JP2003144176A

JP2003144176A - 遺伝子多型の検出方法

Info

Publication number: JP2003144176A
Application number: JP2001395196A
Authority: JP
Inventors: Yusuke Nakamura; 祐輔中村; Akihiro Sekine; 章博関根; Aritoshi Iida; 有俊飯田; Osamu Saito; 督斎藤
Original assignee: RIKEN
Current assignee: RIKEN
Priority date: 2000-12-27
Filing date: 2001-12-26
Publication date: 2003-05-20
Also published as: US20040072156A1; US20070105128A1

Abstract

(57)【要約】【課題】遺伝子多型の検出方法の提供。【解決手段】薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に存
在する遺伝子多型情報から、該遺伝子多型部位を含むよ
うに、又は薬物代謝酵素をコードする遺伝子を増幅した
ときの増幅断片中に前記遺伝子多型部位が含まれるよう
に、オリゴヌクレオチドプローブ及び/又はオリゴヌク
レオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオ
チドプローブ及び/又はオリゴヌクレオチドプライマー
を用いて、目的の薬物代謝酵素をコードする遺伝子中の
少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とす
る遺伝子多型の検出方法。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【発明の属する技術分野】本発明は、遺伝子多型情報、
遺伝子多型情報の検出方法、遺伝子多型を用いた薬物の
評価方法、及び薬物のスクリーニング方法に関する。

【０００２】

【従来の技術】ヒトの姿形が千差万別であるように、30
億からなる遺伝暗号も個人間で比較するとかなり多くの
部位で異なっている。この遺伝暗号の違いを遺伝子多型
（ポリモルフィズム）と呼んでおり、代表的な遺伝子多
型として一塩基多型が知られている。

【０００３】一塩基多型（SNP:single nucleotide poly
morphism）とは、個人間における１遺伝暗号の違いを意
味する。ヒトの顔貌や体型が千差万別であるように、遺
伝暗号である塩基配列も一人ひとりかなり多くの部位で
異なっている。SNPは、その存在する位置によってcSNP
(coding SNP)とgSNP(genome SNP)に分類され、cSNPに
は、さらにsSNP(silent SNP)、rSNP(regulatory SNP)及
びiSNP(intron SNP)が含まれる。

【０００４】上記SNPは、多型マーカーとしての疾患の
発症や増悪に関連する遺伝子を見つけるために有用であ
り、最終的に臨床分野において疾患のリスク診断や薬剤
の使い分けなどに直接関係する。また、疾患の原因とな
っている物質を標的分子とした証拠に基づく薬剤開発
は、世界的趨勢となっている。ある疾患に対して薬剤を
投与した場合、患者の応答性は様々であり、著効を示す
もの、有効性の低いもの、全く効果を示さないもののよ
うに、薬剤に対する応答性には大きな違いがある。これ
は、症状が同じで同じ診断名であっても、その背景とな
っている疾患を起こしている経路が異なっていたり、あ
るいは薬剤の代謝速度が大きく異なっている可能性があ
るからである。従って、SNPなど遺伝子多型を参考にし
ながら、目的の疾患に応じた薬物の選択、治療法の開発
（いわゆるオーダーメイド医療）が望まれる。

【０００５】薬剤に対する応答性に加えて、時には致死
的となるような強い副作用の問題も、医療従事者が対処
していかなければならない大きな問題の一つである。こ
れは、処方ミスなどによる過剰投与がなくても、時には
思わぬ致死的な副作用に遭遇することがある。従って、
薬剤の応答性に対しては、薬剤の代謝、薬剤の輸送、薬
剤のレセプターなどによる薬剤応答性や副作用の強さ
を、SNPなどの遺伝子多型を参考にしながら決定するこ
とが望まれる。

【０００６】

【発明が解決しようとする課題】本発明は、遺伝子多型
情報の検出方法とその情報に基づく薬物の有効性並びに
安全性を評価するための方法、及び薬物のスクリーニン
グ方法を提供することを目的とする。

【０００７】

【課題を解決するための手段】本発明者は、上記課題を
解決するため鋭意研究を行った結果、薬物代謝酵素をコ
ードする遺伝子中の遺伝子多型を見出し、これを用いて
薬物と疾患との因果関係を評価することに成功し、本発
明を完成するに至った。

【０００８】すなわち、本発明は以下の通りである。 (1) 薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に存在する遺伝
子多型情報から、該遺伝子多型部位を含むように、又は
薬物代謝酵素をコードする遺伝子を増幅したときの増幅
断片中に前記遺伝子多型部位が含まれるように、オリゴ
ヌクレオチドプローブ及び/又はオリゴヌクレオチドプ
ライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプロー
ブ及び/又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、
目的の薬物代謝酵素をコードする遺伝子中の少なくとも
１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多
型の検出方法。

【０００９】遺伝子多型部位を含むオリゴヌクレオチド
プローブ及び/又はオリゴヌクレオチドプライマーとし
ては、その5'末端若しくは3'末端又は中央の塩基が当該
遺伝子多型部位となるように作製されたものが挙げられ
る。また、薬物代謝酵素をコードする遺伝子とハイブリ
ダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合
したものであって、前記遺伝子多型部位が、当該ハイブ
リダイズし得る断片の5'末端又は3'末端であるものも、
遺伝子多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブに含
まれる。さらに、配列番号１〜4309に示す塩基配列のう
ち第21番目の塩基を含む少なくとも13塩基の配列又はこ
れに相補的な配列を有するものからなる群から選択され
る少なくとも１つのヌクレオチドも、遺伝子多型部位を
含むオリゴヌクレオチドプローブ及び/又はオリゴヌク
レオチドプライマーに含まれる。上記遺伝子多型として
は、一塩基多型、複数個の塩基の欠失、置換若しくは挿
入による多型、又はVNTR若しくはマイクロサテライトに
よる多型が挙げられる。

【００１０】(2) 前記検出方法により得られた検出結果
から、当該薬物代謝酵素によって代謝される薬物の有効
性及び安全性を評価することを特徴とする薬物の評価方
法。 (3) 前記評価方法により得られた評価を指標として、使
用すべき薬物を選択することを特徴とする薬物のスクリ
ーニング方法。 (4) 薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に含まれる遺伝
子多型情報と、被験者から採取した当該薬物代謝酵素を
コードする遺伝子の遺伝子多型情報とを比較して、当該
薬物代謝酵素によって代謝される薬物の有効性及び/又
は安全性を解析し、得られる解析結果から使用すべき薬
物を選択することを特徴とする薬物のスクリーニング方
法。

【００１１】上記検出方法、評価方法又はスクリーニン
グ方法において、遺伝子多型情報としては、表１に示さ
れるものを、また、薬物代謝酵素としては、エポキシド
ハイドロラーゼ、メチルトランスフェラーゼ、N-アセチ
ルトランスフェラーゼ、スルホトランスフェラーゼ、キ
ノンオキシドレダクターゼ、グルタチオン-S-トランス
フェラーゼ、UDP-グリコシルトランスフェラーゼ、アル
デヒドデヒドロゲナーゼ、アルコールデヒドロゲナー
ゼ、エステラーゼ、NDUF、チトクロームp450（CYP）及
びATP-結合カセット/トランスポーターからなる群から
選択される少なくとも１つを例示することができる。 (5) 配列番号１〜4309に示される塩基配列又はこれに相
補的な塩基配列からなる群から選択されるオリゴヌクレ
オチド。 (6) 薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に存在する遺伝
子多型情報から、該遺伝子多型部位を含むように作製さ
れたオリゴヌクレオチド。

【００１２】上記オリゴヌクレオチドとしては、その5'
末端若しくは3'末端又は中央の塩基が、当該遺伝子多型
部位となるように作製されたものが挙げられる。また、
薬物代謝酵素をコードする遺伝子とハイブリダイズし得
る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したオリゴ
ヌクレオチドであって、前記遺伝子多型部位が、当該ハ
イブリダイズし得る断片の5'末端又は3'末端となるよう
に作製されたオリゴヌクレオチドも、本発明のオリゴヌ
クレオチドに含まれる。さらに、配列番号１〜4309に示
すいずれかの塩基配列のうち第21番目の塩基を含む少な
くとも13塩基の配列又はこれに相補的な配列を有するも
のも、本発明のオリゴヌクレオチドに含まれる。 (7) 前記オリゴヌクレオチドを含む遺伝子多型検出用キ
ット。以下、本発明を詳細に説明する。

【００１３】

【発明の実施の形態】本発明は、薬物代謝酵素に関する
遺伝子多型情報を用いて、被検対象の遺伝子多型を検出
する方法に関する。また、本発明は、薬物代謝酵素によ
って代謝される薬物の有効性及び安全性の有無又は強弱
を解析することを特徴とし、この解析結果により、疾患
と薬物との関係を評価するものである。複数人が同じ疾
患に罹患している場合であっても、薬物代謝酵素遺伝子
の遺伝子多型情報は個々の患者ごとに異なることが多
い。従って、その異なる遺伝子多型情報から薬物代謝と
の関係を導き、どのような遺伝子多型情報を有する場合
に特定の薬物の有効性が認められるのか認められないの
か、また、どのような遺伝子多型情報を有する場合に副
作用が出やすいのか出にくいのか、その薬物の有効性及
び/又は安全性を評価する。その結果、ある疾患に対し
てどのような薬物を使用すべきなのか、遺伝子多型情報
からそれぞれの患者ごとに適した投薬（オーダーメイド
医療）が可能となる。

【００１４】１．遺伝子多型遺伝子多型には、一塩基多型、インサーション/デリー
ション型多型、及び塩基配列の繰り返し数が異なってい
ることにより生じる多型が含まれる。一塩基多型（SN
P）とは、一般にはある遺伝子領域の特定の1個の塩基が
他の塩基に置換することによる多型を意味するが、本発
明においては、上記置換による多型のほか、当該1個の
塩基が欠失したことによる多型、当該1個の塩基にさら
に1個の塩基が挿入したことによる多型も含めることと
する。また、インサーション/デリーション型多型と
は、複数の塩基（例えば2個〜数十塩基）が欠失や挿入
をしていることによる多型をいい、数百塩基〜数千塩基
が欠失や挿入されているものも存在する。さらに、塩基
配列の繰り返し数が異なっていることにより生じる多型
は、２〜数十塩基の配列が繰り返されており、その繰り
返し回数が個人間で異なっているものをいう。繰り返し
の単位が数塩基から数十塩基のものをVNTR(variable nu
mber of tandem repeat)といい、２〜４塩基単位程度の
ものをマイクロサテライト多型という。VNTRやマイクロ
サテライト多型においては、この繰り返し回数の違いが
個々人のアレル（対立遺伝子）で異なることにより、バ
リエーションを獲得している。

【００１５】２．薬物代謝酵素「薬物代謝酵素」とは、医薬品を含む外来性異物の生体
内における構造変換を触媒する酵素群の総称である。ま
た、一部の内在性物質であっても、治療目的で投与され
る場合にはその代謝に関わる酵素群のことを指す。薬物
代謝酵素は、薬物の吸収、代謝、排泄に関わるものであ
るため、その酵素の多型はその酵素の発現量（転写や翻
訳）や活性を変化させ、結果として未変化体や代謝物の
血中濃度などに違いが生じる。本発明において、遺伝子
多型解析の対象となる遺伝子により発現される薬物代謝
酵素としては、以下のものが挙げられる。

【００１６】エポキシドハイドロラーゼ(epoxide hydro
lase) メチルトランスフェラーゼ(methyltransferase) N-アセチルトランスフェラーゼ(N-acetyltransferase) スルホトランスフェラーゼ(sulfotransferase) キノンオキシドレダクターゼ(quinone oxidereductase) グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(glutathione S-tr
ansferase) UDP-グリコシルトランスフェラーゼ(UDP-glycosyltrans
ferase) アルデヒドデヒドロゲナーゼ(aldehyde dehydrogenase) アルコールデヒドロゲナーゼ(alcohol dehydrogenase) エステラーゼ (esterase) ユビキノンデヒドロゲナーゼ(ubiquinone dehydrogenas
e：NDUF) チトクローム P450 (CYP) ATP-結合カセット(ATP-binding cassette) /トランスポ
ーターその他の酵素

【００１７】(1) エポキシドハイドロラーゼは、エポキ
シドをトランス開裂機構で加水分解し、1,2-グリコール
を生成させる酵素であり、例えばミクロソームエポキシ
ドハイドロラーゼ1、細胞質エポキシドハイドロラーゼ2
などが含まれる。 (2) メチルトランスフェラーゼは、アミノ基、水酸基、
チオール基などにメチル基転移を触媒する酵素であり、
例えば以下のものが挙げられる。カテコール-O-メチルトランスフェラーゼヒスタミン N-メチルトランスフェラーゼフェニルエタノールアミンN-メチルトランスフェラーゼホスファチジルエタノールアミンN-メチルトランスフェ
ラーゼニコチンアミドN-メチルトランスフェラーゼグアニジノアセテートN-メチルトランスフェラーゼアセチルセロトニン-O-メチルトランスフェラーゼ

【００１８】(3) N-アセチルトランスフェラーゼは、ア
ミノ基、スルホンアミド基、ヒドラジン基にアセチル基
転移を触媒する酵素であり、例えば以下のものが挙げら
れる。アリールアミンN-アセチルトランスフェラーゼ1、2 アリールアルキルアミン N-アセチルトランスフェラー
ゼサッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisia
e)のN-アセチルトランスフェラーゼ相同体 L1 細胞接着分子

【００１９】(4) スルホトランスフェラーゼは、硫酸抱
合に関与し、フェノール類、ステロイド類、アリールア
ミン、胆汁酸などに硫酸基転移を触媒する酵素であり、
例えば以下のものが挙げられる。スルホトランスフェラーゼ1A1、1A2、1A3、1C1、1C2、2
A1、2B1 甲状腺ホルモンスルホトランスフェラーゼチロシルタンパク質スルホトランスフェラーゼ1、２スルホトランスフェラーゼ-関連タンパク質3 エストロゲンスルホトランスフェラーゼセレブロシドスルホトランスフェラーゼ HNK-スルホトランスフェラーゼ-1 炭水化物スルホトランスフェラーゼ２、４、５カルボハイドレートスルホトランスフェラーゼ-1、３

【００２０】(5) キノンオキシドレダクターゼは、キ
ノン類のo-キノンやp-キノンの還元を触媒する酵素であ
り、例えば以下のものが挙げられる。 NAD(P)H: キノンオキシドレダクターゼ１ NRH: キノンオキシドレダクターゼ２キノンオキシドレダクターゼ相同体のp53誘導遺伝子３ (6) グルタチオン-S-トランスフェラーゼは、グルタチ
オンとの抱合を触媒する酵素であり、例えば以下のもの
が挙げられる。グルタチオン-S-トランスフェラーゼMu1、Mu2、Mu3、Mu
4、Mu5 グルタチオン-S-トランスフェラーゼΖ１(zeta) グルタチオン-S-トランスフェラーゼΠ(pi) グルタチオン-S-トランスフェラーゼT１(zeta) グルタチオン-S-トランスフェラーゼシータ1(theta
1)、シータ2 ミクロソームグルタチオン-S-トランスフェラーゼ1 ミクロソームグルタチオン-S-トランスフェラーゼ1-様1 ミクロソームグルタチオンＳトランスフェラーゼＴ２、
Ｔ３グルタチオン-S-トランスフェラーゼ A１、A4 グルタチオン-S-トランスフェラーゼ M１、M２、M3、M
４

【００２１】(7) UDP-グリコシルトランスフェラーゼ
は、第I相薬物代謝経路である水酸基、カルボキシル
基、アミノ基、チオール基などの官能基導入後にその官
能基にグルクロン酸供与を触媒する酵素であり、例えば
以下のものが挙げられる。 UDP-グリコシルトランスフェラーゼ1ファミリーポリペ
プチドA1 UDP-グリコシルトランスフェラーゼ2ファミリーポリペ
プチドA1, B7, B10, B4, B11, B15, B17 UDP-グリコシルトランスフェラーゼ8 ドリシル-ジホスホオリゴサッカライド-タンパク質グリ
コシルトランスフェラーゼ

【００２２】(8) アルデヒドデヒドロゲナーゼは、アル
デヒドをカルボン酸に変換する酵素であり、例えばアルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリーメンバー
A1、A2、A3 アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリーメンバー
B1 フォルミルテトラヒドロフォレートデヒドロゲナーゼアルデヒドデヒドロゲナーゼ２アルデヒドデヒドロゲナーゼ３ファミリーメンバー
A1、A2 アルデヒドデヒドロゲナーゼ３ファミリーメンバー
B1、B2 アルデヒドデヒドロゲナーゼ５ファミリーメンバー
A1 アルデヒドデヒドロゲナーゼ６ファミリーメンバー
A1 アルデヒドデヒドロゲナーゼ８ファミリーメンバー
A1 アルデヒドデヒドロゲナーゼ９ファミリーメンバー
A1などが含まれる。

【００２３】(9) アルコールデヒドロゲナーゼは、アル
コールをアルデヒド又はケトンに変換する酵素であり、
例えば以下のものが挙げられる。アルコールデヒドロゲナーゼ1〜7 ヒドロキシ-CoAデヒドロゲナーゼ短鎖アルコールデヒドロゲナーゼファミリー遺伝子 (10) エステラーゼは、エステル部分を加水分解する酵
素であり、例えば以下のものが挙げられる。アリールアセトアミドデアセチラーゼグランザイムA（granzyme A）グランザイムB インターロイキン17（サイトトキシック Tリンパ球
アソ-シエイトセリンエステラーゼ8）ユビキチンカルボキシル−ターミナルエステラーゼL1,
3 カルボキシルエステラーゼ1 リパーゼA エステラーゼD/ホルミルグルタチオンハイドロラーゼカルボキシルエステルリパーゼ（胆汁酢酸誘発リパー
ゼ）ドリシル-ジホスホオリゴサッカライド-タンパク質グリ
コシルトランスフェラーゼニューロパチーターゲットエステラーゼ

【００２４】(11) NDUF (ubiquinone dehydrogenase)
は、ミトコンドリアの呼吸鎖、すなわちエネルギー代謝
を担う酵素であり、例えば、 NADH-デハイドロゲナー
ゼ(ユビキノン)１αサブコンプレックス１〜３、５〜１
０ NADH-デハイドロゲナーゼ(ユビキノン)１α/βサブコン
プレックス１ NADH-デハイドロゲナーゼ(ユビキノン)１βサブコンプ
レックス３，５，７ NADH-デハイドロゲナーゼ(ユビキノン)Fe-S蛋白質１、
３、４、５、６、８ NADH-デハイドロゲナーゼ(ユビキノン)フラボプロテイ
ン１〜３などが含まれる。

【００２５】(12) CYP(チトクローム P450) は、第I相
薬物代謝を司り、薬物に酸素原子を導入する酵素であ
り、例えばチトクロームp450(CYP)1A1, CYP1A2, CYP1B
1,CYP2A6, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C18, CYP2C9, CYP2C1
9, CYP2E1, CYP2D6, CYP2E1, CYP2F1, CYP3A3, CYP3A
4, CYP3A5, CYP3A7, CYP3A43, CYP4A11, CYP4B1,CYP4F
2, CYP4F3, CYP4F8, CYP11B1, CYP17, CYP19, CYP21A2,
CYP27A1, CYP27B1などが含まれる。

【００２６】(13) ATP-結合カセット/トランスポーター
は、トランスポーターで薬物の吸収や組織内濃度を調節
するものであり、例えば以下のものが挙げられる。 ATP結合カセットサブファミリーAメンバー1、4、7、8 ATP結合カセットサブファミリーBメンバー1、4、7、8、
9、10、11 ATP結合カセットサブファミリーCメンバー1、2、3、4、
5、7、8、9 ATP結合カセットサブファミリーDメンバー1、3、4 ATP結合カセットサブファミリーGメンバー1、2、4、8 ATP結合カセットサブファミリーEメンバー1 ATP結合カセットサブファミリーFメンバー1 オーガニックアニオントランスポーター１、2、3 オーガニックアニオントランスポーターポリペプ
チド１、2、8 トランスポーター1 ATP結合カセットサブファミリー
B トランスポーター2 ATP結合カセットサブファミリー
B SLC２２A４ソリュートキャリアファミリー２２(オ
ーガニックカチオントランスポーター)メンバー4、 SLC22A5 ソリュートキャリアファミリー22（オーガ
ニックカチオントランスポーター）メンバー5 SLC22A1 ソリュートキャリアファミリー22（オーガ
ニックカチオントランスポーター）メンバー1 SLC22A2 ソリュートキャリアファミリー22（オーガ
ニックカチオントランスポーター）メンバー2 SLC10A2 ソリュートキャリアファミリー10（ナトリ
ウム/胆汁酸コトランスポーターファミリー）メン
バー2 SLC15A1 ソリュートキャリアファミリー15（オリゴ
ペプチドトランスポーター）メンバー1

【００２７】(14) その他の酵素には、ガンマ-グルタミ
ルトランスフェラーゼ１、トランスグルタミナーゼ１な
どが含まれる。３．遺伝子多型情報遺伝子多型情報は、一般的遺伝子多型検出法を利用して
得ることができる。例えば、PCRによる方法、アレル特
異的オリゴヌクレオチドを鋳型としてハイブリダイゼー
ションを行う方法（例えばTaqMan PCR法、インベーダー
法）、プライマー伸長反応を利用する方法、シークエン
ス法、MALDI-TOF/MS法、DNAチップ法等が採用される。
PCR法やシークエンス法はいずれの遺伝子多型の検出法
にも使用することができ、他の方法は、主としてSNPの
検出法に使用することができる。

【００２８】TaqMan PCR法とは、蛍光標識したアレル特
異的オリゴとTaq DNAポリメラーゼによるPCR反応とを利
用した方法である（Livak, K.J. Genet. Anal. 14, 143
(1999); Morris T. et al., J. Clin.Microbiol. 34,
2933 (1996)）。インベーダー法とは、SNPのそれぞれの
アレルに特異的な2種類のレポータープローブ及び1種類
のインベーダープローブの鋳型DNAへのハイブリダイゼ
ーションと、DNAの構造を認識して切断するという特殊
なエンドヌクレアーゼ活性を有する酵素によるDNAの切
断を組み合わせた方法である（Livak, K. J. Biomol. E
ng. 14, 143-149(1999); Morris T. et al., J. Clin.M
icrobiol. 34, 2933 (1996); Lyamichev, V. et al., S
cience, 260, 778-783 (1993)等）。

【００２９】また、プライマー伸長反応を利用する方法
として、例えばSniPer法を採用することもできる。SniP
er法とは、RCA(rolling circle amplification)法と呼
ばれる手法を基本原理とするものであり、環状の一本鎖
DNAを鋳型としてDNAポリメラーゼがその上を移動しなが
ら相補鎖DNAを連続して合成していくものである。この
方法によれば、DNA増幅が起こった場合に生じる発色反
応の有無を測定することによってSNPを判定する（Lizar
di, P. M. et al., Nature Genet., 19, 225-232 (199
8); Piated, A. S. et al., Nature Biotech., 16, 359
-363 (1998)）。

【００３０】シークエンス法とは、遺伝子多型を含む領
域をPCRにて増幅させ、Dye Terminatorなどを用いてDNA
配列をシークエンスすることで遺伝子多型（特に一塩基
多型）の頻度を解析する方法である。MALDI-TOF/MS法と
は、質量分析機（mass spectrmeter）を用いた方法で、
基本的には異なる一塩基の質量の違いを利用してSNPジ
ェノタイピングする方法である。PCR増幅を利用した方
法とmultiplexを利用した方法がある（Haff,L.A., Smir
nov,I.P., Genome Res.,7,378- (1997) ; Little, D.P.
et al. Eur. J. Clinica. Chem. Clin. Biochem., 35,
545- (1997) ; Ross, P., et al. Nat Biotechnol., 1
6, 1347- (1998)）

【００３１】DNAチップ法とは、ガラスなどの基盤上に
多種類のDNAプローブを整列化し、固定し、その上で標
識DNAのハイブリダイゼーションを行い、プローブ上の
標識（蛍光など）シグナルを検出する方法を利用して、
ハイブリダイゼーションで完全マッチと一塩基ミスマッ
チを分別検出する方法である。本発明の方法において使
用することができる遺伝子多型情報、特にSNP情報は表
１の通りである。

【００３２】

【表１】

【００３３】表１において、「遺伝子名」の欄には薬物
代謝酵素をコードする遺伝子名を記載した。「配列」の
欄においてアルファベット大文字で示した塩基がSNP情
報である。「/」を付した2つの塩基は、その塩基のホモ
又はヘテロのSNPを示す。例えば、「A/G」と表示した場
合は、アレルがA/A若しくはG/Gのホモ、又はA/Gのヘテ
ロであることを意味する。表中の配列は、SNPの前後20
塩基を示している。但し、括弧を付した塩基（例えばAB
CB4の第27番の（T）：配列番号555）はインサートによ
る多型を、Δ（例えばNAT2の第10番目：配列番号4255）
は1塩基の欠失による多型を意味する。また、括弧に数
字を付した塩基は、その括弧内の塩基がその数字の数だ
け繰り返されていることを意味する。例えば、配列番号
689の配列（表１、ABCB11の第55番）において「(T)9-1
2」とあるのは、Tが９〜12個の繰り返し配列であること
を意味する。

【００３４】「存在位置」は、SNPのゲノム上の位置を
示す。5'フランキング（flanking）領域、イントロン
（intron）領域、3'フランキング（flanking）領域のSN
Psの存在位置は、エキソン/イントロン結合点（exon/in
tron junction）の最初のイントロンの塩基配列を1番と
して数えた。エキソン領域のSNPsの存在位置は、エキソ
ン/イントロン結合点の最初のエキソンの塩基配列を1番
として数えた。（+）表示又は無表示は3'下流方向に、
（-）は5'上流方向に向かって数えた数字を示した。「N
o.」の欄に記載された数字は、各遺伝子の遺伝子地図
（図９〜177）上のSNPの位置を示す番号と対応する。

【００３５】４．オリゴヌクレオチドプローブ又はオリ
ゴヌクレオチドプライマーの作製本発明の検出方法においてプライマー及び/又はプロー
ブとして使用されるオリゴヌクレオチドは、例えばSNP
を検出するときは表1に示す塩基配列（配列番号１〜430
9）を基本とし、これらの配列自体を合成してもよく、
これらの配列の一部を含むように設計し合成してもよ
い。但し、その塩基配列中には必ずSNP（表１の「配
列」の欄にアルファベット大文字で表示した部分）が含
まれるようにする。また、本発明においてはこれらの配
列の相補鎖も含まれる。

【００３６】SNPを例に説明すると、SNP部位は、プライ
マー又はプローブの塩基配列の3'若しくは5'端に存在す
るように設計し、あるいは、相補的な配列の3'若しくは
5'端に存在するように設計し、又は前２者の3'若しくは
5'端から４塩基内、好ましくは2塩基内に存在するよう
に設計する。あるいは、オリゴヌクレオチドの塩基配列
全長の中央にSNPが存在するように設計する。「中央」
とは、SNPの塩基よりも5'端に向かう塩基の数と、3'端
に向かう塩基の数とがほぼ同数となる中心部の領域をい
い、オリゴヌクレオチドの塩基数が奇数の場合は、中心
部の5塩基、好ましくは中心部の３塩基、さらに好まし
くは最も中心部の1塩基をいう。例えば、41個の塩基数
の場合は、第19番目〜第23番目、好ましくは第20番目〜
第22番目、さらに好ましくは第21番目の塩基が「中央」
となる。また、オリゴヌクレオチドの塩基数が偶数の場
合は、中心部の４塩基、好ましくは中心部の２塩基をい
う。例えば、40個の塩基数の場合は、第19番目〜第22番
目、好ましくは第20番目の塩基が「中央」となる。

【００３７】多型部位が複数の塩基で構成される場合
は、プローブ又はプライマーにその配列が含まれるよう
に設計する。特に、プローブ又はプライマーのDNAと相
補する5’末端側又は3’末端側の１〜４塩基のいずれか
（「対応塩基」と称する。好ましくは5’末端又は3’末
端の塩基。）が、当該複数の塩基の最も端の塩基に対応
するように設計する。例えば、後述のインベーダー法に
おいて表１のNDUFA7の第12番（配列番号3411）に示す遺
伝子多型（CAGAGGCT）を検出するためにインベーダープ
ローブ及びアレルプローブを作製する場合は、図4aに示
すアレルプローブについては、対応塩基（図では塩基と
して「T」を例示してある）の位置が「CAGAGGCT」配列
の最も左の「C」となるように設計し、インベーダープ
ローブについては図4bに示す「N」の塩基が「CAGAGGC
T」配列の最も左の「C」を「N」（A、T、CまたはGのい
ずれか）に置換して設計する。逆に、インベーダープロ
ーブの対応塩基の位置を「CAGAGGCT」配列の最も右の
「T」として設計する場合には、その塩基を「N」とし
て、アレルプローブの対応塩基を「T」に設計する。な
お、インベーダープローブおよびアレルプローブの対応
塩基を「CAGAGGCT」配列のいずれかに設定することも可
能である。

【００３８】塩基配列の長さは、少なくとも13塩基、好
ましくは13塩基〜60塩基、さらに好ましくは15〜40塩
基、最も好ましくは18〜30塩基となるように設計する。
このオリゴヌクレオチド配列は、被検遺伝子を検出する
ためのプローブとして使用することができ、また、フォ
ワード（センス）プライマー及びリバース（アンチセン
ス）プライマーのどちらに使用してもよい。

【００３９】また、オリゴヌクレオチドは、ゲノムDNA
とハイブリダイズする領域とハイブリダイズしない領域
とがタンデムに連結したものであってもよい。連結の順
序はどちらが上流でも下流でもよい。このオリゴヌクレ
オチドのうちハイブリダイズする領域は、表1に記載のS
NPを含む配列情報から設計し、ゲノムDNAとハイブリダ
イズする領域の最も5'側又は3'側の配列がSNPとなるよ
うに作製する。上記オリゴヌクレオチドのうちハイブリ
ダイズしない領域は、表1に記載のSNPを含む配列とハイ
ブリダイズしないように、ランダムに配列を設計する。
このオリゴヌクレオチドは、主としてインベーダー法に
よるSNPの検出に、プローブとして使用することができ
る。

【００４０】さらに、本発明において使用されるプライ
マーは、表1に示す塩基配列のうち、そのSNPに起因する
機能変化、有効／無効の判断、副作用の有無を調べる目
的で、PCRにて増幅される配列の中にSNPを含むよう設計
される。この場合の、プライマーの長さは、少なくとも
15塩基、好ましくは15〜30塩基、さらに好ましくは18〜
24塩基の長さを有するように設計する。このときのプラ
イマー配列は、増幅断片が500bp以下、好ましくは100〜
300bp、さらに好ましくは100〜150bpとなるように鋳型D
NAの領域から適宜選択する。

【００４１】以上のように設計されたオリゴヌクレオチ
ドプライマー又はオリゴヌクレオチドプローブは、公知
の手法により化学合成することができるが、通常は、市
販の化学合成装置を使用して合成される。なお、プロー
ブには、予め蛍光標識（例えばFAM, VIC, Cy3等）を付
加して作業の自動化を図ることも可能である。上記オリ
ゴヌクレオチドは、ポリメラーゼ（例えばTaqポリメラ
ーゼ）、緩衝液（例えばTris緩衝液）、dNTP、蛍光色素
（VIC、FAM等）などと共に、遺伝子多型検出用キットに
含めることができる。

【００４２】５．検出上記のようにして調製されたオリゴヌクレオチドをプラ
イマーとし、DNAポリメラーゼを用いて薬物代謝酵素を
コードする遺伝子（鋳型DNA）を増幅する。あるいは、
上記のようにして調製されたプローブを鋳型DNAとハイ
ブリダイズさせて、目的の遺伝子多型を有するDNAを検
出する。鋳型となるDNAの調製は、公知の手法、例えば
塩化セシウム密度勾配超遠心法、SDS溶解法又はフェノ
ール・クロロホルム抽出法等により行うことができる。

【００４３】(1) PCRによる検出増幅は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により行うことが
できる。DNAポリメラーゼとしてはLA Taq DNAポリメラ
ーゼ(Takara)、Ex Taq ポリメラーゼ（Takara社）、Gol
d Taq ポリメラーゼ（Perkin Elmer）, AmpliTaq (Perk
in Elmer) 、PfuDNAポリメラーゼ（Stratagene社）等が
挙げられる。増幅の条件は、85℃〜105℃で10秒〜40
秒、好ましくは94℃で20秒〜30秒の変性工程、50℃〜72
℃で30秒〜1分、好ましくは60℃で20秒〜1分のアニーリ
ング工程、及び65℃〜75℃で1分〜4分、好ましくは72℃
で2分〜3分の伸長工程を１サイクルとしてこれを30〜40
サイクル行う。但し、鋳型DNA及びプライマーを十分変
性させるために、上記増幅サイクルの前に95℃で1分〜5
分〔但し、Gold Taq ポリメラーゼ（Perkin Elmer）を
使用の際は、最低8分〜15分、好ましくは10分から12分
の変性工程を加えてもよく、また、増幅されたDNAを完
全に伸長するために、増幅サイクルの後に72℃で1分〜1
0分の伸長工程を加えてもよい。さらに、増幅産物の検
出を直ちに行わない場合は、非特異的な増幅が起こらな
いようにするために、増幅産物を4℃で保存する工程を
加えることが好ましい。このようにして、薬物代謝酵素
をコードする遺伝子を増幅することができる。

【００４４】その後は、増幅産物についてアガロースゲ
ル電気泳動を行い、臭化エチジウム、SYBR Green液等に
より染色し、そして増幅産物を1本又は２〜３本のバン
ド（DNA フラグメント）として検出することにより、薬
物代謝酵素をコードする遺伝子中の遺伝子多型を含む薬
物代謝酵素の一部分をDNAフラグメントとして検出する
ことができる。アガロースゲル電気泳動の代わりにポリ
アクリルアミドゲル電気泳動、あるいはキャピラリー電
気泳動を実施してもよい。また、予め蛍光色素等により
標識したプライマーを用いてPCRを行い、増幅産物を検
出することもできる。また、マイクロプレート等の固相
に増幅産物を結合させ、蛍光又は酵素反応等により検出
する等、電気泳動を必要としない検出方法も採用するこ
とができる。

【００４５】(2) TaqMan PCR法による検出 TaqMan PCR法は、蛍光標識したアレル特異的オリゴとTa
q DNAポリメラーゼによるPCR反応とを利用した方法であ
る。TaqMan PCR法で用いるアレル特異的オリゴ(TaqMan
プローブという)は、前記SNP情報に基づいて設計するこ
とができる。TaqManプローブの5'末端はFAMやVICなどの
蛍光レポーター色素Rによって標識されており、同時に
3'末端がクエンチャーQ(消光物質)によって標識されて
いる。（図１）。従って、この状態ではクエンチャーが
蛍光エネルギーを吸収するため蛍光は検出できない。Ta
qMan プローブの3'末端はリン酸化されているため、PCR
反応中にTaqManプローブからの伸長反応は起こらない
（図１）。しかし、このTaqManプローブを、SNPを含む
領域を増幅するように設計したプライマーとTaq DNAポ
リメラーゼとともにPCR反応を行うと、次の反応が起こ
る。

【００４６】まず、TaqManプローブが鋳型DNAの特異的
な配列にハイブリダイゼーションし（図2a）、同時にPC
Rプライマーから伸長反応が起こる（図2b）。この際、T
aq DNAポリメラーゼは5'ヌクレアーゼ活性を有している
ため、PCRプライマーの伸長反応が進む際にハイブリダ
イゼーションしたTaqManプローブを切断する。TaqManプ
ローブが切断されると、蛍光色素がクエンチャーの影響
を受けなくなり、蛍光を検出することができる（図2
c）。

【００４７】例えば、図3に示すように、SNP部位がAの
アレル（アレル１とする）と、Gのアレル（アレル２と
する）が存在すると仮定する。アレル１に特異的なTaqM
anプローブはFAMで、アレル２に特異的なTaqManプロー
ブはVICで標識する（図3）。2種類のアレル特異的オリ
ゴをPCR試薬に添加し、検出の対象となる鋳型とTaqMan
PCRを行う。その後、蛍光検出器にてFAM及びVICの蛍光
強度を測定する。その結果、アレルのSNP部位と、TaqMa
nプローブのSNPに対応する部位とが相補的である場合
は、プローブがアレルとハイブリダイズし、Taqポリメ
ラーゼによりプローブの蛍光色素が切断されて、クエン
チャーの影響を受けなくなり、蛍光強度が検出される。
なお、鋳型がアレル１のホモ接合体である場合はFAMの
強い蛍光強度を認め、VICの蛍光はほとんど認められな
い。鋳型がアレル１とアレル２のヘテロ接合体である場
合は、FAMとVICの両者の蛍光を検出することができる。

【００４８】(3) インベーダー法によるSNPの検出インベーダー法は、アレル特異的オリゴと鋳型とをハイ
ブリダイゼーションすることによりSNPを検出する方法
である。インベーダー法では、2種類の非標識オリゴと1
種類の蛍光標識オリゴを用いる。2種類の非標識オリゴ
のうちのひとつは、アレルプローブと呼ばれるものであ
る。アレルプローブは、ゲノムDNA（鋳型DNA）とハイブ
リダイズして相補二本鎖を形成する領域と、鋳型DNAの
配列とは無関係な配列であってゲノムDNAとハイブリダ
イズしない配列の領域（フラップという）とから構成さ
れており、ハイブリダイズする領域のうち最も5'側又は
3'側の位置が、SNPに対応する塩基となっている（図4
a）。上記フラップ配列は、後述するフレットプローブ
と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドである。も
うひとつのオリゴは、インベーダープローブと呼ばれて
いる。このオリゴは、SNP部位からゲノムDNAの3'側方向
に向かって相補的にハイブリダイズするように設計され
ている（図4b）。但し、SNP部位に対応する配列（図4b
中、「N」）は任意の塩基でよい。従って、鋳型である
ゲノムDNAと上記２つのプローブをハイブリダイゼーシ
ョンさせると、SNP部位にインベーダープローブの1塩基
（N）が割り込むように侵入し（図4c）、SNP部位が３重
鎖を形成する。

【００４９】一方、蛍光標識オリゴはアレルと全く無関
係な配列であり、SNPの種類によらず配列は共通であ
る。このプローブをフレット（FRET）プローブ(fluores
cenceresonance energy transfer probe)という（図
5）。FRETプローブの5'末端の塩基（レポーター）には
蛍光色素Rが標識されており、その上流にはクエンチャ
ーQが結合している。従って、この状態ではクエンチャ
ーが蛍光色素を吸収してしまうため蛍光を検出できな
い。また、FRETプローブの5'末端（レポーター塩基）か
ら一定領域（領域１とする）は、その領域１よりも3'側
の領域と向き合って相補的な配列となるように設計され
ている（これを領域２という）。従って、領域１は領域
２と自分自身で相補鎖を形成する（図5）。また、この
相補鎖形成領域よりもさらに3'方向の領域は、アレルプ
ローブのフラップとハイブリダイズして相補鎖を形成で
きるように設計されている（図5）。

【００５０】インベーダー法では、DNAの特殊な構造を
認識して切断する特殊なエンドヌクレアーゼ活性を有す
る酵素（5'ヌクレオチダーゼ）の１つであるクリーバー
ゼ（cleavase)を用いる。クリーバーゼは、ゲノムDNA、
アレルプローブ及びインベーダープローブがSNP位置で
３重になった時に、アレルプローブのSNP位置の3'側を
切断する酵素である。従って、図4cのように３つの塩基
が並び、5'末端がフラップ状になっている部分を認識し
て、そのフラップ部分を切断する。これによって、この
SNP部位の構造がクリーバーゼにより認識され（図6
a）、フラップの部位でアレルプローブが切断されフラ
ップ部分が遊離する（図6b）。次に、アレルプローブか
ら遊離したフラップ部分は、FRETプローブと相補的な配
列をもつため相補結合する（図6c）。このとき、フラッ
プのSNP部位がFRET自身の相補結合部位に割り込んで侵
入する。クリーバーゼは再びこの構造を認識して蛍光色
素部分を切断する。切断された蛍光色素は、クエンチャ
ーの影響を受けなくなり、蛍光を発する（図6d）。SNP
部位がアレルプローブのSNPに対応する配列とマッチし
ない場合は、図7のように、クリーバーゼが認識する特
異的なDNA構造をとらないため、プローブは切断され
ず、蛍光は検出されない。

【００５１】例えば、あるSNPがT/Cのときに、T用のイ
ンベーダープローブ、アレルプローブ、及びSNPに対応
するレポーターにFAMを結合させたフレットプローブ、
並びにこれとは別にC用のインベーダープローブ、アレ
ルプローブ、及びSNPに対応するレポーターにVICを結合
させたフレットプローブとを準備し、全て混合してSNP
検出を行う。その結果、SNPがT／Tのホモの場合にはFAM
の蛍光を発し、C／Cのホモの場合にはVICの蛍光を発
し、T／Cヘテロの場合にはFAMとVIC両者の蛍光を発す
る。FAMとVICは蛍光波長が異なるため、両者を分別でき
ることになる。

【００５２】(4) SniPer法による検出 SniPer法でSNPを検出するためには、アレルの識別をRCA
による増幅の有無で行うことができる。すなわち、鋳型
になるべきゲノムDNAを直鎖状にしておいて、このゲノ
ムDNAにプローブをハイブリダイズさせる。プローブの
配列と鋳型であるゲノムDNAの配列とが相補的にマッチ
して相補鎖を形成すると、ゲノムDNAはライゲーション
反応が起こって環状になることができる。その結果、環
状DNAのRCAが進行する。これに対し、プローブの端がゲ
ノムDNAとマッチしなければ、ライゲーションされず環
状にならないため、RCAの反応は進まない。従ってSniPe
r法では、ゲノムDNAとアニールし、しかも環状になり得
る一本鎖プローブを設計する。この一本鎖プローブをパ
ドロックプローブという。このパドロックプローブの断
端を検出目的となるSNPに対応する配列にしておいて、
このパドロックプローブとゲノムDNAとを混ぜ、ライゲ
ーション反応を行う。パドロックプローブの断端とゲノ
ムDNAのSNP部分が相補的であれば、ライゲーション反応
によってパドロックプローブは断端がつながり環状とな
るが、相補的でなければ環状にならない。従って、対象
となるSNPに相当するパドロックプローブのみが環状と
なり、DNAポリメラーゼによって増幅する。SNPは、この
増幅の有無を検出すればよい。検出は、両端に蛍光色素
とクエンチャーをもち、ヘアピン構造を有する合成オリ
ゴヌクレオチドを使用する。

【００５３】(5) MALDI-TOF/MS法による検出 MALDI-TOF/MS (Matrix Assisted Laser Desorption-Tim
e of Flight / Mass Spectrometry）法は、質量分析計
をSNPタイピングに応用した方法である。この方法は、
以下のステップから構成される。 (i)SNPを含むDNA断片のPCR増幅及び精製 SNP部位の塩基とPCRプライマーは重複しないように設計
した後DNA断片を増幅し、増幅反応産物からエキソヌク
レアーゼやアルカリホスファターゼ処理によりプライマ
ー、dNTP等を除去して増幅断片を精製する。

【００５４】(ii）プライマー伸長反応（サーマルサイ
クル）及び精製 PCR産物である標的領域の鋳型に対して10倍以上のプラ
イマーを加え、サーマルサイクル反応させてプライマー
伸長反応を行う。ここで使用するプライマーは、その3'
末端がSNP部位の塩基に隣接するように設計する。プラ
イマーの長さは、15〜30塩基、好ましくは20〜25塩基で
ある。マルチプレックス反応を行う場合には、鋳型と相
補的でない配列を5'末端に付加する。また、サーマルサ
イクルは、85〜105℃（好ましくは94℃）と35〜40℃
（好ましくは37℃）の２温度間で20〜30サイクル（好ま
しくは25サイクル）行う。得られた反応産物を、質量分
析機に適した状態にするため精製キット等を用いて精製
する。

【００５５】(iii) 質量分析計によるDNAの質量分析精製された伸長反応産物を質量分析機にアプライして、
目的産物の質量を測定する。すなわち、精製産物をマト
リックスと混合し、MALDIプレートに0.5〜1.0μLスポッ
トする。プレートを乾燥後、試料にレーザー光を照射
し、スペクトログラムを作成する。

【００５６】(6) 塩基配列決定法による検出本発明においては、１塩基の伸長反応を利用した多型の
検出を行うことができる。つまり、異なる蛍光化合物で
標識された４種類のジデオキシヌクレオチドを、検出の
対象となる遺伝子が含まれる反応系に添加し、１塩基の
伸長反応を行う。この場合、伸長する塩基を多型部位と
しておき、また、DNA合成の停止とDNA分子の3’末端の
蛍光標識という2つの反応を操作する。4種類の反応液を
シークエンシング用ゲルの同一レーンやキャピラリー上
で電気泳動を行ない、DNAバンドを標識した蛍光色素の
違いを蛍光検出器により検出して配列決定を行う、ある
いは１塩基伸長したオリゴヌクレオチドを蛍光検出装置
や質量分析装置などを用いてどの塩基が伸長したかを蛍
光色素の種類の違いを利用して調べる方法である。蛍光
標識ジデオキシヌクレオチドの代わりにプライマーを蛍
光標識し、非標識ジデオキシヌクレオチドと共に用いる
こともできる。

【００５７】６．薬物の評価本発明においては、前記のようにして得られる一塩基多
型等の検出結果から、当該薬物代謝酵素によって代謝さ
れる薬物の有効性及び安全性を評価することができる。
薬物の評価は、タイピングシステムにより行うことがで
きる。すなわち、上記いずれかの検出手法に従って、毒
性（副作用）発現群と非発現群のアレル頻度を比較す
る。両者を比較した際、アレル頻度に差が生じるものを
毒性発現認識のためのマーカーとして選出する。統計学
的検定は、通常χ²検定によるが、例えばFisher検定な
どの他の統計処理を行うこともできる。なお、この結果
を、薬物の活性本体（薬物未変化体又は代謝物でもよ
い）の血中濃度、組織濃度に反映させることも可能であ
る。当該全ての遺伝子多型に関して、毒性との因果関係
を調べ、相関のあった遺伝子多型部位のみを選出する。
その全ての遺伝子多型解析用プローブ又はプライマーと
各手法に応じた試薬を、反応プレート、カード又はガラ
ス基盤等に予め用意し、そこに予測したいヒトのゲノム
DNAを添加し、反応させることで、アレルパターンを調
べることができる。毒性と相関する遺伝子多型を有する
場合には、そのヒトの副作用発現予測が可能となる。薬
物の有効性についても同様である。また、薬物の違いに
より、副作用又は有効性と相関する遺伝子多型も異なる
ので、それぞれに関して、当該遺伝子多型を用いてタイ
ピング操作を行えば、有効性や副作用の予測をすること
が可能となる。

【００５８】このことを利用して、その遺伝子多型頻度
と有効／無効又は副作用の有／無を比較し、アレル頻度
に差がある時に判定することが可能となる。例えば、薬
物Aの投与によってある毒性（副作用）を示した者のSNP
を解析した結果、統計的に全体の90％がT/Tを持つ者
（例えばFAMの蛍光強度を検出）であることが判明し、
毒性（副作用）を示さなかった者のSNPを解析した結
果、T/Tを持つ者は全体の10％にすぎず、C/Cを持つもの
が90％を占めたことが判明したとすると、SNP解析の結
果、T/Tを持つ者は薬物Aの投与はできないと評価するこ
とができる。

【００５９】７．薬物のスクリーニング本発明において前記の通り得られた遺伝子多型情報は、
被験者から採取した当該薬物代謝酵素をコードする遺伝
子の遺伝子多型情報と比較することにより、当該薬物代
謝酵素によって代謝される薬物の有効性及び安全性を解
析するための指標として利用される。従って、本発明に
おいて得られた遺伝子多型情報は、どの薬物が治療に最
も有効であるか、その使用すべき薬物を選択するための
情報源となる。

【００６０】手法としては「５．薬物の評価」に記載の
評価方法を利用すればよい。つまり、前項で副作用又は
有効性と相関が認められた遺伝子多型は、その酵素の活
性、転写、翻訳に影響を与えるものであるといえる。ま
た、副作用又は有効性の発現機構と間接的であっても何
らかの因果関係があるといえる。ある薬物の代謝は、製
薬会社などにおいて前臨床又は臨床試験にて調査・確認
される。よって、それらの酵素遺伝子中に存在する遺伝
子多型の中に重篤な副作用と相関する多型がある場合に
はこれを削除すること、あるいは条件付きで使用するこ
とが可能となる。また、有効性についても同様である。
この副作用と有効性の情報から薬物のスクリーニングが
可能となる。

【００６１】さらに、臨床試験（第I〜III相試験）にお
いて副作用発現症例のボランティアと副作用非発現症例
の遺伝子多型頻度解析を行うことで、前記した以外に副
作用や有効性と相関する新たな遺伝子多型を検出するこ
とが可能となる。これを、上記と同様に調べることで薬
物のスクリーニングが可能となる。

【００６２】

【実施例】以下、実施例により本発明をさらに具体的に
説明する。但し、本発明はこれら実施例にその技術的範
囲が限定されるものではない。〔実施例1〕 SNP情報の取得 (1) DNA抽出血縁関係のない48人からEDTA存在下に採血を行った。DN
Aの抽出は、ゲノム解析ラボマニュアル（中村祐輔編シ
ュプリンガー・フェアラーク東京）の方法に従って以下
の通り行った。

【００６３】血液10mlを50mlのファルコンチューブに移
し、室温で3000rpm、５分間遠心を行った。ピペットに
て上清（血清）を採取した後、RBC溶解バッファー(10mM
NH4HCO3, 144mM NH3Cl)を30ml加えた。沈殿がほぐれる
まで混和した後、室温で20分放置した。室温で3000rp
m、５分間遠心を行った後、ピペットにて上清（血清）
を捨て、白血球のペレットを得た。RBC溶解バッファー
を30ml加え、同様の操作をさらに2回行った。白血球の
ペレットにProteinase Kバッファー(50mM Tris-HCl(pH
7.4), 100mM NaCl, 1mM EDTA(pH8.0))を4ml、10% SDSを
200μl、10mg/ml Proteinase Kを200μl加え、転倒混和
した後、37℃で一晩静置した。フェノールを4ml加え、
ローテーター（Rotator T-50, Taitec）にて4時間ゆっ
くりと転倒混和した。室温で3000rpm、10分間遠心を行
い、上層を新しいチューブに回収した。4mlのフェノー
ル-クロロホルム-イソアミルアルコール(容積比25:24:
1)を加え、同様に2時間転倒混和した後、遠心した。上
層を新しいチューブに回収し、4mlのクロロホルム-イソ
アミルアルコール(容積比24:1)を加え、同様に30分転倒
混和した後、遠心した。上層を新しいチューブに回収
し、8M 酢酸アンモニウム400μl、イソプロパノール4ml
を加え、転倒混和した。糸状の白色析出物(DNA)を2ml容
のチューブに回収し、70％エタノールを1ml加え、転倒
混和した。新しい2ml容のチューブにDNAを回収し風乾し
た後、TE溶液(10mM Tris-HCl(pH7.4), 1mM EDTA(pH7.
4))を500μl加え、溶解後、ゲノムDNAサンプルとした。

【００６４】(2) PCR ゲノムシークエンスは、GenBank DNAデータベースから
得た。RepMask コンピュータプログラムを用い、リピー
ト配列を除いた後、PCR産物が1kb前後になるようにPCR
プライマーを設計した。ゲノムDNAは、同濃度に調製し
た血縁関係のない48人のDNAを使用した。それぞれ3人分
のDNAを1本のチューブに同量混ぜ、このうち60ngをPCR
に使用した。PCRは、Ex-Taq(2.5U; TaKaRa)を使用し、G
eneAmp PCRSystem 9700(PE Applied Biosystems)を用い
て行った。94℃で2分間反応後、94℃で30秒の変性、60
℃又は55℃で30秒のアニーリング、72℃で1分の伸長を
行い、これを１サイクルとして35サイクル行った。

【００６５】(3) シークエンス PCR産物は、Arraylt(Telechem)を使用し精製を行った
後、BigDye TerminatorRR Mix(PE Applied Biosystems)
を用い、シークエンス反応を行った。GeneAmp PCR Syst
em 9700(PE Applied Biosystems)を用い、96℃で2分間
反応後、96℃で20秒の変性、50℃で30秒のアニーリン
グ、60℃で4分の伸長を行い、これを１サイクルとして2
5サイクル行った。シークエンス反応後、ABI PRISM 370
0 DNA Analyzerにてシークエンス解析を行った。

【００６６】(4) SNPの検出 SNPの検出には、PolyPhredコンピュータープログラム(N
ickerson et al., 1997, Nucleic Acids Res., 25, 274
5-2751)を使用し、解析を行った。 (5) 結果表１に示すSNPの結果が得られた。また、解析を行った
薬物代謝酵素名とその略号、データベース(GenBank)のA
CCESSION 番号、薬物代謝酵素の遺伝子の構造とSNPsの
存在位置を図9〜177に示した。図9〜177において、エキ
ソンは水平線で表示した遺伝子上に白抜きのボックス又
は黒の線で示した。SNPsの存在位置は、遺伝子の上側に
実線で示し、番号を付した。

【００６７】〔実施例2〕異なる２グループの被験者に
ついてインベーダー法によりタイピングを行った。結果
を図178に示す。図178において、横軸(Allele 1)はTに
対応するFAMの蛍光の強さを、横軸（Allele 2）はCに対
応するVICの蛍光の強さを表す。斜線入りの丸はSNPのパ
ターンがT/Tであり、黒丸（●）はC/C、白丸（○）はT/
Cであることを示す。黒四角（■）はバックグラウンド
値を意味し、×印は判定不能を示す。パネルA（上）の
グラフに示された被検者グループはSNPのパターンがC/C
のものが多く、パネルB（下）のグラフに示された被検
者グループはSNPのパターンがT/Tのものが多いことが分
かる。

【００６８】〔実施例3〕SNPの検出血縁関係のない5人から実施例1に記載した方法により採
取したゲノムDNAを試料とし、3種類の薬物代謝酵素遺伝
子(EPHX1, ABCB2, AANAT)中のSNPの検出を、インベーダ
ー法により行った。EPHX1についてはNo.3（配列番号196
5）及びNo.17（配列番号1979）、ABCB2についてはNo.4
（配列番号4276）及びNo.11（配列番号4283）、AANATに
ついてはNo.3（配列番号4236）の各配列に基づいて設計
されたインベーダープローブ及びアレルプローブを用い
た。各SNPの存在位置は、表１に示されている。結果を
表２に示す。

【００６９】

【表２】表２の結果より、本発明の方法により各被験者の薬物代
謝酵素遺伝子中のSNPの検出及びそのパターンの同定が
可能であることが分かった。

【００７０】〔実施例4〕SNPと薬物の有効性・安全性
（至適量）との関係本実施例は、薬剤の有効性及び安全性についてSNPを用
いて調べたものである。チオプリンSメチルトランスフ
ェラーゼ（TPMT）はプリン環に付加したS原子にメチル
基を転移する酵素であり、抗癌剤である６−メルカプト
プリンや６−チオグアニン、あるいは免疫抑制剤のアザ
チオプリンといったチオプリン誘導体などの主代謝酵素
の１つである。本実施例では、TPMT(アクセッション番
号：AB045146.1）のイントロン３の868番目のSNPである
G/T、およびイントロン３の2682番目のSNPであるC/Aの
組み合わせと、アザチオプリンの至適量との関係を示し
た（表３、表４）。

【００７１】

【表３】

【００７２】至適量とは腎移植後の拒絶反応の抑制を指
標として求めた量である。そして、アザチオプリン量が
100mg/日で有効性が認められた患者群をhigh doseグル
ープとし、100mg/日で副作用が発現し、50mg/日で有効
性が得られた患者をlow doseグループとした。表３中、
「High」、「Low」の欄の数字は、それぞれhigh doseグ
ループ、low doseグループの患者数である。なお、副作
用とは、白血球減少症、発疹、血管炎、悪心・嘔吐、食
欲不振、下痢、倦怠感、筋痛、関節痛、発熱、悪寒、め
まいなどで重症の場合には、血液障害、ショック様症
状、感染症、肝・腎機能障害などを指す。

【００７３】high doseグループ/low doseグループと上
記２種のSNPとの関係を調べると、イントロン３の868番
目にGが存在（G/GあるいはG/T）し、かつ、イントロン
３の2682番目にAが存在（A/AあるいはA/T）する場合に
は、12人中10人が50mg/日で至適量（low doseグルー
プ）であるのに対し、その他の組み合わせでは12人中11
人が100mg/日の至適量（high doseグループ）となった
（表４）。すなわち、該当する２つのSNPの組み合わせ
を調べることで、投与前にアザチオプリンの有効性・安
全性（至適量）を予測することが可能となる。また、本
結果は本報記載の薬剤代謝酵素SNPを用いて薬剤の有効
性および安全性を予測できることを示すものである。

【００７４】

【表４】

【００７５】

【発明の効果】本発明により、SNPの解析方法が提供さ
れる。本発明の方法により、目的の疾患に応じた薬物の
選択をすることが可能となるため、本発明の方法は極め
て有用である。

【００７６】

【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> RIKEN Nakamura Yusuke Sekine Akihiro Iida Aritoshi Saito Susumu <120> A method of detecting gene polymorphism <130> RJH13-147S <150> JP2000-399443 <151> 2000-12-27 <150> JP2001-135256 <151> 2001-05-02 <150> JP2001-256862 <151> 2001-08-27 <160> 4309 <170> PatentIn Ver. 2.0 <210> 1 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 acataaacag aggccgggaa sggggcgggg aggagggaga g 41 <210> 2 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 2 gcggtgttaa atggggagac katgtcctag tacgagctct g 41 <210> 3 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 gaattggcta tatgctcccc sggactggag cggcacagtc c 41 <210> 4 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 gtacaaaacc ctttagcttt kgcaaacctc ctttaagacc c 41 <210> 5 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 ttaagacccg atttaaatgc ytccctcctc atgaagctct t 41 <210> 6 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 aagctcttct ggatccactc yttcccatca ctaagttgaa a 41 <210> 7 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 7 cccatcacta agttgaaagt magatcccct tctctttact t 41 <210> 8 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 8 ttacagtgcc ctttatagga ragaaagaag aaattgtgtc t 41 <210> 9 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 9 tctctgtgga gcaaatagag rgctgtctga cacttggttc c 41 <210> 10 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 10 gaatgtttga tttgtgaaaa wcttaataac agtagttttt t 41 <210> 11 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 11 gtgctgacaa tcttatactc yaggttgaac ctccggggaa g 41 <210> 12 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 12 gagcctcaat cacagattct stctagctca catgaagtta a 41 <210> 13 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 13 ggagcatgac tttgtggaag yctctcctct tccacccaga g 41 <210> 14 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 14 gagggctgac tgtcaccctt ygataggagc ccagcactaa a 41 <210> 15 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 gtgggtggga ggaattggag saggaagctt gcctaagtgt g 41 <210> 16 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 ggaggcacct gtgacaccca rcggagtagg ggggcggtgt g 41 <210> 17 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 17 agtgtgcata tgtgctgacc rtgggagctt gtttgtcggt t 41 <210> 18 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 18 aagaaaagtg atttatttca rgttgctgat gcttagattg t 41 <210> 19 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 19 tgcttagatt gttagagttg saaagatctg gcttgcatct t 41 <210> 20 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 20 tctggcttgc atcttgtaca rctgacagaa ctggggctca g 41 <210> 21 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 21 tgatagctgt tgcctgcagc rtacggacgt tcattgcgca g 41 <210> 22 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 22 tagctgttgc ctgcagcata yggacgttca ttgcgcagtt c 41 <210> 23 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 23 tgttgcctgc agcatacgga ygttcattgc gcagttcctg t 41 <210> 24 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 24 agcatacgga cgttcattgc rcagttcctg tctcctgaga t 41 <210> 25 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 25 acataaagcc tgtgtgctgc ygccaggaag actagaaacg c 41 <210> 26 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 26 gtcaccacat acctggcact rtgctaaggc tgggaatgca g 41 <210> 27 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 27 ccagcccact tcatcttacc rtagttacct ccttagagta t 41 <210> 28 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 28 tgtcaaagag gaactaagga ygccagggac tttctgctta g 41 <210> 29 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 29 ccctctcatc acttctccaa ygctggtatc atgaacccca t 41 <210> 30 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 30 gatgggcatt tgaacttgtt rtctttaaaa agtgaaatct t 41 <210> 31 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 31 tatctgggga gtgggcattt kctgactgag gcattggctg c 41 <210> 32 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 32 ggctacaaaa ctgtgctttc yttgggcagt aaaagaggca a 41 <210> 33 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 33 tagagaacaa gtctaattct rttttccttg aaatagtcga a 41 <210> 34 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 34 aagtccatga ttttttaggc raaatggcct cctttcctct t 41 <210> 35 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 35 ctttctttca caaaattgcc ycccagagct ttctggaagg g 41 <210> 36 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 36 ccagtccctc agccttgcca ytgcttatgc tggtctggaa a 41 <210> 37 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 37 gctcaccgct ctgctcaccc saccctctgg ccatctcctc t 41 <210> 38 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 38 cagcttggtc ccagaggcct rgacctgggt cccagaggtc c 41 <210> 39 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 39 gctggttccc cggcttggtc ycagaggcct ggatgtgtgg c 41 <210> 40 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 40 cctaccacac catgcacgtg yacagccaag ggttgttgac t 41 <210> 41 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 41 ctgggctctt cctggacctg rccagctaaa aggaaatctc c 41 <210> 42 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 42 gcattggtgg tactaagaac rcatattccc tatcctatag g 41 <210> 43 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 43 ctcccccaac attaaaagtg yaagggatgc ttattcaaat g 41 <210> 44 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 44 ggcccaagaa actgcatttt mgcatgctcc ctaaatgaag c 41 <210> 45 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 45 atgctaacag tgtagagtca yatgtgatgg gaagcatcag g 41 <210> 46 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 46 cttgctcaat ttattctgtc yatataactc aatattactg a 41 <210> 47 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 47 catgtgaccc tcttagctcc rcggattaac tcctgtcctc a 41 <210> 48 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 48 gaaaccttct ctgggttcct rtatcacaac ctctctctcc c 41 <210> 49 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 49 gcaacctggc gtcatgggcc mgctggttaa aataaaattg a 41 <210> 50 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 50 acagttctga ggcaataacc rtggttaagg gttattgatc t 41 <210> 51 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 51 cttctttcaa agcttgtggt ycactggacc acgtatgaag t 41 <210> 52 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 52 atgaagtaga atagtttagg yccagaaagg caattaagta a 41 <210> 53 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 53 gtgctttgat acattctgag kttcagtaaa gagacctgat g 41 <210> 54 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 54 catcataaag atgacattgt rggctgtcac agttggaagg c 41 <210> 55 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 55 agaccacact atttagctta yttagtaata acattgcaaa g 41 <210> 56 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 56 ttgcaaagaa aaattccgac raagtttttt cagcctagga a 41 <210> 57 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 57 gctctggtga aattcctctc sctaccccaa acatcatcat t 41 <210> 58 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 58 acaaatgctc accctttcag ytggaatgat tgaaattttg g 41 <210> 59 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 59 tgattaaggt ggctactacc rggtgctttc tgcatatctc g 41 <210> 60 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 60 taggaattcc aagctgtgaa ytttttactg aagctctttg g 41 <210> 61 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 61 atggaaattt gtttatattg wctacagatt gccaatatta t 41 <210> 62 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 62 gaaatttgtt tatattgact rcagattgcc aatattatta g 41 <210> 63 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 63 ctaacaatct tatttccatt sagtccttat aaaagaagtg g 41 <210> 64 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 64 ctgacgttta agggagaccg ygtaggtccc tttgaggact g 41 <210> 65 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 65 agtctgtaaa ttattgttct wttttttctt tagcttatgc t 41 <210> 66 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 66 tagcaaggcc aatcatttta scaacacaca tgcttgctaa c 41 <210> 67 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 67 ggaactgtct ggtgtccccc wgcataggaa gctgagccag g 41 <210> 68 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 68 ctttatgtgg gaagaaattt ktttttttga ttggggagtg g 41 <210> 69 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 69 aaatggcctg gttctctgtc mcctttctgt ctgtatgcct c 41 <210> 70 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 70 ggcagaaggc aaagcttagg wcctagagag tgctggacca c 41 <210> 71 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 71 caaagcttag gacctagaga rtgctggacc acgccactca c 41 <210> 72 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 72 cagggattta ttaatgattt mttgtgaaat gtttggaaat a 41 <210> 73 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 73 agtgccggaa tacatttgca ygtaagacag aacgctgcct g 41 <210> 74 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 74 ggcagagggg tctcagaatc ygcatttcca acaatgtctc c 41 <210> 75 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 75 cgtattgtct gcgggcatcc ygagggaggg gggctgaaga t 41 <210> 76 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 76 cccctcaaga gtcagtttaa rtgttggtca tgttagttgt c 41 <210> 77 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 77 atgggagggc ttgtgcttca ygaaaacatt tttccagatc a 41 <210> 78 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 78 tggggatggg gaggactggc rcagggctgc tgtgatgggg t 41 <210> 79 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 79 ttctgcggtc cctggctccc yacctgactc caggtgaaca a 41 <210> 80 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 80 gaaagaagtg tgggagcaaa mgcatgatgt tacatgtaga c 41 <210> 81 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 81 agtgctctag agacaattgg rttcaaatgt ggagcaggct g 41 <210> 82 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 82 ctctatacaa tcattatgct sccattgaaa taataaatac a 41 <210> 83 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 83 ctccaattcg gtagaaccag rgcttcatct tctctgtcga a 41 <210> 84 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 84 gtttgcagct gctgtttttc yggcagcaca tctgtgcagg c 41 <210> 85 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 85 ggcattattt gtgaaactta yctaaaatcg aattcgggtc c 41 <210> 86 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 86 aattaaattt ttgaaatttt rtattaaaaa ttatattagt a 41 <210> 87 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 87 caggctcaga ggccttggcc yatcaccctg gctcacgtgt g 41 <210> 88 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 88 atgggcctgg acaacagcat mctctggttt agctggttca t 41 <210> 89 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 89 cttttagaca gaaaagttac rtgggatatt atctcccaca g 41 <210> 90 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 90 tatataagga gaaaccagtt raaattacct attgaagaaa c 41 <210> 91 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 91 ttctgcgtag ttttgggtaa rtcacttatc ttctttagga t 41 <210> 92 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 92 cagttgcctc atcagaaaga wgaacagcat tacgcctctg c 41 <210> 93 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 93 agttgagaac agaagatgat wgtcttttcc aatgggacat g 41 <210> 94 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 94 tggtgttttg cttgagtaat rttttctgaa ctaagcacaa c 41 <210> 95 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 95 ctgttgcctc agtctgggct ycataggcat cagcagcccc a 41 <210> 96 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 96 tgaaagttca agcgcagtgc sctgtgtcct tacactccac t 41 <210> 97 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 97 aggaccttac agtgggtagt rtcaggaggg gtcaggggct g 41 <210> 98 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 98 aaagcaccag cgttagcctc rgtggcttcc agcacgattc c 41 <210> 99 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 99 ccctcctcat ctaaagtgaa yacatggggc tcatgtgcag g 41 <210> 100 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 100 catgggatac tcttctgtta kcacagaaga gataaagggc a 41 <210> 101 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 101 aaagctttgc cattctaggg rtcatagcca tacagggtga a 41 <210> 102 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 102 accccttttg ccatgttgaa rccaccatct ccctgctctg t 41 <210> 103 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 103 gtcaaagaaa agagacttgt yaagaggtaa gagccttggc t 41 <210> 104 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 104 acctttcacc ctcaggaagc raggctgttc acacggcaca c 41 <210> 105 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 105 ctctttactt aagtacagtg kgaggaacag cggcatcagg a 41 <210> 106 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 106 gttagaaatt cagcaacttg sgcccagctc agacctactg a 41 <210> 107 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 107 catacatagg aaatgacaaa ygtttatgga tggatagtct a 41 <210> 108 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 108 tcatttaatt ctcaaaaaaa katgaaaaaa tgaacactca g 41 <210> 109 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 109 aatggtaaaa gccacttgtt ytttgcagca tcgtgcatgt g 41 <210> 110 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 110 actatcatgg gagataatga ytatggttgt ccatgattgg a 41 <210> 111 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 111 caggacccag tgttctgagt yaccctgaat gtgagcacta t 41 <210> 112 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Homo sapiens <400> 1667 taatcaaatt ttatcactca rtagagcatc acctgagata g 41 <210> 1668 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1668 ttaatataca cagttcgccc wttaacaaca caggtttaaa c 41 <210> 1669 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1669 acaacacagg tttaaactac rcrttttcac ttctatgcaa a 41 <210> 1670 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1670 aacacaggtt taaactacrc rttttcactt ctatgcaaat t 41 <210> 1671 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1671 atataacttt gctttcattg yaaaaggcaa actrttatat c 41 <210> 1672 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1672 ttcattgyaa aaggcaaact rttatatcat ttaaagactt t 41 <210> 1673 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1673 agtcatgata aacctaatag rataaaacaa caaaaaagaa a 41 <210> 1674 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1674 acagataatt tttacttgtt ygtgcttttc tgtatgatat g 41 <210> 1675 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1675 ccttgattgt aataatctcc mcmtgccaag agtggggcca g 41 <210> 1676 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 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Homo sapiens <400> 4284 aactgcatca ccttttccct yaagcttttt aattcctatg a 41 <210> 4285 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4285 cattcaggga ggcccaggtc rtgtgacgtc gacagttgct g 41 <210> 4286 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4286 tctcctttgg caggtaggtg rtgggcagct gggtccattt g 41 <210> 4287 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4287 cttcacccgt atgccaggac ytggggatgc ttttctcttg t 41 <210> 4288 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4288 gcagcagtgg tgctccctcc rtgggcagcc ccgtcaggtc c 41 <210> 4289 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4289 atggtgccca ggtggatgtg ntccatctca ttcctgtctt t 41 <210> 4290 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4290 agctgcagga ctggaattcc ygtggggatc gcacagtgct g 41 <210> 4291 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4291 aggtggggtg gggtggggtg nggctgtctg tgtccaggaa a 41 <210> 4292 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4292 ccaacgccgg cattagtcgc kcctgcgcac ggccctgtgg a 41 <210> 4293 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4293 agcctaactt ctataccttg raggcactgt ctacaaaaaa a 41 <210> 4294 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4294 ctgttggact gggtggggtc kttataagat tggtgtattt t 41 <210> 4295 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4295 cccagtgggg caacaagcct rtatgctgag caggaggcag a 41 <210> 4296 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4296 ttggctggat tggggtgcta ygctcagagt gagtctgtgt t 41 <210> 4297 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4297 gatgctttcc cagtcctgga kctgcataaa gaataacttg c 41 <210> 4298 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4298 gctttcccag tcctggatct rcataaagaa taacttgcat t 41 <210> 4299 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4299 catgaatgac tctgggaaag ratcattctt agcaatggac t 41 <210> 4300 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4300 aaatggaatc caaacagcaa sagacctccc ctcaccggtc a 41 <210> 4301 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4301 actgagcttc tgccaccggc ygcctgccgg ccttcatgag a 41 <210> 4302 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4302 tccgtgtgga aggcaccttc scccagcctc agtggctagg a 41 <210> 4303 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4303 aacctcaggc gctgcctcag scagggagcc agcctggccc c 41 <210> 4304 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4304 aagcacgcac tgaacatgga rtgagtgagt gaacgaatga a 41 <210> 4305 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4305 tgcccaagaa cctggtgagc yggccgggct gaggcgggca g 41 <210> 4306 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4306 gccccttccg gtcacccttc yccgctcgag gcctcagggc c 41 <210> 4307 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4307 attctcctct ctctctctct nggaccaggc tgggagcagt c 41 <210> 4308 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4308 cagaccctca tacgtgaccc ygctgccccc caggctctta g 41 <210> 4309 <211> 41 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4309 ctttctgatt tttgatagtc sgttgaagaa gggagtttga a 41

【００７７】

【配列表フリーテキスト】配列番号150：nはat又は欠失
を表す（存在位置21）。配列番号152：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号153：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号154：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号155：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号157：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号159：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号161：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号289：nはtcaの14〜16回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号290：nはaの8〜10回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号291：nはcacagtcat又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号292：nはtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号293：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号294：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号295：nはaの16〜18回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号296：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号298：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号299：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号300：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号301：nはtg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号303：nはtの10〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号304：nはgtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号305：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号306：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号307：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号308：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号309：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号311：nはtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号312：nはaの7〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号313：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号314：nはaの9〜10回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号315：nはgt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号316：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号317：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号319：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号320：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号321：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号322：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号323：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号324：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号325：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号326：nは又aaagは欠失を表す（存在位置21）。配列番号391：nはtの22〜26回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号392：nはgの8〜10回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号393：nはcの6〜7回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号394：nはaの12〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号473：nはtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号474：nはaの9〜11回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号475：nはaの8〜12回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号476：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号477：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号478：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号479：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号480：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号481：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号482：nはtの11〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号483：nはcat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号484：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号485：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号486：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号487：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号488：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号497：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号519：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号525：nはaaag又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号555：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号558：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号566：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号573：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号590：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号593：nはgg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号602：nはgtc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号624：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号631：nはtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号634：nはtの9〜12回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号636：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号638：nはaの10〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号641：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号644：nはcagatcttcttcagctaatttagaaatgt又は
欠失を表す（存在位置21）。配列番号670：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号677：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号682：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号689：nはtの9〜12回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号692：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号694：nはg(a)4,a(a)4又はaを表す（存在位置2
1）。配列番号698：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号707：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号709：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号710：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号717：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号719：nはtの18〜20回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号724：nはaの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号725：nはgaaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号729：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号732：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号742：nはca又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号749：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号753：nはctt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号755：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号757：nはggggct又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号761：nはtの19〜22回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号766：nはtの6〜7回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号769：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号813：nはcの7〜8回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号815：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号823：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号828：nはaaga又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号830：nはaの9〜11回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号833：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号838：nはtの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号858：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号864：nはcttt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号869：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号874：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号875：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号878：nはgtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号879：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号899：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号913：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号920：nはaの15〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号934：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号938：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号950：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号954：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号955：nはtの13〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号956：nはaの12〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号957：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号959：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号960：nはaの13〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号965：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号971：nはtの5〜11回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号973：nはtの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号974：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号985：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号988：nはaの10〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号994：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1001：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1012：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1031：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1037：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1038：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1048：nはtgtccaaaggaaggacacg又は欠失を表す
（存在位置21）。配列番号1054：nはtcの6〜8回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1056：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1059：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1064：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1065：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1073：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1075：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1082：nはgattの6〜7回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号1083：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1088：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1089：nはgt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1092：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1093：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1097：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1100：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1106：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1109：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1112：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1113：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1114：nはtの12〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1117：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1119：nはcac又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1126：nはcca又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1154：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1184：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1192：nはaaaa又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1205：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1215：nはtの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1216：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1228：nはtaac又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1229：nはctcttt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1230：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1237：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1240：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1243：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1246：nはaattagaa又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1247：nはtttaaaa又はttttaaを表す（存在位置
21）。配列番号1250：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1255：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1267：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1292：nはtの11〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1293：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1294：nはtの10〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1295：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1297：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1298：nはta又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1300：nはtの13〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1301：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1302：nはaの17〜20回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1303：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1304：nはtの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1305：nはaの10〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1306：nはaの16〜19回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1398：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1400：nはaの6〜7回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1401：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1403：nはtcctcaggg又は欠失を表す（存在位置
21）。配列番号1404：nはcgcの8〜10回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号1405：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1406：nはcaccaggcagcagactctgatgaggaggggagg
ggg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1408：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1448：nはtcac又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1449：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1450：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1451：nはaの7〜8回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1487：nはagg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1488：nはtaacatt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1489：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1490：nはtの15〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1491：nはaの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1517：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1518：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1519：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1520：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1521：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1523：nはcの7〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1524：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1531：nはtの13〜16回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1532：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1533：nはtの14〜16回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1534：nはtの13〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1535：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1537：nはaの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1538：nはtの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1539：nはgcagtattactgtagt又は欠失を表す
（存在位置21）。配列番号1540：nはtの13〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1541：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1542：nはtの10〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1547：nはaの10〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1548：nはaの13〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1549：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1550：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1558：nはaの13〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1559：nはaの12〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1576：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1578：nはaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1623：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1625：nはaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1626：nはca又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1627：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1628：nはtgtgtg又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1716：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1718：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1720：nはactt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1721：nはttta又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1722：nはaの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1723：nはtの8〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1724：nはaの12〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1725：nはcttgta又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1726：nはaの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1727：nはctt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1728：nはctt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1730：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1731：nはaの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1732：nはtgt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1733：nはaの24〜27回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1734：nはtaの10〜21回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号1735：nはaの8〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1736：nはaの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1737：nはaの8〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1795：nはctat又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1796：nはatattcacttggtatctg又は欠失を表す
（存在位置21）。配列番号1797：nはttta又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1798：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1800：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1801：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1802：nはaの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1803：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1804：nはatの4〜5回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1805：nはtの7〜8回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号1806：nはtの19〜23回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1807：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1808：nはtgat又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1809：nはtの8〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1810：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1827：nはgtg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1829：nはgg又はtggtggggtggaを表す（存在位
置21）。配列番号1849：nはacaaca又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1850：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1852：nはacの15〜18回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号1858：nはtの18〜26回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1867：nはtc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1871：nはtの16〜18回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1886：nはtの18〜20回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1887：nはtggtaagt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1889：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1895：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1896：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1897：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1898：nはctct又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号1901：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1904：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1911：nはtの14〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1916：nはtの12〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1917：nはaの10〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1918：nはaの25〜27回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1939：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1948：nはtの20〜24回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1951：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1952：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1954：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号1960：nはtの18〜23回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号1980：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2040：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2044：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2047：nはtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2050：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2076：nはtgt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2085：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2190：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2196：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2197：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2199：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2201：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2204：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2206：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2210：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2215：nはaaga又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号2219：nはaaaa又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号2223：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2231：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2254：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2270：nはacta又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号2276：nはgtg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2281：nはtの11〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2291：nはtta又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2305：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2307：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2309：nはcct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2320：nはgga又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2330：nはtの12〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2335：nはtの16〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2347：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2380：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2440：nはag又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2446：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2447：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2475：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配
列番号2479：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2484：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2486：nはgc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2489：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2524：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2530：nはtc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2542：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2544：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2557：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2561：nはca又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2562：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2574：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2605：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2620：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2621：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2626：nはtの11〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2627：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2629：nはtの16〜18回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2631：nはctta又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号2632：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2634：nはaの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2635：nはgt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2636：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2641：nはaatt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号2643：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2649：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2661：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2667：nはcaaaaの4〜5回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号2676：nはaの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2681：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2687：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2691：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2692：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2700：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2701：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2702：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2712：nはgaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2713：nはag又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2729：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2730：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2731：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2813：nはtat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2814：nはacの14〜17回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号2815：nはaの16〜27回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2816：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2817：nはaの8〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2818：nはgtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2819：nはaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2820：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2821：nはacの8〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2822：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2842：nはagg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2844：nはaの11〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2845：nはaの11〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2848：nはgt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2864：nはta又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2947：nはaの16〜19回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2948：nはaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2950：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2951：nはtの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2952：nはaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2953：nはttgacagtccaatat,ttgaca,gtccaatat
又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2954：nはcta又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2955：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2957：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号2958：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2960：nはgagatgttgtggctcacat又は欠失を表す
（存在位置21）。配列番号2962：nはcc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号2963：nはact又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3045：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3055：nはtの8〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3056：nはtの10〜13回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3112：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3113：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3194：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3195：nはtの12〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3249：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3250：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3365：nはcctgcの16回の繰り返し又はcctgtの1
6回の繰り返しを表す（存在位置21から）。配列番号3366：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3368：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3379：nはacac又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3388：nはgatttgtggtatccag又は欠失を表す
（存在位置21）。配列番号3390：nはag又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3391：nはta又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3397：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3399：nはgtの12〜14回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号3411：nはcagaggct又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3412：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3413：nはag又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3425：nはgtaaa又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3426：nはaaaaa又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3427：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3468：nはtc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3470：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3471：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3472：nはgaagaaactgttgacagttt又は欠失を表
す（存在位置21）。配列番号3473：nはcct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3474：nはtttc又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3475：nはttcttttaaaattg又は欠失を表す（存
在位置21）。配列番号3477：nはttcaggccttt又は欠失を表す（存在位
置21）。配列番号3479：nはggcctg又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3481：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3510：nはcの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3511：nはaの15〜21回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3512：nはggggtggcggggtggg又は欠失を表す
（存在位置21）。配列番号3513：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3514：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3516：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3517：nはtの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3518：nはtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3520：nはtccctccttgaagctgatcgt又は欠失を表
す（存在位置21）。配列番号3521：nはcaの12〜18回の繰り返しを表す（存
在位置21から）。配列番号3534：nはgtt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3537：nはga又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3561：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3580：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3581：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3582：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3605：nはat又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3606：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3607：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3637：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3645：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3646：nはttc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3657：nはctt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3689：nはaの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号3693：nはtの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3699：nはtの22〜25回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3710：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3713：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3714：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3716：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3717：nはtの10〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3718：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3719：nはtの9〜11回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3722：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3725：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3729：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3741：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3745：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3754：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3755：nはaag又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3757：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3758：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3760：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3761：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3763：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3765：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3767：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3774：nはgtの7〜8回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3786：nはcct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3788：nはtc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3804：nはca又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3826：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3849：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3878：nはgccag又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号3918：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3921：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3922：nはt又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3927：nはaaa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3928：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3939：nはc又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号3969：nはaの17〜19回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3972：nはaの16〜18回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3973：nはgaの4〜6回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号3986：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4015：nはtcの2〜3回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4021：nはaの6〜7回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号4023：nはaの13〜15回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4025：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4027：nはaの11〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4029：nはtの14〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4030：nはaの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号4037：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4057：nはtの14〜17回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4061：nはgの7〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号4066：nはaの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4074：nはaの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4076：nはgの6〜7回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号4083：nはg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4098：nはaの8〜9回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号4101：nはcの4〜6回の繰り返しを表す（存在位
置21から）。配列番号4123：nはggcgaaggcggcggc又は欠失を表す（存
在位置21）。配列番号4125：nはata又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4128：nはtの11〜12回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4129：nはtの12〜14回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4133：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4135：nはtaの6〜7回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4137：nはtgtatacgtatacatacgtatacatatatacat
acgtatata又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4143：nはattt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号4150：nはcct又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4159：nはtgtt又は欠失を表す（存在位置2
1）。配列番号4160：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4171：nはtの9〜10回の繰り返しを表す（存在
位置21から）。配列番号4178：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4206：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4255：nはa又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4289：nはgtg又は欠失を表す（存在位置21）。配列番号4291：nはgg又はtggtggggtggaを表す（存在位
置21）。配列番号4307：nはct又は欠失を表す（存在位置21）。

【図面の簡単な説明】

【図１】TaqMan プローブを示す図である。

【図２】TaqMan PCR法の概要を示す図である。

【図３】蛍光色素を付したプローブを示す図である。

【図４】インベーダー法の概要を示す図である。

【図５】フレットプローブを示す図である。

【図６】インベーダー法の概要を示す図である。

【図７】アレルとマッチしないプローブを示す図であ
る。

【図８】ライゲーション反応によるアレルの識別の概要
を示す図である。

【図９Ａ】ATP結合カセットサブファミリーAメンバー1
（ABCA1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号（Accession No.）：AF275948.
1 及びAL359846.11

【図９Ｂ】ATP結合カセットサブファミリーAメンバー1
（ABCA1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。（図９Ａの続き）アクセッション番号：AF275948.1
及びAL359846.11

【図１０】ATP結合カセットサブファミリーAメンバー4
（ABCA4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：NT 019258.1

【図１１】ATP結合カセットサブファミリーAメンバー7
（ABCA7）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：NT 025194.1

【図１２】ATP結合カセットサブファミリーAメンバー8
（ABCA8）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC005922.1 及びAC015844.5

【図１３】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー1
（ABCB1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC002457.1及びAC005068.1

【図１４】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー4
（ABCB4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC079591.1, AC079303.3 及
び AC005045.2

【図１５】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー7
（ABCB7）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL360179.3及びAC002417.1

【図１６】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー8
（ABCB8）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC010973.4

【図１７】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー9
（ABCB9）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC026362.9 及び AC073857.1
0

【図１８】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー10
（ABCB10）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL121990.9

【図１９】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー11
（ABCB11）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC008177.3 及び AC069137.3

【図２０】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー1
（ABCC1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC026452.5 及び AC025778.4

【図２１】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー2
（ABCC2）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL392107.4

【図２２】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー3
（ABCC3）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC004590.1 及び AC005921.3

【図２３Ａ】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー
4（ABCC4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL356257.11, AL157818.12
及び AL139381.12

【図２３Ｂ】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー
4（ABCC4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。（図２３Ａの続き）アクセッション番号：AL35625
7.11, AL157818.12 及び AL139381.12

【図２４】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー5
（ABCC5）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC068644.5

【図２５】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー7
（ABCC7）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC000111.1 及び AC000061.1

【図２６】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー8
（ABCC8）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC000406.1

【図２７】ATP結合カセットサブファミリーCメンバー9
（ABCC9）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC084806.9 及び AC008250.2
3

【図２８】ATP結合カセットサブファミリーDメンバー1
（ABCD1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：U52111.2

【図２９】ATP結合カセットサブファミリーDメンバー3
（ABCD3）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：NT 019284.3

【図３０】ATP結合カセットサブファミリーDメンバー4
（ABCD4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC005519.3

【図３１】ATP結合カセットサブファミリーGメンバー1
（ABCG1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AP001746.1

【図３２】ATP結合カセットサブファミリーGメンバー2
（ABCG2）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：NT 022959.2

【図３３】ATP結合カセットサブファミリーGメンバー4
（ABCG4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AP001315.3

【図３４】ATP結合カセットサブファミリーGメンバー5
（ABCG5）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC084265.2 及び AC011242.8

【図３５】ATP結合カセットサブファミリーGメンバー8
（ABCG8）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC084265.2

【図３６】ATP結合カセットサブファミリーEメンバー1
（ABCE1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：NT 006296.2

【図３７】ATP結合カセットサブファミリーFメンバー1
（ABCF1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：NT 007592.3

【図３８】オーガニックアニオントランスポーター
１(OAT1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AP001858.3, AJ249369.1, 及
び AP000438.4

【図３９】オーガニックアニオントランスポーター
2(OAT2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC26532.3

【図４０】オーガニックアニオントランスポーター
3(OAT3) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AP001858.3

【図４１】オーガニックアニオントランスポーター
ポリペプチド１(OATP1) 遺伝子の構造とSNPの存在位
置を示す図である。アクセッション番号：AC022224.22

【図４２】オーガニックアニオントランスポーター
ポリペプチド2(OATP2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：NT 024399.2

【図４３】オーガニックアニオントランスポーター
ポリペプチド8(OATP8) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：NT 024399.2

【図４４】トランスポーター1 ATP結合カセットサブ
ファミリーB(TAP1)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：X66401.1

【図４５】トランスポーター2 ATP結合カセットサブ
ファミリーB(TAP2)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：X66401.1

【図４６】SLC22A4 ソリュートキャリアファミリー
22（オーガニックカチオントランスポーター）メン
バー4(OCTN1)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：AC008599.6

【図４７】SLC22A5 ソリュートキャリアファミリー
22（オーガニックカチオントランスポーター）メン
バー5(OCTN2)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：AC023861.3

【図４８】SLC22A1 ソリュートキャリアファミリー
22（オーガニックカチオントランスポーター）メン
バー1(OCT1)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL35625.5

【図４９】SLC22A2 ソリュートキャリアファミリー
22（オーガニックカチオントランスポーター）メン
バー2(OCT2)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL162582.18

【図５０】SLC10A2 ソリュートキャリアファミリー
10（ナトリウム/胆汁酸コトランスポーターファミ
リー）メンバー2(NTCP)遺伝子の構造とSNPの存在位置を
示す図である。アクセッション番号：AL157789.6

【図５１】SLC15A1 ソリュートキャリアファミリー
15（オリゴペプチドトランスポーター）メンバー1(PE
PT1)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AL353574.8 及び AL391670.6

【図５２】ミクロソームエポキシドハイドロラーゼ1(EP
HX1)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC058782.8

【図５３】細胞質エポキシドハイドロラーゼ (EPHX2)遺
伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッ
ション番号：AC010856.3

【図５４】カテコール-O-メチルトランスフェラーゼ(CO
MT) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC000080.2

【図５５】グアニジノアセテートN-メチルトランスフェ
ラーゼ(GAMT) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：NT 000879.1

【図５６】フェニルエタノールアミンN-メチルトランス
フェラーゼ(PNMT) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：AC040933.3

【図５７】ヒスタミン N-メチルトランスフェラーゼ(HN
MT) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC019304.3

【図５８】ニコチンアミドN-メチルトランスフェラーゼ
(NNMT) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。
アクセッション番号：AC019290.3

【図５９】ホスファチジルエタノールアミンN-メチルト
ランスフェラーゼ(PEMT) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC020558.3

【図６０】アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー
メンバーA1(ALDH1A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC009284.2 及
び AL162416.3

【図６１】アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー
メンバーA2(ALDH1A2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC025431.7 及
び AC012653.8

【図６２】アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー
メンバーA3(ALDH1A3) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC015712.7

【図６３】アルデヒドデヒドロゲナーゼ１ファミリー
メンバーB1(ALDH1B1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AL135785.9

【図６４Ａ】フォルミルテトラヒドロフォレートデヒ
ドロゲナーゼ(ALDH1L1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC079848.6

【図６４Ｂ】フォルミルテトラヒドロフォレートデヒ
ドロゲナーゼ(ALDH1L1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。（図６４Ａの続き）アクセッション番
号：AC079848.6

【図６５】アルデヒドデヒドロゲナーゼ２(ALDH2)遺伝
子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッシ
ョン番号：AC002996.1 及び AC003029.2

【図６６】アルデヒドデヒドロゲナーゼ３ファミリー
メンバーA1(ALDH3A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC005722.1

【図６７】アルデヒドデヒドロゲナーゼ３ファミリー
メンバーA2(ALDH3A2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC005722.1

【図６８】アルデヒドデヒドロゲナーゼ３ファミリー
メンバーB1(ALDH3B1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC004923.2

【図６９】アルデヒドデヒドロゲナーゼ３ファミリー
メンバーB2(ALDH3B2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC021987.3

【図７０】アルデヒドデヒドロゲナーゼ５ファミリー
メンバーA1(ALDH5A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AL031230.1

【図７１】アルデヒドデヒドロゲナーゼ６ファミリー
メンバーA1(ALDH6A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC005484.2

【図７２】アルデヒドデヒドロゲナーゼ８ファミリー
メンバーA1(ALDH8A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AL445190.9 及
び AL021939.1

【図７３】アルデヒドデヒドロゲナーゼ９ファミリー
メンバーA1(ALDH9A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AL451074.4

【図７４】アルコールデヒドロゲナーゼ1(ADH1) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AP002027.1

【図７５】アルコールデヒドロゲナーゼ2(ADH2) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AP002027.1

【図７６】アルコールデヒドロゲナーゼ3(ADH3) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AP002027.1

【図７７】アルコールデヒドロゲナーゼ4(ADH4) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AP002026.1

【図７８】アルコールデヒドロゲナーゼ5(ADH5) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AC019131.4

【図７９】アルコールデヒドロゲナーゼ6(ADH6) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AP002026.1

【図８０】アルコールデヒドロゲナーゼ7(ADH7) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AC027065.3

【図８１】短鎖アルコールデヒドロゲナーゼファミリー
遺伝子(HEP27)の構造とSNPの存在位置を示す図である。
アクセッション番号：AL135999.3

【図８２】UDP グリコシルトランスフェラーゼ1ファミ
リーポリペプチドA1(UGT1A1) の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC006985.2

【図８３】UDP グリコシルトランスフェラーゼ2ファミ
リーポリペプチドA1(UGT2A1) の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC011254.3

【図８４】UDP グリコシルトランスフェラーゼ2ファミ
リーポリペプチドB15(UGT2B15)の構造とSNPの存在位置
を示す図である。アクセッション番号：AC019173.4

【図８５】UDP グリコシルトランスフェラーゼ8 (UGT8)
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：U31353.1

【図８６】グルタチオンＳトランスフェラーゼＡ１(GST
A1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC021133.4

【図８７】グルタチオンＳトランスフェラーゼＡ４(GST
A4) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC025085.4

【図８８】グルタチオンＳトランスフェラーゼＭ１(GST
M1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC000032.7

【図８９】グルタチオンＳトランスフェラーゼＭ２(GST
M２) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC000031.5

【図９０】グルタチオンＳトランスフェラーゼＺ１(GST
Z1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC007954.7

【図９１】グルタチオンＳトランスフェラーゼＰｉ(GST
Pi) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：X08058.1 及び M24485.1

【図９２】グルタチオンＳトランスフェラーゼＴ１(GST
T1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AF240786.1 及び AP000351.3

【図９３】ミクロソームのグルタチオンSトランスフェ
ラーゼ１(MGST1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：AC007528.5

【図９４】ミクロソームのグルタチオンＳトランスフェ
ラーゼ１like１(MGST1L1) 遺伝子の構造とSNPの存在位
置を示す図である。アクセッション番号：AC007936.2

【図９５】ミクロソームのグルタチオンＳトランスフェ
ラーゼＴ２(MGST2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示
す図である。アクセッション番号：AC019049.4

【図９６】ミクロソームのグルタチオンＳトランスフェ
ラーゼＴ３(MGST3) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示
す図である。アクセッション番号：AC064827.2

【図９７】スルホトランスフェラーゼ1A1(SULT1A1/STP
1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アク
セッション番号：U52852.2

【図９８】スルホトランスフェラーゼ1A2(SULT1A2/STP
2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アク
セッション番号：U33886.1, U34804.1 及び AC020765.5

【図９９】スルホトランスフェラーゼ1A3(SULT1A3/STM/
HAST) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であるア
クセッション番号：L34160.1 及び AC012645.4

【図１００】スルホトランスフェラーゼ1C1(SULT1C1)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AC019100.4

【図１０１】スルホトランスフェラーゼ1C2(SULT1C2)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AF186263.1

【図１０２】スルホトランスフェラーゼ2A1(SULT2A1)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AC024582.4, AC008745.5 ,NT 011190.1
及び AC024582.4

【図１０３】スルホトランスフェラーゼ2B1(SULT2B1)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AC040922.2 及び AC008403.6

【図１０４】スルホトランスフェラーゼ-関連タンパク
質3(SULTX3) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：Z97055.1

【図１０５】チロシルタンパク質スルホトランスフェラ
ーゼ1(TPST1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：AC026281.5

【図１０６】チロシルタンパク質スルホトランスフェラ
ーゼ2(TPST2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：Z95115.1

【図１０７】セレブロシドスルホトランスフェラーゼ(C
ST) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC005006.2

【図１０８】甲状腺ホルモンスルホトランスフェラーゼ
(ST1B2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC027059.2

【図１０９】カルボハイドレートスルホトランスフェ
ラーゼ１(CHST1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：NT 008982.1

【図１１０】カルボハイドレートスルホトランスフェ
ラーゼ2(CHST2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図
である。アクセッション番号：AC055737.10

【図１１１】カルボハイドレートスルホトランスフェ
ラーゼ３(CHST3) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：AC073370.3

【図１１２】カルボハイドレートスルホトランスフェ
ラーゼ4(CHST4) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図
である。アクセッション番号：AC010547.5

【図１１３】カルボハイドレートスルホトランスフェ
ラーゼ5(CHST5) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図
である。アクセッション番号：AC025287.3

【図１１４】HNK-スルホトランスフェラーゼ(HNK-1ST)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AC012493.4

【図１１５】エストロゲンスルホトランスフェラーゼ(S
TE) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC074273.1

【図１１６】NAD(P)H: キノンオキシドレダクターゼ1(N
QO1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：M81596.1

【図１１７】NRH: キノンオキシドレダクターゼ2(NQO2)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AB050248.1

【図１１８】キノンオキシドレダクターゼ相同体のp53
誘導遺伝子3（PIG3）の構造とSNPの存在位置を示す図で
ある。アクセッション番号：AC008073.3

【図１１９】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス１(NDUFA1) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC002477.1

【図１２０】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス２(NDUFA2) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AB054976.1

【図１２１】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス３(NDUFA3) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC009968.6

【図１２２】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス５(NDUFA5) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC073323.5

【図１２３】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス６(NDUFA6) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AL021878.1

【図１２４】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス７(NDUFA7) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC010323.6

【図１２５】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス８(NDUFA8) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AL162423.10

【図１２６】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス９(NDUFA9) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC005832.1

【図１２７】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１αサブコンプレックス１０(NDUFA10) 遺伝子の構
造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC013469.8

【図１２８】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１α/βサブコンプレックス１(NDUFAB1) 遺伝子の
構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション
番号：AC008870.6

【図１２９】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１βサブコンプレックス３(NDUFB3) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC007272.3

【図１３０】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１βサブコンプレックス５(NDUFB5) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC068361.2

【図１３１】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）１βサブコンプレックス７(NDUFB7) 遺伝子の構造
とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション番
号：AC010527.4

【図１３２】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）Ｆｅ−Ｓタンパク質１(NDUFS1)遺伝子の構造とSNP
の存在位置を示す図である。アクセッション番号：AC00
7383.4

【図１３３】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）Ｆｅ−Ｓタンパク質３(NDUFS3)遺伝子の構造とSNP
の存在位置を示す図である。アクセッション番号：AC06
7943.4

【図１３４】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）Ｆｅ−Ｓタンパク質４(NDUFS4)遺伝子の構造とSNP
の存在位置を示す図である。アクセッション番号：AC02
4569.3

【図１３５】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）Ｆｅ−Ｓタンパク質５(NDUFS5)遺伝子の構造とSNP
の存在位置を示す図である。アクセッション番号：AL13
9015.5

【図１３６】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）Ｆｅ−Ｓタンパク質６(NDUFS6)遺伝子の構造とSNP
の存在位置を示す図である。アクセッション番号：AC02
6443.2

【図１３７】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）Ｆｅ−Ｓタンパク質８(NDUFS8)遺伝子の構造とSNP
の存在位置を示す図である。アクセッション番号：AC03
4259.2

【図１３８】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）フラボプロテイン１(NDUFV1)遺伝子の構造とSNPの
存在位置を示す図である。アクセッション番号：NT 009
304.2

【図１３９】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）フラボプロテイン２(NDUFV2)遺伝子の構造とSNPの
存在位置を示す図である。アクセッション番号：NT 011
024.2

【図１４０】ＮＡＤＨ−デハイドロゲナーゼ（ユビキノ
ン）フラボプロテイン３(NDUFV3)遺伝子の構造とSNPの
存在位置を示す図である。アクセッション番号：AP0017
48.1

【図１４１】ガンマ-グルタミルトランスフェラーゼ1
（GGT1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：D87002.1

【図１４２】トランスグルタミナーゼ1(TGM1) 遺伝子の
構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッション
番号：M98447.1

【図１４３】チトクロームＰ４５０サブファミリー１
（アロマティック化合物誘発性）ポリペプチド１(CYP1A
1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アク
セッション番号：X04300.1 及び AC020705.4

【図１４４】チトクロームＰ４５０サブファミリー１
（アロマティック化合物誘発性）ポリペプチド２ (CYP1
A2) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC020705.4

【図１４５】チトクロームＰ４５０サブファミリー１
（ジオキシン誘発性）ポリペプチド１(CYP1B1) 遺伝子
の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッショ
ン番号：AC009229.4

【図１４６】チトクロームＰ４５０サブファミリー３Ａ
（アロマティック化合物誘発性）ポリペプチド４(CYP3A
4) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アク
セッション番号：AF280107.1

【図１４７】チトクロームＰ４５０サブファミリー３
Ａ（アロマティック化合物誘発性）ポリペプチド５(CYP
3A5) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AC005020.5

【図１４８】チトクロームＰ４５０サブファミリー３
Ａポリペプチド７(CYP3A7) 遺伝子の構造とSNPの存在
位置を示す図である。アクセッション番号：AF280107.1

【図１４９】チトクロームＰ４５０ポリペプチド４３
(CYP3A43) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AC011904.3

【図１５０】チトクロームＰ４５０サブファミリーIVB
ポリペプチド１ (CYP4B1) 遺伝子の構造とSNPの存在
位置を示す図である。アクセッション番号：AL356793.1
0

【図１５１】チトクロームＰ４５０サブファミリーIVF
ポリペプチド２(CYP4F2) 遺伝子の構造とSNPの存在位
置を示す図である。アクセッション番号：AC005336.1

【図１５２】チトクロームＰ４５０サブファミリーIVF
ポリペプチド３ (CYP4F3) 遺伝子の構造とSNPの存在
位置を示す図である。アクセッション番号：AD000685.1

【図１５３】チトクロームＰ４５０サブファミリーIVF
ポリペプチド８ (CYP4F8) 遺伝子の構造とSNPの存在
位置を示す図である。アクセッション番号：AC068845.3

【図１５４】チトクロームＰ４５０サブファミリーXXVI
IA ポリペプチド１ (CYP27A1) 遺伝子の構造とSNPの存
在位置を示す図である。アクセッション番号：AC00997
4.7

【図１５５】チトクロームＰ４５０サブファミリーXXVI
IB ポリペプチド１ (CYP27B1) 遺伝子の構造とSNPの存
在位置を示す図である。アクセッション番号：AC02516
5.27

【図１５６】アリルアセタミドデアセチラーゼ(AADAC)
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：AC068647.4

【図１５７】カルボキシルエステラーゼ１(CES1) 遺伝
子の構造とSNPの存在位置を示す図であるアクセッショ
ン番号：AC007602.4

【図１５８】カルボキシルエステラーゼ２(CES2) 遺伝
子の構造とSNPの存在位置を示す図であるアクセッショ
ン番号：AC027131.4

【図１５９】グランザイムA(GZMA)遺伝子の構造とSNPの
存在位置を示す図である。アクセッション番号：AC0919
77.1

【図１６０】グランザイムB(GZMB)遺伝子の構造とSNPの
存在位置を示す図である。アクセッション番号：AL1360
18.3

【図１６１】エステラーゼD/ホルミルグルタチオンハイ
ドロラーゼ(ESD) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す
図である。アクセッション番号：AL136958.9

【図１６２Ａ】カルボキシルエステルリパーゼ（胆
汁酢酸誘発リパーゼ）（CEL）遺伝子の構造とSNPの存在
位置を示す図である。アクセッション番号：AL138750.
8, AL162417.20 及び AF072711.1

【図１６２Ｂ】カルボキシルエステルリパーゼ（胆
汁酢酸誘発リパーゼ）（CEL）遺伝子の構造とSNPの存在
位置を示す図である。（図１６２Ａの続き）アクセッシ
ョン番号：AL138750. , AL162417.20 及び AF072711.1

【図１６３】インターロイキン17（サイトトキシック
Tリンパ球アソシエイトセリンエステラーゼ8）（IL
17）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AL355513.11

【図１６４】ユビキチンカルボキシルターミナル
エステラーゼL3(ユビキチンチオールエステラーゼ)
（UCHL3）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：AL137244.28

【図１６５】ドリシル-ジホスホオリゴサッカライド-タ
ンパク質グリコシルトランスフェラーゼ（DDOST）遺伝
子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッシ
ョン番号：D89060

【図１６６】ニューロパチーターゲットエステラーゼ(N
TE)遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アク
セッション番号：AC021153

【図１６７】L1細胞接着分子（L1CAM）遺伝子の構造とS
NPの存在位置を示す図である。アクセッション番号：U5
2112

【図１６８】アリールアルキルアミン N-アセチルトラ
ンスフェラーゼ(AANAT)遺伝子の構造とSNPの存在位置を
示す図である。アクセッション番号：U40391

【図１６９】サッカロミセス・セレビシエ（Saccharomy
ces cerevisiae）のN-アセチルトランスフェラーゼ相同
体（ARD1）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：U52112

【図１７０】N-アセチルトランスフェラーゼ（NAT1）遺
伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッ
ション番号：X17059

【図１７１】N-アセチルトランスフェラーゼ2（NAT2）
遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセ
ッション番号：D10870

【図１７２】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー
2（ABCB2）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：X66401

【図１７３】ATP結合カセットサブファミリーBメンバー
3（ABCB3）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：X66401

【図１７４】グルタチオンSトランスフェラーゼM3（GST
M3）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：AF043105.1

【図１７５】グルタチオンSトランスフェラーゼM４（GS
TM4）遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。ア
クセッション番号：M96233.1

【図１７６】アルデヒドデヒドロゲナーゼ７(ALDH7)遺
伝子の構造とSNPの存在位置を示す図である。アクセッ
ション番号：AC004923

【図１７７】high-mobility group protein 17-like１
(HMG17L1) 遺伝子の構造とSNPの存在位置を示す図であ
る。アクセッション番号：Z97055.1

【図１７８】異なる２グループの被験者についてインベ
ーダー法によりタイピングを行った結果を示す図であ
る。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号ＦＩテーマコート゛(参考）Ｇ０１Ｎ 33/566 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ (71)出願人 501002482 飯田有俊神奈川県川崎市中原区田尻町21 (71)出願人 501002493 斎藤督東京都青梅市東青梅５−10−６河辺パークホームズ108 (72)発明者中村祐輔神奈川県横浜市青葉区あざみ野１−17−33 (72)発明者関根章博東京都国立市北１−11−８ (72)発明者飯田有俊神奈川県川崎市中原区田尻町21 (72)発明者斎藤督東京都青梅市東青梅５−10−６河辺パークホームズ108 Ｆターム(参考） 2G045 AA25 AA35 AA40 CA25 CA26 DA12 DA13 DA14 DA20 DA36 DA77 FB02 FB07 FB12 GC15 4B024 AA11 CA04 CA09 HA14 4B063 QA01 QA12 QA18 QQ44 QR55 QR62 QS25 QS34

Claims

【特許請求の範囲】

【請求項１】薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に存
在する遺伝子多型情報から、該遺伝子多型部位を含むよ
うに、又は薬物代謝酵素をコードする遺伝子を増幅した
ときの増幅断片中に前記遺伝子多型部位が含まれるよう
に、オリゴヌクレオチドプローブ及び/又はオリゴヌク
レオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオ
チドプローブ及び/又はオリゴヌクレオチドプライマー
を用いて、目的の薬物代謝酵素をコードする遺伝子中の
少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とす
る遺伝子多型の検出方法。
【請求項２】遺伝子多型部位を含むオリゴヌクレオチ
ドプローブ及び/又はオリゴヌクレオチドプライマー
が、その5'末端若しくは3'末端又は中央の塩基が当該遺
伝子多型部位となるように作製されたものである請求項
１記載の検出方法。
【請求項３】遺伝子多型部位を含むオリゴヌクレオチ
ドプローブが、薬物代謝酵素をコードする遺伝子とハイ
ブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが
結合したものであって、前記遺伝子多型部位が、当該ハ
イブリダイズし得る断片の5'末端又は3'末端である請求
項１記載の検出方法。
【請求項４】遺伝子多型部位を含むオリゴヌクレオチ
ドプローブ及び/又はオリゴヌクレオチドプライマー
が、配列番号１〜4309に示す塩基配列のうち第21番目の
塩基を含む少なくとも13塩基の配列又はこれに相補的な
配列を有するものからなる群から選択される少なくとも
１つである請求項１〜３のいずれかに記載の検出方法。
【請求項５】遺伝子多型が、一塩基多型、複数個の塩
基の欠失、置換若しくは挿入による多型、又はVNTR若し
くはマイクロサテライトによる多型である請求項１〜４
のいずれかに記載の検出方法。
【請求項６】請求項１〜５のいずれかの方法により得
られた検出結果から、当該薬物代謝酵素によって代謝さ
れる薬物の有効性及び安全性を評価することを特徴とす
る薬物の評価方法。
【請求項７】請求項６記載の評価方法により得られた
評価を指標として、使用すべき薬物を選択することを特
徴とする薬物のスクリーニング方法。
【請求項８】薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に含
まれる遺伝子多型情報と、被験者から採取した当該薬物
代謝酵素をコードする遺伝子の遺伝子多型情報とを比較
して、当該薬物代謝酵素によって代謝される薬物の有効
性及び/又は安全性を解析し、得られる解析結果から使
用すべき薬物を選択することを特徴とする薬物のスクリ
ーニング方法。
【請求項９】遺伝子多型情報が表１に示されるもので
ある請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】薬物代謝酵素が、エポキシドハイドロ
ラーゼ、メチルトランスフェラーゼ、N-アセチルトラン
スフェラーゼ、スルホトランスフェラーゼ、キノンオキ
シドレダクターゼ、グルタチオン-S-トランスフェラー
ゼ、UDP-グリコシルトランスフェラーゼ、アルデヒドデ
ヒドロゲナーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ、エステ
ラーゼ、NDUF、チトクロームp450（CYP）及びATP-結合
カセット/トランスポーターからなる群から選択される
少なくとも１つである請求項１〜９のいずれかに記載の
方法。
【請求項１１】配列番号１〜4309に示される塩基配列
又はこれに相補的な塩基配列からなる群から選択される
オリゴヌクレオチド。
【請求項１２】薬物代謝酵素をコードする遺伝子中に
存在する遺伝子多型情報から、該遺伝子多型部位を含む
ように作製されたオリゴヌクレオチド。
【請求項１３】オリゴヌクレオチドの5'末端若しくは
3'末端又は中央の塩基が、当該遺伝子多型部位となるよ
うに作製されたものである請求項12記載のオリゴヌクレ
オチド。
【請求項１４】遺伝子多型部位を含むオリゴヌクレオ
チドが、薬物代謝酵素をコードする遺伝子とハイブリダ
イズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合し
たものであって、前記遺伝子多型部位が、当該ハイブリ
ダイズし得る断片の5'末端又は3'末端である請求項12記
載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１５】オリゴヌクレオチドが、配列番号１〜
4309に示すいずれかの塩基配列のうち第21番目の塩基を
含む少なくとも13塩基の配列又はこれに相補的な配列を
有するものである請求項12〜14のいずれかに記載のオリ
ゴヌクレオチド。
【請求項１６】請求項11〜15のいずれかに記載のオリ
ゴヌクレオチドを含む遺伝子多型検出用キット。