[go: up one dir, main page]

HUP0003327A2 - Szőlőlevél-sodródást okozó vírus (2. típus) fehérjék és alkalmazásuk - Google Patents

Szőlőlevél-sodródást okozó vírus (2. típus) fehérjék és alkalmazásuk Download PDF

Info

Publication number
HUP0003327A2
HUP0003327A2 HU0003327A HUP0003327A HUP0003327A2 HU P0003327 A2 HUP0003327 A2 HU P0003327A2 HU 0003327 A HU0003327 A HU 0003327A HU P0003327 A HUP0003327 A HU P0003327A HU P0003327 A2 HUP0003327 A2 HU P0003327A2
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
protein
leu
ser
polypeptide
dna molecule
Prior art date
Application number
HU0003327A
Other languages
English (en)
Inventor
Dennis Gonsalves
Kai-Shu Ling
Hai-Ying Zhu
Original Assignee
Cornell Research Foundation, Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Cornell Research Foundation, Inc. filed Critical Cornell Research Foundation, Inc.
Publication of HUP0003327A2 publication Critical patent/HUP0003327A2/hu
Publication of HUP0003327A3 publication Critical patent/HUP0003327A3/hu

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8283Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for virus resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56961Plant cells or fungi
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56983Viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011Details
    • C12N2770/00022New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/005Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from viruses
    • G01N2333/08RNA viruses

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)

Abstract

A találmány tárgyát a szőlőnövény levélsodródást okozó vírusának (2.típus) fehérjéi, a fehérjékkel reagáló ellenanyagok, a fehérjéketkódoló nukleinsavmolekulák, valamint ezek alkalmazásai képezik. Atalálmány tárgyát képezik továbbá a találmány szerintinukleinsavmolekulákkal transzformált gazdasejtek, a találmány szerintigazdasejteket tartalmazó transzgenikus növények, valamint eljárásoknövények vírusrezisztenssé tételére és a levélsodródást okozó víruskimutatására a találmány szerinti nukleinsavmolekulák és ellenanyagokalkalmazásával. A találmány szerinti megoldás alkalmas vírusrezisztenstranszgenikus növények előállítására és új, hatékonyabb növényvédelmieljárások kidolgozására. Ó

Description

Képviselő: KÖZZÉTÉTELI
Danubia PÉLDÁNY
Szabadalmi és Védjegy Iroda Kft.
Budapest
Szőlőlevél-sodródást okozó vírus (2. típus) fehérjék és alkalmazásuk
A találmány tárgyát a szőlőnövény levélsodródást okozó vírusának (2. típus) fehérjéi, a fehérjékkel reagáló ellenanyagok, a fehérjéket kódoló nukleinsav-molekulák, valamint ezek alkalmazásai képezik.
A találmány tárgyát képezik továbbá a találmány szerinti nukleinsav-molekulákkal transzformált gazdasejtek, a találmány szerinti gazdasejteket tartalmazó transzgenikus növények, valamint eljárások növények vírus-rezisztenssé tételére és a levélsodródást okozó vírus kimutatására a találmány szerinti nukleinsav-molekulák és ellenanyagok alkalmazásával .
A találmány szerinti megoldás alkalmas vírusrezisztens transzgenikus növények előállítására és új, hatékonyabb növényvédelmi eljáeások kidolgozására.
Aktaszámunk: 91044-9259/PÁ
A világ legszélesebb körben termesztett gyümölcsnövényét, a szőlőt (Vitis sp.) az Antarktisz kivételével az Összes kontinensen termesztik. Azonban a fő szőlőtermelő központokat az európai országokban találjuk (beleértve Olaszországot, Spanyolországot és Franciaországot), amelyek a világ szőlőtermelésének körülbelül a 70%-át állítják elő [Mullins és mtsai.: Biology of the Grapevine, Cambridge, Egyesült Királyság, University Press, (1992)]. Az Egyesült Államok - 300.000 hektár szőlőültetvénnyel - a nyolcadik legnagyobb szőlőtermesztő világviszonylatban. Bár a szőlőt sokféle módon használják fel, a termelt szőlő fő részét (közel 80%) bortermelésre használják. A gabonanövényekkel ellentétben a világ szőlőültetvényeit hagyományos szőlőnövény-termesztési változatokkal ültetik be, amelyeket évszázadokon keresztül vegetatív szaporítással tartottak fenn. Számos fontos szőlőnövény vírus és vírus-szerű betegség mint például a szőlőnövény-levélsodródás, parafakéreg kialakulás, és Rupestris szár kipattogzás - kerül átvitelre és terjed a fertőzött, vegetatív módon szaporított anyagok alkalmazása útján. így tehát a tanúsított, vírusmentes anyagok szaporítása a legfontosabb betegség ellenőrző intézkedések egyike. A betegségekkel szembeni ellenálló képesség kifejlesztéséhez a hagyományos nemesitési eljárások nehezen megvalósíthatók a szőlőnövény erősen heterozigóta jellegének és kikereszteződési viselkedésének köszönhetően valamint az öröklődés poligénes mintázatának megfelelően. Továbbá, egy új termesztési változat bevezetését tilthatják a szokások vagy a törvény. Az utóbbi idők biotechnológiai fejlesztései lehetővé tették speciális tulajdonságok bejuttatását - mint például a betegségekkel szembeni ellenálló képesség - egy megalapozott termesztési variánsba annak kertészeti jellemzőinek megváltoztatása nélkül.
Sok növényi patogén - mint például gombák, baktériumok, fitoplazmák, vírusok és nematódák - fertőzhetik meg a szőlőt és az ennek eredményeképpen kialakult betegségek jelentős veszteségeket okozhatnak a termelésben [Pearson és mtsai.: Compendium of Grape Diseases, American Phytopathological Society Press (1988)]. Ezek között a vírusbetegségek jelentenek fő akadályt a szőlőnövény hasznot biztosító termesztése útjában. Már körülbelül 34 vírust izoláltak és jellemeztek szőlőnövényekből. A főbb vírusbetegségeket a következő csoportokba sorolhatjuk: (1) a legyezőszerű levelet okozó nepovírus, más európai nepovírusok és amerikai nepovírusok okozta szőlőnövény degeneráció; (2) a levélsodródást okozó komplex; és (3) a göcsörtös faszerkezetet létrehozó komplex [Martelli (szerk.): Graft Transmissible Diseases of Grapevines. Handbook for Detection and Diagnosis, FAO, Egyesült Nemzetek Szervezete, Róma, Olaszország, (1993)].
A főbb vírusbetegségek közül a szőlőnövény-levélsodródás komplex a legszélesebb körben elterjedt szerte a világban. Goheen szerint [Grape leafroll In: Frazier és mtsai., (szerk.) : Virus Diseases of Small Fruits and Grapevines (A Handbook), University of California, Division of Agricultural Sciences, Berkeley, Kalifornia, Egyesült Államok, 209-212. oldal, (1970); a továbbiakban:
Goheen, (1970)] szőlőnövény-levélsodródás-szerű betegség már az 1850-es években leírásra került a német és a francia irodalomban. Azonban a betegség vírus természetét először Scheu mutatta ki [Scheu: D. D. Weinbau 14 222 (1935); a továbbiakban: Scheu, (1935)]. 1946-ban Hármon és Snyder állapította meg a White Emperor betegség vírustermészetét Kaliforniában [Harmon és mtsai: Proc. Am. Soc. Hort. Sci. 74 190 (1946)]. Később Goheen és munkatársai bebizonyították [Goheen és mtsai.: Phytopathology 48 51 (1958); a továbbiakban: Goheen, (1958)], hogy a levélsodródás és a White Emperor betegség ugyanaz és csak a levélsodródás név maradt fenn.
A levélsodródás a szőlő súlyos vírusbetegsége és mindenütt előfordul, ahol szőlőt termesztenek. A betegségnek ez a széleskörű elterjedése a beteg vesszők szaporításán keresztül történt meg. Érinti a Vitis nemzetség csaknem az összes termesztett és gyökértörzs variánsát. Bár a betegség nem végzetes, termésveszteséget és a cukortartalom csökkenését okozza. Scheu becslése szerint 1936-ban a Németországban ültetett szőlőnövények összességének a 80% fertőzött volt [Scheu: Mein Winzerbuch, Berlin, Reichsnahrstand-Verlags (1936)]. Sok kaliforniai borszőlőt termelő szőlőskertben a levélsodródás előfordulása (a szabadföldön észlelhető tünetek 1959-ben elvégzett felmérése alapján) megegyezik Scheu eredeti megfigyeléseivel a német szőlőskertekben [Goheen és mtsai.: Amer. J. Enol. Vitic. 10 78 (1959)]. A levélsodródás betegség jelenlegi helyzete nem látszik semmivel sem jobbnak [Goheen: The * · ·· ···· ··· ······ M·· i
American Phytopathological Society 1 47 (1988); a továbbiakban: Goheen, (1988)]. Goheen azt is felbecsülte, hogy a betegség éves szinten a teljes termesztett szőlőmennyiségben körülbelül 5-20% veszteséget okoz [Goheen, (1970) és Goheen, (1988)]. A cukor mennyisége a fertőzött vesszők egyes bogyóiban csak körülbelül fele-kétharmada az egészséges vesszőkről származó bogyókban található cukor mennyiségének [Goheen, (1958)].
A levélsodródás betegség tünetei jelentős mértékben változhatnak a termesztett változattal, a környezettől függően es az időszakkal az éven belül. Vörös vagy sötét színű gyümölcs változatok esetén a bazális, érett levelek tipikus lefelé irányuló felsodródása és az erek közötti vörösödés a legerőteljesebben ősszel fordul elő, de nem jelentkezik tavasszal vagy kora nyáron. A világos színű gyümölcs változatok esetén azonban a tünetek kevésbé feltűnőek, rendszerint lefelé irányuló felsodródás jelentkezik, amit az erek közötti klorozis kísér. Továbbá sok fertőzött gyökértörzs termesztett változat esetén nem is fejlődnek ki a tünetek. Ezekben az esetekben a betegség kimutatása általánosságban egy fás indikátor indexelő vizsgálati eljárással történik, Vitis vivifera cv. Cabernet Franc alkalmazásával [Goheen, (1988) ] .
Mióta Scheu kimutatta, hogy a levélsodródás graft-tal átvihető, vírus etiológiát tételeztek fel [Scheu, (1935)] Számos vírus részecske típust izoláltak levélsodródás betegséget mutató vesszőkből. Ezek magukba foglalnak potyvírus-szerű [Tanne és mtsai.: Phytopathology 67 442 (1977)], izometrikus vírus-szerű [Castellano és mtsai.: Vitis 22 23 (1983); a továbbiakban: Castellano, (1983) valamint Namba és mtsai.: Ann. Phytopathol. Soc. Japan 45 70 (1979)], és closterovírus-szerű [Namba: Ann.
Phytopathol. Soc. Japan 45 497 (1979)] részecskéket. Az utóbbi években azonban 1400-2200 nm tartományba eső hosszú, csavarodó closterovírusokat azonosítottak leggyakrabban a levélsodródás betegséggel (1. ábra), [Castellano, (1983); Faoro és mtsai.: Riv. Patol. Vég., Ser IV., 17 183 (1981); Gugerli és mtsai.: Rev. Suisse Viticult. Arboricult. Hort. 16 299 (1984); a továbbiakban: Gugerli, (1984); Hu és mtsai.: J. Phytopathol. 128 1 (1990); a továbbiakban: Hu, (1990); Milne és mtsai.: Phytopathol. Z. 110 360 (1984); Zee és mtsai.: Phytopathology 77 1427 (1987); a továbbiakban: Zee, (1987); valamint Zimmermann és mtsai.: J. Phytopathol. 130 205 (1990); a továbbiakban: Zimmermann, (1990)]. Ezekre a closterovirusokra mint szőlőnövény-levélsodródáshoz kapcsolódó vírusokra hivatkozunk (GLRaV) Legalább hat szerológiailag megkülönböztethető GLRaV típust mutattak ki (GLRaV-1 - GLRaV-6) levélsodródás betegség által megtámadott vesszőkből (1. táblázat) [Boscia és mtsai.: Vitis 34 171 (1995); a továbbiakban: Boscia, (1995); valamint Martelli: Leafroll, 37-44. oldalak, In: Martelli, (szerk.): Graft Transmissible Diseases of Grapevines, Handbook for Detection and Diagnosis, FAO, Róma, Olaszország, (1993); a továbbiakban: Martelli I]. Ezek közül az első öt megerősítést nyert az alábbi konferencia során: 10th Meeting of the International Council for the Study of ·:. .:. ··.?·
Virus and Virus Diseases of the Grapevine (ICVG), Volos, Görögország, (1990).
1. táblázat
típus részecske hossz (nm) Burokfehérje Mr (x 103) hivatkozás
GLRaV-1 1400-2200 39 Gugerli, (1984)
GLRaV-2 1400-1800 26 Gugerli, (1984);
Zimmermann, (1990)
GLRaV-3 1400-2200 43 Zee, (1987)
GLRaV-4 1400-2200 36 Hu, (1990)
GLRaV-5 1400-2200 36 Zimmermann, (1990)
GLRaV-6 1400-2200 36 Gugerli, (1993)
Monoklonális antitestek alkalmazásán keresztül azonban, az eredeti Gugerli által leírt GLRaV-II [Gugerli, (1984)] esetében kimutatták, hogy feltételezhetően legalább két komponens - Ila és Ilb - keveréke [Gugerli és mtsai.: Grapevine Leafroll Associated Virus II Analyzed by Monoclonal Antibodies, 11th Meeting of the International Council for the Study of Viruses and Virus Diseases of the Grapevine, Montreaux, Svájc, 23-24. oldalak, (1993); a továbbiakban: Gugerli, (1993)]. Az újabb kutatások összehasonlító szerológiai vizsgálati eljárások alkalmazásával [Boscia, (1995)] kimutatták, hogy a cv. Chasselas 8/22 Ilb komponense megegyezik a Franciaországból származó GLRaV-2 izolátummal [Zimmermann, (1990)], amely ugyanakkor magába foglalja a szőlőnövény parafakérgességhez kapcsolódó closterovírus izolátumokat is Olaszországból (GCBaV-BA) [Boscia, (1995)] és az Egyesült Államokból (GCBaV-NY) [Namba és mtsai.: Phytopathology 81 964 (1991); a továbbiakban: Namba, (1991)]. A cv. Chasselas 8/22 Ha komponense ideiglenesen a szőlőnövény-levélsodródáshoz kapcsolódó 6. vírus nevet kapta (GLRaV-6). Továbbá a Boscia és munkatársai által előállított GLRaV-2 CA-5 izolátum elleni antiszérumról [Boscia és mtsai.: Phytopathology 80 117 (1990)] kimutatták, hogy mind a GLRaV-2 és a GLRaV-1 elleni antitesteket tartalmaz, előnyben részesítve az utóbbit [Boscia, (1995)].
A GLRaV-2 virionok csavarodó, filament-szerű részecskék, körülbelül 1400-1800 nm hosszal [Gugerli és mtsai.: Rev. Suisse Viticult. Arboricult. Horticult. 16 299 (1984)]. Egy körülbelül 15 kilobázis (kb) nagyságú kettősszálú RNS (dsRNS) izolálható állandó jelleggel a GLRaV-2 fertőzött szövetekből [Goszczynski és mtsai.: Vitis 35 133 (1996)]. A GLRaV-2 burokfehérjéje körülbelül 22-26 kiloDalton (kDa) nagyságú [Zimmermann és mtsai.: J. Phytopathol. 130 205 (1990); Gugerli és Ramel (részletezett összefoglaló): Grapevine Leafroll Associated Virus II Analyzed by Monoclonal Antibodies, 11th ICVG, Montreux, Svájc, (szerk. Gugerli), Federal Agricultural Research Station of Changins, CH-1260, Nyon, Svájc, 23-24. oldalak, (1993); Boscia és mtsai.: Vitis 34 171 (1995)], ami jelentősen kisebb, mint más GLRaV-k (35-43 kDa) esetében [Zee és mtsai.: Phytopathology 77 1427 (1987); Hu és mtsai.: J.
··:·
Phytopathology 128 1 (1990); Ling és mtsai.: Arch, of
Virology 142 1101 (1997)]. Bár a GLRaV-2-t a Closterovirus nemzetség tagjaként osztályozták részecske morfológia és citopatológia alapján [Martelli: Circular of ICTV-Plant Virus Subcommittee Study Group on Closterolike Viruses, (1996)], ennek molekuláris és biokémiai tulajdonságai nincsenek jól jellemezve.
A closterovirus csoportban számos vírust szekvenáltak meg az utóbbi időkben. A részleges vagy teljes genomi szekvenciák a cékla sárgulást okozó vírus (BYV) esetében [Agranovsky és mtsai.: J. General Virology 72 15 (1991); Agranovsky és mtsai.: Virology 198 311 (1994)], cékla sárgás elsatnyulást okozó vírus (BYSV) esetében [Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996)], citrus tristeza vírus (CTV) esetében [Pappu és mtsai.: Virology 199 35 (1994); Karasev és mtsai.: Virology 208 511 (1995)], fejes saláta fertőző sárgulást okozó vírus (LIYV) esetében [Klaassen és mtsai.: J. General Virology 75 1525 (1994); Klaassen és mtsai.: Virology 208 99 (1995)], apró cseresznye vírus (LChV) esetében [Keim és Jelkmann: Arch. Virology 141 1437 (1996); Jelkmann és mtsai.: J. General Virology 78 2067 (1997)] valamint GLRaV-3 esetében [Ling és mtsai.: J. Gén. Virology 79(5) 1289 (1998)] a closterovirusok számos közös jellegzetességét tártak fel, beleertve a HSP70 chaperon hősokk fehérje jelenlétét és a burokfehérje gén duplikátumának jelenlétét [Agranovsky és mtsai.: Adv. in Virus Res. 12 119 (1996); Dolja és mtsai.: Annual Rev. Photopathology 32 261 (1994); Boyko és mtsai.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 9156 (1992)]. A GLRaV-k genomi szerveződésének jellemzése molekuláris információt biztosíthat azon szerológiailag megkülönböztethető closterovírusok esetében, amelyek hasonló levélsodródási tüneteket okoznak szőlőnövényen.
Számos rövidebb closterovirust (részecske hosszúság 800 nm) izoláltak hasonlóképpen szőlőnövényekből. Ezek közül az egyiket - amelyet szőlőnövény A-vírusnak neveznek (GVA) megtalálták a levélsodródás betegséggel társultan is, bár ez a kapcsolódás nem volt következetes [Agran és mtsai.: Vitis 29 43 (1990); Conti és mtsai.: Phytopathol. Mediterr. 24 110 (1985); valamint Conti és mtsai.: Phytopathology 70 394 (1980)]. A GVA etiológiája nem igazán ismert, azonban úgy tűnik, hogy rendszeresebben társul a göcsörtös fásodáshoz sensu lato [Rosciglione és mtsai.: Rev. Suisse Vitic Arboric. Hortic. 18 207 (1986); a továbbiakban:
Rosciglione, (1986); valamint Zimmermann, (1990)]. Továbbá egy másik rövid closterovirust (800 nm hosszú) - elnevezése szőlőnövény B-vírus (GVB) - izoláltak és jellemeztek parafa-kérgesedéssel fertőzött vesszőkből [Boscia és mtsai.: Arch. Virol. 130 109 (1993); valamint Namba, (1991)].
Ahogyan ezt Martelli feltételezte [Martelli I], a levélsodródási tüneteket okozhatja egynél több vírus is, vagy ez egyszerűen általános növényi fiziológiai válasz is lehet floem-betelepülő vírusok csoportjának az inváziójával szemben. Az utóbbi 15 évben összegyűlt bizonyítékok erősen alátámasztják azt az elképzelést, hogy a szőlőnövény-levélsodródást egy (vagy egy komplex) hosszú closterovírus okozza
(részecske hossz 1400-2200 nm között).
A szőlőnövény-levélsodródás elsődlegesen fertőzött oltvánnyal és gyökértörzzsel vihető át. Azonban szabadföldi körülmények között a bibortetvek számos fajáról kimutatták, hogy a levélsodródás vektorai [Engelbrecht és mtsai.: Phytophylactica 22 341 (1990); Rosciglione és mtsai.:
Phytoparasitica 17 63 (1989); valamint Tanne:
Phytoparasitica 16 288 (1988)]. A rovarvektorok útján a levélsodródás természetes terjedése a világ különböző részein gyors. Új-Zélandon három szőlőskert megfigyelése azt mutatta, hogy a fertőzött vesszők száma csaknem megduplázódott egyetlen év alatt [Jordan és mtsai.: Spread of Grapevine Leafroll and its Associated Virus in New Zealand Vineyards, 11th Meeting of the International Council for the Study of Viruses and Virus Diseases of the Grapevine, Montreux, Svájc, 113-114. oldalak, (1993)]. Egy szőlőskert 90%-ban fertőzött lett a GLRaV-3 első megfigyelése után 5 évvel. A levélsodródás előfordulása világszerte megnövekedhet, mivel a bibortetvek kémiai úton történő korlátozása nehezebbé válik a hatékony inszekticidek hiánya miatt.
Annak a súlyos kockázatnak a fényében, amit a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus jelent a szőlőskertekben és ennek hatékony kezelési módja hiányában, ezen csapás kivédésének szükségessége továbbra is fennáll. A találmányi gondolat a technika állása szerint fennálló ezen hiány pótlását kívánja szolgálni.
A találmány tárgyát izolált fehérjék és polipeptidek képezik, amelyek megfelelnek szőlőnövény-levélsodródást
okozó vírus (2. típus) fehérjéinek vagy polipeptideinek. A. kódoló RNS- és DNS-molekulák, akár izolált formában vagy expressziós rendszerbe beépítve, gazdasejt, transzgént hordozó Vitis vagy citrus oltvány vagy gyökértörzs termesztési változat, vagy transzgént hordozó Nicotiana növény vagy céklanövény úgyszintén a találmány tárgyát képezi.
Más szempontból a találmány tárgyát képezi egy eljárás szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal (2. típus) szemben mutatott ellenálló képesség átvitelére Vitis oltványba vagy gyökértörzs termesztési változatokba, vagy Nicotiana növényekbe oly módon, hogy a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjének vagy polipeptidnek megfelelő fehérjét vagy polipeptidet kódoló DNS-molekulával a növényt transzformáljuk. A találmány más szempontjai szerint a találmány tárgyát képezi továbbá egy eljárás cékla sárgulást okozó vírussal szemben mutatott ellenálló képesség átvitelére céklanövénybe, és egy eljárás tristeza vírussal szemben mutatott ellenálló képesség átvitelére citrus oltvány vagy gyökértörzs termesztési változatokra, mindkét esetben oly módon, hogy a növényeket vagy termesztési változatokat a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjének vagy polipeptidnek megfelelő fehérjét vagy polipeptidet kódoló DNS molekulával transzformáljuk.
A találmány tárgyát képezi továbbá antitest vagy annak kötő része, vagy olyan próba, amely a fehérjét vagy polipeptidet felismerni képes.
A jelenleg forgalomban levő szőlő termesztési változatok és gyökértörzsek szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus rezisztens transzgént hordozó variánsai lehetővé teszik a vírus fokozottabb mértékű korlátozását, míg megtartják a specifikus termesztési változatok különböző jellemzőit. Továbbá ezek a variánsok lehetővé teszik a GLRaV-2 korlátozását, amelyet akár fertőzött oltványok vagy gyökértörzsek alkalmazásával, akár egy ma még nem jellemzett rovar vektor közvetítésével viszünk át. Az átvitel ez utóbbi módjára vonatkozóan a találmány megkerülő megoldást kínál a peszticidek alkalmazásának növekvő korlátozására, amely korlátozás a rovar fertőzések kémiai szabályozását növekvő mértékben nehezíti. Ezen a módon a találmány alkalmazása a környezetvédelem érdekeit, valamint a szőlőművelés és a borkészítés gazdaságosságát is előre viszi.
Az 1A. és 1B. ábrák a GLRaV-2 kettős-szálú RNS (dsRNS) profil (1A. ábra) és annak Northern-hibridizációs analízisének (1B. ábra) az összehasonlítását mutatják be. Az ÍA. ábrán: az M-sáv a lambda Hindii! DNS—marker; és az 1. sáv: dsRNS mintázat 1%-os agaróz gélben, amit etídium-bromiddal festettünk. Az 1B. ábra a GLRaV-2 izolált nagy molekulatömegű dsRNS Northern-hibridizációját mutatja be olyan próbával, amit 32P-[α-dATP]-vei jelölt, a GLRaV-2 specifikus TC1 cDNS-klónból előállított cDNS-inszerttel kapunk. Az 1. sáv: GLRaV—2 nagy molekulatömegű dsRNS. 2. sáv: egészséges szőlőnövényből extrahált összes RNS.
A 2. ábra a GLRaV-2 genomi szerveződését és annak szekvenálási stratégiáját mutatja be. A zárt négyszögek olyan ORF-szekvenciákat jelentenek, amelyek a GLRaV-2 következtetett aminosav szekvenciáit kódolják; a számozott vonalak nukleotid koordinátákat jelentenek kilobázisban (kb) megadva, az RNS 5'-terminálisától kezdve. A GLRaV-2 RNS genom alatti vonalak azokat a cDNS—kiónokat jelölik, amelyeket a nukleotid szekvenciák meghatározása során alkalmaztunk.
A 3A-3D. ábrák összehasonlításokat mutatnak be a GLRaV2 ORFla/ORFlb és a BYV között. A 3A-3D. ábrák - sorrendben megfeleltetve - a két papain-szerű proteáz (P-PRO), metiltranszferáz (MT/MTR), helikáz (HEL) és RNS-függő RNS-polimeráz (RdRP) konzervált doménjeit mutatják be. A felkiáltójelek jelölik a vezető papain-szerű proteáz feltételezett katalitikus aminosav maradékait; törtjelek jelölik a feltételezett hasítási helyeket. Az MT, HEL és RdRP domének konzervált részegységeit fölöttük húzott vonalakkal emeljük ki, amelyeket a megfelelő betűkkel jelölünk. Az összevetést a DNASTAR MegAlign program segítségével szerkesztettük.
A 4A. és 4B. ábrák a GLRaV-2, BYV, BYSV és CTV ORFla/ORFlb átfedő régiók nukleotid (4A. ábra) és levezetett aminosav (4B. ábra) szekvenciáinak összevetését mutatják be. Az azonos nukleotidokat és aminosavakat konszenzusban mutatjuk be. A GLRaV-2 vélelmezett +1 leolvasási fázis eltolási helyet (TAGC) és az ennek megfelelő helyeket a BYV (TAGC) és BYSV (TAGC) és CTV (CGGC) szekvenciákban a nukleotid és aminosav szekvenciákon belül aláhúzásokkal emeljük ki.
Az 5. ábra a GLRaV-2 és a BYV HSP7 0 fehérje aminosav szekvenciájának az összevetését mutatja be. A konzervált részegységeket (A és H között) felülvonalazással emeljük ki és a megfelelő betűkkel jelöljük. Az összevetést a DNASTAR
MegAlign programja segítségével végeztük el.
A 6A. ábra a GLRaV-2 burokfehérje (CP) és a burokfehérje duplikátum (CPd) összevetése más closterovirusokkal. A GLRaV-2 CP és CPd aminosav szekvenciákat vetjük össze a BYV, BYSV és CTV CP és CPd szekvenciákkal. A konzervált aminosavakat félkövéren szedtük és jelöljük a konszenzus szekvenciákat. A szekvencia összevetést és a filogenetikus fát a DNASTAR MegAlign programjában a Clustal módszer segítségével szerkesztettük meg.
A 6B. ábra a GLRaV-2 CP és CPd kísérleti filogenetikus fáját mutatja be a következő szekvenciákkal összevetve: BYV, BYSV, CTV, LIYV, LChV és GLRaV-3. Az összevetés elősegítésére az LIYV, LChV és a GLRaV-3 CP és CPd szekvenciákból csak a C-terminális 250 aminosavat vettük. A filogenetikus fa alatti skála a szekvenciák közötti távolságot jelzi. Az egységek a szubsztitúciós események számát jelzik.
A 7. ábra a GLRaV-2, BYV, BYSV, CTV, LIYV, LChV és a GLRaV-3 genomi szerveződésének összehasonlítása. A P-PRO jelöli a papain-szerű proteázt; az MT/MTR jelöli a metiltranszferázt; a HEL jelöli a helikázt; az RdRP jelöli az RNS-függő RNS-polimerázt; a HSP70 jelöli a 70 kDa hősokk fehérjét; CP jelöli a burokfehérjét és CPd jelöli a burokfehérje duplikátumot.
A 8. ábra kísérleti filogenetikus fát mutat be, amely a GLRaV-2 RdRP rokonságát mutatja be a BYV, BYSV, CTV és LIYV szekvenciákkal összevetve. A filogenetikus fát a DNASTAR MegAlign programból a Clustal módszer segítségével szerkesztettük meg.
A 9. ábra a GLRaV-2 HSP90 fehérje aminosav szekvenciájának összevetését mutatja be más closterovirusokkal - mint BYV, BYSV és CTV - szemben. A leginkább konzervált részegységeket (I és II között) a vonalakkal emeljük ki és a megfelelő betűkkel jelöljük.
A 10. ábra összevetést mutat be a GLRaV-2 transzlációra nem kerülő 3'-terminális régiójának nukleotid szekvenciája és a következő closterovirusok között: BYV [Agranovsky és mtsai.: Virology 198 311 (1994); amely publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő]; BYSV [Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996); amely publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő]; és CTV [Karasev és mtsai.: Virology 208 511 (1995); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Bemutatjuk a konszenzus szekvenciákat és jelöljük a 3'-véghez viszonyított távolságot. Aláhúzással jelöltünk egy komplementer régiót, amely képes haj tű-szerű szerkezetet kialakítani.
A HA. és 11B. ábrák - sorrendben megfeleltetve - a pGA482GG/EPT8CP-GLRaV-2 és pGA482G/EPT8CP-GLRaV-2 transzformációs vektorok genetikai térképei. Ahogyan ezt a 11A. és 11B. ábrákon bemutatjuk, a növényi expressziós kazettát (EPT8CP-GLRaV-2) - amely dupla karfiol mozaik vírus (CaMV) 35S-enhanszert, CaMV 35S-promótert, lucerna mozaik virus (ALMV) RNS4 5'-vezető szekvenciát, GLRaV-2 burokfehérje gént (CP-GLRaV-2) és CaMV 35S 3-végi transzlációra nem kerülő régiót tartalmaz, mint terminátort - a transzformációs vektorba klónoztuk EcoRI restrikciós hely segítségével. A GLRaV-2 CP-t a növényi expressziós vektorba klónoztuk Ncol restrikciós hely segítségével.
A 12. ábra vélelmezett transzgént hordozó növények leveleiből extrahált DNS—molekulák PCR analízisét mutatja be amikor mind a GLRaV-2 CP-génjére és az NPT-II génre specifikus prímeteket alkalmazunk. Egy etídium—bromiddal festett gél az NPT-II génre egy 720 bázispár (bp) nagyságú amplifikált DNS-fragmenst mutat és a CP-gén teljes kódoló szekvenciájára egy 653 bp nagyságú DNS fragmenst mutat. 1. sáv: O174/HaeIII DNS-marker; 2-6. sávok: különböző vonalakból származó transzgént hordozó növények; 7. sáv: a pozitív kontroll GLRaV-2 CP-génje; és 8. sáv: a pozitív kontroll NPT-II génje.
A 13. ábra összehasonlítást mutat be rezisztens (jobb oldali 3 növény) és fogékony (bal oldali 3 növény) transzgént hordozó Nicotiana benthamiana növények között. A növényeket 48 nappal a GLRaV-2-vel történt beoltást követően mutatjuk be.
A 14. ábra transzgént hordozó Nicotiana benthamiana növények Northern-blot analízisét mutatja be. A vélelmezett transzgént hordozó növényekből extrahált teljes RNS 10 μg kisebb részletét denaturáltuk és formaldehidet tartalmazó 1%-os agaróz gélre vittük fel. Az elválasztott RNS-ket Gene Screen Plus membránra átvittük és egy 32P-jelölt DNS-próbával hibridizáltuk, amely próba a CP-gén szekvencia 3'-végi egyharmadát tartalmazta. Az 1., 3. és 4. sávok RNS expreszszió nélküli nem-transzformált transzgént hordozó növényeknek felelnek meg. A maradék sávok különböző vonalakból származó transzgént hordozó növényeknek felelnek meg: a
2·ζ 14-17. és 22-27. sávok magas RNS expressziós szintet mutató növényeknek felelnek meg, amelyek fogékonyak GLRaV2~re; az összes többi sáv olyan növényeknek felel meg, amelyekben az RNS expressziós szint kimutathatatlan vagy alacsony, és amelyek rezisztensek a GLRaV-2 vírussal szemben.
A találmány tárgyát izolált DNS-molekulák képezik, amelyek egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjéit vagy polipeptidjeit kódolják. A szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) (GLRaV-2) genom jelentős részét már megszekvenálták. A genomon belül nyílt leolvasási fázisok (ORF) sokaságát és egy 3'-végi transzkripcióra nem kerülő régiót (UTR) találunk, amelyek mindegyike a találmány szerinti DNS-molekulákat tartalmazza. A DNSmolekula, amely a GLRaV-2 genom egy jelentős részét képviseli, az 1. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza az alábbiak szerint:
TAAACATTGC GAGAGAACCC CATTAGCGTC TCCGGGGTGA ACTTGGGAAG GTCTGCCGCC 60
GCTCAGGTTA TTTATTTCGG CAGTTTCACG CAGCCCTTCG CGTTGTATCC GCGCCAAGAG 120
AGCGCGATCG TAAAAACGCA ACTTCCACCG GTCAGTGTAG TGAAGGTGGA GTGCGTAGCT 180
GCGGAGGTAG CTCCCGACAG GGGCGTGGTC GACAAGAAAC CTACGTCTGT TGGCGTTCCC 240
CCGCAGCGCG GTGTGCTTTC TTTTCCGACG GTGGTTCGGA ACCGCGGCGA CGTGATAATC 300
ACAGGGGTGG TGCATGAAGC CCTGAAGAAA ATTAAAGACG GGCTCTTACG CTTCCGCGTA 360
GGCGGTGACA TGCGTTTTTC GAGATTTTTC TCATCGAACT ACGGCTGCAG ATTCGTCGCG 420
AGCGTGCGTA CGAACACTAC AGTTTGGCTA AATTGCACGA AAGCGAGTGG TGAGAAATTC 480
TCACTCGCCG CCGCGTGCAC GGCGGATTAC GTGGCGATGC TGCGTTATGT GTGTGGCGGG 540
AAATTTCCAC TCGTCCTCAT GAGTAGAGTT ATTTACCCGG ATGGGCGCTG TTACTTGGCC 600
CATATGAGGT ATTTGTGCGC CTTTTACTGT CGCCCGTTTA GAGAGTCGGA TTATGCCCTC 660
GGAATGTGGC CTACGGTGGC GCGTCTCAGG GCATGCGTTG AGAAGAACTT CGGTGTCGAA 720
GCTTGTGGCA TAGCTCTTCG TGGCTATTAC ACCTCTCGCA ATGTTTATCA CTGTGATTAT 780
GACTCTGCTT ATGTAAAATA TTTTAGAAAC CTTTCCGGCC GCATTGGCGG TGGTTCGTTC 840
GATCCGACAT CTTTAACCTC CGTAATAACG GTGAAGATTA GCGGTCTTCC AGGTGGTCTT 900
CCTAAAAATA TAGCGTTTGG TGCCTTCCTG TGCGATATAC GTTACGTCGA ACCGGTAGAC 960
TCGGGCGGCA TTCAATCGAG CGTTAAGACG AAACGTGAAG ATGCGCACCG AACCGTAGAG 1020
GAACGGGCGG CCGGCGGATC CGTCGAGCAA CCGCGACAAA AGAGGATAGA TGAGAAAGGT 1080
TGCGGCAGAG TTCCTAGTGG AGGTTTTTCG CATCTCCTGG TCGGCAACCT TAACGAAGTT 1140
AGGAGGAAGG TAGCTGCCGG ACTTCTACGC TTTCGCGTTG GCGGTGATAT GGATTTTCAT 1200
CGCTCGTTCT CCACCCAAGC GGGCCACCGC TTGCTGGTGT GGCGCCGCTC GAGCCGGAGC 1260
GTGTGCCTTG AACTTTACTC ACCATCTAAA AACTTTTTGC GTTACGATGT CTTGCCCTGT 1320
TCTGGAGACT ATGCAGCGAT GTTTTCTTTC GCGGCGGGCG GCCGTTTCCC TTTAGTTTTG 1380
ATGACTAGAA TTAGATACCC GAACGGGTTT TGTTACTTGG CTCACTGCCG GTACGCGTGC 1440
GCGTTTCTCT TAAGGGGTTT TGATCCGAAG CGTTTCGACA TCGGTGCTTT CCCCACCGCG 1500
GCCAAGCTCA GAAACCGTAT GGTTTCGGAG CTTGGTGAAA GAAGTTTAGG TTTGAACTTG 1560
TACGGCGCAT ATACGTCACG CGGCGTCTTT CACTGCGATT ATGACGCTAA GTTTATAAAG 1620
GATTTGCGTC TTATGTCAGC AGTTATAGCT GGAAAGGACG GGGTGGAAGA GGTGGTACCT 1680
TCTGACATAA CTCCTGCCAT GAAGCAGAAA ACGATCGAAG CCGTGTATGA TAGATTATAT 1740
GGCGGCACTG ACTCGTTGCT GAAACTGAGC ATCGAGAAAG ACTTAATCGA TTTCAAAAAT 1800
GACGTGCAGA GTTTGAAGAA AGATCGGCCG ATTGTCAAAG TGCCCTTTTA CATGTCGGAA 1860
GCAACACAGA ATTCGCTGAC GCGTTTCTAC CCTCAGTTCG AACTTAAGTT TTCGCACTCC 1920
TCGCATTCAG ATCATCCCGC CGCCGCCGCT TCTAGACTGC TGGAAAATGA AACGTTAGTG 1980
CGCTTATGTG GTAATAGCGT TTCAGATATT GGAGGTTGTC CTCTTTTCCA TTTGCATTCC 2040
AAGACGCAAA GACGGGTTCA CGTATGTAGG CCTGTGTTGG ATGGCAAGGA TGCGCAGCGT 2100
CGCGTGGTGC GTGATTTGCA GTATTCCAAC GTGCGTTTGG GAGACGATGA TAAAATTTTG 2160
GAAGGGCCAC GCAATATCGA CATTTGCCAC TATCCTCTGG GCGCGTGTGA CCACGAAAGT 2220
AGTGCTATGA TGATGGTGCA GGTGTATGAC GCGTCCCTTT ATGAGATATG TGGCGCCATG 2280
ATCAAGAAGA AAAGCCGCAT AACGTACTTA ACCATGGTCA CGCCCGGCGA gtttcttgac 2340
GGACGCGAAT GCGTCTACAT GGAGTCGTTA GACTGTGAGA TTGAAGTTGA TGTGCACGCG 2400
GACGTCGTAA TGTACAAATT CGGTAGTTCT TGCTATTCGC ACAAGCTTTC AATCATCAAG 2460
GACATCATGA CCACTCCGTA CTTGACACTA GGTGGTTTTC TATTCAGCGT GGAGATGTAT 2520
GAGGTGCGTA TGGGCGTGAA TTACTTCAAG ATTACGAAGT CCGAAGTATC GCCTAGCATT 2580
AGCTGCACCA AGCTCCTGAG ATACCGAAGA GCTAATAGTG ACGTGGTTAA AGTTAAACTT 2640
CCACGTTTCG ATAAGAAACG TCGCATGTGT CTGCCTGGGT ATGACACCAT ATACCTAGAT 2700
TCGAAGTTTG TGAGTCGCGT TTTCGATTAT GTCGTGTGTA ATTGCTCTGC CGTGAACTCA 2760
AAAACTTTCG AGTGGGTGTG GAGTTTCATT AAGTCTAGTA AGTCGAGGGT GATTATTAGC 2820
GGTAAAATAA TTCACAAGGA TGTGAATTTG GACCTCAAGT ACGTCGAGAG TTTCGCCGCG 2880
GTTATGTTGG CCTCTGGCGT GCGCAGTAGA CTAGCGTCCG AGTACCTTGC TAAGAACCTT 2940
AGTCATTTTT CGGGAGATTG CTCCTTTATT GAAGCCACGT CTTTCGTGTT GCGTGAGAAA 3000
ATCAGAAACA TGACTCTGAA TTTTAACGAA AGACTTTTAC AGTTAGTGAA GCGCGTTGCC 3060
TTTGCGACCT TGGACGTGAG TTTTCTAGAT TTAGATTCAA CTCTTGAATC AATAACTGAT 3120
TTTGCCGAGT GTAAGGTAGC GATTGAACTC GACGAGTTGG GTTGCTTGAG AGCGGAGGCC 3180
GAGAATGAAA AAATCAGGAA TCTGGCGGGA GATTCGATTG CGGCTAAACT CGCGAGCGAG 3240
ATAGTGGTCG ATATTGACTC TAAGCCTTCA CCGAAGCAGG TGGGTAATTC GTCATCCGAA 3300
AACGCCGATA AGCGGGAAGT TCAGAGGCCC GGTTTGCGTG GTGGTTCTAG AAACGGGGTT 3360
GTTGGGGAGT TCCTTCACTT CGTCGTGGAT TCTGCCTTGC GTCTTTTCAA ATACGCGACG 3420
GATCAACAAC GGATCAAGTC TTACGTGCGT TTCTTGGACT CGGCGGTCTC ATTCTTGGAT 3480
TACAACTACG ATAATCTATC GTTTATACTG CGAGTGCTTT CGGAAGGTTA TTCGTGTATG 3540
TTCGCGTTTT TGGCGAATCG CGGCGACTTA TCTAGTCGTG TCCGTAGCGC GGTGTGTGCT 3600
GTGAAAGAAG TTGCTACCTC ATGCGCGAAC GCGAGCGTTT CTAAAGCCAA GGTTATGATT 3660
ACCTTCGCAG CGGCCGTGTG TGCTATGATG TTTAATAGCT GCGGTTTTTC AGGCGACGGT 3720
CGGGAGTATA AATCGTATAT ACATCGTTAC ACGCAAGTAT TGTTTGACAC TATCTTTTTT 3780
GAGGACAGCA GTTACCTACC CATAGAAGTT CTGAGTTCGG CGATATGCGG TGCTATCGTC 3840
ACACTTTTCT CCTCGGGCTC GTCCATAAGT TTAAACGCCT TCTTACTTCA AATTACCAAA 3900
GGATTCTCCC TAGAGGTTGT CGTCCGGAAT GTTGTGCGAG TCACGCATGG TTTGAGCACC 3960
ACAGCGACCG ACGGCGTCAT ACGTGGGGTT TTCTCCCAAA TTGTGTCTCA CTTACTTGTT 4020
GGAAATACGG GTAATGTGGC TTACCAGTCA GCTTTCATTG CCGGGGTGGT GCCTCTTTTA 4080
GTTAAAAAGT GTGTGAGCTT AATCTTCATC TTGCGTGAAG ATACTTATTC CGGTTTTATT 4140
AAGCACGGAA TCAGTGAATT CTCTTTCCTT AGTAGTATTC TGAAGTTCTT GAAGGGTAAG 4200
CTTGTGGACG AGTTGAAATC GATTATTCAA GGGGTTTTTG ATTCCAACAA GCACGTGTTT 4260
AAAGAAGCTA CTCAGGAAGC GATTCGTACG ACGGTCATGC AAGTGCCTGT CGCTGTAGTG 4320
GATGCCCTTA AGAGCGCCGC GGGAAAAATT TATAACAATT TTACTAGTCG ACGTACCTTT 4380
GGTAAGGATG AAGGCTCCTC TAGCGACGGC GCATGTGAAG AGTATTTCTC ATGCGACGAA 4440
GGTGAAGGTC CGGGTCTGAA AGGGGGTTCC AGCTATGGCT TCTCAATTTT AGCGTTCTTT 4500
TCACGCATTA TGTGGGGAGC TCGTCGGCTT ATTGTTAAGG TGAAGCATGA GTGTTTTGGG 4560
AAACTTTTTG AATTTCTATC GCTCAAGCTT CACGAATTCA GGACTCGCGT TTTTGGGAAG 4620
AATAGAACGG ACGTGGGAGT TTACGATTTT TTGCCCACGG GCATCGTGGA AACGCTCTCA 4680
TCGATAGAAG AGTGCGACCA AATTGAAGAA CTTCTCGGCG ACGACCTGAA AGGTGACAAG 4740
GATGCTTCGT TGACCGATAT GAATTACTTT GAGTTCTCAG AAGACTTCTT AGCCTCTATC 4800
GAGGAGCCGC CTTTCGCTGG ATTGCGAGGA GGTAGCAAGA ACATCGCGAT TTTGGCGATT 4860
TTGGAATACG CGCATAATTT GTTTCGCATT GTCGCAAGCA AGTGTTCGAA ACGACCTTTA 4920
TTTCTTGCTT TCGCCGAACT CTCAAGCGCC CTTATCGAGA AATTTAAGGA GGTTTTCCCT 4980
CGTAAGAGCC AGCTCGTCGC TATCGTGCGC GAGTATACTC AGAGATTCCT CCGAAGTCGC 5040
ATGCGTGCGT TGGGTTTGAA TAACGAGTTC GTGGTAAAAT CTTTCGCCGA TTTGCTACCC 5100
GCATTAATGA AGCGGAAGGT TTCAGGTTCG TTCTTAGCTA GTGTTTATCG CCCACTTAGA 5160
GGTTTCTCAT ATATGTGTGT TTCAGCGGAG CGACGTGAAA AGTTTTTTGC TCTCGTGTGT 5220
TTAATCGGGT TAAGTCTCCC TTTCTTCGTG CGCATCGTAG GAGCGAAAGC GTGCGAAGAA 5280
CTCGTGTCCT CAGCGCGTCG CTTTTATGAG CGTATTAAAA TTTTTCTAAG GCAGAAGTAT 5340
• » · · *·* «·· ·*« ··· ·* · ·
GTCTCTCTTT CTAATTTCTT TTGTCACTTG TTTAGCTCTG ACGTTGATGA CAGTTCCGCA 5400
TCTGCAGGGT TGAAAGGTGG TGCGTCGCGA ATGACGCTCT TCCACCTTCT GGTTCGCCTT 5460
GCTAGTGCCC TCCTATCGTT AGGGTGGGAA GGGTTAAAGC TACTCTTATC GCACCACAAC 552 0
TTGTTATTTT TGTGTTTTGC ATTGGTTGAC GATGTGAACG TCCTTATCAA AGTTCTTGGG 5580
GGTCTTTCTT TCTTTGTGCA ACCAATCTTT TCCTTGTTTG CGGCGATGCT TCTACAACCG 564 0
GACAGGTTTG TGGAGTATTC CGAGAAACTT GTTACAGCGT TTGAATTTTT CTTAAAATGT 5700
TCGCCTCGCG CGCCTGCACT ACTCAAAGGG TTTTTTGAGT GCGTGGCGAA CAGCACTGTG 5760
TCAAAAACCG TTCGAAGACT TCTTCGCTGT TTCGTGAAGA TGCTCAAACT TCGAAAAGGG 5820
CGAGGGTTGC GTGCGGATGG TAGGGGTCTC CATCGGCAGA AAGCCGTACC CGTCATACCT TCTAATCGGG TCGTGACCGA CGGGGTTGAA AGACTTTCGG TAAAGATGCA AGGAGTTGAA 5880 5940
GCGTTGCGTA CCGAATTGAG AATCTTAGAA GATTTAGATT CTGCCGTGAT CGAAAAACTC 6000
AATAGACGCA GAAATCGTGA CACTAATGAC GACGAATTTA CGCGCCCTGC TCATGAGCAG 6060
ATGCAAGAAG TCACCACTTT CTGTTCGAAA GCCAACTCTG CTGGTTTGGC CCTGGAAAGG 6120
GCAGTGCTTG TGGAAGACGC TATAAAGTCG GAGAAACTTT CTAAGACGGT TAATGAGATG 6180
GTGAGGAAAG GGAGTACCAC CAGCGAAGAA GTGGCCGTCG CTTTGTCGGA CGATGAAGCC 6240
GTGGAAGAAA TCTCTGTTGC TGACGAGCGA GACGATTCGC CTAAGACAGT CAGGATAAGC 6300
GAATACCTAA ATAGGTTAAA CTCAAGCTTC GAATTCCCGA AGCCTATTGT TGTGGACGAC 6360
AACAAGGATA CCGGGGGTCT AACGAACGCC GTGAGGGAGT TTTATTATAT GCAAGAACTT 6420
GCTCTTTTCG AAATCCACAG CAAACTGTGC ACCTACTACG ATCAACTGCG CATAGTCAAC 6480
TTCGATCGTT CCGTAGCACC ATGCAGCGAA GATGCTCAGC TGTACGTACG GAAGAACGGC 654 0
TCAACGATAG TGCAGGGTAA AGAGGTACGT TTGCACATTA AGGATTTCCA CGATCACGAT 6600
TTCCTGTTTG ACGGAAAAAT TTCTATTAAC AAGCGGCGGC GAGGCGGAAA TGTTTTATAT 6660
CACGACAACC TCGCGTTCTT GGCGAGTAAT TTGTTCTTAG CCGGCTACCC CTTTTCAAGG 6720
AGCTTCGTCT TCACGAATTC GTCGGTCGAT ATTCTCCTCT ACGAAGCTCC ACCCGGAGGT 6780
GGTAAGACGA CGACGCTGAT TGACTCGTTC TTGAAGGTCT TCAAGAAAGG TGAGGTTTCC 6840
ACCATGATCT TAACCGCCAA CAAAAGTTCG CAGGTTGAGA TCCTAAAGAA AGTGGAGAAG 6900
GAAGTGTCTA ACATTGAATG CCAGAAACGT AAAGACAAAA GATCTCCGAA AAAGAGCATT 6960
TACACCATCG ACGCTTATTT AATGCATCAC CGTGGTTGTG ATGCAGACGT TCTTTTCATC 7020
GATGAGTGTT TCATGGTTCA TGCGGGTAGC GTACTAGCTT GCATTGAGTT CACGAGGTGT 7080
CATAAAGTAA TGATCTTCGG GGATAGCCGG CAGATTCACT ACATTGAAAG GAACGAATTG 7140
GACAAGTGTT TGTATGGGGA TCTCGACAGG TTCGTGGACC TGCAGTGTCG GGTTTATGGT 7200
AATATTTCGT ACCGTTGTCC ATGGGATGTG TGCGCTTGGT TAAGCACAGT GTATGGCAAC7260
CTAATCGCCA CCGTGAAGGG TGAAAGCGAA GGTAAGAGCA GCATGCGCAT TAACGAAATT7320
AATTCAGTCG ACGATTTAGT CCCCGACGTG GGTTCCACGT TTCTGTGTAT GCTTCAGTCG7380
GAGAAGTTGG AAATCAGCAA GCACTTTATT CGCAAGGGTT TGACTAAACT TAACGTTCTA7440
ACGGTGCATG AGGCGCAAGG TGAGACGTAT GCGCGTGTGA ACCTTGTGCG ACTTAAGTTT7500
CAGGAGGATG AACCCTTTAA ATCTATCAGG CACATAACCG TCGCTCTTTC TCGTCACACC7560
GACAGCTTAA CTTATAACGT CTTAGCTGCT CGTCGAGGTG ACGCCACTTG CGATGCCATC7620
CAGAAGGCTG CGGAATTGGT GAACAAGTTT CGCGTTTTTC CTACATCTTT TGGTGGTAGT7680
GTTATCAATC TCAACGTGAA GAAGGACGTG GAAGATAACA GTAGGTGCAA GGCTTCGTCG7740
GCACCATTGA GCGTAATCAA CGACTTTTTG AACGAAGTTA ATCCCGGTAC TGCGGTGATT7800
GATTTTGGTG ATTTGTCCGC GGACTTCAGT ACTGGGCCTT TTGAGTGCGG TGCCAGCGGT7860
ATTGTGGTGC GGGACAACAT CTCCTCCAGC AACATCACTG ATCACGATAA GCAGCGTGTT7920
TAGCGTAGTT CGGTCGCAGG CGATTCCGCG TAGAAAACCT TCTCTACAAG AAAATTTGTA7980
TTCGTTTGAA GCGCGGAATT ATAACTTCTC GACTTGCGAC CGTAACACAT CTGCTTCAAT8040
GTTCGGAGAG GCTATGGCGA TGAACTGTCT TCGTCGTTGC TTCGACCTAG ATGCCTTTTC8100
GTCCCTGCGT GATGATGTGA TTAGTATCAC ACGTTCAGGC ATCGAACAAT GGCTGGAGAA8160
ACGTACTCCT AGTCAGATTA AAGCATTAAT GAAGGATGTT GAATCGCCTT TGGAAATTGA8220
CGATGAAATT TGTCGTTTTA AGTTGATGGT GAAGCGTGAC GCTAAGGTGA AGTTAGACTC8280
TTCTTGTTTA ACTAAACACA GCGCCGCTCA AAATATCATG TTTCATCGCA AGAGCATTAA8340
TGCTATCTTC TCTCCTATCT TTAATGAGGT GAAAAACCGA ATAATGTGCT GTCTTAAGCC8400
TAACATAAAG TTTTTTACGG AGATGACTAA CAGGGATTTT GCTTCTGTTG TCAGCAACAT8460
GCTTGGTGAC GACGATGTGT ACCATATAGG TGAAGTTGAT TTCTCAAAGT ACGACAAGTC8520
TCAAGATGCT TTCGTGAAGG CTTTTGAAGA AGTAATGTAT AAGGAACTCG GTGTTGATGA8580
AGAGTTGCTG GCTATCTGGA TGTGCGGCGA GCGGTTATCG ATAGCTAACA CTCTCGATGG8640
TCAGTTGTCC TTCACGATCG AGAATCAAAG GAAGTCGGGA GCTTCGAACA CTTGGATTGG8700
TAACTCTCTC GTCACTTTGG GTATTTTAAG TCTTTACTAC GACGTTAGAA ATTTCGAGGC8760
GTTGTACATC TCGGGCGATG ATTCTTTAAT TTTTTCTCGC AGCGAGATTT CGAATTATGC8820
CGACGACATA TGCACTGACA TGGGTTTTGA GACAAAATTT ATGTCCCCAA GTGTCCCGTA8880
CTTTTGTTCT AAATTTGTTG TTATGTGTGG TCATAAGACG TTTTTTGTTC CCGACCCGTA8940
CAAGCTTTTT GTCAAGTTGG GAGCAGTCAA AGAGGATGTT TCAATGGATT TCCTTTTCGA9000
GACTTTTACC TCCTTTAAAG ACTTAACCTC CGATTTTAAC GACGAGCGCT TAATTCAAAA
GCTCGCTGAA CTTGTGGCTT TAAAATATGA GGTTCAAACC GGCAACACCA CCTTGGCGTT
AAGTGTGATA CATTGTTTGC GTTCGAATTT CCTCTCGTTT AGCAAGTTAT ATCCTCGCGT
GAAGGGATGG CAGGTTTTTT ACACGTCGGT TAAGAAAGCG CTTCTCAAGA GTGGGTGTTC
TCTCTTCGAC AGTTTCATGA CCCCTTTTGG TCAGGCTGTC ATGGTTTGGG ATGATGAGTA
GCGCTAACTT GTGCGCAGTT TCTTTGTTCG TGACATACAC CTTGTGTGTC ACCGTGCGTT
TATAATGAAT CAGGTTTTGC AGTTTGAATG TTTGTTTCTG CTGAATCTCG CGGTTTTTGC
TGTGACTTTC ATTTTCATTC TTCTGGTCTT CCGCGTGATT AAGTCTTTTC GCCAGAAGGG
TCACGAAGCA CCTGTTCCCG TTGTTCGTGG CGGGGGTTTT TCAACCGTAG TGTAGTCAAA
AGACGCGCAT ATGGTAGTTT TCGGTTTGGA CTTTGGCACC ACATTCTCTA CGGTGTGTGT
GTACAAGGAT GGACGAGTTT TTTCATTCAA GCAGAATAAT TCGGCGTACA TCCCCACTTA
CCTCTATCTC TTCTCCGATT CTAACCACAT GACTTTTGGT TACGAGGCCG AATCACTGAT
GAGTAATCTG AAAGTTAAAG GTTCGTTTTA TAGAGATTTA AAACGTTGGG TGGGTTGCGA
TTCGAGTAAC CTCGACGCGT . ACCTTGACCG TTTAAAACCT CATTACTCGG TCCGCTTGGT
TAAGATCGGC TCTGGCTTGA ACGAAACTGT TTCAATTGGA AACTTCGGGG GCACTGTTAA GTCTGAGGCT CATCTGCCAG GGTTGATAGC TCTCTTTATT AAGGCTGTCA TTAGTTGCGC GGAGGGCGCG TTTGCGTGCA CTTGCACCGG GGTTATTTGT TCAGTACCTG CCAATTATGA TAGCGTTCAA AGGAATTTCA CTGATCAGTG TGTTTCACTC AGCGGTTATC AGTGCGTATA TATGATCAAT GAACCTTCAG CGGCTGCGCT ATCTGCGTGT AATTCGATTG GAAAGAAGTC CGCAAATTTG GCTGTTTACG ATTTCGGTGG TGGGACCTTC GACGTGTCTA TCATTTCATA CCGCAACAAT ACTTTTGTTG TGCGAGCTTC TGGAGGCGAT CTAAATCTCG GTGGAAGGGA TGTTGATCGT GCGTTTCTCA CGCACCTCTT CTCTTTAACA TCGCTGGAAC CTGACCTCAC TTTGGATATC TCGAATCTGA AAGAATCTTT ATCAAAAACG GACGCAGAGA TAGTTTACAC TTTGAGAGGT GTCGATGGAA GAAAAGAAGA CGTTAGAGTA AACAAAAACA TTCTTACGTC GGTGATGCTC CCCTACGTGA ACAGAACGCT TAAGATATTA GAGTCAACCT TAAAATCGTA TGCTAAGAGT ATGAATGAGA GTGCGCGAGT TAAGTGCGAT TTAGTGCTGA TAGGAGGATC TTCATATCTT CCTGGCCTGG CAGACGTACT AACGAAGCAT CAGAGCGTTG ATCGTATCTT
AAGAGTTTCG GATCCTCGGG CTGCCGTGGC
CTCAGGATCT GGGGGGTTGC TACTGATCGA
CAGAAGTTGT CATCAAATCA TTTGCGCTCC
9060
9120
9180
9240
9300
9360
9420
94B0
9540
9600
9660
9720
9780
9840
9900
9960
10020
10080
10140
10200
10260
10320
10380
10440
10500
10560
10620
10680
10740 loeoo
CGTCGGTTGC GCATTATATT CTTCATGCCT
CTGTGCAGCT CACACTGTCG CTATAGCGGA
AGCGGGGGCA CCGATCCCCT TTTCAGGAAG
CATGCCTTTG TACTTAGCCA GGGTCAACAA GAACTCGCAG CGTGAAGTCG CCGTGTTTGA 10860
AGGGGAGTAC GTTAAGTGCC CTAAGAACAG AAAGATCTGT GGAGCAAATA TAAGATTTTT10920
TGATATAGGA GTGACGGGTG ATTCGTACGC ACCCGTTACC TTCTATATGG ATTTCTCCAT10980
TTCAAGCGTA GGAGCCGTTT CATTCGTGGT GAGAGGTCCT GAGGGTAAGC AAGTGTCACT11040
CACTGGAACT CCAGCGTATA ACTTTTCGTC TGTGGCTCTC GGATCACGCA GTGTCCGAGA11100
ATTGCATATT AGTTTAAATA ATAAAGTTTT TCTCGGTTTG CTTCTACATA GAAAGGCGGA11160
TCGACGAATA CTTTTCACTA AGGATGAAGC GATTCGATAC GCCGATTCAA TTGATATCGC11220
GGATGTGCTA AAGGAATATA AAAGTTACGC GGCCAGTGCC TTACCACCAG ACGAGGATGT11280
CGAATTACTC CTGGGAAAGT CTGTTCAAAA AGTTTTACGG GGAAGCAGAC TGGAAGAAAT11340
ACCTCTCTAG GAGCATAGCA GCACACTCAA GTGAAATTAA AACTCTACCA GACATTCGAT11400
TGTACGGCGG TAGGGTTGTA AAGAAGTCCG AATTCGAATC AGCACTTCCT AATTCTTTTG11460
AACAGGAATT AGGACTGTTC ATACTGAGCG AACGGGAAGT GGGATGGAGC AAATTATGCG11520
GAATAACGGT GGAAGAAGCA GCATACGATC TTACGAATCC CAAGGCTTAT AAATTCACTG11580
CCGAGACATG TAGCCCGGAT GTAAAAGGTG AAGGACAAAA ATACTCTATG GAAGACGTGA 1164 0
TGAATTTCAT GCGTTTATCA AATCTGGATG TTAACGACAA GATGCTGACG GAACAGTGTT11700
GGTCGCTGTC CAATTCATGC GGTGAATTGA TCAACCCAGA CGACAAAGGG CGATTCGTGG11760
CTCTCACCTT TAAGGACAGA GACACAGCTG ATGACACGGG TGCCGCCAAC GTGGAATGTC11820
GCGTGGGCGA CTATCTAGTT TACGCTATGT CCCTGTTTGA GCAGAGGACC CAAAAATCGC11880
AGTCTGGCAA CATCTCTCTG TACGAAAAGT ACTGTGAATA CATCAGGACC TACTTAGGGA11940
GTACAGACCT GTTCTTCACA GCGCCGGACA GGATTCCGTT ACTTACGGGC ATCCTATACG12000
ATTTTTGTAA GGAATACAAC GTTTTCTACT CGTCATATAA GAGAAACGTC GATAATTTCA12060
GATTCTTCTT GGCGAATTAT ATGCCTTTGA TATCTGACGT CTTTGTCTTC CAGTGGGTAA12120
AACCCGCGCC GGATGTTCGG CTGCTTTTTG AGTTAAGTGC AGCGGAACTA ACGCTGGAGG12180
TTCCCACACT GAGTTTGATA GATTCTCAAG TTGTGGTAGG TCATATCTTA AGATACGTAG12240
AATCCTACAC ATCAGATCCA GCCATCGACG CGTTAGAAGA CAAACTGGAA GCGATACTGA12300
AAAGTAGCAA TCCCCGTCTA TCGACAGCGC AACTATGGGT TGGTTTCTTT TGTTACTATG12360
GTGAGTTTCG TACGGCTCAA AGTAGAGTAG TGCAAAGACC AGGCGTATAC AAAACACCTG12420
ACTCAGTGGG TGGATTTGAA ATAAACATGA AAGATGTTGA GAAATTCTTC GATAAACTTC12480
AGAGAGAATT GCCTAATGTA TCTTTGCGGC GTCAGTTTAA CGGAGCTAGA GCGCATGAGG12540
CTTTCAAAAT ATTTAAAAAC GGAAATATAA GTTTCAGACC TATATCGCGT TTAAACGTGC12600
CTAGAGAGTT CTGGTATCTG AACATAGACT ACTTCAGGCA CGCGAATAGG TCCGGGTTAA12660
- 26 - : ; ···, .·
-*· »*· ·** H »
CCGAAGAAGA AATACTCATC CTAAACAACA TAAGCGTTGA TGTTAGGAAG TTATGCGCTG12720
AGAGAGCGTG CAATACCCTA CCTAGCGCGA AGCGCTTTAG TAAAAATCAT AAGAGTAATA12780
TACAATCATC ACGCCAAGAG CGGAGGATTA AAGACCCATT GGTAGTCCTG AAAGACACTT12840
TATATGAGTT CCAACACAAG CGTGCCGGTT GGGGGTCTCG AAGCACTCGA GACCTCGGGA12900
GTCGTGCTGA CCACGCGAAA GGAAGCGGTT GATAAGTTTT TTAATGAACT AAAAAACGAA12960
AATTACTCAT CAGTTGACAG CAGCCGATTA AGCGATTCGG AAGTAAAAGA AGTGTTAGAG13020
AAAAGTAAAG AAAGTTTCAA AAGCGAACTG GCCTCCACTG ACGAGCACTT CGTCTACCAC13080
ATTATATTTT TCTTAATCCG ATGTGCTAAG ATATCGACAA GTGAAAAGGT GAAGTACGTT13140
GGTAGTCATA CGTACGTGGT CGACGGAAAA ACGTACACCG TTCTTGACGC TTGGGTATTC13200
AACATGATGA AAAGTCTCAC GAAGAAGTAC AAACGAGTGA ATGGTCTGCG TGCGTTCTGT13260
TGCGCGTGCG AAGATCTATA TCTAACCGTC GCACCAATAA TGTCAGAACG CTTTAAGACT13320
AAAGCCGTAG GGATGAAAGG TTTGCCTGTT GGAAAGGAAT ACTTAGGCGC CGACTTTCTT13380
TCGGGAACTA GCAAACTGAT GAGCGATCAC GACAGGGCGG TCTCCATCGT TGCAGCGAAA13440
AACGCTGTCG ATCGTAGCGC TTTCACGGGT GGGGAGAGAA AGATAGTTAG TTTGTATGAT13500
CTAGGGAGGT ACTAAGCACG GTGTGCTATA GTGCGTGCTA ΤΑΑΤΆΑΤΑΑΑ CACTAGTGCT13560
TAAGTCGCGC AGAAGAAAAC GCTATGGAGT TGATGTCCGA CAGCAACCTT AGCAACCTGG13620
TGATAACCGA CGCCTCTAGT CTAAATGGTG TCGACAAGAA GCTTTTATCT GCTGAAGTTG13680
AAAAAATGTT GGTGCAGAAA GGGGCTCCTA ACGAGGGTAT AGAAGTGGTG TTCGGTCTAC13740
TCCTTTACGC ACTCGCGGCA AGAACCACGT CTCCTAAGGT TCAGCGCGCA GATTCAGACG13800
TTATATTTTC AAATAGTTTC GGAGAGAGGA ATGTGGTAGT AACAGAGGGT GACCTTAAGA13860
AGGTACTCGA CGGGTGTGCG CCTCTCACTA GGTTCACTAA TAAACTTAGA ACGTTCGGTC13920
GTACTTTCAC TGAGGCTTAC GTTGACTTTT GTATCGCGTA TAAGCACAAA TTACCCCAAC13980
TCAACGCCGC GGCGGAATTG GGGATTCCAG CTGAAGATTC GTACTTAGCT GCAGATTTTC14040
TGGGTACTTG CCCGAAGCTC TCTGAATTAC AGCAAAGTAG GAAGATGTTC GCGAGTATGT14100
ACGCTCTAAA AACTGAAGGT GGAGTGGTAA ATACACCAGT GAGCAATCTG CGTCAGCTAG14160
GTAGAAGGGA AGTTATGTAA TGGAAGATTA CGAAGAAAAA TCCGAATCGC TCATACTGCT14220
ACGCACGAAT CTGAACACTA TGCTTTTAGT GGTCAAGTCC GATGCTAGTG TAGAGCTGCC14280
TAAACTACTA ATTTGCGGTT ACTTACGAGT GTCAGGACGT GGGGAGGTGA CGTGTTGCAA 14 34 0
CCGTGAGGAA TTAACAAGAG ATTTTGAGGG CAATCATCAT ACGGTGATCC GTTCTAGAAT 14 4 00
CATACAATAT GACAGCGAGT CTGCTTTTGA GGAATTCAAC AACTCTGATT GCGTAGTGAA 14 4 60
GTTTTTCCTA GAGACTGGTA GTGTCTTTTG GTTTTTCCTT CGAAGTGAAA CCAAAGGTAG 14 520
AGCGGTGCGA CATTTGCGCA CCTTCTTCGA AGCTAACAAT TTCTTCTTTG GATCGCATTG 14580
CGGTACCATG GAGTATTGTT TGAAGCAGGT ACTAACTGAA ACTGAATCTA TAATCGATTC 14640
TTTTTGCGAA GAAAGAAATC GTTAAGATGA GGGTTATAGT GTCTCCTTAT GAAGCTGAAG 14700
ACATTCTGAA AAGATCGACT GACATGTTAC GAAACATAGA CAGTGGGGTC TTGAGCACTA 14760
AAGAATGTAT CAAGGCATTC TCGACGATAA CGCGAGACCT ACATTGTGCG AAGGCTTCCT 14820
ACCAGTGGGG TGTTGACACT GGGTTATATC AGCGTAATTG CGCTGAAAAA CGTTTAATTG 14880
ACACGGTGGA GTCAAACATA CGGTTGGCTC AACCTCTCGT GCGTGAAAAA GTGGCGGTTC 14940
ATTTTTGTAA GGATGAACCA AAAGAGCTAG TAGCATTCAT CACGCGAAAG TACGTGGAAC 15000
TCACGGGCGT GGGAGTGAGA GAAGCGGTGA AGAGGGAAAT GCGCTCTCTT ACCAAAACAG 15060
TTTTAAATAA AATGTCTTTG GAAATGGCGT TTTACATGTC ACCACGAGCG TGGAAAAACG 15120
CTGAATGGTT AGAACTAAAA TTTTCACCTG TGAAAATCTT TAGAGATCTG CTATTAGACG 15180
TGGAAACGCT CAACGAATTG TGCGCCGAAG ATGATGTTCA CGTCGACAAA GTAAATGAGA 15240
ATGGGGACGA AAATCACGAC CTCGAACTCC AAGACGAATG TTAAACATTG GTTAAGTTTA 15300
ACGAAAATGA TTAGTAAATA ATAAATCGAA CGTGGGTGTA TCTACCTGAC GTATCAACTT 15360
AAGCTGTTAC TGAGTAATTA AACCAACAAG TGTTGGTGTA ATGTGTATGT TGATGTAGAG 15420
AAAAATCCGT TTGTAGAACG GTGTTTTTCT CTTCTTTATT TTTAAAAAAA AAATAAAAAA 15480
AAAAAAAAAA AAGCGGCCGC 15500
A találmány tárgyát képező másik DNS-molekula (GLRaV-2 ORFla) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 4-7923. nukleotidjait és feltételezhetően egy nagyméretű szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus poliproteint kódol, amely két papain-szerű proteáz, egy metü-transzferáz és egy helikáz jellemző konzervált doménjeit tartalmazza. Ez a DNS-molekula a 2. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ACATTGCGAG AGAACCCCAT TAGCGTCTCC caggttattt atttcggcag tttcacgcag gcgatcgtaa aaacgcaact tccaccggtc gaggtagctc ccgacagggg cgtggtcgac cagcgcggtg tgctttcttt tccgacggtg ggggtgaact tgggaaggtc tgccgccgct CCCTTCGCGT TGTATCCGCG CCAAGAGAGC agtgtagtga AGGTGGAGTG cgtagctgcg aagaaaccta cgtctgttgg cgttcccccg gttcggaacc gcggcgacgt gataatcaca
120
180
240
300
GGGGTGGTGC ATGAAGCCCT GAAGAAAATT AAAGACGGGC TCTTACGCTT CCGCGTAGGC 360
GGTGACATGC GTTTTTCGAG ATTTTTCTCA TCGAACTACG GCTGCAGATT CGTCGCGAGC 420
GTGCGTACGA ACACTACAGT TTGGCTAAAT TGCACGAAAG CGAGTGGTGA GAAATTCTCA 480
CTCGCCGCCG CGTGCACGGC GGATTACGTG GCGATGCTGC GTTATGTGTG TGGCGGGAAA 540
TTTCCACTCG TCCTCATGAG TAGAGTTATT TACCCGGATG GGCGCTGTTA CTTGGCCCAT 600
ATGAGGTATT TGTGCGCCTT TTACTGTCGC CCGTTTAGAG AGTCGGATTA TGCCCTCGGA 660
ATGTGGCCTA CGGTGGCGCG TCTCAGGGCA TGCGTTGAGA AGAACTTCGG TGTCGAAGCT 720
TGTGGCATAG CTCTTCGTGG CTATTACACC TCTCGCAATG TTTATCACTG TGATTATGAC 780
TCTGCTTATG TAAAATATTT TAGAAACCTT TCCGGCCGCA TTGGCGGTGG TTCGTTCGAT 840
CCGACATCTT TAACCTCCGT AATAACGGTG AAGATTAGCG GTCTTCCAGG TGGTCTTCCT 900
AAAAATATAG CGTTTGGTGC CTTCCTGTGC GATATACGTT ACGTCGAACC GGTAGACTCG 960
GGCGGCATTC AATCGAGCGT TAAGACGAAA CGTGAAGATG CGCACCGAAC CGTAGAGGAA 1020
CGGGCGGCCG GCGGATCCGT CGAGCAACCG CGACAAAAGA GGATAGATGA GAAAGGTTGC 1080
GGCAGAGTTC CTAGTGGAGG TTTTTCGCAT CTCCTGGTCG GCAACCTTAA cgaagttagg 1140
AGGAAGGTAG CTGCCGGACT TCTACGCTTT CGCGTTGGCG GTGATATGGA TTTTCATCGC 1200
TCGTTCTCCA CCCAAGCGGG CCACCGCTTG CTGGTGTGGC GCCGCTCGAG CCGGAGCGTG 1260
TGCCTTGAAC TTTACTCACC ATCTAAAAAC TTTTTGCGTT ACGATGTCTT GCCCTGTTCT 1320
GGAGACTATG CAGCGATGTT TTCTTTCGCG GCGGGCGGCC GTTTCCCTTT AGTTTTGATG 1380
ACTAGAATTA GATACCCGAA CGGGTTTTGT TACTTGGCTC ACTGCCGGTA CGCGTGCGCG 1440
TTTCTCTTAA GGGGTTTTGA TCCGAAGCGT TTCGACATCG GTGCTTTCCC CACCGCGGCC 1500
AAGCTCAGAA ACCGTATGGT TTCGGAGCTT GGTGAAAGAA GTTTAGGTTT GAACTTGTAC 1560
GGCGCATATA CGTCACGCGG CGTCTTTCAC TGCGATTATG acgctaagtt TATAAAGGAT 1620
TTGCGTCTTA TGTCAGCAGT TATAGCTGGA AAGGACGGGG TGGAAGAGGT GGTACCTTCT 1680
GACATAACTC CTGCCATGAA GCAGAAAACG ATCGAAGCCG TGTATGATAG ATTATATGGC 1740
GGCACTGACT CGTTGCTGAA ACTGAGCATC GAGAAAGACT TAATCGATTT CAAAAATGAC 1800
GTGCAGAGTT TGAAGAAAGA TCGGCCGATT GTCAAAGTGC CCTTTTACAT GTCGGAAGCA 1860
ACACAGAATT CGCTGACGCG TTTCTACCCT CAGTTCGAAC TTAAGTTTTC GCACTCCTCG 1920
CATTCAGATC ATCCCGCCGC CGCCGCTTCT AGACTGCTGG AAAATGAAAC GTTAGTGCGC 1980
TTATGTGGTA ATAGCGTTTC AGATATTGGA GGTTGTCCTC TTTTCCATTT GCATTCCAAG 2040
ACGCAAAGAC GGGTTCACGT ATGTAGGCCT GTGTTGGATG GCAAGGATGC GCAGCGTCGC 2100
GTGGTGCGTG ATTTGCAGTA TTCCAACGTG CGTTTGGGAG ACGATGATAA AATTTTGGAA 2160
GGGCCACGCA ATATCGACAT TTGCCACTAT CCTCTGGGCG CGT.GTGACCA CGAAAGTAGT 2220
GCTATGATGA TGGTGCAGGT GTATGACGCG TCCCTTTATG AGATATGTGG CGCCATGATC 2280
aagaagaaaa gccgcataac gtacttaacc atggtcacgc ccggcgagtt TCTTGACGGA CGCGAATGCG TCTACATGGA GTCGTTAGAC TGTGAGATTG AAGTTGATGT GCACGCGGAC GTCGTAATGT ACAAATTCGG TAGTTCTTGC TATTCGCACA AGCTTTCAAT CATCAAGGAC ATCATGACCA CTCCGTACTT GACACTAGGT GGTTTTCTAT TCAGCGTGGA GATGTATGAG GTGCGTATGG GCGTGAATTA CTTCAAGATT ACGAAGTCCG AAGTATCGCC TAGCATTAGC ‘ TGCACCAAGC TCCTGAGATA CCGAAGAGCT AATAGTGACG TGGTTAAAGT TAAACTTCCA CGTTTCGATA AGAAACGTCG CATGTGTCTG CCTGGGTATG ACACCATATA CCTAGATTCG AAGTTTGTGA GTCGCGTTTT CGATTATGTC GTGTGTAATT GCTCTGCCGT GAACTCAAAA ACTTTCGAGT GGGTGTGGAG TTTCATTAAG TCTAGTAAGT CGAGGGTGAT TATTAGCGGT AAAATAATTC ACAAGGATGT GAATTTGGAC CTCAAGTACG TCGAGAGTTT CGCCGCGGTT ATGTTGGCCT CTGGCGTGCG CAGTAGACTA GCGTCCGAGT ACCTTGCTAA GAACCTTAGT CATTTTTCGG GAGATTGCTC CTTTATTGAA GCCACGTCTT TCGTGTTGCG TGAGAAAATC AGAAACATGA CTCTGAATTT TAACGAAAGA CTTTTACAGT TAGTGAAGCG CGTTGCCTTT GCGACCTTGG ACGTGAGTTT TCTAGATTTA GATTCAACTC TTGAATCAAT AACTGATTTT GCCGAGTGTA AGGTAGCGAT TGAACTCGAC GAGTTGGGTT GCTTGAGAGC GGAGGCCGAG AATGAAAAAA TCAGGAATCT GGCGGGAGAT TCGATTGCGG CTAAACTCGC GAGCGAGATA GTGGTCGATA TTGACTCTAA GCCTTCACCG AAGCAGGTGG GTAATTCGTC ATCCGAAAAC GCCGATAAGC GGGAAGTTCA GAGGCCCGGT TTGCGTGGTG GTTCTAGAAA CGGGGTTGTT GGGGAGTTCC TTCACTTCGT CGTGGATTCT GCCTTGCGTC TTTTCAAATA CGCGACGGAT CAACAACGGA TCAAGTCTTA CGTGCGTTTC TTGGACTCGG CGGTCTCATT CTTGGATTAC aactacgata atctatcgtt tatactgcga gtgctttcgg aaggttattc gtgtatgttc GCGTTTTTGG CGAATCGCGG CGACTTATCT AGTCGTGTCC GTAGCGCGGT GTGTGCTGTG AAAGAAGTTG CTACCTCATG CGCGAACGCG AGCGTTTCTA AAGCCAAGGT TATGATTACC TTCGCAGCGG CCGTGTGTGC TATGATGTTT AATAGCTGCG GTTTTTCAGG CGACGGTCGG GAGTATAAAT CGTATATACA TCGTTACACG CAAGTATTGT TTGACACTAT CTTTTTTGAG GACAGCAGTT ACCTACCCAT AGAAGTTCTG AGTTCGGCGA TATGCGGTGC TATCGTCACA CTTTTCTCCT CGGGCTCGTC CATAAGTTTA AACGCCTTCT TACTTCAAAT TACCAAAGGA TTCTCCCTAG AGGTTGTCGT CCGGAATGTT GTGCGAGTCA CGCATGGTTT GAGCACCACA GCGACCGACG GCGTCATACG TGGGGTTTTC TCCCAAATTG TGTCTCACTT ACTTGTTGGA AATACGGGTA atgtggctta CCAGTCAGCT ttcattgccg gggtggtgcc tcttttagtt aaaaagtgtg tgagcttaat cttcatcttg cgtgaagata cttattccgg ttttattaag
2340
2400
2460
2520
2580
2640
2700
2760
2820
2880
2940
3000
3060
3120
3180
3240
3300
3360
3420
3480
3540
3600
3660
3720
3780
3840
3900
3960
020
4080
4140 ··/
CACGGAATCA GTGAATTCTC TTTCCTTAGT AGTATTCTGA AGTTCTTGAA GGGTAAGCTT GTGGACGAGT TGAAATCGAT TATTCAAGGG GTTTTTGATT CCAACAAGCA CGTGTTTAAA GAAGCTACTC AGGAAGCGAT TCGTACGACG GTCATGCAAG TGCCTGTCGC TGTAGTGGAT GCCCTTAAGA GCGCCGCGGG aaaaatttat AACAATTTTA CTAGTCGACG TACCTTTGGT AAGGATGAAG GCTCCTCTAG CGACGGCGCA TGTGAAGAGT ATTTCTCATG CGACGAAGGT 4200 4260 4320 4380 4440
GAAGGTCCGG GTCTGAAAGG GGGTTCCAGC TATGGCTTCT CAATTTTAGC GTTCTTTTCA CGCATTATGT GGGGAGCTCG TCGGCTTATT GTTAAGGTGA AGCATGAGTG TTTTGGGAAA CTTTTTGAAT TTCTATCGCT CAAGCTTCAC GAATTCAGGA CTCGCGTTTT TGGGAAGAAT AGAACGGACG TGGGAGTTTA CGATTTTTTG CCCACGGGCA TCGTGGAAAC GCTCTCATCG ATAGAAGAGT GCGACCAAAT TGAAGAACTT CTCGGCGACG ACCTGAAAGG TGACAAGGAT GCTTCGTTGA CCGATATGAA TTACTTTGAG TTCTCAGAAG ACTTCTTAGC CTCTATCGAG 4500 4560 4 620 4680 4740 4800
GAGCCGCCTT TCGCTGGATT GCGAGGAGGT AGCAAGAACA TCGCGATTTT GGCGATTTTG GAATACGCGC ATAATTTGTT TCGCATTGTC gcaagcaagt gttcgaaacg acctttattt 4860 4 920
CTTGCTTTCG CCGAACTCTC AAGCGCCCTT ATCGAGAAAT TTAAGGAGGT TTTCCCTCGT aagagccagc tcgtcgctat cgtgcgcgag TATACTCAGA GATTCCTCCG AAGTCGCATG CGTGCGTTGG GTTTGAATAA CGAGTTCGTG GTAAAATCTT TCGCCGATTT GCTACCCGCA 4 980 5040 5100
TTAATGAAGC GGAAGGTTTC AGGTTCGTTC TTAGCTAGTG TTTATCGCCC ACTTAGAGGT 5160
TTCTCATATA TGTGTGTTTC AGCGGAGCGA CGTGAAAAGT TTTTTGCTCT CGTGTGTTTA 5220
ATCGGGTTAA GTCTCCCTTT CTTCGTGCGC ATCGTAGGAG CGAAAGCGTG CGAAGAACTC 5280
GTGTCCTCAG CGCGTCGCTT TTATGAGCGT ATTAAAATTT TTCTAAGGCA GAAGTATGTC 5340
TCTCTTTCTA ATTTCTTTTG TCACTTGTTT AGCTCTGACG TTGATGACAG TTCCGCATCT 5400
GCAGGGTTGA AAGGTGGTGC GTCGCGAATG ACGCTCTTCC ACCTTCTGGT TCGCCTTGCT 5460
AGTGCCCTCC TATCGTTAGG GTGGGAAGGG TTAAAGCTAC TCTTATCGCA CCACAACTTG 5520
TTATTTTTGT GTTTTGCATT GGTTGACGAT GTGAACGTCC TTATCAAAGT TCTTGGGGGT 5580
CTTTCTTTCT TTGTGCAACC AATCTTTTCC TTGTTTGCGG CGATGCTTCT ACAACCGGAC 5640
AGGTTTGTGG AGTATTCCGA GAAACTTGTT ACAGCGTTTG AATTTTTCTT AAAATGTTCG 5700
CCTCGCGCGC CTGCACTACT CAAAGGGTTT TTTGAGTGCG TGGCGAACAG CACTGTGTCA 5760
AAAACCGTTC GAAGACTTCT TCGCTGTTTC GTGAAGATGC TCAAACTTCG AAAAGGGCGA 5820
GGGTTGCGTG CGGATGGTAG GGGTCTCCAT CGGCAGAAAG CCGTACCCGT CATACCTTCT 5880
AATCGGGTCG TGACCGACGG GGTTGAAAGA CTTTCGGTAA AGATGCAAGG AGTTGAAGCG 5940
TTGCGTACCG AATTGAGAAT CTTAGAAGAT TTAGATTCTG CCGTGATCGA AAAACTCAAT 6000
AGACGCAGAA ATCGTGACAC TAATGACGAC GAATTTACGC GCCCTGCTCA TGAGCAGATG 6060
CAAGAAGTCA CCACTTTCTG TTCGAAAGCC AACTCTGCTG GTTTGGCCCT GGAAAGGGCA 6120
GTGCTTGTGG AAGACGCTAT AAAGTCGGAG AAACTTTCTA AGACGGTTAA TGAGATGGTG 6180
AGGAAAGGGA GTACCACCAG CGAAGAAGTG GCCGTCGCTT TGTCGGACGA TGAAGCCGTG 6240
GAAGAAATCT CTGTTGCTGA CGAGCGAGAC GATTCGCCTA AGACAGTCAG GATAAGCGAA 6300
TACCTAAATA GGTTAAACTC AAGCTTCGAA TTCCCGAAGC CTATTGTTGT GGACGACAAC 6360
AAGGATACCG GGGGTCTAAC GAACGCCGTG AGGGAGTTTT ATTATATGCA AGAACTTGCT 6420
CTTTTCGAAA TCCACAGCAA ACTGTGCACC TACTACGATC AACTGCGCAT AGTCAACTTC 6480
GATCGTTCCG TAGCACCATG CAGCGAAGAT GCTCAGCTGT ACGTACGGAA GAACGGCTCA 6540
ACGATAGTGC AGGGTAAAGA GGTACGTTTG CACATTAAGG ATTTCCACGA TCACGATTTC 6600
CTGTTTGACG GAAAAATTTC TATTAACAAG CGGCGGCGAG GCGGAAATGT TTTATATCAC 6660
GACAACCTCG CGTTCTTGGC GAGTAATTTG TTCTTAGCCG GCTACCCCTT TTCAAGGAGC 6720
TTCGTCTTCA CGAATTCGTC GGTCGATATT CTCCTCTACG AAGCTCCACC CGGAGGTGGT 6780
AAGACGACGA CGCTGATTGA CTCGTTCTTG AAGGTCTTCA AGAAAGGTGA GGTTTCCACC 6840
ATGATCTTAA CCGCCAACAA AAGTTCGCAG GTTGAGATCC TAAAGAAAGT GGAGAAGGAA 6900
GTGTCTAACA TTGAATGCCA GAAACGTAAA GACAAAAGAT CTCCGAAAAA GAGCATTTAC 6960
ACCATCGACG CTTATTTAAT GCATCACCGT GGTTGTGATG CAGACGTTCT TTTCATCGAT 7020
GAGTGTTTCA TGGTTCATGC GGGTAGCGTA CTAGCTTGCA TTGAGTTCAC GAGGTGTCAT 7080
AAAGTAATGA TCTTCGGGGA TAGCCGGCAG ATTCACTACA TTGAAAGGAA CGAATTGGAC 7140
AAGTGTTTGT ATGGGGATCT CGACAGGTTC GTGGACCTGC AGTGTCGGGT TTATGGTAAT 7200
ATTTCGTACC GTTGTCCATG GGATGTGTGC GCTTGGTTAA GCACAGTGTA TGGCAACCTA 7260
ATCGCCACCG TGAAGGGTGA AAGCGAAGGT AAGAGCAGCA TGCGCATTAA CGAAATTAAT 7320
TCAGTCGACG ATTTAGTCCC CGACGTGGGT TCCACGTTTC TGTGTATGCT TCAGTCGGAG 7380
AAGTTGGAAA TCAGCAAGCA ctttattcgc aagggtttga ctaaacttaa CGTTCTAACG 7440
GTGCATGAGG CGCAAGGTGA GACGTATGCG CGTGTGAACC TTGTGCGACT TAAGTTTCAG 7500
gaggatgaac cctttaaatc tatcaggcac ataaccgtcg ctctttctcg tcacaccgac 7560
agcttaactt ataacgtctt agctgctcgt cgaggtgacg ccacttgcga tgccatccag 7620
aaggctgcgg aattggtgaa caagtttcgc gtttttccta catcttttgg tggtagtgtt 7680
ATCAATCTCA ACGTGAAGAA GGACGTGGAA GATAACAGTA GGTGCAAGGC TTCGTCGGCA 7740
CCATTGAGCG TAATCAACGA ctttttgaac gaagttaatc CCGGTACTGC ggtgattgat 7800
TTTGGTGATT TGTCCGCGGA CTTCAGTACT GGGCCTTTTG AGTGCGGTGC CAGCGGTATT 7860
GTGGTGCGGG ACAACATCTC ctccagcaac atcactgatc acgataagca gcgtgtttag 7920
A nagyméretű poliprotein (papain-szerű proteázok, metil-transzferáz és helikáz) a 3 szekvenciának megfelelő aminosav az alábbiak szerint azonosítási szám szerinti szekvenciával rendelkezik
Thr Leu 1 Arg Glu Asn Pro Ile 5 Ser Val Ser 10 Gly Val Asn Leu Gly 15 Arg
Ser Alá Alá Alá 20 Gin Val Ile Tyr Phe 25 Gly Ser Phe Thr Gin 30 Pro Phe
Alá Leu Tyr 35 Pro Arg Gin Glu Ser 40 Alá Ile Val Lys Thr 45 Gin Leu Pro
Pro Val 50 Ser Val Val Lys Val 55 Glu Cys Val Alá Alá 60 Glu Val Alá Pro
Asp 65 Arg Gly Val Val Asp 70 Lys Lys Pro Thr Ser 75 Val Gly Val Pro Pro 80
Gin Arg Gly Val Leu 85 Ser Phe Pro Thr Val 90 Val Arg Asn Arg Gly 95 Asp
Val
Ile
Thr 100
Gly
Val
Val
His
Glu
105
Alá
Leu
Lys
Lys
110
Lys
Asp
Gly
Lett
Leu
115
Arg
Phe
Arg
Val
Gly 120
Gly
Asp
Met
Arg
Phe 125
Ser
Arg
Phe
Phe
Ser 130
Ser
Asn
Tyr
Gly
Cys 135
Arg
Phe
Val
Alá
Ser 140
Val
Arg
Thr
Asn
Thr Thr Val 145 Trp Leu Asn Cys 150 Thr Lys Alá Ser 155 Gly Glu Lys Phe Ser 160
Leu Alá Alá Alá Cys 165 Thr Alá Asp Tyr Val 170 Alá Met Leu Arg Tyr 175 Val
Cys Gly Gly Lys 180 Phe Pro Leu Val Leu 185 Met Ser Arg Val Ile 190 Tyr Pro
Asp Gly Arg 195 Cys Tyr Leu Alá His 200 Met Arg Tyr Leu Cys 205 Alá Phe Tyr
Cys Arg 210 Pro Phe Arg Glu Ser 215 Asp Tyr Alá Leu Gly 220 Met Trp Pro Thr
Val 225 Alá Arg Leu Arg Alá 230 Cys Val Glu Lys Asn 235 Phe Gly Val Glu Alá 240
Cys Gly Ile Alá Leu 245 Arg Gly Tyr Tyr Thr 250 Ser Arg Asn Val Tyr 255 His
Cys Asp Tyr Asp 260 Ser Alá Tyr Val Lys 265 Tyr Phe Arg Asn Leu 270 Ser Gly
Arg lie Gly Gly Gly Ser Phe Asp Pro Thr Ser Leu Thr Ser Vai He 275 280285
Thr Vai Lys He Ser Gly Leu Pro Gly Gly Leu Pro Lys Asn He Ala 290 295300
Phe Gly Ala Phe Leu Cys Asp He Arg Tyr Vai Glu Pro Vai AspSer 305 310 315320
Gly Gly He Gin Ser Ser Vai Lys Thr Lys Arg Glu Asp Ala HisArg
325 330335
Thr Vai Glu Glu 340 Arg Ala Ala Gly Gly Ser Vai Glu Gin 345 Pro 350 Arg Gin
Lys Arg He Asp 355 Glu Lys Gly Cys Gly Arg Vai Pro Ser 360 365 Gly Gly Phe
Ser His 370 Leu Leu Vai Gly Asn Leu Asn Glu Vai Arg Arg 375 380 Lys Vai Ala
Ala Gly 385 Leu Leu Arg Phe Arg Vai Gly Gly Asp Met Asp 390 395 Phe His Arg 400
Ser Phe Ser Thr Gin Ala Gly His Arg Leu Leu Vai Trp 405 410 Arg Arg 415 Ser
Ser Arg Ser Vai 420 Cys Leu Glu Leu Tyr Ser Pro Ser Lys 425 Asn 430 Phe Leu
Arg Tyr Asp Vai 435 Leu Pro Cys Ser Gly Asp Tyr Ala Ala 440 445 Met Phe Ser
Phe Ala 450 Ala Gly Gly Arg Phe Pro Leu Vai Leu Met Thr 455 460 Arg He Arg
Tyr Pro 4 65 Asn Gly Phe Cys Tyr Leu Ala His Cys Arg Tyr 470 475 Ala Cys Ala 480
Phe Leu Leu Arg Gly Phe Asp Pro Lys Arg Phe Asp lie 485 490 Gly Ala 495 Phe
Pro Thr Ala Ala Lys Leu Arg Asn Arg Met Vai Ser Glu Leu Gly Glu
500 505sió
Arg Ser Leu Gly Leu Asn Leu Tyr Gly Ala Tyr Thr Ser Arg Glv Vai 515 520525
Phe His Cys Asp Tyr Asp Ala Lys Phe lie Lys Asp Leu Arg Leu Met 530 535
Ser Ala Vai lie Ala Gly Lys Asp Gly Vai Glu Glu Vai Vai ProSer 545 550 555560
Asp He Thr Pro Ala Met Lys Gin Lys Thr He Glu Ala Vai TyrAsp
565 570575
Arg Leu Tyr Gly Gly Thr Asp Ser Leu Leu Lys Leu Ser He Glu Lys 580 58559Q
Asp Leu lie Asp Phe Lys Asn Asp Val Gin Ser Leu Lys Lys Asp Arg 600605
Pro lie Val Lys v.i Pro Tyr Het Ser Glu Ala Thr Gin Aan Ser 615620
Leu Thr Arg Phe Tyr Pro Gin Phe Glu Leu Lys Phe Ser His Ser Ser 630 «5
His Ser Asp His Pro Ala Ala Ala Ala Ser Arg Leu Leu Glu Asn Glu 645 θ50
Thr Leu Val Arg Leu Cys Gly Asn Ser Val Ser Asp lie Gly Gly Cys 665670
Pro Leu Phe His Leu His Ser 675 ’ Lys 680 Thr Gin Arg Arg Val 685 His Val Cys
Arg Pro 690 Val Let i Asp i Gly ’ Lys 695 Asp Ala Gin Arg Arg 700 Val Val Arg Asp
Leu 705 Gin Tyr Ser Asn Val 710 Arg Leu Gly Asp Asp 715 Asp Lys lie Leu Glu 720
Gly Pro Arg Asn lie 725 Asp He Cys His Tyr 730 Pro Leu Gly Ala Cys 735 Asp
His Glu Ser Ser 740 Ala Met Met Met Val 745 Gin Val Tyr Asp Ala 750 Ser Leu
Tyr Glu lie 755 Cys Gly Ala Met He 760 Lys Lys Lys Ser Arg 765 He Thr Tyr
Leu Thr 770 Met Val Thr Pro Gly 775 Glu Phe Leu Asp Gly 780 Arg Glu Cys Val
Tyr 785 Met Glu Ser Leu Asp 790 Cys Glu He Glu Val 7 95 Asp Val His Ala Asp 800
Val Val l Met 1 Tyr Lys 805 Phe Gly Ser , Ser Cys 810 Tyr Ser His Lys Leu 815 Ser
lie lie Lys Asp He Met Thr Thr Pro Tyr Leu Thr Leu Gly Gly Phe 825 830
Leu Phe Ser Val Glu Met Tyr Glu Val Arg Met Gly Val Asn Tyr Phe 840845
Lys lie Thr Lys Ser Glu Val Ser Pro Ser lie Ser Cys Thr Lys Leu 855860
Leu Arg Tyr Arg Arg Ala Asn Ser 865 870
Arg Phe Asp Lys Lys Arg Arg Met 885
Tyr Leu Asp Ser Lys Phe Val Ser 900
Asp Val Val Lys Val Lys Leu Pro 875880
Cys Leu Pro Gly Tyr Asp Thr He 890395
Arg Val Phe Asp Tyr Val Val Cvs 905
Asn Cys Ser Ala Vai Asn Ser Lys Thr Phe Glu Trp Vai Trp Ser Phe 915 920925
He Lys Ser Ser Lys Ser Arg Vai He He Ser Gly Lys He He His 9J0 93594Q
Lys Asp Vai Asn Leu Asp Leu Lys Tyr Vai Glu Ser Phe Ala Ala Vai 950 955
Met Leu Ala Ser Gly Vai Arg Ser Arg Leu Ala Ser Glu Tyr Leu Ala 965 97097
Lys Asn Leu Ser His Phe Ser Gly Asp Cys Ser Phe lie Glu Ala Thr 980 985990
Ser Phe Vai Leu Arg Glu Lys He Arg Asn Met Thr Leu Asn Phe Asn 995 1000
Glu Arg Leu Leu Gin Leu Vai Lys 1010 1015
Vai Ser Phe Leu Asp Leu Asp Ser 1025 1030
Ala Glu Cys Lys Vai Ala lie Glu 1045
Ala Glu Ala Glu Asn Glu Lys He 1060
Arg Vai Ala Phe Ala Thr Leu Asp 1020
Thr Leu Glu Ser He Thr Asp Phe 10351040
Leu Asp Glu Leu Gly Cys Leu Arg 10501055
Arg Asn Leu Ala Gly Asp Ser He 1°651070
Ala Ala Lys Leu Ala Ser 1075
Glu lie Vai Vai Asp He Asp Ser Lys Pro 10801085
Ser Pro Lys Gin Vai 1090
Gly Asn Ser Ser Ser Glu Asn Ala Asp Lys Ara
10951100
Gl^Val Gin Arg Pro Gly^Leu Arg Gly Gly Ser^Arg Asn Gly VaiVai
Gly Glu Phe Leu Hi, Phe Vai Vai Asp Ser Ala Leu Arg Leu PheLys 1125 1130i
Tyr Ala Thr Asp Gin Gin Arg He Lys Ser Tyr Vai Arg Phe LeuAsp 1140 1145 1150
Ser Ala Vai Ser Phe Leu Asp Tyr Asn Tyr Asp Asn Leu Ser Phelie 1155 1160 LeU 1170Val LeU G1U ?i75 Tyr 3βΓ CyS Met Phe Ala Phe Leu Ala
Asn Arg Gly Asp Leu Ser Ser Arg 1185 1190
Lys Glu Val Ala Thr Ser Cys Ala 1205
Val Met He Thr Phe Ala Ala Ala 1220
Val Arg Ser Ala Val Cys Ala Val 11951200
Asn Ala Ser Val Ser Lys Ala Lys 12101215
Val Cys Ala Met Met Phe Asn Ser 12251230 t
Cys
Gly Phe Ser 1235
Gly
Asp
Gly Arg Glu 1240
Tyr
Lys
Ser Tyr He 1245
His
Arg
Tyr
Thr Gin 1250
Vai
Leu
Phe
Asp Thr 1255 lie
Phe
Phe
Glu Asp Ser 1260
Ser
Tyr
Leu 1265
Pro
He
Glu
Vai
Leu 1270
Ser
Ser
Ala
He
Cys 1275
Gly
Ala
He
Vai
Thr 1280
Leu
Phe
Ser
Ser
Gly 1285
Ser
Ser
He
Ser
Leu . 1290
Asn
Ala
Phe
Leu
Leu 1295
Gin lie
Thr
Lys
Gly 1300
Phe Ser
Leu
Glu
Vai 1305
Vai
Vai
Arg
Asn
Vai 1310
Vai Arg
Vai
Thr
His 1315
Gly
Leu
Ser
Thr
Thr . 1320
Ala Thr
Asp
Gly
Vai 1325
He Arg Gly
Vai
Phe 1330
Ser Gin
He
Vai
Ser 1335
His
Leu
Leu
Vai
Gly . 1340
Asn Thr
Gly
Asn
Vai . 1345
Ala Tyr Gin
Ser
Ala 1350
Phe lie
Ala
Gly
Vai 1355
Vai Pro
Leu
Leu
Vai 1360
Lys Lys
Cys
Vai
Ser 1365
Leu
He
Phe
Leu . 1370
Arg Glu
Asp
Thr
Tyr Ser 1375
Gly Phe lie Lys His 1380 Gly He Ser Glu Phe 1385 Ser Phe Leu Ser Ser 1390 He
Leu Lys Phe Leu 1395 Lys Gly Lys Leu Vai 1400 Asp Glu Leu Lys Ser 1405 He He
Gin Gly 1410 Vai 1 Phe Asp Ser Asn 141S Lys His Vai Phe Lys Glu 1420 Ala Thr Gin
Glu 1425 Ala He Arg Thr Thr 1430 Vai Met Gin Vai Pro 1435 Vai Ala Vai Vai Asp 1440
Ala
Leu
Lys
Ser
Ala . 1445
Ala
Gly
Lys lie
Tyr j 1450
Asn
Asn
Phe
Thr
Ser . 1455
Arg
Arg
Thr
Phe
Gly 1460
Lys
Asp
Glu
Gly
Ser , 1465
Ser
Ser
Asp
Gly
Ala I 1470
Cys
Glu
Glu
Tyr
Phe 1475
Ser
Cys
Asp
Glu
Gly I 1480
Glu Gly
Pro
Gly
Leu 1485
Lys
Gly
Gly
Ser
Ser 1490
Tyr
Gly
Phe
Ser
He 1495
Leu
Ala
Phe
Phe
Ser . 1500
Arg
He
Met
Trp
Gly . 1505
Ala
Arg
Arg
Leu
He 1510
Vai
Lys
Vai
Lys
His 1515
Glu
Cys
Phe
Gly
Lys 1520
Leu Phe
Glu
Phe
Leu 1525
Ser Leu
Lys
Leu
His 1530
Glu Phe
Arg
Thr
Arg 1535
Vai
Phe Gly
Lys
Asn . 1540
Arg Thr Asp
Vai
Gly 1545
Vai Tyr Asp
Phe
Leu 1550
Pro Thr
Gly
He Vai Glu 1555
Thr Leu Ser Ser He Glu Glu Cys Asp Gin lie Glu 15601565
Glu Leu Leu Gly Asp Asp Leu Lys Gly Asp Lys Asp Ala Ser Leu Thr
I570 15751580
Asp Met Asn Tyr Phe Glu Phe Ser Glu Asp Phe Leu Ala Ser lieGlu 1585 1590 1595
Glu Pro Pro Phe Ala Gly Leu Arg Gly Gly Ser Lys Asn lie AlaHe
1605 16101615
Leu Ala He Leu Glu Tyr Ala His Asn Leu Phe Arg He Vai Ala Ser I620 16251630
Lys Cys Ser Lys Arg Pro Leu Phe Leu Ala Phe Ala Glu Leu Ser Ser
I635 16401645
Ala Leu He Glu Lys Phe Lys Glu Vai Phe Pro Arg Lys Ser Gin Leu
I650 16551660
Vai Ala He Vai Arg Glu Tyr Thr Gin Arg Phe Leu Arg Ser ArgMet 1665 1670 1675
Arg Ala Leu Gly Leu Asn Asn Glu Phe Vai Vai Lys Ser Phe AlaAsp
1685 16901695
Leu Leu Pro Ala Leu Met Lys Arg Lys Vai Ser Gly Ser Phe Leu Ala 1100 17051710
Ser Vai Tyr Arg Pro Leu Arg Gly Phe Ser Tyr Met Cys Vai Ser Ala H15 17201725
Glu Arg Arg Glu Lys Phe Phe Ala Leu Vai Cys Leu He Gly Leu Ser I730 17351740
Leu Pro Phe Phe Vai Arg He Vai Gly Ala Lys Ala Cys Glu GluLeu 1745 1750 17551760
Vai Ser Ser Ala Arg Arg Phe Tyr Glu Arg He Lys lie Phe LeuArg
1765 17701775
Gin Lys Tyr Vai Ser Leu Ser Asn Phe Phe Cys His Leu Phe Ser Ser 1780 1785
Asp Vai Asp Asp Ser Ser Ala Ser Ala Gly Leu Lys Gly Gly Ala Ser 1795 18001805
Arg Met Thr Leu Phe His Leu Leu Vai Arg Leu Ala Ser Ala Leu Leu 1810 18151820 ?!LLeU Gly Trp G1U Gly Leu Lys Leu Leu Leu Ser His His AsnLeu 1825 1830 18351840
Leu Phe Leu Cys Phe Ala Leu Vai Asp Asp Vai Asn Vai Leu lieLys
18^5 18501855
Vai
Leu Gly Gly Leu Ser Phe Phe Vai Gin Pro He I8601865
Phe Ser Leu Phe 1870
Ala Ala Met Leu Leu Gin Pro Asp Arg Phe Val Glu Tyr Ser 1875 18801885
Glu Lys
Leu Val Thr Ala Phe Glu Phe Phe 1890 1895
Ala Leu Leu Lys Gly Phe Phe Glu 1905 1910
Lys Thr Val Arg Arg Leu Leu Arg 1925
Arg Lys Gly Arg Gly Leu Arg Ala 1940
Lys Ala Val Pro Val He Pro Ser 1955 1960
Leu Lys Cys Ser Pro Arg Ala Pro 1900
Cys Val Ala Asn Ser Thr Val Ser 19151920
Cys Phe Val Lys Met Leu Lys Leu 19301935
Asp Gly Arg Gly Leu His Arg Gin 19451950
Asn Arg Val Val Thr Asp Gly Val 1965
Glu Arg Leu Ser Val 1970
Lys Met Gin Gly Val Glu Ala Leu Arg Thr Glu 19751980
LeuAsg Xie Leu Glu P Leu Asp Set Ala Val lie Glu Lys Leu Asp 1990 19952000
Arg Arg Arg Asn Arg Asp Thr Asn Asp Asp Glu Phe Thr Arg Pro Ala 2005 2010
His Glu Gin Hetein Glu Val Thr Thr^he Cys Ser Lys Ala Asn Ser
Ala Gly Leu Ala Leu Glu Arg Ala Val Leu Val Glu Asp Ala lie Lys 2035 2040 2045 “50LyS LeSG1U Val **5 Gly 3« U3U 20552060
Thr Thr Ser Glu Glu Val Ala Val Ala Leu Ser Asp Asp Glu Ala Val 2070 2075
Glu Glu He Ser Val Ala Asp Glu Arg Asp Asp Ser Pro Lys Thr Val 2085 20902095
Arg lie Ser Glu Tyr Leu Asn Arg Leu Asn Ser Ser Phe Glu Phe Pro 2100 21052110
Lys Pro He Val Val Asp Asp Asn Lys Asp Thr Gly Gly Leu Thr Asn 2115 21202125
213QAr9 G1U Phe TyX 2H5Met Gln G1U LeU LeU Phe Glu Ile
His Ser Lys Leu Cys Thr Tyr Tvr 2145 2150
Asp Arg Ser Val Ala Pro Cys Ser 2165
Lys Asn Gly Ser Thr lie Val Gin 2180
Asp Gin Leu Arg lie Val Asn Phe 21552160
Glu Asp Ala Gin Leu Tyr Val Ara 2170
Gly Lys Glu Val Arg Leu His He 21852190
- 39 - í : *ϊ·-·'.:·ί »«· ··· ♦*· ·*♦ · ·
Lys Asp Phe His Asp 2195
His Asp Phe Leu Phe 2200
Asp Gly Lys lie Ser 2205 lie AStl Ar9 Arg Gly Gly Asn Val Leu T*r His AsP Asn Leu Ala 2210 2215 2220
Phe Leu Ala Ser Asn Leu Phe Leu 2225 2230
Phe Val Phe Thr Asn Ser Ser Val 2245
Pro Gly Gly Gly Lys Thr Thr Thr 2260
Ala Gly Tyr Pro Phe Ser Arg Ser 22352240
Asp lie Leu Leu Tyr Glu Ala Pro 22502255
Leu He Asp Ser Phe Leu Lys Val 22652270
Phe Lys Lys Gly Glu Val Ser 2275
Thr Met He Leu Thr Ala Asn Lys Ser 22802285 Ser SanVal G1U Ile LeU LyS LyS Val Glu LyS Glu Val Ser Asn He 2290 22952300
Glu Cys Gin Lys Arg Lys Asp Lys Arg Ser Pro Lys Lys Ser lieTyr 2305 2310 231523
Thr He Asp Ala Tyr Leu Met His His Arg Gly Cys Asp Ala AspVal
2325 2330
Leu Phe lie Asp Glu Cys Phe Met Val His Ala Gly Ser Val Leu Ala 2340 23452350 Cys lie Glu Phe Thr Arg Cys His Lys Val Met lie Phe Gly Asp Ser 2355 23602365 Ar9Ι1β HiS Tyr Ile Glu Arg Asn Glu Leu Asp Lys Cys Leu Tyr 2370 23752380
Gly Asp Leu Asp Arg Phe Val Asp Leu Gin Cys Arg Val Tyr Gly Asn 2385 2390 23952400
He Ser Tyr Arg Cys Pro Trp Asp Val Cys Ala Trp Leu Ser Thr Val
2405 24102415
Tyr Gly Asn Leu lie Ala Thr Val Lys Gly Glu Ser Glu Gly Lys Ser 2420 24252430
Ser Met Arg He Asn Glu lie Asn Ser Val Asp Asp Leu Val Pro Asp 2435 2440 Val ?«nSer THr Phe LeU CyS Met Leu Gln Ser Glu Lys Leu Glu lie 2450 24552460
Ser Lys His Phe lie Arg Lys Gly Leu Thr Lys Leu Asn 2465 24702475
Val His Glu Ala Gin Gly Glu Thr
2485
Val Leu Thr
2480
Leu Val Arg 2495
Tyr Ala Arg Val Asn 2490
Leu Lys
Phe Gin Glu Asp Glu
2500
Pro Phe Lys Ser He Arg 2505
His lie Thr 2510
Val Ala Leu Ser Arg His Thr Asp Ser Leu Thr Tyr Asn Vai Leu Ala Z515 2520 2525
Al« Arg Arg Gly Asp Ala ThX Cys Asp Ala He Gin Lys Ala Ala Gin
Leu val Asn Lys Phe Arg Val Phe Pro Thr Ser Pho Gly Gly Ser Val 2550 2SSS 256
He Asn Leu Asn Val Lys Lys Asp Val Glu Asp Asn Ser Arg Cys Lys
Ala Ser Ser Ala Fro Leu Ser val Ue Asn Asp Phe Leu Asn Glu
Asn Pro Gly Thr Ala Val He Asp Phe Gly Asp Leu Ser Ala Asp She Ser ?fnnGly Pr° Phe Glu Cys Gly Ala Ser G1y Ile Val Val 9κις
Arg Asp
Asn H. ser Ser Ser Aon He Thr Asp Sis Asp Lys Gin Arg Val és molekulatömege körülbelül 290-300 kDa között van, előnyösen 294 kDa.
Egy másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORFlb) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 79229301. nukleotidjait és egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus RNS-függő RNS-polimerázt (RdRP) kódol. Ez a DNSmolekula a 4. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
AGCGTAGTTC GGTCGCAGGC GATTCCGCGT AGAAAACCTT CTCTACAAGA AAATTTGTAT 60
TCGTTTGAAG CGCGGAATTA TAACTTCTCG ACTTGCGACC GTAACACATC TGCTTCAATG120
TTCGGAGAGG CTATGGCGAT GAACTGTCTT CGTCGTTGCT TCGACCTAGA TGCCTTTTCG180
TCCCTGCGTG ATGATGTGAT TAGTATCACA CGTTCAGGCA TCGAACAATG GCTGGAGAAA240
CGTACTCCTA GTCAGATTAA AGCATTAATG AAGGATGTTG AATCGCCTTT GGAAATTGAC300
GATGAAATTT GTCGTTTTAA GTTGATGGTG AAGCGTGACG CTAAGGTGAA GTTAGACTCT
TCTTGTTTAA CTAAACACAG CGCCGCTCAA AATATCATGT TTCATCGCAA GAGCATTAAT420
GCTATCTTCT CTCCTATCTT TAATGAGGTG AAAAACCGAA TAATGTGCTG TCTTAAGCCT
AACATAAAGT TTTTTACGGA GATGACTAAC AGGGATTTTG CTTCTGTTGT CAGCAACATG
- 41 - *· ·* ··· ♦ e· t·· C • ·*#· «»* · *
CTTGGTGACG ACGATGTGTA CCATATAGGT GAAGTTGATT TCTCAAAGTA CGACAAGTCT 600
CAAGATGCTT TCGTGAAGGC TTTTGAAGAA GTAATGTATA AGGAACTCGG TGTTGATGAA 660
GAGTTGCTGG CTATCTGGAT GTGCGGCGAG CGGTTATCGA TAGCTAACAC TCTCGATGGT 720
CAGTTGTCCT TCACGATCGA GAATCAAAGG AAGTCGGGAG CTTCGAACAC TTGGATTGGT 780
AACTCTCTCG TCACTTTGGG TATTTTAAGT CTTTACTACG ACGTTAGAAA TTTCGAGGCG 840
TTGTACATCT CGGGCGATGA TTCTTTAATT TTTTCTCGCA GCGAGATTTC GAATTATGCC 900
GACGACATAT GCACTGACAT GGGTTTTGAG ACAAAATTTA TGTCCCCAAG TGTCCCGTAC 960
TTTTGTTCTA AATTTGTTGT TATGTGTGGT CATAAGACGT TTTTTGTTCC CGACCCGTAC 1020
AAGCTTTTTG TCAAGTTGGG AGCAGTCAAA GAGGATGTTT CAATGGATTT CCTTTTCGAG 1080
ACTTTTACCT CCTTTAAAGA CTTAACCTCC GATTTTAACG ACGAGCGCTT AATTCAAAAG 1140
CTCGCTGAAC TTGTGGCTTT AAAATATGAG GTTCAAACCG GCAACACCAC CTTGGCGTTA 1200
AGTGTGATAC ATTGTTTGCG TTCGAATTTC CTCTCGTTTA GCAAGTTATA TCCTCGCGTG 1260
AAGGGATGGC AGGTTTTTTA CACGTCGGTT AAGAAAGCGC TTCTCAAGAG TGGGTGTTCT 1320
CTCTTCGACA GTTTCATGAC CCCTTTTGGT CAGGCTGTCA TGGTTTGGGA TGATGAGTAG 1380
Az RNS-függő RNS-polimeráz az 5. azonosítási szám sze rinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával ren delkezik, az alábbiak szerint:
Ser V.l Val Arg Ser Gia Ala Ile Pro Arg Arg Lya Pro Ser Leu Gl„ 1015
Glu Asn Leu Tyr Ser Phe Glu Alá Arg Asn Tyr Asn Phe Ser Thr Cys 20 25
Asp Arg Asn Thr Ser Alá Ser Met Phe Gly Glu Ala Met Ala Met Asn
Cys Leu Arg Arg Cys Phe Asp Leu Asp Alá Phe Ser Ser Leu Arg Asp 5560
Asp Val Ile Ser Ile Thr Arg Ser Gly He Glu Gin Trp Leu Glu Lys 70 7380
Arg Thr Pro Ser Gin lie Lys Ala Leu Met Lys Asp Val Glu Ser Pro 85 9095
Leu Glu lie Asp Asp Glu He Cys Arg Phe Lys Leu Met Val Lys Arg 100 105 110
Asp Alá Lys Val Lys Leu Asp Ser Ser Cys Leu Thr Lys His Ser Alá 115 120125
Ala Gin Asn He Met Phe His Arg Lys Ser He Asn Alá Ile Phe Ser
135
Vai Lys Asn Arg He Met 150 155
Thr Glu Met Thr Asn Arg 170
Pro He Phe Asn Glu ; 145
Asn He Lys Phe Phe 165
Vai Ser Asn Met Leu 180
Asp Phe Ser Lys Tyr 195
Glu Glu Vai Met Tyr 210
He Trp Met Cys Gly 225
Gin Leu Ser Phe Thr 245 . Thr Trp He Gly Asn 260
I 1 Tyr Asp Vai Arg Asn 275
Leu He Phe Ser Arg 290
Thr Asp Met Gly Phe 305
Phe Cys Ser Lys Phe 325
Pro Asp Pro Tyr Lys 340
Vai Ser Met Asp Phe 355
Thr Ser Asp Phe Asn 370
Vai Ala Leu Lys Tyr 385
Ser Vai He His Cys
405
Tyr Pro Arg Vai Lys 420
Ala Leu Leu Lys Ser 435
Phe Gly Gin Ala Vai 450
Gly Asp Asp Asp Vai Tyr 185
Asp Lys Ser Gin Asp Ala 200
Lys Glu Leu Gly Vai Asp 215
Glu Arg Leu Ser He Ala
230 235
He Glu Asn Gin Arg Lys 250
Ser Leu Vai Thr Leu Gly 265
Phe Glu Ala Leu Tyr He 280
Ser Glu He Ser Asn Tyr 295
Glu Thr Lys Phe Met Ser 310 315
Vai Vai Met Cys Gly His 330
Leu Phe Vai Lys Leu Gly 345
Leu Phe Glu Thr Phe Thr 360
Asp Glu Arg Leu He Gin 375
Glu Vai Gin Thr Gly Asn
390 395
Leu Arg Ser Asn Phe Leu 410
Gly Trp Gin Vai Phe Tyr 425
Cys Cys Leu Lys Pro 160
Asp Phe Ala Ser Vai 175
His lie Gly Glu Vai 190
Phe Vai Lys Ala Phe
205
Glu Glu Leu Leu Ala
220
Asn Thr Leu Asp Gly 240
Ser Gly Ala Ser Asn 255
He Leu Ser Leu Tyr 270
Ser Gly Asp Asp Ser 285
Ala Asp Asp He Cys 300
Pro Ser Vai Pro Tyr 320
Lys Thr Phe Phe Vai 335
Ala Vai Lys Glu Asp 350
Ser Phe Lys Asp Leu 365
Lys Leu Ala Glu Leu
380
Thr Thr Leu Ala Leu 400
Ser Phe Ser Lys Leu 415
Thr Ser Vai Lys Lys
430
Ser Phe Met Thr Pro
445
Gly Cys Ser Leu Phe Asp 440
Met Vai Trp Asp Asp Glu 455
és molekulatömege körülbelül 50 és körülbelül 54 kDa között van, előnyösen körülbelül 52 kDa.
Egy másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORF2) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 9365-9535. nukleotidjait és egy kisméretű, szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus hidrofób fehérjét vagy polipeptidet kódol. Ez a DNS-molekula a 6. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ATGAATCAGG TTTTGCAGTT TGAATGTTTG TTTCTGCTGA ATCTCGCGGT TTTTGCTGTG ACTTTCATTT TCATTCTTCT GGTCTTCCGC GTGATTAAGT CTTTTCGCCA GAAGGGTCAC GAAGCACCTG TTCCCGTTGT TCGTGGCGGG GGTTTTTCAA CCGTAGTGTA G
120
171
A kisméretű hidrofób fehérje vagy polipeptid a 7. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Met Asn Gin 1 Val Leu 5 Gin Phe Glu Cys Leu 10 Phe Leu Leu Asn Leu 15 Alá
Val Phe Alá Val 20 Thr Phe Ile Phe Ile Leu 25 Leu Val Phe Arg 30 Val Ile
Lys Ser Phe 35 Arg Gin Lys Gly His Glu Alá 40 Pro Val Pro 45 Val Val Arg
Gly Gly Gly Phe Ser Thr Val Val
55 és molekulatömege körülbelül 5 és körülbelül 7 kDa között van, előnyösen körülbelül 6 kDa.
Egy másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORF3) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 955111350. nukleotidjait és egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus 70 kDa hősokk fehérjét kódol. Ez a DNS-molekula a 8. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ATGGTAGTTT TCGGTTTGGA CTTTGGCACC ACATTCTCTA CGGTGTGTGT GTACAAGGAT60
GGACGAGTTT TTTCATTCAA GCAGAATAAT TCGGCGTACA TCCCCACTTA CCTCTATCTC120
TTCTCCGATT CTAACCACAT GACTTTTGGT TACGAGGCCG AATCACTGAT GAGTAATCTG180
AAAGTTAAAG GTTCGTTTTA TAGAGATTTA AAACGTTGGG TGGGTTGCGA TTCGAGTAAC240
CTCGACGCGT ACCTTGACCG TTTAAAACCT CATTACTCGG TCCGCTTGGT TAAGATCGGC300
TCTGGCTTGA ACGAAACTGT TTCAATTGGA AACTTCGGGG GCACTGTTAA GTCTGAGGCT360
CATCTGCCAG GGTTGATAGC TCTCTTTATT AAGGCTGTCA TTAGTTGCGC GGAGGGCGCG420
TTTGCGTGCA CTTGCACCGG GGTTATTTGT TCAGTACCTG CCAATTATGA TAGCGTTCAA480
AGGAATTTCA CTGATCAGTG TGTTTCACTC AGCGGTTATC AGTGCGTATA TATGATCAAT54 0
GAACCTTCAG CGGCTGCGCT ATCTGCGTGT AATTCGATTG GAAAGAAGTC CGCAAATTTG600
GCTGTTTACG ATTTCGGTGG TGGGACCTTC GACGTGTCTA TCATTTCATA CCGCAACAAT660
ACTTTTGTTG TGCGAGCTTC TGGAGGCGAT CTAAATCTCG GTGGAAGGGA TGTTGATCGT720
GCGTTTCTCA CGCACCTCTT CTCTTTAACA TCGCTGGAAC CTGACCTCAC TTTGGATATC780
TCGAATCTGA AAGAATCTTT ATCAAAAACG GACGCAGAGA TAGTTTACAC TTTGAGAGGT840
GTCGATGGAA GAAAAGAAGA CGTTAGAGTA AACAAAAACA TTCTTACGTC GGTGATGCTC900
CCCTACGTGA ACAGAACGCT TAAGATATTA GAGTCAACCT TAAAATCGTA TGCTAAGAGT960
ATGAATGAGA GTGCGCGAGT TAAGTGCGAT TTAGTGCTGA TAGGAGGATC TTCATATCTT1020
CCTGGCCTGG CAGACGTACT AACGAAGCAT CAGAGCGTTG ATCGTATCTT AAGAGTTTCG1000
GATCCTCGGG CTGCCGTGGC CGTCGGTTGC GCATTATATT CTTCATGCCT CTCAGGATCT1140
GGGGGGTTGC TACTGATCGA CTGTGCAGCT CACACTGTCG CTATAGCGGA CAGAAGTTGT1200
CATCAAATCA TTTGCGCTCC AGCGGGGGCA CCGATCCCCT TTTCAGGAAG CATGCCTTTG1260
TACTTAGCCA GGGTCAACAA GAACTCGCAG CGTGAAGTCG CCGTGTTTGA AGGGGAGTAC1320
GTTAAGTGCC CTAAGAACAG AAAGATCTGT GGAGCAAATA TAAGATTTTT TGATATAGGA 1380
GTGACGGGTG ATTCGTACGC ACCCGTTACC TTCTATATGG ATTTCTCCAT TTCAAGCGTA 1440
GGAGCCGTTT CATTCGTGGT GAGAGGTCCT GAGGGTAAGC AAGTGTCACT CACTGGAACT 1500
CCAGCGTATA ACTTTTCGTC TGTGGCTCTC GGATCACGCA GTGTCCGAGA ATTGCATATT 1560
AGTTTAAATA ATAAAGTTTT TCTCGGTTTG CTTCTACATA GAAAGGCGGA TCGACGAATA 1620
CTTTTCACTA AGGATGAAGC GATTCGATAC GCCGATTCAA TTGATATCGC GGATGTGCTA 1680
AAGGAATATA AAAGTTACGC GGCCAGTGCC TTACCACCAG ACGAGGATGT CGAATTACTC 1740
CTGGGAAAGT CTGTTCAAAA AGTTTTACGG GGAAGCAGAC TGGAAGAAAT ACCTCTCTAG 1800
A 70 kDa hősokk fehérje feltételezhetően mint dajkafehérje (chaperon protein) működik és a 9. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Gly Gly Thr Val Lys Ser Glu Alá 115120
Phe lie Lys Alá Val Ile Ser Cys 130135
Cys Thr Gly Val Ile Cys Ser Val 145150
Arg Asn Phe Thr Asp Gin Cys Val 165
Tyr Met Ile Asn Glu Pro Ser Alá 180
Ile Gly Lys Lys Ser Alá Asn Leu 195200
Thr Phe Asp Val Ser Ile Ile Ser 210215
Arg Alá Ser Gly Gly Asp Leu Asn 225230
Alá Phe Leu Thr His Leu Phe Ser 245
Thr Leu Asp Ile Ser Asn Leu Lys 260
Glu Ile Val Tyr Thr Leu Arg Gly
275 280
His Leu Pro Gly Leu lie Alá Leu 125
Ala Glu Gly Ala Phe Alá Cys Thr 140
Pro Alá Asn Tyr Asp Ser Val Gin 155160
Ser Leu Ser Gly Tyr Gin Cys Val 170175
Ala Alá Leu Ser Alá Cys Asn Ser 185190
Alá Val Tyr Asp Phe Gly Gly Gly 205
Tyr Arg Asn Asn Thr Phe Val Val 220
Leu Gly Gly Arg Asp Val Asp Arg 235240
Leu Thr Ser Leu Glu Pro Asp Leu 250255
Glu Ser Leu Ser Lys Thr Asp Alá 265270
Val Asp Gly Arg Lys Glu Asp Val 285
Arg Vai Asn Lys Asn He Leu 290 295
Arg Thr Leu Lys He Leu Glu 305 310
Met Asn Glu Ser Ala Arg Vai 325
Ser Ser Tyr Leu Pro Gly Leu 340
Vai Asp Arg He Leu Arg Vai 355
Gly Cys Ala Leu Tyr Ser Ser 370 375
Leu He Asp Cys Ala Ala His 385 390
His Gin He lie Cys Ala Pro 405
Ser Met Pro Leu Tyr Leu Ala 420
Thr Ser Vai Met Leu Pro Tyr Vai Asn 300
Ser Thr Leu Lys Ser Tyr Ala Lys Ser 315320
Lys Cys Asp Leu Vai Leu lie Gly Gly 330335
Ala Asp Vai Leu Thr Lys His Gin Ser 345350
Ser Asp Pro Arg Ala Ala Vai Ala Vai 360365
Cys Leu Ser Gly Ser Gly Gly Leu Leu 380
Thr Vai Ala lie Ala Asp Arg Ser Cys 395400
Ala Gly Ala Pro He Pro Phe Ser Gly 410415
Arg Vai Asn Lys Asn Ser Gin Arg Glu 425430
Vai Ala Vai Phe Glu Gly Glu 435 lie Cys Gly Ala Asn He Arg 450 455
Ser Tyr Ala Pro Vai Thr Phe 465 470
Gly Ala Vai Ser Phe Vai Vai 485
Leu Thr Gly Thr Pro Ala Tyr 500
Arg Ser Vai Arg Glu Leu His 515
Gly Leu Leu Leu His Arg Lys 530 ’ 535
Asp Glu Ala lie Arg Tyr Ala 545 550
Lys Glu Tyr Lys Ser Tyr Ala 565
Vai Glu Leu Leu Leu Gly Lys 580
Arg Leu Glu Glu lie Pro Leu 595
Tyr Vai Lys Cys Pro Lys Asn Arg Lys 440445
Phe Phe Asp lie Gly Vai Thr Gly Asp 460
Tyr Met Asp Phe Ser lie Ser Ser Vai 475480
Arg Gly Pro Glu Gly Lys Gin Vai Ser 490495
Asn Phe Ser Ser Vai Ala Leu Gly Ser 505510 lie Ser Leu Asn Asn Lys Vai Phe Leu 520525
Ala Asp Arg Arg He Leu Phe Thr Lys 540
Asp Ser He Asp He Ala Asp Vai Leu 555560
Ala Ser Ala Leu Pro Pro Asp Glu Asp 570575
Ser Vai Gin Lys Vai Leu Arg Gly Ser 585590 és molekulatömege körülbelül 63 és körülbelül 67 kDa között van, előnyösen körülbelül 65 kDa.
Egy másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORF4) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 1127712932. nukleotidjait és egy vélelmezett szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus 90 kDa hősokk fehérjét kódol. Ez a DNS-molekula a 10. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ATGTCGAATT ACTCCTGGGA AAGTCTGTTC AAAAAGTTTT ACGGGGAAGC AGACTGGAAG 60
AAATACCTCT CTAGGAGCAT AGCAGCACAC TCAAGTGAAA TTAAAACTCT ACCAGACATT 120
CGATTGTACG GCGGTAGGGT TGTAAAGAAG TCCGAATTCG AATCAGCACT TCCTAATTCT 180
TTTGAACAGG AATTAGGACT GTTCATACTG AGCGAACGGG AAGTGGGATG GAGCAAATTA 240
TGCGGAATAA CGGTGGAAGA AGCAGCATAC GATCTTACGA ATCCCAAGGC TTATAAATTC 300
ACTGCCGAGA CATGTAGCCC GGATGTAAAA GGTGAAGGAC AAAAATACTC TATGGAAGAC 360
GTGATGAATT TCATGCGTTT ATCAAATCTG GATGTTAACG ACAAGATGCT GACGGAACAG 420
TGTTGGTCGC TGTCCAATTC ATGCGGTGAA TTGATCAACC CAGACGACAA AGGGCGATTC 480
GTGGCTCTCA CCTTTAAGGA CAGAGACACA GCTGATGACA CGGGTGCCGC CAACGTGGAA 540
TGTCGCGTGG GCGACTATCT AGTTTACGCT ATGTCCCTGT TTGAGCAGAG GACCCAAAAA 600
TCGCAGTCTG GCAACATCTC TCTGTACGAA AAGTACTGTG AATACATCAG GACCTACTTA 660
GGGAGTACAG ACCTGTTCTT CACAGCGCCG GACAGGATTC CGTTACTTAC GGGCATCCTA 720
TACGATTTTT GTAAGGAATA CAACGTTTTC TACTCGTCAT ATAAGAGAAA CGTCGATAAT 780
TTCAGATTCT TCTTGGCGAA TTATATGCCT TTGATATCTG ACGTCTTTGT CTTCCAGTGG 840
GTAAAACCCG CGCCGGATGT TCGGCTGCTT TTTGAGTTAA GTGCAGCGGA ACTAACGCTG 900
GAGGTTCCCA CACTGAGTTT GATAGATTCT CAAGTTGTGG TAGGTCATAT CTTAAGATAC 960
GTAGAATCCT ACACATCAGA TCCAGCCATC GACGCGTTAG AAGACAAACT GGAAGCGATA 1020
CTGAAAAGTA GCAATCCCCG TCTATCGACA GCGCAACTAT GGGTTGGTTT CTTTTGTTAC 1080
TATGGTGAGT TTCGTACGGC TCAAAGTAGA GTAGTGCAAA GACCAGGCGT ATACAAAACA 1140
CCTGACTCAG TGGGTGGATT TGAAATAAAC ATGAAAGATG TTGAGAAATT CTTCGATAAA 1200
CTTCAGAGAG AATTGCCTAA TGTATCTTTG CGGCGTCAGT TTAACGGAGC TAGAGCGCAT 1260
GAGGCTTTCA AAATATTTAA AAACGGAAAT ATAAGTTTCA GACCTATATC GCGTTTAAAC 1320
GTGCCTAGAG AGTTCTGGTA TCTGAACATA GACTACTTCA GGCACGCGAA TAGGTCCGGG 1380
TTAACCGAAG AAGAAATACT CATCCTAAAC AACATAAGCG TTGATGTTAG GAAGTTATGC 1440
GCTGAGAGAG CGTGCAATAC CCTACCTAGC GCGAAGCGCT TTAGTAAAAA TCATAAGAGT 1500
AATATACAAT CATCACGCCA AGAGCGGAGG ATTAAAGACC CATTGGTAGT CCTGAAAGAC 1560
ACTTTATATG AGTTCCAACA CAAGCGTGCC GGTTGGGGGT CTCGAAGCAC TCGAGACCTC 1620
GGGAGTCGTG CTGACCACGC GAAAGGAAGC GGTTGA 1656
A 90 kDa hősokk fehérje a 11. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Met Ser Asn Tyr Ser Trp Glu Ser 15
Ala Asp Trp Lys Lys Tyr Leu Ser 20
Glu Ile Lys Thr Leu Pro Asp Ile 354Q
Lys Lys Ser Glu Phe Glu Ser Alá 5055
Leu Gly Leu Phe Ile Leu Ser Glu 6570
Leu Phe Lys Lys Phe Tyr Gly Glu 1015
Arg Ser lie Ala Alá His Ser Ser 2530
Arg Leu Tyr Gly Gly Arg Val Val 45
Leu Pro Asn Ser Phe Glu Gin Glu 60
Arg Glu Val Gly Trp Ser Lys Leu 75 80
Cys Gly lie Thr Val Glu Glu Alá 85
Ala Tyr Lys Phe Thr Alá Glu Thr 100
Gly Gin Lys Tyr Ser Met Glu Asp 115 '120
Asn Leu Asp Val Asn Asp Lys Met 130135
Ser Asn Ser Cys Gly Glu Leu Ile 145150
Val Alá Leu Thr Phe Lys Asp Arg 165
Alá Asn Val Glu Cys Arg Val Gly 180
Alá Tyr Asp Leu Thr Asn Pro Lys 90 95
Cys Ser Pro Asp Val Lys Gly Glu 105 110
Val Met Asn Phe Met Arg Leu Ser 125
Leu Thr Glu Gin Cys Trp Ser Leu 140
Asn Pro Asp Asp Lys Gly Arg Phe 155160
Asp Thr Ala Asp Asp Thr Gly Alá 170175
Asp Tyr Leu Val Tyr Ala Met Ser 185190 • ··· «·· ··· ··· · r· * «*· « **t
Leu Phe Glu Gin Arg Thr Gin Lys 195zoo
Tyr Glu Lys Tyr Cys Glu Tyr lie 210215
Leu Phe Phe Thr Ala Pro Asp Arg 225230
Tyr Asp Phe Cys Lys Glu Tyr Asn 245
Asn Val Asp Asn Phe Arg Phe Phe 260
Ser Asp Val Phe Val Phe Gin Trp 275280
Leu Leu Phe Glu Leu Ser Ala Ala 290
Leu Ser Leu lie Asp Ser Gin Val 305310
Val Glu Ser Tyr Thr Ser Asp Pro 325
Leu Glu Ala lie Leu Lys Ser Ser 340
Leu Trp Val Gly Phe Phe Cys Tvr 355360
Ser Arg Val Val Gin Arg Pro Glv 370375
Gly Gly Phe Glu lie Asn Met Lys 385390
Ser Gin Ser Gly Asn Ile Ser Leu 205
Arg Thr Tyr Leu Gly Ser Thr Asp 220 lie Pro Leu Leu Thr Gly ne Leu 235240
Val Phe Tyr Ser Ser Tyr Lys Ara
250
Leu Ala Asn Tyr Met Pro Leu lie 265
Val Lys Pro Ala Pro Asp Val Arg 285
Glu Leu Thr Leu Glu Val Pro Thr 300
Val Val Gly His lie Leu Arg Tyr 315320
Ala lie Asp Ala Leu Glu Asp Lvs 330335
Asn Pro Arg Leu Ser Thr Ala Gin 345350
Tyr Gly Glu Phe Arg Thr Ala Gin 365
Val Tyr Lys Thr Pro Asp Ser Val 380
Asp Val Glu Lys Phe Phe Asp Lys 395 400
Leu Gin Arg Glu Leu Pro Asn Val 405
Ala Arg Ala His Glu Ala Phe Lys 420
Phe Arg Pro lie Ser Arg Leu Asn 435440
Asn lie Asp Tyr Phe Arg His Ala 45045
Glu lie Leu lie Leu Asn Asn lie 465470
Ala Glu Arg Ala Cys Asn Thr Leu 485
Asn His Lys Ser Asn Ile Gin Ser 500
Asp Pro Leu Val Val Leu Lys Asp 515520
Ser Leu Arg Arg Gin Phe Asn Gly 410415 lie Phe Lys Asn Gly Asn lie Ser
425430
Val Pro Arg Glu Phe Trp Tyr Leu 445
Asn Arg Ser Gly Leu Thr Glu Glu 460
Ser Val Asp Val Arg Lys Leu Cys
475480
Pro Ser Ala Lys Arg Phe Ser Lys 490495
Ser Arg Gin Glu Arg Arg lie Lys 505510
Thr Leu Tyr Glu Phe Gin His Lys 525
Arg
Ala Gly Trp Gly Ser Arg Ser Thr Arg Asp Leu Gly Ser Arg Ala 530 535 540
Asp His Ala Lys Gly Ser Gly 543 550 és molekulatömege körülbelül 61 és körülbelül 65 kDa között van, előnyösen körülbelül 63 kDa.
Egy ismét másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORF5) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 12844-13515. nukleotidjait és egy divergálódott burokfehérjét kódol. Ez a DNS-molekula a 12. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ATGAGTTCCA ACACAAGCGT GCCGGTTGGG GGTCTCGAAG CACTCGAGAC CTCGGGAGTC 60
GTGCTGACCA CGCGAAAGGA AGCGGTTGAT AAGTTTTTTA ATGAACTAAA AAACGAAAAT 120
TACTCATCAG TTGACAGCAG CCGATTAAGC GATTCGGAAG TAAAAGAAGT GTTAGAGAAA 180
AGTAAAGAAA GTTTCAAAAG CGAACTGGCC TCCACTGACG AGCACTTCGT CTACCACATT 240
ATATTTTTCT TAATCCGATG TGCTAAGATA TCGACAAGTG AAAAGGTGAA GTACGTTGGT 300
AGTCATACGT ACGTGGTCGA CGGAAAAACG TACACCGTTC TTGACGCTTG GGTATTCAAC 360
ATGATGAAAA GTCTCACGAA GAAGTACAAA CGAGTGAATG GTCTGCGTGC GTTCTGTTGC 420
GCGTGCGAAG ATCTATATCT AACCGTCGCA CCAATAATGT CAGAACGCTT TAAGACTAAA 480
GCCGTAGGGA TGAAAGGTTT GCCTGTTGGA AAGGAATACT TAGGCGCCGA CTTTCTTTCG 540
GGAACTAGCA AACTGATGAG CGATCACGAC AGGGCGGTCT CCATCGTTGC AGCGAAAAAC 600
GCTGTCGATC GTAGCGCTTT CACGGGTGGG GAGAGAAAGA TAGTTAGTTT GTATGATCTA GGGAGGTACT AA ' 660
672
A divergálódott burokfehérje a 13. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Met Ser Ser Asn Thr Ser Vai Pro 15
Thr Ser Gly Vai Vai Leu Thr Thr 20
Phe Asn Glu Leu Lys Asn Glu Asn 3540
Leu Ser Asp Ser Glu Vai Lys Glu 5055
Phe Lys Ser Glu Leu Ala Ser Thr 6570 lie Phe Phe Leu lie Arg Cys Ala 85
Lys Tyr Vai Gly Ser His Thr Tyr 100
Vai Leu Asp Ala Trp Vai Phe Asn 115120
Tyr Lys Arg Vai Asn Gly Leu Arg 130135
Leu Tyr Leu Thr Vai Ala Pro lie 145150
Ala Vai Gly Met Lys Gly Leu Pro 165
Asp Phe Leu Ser Gly Thr Ser Lys 180
Vai Ser lie Vai Ala Ala Lys Asn 195200
Gly Gly Glu Arg Lys lie Vai Ser 210215
Vai Gly Gly Leu Glu Ala Leu Glu 1015
Arg Lys Glu Ala Vai Asp Lys Phe 2530
Tyr Ser Ser Vai Asp Ser Ser Arg 45
Vai Leu Glu Lys Ser Lys Glu Ser 60
Asp Glu His Phe Vai Tyr His lie 7580
Lys lie Ser Thr Ser Glu Lys Vai 9095
Vai Vai Asp Gly Lys Thr Tyr Thr 105110
Met Met Lys Ser Leu Thr Lys Lys 125
Ala Phe Cys Cys Ala Cys Glu Asp 140
Met Ser Glu Arg Phe Lys Thr Lys 155160
Vai Gly Lys Glu Tyr Leu Gly Ala 170175
Leu Met Ser Asp His Asp Arg Ala 185190
Ala Vai Asp Arg Ser Ala Phe Thr 205
Leu Tyr Asp Leu Gly Arg Tyr 220 és molekulatömege körülbelül 23 és körülbelül 27 kDa között van, előnyösen körülbelül 25 kDa.
Egy másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORF6) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 1358414180. nukleotidjait és egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus burokfehérjét kódol. Ez a DNS-molekula a 14. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
A burokfehérje a 15. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
ATGGAGTTGA TGTCCGACAG CAACCTTAGC AACCTGGTGA TAACCGACGC CTCTAGTCTA 60
AATGGTGTCG ACAAGAAGCT TTTATCTGCT GAAGTTGAAA AAATGTTGGT GCAGAAAGGG 120
GCTCCTAACG AGGGTATAGA AGTGGTGTTC GGTCTACTCC TTTACGCACT CGCGGCAAGA 180
ACCACGTCTC CTAAGGTTCA GCGCGCAGAT TCAGACGTTA TATTTTCAAA TAGTTTCGGA 240
GAGAGGAATG TGGTAGTAAC AGAGGGTGAC CTTAAGAAGG TACTCGACGG GTGTGCGCCT 300
CTCACTAGGT TCACTAATAA ACTTAGAACG TTCGGTCGTA CTTTCACTGA GGCTTACGTT 360
GACTTTTGTA TCGCGTATAA GCACAAATTA CCCCAACTCA ACGCCGCGGC GGAATTGGGG 420
ATTCCAGCTG AAGATTCGTA CTTAGCTGCA GATTTTCTGG GTACTTGCCC GAAGCTCTCT 480
GAATTACAGC AAAGTAGGAA GATGTTCGCG AGTATGTACG CTCTAAAAAC TGAAGGTGGA 540
GTGGTAAATA CACCAGTGAG CAATCTGCGT CAGCTAGGTA GAAGGGAAGT TATGTAA 597
A burokfehérje a 15. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Met 1 : Glu i Let i Met . Sei 5 • Asp Ser Asn i Let i Ser 10 ’ Asr i Let i Val Ile Thr 15 Asp
Ala . Ser Ser ’ Leu 20 Asn Gly Val Asp Lys 25 Lys Let i Leu i Ser Alá 30 Glu Val
Glu Lys Met 35 Leu Val Gin Lys Gly 40 Alá Pro Asn i Glu Gly 45 Ile Glu Val
Val Phe 50 Gly Leu Leu Leu Tyr 55 Alá Leu Alá Alá Arg 60 Thr Thr Ser Pro
Lys 65 Val Gin Arg Alá Asp 70 Ser Asp Val He Phe 75 Ser Asn Ser Phe Gly 80
Glu Arg Asn Val Val 85 Val Thr Glu Gly Asp 90 Leu Lys Lys Val Leu 95 Asp
Gly Cys Alá Pro 100 Leu Thr Arg Phe Thr 105 Asn Lys Leu Arg Thr 110 Phe Gly
Arg Thr Phe 115 Thr Glu Alá Tyr Val . 120 Asp Phe Cys He Alá 125 Tyr Lys His
Lys Leu 130 Pro i Gin : Leu . Asn Alá , 135 Alá j Ma Glu : Leu Gly 140 He Pro . Ma Glu
Asp Ser Tyr Lee Ala Ala Asp Phe Leu Gly Thr Cys Pro Lys
Leu Ser
160
Glu Leu Gin Gin Ser Arg Lys Met Phe Ala Ser Met Tyr Ala Leu Lys 1 Da π η λ *
170
Thr Glu Gly Gly Val Val Asn Thr Pro Val Ser Asn
Leu Arg Gin Leu 190
185
Gly Arg Arg Glu Val Met 195 és molekulatömege körülbelül 20 és körülbelül 24 kDa között van, előnyösen körülbelül 22 kDa.
Egy másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 0RF7) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 1418014665. nukleotidjait és egy második meghatározatlan szőlőnövény- levélsodródást okozó vírus fehérjét vagy polipeptidet kódol. Ez a DNS—molekula a 16. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ATGGAAGATT ACGAAGAAAA ATCCGAATCG CTCATACTGC TACGCACGAA TCTGAACACT60
ATGCTTTTAG TGGTCAAGTC CGATGCTAGT GTAGAGCTGC CTAAACTACT AATTTGCGGT120
TACTTACGAG TGTCAGGACG TGGGGAGGTG ACGTGTTGCA ACCGTGAGGA ATTAACAAGA180
GATTTTGAGG GCAATCATCA TACGGTGATC CGTTCTAGAA TCATACAATA TGACAGCGAG24 0
TCTGCTTTTG AGGAATTCAA CAACTCTGAT TGCGTAGTGA AGTTTTTCCT AGAGACTGGT300
AGTGTCTTTT GGTTTTTCCT TCGAAGTGAA ACCAAAGGTA GAGCGGTGCG ACATTTGCGC360
ACCTTCTTCG AAGCTAACAA TTTCTTCTTT GGATCGCATT GCGGTACCAT GGAGTATTGT420
TTGAAGCAGG TACTAACTGA AACTGAATCT ATAATCGATT CTTTTTGCGA AGAAAGAAAT480
CGTTAA
A második meghatározatlan szőlőnövény—levélsodródást okozó vírus fehérje vagy polipeptid a 17. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő levezetett aminosav szék—' venciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Met Glu 1
Asn Leu
Leu Pro
Glu Val 50
Asn His 65
Ser Alá
Leu Glu
Gly Arg
Phe Phe 130
Leu Thr 145
Arg
Tyr Glu 5
Thr Met 20
Leu Leu
Cys Cys
Thr Val
Glu Glu 85
Gly Ser 100
Val
Asp
Asn
Lys 35
Thr
His
Phe
Thr
Alá 115
Gly Ser
Glu Thr
Glu
Leu
Ile
Asn
Ile 70
Phe
Val
Arg His
His Cys
Glu Ser
150
Lys
Leu
Cys
Arg 55
Arg
Asn
Phe
Leu Arg
120
Gly Thr 135
Ile Ile
Ser Glu Ser 10
Val Val Lys 25
Gly Tyr Leu 40
Glu Glu Leu
Ser Arg Ile
Asn Ser Asp 90
Trp Phe Phe
Leu Ile
105
Thr Phe
Met Glu
Asp Ser
Ser Asp
Arg Val
Thr Arg 60
Ile Gin 75
Cys Val
Leu Arg
Phe Glu
Tyr Cys 140
Phe Cys 155
Leu Arg Thr 15
Ser Val Glu 30
Gly Arg Gly
Leu
Alá
Ser 45
Asp Phe
Tyr Asp
Val Lys
Ser Glu
110
Alá Asn 125
Leu Lys
Glu Glu
Glu Gly
Ser Glu 80
Phe Phe 95
Thr Lys
Asn Phe
Gin Val
Arg Asn 160 és molekulatömege körülbelül 17 és körülbelül 21 kDa között van, előnyösen körülbelül 19 kDa.
Egy ismét másik ilyen DNS-molekula (GLRaV-2 ORF8) magába foglalja az 1. azonosítási szán szerinti szekvencia 14667-15284. nukleotidjait és egy harmadik meghatározatlan szölönövény-levélsodródást okozó virus fehérjét vagy polipeptidet kódol. Ez a DNS-molekula a 18. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alabbiak szerint:
ATGAGGGTTA TAGTGTCTCC TTATGAAGCT GAAGACATTC TGAAAAGATC GACTGACATG
TTACGAAACA TAGACAGTGG GGTCTTGAGC ACTAAAGAAT GTATCAAGGC ATTCTCGACG
ATAACGCGAG ACCTACATTG TGCGAAGGCT TCCTACCAGT GGGGTGTTGA CACTGGGTTA1B0
TATCAGCGTA ATTGCGCTGA AAAACGTTTA ATTGACACGG TGGAGTCAAA CATACGGTTG240
GCTCAACCTC TCGTGCGTGA AAAAGTGGCG GTTCATTTTT GTAAGGATGA ACCAAAAGAG300
CTAGTAGCAT TCATCACGCG AAAGTACGTG GAACTCACGG GCGTGGGAGT GAGAGAAGCG360
GTGAAGAGGG AAATGCGCTC TCTTACCAAA ACAGTTTTAA ATAAAATGTC TTTGGAAATG420
GCGTTTTACA TGTCACCACG AGCGTGGAAA AACGCTGAAT GGTTAGAACT AAAATTTTCA480
CCTGTGAAAA TCTTTAGAGA TCTGCTATTA GACGTGGAAA CGCTCAACGA ATTGTGCGCC540
GAAGATGATG TTCACGTCGA CAAAGTAAAT GAGAATGGGG ACGAAAATCA CGACCTCGAA 600
CTCCAAGACG AATGTTAA
A harmadik meghatározatlan fehérje vagy polipeptid a 19. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő levezetett aminosav szekvenciával rendelkezik, az alábbiak szerint:
Met Arg Val Ile Val Ser Pro Tyr 15
Ser Thr Asp Met Leu Arg Asn Ile 20
Glu Cys lie Lys Alá Phe Ser Thr 3540
Glu Alá Glu Asp Ile Leu Lys Arg 1015
Asp Ser Gly Val Leu Ser Thr Lys 2530 lie Thr Arg Asp Leu His Cys Alá 45
Lys Alá Ser Tyr Gin Trp Gly Val 50 55
Cys Alá Glu Lys Arg Leu Ile Asp 65 70
Alá Gin Pro Leu Val Arg Glu Lys 85
Glu Pro Lys Glu Leu Val Alá Phe 100
Thr Gly Val Gly Val Arg Glu Alá
115120
Thr Lys Thr Val Leu Asn Lys Met 130135
Ser Pro Arg Ala Trp Lys Asn Alá 145iso
Pro Val Lys Ile Phe Arg Asp Leu 165
Asp Thr Gly Leu Tyr Gin Arg Asn 60
Thr Val Glu Ser Asn Ile Arg Leu 7580
Val Alá Val His Phe Cys Lys Asp 90
Ile Thr Arg Lys Tyr Val Glu Leu 105110
Val Lys Arg Glu Met Arg Ser Leu 125
Ser Leu Glu Met Ala Phe Tyr Met 140
Glu Trp Leu Glu Leu Lys Phe Ser 155 160
Leu Leu Asp Val Glu Thr Leu Asn 170 175
- 56 Glu Leu Cys Ala Glu Asp Asp Vai His Vai Asp Lys Vai Asn Glu Asn 180 185 190
Gly Asp Glu Asn His Asp Leu Glu Leu Gin Asp Glu Cys 195 200 205 és molekulatömege körülbelül 22 és körülbelül 26 kDa között van, előnyösen körülbelül 24 kDa.
Egy másik, találmány szerinti DNS-molekula (GLRaV-2 3'UTR) magába foglalja az 1. azonosítási szám szerinti szekvencia 15285-15500. nukleotidjait és a 23. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazza, az alábbiak szerint:
ACATTGGTTA AGTTTAACGA AAATGATTAG
TAAATAATAA
ATCGAACGTG
GGTGTATCTA
CCTGACGTAT
CAACTTAAGC
TGTTACTGAG
TAATTAAACC
AACAAGTGTT
GGTGTAATGT
120
GTATGTTGAT
GTAGAGAAAA
ATCCGTTTGT
AGAACGGTGT
TTTTCTCTTC
TTTATTTTTA
180
ΑΑΑΑΑΑΑΆΑΤ
ΑΑΑΆΑΑΑΑΑΆ
AAAAAAAAGC
GGCCGC
216 találmány tárgyát képezik továbbá a találmány szerinti DNS-molekulák fragmensei is. A szőlőnövény-levélsodródással szembeni ellenálló képességet szőlőnövényekre történő átvitelére képes fragmensek megszerkesztéséhez a megfelelő restrikciós helyeket - ezeket a DNS-molekula szekvencia vizsgálata tárja fel - alkalmazzuk, hogy: (i) interpozont illesszünk be - [Felley és mtsai.: Gene 52 147 (1987) ; amely publikáció teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő] - oly módon, hogy a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus burok polipeptid vagy fehérje lerövidített formáit hozhatjuk létre, amelyekben a Cterminálisról különböző hosszúságú darabok hiányoznak; vagy (ii) a fehérje különböző hosszúságú belső részeit töröljük.
Alternatív módon a szekvencia alkalmazható a kódoló régió bármely részének amplifikálására oly módon, hogy a transzkripciós és transzlációs start szignálokat egyaránt biztosító vektorba klónozható.
Megfelelő DNS-molekuláknak tekinthetők azok, amelyek az 1. azonosítási szám szerinti szekvenciából legalább 15, egymást követő bázisból álló nukleotid szekvenciával rendelkező DNS-molekulával hibridizálni képesek sztringens körülmények között, amelyet 0,9 M nátrium-citrát puffért (SSC) tartalmazó hibridizációs puffer jellemez 37 °C hőmérsékleten, és a kötődés fennmarad az SSC pufferrel, 37 °C-on történő mosás során; és előnyösen olyan körülmények között, amelyet 20% formamidot, 0,9 M fiziológiás sóoldat/0,9 M SSC puffért tartalmazó hibridizációs puffer jellemez 42 °C hőmérsékleten, és a kötődés fennmarad a 0,2x SSC pufferrel, 42 °C-on történő mosás során.
A variánsok úgyszintén (vagy alternatív módon) módosíthatók például nukleotidok deléciójával vagy hozzáadásával, amelyeknek minimális hatása van a kódolt polipeptid tulajdonságaira, szekunder struktúrájára és hidropátiás természetére. így például egy polipeptidet kódoló nukleotidok konjugálhatók egy szignál (vagy vezető) szekvenciához a fehérje N-terminális végén, amely ko-transzlációsan vagy poszt-transzlációsan irányítja a fehérje szállítását. A nukleotid szekvencia megváltoztatható oly módon is, hogy a kódolt polipeptidet egy linkerhez vagy más szekvenciához konjugáljuk a szintézis, tisztítás vagy a polipeptid azonosításának megkönnyítése céljából.
Ά. találmány szerinti fehérjét vagy polipeptidet előnyösen tisztított formában állítjuk elő (előnyösen legalább körülbelül 80%-os, előnyösebben 90%-os tisztaságban) hagyományos módszerek segítségével. Tipikus esetben a találmány szerinti fehérjét vagy polipeptidet lízis és szonikálás segítségével izoláljuk. Mosást követően a lizátum üledékét Trisz-HCl-t tartalmazó pufferben újra szuszpendáljuk. Dialízis során ebből a fehérje oldatból csapadék válik ki. Az oldatot lecentrifugáljuk és az üledéket mossuk, majd a Trisz-HCl-t tartalmazó pufferben újra szuszpendáljuk. A fehérjéket elektroforézis segítségével választjuk el SDS-t tartalmazó 12%-os poliakrilamid gélen.
A találmány szerinti szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjét vagy polipeptidet kódoló DNSmolekula beépíthető sejtekbe hagyományos rekombináns DNSmódszerek alkalmazásával. Általánosságban ez magába foglalja a DNS-molekula beillesztését egy expressziós rendszerbe, amelyhez képest a DNS-molekula heterológ (azaz normál körülmények között nem található meg benne). A heterológ DNSmolekulát a helyes szensz irányításban és a korrekt leolvasási fázisban illesztjük be az expressziós rendszerbe vagy a vektorba. A vektor tartalmazza a beillesztett fehérjekódoló szekvenciák transzkripciójához és a transzlációjához szükséges elemeket.
Cohen és Boyer 4,237,224 lajstromszámú US szabadalma amely teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő írja le az expressziós rendszerek előállítását rekombináns plazmidok formájában, restrikciós enzimes hasítást és DNS59 ligázzal történő ligálást alkalmazva. Ezeket a rekombináns plazmidokat ezután transzformálás útján juttatjuk be és egysejtű tenyészetekben replikáljuk, beleértve prokarióta organizmusokat és szövettenyészetben nevelt eukarióta sejteket .
A rekombináns gének vírusokba is bejuttathatok, mint például a vaccinia vírus. Rekombináns vírusok állíthatók elő oly módon, hogy plazmidokat transzfektálunk vírussal fertőzött sejtekbe.
A megfelelő vektorok közé tartoznak - nem korlátozó értelemben véve - a következő vírusvektorok: gtll, gtWES.tb, Charon-4 lambda vektor rendszerek, és az alább következő plazmid vektorok, mint például: pBR322, pBR325, pACYC177, PACYC184, pUC8, pUC9, pUC18, pUC19, pLG339,pR290, pKC37, pKCIOl, SV 40, pBluescript II SK +/- vagy KS +/- (lásd például: Stratagene Cloning Systems katalógus (1993), Stratagene, La Jolla, Kalifornia; amely hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő), a pQE, pIH821, pGEX, pET sorozatok (lásd például: Studier és mtsai.: Use of T7 RNA Polymerase to Direct Expression of Cloned Genes, Gene Expression Technology 185 (1990); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő), valamint ezek bármely származéka. A rekombináns molekulák bejuttathatok sejtekbe transzformáció, transzdukció, konjugáció, mobilizáció vagy elektroporáció segítségével. A DNS-szekvenciák a vektorba a technika állása szerint ismert standard klónozó eljárások segítségével klónozhatok, ahogyan ez leírásra került: Maniatis és mtsai.: Molecular
Cloning: A Laboratory Manual, Cold Springs Laboratory, Cold. Springs Harbor, New York (1982); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő.
Gazda-vektor rendszerek széles skálája alkalmazható a fehérjét kódoló szekvencia(szekvenciák) expresszálására. Elsődlegesen a vektor rendszer kompatibilis kell legyen az alkalmazott gazdasejttel. A gazda-vektor rendszerek nem korlátozó értelemben magukba foglalják az alább következőket: bakteriofág DNS-sel, plazmid DNS-sel vagy kozmid DNSsel transzformált baktériumok; mikroorganizmusok, mint például élesztő vektorokat tartalmazó élesztő; vírussal fertőzött emlős sejtrendszerek (például vaccinia vírus, adenovirus, stb.); és baktériummal fertőzött, vagy részecske bombázással (mint például biolisztikumok) transzformált növényi sejtek. Ezen vektorok expressziós elemei változhatnak erősségükben és specifitásukban. Az alkalmazott gazdavektor rendszertől függően számos megfelelő transzkripciós és transzlációs elem bármelyike alkalmazható.
A különböző genetikai szignálok és feldolgozási események a génexpresszió sok szintjét szabályozzák (mint például a DNS transzkripciója és a hírvivő RNS (mRNS) transzlációja) .
A DNS transzkripciója függ egy promoter jelenlététől, egy olyan DNS-szekvenciától, ami irányítja az RNS-polimeráz kötődését és ezáltal elősegíti a mRNS szintézist. Az eukarióta promóterek DNS szekvenciái különböznek a prokarióta promóterek szekvenciáitól. Továbbá elképzelhető, hogy az eukarióta promótereket és a hozzájuk kapcsolódó genetikai
- 61 szignálokat egy prokarióta rendszer nem ismeri fel, vagy nem működnek egy prokarióta rendszerben és továbbá a prokarióta promótereket nem ismerik fel az eukarióta sejtek és nem működnek eukarióta sejtekben.
Hasonlóképpen a mRNS transzlációja prokariótákban függ a megfelelő prokarióta szignálok jelenlététől, amely szignálok eltérnek az eukariótákban előforduló szignáloktól. A mRNS hatékony transzlációjához prokariótákban szükséges egy riboszóma kötő hely, amit a mRNS-en Shine-Dalgarno (SD) szekvenciának nevezünk. Ez a szekvencia a mRNS egy rövid nukleotid szekvenciája, amely a start kodon - rendszerint AUG, amely a fehérje amino-terminális metioninját kódolja előtt helyezkedik el. Az SD-szekvenciák komplementerek a 16S rRNS (riboszómális RNS) 3'-végével és feltételezhetően oly módon segítik elő a mRNS kötődését a riboszómákhoz, hogy az rRNS-sel duplexet képeznek és ezzel lehetővé teszik a riboszóma megfelelő elhelyezkedését. A génexpresszió maximalizálásának irodalmi összefoglalását lásd: Roberts és Lauer: Methods in Enzymology 68 473 (1979); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanitás részeként tekintendő .
A promóterek változhatnak erősségükben (azaz azon képességükben, hogy elősegítik a transzkripciót). Egy klónozott gén expressziója kiváltására kívánatos erős promótereket alkalmazni annak érdekében, hogy magas szintű transzkripciót érjünk el és ennél fogva a gén magas szintű expresszióját váltsuk ki. Az alkalmazott gazdasejt rendszertől függően számos megfelelő promoter bármelyike alkalmaz ható. így például, amikor E. coli-ban végezzük a klónozást, annak bakteriofágjai vagy plazmidjai, olyan promóterek mint például a T7 fág promoter, lac promoter, trp promoter, recA promoter, riboszómális RNS promoter, a lambda colifág PR és PL promóterei, és nem korlátozó értelemben vett más promóterek, mint a lacUV5, ompF, bla, Ipp és más hasonlók alkalmazhatók, hogy a közvetlenül mellettük található DNSszegmensek magas szintű transzkripcióját irányítsák. Továbbá rekombináns DNS vagy más szintetikus DNS módszerekkel előállított hibrid trp-lacUV5 (tac) promoter vagy más E. coli promóterek alkalmazhatók a beillesztett gén transzkripciójának biztosítására.
Olyan bakteriális gazdasejt törzsek és expressziós vektorok választhatók ki, amelyek a promoter működését gátolják, míg specifikus indukcióra nem kerül sor. Egyes operonok esetében specifikus indukálószerek hozzáadása szükséges a beillesztett DNS hatékony transzkripciójához. így például a lac operon indukálható laktóz vagy IPTG (izopropil-tiobéta-D-galaktozid) hozzáadásával. Különböző további operonok - mint például trp, pro, stb. - eltérő szabályozás alá esnek.
Specifikus iniciációs szignálokra hasonlóképpen szükség van gének hatékony transzkripciójához és transzlációjához prokarióta sejtekben. Ezek a transzkripciós és transzlációs iniciációs szignálok változhatnak erősségükben, ahogyan ez - sorrendben megfeleltetve - mérhető a gén specifikus hírvivő RNS mennyiségével és a szintetizált fehérje mennyiségével. A promoter! tartalmazó DNS expressziós vektor tar talmazhatja különböző erős transzkripciós és/vagy transzlációs iniciációs szignálok bármely kombinációját is. így például E. coli-ban végrehajtandó hatékony transzlációhoz szükséges egy Shine-Dalgarno (SD) szekvencia, körülbelül 79 bázis távolságra 5'-irányban az iniciációs kodontól (ATG) - riboszóma kötődési hely biztosítására. így tehát bármely olyan SD-ATG kombináció alkalmazható, amelyet a gazdasejt riboszómák használni képesek. Ilyen kombinációk közé tartoznak - nem korlátozó értelemben véve - a colifág lambda N-génből vagy a cro génből származó SD-ATG kombináció, vagy az E. coli triptofán E, D, C, B vagy A génekből származó kombináció. Továbbá bármely olyan SD-ATG kombináció alkalmazható, amelyet szintetikus nukleotidok beépítését magába foglaló rekombináns DNS vagy más módszerek segítségével állítunk elő.
Miután a fentebb leírtak szerint a különböző szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjéket vagy polipeptideket kódoló DNS-molekulákat expressziós rendszerbe klónoztuk, ezzel beépíthetők lesznek gazdasejtbe. Az ilyen beépítést a fentebb leírtak szerint különböző transzformációs módokon hajthatjuk végre, a vektor/gazdasejt rendszertől függő módon. A megfelelő gazdasejtek nem korlátozó értelemben magukba foglalják a következőket: baktériumok, vírusok, élesztő, emlős sejtek, rovarsejtek, növényi sejtek és más hasonlók.
A találmány tárgyát képezik olyan RNS molekulák is, amelyek a fentebb leírt különböző szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjéket vagy polipeptideket kódolják. A transzkriptumok megszintetizálhatók a találmány szerinti gazdasejtek alkalmazásával, a hagyományos módszerek bármelyikének segítségével. A mRNS transzlálható akár in vitro vagy in vivo. Az alkalmazható sejtmentes rendszerek tipikus esetben tartalmazhatnak búzacsíra vagy retikulocita kivonatokat. Az in vivo transzláció például végrehajtható béka petesejtekbe történő mikroinjekció segítségével .
A találmány egy aspektusa szerint szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) különböző fehérjéit vagy polipeptidjeit kódoló fentebb leírt DNS-molekulákból egyet vagy többet alkalmazunk szőlőnövények transzformálására annak érdekében, hogy a növényekre szőlőnövény-levélsodródással szembeni rezisztenciát vigyünk át. Nem ismert az a mechanizmus, amellyel a rezisztencia átvitele történik. Egy hipotetikus mechanizmus szerint a transzformált növény képes szőlőnövény-levélsodródás vírus (2. típus) fehérjét vagy polipeptidet expresszálni és amikor a transzformált növényt beoltjuk szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal, mint például a GLRaV-1, GLRaV-2, GLRaV-3, GLRaV-4, GLRaV-5 vagy GLRaV-6 vírussal vagy ezek kombinációjával, a expreszszált fehérje vagy polipeptid megakadályozza a vírus DNS transzlációj át.
A találmány ezen aspektusa szerint a találmány tárgyát képező, a növénybe beépített DNS-molekula folyamatosan expresszálható. Alternatív módon eljárva az expressziót szabályozhatja egy promoter, amely szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus jelenléte esetében aktiválódik. Az ezen célra megfelelő promóterek magukba foglalják azokat amelyek szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus bejutására adott válaszként expresszióra kerülő génekből származnak.
A találmány szerinti izolált DNS-molekulák alkalmazhatók szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal szembeni rezisztencia átvitelére a szőlőnövények széles skálája esetében. A DNS-molekulák különösen jól alkalmazhatók rezisztencia átvitelére Vitis oltványokra vagy gyökértörzs termesztési variánsok esetében. Az ily módon védhető oltvány termesztési variánsok közé tartoznak az alábbi, általános neveken ismert változatok: asztali- vagy mazsolaszőlők, mint például: Alden, Almeria, Anab-E-Shahi, Őszi Fekete, Beauty Magnélküli, Black Corinth, Black Damascus, Black Malvoisie, Black Prince, Blackrose, Bronx Magnélküli, Burgrave, Calmeria, Korai Campbell, Canner, Cardinal, Catawba, Christmas, Concord, Dattier, Delight, Diamond, Dizmar, Duchess, Korai Muskotály, Emerald Magnélküli, Emperor, Exotic, Ferdinand de Lesseps, Fiesta, Flame Magnélküli, Flame Tokay, Gasconade, Gold, Himrod, Hunisa, Hussiene, Isabella, Italia, Júliusi Muskotály, Khandahar, Katta, Kourgane, Kishmishi, Laza Periette, Malaga, Monukka, Alexandriai Muskotály, Flame Muskotály, Hamburgi Muskotály, New York-i Muskotály, Niabell, Niagara, Olivette blanche, Ontario, Pierce, Queen, Vörös Malaga, Ribier, Rish Baba, Romulus, Rubint Magnélküli, Schuyler, Seneca, Suavis (IP 365), Thompson Magnélküli és Thomuscat. Magába foglalja azokat is amelyeket bortermelésre alkalmaznak, mint például: Aleatico, Alicante Bouschet, Aligote, Alvarelhao,
Aramon, Baco blanc (22A) , Burger, Cabernet franc, Cabernet, Sauvignon, Calzin, Carignane, Charbono, Chardonnay, Chasselas dore, Chenin blanc, Clairette blanche, Korai Burgundi, Zöld Rizling, Szagos Fehér, Fernao Pires, Flora, French Colombard, Fresia, Furmint, Gamay, Gewurztraminer, Grand noir, Szürke Rizling, Zöld Magyar, Zöld Veltliner, Grenache, Grillo, Helena, Inzolia, Lagrein, Lambrusco de Salamino, Malbec, Malvasia bianca, Mataro, Melon, Merlot, Meunier, Mission, Montua de Pilas, Muscadelle du Bordelais, Muskotály blanc, Muskotály Ottonel, Muskotály SaintVallier, Nebbiolo, Nebbiolo fino, Nebbiolo Lampia, Orange Muskotály, Palomino, Pedro Ximenes, Petit Bouschet, Petite Sirah, Peverella, Pinot noir, Pinot Saint-George, Primitivo di Gioa, Vörös Veltliner, Refosco, Rkatsiteli, Royalty, Rubinvörös, Rubint Cabernet, Saint-Emilion, Saint Macaire, Salvador, Sangiovese, Sauvignon blanc, Sauvignon gris, Sauvignon vert, Scarlet, Seibel 5279, Seibel 9110, Seibel 13053, Semillon, Servant, Shiraz, Souzao, Sultana Crimson, Sylvaner, Tannat, Teroldico, Tinta Madeira, Tinto cao, Touriga, Traminer, Trebbiano Toscano, Trousseau, Valdepenas, Viognier, Walschriesling, Fehér Rizling és Zinfandel. Az ily módon védhető gyökértörzs termesztési változatok magukba foglalják a következőket: Couderc 1202, Couderc 1613, Couderc 1616, Couderc 3309, Dog Ridge, Foex 33 EM, Freedom, Ganzin 1 (A x R #1), Harmony, Kober 5BB, LN33, Millardet & de Grasset 41B, Millardet & de Grasset 420A, Millardet & de Grasset 101-14, Oppenheim 4 (S04), Paulsen 775, Paulsen 1045, Paulsen 1103, Richter 99, Rich
- 67 ·· · ter 110, Riparia Gloire, Ruggeri 225, Saint-George, Salt Creek, Teleki 5A, Vitis rupestris Constantia, Vitis California és Vitis girdiana.
Kiterjedt hasonlóság tapasztalható a GLRaV-2 és más closterovírusok - mint például a tristeza virus és a cékla sárgulást okozó virus - HSP70-rokon szekvencia régiói között. Ennek következtében a GLRaV-2 HSP70-rokon gén úgyszintén alkalmazható, hogy a szőlőtől különböző más transzgént hordozó növényeket vagy termesztési változatokat hozzunk létre - mint például citrus fajok vagy cukorrépa amelyek a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírustól különböző más closterovírusokkal szemben rezisztenciát mutatnak, mint például a tristeza vírussal és a cékla sárgulást okozó vírussal szemben.
A megfelelő citrus termesztési változatok magukba foglalják az alábbiakat: citrom, lime, narancs, grapefruit, pineapple, mandarin és más hasonlók, mint például az alábbiak: Joppa, Máltai Ovál, Parson (Parson Brown), Pera, Pineapple, Queen, Shamouti, Valencia, Tenerife, Imperial Doblefina, Washington Sanguine, Moro, Sanguinello Moscato, Spanyol Sanguinelli, Tarocco, Atwood, Australian, Bahia, Baiana, Cram, Dalmau, Eddy, Fisher, Frost Washington, Gillette LengNavelina, Washington, Satsuma Mandarin, Dancy, Robinson, Ponkan, Duncan, Marsh, Rózsaszín Marsh, Rubintvörös, Vörös Magnélküli, Seville Sima, Orlando Tangelo, Eureka, Lisbon, Meyer Citrom, Rücskös Citrom, Fanyar Narancs, Persian Lime, West Indian Lime, Bearss, Sweet Lime, Troyer Citrange és Citrus Trifoliata. Ezen citrus
- 68 - ::
·· · ·*···· ··· · * termesztési változatok mindegyike alkalmazható tristeza vírussal szemben rezisztens transzgént hordozó citrus növények előállítására.
A cukorrépa gazdaságilag fontos faja a Beta vulgaris L.r amelynek négy fontos termelési változata ismert: cukorrépa, étkezési cékla, marharépa és a mangold (Swiss chard). Ezen cékla termelési változatok mindegyike alkalmazható a fentebb leírtak szerint cékla sárgulást okozó vírussal szembeni rezisztenciával rendelkező transzgént hordozó céklanövények előállítására.
Annak következtében, hogy a GLRaV-2 vírusról ismert, hogy képes dohánynövényeket is megfertőzni (mint például Nicotiana benthamiana) , úgyszintén kívánatos olyan transzgént hordozó dohánynövények előállítása, amelyek rezisztensek szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal szemben, mint például a GLRaV-2 vírussal szemben.
A transzformációra alkalmazható növényi szövetek közé tartoznak az alábbiak; levélszövet, gyökérszövet, merisztéma, zigóta és szomatikus eredetű embriók és portokok. Különösen előnyösen alkalmazhatók portok tenyészetekből nyert embriók.
A találmány szerinti expressziós rendszer alkalmazható gyakorlatilag bármely növényi szövet transzformálására megfelelő körülmények között. A találmány szerint transzformált szöveti sejtek in vitro növeszthetők megfelelő táptalajban, hogy átvigyük a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal szembeni rezisztenciát. A transzformált sejtek teljes növénnyé regenerálhatok oly módon, hogy a fehérje vagy polipeptid rezisztenciát biztosít a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal szemben a teljes transzgént hordozó növényekben. Mindegyik esetben a találmány szerinti rekombináns DNS expressziós rendszerrel transzformált sejteket növesztjük és kiváltjuk a DNS-molekula expresszióját, hogy a fentebb leírt szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus fehérjék vagy polipeptidek egyikét termelje és így szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal szembeni rezisztenciát közvetítsen.
Transzgént hordozó növények előállításához a fentebb leírtak szerinti DNS-konstrukciót egy vektorban mikroinjektálhatjuk közvetlenül növényi sejtbe mikropipetták segítségével, hogy a rekombináns DNS-t mechanikai úton átvigyük [Crossway: Mol. Gen. Genetics 202 179 (1985); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő]. A genetikai anyag a növényi sejtbe polietilénglikol segítségével is bevihető [Krens és mtsai.: Nature 296 72 (1982) ; amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő].
A találmányi leírásnak megfelelően egy eljárás lehet növények transzformálására a DNS-molekulával, amikor az ilyen növények szövetét bakteriális eredetű oltóanyaggal érintkeztetjük, amely baktériumot a találmány szerinti gént tartalmazó vektorral transzformáljuk, amely gén szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal szembeni rezisztencia átvitelére képes. Általánosságban ezen eljárás keretében a növényi szövetet baktériumok szuszpenziójával oltjuk be és a szövetet 48-72 órán keresztül regeneráló táptalajon inku
ΊΟ báljuk antibiotikumok nélkül 25-28 °C-on.
Az Agrobacterium nemzetségből származó baktériumok alkalmazhatók növényi sejtek transzformálására. Az ilyen baktériumok megfelelő fajai közé tartoznak az Agrobacterium tumefaciens és az Agrobacterium rhizogenes fajok. Az Agrobacterium tumefaciens (mint például a C58, LBA4404 vagy EHA105 törzsek) különösen jól alkalmazható jól ismert növény transzformáló képessége alapján.
Heterológ genetikai szekvenciák juttathatók be megfelelő növényi sejtekbe az A. tumefaciens Ti-plazmidja vagy az A. rhizogenes Ri plazmidja segítségével. A Ti- vagy Riplazmid a növényi sejtekbe Agrobacterium fertőzés útján vihető át és stabilan beépül a növényi genomba [Schell: Science 237 1176 (1987); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő].
Transzformálás után a transzformált növényi sejteket regenerálni kell.
Tenyésztett protoplasztokból történő növény regenerálás került leírásra a következő irodalmi referenciákban: Evans és mtsai.: Handbook of Plant Cell Cultures I. kötet, MacMillan Publishing Co., New York, (1983) és I.R. Vasil (szerk.): Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Acad. Press, Orlando, I. kötet, (1984) és III. kötet, (1986), amelyek teljes egészében a kitanítás részeként tekintendők.
Ismert, hogy gyakorlatilag az összes növény regenerálható tenyésztett sejtekből vagy szövetekből, nem korlátozó jelleggel beleértve az összes főbb cukornád, cukorrépa, gyapot, gyümölcsfa és hüvelyes fajokat.
A regenerációs módok fajról fajra változnak a növények esetében, de általánosságban először transzformált protoplasztok szuszpenzióját vagy explantátumokat tartalmazó Petri-lemezt állítunk elő. Kallusz szövet alakul ki és a kalluszból hajtások indukálhatok, majd ezt követően gyökereztethetők. Alternatív módon embrió kialakulása indukálható a kallusz szövetben. Ezek az embriók - mint természetes úton keletkezett embriók - csíráznak, hogy belőlük növények alakuljanak ki. A tenyésztáptalaj általánosságban különböző aminosavakat és hormonokat tartalmaz, mint például auxin és citokininek. Ugyancsak előnyös módon glutaminsav és prolin adható a táptalajhoz. A hatékony regeneráció függ a táptalajtól, a genotípustól és a tenyészet folyamatától. Amenynyiben ezt a három változót szabályozzuk, a regeneráció általánosságban reprodukálható és megismételhető.
Miután az expressziós kazettát stabil módon beépítettük transzgént hordozó növényekbe, további növényekbe szexuális úton történő keresztezések során átvihető. A számos standard nemesítési eljárás bármelyike alkalmazható a keresztezendő fajoktól függően.
Miután az ilyen típusú transzgént hordozó növényeket előállítottuk, a növények önmagukban termeszthetők hagyományos eljárás szerint, hogy a DNS konstrukció az eredményül kapott növényekben jelen legyen. Alternatív módon transzgént hordozó magokat gyűjtünk a transzgént hordozó növényekről. Ezeket a magokat ezután elültethetjük a talajba és hagyományos eljárásokat alkalmazva neveljük, hogy ezzel transzgént hordozó növényeket állítsunk elő.
Egy patogénekkel szembeni rezisztenciát biztosító génnel történő, növényi sejtek transzformálására szolgáló másik eljárás lehet a gazdasejt részecske bombázása (úgy is ismerjük, mint biolisztikus transzformáció). Ez számos út bármelyikével megvalósítható. Az első módon közömbös vagy biológiailag aktív részecskéket gyorsítunk fel és ezeket a sejtekre irányítjuk. Ezt az eljárást ismertetik Sanford és mtsai.: 4,945,050, 5,036,006 és 5,100,792 lajstromszámú US szabadalmai, valamint Emerschad és mtsai.: Plant Cell Reports 14 6 (1995); a továbbiakban mint: Emerschad, (1995); amely irodalmi hivatkozások mindegyike teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő. Általánosságban ez az eljárás magába foglalja közömbös vagy biológiailag aktív részecskék felgyorsítását és ezek sejtekre irányítását olyan körülmények között, amelyek hatékonyan biztosítják a sejt külső felszínén történő áthatolást és biztosítják, hogy annak belsejében beépülés történjen. Amikor inert részecskéket alkalmazunk, a vektor bejuttatható a sejtbe oly módon, hogy a részecskéket a heterológ DNS-t tartalmazó vektorral bevonjuk. Alternatív módon a célsejtet körülvehet jük a vektorral oly módon, hogy a vektor a sejtbe a részecske nyomán kerül be. Biológiailag aktív részecskék (azaz a vektort és a heterológ DNS-t tartalmazó szárított baktériumsejtek) hasonló módon bejuttathatok növényi sejtekbe.
Miután egy szőlőnövény szövetet, citrusnövény szövetet, céklanövény szövetet vagy dohánynövény szövetet a találmányi leírás szerint transzformálunk, a transzformált szőve tét regeneráljuk, hogy transzgént hordozó növényt hozzunk létre. Általánosságban a regenerálást úgy valósítjuk meg, hogy a transzformált szövetet tenyésztjük a megfelelő növekedés szabályozókat és tápanyagokat tartalmazó táptalajon, hogy lehetővé tegyük a hajtás merisztémák iniciálását. Megfelelő antibiotikumokat adunk a regenerációs táptalajhoz, hogy gátoljuk az Agrobacterium növekedését és szelektáljunk a transzformált sejtek kifejlődésére. A hajtás iniciálását követően lehetővé tesszük, hogy a hajtások szövettenyészetet hozzanak létre és a hajtásokat marker gén aktivitásra szkríneljük. A találmány szerinti DNS molekulákat képessé tehetjük arra, hogy átíródjanak olyan hírvivő RNS-be, amely - bár kódol ugyan egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérjét vagy polipeptidet - nem transzlálódik a fehérjébe. Ezt úgy ismerjük, mint RNS-közvetített rezisztencia. Amikor egy Vitis oltványt vagy gyökértörzs termesztési változatot, vagy citrus, cékla valamint dohány termesztési változatot ilyen DNS-molekulával transzformálunk, a DNS-molekula átírható olyan körülmények között, amelyek hatékonyan fenntartják a hírvivő RNS-t a növényi sejtben alacsony szintű denzitás értékek mellett. Előnyösen 15 és 50 közötti denzitás értékeket választunk Hewlett ScanJet készüléket és Image Analysis Programot alkalmazva.
A találmány szerinti egy vagy több DNS-molekula egy részét és hasonlóképpen más DNS-molekulákat alkalmazhatunk transzgént hordozó szőlőnövényben, citrusnövényben, céklanövényben vagy dohánynövényben a 09/025,635 sorozatszámú US szabadalmi bejelentésnek megfelelően, amely hivatkozás tel jes egészében a kitanítás részeként tekintendő.
A találmány szerinti szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) fehérje vagy polipeptid alkalmazható antitestek vagy azok kötő részeinek termeltetésére vagy próbákként. Az antitestek lehetnek monoklonális antitestek vagy poliklonális antitestek.
A monoklonális antitest termelés megvalósítható a technika állása szerint jól ismert eljárások alkalmazásával. Alapvetően az eljárás során először emlős (például egér) lépéből immunsejteket (limfocitákat) nyerünk, amely emlőst ezt megelőzően a kívánt antigénnel In vivo vagy in vitro immunizáljuk. Az antitestet szekretáló limfocitákat ezután (egér) mielóma sejtekkel vagy transzformált sejtekkel fuzionáljuk, amelyek korlátlanul képesek replikálódni sejtte— nyészetben és ezúton halhatatlan, immunglobulint szekretáló sejtvonalat állítunk elő. Az eredményül kapott fuzionált sejteket vagy hibridómákat tenyésztjük, és a kapott telepeket a kívánt monoklonális antitestek termelésére szkríneljük. Az ilyen antitesteket termelő telepeket klónozzuk és akár in vivo vagy in vitro növesztjük, hogy nagymennyiségű antitestet állítsunk elő. Az ilyen sejtek fúziójának elméleti alapjai és a gyakorlatban alkalmazható eljárások az alábbi irodalmi hivatkozásban kerültek leírásra: Kohler és Milstein: Nature 256 495 (1975); amely teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő.
Az emlős limfocitákat az állat (például egér) a találmány szerinti fehérjével vagy polipeptiddel történő in vivo immunizációja során immunizáljuk. Az ilyen immunizációkat szükség szerint megismételjük, fel egészen néhány hetes időtartamokig, hogy az antitestek megfelelő titerét érjük el. Az utolsó antigén gyorsító-injekciót követően az állatokat feláldozzuk és a lépsejteket eltávolítjuk.
Emlős mielóma sejtekkel vagy más olyan fúziós partnerekkel történő fúzió, amelyek képesek korlátozás nélkül replikálódni sejttenyészetben, végrehajtható standard, és a technika állása szerint jól ismert eljárások segítségével, mint például polietilén-glikol (PEG) vagy más fúziós anyagok alkalmazásával [lásd például: Milstein és Kohler: Eur. J. Immunoi. 6 511 (1976); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő]. Ezt a halhatatlan sejtvonalat - amely előnyösen egér eredetű, de származhat más emlős fajok sejtjeiből, nem korlátozó jelleggel beleértve patkány és emberi eredetű sejteket - úgy választjuk ki, hogy bizonyos tápanyagok felhasználásához szükséges enzimekre nézve hiányos legyen, képes legyen gyors növekedésre és jó fúziós képességekkel rendelkezzen. A szakember számára sok ilyen ismert sejtvonal található, és rendszeresen leírásra kerülnek további sejtvonalak is.
Úgyszintén jól ismertek a poliklonális antitestek termelésére szolgáló eljárások. Tipikus esetben ilyen antitestek termeltethetek oly módon, hogy a találmány szerinti fehérjét vagy polipeptidet szubkután bejuttatjuk New Zealand fehér nyulakba, amelyeket ezt megelőzően először véreztettünk, hogy immunizálás előtti szérumot nyerjünk. Az antigének beadhatók injekciós helyenként 100 μΐ teljes térfogatban, hat különböző helyen. Mindegyik beinjektált mennyiség tartalmaz szintetikus felületaktív adjuváns hatású többszörös poliolokat, vagy az SDS-poliakrilamid gél elektroforézis után a fehérjét vagy polipeptidet tartalmazó elporított akrilamid gélt. A nyulakat ezután két hétre az első injekció után véreztetjük és ismétlődően ugyanazon antigén gyorsító injekcióit adjuk be három alkalommal hat hetes időközökben. Szérum mintát veszünk 10 nappal mindegyik gyorsító injekciót követően. Ezt követően a szérumból poliklonális antitesteket nyerünk affinitás kromatográfia segítségével, a megfelelő antigént alkalmazva az antitest megfogására. Végül a nyulakat túlaltatjuk 150 mg/kg pentobarbitállal intravénásán. Ez és más poliklonális antitestek termeltetésére alkalmas eljárások leírásra kerültek: Harlow és mtsai. (szerk.): Antibodies: A Laboratory Manual (1988); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő.
A teljes antitestek alkalmazásán túl az ilyen antitestek kötő részei is alkalmazhatók. Ilyen kötő részek közé tartoznak a következők: Fab fragmensek, F(ab,)2 fragmensek és Fv fragmensek. Ezek az antitest fragmensek előállíthatok hagyományos eljárások segítségével, mint például proteolitikus fragmentációs eljárások segítségével, ahogyan ez leírásra került a következő publikációban: Goding: Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, New York, Academic Press, 98-118. oldalak, (1983); amely teljes egészében a kitanitás részeként tekintendő.
A találmány tárgyát képezik továbbá olyan próbák, amelyek természetes körülmények között megtalálhatók, vagy akár szintetikusan előállíthatok rekombináns DNS eljárások segítségével vagy más biológiai eljárások segítségével. Megfelelő próbáknak tekinthetők az olyan molekulák, amelyek a találmány szerinti monoklonális antitestek által azonosított szőlőnövény-levélsodródást okozó (2. típus) vírus eredetű antigéneket megkötni képesek. Ilyen próbák lehetnek például fehérjék, peptidek, lektinek vagy nukleinsav próbák.
Az antitestek, vagy azok kötő részei vagy a próbák bejuttathatok szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal fertőzött termesztési változat oltványokba vagy gyökértörzs termesztési változatokba. Alternatív módon ezen antitesteknek legalább a kötő részei szekvenálhatók és az ezeket kódoló DNS megszintetizálható. A kódoló DNS-molekula alkalmazható növények transzformálására egy promóterrel együtt, amely a kódolt antitest expresszióját hozza létre amikor a növény szőlőnövény-levélsodródást okozó vírussal fertőződik. Bármelyik esetben az antitest vagy annak kötő része vagy a próba a vírushoz kötődik és segítséget nyújt a szokásos levélsodródási válasz megakadályozásában.
A találmány szerinti GLRaV-2 fehérjék vagy polípeptidek ellen termeltetett antitestek vagy ezen antitestek kötő részei alkalmazhatók egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus kimutatására alkalmas eljárásban szöveti mintában, mint például szőlőnövényből (azaz oltványból vagy gyökértörzsből) származó, vagy dohánynövényből származó szövetben. A kimutatási eljárásban alkalmazható antitestek vagy azok kötő részei magukba foglalják az alább következők ellen tér-
meltetett anyagokat: helikáz, metil-transzferáz, papainszerű proteáz, RNS-függő RNS-polimeráz, 70 kDa hősokk fehérje, 90 kDa hősokk fehérje, burokfehérje, divergált burokfehérje, vagy a találmány szerinti más fehérjék vagy polipeptidek. A mintának az antitesttel mutatott bármely reakcióját vizsgálati rendszer segítségével mutathatjuk ki, amely jelzi a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus jelenlétét a mintában. Különböző vizsgálati rendszerek alkalmazhatók, mint például enzim-kapcsolt immunszorbens vizsgálati módszerek, radioimmun vizsgálati módszerek, gél diffúziós precipitin reakciós vizsgálati módszerek, immundiffúziós vizsgálati módszerek, agglutinációs vizsgálati módszerek, fluoreszcens immunvizsgálati módszerek, protein-A immunvizsgálati módszerek vagy immun-elektroforézises vizsgálati módszerek.
Alternatív módon szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus kimutatható ilyen mintában a DNS—molekula vagy annak frag— mense nukleotid szekvenciáját alkalmazva, amely a találmány szerinti fehérjét vagy polipeptidet kódolja. A nukleotid szekvencia mint próba vihető be egy nukleinsav hibridizációs vizsgálati módszerbe vagy génamplifikációs kimutatási eljárásba (azaz például polimeráz láncreakciós eljárást alkalmazva) . A találmány szerinti nukleinsav próbák alkalmazhatók bármely, a technika állása szerint ismert nukleinsav hibridizációs vizsgálati eljárásban, nem korlátozó értelemben beleértve az alábbiakat: Southern-blot [Southern: J. Mól. Bioi. 98 503 (1975); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő], Northern-blot
- 79 [Thomas: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77 5201 (1980); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanitás részeként tekintendő], valamint telep-hibridizációs biottok [Grunstein és mtsai.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72 3961 (1975); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő]. Alternatív módon a próbák alkalmazhatók génamplifikációs kimutatási eljárásban is (mint például polimeráz láncreakció során) [Erlich és mtsai.: Science 252 1643 (1991); amely irodalmi hivatkozás teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő]. A próbával létrejövő bármely reakciót úgy mutatjuk ki, hogy az jelezze szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus jelenlétét a mintában. Az ilyen kimutatás elősegíthető oly módon, hogy a találmány szerinti próbát jelöléssel látjuk el. Megfelelő jelölők közé tartozhatnak a következők: radioaktív vegyület, fluoreszcens vegyület, kemilumineszcenciás vegyület, enzimhatású vegyület, vagy más ezekkel egyenértékű nukleinsav j elölő.
A kimutatás kívánt körének megfelelően elképzelhető olyan próbák alkalmazása is, amelyek nukleotid szekvenciája megfelel az ORF vagy UTR konzervált vagy variábilis régióinak. így például annak érdekében, hogy megkülönböztessük egy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírust a többi rokon vírustól (például más closterovírusoktól) kívánatos, hogy olyan próbákat alkalmazzunk, amelyek az összes szőlőnövénylevélsodródást okozó vírusok között a nagyobb mértékben konzervált szekvenciáknak megfelelő nukleotid szekvenciákat tartalmaznak. Úgyszintén, annak érdekében, hogy különbséget
- 80 tegyünk különböző szőlőnövény-levélsodródást okozó vírusok között (azaz megkülönböztessük a GLRaV-2 vírust a GLRaV-1, GLRaV-3, GLRaV-4, GLRaV-5 valamint GLRaV-6 vírusoktól) kívánatos, hogy olyan próbákat alkalmazzunk, amelyek a különböző szőlőnövény-levélsodródást okozó vírusok között a kisebb mértékben konzervált szekvenciáknak megfelelő nukleotid szekvenciákat tartalmaznak.
A találmány szerinti nukleinsav (DNS vagy RNS) próbák hibridizálnak a komplementer GLRaV-2 nukleinsavhoz sztringens körülmények között. Általánosságban a sztringens körülményeket úgy választjuk meg, hogy a hőmérséklet körülbelül 50 °C-kal alacsonyabb legyen, mint a termális olvadási pont (Tm) a specifikus szekvenciára, meghatározott ionerősségnél és pH értéknél. A Tm az a hőmérséklet (meghatározott ionerősségnél és pH értéknél) amelynél a célszekvencia 50%a hibridizál egy tökéletesen illeszkedő próbához. A Tm függ az oldatban fennálló körülményektől és a próba bázisösszetételétől és a következő képlet segítségével számítható ki:
Tm = 79,8 °C + (18, 5 x log[Na+] ) + (58,4 °C x %[G+C]) (820/#bp a duplexben) (0,5 x %formamid)
A nem-specifikus kötődések szabályozhatók a számos ismert módszer bármelyike segítségével, mint például a membrán blokkolása fehérjét tartalmazó oldatokkal, heterológ
RNS, DNS és SDS hozzáadásával a hibridizáló pufferhez, és
- 81 RN-ázzal történő kezeléssel. A mosási körülményeket tipikus esetben a sztringens feltételeknek megfelelő vagy azoknál alacsonyabb szinten választjuk meg. Általánosságban nukleinsav hibridizációs vizsgálati módszerekhez vagy gén amplifikálási kimutatási eljárások során megfelelő sztringens körülményeknek választhatjuk a fentebb leírt körülményeket. Ugyanakkor kevésbé vagy erősebben sztringens körülményeket is választhatunk.
Az alább következő példák csupán a találmány megvalósítási módjainak illusztrálását szolgálják és semmiféleképpen nem a találmány érvényességi körének korlátozását jelentik.
1. példa
Northern-hibridizáció
A kiválasztott kiónok specifitását Northern-hibridizációval igazoltuk. A Northern-hibridizációt GLRaV-2 dsRNS 1 %-os agaróz gében, nem denaturáló körülmények között végzett elektroforézise után végeztük. Az agaróz gélt 0,4 M NaCl tartalmú 50 mM NaOH oldatban történő 30 perces áztatással denaturáltuk, majd 0,5 M NaCl tartalmú 0,1 M TriszHC1 (pH 7,5) oldatban történő további 30 perces áztatással semlegesítettük. Az RNS-t éjszakán át szendvics-blottoltuk Genescreen™ plusz membránra (DuPont NEN Research Product) lOx SSC-pufferben és a gyártó (DuPont, NEN) utasításai sze rint hibridizáltuk.
2. példa
Szekvenálás és komputerrel támogatott nukleotid és aminosav szekvencia analízis
A DNS-inszerteket pBluescript SK+ plazmidban szekvenáltuk T3 és T7 univerzális printereket alkalmazva a terminális régió szekvenciára és további oligonukleotid primereket terveztünk a belső régió szekvencia ismert szekvenciája alapján. A plazmid DNS tisztítását a gyártó által (Applied Biosystems, Inc.) ismertetett módosított mini alkalikus lízis/PEG precipitációs eljárással végeztük. A nukleotid szekvenálást a cDNS mindkét szálán elvégeztük az ABI TaqDyeDeoxy Terminator Cycle szekvenáló reagenskészlet (Applied Biosystems, Inc.) alkalmazásával. Az automata szekvenálást ABI373 automatizált szekvenátoron (Applied Biosystems, Inc.) végeztük a Cornell Egyetemen (Geneva, New York).
A GLRaV-2 nukleotid szekvenciáit - sorrendben megfeleltetve - a DNASTAR csomag (Madison, WI) EditSeq és SeqMan programjaival állítottuk össze és analizáltuk. A nukleotid szekvenciákból következtethető aminosav szekvenciákat és az azokat kódoló nyílt leolvasási fázisokat a MapDraw program segítségével származtattuk. Az aminosav szekvenciák többszörös összeillesztését, a konszenzus aminosav szekvenciák azonosítását és filogenetikus fák létrehozását a MegAlign programban található Clustal eljárással végeztük. A további closterovírusok nukleotid és aminosav szekvenciáit az Entrez Program segítségével nyertük, és a nem-redundáns adatbázisokkal végzett szekvencia összehasonlításokat a
National Center for Biotechnology Information-tól származó Blast Programmal történő kereséssel végeztük.
3. példa dsRNS izolálása Számos GLRaV-2 fertőzött Vitis vinifera cv Pinot Noir hajtás - amelyek egy New York állam központi részén található szőlőskertből származtak - szolgált forrásként dsRNS izoláláshoz és cDNS klónozáshoz. dsRNS-t extraháltunk fertőzött szőlőnövények floem szövetéből a Hu és munkatársai által leírt módszer szerint [Hu és mtsai.: J. Phytopathology 128 1 (1990); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. A nagy molekulatömegű dsRNS (körülbelül 15 kb) tisztítását a teljes dsRNS elektroforetikus elválasztásával végeztük el 0,7 % koncentrációjú alacsony olvadáspontú agaróz gélben, majd ezt követően fenol/kloroformos extrahálást végeztünk a Sambrook és munkatársai által leírt eljárás szerint [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. kiadás, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York (1989); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] . A dsRNS koncentrációját az etidium-bromiddal festett dsRNS sáv UV fluoreszcens optikai sűrűségének becslése alapján végeztük, ismert koncentrációjú DNS-markerrel öszszehasonlitva.
4. példa cDNS szintézis és klónozás
A cDNS szintézist az eredetileg Jelkmann és munkatársai által leírt, majd Ling és munkatársai által módosított eljárás szerint végeztük [Jelkmann és mtsai.: Phytopathology 79 1250 (1989); Ling és mtsai.: Arch. Virology 142 1101 (1997); amely publikációk teljes egészében a kitanítás részének tekintendők]. Alacsony olvadáspontú agaróz gélből tisztított körülbelül 100 ng nagy molekulatömegű dsRNS-t denaturáltunk 20 mM metil-merkurát-hidroxidban és szobahőmérsékleten inkubáltuk 10 percig 350 ng mennyiségű random primerekkel. A cDNS első szálját madár mieloblasztózis vírus (AMV) reverz-transzkriptázzal szintetizáltuk. A cDNS második szálját RNáz-H és E. coli DNS-polimeráz-I alkalmazásával állítottuk elő. A kettős-szálú cDNS tompa végeit T4 DNS-polimerázzal állítottuk elő és EcoRI adapterekkel ligáltuk. A cDNS-t, amelynek a végein EcoRI adapterek találhatók, kináz reakcióval aktiváltuk és Lambda ZAPII/EcoRI előkészített karokba ligáltuk, a gyártó utasításai szerint eljárva (Stratagene). A rekombináns DNS-t ezután in vitro pakoltuk Gigapack®!! pakoló extraktummal (Stratagene). A pakolt fág részecskéket amplifikáltuk és titerét meghatároztuk a gyártó utasításai szerint.
Kétféle próbát alkalmaztunk GLRaV-2 specifikus kiónok azonosítására a klóntárból. Az egyik típust a PCR-reakcióval amplifikált szintetizált cDNS-ből állítottuk elő specifikus EcoRI Uni-Amp™ adapterekhez (Clontech) történő ligálás után; a másik típust DNS-inszertek vagy PCR-termékek képezték korábban már szekvenált klónokból. A cDNS-klóntárból származó kiónokat telep/plakk Screen membránra (NEM Research Product) történő telep-átemelő hibridizációval szelektáltuk a fentebb leírt próba alkalmazásával. A próbát az előkészítés során 32P[α-dATP]-vei jelöltük az E. coli DNS-polimeráz-I Klenow fragmensének alkalmazásával. Az előhibridizációs, hibridizációs és mosási lépéseket 65 C°-on végeztük a gyártó utasításai szerint (DuPont, NEN Research Product). A szelektált plakkokat rekombináns pBluescriptplazmiddá alakítottuk át in vivo kivágásos eljárással, a gyártó utasításai szerint (Stratagene).
A GLRaV-2 extrém 3'-végét képviselő kiónok előállításához a dsRNS-t poli-adeniláltuk élesztő poli(A)-polimeráz segítségével. A poli(A)-farokkal ellátott dsRNS-t templátként alkalmazva, cDNS-t amplifikáltunk RT-PCR-reakcióval a következő primerek alkalmazásával: oligo(dT)18 és specifikus primerként CP-1/T7R, amely a CP-1 kiónból származott és nukleotid szekvenciája megfelel a 20. azonosító szám szerinti szekvenciának, a következők szerint:
TGCTGGAGCT TGAGGTTCTG C
Az így kapott PCR-terméket (3'-PCR) TA vektorba (Invitrogen) klónoztuk és szekvenáltuk.
Amint az 1A. ábrán bemutatjuk, egy körülbelül 15 kb nagyságú, nagy molekulatömegű dsRNS-t tudtunk ismételten azonosítani GLRaV-2 fertőzött szőlőnövényekben, de nem tudtuk azonosítani az egészséges növényekben. Továbbá számos alacsony molekulatömegű dsRNS-t tudtunk kimutatni fertőzött szövetben. A GLRaV-2 dsRNS kitermelése becslésünk szerint
5-10 ng/15 g floem szövet, amely sokkal alacsonyabb, mint a GLRaV-3 kitermelése [Hu és mtsai.: J. Phytopathology 128 1 (1990); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Csak az alacsony olvadáspontú agaróz gélből tisztított nagy molekulatömegű dsRNS-t alkalmaztuk cDNS szintézisre, klónozásra és a Lambda/ZAP II cDNSklóntár létrehozására.
A cDNS-klóntár szkrínelésére kétféle próbát alkalmaztunk. Az eredeti kiónokat Uni-Amp™ PCR-reakcióval amplifikált cDNS-hez, mint próbához történő hibridizációval azonosítottuk. Ezeknek a kiónoknak a specifitását (például TC-1) - amely kiónok méretüket tekintve 200-1,800 bp között változtak - GLRaV-2 dsRNS-hez történő Northern-hibridizációval igazoltuk, amint azt az 1B. ábrán bemutatjuk. Továbbá, több mint 40 különböző kiónt - amelyek nagysága 800-7500 bp között változott - azonosítottunk, a GLRaV-2 specifikus cDNSklónokból vagy PCR-termékekből előállított próbákkal történő hibridizációt követően. Ezt követően több mint 40 kiónt szekvenáltunk (2. ábra) mindkét szálon.
5. példa
A burokfehérje expressziója E. coli-ban és immun blottolása
Annak meghatározására, hogy az 0RF6 a GLRaV-2 burokfehérje génje, a teljes ORF6 DNS-molekulát PCR-termékből szubklónoztuk és a pMAL-C2 fúziós fehérje expressziós vektorba (New England Biolabs, Inc.) beillesztettük. A PCR reakcióban a CP-96F és CP-96R specifikus primereket alkalmaz tűk, amelyek EcoRI vagy BamHI hasítási helyet tartalmaztak a klónozás elősegítésére. A CP-96F prímért úgy terveztük meg, hogy magába foglalja a CP start kodonját és tartalmazza a 21. azonosító szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát a következők szerint:
CGGAATTCAC CATGGAGTTG ATGTCCGACA G
A CP-96R a CP stop kodonjától 3'-irányban 66 nukleotid távolságban helyezkedik el és tartalmazza a 22. azonosító szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát a következők szerint:
AGCGGATCCA TGGCAGATTC GTGCGTAGCA GTA
A burokfehérjét mint fúziós fehérjét expresszáltuk E. coli maltóz-kötő fehérjével (MBP), a „tac promoter szabályozása és a „lac represszor szupressziója alatt. Az MBPCP fúziós fehérjét 0,3 mM izopropil-p-D-tio-galaktopiranozid (IPTG) hozzáadásával indukáltuk, és egylépéses affinitás! oszlopon történő elválasztással tisztítottuk a gyártó (New England, Biolabs, Inc.) utasításai szerint. Az MBP-CP fúziós fehérjét vagy a fúziós fehérjéről lehasított burokfehérjét Western-blot segítségével vizsgáltuk GLRaV-2 specifikus antiszérummal (melyet Dr. Charles Greif (INRA, Colmar, Franciaország) volt kedves biztosítani) szemben mutatott reakcióra a Hu és munkatársai által leírt módszer alapján [Hu és mtsai.: J. Phytopathology 128 1 (1990); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] . Ezzel ellentétesen a nem-rekombináns plazmidok vagy a nem-indukált sejtek nem reagáltak a GLRaV-2 elleni antiszérummal.
6. példa
A GLRaV-2 szekvencia analízise és genomi szerveződése
A GLRaV-2 RNS-genomjának összesen 15.500 bp méretű darabját szekvenáltuk meg és letétbe helyeztük a GenBank-nál (katalógusszáma: AF039204). A teljes RNS-genom körülbelül 85 %-át legalább két különböző klón alkalmazásával határoztuk meg. A burokfehérje gén régióban a szekvenciát meghatároztuk és számos különböző, átfedő klón alkalmazásával igazoltuk. A GLRaV-2 genomi szerveződése - amelyet a 2. ábrán mutatunk be - kilenc nyílt leolvasási fázist tartalmaz (mint például ORFla, lb-8).
Az ORFla és ORFlb: A GLRaV-2 ORFla által kódolt termék N-terminális aminosav szekvenciájának az analízise két, feltételezhetően papain-szerű proteáz domént mutatott ki, amelyek jelentős mértékű hasonlóságot mutattak a BYV papain-szerű vezető proteázhoz [Agranovsky és mtsai.: Virology 198 311 (1994); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] . így ez lehetővé tette a feltételezhető GLRaV-2 proteáz katalitikus cisztein és hisztidin aminosavak előrejelzését. A BYV papain-szerű proteáz szekvenciának és a GLRaV-2 proteáz szekvenciának az összevetése során, a BYV Gly-Gly aminosavaknál (588-589. aminosavak) található hasítási hely fedésbe került a GLRaV2 megfelelő alanin-glicin (Ala-Gly) és Gly-Gly dipeptidjével (3A. ábra). Az ezen helynél bekövetkező hasítás egy vezető fehérjét és egy 234 kDa (2090 aminosav) méretű, MT és HEL doméneket magába foglaló C-terminális fragmenst eredményez. Azonban a GLRaV-2-ben a papain-szerű proteáz doméntől 5' -irányban elhelyezkedő régió nem mutatott hasonlóságot a BYV megfelelő régiójával. Továbbá variabilitás figyelhető meg a hasítható kötésnél található aminosavakban (BYV esetében Gly, GLRaV-2 esetében Ala) . A PPRO doménben a hasítási helyet alkotó aminosavban hasonló variabilitást írtak le korábban az LChV vírus esetében [Jelkmann és mtsai.: J. General Virology 78 2067 (1997); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] .
Az ORFla/lb által kódolt fehérje levezetett aminosav szekvenciájával végzett adatbázis kutatás jelentős mértékű hasonlóságot tárt fel a többi closterovírus MT, HEL és RdRP doménjeivel. A P-PRO hasítási helytől 3'-irányban található régió jelentős mértékű hasonlóságot mutatott (57,4% azonosság 266 aminosavra kiterjedő összevetésben) a BYV vélelmezett metil-transzferáz doménjével, és tartalmazta az öszszes, pozitív-szálú RNS 1 MT típusú vírusokra jellemző konzervált részegységet (3B. ábra). Az ORFla C-terminális részét helikáz doménként azonosítottuk, amelynek a szekvenciája nagy hasonlóságot mutatott (57,1% azonosság 315 aminosavra kiterjedő összevetésben) mutatott a BYV helikáz doménjével és tartalmazta a pozitív-szálú RNS vírusok Szupercsalád-I helikázra jellemző hét konzervált részegységet (3C. ábra) [Hodgman: Nature 333 22 (1988); Koonin és Dolja: Crit. Rév. in Biochem. and Mól. Bioi. 28 375 (1993); mindkét publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő] .
.:. .:. ... * j.. ··:·
Az ORFlb egy 460 aminosavból álló polipeptidet kódol, amelynek molekulatömege 52.486 Da, a leolvasási fázist váltó helytől számolva. Az RdRP-vel végzett adatbázis keresés jelentős mértékű hasonlóságot mutatott a pozitív-szálú RNS vírusok RdRP-doménjelvei. A BYV és GLRaV-2 RdRP doménjeinek összehasonlítása kimutatta az RdRP nyolc konzervált részegységének jelenlétét (3D. ábra).
Amint a 8. ábrán bemutatjuk, a GLRaV-2 RdRP kísérleti filogenetikai fája a többi closterovírushoz viszonyítva azt mutatja, hogy közeli rokonságban van a BYV, BYSV és CTV monopartite closterovírusokkal.
Closterovírusok esetében a feltételezések szerint egy +1 riboszómális leolvasási fázist váltó mechanizmus játszik szerepet az ORFlb expressziójában, mint az ORFla részvételével alkotott nagyméretű fúziós fehérje [Agranovsky és mtsai.: Virology 198 311 (1994); Karasev és mtsai.: Virology 208 511 (1995); Klaassen és mtsai.: Virology 208 99 (1995); Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996); Jelkmann és mtsai.: J. General Virology 78 2067 (1997); a felsorolt összes publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. A BYV átfedő ORFla/lb régiójában a GGGUUUA csúszós szekvenciáról és két haj tű struktúráról (szár-hurok és álcsomó) feltételezzük, hogy +1 leolvasási fázis eltolódást eredményez [Agranovsky és mtsai.: Virology 198 311 (1994); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Ezen jellegzetességek egyike sem konzerválódott a CTV és a BYSV esetében [Karasev és mtsai.: Virology 208 511 (1995); Karasev és mtsai.: Virology 221
199 (1996); mindkét publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő], amelyek esetében feltételezhetően egy terminátor kodonnál vagy egy ritkán előforduló kodonnál bekövetkező riboszómális várakozás látja el ugyanezt a funkciót. A GLRaV-2 RdRP N-terminális régiójának és a helikáz C-terminális régiójának nukleotid szekvenciáját más closterovírusok ugyanazon régióival összehasonlítva jelentős mértékű hasonlóságot fedeztünk fel a BYV, BYSV és CTV vírusokkal összevetve. Amint a 4. ábrán látható, a GLRaV-2 C-terminális helikáz végén a terminátor UAG megfelelt a BYV és BYSV terminátor UAG szekvenciájának és a CTV arginin CGG kodonj ának.
Az ORF2 egy 171 bázispárt (57 aminosavat) tartalmazó kisméretű fehérjét kódol, amelynek molekulatömege 6297 Da. Amint várható volt, a levezetett aminosav szekvencia apoláros aminosavakból álló szakaszt tartalmaz, amelyről feltételezhetjük, hogy transzmembrán hélixet alkot. A BYV, BYSV, CTV, LIYV és LChV vírusokban szintén megtalálható egy kisméretű analóg hidrofób fehérje [Agranovsky és mtsai.: J. General Virology 72 15 (1991); Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996); Pappu és mtsai.: Virology 199 35 (1994); Klaassen és mtsai.: J. General Virology 75 1525 (1994); Jelkmann és mtsai.: J. General Virology 78 2067 (1997); a felsorolt összes publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő].
Az ORF3 65.111 Da molekulatömegű, 600 aminosavból álló polipeptidet kódol, amely homológ a HSP70 sejtben megtalálható hősokk fehérjével. A HSP70 nagymértékben konzervált a closterovírusok között és feltételezhetően szerepet játszik ATP-áz aktivitásban és a chaperon aktivitáshoz szükséges fehérje-fehérje kölcsönhatásban [Agranovsky és mtsai.: J. General Virology 78 535 (1997); Agranovsky és mtsai.: Doklady Akademii Nauk. 340 416 (1995); Karasev és mtsai.: FEBS Letters 304 12 (1992); a felsorolt összes publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Amint ez az 5. ábrán látható, a GLRaV-2 teljes ORF3 szekvenciájának összevetése a BYV HSP70 homológjával nyolc konzervált részegység jelenlétét mutatta ki. A HSP70 százalékokban kifejezett hasonlósága a GLRaV-2 és - sorrendben megfeleltetve - a BYV, BYSV, CTV, LIYV és LChV vírusok között az alábbi: 47,8%, 47,2%, 38,6%, 20,9% és 17,7%.
Az 0RF4 551 aminosavat tartalmazó fehérjét kódol, amelynek molekulatömege 63.349 Da. Az ORF4 fehérje termékkel végzett adatbázis kutatás során nem azonosítottunk hasonló fehérjéket, kivéve az alább felsorolt, a closterovirusokban előforduló megfelelőit: BYV (P64), BYSV (P61), CTV (P61), LIYV (P59) és LChV (P61). Erről a fehérjéről úgy gondoljuk, hogy feltételezhetően 90 kDa hősokk fehérje. Amint ez a 9. ábrán látható, két konzervált részegységet amelyek előfordulnak a BYV vírusban [Agranovsky és mtsai.: J. General Virology 72 15 (1991); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] és amelyek előfordulnak a CTV vírusban [Pappu és mtsai.: Virology 199 35 (1994); amely publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő] - azonosítottunk a GLRaV-2 ORF4 szekvenciáj ában.
- 93 Az 0RF5 és az 0RF6 - sorrendben megfeleltetve - 24.803 Da és 21.661 Da molekülatömegű polipeptideket kódolnak. Mindkét ORF start kodonja a transzlációhoz előnyös helyzetben található. Az ORF6 szekvenciát mint a GLRaV-2 burokfehérje gént azonosítottuk más closterovírusokkal való szekvencia összehasonlítás alapján. Az ORF6 fehérje termékének kiszámított molekulatömege (21.662 Da) jó egyezést mutat a korábban SDS-PAGE alapján becsült 22-26 kDa értékkel [Zimmermann és mtsai.: J. Phytopathology 130 205 (1990); Boscia és mtsai.: Vitis 34 171 (1995); mindkét publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő].
A GLRaV-2 ORF6 szekvenciának a levezetett aminosav szekvenciájával végzett adatbázis keresés hasonlóságot mutatott a closterovírusok - BYV, BYSV, CTV, LIYV, LChV és GLRaV-3 - burokfehérjéi között. A nukleotid szinten a legmagasabb százalékos hasonlóságot a BYSV vírus burokfehérjéjével találtuk (34,8%); az aminosav szinten a legmagasabb százalékos hasonlóságot a BYV vírus (32,7%) és BYSV vírus (32,7%) burokfehérjékkel találtuk. Amint ez a 6A. ábrán látható, a GLRaV-2 burokfehérje és burokfehérje duplikátum aminosav szekvenciáinak az összevetése más closterovírusok szekvenciáival kimutatta, hogy a változatlan aminosavak (N. R. G. D.) egyaránt megtalálhatók a GLRaV-2 ORF5 és ORF6 szekvenciákban. Ezen aminosavak közül kettő (R és D) feltételezhetően szerepet játszanak a molekulák stabilizálásában sóhíd kialakításával, és az összes filament-szerű növényi vírus legnagyobb mértékben konzerválódott belső régiójának a megfelelő feltekeredését biztosítva [Dőlj a és mtsai.:
Virology 184 79 (1991); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő].
Az ORF6 burokfehérje génként történő azonosítását fúziós fehérje expresszióját követően Western-blot segítségével is igazoltuk; és a fúziós fehérje a következő részeket tartalmazta: egy 22 kDa 0RF6 CP és egy 42 kDa maltóz-kötő fehérje, amelyet transzformált E. coli termelt a fentebb, az 5. példában leírtak szerint. Amint az a 6B. ábrán látható, a GLRaV-2 burokfehérje és a burokfehérje duplikátum vélelmezett filogenetikai fája más closterovírusokkal összevetve az mutatta, hogy a GLRaV-2 közelebbi rokonságban van a levéltetvek átvihető closterovírusaival (BYV, BYSV és CTV) [Candresse: Closteroviruses and Clostero-like Elongated Plant Viruses, Encyclopedia of Virology, 242-248. oldalak, szerk.: Webster és Granoff, Academic Press, New York (1994); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő], mint a whitefly (LIYV) vagy bibortetű átvihető closterovírusokkal (LChV és GLRaV-3) [Raine és mtsai.: Canadian J. Plant Pathology 8 6 (1986); Jelkmann és mtsai.: J. General Virology 78 2067 (1997); Rosciglione és Gugerli: Phytoparasitica 17 63 (1989); Engelbrecht és Kasdorf: Phytophlactica 22 341 (1990); Cabaleiro és Segura, (1997); Petersen és Charles: Plant Pathology 45 509 (1997); a felsorolt összes publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő].
Az ORF7 és az ORF8 szekvenciák - sorrendben megfeleltetve - egy 162 aminosavat tartalmazó, 18.800 Da molekulatömegű, illetve egy 206 aminosavat tartalmazó, 23.659 Da
- 95 ►λ ΙΓ ·α. :·<
molekulatömegű polipeptidet kódolnak. AZ 0RF7 és ORF8 szekvenciákkal végzett adatbázis keresés nem mutatott ki jelentős mértékű hasonlóságot semmiféle más fehérjével. Azonban ezek a gének méretben és elhelyezkedésben hasonlók voltak azokhoz, amelyeket más closterovírusok - BYV (P20, P21) , BYSV (P18, P22) és LChV (P21, P27) - szekvenciáiban megfigyeltünk (7. ábra). Azonban nem találtunk konzervált régiókat az 0RF7 vagy ORF8 szekvenciák és az ezeknek megfelelők között a BYV, BYSV és LChV vírusok esetében.
A 3'-terminális transzlációra nem kerülő régió (3'-UTR) 216 nukleotidból áll. A nukleotid szekvencia analízis a GLRaV-2 genom végéhez közel egy hosszú oligo(A) szakaszt mutatott, amely hasonló a BYV és BYSV genomok esetében megfigyelhető szekvenciákhoz [Agranovsky és mtsai.: J. General Virology 72 15 (1991); Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996), mindkét publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. A BYV genom CCC szekvenciával végződik, a BYSV és CTV genom CC szekvenciával végződik; - sorrendben megfeleltetve egy további G vagy A nukleotiddal a BYSV kettős-szálú replikativ formájában [Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő], illetve a CTV esetében [Karasev és mtsai.: Virology 208 511 (1995); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. A GLRaV-2 genom 3 ’-terminálisán CGC szekvencia található. Újabban egy konzervált, 60 nukleotidból álló cis-elemet azonosítottak három monopartite closterovírus 3'-UTR régiójában, amely magába foglalt egy prominens konzervált szár-és-hurok struktúrát [Karasev és mtsai.: (1996)]. Amint ez a 10. ábrán látható, a GLRaV-2 3'-UTR szekvenciájának az összevetése a BYV, BYSV és CTV vírusok megfelelő régióival, ugyanazon 60 nukleotidból álló konzervált szakasz jelenlétét mutatta ki. Ezen a cis-elemen kívül nem találtunk konzervált szekvenciákat a GLRaV-2, BYV, BYSV és CTV vírusok 3'-UTR régióiban.
Az eddig tanulmányozott closterovírusok (azaz BYV, BYSV, CTV, LIYV, LChV és GLRaV-3) látható hasonlóságokat mutatnak a genomi szerveződésükben, amely magában foglalja az olyan replikációhoz társuló géneket, amelyek MT, HEL és RdRP konzervált doménekből állnak és a closterovírusok esetében egyedi, öt génből álló elrendezést mutatnak [Dolja és mtsai.: Annual Rev. Phytopathology 32 261 (1994); Agranovsky: Adv. in Virus Res. 47 119 (1996); Jelkmann és mtsai.: J. General Virology 78 2067 (1997); Ling és mtsai.: J. General Virology 79(5) 1289 (1998); a felsorolt összes publikácó teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] .
A fenti adatok egyértelműen bizonyítják, hogy a GLRaV-2 closterovírus. A GLRaV-2 genomjában két feltételezhetően papain-szerű proteázt azonosítottunk és egy autoproteolítikus hasítási eljárás előre jelezhető. Az MT, HEL és RdRP konzerválódott részegységeket tartalmazó replikációhoz kapcsolódó fehérjéket szintén azonosítottuk, amelyek filogenetikusán szoros rokonságban álltak más closterovírusok replikációhoz kapcsolódó fehérjéivel. A GLRaV-2 vírusban úgyszintén megőrződött egy egyedi gén elrendeződés, amely a következőkből áll: kisméretű hidrofób transzmembrán fehérje, HSP70 homológ, HSP90 homológ, divergálódott CP és CP. Továbbá a GLRaV-2 burokfehérje (0RF6) számított molekulatömege (21.661 Da) jó egyezésben van a többi closterovírus burokfehérjével (22-28 kDa) [Martelli és Bar-Joseph: Closteroviruses: Classification and Nomenclature of Viruses, In: Fifth Report of the International Comittee on Taxonomy of Viruses, szerk.: Francki és mtsai., SpringerVerlag Wein, New York, 345-347. oldalak, (1991); Candresse és Martelli: Genus Closterovírus'’, In: Virus Taxonomy. Report of the International Comittee on Taxonomy of Viruses, szerk.: Murphy és mtsai., Springer-Verlag, New York, 461463. oldalak, (1995); mindkét publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Két ORF a CP-szekvenciához viszonyítva 3'-irányban, méretben és elhelyezkedésben hasonló azokhoz, amelyeket a BYV genomban figyeltek meg. Továbbá, a poli(A)-farok hiánya a GLRaV-2 3'-végén úgyszintén jó egyezésben van a többi closterovírusnál tapasztaltakkal. Mint az összes többi closterovírus esetében, az ORFlb expressziója feltételezhetően egy +1 riboszómális leolvasási fázis eltolás útján történik és a 3'-proximális ORF szekvenciák expressziója valószínűleg szubgenomi RNS-ek egymásba ágyazott sorozatának kialakulása útján történik. Mivel a BYV vírus esetén a leolvasási fázis eltolásban résztvevő csúszós szekvencia, szár-hurok és álcsomó struktúrák a GLRaV-2 esetében hiányoznak, a GLRaV-2 esetében a leolvasási fázis eltolás mechanizmusa ugyanaz lehet, mint amit a CTV esetében javasoltak [Karasev és mtsai.:
Virology 208 511 (1995); amely publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő] és amit a BYSV esetében javasoltak [Karasev és mtsai.: Virology 221 199 (1996); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] .
Összességében a GLRaV-2 közelebbi rokonságban áll a BYV, BYSV és CTV monopartite closterovírusokhoz, mint a GLRaV-3 vírushoz (7. ábra) [Ling és mtsai.: J. General Virology 79 1289 (1998); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő], bár ez utóbbi hasonló levélsodródásos tüneteket okoz szőlőnövényen [Rosciglione és Gugerli: Rev. Suisse Viticult. Arboricult. Horticulture 18 207 (1986); Hu és mtsai.: J. Pytopathology 128 1 (1990); mindkét publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő].
A closterovírusok szétágazó csoportot alkotnak, bonyolult és heterogén genomi szerveződésekkel. Mostanáig a GLRaV-2 az egyetlen closterovírus, amely megfelel a BYV vírus genomi szerveződésének, a Closterovírus nemzetség típusos tagjának. Továbbá a GLRaV-2 genomi eredetű RNS körülbelül azonos méretű, mint a BYV esetében; azonban a GLRaV-2 transzmissziós vektora ismeretlen. A GLRaV-2 genomi szerveződése közelebbi rokonságot mutat a levéltetű átvihető closterovírusokkal - BYV és CTV - mint a whitefly (LIYV) vagy a bibortetű (LChV Is GLRaV-3) átvihető closterovírusokkal. így elképzelhető, hogy a GLRaV-2 átvitelét levéltetvek végzik. A GLRaV-2 vírussal végzett levéltetű átviteli kísérletek szolgáltathatnak olyan információt, amely elősegítheti módszerek kifejlesztését a GLRaV-2 további ellenőrzésére .
Összesen 15.500 nukleotidot, azaz a becsült GLRaV-2 genom több, mint 95%-t klónoztuk és szekvenáltuk. A GLRaV-2 és GLRaV-3 [Ling és mtsai.: J. General Virology 79 1289 (1998); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] az első szőlőlevél sodródással kapcsolatos closterovírusok, amelyeket csaknem teljes mértékben megszekvenáltak. A fenti adatok egyértelműen igazolják a GLRaV-2 beillesztését a Closterovirus nemzetségbe. Továbbá, a GLRaV-2 genomra vonatkozó ismeretek ennek és a rokon GLRaV vírusoknak a jobb megértéséhez vezetnek és a closterovírusok csoportjára vonatkozó alapvető ismeretekhez is hozzájárulnak.
7. példa
A GLRaV-2 CP-génjének konstrukciója növényi expressziós vektorban
GLRaV-2 fertőzött Vitis vinifera cv Pinot Noir szőlőnövényeket - amelyek egy New York állam középső részén található szőlőskertből származtak - alkalmaztunk mint vírus izolátumot, amelyből a GLRaV-2 CP-gént azonosítottuk. A szekvencia információ alapján két oligonukleotid prímért terveztünk meg. A CP-96F szensz primer (21. azonosítási szám szerinti szekvencia) a burokfehérje gén ATG iniciációs kodonjától kezdődik és a CP-96R komplementer primer (22. azonosítási szám szerinti szekvencia) a CP-gén stop kodonjától 56 nukleotid távolságra a 3'-irányban kezdődik. A
- 100 klónozás elősegítésére egy Ncol restrikciós helyet (11 bp a 21. azonosítási szám szerinti szekvenciában és 13 bp a 22. azonosítási szám szerinti szekvenciában) illesztettünk be mindkét primer kezdeténél. A GLRaV-2 burokfehérje gént GLRaV-2 fertőzött szőlőnövényből· extrahált dsRNS-ből amplifikáltuk reverz transzkriptáz polimeráz láncreakció segítségével (RT-PCR). A PCR-amplifikált CP-terméket alacsony olvadáspontú agaróz gélből tisztítottuk, Ncol-gyel emésztettük és az ugyanezen enzimmel emésztett pEPT8 növényi expressziós vektorba klónoztuk (ahogy a 11. ábrán látható). Szkrínelés után a rekombináns konstrukció irányítottságát a CP-gén belső restrikciós helyének segítségével és a CP-gén közvetlen szekvenálásával ellenőriztük. A lefordítható (szensz) teljes hosszúságú burokfehérje gén rekombináns konstrukciót - pEPT8CP-GLRaV2 - vittük tovább a következő klónozáshoz. A növényi expressziós kazettát - amely megkettőzött karfiol mozaikvírus (CaMV) 35S-enhanszert, CaMV 35Spromótert, lucerna mozaikvírus (ALMV) RNS4 5'-vezető szekvenciát, GLRaV-2 burokfehérje gént (CP-GLRaV-2) tartalmaz, valamint CaMV 35S 3'-végi transzlációra nem kerülő régiót tartalmaz, mint terminátor - az EcoRI restrikciós enzimmel hasítottuk, alacsony olvadáspontú agaróz gélből izoláltuk, és az ugyanezen restrikciós enzimmel kezelt binér vektorba - pGA482GG vagy pGA482G (a pGA482 vektor származéka, lásd például: /ín és mtsai.: Binary Vectors, In: Plant Molecular Biology Manual, A3 kötet, 1-19. oldalak, szerk.: Gelvin és Schilperot, Kinwer Academic Publishers,
Dordrecht, Hollandia, (1988), amely publikáció teljes égé
- 101 - .·. .i.·.
szében a kitanitás részeként tekintendő) - klónoztuk. Az eredményül kapott rekombináns konstrukciók a következők: pGA482GG/EPT8CP-GLRaV2 - ahogyan ezt a 11A. ábrán bemutatjuk - amely mind neomicin foszfotranszferázt (npt-II) és βglükuronidázt (GUS) tartalmaz a T-DNS belső régiójában és pGA482G/EPT8CP-GLRaV2 - ahogyan ezt a 11B. ábrán bemutatjuk - amely nem tartalmaz GUS-t. Ezeket a rekombináns konstrukciókat külön-külön elektroporáció segítségével ártalmatlanná tett avirulens Agrobacterium tumefaciens C58Z707 törzsbe vittük. A vektort tartalmazó Agrobacterium tumefaciens törzset alkalmaztuk Nicotiana benthamiana felsértett levélkorongok fertőzésére lényegében a Horsch és munkatársai által leírt eljárás szerint [Horsch és mtsai.: Science 277 1229 (1985)], amely publikáció teljes egészében a kitanítás részeként tekintendő.
8. példa
Transzgént hordozó Nicotiana benthamiana növények analízise a GLRaV-2 CP-génjével
NPT-II ELISA: Kéttős-antitest szendvics, enzim kapcsolt immunszorbens vizsgálati eljárást (DAS-ELISA) alkalmaztunk az npt-II enzim kimutatására NPT-II ELISA reagenskészlet alkalmazásával (5'-prime to 3'-prime, Inc., Boulder, Colorado) .
Közvetett ELISA: GLRaV-2 elleni poliklonális antitesteket - a GLRaV-2-t az E. coli-ban expresszált burokfehérjéből állítottunk elő - alkalmaztunk. A lemezeket az extrakciós pufferben készített homogenizált mintákkal vontuk be
- 102 (1:10, tömeg/térf.; foszfát pufferolt fiziológiás sóoldat, amely 0,05% Tween 20-t és 2% polivinil-pirrolidont tartalmaz) és éjszakán át 4 °C-on inkubáltuk. Miután 0,05% Tween 20-t tartalmazó foszfát-pufférőit fiziológiás sóoldattal mostuk (PBST), a lemezeket blokkoló pufferrel (2% BSA-t tartalmazó foszfát-pufférőit fiziológiás sóoldat) blokkoltuk és szobahőmérsékleten 1 órán keresztül inkubáltuk. Az anti-GLRaV-2 IgG-t 2 ug/ml koncentrációban adtuk hozzá PBST-vel történő mosást követően. 30 °C-on inkubáltuk 4 órán keresztül, majd a lemezeket PBST-vel mostuk és a kecskében termelt anti-nyúl alkalikus foszfatáz-IgG konjugátumot (Sigma) 1:10.000 arányú hígításban adtuk hozzá. Az abszorbancia mérést 405 nm-nél végeztük MicroELISA AutoReader segítségével. Továbbá Western-blot kísérleteket is végeztünk a Hu és munkatársai által leközölt eljárás szerint [Hu és mtsai.: J. Phytopathology 128 1 (1990); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] .
PCR-analízis: Genomi eredetű DNS-t extraháltunk feltételezhetően transzgént hordozó és transzgént nem hordozó növények leveleiből Cheung és munkatársai eljárása szerint [Cheung és mtsai.: PCR Methods and Applications 3 69 (1996) ; amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Az extrahált teljes DNS templátként szolgált a PCR reakcióhoz. A GLRaV-2 CP-génhez a CP-96F és CP-96R primereket (sorrendben megfeleltetve a 21. és a 22. azonosítási szám szerinti szekvenciák) és hasonlóképpen az npt-II 5'- és 3'-primereket alkalmaztuk a PCR analízishez.
- 103 Ά PCR-reakciót a következők szerint végeztük: 3 perc 94 °Con egy ciklusban, amelyet 30 ciklus követett az alábbiak szerint: 1 perc 94 °C-on, 1 perc 50 °C-on és 2 perc 30 másodperc 72 °C-on, amelyeket egy további extenzió követett 10 percig 72 °C-on. A PCR-terméket agaróz gélen analizáltuk.
Transzformáció után összesen 42 kanamicin rezisztenciát mutató Nicotiana benthamiana vonalat (Ro) kaptunk, amelyek esetében a levélmintákat NPT-II enzim aktivitásra vizsgáltuk. Ezek közül 37 vonal volt NPT-II pozitív ELISA szerint, amely az összes transzformánsok körülbelül 88%-a. Azonban néhány NPT-II negatív növényt is kaptunk ezen kiválasztott kanamicin rezisztens növények között. Az összes transzgént hordozó növényt üvegházban termesztve önbeporoztuk és az ezen transzgént hordozó vonalakból származó magokat további analízis céljából csíráztattuk.
A GLRaV-2 CP termelődését a transzgént hordozó növényekben közvetett ELISA segítségével mutattuk ki a beoltást megelőzően és az eredmények azt jelezték, hogy a GLRaV-2 CP-gén expressziója nem volt kimutatható az összes vizsgált transzgént hordozó növényben. Ezt az eredményt továbbá Western-blot segítségével is megerősítettük. A GLRaV-2 elleni antitest alkalmazásával a CP termelődése nem volt kimutatható a transzgént hordozó és a transzgént nem hordozó kontroll növényekben. Azonban egy, a várható méretnek megfelelő (körülbelül 22 kDa) fehérje volt kimutatható a GLRaV-2 fertőzött pozitív kontroll növényekben. Ez az eredmény egybeesett az ELISA eredményekkel. A GLRaV-2 CP-génjének jelen
-104- .:.
léte a transzgént hordozó növényekben kimutatható volt a növényi szövetekből extrahált teljes genomi eredetű DNS-ből PCR analízis segítségével (12. ábra). A várt méretnek megfelelő (653 bp) DNS-terméket húsz vizsgált transzgént hordozó vonalból amplifikáltuk, de nem amplifikáltuk transzgént nem hordozó növényekből. Az eredmények azt jelezték, hogy a GLRaV-2 CP-génje megtalálható ezen transzgént hordozó vonalakban, amelyet továbbá a Northern-blot analízis is megerősített.
9. példa
Az RÍ és R2 transzgént hordozó Nicotiana benthamiana növények rezisztensek a GLRaV-2-vel szemben
Transzgént hordozó növények beoltása: 94/970 GLRaV-2 izolátumot - amelyet eredetileg Dél-Afrikában azonosítottak és vittek át szőlőnövényről Nicotiana benthamiana-ra [Goszczynski és mtsai.: Vitis 35 133 (1996); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő] - alkalmaztunk oltóanyagként. A 94/970 izolátum CP-génjét megszekvenáltuk és azonosnak találtuk a konstrukció során alkalmazott CP-génnel. A Nicotiana benthamiana a GLRaV-2 kísérleti gazdanövénye. Az ezen létrejövő fertőzés klorózisos és esetenként nekrotikus léziókat okoz, amelyet szisztémás levélér feltisztulás követ. A levélér feltisztulás levélér nekrózishoz vezet. Végül a fertőzött növény elpusztult, a tetejétől kezdve az alsó részekig.
Az öt-hét leveles állapotban a két legfiatalabb csúcsállású levelet 94/970 GLRaV-2 izolátummal érintkeztettük.
Az oltóanyag előállításához 1,0 g GLRaV-2 fertőzött Nicotiana benthamiana levélszövetet dörzsöltünk el 5 ml foszfát pufferben (0,01 M K2HPO4, pH 7,0). A vizsgált növényeket korunddal beporoztuk és az előkészített oltóanyaggal bedörzsöltük. A nem-transzformált növényeket ezzel egyidejűleg a fentiekkel azonos módon beoltottuk. A növényeket a beoltást követően 60 napig minden második nap a tünetek kifejlődésére megfigyeltük. A rezisztens Rí transzgént hordozó növényeket továbbvittük az R2 generációba további értékelés céljából.
Ro vonalból származó transzgént hordozó utódokat szkríneltünk előzetesen GLRaV-2 elleni rezisztenciára, amelyet 94/970 GLRaV-2 izolátummal történő beoltás követett. A transzgént hordozó növények magoncait (NPT-II pozitív) és transzformálás nélküli kontroll növények magoncait oltottuk be GLRaV-2-vel. Beoltás után a vizsgált növények reakcióit három típusba soroltuk: nagymértékben fogékony (azaz tipikus tüneteket figyeltünk meg a beoltást követően kettő-négy hetes időtartamban); toleráns (azaz nem fejlődtek ki tünetek a korai fázisban és tipikus tünetek a beoltást követően négy-nyolc héttel jelentkeztek); és rezisztens (azaz a növények tünetmentesek maradtak a beoltást követően nyolc héttel). A növények reakciója alapján a rezisztens növényeket tizennégy különböző vonalból nyertük (az 1. táblázatban alább feltüntetve). Ezen tizennégy vonal egyikében sem tudtunk vírust kimutatni a növényekben ELISA segítségével 6 héttel a beoltást követően. Ezzel ellentétben GLRaV-2-t tudtunk kimutatni a tüneteket mutató növényekben közvetett • ···· · · , .:. .:. ...· ·τ
- 106 ELISA segítségével. A további hat vonalban - bár volt néhány növény, amelyekben valamilyen mértékű késleltetést figyeltünk meg a tünetek kifejlődésében - az összes beoltott növény elpusztult a beoltást követően három-nyolc héttel. Az elsődleges szkrínelési eredmények alapján három rezisztens vonalból (1., 4. és 19.) és két fogékony vonalból (12. és 13.) álló öt reprezentatív vonalat választottunk ki a további analízisekhez.
1. táblázat
vizsgált növények reakciója
vonal száma száma HS T HR
1. vonal 39 14 3 22
2. vonal 36 7 6 23
3. vonal 38 11 4 23
4. vonal 31 4 5 22
5. vonal 33 6 13 14
6. vonal 36 4 16 16
7. vonal 32 5 9 18
8. vonal 37 22 9 6
9. vonal 36 9 12 15
10. vonal 14 13 1 0
11. vonal 13 11 2 0
12. vonal 17 16 1 0
13. vonal 16 14 0 0
14. vonal 17 17 0 0
15. vonal 32 30 2 0
16. vonal 33 6 13 14
17. vonal 12 0 1 11
19. vonal 15 0 0 15
20. vonal 19 3 0 16
21. vonal 14 1 3 10
kontroll 15 15 0 0
— 107 — ··· ··· ·-♦* ··»·
Vonal száma: Magába foglalja a transzgént hordozó vonalakat és a transzformálás nélküli kontrollt;
Száma: A transzgént hordozó és a transzformálás nélküli növények darabszáma;
HS: Nagymértékben fogékony, tipikus tüneteket figyeltünk meg a beoltást követően kettő-négy héttel;
T: Toleráns, a tüneteket a beoltást követően öt-nyolc héttel figyeltük meg; és
HR: A növények tünetmentesek maradtak a beoltást követően nyolc héttel is.
Az alábbi 2. táblázat mutatja be a tünetek kifejlődését transzgént hordozó növényekben a transzgént nem hordozó kontroll növényekkel összehasonlítva az öt kiválasztott vonalban külön kísérletekben. A transzgént nem hordozó kontroll növények mind fertőzötté váltak a beoltást követően kettő-négy héttel, ami tipikus GLRaV-2 tüneteket mutatott A/ícotiana benthamiana növényeken, beleértve klorózisos és helyi léziókat, amelyeket szisztémás levélér feltisztulás és levélér nekrózis követett a levelekben. A vizsgált vonalak közül három (1., 4. és 19.) valamely mértékű rezisztenciát mutatott, ami vagy a tünetmentességben vagy a tünetek kifejlődésének a késésében nyilvánult meg. Két további vonal ~ 12. és 13. esetében - közel azonos időben fejlődtek ki tünetek, mint a nem transzformált kontroll növények esetében. Fentről lefelé, a fertőzött növények levelei fokozatosan elsárgultak, elfonnyadtak és elszáradtak és végül a teljes növény elpusztult. Függetlenül attól, hogy mikor történt a fertőzés, a végső eredmény azonos volt. A beol- 108 tást követően hat hétre az összes transzgént nem hordozó növény és a fogékony növények elpusztultak. Néhány toleráns növény is pusztulni kezdett. Ezzel ellentétben a tünetmentes növények normális módon virágot hoztak és beporzódtak, éppúgy, mint a beoltatlan egészséges kontroll növények (13. ábra).
2. táblázat
vizsgált növények reakciója
vonal száma száma HS T HR
1. vonal 19 5 6 8
4. vonal 15 9 1 5
12. vonal 16 14 2 0
13. vonal 18 13 5 0
19. vonal 13 10 0 3
transzgént nem hordozó 24 23 1 0
Vonal száma: Magába foglalja a transzgént hordozó vonalakat és a transzformálás nélküli kontrollt;
Száma: A transzgént hordozó és a transzformálás nélküli növények darabszáma;
HS: Nagymértékben fogékony, tipikus tüneteket figyeltünk meg a beoltást követően kettő-négy héttel;
T: Toleráns, a tüneteket a beoltást követően öt-nyolc héttel figyeltük meg; és — 109 — *** *“* ··» * *···
HR: A növények tünetmentesek maradtak a beoltást követően nyolc héttel is.
ELISA-t hajtottunk végre a beoltást követően hat hétre a GLRaV-2 replikáció vizsgálatára a növényekben. Feltételezhetően a CP megemelkedett szintje vírus replikációt tükrözött. Az eredmény azt mutatta, hogy az abszorbancia érték a tüneteket mutató növényekben elérte a 0,7-3,2 OD értéket, összehasonlítva a 0,10-0,13 OD értékkel a beoltást megelőzően. Ezzel ellentétben GLRaV-2-t nem tudtunk kimutatni tünetmentes növényekben, amelyek esetében az abszorbancia értéke ugyanaz, vagy közel ugyanaz volt, mint az egészséges, transzformálás nélküli kontroll növények esetében. Az adatok megerősítették, hogy a vírus replikálódott tüneteket mutató növényekben, de nem replikálódott tünetmentes növényekben. A GLRaV-2 replikációja visszaszorult a tünetmentes növényekben. Ez az eredmény arra utalt, hogy feltételezhetően a CP-közvetített ellenálló képesség mellett további mechanizmus vett részt a rezisztencia kialakításában.
Az 1., 4. és 19. transzgént hordozó rezisztens növényvonalból három R2 utódot állítottunk elő és segítségükkel megvizsgáltuk a transzmisszió stabilitását és azt, hogy a rezisztencia fennmarad-e az R2 nemzedékben. Ezeket az eredményeket alább a 3. táblázatban mutatjuk be. Az NPT-II analízis feltárta, hogy az R2 nemzedék még szegregálódik. Az R2 nemzedékben a CP expresszió továbbra is kimutathatatlan. Beoltás után az összes transzgént nem hordozó növény megfertőződött és GLRaV-2 tüneteket mutatott a leveleken 24 nappal a beoltás után. Ezzel ellentétben a beoltott transz- 110 gént hordozó R2 utódok különböző szintű ellenálló képességet mutattak, a nagymértékben fogékonytól a nagymértékben ellenállóig. A toleráns és a rezisztens sajátosság a növényekben - sorrendben megfeleltetve - mint késés jelentkezett a tünetek kifejlődésében illetve tünetmentességben nyilvánult meg. A beoltás után 6 héttel GLRaV-2 volt kimutatható a toleráns, tüneteket mutató fertőzött növényekben közvetett ELISA segítségével; de nem volt kimutatható tünetmentes növényekben. Ez az eredmény azt jelezte, hogy a vírus replikáció visszaszorult ezekben a rezisztens növényekben, amelyet Western-blot segítségével is megerősítettünk. Ezek a rezisztens növények tünetmentesek maradtak nyolc héttel a beoltást követően és normális módon virágot hoztak és beporzódtak.
3. táblázat
NPT-II vizsgált növények reakciója
vonal száma növ. száma pozitív/ negatív HS T HR
1/22 vonal 12 12/20 3 3 6
1/30 vonal 11 8/3 7 2 2
1/31 vonal 11 10/1 6 3 2
1/35 vonal 10 10/0 4 6 0
1/41 vonal 8 7/1 2 2 4
4/139 vonal 12 11/1 4 4 3
4/149 vonal 10 7/3 4 5 1
- Ill -
4/152 vonal 10 8/2 9 0 1
4/174 vonal 9 8/1 4 0 4
19/650 vonal 11 10/1 7 0 2
19/657 vonal 12 12/0 6 2 4
19/659 vonal 12 8/4 5 2 5
19/660 vonal 10 8/2 3 6 1
nem-transzfor- mált 12 0/12 12 0 0
CK ........
HS: Nagymértékben fogékony, tipikus tüneteket figyeltünk meg a beoltást követően kettő-négy héttel;
T: Toleráns, a tüneteket a beoltást követően öt-nyolc héttel figyeltük meg; és
HR: A növények tünetmentesek maradtak a beoltást követően nyolc héttel is.
10. példa
Az RNS-közvetített védelem bizonyítéka transzgént hordozó növényekben
Northern-blot analízis: Teljes RNS-t extraháltunk levelekből a beoltást megelőzően Napoli és munkatársai eljárása szerint [Napoli és mtsai.: Plant Cell 2 279 (1990); amely publikáció teljes egészében a kitanitás részének tekintendő] . Az extrahált RNS koncentrációját spektrofotométer segítségével határoztuk meg OD 260 értéknél. Körülbelül 10 μg teljes RNS-t alkalmaztunk mindegyik mintában. Az alkalmazott próba a GLRaV-2 CP-gén 3'-végi egyharmada volt, ame- 112 lyet random módon jelöltünk 32P (α-dATP)-vei, a DNS polimeráz-I Klenow fragmensét alkalmazva.
A CP-gén szekvencia 3'-végi egyharmadának megfelelő DNS-t alkalmazva egyetlen sávot tudtunk kimutatni Northern hibridizáció segítségével az 5., 12. és 13. vonalak Rí utódaiból származó fogékony növényekből extrahált RNS-ben. Csak kismértékű szignált kaptunk vagy egyáltalán nem kaptunk szignált az 1., 4. és 19. vonalak Rí utódaiból származó transzgént hordozó növények esetében. Ez az RNS nem található meg a transzformálás nélküli kontroll növényekben. A hibridizációs szignál mérete egy körülbelül 0,9 kb nagyságú nukleinsavnak felel meg, amely körülbelül megegyezik a várható mérettel (14. ábra). Az 1., 4. és 19. vonalakban az RNS expresszió állandó szintje úgyszintén alacsony volt az R2 utódokban. Ezek az adatok jelezték, hogy a 12. és 13. vonalakból származó fogékony növények magas mRNS szinttel rendelkeznek és az 1., 4. és 19. vonalakból származó transzgént hordozó növények alacsony mRNS szinttel rendelkeznek.
11. példa
Transzgént hordozó szőlőnövények transzformációja és analízise a GLRaV-2 CP-génjével
Növényanyag: A következő gyökértörzs termesztési változatokat alkalmaztuk: Couderc 3309 (3309C) {V. riparia x V. rupestris), Vitis riparia 'Gloire de Montpellier' (Gloire), Teleki 5C (5C) (V. berlandieri x V. riparia) , Millardet et De Grasset 101-14 (101-14 MGT) (V. riparia x V. rupestris)
- 113 és Richter 110 (110R) (V. rupestris χ V. berlandieri) . A Gloire kezdeti embriogén kalluszokat Mozsár és Sülé biztosította (Nővényvédelmi Kutatóintézet, Magyar Tudományos Akadémia, Budapest). Az összes többi növényanyagot a New York Állami Mezőgazdasági Kísérleti Állomás egy szőlőskertjéből kaptuk (Geneva, N.Y.). A rügyeket a csoportokból eltávolítottuk és felület-sterilizáltuk 70%-os etanolban, 1-2 percig. A rügyeket (az üvegházból és szabadföldről) 1%-os nátrium-hipokloritba vittük át 15 percre és ezután háromszor leöblítettük steril kétszer-desztillált vízzel. A porzókat aszeptikus módon kimetszettük a virágrügyekből sztereo mikroszkóp segítségével. A virágport mikroszkóp tárgylemezen egy fedőlemez alatt egy csepp acetocarmin hozzáadása mellett összezúztuk, hogy megfigyeljük a citológiai állapotát. Ezt annak érdekében végeztük, hogy meghatározzuk a legkedvezőbb fázist a kallusz indukálásra.
Szomatikus embriogenezis és regenerálás: Porzókat szélesztettünk aszeptikus körülmények között 40-50 porzó / 9 cm Petri-csésze sűrűséggel, amely MSE-táptalajt tartalmazott. A lemezeket 28 °C-on tenyésztettük, sötétben. Kalluszokat iniciáltunk és 60 nap elteltével embriókat indukáltunk és ezt követően hormon-mentes HMG-táptalajra átvittük differenciálás céljából. Ezután torpedó-fázisú embriókat vittünk át a HMG-táptalajról MGC-táptalajra, hogy elősegítsük az embrió csírázást. A tenyészeteket 26-28 °C-on tartottuk fenn, sötétben és friss táptalajra vittük át 3-4 hetes időközökben. A megnyúlt embriókat ezután gyökereztető táptalajra vittük át bébiételes üvegekbe (üvegenként 5-8
- 114 embrió). Az embriókat szövettenyésztő szobában neveltük 25 °C-on 16 órás napi fotóperiódussal (76 :mol. s) a hajtás és gyökér kialakulás indukálására. Miután a növények kifejlesztették a gyökereiket, az üvegházban talajba ültettük őket.
Transzformálás: A transzformálás során alkalmazott eljárásokat a Scorza és munkatársai által leközölt eljárásokból módosítottuk [Scorza és mtsai.: Plant Cell Rpt. 14 589 (1995); amely publikáció teljes egészében a kitanítás részének tekintendő]. Agrobacterium C58Z707 vagy LBA4404 törzsek tenyészeteit növesztettük éjszakán át LB táptalajon 28 °C-on rázó inkubátorban. A baktériumokat centrifugáltuk (5 perc, 3000-5000 ford/perc) és MS folyékony táptalajban újra szuszpendáltuk (OD 1,0 érték, A600 nm-nél) . Az embriókkal rendelkező kalluszokat 15-30 perc időtartamra a baktérium szuszpenzióba merítettük, szárazra leitattuk és HMG-táptalajba átvittük acetosyringone (100 μΜ) jelenlétében vagy anélkül. Az embriogén kalluszokat a baktériummal együtttenyésztettük 48 órán keresztül sötétben, 28 °C-on. Ezt követően a növényanyagot cefotaxim-mal (300 mg/1) és carbenicillin-nel (200 mg/1) kiegészített MS folyékony táptalajban 2-3 alkalommal mostuk. A transzgént hordozó embriók kiválasztásához az anyagot HMG-táptalajra átvittük, amely 20 mg/1 vagy 40 mg/1 kanamicint, 300 mg/1 cefotaximet és 200 mg/1 carbenicillin-t tartalmazott. Alternatív módon - az együtt-tenyésztést követően - az embriogén kalluszokat iniciációs MSE-táptalajra vittük át, amely 25 mg/1 kanamicint plusz a fentebb felsorolt antibiotikumokat tar
- 115 talmazta. Az összes növényanyagot folyamatosan sötétben, 28 °C-on inkubáltuk. A szelekciós táptalajon 3 hónapig történő növesztést követően az embriókat kanamicin nélküli HMGvagy MGC-táptalajra átvittük, hogy elősegítsük az embriók elongációját. Ezt követően az embriókat antibiotikum hiányos gyökereztető táptalajra átvittük. Transzformálás nélküli kalluszokat növesztettünk azonos táptalajon kanamicin jelenlétében és hiányában, hogy igazoljuk a kanamicin szelekciós eljárás hatékonyságát.
Felhívjuk a figyelmet arra, hogy a megelőzőekben ismertetett specifikációk, megvalósítási módok és példák csupán a találmány jobb megérthetőségét szolgálják és nem korlátozó értelemben kerültek bemutatásra. Számos más, a fentiekkel egyenértékű módosítás illetve változtatás hajtható végre, és az ilyen módosítások nem térnek el a találmányi gondolattól és a csatolt szabadalmi igénypontok által meghatározott igényelt oltalmi körön belülinek tekintendők.
- 116 SZEKVENCIALISTA
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 15500 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
TAAACATTGC GAGAGAACCC CATTAGCGTC TCCGGGGTGA ACTTGGGAAG GTCTGCCGCC
GCTCAGGTTA TTTATTTCGG
AGCGCGATCG TAAAAACGCA GCGGAGGTAG CTCCCGACAG CCGCAGCGCG GTGTGCTTTC ACAGGGGTGG TGCATGAAGC GGCGGTGACA TGCGTTTTTC AGCGTGCGTA CGAACACTAC TCACTCGCCG CCGCGTGCAC AAATTTCCAC TCGTCCTCAT CATATGAGGT ATTTGTGCGC GGAATGTGGC CTACGGTGGC GCTTGTGGCA TAGCTCTTCG GACTCTGCTT ATGTAAAATA GATCCGACAT CTTTAACCTC CCTAAAAATA TAGCGTTTGG TCGGGCGGCA TTCAATCGAG GAACGGGCGG CCGGCGGATC
CAGTTTCACG CAGCCCTTCG
ACTTCCACCG GTCAGTGTAG GGGCGTGGTC GACAAGAAAC TTTTCCGACG GTGGTTCGGA CCTGAAGAAA ATTAAAGACG GAGATTTTTC TCATCGAACT AGTTTGGCTA AATTGCACGA GGCGGATTAC GTGGCGATGC GAGTAGAGTT ATTTACCCGG CTTTTACTGT CGCCCGTTTA GCGTCTCAGG GCATGCGTTG TGGCTATTAC ACCTCTCGCA TTTTAGAAAC CTTTCCGGCC CGTAATAACG GTGAAGATTA TGCCTTCCTG TGCGATATAC CGTTAAGACG AAACGTGAAG CGTCGAGCAA CCGCGACAAA
CGTTGTATCC GCGCCAAGAG TGAAGGTGGA GTGCGTAGCT CTACGTCTGT TGGCGTTCCC ACCGCGGCGA CGTGATAATC GGCTCTTACG CTTCCGCGTA ACGGCTGCAG ATTCGTCGCG AAGCGAGTGG TGAGAAATTC TGCGTTATGT GTGTGGCGGG ATGGGCGCTG TTACTTGGCC GAGAGTCGGA TTATGCCCTC AGAAGAACTT CGGTGTCGAA ATGTTTATCA CTGTGATTAT GCATTGGCGG TGGTTCGTTC GCGGTCTTCC AGGTGGTCTT GTTACGTCGA ACCGGTAGAC ATGCGCACCG AACCGTAGAG AGAGGATAGA TGAGAAAGGT
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
- 117 ......... —. ··:
TGCGGCAGAG TTCCTAGTGG AGGTTTTTCG CATCTCCTGG TCGGCAACCT TAACGAAGTT 1140
AGGAGGAAGG TAGCTGCCGG ACTTCTACGC TTTCGCGTTG GCGGTGATAT GGATTTTCAT 1200
CGCTCGTTCT CCACCCAAGC GGGCCACCGC TTGCTGGTGT GGCGCCGCTC GAGCCGGAGC 1260
GTGTGCCTTG AACTTTACTC ACCATCTAAA AACTTTTTGC GTTACGATGT CTTGCCCTGT 1320
TCTGGAGACT ATGCAGCGAT GTTTTCTTTC GCGGCGGGCG GCCGTTTCCC TTTAGTTTTG 1380
ATGACTAGAA TTAGATACCC GAACGGGTTT TGTTACTTGG CTCACTGCCG GTACGCGTGC 1440
GCGTTTCTCT TAAGGGGTTT TGATCCGAAG CGTTTCGACA TCGGTGCTTT CCCCACCGCG 1500
GCCAAGCTCA GAAACCGTAT GGTTTCGGAG CTTGGTGAAA GAAGTTTAGG TTTGAACTTG 1560
TACGGCGCAT ATACGTCACG CGGCGTCTTT CACTGCGATT ATGACGCTAA GTTTATAAAG 1620
GATTTGCGTC TTATGTCAGC AGTTATAGCT GGAAAGGACG GGGTGGAAGA GGTGGTACCT 1680
TCTGACATAA CTCCTGCCAT GAAGCAGAAA ACGATCGAAG CCGTGTATGA TAGATTATAT 1740
GGCGGCACTG ACTCGTTGCT GAAACTGAGC ATCGAGAAAG ACTTAATCGA TTTCAAAAAT 1800
GACGTGCAGA GTTTGAAGAA AGATCGGCCG ATTGTCAAAG TGCCCTTTTA CATGTCGGAA I860
GCAACACAGA ATTCGCTGAC GCGTTTCTAC CCTCAGTTCG AACTTAAGTT TTCGCACTCC 1920
TCGCATTCAG ATCATCCCGC CGCCGCCGCT TCTAGACTGC TGGAAAATGA AACGTTAGTG 1980
CGCTTATGTG GTAATAGCGT TTCAGATATT GGAGGTTGTC CTCTTTTCCA TTTGCATTCC 2040
AAGACGCAAA GACGGGTTCA CGTATGTAGG CCTGTGTTGG ATGGCAAGGA TGCGCAGCGT 2100
CGCGTGGTGC GTGATTTGCA GTATTCCAAC GTGCGTTTGG GAGACGATGA TAAAATTTTG 2160
GAAGGGCCAC GCAATATCGA CATTTGCCAC TATCCTCTGG GCGCGTGTGA CCACGAAAGT 2220
AGTGCTATGA TGATGGTGCA GGTGTATGAC GCGTCCCTTT ATGAGATATG TGGCGCCATG 2280
ATCAAGAAGA AAAGCCGCAT AACGTACTTA ACCATGGTCA CGCCCGGCGA GTTTCTTGAC 2340
GGACGCGAAT GCGTCTACAT GGAGTCGTTA GACTGTGAGA TTGAAGTTGA TGTGCACGCG 2400
GACGTCGTAA TGTACAAATT CGGTAGTTCT TGCTATTCGC ACAAGCTTTC AATCATCAAG 2460
GACATCATGA CCACTCCGTA CTTGACACTA GGTGGTTTTC TATTCAGCGT GGAGATGTAT 2520
GAGGTGCGTA TGGGCGTGAA TTACTTCAAG ATTACGAAGT CCGAAGTATC GCCTAGCATT 2580
AGCTGCACCA AGCTCCTGAG ATACCGAAGA GCTAATAGTG ACGTGGTTAA AGTTAAACTT 2640
CCACGTTTCG ATAAGAAACG TCGCATGTGT CTGCCTGGGT ATGACACCAT ATACCTAGAT 2700
TCGAAGTTTG TGAGTCGCGT TTTCGATTAT GTCGTGTGTA ATTGCTCTGC CGTGAACTCA 2760
AAAACTTTCG AGTGGGTGTG GAGTTTCATT AAGTCTAGTA AGTCGAGGGT GATTATTAGC 2820
« - 118 - .:. . :· ···· u.’. ··;
GGTAAAATAA TTCACAAGGA TGTGAATTTG GACCTCAAGT ACGTCGAGAG TTTCGCCGCG 2880
GTTATGTTGG CCTCTGGCGT GCGCAGTAGA CTAGCGTCCG AGTACCTTGC TAAGAACCTT 2340
AGTCATTTTT CGGGAGATTG CTCCTTTATT GAAGCCACGT CTTTCGTGTT GCGTGAGAAA 3000
atcagaaaca tgactctgaa ttttaacgaa agacttttac agttagtgaa GCGCGTTGCC 3060
TTTGCGACCT TGGACGTGAG TTTTCTAGAT TTAGATTCAA CTCTTGAATC AATAACTGAT 3120
TTTGCCGAGT GTAAGGTAGC GATTGAACTC GACGAGTTGG GTTGCTTGAG AGCGGAGGCC 3180
gagaatgaaa aaatcaggaa TCTGGCGGGA GATTCGATTG cggctaaact cgcgagcgag 3240
ATAGTGGTCG ATATTGACTC TAAGCCTTCA CCGAAGCAGG TGGGTAATTC GTCATCCGAA 3300
AACGCCGATA AGCGGGAAGT TCAGAGGCCC GGTTTGCGTG GTGGTTCTAG AAACGGGGTT 3360
GTTGGGGAGT TCCTTCACTT CGTCGTGGAT TCTGCCTTGC GTCTTTTCAA ATACGCGACG 3420
GATCAACAAC GGATCAAGTC TTACGTGCGT TTCTTGGACT CGGCGGTCTC ATTCTTGGAT 3480
TACAACTACG ATAATCTATC GTTTATACTG CGAGTGCTTT CGGAAGGTTA TTCGTGTATG 3540
TTCGCGTTTT TGGCGAATCG CGGCGACTTA TCTAGTCGTG TCCGTAGCGC GGTGTGTGCT 3600
gtgaaagaag ttgctacctc ATGCGCGAAC GCGAGCGTTT CTAAAGCCAA ggttatgatt 3660
ACCTTCGCAG cggccgtgtg tgctatgatg TTTAATAGCT GCGGTTTTTC AGGCGACGGT 3720
CGGGAGTATA AATCGTATAT ACATCGTTAC ACGCAAGTAT TGTTTGACAC TATCTTTTTT 3780
GAGGACAGCA GTTACCTACC CATAGAAGTT CTGAGTTCGG CGATATGCGG TGCTATCGTC 3840
ACACTTTTCT CCTCGGGCTC GTCCATAAGT TTAAACGCCT TCTTACTTCA AATTACCAAA 3300
GGATTCTCCC TAGAGGTTGT CGTCCGGAAT GTTGTGCGAG TCACGCATGG TTTGAGCACC 3360
ACAGCGACCG ACGGCGTCAT ACGTGGGGTT TTCTCCCAAA TTGTGTCTCA CTTACTTGTT 4020
GGAAATACGG GTAATGTGGC TTACCAGTCA GCTTTCATTG CCGGGGTGGT GCCTCTTTTA 4080
GTTAAAAAGT GTGTGAGCTT AATCTTCATC TTGCGTGAAG ATACTTATTC CGGTTTTATT 4140
AAGCACGGAA TCAGTGAATT CTCTTTCCTT AGTAGTATTC TGAAGTTCTT GAAGGGTAAG 4200
CTTGTGGACG AGTTGAAATC GATTATTCAA GGGGTTTTTG ATTCCAACAA GCACGTGTTT 4260
AAAGAAGCTA CTCAGGAAGC GATTCGTACG ACGGTCATGC AAGTGCCTGT CGCTGTAGTG 4320
GATGCCCTTA AGAGCGCCGC GGGAAAAATT TATAACAATT TTACTAGTCG ACGTACCTTT 4380
GGTAAGGATG AAGGCTCCTC TAGCGACGGC GCATGTGAAG AGTA1TTCTC ATGCGACGAA 4440
GGTGAAGGTC CGGGTCTGAA AGGGGGTTCC AGCTATGGCT tctcaatttt AGCGTTCTTT 4500
TCACGCATTA TGTGGGGAGC TCGTCGGCTT ATTGTTAAGG TGAAGCATGA GTGTTTTGGG 4560
AAACTTTTTG aatttctatc gctcaagctt cacgaattca ggactcgcgt ttttgggaag 4620
- 119 AATAGAACGG ACGTGGGAGT TTACGATTTT TTGCCCACGG GCATCGTGGA AACGCTCTCA4680
TCGATAGAAG AGTGCGACCA AATTGAAGAA CTTCTCGGCG ACGACCTGAA AGGTGACAAG4740
GATGCTTCGT TGACCGATAT GAATTACTTT GAGTTCTCAG AAGACTTCTT AGCCTCTATC4800
GAGGAGCCGC CTTTCGCTGG ATTGCGAGGA GGTAGCAAGA ACATCGCGAT TTTGGCGATT4860
TTGGAATACG CGCATAATTT GTTTCGCATT GTCGCAAGCA AGTGTTCGAA ACGACCTTTA4920
TTTCTTGCTT TCGCCGAACT CTCAAGCGCC CTTATCGAGA AATTTAAGGA GGTTTTCCCT4980
CGTAAGAGCC AGCTCGTCGC TATCGTGCGC GAGTATACTC AGAGATTCCT CCGAAGTCGC5040
ATGCGTGCGT TGGGTTTGAA TAACGAGTTC GTGGTAAAAT CTTTCGCCGA TTTGCTACCC5100
GCATTAATGA AGCGGAAGGT TTCAGGTTCG TTCTTAGCTA GTGTTTATCG CCCACTTAGA5160
GGTTTCTCAT ATATGTGTGT TTCAGCGGAG CGACGTGAAA AGTTTTTTGC TCTCGTGTGT5220
TTAATCGGGT TAAGTCTCCC TTTCTTCGTG CGCATCGTAG GAGCGAAAGC GTGCGAAGAA5280
CTCGTGTCCT CAGCGCGTCG CTTTTATGAG CGTATTAAAA TTTTTCTAAG GCAGAAGTAT534 0
GTCTCTCTTT CTAATTTCTT TTGTCACTTG TTTAGCTCTG ACGTTGATGA CAGTTCCGCA5400
TCTGCAGGGT TGAAAGGTGG TGCGTCGCGA ATGACGCTCT TCCACCTTCT GGTTCGCCTT5460
GCTAGTGCCC TCCTATCGTT AGGGTGGGAA GGGTTAAAGC TACTCTTATC GCACCACAAC5520
TTGTTATTTT TGTGTTTTGC ATTGGTTGAC GATGTGAACG TCCTTATCAA AGTTCTTGGG5580
GGTCTTTCTT TCTTTGTGCA ACCAATCTTT TCCTTGTTTG CGGCGATGCT TCTACAACCG5640
GACAGGTTTG TGGAGTATTC CGAGAAACTT GTTACAGCGT TTGAATTTTT CTTAAAATGT5700
TCGCCTCGCG CGCCTGCACT ACTCAAAGGG TTTTTTGAGT GCGTGGCGAA CAGCACTGTG5760
TCAAAAACCG TTCGAAGACT TCTTCGCTGT TTCGTGAAGA TGCTCAAACT TCGAAAAGGG5820
CGAGGGTTGC GTGCGGATGG TAGGGGTCTC CATCGGCAGA AAGCCGTACC CGTCATACCT5880
TCTAATCGGG TCGTGACCGA CGGGGTTGAA AGACTTTCGG TAAAGATGCA AGGAGTTGAA5940
GCGTTGCGTA CCGAA.TTGAG AATCTTAGAA GATTTAGATT CTGCCGTGAT CGAAAAACTC6000
AATAGACGCA GAAATCGTGA CACTAATGAC GACGAATTTA CGCGCCCTGC TCATGAGCAG6060
ATGCAAGAAG TCACCACTTT CTGTTCGAAA GCCAACTCTG CTGGTTTGGC CCTGGAAAGG6120
GCAGTGCTTG TGGAAGACGC TATAAAGTCG GAGAAACTTT CTAAGACGGT TAATGAGATG6180
GTGAGGAAAG GGAGTACCAC CAGCGAAGAA GTGGCCGTCG CTTTGTCGGA CGATGAAGCC6240
GTGGAAGAAA TCTCTGTTGC TGACGAGCGA GACGATTCGC CTAAGACAGT CAGGATAAGC6300
GAATACCTAA ATAGGTTAAA CTCAAGCTTC GAATTCCCGA AGCCTATTGT TGTGGACGAC6360
- 120 -
aacaaggata CCGGGGGTCT AACGAACGCC gtgagggagt TTTATTATAT GCAAGAACTT 6420
GCTCTTTTCG AAATCCACAG CAAACTGTGC ACCTACTACG ATCAACTGCG catagtcaac 6480
TTCGATCGTT CCGTAGCACC atgcagcgaa GATGCTCAGC TGTACGTACG gaagaacggc 6540
TCAACGATAG TGCAGGGTAA AGAGGTACGT TTGCACATTA AGGATTTCCA cgatcacgat 6600
TTCCTGTTTG acggaaaaat TTCTATTAAC AAGCGGCGGC GAGGCGGAAA tgttttatat 6660
CACGACAACC TCGCGTTCTT GGCGAGTAAT TTGTTCTTAG CCGGCTACCC CTTTTCAAGG 6720
AGCTTCGTCT TCACGAATTC GTCGGTCGAT ATTCTCCTCT ACGAAGCTCC ACCCGGAGGT 6780
GGTAAGACGA CGACGCTGAT TGACTCGTTC TTGAAGGTCT TCAAGAAAGG TGAGGTTTCC 6840
ACCATGATCT TAACCGCCAA CAAAAGTTCG CAGGTTGAGA TCCTAAAGAA AGTGGAGAAG 6900
gaagtgtcta ACATTGAATG CCAGAAACGT aaagacaaaa gatctccgaa . aaagagcatt 6960
TACACCATCG ACGCTTATTT AATGCATCAC I CGTGGTTGTG . atgcagacgt ' rCTTTTCATC 7020
ΟΛΤ^ττ TCATSOTTCA TGGGGGTAGG GTACTASCTT CCATTCACTT CACOA^ 7080 CATAAAGTAA 1X3ATCTTCCG GCATACCCCG CAGATTCACT ACATTGAAAG GAACGAATTG 7148 OACAAGTCTT TGTATGGGGA TCTCGACAGG TTCGTGGACC TCCAGTGTCG GCTTTATGGT „„ aatatttcgt accgttgtcc atgggatgtg zgggcttggt «vagcacagt CTMCCCAAt; 7260
CTAATCGCCA CCGTGAAGGG TGAAAGCGAA GGTAAGAGCA GCATGCGCAT TAACGAAATT 7320
AATTCAGTCG ACGATTTAGT CCCCGACGTG GGTTCCACGT TTCTGTGTAT gcttcagtcg 7380
GAGAAGTTGG AAATCAGCAA GCACTTTATT CGCAAGGGTT tgactaaact TAACGTTCTA 7440
ACGGTGCATG aggcgcaagg TGAGACGTAT GCGCGTGTGA ACCTTGTGCG ACTTAAGTTT 7500
CAGGAGGATG AACCCTTTAA ATCTATCAGG CACATAACCG TCGCTCTTTC TCGTCACACC 7560
GACAGCTTAA CTTATAACGT CTTAGCTGCT CGTCGAGGTG ACGCCACTTG CGATGCCATC 7620
CAGAAGGCTG CGGAATTGGT GAACAAGTTT CGCGTTTTTC CTACATCTTT TGGTGGTAGT 7680
GTTATCAATC TCAACGTGAA GAAGGACGTG gaagataaca GTAGGTGCAA GGCTTCGTCG 7740
GCACCATTGA GCGTAATCAA CGACTTTTTG AACGAAGTTA ATCCCGGTAC TGCGGTGATT 7800
gattttggtg ATTTGTCCGC GGACTTCAGT . ACTGGGCCTT TTGAGTGCGG TGCCAGCGGT 7860
attgtggtoc gggacaacat ctcctccagc aacatcactg atcacgataa GCAGCCTGTT 7920 TAGCGTAGTT CGGTCGCAGG CGATTCCGCG TAGAAAACCT TCTCTACAAG AAAATTTGTA 7980 TTCGTTTGAA GCGCGGAATT ATAACTTCTC GACTTGCGAC CGTAACACAT CTQCTTCAAT ,M, ««CGGAGAG GCTAIGGOGA TGAACTGTCT TCGTCGTTGC TTCGACCTAG A1GCCTTTTC 8100 gtccctgcgt gatgatgtca ttagtatcac acgttcaggc atcgaacaat ggctosagaa 8160
- 121 -
ACGTACTCCT AGTCAGATTA AAGCATTAAT GAAGGATGTT GAATCGCCTT TGGAAATTGA 8220
CGATGAAATT TGTCGTTTTA AGTTGATGGT GAAGCGTGAC GCTAAGGTGA AGTTAGACTC 8280
TTCTTGTTTA ACTAAACACA GCGCCGCTCA AAATATCATG TTTCATCGCA AGAGCATTAA 8340
TGCTATCTTC TCTCCTATCT TTAATGAGGT GAAAAACCGA ATAATGTGCT GTCTTAAGCC 8400
TAACATAAAG TTTTTTACGG AGATGACTAA CAGGGATTTT GCTTCTGTTG TCAGCAACAT 8460
GCTTGGTCAC GACOMCTst ACCATATACG TCAACTTGAT TTCTCMAOT ACGACMffirc 8520 TOUUautCCT TTCGTOAMO CTTTTGAAGA AGTAATGTAT AAGGAACTCG GTGTTGATGA BSSO
AGAGTTGCTG GCTATCTGGA TGTGCGGCGA GCGGTTATCG ATAGCTAACA CTCTCGATGG 8640
TCAGTTGTCC TTCACGATCG AGAATCAAAG GAAGTCGGGA GCTTCGAACA CTTGGATTGG 8700
TAACTCTCTC GTCACTTTGG GTATTTTAAG TCTTTACTAC GACGTTAGAA ATTTCGAGGC 8760
GTTGTACATC TCGGGCGATG ATTCTTTAAT TTTTTCTCGC AGCGAGATTT CGAATTATGC 8820
CGACGACATA TGCACTGACA TGGGTTTTGA GACAAAATTT ATGTCCCCAA GTGTCCCGTA 8880
CTTTTGTTCT AAATTTGTTG TTATGTGTGG TCATAAGACG TTTTTTGTTC CCGACCCGTA 8940
CAAGCTTTTT GTCAAGTTGG GAGCAGTCAA AGAGGATGTT TCAATGGATT TCCTTTTCGA 9000
OACTTTTACC TCCTTTAMG ACTTAACCTC CGATCTIMC GACGAGCGCT TAATTCAAM S060 gctcgctgaa cttctggctt gg^-caaagc ggcaagacca CCTTOgcgtt
AAGTGTGATA CATTGTTTGC GTTCGAATTT CCTCTCGTTT AGCftAGTTAT ATCCTCGCOT
GAAGOGATGG CAGGTTTTTT ACACGTCGGT TAAGAAAGCG CTTCTCMG* GTGGGTGTTC
TCTCTTCGAC AOTTTCATOA CCCCTTTTGG TCAGGCTOTC ATGGTTTO ATGATGAGTA SCCCTMCTT GTGCGCAGTG TCTTTGTTCG TGACATACAC CTTOTGTGTC ACCGTGCGTT TATAATGAAT CMGTTTOC AGTTTGAATG mGTTTCTG CTOAATCTCG CGGTTTTMC
TSTGACTTTC ATTTTOOTe TTCTGGTCTT CCGCOTGATT AACTCTTTTC SCCAGAAGGG
TCACGAAGCA CCTOTTCCCG TTGTGCGTGG CGGGGOTm TCAACCCTAC TCTAGTCAAA
AGACGCGCAT ATGGTASTTT TCGGTrrGGA CTOGCACG ACATTCTCTA CGGTGTCaTGT gtacamom ogacsagttt TTTCATTCAA GCAGAMAAT TCGGCOTACA tccccactta
CCTCTATCTC TTCTCCGATT CTAACCACM GACTTTTGGT TACGAGGCCG AATCACTCAT gagtaatctg aaagttaaag gttcctttta tmmattbl aaacgtogg TKGT-recOA rrCGAGTAAC CTCGACGCGT ACCATCACCG TTTAAAACCT CATTACTCGG TCCGCTTGGT
TAAOATCGOC TCAGGCTTGA ACGAAACTCT TTCAATTGGA MCTTCGGGG GCACTGTTAA
GTCTGAGGCT CATCTGCCAG GGTTGATAGC TCTCTTTATT AACGCTGTCA TTAOTTGCGC
- 122 -
GGAGGGCGCG TTTGCGTGCA CTTGCACCGG GGTTATTTGT TCAGTACCTG CCAATTATGA 10020
TAGCGTTCAA AGGAATTTCA CTGATCAGTG TGTTTCACTC AGCGGTTATC AGTGCGTATA 10080
TATGATCAAT GAACCTTCAG CGGCTGCGCT ATCTGCGTGT AATTCGATTG GAAAGAAGTC 10140
CGCAAATTTG GCTGTTTACG ATTTCGGTGG TGGGACCTTC GACGTGTCTA TCATTTCATA 10200
CCGCAACAAT ACTTTTGTTO TGCGAGCTTC TGGAGQCCAT CTAAATCTCG GTCCAAGGGA 10260
WTOATCGT gcgtttctca cgcacctctt ctctttmca TCCCTCGAAC CTOACCTCAC 10329
TTTGGATATC TCGAATCTGA aagaatcttt ATCAAAAACG gacgcagaga TAGTTTACAC 10380
TTTGAGAGGT GTCGATGGAA gaaaagaaga CGTTAGAGTA aacaaaaaca TTCTTACGTC 10440
GGTGATGCTC CCCTACGTGA ACAGAACGCT taagatatta GAGTCAACCT TAAAATCGTA 10500
tgctaagagt ATGAATGAGA gtgcgcgagt TAAGTGCGAT TTAGTGCTGA TAGGAGGATC 10560
TTCATATCTT CCTGGCCTGG CAGACGTACT AACGAAGCAT CAGAGCGTTG ATCGTATCTT 10620
AAGAGTTTCG GATCCTCGGG CTGCCGTGGC CGTCGGTTGC GCATTATATT CTTCATGCCT 10680
CTCAGGATCT GGGGGGTTGC TACTGATCGA CTGTGCAGCT CACACTGTCG CTATAGCGGA 10740
CAGAftGTTGT CATCAAATCA TTTGCGCTCC AGCGGGGGCA CCGATCCCCT TTTCAQGAAG loeoo CATGCCTTTG TACTTAGCCA GCGTCAACAA GAACTCCCAG CGTGAAGTCG CCGTCTTTGA 108£0 AGGGGAGTAC GTTAAGTOCC CTAAGAACAG AAAGATCTGT GGAGCAAATA TAAGATTTTr 10920 TGATATAGGA GTGACGGGTG ATTCGTACGC ACCCGTTACC TTCTATATGG ATTTCTCCAT 10980 TTCAAGCGTA GGAGCCGTTT CATTCGTGGT GAGAGGTCCT GAGCGTAAGC AAGTGTCACT H040 CACTGGAACT CCAGCGTATA ACTTTTCGTC TSTCOCTCTC GGATCACGCA GTGTCCGAGA 11100
attgcatatt AGTTTAAATA ATAAAGTTTT TCTCGGTTTG CTTCTACATA gaaaggcgga 11160
TCGACGAATA CTTTTCACTA AGGATGAAGC GATTCGATAC gccgattcaa TTGATATCGC 11220
ggatgtgcta AAGGAATATA AAAGTTACGC ggccagtgcc TTACCACCAG ACGAGGATGT 11280
CGAATTACTC CTGGGAAAGT CTGTTCAAAA AGTTTTACGG GGAAGCAGAC TGGAAGAAAT 11340
ACCTCTCTAG GAGCATAGCA GCACACTCAA GTGAAATTAA AACTCTACCA GACATTCGAT 11400
TGTACGGCGG TAGGGTTGTA AAGAAGTCCG AATTCGAATC AGCACTTCCT AATTCTTTTG 11460
AACAGGAATT AGGACTGTTC atactgagcg AACGGGAAGT GGGATGGAGC AAATTATGCG 11520
gaataacggt GGAAGAAGCA GCATACGATC TTACGAATCC CAAGGCTTAT AAATTCACTG 11580
CCGAGACATG TAGCCCGGAT GTAAAAGGTG aaggacaaaa ATACTCTATG GAAGACGTGA 11640
TGAATTTCAT GCGTTTATCA aatctggatg TTAACGACAA GATGCTGACG GAACAGTGTT 11700
GGTCGCTGTC CAATTCATGC GGTGAATTGA TCAACCCAGA CGACAAAGGG CGATTCGTGG n7eo
123 CTCTCACCTT TAAGGACAGA GACACAGCTG ATGACACGGG TGCCGCCAAC GTGGAATGTC 11820
GCGTGGGCGA CTATCTAGTT TACGCTATGT CCCTGTTTGA GCAGAGGACC CAAAAATCGC 11880
AGTCTGGCAA CATCTCTCTG TACGAAAAGT ACTGTGAATA CATCAGGACC TACTTAGGGA 11940
GTACAGACCT GTTCTTCACA GCGCCGGACA GGATTCCGTT ACTTACGGGC ATCCTATACG 12000
ATTTTTGTAA GGAATACAAC GTTTTCTACT CGTCATATAA GAGAAACGTC GATAATTTCA 12060
GATTCTTCTT GGCGAATTAT ATGCCTTTGA TATCTGACGT CTTTGTCTTC CAGTGGGTAA 12120
AACCCGCGCC GGATGTTCGG CTGCTTTTTG AGTTAAGTGC AGCGGAACTA ACGCTGGAGG 12180
TTCCCACACT GAGTTTGATA GATTCTCAAG TTGTGGTAGG TCATATCTTA AGATACGTAG 12240
AATCCTACAC ATCAGATCCA GCCATCGACG CGTTAGAAGA CAAACTGGAA GCGATACTGA 12300
AAAGTAGCAA TCCCCGTCTA TCGACAGCGC AACTATGGGT TGGTTTCTTT TGTTACTATG 12360
GTGAGTTTCG TACGGCTCAA AGTAGAGTAG TGCAAAGACC AGGCGTATAC AAAACACCTG 12420
ACTCAGTGGG TGGATTTGAA ATAAACATGA AAGATGTTGA GAAATTCTTC GATAAACTTC 12480
AGAGAGAATT GCCTAATGTA TCTTTGCGGC GTCAGTTTAA CGGAGCTAGA GCGCATGAGG 12540
CTTTCAAAAT ATTTAAAAAC GGAAATATAA GTTTCAGACC TATATCGCGT TTAAACGTGC 12600
CTAGAGAGTT CTGGTATCTG AACATAGACT ACTTCAGGCA CGCGAATAGG TCCGGGTTAA 12660
CCGAAGAAGA AATACTCATC CTAAACAACA TAAGCGTTGA TGTTAGGAAG TTATGCGCTG 12720
AGAGAGCGTG CAATACCCTA CCTAGCGCGA AGCGCTTTAG TAAAAATCAT AAGAGTAATA 12780
TACAATCATC ACGCCAAGAG CGGAGGATTA AAGACCCATT GGTAGTCCTG AAAGACACTT 12840
TATATGAGTT CCAACACAAG CGTGCCGGTT GGGGGTCTCG AAGCACTCGA GACCTCGGGA 12900
GTCGTGCTGA CCACGCGAAA GGAAGCGGTT GATAAGTTTT TTAATGAACT AAAAAACGAA 12960
AA.TTACTCAT CAGTTGACAG CAGCCGATTA AGCGATTCGG AAGTAAAAGA AGTGTTAGAG 13020
AAAAGTAAAG AAAGTTTCAA AAGCGAACTG GCCTCCACTG ACGAGCACTT CGTCTACCAC 13080
ΑΤΤΑΤΑΤΤΤΤ TCTTAATCCG ATGTGCTAAG ATATCGACAA GTGAAAAGGT GAAGTACGTT 13140
GGTAGTCATA CGTACGTGGT CGACGGAAAA ACGTACACCG TTCTTGACGC TTGGGTATTC 13200
AACATGATGA AAAGTCTCAC GAAGAAGTAC AAACGAGTGA ATGGTCTGCG TGCGTTCTGT 13260
TGCGCGTGCG AAGATCTATA TCTAACCGTC GCACCAATAA TGTCAGAACG CTTTAAGACT 13320
AAAGCCGTAG GGATGAAAGG TTTGCCTGTT GGAAAGGAAT ACTTAGGCGC CGACTTTCTT 13380
TCGGGAACTA GCAAACTGAT GAGCGATCAC GACAGGGCGG TCTCCATCGT TGCAGCGAAA 13440
AACGCTGTCG ATCGTAGCGC TTTCACGGGT GGGGAGAGAA AGATAGTTAG TTTGTATGAT 13500
CTAGGGAGGT ACTAAGCACG GTGTGCTATA GTGCGTGCTA ΤΆΑΤΑΑΤΑΑΑ CACTAGTGCT 13560
-124- -ί. .:.
TAAGTCGCGC AGAAGAAAAC GCTATGGAGT TGATGTCCGA CAGCAACCTT AGCAACCTGG 13620 TGATAACCGA CGCCTCTAGT CTAAATGGTG TCGACAAGAA GCTTTTATCT GCTGAAGTTG 13680 AAAAAATGTT GGTGCAGAAA GGGGCTCCTA ACGAGGGTAT AGAAGTGGTG TTCGGTCTAC 13740 TCCTTTACGC ACTCGCGGCA AGAACCACGT CTCCTAAGGT TCAGCGCGCA GATTCAGACG 13800 TTATATTTTC AAATAGTTTC GGAGAGAGGA ATGTGGTAGT AACAGAGGGT GACCTTAAGA 13860 AGGTACTCGA CGGGTGTGCG CCTCTCACTA GGTTCACTAA TAAACTTAGA ACGTTCGGTC 13920 GTACTTTCAC TGAGGCTTAC GTTGACTTTT GTATCGCGTA TAAGCACAAA TTACCCCAAC 13980 TCAACGCCGC GGCGGAATTG GGGATTCCAG CTGAAGATTC GTACTTAGCT GCAGATTTTC 14040 TGGGTACTTG CCCGAAGCTC TCTGAATTAC AGCAAAGTAG GAAGATGTTC GCGAGTATGT 14100 ACGCTCTAAA AACTGAAGGT GGAGTGGTAA ATACACCAGT GAGCAATCTG CGTCAGCTAG 14160 GTAGAAGGGA AGTTATGTAA TGGAAGATTA CGAAGAAAAA TCCGAATCGC TCATACTGCT 14220 ACGCACGAAT CTGAACACTA TGCTTTTAGT GGTCAAGTCC GATGCTAGTG TAGAGCTGCC 14280 TAAACTACTA ATIrGCGŰTT ACTTACGAGT GTCAGGACGT GGGGAGGTGA CGTGTTGCAA 14340 CCGTGAGGAA TTAACAAGAG ATTTTGAGGG CAATCATCAT ACGGTGATCC GTTCTAGAAT 14400 CATACAATAT GACAGCGAGT CTGCTTTTGA GGAATTCAAC AACTCTGATT GCGTAGTGAA 14460 GTTTTTCCTA GAGACTGGTA GTGTCTTTTG GTTTTTCCTT CGAAGTGAAA CCAAAGGTAG 14520 AGCGGTGCGA CATTTGCGCA CCTTCTTCGA AGCTAACAAT TTCTTCTTTG GATCGCATTG 14 580
CGGTACCATG GAGTATTGTT TGAAGCAGGT ACTAACTGAA ACTGAATCTA TAATCGATTC 14640 TTTTTGCGAA GAAAGAAATC GTTAAGATGA GGGTTATAGT GTCTCCTTAT GAAGCTGAAG 14700 ACATTCTGAA AAGATCGACT GACATGTTAC GAAACATAGA CAGTGGGGTC TTGAGCACTA 14760 AAGAATGTAT CAAGGCATTC TCGACGATAA CGCGAGACCT ACATTGTGCG AAGGCTTCCT 14820 ACCAGTGGGG TGTTGACACT GGGTTATATC AGCGTAATTG CGCTGAAAAA CGTTTAATTG 14880 ACACGGTGGA GTCAAACATA CGGTTGGCTC AACCTCTCGT GCGTGAAAAA GTGGCGGTTC 14940 ATTTTTGTAA GGATGAACCA AAAGAGCTAG TAGCATTCAT CACGCGAAAG TACGTGGAAC 15000 TCACGGGCGT GGGAGTGAGA GAAGCGGTGA AGAGGGAAAT GCGCTCTCTT ACCAAAACAG 15060 TTTTAAATAA AATGTCTTTG GAAATGGCGT TTTACATGTC ACCACGAGCG TGGAAAAACG 15120 CTGAATGGTT AGAACTAAAA TTTTCACCTG TGAAAATCTT TAGAGATCTG CTATTAGACG 15180 TGGAAACGCT CAACGAATTG TGCGCCGAAG ATGATGTTCA CGTCGACAAA GTAAATGAGA 15240 ATGGGGACGA AAATCACGAC CTCGAACTCC AAGACGAATG TTAAACATTG GTTAAGTTTA 15300
- 125 ACGAAAATGA TTAGTAAATA ATAAATCGAA CGTGGGTGTA TCTACCTGAC GTATCAACTT 15360
AAGCTGTTAC TGAGTAATTA AACCAACAAG TGTTGGTGTA ATGTGTATGT TGATGTAGAG 15420
AAAAATCCGT TTGTAGAACG GTGTTTTTCT CTTCTTTATT TTTAAAAAAA AAATAAAAAA 15480
ΑΑΆΑΑΑΑΑΑΑ AAGCGGCCGC 15500
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 7920 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ACATTGCGAG AGAACCCCAT TAGCGTCTCC GGGGTGAACT TGGGAAGGTC TGCCGCCGCT 60
CAGGTTATTT ATTTCGGCAG TTTCACGCAG CCCTTCGCGT TGTATCCGCG CCAAGAGAGC 120
GCGATCGTAA AAACGCAACT TCCACCGGTC AGTGTAGTGA AGGTGGAGTG CGTAGCTGCG 180
GAGGTAGCTC CCGACAGGGG CGTGGTCGAC AAGAAACCTA CGTCTGTTGG CGTTCCCCCG 240
CAGCGCGGTG TGCTTTCTTT TCCGACGGTG GTTCGGAACC GCGGCGACGT GATAATCACA 300
GGGGTGGTGC ATGAAGCCCT GAAGAAAATT AAAGACGGGC TCTTACGCTT CCGCGTAGGC 360
UU IXiACAi G C GTTTTTCGAG ATTTTTUIUA TCGAACTACG GCTGCAGATT CGTCGCGAGC 420
GTGCGTACGA ACACTACAGT TTGGCTAAAT TGCACGAAAG CGAGTGGTGA GAAATTCTCA 480
CTCGCCGCCG CGTGCACGGC GGATTACGTG GCGATGCTGC GTTATGTGTG TGGCGGGAAA 540
TTTCCACTCG TCCTCATGAG TAGAGTTATT TACCCGGATG GGCGCTGTTA CTTGGCCCAT 600
ATGAGGTATT TGTGCGCCTT TTACTGTCGC CCGTTTAGAG AGTCGGATTA TGCCCTCGGA 660
ATGTGGCCTA CGGTGGCGCG TCTCAGGGCA TGCGTTGAGA AGAACTTCGG TGTCGAAGCT 720
TGTGGCATAG CTCTTCGTGG CTATTACACC TCTCGCAATG TTTATCACTG TGATTATGAC 780
TCTGCTTATG ΤΆΑΑΑΤΑΤΤΤ TAGAAACCTT TCCGGCCGCA TTGGCGGTGG TTCGTTCGAT 840
CCGACATCTT TAACCTCCGT AATAACGGTG AAGATTAGCG GTCTTCCAGG TGGTCTTCCT 900
AAAAATATAG CGTTTGGTGC CTTCCTGTGC GATATACGTT ACGTCGAACC GGTAGACTCG 960
GGCGGCATTC AATCGAGCGT TAAGACGAAA CGTGAAGATG CGCACCGAAC CGTAGAGGAA 1020
CGGGCGGCCG GCGGATCCGT CGAGCAACCG CGACAAAAGA GGATAGATGA GAAAGGTTGC
1080
- 126 -
GGCAGAGTTC CTAGTGGAGG TTTTTCGCAT CTCCTGGTCG GCAACCTTAA CGAAGTTAGG aggaaggtag ctgccggact tctacgcttt cgcgttggcg gtgatatgga ttttcatcgc TCGTTCTCCA CCCAAGCGGG CCACCGCTTG CTGGTGTGGC GCCGCTCGAG CCGGAGCGTG TGCCTTGAAC TTTACTCACC ATCTAAAAAC TTTTTGCGTT ACGATGTCTT GCCCTGTTCT GGAGACTATG CAGCGATGTT ttctttcgcg gcgggcggcc gtttcccttt agttttgatc ACTAGAATTA GATACCCGAA CGGGTTTTGT TACTTGGCTC ACTGCCGGTA CGCGTGCGCG TTTCTCTTAA GGGGTTTTGA TCCGAAGCGT TTCGACATCG GTGCTTTCCC CACCGCGGCC aagctcagaa accgtatggt ttcggagctt GGTGAAAGAA gtttaggttt GAACTTGTAC ggcgcatata cgtcacgcgg cgtctttcac tgcgattatg ACGCTAAGTT TATAAAGGAT TTGCGTCTTA tgtcagcagt tatagctgga aaggacgggg tggaagaggt ggtaccttct GACATAACTC CTGCCATGAA GCAGAAAACG ATCGAAGCCG TGTATGATAG ATTATATGGC GGCACTGACT CGTTGCTGAA ACTGAGCATC GAGAAAGACT TAATCGATTT CAAAAATGAC gtgcagagtt tgaagaaaga tcggccgatt gtcaaagtgc ccttttacat gtcggaagca acacagaatt cgctgacgcg tttctaccct cagttcgaac ttaagttttc gcactcctcg CATTCAGATC ATCCCGCCGC CGCCGCTTCT AGACTGCTGG AAAATGAAAC GTTAGTGCGC TTATGTGGTA ATAGCGTTTC AGATATTGGA GGTTGTCCTC TTTTCCATTT GCATTCCAAG acgcaaagac gggttcacgt atgtaggcct gtgttggatg gcaaggatgc gcagcgtcgc GTGGTGCGTG ATTTGCAGTA TTCCAACGTG CGTTTGGGAG ACGATGATAA AATTTTGGAA gggccacgca atatcgacat ttgccactat cctctgggcg cgtgtgacca cgaaagtagt GCTATGATGA TGGTGCAGGT GTATGACGCG TCCCTTTATG AGATATGTGG CGCCATGATC AAGAAGAAAA gccgcataac gtacitaacc atggtcacgc ccggcgagtt tcttcacgga CGCGAATGCG TCTACATGGA GTCGTTAGAC TGTGAGATTG AAGTTGATGT GCACGCGGAC GTCGTAATGT acaaattcgg tagttcttgc tattcgcaca agctttcaat catcaaggac atcatgacca ctccgtactt gacactaggt ggttttctat tcagcgtgga gatgtatgag gtgcgtatgg gcgtgaatta cttcaagatt acgaagtccg aagtatcgcc tagcattagc TGCACCAAGC TCCTGAGATA CCGAAGAGCT AATAGTGACG TGGTTAAAGT TAAACTTCCA CGTTTCGATA AGAAACGTCG CATGTGTCTG CCTGGGTATG ACACCATATA CCTAGATTCG aagtttgtga gtcgcgtttt cgattatgtc gtgtgtaatt gctctgccgt GAACTCAAAA
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
I860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
2280
2340
2400
2460
2520
2580
2640
2700
2760
- 127 -
ACTTTCGAGT GGGTGTGGAG tttcattaag TCTAGTAAGT CGAGGGTGAT TATTAGCGGT 2820
aaaataattc ACAAGGATGT GAATTTGGAC ctcaagtacg TCGAGAGTTT CGCCGCGGTT 2880
ATGTTGGCCT CTGGCGTGCG CAGTAGACTA GCGTCCGAGT ACCTTGCTAA gaaccttagt 2940
CATTTTTCGG GAGATTGCTC CTTTATTGAA GCCACGTCTT TCGTGTTGCG TGAGAAAATC 3000
agaaacatga ctctgaattt taacgaaaga cttttacagt TAGTGAAGCG cgttgccttt 3060
GCGACCTTGG ACGTGAGTTT TCTAGATTTA GATTCAACTC TTGAATCAAT AACTGATTTT 3120
gccgagtgta AGGTAGCGAT TGAACTCGAC GAGTTGGGTT GCTTGAGAGC GGAGGCCGAG 3180
AATGAAAAAA TCAGGAATCT GGCGGGAGAT TCGATTGCGG CTAAACTCGC GAGCGAGATA 3240
GTGGTCGATA TTGACTCTAA GCCTTCACCG AAGCAGGTGG GTAATTCGTC ATCCGAAAAC 3300
GCCGATAAGC GGGAAGTTCA GAGGCCCGGT TTGCGTGGTG GTTCTAGAAA CGGGGTTGTT 3360
GGGGAGTTCC TTCACTTCGT CGTGGATTCT GCCTTGCGTC TTTTCAAATA CGCGACGGAT 3420
CAACAACGGA TCAAGTCTTA CGTGCGTTTC TTGGACTCGG CGGTCTCATT CTTGGATTAC 3480
aactacgata atctatcgtt tatactgcga gtgctttcgg aaggttattc gtgtatgttc 3540
GCGTTTTTGG CGAATCGCGG CGACTTATCT AGTCGTGTCC GTAGCGCGGT GTGTGCTGTG 3600
aaagaagttg ctacctcatg cgcgaacgcg agcgtttcta aagccaaggt tatgattacc 3660
TTCGCAGCGG CCGTGTGTGC TATGATGTTT AATAGCTGCG GTTTTTCAGG CGACGGTCGG 3720
gagtataaat cgtatataca tcgttacacg caagtattgt ttgacactat cttttttgag 3780
gacagcagtt acctacccat agaagttctg agttcggcga tatgcggtgc tatcgtcaca 3840
cttttctcct cgggctcgtc cataagttta aacgccttct tacttcaaat taccaaagga 3900
TTCTCCCTAG AGGTTGTCGT CCGGAATGTT GTGCGAGTCA CGCATGGTTT GAGCACCACA 3960
GCGACCGACG GCGTCATACG TGGGGTTTTC TCCCAAATTG TGTCTCACTT ACTTGTTGGA 4020
aatacgggta atgtggctta ccagtcagct TTCATTGCCG gggtggtgcc tcttttagtt 4080
aaaaagtgtg tgagcttaat cttcatcttg cgtgaagata cttattccgg TTTTATTAAG 4140
cacggaatca gtgaattctc tttccttagt astattctga agttcttgaa gggtaagctt 4200
gtggacgagt tgaaatcgat tattcaaggg gtttttgatt ccaacaagca cgtgtttaaa 4260
gaagctactc aggaagcgat tcgtacgacg gtcatgcaag TGCCTGTCGC rGTAGTGGAT 4320
GCCCTTAAGA GCGCCGCGGG ΆΑΑΑΑΤΤΤΑΤ AACAATTTTA CTAGTCGACG TACCTTTGGT 4380
aaggatgaag gctcctctag cgacggcgca tgtgaagagt atttctcatg CGACGAAGGT 4440
GAAGGTCCGG GTCTGAAAGG GGGTTCCAGC TATGGCTTCT CAATTTTAGC GTTCTTTTCA 4500
128 CGCATTATGT GGGGAGCTCG TCGGCTTATT GTTAAGGTGA AGCATGAGTG TTTTGGGAAA4560
CTTTTTGAAT TTCTATCGCT CAAGCTTCAC GAATTCAGGA CTCGCGTTTT TGGGAAGAAT4620
AGAACGGACG TGGGAGTTTA CGATTTTTTG CCCACGGGCA TCGTGGAAAC GCTCTCATCG4680
ATAGAAGAGT GCGACCAAAT TGAAGAACTT CTCGGCGACG ACCTGAAAGG TGACAAGGAT 4740
GCTTCGTTGA CCGATATGAA TTACTTTGAG TTCTCAGAAG ACTTCTTAGC CTCTATCGAG 4800
GAGCCGCCTT TCGCTGGATT GCGAGGAGGT AGCAAGAACA TCGCGATTTT GGCGATTTTG 4860
GAATACGCGC ATAATTTGTT TCGCATTGTC GCAAGCAAGT GTTCGAAACG ACCTTTATTT 4920
CTTGCTTTCG CCGAACTCTC AAGCGCCCTT ATCGAGAAAT TTAAGGAGGT TTTCCCTCGT 4980
aagagccagc TCGTCGCTAT CGTGCGCGAG TATACTCAGA GATTCCTCCG AAGTCGCATG 5040
CGTGCGTTGG GTTTGAATAA CGAGTTCGTG GTAAAATCTT TCGCCGATTT GCTACCCGCA 5100
TTAATGAAGC GGAAGGTTTC AGGTTCGTTC TTAGCTAGTG TTTATCGCCC ACTTAGAGGT 5160
TTCTCATATA TGTGTGTTTC AGCGGAGCGA CGTGAAAAGT TTTTTGCTCT CGTGTGTTTA 5220
atcgggttaa gtctcccttt cttcgtgcgc ATCGTAGGAG cgaaagcgtg cgaagaactc 5280
GTGTCCTCAG CGCGTCGCTT TTATGAGCGT ATTAAAATTT TTCTAAGGCA GAAGTATGTC 5340
TCTCTTTCTA ATTTCTTTTG TCACTTGTTT AGCTCTGACG TTGATGACAG TTCCGCATCT 5400
GCAGGGTTGA AAGGTGGTGC GTCGCGAATG ACGCTCTTCC ACCTTCTGGT TCGCCTTGCT 5460
AGTGCCCTCC TATCGTTAGG GTGGGAAGGG TTAAAGCTAC TCTTATCGCA CCACAACTTG 5520
TTATTTTTGT GTTTTGCATT GGTTGACGAT GTGAACGTCC TTATCAAAGT TCTTGGGGGT 5580
CTTTCTTTCT TTGTGCAACC AATCTTTTCC TTGTTTGCGG CGATGCTTCT ACAACCGGAC 5640
AGGTTTGTGG AGTATTCCGA GAAACTTGTT ACAGCGTTTG AATTTTTCTT AAAATGTTCG 5700
CCTCGCGCGC CTGCACTACT CAAAGGGTTT TTTGAGTGCG TGGCGAACAG CACTGTGTCA 5760
aaaaccgttc gaagacttct tcgctgtttc GTGAAGATGC tcaaacttcg aaaagggcga 5820
GGGTTGCGTG CGGATGGTAG GGGTCTCCAT CGGCAGAAAG CCGTACCCGT CATACCTTCT 5880
AATCGGGTCG TGACCGACGG GGTTGAAAGA CTTTCGGTAA AGATGCAAGG AGTTGAAGCG 5940
TTGCGTACCG AATTGAGAAT CTTAGAAGAT TTAGATTCTG CCGTGATCGA AAAACTCAAT 6000
AGACGCAGAA ATCGTGACAC TAATGACGAC GAATTTACGC GCCCTGCTCA TGAGCAGATG 6060
CAAGAAGTCA CCACTTTCTG TTCGAAAGCC AACTCTGCTG GTTTGGCCCT GGAAAGGGCA 6120
GTGCTTGTGG AAGACGCTAT AAAGTCGGAG AAACTTTCTA AGACGGTTAA TGAGATGGTG 6180
- 129 aggaaaggga gtaccaccag cgaagaagtg gccgtcgctt tgtcggacga TGAAGCCGTG GAAGAAATCT CTGTTGCTGA CGAGCGAGAC GATTCGCCTA AGACAGTCAG GATAAGCGAA TACCTAAATA GGTTAAACTC AAGCTTCGAA TTCCCGAAGC CTATTGTTGT GGACGACAAC AAGGATACCG GGGGTCTAAC GAACGCCGTG AGGGAGTTTT ATTATATGCA AGAACTTGCT CTTTTCGAAA TCCACAGCAA ACTGTGCACC TACTACGATC AACTGCGCAT AGTCAACTTC GATCGTTCCG TAGCACCATG CAGCGAAGAT GCTCAGCTGT ACGTACGGAA GAACGGCTCA ACGATAGTGC AGGGTAAAGA GGTACGTTTG CACATTAAGG ATTTCCACGA TCACGATTTC CTGTTTGACG GAAAAATTTC TATTAACAAG CGGCGGCGAG GCGGAAATGT TTTATATCAC GACAACCTCG CGTTCTTGGC GAGTAATTTG TTCTTAGCCG GCTACCCCTT TTCAAGGAGC TTCGTCTTCA CGAATTCGTC GGTCGATATT CTCCTCTACG AAGCTCCACC CGGAGGTGGT AAGACGACGA CGCTGATTGA CTCGTTCTTG AAGGTCTTCA AGAAAGGTGA GGTTTCCACC ATGATCTTAA CCGCCAACAA AAGTTCGCAG GTTGAGATCC TAAAGAAAGT GGAGAAGGAA GTGTCTAACA TTGAATGCCA GAAACGTAAA GACAAAAGAT CTCCGAAAAA GAGCATTTAC ACCATCGACG CTTATTTAAT GCATCACCGT GGTTGTGATG CAGACGTTCT TTTCATCGAT GAGTGTTTCA tggttcatgc gggtagcgta ctagcttgca TTGAGTTCAC GAGGTGTCAT aaagtaatga tcttcgggga tagccggcag attcactaca ttgaaaggaa cgaattggac AAGTGTTTGT ATGGGGATCT CGACAGGTTC GTGGACCTGC AGTGTCGGGT TTATGGTAAT ATTTCGTACC GTTGTCCATG ggatgtgtgc gcttggttaa gcacagtgta tggcaaccta ATCGCCACCG TGAAGGGTGA AAGCGAAGGT AAGAGCAGCA TGCGCATTAA CGAAATTAAT TCAGTCGACG ATTTAGTCCC CGACGTGGGT TCCACGTTTC TCTGTATGCT TCAGTCGGAG aagttggaaa tcagcaagca ctttattcgc aagggtttga ctaaacttaa cgttctaacg gtgcatgagg cgcaaggtga gacgtatgcg cgtgtgaacc ttgtgcgact taagtttcag gaggatgaac cctttaaatc tatcaggcac ataaccgtcg ctctttctcg tcacaccgac AGCTTAACTT ATAACGTCTT AGCTGCTCGT CGAGGTGACG CCACTTGCGA TGCCATCCAG AAGGCTGCGG AATTGGTGAA CAAGTTTCGC gtttttccta CATCTTTTGG TGGTAGTGTT ATCAATCTCA ACGTGAAGAA GGACGTGGAA GATAACAGTA GGTGCAAGGC TTCGTCGGCA CCATTGAGCG TAATCAACGA CTTTTTGAAC GAAGTTAATC CCGGTACTGC GGTGATTGAT TTTGGTGATT TGTCCGCGGA CTTCAGTACT GGGCCTTTTG AGTGCGGTGC CAGCGGTATT gtggtgcggg acaacatctc ctccagcaac atcactgatc ACGATAAGCA GCGTGTTTAG
6240
6300
6360
6420
6480
6540
6600
6660
6720
6780
6840
6900
6960
7020
7080
7140
7200
7260
7320
7380
7440
7500
7560
7620
7680
7740
7800
7860
7920
- 130 Ά 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 2639 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Thr Leu Arg Glu Asn Pro Ile 1 5
Ser Ala Ala Alá Gin Val Ile 20
Alá Leu Tyr Pro Arg Gin Glu 35
Pro Val Ser Val Val Lys Val 50 55
Asp Arg Gly Val Val Asp Lys 65 70
Gin Arg Gly Val Leu Ser Phe 85
Val Ile Ile Thr Gly Val Val 100
Gly Leu Leu Arg Phe Arg Val 115
Phe Ser Ser Asn Tyr Gly Cys 130 135
Thr Thr Val Trp Leu Asn Cys 145 150
Leu Ala Ala Ala Cys Thr Alá 165
Cys Gly Gly Lys Phe Pro Leu 180
Asp Gly Arg Cys Tyr Leu Alá 195
Ser Val Ser Gly Val Asn Leu Gly Arg 1015
Tyr Phe Gly Ser Phe Thr Gin Pro Phe 2530
Ser Alá Ile Val Lys Thr Gin Leu Pro 4045
Glu Cys Val Ala Ala Glu Val Alá Pro 60
Lys Pro Thr Ser Val Gly Val Pro Pro 7580
Pro Thr Val Val Arg Asn Arg Gly Asp 9095
His Glu Alá Leu Lys Lys Ile Lys Asp 105110
Gly Gly Asp Met Arg Phe Ser Arg Phe 120125
Arg Phe Val Alá Ser Val Arg Thr Asn 140
Thr Lys Alá Ser Gly Glu Lys Phe Ser 155160
Asp Tyr Val Ala Met Leu Arg Tyr Val 170175
Val Leu Met Ser Arg Val Ile Tyr Pro 185iga
His Met Arg Tyr Leu Cys Alá Phe Tyr 200205
Cys Arg Pro Phe Arg Glu Ser Asp
210 215
Ala Leu Gly Met Trp Pro Thr 220
- 131 .........· ·τ
Val Ala Arg Leu Arg Ala Cys Val Glu Lys Asn Phe Gly Val Glu Ala 225 230 235240
Cys Gly lie Ala Leu Arg Gly Tyr Tyr Thr Ser Arg Asn Val TyrHis
245 250255
Cys Asp Tyr Asp Ser Ala Tyr Val Lys Tyr Phe Arg Asn Leu Ser Gly 260 265270
Arg lie Gly Gly Gly Ser Phe Asp Pro Thr Ser Leu Thr Ser Val lie 275 280285
Thr Val Lys lie Ser Gly Leu Pro Gly Gly Leu Pro Lys Asn lie Ala 290 295300
Phe Gly Ala Phe Leu Cys Asp lie Arg Tyr Val Glu Pro Val AspSer 305 310 315320
Gly Gly lie Gin Ser Ser Val Lys Thr Lys Arg Glu Asp Ala HisArg
325 330335
Thr Val Glu Glu Arg Ala Ala Gly Gly Ser Val Glu Gin Pro Arg Gin 340 345350
Lys Arg Xie Asp Glu Lys Gly Cys Gly Arg Val Pro Ser Gly Gly Phe 355 360365
Ser His Leu Leu Val Gly Asn Leu Asn Glu Val Arg Arg Lys Val Ala 370 375380
Ala Gly Leu Leu Arg Phe Arg Val Gly Gly Asp Met Asp Phe His Arg
385 390 395400
Ser Phe Ser Thr Gin Ala Gly His Arg Leu Leu Val Trp Arg Arg Ser
405 410415
Ser Arg Ser Val Cys Leu Glu Leu Tyr Ser Pro Ser Lys Asn Phe Leu 420 425430
Arg Tyr Asp Val Leu Pro Cys Ser Gly Asp Tyr Ala Ala Met Phe Ser 435 440445
Phe Ala Ala Gly Gly Arg Phe Pro Leu Val Leu Met Thr Arg lie Arg 450 455460
Tyr Pro Asn Gly Phe Cys Tyr Leu Ala His Cys Arg Tyr Ala CysAla
465 470 475480
Phe Leu Leu Arg Gly Phe Asp Pro Lys Arg Phe Asp lie Gly Alaph»
485 490495
Pro Thr Ala Ala Lys Leu Arg Asn Arg Met Val Ser Glu Leu Gly Glu 500 505510
Arg Ser Leu Gly Leu Asn Leu Tyr Gly Ala Tyr Thr Ser Arg Gly Val 515 520525
- 132 Phe His Cys Asp Tyr Asp Ala Lys 530 535
Ser Ala Val lie Ala Gly Lys Asp 545 550
Asp lie Thr Pro Ala Met Lys Gin 5S5
Arg Leu Tyr Gly Gly Thr Asp Ser 580
Asp Leu lie Asp Phe Lys Asn Asp 595600
Pro lie Val Lys Val Pro Phe Tyr 610615
Leu Thr Arg Phe Tyr Pro Gin Phe 625630
His Ser Asp His Pro Ala Ala Ala 645
Thr Leu Val Arg Leu Cys Gly Asn 660
Pro Leu Phe His Leu His Ser Lys 675680
Arg Pro Val Leu Asp Gly Lys Asp 690695
Leu Gin Tyr Ser Asn Val Arg Leu 705710
Gly Pro Arg Asn lie Asp lie Cys 725
His Glu Ser Ser Ala Met Met Met 740
Tyr Glu lie Cys Gly Ala Met lie 755760
Leu Thr Met Val Thr Pro Gly Glu 770775
Tyr Met Glu Ser Leu Asp Cys Glu 785790
Val Val Met Tyr Lys Phe Gly Ser 805 lie lie Lys Asp lie Met Thr Thr 820
Phe lie Lys Asp Leu Arg Leu Met 540
Gly Val Glu Glu Val Val Pro Ser 555seo
Lys Thr lie Glu Ala Val Tyr Asp 570575
Leu Leu Lys Leu Ser lie Glu Lys 585590
Val Gin Ser Leu Lys Lys Asp Arg 605
Met Ser Glu Ala Thr Gin Asn Ser 620
Glu Leu Lys Phe Ser His Ser Ser 635640
Ala Ser Arg Leu Leu Glu Asn Glu 650655
Ser Val Ser Asp lie Gly Gly Cys 665670
Thr Gin Arg Arg Val His Val Cys 685
Ala Gin Arg Arg Val Val Arg Asp 700
Gly Asp Asp Asp Lys lie Leu Glu 715720
His Tyr Pro Leu Gly Ala Cys Asp 730735
Val Gin Val Tyr Asp Ala Ser Leu 745750
Lys Lys Lys Ser Arg lie Thr Tyr 765
Phe Leu Asp Gly Arg Glu Cys Val 780 lie Glu Val Asp Val His Ala Asp 795800
Ser Cys Tyr Ser His Lys Leu Ser 810815
Pro Tyr Leu Thr Leu Gly Gly Phe 825830
133 • Σ· · ·
...... ··/
Leu Phe Ser Val Glu Met Tyr Glu Val Arg Met Gly Val Asn Tyr Phe 835 840845
Lys lie Thr Lys Ser Glu Val Ser Pro Ser lie Ser Cys Thr Lys Leu 850 855860
Leu Arg Tyr Arg Arg Ala Asn Ser Asp Val Val Lys Val Lys LeuPro
865 870 875880
Arg Phe Asp Lys Lys Arg Arg Met Cys Leu Pro Gly Tyr Asp Thrlie
885 890895
Tyr Leu Asp Ser Lys Phe Val Ser Arg Val Phe Asp Tyr Val Val Cys 900 905910
Asn Cys Ser Ala Val Asn Ser Lys Thr Phe Glu Trp Val Trp Ser Phe 915 920925 lie Lys Ser Ser Lys Ser Arg Val lie lie Ser Gly Lys lie lie His 930 935940
Lys Asp Val Asn Leu Asp Leu Lys Tyr Val Glu Ser Phe Ala AlaVal
945 950 955960
Met Leu Ala Ser Gly Val Arg Ser Arg Leu Ala Ser Glu Tyr LeuAla
965 970975
Lys Asn Leu Ser His Phe Ser Gly Asp Cys Ser Phe lie Glu Ala Thr 980 985990
Ser Phe Val Leu Arg Glu Lys lie Arg Asn Met Thr Leu Asn Phe Asn 995 10001005
Glu Arg Leu Leu Gin Leu Val Lys Arg Val Ala Phe Ala Thr Leu Asp 1010 10151020
Val Ser Phe Leu Asp Leu Asp Ser Thr Leu Glu Ser lie Thr AspPhe
1025 1030 10351040
Ala Glu Cys Lys Val Ala lie Glu Leu Asp Glu Leu Gly Cys LeuArg
1045 10501055
Ala Glu Ala Glu Asn Glu Lys lie Arg Asn Leu Ala Gly Asp Ser Ile 1060 10651070
Ala Ala Lys Leu Ala Ser Glu lie Val Val Asp Ile Asp Ser Lys Pro 1075 10801085
Ser Pro Lys Gin Val Gly Asn Ser Ser Ser Glu Asn Ala Asp Lys Arg 1090 10951100
Glu Val Gin Arg Pro Gly Leu Arg Gly Gly Ser Arg Asn Gly Val Val
1105 1110 11151120
Gly Glu Phe Leu His Phe Val Val Asp Ser Ala Leu Arg Leu Phe Lys
1125 11301135
- 134 Tyr Ala
Thr Asp Gin Gin Arg lie Lys Ser Tyr Val Arg Phe Leu Asp
1140 1145 Ugo
Ser Ala Val Ser Phe Leu Asp Tyr Asn Tyr Asp Asn Leu Ser Phe lie 1155 11601165
Leu Arg Val Leu Ser Glu Gly Tyr Ser Cys Met Phe Ala Phe Leu Ala 1170 11751180
Asn Arg Gly Asp Leu Ser Ser Arg Val Arg Ser Ala Val Cys AlaVal 1185 1190 1195
Lys Glu Val Ala Thr Ser Cys Ala Asn Ala Ser Val Ser Lys AlaLys
1205 12101215
Val Met lie Thr Phe Ala Ala Ala Val Cys Ala Met Met Phe Asn Ser 1220 12251230
Cys Gly Phe Ser Gly Asp Gly Arg Glu Tyr Lys Ser Tyr lie His Arg 1235 12401245
Tyr Thr Gin Val Leu Phe Asp Thr lie Phe Phe Glu Asp Ser Ser Tyr 1250 12551260
Leu Pro lie Glu Val Leu Ser Ser Ala lie Cys Gly Ala lie ValThr 1265 1270 12751280
Leu Phe Ser Ser Gly Ser Ser lie Ser Leu Asn Ala Phe Leu LeuGin
1285 12901295 lie Thr Lys Gly Phe Ser Leu Glu Val Val Val Arg Asn Val Val Arg 1300 13051310
Val Thr His Gly Leu Ser Thr Thr Ala Thr Asp Gly Val lie Arg Gly 1315 13201325
Val Phe Ser Gin lie Val Ser His Leu Leu Val Gly Asn Thr Gly apn 1330 13351340
Val Ala Tyr Gin Ser Ala Phe lie Ala Gly Val Val Pro Leu LeuVal
I345 1350 1355136
Lys Lys Cys Val Ser Leu lie Phe lie Leu Arg Glu Asp Th-»- TyrSer
1365 13701375
Gly Phe lie Lys His Gly lie Ser Glu Phe Ser Phe Leu Ser Ser lie 1380 13851390
Leu Lys Phe Leu Lys Gly Lys Leu Val Asp Glu Leu Lys Ser lie lie 1395 14001405
Gin Gly Val Phe Asp Ser Asn Lys His Val Phe Lys Glu Ala Thr Gin 1410 14151420
Glu Ala lie Arg Thr Thr Val Met Gin Val Pro Val Ala Val Val 1425 14301435
Asp 1440
- 135 Ala Leu Lys Ser Ala Ala Gly Lys 1445 lie Tyr Asn Asn Phe Thr Ser Arg 1450 1455
Arg Thr Phe Gly Lys Asp Glu Gly Ser Ser Ser Asp Gly Ala Cys Glu 1460 14651470
Glu Tyr Phe Ser Cys Asp Glu Gly Glu Gly Pro Gly Leu Lys Gly Gly 1475 14801485
Ser Ser Tyr Gly 1490 Phe Ser lie Leu Ala Phe Phe Ser Arg lie Met Trp
1495 1500
Gly Ala Arg Arg 1505 Leu Ile 151( Val Lys J Val Lys His Glu Cys 1515 Phe Gly Lys 1520
Leu Phe Glu Phe Leu 152' Ser Leu Lys Leu His Glu Phe Arg 1530 Thr Arg 153Í Val
Phe Gly Lys Asn 154 C Arg t Thr Asp Val Gly Val Tyr Asp Phe 1545 Leu 1550 Pro Thr
Gly lie Val Glu Thr Leu Ser Ser lie Glu Glu Cys Asp Gin lie Glu
1555 1560 1565
Glu Leu Leu Gly Asp Asp Leu Lys Gly Asp Lys Asp Ala Ser Leu Thr 1570 15751580
Asp Met Asn Tyr Phe Glu Phe Ser Glu Asp Phe Leu Ala Ser lieGlu
I585 1590 15951600
Glu Pro Pro Phe Ala Gly Leu Arg Gly Gly Ser Lys Asn lie Alalie
1505 16101615
Leu Ala lie Leu Glu Tyr Ala His Asn Leu Phe Arg lie Val Ala Ser 1620 16251630
Lys Cys Ser Lys Arg Pro Leu Phe Leu Ala Phe Ala Glu Leu Ser Ser 1635 16401645
Ala Leu lie Glu Lys Phe Lys Glu Val Phe Pro Arg Lys Ser Gin Leu 1650 16551660
Val Ala lie Val Arg Glu Tyr Thr Gin Arg Phe Leu Arg Ser ArgMet
1665 1670 16751680
Arg Ala Leu Gly Leu Asn Asn Glu Phe Val Val Lys Ser Phe AlaAsp
1685 16901695
Leu Leu Pro Ala Leu Met Lys Arg Lys Val Ser Gly Ser Phe Leu Ala 1700 17051710
Ser Val Tyr Arg Pro Leu Arg Gly Phe Ser Tyr Met Cys Val Ser Ala 1715 17201725
Glu Arg Arg Glu Lys Phe Phe Ala Leu Val Cys Leu lie Gly Leu Ser 1730 17351740
- 136 Leu Pro Phe Phe Val Arg lie Val 1745 1750
Val Ser Ser Ala Arg Arg Phe Tyr 1765
Gin Lys Tyr Val Ser Leu Ser Asn 1780
Asp Val Asp Asp Ser Ser Ala Ser 1795i8oe
Gly Ala Lys Ala Cys Glu Glu Leu 17S51760
Glu Arg lie Lys lie Phe Leu Arg 17701775
Phe Phe Cys His Leu Phe Ser Ser 17851790
Ala Gly Leu Lys Gly Gly Ala Ser 11805
Arg Met Thr 1810
Leu Phe His Leu Leu Val Arg Leu Ala Ser Ala 18151820
Leu Leu
Ser Leu Gly 1825 Trp Glu Gly Leu Lys Leu Leu Leu Ser His His Asn Leu 1830 - 1835 1840
Leu Phe Leu Cys Phe Ala Leu Val Asp Asp Val Asn Val Leu He Lvs 1845 1850 1B55
Val Leu Gly Gly Leu Ser Phe Phe Val Gin Pro lie Phe Ser Leu Phe 1860 1865 1870
Ala Ala Met Leu Leu Gin Pro Asp Arg Phe Val 1875i
Glu Tyr Ser Glu Lys 1885
Leu Val Thr Ala Phe Glu Phe Phe Leu Lys Cys Ser Pro Arg Ala Pro 1890 1835isoO
Ala Leu Leu Lys Gly Phe Phe Glu Cys Val Ala Asn Ser Thr ValSer 1905 1910 1915i
Lys Thr Val Arg Arg Leu Leu Arg Cys Phe Val Lys Met Leu LysLeu 1925 IS381935
Arg Lys Gly Arg Gly Leu Arg Ala Asp Gly Arg Gly Leu His Arg Gin 1940 19«1950
Lys Ala Val Pro Val He Pro Ser Asn Arg Val Val Thr Asp Gly Val 1955 19601965
Glu Arg Leu Ser Val Lys Met Gin Gly Val Glu Ala Leu Arg Thr Glu 1970 19751980
Leu Arg lie Leu Glu Asp Leu Asp 1985 1990
Arg Arg Arg Asn Arg Asp Thr Asn 2005
His Glu Gin Met Gin Glu Val Thr 2020
Ser Ala Val He Glu Lys Leu Asn 19952000
Asp Asp Glu Phe Thr Arg Pro Ala 20102015
Thr Phe Cys Ser Lys Ala Asn Ser 20252030
Ala Gly Leu Ala Leu Glu Arg Ala Val Leu Val 2035 2040
Glu Asp Ala lie Lys 2045
- 137 Ser Glu Lys Leu Ser Lys Thr Val Asn Glu Met Val Arg Lys Gly Ser 2050 20552060
Thr Thr Ser Glu Glu Val Ala Val Alá Leu Ser Asp Asp Glu AláVal 2065 2070 20752081
Glu Glu He Ser Val Alá Asp Glu Arg Asp Asp Ser Pro Lys ThrVal 20B5 20902095
Arg He Ser Glu Tyr Leu Asn Arg Leu Asn Ser Ser Phe Glu Phe Pro 2100 21052110
Lys Pro He Val Val Asp Asp Asn Lys Asp Thr Gly Gly Leu Thr Asn 2115 21202125
Ala Val Arg Glu Phe Tyr Tyr Met Gin Glu Leu Alá Leu Phe Glu He 2130 21352140
His Ser Lys Leu Cys Thr Tyr Tyr Asp Gin Leu Arg He Val Asn Phe 2145 22-50 21552160
Asp Arg Ser val Alá Pro Cys Ser Glu Asp Alá Gin Leu Tyr Val Arg
2165 21702175
Lys Asn Gly Ser Thr He Val Gin Gly Lys Glu Val Arg Leu His He 2180 21852190
Lys Asp Phe His Asp His Asp Phe Leu Phe Asp Gly Lys Ile Ser Ile 2195 22002205
Asn Lys Arg Arg Arg Gly Gly Asn Val Leu Tyr His Asp Asn Leu Alá 2210 22152220
Phe Leu Alá Ser Asn Leu Phe Leu Alá Gly Tyr Pro Phe Ser ArgSer 2225 2230 22352240
Phe Val Phe Thr Asn Ser Ser Val Asp He Leu Leu Tyr Glu AláPro
2245 22502255
Pro Gly Gly Gly Lys Thr Thr Thr Leu He Asp Ser Phe Leu Lys Val. 2260 226S2270
Phe Lys Lys Gly Glu Val Ser Thr Met He Leu Thr Alá Asn Lys Ser 2275 22802285
Ser Gin Val Glu Ile Leu Lys Lys Val Glu Lys Glu Val Ser Asn He 2290 22952300
Glu Cys Gin Lys Arg Lys Asp Lys Arg Ser Pro Lys Lys Ser IleTyr 2305 2310 23152320 ^hr lie Asp Ala Tyr Leu Met His His Arg Gly Cys Asp Alá AspVal
2325 23302335
Leu Phe He Asp Glu Cys Phe Met Val His Alá Gly Ser Val Leu Alá 2340 23452350
- 138 Cys lie Glu Phe Thr Arg Cys His Lys Val Met lie Phe Gly Asp Ser 2359 23602365
Arg Gin lie His Tyr lie Glu Arg Asn Glu Leu Asp Lys Cys Leu Tyr 237θ 23752380
Gly Asp Leu Asp Arg Phe Val Asp Leu Gin Cys Arg Val Tyr Gly Asn 2385 2390 2395240( lie Ser Tyr Arg Cys Pro Trp Asp Val Cys Ala Trp Leu Ser Thr Val
2405 24102415
Tyr Gly Asn Leu He Ala Thr Val Lys Gly Glu Ser Glu Gly Lys Ser 2420 24252430
Ser Met Arg He Asn Glu lie Asn Ser Val Asp Asp Leu Val Pro Asp 2435 24402445
Val Gly Ser Thr Phe Leu Cys Met Leu Gin Ser Glu Lys Leu Glu lie
2450
2455
2460
Ser Lys His Phe lie Arg Lys Gly Leu Thr Lys Leu Asn Val Leu Thr
2465 2470 24752481
Val His Glu Ala Gin Gly Glu Thr Tyr Ala Arg Val Asn Leu Val Arg
2485 24902495
Leu Lys Phe Gin Glu Asp Glu Pro Phe Lys Ser lie Arg His lie Thr
2500
2505
2510
Val Ala Leu Ser Arg His Thr Asp Ser Leu Thr Tyr Asn Val Leu Ala 2515 25202525
Ala Arg Arg Gly Asp Ala Thr Cys Asp Ala He Gin Lys Ala Ala Glu 2530 25352540
Leu Val Asn Lys Phe Arg Val Phe Pro Thr Ser Phe Gly Gly SerVal
2545 2550 25552561 lie Asn Leu Asn Val Lys Lys Asp Val Glu Asp Asn Ser Arg CysLys
2565 25702575
Ala Ser Ser Ala Pro Leu Ser Val lie Asn Asp Phe Leu Asn Glu Val 2580 25852590
Asn Pro Gly Thr Ala Val lie Asp Phe Gly Asp Leu Ser Ala Asp Phe 2595 26002605
Ser Thr Gly Pro Phe Glu Cys Gly Ala Ser Gly lie Val Val Arg Asp 2610 26152620
Asn lie Ser Ser Ser Asn lie Thr Asp His Asp Lys Gin Arg Val
2625
2630
2635
- 139 -
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1380 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁNÓ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
AGCGTAGTTC ggtcgcaggc gattccgcgt agaaaacctt ctctacaaga aaatttctat 60
TCGTTTGAAG CGCGGAATTA TAACTTCTCG ACTTGCGACC GTAACACATC TGCTTCAATG 120
TTCGGAGAGG CTATGGCGAT GAACTGTCTT CGTCGTTGCT TCGACCTAGA TGCCTTTTCG ISO
TCCCTGCGTG ATGATGTGAT TAGTATCACA CGTTCAGGCA TCGAACAATG GCTGGAGAAA 240
CGTACTCCTA GTCAGATTAA AGCATTAATG AAGGATGTTG AATCGCCTTT GGAAATTGAC 300
GATGAAATTT GTCGTTTTAA GTTGATGGTG AAGCGTGACG CTAAGGTGAA gttagactct 360
TCTTGTTTAA CTAAACACAG CGCCGCTCAA AATATCATGT TTCATCGCAA GAGCATTAAT 420
GCTATCTTCT CTCCTATCTT AAAAACCGAA TAATGTGCTG aacatmact tttttacgga gatgactaac agggawttg CTTmTTCT cagcaacatg
CTTGGTGACG ACGATGTGTA CCATATAGCT GAAGTTOATT TCTCAAAGTA CGACAACTCT 600 caagatoctt tcgtgaaggc ttttgaagaa gtaatgtata aggaactcgg tgitgmgaa880
GAGTTCCTGG CTATCTGGAT GTGCGGCGAG CGGWATCOA TAGCTAACAC TCTOGATGGT720
CAGTTOTCCT tcacgatcga gaatcaaagg aagtcgggag otcgaacac ttogattcgt780
AACTCTCTCG TCACTTTGGG 1ATTTTAAST CmACTACG ACGTTAGAAA TTTCGAGOCO8«
TT6TACATCT CGGGCGA1GA TTCTTtAATT TTTTCTOTCA GCCAGATTTC GAATTATGCC
GACGACATA7 gcactgacat GGGTTTTGAG acaaaattta tgtccccaag TGTCCGCTAC980
TTTTGTTCTA AATTTCTTGT 7ATOTGTGGT CATAAGACCT TCTTOSTTCC CGACCCGTAC1020 aagctttttg tcaaottsgc agcagtcam gaggatgttt caatsgattt CCTTTTCSAG1080
ACTTOTACCT CCTTTAAAGA CTTAACCTCC GATTTTAACG ACGAGCCCTT AATTCAAAAC1140 ctcgctoaac ttotggcttt maatmgag cttcaaaccg gcaacaccac otggcgtta1200
AGTGTGATAC ATTGTTTGCG TTCGAATTTC CTCTCGTTTA GGAAGTTATA TCCTCGCGTG1280
AAGGGA7GGC aggtttttta cacgtcggtt aagaaagcgc ttctcaagag tgggtgwt1320
CTCTTCGACA GTTTCATGAC CCCTT7TGGT CAGGCTGTCA TGGTTTGGGA TGATGAGTAG13
- 140 -
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 459 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Val val hrg ser sm Λ1, Ha Pro irg Arg Lrs pro s„ Leu Gin S 1015
Glu Asn Leu Tyr Ser Ph. Glu Alá Arg Asn Tyr Asn Phe Ser Thr Cys 2530
Asp Arg Asn Thr Ser Alá Ser Met Phe Gly Glu Ala Met Ala Met Asn 4045
Cys Leu Arg Arg Cys Phe Asp Leu Asp Alá Phe Ser Ser Leu Arg Asp 5550
Asp Val Ile Ser Ile Thr Ser Gly χχβ 70 7580
Arg Thr Pro Ser Gin He Lys Ala Leu Met Lys Asp Val Glu Ser Pro 85 9095
Leu Glu lie Asp Asp Glu lie Cys Arg Phe Lys Leu Met Val Lys Arg XUO i ne 105110
Asp Alá Lys Val Lys Leu Asp Ser Ser Cys Leu Thr Lys His Ser Alá 120 !/' *“ Ile Met Phe “· **« L1” n· *la He Phe ser 135140
Pro He Phe Asn Glu Val Lys Asn Arg He Met Cys Cys Leu Lys Pro 150 155
Asn He Lys Phe Phe Thr Glu Met Thr Asn Arg Asp Phe Alá Ser Val 165 170175
Val ser Asn Met Leu Gly Asp Asp Asp Val Tyr His He Gly Glu Val 180 185190
Asp Phe Ser Lys Tyr Asp Lys Ser Gin Asp Ala Phe Val Lys Alá Phe 195 200
Glu Glu Val Met Tyr Lys Glu Leu Gly Val Asp Glu Glu Leu Leu Alá xxu oi e·**·* 215220 lie Trp Met Cys Gly Glu Arg Leu Ser lie Alá Asn Thr Leu Asp Gly
141 225 230
Gin Leu Ser Phe Thr Ile Glu Asn 245
Thr Trp He Gly Asn Ser Leu Val 260 235 240
Gin Arg Lys Ser Gly Ala Ser Asn 250 255
Thr Leu Gly He Leu Ser Leu Tyr
Tyr Asp Val Arg Asn Phe Glu Ala 275280
Leu He Phe Ser Arg Ser Glu Ile 290
Thr Asp Met Gly Phe Glu Thr Lys 399310
Phe Cys Ser Lys Phe Val Val Met 325
Pro Asp Pro Tyr Lys Leu Phe Val 340
Val Ser Met Asp Phe Leu phe Glu 355360
Thr Ser Asp Phe Asn Asp Glu Arg 370375
Vei Ala Leu Lys Tyr Glu Val óin 385390
Ser Val Ile His Cys Leu Arg Ser 405
Tyr Pro Arg Val Lys Gly Trp Gin 420
Ala Leu Leu Lys Ser Gly Cys Ser 438 440
Phe Gly Gin Ala Val Met Val Trp 450 455
Leu Tyr He Ser Gly Asp Asp Ser 285
Ser Asn Tyr Ala Asp Asp He Cys 300
Phe Met Ser Pro Ser Val Pro Tyr
Cys Gly His Lys Thr Phe Phe Val 330 33g
Lys Leu Gly Ala Val Lys Glu Asp 345 350
Thr Phe Thr Ser Phe Lys Asp Leu 365
Leu He Gin Lys Leu Ala Glu Leu 380
Thr Gly Asn Thr Thr Leu Ala Leu 395400
Asn Phe Leu Ser Phe Ser Lys Leu 439415
Val Phe Tyr Thr Ser Val Lys Lys 429430
Leu Phe Asp Ser Phe Met Thr Pro 445
Asp Asp Glu
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 171 bázispár TÍPUSA: nukleinsav Hány SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULÁT í PUS: cDNS
- 142 A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGAATCAGG TTFTGCAGTT TGAATGTTTG TTTCTGCTGA ATCTCGCGGT TTTTGCTGTG60
ACTTTCATTT TCATTCTTCT GGTCTTCCGC GTGATTAAGT CTTTTCGCCA GAAGGGTCAC120
GAAGCACCTG TTCCCGTTGT TCGTGGCGGG GGTTTTTCAA CCGTAGTGTA G171
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 56 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Asn Gin Val Leu Gin Phe 1 5
Val Phe Ala Val Thr Phe He 20
Lys Ser Phe Arg Gin Lys Gly 35
Gly Gly Gly Phe Ser Thr Val
Glu Cys Leu Phe Leu Leu Asn Leu Alá 1015
Phe Ile Leu Leu Val Phe Arg val He 2530
His Glu Alá Pro Val Pro Val Val Arg 4045
Val
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1800 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
- 143
ATGGTAGTTT TCGGTTTGGA CTTTGGCACC ACATTCTCTA CGGTGTGTGT GTACAAGGAT 60 GGACGAGTTT TTTCATTCAA GCAGAATAAT TCGGCGTACA TCCCCACTTA CCTCTATCTC120
TTCTCCGATT CTAACCACAT GACTTTTGGT TACGAGGCCG AATCACTGAT GAGTAATCTG180
AAAGTTAAAG GTTCGTTTTA TAGAGATTTA AAACGTTGGG TGGGTTGCGA TTCGAGTAAC240
CTCGACGCGT ACCTTGACCG TTTAAAACCT CATTACTCGG TCCGCTTGGT TAAGATCGGC300
TCTGGCTTGA ACGAAACTGT TTCAATTGGA AACTTCGGGG GCACTGTTAA GTCTGAGGCT360
CATCTGCCAG GGTTGATAGC TCTCTTTATT AAGGCTGTCA TTAGTTGCGC GGAGGGCGCG420
TTTGCGTGCA CTTGCACCGG GGTTATTTGT TCAGTACCTG CCAATTATGA TAGCGTTCAA480
AGGAATTTCA CTGATCAGTG TGTTTCACTC AGCGGTTATC AGTGCGTATA TATGATCAAT540
GAACCTTCAG CGGCTGCGCT ATCTGCGTGT AATTCGATTG GAAAGAAGTC CGCAAATTTG600
GCTGTTTACG ATTTCGGTGG TGGGACCTTC GACGTGTCTA TCATTTCATA CCGCAACAAT660
ACTTTTGTTG TGCGAGCTTC TGGAGGCGAT CTAAATCTCG GTGGAAGGGA TGTTGATCGT720
GCGTTTCTCA CGCACCTCTT CTCTTTAACA TCGCTGGAAC CTGACCTCAC TTTGGATATC780
TCGAATCTGA AAGAATCTTT ATCAAAAACG GACGCAGAGA TAGTTTACAC TTTGAGAGGT840
GTCGATGGAA GAAAAGAAGA CGTTAGAGTA AACAAAAACA TTCTTACGTC GGTGATGCTC900
CCCTACGTGA ACAGAACGCT TAAGATATTA GAGTCAACCT TAAAATCGTA TGCTAAGAGT960
ATGAATGAGA GTGCGCGAGT TAAGTGCGAT TTAGTGCTGA TAGGAGGATC TTCATATCTT1020
CCTGGCCTGG CAGACGTACT AACGAAGCAT CAGAGCGTTG ATCGTATCTT AAGAGTTTCG1080
GATCCTCGGG CTGCCGTGGC CGTCGGTTGC GCATTATATT CTTCATGCCT CTCAGGATCT1140
GGGGGGTTGC TACTGATCGA CTGTGCAGCT CACACTGTCG CTATAGCGGA CAGAAGTTGT1200
CATCAAATCA TTTGCGCTCC AGCGGGGGCA CCGATCCCCT TTTCAGGAAG CATGCCTTTG1260
TACTTAGCCA GGGTCAACAA GAACTCGCAG CGTGAAGTCG CCGTGTTTGA AGGGGAGTAC1320
GTTAAGTGCC CTAAfiAACAG AAAGATCTGT GGAGCAAATA TAAGATTTTT TGATATAGGA1380
GTGACGGGTG ATTCGTACGC ACCCGTTACC TTCTATATGG ATTTCTCCAT TTCAAGCGTA1440
GGAGCCGTTT CATTCGTGGT GAGAGGTCCT GAGGGTAAGC AAGTGTCACT CACTGGAACT1500
CCAGCGTATA ACTTTTCGTC TGTGGCTCTC GGATCACGCA GTGTCCGAGA ATTGCATATT1560
AGTTTAAATA ATAAAGTTTT TCTCGGTTTG CTTCTACATA GAAAGGCGGA TCGACGAATA1620
CTTTTCACTA AGGATGAAGC GATTCGATAC GCCGA.TTCAA TTGATATCGC GGATGTGCTA1680
AAGGAATATA AAAGTTACGC GGCCASTGCC TTACCACCAG ACGAGGATGT CGAATTACTC1740
CTGGGAAAGT CTGTTCAAAA AGTTTTACGG GGAAGCAGAC TGGAAGAAAT ACCTCTCTAG1800
- 144 A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 599 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Val Val Phe Gly Leu Asp Phe 15
Val Tyr Lys Asp Gly Arg Val Phe 20
Tyr Ile Pro Thr Tyr Leu Tyr Leu 3540
Phe Gly Tyr Glu Alá Glu Ser Leu 5055
Ser Phe Tyr Arg Asp Leu Lys Arg 6570
Leu Asp Alá Tyr Leu Asp Arg Leu BS
Val Lys He Gly ser Gly Leu Asn 100
Gly Gly Thr Val Lys Ser Glu Alá 3-35i
Phe He Lys Alá Val He Ser Cys 3-3 0
Cys Thr Gly Val He Cys Ser Val 145150
Arg Asn Phe Thr Asp Gin Cys Val 165
Tyr Met He Asn Glu Pro Ser Alá 180
He Gly Lys Lys Ser Alá Asn Leu 355
Thr Phe Asp Val Ser He Ile Ser 210215
Gly Thr Thr Phe Ser Thr Val Cys 10 15
Ser Phe Lys Gin Asn Asn Ser Alá 25 30
Phe Ser Asp Ser Asn His Met Thr 45
Met Ser Asn Leu Lys Val Lys Gly 60
Trp Val Gly Cys Asp Ser Ser Asn 75' 80
Lys Pro His Tyr Ser Val Arg Leu 9095
Glu Thr Val Ser Ile Gly Asn Phe 3°5no
His Leu Pro Gly Leu He Alá Leu 125
Ala Glu Gly Ala Phe Alá Cys Thr 140
Pro Alá Asn Tyr Asp Ser Val Gin 355
Ser Leu Ser Gly Tyr Gin Cys Val 170175
Ala Alá Leu Ser Alá Cys Asn Ser 185
Alá Val Tyr Asp Phe Gly Gly Gly 205
Tyr Arg Asn Asn Thr Phe Val Val 220
Arg Alá Ser Gly Gly Asp Leu Asn Leu Gly Gly Arg Asp Val Asp Arg 230 235
- 145 Ala Phe Leu Thr His Leu Phe Ser Leu. Thr Ser Leu Glu Pro Asp Leu 245 250255
Thr Leu Asp He Ser Asn Leu Lys Glu Ser Leu Ser Lys Thr Asp Ala 260 265270
Glu lie Vai Tyr Thr Leu Arg Gly Vai Asp Gly Arg Lys Glu Asp Vai 275 280285
Arg Vai Asn Lys Asn lie Leu Thr Ser Vai Met Leu Pro Tyr Vai Asn 290 295300
Arg Thr Leu Lys lie Leu Glu Ser Thr Leu Lys Ser Tyr Ala LysSer 305 310 315320
Met Asn Glu Ser Ala Arg Vai Lys Cys Asp Leu Vai Leu He GlyGly
325 330335
Ser Ser Tyr Leu Pro Gly Leu Ala Asp Vai Leu Thr Lys His Gin Ser 340 345
Vai Asp Arg lie Leu Arg Vai Ser Asp Pro Arg Ala Ala Vai Ala Vai 355 360365
Gly Cys Ala Leu Tyr Ser Ser Cys Leu Ser Gly Ser Gly Gly Leu Leu 370 375380
Leu He Asp Cys Ala Ala His Thr Vai Ala He Ala Asp Arg SerCys 385 390 395400
His Gin lie He Cys Ala Pro Ala Gly Ala Pro He Pro Phe SerGly
405 410415
Ser Met Pro Leu Tyr Leu Ala Arg Vai Asn Lys Asn Ser Gin Arg Glu 420 425430 Val Ala Vai Phe Glu Gly Glu Tyr Vai Lys Cys Pro Lys Asn Arg Lys 435 440445
He Cys Gly Ala Asn lie Arg Phe Phe Asp He Gly Vai Thr Gly Asp 450 455460
Ser Tyr Ala Pro Vai Thr Phe Tyr Met Asp Phe Ser He Ser SerVai 485 470 475480
Gly Ala Vai Ser Phe Vai Vai Arg Gly Pro Glu Gly Lys Gin VaiSer
485 490495
Leu Thr Gly Thr Pro Ala Tyr Asn Phe Ser Ser Vai Ala Leu Gly Ser 500 505510
Arg Ser Vai Arg Glu Leu His He Ser Leu Asn Asn Lys Vai Phe Leu 515 520525
Gly Leu Leu Leu His Arg Lys Ala Asp Arg Arg He Leu Phe Thr Lys 530 535540
- 146 .:. .:. ...· -.. -r
Asp Glu Ala lie Arg Tyr Ala Asp Ser lie Asp He Ala Asp Vai Leu
545 550 555560
Lys Glu Tyr Lys Ser Tyr Ala Ala Ser Ala Leu Pro Pro Asp GluAsp
565 570575
Vai Glu Leu Leu Leu Gly Lys Ser Vai Gin Lys Vai Leu Arg Gly Ser 580 585590
Arg Leu Glu Glu He Pro Leu 595
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1656 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGTCGAATT ACTCCTGGGA AAGTCTGTTC AAAAAGTTTT ACGGGGAAGC AGACTGGAAG 60
AAATACCTCT ctaggagcat agcagcacac tcaagtgaaa ttaaaactct accagacatt 120
CGATTGTACG GCGGTAGGGT TGTAAAGAAG TCCGAATTCG AATCAGCACT TCCTAATTCT 180
TTTGAACAGG AATTAGGACT GTTCATACTG agcgaacggg AAGTGGGATG GAGCAAATTA 240
TGCGGAATAA CGGTGGAAGA AGCAGCATAC GATCTTACGA ATCCCAAGGC TTATAAATTC 300
ACTGCCGAGA CATGTAGCCC GGATGTAAAA GGTGAAGGAC AAAAATACTC TATGGAAGAC 360
GTGATGAATT TCATGCGTTT ATCAAATCTG GATGTTAACG ACAAGATGCT GACGGAACAG 420
TGTTGGTCGC TGTCCAATTC ATGCGGTGAA TTGATCAACC CAGACGACAA AGGGCGATTC 480
GTGGCTCTCA CCTTTAAGGA CAGAGACACA GCTGATGACA CGGGTGCCGC CAACGTGGAA 540
TGTCGCGTGG GCGACTATCT AGTTTACGCT ATGTCCCTGT TTGAGCAGAG GACCCAAAAA 600
TCGCAGTCTG GCAACATCTC TCTGTACGAA AAGTACTGTG AATACATCAG GACCTACTTA 660
GGGAGTACAG ACCTGTTCTT CACAGCGCCG GACAGGATTC CGTTACTTAC GGGCATCCTA 720
TACGATTTTT GTAAGGAATA CAACGTTTTC TACTCGTCAT ATAAGAGAAA CGTCGATAAT 780
TTCAGATTCT TCTTGGCGAA TTATATGCCT TTGATATCTG ACGTCTTTGT CTTCCAGTGG 840
- 147 «·· ·····< ···*
GTAAAACCCG CGCCGGATGT TCGGCTGCTT TTTGAGTTAA GTGCAGCGGA ACTAACGCTG 900
GAGGTTCCCA CACTGAGTTT gatagattct CAAGTTGTGG TAGGTCATAT CTTAAGATAC 960
GTAGAATCCT ACACATCAGA TCCAGCCATC GACGCGTTAG aagacaaact GGAAGCGATA 1020
CTGAAAAGTA GCAATCCCCG TCTATCGACA gcgcaactat GGGTTGGTTT CTTTTGTTAC 1080
TATGGTGAGT TTCGTACGGC TCAAAGTAGA GTAGTGCAAA GACCAGGCGT atacaaaaca 1140
CCTGACTCAG TGGGTGGATT TGAAATAAAC ATGAAAGATG TTGAGAAATT CTTCGATAAA 1200
CTTCAGAGAG 1 AATTGCCTAA TGTATCTTTG CGGCGTCAGT TTAACGGAGC TAGAGCGCAT 1260
GAGGCTTTCA AAATATTTAA aaacggaaat ataagtttca GACCTATATC GCGTTTAAAC 1320
GTGCCTAGAG AGTTCTGGTA TCTGAACATA GACTACTTCA GGCACGCGAA TAGGTCCGGG 1380
TTAACCGAAG aagaaatact CATCCTAAAC AACATAAGCG TTGATGTTAG GAAGTTATGC 1440
GCTGAGAGAG CGTGCAATAC CCTACCTAGC GCGAAGCGCT TTAGTAAAAA TCATAAGAGT 1500
aatatacaat CATCACGCCA AGAGCGGAGG ATTAAAGACC CATTGGTAGT CCTGAAAGAC 1560
ACTTTATATG AGTTCCAACA CAAGCGTGCC GGTTGGGGGT CTCGAAGCAC TCGAGACCTC 1620
GGGAGTCGTG CTGACCACGC gaaaggaagc GGTTGA 1656
A 11. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 551 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 11. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Ser Asn Tyr Ser Trp Glu Ser Leu Phe Lys Lys Phe Tyr Gly Glu 35 1015
Alá Asp Trp Lys Lys Tyr Leu Ser Arg Ser He Ala Alá His Ser Ser 20 2530
Glu He Lys Thr Leu Pro Asp He Arg Leu Tyr Gly Gly Arg Val Val 35 4045
Lys Lys Ser Glu Phe Glu Ser Alá Leu Pro Asn Ser Phe Glu Gin Glu 50 5560
- 148 Leu Gly Leu Phe lie Leu Ser Glu 65 70
Cys Gly lie Thr Val Glu Glu Ala 85
Ala Tyr Lys Phe Thr Ala Glu Thr 100
Gly Gin Lys Tyr Ser Met Glu Asp 115120
Asn Leu Asp Val Asn Asp Lys Met 130135
Ser Asn Ser Cys Gly Glu Leu 11« 145150
Val Ala Leu Thr Phe Lys Asp Arg 165
Ala Asn Val Glu Cys Arg Val Gly 180
Leu Phe Glu Gin Arg Thr Gin Lys 195200
Tyr Glu Lys Tyr Cys Glu Tyr lie 210215
Leu Phe Phe Thr Ala Pro Asp Arg 225230
Tyr Asp Phe Cys Lys Glu Tyr Asn 245
Asn Val Asp Asn Phe Arg Phe Phe 260
Ser Asp Val Phe Val Phe Gin Trp 275280
Leu Leu Phe Glu Leu Ser Ala Ala 290295
Leu Ser Leu lie Asp Ser Gin Val 305310
Val Glu Ser Tyr Thr Ser Asp Pro 325
Leu Glu Ala lie Leu Lys Ser Ser 340
Leu Trp Val Gly Phe Phe Cys Tyr 355 360
Arg Glu Val Gly Trp Ser Lys Leu 7580
Ala Tyr Asp Leu Thr Asn Pro Lys 9095
Cys Ser Pro Asp Val Lys Gly Glu 105no
Val Met Asn Phe Met Arg Leu Ser 125 ’
Leu Thr Glu Gin Cys Trp Ser Leu 14 0
Asn Pro Asp Asp Lys Gly Arg Phe
155Igo
Asp Thr Ala Asp Asp Thr Gly Ala 170
Asp Tyr Leu Val Tyr Ala Met Ser 185190
Ser Gin Ser Gly Asn lie Ser Leu 205
Arg Thr Tyr Leu Gly Ser Thr Asp 220 lie Pro Leu Leu Thr Gly lie Leu 235240
Val Phe Tyr Ser Ser Tyr Lys Arg 250255
Leu Ala Asn Tyr Met Pro Leu lie 265270
Val Lys Pro Ala Pro Asp Val Arg 285
Glu Leu Thr Leu Glu Val Pro Thr 300
Val Val Gly His lie Leu Arg Tyr 315320
Ala lie Asp Ala Leu Glu Asp Lys 330335
Asn Pro Arg Leu Ser Thr Ala Gin 345350
Tyr Gly Glu Phe Arg Thr Ala Gin 365
- 149 Ser Arg Vai Vai Gin Arg Pro Gly Vai Tyr Lys Thr Pro Asp Ser Vai 370 375
Gly Gly Phe Glu lie Asa Met Lys Asp Vai Glu Lys Phe Phe AspLys 385 390 395
Leu Gin Arg Glu Leu Pro Asn Vai Ser Leu Arg Arg Gin Phe AsnGly
405 410415
Ala Arg Ala His Glu Ala Phe Lys He Phe Lys Asn Gly Asn He Ser 420 425430
Phe Arg Pro He Ser Arg Leu Asn Vai Pro Arg Glu Phe Trp Tyr Leu 435 440445
Asn He Asp Tyr Phe Arg His Ala Asn Arg Ser Gly Leu Thr Glu Glu 450 455460
Glu lie Leu He Leu Asn Asn lie Ser Vai Asp Vai Arg Lys LeuCys 465 470 475
Ala Glu Arg Ala Cys Asn Thr Leu Pro Ser Ala Lys Arg Phe SerLys
485 490495
Asn His Lys Ser Asn lie Gin Ser Ser Arg Gin Glu Arg Arg lie Lys 500 505510
Asp Pro Leu Vai Vai Leu Lys Asp Thr Leu Tyr Glu Phe Gin His Lys 515 520525
Arg Ala Gly Trp Gly Ser Arg Ser Thr Arg Asp Leu Gly Ser Arg Ala 530 535540
Asp His Ala Lys Gly Ser Gly 545550
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 672 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGAGTTCCA ACACAAGCGT GCCGGTTGGG GGTCTCGAAG CACTCGAGAC CTCGGGAGTC 60
GTGCTGACCA CGCGAAAGGA AGCGGTTGAT AAGTTTTTTA ATGAACTAAA AAACGAAAAT 120
TACTCATCAG TTGACAGCAG CCGATTAAGC GATTCGGAAG TAAAAGAAGT GTTAGAGAAA 180
AGTAAAGAAA GTTTCAAAAG CGAACTGGCC TCCACTGACG AGCACTTCGT CTACCACATT 240
ATATTTTTCT TAATCCGATG TGCTAAGATA TCGACAAGTG AAAAGGTGAA GTACGTTGGT 300
AGTCATACGT ACGTGGTCGA CGGAAAAACG TACACCGTTC TTGACGCTTG GGTATTCAAC 360
ATGATGAAAA GTCTCACGAA GAAGTACAAA CGAGTGAATG GTCTGCGTGC GTTCTGTTGC 420
GCGTGCGAAG ATCTATATCT AACCGTCGCA CCAATAATGT CAGAACGCTT TAAGACTAAA 480
GCCGTAGGGA TGAAAGGTTT GCCTGTTGGA AAGGAATACT TAGGCGCCGA CTTTCTTTCG 540
GGAACTAGCA AACTGATGAG CGATCACGAC AGGGCGGTCT CCATCGTTGC AGCGAAAAAC 600
GCTGTCGATC GTAGCGCTTT CACGGGTGGG GAGAGAAAGA TAGTTAGTTT GTATGATCTA 660
GGGAGGTACT AA 672
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 686 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Ser Ser Asn 1
Thr Ser Gly Val 20
Phe Asn Glu Leu 35
Leu Ser Asp Ser 50
Thr Ser Val Pro 5
Val Leu Thr Thr
Lys Asn Glu Asn 40
Glu Val Lys Glu 55
Val Gly Gly Leu 10 ’
Arg Lys Glu Alá 25
Tyr Ser Ser Val
Val Leu Glu Lys 60
Glu Alá Leu Glu 15
Val Asp Lys Phe 30
Asp Ser Ser Arg 45
Ser Lys Glu Ser
- 151 -
Phe 65 Lys Ser Glu Leu Alá 70 Ser Thr Asp Glu His Phe Val 75 Tyr His He 80
He Phe Phe Leu He Arg 85 Cys Alá Lys He Ser Thr Ser 90 Glu Lys 95 Val
Lys Tyr Val Gly 100 Ser His Thr Tyr Val Val Asp Gly Lys 105 Thr Tyr 110 Thr
Val Leu Asp Alá 115 Trp Val Phe Asn 120 Met Met Lys Ser Leu 125 Thr Lys Lys
Tyr Lys 130 Arg Val Asn Gly Leu Arg 135 Ala Phe Cys Cys Alá 140 Cys Glu Asp
Leu 145 Tyr Leu Thr Val Alá 150 Pro He Met Ser Glu Arg Phe 155 Lys Thr Lys 160
Alá Val Gly Met Lys Gly 165 Leu Pro Val Gly Lys Glu Tyr 170 Leu Gly 175 Alá
Asp Phe Leu Ser 180 Gly Thr Ser Lys Leu Met Ser Asp His 185 Asp Arg 190 Alá
Val Ser He Val 195 Ala Alá Lys Asn 200 Alá Val Asp Arg Ser 205 Alá Phe Thr
Gly Gly Glu Arg Lys He Val
210 215
Ser Leu Tyr Asp Leu Gly Arg Tyr
220
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: HOSSZA: 597 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGGAGTTGA TGTCCGACAG CAACCTTAGC AACCTGGTGA TAACCGACGC CTCTAGTCTA 60
AATGGTGTCG ACAAGAAGCT TTTATCTGCT GAAGTTGAAA AAATGTTGGT GCAGAAAGGG 120
GCTCCTAACG AGGGTATAGA AGTGGTGTTC GGTCTACTCC TTTACGCACT CGCGGCAAGA 180
ACCACGTCTC CTAAGGTTCA GCGCGCAGAT TCAGACGTTA TATTTTCAAA TAGTTTCGGA 240
GAGAGGAATG TGGTAGTAAC AGAGGGTGAC CTTAAGAAGG TACTCGACGG GTGTGCGCCT 300
CTCACTAGGT TCACTAATAA ACTTAGAACG TTCGGTCGTA CTTTCACTGA GGCTTACGTT 360
- 152 GACTTTTGTA TCGCGTATAA GCACAAATTA CCCCAACTCA ACGCCGCGGC GGAATTGGGG420
ATTCCAGCTG AAGATTCGTA CTTAGCTGCA GATTTTCTGG GTACTTGCCC GAAGCTCTCT480 gaattacagc AAAGTAGGAA GATGTTCGCG AGTATGTACG CTCTAAAAAC TGAAGGTGGA540
GTGGTAAATA CACCAGTGAG CAATCTGCGT CAGCTAGGTA GAAGGGAAGT TATGTAA597
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Glu Leu Met Ser Asp Ser Asn 15
Alá Ser Ser Leu Asn Gly Val Asp 20
Glu Lys Met Leu Val Gin Lys Gly 3540
Val Phe Gly Leu Leu Leu Tyr Alá 5055
Lys Val Gin Arg Alá Asp Ser Asp 6570
Glu Arg Asn Val Val Val Thr Glu 85
Gly Cys Alá Pro Leu Thr Arg Phe 100
Arg Thr Phe Thr Glu Alá Tyr Val 115120
Lys Leu Pro Gin Leu Asn Ala Alá .
130135
Leu Ser Asn Leu Val He Thr Asp 10
Lys Lys Leu Leu Ser Alá Glu Val 2530
Ala Pro Asn Glu Gly He Glu Val 45
Leu Ala Alá Arg Thr Thr Ser Pro 60
Val He Phe Ser Asn Ser Phe Gly 73 80
Gly Asp Leu Lys Lys Val Leu Asp
Thr Asn Lys Leu Arg Thr Phe Gly 105 110
Asp Phe Cys II e Alá Tyr Lys His 125
Ma Glu Leu Gly He Pro Alá Glu 140
Asp Ser Tyr Leu Ala Alá Asp Phe Leu Gly 145150
Glu Leu Gin Gin Ser Arg Lys Met Phe Alá
165170
Thr Cys Pro Lys Leu Ser 155 160
Ser Met Tyr Alá Leu Lys 175
Thr Glu Gly Gly Val
180
Val Asn Thr Pro Val Ser Asn Leu Arg Gin Leu
185
Gly Arg Arg Glu Val Met 195
- 153 . » ·♦· · » * .:. .:..., - r
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI;
HOSSZA: 486 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULÁT í PUS: cDNS
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGGAAGATT ACGAAGAAAA ATCCGAATCG CTCATACTGC TACGCACGAA TCTGAACACT 60
ATGCTTTTAG TGGTCAAGTC CGATGCTAGT GTAGAGCTGC CTAAACTACT AATTTGCGGT 120
TACTTACGAG TGTCAGGACG TGGGGAGGTG ACGTGTTGCA ACCGTGAGGA attaacaaga 180
GATTTTGAGG GCAATCATCA TACGGTGATC CGTTCTAGAA TCATACAATA TGACAGCGAG 240
TCTGCTTTTG AGGAATTCAA CAACTCTGAT TGCGTAGTGA AGTTTTTCCT AGAGACTGGT 300
AGTGTCTTTT GGTTTTTCCT TCGAAGTGAA ACCAAAGGTA GAGCGGTGCG ACATTTGCGC 360
ACCTTCTTCG aagctaacaa TTTCTTCTTT GGATCGCATT GCGGTACCAT GGAGTATTGT 420
TTGAAGCAGG TACTAACTGA AACTGAATCT ATAATCGATT CTTTTTGCGA AGAAAGAAAT 4r80
CGTTAA 486
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 161 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
- 154 Met Glu Asp Tyr Glu Glu Lys Ser Glu Ser Leu lie Leu Leu Arg Thr 15 1015
Asn Leu Asn. Thr Met Leu Leu Val Val Lys Ser Asp Ala Ser Val Glu 20 2530
Leu Pro Lys Leu Leu lie Cys Gly Tyr Leu Arg Val Ser Gly Arg Gly 35 4045
Glu Val Thr Cys Cys Asn Arg Glu Glu Leu Thr Arg Asp Phe Glu Gly 50 5560
Asn His His Thr Val Ile Arg Ser Arg lie lie Gin Tyr Asp SerGlu
70 7580
Ser Ala Phe Glu Glu Phe Asn Asn Ser Asp Cys Val Val Lys PhePhe
9095
Leu Glu Thr Gly Ser Val Phe Trp Phe Phe Leu Arg Ser Glu Thr Lys 100 105110
Gly Arg Ala Val Arg His Leu Arg Thr Phe Phe Glu Ala Asn Asn Phe 115 120125
Phe Phe Gly Ser His Cys Gly Thr Met Glu Tyr Cys Leu Lys Gin Val 130 135140
Leu Thr Glu Thr Glu Ser lie lie Asp Ser Phe Cys Glu Glu Arg Asn 145 150 155160
Arg
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 618 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATGAGGGTTA TAGTGTCTCC TTATGAAGCT GAAGACATTC TGAAAAGATC GACTGACATG 60
TTACGAAACA TAGACAGTGG GGTCTTGAGC ACTAAAGAAT GTATCAAGGC ATTCTCGACG 120
ATAACGCGAG ACCTACATTG TGCGAAGGCT TCCTACCAGT GGGGTGTTGA CACTGGGTTA 180
TATCAGCGTA ATTGCGCTGA AAAACGTTTA ATTGACACGG TGGAGTCAAA CATACGGTTG 240
- 155 -
GCTCAACCTC TCGTGCGTGA aaaagtggcg GTTCATTTTT gtaaggatga ACCAAAAGAG 300
CTAGTAGCAT TCATCACGCG aaagtacgtg GAACTCACGG gcgtgggagt GAGAGAAGCG 360
GTGAAGAGGG aaatgcgctc TCTTACCAAA acagttttaa ataaaatgtc TTTGGAAATG 420
GCGTTTTACA TGTCACCACG AGCGTGGAAA AACGCTGAAT ggttagaact aaaattttca 480
CCTGTGAAAA TCTTTAGAGA TCTGCTATTA GACGTGGAAA cgctcaacga attgtgcgcc 540
GAAGATGATG TTCACGTCGA CAAAGTAAAT gagaatgggg acgaaaatca cgacctcgaa 600
CTCCAAGACG AATGTTAA 618
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 686 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Arg Vai lie Vai Ser Pro Tyr Glu Ala Glu Asp lie Leu Lys Arg 15 iois
Ser Thr Asp Met Leu Arg Asn lie Asp Ser Gly Vai Leu Ser Thr Lys 20 2530
Glu Cys lie Lys Ala Phe Ser Thr lie Thr Arg Asp Leu His Cys Ala 35 4045
Lys Ala Ser Tyr Gin Trp Gly Vai Asp Thr Gly Leu Tyr Gin Arg Asn SO 5560
Cys Ala Glu Lys Arg Leu lie Asp Thr Vai Glu Ser Asn He ArgLeu
70 7580
Ala Gin Pro Leu Vai Arg Glu Lys Vai Ala Vai His Phe Cys LysAsp so95
Glu Pro Lys Glu Leu Vai Ala Phe He Thr Arg Lys Tyr Vai Glu Leu 100 105110
Thr Gly Vai Gly Vai Arg Glu Ala Vai Lys Arg Glu Met Arg Ser Leu 115 120125
Thr Lys Thr Vai Leu Asn Lys Met Ser Leu Glu Met Ala Phe Tyr Met
130 135140
- 156 Ser Pro Arg Ala Trp Lys Asn Alá Glu Trp Leu Glu Leu Lys Phe Ser
145 150 155160
Pro Val Lys Ile Phe Arg Asp Leu Leu Leu Asp Val Glu Thr LeuAsn
165 170175
Glu Leu Cys Alá Glu Asp Asp Val His Val Asp Lys Val Asn Glu Asn 180 185190
Gly Asp Glu Asn His Asp Leu Glu Leu Gin Asp Glu Cys 195 200205
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 21 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
TGCTGGAGCT TGAGGTTCTG C
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: HOSSZA: 31 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: cDNS
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CGGAATTCAC CATGGAGTTG ATGTCCGACA G
- 157 A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 33 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS.· cDNS
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
AGCGGATCCA TGGCAGATTC GTGCGTAGCA GTA 33
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 216 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: CDNS
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ACATTGGTTA AGTTTAACGA AAATGATTAG TAAATAATAA ATCGAACGTG GGTGTATCTA 60
CCTGACGTAT CAACTTAAGC TGTTACTGAG TAATTAAACC AACAAGTGTT GGTGTAATGT 120
GTATGTTGAT GTAGAGAAAA ATCCGTTTGT AGAACGGTGT TTTTCTCTTC TTTATTTTTA 180
ΑΆΑΑΑΑΑΑΆΤ ΑΑΑΆΑΑΑΑΑΑ AAAAAAAAGC GGCCGC
216

Claims (78)

  1. - 158 SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1. Izolált fehérje vagy polipeptid, amely megfelel a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus (2. típus) egy fehérjéjének vagy polipeptidének.
  2. 2. Az 1. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely poliprotein, RNS-függő RNS-polimeráz, hősokk fehérje 70, hősokk fehérje 90, divergálódott burokfehérje vagy burokfehérje.
  3. 3. A 2. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely poliprotein.
  4. 4. A3, igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 3. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  5. 5. A 2. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely körülbelül 50 kDa és körülbelül 54 kDa közé eső molekulatömegű RNS-függő RNS-polimeráz.
  6. 6. Az 5. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 5. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  7. 7. A 2. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely körülbelül 63 kDa és körülbelül 67 kDa közé eső molekulatömegű hősokk fehérje 70.
  8. 8. A 7. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 9. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
    - 159 -
  9. 9. A 2. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely körülbelül 61 kDa és körülbelül 65 kDa közé eső molekulatömegű hősokk fehérje 90.
  10. 10. A 9. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 11. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  11. 11. A 2. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely körülbelül 20 kDa és körülbelül 24 kDa közé eső molekulatömegű burokfehérje.
  12. 12. A 11. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 15. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  13. 13. A 2. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely körülbelül 23 kDa és körülbelül 27 kDa közé eső molekulatömegű divergálódott burokfehérje.
  14. 14. A 13. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 13. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  15. 15. Az 1. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 7. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  16. 16. Az 1. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 17. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
  17. 17. Az 1. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tartalmaz egy 19. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát.
    - 160 -
  18. 18. Az 1. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely tisztított.
  19. 19. Az 1. igénypont szerinti izolált fehérje vagy polipeptid, amely rekombináns.
  20. 20. Az 1. igénypont szerinti fehérjét vagy polipeptidet kódoló izolált RNS-molekula.
  21. 21. A 20. igénypont szerinti izolált RNS-molekula, amely poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódol.
  22. 22. Az 1. igénypont szerinti fehérjét vagy polipeptidet kódoló izolált DNS-molekula.
  23. 23. A 22. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódol.
  24. 24. A 23. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely helikáz, papain-szerű proteáz és metil-transzferáz konzervált régióit tartalmazó poliproteint kódol.
  25. 25. A 24. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 3. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  26. 26. A 25. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 2. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciájú.
    - 161 • ···· ··· .:. .:. ...· „·.. ··:·
  27. 27. A 23. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely körülbelül 50 kDa és körülbelül 54 kDa közé eső molekulatömegű RNS-függő RNS-polimerázt kódol.
  28. 28. A 27. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely az 5. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  29. 29. A 28. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 4. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  30. 30. A 23. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely körülbelül 63 kDa és körülbelül 67 kDa közé eső molekulatömegű hősokk fehérje 70-et kódol.
  31. 31. A 30. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 9. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  32. 32. A 31. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 8. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  33. 33. A 23. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely körülbelül 61 kDa és körülbelül 65 kDa közé eső molekulatömegű hősokk fehérje 90-et kódol.
  34. 34. A 33. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 11. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy po-
    - 162 .:. .:. ...· j.. ·τ
    1ipept idet kódol.
  35. 35. A 34. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 10. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  36. 36. A 23. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely körülbelül 20 kDa és körülbelül 24 kDa közé eső molekulatömegű burokfehérjét kódol.
  37. 37. A 36. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 15. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  38. 38. A 37. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 14. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  39. 39. A 23. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely körülbelül 23 kDa és körülbelül 27 kDa közé eső molekulatömegű divergálódott burokfehérjét kódol.
  40. 40. A 39. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 13. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  41. 41. A 40. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 12. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
    - 163 .:. .:. ...· j.. ··:·
  42. 42. A 22. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 7. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  43. 43. A 42. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 6. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  44. 44. A 22. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 17. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  45. 45. A 44. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 16. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  46. 46. A 22. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 19. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő aminosav szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  47. 47. A 46. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 18. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
  48. 48. A 22. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 23. azonosítási szám szerinti szekvenciának megfelelő nukleotid szekvenciát tartalmazó fehérjét vagy polipeptidet kódol.
    - 164 -
  49. 49. 22. igénypont szerinti DNS-molekulát a DNS-molekulához képest heterológ vektorban tartalmazó expressziós rendszer.
  50. 50. A 49. igénypont szerinti expressziós rendszer, amely poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódoló DNS-molekulát tartalmaz.
  51. 51. A 22. igénypont szerinti heterológ DNS-molekulával transzformált gazdasejt.
  52. 52. Az 51. igénypont szerinti gazdasejt, amely Agrobacterium vitis vagy Agrobacterium tumefacíens.
  53. 53. Az 51. igénypont szerinti gazdasejt, amely szőlőnövénysejt, citrusnövénysejt, céklanövénysejt vagy dohánynövénysej t.
  54. 54. Az 51. igénypont szerinti gazdasejt, amely poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódoló heterológ DNS-molekulával lett transzformálva
  55. 55. 22. igénypont szerinti DNS-molekulát tartalmazó transzgént hordozó növénytermesztési változat.
  56. 56. Az 55. igénypont szerinti transzgént hordozó növénytermesztési változat, amely szőlőnövény-termesztési változat, citrusnövény-termesztési változat, céklanövénytermesztési változat vagy dohánynövény-termesztési válto zat .
    - 165 .:. .:. . ·τ
  57. 57. Az 55. igénypont szerinti transzgént hordozó növénytermesztési változat, amely poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódoló transzgént tartalmaz.
  58. 58. Eljárás szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus elleni rezisztencia átvitelére Vitis oltványra vagy gyökértörzs-termesztési változatra, vagy Nicotiana termesztési változatra, azzal jellemezve, hogy:
    Vitis oltványt vagy gyökértörzs-termesztési változatot vagy Nicotiana termesztési változatot 22. igénypont szerinti DNS-molekulával transzformálunk.
  59. 59. Az 58. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódoló DNS-molekulával transzformálunk.
  60. 60. Az 58. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy szőlőnövény-levélsodródást okozó vírusként GLRaV-2 vírus elleni rezisztenciát viszünk át.
  61. 61. Az 58. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy Agrobacterium-közvetített transzformálást hajtunk végre.
  62. 62. Az 58. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a transzformálás során:
    részecskéket gyorsítunk fel szőlőnövény vagy dohánynövénysejtekre irányítva, a részecskéknek a sejt belsejébe történő behatolását biztosító körülmények között; és
    - 166 ··· ··· ··· «φβ 9 t a DNS-molekulát tartalmazó expressziós vektort juttatunk be a sejt belsejébe.
  63. 63. Eljárás céklasárgulást okozó vírus elleni rezisztencia átvitelére céklatermesztési változatra, azzal jellemezve, hogy:
    céklatermesztési változatot a 22. igénypont szerinti DNS-molekulával transzformálunk.
  64. 64. A 63. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét kódoló DNS-molekulával transzformálunk.
  65. 65. A 63. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy Agrobacterium-közvetített transzformálást hajtunk végre .
  66. 66. A 63. igénypont szerinti eljárás, továbbá azzal jellemezve, hogy a transzformálás során:
    részecskéket gyorsítunk fel céklanövénysejtekre irányítva a részecskéknek a sejt belsejébe történő behatolását biztosító körülmények között; és a DNS-molekulát tartalmazó expressziós vektort juttatunk be a sejt belsejébe.
  67. 67. Eljárás tristeza vírus elleni rezisztencia átvitelére citrusoltvány-termesztési változatra vagy gyökértörzstermesztési változatra, azzal jellemezve, hogy:
    citrusoltvány-termesztési változatot vagy gyökértörzstermesztési változatot a 22. igénypont szerinti DNS-mole kulával transzformálunk.
    - 167 *·* ··» ·♦-* w* · **t*
  68. 68. A 67. igénypont szerinti eljárás továbbá azzal jellemezve, hogy poliproteint, RNS-függő RNS-polimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehér jet vagy burokfehérjét kódoló DNS-molekulával transzformálunk.
  69. 69. A 67. igénypont szerinti eljárás, továbbá azzal jellemezve, hogy Agrobacterium-közvetített transzformálást hajtunk végre.
  70. 70. A 67. igénypont szerinti eljárás, továbbá azzal jellemezve, hogy a transzformálás során:
    részecskéket gyorsítunk fel citrusnövénysejtekre irányítva a részecskéknek a sejt belsejébe történő behatolását biztosító körülmények között; és a DNS-molekulát tartalmazó expressziós vektort juttatunk be a sejt belsejébe.
  71. 71. Az 1. igénypont szerinti fehérjét vagy polipeptidet felismerő antitest vagy annak kötő része, vagy próba.
  72. 72. A 71. igénypont szerinti antitest vagy annak kötő részé, vagy próba, amely poliproteint, RNS-függő RNSpolimerázt, hősokk fehérje 70-et, hősokk fehérje 90-et, divergálódott burokfehérjét vagy burokfehérjét ismer fel.
  73. 73. Eljárás szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus kimutatására mintában, azzal jellemezve, hogy:
    az 1. igénypont szerinti fehérjét vagy polipeptidet felismerő antitestet vagy annak kötő részét előállítjuk;
    a mintát az antitesttel vagy annak kötő részével érintkeztetjük; és
    vizsgálati rendszer alkalmazásával egy, a szőlőnövénylevélsodródást okozó vírus mintában való jelenlétét jelző reakciót kimutatunk.
  74. 74. A 73. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy vizsgálati rendszerként enzim-kapcsolt immunszorbens vizsgálati eljárást, radioimmun vizsgálati eljárást, gél diffúziós precipitin reakciós vizsgálati eljárást, immundiffúziós vizsgálati eljárást, agglutinációs vizsgálati eljárást, fluoreszcens immunológiai vizsgálati eljárást, protein-A immunológiai vizsgálati eljárást és/vagy immunelektroforézis vizsgálati eljárást alkalmazunk.
  75. 75. Eljárás szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus kimutatására mintában, azzal jellemezve, hogy:
    próbaként a 22. igénypont szerinti DNS-molekula nukleotid szekvenciáját állítjuk elő nukleinsav hibridizációs vizsgálati eljáráshoz;
    a mintát a próbával érintkeztetjük; és egy, a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus mintában való jelenlétét jelző reakciót kimutatunk.
  76. 76. A 75. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a nukleinsav hibridizációs vizsgálati eljárásként dotblot hibridizációt, szöveti lenyomat készítést, Southernhibridizációt és/vagy Northern-hibridizációt hajtunk végre.
  77. 77. Eljárás szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus kimutatására mintában, azzal jellemezve, hogy:
    próbaként a 22. igénypont szerinti DNS-molekula nukleotid szekvenciáját állítjuk elő génamplifikációs kimutatási élj áráshoz;
    - 169 -
    a mintát a próbával érintkeztetjük; és egy, a szőlőnövény-levélsodródást okozó vírus mintában való jelenlétét jelző reakciót kimutatunk.
  78. 78. A 77. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy génamplifikációs kimutatási eljárásként polimerázláncreakciót és/vagy immun-befogásos polimeráz-láncreakciót hajtunk végre.
    A meghatalmazott:
    DANUBIA
    Szabadalmi és Védjegy Iroda Kft.
    dr. Pethő Árpád szabadalmi ügyvivő
HU0003327A 1997-05-20 1998-05-20 Grapevine leafroll virus (type 2) proteins and their uses HUP0003327A3 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US4719497P 1997-05-20 1997-05-20

Publications (2)

Publication Number Publication Date
HUP0003327A2 true HUP0003327A2 (hu) 2001-02-28
HUP0003327A3 HUP0003327A3 (en) 2002-09-30

Family

ID=21947574

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU0003327A HUP0003327A3 (en) 1997-05-20 1998-05-20 Grapevine leafroll virus (type 2) proteins and their uses

Country Status (16)

Country Link
US (3) US6197948B1 (hu)
EP (1) EP0986641A4 (hu)
AR (1) AR011740A1 (hu)
AU (1) AU746187B2 (hu)
BG (1) BG103906A (hu)
BR (1) BR9809450A (hu)
CA (1) CA2290551A1 (hu)
DE (1) DE986641T1 (hu)
ES (1) ES2146193T1 (hu)
HU (1) HUP0003327A3 (hu)
IL (1) IL132975A0 (hu)
MD (1) MD20000034A (hu)
SK (1) SK158599A3 (hu)
TR (1) TR199902852T2 (hu)
WO (1) WO1998053055A1 (hu)
ZA (1) ZA984232B (hu)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA9610721B (en) * 1995-12-21 1998-06-19 Cornell Res Foundation Inc Grapevine leafroll virus proteins and their uses.
US6197948B1 (en) 1997-05-20 2001-03-06 Cornell Research Foundation, Inc. Grapevine leafroll virus (type 2) proteins and their uses
WO2001005957A2 (en) * 1999-07-19 2001-01-25 Agritope, Inc. Grapevine leafroll-associated virus proteins
WO2004044161A2 (en) * 2002-11-06 2004-05-27 Fraunhofer Usa Expression of foreign sequences in plants using trans-activation system
US7683238B2 (en) * 2002-11-12 2010-03-23 iBio, Inc. and Fraunhofer USA, Inc. Production of pharmaceutically active proteins in sprouted seedlings
US7692063B2 (en) * 2002-11-12 2010-04-06 Ibio, Inc. Production of foreign nucleic acids and polypeptides in sprout systems
AU2004209660A1 (en) 2003-02-03 2004-08-19 Fraunhofer Usa, Inc. System for expression of genes in plants
CA2555230A1 (en) * 2004-02-20 2005-09-09 Fraunhofer Usa Inc. Systems and methods for clonal expression in plants
WO2009099877A2 (en) * 2008-01-31 2009-08-13 State Of Oregon Acting By And Through The State Board Of Higher Educ. On Behalf Of Oregon State University Closterovirus vectors and methods
US8629334B2 (en) * 2008-07-16 2014-01-14 University Of Florida Research Foundation, Inc. Viral-based transient-expression vector system for trees
CN111298923B (zh) * 2018-12-11 2021-11-30 中国食品药品检定研究院 破碎离心一体装置

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4358535A (en) 1980-12-08 1982-11-09 Board Of Regents Of The University Of Washington Specific DNA probes in diagnostic microbiology
US4480040A (en) 1981-12-03 1984-10-30 The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture Sensitive and rapid diagnosis of viroid diseases and viruses
US5288611A (en) 1983-01-10 1994-02-22 Gen-Probe Incorporated Method for detecting, identifying, and quantitating organisms and viruses
US5322770A (en) 1989-12-22 1994-06-21 Hoffman-Laroche Inc. Reverse transcription with thermostable DNA polymerases - high temperature reverse transcription
US5043272A (en) 1989-04-27 1991-08-27 Life Technologies, Incorporated Amplification of nucleic acid sequences using oligonucleotides of random sequence as primers
US5106727A (en) 1989-04-27 1992-04-21 Life Technologies, Inc. Amplification of nucleic acid sequences using oligonucleotides of random sequences as primers
US5196305A (en) 1989-09-12 1993-03-23 Eastman Kodak Company Diagnostic and amplification methods using primers having thymine at 3' end to overcome primer-target mismatch at the 3' end
US5104792A (en) 1989-12-21 1992-04-14 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Method for amplifying unknown nucleic acid sequences
CA2031659A1 (en) 1990-01-26 1991-07-27 John B. Findlay Water-insoluble reagent, nucleic acid probe, test kit and diagnostic and purification methods
ES2044784B1 (es) 1992-06-12 1994-09-01 Inia Procedimiento para la deteccion e identificacion de patogenos virales y subvirales.
US5872241A (en) 1995-01-25 1999-02-16 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Multiple component RNA catalysts and uses thereof
US5990388A (en) 1995-06-07 1999-11-23 Research Corporation Technologies, Inc. Resistance to viruses and viroids in transgenic plants and animals expressing dsRNA-binding protein
US5965355A (en) * 1995-09-21 1999-10-12 Agritope, Inc. Antibodies and proteins useful for assaying virus infection in grape plants
ZA9610721B (en) 1995-12-21 1998-06-19 Cornell Res Foundation Inc Grapevine leafroll virus proteins and their uses.
US6197948B1 (en) 1997-05-20 2001-03-06 Cornell Research Foundation, Inc. Grapevine leafroll virus (type 2) proteins and their uses
AU762038B2 (en) 1998-04-29 2003-06-19 Cornell Research Foundation Inc. Grapevine leafroll virus proteins and their uses

Also Published As

Publication number Publication date
WO1998053055A1 (en) 1998-11-26
MD20000034A (ro) 2000-09-30
BG103906A (en) 2000-06-30
US6858426B1 (en) 2005-02-22
EP0986641A1 (en) 2000-03-22
US20050183165A1 (en) 2005-08-18
HUP0003327A3 (en) 2002-09-30
BR9809450A (pt) 2002-02-13
DE986641T1 (de) 2000-09-14
EP0986641A4 (en) 2001-04-25
IL132975A0 (en) 2001-03-19
AR011740A1 (es) 2000-08-30
TR199902852T2 (xx) 2001-09-21
AU7583198A (en) 1998-12-11
AU746187B2 (en) 2002-04-18
SK158599A3 (en) 2000-06-12
CA2290551A1 (en) 1998-11-26
ES2146193T1 (es) 2000-08-01
US6197948B1 (en) 2001-03-06
ZA984232B (en) 1998-12-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6916617B2 (en) Grapevine leafroll virus proteins and their uses
Berzal-Herranz et al. The Capsicum L3 gene-mediated resistance against the tobamoviruses is elicited by the coat protein
Pang et al. Resistance to heterologous isolates of tomato spotted wilt virus in transgenic tobacco expressing its nucleocapsid protein gene.
Chen et al. A chlorotic spot disease on calla lilies (Zantedeschia spp.) is caused by a tospovirus serologically but distantly related to Watermelon silver mottle virus
Bardonnet et al. Protection against virus infection in tobacco plants expressing the coat protein of grapevine fanleaf nepovirus
HUP0003327A2 (hu) Szőlőlevél-sodródást okozó vírus (2. típus) fehérjék és alkalmazásuk
Habekuss et al. Identification of Barley mild mosaic virus isolates in Germany breaking rym5 resistance
Sun et al. Citrus miraculin‐like protein hijacks a viral movement‐related p33 protein and induces cellular oxidative stress in defence against Citrus tristeza virus
CA2290779A1 (en) Rupestris stem pitting associated virus nucleic acids, proteins, and their uses
AU762038B2 (en) Grapevine leafroll virus proteins and their uses
MXPA99010661A (en) Grapevine leafroll virus (type 2) proteins and their uses
He et al. Serological characterization of the 3′-proximal encoded proteins of beet yellows closterovirus
AU727208C (en) Grapevine leafroll virus proteins and their uses
WO1998044803A9 (en) Dna molecule encoding tomato ringspot virus proteins and uses thereof
Jung et al. Characterization and partial nucleotide sequence analysis of Alfalfa mosaic Alfamoviruses isolated from potato and azuki bean in Korea
WO1998044803A1 (en) Dna molecule encoding tomato ringspot virus proteins and uses thereof
Hughes Molecular investigations of subgroup I geminiviruses
US7279335B2 (en) Nucleic acids encoding lettuce big-vein viral proteins and utilization thereof
Rothmann An assessment of the mutation patterns in South African isolates of Potato leafroll virus and the expression of recombinant viral coat protein genes in Escherichia coli
Liu et al. Serological and molecular characterizations of a hibiscus-infecting tobamovirus in Taiwan
Robbins Molecular characterization of the interaction between cucumber necrosis virus and zoospores of the fungal vector olpidium bornovanus
Veliceasa Serological and genomic characterization of two plant RNA viruses: Barley Mild Mosaic Virus (BaMMV) and a potential cryptic virus from pine (Pinus sylvestris)
Popovich Investigation of a rapid screening method to study the effects of the snowdrop lectin (Galanthus nivalis Agglutinin) on plant pathogens
WO2000017372A2 (en) Pineapple mealybug-associated wilt virus proteins and their uses