JP4035152B2 - 滑膜細胞タンパク質 - Google Patents
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Description
〔1〕下記(a)から(e)のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
(a)配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質をコードするポリヌクレオチド、
(b)配列番号:1に記載の塩基配列の蛋白質コード領域を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号:2に記載のアミノ酸配列において1若しくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列を有し、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質をコードするポリヌクレオチド。
(d)配列番号:1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質をコードするポリヌクレオチド
(e)配列番号:1に記載の塩基配列と少なくとも70%以上の相同性を有する塩基配列からなり、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質をコードするポリヌクレオチド
〔2〕配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチド。
〔3〕〔1〕、または〔2〕に記載のポリヌクレオチドによりコードされる蛋白質またはペプチド。
〔4〕次の(1)−(3)からなる群から選択される少なくとも1つの活性を有する〔3〕に記載の蛋白質またはペプチド。
(1)慢性関節リウマチ患者の血液中に見出される抗体と結合する
(2)シノビオリンリガンドS1-5と結合する
(3)滑膜増生を促進する
〔5〕〔1〕、または〔2〕に記載のポリヌクレオチドが挿入されたベクター。
〔6〕〔1〕に記載のポリヌクレオチドまたは〔5〕に記載のベクターを保持する形質転換細胞。
〔7〕〔6〕に記載の形質転換細胞を培養し、該形質転換細胞またはその培養上清から発現させた蛋白質またはペプチドを回収する工程を含む、〔3〕に記載の蛋白質またはペプチドの製造方法。
〔8〕〔3〕に記載の蛋白質またはペプチドに結合する抗体。
〔9〕〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドを含む、〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドを認識する抗体を分析するための免疫学的分析用試薬。
〔10〕慢性関節リウマチの診断、または治療効果の判定を目的とするものである〔9〕の免疫学的分析用試薬。
〔11〕〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドと反応する抗体を含む、〔3〕に記載のタンパク質を分析するための免疫学的分析用試薬。
〔12〕慢性関節リウマチの診断、または治療効果の判定を目的とするものである〔11〕に記載の免疫学的分析用試薬。
〔13〕分析すべき〔3〕に記載のタンパク質が滑膜細胞に存在するものである〔12〕の免疫学的分析用試薬。
〔14〕次の工程を含む、生体試料中の〔3〕に記載の蛋白質、および/またはその部分ペプチドに結合する抗体の測定方法。
(1)生体試料を〔3〕に記載の蛋白質、および/またはその部分ペプチドと接触させる工程、および
(2)〔3〕に記載の蛋白質、および/またはその部分ペプチドに結合する抗体を検出する工程
〔15〕次の工程を含む、生体試料中の〔3〕に記載の蛋白質、および/またはその部分ペプチドの測定方法。
(1)生体試料を〔8〕に記載の抗体と接触させる工程、および
(2)〔3〕に記載の蛋白質、および/またはその部分ペプチドに結合する、〔8〕に記載の抗体を検出する工程
〔16〕配列番号:1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドまたはその相補鎖に相補的な少なくとも15ヌクレオチドを含むポリヌクレオチド。
〔17〕次の工程を含む、生体試料中の〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの測定方法。
(1)生体試料を〔16〕に記載のポリヌクレオチドと接触させる工程、および
(2)〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドにハイブリダイズする、〔16〕に記載のポリヌクレオチドを検出する工程
〔18〕〔16〕に記載のポリヌクレオチドを含む、〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの測定用キット。
〔19〕〔3〕に記載のタンパク質または該タンパク質をコードする遺伝子の発現を指標に、該タンパク質を発現する細胞を検出または分離する方法。
〔20〕細胞がリウマチ滑膜細胞である、〔19〕に記載の方法。
〔21〕細胞が未分化間葉系細胞である、〔19〕に記載の方法。
〔22〕〔8〕に記載の抗体を含む、〔3〕に記載のタンパク質を発現する細胞の検出または分離用試薬。
〔23〕次の工程を含む、慢性関節リウマチの検出方法であって、慢性関節リウマチのマーカーが、〔1〕に記載のポリヌクレオチド、〔3〕に記載のタンパク質、〔3〕に記載のペプチド、〔3〕に記載のタンパク質に結合する抗体、および〔3〕に記載のペプチドに結合する抗体からなる群から選択された少なくともひとつのマーカーである方法。
i) 被検者の生体試料中に存在する慢性関節リウマチのマーカーを検出する工程、および
ii) 工程 i)の検出結果を、慢性関節リウマチと関連付ける工程
〔24〕生体試料が被検者の血液であり、慢性関節リウマチのマーカーが〔3〕に記載のタンパク質に結合する抗体、および/または〔3〕に記載のペプチドに結合する抗体である〔23〕に記載の方法。
〔25〕生体試料が被検者の滑膜組織または滑膜細胞であり、慢性関節リウマチのマーカーが〔1〕に記載のポリヌクレオチド、および/または〔3〕に記載のタンパク質である〔23〕に記載の方法。
〔26〕次の工程を含む、被験化合物の〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドと結合する活性の検出方法。
a)被験化合物を〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドと接触させる工程、および
b)被験化合物と前記タンパク質またはペプチドとの結合を観察する工程
〔27〕次の工程を含む、〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドと結合する活性を有する化合物のスクリーニング方法。
a)〔26〕に記載の方法によって被験化合物の〔3〕に記載の蛋白質またはペプチドに対する結合活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記結合活性が高い被験化合物を選択する工程
〔28〕次の工程を含む、〔3〕に記載のタンパク質とそのリガンドとの結合を阻害する活性の検出方法。
a)被験化合物存在下で〔3〕に記載のタンパク質またはペプチドとそのリガンドとを接触させる工程、および
b)前記タンパク質またはペプチドに結合するリガンド、および/または被験化合物を検出する工程
〔29〕リガンドがシノビオリンリガンドS1-5である〔28〕に記載の方法。
〔30〕次の工程を含む、〔3〕に記載のタンパク質とそのリガンドとの結合を阻害する化合物のスクリーニング方法。
a)〔28〕に記載の方法によって、被験化合物の〔3〕に記載のタンパク質とそのリガンドとの結合を阻害する活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記阻害活性が高い被験化合物を選択する工程
〔31〕次の工程を含む、被験化合物の〔3〕に記載のタンパク質によるシグナル伝達を調節する活性を検出する方法。
a)前記タンパク質のリガンドの存在下または不存在下で、被験化合物と前記タンパク質を接触させる工程、および
b)前記タンパク質を介するシグナル伝達を検出する工程
〔32〕次の工程を含む、〔3〕に記載のタンパク質によるシグナル伝達を調節する活性を有する化合物のスクリーニング方法。
a)〔31〕に記載の方法によって、被験化合物の前記タンパク質によるシグナル伝達を調節する活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記調節の活性が高い被験化合物を選択する工程
〔33〕次の工程を含む、〔1〕に記載のポリヌクレオチドの発現を調節する活性の検出方法であって、
a)被験化合物の存在下で〔1〕に記載のポリヌクレオチドを発現する細胞を培養する工程、および
b)前記ポリヌクレオチドの発現レベルを測定する工程、
〔34〕次の工程を含む、〔1〕に記載のポリヌクレオチドの発現を調節する化合物のスクリーニング方法。
a)〔33〕に記載の方法によって、被験化合物の〔1〕に記載のポリヌクレオチドの発現を調節する活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記活性に差を有する被験化合物を選択する工程
〔35〕〔27〕に記載のスクリーニング方法によって得ることができる化合物を有効成分として含む、シノビオリン刺激剤。
〔36〕〔30〕に記載のスクリーニング方法によって得ることができる化合物を有効成分として含む、シノビオリンとシノビオリンリガンドとの結合阻害剤。
〔37〕〔30〕または〔32〕のスクリーニング方法によって得ることができる化合物を有効成分として含む、滑膜増生阻害剤。
〔38〕〔1〕若しくは〔2〕に記載のポリヌクレオチド、〔3〕に記載の蛋白質若しくはペプチド、および〔5〕に記載のベクターからなる群から選択されるいずれかの成分を有効成分として含有する医薬組成物。
〔39〕〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの発現が改変されているか、または該改変を誘導することができるトランスジェニック非ヒト脊椎動物。
〔40〕〔1〕または2に記載のポリヌクレオチドが外来的に導入されている、〔39〕に記載のトランスジェニック非ヒト脊椎動物。
〔41〕慢性関節リウマチモデル動物である、〔40〕に記載のトランスジェニック非ヒト脊椎動物。
〔42〕内因性に持つ〔1〕または〔2〕のいずれかに記載のポリヌクレオチドの発現が抑制されているトランスジェニック非ヒト脊椎動物。
〔43〕他の遺伝子がノックインされている、〔42〕に記載のトランスジェニック非ヒト脊椎動物。
〔44〕〔40〕または〔42〕に記載のトランスジェニック非ヒト脊椎動物に由来する細胞。
〔45〕次の工程を含む、〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの内因性プロモーターの活性を調節する活性の検出方法。
a)〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの内因性プロモーターの制御下にレポーター遺伝子を発現することができる発現系に、被験化合物を接触させる工程、および
b)レポーター遺伝子の発現レベルを測定する工程
〔46〕前記発現系が、〔43〕に記載のトランスジェニック非ヒト脊椎動物またはこの動物に由来する細胞である〔45〕に記載の方法。
〔47〕次の工程を含む、〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの内因性プロモーターの活性を調節する化合物のスクリーニング方法。
a)〔45〕に記載の方法によって、被験化合物の〔1〕または〔2〕に記載のポリヌクレオチドの内因性プロモーターの活性を調節する活性を測定する工程、および
b)対照と比較して、前記活性に差がある被験化合物を選択する工程
〔48〕〔34〕、または〔47〕に記載のスクリーニング方法によって得ることができる化合物を有効成分として含む、〔1〕に記載のポリヌクレオチドの発現を調節するための医薬組成物。
アミノ酸を人為的に置換する場合、性質の似たアミノ酸に置換すれば、もとのタンパク質の活性が維持されやすいと考えられる。本発明のタンパク質には、上記アミノ酸置換において保存的置換が加えられたタンパク質であって、ヒトシノビオリン蛋白質(配列番号:2)と機能的に同等なタンパク質が含まれる。保存的置換は、タンパク質の活性に重要なドメインのアミノ酸を置換する場合などにおいて重要であると考えられる。このようなアミノ酸の保存的置換は、当業者にはよく知られている。
また、非保存的置換によりタンパク質の活性などをより上昇(例えば恒常的活性化型タンパク質などを含む)または下降(例えばドミナントネガティブなどを含む)させることも考えられる。
なおストリンジェントな条件とは、具体的には例えば 6×SSC、40%ホルムアミド、25℃でのハイブリダイゼーションと、1×SSC、55℃での洗浄といった条件を示すことができる。ストリンジェンシーは、塩濃度、ホルムアミドの濃度、あるいは温度といった条件に左右されるが、当業者であればこれらの条件を必要なストリンジェンシーを得られるように設定することは自明である。
ヒトシノビオリン(配列番号:2)に変異を導入して得たタンパク質や、上記のようなハイブリダイゼーション技術等を利用して単離されるポリヌクレオチドがコードするタンパク質は、通常、ヒトシノビオリン(配列番号:2)とアミノ酸配列において高い相同性を有する。高い相同性とは、少なくとも30%以上、好ましくは50%以上、さらに好ましくは80%以上(例えば、95%以上)の配列の同一性を指す。塩基配列やアミノ酸配列の同一性は、インターネットを利用したホモロジー検索サイトを利用して行うことができる[例えば日本DNAデータバンク(DDBJ)において、FASTA、BLAST、PSI-BLAST、および SSEARCH 等の相同性検索が利用できる[例えば日本DNAデータバンク(DDBJ)のウェブサイトの相同性検索(Search and Analysis)のページ ; http://www.ddbj.nig.ac.jp/E-mail/homology-j.html]。また、National Center for Biotechnology Information (NCBI) において、BLASTを用いた検索を行うことができる(例えばNCBIのホームページのウェブサイトのBLASTのページ; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/; Altschul, S.F. et al., J. Mol. Biol., 1990, 215(3):403-10; Altschul, S.F. & Gish, W., Meth. Enzymol., 1996, 266:460-480; Altschul, S.F. et al., Nucleic Acids Res., 1997, 25:3389-3402)]。
Syno-P3(SLALTGAVVAHAYYC/配列番号:3)、
Syno-P2(TCRMDVLRASLPAQS/配列番号:4)、および
Syno-P1(GAATTTAAGTSATAC/配列番号:5)
i) 被検者の生体試料中に存在するRAのマーカーを検出する工程、および
ii) 工程 i)の検出結果を、RAと関連付ける工程
・シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なポリヌクレオチド、
・シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なタンパク質、
・シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なペプチド、
・シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なタンパク質に結合する抗体、および
・ シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なペプチドに結合する抗体
a)被験化合物を、シノビオリンもしくはシノビオリンと機能的に同等なタンパク質、またはペプチドと接触させる工程、および
b)被験化合物と前記タンパク質またはペプチドとの結合を観察する工程
a)上記のシノビオリンに対する結合活性の検出方法によって、被験化合物のシノビオリンもしくはシノビオリンと機能的に同等な蛋白質に対する結合活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記結合活性が高い被験化合物を選択する工程
a)被験化合物存在下で、シノビオリンもしくはシノビオリンと機能的に同等な蛋白質またはペプチドとそのリガンドとを接触させる工程、および
b)前記タンパク質またはペプチドに結合するリガンド、および/または被験化合物を検出する工程
a)上記検出方法に基づいて、被験化合物のシノビオリンもしくはシノビオリンと機能的に同等な蛋白質とそのリガンドとの結合を阻害する活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記阻害活性が高い被験化合物を選択する工程
a)シノビオリンリガンドの存在下または不存在下で、被験化合物とシノビオリンを接触させる工程、および
b)シノビオリンを介するシグナル伝達を検出する工程
a)前記の方法によって、被験化合物のシノビオリンによるシグナル伝達を調節する活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記調節の活性が高い被験化合物を選択する工程
チロシンキナーゼドメイン(VEGF受容体、PDGF受容体、HGF受容体、EGF受容体など)、
チロシンホスファターゼドメイン(RPTPなど)、または
セリン/スレオニンキナーゼドメイン(TGFβ受容体など)
あるいは、リン酸化チロシン抗体など、リン酸化蛋白質に対する特異的抗体を用いて特定のアミノ酸のリン酸化を検出することもできる。
得られた受精卵は、輸精管結紮雄個体との交配により偽妊娠させたレシピエントの卵管内に移植し、産仔を得ることができる。産仔の尾などからDNAを調製し、PCRにより導入DNAの保持を確認する(Brigid Hogan et al. eds., "Manipulating the Mouse Embryo : A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, 1994, Gordon, J. W. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 7380-7384, 1980; Jaenisch, R. and B. Mintz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 71: 1250-1254, 1974)。生殖系列に遺伝子が導入されたキメラ動物からは、正常動物と交配することによりヘテロ接合体が得られる。ヘテロ接合体同士の交配によりホモ接合体を得ることができる。本発明のトランスジェニック非ヒト脊椎動物には、これらの子孫も含む。
全身性プロモーターとしては、例えばβアクチンプロモーター等が挙げられる。例えば、pCAGGS等に含まれている、ヒトサイトメガロウイルスエンハンサーが連結されたニワトリβアクチンプロモーターを用いることができる。部位特異的または時期特異的に本発明のDNAを発現するトランスジェニック動物を作製する場合、Cre-loxPの系などを利用することが可能である。例えば、部位特異的または時期特異的なプロモーターの下流にCreリコンビナーゼ遺伝子を有するトランスジェニック動物を作製し、別に汎用プロモーターの下流に本発明のポリペプチドをコードするDNAを連結させたベクターを保持するトランスジェニック動物を作製する。この時、プロモーターと本発明のポリペプチドをコードするDNAとの間に一対のloxPに挟まれたストップコドンまたは転写終結シグナル等を挿入しておく。2つの個体を掛け合わせることにより、Creの発現に伴なって本発明のポリペプチドを発現させることができる。
関節異常を寛解または増悪させる化合物を試験またはスクリーニングする方法であって、(a)本発明のDNAが外来的に導入されているトランスジェニック非ヒト脊椎動物に被験化合物を投与する工程、および(b)投与された動物の関節異常を評価する工程、を含む方法。
a)被験化合物を前記ノックイン動物またはノックイン細胞に適用する工程、および
b)マーカー遺伝子の発現レベルを測定する工程、
すなわち、被験化合物を適用した動物または細胞において、マーカー遺伝子の発現を検出し、マーカー遺伝子の発現を上昇または低下させる化合物を選択する。LacZをマーカーに用いた場合のマーカー遺伝子の発現の検出は、実施例に記載の方法により行うことができる。この方法により、個体を用いた試験やスクリーニングに加え、例えば器官や組織を単離して用いたり、トランスジェニック動物から得られた細胞を用いて同様の試験やスクリーニングを行うことも可能である。
a)シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なポリヌクレオチドの内因性プロモーターの制御下にレポーター遺伝子を発現することができる発現系に、被験化合物を接触させる工程、および
b)レポーター遺伝子の発現レベルを測定する工程
a)前記活性の検出方法に基づいて、被験化合物のシノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なポリヌクレオチドの内因性プロモーターの活性を調節する活性を測定する工程、および
b)対照と比較して、前記活性に差がある被験化合物を選択する工程
a)被験化合物の存在下で、シノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なポリヌクレオチドを発現する細胞を培養する工程、および
b)前記ポリヌクレオチドの発現レベルを測定する工程、
a)前記活性の検出方法に基づいて、被験化合物のシノビオリンまたはシノビオリンと機能的に同等なポリヌクレオチドの発現を調節する活性を検出する工程、および
b)対照と比較して前記活性に差を有する被験化合物を選択する工程
なお本明細書において引用された全ての先行技術文献は、参照として本明細書に組み入れられる。
抗滑膜細胞抗血清は、以下のような操作で調製した滑膜細胞を免疫原として用いて得た。10人の慢性関節リウマチ(RA)患者の滑膜除去手術により摘出された関節滑膜組織を、無菌的な状態でphosphate buffered saline(PBS)で洗浄した。洗浄した組織を約5mm立方の大きさに細断し、37℃、20分 0.25%トリプシン/PBS消化を行った。消化された滑膜組織より余分な組織片を取り除き、得られた細胞を10%牛胎仔血清を含むダルベッコ改変イーグル培地(Virology, 8, 396, 1959)(10%FCS-DMEM)を用いて懸濁し、細胞培養用の滅菌シャーレ上で、5%CO2、37℃、24時間培養した。培養上清を捨て、10%FCS-DMEMを用いて洗浄し非接着細胞を取り除き、シャーレに付着した細胞としてリウマチ患者由来滑膜細胞を取得した(The Journal of Clinical Investigation, 92, 186, 1993)。培養された細胞をプールして、RA患者由来の以下の滑膜細胞として実験に用いた。
実施例1で得たRA患者10名分の滑膜細胞からAcid guanidine/phenol chloroform法にてtotal RNAを抽出し、poly Tビーズを用いmRNAを精製した(Analytical Biochemistry, 162, 159, 1987)。λZAPベクター(STRATAGENE社)を用いてRA患者滑膜細胞のcDNAライブラリーを常法に従い作製した。picoBlue immunoscreening kit(STRATAGENE社)により、上記実施例1の抗滑膜細胞抗血清によるimmunoscreeningを行った(図1)。得られた陽性クローン(ファージ)をヘルパーファージによりプラスミドpBluescript II SK(+)へと変換した。pBluescripte II SK(+)に挿入されたDNAの塩基配列はM13PrimerM4及びM13PrimerRV(Takara)を用いダイターミネーター法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 74, 5463, 1977)に基づきABI PRISM 377 DNA Sequencer(PERKIN ELMER)により決定した。前述の抗滑膜細胞抗血清が認識する抗原をコードする遺伝子(「シノビオリン」と名付けた)の3'末端から塩基配列を決定し、poly(A)+ 鎖を含む2990bpの塩基配列を明らかにした(配列番号:1の42-3031番目)。この塩基配列を用い、滑膜細胞cDNAライブラリーから5'-RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 85:8998-9002, 1988)により全長シノビオリンの翻訳領域と5'-非翻訳領域の一部及びpoly(A)+ 鎖を含む3031bpの塩基配列を決定した(配列番号:1)。この塩基配列を GenBank によりホモロジーサーチした結果、類似の配列は報告されておらず新規な遺伝子であった。
抗滑膜細胞抗血清を用いたイムノスクリーニングで得られたcDNAクローンから、シノビオリンの一部をコードするcDNA(1799bp; 配列番号:1の1233-3031番)を制限酵素EcoRI及びXhoI処理し抽出した。EcoRI/XhoIの認識配列を末端に持つcDNAを、グルタチオン S-トランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質発現ベクターpGEX-5X-3に挿入してサブクローニングした。シノビオリンcDNAの一部を挿入したpGEX-5X-3をBL21大腸菌株に42℃、45秒ヒートショックにより導入し、BL21/synoviolin-GST gene/pGEX-5X-3を得た。このBL21を0.1mg/mLアンピシリンを含むLB培地で培養し、0.1mM isopropylthio-β-D-galactoside(IPTG)を添加して37℃で更に2時間培養し前記融合タンパク質の発現を誘導した。遠心分離法で回収したBL21をPBSで洗浄後、1mg/mLリゾチーム消化し0.1% TritonX-100により可溶化した。可溶化されたGST融合タンパク質を含むBL21由来タンパク質懸濁液をグルタチオンセファロース4B(GS4B)に適用後PBSで洗浄し、50mM還元型グルタチオン/PBSにより目的とするGST-部分シノビオリン融合タンパク質を精製した。
実施例2で得られたシノビオリンをコードするcDNA(1851bp; 配列番号:1の60-1910番)の3'-末端に、2分子のインフルエンザ赤血球凝集素(hemagglutinin;HA)-tagを付加したシノビオリンcDNA(syno-HAHA)を、グルタチオン S-トランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質発現ベクターpGEX-5X-1に挿入してサブクローニングした。syno-HAHA遺伝子を挿入したpGEX-5X-1をBL21大腸菌株に42℃、45秒ヒートショックにより導入し、BL21/syno-HAHA/pGEX-5X-1を得た。このBL21を0.1mg/mlアンピシリンを含むLB培地で培養し、0.1mM isopropylthio-β-D-galactoside(IPTG)を添加して30℃で更に3時間培養しN末端にGST、C末端にHAを融合したシノビオリン(GST-シノビオリン-HAHA)タンパク質の発現を誘導した。遠心分離法で回収したBL21をPBSで洗浄した後、1mg/mlリゾチーム消化し0.1% TritonX-100により可溶化した。可溶化したGST-シノビオリン-HAHAタンパク質を含むBL21由来タンパク質懸濁液をグルタチオンセファロース4B(GS4B)に適用後PBSで洗浄し、50mM還元型グルタチオン/Tris-HCl(pH8.0)により目的とするGST-シノビオリン-HAHAタンパク質を精製した。
シノビオリン遺伝子(配列番号:1)の末端を制限酵素EcoRI修飾し、pBluescript II KSベクターに挿入した(syno/pBluescript)。その後、syno/pBluescript(1μg)とTNT-coupled Translation System(Promega社)を用いin vitro translation法により、シノビオリンタンパク質を試験管内で[35S]ラベル体として発現させた。[35S]ラベルしたシノビオリンタンパク質は、10% SDS-PAGEに適用しイメージアナライザー(BAS2000, Fujix)により放射活性を検出した。結果を図3に示した。シノビオリン遺伝子から試験管内で翻訳されるシノビオリンタンパク質のSDS-PAGEによる分子量は、約80kDaであることが認められた。
実施例1で得られたRA患者由来の滑膜細胞、A549細胞株、Jurkat細胞株そしてHeLa細胞株より常法に従いmRNAを採取した。このmRNA 1μgを1%アガロースゲル電気泳動で分離し、ナイロン膜にコンタクトブロッティング法で転写した。ナイロン膜を80℃、2時間処理し、デンハルト液中で42℃、2時間のプレハイブリダイゼイションを行った。次いで32P放射ラベルしたシノビオリンのcDNA(1799bp; 配列番号:1の1233-3031番)をプローブとして42℃、12時間ハイブリダイズさせた。反応後のナイロン膜を300mM NaCl、30mM sodium citrateで洗浄後、15mM NaCl、1.5mM sodium citrateを使って50℃で再度洗浄を行った。目的のmRNAはX線フィルムを感光させることにより検出した。この結果得られたオートラジオグラフを図4に示した。シノビオリン遺伝子が、RA患者由来滑膜細胞に強く発現していることを認めた。
以下の細胞を試料として、シノビオリンの発現状態をウエスタンブロッティング法で確認した。
・ 実施例1で調製したRA患者由来の滑膜細胞
・ヒト臍帯血管内皮細胞(HUVEC)
・HEK(human embryonic kidney)-293T
・実施例3で調製したGST-部分シノビオリン融合タンパク質(陽性コントロール)
実施例1で調製したRA患者由来の滑膜細胞を 1% NP-40で可溶化した細胞破砕画分を調製した。この滑膜細胞破砕液は、25mM Tris-HCl(pH6.8)、0.25%sodium dodecyl sulfate(SDS)、0.05%メルカプトエタノール、0.1%グリセロールで処理し、8% SDS polyacrylamide電気泳動(SDS-PAGE)により分離した。SDS-PAGE後、滑膜細胞由来タンパク質は、エレクトロブロッティング法によりニトロセルロース(NC)膜に転写した。このNC膜に対し、5%スキンミルクを加えた Tris buffered saline(TBS)で室温、1時間ブロッキングした後、RA患者由来滑膜細胞を免疫し得られた抗滑膜細胞抗血清(図中の免疫後)を5%スキンミルクを加えたTBSで1000倍希釈して室温、1時間免疫反応させた。同時に、ウサギに滑膜細胞を免疫する前に採取した血清(プレイミューン)を陰性コントロールとして用いた。反応後のNC膜を0.1% Tween20/TBSで洗浄し、horse radish peroxidase(HRP)標識抗ウサギIgG抗体を2次抗体として室温、1時間免疫反応させ、0.1% Tween20/TBSで洗浄し、HRP活性を検出することにより目的抗原を検出した。HRP活性の検出にはECLキット(Amersham社)を用いた(Clinical Chemistry. 25, p1531, 1979)。結果を図6に示した。
免疫染色法は、滑膜細胞を常法に従いスライドガラス上に固定し、実施例1の抗滑膜細胞抗血清を用いた免疫染色を行った。1% 牛血清アルブミン(BSA)で30分ブロッキングを行った標本に、1%BSAで100倍希釈した抗滑膜細胞抗血清を室温で60分免疫反応させた。また抗血清による観察とともに、この抗血清から精製した精製抗滑膜細胞抗体を用いた実験も行った。精製抗滑膜細胞抗体は、GST-部分シノビオリン融合タンパク質をリガンドとしてイムノアフィニティ精製することにより調製した。リガンドには、配列番号:1の1233-3031番までのシノビオリン遺伝子1799bp挿入したGST-融合タンパク質発現ベクターpGEX-5X-3をBL21に導入後発現させた融合タンパク質を用い、グルタチオンセファロースカラムをファルマシア社の方法により作製してGST-部分syno-GSカラムとした。精製抗滑膜細胞抗体を用いる場合のコントロールには、GSTをリガンドとして同じように抗血清をイムノアフィニティ精製して得た抗GST抗体を用いた。
ウエスタンブロッティング法(実施例8)および免疫染色法の結果より、抗滑膜細胞抗血清が認識するシノビオリンタンパク質はRA患者由来滑膜細胞及び滑膜組織に発現していることが確認された。
GST-部分シノビオリン融合タンパク質を抗原として、ウエスタンブロッティング法によってRA患者血清中の抗シノビオリン抗体の検出を試みた。実施例7と同様の操作により、まずGST-部分シノビオリン融合タンパク質(100ng/lane)をSDS-PAGEにより泳動し、NC膜に転写した。1次抗体としてRA患者血清(5例)を Tris buffered saline(TBS)で1000倍希釈し、GST-部分シノビオリン融合タンパク質を転写したNC膜に対して室温で60分免疫反応させた。0.1% Tween20/TBSでNC膜を洗浄した後HRP標識抗ヒトIgG抗体を2次抗体として室温で60分免疫反応させ、0.1% Tween20/TBSで洗浄し、HRP活性を検出することにより目的抗原と反応したヒトIgGを検出した。HRP活性の検出は実施例7と同様に行った。結果を図10に示した。RA患者の血清中(5例中5例)にはGST-部分シノビオリン融合タンパク質に対する抗IgG抗体が存在することが認められた(図10)。一方、変形性関節症(OA)患者由来血清及び正常ヒト血清中にはGST-部分シノビオリンを認識する抗体は認められなかった。
実施例2で作製したRA患者滑膜細胞由来のcDNA発現ライブラリーを用いて、シノビオリンリガンドのスクリーニングを行った(竹縄忠臣、渡邉俊樹編、バイオマニュアルUPシリーズ"タンパク質の分子間相互作用実験法"、pp. 66-67、羊土社; Kaelin, W. G. et al., Cell 70, 351-364, 1992; Skolnik, E. Y. et al., Cell 65, 83-90, 1991; Sambrook, J. et al., Molecular Cloning, a laboratory manual second edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press 12.16-12.20, 1989)。ライブラリーファージを大腸菌(XL1-Blue MRF')に37℃20分間インキュベートして感染させ、Topアガロースと混和後プレートに広げた。42℃で3.5時間培養後、10mM IPTG に浸漬した後乾燥させたニトロセルロースメンブレンをプレートに載せ、さらに37℃で3.5時間培養を行った。メンブレンを回収後、洗浄バッファー[10mM Tris-HCl (pH8.0), 0.5% Skim milk, 0.1% TritonX-100, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 5mM MgCl2, 1mM DTT, protease inhibitor(complete, Boehringer Mannheim社)]で5分間の洗浄を5回行った後、ブロッキングバッファー[10mM Tris-HCl (pH8.0), 5% Skim milk, 0.1% Triton X-100, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 5% glycerol, protease inhibitor(complete, Boehringer Mannheim社)]に1時間浸漬した。洗浄バッファーで5分間の洗浄を5回行った後、プロテインキナーゼAで 32Pラベルした GST-シノビオリン(実施例3で精製した GST-部分シノビオリン融合タンパク質)をプローブとして加え(約106 cpm/ml)、インキュベートした。メンブレン1枚のカウントが約1kcpmになるまで洗浄バッファーを変えながら洗浄を繰り返し、オートラジオグラフィーによりシグナルを検出した。その結果、シノビオリンに結合するクローンが得られた。このクローンをシノビオリンリガンド(SL)と名付けた。
実施例6と同様に各種細胞よりmRNAを採取し、実施例11で得られたSLのcDNAをプローブとしてノーザンブロッティング法を行った。用いた細胞は以下のとおりである。RA患者由来滑膜細胞は、SL遺伝子を強発現していることが認められた(図11)。
HEK-293T
実施例1で調製したRA患者由来の滑膜細胞
A549
HeLa
SL cDNAを実施例3と同様にpGEXベクターに挿入し、GST-SL融合タンパク質を作製し、10% SDS-PAGEにGST-SL(500ng)、コントロールとしてGST(1μg)を適用した。SDS-PAGE後、エレクトロブロッティング法によりナイロン膜に転写した。このナイロン膜を、6M guanidine hydrochrolide、5mM 2-Mercaptoethanolを含む50mM Tris-HCl(pH8.0)で1時間、室温で変性させ、5mM 2-Mercaptoethanol、0.05% Tween20を含む50mM Tris-HCl(pH8.0)で4℃、一晩再生した。再生されたナイロン膜は、Blocking buffer[10mM Tris-HCl (pH8.0), 5% Skim milk, 0.1% Triton X-100, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 5% glycerol, protease inhibitor(complete, Boehringer Mannheim社)]で処理し、Blocking buffer(0.5% skim milk以外は上記と同じ組成)で洗浄した。その後、TNT-coupled Translation System(Promega社)及びpcDNA3-HA-シノビオリン-HAHA(配列番号:1のシノビオリンcDNA 1851bp;60-1910にHA-tagを付加したシノビオリンcDNAを発現ベクターpcDNA3に挿入した)を用い、in vitro translationを行い[35S]ラベルしたHA-シノビオリン-HAHA融合タンパク質([35S]HA-シノビオリン-HAHA)をプローブとして用いナイロン膜上のGST-SL及びGSTと室温で2時間反応させた。そのナイロン膜は、10mM Tris-HCl (pH8.0), 0.5% Skim milk, 0.1% TritonX-100, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 5mM MgCl2, 1mM DTT, protease inhibitor(complete, Boehringer Mannheim社)で洗浄し、イメージアナライザー(BAS2000, Fujix)で放射活性を検出した。ナイロン膜に転写されたGST-SL融合タンパク質と[35S]HA-シノビオリン-HAHAは、両者の結合が観察された。またコントロールであるGSTと[35S]HA-シノビオリン-HAHAとの結合は認められなかった(図12)。この結果から、シノビオリンとSLは、タンパク質の相互作用により結合することが推測された。
実施例1で調製したRA患者由来滑膜細胞を5×103 cell/wellとなるように 96 well plateを用い調製し、GSTまたはGST-部分シノビオリンを最終濃度0.01〜1μMとなるように細胞上清に添加した。培養3日後 3-(4,5-dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazolium bromide (MTT)/PBSを細胞上清に添加し、37℃、5% CO2 の条件で3時間培養を行った。培養後細胞上清を取り除きdimethyl sulfoxideによりMTT formazanの結晶を溶解し吸光度測定を行った(Journal of Immunological Methods, 65, 55, 1983)。10%-FCS/DMEM、37℃、5% CO2 の条件下でのRA患者由来滑膜細胞増殖はGST-部分シノビオリン(1μM)によって有意に抑制された(図13)。
シノビオリン蛋白質をコードするDNAのN末にFlagタグを連結させ、3'側下流にポリA シグナルを結合させたシノビオリン遺伝子導入用ベクターを構築した。ベクターはpCAGGS(Niwa, H. et al., Gene 108: 193-9, 1991)を基にして構築し、プロモーターには、βアクチンプロモーター、エンハンサーには、ヒトサイトメガロウイルス前期エンハンサー(human cytomegalovirus immediate early enhancer)を用いた(図14)。
シノビオリン遺伝子導入マウス(1匹)の指関節の組識学的な検討を行った。指関節部分の組識切片をヘマトキシリンエオジン(HE)染色した。ヘマトキシリンエオジン染色は、公知の方法により実施した。
HE染色の結果、関節症を呈した部分においては著しい滑膜増生に伴う骨破壊と異常な骨新生が認められた(図16)。一方、対照とした遺伝子導入マウスの正常な指関節においては、上記所見は観察されなかった(図17上)。
また、指関節における抗Flag抗体による免疫染色を行った結果、シノビオリン遺伝子導入マウスにおいては、増生を示した滑膜組織および軟骨細胞にシノビオリンの発現が認められた(図18)が、遺伝子導入マウスの正常な指関節においては上記所見は観察されなかった(図17下)。
マウスシノビオリン遺伝子断片の翻訳開始点(第一メチオニンを翻訳するATGコドン)にlacZ遺伝子を導入し、ターゲティングベクターを構築した。マーカー遺伝子としてネオマイシン耐性(neo)遺伝子を導入し、またジフテリア毒素A(DT-A)遺伝子も結合させ非相同的な組換えを起こした細胞株を排除できるようにした(図19)。
実施例17で得た変異マウスにおけるシノビオリン発現部位をLacZ染色により検討した。すなわち、5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactoside(X-Gal)を用いて胚全体を発色させ、LacZ(β-ガラクトシダーゼ活性として)の発現分布を調べた。観察した胚の数は、32個である。
その結果、胎生12.5日齢では、頭頂骨および四肢に、13.5日齢では耳および四肢にLacZの強い発現が認められた(図22)。いずれも骨および軟骨が形成される部位であった。更に四肢形成期における四肢組識切片のLacZ染色およびHE染色を行った結果、Apical Ectodermal Ridge(AER;外胚葉頂堤)および軟骨・骨原基(または軟骨・骨)に強い発現が観察された(図23)。
更にシノビオリン遺伝子ノックアウトマウスの表現型について検討を行った。
胎生12.5日齢では、ホモはヘテロと比較し、頭頂部から臀部までの長さが短く、頭蓋や四肢の形成が未熟である傾向が認められたが、胎生13日齢ではヘテロと野生型の表現型の間に顕著な差は認められなかった(図26)。なお、ホモマウスでは出生が認められず、さらに少なくとも胎生17日以降のホモの胎仔の生存が確認できなかったことにより、胎生致死と考えられた(表1)。
更に、ホモで異常を示した後肢に対しLacZおよびHE染色を行った結果、AER及び未分化間葉系細胞の濃縮部位(将来指骨を形成する部位)にシノビオリンの発現を反映するLacZの発現が認められた(図28)。
以上の結果より、シノビオリン遺伝子ホモノックアウトマウスは、胎生期において肢芽の発生異常が認められ、また、軟骨及び骨への形成が認められず、肢芽と軟骨、骨の発生部位にシノビオリンの発現が認められたことから、シノビオリン分子の骨格形成への関与が強く考えられた。
マウスにおけるコラーゲン誘導関節炎(CIA)は、ヒト慢性関節リウマチの関節炎モデルとして広く利用されている。実施例17で作製したシノビオリン遺伝子ノックアウトマウス(ヘテロ接合体)または野生型マウスに抗コラーゲン抗体カクテルを投与し、惹起される関節炎を観察した。その結果、シノビオリンのヘテロノックアウトマウスでは、野生型に比べ関節炎の惹起が弱いことが判明した(図31)。この結果からも、シノビオリンがRAにおける関節炎誘発に貢献していることが支持される。
ノックアウト(KO)マウスより得られた(explant法)細胞のうち、軟骨・骨および肢の原基となると考えられる未分化間葉系細胞にのみLacZ染色、すなわちシノビオリンの発現が認められた。また、胎仔肢芽細胞の初代培養において、LacZ陽性のコロニー(すなわちシノビオリン発現細胞)とアルシャンブルー染色陽性のコロニーは一致しており、さらに双核の典型的な軟骨細胞においてもLacZ(β-ガラクトシダーゼ活性として)の染色(シノビオリンの発現)が見られることから、骨・軟骨分化にシノビオリンが関与していることが支持された。さらにアルカリフォスファターゼ染色、Kossaの染色などにより、骨・軟骨形成能がホモノックアウト由来の細胞では遅延していることが確認された(図32〜38)。
シノビオリン遺伝子へテロノックアウトマウス(lacZ遺伝子ノックイン)の初代培養細胞を用いて、被験試料がシノビオリン遺伝子の発現に及ぼす効果をβ-galアッセイにより評価した。3回継代したシノビオリン遺伝子へテロノックアウトマウスの初代培養細胞を24ウェルプレートに1ウェル当たり 0、1×103、3×103、1×104、3×104、および 1×105 細胞播き、10%ウシ胎仔血清を含むダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で一晩培養した。まず、無刺激条件のまま細胞培養に細胞溶解液(プロメガ社製)を細胞層が完全に覆われるのに十分な量(100μl/well)加え、培養プレートを振とう機に移し、細胞層が溶解液に常に浸されるように室温で15分ゆっくりと振とうした。
シノビオリンに対するモノクローナル抗体を以下のように調製した。免疫用のペプチドとして、以下に示すヒトシノビオリンの部分アミノ酸配列を含む3種類のペプチドを合成した。これらのアミノ酸配列は、抗原性を有すると推測された領域から選択した。
Syno-P3(SLALTGAVVAHAYYC/配列番号:3)、
Syno-P2(TCRMDVLRASLPAQS/配列番号:4)、および
Syno-P1(GAATTTAAGTSATAC/配列番号:5)
〈1〉抗シノビオリンモノクローナル抗体による患者由来滑膜細胞のウェスタンブロッティング
実施例23で得られたSyno-P2を認識する2種の抗シノビオリンモノクローナル抗体(10Dbおよび7Bc)を用いて、慢性関節リウマチ患者(RA)由来滑膜細胞の蛋白質をSDS-PAGEで分離し、ウェスタンブロッティング法を行った。ウェスタンブロッティング法の操作は、抗体として実施例23のモノクローナル抗体10Dbおよび7Bcを、そして標識抗体として抗マウスIgGヒツジ-HRPを用いる他は実施例8に記載のとおりである。対照として、変形性関節症患者(OA)由来の滑膜細胞も解析した。その結果、RA患者由来の滑膜細胞で特異的なシグナルが検出された(図44A)。実施例23で得られたモノクローナル抗体は、RA患者の滑膜細胞を特異的に認識することが確認された。これらのモノクローナル抗体は、RAの検出に有用である。
モノクローナル抗体10Dbを用いて、RA患者由来滑膜細胞の蛍光免疫細胞化学解析を行った。免疫染色の操作は、抗体として実施例23のモノクローナル抗体10Dbを、そして標識抗体として抗マウスIgGヒツジ-FITCを用いる他は実施例9に記載のとおりである。シノビオリン蛋白質のシグナルは、RA患者由来滑膜細胞で強く検出されたが、二次抗体のみを反応させた対照では検出されなかった(図44B)。
モノクローナル抗体10Dbおよび7Bcを用いて、RA患者から採取した滑膜組織切片の免疫染色を行った。免疫染色の操作は、抗体として実施例23のモノクローナル抗体10Dbおよび7Bcを、そして標識抗体として抗マウスIgGヒツジ-HRPを用いる他は実施例9に記載のとおりである。シノビオリン蛋白質のシグナルは、RA患者由来滑膜組織で強く検出された(図45)。同時に行ったHE染色により、滑膜細胞の増殖層が観察され、その部分がモノクローナル抗体で染色されていることが確認された。これらの結果から、本発明のモノクローナル抗体は、RA患者の滑膜組織を特異的に認識することが確認された。以上のように、シノビオリン抗体を用いて患者試料中のシノビオリンを検出することにより、RAの検査および診断を実施することができる。
E3ユビキチン-蛋白質リガーゼは、自己ユビキチン化をすることが知られている(Hashizume R et al., J. Biol. Chem. 276, 14537-14540, 2001)。そこで、シノビオリンについて自己ユビキチン化活性があるかどうか検討した。pCAGGSベクターにFLAG-シノビオリン遺伝子を挿入したプラスミドを、HEK-293細胞にトランスフェクションし、36時間後細胞を回収した。Buffer A [15 mM Tris-HCl pH 7.5、0.5 M NaCl、0.35% NP-40、1 mM PMSF、2μg/ml aprotinin、2μg/ml leupeptin] にて細胞破砕液を得た。細胞破砕液を高速遠心器にて遠心分離し、その上清0.6 mlに、3μgの抗FLAG抗体および7.5μlのプロテインAビーズを添加し、一晩免疫沈降を行った。Buffer Aもしくは0.1% SDS を添加した Buffer Aにて3回、Buffer B [25 mM Tris-HCl pH 7.5, 50 mM NaCl, 0.01% Nonidet P-40, 10% glycerol, 1 mM EDTA] にて2回ビーズを洗浄し、30μlのユビキチンリガーゼ反応液 [50 mM Tris-HCl pH 7.4, 5 mM MgCl2, 2 mM NaF, 10 nM okadaic acid, 2 mM ATP, 0.6 mM DTT, 1.5μg GST-HA-ユビキチン, 40 ng 酵母由来E1, 0.3μg UbcH5c(E2)] を添加し、37℃で30分反応させた。0.1 M DTTを含む 2×Laemmli SDS-loading bufferを30μl加え、ボイルした後、SDS-PAGEにて展開し、ニトロセルロース膜にトランスファーした。一次抗体には抗FLAG抗体(SIGMA)および抗HA抗体(ロシュ・ダイアグノスティックス社)を用いた。HRP活性の検出は実施例7と同様に行った。なお、コントロールとして FLAG-シノビオリン遺伝子をトランスフェクションした細胞の破砕液のみ(免疫沈降前)、または、細胞破砕液を免疫沈降操作して得た溶液(すなわちFLAG-シノビオリンタンパク質とその免疫複合体のみ)を用いた。さらに、GST-HA-ユビキチン、ATP、E1またはE2のいずれかを添加しない反応も行った(GST-HA-ユビキチン非添加の場合はGSTを用いて反応を行った)。0.1% SDS添加Buffer A洗浄によりimmunopurificationしたシノビオリンを用いた結果を図46に示した。抗HA抗体によるブロットにおいて、シノビオリンの分子量(図46 *印)より約35 kDa大きなサイズのバンドが検出された(図46 矢印)。このバンドは抗FLAG抗体によるブロットにも見られ、GST-HA-ユビキチンがシノビオリンに付加したものと考えられた。さらに、ATP、E1またはE2のいずれかを欠損した反応系では、シノビオリンの自己ユビキチン化が起こらないことが示された。Buffer Aのみでビーズを洗浄した場合にも同様の結果となった。これらの結果より、1)シノビオリンを含む免疫複合体にE1およびE2依存的なユビキチンリガーゼ活性が存在し、かつ、immunopurificationの結果より、2)シノビオリンはE3ユビキチン-蛋白質リガーゼ活性を有することが明らかとなった。
Claims (13)
- 被検者の生体試料中に存在する慢性関節リウマチのマーカーを検出する方法であって、慢性関節リウマチのマーカーが、配列番号:1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチド、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体からなる群から選択された少なくともひとつのマーカーである方法。
- 次の工程を含む、生体試料中において慢性関節リウマチのマーカーである配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体を測定する方法。
a)生体試料を、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドと接触させる工程、および
b)配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体を検出する工程 - 次の工程を含む、生体試料中において慢性関節リウマチのマーカーである配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドを測定する方法。
a)生体試料を、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体と接触させる工程、および
b)配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドを検出する工程 - 慢性関節リウマチのマーカーである配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドの発現を指標に、該タンパク質またはポリヌクレオチドを発現する細胞を検出または分離する方法。
- 細胞がリウマチ滑膜細胞である、請求項4に記載の方法。
- 細胞が未分化間葉系細胞である、請求項4に記載の方法。
- 次の工程を含む、慢性関節リウマチの検出方法であって、慢性関節リウマチのマーカーが、配列番号:1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチド、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体からなる群から選択された少なくともひとつのマーカーである方法。
i)被検者の生体試料中に存在する慢性関節リウマチのマーカーを検出する工程
ii)工程i)の検出結果を、慢性関節リウマチと関連付ける工程 - 生体試料が被検者の血液であり、慢性関節リウマチのマーカーが配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体である請求項7に記載の方法。
- 生体試料が被検者の滑膜組織または滑膜細胞であり、慢性関節リウマチのマーカーが配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドである請求項7に記載の方法。
- 慢性関節リウマチの診断、または治療効果の判定を目的とする免疫学的分析用試薬であって、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドを含む、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質を認識する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドを認識する抗体を分析するための免疫学的分析用試薬。
- 慢性関節リウマチの診断、または治療効果の判定を目的とする免疫学的分析用試薬であって、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体を含む、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドを分析するための免疫学的分析用試薬。
- 分析をすべき配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドが滑膜細胞に存在するものである請求項11に記載の免疫学的分析用試薬。
- 慢性関節リウマチの診断、または治療効果の判定を目的とする試薬であって、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質に結合する抗体、および/または配列番号:3〜5に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドに結合する抗体を含む、配列番号:2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質を発現する細胞の検出または分離用試薬。
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