNAの投与は、リンパ節に直接注射すると、抗腫瘍免疫を与えることができる(非特許文献3、4)。大型複製RNA(repRNA)も、ワクチン抗原を細胞に送達するために開発された。repRNAは、宿主細胞のリボソーム機構と相互作用することによって、翻訳及び複製する。したがって、RepRNAは、翻訳RNA分子数を増加させ、ひいては、抗原産生回数を増加させてmRNAよりも長い抗原発現を誘発するテンプレートを与える(非特許文献5)。
しかし、精製RNAは、周知のように不安定であり、例えば、ヌクレアーゼ、ヒドロキシラジカル、UV光、及びMg2+媒介性の系内攻撃によって、極度に劣化しやすい。さらに、細胞膜を通る移動の制限、及び大幅な肝臓での除去によって、siRNA、mRNA、特に大型複製RNAなどのRNAベースの医薬化合物の適用可能性が極度に制限される。RepRNAの翻訳とそれに続く複製の両方によって、RepRNAは、リボソーム侵入又は遺伝子翻訳を容易に破壊し得るリボヌクレアーゼに特に敏感になる。したがって、完全な、機能的に生存可能なRNA分子を細胞内に送達することは、RNAベースの技術を治療に応用するのに中核的な難題として残っている。
非感染性ビリオン、ウイルス様粒子(VLP:virus-like particles)などの弱毒生ウイルスに基づくワクチンの開発は、ある程度成功している。残念ながら、現行の弱毒生ウイルスに基づくワクチン製造法は、長い製造時間を必要とする。受精卵に基づく方法、及びより新しい細胞バイオリアクター法は、数か月のリードタイムを必要とする。製造では、VLPは、培養細胞にも依存する。アデノウイルス、AAV、CMV、rVSV及び種々のアルファウイルスに基づくウイルス様粒子の形で投与される遺伝子ワクチンは、繰り返し投与を妨げる既存の、又は誘導される抗ベクター免疫のために、使用が制限される。
核酸及びタンパク質を哺乳動物細胞に送達する能力は、カチオン性ポリマー(CP:cationic polymer)の「ポリプレックス」などの生体材料ナノ粒子を用いても示された。しかし、CPポリプレックス及び関連核酸は、塩及び血清成分によって不安定化されることが多く、生理学的流体中で分解又は凝集することもあり(非特許文献6、7)、カプセル剤を細胞に生体内送達するビヒクルとして非効率的と考えられる。さらに、多くのカチオン性ポリマーは、細胞毒性を示す(非特許文献7~11)。
種々のナノ粒子形式が、皮内(非特許文献12)、脾臓内(非特許文献13)、皮下(非特許文献14)、静脈内(非特許文献12、15)、更には鼻腔内(非特許文献16)投与経路で有効性を示した。しかし、こうした手法で臨床試験に進んだのはほとんどない。ヒトにおける免疫防御の相関が報告されたものの、臨床効果は期待はずれであった(非特許文献17~20)。プロタミン複合型mRNAの投与は、インフルエンザ感染の皮内免疫マウス、フェレット及びブタモデルにおいて成功のきざしを示した(非特許文献21)。
repRNAなどの大型RNA分子に基づく治療法は、有効な生体内送達にとって更なる問題を提起した。RNA分子は、無修飾で放置されると細胞内分解しやすく、mRNA発現は一過性であり、RNA自体の固有の免疫原性のために翻訳抑制(非特許文献22~24)は、すべて、効力を制限する。ワクチンの配置に使用される送達化合物の免疫原性及び/又は毒性は、別の厄介な問題である。一部の用途に有効なカチオン性脂質は(非特許文献25)、より高用量で使用すると、また、不十分に複合化されると、有毒である(非特許文献26~28)。それらは、効率的送達のために高い正のゼータ電位に依存し、それは、生体内の血清中での中和のために制約要因になり得る(非特許文献29)。さらに、カチオン性脂質は免疫原性であり、それは、導入遺伝子発現を制限する可能性があり、安全を脅かす懸念を生じる(非特許文献30)。mRNAに反応したIFN産生は、実際、mRNAワクチンの効力を制限し得る(非特許文献31)。カチオン性脂質を用いて形成される脂質ナノ粒子も、一般に、その処方に追加の安定化剤を必要とし、最終製品のコスト及び複雑さが増す。
無処置の遺伝物質など、カプセル剤を対象の細胞中に効果的に送達する改善されたシステムが必要とされる。
世界保健機構、世界的ワクチン実行計画(Global Vaccine Action Plan)2011~2020、ジュネーブ、2012 Bhaduryら、Oncogenesis 2、e44、doi:10.1038/oncsis(2013) Kreiterら、Cancer Res70、9031~9040(2010) Van Lintら、Cancer Res72、1661~1671(2012) McCulloughら、Molecular Therapy-Nucleic Acids、3、e173(2014) Al-Dosariら、AAPSJ.11、671~681(2009) Tros de Ilarduyaら、Eur.J.Pharm.Sci.40、159~170(2010) Gaoら、Biomaterials32、8613~8625(2011) Felgnerら、J.Biol.Chem.269、2550~2561(1994) Kafilら、BioImpacts1、23~30(2011) Lvら、J Contr.Rel.114、100~109(2006) Hoerrら、Eur J Immunol、30、1~7(2000) Zhouら、Hum Gene Ther、10、2719~2724(1999) Pollard、C.ら、Mol Ther、21、251~259(2013) Mockeyら、Cancer Gene Ther、14、802~814(2007) Phuaら、Sci Rep、4、5128(2014) Weideら、J Immunother、31、180~188(2008) Weideら、J Immunother、32、498~507(2009) Rittigら、Mol Ther、19、990~999(2011) Kreiterら、Curr Opin Immunol、23、399~406(2011) Petschら、Nat Biotechnol、30、1210~1216(2012) Karikoら、J Biol Chem、279、12542~12550(2004) Pichlmairら、Science、314、997~1001(2006) Levinら、J Biol Chem、256、7638~7641(1981) Geallら、Proc Natl Acad Sci USA、109、14604~14609(2012) Hoflandら、Proc Natl Acad Sci USA、93、7305~7309(1996) Liら、Gene Ther5、930~937(1998) Lvら、J Control Release、114、100~109(2006) Mirskaら、Colloids Surf B Biointerfaces、40、51~59(2005) Henriksen-Laceyら、Mol Pharm、8、153~161(2011) Pollardら、Mol Ther、21、251~259(2013)
したがって、本発明の一目的は、免疫原性及び細胞毒性を極力、又は全く発揮しない送達ビヒクルによって、核酸、タンパク質及び小分子を細胞内送達するための組成物及び方法を提供することである。
本発明の更なる一目的は、2個以上のrepRNA分子を細胞の内部に同時に送達するための方法及び組成物を提供することである。
本発明の更なる一目的は、標的宿主細胞による外来遺伝子の持続的発現のための組成物、方法及び装置を提供することである。
本発明の更なる一目的は、治療用分子を対象の細胞に送達するための方法及び組成物を提供することである。
大型repRNA分子を含めて、核酸、抗原、小分子などの治療薬、予防薬及び/又は診断薬を対象に送達するための修飾デンドリマーナノ粒子(「MDNP」:Modified dendrimer nanoparticle)を提供し、対象の細胞に開発された。MDNPは、細胞内抗原に対する抗原特異的CD8+T細胞を効率的に増殖させ、特異抗原に対する抗体応答を増強する。ナノ粒子は、1種以上のアルキル化デンドリマーと、疎水性端部を介してNPに結合したPEG-脂質ポリマーなどの1種以上の両親媒性ポリマーと、送達される治療薬、予防薬又は診断薬とを含む。
送達される薬剤は、一般に、ポリヌクレオチド、タンパク質若しくはペプチド、又は小分子である。好ましい例としては、複製RNA、最も好ましくは、抗原をコードする複製RNAが挙げられる。一部の実施形態においては、ナノ粒子は、対象の細胞中で異なる速度で発現され得る同じ又は異なる抗原をコードし得る2個以上の複製RNAを含む。一部の実施形態においては、ナノ粒子は、1個以上の複製RNA及び1個以上のメッセンジャーRNAを含む。メッセンジャーRNAの1個以上は、複製RNAの5’及び3’非翻訳領域を含むように修飾することができる。
別の実施形態においては、ナノ粒子は、マイクロRNA(miRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、少なくとも24ヌクレオチド長である二本鎖RNA(dsRNA)などの対応する標的遺伝子に対する干渉作用を生じ得る1個以上のRNAを含む。一部の実施形態においては、RNAは、RNA:デンドリマー約5:1のモル比でナノ粒子内に含まれる。ナノ粒子は、一般に、サイズが30nm~450nm(両端を含む)、好ましくは60nm~190nm(両端を含む)である。
一般に、ナノ粒子は、ポリプロピレンイミンテトラミン、ポリ(アミドアミン)などの1種以上のアルキル化デンドリマーで形成される。例示的なアルキル化デンドリマーとしては、第1~7世代デンドリマーが挙げられる。一部の実施形態においては、デンドリマーの1種以上がエポキシド末端アルキル鎖の付加によって修飾される。エポキシド末端アルキル鎖は、サイズが1~30個の炭素(両端を含む)、好ましくは6~16個の炭素(両端を含む)の範囲、最も好ましくは6個の炭素であり得る。
一部の実施形態においては、疎水性固定化ポリマーのポリマー成分は、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ(プロピレングリコール)(PPG)、及びエチレングリコールとプロピレングリコールのコポリマー、多糖類、又はコポリマー、及びそれらの混合物であり得る。一部の実施形態においては、疎水性固定化ポリマーのポリマー成分は、分子量120Da~25,000Da(両端を含む)、好ましくは2,000Daのポリエチレングリコールである。ある実施形態においては、疎水性固定化ポリマーは、1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000]である。一般に、ナノ粒子のデンドリマーとポリエチレングリコールの質量比は、20:1~5:1、好ましくは11.5:1である。一部の実施形態においては、ナノ粒子は、約10~15,000ヌクレオチド長である1個以上のリボ核酸配列を含む。デンドリマーとリボ核酸の質量比は、10:1~1.5:1、好ましくは5:1とすることができる。
対象に投与するための、核酸、抗原又は小分子の送達のためのナノ粒子、及び薬学的に許容される賦形剤を含む、ワクチンも提供される。一部の実施形態においては、ワクチンは、1種以上の抗原を対象の細胞中で異なる速度で発現する2個以上の複製RNAを含むナノ粒子を含む。
RNAペイロードの略図である。複製RNAの「全レプリコン」を示し、右から左に、5’キャップ、5’非翻訳領域、それぞれnsP1、nsP2、nsP3及びnsP4ドメインを含む多サブユニットRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)、抗原、3’非翻訳領域及び3’ポリ(A)テールを示す。全レプリコンRNAからRdRpによって産生される複数の末端mRNA転写産物が、全レプリコンの下に示され、右から左に、それぞれ5’キャップ、抗原、3’非翻訳領域及び3’ポリ(A)テールを含む。 RNAペイロードの略図である。図1Aと同じ複製RNAの「全レプリコン」を含むペイロード、及び複製mRNAによってコードされたRdRpと同じ非翻訳領域を含むメッセンジャーRNA(mRNA)構築物を示す。全レプリコンとmRNA構築物の両方からRdRpによって産生される複数の末端mRNA転写産物が、全レプリコンの下に示され、右から左に、それぞれ5’キャップ、抗原、3’非翻訳領域及び3’ポリ(A)テールを含む。 RNAペイロードの略図である。siRNA、mRNA及びレプリコンRNAそれぞれの相対的サイズを示す模式図である。 細胞内カーゴの送達のための3成分系を示す略図である。PEIデンドリマーの第1~3世代(G1~G3)の分子構造。 細胞内カーゴの送達のための3成分系を示す略図である。DAB-Am4デンドリマーの第1~4世代(G1~G4)の分子構造。 細胞内カーゴの送達のための3成分系を示す略図である。PAMAMデンドリマーの第0~3世代(G0~G3)の分子構造。 細胞内カーゴの送達のための3成分系を示す略図である。PAMAMデンドリマーの第0~3世代(G0~G3)の分子構造。 細胞内カーゴの送達のための3成分系を示す略図である。イオン性デンドリマー系ナノ材料を処方するのに使用することができるC6~C18のサイズのエポキシドの分子構造。 細胞内カーゴの送達のための3成分系を示す略図である。RNAカプセル剤を含む3成分(イオン性デンドリマー、脂質固定化PEG及びRNA)を示す図である。 層状のデンドリマー材料(12)、疎水性(16)成分と親水性(18)成分を含む両親媒性ポリマー(14)、及びカプセルRNA(20)を含むように図2Bに示したように処方される修飾デンドリマー系ナノ粒子(10)の図である。 対数目盛のMDNP(修飾デンドリマーナノ粒子)直径(nm)に対する強度(%)を示す線グラフである。エラーバー±S.D.及びn=3。 非形質転換BHK細胞、従来のmRNA並びにVEE及びSFVゲノムに基づくレプリコンRNAで形質転換されたBHK細胞によって媒介された、BHK細胞におけるホタルルシフェラーゼ活性(RLU)を示すヒストグラムである。技術的3つ組のエラーバー±S.D.。 それぞれPG1.C12(▲)、PG1.C15(●)、PEI(◇)、遊離RNA(■)及びPBS(x)の各々に対する、0~110分間の時間にわたる規準化FRETシグナル(0.9~1.7)を示す線グラフである。N=4~8及びエラーバー±S.D.。 1日、3日、20日及び30日それぞれの時点のナノ粒子ワクチン日数にわたる0~45,000の発光(任意の単位)を示すヒストグラムである。N=4及びエラーバー±S.D.。 例示的なワクチン接種計画を示す略図であり、修飾デンドリマーナノ粒子(30)、試験動物への筋肉内注射(32)、筋細胞における腫瘍関連抗原の産生及び放出(34)、それに続いて、抗原特異的抗体及び細胞傷害性T細胞の産生をもたらす、抗原に対する免疫応答(36)、免疫マウスへの腫瘍細胞の注入(40)による抗原を発現する腫瘍細胞の調製(38)、その結果、腫瘍細胞の認識(42)、及び免疫系による腫瘍細胞の破壊(44)を利用する。 それぞれ非免疫、裸のmRNA、裸のSFVrep、mRNA MDNP及びSFV MDNPの各々に対して、経時的に(n=2、曝露後10~28日)腫瘍サイズ(0~200mm)を示す線グラフである。 それぞれ非免疫、裸のmRNA、裸のSFVrep、mRNA MDNP及びSFV MDNPの各々に対して、経時的に(曝露後10~28日)マウス(n=10)の生存(%)を示す線グラフである。 遊離mRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 ナノカプセルmRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 遊離VEErepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 ナノカプセルVEErepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 遊離SFVrepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 ナノカプセルSFVrepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 負の対照と正の対照の両方に対するCFSEと細胞数を示すグラフである。検出可能なタンパク質発現を、各パネルにおいて、それぞれクロス(発現なし、図5Gの負の対照を参照)及び発現ありのチェック印(図5Gの正の対照を参照)で示す。 遊離mRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 ナノカプセルmRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 遊離VEErepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 ナノカプセルVEEVrepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 遊離SFVrepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 ナノカプセルSFVrepRNAのCFSEに対する数(細胞)を示すグラフである。 非免疫対照に対するCFSEと細胞数を示すグラフである。検出可能なタンパク質発現を、各図6A~6Gにおいて、発現なしのクロス(図6Gの負の対照を参照)及び発現ありのチェック印(図6D参照)で示す。 移入後4日目/ナノカプセルrepRNA VEEV-cOVA MDNP40μgで免疫後3日目のOT-1細胞の細胞数とCFSEを示す蛍光活性化細胞選別(FACS:fluorescence-activated cell sorting)のグラフである。実験結果は、2匹の試験動物、それぞれマウス1(図7A)及びマウス2(図7B)の各々の独立した実験で同じである。 移入後4日目/ナノカプセルrepRNA VEEV-cOVA MDNP40μgで免疫後3日目のOT-1細胞の細胞数とCFSEを示す蛍光活性化細胞選別(FACS:fluorescence-activated cell sorting)のグラフである。 3日目におけるOT1増殖を示すグラフであり、非免疫試料の各々、並びにそれぞれ裸のmRNA、MDNP mRNA、裸のVEEV、MDNP VEEV、裸のSFV及びMDNP SFVで免疫された試料の各々の増殖%を示す。 14日目におけるOT1増殖を示すグラフであり、非免疫試料の各々、並びにそれぞれ裸のmRNA、MDNP mRNA、裸のVEEV、MDNP VEEV、裸のSFV及びMDNP SFVで免疫された試料の各々の増殖%を示す。 それぞれPBS、5meC/ΨmRNA及びVEEV試料の各々において、OD650におけるI型IFN(□)及びII型IFN(■)の相対量を示すヒストグラムである。生物学的3つ組に対するエラーバー±SD。 それぞれ非免疫、MDNP VP40 40μg、裸のcOVA40μg、MDNPcOVA0.4μg、MDNPcOVA4μg及びMDNP40μgの各々に対する、非刺激細胞に対して規準化された、ペプチド刺激培養上清のIFNg濃度を示すヒストグラムである。 それぞれナノカプセルmRNA、SFV及びVEEからの経時的抗原産生を示す、発現の時間経過を示す図である。 層状のデンドリマー材料(52)、両親媒性ポリマー(54)を含み、各々異なる抗原(抗原A~C)をコードする3個のナノカプセルrepRNA(56)、(58)、(60)を含めた複数の核酸ペイロード、及び第4の抗原(抗原D)をコードするmRNA構築物(62)を含み、ナノカプセルrepRNA(64)の5’非翻訳配列がmRNA(66)と同じである、修飾デンドリマー系ナノ粒子(50)の略図である。 それぞれ非形質移入及びVEE HA形質移入試料の各々の細胞数(モードに対して規準化、0~100)とHAタンパク質数を示すグラフである。 それぞれcOVA免疫及びHA免疫動物の各々に対して経時的に(感染後日数)平均体重(感染前%)を示す線グラフである。安楽死カットオフは、80%感染前体重であり、線で示した。 各曝露前後のcOVA免疫マウスNo.1~3及びHA免疫マウスNo.1~3それぞれの450nmにおけるO.D.を示すヒストグラムである。 ワクチン接種(--)及び非ワクチン接種(・・・)マウスそれぞれに対するH1N1感染後(日数)の経時的生存%を示す線グラフである。 それぞれアジュバント(●)、GP(■)、GP/VP40(▲)及びアジュバント/GP/VP40(▼)を含む各試料の追加免疫後14日目における1/100希釈血清中のEBOV GP IgGのODを示す線グラフである。 非免疫対照(●、0/7)、GPで免疫された(■、6/7)、GP/VP40で免疫された(▲、6/7)、及びポリ/GP/VP40で免疫された(▼、4/7)動物それぞれに対する、エボラウイルス(EBOV)曝露後のマウス生存率を示す線グラフである。 それぞれ2回の40μg cOVA MDNP(対照)、2回の40μg裸のGPレプリコン(■)、2回の0.4μg GP MDNP(▲)、2回の4.0μg GP MDNP(▼)、2回の40μg GP MDNP(◆)、及び1回の40μg GP MDNP(○)の各々に対する抗体価を示すグラフである。 それぞれ2回の40μg cOVA MDNP(対照)、2回の40μg裸のGPレプリコン、2回の0.4μg GP MDNP、2回の4.0μg GP MDNP、2回の40μg GP MDNP、及び1回の40μg GP MDNPで非免疫された動物に対する、エボラウイルス(EBOV)曝露後のマウス生存率を示す線グラフである。 ワクチン接種(-)及び非ワクチン接種(対照)マウスそれぞれに対する、T.ゴンヂ(gondii)感染後(日数)の経時的生存%を示す線グラフである。 ワクチン接種(●)及び非ワクチン接種(□、対照)マウスそれぞれに対する、T.ゴンヂ感染後(日数)の経時的平均相対体重(%)を示す線グラフである。 ワクチン接種(T.ゴンヂ)及び非ワクチン接種(T.対照)マウスそれぞれに対する、T.ゴンヂ曝露後日数(0~175日)と生存%を示す線グラフである。 ワクチン接種(●)及び非ワクチン接種(□、T.対照)マウスそれぞれに対する、T.ゴンヂ感染後(0~175日)の経時的平均相対体重(%)を示す線グラフである。 2種のMDNPワクチン、すなわち、対照(ザイールエボラウイルスに対するNP製剤)及びZIKV(ジカウイルスに対するNP製剤)それぞれの各々に対する(IgG)抗体エンドポイント力価を示すグラフである。 OVA(対照)ペプチド又はZIKA(ジカウイルス由来のペプチド)それぞれによる刺激後の、独立に、2種のMDNPワクチン、すなわち、対照(ザイールエボラウイルスに対するNP製剤)及びZIKV(ジカウイルスに対するNP製剤)の各々に対する、免疫処置後のIFNγCD8+脾細胞パーセントを示すグラフである。 Hmga2+細胞で誘導される、ワクチンを用いた(▼)及び用いない(●)d>5、2<d<5及びd<2群の各々に対する、腫瘍数(0~6)と腫瘍直径(mm)を示すグラフである。 Hmga2-細胞で誘導される、ワクチンを用いた(▼)及び用いない(●)d>5、2<d<5及びd<2群の各々に対する、腫瘍数(0~6)と腫瘍直径(mm)を示すグラフである。
I.定義
「宿主細胞」という用語は、組換え発現ベクターを導入することができる原核及び真核細胞を指す。
「疎水性固定化ポリマー」、両親媒性ポリマー及び「脂質ポリマー」という用語は、1個以上の脂肪族基に共有結合したポリマーを指すのに区別なく使用される。
「デンドリマー」という用語は、内部コアと、この内部コアに結合し、内部コアから延びる繰返し単位の層(又は「世代」)とを有し、各層が1個以上の分岐点を有し、末端基の外面が最外側の世代に結合した、分子構造を含むように意図されるが、それに限定されない。デンドリマーは、規則性デンドリマー又は「星形」分子構造を有する。
「アルキル」という用語は、直鎖アルキル、アルケニル又はアルキニル基、分枝鎖アルキル、アルケニル又はアルキニル基、シクロアルキル、シクロアルケニル又はシクロアルキニル(脂環式)基、アルキル置換シクロアルキル、シクロアルケニル又はシクロアルキニル基、及びシクロアルキル置換アルキル、アルケニル又はアルキニル基を含めて、飽和又は不飽和脂肪族基を指す。別段の記載がない限り、直鎖又は分枝鎖アルキルは、その骨格に30個以下の炭素原子(例えば、直鎖の場合C1~C30、分枝鎖の場合C3~C30)、より好ましくは20個以下の炭素原子、好ましくは12個以下の炭素原子、最も好ましくは8個以下の炭素原子を有する。同様に、好ましいシクロアルキルは、その環構造中に3~10個の炭素原子を有し、より好ましくは環構造中に5、6又は7個の炭素を有する。アルキル基は、ハロゲン、ヒドロキシ、アミノ、チオ、エーテル、エステル、カルボキシ、オキソ及びアルデヒド基を含めて、ただしそれらに限定されない、1個以上の基で置換することもできる。アルキル基は、1個以上のヘテロ原子を含んでもよい。「低級アルキル」とは、1~6個の炭素、好ましくは1~5個の炭素、より好ましくは1~4個の炭素、最も好ましくは1~3個の炭素を意味する。
「アミン」及び「アミノ」という用語は、当該技術分野で認知されており、非置換アミンと置換アミンの両方、例えば、下記一般式で表すことができる部分を指す。
Figure 0006991977000001
式中、R、R10及びR’10は各々独立に、水素、アルキル、アルケニル、-(CH-Rであり、又はR及びR10は、それらが結合しているN原子と一緒に、4から8個の原子を環構造中に有する複素環を完成し、Rは、アリール、シクロアルキル、シクロアルケニル、複素環又は多環であり、mはゼロ又は1から8の整数である。好ましい実施形態においては、R又はR10の一方のみをカルボニルとすることができ、例えば、R、R10及び窒素は、一緒にイミドを形成しない。更により好ましい実施形態においては、「アミン」という用語は、例えばRとR10の一方がカルボニルである、アミドを包含しない。更により好ましい一実施形態においては、R及びR10(及び場合によってはR’10)は各々独立に、水素、アルキル若しくはシクロアルキル、アルケニル若しくはシクロアルケニル、又はアルキニルである。したがって、「アルキルアミン」という用語は、(アルキルに関して上述したような)置換又は非置換アルキルが結合した上記アミン基を指し、すなわち、RとR10の少なくとも一方はアルキル基である。
「アミド」という用語は、アミノ置換カルボニルとして当該技術分野で認知されており、下記一般式で表すことができる部分を含む。
Figure 0006991977000002
式中、R及びR10は、上で定義したとおりである。
「ナノ材料」という用語は、少なくとも1つの寸法が約1ナノメートル~1ミクロンである材料を指す。
「デンドリマー系ナノ粒子」又は「MDNP」という用語は、デンドリマー及び疎水性固定化ポリマー、並びに一般にペイロード分子を含む外面を含む、ナノスケール粒子、送達ビヒクルを指す。一般に、ペイロード分子は、粒子内に封入される。
「形質転換」及び「形質移入」という用語は、当該技術分野で公知の幾つかの技術による細胞への核酸(例えば、ベクター)の導入を包含する。
標的に「特異的に結合する」という用語は、他の生物学的製剤の不均一な集団の存在下で、分子の存在の決定因である結合反応を指す。
「移行シグナル」又は「局在配列」又は「認識配列」又は「ターゲティングシグナル」又は「認識配列」又は「認識タグ」又は「認識ポリヌクレオチド」は、区別なく使用され、特定の細胞、組織、細胞小器官又は細胞内領域に分子を誘導するシグナルを指す。シグナルは、ポリヌクレオチド、ポリペプチド若しくは炭水化物部分とすることができ、又は結合分子を所望の場所に誘導するのに十分な有機若しくは無機化合物とすることができる。
「ベクター」という用語は、挿入セグメントの複製を引き起こすように別の核酸配列セグメントをその中に挿入することができる複製RNA、プラスミド、ファージ、コスミドなどの核酸分子又はポリヌクレオチドを指す。上記ベクターは、発現ベクターとすることができる。
「複製RNA」、「repRNA」、「レプリコンmRNA」、「mRNAレプリコン」及び「レプリコンRNA」という用語は、区別なく使用され、感染性子孫ビリオンを産生することができない、複製能力のある、子孫のできないRNAウイルスゲノムを指す。一般にrepRNAとして使用するために修飾されるウイルスゲノムとしては、「プラス鎖」RNAウイルスが挙げられる。これらの修飾ウイルスゲノムは、複製のためのmRNAとテンプレートの両方として機能する。「発現ベクター」という用語は、1個以上の発現制御配列を含むベクターを指す。
「核酸」という用語は、ヌクレオチド及びヌクレオシドの任意の天然又は合成線状連続アレイ、例えば、相補DNA(cDNA)を含めたDNA、複製RNA(repRNA)、メッセンジャーRNA(mRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、転移RNA(tRNA)、マイクロRNA(miRNA)、ガイド鎖RNA(sgRNA)、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド及びそれらの誘導体を指す。こうした核酸を「構築物」又は「プラスミド」と総称する。核酸の代表例としては、ウイルスベクター、バクテリオファージ核酸由来のベクター、及び化学合成DNA又はRNAのような合成オリゴヌクレオチドなど、ただしそれらに限定されない、発現、クローニング、コスミド及び形質転換ベクターを含めた細菌プラスミドベクターが挙げられる。「核酸」という用語は、更に、5-ブロモウラシルなど、ただしそれだけでないハロゲン化ヌクレオチド、ビオチン標識ヌクレオチドなどの誘導体化ヌクレオチドなど、ただしそれらに限定されない、修飾又は誘導体化ヌクレオチド及びヌクレオシドも含む。
「遺伝子」又は「複数の遺伝子」という用語は、RNA全体、タンパク質全体、又はこうしたRNA全体若しくはタンパク質全体の任意の部分の合成用遺伝情報をコードするRNAとDNAの両方を含めて、単離又は修飾核酸配列を指す。特定の生物のゲノムの天然に一部ではない遺伝子は、「外来性遺伝子」、「異種遺伝子」又は「外来遺伝子」と称され、特定の生物のゲノムの天然に一部である遺伝子は「内在性遺伝子」と称される。ゲノムDNAに関連して使用される「遺伝子」という用語は、介在非翻訳領域及び調節領域を含み、5’及び3’末端を含むことができる。
「発現される」又は「発現」という用語は、遺伝子の2本の核酸鎖の一方の領域に少なくとも部分的に相補的なRNA核酸分子へのDNAからの転写を指す。「発現される」又は「発現」という用語は、タンパク質若しくはポリペプチド又はその一部を生じる前記RNA核酸分子からの翻訳も指す。
「抗原」という用語は、適応免疫応答の受容体の標的として働く任意の物質(例えば、病原体又は癌若しくは前癌細胞によって発現される、又はそれに関連する成分などのペプチド、タンパク質、核酸、脂質、小分子)を指す。抗原は、病原体、癌又は前癌細胞の構成成分であり得る。
「病原体」という用語は、疾患を引き起こす生物又は他の実体を指す。例えば、病原体は、プリオン、ウイルス、細菌などの原核生物、原生動物、真菌などの真核生物であり得る。病原体は、適応免疫応答を発生させることができる抗原源であり得る。
「ポリペプチド」という用語は、タンパク質及びその断片を含む。ポリペプチドは、アミノ酸残基配列として記述される。これらの配列は、アミノ(N)からカルボキシル(C)末端の方向に左から右に記述される。標準命名法に従って、アミノ酸残基配列は、以下に示すように3文字又は1文字表記で命名される:アラニン(Ala、A)、アルギニン(Arg、R)、アスパラギン(Asn、N)、アスパラギン酸(Asp、D)、システイン(Cys、C)、グルタミン(Gln、Q)、グルタミン酸(Glu、E)、グリシン(Gly、G)、ヒスチジン(His、H)、イソロイシン(Ile、I)、ロイシン(Leu、L)、リジン(Lys、K)、メチオニン(Met、M)、フェニルアラニン(Phe、F)、プロリン(Pro、P)、セリン(Ser、S)、スレオニン(Thr、T)、トリプトファン(Trp、W)、チロシン(Tyr、Y)及びバリン(Val、V)。
「抗体」という用語は、特に明示しない限り、最も広い意味で使用される。したがって、「抗体」は、天然、又は従来のハイブリドーマ技術によって製造されるモノクローナル抗体などの人工のものとすることができる。抗体としては、モノクローナル及びポリクローナル抗体、並びにこれらの抗体の抗原結合ドメイン及び/又は1個以上の相補性決定領域を含む断片が挙げられる。「抗体」とは、任意の形態の抗体又はその抗原結合断片を指し、モノクローナル抗体(完全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)及び抗体断片を含む。
「個体」、「個体」、「対象」及び「患者」という用語は、区別なく使用され、ヒト、マウス、ラットなどのげっ歯類、及び他の実験動物を含めて、ただしそれらに限定されない哺乳動物を指す。
「生体適合性」という用語は、それ自体が宿主(例えば、動物又はヒト)に有毒でなく、単量体若しくはオリゴマーのサブユニット又は他の副生物を有毒な濃度で宿主中で生成する速度で分解しない(ポリマーが分解する場合)、1種以上の材料を指す。
「薬学的に許容される担体」という用語は、任意のすべての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤及び抗真菌剤、等張化剤、吸収遅延剤などを含む。薬学的活性物質のためのこうした媒体及び剤の使用は、当該技術分野でよく知られている。従来の媒体又は薬剤が活性化合物に不適合な場合を除いて、治療用組成物におけるその使用が企図される。補充の活性化合物を組成物に混ぜ込むこともできる。
II.タンパク質、小分子及び核酸を細胞の内部に送達するための組成物
治療薬、予防薬及び診断薬を対象の細胞に送達するのを促進する組成物が開発された。核酸などの分子を細胞の内部に送達する効力は、抗原提示細胞による取り込み、ファゴソーム/リソソームエスケープ、核酸非パッケージング、細胞内移動などの障壁を克服することと強く相関する。遺伝物質の場合、持続的な遺伝子発現も考慮事項である。血流中で効果的に存続し、標的細胞による取り込みを可能にするには、送達ビヒクルは、免疫原性が最小でなければならない。臨床的に妥当であるためには、送達ビヒクルは、細胞毒性が最小でなければならない。
組成物は、無毒、非免疫原性、生分解性ナノ粒子内に封入又はカプセル化された治療薬、予防薬及び診断薬を含み、治療薬、予防薬及び診断薬を細胞内空間に効率的に送達するために生体内で真核細胞による取り込みに適したサイズである。送達ビヒクルは、治療薬、予防薬及び診断薬を体内の免疫監視及び劣化から保護し、カプセル活性薬剤の血清中半減期を延ばすことができる。送達ビヒクルは、場合によっては、特異性及び標的細胞による取り込みを高める1個以上のターゲティングモチーフを含むことができる。
A.修飾デンドリマー系ナノ粒子(MDNP)
MDNPは、細胞内部への広範な分子の有用な送達ビヒクルである。MDNPは、リピドイド様形態の100nmスケール粒子に自己組織化する合成多成分構造体である。MDNPは、大型複製RNA、mRNA、タンパク質、小分子などの1個以上の核酸を包む球状の層状構造体である。核酸、タンパク質及び小分子を含む容器としてMDNPを使用する治療薬、予防薬及び診断薬の細胞内送達用組成物は、ワクチン試薬、治療法、及び基礎研究用ツールを含めて、様々な適用例について記述されている。
MDNPは、イオン化可能であり低pHで正に帯電するデンドリマー、1種以上の両親媒性ポリマー、並びに対象の細胞に送達される1種以上の治療薬、予防薬及び/又は診断薬から処方される。一般に、MDNPは、無毒、非免疫原性であり、一般に、真核細胞による取り込みに適したサイズである。一部の実施形態においては、MDNPは、特定の細胞型又は細胞型のグループによる取り込みを阻止又は促進するサイズである。例えば、MDNPは、マクロファージなどの抗原提示細胞による取り込みを促進又は阻止するように設計することができる。単一の修飾デンドリマー系ナノ粒子の例示的サイズは、最長寸法が30nm~1,000nmの範囲であり、例えば、MDNPは、平均サイズが30nm~450nm(両端を含む)、例えば50nm~300nm(両端を含む)、より好ましくは60nm~250nm(両端を含む)とすることができる。ナノ粒子サイズは、コアデンドリマーを置換するアルキル鎖の長さによって影響され得る。それは、両親媒性ポリマーの量、及びカプセル剤のサイズによっても影響され得る。
1.イオン性デンドリマー系ナノ材料
一般に、デンドリマーは、イオン化可能であり、低pH値で正に帯電する。デンドリマーは、一般に、連続的な世代がその上に結合する、特定の数の反応基を有する明確なコア構造に由来する繰返し層、すなわち世代から構成される。デンドリマーは、第0~7世代とすることができる。デンドリマーの世代が高いほど、溶解性が大きく減少する。デンドリマーの構造的多様性、世代の数、及び可能な脂質修飾の範囲のため、薬物送達システムの開発は途方もない組み合わせの可能性がある。一般に、デンドリマー系ナノ材料は、エポキシド末端分子を用いて処方される。
連続的な各デンドリマー世代は、前の世代に共有結合することができる。コア構造の反応基の数は、n-方向性(n-directionality)を決定し、結合して次世代を形成することができる構造体の数を規定する。
樹状構造における分岐の数は、コアを含めて、単量体構成要素の分岐価数に依存する。例えば、コアが第一級アミンである場合、アミン窒素は二価であり、1→2分岐モチーフを生じるであろう。
デンドリマーは、好ましくは、本明細書で「アルキル化デンドリマー」と称するアルキル化デンドリマーである。例示的なデンドリマー材料としては、ポリ(アミド-アミン)(PAMAM)、ポリ(エチレンイミン)(PEI)、ポリエステル、ポリリジン、ポリプロピレンイミン(PPI)、ジアミノブタンアミンポリプロピレンイミンテトラミン(DAB-Am4)、ポリプロピルアミン(POPAM)、ポリリジン、ポリエステル、イプチセン、脂肪族ポリ(エーテル)、及び/又は芳香族ポリエーテルデンドリマーが挙げられるが、それらに限定されない。
デンドリマーは、カルボキシ、アミン及びヒドロキシ末端を有することができ、第1世代デンドリマー(G1)、第2世代デンドリマー(G2)、第3世代デンドリマー(G3)、第4世代デンドリマー(G4)、第5世代デンドリマー(G5)、第6世代デンドリマー(G6)、第7世代デンドリマー(G7)、第8世代デンドリマー(G8)、第9世代デンドリマー(G9)又は第10世代デンドリマー(G10)を含めて、ただしそれらに限定されない、任意の世代のものとすることができる。MDNPは、10を超える世代のデンドリマーから形成することもできる。
PAMAMクラスのデンドリマーは、それらの生分解性を高め、したがってヒトへの治療応用に関して寛容性を向上させることができる内部アミド結合を含む。アミノ表面は、極性、高反応性第一級アミン表面基を含む。アミノ官能性PAMAMデンドリマーの表面は、カチオン性であり、負に帯電した分子とのイオン相互作用によって、又は第一級アミンの多数の周知の共有結合性官能基化試薬を用いて、誘導体化することができる。
Figure 0006991977000003
式I:第0世代(G0)ポリ(アミド-アミン)(PAMAM)の分子構造。
MDNPがPAMAMデンドリマーから形成されるときには、第0~7世代PAMAMデンドリマーが一般に使用される。例えば、MDNPを第0世代PAMAMデンドリマー(G0)、第1世代(G1)PAMAMデンドリマー、第2世代(G2)PAMAMデンドリマー、第3世代(G3)PAMAMデンドリマー、第4世代(G4)PAMAMデンドリマー、第5世代(G5)PAMAMデンドリマー、第6世代(G6)PAMAMデンドリマー又は第7世代(G7)PAMAMデンドリマーから形成することができる。連続的に増加する世代(G0~G3)のPAMAMデンドリマーの構造を示す例示的なスキームを下記スキームIに示す。
PAMAMは、Sigma-Aldrich(カタログ番号597309)を含めて、複数の供給源から市販されている。
第0~3世代(G0~G3)のPAMAMデンドリマーの分子構造を図2Aに示す。
ポリエチレンイミン(ポリアジリジンとしても知られる)は、アミン基の繰返し単位及び炭素2個の脂肪族(CHCH)スペーサを有するポリマーである。
Figure 0006991977000004
式II:ポリエチレンイミンモノマー、及びポリ(エチレン-イミン)(PEI)モノマーの繰返し単位。
MDNPがPEIデンドリマーから形成されるときには、第0~7世代PEIデンドリマーが一般に使用される。例えば、MDNPを第0世代PEIデンドリマー(G0)、第1世代(G1)PEIデンドリマー、第2世代(G2)PEIデンドリマー、第3世代(G3)PEIデンドリマー、第4世代(G4)PEIデンドリマー、第5世代(G5)PEIデンドリマー、第6世代(G6)PEIデンドリマー又は第7世代(G7)PEIデンドリマーから形成することができる。連続的に増加する世代(G1~G3)のPEIデンドリマーの構造の例示的なスキームを下記スキームIIに示す。
PEIは、Sigma-Aldrich(カタログ番号482595)を含めて、複数の供給源から市販されている。
第1~3世代(G1~G3)のPEIデンドリマーの分子構造を図2Aに示す。
ジアミノブタンアミンポリプロピレンイミンテトラミン(DAB Am4)は、4個の表面第一級アミノ基を有する1,4-ジアミノブタンコア(4炭素コア)を有するポリマーである。
Figure 0006991977000005
式III:第1世代(G1)ジアミノブタンアミンポリプロピレンイミンテトラミン(DAB-Am4)の分子構造。
MDNPがDAB-AM4デンドリマーから形成されるときには、第0~7世代DAB-AM4デンドリマーが一般に使用される。例えば、MDNPを第0世代DAB-AM4デンドリマー(G0)、第1世代(G1)DAB-AM4デンドリマー、第2世代(G2)DAB-AM4デンドリマー、第3世代(G3)DAB-AM4デンドリマー、第4世代(G4)DAB-AM4デンドリマー、第5世代(G5)DAB-AM4デンドリマー、第6世代(G6)DAB-AM4デンドリマー又は第7世代(G7)DAB-AM4デンドリマーから形成することができる。連続的に増加する世代(G1~G3)のDAB-AM4デンドリマーの構造の例示的なスキームを下記スキームIIIに示す。
DAB-Am4は、Sigma-Aldrich(カタログ番号460699)を含めて、複数の供給源から市販されている。
第1~4世代(G1~G4)のDAB-Am4デンドリマーの分子構造を図2Aに示す。
MDNPは、1種以上の異なるデンドリマーで形成することができる。デンドリマー複合体の各デンドリマーは、化学的性質が他のデンドリマーと類似していても、異なってもよい(例えば、第1のデンドリマーをPAMAMデンドリマーとすることができ、第2のデンドリマーをPOPAMデンドリマーとすることができる)。一部の実施形態においては、第1又は第2のデンドリマーは、追加の薬剤を更に含むことができる。デンドリマー複合体は、複数のデンドリマーを含むことができる。例えば、ナノ粒子は第3のデンドリマーを含むことができ、第3のデンドリマーは、少なくとも1種の別のデンドリマーと複合化される。第3の薬剤を第3のデンドリマーと複合化することができる。別の一実施形態においては、第1及び第2のデンドリマーが各々第3のデンドリマーと複合化され、第1及び第2のデンドリマーがPAMAMデンドリマーであり、第3のデンドリマーがPOPAMデンドリマーである。追加のデンドリマーを組み込むこともできる。複数のデンドリマーを利用するときには、複数の薬剤を組み込むこともできる。一般に、末端エポキシドを有するデンドリマー上の第一級アミンと第二級アミンの反応は、アルキル鎖で置換されたデンドリマーを生成する。
a.エポキシド
一般に、デンドリマーは、アルキルエポキシドとの反応によって修飾される。一部の実施形態においては、アルキルエポキシドは、デンドリマー上に存在するアミノ基と反応して、アルキル化デンドリマーを形成する。
エポキシドは、式IVに示す構造を有することができる。式中、Rは、C1~C30(両端を含む)、好ましくはC6~C18の任意の線状アルキル基とすることができる。
Figure 0006991977000006
式IV:繰返し単位を含むエポキシドの一般構造式。式中、Rは、C1~C30(両端を含む)の任意の線状アルキル基とすることができる。
Figure 0006991977000007
式V:エポキシドの代表的な基の構造式(C~C18
例示的なエポキシドとしては、2-トリデシルオキシラン(C1530O)及び1,2-エポキシドデカン(C1224O)が挙げられる。
エポキシドを含むデンドリマーの修飾の例示的なスキームを下記スキームIに示す。スキームIは、アルキル鎖上に末端エポキシドを有するデンドリマー内の第一級アミンと第二級アミンの反応によるデンドリマー-脂質の合成経路を示す。一般に、反応は、エタノール溶媒、90℃の反応温度、及び暗所で最低72時間の反応時間を必要とする。
Figure 0006991977000008
スキームI:MDNPの形成に使用されるイオン性デンドリマー系ナノ材料を形成する例示的な反応スキーム。
2.両親媒性ポリマー
MDNPは、生体適合性、非免疫原性、無毒であるPEG-脂質複合物などの親水性-疎水性ポリマーを含む。
a.疎水性成分
疎水性二重層又は脂質二重層内の会合に十分適合した1タイプの疎水性成分は、ホスファチジルエタノールアミン(PE)などのリン脂質、コレステロール、セラミド、リゾ脂質、リゾリン脂質、及びスフィンゴ脂質である。PEと結合ポリマーの結合は、エステル及び/又はカルバミン酸誘導体を含むことができる。PEは、飽和又は不飽和PEとすることができる。セラミドは、短鎖(例えば、C8)、中間鎖(例えば、C14)若しくは長鎖(例えば、C20)脂肪アミド、又は脂肪酸(例えば、オレイン酸)誘導体とすることができる。中性及びアニオン性脂質としては、ホスファチジルコリン(PC)(卵PC、大豆PCなど)、1,2-ジアシル-グリセロ-3-ホスホコリン;ホスファチジルセリン(PS)、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルイノシトール(PI);糖脂質;スフィンゴミエリンなどのスフィンゴリン脂質、セラミドガラクトピラノシド、ガングリオシド、セレブロシドなどのスフィンゴ糖脂質(1-セラミジルグルコシドとしても知られる);脂肪酸、コレステロール、その誘導体などのカルボン酸基を含むステロール;並びに1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミンを含めた1,2-ジアシル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン、又は1,2-ジオレオイルグリセリルホスファチジルエタノールアミン(DOPE)、1,2-ジヘキサデシルホスホエタノールアミン(DHPE)、1,2-ジステアロイルホスファチジルコリン(DSPC)、1,2-ジパルミトイルホスファチジルコリン(DPPC)、及び1,2-ジミリストイルホスファチジルコリン(DMPC)が挙げられるが、それらに限定されない。
TAP脂質とも称されるトリメチルアンモニウム塩、例えば、硫酸メチル。適切なTAP脂質としては、DOTAP(ジオレオイル-)、DMTAP(ジミリストイル-)、DPTAP(ジパルミトイル-)及びDSTAP(ジステアロイル-)が挙げられるが、それらに限定されない。別の適切なカチオン性脂質としては、臭化ジメチルジオクタデシルアンモニウム(DDAB)、1,2-ジアシルオキシ-3-トリメチルアンモニウムプロパン、N-[1-(2,3-ジオロイルオキシ(dioloyloxy))プロピル]-Ν,Ν-ジメチルアミン(DODAP)が挙げられる。
b.親水性成分
ポリβアミノエステル及び1,2-アミノアルコール脂質を含めて、多種多様な親水性ポリマーが挙げられる。一部の実施形態においては、ポリマーは、アルキル修飾ポリ(エチレングリコール)などのアルキル修飾ポリマーである。別の例示的なポリマーとしては、ポリ(アルキレングリコール)、多糖、ポリ(ビニルアルコール)、ポリピロリドン、ポリオキシエチレンブロックコポリマー(例えば、PLURONIC(登録商標))、ポリエチレングリコール(PEG)及びそれらのコポリマーが挙げられる。好ましい親水性ポリマーは、生体適合性であり(すなわち、重大な炎症反応又は免疫応答を誘導しない)、無毒である。適切な親水性ポリマーの例としては、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ(プロピレングリコール)(PPG)、エチレングリコールとプロピレングリコールのコポリマーなどのポリ(アルキレングリコール)、ポリ(オキシエチル化ポリオール)、ポリ(オレフィンアルコール)、ポリビニルピロリドン)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリルアミド)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリラート)、多糖類、ポリ(アミノ酸)、ポリ(ヒドロキシ酸)、ポリ(ビニルアルコール)、並びにそれらのコポリマー、ターポリマー及び混合物が挙げられるが、それらに限定されない。
好ましい実施形態においては、1種以上の親水性ポリマー成分は、ポリ(アルキレングリコール)鎖を含む。ポリ(アルキレングリコール)鎖は、1~500個の繰り返し単位、より好ましくは40~500個の繰り返し単位を含むことができる。適切なポリ(アルキレングリコール)としては、ポリエチレングリコール、ポリプロピレン1,2-グリコール、ポリ(プロピレンオキシド)、ポリプロピレン1,3-グリコール、及びそれらのコポリマーが挙げられる。
一部の実施形態においては、1種以上の親水性ポリマー成分は、別の生体適合性ポリマー(例えば、ポリ(ラクチド)、ポリ(グリコリド)、ポリ(ラクチド-コ-グリコリド)又はポリカプロラクトン)で構成される1個以上のブロックと一緒にポリエチレンオキシド(PEO)の1個以上のブロックを含むコポリマーである。1個以上の親水性ポリマーセグメントは、ポリプロピレンオキシド(PPO)を含む1個以上のブロックと一緒にPEOの1個以上のブロックを含むコポリマーとすることができる。具体例としては、POLOXAMERS(商標)、PLURONICS(商標)などのPEO-PPO-PEOのトリブロックコポリマーが挙げられる。
ポリエチレングリコール(PEG)。PEGは、最も一般的に使用される遮蔽剤の1つである。MDNPに含まれる両親媒性PEGのサイズ、相対量及び分布は、生成する修飾デンドリマー系ナノ粒子(MDNP)の構造的特徴、電荷密度などの生物物理学的特性に影響し得る。
MDNPの物性は、両親媒性PEGのサイズ、相対量及び分布(すなわち、PEG化の程度)に直接関連する。改変し得る例示的な性質としては、1タイプ以上の真核細胞によるMDNPの取り込みの有効性、治療薬、予防薬及び診断薬の細胞内送達の速度及び有効性、並びにMDNPの免疫原性及び細胞毒性が挙げられる。ある実施形態においては、PEG化は、MDNPの電荷中和をもたらす。
一般に、両親媒性PEGとしては、短鎖オリゴエチレングリコールが挙げられる。例示的なオリゴエチレングリコールとしては、ジ-エチレングリコール、トリ-エチレングリコール、テトラ-エチレングリコール、ペンタ-エチレングリコール、ヘキサ-エチレングリコールなどが挙げられる。
Figure 0006991977000009
式VI:短鎖オリゴエチレングリコール(n=1~6)PEGモノマーの繰返し単位
一部の実施形態においては、両親媒性ポリマーは、モノメトキシポリエチレングリコール(mPEG)と複合化されたリン脂質である。ある実施形態においては、脂質に連結されたPEG又はmPEGは、分岐又は「多腕」PEGである。MDNPは、スルフヒドリル又はチオピリジン末端基を有する少なくとも2個の分枝を有する多腕ポリエチレングリコールを含むことができるが、スクシンイミジル又はマレイミド末端などの別の末端基を有するPEGポリマーを使用することもできる。
MDNPは、分子量の異なるポリエチレングリコールポリマーを含むことができる。例えば、PEGは分子量が約100Da(すなわち、PEG100Da)~約12,000kDa(すなわち、PEG12KDa)(両端を含む)とすることができる。MDNPは、単一種の両親媒性PEG、又は2つ以上の異なる種の両親媒性PEGから形成することができる。例えば、MDNPは、分子量の異なる複数種の脂質固定化PEGを用いて形成することができる。
MDNPは、単一の両親媒性ポリマー種、又は複数の異なる両親媒性ポリマー種の混合物を用いて形成することができる。両親媒性ポリマーは、付加物で修飾することができる。例えば、両親媒性ポリマーを同じ又は異なる1種以上の異なる付加物で修飾することができる。したがって、修飾デンドリマー系ナノ粒子は、場合によっては同じ又は異なる付加物の混合物を含む、1種以上の脂質固定化ポリマーを用いて形成することができる。
一部の実施形態においては、MDNPは、1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-[メトキシ(ポリエチレングリコール)](C14-MPEG)分子を用いて処方される。C14-MPEGは、一般に、分子量350Da~12,000Da、より好ましくは1,000Da~5,000Da、最も好ましくは2,000DaのmPEG成分を含む。
例示的な脂質固定化mPEGは、分子構造が式VIIで示される1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000](C14-mPEG(2000))である。
Figure 0006991977000010
式VII:1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000]の分子構造
一部の実施形態においては、MDNPは、両親媒性ポリマーC14-mPEG2000を用いて処方される。別の実施形態においては、MDNPは、C14-mPEG(350)、C14-mPEG(550)、C14-mPEG(750)、C14-mPEG(1000)、C14-mPEG(3000)、C14-mPEG(5000)などの異なる分子量のmPEGを含むC14-mPEG分子を用いて処方される。一部の実施形態においては、PEGは、mPEG5000(すなわち、1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-5000])である。脂質成分は、飽和又は不飽和脂肪酸部分を含むことができる。
一部の実施形態においては、MDNPは、1,2-ジステアロイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[アミノ(ポリエチレングリコール)-2000](DSPE-MPEG)分子を用いて処方される。DSPE-MPEGは、一般に、分子量350Da~12,000Da、より好ましくは1,000Da~5,000Da、最も好ましくは2,000DaのmPEG成分を含む。
例示的な脂質固定化mPEGは、分子構造が式VIIIで示される1,2-ジステアロイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[アミノ(ポリエチレングリコール)-2000](DSPE-mPEG(2000))である。
Figure 0006991977000011
式VIII:1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000]の分子構造
一部の実施形態においては、MDNPは、両親媒性ポリマーDSPE-mPEGを用いて処方される。別の実施形態においては、MDNPは、DSPE-mPEG(350)、DSPE-mPEG(550)、DSPE-mPEG(750)、DSPE-mPEG(1000)、DSPE-mPEG(2000)、DSPE-mPEG(3000)、DSPE-mPEG(5000)などの異なる分子量のmPEGを含むDSPE-mPEG分子を用いて処方される。脂質成分は、飽和又は不飽和脂肪酸部分を含むことができる。
別の実施形態においては、MDNPは、両親媒性ポリマーN-オクタノイル-スフィンゴシン-1-{スクシニル[メトキシ(ポリエチレングリコール)]}(C8MPEGセラミド)分子を用いて処方される。C8MPEGセラミド分子は、一般に、分子量750Da~5,000Da、より好ましくは1,000Da~5,000Da、最も好ましくは2,000DaのmPEG成分を含む。
例示的なセラミド固定化mPEGは、分子構造が式IXで示されるN-オクタノイル-スフィンゴシン-1-{スクシニル[メトキシ(ポリエチレングリコール)2000]}(C8MPEG2000セラミド)である。
Figure 0006991977000012
式IX:N-オクタノイル-スフィンゴシン-1-{スクシニル[メトキシ(ポリエチレングリコール)2000]}の分子構造
一部の実施形態においては、MDNPは、セラミド固定化ポリマーC8MPEG2000セラミドを用いて処方される。別の実施形態においては、MDNPは、C8MPEG750セラミド、C16MPEG750セラミド、C8MPEG2000セラミド、C16MPEG2000セラミド、C8MPEG5000セラミド、C16MPEG5000セラミドなどの異なる分子量mPEGを含むC8MPEGセラミド分子を用いて処方される。
一部の実施形態においては、1種以上の両親媒性ポリマーは、異なる構造的及び機能的特性をポリマーに付与する1個以上の部分の付加によって修飾される。例えば、一部の実施形態においては、1種以上の両親媒性ポリマーがポリペプチド又は別の小分子の付加によって修飾される。修飾脂質結合ポリマーを使用して、修飾のない同じMDNPに比べて、1つ以上の異なる機能的又は構造的特性を修飾デンドリマー系ナノ粒子(MDNP)に付与することができる。例示的な機能的又は構造的特性としては、修飾デンドリマー系ナノ粒子(MDNP)の流体力学的体積、疎水性、抗原性、受容体結合特異性及び血清中半減期の変化が挙げられる。
3.治療薬、予防薬及び診断薬
MDNPは、細胞内空間に送達する1種以上の治療薬、予防薬及び診断薬を含む。一部の実施形態においては、1種以上の治療薬、予防薬及び診断薬は、外来遺伝子配列をコードするmRNA、repRNAなどの核酸である。一部の実施形態においては、外来遺伝子配列は、ウイルス、病原体、微生物又は癌に特異的な1種以上の抗原をコードする。
MDNPは、封入された治療薬、予防薬及び診断薬を化学、光及び酵素分解から保護する。MDNP内に封入されたRNA分子は、ヌクレアーゼ、ヒドロキシラジカル、UV光、及びMg2+媒介性の系内攻撃による劣化に対して安定化され、RNAを安定化し生体内で細胞に送達するための化学修飾が不要である。MDNPの高い安定性によって、長期間の貯蔵が可能になり、エアロゾル、溶液、粉体などでの分散を含めて、広範囲の適用法が可能になる。
a.核酸
一部の実施形態においては、MDNP内にカプセル化された治療薬、予防薬及び診断薬は、1個以上の核酸を含む。核酸治療薬、予防薬及び診断薬の代表例としては、発現ベクターなどのDNAプラスミドベクター、iRNA、siRNA、リボザイム、アプタマー、repRNA、gRNA/sgRNA(CRISPRによる遺伝子編集のためのガイドRNA/単一ガイドRNA)、mRNAなどのRNA分子が挙げられる。
一部の実施形態においては、MDNP内にカプセル化された治療薬、予防薬及び診断薬は、レシピエント細胞における1個以上の遺伝子の発現のための1個以上の核酸発現ベクターを含む。一部の実施形態においては、遺伝子は、宿主生物に外来のものである。別の実施形態においては、遺伝子は、宿主生物に生来のものである。ある実施形態においては、遺伝子は、1個以上の対立遺伝子の変種など、生物に一般に付随するものの修飾変異体である。
核酸発現ベクターの代表例としては、ウイルスベクター、バクテリオファージ核酸由来のベクター、及び化学合成DNAを含めた合成オリゴヌクレオチドなど、ただしそれらに限定されない、発現、クローニング、コスミド及び形質転換ベクターなどのDNAプラスミドベクター、並びに複製RNAを含めたRNAベクターが挙げられる。一般に、挿入セグメントの複製及び発現を引き起こすように遺伝子セグメントをその中に挿入することができる任意の発現ベクターを、対象の細胞中に送達するために、修飾デンドリマー系ナノ粒子中に含むことができる。
一般に、MDNPの核酸発現ベクターは、対象の細胞などの標的細胞において異種核酸配列を発現するように設計され、1個以上の発現制御配列を含む。発現ベクターは、プロモーター、プロモーターに作動可能に結合した異種核酸配列、異種核酸配列に作動可能に結合した真核生物転写ターミネーター、及び複製開始点を含むことができる。
一般に、宿主細胞に適合した種に由来するレプリコン及び制御配列を含むプラスミドベクターが、これらの宿主に関連して使用される。ベクターは、通常、複製部位、及び形質転換細胞において表現型選抜を行うことができる標識配列を有する。異なる宿主細胞は、タンパク質の翻訳後プロセシング及び修飾の特徴的特異的機序を有する。哺乳動物細胞に使用される発現ベクターは、通常、任意の必要なリボソーム結合部位、RNAスプライス部位、ポリアデニル化部位及び転写終結配列と一緒に、複製開始点(必要に応じて)、発現すべき遺伝子の前に位置するプロモーターを含む。
ある実施形態においては、MDNPは、1個以上のリボ核酸(RNA)分子を含む。RNAは、大量に製造するのに費用効果が高く、商業的に合成されたDNA前駆体由来の任意の所与の発見配列からほぼ即日の迅速性で内毒素なしに生成することができる。それは、ゲノム組み込みのリスクがなく、細胞質に接近するだけで機能するので、DNAよりも安全で投与が容易である。さらに、アルファウイルス又はフラビウイルスゲノムに基づく自己複製mRNA(repRNA)が利用可能であるため、極めて低用量で、最大の免疫原性及び抗原産生レベルを達成することができる。
ある実施形態においては、MDNPは、レプリコンとしても知られる1個以上の複製リボ核酸(repRNA)を含む。複製RNAは、ワクチン抗原をコードする遺伝子を含めた遺伝子を送達する能力がある自己増幅RNAである。repRNAは、子孫ビリオンの生成に必要なウイルス構造タンパク質を欠く弱毒ウイルスゲノムである。しかし、repRNAは、翻訳及び複製の能力を保持し、したがってmRNAの翻訳の半減期を効果的に増加させることができる。したがって、1個以上の外来遺伝子をコードするrepRNAを細胞に送達すると、1個以上の外来遺伝子をコードする等モル量の従来のmRNAの細胞への送達によるのに比べて、細胞における外来遺伝子の翻訳及び発現を効果的に増加させることができる。一部の実施形態においては、repRNAは、非細胞変性repRNAである。
アルファウイルス自己増幅repRNAは、一般に、5’Cap;5’非翻訳領域(5’UTR)、第1のオープンリーディングフレーム内でコードされた非構造遺伝子(例えば、NSP1-4)、ゲノムプロモーター領域(例えば、26Sサブゲノムプロモーター)、第2のオープンリーディングフレーム、3’非翻訳領域(3’UTR)、及び3’ポリアデニル化テールを含む。repRNA分子は、一般に、コードされた遺伝子配列のサイズに応じて、9,000~20,000ヌクレオチド長である(図1A~1C参照)。
非構造遺伝子は、RNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)をコードする。一般に、RdRpは、従来のmRNAをエンドヌクレオーゼ(endonucleose)及び自己触媒分解に対して保護するために使用される古典的なヌクレオチド修飾を許容しない。したがって、ナノカプセル化は、ワクチンプラットホームにおける有効な配置に必要である。repRNAは、モジュール方式であり、第2のオープンリーディングフレームを、外来性の対象遺伝子(GOI:gene of interest)などの完全な遺伝子に合わせて配列するように設計することができる。
第2のオープンリーディングフレーム内でコードされた抗原遺伝子などの1個以上の所望の遺伝子配列を含むrepRNAを使用することができる。repRNAが宿主細胞の細胞質に入ると、repRNA NS遺伝子によってコードされたRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)が細胞内で発現される。RdRpは、次いで、repRNA全体、又はrepRNAでコードされた抗原のRdRp複製物のみ(すなわち、サブゲノムプロモーターによって)を複製することができる。
repRNAは、完全長レプリコンのより多くの複製物、及び第2のオープンリーディングフレームに含まれる遺伝子をコードするmRNAのより多くの複製物を合成することができるので、レプリコンRNAは、RNAによって媒介される遺伝子送達の総合効率を増加させる。宿主細胞リボソームは、完全長レプリコン複製物又はより短い抗原のみのmRNAを連続して翻訳して、repRNAによってコードされた遺伝子の発現を高める(図1A参照)。
自己複製RNAは、容易に送達されて標的細胞の正しいサイトゾル移行の成功を保証できるよりも多数のmRNAテンプレートを生成し得る。repRNAの自己複製性は、天然の感染性ウイルス粒子のそれを厳密に模倣したものであり、液性細胞免疫防御と細胞毒性細胞免疫防御の両方のアームを誘導するのにより効率的である。
単一repRNAは、1個以上の外来遺伝子をコードする核配列を含むことができる。したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、1個以上の外来遺伝子配列各々をコードする1個以上のrepRNAを含む。
異なるウイルスゲノムに由来するrepRNAは、異なる機能特性を外来遺伝子の発現及び転写に付与することができる。例えば、同じ外来遺伝子をコードする異なるrepRNA種は、外来遺伝子の転写の異なる速度及び異なる半減期を生じ得る。一般に、遺伝子の翻訳効率(翻訳の活性化又は完全な阻害を含む)は、UTRによって制御することができる。
一部の実施形態においては、単一のMDNPは、異なるウイルスゲノムに由来する1個を超える異なるrepRNAを含む。異なるウイルスゲノムに由来する2個以上のrepRNAを同じMDNP内にカプセル化すると、repRNAは、同じ又は異なる外来遺伝子の1個以上をコードすることができる。1個を超えるrepRNAを単一のMDNP内にカプセル化するときには、repRNAは、repRNAの同じ種でも異なる種でもよい。
一般に、repRNAは、「プラス鎖」RNAウイルスの修飾によって生成される。修飾ウイルスゲノムは、細胞内自己複製のためのmRNAとテンプレートの両方として機能する。これは、mRNAテンプレートの初期の複製及び形成を促進するためにそれら自体のポリメラーゼと一緒に送達されなければならない「マイナス鎖」ウイルスとは対照的である。後者の送達は、ウイルス様粒子の使用により依存し、合成粒子による送達にはあまり適切でない。例示的なrepRNAとしては、アルファウイルス及びフラビウイルス属に属するウイルスの修飾ウイルスゲノムを含む。
アルファウイルスは、ウイルスのIV族トガウイルス科に属する。一般に、これらのウイルスは、5’キャップ及び3’ポリAテールを含めて、全ゲノム長が11,000~12,000ヌクレオチドである。4個の非構造タンパク質遺伝子が、ゲノムの5’側2/3でコードされる。複製は、宿主細胞の細胞質内で起こる。アルファウイルスゲノムの修飾に基づくrepRNAの形成は、当該技術分野において確立されている(Atkinsら、Expert Rev Mol Med、10:e33(2008)、Khromykh、Curr Opin Mol Ther、2:555~569(2000)、Lundstrom Curr Opin Mol Ther4:28~34(2002)、及びRayner、Rev Med Virol.、12:279~296(2002))。
一部の実施形態においては、MDNP内のrepRNAカプセル化は、ベネズエラウマ脳炎ウイルス(VEEV)(カバソウ(Cabassou)ウイルス、エバーグレイズウイルス、モッソ ダス ペドラス(Mosso das Pedras)ウイルス、ムカンボウイルス、パラマナ(Paramana)ウイルス、ピクスナ(Pixuna)ウイルス、リオネグロウイルス、トロカラ(Trocara)ウイルス及びベネズエラウマ脳炎ウイルスサブタイプを含む);セムリキ森林ウイルス(SFV)(ベバラ(Bebaru)ウイルス、チクングニアウイルス、マヤロウイルス、オニョンニョンウイルス、ロスリバーウイルス及びセムリキ森林ウイルスサブタイプを含む);シンドビスウイルス(SV);東部ウマ脳炎ウイルス(EEEV);バーマ森林ウイルス(BFV);ミッデルブルクウイルス(MV);ンズム(Ndumu)ウイルス(NV);及び西部ウマ脳炎(WEEV)(アウラウイルス、ババンキ(Babanki)ウイルス キジラガク(Kyzylagach)ウイルス、シンドビスウイルス、オケルボ(Ockelbo)ウイルス及びワタロア(Whataroa)ウイルスサブタイプを含む)を含めて、ただしそれらに限定されない修飾アルファウイルス種に由来する。
フラビウイルスは、フラビウイルス科のウイルス属に属する。フラビウイルスは、5’キャップを含むが3’ポリAテールを欠く、約10,000~11,000ヌクレオチドのプラスセンス一本鎖RNAウイルスである。一般に、フラビウイルスゲノムは、3種の構造タンパク質及び8種の非構造タンパク質をコードする。フラビウイルスは、細胞質中で複製し、構築され、ヒトを含めた哺乳動物宿主に主に感染する。フラビウイルスゲノムの修飾に基づくrepRNAの形成は、当該技術分野において確立されている(Koflerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、101、1951~1956(2004)、McCulloughら、Vaccines2014、2、735~754(2004))。
一部の実施形態においては、MDNP内にカプセル化されたrepRNAは、西ナイルウイルス(WNV)、アロア(Aroa)ウイルス;日本脳炎ウイルス;デングウイルス(DV)、ダニ媒介脳炎ウイルス及び黄熱病ウイルスを含めて、ただしそれらに限定されない修飾フラビウイルス種に由来する。
一部の実施形態においては、MDNPは、メッセンジャーリボ核酸配列(mRNA)を含む。mRNAは、5’キャップ、5’非翻訳領域(5’UTR)、翻訳開始コドンを含むコード領域、完全な遺伝子のヌクレオチド配列、翻訳終止コドン、3’非翻訳領域(3’UTR)、3’末端に付加した100~200アデニンを含めたポリA付加部位を含む、遺伝子の一本鎖転写物である。mRNA分子は、一般に、コードされた遺伝子配列のサイズに応じて、200~10,000ヌクレオチド長である。
宿主細胞の細胞質内の真核生物mRNAは、リボソームによって翻訳され、翻訳効率(翻訳の活性化又は完全な阻害を含む)は、UTRによって制御することができる。3’又は5’UTRに結合するタンパク質は、mRNAに結合するリボソームの能力を媒介することによって翻訳に影響し得る。翻訳は、細胞質中に浮遊する、又はシグナル認識粒子によって小胞体に誘導される、リボソームで行うことができる。
一部の実施形態においては、MDNP内にカプセル化された治療薬、予防薬及び診断薬は、対象の細胞中で発現され得る遺伝子をコードするmRNA分子である。mRNAは、ペプチド抗原などの外来遺伝子をコードすることができる。1個以上の外来遺伝子をコードする1個以上のmRNAを単一のMDNP内に封入することができる。一部の実施形態においては、MDNPは、同じmRNAの2個以上の分子を含む。別の実施形態においては、MDNPは、2個以上の異なるmRNAを含む。例えば、単一のMDNPは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20又は20個を超える異なるmRNAを含むことができる。2種以上のmRNAが単一のMDNP内にカプセル化されるときには、2種以上のmRNAが等モル比(すなわち、1:1)又は不等モル比(すなわち、>1:1)で存在することができる。例えば、2種のmRNAがMDNP内に1:1、2:1、3:1、4:1、10:1又は10:1を超えるモル比で存在することができる。
MDNP内にカプセル化された治療薬、予防薬及び診断薬が、発現ベクター、mRNAなどの1個以上の核酸を含むときには、ベクターは、レシピエント細胞内の発現のための1個以上の遺伝子領域をコードすることができる。一般に、遺伝子は、標的細胞に対して外来(すなわち、異種)遺伝子である。異種核酸配列は、1種以上の遺伝子産物の産生の目的で、及び/又はレシピエントにおける遺伝子発現を調節する目的で、RNAの一部若しくは全体、又はタンパク質の一部若しくは全体の合成のための遺伝情報をコードする任意の核酸配列とすることができる。一部の実施形態においては、異種核酸は、抗原をコードする。別の実施形態においては、異種核酸配列は、宿主細胞における生物学的反応を惹起及び/又は加減する要素をコードする。例えば、異種タンパク質は、1個以上の遺伝子の発現を阻害することができる。
異種核酸配列の例示的なリストは、抗原、リボザイム、酵素、ペプチド、構造タンパク質、構造RNA、shRNA、siRNA、miRNA、gRNA/sgRNA(CRISPRによる遺伝子編集のためのガイドRNA/単一ガイドRNA)、転写因子、シグナル伝達分子、及びそれらの断片又は変異体をコードする遺伝子を含む。一実施形態においては、異種配列は、抗原をコードする。
異種配列は、場合によっては、特定の場所(例えば、細胞内の小器官)にターゲティング可能な核酸配列(すなわち、ターゲティング配列)を含むことができる。一部の実施形態においては、異種配列は、抗原をコードする。
ある実施形態においては、異種核酸配列は、機能性核酸である。標的遺伝子の転写、翻訳又は機能を阻害する機能性核酸について記述する。
機能性核酸は、標的分子との結合、特異反応の触媒などの特定の機能を有する核酸分子である。以下でより詳細に考察するように、機能性核酸分子は、以下の非限定的カテゴリに分類することができる:アンチセンス分子、siRNA、miRNA、アプタマー、リボザイム、三重鎖形成分子、RNAi及び外部ガイド配列。機能性核酸分子は、標的分子によって保有される比活性のエフェクター、阻害物質、調節物質及び刺激物質として働くことができ、又は機能性核酸分子は、他の分子とは無関係に新規活性を保有することができる。
機能性核酸分子は、DNA、RNA、ポリペプチド、糖鎖などの任意の巨大分子と相互作用することができる。したがって、機能性核酸は、標的ポリペプチドのmRNA若しくはゲノムDNAと相互作用することができ、又は標的ポリペプチド自体と相互作用することができる。機能性核酸は、標的分子と機能性核酸分子の配列相同性に基づいて、別の核酸と相互作用するように設計されることが多い。別の状況では、機能性核酸分子と標的分子の間の特異的認識は、機能性核酸分子と標的分子の配列相同性に基づくのではなく、特異的認識を生じさせる三次構造の形成に基づく。したがって、組成物は、標的タンパク質の発現又は機能を抑制するように設計された1種以上の機能性核酸を含むことができる。
アンチセンスオリゴヌクレオチド、siRNA、shRNA、miRNA、EGS、gRNA、sgRNA、リボザイム、アプタマーなどの上記機能性核酸の生体内発現のためのベクターを製造し、使用する方法は、当該技術分野で公知である。
ある実施形態においては、機能性核酸は、アンチセンス分子である。アンチセンス分子は、標準又は非標準の塩基対合によって、標的核酸分子と相互作用するように設計される。アンチセンス分子と標的分子の相互作用は、例えばRNAseHによって媒介されるRNA-DNAハイブリッド分解によって、標的分子の破壊を促進するように設計される。或いは、アンチセンス分子は、転写、複製などの標的分子上で通常は起こるプロセシング機能を妨害するように設計される。アンチセンス分子は、標的分子の配列に基づいて設計することができる。標的分子の最も利用可能な領域を見つけることによってアンチセンス効率を最適化する多数の方法が存在する。例示的な方法としては、DMS及びDEPCを用いたインビトロ選択実験及びDNA修飾試験が挙げられる。アンチセンス分子は、10-6、10-8、10-10又は10-12以下の解離定数(Kd)で標的分子に結合することが好ましい。
ある実施形態においては、機能性核酸は、アプタマーである。アプタマーは、好ましくは特異的様式で、標的分子と相互作用する分子である。典型的には、アプタマーは、ステムループ、Gカルテットなどの明確な二次及び三次構造に折り畳まれる15~50塩基長の小さい核酸である。アプタマーは、ATP、テオフィリンなどの小分子、及び逆転写酵素、トロンビンなどの大分子に結合することができる。アプタマーは、10-12M未満の標的分子からのKdで極めて堅固に結合することができる。アプタマーは、10-6、10-8、10-10又は10-12未満のKdで標的分子に結合することが好ましい。アプタマーは、極めて高度の特異性で標的分子に結合することができる。例えば、標的分子と、分子上の単一位置しか異ならない別の分子との結合親和性差が10,000倍を超えるアプタマーが単離された。アプタマーは、バックグラウンド結合分子とのKdの少なくとも1/10、1/100、1/1000、1/10,000又は1/100,000倍の標的分子とのKdを有することが好ましい。ポリペプチドなどの分子と比較するときには、バックグラウンド分子が異なるポリペプチドであることが好ましい。
機能性核酸は、リボザイムとすることができる。リボザイムは、分子内又は分子間で化学反応を触媒する能力のある核酸分子である。リボザイムは、分子間反応を触媒することが好ましい。ハンマーヘッド型リボザイムなどの天然の系に見られるリボザイムに基づく、ヌクレアーゼ又は核酸ポリメラーゼ型反応を触媒する様々なタイプのリボザイムについて記述する。天然の系には見られないが、特異反応を新規に触媒するように設計されたリボザイムについても記述する。好ましいリボザイムは、RNA又はDNA基質を切断し、より好ましくはRNA基質を切断する。リボザイムは、一般に、標的基質の認識及び結合と、それに続く切断によって、核酸基質を切断する。この認識は、大部分が標準又は非標準の塩基対相互作用に基づくことが多い。標的基質の認識は標的基質配列に基づくので、この性質によって、リボザイムは、核酸の特異的切断のターゲティングに特に良好な候補になる。
機能性核酸は、三本鎖形成オリゴヌクレオチド分子とすることができる。三本鎖形成機能性核酸分子は、二本鎖又は一本鎖核酸と相互作用することができる分子である。三本鎖分子が標的領域と相互作用すると、ワトソン-クリックとフーグスティーンの両方の塩基対合に依存した複合体を形成する3本のDNA鎖が存在する、三本鎖と呼ばれる構造が形成される。三本鎖分子は、標的領域と高い親和性及び特異性で結合することができるので好ましい。三本鎖形成分子は、10-6、10-8、10-10又は10-12未満のKdで標的分子に結合することが好ましい。
機能性核酸は、外部ガイド配列とすることができる。外部ガイド配列(EGS:external guide sequence)は、複合体を形成する標的核酸分子に結合する分子であり、この複合体はRNase Pによって認識され、次いでRNase Pが標的分子を切断する。EGSは、最適なRNA分子を特異的に標的にするように設計することができる。RNAse Pは、細胞内の転移RNA(tRNA)のプロセシングを支援する。細菌RNAse Pは、標的RNA:EGS複合体が天然tRNA基質を模倣するようにするEGSを用いることによって、実質的にあらゆるRNA配列を切断するように動員することができる。同様に、RNAの真核生物EGS/RNAse P指向的切断を利用して、真核細胞内の所望の標的を切断することができる。種々の標的分子の切断を容易にするEGS分子の製造及び使用方法の代表例は、当該技術分野で公知である。
一部の実施形態においては、機能性核酸は、RNA干渉(siRNA)によって遺伝子発現抑制を誘導する。標的遺伝子の発現は、RNA干渉によって極めて特異的な様式で効果的に抑制することができる。
所与の遺伝子の干渉作用を有するRNAポリヌクレオチドは、対応する相補配列を有する特異的メッセンジャーRNA(mRNA)を分解し、タンパク質の産生を阻止することによって、遺伝子を下方制御する(Sledz及びWilliams、Blood、106(3):787~794(2005)参照)。RNA分子がmRNAと相補的ワトソン-クリック塩基対を形成すると、それは、アクセサリータンパク質によるmRNA切断を誘導する。RNAの供給源は、外部供給源からのウイルス感染、転写又は導入であり得る。
遺伝子発現抑制は、二本鎖RNA(dsRNA)の添加によって最初に認められた(Fireら(1998)Nature、391:806~11、Napoliら(1990)Plant Cell 2:279~89、Hannon、(2002)Nature、418:244~51)。dsRNAは、細胞に入ると、ダイサーと呼ばれるRNaseIII様酵素によって、2個のヌクレオチドオーバーハングを3’末端に含む21~23ヌクレオチド長の二本鎖低分子干渉RNA(siRNA)に切断される(Elbashirら、Genes Dev.、15:188~200(2001)、Bernsteinら、Nature、409:363~6(2001)、Hammondら、Nature、404:293~6(2000)、Nykanenら、Cell、107:309~21(2001)、Martinezら、Cell、110:563~74(2002))。iRNA若しくはsiRNAの効果又はそれらの使用は、どのタイプの機序にも限定されない。
一実施形態においては、siRNAは、siRNAと標的RNAの間の配列相同領域内のmRNAなどの相同RNA分子の特異的分解を誘発する。配列特異的遺伝子発現抑制は、酵素ダイサーによって生成されるsiRNAを模倣した合成低分子二本鎖RNAを用いて、哺乳動物細胞において実施することができる(Elbashirら、Nature、411:494~498(2001))(Ui-Teiら、FEBS Lett、479:79~82(2000))。siRNAは、化学的に若しくはインビトロで合成することができ、又は細胞内でsiRNAにプロセシングされる低分子二本鎖ヘアピン様RNA(shRNA)の結果であり得る。例えば、国際公開第02/44321号は、3’オーバーハング末端と塩基対を形成したときに標的mRNAの配列特異的分解が可能なsiRNAを記述している。これらのsiRNAの製造方法を参照により本明細書に援用する。合成siRNAは、一般に、アルゴリズム及び従来のDNA/RNA合成装置を用いて設計される。供給業者としては、Ambion(オースティン、テキサス)、ChemGenes(アシュランド、マサチューセッツ)、Dharmacon(ラフィエット、コロラド)、Glen Research(スターリング、バージニア)、MWB Biotech(Esbersberg、ドイツ)、Proligo(ボールダー、コロラド)及びQiagen(Vento、オランダ)が挙げられる。siRNAは、AmbionのSILENCER(登録商標)siRNA Construction Kitなどのキットを用いてインビトロで合成することもできる。
したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、1個以上のsiRNA、又はsiRNAを発現する1個以上のベクターを含む。ベクターからのsiRNAの生成は、より一般的には、低分子ヘアピン型RNAse(shRNA)の転写によってなされる。例えば、ImgenexのGENESUPPRESSOR(商標)Construction Kits、InvitrogenのBLOCK-IT(商標)誘導RNAiプラスミド及びレンチウイルスベクターなど、shRNAを含むベクターの製造キットが利用可能である。一部の実施形態においては、機能性核酸は、siRNA、shRNA又はmiRNAである。
b.抗原
一部の実施形態においては、外来核酸配列は、ワクチン抗原をコードする。抗原は、対象生物に外来性である任意のタンパク質又はペプチドを含み得る。好ましい抗原は、CD4受容体(CD4T細胞)を発現する白血球、ナチュラルキラー(NK)細胞などの免疫エフェクター細胞による監視のために、対象の抗原提示細胞(APC:antigen presenting cell)の表面に提示され得る。一般に、抗原は、ウイルス、細菌、原生動物、真菌又は動物起源である。一部の実施形態においては、抗原は、癌抗原である。癌抗原は、腫瘍細胞上でのみ発現される、及び/又は腫瘍細胞生存に必要である、抗原であり得る。ある種の抗原は、当業者によって免疫賦活性である(すなわち、有効な免疫認識を刺激する)と認識され、それが由来する生物又は分子に対して有効な免疫を提供する。
B細胞抗原は、ペプチド、タンパク質、多糖、糖類、脂質、核酸、小分子(単独で、又はハプテンと一緒に)、又はそれらの組合せであり得る。T細胞抗原は、タンパク質又はペプチドである。抗原は、ウイルス、細菌、寄生生物、植物、原生動物、真菌、組織、又は癌細胞、白血病細胞などの形質転換細胞に由来する可能性があり、細胞全体又はその免疫原性成分、例えば、細胞壁成分若しくはその分子成分であり得る。適切な抗原は、当該技術分野で公知であり、商業的な政府及び科学的供給源から入手可能である。抗原は、腫瘍又はウイルス若しくは細菌源に由来する精製又は部分精製ポリペプチドであり得る。抗原は、異種発現系においてポリペプチド抗原をコードするDNAを発現することによって産生される組換えポリペプチドであり得る。抗原タンパク質の全部又は一部は、送達のためにDNA又はRNA分子によってコードされ得る。抗原は、単一抗原として供給され、又は組み合わせて供給され得る。抗原は、ポリペプチド又は核酸の複合混合物としても供給され得る。
ウイルス抗原
一部の実施形態においては、抗原は、ウイルス抗原である。ウイルス抗原は、以下のウイルス科のいずれかのウイルスを含めて、ただしそれらに限定されない任意のウイルスから単離することができる:アレナウイルス科、アルテリウイルス、アストロウイルス科、バキュロウイルス科、バドナウイルス、バルナウイルス科、ビルナウイルス科、ブロモウイルス科、ブニヤウイルス科、カリチウイルス科、カピロウイルス、カルラウイルス、カリモウイルス、サーコウイルス科、クロステロウイルス、コモウイルス科、コロナウイルス科(例えば、重症急性呼吸器症候群(SARS:severe acute respiratory syndrome)ウイルスなどのコロナウイルス)、コルチコウイルス科、シストウイルス科、デルタウイルス、ダイアンソウイルス、エナモウイルス、フィロウイルス科(例えば、マールブルグウイルス及びエボラウイルス(EBOV)(例えば、ザイール、レストン、コートジボワール又はスーダン系統))、フラビウイルス科、(例えば、C型肝炎ウイルス、デングウイルス1、デングウイルス2、デングウイルス3及びデングウイルス4)、ヘパドナウイルス科、ヘルペスウイルス科(例えば、ヒトヘルペスウイルス1、3、4、5及び6、並びにサイトメガロウイルス)、ハイポウイルス科、イリドウイルス科、レビウイルス科、リポスリクスウイルス科、ミクロウイルス科、オルトミクソウイルス科(例えば、H1N1系統などのインフルエンザウイルスA、並びにB及びC)、パポバウイルス科、パラミクソウイルス科(例えば、麻疹、流行性耳下腺炎及びヒト呼吸器合胞体ウイルス)、パルボウイルス科、ピコルナウイルス科(例えば、ポリオウイルス、ライノウイルス、ヘパトウイルス及びアフトウイルス)、ポックスウイルス科(例えば、ワクシニア及び疱瘡ウイルス)、レオウイルス科(例えば、ロタウイルス)、レトロウイルス科(例えば、ヒト免疫不全症ウイルス(HIV:human immunodeficiency virus)1及びHIV2などのレンチウイルス)、ラブドウイルス科(例えば、狂犬病ウイルス、麻疹ウイルス、呼吸器合胞体ウイルスなど)、トガウイルス科(例えば、風疹ウイルス、デングウイルスなど)、並びにトティウイルス科。適切なウイルス抗原としては、デングタンパク質M、デングタンパク質E、デングD1NS1、デングD1NS2及びデングD1NS3の全部又は一部も挙げられる。ウイルス抗原は、パピローマウイルス、ヘルペスウイルス、すなわち単純ヘルペス1及び2;肝炎ウイルス、例えば、A型肝炎ウイルス(HAV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、デルタD型肝炎ウイルス(HDV)、E型肝炎ウイルス(HEV)及びG型肝炎ウイルス(HGV)、ダニ媒介脳炎ウイルス;パラインフルエンザ、水痘-帯状疱疹、サイトメガロウイルス(cytomeglavirus)、エプスタインバー、ロタウイルス、ライノウイルス、アデノウイルス、コクサッキーウイルス、ウマ脳炎、日本脳炎、黄熱病、リフトバレー熱、リンパ性脈絡髄膜炎などの特定の系統に由来し得る。一般に、repRNAによってコードされたウイルス抗原は、repRNAが発現された天然ウイルスゲノムには由来しない。
一部の実施形態においては、ウイルス抗原は、オルソミクソウイルス科の1種以上のウイルス、例えば、インフルエンザウイルスA、インフルエンザウイルスB、インフルエンザウイルスC、イサウイルス、トゴトウイルス及びクアランジャウイルスに由来する。例示的なA型インフルエンザウイルスサブタイプとしては、H1N1、H1N2、H3N2、H3N1、H5N1、H2N2及びH7N7が挙げられる。例示的なインフルエンザウイルス抗原としては、HA1及びHA2サブユニットなどの赤血球凝集素、ノイラミニダーゼ(neurominidase)、PB1、PB2PA及びPB1-F2の1種以上などのウイルスRNAポリメラーゼ、逆転写酵素、カプシドタンパク質、NS1、NEPなどの非構造タンパク質、核タンパク質、M1、M2などの基質タンパク質、孔タンパク質などの1種以上のタンパク質又は糖タンパク質が挙げられる。一部の実施形態においては、A型インフルエンザウイルス抗原としては、赤血球凝集素HA1糖タンパク質の抗原性部位を含めて、赤血球凝集素(HA)若しくはノイラミニダーゼ(NA)糖タンパク質又はHA若しくはNAの断片の1種以上が挙げられる。例示的一実施形態においては、MDNPは、インフルエンザA/WSN/33HAタンパク質をコードするRNAを含む。
一部の実施形態においては、ウイルス抗原は、エボラウイルス属の1種以上のウイルス、例えば、ザイールエボラウイルス(EBOV)、スーダンエボラウイルス(SUDV)、タイフォレストエボラウイルス(TAFV)、レストンエボラウイルス(RESTV)及びブンデブージョエボラウイルス(BDBV)に由来する。例示的一実施形態においては、MDNPは、ザイールエボラウイルス糖タンパク質(GP)、又はザイールエボラウイルス糖タンパク質(GP)の1種以上の断片をコードするrepRNAなどのRNAを含む。
一部の実施形態においては、ウイルス抗原は、フラビウイルス属の1種以上のウイルス、例えば、ジカウイルス(ZIKV)に由来する。
細菌抗原
一部の実施形態においては、抗原は、細菌抗原である。細菌抗原は、アクチノミセス、アナベナ、バチルス、バクテロイデス、デロビブリオ、ボルデテラ、ボレリア、カンピロバクター、カウロバクター、クラミジア、クロロビウム、クロマチウム、クロストリジウム、コリネバクテリウム、サイトファーガ、デイノコッカス、エシェリキア、フランシセラ、ハロバクテリウム、ヘリコバクター(Heliobacter)、ヘモフィルス、ヘモフィルスインフルエンザタイプB(HIB)、ハイフォミクロビウム、レジオネラ、レプトスピロシス(Leptspirosis)、リステリア、髄膜炎菌A、B及びC、メタノバクテリウム、ミクロコッカス、マイコバクテリウム(Myobacterium)、マイコプラズマ、ミクソコッカス、ナイセリア、硝酸菌、オシラトリア、プロクロロン、プロテウス、シュードモナス、ロドスピリルム(Phodospirillum)、リケッチア、サルモネラ、シゲラ、スピリルム、スピロヘータ、スタフィロコッカス、ストレプトコッカス、ストレプトミセス、スルフォロブス、サーモプラズマ、硫黄菌、及びトレポネーマ、ビブリオ、並びにエルシニアを含めて、ただしそれらに限定されない任意の細菌から生じ得る。
寄生生物抗原
一部の実施形態においては、抗原は、寄生生物抗原である。例示的な寄生生物アレルゲンとしては、クリプトコッカス ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、ヒストプラスマ カプスラツーム(Histoplasma capsulatum)、カンジダ アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ トロピカリス(Candida tropicalis)、ノカルジア アステロイデス(Nocardia asteroides)、リケッチア リケッチイ(Rickettsia ricketsii)、リケッチア チフィ(Rickettsia typhi)、マイコプラズマ ニューモニエ(Mycoplasma pneumoniae)、クラミジア シタッシ(Chlamydial psittaci)、クラミジア トラコマチス(Chlamydial trachomatis)、プラスモディウム ファルシパルム(Plasmodium falciparum)、トリパノソーマ ブルセイ(Trypanosoma brucei)、エントアメーバ ヒストリティカ(Entamoeba histolytica)、トキソプラズマ ゴンヂ(Toxoplasma gondii)、トリコモナス バギナリス(Trichomonas vaginalis)及びシストソーマ マンソニ(Schistosoma mansoni)が挙げられるが、それらに限定されない。これらは、スポロゾイト周囲タンパク質、スポロゾイト表面タンパク質、肝臓ステージ抗原、頂端膜結合タンパク質、又はメロゾイト表面タンパク質の全部若しくは一部などの胞子虫抗原、プラスモディウム抗原を含む。
一部の実施形態においては、寄生生物抗原は、トキソプラズマ属の1種以上の原生動物、例えば、T.ゴンヂ、及びネオスポラ、ハモンジア(Hammondia)、フレンケリア(Frenkelia)、イソスポーラ、サルコシスティスなどの関連する属の種などの原生動物由来の1種以上の抗原である。T.ゴンヂ由来の例示的な抗原としては、GRA6、ROP2A、ROP18、SAG1、SAG2A及びAMA1遺伝子産物が挙げられる。
アレルゲン及び環境抗原
一部の実施形態においては、抗原は、アレルゲン又は環境抗原である。
例示的なアレルゲン及び環境抗原としては、花粉アレルゲン(木、草本、草及びイネ科草本花粉アレルゲン)、昆虫アレルゲン(吸入、唾液及び毒液アレルゲン)、動物の毛及びフケアレルゲン、食品アレルゲンなどの天然アレルゲン由来の抗原が挙げられるが、それらに限定されない。
木、イネ科草本及び草本由来の重要な花粉アレルゲンは、とりわけ、カバノキ(カバノキ属)、ハンノキ(ハンノキ属)、ハシバミ(ハシバミ属)、シデ(クマシデ属)及びオリーブ(オリーブ属)、ヒマラヤスギ(クリプトメリアアンド ジュニペルス(Cryptomeriaand Juniperus))、スズカケノキ(プラタナス)を含めたブナ目、モクセイ目、マツ目及びスズカケノキ科、すなわち、ドクムギ属、アワガエリ属、イチゴツナギ属、ギョウギシバ属、カモガヤ属、シラゲガヤ属、クサヨシ属、ライムギ属及びモロコシ属のイネ科草本を含めたイネ目、とりわけ、ブタクサ属、ヨモギ属及びヒカゲミズ属の草本を含めたキク目及びイラクサ目から生ずる。使用することができる別のアレルゲン抗原としては、ヒョウヒダニ属及びシワダニ(Euroglyphus)属のチリダニ、貯蔵庫ダニ、例えば、サヤアシニクダニ(Lepidoglyphys)、ニクダニ属及びケナガコナダニ属由来のアレルゲン、ゴキブリ、小昆虫及びノミ、例えば、チャバネゴキブリ属、ゴキブリ属、ユスリカ属及びイヌノミ属由来のアレルゲン、ネコ、イヌ及びウマなどの哺乳動物、トリ由来のアレルゲン、ミツバチ(ミツバチ上科)、スズメバチ(スズメバチ上科)及びアリ(アリ上科)を含めた膜翅目由来のものなどの刺咬昆虫(stinging or biting insects)由来のものを含めた毒液アレルゲンが挙げられる。使用することができる更に別のアレルゲン抗原としては、アルテルナリア属及びクラドスポリウム属などの真菌由来の吸入アレルゲンが挙げられる。
例示的な食品アレルゲンとしては、牛乳(例えば、ラクトース)、卵、ナッツ、甲殻類、魚、及びマメ科植物(ピーナッツ及びダイズ)、果実、トマトなどの野菜が挙げられる。
抗原がアレルゲンであるときには、MDNPは、送達アレルゲンに対してTh1(細胞性)又はTh2(液性)分極に特異的な免疫応答を誘導する1個以上の免疫調節性分子、又は免疫調節性分子をコードする1個以上の核酸を含むことができる。
腫瘍抗原
一部の実施形態においては、抗原は、腫瘍抗原である。癌遺伝子発現産物、選択的にスプライスされた発現産物、変異遺伝子産物、過剰発現遺伝子産物、異常発現遺伝子産物、腫瘍ウイルスによって産生される抗原、癌胎児性抗原、並びに改変細胞表面糖脂質を含むタンパク質、及び改変グリコシル化プロファイルを有するタンパク質を含めて、ただしそれらに限定されない、多数のクラスの腫瘍抗原が存在する。
MDNPに含まれる、又はMDNPによってコードされた、例示的な腫瘍抗原としては、アルファ-アクチニン-4、アルファフェトプロテイン(AFP)、Bcr-Abl融合タンパク質、癌胎児性抗原(CEA)、CA-125、Casp-8、ベータ-カテニン、cdc27、cdk4、cdkn2a、coa-1、dek-can融合タンパク質、上皮性腫瘍抗原、EF2、ETV6-AML1融合タンパク質、LDLR-フコシルトランスフェラーゼAS融合タンパク質、HLA-A2、HLA-A11、hsp70-2、KIAAO205、Mart2、Mum-1、2及び3、neo-PAP、ミオシンクラスI、OS-9、pml-RARa融合タンパク質、PTPRK、K-ras、N-ras、トリオースリン酸イソメラーゼ、Bage-1、Gage 3、4、5、6、7、GnTV、Herv-K-mel、Lage-1、黒色腫関連抗原(MAGE);Mage-A1、2、3、4、6、10、12、Mage-C2、NA-88、NY-Eso-1/Lage-2、SP17、SSX-2、及びTRP2-Int2、MelanA(MART-I)、gp100(Pmel17)、チロシナーゼ、TRP-1、TRP-2、MAGE-1、MAGE-3、BAGE、GAGE-1、GAGE-2、p15(58)、CEA、RAGE、NY-ESO(LAGE)、SCP-1、Hom/Mel-40、PRAME、p53、H-Ras、HER-2/neu、BCR-ABL、E2A-PRL、H4-RET、IGH-IGK、MYL-RAR、エプスタインバーウイルス抗原、EBNA、ヒトパピローマウイルス(HPV)抗原E6及びE7、TSP-180、MAGE-4、MAGE-5、MAGE-6、p185erbB2、p180erbB-3、c-met、nm-23H1、PSA、TAG-72-4、CA19-9、CA72-4、CAM17.1、NuMa、K-ras、b-カテニン、CDK4、Mum-1、p16、TAGE、PSMA、PSCA、CT7、テロメラーゼ、43-9F、5T4、791Tgp72、a-フェトプロテイン、13HCG、BCA225、BTAA、CA125、CA15-3(CA27.29\BCAA)、CA195、CA242、CA-50、CAM43、CD68\KP1、CO-029、FGF-5、G250、Ga733(EpCAM)、HTgp-175、M344、MA-50、MG7-Ag、MOV18、MUC-1、NB\70K、NY-CO-1、RCAS1、SDCCAG16、TA-90(Mac-2結合タンパク質\シクロフィリンC関連タンパク質)、TAAL6、TAG72、TLP、チロシナーゼ、TPSなど、ただしそれらに限定されない、腫瘍関連又は腫瘍特異性抗原が挙げられる。例示的な腫瘍抗原は、モデル黒色腫腫瘍抗原Trp1である。
ある実施形態においては、腫瘍抗原は、「癌胎児性」タンパク質、正常タンパク質の選択的にスプライスされた変異体など、通常は胚形成中に発現される遺伝子の遺伝子産物であり、正常な成体組織におけるその発現が制限される遺伝子の遺伝子産物である。癌胎児性抗原は、一般には胎児発生中にのみ存在するが、ある種の癌を有する成体に見られる、タンパク質である。これらのタンパク質は、癌を有する個体の血中でしばしば測定され、腫瘍の診断とその後の処置の両方に利用することができる。したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、1種以上の癌胎児性タンパク質を含み、又はコードする。例示的な癌胎児性タンパク質は、Hmga2タンパク質である。
c.別の治療薬又は予防薬
MDNP内にカプセル化することができる、又はMDNPの表面に結合することができる、活性剤の非限定的なリストは、抗感染薬、免疫調整剤、ホルモン、抗酸化剤、ステロイド、抗増殖剤及び診断薬を含む。治療薬は、薬物、又はプロドラッグ、類似体などの薬物の改変体を含み得る。一部の実施形態においては、MDNPは、ペプチド薬物、色素、抗体、又は抗体の抗原結合断片の送達に使用される。
治療薬
一部の実施形態においては、MDNPは、1種以上の治療薬を包む。
MDNPに付随し得る治療薬の例としては、ベータ-ラクタム抗生物質(アンピシリンなどのペニシリン、更にはセフロキシム、セファクロル、セファレキシン、セフィドロキシル(cephydroxil)及びセフポドキシムプロキセチルから選択されるセファロスポリンを含む);テトラサイクリン抗生物質(ドキシサイクリン及びミノサイクリン);ミクロライド(microlides)抗生物質(アジスロマイシン、エリスロマイシン、ラパマイシン及びクラリスロマイシン);フルオロキノロン(シプロフロキサシン、エンロフロキサシン、オフロキサシン、ガチフロキサシン、レボフロキサシン)ノルフロキサシン、抗酸化薬はN-アセチルシステイン(NAC)を含む;非ステロイド性薬物などの抗炎症薬(例えば、インドメタシン、アスピリン、アセトアミノフェン、ジクロフェナクナトリウム及びイブプロフェン);ステロイド性抗炎症薬(例えば、デキサメタゾン);抗増殖剤(例えば、パクリタキセル(タキソール)、QP-2ビンクリスチン、メトトレキサート、アンジオペプチン、マイトマイシン、BCP678、アンチセンスc-myc、ABT578、アクチノマイシンD、RestenASE、1-クロル-デオキシアデノシン、PCNAリボザイム及びセレコキシブ)シロリムス、エベロリムス及びABT-578)、パクリタキセル、及びアルキル化剤(例えば、シクロホスファミド、メクロレタミン、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン、ロムスチン、イホスファミド、プロカルバジン、ダカルバジン、テモゾロマイド、アルトレタミン、シスプラチン、カルボプラチン及びオキサリプラチン)、抗腫瘍性抗生物質(例えば、ブレオマイシン、アクチノマイシンD、ミトラマイシン、マイトマイシンC、エトポシド、テニポシド、アムサクリン、トポテカン、イリノテカン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、イダルビシン、エピルビシン、ミトキサントロン及びミトキサントロン)、代謝拮抗物質(例えば、デオキシコホルマイシン、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、アザチオプリン、2-クロロデオキシアデノシン、ヒドロキシ尿素、メトトレキサート、5-フルオロウラシル、カペシタビン、シトシンアラビノシド、アザシチジン、ゲムシタビン、リン酸フルダラビン及びアスパラギナーゼ)を含めた抗腫瘍薬;有糸分裂阻害剤(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビノレルビン、ドセタキセル、エストラムスチン);抗体、抗体断片又は炭水化物/多糖を含む分子標的薬(例えば、イマチニブ、トレチノイン、ベキサロテン、ベバシズマブ、ゲムツズマブオゴミシン(ogomicin)及びデニロイキン ジフチトクス);並びにコルチコステロイド(例えば、フルオシノロンアセトニド及びメチルプレドニゾロン)が挙げられるが、それらに限定されない。
免疫調節剤
ある実施形態においては、MDNPは、送達抗原に対してTヘルパー細胞1(Th1、細胞性)又はTヘルパー細胞2(Th2、液性)分極に特異的な免疫応答を誘導するように生成される、1個以上の免疫調節性分子、又は免疫調節性タンパク質をコードする核酸を包む。
これは、防御と相関するTh経路を増進することによって抗原に関連する疾患に対する機能的免疫を高める、又は抗原に対する不適当な免疫応答と相関するTh経路から免疫応答を引き離すことによって寛容性が得られる可能性がある。したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、液性応答を低下させ、かくしてアレルギーに対処するために、アレルゲンに対する細胞性免疫を惹起するタンパク質をコードする分子又はRNAを含む。この原理を適用して、例えば、Th2応答を惹起して、多発性硬化症又は関節リウマチのTh1に関連する症状を抑えることによって、自己免疫疾患の原因である自己抗原に対して寛容化することができる。例示的な免疫調節性分子としては、合成受容体リガンド若しくはタンパク質、サイトカイン又は他のシグナル伝達分子が挙げられる。
非炎症性抗体アイソタイプ(すなわち、免疫グロブリンA(IgA)及び免疫グロブリンG(IgG4))に向かい、アレルギー反応に関連する免疫グロブリンE(IgE)アイソタイプから離れる、B細胞のクラススイッチが望ましい場合もある。したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、非炎症性抗体アイソタイプに対するB細胞のクラススイッチを惹起することができる分子を含み、又はコードする。例示的な免疫調節性分子としては、IL-10などのインターロイキンが挙げられる。
4.多重修飾デンドリマー系ナノ粒子
一部の実施形態においては、MDNPは、1タイプを超えるカプセル剤分子を含む(すなわち「多重」MDNP)。例えば、MDNPは、mRNA、repRNAなどの1種を超えるRNAを含むことができる。mRNA及びrepRNAは、同じ又は異なる遺伝子をコードすることができる。一部の実施形態においては、多重MDNPは、1種を超えるrepRNA及び1種を超えるmRNAを含むように設計される。repRNA及びmRNAは、同じ又は異なる遺伝子をコードすることができる。
mRNAとrepRNAが同じ多重MDNP内に封入されるときには、mRNA及びrepRNAは、相補的5’及び3’非翻訳領域(UTR)を含むように操作することができる。例えば、repRNAによってコードされたRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)によって認識されるUTRを含むようにmRNAを修飾することができる(「修飾mRNA」)。
同じ又は相補的UTRを含む修飾mRNAとrepRNA種が宿主細胞の細胞質に同時に入ると、repRNAによってコードされたRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)が、レプリコンUTRの認識を通して、修飾mRNAを複製することができる。
この戦略のために、2タイプの増幅可能なペイロードが細胞質に同時に送達される。レプリコンUTRを有する修飾mRNAの添加は、1つの代わりに2つの増幅可能なペイロードが細胞に同時に送達されるので、システムの総合効率を高める。したがって、repRNAは、完全長レプリコンのより多くの複製物、又はrepRNAによってコードされた抗原のみの複製物(すなわち、サブゲノムプロモーターによる)、又は多重MDNP内に含まれる修飾mRNAのより多くの複製物を合成することができる。
宿主細胞リボソームは、完全長レプリコン複製物又はより短い抗原のみのmRNAを連続して翻訳して、修飾mRNA及びrepRNAによってコードされた遺伝子の発現を高める(図1B参照)。
したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、2つ以上のペイロードタイプを同時に輸送する多重MDNPである。例えば、MDNPは、1個以上のrepRNA、並びにレプリコンの5’及び3’非翻訳領域(UTR)を組み込む1個以上のmRNAを輸送することができる。1個以上のrepRNA及び1個以上のmRNAは、同じ又は異なる遺伝子をコードすることができる。一部の実施形態においては、MDNPは、2個以上の異なるペプチド抗原をコードする2個以上の遺伝子を含む。
更なる実施形態においては、多重MDNPは、1個以上のrepRNAと、レプリコン付加核酸(replicon additional nucleic acid)の5’及び3’非翻訳領域(UTR)を組み込む1個以上のmRNAと、場合によっては、機能性核酸、タンパク質、小分子などの1種以上の追加の活性剤とを含むように処方することができる。
一部の実施形態においては、多重MDNPは、1種を超える原生動物抗原をコードする1個以上のrepRNAを含むように処方される。例示的一実施形態においては、多重MDNPは、T.ゴンヂのGRA6、ROP2A、ROP18、SAG1、SAG2A及びAMA1遺伝子産物をコードする。
一部の実施形態においては、多重MDNPは、オルソミクソウイルス科の1種以上のウイルス、例えば、インフルエンザウイルスA、インフルエンザウイルスB及びインフルエンザウイルスCに由来する2種以上のウイルス抗原を含むように処方される。例示的一実施形態においては、多重MDNPは、季節性及び汎発性インフルエンザウイルス系統を含めて、同じ又は異なるA型インフルエンザウイルスサブタイプ由来の2種以上の抗原をコードするRNAを含む。例えば、一部の実施形態においては、多重MDNPは、H1N1、H1N2、H3N2、H3N1、H5N1、H2N2及びH7N7サブタイプの1つ以上に由来する2種以上の抗原を含む。一部の実施形態においては、多重MDNPは、赤血球凝集素のHA1サブユニット、赤血球凝集素のHA2サブユニット、ノイラミニダーゼ、PB1、PB2PA及びPB1-F2の1種以上などのウイルスRNAポリメラーゼ、逆転写酵素、カプシドタンパク質、NS1、NEPなどの非構造タンパク質、核タンパク質、M1、M2などの基質タンパク質、孔タンパク質などのH1N1、H1N2、H3N2、H3N1、H5N1、H2N2及びH7N7インフルエンザウイルスサブタイプの1つ以上に由来する2種以上のタンパク質又は糖タンパク質を含む。一部の実施形態においては、多重MDNPは、H1N1、H1N2、H3N2、H3N1、H5N1、H2N2及びH7N7サブタイプの2つ以上に由来する2種以上のHA抗原を含む。
B.賦形剤、送達ビヒクル及び装置
MDNPは、ナノ粒子を対象の体内に投与するのに適切な賦形剤を含む組成物中に処方することができる。
ある実施形態においては、MDNPは、注射、例えば、筋肉内(i.m.)、静脈内(i.v.)、皮下(s.c.)、腹腔内(i.p.)によって、又は皮膚乱切によって、対象内に送達するのに適切な担体又は賦形剤中に処方される。典型的な担体は、食塩水、リン酸緩衝食塩水、グルコース溶液、及び他の注射用担体である。
したがって、送達ビヒクルを含む、又は含まない、MDNPを含む製剤について記述する。MDNPは、1種以上の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物に処方することができる。医薬組成物は、MDNPの所望の目的、及び意図した用途に応じて、異なる投与機序用に処方することができる。非経口投与経路(筋肉内、腹腔内、静脈内(IV)、眼内又は皮下注射)、局所若しくは経皮投与経路(受動的に、又はイオントフォレーシス若しくは電気穿孔法を用いて)による、又は生分解性(bioerodible)挿入断片を用いた、投与用に処方された医薬組成物について記述する。
1.非経口投与
一部の実施形態においては、MDNPは、非経口注射による水溶液投与用に処方される。製剤は、懸濁液剤又は乳濁液剤の形とすることもできる。一般に、医薬組成物は、有効量の活性剤、ターゲティング成分及び場合によっては送達ビヒクルを含んで提供され、場合によっては、薬学的に許容される希釈剤、防腐剤、可溶化剤、乳化剤及び/又は担体を含む。こうした組成物は、希釈剤滅菌水と、種々の緩衝剤内容物(例えば、トリス-HCl、酢酸塩、リン酸塩)、pH及びイオン強度の緩衝食塩水と、場合によっては洗浄剤及び可溶化剤(例えば、ポリソルベート20又は80とも称されるTWEEN(登録商標)20、TWEEN(登録商標)80)、抗酸化剤(例えば、アスコルビン酸、メタ重亜硫酸ナトリウム)、防腐剤(例えば、Thimersol、ベンジルアルコール)、バルク化物質(例えば、ラクトース、マンニトール)などの添加剤とを含む。非水溶媒又はビヒクルの例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、オリーブ油、トウモロコシ油などの植物油、ゼラチン、及びオレイン酸エチルなどの注射用有機エステルである。製剤を凍結乾燥させ、使用直前に再溶解/再懸濁することができる。製剤は、例えば、細菌保持フィルタ濾過によって、殺菌剤を組成物に混ぜ込むことによって、組成物に照射することによって、又は組成物を加熱することによって、滅菌することができる。
2.肺、局所及び粘膜投与
MDNPの組成物は、局所、滴下又は吸入適用用に処方することができる。一部の実施形態においては、MDNPは、肺、口、目、肺、鼻、口(舌下、頬)、膣、直腸粘膜などの粘膜への投与用に処方される。粘膜投与製剤は、一般に、噴霧乾燥薬物粒子であり、錠剤、ゲル剤、カプセル剤、懸濁液剤又は乳濁液剤に混ぜ込むことができる。標準医薬品賦形剤は、任意の処方者から入手可能である。
一部の実施形態においては、MDNPは、例えば、罹患した、損傷を受けた、又は裂けた皮膚の表面に直接適用することによって、皮膚に送達するために処方される。したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、創傷又は手術部位に送達するために処方される。局所送達用に処方された組成物は、1種以上の浸透促進剤を含むことができる。
一実施形態においては、MDNPは、鼻腔内投与、経口吸入などの肺送達用に処方される。気道は、空気と血流の間のガス交換に関与する構造体である。上下気道は、誘導気道と呼ばれる。終末細気管支は、呼吸細気管支に分岐し、呼吸細気管支は、次いで、最終的な呼吸領域である肺胞、すなわち肺深部に至る。肺深部、すなわち肺胞は、吸入された治療用エアロゾルの全身薬物送達のための最初の標的である。肺で活性である治療薬は、全身に投与することができ、肺吸収によって標的に向けることができる。エアロゾルという用語は、溶液でも懸濁液でもよい、粒子の微細なミストの任意の調製物を指し、噴霧剤を用いて生成されるか否かにかかわらない。エアロゾルは、超音波処理、高圧処理などの標準技術を用いて生成することができる。
肺製剤用担体は、乾燥粉末製剤用のものと溶液としての投与用のものに分類することができる。治療薬を気道に送達するためのエアロゾルは、当該技術分野で公知である。上気道を介した投与の場合、製剤は、点滴薬又は噴霧剤として鼻腔内投与用に、溶液、例えば、水又は緩衝若しくは非緩衝等張食塩水に、又は懸濁液として、処方することができる。好ましくは、こうした溶液又は懸濁液は、鼻汁と等張であり、ほぼ同じpH、例えば、約pH4.0~約pH7.4又はpH6.0~pH7.0である。緩衝剤は、生理的に適合すべきであり、単なる例として、リン酸緩衝剤などである。当業者は、経鼻及び/又は上気道投与用非侵害性水溶液の場合の適切な塩分及びpHを容易に決定することができる。
組成物は、吸入中に肺に送達することができ、空気力学的直径約5ミクロン未満のエアロゾル又は噴霧乾燥粒子として送達すると、肺上皮層を通って、血流に入ることができる。
粒径の大きい乾燥粉末製剤(「DPF」:dry powder formulation)は、凝集しにくいなど、流動性が改善され、エアロゾル化が容易であり、潜在的に食作用が少ない。吸入療法用乾燥粉末エアロゾルは、主に5ミクロン未満の範囲の平均直径で一般に生成されるが、好ましい範囲は、空気力学的直径で1~10ミクロンである。(薬物を含まない)大型「担体」粒子は、治療用エアロゾルと一緒に送達され、とりわけ効率的エアロゾル化を助ける。そのすべてが当業者によく知られた、噴霧器、定量吸入器及び粉末吸入器を含めて、ただしそれらに限定されない、治療用製品の肺送達用に設計された広範囲の機械装置を使用することができる。
III.修飾デンドリマー系ナノ粒子の製造方法
MDNPの製造方法を示す。一般に、該方法は、アルキル化デンドリマーを1種以上の治療薬、予防薬及び診断薬の存在下で1種以上の両親媒性ポリマーと組み合わせることを含む。
repRNAなどのカプセル剤を含むMDNPの製造方法について記述する。該方法は、例えば、大型repRNAをMDNPにパッケージするのに使用することができる。
一般に、MDNPを製造する方法は、MDNP内にパッケージされるカプセル剤の構造を何ら制限しない。例えば、MDNP内に封入された核酸は、長鎖でも短鎖でもよく、一本鎖でも二本鎖でもよく、任意の配列とすることができる。上記方法によって製造された治療薬、予防薬及び診断薬を含むMDNPの精製は、平凡なものであり、パッケージされていないカーゴの精製よりも単純であり得る。
核酸をMDNPに封入するときには、核酸は少なくとも純度80%であり得る。別の実施形態においては、核酸は、少なくとも純度85%、少なくとも純度90%、又は少なくとも純度95%である。一般に、1個のMDNPは、少なくとも1分子の核酸を含む。
一実施形態においては、RNAは、修飾デンドリマー/RNAモル比約5:1でMDNP内にパッケージされる。
A.多重修飾デンドリマー系ナノ粒子の構築
一般に、MDNPは、イオン性デンドリマーと、親水性固定化ポリマーと、治療薬、予防薬及び診断薬との混合によって処方される。混合は、マイクロ流体混合の使用などの当該技術分野で公知の任意の適切な手段によって行うことができる(Khanら、Nano Lett、doi:10.1021/nl5048972(2015)、Khanら、Angewandte Chemie53、14397~14401、doi:10.102/anie.201408221(2014))。
修飾デンドリマーと両親媒性ポリマーは、エタノールなどの適切な溶媒を用いて組み合わせることができる。RNA分子がMDNP内にカーゴとして含まれるときには、RNAをクエン酸緩衝剤(pH2~4)などの低pH緩衝剤で希釈することができる。
B.MDNPの精製
MDNPは、その特有のサイズ、性質及び高い安定性のため、構築後に基質から容易に精製することができる。上記方法によって製造された様々な治療薬、予防薬及び診断薬を含むMDNPの精製は、簡単であり、高速タンパク質液体クロマトグラフィ(FPLC:fast protein liquid chromatography)、濾過、沈降、スクロース勾配分離、親和性タグクロマトグラフィ、流動場分画多角度光散乱(FFF-MALS:flow-field fractionation multi-angle light scattering)などの当該技術分野で公知の標準方法を用いて行うことができる。一部の実施形態においては、ナノ粒子は、例えば0.2ミクロンポリ(エーテルスルホン)フィルタを用いた、濾過によって精製することができる。
精製ナノ粒子は、光散乱などの当該技術分野で公知の任意の技術を用いて特徴づけることができる。
一部の実施形態においては、粒子は、成熟粒子の界面動電位、すなわちゼータ電位に基づいて特徴づけることができ、及び/又は単離することができる。ゼータ電位は、粒子間の静電気又は電荷斥力/引力の大きさの尺度である。PBS中の完全に形成された粒子のゼータ電位は、約-2mV~約-25mV(両端を含む)、例えば、-5mV~-20mVの範囲であり得る。粒子のゼータ電位を測定し、ゼータ電位に基づいて粒子を単離する方法は、当該技術分野で公知である。
一部の実施形態においては、粒子は、成熟粒子の分子量及び/又は流体力学的体積に基づいて特徴づけることができ、及び/又は単離することができる。粒子のコアの処方に使用される世代サイズに応じて、完全に形成された粒子の分子量を約2,000Da~約80,000Da(両端を含む)の範囲にすることができる。粒子の分子量を測定し、分子量に基づいて粒子を単離する方法は、当該技術分野で公知である。
MDNPは、様々な質量比の修飾デンドリマーと疎水性固定化ポリマーを含むように処方することができる。一般に、MDNPは、疎水性固定化ポリマーよりも質量の多い修飾デンドリマーを含む。例えば、MDNPは、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1、10:1、11:1、12:1、13:1、14:1、15:1、15:1超などの2:1~20:1の質量比の修飾デンドリマーと疎水性固定化ポリマーを含むように処方することができる。ある一実施形態においては、MDNPは、修飾デンドリマーと疎水性固定化ポリマーの質量比が11.5:1である。MDNP内にカプセル化された治療薬、予防薬及び診断薬の最終濃度は、理論物質収支計算によって求めることができる。一般に、MDNPは、治療薬、予防薬及び診断薬よりも質量の多い修飾デンドリマーを含む。例えば、MDNPは、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1、10:1、10:1超などの2:1~10:1の質量比の修飾デンドリマーと治療薬、予防薬及び診断薬を含むように処方することができる。カプセル剤がRNAを含むある一実施形態においては、MDNPは、修飾デンドリマーとRNAの質量比が5:1である。
カプセル剤がDNA及び/又はmRNAを含む一部の実施形態においては、MDNPは、修飾デンドリマーとRNAの質量比が2:1~10:1(両端を含む)である。
IV.使用方法
MDNPを使用する方法について述べる。MDNPが、大きい核酸及び/又はポリペプチドを含むカプセル剤を対象の細胞に送達するための有効な生体適合性無毒ビヒクルを与えることが立証された。MDNPは、非免疫原性でもあり、対象の血清中で、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、数週間、数か月などの長期間存続することができる。例えば、MDNPは、宿主の免疫監視を回避して、MDNPの血清中半減期を延長し、食胞及び/又は非食細胞タイプのリソソーム区画内に内部移行するように設計することができる。
MDNPは、多数の細胞型によって容易に取り入れられ、封入された治療薬、予防薬及び診断薬を生物学的標的に効率的に送達する。例えば、MDNPが宿主細胞の細胞質に移行すると、核酸、小分子及びタンパク質カプセル剤を細胞質空間に堆積することができる。カプセル剤が外来遺伝子を含むと、遺伝子は、宿主細胞中で発現され、免疫調節などの生物学的エフェクター機能を生じることができる。
したがって、MDNPを使用する方法は、MDNPを含む有効量の組成物を対象に投与して、1個以上の外来遺伝子又はポリペプチドを対象の細胞に送達することを含むことができる。一般に、細胞は、プロフェッショナル抗原提示細胞ではない。
MDNPは、レシピエントの細胞において免疫調節効果などの生物学的効果を誘導することができる。例えば、MDNPは、対象において所望の抗原に対する免疫応答を刺激するのに使用することができる。一部の実施形態においては、MDNPは、疾患に対する免疫応答を誘発する免疫原として働くRNA新抗原の安全で有効な送達ビヒクルである。
対象における標的遺伝子の発現又は機能を防止、抑制又は阻害する方法も提供する。
A.核酸及びポリペプチドを送達する方法
MDNPが、細胞内部への大型repRNAを含めた核酸治療薬、予防薬及び診断薬を効果的に送達して、標的細胞における外来遺伝子の発現を増大させ得ることが立証された。一般に、repRNAによってコードされた遺伝子の発現は、対象において、RNAが単独で送達されるときよりもrepRNAがMDNP内に送達されるときの方が大きい。例えば、MDNP内にカプセル化された1個以上の外来遺伝子をコードするrepRNAを細胞に送達すると、等量の純粋なrepRNA単独の投与に比べて、又はMDNP内にカプセル化された非複製mRNAの細胞への送達に比べて、細胞内の外来mRNA配列の翻訳を促進し、外来ペプチドの長期発現を維持することができる。
MDNPは、粒子が宿主細胞の内部に取り込まれるまで、核酸を分解から保護する。恐らく、MDNPは、一般化されたエンドサイトーシスによって細胞内部に取り込まれる。MDNPは、外来核酸及びポリペプチドを真核生物細胞に生体内で又はインビトロで送達することができる。一般に、送達は、標的細胞によるMDNPの接触及び内部移行を必要とする。内部移行は、1つ以上の異なる機序によって起こり得る。MDNPと標的細胞の接触は、生体内で又はインビトロで起こり得る。一般に、接触は生体内で起こる。
したがって、一部の実施形態においては、MDNPを対象に投与する。一部の実施形態においては、MDNPを対象の特定の身体部位に直接投与する。更なる実施形態においては、投与経路は、MDNPを特定の器官に直接向ける。
MDNPを含む医薬組成物は、局所投与又は全身投与のどちらが望ましいかによって、また、処置する領域に応じて、種々の様式で投与することができる。注射用製剤は、溶液剤若しくは懸濁液剤、注射前の懸濁液の溶液に適切な固形剤として、又は乳濁液剤として、従来の形態で調製することができる。ある実施形態においては、組成物を局所的に、例えば、注射によって治療部位に直接投与する。一部の実施形態においては、局所送達は、全身送達に付随する副作用又は毒性を低減することができ、局所的な用量が増加するため、向上した結果を得ることができる。
組成物は、1つ以上の手術部位に直接注射又は投与することができる。一般に、局所注射は、MDNP組成物の局所濃度を増加させ、それは全身投与で得ることができる局所濃度よりも高い。
一部の実施形態においては、全身投与されたMDNPは、ある期間にわたって血流中に存続し、カプセル剤を標的細胞に放出する。好ましくは、定常的な放出によって、標的細胞における外来核酸又はポリペプチドの所望の濃度を維持する。
MDNPの組成物は、疾患の症候の発生前、発生中若しくは発生後の期間に、又は1つ以上の症候の発生前、発生中若しくは発生後の任意の組合せの期間に、投与することができる。例えば、症候の発生前に(すなわち、予測発生日前に)1、2、3、4、5、6 7、14、21、28、35又は48日ごとに1回以上の組成物を対象に投与することができる。症候の発生後に1、2、3、4、5、6、7、14、21、28、35又は48日ごとに1回以上の組成物を対象に投与することができる。一部の実施形態においては、症状の改善が明らかになる前に、組成物を複数回投与する。例えば、一部の実施形態においては、対象は、疾患又は症状の改善が明らかになる前に、1、2、3、4、5、6 7、14、21、28、35若しくは48日又は週間にわたって、1、2、3、4、5、6 7、14、21、28、35又は48回投与される。
したがって、1個以上のMDNPを含む組成物は、標的細胞に送達される核酸又はポリペプチドの所望の効果に応じて、診断、予後、手術又は傷害に関連して様々な時間で投与することができる。MDNPの投与開始のタイミングは、対象の要求に基づいて決定されるべきであり、それに応じて変動し得る。
一部の実施形態においては、単一用量のMDNPを対象に1回以上の大量瞬時投与として送達して、MDNPの血中濃度、又はMDNPのペイロードの血中濃度を所望のレベルに上昇させる。大量瞬時投与は、注射などの任意の手段によることができる。大量瞬時投与の位置は、所望の効果、及び処置される標的器官又は組織に応じて変わり得る。特定の一実施形態においては、大量瞬時投与は、別の剤形の投与前に行われる。
例えば、MDNPは、例えば、ターゲティング成分、PEG化、ポリマー表面密度などの1つ以上の変更によって、血流中の滞留時間が変わるように設計することができる。したがって、MDNPの所望の血中濃度は、所望のとおりに、同時に投与される製剤の組合せを用いて、又はある期間にわたって一連の投与として、所望の期間維持することができる。
B.ワクチン接種
一部の実施形態においては、MDNPは、外来タンパク質及び/又は核酸を対象に送達して、対象における所望の免疫応答を刺激することができる。MDNPを介した抗原の送達は、ウイルス、細菌などの感染病原体に対する防御免疫を与える。修飾デンドリマーの非免疫原性は、エボラ曝露に対して防御する用量よりも50倍高い用量でも(Khanら、Nano Lett、doi:10.1021/nl5048972(2015)、Khanら、Angewandte Chemie53、14397~14401(2014))、効率的導入遺伝子発現に有利な性質であり、自然免疫の刺激は、mRNAペイロードのみの発現による。
MDNP内に封入された大型自己増幅RNAレプリコンを用いたワクチン接種方法を示す。該方法は、注射後早期にIFN応答を刺激せずに免疫系に対して強力で持続的な抗原提示を可能にする。強力なIFN応答は、アルファウイルス複製を妨害し、したがって、抗原用量を次第に制限する可能性がある。(Zhangら、J Virol81、11246~11255、(2007)、Whiteら、J Virol75、3706~3718(2001))。
(後で考察する)OVAペプチド、HA抗原及びEBOV GP抗原ペプチドをコードするrepRNAを含むMDNPを用いて行われた実験によれば、MDNPは、repRNAを細胞に送達して、ある範囲のウイルスに対して、また、OVAペプチドに対しても、強力な免疫応答を発生させることができる。
別のタンパク質でこれらのペプチドを置換することができる。これらとしては、ウイルス、細菌、真菌、原生動物などの病原微生物、及び癌抗原に由来するタンパク質が挙げられる。したがって、MDNPは、多種多様な病原微生物を標的にした、RNAによってコードされた抗原、新抗原などのワクチン薬剤を送達する安全で有効なプラットホームとして役立つことができる。
一般に、外来抗原を対象の細胞にMDNPによって送達すると、抗原を認識し、中和することができる抗体及び他の生体分子が産生される。抗原提示細胞(APC)の表面に整列した抗原を、抗原特異的ナイーブCD4+T細胞などの「ヘルパー」T細胞に提示することができる。こうした提示によって、信号がT細胞受容体(TCR:T cell receptor)を介して送られ、それによって、T細胞は提示されたものに特異的である免疫応答を開始する。
したがって、MDNPを使用して、コードされた抗原に対する液性及び/又は細胞性免疫を惹起、緩和又は増強することができる。例えば、MDNPは、マクロファージ、B細胞、T細胞、樹状細胞、NK細胞などの免疫細胞の生物活性を誘導、増強又は緩和するのに有効な量の外来核酸及び/又はタンパク質を送達する。
一部の実施形態においては、抗原をコードする核酸配列を含むMDNPの対象への投与は、抗原に対する免疫を対象に付与する。免疫は、対象において、繰り返しの抗原曝露に対して急速な免疫細胞性及び/又は液性免疫応答を示すのに十分な蓄積のメモリーT細胞(すなわち、メモリーCD8+T細胞)及び/又は抗原特異的B細胞の産生として現れ得る。好ましくは、抗原をコードする核酸配列を含むMDNPの投与は、抗原が由来する生物(単数又は複数)に起因する感染又は疾患を予防する。
一般に、抗原をコードする核酸配列を含むMDNPの対象への投与は、等量の抗原又は抗原をコードする核酸単独の投与に比べて、抗原の取り込み及び対象の抗原提示細胞への抗原の送達を促進する。したがって、MDNPを介した対象への抗原の投与は、等量の抗原又は抗原をコードする核酸単独の投与に比べて、対象における抗原に対する免疫応答を増強することができる。例えば、MDNPは、対象の抗原提示細胞の表面におけるコードされた抗原の提示を増加、延長又は増強することができる。
ワクチンは、予防的又は治療的に投与することができる。ワクチンは、ワクチンスケジュールに従って投与することもできる。ワクチンスケジュールは、すべての投与のタイミングを含む一連のワクチン接種である。多くのワクチンは、十分な初期免疫応答を得るために、又は次第に薄れる応答を押し上げるために、有効性を最大にする複数回の投与を必要とする。ワクチンスケジュールは、当該技術分野で公知であり、最大の有効性が得られるように設計される。MDNP中で送達される1種以上の抗原に対する適応免疫応答は、ワクチン接種手順の有効性を測定する当該技術分野で公知の方法によってモニターすることができる。
一部の実施形態においては、MDNPは、外来タンパク質及び/又は核酸を対象に送達し、宿主細胞によって発現され生物学的に処理された抗原に対して特異的に免疫応答を刺激する。したがって、MDNPによって送達される抗原をコードする核酸を用いたワクチン接種方法は、宿主対象に特異的な翻訳後修飾を含む抗原に対して免疫を与えることができる。例えば、MDNPによって送達される抗原をコードする核酸を用いたワクチン接種は、グリコシル化、脂質化(ミリストイル化、パルミトイル化、イソプレニル化を含む)、硫酸化、酸化、リン酸化、アデニル化、メチル化、アミド化などの宿主に生来の翻訳後修飾を含むタンパク質に対して免疫を与えることができる。これらの翻訳後修飾ペプチド抗原に対して対象によって引き起こされる免疫応答は、同じ抗原ペプチドの非天然発現体又は翻訳後修飾体に対して同じ宿主で引き起こされる免疫応答と同じでも異なってもよい。
1.複数のrepRNAの場合のワクチン接種戦略
上述したように、MDNPは、2個以上の異なるrepRNAを含むことができる。2個以上の異なるrepRNAは、同じ又は異なる外来免疫原性抗原を発現するように操作することができる。
一部の実施形態においては、ナノ粒子ワクチンは、各々抗原産生動力学が異なるmRNA、repRNAなどの異なるRNA種の組合せを含む。動力学の異なるRNAを「多重化する」ことによって、投与後に1種以上の抗原を異なる時間で発現するようにMDNP/RNAワクチンを設計することができる。多重MDNP/RNAワクチンは、異なるRNA種を各々含む異なるMDNPの混合物を含むことができ、又は各MDNPを1つを超えるRNA種を含むように設計することができる。
単一の抗原をコードする単一種のrepRNAなどの1つの種のRNAを含むようにMDNPが設計されると、所望量の各MDNPを混合することによって、所望の発現動力学を有する複合MDNPワクチンを生成するようにワクチンを設計することができる。
対象の細胞における外来抗原をコードするRNAの存続が有限であるため、MDNPベースのRNAワクチンは、自己制御式であり、宿主がRNAを排出し、すべてのワクチン生成物が体によって除去されるまで、有限の時間抗原を産生するにすぎない。抗原産生は宿主細胞質で起こり、細胞の核中の遺伝物質は決して操作されない。repRNA固有の自己増幅によって、ワクチン用量のわずかな増加が可能になり、抗原産生が非線形増加する。したがって、一部の実施形態においては、同じ抗原を発現する2個以上の異なるrepRNAを含むMDNPを使用して、発現動力学の異なるレシピエントの細胞において抗原の発現を誘導することができる。例えば、同じ抗原を発現する2個以上の異なるrepRNAの送達によって、発現産物の血清中半減期を変えることができる。
例えば、repRNAは、レシピエント細胞内で同じ抗原の発現を異なる速度で誘導することができる。したがって、異なるrepRNAが同じ抗原の発現を異なる速度で生じると、抗原の全血清中半減期を、1つの種のrepRNAしか送達されないときに比べて、延長することができる。
一部の実施形態においては、MDNPのカプセル剤を、1つを超えるRNA種を含むように操作して、投与後の長時間にわたって、又は一定時間にわたって、抗原を発現することができる。例えば、MDNPは、同じ又は異なる抗原をコードするmRNA及び1個以上のrepRNAを含むことができ、対象内の抗原(単数又は複数)の発現動力学を別個のものにし、異ならせることができる。
一部の実施形態においては、MDNPは、RNA新抗原などのカーゴを対象に送達して、対象における抗原の発現を2つ以上の異なる時期にする。例えば、抗原をコードするmRNA及び/又はrepRNAは、1つのRNA種の翻訳に関連する抗原の第1の「発現時期」を生じ、抗原の血清中濃度を増加させることができる。抗原発現が減少し、抗原血清中濃度が減少すると、第2のRNA種の翻訳に関連する同じ又は異なる抗原の第2の「発現時期」によって、抗原の血清中濃度が引き続き増加する。したがって、抗原を発現する2個以上の異なるrepRNAを含むMDNPをワクチン接種に使用するときには、MDNPワクチンの単独投与のみに基づいて、抗原(単数又は複数)の血清中濃度の一次(すなわち「初回抗原刺激」)増加を与え、続いて抗原(単数又は複数)の血清中濃度の二次又は更なる後続の(すなわち「追加免疫」)増加を与えるように、MDNP治療薬、予防薬及び診断薬を操作することが望ましいことがある。例えば、1個を超えるrepRNAを含むMDNPは、「自己追加免疫」ワクチンを与えることができる(図10A~10B参照)。
repRNAゲノムの選択は、repRNAによってコードされた抗原の発現に影響し得る。例えば、MDNP/repRNAワクチン投与後の所与の時点における抗原の血清中濃度は、特定のrepRNA遺伝子型と相関し得る(図5A~5G及び図6A~6G参照)。
コードされた遺伝子産物の発現の変化に関連するrepRNAの核酸配列の修飾を利用して、所望の発現動力学を与えるように操作された修飾repRNAの設計を支援することができる。一部の実施形態においては、repRNAは、特異抗原又は群抗原に対する血清中濃度及び血清中半減期の測定に基づいて、多重ワクチンに含まれるように設計される。
したがって、「自己追加免疫」MDNP媒介ワクチンに含まれる、コードされた抗原の発現動力学が異なるrepRNAは、repRNAの核酸配列を変更することによって開発することができる。例えば、アルファウイルス由来のrepRNAを使用して、外来抗原を宿主細胞において送達するときには、repRNAの1種以上の非構造タンパク質を変化させて、repRNAによってコードされた外来遺伝子の発現に影響を及ぼすことができる。
別の実施形態においては、MDNPビヒクルは、例えば、MDNPの血清中半減期を生体内で変えるMDNPの組成物の修飾によって、細胞に入り治療薬、予防薬及び診断薬をある速度で送達するように設計することができる。
更なる実施形態においては、MDNPは、例えば同じ又は異なる投与経路によって、1箇所を超える身体位置に送達され、血清中半減期及びMDNPの細胞取り込み動力学が変化し、続いて抗原発現の場所及び速度が変化する。
一部の実施形態においては、MDNPを使用して、repRNAを送達して、対象の細胞における抗原を発現させるときには、対象における同じ抗原特異的免疫応答を示すのに必要なrepRNAのモル量は、同じ抗原特異的免疫応答を示すようにMDNPによって送達されたmRNAのモル量よりも少ない。一般に、対象における抗原特異的免疫応答を示すのに必要なrepRNAを含むMDNPの量を、タンパク質抗原又は同じ抗原をコードするmRNAを含むMDNPの量よりも少なくすることができる。したがって、repRNAを含むMDNPを使用して、対象へのMDNPの導入に付随する望ましくない効果を抑制する抗原特異的免疫応答を対象において誘導することができる。
MDNPによって送達された異なるワクチン薬剤のスクリーニング方法についても記述する。一般に、該方法は、1種以上の異なる抗原又は抗原をコードする核酸を含むMDNPを対象に接種し、対象における免疫応答を評価することを含む。MDNP中で送達される1種以上の抗原に対する適応免疫応答は、ワクチン接種手順の有効性を測定する当該技術分野で公知の方法によってモニターすることができる。例えば、抗原特異的T細胞活性化の持続時間及び程度を、抗原発現動力学のマーカーとして使用することができる。抗原血清中濃度を使用して、抗原発現動力学を求めることもできる。
同じ又は異なる送達ビヒクル、同じ又は異なる手順、ワクチン接種スケジュール若しくは投与によって、異なる抗原又は抗原の組合せを接種した対象などの対照と結果を比較することができる。一部の実施形態においては、適切な対照は、非ワクチン接種対象である。
2.ワクチン接種される病原体/疾患
MDNPは、1つ以上の疾患及び障害の対象に接種するのに有効な量のタンパク質及び核酸抗原を対象に送達することができる。MDNPは、細菌、ウイルス、真菌、原生動物病原体などの多種多様な微生物病原体のワクチン接種プラットホームとして役立ち得る。
一部の実施形態においては、ワクチンの標的を、癌治療として1タイプの癌細胞にすることができる。あるいは、標的を多数の微生物病原体のいずれかにすることができる。ワクチン接種することができる例示的な疾患としては、ワクチンが現在入手可能である疾患が挙げられる。その代わりに、又はそれに加えて、MDNPは、食品アレルゲン、環境アレルゲンなどの1種以上のアレルゲンに対する免疫寛容を対象に誘導するためのプラットホームとして役立ち得る。
a.癌
ある実施形態においては、MDNPを使用して、対象を癌に対して免疫することができる。MDNPは、癌と診断された対象に(すなわち、治療ワクチンとして)、又は癌を発症する素因若しくはリスクのある対象に(すなわち、予防ワクチンとして)、投与することができる。一部の実施形態においては、MDNPの組成物を、1種以上の追加の治療薬に加えて、癌患者に投与する。
理想的な癌治療を行うために、バイオインフォマティクスを使用して、各患者の独特の腫瘍エクソームの配列を決定して、新抗原を同定する。次いで、これらの新抗原の対応するmRNAを使用して、免疫を生じるのに必要な抗原を産生する。最後に、これらのmRNAは、新しい腫瘍増殖及び転移に対して耐久性の長期の防御を生じるために、免疫系の細胞傷害性T細胞と液性の両方のアームを活性化することができる、アジュバントを用いないナノ技術送達プラットホームを用いて、送達される。
一部の実施形態においては、MDNPは、1種以上の腫瘍抗原、又は腫瘍抗原を発現する1個以上の核酸を含む。MDNPを使用して、腫瘍又は腫瘍環境内に位置する腫瘍細胞及び非腫瘍細胞に対して免疫及び治療活性を示すことができる。MDNPは、固形腫瘍及び血液の癌に対して防御及び/又は治療活性を示すように処方することができる。例示的な腫瘍細胞としては、急性白血病、急性リンパ性白血病、骨髄芽球性、前骨髄球性、骨髄単球性、単球性、赤白血病、骨髄異形成症候群などの急性骨髄性白血病、慢性骨髄球性(顆粒球性)白血病、慢性リンパ性白血病、有毛細胞白血病など、ただしそれらに限定されない慢性白血病を含めて、ただしそれらに限定されない白血病;真性赤血球増多症;ホジキン病、非ホジキン病など、ただしそれらに限定されないリンパ腫;くすぶり型多発性骨髄腫、非分泌性骨髄腫、骨硬化性骨髄腫、形質細胞性白血病、孤立性形質細胞腫及び髄外形質細胞腫など、ただしそれらに限定されない多発性骨髄腫;ワルデンシュトレームマクログロブリン血症;有意性が未確定のモノクローナル高ガンマグロブリン血症;良性モノクローナル高ガンマグロブリン血症;H鎖病;骨の肉腫、骨肉腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性巨細胞腫、骨の線維肉腫、脊索腫、骨膜性骨肉腫、軟部組織肉腫、血管肉腫(血管内皮腫)、線維肉腫、カポジ肉腫、平滑筋肉腫、脂肪肉腫、リンパ管肉腫、神経鞘腫、横紋筋肉腫、滑膜肉腫など、ただしそれらに限定されない骨及び結合組織肉腫;神経膠腫、星細胞腫、脳幹神経膠腫、上衣腫、乏突起膠腫、非神経膠腫、聴神経鞘腫、頭蓋咽頭腫、髄芽腫、髄膜腫、松果体腫、松果体芽腫、原発性脳リンパ腫を含めて、ただしそれらに限定されない脳腫瘍;腺癌、小葉(小細胞)癌、管内癌、乳腺髄様癌、粘液乳癌、乳腺管状癌、乳頭癌、パジェット病、及び炎症性乳癌を含めて、ただしそれらに限定されない乳癌;褐色細胞腫及び副腎皮質癌を含めて、ただしそれらに限定されない副腎癌;乳頭様又は濾胞性甲状腺癌、甲状腺髄様癌、未分化甲状腺癌など、ただしそれらに限定されない甲状腺癌;膵島細胞腺腫、ガストリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ビポーマ、ソマトスタチン分泌腫瘍、及びカルチノイド又は島細胞腫瘍を含めて、ただしそれらに限定されない膵癌;クッシング病、プロラクチン分泌腫瘍、末端肥大症及び尿崩症を含めて、ただしそれらに限定されない下垂体癌;虹彩黒色腫、脈絡膜黒色腫、毛様体黒色腫などの眼球黒色腫、及び網膜芽細胞腫を含めて、ただしそれらに限定されない眼癌;扁平上皮癌、腺癌及び黒色腫を含めて、ただしそれらに限定されない膣癌;扁平上皮癌、黒色腫、腺癌、基底細胞癌、肉腫、及びパジェット病を含めて、ただしそれらに限定されない外陰癌;扁平上皮癌及び腺癌を含めて、ただしそれらに限定されない子宮頚癌;子宮内膜癌及び子宮肉腫を含めて、ただしそれらに限定されない子宮癌;卵巣上皮癌、境界型腫瘍、胚細胞腫瘍及び間質性腫瘍を含めて、ただしそれらに限定されない卵巣癌;扁平上皮癌、腺癌、腺様嚢胞癌、粘膜表皮癌、腺扁平上皮癌、肉腫、黒色腫、形質細胞腫、疣状癌及び燕麦細胞(小細胞)癌を含めて、ただしそれらに限定されない食道癌;腺癌、菌状(ポリポイド)、潰瘍性、表在拡大型、びまん性拡大型、悪性リンパ腫、脂肪肉腫、線維肉腫及び癌肉腫を含めて、ただしそれらに限定されない胃癌;結腸癌;直腸癌;肝細胞癌及び肝芽腫を含めて、ただしそれらに限定されない肝癌、腺癌を含めて、ただしそれらに限定されない胆嚢癌;乳頭、結節及びびまん性を含めて、ただしそれらに限定されない胆管癌;非小細胞肺癌、扁平上皮癌(類表皮癌)、腺癌、大細胞癌及び小細胞肺癌を含めて、ただしそれらに限定されない肺癌;胚細胞腫瘍、精上皮腫、未分化、古典的(典型的)、精母細胞性、非精上皮腫、胎児性癌、奇形腫、絨毛癌(卵黄嚢腫瘍)を含めて、ただしそれらに限定されない精巣癌、腺癌、平滑筋肉腫及び横紋筋肉腫を含めて、ただしそれらに限定されない前立腺癌;腎癌(penal cancer);扁平上皮癌を含めて、ただしそれらに限定されない口腔癌;基底癌(basal cancer);腺癌、粘膜表皮癌及び腺様嚢胞癌を含めて、ただしそれらに限定されない唾液腺癌;扁平細胞癌及びいぼ状を含めて、ただしそれらに限定されない咽頭癌;基底細胞癌、扁平上皮癌及び黒色腫、表在拡大型黒色腫、結節型黒色腫、悪性黒子黒色腫、末端黒子型黒色腫を含めて、ただしそれらに限定されない皮膚癌;腎細胞癌、腺癌、副腎腫、線維肉腫、移行細胞癌(腎盂及び/又は尿管(uterer))を含めて、ただしそれらに限定されない腎癌;ウィルムス腫瘍;移行上皮癌、扁平細胞癌、腺癌、癌肉腫を含めて、ただしそれらに限定されない膀胱癌を含めた、癌の腫瘍細胞が挙げられるが、それらに限定されない。MDNPによって防止、処置又は抑制することができる癌としては、粘液肉腫、骨原性肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、中皮腫、滑膜性腫瘍、血管芽細胞腫、上皮癌、嚢胞腺癌、気管支癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌及び胃癌が挙げられる(こうした障害の総説としては、Fishmanら、1985、Medicine、第2版、J.B.Lippincott Co.、フィラデルフィア、及びMurphyら、1997、Informed Decisions:The Complete Book of Cancer Diagnosis, Treatment, and Recovery、Viking Penguin、Penguin Books U.S.A.,Inc.、米国を参照されたい)。一部の実施形態においては、MDNPを使用して、代替ワクチンを利用できない1種以上の癌に対して対象を免疫することができる。
b.感染症
MDNPは、細菌、ウイルス、真菌、原生動物病原体などの多種多様な微生物病原体に起因する1種以上の感染症の対象に接種するのに有効な量の抗原を対象のAPCに送達することができる。
一部の実施形態においては、ワクチンの標的を多数の微生物病原体のいずれかとすることができる。ワクチン接種することができる例示的な疾患としては、炭疽、ヒトパピローマウイルス(HPV)に起因する疾患(例えば、子宮頚癌、食道癌)、ジフテリア、A型肝炎、B型肝炎、ヘモフィルス インフルエンザタイプb(Hib)、インフルエンザウイルス(Flu)、日本脳炎(JE:Japanese encephalitis)、ライム病、麻疹、髄膜炎菌性(Meningococcal)、サル痘、流行性耳下腺炎、百日咳、肺炎球菌性(Pneumococcal)、ポリオ、狂犬病、ロタウイルス、風疹、帯状疱疹(帯状ヘルペス)、天然痘、テタヌス、トキソプラズマ症、腸チフス、結核(TB)、水痘(水疱瘡)、黄熱病を含めて、ワクチンが現在入手可能である疾患が挙げられる。
一部の実施形態においては、MDNPを使用して、マラリア、ストレプトコッカス、エボラザイール、HIV、ヘルペスウイルス、C型肝炎、中東呼吸器症候群(MERS:Middle East Respiratory Syndrome)、睡眠病、重症急性呼吸器症候群(SARS:Severe Acute Respiratory Syndrome)、ライノウイルス、水疱瘡、ヘンドラ、NIPAウイルス、ジカウイルスなどを含めて、ただしそれらに限定されない疾患など、代替ワクチンを利用できない感染症又は病原体に対して対象を免疫することができる。
一部の実施形態においては、疾患は、トリなどの非哺乳動物対象に感染する病原体である。例示的なトリ対象としては、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、キジ及び他の商業的な家禽などの家畜化されたトリ(すなわち、家禽)、又はインコ、オウムなどのペットのトリが挙げられる。例えば、細菌ハイブリッドベクターは、伝染性ファブリキウス嚢病(IBD:Infectious Bursal Disease)に対するワクチンをトリに接種するのに有用であり得る。ガンボロ病としても知られるIBD、幼鶏のファブリキウス嚢に影響を及ぼすウイルス性疾患。上記細菌ハイブリッドベクターを用いてワクチン接種することができる家禽の他の疾患及び障害としては、インフルエンザ、ラニケット;マレック病、鶏痘、家禽コレラ、軟卵症候群、感染性コリーザ、コクシジウム症、トリ脳炎、トリインフルエンザ、ニワトリ貧血及びサルモネラが挙げられる。
c.アレルギー
ある実施形態においては、MDNPを使用して、対象をアレルゲンに対して免疫することができる。MDNPは、アレルギーと診断された対象、又はアレルギーの素因がある対象に投与することができる。一部の実施形態においては、MDNPの組成物を、1種以上の追加の治療薬に加えて、アレルギー患者に投与する。
アレルギーは、その他の点では無害な物質に反応して起こる免疫系の異常反応である。アレルギーは、免疫系が、花粉、粉塵、獣毛などのアレルゲンに結合可能な特異抗体を産生することによって、外来微生物又は粒子に反応するタイプの免疫反応である。治療することができるアレルギー反応としては、遅延型過敏反応及び即時型過敏反応が挙げられる。
治療することができるアレルギーとしては、皮膚炎などの皮膚、食品アレルギーなどの消化管におけるアレルギー性鼻炎、枯草熱、喘息、結膜炎(急性カタル性結膜炎)などの上気道及び目、並びに蕁麻疹、発疹などの血流におけるアレルギー反応、血管性浮腫、アナフィラキシー、又はアトピー性皮膚炎が挙げられる。
C.遺伝子ターゲティング
MDNPは、特定の標的生物内の特定の標的遺伝子に対して干渉作用を有するRNA(iRNA)の送達のための遺伝子ターゲティング戦略に使用することができる。一部の実施形態においては、iRNAは、標的ポリヌクレオチドの発現又は翻訳の配列特異的サイレンシングを誘導し、それによって遺伝子発現を減少させる、又は阻止することができる。例えば、MDNPを使用して、iRNAを送達して、標的遺伝子の発現の完全な欠如を誘導することができる。一部の実施形態においては、iRNAは、標的遺伝子の発現レベルを無処置対照よりも低下させることができる。
一部の実施形態においては、MDNPを使用して、RNAを送達する。RNAは、二本鎖低分子干渉RNA(siRNA)ポリヌクレオチドである。一般に、低分子干渉RNAは、21~23ヌクレオチド長である。siRNAは、宿主細胞内で発現され得る。
別の実施形態においては、MDNPを使用して、マイクロRNA(miRNA)ポリヌクレオチドを送達する。miRNAは、ヘアピン構造をとる低分子RNAである。miRNAは、内在細胞酵素、例えば、酵素ダイサー及びダイサー様酵素の活性によって、標的細胞内の生物活性dsRNAに開裂し得る。別の実施形態においては、RNAポリヌクレオチドは、少なくとも24ヌクレオチド長である長い二本鎖RNA分子(dsRNA)である。dsRNAは、標的生物内の内在細胞酵素、例えば、酵素ダイサー及びダイサー様酵素の活性によって、21~23ヌクレオチドの生物活性siRNAにプロセシングされる。dsRNAは、下方制御の標的とされる1個以上の遺伝子に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
1個以上の標的遺伝子は、任意の所望の配列のものとすることができる。一部の実施形態においては、RNAの配列は、標的遺伝子の配列に100%相補的である。別の実施形態においては、RNAは、標的遺伝子に100%未満相補的である。ある実施形態においては、RNAは、標的遺伝子のヌクレオチド配列に少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも85%又は少なくとも80%相補的であり、したがって、例えば、遺伝子変異、進化的分岐及び系統多型のために起こり得る配列多様性が許容され得る。
一部の実施形態においては、MDNPを遺伝子ターゲティング戦略に使用することができる。例えば、MDNPを使用して、標的細胞のゲノムの一本鎖又は二本鎖切断を誘発する薬剤を送達することができる。標的細胞のゲノムの一本鎖又は二本鎖切断を誘発する例示的なシステムは、CRISPR/Casシステムである。クラスター化された規則的な配置の短い回文配列リピート(CRISPR:Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)は、塩基配列の複数の短い直接反復を含むDNA遺伝子座の頭字語である。原核生物CRISPR/Casシステムは、真核生物に使用される遺伝子編集(特異的遺伝子のサイレンシング、増強又は変更)としての使用に適応されている(例えば、Cong、Science、15:339(6121):819~823(2013)及びJinekら、Science、337(6096):816~21(2012)を参照されたい)。Cas遺伝子及び特異的に設計されたCRISPRを含む必要な配列を細胞に移入することによって、生物のゲノムを任意の所望の位置で切断及び修飾することができる。
一般に、「CRISPRシステム」とは、Cas遺伝子をコードする配列、tracr(トランス活性化CRISPR)配列(例えば、tracrRNA又は活性部分tracrRNA)、tracr-mate配列(内在性CRISPRシステムに関連して「直接反復配列」及びtracrRNAプロセシング部分直接反復配列を包含する)、ガイド配列(やはり内在性CRISPRシステムに関連して「スペーサ」とも称される)、又はCRISPR遺伝子座由来の別の配列及び転写物を含めて、CRISPR関連(「Cas」)遺伝子の発現、又は該遺伝子の活性の誘導に関与する転写物及び他の要素を総称するものである。ガイド配列に作動可能に結合した1個以上のtracr mate配列(例えば、直接反復配列-スペーサ-直接反復配列)は、プロセシング前にはpre-crRNA(pre-CRISPR RNA)、ヌクレアーゼによるプロセシング後にはcrRNAとも称される。
一部の実施形態においては、tracrRNAとcrRNAは連結され、キメラcrRNA-tracrRNAハイブリッドを形成する。ここで、成熟crRNAは、部分tracrRNAに合成ステムループを介して融合して、Cong、Science、15:339(6121):819~823(2013)及びJinekら、Science、337(6096):816~21(2012))に記載のように天然crRNA:tracrRNA二重鎖を模倣する。単一融合crRNA-tracrRNA構築物は、ガイドRNA又はgRNA(又は単一ガイドRNA(sgRNA))とも称される。sgRNA内では、crRNA部分を「標的配列」として同定することができ、tracrRNAはしばしば「足場」と称される。したがって、一部の実施形態においては、MDNPを使用して、sgRNAを送達する。
D.追加の活性剤の送達
一部の実施形態においては、MDNPは、疾患又は障害の治療のために、対象の細胞への小分子治療薬などの追加の活性剤の送達に使用される。ある実施形態においては、MDNPを使用して、対象の1つ以上の特定の細胞型を選択的に標的にして、治療薬、予防薬及び診断薬をその細胞型に送達する。
したがって、一部の実施形態においては、MDNPは、感染症、癌、炎症性疾患などに対して有効な治療戦略を提供することができる。
E.投与量及び有効量
一部の生体内手法においては、MDNPの組成物を対象に治療有効量で投与する。「有効量」又は「治療有効量」という用語は、治療する障害の1つ以上の症候を治療、阻害若しくは軽減するのに、又は所望の薬理的及び/又は生理的効果をもたらすのに、十分な投与量を意味する。正確な投与量は、対象に依存した変数(例えば、年齢、免疫系の健康など)、疾患又は障害、実施する処置などの種々の要因に応じて変わる。
上記すべての化合物の場合、更に研究を進めると、様々な患者において種々の症状の治療に適切な投与量レベルに関する情報が明らかになり、通常の技能を有する者は、レシピエントの治療状況、年齢及び全般的健康状態を考慮して、適切な投薬を確認することができるであろう。選択される投与量は、所望の治療効果、投与経路、及び所望の治療期間に応じて決まる。
一般に、毎日0.001~100mg/kg体重の投与量レベルが哺乳動物などの対象、最も好ましくはヒトに投与される。一般に、静脈内注射又は注入の場合、投与量を少なくすることができる。好ましくは、組成物は、約1~約1000μMの改変原核細胞血清レベルが得られるように処方される。
例えば、MDNPは、抗原を対象に送達し、B細胞、T細胞の増殖及びクローン増殖を誘導し、又はマクロファージの移動若しくは走化活性を誘導するのに有効な量とすることができる。したがって、一部の実施形態においては、カプセル剤を含むMDNPは、対象における抗原に対して一次免疫応答を刺激するのに有効な量である。好ましい一実施形態においては、有効量のMDNPは、無処置対照対象に比べて、対象の細胞における有意な細胞毒性を誘導しない。好ましくは、MDNPの量は、無処置対照に比べて、対象における疾患又は障害の感染又は発生を防止又は抑制するのに有効である。
別の一実施形態においては、MDNPは、標的遺伝子の発現量を減少させるのに、又は対象における標的遺伝子産物の血清中濃度を防止する、若しくは減少させるのに有効な量である。
特定の一実施形態においては、MDNPは、抗原提示細胞による抗原の提示を誘導するのに有効な量である。例えば、MDNPは、MDNPによって対象の細胞に送達される遺伝子によってコードされた外来ポリペプチドに反応してT細胞活性化を誘導するのに有効な量とすることができる。更なる一実施形態においては、1個以上のMDNPは、対象における抗原に対する頑強な又は防御の免疫応答を刺激するのに必要な抗原量の削減に有効な量である。MDNPは、MDNPによってコードされた抗原に対する産生又は抗体を誘導するのに有効であり得る。
したがって、MDNPは、対象における抗原特異的免疫細胞の量を増加させるのに有効であり得る。例えば、対象における抗原特異的免疫細胞の量を、無処置対照における量よりも増加させることができる。例えば、MDNPは、細胞増殖、化学走性及びアクチン再構成を含めて、細胞性免疫活性を制御する幾つかのシグナル伝達経路を誘導するのに有効であり得る。好ましくは、有効量のMDNPは、細胞毒性を生じない。コードされた抗原又はアレルゲンに対する適応免疫を与える有効量のMDNPは、IFNを含めて、炎症性サイトカイン産生の有意な全身的増加を生じるべきではない。
一部の実施形態においては、MDNPを使用して、単回投与のみによって、癌、感染症又はアレルゲンに対して対象を免疫することができる。したがって、一部の実施形態においては、単一投与のみが必要であり、追加免疫は不要である。別の実施形態においては、1回以上の追加の投与によって、第1又は以前の投与に対する免疫応答を押し上げると、防御免疫などの強化又は延長された免疫が得られる。
一般に、生体内でナノ粒子送達ビヒクルに対するサイトカイン応答がないと、抗ベクター免疫の発生が妨げられる。したがって、一部の実施形態においては、抗原をコードする同じ又は異なるRNAを含む同じ又は異なる用量のMDNPを用いて、MDNPの投与を繰り返し行って、例えば、同じ対象における種々の抗原又はアレルゲンに対する免疫を与えることができる。
F.対照
MDNPの効果を対照と比較することができる。適切な対照は、当該技術分野で公知であり、例えば、未処理細胞又は無処置対象が挙げられる。一部の実施形態においては、対照は、処置された対象からの、又は無処置対象からの未処理組織である。好ましくは、対照の細胞又は組織は、処理細胞又は組織と同じ組織に由来する。一部の実施形態においては、無処置対照対象は、処置対象と同じ疾患若しくは症状を有する、又はそのリスクがある。例えば、一部の実施形態においては、無処置対照対象は、抗原に対して免疫応答を生じない。
G.組合せ
MDNPは、治療又は予防処置計画の一部として、単独で、又は1種以上の追加の活性剤(単数又は複数)と組み合わせて、投与することができる。MDNPは、第2の活性剤と同じ日に、又は異なる日に投与することができる。例えば、MDNPを含む組成物を、1、2、3若しくは4日目に、又はそれらの組合せで投与することができる。
「組合せ」又は「組み合わせる」という用語は、2種以上の薬剤の随伴、同時又は連続投与を指すのに使用される。したがって、組合せは、随伴的に(例えば、混合物として)、別々ではあるが同時に(例えば、別々の静脈ラインを介して同じ対象に)、又は連続的に(例えば、化合物又は薬剤の1つを最初に投与し、続いて第2の薬剤を投与)投与することができる。
一部の実施形態においては、追加の予防薬又は治療薬を特異抗原に対するワクチンとすることができる。抗原は、MDNPによってコードされたものと同じでも異なってもよい。
一部の実施形態においては、MDNPは、MDNP送達ビヒクルの非存在下で対象における抗原に対する免疫応答に比べて、同じ抗原に対する免疫応答を増強する薬剤として有用である。
MDNPを使用して、例えば、MDNP内にカプセル化されたRNAによってコードされた1種以上の抗原又はアレルゲンに対する免疫応答を誘導するときには、有効量のMDNPの投与は、所望の免疫応答を誘発するのにアジュバントの同時投与を必要としない。したがって、一部の実施形態においては、MDNPをアジュバント又は免疫刺激分子の非存在下で投与する。
実施例1 ワクチンとして使用されるRNA分子を含むMDNPの構築
材料及び方法
プラスミド及びクローニング
制限配列が隣接するeGFPコード配列の切り出し後に、哺乳動物発現プラスミドpcDNA3-EGFP(Doug Golenbockからの提供(Addgeneプラスミド#13031)のマルチクローニング部位のHindIII及びXbaI部位に目的抗原をクローン化することによって、化学修飾も安定化UTRもない従来のmRNAを作製した。コザックコンセンサス配列(Kozak、M.Nucleic Acids Res15、8125~8148(1987))、続いて所望の抗原コード配列を含むPCR産物を、In-Fusion(Clontech Laboratories Inc.)クローニングキットを用いて挿入した。
ベネズエラウマ脳炎ウイルス(VEEV)
Tasuku Kitada(Weiss Lab、MIT)の好意で提供された野生型TRD系統に基づくVEEVレプリコンプラスミドpTK126中に抗原をクローン化して、VEEVサブゲノムプロモーター配列の下流にあるmVenusコード配列を置換することによってVEEVレプリコンRNAベクターを作製した。ルシフェラーゼ発現VEEVレプリコンpTK158もTasuku Kitada(Weiss Lab、MIT)によって提供された。
セムリキ森林ウイルス(SFV)
部位HindIII及びXbaIにおける(Giuseppe Balistreri、Ari Helenius lab、ETH Zurich、Institute of Biochemistryの好意で提供された)pSFV1-GFPの制限酵素消化、続いてPCR断片延在位置8,145~9,226の連結と断片のすぐ上流のカスタムクローニング部位リンカーの付加によって構築された、pSFV1-JC1と呼ばれるプラスミドpSFV1の修飾バージョン(Liljestrom,P.&Garoff,H.Biotechnology(NY)9、1356~1361(1991))中に抗原をクローン化して、最初のプラスミドを再構築し、ただし抗原コード配列の挿入部位として役立つサブゲノムプロモーターの下流のeGFPコード配列の代わりに独特のBamHI拘束性部位を有することによって、SFVレプリコンRNAベクターを作製した。
インフルエンザウイルス(HA)抗原
発現の準備ができた市販インフルエンザA H1N1(A/WSN/33)cDNAクローン、コドン最適化、完全長ORF(Sino Biological Inc.製品VG11692-C)からインフルエンザHAコード配列を増幅した。
エボラザイールウイルス(EBOV)抗原
EBOV GP及びVP40コード配列を、それぞれpWRG7077-GP及びpWRG7077-VP40から増幅した。
卵白アルブミン(cOVA)抗原
細胞質制限卵白アルブミン(cOVA)コード配列を、Maria Castroから提供されたベクターpCI-neo-cOVA(Addgeneプラスミド#25097)からPCRによって増幅し(Yangら、Proc Natl Acad Sci USA107、4716~4721、doi:10.1073/pnas.0911587107)、In-Fusionクローニングキットを用いて製造者の指示に従ってpcDNA3又はpSFV1-JC1にクローン化した。
卵白アルブミン(OVA)及びルシフェラーゼ
組織培養におけるルシフェラーゼ及びcOVA発現、並びに生体内OT-1刺激の研究用RNAを、MEGAスクリプトキット(Life Technologies)を用いてインビトロ転写によって線状プラスミドベクターから生成させ、ScriptCap m7Gキャッピングシステムキット(CellScript Inc.)を用いて5’キャッピングして、キャップ0構造7-メチルグアニル酸5’末端を生成し、A-Plusポリ(A)ポリメラーゼテーリングキット(CellScript Inc.)を用いて3’ポリ(A)テール化した。すべて、製造者の手順に従った。他の実験ではすべて、RNAのキャップ隣接5’ヌクレオチドをメチル化し、cap-1構造を生成し、より効率的なタンパク質翻訳を確実にする、キャッピングステップにおける(ScriptCap(商標)2’-O-メチルトランスフェラーゼキット、CellScript Inc.製)2’-O-メチルトランスフェラーゼの(提供された手順に従った)封入を除いて、RNAを本質的に同じ方法で合成した。SacIを用いた線形化後にT7 RNAポリメラーゼを用いてHindIII/XbaI部位にクローン化された抗原を有するpcDNA3由来のプラスミドから従来のmRNAを合成した。これらのmRNAは、T7プロモーターと開始コドンのKozakコンセンサス配列の間、及び終止コドンと線形化に用いられるSacI制限部位の下流の制限部位の間にある短いベクター由来の空間を除いて、5’又は3’UTR配列を実質的に含まない。SpeIを用いた線形化後にSp6RNAポリメラーゼ転写によってpSFV1-JC1由来のプラスミドからSFV系RNAレプリコンを構築した。
修飾デンドリマー合成
室温で定常撹拌下、ジクロロメタン(BDH)中の2倍モル過剰の3-クロロ過安息香酸(Sigma)に1-ペンタデセン(TCI)を滴下して、2-トリデシルオキシランを合成した。8時間反応後、反応混合物を等体積の過飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液(Sigma)で3回洗浄した。各洗浄後、有機層を分離漏斗によって収集した。同様に、有機層を、次いで、1M NaOH(Sigma)で3回洗浄した。無水硫酸ナトリウムを有機相に添加し、終夜撹拌して、残留水を除去した。有機層を減圧濃縮すると、わずかに黄色の透明油状液体が生成した。この液体を減圧蒸留すると(約50mTorr、約80℃)、透明無色の2-トリデシルオキシランが生成した。エチレンジアミンコアを有する第1世代ポリ(アミドアミン)デンドリマー(Dendritech,Inc.)を次いで2-トリデシルオキシランと反応させた。2-トリデシルオキシランの化学量論量は、デンドリマー内のアミン反応部位(第一級アミンの場合2部位、第二級アミンの場合1部位)の総数の1.5倍に等しかった。反応物を清浄20mL黄褐色ガラスバイアル中で混合した。バイアルに200プルーフエタノールを溶媒として充填し、90℃で7日間暗所で定常撹拌下反応させて、反応を確実に完了した。粗生成物をCelite(商標)545(VWR)プレカラムに乗せ、RediSep Gold Resolutionシリカカラム(Teledyne Isco)を備えたCombiFlash Rf装置を用いたフラッシュクロマトグラフィによって、100%CH2Cl2~75:22:3CH2Cl2/MeOH/NH4OH水溶液(体積)で40分間勾配溶出して精製した。薄層クロマトグラフィ(TLC:thin layer chromatography)を使用して、87.5:11:1.5CH2Cl2/MeOH/NH4OH水溶液(体積)溶媒系を用いて、修飾デンドリマーの存在について溶出画分を試験した。置換レベルの異なる修飾デンドリマーは、異なるバンドとしてTLCプレート上に出現した。未反応2-トリデシルオキシラン及びポリ(アミドアミン)デンドリマーを含む画分を廃棄した。残留画分を混合し、傾斜高真空下で12時間乾燥させ、使用するまで乾燥不活性雰囲気下で貯蔵した。すべての生成物が、配座異性体の混合物を含んだ。
RNAを含むMDNPの構築及び精製
Khanら、Nano Lett、doi:10.1021/nl5048972(2015)、Khanら、Angewandte Chemie53、14397~14401、doi:10.102/anie.201408221(2014)によって記述されたマイクロ流体混合装置を用いてナノ粒子を処方した。
手短に述べると、修飾デンドリマーと1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000](Avanti Polar Lipids)をエタノール中で混合した。UltraPure、DNase/RNaseを含まない、内毒素を含まない蒸留水(Invitrogen)及び無菌100mM pH3.0 QBクエン酸緩衝剤(Teknova,Inc.)でRNAを最終クエン酸濃度10mMに希釈した。エタノール及びクエン酸の流れを気密ガラスシリンジ(Hamilton Co.)に充填し、マイクロ流体混合装置を用いて、エタノールとクエン酸の流れを1:3体積流量比(5.3mL/minに等しい組み合わせ総流量)で組み合わせ、混合して、ナノ粒子を製造した。内毒素除去のために1.0M NaOH(Sigma)で24時間洗浄し、蒸気オートクレーブで滅菌したガラス製品を用い、20,000MWCO Slide-A-LyzerG2透析カセットを用いて、ナノ粒子を内毒素のない無菌PBSで透析した。透析ナノ粒子を0.2ミクロンポリ(エーテルスルホン)フィルタ(Genesee Scientific)を用いて無菌濾過し、Zetasizer NanoZS装置(Malvern)を用いて特性を明らかにした。RNAの濃度を理論物質収支計算によって求め、NanoDrop測定(Thermo Scientific)によって確認した。最終ナノ粒子は、11.5:1質量比の修飾デンドリマーと1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000]及び5:1質量比の修飾デンドリマーとRNAを含んだ。MDNPのサイズ分布を動的光散乱及び透過型電子顕微鏡法によって評価した。
結果
アジュバントを含まないナノテクノロジー送達システムを用いた対象の細胞への複製RNA(repRNA)などの分子の送達のためにMDNPワクチンプラットホームを開発した。この目標に向かって、修飾されたイオン化可能な両親媒性デンドリマーを使用した大型自己増幅mRNA送達のための独特で効率の高い送達法が開発された(図1A~1C及び図2A~2C参照)。MDNPの透過型電子顕微鏡法、及びナノ粒子のサイズ分布の分析によれば、低多分散性粒子(図2D)が、この方法を用いて型通りに製造された。
このMDNPワクチンプラットホームは、柔軟性が高く、各患者の独特の要求に合わせて数日で迅速に調整することができる。宿主細胞中で複数の抗原を同時に産生する能力(多重化)が示された。
レプリコンで構成されたMDNPは、ワクチン接種に使用することができる(すなわち、修飾デンドリマーワクチン(MDV:modified dendrimer vaccine)プラットホームとして)。MDVは、3成分系であり、イオン性デンドリマー系ナノ材料、両親媒性PEG及びRNAが組み合わされて、最終ワクチンナノ粒子を形成する。
MDNP配置戦略
ワクチンとして、MDNPを多種多様な方法で配置することができる。一例においては、MDNPは、1タイプの増幅可能なペイロード、すなわちレプリコンを含む(図1A)。細胞質内で放出されると、レプリコンは、リボソームによって翻訳されて、RNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)と抗原の両方を産生する。RNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)は、完全長レプリコンのより多くの複製物、又はサブゲノムプロモーターによって抗原のみの複製物を産生する。リボソームは、完全長レプリコン複製物又はより短い抗原のみの(従来の)mRNAを翻訳し続ける。この戦略のために、1タイプの増幅可能なペイロードが細胞質に送達される。
別の戦略においては、MDNPは、2タイプの増幅可能なペイロード、すなわちレプリコンと、レプリコンの3’及び5’非翻訳領域(UTR)を含むmRNAとを同時に輸送する(図1B)。この戦略においては、RdRpは、レプリコンの最初、又はサブゲノムプロモーターにおいて、コピーを開始することができる。第1は、レプリコンである。第2は、レプリコンの5’及び3’非翻訳領域(UTR)を組み込むmRNAである。レプリコンのリボソーム翻訳によって生成するRdRpは、3通りで作用することができる:(1)レプリコン全体を複製すること、(2)レプリコンのサブゲノムプロモーターにおいて開始することによってmRNAのみを複製すること、及び(3)レプリコンUTRを有する修飾mRNAを複製すること。この戦略のために、2タイプの増幅可能なペイロードが細胞質に同時に送達される。サブゲノムプロモーターにおいて産生された短いmRNAは、リボソームによってのみ翻訳することができ、RdRpではレプリコンUTRがないのでコピーすることができない。しかし、RdRpは、レプリコンUTRを有するmRNAを複製することができる。したがって、レプリコンUTRを有するmRNAの封入は、1つの代わりに2つの増幅可能なペイロードが細胞に同時に送達されるので、システムの総合効率を高める。
MDNPは、1個以上の標的抗原に対して耐久性長期防御をもたらすために、免疫系の細胞傷害性T細胞と液性の両方のアームを活性化することができる。MDNPワクチンは、数日で迅速に生成され、従来のワクチン製造に必要な多数の月数とは対照的である。その柔軟性のために、MDNPプラットホームは、カスタマイズされた癌ワクチンを迅速に生成するために、膵癌、結腸癌及び白血病の腫瘍細胞モデルからの容易に利用可能なエクソーム配列データを容易に活用することができる(Bhaduryら、Oncogenesis2、e44、doi:10.1038/oncsis.2013.8)。
実施例2 修飾デンドリマーRNAナノ粒子は、血清中で37℃及び4℃で安定である。
材料及び方法
統計解析
Tukey多重比較補正を用いたANOVAによって平均を比較した。生存曲線では、Mantel-Cox検定を使用した。0.05未満のP値を統計的に有意とみなした。
初代細胞及び細胞系
C2C12マウス筋芽細胞(ATCC CRL-1772)及びL6ラット筋芽細胞(ATCC CRL-1458)を、10%FBSを補充したDMEM中で維持した。分化のために、C2C12細胞をコンフルエントまで増殖させ、次いで10%ウマ血清を補充したDMEM(Sigma)中で5日間維持し、その時点までに、単層の大部分は、大きい隣接融合筋管状構造を示した。DC2.4細胞を10%不活性化FBS、1%L-グルタミン及び60uM2-メルカプトエタノールを補充したRPMI中で維持した。マウス胎仔線維芽細胞(MEF:mouse embryonic fibroblast)をLonzaから入手し、10%FBSを補充したDMEM中で維持した。ヒト包皮線維芽細胞(HFF:human foreskin fibroblast)を、10%FBS、2mMグルタミン、10mM Hepes pH7.5、及び20μg/mLゲンタマイシンを補充したDMEM中で維持した。1ウェル当たり400ngのカプセルRNAを96ウェル皿中の70~90%コンフルエント細胞単層上に適用し、24時間後にルシフェラーゼアッセイで分析することによって、MDNP処置実験を行った(材料及び方法の本文参照)。
組織培養タンパク質発現アッセイ
ナノ粒子処理細胞中のルシフェラーゼ遺伝子発現をSteady-Gloルシフェラーゼアッセイシステム(Promega Corporation)によって製造者の手順に従って測定した。RNA移入BHK21細胞におけるcOVA、インフルエンザHA及びEBOV GPの発現を免疫ブロットによって分析した。細胞を溶解し、タンパク質をRIPA-benzonase緩衝剤(20mM Tris(pH8)、137mM NaCl、0.5mM EDTA、10%グリセロール、1%ノニデットP-40、0.1%SDS、1%デオキシコラート、2mM MgCl2、25U/μl benzonase[EMD Millipore]、プロテアーゼ阻害剤[cOmplete、Mini、EDTAフリー、Roche Life Science、製造者の推奨に従って使用])で抽出し、免疫ブロット用にPVDF膜に移す前にSDS-PAGEによって分離した。膜をTBS-T中の10%乳でブロックし、以下の検出用抗体と一緒にブロッキング緩衝剤中で2~4時間室温でインキュベートした:cOVA検出の場合、抗卵白アルブミンウサギポリクローナル、HRP複合、ab20415(Abcam plc)1:3000希釈;HA検出の場合、単鎖アルパカナノボディVHH68(Douganら、Nature503(7476):406~409(2013))1:1000希釈、続いて抗ペンタ-His HRP複合物(Qiagen)1:5000希釈;EBOV GP検出の場合、マウスモノクローナル6D8 1:1000希釈、続いて抗マウスHRP1:10000希釈。強化ルミノールに基づく検出をWestern Lightning-ECLキット(Perkin Elmer Inc.)を用いて行った。移入細胞単層をトリプシン処理によって解離させ、増殖培地で1回洗浄し、PBS中のAlexa Fluor 647複合VHH68を用いて氷上で15分間染色して、インフルエンザHAの細胞表面発現を分析した。細胞をPBSで2回洗浄し、表面染色をFACSによってBD LSRIIフローサイトメータ(BD Biosciences)上で測定した。
FRETによるナノ粒子分解の実時間分析
蛍光共鳴エネルギー移動(FRET:Fluorescence Resonance Energy Transfer)を使用して、模擬筋肉内病状下でナノ粒子の安定性を推定した。センス鎖の5’末端がAlexa Fluor594又はAlexa Fluor647色素で標識された脱塩HPLC精製RNA二重鎖をIntegrated DNA Technologiesから購入した。等モル量の両タイプのRNAを含むナノ粒子を処方し、最終RNA濃度2μg/mLに希釈した。近接状態(すなわち、無処置MNDP内)では、RNAは、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)ペアとして働くと考えられる。
四つ組で、希釈ナノ粒子100μLを不透明黒色96ウェルプレートの各ウェルに添加した。PBSで希釈した50%ABヒト血清(Invitrogen)100μLを各ウェルに添加した。負の対照ウェルは、遊離siRNAを含んだ。正の対照ウェルは、PEIナノ粒子を含んだ。PEIナノ粒子は、10wt%スクロース溶液中の800MW PEI(Sigma)とRNAをPEIとRNAの質量比5:1でピペット操作を繰り返して形成された。プレートを透明接着プレートシールで密封し、37℃に設定されたTecan Infinite M200マイクロプレートリーダー中に置いた。MDNPが分解すると、放出されたRNAは、もはやFRETシグナルを発生するほど接近していないと考えられる。FRETを測定するために、試料を540nmで励起し、蛍光強度を690及び620nmで5分ごとに2時間読んだ。FRETを690nm/620nm蛍光強度シグナル比として計算した。負の対照は遊離RNAであった。PBSを使用して、バックグラウンドレベルを求めた。FRETシグナルは、オクチルβ-D-グルコピラノシド(Sigma)を最終ウェル内濃度2wt%まで添加し、37℃で1時間混合した後に測定された完全に破断したナノ粒子の値に対して規準化された。
4℃で貯蔵後のナノ粒子分解の分析
4℃におけるワクチン安定性を求めるために、ルシフェラーゼレプリコンRNAを含むナノ粒子を作製し、4℃で長期間貯蔵した。HeLa細胞を一定量のナノ粒子で処理し、ルシフェラーゼ発現を14時間後に分析した。
結果
ナノ粒子ベースのワクチンは、頑強な抗原発現を誘発し、RNAペイロードを周囲のリボヌクレアーゼ活性から保護し、理想的にはコールドチェーンを必要とせずに、これらの性質を長期間の貯蔵にわたって保持するべきである。
MDNPがこれらの特性を示すかどうか試験するために、ホタルルシフェラーゼをコードするVEEVレプリコンRNAをモデルナノカプセル化カーゴとして選択した。組織培養におけるVEEVによる発現は、試験した3種のRNAベクター(従来のmRNA、VEEVレプリコン及びSFVレプリコン)の中で最強であるので(図2E)、ルシフェラーゼを選択した。したがって、VEEVレプリコンRNAを、マイクロ流体に基づく製造法によるMDNPの処方に使用した(Khanら、Nano Lett、doi:10.1021/nl5048972(2015)、Khanら、Angewandte Chemie53、14397~14401、doi:10.1002/anie.201408221(2014))。
筋肉内注射に対して最適化された単分散粒子(動的光散乱によって評価して平均直径100~150nm)をこの方法によって型通りに製造した。FRETペア標識RNAをナノカプセル化し、続いて50%ヒト血清中で2時間37℃でインキュベーションすることによって、MDNPの安定性を推定した。破断した粒子は、それらの標識RNAペイロードを放出し、FRETシグナルの強度を減少させる。
より安定なMDNPナノ材料を2-トリデシルオキシランを用いて合成し、より不安定な対照MDNPには1,2-エポキシドデカンを使用した。MDNP中のナノカプセル化は、ナノ粒子がヒト全血清中で無傷のままであり、そのRNAペイロードを放出しないので、優れた保護を示す。この安定性のために、RNAペイロードは、エンドヌクレアーゼ分解から保護される。
MDNPは、化学的に破断したMDNP、遊離RNA、及びカチオン性ポリマーポリエチレンイミン中にナノカプセル化されたRNAに比べて、安定なままであり、強いFRETシグナルを維持した(図2F)。
ナノ粒子の4℃における長期間の貯蔵安定性についても試験した。貯蔵MDNP調製物を培養HeLa細胞に適用して、ルシフェラーゼ発現を測定した。4℃で1、3、20又は30日間貯蔵した粒子を用いると、統計的に有意な生物発光変化が認められなかった(図2G)。したがって、最低30日間貯蔵後に、ルシフェラーゼ移入効率の統計的に有意な変化が(Tukey多重比較補正を用いた)ANOVA分析によって形成検出されず、粒子が安定なままであり、RNAペイロードが無傷のままであることを示している。
修飾デンドリマーは、完全に合成であり、精製されており、RNAペイロードは、細胞の完全な非存在下で産生される。MDNPナノ材料は、Khanら、Angewandte Chemie53(52):14397~14401(2014)、Khanら、Nano Lett15(5):3008~3016(2015)に記載の免疫処置に使用されるよりも1桁多い用量で、生体内の炎症性サイトカインの全身的な増加を回避することが証明された。これらの研究に使用される粒子調製物は、感染性混入物を含まず、実質的に内毒素を含まない(<0.228EU/mL、これは、ウイルス/非ウイルスベクターの許容される内毒素負荷の1/40である(Britoら、J Pharm Sci100(1):34~37(2011))。
実施例3 RNAを含むMDNP(複数又は単数)は、癌細胞を選択的に標的にし、死滅させる
材料及び方法
MDNPプラットホームを使用して、cOVA発現腫瘍細胞を含む癌腫瘍モデルを用いて、抗癌ワクチンを製造し、評価した。MDNPプラットホームを使用して、従来のcOVA発現mRNA若しくはセムリキ森林ウイルス(SFV)レプリコン、又はTrp1発現VEEVレプリコンをマウスに接種した。
RNA設計及び発現
理想的な癌治療を行うために、バイオインフォマティクスを使用して、各患者の独特の腫瘍エクソームの配列を決定して、「新抗原」を同定する。これらの新抗原の対応するmRNAを使用して、免疫を生じるのに必要な抗原を産生する。モデル抗原OVAを発現する腫瘍細胞は、腫瘍で発現される非野生型タンパク質配列に対する免疫処置を試験するモデル系として役立つ。免疫処置は、変異しないが癌細胞タイプが選択的に濃縮される抗原(例えば、黒色腫におけるTrp1)に対しても実施することができる。公知の方法を用いて、1個以上の遺伝子を反復PCRによって構築し、又はcDNA若しくはゲノムライブラリからクローン化する。遺伝子は、プロモーター及びターミネーターと一緒に、所望のmRNAを発現するように設計されたDNA配列である。本質的に任意の長さ及び配列のDNAを大腸菌中で高収率で産生することができる。任意の所望の配列のmRNA又はrepRNAを、当該技術分野で確立されたインビトロ転写技術によって鋳型DNAから産生することができる。
マウス
野生型雌性C57BL/6マウスをJackson Laboratoryから入手し、5~8週齢で使用した。マウスをWhitehead Institute for Biomedical Researchで飼育し、MIT Committee on Animal Careによって認可された手順に従って維持した。
腫瘍細胞系
cOVA及びTrp1発現腫瘍細胞(B16細胞)を37℃及び5%CO2で、10%FBSを含むDMEM中で培養維持した。腫瘍を発生させるために、500,000個のcOVA発現細胞を野生型雌性BL/6マウスの背中に皮下注射した。Trp1研究の場合、約300,000個の細胞を注射した。
戦略
0及び16日目に、4μg用量の修飾デンドリマーナノ粒子(MDNP)レプリコンワクチンを動物に接種した。28日目に、図3に示すように、250,000個の腫瘍細胞を腫瘍形成のためにマウスに注射した。Trp1免疫処置の場合、単一の40μg用量を曝露の4週間前に投与した。
ワクチン接種
マウス(1群当たり2匹)を複合8μg用量の裸のcOVA mRNA(裸のmRNA)、裸のcOVA SFVレプリコン(裸のSFVrep)、cOVA mRNA修飾デンドリマーナノ粒子ワクチン(mRNA MDNP)又はSFV cOVA修飾デンドリマーナノ粒子ワクチン(SFV MDNP)で処置した。非免疫マウスは処置しなかった。ワクチン接種後、マウスに500,000個のcOVA発現腫瘍細胞(B16-OVA)を注射した。1か月にわたって、修飾デンドリマープラットホームを利用したすべての処置は、腫瘍を生じなかった。
より厳密な実験では、1群当たり10匹のマウスを、モデル黒色腫腫瘍抗原Trp1を発現する裸の又はMDNP送達されたVEEVレプリコン40μgで1回免疫した。内在性Trp1を天然に発現する300,000個の腫瘍細胞(野生型B16細胞)にマウスを曝露した。
結果
非免疫マウス、及び裸のmRNAで免疫したマウスは、安楽死を必要とする浸潤性腫瘍を形成した。裸のSFVレプリコン注射は、結果が様々であり、1匹の動物は全く腫瘍を形成しなかった。それに対して、MDNPプラットホームを介して従来のcOVA mRNA及びSFV cOVAレプリコンを接種した動物はすべて腫瘍を形成せず、100%生存した(図4A~4B)。より現実的な腫瘍ワクチン接種モデルである、より厳密なTrp1免疫処置研究では、MDNPによって送達されるTrp1 VEEVレプリコンの単一の大量瞬時投与は、生存時間を有意に改善した(Mantel-Cox検定によってp=0.022)。
MDNPは、多数のタイプのワクチン接種に使用することができるマルチプラットホーム技術である。それは、致死的なウイルス感染に対して、わずか1回で免疫を生じるのに使用することができる。将来の癌ワクチン研究は、多種多様な癌特異抗原に対する免疫を同時に生じるRNAペイロードを組み込むことによって、MDNPの多重化及び超多重化能力を活用することになるであろう。
実施例4 修飾デンドリマー中にナノカプセル化されたRNAは、抗原特異的T細胞を生体内で刺激する。
材料及び方法
戦略
送達に成功すると、RNAベクターによってコードされたタンパク質の翻訳は、トール様受容体(TLR:Toll-like receptor)を含めた細胞パターン認識受容体(Heilら、Science、303、1526~1529(2004)、Karikoら、J Biol Chem、279、12542~12550(2004))、酸誘導遺伝子1(RIG-I)(Pichlmairら、Science、314、997~1001(2006))、及びRNA依存性プロテインキナーゼ(PKR)(Levinら、J Biol Chem256、7638~7641(1981))を活性化する、インビトロで転写された外来RNAの能力と組み合わせて、導入遺伝子由来のペプチドディスプレイをクラスI MHC分子上で誘発し、CD8+T細胞を刺激するはずである。細胞質で発現される卵白アルブミン断片(cOVA)(Yangら、Proc Natl Acad Sci USA、107、4716~4721(2010))がモデル細胞内抗原として選択され、従来のmRNA、VEEVレプリコン、及びSFVレプリコンRNAが産生されて、このタンパク質を発現した。
細胞系
すべての細胞を37℃及び5%COで維持した。BHK21細胞は、Tasuku Kitada(Weiss Lab、MIT)の好意で提供され、5%FBS及び2mMピルビン酸ナトリウムを補充したEMEM中で維持された。別段の記載がない限り、対数期増殖したBHK21細胞を培養密度50~75%でTransIT-mRNA移入キット(Mirus Bio LLC)を用いて製造者の手順に従って移入した。HeLa細胞を10%FBSを含むDMEM中で維持した。
マウス
野生型雌性C57BL/6及びBalb/cJマウスをJackson Laboratoryから入手し、5~8週齢で使用した。養子細胞移入のレシピエントとして役立つC57BL/6Ptprcaマウスを室内で維持し、5~8週齢で使用した。OT-1/Rag2-/-マウスを、Taconicから購入した創始者の同系交配によって室内で維持した。
マウスをWhitehead Institute for Biomedical Researchで飼育し、MIT Committee on Animal Careによって認可された手順に従って維持した。マウスに表示MDNPを0及び21日目に筋肉内接種した。
IFNシグナル伝達レポーター細胞アッセイ
複合IFNα/β誘導性ISG54プロモーター及びISRE調節エレメントの制御下にあるSEAPレポーター遺伝子を有し、IFN-γ受容体活性を欠くB16細胞[「I型」レポーター細胞(B16-BLUE(商標)IFNα/β細胞、Invivogen]、又は同じレポーター構築物を有し、I型IFN受容体活性を欠くB16細胞[「II型」レポーター細胞(B16-BLUE(TM)IFN-γ細胞、Invivogen)]に、5-メチルシチジン/シュードウリジン塩基修飾mRNAを対照として(5meC/ΨmRNA、Trilink)又はVEEVレプリコンRNAをTransIT-mRNA試薬を用いて移入した。培地中のSEAP活性を移入から20時間後に比色分析によって定量化した。20時間後、培養上清20μLを平底透明96ウェル皿中のQuantiblue試薬(Invivogen)180μLに添加し、30分間発色させることによって、SEAP活性について分析した。吸光度を650nmで測定した。VEEVレプリコンは、マウス細胞においてI型IFN応答を刺激する。
四量体染色分析
免疫マウスの血液100μLを頬からK2EDTA Microtainerコレクションバイアル(BD Biosciences)に採血し、赤血球をVersaLyse緩衝剤(Beckman Coulter)を用いて10分間室温で溶解した。PE複合SIINFEKL特異的四量体(配列番号1)(MBL International)染色をAPC複合抗CD8クローン53-6.7(BD Biosciences)と一緒に30分間室温でPBS+1%不活性化FBS中で行った。細胞を洗浄し、本文に記載のようにFACSによって分析した。MDNP mRNA免疫実験では、6匹のマウスを免疫し、3匹の2群に無作為に分割し、1群を4及び12日目に採血し、他方を8及び16日目に採血して、1週間未満に複数回採取しないようにした。
組織のmRNAレベルの定量化
免疫後11日目にマウスをCO窒息によって安楽死させた。器官及び組織をすぐに収集し、液体窒素で凍結した。凍結組織を微粉砕して粉末を形成し、組織溶解物を0.5mg/mLプロテイナーゼK(Epicentre)を補充した組織及び細胞溶解緩衝剤(Epicentre)中で調製した。混合物を1400RPMで2時間65℃で混合し、16,000RCFで遠心分離して、残骸を除去した。上清(溶解物)のmRNAレベルを、QuantiGene2.0発光ベース分岐DNAアッセイキット並びにcOVA及びGapdhに対するQuantiGene2.0プローブ(Affymetrix)を用いて、製造者の手順に従って定量化した。発光シグナルをTecan Infinite200PROプレートリーダーを用いて測定した。シグナルが飽和しないようにし、すべての発光シグナルがそれらの線形領域内に確実に残るようにするために、各組織及び標的遺伝子の検量線を、PBS処置マウスからの試料を用いて作成して、アッセイ試料の最適な希釈度を決定した。処置群の相対発現を、標的遺伝子発光とGapdhハウスキーパー遺伝子発光の比を計算することによって求めた。すべての値をPBS処置マウスの標的:ハウスキーパー遺伝子比に対して規準化した。
T細胞細胞内サイトカイン染色アッセイ
脾細胞を40μgMDNP免疫処置後9日目にマウスから単離し、増殖培地中で培養した(別段の記載がない限り、すべての成分がLife Technologies製である:8%FBS、1mM非必須アミノ酸、1mMピルビン酸ナトリウム、10mM HEPES、50μM2-メルカプトエタノール(Sigma)及びペニシリン/ストレプトマイシンを補充したGlutaMAXを含むRPMI1620)。免疫優性H-2Kb拘束性MHCクラスI OVA由来のペプチドSIINFEKL(配列番号1)(InvivoGen)、又はEBOV GP由来のWE15ペプチド(WIPYFGPAAEGIYTE)(配列番号2)による刺激に反応したサイトカイン発現を、本質的にMartinsら、PLoS One9(2):e89735(2014)によって記述されたように、細胞内サイトカイン染色及びFACS分析によって分析した。手短に述べると、1×10脾細胞/mLを、IL-2(10U/ml)、抗CD28+抗CD49d(各0.5μg/mL、BioLegend)、及びBFA(最終2μg/mL、Sigma)の存在下で、2μg/mlペプチドと一緒に、又は2μg/mlペプチドなしで、培養した。IL-2、抗CD28及び抗CD49dをSIINFEKL(配列番号1)による刺激では省略した。というのは、OVAワクチン接種マウスにおけるこのペプチドに対する脾臓の応答が、外因性同時刺激なしでも明白であるからである。0.1μg/mL PMA及び1μg/mLイオノマイシンで非特異的に刺激した培養物をFACS分析の単色抗体染色対照として使用した。6時間の培養後、BD cytofix/cytopermキット(BD Biosciences)を用いて、製造者の手順に従って、FITC複合抗CD8(BioLegend)、APC複合抗CD4(BioLegend)、PE複合抗IFNg(BD Biosciences)、及びPacific Blue複合IL-2(BioLegend)で細胞を染色した。染色試料をFACSによってBD LSRIIフローサイトメータ(BD Biosciences)上で分析した。
養子移入及びOT-1増殖アッセイ
OT-1細胞をトランスジェニック6~12週齢OT-1/Rag2-/-C57BL/6マウスの腸間膜及び鼠径リンパ節並びに脾臓から単離し、PBSに再懸濁させた。細胞を5分間室温でCFSE(Sigma)を用いて最終濃度5uMで標識し、次いで、注射用PBSに再懸濁する前に、10%FBSを補充したRPMIで1回洗浄した。野生型CD45.1マウス4~8週齢に、150万個の標識OT-1細胞を静脈内注射した。養子移入後4日目に鼠径リンパ節を解剖し、リンパ球をFACS分析用に単離した。細胞を7-AAD(BD Biosciences)、Alexa Fluor700又はAPC複合抗CD45.1、PE-Cy7又はAPC-Cy7複合抗CD45.2、及びPacificブルー又はPE複合抗CD8で染色した。染色試料をFACSによってBD LSRIIフローサイトメータ(BD Biosciences)上で分析した。
T細胞活性化アッセイ
脾細胞をマウスから単離し、密度1000万細胞/mlで96ウェル培養プレート中で増殖培地(別段の記載がない限り、すべての成分がLife Technologies製である:8%FBS、1mM非必須アミノ酸、1mMピルビン酸ナトリウム、10mM HEPES、50μM2-メルカプトエタノール(Sigma)及びペニシリン/ストレプトマイシンを補充したGlutaMAXを含むRPMI1620)のみ、又は増殖培地中2μg/ml OVA由来のペプチドの存在下で播いた。使用したペプチドは、免疫優性H-2Kb拘束性MHCクラスI OVA由来のペプチドSIINFEKL(InvivoGen)又はH-2I-AbMHCクラスII拘束性ペプチドISQAVHAAHAEINEAGR(InvivoGen)であった。5日間の培養後、濃度1:20希釈上清IFNγをIFNγELISAキット(BD Biosciences)を用いて定量化した。
結果
MDNPカプセルRNAは、ヒト上皮細胞系HeLa、マウス及びヒト初代線維芽細胞、マウス樹状細胞系DC2.4、マウス及びラット骨格筋芽細胞系C2C12及びL6、並びにC2C12細胞系由来の分化型マウス筋管を含めて、培養中の多種多様な細胞型において発現に成功した(表1参照)。MDNPの筋肉内注射は、生体内の注射部位で容易に検出可能な遺伝子発現を惹起することが認められた。
Figure 0006991977000013
免疫応答がMDNPシステムを用いて誘導されたかどうかを試験するために、細胞質で発現される卵白アルブミン断片(cOVA)をモデル細胞内抗原として使用した。従来のmRNA、VEEVレプリコンRNA、及びSFVレプリコンRNAが産生されて、このタンパク質を発現した。
cOVAタンパク質は、CD8及びCD4T細胞によって認識されるドミナントエピトープを含む(Yangら、Proc Natl Acad Sci USA、107、4716~4721(2010))。BHK21細胞に移入した14時間後のcOVA発現の発現が、従来のTransIT移入試薬を用いた免疫ブロットによって確認され、VEEVレプリコンが最も有効であることが判明した。
抗原発現がCD8+T細胞を生体内でMDNPを用いて活性化するのに十分かどうか判定するために、OT-1 Rag1-KO C57BL/6マウス、H-2Kb拘束性OVA特異的T細胞受容体(TCR)を発現する遺伝子導入系を養子実験におけるリンパ球供与体として使用した。
OT-1T細胞を投与したマウスに、パッケージされていない(「裸の」)RNA、又は両側のi.m.注射によってMDNPとしてカプセル化された同じRNAを投与した。免疫後3日目(移入後4日目)に、OT-1T細胞の増殖をCFSE希釈によって分析した(図5A~5G、図8A)。裸のRNAで免疫されたマウスは、OT-1細胞の増殖を誘発しなかった。MDNPを介してRNAを投与したマウスにおいては、少なくとも6回の増殖を検出した。最強の増殖は、mRNA含有MDNPで免疫されたマウスで認められた。
投与用量は、注射RNAの等価な質量に基づき、したがってレプリコンRNAに比べて分子量差に基づいて約10倍モル過剰の従来のmRNAを注射する。10倍の用量のパッケージVEEVレプリコンRNAは、実際、デンドリマーパッケージmRNAに類似したOT-1増殖プロファイルを示した。移入後4日目/VEEV-cOVA MDNP40μgで免疫後3日目に行われたOT-1増殖アッセイの結果を図7A~7Bに示す。
単一用量のMDNP送達RNAが効率的な抗原提示をもたらし得るかどうか証明するために、C57BL/6マウスを裸又はMDNPで免疫し、CFSE標識OT-1細胞を10日後に養子移入した。
移入後4日目(すなわち、免疫後14日目)に、増殖を上述したように分析した(図6A~6G)。裸のmRNA免疫処置は、OT-1T細胞の増殖を誘導しなかった。mRNA MDNPは、免疫マウスの2/3で小さいが検出可能なOT-1増殖をもたらした。裸のレプリコンによる免疫処置は、OT-1T細胞の不定の増殖を引き起こした。裸のSFVで免疫されたマウスも極めて変わりやすい結果を示した。しかし、MDNPシステムを用いると、VEEVレプリコンRNAは、免疫マウスの大部分においてOT-1T細胞の再現性のある一貫した増殖を引き起こした(6匹の動物の5匹で20~50%)(図8B)。MDNP送達SFVレプリコンRNAは、OT-1増殖を誘導しなかった。2種のアルファウイルスレプリコンの発現プロファイルの差が、ナノカプセル化の短期の効果と相まって、原因であるかもしれない。
したがって、MDNP送達VEEVレプリコンをワクチン候補として探究した。VEEV MDNPが内在性T細胞応答を刺激し得ることを確認するために、C57BL/6マウスを高い(40μg)用量のcOVA VEEV MDNPで免疫した。9日後、免疫優性H2-KbクラスI MHC拘束性OVAペプチドSIINFEKL(配列番号1)を用いてインビトロで刺激した脾細胞において、細胞内IFN-γ及びIL-2産生を測定した。2つの独立した実験においては、免疫マウスの内在性CD8+脾細胞の>1%が、別々の集団の強いIFN-γ+細胞をペプチド刺激によって含んだ。免疫後18日目に、四量体染色によって検出された、MHCクラスI結合SIINFEKLに対するTCR特異性を有する多量の循環CD8+T細胞が、同様に免疫マウスにおいて認められた。比較のために、mRNAをペイロードとして用いた同様の独立した実験において、より少ない循環四量体陽性細胞が検査の間に検出され、レベルは、16日目までにほぼ検出不可能であった。アルファウイルスレプリコンが強力なI型IFN応答を誘導すること(図8C)と相まって、これらの観察、並びにアポトーシス及び樹状細胞による抗原取り込みは、種々の標的抗原を用いた更なる実験のペイロード候補としてのVEEVの選択を更に正当化するものであった。MDNP VEEV免疫動物においては、抗原をコードするRNAは、流入鼠径リンパ節において11日目までに検出され、MDNPによって送達されたレプリコンの免疫原作用が注射部位に限定されない可能性が提起されたことに留意されたい。ただし、注射部位は、恐らく、生体内で主要な実際の抗原産生源である。
MDNP送達VEEVレプリコン構築物(VEEV MDNP)の活性を、HIV1 Gag特異的ヤギポリクローナルIgG vT-20(Santa Cruz Biotechnology,Inc.)移入から14時間後に行われた免疫ブロットで測定して、更に別のウイルス構造ポリタンパク質HIV1 Gagのワクチン候補として評価した。VEEVレプリコンはHIV1 Gagの発現が明瞭に見えたのに対して、mRNA及びSFV媒介性移入は発現が見えなかった。
VEEV MDNPが内在性T細胞応答を実現できることを確認するために、C57BL/6マウスを漸増用量のcOVA発現VEE MDNPで免疫した。9日後、インビトロで免疫優性H2-KbクラスI MHC拘束性I OVAペプチドSIINFEKL(配列番号1)で刺激された脾細胞においてIFNg産生を測定した(図9)。
対照マウス、又は無関係な抗原をコードするVEE MDNP40μgで免疫されたマウスの脾細胞は、ペプチド処置後にIFNγを産生しなかった。cOVA発現VEEV MDNP40μgで免疫されたマウスから得られた脾細胞は、ペプチドに反応してIFNγが8~14倍増加した。VEEV MDNP0.4μg又は4μgで免疫されたマウスは、さほど増加を示さなかった。
実施例5 単一用量のHA発現VEEVレプリコンRNAナノ粒子は、致死的なインフルエンザ曝露に対して防御の働きがある。
材料及び方法
抗HA IgG ELISA
高結合表面処理ポリスチレン96ウェルマイクロプレート(Corning)をPBS中0.5μg/ml組換えインフルエンザA H1N1 WSN/33タンパク質(Sino Biological Inc.)で終夜4℃で被覆した。プレートをブロッキング緩衝剤(10%FBSを含むPBS)で2時間室温でブロックし、血清をウェルに二つ組でブロッキング緩衝剤中1:100希釈で塗布し、2時間室温でインキュベートした。プレートを洗浄緩衝剤(0.05%Tween-20を含むPBS)で洗浄し、ブロッキング緩衝剤で1:3000希釈した抗マウスIgG-HRP(GE Healthcare)と一緒に室温で1時間インキュベートした。洗浄緩衝剤で5回洗浄した後、プレートをTMB基質(Sigma)を用いて20~30分間現像し、吸光度を450nmで読む前に1体積の1M HClを添加して反応を停止させた。
インフルエンザ曝露
Balb/cJマウス(n=3)を、対照としての無関係な抗原(cOVA)、又はHAタンパク質をコードするVEE MDNPで免疫し、それらを14日後に致死量のインフルエンザA/WSN/33に曝露した。感染Balb/cマウスの100%を9日以内に死滅させる致死量(5×10CEID50)のインフルエンザA/NWS/33(H1N1)(ATCC)の鼻腔内投与によって免疫マウスを接種した。体重を毎日モニターし、20%を超える減量が認められたときにマウスを安楽死させた。マウスは、感染前体重を越えたときに回復したとみなされ、感染の臨床徴候が認められないことを確実にするために健康を更に3週間モニターした。A/WSN/33感染動物をWhitehead Instituteの認可隔離室に収容した。
結果
ナノ粒子ベースのワクチンが致死的なウイルス曝露に対して防御する免疫を誘発し得るかどうか証明するために、インフルエンザA/WSN/33HAタンパク質の発現を惹起するRNAを作製した。
達成された発現レベルの点で、VEEVレプリコンRNAは、組織培養実験において他の構築物より優れていた。3’UTR安定化mRNA変異体(Warren、L.ら、Cell Stem Cell7、618~630、2010)でもVEEVレプリコンに匹敵するレベルでHAを産生した。VEEV RNA発現HAタンパク質の正しいプロセシング及び細胞表面への移動は、HA特異的単鎖抗体を用いた表面免疫染色によって確認された(Douganら、Nature503、406~409、(2013))(図11A)。
対照マウスが7日目までに感染症に屈っしたのに対して、HA発現ナノ粒子免疫マウスは、少なくとも3週間曝露に耐え、実験終了時に感染の臨床徴候が残らなかった(図11B)。抗HA IgGは、免疫後7日目のマウスの血清には検出されず、又は屠殺時(感染後6又は7日目(図11C)の対照マウスでは検出されなかった。曝露後7日目に、HA反応性IgGは、HAをコードするVEEVレプリコンナノ粒子で免疫された生存マウスにおいて容易に検出でき(図11C~11D)、修飾デンドリマーmRNAワクチンによる初回刺激が液性応答を増強したことを示している。
実施例6 修飾デンドリマーナノ粒子送達VEEレプリコンRNAは、致死的なZEBOV曝露からマウスを防御する
材料及び方法
エボラ糖タンパク質(GP:ebola glycoprotein)を生きているザイールエボラウイルスに対する免疫を発生する抗原として選択した。VEE-GPとVEE-GP/VP40MDNP(単数又は複数)ワクチン候補を致死的なEBOV曝露に対してマウスを防御するそれらの能力について比較した。
cOVA MDNPは、無関係な抗原をコードし、負の対照として使用される。パッケージされない裸のGPレプリコンをナノ粒子を含まない対照として使用した。
EBOV GP免疫処置
各群10匹のマウス(VEE-GP又はVEE-GP/VP40、各n=10)に、修飾デンドリマー中にナノカプセル化されたRNA4μgを両側の筋肉内(i.m.)注射によって接種し、21日目に同じ用量を追加した。血清を14、35及び48日目に収集して、循環EBOV GP特異的IgG力価をELISAによって測定した。
サイトカイン産生を測定するために、各群3匹のマウスを25日目に安楽死させて、ELISpotアッセイ及び細胞内サイトカイン染色のために脾細胞を単離した。残り7匹のマウスを49日目にマウス適応EBOVに腹腔内(i.p.)注射によって曝露した。
EBOV GP血清ELISA
ELISAプレートをPBS中2μg/mlの組換え哺乳動物エボラGPで4度で終夜被覆した。プレートをPBS-T(PBS、0.1%Tween-20)で3回洗浄し、次いでPBS-T5%脱脂乳を用いて2時間室温でブロックした。血清を1:100から始まる半対数希釈で希釈し、GP被覆プレート上で1時間インキュベートした。次いで、プレートをPBS-Tで3回洗浄し、示した二次HRP抗体と一緒に45分間インキュベートし、次いでPBS-Tで3回洗浄した。ELISAをTMB基質/停止液を用いて現像し、Tecanプレートリーダーで測定した。吸光度カットオフをバックグラウンド+0.2O.D.として決定した。
EBOV曝露
マウスに標的力価1,000pfuのma-EBOVを接種した(Kuhn JHら、Arch Virol、158(6):1425~1432(2013))。すべての検討をUSAMRIIDバイオセーフティレベル4封じ込め施設で行った。0日目に開始し、生存期間継続して、臨床観察を記録し、動物の疾患進行を綿密にモニターした。瀕死の動物を施設認可の臨床スコアに基づいて安楽死させた。
用量反応実験
様々な用量のワクチンに対する応答を試験するために、マウスに0日、21日目にワクチン接種し、49日目に生ウイルスに曝露した。高用量初回抗原刺激のみの実験では、マウスに0日目にワクチン接種し、28日目に生ウイルスに曝露した。
結果
cOVA対照は、致死的なエボラ曝露に対して防御を示さなかった。さらに、EBOV GPに特異的な血清IgGは、ZEBOV VLPをELISAで測定して、14日目までに免疫マウスの大部分で無視し得る程度であり、48日目に類似レベルのままであった(図12A)。
曝露後、すべての対照(非免疫)マウスが感染後7日目までに感染症に屈っしたのに対して、いずれの免疫処置群(VEE-GP又はVEE-GP/VP40)も1/7しか死ななかった。VEEV GP又はVEEV GP/VP40混合物で免疫された群の7匹のマウスのうち6匹は、検査期間を通して感染の臨床徴候を示さなかった(図12B)。
用量反応実験においては、抗体価は、cOVA MDNP対照で認められなかった。2×40μgの裸のGPレプリコン群は、低用量2×0.4μgのGP MDNP用量と類似の力価を示した(図13A)。抗体価の用量反応は、MDNPを2回投与した動物で認められた。
特に、単一用量の40μgのGP MDNPは、高抗体価を優れた精度(低標準偏差)で示した。
cOVA MDNP群のすべてのマウスが7日目までに死んだ。2×4μg、2×40μg及び1×40μgのGP MDNP群は、100%生存した。2×40μgの裸のGPレプリコンを投与した群は、2×0.4μgのGP MDNP用量を投与した群と同様の生存動態を示した(図13B)。
総合すると、防御データによれば、MDNPは、致死的なウイルス感染症の2つのマウスモデルにおいて防御をもたらす。修飾デンドリマーの非免疫原性は、エボラ曝露に対する防御用量よりも50倍高い用量でも(図12B)(Khanら、Nano Lett、doi:10.1021/nl5048972(2015)、Khanら、Angewandte Chemie53、14397~14401、doi:10.1002/anie.201408221(2014))、効率的導入遺伝子発現に有利な性質であり、自然免疫の刺激は、mRNAペイロードのみの発現による。この方法は、大型自己増幅RNAレプリコンに適合し、注射後早期にIFN応答を刺激せずに免疫系に対して強力で持続的な抗原提示を可能にする。強力なIFN応答は、アルファウイルス複製を妨害し、したがって、抗原用量を次第に制限する可能性がある。(Henriksen-Laceyら、Mol Pharm.8、153~161(2011)、Zhangら、J Virol.、81、11246~11255(2007)。
RNAベクターの選択は、従来のものでもレプリコンでも、抗原発現の強度及び持続性を決定するのに重要なパラメータである。SFV、EEV、VEE及びSINを含めたアルファウイルス科のRNAウイルスに基づくレプリコンは、それらの比較的小さいサイズ、遺伝子操作の容易さ、及び宿主細胞細胞質においてすべての構造遺伝子の非存在下で自律的に複製する能力のために、ワクチンベクターとして役立っている。
これらのベクターは、複製欠損型偽ウイルス粒子として送達されると、細胞培養系において構造遺伝子の相補性を必要とする。(Yingら、Nat Med5、823~827(1999))。カチオン性リポソームは、生体内でのキメラSIN/VEEVレプリコンワクチンの合成送達法として働き得る(Geallら、Proc Natl Acad Sci USA109、14604~14609(2012)、Bogersら、J Infect Dis、doi:jiu522[pii]10.1093/infdis/jiu522(2014))が、致死的な病原体曝露に対する防御はまだ報告されていない。レプリコンの急速な送達は、自然免疫活性化を制限する。複製は、恐らく、抗原の単一サイクルの制限された細胞内産生がレプリコンを除去するのに十分な免疫応答を誘発するまで堅牢に進行する。(Liljestrom&Garoff、Biotechnology(NY)9、1356~1361(1991)。
MDNP送達システムの完全な合成性は、重要な利点である。それは、産生のために生細胞に依存するステップを必要とせず、原則的には多数の個々のワクチン候補の迅速なスクリーニングを可能にする。マウスにおける安全で有効な用量(少なくとも40μgまで)は、有意な防御免疫を得るのに必要な用量よりも1桁大きい(図13A~13B)。
幾つかの個々の抗原を処方して広範な多価ワクチンを生成するように抗原組成を多重化することが可能であるべきである。精製及び拡張性の容易さ、並びにコールドチェーンが不要であることは、合成ナノ粒子に基づくプラットホームの更なる開発を促進するものである。
実施例7 修飾デンドリマーナノ粒子送達VEEレプリコンRNAは、致死的なトキソプラズマ ゴンヂ曝露からマウスを防御する
材料及び方法
Jeroen J.P.Saeij Labから提供されたT.ゴンヂ寄生生物の野生型PRU-デルタHXGPRT系統を既述のように調製した。マウスにタキゾイトを接種した。動物の体重減少、不十分な毛づくろい、嗜眠、斜視、脱水症状及び体温低下を含めて、病気の臨床徴候をモニターした。マウスが10%を超える体重減少、激しい脱水症状、重篤な嗜眠、及び/又はかなりの体温低下を起こした場合には安楽死させた。
結果
MDNPの大きいペイロード能力の証明として、6重ワクチンをT.ゴンヂ用に製造した。T.ゴンヂは、世界人口の1/3に汚染食品を介して感染するアピコンプレックス門の原生動物であり、免疫無防備状態の個体において脳トキソプラズマ症を引き起こす可能性があり、生/弱毒寄生生物、DNA及びペプチドの注射によって免疫を生じる努力にもかかわらず、認可されたヒトワクチンがない(Zhangら、Expert Review of Vaccines、12(11):1287~1299(2013))。米国におけるこの疾病の年間経費は、30億ドルと推定される(Hoffmannら、Journal of Food Protection、75(7):1292~1302(2012))。単一のMDNPに同時処方された複数のレプリコンを同時に発現する能力を確認した後、多重T.ゴンヂMDNPワクチンを製造した。6種のT.ゴンヂ特異抗原GRA6、ROP2A、ROP18、SAG1、SAG2A及びAMA1をVEEVレプリコンにコードし、等モル量をMDNPに同時処方した。これらの抗原が選択されたのは、寄生生物の複数の生活環ステージで発現されるタンパク質であり、複数の系統及びタイプで保存されるからである。動物に単一の40μg用量のワクチンを接種した(図12A及び12Bにおいてエボラ用に確立された有効量範囲内である6.67μg/レプリコン)。対照として、VEEV HAを無関係な抗原として含む適合用量のMDNPで動物を処理した。免疫後32日目に、動物を致死量のT.ゴンヂII型系統PRUに曝露した(図14A~14B)。12日目までにすべての対照動物が感染に屈した。6重MDNPワクチンを接種した残りの動物は、臨床徴候なしに6か月以上生存した。単回投与の有効性を試験した同様の長期実験においては、1回のT.ゴンヂワクチン40μgを受けてから32日後にマウスを曝露すると、100%防御が認められた(図14C、14D)。これは、T.ゴンヂに対する完全な防御性単回投与mRNAレプリコンナノ粒子ワクチンを初めて実証したものである。
実施例8 修飾デンドリマーナノ粒子送達VEEVレプリコンRNAは、ジカウイルスに対して液性及び細胞性適応免疫応答を誘発する
材料及び方法
別の病原体であるジカウイルスの抗原成分を、ジカウイルスペプチドに対して免疫を生じる別の抗原として選択した。ワクチン候補をマウスにおけるジカウイルスに対して液性及び細胞性適応免疫応答を誘発する能力について比較した。
ザイールエボラウイルスに対するMDNP製剤(上記実施例6参照)を負の対照ワクチンとして使用した。
結果
液性(図15A)及び細胞性(図15B)適応免疫応答は、対照ワクチン(ザイールエボラウイルスに対するNP製剤)接種マウスに比べて、NPワクチン接種マウスの100%でジカウイルスに対して生じた。
概要
遺伝子に基づくワクチン手法は、完全に合成で迅速にカスタマイズでき、アジュバントを含まない調製物中で製造できるので、従来法よりも幾つかの潜在的利点を有する(Srivastavaら、Annals of internal medicine、138(7):550~559(2003))。現行のウイルスに基づくワクチン製造法は、時間がかかり、2009年のH1N1汎流行で経験したように、5か月を超えるリードタイムを必要とし、生産量はスケールアップ及び収率問題で複雑化し得る(Partridgeら、Vaccine28(30):4709~4712(2010))。アデノウイルス、rVSV、AAV、CMVなどのウイルスベクターによる遺伝子送達に基づくワクチンは、繰り返し投与を妨げる既存の又は誘導される抗ベクター免疫の更なる課題に直面している。MDNPプラットホームは、その柔軟性、安全性及び効率のために、突然の大流行、進化する病原体、個々の患者の要求に対してより適切に答えることができる。このプラットホームを用いると、関連するDNA配列を最初に入手してからミリグラム規模のすぐに注射できるMDNPワクチンまでの製造のタイムラインは、わずか7日である。サイトゾルへのレプリコン送達を促進することによって、MDNPは、T細胞と抗体応答の両方を刺激する内在性抗原産生を惹起する。さらに、ナノカプセル化は、RNA配列に無関係であるので、各々が独特の抗原をコードする種々のレプリコンを生成し、同時にカプセル化することができる(図10A、10B)。達成可能な用量(少なくとも40μgまで)は、有意な防御免疫を得るのに必要な用量よりも1桁大きい(図12A、12B、13A、13B、14A、14B、15A、15B)。この治療指数範囲をヒトに換算すれば、複数の異なる抗原を単一の製剤に組み込むことが可能である。
免疫処置用ベクターとして、mRNAが、特に癌免疫療法の分野で研究され、様々な成功をおさめた(Van Lintら、Expert Review of Vaccines、14(2):235~251(2015))。幾つかの要因が、mRNAに基づく治療法を複雑にし、その有効性を制限している:(1)RNA分子は、細胞内及び細胞外分解しやすい、(2)mRNA発現は一過性である、及び(3)翻訳抑制がRNAに反応して起こり得る(Baum A&Garcia-Sastre(2010)「RNAウイルスによるI型インターフェロンの誘導:細胞受容体及びそれらの基質(Induction of type I interferon by RNA viruses:cellular receptors and their substrates)」(Baum&Garcia-Sastre、Amino Acids、38(5):1283~1299(2010)、Heilら、Science303(5663):1526~1529(2004)、Karikoら、Journal of biological chemistry279(13):12542~12550(2004)、Pichlmairら、Science314(5801):997~1001(2006)、Levinら、Journal of biological chemistry256(14):7638~7641(1981)。それでも、抗原をコードする裸のmRNAの投与は、リンパ節に直接注射すると、抗腫瘍免疫を与えることができる(Kreiterら、Cancer Res、70(22):9031~9040(2010)、Van Lintら、Cancer Res、72(7):1661~1671(2012))。より受け入れやすい経路によってワクチンを配置するのに使用することができる送達化合物の免疫原性及び/又は毒性は、追加の合併症を引き起こす。一部の用途に有効なカチオン性脂質(Geallら、Proc Natl Acad Sci USA109(36):14604~14609(2012)、Bogersら、The Journal of infectious diseases(2014))は、より高用量で使用され、複合化が不完全であると、有毒になり得る(Hoflandら、Proc Natl Acad Sci USA93(14):7305~7309(1996)、Cullisら、Advanced drug delivery reviews32(1-2):3~17(1998)、Lvら、J.Control.Release、114(1):100~109(2006))。さらに、カチオン性脂質は免疫原性である可能性があり、それは、導入遺伝子発現を制限し、安全上の懸念を生じ得る(Henriksen-Lacey Mら、Mol Pharm8(1):153~161(2011))。脂質複合型mRNAに反応したIFN産生は、mRNAベースのワクチンの有効性を制限し得る(Pollard Cら、Molecular therapy:the journal of the American Society of Gene Therapy、21(1):251~259(2013))。種々のナノ粒子形式が、皮内(Hoerrら、Eur J Immunol30(1):1~7(2000))、脾臓内(Zhouら、Human gene therapy10(16):2719~2724(1999))、皮下(Pollard Cら、Molecular therapy:the journal of the American Society of Gene Therapy21(1):251~259.(2013))、静脈内(Hoerrら、Eur J Immunol30(1):1~7(2000)、Mockeyら、Cancer Gene Ther14(9):802~814(2007))、更には鼻腔内(Phuaら、Sci Rep4:5128(2014))投与経路で様々なレベルの有効性を示した。抗原提示細胞の生体外移入とは無関係であるRNAナノ粒子ワクチンの適用の成功例は、動物モデルに限られ((Ulmerら、Vaccine30(30):4414~4418(2012)、及び(Weiner、Molecular therapy:the journal of the American Society of Gene Therapy21(3):506~508(2013))に概説されている)、こうした手法はほとんど臨床試験に供されていない。ヒトにおける免疫防御の相関が報告されてはいるが、臨床効果は失望するものである(Weideら、J Immunother31(2):180~188(2008)、Weideら、J Immunother、32(5):498~507(2009)、Rittigら、Molecular therapy:the journal of the American Society of Gene Therapy19(5):990~999(2011)、Kreiterら、Curr Opin Immunol、23(3):399~406(2011))。SFV、VEEV、SINなどのアルファウイルス科のRNAウイルスに基づくレプリコンは、細胞培養における構造遺伝子の相補性によって生成される複製欠損型偽ウイルス粒子として通常送達される、ワクチンベクターとして役立つ(Lundstrom、Viruses7(5):2321~2333(2015))。
以前、PRINTタンパク質粒子がmRNAレプリコンの非ウイルス性インビトロ送達用に探索された(Xuら、Molecular Pharmaceutics10(9):3366~3374(2013))。しかし、わずか2つの非ウイルス性生体内送達方法しか報告されていない。これらは、MF59アジュバントの構成成分で乳化されたカチオン性脂質DOTAPを含むカチオン性ナノエマルジョン(Britoら、Molecular Therapy22(12):2118~2129(2014)、Bogersら、Journal of Infectious Diseases211(6):947~955(2015))、DLinDMAを中心にした脂質ナノ粒子(Hekele Aら、Emerging Microbes and Infections2(2013)、Geallら、Proc Natl Acad Sci USA109(36):14604~14609(2012))などであり、その両方が5成分系である。これらは、生体内でのキメラSIN/VEEVレプリコンワクチンの合成送達方法として使用されたが、それらは、致死的な病原体曝露に対して防御を示していない(Hekele Aら、Emerging Microbes and Infections2(2013)、Geallら、Proc Natl Acad Sci USA109(36):14604~14609(2012))。それに対して、MDNP手法は、イオン性送達材料、脂質固定化PEG及びレプリコンを利用した完全な合成3成分系であり、致死的なウイルス及び原虫感染症のマウスモデルで防御を示す。これは、致死的な曝露モデルにおいて多種多様な病原体に対して防御免疫を生じ得る最初の完全な合成RNAベースのレプリコンシステムである。この研究は、従来のmRNAでもレプリコンでも、RNAペイロードの選択が、抗原発現の強度及び持続性にかなり影響し得ることも示している(図2F~2G、図8a~8b)。
MDNP送達技術は、エボラ及びT.ゴンヂ防御に必要な用量の500倍の用量を用いたときに、IFNを含めた炎症性サイトカイン産生の全身的増加を生じない(Khan OFら、Angewandte Chemie53(52):14397~14401(2014)、Khan OFら、Nano Lett15(5):3008~3016(2015))。強い初期のIFN応答は、アルファウイルス複製を妨害し、したがって抗原の用量を次第に制限し得るので、これは役立つ(Whiteら、J Virol75(8):3706~3718(2001)、Zhangら、J Virol81(20):11246~11255(2007))。さらに、両方の疾患モデルにおける完全な防御、及び長期の抗原特異的T細胞応答(ワクチン接種後少なくとも10日)が、炎症反応を増加させるのに一般に使用されるアジュバントの非存在下で得られた(Schijnsら、Expert Rev Vaccines10(4):539~550(2011))。
ナノ粒子送達ビヒクルに対する全身的サイトカイン応答の欠如は、抗ベクター免疫を阻止する可能性もある(Ulmerら、Vaccine30(30):4414~4418(2012))。抗ベクター免疫は、免疫系が送達ビヒクルに応答し、送達ビヒクルを不活性化するときに生じ、例えば、ウイルス媒介性送達プラットホームにおいて認められた(Smallら、Current Opinion in Virology1(4):241~245(2011)、Lopez-Gordo Eら、Human gene therapy25(4):285~300(2014))。この性質のため、最近のヒト治験中にrVSVベースの系で必要であることが示唆された同種追加免疫を不要にすることもできる(Fuchsら、Open Forum Infectious Diseases2(3)(2015))。これによって、種々の疾患に対して同じ送達技術を用いて患者に繰り返し投薬することが可能になり得る。
進化する病原体、突然の大流行及び個々の患者の要求に対してより適切に答えるために、医療現場近傍での迅速な製造に適した柔軟で安全で効率的なワクチンプラットホームが必要である。ここで開発されたプラットホームは、以下を可能にし得る合成システムを提供することによって、この要求に対処するものである:1)標的同定後の極めて迅速な製造、2)製造後に必要な精製を最小限にすること、3)混入アレルゲンの可能性が低いこと、4)レプリコンを含めて、複数の抗原産生RNAのカプセル化を可能にする、比較的大きいペイロードを可能にすること、5)好ましくない免疫応答を誘導し得る、内在性mRNA産生を減少させ得る、また、レプリコン自己増幅を減少させ得る、追加のアジュバントの使用を不要にすること(Guptaら、Vaccine11(3):293~306(1993)、Pollard Cら、Molecular therapy:the journal of the American Society of Gene Therapy21(1):251~259(2013)、Whiteら、J Virol75(8):3706~3718(2001)、Zhangら、J Virol81(20):11246~11255(2007))、6)適切な抗体産生及びCD8+T細胞応答を誘導すること、最後に7)患者の服薬遵守を向上させ、医療従事者の負担を軽減する、単回投与で防御免疫を生じること。
実施例9 修飾デンドリマーナノ粒子送達レプリコンRNAは、非小細胞肺癌の発生に対して予防的に接種される
このワクチン接種様式を予防癌ワクチンの製造に使用できることを示すために、推定NSCLC関連癌胎児性抗原Hmga2を用いたレプリコンを合成した。
材料及び方法
Hmga2をコードするレプリコンを用いてナノ粒子ワクチンを製造し、Hmga2をコードするMDNPでマウスを免疫した。免疫処置から2週間後、Hmga2+又はHmga2-KP腫瘍細胞を気管内注入によってマウス肺に同所移植した。N=5。
結果
Krasの潜在発癌性対立遺伝子を活性化し、腫瘍抑制因子p53を欠失させる、Creリコンビナーゼのウイルス投与を利用した、Kras癌遺伝子及びp53癌抑制遺伝子の肺特異的変異を含む肺腺癌の確立されたモデル(肺癌の「KP」モデル)を用いて、非小細胞肺癌の進行を調べることができる(DuPageら、Nat Protoc.;4(7):1064~1072(2009))。適用例の中でも、KPモデルは、肺腫瘍細胞における分化マーカーの漸進的な消失を経時的に追跡し、それに続いて、その発現がHmga2などの胚形成に通常関連するタンパク質の上方制御を追跡するのに使用される。(Winslowら、Nature、473(7345)、101~104(2011))。
移植されたマウス腫瘍由来の細胞系を利用する予備研究においては、レシピエントマウスの予防的ワクチン接種は、大きい及び中間サイズの腫瘍の発生を抑制し、小さい腫瘍の数も明らかに減少させた。Hmga2+KP腫瘍細胞によって誘導される腫瘍は、腫瘍の数及びサイズがHmga2-腫瘍(図16B)よりも減少し(図16A)、抗原特異的効果を示した。重要なことには、この防御作用は、移植細胞における抗原発現に依存し、特異性を示した。

Claims (14)

  1. 治療薬、予防薬及び/又は診断薬とを対象に送達するための修飾デンドリマーナノ粒子であって、
    1種以上の第~7世代アルキル化デンドリマー、
    1種以上の両親媒性ポリマー、及び
    相補DNA(cDNA)、複製RNA(repRNA)、メッセンジャーRNA(mRNA)、転移RNA(tRNA)、ガイド鎖RNA(sgRNA)、発現ベクター及びそれらの組合せからなる群から選択される1種以上の核酸を含む治療薬、予防薬及び/又は診断薬、
    を含み、前記ナノ粒子がコレステロールを含む場合、コレステロールは両親媒性ポリマーの一部としてのみ存在する、修飾デンドリマーナノ粒子。
  2. 前記1種以上のアルキル化デンドリマーが、ポリ(エチレンイミン)、ポリ(ポリプロピレンイミン)、ジアミノブタンアミンポリプロピレンイミンテトラミン及びポリ(アミドアミン)からなる群から選択され
    意選択的に、前記1種以上のアルキル化デンドリマーが、第1世代デンドリマー、第2世代デンドリマー及び第3世代デンドリマーからなる群から選択され、及び
    1種以上のアルキル化デンドリマーが、1~30個の炭素(両端を含む)、好ましくは6~16個の炭素(両端を含む)のサイズのエポキシド末端アルキル鎖を含む、請求項1に記載のナノ粒子。
  3. 前記1種以上の両親媒性ポリマーが、ポリアルキレンオキシド及びそれらのブロックコポリマーからなる群から選択される親水性成分を含み、
    好ましくは、前記1種以上の両親媒性ポリマーが、ポリアルキレンオキシド、好ましくは分子量120Da~25,000Da(両端を含む)、最も好ましくは2,000Daのポリエチレングリコールを含み、
    好ましくは、前記1種以上の両親媒性ポリマーが1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-N-[メトキシ(ポリエチレングリコール)-2000]を含み、及び
    記1種以上の両親媒性ポリマーが、脂質及びリン脂質からなる群から選択される疎水性成分を含む、請求項1又は2のいずれか一項に記載のナノ粒子。
  4. 前記1種以上のアルキル化デンドリマーと前記両親媒性ポリマーの前記親水性成分の質量比が20:1~5:1(両端を含む)、好ましくは11.5:1である、請求項3に記載のナノ粒子。
  5. さらにタンパク質、ペプチド、炭水化物、脂質、小分子及びそれらの組合せからなる群から選択される治療薬、予防薬及び/又は診断薬を含む、請求項1から4のいずれか一項に記載のナノ粒子。
  6. 前記1種以上の核酸が、0~20,000塩基長(両端を含む)の、好ましくは、,000~15,000塩基長(両端を含む)の1個以上のリボ核酸配列を含む、請求項に記載のナノ粒子。
  7. 記1種以上の核酸が、修飾アルファウイルスレプリコンRNAを含む、請求項1~のいずれか一項に記載のナノ粒子。
  8. 前記1種以上の核酸が、感染病原体、若しくは寄生生物、又は癌などの異常増殖障害由来の1種以上の抗原を独立にコードし、
    好ましくは、前記感染病原体がウイルス及び細菌からなる群から選択される、請求項11からのいずれか一項に記載のナノ粒子。
  9. 前記1種以上の核酸1個以上の複製RNA及び1個以上のメッセンジャーRNAを含み、前記メッセンジャーRNAが前記複製RNAの5’及び3’非翻訳領域を含むように修飾される、請求項1からのいずれか一項に記載のナノ粒子。
  10. 前記ナノ粒子のサイズが30nm~450nm(両端を含む)、好ましくは60nm~250nm(両端を含む)である、請求項1からのいずれか一項に記載のナノ粒子。
  11. 前記1種以上のアルキル化デンドリマーと前記1種以上の核酸の質量比が10:1~5:1(両端を含む)、好ましくは5:1である、請求項1~10のいずれか一項に記載のナノ粒子。
  12. 1種以上の治療薬、予防薬及び/又は診断薬を対象に送達することに使用するための請求項1~11のいずれか一項に記載のナノ粒子。
  13. 請求項1から11のいずれか一項に記載のナノ粒子を含むワクチンであって、
    前記1種以上の核酸が、抗原又はタンパク質抗原をコードするものであり、又は
    前記ナノ粒子が、さらに抗原を含むものであり、
    前記ナノ粒子が、対象の抗原提示細胞における抗原に対する免疫応答を誘導するのに有効な量であり、
    好ましくは、1種以上の免疫調節剤を更に含み、
    前記免疫調節剤が、合成受容体リガンド、タンパク質、サイトカイン、インターロイキン、腫瘍壊死因子及びそれらの組合せからなる群から選択される、
    ワクチン。
  14. 前記タンパク質抗原が、腫瘍抗原、微生物抗原、アレルゲン及びそれらの組合せからなる群から選択され、
    前記腫瘍抗原が、癌遺伝子発現産物、選択的にスプライスされたタンパク質、変異遺伝子産物、過剰発現遺伝子産物、異常発現遺伝子産物、腫瘍ウイルスによって産生される抗原、癌胎児性抗原、改変細胞表面糖脂質を含むタンパク質、及びそれらの組合せからなる群から選択され、
    好ましくは、前記癌胎児性抗原がHmga2タンパク質であり
    前記微生物抗原が、細菌、ウイルス、真菌、原生動物及びそれらの組合せからなる群から選択され、
    前記ウイルス抗原が、インフルエンザウイルス、エボラウイルス、ジカウイルス及びそれらの組合せからなる群から選択されるウイルスに由来する、又は、前記原生動物抗原がトキソプラズマ ゴンヂ(Toxoplasma gondii)に由来する、請求項13に記載のワクチン。
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