JP6959644B2 - Electrophoresis fully automatic processing device and its method - Google Patents
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Description
本発明は、電気泳動全自動処理装置およびその方法に関するものである。 The present invention relates to a fully automatic electrophoresis processing device and a method thereof.
近年、核酸(DNA,RNA等)やその断片(オリゴヌクレオチド、ヌクレオチド等)の塩基配列を決定するために、しばしばジデオキシ法によるキャピラリーシーケンシングが用いられている。この方法では、4つの通常のDNA合成系を用意し、そこに低濃度の鎖停止ヌクレオチド(ターミネータ)を加えて反応させるようにしたものである。ターミネータは4種類のジデオキシヌクレオチド(ddATP,ddGTP,ddCTP,ddTTP)の内、それぞれ1種類だけを用いる。DNAポリメラーゼは鋳型配列に対応するデオキシリボヌクレオチドを取り込みながらDNAを合成していくが、時々対応するターミネータを取り込んで反応がそこで止まることが起きる。結果的に使用したターミネータの塩基に対応する様々な長さのDNA断片がランダムに生ずることになる。例えば、ターミネータとしてddATPを加えた系では、生じたDNA断片の3'末端の塩基はアデニンになるという具合である。これによって、最初に単なるDNA合成をする必要がなく、4つの反応系だけできちんと配列が確定できる。 In recent years, capillary sequencing by the dideoxy method is often used to determine the base sequence of nucleic acids (DNA, RNA, etc.) and fragments thereof (oligonucleotides, nucleotides, etc.). In this method, four ordinary DNA synthesis systems are prepared, and low-concentration strand-stop nucleotides (terminators) are added thereto for reaction. As the terminator, only one of each of the four types of dideoxynucleotides (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP) is used. DNA polymerase synthesizes DNA while incorporating the deoxyribonucleotide corresponding to the template sequence, but sometimes the reaction stops there by incorporating the corresponding terminator. As a result, DNA fragments of various lengths corresponding to the base of the terminator used will be randomly generated. For example, in a system in which ddATP is added as a terminator, the base at the 3'end of the resulting DNA fragment becomes adenine. As a result, it is not necessary to simply synthesize DNA at the beginning, and the sequence can be properly determined with only four reaction systems.
この方法では、各種の色素を結合することで標識化されたジデオキシヌクレオチド等が含まれた種々の長さのDNA断片を調製する。この標識化されたDNA断片をゲル充填電気泳動用キャピラリーにより分離し、標識を検出することによって、4種類の塩基(A,C,G,T)の配列を決定することによって行われている(サンガー法:ダイ・ターミネータ・シーケンシング)。 In this method, DNA fragments of various lengths containing labeled dideoxynucleotides and the like are prepared by binding various dyes. This is done by separating the labeled DNA fragment with a gel-filled electrophoresis capillary and detecting the label to sequence four bases (A, C, G, T) (A, C, G, T). Sanger method: die terminator sequencing).
ところが、従来では、サンプルからの核酸の抽出処理、抽出した核酸について、シーケンサにかける前処理としての、プライマー、DNAポリメラーゼ、標識化ジデオキシヌクレオチドを用いた断片の合成処理および増幅処理、該標識化断片の電気泳動処理、さらにはこれらの各処理における生成物の品質評価処理、およびシーケンサ処理は別箇の専用の装置によって行われている。 However, conventionally, the extraction process of nucleic acid from a sample, the synthesis process and amplification process of a fragment using a primer, DNA polymerase, and labeled dideoxynucleotide as a pretreatment for applying the extracted nucleic acid to a sequencer, and the labeled fragment. The electrophoresis process, the quality evaluation process of the product in each of these processes, and the sequencer process are performed by another dedicated device.
ところが、このような塩基配列の解析を行う場合には、解析の対象となる核酸、使用する化学物質、生成された生成物を用いて高精度の増幅処理が求められることになる。特に、目的とする核酸以外の核酸が混じっていたために、増幅することによって誤った結論を導いたり、増幅処理を行った後に、何回も最初から増幅までの処理を繰り返したり、目的とする核酸の塩基配列を解析するためには、特に核酸またはその断片についてランダムに分断させることが解析の成功に特に必要となる。 However, when analyzing such a base sequence, a highly accurate amplification process is required using the nucleic acid to be analyzed, the chemical substance to be used, and the produced product. In particular, since a nucleic acid other than the target nucleic acid is mixed, an erroneous conclusion may be drawn by amplifying the nucleic acid, or the target nucleic acid may be repeated many times from the beginning to the amplification after the amplification process. In order to analyze the base sequence of Nucleic Acid, it is particularly necessary for the success of the analysis to randomly divide the nucleic acid or a fragment thereof.
したがって、使用する各種生体高分子等の化学物質溶液、抽出した生成物である目的核酸、断片生成のために増幅した目的核酸の断片が、処理目的に合致しているかどうかをみるためには、使用する化学物質溶液や、抽出したり断片化された生成物から、人手を用いて一部抜き出して、種々の物理化学量、例えば、量、濃度、吸光度、粘性、分散度、沈降速度、高分子分子量、核酸増幅量等、または、種々の物理化学的性質、例えば、目的核酸またはその断片の有無、その量等を測定し、かつその目的核酸の塩基配列の決定を行う場合において、それぞれ専用の装置、例えば、電気泳動装置等を用意して測定が行われることになる。これは、ユーザにとって手間がかかるとともに、クロスコンタミネーションのおそれがあり、また電気泳動法や、核酸に関する専門の研究者や技術者を必要とするのが現状であり、この分野の専門外の医師等が簡単に臨床応用に用いることができるものではなかった。 Therefore, in order to see whether the chemical substance solutions such as various biopolymers to be used, the target nucleic acid which is the extracted product, and the fragment of the target nucleic acid amplified for fragment production meet the processing purpose. Various physical chemical quantities, such as quantity, concentration, absorbance, viscosity, dispersibility, sedimentation rate, high, are manually extracted from the chemical solution to be used or the product extracted or fragmented. Molecular molecular weight, nucleic acid amplification amount, etc., or various physicochemical properties, for example, when measuring the presence or absence of the target nucleic acid or a fragment thereof, the amount thereof, etc., and determining the base sequence of the target nucleic acid, respectively. The measurement is performed by preparing an apparatus of the above, for example, an electrophoresis apparatus and the like. This is troublesome for the user, there is a risk of cross-contamination, and the current situation is that it requires researchers and technicians who are specialized in electrophoresis and nucleic acids, and doctors who are not specialized in this field. Etc. could not be easily used for clinical application.
例えば、蛍光物質によって標識化した目的核酸の有無または量、若しくは塩基配列を測定するには、測定用光として励起光を照射し生ずる蛍光を受光する必要がある。この場合には、PCR法による温度制御可能な容器内に、蛍光物質で標識化した目的物質の溶液を収容し、透光性を有する密閉蓋または密閉液で前記溶液を密封した後に、前記密閉蓋または密閉液を通して、励起光を照射し蛍光を受光する必要がある。 For example, in order to measure the presence or absence or amount of the target nucleic acid labeled with a fluorescent substance, or the base sequence, it is necessary to receive the fluorescence generated by irradiating the excitation light as the measurement light. In this case, a solution of the target substance labeled with a fluorescent substance is placed in a temperature-controllable container by the PCR method, the solution is sealed with a translucent sealing lid or a sealing liquid, and then the sealing is performed. It is necessary to irradiate the excitation light through the lid or the sealing solution to receive the fluorescence.
また、例えば、核酸、タンパク質等の各種生体高分子等の化学物質を含有する化学物質溶液の吸光度を測定するには、石英セルに対象となる該溶液を収容し、該石英セルの所定側面に垂直に該石英セルを透過可能であって、前記化学物質によって吸光可能な所定の波長λの測定用光(ここでは、検出されるべき光を得るために、測定対象に照射されるべき光として用いる。例えば、吸光度測定用の光、励起光等である。)を当てて、入射光強度I0と透過光強度Iとの比(透過率)を測定し、Aλ=−log10(I/I0)より吸光度Aλを求める。 Further, for example, in order to measure the absorbance of a chemical substance solution containing chemical substances such as various biopolymers such as nucleic acids and proteins, the target solution is contained in a quartz cell and placed on a predetermined side surface of the quartz cell. Light for measurement having a predetermined wavelength λ that can be vertically transmitted through the quartz cell and can be absorbed by the chemical substance (here, as light to be irradiated to the measurement target in order to obtain light to be detected. (For example, light for measuring absorbance, excitation light, etc.) is applied to measure the ratio (transmission) between the incident light intensity I 0 and the transmitted light intensity I, and A λ = −log 10 (I). Obtain the absorbance A λ from / I 0).
この場合、該核酸によって吸光可能な波長の光として、260nm付近の紫外線が測定用光として用いられる。これは、DNA、RNAやオリゴヌクレオチドの核酸を構成する塩基がこの付近に吸収ピークをもつことに由来するからである。また一般に、核酸の他、たんぱく質等の各種生体高分子物質や、生体組織、コロイド物質、各種物質の凝集または各種固形物等の種々の溶液(懸濁液をも含む)についての吸光度を測定する場合にも、それぞれ適した波長をもつ測定用光が必要であり、それぞれ専用の測定用光を照射することができる装置を用意する必要があった。 In this case, as the light having a wavelength that can be absorbed by the nucleic acid, ultraviolet rays in the vicinity of 260 nm are used as the measurement light. This is because the bases constituting the nucleic acids of DNA, RNA and oligonucleotides have absorption peaks in the vicinity thereof. In general, in addition to nucleic acids, the absorbance of various biopolymer substances such as proteins, biological tissues, colloidal substances, aggregation of various substances, and various solutions (including suspensions) such as various solids is measured. In each case, measurement light having a suitable wavelength is required, and it is necessary to prepare a device capable of irradiating each dedicated measurement light.
ところで、種々の測定内容に応じて使用する測定用光を測定対象の化学物質溶液を収容した容器等の外部から照射・受光する場合には、測定用光は壁を通過することになり、壁が透明部材であっても測定用光の吸収が無視できないおそれがある。 By the way, when the measurement light used according to various measurement contents is irradiated or received from the outside such as a container containing a chemical substance solution to be measured, the measurement light passes through the wall, and the wall. Even if is a transparent member, the absorption of measurement light may not be negligible.
例えば、前記吸光度を測定する場合には、光学部品の素材として良く用いられるガラスは、紫外線の波長領域では吸光係数が著しく増大し、透過率が急激に減少し使用が困難であるため、特殊な材料を使用した専用の光学部品が使用され(例えば、石英ガラス[波長200nm以上で使用可]やフッ化カルシウム、フッ化マグネシウム[150nm以上で使用可])、これらの材料で形成されたセル容器内に測定対象となる溶液を収容して測定用光を照射することで吸光度を測定する。しかしながら、これらの素材は高価であって、装置の製造費用の増大を招くおそれがあるというだけでなく、水平方向に測定する場合には容器の向かい合った側壁の間隔に光路長が限定され、上下方向に測定する場合には容器の大きさや液体の量によって光路長が限定されるおそれがあるという問題点を有していた。 For example, when measuring the absorbance, glass, which is often used as a material for optical components, is special because its extinction coefficient increases remarkably in the wavelength region of ultraviolet rays and its transmittance decreases sharply, making it difficult to use. Dedicated optical components made of materials are used (for example, quartz glass [can be used at wavelengths of 200 nm and above], calcium fluoride, magnesium fluoride [can be used at 150 nm and above]), and cell containers made of these materials. The absorbance is measured by accommodating the solution to be measured inside and irradiating it with measurement light. However, not only are these materials expensive and can lead to increased manufacturing costs for the equipment, but when measured horizontally, the optical path length is limited to the distance between the opposite side walls of the container, and the top and bottom When measuring in the direction, there is a problem that the optical path length may be limited by the size of the container and the amount of liquid.
光路長が限定されると、適切な光路長をとって測定精度を上げることが困難なおそれがある。例えば、測定用光の強度が同一として、測定対象の溶液が透過率の低い場合(濃度が高い場合)には光路長を短くとり、透過率の高い場合(濃度が低い場合)には光路長を長くすることで測定精度を高めることができ、特に測定対象の溶液の液量が少量の場合には、測定用のセル容器を満たすことができず、定められた光路長を得ることができないおそれがあるという問題点を有していた。 If the optical path length is limited, it may be difficult to obtain an appropriate optical path length and improve the measurement accuracy. For example, assuming that the intensity of the light for measurement is the same, if the solution to be measured has a low transmittance (high concentration), the optical path length is shortened, and if the transmittance is high (low concentration), the optical path length is short. The measurement accuracy can be improved by lengthening the length, and especially when the amount of the solution to be measured is small, the cell container for measurement cannot be filled and the specified optical path length cannot be obtained. There was a problem that there was a risk.
したがって、核酸シーケンシング処理等の電気泳動処理をサンプルからの目的物質の抽出、抽出した目的物質の有無、量、増幅等の加工した目的物質の有無、量、目的物質の標識化、目的物質の電気泳動による解析、例えば塩基配列の測定を行うことの手間や使用する装置の種類の多さ、専門知識や技術を習熟する必要があり、このようなことが、例えば、電気泳動を用いた遺伝子解析の汎用化や、病院等における臨床応用の拡大を妨げることになっている。そこで、臨床時等において、クロスコンタミネーションを防止しかつユーザの手間を軽減して、迅速かつ効率的に電気泳動処理を可能とする信頼性の高い精度の核酸の増幅等の処理を行うことが重要である。さらに、目的物質の抽出から増幅等の加工さらには測定までを一貫して自動化することが必要であるとともに、装置の小型化と、安価で高精度の装置を提供することが重要である。 Therefore, in electrophoresis treatment such as nucleic acid sequencing treatment, extraction of the target substance from the sample, presence / absence of the extracted target substance, amount, presence / absence of processed target substance such as amplification, amount, labeling of the target substance, labeling of the target substance, It is necessary to master the labor of analysis by electrophoresis, for example, measurement of base sequence, the variety of devices used, specialized knowledge and techniques, and such things are, for example, genes using electrophoresis. It is supposed to hinder the generalization of analysis and the expansion of clinical application in hospitals and the like. Therefore, in clinical practice, it is possible to perform processing such as highly reliable and accurate nucleic acid amplification that prevents cross-contamination, reduces user's labor, and enables rapid and efficient electrophoresis processing. is important. Furthermore, it is necessary to consistently automate the process from extraction of the target substance to processing such as amplification and measurement, and it is also important to reduce the size of the device and to provide an inexpensive and highly accurate device.
そこで、本発明は以上の問題点を解決するためになされたものであり、その第1の目的は、目的物質の解析(例えば、目的核酸の塩基配列の解析)をキャピラリー電気泳動法によって行う電気泳動処理(シーケンス処理を含む)を、臨床時等において行うに際し、クロスコンタミネーションを防止しかつユーザの手間を軽減して、サンプルからの目的物質(例えば、目的核酸)の抽出から、標識化、加工(例えば、核酸の断片化、増幅)さらには目的物質の解析(例えば、核酸の塩基配列の決定)までを一貫して自動化し、ユーザの手を経ることなく迅速かつ効率的に処理を実行することができる電気泳動全自動処理装置またはその方法を提供することである。 Therefore, the present invention has been made to solve the above problems, and the first object thereof is electricity in which analysis of a target substance (for example, analysis of the base sequence of a target nucleic acid) is performed by capillary electrophoresis. When performing electrophoresis treatment (including sequence processing) in clinical practice, etc., cross-contamination is prevented and the user's labor is reduced, and the target substance (for example, target nucleic acid) is extracted from the sample, labeled, and labeled. Processing (for example, fragmentation and amplification of nucleic acid) and analysis of the target substance (for example, determination of the base sequence of nucleic acid) are consistently automated, and processing is executed quickly and efficiently without the intervention of the user. It is to provide a fully automated electrophoresis processing apparatus or a method thereof.
第2の目的は、キャピラリー電気泳動法を用いて目的物質の解析を行う際のその生成物や関連する化学物質の品質評価をも、手動や、他の専用装置を用いることなく、同一の装置を用いて行うことを可能にすることによって、ユーザの手間を軽減し、かつ、外部からの異物の侵入や、コンタミネーションを確実に防止し、信頼性の高い化学物質を用い、かつ高い品質の生成物を得て精度の高い目的物質の解析を行うことができる電気泳動全自動処理装置およびその方法を提供することである。 The second purpose is to evaluate the quality of the product and related chemical substances when analyzing the target substance using capillary electrophoresis, without using the same device manually or using other dedicated devices. By making it possible to do it using, it reduces the trouble of the user, prevents the invasion of foreign substances from the outside and contamination, uses highly reliable chemical substances, and has high quality. It is an object of the present invention to provide a fully automated electrophoresis processing apparatus and a method thereof capable of obtaining a product and performing highly accurate analysis of a target substance.
第3の目的は、分注装置のみならず、PCR法に基づく核酸増幅装置等の化学物質の処理装置、キャピラリー電気泳動専用装置、制御部および光測定器を組み込み、かつ部品や器具、機構を共通に利用することで装置規模を拡大することなく、効率的に処理を行い、かつ安価に製造し使用することができる電気泳動全自動処理装置およびその方法を提供することである。 The third purpose is to incorporate not only a dispensing device but also a processing device for chemical substances such as a nucleic acid amplification device based on the PCR method, a dedicated device for capillary electrophoresis, a control unit and an optical measuring device, and to incorporate parts, instruments and mechanisms. It is an object of the present invention to provide a fully automatic electrophoresis processing apparatus and a method thereof that can be efficiently processed and inexpensively manufactured and used without expanding the scale of the apparatus by being commonly used.
第4の目的は、複数種類の目的物質の一部または全部を並行してかつ高い精度で処理可能とすることによって、処理を迅速かつ効率的に行うにも拘らず高い精度の解析を行うことができる電気泳動全自動処理装置およびその方法を提供することである。 The fourth purpose is to perform high-precision analysis in spite of quick and efficient processing by enabling some or all of a plurality of types of target substances to be processed in parallel and with high accuracy. It is to provide a fully automatic electrophoresis processing apparatus capable of performing the above and a method thereof.
第1の発明は、複数本の電気泳動用キャピラリーを有し、電圧を印加することにより該キャピラリー内で目的物質を泳動させるキャピラリー電気泳動部と、サンプルからの前記目的物質の抽出処理、該目的物質の加工処理、および各処理に関する生成物または化学物質の品質評価を経て得られた前記目的物質を含有する電気泳動用試料を、前記キャピラリー電気泳動部の前記各キャピラリーに各々供給可能とする電気泳動前処理部と、前記電気泳動部の各前記キャピラリーに関する光の測定および前記電気泳動前処理部の前記品質評価のための光の測定からなるグループの中から選択して、任意の少なくとも1の光の測定を実行可能とする光選択測定部と、前記サンプルからの前記目的物質の抽出処理、該目的物質の加工処理、前記目的物質の解析処理、および前記品質評価を制御する制御部とを有し、前記光選択測定部は、測光内容または前記目的物質を含む前記生成物または前記化学物質により定まる測定用光を照射可能な複数個の導光路の各一端部である照射端を各組に有する複数組の照射端組、および、該照射端組に対応する位置に位置しまたは位置付け可能に設けられ該照射端から照射された測定用光に基づいて生ずる光を各々受光可能な複数個の導光路の各一端部である受光端を各組に有する複数組の受光端組と、前記制御部による目的物質の解析処理または品質評価の指示があった場合に、前記複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から対となる1組の照射端組および1組の受光端組を選択して、対応する1対の照射端および受光端からなる照射受光対ごとに、前記照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を測定する照射受光対選択測定部とを有する電気泳動全自動処理装置である。 The first invention comprises a capillary electrophoresis unit which has a plurality of electrophoresis capillaries and allows a target substance to be electrophoresed in the capillary by applying a voltage, and an extraction process of the target substance from a sample. Electricity that enables the electrophoretic sample containing the target substance obtained through the processing of the substance and the quality evaluation of the product or chemical substance related to each treatment to be supplied to each of the capillaries of the capillary electrophoresis unit. Any one of at least one selected from the group consisting of the migration pretreatment unit, the measurement of light for each of the capillarys of the electrophoresis unit, and the measurement of light for the quality evaluation of the electrophoresis pretreatment unit. An optical selective measurement unit that enables light measurement, and a control unit that controls the extraction process of the target substance from the sample, the processing process of the target substance, the analysis process of the target substance, and the quality evaluation. Yes, and the light selection measurement unit photometric content or the product or each set of irradiation end is the end of the plurality of light guide capable of irradiating a measuring light determined by the chemical containing the target substance A plurality of sets of irradiation ends, and a plurality of sets that are located or positionably provided at a position corresponding to the irradiation end set and capable of receiving light generated based on the measurement light emitted from the irradiation end. When there are a plurality of sets of light-receiving end sets each having a light-receiving end, which is one end of each of the light guide paths, and an instruction for analysis processing or quality evaluation of a target substance by the control unit, the plurality of sets of irradiation ends. A pair of irradiation end sets and a set of light receiving end sets are selected from the set and a plurality of sets of light receiving end sets, and for each irradiation light receiving pair consisting of the corresponding pair of irradiation ends and light receiving ends, said sequential supplies a predetermined measurement light to the irradiation end, is an electrophoretic fully automatic processing apparatus for chromatic and illumination light receiving pair selecting measuring unit for measuring the intensity of light successively received by said light receiving end.
ここで、「電気泳動用キャピラリー」とはキャピラリー電気泳動で用いる毛細管であって、「キャピラリー電気泳動」には、種々の分離方式があり、本発明はその分離方式のいずれにも適用可能である。該分離方式には、例えば、(1) キャピラリー内に緩衝液を満たし、一端から試料を注入する方式(自由ゾーン電気泳動方式)。(2) 電気的に中性である複数の成分が試料中に存在している場合に、硫酸ドデシルナトリウム(SDS)という陰イオン性界面活性剤を用いるSDSミセルに取り込んで移動させる方式(動電クロマトグラフィー方式)。(3) ポリアクリルアミドゲルをキャピラリー内に形成する方式。またはその代わりに高分子溶液を用いる方式(ゲル電気泳動方式)。(4) キャピラリー内に、様々な等電点を持つ両性電解質と試料の混合物を満たし、正極は酸に浸し、その酸は両性電解質の中で最も等電点が低いものよりさらに酸性の強いものとし、負極には、塩基で満たし、該塩基は最も等電点の高い両性電解質よりも塩基性が強いものとする方式(等電点方式)。(5) 試料混合物の前端にいずれの成分よりも速やかに電気泳動するイオンを含む媒体、後端に逆の性格の媒体、試料液は両者の中間という設定で電気泳動を行う方式(等速電気泳動方式)等がある。「電気泳動用キャピラリー」は、キャピラリーの両端部を一対の液収容部(例えば後述する可動液収容部および泳動後収容部)内に挿入し、収容された緩衝液を含有する電気泳動用試料に浸し、例えば、10〜30kVの高電圧を印加して電気泳動させるものである。泳動中、試料はキャピラリー内を移動しながら徐々に分離され、キャピラリーの途中に設けられたセルにおいて、試料内容の検出が行われる。キャピラリーの内径は、100μ\ochm以下、例えば50μ\ochmである。隣接するキャピラリー間のピッチは、例えば、18mmである。またキャピラリーの長さは、例えば、約80cmである。キャピラリーは、例えばシリカまたはガラス製である。 Here, the "capillary for electrophoresis" is a capillary tube used in capillary electrophoresis, and "capillary electrophoresis" has various separation methods, and the present invention can be applied to any of the separation methods. .. The separation method includes, for example, (1) a method in which a buffer solution is filled in a capillary and a sample is injected from one end (free zone electrophoresis method). (2) When multiple electrically neutral components are present in the sample, they are taken into an SDS micelle using an anionic surfactant called sodium dodecyl sulfate (SDS) and moved (electrodynamics). Chromatography method). (3) A method of forming polyacrylamide gel in the capillary. Alternatively, a method using a polymer solution (gel electrophoresis method). (4) The capillary is filled with a mixture of an amphoteric electrolyte having various isoelectric points and a sample, the positive electrode is immersed in an acid, and the acid is more acidic than the one having the lowest isoelectric point among the amphoteric electrolytes. The negative electrode is filled with a base, and the base is stronger than the amphoteric electrolyte having the highest isoelectric point (isoelectric point method). (5) A method in which a medium containing ions that electrophores faster than any of the components at the front end of the sample mixture, a medium having the opposite character at the rear end, and the sample solution are electrophoresed at an intermediate setting between the two (constant velocity electrophoresis). Migration method) and so on. The "electrophoretic capillary" is a sample for electrophoresis containing a buffer solution in which both ends of the capillary are inserted into a pair of liquid accommodating portions (for example, a movable fluid accommodating portion and a post-electrophoretic accommodating portion, which will be described later). It is immersed and electrophoresed by applying a high voltage of, for example, 10 to 30 kV. During the electrophoresis, the sample is gradually separated while moving in the capillary, and the sample content is detected in a cell provided in the middle of the capillary. The inner diameter of the capillary is 100 μ \ ochm or less, for example 50 μ \ ochm. The pitch between adjacent capillaries is, for example, 18 mm. The length of the capillary is, for example, about 80 cm. Capillaries are made of, for example, silica or glass.
「目的物質」とは、主として核酸またはその一部であるが、その他、例えば、タンパク質、アミノ酸、糖鎖、脂肪等の生化学物質を含む。「目的物質の加工処理」とは、目的物質を、電気泳動に適するように行う処理であって、例えば、目的物質とバッファ液の混合、目的物質が核酸等の場合の断片化処理、増幅処理、標識化処理等である。「キャピラリー電気泳動部」には、例えば、複数本のゲルが充填された電気泳動用キャピラリーが設けられ、その一端部は各可動液収容部に設けられ、その他端部は泳動後収容部に挿入されて連通し、各収容部に電極対(負極、正極の対または陰極、陽極)の一方をそれぞれ設け、該電極対間に所定の電圧を印加して、電気泳動用キャピラリー内に蛍光物質で標識化された目的物質またはその断片、例えば、DNA断片(電気泳動用試料)を泳動させて、分子量の大きさに応じてその断片の位置または泳動の順序から塩基配列を解析するものである。電気泳動用試料は、例えば、4種(A,C,G,T)の塩基に対応する蛍光体の混合物であるので、例えば、4色の波長の光を同時に検出することによって測定を行う(サンガー法)。「前記キャピラリーに関する光の測定」には、該キャピラリーの側壁において光を測定する場合、および、前記泳動後収容部の側壁で光を測定する場合がある。ここで、「電気泳動用試料」とは、電気泳動用キャピラリーに供給される試料であって、目的物質、または目的物質を電気泳動用に加工処理したものまたは加工処理に必要な試薬、電気泳動に必要な試薬、またはバッファ液等を含有するものである。 The "target substance" is mainly a nucleic acid or a part thereof, but also includes other biochemical substances such as proteins, amino acids, sugar chains, and fats. The "processing process of the target substance" is a process of processing the target substance so as to be suitable for electrophoresis, for example, mixing of the target substance and the buffer solution, fragmentation processing when the target substance is nucleic acid or the like, and amplification processing. , Labeling processing, etc. The "capillary electrophoresis section" is provided with, for example, an electrophoresis capillary filled with a plurality of gels, one end of which is provided in each moving fluid storage section, and the other end is inserted into the post-migration storage section. One of the electrode pairs (negative electrode, positive electrode pair or cathode, anode) is provided in each accommodating portion, and a predetermined voltage is applied between the electrode pairs, and a fluorescent substance is used in the electrophoresis capillary. A labeled target substance or a fragment thereof, for example, a DNA fragment (electrophoretic sample) is run, and the base sequence is analyzed from the position of the fragment or the order of electrophoresis according to the size of the molecular weight. Since the electrophoresis sample is, for example, a mixture of phosphors corresponding to four types (A, C, G, T) of bases, measurement is performed by, for example, simultaneously detecting light having four wavelengths (for example). Sanger method). The "measurement of light with respect to the capillary" includes a case where the light is measured on the side wall of the capillary and a case where the light is measured on the side wall of the post-electrophoresis accommodating portion. Here, the "electrophoretic sample" is a sample supplied to an electrophoresis capillary, and is a target substance or a processed target substance for electrophoresis, a reagent required for the processing, or electrophoresis. It contains a reagent or a buffer solution necessary for the above.
例えば、「断片の生成」は、塩基配列測定対象となる目的核酸の断片に熱を加えて、2本鎖から1本鎖に変性し、さらに鋳型DNA,プライマー、DNA合成酵素、ヌクレオチドに、低濃度の4種類の内の1種類の鎖停止ヌクレオチド(ターミネータ)をそれぞれ加えた4つの反応容器内で反応させることによってランダムな長さのA,C,G,Tで停止した断片を生成する(サンガー法)。 For example, in "fragment generation", heat is applied to a fragment of the target nucleic acid to be sequenced to denature it from double-stranded to single-stranded, and further, it is low in template DNA, primers, DNA synthase, and nucleotides. By reacting in four reaction vessels to which one of the four concentrations of chain-stopping nucleotides (terminators) is added, fragments stopped at random lengths A, C, G, and T are produced (. Sanger method).
「品質評価」とは、抽出処理、断片生成処理、および増幅処理等の加工処理の結果生成された生成物または使用する化学物質に関する品質の評価を行うものであって、これによって、最終的に得られた結果が信頼性の高いものであることを保証し、または、どの処理で誤りがあったかを確認することによって、その原因をより容易に突き止め、処理または工程の結果得られた生成物の品質の向上を図ることができる。 "Quality evaluation" is an evaluation of the quality of a product or a chemical substance used as a result of processing such as extraction treatment, fragment formation treatment, and amplification treatment, thereby finally performing quality evaluation. By ensuring that the results obtained are reliable, or by ascertaining which process was erroneous, the cause can be more easily identified and the product obtained as a result of the process or process. Quality can be improved.
品質の評価は、例えば、得られた目的物質、例えば、核酸またはその断片の分子量や濃度を評価するために前記光選択測定部を利用して流管、電気泳動用キャピラリー、反応容器または泳動後収容部内の光学的状態を測定することによって行う。例えば、分子量の範囲を解析し、塩基配列を解析し、核酸の増幅量または該吸光度を光測定することでその核酸またはその断片の濃度等を測定することである。品質の評価には、例えば、生成物、生化学物質の検出または定量測定、または生化学物質溶液の濃度若しくは吸光度の測定が含まれる。「測定」には、その他、比色法、比濁法等を含有する場合がある。さらに、「測定」には、例えば、リアルタイムPCR、酵素活性、若しくは反応速度等のように、前記増幅量、生化学物質量、反応量、濃度、若しくは吸光度等の時間的変化の測定を含有することがある。
「物理化学的性質」とは、例えば、測定対象の生成物または化学物質の特定、目的物質(目的核酸)の有無、生成物、化学物質の構造の特定、塩基配列、分子構造、ウィルスの有無、細菌の有無、免疫測定等である。
「物理化学的数値」とは、例えば、化学物質溶液量、化学物質量、濃度、吸光度、分子量等である。
Quality evaluation is performed, for example, by using the optical selective measurement unit to evaluate the molecular weight or concentration of the obtained target substance, for example, nucleic acid or a fragment thereof, in a flow tube, a capillary for electrophoresis, a reaction vessel or after migration. This is done by measuring the optical condition inside the housing. For example, the range of molecular weight is analyzed, the base sequence is analyzed, and the concentration of the nucleic acid or a fragment thereof is measured by photo-measuring the amplified amount or the absorbance of the nucleic acid. Quality assessments include, for example, detection or quantitative measurement of products, biochemicals, or measurement of concentration or absorbance of biochemical solutions. In addition, the "measurement" may include a colorimetric method, a turbidity method, and the like. Further, the "measurement" includes measurement of temporal changes such as the amount of amplification, the amount of biochemical substance, the amount of reaction, the concentration, or the absorbance, such as real-time PCR, enzyme activity, or reaction rate. Sometimes.
"Physical and chemical properties" means, for example, identification of a product or chemical substance to be measured, presence / absence of a target substance (target nucleic acid), identification of a product or structure of a chemical substance, base sequence, molecular structure, presence / absence of virus. , Presence or absence of bacteria, immunoassay, etc.
The "physicochemical value" is, for example, a chemical substance solution amount, a chemical substance amount, a concentration, an absorbance, a molecular weight, or the like.
「光学的状態」には、発光、呈色、変色、変光を含み、「変光」には、光の反射、吸収、散乱を含む。 The "optical state" includes light emission, coloration, discoloration, and light change, and the "variable light" includes reflection, absorption, and scattering of light.
「化学物質」とは、化学反応に用いられる物質、特に、例えば、核酸等の遺伝物質、免疫物質等のタンパク質、糖類、ペプチド等の生化学物質が該当する。 The “chemical substance” corresponds to a substance used in a chemical reaction, in particular, a genetic substance such as a nucleic acid, a protein such as an immune substance, a saccharide, or a biochemical substance such as a peptide.
「核酸増幅法」には、例えば、PCR(polymerase chain reaction)法、LAMP(loop-mediated isothermal amplification)法、LCR(ligase chain reaction)法、SDA(strand displacement amplification)法、MTD(transcription mediated amplification)法等がある。「核酸検出法」には、相補性を利用した標的核酸の検出を行う場合がある。 The "nucleic acid amplification method" includes, for example, PCR (polymerase chain reaction) method, LAMP (loop-mediated isothermal amplification) method, LCR (ligase chain reaction) method, SDA (strand displacement amplification) method, MTD (transcription mediated amplification). There are laws, etc. The "nucleic acid detection method" may detect a target nucleic acid using complementarity.
「制御部」とは、該電気泳動全自動処理装置に内蔵したコンピュータ(CPU)および該コンピュータを駆動するプログラム等からなり、例えば、メモリ、表示装置、キーボード、タッチパネル、マウス等の入力装置を有し、DA変換器およびAD変換器を通して信号を後述する吸引吐出機構やノズル移動機構、ノズルヘッドを有する電気泳動前処理部、または、光源、光電変換部、または電気泳動部等との間で信号をやり取りして制御が行われる。 The "control unit" includes a computer (CPU) built in the fully automatic electrophoresis processing device, a program for driving the computer, and the like, and includes, for example, an input device such as a memory, a display device, a keyboard, a touch panel, and a mouse. Then, the signal is transmitted through the DA converter and the AD converter to the suction / discharge mechanism, the nozzle moving mechanism, the electrophoresis preprocessing unit having the nozzle head, the light source, the photoelectric conversion unit, the electrophoresis unit, etc., which will be described later. Is exchanged for control.
ここで、前記流管内に吸引して保持されまたは前記測光用容器内に収容される化学物質溶液の量は、予め定めた規定量であることが好ましい。「前記受光端で受光した光」とは、「前記測定用光を該流管内または前記測光用容器内を通り上下方向に沿って照射することによって生じた光、または流管内または測光用容器内で生じた光」であり、例えば、前記化学物質溶液の透過光、散乱光、または発光、呈色、変色若しくは変光に係る光である。 Here, the amount of the chemical substance solution that is sucked and held in the flow tube or contained in the photometric container is preferably a predetermined amount. "Light received at the light receiving end" means "light generated by irradiating the measurement light through the flow tube or the photometric container in the vertical direction, or in the flow tube or the photometric container. Is, for example, transmitted light, scattered light, or light related to light emission, color development, discoloration, or photometry of the chemical substance solution.
該制御部は、例えば、測定対象の化学物質溶液の透過光の強度から吸光度を導くことで、該吸光度に基づいて種々の物理量を得て該化学物質溶液を解析することが可能である。
例えば、各種化学物質(核酸、脂質、タンパク質、糖質等)の濃度の解析を行うには、該吸光度から、ランベルト・ベールの法則に基づいて以下に示すように該溶液の濃度を導く。
By deriving the absorbance from the intensity of the transmitted light of the chemical substance solution to be measured, for example, the control unit can obtain various physical quantities based on the absorbance and analyze the chemical substance solution.
For example, in order to analyze the concentration of various chemical substances (nucleic acid, lipid, protein, sugar, etc.), the concentration of the solution is derived from the absorbance as shown below based on Lambert-Beer's law.
前記流管の前記化学物質溶液に入射する前の測定用光(波長λ)の強度をI0とし、透過後の光の強度をIとし、モル吸光係数(前記波長λおよび測定対象となる化学物質に応じて定まる単位モル濃度で規格化した)をε、最終的に求めるべきモル濃度をc、光路長をLとした場合、I=I0・10(-εcL) となる。一方、吸光度 Aλ=−log10(I/I0) の関係から、
吸光度 Aλ、したがって、透過率 I/I0を求めることで、次の関係式より溶液に含有する核酸等のモル濃度cを求めることができることになる。
Aλ=εcL (1)
なお、実際には測定用光は散乱や反射によってそのまま平行に進むことにはならないので、精度を高めるためには検量線や検量式を用いてこの式を修正することが好ましい。
The intensity of the measurement light (wavelength λ) before it is incident on the chemical substance solution in the flow tube is I 0 , the intensity of the light after transmission is I, and the molar extinction coefficient (the wavelength λ and the chemistry to be measured). the normalized) in units molar concentration determined in accordance with the substance epsilon, if the final molar concentration to determine c, and optical path length is L, the I = I 0 · 10 (-εcL ). On the other hand, from the relationship of absorbance A λ = −log 10 (I / I 0),
By determining the absorbance A λ and therefore the transmittance I / I 0 , the molar concentration c of the nucleic acid or the like contained in the solution can be determined from the following relational expression.
A λ = εcL (1)
In reality, the measurement light does not travel in parallel as it is due to scattering or reflection, so it is preferable to correct this formula by using a calibration curve or a calibration formula in order to improve the accuracy.
また、測定対象となる化学物質(サンプル)が、各種酵素(AST、ALT、リパーゼ、LDH、γ\och-GTP等)によって反応し、その濃度が変化する場合には、該化学物質溶液の透過光から導いた吸光度に基づいて、前記酵素活性を解析することができる。
酵素活性を求めるには、反応速度、すなわち、前記化学物質の濃度の変化速度dc/dt(濃度:mol/リットルの変化速度)で表されるので、前記ランベルト・ベールの法則の式(1)に基づいて、吸光度変化の単位時間当たりの吸光度変化(dAλ/dt)によって表されることになる。すなわち、
dc/dt=(dAλ/dt)・(1/εL) (2)となる。
εは、例えば、NADH(ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド)については、6300リットル/(mol・cm)である。
すると、酵素活性は、次のように表される。すなわち、
酵素活性=(dc/dt)・(Vt/Vs) (3)
Vt=前記化学物質溶液の全容量(リットル)
Vs=サンプル容量(リットル)
したがって、(3)式を(2)式に代入することによって、
酵素活性=(dAλ/dt)・ Vt/(εLVs) (4)となる。
ただし、酵素の単位は、最適条件下で、試料1リットル中において1分間に1μ\ochmolの基質を変換させることができる酵素量を1U (Unit)と定義しているので、酵素活性の単位は、1U/リットルと表されることになり、上記(4)式を変形した以下の式で表される。
酵素活性(U/リットル)=ΔAλ・(Vt・106)/(εLVs)
ΔAλ: 1分間当たりの吸光度変化
Vt: 全反応物容量(mリットル)
Vs: サンプル容量(mリットル)
ε: モル吸光度(リットル/(mol・cm))
L: 光路長(cm)
である。
If the chemical substance (sample) to be measured reacts with various enzymes (AST, ALT, lipase, LDH, γ \ och-GTP, etc.) and its concentration changes, the chemical substance solution permeates. The enzyme activity can be analyzed based on the absorbance derived from light.
The reaction rate, that is, the rate of change in the concentration of the chemical substance, dc / dt (concentration: the rate of change in mol / liter) is used to determine the enzymatic activity. Is expressed by the change in absorbance (dA λ / dt) per unit time of the change in absorbance. That is,
dc / dt = (dA λ / dt) · (1 / εL) (2).
ε is, for example, 6300 liters / (mol · cm) for NADH (nicotinamide adenine dinucleotide).
Then, the enzyme activity is expressed as follows. That is,
Enzyme activity = (dc / dt) · (V t / V s ) (3)
V t = total volume (liter) of the chemical substance solution
V s = sample capacity (liter)
Therefore, by substituting Eq. (3) into Eq. (2),
Enzyme activity = (dA λ / dt) · V t / (εLV s ) (4).
However, the unit of enzyme is defined as 1U (Unit), which is the amount of enzyme that can convert 1 μ \ ochmol of substrate per minute in 1 liter of sample under the optimum conditions. , 1 U / liter, and is expressed by the following equation, which is a modification of the above equation (4).
Enzyme activity (U / liter) = ΔA λ・ (V t・ 10 6 ) / (εLV s )
ΔA λ : Change in absorbance per minute
V t : Total reactant capacity (m liter)
V s : Sample capacity (m liter)
ε: Molar absorbance (liter / (mol · cm))
L: Optical path length (cm)
Is.
さらに、前記制御部は、未知の化学物質溶液(サンプル)の濃度を、濃度既知の物質(標準液)の吸光度を測定し、濃度と吸光度の関係を表す検量線をグラフまたは表で作成しておく。該検量線または表を用いて、未知の化学物質溶液の吸光度からその濃度を求めることができることになる。 Further, the control unit measures the concentration of an unknown chemical substance solution (sample) and the absorbance of a substance (standard solution) having a known concentration, and creates a calibration curve showing the relationship between the concentration and the absorbance in a graph or table. back. Using the calibration curve or table, the concentration can be determined from the absorbance of an unknown chemical substance solution.
ここで、ある化学物質溶液(A1)について、その測定に適した波長をもつ測定用光に対する該当する吸光度をA1、吸光係数をε1、該化学物質の濃度をc1とする。また、内部標準(A0)について、その測定に適した波長をもつ標準測定用光に対する該当する吸光度をA0、吸光係数をε0、該内部標準の規定濃度をc0とする。また、流管に混合して吸引された場合の光路長をL(混合液として共通)とすると、ランベルト・ベールの法則から各々次の式が得られる。
A1=ε1c1L
A0=ε0c0L
これらの式から光路長を消去すると、c1=(A1ε0c0)/(A0ε1)より濃度c1が求められることになり、変動しやすい光路長の影響を受けずに内部標準との相対比に基づく信頼性の高い濃度を得ることができることになる。
Here, for a certain chemical substance solution (A1), the corresponding absorbance for measurement light having a wavelength suitable for the measurement is A 1 , the extinction coefficient is ε 1 , and the concentration of the chemical substance is c 1 . Regarding the internal standard (A0), the corresponding absorbance for standard measurement light having a wavelength suitable for the measurement is A 0 , the extinction coefficient is ε 0 , and the specified concentration of the internal standard is c 0 . Further, assuming that the optical path length when the mixture is mixed in the flow tube and sucked is L (common as a mixed solution), the following equations can be obtained from Lambert-Beer's law.
A 1 = ε 1 c 1 L
A 0 = ε 0 c 0 L
When the optical path length is eliminated from these equations, the concentration c 1 can be obtained from c 1 = (A 1 ε 0 c 0 ) / (A 0 ε 1 ), and it is not affected by the variable optical path length. It is possible to obtain a highly reliable concentration based on the relative ratio to the internal standard.
また、前記制御部は、免疫抗体定量測定(CPR、FDP、Dダイマー等)を行うことができる。検体中のヘモグロビン等の測定を抗原抗体反応を利用して抗体を樹脂製のラテックス粒子に固定し、サンプル中の抗原と抗原抗体反応を起こさせ該ラテックス粒子を凝集させる。この凝集反応を吸光度変化としてとらえると、吸光度の変化量は、サンプル中の抗原量に依存して増加する。この濃度既知の標準液を用いて検量線を作成しておけば、吸光度の変化量から検体中の抗原量を測定することができる。 In addition, the control unit can perform quantitative measurement of immune antibody (CPR, FDP, D-dimer, etc.). For the measurement of hemoglobin and the like in the sample, the antibody is fixed to the latex particles made of resin by using the antigen-antibody reaction, and the antigen-antibody reaction is caused with the antigen in the sample to aggregate the latex particles. If this agglutination reaction is regarded as a change in absorbance, the amount of change in absorbance increases depending on the amount of antigen in the sample. If a calibration curve is prepared using this standard solution having a known concentration, the amount of antigen in the sample can be measured from the amount of change in absorbance.
なお、前記制御部は、前記1または2種類以上の透過光に基づいて前記1または2種類以上の化学物質の吸光度を求め、該吸光度に基づいて前記1または2種類以上の化学物質の濃度等を求めることができる。同様にして、前記1または2種類以上の透過光、散乱光等に基づいて前記1または2種類以上の化学物質溶液の物理化学的性質または数値を求めることができる。 The control unit obtains the absorbance of the one or two or more types of chemical substances based on the one or two or more types of transmitted light, and based on the absorbance, the concentration of the one or two or more types of chemical substances, etc. Can be sought. Similarly, the physicochemical properties or numerical values of the one or more kinds of chemical substance solutions can be obtained based on the one or more kinds of transmitted light, scattered light and the like.
前記光選択測定部は、測光内容または前記目的物質を含む前記生成物または前記化学物質により定まる測定用光を照射可能な複数個の導光路の各一端部である照射端を各組に有する複数組の照射端組、および、該照射端組に対応する位置に位置しまたは位置付け可能に設けられ、該照射端から照射された測定用光に基づいて生ずる光を各々受光可能な複数個の導光路の各一端部である受光端を各組に有する複数組の受光端組と、前記制御部による目的物質の解析処理または品質評価の指示があった場合に、前記複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から対となる1組の照射端組および1組の受光端組を選択して対応する1対の照射端および受光端からなる照射受光対ごとに、前記照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を測定する照射受光対選択測定部とを有する電気泳動全自動処理装置である。 Before Symbol light selecting measuring unit has an irradiation end is the product or the one end of the plurality of light guide capable of irradiating a measuring light determined by the chemical containing photometric content or the target substance each set A plurality of sets of irradiation end sets and a plurality of sets of irradiation end sets and a plurality of sets that are positioned or positionably provided at positions corresponding to the irradiation end sets and capable of receiving light generated based on the measurement light emitted from the irradiation ends. A plurality of sets of light receiving ends having light receiving ends, which are one end of each light guide path, and the plurality of sets of irradiation end sets when the control unit gives an instruction for analysis processing or quality evaluation of a target substance. And a pair of irradiation end sets and a set of light receiving end sets are selected from a plurality of sets of light receiving end sets, and the irradiation is performed for each irradiation light receiving pair consisting of the corresponding pair of irradiation ends and light receiving ends. This is a fully automatic electrophoresis processing device having an irradiation light receiving pair selective measuring unit that sequentially supplies predetermined measurement light to the ends and measures the intensity of the light sequentially received by the light receiving ends.
「測定用光」は、測定対象の化学物質溶液の物理化学的性質または数値を測定するために照射される光であって測光内容(例えば、標識物質の有無)及び化学物質や生成物のサイズや分子量等に応じた波長をもつ光である。例えば、吸光度の測定の場合であって、DNA、RNA、オリゴヌクレオチド等の核酸の場合には、260nm付近の紫外光が適当である。これは、核酸の塩基がこの付近に吸光ピークをもつからである(A:259nm,T:267nm, G:253nm, C:267nm)。吸光の値は核酸の構造(一本鎖、二本鎖)や長さ、塩基組成によって影響を受けることになる。その他の物質にあっては、例えば白色光を用いる。また、標識物質として蛍光物質を用いる場合には、該蛍光に対応する波長を持つ励起光である。「照射端(または受光端)」とは、光を照射(または受光)することができる導光路の端部であって、レンズ等の光学素子を有する場合がある。「導光路」は、導光可能な通路であって、導光方向に沿って細長く形成され、例えば、透光性のある部材、空洞等があり、可撓性がある場合としては、例えば光ファイバである。 "Measurement light" is light emitted to measure the physicochemical properties or numerical values of the chemical substance solution to be measured, and the measurement content (for example, the presence or absence of a labeling substance) and the size of the chemical substance or product. It is light having a wavelength corresponding to the molecular weight and the like. For example, in the case of measuring absorbance, in the case of nucleic acids such as DNA, RNA, and oligonucleotides, ultraviolet light near 260 nm is appropriate. This is because the base of the nucleic acid has an absorption peak near this (A: 259 nm, T: 267 nm, G: 253 nm, C: 267 nm). The value of absorption will be affected by the structure (single-stranded, double-stranded), length, and base composition of the nucleic acid. For other substances, for example, white light is used. When a fluorescent substance is used as the labeling substance, it is excitation light having a wavelength corresponding to the fluorescence. The "irradiation end (or light receiving end)" is an end portion of a light guide path capable of irradiating (or receiving) light, and may have an optical element such as a lens. The "light guide path" is a passage capable of guiding light, and is formed in an elongated shape along the light guide direction. It is a fiber.
ここで、「複数個」とは、例えば、前記「複数本」、すなわち、前記電気泳動用キャピラリーの個数(n)と同一の場合(n)である。なお、後述する収容部群数、さらにはノズル数や全収容部群に属する収容部列数を含めて、必ずしもnの場合に限定されず、該キャピラリーの個数の倍数の場合、例えば、2n, 3n等の場合があり得る。前処理に多種類の試薬を使用する場合や複雑な処理を行う場合もあるからである。 Here, the “plurality” is, for example, the case (n) which is the same as the “plurality”, that is, the number (n) of the electrophoresis capillaries. Including the number of accommodating unit groups described later, the number of nozzles, and the number of accommodating unit rows belonging to all accommodating unit groups, the case is not necessarily limited to n, and in the case of a multiple of the number of capillaries, for example, 2n, It may be 3n or the like. This is because many types of reagents may be used for pretreatment or complicated treatment may be performed.
「照射端組(受光端組)」とは、前記複数個の照射端(または受光端)からなる組である。本発明にあっては、これらの照射端組および受光端組の組数が各々複数組含まれている。その際、照射端組の組数と、受光端組の組数とは必ずしも一致していない。したがって、1対の照射端組と受光端組の選択は、組数の少ない方が重複して選択されることがあることになる。「選択」は、例えば、該当する測定用光を出射する光源のみをオン状態とし、それ以外の光源をオフ状態とすることによって、またはその光源と照射端を接続する導光路を導光状態とし、それ以外の光源と接続する導光路を非導光状態とすることによって、かつ該当する光を受光する光電変換部のみをオン状態とし、それ以外の光電変換部をオフ状態とすることによって、または、その光電変換部と受光端を接続する導光路を導光状態とし、それ以外の光電変換部と接続する導光路を非導光状態とすることによって行われる。 The "irradiation end set (light receiving end set)" is a set including the plurality of irradiation ends (or light receiving ends). In the present invention, a plurality of sets of each of these irradiation end sets and light receiving end sets are included. At that time, the number of irradiation end sets and the number of light receiving end sets do not always match. Therefore, the selection of the pair of irradiation end sets and the light receiving end sets may be duplicated when the number of sets is small. In "selection", for example, only the light source that emits the corresponding measurement light is turned on and the other light sources are turned off, or the light guide path connecting the light source and the irradiation end is set to the light guide state. By putting the light guide path connected to other light sources in a non-light guide state, and by turning on only the photoelectric conversion unit that receives the corresponding light and turning off the other photoelectric conversion units. Alternatively, the light guide path connecting the photoelectric conversion unit and the light receiving end is placed in a light guide state, and the light guide path connected to the other photoelectric conversion unit is in a non-light guide state.
第2の発明は、前記照射受光対選択測定部は、前記指示に応じて選択された所定の測定用光を出射する1または2以上の光源と、受光した光を電気信号に変換する1または2以上の光電変換部と、前記指示に基づいて、複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から、1対の照射端組および受光端組を選択し、1または2以上の前記光源と選択された前記照射端組に属する照射端との間の接続または遮断と、1または2以上の前記光電変換部と選択された前記受光端組に属する受光端との間の接続または遮断とを、前記照射受光対ごとに連動して切り換える対選択連動切換部と、を有する電気泳動全自動処理装置である。 In the second invention, the irradiation / light receiving pair selective measuring unit emits one or two or more light sources that emit a predetermined measurement light selected according to the instruction, and one or two or more light sources that convert the received light into an electric signal. Two or more photoelectric conversion units, and one or two or more irradiation end sets and one or more light receiving end sets are selected from a plurality of irradiation end sets and a plurality of light receiving end sets based on the above instructions. A connection or cutoff between the light source and an irradiation end belonging to the selected irradiation end set, and a connection or disconnection between one or more of the photoelectric conversion units and a light receiving end belonging to the selected light receiving end set. This is a fully automatic electrophoresis processing device having a pair selection interlocking switching unit that switches the cutoff in conjunction with each irradiation / light receiving pair.
「1または2以上の光源」であるので、これらと光学的に接続する1または2以上の後述する照射測定端が設けられている。「1または2以上の光電変換部」であるので、これらと光学的に接続する1または2以上の後述する受光測定端が設けられている。「切換え」は、例えば、後述する複数対接続端組配列体と後述する複数対測定端組配列体間の、所定方向に沿って、所定速度での相対的な移動、例えば往復運動、または搖動による所定周期で繰り返して行われる。
ここで、「1の光源」とは、例えば、波長220-350nmの範囲の白色光(紫外線を含む)の測定用光を照射する白色光光源であり、「2以上の光源」とは、例えば、6種類の励起光(例えば、496nm, 527nm, 555nm, 587nm, 593nm, 647nm)を各々照射可能となるように設定された6台の可変光源である。一方、「1の光電変換部」とは、例えば、分光器を介して設けられた光電変換部であり、「2以上の光電変換部」とは、例えば、複数のバンドパスフィルタ(例えば、517nm, 549nm, 580nm, 599nm, 613nm, 653nm、これらの波長は、蛍光物質、FAM, HEX, TAMURA, ROX, Texas Red, Cy5に対応するものである。)を介して接続された複数の光電変換部である。
Since it is a "one or two or more light sources", one or two or more irradiation measurement ends, which will be described later, are provided to be optically connected to these. Since it is a "one or two or more photoelectric conversion units", one or two or more light receiving measurement ends described later are provided which are optically connected to these. “Switching” refers to, for example, relative movement at a predetermined speed, for example, reciprocating motion or oscillating, along a predetermined direction between a plurality of pairs of end-set arrangements described below and a plurality of pairs of measurement end-set arrangements described below. It is repeated at a predetermined cycle according to.
Here, the “1 light source” is, for example, a white light light source that irradiates measurement light of white light (including ultraviolet rays) having a wavelength in the range of 220 to 350 nm, and the “2 or more light sources” is, for example, , 6 types of variable light sources set so as to be able to irradiate 6 types of excitation light (for example, 496 nm, 527 nm, 555 nm, 587 nm, 593 nm, 647 nm). On the other hand, the "1 photoelectric conversion unit" is, for example, a photoelectric conversion unit provided via a spectroscope, and the "2 or more photoelectric conversion units" is, for example, a plurality of bandpass filters (for example, 517 nm). , 549nm, 580nm, 599nm, 613nm, 653nm, these wavelengths correspond to fluorescent materials, FAM, HEX, TAMURA, ROX, Texas Red, Cy5). Is.
また、「光源」としては、例えば、LED、重水素ランプ(例えば、浜松ホトニクス株式会社、L10691D)、ハロゲンランプ等の波長可変光源を用いて、紫外線領域から可視領域に至るまでの連続的な波長を試料に照射することができる。「光電変換部」とは、光の強度を対応する電気信号およびデジタル信号に変換するものであって、例えば、増幅を伴うPMT(光電子増倍管)、ADP、CCDイメージセンサ、フォトダイオード等の受光素子である。 Further, as the "light source", for example, an LED, a deuterium lamp (for example, Hamamatsu Photonics Co., Ltd., L10691D), a halogen lamp, or the like is used, and a continuous wavelength from the ultraviolet region to the visible region is used. Can be irradiated on the sample. The "photomultiplier conversion unit" converts the intensity of light into a corresponding electric signal and digital signal, and is, for example, a PMT (photomultiplier tube) with amplification, an ADP, a CCD image sensor, a photodiode, or the like. It is a light receiving element.
第3の発明は、前記照射受光対選択測定部は、前記一端部が前記照射端組に属する1の照射端を各々有する前記複数個の導光路の各他端部が各々有する照射接続端が前記複数個属する照射接続端組、および、前記一端部が前記受光端組に属する1の受光端を各々有する前記複数個の導光路の各他端部が各々有する受光接続端が前記複数個属する受光接続端組が、各々複数組あって、各同一の組に属する前記照射接続端または前記受光接続端が所定方向に沿って1列状に所定間隔で配列され、対となり得る異なる組に属する前記照射接続端または前記受光接続端同士は前記所定方向に直交する方向に沿って対間隔を開けて並列に配列されている接続端配列面を有する複数対接続端組配列体をさらに有し、前記対選択連動切換部は、オンオフ可能な前記光源と光学的に接続され、前記照射接続端組に属する照射接続端と順次接続可能に設けられた1または2以上の照射測定端が前記所定方向に沿って1列状に所定間隔で各々設けられた複数組の照射測定端組、およびオンオフ可能な前記光電変換部と光学的に接続され、前記受光接続端組に属する受光接続端と順次接続可能に設けられた1または2以上の受光測定端が前記所定方向に沿って1列状に所定間隔で各々設けられた複数組の受光測定端組が前記所定方向に直交する方向に沿って前記対間隔を開けて配列された測定端配列面を有する複数対測定端組配列体と、前記接続端配列面と前記測定端配列面とが向き合って前記所定方向に沿って摺動するように前記複数対接続端組配列体と前記複数対測定端組配列体を相対的に移動させて、選択された前記照射接続端および受光接続端と前記照射測定端および受光測定端の各々の同時の接続または遮断を可能にして、選択された組同士の照射受光対ごとに、前記照射端とオン状態にある前記光源との接続または遮断が、前記受光端とオン状態にある前記光電変換部との接続および遮断と連動して順次行われる切換機構とを有する電気泳動全自動処理装置である。 In the third invention, in the irradiation light receiving pair selective measurement unit, the irradiation connection end of each of the other ends of the plurality of light guide paths, each of which has one irradiation end whose one end belongs to the irradiation end set, is provided. The plurality of irradiation connection ends to which the plurality of light receiving connections belong, and the plurality of light receiving connection ends to which the other end of each of the plurality of light guide paths having one light receiving end having one light receiving end belonging to the light receiving end set belong to the plurality of light receiving connection ends. There are a plurality of light receiving connection end sets, and the irradiation connection ends or the light receiving connection ends belonging to the same set are arranged in a row at predetermined intervals along a predetermined direction and belong to different sets that can be paired. The irradiation connection end or the light receiving connection end further has a plurality of pair connection end array having a connection end arrangement surface arranged in parallel at intervals along a direction orthogonal to the predetermined direction. The pair selection interlocking switching unit is optically connected to the light source that can be turned on and off, and one or two or more irradiation measurement ends provided so as to be sequentially connectable to the irradiation connection ends belonging to the irradiation connection end set are in the predetermined direction. It is optically connected to a plurality of sets of irradiation measurement ends provided in a row at predetermined intervals along the above, and the photoelectric conversion unit that can be turned on and off, and sequentially connected to the light receiving connection ends belonging to the light receiving connection end set. The above-mentioned is The plurality of pairs of measurement end set arrays having measurement end array surfaces arranged at intervals, and the connection end array surface and the measurement end array surface facing each other and sliding along the predetermined direction. The multiple-pair connection end-set array and the multiple-pair measurement end-set array are relatively moved to simultaneously connect the selected irradiation connection end and light-receiving connection end to the irradiation measurement end and light-receiving measurement end. Alternatively, for each irradiation-receiving pair of selected pairs, the connection or blocking between the irradiation end and the light source in the ON state is connected to the photoelectric conversion unit in which the light-receiving end and the light-receiving end are in the ON state. It is a fully automatic electrophoresis processing device that has a switching mechanism that is sequentially performed in conjunction with connection and disconnection.
この場合、複数対接続端組配列体の接続端配列面は1平面の場合、1曲面の場合、または複数平面、複数曲面の場合があり得る。各前記照射接続端組は所定方向(例えば、水平方向またはマトリクス状に配列された複数の収容部群の列方向(Y軸方向)または行方向(X軸方向)に沿って1列状に複数の照射接続端が配列され、各前記受光接続端組は前記所定方向に沿って1列状に複数の受光接続端が配列され、したがって、これらは相互に平行であって、前記所定方向に直交する方向(例えば、上下方向(Z軸方向)または前記マトリクス状に配列された複数の収容部群の行方向(X軸方向)または列方向(Y軸方向))に各々所定距離空けて並列に配列されている(所定方向とそれに直交する方向の例は相互に入れ換えることが可能である)。その際、対となり得る照射接続端組に属する照射端および受光接続端組に属する受光端が前記所定方向に直交する方向に沿って対間隔をもって配列される。その際、対となり得る照射接続端組および受光接続端組が複数ある場合には、それらを、直交する方向に並列に配列する場合であって、照射接続端組または受光接続端組のいずれか一方が共通する場合には対間隔を異ならせる必要がある。なお、同一の対間隔をもって直列に配列することもできる。 In this case, the connection end arrangement surface of the plurality of pairs of connection end set array may be one plane, one curved surface, or multiple planes or multiple curved surfaces. Each of the irradiation connection ends is arranged in a row along a predetermined direction (for example, in the horizontal direction or in the column direction (Y-axis direction) or row direction (X-axis direction) of a plurality of accommodating portions arranged in a matrix. The irradiation connection ends of the above are arranged, and each of the light receiving connection end sets is arranged with a plurality of light receiving connection ends in a row along the predetermined direction, so that they are parallel to each other and orthogonal to the predetermined direction. (For example, in the vertical direction (Z-axis direction) or in the row direction (X-axis direction) or column direction (Y-axis direction) of the plurality of accommodating portions arranged in the matrix) in parallel with each other at a predetermined distance. They are arranged (examples of a predetermined direction and a direction orthogonal to the predetermined direction can be interchanged with each other). At that time, the irradiation end belonging to the irradiation connection end set and the light receiving end belonging to the light receiving connection end set that can be paired are described above. They are arranged at intervals along the directions orthogonal to the predetermined direction. At that time, when there are a plurality of irradiation connection end sets and light receiving connection end sets that can be paired, when they are arranged in parallel in the orthogonal directions. Therefore, when either the irradiation connection end set or the light receiving connection end set is common, the pair spacing needs to be different. It is also possible to arrange them in series with the same pair spacing.
一方、前記複数対測定端組配列体の測定端配列面は1平面の場合、1曲面の場合、複数平面の場合、複数曲面の場合(例えば、分割可能な平面)があり得る。その場合、前記複数対の照射接続端組および受光接続組と接続すべき複数の光源と接続した複数対の照射測定端組および接続すべき複数の光電変換部と接続した受光測定端組が、各々組ごとに前記所定方向(例えば水平方向またはマトリクス状に配列された複数の収容部群の列方向(Y軸方向)または行方向(X軸方向))に沿って1列状に配列され(1個しかない場合には単独で配置され)、かつ対となり得る照射測定端組および受光測定端組は、前記所定方向に直交する方向(例えば、上下方向(Z軸方向)または前記マトリクス状に配列された複数の収容部群の行方向(X軸方向)または列方向(Y軸方向))に沿って各対に対応する位置に前記接続端配列面における前記対間隔を空けて配列されている(所定方向とそれに直交する方向の例は相互に入れ換えることが可能である)。 On the other hand, the measurement end array surface of the plurality of pairs of measurement end set array may be one plane, one curved surface, multiple planes, or multiple curved surfaces (for example, a divisible plane). In that case, the plurality of pairs of irradiation connection ends, the plurality of pairs of irradiation measurement ends connected to the plurality of light sources to be connected to the light receiving connection set, and the light receiving measurement ends connected to the plurality of photoelectric conversion units to be connected are used. Each set is arranged in a single column along the predetermined direction (for example, the column direction (Y-axis direction) or the row direction (X-axis direction) of a plurality of accommodating units arranged in a horizontal direction or a matrix) ( The irradiation measurement end set and the light reception measurement end set, which can be paired with each other when there is only one, are arranged in a direction orthogonal to the predetermined direction (for example, in the vertical direction (Z-axis direction) or in the matrix shape). The plurality of housing units arranged are arranged at positions corresponding to each pair along the row direction (X-axis direction) or the column direction (Y-axis direction) with the pair spacing in the connection end arrangement surface. (Examples of a predetermined direction and a direction orthogonal to it can be interchanged).
なお、前記配列面が分割可能に配列されている場合には、対応する1対の光源84と光電変換部83が各々含まれているもの(対測定端体)を単位に分割可能となることが好ましい。これらの各分割配列面は、分割可能な対測定端組配列体の組合せにより形成され、各分割配列体は、その処理内容に応じて任意に前記対測定端体ごとに挿抜することができる。前述したように前記接続端配列面上の前記複数対の前記照射接続端組と前記受光接続端組との間の対間隔と、前記測定端配列面上の対応する複数対の前記照射測定端組と前記受光測定端組との間の対間隔とは等しく設けられている。ここで、「対間隔」とは、対となり得る照射接続端組および受光接続端組との間の前記所定方向に直交する方向における接続端配列面上の間隔、または対となり得る照射測定端組および受光測定端組との間の前記所定方向に直交する方向における測定端配列面上の間隔であって、対応する接続端配列面上の対間隔と、測定端配列面上の対間隔は等しい。ここで、前記対測定端体は、前記対測定端組配列体を形成するために、例えば、複数個を連結して収容可能な枠体に収容される。また前記複数対測定端組配列体811を形成するために、例えば、複数の対測定端配列体、または前記対測定端体を収容可能な枠体に収容される。
When the array planes are arranged in a divisible manner, the one including the corresponding pair of
前記「1列状」は、例えば、配列面が平面の場合には直線状が好ましい。前記複数対接続端組配列体と前記複数対測定端組配列体の相対的な移動方向は、前記各組の接続端列、および各組の測定端列に沿った方向、すなわち前記所定方向に沿って相対的に移動可能にであって、該第1の接続端列と前記第1の測定端列が重なり、該第2の接続端列と該第2の測定端列が重なりかつ切換えが移動によって連動するように配列されている。この場合には、1または2以上の照射受光対の各切り換えを1の切換機構で共用することができるので、装置規模の拡大を防止することができる。ここで、「オン(状態)」とは、活性の状態、電気回路において回路が成立している状態、「オフ(状態)」とは、非活性の状態、電気回路が成立している状態をいう。 The "single row" is preferably a straight line when the arrangement surface is a flat surface, for example. The relative movement directions of the plurality of pairs of connection end sets and the plurality of pairs of measurement end sets are in the direction along the connection end rows of each set and the measurement end rows of each set, that is, in the predetermined direction. It is relatively movable along, and the first connection end row and the first measurement end row overlap, and the second connection end row and the second measurement end row overlap and switch. They are arranged so that they are linked by movement. In this case, since each switching of one or two or more irradiation / light receiving pairs can be shared by the switching mechanism of 1, it is possible to prevent the expansion of the scale of the apparatus. Here, "on (state)" means an active state and a state in which a circuit is established in an electric circuit, and "off (state)" means an inactive state and a state in which an electric circuit is established. say.
第4の発明は、前記電気泳動前処理部は、気体の吸引吐出を行う吸引吐出機構と連通し、液体の吸引吐出が可能な流管が着脱可能に装着される複数連のノズルおよび該ノズルに装着された該流管に外部から磁場を及ぼしかつ除去することが可能な磁力部と、検査対象となるサンプルおよび磁性粒子懸濁液を含む各種の化学物質溶液を収容する液収容部および温度昇降器により温度制御可能な反応容器を少なくとも各々有し、前記各ノズルに対応して設けられた複数群の収容部群を有するステージと、前記ノズルと前記ステージとの間を相対的に移動可能とするノズル移動機構とを有し、前記光選択測定部の前記照射端組および前記受光端組の一方の第1組は、前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該一方の第2組は前記電気泳動用キャピラリーまたは泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられ、前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組は、前記一方の第1組と対をなすように前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該他方の第2組は、前記一方の第2組と対をなすように、前記各電気泳動用キャピラリーまたは各泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられた電気泳動全自動処理装置である。 According to a fourth aspect of the present invention, the electrophoresis pretreatment unit communicates with a suction / discharge mechanism for sucking and discharging a gas, and a plurality of nozzles and the nozzles to which a flow tube capable of sucking and discharging a liquid is detachably attached. A magnetic part that can apply and remove a magnetic field from the outside to the flow tube attached to the flow tube, a liquid storage part that houses various chemical substance solutions including a sample to be inspected and a magnetic particle suspension, and a temperature. A stage having at least each reaction vessel whose temperature can be controlled by an elevator and having a plurality of groups of accommodating units provided corresponding to each nozzle, and the nozzle and the stage can be relatively moved. The first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set of the light selection measuring unit is provided in the nozzle or the suction / discharge mechanism, and the second set of the one is provided. The irradiation end set and the other first set of the light receiving end set are paired with the one first set so as to be provided in contact with or close to the outer surface of the electrophoretic capillary or the post-migration accommodating portion. The other second set is provided in the nozzle or suction / discharge mechanism, and contacts or contacts the outer surface of each electrophoresis capillary or the post-migration accommodating portion so as to be paired with the one second set. It is a fully automatic electrophoresis processing device installed in close proximity.
前記吸引吐出機構、前記ノズルおよび前記磁力部はノズルヘッドに設けられるのが好ましい。この場合、前記ノズル移動機構は、例えば、前記ステージおよびノズルヘッドが固定されるステージにおいて、該ノズルのみをステージに対して移動する場合、ノズルヘッドに固定されたノズルを、前記ステージに対してノズルヘッドとともに相対的に移動する場合、ノズルヘッドに対してノズルを相対的に移動可能に設け、かつノズルヘッドを前記ステージに対して相対的に移動可能とする場合等がある。 The suction / discharge mechanism, the nozzle, and the magnetic force portion are preferably provided on the nozzle head. In this case, the nozzle moving mechanism, for example, in a stage where the stage and the nozzle head are fixed, when only the nozzle is moved with respect to the stage, the nozzle fixed to the nozzle head is ejected to the stage. When moving relative to the head, the nozzle may be provided so as to be relatively movable with respect to the nozzle head, and the nozzle head may be made movable relative to the stage.
前記ステージには、前記流管を、前記ノズル移動機構による前記ノズルの下降によりノズルに装着可能となるように前記装着用開口部を上側にして収容するチップ収容部を設けることが好ましい。また、液収容部の他に温度制御が可能な反応容器を設けることが好ましい。前記制御部は、前記ノズル移動機構を制御して、ノズルの相対的な下降によって該ノズルに前記流管を装着させるように制御することが好ましい。この場合には、前記ノズルヘッドには、前記ノズル移動機構を制御することによって、前記流管をノズルから脱着させる脱着機構を設けることが好ましい。これによって、人手を介することなく、流管等の装着脱着を行うことで、クロスコンタミネーションを防止し、かつ測定対象の液量に合った流管を使用することができる。 It is preferable that the stage is provided with a chip accommodating portion for accommodating the flow pipe with the mounting opening facing upward so that the flow pipe can be mounted on the nozzle by lowering the nozzle by the nozzle moving mechanism. Further, it is preferable to provide a reaction vessel capable of temperature control in addition to the liquid accommodating portion. It is preferable that the control unit controls the nozzle moving mechanism so that the flow pipe is attached to the nozzle by the relative descent of the nozzle. In this case, it is preferable that the nozzle head is provided with a detachable mechanism for detaching the flow pipe from the nozzle by controlling the nozzle moving mechanism. As a result, cross-contamination can be prevented and a flow tube suitable for the amount of liquid to be measured can be used by attaching / detaching the flow tube or the like without human intervention.
ここで、「相対的」とは、比較すべき他の対象との関係において成り立つことを示すものである。したがって、「相対的に移動」する場合には、対象の一方(例えば、ノズル)が動いて、対象の他方(例えば、ステージ)が静止している場合、対象の一方が静止して、対象の他方が動く場合、またはその両方の場合(速度が異なる場合)がある。 Here, "relative" indicates that it holds in relation to other objects to be compared. Therefore, in the case of "relative movement", when one of the objects (for example, a nozzle) is moving and the other of the objects (for example, a stage) is stationary, one of the objects is stationary and the object is stationary. There are cases where the other moves, or both (when the speeds are different).
「磁性粒子」とは、磁性をもつ粒子であって、その大きさは、例えば、約1nmから数10μ\ochmである。該サイズ、質量、材料、構造(単一ドメイン、表面に種々の被覆物質で被覆等)、その性質(常磁性、超常磁性、強磁性、フェリ磁性等、磁力の大きさ)等は、その処理目的に応じて定めることができる。被覆物質としては、各種の官能基を生じさせる有機物質、イオンを生じさせるイオン性物質、磁場による凝集や沈澱を防ぐ表面安定化物質(脂肪族ジー、ポリカルボン酸およびこれらの置換生成物および誘導体等)、特異的結合物質(リガンド、受容体等)、薬利的活性物質等がある。 "Magnetic particles" are magnetic particles, the size of which is, for example, about 1 nm to several tens of μ \ ochm. The size, mass, material, structure (single domain, surface coated with various coating substances, etc.), its properties (paramagnetism, superparamagnetism, ferromagnetism, ferrimagnetism, etc., magnitude of magnetic force), etc. are processed. It can be determined according to the purpose. Coating materials include organic substances that give rise to various functional groups, ionic substances that give rise to ions, and surface stabilizers that prevent aggregation and precipitation due to magnetic fields (aliphatic gee, polycarboxylic acids and their substitution products and derivatives. Etc.), specific binding substances (ligants, receptors, etc.), medicinal active substances, etc.
なお、複数対の照射端組または受光端組の一方の第1組は、ノズルまたは吸引吐出機構、すなわちノズルヘッドに設けられ、該一方の第2組は電気泳動用キャピラリーまたは泳動後収容部に設けられ、複数対の照射端組または受光端組の他方の第1組は、ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該他方の第2組は、電気泳動用キャピラリーまたは泳動後収容部に設けられている。しかし、光源または光電変換部も、照射端または受光端と同じノズルヘッド、ステージまたはキャピラリー部に必ずしも設けられる必要はない。前記一方の第1組と、前記他方の第1組が対をなす場合には、前記ノズルには流管が装着される必要がなく、その場合には、ノズルにはシリンダ等の吸引吐出機構が連通する必要がないことになる。ここで、「複数連のノズル」または「複数の収容部群」の「複数」は、例えば、複数本に対応する複数、すなわち、前記電気泳動用キャピラリーの個数(n)と同一の場合(n)、または、該キャピラリーの個数の倍数の場合(特にノズル数または収容部列数の場合)、例えば、2n, 3n等の場合があり得る。前処理に多種類の試薬を使用する場合や複雑な処理を行う場合もあるからである。 The first set of one of a plurality of pairs of irradiation end sets or light receiving end sets is provided on the nozzle or suction / discharge mechanism, that is, the nozzle head, and the second set of the one is provided on the electrophoresis capillary or the post-electrophoresis accommodating portion. The other first set of the plurality of pairs of irradiation end sets or light receiving end sets is provided in the nozzle or suction / discharge mechanism, and the other second set is provided in the electrophoresis capillary or the post-electrophoresis accommodating portion. ing. However, the light source or photoelectric conversion unit does not necessarily have to be provided in the same nozzle head, stage, or capillary unit as the irradiation end or the light receiving end. When the first set of one is paired with the first set of the other, it is not necessary to attach a flow pipe to the nozzle. In that case, the nozzle has a suction / discharge mechanism such as a cylinder. Will not need to communicate. Here, the “plurality” of the “plurality of nozzles” or the “plurality of accommodating portions” is, for example, the same as the number (n) of the plurality of nozzles corresponding to the plurality of nozzles, that is, the number (n) of the electrophoresis capillaries (n). ), Or in the case of a multiple of the number of the capillaries (particularly in the case of the number of nozzles or the number of rows of accommodating parts), for example, 2n, 3n and the like. This is because many types of reagents may be used for pretreatment or complicated treatment may be performed.
「流管」は、下端に前記口部を有し、上端に前記ノズルに着脱可能に装着される装着用開口部を有する管状の部材である。流管は、先端に口部を有し測定対象となる化学物質溶液が収容される前記ノズルよりも細く形成された細管、該細管と連通し前記装着用開口部を有する該細管よりも太く形成された太管を有するチップ状容器であることが好ましい。ノズルよりも細く形成される細管を有する前記流管は、前記測定用光が通過可能な断面の形状および大きさを有し、例えば、流管の内部空間は、断面が円形の円筒状で、例えば、その内径は0.05mm〜10mmであり、好ましくは、0.1mm〜5mm、さらに好ましくは、0.5mm〜1mm程度である。この断面の大きさおよび形状は、前記照射端および受光端の形状または大きさに基づいて定められる。これによって、液量の小さい(例えば、0.1μ\ochL〜10μ\ochL程度)化学物質溶液に応じた光路長を設定可能な軸方向または上下方向の長さを有する。その他、流管の内部空間は円錐台状若しくは角柱状の場合があり得る。 The "flow pipe" is a tubular member having the mouth portion at the lower end and a mounting opening at the upper end which is detachably attached to the nozzle. The flow tube is formed to be thinner than the nozzle having a mouth at the tip and accommodating the chemical substance solution to be measured, and thicker than the thin tube communicating with the thin tube and having the mounting opening. It is preferably a chip-shaped container having a thick tube. The flow tube having a thin tube formed thinner than a nozzle has a cross-sectional shape and size through which the measurement light can pass. For example, the internal space of the flow tube has a cylindrical shape with a circular cross section. For example, the inner diameter thereof is 0.05 mm to 10 mm, preferably 0.1 mm to 5 mm, and more preferably about 0.5 mm to 1 mm. The size and shape of this cross section are determined based on the shape or size of the irradiation end and the light receiving end. As a result, it has an axial or vertical length in which the optical path length can be set according to the chemical substance solution having a small liquid volume (for example, about 0.1 μ \ ochL to 10 μ \ ochL). In addition, the internal space of the flow pipe may be truncated cone-shaped or prismatic.
流管は、液体の吸引および吐出によって、1の液収容部における液体の撹拌、複数の液収容部間での液体の移動、分注を行う分注用流管、および、内部に吸引した溶液に対してその上下方向に沿った透過光の強度が測定される測光用流管を含有する。測光用流管は、例えば、側壁部を遮光部材としての黒色物質で形成しまたは透光性のある素材を黒色塗料で塗布することで外光を遮光することが好ましい。「外光」とは、主として可視光または紫外線であり、黒色物質で形成する場合としては樹脂に黒色顔料を練り込んで成型することによって形成する。分注用流管または微小量分注用流管と測光用流管を兼用する場合、または別のものとして形成することもある。ノズルに対して流管が着脱可能に装着されることから、ノズルから流管を脱着する脱着機構が、例えば、後述するノズルヘッドに設けられる。なお、前記照射端組および前記受光端組は、複数連またはその倍数のノズルまたは吸引吐出機構の一部のみに設けられる場合がある。例えば、第2のピッチ(ノズルの第1のピッチの複数倍のピッチ)の間隔のノズルまたは吸引吐出機構にのみ設ける場合がある。また、流管も、ノズルの一部に装着する場合がある。例えば、前記第2のピッチの間隔のノズルにのみ装着する場合である。これは収容部群の収容部の配列において、該ノズルに対応する収容部列に光の測定を行う収容部や反応容器や測定領域が集中し、他のノズルに対応する収容部列には存在しないような場合であり、収容部の配列に依存して定まる。 The flow tube is a flow tube for dispensing that agitates the liquid in one liquid storage part, moves the liquid between a plurality of liquid storage parts, and dispenses by sucking and discharging the liquid, and the solution sucked inside. It contains a flow tube for measuring light in which the intensity of transmitted light along the vertical direction is measured. For the photometric flow tube, for example, it is preferable that the side wall portion is formed of a black substance as a light-shielding member or a translucent material is applied with a black paint to block external light. "External light" is mainly visible light or ultraviolet light, and when it is formed of a black substance, it is formed by kneading a black pigment into a resin and molding it. The flow tube for dispensing or the flow tube for minute amount dispensing and the flow tube for metering may be used together, or they may be formed as different ones. Since the flow tube is detachably attached to the nozzle, a attachment / detachment mechanism for attaching / detaching the flow tube from the nozzle is provided, for example, in the nozzle head described later. The irradiation end set and the light receiving end set may be provided only in a part of a plurality of nozzles or a multiple of the nozzles or a suction / discharge mechanism. For example, it may be provided only in the nozzle or the suction / discharge mechanism at intervals of the second pitch (a pitch that is a plurality of times the first pitch of the nozzle). The flow pipe may also be attached to a part of the nozzle. For example, it is a case where it is mounted only on the nozzles at the interval of the second pitch. This is because in the arrangement of the accommodating units of the accommodating unit group, the accommodating unit for measuring light, the reaction vessel, and the measurement area are concentrated in the accommodating unit row corresponding to the nozzle, and exist in the accommodating unit row corresponding to other nozzles. This is a case where it does not occur, and it depends on the arrangement of the housing.
第5の発明は、前記照射端組および前記受光端組の他方の第3組をさらに有し、該他方の第3組は、前記流管外であって、該流管の口部がその上方に位置付け可能となって前記一方の前記第1組と対をなすことが可能なように設けられた電気泳動全自動処理装置である。 The fifth invention further comprises the other third set of the irradiation end set and the light receiving end set, and the other third set is outside the flow tube, and the mouth portion of the flow tube is the same. It is a fully automatic electrophoresis processing device that can be positioned upward and can be paired with the first set of the one.
この場合には、前記他方の第3組をステージの受光領域に設ける場合またはステージに設けた測光用容器の底部に設ける場合がある。該測光用容器は、前記測光用流管の下端部が上方から挿入または緩挿可能であって、該測光用容器の前記底部の略中央に形成された筒状の凹部を有し、前記透光領域が該凹部の細底部に形成され、該凹部の細側壁部は前記外光に対して遮光されるように形成されるのが好ましい。
「測光用容器」は、前記流管の口部が挿入可能であるので、その断面は流管の前記細管の断面よりも大きいことになり、液量が小さい化学物質溶液を測定する場合には、測光用容器に化学物質溶液を収容するよりも、液量および測光内容に応じたより小さい断面を持つ流管に前記吸引吐出機構を用いて該化学物質溶液を吸引して保持させることでより適切な光路長を設定することができて測光上好ましい。
In this case, the other third set may be provided in the light receiving region of the stage or may be provided at the bottom of the photometric container provided on the stage. The photometric container has a cylindrical recess formed at substantially the center of the bottom of the photometric container, the lower end of the photometric flow tube can be inserted or loosely inserted from above, and the transparent container has a tubular recess. It is preferable that the light region is formed in the narrow bottom portion of the recess, and the narrow side wall portion of the recess is formed so as to block light from the external light.
Since the mouth of the flow tube can be inserted into the "light measuring container", the cross section thereof is larger than the cross section of the thin tube of the flow tube, and when measuring a chemical substance solution having a small amount of liquid, It is more appropriate to suck and hold the chemical substance solution in a flow tube having a smaller cross section according to the amount of liquid and the content of measurement by using the suction and discharge mechanism, rather than storing the chemical substance solution in a light measuring container. The optical path length can be set, which is preferable in terms of photometric measurement.
この場合には、測定対象となる化学物質溶液を通る光路の全体を遮光することができて、該光路への外光の進入を防止し精度の高い測定を行うことができる。なお、前記凹部は、流管の下端部が挿入または緩挿可能な程度の前記測光用容器の開口部よりも十分に小さい断面積をもつ開口部を有する細筒状に形成される。ここで凹部の細底部は、前記受光端の受光端面と空気層を介さずに密着または密接して光学的に接続されることが好ましい。これによって、流管に収容された液体の上端面から受光端まで、空気層を介さずに光路長を設定することができる。「略中央」は好ましくは「中央」である。 In this case, the entire optical path passing through the chemical substance solution to be measured can be shielded from light, and external light can be prevented from entering the optical path to perform highly accurate measurement. The recess is formed in a thin cylinder shape having an opening having a cross-sectional area sufficiently smaller than the opening of the photometric container to the extent that the lower end of the flow tube can be inserted or loosely inserted. Here, it is preferable that the narrow bottom portion of the recess is optically connected to the light receiving end surface of the light receiving end in close contact with or in close contact with each other without an air layer. As a result, the optical path length can be set from the upper end surface of the liquid contained in the flow tube to the light receiving end without going through the air layer. The "substantially center" is preferably the "center".
前記測光用容器は、例えば、前記密閉蓋(上側がノズルに嵌合可能)の下側で嵌合可能な筒状の太筒部と、該太筒部(従って、ノズル)よりも細く形成された円筒状で、内側及び外側が水平方向に平坦な底部が下端に形成された細筒部と、太筒部と細筒部と連通しそれらの間に挟まれるように形成され、前記太筒部および細筒部の中間の内径及び外径をもつように形成された先細り形状の中間部とを有する。中間部には、前記密閉蓋のシール部を嵌合して受け止めるための円筒状の受止部がその中央付近に形成されている。細筒部の外径は、例えば3.0mm、内径は2.5mmであり、該細筒部の底部の厚みは、例えば0.5mmである。これによって、該測光用反応容器の細筒部の軸方向に後述する照射端から照射された測定用光が底部を確実に透過し、該底部と下側で密接する後述する受光端により空気層を介さずに前記透過光を確実に受光することができる。また、測定用光が通過可能な程度の断面をもつ細筒状に化学物質溶液を収容させるので、測定に必要な液量を抑制し、小容量の液体についての測光を可能にする。
さらに、細筒部の上下方向の長さの範囲内に収容した液量に応じた適切な光路長を設定することができ、かつ照射端および受光端と該溶液とを接触させることなく測定用光を照射しかつ受光することができてクロスコンタミネーションを防止して信頼性が高い。
The photometric container is formed, for example, with a cylindrical thick cylinder portion that can be fitted under the closed lid (the upper side can be fitted to the nozzle) and a thinner cylinder portion than the thick cylinder portion (hence, the nozzle). A thin cylinder having a cylindrical shape with a flat bottom in the horizontal direction on the inside and outside at the lower end, and a thick cylinder that communicates with the thick cylinder and the thin cylinder and is sandwiched between them. It has a tapered middle portion formed so as to have an inner diameter and an outer diameter intermediate between the portion and the thin cylinder portion. In the intermediate portion, a cylindrical receiving portion for fitting and receiving the sealing portion of the sealing lid is formed near the center thereof. The outer diameter of the thin cylinder portion is, for example, 3.0 mm, the inner diameter is 2.5 mm, and the thickness of the bottom portion of the thin cylinder portion is, for example, 0.5 mm. As a result, the measurement light emitted from the irradiation end described later in the axial direction of the thin cylinder portion of the photometric reaction vessel is surely transmitted through the bottom portion, and the air layer is formed by the light receiving end described later which is in close contact with the bottom portion on the lower side. It is possible to reliably receive the transmitted light without going through. In addition, since the chemical substance solution is housed in a thin cylinder having a cross section that allows the light for measurement to pass through, the amount of liquid required for measurement is suppressed, and light measurement of a small volume of liquid is possible.
Further, an appropriate optical path length can be set according to the amount of liquid contained within the range of the vertical length of the thin cylinder portion, and for measurement without contacting the irradiation end and the light receiving end with the solution. It can irradiate and receive light, prevents cross-contamination, and is highly reliable.
また、制御部は、前記流管の口部から一定間隔上方に空けた位置より上側に前記化学物質溶液を吸引するように制御することがある。これによって、流管の下端の口部からの液漏れを防止して、光路長を安定させて精度の高い物理化学的性質または数値(例えば、吸光度)を得ることができる。また、照射端と受光端を結ぶ垂直共通軸線上に沿った流管内の光路は、流管の壁部を含み化学物質溶液及び空気以外の物質で遮られることがないので、流管及び容器を含め測定用光に透明な物質で形成する必要がなく、安価で精度の高い物理化学的性質または数値(例えば、吸光度)の測定を行うことができる。 In addition, the control unit may control the chemical substance solution to be sucked above the position separated from the mouth of the flow pipe by a certain interval. This makes it possible to prevent liquid leakage from the mouth at the lower end of the flow tube, stabilize the optical path length, and obtain highly accurate physicochemical properties or numerical values (for example, absorbance). In addition, the optical path in the flow tube along the vertical common axis connecting the irradiation end and the light receiving end includes the wall of the flow tube and is not blocked by substances other than the chemical substance solution and air. Including, it is not necessary to form a substance that is transparent to the measurement light, and it is possible to measure physicochemical properties or numerical values (for example, absorbance) at low cost and with high accuracy.
ここで、例えば、全長3cm〜20cm程度の流管にあっては、前記一定間隔は例えば、0.5mm〜10mm、好ましくは1mm〜5mmであり、化学物質溶液または混合液の収容されている部分は例えば、1mm〜15mmである。これによって、流管の口部からの液漏れを防止して、光路長を安定させて信頼性の高い吸光度、濃度を始め種々の数値または性質を得ることができる。 Here, for example, in a flow tube having a total length of about 3 cm to 20 cm, the fixed interval is, for example, 0.5 mm to 10 mm, preferably 1 mm to 5 mm, and the portion containing the chemical substance solution or the mixed solution is For example, it is 1 mm to 15 mm. As a result, it is possible to prevent liquid leakage from the mouth of the flow tube, stabilize the optical path length, and obtain various numerical values or properties including highly reliable absorbance and concentration.
なお、例えば、化学物質溶液、抽出用試薬、増幅用試薬、蛍光物質や化学発光物質等の標識化試薬、若しくは酵素等の試薬を収容可能な複数の液収容部、温度制御可能な1または2以上の反応容器、または該測光用容器は、1列状に形成されたカートリッジ容器に設けられて1列状または複数列状に配列され、該カートリッジ容器の略長方形状の基板にその長手方向に沿った片側の縁部に所定高さの隔壁が形成されているものが好ましい。該隔壁は、該カートリッジ容器を隣接して複数並べて使用する場合に、他のカートリッジ容器からの試薬等の飛沫の混入を防止するためのものである。該カートリッジ容器の長手方向の基板の長さは、例えば150mm〜200mmである。 In addition, for example, a plurality of liquid storage units capable of accommodating a chemical substance solution, an extraction reagent, an amplification reagent, a labeling reagent such as a fluorescent substance or a chemiluminescent substance, or a reagent such as an enzyme, and 1 or 2 having temperature controllability. The above reaction container or the photometric container is provided in a cartridge container formed in a single row and arranged in a single row or in a plurality of rows, and is arranged in a substantially rectangular substrate of the cartridge container in the longitudinal direction thereof. It is preferable that a partition wall having a predetermined height is formed on one side of the edge. The partition wall is for preventing the mixing of droplets of reagents and the like from other cartridge containers when a plurality of the cartridge containers are used side by side. The length of the substrate in the longitudinal direction of the cartridge container is, for example, 150 mm to 200 mm.
第6の発明は、前記制御部によって、前記生成物または化学物質溶液について、蛍光物質で標識化された目的物質の有無または量の測定が指示された場合には、前記生成物または化学物質溶液が収容されている収容部にまで前記ノズルを移動し、前記対選択連動切換部は、前記照射端組および前記受光端組の一方の前記第1組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または2以上の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光を測定用光とする1または複数種類の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または複数の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する光電変換部のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換え、前記制御部によって、前記目的物質の電気泳動を用いた解析処理の指示があった場合には、前記電気泳動用試料が収容されている各可動液収容部内に各前記電気泳動用キャピラリーの一端部を挿入させ、前記対選択連動切換部は、前記照射端組および前記受光端組の一方の第2組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第2組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または複数の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光、または白色光を測定用光とする1または複数種類の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または複数の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する光電変換部または分光光度計のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える電気泳動全自動処理装置である。 In the sixth invention, when the control unit instructs the measurement of the presence or absence or amount of the target substance labeled with a fluorescent substance in the product or chemical substance solution, the product or chemical substance solution is instructed. The nozzle is moved to the accommodating portion in which the is housed, and the pair selection interlocking switching unit is the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the irradiation end set and the light receiving end set. In the other first set, a pair of the irradiation measurement end set and the light reception measurement end set that can be connected to the irradiation end and the light receiving end to which they belong are selected, and 1 or 2 belonging to the selected irradiation measurement end set. Only one or more light sources that use excitation light of one or more kinds of wavelengths optically connected to the above irradiation measurement end as measurement light are turned on, and one or one or one or a plurality of light receiving measurement ends belonging to the selected light receiving measurement end set. Only the photoelectric conversion unit via the bandpass filter that can pass the fluorescence excited by the excitation light that is optically connected to the plurality of light receiving measurement ends is turned on, and the irradiation end and the light receiving end, the irradiation measuring end, and the light receiving light are turned on. The connection and disconnection between the measurement end and the measurement end are sequentially switched, and when the control unit instructs the analysis process using the electrophoresis of the target substance, the electrophoresis sample is accommodated. One end of each of the electrophoresis capillaries is inserted into each movable liquid accommodating portion, and the pair selection interlocking switching portion is the second set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the irradiation end set. And a pair of the irradiation measurement end set and the light receiving measurement end set that can be connected to the irradiation end and the light receiving end to which they belong are selected as the other second set of the light receiving end set, and the selected irradiation measurement end set is selected. Only one or more kinds of excitation light having one or more kinds of wavelengths optically connected to one or more irradiation measurement ends belonging to the above, or one or more kinds of light sources using white light as measurement light are turned on and selected. Only the photoelectric conversion unit or the spectrophotometer via the bandpass filter capable of passing the fluorescence excited by the excitation light, which is optically connected to one or more light receiving measurement ends belonging to the light receiving measurement end set, is turned on. This is a fully automatic electrophoresis processing device that sequentially switches the connection and disconnection between the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end.
前記「照射端組および受光端組の一方の第1組」および「照射端組および受光端組の他方の第1組」とは、「照射端組」および「受光端組」(順不同)であって、両者は対として、前記ノズルまたは前記吸引吐出機構、例えば、前記ノズルの下端、前記ノズルの上側に設けられた前記吸引吐出機構が有するシリンダ内を摺動するプランジャの下端、またはノズルに設けた凹部や凸部等であって、照射端面または受光端面を下方向に向けて設けられる。主として、qPCRの測定に用いられる。なお、電気泳動を用いて塩基配列の解析を行う場合には、塩基A,C,G,Tに対応して4種類の蛍光を測定するために4種類の励起光を照射するのが好ましく、したがって、例えば、4種類の光源を用いる。電気泳動用キャピラリーについて、吸光度の測定を行う場合とは、例えば、タンパク質のサイズに基づいて分離して測定を行う場合である。 The "first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set" and the "first set of the other of the irradiation end set and the light receiving end set" are "irradiation end set" and "light receiving end set" (in no particular order). The two are paired with the nozzle or the suction / discharge mechanism, for example, the lower end of the nozzle, the lower end of the plunger sliding in the cylinder of the suction / discharge mechanism provided above the nozzle, or the nozzle. It is a concave portion, a convex portion, or the like provided, and is provided with the irradiation end face or the light receiving end face facing downward. It is mainly used for the measurement of qPCR. When analyzing the base sequence using electrophoresis, it is preferable to irradiate four types of excitation light in order to measure four types of fluorescence corresponding to the bases A, C, G, and T. Therefore, for example, four types of light sources are used. The case where the absorbance of the electrophoresis capillary is measured is, for example, the case where the measurement is performed separately based on the size of the protein.
前記「照射端組および受光端組の一方の第2組」および「照射端組および受光端組の他方の第2組」とは、「照射端組」および「受光端組」(順不同)であって、両者は、対として、前記複数本の電気泳動用キャピラリーまたは泳動後収容部の各々外側面に近接しまたは接触して設けられている。主に、電気泳動部による目的物質の解析のため、例えば、目的核酸の塩基配列の決定に用いられる。 The "second set of one of the irradiation end set and the light receiving end set" and the "second set of the other of the irradiation end set and the light receiving end set" are "irradiation end set" and "light receiving end set" (in no particular order). Both are provided as a pair in close proximity to or in contact with the outer surface of each of the plurality of electrophoresis capillaries or post-electrophoretic accommodating portions. It is mainly used for analysis of a target substance by an electrophoresis unit, for example, for determining the base sequence of a target nucleic acid.
なお、「照射端組および受光端組の一方の第1組」および「照射端組および受光端組の他方の第3組」とは、「照射端組」または「受光端組」のどちらか一方が、前記ノズルまたは前記吸引吐出機構、例えば、前記ノズルの下端、前記ノズルの上側に設けられた前記吸引吐出機構が有するシリンダ内を摺動するプランジャの下端、またはノズルに設けた凹部や凸部等であって、照射端面または受光端面を下方向に向けて設けられ、「照射端組」または「受光端組」の前記他方が、前記ステージに直接または収容部群の測光用容器の透光領域が設けられた底部に第2のピッチで複数個配列して設けられ、前記照射端面または受光端面を上方向に向けて設けられる。主に、制御部より、前記生成物または化学物質溶液について、吸光度の測定が指示された場合に用いられる。 The "first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set" and the "third set of the other of the irradiation end set and the light receiving end set" are either "irradiation end set" or "light receiving end set". One is the nozzle or the suction / discharge mechanism, for example, the lower end of the nozzle, the lower end of a plunger that slides in the cylinder of the suction / discharge mechanism provided on the upper side of the nozzle, or a concave or convex portion provided on the nozzle. A portion or the like, which is provided with the irradiation end face or the light receiving end face facing downward, and the other of the “irradiation end set” or the “light receiving end set” is directly connected to the stage or transparent to the light measuring container of the accommodating part group. A plurality of light regions are arranged at a second pitch on the bottom surface, and the irradiation end face or the light receiving end face is provided with the irradiation end face or the light receiving end face facing upward. It is mainly used when the control unit instructs the measurement of the absorbance of the product or chemical substance solution.
なお、吸光度または濃度の測定をも可能とするには、さらに前記1または2以上の光源の少なくとも1は測定用光として白色光を発する白色光光源、および1の分光器を介して接続された複数の光電変換部を設ける。前記生成物または化学物質溶液について、その吸光度または濃度の測定が指示された場合には、前記ノズルに着脱可能に下端に口部を有する流管を上端で装着し、測定すべき生成物または化学物質溶液を該流管内に吸引して収容保持し、または測光用容器に収容保持し、前記対選択連動切換部は、前記照射端組および前記受光端組の一方の第1組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる前記照射測定端および受光測定端を選択し、選択された該照射測定端と光学的に接続された前記白色光源をオン状態とし、選択された該受光測定端と光学的に接続された1の分光器と接続された光電変換部をオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える。前記制御部によって、または、使用時にあっては、前記照射受光対に属する照射端の端面と受光端の端面とを共通に通る垂直線、すなわち垂直共通軸線が存在する状態で使用することが好ましい。さらに、前記ノズルに装着された前記流管の前記口部を前記垂直共通軸線が通る状態に位置することが好ましい。前記照射受光対のいずれか一方を少なくとも1の前記ノズルまたは前記吸引吐出機構の前記流管の前記垂直共通軸線上に設け、他方をステージ上に設けることによって、後述するノズル移動機構を用いて前記受光端および前記照射端を前記垂直共通軸線上に容易かつ確実に位置付けすることができるので、測定用光の照射を流管の垂直共通軸線方向に沿って容易かつ確実に行うことができることになる。「上下方向」は、流管をノズルに装着した場合の方向であって、前記流管の垂直共通軸線に沿った方向または流管の吸引吐出方向に相当させるのが好ましい。 In order to enable measurement of absorbance or concentration, at least one of the one or more light sources is further connected via a white light source that emits white light as measurement light and one spectroscope. A plurality of photoelectric conversion units are provided. When the measurement of the absorbance or concentration of the product or chemical substance solution is instructed, a flow tube having a mouth at the lower end is attached to the nozzle so as to be removable, and the product or chemical to be measured is to be measured. The substance solution is sucked into the flow tube and stored and held, or stored and held in a light measuring container, and the pair selection interlocking switching unit is the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the irradiation. The irradiation measurement end and the light reception measurement end that can be connected to the irradiation end and the light reception end to which they belong are selected for the other first set of the end set and the light receiving end set, and optically with the selected irradiation measurement end. The connected white light source is turned on, the photoelectric conversion unit connected to one spectroscope optically connected to the selected light receiving measurement end is turned on, and the irradiation end, the light receiving end, and the irradiation are turned on. The connection and disconnection between the measurement end and the light receiving measurement end are sequentially switched in conjunction with each other. It is preferable to use it by the control unit or in a state where there is a vertical line that commonly passes through the end face of the irradiation end belonging to the irradiation light receiving pair and the end face of the light receiving end, that is, a vertical common axis. .. Further, it is preferable that the vertical common axis passes through the mouth of the flow pipe mounted on the nozzle. By providing any one of the irradiation light receiving pairs on the vertical common axis of at least one nozzle or the flow tube of the suction discharge mechanism and providing the other on the stage, the nozzle moving mechanism described later is used. Since the light receiving end and the irradiation end can be easily and surely positioned on the vertical common axis, the irradiation of the measurement light can be easily and surely performed along the vertical common axis direction of the flow tube. .. The "vertical direction" is the direction when the flow pipe is attached to the nozzle, and preferably corresponds to the direction along the vertical common axis of the flow pipe or the suction / discharge direction of the flow pipe.
より好ましくは、前記ノズルまたは前記吸引吐出機構に設ける前記「照射受光対の一方」(の要素)は「照射端」であり、「照射受光対の他方」は「受光端」である。これによって、照射端から照射される測定用光は口部または底部から上方向に照射する場合に比較してより確実に化学物質溶液に照射され、光の全量または主要部を前記流管内を通過させることができる。特に、流管がチップ状容器のように先細りに形成されている場合には、その程度が高い。 More preferably, the "one of the irradiation / light receiving pairs" (element) provided in the nozzle or the suction / discharge mechanism is the "irradiation end", and the "other of the irradiation / light receiving pairs" is the "light receiving end". As a result, the measurement light emitted from the irradiation edge is more reliably irradiated to the chemical substance solution than when it is irradiated upward from the mouth or bottom, and the entire amount or the main part of the light passes through the flow tube. Can be made to. In particular, when the flow pipe is formed to be tapered like a chip-shaped container, the degree is high.
第7の発明は、前記電気泳動前処理部において、前記ノズルは列方向および上下方向に沿ってのみ移動可能に設けられ、かつ1列状に行方向に沿って第1のピッチで配列して設けられ、前記各収容部群は、列方向に沿って1列状または複数列状に延びかつ行方向に沿って第2のピッチで配列して設けられ、前記キャピラリー電気泳動部において、前記電気泳動用キャピラリーは列方向に沿って延び、行方向に第3のピッチで配列して設けられ、前記ノズルの内前記第2のピッチで配列された1群または複数群のノズル群に装着された複数の流管は一斉に各収容部に挿入可能に設けられ、1列状に前記行方向に沿って可変ピッチで配列された前記複数の可動液収容部からなる1群の可動液収容部群または該可動液収容部群が列方向に間隔を開けて並列に複数群設けられた可変ピッチ液収容架台と、該架台を前記行方向に沿って前記第1のピッチごとまたは前記電気泳動前処理部と前記キャピラリー電気泳動部との間を移動するように設けられた架台移動部と、前記可変ピッチを前記第2のピッチと前記第3のピッチの間で変換可能に設けられたピッチ変換機構とを有し、前記電気泳動用キャピラリーの一端部は1群の可動液収容部群に属する複数の前記可動液収容部に一斉に挿入可能に設けられた電気泳動全自動処理装置である。 According to the seventh invention, in the electrophoresis pretreatment unit, the nozzles are provided so as to be movable only in the column direction and the vertical direction, and are arranged in a row at the first pitch along the row direction. Each of the accommodating portions is provided so as to extend in a row or a plurality of rows along the column direction and arranged at a second pitch along the row direction, and in the capillary electrophoresis section, the electricity is provided. The electrophoresis capillary extends along the column direction and is provided arranged in the row direction at a third pitch, and is attached to one or more groups of nozzles arranged at the second pitch among the nozzles. A group of movable fluid accommodating portions composed of the plurality of movable fluid accommodating portions arranged in a row at a variable pitch along the row direction so that a plurality of flow tubes can be inserted into each accommodating portion all at once. Alternatively, a variable pitch liquid accommodating pedestal in which a plurality of groups of the movable liquid accommodating portions are provided in parallel at intervals in the column direction, and the pedestal is placed along the row direction at each of the first pitches or in the electrophoresis pretreatment. A gantry moving unit provided so as to move between the unit and the capillary electrophoresis unit, and a pitch conversion mechanism provided so that the variable pitch can be converted between the second pitch and the third pitch. One end of the electrophoresis capillary is a fully automatic electrophoresis processing device provided so as to be able to be inserted into a plurality of movable fluid accommodating portions belonging to one group of movable fluid accommodating portions all at once.
ここで、「列方向」および「行方向」とは、前記収容部群の収容部が水平面に行列状に配列された場合の配列方向に沿った直交する2方向であり、例えば、直交座標系(X,Y,Z)のY軸方向およびX軸方向である。なお、この場合Z軸方向はステージに対して直交する上下方向である。「ピッチ」とは、同一または異なる要素(例えば、容器、ウェル、液収容部、ノズル等)が等間隔に配列されているとき、その配列された要素の中心間の距離をいう。
「第1のピッチ」とは、前記ノズルの配列されているピッチであって、各収容部群内に属する1列の収容部列間の間隔、および前記可変ピッチ液収容架台が移動可能な距離の1つに相当する。「第2のピッチ」は、前記第1のピッチと同じ場合または第1のピッチの複数倍であり、複数倍の「複数」は、前記収容部群に属する収容部列の列数に等しく、さらに前記可変ピッチ液収容架台の可動液収容部群の群数と同じである。第2のピッチが第1のピッチに等しい場合とは、前記各収容部群は、列方向に沿って1列状に延びる場合であって、ノズルに装着された1群の流管は一斉に各収容部に挿入可能に設けられている場合である。第2のピッチが第1のピッチの複数倍の場合には、各収容部群の列数が複数になるために、多くの試薬や反応容器を収容部群の各列の長さを増加させることなく収容することができるので、ステージをしたがって装置規模を、コンパクトに形成することができることになる。この場合、各列の配列は同一ではないが、1の流管収容部および1の液収容部または1の反応容器を有している。この場合、第2のピッチで配列された複数群の流管群や密閉蓋群を有するように一列置きまたは(複数−1)列置きに流管や密閉蓋を収容部列に配列することができる(図1,4参照)。
Here, the "column direction" and the "row direction" are two directions orthogonal to each other along the arrangement direction when the accommodating portions of the accommodating portion group are arranged in a matrix on a horizontal plane, for example, a Cartesian coordinate system. (X, Y, Z) in the Y-axis direction and the X-axis direction. In this case, the Z-axis direction is the vertical direction orthogonal to the stage. "Pitch" refers to the distance between the centers of the arranged elements when the same or different elements (eg, container, well, liquid reservoir, nozzle, etc.) are arranged at equal intervals.
The "first pitch" is the pitch in which the nozzles are arranged, the distance between one row of housing units belonging to each storage unit group, and the distance at which the variable-pitch liquid storage stand can move. Corresponds to one of. The "second pitch" is the same as the first pitch or is a plurality of times the first pitch, and the "plurality" of a plurality of times is equal to the number of rows of the accommodation unit row belonging to the accommodation unit group. Further, it is the same as the number of groups of the movable liquid accommodating portion group of the variable pitch liquid accommodating stand. The case where the second pitch is equal to the first pitch is the case where each of the accommodating portions extends in a row along the row direction, and the flow pipes of the group mounted on the nozzle are all at once. This is a case where each accommodating portion is provided so as to be insertable. When the second pitch is a plurality of times the first pitch, the number of rows of each containment group is multiple, so that many reagents and reaction vessels are used to increase the length of each row of the containment group. Since it can be accommodated without any need, the stage and therefore the device scale can be compactly formed. In this case, the arrangement of each row is not the same, but it has 1 flow tube accommodating part and 1 liquid accommodating part or 1 reaction vessel. In this case, the flow tubes and the sealing lids may be arranged in the accommodating section row in a row or (plural-1) rows so as to have a plurality of groups of flow tubes and sealing lids arranged at the second pitch. Yes (see Figures 1 and 4).
「第3のピッチ」は、一般に、「第2のピッチ」とは相違する。なお、「第2のピッチ」で配列された流管の個数は、前記電気泳動用キャピラリーの本数と等しいことが好ましい。すると、ノズルの全数は、収容部群数の1または複数倍あり、各収容部群には、第1のピッチで1または複数列の収容部列が設けられることになる。例えば、第2のピッチは44mmであり、第3のピッチは18mmである。 The "third pitch" is generally different from the "second pitch". The number of flow tubes arranged at the "second pitch" is preferably equal to the number of the electrophoresis capillaries. Then, the total number of nozzles is one or more times the number of accommodating unit groups, and each accommodating unit group is provided with one or a plurality of accommodating unit rows at the first pitch. For example, the second pitch is 44 mm and the third pitch is 18 mm.
なお、前記各収容部群において、光測定を行わない収容部列に対応するノズル群については、照射端および受光端を設ける必要がない。
また、ノズル移動機構が列方向および上下方向に沿ってのみ移動可能に設ける場合には、行方向および上下方向に沿ってのみ移動可能な1のノズルを有する横断ノズルを設けて、共通収容領域から前記各収容部群に、サンプルとは無関係な共通に使用する試薬を反応容器に供給するようにするのが好ましい。これによって、ステージに予め収容する試薬数を削減して、ステージをコンパクトに形成することができる。また、前記可変ピッチ液収容架台において前記各可動液収容部群は、各可動液収容部の配列方向に直交する方向に沿って間隔を空けて並列に配列されるのが好ましい。
In each of the housing units, it is not necessary to provide an irradiation end and a light receiving end for the nozzle group corresponding to the storage unit row in which the light measurement is not performed.
When the nozzle moving mechanism is provided so as to be movable only in the column direction and the vertical direction, a cross-sectional nozzle having one nozzle movable only in the row direction and the vertical direction is provided from the common accommodation area. It is preferable that each of the housing groups is supplied with a commonly used reagent that is independent of the sample and is supplied to the reaction vessel. As a result, the number of reagents stored in the stage in advance can be reduced, and the stage can be formed compactly. Further, in the variable pitch liquid accommodating stand, it is preferable that the movable liquid accommodating portions are arranged in parallel at intervals along a direction orthogonal to the arrangement direction of the movable liquid accommodating portions.
第8の発明は、複数本の電気泳動用キャピラリー内に電圧を印加することにより目的物質の泳動を行うキャピラリー電気泳動工程と、前記目的物質のサンプルからの抽出処理、および加工処理、並びに各処理に関する生成物または化学物質の品質評価を経て得られた前記目的物質を含む電気泳動用試料を前記各電気泳動用キャピラリーに供給可能とする電気泳動前処理工程と、前記キャピラリー電気泳動工程で使用する前記各キャピラリーに関する光の測定および前記電気泳動前処理工程での前記品質評価のための光の測定からなるグループの中から選択して、任意の少なくとも1の測定を実行可能とする光選択測定工程と、各処理に関する品質評価および目的物質の解析を行う解析工程と、を有し、前記光選択測定工程は、測光内容または前記目的物質を含む前記生成物または前記化学物質により定まる測定用光を照射可能な複数個の導光路の各一端部である照射端を各組に有する複数組の照射端組、および、該照射端組に対応する位置に位置しまたは位置付け可能に設けられ該照射端から照射された測定用光に基づいて生ずる光を各々受光可能な複数個の導光路の各一端部である受光端を各組に有する複数組の受光端組とが設けられ、前記目的物質の電気泳動に基づく解析処理または品質評価の指示があった場合には、前記複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から対となる1組の照射端組および1組の受光端組を選択して、対応する1対の照射端および受光端からなる照射受光対ごとに、前記照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を測定する照射受光対選択測定工程を有する電気泳動全自動処理方法である。 The eighth invention is a capillary electrophoresis step in which a target substance is electrophoresed by applying a voltage into a plurality of electrophoresis capillaries, an extraction process and a processing process of the target substance from a sample, and each process. Used in the electrophoresis pretreatment step and the electrophoresis step of making it possible to supply an electrophoresis sample containing the target substance obtained through quality evaluation of the product or chemical substance to each of the electrophoresis capillaries. A light selective measurement step that enables any at least one measurement to be performed by selecting from a group consisting of light measurements for each capillary and light measurements for the quality evaluation in the electrophoresis pretreatment step. When the analyzing step to analyze the quality evaluation and objective substance for each process, it has a, the light selection measuring step, the measurement light is determined by the product or the chemical containing photometric content or the target substance A plurality of sets of irradiation end sets having an irradiation end, which is one end of each of the plurality of irradiation paths, in each set, and an irradiation end set located at a position corresponding to the irradiation end set or provided so as to be positioned. A plurality of sets of light-receiving end sets having a light-receiving end, which is one end of each of a plurality of light guide paths capable of receiving light generated based on the measurement light emitted from the light guide path, are provided. When an instruction for analysis processing or quality evaluation based on electrophoresis is given, a pair of irradiation end sets and a set of light receiving ends are paired from the plurality of sets of irradiation end sets and multiple sets of light receiving end sets. A set is selected, and a predetermined measurement light is sequentially supplied to the irradiation end for each irradiation light receiving pair consisting of the corresponding pair of irradiation ends and the light receiving ends, and the intensity of the light sequentially received by the light receiving ends is measured. it is an electrophoretic fully automatic processing method for chromatic illumination light receiving pair selection measuring step for.
第9の発明は、前記照射受光対選択測定工程は、前記指示に基づいて、複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から、1対の照射端組および受光端組を選択し、指示に応じて選択された所定の測定用光を出射する1または2以上の光源と、選択された前記照射端組に属する照射端との間の接続または遮断と、受光した光を電気信号に変換する1または2以上の光電変換部と、選択された前記受光端組に属する受光端との間の接続または遮断とを、前記照射受光対ごとに連動して切り換える対選択連動切換工程を有する電気泳動全自動処理方法である。 In the ninth invention, in the irradiation / light receiving pair selection measurement step, a pair of irradiation end sets and a light receiving end set are selected from a plurality of sets of irradiation end sets and a plurality of sets of light receiving end sets based on the above instructions. Then, the connection or blocking between one or two or more light sources that emit a predetermined measurement light selected according to the instruction and the irradiation end belonging to the selected irradiation end set, and the received light are electrophoresed. A pair selection interlocking switching step of interlocking and switching between one or two or more photoelectric conversion units that convert signals and a light receiving end belonging to the selected light receiving end set for each irradiation light receiving pair. This is a fully automatic electrophoresis processing method.
第10の発明は、前記対選択連動切換工程は、前記一端部が前記照射端組に属する1の照射端を各々有する前記複数個の導光路の各他端部が各々有する照射接続端が前記複数個属する照射接続端組、および、前記一端部が前記受光端組に属する1の受光端を各々有する前記複数個の導光路の各他端部が各々有する受光接続端が前記複数個属する受光接続端組が、各々複数組あって、各同一の組に属する前記照射接続端または前記受光接続端が所定方向に沿って1列状に所定間隔で配列され、対となり得る異なる組に属する前記照射接続端または前記受光接続端同士は前記所定方向に直交する方向に沿って対間隔を開けて並列に配列されている接続端配列面を有する複数対接続端組配列体と、オンオフ可能な前記光源と光学的に接続され、該照射接続端組に属する照射接続端と順次接続可能に設けられた1または2以上の照射測定端が前記所定方向に沿って1列状に所定間隔で各々設けられた複数組の照射測定端組、およびオンオフ可能な前記光電変換部と光学的に接続され、前記受光接続端組に属する受光接続端と順次接続可能に設けられた1または2以上の受光測定端が前記所定方向に沿って1列状に所定間隔で各々設けられた複数組の受光測定端組が前記所定方向に直交する方向に沿って前記対間隔を開けて配列された測定端配列面を有する複数対測定端組配列体とを、前記接続端配列面と前記測定端配列面とが向き合って前記所定方向に沿って摺動するように相対的に移動させて、選択された前記照射接続端および受光接続端と前記照射測定端および受光測定端の各々を連動して接続または遮断を行い、選択された組同士の照射端および受光端の対ごとに、前記照射端とオン状態にある前記光源との接続遮断が、前記受光端とオン状態にある前記光電変換部との接続および遮断と連動して順次行われる電気泳動全自動処理方法である。 According to a tenth invention, in the pair selection interlocking switching step, the irradiation connection end of each of the other ends of the plurality of light guide paths having one irradiation end having one irradiation end belonging to the irradiation end group is the irradiation connection end. A plurality of irradiation connection ends and a light receiving end to which each of the other ends of the plurality of light guide paths having one light receiving end having one light receiving end belonging to the light receiving end set belong to the plurality of light receiving connections. There are a plurality of connection end sets, and the irradiation connection ends or the light receiving connection ends belonging to the same set are arranged in a row at predetermined intervals along a predetermined direction, and belong to different sets that can be paired. The irradiation connection end or the light receiving connection end can be turned on and off with a plurality of pair connection end array having a connection end array surface arranged in parallel with a pair spacing along a direction orthogonal to the predetermined direction. One or two or more irradiation measurement ends that are optically connected to the light source and are provided so as to be sequentially connectable to the irradiation connection ends belonging to the irradiation connection end set are provided in a row at predetermined intervals along the predetermined direction. 1. A plurality of sets of light receiving measurement end sets, each of which is provided in a row at predetermined intervals along the predetermined direction, are arranged with the pair spacing along the direction orthogonal to the predetermined direction. The irradiation of the selected irradiation ends by relatively moving the plurality of pairs of measurement end array having the above-mentioned The connection end and the light receiving connection end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end are connected or disconnected in conjunction with each other, and each pair of the irradiation end and the light receiving end of the selected pair is turned on with the irradiation end. This is a fully automatic electrophoresis processing method in which the connection with the light source is cut off in sequence in conjunction with the connection and cutoff between the light receiving end and the photoelectric conversion unit in the ON state.
第11の発明は、前記電気泳動前処理工程は、気体の吸引吐出を行う吸引吐出機構と連通し、液体の吸引吐出が可能な流管が着脱可能に装着される複数連のノズルおよび該ノズルに装着された該流管に外部から磁場を及ぼしかつ除去することが可能な磁力部が設けられ、検査対象となるサンプルおよび磁性粒子懸濁液を含む各種の化学物質溶液を収容する液収容部および温度昇降器により温度制御可能な反応容器を少なくとも各々有し、前記各ノズルに対応して設けられた複数群の収容部群を有するステージと、前記ノズルと前記ステージとの間を相対的に移動するノズル移動工程を有し、前記光選択測定工程は、前記照射端組および前記受光端組の一方の第1組は、前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該一方の第2組は前記電気泳動用キャピラリーまたは各泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられ、前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組は、前記一方の第1組と対をなすように前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該他方の第2組は、前記一方の第2組と対をなすように、前記電気泳動用キャピラリーまたは前記泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられることで測定が行われる電気泳動全自動処理方法である。ここで、「複数個」は前記複数本に対応するのが好ましい。 According to the eleventh invention, the electrophoresis pretreatment step communicates with a suction / discharge mechanism for sucking and discharging a gas, and a plurality of nozzles and the nozzles to which a flow tube capable of sucking and discharging a liquid is detachably attached. The flow tube mounted on the is provided with a magnetic force portion capable of applying and removing a magnetic field from the outside, and a liquid storage portion for accommodating various chemical substance solutions including a sample to be inspected and a magnetic particle suspension. And a stage having at least each reaction vessel whose temperature can be controlled by a temperature evaporator and having a plurality of groups of accommodating portions provided corresponding to each nozzle, and a relative between the nozzle and the stage. The light selective measurement step includes a moving nozzle moving step, in which the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set is provided on the nozzle or the suction / discharge mechanism, and the second set of the one is provided. The irradiation end set and the other first set of the light receiving end set are paired with the one first set, which is provided in contact with or close to the electrophoretic capillary or the outer surface of each post-electrophoresis accommodating portion. As described above in the nozzle or suction / discharge mechanism, the other second set contacts or contacts the outer surface of the electrophoresis capillary or the post-electrophoresis accommodating portion so as to be paired with the one second set. This is a fully automatic electrophoresis processing method in which measurements are taken by being provided close to each other. Here, "plurality" preferably corresponds to the plurality of pieces.
第12の発明は、前記光選択測定工程は、前記照射端組および前記受光端組の他方の第3組をさらに有し、該他方の第3組は、前記流管外であって、該流管の口部がその上方に位置付け可能となって前記一方の前記第1組と対をなすようにして測定を行う電気泳動全自動処理方法である。 In the twelfth invention, the light selective measurement step further includes the other third set of the irradiation end set and the light receiving end set, and the other third set is outside the flow tube. This is a fully automatic electrophoresis processing method in which the mouth of the flow pipe can be positioned above the mouth of the flow pipe and the measurement is performed so as to form a pair with the first set of the one.
第13の発明は、前記光選択測定工程は、前記生成物または化学物質溶液について、蛍光物質で標識化された目的物質の有無または量の測定が指示された場合には、前記生成物または化学物質溶液が収容されている収容部にまで前記ノズルを移動した後、前記照射端組および前記受光端組の一方の前記第1組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および前記受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または2以上の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光を測定用光とする1または2以上の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または2以上の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する前記光電変換部のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える対選択連動切換工程を有し、前記目的物質の電気泳動による解析処理の指示があった場合には、前記電気泳動用試料が収容されている可動液収容部内に前記電気泳動用キャピラリーの一端部を挿入させた後、前記照射端組および前記受光端組の一方の第2組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第2組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または複数の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光、または白色光を測定用光とする1または複数種類の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または複数の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する光電変換部または分光光度計のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える対選択連動切換工程を有する電気泳動全自動処理方法である。 In a thirteenth invention, the optical selective measurement step is instructed to measure the presence or absence or amount of a fluorescent substance-labeled target substance in the product or chemical solution, if the product or chemical is instructed to measure the presence or absence of the target substance. After moving the nozzle to the accommodating portion in which the substance solution is contained, the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the other first set of the irradiation end set and the light receiving end set. A pair of the irradiation measurement end set and the light reception measurement end set that can be connected to the irradiation end and the light receiving end to which each belongs is selected, and one or two or more irradiation measurements belonging to the selected irradiation measurement end set are selected. Only one or two or more light sources whose measurement light is excitation light of one or more kinds of wavelengths optically connected to the end is turned on, and one or two or more light receivers belonging to the selected light receiving measurement end set are turned on. Only the photoelectric conversion unit is turned on via a bandpass filter that can pass fluorescence excited by the excitation light that is optically connected to the measurement end, and the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end are turned on. It has a pair-selection interlocking switching step that sequentially switches the connection and disconnection between the two, and when instructed to perform an analysis process by electrophoresis of the target substance, the electrophoretic sample is accommodated. After inserting one end of the electrophoretic capillary into the movable liquid accommodating portion, the second set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the other second set of the irradiation end set and the light receiving end set. For the two sets, a pair of the irradiation measurement end set and the light receiving measurement end set that can be connected to the irradiation end and the light receiving end to which they belong are selected, and one or more irradiation measurement ends belonging to the selected irradiation measurement end set are selected. Only one or more types of light sources that are optically connected to one or more kinds of excitation light or white light as measurement light are turned on, and one or more members belong to the selected light receiving measurement end group. Only the photoelectric conversion unit or the spectrophotometer via the bandpass filter capable of passing the fluorescence excited by the excitation light, which is optically connected to the light receiving measurement end of the above, is turned on, and the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement are performed. This is a fully automatic electrophoresis processing method having a pair-selection interlocking switching step of sequentially switching the connection and disconnection between the end and the light receiving measurement end.
第14の発明は、前記電気泳動前処理工程は、前記ノズルは1列状に行方向に沿って第1のピッチで配列して設けられ、かつ、列方向および上下方向に沿ってのみ移動可能であり、前記各収容部群は、列方向に沿って1列状または複数列状に延びかつ行方向に沿って第1のピッチまたはその複数倍に相当する第2のピッチで配列され、1列状または複数列状に前記行方向に沿って第2のピッチで配列された前記複数の可動液収容部からなる1群または複数群の可動液収容部群が設けられた可変ピッチ液収容架台に、第2のピッチで配列された複数の前記ノズルに装着された流管によって、1群の該可動液収容部内に吐出して収容し、前記行方向に沿って該架台を前記第1のピッチごとまたは前記キャピラリー電気泳動部にまで移動させ、前記キャピラリー電気泳動工程は、前記可変ピッチ液収容架台の各可動液収容部の第2のピッチを第3のピッチに変換して、前記電気伝導用キャピラリーの一端部を挿入させて、該キャピラリーの端部間に所定電圧を印加して前記電気泳動用試料に含有する目的物質の泳動を行う電気泳動全自動処理方法である。 In the fourteenth invention, in the electrophoresis pretreatment step, the nozzles are provided in a row in a row along the row direction at a first pitch, and can move only in the column direction and the vertical direction. Each of the accommodating portions is arranged in a row or a plurality of columns along the column direction and at a second pitch corresponding to the first pitch or a plurality of times thereof along the row direction. A variable-pitch liquid storage stand provided with one group or a plurality of groups of movable liquid storage parts composed of the plurality of movable liquid storage parts arranged in a row or a plurality of rows at a second pitch along the row direction. In addition, the flow tubes mounted on the plurality of nozzles arranged at the second pitch discharge and accommodate the moving fluid in a group of the moving fluid accommodating portions, and the gantry is accommodated along the row direction of the first group. It is moved pitch by pitch or to the capillary electrophoresis section, and the capillary electrophoresis step converts the second pitch of each movable liquid storage section of the variable pitch liquid storage stand into a third pitch, and the electrical conduction This is a fully automatic electrophoresis processing method in which one end of a capillary is inserted and a predetermined voltage is applied between the ends of the capillary to perform electrophoresis of a target substance contained in the electrophoresis sample.
第1の発明、または第8の発明によれば、目的核酸の塩基配列の解析を含むキャピラリー電気泳動処理を、臨床時等において行うに際し、クロスコンタミネーションを防止しかつユーザの手間を軽減して、サンプルからの目的物質(例えば目的核酸)の抽出から、標識化、断片化、増幅等の加工処理さらには目的物質の電気泳動を用いた解析(例えば、塩基配列の決定)までを一貫して自動化し、ユーザの手を経ることなく迅速かつ効率的に処理を実行することができる。また、目的物質の電気泳動を用いた解析(例えば目的核酸の塩基配列の解析)を行う際のその生成物や関連する化学物質の品質評価をも、手動や、測定すべき内容に応じた個数の専用装置の使用を不要とし、同一の装置を用いて、行うことを可能にすることによって、ユーザの手間を軽減し、かつ、外部からの異物の侵入や、コンタミネーションを確実に防止し、信頼性の高い化学物質を用い、かつ高い品質の生成物を得て精度の高い目的物質の電気泳動に基づく解析をすることができる。さらに、分注装置のみならず、PCR法に基づく核酸増幅装置、電気泳動専用装置、制御部および光測定器(光選択測定部)を組み込み、かつ部品や器具、機構を共通に利用することで装置規模を拡大することなく、効率的に処理を行い、かつ安価に製造し使用することができる。 According to the first invention or the eighth invention, when performing capillary electrophoresis processing including analysis of the base sequence of a target nucleic acid in clinical practice or the like, cross-contamination is prevented and the user's labor is reduced. , From extraction of target substance (for example, target nucleic acid) from sample to processing such as labeling, fragmentation, amplification, and analysis using electrophoresis of target substance (for example, determination of base sequence). It can be automated and the process can be executed quickly and efficiently without the intervention of the user. In addition, the quality evaluation of the product and related chemical substances when performing analysis using electrophoresis of the target substance (for example, analysis of the base sequence of the target nucleic acid) can be performed manually or according to the content to be measured. By eliminating the need to use a dedicated device and making it possible to use the same device, the user's labor is reduced, and foreign matter from the outside and contamination are reliably prevented. It is possible to use highly reliable chemical substances, obtain high-quality products, and perform highly accurate electrophoretic analysis of the target substances. Furthermore, by incorporating not only a dispensing device but also a nucleic acid amplification device based on the PCR method, a dedicated electrophoresis device, a control unit and an optical measuring device (optical selective measuring unit), and by using parts, instruments and mechanisms in common. It can be processed efficiently and can be manufactured and used at low cost without expanding the scale of the apparatus.
複数組の導光路組を用いて、各導光路の一端部である照射端または受光端を各組に有する複数組の照射端組、または、該照射端組に対応する位置に位置しまたは位置付け可能に設けられた複数組の受光端組を、目的物質の電気泳動を用いた解析処理または品質評価の対象となる生成物や化学物質が収容された収容部または流管が装着されるノズル若しくは吸引吐出機構、ステージ上の位置や測光用容器、電気泳動用キャピラリー、又は泳動後収容部の側壁等に設けることによって、導光路を通して測定用光を供給し、受光することで、種々の場面における対象に対する光測定を共通の1の光測定器に集中させて、装置規模を拡大または複雑化することなく、同一の操作でコンパクトかつ容易に、かつ効率的に確実に行うことができることになる。 Using multiple sets of light guide assembly, a plurality of sets of irradiation end sets having an illumination end or receiving end which is one end portion of each light guide in each set, or located at a position corresponding to the irradiation end group or A nozzle in which a storage unit or a flow tube containing a product or chemical substance to be analyzed or quality evaluated by electrophoresis of a target substance is mounted on a plurality of sets of light receiving ends that are provided so as to be positioned. Alternatively, by providing the suction / discharge mechanism, the position on the stage, the measuring container, the capillary for electrophoresis, or the side wall of the accommodating portion after electrophoresis, the light for measurement is supplied and received through the light guide path, thereby performing various situations. By concentrating the optical measurement for the object in the above on one common optical measuring instrument, the same operation can be performed compactly, easily, and efficiently and reliably without expanding or complicating the scale of the apparatus. ..
第2の発明または第9の発明によれば、複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から、1対の照射端組および受光端組を選択し、指示に応じて選択された各組に属する1対の照射端と受光端と該当する光源および該当する光電変換部との各々の接続および遮断を連動して行うようにしている。したがって、1の化学物質溶液について、種々の光源若しくは光源からの遮断および種々の光電変換部を組み合わせて種々の測定を行うことができて汎用性が高い。また、複数の化学物質溶液に対して複数種類の測定を同時並行して行うことができるので効率性が高く、複数の化学物質溶液ごとに光源や光電変換部を設ける必要がないので、装置規模の拡大や製造費用の増大を防止することができる。 According to the second invention or the ninth invention, a pair of irradiation end sets and light receiving end sets are selected from a plurality of sets of irradiation end sets and a plurality of sets of light receiving end sets, and are selected according to instructions. Each pair of irradiation end and light receiving end belonging to each set, the corresponding light source, and the corresponding photoelectric conversion unit are connected and cut off in conjunction with each other. Therefore, it is highly versatile because it is possible to perform various measurements on one chemical substance solution by combining various light sources or blocking from the light sources and various photoelectric conversion units. In addition, since multiple types of measurements can be performed simultaneously for a plurality of chemical substance solutions, the efficiency is high, and since it is not necessary to provide a light source or a photoelectric conversion unit for each of a plurality of chemical substance solutions, the scale of the device It is possible to prevent the expansion of the manufacturing cost and the increase of the manufacturing cost.
第3の発明または第10の発明によると、多数の照射端と1または2以上の光源との接続および遮断と、多数の受光端と1または2以上の光電変換部との接続および遮断とを、共通の連動切換機構による複数対接続端組配列体と複数対測定端組配列体との相対的な一直線に沿った移動によって実現することができるので、複数の電気泳動処理の対象となるサンプルに対する、前記目的物質の解析処理、および生成物または化学物質溶液の品質評価を1の装置で同時並行して行うことができるので、装置規模の拡大や部品点数の増大を防止し、かつ効率性が高いことになる。また、前記複数対接続端組配列体において配列された対となり得る照射接続端組および受光接続端組と、それと向き合って摺動する複数対測定組配列体に設けられた対となり得る照射測定端組および受光測定端組が行方向および列方向に沿って配列されているため、ユーザのニーズに応じたそれらの追加による拡張、削減による縮小が容易で柔軟性が高い。 According to the third or tenth invention, the connection and disconnection of a large number of irradiation ends and one or more light sources and the connection and disconnection of a large number of light receiving ends and one or more photoelectric conversion units are performed. Since it can be realized by moving along a relative straight line between the multiple pair connection end set array and the multiple pair measurement end set array by the common interlocking switching mechanism, the sample to be subjected to multiple electrophoresis processing. Since the analysis process of the target substance and the quality evaluation of the product or chemical substance solution can be performed simultaneously and simultaneously with one device, it is possible to prevent the expansion of the device scale and the increase in the number of parts, and the efficiency. Will be high. Further, the irradiation connection end set and the light receiving connection end set which can be a pair arranged in the plurality of pair connection end set array, and the irradiation measurement end which can be a pair provided in the multiple pair measurement set array which slides facing the same. Since the sets and the light receiving measurement end sets are arranged along the row direction and the column direction, it is easy to expand by adding them and shrink by reducing them according to the user's needs, and it is highly flexible.
第4の発明または第11の発明によれば、装置に設けられたノズルまたは吸引吐出機構、電気泳動用キャピラリーに各々1対の照射端組および受光端組を設けるととともに、それらは、導光路を用いて前記光選択測定部の複数対接続端組配列体上に、対として同時に接続および遮断可能なように照射接続端組および受光端組として1列状に所定方向に沿って配列されかつその直交する方向に所定間隔を開けて配列されることによって、線型の運動によって光源および光電変換部と確実かつ簡単に接続することができるので、目的核酸の塩基配列の解析のみならず、その品質評価をも1の装置で実行することができるので、装置全体をコンパクトかつ効率性が高い。 According to the fourth or eleventh invention, the nozzle or suction / discharge mechanism provided in the apparatus, the capillary for electrophoresis is provided with a pair of irradiation end set and light receiving end set, respectively, and they are used as a light guide path. Are arranged in a row along a predetermined direction as an irradiation connection end set and a light receiving end set so that they can be connected and blocked at the same time as a pair on a plurality of pairs of connection end sets of the optical selection measurement unit. By arranging them at predetermined intervals in the orthogonal directions, it is possible to reliably and easily connect to the light source and the photoelectric conversion part by linear motion, so that not only the base sequence of the target nucleic acid can be analyzed but also its quality. Since the evaluation can be performed by one device, the entire device is compact and highly efficient.
ノズルまたは吸引吐出機構に対しその基本的形態および基本的機能を変えることなく照射端または受光端を設けることによって、分注処理とは別個に測光処理に専用のノズルや吸引吐出機構または専用部品を設けることなく、また、吸引吐出機能を妨害することなく通常の分注処理と共通のノズルおよび吸引吐出機構を用いて、前記ノズルに流管を装着させることで通常の分注処理および測光処理を行うことができるので処理が容易で作業効率が高い。 By providing an irradiation end or a light receiving end for the nozzle or suction / discharge mechanism without changing its basic form and basic function, a nozzle, suction / discharge mechanism or special parts dedicated to photometric processing can be provided separately from the dispensing process. Using the same nozzle and suction / discharge mechanism as the normal dispensing process without providing and without interfering with the suction / discharge function, the normal dispensing process and photometric processing can be performed by attaching a flow tube to the nozzle. Since it can be performed, processing is easy and work efficiency is high.
第5の発明または第12の発明によれば、測定用光が通過可能な程度の断面をもつ細柱状に化学物質溶液を流管内または測光容器内に保持または収容させて、測定に必要な液量を抑制し小容量の液体についての物理化学的性質または数値(例えば、吸光度)の測定を可能にする。また、化学物質溶液を収容する流管または透光領域を有する測光用流管によって測定用光が遮られることがないので、測定用光に対する光学的影響を除去または削減して精度の高い物理化学的性質または数値(例えば、吸光度)を得ることができる。また、流管または測光用容器の透光領域によって測定用光が遮られることがないので、測定用光の種類に応じた専用素材のみで製造した流管や測光用容器を用いることなく安価に製造することができるとともに、測定用光に不透明な部材(例えば、黒色物質)を流管や測光用容器に使用して外部からの光の進入を防止し精度の高い物理化学的性質または数値(例えば、濃度)の測定を行うことができることになる。ここで「細柱状」とは、例えば、ノズルの断面に比較して細く形成されていることをいい、前記流管または測光用容器に液を収容かつ保持することで形成される。 According to the fifth or twelfth invention, a liquid required for measurement is obtained by holding or accommodating a chemical substance solution in a flow tube or a light measuring container in a columnar shape having a cross section that allows measurement light to pass through. It suppresses the amount and enables measurement of physicochemical properties or numerical values (for example, absorbance) for a small volume of liquid. In addition, since the measurement light is not blocked by the flow tube for accommodating the chemical substance solution or the light measurement flow tube having a translucent region, the optical influence on the measurement light can be eliminated or reduced to achieve highly accurate physical chemistry. Physical properties or numerical values (eg, absorbance) can be obtained. In addition, since the light for measurement is not blocked by the translucent region of the flow tube or the light measurement container, it is inexpensive without using a flow tube or a light measurement container manufactured only with a special material according to the type of measurement light. A member that is opaque to the measuring light (for example, a black substance) can be used for the flow tube or the measuring container to prevent the ingress of light from the outside and have highly accurate physicochemical properties or numerical values (for example). For example, the concentration) can be measured. Here, the term "thin columnar" means, for example, that the nozzle is formed thinner than the cross section of the nozzle, and is formed by accommodating and holding the liquid in the flow tube or the photometric container.
前記流管の上下方向の長さの範囲内で前記吸引した液量に応じた適切な光路長(例えば透過光や散乱光の場合)を設定することができ、照射端および受光端を溶液と接触させることなく測定用光を照射しかつ受光することができる。したがって、受光端、照射端と溶液との接触によるクロスコンタミネーションを防止して信頼性が高く、かつ容器のサイズによって光路長が固定されることなく、液量に応じた適切な光路長を設定することができて種々の液量に応じた物理化学的性質または数値(例えば、吸光度)を測定することができるので汎用性が高い。 An appropriate optical path length (for example, in the case of transmitted light or scattered light) can be set according to the amount of the sucked liquid within the range of the length in the vertical direction of the flow tube, and the irradiation end and the light receiving end can be regarded as a solution. The measurement light can be irradiated and received without contact. Therefore, it is highly reliable by preventing cross-contamination due to contact between the light receiving end and the irradiation end and the solution, and the optical path length is not fixed by the size of the container, and an appropriate optical path length is set according to the amount of liquid. It is highly versatile because it can measure physicochemical properties or numerical values (for example, absorbance) according to various liquid volumes.
さらに、定量性の高い吸引吐出機構および制御部を用いることで、光路長を精度良く確定しかつ安定させて、信頼性の高い測定を行うことができることになる。
また、複数のノズルを用いることで、複数の化学物質溶液の性質または数値を並行して測定することが可能であるとともに、1の化学物質溶液に対して種々の性質または数値を順次測定することが可能であり、効率性が高い。
Further, by using a highly quantitative suction / discharge mechanism and a control unit, the optical path length can be accurately determined and stabilized, and highly reliable measurement can be performed.
Further, by using a plurality of nozzles, it is possible to measure the properties or numerical values of a plurality of chemical substance solutions in parallel, and to sequentially measure various properties or numerical values for one chemical substance solution. Is possible and highly efficient.
第6の発明または第13の発明によれば、複数対の照射端組および受光端組と、1または複数種類の励起光または白色光を出射可能な1または複数の光源および該当する1または複数種類の蛍光のバンドパスフィルタを介しての1または複数の光電変換部または分光光度計との接続および遮断とを、選択した1対の各照射端組および受光端組ごとに連動して行うことを可能にして、目的物質を含む複数種類の生成物または化学物質溶液についての1または複数種類の蛍光物質で標識化された目的物質の有無または量を、または吸光度を用いて目的物質の有無または量を、1の対選択連動切換装置や工程によって、容易かつ効率良く、種々のキャピラリー電気泳動法に対応することができて汎用性が高い。 According to the sixth or thirteenth invention, a plurality of pairs of irradiation end set and light receiving end set, one or more light sources capable of emitting one or more kinds of excitation light or white light, and one or more applicable light sources. Connecting and blocking with one or more photoelectric converters or spectrophotometers via a type of fluorescence bandpass filter is performed in conjunction with each selected pair of irradiated end sets and light receiving end sets. The presence or absence or amount of the target substance labeled with one or more fluorescent substances for multiple product or chemical solutions containing the target substance, or the presence or absence of the target substance using absorbance. It is highly versatile because it can easily and efficiently correspond to various capillary electrophoresis methods by using a pair selection interlocking switching device or process of 1.
第7の発明または第14の発明によれば、第2のピッチで配列された複数の可動液収容部からなる可動液収容部群が、1群または複数群(例えば、該配列方向に直交する方向に間隔を空けて配列される)が可変ピッチ液収容架台に設けられ、その1群に電気泳動前処理部で生成した電気泳動用試料を収容し、該可変ピッチ液収容架台を、電気泳動部に移動し、かつ第3のピッチで配列された複数列の電気泳動用キャピラリーの一端部を前記1群の可動液収容部群に属する各可動液収容部に確実に挿入しかつ接触させる位置に移動させることができる。したがって、人手を介することなく、電気泳動部における処理を確実、円滑かつ迅速に実行することができることになる。また、他の可動液収容部群について、前記第2のピッチで配列された各可動液収容部を前記各収容部群のある収容部列の列方向に揃えて位置させた後、該架台を第1のピッチごとに移動することで各収容部群に属する収容部列間でノズルに装着された流管を用いて液の移動を行うことが可能となる。したがって、前記ノズルヘッドの移動機構や、横断ヘッドを用いることなく、前記可変ピッチ液収容架台の移動により、同一の収容部群の第1のピッチで行方向に配列された収容部列間での液体の移動を簡単な機構で装置規模を拡大することなく、効率良く行うことができる。 According to the seventh invention or the fourteenth invention, the movable liquid storage unit group consisting of the plurality of movable liquid storage parts arranged at the second pitch is one group or a plurality of groups (for example, orthogonal to the arrangement direction). (Arranged at intervals in the direction) is provided on the variable pitch liquid accommodating pedestal, and the electrophoresis sample produced by the electrophoresis pretreatment unit is accommodated in one group thereof, and the variable pitch liquid accommodating pedestal is electrophoresed. A position where one end of a plurality of rows of electrophoresis capillaries arranged at a third pitch is securely inserted and brought into contact with each of the movable fluid accommodating portions belonging to the first group of movable fluid accommodating portions. Can be moved to. Therefore, the process in the electrophoresis unit can be reliably, smoothly, and quickly executed without human intervention. Further, with respect to the other movable liquid accommodating portions, the movable liquid accommodating portions arranged at the second pitch are aligned in the row direction of a certain accommodating portion row of each accommodating portion group, and then the gantry is placed. By moving at each first pitch, it becomes possible to move the liquid between the accommodation unit rows belonging to each accommodation unit group using the flow pipe attached to the nozzle. Therefore, by moving the variable-pitch liquid accommodating pedestal without using the nozzle head moving mechanism or the crossing head, the accommodating portions arranged in the row direction at the first pitch of the same accommodating portion group can be moved. The liquid can be moved efficiently with a simple mechanism without expanding the scale of the device.
図1に基づいて、本発明の実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置10を説明する。
該電気泳動全自動処理装置10は、ゲルが充填された複数本(n本)の電気泳動用キャピラリーを有し、該キャピラリー内に対して、電圧を印加して目的物質を該キャピラリー内で泳動可能とする電気泳動部5と、複数種類のサンプルからの前記目的物質の抽出処理、該目的物質の加工処理(例えば目的核酸の断片の生成および増幅処理)、および各処理における生成物または化学物質の品質評価を経て得られた複数種類の電気泳動用試料(例えば、前記断片を含む複数種類の電気泳動用試料)を、前記電気泳動部に供給する電気泳動前処理部3,4と、前記電気泳動部5の前記各キャピラリー内での光の測定および前記電気泳動前処理部の各処理における前記品質評価のための光の測定からなるグループの中から選択して、任意の少なくとも1の測定を実行可能とする光選択測定部8と、前記サンプルからの前記目的物質の抽出処理、該目的物質の加工処理(例えば、目的核酸の断片の生成および増幅処理)、前記目的物質の電気泳動を用いた解析処理(例えば、目的核酸の塩基配列の解析処理)、および各処理における生成物または前記化学物質溶液の品質評価を制御する制御部としてのCPU+プログラム+メモリ9と、該CPU+プログラム+メモリ9に対するユーザの指示等の操作を行うタッチ式タブレット、キーボード、スイッチ等の操作パネル94とを有する。
The fully automatic
The electrophoresis fully
前記電気泳動前処理部3,4は、1または2種類以上の化学物質溶液、各種試薬を収容する液収容部、(分注用)流管21〜2n,21〜2n、微小量(分注用)流管(例えば、測光用流管を兼ねる)、穿孔用チップ等を収容する流管収容部および温度制御可能な1または2以上の反応容器を含有する収容部列が、Y軸方向(列方向)に沿って延び、かつX軸方向(行方向)に沿って前記第1のピッチの間隔で2列に渡って配列された前記収容部列を各々有し、かつX軸方向(行方向)に沿って第2のピッチ(第1のピッチの2倍)で配列された複数の収容部群31〜3nを有するステージ3と、気体の吸引吐出を行う吸引吐出機構41、該吸引吐出機構41と連通し、第1のピッチでX軸方向に沿って配列され、第2のピッチで1つおきに交互に配列された2つのノズル群41〜4n,4'1〜4'nに各々属する複数のノズル、および該複数のノズルが支持されたノズル支持体44を有するノズルヘッド4と、該複数のノズルを前記ステージ3に対して相対的に移動可能とするノズル移動機構(ノズルヘッド移動機構49およびノズルZ軸移動部42)とを有する。したがって、1の各収容部群31〜3nに、2つのノズル群の各1のノズルが対応している。
The
測定対象となる化学物質溶液としては、例えば、目的物質が核酸の場合には核酸溶液であり、各種試薬としては、例えば、核酸抽出用試薬、核酸増幅用試薬、リアルタイムPCR用試薬、標識化物質、磁性粒子を含む各種担体懸濁液である。前記流管21〜2n,21〜2nは(例えば、図13(a)参照)、下端に液体の吸引吐出が可能で前記収容部群の各収容部内または反応容器(測光用容器を含む)内に一斉に挿入可能な口部2a、上端に前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nに着脱可能に装着される装着用開口部2bを有し、該流管として、分注に用いる分注用流管(分注チップ)と測光に用いる測光用流管とを有する場合と、両者を一種類の流管で兼用する場合がある。
The chemical substance solution to be measured is, for example, a nucleic acid solution when the target substance is nucleic acid, and various reagents include, for example, a reagent for nucleic acid extraction, a reagent for nucleic acid amplification, a reagent for real-time PCR, and a labeling substance. , Various carrier suspensions containing magnetic particles. The
前記ステージ3の前記各収容部群31〜3nには、サンプル(後述する場合では、サンプル領域にある収容部35に収容)、前記1または2種類以上の前記化学物質溶液、各種試薬等が収容されている液収容部331〜33n、分注チップとして用いる分注用流管、また測光を行う測光用流管または微小量分注用流管、および穿孔用チップが前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nに装着可能となるように前記装着用開口部2bを上側にして収容されている収容部群311〜31n、温度制御が可能な反応容器321〜32n,32'1〜32'n(測光用容器を含む)、および温度制御の際に反応容器を密閉する密閉蓋収容部341〜34nが、この例では、各収容部群ごと2列に渡って配列されている。なお、これらの密閉蓋34は、反応容器装着後に前記穿孔用チップによって穿孔可能に設けられている。該ステージ3には、温度制御を行うペルチェ素子やヒートブロック等を有する温度昇降器39が設けられている。
In each of the
なお、以下、説明を簡単にするために、符号61,63を照射端組、符号71,73,75を受光端組とする(これらについて、照射端組と受光端組を入れ変えることは可能である)。これらは、光測定の対象となる反応容器(測光用容器を含有する)、後述する測光領域38の受光端組75が設けられている各収容部群31〜3nの1列目の収容部列に対応するノズル群41〜4nに設けられ、各収容部群31〜3nの2列目の収容部列に対応するノズル群4'1〜4'nには設けられていないとする。すると、前記光選択測定部8は、少なくとも1の(測光用)流管21〜2n、前記反応容器321〜32n(測光用容器を含む)、電気泳動用キャピラリーまたは泳動後収容部に対して、前記1または2種類以上の測定用光を照射可能な2以上の照射端611〜61n,631〜63nからなる2組の照射端組61,63、および該照射端611〜61n,631〜63nからの光を受光可能な2以上の受光端711〜71n,731〜73n,751〜75n,771〜77nからなる4組の受光端組71,73,75,77と、前記制御部(9)による目的物質の電気泳動を用いた解析処理または品質評価の指示があった場合に、前記複数組の照射端組の中から1組の照射端組を選択して所定の測定用光を順次供給し、前記複数組の受光端組の中から1組の受光端組を選択して1対の照射受光対とし、受光した光の強度を順次測定する照射受光対選択測定部80を有する。
Hereinafter, in order to simplify the explanation, reference numerals 61 and 63 are used as irradiation end sets and reference numerals 71, 73 and 75 are used as light receiving end sets (for these, the irradiation end set and the light receiving end set can be interchanged). Is). These are the reaction vessels (including the photometric container) to be measured by light, and the accommodations in the first row of each accommodation group 3 1 to 3 n provided with the light receiving end set 75 of the photometric region 38 described later. parts provided in the
ここで、照射端組61の各照射端611〜61nは前記ノズル41〜4nまたは吸引吐出機構441〜44nに設けられ、照射端組63の各照射端631〜63nは、前記電気泳動用キャピラリーに設けられ、前記受光端組71の各受光端711〜71nは前記ノズル41〜4nまたは吸引吐出機構441〜44nに設けられ、前記受光端組73の各受光端731〜73nは、前記電気泳動用キャピラリーまたは泳動後収容部に設けられ、前記受光端組75は、前記ステージ3の測光領域38に設けられ,各受光端751〜75nは、前記収容部群31〜3nの配列に応じた間隔で配列されている。前記受光端組77の各受光端771〜77nは測光用容器(321〜32n)の底部に設けられている。
Here, the irradiation ends 61 1 to 61 n of the irradiation end assembly 61 are provided in the
したがって、5対の照射端組および受光端組(61,71),(61,75),(61,77),(63,73)が形成される。なお、2対の照射端組および受光端組(61,75),(61,77)の場合、前記照射端611〜61nと受光端751〜75nまたは受光端771〜77nとの対は、前記ノズル41〜4nに装着された前記流管21〜2nの前記口部2aと前記装着用開口部2bを共通に通る垂直共通軸線上にあることが好ましい。また、前記測光用容器(321〜32n)には、前記化学物質溶液等を収容可能で前記測定用光に対して透光性のある透光領域が形成された底部を有する。なお、この例では、照射端組61は、前記「照射端組および受光端組の一方の第1組」に相当し、照射端組63は前記「照射端組および受光端組の一方の第2組」に相当し、受光端組71は、前記「照射端組および受光端組」の他方の第1組に相当し、受光端組73は、前記「照射端組および受光端組の他方の第2組」に相当し、受光端組75または受光端組77は、前記「照射端組および受光端組の他方の第3組」に相当する。
Therefore, five pairs of irradiation end sets and light receiving end sets (61,71), (61,75), (61,77), (63,73) are formed. In the case of two pairs of irradiation end sets and light receiving end sets (61, 75) and (61, 77), the irradiation ends 61 1 to 61 n and the light receiving ends 75 1 to 75 n or the light receiving ends 77 1 to 77 n. The pair with is preferably on a vertical common axis that commonly passes through the
前記照射受光対選択測定部80は、前記制御部(9)の前記指示に基づいて選択された所定の測定用光を出射する光源84と、受光した光を電気信号に変換する光電変換部83と、前記制御部(9)の指示に基づいて複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から、1対の照射端組および受光端組を選択し、選択された1または2以上の光源84と選択された前記照射端組に属する照射端との間の接続または遮断と、選択された1または2以上の前記光電変換部83と選択された前記受光端組に属する受光端との間の接続または遮断とを、対応する該照射端と受光端(照射受光対)毎に連動して切り換える対選択連動切換部81とを有する。
The irradiation / light receiving pair
さらに、該照射受光対選択測定部80は、前記一端部が前記照射端組61,63に属する1の照射端611〜61n,631〜63nを各々有する複数の導光路161,163の各他端部が各々有する照射接続端621〜62n,641〜64nが前記複数個属する照射接続端組62,64および、前記一端部が前記受光端組71,73,75,77の複数の受光端711〜71n,731〜73n,751〜75n,771〜77nを有する複数の導光路171,173,175,177の各他端部が各々有する受光接続端721〜72n,741〜74n,761〜76n,781〜78nが複数個属する受光接続端組72,74,76,78が、各々複数組あって、各同一の組に属する前記照射接続端または受光接続端が所定方向(例えば、行方向)に沿って1列状に所定間隔で配列され、異なる組に属する対となり得る照射接続端または受光接続端同士は前記所定方向に直交する方向(例えば、列方向)に沿って対間隔を開けて並列に配列されている接続端配列面を有する複数対接続端組配列体82をさらに有する。
Further, the irradiation light receiving pair
複数の光源として、例えば、複数種類の特定波長光源を有する場合があり、または各特定波長に設定された複数の波長可変光源を用いる。複数の光電変換部としては、複数種類の特定波長の光に対応するバンドパスフィルタを介した複数の光電変換部を設ける場合や、分光計を介して、各波長に対応して光電変換部を設ける場合がある。 As the plurality of light sources, for example, there are cases where a plurality of types of specific wavelength light sources are provided, or a plurality of tunable wavelength light sources set for each specific wavelength are used. As the plurality of photoelectric conversion units, a case where a plurality of photoelectric conversion units are provided via a bandpass filter corresponding to a plurality of types of light of a specific wavelength, or a photoelectric conversion unit is provided corresponding to each wavelength via a spectroscope. It may be provided.
前記ノズルヘッド4には、さらに前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nを一斉に該ノズルヘッド4に対してZ軸方向に沿って移動させるノズルZ軸移動部42と、前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nに装着された前記流管21〜2n,21〜2n内に磁力を及ぼすことが可能な磁力機構43と、前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nから前記流管21〜2n,21〜2nを一斉に脱着可能とする脱着機構45とが設けられている。ここで、前記ノズル41〜4n,4'1〜4'nをZ軸方向に移動可能な前記ノズルZ軸移動部42と前記ノズルヘッド移動機構49とを合わせたものが前記ノズル移動機構49,42に相当する。
Wherein the
該ノズルヘッド4には、さらに、前記全収容部群31〜3nをX軸方向に沿って横断するように前記ステージ3またはノズルヘッド4に対して前記相対的に移動可能であって、前記各収容部群31〜3nの前記反応容器または前記液収容部に挿入可能な先端部を通して液体の吸引および吐出を行う1の分注チップ20が着脱可能に装着された横断ヘッド46および該横断ヘッド46をX軸方向に沿って移動させる横断ヘッド移動機構47を有する。また、該全収容部群31〜3n外に設けられ該横断ヘッド46に着脱可能に装着される複数の分注チップ20を収容するチップ収容部を少なくとも有する共通収容領域30が該ステージ3に設けられる。
The
該共通収容領域30には、その他、前記全収容部群31〜3nの反応容器に供給されるべきサンプルと無関係な共通の種々の試薬等の液、例えば、目的物質が目的核酸である場合には、リアルタイムPCRのための温度管理が必要な酵素、標識化に用いるためのプライマー、プローブ等、または、大量に用いられる水、バッファ等を収容する液収容部が設けられている。これによって、全収容部群31〜3nの規模を縮小することができる。さらに、本実施の形態に係る装置10にあっては、前記電気泳動部5と電気泳動前処理部3,4との間で移動可能に設けられ、各々1列状にX軸方向に沿って所定ピッチで配列された複数(n個)の可動液収容部からなる2群の可動液収容部群361〜36n,36'1〜36'nがY軸方向に間隔を開けて並列に設けられた可変ピッチ液収容架台36と、該可変ピッチ液収容架台36をX軸方向に沿って前記電気泳動部5と電気泳動前処理部3,4との間を移動可能に設けた架台移動部37とを有し、前記可変ピッチ液収容架台36には、前記所定ピッチを、前記第2のピッチと前記電気泳動部5の前記複数本の電気泳動用キャピラリーのX軸方向に沿って配列された第3のピッチとの間で変換可能とするピッチ変換機構が設けられている。
The said
前記CPU+プログラム+メモリ9には、前記ノズル移動機構(49,42)、前記吸引吐出機構41、前記磁力機構43、温度昇降器39に対して抽出または反応の指示を行う抽出・反応制御部91と、前記電気泳動部5に対する制御を行う電気泳動制御部95、前指定された測光内容に基づいて、前記ノズル移動機構49,42、前記吸引吐出機構41、光選択測定部8に対して前記測光内容に関する制御を行う測光制御部92と、前記光選択測定部8から得られた生成物、化学物質または標識物質に関する透過光、散乱光、または発光、呈色、変色若しくは変光に係る光の強度に基づいて、前記目的物質の電気泳動を用いた解析、品質評価を行う測光解析部93とを有する。
In the CPU + program + memory 9, the extraction / reaction control unit 91 that instructs the nozzle moving mechanism (49, 42), the suction /
続いて、図2乃至図13に基づいて、図1で説明した本発明の実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置10をより具体的に示す。目的物質として目的核酸を使用する場合の電気泳動全自動処理装置100を説明する。
Subsequently, based on FIGS. 2 to 13, the fully automatic
図2に示すように、本電気泳動全自動処理装置100は、1または2種類以上の化学物質溶液、各種試薬、分注用流管21〜2n,21〜2n、穿孔用チップ231〜23n等、密閉蓋34を収容する1または2以上の収容部、または温度制御可能で前記測光内容により定まる測定用光に対して透光性のある透光領域が形成された底部を有する測光用容器を含む2以上の反応容器がY軸方向(列方向)に沿って延び、かつX軸方向(行方向)に沿って前記第1のピッチの間隔で2列に渡って配列された前記収容部列を各々有し、かつX軸方向(行方向)に沿って第2のピッチ(この例では、第1のピッチの2倍)の間隔で配列された複数(この例では6個)の収容部群31〜36をカートリッジ容器として装填可能な装填用の孔部が設けられたステージ3と、気体の吸引吐出を行う吸引吐出機構41、該吸引吐出機構41と連通し、各ノズルが第1のピッチでX軸方向に沿って配列され、各々第2のピッチで1つおきに交互に配列された2群のノズル群41〜46,4'1〜4'6(収容部群と同じ添え数字をもつノズルは同一の添え数字をもつ収容部群に対応している。)を有するノズルヘッド4と、該ノズルヘッド4と前記ステージ3との間を相対的にY軸方向に沿って移動可能とするノズルヘッド移動機構(図示せず)と、前記光選択測定部8(図6、図7、図8に示す)と、2列状に行方向(X軸方向)に沿って可変ピッチで配列された複数(この例では6個)の可動収容部を各々有する2群の可動液収容部群361〜366,36'1〜36'6が設けられた可変ピッチ液収容架台36および該架台36を行方向に沿って移動可能とする架台移動部37と、Z軸方向に湾曲するようにX軸方向に沿って第3のピッチで配列され、ゲルが充填された複数本(この例では、6本)の電気泳動用キャピラリー511〜516を有し、複数種類の塩基配列の解析を行う目的核酸から生成した断片を含む電気泳動用試料に電圧を印加し て該キャピラリー511〜516内を泳動可能とする電気泳動部5とを有する。なお、前記可変ピッチ液収容架台36は、前記第3のピッチと第2のピッチとの間でピッチ変換を可能とするピッチ変換機構を有する。
As shown in FIG. 2, the electrophoretic fully
前記ノズルヘッド4には、さらに、前記下端に液体吸引吐出が可能で前記収容部内に挿入可能な口部2a、上端に前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nに着脱可能に装着される装着用開口部2bを有する2n本(この例では12本)の流管21〜2n,21〜2nと、該ノズル41〜4n,4'1〜4'nを前記ステージ3に対して一斉にZ軸方向に沿って移動可能とするノズルZ軸移動部42と、前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nに装着された流管21〜2n,21〜2nの内部に一斉に磁力を及ぼしかつ除去することが可能となるように前記流管21〜2n,21〜2nに対して磁石を進退動作可能に設けた磁力機構43と、前記ノズル群41〜4n,4'1〜4'nに装着された流管21〜2n,21〜2nをノズルから脱着することが可能な脱着機構45とが設けられている。ここで、前記ノズルZ軸移動部42とノズルヘッド移動機構49(図示せず)を合わせたものが前記ノズル移動機構に相当する。
Wherein the
なお、本実施の形態にあっては、前記ノズル群4'1〜4'6は、ノズル群41〜46と同様に、流管21〜26が装着され、従って吸引吐出機構41が搭載されているが、後述する1対の照射端組および受光端組(61,71)は設けられていない点で異なる。該ノズル群4'1〜4'6に対応する収容部列には光測定が行われる反応容器等が設けられていないからである。
Incidentally, in the present embodiment, the
該ノズルヘッド4は、該ノズルヘッド移動機構49によってY軸方向に移動可能なY軸移動体425に支持されている。前記ノズルヘッド移動機構49は、該電気泳動全自動処理装置100の基板13に設けられたY軸方向に敷設されたレール、Y軸方向に沿ってロータに掛け渡されたタイミングベルトを有し、前記Y軸移動体425は該タイミングベルトと連結し、該タイミングベルトによってY軸方向に移動可能となる。
The
図2、図3、図6または図7に示すように、該ノズルヘッド4の前記Y軸移動体425はそのX軸方向に延びる梁425aに設けられたモータ421と、該モータ421によって回転駆動される下方向に延びるように設けられたボール螺子422(図7参照)と、該ボール螺子422の回転によって、該ボール螺子422と螺合するナット部(図示せず)に取り付けられたZ軸移動体(前記ノズル支持体)44と、前記Y軸移動体425に設けられZ軸方向に沿って敷設された案内用レール(図示せず)が設けられている。
As shown in FIGS. 2, 3, 6 or 7, the Y-
図2、図3、図6または図7に示すように、前記ノズルヘッド4の前記吸引吐出機構41は、前記Z軸移動体(前記ノズル支持体)44に支持された気体の吸引吐出用モータ411、該モータ411により回転駆動されるカップリング412を介して連結されたボール螺子と、該ボール螺子と螺合するナット部と連結して上下動可能なプランジャ駆動板413(図6参照)と、該プランジャ駆動板413と係合して複数(この例では6本)のシリンダ416内を摺動する複数(この例では、6本)のプランジャ414とを有する。なお、該プランジャ414はシリンダ416内に設けられたコイル状のばねが巻装されていて前記シリンダ416に対して常に下方向に付勢されている。
As shown in FIGS. 2, 3, 6 or 7, the suction /
図2、図3、図6または図7に示すように、前記複数本のシリンダ416は、前記Z軸移動体44に取り付けられたシリンダ支持部材415にその上端で支持され、下方に延びその下端で前記Z軸移動体44に取り付けられたノズル支持部材417に取り付けられている。該ノズル支持部材417の下側にノズル群41〜46,4'1〜4'6のノズルが交互に配列され、かつ該ノズル支持部材417に対して移動可能に脱着部材452が設けられている。
As shown in FIGS. 2, 3, 6 or 7, the plurality of
図2、図3、図6または図7に示すように、前記ノズルヘッド4には、前記ノズル群41〜46,4'1〜4'6に装着された流管21〜26,21〜26を脱着するための脱着機構45を有し、該脱着機構45は前記脱着部材452を有し、該脱着部材452は前記ノズル群41〜46,4'1〜4'6の各ノズルの外径よりも大きいが、該ノズル群41〜46,4'1〜4'6nに装着される流管の外径よりも小さい内径をもち内部を前記各ノズルが貫通する脱着用の孔または隙間が形成されている。前記ノズル支持部材417の両端を通り、前記脱着部材452の両端に取り付けられたばね453を通り、下側が前記脱着部材452に固定され、上端が前記シリンダ支持部材415を貫通してその上側に達するが、前記プランジャ駆動板413の下側に所定距離を空けて位置する2本のポール451と、該ポール451の周囲を螺旋状に巻き付きその上端が該ポール451に取り付けられ、その下端がシリンダ支持部材415に取り付けられたばね453とを有する。前記プランジャ駆動板413が吸引吐出のための高さ位置よりも低い位置に移動させることで前記脱着部材452を下方向に移動させて前記流管の脱着を行う。前記プランジャ駆動板413を吸引吐出の高さ位置に戻せば、前記ばね453によって前記脱着部材452を元の位置にまで後退させる。
2, 3, 6 or 7, wherein the
図2、図3、または図6に示すように、該ノズルヘッド4には、さらに、横断ヘッド46と、該横断ヘッドをX軸方向(行方向)に沿って移動させる横断ヘッド移動機構47が設けられている。したがって、横断ヘッド46自体はノズルヘッド4とともにY軸方向に移動可能である。横断ヘッド46は、ノズル461が支持されたノズル支持部材462と、該ノズル支持部材462上に設けられ前記ノズル461と連通するシリンダ466と、前記シリンダ466内を摺動するプランジャを上下方向に駆動するモータ464と、該プランジャを駆動するプランジャ駆動板467と、該プランジャ駆動板467の下側に所定距離を空けて位置する2本のポール463と、該ポール463の周囲を螺旋状に巻き付きその上端が該ポール463に取り付けられたばねとを有する。前記プランジャ駆動板467が吸引吐出のための高さ位置よりも低い位置で移動させることで脱着部材465を下方向に移動させて分注チップ20の脱着を行う。前記プランジャ駆動板467を吸引吐出の高さ位置に戻せば、前記ばねによって前記脱着部材465を元の位置にまで後退させる。なお、符号464は、吸引吐出のための前記プランジャを駆動するモータである。
As shown in FIG. 2, FIG. 3, or FIG. 6, the
該横断ヘッド46は、横断ヘッド移動機構47によって、X軸方向およびZ軸方向に移動可能に設けられている。該横断ヘッド移動機構47は、前記横断ヘッド46をZ軸方向に移動可能に取り付けたX軸移動体475と、該X軸移動体475をX軸方向に移動可能に支持するX軸移動体支持板473と、該X軸移動体支持板473に設けられ前記X軸移動体475と連結したタイミングベルト474と、該タイミングベルト474が架け渡されたプーリ474a,474bとを有する。前記X軸移動体475は、モータ472と、該モータ472によって回転駆動されるボール螺子476と、該ボール螺子476と螺合し前記横断ヘッド46が取り付けられたナット部とを有するものである。
The crossing
図2、図3、図5または図6に示すように、本電気泳動全自動処理装置100には、さらに、前記可変ピッチ液収容架台36および該可変ピッチ液収容架台36を前記キャピラリー電気泳動部5と電気泳動前処理部3,4との間で移動可能とする架台移動部37が設けられている。
該可変ピッチ液収容架台36は、1列状に行方向(X軸方向)に沿って前記可変ピッチで配列された複数(この例では6個)の可動液収容部361〜366を有する第1の可動液収容部群および該第1の可動液収容部群と列方向(Y軸方向)に間隔を開けて設けられ前記第2のピッチで配列された複数(この例では6個)の可動液収容部36'1〜36'6を有する第2の可動液収容部群と、前記可変ピッチを、前記収容部群31〜36の第2のピッチから前記キャピラリー電気泳動部5に設けられた前記電気泳動用キャピラリー511〜516の第3のピッチに変換可能なピッチ変換機構とを有するものである。
As shown in FIGS. 2, 3, 5 or 6, the electrophoresis fully
The variable pitch
該ピッチ変換機構は、架台本体361と、該架台本体361にX軸方向に沿って横設された案内用レール361aと、該案内用レール361aにX軸方向に沿って摺動可能に案内され、前記各可動液収容部群361〜366,36'1〜36'6の各群の対となる2個の可動液収容部が上端に設けられた並列に配列された6枚の支持プレート3651〜3656と、隣接する支持プレート間を連結する6本のリンク3661〜3666と、を有する。
The pitch conversion mechanism is slidably guided by the gantry
前記支持プレート3651は前記架台本体361に固定され、前記案内用レール361aは、前記支持プレート3651に一端が支持され、他端は前記架台本体に設けられた側板361cに支持されている。隣接する前記支持プレート3651〜3656は、6本のリンク3661〜3666を介して所定の節点で回り対偶で結合されている。さらに、6枚の支持プレート3651〜3656の内、端の前記支持プレート3656を除く5枚の支持プレート3651〜3655を前記X軸方向に移動させるためのタイミングベルト364、および該タイミングベルト364が架け渡されたプーリ363a,363b、プーリ363aを回転駆動するモータ363が前記架台本体361に設けられている。前記他端の支持プレート3651は前記タイミングベルト364と結合している。
The support plate 365 1 is fixed to the gantry
さらに、図2または図3または図6に示すように、前記架台移動部37は、前記架台本体361を、X軸方向に沿って、前記電気泳動前処理部3,4から電気泳動部5に移動するためのもので、前記可変ピッチ液収容架台36の前記可動液収容部361〜366,36'1〜36'6が設けられた支持プレート3651〜3656が摺動可能に収容された支持プレート収容部374と、前記架台本体361をX軸方向に沿って移動可能とするために該架台本体361に設けられた連結部362と連結するタイミングベルト372と、該タイミングベルト372が架け渡された第1のプーリ372aおよびモータ371によって回転駆動される第2のプーリ(図示せず)と、該可変ピッチ液収容架台36および架台移動部37を組み込んだ枠体373とを有する。
Further, as shown in FIG. 2 or FIG. 3 or FIG. 6, the
続いて、図4に基づいて、本発明の実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置100のステージ3を説明する。
該ステージ3は、プレート状に形成され、複数(この例では12)列の前記収容部群31〜3n(各収容部群は2列からなり、n=6)が、列方向(Y軸方向)に沿ってカートリッジ容器として配列されている。各収容部群31〜3nは、定量PCRおよびサンガー法シーケンス反応が行われる反応領域32と、DNAの抽出、抽出液を収容する領域33、流管(2種類の分注用流管21〜26,21〜26,221〜226、(測光用)微小量分注用流管211〜216、穿孔用チップ231〜236,231〜236)が収容される流管収容領域31、サンプルが収容されるサンプル領域35、および前述した電気泳動用試料等が収容される可変ピッチ液収容架台36を有する。
Subsequently, the
The
前記反応領域32には、反応容器3211〜3216、測光が可能な反応容器3221〜3226、反応容器3211〜3216,3221〜3226の開口部を密閉可能な密閉蓋34を収容部する収容部341〜346が設けられている。なお、該密閉蓋34は、前記穿孔用チップ231〜236,231〜236または穿孔用部材123によって、穿孔可能に設けられている。
In the
前記DNA抽出領域33には、サンプルから目的とする核酸を抽出するための抽出用試薬、磁性粒子懸濁液等を収容するカートリッジ容器332、サンプルからの抽出液を収容する抽出液チューブ331を有している。サンプル領域35には、例えば採血管351や1.5mlチューブ352が設けられている。
The
続いて、図2、図3、図6、および図7に基づいて、本発明の実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置100の電気泳動部5について説明する。
Subsequently, the
該キャピラリー電気泳動部5には、内部にゲルが充填された複数本(この例では6本)の電気泳動用キャピラリー511〜516と、各該キャピラリー511〜516の一端部が挿入され、前記可変ピッチ液収容架台36に設けられて前記電気泳動前処理部3,4からX軸方向に移動して、前記第2のピッチから変換された第3のピッチで配列された6個の第1の可動液収容部群の可動液収容部361〜366と、各該キャピラリー511〜516の他端部が挿入されるべき泳動後収容部(図示せず)と、前記キャピラリー511〜516を前記一端部側において第3のピッチで保持する該キャピラリーホルダー52と、該キャピラリー511〜516を前記他端部側において保持するとともに、該キャピラリー511〜516の外側壁に近接または接触して設けた一対の照射端組および受光端組(63,73)を有するキャピラリーホルダー53と、前記キャピラリーホルダー52に保持されて前記可動液収容部361〜366内に挿入可能に設けた負電極541〜546と、前記キャピラリーホルダー53に保持されて前記泳動後収容部(図示せず)内に挿入可能に設けた正電極55とを有する。なお、前記電気泳動用キャピラリー511〜516の一端部および前記負電極541〜546は、前記可変ピッチ液収容架台36が、前記キャピラリー電気泳動部5に移動した後、一端部昇降機構(図示せず)により、前記キャピラリー511〜516の各一端部を下降させることによって第1の可動液収容部群の各可動液収容部361〜366内に挿入され、該一端部昇降機構によって該一端部を上昇させて、可動液収容部から抜出した後に該可変ピッチ液収容架台36が移動されることになる。
The said
続いて、図7、図8、図9に基づいて、本実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置100の光測定系について詳細に説明する。
Subsequently, the optical measurement system of the fully automatic
図7は、本実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置100の光選択測定部8の内、該装置100の背面に搭載された照射受光対選択測定部80を示すものであり、該照射受光対選択測定部80は、選択された所定の測定用光を出射するオンオフ可能な光源84と、受光した光を電気信号に変換するオンオフ可能な光電変換部83と、複数対接続端組配列体82と、対選択連動切換部81とを有する。
FIG. 7 shows an irradiation light receiving pair
図7に示すように、該対選択連動切換部81は、測定端配列面813を有する複数対測定端組配列体811と、切換機構(814,815,816)とを有する。該切換機構には、前記ノズルヘッド4のY軸移動体425に取り付けられたプーリ815と、モータ816によって回転駆動されるプーリ(図示せず)と、該プーリ間にX軸方向に沿って掛け渡されたタイミングベルト814とを有し、該タイミングベルト814と連結した複数対接続端組配列体82が、X軸方向に沿って前記複数対測定端組配列体811に対して摺動可能に設けられている。
As shown in FIG. 7, the pair selection
図8(a)は、本実施の形態の第1の実施例に係る光選択測定部8の1対の照射端組および受光端組(61,71)の照射受光対(611,711)〜(616,716)の一部を示すものであって、ノズル群41〜46に設けられているものである。
図8(b)は、1対の照射端組および受光端組(63,73)の照射受光対(631,731)〜(636,736)を示すものであって、前記電気泳動用キャピラリー511〜516の測定部に設けられており、例えば、照射端と受光端が各キャピラリー511〜516を例えば、径方向に対向して挟むように、各キャピラリーの外壁面に対して同一半径方向に揃えてまたは所定角度をもって設けられる。
8 (a) is irradiated receiving pairs of first irradiation end sets of a pair of light-selecting
FIG. 8 (b), there is shown a radiation receiving pair of one-irradiation end set and light receiving end sets of (63, 73) (63 1, 73 1) to (63 6, 73 6), the electric is provided in the measuring unit of the
図8(c)は、前記複数組の照射端組61,63および複数組の受光端組71,73の中から対となる照射端組および受光端組(61,71),(63,73)のいずれかを選択して、選択した組に属する照射端および受光端の各対を各照射受光対とし、照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を順次測定する前記照射受光対選択測定部80を示すものである。
FIG. 8C shows a pair of irradiation end sets and light receiving end sets (61, 71), (63, 73) from the plurality of sets of irradiation end sets 61, 63 and the plurality of sets of light receiving end sets 71, 73. ) Is selected, each pair of the irradiation end and the light receiving end belonging to the selected set is used as each irradiation light receiving pair, and a predetermined measurement light is sequentially supplied to the irradiation end, and the light sequentially received by the light receiving end. It shows the irradiation light-receiving pair
図8(c)は、該照射受光対選択測定部80の複数対接続端組配列体82および前記対選択連動切換部81の前記複数対測定端組配列体811とを示すものである。
FIG. 8C shows the plurality of pairs of the paired connection end set
該複数対接続端組配列体82は、一端部が2組の前記照射端組61,63の各他端部が各々有する照射接続端621〜626,641〜646が前記複数個(この例では6個)属する2組の照射接続端組62,64および、前記一端部が前記受光端組71,73の複数の受光端711〜716,731〜736を有する複数の導光路としての光ファイバ171,173の各他端部が各々有する受光接続端が複数個(この例では6個)属する2組の受光接続端組72,74があって、各同一の組に属する前記照射接続端または受光接続端が行方向(X軸方向)に沿って1列状に所定間隔で配列され、対となり得る異なる組に属する照射接続端および受光接続端同士は前記行方向(X軸方向)に直交する方向(この例では列方向、すなわちY軸方向)に沿って対間隔を隔てて並列に配列されている接続端配列面を有する複数対接続端組配列体82と、対選択連動切換部81の前記複数対測定端組配列体811とを有するものである。なお、それらと対となり得ない異なる組に属する照射接続端および受光接続端同士は、前記行方向(X軸方向)に沿って所定間隔空けた位置または列方向(Y軸方向)に前記対間隔と異なる対間隔を開けて並列に配列可能である(図12参照)。
Plurality several pairs connecting
該複数対測定端組配列体811は、図8(c)に示すように、オンオフ可能な前記光源84と光学的に接続され、前記照射接続端組62,64の照射接続端621〜626,641〜646と順次接続可能に設けられた1または2以上の照射測定端841a〜841d,842a〜842dが各々設けられた複数組の照射測定端組841,842と、オンオフ可能な前記光電変換部83と光学的に接続され、前記受光接続端組72,74の受光接続端721〜726,741〜746と順次接続可能に設けられた1または2以上の受光測定端831a〜831d,832a〜832dが各々設けられた複数組の受光測定端組831,832が平行に所定方向(この例ではX軸方向)に沿って配列された測定端配列面813を有する(対応関係は、符号順)。ここで、対となり得る照射測定端組841および受光測定端組831は、対となり得る前記対間隔を開けて設けられた各照射測定端および受光測定端(841a,831a)〜(841d,831d)ごとの対測定端体に分割可能な対測定端組配列体8111を形成し、対となり得る照射測定端組842および受光測定端組832は、対となり得る照射測定端および受光測定端(842a,832a)〜(842d,832d)ごとの対測定端体に分割可能な対測定端組配列体8112を形成している。該対測定端組配列体8111,8112には、各々該当する光源84および光電変換部83が各対測定端体ごとに1対ずつ含まれている。
As shown in FIG. 8C, the plurality of pairs of measurement end sets 811 are optically connected to the
ここで、前記接続端配列面と前記測定端配列面813は向き合い前記所定方向(この例では行方向、すなわち、X軸方向)に沿って摺動するように切換機構(814,815,816)によって前記複数対接続端組配列体82を前記複数対測定端組配列体811に対して相対的に移動させる。すると、対として選択された照射接続端組および受光接続端組(62,72),(64,74)に属する各接続端対(621,721)〜(626,726)、(641,741)〜(646,746)と、選択されてオン状態にある光源84と接続する照射測定端組および選択されてオン状態にある光電変換部83と接続する受光測定端組からなる第1の測定端組の対(841,831)に属する各測定端対(841a,831a)〜(841d,831d)、または第2の測定端組の対(842,832)に属する各測定端対(842a,832a)〜(842d,832d)との、各対同士の接続および遮断を可能にして、これらと接続する照射端および受光端の対(照射受光対)ごとに、オン状態にある前記光源およびオン状態にある前記光電変換部との接続または遮断が連動して順次行われる。なお、第1の測定端組の対または第2の測定端組の対の一方が選択されて該当する光源および光電変換部はオン状態となっている場合には、他方は選択されていないので、該当する光源および光電変換部はオフ状態となっている。
Here, the switching mechanism (814,815,816) so that the connection end array surface and the measurement
ここで、前記照射端組61の各照射端611〜616は、qPCRの測定に用いられるものであるので、これらと複数対接続端組配列体82の照射接続端組62の照射接続端621〜626および前記複数対測定端組配列体811の前記照射測定端組841の照射測定端841a〜841dを介して接続する光源84としては、例えば、4色の励起光(例えば、波長496nm、波長527nm、波長555nm、波長587nm)を出射する4種類のLEDである。すると、選択されて対となる受光端組71の各受光端711〜716は、これらと複数対接続端組配列体82の受光接続端組72の受光接続端721〜726および複数対測定端組配列体811の前記受光測定端組831の受光測定端831a〜831dを介して接続する光電変換部83としては、4色の蛍光を受光するための波長517nmのバンドパスフィルタを介して接続された高感度フォトダイオード、波長549nmのバンドパスフィルタを介して接続された高感度フォトダイオード、波長580nmのバンドパスフィルタを介して接続された高感度フォトダイオード、および波長599nmのバンドパスフィルタを介して接続された高感度フォトダイオードである。これらは、各々、蛍光物質FAM, HEX, TAMURA, ROXに対応するものである。
Here, each of the irradiation end 61 1-61 6 irradiation end group 61, because those used to measure the qPCR, irradiation connection end of the irradiation connecting end assembly 62 of a plurality of pairs of connection
さらに、前記照射端組63の各照射端631〜636は、電気泳動用キャピラリー511〜516に関する測定に用いられるものであるので、これらと複数対接続端組配列体82の照射接続端組64の照射接続端641〜646および前記複数対測定端組配列体811の照射測定端組842の照射測定端842a〜842dを介して、例えば、4色の励起光を出射する4種類のLEDである。すると、選択されて対となる受光端組73の各受光端731〜736は、これらと複数対接続端組配列体82の受光接続端組741〜746および前記複数対測定端組配列体811の前記受光測定端組832の受光測定端832a〜832dを介して接続する該当する波長のバンドパスフィルタを介して接続された高感度フォトダイオードである。なお、前記複数対測定端組配列体811は、1対の照射測定端および受光測定端ごとに測定分割が可能となっていて、部分的に他の波長範囲をもつ光源および光電変換部と置き換えることが可能であり、汎用性がある。
Furthermore, the irradiation end 63 1-63 6 of the irradiation end group 63, because those used to measure relates to an
図9(a)は、本発明の実施の形態に係るノズル4n(n=1〜6)および該ノズル4nと連通する吸引吐出機構41nを示すものである。該ノズル4nは前記流管2nの装着用開口部2bが装着可能に設けられ前記流管2nと連通する。該ノズル4nは内部に中空部が形成され、その中心軸を通る中央に前記導光路としての光ファイバ161n,171nが設けられその先端が1対の照射端61nおよび受光端71nに相当し、その下側にレンズ1nがノズル4nの先端部の中央に周囲にノズル4nの先端開口部と連通する隙間を設けた状態で支持されている。該隙間は吸引吐出用流路416dおよび吸引吐出口416eを介してシリンダ416と連通し、かつ横孔416gを通じて圧力センサ416fと連通している。
FIG. 9A shows a nozzle 4 n (n = 1 to 6) according to the embodiment of the present invention and a suction /
該シリンダ416内には、内部に空洞を有するとともに、該空洞と摺動可能に設けられたプランジャ414を有する。該空洞には、小径領域416a、該小径領域416aよりも内径が大きい大径領域416b、小径領域416aと大径領域416bの間に設けられた遊動領域416cが設けられ、前記プランジャ414は、前記小径領域416aと摺動する細軸部414a、前記大径領域416bと摺動する太軸部414bとを有し、前記遊動領域416c内では前記太軸部414b(したがって、細軸部414aも)は摺動せずに移動可能である。これによって、1の各ノズル41〜4nと連通する1の各吸引吐出機構411〜41nによって、微小量および大量の双方の体積の液体の分注を可能とするものである。
The
図9(b)は、反応容器322の開口部に装着された密閉蓋34に装着して該密閉蓋34の透光性を有する穿孔可能な透光膜34aを介して反応容器内の光学的状態を測定する場合を示すものである。
FIG. 9B shows the optical inside of the reaction vessel via the perforable
続いて、図10に基づいて、本発明の実施の形態に係る電気泳動全自動処理装置100の動作について、目的物質としてイヌゲノムの解析を行う場合を説明する。
前記電気泳動全自動処理装置100のステージ3上に設けられたサンプル領域35に設けられた採血管には、6匹の異なるイヌから採取された全血が収容されている。該全血からイヌゲノムを抽出し、抽出したDNAの濃度を測定して、その品質評価を行い、さらにそのイヌゲノムの塩基配列の解析を行う場合について説明する。
Subsequently, based on FIG. 10, a case where the canine genome is analyzed as a target substance will be described with respect to the operation of the electrophoresis fully
The blood collection tube provided in the
そのため、前記サンプル領域35の液収容部には、イヌの全血を生理食塩水で希釈化した血清溶液を収容しておく。また、前記DNA抽出領域33の各液収容部には、抽出用試薬、洗浄液を予めプレパックされている。
ステップS1で、前記操作パネル94により、前記サンプルからのイヌゲノムの処理を指示する。
Therefore, a serum solution obtained by diluting whole dog blood with physiological saline is stored in the liquid storage portion of the
In step S1, the
ステップS2で、前記電気泳動全自動処理装置100のCPU+プログラム+メモリ9の前記抽出・反応制御部91は、前記ノズルヘッド移動機構49に支持して、前記ノズルヘッド4をY軸方向に移動して、前記流管収容領域31の収容されている穿孔用チップの上方にノズル群41〜46,4'1〜4'6を移動して、前記ノズルZ軸移動部42を用いて下降させることによって穿孔用チップ231〜236,231〜236を前記ノズル群41〜46,4'1〜4'6に装着し、前記ノズルヘッド移動機構49を用いて前記DNA抽出領域33の最初の液収容部の上方に前記穿孔用チップを位置させ前記ノズルZ軸移動部42によってノズルを下降させることで、前記液収容部の開口部を被覆するフィルムを穿孔し、同様にして、前記ノズルヘッド移動機構49によって、Y軸方向に移動させて他の液収容部および反応容器についても順次穿孔する。なお、前記DNA抽出領域33には、分離抽出用溶液を次のように収容する。例えば、第1の液収容部には、Lysis 1を40μ\ochL、第2の液収容部には、Lysis 2を200μ\ochL、第3の液収容部には、結合バッファ液を500μ\ochL、第4の液収容部には、磁性粒子懸濁液、第5の液収容部には、洗浄液1を700μ\ochL、第6の液収容部には、洗浄液2を700μ\ochL、第7の液収容部には解離液として蒸留水を50μ\ochL収容し、第8の液収容部には、前記タンパク質分離抽出用溶液の一部として、タンパク質の除去等に用いるイソプロピルアルコール(isopropanol)が収容されているものとする。これらは各収容部群31〜36の1列目の第1の収容部列(カートリッジ容器332)にのみ収容されている。
In step S2, the extraction / reaction control unit 91 of the CPU + program + memory 9 of the electrophoretic fully
次に、前記ノズルヘッド移動機構49によって再度Y軸方向に移動させて、前記流管収容領域31にまで移動させて、穿孔用チップを前記脱着機構45により脱着させ、再度ノズルヘッド移動機構49をY軸方向に移動させ、ノズル群41〜46,4'1〜4'6を前記ノズルZ軸移動部42により下降させて、各収容部群31〜36の内の流管収容領域31の第1列目の収容部列にのみ収容されている分注用流管221〜226を前記ノズル群41〜46のみに装着させる(図4に示すように、流管収容領域31では、ノズル群4'1〜4'6に対応する収容部内は空になっている)。
Next, the nozzle
次に、前記サンプルが収容されているサンプル領域35にまで移動した後、ノズルZ軸移動部42を用いて、流管221〜226の口部2aを下降挿入させて、前記吸引吐出機構41のプランジャ駆動板413を上昇および下降させることで該サンプル領域に収容されている全血の懸濁液について、吸引吐出を繰り返すことで該サンプルを液中に懸濁させた後、該サンプル懸濁液を流管221〜226内に吸引する。該サンプル検体懸濁液は前記ノズルヘッド移動機構49とによってY軸に沿って分離抽出用溶液としてのLysis 1 (酵素)が収容されている液収容部の第1の液収容部にまで移動させて、穿孔されたフィルムの孔を通して前記流管221〜226の口部2aを挿入して前記サンプル懸濁液と前記Lysis 1とを撹拌するため吸引吐出を繰り返す。
Then, after moving to the
次に、撹拌した該液の全量を前記流管221〜226によって吸引し、前記温度昇降器39によって55℃に設定された温度制御可能な反応容器に収容してインキュベーションを行う。これによって、前記サンプルに含まれるタンパク質を破壊して低分子化する。所定時間経過後、該反応液を前記反応容器に残したまま、前記流管221〜226を前記ノズルヘッド移動機構49および前記吸引吐出機構41を用いて前記第2の液収容部に収容されている液の全量を吸引し、前記ノズルヘッド移動機構49により前記流管221〜226を用いて移送し、前記第3の液収容部内に前記フィルムの孔を貫通して前記口部を挿入して前記反応溶液を吐出する。
Next, by suction the entire amount of the stirred liquid by said
次に、該第3の液収容部内に収容されている分離抽出溶液としての結合バッファ液と前記反応溶液とを撹拌して、可溶化したタンパク質をさらに脱水させ、核酸等を溶液中に分散させる。 Next, the binding buffer solution as the separation / extraction solution contained in the third liquid container and the reaction solution are stirred to further dehydrate the solubilized protein and disperse nucleic acids and the like in the solution. ..
次に、該流管221〜226を用いて該第3の液収容部中にその口部を前記フィルムの孔を貫通して挿入し、全量を吸引してノズル移動部42により該流管221〜226を上昇させ、該反応溶液を第4の液収容部にまで移送し、該第4の液収容部内に収容されている磁性粒子懸濁液と該反応溶液とを撹拌する。該磁性粒子懸濁液内に含まれる磁性粒子の表面に形成された水酸基にNa+イオンが結合するカチオン構造が形成されている。そのために負に帯電したDNAが磁性粒子に捕獲される。
Then the mouth portions in the liquid containing portion of the third with the
次に、前記流管221〜216の細管に前記磁力機構43の磁石を各流管221〜226に対応するようにY軸方向に延びる磁石支持部材に配列して設けられた磁石進退機構(図示せず)を用いて一斉にY軸方向に沿って接近させることによって該流管221〜226の細管の内壁に前記磁性粒子を吸着させる。該磁性粒子を該流管221〜226の細管の内壁に吸着させた状態で、前記ノズルZ軸移動部42により上昇させ、前記ノズルヘッド移動機構49を用いて該流管221〜226を該第4の液収容部から第5の液収容部にまで移動させ、前記フィルムの孔を貫通して前記細管を挿入する。
Next, magnet provided by arranging the magnet of the
前記磁力機構43の前記磁石を該流管221〜226の細管から一斉に離間させることによって前記細管内への磁力を除去した状態で、該第5の液収容部に収容されている洗浄液1(NaCl, SDS, isopropanol)について吸引吐出を繰り返すことにより、前記磁性粒子を前記内壁から離脱させて洗浄液1中で攪拌することでタンパク質を洗浄する。その後、前記磁力機構43の磁石を再び前記流管221〜226の細管に接近させることで前記磁性粒子を細管の内壁に吸着させた状態で、前記流管221〜226を前記ノズルZ軸移動部42および前記ノズルヘッド移動機構49を用いて該第5の液収容部から第6の液収容部にまで移動させる。
While removing the magnetic force to the narrow tube by spaced all together the magnets of the
次に、前記流管221〜226の細管をノズルZ軸移動部42を用いて前記フィルムの孔を貫通して挿入する。前記磁力機構43の磁石を前記流管221〜226の細管から離間させることで前記細管内への磁力を除去した状態で、該第6の液収容部に収容されている洗浄液2(isopropanol)について吸引吐出を繰り返すことで、前記磁性粒子を液中で攪拌させ NaClおよびSDSを除去し、タンパク質を洗浄する。その後、前記磁力機構43の磁石を再び前記流管221〜226の細管に接近させることで前記磁性粒子を細管の内壁に吸着させた状態で、前記流管221〜226を前記ノズルZ軸移動部42により上昇させた後、該第6の液収容部から蒸留水が収容されている前記第7の液収容部に前記ノズルヘッド移動機構49によって移動させる。
Then inserted through the hole of the film using a nozzle Z-
次に、前記ノズルZ軸移動部42によって、前記流管221〜226の細管を前記孔を通って下降させ、前記磁力を前記流管221〜226の細管内に及ぼした状態で、ゆっくりとした流速での前記蒸留水の吸引吐出を繰り返すことで、洗浄液2(isopropanol)を水と置き換えて除去する。その後、前記磁力機構43の磁石を前記流管221〜226の細管から離間させて磁力を除去した状態で前記磁性粒子を前記解離液としての蒸留水中で吸引吐出を繰り返すことで攪拌して、前記磁性粒子が保持していた核酸を磁性粒子から液中に解離(溶出)する。その後、前記流管221〜226の細管に前記磁石を接近させることで細管内に磁場を及ぼし磁性粒子を内壁に吸着させ、前記第8の液収容部内に前記抽出した核酸等を含有する溶液を残留させる。ノズルヘッド移動機構49により前記流管221〜226を前記流管収容領域31にまで移動させ、前記脱着機構45を用いて該ノズル41〜48から磁性粒子を吸着した該流管221〜226を前記磁性粒子と共に該収容部内に脱着させる。
Then, by the nozzle Z-
ステップS3において、ステップS2で抽出されたDNAの内、少量の5μ\ochLについて、その濃度を測定するためFAM蛍光物質等を用いたリアルタイムPCR試薬を用いて測定する。
この例では、前記電気泳動全自動処理装置100の前記ステージ3には、図5におけるリアルタイムPCR測定用の反応容器3221〜3226には、増幅すべき目的核酸の増幅領域両端の2種類のプライマーに加えて、増幅領域内で相補的に結合する蛍光プローブとして、蛍光レポーターとその隣にクエンチャーを入れた4種対の塩基配列を持つもの、例えば、蛍光物質HEX、蛍光物質TAMURA、蛍光物質ROX、蛍光物質Texas Redで標識化したリアルタイムPCR試薬が収容されている。これらの試薬は、前記横断ヘッド46を用いて共通収容領域30から各反応容器に分注する。
In step S3, a small amount of 5 μ \ ochL of the DNA extracted in step S2 is measured using a real-time PCR reagent using a FAM fluorescent substance or the like in order to measure the concentration thereof.
In this example, in the
次に、前記ノズルヘッド4をノズルヘッド移動機構49を用いて前記流管収容領域31の上方にまで移動させ、前記ノズルZ軸移動部42を用いて前記ノズル41〜46,4'1〜4'6を下降させることによって、微小量分注用流管211〜216をノズル41〜48のみに装着させる。該装着した流管211〜216を用いて前記第8の液収容部内に収容された抽出した核酸溶液、例えば、各50μ\ochLの内、少量、例えば、各5μ\ochLを吸引する。
Next, the
ステップS4で、前記ノズルヘッド移動機構49を用いてY軸方向に移動し、かつノズルZ軸移動部42を用いてZ軸方向に移動して前記液収容部に収容されている前記抽出した核酸溶液の5μ\ochLを反応容器3221〜3226内に吐出収容し混合する。一方、第8の液収容部内に残された各45μ\ochLの核酸溶液については、前記ノズルヘッド移動機構49を用いてY軸方向に移動し、前記微小量分注用流管211〜216内に吸引し、前記可変ピッチ液収容架台36の1群の可動液収容部群36'1〜36'6に収容する。
In step S4, the extracted nucleic acid is moved in the Y-axis direction by using the nozzle
次に、前記ノズルヘッド移動機構49によって、該流管211〜216を前記流管収容領域31の上方に位置付け、前記脱着機構45によって該流管211〜216を該流管収容領域31内に脱着する。該ノズルヘッド移動機構49によって該ノズル群41〜46,4'1〜4'6を前記反応領域32の密閉蓋収容部341〜346の上方に位置付け下降することによって該ノズル群41〜46に各収容部群31〜36の第1列目の収容部列にある密閉蓋34を装着させ、再び、該反応容器3221〜3226の上方に位置させた後、前記ノズルZ軸移動部42によってノズルを下降させて、該反応容器3221〜3226の開口部に密閉蓋34を嵌合させる。
Then, by the nozzle
次に、qPCR法に従い前記温度昇降器39によって、前記反応容器3221〜3226に対して一斉に温度制御を行いかつ増幅するとともに、前記光選択測定部8の前記照射受光対選択測定部80によって、該ノズル41〜46に設けられた1対の照射端組61および受光端組71が選択され、すなわち、複数対の照射端および受光端(611,711)〜(616,716)が選択され、したがって、複数対接続端組配列体82の対応する1対の照射接続端組62および受光接続端組72、したがって、複数対測定端組配列体811の1対の照射測定端組841,842および受光測定端組831,832が選択されて、前記複数対接続端組配列体82を、複数対測定端組配列体811に対してX軸方向に所定速度で移動させ、さらに、定められた所定周期で繰り返し往復移動させる。それによって、前記複数対接続端組配列体82の選択された1対の各接続端組(62,72)を順次該当する複数対測定端組配列体811の使用された蛍光物質に対応する1対の測定端組(841,831)に対して接続および遮断を繰り返す。その往復運動は、PCR法の1温度サイクル(例えば30秒で、例えば40サイクル繰り返される)に対し、例えば2〜3秒の所定周期で行うことで光学的な接続および遮断を繰り返させる。
Next, according to the qPCR method, the temperature elevator 39 controls and amplifies the temperatures of the reaction vessels 322 1 to 322 6 all at once, and the irradiation light receiving pair
なお、照射受光対の選択は、選択される1対の照射端組61および受光端組71と接続されるべき、前記1対の照射測定端組841および受光測定端組831と光学的に接続される光源84および光電変換部83をオン状態とし、それ以外の光源84及び光電変換部83をオフ状態とすることによって行われる。前記測光解析部93は、得られた蛍光強度を縦軸とし、前記各温度サイクルを横軸としてグラフ化すれば図11に示す増幅曲線が各々得られることになる。これによって、6個のサンプルについて同時に並行して増幅曲線を得ることができる。
The selection of the irradiation light receiving pair is optically connected to the pair of irradiation measurement end sets 841 and the light receiving measurement end set 831 which should be connected to the selected pair of irradiation end sets 61 and the light receiving end set 71. This is performed by turning on the
ステップS5において、前記測光解析部93によって、核酸溶液中に目的核酸の量が十分存在するかどうかを判断し、十分に存在しない場合には、ステップS9に進み、処理は終了することになる。核酸溶液中に目的核酸の量が十分に存在すると判断された場合には、ステップS6に進む。
In step S5, the
ステップS6において、前記可変ピッチ液収容架台36をX軸方向に沿って第1のピッチ分移動することによって、該可変ピッチ液収容架台36に設けられ前記核酸溶液45μ\ochLが収容されている前記可動液収容部36'1〜36'6を、各収容部群31〜36の第1の収容部列から第2の収容部列に沿った位置に移動させる。次に、前記ノズルヘッド4をノズルヘッド移動機構49を用いて前記流管収容領域31の上方にまで移動させ、前記ノズルZ軸移動部42を用いて前記ノズル群41〜46,4'1〜4'6を下降させることによって、分注用流管21〜26,21〜26をノズル群41〜46,4'1〜4'6に各々装着させる。該ノズルヘッド4をY軸方向に移動させて、前記可変ピッチ液収容架台36の上方に位置した後、下降させることによって、ノズル群4'1〜4'6に装着された分注用流管21〜26が該可動収容部36'1〜36'6内に挿入して前記核酸溶液45μ\ochLを吸引し、ノズル群41〜46に装着された分注用流管21〜26は、前記可動液収容部群361〜366,36'1〜36'6を支える支持プレート3651〜3656外の空間部分を下降し、該可変ピッチ液収容架台36に衝突することはない。可変ピッチ液収容架台36は第2のピッチを最大のピッチとする可変ピッチであるために隣接する可動液収容部間に隙間が形成されているからである。
In step S6, the variable-pitch
該ノズル群4'1〜4'6に装着された流管21〜26に収容された前記45μ\ochLの核酸溶液を、前記ノズルヘッド4をY軸方向に移動させることによって、前記流管21〜26,21〜26を前記反応容器3211〜3216および該反応容器3211〜3216と交互に設けられている6個の逃げ孔324の上方に位置させた後、下降させることによって、ノズル群4'1〜4'6に装着された分注用流管21〜26が反応容器3211〜3216内に挿入して前記核酸溶液45μ\ochLを吐出し、ノズル群41〜46に装着された流管21〜26は、前記逃げ孔324内を下降し、該収容部群31〜36と衝突することはない。なお、該反応容器3211〜3216には、前記横断ヘッド46を用いて、予め共通収容領域30からサンガー法に基づき、プライマー、DNAポリメラーゼ、4種類の蛍光物質で標識化された標識化ジデオキシヌクレオチド(ddATP,ddGTP,ddCTP,ddTTP)が分注されている。
By moving the nucleic acid solution of the 45μ \ ochL housed in the
ステップS7において、前記ノズルヘッド7を前記流管収容領域31にまで移動して、前記流管21〜26,21〜26を一斉に前記流管脱着機構45により脱着させた後、前記ノズルヘッド7を密閉蓋収容部341〜346の上方に位置づけた後、下降することによって前記ノズル群41〜46に密閉蓋34を装着し、該ノズルヘッド7を反応容器3211〜3216の上方に位置した後、下降することで該密閉蓋34を開口部に嵌合させて、反応容器を密閉させた後、該反応容器3211〜3216を前記温度昇降器39を用いてPCR法により、目的核酸の断片の生成および増幅を行う。
In step S7, the nozzle head 7 is moved to the flow
次に、生成された断片化された核酸溶液は、前記ノズルヘッド4をY軸方向に移動して前記流管収容領域31の穿孔用チップ231〜236,231〜236の収容部上に位置した後、下降して各ノズル41〜48に装着し、再びY軸方向に移動して、前記反応容器3211〜3216を塞ぐ密閉蓋34を穿孔し、再び該ノズル41〜48,4'1〜4'6に前記流管21〜26,21〜26を装着し、生成された断片化された核酸溶液を該流管内に吸引し、該ノズルヘッド移動機構49を用いて、前記可変ピッチ液収容架台36の可動液収容部群361〜366に収容し、前記可変ピッチ液収容架台36は、架台移動部37によってX軸方向に移動して前記電気泳動部5に移動し、同時に、該可動液収容部361〜366のピッチを、第2のピッチから第3のピッチに変換する。
Then, the nucleic acid solution that is fragmented is generated, the drilling tip 23 1-23 6 of the
ステップS8において、生成された前記目的核酸の断片がランダムに含まれる電気泳動用試料が収容された前記各可動液収容部361〜366に前記電気泳動部5のn本(この例では6本)の前記電気泳動用キャピラリー511〜516の一端部および負電極541〜546が挿入され、前記電極対間に所定の電圧が印加されることで、前記目的核酸の断片が泳動する。
In step S8, the n pieces (this example of the fragments of the target nucleic acids are generated to the respective movable
すると、前記光選択測定部8の前記照射受光対選択測定部80によって、前記電気泳動用キャピラリー511〜516の他端部の近くで該キャピラリー511〜516を保持するキャピラリーホルダー53に設けられて前記各電気泳動用キャピラリー511〜516の外側面に近接または接触する該1対の照射端組63および受光端組73が選択され、すなわち、複数対の照射端および受光端(631,731)〜(636,736)が選択され、したがって、複数対接続端組配列体82の対応する1対の照射接続端組64および受光接続端組74、したがって、複数対測定端組配列体811の対測定端組配列体8112に配列された1対の照射測定端組842および受光測定端組832が選択されて、前記複数対接続端組配列体82を、複数対測定端組配列体811に対してX軸方向に所定速度で移動させ、さらに、定められた所定周期で繰り返し往復移動させる。それによって前記複数対接続端組配列体82の選択された1対の各接続端組(64,74)を順次該当する複数対測定端組配列体811の使用された蛍光物質に対応する1対の測定端組(842,832)に対して接続および遮断を繰り返す。
Then, by the irradiation light receiving pair selecting measuring
なお、照射受光対の選択は、選択される1対の照射端組63および受光端組73と接続されるべき、前記1対の照射測定端組842および受光測定端組832と光学的に接続される光源84および光電変換部83をオン状態とし、それ以外の光源84及び光電変換部83をオフ状態とすることによって行われる。前記測光解析部93は、得られた蛍光強度を縦軸とし、検出時間(断片の大きさ)を横軸としてグラフ化すれば図14(a)に示すように各キャピラリーごとの各種類の蛍光強度のグラフが得られることになる。この蛍光強度のデータを重ねると図14(b)に示すように塩基配列が得られる。したがって、6個のサンプルについて同時に並行して塩基配列を決定することができる。なお、測光解析部93による解析の処理は前記解析工程での処理に相当する。
The selection of the irradiation / light receiving pair is optically connected to the pair of irradiation measurement end sets 842 and the light receiving measurement end set 832, which should be connected to the selected pair of irradiation end sets 63 and light receiving end set 73. This is performed by turning on the
続いて、本発明の実施の形態に係る第2の実施例に係る光選択測定部8'を説明する。
図12(a)は、本発明の第2の実施例に係る光選択測定部8'の1対の照射端組および受光端組(61,71)の照射受光対(611,711)〜(616,716)の一部を示すものであって、ノズル群41〜46に設けられているものである。なお、第1の実施例に係る光選択測定部8と重複する部分については、同一の符号を用い、説明を省略することがある。
図12(b)は、照射端組および受光端組(63,73)の照射受光対(631,731)〜(636,736)を示すものであって、前記電気泳動用キャピラリー511〜516の測定部に設けられており、例えば、照射端と受光端が各キャピラリー511〜516を径方向に対向して挟むように、各キャピラリーの外壁面に対して同一半径方向に揃えてまたは所定角度をもって設けられる。
Subsequently, the optical selective measurement unit 8'according to the second embodiment according to the embodiment of the present invention will be described.
12 (a) is a second pair of irradiation end sets of light selecting measuring unit 8 'according to the embodiment and light receiving end sets of the present invention (61, 71) irradiation light receiving pairs (61 1, 71 1) there is shown a portion of a ~ (61 6, 71 6), are those provided in the nozzle group 41 to 6. The same reference numerals may be used for the portions that overlap with the optical
12 (b) is a view illustrating the light irradiating and receiving pair of irradiation end set and light receiving end sets (63, 73) (63 1, 73 1) to (63 6, 73 6), a capillary for the electrophoretic 51 1-51 provided on the measuring unit 6, for example, as a light receiving end and radiation end sandwich facing each capillary 51 1-51 6 in the radial direction, the same radius with respect to the outer wall surface of each capillary It is provided so that it is aligned in the direction or at a predetermined angle.
図12(c)は、1対の照射端組および受光端組(61,75)の照射受光対(611,751)〜(616,756)の一部を示すものであり、照射端組611〜616は、ノズル群41〜46に設けられ、各受光端組751〜756は、前記測光領域38にX軸方向(行方向)に沿って第2のピッチで配列され、かつ前記各収容部群31〜36の第1の収容部列に位置するように配列されている。また、前記各照射受光対の該照射端と受光端とは、ノズル41〜46に装着した流管の口部2aと装着用開口部2bを結ぶ垂直共通軸線上に位置付け可能に設けられている。
FIG. 12 (c), which shows a part of the irradiation light receiving pairs of pair irradiation end set and light receiving end sets of (61,75) (61 1, 75 1) to (61 6, 75 6), irradiation end assembly 61 1-61 6 is provided in the
図12(d)は、前記複数組の照射端組61,63および複数組の受光端組71,73,75の中から対となる照射端組および受光端組(61,71),(63,73),(61,75)のいずれかを選択して、選択した組に属する照射端および受光端の対を照射受光対とし、照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を測定する前記照射受光対選択測定部80を示すものである。
FIG. 12 (d) shows a pair of irradiation end sets and light receiving end sets (61, 71), (63) from the plurality of sets of irradiation end sets 61, 63 and the plurality of sets of light receiving end sets 71, 73, 75. , 73), (61, 75) are selected, the pair of the irradiation end and the light receiving end belonging to the selected set is set as the irradiation light receiving pair, and a predetermined measurement light is sequentially supplied to the irradiation end, and the light receiving is received. The irradiation light-receiving pair
図12(d)は、該照射受光対選択測定部80'の複数対接続端組配列体82'および前記対選択連動切換部81'の前記複数対測定端組配列体811'とを示すものである。 FIG. 12D shows the plurality of pairs of the paired connection end set array 82'of the irradiation light receiving pair selective measurement unit 80'and the multiple pair measurement end set array 811'of the pair selection interlocking switching unit 81'. Is.
該複数対接続端組配列体82'は、一端部が2組の前記照射端組61,63の各他端部が各々有する照射接続端621〜626,641〜646が前記複数個(この例では6個)属する2組の照射接続端組62,64および、前記一端部が前記受光端組71,73,75の複数の受光端711〜716,731〜736,751〜756を有する複数の導光路としての光ファイバ171,173,175の各他端部が各々有する受光接続端が複数個(この例では6個)属する3組の受光接続端組72,74,76があって、各同一の組に属する前記照射接続端または受光接続端が行方向(X軸方向)に沿って1列状に所定間隔で配列され、対となり得る異なる組に属する照射接続端および受光接続端同士は前記行方向(X軸方向)に直交する方向(この例では列方向、すなわちY軸方向)に沿って対間隔を開けて並列に配列されている接続端配列面を有する複数対接続端組配列体82'と、対選択連動切換部81'の前記複数対測定端組配列体811'とを有するものである。なお、それらと対となり得ない異なる組に属する照射接続端および受光接続端同士は、前記行方向(X軸方向)に沿って所定間隔空けた位置(図8参照)または列方向(Y軸方向)に前記対間隔と異なる対間隔を開けて並列に配列可能である。
Plurality several pairs connecting end assembly array 82 'is irradiated connecting end 62 1-62 6 having one end with the other end of the two pairs of the irradiation end sets 61 and 63 are each 64 1-64 6 wherein the plurality number (six in this example) belonging two sets irradiation connection end pairs 62, 64 and of the one end a plurality of light receiving ends of the light receiving end sets 71, 73, 75 71 1-71 6 73 1-73 6 , 75 1-75 plurality is receiving connection end of the other end portion has respective
該複数対測定端組配列体811'は、図12(d)に示すように、オンオフ可能な前記光源84と光学的に接続され、前記照射接続端組62,64の照射接続端621〜626,641〜646と順次接続可能に設けられた1または2以上の照射測定端841a〜841d,842a〜842d,843a,843bが各々設けられた複数組の照射測定端組841,842,843と、オンオフ可能な前記光電変換部83と光学的に接続され、前記受光接続端組72,74,76の受光接続端721〜726,741〜746,761〜766と順次接続可能に設けられた1または2以上の受光測定端831a〜831d,832a〜832d,833a,833bが各々設けられた複数組の受光測定端組831,832,833とが平行に所定方向(この例ではX軸方向)に沿って配列された測定端配列面813を有する(対応関係は、符号順)。ここで、対となり得る照射測定端組843および受光測定端組833は、対となり得る照射測定端および受光測定端(843a,833a)〜(843b,833b)ごとの各対測定端体に分割可能な対測定端組配列体8113を形成している。
As shown in FIG. 12 (d), the plurality of pairs of measurement end sets 811'are optically connected to the
ここで、前記接続端配列面と前記測定端配列面813は向き合い、前記所定方向(この例では行方向、すなわち、X軸方向)に沿って摺動するように切換機構(814,815,816)によって前記複数対接続端組配列体82を前記複数対測定端組配列体811に対して相対的に移動させる。すると、対として選択された照射接続端組および受光接続端組(62,72),(64,74),(62,76)に属する各接続端対(621,721)〜(626,726),(641,741)〜(646,746),(621,761)〜(626,766)と、選択されてオン状態にある光源84と接続する照射測定端組および選択されてオン状態にある光電変換部83と接続する受光測定端組からなる第1の測定端組の対(841,831)(対測定端組配列体8111に配列されている)に属する各測定端対(841a,831a)〜(841d,831d)、第2の測定端組の対(842,832)(対測定端組配列体8112に配列されている)に属する各測定端対(842a,832a)〜(842d,832d)、または第3の測定端組(対測定端組配列体8113に配列されている)に属する各測定端対(843a,833a)〜(843b,833b)との、各対同士の接続および遮断を可能にして、これらと接続する照射端および受光端の対(照射受光対)ごとに、オン状態にある前記光源およびオン状態にある前記光電変換部との接続または遮断が連動して順次行われる。なお、第1の測定端組の対、第2の測定端組の対および第3の測定端組の3つの内の1が選択されて該当する光源および光電変換部はオン状態となっている場合には、他の2は選択されていないので、該当する光源および光電変換部はオフ状態となっている。前記対測定端組配列体8113には該当する光源84および光電変換部83が各対測定端体ごとに1対ずつ含まれている。
Here, the switching mechanism (814,815,816) is such that the connection end array surface and the measurement
ここで、第2の実施例にあっては、第1の実施例で説明したqPCRの測定に追加し、吸光度の測定をも可能とするものであり、これによって、qPCRの代わりに吸光度を測定することで核酸の濃度を測定に用いることができる。
この場合、前記照射端組61の各照射端611〜616は、複数対接続端組配列体82の照射接続端組62の照射接続端621〜626および複数対測定端組配列体811'の前記照射測定端組843の照射測定端843a,843bを介して、光源84として、例えば、波長260nmおよび波長280nmの紫外線を各々出射する重水素ランプをオン状態とし他の光源をオフ状態として、光学的に接続する。すると、選択されて対となる受光端組75の各受光端751〜756は、複数対接続端組配列体82'の受光接続端組76の受光接続端761〜766および複数対測定端組配列体811'の前記受光測定端組833の受光測定端833a,833bを介して、光電変換部83としてラインセンサ型分光光度計をオン状態とし、他の光電変換部をオフ状態として、光学的に接続する。
Here, in the second embodiment, in addition to the measurement of qPCR described in the first embodiment, it is also possible to measure the absorbance, whereby the absorbance is measured instead of qPCR. By doing so, the concentration of nucleic acid can be used for measurement.
In this case, the irradiation end 61 1-61 6 of the irradiation end sets 61, irradiation connecting end 62 1-62 6 and a plurality of pairs measuring portion sets array of irradiation connecting end assembly 62 a plurality of pairs of connection ends
該第2の実施例にあっては、第1の実施例の場合と異なり、ステップS4では、目的核酸の品質評価処理としてqPCR法の代わりに、該核酸溶液の吸光度を測定することによって目的核酸の量を測定する。 In the second example, unlike the case of the first example, in step S4, the target nucleic acid is measured by measuring the absorbance of the nucleic acid solution instead of the qPCR method as a quality evaluation process of the target nucleic acid. Measure the amount of.
図2、図4、図12および図13に基づいて説明する。なお、第1の実施例と重複する部分については説明を省略した。ステップS4として、前記微少量分注用流管211〜216を用いて前記第8の液収容部内に収容された抽出した核酸溶液5μ\ochLを吸引した際に、前記ノズルZ軸移動部42により上昇させた後、前記ノズルヘッド移動機構49を用いて前記ステージ3の前記測光領域38の受光端751〜756の上方であって、前記ノズル41〜46の下端に設けた照射端611〜616と前記受光端751〜756が、該流管211〜216の口部2aと装着用開口部2bを結ぶ垂直共通軸線上にくるように位置付ける。
This will be described with reference to FIGS. 2, 4, 12, and 13. The description of the part overlapping with the first embodiment has been omitted. Step S4, when aspiration of the said eighth extracted nucleic acid solution 5 [mu] \ och1 contained in the liquid accommodating portion with the small amount dispensing
次に、前記光選択測定部8'の前記照射受光対選択測定部80'によって、該ノズル41〜46に設けられた1対の照射端組61および受光端組75が選択され、すなわち、複数対の照射端および受光端(611,751)〜(616,756)が選択され、したがって、複数対接続端組配列体82'の対応する1対の照射接続端組62および受光接続端組76、したがって、複数対測定端組配列体811'の1対の照射測定端組843および受光測定端組833が選択されて、前記複数対接続端組配列体82を、複数対測定端組配列体811'に対してX軸方向に所定速度で移動させ、さらに、定められた所定周期で繰り返し往復移動させる。前記測定端それによって前記複数対接続端組配列体82'の選択された1対の各接続端組(62,76)を順次該当する複数対測定端組配列体811'の対応する1対の測定端組(843,833)に対して接続および遮断を繰り返す。図13(b)はその接続および遮断の様子を示すものである。
これによって、例えば、重水素ランプ(またはキセノンランプ)による前記白色光の光源84をオン状態とし、例えば波長260nmおよび280nmの白色光(紫外線を含む)の測定用光を照射し、受光端751〜756に設けられたレンズを介して受光された前記溶液の透過光の強度を前記測定端組832から分光器を介して波長260nmおよび280nmに対する前記光電変換部83をオン状態にして電気信号としての強度データを得る。
Next, the 'the irradiation light receiving pair selecting measuring section 80' of the light
As a result, for example, the
次に、前記制御部としてのCPU+プログラム+メモリ9の前記測光解析部93によって、前記強度データI0および前記強度データIに基づいて、前記核酸溶液の吸光度を得る。
Next, the
すなわち、前記測光解析部93は、前述したように、予め求めた入射光強度I0から、化学物質溶液Aの波長λの吸光度が Aλ=−log10(I/Io)より得られる。すると、化学物質溶液Aの濃度をcとすると、化学物質溶液A(dNTP)の既知の吸光係数ε\och(モル吸光係数、=0.002mg/mL)を用い、例えば、光路長Lより、前記関係式 Aλ=ε\ochcLから濃度cを求めることができる。
That is, as described above, the
その際、前記吸光度曲線のピークの波長λ=260nm、280nmにおける吸光度A260かA280から、その光路長Lまたは液量を用いて、予め得られた関係式から濃度cを得るのが好ましい。図13は、このようにして得られた前記犬の全血から抽出されたイヌゲノムの核酸溶液を収容した流管211〜216に対応した各核酸溶液の強度データを示すものである。吸光度A260の例を示すものであり、前記測光解析部93は、予め得られた関係式を用いて吸光度A260かA280から濃度を得ることができる。図13(c)の縦軸は波長260nm、および280nmにおける強度データIを示すものであり、横軸は前記各流管211〜216、およびノズル41〜46の照射受光対に対応する前記複数対接続端組配列体82'と前記複数対測定端組配列体811'に対するX軸方向に沿ったX座標を表す。測定は所定速度、例えば、X軸方向に沿って、例えば、0.1mmを1msecの速さで一方向に進みながら1の所定周期(1秒)内で順次測定を行ったものである。
At that time, it is preferable to obtain the concentration c from the relationship formula obtained in advance from the absorbance A 260 or A 280 at the peak wavelength λ = 260 nm and 280 nm of the absorbance curve, using the optical path length L or the amount of the liquid. Figure 13 shows the intensity data of each nucleic acid solution corresponding to the
以上の説明では、6本の電気泳動用キャピラリーおよび流管が設けられ、6群の収容部群が設けられている場合のみについて説明したが、6に限定されることはない。また、対となる照射端および受光端は入れ換えることが可能であり、以上の説明の場合に限られない。 In the above description, only the case where six electrophoresis capillaries and flow tubes are provided and six storage groups are provided has been described, but the present invention is not limited to six. Further, the paired irradiation end and the light receiving end can be exchanged, and the above description is not limited to the case.
さらに、以上説明した各構成要素の形状、構造、機能は、実施の形態で説明した例のみに限られることはない。例えば、以上の説明では、ノズルヘッド移動機構はタイミングベルトを用い、ノズル移動部はボール螺子を用いた場合について説明したが、タイミングベルトとボール螺子は任意に入れ換えることが可能であり、その他の機構を用いても同様に構成することができる。以上の説明において、X軸、Y軸、Z軸は直交座標系をなすものとする。また、行方向および列方向はX軸方向およびY軸方向に相当するとしたが、Y軸方向およびX軸方向に相当するとしても良い。 Further, the shape, structure, and function of each component described above are not limited to the examples described in the embodiments. For example, in the above description, a timing belt is used for the nozzle head moving mechanism and a ball screw is used for the nozzle moving part. However, the timing belt and the ball screw can be arbitrarily replaced, and other mechanisms can be used. Can be configured in the same manner by using. In the above description, it is assumed that the X-axis, the Y-axis, and the Z-axis form a Cartesian coordinate system. Further, although the row direction and the column direction correspond to the X-axis direction and the Y-axis direction, they may correspond to the Y-axis direction and the X-axis direction.
以上の説明では分光器を受光部側に用いて吸光度を測定したが、フィルタを用いて測定することも可能である。分光器として光電変換部をもその内部に含むようなマルチチャネル分光器等を用いる場合には、前記受光切換部は不要となる。また、照射部側についても分光器またはフィルタを用いることも可能である。 In the above description, the absorbance was measured using a spectroscope on the light receiving portion side, but it is also possible to measure using a filter. When a multi-channel spectroscope or the like including a photoelectric conversion unit is used as the spectroscope, the light receiving switching unit becomes unnecessary. It is also possible to use a spectroscope or a filter on the irradiation unit side.
また、以上の説明では、化学物質として核酸を測定対象としたが、該場合に限られることなく、その他の高分子物質、例えば、アミノ酸、タンパク質、糖鎖、脂肪等や、磁性体等の固形物、泡、気体、または液体等の各種化学物質を含有する各種液量の化学物質溶液であっても良い。 Further, in the above description, the measurement target is nucleic acid as a chemical substance, but the measurement target is not limited to this case, and other high molecular substances such as amino acids, proteins, sugar chains, fats and the like, and solids such as magnetic substances are used. It may be a chemical substance solution having various liquid amounts containing various chemical substances such as substances, bubbles, gases, and liquids.
目的物質としてタンパク質を主として分子サイズの違いを電気泳動法により測定するには、例えば、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動法を用いる。この場合、選択された前記キャピラリーに設けられた1対の照射端組および受光端組(63、73)に属する照射受光端対(631,731)〜(636,736)は、1対の照射接続端組および受光接続端組(64,74)に属する1対の照射接続端および受光接続端(641,741)〜(646,746)を介して、1対の照射測定端組および受光測定端組(842,832)に属する1対の照射測定端および受光測定端(842a,832a)〜(842b,832b)を有する対測定端組配列体と光学的に接続することになる。その際、該対測定端組配列体を形成する分割可能な各対測定端体は波長260nmまたは280nmの紫外線を各々出射する重水素ランプと光学的に接続するものと置き換えられ、該重水素ランプをオン状態とし他の光源をオフ状態とし、かつラインセンサ型分光光度計をオン状態とし他の光電変換部をオフ状態とすることによって、前記電気泳動用キャピラリー511〜516内の紫外線を用いた吸光度を測定することによって行う。
In order to measure the difference in molecular size mainly of protein as a target substance by electrophoresis, for example, SDS polyacrylamide gel electrophoresis is used. In this case, irradiation end set and light receiving end sets of a pair provided in the capillary which is selected (63, 73) in the irradiation receiving end pair belonging (63 1, 73 1) to (63 6, 73 6), via a pair of irradiation connecting end set and receiving a connection end sets of irradiation connection end and receiving the connection end of the pair belonging to the (64, 74) (64 1, 74 1) to (64 6, 74 6), a pair Optically with a pair of measurement end set having a pair of irradiation measurement ends and light receiving measurement ends (842a, 832a) to (842b, 832b) belonging to the irradiation measurement end set and the light receiving measurement end set (842,832). Will connect. At that time, each separable paired measurement end body forming the paired measurement end assembly is replaced with one that is optically connected to a deuterium lamp that emits ultraviolet rays having a wavelength of 260 nm or 280 nm, respectively, and the deuterium lamp is replaced. It was turned on and the other light source off, and by the oFF state of the other photoelectric conversion unit is turned on the line sensor type spectrophotometer, ultraviolet of the
なお、以上の説明において、対となる照射端組および受光端組(61,71),(61,75),(61,77),(63,73)において、必要な修正および入れ換えを行うことで照射端と受光端を入れ換えて使用することが可能である。 In the above description, necessary corrections and replacements shall be made in the paired irradiation end set and light receiving end set (61,71), (61,75), (61,77), (63,73). It is possible to switch between the irradiation end and the light receiving end.
本発明は、電気泳動全自動処理装置およびその方法に関する。本発明は、遺伝子、免疫系、アミノ酸、タンパク、糖等の生体高分子、生体低分子の扱いが要求される分野、例えば、工業分野、食品、農産、水産加工等の農業分野、製薬分野、衛生、保健、免疫、疾病、遺伝等の医療分野、化学若しくは生物学等の理学の分野等、あらゆる分野に関係するものである。 The present invention relates to a fully automatic electrophoresis processing device and a method thereof. The present invention relates to fields requiring the handling of biopolymers such as genes, immune systems, amino acids, proteins and sugars, and small biomolecules, such as industrial fields, foods, agricultural products, agricultural fields such as fishery processing, and pharmaceutical fields. It is related to all fields such as health, health, immunity, diseases, medical fields such as heredity, and science fields such as chemistry or biology.
10,100 電気泳動全自動処理装置
21〜2n,21〜2n 分注用流管
211〜21n 微小量分注用流管(測光用流管を兼用)
221〜22n 分注用流管
231〜23n,231〜23n 穿孔用チップ
3 ステージ
31〜3n 収容部群
341〜34n 密閉蓋収容部
34 密閉蓋
321〜32n,32'1〜32'n 反応容器
4, ノズルヘッド
41〜4n,4'1〜4'n ノズル群
41,411〜41n 吸引吐出機構
416 分注シリンダ
44 Z軸移動体(ノズル支持体)
45 脱着機構
49 ノズルヘッド移動機構
511〜51n 電気泳動用キャピラリー
611〜61n,631〜63n 照射端(光選択測定部)
161,171,163,173,175,177
導光路(光選択測定部)
711〜71n,731〜73n,751〜75n,771〜77n
受光端(光選択測定部)
8、8' 光選択測定部
80,80' 照射受光対選択測定部(光選択測定部)
81,81' 対選択連動切換部(光選択測定部)
82,82' 複数対接続端組配列体(光選択測定部)
83 光電変換部(光選択測定部)
84 光源(光選択測定部)
9 CPU+プログラム+メモリ(制御部)
93 測光解析部(制御部)
10,100 Electrophoresis fully
22 1 to 22 n Dispensing flow pipe
23 1 ~23 n, 23 1 ~23 for n
45
161,171,163,173,175,177
Light guide path (optical selection measurement unit)
71 1 to 71 n , 73 1 to 73 n , 75 1 to 75 n , 77 1 to 77 n
Light receiving end (light selective measurement unit)
8,8'Light
81, 81'pair selection interlocking switching unit (optical selection measurement unit)
82, 82'Multiple paired end assembly array (optical selective measurement unit)
83 Photoelectric conversion unit (optical selective measurement unit)
84 Light source (light selective measurement unit)
9 CPU + program + memory (control unit)
93 Photometric analysis unit (control unit)
Claims (14)
サンプルからの前記目的物質の抽出処理、目的物質の加工処理、および各処理に関する生成物または化学物質の品質評価を経て得られた前記目的物質を含有する電気泳動用試料を、前記キャピラリー電気泳動部の前記各キャピラリーに各々供給可能とする電気泳動前処理部と、
前記電気泳動部の各前記キャピラリーに関する光の測定および前記電気泳動前処理部の前記品質評価のための光の測定からなるグループの中から選択して、任意の少なくとも1の光の測定を実行可能とする光選択測定部と、
前記サンプルからの前記目的物質の抽出処理、該目的物質の加工処理、前記目的物質の解析処理、および前記品質評価を制御する制御部と、を有し、
前記光選択測定部は、
測光内容または前記目的物質を含む前記生成物または前記化学物質により定まる測定用光を照射可能な複数個の導光路の各一端部である照射端を各組に有する複数組の照射端組、および、該照射端組に対応する位置に位置しまたは位置付け可能に設けられ該照射端から照射された測定用光に基づいて生ずる光を各々受光可能な複数個の導光路の各一端部である受光端を各組に有する複数組の受光端組と、
前記制御部による目的物質の解析処理または品質評価の指示があった場合に、前記複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から対となる1組の照射端組および1組の受光端組を選択して、対応する1対の照射端および受光端からなる照射受光対ごとに、前記照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を測定する照射受光対選択測定部とを有する電気泳動全自動処理装置。 A capillary electrophoresis unit that has a plurality of capillarys for electrophoresis and allows a target substance to be electrophoresed in the capillary by applying a voltage.
An electrophoresis sample containing the target substance obtained through extraction treatment of the target substance from the sample, processing treatment of the target substance, and quality evaluation of the product or chemical substance related to each treatment is obtained from the capillary electrophoresis unit. An electrophoresis pretreatment unit that can be supplied to each of the above-mentioned capillaries,
Any at least one light measurement can be performed by selecting from the group consisting of light measurement for each of the capillaries of the electrophoresis unit and light measurement for the quality evaluation of the electrophoresis pretreatment unit. Light selection measurement unit and
The extraction process of the target substance from a sample, processing that purpose materials, analysis of the target substance, and possess a control unit for controlling the quality evaluation,
The optical selective measurement unit
A plurality of sets of irradiation end sets having an irradiation end, which is one end of each of a plurality of light guide paths capable of irradiating measurement light determined by the measurement content or the product containing the target substance or the chemical substance, and a plurality of sets of irradiation ends. , Each one end of a plurality of light guide paths that are located at a position corresponding to the irradiation end set or are positionably provided and can receive light generated based on the measurement light emitted from the irradiation end. Multiple sets of light receiving ends, each set having an end,
When the control unit gives an instruction for analysis processing or quality evaluation of the target substance, one set of irradiation end sets and one set of paired irradiation end sets from the plurality of sets of irradiation end sets and multiple sets of light receiving end sets. A light receiving end set is selected, and a predetermined measurement light is sequentially supplied to the irradiation end for each irradiation light receiving pair consisting of the corresponding pair of irradiation ends and the light receiving end, and the intensity of the light sequentially received by the light receiving end. electrical to have the irradiation light receiving pair selecting measuring unit for measuring the electrophoretic fully automatic processing apparatus.
前記指示に応じて選択された所定の測定用光を出射する1または2以上の光源と、
受光した光を電気信号に変換する1または2以上の光電変換部と、
前記指示に基づいて、複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から1対の照射端組および受光端組を選択し、1または2以上の光源と選択された前記照射端組に属する照射端との間の接続または遮断と、1または2以上の光電変換部と選択された前記受光端組に属する受光端との間の接続または遮断とを、前記照射受光対ごとに連動して切り換える対選択連動切換部と、を有する請求項1に記載の電気泳動全自動処理装置。 The irradiation light receiving pair selective measuring unit is
One or more light sources that emit a predetermined measurement light selected according to the above instructions, and
One or more photoelectric conversion units that convert the received light into an electric signal,
Based on the above instructions, a pair of irradiation end sets and light receiving end sets are selected from a plurality of sets of irradiation end sets and a plurality of sets of light receiving end sets, and one or more light sources and the selected irradiation end sets are selected. The connection or cutoff between the irradiation end belonging to the above and the connection or cutoff between one or two or more photoelectric conversion units and the light receiving end belonging to the selected light receiving end set are interlocked for each irradiation light receiving pair. electrophoresis fully automatic processing apparatus according to claim 1 having, a pair selected interlock switching unit for switching to.
前記対選択連動切換部は、
オンオフ可能な前記光源と光学的に接続され、前記照射接続端組に属する照射接続端と順次接続可能に設けられた1または2以上の照射測定端が前記所定方向に沿って1列状に所定間隔で各々設けられた複数組の照射測定端組、およびオンオフ可能な前記光電変換部と光学的に接続され、前記受光接続端組に属する受光接続端と順次接続可能に設けられた1または2以上の受光測定端が前記所定方向に沿って1列状に所定間隔で各々設けられた複数組の受光測定端組が前記所定方向に直交する方向に沿って前記対間隔を開けて配列された測定端配列面を有する複数対測定端組配列体と、
前記接続端配列面と前記測定端配列面とが向き合って前記所定方向に沿って摺動するように前記複数対接続端組配列体と前記複数対測定端組配列体を相対的に移動させて、選択された前記照射接続端および受光接続端と前記照射測定端および受光測定端の各々の同時の接続または遮断を可能にして、選択された組同士の照射受光対ごとに、前記照射端とオン状態にある前記光源との接続または遮断が、前記受光端とオン状態にある前記光電変換部との接続および遮断と連動して順次行われる切換機構とを有する請求項2に記載の電気泳動全自動処理装置。 In the irradiation light receiving pair selective measurement unit, the irradiation connection to which one end of each of the other ends of the plurality of light guide paths having one irradiation end belonging to the irradiation end set belongs to the plurality of irradiation connection ends. The end set and the light receiving connection end set to which the plurality of light receiving connection ends each of the other ends of the plurality of light guide paths each having one light receiving end whose one end belongs to the light receiving end set belong. There are a plurality of sets of each, and the irradiation connection ends or the light receiving connection ends belonging to the same set are arranged in a row at predetermined intervals along a predetermined direction, and the irradiation connection ends or the light receiving connection ends belonging to different sets that can be paired with each other. The light-receiving connection ends further have a plurality of pairs of connection-end array having connection-end array planes arranged in parallel at intervals along a direction orthogonal to the predetermined direction.
The pair selection interlocking switching unit is
One or two or more irradiation measurement ends that are optically connected to the light source that can be turned on and off and are provided so as to be sequentially connectable to the irradiation connection ends belonging to the irradiation connection end set are predetermined in a row along the predetermined direction. 1 or 2 provided to be optically connected to a plurality of sets of irradiation measurement ends provided at intervals and the photoelectric conversion unit capable of being turned on and off, and sequentially connectable to the light receiving connection ends belonging to the light receiving connection end set. A plurality of sets of light receiving measurement ends, each of which is provided in a row at predetermined intervals along the predetermined direction, are arranged with the pair spacing along a direction orthogonal to the predetermined direction. Multiple pairs of measurement end-set arrays with measurement end array planes,
The plurality of pairs of connection end arrangements and the plurality of pairs of measurement end arrangements are relatively moved so that the connection end arrangement surface and the measurement end arrangement surface face each other and slide along the predetermined direction. Allows simultaneous connection or disconnection of the selected irradiation connection end and light reception connection end and the irradiation measurement end and light reception measurement end, and for each irradiation light reception pair of the selected pair, the irradiation end and the light reception end The electrophoresis according to claim 2 , further comprising a switching mechanism in which the connection or disconnection with the light source in the ON state is sequentially performed in conjunction with the connection and disconnection between the light receiving end and the photoelectric conversion unit in the ON state. Fully automatic processing device.
気体の吸引吐出を行う吸引吐出機構と連通し、液体の吸引吐出が可能な流管が着脱可能に装着される複数連のノズルおよび該ノズルに装着された該流管に外部から磁場を及ぼしかつ除去することが可能な磁力部と、
検査対象となるサンプルおよび磁性粒子懸濁液を含む各種の化学物質溶液を収容する液収容部および温度昇降器により温度制御可能な反応容器を少なくとも各々有し、前記各ノズルに対応して設けられた複数群の収容部群を有するステージと、
前記ノズルと前記ステージとの間を相対的に移動可能とするノズル移動機構とを有し、
前記光選択測定部の前記照射端組および前記受光端組の一方の第1組は、前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該一方の第2組は前記各電気泳動用キャピラリーまたは各泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられ、前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組は、前記一方の第1組と対をなすように前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該他方の第2組は、前記一方の第2組と対をなすように、前記各電気泳動用キャピラリーまたは前記各泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられた請求項3に記載の電気泳動全自動処理装置。 The electrophoresis pretreatment unit is
A magnetic field is applied from the outside to a plurality of nozzles to which a flow tube capable of sucking and discharging a liquid is detachably attached and a flow tube attached to the nozzle, which communicates with a suction and discharge mechanism for sucking and discharging gas. A magnetic part that can be removed and
It has at least a liquid storage unit for accommodating various chemical substance solutions including a sample to be inspected and a suspension of magnetic particles and a reaction vessel whose temperature can be controlled by a temperature elevator, and is provided corresponding to each of the nozzles. A stage with multiple containment groups and
It has a nozzle moving mechanism that allows relative movement between the nozzle and the stage.
The first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set of the light selective measurement unit is provided in the nozzle or the suction / discharge mechanism, and the second set of the one is the capillary for each electrophoresis or after each electrophoresis. The first set of the irradiation end set and the other first set of the light receiving end set is provided on the nozzle or the suction / discharge mechanism so as to be paired with the first set of the one, which is provided in contact with or close to the outer surface of the accommodating portion. The other second set is provided so as to be paired with the one second set and is provided in contact with or close to each of the electrophoresis capillaries or the outer surface of each post-electrophoretic accommodating portion. Item 3. The fully automatic electrophoresis processing apparatus according to Item 3.
前記生成物または化学物質溶液が収容されている収容部にまで前記ノズルを移動し、
前記対選択連動切換部は、前記照射端組および前記受光端組の一方の前記第1組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または2以上の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光を測定用光とする1または複数の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または2以上の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する光電変管部のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換え、
前記制御部によって、前記目的物質の電気泳動を用いた解析処理の指示があった場合には、前記電気泳動用試料が収容されている各可動液収容部内に各前記電気泳動用キャピラリーの一端部を挿入させ、
前記対選択連動切換部は、前記照射端組および前記受光端組の一方の第2組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第2組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または複数の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光、または白色光を測定用光とする1または複数種類の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または複数の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する光電変換部または分光光度計のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える請求項4に記載の電気泳動全自動処理装置。 When the control unit instructs the measurement of the presence or absence or amount of the target substance labeled with a fluorescent substance in the product or chemical substance solution, when the control unit instructs the measurement.
Move the nozzle to the containment area where the product or chemical solution is contained and
The pair selection interlocking switching unit belongs to the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the irradiation end and the light receiving end belonging to the other first set of the irradiation end set and the light receiving end set, respectively. One or more types that select a pair of the irradiation measurement end set and the light receiving measurement end set that can be connected to, and optically connect to one or two or more irradiation measurement ends belonging to the selected irradiation measurement end set. Only one or more light sources using the excitation light of the wavelength of (1) as the measurement light are turned on, and the excitation light optically connected to one or more light reception measurement ends belonging to the selected light reception measurement end set is used. Only the photoelectric transformation tube portion via the bandpass filter capable of passing the excited fluorescence is turned on, and the connection and cutoff between the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end are interlocked. Sequential switching,
When the control unit gives an instruction for analysis processing using electrophoresis of the target substance, one end of each electrophoresis capillary is contained in each moving fluid accommodating portion in which the electrophoresis sample is accommodated. To insert
The pair selection interlocking switching unit includes an irradiation end and a light receiving end that belong to the second set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the other second set of the irradiation end set and the light receiving end set, respectively. One or a plurality of wavelengths that select a pair of the irradiation measurement end set and the light receiving measurement end set that can be connected and optically connect to one or a plurality of irradiation measurement ends belonging to the selected irradiation measurement end set. Only one or more types of light sources using the excitation light or white light as measurement light are turned on, and the excitation is optically connected to one or more light receiving measurement ends belonging to the selected light receiving measurement end set. Only the photoelectric conversion unit or spectrophotometer via a bandpass filter capable of passing fluorescence excited by light is turned on, and the connection and disconnection between the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end are cut off. The fully automatic electrophoretic processing apparatus according to claim 4 , wherein the devices are sequentially switched in conjunction with each other.
1列状に前記行方向に沿って可変ピッチで配列された前記複数の可動液収容部からなる1群の可動液収容部群または該可動液収容部群が列方向に間隔を開けて並列に複数群設けられた可変ピッチ液収容架台と、該架台を前記行方向に沿って前記第1のピッチごとまたは前記電気泳動前処理部と前記キャピラリー電気泳動部との間を移動するように設けられた架台移動部と、前記可変ピッチを前記第2のピッチと前記第3のピッチの間で変換可能に設けられたピッチ変換機構とを有し、前記電気泳動用キャピラリーの一端部は1群の可動液収容部群に属する複数の前記可動液収容部に一斉に挿入可能に設けられた請求項6に記載の電気泳動全自動処理装置。 In the electrophoresis pretreatment unit, the nozzles are provided so as to be movable only in the column direction and the vertical direction, and are provided so as to be arranged in a row along the row direction at a first pitch. The groups are provided so as to extend in a single row or a plurality of rows along the column direction and are arranged at a second pitch along the row direction. A plurality of flow tubes extending along the column direction and arranged in the row direction at a third pitch, and attached to a group of nozzles arranged at the second pitch among the nozzles. Are provided so that they can be inserted into each housing all at once.
A group of movable fluid accommodating portions or a group of movable fluid accommodating portions composed of the plurality of movable fluid accommodating portions arranged in a row at a variable pitch along the row direction are arranged in parallel at intervals in the column direction. A plurality of groups of variable-pitch liquid accommodating pedestals are provided so as to move the gantry along the row direction for each of the first pitches or between the electrophoresis pretreatment unit and the capillary electrophoresis unit. It has a gantry moving portion and a pitch conversion mechanism provided so that the variable pitch can be converted between the second pitch and the third pitch, and one end of the electrophoresis capillary is a group. The fully automatic electrophoresis processing device according to claim 6 , which is provided so as to be able to be inserted into a plurality of the movable liquid storage units belonging to the movable liquid storage unit group all at once.
前記目的物質のサンプルからの抽出処理、および加工処理、並びに各処理に関する生成物または化学物質の品質評価を経て得られた前記目的物質を含む電気泳動用試料を、前記各電気泳動用キャピラリーに供給可能とする電気泳動前処理工程と、
前記キャピラリー電気泳動工程で使用する前記各キャピラリーに関する光の測定および前記電気泳動前処理工程での前記品質評価のための光の測定からなるグループの中から選択して、任意の少なくとも1の測定を実行する光選択測定工程と、
各処理に関する品質評価および目的物質の解析を行う解析工程と、を有し、前記光選択測定工程は、測光内容または前記目的物質を含む前記生成物または前記化学物質により定まる測定用光を照射可能な複数個の導光路の各一端部である照射端を各組に有する複数組の照射端組、および、該照射端組に対応する位置に位置しまたは位置付け可能に設けられ該照射端から照射された測定用光に基づいて生ずる光を各々受光可能な複数個の導光路の各一端部である受光端を各組に有する複数組の受光端組とが設けられ、前記目的物質の電気泳動に基づく解析処理または品質評価の指示があった場合には、前記複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から対となる1組の照射端組および1組の受光端組を選択して、対応する1対の照射端および受光端からなる照射受光対ごとに、前記照射端に所定の測定用光を順次供給し、前記受光端により順次受光した光の強度を測定する照射受光対選択測定工程を有する電気泳動全自動処理方法。 A capillary electrophoresis step in which a target substance is electrophoresed by applying a voltage into a plurality of capillary electrophoresis steps,
An electrophoresis sample containing the target substance obtained through extraction treatment and processing treatment of the target substance from the sample and quality evaluation of the product or chemical substance related to each treatment is supplied to each of the electrophoresis capillaries. The electrophoretic pretreatment process that enables
Select from the group consisting of light measurements for each capillary used in the capillary electrophoresis step and light measurements for quality evaluation in the electrophoresis pretreatment step, and any at least one measurement. The optical selective measurement process to be performed and
Possess the analyzing step to analyze the quality evaluation and objective substance for each treatment, wherein the light selection measuring step, capable of emitting measurement light is determined by the product or the chemical containing photometric content or the target substance A plurality of sets of irradiation ends having an irradiation end, which is one end of each of the plurality of light guide paths, and a position corresponding to the irradiation end set or provided so as to be positioned and irradiating from the irradiation end. A plurality of sets of light-receiving end sets having a light-receiving end, which is one end of each of a plurality of light guide paths capable of receiving light generated based on the measured light, are provided, and electrophoresis of the target substance is performed. When an instruction is given for analysis processing or quality evaluation based on the above, a pair of irradiation end sets and a set of light receiving end sets are selected from the plurality of sets of irradiation end sets and multiple sets of light receiving end sets. Irradiation that selects and sequentially supplies a predetermined measurement light to the irradiation end for each irradiation light receiving pair consisting of the corresponding pair of irradiation ends and the light receiving end, and measures the intensity of the light sequentially received by the light receiving end. electrophoresis fully automatic processing method for chromatic light receiving pair selection measuring step.
前記指示に基づいて、複数組の照射端組および複数組の受光端組の中から、1対の照射端組および受光端組を選択し、指示に応じて選択された所定の測定用光を出射する1または2以上の光源と、選択された前記照射端組に属する照射端との間の接続または遮断と、受光した光を電気信号に変換する1または2以上の光電変換部と、選択された前記受光端組に属する受光端との間の接続または遮断とを、前記照射受光対ごとに連動して切り換える対選択連動切換工程を有する請求項8に記載の電気泳動全自動処理方法。 The irradiation light receiving pair selective measurement step is
Based on the above instructions, a pair of irradiation end sets and light receiving end sets are selected from a plurality of sets of irradiation end sets and a plurality of sets of light receiving end sets, and a predetermined measurement light selected according to the instruction is emitted. A selection of one or more light sources to be emitted, a connection or cutoff between the selected irradiation ends belonging to the irradiation end set, and one or more photoelectric conversion units for converting the received light into an electric signal. The fully automatic electrophoresis processing method according to claim 8 , further comprising a pair selection interlocking switching step of interlocking and switching the connection or disconnection with the light receiving end belonging to the light receiving end set for each irradiation light receiving pair.
前記接続端配列面と前記測定端配列面とが向き合って前記所定方向に沿って摺動するように相対的に移動させて、選択された前記照射接続端および受光接続端と前記照射測定端および受光測定端の各々を連動して接続または遮断を行い、選択された組同士の照射端および受光端の対ごとに、前記照射端とオン状態にある前記光源との接続遮断が、前記受光端とオン状態にある前記光電変換部との接続および遮断と連動して順次行われる請求項9に記載の電気泳動全自動処理方法。 In the pair selection interlocking switching step, the irradiation connection end to which the plurality of irradiation connection ends of each of the other ends of the plurality of light guide paths each having one irradiation end belonging to the irradiation end set belongs to the one end. Each of the set and the light receiving connection end set having the plurality of light receiving connection ends each of the other ends of the plurality of light guide paths having one light receiving end having one light receiving end belonging to the light receiving end set. There are a plurality of sets, and the irradiation connection ends or the light receiving connection ends belonging to the same set are arranged in a row at predetermined intervals along a predetermined direction, and the irradiation connection ends or the light receiving light belonging to different sets that can be paired. The connection ends are optically connected to a plurality of pairs of connection end array having a connection end array surface arranged in parallel at intervals along a direction orthogonal to the predetermined direction, and the light source that can be turned on and off. A plurality of sets of irradiation in which one or more irradiation measurement ends provided so as to be sequentially connectable to the irradiation connection ends belonging to the irradiation connection end set are provided in a row at predetermined intervals along the predetermined direction. One or two or more light receiving measurement ends that are optically connected to the measurement end set and the photoelectric conversion unit that can be turned on and off and are provided so as to be sequentially connectable to the light receiving connection ends belonging to the light receiving connection end set are in the predetermined direction. Multiple pairs of measurement ends having a pair of measurement end array planes in which a plurality of sets of light receiving measurement end sets provided in a row at predetermined intervals are arranged at intervals along a direction orthogonal to the predetermined direction. With a set array,
The irradiation connection end, the light receiving connection end, the irradiation measurement end, and the selected irradiation connection end, the light receiving connection end, and the irradiation measurement end are relatively moved so that the connection end arrangement surface and the measurement end arrangement surface face each other and slide along the predetermined direction. Each of the light receiving measurement ends is connected or cut off in conjunction with each other, and for each pair of the irradiation end and the light receiving end of the selected pair, the connection cutoff between the irradiation end and the light source in the ON state is the light receiving end. The fully automatic electrophoresis processing method according to claim 9 , which is sequentially performed in conjunction with the connection and disconnection of the photoelectric conversion unit in the ON state.
気体の吸引吐出を行う吸引吐出機構と連通し、液体の吸引吐出が可能な流管が着脱可能に装着される複数連のノズルおよび該ノズルに装着された該流管に外部から磁場を及ぼしかつ除去することが可能な磁力部が設けられ、検査対象となるサンプルおよび磁性粒子懸濁液を含む各種の化学物質溶液を収容する液収容部および温度昇降器により温度制御可能な反応容器を少なくとも各々有し前記各ノズルに対応して設けられた複数群の収容部群を有するステージと、前記ノズルと前記ステージとの間を相対的に移動するノズル移動工程を有し、
前記光選択測定工程は、前記照射端組および前記受光端組の一方の第1組は、前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該一方の第2組は前記電気泳動用キャピラリーまたは各泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられ、前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組は、前記一方の第1組と対をなすように前記ノズルまたは吸引吐出機構に設けられ、該他方の第2組は、前記一方の第2組と対をなすように、前記電気泳動用キャピラリーまたは前記泳動後収容部の外側面に接触または接近して設けられることで測定が行われる請求項10に記載の電気泳動全自動処理方法。 The electrophoresis pretreatment step is
A magnetic field is applied from the outside to a plurality of nozzles to which a flow tube capable of sucking and discharging a liquid is detachably attached and a flow tube attached to the nozzle, which communicates with a suction and discharge mechanism for sucking and discharging a gas. At least each of the reaction vessels, which are provided with a magnetic force unit that can be removed and whose temperature can be controlled by a liquid storage unit and a temperature elevator, which accommodate various chemical substance solutions including a sample to be inspected and a magnetic particle suspension. It has a stage having a plurality of groups of accommodating portions provided corresponding to each nozzle, and a nozzle moving step of relatively moving between the nozzle and the stage.
In the light selective measurement step, the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set is provided in the nozzle or the suction / discharge mechanism, and the second set of the one is the capillary for electrophoresis or after each electrophoresis. The first set of the irradiation end set and the other first set of the light receiving end set is provided on the nozzle or the suction / discharge mechanism so as to be paired with the first set of the one, which is provided in contact with or close to the outer surface of the accommodating portion. The second set of the other is provided so as to be paired with the second set of the one, and can be measured by being provided in contact with or close to the outer surface of the electrophoresis capillary or the post-electrophoretic accommodating portion. The fully automatic electrophoresis processing method according to claim 10.
前記生成物または化学物質溶液について、蛍光物質で標識化された目的物質の有無または量の測定が指示された場合には、
前記生成物または化学物質溶液が収容されている収容部にまで前記ノズルを移動した後、
前記照射端組および前記受光端組の一方の前記第1組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第1組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および前記受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または2以上の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光を測定用光とする1または2以上の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または2以上の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する前記光電変換部のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える対選択連動切換工程を有し、
前記目的物質の電気泳動による解析処理の指示があった場合には、
前記電気泳動用試料が収容されている可動液収容部内に前記電気泳動用キャピラリーの一端部を挿入させた後、
前記照射端組および前記受光端組の一方の第2組、および前記照射端組および前記受光端組の他方の第2組に、各々属する照射端および受光端と接続可能となる1対の前記照射測定端組および受光測定端組を選択し、選択された該照射測定端組に属する1または複数の照射測定端と光学的に接続する1または複数種類の波長の励起光、または白色光を測定用光とする1または複数種類の光源のみをオン状態とし、選択された該受光測定端組に属する1または複数の受光測定端と光学的に接続する前記励起光によって励起される蛍光を通過可能なバンドパスフィルタを介する光電変換部または分光光度計のみをオン状態とし、前記照射端および受光端と前記照射測定端および受光測定端との間の接続および遮断とを連動して順次切り換える対選択連動切換工程を有する請求項11に記載の電気泳動全自動処理方法。 The optical selective measurement step is
When instructed to measure the presence or absence or amount of a fluorescent substance-labeled target substance in the product or chemical solution,
After moving the nozzle to a containment containing the product or chemical solution,
A pair that can be connected to the irradiation end and the light receiving end that belong to the first set of one of the irradiation end set and the light receiving end set, and the other first set of the irradiation end set and the light receiving end set, respectively. The irradiation measurement end set and the light reception measurement end set are selected, and excitation light of one or a plurality of wavelengths optically connected to one or more irradiation measurement ends belonging to the selected irradiation measurement end set is measured. Only one or two or more light sources to be used as light are turned on, and the fluorescence excited by the excitation light is optically connected to one or two or more light receiving measurement ends belonging to the selected light receiving measurement end set. Pair-selective interlocking switching that turns on only the photoelectric conversion unit via a possible bandpass filter and sequentially switches the connection and disconnection between the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end. Have a process,
When instructed to analyze the target substance by electrophoresis,
After inserting one end of the electrophoresis capillary into the moving liquid accommodating portion in which the electrophoresis sample is accommodated,
A pair of the above, which can be connected to the irradiation end and the light receiving end to which the second set of one of the irradiation end set and the light receiving end set and the other second set of the irradiation end set and the light receiving end set belong to each other. The irradiation measurement end set and the light reception measurement end set are selected, and one or more kinds of excitation light or white light having one or more kinds of wavelengths optically connected to one or more irradiation measurement ends belonging to the selected irradiation measurement end set are emitted. Only one or more types of light sources used as measurement light are turned on, and pass through the fluorescence excited by the excitation light that is optically connected to one or more light receiving measurement ends belonging to the selected light receiving measurement end set. A pair in which only the photoelectric conversion unit or the spectrophotometer via a possible bandpass filter is turned on, and the connection and disconnection between the irradiation end and the light receiving end and the irradiation measurement end and the light receiving measurement end are sequentially switched in conjunction with each other. The fully automatic electrophoresis processing method according to claim 11 , further comprising a selection-linked switching step.
前記ノズルは1列状に行方向に沿って第1のピッチで配列して設けられ、かつ、列方向および上下方向に沿ってのみ移動可能であり、前記各収容部群は、列方向に沿って1列状または複数列状に延びかつ行方向に沿って第1のピッチまたはその複数倍に相当する第2のピッチで配列され、
1列状または複数列状に前記行方向に沿って第2のピッチで配列された前記複数の可動液収容部からなる1群または複数群の可動液収容部群が設けられた可変ピッチ液収容架台に、第2のピッチで配列された複数の前記ノズルに装着された流管によって、1群の該可動液収容部内に吐出して収容し、前記行方向に沿って該架台を前記第1のピッチごとまたはキャピラリー電気泳動部にまで移動させ、
前記キャピラリー電気泳動工程は、
前記可変ピッチ液収容架台の各可動液収容部の第2のピッチを第3のピッチに変換して、前記電気泳動用キャピラリーの一端部を挿入させて、該キャピラリーの端部間に所定電圧を印加して前記電気泳動用試料に含有する目的物質の泳動を行う請求項13に記載の電気泳動全自動処理方法。 The electrophoresis pretreatment step is
The nozzles are arranged in a row along the row direction at a first pitch, and can be moved only along the column direction and the vertical direction, and each of the accommodating portions groups is arranged along the column direction. They are arranged in a single column or a plurality of columns and along the row direction at a first pitch or a second pitch corresponding to a plurality of times thereof.
Variable pitch liquid storage provided with one or more groups of movable liquid storage units composed of the plurality of movable liquid storage units arranged in a single row or a plurality of rows at a second pitch along the row direction. A flow pipe mounted on the plurality of nozzles arranged at a second pitch on the gantry discharges and accommodates the movable liquid in a group of the movable liquid accommodating portions, and the gantry is housed in the row direction along the first row direction. each of the pitch or move to a key Yapirari electrophoresis unit,
The capillary electrophoresis step is
The second pitch of each movable liquid accommodating portion of the variable pitch liquid accommodating stand is converted into a third pitch, one end of the electrophoresis capillary is inserted, and a predetermined voltage is applied between the ends of the capillary. The fully automatic electrophoresis processing method according to claim 13 , wherein the target substance contained in the electrophoresis sample is electrophoresed by applying the electrophoresis.
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