JP2007509631A - 電位色素及びカルシウム色素を用いた新規の細胞ベースアッセイ - Google Patents
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Abstract
【選択図】図1
Description
(発明の分野)
(発明の背景)
(発明の概要)
(好ましい実施形態の詳細な説明)
[I.概説]
[新規のクエンチャー/色素調合物]
(a)候補クエンチャー分子のコレクションを準備するステップと、
(b)少なくとも5つの受容体のパネルを提供するステップであり、
前記受容体は、少なくとも3つのタイプから選択され、
生体内アミン、アデノシン、脂質、アルカロイド、アミノ酸、ペプチド、及びタンパク質を含めたファーマコフォアによって識別されるステップと、
(c)活性化ファーマコフォアの存在下、並びに候補クエンチャー分子の前記コレクションのメンバーの存在下及び非存在下で、前記受容体の活性をアッセイするステップと、
を含み、
生物学的に不活性の蛍光クエンチャーは、受容体の前記パネルの活性化に対して影響を及ぼさない、方法を提供する。そのようなアッセイでは、受容体の活性化は、通常、クエンチャーの機能的な使用が関与しない方法で定量化される。
[細胞ベースのcAMPアッセイに用いる新規のCNG変異体]
[GPCR/CNGアッセイ]
[A.定義]
[B.技法]
[II.特定の実施形態]
現在のところ、匂い物質受容体及び味覚受容器を除いて、ゲノムデータベースから同定することのできるGPCR遺伝子が約400ある。これらのうち、約200の受容体のリガンドが同定されており、その残部が「オーファン受容体」として残っている。これらオーファンGPCRの作動薬及び/又は拮抗薬の治療効果の可能性を明らかにする鍵は、それらの天然の生物学的リガンドを同定して、それらの生物学的機能及び疾患関連性を解明する能力にある。リガンドが既知であるGPCRに関しては、GPCRによって媒介される活性を調節する薬剤を同定することによって、臨床上の可能性の評価に用いるこれらの受容体に対して高い親和性と望ましい機能性とを備えた医薬品の開発が可能となる(概説には、Debouck及びMetcalf、2000年、Annu.Rev.Pharmacol.Toxicol、40:193−208;並びに、Howardら、2001年、Trends Pharmacol.Sci.22:132−140を参照のこと)。
脊椎動物の環状ヌクレオチド作動性(CNG)チャンネルは、cGMP及びcAMPの細胞質中濃度によって制御されるカチオンチャンネルである(概説には、Kaupp、1995年、Curr.Opin.Neurobiol.5:434−442;Finnら、1996年、Annu.Rev.Physio.58:395−426;Zogotta及びSiegelbaum、1996年、Annu.Rev.Neurosci、19:235−263;並びに、Liら、1997年、Q.Rev.Biophys.30:177−193を参照のこと)。これらのチャンネルは、混成イオン(Na+、K+、及びCa2+)によって伝達されるカチオン電流の伝導をもたらし、電気的興奮及びCa2+シグナル伝達の両方を、細胞内環状ヌクレオチド濃度の変化と共役させる働きをもつ。脊椎動物の光受容体及び嗅覚感覚受容体では、CNGチャンネルが膜電位を脱分極させ、細胞の興奮及び適応に関与する多数のCa2+調節タンパク質の活性を決定する(概説には、Kaupp及びKoch、1992年、Annu.Rev.Physio 54:153−175;並びに、Koch、1995年、Cell Calcium 18:314−321を参照)。
様々なGアルファサブユニットをコードする20を超える遺伝子を含めた多数のヘテロ3量体Gタンパク質がクローニングされている。アミノ酸配列及び機能的相同性に基づいて、様々なGサブユニットが6つのファミリーに分類されている。これらの6つのファミリーは、Gs、Gi、Gq、Golf、Go、及びG12と呼ばれる。細胞質Ca2+の放出をもたらすGqを除いて、他のすべてのGタンパク質が、環状ヌクレオチド、主としてcAMPを介して、それらのシグナルを媒介する(Watson及びArkinstall、「The G−Protein−Linked Receptor Facts Book」、Academic Press社、ロンドン、1994年)。
3’,5’環状アデノシン一リン酸(cAMP)は、細菌からヒトまでの種における原型的なセカンドメッセンジャーである。哺乳類では、cAMPは少なくとも9つのアデニリルシクラーゼ(AC)アイソザイムのファミリーによって生成される。哺乳類ACは、Ca2+/カルモジュリン、プロテインキナーゼA及びCによるリン酸化、抑制性Gタンパク質αサブユニット(Giα)、並びにGタンパク質β及びγサブユニット(Gβγ)によるそれらの活性化又は阻害が相互に異なっている。すべての哺乳類ACが、GTPが結合した促進性Gタンパク質αサブユニット(Gsα)によって活性化され、AC9以外のすべてが降圧薬であるフォルスコリンによって活性化される。既知の哺乳類ACは、12本の膜貫通ヘリックス及び2つの細胞質触媒ドメインからなる(Hurley、J.H.、Curr Opin Struct Biol.1998年12月;8(6):770−7)。
本発明は、さらに、宿主細胞を提供し、これらの宿主細胞は、1つ又は複数のGPCR及び/又はGタンパク質及び/又はCNGチャンネルをコードする核酸分子で形質転換されたものでありうる。宿主細胞には、組換え体CNGチャンネルの発現と併せて本発明の方法で使用できる内在性のGPCR及び/又はGタンパク質を有する細胞又は細胞系も含まれることがある。好ましい細胞は真核細胞である。本発明の実施に有用な真核細胞には、哺乳類細胞が含まれるが、これらに限定されない。いかなる細胞でも、その細胞系が細胞培養法に適合しており、発現ベクターの増幅及び遺伝子産物の発現に適合している限り使用できる。好ましい真核宿主細胞には、酵母、昆虫、及び哺乳類細胞、好ましくは、マウス、ラット、サル、又はヒト細胞系に由来する細胞など脊椎動物細胞が含まれるが、これらに限定されない。好ましい真核宿主細胞には、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、例えばATCCからCCL61として入手できるもの、ATCCからCRL1658として入手できるNIH Swissマウス胚細胞(NIH/3T3)、ベビーハムスター腎臓細胞(BHK)、マウスL細胞、ジャーカット細胞、SF9、アフリカツメガエル卵母細胞、153DG44細胞、HEK細胞、PC12細胞、ヒトTリンパ球細胞、及びCos−7細胞、並びに、同様の真核宿主細胞が含まれる。
本発明は、GPCRによって媒介される活性の存在及び/又は調節をアッセイする様々な方法を提供する。好ましい実施形態では、CNGチャンネルの活性化によるcAMP産生の検出がそれに伴う場合がある。一部の実施形態では、GPCRの活性化と、Gタンパク質及びアデニルシクラーゼを介したcAMP産生へのシグナル伝達との結果として生じたcAMPによる活性化の結果として、本発明の宿主細胞のCa2+流入をアッセイする。
本発明の付加的なの実施形態は、GPCRによって媒介された活性を調節する薬剤を同定する方法を提供する。その活性に関与するタンパク質に結合する薬剤、又はこれらのタンパク質の発現に影響を与える薬剤は、前記タンパク質の機能に影響を与える場合もあれば、与えない場合もある。薬剤の機能的作用の検査には、1)リガンド結合への影響、2)Gタンパク質共役シグナル伝達経路への影響、及び、3)受容体の下方制御/脱感作の活性化又は阻害が含まれるが、これらに限定されない。
GPCRの作動薬又は拮抗薬など、GPCRによって媒介された1つ又は複数の活性を調節する薬剤は、GPCRの機能及び活性に付随する過程を調節するのに用いることができる。一部の実施形態では、GPCRによって媒介された活性を調節する、すなわち増大させるか、低下させるか、あるいは活性の速度論的性質を改変する薬剤を、GPCRによって媒介された1つ又は複数の活性に随伴する生物学的及び病理学的過程を調節するのに使用することができる。
薬剤の適用が、GPCRによって媒介された活性を調節するかどうか判定するために、候補薬剤をスクリーニングすることができる。これは、例えば、GPCRによって媒介された活性の異常を特徴とする疾患を有する特定の患者を治療するのに、ある特定の薬物が有効であるかどうか決定するのに有用となる場合がある。候補薬剤によってその活性が影響を受けて、活性が正常に戻るか、あるいは、より正常に近くなるように改変された場合には、その薬剤は、その疾患の治療に指示されるものでありうる。同様に、疾患状態で発現されたものに類似した活性を誘導する薬剤は禁忌的でありうる。
本発明の薬剤を含む組成物は、単独で与えることも、特定の病理学的過程を調節する他の組成物及び/又は薬剤と併せて与えることもできる。例えば、他の既知の薬物と併せて本発明の薬剤を投与することができる。ここで使用する場合、2つの薬剤を併せて投与するというのは、それら2つの組成物及び/又は薬剤を同時に投与するか、あるいは、それらの薬剤が同時に作用するような仕方で独立的に投与する場合である。
(実施例1)
[単一細胞イメージングアッセイ]
図2は、単一細胞イメージングアッセイの結果を示す。この実施例では、CNGチャンネル(配列番号3)で2日間、一時的に形質導入されたHEK293細胞に、カルシウム蛍光色素を添加した。詳細には、MATRIGEL(Becton Dickinson社、カリフォルニア州サンノゼ)でプレコーティングされた、Fisher社ブランドの顕微鏡カバーガラス#1上で、細胞を培養し、5μMのfura−2 AM(Molecular Probes社、カリフォルニア州サニーベイル)を含有する培養培地(10%ウシ胎仔血清を含むDMEM)中、37℃で、0.5時間インキュベートした。カルシウム蛍光は、Attofluor(登録商標)RatioVision(登録商標)リアルタイム蛍光イメージング装置(ATTO、Rockville、MD)で記録した。このシステムは、Fura−2(カルシウム用)とGFP(形質導入マーカー)との組合せなど、複数の蛍光プローブを、同一の細胞で同一の期間にわたって用いた実験を行うことができる。複数の色素から得られる比率イメージ及びグラフィカルデータは、オンラインで表示される。この実施例は、CNGチャンネルを発現する単一細胞の中の細胞質遊離カルシウム濃度の変化をリアルタイムでモニターすることによって、Gs共役GPCR及びアデニリルシクラーゼの活性化を検出できることを実証する。図2中の矢印で示された時間にノルエピネフリン(NE)及びフォルスコリン(forsk)を添加したところ、GFP陽性細胞、すなわちGFP形質導入細胞で、細胞質中カルシウム濃度の上昇が開始された。2つの代表的な画像は、NEを添加する前(パネルA)及び後(パネルB)に撮ったものであり、個々の細胞の反応を示している。カルシウム蛍光の変化を、GFP陽性の細胞集団と全細胞集団とでそれぞれ平均し、図式的に示した(パネルC)。
[マルチウェルフォーマットにおけるカルシウム感受性色素と電位感受性色素との比較]
この実施例では、マイクロプレートリーダーFLEXstation(Molecular Devices社、カリフォルニア州サニーベイル)を用いて記録を行い、また、カルシウムアッセイ及び膜電位アッセイの両方に、アッセイキットに伴って提供されたプロトコールを採用した。図3は、cAMPのEC50値が配列番号3のものより低く、従って、cAMP変化に対してより感受性であると予測される変異型CNGチャンネル(配列番号5)(Richら、2001年、J.Gen.Phys.118:63−77)を用いたマルチウェルアッセイの結果を示す。図3Aは、CNGチャンネルで一時的に形質導入された細胞でCa2+感受性色素、fluo−4を用いて測定された、イソプロテレノール(β2アドレナリン受容体の作動薬)に対する反応を示す。飽和用量である10μMのイソプロテレノールで細胞を刺激した後でも、色素の蛍光に有意な変化がなかった。図3Bは、Gq経路を介した細胞内カルシウム貯蔵動員の陽性対照として、ムスカリン受容体作動薬であるカルバコールで活性化した結果を示す。この処置の結果として、細胞内Ca2+濃度の観察可能な変化がみられた。
[変異体CNGチャンネルを膜電位色素と共に用いた、GPCR活性化に反応した細胞内cAMPのアッセイ]
図5は、膜電位アッセイキット(Molecular Probes社、カリフォルニア州サニーベイル)の電位感受性色素を用いた同様のアッセイの結果を示す。電位感受性色素を再構成するには、この市販キットで供給された緩衝溶液の代わりに、0.1mM MgCl2、1mM EGTAで補足され、pH7.3に滴定されたDPBS(2価イオンを含まないダルベッコリン酸緩衝塩)を用いた。CNGチャンネル(配列番号5)で一時的に形質導入されたHEK293細胞に室温で約0.5時間、電位感受性色素の添加を行った。β−アドレナリン受容体を活性化するイソプロテレノールの0.1μMという低い濃度では、容易に検出可能な蛍光シグナルの変化がみられたが、これは、図3Aに示したように、カルシウム感受性色素を用いた場合、10μMのイソプロテレノールでも検出可能な変化がなかったことと比較される。同様に、図6は、膜電位色素を別のCNGチャンネル変異体(配列番号7)と共に用いた結果を示す。
[膜電位色素と共に、同時発現されたGPCR及びCNGチャンネルを用いた、細胞内cAMPのアッセイ]
本発明のアッセイは、外因的に導入されたGPCRを用いて行うことができる。HEK273細胞に、タイプIドーパミン受容体をコードするDNAを、変異型CNGチャンネル(配列番号7)と共に同時形質導入した。図7は、この受容体を、その天然リガンドであるドーパミンで活性化した結果を示す。膜電位色素(Molecular Probes社、カリフォルニア州サニーベイル)の存在下において、ドーパミンを添加した直後に用量依存的な蛍光シグナルが得られる。
[一時的に形質導入された細胞におけるオーファンGPCRのリガンドの同定]
野生型又は変異型のCNGチャンネルタンパク質及び対象のGPCRをコードする遺伝子は、標準的な形質導入技法を用いて標的細胞に形質導入することができる(Ausueblら、「Current Protocols in Molecular Biology」(2001年)、John Wiley & Sons社)。形質導入の2日後には、コンフルエントな細胞単層を生成するため、96ウェルプレートには1ウェルあたり50000細胞、384ウェルプレートには1ウェルあたり10000細胞を用い、プレーティング容積を、96ウェルプレートには100μL/ウェル、384ウェルプレートには25μL/ウェルとすればよい。
[GPCRによって媒介された活性を調節する薬剤の同定]
GPCRによって媒介された1つ又は複数の活性を調節する薬剤として機能する能力のあるものを求めて、化合物のスクリーニングを行うことができる。本発明に従って調製された細胞を化合物と接触させることができ、さらに、GPCRによって媒介された1つ又は複数の活性をアッセイすることができる。一例として、CNGチャンネルタンパク質及び対象のGPCRをコードする遺伝子を発現する安定細胞系を得ることができる(Ausueblら、「Current Protocols in Molecular Biology」(2001年)、John Wiley&Sons社)。GPCR遺伝子は、内在性供給源のものでも、外因性供給源のものでもよい。コンフルエントな細胞単層を生成するため、プレーティング容積を、96ウェルプレートには100μL/ウェル、また、384ウェルプレートには25μL/ウェルとして、96ウェルプレートには1ウェルあたり50000細胞、そして、384ウェルプレートには1ウェルあたり10000細胞を用いることができる。
[384ウェルプレート中のHEK 293−CNG細胞を膜電位色素と共に用いたホモジニアスカイネティックアッセイ]
細胞集団を、安定的に形質転換してCNGチャンネルを発現させ、付着細胞又は懸濁液培養条件のいずれかにおいて樹立する。それらの細胞を収集し、10%FBSを含有するDMEM(高グルコース)中に1×106細胞/mlに調整する。384ウェルマイクロプレート(Corning社;3712)に、細胞懸濁液を1ウェルあたり20μl分配し、アッセイの前に16〜24時間インキュベートする。アッセイの直前に、細胞プレートのウェルを顕微鏡で観察して、むらなく広がった集密細胞集団の存在を確認する。
[HEK 293H−CNG細胞をカルシウム感受性色素と共に用いたカイネティックアッセイ]
細胞集団、例えば、HEK293又はHEK 293Hを安定的に形質転換して、CNGチャンネル、例えば配列番号7を発現させ、付着細胞又は懸濁液培養条件のいずれかにおいて樹立した。それらの細胞を収集し、10%FBSを含有するDMEM(高グルコース)中に1×106細胞/mlに調整する。384ウェルマイクロプレートに1ウェルあたり20μlの細胞懸濁液を分注するか、あるいは、96ウェルマイクロプレートに1ウェルあたり100μlの細胞懸濁液を分注し、アッセイ前に16〜24時間インキュベートする。アッセイの直前に、細胞プレートのウェルを顕微鏡で観察して、むらなく広がったコンフルエントな細胞集団の存在を確認する。
[単一細胞イメージングアッセイ]
この実施例では、CNG遺伝子(配列番号7)を発現する安定的に形質転換されたHEK 293H細胞を、電位感受性色素(Molecular Devices社、R−7056)を用いてアッセイした。細胞は、MATRIGELでプレコーティングされた96ウェルプレートに播種した。膜電位蛍光は、Pathway HTイメージングプラットホーム(ATTO社、Rockville、MD)で、同一の細胞で同一の期間にわたって記録した。任意決定の強度範囲を280〜650として、共焦点蛍光強度イメージを図12に示した。画像は、イソプロテレノールの添加前と、最終1μMに添加した15、30、及び45秒後に、図12Aに示した時間系列で取得した。50×50μmのイメージング領域1つを図12Aに示した。撮影された71細胞で得られた蛍光軌跡の平均を図12Bに示した。イソプロテレノールを添加した時間を矢印で示した。
[野生型サブユニット及び変異を含有するサブユニットからなるCNGチャンネルを用いた細胞内cAMPのアッセイ]
野生型α+βサブユニットのヘテロマーCNGチャンネル、様々な変異を含むαサブユニットのホモマーCNGチャンネル、又は、野生型αサブユニットのみのホモマーCNGチャンネルで一時的に形質導入された細胞における、cAMP上昇に対する相対蛍光反応を調査した。この実施例では、記録をとる2日前に、HEK293細胞を、野生型のラット嗅覚CNGチャンネルαサブユニット(NCBI LocusID25411、配列番号1)プラスβサブユニット(NCBI LocusID85258)、変異C460R/E583M、C460H/E583M、C460W/Y565A/E583M(配列番号7)、又はY565A(配列番号3)を含有するラット嗅覚CNGチャンネルαサブユニット、及びαサブユニット(NCBI Locus ID25411、配列番号1)のみで形質導入した。色素添加緩衝液含有膜電位色素(Molecular Devices社、R−7056)で細胞は室温でインキュベートされた。実施例8にある通りに、イソプロテレノールを化合物緩衝液で最終濃度300nMまで溶解させ、矢印で印した時に添加した(図13)。図13は、野生型のα及びβサブユニットで構成されたヘテロマーCNGチャンネルを発現する細胞におけるイソプロテレノール反応が、ホモマー野生型αサブユニットによって形成されたCNGチャンネル、又はC460R/E583M、C460H/E583M、C460W/Y565A/E583M、若しくはY565A変異を含有するαサブユニットホモマーを発現する細胞における反応より大きいか、あるいはそれらと同程度であることを示す(図13)。
[CNGチャンネルアッセイと、従来の転写アッセイ及びcAMP ELISAアッセイとの感度比較]
cAMP抗体の競合的結合、又はcAMP応答エレメント(CRE)によって調節されている遺伝子の転写の原理に基づいて、多数のcAMPアッセイ技法が開発された。cAMP特異的な抗体を用いたアッセイでは、cAMPをアッセイ媒体に放出するために細胞溶解を必要とする。その結果、細胞数が減少するのに従って、アッセイ感度が損なわれる。遺伝子レポーターアッセイでは、CREの転写が様々なシグナル伝達経路によって非特異的に影響を受ける場合があるので、偽陽性及び偽陰性の記録がより多いことが予測される。対照的に、CNGチャンネルアッセイは、従来の間接的なcAMPアッセイ技術に付随する問題を回避するために、細胞内cAMPの直接的な生理的リードアウトを提供する。CNGチャンネルは、原形質膜を標的とし、アデニリルシクラーゼと共局在するので、局所的なcAMP上昇の高感度の検出が可能である。CNGチャンネルアッセイにおける蛍光リードアウトは、単一の生存細胞の活性に由来するので、細胞数が減少しても、間接測定で起こりうるような、アッセイ感度の低下が起こらない。
[異なったファミリーのGs共役GPCRのCNGチャンネルアッセイ]
Gs共役GPCRのカイネティックアッセイとしてのCNGチャンネルアッセイの感度を示すため、アッセイ用のGs共役GPCRを、クラスB(セクレチンファミリー)及びクラスA(例えば、生体内アミン、ペプチド、プロスタノイド、及びアデノシンの受容体が含まれる)から無作為に選択した。表1に記載するGPCRの同族作動薬による活性化を、CNGチャンネルアッセイを適用して検査した。CNGチャンネルアッセイは、これらすべてのGPCRのリードアウトに成功した。これは、Gs共役CPCRの活性化の正確な反応速度測定を、リガンドファミリーに関係なく提供するCNGアッセイの性能を実証するものである。他の薬理学分析とのそれらの関連性を例示するために、試験された3つのGPCRの用量反応曲線を図15に示した。
[無差別共役のGタンパク質及びGタンパク質キメラを用いたアッセイと比較したCNGチャンネルアッセイの有効性]
以前には、細胞内カルシウムの上昇を測定するのに、無差別共役のGタンパク質Gα16及びGタンパク質キメラGαqsを用いたカルシウム蛍光アッセイが使用されてきた。しかし、Gα16又はGαqsのいずれを用いたGPCR活性化測定も間接的である。何故なら、それらは両方とも、一部のGs共役GPCRの活性を、ホスホリパーゼCに媒介された細胞内カルシウムの上昇に再転換するためである。Gα16及びGαqsの共役効率は、Gs共役GPCR相互で異なるので、最終的なカルシウムシグナルリードアウトは受容体相互で異なっている。
[CNGチャンネルアッセイを適用した、GPCRの作動薬及び拮抗薬の同定]
CNGチャンネルアッセイは、GPCRリガンドを同定するのに用いることができる。この実施例では、β−アドレナリン受容体の作動薬又は拮抗薬である化合物を求めて、アドレナリン様化合物のパネルを探索するのに、CNGチャンネルアッセイを用いた。CNGチャンネル遺伝子(配列番号7)を発現する安定的に形質転換されたHEK293H細胞を96ウェルプレートに播種し、上記の実施例に記載した通りに培養した。図17Bに示す通り、96ウェルプレートのカラム1〜11に試験化合物のアレイをつくり、カラム12は、対照として緩衝液のみにした。記録開始の20秒後に、最終濃度1μMの試験化合物を細胞プレートに添加した。cAMPの上昇を誘起するために、開始120秒後に最終濃度10μMのイソプロテレノールを添加した。記録の継続時間は230秒であった。作動薬は、試験化合物の添加直後、かつイソプロテレノールの添加前における蛍光の増大を検出することによって同定した。図17Aにおいて、それらには中空の円で印が付けられている。拮抗薬は、イソプロテレノール刺激に対する細胞の反応の遅延又は消失によって同定し、図17Aでは中実の正方形によって印が付けられている。
[エンドポイントアッセイ]
CNGチャンネルアッセイは、エンドポイントアッセイを行うのに用いることもできる。CNGチャンネルの脱感作から引き起こされる蛍光反応の衰退は、細胞外カルシウムをEGTAでキレート化すること、及びホスホジエステラーゼの阻害剤を補足することによって効果的に排除された。CNGチャンネル遺伝子を発現する安定的に形質転換された細胞を384ウェルプレートに播種し、上記の実施例に記載した通りに培養した。フォルスコリンは、最終濃度30μMのEGTAを含有する化合物緩衝液中に溶解させた。フォルスコリン又は化合物緩衝液のみでインキュベートされた細胞の蛍光強度は、フォルスコリン刺激後の様々な時点に、FLEXstation(Molecular Devices社)を用いて測定した。フォルスコリンで処理したことによって、刺激の90分後に、5.3±0.5×105RFU(30μMフォルスコリン、n=192)の蛍光強度がもたらされたが、これは、1.9±0.1×105RFU(緩衝液対照、n=192)に対して、2.8倍の増大を表す。
[蛍光クエンチャーの同定]
色素クエンチャー(表1)の事前選択は、概して、それらの物理化学的特性、すなわち、(1)水溶性であること、(2)吸収スペクトルが蛍光指示薬の発光スペクトルと重なること、(3)自発蛍光が低いこと、及び、(4)細胞から完全に排除されること、すなわち細胞内の蛍光に影響を与えないことに基づいている(Sahlinら、1983年)。吸光色素クエンチャーによる細胞外蛍光の効果的な消光は、0.1〜10mMの濃度で実現される(図18)(Sahlinら、1983年、「Differentiation between attached and ingested immune complexes by a fluorescence quenching cytofluorometric assay」、J.Immunol.Methods 60:115−124;Wanら、1993年、「A rapid and simple microfluorometric phagocytosis assay」、J.Immunol.Methods 162:1−7)。正に帯電した色素は、負に帯電した蛍光電位色素であるHLB30602に対して、無細胞溶液中で大きな消光効果を有する(表2)。しかし、多くのクエンチャーは、細胞によってそれらが十分に排除されないため、細胞ベースのアッセイでの使用に適さない(Sahlinら、1983年)。例えば、知られている多数の正帯電色素クエンチャーの存在下では、細胞反応が完全に失われた(図19)。本発明の前には、細胞ベースのアッセイに対する干渉がほとんどないか、あるいは全くないクエンチャー色素を、その色素の分子構造又はその物理化学特性に基づいて選択するには、どうすればよいか知られていなかった。
[CNGチャンネル孔変異]
網膜及び嗅覚器組織からのCNGチャンネルは、タンパク質レベルで高い相同性を有する。しかし、それらのCNGチャンネルは、特異性が大きく異なり、それぞれcGMP又はcAMPに主として反応する。網膜のCNGチャンネルに関して発表されたいくつかの構造−機能研究によって、これらの特異性に影響を与える単一部位変化が開示された。他の論文は、活性化されたチャンネルを通過するイオンのアイデンティティ、又は環状ヌクレオチドに対するチャンネルの感度に影響を与える他の位置及び変化を開示した。これらの変化は、cAMPに対する特異性及び感度、並びに、ハイスループットスクリーニングでcAMPセンサーとして適用するための有効性を強化する試みにおいて、ラット嗅覚チャンネルCNGA2(以前には、rOCNC1と呼ばれた)に、変異の組合せを導入するための手引きを提供するものであった。選択された部位か、又はアミノ酸変化のアイデンティティのいずれかが、ラットCNGA2チャンネルでも、記載されたものと同様に機能するであろうかどうかは自明なことではなかった。また、それらの多重突然変異が、協調して機能することによって、望ましい累積的な効果が得られる、望ましい個別の効果を有する変異が同定されたかどうかも自明ではなかった。
[Gi共役GPCRのアッセイ及びGs−iキメラの使用]
Gi共役受容体は、全GPCRの約45%を構成し、これは、HTSアッセイを開発するのが最も困難な受容体のグループでもある。Gi受容体はcAMP濃度を下方制御するので、それらの活性化を検出するアッセイは、通常、フォルスコリン又はGs共役受容体の活性化によるcAMPの上方制御の抑制に基づく。この上方制御/下方制御の均衡は、微妙であり、かつ受容体に依存するものであり、その結果、現在のcAMPアッセイでは、Gi受容体活性化のための適切な検出ウィンドウが得られないことが多い。Gi共役GPCRの伝統的な機能性cAMPアッセイは、通常、アデニリルシクラーゼ(AC)をフォルスコリンで刺激するか、Gs共役受容体をその作動薬で活性化して、その後、cAMP濃度を低下させるために、Gi共役受容体を活性化することによって行う。この種のアッセイは、受容体の活性化が、高レベルに活性化された蛍光シグナルを引き戻すものであるので、比喩的に「逆向アッセイ」と呼ばれる。本発明者らのリアルタイムcAMPアッセイは、AC活性化と、それに続くDRD2受容体活性化との全過程の毎秒おきの検査を可能にした(図28A)。PDE阻害剤なしで、細胞をフォルスコリンによって刺激し、その後、ドーパミンを添加した。ドーパミンの添加は、フォルスコリンで誘導された蛍光シグナルを直ちに低下させ、約7分以内にフォルスコリンの前のレベル近くまで引き戻す(図28A)。図28Aは、96ウェルプレート中で、FLEXstationプレートリーダーを用いて測定されたCNG−DRD2細胞系のドーパミンに対する動態反応を示す。1μMのドーパミンに対する最大反応には、約400秒以内に到達した。
[蛍光活性化細胞選別装置(FACS)へのCNG cAMPアッセイの適用]
FACS分析及び細胞選別は、臨床研究及び基礎研究の両方で広範に使用されている。セカンドメッセンジャーであるcAMPの測定は、抗原、ホルモン、及び他の様々な化学的刺激及び物理的刺激に対する、細胞の生物反応の迅速な機能アッセイを提供できる。現在のところ生存細胞の中のcAMP濃度をFACSを用いて測定するのに利用できるいかなる有効なアプローチも存在せず、また、cAMPのための小分子指示体もない。さらに、伝統的なcAMP競合イムノアッセイは、単一細胞に対して感受性をもたず、細胞を溶解させる必要があるので、FACSには適用することができない。従って、ここでは、cAMPセンサーとしてのCNGチャンネルの使用と、カルシウム色素及び膜電位色素の使用とを併用する方法を記述する。細胞の[Ca2+]i及び膜電位のモニターにFACSを用いるプロトコールは確立されており、CNGチャンネル活性をモニターするために、容易に採用することができる(Lazzarら、1986年、J Biol Chem、261:9710−9713;Shapiro、2000年、Methods、21:271−279)。
[CNGチャンネル技術を用いた、受容体脱オーファン化及び化合物プロファイリングのための、Gs、Gi、及びGq GPCRの同時スクリーニング]
750を超えるヒトGPCR遺伝子のうち、少なくとも367が内因性リガンドに結合すると予測されている。このグループの中では、224のGPCRに関してリガンドが同定されており、リガンドも機能も知られていない、残り143のオーファン受容体が残されている(Vassilatisら、2003年、Vassilatis DK、「The G protein−coupled receptor repertoires of human and mouse」、Proc Natl Acad Sci USA;2003年;100:4903−4908)。市販されている全薬物のうち約40%が、わずか30のGPCRを標的としたものなので、機能の特徴付けが行われていないGPCRのプールの中には、まだ相当数の潜在的にドラッガブルなGPCR標的が存在すると推論するのが合理的である。従って、受容体脱オーファン化[オーファン受容体のリガンド(作動薬又は拮抗薬)、共役Gタンパク質、及び機能の同定]を可能にするアッセイが、創薬において活発に探求されている。本明細書に記載したCNG技術は、普遍的なカルシウムリードアウトフォーマットによるオーファンGPCR受容体のスクリーニングを可能にする新規かつ有利なツールを代表するものである。
Claims (54)
- 変異型の環状ヌクレオチド作動性(CNG)チャンネルをコードする配列を含む単離されたポリヌクレオチドであって、
(a)2価のカチオンに媒介された、カチオン流動の遮断、を低減する少なくとも1つの変異と、
b)チャンネルを、変異を含まないチャンネルよりもcAMPに対して高感度にする少なくとも1つの変異と、
を含む単離されたポリヌクレオチド。 - 前記CNGチャンネルは、CNGA2である、請求項1記載の単離されたポリヌクレオチド。
- 前記CNGA2チャンネルは、ラットCNGA2である、請求項2記載の単離されたポリヌクレオチド。
- 2価カチオンに媒介されたカチオンの遮断を低減する前記少なくとも1つの変異は、E342G及びE342Nからなる群から選択される、請求項3記載の単離されたポリヌクレオチド。
- チャンネルを、変異を含まないチャンネルよりもcAMPに対して高感度にする前記少なくとも1つの変異は、C460R、C460H、及びE583Lからなる群から選択される、請求項3記載の単離されたポリヌクレオチド。
- プロモーターに作動可能に連結した請求項1記載の単離されたポリヌクレオチド、を含むベクター。
- 前記ベクターは、発現プラスミド、レトロウイルス、及びアデノウイルスからなる群から選択される、請求項6記載のベクター。
- 請求項1記載の単離されたポリヌクレオチドを含む第1の核酸、を含む宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、BHK細胞、マウスL細胞、ジャーカット細胞、153DG44細胞、HEK細胞、CHO細胞、PC12細胞、ヒトTリンパ球細胞、Cos−7細胞、及び初代培養細胞からなる群から選択される、請求項8記載の宿主細胞。
- 前記単離されたポリヌクレオチドは、宿主染色体に安定的に組み込まれている、請求項8記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、少なくとも第1の内在性GPCRを発現する、請求項8記載の宿主細胞。
- 第2のポリヌクレオチドに作動可能に連結したプロモーターを含む第2の核酸をさらに含み、
前記第2のポリヌクレオチドは、異種のGタンパク質共役受容体(GPCR)をコードする配列を含む、
請求項11記載の宿主細胞。 - 前記内在性GPCRは、過剰発現している、請求項11記載の宿主細胞。
- 前記第1の核酸及び前記第2の核酸は、1個の分子又は異なった分子、の一部である、請求項12記載の宿主細胞。
- 前記第1の核酸及び前記第2の核酸のうち少なくとも1つは、ウイルス及びプラスミドからなる群から選択される、請求項12記載の宿主細胞。
- 前記第1の核酸及び前記第2の核酸のうち少なくとも1つは、細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、請求項12記載の宿主細胞。
- 前記第1の核酸及び前記第2の核酸のうち少なくとも1つは、細胞のゲノムの一部ではない、請求項12記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、哺乳動物の細胞である、請求項11記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、BHK細胞、マウスL細胞、ジャーカット細胞、153DG44細胞、HEK細胞、CHO細胞、PC12細胞、ヒトTリンパ球細胞、Cos−7細胞、及び初代培養細胞からなる群から選択される、請求項18記載の宿主細胞。
- 前記環状ヌクレオチド作動性チャンネルは、変異型CNGチャンネルであり、
チャンネルを、その変異を含まないチャンネルよりcAMPに対して高感度にする少なくとも2つの変異を含む、
請求項11記載の宿主細胞。 - 前記環状ヌクレオチド作動性チャンネルは、変異型CNGチャンネルであり、
チャンネルを、その変異を含まないチャンネルよりcAMPに対して高感度にする少なくとも3つの変異を含む、
請求項20記載の宿主細胞。 - 前記CNGチャンネルは、CNGA2である、請求項8記載の宿主細胞。
- 前記CNGA2チャンネルは、ラットCNGA2である、請求項22記載の宿主細胞。
- 2価カチオンに媒介されたカチオンの遮断を低減する前記少なくとも1つの変異が、E342G及びE342Nからなる群から選択される、請求項23に記載の宿主細胞。
- チャンネルを、変異を含まないチャンネルよりcAMPに対して高感度にする前記少なくとも1つの変異は、C460R、C460H、及びE583Lからなる群から選択される、請求項24記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、CNGA4及びCNG4.3からなる群から選択される少なくとも1つの付加的なCNGサブユニットをさらに発現する、請求項8記載の宿主細胞。
- 前記第2のポリヌクレオチドは、変異導入又は末端切除された、Gタンパク質共役受容体をコードする配列、を含む、請求項12記載の宿主細胞。
- 第3のポリヌクレオチドに作動可能に連結したプロモーターを含む第2の核酸をさらに含み、
前記第3のポリヌクレオチドは、前記少なくとも1つの内在性GPCRと相互作用するGタンパク質をコードする配列を含む、
請求項11記載の宿主細胞。 - 第3のポリヌクレオチドに作動可能に連結したプロモーターを含む第3の核酸をさらに含み、
前記第3のポリヌクレオチドは、前記内在性GPCR及び異種GPCRのうちの少なくとも1つと相互作用するGタンパク質をコードする配列を含む、
請求項12に記載の宿主細胞。 - 前記Gタンパク質は、Gs、Gi、Gq、Golf、Go、G12、及びGs−iキメラGタンパク質からなる群から選択される、請求項28記載の宿主細胞。
- キメラGタンパク質、異種Gタンパク質、及び異種アデニリルシクラーゼをコードする配列を含む少なくとも1つのポリヌクレオチドをさらに含む、請求項11又は12記載の宿主細胞。
- 前記ポリヌクレオチドをコードする配列のうち少なくとも2つは、単一のベクター上にある、請求項31記載の宿主細胞。
- 前記ベクターは、プラスミド又はウイルスからなる群から選択される、請求項32記載の宿主細胞。
- 前記アデニリルシクラーゼは、アデニリルシクラーゼタイプV及びタイプVIからなる群から選択される、請求項31記載の宿主細胞。
- cAMPの細胞内濃度の変化を検出する方法であって、
(a)請求項1記載のポリヌクレオチドを細胞に発現させるステップと、
(b)チャンネルの活性を測定するステップと、
を含み、
前記チャンネルの活性は、細胞内cAMP変化を示す、方法。 - 前記活性は、膜電位指示体及びカチオン感受性指示体からなる群から選択される指示体を用いて測定される、請求項35記載の方法。
- 前記指示体は、蛍光指示体及び発光指示体からなる群から選択される、請求項36記載の方法。
- 前記カチオンは、カルシウム、ナトリウム、及びカリウムからなる群から選択される、請求項36記載の方法。
- 前記方法は、マイクロプレートアッセイ、細胞イメージング分析、FACS分析、放射性同位元素分析、及び電子生理学プラットホームからなる群から選択される、請求項35記載の方法。
- GPCRの活性を検出する方法であって、
(a)請求項11又は12記載の宿主細胞に、CNGチャンネル及びGPCRを発現させるステップと、
(b)前記チャンネルの活性を測定するステップと、
を含み、
前記チャンネルの活性は、GPCRの活性を示す、方法。 - 受容体のリガンドを同定する方法であって、
(a)前記受容体及び請求項1記載の変異型のCNGチャンネルを発現している細胞を化合物と接触させるステップと、
(b)前記CNGチャンネルの活性化を測定するステップと
を含み、
前記CNGチャンネルの活性化は、前記化合物が前記受容体のリガンドであることを示す、方法。 - GPCRによって媒介された活性を調節する薬剤を同定する方法であって、
(a)請求項11記載の宿主細胞を、前記薬剤及び前記受容体のリガンドと接触させるステップと、
(b)CNGチャンネルの活性化を測定するステップと、
を含む方法。 - (c)前記CNGチャンネルの活性化を、前記薬剤の非存在下における前記チャンネルの活性化と比較するステップ、をさらに含み、
前記CNGチャンネルの活性化の相違は、前記薬剤が前記活性を調節することを示す、請求項43記載の方法。 - 請求項8記載の細胞を含有する容器、を含むキット。
- 緩衝液、塩、クエンチャー、及び指示体からなる群から選択される少なくとも1つの試薬をさらに含む、請求項44記載のキット。
- 電位感受性指示体及びカチオン感受性指示体からなる群から選択される少なくとも1つの指示体をさらに含む、請求項45記載のキット。
- 前記クエンチャーは、ニトラジンイエロー及びニトロレッドからなる群から選択される、蛍光色素及びクエンチャーの調合物。
- 前記調合物は、生存細胞ベースのアッセイで使用される、請求項47記載の蛍光色素及びクエンチャーの調合物。
- 前記蛍光色素は、膜電位色素及びカルシウム色素からなる群から選択される、請求項47記載の調合物。
- 前記カルシウム色素は、Fluo3、Fluo4、及びFura−2からなる群から選択される、請求項49記載の調合物。
- 請求項47記載の蛍光色素及びクエンチャーの調合物を用いた、CNGチャンネルの活性を検出する方法であって、
(a)前記蛍光色素及びクエンチャーの調合物の存在下において、細胞にCNGを発現させるステップと、
(b)CNGチャンネルの活性を測定するステップと、
を含み、
蛍光レベルの変化は、前記CNGチャンネルの活性を示す、方法。 - 前記蛍光レベルは、CNGチャンネル活性に反応して上昇又は低下する、請求項51記載の方法。
- 請求項47記載の蛍光色素及びクエンチャーの調合物を用いた、GPCRの活性を検出する方法であって、
(a)前記蛍光色素及びクエンチャーの調合物の存在下において、内在性又は異種のGPCRを細胞に発現させるステップと、
(b)CNGチャンネルの活性を測定するステップと
を含み、
蛍光レベルの変化は、前記CNGチャンネルの活性を示し、
それによって、前記GPCRの活性を示す、方法。 - 生物学的に不活性の蛍光クエンチャーを同定する方法であって、
(a)候補クエンチャー分子のコレクションを準備するステップと、
(b)少なくとも5つの受容体のパネルを提供するステップであり、
前記受容体は、少なくとも3つのタイプから選択され、
生体内アミン、アデノシン、脂質、アルカロイド、アミノ酸、ペプチド、及びタンパク質を含めたファーマコフォアによって識別されるステップと、
(c)活性化ファーマコフォアの存在下、並びに候補クエンチャー分子の前記コレクションのメンバーの存在下及び非存在下で、前記受容体の活性をアッセイするステップと、
を含み、
生物学的に不活性の蛍光クエンチャーは、受容体の前記パネルの活性化に対して影響を及ぼさない、方法。
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