JP5567016B2 - ヌクレアーゼプロドラッグの酵素アクチベーターとしてのプリンヌクレオシドホスホリラーゼ - Google Patents
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Description
反応:プリンヌクレオシド + PO4 → リボース-1-PO4 (またはデオキシリボース-1-リン酸) + プリン塩基
を触媒する。本発明は、野生型トリコモナス・ヴァジナリスプリン切断酵素をコードするヌクレオチド配列およびアミノ酸配列、ならびに、それぞれ他の生物由来の構造的に関連する野生型PNP酵素に比べて驚くほど高い切断特異的基質における生物学的活性を有するtm-PNP配列、およびテール化酵素が由来する野生型配列を提供する。
(a) Tv-PNPまたはtm-PNPをコードする核酸で標的哺乳動物細胞を形質転換または形質導入する、あるいは標的細胞の近隣に直接そのような酵素を提供する工程;
(b) Tv-PNP切断酵素を発現する、またはTv-PNP切断酵素を提供される標的細胞を、前記酵素に対する基質と接触させ、野生型または置換体大腸菌PNPおよび他のPNPよりも多量に毒性プリン塩基を生成し、それにより標的細胞および切断酵素を発現しないまたは切断酵素と接触しないバイスタンダー細胞を殺す工程。そして、基質の存在下で、Tv-PNPまたはtm-PNP切断酵素は毒性生成物を生成する。本発明の作用は、ヒトまたは非ヒト哺乳動物、または他の細胞とともに、in vitroまたはin vivoで生じうる。
好ましい実施態様において、Tv-PNPまたはtm-PNPは、哺乳動物細胞におけるTv-PNPまたはtm-PNPの発現が、PNPコード配列に連結した真核生物転写制御配列の存在により達成されるように、原核生物遺伝子上にコードされる。前記Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子は、例示的に、市販のプラスミド(例えば、SV40アーリープロモーター/エンハンサー (pSVK30 Pharmacia, Piscataway, NJ)、モロニーマウス腫瘍ウイルス長末端リピート(pBPV, Pharmacia)、マウス乳癌ウイルス長末端リピート(pMSG, Pharmacia)、およびサイトメガロウイルスアーリープロモーター/エンハンサー (pCMVβ, Clontech, Palo Alto, CA))内で得られる強力な構成的プロモーター/エンハンサーエレメントの制御下で発現される。
(i) 制御配列は、十分な遺伝子発現を引き起こし、標的細胞において治療のための量で酵素の生産をもたらす、
(ii) 制御配列は、非標的細胞において十分な量の酵素の生産を引き起こさず、治療アプローチを損なわない。
適切な組換えウイルスの構築および、哺乳動物細胞へのTv-PNPまたはtm-PNPの転移のための、\アデノウイルスの使用が提供される。非ウイルス遺伝子送達もまた使用することができる。例として、担体または安定化剤の非存在下のDNA(「ネーキッドDNA(naked DNA)」)、薬学的安定化剤または担体の存在下のDNA(「配合したDNA」)、細胞中への導入を容易にするタンパク質と複合体化したDNA(「分子コンジュゲート」)、あるいは脂質へ複合体化したDANの分散を含む。哺乳動物細胞への微生物PNP遺伝子の脂質介在送達の使用が、本明細書で例示される。特に、非ヒトPNP遺伝子を含むプラスミドのカチオン性リポソーム介在転移が示される。Tv-PNP遺伝子を細胞に転移する特定の方法は、標的細胞阻害に成功したことの単なる提示ではないため、他の遺伝子転移方法はまた、一般的に適用可能である。そして、さらに下記で記載される、ウイルス由来転移ベクターを利用する遺伝子送達もまた使用できる。そのような方法は、よく知られており、本明細書に記載される遺伝子介在毒物治療における使用に容易に応用できる。
治療方法は、例示的に、本発明のTv-PNPまたはtm-PNP遺伝子またはタンパク質を有する細胞を適切な基質に暴露しつつ、Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子を細胞に、形質転換または他の方法で投与する工程を含む。基質は、Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子を発現する細胞、ならびにTv-PNPまたはtm-PNP遺伝子発現細胞の近隣にあるバイスタンダー細胞を、細胞毒性プリンアナログ濃度に依存して、阻害するまたは殺す、毒性プリンアナログに変換される。Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子は、例示的に、直接標的細胞に投与される、あるいは、特定のウイルスベクターまたは送達配合物を介するような、標的組成物と組み合わせて全身投与される。好ましくは細胞は、治療する患者中in vivoで処理され、あるいはin vitroで処理され、その後患者に注射される。患者内の細胞へのTv-PNPまたはtm-PNP遺伝子の導入後、Tv-PNPまたはtm-PNPによる標的細胞に対する細胞毒性プリンアナログへの変換に十分な量で、プロドラッグを全身または局所投与する。プロドラッグは、任意に、本発明のTv-PNPまたはtm-PNPの投与前、投与と一緒に、または投与の後に送達される。好ましくは、Tv-PNPまたはtm-PNPの投与に続いて、プロドラッグを投与する。
Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子を任意に戦略の一部として使用して、メラノーマ、膵臓癌、肝臓癌または大腸癌のような、転移性固形腫瘍を治療する。この方法では、腫瘍特異的プロモーターの制御下にあるTv-PNPまたはtm-PNP遺伝子を含むプラスミドDNAを任意に使用する。例えば、チロシナーゼプロモーターは、メラノーマ細胞における発現の仲介に対して高度に特異的であり、ほとんどの組織タイプでは遺伝子発現を導かない。このプロモーターの制御コントロール下にあるTv-PNPまたはtm-PNP遺伝子は、メラノーマ腫瘍において大部分で活性化されており、米国特許第6,017,896号で大腸菌PNPについて示されたように、患者内の他の部分では活性化しない。他の腫瘍タイプに特異的なプロモーター、例えば、全ての固形腫瘍に存在する、迅速に分裂する上皮細胞において活性なプロモーターを使用して、初期または転移性腫瘍においてのみTv-PNPまたはtm-PNPを特異的に活性化する。この方法では、腫瘍特異的プロモーターの制御下にあるTv-PNPまたはtm-PNPを含むプラスミドDNAを、カチオン性リポソームを使用して細胞に送達する。例えば、動物実験に基づいて、1200から3600マイクロモルの脂質DOTMA(1,2-ジオレイルオキシプロピール-3-トリメチルアンモニウムブロミド)とDOPE(ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン)の1:1混合物と複合化した100mgから400 mgのプラスミドDNAを使用して、患者における腫瘍転移物にTv-PNPまたはtm-PNP遺伝子を送達することができた。その後上記の量のプロドラッグを投与できる。腫瘍の医学的治療を、金銭的および治療的な有益性のために実行することができる。
腫瘍細胞を阻害し、しばしば殺すことに加えて、本明細書に記載の方法を使用して、ウイルス感染細胞を殺すことができる。ウイルス殺傷実施態様において、ウイルス感染細胞における切断酵素の発現を標的化する能力に対して、選択的な遺伝子送達方法を選択する。例えば、ウイルス感染細胞は、ウイルス特異的プロモーターのような遺伝子発現を制御および許可する特別なウイルス遺伝子配列を利用する。そのような配列は、非感染細胞には存在しない。Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子は、ウイルス感染細胞における切断酵素の選択的発現を生み出すウイルスプロモーターのような点に関して適切に方向付けられる。それにより、ウイルス感染細胞は、毒性形態に変換されるように設計されるF-araAまたは他の基質の投与に感受性である。
本発明のベクターで形質転換した宿主細胞もまた提供される。
プロドラッグを有する、または有さないTv-PNPまたはtm-PNPタンパク質は、任意に、Tv-PNPまたはtm-PNP遺伝子よりも標的細胞に直接送達される。例示的に、プリンアナログヌクレオチドを切断することができるTv-PNPまたはtm-PNP酵素を、市販のキットを使用する、利用可能な組換えタンパク質技術により製造する。微生物Tv-PNPタンパク質を生成する方法の一例として、Tv-PNPコード配列を、標準技術を使用してグルタチオン-s-トランスフェラーゼ(GST)と「インフレーム(in frame)」となるように、pGEX-4T-1 (Pharmacia, Piscataway, NJ)のマルチクローニングサイトにライゲーションする(このベクターのクローニングサイトにより、3つの全ての可能な翻訳リーディングフレームにおいてコード配列を挿入するようにしてこの工程を容易とすることに注意)。得られるプラスミドは、IPTG誘導原核tacプロモーターの転写制御下にある配列をコードするGST-PNP融合を含む。T. vaginalis細胞を、組換えプラスミドで形質転換し、tacプロモーターをIPTGで誘導する。IPTG誘導細胞を溶菌し、GST-PNP融合タンパク質を、グルタチオンセファロース4Bカラム上のアフィニティクロマトグラフィにより精製する。GST-PNP融合タンパク質を溶出し、トロンビン切断異より分子のGST部分を除去する。これらの技術および試薬の全ては、市販されている(Pharmacia, Piscataway, NJ)。組換えタンパク質精製のための他の方法は、公開された研究室マニュアルに詳述されている。
Freidenreich et al., Cancer Chemother. Rep., 50:219-244, (1966)の式を任意に使用して、ヒト被験者に対する基質の最大許容投与量を決定する。例えば、1日あたり、1kgあたり25mg(MeP-dR)の全身投与を9日間(9総ドーズ(dose))行うことにより、いくぶんかの毒性がもたらされるが、致死ではない。この結果より、75 mg MeP-dR/m2のヒト用量が、式:25 mg/kg x 3=75 mg/m2により決定された。この量または少し少ない量は、被験者を殺すことなく、ヒトにおける腫瘍細胞殺傷を最大化し、それにより安全プロフィールに好ましい薬効を生み出すと期待される。この有効性の標準は、癌治療の分野で受容されている。より好ましくは、最大許容用量の約10%から1%の範囲(例えば、7.5 mg/m2から0.75 mg/m2)の薬剤レベルで投与する。基質を、腫瘍の部位で、またはその近辺で局在し続けさせる投与モードは、全身投与基質よりもより低い容量で有効であることが理解される。
本発明は、Tv-PNPをコードするDNA配列を含むベクターを提供する。前記ベクターは、さらに、前記核酸配列が、宿主中で転写および翻訳されるような核酸配列に連結して作用する制御因子を含む。好ましくは、ベクターはウイルスまたはプラスミドである。適切なウイルスベクターの例示的事例は、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、ワクシニアウイルス、ヘルペスウイルス、および化学的ウイルス構造体、例えばアデノレトロウイルスベクターを含む。有用なアデノウイルスベクターは、2型または5型のようなヒトアデノウイルス、例示的にトリ、ウシ胎仔、イヌ、マウス、ヒツジ、ブタまたはサル始原のような、動物始原のアデノウイルスである。
本発明のTv-PNP酵素を、in vitroおよびin vivoにおいて転写および翻訳する。in vivoにおいて前記タンパク質を生成するために、特異的Tv-PNPをコードする核酸を含むベクターを、in vivoまたはex vivoにおいて細胞に導入する。これは、本明細書に概説されるベクターを介する、動物へ細胞を戻す再導入を含む。別の実施態様において、興味のあるタンパク質を細胞内または無細胞系において、in vitroで生成する。この方法で生成したタンパク質を、in vitroで使用して、あるいは細胞または動物に導入して、所望の結果を生み出す。
適切な基質は、細胞毒性切断プリン塩基アナログに比較して、哺乳動物細胞に比較的非毒性であることを特徴とする。基質のいくつかの例として以下を列記する。複数の化合物の後に、一般的な略号が含まれ、セミコロンで補足される。
9-(β-D-アラビノフラノシル)-2-フルオロアデニン;F-araA、フルダラビン
9-(2-デオキシ-β-D-リボフラノシル]-6-メチルプリン;MeP-dR
9-(β-D-リボフラノシル)-2-アミノ-6-クロロ-1-デアザプリン;ACDP-R
7-(β-D-リボフラノシル)-3-デアザグアニン
2-フルオロ-2’-デオキシアデノシン
9-(5-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-6-メチルプリン
2-フルオロ-5’-デオキシアデノシン
2-クロロ-2’-デオキシアデノシン;Cl-dAdo、クラドリビン
5’-アミノ-5’-デオキシ-2-フルオロアデノシン
9-(5-アミノ-5-デオキシ-β-D-リボフラノシル)-6-メチルプリン
9-(α-D-リボフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,3-ジデオキシ-β-D-リボフラノシル)-6-メチルプリン
2’,3’-ジデオキシ-2-フルオロアデノシン
9-(3-デオキシ-β-D-リボフラノシル]-6-メチルプリン
2-フルオロ-3’-デオキシアデノシン
9-(α-L-リキソフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(α-L-リキソフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6-デオキシ-β-D-アロフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6-デオキシ-β-D-アロフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(6-デオキシ-α-L-タロフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6-デオキシ-α-L-タロフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,6-ジデオキシ-β-D-アロフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6-ジデオキシ-β-D-アロフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,6-ジデオキシ-α-L-タロフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6-ジデオキシ-α-L-タロフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(6,7-ジデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6,7-ジデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(6,7-ジデオキシ-β-D-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6,7-ジデオキシ-β-D-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,6,7-トリデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6,7-トリデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,6,7-トリデオキシ-β-D-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6,7-トリデオキシ-β-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,3-ジデオキシ-3-ヒドロキシメチル-α-D-リボフラノシル)-6-チオグアニン
9-(2,6-ジデオキシ-α-L-タロフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6-ジデオキシ-α-L-タロフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(6,7-ジデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6,7-ジデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(6,7-ジデオキシ-β-D-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(6,7-ジデオキシ-β-D-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,6,7-トリデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6,7-トリデオキシ-α-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,6,7-トリデオキシ-β-D-ヘプタ-6-イノフラノシル)-6-メチルプリン
9-(2,6,7-トリデオキシ-β-L-ヘプタ-6-イノフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(2,3-ジデオキシ-3-ヒドロキシメチル-α-D-リボフラノシル)-6-チオグアニン
9-(5,5-ジ-C-メチル-β-D-リボフラノシル)-2-フルオロ-アデニン
9-(5,5-ジ-C-メチル-β-D-リボフラノシル)-6-メチルプリン
9-(5-デオキシ-5-ヨード-β-D-リボフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(5-デオキシ-5-ヨード-β-D-リボフラノシル)-6-メチルプリン
9-(5-デオキシ-5-メチルチオ-β-D-リボフラノシル)-2-フルオロアデニン
9-(5-デオキシ-5-メチルチオ-β-D-リボフラノシル)-6-メチルプリン
さらなる例が、Ichikawa E.およびKato K., Curr. Med. Chem. 2001 Mar; 8(4): 385-423にみられる。
T. vaginalisゲノムDNAを、メトロニダゾール抵抗株(R: CDC955)由来の第一のDNAクローン、および感受性株(S3: CDC520)由来の第二のDNAクローンとともに取得する。TvPNP遺伝子を、AccuPrime Pfx supermix (Invitrogen)を使用して、両方のサンプルから以下のプライマーを使用するPCRにより増幅する。TIGRトリコマナスゲノムプロジェクトウェブサイトからダウンロードしたTvPNP配列に基づき、プライマーを設計する。配列は、GenBank (XM_001323400)で現在利用可能である。本明細書で使用するTv-PNPプライマーは、その中に括弧の制限酵素部位を有するものを含む:
フォワードプライマーTvPNP-F: 5’-GTTAACGGATCCATGGCAACACCCCATAACTCTGCT -3’ (HpaI & BamHI) (配列番号1)
Tv-PNPリバースプライマーTvPNP-R: 5’ -TCTAGAGTTAACGTCCTTATAATTTGATTGCTGCTTC -3’ (XbaI & HpaI) (配列番号2)、および
TvPNP-R1: 5’- ATAGTTTAGATCCGAGGACCAATCAT- 3’ (配列番号3)
野生型Tv-PNPのヌクレオチド配列が、配列番号4として示される。野生型Tv-PNPのアミノ酸配列は配列番号5である。
以下の方法は、野生型大腸菌PNPまたは他のPNPよりも、野生型Tv-PNPによって、より有効に切断される基質を同定するために有用である。その後、この方法により同定されたプロドラッグを、動物実験において、毒性の決定、種々の薬剤担体を投与するための適性、ならびに他の薬学的特性において検査することができる。
実施例2の手順ににより、種々の始原のPNPの相対的な切断活性を比較して、重要な化学治療剤であるMeP-dRおよびF-araAの切断に対して最適な酵素を決定する。種々の純度の酵素を、100μMのMeP-dRまたはF-araAとインキュベートし、切断速度を、実施例2に記載されたHPLCによる生成物(MePまたはF-Ade)の生成を測定することにより決定する。結果は、表2に示される。
2,134ヌクレオチド塩基に相当する、野生型大腸菌PNP由来のヌクレオチド配列を、pACCMV.plpAアデノウイルストランスファーベクターのEcoRIおよびXbaI部位にクローニングした。この配列は、野生型大腸菌PNPから、他で残基1634として存在するアデノシン残基を欠く点で異なっている。野生型大腸菌PNPにおいて“GGTAA”を生み出すこの塩基削除は、“GAG”(グルタミン酸に相当する239番目のコドン)および終結コドンに相当する“TAA”であった。得られるフレームシフトにより、野生型大腸菌PNPにおいてみられるグルタミン酸の末端(239番目の残基)として、グルタミン酸の位置に30アミノ酸テールを生じる。このテール変異PNPに相当する認識配列(cogenics sequence)が、ハイライトされたテール変異PNPの開始(atg)および終結(taa)コドン、ならびにアデノウイルストランスファーベクター配列のフレームシフト領域として、図7に示される。あるいは、図7の塩基919から1632の間に伸長するヌクレオチド配列は、野生型PNPヌクレオチド配列に相当する。
図7のヌクレオチドを改変して、塩基1705の後のアデノシン残基を挿入し、野生型大腸菌PNPの末端のグルタミン酸の位置に、24アミノ酸テールを有する終結コドン(TAA)を作り出した。tm-PNPに付加したこの24アミノ酸テールは、図4に詳述したようなpACCMV.pLpAアデノウイルストランスファーベクターにクローニングした配列であり、配列番号9に示される。発現するアミノ酸配列を、配列番号10に示す。
実施例4の手順を、Tv-PNPからTAA削除を繰り返し、アデノウイルス発現ベクターにおけるポリペプチドテールを付加した。この30残基末端テール化tmTv-PNPは、図4に詳述したようなpACCMV.pLpAアデノウイルストランスファーベクターにクローニングした配列であり、配列番号11に示される。発現するアミノ酸配列を、配列番号12に示す。
Claims (11)
- 哺乳動物癌細胞またはウイルス感染細胞の近隣に提供されて細胞毒性プリンアナログを得ることによって、前記哺乳動物癌細胞またはウイルス感染細胞を阻害するための組成物であって、
1)テール変異プリンヌクレオシドホスホリラーゼ酵素、または、前記細胞において発現可能であり、かつ、テール変異プリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードするヌクレオチド配列、および
2)細胞毒性プリンアナログを得るために前記酵素によって切断可能な基質
を含み、
前記テール変異プリンヌクレオシドホスホリラーゼ酵素が、終始ストップコドンを除去したフレームシフト変異によって得られる、組成物。 - 前記基質が、9-(β-D-アラビノフラノシル)-2-フルオロアデニン(フルダラビン)、クラドリビン、コルディセピンのアナログ、2’,3’-ジデオキシアデノシンのアナログ、5’-メチル(talo)-6-メチルプリン-リボシド、5’-メチル(talo)-2’-デオキシ-6-メチルプリン-リボシド、5’-メチル(allo)-6-メチルプリン-リボシド、2-F-5’-デオキシアデノシン、または2-F-α-L-リキソ-アデニンである、請求項1に記載の組成物。
- 前記細胞において発現可能な前記酵素のためのヌクレオチド配列をコードするウイルスベクターを含む、請求項1または2に記載の組成物。
- 前記組成物が、前記細胞において発現可能な酵素のためのヌクレオチド配列を含み、かつ、直接注入、感染、リポフェクション、または微粒子的投与によって提供される、請求項1から3のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記組成物が、前記細胞の近傍における直接注入によって提供される、請求項1から4のいずれか一項に記載の組成物。
- テール変異プリンヌクレオシドホスホリラーゼを発現するよう改変した被験者または被験者細胞へ投与するための、請求項1から5のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記酵素をコードする発現可能なヌクレオチド配列の細胞内送達のために提供するための、請求項1から6のいずれか一項に記載の組成物。
- 哺乳動物癌細胞またはウイルス感染細胞の溶解物;
テール変異プリンヌクレオシドホスホリラーゼ酵素;および
前記酵素により細胞毒性プリンアナログを得るよう切断可能である基質
を含む、請求項1に記載の組成物。 - 前記テール変異プリンヌクレオシドホスホリラーゼ酵素が、10から50アミノ酸残基のテールを有する、請求項8に記載の組成物。
- 前記基質が、フルダラビン、クラドリビン、コルディセピンのアナログ、2’,3’-ジデオキシアデノシンのアナログ、5’-メチル(talo)-6-メチルプリン-リボシド、5’-メチル(talo)-2’-デオキシ-6-メチルプリン-リボシド、5’-メチル(allo)-6-メチルプリン-リボシド、2-F-5’-デオキシアデノシン、または2-F-α-L-リキソ-アデニンを含む群より選択される、請求項8または9に記載の組成物。
- ウイルスタンパク質をさらに含む、請求項8から10のいずれか一項に記載の組成物。
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