JP2023533565A - ANTI-HUMAN IMMUNODEFICIENCE VIRUS-1 ANTIBODY AND METHOD OF USE THEREOF - Google Patents
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Abstract
L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む抗HIV-1抗体であって、L-CDR1は、配列番号15、配列番号18、配列番号21、及び配列番号15、18又は21のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号16、配列番号19、配列番号22、及び配列番号16、19又は22のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号17、配列番号20、配列番号23、及び配列番号17、20又は23のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択される、抗体。An anti-HIV-1 antibody comprising L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein L-CDR1 is SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 21, and any of SEQ ID NO: 15, 18 or 21 selected from the group consisting of sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 22, and SEQ ID NO: 16, 19 or 22; selected from the group consisting of sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 23, and SEQ ID NO: 17, 20 or An antibody selected from the group consisting of any of the 23 and sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions.
Description
本出願は、HIV-1 p24タンパク質に特異的に結合する、ヒト免疫不全ウイルス-1に対する抗体(抗HIV-1)に関する。本発明はまた、前記抗体を使用して試料中のHIV-1を検出するための方法及びアッセイにも言及する。 The present application relates to antibodies against human immunodeficiency virus-1 (anti-HIV-1) that specifically bind to the HIV-1 p24 protein. The invention also refers to methods and assays for detecting HIV-1 in samples using said antibodies.
ヒト免疫不全ウイルス1(HIV-1)は、世界で3790万人が感染しているレトロウイルスであり、特に診断及び治療を受けることができない脆弱な集団において、毎年約100万人を死亡させている(Soliman, M.ら、「Mechanisms of HIV Control」、Current HIV/AIDS Reports 2017、vol.14(3);101~9頁)。HIV-1は後天性免疫不全症候群(AIDS)の主な原因であり、HIV-1感染者から性的接触によって、又は血液若しくは血液由来の汚染した製品への曝露によって伝染する不治の病である。ウイルスは、免疫細胞の機能を破壊して損なうことにより、免疫系を標的化する。感染者は免疫不全になり、他の日和見感染症、並びにある種の癌にかかりやすくなる(WHOウェブサイトの出典 - https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hiv-aids)。現在、HIV-1感染者の46%だけが自分の感染状態を知っている。したがって、急性感染時のHIV-1の検出は、公衆衛生上の重大な懸念事項である(Stone, M.ら、「Comparison of detection limits of fourth- and fifth-generation combination HIV antigen-antibody, p24 antigen, and viral load assays on diverse HIV isolates.」、Journal of Clinical Microbiology 2018、vol. 56(8);1~12頁)。 Human Immunodeficiency Virus 1 (HIV-1) is a retrovirus that infects 37.9 million people worldwide and kills approximately 1 million people each year, especially in vulnerable populations unable to access diagnosis and treatment. (Soliman, M. et al., "Mechanisms of HIV Control," Current HIV/AIDS Reports 2017, vol. 14(3); pp. 101-9). HIV-1 is the major cause of acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), a fatal disease transmitted from HIV-1 infected persons by sexual contact or by exposure to contaminated blood or blood-derived products. Viruses target the immune system by destroying and impairing immune cell function. Infected individuals become immunocompromised and susceptible to other opportunistic infections, as well as some types of cancer (Source from WHO website - https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/ hiv-aids). Currently, only 46% of people living with HIV-1 know their infection status. Therefore, detection of HIV-1 during acute infection is a major public health concern (Stone, M. et al., Comparison of detection limits of fourth- and fifth-generation combination HIV antigen-antibody, p24 antigen , and viral load assays on diverse HIV isolates.”, Journal of Clinical Microbiology 2018, vol. 56(8); pp. 1-12).
この特定の状況では、個人が感染した直後の数週間(急性期)のうちにHIV-1を診断することが目標となるが、これは二次感染を防止する可能性が高く、治療及びケアへの早期アクセスが可能となるためである(Lewis J.ら、「Field accuracy of fourth-generation rapid diagnostic tests for acute HIV-1: a systematic review.」、AIDS 2015、vol. 29(18);2465~71頁)。この目標をタイムリーに達成するためには、HIV-1検出のための早期バイオマーカーの使用が鍵となる。HIV-1感染の診断に最も一般的に使用されるバイオマーカーは、ウイルス構造タンパク質に対する抗体である。ここで、p24は、HIV-1ウイルスエンベロープの最も豊富な構造タンパク質であり、感染の初期段階に血清中に高レベルで分泌されるため、早期のHIV-1検出にとって重要なバイオマーカーであると考えられている。p24は、ウイルスRNA分子の周りのHIV-1エンベロープの主要な構造成分として働く重合カプシドタンパク質である。p24は、HIV-1 RNAのように、セロコンバージョンの前に検出可能なGagポリタンパク質前駆体に由来する24~25kDaのタンパク質である(Gray, E.R.ら、「p24 revisited: a landscape review of antigen detection for early HIV diagnosis.」、AIDS. 2018、vol. 32(15);2089~102頁)。 In this particular situation, the goal is to diagnose HIV-1 within the first few weeks after the individual becomes infected (the acute phase), which is likely to prevent secondary infections and facilitate treatment and care. (Lewis J. et al., "Field accuracy of fourth-generation rapid diagnostic tests for acute HIV-1: a systematic review.", AIDS 2015, vol. 29(18);2465 ~71 pages). The use of early biomarkers for HIV-1 detection is key to achieving this goal in a timely manner. The most commonly used biomarkers for diagnosis of HIV-1 infection are antibodies against viral structural proteins. Here, p24 is the most abundant structural protein of the HIV-1 viral envelope and is secreted at high levels into the serum during the early stages of infection, making it an important biomarker for early HIV-1 detection. It is considered. p24 is a polymeric capsid protein that serves as the major structural component of the HIV-1 envelope around the viral RNA molecule. Like HIV-1 RNA, p24 is a 24-25 kDa protein derived from the Gag polyprotein precursor that is detectable prior to seroconversion (Gray, E.R. et al., p24 revisited: a landscape review of antigen detection). for early HIV diagnosis.”, AIDS. 2018, vol. 32(15); pp. 2089-102).
疾病管理予防センター(CDC)及び世界保健機関(WHO)の現在のガイドラインは、HIV-1スクリーニングのための好ましい方法として、第4世代の抗体-抗原アッセイの使用を推奨している。これらの検査は、p24抗原と抗HIV-1抗体を検出し、診断空白期間を曝露後4週間から2週間へと狭めた(Gray, E.R.ら、「p24 revisited: a landscape review of antigen detection for early HIV diagnosis.」、AIDS. 2018、vol. 32(15);2089~102頁; Codoner, F.ら、「Gag protease coevolution analyses define novel structural surfaces in the HIV-1 matrix and capsid involved in resistance to Protease Inhibitors.」、Scientific Reports 2017、vol. 7(3717);1~10頁; Alexander TS.、「Human Immunodeficiency Virus Diagnostic Testing: 30 Years of Evolution.」、Clinical and Vaccine Immunology 2016、vol. 23(4);249~53頁; WHO、「World Health Organization Model List of Essential In Vitro Diagnostics.」、第1版、Geneva、2018; Centers for Disease Control and Prevention、2017、「National HIV testing day and new testing recommendations.」、Morbidity and Mortality Weekly Report vol. 63(25);537~37頁). Current guidelines from the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) and the World Health Organization (WHO) recommend the use of fourth generation antibody-antigen assays as the preferred method for HIV-1 screening. These tests detected p24 antigen and anti-HIV-1 antibodies, narrowing the diagnostic gap from 4 weeks to 2 weeks after exposure (Gray, E.R., et al., p24 revisited: a landscape review of antigen detection for early HIV diagnosis.", AIDS. 2018, vol. 32(15); pp. 2089-102; Codoner, F. et al., "Gag protease coevolution analyzes define novel structural surfaces in the HIV-1 matrix and capsid involved in resistance to Protease Inhibitors .”, Scientific Reports 2017, vol. 7(3717); pp. 1-10; Alexander TS., “Human Immunodeficiency Virus Diagnostic Testing: 30 Years of Evolution.”, Clinical and Vaccine Immunology 2016, vol. 23(4); 249-53; WHO, "World Health Organization Model List of Essential In Vitro Diagnostics.", 1st edition, Geneva, 2018; Centers for Disease Control and Prevention, 2017, "National HIV testing day and new testing recommendations." Morbidity and Mortality Weekly Report vol.63(25);pp.537-37).
しかしながら、現在市販されている一部の抗体は、初期のp24検出に対する感度が低いため、p24抗原に特異的に結合し、高い結合能力と優れた製造特性を備えた抗HIV-1抗体が依然として求められている。 However, some antibodies currently on the market have low sensitivity for initial p24 detection, so there are still anti-HIV-1 antibodies that bind specifically to the p24 antigen, with high binding capacity and excellent manufacturing properties. It has been demanded.
したがって、本発明は、類似の市販の試薬と比較して、HIV-1 p24タンパク質に対する結合能力が改善された抗HIV-1抗体を提供する。これらの抗体は、新規の非交差反応性エピトープを認識し、単体として、又は免疫診断若しくは血液スクリーニングプラットフォーム等の複数のHIV-1イムノアッセイにおける捕捉/検出パートナーとして、使用され得る。 Accordingly, the present invention provides anti-HIV-1 antibodies with improved binding capacity to the HIV-1 p24 protein compared to similar commercially available reagents. These antibodies recognize novel non-cross-reactive epitopes and can be used either alone or as capture/detection partners in multiple HIV-1 immunoassays, such as immunodiagnostic or blood screening platforms.
本明細書がCDR Xの配列、又は1つ若しくは2つの置換、欠失若しくは付加によりCDR Xと異なる配列に言及する場合、そのような置換、欠失又は付加は、CDR Xによって定義されるアミノ酸の範囲の任意のアミノ酸において生じ得ることが理解されるべきである。本明細書は、そのような置換、欠失又は付加に適しているとして、CDR Xによって定義されるアミノ酸の範囲内の各特定のアミノ酸を個別化する。 When this specification refers to a sequence of CDR X or a sequence that differs from CDR X by one or two substitutions, deletions or additions, such substitutions, deletions or additions are amino acids defined by CDR X. It should be understood that any amino acid in the range of The present specification identifies each particular amino acid within the amino acid ranges defined by CDR X as suitable for such substitutions, deletions or additions.
非限定的な例として、抗体#AのL-CDR1は、アミノ酸(1)~(11)の配列、RASQDISNYLH[配列番号15に概略的に示されている]を含むと定義され得る。位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、及び11のそれぞれは、別段の指定がない限り、又は後に補正によって精緻化されない限り、置換、欠失又は付加に適しているとみなされる。 As a non-limiting example, the L-CDR1 of Antibody #A can be defined as comprising the sequence of amino acids (1)-(11), RASQDISNYLH [shown schematically in SEQ ID NO: 15]. Each of positions 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, and 11 may be substituted, deleted or added, unless otherwise specified or later refined by amendment. considered suitable.
第1の態様において、本発明は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含む抗HIV-1抗体であって、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号15、配列番号18、配列番号21、及び配列番号15、18又は21のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号16、配列番号19、配列番号22、及び配列番号16、19又は22のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号17、配列番号20、配列番号23、及び配列番号17、20又は23のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択される、抗体を開示する。 In a first aspect, the present invention provides an anti-HIV-1 antibody comprising a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 21, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 15, 18 or 21 by one or two substitutions, deletions or additions, wherein the amino acid sequence of L-CDR2 is L-CDR3 amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 22, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 16, 19 or 22 by one or two substitutions, deletions or additions discloses an antibody selected from the group consisting of SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 23, and sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions from any of SEQ ID NOs: 17, 20 or 23 do.
他の実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号24、配列番号27、配列番号30、及び配列番号24、27、又は30のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号25、配列番号28、配列番号31、及び配列番号25、28、又は31のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号26、配列番号29、配列番号32、及び配列番号26、29、又は32のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択される。 In other embodiments, an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, wherein the amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:24, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 30, and sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions from any of SEQ ID NOs: 24, 27, or 30, wherein the amino acid sequence of H-CDR2 is the sequence the amino acid sequence of H-CDR3 selected from the group consisting of: No. 25, SEQ ID No. 28, SEQ ID No. 31, and a sequence that differs from any of SEQ ID Nos. 25, 28, or 31 by one or two substitutions, deletions or additions; is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 32, and sequences that differ from any of SEQ ID NOs: 26, 29, or 32 by one or two substitutions, deletions or additions.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖は、配列番号7、又は配列番号8、又は配列番号9のアミノ酸配列と約90%の相同性を有する配列を含む。他の実施形態において、軽鎖は、配列番号7、又は配列番号8、又は配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the light chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a sequence having about 90% homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO:7, or SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9. In other embodiments, the light chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:7, or SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の重鎖は、配列番号10、配列番号11、又は配列番号12のアミノ酸配列と約90%の相同性を有する配列を含む。他の実施形態において、重鎖は、配列番号10、配列番号11、又は配列番号12のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the heavy chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a sequence having about 90% homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, or SEQ ID NO:12. In other embodiments, the heavy chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, or SEQ ID NO:12.
いくつかの実施形態において、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号15、又は配列番号15と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号16、又は配列番号16と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号17、又は配列番号17と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。他の実施形態において、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号18、又は配列番号18と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号19、又は配列番号19と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号20、又は配列番号20と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。他の実施形態において、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号21、又は配列番号21と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号22、又は配列番号22と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号23、又は配列番号23と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 15, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 15 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR2 comprises the sequence No. 16, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 16 by one or two substitutions, deletions, or additions, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 17, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 17 Includes sequences that differ due to deletions or additions. In other embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 18, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 18 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 19, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 19 by one or two substitutions, deletions, or additions, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 20, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 20 or contain additional sequences that differ. In other embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO:21 or a sequence that differs from SEQ ID NO:21 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 22, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 22 by one or two substitutions, deletions, or additions, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 23, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 23 or contain additional sequences that differ.
いくつかの実施形態において、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号24、又は配列番号24と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号25、又は配列番号25と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号26、又は配列番号26と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。他の実施形態において、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号27、又は配列番号27と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号28、又は配列番号28と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号29、又は配列番号29と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。他の実施形態において、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号30、又は配列番号30と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号31、又は配列番号31と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号32、又は配列番号32と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO:24, or a sequence that differs from SEQ ID NO:24 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR2 comprises the sequence No. 25, or a sequence that differs from SEQ ID No. 25 by one or two substitutions, deletions, or additions, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID No. 26, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID No. 26. Includes sequences that differ due to deletions or additions. In other embodiments, the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO:27 or a sequence that differs from SEQ ID NO:27 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 28, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 28 by one or two substitutions, deletions, or additions, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO: 29, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 29 or contain additional sequences that differ. In other embodiments, the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO:30 or a sequence that differs from SEQ ID NO:30 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 31, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 31 by one or two substitutions, deletions, or additions, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO: 32, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 32 or contain additional sequences that differ.
いくつかの実施形態において、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号15、又は配列番号15と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号16、又は配列番号16と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号17、又は配列番号17と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号24、又は配列番号24と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号25、又は配列番号25と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号26、又は配列番号26と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 15, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 15 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR2 comprises the sequence No. 16, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 16 by one or two substitutions, deletions, or additions, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 17, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 17 The amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 24 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 24 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR2 comprises , SEQ ID NO:25, or a sequence that differs from SEQ ID NO:25 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:26, or one or two substitutions from SEQ ID NO:26 , includes sequences that differ due to deletions or additions.
いくつかの実施形態において、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号18、又は配列番号18と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号19、又は配列番号19と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号20、又は配列番号20と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号27、又は配列番号27と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号28、又は配列番号28と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号29、又は配列番号29と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 18, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 18 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR2 comprises the sequence No. 19, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 19 by one or two substitutions, deletions, or additions, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 20, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 20 The amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 27 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 27 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR2 comprises , SEQ ID NO:28, or a sequence that differs from SEQ ID NO:28 by one or two substitutions, deletions or additions, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:29, or one or two substitutions from SEQ ID NO:29 , includes sequences that differ due to deletions or additions.
いくつかの実施形態において、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号21、又は配列番号21と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号22、又は配列番号22と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号23、又は配列番号23と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号30、又は配列番号30と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号31、又は配列番号31と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号32、又は配列番号32と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO:21, or a sequence that differs from SEQ ID NO:21 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR2 comprises the sequence No. 22, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 22 by one or two substitutions, deletions, or additions, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 23, or one or two substitutions, deletions from SEQ ID NO: 23. The amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 30 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 30 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR2 comprises , SEQ ID NO:31, or a sequence that differs from SEQ ID NO:31 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:32, or one or two substitutions from SEQ ID NO:32 , includes sequences that differ due to deletions or additions.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the light chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, or SEQ ID NO:3.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の重鎖は、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the heavy chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, or SEQ ID NO:6.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、配列番号33のアミノ酸配列を含むHIV-1 p24タンパク質のエピトープに特異的に結合する。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention specifically bind to an epitope of the HIV-1 p24 protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:33.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体のL-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号21、又は配列番号21と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号22、又は配列番号22と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号23、又は配列番号23と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the amino acid sequence of L-CDR1 of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises SEQ ID NO:21 or a sequence that differs from SEQ ID NO:21 by one or two substitutions, deletions or additions, The amino acid sequence of L-CDR2 includes SEQ ID NO: 22 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 22 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 23. and sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体のH-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号30、又は配列番号30と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号31、又は配列番号31と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号32、又は配列番号32と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む。 In some embodiments, the H-CDR1 amino acid sequence of the anti-HIV-1 antibody of the invention comprises SEQ ID NO:30 or a sequence that differs from SEQ ID NO:30 by one or two substitutions, deletions or additions, The amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 31 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 31 by one or two substitutions, deletions or additions, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO: 32 or SEQ ID NO: 32. and sequences that differ by one or two substitutions, deletions or additions.
いくつかの実施形態において、前記抗体の軽鎖は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、前記抗体の重鎖は、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the antibody light chain comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 3, and the antibody heavy chain comprises SEQ ID NO: 4, sequence No. 5, or SEQ ID No. 6.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、モノクローナル抗体又は組換え抗体である。他の実施形態において、前記抗体は抗体断片である。抗HIV-1抗体が抗体断片である場合には、可変断片(Fv)、単鎖Fv(scFv)、二重特異性抗体(sc(Fv)2)、単鎖抗体、単一ドメイン抗体、Fab断片、F(ab')2断片、Fab'断片、ジスルフィド結合Fv(dsFv)、化学的にコンジュゲートされたFv(ccFv)、ダイアボディ、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、アフィボディ、ナノボディ及びユニボディから選択される。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention are monoclonal antibodies or recombinant antibodies. In another embodiment, said antibody is an antibody fragment. When the anti-HIV-1 antibody is an antibody fragment, variable fragment (Fv), single chain Fv (scFv), bispecific antibody (sc(Fv)2), single chain antibody, single domain antibody, Fab fragments, F(ab')2 fragments, Fab' fragments, disulfide-linked Fv (dsFv), chemically conjugated Fv (ccFv), diabodies, anti-idiotypic (anti-Id) antibodies, affibodies, nanobodies and Selected from unibody.
いくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、マウスIgG1クラス又はマウスIgG2aクラスの定常領域を含む。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibody comprises a constant region of the murine IgG1 class or the murine IgG2a class.
いくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、固体支持体に結合している。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibody is attached to a solid support.
いくつかの態様において、本発明は、本発明の抗HIV-1抗体を含む細胞を開示する。 In some embodiments, the invention discloses cells comprising the anti-HIV-1 antibodies of the invention.
他の態様では、本発明は、抗HIV-1抗体をコードするヌクレオチド配列、ヌクレオチド配列に作動可能に連結されたプロモーター、及び選択マーカーを含む核酸を開示する。前記核酸を含む細胞もまた、本明細書に開示される。 In another aspect, the invention discloses a nucleic acid comprising a nucleotide sequence encoding an anti-HIV-1 antibody, a promoter operably linked to the nucleotide sequence, and a selectable marker. A cell comprising said nucleic acid is also disclosed herein.
本発明はまた、本明細書に記載された抗HIV-1抗体及び固体支持体を含む組成物も開示し、抗HIV-1抗体は固体支持体に共有的又は非共有的に結合している。いくつかの実施形態において、固体支持体は、粒子、ビーズ、膜、表面、ポリペプチドチップ、マイクロタイタープレート、又はクロマトグラフィーカラムの固相を含む。 The present invention also discloses compositions comprising an anti-HIV-1 antibody as described herein and a solid support, wherein the anti-HIV-1 antibody is covalently or non-covalently attached to the solid support. . In some embodiments, solid supports comprise solid phases of particles, beads, membranes, surfaces, polypeptide chips, microtiter plates, or chromatography columns.
また、本発明は、試料中のHIV-1の存在を検出するためのキットも開示し、前記キットは、本発明による少なくとも1つの抗HIV-1抗体及び固体支持体を含み、前記少なくとも1つの抗体は、固体支持体に共有的又は非共有的に結合している。 The present invention also discloses a kit for detecting the presence of HIV-1 in a sample, said kit comprising at least one anti-HIV-1 antibody according to the invention and a solid support, wherein said at least one Antibodies are covalently or non-covalently attached to a solid support.
以下の説明は、単に、本開示の様々な実施形態を例示することを意図している。そのようなものとして、論じられる特定の改変は、限定することを意図するものではない。本明細書に提示された主題の精神又は範囲から逸脱することなく、様々な等価物、変化、及び改変が生み出され得ることは当業者に明らかであろうし、そのような等価の実施形態が本明細書に含まれるべきであることは理解されている。 The following description is intended merely to exemplify various embodiments of the present disclosure. As such, the specific modifications discussed are not intended to be limiting. It will be apparent to those skilled in the art that various equivalents, changes, and modifications can be made without departing from the spirit or scope of the subject matter presented herein, and such equivalent embodiments are provided herein. It is understood that should be included in the specification.
この明細書及び添付の特許請求の範囲で用いられる場合、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」、及び「その(the)」は、文脈が明らかに他に指図しない限り、複数の指示物を含む。 As used in this specification and the appended claims, the singular forms "a," "an," and "the" do not clearly dictate otherwise. as long as it contains more than one referent.
この明細書を通して、文脈が別段に要求しない限り、語「含む(comprise)」、又は「含む(comprises)」若しくは「含むこと(comprising)」等の変形は、言及された要素若しくは整数、又は要素若しくは整数の群の包含を意味するが、任意の他の要素若しくは整数、又は要素若しくは整数の群の排除を意味しないことは理解されているだろう。 Throughout this specification, unless the context requires otherwise, the word "comprises," or variations such as "comprises," or "comprising," refer to the elements or integers referred to, or the elements. or groups of integers are meant to be inclusive, but not to the exclusion of any other element or integer or group of elements or integers.
他に定義がない限り、本明細書で用いられる全ての技術的及び科学的用語は、この発明が属する技術分野の当業者により一般的に理解されているのと同じ意味をもつ。例示的な方法及び材料が下で記載されているが、本明細書に記載されたものと類似した又は等価の方法及び材料もまた、用いることができ、当業者に明らかだろう。本明細書で言及された全ての刊行物及び他の参考文献は、全体として参照により組み入れられている。矛盾する場合、定義を含む本明細書が、支配するものとする。材料、方法、及び例は、単なる例示であり、限定することを意図するものではない。 Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. Although exemplary methods and materials are described below, methods and materials similar or equivalent to those described herein can also be used and will be apparent to those skilled in the art. All publications and other references mentioned herein are incorporated by reference in their entirety. In case of conflict, the present specification, including definitions, will control. The materials, methods, and examples are illustrative only and not intended to be limiting.
この明細書における各実施形態は、別段に明確に述べられていない限り、変更すべき所は変更して、あらゆる他の実施形態へ適用され得る。 Each embodiment in this specification can be applied to any other embodiment mutatis mutandis unless expressly stated otherwise.
以下の用語は、他に指示がない限り、以下の意味をもつものと理解されるべきである。 The following terms shall be understood to have the following meanings, unless otherwise indicated.
本明細書で用いられる場合、用語「核酸」は、DNA又はRNAで構成される任意の材料を指す。核酸は、合成的に又は生細胞により生成され得る。 As used herein, the term "nucleic acid" refers to any material composed of DNA or RNA. Nucleic acids can be produced synthetically or by living cells.
本明細書で使用される「ヌクレオチド」は、リン酸基、5炭素糖及び窒素含有塩基からなる核酸のサブユニットである。RNA中に見出される5炭素糖はリボースである。DNAでは、5炭素糖は2'-デオキシリボースである。この用語には、そのようなサブユニットの類似体も含まれる。 As used herein, a "nucleotide" is a nucleic acid subunit consisting of a phosphate group, a five-carbon sugar and a nitrogenous base. The five-carbon sugar found in RNA is ribose. In DNA, the 5-carbon sugar is 2'-deoxyribose. The term also includes analogues of such subunits.
本明細書で用いられる場合、用語「ポリヌクレオチド」は、ヌクレオチドのポリマー鎖を指す。その用語は、DNA分子(例えば、cDNA又はゲノム若しくは合成DNA)及びRNA分子(例えば、mRNA又は合成RNA)、加えて非天然ヌクレオチド類似体、非天然ヌクレオシド間結合、又は両方を含有するDNA又はRNAの類似体を含む。核酸は、任意のトポロジー構造をとり得る。例として、核酸は、一本鎖、二本鎖、三本鎖、四重鎖、部分的二本鎖、分岐型、ヘアピン型、環状、又はパッドロック構造であり得る。 As used herein, the term "polynucleotide" refers to a polymeric chain of nucleotides. The term includes DNA molecules (e.g., cDNA or genomic or synthetic DNA) and RNA molecules (e.g., mRNA or synthetic RNA), as well as DNAs or RNAs containing non-natural nucleotide analogs, non-natural internucleoside linkages, or both. including analogues of Nucleic acids can adopt any topological structure. By way of example, nucleic acids can be single stranded, double stranded, triple stranded, quadruplex, partially double stranded, branched, hairpinned, circular, or padlock structures.
本明細書で用いられる場合、用語「タンパク質」は、アミノ酸残基の1つ又は複数の鎖からなる大きな生体分子又は高分子を指す。多くのタンパク質は、生化学的反応を触媒する酵素であり、代謝にとって極めて重要である。タンパク質はまた、構造的又は機械的な機能を有し、例えば、筋肉におけるアクチン及びミオシン、並びに細胞の形を維持する足場のシステムを形成する、細胞骨格におけるタンパク質である。他のタンパク質は、細胞シグナル伝達、免疫応答、細胞接着、及び細胞周期において重要である。しかしながら、タンパク質は、完全に人工的又は組換え体であってもよく、すなわち、天然で生体系に存在しなくてもよい。 As used herein, the term "protein" refers to large biomolecules or macromolecules composed of one or more chains of amino acid residues. Many proteins are enzymes that catalyze biochemical reactions and are crucial for metabolism. Proteins also have structural or mechanical functions, such as actin and myosin in muscles and proteins in the cytoskeleton that form the scaffolding system that maintains cell shape. Other proteins are important in cell signaling, immune response, cell adhesion, and cell cycle. However, the protein may also be wholly artificial or recombinant, ie not naturally occurring in living systems.
本明細書で用いられる場合、用語「ポリペプチド」は、天然に存在するタンパク質と天然に存在しないタンパク質の両方、並びにその断片、変異体、誘導体、及び類似体を指す。ポリペプチドは、モノマー又はポリマーであり得る。ポリペプチドは、いくつかの異なるドメイン(ペプチド)を含み得、それらのドメインのそれぞれが、1つ又は複数の別個の活性を有する。 As used herein, the term "polypeptide" refers to both naturally occurring and non-naturally occurring proteins, as well as fragments, variants, derivatives and analogs thereof. Polypeptides can be monomeric or polymeric. A polypeptide may contain several different domains (peptides), each of which has one or more distinct activities.
本明細書で用いられる場合、用語「組換え体」は、(1)それの天然に存在する環境から取り出されている、(2)その遺伝子が、天然で見出されるポリヌクレオチドの全部若しくは一部分と関連していない、(3)それが天然では連結されていないポリヌクレオチドと作動可能に連結されている、又は(4)天然では存在しない、生体分子、例えば、遺伝子又はタンパク質を指す。用語「組換え体」は、クローニングされたDNA単離物、化学合成されたポリヌクレオチド類似体、又は異種系により生体で合成されるポリヌクレオチド類似体、加えて、そのような核酸によりコードされるタンパク質及び/若しくはmRNAに関連して用いることができる。 As used herein, the term "recombinant" means that (1) it has been removed from its naturally occurring environment, and (2) the gene has been combined with all or part of a polynucleotide found in nature. Refers to a biomolecule, eg, a gene or protein, that is unrelated, (3) operably linked to a polynucleotide with which it is not naturally linked, or (4) does not occur in nature. The term "recombinant" refers to cloned DNA isolates, chemically synthesized polynucleotide analogues, or polynucleotide analogues synthesized in vivo by heterologous systems, as well as nucleic acids encoded by such It can be used in connection with protein and/or mRNA.
本明細書で用いられる場合、用語「融合タンパク質」は、天然に存在するタンパク質内に共存しない2つ以上のアミノ酸配列を含むタンパク質を指す。融合タンパク質は、同じ又は異なる生物体由来の2つ以上のアミノ酸配列を含み得る。融合タンパク質の2つ以上のアミノ酸配列は、典型的には、インフレームであり、それらの間に終止コドンを含まず、典型的には、融合タンパク質の一部としてmRNAから翻訳される。 As used herein, the term "fusion protein" refers to a protein containing two or more amino acid sequences that are not coexistent in the naturally occurring protein. A fusion protein may comprise two or more amino acid sequences from the same or different organisms. The two or more amino acid sequences of the fusion protein are typically in-frame, do not contain stop codons between them, and are typically translated from the mRNA as part of the fusion protein.
(3)によるタンパク質に言及する場合、用語「融合タンパク質」及び用語「組換え」は、本明細書では交換可能に使用され得る。 When referring to proteins according to (3), the term "fusion protein" and the term "recombinant" may be used interchangeably herein.
本明細書で用いられる場合、用語「抗体」又は「免疫グロブリン」は、同じ意味を有し、本発明において同等に使用される。本明細書で用いられる場合、用語「抗体」は、免疫グロブリン分子、及び免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、抗原に特異的に結合する抗原結合部位を含む分子を指す。したがって、抗体という用語は、抗体分子全体だけでなく、抗体断片又は誘導体もまた包含する。 As used herein, the terms "antibody" or "immunoglobulin" have the same meaning and are used interchangeably in the present invention. As used herein, the term "antibody" refers to immunoglobulin molecules and immunologically active portions of immunoglobulin molecules, ie, molecules that contain an antigen-binding site that specifically binds an antigen. Thus, the term antibody includes not only whole antibody molecules, but also antibody fragments or derivatives.
天然抗体において、2つの重鎖が、互いにジスルフィド結合によって連結されており、各重鎖が、軽鎖とジスルフィド結合によって連結されている。2つのタイプの軽鎖、ラムダ(λ)及びカッパ(κ)がある。抗体分子の機能活性を決定する5つの主要な重鎖クラス(又はアイソタイプ): IgM、IgD、IgG、IgA、及びIgEがある。各鎖は、異なる配列ドメインを含有する。軽鎖は、可変ドメイン(VL)及び定常ドメイン(CL)の2つのドメインを含む。重鎖は、可変ドメイン(VH)及び3つの定常ドメイン(CH1、CH2、及びCH3、まとめてCHと呼ばれる)の4つのドメインを含む。軽鎖(VL)と重鎖(VH)の両方の可変領域は、抗原に対する結合認識及び特異性を決定する。軽鎖(CL)及び重鎖(CH)の定常領域ドメインは、抗体鎖会合、分泌、経胎盤移動性、補体結合、及びFc受容体(FcR)との結合等の重要な生体特性を与える。Fv断片は、免疫グロブリンのFab断片のN末端部分であり、1つの軽鎖の可変部分及び1つの重鎖の可変部分からなる。抗体の特異性は、抗体結合部位と抗原決定基との間の構造的相補性に存する。抗体結合部位は、主として超可変又は相補性決定領域(CDR)由来である残基で構成される。たまに、非超可変又はフレームワーク領域(FR)由来の残基が、全体のドメイン構造、及びそれゆえに、結合部位に影響する。相補性決定領域又はCDRは、天然免疫グロブリン結合部位の天然Fv領域の結合親和性及び特異性をまとまって定義するアミノ酸配列を指す。免疫グロブリンの軽鎖及び重鎖はそれぞれ、3つのCDRを有し、それらは、それぞれ、L-CDR1、L-CDR2、L-CDR3、及びH-CDR1、H-CDR2、H-CDR3と名付けられている。したがって、抗原結合部位は、通常、重鎖V領域及び軽鎖V領域のそれぞれからのCDRセットを含む、6つのCDRを含む。フレームワーク領域(FR)は、CDR間に挿入されたアミノ酸配列を指す。 In a native antibody, two heavy chains are linked to each other by disulfide bonds, and each heavy chain is linked to a light chain by disulfide bonds. There are two types of light chains, lambda (λ) and kappa (κ). There are five major heavy chain classes (or isotypes) that determine the functional activity of antibody molecules: IgM, IgD, IgG, IgA, and IgE. Each chain contains distinct sequence domains. A light chain comprises two domains, a variable domain (VL) and a constant domain (CL). The heavy chain comprises four domains, a variable domain (VH) and three constant domains (CH1, CH2, and CH3, collectively referred to as CH). The variable regions of both the light (VL) and heavy (VH) chains determine binding recognition and specificity for antigen. Light (CL) and heavy (CH) chain constant region domains confer important biological properties such as antibody chain association, secretion, transplacental mobility, complement fixation, and binding to Fc receptors (FcR) . The Fv fragment is the N-terminal part of the Fab fragment of an immunoglobulin and consists of one light chain variable part and one heavy chain variable part. Antibody specificity resides in the structural complementarity between the antibody combining site and the antigenic determinant. Antibody combining sites are composed primarily of residues that are from the hypervariable or complementarity determining regions (CDRs). Occasionally, residues from non-hypervariable or framework regions (FR) influence the overall domain structure and hence the binding site. Complementarity Determining Regions or CDRs refer to amino acid sequences that collectively define the binding affinity and specificity of the natural Fv region of the native immunoglobulin binding site. Immunoglobulin light and heavy chains each have three CDRs, which are named L-CDR1, L-CDR2, L-CDR3, and H-CDR1, H-CDR2, H-CDR3, respectively. ing. An antigen-binding site therefore typically comprises six CDRs, with a set of CDRs from each of the heavy and light chain V-regions. Framework regions (FR) refer to amino acid sequences interposed between the CDRs.
CDRは、Kabat、Chothia、KabatとChothiaの両方の蓄積、AbM、contact、IMGT unique numbering、及び/又は立体構造定義、又は当技術分野において周知されているCDR決定の任意の方法の定義に従って同定することができる。抗体CDRは、Kabatらにより最初に定義された超可変領域として同定され得る。例えば、Kabatら、1992、Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、Public Health Service、NIH、Washington D.C.参照。CDRの位置は、Chothia他により最初に記載された構造のループ構造としても同定され得る(例えば、Chothiaら、Nature 342:877~883頁、1989参照)。CDR同定への他のアプローチには、「AbM定義」(KabatとChothiaの折衷であり、Oxford Molecular's AbM抗体モデリングソフトウェア(現在、Accelrys0)を用いて導かれる)、観察される抗原接触に基づいたCDRの「contact定義」(MacCallumら、J. Mol. Biol.、262:732~745頁、1996に示されている)、又は「IMGT unique numbering」(可変領域の構造の高い保存性に頼る(Lefranc、M.-P. Nucl. Acids Res.、33、D593~D597頁、2005参照))が挙げられる。本明細書でCDRの「立体構造定義」と呼ばれる、別のアプローチにおいて、CDRの位置は、抗原結合へのエンタルピー寄与を生じる残基として同定され得る。例えば、Makabeら、Journal of Biological Chemistry、283:1156~1166頁、2008参照。更に他のCDR境界定義は、上記のアプローチの1つに厳密に従うわけではないが、それでもなお、Kabat CDRの少なくとも一部分と重複し、ただし、特定の残基又は残基群又は更にCDR全体が抗原結合へ有意には影響しないという予測又は実験的所見を踏まえると、それらは短縮又は延長され得る。本明細書で用いられる場合、CDRは、アプローチの組合せを含む、当技術分野において知られた任意のアプローチにより定義されるCDRを指す。本明細書で用いられる方法は、これらのアプローチのいずれかに従って定義されたCDRを利用し得る。複数のCDRを含む任意の所与の実施形態について、CDRは、特に指定しない限り、Kabat番号付け、Chothia番号付け、拡張番号付け、AbM番号付け、コンタクト番号付け、IMGT固有の番号付け、及び/又はコンフォメーション定義のいずれかに従って定義され得る。 CDRs are identified according to the definitions of Kabat, Chothia, accumulation of both Kabat and Chothia, AbM, contact, IMGT unique numbering, and/or conformational definitions, or any method of CDR determination known in the art. be able to. Antibody CDRs can be identified as the hypervariable regions originally defined by Kabat et al. See, eg, Kabat et al., 1992, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, NIH, Washington D.C. The positions of the CDRs can also be identified as loop structures in the structure originally described by Chothia et al. (see, eg, Chothia et al., Nature 342:877-883, 1989). Other approaches to CDR identification include the "AbM definition" (a compromise between Kabat and Chothia and derived using Oxford Molecular's AbM antibody modeling software (now Accelrys0)), CDRs based on observed antigen contacts. (as presented in MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262:732-745, 1996) or the "IMGT unique numbering" (relying on the high conservation of the structure of the variable regions (Lefranc , M.-P. Nucl. Acids Res., 33, D593-D597, 2005))). In another approach, referred to herein as "conformational definition" of CDRs, CDR positions can be identified as residues that produce enthalpy contribution to antigen binding. See, eg, Makabe et al., Journal of Biological Chemistry, 283:1156-1166, 2008. Still other CDR boundary definitions do not strictly follow one of the above approaches, but still overlap at least a portion of the Kabat CDRs, provided that a particular residue or group of residues or even the entire CDR is antigenic. They may be shortened or lengthened given predictions or experimental findings that binding is not significantly affected. As used herein, CDRs refer to CDRs defined by any approach known in the art, including combinations of approaches. The methods used herein may utilize CDRs defined according to any of these approaches. For any given embodiment containing multiple CDRs, the CDRs are Kabat numbering, Chothia numbering, extended numbering, AbM numbering, contact numbering, IMGT specific numbering, and/or or according to any of the conformational definitions.
抗体配列の例示的なデータベースは、www.bioinf.org.uk/absにおける「Abysis」ウェブサイト(Department of Biochemistry & Molecular Biology University College London、London、EnglandのA. C. Martinにより維持されている)及びRetterら、Nucl. Acids Res.、33(Database issue): D671~D674頁(2005)に記載されているようなwww.vbase2.orgにおけるVBASE2ウェブサイトに記載され、それらを通してアクセスすることができる。好ましくは、配列は、Kabat、IMGT、及びタンパク質データバンク(Protein Data Bank)(PDB)からの配列データをPDBからの構造データと共に統合するAbysisデータベースを用いて分析される。他に指示がない限り、本明細書に示された全てのCDRは、Abysisデータベースウェブサイトに従って、示されたスキームの通り、導き出されている。 An exemplary database of antibody sequences is the "Abysis" website at www.bioinf.org.uk/abs (maintained by A. C. Martin, Department of Biochemistry & Molecular Biology University College London, London, England) and Retter et al. , Nucl. Acids Res., 33 (Database issue): D671-D674 (2005), and can be accessed through the VBASE2 website at www.vbase2.org. Preferably, sequences are analyzed using Kabat, IMGT, and the Abysis database, which integrates sequence data from the Protein Data Bank (PDB) with structural data from the PDB. Unless otherwise indicated, all CDRs presented herein are derived according to the scheme shown according to the Abysis database website.
本明細書で用いられる場合、用語「抗体」は、単離された抗体、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、多重特異性抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体(完全又は部分ヒト化)、動物抗体、組換え抗体、キメラ抗体、及び抗体断片を含む。 As used herein, the term "antibody" includes isolated antibodies, polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, multispecific antibodies, human antibodies, humanized antibodies (fully or partially humanized), animal antibodies, recombinant Including antibodies, chimeric antibodies, and antibody fragments.
本明細書で用いられる場合、用語「モノクローナル抗体」又は「mAb」は、同じエピトープと結合する均一な抗体集団を有する抗体組成を指す。その用語は、抗体の種又は供給源に関して限定されず、それが作製される方法によって限定されることも意図されない。したがって、その用語は、マウスハイブリドーマから得られた抗体、加えてマウスハイブリドーマよりむしろヒトを用いて得られたヒトモノクローナル抗体を包含する。この用語はまた、一過性又は安定トランスフェクションによる真核細胞株の樹立等、当技術分野で知られているモノクローナル抗体を産生するための他の方法によって得られる抗体も包含する。 As used herein, the term "monoclonal antibody" or "mAb" refers to an antibody composition having a homogeneous population of antibodies that bind the same epitope. The term is not limited with respect to the species or source of the antibody, nor is it intended to be limited by the method by which it is made. Thus, the term includes antibodies obtained from murine hybridomas, as well as human monoclonal antibodies obtained using humans rather than murine hybridomas. The term also includes antibodies obtained by other methods for producing monoclonal antibodies known in the art, such as establishment of eukaryotic cell lines by transient or stable transfection.
本明細書で用いられる場合、用語「組換え抗体」は、抗体のコード配列を含む1つ又は複数の発現ベクターでトランスフェクトされた細胞又は細胞株から発現される抗体を指し、前記コード配列は細胞と天然には関連していない。組換え抗体又はその断片は、当業者に周知のように、任意の組換え手段によって調製、発現、作成又は単離される。 As used herein, the term "recombinant antibody" refers to an antibody expressed from a cell or cell line transfected with one or more expression vectors containing coding sequences for the antibody, wherein the coding sequences are Not naturally associated with cells. Recombinant antibodies or fragments thereof are prepared, expressed, produced or isolated by any recombinant means, as is well known to those of skill in the art.
いくつかの実施形態において、「組換え抗体」は、同じエピトープに結合する均一な抗体集団に由来する場合、「モノクローナル抗体」でもあり得る。 In some embodiments, a "recombinant antibody" can also be a "monoclonal antibody" when it is derived from a homogeneous antibody population that binds the same epitope.
したがって、用語「抗体断片」は、本明細書で用いられる場合、可変断片(Fv)、一本鎖Fv(scFv)、二重特異性抗体(sc(Fv)2)、一本鎖抗体、単一ドメイン抗体、Fab断片、F(ab')2断片、Fab'断片、ジスルフィド連結型Fv(dsFv)、化学的コンジュゲート型Fv(ccFv)、ダイアボディ及び抗イディオタイプ(抗Id)抗体、並びに上記のいずれかの機能的活性エピトープ結合性断片を含むが、それらに限定されない。ある特定の実施形態において、抗体はまた、アフィボディ、ナノボディ、及びユニボディを含む。ある特定の実施形態において、特定の抗体は、免疫グロブリン分子、及び免疫グロブリン分子の免疫学的活性断片、すなわち、抗原結合部位を含有する分子を含む。免疫グロブリン分子は、任意のタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgAi及びIgA2)又はサブクラスであり得る。 Thus, the term "antibody fragment" as used herein includes variable fragment (Fv), single chain Fv (scFv), bispecific antibody (sc(Fv) 2 ), single chain antibody, single single domain antibodies, Fab fragments, F(ab') 2 fragments, Fab' fragments, disulfide-linked Fvs (dsFv), chemically conjugated Fvs (ccFv), diabodies and anti-idiotypic (anti-Id) antibodies, and It includes, but is not limited to, functionally active epitope-binding fragments of any of the above. In certain embodiments, antibodies also include affibodies, nanobodies, and unibodies. In certain embodiments, specific antibodies include immunoglobulin molecules and immunologically active fragments of immunoglobulin molecules, ie, molecules that contain an antigen-binding site. Immunoglobulin molecules can be of any type (eg IgG, IgE, IgM, IgD, IgA and IgY), class (eg IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgAi and IgA2) or subclass.
本明細書で用いられる場合、用語「抗原結合断片(Fab)」は、重鎖及び軽鎖のそれぞれの1つの定常ドメイン及び1つの可変ドメインを含む抗体断片を指す。可変ドメインは抗原結合部位を含有する。一般的に、抗体は、結晶化可能領域の断片(fragment crystallizable region)(Fc)及び2つの抗原結合性断片(Fab)を含む。Fab断片は、Fc領域から分離されて、2つのFab断片を生じることができ、その2つのFab断片は、F(ab')2断片又は抗原結合性の二量体断片(dimeric fragment antigen binding)としても知られている。 As used herein, the term "antigen-binding fragment (Fab)" refers to an antibody fragment that contains one constant domain and one variable domain for each of the heavy and light chains. The variable domain contains the antigen binding site. Antibodies generally comprise a fragment crystallizable region (Fc) and two antigen binding fragments (Fab). The Fab fragment can be separated from the Fc region to produce two Fab fragments, which are either F(ab') 2 fragments or dimeric fragment antigen binding fragments. Also known as
用語「単離された」は、他の細胞物質及び/又は化学物質を実質的に含まないタンパク質(例えば、抗体)又は核酸を指す。例えば、単離された抗体が異なる種由来の細胞によって発現される場合、例えば、マウス細胞で発現されるヒト抗体は、異なる種由来の他のタンパク質を実質的に含まない。タンパク質は、当技術分野で周知のタンパク質精製技術を用いて単離することにより、天然に関連する成分(又は抗体を産生するために使用される細胞発現系に関連する成分)を実質的に含まないようにされ得る。 The term "isolated" refers to a protein (eg, antibody) or nucleic acid that is substantially free of other cellular material and/or chemicals. For example, where the isolated antibody is expressed by cells from a different species, eg, a human antibody expressed in mouse cells will be substantially free of other proteins from the different species. A protein is substantially free of naturally associated components (or components associated with the cellular expression system used to produce the antibody) by isolation, using protein purification techniques well known in the art. can be prevented.
本明細書で用いられる場合、用語「抗原」は、それぞれの抗体と特異的に結合する生体分子を指す。多様なレパートリーからの抗体は、それの可変領域相互作用によって特異的な抗原構造を結合する。 As used herein, the term "antigen" refers to a biomolecule that specifically binds to its respective antibody. Antibodies from a diverse repertoire bind specific antigenic structures through their variable region interactions.
本明細書で用いられる場合、用語「エピトープ」は、抗体が特異的に結合する抗原の一部分を指す。したがって、用語「エピトープ」は、免疫グロブリン又はT細胞受容体との特異的な結合の能力がある任意のタンパク質決定因子を含む。 As used herein, the term "epitope" refers to the portion of an antigen that is specifically bound by an antibody. Thus, the term "epitope" includes any protein determinant capable of specific binding to an immunoglobulin or T-cell receptor.
ポリペプチドは、それが、そのポリペプチド内に含有される特定のエピトープの抗体認識により抗体と結合する場合、抗体と「免疫学的に反応性」である。免疫学的反応性は、抗体結合、より具体的には、抗体結合の速度論により、及び/又は抗体が方向づけられているエピトープを含有する既知のポリペプチドを競合相手として用いる結合における競合により、決定され得る。ポリペプチドが抗体と免疫学的に反応性であるかどうかを決定するための技術は当技術分野において知られている。 A polypeptide is "immunologically reactive" with an antibody if it binds to the antibody through antibody recognition of a specific epitope contained within that polypeptide. Immunological reactivity is determined by antibody binding, more specifically by the kinetics of antibody binding and/or by competition in binding using known polypeptides containing the epitope to which the antibody is directed as a competitor. can be determined. Techniques for determining whether a polypeptide is immunologically reactive with an antibody are known in the art.
本明細書で用いられる場合、用語「試料」は、対象又は患者から得られる任意の生体材料を指す。一態様において、試料は、血液、腹水、CSF、唾液、又は尿を含み得る。他の態様において、試料は、全血、血漿、血清、血液試料から濃縮されたB細胞、及び培養細胞(例えば、対象由来のB細胞)を含み得る。試料にはまた、神経組織を含む、生検又は組織試料を挙げることができる。更に他の態様において、試料は、細胞全体及び/又は細胞の可溶化液を含み得る。 As used herein, the term "sample" refers to any biological material obtained from a subject or patient. In one aspect, the sample may comprise blood, ascites, CSF, saliva, or urine. In other embodiments, the sample may comprise whole blood, plasma, serum, B cells enriched from a blood sample, and cultured cells (eg, B cells from a subject). Samples can also include biopsies or tissue samples, including neural tissue. In still other embodiments, the sample may comprise whole cells and/or cell lysates.
試料を処理して、組織又は細胞の構造を物理的又は機械的に破壊し、これにより、細胞内成分を溶液中に放出させてもよく、この溶液には更に、標準法を用いて、分析用の生物学的試料を調製するために使用される酵素、バッファー、塩、界面活性剤等が含まれていてもよい。また、試料は、濾過装置に試料をかける若しくは通すことで、又は遠心分離後、又は媒体、マトリックス、若しくは支持体への付着によって得られるもの等、処理された試料も含み得る。 The sample may be treated to physically or mechanically disrupt tissue or cellular structures, thereby releasing intracellular components into solution, which is further subjected to analysis using standard methods. Enzymes, buffers, salts, detergents, etc. used to prepare the biological sample for use may also be included. Samples can also include processed samples, such as those obtained by applying or passing the sample through a filtration device, or after centrifugation, or by attachment to a medium, matrix, or support.
用語「患者」又は「個体」は、本明細書で交換可能に用いられ、診断又は治療される哺乳動物対象を指し、ヒト患者が好ましい。場合によっては、本発明の方法は、実験動物において、獣医学的適用において、並びに非限定的に、マウス、ラット、及びハムスターを含むげっ歯類;及び霊長類を含む、疾患の動物モデルの開発において、用いられる。 The terms "patient" or "individual" are used interchangeably herein and refer to the mammalian subject being diagnosed or treated, with human patients being preferred. Optionally, the methods of the invention are useful in experimental animals, in veterinary applications, and in the development of animal models of disease, including, but not limited to, rodents, including mice, rats, and hamsters; and primates. Used in
用語「ベクター」は、それに結合した別の核酸を細胞内に導入するために使用され得る核酸を指す。ベクターの1つのタイプは「プラスミド」であり、これは、その中に追加の核酸セグメントが連結され得る直鎖状又は環状の二本鎖DNA分子を指す。別のタイプのベクターはウイルスベクター(例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、及びアデノ随伴ウイルス)であり、ここでは、追加のDNAセグメントがウイルスゲノム中に導入され得る。特定のベクターは、それらが導入される宿主細胞内での自律複製が可能である(例えば、細菌の複製起点を含む細菌ベクター及びエピソーム哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞への導入時に宿主細胞のゲノムに組み込まれ、それによって宿主ゲノムと共に複製される。 The term "vector" refers to a nucleic acid that can be used to introduce into a cell another nucleic acid to which it has been linked. One type of vector is a "plasmid," which refers to a linear or circular double-stranded DNA molecule into which additional nucleic acid segments may be ligated. Another type of vector is a viral vector (eg, replication defective retroviruses, adenoviruses and adeno-associated viruses), wherein additional DNA segments can be introduced into the viral genome. Certain vectors are capable of autonomous replication in a host cell into which they are introduced (eg, bacterial vectors containing a bacterial origin of replication and episomal mammalian vectors). Other vectors (eg, non-episomal mammalian vectors) integrate into the genome of the host cell upon introduction into the host cell, thereby replicating along with the host genome.
「発現ベクター」は、選択されたポリヌクレオチドの発現を指示し得るタイプのベクターである。「発現細胞」は、発現ベクターを含む細胞である。 An "expression vector" is a type of vector capable of directing the expression of a selected polynucleotide. An "expressing cell" is a cell that contains an expression vector.
ヌクレオチド配列は、調節配列がヌクレオチド配列の発現(例えば、発現のレベル、タイミング、又は位置)に影響を与える場合、調節配列に「作動可能に連結」されている。「調節配列」は、作動可能に連結された核酸の発現(例えば、発現のレベル、タイミング、又は位置)に影響を及ぼす核酸である。調節配列は、例えば、調節される核酸に直接的に、又は1つ若しくは複数の他の分子(例えば、調節配列及び/又は核酸に結合するポリペプチド)の作用を通して、その効果を及ぼし得る。調節配列の例には、プロモーター、エンハンサー、及び他の発現制御エレメントが含まれる。 A nucleotide sequence is "operably linked" to a regulatory sequence when the regulatory sequence affects the expression of the nucleotide sequence (eg, the level, timing, or location of expression). A "regulatory sequence" is a nucleic acid that affects expression (eg, level, timing, or location of expression) of an operably linked nucleic acid. A regulatory sequence may, for example, exert its effect directly on the regulated nucleic acid or through the action of one or more other molecules (eg, a polypeptide that binds the regulatory sequence and/or the nucleic acid). Examples of regulatory sequences include promoters, enhancers, and other expression control elements.
本明細書で用いられる場合、用語「診断の」又は「診断される」は、病的状態の存在若しくは性質又は疾患に罹りやすい患者を同定することを意味する。診断方法は、それらの感度及び特異度が異なる。診断アッセイの「感度」は、検査で陽性と出る罹患個体のパーセンテージ(「真の陽性のパーセント」)である。そのアッセイにより検出されなかった罹患個体は「偽陰性」である。罹患せず、且つそのアッセイにおいて陰性と出る対象は、「真の陰性」と呼ばれる。診断アッセイの「特異度」は、1マイナス偽陽性率であり、「偽陽性」率は、検査で陽性と出る、疾患をもたない者の割合として定義される。特定の診断方法が状態の確定診断を提供し得るわけではないが、その方法が、診断に役立つ陽性の表示を提供するならば、それは十分である。 As used herein, the terms "diagnostic" or "diagnosed" mean identifying the presence or nature of a pathological condition or a patient predisposed to a disease. Diagnostic methods differ in their sensitivity and specificity. The "sensitivity" of a diagnostic assay is the percentage of diseased individuals who test positive ("percent true positives"). Diseased individuals not detected by the assay are "false negatives." Subjects who are not affected and who test negative in the assay are termed "true negatives." The "specificity" of a diagnostic assay is 1 minus the false positive rate, where the "false positive" rate is defined as the proportion of people without disease who test positive. Although no particular diagnostic method can provide a definitive diagnosis of a condition, it is sufficient if the method provides a diagnostically positive indication.
本明細書で用いられる用語「結合親和性」は、抗原のエピトープと抗体の抗原結合部位との間の相互作用の強さを指す。 As used herein, the term "binding affinity" refers to the strength of interaction between an epitope of an antigen and the antigen-binding site of an antibody.
本発明は、ヒト免疫不全ウイルス1(HIV-1)p24タンパク質の検出に特異的な新規抗体に関する。これらの抗体は、HIV-1 p24タンパク質の新規で非交差反応性のエピトープを認識し、他の市販の製品と比較して高い度合いの親和性と感度を示す。したがって、本明細書に記載された抗体は、早期のHIV-1検出のためのイムノアッセイにおける診断試薬、標準又は陽性対照として利用され得る。それらは3つの主要なHIV-1のグループ(グループM(主系統)、グループN(新型)、及びグループO(分類外))のいずれかの検出に使用され得る。 The present invention relates to novel antibodies specific for the detection of Human Immunodeficiency Virus 1 (HIV-1) p24 protein. These antibodies recognize novel, non-cross-reactive epitopes of the HIV-1 p24 protein and exhibit a high degree of affinity and sensitivity compared to other commercial products. Accordingly, the antibodies described herein can be utilized as diagnostic reagents, standards or positive controls in immunoassays for early HIV-1 detection. They can be used to detect any of the three major groups of HIV-1: group M (main lineage), group N (novel), and group O (unclassified).
本発明はまた、試料中のHIV-1の存在を検出するための前記抗HIV-1抗体を含む組成物及びキットに関する。 The invention also relates to compositions and kits containing said anti-HIV-1 antibodies for detecting the presence of HIV-1 in a sample.
I. 抗HIV-1抗体
本明細書で用いられる場合、用語「相同性」、「類似性」又は「同一性」は、2つ以上の核酸又はポリペプチド配列の文脈において、最大の一致のために比較及び整列された場合に、同一であるか、同一なヌクレオチド若しくはアミノ酸残基の特定のパーセンテージを有する2つ以上の配列又は部分配列を指す。パーセント相同性/同一性を決定するために、最適な比較の目的で配列が整列される(例えば、第2のアミノ酸配列又は核酸配列との最適な整列のために、第1のアミノ酸配列又は核酸配列にギャップが導入され得る)。その後、対応するアミノ酸位置又はヌクレオチド位置におけるアミノ酸残基又はヌクレオチドが比較される。第1の配列における位置が、第2の配列における対応する位置と同じアミノ酸残基又はヌクレオチドにより占められている場合、それらの分子はその位置において同一である。2つの配列間のパーセント同一性は、それらの配列によって共有される同一の位置の数の関数である(すなわち、%同一性=同一の位置の数/位置(例えば、重複する位置)の総数×100)。いくつかの実施形態において、比較される2つの配列は、必要に応じて、それらの配列内にギャップが導入された後、同じ長さである(例えば、比較されることになっている配列を超えて伸長する追加の配列を除く)。2つの配列間の配列比較について、「対応する」CDRは、両方の配列における同じ場所におけるCDR(例えば、各配列のCDR-H1)を指す。
I. Anti-HIV-1 Antibodies As used herein, the terms "homology,""similarity," or "identity," in the context of two or more nucleic acid or polypeptide sequences, are for maximum correspondence. Refers to two or more sequences or subsequences that are identical or have a specified percentage of identical nucleotides or amino acid residues when compared and aligned to . To determine percent homology/identity, the sequences are aligned for optimal comparison (e.g., a first amino acid sequence or nucleic acid sequence is aligned for optimal alignment with a second amino acid sequence or nucleic acid sequence). gaps may be introduced in the sequence). The amino acid residues or nucleotides at corresponding amino acid positions or nucleotide positions are then compared. When a position in the first sequence is occupied by the same amino acid residue or nucleotide as the corresponding position in the second sequence, then the molecules are identical at that position. The percent identity between the two sequences is a function of the number of identical positions shared by the sequences (i.e., % identity = number of identical positions/total number of positions (e.g., overlapping positions) x 100). In some embodiments, the two sequences to be compared are the same length, after gaps have been introduced in their sequences if necessary (e.g., the sequences to be compared are (excluding additional sequences that extend beyond). For a sequence comparison between two sequences, "corresponding" CDRs refer to CDRs at the same location in both sequences (eg, CDR-H1 of each sequence).
パーセント同一性、パーセント類似性、又は2つの配列間のパーセント類似性の決定は、数学的なアルゴリズムを用いて達成され得る。2つの配列の比較に利用される数学的アルゴリズムの好ましい非限定的例は、Karlin及びAltschul、1993、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873~5877頁においてのように改変された、Karlin及びAltschul、1990、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264~2268頁のアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、Altschulら、1990、J. Mol. Biol. 215:403~410頁のNBLAST及びXBLASTプログラムへ組み込まれている。BLASTヌクレオチド検索は、目的のタンパク質をコードする核酸と相同なヌクレオチド配列を得るために、NBLASTプログラム、スコア=100、ワード長=12を用いて実施することができる。BLASTタンパク質検索は、目的のタンパク質と相同なアミノ酸配列を得るために、XBLASTプログラム、スコア=50、ワード長=3を用いて実施することができる。比較を目的として、ギャップドアライメントを得るために、ギャップドBLASTを、Altschulら、1997、Nucleic Acids Res. 25:3389~3402頁に記載されているように利用することができる。BLAST及びギャップドBLASTを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLAST及びNBLAST)のデフォルトパラメータを用いることができる。配列の比較に利用される数学的アルゴリズムの別の好ましい非限定的例は、Myers及びMiller、CABIOS (1989)のアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、GCG配列アライメントソフトウェアパッケージの一部であるALIGNプログラム(バージョン2.0)へ組み込まれている。アミノ酸配列を比較するためにALIGNプログラムを利用する場合、PAM120重み残基表(weight residue table)、12のギャップ長ペナルティ、及び4のギャップペナルティを用いることができる。 The determination of percent identity, percent similarity, or percent similarity between two sequences can be accomplished using a mathematical algorithm. A preferred, non-limiting example of a mathematical algorithm utilized to compare two sequences is the Karlin algorithm, modified as in Karlin and Altschul, 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. and Altschul, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-2268. Such algorithms are incorporated into the NBLAST and XBLAST programs of Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215:403-410. BLAST nucleotide searches can be performed with the NBLAST program, score=100, wordlength=12 to obtain nucleotide sequences homologous to a nucleic acid encoding a protein of interest. BLAST protein searches can be performed with the XBLAST program, score=50, wordlength=3 to obtain amino acid sequences homologous to a protein of interest. To obtain gapped alignments for comparison purposes, Gapped BLAST can be utilized as described in Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. When utilizing BLAST and Gapped BLAST, the default parameters of the respective programs (eg, XBLAST and NBLAST) can be used. Another preferred, non-limiting example of a mathematical algorithm utilized for sequence comparison is the algorithm of Myers and Miller, CABIOS (1989). Such an algorithm is incorporated into the ALIGN program (version 2.0) which is part of the GCG sequence alignment software package. When utilizing the ALIGN program for comparing amino acid sequences, a PAM120 weight residue table, a gap length penalty of 12, and a gap penalty of 4 can be used.
本明細書に記載された一実施形態において、組換え抗体は、軽鎖及び重鎖を含む。本明細書に記載された他の実施形態において、組換え抗体は、2つの軽鎖及び2つの重鎖を含む。本発明の組換え抗体の軽鎖は、2つのドメインである、可変ドメイン(VL)及び定常ドメイン(CL)を含み得る。本発明の組換え抗体の重鎖は、4つのドメインである、可変ドメイン(VH)及び3つの定常ドメイン(CH1、CH2、及びCH3、まとめてCHと呼ばれる)を含み得る。 In one embodiment described herein, a recombinant antibody comprises a light chain and a heavy chain. In other embodiments described herein, a recombinant antibody comprises two light chains and two heavy chains. A light chain of a recombinant antibody of the invention may comprise two domains, a variable domain (VL) and a constant domain (CL). A heavy chain of a recombinant antibody of the invention may comprise four domains, a variable domain (VH) and three constant domains (CH1, CH2, and CH3, collectively referred to as CH).
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、モノクローナル抗体である。他の実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、組換え抗体である。他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、本発明の定義による組換えモノクローナル抗体である。他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、単離された抗体である。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention are monoclonal antibodies. In other embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention are recombinant antibodies. In other embodiments, the anti-HIV-1 antibody is a recombinant monoclonal antibody according to the definition of the invention. In other embodiments, the anti-HIV-1 antibody is an isolated antibody.
いくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、抗体断片である。好ましい実施形態において、前記抗体断片は、可変断片(Fv)、一本鎖Fv(scFv)、二重特異性抗体(sc(Fv)2)、一本鎖抗体、単一ドメイン抗体、Fab断片、F(ab')2断片、Fab'断片、ジスルフィド連結型Fv(dsFv)、化学的コンジュゲート型Fv(ccFv)、ダイアボディ、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、アフィボディ、ナノボディ、及びユニボディから選択される。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibody is an antibody fragment. In a preferred embodiment, said antibody fragment is a variable fragment (Fv), a single chain Fv (scFv), a bispecific antibody (sc(Fv) 2 ), a single chain antibody, a single domain antibody, a Fab fragment, from F(ab') 2 fragments, Fab' fragments, disulfide-linked Fvs (dsFv), chemically conjugated Fvs (ccFv), diabodies, anti-idiotypic (anti-Id) antibodies, affibodies, nanobodies, and unibodies selected.
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、Fc領域及び2つのFab断片を含む。本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、抗原結合性断片であり、Fc領域を含まない。本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、1つのFab断片からなる。本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は2つのFab断片(F(ab)2)からなる。 In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises an Fc region and two Fab fragments. In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody is an antigen-binding fragment and does not contain an Fc region. In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody consists of one Fab fragment. In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody consists of two Fab fragments (F(ab) 2 ).
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、当業者に知られている任意のタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA及びIgY)、又は当業者に知られている任意のクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgAi及びIgA2)若しくは任意の既知のサブクラスであり得る。 In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody is of any type known to those of skill in the art (e.g., IgG, IgE, IgM, IgD, IgA and IgY) or (eg IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgAi and IgA2) or any known subclass.
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、IgGタイプである。好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体はIgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4クラスである。別の好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、IgG1又はIgG2クラスである。別の好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体はIgG2aクラスである。 In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody is of the IgG type. In preferred embodiments, the anti-HIV-1 antibody is of the IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 class. In another preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody is of the IgG1 or IgG2 class. In another preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody is of the IgG2a class.
本発明の抗体の定常領域の種は、ヒト、マウス、ウサギ、ラット、ハムスター、モルモット、ヤギ、ヒツジ、ウマ、ニワトリ、又は前記の種のいずれかのキメラであり得るが、本発明の抗体の種は特に限定されるものではない。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV抗体は、マウスIgG1クラス又はマウスIgG2aクラスの定常領域を含む。 The species of the constant regions of the antibodies of the invention may be human, mouse, rabbit, rat, hamster, guinea pig, goat, sheep, horse, chicken, or a chimera of any of the foregoing species, although the Species are not particularly limited. In some preferred embodiments, the anti-HIV antibodies of the invention comprise constant regions of the murine IgG1 class or the murine IgG2a class.
A. 軽鎖
本明細書に記載されたいくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域(CDR)を含む軽鎖を含む。前記CDRは、当業者により知られた任意のCDR定義アプローチに従って同定された配列に対応する。いくつかの好ましい実施形態において、CDR領域は、Kabat番号付けスキームに従って同定される配列に対応する。他の好ましい実施形態において、CDR領域は、他の番号付け方法又はKabat及び他の番号付け方法の組合せに従って同定される配列に対応し得る。例えば、CDR領域は、Chothia番号付けスキームに従って同定される配列に対応し得る。
A. Light Chains In some embodiments described herein, an anti-HIV-1 antibody comprises a light chain that includes complementarity determining regions (CDRs). Said CDRs correspond to sequences identified according to any CDR definition approach known to those skilled in the art. In some preferred embodiments, the CDR regions correspond to sequences identified according to the Kabat numbering scheme. In other preferred embodiments, the CDR regions may correspond to sequences identified according to other numbering schemes or combinations of Kabat and other numbering schemes. For example, the CDR regions can correspond to sequences identified according to the Chothia numbering scheme.
本明細書に記載されたいくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、それらの各々は、配列番号7、又は配列番号8、又は配列番号9のアミノ酸配列から選択される少なくとも5つの連続するアミノ酸の配列を含む。いくつかの好ましい実施形態において、L-CDR1の配列は、配列番号15、配列番号18及び配列番号21からなる群から選択される。いくつかの好ましい実施形態において、L-CDR2の配列は、配列番号16、配列番号19及び配列番号22からなる群から選択される。いくつかの好ましい実施形態において、L-CDR3の配列は、配列番号17、配列番号20及び配列番号23からなる群から選択される。他の好ましい実施形態において、L-CDR1の配列は、配列番号15、配列番号18及び配列番号21からなる群から選択され、L-CDR2の配列は、配列番号16、配列番号19及び配列番号22からなる群から選択され、L-CDR3の配列は、配列番号17、配列番号20及び配列番号23からなる群から選択される。 In some embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, each of which has SEQ ID NO: 7, or SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9. In some preferred embodiments, the sequence of L-CDR1 is selected from the group consisting of SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:18 and SEQ ID NO:21. In some preferred embodiments, the sequence of L-CDR2 is selected from the group consisting of SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:19 and SEQ ID NO:22. In some preferred embodiments, the sequence of L-CDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:20 and SEQ ID NO:23. In other preferred embodiments, the sequence of L-CDR1 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 18 and SEQ ID NO: 21, and the sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 19 and SEQ ID NO: 22. and the sequence of L-CDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:20 and SEQ ID NO:23.
本明細書に記載された別の実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖の可変領域は、配列番号7、又は配列番号8、又は配列番号9のアミノ酸配列を含む。更に別の実施形態において、組換え抗体の軽鎖の可変領域は、配列番号7、又は配列番号8、又は配列番号9からなるアミノ酸配列に対して、約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有し得る。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖は、配列番号7、又は配列番号8、又は配列番号9のアミノ酸配列と約90%の相同性を有する配列を含む。 In another embodiment described herein, the variable region of the light chain of the anti-HIV-1 antibody of the invention comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:7, or SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9. In yet another embodiment, the variable region of the light chain of the recombinant antibody is about 70%, 75%, 80%, 85% relative to the amino acid sequence consisting of SEQ ID NO:7, or SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9. %, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology. In some preferred embodiments, the light chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a sequence having about 90% homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO:7, or SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9.
本明細書に記載された別の実施形態において、組換え抗体は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。他の実施形態において、組換え抗体の軽鎖は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3からなるアミノ酸配列に対して、約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有し得る。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3のアミノ酸配列と約90%の相同性を有する配列を含む。 In another embodiment described herein, the recombinant antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, or SEQ ID NO:3. In other embodiments, the light chain of the recombinant antibody is about 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, They may have 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology. In some preferred embodiments, the light chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a sequence having about 90% homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, or SEQ ID NO:3.
B. 重鎖
本明細書に記載されたいくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域(CDR)を含む重鎖を含む。前記CDRは、当業者に知られている任意のCDR定義アプローチに従って同定される配列に対応する。いくつかの好ましい実施形態において、CDR領域は、Kabat番号付けスキームに従って同定される配列に対応する。他の好ましい実施形態において、CDR領域は、他の番号付け方法又はKabat及び他の番号付け方法の組合せに従って同定される配列に対応し得る。例えば、CDR領域は、Chothia番号付けスキームに従って同定される配列に対応し得る。
B. Heavy Chains In some embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibodies comprise heavy chains that include complementarity determining regions (CDRs). Said CDRs correspond to sequences identified according to any CDR definition approach known to those skilled in the art. In some preferred embodiments, the CDR regions correspond to sequences identified according to the Kabat numbering scheme. In other preferred embodiments, the CDR regions may correspond to sequences identified according to other numbering schemes or combinations of Kabat and other numbering schemes. For example, the CDR regions can correspond to sequences identified according to the Chothia numbering scheme.
本明細書に記載されたいくつかの実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、それらの各々は、配列番号10、又は配列番号11、又は配列番号12のアミノ酸配列から選択される少なくとも5つの連続するアミノ酸の配列を含む。いくつかの好ましい実施形態において、H-CDR1の配列は、配列番号24、配列番号27及び配列番号30からなる群から選択される。いくつかの好ましい実施形態において、H-CDR2の配列は、配列番号25、配列番号28及び配列番号31からなる群から選択される。いくつかの好ましい実施形態において、H-CDR3の配列は、配列番号26、配列番号29及び配列番号32からなる群から選択される。いくつかの好ましい実施形態において、H-CDR1の配列は、配列番号24、配列番号27及び配列番号30からなる群から選択され、H-CDR2の配列は、配列番号25、配列番号28及び配列番号31からなる群から選択され、H-CDR3の配列は、配列番号26、配列番号29及び配列番号32からなる群から選択される。 In some embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, each of which has SEQ ID NO: 10, or SEQ ID NO:11, or SEQ ID NO:12. In some preferred embodiments, the H-CDR1 sequence is selected from the group consisting of SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:27 and SEQ ID NO:30. In some preferred embodiments, the H-CDR2 sequence is selected from the group consisting of SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:28 and SEQ ID NO:31. In some preferred embodiments, the H-CDR3 sequence is selected from the group consisting of SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:29 and SEQ ID NO:32. In some preferred embodiments, the H-CDR1 sequence is selected from the group consisting of SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:27 and SEQ ID NO:30, and the H-CDR2 sequence is SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:28 and SEQ ID NO:28 31 and the sequence of H-CDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:29 and SEQ ID NO:32.
本明細書に記載された別の実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の重鎖の可変領域は、配列番号10、又は配列番号11、又は配列番号12のアミノ酸配列を含む。更に別の実施形態において、組換え抗体の重鎖の可変領域は、配列番号10、又は配列番号11、又は配列番号12からなるアミノ酸配列に対して、約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有し得る。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の重鎖は、配列番号10、又は配列番号11、又は配列番号12のアミノ酸配列と約90%の相同性を有する配列を含む。 In another embodiment described herein, the variable region of the heavy chain of the anti-HIV-1 antibody of the invention comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, or SEQ ID NO:11, or SEQ ID NO:12. In yet another embodiment, the variable region of the heavy chain of the recombinant antibody is about 70%, 75%, 80%, 85% relative to the amino acid sequence consisting of SEQ ID NO: 10, or SEQ ID NO: 11, or SEQ ID NO: 12. %, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology. In some preferred embodiments, the heavy chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a sequence having about 90% homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO:10, or SEQ ID NO:11, or SEQ ID NO:12.
本明細書に記載された別の実施形態において、組換え抗体は、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。他の実施形態において、組換え抗体の重鎖は、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6からなるアミノ酸配列と約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有し得る。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の重鎖は、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6のアミノ酸配列と約90%の相同性を有する配列を含む。 In another embodiment described herein, the recombinant antibody comprises a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, or SEQ ID NO:6. In other embodiments, the heavy chain of the recombinant antibody is about 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, They may have 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology. In some preferred embodiments, the heavy chain of an anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a sequence having about 90% homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, or SEQ ID NO:6.
C. 例示的な抗HIV-1抗体
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号15であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号16であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号17である。
C. Exemplary Anti-HIV-1 Antibodies In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3. , the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO:15, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO:16, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO:17.
本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号18であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号19であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号20である。 In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is the sequence 18, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 19, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 20.
本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号21であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号22であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号23である。 In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is the sequence 21, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO:22, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO:23.
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号24であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号25であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号26である。 In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, wherein the amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO: 24, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:25, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:26.
本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号27であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号28であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号29である。 In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, wherein the amino acid sequence of H-CDR1 is the sequence 27, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:28, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:29.
本明細書に記載された他の実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号30であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号31であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号32である。 In other embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, wherein the amino acid sequence of H-CDR1 is the sequence 30, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:31, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:32.
本発明の抗HIV-1抗体は、本明細書に記載された軽鎖及び重鎖の両方のCDR領域の任意の組合せを含み得る。 The anti-HIV-1 antibodies of the invention can comprise any combination of both the light and heavy chain CDR regions described herein.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号15であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号16であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号17であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号24であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号25であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号26である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 15, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 16, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 17. The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:24, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:25, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:26.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号15であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号16であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号17であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号27であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号28であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号29である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 15, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 16, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 17. The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:27, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:28, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:29.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号15であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号16であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号17であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号30であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号31であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号32である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 15, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 16, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 17. The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:30, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:31, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:32.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号18であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号19であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号20であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号24であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号25であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号26である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 18, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 19, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 20; The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:24, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:25, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:26.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号18であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号19であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号20であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号27であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号28であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号29である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 18, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 19, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 20; The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:27, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:28, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:29.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号18であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号19であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号20であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号30であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号31であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号32である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 18, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 19, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 20; The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:30, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:31, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:32.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号21であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号22であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号23であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号24であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号25であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号26である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 21, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 22, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 23; The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:24, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:25, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:26.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号21であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号22であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号23であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号27であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号28であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号29である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 21, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 22, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 23; The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:27, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:28, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:29.
本明細書に記載された好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は配列番号21であり、L-CDR2のアミノ酸配列は配列番号22であり、L-CDR3のアミノ酸配列は配列番号23であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を含み、H-CDR1のアミノ酸配列は配列番号30であり、H-CDR2のアミノ酸配列は配列番号31であり、H-CDR3のアミノ酸配列は配列番号32である。 In preferred embodiments described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 21, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 22, and the amino acid sequence of L-CDR3 is SEQ ID NO: 23; The amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO:30, the amino acid sequence of H-CDR2 is SEQ ID NO:31, and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:32.
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号7、配列番号8、又は配列番号9からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号10、配列番号11、又は配列番号12からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9; A heavy chain comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:11, or SEQ ID NO:12.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号10のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:7 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:10.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号11のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:7 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:11.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号12のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:7 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:12.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号8のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号10のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:8 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:10.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号8のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号11のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:8 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:11.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号8のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号12のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:8 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:12.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号9のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号10のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:10.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号9のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号11のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:11.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号9のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号12のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:12.
他の好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体の軽鎖は、配列番号7、配列番号8、又は配列番号9からなるアミノ酸配列に対して約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有していてもよく、抗HIV-1抗体の重鎖は、配列番号10、配列番号11、又は配列番号12からなるアミノ酸配列に対して約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有していてもよい。 In other preferred embodiments, the light chain of the anti-HIV-1 antibody is about 70%, 75%, 80%, 85%, 90% relative to the amino acid sequence consisting of SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, or SEQ ID NO:9. %, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology, the heavy chain of an anti-HIV-1 antibody is about 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% of the amino acid sequence consisting of SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, or SEQ ID NO: 12 %, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology.
本明細書に記載された一実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In one embodiment described herein, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 3; A heavy chain comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:5 or SEQ ID NO:6.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号4のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:1 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:4.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:1 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:5.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号6のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:1 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:6.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号4のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:2 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:4.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:2 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:5.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号6のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:2 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:6.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号3のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号4のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:3 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:4.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号3のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:3 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:5.
好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体は、配列番号3のアミノ酸配列を含む軽鎖と、配列番号6のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。 In a preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody comprises a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:3 and a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:6.
他の好ましい実施形態において、抗HIV-1抗体の軽鎖は、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3からなるアミノ酸配列に対して約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有していてもよく、抗HIV-1抗体の重鎖は、配列番号4、配列番号5、又は配列番号6からなるアミノ酸配列に対して約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の相同性を有していてもよい。 In other preferred embodiments, the light chain of the anti-HIV-1 antibody is about 70%, 75%, 80%, 85%, 90% relative to the amino acid sequence consisting of SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, or SEQ ID NO:3. %, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology, the heavy chain of an anti-HIV-1 antibody is about 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% for an amino acid sequence consisting of SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 6 %, 96%, 97%, 98%, 99% or more homology.
いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、HIV-1 p24タンパク質に特異的に結合する。いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、HIV-1 p24タンパク質のエピトープに結合する。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、HIV-1 p24タンパク質の直鎖状エピトープに結合する。いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、HIV-1 p24タンパク質のアミノ酸配列(配列番号35)又は前記配列と少なくとも90%の相同性を有する配列から選択される少なくとも5つの連続するアミノ酸を含む直鎖状エピトープに結合する。他の実施形態において、HIV-1 p24タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号36に規定される。 In some preferred embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention specifically bind to the HIV-1 p24 protein. In some embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention bind to an epitope of the HIV-1 p24 protein. In some preferred embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention bind to linear epitopes of the HIV-1 p24 protein. In some preferred embodiments, the anti-HIV-1 antibody of the invention comprises at least 5 selected from the amino acid sequence of the HIV-1 p24 protein (SEQ ID NO:35) or a sequence having at least 90% homology with said sequence. Binds a linear epitope containing three consecutive amino acids. In other embodiments, the amino acid sequence of the HIV-1 p24 protein is set forth in SEQ ID NO:36.
他の好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、配列番号33のアミノ酸配列を含むことを特徴とするHIV-1 p24タンパク質のエピトープに結合する。 In another preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody of the invention binds to an epitope of the HIV-1 p24 protein characterized by comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:33.
より好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、配列番号33からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするHIV-1 p24タンパク質のエピトープに結合し、前記抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2、及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号15、配列番号18、及び配列番号21からなる群から選択され、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号16、配列番号19及び配列番号22からなる群から選択され、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号17、配列番号20及び配列番号23からなる群より選択され、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を更に含み、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号24、配列番号27及び配列番号30からなる群から選択され、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号25、配列番号28及び配列番号31からなる群から選択され、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号26、配列番号29及び配列番号32からなる群から選択される。 In a more preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody of the invention binds to an epitope of the HIV-1 p24 protein characterized by comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:33, said antibody comprising: a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2, and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 18, and SEQ ID NO: 21; The amino acid sequence of L-CDR2 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 19 and SEQ ID NO: 22, and the amino acid sequence of L-CDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 20 and SEQ ID NO: 23. and further comprising a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, wherein the amino acid sequence of H-CDR1 is from the group consisting of SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 27 and SEQ ID NO: 30 The H-CDR2 amino acid sequence is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 28 and SEQ ID NO: 31, and the H-CDR3 amino acid sequence consists of SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 29 and SEQ ID NO: 32 selected from the group.
いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、配列番号33のアミノ酸配列を含むことを特徴とするHIV-1 p24タンパク質のエピトープに結合し、前記抗体は、相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2及びL-CDR3を含む軽鎖を含み、L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号18であり、L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号19であり、L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号20であり、また、相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2及びH-CDR3を含む重鎖を更に含み、H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号27であり、H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号28であり、H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号29である。 In some preferred embodiments, the anti-HIV-1 antibody of the invention binds to an epitope of the HIV-1 p24 protein characterized by comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:33, said antibody comprising a complementarity determining region A light chain comprising L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3, wherein the amino acid sequence of L-CDR1 is SEQ ID NO: 18, the amino acid sequence of L-CDR2 is SEQ ID NO: 19, and the amino acid sequence of L-CDR3 is The amino acid sequence is SEQ ID NO: 20 and further comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3, the amino acid sequence of H-CDR1 is SEQ ID NO: 27, H The amino acid sequence of -CDR2 is SEQ ID NO:28 and the amino acid sequence of H-CDR3 is SEQ ID NO:29.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、固体支持体に結合している。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention are attached to a solid support.
D. 親和タグ
本発明による抗HIV-1抗体は、親和タグを含んでもよい。親和タグは、精製に有用である。例示的な親和タグには、ポリヒスチジン、グルタチオンS-トランスフェラーゼ(GST)、キチン結合性タンパク質、マルトース結合性タンパク質(MBP)、ストレプトアビジン結合性ペプチド(Strepタグ)、イソペプチド結合形成、FLAGタグ、V5タグ、Mycタグ、HAタグ、NEタグ、AviTag、カルモジュリンタグ、ポリグルタミン酸、Sタグ、SBPタグ、Softag 1、Softag 3、TCタグ、VSVタグ、Xpressタグ、Isopeptag、SpyTag、SnoopTag、ビオチンカルボキシル担体タンパク質、緑色蛍光タンパク質タグ、HaloTag、Nusタグ、及びチオレドキシンタグが挙げられるが、親和タグの選択は特に限定的なわけではない。そうとは言え、抗HIV-1抗体は、例えば、使用後、親和タグが除去される場合、又は抗HIV-1抗体が、親和タグを必要としない戦略を用いて精製される場合には、親和タグを欠き得る。例示的な親和タグはポリヒスチジンであり、それは、典型的には、4個から10個の間の連続したヒスチジンを含むアミノ酸配列を含む。
D. Affinity Tags An anti-HIV-1 antibody according to the invention may comprise an affinity tag. Affinity tags are useful for purification. Exemplary affinity tags include polyhistidine, glutathione S-transferase (GST), chitin binding protein, maltose binding protein (MBP), streptavidin binding peptide (Strep tag), isopeptide bond formation, FLAG tag, V5 tag, Myc tag, HA tag, NE tag, AviTag, calmodulin tag, polyglutamic acid, S tag, SBP tag, Softag 1, Softag 3, TC tag, VSV tag, Xpress tag, Isopeptag, SpyTag, SnoopTag, biotin carboxyl carrier Protein, green fluorescent protein tags, HaloTag, Nus tags, and thioredoxin tags include, but are not particularly limited to, the choice of affinity tag. That said, the anti-HIV-1 antibody may, for example, be purified after use if the affinity tag is removed or if the anti-HIV-1 antibody is purified using a strategy that does not require an affinity tag. May lack an affinity tag. An exemplary affinity tag is polyhistidine, which typically comprises an amino acid sequence containing between 4 and 10 consecutive histidines.
本発明の抗HIV-1抗体は、親和タグを含んでもよく、前記親和タグを用いて精製されてもよい。抗HIV-1抗体の精製のいくつかの方法が最先端技術において利用可能であり、当業者はそれらを周知している。親和タグを含む又は含まない、抗HIV-1抗体のための精製の例示的な方法は、固定化金属アフィニティークロマトグラフィー(IMAC)、プロテインA/G親和性、交換クロマトグラフィー(IEX又はIEC)、疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC)、並びに/又はIMAC若しくはプロテインA/Gを超えるタグ及びアフィニティークロマトグラフィー技術の追加の使用である。利用される精製方法及びタグは、限定するものとみなされるべきではない。 The anti-HIV-1 antibodies of the invention may contain an affinity tag and may be purified using said affinity tag. Several methods of purification of anti-HIV-1 antibodies are available in the state of the art and are well known to those skilled in the art. Exemplary methods of purification for anti-HIV-1 antibodies, with or without affinity tags, include immobilized metal affinity chromatography (IMAC), protein A/G affinity, exchange chromatography (IEX or IEC), Additional use of tag and affinity chromatography techniques over hydrophobic interaction chromatography (HIC) and/or IMAC or protein A/G. The purification methods and tags utilized should not be considered limiting.
II. 核酸、クローニング細胞、及び発現細胞
本発明はまた、本明細書に記載された抗HIV-1抗体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸に関する。核酸は、単離された核酸であってもよい。核酸は、DNA又はRNAであり得る。本明細書に記載された抗HIV-1抗体をコードするヌクレオチド配列を含むDNAは、典型的には、ヌクレオチド配列と作動可能に連結されているプロモーターを含む。プロモーターは、好ましくは、目的の発現細胞においてヌクレオチド配列の構成的又は誘導性発現を駆動させる能力がある。前記核酸はまた、目的の前記核酸を含有する細胞を選択するために有用な選択マーカーを含み得る。有用な選択マーカーは当業者により周知されている。核酸の正確なヌクレオチド配列は、そのヌクレオチド配列が本明細書に記載された抗HIV-1抗体をコードする限り、特に限定的なわけではない。コドンは、例えば、目的の発現細胞(例えば、ヒト細胞等の哺乳動物細胞)のコドンバイアスに適合するように、及び/又はクローニング中の便宜のために、選択され得る。DNAは、複製起点(例えば、原核細胞におけるプラスミドの複製のための)を含み得る、例えばプラスミドであり得る。
II. Nucleic Acids, Cloning Cells, and Expression Cells The present invention also relates to nucleic acids comprising nucleotide sequences encoding the anti-HIV-1 antibodies described herein. The nucleic acid may be an isolated nucleic acid. Nucleic acids can be DNA or RNA. A DNA comprising a nucleotide sequence encoding an anti-HIV-1 antibody described herein typically includes a promoter operably linked to the nucleotide sequence. The promoter is preferably capable of driving constitutive or inducible expression of the nucleotide sequence in the intended expressing cells. The nucleic acid may also contain a selectable marker useful for selecting cells containing the nucleic acid of interest. Useful selectable markers are well known to those of skill in the art. The exact nucleotide sequence of the nucleic acid is not critical, so long as the nucleotide sequence encodes the anti-HIV-1 antibodies described herein. Codons may be chosen, for example, to match the codon bias of the expression cell of interest (eg, mammalian cells such as human cells) and/or for convenience during cloning. The DNA may be, eg, a plasmid, which may include an origin of replication (eg, for replication of the plasmid in prokaryotic cells).
本明細書に記載された一実施形態において、核酸は、本発明の抗HIV-1抗体をコードするヌクレオチド配列、前記ヌクレオチド配列と作動可能に連結されたプロモーター、及び選択マーカーを含む。 In one embodiment described herein, a nucleic acid comprises a nucleotide sequence encoding an anti-HIV-1 antibody of the invention, a promoter operably linked to said nucleotide sequence, and a selectable marker.
いくつかの好ましい実施形態において、核酸は、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41及び配列番号42からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。より好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖の核酸は、配列番号37、配列番号39、及び配列番号41からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含み、本発明の抗HIV-1抗体の重鎖の核酸は、配列番号38、配列番号40、及び配列番号42からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。 In some preferred embodiments, the nucleic acid comprises a nucleotide sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41 and SEQ ID NO:42. In a more preferred embodiment, the anti-HIV-1 antibody light chain nucleic acid of the invention comprises a nucleotide sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:39, and SEQ ID NO:41, and the anti-HIV-1 antibody of the invention comprises a nucleotide sequence selected from the group consisting of: The -1 antibody heavy chain nucleic acid comprises a nucleotide sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:40, and SEQ ID NO:42.
いくつかの実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖及び重鎖の核酸は、配列番号37のヌクレオチド配列及び配列番号38のヌクレオチド配列をそれぞれ含む。他の実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖及び重鎖の核酸は、配列番号39のヌクレオチド配列及び配列番号40のヌクレオチド配列をそれぞれ含む。他の実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体の軽鎖及び重鎖の核酸は、配列番号41のヌクレオチド配列及び配列番号42のヌクレオチド配列をそれぞれ含む。 In some embodiments, the anti-HIV-1 antibody light and heavy chain nucleic acids of the invention comprise the nucleotide sequence of SEQ ID NO:37 and SEQ ID NO:38, respectively. In other embodiments, the anti-HIV-1 antibody light and heavy chain nucleic acids of the invention comprise the nucleotide sequences of SEQ ID NO:39 and SEQ ID NO:40, respectively. In other embodiments, the anti-HIV-1 antibody light and heavy chain nucleic acids of the invention comprise the nucleotide sequences of SEQ ID NO:41 and SEQ ID NO:42, respectively.
本発明の様々な態様はまた、本明細書に記載されているような抗HIV-1抗体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸を含む細胞に関する。細胞は、発現細胞又はクローニング細胞であり得る。核酸は、典型的には、大腸菌(E. coli)においてクローニングされるが、他のクローニング細胞を用いてもよい。 Various aspects of the invention also relate to cells containing a nucleic acid comprising a nucleotide sequence encoding an anti-HIV-1 antibody as described herein. Cells can be expression cells or cloned cells. Nucleic acids are typically cloned in E. coli, although other cloning cells may be used.
細胞が発現細胞である場合には、核酸は、染色体の核酸であってもよく、すなわち、そのヌクレオチド配列が染色体へ組み込まれる場合であり、とは言え、その時、核酸は、発現細胞において、例えば、染色体外DNA又はベクター、例えば、プラスミド、コスミド、ファージ等として存在し得る。ベクターの型式は、限定的とみなされるべきではない。 Where the cell is an expression cell, the nucleic acid may be a chromosomal nucleic acid, i.e. where the nucleotide sequence is integrated into the chromosome, provided that the nucleic acid is then in the expression cell e.g. , extrachromosomal DNA or vectors such as plasmids, cosmids, phages and the like. The type of vector should not be considered limiting.
本明細書に記載された一実施形態において、細胞は、典型的には、発現細胞である。発現細胞の性質は特に限定的なわけではない。哺乳動物発現細胞は、組換え抗体又はオリゴマー組換え抗体の都合良いフォールディング、翻訳後修飾、及び/又は分泌を可能にし得るが、他の真核細胞又は原核細胞が発現細胞として用いられてもよい。例示的な発現細胞には、TunaCHO又はExpiCHOなどのCHO細胞株、Expi293、BHK、NS0、Sp2/0、COS、C127、HEK、HT-1080、PER.C6、HeLa、及びJurkat細胞が挙げられる。細胞はまた、ベクターの組込みのため、より好ましくはプラスミドDNAの組込みのために、選択され得る。 In one embodiment described herein, the cells are typically expression cells. The nature of the expressing cells is not particularly limited. Mammalian expression cells may allow for convenient folding, post-translational modification, and/or secretion of recombinant or oligomeric recombinant antibodies, although other eukaryotic or prokaryotic cells may be used as expression cells. . Exemplary expressing cells include CHO cell lines such as TunaCHO or ExpiCHO, Expi293, BHK, NS0, Sp2/0, COS, C127, HEK, HT-1080, PER.C6, HeLa, and Jurkat cells. Cells may also be selected for vector integration, more preferably for plasmid DNA integration.
本発明の抗HIV-1抗体は、抗HIV-1抗体をコードするヌクレオチド配列を含む核酸の哺乳動物細胞への適切なトランスフェクション戦略により産生され得る。当業者は、核酸のえり抜きの細胞株へのトランスフェクションに利用可能な種々の技術(リポフェクション、エレクトロポレーション等)を知っている。したがって、哺乳動物細胞株及びトランスフェクション戦略の選択は、限定的とみなされるべきではない。細胞株は更に、プラスミドDNAの組込みについて選択され得る。 The anti-HIV-1 antibodies of the present invention can be produced by appropriate transfection strategies of nucleic acids containing nucleotide sequences encoding anti-HIV-1 antibodies into mammalian cells. Those skilled in the art are aware of the various techniques (lipofection, electroporation, etc.) available for transfection of nucleic acids into the cell line of choice. Therefore, the choice of mammalian cell line and transfection strategy should not be considered limiting. Cell lines can also be selected for integration of plasmid DNA.
本明細書に記載された一つの好ましい実施形態において、細胞は、本発明の抗HIV-1抗体を含む。 In one preferred embodiment described herein, the cell comprises an anti-HIV-1 antibody of the invention.
III. 組成物、及びキット
本発明の様々な態様は、本明細書に記載されているような抗HIV-1抗体を含む組成物に関する。
III. Compositions and Kits Various aspects of the invention relate to compositions comprising anti-HIV-1 antibodies as described herein.
本明細書に記載された一実施形態において、組成物は、本発明の抗HIV-1抗体及び固体支持体を含む。 In one embodiment described herein, a composition comprises an anti-HIV-1 antibody of the invention and a solid support.
他の実施形態において、組成物は、本発明の抗HIV-1抗体及び固体支持体を含み、前記抗HIV-1抗体が前記固体支持体と共有結合性に又は非共有結合性に結合している。本明細書で用いられる場合、用語「非共有結合性に結合した」は、例えば、ストレプトアビジン結合性タンパク質とストレプトアビジンとの間又は抗体とそれの抗原との間の相互作用による等に例示される、抗体とそれの抗原の間、リガンドとそれの受容体の間、又は酵素とそれの基質の間等の特異的な結合を指す。 In other embodiments, a composition comprises an anti-HIV-1 antibody of the invention and a solid support, wherein said anti-HIV-1 antibody is covalently or non-covalently bound to said solid support. there is As used herein, the term "non-covalently bound" is exemplified, for example, by interactions between a streptavidin-binding protein and streptavidin or between an antibody and its antigen. specific binding, such as between an antibody and its antigen, between a ligand and its receptor, or between an enzyme and its substrate.
他の実施形態において、組成物は、本発明の抗HIV-1抗体及び固体支持体を含み、前記抗HIV-1抗体が固体支持体と直接的に又は間接的に結合している。本明細書で用いられる場合、用語「直接的」結合は、分子の固体支持体への直接的コンジュゲーション、例えば、抗HIV-1抗体のシステインチオールを金表面へ結合する金-チオール相互作用を指す。本明細書で用いられる場合、用語「間接的」結合は、固体支持体と直接的に結合している別の分子との抗HIV-1抗体の特異的結合を含み、例えば、抗HIV-1抗体が、固体支持体と直接的に結合している抗体を結合し、それにより、前記抗HIV-1抗体を前記固体支持体と間接的に結合させ得る。用語「間接的」結合は、(a)分子のデイジーチェーン間の各相互作用が特異的又は共有結合性相互作用であり、且つ(b)デイジーチェーンの末端分子が固体支持体と直接的に結合している限り、抗HIV-1抗体と固体支持体の間の分子の数とは無関係である。 In other embodiments, a composition comprises an anti-HIV-1 antibody of the invention and a solid support, wherein said anti-HIV-1 antibody is directly or indirectly bound to the solid support. As used herein, the term "direct" binding refers to direct conjugation of a molecule to a solid support, e.g., a gold-thiol interaction that binds the cysteine thiol of an anti-HIV-1 antibody to a gold surface. Point. As used herein, the term "indirect" binding includes specific binding of an anti-HIV-1 antibody to another molecule that is directly attached to a solid support, e.g. Antibodies can bind antibodies that are directly bound to a solid support, thereby indirectly binding the anti-HIV-1 antibody to the solid support. The term "indirect" binding means that (a) each interaction between a daisy chain of molecules is a specific or covalent interaction and (b) the terminal molecule of the daisy chain is directly bound to the solid support. irrespective of the number of molecules between the anti-HIV-1 antibody and the solid support, as long as
固体支持体は、粒子、ビーズ、膜、表面、ポリペプチドチップ、マイクロタイタープレート、又はクロマトグラフィーカラムの固相を含み得る。好ましくは、固体支持体はラテックスビーズであり得る。 Solid supports can include solid phases of particles, beads, membranes, surfaces, polypeptide chips, microtiter plates, or chromatography columns. Preferably, the solid support may be latex beads.
組成物は、複数のビーズ又は粒子を含み得、前記複数のビーズ又は粒子の各ビーズ又は粒子が、本明細書に記載されているような少なくとも1つの抗HIV-1抗体と直接的に又は間接的に結合している。組成物は、複数のビーズ又は粒子を含み得、前記複数のビーズ又は粒子の各ビーズ又は粒子が、本明細書に記載されているような少なくとも1つの抗HIV-1抗体と共有結合性に又は非共有結合性に結合している。 The composition may comprise a plurality of beads or particles, each bead or particle of said plurality of beads or particles being directly or indirectly associated with at least one anti-HIV-1 antibody as described herein. physically connected. The composition may comprise a plurality of beads or particles, each bead or particle of said plurality of beads or particles covalently binding to at least one anti-HIV-1 antibody as described herein or Non-covalently bound.
実施形態の様々な態様は、試料中のHIV-1の存在を検出するためのキットに関し、前記キットは、少なくとも1つの抗HIV-1抗体と、本明細書に記載された固体支持体又は組成物とを含む。いくつかの実施形態において、少なくとも1つの抗体は、固体支持体に共有的又は非共有的に結合されている。 Various aspects of embodiments relate to a kit for detecting the presence of HIV-1 in a sample, said kit comprising at least one anti-HIV-1 antibody and a solid support or composition described herein. Including things. In some embodiments, at least one antibody is covalently or non-covalently attached to a solid support.
本明細書に記載された抗HIV-1抗体、組成物及びキットは、例えば、試料中のHIV-1の存在を検出するための、又は試料中のHIV-1の濃度を測定するためのアッセイにおいて使用するためのものであり得るが、それらは前記アッセイに限定されない。本発明の抗HIV-1抗体、組成物及びキットはまた、HIV-1のみの検出のために、又は多重アッセイ及び方法等の他の病原体の検出のための他の抗体と組み合わせて使用され得る。 Anti-HIV-1 antibodies, compositions and kits described herein can be used, for example, in assays for detecting the presence of HIV-1 in a sample or for measuring the concentration of HIV-1 in a sample. but they are not limited to said assays. The anti-HIV-1 antibodies, compositions and kits of the invention can also be used for the detection of HIV-1 alone or in combination with other antibodies for the detection of other pathogens such as multiplex assays and methods. .
いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗HIV-1抗体は、他のRNAウイルスもまた検出される方法及びアッセイにおいて使用される。他の実施形態において、前記抗HIV-1抗体及び他の抗HIV-2抗体は、試料中のHIV-1及びHIV-2の同時検出のための方法及びアッセイにおいて使用される。より好ましい実施形態において、前記抗HIV-1抗体及び他の抗HIV-2抗体は、試料中のHIV-1 p24タンパク質及びHIV-2 p26タンパク質の特異的検出のための方法及びアッセイにおいて使用される。 In some preferred embodiments, the anti-HIV-1 antibodies of the invention are used in methods and assays in which other RNA viruses are also detected. In other embodiments, the anti-HIV-1 and other anti-HIV-2 antibodies are used in methods and assays for simultaneous detection of HIV-1 and HIV-2 in a sample. In a more preferred embodiment, said anti-HIV-1 and other anti-HIV-2 antibodies are used in methods and assays for the specific detection of HIV-1 p24 and HIV-2 p26 proteins in a sample. .
試料中のHIV-1を検出するための方法及びアッセイにおいて、本明細書に記載された複数の抗HIV-1抗体を使用することも、本発明の範囲内において企図されている。 Also contemplated within the scope of the present invention is the use of multiple anti-HIV-1 antibodies described herein in methods and assays for detecting HIV-1 in a sample.
以下、本発明を例示的な実施例を参照してより詳細に説明するが、これは本発明の限定を構成するものではない。 The invention is explained in more detail below with reference to exemplary embodiments, which do not constitute a limitation of the invention.
(実施例1)
好ましい抗HIV抗体と安定細胞株の生成
本明細書に開示されるように、本発明の軽鎖及び重鎖の特定の組合せは、好ましい抗体をもたらした:
(Example 1)
Generation of Preferred Anti-HIV Antibodies and Stable Cell Lines As disclosed herein, certain combinations of light and heavy chains of the present invention have resulted in preferred antibodies:
各抗体の可変領域と定常領域をバイシストロン性ベクターにクローニングし、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞で発現させた。各抗体の製造特性をそれぞれの安定細胞株クローンを生成する能力、並びに機能的抗体の再現可能な発現及び精製に基づいて評価した。 The variable and constant regions of each antibody were cloned into bicistronic vectors and expressed in Chinese Hamster Ovary (CHO) cells. The manufacturing properties of each antibody were evaluated based on their ability to generate stable cell line clones and reproducible expression and purification of functional antibodies.
プールの開発
トランスフェクション:抗体#A、#B及び#D(配列番号37~42)のヌクレオチド配列を含む3つのコンストラクトの発現は、各抗体の重鎖及び軽鎖を含むバイシストロン性発現ベクターにおいて生成した。抗体を発現させるために、CHO細胞に200μgのDNAをエレクトロポレーションして、安定細胞株を作製した。24時間後、トランスフェクトされた細胞を計数し、タンパク質遺伝子の安定した組込みのために選択培地下に置いた。
Pool Development Transfection: Expression of the three constructs containing the nucleotide sequences of antibodies #A, #B and #D (SEQ ID NOS:37-42) in bicistronic expression vectors containing the heavy and light chains of each antibody. generated. For antibody expression, CHO cells were electroporated with 200 μg of DNA to generate stable cell lines. After 24 hours, transfected cells were counted and placed under selective medium for stable integration of protein genes.
プールの生成:トランスフェクトされた細胞を、0.5×106細胞/mLの細胞密度で、50mLの作業容積を持つ250mLのシェーカーフラスコ中の選択培地に播種し、37℃、5%のCO2でインキュベートした。選択プロセス中、プールがその増殖速度及び生存率を回復するまで、細胞をスピンダウンし、2~3日ごとに新鮮な選択培地に再懸濁した。生細胞密度(VCD)、パーセント生存率、及び力価を介して、細胞培養物を増殖についてモニターした。 Generation of pools: Transfected cells are seeded at a cell density of 0.5 x 106 cells/mL in selective medium in 250 mL shaker flasks with a working volume of 50 mL, at 37°C, 5% CO2. incubated. During the selection process, cells were spun down and resuspended in fresh selection medium every 2-3 days until the pool regained its growth rate and viability. Cell cultures were monitored for growth via viable cell density (VCD), percent viability, and titer.
生産プール:VCD、力価、及び生存率を評価するために、安定したプールをもとに1リットルの生産過程を実施した。細胞は、3Lの振盪フラスコ(作業容量1L)中の生産培地にスケールアップした。各安定プール生産過程から採取した馴化培地上清を遠心分離により清澄化し、プロテインAカラムを使用したアフィニティー精製によりタンパク質を精製した(Table 2(表2)~Table 4(表4))。 Production pool: A 1 liter production run was performed on the stable pool to assess VCD, titer and viability. Cells were scaled up to production medium in 3 L shake flasks (1 L working volume). Conditioned media supernatants taken from each stable pool production run were clarified by centrifugation and proteins were purified by affinity purification using protein A columns (Tables 2-4).
細胞株バンキング:細胞を1mLあたり2.5×106個まで増殖させた。細胞バンキングのための採取時において、生存率は95%を超えていた。次に細胞を遠心分離し、細胞ペレットを7.5%ジメチルスルホキシド(DMSO)(Sigma-Aldrich社、D1435)を含むCHO完全培地に再懸濁して、1バイアルあたり15×106細胞/mLの細胞数とした。各プールの合計5本のバイアルを作製し、液体窒素中で保存するために凍結保存した。 Cell line banking: Cells were grown to 2.5×10 6 per mL. Viability was greater than 95% at the time of harvest for cell banking. Cells were then centrifuged and the cell pellet resuspended in CHO complete medium containing 7.5% dimethylsulfoxide (DMSO) (Sigma-Aldrich, D1435) to obtain a cell count of 15 x 106 cells/mL per vial. and A total of 5 vials of each pool were made and cryopreserved for storage in liquid nitrogen.
安定な抗体の生成
抗体#A、#B及び#Dのバンキングされたベストなプール細胞株から始めて、単一細胞クローニングによって安定なクローンを得た。各抗体のベストなクローンは、発現レベルと、製造過程からの抗体#A、#B及び#Dの精製材料の生物分析の特徴付けに基づいて選択した。生物分析の特徴付けには、SE-UPLC及びSDS-PAGEが含まれていた(図1~3)。
Generation of Stable Antibodies Starting with the best banked pooled cell lines for antibodies #A, #B and #D, stable clones were obtained by single cell cloning. The best clone for each antibody was selected based on expression levels and bioanalytical characterization of purified material of antibodies #A, #B and #D from the manufacturing process. Bioanalytical characterization included SE-UPLC and SDS-PAGE (Figures 1-3).
(実施例2)
抗体のモデリングと評価
計算モデリングソフトウェアのBioiluminate(Schrodinger社)、バージョン3.5を使用して、抗体#A、#B及び#Dの三次元構造モデルを抗体相同性によって構築した。簡単に述べると、抗体#A、#B及び#DのVH及びVL領域のアミノ酸配列をBioiluminateにロードした。タンパク質データバンク(PDB)で抗体構造を検索し、高い配列類似性及び構造適合性に基づきPDBテンプレートを選択することによって、フレームワーク領域及びCDRを同定した(Table 5(表5))。本発明の各抗体について予測されるCDR配列をTable 5(表5)に示し、抗体#A、#B及び#DのPDB予測構造をそれぞれ図4A、4B及び4Dに示す。抗体#Aについては、PDB構造コード2XKNを相同性クエリにおいて使用し、抗体B#及び#Dについては、コード5OPY及び1F3Dをそれぞれ使用した。
(Example 2)
Antibody Modeling and Evaluation Three-dimensional structural models of antibodies #A, #B and #D were constructed by antibody homology using the computational modeling software Bioiluminate (Schrodinger), version 3.5. Briefly, the amino acid sequences of the VH and VL regions of antibodies #A, #B and #D were loaded into Bioiluminate. Framework regions and CDRs were identified by searching antibody structures in the protein data bank (PDB) and selecting PDB templates based on high sequence similarity and structural compatibility (Table 5). The predicted CDR sequences for each antibody of the invention are shown in Table 5, and the PDB predicted structures of antibodies #A, #B and #D are shown in Figures 4A, 4B and 4D respectively. For antibody #A the PDB structure code 2XKN was used in the homology query, for antibodies B# and #D the codes 5OPY and 1F3D respectively.
抗体#A及び#Bは、IgG1kアイソタイプの結果であり、抗体#Dは、IgG2akアイソタイプの結果であった。 Antibodies #A and #B were of the IgG1k isotype and antibody #D was of the IgG2ak isotype.
3つの抗体のヌクレオチド配列の分析は、ImMunoGeneTics Database(IMGT)データベースに対する免疫グロブリン可変ドメイン配列の解析を容易にする国立生物工学情報センター(NCBI)が開発したアルゴリズムであるIgBLASTに対してクエリを実行したところ、生成された全ての重鎖(VH)及び軽鎖(VL)が、固有の相補性決定領域(CDR)を有していることを示している(Lefranc M-P、Lefranc G、「IMGT(登録商標) and 30 years of Immunoinformatics Insight in Antibody V and C Domain Structure and Function.」、Jefferis R;Strohl W. R.、Kato K.、Antibodies 2019、vol. 8(29);1~21頁)。 Analysis of the nucleotide sequences of the three antibodies was queried against IgBLAST, an algorithm developed by the National Center for Biotechnology Information (NCBI) that facilitates analysis of immunoglobulin variable domain sequences against the ImMunoGeneTics Database (IMGT) database. It has been shown that all heavy (VH) and light (VL) chains generated have unique complementarity determining regions (CDRs) (Lefranc M-P, Lefranc G, IMGT Trademark) and 30 years of Immunoinformatics Insight in Antibody V and C Domain Structure and Function.”, Jefferis R; Strohl W. R., Kato K., Antibodies 2019, vol. 8(29); pp. 1-21).
(実施例3)
mAb Dのエピトープマッピング
切断されたペプチドを避けるために、HIV-p24の配列をC末端とN末端において中性GSGSGSGリンカーによって伸長させた。伸長させた抗原配列を14アミノ酸のペプチド-ペプチド重複を有する15アミノ酸の直鎖状ペプチドへと翻訳させた。結果として得られたHIV-p24ペプチドマイクロアレイには、2つずつプリントされた232の異なる直鎖状ペプチド(464スポット)が含まれており、追加のHA(YPYDVPDYAG、38スポット)及びc-Myc(EQKLISEEDL、38スポット)対照ペプチドによって形作られていた。
(Example 3)
Epitope Mapping of mAb D To avoid truncated peptides, the sequence of HIV-p24 was extended by neutral GSGSGSG linkers at the C- and N-termini. The extended antigen sequence was translated into 15 amino acid linear peptides with a 14 amino acid peptide-peptide overlap. The resulting HIV-p24 peptide microarray contained 232 different linear peptides (464 spots) printed in duplicate, plus additional HA (YPYDVPDYAG, 38 spots) and c-Myc ( EQKLISEEDL, 38 spots) were shaped by the control peptide.
洗浄バッファー:0.05% Tween 20を含むPBS、pH 7.4;各インキュベーション工程の後、10秒の洗浄×3回 Wash buffer: PBS with 0.05% Tween 20, pH 7.4; 3 x 10 second washes after each incubation step
ブロッキングバッファー:RocklandブロッキングバッファーMB-070(最初のアッセイの30分前) Blocking Buffer: Rockland Blocking Buffer MB-070 (30 minutes before first assay)
インキュベーションバッファー:10%ブロッキングバッファーを含む洗浄バッファー Incubation buffer: wash buffer containing 10% blocking buffer
アッセイ条件:インキュベーションバッファー中、1μg/ml、10μg/ml及び100μg/mlの抗体濃度;4℃で16時間のインキュベーション;140rpmで振盪 Assay conditions: antibody concentrations of 1 μg/ml, 10 μg/ml and 100 μg/ml in incubation buffer; incubation for 16 h at 4° C.; shaking at 140 rpm.
二次抗体:ヤギ抗マウスIgG(H+L)DyLight680(0.2μg/ml); RTにおいてインキュベーションバッファー中で45分間染色 Secondary antibody: goat anti-mouse IgG(H+L) DyLight680 (0.2 μg/ml); staining for 45 minutes in incubation buffer at RT
対照抗体:マウスモノクローナル抗HA(12CA5) DyLight800(0.5μg/ml);RTにおいてインキュベーションバッファー中で45分間染色 Control antibody: mouse monoclonal anti-HA (12CA5) DyLight800 (0.5 μg/ml); stained for 45 minutes in incubation buffer at RT
スキャナー:LI-COR Odyssey Imaging System;スキャンオフセット0.65mm、解像度21μm、スキャン強度7/7(赤=680nm/緑=800nm) Scanner: LI-COR Odyssey Imaging System; scan offset 0.65 mm, resolution 21 μm, scan intensity 7/7 (red=680 nm/green=800 nm)
HIV-p24ペプチドマイクロアレイの前染色は、主要なアッセイに干渉し得る抗原由来ペプチドとのバックグラウンド相互作用を調査するために、インキュベーションバッファー中の二次ヤギ抗マウスIgG(H+L)DyLight680抗体を用いて行った。その後の、他のHIV-p24ペプチドマイクロアレイコピーと、インキュベーションバッファー中の1μg/ml、10μg/ml及び100μg/mlの濃度のモノクローナル抗体Dとのインキュベーション後、二次抗体及び対照抗体で染色し、7/7(赤/緑)のスキャン強度で読み取りを行った。ペプチドマイクロアレイを形作る追加のHAペプチドは、その後、アッセイの品質とペプチドマイクロアレイの完全性を確認するための内部品質対照として染色した。 Pre-staining of HIV-p24 peptide microarrays was performed using a secondary goat anti-mouse IgG(H+L) DyLight680 antibody in incubation buffer to investigate background interactions with antigen-derived peptides that could interfere with the primary assay. I used it. Subsequent incubation of other HIV-p24 peptide microarray copies with monoclonal antibody D at concentrations of 1 μg/ml, 10 μg/ml and 100 μg/ml in incubation buffer followed by staining with secondary and control antibodies; Readings were taken at a scan intensity of /7 (red/green). Additional HA peptides forming the peptide microarray were then stained as an internal quality control to confirm assay quality and peptide microarray integrity.
mAb DについてのHIV-p24に対するエピトープマッピングと、その後のエピトープ置換スキャンは、保存された7アミノ酸のコアモチーフPIAPGQM(配列番号33)を強調した。 Epitope mapping to HIV-p24 for mAb D and subsequent epitope replacement scan highlighted a conserved 7-amino acid core motif PIAPGQM (SEQ ID NO:33).
(実施例4)
エピトープビニング試験
抗体#A、#B及び#Dの分子ドッキング及びウェスタンブロット評価は、これらの抗体がHIV-1 p24タンパク質の領域1、4及び7における直鎖状エピトープをそれぞれ認識することを示唆した。これらの観察を更に確認するために、バイオレイヤー干渉法(BLI)を使用してタンデムエピトープビニングアッセイを実施した。酵母由来バージョンのHIV-1 p24抗原をビオチン化し(bt-p24)、ストレプトアビジン(SA)バイオセンサーに300秒間ロードした。ロードしたセンサーを飽和抗体(100μg/mL)に600秒間浸し、続いて競合抗体(25μg/mL)に300秒間浸した。結果は、抗体#AがHIV-1 p24に結合している場合、抗体#B及び#DがBLIシグナル応答に増加を追加することを示しており、これは、抗体Aと比較して抗体#B及び#Dが異なるエピトープに結合することを示している。同様に、抗体#A又は#Dを飽和抗体として使用した場合、残りの抗体は同じエピトープに対して競合を示さない(図9~10)。
(Example 4)
Epitope binning studies Molecular docking and Western blot evaluation of antibodies #A, #B and #D suggested that these antibodies recognized linear epitopes in regions 1, 4 and 7 of the HIV-1 p24 protein, respectively. . To further confirm these observations, a tandem epitope binning assay was performed using biolayer interferometry (BLI). A yeast-derived version of the HIV-1 p24 antigen was biotinylated (bt-p24) and loaded onto the streptavidin (SA) biosensor for 300 seconds. The loaded sensor was soaked in saturating antibody (100 μg/mL) for 600 seconds followed by competing antibody (25 μg/mL) for 300 seconds. The results show that antibodies #B and #D add an increase in the BLI signal response when antibody #A binds to HIV-1 p24, which is similar to antibody # B and #D show that they bind to different epitopes. Similarly, when antibody #A or #D was used as a saturating antibody, the remaining antibodies show no competition for the same epitope (Figures 9-10).
Table 6(表6)は、抗体#A、#B及び#Dのエピトープビニングデータをまとめたものである。簡単に述べると、競合抗体と飽和抗体のBLIシグナルをバッファーに対して正規化した。抗体のブロッキング又は結合を決定するための閾値を0.02に設定して、マトリックスの対角線で自己ブロッキング対を認識できるようにした(灰色は結合を、太字は自己ブロッキングを指す)。Microsoft ExcelのPEARSON関数を用いて、第1の抗体#Aに対するPEARSON相関係数を算出した(Liao-Chan S.ら、「Monoclonal Antibody Binding-site Diversity Assessment with a Cell-based Clustering Assay.」、Journal of Immunological Methods 2014、vol.405;1~14頁)。抗体#A、#B及び#Dについて、3つの異なるビンを同定した。抗体のブロッキングは観察されなかった。 Table 6 summarizes the epitope binning data for antibodies #A, #B and #D. Briefly, the BLI signals of competing and saturating antibodies were normalized to buffer. The threshold for determining antibody blocking or binding was set at 0.02 to allow recognition of self-blocking pairs on the diagonal of the matrix (grey indicates binding, bold indicates self-blocking). The PEARSON correlation coefficient for the first antibody #A was calculated using the PEARSON function in Microsoft Excel (Liao-Chan S. et al., "Monoclonal Antibody Binding-site Diversity Assessment with a Cell-based Clustering Assay." Journal of Immunological Methods 2014, vol.405; pp.1-14). Three different bins were identified for antibodies #A, #B and #D. No antibody blocking was observed.
(実施例5)
抗HIV-1抗体#A、#B及び#Dの親和性評価
抗体#A、#B及び#DとHIV-1 p24抗原との間の相互作用をより詳細に調査するために、BLIによる親和性分析を行った。抗体#A、#B及び#Dを市販のモノクローナル抗体(市販mAb #1)と比較した。抗マウスFcで特異的にコーティングしたバイオセンサーチップ(ForteBio社)を使用して、抗体#A、#B及び#D、並びに市販mAb #1を捕捉した。各抗体に使用した濃度勾配は0.1から33nMの範囲で、各希釈は0.01%(w/v)のウシ血清アルブミン(BSA)と0.02%(v/v)の界面活性剤Tween-20を含むリン酸バッファー(PBS)で調製した。記録されたセンサーグラムを1:1結合モデルを用いてフィッティングし、解離速度と会合速度の比(kd/ka)から平衡定数KDを算出した。試験された抗体は、計算された親和性定数に基づいて次のようにランク付けされた:抗体#B≒抗体#D>抗体#A>市販mAb #1。観察された解離曲線が長いため、抗体#B及び#Dの正確なKD値を計算することはできなかったが、提示されたデータは、抗体#A、#B及び#Dについて計算されたKD値が、市販mAb #1で観察された値よりも低いことを示している(Table 7(表7))。このデータは、抗体#A、#B及び#Dが市販mAb #1よりもHIV-1 p24に対して高い親和性を示すという観察を裏付けている。
(Example 5)
Affinity Assessment of Anti-HIV-1 Antibodies #A, #B and #D To investigate in more detail the interaction between antibodies #A, #B and #D and the HIV-1 p24 antigen, affinity assays were performed by BLI. A sex analysis was performed. Antibodies #A, #B and #D were compared to a commercially available monoclonal antibody (commercial mAb #1). Biosensor chips (ForteBio) specifically coated with anti-mouse Fc were used to capture antibodies #A, #B and #D, as well as commercial mAb #1. The concentration gradients used for each antibody ranged from 0.1 to 33 nM, and each dilution consisted of 0.01% (w/v) bovine serum albumin (BSA) and 0.02% (v/v) surfactant Tween-20. Prepared in acid buffer (PBS). The recorded sensorgrams were fitted using a 1:1 binding model, and the equilibrium constant KD was calculated from the ratio of dissociation rate to association rate (kd/ka). The tested antibodies were ranked based on their calculated affinity constants as follows: Antibody #B≈Antibody #D>Antibody #A>Commercial mAb #1. Due to the long dissociation curves observed, it was not possible to calculate exact KD values for antibodies #B and #D, but the data presented show the calculated KDs for antibodies #A, #B and #D. values are lower than those observed for commercial mAb #1 (Table 7). This data supports the observation that antibodies #A, #B and #D show higher affinity for HIV-1 p24 than commercial mAb #1.
(実施例6)
抗HIV-1抗体#A、#B及び#Dの結合能力
HIV-1 p24抗原に対する抗体#A、#B及び#Dの結合を更に評価するために、間接ELISAアッセイをやり遂げた。各抗体の滴定曲線は、2μg/mLの開始濃度を用い、2×10-2ng/mLの低濃度に達するまで1:10の連続希釈を行うことで生成した。各抗体の性能を市販のクローン(市販mAb #2)と比較した(図10、左)。データは、抗体#A、#B及び#Dが、主に20~2000ng/mLの濃度で市販の抗体よりも高い信号対雑音比(S/N)で結合すること、また、これらは市販mAb #2と比較して低いEC50値も呈することを示している(図10、右)。
(Example 6)
Binding capacity of anti-HIV-1 antibodies #A, #B and #D
To further evaluate the binding of antibodies #A, #B and #D to the HIV-1 p24 antigen, an indirect ELISA assay was performed. A titration curve for each antibody was generated using a starting concentration of 2 μg/mL and making 1:10 serial dilutions to reach concentrations as low as 2×10 −2 ng/mL. The performance of each antibody was compared to a commercial clone (commercial mAb #2) (Figure 10, left). The data show that antibodies #A, #B and #D bind with higher signal-to-noise ratios (S/N) than the commercial antibodies, primarily at concentrations of 20-2000 ng/mL, and that these are the commercial mAbs. It also exhibits lower EC50 values compared to #2 (Figure 10, right).
結論
抗HIV-1抗体#A、#B及び#Dを市販mAb #1及び#2からの市販の抗HIV-1 p24抗体と比較する機能アッセイを実施した。各抗体の結合親和性と効力をBLIと間接ELISAによって評価した。両方の実験において、HIV-1抗体#A、#B及び#Dは、試験した市販の抗体よりも優れた親和性と優れたEC50値を示している(速度論的分析については図9及びTable 7(表7)、ELISAデータについては図10)。
CONCLUSION A functional assay comparing anti-HIV-1 antibodies #A, #B and #D with commercial anti-HIV-1 p24 antibodies from commercial mAbs #1 and #2 was performed. The binding affinity and potency of each antibody were evaluated by BLI and indirect ELISA. In both experiments, HIV-1 antibodies #A, #B and #D show superior affinities and superior EC50 values than the commercial antibodies tested (see Figure 9 and Table for kinetic analysis). 7 (Table 7), Figure 10 for ELISA data).
ここに示した実験データは、本発明の抗HIV-1抗体を使用してHIV-1のp24構造タンパク質を検出できることを示している。前記抗体は、市販の同様な製品と比較した場合、親和性、感度、効力、発現、溶解性、及び製造可能性に関して改善された特性を示し、また、血清学的検査におけるそれらの使用は、HIV-1感染と診断イベントとの間の時間枠の短縮に寄与し、したがって、ウイルスの二次感染を防ぐことができる。 The experimental data presented here demonstrate that the anti-HIV-1 antibodies of the invention can be used to detect the p24 structural protein of HIV-1. Said antibodies exhibit improved properties with respect to affinity, sensitivity, potency, expression, solubility and manufacturability when compared to similar products on the market, and their use in serological tests is It contributes to shortening the time window between HIV-1 infection and a diagnostic event, thus preventing secondary viral transmission.
Claims (32)
L-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号15、配列番号18、配列番号21、及び配列番号15、18又は21のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、
L-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号16、配列番号19、配列番号22、及び配列番号16、19、又は22のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、
L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号17、配列番号20、配列番号23、及び配列番号17、20又は23のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択される、抗HIV-1抗体。 An anti-HIV-1 antibody comprising a light chain comprising complementarity determining regions L-CDR1, L-CDR2 and L-CDR3,
The amino acid sequence of L-CDR1 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 21, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 15, 18 or 21 by one or two substitutions, deletions or additions. is,
The amino acid sequence of L-CDR2 is from the group consisting of SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 22, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 16, 19, or 22 by one or two substitutions, deletions, or additions. selected,
The amino acid sequence of L-CDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 23, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 17, 20 or 23 by one or two substitutions, deletions or additions. , anti-HIV-1 antibodies.
H-CDR1のアミノ酸配列は、配列番号24、配列番号27、配列番号30、及び配列番号24、27又は30のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、
H-CDR2のアミノ酸配列は、配列番号25、配列番号28、配列番号31、及び配列番号25、28、又は31のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択され、
H-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号26、配列番号29、配列番号32、及び配列番号26、29又は32のいずれかと1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列からなる群から選択される、請求項1に記載の抗HIV-1抗体。 the antibody comprises a heavy chain comprising complementarity determining regions H-CDR1, H-CDR2 and H-CDR3;
The amino acid sequence of H-CDR1 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 30, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 24, 27 or 30 by one or two substitutions, deletions or additions. is,
The amino acid sequence of H-CDR2 is from the group consisting of SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 31, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 25, 28, or 31 by one or two substitutions, deletions, or additions. selected,
The amino acid sequence of H-CDR3 is selected from the group consisting of SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 32, and a sequence that differs from any of SEQ ID NO: 26, 29 or 32 by one or two substitutions, deletions or additions. The anti-HIV-1 antibody of claim 1, wherein the antibody is
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号16、又は配列番号16と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号17、又は配列番号17と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 15 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 15 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 16 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 16 by one or two substitutions, deletions or additions;
7. The anti-HIV-A according to any one of claims 1 to 6, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO: 17 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 17 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号19、又は配列番号19と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号20、又は配列番号20と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 18 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 18 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 19 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 19 by one or two substitutions, deletions or additions;
Anti-HIV-anti-HIV- according to any one of claims 1 to 6, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO: 20 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 20 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号22、又は配列番号22と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号23、又は配列番号23と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 21 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 21 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 22 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 22 by one or two substitutions, deletions or additions;
Anti-HIV-anti-HIV- according to any one of claims 1 to 6, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO: 23 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 23 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号25、又は配列番号25と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号26、又は配列番号26と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~7のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 24 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 24 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 25 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 25 by one or two substitutions, deletions or additions;
8. The anti-HIV-A according to any one of claims 1 to 7, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 26 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 26 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号28、又は配列番号28と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号29、又は配列番号29と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6又は8のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 27 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 27 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 28 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 28 by one or two substitutions, deletions or additions;
9. The anti-antibody according to any one of claims 1 to 6 or 8, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 29, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 29 by one or two substitutions, deletions or additions. HIV-1 antibody.
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号31、又は配列番号31と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号32、又は配列番号32と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6又は9のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 30 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 30 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 31 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 31 by one or two substitutions, deletions or additions;
10. The anti-antibody according to any one of claims 1 to 6 or 9, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 32, or a sequence that differs from SEQ ID NO: 32 by one or two substitutions, deletions or additions. HIV-1 antibody.
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号16、又は配列番号16と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号17、又は配列番号17と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR1のアミノ酸配列が、配列番号24、又は配列番号24と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号25、又は配列番号25と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号26、又は配列番号26と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 15 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 15 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 16 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 16 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO: 17 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 17 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 24 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 24 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 25 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 25 by one or two substitutions, deletions or additions;
7. The anti-HIV-A according to any one of claims 1 to 6, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 26 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 26 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号19、又は配列番号19と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号20、又は配列番号20と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR1のアミノ酸配列が、配列番号27、又は配列番号27と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号28、又は配列番号28と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号29、又は配列番号29と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 18 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 18 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 19 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 19 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO: 20 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 20 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 27 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 27 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 28 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 28 by one or two substitutions, deletions or additions;
7. The anti-HIV-A according to any one of claims 1 to 6, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 29 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 29 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号22、又は配列番号22と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列は、配列番号23、又は配列番号23と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR1のアミノ酸配列が、配列番号30、又は配列番号30と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号31、又は配列番号31と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号32、又は配列番号32と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 21 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 21 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 22 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 22 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO: 23 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 23 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 30 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 30 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 31 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 31 by one or two substitutions, deletions or additions;
7. The anti-HIV-A according to any one of claims 1 to 6, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 32 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 32 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
L-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号22、又は配列番号22と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
L-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号23、又は配列番号23と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項30に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of L-CDR1 comprises SEQ ID NO: 21 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 21 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of L-CDR2 comprises SEQ ID NO: 22 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 22 by one or two substitutions, deletions or additions;
31. The anti-HIV-1 antibody of claim 30, wherein the amino acid sequence of L-CDR3 comprises SEQ ID NO:23 or a sequence that differs from SEQ ID NO:23 by one or two substitutions, deletions or additions.
H-CDR2のアミノ酸配列が、配列番号31、又は配列番号31と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含み、
H-CDR3のアミノ酸配列が、配列番号32、又は配列番号32と1つ又は2つの置換、欠失又は付加により異なる配列を含む、請求項30~31のいずれか一項に記載の抗HIV-1抗体。 the amino acid sequence of H-CDR1 comprises SEQ ID NO: 30 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 30 by one or two substitutions, deletions or additions;
the amino acid sequence of H-CDR2 comprises SEQ ID NO: 31 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 31 by one or two substitutions, deletions or additions;
32. Anti-HIV-A according to any one of claims 30 to 31, wherein the amino acid sequence of H-CDR3 comprises SEQ ID NO: 32 or a sequence that differs from SEQ ID NO: 32 by one or two substitutions, deletions or additions. 1 antibody.
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