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JP2002181817A - Method for producing polynucleotide array - Google Patents

Method for producing polynucleotide array

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JP2002181817A
JP2002181817A JP2000374754A JP2000374754A JP2002181817A JP 2002181817 A JP2002181817 A JP 2002181817A JP 2000374754 A JP2000374754 A JP 2000374754A JP 2000374754 A JP2000374754 A JP 2000374754A JP 2002181817 A JP2002181817 A JP 2002181817A
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JP
Japan
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polynucleotide
solution
support
dispensing needle
producing
Prior art date
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JP2000374754A
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Japanese (ja)
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Manabu Harada
学 原田
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Nippon Laser and Electronics Lab
Original Assignee
Nippon Laser and Electronics Lab
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Publication date
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  • Investigating Or Analyzing Non-Biological Materials By The Use Of Chemical Means (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

(57)【要約】 (修正有) 【課題】支持体上にスポッティングされる多種類のポリ
ヌクレオチドの相互汚染を防止しながら濃度がほぼは均
一な状態で強固に固定して被検用ヌクレオチドの解析作
業を有効、かつ効率的に行ない充分な測定感度のあるポ
リヌクレオチドアレイの作製方法を提供する。 【解決手段】1.ポリヌクレオチドを少なくとも水に約
10体積%ホルムアミドを添加した溶媒に溶解して溶液
を調整する、2.上記該溶液を(1).洗浄液により分注
針の先端部を洗浄する、(2).分注針に該溶液をサンプ
リングする、(3).分注針を捨て打ち板に当接して先端
部に付着した余剰の該溶液を除去する、(4).支持体表
面に分注針を当接して多数の該溶液をスポッティングす
る、(5).乾燥してポリヌクレオチドを固定する、(6).
支持体をブロック液に浸漬してポリヌクレオチドスポッ
ト相互間の支持体表面をブロッキング処理する、上記工
程に従って支持体表面にポリヌクレオチドを固定する。
(57) [Summary] (Corrected) [PROBLEMS] To prevent cross-contamination of various kinds of polynucleotides spotted on a support while firmly fixing the concentration of the polynucleotides to be substantially uniform in a substantially uniform state. Provided is a method for producing a polynucleotide array having sufficient measurement sensitivity by performing an analysis operation effectively and efficiently. [MEANS FOR SOLVING PROBLEMS] 1. Prepare a solution by dissolving the polynucleotide in at least about 10% by volume of formamide in water. The above solution was used in (1). Wash the tip of the dispensing needle with the washing liquid, (2). Sampling the solution on a dispensing needle, (3). (4) The dispensing needle is brought into contact with the discard plate to remove excess solution adhering to the tip. A large number of the solutions are spotted by abutting a dispensing needle on the surface of the support (5). Drying to fix the polynucleotide, (6).
The support is immersed in a blocking solution to block the surface of the support between the polynucleotide spots. The polynucleotide is immobilized on the surface of the support according to the above-described steps.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明が属する技術分野】本発明は、支持体上に多種類
で多数のポリヌクレオチドをスポット状に固定したポリ
ヌクレオチドアレイの作製方法に関する。
BACKGROUND OF THE INVENTION 1. Field of the Invention The present invention relates to a method for producing a polynucleotide array in which many and many kinds of polynucleotides are immobilized in spots on a support.

【0002】[0002]

【発明が解決しようとする課題】遺伝子発現や遺伝子多
系解析の研究においては、スライドガラス等の支持体表
面に、適当な塩類(0.45mol/lの塩化ナトリウム、
0.045mol/lのクエン酸ナトリウム等)を含む夫々
の溶液に異なる種類のポリヌクレオチドを夫々溶解した
多種類のポリヌクレオチド溶液を、高密度で多数、スポ
ッティングして乾燥固定したポリヌクレオチドアレイ
(DNAチップ)を使用し、1回の測定作業で多種類の
ポリヌクレオチド試料を多項目にわたって同時に解析で
きるようにしている。
In the study of gene expression and gene polymorphism analysis, a suitable salt (0.45 mol / l sodium chloride,
Polynucleotide arrays (DNA) in which a large number of various types of polynucleotide solutions obtained by dissolving different types of polynucleotides in respective solutions containing 0.045 mol / l sodium citrate, etc., are spotted at high density and dried and fixed. Chip), so that multiple types of polynucleotide samples can be analyzed simultaneously on multiple items in one measurement operation.

【0003】しかし、上記のポリヌクレオチドアレイに
あっては、乾燥固定したポリヌクレオチドを乾燥固定し
た後にポリヌクレオチドの相互間の支持体表面に被検用
ヌクレオチドが付着するのを防止するブロッキング処理
を施したり、支持体表面に被検用ヌクレオチド溶液を滴
下してハイブリダイゼーションする際に、支持体表面か
らポリヌクレオチドが剥離し易く、被検用ヌクレオチド
を有効、かつ高感度に測定できなかった。
[0003] However, in the above-mentioned polynucleotide array, after the dried and fixed polynucleotide is dried and fixed, a blocking treatment for preventing the test nucleotide from adhering to the surface of the support between the polynucleotides is performed. In addition, when the nucleotide solution for test was dropped on the surface of the support for hybridization, the polynucleotide was easily peeled off from the surface of the support, and the nucleotide for test could not be measured effectively and with high sensitivity.

【0004】この欠点は、支持体表面を、例えばアミノ
基と結合し易い状態に表面処理すると共に固定されるポ
リヌクレオチドの末端をアミノ化して固定強度を高くす
ることにより解決し得るが、多種類のポリヌクレオチド
の末端をアミノ化修飾するのに多大の費用と時間がかか
り、解析コストが増大する問題を生じさせていた。
[0004] This disadvantage can be solved by treating the surface of the support so as to easily bind to amino groups, for example, and aminating the end of the polynucleotide to be fixed to increase the fixing strength. Amination and modification of the termini of the polynucleotides require a great deal of cost and time, resulting in an increase in analysis costs.

【0005】また、支持体表面とポリヌクレオチドの反
応時間を長くして固定化反応を高くするため、ポリヌク
レオチドが溶解される溶媒としてジメチルスルホキシド
やエチレングリコール等の吸水性が高い溶媒を使用する
処理方法が提案されている。
[0005] Further, in order to increase the reaction time between the surface of the support and the polynucleotide to enhance the immobilization reaction, a treatment using a highly water-absorbing solvent such as dimethyl sulfoxide or ethylene glycol as the solvent in which the polynucleotide is dissolved. A method has been proposed.

【0006】この方法にあっては、支持体上にポリヌク
レオチドがスポッティングされた際にスポット形状が不
均一になり易く、ポリヌクレオチドの濃度が不均一にな
って被検用ヌクレオチドを高感度で、効率的に解析する
ことが困難であった。
In this method, when a polynucleotide is spotted on a support, the spot shape is likely to be non-uniform, and the concentration of the polynucleotide is non-uniform, so that the test nucleotide can be obtained with high sensitivity. It was difficult to analyze efficiently.

【0007】また、支持体表面に所定量で多数のポリヌ
クレオチド溶液をスポッティングする装置としては、先
端部に軸線方向に延びる縦割り溝を設けた分注針を使用
し、該縦割り溝内にポリヌクレオチド溶液をサンプリン
グした後に支持体表面に接触させることにより所定量の
ポリヌクレオチドを所定のスポット形状でスポッティン
グしている。
Further, as a device for spotting a large number of polynucleotide solutions in a predetermined amount on the surface of a support, a dispensing needle provided with a longitudinally extending groove at the tip end thereof is used. A predetermined amount of the polynucleotide is spotted in a predetermined spot shape by contacting the surface of the support after sampling the polynucleotide solution.

【0008】しかし、上記した分注針を使用したスポッ
ティング方法にあっては、スポッティング初期には先端
部に付着した余剰のポリヌクレオチド溶液が流出して支
持体に付着してスポット径が大きくなることによりポリ
ヌクレオチドのスポット相互が汚染し合うおそれがある
と共にスポット形状が不均一化により濃度が均一化せ
ず、被検用ヌクレオチドを高感度に検出できない問題を
有している。
However, in the spotting method using the dispensing needle described above, at the initial stage of spotting, the excess polynucleotide solution adhering to the tip portion flows out and adheres to the support, and the spot diameter increases. Therefore, there is a problem that the spots of the polynucleotide may be contaminated with each other, and the concentration of the spots is not made uniform due to the non-uniform spot shape, so that the nucleotide to be tested cannot be detected with high sensitivity.

【0009】更に、上記した分注針を使用したスポッテ
ィング方法にあっては、1個の分注針で多種類のポリヌ
クレオチド溶液をスポッティングしているが、分注針の
洗浄が不充分な場合にはスポッティングされるポリヌク
レオチドが汚染されて被検用ヌクレオチドを正確に解析
できなかった。
Further, in the spotting method using the above-described dispensing needle, a single dispensing needle spots many kinds of polynucleotide solutions, but the dispensing needle is not sufficiently washed. In the above, the polynucleotide to be spotted was contaminated and the test nucleotide could not be accurately analyzed.

【0010】本発明は、上記した従来の欠点を解決する
ために発明されたものであり、その課題とする処は、支
持体上にスポッティングされるポリヌクレオチドの相互
汚染を防止しながら多種類のポリヌクレオチドを濃度が
ほぼは均一な状態で強固に固定して被検用ヌクレオチド
の解析作業を有効、かつ効率的に行うことができるポリ
ヌクレオチドアレイの作製方法を提供することにある。
SUMMARY OF THE INVENTION The present invention has been made to solve the above-mentioned conventional drawbacks, and an object of the present invention is to prevent various kinds of polynucleotides spotted on a support while preventing cross-contamination. It is an object of the present invention to provide a method for producing a polynucleotide array that can effectively and efficiently perform a work of analyzing a test nucleotide by firmly fixing a polynucleotide in a substantially uniform concentration state.

【0011】また、本発明の他の課題は、支持体上にス
ポッティングされるポリヌクレオチド試料のスポット濃
度をほぼ均一化して充分な測定感度を得ることができる
ポリヌクレオチドアレイの作製方法を提供することにあ
る。
Another object of the present invention is to provide a method for producing a polynucleotide array capable of obtaining a sufficient measurement sensitivity by making the spot concentration of a polynucleotide sample spotted on a support substantially uniform. It is in.

【0012】[0012]

【課題を解決するための手段】請求項1の発明は、支持
体表面に分注針を当接してポリヌクレオチド溶液をスポ
ッティングした後に固定してポリヌクレオチドアレイを
作製する方法において、1.ポリヌクレオチドを少なく
とも水に約10体積%ホルムアミドを添加した溶媒に溶
解してポリヌクレオチド溶液に調整する、2.上記のよ
うに調整されたポリヌクレオチドを以下の工程に従って
支持体表面にポリヌクレオチドを固定することを特徴と
する。
According to the first aspect of the present invention, there is provided a method for producing a polynucleotide array by abutting a dispensing needle on a surface of a support, spotting a polynucleotide solution, and then fixing the solution. 1. preparing a polynucleotide solution by dissolving the polynucleotide in at least about 10% by volume of formamide in water. The polynucleotide prepared as described above is characterized in that the polynucleotide is immobilized on the surface of a support according to the following steps.

【0013】(1).洗浄液により分注針の先端部を洗浄
する。 (2).先端部が洗浄された分注針にポリヌクレオチド溶
液をサンプリングする。 (3).ポリヌクレオチド溶液がサンプリングされた分注
針を捨て打ち板に当接して先端部に付着した余剰のポリ
ヌクレオチド溶液を除去する。 (4).支持体表面に対して分注針を当接して多数のポリ
ヌクレオチド溶液をスポッティングする。 (5).支持体表面にスポッティングされた多数のポリヌ
クレオチド溶液を乾燥してポリヌクレオチドを固定す
る。 (6).ポリヌクレオチドが固定された支持体をブロック
液に浸漬してポリヌクレオチドスポット相互間の支持体
表面をブロッキング処理する。
(1). The tip of the dispensing needle is washed with the washing liquid. (2). The polynucleotide solution is sampled on the dispensing needle whose tip has been washed. (3). The dispensing needle from which the polynucleotide solution has been sampled is discarded, and the surplus polynucleotide solution adhering to the tip is removed by contacting the hitting plate. (Four). A number of polynucleotide solutions are spotted by contacting the dispensing needle against the surface of the support. (Five). A large number of polynucleotide solutions spotted on the surface of the support are dried to fix the polynucleotides. (6). The support on which the polynucleotide is immobilized is immersed in a blocking solution to block the surface of the support between the polynucleotide spots.

【0014】また、請求項2の発明は、支持体表面に分
注針を当接してポリヌクレオチド溶液をスポッティング
した後に固定してポリヌクレオチドアレイを作製する方
法において、1.ポリヌクレオチドを少なくとも水に約
10体積%グリセロールを添加した溶媒に溶解してポリ
ヌクレオチド溶液に調整する、上記のように調整された
ポリヌクレオチドを以下の工程に従って支持体表面にポ
リヌクレオチドを固定することを特徴とする。
According to a second aspect of the present invention, there is provided a method for producing a polynucleotide array by abutting a dispensing needle on the surface of a support, spotting a polynucleotide solution, and then fixing the solution. Dissolving the polynucleotide in a solvent in which at least about 10% by volume of glycerol is added to water to prepare a polynucleotide solution; immobilizing the polynucleotide prepared as described above on the surface of a support according to the following steps: It is characterized by.

【0015】(1).洗浄液により分注針の先端部を洗浄
する。 (2).先端部が洗浄された分注針にポリヌクレオチド溶
液をサンプリングする。 (3).ポリヌクレオチド溶液がサンプリングされた分注
針を捨て打ち板に当接して先端部に付着した余剰のポリ
ヌクレオチド溶液を除去する。 (4).支持体表面に対して分注針を当接して多数のポリ
ヌクレオチド溶液をスポッティングする。 (5).支持体表面にスポッティングされた多数のポリヌ
クレオチド溶液を乾燥してポリヌクレオチドを固定す
る。 (6).ポリヌクレオチドが固定された支持体をブロック
液に浸漬してポリヌクレオチドスポット相互間の支持体
表面をブロッキング処理する。
(1). The tip of the dispensing needle is washed with the washing liquid. (2). The polynucleotide solution is sampled on the dispensing needle whose tip has been washed. (3). The dispensing needle from which the polynucleotide solution has been sampled is discarded, and the surplus polynucleotide solution adhering to the tip is removed by contacting the hitting plate. (Four). A number of polynucleotide solutions are spotted by contacting the dispensing needle against the surface of the support. (Five). A large number of polynucleotide solutions spotted on the surface of the support are dried to fix the polynucleotides. (6). The support on which the polynucleotide is immobilized is immersed in a blocking solution to block the surface of the support between the polynucleotide spots.

【0016】[0016]

【発明の実施形態】以下、本発明の実施形態を図に従っ
て説明する。図1〜図2において、ポリヌクレオチドア
レイ1の支持体3は、例えばガラス、膜、プラスチック
(ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリスチレン等)等
が使用可能で、好適例としては、例えば松浪硝子工業株
式会社製のスライドガラス(型式S9115)が挙げら
れる。
DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS Embodiments of the present invention will be described below with reference to the drawings. 1 and 2, the support 3 of the polynucleotide array 1 can be made of, for example, glass, membrane, plastic (polyethylene, polypropylene, polystyrene, etc.), and a preferred example is manufactured by Matsunami Glass Co., Ltd. A slide glass (model S9115) can be used.

【0017】支持体の表面処理 支持体3の表面は陽電荷処理またはアミノ化処理され
る。陽電荷処理としては支持体3の表面をポリ−L−リ
シンまたはアミノプロピルトリエトキシシラン等で表面
処理して陽電荷化させる。また、アミノ化処理としては
上記方法により陽電荷化された支持体3の表面を、アル
デヒド処理またはスクシニド処理してアミノ基が結合し
易い状態にする。このアミノ化処理は固定されるポリヌ
クレオチド末端のアミノ基の結合を促進させるのに有効
である。
Surface Treatment of Support The surface of the support 3 is subjected to a positive charge treatment or an amination treatment. As the positive charge treatment, the surface of the support 3 is surface-treated with poly-L-lysine, aminopropyltriethoxysilane, or the like to be positively charged. In the amination treatment, the surface of the support 3 which has been positively charged by the above method is treated with an aldehyde or succinide so that the amino group is easily bonded. This amination treatment is effective in promoting the binding of the amino group at the terminal of the polynucleotide to be immobilized.

【0018】ポリヌクレオチド溶液の調整 支持体3の表面に固定されるポリヌクレオチド溶液を以
下のように調整する。
Preparation of Polynucleotide Solution A polynucleotide solution to be fixed on the surface of the support 3 is prepared as follows.

【0019】本発明で使用するポリヌクレオチド(核
酸)の種類は特に限定されず、DNA(デオキシリボ核
酸)、RNA(リボ核酸)等が挙げられる。そしてDN
A及びRNAについても特に限定されず、染色体DNA
由来のDNA断片、mRNA、cDNA、化学合成DN
Aまたは化学合成RNAの何れでもよく、具体的にはP
CR増幅産物、制限酵素切断処理DNA等の何れであっ
てもよい。
The kind of the polynucleotide (nucleic acid) used in the present invention is not particularly limited, and includes DNA (deoxyribonucleic acid), RNA (ribonucleic acid) and the like. And DN
A and RNA are not particularly limited, and chromosomal DNA
DNA fragments, mRNA, cDNA, chemically synthesized DN
A or any of chemically synthesized RNAs.
Any of a CR amplification product, restriction enzyme digested DNA and the like may be used.

【0020】本発明で使用するポリヌクレオチドは、任
意生物に由来するものを使用できる。また、本発明で使
用するポリヌクレオチドは疾患と関連することが知られ
ている染色体位置由来のDNA断片、cDNA断片、化
学合成DNAが挙げられる。更に、本発明のポリヌクレ
オチドは特定の遺伝子の一部を含むDNA断片、転写レ
ベルの異常が見られるmRNAまたは該mRNAに由来
するcDNAでもよい。
The polynucleotide used in the present invention may be derived from any organism. The polynucleotide used in the present invention includes a DNA fragment derived from a chromosome position known to be associated with a disease, a cDNA fragment, and a chemically synthesized DNA. Furthermore, the polynucleotide of the present invention may be a DNA fragment containing a part of a specific gene, mRNA having an abnormal transcription level, or cDNA derived from the mRNA.

【0021】上記した本発明のポリヌクレオチドは、純
水または3×SSC溶液(0.45M塩化ナトリウム、
0.045Mクエン酸ナトリウムでpH:7.0に調
整)に10体積%のホルムアミドまたはグリセロールを
添加してポリヌクレオチド濃度を0.5〜50pmol/μl
に調整したものを使用する。
The above-mentioned polynucleotide of the present invention can be prepared using pure water or a 3 × SSC solution (0.45 M sodium chloride,
10% by volume of formamide or glycerol was added to the mixture to adjust the polynucleotide concentration to 0.5 to 50 pmol / μl.
Use the one adjusted to.

【0022】支持体3の表面に対する前記ポリヌクレオ
チド溶液をスポッティングするには、多数の分注針5
が、例えば100〜200μmの間隔でマトリクス状に
配列された分注ヘッド7を使用。支持体3の表面に対し
てX−Y−Z軸方向へ移動制御して多数のポリヌクレオ
チド溶液をスポッティングする。このスポッティングに
使用する各分注針5は先端直径が、例えば100〜20
0μmで、先端から軸線方向へ縦割り溝5aが形成さ
れ、縦割り溝5a内にスポッティングされるポリヌクレ
オチド溶液を毛細管現象により吸水させて溜める。
In order to spot the polynucleotide solution on the surface of the support 3, a large number of dispensing needles 5
However, dispensing heads 7 arranged in a matrix at intervals of, for example, 100 to 200 μm are used. A large number of polynucleotide solutions are spotted by controlling the movement in the XYZ axis direction with respect to the surface of the support 3. Each dispensing needle 5 used for this spotting has a tip diameter of, for example, 100 to 20.
At 0 μm, a vertically dividing groove 5a is formed in the axial direction from the tip, and the polynucleotide solution spotted in the vertically dividing groove 5a is absorbed by capillary action and stored.

【0023】分注針5としては先端部に貫通孔が形成さ
れると共に先端部外周に加熱部材を取り付け、後端部に
設けられたタンク内に溜められて貫通孔内に滞留するポ
リヌクレオチド溶液を加熱部材に瞬間加熱して気泡化し
て支持体3の表面に飛び出させることによりスポッティ
ングするものであってもよい。
The dispensing needle 5 has a through-hole at the tip and a heating member attached to the outer periphery of the tip, and a polynucleotide solution stored in a tank provided at the rear end and retained in the through-hole. May be spotted by instantaneously heating the heating member to form bubbles and pop out on the surface of the support 3.

【0024】また、上記した気泡飛び出し形式の分注針
のほかにピエゾ素子の変形や超音波振動を利用してポリ
ヌクレオチド溶液を直接飛び出させて支持体3の表面に
スポッティングする形式であってもよい。
Further, in addition to the above-described dispensing needle of the bubble pop-out type, a type in which the polynucleotide solution is directly popped out by using deformation of a piezo element or ultrasonic vibration and spotted on the surface of the support 3 may be used. Good.

【0025】洗浄 分注ヘッド7を移動制御して支持体3の表面にポリヌク
レオチド溶液をスポッティングする際に、先ず、分注ヘ
ッド7における各分注針5の先端部を洗浄し、スポッテ
ィングされる多種類のポリヌクレオチド相互が汚染(キ
ャリーオーバー)されるのを防止する。
When the polynucleotide solution is spotted on the surface of the support 3 by controlling the movement of the dispensing head 7, first, the tip of each dispensing needle 5 in the dispensing head 7 is washed and spotted. Prevents contamination of various types of polynucleotides (carryover).

【0026】洗浄方法としては、先ず、分注ヘッド7に
おける各分注針5の先端を多孔質セラミック板、吸水紙
板等の洗浄吸水板に押し当てて各縦割り溝5a内に残溜
したポリヌクレオチド溶液を排出させた後、0.1%ド
デシル硫酸ナトリウム水溶液槽、超純水槽、エタノール
槽の順に約1〜5sec.間、浸漬して洗浄した後、各分注
針5の先端部を気相吸引して付着したエタノールを乾燥
させて行う。
As the cleaning method, first, the tip of each dispensing needle 5 in the dispensing head 7 is pressed against a cleaning water-absorbing plate such as a porous ceramic plate or a water-absorbing paper plate to remove the poly remaining in each vertically-divided groove 5a. After discharging the nucleotide solution, the solution is immersed in the order of a 0.1% sodium dodecyl sulfate aqueous solution tank, an ultrapure water tank, and an ethanol tank for about 1 to 5 sec. This is performed by drying the attached ethanol by phase suction.

【0027】ポリヌクレオチドのサンプリング 上記のように洗浄された分注ヘッド7における各分注針
5の先端部を、支持体3表面に固定しようとする多種類
のポリヌクレオチド溶液が溜められた、例えば384穴
マルチプレートの各溶液槽内に約7sec.間、浸漬して各
縦割り溝5a内に、ポリヌクレオチド溶液を毛細管現象
により吸水させてサンプリングする。
Sampling of Polynucleotides The tip of each dispensing needle 5 in the dispensing head 7 that has been washed as described above is filled with various kinds of polynucleotide solutions to be fixed to the surface of the support 3. The polynucleotide solution is immersed in each solution tank of the 384-well multi-plate for about 7 sec., And the polynucleotide solution is absorbed into each of the vertically divided grooves 5a by capillary action and sampled.

【0028】余剰ポリヌクレオチドの除去 分注ヘッド7によるスポッティング作業に先立って捨て
打ち操作を行う。即ち、分注針5にポリヌクレオチド溶
液をサンプリングした際に各分注針5の先端部外面には
余剰のポリヌクレオチド溶液が付着したままの状態にな
っている。このため、各分注針5の先端面を多孔質セラ
ミック板、吸水紙板またはガラス板等の捨て打ち板に対
し、1回当り約0.5〜1sec.間で数回、押し当てるこ
とにより各分注針5の先端部外面に付着した余剰溶液を
吸収させる。
Removal of surplus polynucleotide Prior to the spotting operation by the dispensing head 7, a discard operation is performed. That is, when the polynucleotide solution is sampled on the dispensing needle 5, the surplus polynucleotide solution remains attached to the outer surface of the tip of each dispensing needle 5. For this reason, the tip surface of each dispensing needle 5 is pressed several times at a time of about 0.5 to 1 sec. Each time against a discarded punching plate such as a porous ceramic plate, a water-absorbing paper plate or a glass plate. Excess solution adhering to the outer surface of the tip of the dispensing needle 5 is absorbed.

【0029】これにより支持体3表面に対するスポッテ
ィング初期に分注針5の先端部に付着した余剰のポリヌ
クレオチド溶液がスポッティングされるのを防止し、ス
ポッティングされるポリヌクレオチド溶液による各スポ
ットの大きさをほぼ均一することによりしてポリヌクレ
オチド溶液の濃度を均一化させると共にスポット相互間
の汚染を防止する。
This prevents excess polynucleotide solution adhering to the tip of the dispensing needle 5 from being spotted at the beginning of spotting on the surface of the support 3 and reducing the size of each spot due to the polynucleotide solution to be spotted. Substantially uniformity makes the concentration of the polynucleotide solution uniform and prevents contamination between spots.

【0030】スポッティング 次に、支持体3表面に対し、分注ヘッド7をX−Y−Z
軸方向へ移動制御して分注ヘッド7における各分注針5
の先端面を約0.5〜1sec.間、当接させて多種類のポ
リヌクレオチド溶液をマトリクス状にスポッティングす
る。このスポッティング作業において分注ヘッド7はX
−Y軸方向に対し、各スポットの相互間隔が約100〜
200μmになるように移動制御される。その際のスポ
ッティング環境としては、常温環境下であってもよい
が、好ましくは外部環境温度を約2〜10℃、好適例と
しては約2〜6℃で、湿度を50〜70%に保って行う
ことによりスポッティングされたポリヌクレオチド溶液
が短時間に乾燥するのを回避して固定化時間を長くする
ことができる。
Next, the dispensing head 7 is moved to the surface of the support 3 by XYZ
Each dispensing needle 5 in the dispensing head 7 is controlled to move in the axial direction.
The various types of polynucleotide solutions are spotted in a matrix by contacting the tip surfaces of the above for about 0.5 to 1 sec. In this spotting operation, the dispensing head 7
-The distance between the spots is approximately 100 to
The movement is controlled to be 200 μm. The spotting environment at that time may be a normal temperature environment, but preferably the external environment temperature is about 2 to 10 ° C, preferably about 2 to 6 ° C, and the humidity is kept at 50 to 70%. By doing so, the spotted polynucleotide solution can be prevented from drying in a short time, and the immobilization time can be lengthened.

【0031】具体的には、支持体3及び分注ヘッド7を
含む領域全体を外気と仕切ると共に仕切られた内部領域
に温度センサー、湿度センサーを設けて上記設定温度及
び湿度となるように加熱及び加湿する装置が設けて行な
う。
More specifically, the entire area including the support 3 and the dispensing head 7 is partitioned from the outside air, and a temperature sensor and a humidity sensor are provided in the partitioned internal area so that the heating and heating are performed so that the above-mentioned set temperature and humidity are obtained. This is performed by providing a humidifying device.

【0032】次に、多種類のポリヌクレオチド溶液を多
数、スポッティングした支持体3表面に水蒸気を約1〜
3sec.間、吹き付けた後に支持体3を約80〜95℃に
加熱されたホットプレート上に載置して乾燥固定させ
る。支持体3の表面に分注針5の先端面を当接してポリ
ヌクレオチド溶液をスポッティングした際には各スポッ
トにおけるポリヌクレオチド溶液の付着状態が不均一に
なってスポット内の濃度が一定しない。これを回避する
ため、支持体3に対するポリヌクレオチド溶液のスポッ
ティング後、水蒸気を吹き付けることによりスポッティ
ングされたポリヌクレオチド溶液の濃度を低くして各ス
ポットにおける付着状態を均一化させる。
Next, water vapor is applied to the surface of the support 3 on which a large number of polynucleotide solutions of various types are spotted.
After spraying for 3 seconds, the support 3 is placed on a hot plate heated to about 80 to 95 ° C. and dried and fixed. When the tip surface of the dispensing needle 5 is brought into contact with the surface of the support 3 and the polynucleotide solution is spotted, the adhesion state of the polynucleotide solution in each spot becomes uneven, and the concentration in the spot is not constant. In order to avoid this, after spotting the polynucleotide solution on the support 3, the concentration of the spotted polynucleotide solution is reduced by spraying water vapor to make the adhesion state at each spot uniform.

【0033】このとき、ホルムアミドが添加されたポリ
ヌクレオチド溶液にあっては、ホルムアミドによりヌク
レオチドの変性が阻害されることにより一定形態を保つ
ことができる。このため、陽電荷化処理された支持体3
の表面にスポッティングした際には、ポリヌクレオチド
において陰電荷化したリン酸が支持体3表面に静電結合
し合う確率を高めている。
At this time, in the polynucleotide solution to which formamide is added, a certain form can be maintained by inhibiting the denaturation of nucleotides by formamide. Therefore, the positively charged support 3
When spotting is performed on the surface of the substrate 3, the probability that the negatively charged phosphate in the polynucleotide is electrostatically bonded to the surface of the support 3 is increased.

【0034】また、アミノ化処理された支持体3の表面
にスポッティングした際にはポリヌクレオチド末端のア
ミノ基との結合確率を高めている。即ち、ポリヌクレオ
チドが絶えず変性する場合には静電結合或いはアミノ基
結合がし難くなるが、ポリヌクレオチドの変性を阻害し
て一定形態にすることにより結合確率を高めることがで
きる。
Further, when spotting is performed on the surface of the aminated support 3, the probability of binding to the amino group at the end of the polynucleotide is increased. That is, when the polynucleotide is constantly denatured, it becomes difficult to form an electrostatic bond or an amino group bond. However, the denaturation of the polynucleotide is inhibited and the binding probability can be increased by keeping the polynucleotide in a certain form.

【0035】更に、グリセロースが添加されたポリヌク
レオチド溶液にあっては、ホルムアミド添加のようにヌ
クレオチドの変性は阻害されず、絶えず変性するが、乾
燥時間を長くして静電結合またはアミン基結合の時間を
長くして結合確率を高めることができる。
Furthermore, in the polynucleotide solution to which glycerose is added, the denaturation of nucleotides is not inhibited as in the case of formamide addition, and is constantly denatured. By increasing the time, the connection probability can be increased.

【0036】これにより支持体3表面に対するポリヌク
レオチドの固定強度を高くする。
Thus, the fixing strength of the polynucleotide to the surface of the support 3 is increased.

【0037】乾燥 次に、ポリヌクレオチドが固定された支持体3表面に対
し、UVクロスリンカー(Hoefer社製 UVC5
00)を使用して約50〜120mJの紫外光を照射し
てポリヌクレオチドを固定化する。
Drying Next, a UV crosslinker (UVC5 manufactured by Hoefer) was applied to the surface of the support 3 on which the polynucleotide was immobilized.
(00) to irradiate about 50 to 120 mJ of ultraviolet light to immobilize the polynucleotide.

【0038】ブロッキング処理 次に、支持体3表面におけるポリヌクレオチドの非スポ
ッティング領域をブロッキング処理する。ブロッキング
処理方法としては、1〜1.5wt%無水こはく酸、9
0体積%N−メチルピロシノン、10体積%0.2Mほ
う酸ナトリウム溶液(pH:8.0)でpH5〜6に調整さ
れたブロック液中にポリヌクレオチドが固定された支持
体3全体を約15min.間、浸漬して行なう。
Next, the non-spotting region of the polynucleotide on the surface of the support 3 is subjected to a blocking treatment. As the blocking treatment method, 1 to 1.5 wt% succinic anhydride, 9
The entire support 3 on which the polynucleotide was immobilized in a block solution adjusted to pH 5 to 6 with 0 vol% N-methylpyrosinone and 10 vol% 0.2 M sodium borate solution (pH: 8.0) for about 15 minutes. During this time, it is immersed.

【0039】そしてブロック溶液から取り出した支持体
3を95〜99℃の熱水に浸漬して約60秒間、放置し
た後、支持体3をエタノールに浸漬した後に、支持体3
表面を風乾させる。
Then, the support 3 taken out from the block solution is immersed in hot water of 95 to 99 ° C. and left for about 60 seconds, and then the support 3 is immersed in ethanol.
Allow the surface to air dry.

【0040】他のブロッキング処理方法としては、ブロ
ック液にエタノールアミン溶液でpH8〜9に調整したも
のを使用し、同様に浸漬して行なう。即ち、ポリヌクレ
オチドがスポッティングされた支持体3を45〜65℃
の飽和水蒸気下で4〜14時間、インキベーションした
後、各終濃度50mmol/l エタノールアミン、
0.1Mトリス緩衝液pH:9.0、0.1%ドデシル
硫酸ナトリウムで全体がpH:8〜9に調整したブロッ
ク液に10〜30min.浸漬し、次に水洗した後に50
℃、0.1%ドデシル硫酸ナトリウムを含むSSC溶液
に15〜60min.浸漬する。更に、水洗後、支持体3に
付着した液体成分を除去した後に乾燥して行なう。
As another blocking treatment method, a blocking solution adjusted to pH 8 to 9 with an ethanolamine solution is used and immersed similarly. That is, the support 3 on which the polynucleotide was spotted was heated at 45 to 65 ° C.
After incubating for 4-14 hours under saturated steam of ethanol, each final concentration 50 mmol / l ethanolamine,
0.1M Tris buffer pH: 9.0, immersed in a block solution adjusted to pH: 8 to 9 with 0.1% sodium dodecyl sulfate for 10 to 30 min.
C. at 15 ° C. for 15 to 60 minutes in an SSC solution containing 0.1% sodium dodecyl sulfate. Furthermore, after washing with water, drying is performed after removing the liquid component adhering to the support 3.

【0041】比較例1 本比較例においては、酵母内の機能ヌクレオチドをコピ
ーした合成オリゴヌクレオチド(80塩基、終濃度25
pmol/μl)を、3×SSC溶液、リン酸緩衝液(pH:
7.5)、超純水、10体積%ホルムアルデヒド水溶液
の4種類の溶媒に溶解した合成オリゴヌクレオチド溶液
を使用し、各溶媒毎の固定化率を検証した。
Comparative Example 1 In this comparative example, a synthetic oligonucleotide (80 bases, final concentration 25
pmol / μl) in 3 × SSC solution, phosphate buffer (pH:
7.5) Using a synthetic oligonucleotide solution dissolved in four kinds of solvents of ultrapure water and a 10% by volume aqueous formaldehyde solution, the immobilization rate of each solvent was verified.

【0042】ハイブリダイゼーションに使用したヌクレ
オチドは、支持体3表面に固定された合成オリゴヌクレ
オチドと相補的塩基配列を持ち、蛍光色素(Cy3)によ
り標識されたオリゴヌクレオチド(80塩基、終濃度1
pmol/μl、0.1g/ml鮭精子DNAを含む)を使用し
た。
The nucleotides used for the hybridization were oligonucleotides (80 bases, final concentration of 1) having a complementary nucleotide sequence to the synthetic oligonucleotide fixed on the surface of the support 3 and labeled with a fluorescent dye (Cy3).
pmol / μl, containing 0.1 g / ml salmon sperm DNA).

【0043】また、支持体3としては、松浪硝子工業株
式会社製のDNAチップ用スライドガラス(商品名:M
ASコートスライド)を使用した。
As the support 3, a slide glass for DNA chips manufactured by Matsunami Glass Industry Co., Ltd. (trade name: M
AS-coated slide).

【0044】図3及び図4で示すように、溶媒としての
ホルムアルデヒドで合成オリゴヌクレオチドを溶解した
場合が、他の溶媒に比べて蛍光強度が一番高いことを示
している。この事実は合成オリゴヌクレオチドの溶媒と
してホルムアルデヒドを使用した場合に、支持体3表面
に対する合成オリゴヌクレオチドの固定量が一番多いこ
とを示している。
As shown in FIGS. 3 and 4, when the synthetic oligonucleotide is dissolved in formaldehyde as a solvent, the fluorescence intensity is highest as compared with other solvents. This fact indicates that when formaldehyde is used as a solvent for the synthetic oligonucleotide, the amount of the synthetic oligonucleotide immobilized on the surface of the support 3 is the largest.

【0045】図5は、溶媒としてホルムアミドを使用し
て合成オリゴヌクレオチドを溶解した合成オリゴヌクレ
オチド溶液をスポッティングして固定したポリヌクレオ
チドアレイ1に対し、ブロッキング過程及びハイブリダ
イゼーション過程を施した場合における支持体3表面に
おける合成オリゴヌクレオチドスポットの固定化率につ
いて16回試行した結果であり、溶媒としてホルムアミ
ドを使用した場合においては平均固定化率は97.6%
であり、充分の固定量を残すことができた。
FIG. 5 shows a support obtained when a blocking step and a hybridization step were performed on a polynucleotide array 1 in which a synthetic oligonucleotide solution obtained by dissolving a synthetic oligonucleotide using formamide as a solvent was spotted and fixed. This is the result of 16 trials of the immobilization rate of the synthetic oligonucleotide spot on the 3 surfaces. When formamide is used as a solvent, the average immobilization rate is 97.6%.
Thus, a sufficient fixed amount could be left.

【0046】比較例2 図6及び図7はスポッティングに先だって捨て打ちを行
なった場合と行なわない場合との比較を示し、本実験に
おいては吸水板9として多孔質セラミック板を使用する
と共に支持体3の表面にスポッティングするポリヌクレ
オチドとしてλファージDNAを蛍光色素(Cy3)で
標識したものを使用した。
Comparative Example 2 FIGS. 6 and 7 show a comparison between the case where discarding is performed prior to spotting and the case where no dumping is performed. In this experiment, a porous ceramic plate was used as the water absorbing plate 9 and the support 3 was used. A λ phage DNA labeled with a fluorescent dye (Cy3) was used as a polynucleotide to be spotted on the surface of the sample.

【0047】そして支持体3表面に対し、1回のスポッ
ティング作業で116スポットを連続スポッティングし
た後に、スキャナーで蛍光強度を読み取ってグラフ化し
た。
Then, after 116 spots were continuously spotted on the surface of the support 3 by one spotting operation, the fluorescence intensity was read by a scanner and graphed.

【0048】この結果、支持体3表面にスポッティング
するのに先立って数回、捨て打ち(タッピング)した場
合には、タッピングしない場合に比べて1スポット当り
の蛍光強度が均一化している。反対にタッピングしない
場合には、スポッティング初期の蛍光強度が高く、従っ
てポリヌクレオチドのスポット量が多いことを示してい
る。
As a result, in the case where tapping is performed several times before spotting on the surface of the support 3, the fluorescence intensity per spot is made uniform as compared with the case where tapping is not performed. Conversely, no tapping indicates that the fluorescence intensity at the initial stage of spotting is high, and therefore the amount of polynucleotide spots is large.

【0049】比較例3 一本の分注針5を使用し、純水に400fmol/μlの蛍光
色素(Cy3、Cy5)を溶解した蛍光溶液と純水とを
交互にサンプリングして支持体3表面にスポッティング
し、スキャナーにより蛍光標識を検出する。スポッティ
ングサイクルは、蛍光サンプリング→スポッティング→
洗浄→純水サンプリング→スポッティング・・・の順に
行い、分注針5の洗浄効果を検証する。
Comparative Example 3 Using one dispensing needle 5, a fluorescent solution in which 400 fmol / μl of a fluorescent dye (Cy3, Cy5) was dissolved in pure water and pure water were alternately sampled, and the surface of the support 3 was sampled. And fluorescent labels are detected by a scanner. The spotting cycle is fluorescence sampling → spotting →
Washing, pure water sampling, spotting, etc. are performed in this order, and the washing effect of the dispensing needle 5 is verified.

【0050】図8に示すように蛍光が検出されるスポッ
トと非検出のスポットとが交互に表われることから、上
記した分注針5の洗浄により縦割り溝5a内がほぼ完全
に洗浄され、純水中に蛍光色素が検出されていないこと
を示している。
As shown in FIG. 8, since spots where fluorescence is detected and spots where no fluorescence are detected appear alternately, the inside of the vertical groove 5a is almost completely washed by washing the dispensing needle 5 described above. This indicates that no fluorescent dye was detected in pure water.

【0051】[0051]

【発明の効果】本発明は、支持体上にスポッティングさ
れるポリヌクレオチドの相互汚染を防止しながら多種類
のポリヌクレオチドを濃度がほぼは均一な状態で強固に
固定して被検用ヌクレオチドの解析作業を有効、かつ効
率的に行うことができる。また、支持体上にスポッティ
ングされるポリヌクレオチド試料のスポット濃度をほぼ
均一化して充分な測定感度を得ることができる。
Industrial Applicability The present invention provides an analysis of nucleotides to be tested by firmly fixing various types of polynucleotides in a substantially uniform concentration while preventing cross-contamination of polynucleotides spotted on a support. Work can be performed effectively and efficiently. Further, the spot concentration of the polynucleotide sample spotted on the support can be made substantially uniform to obtain sufficient measurement sensitivity.

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】ポリヌクレオチドアレイの作製工程を示す説明
図である。
FIG. 1 is an explanatory diagram showing a process for producing a polynucleotide array.

【図2】ポリヌクレオチドアレイのスポッティング状態
を示す部分斜視図である。
FIG. 2 is a partial perspective view showing a spotting state of the polynucleotide array.

【図3】各溶媒に溶解したポリヌクレオチドを使用して
ハイブリダイゼーションした際の各溶媒毎の蛍光状態を
スキャナーにより観察した写真である。
FIG. 3 is a photograph obtained by observing, with a scanner, a fluorescence state of each solvent when hybridization is performed using a polynucleotide dissolved in each solvent.

【図4】図3の各スポットの蛍光強度を定量化したグラ
フである。
FIG. 4 is a graph quantifying the fluorescence intensity of each spot in FIG.

【図5】ブロッキング過程及びハイブリダイゼーション
過程の回数に応じたポリヌクレオチドの固定化率を示す
表である。
FIG. 5 is a table showing the immobilization ratio of a polynucleotide according to the number of times of a blocking process and a hybridization process.

【図6】支持体にポリヌクレオチドをスポッティングす
るに先立って分注針をタッピングした際の蛍光強度を示
すグラフである。
FIG. 6 is a graph showing the fluorescence intensity when a dispensing needle is tapped before spotting a polynucleotide on a support.

【図7】タッピングせずにスポッティングした際の蛍光
強度を示すグラフである。
FIG. 7 is a graph showing the fluorescence intensity when spotting is performed without tapping.

【図8】分注針の洗浄効果を示す写真である。FIG. 8 is a photograph showing a cleaning effect of a dispensing needle.

【符号の説明】[Explanation of symbols]

1−ポリヌクレオチドアレイ、3−支持体、5−分注
針、5a−縦割り溝
1-polynucleotide array, 3-support, 5-dispensing needle, 5a-vertical groove

─────────────────────────────────────────────────────
────────────────────────────────────────────────── ───

【手続補正書】[Procedure amendment]

【提出日】平成13年7月18日(2001.7.1
8)
[Submission date] July 18, 2001 (2001.7.1)
8)

【手続補正1】[Procedure amendment 1]

【補正対象書類名】明細書[Document name to be amended] Statement

【補正対象項目名】0010[Correction target item name] 0010

【補正方法】変更[Correction method] Change

【補正内容】[Correction contents]

【0010】本発明は、上記した従来の欠点を解決する
ために発明されたものであり、その課題とする処は、支
持体上にスポッティングされるポリヌクレオチドの相互
汚染を防止しながら多種類のポリヌクレオチドを濃度が
ほぼ均一な状態で強固に固定して被検用ヌクレオチドの
解析作業を有効、かつ効率的に行うことができるポリヌ
クレオチドアレイの作製方法を提供することにある。
SUMMARY OF THE INVENTION The present invention has been made to solve the above-mentioned conventional drawbacks, and an object of the present invention is to prevent various kinds of polynucleotides spotted on a support while preventing cross-contamination. It is an object of the present invention to provide a method for producing a polynucleotide array that can effectively and efficiently perform a work of analyzing a test nucleotide by firmly fixing a polynucleotide in a substantially uniform concentration state.

【手続補正2】[Procedure amendment 2]

【補正対象書類名】明細書[Document name to be amended] Statement

【補正対象項目名】0029[Correction target item name] 0029

【補正方法】変更[Correction method] Change

【補正内容】[Correction contents]

【0029】これにより支持体3表面に対するスポッテ
ィング初期に分注針5の先端部に付着した余剰のポリヌ
クレオチド溶液がスポッティングされるのを防止し、ス
ポッティングされるポリヌクレオチド溶液による各スポ
ットの大きさをほぼ均一にしてポリヌクレオチド溶液の
濃度を均一化させると共にスポット相互間の汚染を防止
する。
This prevents excess polynucleotide solution adhering to the tip of the dispensing needle 5 from being spotted at the beginning of spotting on the surface of the support 3 and reducing the size of each spot due to the polynucleotide solution to be spotted. It is made substantially uniform to make the concentration of the polynucleotide solution uniform and to prevent contamination between spots.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 37/00 102 C12N 15/00 F ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) G01N 37/00 102 C12N 15/00 F

Claims (16)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】支持体表面に分注針を当接してポリヌクレ
オチド溶液をスポッティングした後に固定してポリヌク
レオチドアレイを作製する方法において、以下の事項か
らなるポリヌクレオチドアレイの作製方法。 1.ポリヌクレオチドを少なくとも水に約10体積%ホ
ルムアミドを添加した溶媒に溶解してポリヌクレオチド
溶液に調整する。 2.以下の工程に従って支持体表面にポリヌクレオチド
を固定する。 (1).洗浄液により分注針の先端部を洗浄する。 (2).先端部が洗浄された分注針にポリヌクレオチド溶
液をサンプリングする。 (3).ポリヌクレオチド溶液がサンプリングされた分注
針を捨て打ち板に当接して先端部に付着した余剰のポリ
ヌクレオチド溶液を除去する。 (4).支持体表面に対して分注針を当接して多数のポリ
ヌクレオチド溶液をスポッティングする。 (5).支持体表面にスポッティングされた多数のポリヌ
クレオチド溶液を乾燥してポリヌクレオチドを固定す
る。 (6).ポリヌクレオチドが固定された支持体をブロック
液に浸漬してポリヌクレオチドスポット相互間の支持体
表面をブロッキング処理する。
1. A method for producing a polynucleotide array, comprising the steps of: (1) contacting a dispensing needle to the surface of a support, spotting a polynucleotide solution, and fixing the polynucleotide solution to produce a polynucleotide array; 1. The polynucleotide is dissolved in a solvent containing at least about 10% by volume formamide in water to prepare a polynucleotide solution. 2. The polynucleotide is immobilized on the surface of the support according to the following steps. (1). The tip of the dispensing needle is washed with the washing liquid. (2). The polynucleotide solution is sampled on the dispensing needle whose tip has been washed. (3). The dispensing needle from which the polynucleotide solution has been sampled is discarded and abuts against the striking plate to remove excess polynucleotide solution attached to the tip. (Four). A number of polynucleotide solutions are spotted by contacting the dispensing needle against the surface of the support. (Five). A large number of polynucleotide solutions spotted on the surface of the support are dried to fix the polynucleotides. (6). The support on which the polynucleotide is immobilized is immersed in a blocking solution to block the surface of the support between the polynucleotide spots.
【請求項2】支持体表面に分注針を当接してポリヌクレ
オチド溶液をスポッティングした後に固定してポリヌク
レオチドアレイを作製する方法において、以下の事項か
らなるポリヌクレオチドアレイの作製方法。 1.ポリヌクレオチドを少なくとも水に約10体積%グ
リセロールを添加した溶媒に溶解してポリヌクレオチド
溶液に調整する。 2.以下の工程に従って支持体表面にポリヌクレオチド
を固定する。 (1).洗浄液により分注針の先端部を洗浄する。 (2).先端部が洗浄された分注針にポリヌクレオチド溶
液をサンプリングする。 (3).ポリヌクレオチド溶液がサンプリングされた分注
針を捨て打ち板に当接して先端部に付着した余剰のポリ
ヌクレオチド溶液を除去する。 (4).支持体表面に対して分注針を当接して多数のポリ
ヌクレオチド溶液をスポッティングする。 (5).支持体表面にスポッティングされた多数のポリヌ
クレオチド溶液を乾燥してポリヌクレオチドを固定す
る。 (6).ポリヌクレオチドが固定された支持体をブロック
液に浸漬してポリヌクレオチドスポット相互間の支持体
表面をブロッキング処理する。
2. A method for producing a polynucleotide array, comprising the steps of: contacting a dispensing needle to the surface of a support, spotting a polynucleotide solution, and fixing the solution; 1. The polynucleotide is dissolved in a solvent containing at least about 10% by volume of glycerol in water to prepare a polynucleotide solution. 2. The polynucleotide is immobilized on the surface of the support according to the following steps. (1). The tip of the dispensing needle is washed with the washing liquid. (2). The polynucleotide solution is sampled on the dispensing needle whose tip has been washed. (3). The dispensing needle from which the polynucleotide solution has been sampled is discarded and abuts against the striking plate to remove excess polynucleotide solution attached to the tip. (Four). A number of polynucleotide solutions are spotted by contacting the dispensing needle against the surface of the support. (Five). A large number of polynucleotide solutions spotted on the surface of the support are dried to fix the polynucleotides. (6). The support on which the polynucleotide is immobilized is immersed in a blocking solution to block the surface of the support between the polynucleotide spots.
【請求項3】請求項1または2において、溶媒に溶解し
たポリヌクレオチド濃度を0.5〜50pmol/μlとした
ポリヌクレオチドアレイの作製方法。
3. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein the concentration of the polynucleotide dissolved in the solvent is 0.5 to 50 pmol / μl.
【請求項4】請求項1または2において、ポリヌクレオ
チドを生体遺伝子由来のPCR増幅産物としたポリヌク
レオチドアレイの作製方法。
4. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein the polynucleotide is a PCR amplification product derived from a biological gene.
【請求項5】請求項1または2において、ポリヌクレオ
チドを人工合成したオリゴヌクレオチドとしたポリヌク
レオチドアレイの作製方法。
5. The method according to claim 1, wherein the polynucleotide is an artificially synthesized oligonucleotide.
【請求項6】請求項1または2において、捨て打ち板は
多孔質セラミックス板、吸水紙板及びガラス板の何れか
としたポリヌクレオチドアレイの作製方法。
6. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein the discarded plate is any one of a porous ceramics plate, a water-absorbing paper plate and a glass plate.
【請求項7】請求項1または2において、分注針の洗浄
を、吸水材に接触させて縦割り溝内に残留するポリヌク
レオチド溶液を排出する、0.1%ドデシル硫酸ナトリ
ウム溶液に浸漬する、純水に浸漬する、エタノールに浸
漬する、気相吸引乾燥する工程により行なうポリヌクレ
オチドアレイの作製方法。
7. The washing of the dispensing needle according to claim 1 or 2, wherein the dispensing needle is immersed in a 0.1% sodium dodecyl sulfate solution for discharging the polynucleotide solution remaining in the vertically divided groove by contacting with a water absorbing material. A method for producing a polynucleotide array, comprising: immersing in pure water, immersing in ethanol, and vapor-phase suction-drying.
【請求項8】請求項1または2において、支持体表面に
対するポリヌクレオチドのスポッティング環境を常温環
境としたポリヌクレオチドアレイの作製方法。
8. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein the environment for spotting the polynucleotide on the surface of the support is a normal temperature environment.
【請求項9】請求項1または2において、支持体表面に
対するポリヌクレオチドのスポッティング環境を、温度
2〜10℃、湿度50〜70%としたポリヌクレオチド
アレイの作製方法。
9. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein the environment for spotting the polynucleotide on the surface of the support is 2 to 10 ° C. and 50 to 70% humidity.
【請求項10】請求項1または2において、支持体表面
はポリ−L−リシン及びアミノプロピルトリエトキシシ
ランの何れかによる表面処理により陽電荷化したポリヌ
クレオチドアレイの作製方法。
10. The method according to claim 1, wherein the surface of the support is positively charged by surface treatment with either poly-L-lysine or aminopropyltriethoxysilane.
【請求項11】請求項1または2において、支持体表面
はアルデヒド処理及びスクシニド処理の何れかによりア
ミノ化したポリヌクレオチドアレイの作製方法。
11. The method according to claim 1, wherein the surface of the support is aminated by either aldehyde treatment or succinide treatment.
【請求項12】請求項1または2において、ブロック液
は少なくともpH5〜6に調整されたこはく酸溶液とした
ポリヌクレオチドアレイの作製方法。
12. The method according to claim 1, wherein the blocking solution is a succinic acid solution adjusted to at least pH 5 to 6.
【請求項13】請求項1または2において、ブロック液
は少なくともpH8〜9に調整されたエタノールアミン溶
液としたポリヌクレオチドアレイの作製方法。
13. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein the blocking solution is an ethanolamine solution adjusted to at least pH 8-9.
【請求項14】請求項1または2において、ポリヌクレ
オチド溶液がスポッティングされた支持体の表面に水蒸
気を吹き付けて各スポットにおけるポリヌクレオチド溶
液の付着状態を均一化するポリヌクレオチドアレイの作
製方法。
14. The method for producing a polynucleotide array according to claim 1, wherein water vapor is sprayed onto the surface of the support on which the polynucleotide solution has been spotted to make the adhesion state of the polynucleotide solution uniform at each spot.
【請求項15】請求項1または2において、分注針は先
端部に軸線方向へ延びる縦割り溝を形成し、該縦割り溝
内にポリヌクレオチド溶液をサンプリング可能にしたポ
リヌクレオチドアレイの作製方法。
15. A method for producing a polynucleotide array according to claim 1 or 2, wherein the dispensing needle has a longitudinally extending groove formed at an end thereof extending in the axial direction, and a polynucleotide solution can be sampled in the longitudinally dividing groove. .
【請求項16】請求項1または2において、分注針は貫
通孔を有した先端部に加熱部材を設け、該貫通孔内のポ
リヌクレオチド溶液を加熱部材により瞬間加熱して気泡
化して支持体表面にポリヌクレオチド溶液をスポッティ
ングするポリヌクレオチドアレイの作製方法。
16. A dispensing needle according to claim 1, wherein the dispensing needle is provided with a heating member at a tip portion having a through-hole, and the polynucleotide solution in the through-hole is instantaneously heated by the heating member to form bubbles to form a support. A method for producing a polynucleotide array in which a polynucleotide solution is spotted on a surface.
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