JP5242418B2 - 核酸構築体および変化した種子油組成の生成方法 - Google Patents
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Description
本出願は、米国特許法第119条第(e)項の下、2006年2月13日出願、名称「改変遺伝子サイレンシング」の米国仮出願第60/772,614号;2006年3月10日付けで出願された、名称「ダイズ種子および油の組成ならびにその作製方法」の米国仮出願第60/781,519号、および2006年3月16日付けで出願された、名称「核酸構築体および変化した種子油組成の生成方法」の米国出願第11/376,328号の優先権を主張するものである。
配列表の紙原稿、および、ファイル名が「Omni2 AS FILED.txt」であり、サイズが60,690バイト(MS−DOSで測定)であり、2003年9月25日に記録され、米国出願第10/669,888号において提出されたファイルを含むディスケット上のコンピュータ−可読形態の配列表を、ここに出典明示して本明細書の一部とみなす。配列表の紙原稿、および、ファイル名が「OmniChild.txt」であり、サイズが61,434バイト(MS−DOSで測定)であり、2006年3月15日に記録されたファイルを含むディスケット上のコンピュータ−可読形態の配列表を、ここに出典明示して本明細書の一部とみなす。
図1〜4は、それぞれ例示的な核酸分子の配置を示す。
図5(a)〜(d)および図6(a)〜(c)は、それぞれ第1の組のDNA配列の例示的な配置を示す。
図7〜20は、それぞれ本発明の核酸分子を示す。
図21は、構築体pMON68537を示す。
図22は、構築体pMON68539を示す。
配列番号1は、FAD2−1Aのイントロン1の核酸配列である。
「ACP」とは、アシル担体タンパク質部分をいう。「変化した種子油組成」とは、それ中の脂肪酸のレベルが、類似の遺伝的背景を有するが形質転換していない植物からの種子油と比較して変更または改変されている、本発明のトランスジェニックまたは形質転換した植物からの種子油組成をいう。
本発明の作用物質は、もう一つの核酸分子とハイブリダイズする核酸分子の能力などの構造的属性、または抗体によって結合される(もしくはそのような結合に関してもう一つの分子と競合する)タンパク質の能力のどちらかに関して「生物活性のある」ことが好ましい。あるいは、そのような属性は触媒的であってもよく、したがって化学反応または応答を媒介する作用物質の能力に関与する。作用物質は、「実質的に精製」されていることが好ましい。本明細書中で使用する用語「実質的に精製」したとは、通常そのネイティブな環境条件と関連している実質的にすべての他の分子から分離された分子をいう。より好ましくは、実質的に精製した分子とは、調製物中に存在する優勢の種である。実質的に精製した分子は、天然の混合物中に存在する他の分子(溶媒を除く)を60%超、75%超、好ましくは90%超、最も好ましくは95%超含まなくてもよい。用語「実質的に精製した」とは、そのネイティブな環境条件中に存在する分子を包含することを意図しない。
本発明の一態様では、核酸分子は、細胞または生物内に導入した場合に、1つまたは複数の遺伝子によってコードされているmRNA転写物またはタンパク質のレベルを有効に排除する、実質的に低下させる、または少なくとも部分的に低下させることができる1つまたは複数の配列を発現する、第1の組のDNA配列を含む。好ましい態様には、標的として内在性遺伝子、植物遺伝子、および非ウイルス遺伝子が含まれる。本発明の一態様では、遺伝子はFAD2、FAD3、またはFATB遺伝子である。
本発明の一態様では、核酸分子は、細胞または生物内に導入した場合に、1つまたは複数の遺伝子によってコードされているmRNA転写物またはタンパク質のレベルを部分的に増強する、増加させる、増強する、または実質的に増強できる、第2の組のDNA配列を含む。本発明の一態様では、遺伝子は内在性遺伝子である。本発明のもう一つの態様では、遺伝子は異種遺伝子であることができる。好ましい態様では、異種および内在性の遺伝子は同一の核酸分子上にあることができる。本発明の一態様では、遺伝子は植物遺伝子である。本発明のもう一つの態様では、遺伝子は、完全な遺伝子によって触媒される反応を触媒できる切断遺伝子である。本発明の一態様では、遺伝子は、β−ケトアシル−ACP合成酵素I遺伝子、β−ケトアシル−ACP合成酵素IV遺伝子、Δ−9不飽和化酵素遺伝子、CP4 EPSPS遺伝子、またはこれらの遺伝子の組合せである。
本発明の核酸構築体の1つまたは複数を植物の形質転換または形質移入に用い得る。転写物またはタンパク質などの生成物のレベルは、植物などの生物全体にわたって増加もしくは減少させるか、または生物の1つもしくは複数の特定の器官もしくは組織に局在させ得る。例えば、生成物のレベルは、限定されるものではないが、根、塊茎、茎、葉、柄、果実、液果、殻果、樹皮、鞘、種子および花を含めた植物の組織および器官の1つまたは複数内で増加または減少させ得る。好ましい器官は種子である。例えば、外来性遺伝物質を植物細胞内に移植し、植物細胞を完全な繁殖可能または繁殖不能の植物または植物部分へと再生し得る。
本発明の核酸分子および構築体のうちの任意のものを、永久的または一過性の様式で植物または植物細胞内に導入し得る。本発明の好ましい核酸分子および構築体は、上記発明を実施するための最良の形態のパートA〜Dおよび実施例に記載されている。本発明のもう一つの実施形態は、適切な植物または植物細胞を選択する工程、植物または植物細胞を組換えベクターで形質転換させる工程、および形質転換した宿主細胞を得る工程を一般的に含むトランスジェニック植物を生成する方法に指向される。
本発明の植物は全体または部分的に用い得る。好ましい植物部位には、生殖部分または貯蔵部分が含まれる。本明細書中で使用する用語「植物部位」には、限定されるものではないが、種子、胚乳、胚珠、花粉、根、塊茎、茎、葉、柄、果実、液果、殻果、樹皮、鞘、種子および花が含まれる。本発明の特に好ましい実施形態では、植物部分は種子である。
多くの油用途には、飽和脂肪酸レベルは好ましくは8重量%未満、より好ましくは約2〜3重量%である。飽和脂肪酸は、多くの用途で望ましくない高融点を有する。供給原料または燃料として用いる場合、飽和脂肪酸は低温で曇りを引き起こし、流動点および目詰まり点などの乏しい低温フロー特性を燃料に与える。低飽和脂肪酸レベルを含む油生成物は、より健康的であると認知されているかつ/またはFDA指針に従って「飽和脂肪を含まない」表示し得るので、消費者および食品工業にとって好ましい場合がある。さらに、低飽和油は、サラダ油などの食品用途の油を脱蝋する必要性を軽減または排除する。バイオディーゼルおよび潤滑剤の用途では、低飽和脂肪酸レベルを有する油は、改良された低温フロー特性を与え、低温で曇らない。
本発明のもう一つの実施形態は、遺伝子抑制レベルを調節する方法に指向される。遺伝子抑制の調節は、多かれ少なかれ、遺伝子抑制をもたらすことができる。遺伝子産物の抑制は、本発明の構築体を植物ゲノム内に挿入することからもたらされることができる。同様に、遺伝子抑制の調節は、本発明の構築体を植物ゲノム内に挿入することからもたらされることができる。遺伝子抑制を調節する方法の他の例には、限定されるものではないが、本発明の構築体を用いたアンチセンス技術、共抑制、RNA干渉(dsRNAi)、トランスジェニック動物、ハイブリッド、およびリボザイムが含まれる。以下の例を例示によって提供し、本発明の制限であることを意図しない。
葉組織をAsgrowダイズ品種A3244から得て、液体窒素中で磨砕し、使用時まで−80℃で貯蔵した。6mlのSDS抽出緩衝液(650mlの滅菌ddH2O、100mlの1Mのトリス−Cl、pH8、100mlの0.25MのEDTA、50mlの20%のSDS、100mlの5MのNaCl、4μlのβ−メルカプトエタノール)を2mlの凍結/磨砕した葉組織に加え、混合物を65℃で45分間インキュベーションを行った。サンプルを15分間毎に振盪。氷冷した2mlの5Mの酢酸カリウムをサンプルに加え、サンプルを振盪し、その後、氷上で20分間インキュベーションを行った。3mlのCHCl3をサンプルに加え、サンプルを10分間振盪した。
2A.FAD2−1構築体
FAD2−1Aのイントロン#1(配列番号1)を、発現カセットpCGN3892内に、センスおよびアンチセンス方向にクローニングした。ベクターpCGN3892はダイズ7SプロモーターおよびエンドウマメrbcSの3'を含む。その後、どちらの遺伝子融合体も、FMVプロモーターによって調節されるCP4 EPSPS遺伝子を含むベクターであるpCGN9372内に別々にライゲーションした。生じた発現構築体(pCGN5469センスおよびpCGN5471アンチセンス)をダイズの形質転換に用いた。
FAD3−1Aのイントロン#1、#2、#4および#5(それぞれ配列番号7、8、10および11)、FAD3−1Bのイントロン#3C(配列番号23)および#4(配列番号24)をすべて、pCGN3892内に、センスまたはアンチセンス方向に別々にライゲーションした。pCGN3892はダイズ7SプロモーターおよびエンドウマメrbcSの3'を含む。これらの融合体を、ダイズ内に形質転換させるために、FMVプロモーターによって調節されるCP4 EPSPS遺伝子を含むベクターであるpCGN9372内にライゲーションした。生じた発現構築体(pCGN5455、FAD3−1Aのイントロン#4センス;pCGN5459、FAD3−1Aのイントロン#4アンチセンス;pCGN5456、FAD3のイントロン#5センス;pCGN5460、FAD3−1Aのイントロン#5アンチセンス;pCGN5466、FAD3−1Aのイントロン#2アンチセンス;pCGN5473、FAD3−1Aのイントロン#1アンチセンス)をダイズの形質転換に用いた。
ダイズFATB−1のイントロンII配列(配列番号30)を、FATB−1部分的ゲノムクローンを鋳型として用いたPCRによって増幅した。PCR増幅は以下のように実施した:1サイクル、95℃で10分間;25サイクル、95℃で30秒間、62℃で30秒間、72℃で30秒間;1サイクル、72℃で7分間。PCR増幅により、両末端に再度遺伝子操作した制限部位が含まれる長さが854bpの生成物がもたらされた。PCR産物を、PCRプライマーの5'末端上に遺伝子操作したXhoI部位によって発現カセットpCGN3892内にセンス方向に直接クローニングして、pMON70674を形成した。ベクターpCGN3892はダイズ7SプロモーターおよびエンドウマメrbcSの3'を含む。その後、pMON70674をNotIで切断し、FMVプロモーターによって調節されるCP4 EPSPS遺伝子を含むベクターであるpMON41164内にライゲーションした。生じた遺伝子発現構築体pMON70678を、アグロバクテリウム方法を用いたダイズの形質転換に用いた。
第1の組のDNA配列の様々な順列を含む発現構築体を作製した。第1の組のDNA配列は、記載したもののうちの任意のもの、もしくは図5および6に例示したもの、または、dsRNA構築体、センス共抑制構築体、アンチセンス構築体、もしくは前述の様々な組合せを形成できるように、センス、アンチセンス、もしくはセンスおよびアンチセンスのFAD2、FAD3、およびFATB非コードもしくはコード領域の様々な組合せを含む、任意の他のDNA配列の組である。
図7〜15では、プロモーターを矢印によって示し、コード配列(コードおよび非コード)を転写の方向を指す五角形によって示し、センス配列を通常テキストで表示し、アンチセンス配列を上下逆のテキストで表示した。これらの図中で用いた略記には、7Sa=7Sαプロモーター;7Sa'=7Sα'プロモーター;Brナピン=ブラシカ属のナピンプロモーター;FMV=FMVプロモーター;ARC=アルセリンプロモーター;RBC E9 3'=ルビスコE9終止シグナル;Nos3'=nos終止シグナル;TML3'=tml終止シグナル;ナピン3'=ナピン終止シグナル;'3(FADまたはFATと同一のボックス内で)=3'UTR;5'(FADまたはFATと同一のボックス内で)=5'UTR;Cr=クフェア・プルチェリマ;Gm=グリシンマックス;Rc=リシヌス・コムニス;FAB2=Δ9ステアロイル−不飽和化酵素遺伝子のFAB2対立遺伝子;およびIntrまたはInt=イントロンが含まれる。
図7〜9は、第1の組のDNA配列がdsRNA構築体を発現できる本発明の核酸分子を示す。図7〜9に示した第1の組のDNA配列は、関連するセンスおよびアンチセンス配列の対、例えば、第1のセンス配列によって発現されるRNAが、第1のアンチセンス配列によって発現されるアンチセンスRNAと二本鎖RNAを形成できるように並べられた対を含む。図9に示すように、センス配列は、アンチセンス配列に隣接しているか、またはスペーサー配列によってアンチセンス配列から隔てられていてもよい。
図10〜13および19〜20は、第1の組のDNA配列がセンス共抑制構築体を発現できる本発明の核酸分子を示す。第2の組のDNA配列はコード配列を含み、そのそれぞれが、発現された場合に、KAS I、KAS IV、Δ−9不飽和化酵素、およびCP4 EPSPSからなる群から選択された遺伝子によってコードされているタンパク質および転写物の一方または両方を増加させることができる配列をコードしているDNA配列である。それぞれのコード配列はプロモーターと結合しており、これは、植物中で機能的な任意のプロモーター、または任意の植物プロモーターであることができ、FMVプロモーター、ナピンプロモーター、7Sプロモーター(7Sαもしくは7Sα')、アルセリンプロモーター、Δ−9不飽和化酵素プロモーター、またはFAD2−1Aプロモーターであり得る。
図14は、第1の組のDNA配列がアンチセンス構築体を発現できる本発明の核酸分子を示し、図15〜18は、第1の組のDNA配列がセンスおよびアンチセンス構築体の組合せを発現できる本発明の核酸分子を示す。第2の組のDNA配列はコード配列を含み、そのそれぞれが、発現された場合に、KAS I、KAS IV、Δ−9不飽和化酵素、およびCP4 EPSPSからなる群から選択された遺伝子によってコードされているタンパク質および転写物の一方または両方を増加させることができる配列をコードしているDNA配列である。それぞれのコード配列はプロモーターと結合しており、これは、植物中で機能的な任意のプロモーター、または任意の植物プロモーターであることができ、FMVプロモーター、ナピンプロモーター、7S(7Sαもしくは7Sα')プロモーター、アルセリンプロモーター、Δ−9不飽和化酵素プロモーター、またはFAD2−1Aプロモーターであり得る。
本発明の一態様には、植物内で、二本鎖RNAを形成できる植物染色体上の組換え転写ユニットへと組み立てられる、DNA構築体が含まれる。遺伝子を抑制するための、そのような構築体の組立ておよびin vivoで組換え転写ユニットを組み立てる方法は、参考としてその全体が本明細書中に組み込まれている国際出願PCT/US2005/00681号に記載されている。
実施例2および3の構築体を、McCabeら、Bio/Technology、6:923〜926(1988)の方法、またはアグロバクテリウム属に媒介される形質転換を含めた既に記載した方法によってダイズ(例えば、Asgrow品種A4922またはAsgrow品種A3244またはAsgrow品種A3525)内に安定に導入した。形質転換したダイズ植物は、グリフォセートを含む培地上での選択によって同定した。脂肪酸組成は、構築体で形質転換したダイズ系の種子からガスクロマトグラフィーを用いて分析した。さらに、どの構築体も他の目的配列、およびプロモーターの様々な組合せを含み得る。
以下の脂肪酸メチルエステルの混合物を有する合成燃料油脂肪酸組成物を調製した:73.3%のオレイン酸、21.4%のリノール酸、2.2%のパルミチン酸、2.1%のリノレン酸および1.0%のステアリン酸(すべて重量による)。精製した脂肪酸メチルエステルは、Nu−Chek Prep,Inc.、米国ミネソタ州Elysianから得た。この組成物のセタン価および発火遅れは、Southwest Research Instituteによって発火性テスター(Ignition Quality Tester、「IQT」)613(Southwest Research Institute、米国テキサス州San Antonio)を用いて決定された。
植物組成物のコレステロール低下特性は、血清脂質レベルに対して慣用のダイズ油よりも好都合な効果(すなわち、より低いLDL−コレステロールおよびより高いHDL−コレステロール)を有する脂肪酸組成を同定するために決定する。27個の臨床治験に基づいた公開された方程式(Mensink,R.P.およびKatan,M.B.、動脈硬化症および血栓症(Arteriosclerosis and Thrombosis)、12:911〜919(1992))を用いて、ヒトにおける血清脂質レベルに対する新規油種子組成の効果を通常のダイズ油の効果と比較する。
以下の14個の工程は、ダイズにおいてFAD2、FAD3、およびFATB遺伝子を抑制し、Δ−9不飽和化酵素を過剰発現させるために植物を形質転換させるために設計したベクターpMON68537の構築を例示する。具体的には、構築体は、ダイズのセンス方向のイントロンおよび3'UTR、すなわち、FAD2−1Aのイントロン#1、FAD3−1Aの3'UTR、FATB−1の3'UTR、ヘアピンループを形成するスプライシング可能なイントロンと作動可能に連結している7Sαプロモーター、ならびにダイズのアンチセンス方向のイントロンおよび3'UTR'、すなわち、FATB−1の3'UTR、FAD3−1Aの3'UTRおよびFAD2−1Aのイントロン#1の一連の相補体、ならびにΔ−9不飽和化酵素を駆動するダイズFAD2プロモーターを含む。
5'プライマー=19037=
ACTAGTATATTGAGCTCATATTCCACTGCAGTGGATATT
GTTTAAACATAGCTAGCATATTACGCGTATATTATACAAGCTTATATTCCCGGGATATTGTCGACATATTAGCGGTACATTTTATTGCTTATTCAC
3'プライマー=19045=
ACTAGTATATTGAGCTCATATTCCTGCAGGATATTCTCGAG
ATATTCACGGTAGTAATCTCCAAGAACTGGTTTTGCTGCTTGTGTCTGCAGTGAATC。
以下の15個の工程は、ダイズにおいてFAD2、FAD3、およびFATB遺伝子を抑制し、Δ−9不飽和化酵素およびKASIV酵素を過剰発現する植物を形質転換させるために設計したベクターpMON68539(図22)の構築を例示する。具体的には、構築体は、ダイズのセンス方向のイントロンおよび3'UTR、すなわち、FAD2−1Aのイントロン#1、FAD3−1Aの3'UTR、FATB−1の3'UTR、ヘアピンループを形成するスプライシング可能なイントロンと作動可能に連結している7Sαプロモーター、ならびにダイズのアンチセンス方向のイントロンおよび3'UTR'、すなわち、FATB−1の3'UTR、FAD3−1Aの3'UTRおよびFAD2−1Aのイントロン#1の一連の相補体、Δ−9不飽和化酵素を駆動するダイズFAD2プロモーター、ならびにKASIVを駆動するナピンプロモーターを含む。
5'プライマー=19037=
ACTAGTATATTGAGCTCATATTCCACTGCAGTGGATATTG
TTTAAACATAGCTAGCATATTACGCGTATATTATACAAGCTTATATTCCCGGGATATTGTCGACATATTAGCGGTACATTTTATTGCTTATTCAC
3'プライマー=19045=
ACTAGTATATTGAGCTCATATTCCTGCAGGATATTCTCGAG
ATATTCACGGTAGTAATCTCCAAGAACTGGTTTTGCTGCTTGTGTCTGCAGTGAATC。
本実施例は、抑制された遺伝子を有するダイズ植物を生成するための植物の形質転換を例示する。
本実施例は、抑制された遺伝子を有するダイズ植物を生成するための植物の形質転換を例示する。
Fad2遺伝子を抑制するために、実施例3Dに記載の構築体pMON95829を用いて、FAD2−1のイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。次いで、形質転換した植物のゲノムを、第1のT−DNAおよび第2のT−DNAの同時タンデム挿入、すなわち「右境界から右境界」の組立てについてスクリーニングする。スクリーニングはサザンハイブリダイゼーションマッピング方法を用いて行った。そのゲノム内に好ましい配置を含む形質転換したダイズ植物を温室に移して種子を生産させる。
Fad2遺伝子を抑制するために、実施例3Dに記載の構築体pMON93505を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。次いで、形質転換した植物のゲノムを、第1のT−DNAおよび第2のT−DNAの同時タンデム挿入、すなわち「右境界から右境界」の組立てについてスクリーニングする。スクリーニングはサザンハイブリダイゼーションマッピング方法を用いて行った。そのゲノム内に好ましい配置を含む形質転換したダイズ植物を温室に移して種子を生産させる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例3Dに記載の構築体pMON93506を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。次いで、形質転換した植物のゲノムを、第1のT−DNAおよび第2のT−DNAの同時タンデム挿入、すなわち「右境界から右境界」の組立てについてスクリーニングする。スクリーニングはサザンハイブリダイゼーションマッピング方法を用いて行った。そのゲノム内に好ましい配置を含む形質転換したダイズ植物を温室に移して種子を生産させる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例3Bに記載の構築体pMON93501を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON97552を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93758を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON97553を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93770を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93759を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON97554を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93771を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON97555を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93760を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93772を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON97556を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
FAD2遺伝子を抑制するために、実施例2Dに記載の構築体pMON93764を用いて、FAD2−1Aのイントロン、二本鎖RNAを形成する構築体をダイズ内に導入した。ベクターは、アグロバクテリウム・ツメファシエンス株ABIによってダイズ(Asgrow品種A4922)内に安定に導入される(Martinell、米国特許第6,384,301号)。CP4選択マーカーにより、形質転換したダイズ植物を、グリフォセート除草剤を含む培地上での選択によって同定することが可能となる。
TaqManとは、選択的増幅およびリアルタイム蛍光測定によって核酸を定量するアッセイである(リアルタイムPCRとも呼ばれる)。この手順を用いて、発生中のトランスジェニック種子における標的転写物の抑制程度を決定した。サンプル中の標的mRNAの絶対的転写レベルを決定するために、それぞれのTaqMan実験において検量線を確立した。この目的のために、アブラナからの20ngの全RNAで希釈した様々な量のクローニングしたダイズ標的遺伝子配列を、未知の標的の量のサンプルと平行して増幅させた。この方法で決定した転写物のコピー数の精度の許容誤差は25%であった。
ダイズFAD2−1のイントロン1(配列番号1)配列の200個の連続する断片をPCRによって増幅して、配列番号1の5'末端から開始して配列番号1の最初の200ヌクレオチドが含まれるPCR産物がもたらされた。PCR産物を、センス方向に、ダイズ7Sα'プロモーターおよびtmlの3'終止配列を含むベクター内に、PCRプライマーの5'末端上に遺伝子操作した制限部位によって、直接クローニングした。その後、ベクターを制限酵素で切断し、FMVプロモーターおよびエンドウマメルビスコE9の3'終止配列によって調節されるCP4 EPSPS遺伝子を含むベクター内にライゲーションした。生じた遺伝子発現構築体を、本明細書中に記載の方法を用いた形質転換に使用した。
ダイズFAD2−1のイントロン1(配列番号1)配列の180個の連続する断片をPCRによって増幅して、配列番号1の3'末端から開始して最初の180ヌクレオチドが含まれるPCR産物がもたらされた。PCR産物を、センス方向に、ダイズ7Sα'プロモーターおよびtmlの3'終止配列を含むベクター内に、PCRプライマーの5'末端上に遺伝子操作した制限部位によって、直接クローニングした。その後、ベクターを制限酵素で切断し、FMVプロモーターおよびエンドウマメルビスコE9の3'終止配列によって調節されるCP4 EPSPS遺伝子を含むベクター内にライゲーションした。生じた遺伝子発現構築体を、本明細書中に記載の方法を用いた形質転換に使用した。
pMON97562は、3'末端から連続する100ヌクレオチドが短縮されており、FAD3−1Aの5'UTRと連結しているダイズFAD2−1Aのイントロン1(配列番号1)と作動可能に連結しているダイズ7Sα'プロモーター、続いて、FAD3−1Bの5'UTRと連結したFAD3−1Aの3'UTR、続いて、FAD3−1Bの3'UTR、続いて、FATB−1aの5'UTR、続いて、FATB−1aの3'UTRとアンチセンス方向に作動可能に連結しているFAD3−1Aのイントロン4からの70ヌクレオチドと作動可能に連結している、FATB−1aの3'UTR、続いて、FAD3−1Bの3'UTRとアンチセンスで連結したアンチセンス方向のFATB−1aの5'UTR、続いて、FAD3−1Aの3'UTRとアンチセンスで連結したアンチセンスのFAD3−1Bの5'UTR、続いて、アンチセンスのFAD3−1Aの5'UTR、続いて、EFMVプロモーターおよびエンドウマメルビスコE9の3'終止配列と作動可能に連結しているCP4 EPSPS遺伝子を有するH6 3'ポリアデニル化セグメントと作動可能に連結している、3'末端から連続する100ヌクレオチドが短縮されており、かつアンチセンス方向のダイズFAD2−1Aのイントロン1(配列番号1)を含み、これらはすべて同一のDNA分子上のRBおよびLBに隣接している。生じた遺伝子発現構築体は、本明細書中に記載の方法を用いたダイズ形質転換に使用した。脂肪酸組成を、この構築体で形質転換したダイズ系の種子から、実施例4に記載のようにガスクロマトグラフィーを用いて決定した。表25に代表的な種子の組成を示す。18:3のレベルが約1%まで低下していた。
pMON97563は、3'末端から連続する100ヌクレオチドが短縮されており、FAD3−1Aの5'UTRと連結しているダイズFAD2−1Aのイントロン1(配列番号1)と作動可能に連結しているダイズ7Sα'プロモーター、続いて、FAD3−1Bの5'UTRと連結したFAD3−1Aの3'UTR、続いて、FAD3−1Cの5'UTRと連結したFAD3−1Bの3'UTR、続いて、FAD3−1Cの3'UTR、続いて、FATB−1aのCTPコード領域、続いて、FATB−2aのCTPコード領域とアンチセンス方向に作動可能に連結しているFAD3−1Aのイントロン4からの70ヌクレオチドと作動可能に連結している、FATB−2aのCTPコード領域、続いて、FAD3−1Cの3'UTRとアンチセンスで連結しているアンチセンス方向のFATB−1aのCTPコード領域、続いて、FAD3−1Bの3'UTRとアンチセンスで連結したアンチセンスのFAD3−1Cの5'UTR、続いて、FAD3−1Aの3'UTRとアンチセンスで連結したアンチセンスのFAD3−1Bの5'UTR、続いて、アンチセンスのFAD3−1Aの5'UTR、続いて、EFMVプロモーターおよびエンドウマメルビスコE9の3'終止配列と作動可能に連結しているCP4 EPSPS遺伝子を有するH6 3'ポリアデニル化セグメントと作動可能に連結している、3'末端から連続する100ヌクレオチドが短縮されており、かつアンチセンス方向のダイズFAD2−1Aのイントロン1(配列番号1)を含み、これらはすべて同一のDNA分子上のRBおよびLBに隣接している。生じた遺伝子発現構築体を、本明細書中に記載の方法を用いた植物の形質転換に使用した。脂肪酸組成を、この構築体で形質転換したダイズ系の種子から、実施例4に記載のようにガスクロマトグラフィーを用いて決定した。表26に代表的な種子の組成を示す。18:3のレベルが約1%まで低下していた。
Claims (18)
- 全脂肪酸の42重量%〜85重量%のオレイン酸含量および全脂肪酸の8重量%未満の飽和脂肪酸含量を含む種子油の脂肪酸組成を示し、かつ50〜400ヌクレオチドの長さの配列番号1のダイズFAD2−1Aのイントロンの断片および40〜450ヌクレオチドの長さの配列番号28のダイズFATB−1遺伝子の断片を含む組換えDNA核酸配列を有するゲノムを有するダイズ種子。
- 50〜400ヌクレオチドの長さのダイズFAD2−1Aのイントロンの前記断片が、
配列番号1の第1〜260位の260ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜180位の180ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜100位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第141〜420位の280ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第201〜420位の220ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第261〜420位の160ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第321〜420位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第381〜420位の40ヌクレオチドの配列、および
配列番号1の第301〜420位の120ヌクレオチドの配列
からなる群から選択された、請求項1記載のダイズ種子。 - ダイズFAD2−1Aのイントロンの前記断片およびダイズFATB−1遺伝子の前記断片がそれぞれセンスおよびアンチセンス方向に転写され、少なくとも部分的に二本鎖であるRNAがもたらされる、請求項1記載のダイズ種子。
- 前記DNA核酸配列が、植物染色体内に挿入した後に機能的転写ユニットとして組み立てられる、請求項1記載のダイズ種子。
- a)i)配列番号1の第1〜260位の260ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜180位の180ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜100位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第141〜420位の280ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第201〜420位の220ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第261〜420位の160ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第321〜420位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第381〜420位の40ヌクレオチドの配列、および
配列番号1の第301〜420位の120ヌクレオチドの配列
からなる群から選択された50〜400ヌクレオチドの長さの配列番号1のダイズFAD2−1Aのイントロン核酸配列の断片、および
ii)配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列のダイズFATB−1遺伝子の断片、ここに、ダイズFATB−1遺伝子の前記断片は、配列番号36の208ヌクレオチドの配列をさらに含む
を含む核酸配列をダイズ植物細胞中で発現させ;次いで
b)前記ダイズFAD2−1Aのイントロン核酸配列および前記ダイズFATB−1遺伝子核酸配列が開始される条件下で、前記ダイズ植物細胞を成長させることを含み、それにより、油組成は、全脂肪酸の42重量%〜85重量%のオレイン酸含量および全脂肪酸の0.5重量%〜8重量%の飽和脂肪酸含量を含むことを特徴とする植物細胞の油組成を変更する方法。 - 全脂肪酸の42重量%〜85重量%のオレイン酸含量および全脂肪酸の8重量%未満の飽和脂肪酸含量を含む種子油の脂肪酸組成を示し、かつ内在性ダイズFAD2−1AおよびFATB−1の発現を抑制する組換えDNA核酸配列を有するゲノムを有するダイズ種子の細胞であって、
前記組換えDNA核酸配列は、
配列番号1の第1〜260位の260ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜180位の180ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜100位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第141〜420位の280ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第201〜420位の220ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第261〜420位の160ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第321〜420位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第381〜420位の40ヌクレオチドの配列、および
配列番号1の第301〜420位の120ヌクレオチドの配列
からなる群から選択されたダイズFAD2−1Aのイントロンの断片、ならびに
配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列のダイズFATB−1遺伝子の断片、ここに、ダイズFATB−1遺伝子の前記断片は、配列番号36の208ヌクレオチドの配列をさらに含む
を含む前記ダイズ種子の細胞。 - 50〜400ヌクレオチドの長さの配列番号1のダイズFAD2−1のイントロンの断片、ならびに40〜450ヌクレオチドの長さの配列番号28のダイズFATB−1遺伝子の断片を含む組換え核酸分子。
- 全脂肪酸の42重量%〜85重量%のオレイン酸含量および全脂肪酸の8重量%以下の飽和脂肪酸含量を含む脂肪酸組成を有し、かつ
配列番号1の第1〜260位の260ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜180位の180ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜100位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第141〜420位の280ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第201〜420位の220ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第261〜420位の160ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第321〜420位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第381〜420位の40ヌクレオチドの配列、および
配列番号1の第301〜420位の120ヌクレオチドの配列
からなる群から選択されたダイズFAD2−1Aのイントロンの断片、ならびに
配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列のダイズFATB−1遺伝子の断片、ここに、ダイズFATB−1遺伝子の前記断片は、配列番号36の208ヌクレオチドの配列をさらに含む
を含む組換えDNA核酸配列を有する粗ダイズ油。 - 全脂肪酸の42重量%〜85重量%のオレイン酸含量および全脂肪酸の8重量%未満の飽和脂肪酸含量を含む種子油の脂肪酸組成を示し、かつ
配列番号1の第1〜260位の260ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜180位の180ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜100位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第141〜420位の280ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第201〜420位の220ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第261〜420位の160ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第321〜420位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第381〜420位の40ヌクレオチドの配列、および
配列番号1の第301〜420位の120ヌクレオチドの配列
からなる群から選択されたダイズFAD2−1Aのイントロンの断片、ならびに
配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列のダイズFATB−1遺伝子の断片、ここに、ダイズFATB−1遺伝子の前記断片は、配列番号36の208ヌクレオチドの配列をさらに含む
を含む組換えDNA核酸配列を有するダイズ種子に由来するダイズミール。 - 全脂肪酸の42重量%〜85重量%のオレイン酸含量、全脂肪酸の8重量%以下の飽和脂肪酸含量、および全脂肪酸の1.5重量%以下のリノレン酸含量を含む脂肪酸組成を有し、かつ
配列番号1の第1〜260位の260ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜180位の180ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第1〜100位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第141〜420位の280ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第201〜420位の220ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第261〜420位の160ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第321〜420位の100ヌクレオチドの配列、
配列番号1の第381〜420位の40ヌクレオチドの配列、および
配列番号1の第301〜420位の120ヌクレオチドの配列
からなる群から選択されたダイズFAD2−1Aのイントロンの断片、ならびに
配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列のダイズFATB−1遺伝子の断片、ここに、ダイズFATB−1遺伝子の前記断片は、配列番号36の208ヌクレオチドの配列をさらに含む
を含む組換えDNA核酸配列を有する粗ダイズ油。 - ダイズFATB−1遺伝子の前記断片が、配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列を含む、請求項2記載のダイズ種子。
- 50〜400ヌクレオチドの長さのダイズFAD2−1Aのイントロンの前記断片が、配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列である、請求項2記載のダイズ種子。
- ダイズFATB−1遺伝子の前記断片が、さらに、配列番号36のFATB−1配列の連続する少なくとも25ヌクレオチドを含む、請求項11記載のダイズ種子。
- 配列番号36のFATB−1配列の連続する少なくとも25ヌクレオチドが、208ヌクレオチドである、請求項13記載のダイズ種子。
- 50〜400ヌクレオチドの長さの配列番号1のダイズFAD2−1Aのイントロンの前記断片が、配列番号1の第101〜420位の320ヌクレオチドの配列であり、配列番号28のダイズFATB−1遺伝子の断片が、配列番号28の第274〜296位および第1122〜1290位の192ヌクレオチドの配列であり、ダイズFATB−1遺伝子の前記断片が、配列番号36の208ヌクレオチドの配列をさらに含む、請求項2記載のダイズ種子。
- 前記油組成が、全脂肪酸の55重量%〜80重量%のオレイン酸含量および全脂肪酸の1重量%〜7重量%の飽和脂肪酸含量を含む、請求項1記載のダイズ種子。
- さらに、全脂肪酸の3重量%未満のリノレン酸含量を含む、請求項1記載のダイズ種子。
- 前記種子が、42%〜85%のオレイン酸、1.5%〜8%の飽和脂肪酸、35%未満のリノレン酸を含み、オレイン酸およびリノレン酸の合わせた量が、全油組成の65%〜90%である、請求項1記載のダイズ種子。
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