JP6746945B2 - 情報処理装置、情報処理システム及び情報処理方法 - Google Patents
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Description
上記解析部は、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの動き量を算出し、上記単位時間当たりの動き量に基づいて、上記細胞の細胞周期に関する情報を特定する。
上記情報処理装置は、上記撮像装置が細胞を撮像するように制御する撮像制御部と、上記撮像装置により上記細胞を撮像した画像から単位時間当たりの動き量を算出し、上記単位時間当たりの動き量に基づいて、上記細胞の細胞周期に関する情報を特定する解析部とを有する。
解析部が、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの動き量を算出し、上記単位時間当たりの動き量に基づいて、上記細胞の細胞周期に関する情報を特定する。
[情報処理システムの構成]
図1は、本実施形態に係る情報処理システム1の構成を示す模式図である。同図に示すように、情報処理システム1は、撮像装置11及び情報処理装置12を具備する。また、図1には、観察対象物Sを示す。観察対象物Sは、例えば培養容器中で培養されている細胞とすることができる。細胞の種類は特に限定されないが、がん細胞や幹細胞(ES細胞やiPS細胞)等の分裂細胞が情報処理システム1による解析の対象として好ましい。
方法であればよい。以下、撮像装置11によって撮影された画像を撮像画像とする。
図1に示すように、情報処理装置12は機能的構成として、撮像制御部121、画像取得部122、解析部123及び表示制御部124を備える。図2は、情報処理装置12の動作を示すフローチャートである。
表示制御部124は、解析部123によって算出された単位時間当たりの動き量のパラメータを可視化してもよい(St106)。図6は、図5に示した細胞毎の単位時間当たりの動き量の平均値を可視化した画像の例である。単位時間当たりの動き量の平均値が大きい領域を白色で示す。表示制御部124は、単位時間当たりの動き量のパラメータを可視化した画像をディスプレイ等に出力し、ユーザーに提示することができる。可視化画像は、撮像時間の異なる複数の撮像画像に対して生成してもよく、また解析部123にて特定した個別細胞のみを抽出して生成してもよい。ユーザーは、この画像を参照して単位時間当たりの動き量細胞周期に関する情報を推定することが可能となる。
上記のような情報処理装置12の機能的構成は、以下に示すハードウェア構成によって実現することが可能である。
次に、本開示の第2の実施形態について説明する。第2の実施形態の「情報処理システムの構成」、「情報処理装置のハードウェア構成」は、第1の実施形態と同様である。第2の実施形態では、細胞周期に関する情報を特定するのではなく、細胞内代謝状態又は細胞内骨格の状態を評価する際に本開示を適用した場合について説明する。
第2の実施形態における情報処理装置の機能的構成は、第1の実施形態の図1に示す構成と同様である。また、情報処理装置12の構成としての撮像制御部121及び画像取得部122、撮像装置11も第1の実施形態と同様であるため、解析部123及び表示制御部124について具体的に説明する。図18は、本実施形態に係る情報処理装置12の動作を示すフローチャートである。
U2OS細胞を48時間非血清培養液で培養した後、10%のウシ胎児血清を加え、細胞間の細胞周期同調を行った。非血清培養液で培養すると細胞周期はS期の前で停止し、ウシ胎児血清を加えると細胞周期がS期から開始されるため、培養されているほとんどの細胞の細胞周期を同調させることが可能である。ウシ退治血清を加えた時点から1時間おきに経時的に位相差顕微鏡で画像(動画)を撮像した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間60秒とした。
位相差顕微鏡によりU2OS細胞の画像(動画)を撮像した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間60秒とした。その後、染色手法(Cell clock: biocolor)によりG1期とG2期を識別した。
U2OS細胞を高密度で播種し、1時間おきに継続的に位相差顕微鏡で画像(動画)を撮像した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間60秒とした。約1μm間隔で動きベクトルを算出後、撮像画像内の単位時間当たりの動き量(動き速度)の時空間的平均を算出した。撮像画像内で細胞が占める割合から細胞領域も算出した。
位相差顕微鏡によりU2OS細胞の画像(動画)を撮像した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間60秒とした。図11は、撮像された位相差画像とその拡大図を示す。位相差画像では、細胞の辺縁部(主に仮足)、細胞内顆粒及び細胞内繊維が観察される。
位相差顕微鏡によりU2OS細胞の画像(動画)を撮像した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間60秒とした。約1μm間隔で動きベクトルを算出後、画像から3つの細胞を特定し、各細胞毎に単位時間当たりの動き量(動き速度)の平均を算出した。
位相差顕微鏡により異なる条件で培養されたU2OS細胞の画像(動画)を撮像した。微小管を安定化するPaclitaxel 2μMを投与した細胞、微小管を不安定化するNocodazole 2μMを投与した細胞、何も投与していない比較細胞の3種類を準備した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間20分とした。約1μm間隔で動きベクトルを算出後、各座標の単位時間当たりの動き量(動き速度)の時空間的平均を算出し、カラーマップを作成した。また、撮像画像内で細胞が占める割合から細胞領域、所定の動き速度以上の動き速度を示す動き領域を算出し、細胞領域に対する動き領域の割合を示す相対動き領域を特定し、グラフを作成した。
位相差顕微鏡により異なる薬剤濃度にて培養されたU2OS細胞の画像(動画)を撮像した。薬剤は代謝阻害剤として用いられるミトコンドリア脱共役剤であるCCCPを用い、0.5、5、50μMの三種類の薬剤濃度の細胞と何も投与していない比較細胞とを準備した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間20分とした。約1μm間隔で動きベクトルを算出後、相対動き領域を算出し、グラフを作成した。
位相差顕微鏡により異なる薬剤濃度にて培養されたU2OS細胞の画像(動画)を撮像した。薬剤はATPを競合的に阻害するATPアナログであるAMP−PNP、モータータンパク質阻害剤であるATAとを用い、それぞれの薬剤について67、200、670μM、10、30、100μMの三種類の薬剤濃度の細胞と何も投与していない比較細胞とを準備した。顕微鏡拡大倍率は20倍、撮像間隔5フレーム/秒、撮像時間60分とした。約1μm間隔で動きベクトルを算出後、単位時間当たりの動き量(動き速度)の平均を算出し、グラフを作成した。
細胞を撮像した画像から単位時間当たりの動き量を算出し、上記単位時間当たりの動き量に基づいて、上記細胞の細胞周期に関する情報を特定する解析部
を具備する情報処理装置。
上記(1)に記載の情報処理装置であって、
請求項1に記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、上記画像から動きベクトルを抽出し、上記動きベクトルから上記単位時間当たりの動き量を算出する
情報処理装置。
上記(1)又は(2)に記載の情報処理装置であって、
請求項1に記載の情報処理装置であって、
上記細胞周期に関する情報を可視化する表示制御部
をさらに具備する情報処理装置。
上記(3)に記載の情報処理装置であって、
上記表示制御部は、上記細胞周期に関する情報を上記画像に重畳させた画像を生成する
情報処理装置。
上記(3)又は(4)に記載の情報処理装置であって、
上記表示制御部は、さらに、上記単位時間当たりの動き量を可視化する
情報処理装置。
上記(1)から(5)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、細胞周期の位置又は細胞周期の長さを上記細胞周期に関する情報として特定する
情報処理装置。
上記(1)から(6)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、上記単位時間当たりの動き量の平均値又は中央値を算出し、上記平均値又は中央値に基づいて上記細胞周期に関する情報を特定する
情報処理装置。
上記(1)から(7)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、上記画像上でユーザーにより指定された範囲から算出された上記単位時間当たりの動き量に基づいて上記細胞周期に関する情報を特定する
情報処理装置。
上記(1)から(7)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、上記画像に対する画像認識処理結果と上記単位時間当たりの動き量に基づいて上記細胞周期に関する情報を特定する
情報処理装置。
上記(9)に記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、上記画像から上記少なくとも一つの細胞の範囲を特定し、上記画像において上記少なくとも一つの細胞の範囲に該当する領域から算出された上記単位時間当たりの動き量に基づいて上記細胞周期に関する情報を特定する
情報処理装置。
上記(9)に記載の情報処理装置であって、
上記解析部は、上記画像から少なくとも一つの細胞の細胞内構造の範囲を特定し、上記画像において上記細胞内構造の範囲に該当する領域から算出された上記単位時間当たりの動き量に基づいて上記細胞周期に関する情報を特定する
情報処理装置。
上記(1)から(11)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記単位時間当たりの動き量が算出される画像の撮像間隔が1秒以下となるように撮像装置を制御する撮像制御部
をさらに具備する情報処理装置。
上記(1)から(12)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記細胞は、単一の分裂細胞又は分裂細胞群である
情報処理装置。
上記(1)から(13)のうちいずれか一つに記載の情報処理装置であって、
上記細胞は、がん細胞又は幹細胞である
情報処理装置。
撮像装置と、
上記撮像装置が細胞を撮像するように制御する撮像制御部と、上記撮像装置により上記細胞を撮像した画像から単位時間当たりの動き量を算出し、上記単位時間当たりの動き量に基づいて、上記細胞の細胞周期に関する情報を特定する解析部とを有する情報処理装置と
を具備する情報処理システム。
上記(15)に記載の情報処理システムであって、
上記撮像制御部は、1秒以下の撮像間隔で上記単位時間当たりの動き量が算出される画像を撮像するように上記撮像装置を制御する
情報処理システム。
解析部が、細胞を撮像した画像から単位時間当たりの動き量を算出し、上記単位時間当たりの動き量に基づいて、上記細胞の細胞周期に関する情報を特定する
情報処理方法。
11…撮像装置
12…情報処理装置
121…撮像制御部
122…画像取得部
123…解析部
124…表示制御部
Claims (13)
- 細胞を撮像した画像に対する画像認識処理結果に基づいて前記画像に含まれる細胞の範囲を特定し、前記画像において前記細胞の範囲に該当する領域から単位時間当たりの動き量を算出し、前記単位時間当たりの動き量の推移に基づいて前記細胞の細胞周期に関する情報を特定する解析部
を具備する情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記解析部は、前記画像から動きベクトルを抽出し、前記動きベクトルから前記単位時間当たりの動き量を算出する
情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記細胞周期に関する情報を可視化する表示制御部
をさらに具備する情報処理装置。 - 請求項3に記載の情報処理装置であって、
前記表示制御部は、前記細胞周期に関する情報を前記画像に重畳させた画像を生成する
情報処理装置。 - 請求項3に記載の情報処理装置であって、
前記表示制御部は、さらに、前記単位時間当たりの動き量を可視化する
情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記解析部は、細胞周期の位置又は細胞周期の長さを前記細胞周期に関する情報として特定する
情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記解析部は、前記単位時間当たりの動き量の平均値又は中央値を算出し、前記平均値又は中央値に基づいて前記細胞周期に関する情報を特定する
情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記単位時間当たりの動き量が算出される画像の撮像間隔が1秒以下となるように撮像装置を制御する撮像制御部
をさらに具備する情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記細胞は、単一の分裂細胞又は分裂細胞群である
情報処理装置。 - 請求項1に記載の情報処理装置であって、
前記細胞は、がん細胞又は幹細胞である
情報処理装置。 - 撮像装置と、
前記撮像装置が細胞を撮像するように制御する撮像制御部と、前記撮像装置により前記細胞を撮像した画像に対する画像認識処理結果に基づいて前記画像に含まれる細胞の範囲を特定し、前記画像において前記細胞の範囲に該当する領域から単位時間当たりの動き量を算出し、前記単位時間当たりの動き量の推移に基づいて前記細胞の細胞周期に関する情報を特定する解析部とを有する情報処理装置と
を具備する情報処理システム。 - 請求項11に記載の情報処理システムであって、
前記撮像制御部は、1秒以下の撮像間隔で前記単位時間当たりの動き量が算出される画像を撮像するように前記撮像装置を制御する
情報処理システム。 - 解析部が、細胞を撮像した画像に対する画像認識処理結果に基づいて前記画像に含まれる細胞の範囲を特定し、前記画像において前記細胞の範囲に該当する領域から単位時間当たりの動き量を算出し、前記単位時間当たりの動き量の推移に基づいて前記細胞の細胞周期に関する情報を特定する
情報処理方法。
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