FR2732112A1 - METHOD FOR IDENTIFYING PLANT SPECIES AND THEIR HYBRIDS - Google Patents
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Abstract
Selon le procédé de l'invention, on soumet un extrait de composés polyphénoliques, provenant d'un matériau végétal d'une espèce végétale ou de l'un de ses hybrides ou de leurs taxons de rang inférieur, ou d'un produit élaboré à partir de ce matériau, à au moins une analyse par RMN multidimensionnelle, suivie d'une analyse quantitative des signaux et du traitement statistique des données d'intégration, conduisant à l'obtention de données caractéristiques de l'espèce végétale, de l'hybride et des taxons de rang inférieur. Application à l'identification d'une espèce végétale de ses hybrides ou taxons de rang inférieur et utilisation à des fins de contrôle de leur origine.According to the method of the invention, an extract of polyphenolic compounds, derived from a plant material of a plant species or one of its hybrids or their lower rank taxa, or from an elaborated product, is subjected to from this material, to at least one multidimensional NMR analysis, followed by a quantitative analysis of the signals and the statistical processing of the integration data, leading to the obtaining of characteristic data of the plant species, of the hybrid and lower rank taxa. Application to the identification of a plant species of its hybrids or lower rank taxa and use for purposes of control of their origin.
Description
PROCEDE D'IDENTIFICATION D'ESPECESMETHOD OF IDENTIFYING SPECIES
VEGETALES ET DE LEURS HYBRIDESVEGETALES AND THEIR HYBRIDS
L'invention a pour objet un procédé d'identification d'espèces végétales et de leurs hybrides, et des taxons de rang inférieur, basé sur The subject of the invention is a method for identifying plant species and their hybrids, and lower rank taxa based on
l'utilisation d'un référentiel.the use of a repository.
Par taxons de rang inférieur, on entend en particulier sous-espèces, variétés, sous-variétés, formes et sous-formes, ainsi que cultivars ou cépages et clones, Lower-order taxa means in particular subspecies, varieties, sub-varieties, forms and sub-forms, as well as cultivars or grape varieties and clones,
sans être lié à des définitions strictes de ceux-ci. without being bound by strict definitions of these.
En prenant comme exemple Vitis vinifera, Y. labrusCA, V. riaria ou M. rupeftars qui sont des vignes comme espèce végétale, il est couramment considéré que Viti correspond au genre, vinifera, rIparla, labguaRa, ou rupestr i correspondent à l'espèce, que ces espèces comprennent plusieurs cultivars ou cépages, parmi Taking as an example Vitis vinifera, Y. labrusCA, V. riaria or M. rupeftars which are vines as a plant species, it is commonly considered that Viti corresponds to the genus, vinifera, rIparla, labguaRa, or rupestr i correspond to the species. , that these species include several cultivars or grape varieties, among
lesquels divers clones.which various clones.
Les expressions "espèces végétales" et The expressions "plant species" and
"hybrides", telles qu'utilisées dans la description et "hybrids" as used in the description and
les revendications englobent, sauf indications the claims include, unless otherwise indicated
contraires, les taxons de rang inférieur qu'elles renferment. Dans le domaine de la vigne par exemple, de nombreuses recherches sont effectuées pour mettre au point des méthodes de reconnaissance de cépages et, parmi ceux-ci, de clones, permettant aux services de contrôle de s'assurer qu'un pied de vigne, voire une bouteille de vin, correspond bien aux indications données. Leur reconnaissance par la seule observation ampélographique est difficile et rend nécessaire le recours à des contrary, the taxa of lower rank which they contain. In the field of vines, for example, a great deal of research is being done to develop methods of grape recognition and, among these, clones, allowing control services to ensure that a vine, even a bottle of wine, corresponds well to the indications given. Their recognition by the only ampelographic observation is difficult and makes it necessary to resort to
méthodes de laboratoire.laboratory methods.
Des techniques de séparation par chromatographie ont ainsi été proposées. Toutefois, elles ne permettent pas une analyse globale et reproductible des produits, une partie des tanins étant retenue sur la colonne. De plus, ces techniques ne permettent pas de Chromatography separation techniques have thus been proposed. However, they do not allow an overall and reproducible analysis of the products, some of the tannins being retained on the column. Moreover, these techniques do not allow
différencier les clones entre eux.differentiate the clones between them.
On a également rapporté l'utilisation de la RMN The use of NMR has also been reported
ou des techniques de génie génétique. or genetic engineering techniques.
Cependant, les travaux décrits, en ce qui concerne la RMN, portent essentiellement sur les vins et However, the work described, with regard to NMR, focuses on wines and
non sur les organes de la vigne.not on the organs of the vine.
Il s'agit plus spécialement d'études sur des produits issus de la fermentation de levures dans des vins blancs, comme le glycérol, ou de produits fermentescibles, comme les sucres, qui ne sont donc pas It is more specifically studies on products resulting from the fermentation of yeasts in white wines, such as glycerol, or fermentable products, such as sugars, which are therefore not
propres à la vigne.proper to the vineyard.
En ce qui concerne la RMN, il s'agit de techniques monodimensionnelles (lH et 13c) pour lesquelles les raies spectrales se chevauchent, ce qui With regard to NMR, these are one-dimensional techniques (1H and 13c) for which the spectral lines overlap, which
induit des erreurs dans les données d'intégration. induces errors in the integration data.
Quant aux techniques de génie génétique, elles présentent l'inconvénient d'être difficiles à mettre en oeuvre. De plus, elles nécessitent du personnel hautement qualifié et des équipements de laboratoires répondant à des normes strictes, ce qui ne permet pas d'envisager des applications à l'échelle industrielle, compte tenu des As for genetic engineering techniques, they have the disadvantage of being difficult to implement. In addition, they require highly qualified personnel and laboratory equipment meeting strict standards, which makes it impossible to envisage applications on an industrial scale, taking into account
coûts qui en résultent.resulting costs.
La recherche de moyens fiables de caractérisation a conduit les inventeurs à prendre en compte un type de composés présent dans la vigne et de nombreuses autres espèces végétales, et à le soumettre à une succession d'analyses réalisées dans des conditions déterminées. Les travaux effectués ont ainsi montré que, de manière inattendue, les composés polyphénoliques présentent des constantes qualitatives et quantitatives caractéristiques d'une espèce végétale et de ses hybrides et, à l'intérieur d'une espèce végétale et de ses hybrides, caractéristiques de leurs taxons de rang The search for reliable means of characterization led the inventors to take into account a type of compounds present in the vine and many other plant species, and to subject it to a succession of analyzes carried out under specified conditions. The work carried out has thus shown that, unexpectedly, the polyphenolic compounds have characteristic qualitative and quantitative constants of a plant species and its hybrids and, within a plant species and its hybrids, characteristic of their rank taxa
inférieur comme leurs sous-espèces, variétés, sous- as their subspecies, varieties, sub-species
variétés, formes et sous-formes ainsi que cultivars ou varieties, forms and subforms as well as cultivars or
cépages et mime parmi ceux-ci, des clones. grape varieties and mime among them, clones.
L'invention repose sur l'utilisation de ces composés phénoliques pour obtenir des informations constituant une carte d'identité d'une espèce végétale ou The invention is based on the use of these phenolic compounds to obtain information constituting an identity card of a plant species or
d'un hybride donné et de leurs taxons de rang inférieur. of a given hybrid and their lower rank taxa.
L'invention a donc pour but de fournir un nouveau procédé de reconnaissance d'espèces végétales et de leurs hybrides, de leurs taxons de rang inférieur basé sur l'utilisation d'un référentiel permettant une The purpose of the invention is therefore to provide a new method for recognizing plant species and their hybrids, their lower rank taxons based on the use of a reference system enabling a
discrimination de grande fiabilité. discrimination of great reliability.
L'invention vise ainsi à fournir plus spécialement un système de référence, ou banque de données, pour une espèce végétale, ou ses hybrides et leurs taxons de rang inférieur, élaboré à partir de caractéristiques des composés phénoliques qu'elles renferment. Selon un autre aspect, l'invention vise à fournir des moyens pour vérifier la nature du rang d'un The invention thus aims to provide more specifically a reference system, or database, for a plant species, or its hybrids and their lower rank taxa, developed from characteristics of the phenolic compounds they contain. In another aspect, the invention aims to provide means for verifying the nature of the rank of a
taxon d'une espèce végétale ou d'un hybride à contrôler. taxon of a plant species or a hybrid to be controlled.
Elle vise également des moyens pour contrôler à partir d'un produit issu d'un matériau végétal, l'appartenance de ce dernier à un taxon de rang inférieur It also relates to means for controlling from a product derived from a plant material, the belonging of the latter to a taxon of lower rank
d'une espèce végétale ou d'un hybride. of a plant species or a hybrid.
Le procédé, selon l'invention, d'identification d'une espèce végétale, ou de ses hybrides, ou d'un taxon de rang inférieur de cette espèce ou de ses hybrides, est caractérisé en ce qu'on soumet un extrait essentiellement constitué par des composés polyphénoliques, provenant d'un matériau végétal donné de ladite espèce ou hybride, de leurs taxons de rang inférieur, ou d'un produit élaboré à partir de ces matériaux, à au moins une analyse par RMN multidimensionnelle, suivie d'une analyse quantitative des signaux et du traitement statistique des données d'intégration, conduisant à l'obtention de données caractéristiques de l'espèce végétale, de The method, according to the invention, for identifying a plant species, or its hybrids, or a lower-ranking taxon of this species or its hybrids, is characterized by subjecting an essentially constituted extract polyphenolic compounds, derived from a given plant material or hybrid, from their lower rank taxa, or from a product made from these materials, to at least one multidimensional NMR analysis, followed by a quantitative analysis of the signals and the statistical processing of the integration data, leading to the obtaining of characteristic data of the plant species,
l'hybride, ou de leurs taxons de rang inférieur. the hybrid, or their lower rank taxa.
L'exploitation des données des cartes de RMN obtenues selon l'invention, concernant les extraits polyphénoliques des matériaux et produits étudiés, permet de disposer d'une technique de reconnaissance de grande fiabilité des taxons de rang inférieur auxquels appartiennent ces matériaux, ou à partir desquels sont obtenus ces produits. Cette fiabilité implique la réalisation des extractions et des analyses dans les The exploitation of the data of the NMR maps obtained according to the invention, concerning the polyphenolic extracts of the materials and products studied, makes it possible to have a high reliability recognition technique of the lower rank taxa to which these materials belong, or from from which these products are obtained. This reliability implies carrying out the extractions and analyzes in the
mêmies conditions.same conditions.
D'une manière avantageuse, ces données s'avèrent constantes pour un matériau donné, ce qui permet leur utilisation pour élaborer un système de référence ou de banque de données constituant une signature du potentiel génétique des taxons de rang Advantageously, these data prove to be constant for a given material, which allows their use to develop a reference system or database constituting a signature of the genetic potential of rank taxa
inférieur étudiés.lower studied.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, les extraits polyphénoliques sont soumis à une analyse RMN hétéronucléaire lH-13C, procurant des informations sur la structure des polyphénols présents According to a preferred embodiment of the invention, the polyphenol extracts are subjected to 1H-13C heteronuclear NMR analysis, providing information on the structure of the polyphenols present.
dans les extraits.in the extracts.
On a plus spécialement recours à une analyse More specifically, an analysis is
bidimensionnelle (2D).two-dimensional (2D).
Au moyen d'une détection protonique, en utilisant d'une manière avantageuse une sonde de détection dite inversée 1H- 13C, donc de grande sensibilité 1H, on établit les corrélations entre le 1H et le 13C (taches de corrélation) par le biais de leur By means of proton detection, advantageously using a so-called inverted 1H-13C detection probe, thus of high sensitivity 1H, the correlations between 1H and 13C (correlation spots) are established by means of their
couplage mutuel.mutual coupling.
De manière avantageuse, on a plus spécialement recours à l'analyse HMBC (Heteronuclear Multiple Bond Connectivity), qui établit des corrélations hétéronucléaires lH-l3C à longue distance. On voit ainsi le couplage entre les protons et les carbones 13 distants Advantageously, the HMBC (Heteronuclear Multiple Bond Connectivity) analysis, which establishes long-range heteronuclear IH-13C correlations, is especially useful. We thus see the coupling between the protons and the distant carbons 13
de deux ou trois liaisons.two or three links.
La séquence d'impulsions utilisée est plus spécialement celle d'une HMBCGAS (Gradient Accelerated Spectroscopy). Des impulsions de gradients de champ magnétique sont envoyées au cours de l'expérience, ce qui permet une suppression satisfaisante des pics centraux, c-à-d horizontalement sur le milieu du spectre ne contenant pas d'informations, et ceci avec un temps d'expérience réduit dans les conditions de la mise en The pulse sequence used is more specifically that of a HMBCGAS (Gradient Accelerated Spectroscopy). Pulses of magnetic field gradients are sent during the experiment, which allows a satisfactory suppression of the central peaks, that is to say horizontally on the medium of the spectrum containing no information, and this with a time of experience in the conditions of implementation
oeuvre du procédé par rapport à 1'HMBC sans gradients. process compared to HMBC without gradients.
De plus, les cartes HMBC-GAS présentent l'avantage d'une plus grande lisibilité. En effet, elles ne contiennent pas de traînées verticales ("tl noise) situées à la fréquence de chaque signal et provenant de l'imperfection du système d'élimination de tels signaux dans le cas de "détection en quadrature" dans les In addition, HMBC-GAS cards have the advantage of greater readability. Indeed, they do not contain vertical streaks ("tl noise) located at the frequency of each signal and coming from the imperfection of the system of elimination of such signals in the case of" quadrature detection "in the
expériences sans gradients.experiences without gradients.
Les interférogrammes (FID) sont tout d'abord multipliés par une fonction sinusoïdale carrée pour augmenter le rapport signal/bruit (S/B) et subissent une Interferograms (FID) are first multiplied by a square sinusoidal function to increase the signal-to-noise ratio (S / N) and undergo a
Transformée de Fourier en magnitude. Fourier transform in magnitude.
En variante, ou en plus de l'analyse HMBC-GAS, on soumet l'extrait polyphénolique à une analyse HMQC (Heteronuclear Multiple Quantum Correlation). Cette Alternatively, or in addition to HMBC-GAS analysis, the polyphenol extract is subjected to HMQC (Heteronuclear Multiple Quantum Correlation) analysis. This
analyse permet d'étudier les corrélations hétéro- analysis makes it possible to study the heterogeneous correlations
nucléaires entre les 1H et les 13C situés à une seule liaison. Les interférogrammes (FID) sont tout d'abord multipliés par une fonction sinusoïdale carrée pour augmenter le rapport S/B, et subissent une Transformée de Fourier, mais dans ce cas-là en amplitude, puis ils sont phases. Dans une autre variante, utilisée seule ou en combinaison avec l'analyse HMBC-GAS et/ou HMQC, on soumet l'extrait à étudier à une analyse HMQC-HOHAHA (HOmonuclear HArtman HAhn). Cette analyse permet de voir non seulement le couplage d'un carbone 13 avec le proton qu'il porte directement, mais également avec tous les protons qui sont couplés à ce dernier. Les principaux paramètres expérimentaux correspondent à ceux de 1'HMQC between 1H and 13C at a single link. The interferograms (FID) are first multiplied by a square sinusoidal function to increase the S / B ratio, and undergo a Fourier Transform, but in this case in amplitude, then they are phases. In another variant, used alone or in combination with HMBC-GAS and / or HMQC analysis, the extract to be studied is subjected to HMQC-HOHAHA analysis (HOmonuclear HArtman HAhn). This analysis makes it possible to see not only the coupling of a carbon 13 with the proton it bears directly, but also with all the protons that are coupled to the latter. The main experimental parameters correspond to those of the HMQC
auxquels est ajouté un "temps de mélange" (spin-lock). to which is added a "spin-lock time".
Pour réaliser ces expériences, il est avantageux d'utiliser un spectromètre équipé d'un système de régulation de la température très stable, afin To carry out these experiments, it is advantageous to use a spectrometer equipped with a very stable temperature control system in order to
d'éviter des perturbations sur les cartes de RMN. to avoid disturbances on the NMR charts.
Les taches de corrélation des analyses RMN sont ensuite intégrées et les données obtenues font l'objet The correlation spots of the NMR analyzes are then integrated and the data obtained are
d'une analyse statistique multidimensionnelle. multidimensional statistical analysis.
L'intégration correspond au calcul du volume de chaque pic de corrélation en additionnant tous les points présents dans le secteur délimité autour de chaque tache de corrélation, chaque tache de corrélation étant The integration corresponds to the calculation of the volume of each correlation peak by adding all the points present in the sector delimited around each correlation task, each correlation task being
digitalisée en points d'intensité variable. digitized in points of variable intensity.
L'ensemble des données d'intégration est soumis All integration data is submitted
à une analyse multidimensionnelle.to a multidimensional analysis.
On a ainsi plus spécialement recours à l'analyse de variance (ANOVA), et/ou à l'analyse en composantes principales (ACP), et/ou à l'analyse In particular, analysis of variance (ANOVA) and / or principal components analysis (PCA) and / or analysis
factorielle discriminante (AFD).discriminant factorial (AFD).
L'ANOVA permet de sélectionner les taches de corrélation (variables) qui apportent le plus d'informations. L'ACP représente les individus (clones) dans un espace à deux dimensions, les individus étant ANOVA allows you to select correlation (variable) tasks that provide the most information. PCA represents individuals (clones) in a two-dimensional space, individuals being
initialement présents dans un espace à N dimensions (N - initially present in a space with N dimensions (N -
nombre de variables sélectionnées). Cette analyse permet d'étudier les individus dans l'espace des composantes principales, de manière à pouvoir déterminer l'existence number of selected variables). This analysis makes it possible to study the individuals in the space of the principal components, so as to be able to determine the existence
possible de groupes et d'anomalies.possible groups and anomalies.
L'AFD est utilisée pour discriminer de manière AFD is used to discriminate
optimale les groupes prédéfinis de clones. optimal predefined groups of clones.
Le recours à l'ANOVA permet de sélectionner les variables les plus riches en informations. On rappelle que cette technique repose sur le calcul d'un facteur F proportionnel au rapport de la variance calculée tous groupes confondus sur la somme des variances calculées à l'intérieur de chaque groupe pré-défini. Dans le cas de The use of ANOVA makes it possible to select the most informative variables. It is recalled that this technique is based on the calculation of a factor F proportional to the ratio of the variance calculated for all groups together on the sum of the variances calculated within each pre-defined group. In the case of
la vigne, ces groupes sont les cépages, ou les clones. the vine, these groups are the grape varieties, or the clones.
Les variables pour lesquelles F est le plus élevé sont retenues pour 1'ACP et 1'AFD. La réduction de ce nombre de variables avant de procéder à l'analyse multidimensionnelle permet de s'assurer de l'obtention de résultats fiables. De tels résultats sont obtenus avec un rapport nombre d'échantillons/nombre de variables The variables for which F is the highest are retained for the ACP and the AFD. Reducing this number of variables before performing the multidimensional analysis ensures that reliable results are obtained. Such results are obtained with a ratio of number of samples / number of variables
supérieur à 3.greater than 3.
Une fois le nombre de variables réduit, une analyse en composantes principales, ACP, est effectuée sur les données. Cette technique calcule de nouvelles variables (composantes principales orthogonales) par combinaison linéaire des variables originales, à partir de l'ensemble des individus (cépages, clones) auxquels sont associés des caractères quantitatifs. Ces composantes principales permettent de distinguer le mieux possible les individus, sans présupposer l'existence de Once the number of variables is reduced, a principal component analysis, ACP, is performed on the data. This technique calculates new variables (orthogonal principal components) by linear combination of the original variables, from the set of individuals (grape varieties, clones) with which quantitative characters are associated. These main components make it possible to distinguish individuals as best as possible, without presupposing the existence of
regroupements parmi les individus.groupings among individuals.
L'analyse est réalisée sur des données brutes. The analysis is performed on raw data.
On obtient une représentation des individus dans un plan à deux dimensions o le premier axe calculé possède la plus grande variance conduisant à la plus grande dispersion des individus sur cet axe. Cette analyse permet de détecter l'existence de groupes ou d'individus atypiques. Pour discriminer de manière optimale les individus constitués de sous-groupes définis (variétés, cultivars, clones...), ces distinctions n'étant pas exhaustives, ni limitatives, par les résultats de l'ACP, on réalise avantageusement une AFD. A cet effet, on calcule de nouvelles variables, combinaisons linéaires des variables originales, en recherchant un centre de We obtain a representation of the individuals in a two-dimensional plane where the first calculated axis has the greatest variance leading to the greatest dispersion of individuals on this axis. This analysis makes it possible to detect the existence of atypical groups or individuals. To discriminate optimally individuals with defined subgroups (varieties, cultivars, clones ...), these distinctions are not exhaustive or limiting, by the results of the PCR, it is advantageously carried out an AFD. For this purpose, new variables, linear combinations of the original variables, are calculated by searching for a
gravité pour chaque groupe le plus éloigné possible. severity for each group as far away as possible.
L'AFD est ensuite utilisée pour l'affectation d'individus AFD is then used for the assignment of individuals
supplémentaires à l'un des groupes précédents. additional to one of the previous groups.
Les étapes qui précèdent sont avantageusement réalisées sur les extraits polyphénoliques totaux d'un matériau végétal de l'espèce végétale ou de l'hybride à étudier, ou d'un produit élaboré à partir de cette espèce végétale ou de cet hybride, ce matériau et ce produit The foregoing steps are advantageously carried out on the total polyphenol extracts of a plant material of the plant species or of the hybrid to be studied, or of a product produced from this plant species or from this hybrid, this material and this product
étant appelés ci-après matières premières. hereinafter referred to as raw materials.
Ces matières premières sont soumises à une et, avantageusement, plusieurs extractions réalisées dans des conditions identiques. On utilise des solvants organiques, le cas échéant additionnés d'eau. Des solvants appropriés comprennent l'acétone, l'acétate These raw materials are subjected to one and, advantageously, several extractions carried out under identical conditions. Organic solvents are used, if necessary added with water. Suitable solvents include acetone, acetate
d'éthyle, l'éther, seuls ou en mélange. of ethyl, ether, alone or as a mixture.
Pour des commodités de manipulation, il est avantageux d'utiliser ces extraits sous forme lyophilisée. Les matières premières proviennent d'espèces végétales ou de leurs hybrides possédant des organes végétaux riches en composés polyphénoliques. On citera tout particulièrement la vigne, le champ de l'invention s'étendant toutefois à la reconnaissance d'autres tanins que ceux de la vigne, comme les tanins oenologiques de For convenience of handling, it is advantageous to use these extracts in freeze-dried form. Raw materials come from plant species or their hybrids with plant organs rich in polyphenolic compounds. Of particular note is the vine, the scope of the invention extending however to the recognition of other tannins than those of the vine, as the oenological tannins of
pin, de chine, ou de noix de galle.pine, china, or walnut.
La technique de différenciation de l'invention présente également un grand intérêt pour la reconnaissance de différentes variétés d'arbres fruitiers (par exemple de pommiers), ou de variétés florales The differentiation technique of the invention is also of great interest for the recognition of different varieties of fruit trees (for example of apple trees), or of flower varieties.
(notamment de rosiers), ou encore de plantes médicinales. (including roses), or medicinal plants.
Les organes végétaux utilisés pour l'obtention des extraits sont choisis, avantageusement, en tenant compte de leur richesse en composés polyphénoliques et de leur traitement facile. Il s'agit par exemple de feuilles, de graines, de pépins ou, le cas échéant, d'écorces ou de The plant organs used to obtain the extracts are chosen, advantageously, taking into account their richness in polyphenolic compounds and their easy treatment. This includes, for example, leaves, seeds, pips or, where appropriate, bark or
pétales de fleurs.flower petals.
Les produits élaborés à partir de l'espèce ou de l'organe végétal comprennent du jus de fruits, ou des produits issus de leur fermentation, comme le vin ou la bière. L'invention fournit ainsi les moyens, à partir du contenu polyphénolique d'un extrait de végétal, d'établir un ensemble de données caractéristiques d'une espèce végétale ou de ses hybrides et, selon un aspect de grand intérêt, de taxons de rang inférieur de cette Products made from the species or plant organ include fruit juice, or products derived from their fermentation, such as wine or beer. The invention thus provides the means, from the polyphenolic content of a plant extract, to establish a set of characteristic data of a plant species or its hybrids and, according to an aspect of great interest, rank taxa lower than this
espèce végétale ou de ses hybrides. plant species or its hybrids.
Compte-tenu du caractère constant obtenu pour ces données, dans les conditions énoncées ci-dessus, ces dernières sont utilisées selon l'invention pour Given the constant nature obtained for these data, under the conditions set out above, the latter are used according to the invention for
constituer une banque servant de référentiel. establish a bank as a repository.
Ce référentiel est donc établi, par accumulation de résultats, en opérant dans des conditions identiques, pour une espèce végétale et ses hybrides, ou pour les taxons de rang inférieur, selon l'organe végétal ou le produit élaboré à partir de l'organe végétal, d'o This reference is established, by accumulation of results, by operating under identical conditions, for a plant species and its hybrids, or for taxons of lower rank, according to the plant organ or the product made from the plant organ , from where
sont extraits les composés polyphénoliques. the polyphenolic compounds are extracted.
L'invention vise un procédé d'identification d'une espèce végétale ou de ses hybrides et de leurs taxons de rang inférieur, caractérisé en ce qu'on soumet un extrait provenant d'un organe végétal, ou d'un produit élaboré à partir de cet organe ou de l'espèce végétale, de ses hybrides et de leurs taxons de rang inférieur, à une analyse par RMN multidimensionnelle et au traitement des données de RMN comme indiqué ci- dessus, et on compare les résultats obtenus aux données d'un référenciel The invention relates to a process for the identification of a plant species or its hybrids and their lower rank taxa, characterized in that an extract originating from a plant organ or from a product produced from from this organ or plant species, its lower rank hybrids and taxa, to multidimensional NMR analysis and to the processing of NMR data as indicated above, and the results obtained are compared with the data of a reference
correspondant à l'espèce.corresponding to the species.
L'invention fournit ainsi les moyens de contrôler avec une grande précision une origine et, par là, un ensemble de qualités d'un matériau végétal ou d'un produit élaboré à partir de ce matériau, comme les jus de fruits ou des produits issus de leur fermentation comme The invention thus provides the means of controlling with great precision an origin and, hence, a set of qualities of a plant material or a product made from this material, such as fruit juices or products derived from of their fermentation as
le vin ou la bière.wine or beer.
D'autres caractéristiques et avantages de l'invention sont donnés dans les exemples qui suivent aux Other characteristics and advantages of the invention are given in the examples which follow at
fins d'illustration.for illustration purposes.
Dans ces exemples, il est fait référence aux figures 1 à 17, qui représentent respectivement: - les figures 1 à 3, représentent respectivement les cartes de 1'HMBC-GAS, l'HMQC et l'HiMQC- HOHAHA d'extraits de pépins de raisin du clone Merlot Noir 343, - la figure 4, les résultats de l'ANOVA sur l'HMBC d'extraits de pépins de différents cépages, - la figure 5, la classification hiérarchique pour ces cépages (sur HMBC-GAS), - les figures 6 et 7, les résultats respectivement de i'ACP et de 1'AFD sur 1'HMBC-GAS de ces cépages, - les figures 8, 9 et 10, les résultats de l'ANOVA sur 1'HMBC-GAS, respectivement de Merlot Noir, Cabernet Franc et Cabernet Sauvignon, - les figures 11, 12 et 13, les résultats de l'ACP sur l'HMBC-GAS, respectivement de Merlot Noir, Cabernet Franc et Cabernet Sauvignon, - les figures 14, 15 et 16, les résultats correspondant de 1'AFD, - la figure 17, la carte de 1'HMBC-GAS gradients de feuilles de vigne de Cabernet Sauvignon 337, et - la figure 18, les résultats de 1'ANOVA sur In these examples, reference is made to FIGS. 1 to 17, which represent respectively: FIGS. 1 to 3 show respectively the maps of HMBC-GAS, HMQC and HiMQC-HOHAHA of seed extracts of grapes of the Black Merlot clone 343, - Figure 4, the results of the ANOVA on the HMBC of seed extracts of different grape varieties, - Figure 5, the hierarchical classification for these grape varieties (on HMBC-GAS), FIGS. 6 and 7 show the results of ACP and AFD respectively on the HMBC-GAS of these grape varieties, FIGS. 8, 9 and 10, the results of ANOVA on HMBC-GAS. respectively, of Merlot Noir, Cabernet Franc and Cabernet Sauvignon, - Figures 11, 12 and 13, the results of the PCA on HMBC-GAS, respectively Merlot Noir, Cabernet Franc and Cabernet Sauvignon, - Figures 14, 15 and 16, the corresponding results of AFD, FIG. 17, map of HMBC-GAS grape leaves gradients of Cabernet Sauvignon 337, and FIG. 18, the results of the NANOVA on
1'HMBC-GAS de feuilles de vigne.HMBC-GAS of vine leaves.
paJ_: Etude d'extraits de pépins de raisin. On rapporte un protocole opératoire appliqué paJ_: Study of grape seed extracts. An operating protocol applied is reported
aux pépins de raisin de clones de trois cépages. grape seed clones of three grape varieties.
Il s'agit des cépages de Cabernet Franc (en abrégé CF), Cabernet Sauvignon (en abrégé CS), et Merlot Noir (en abrégé MN) et des clones: N 312, 332, 331, 330, 187 de Blanquefort et, N 312, 332, 331 de Montagne, pour CF; N 335, 337, 339, 341, 191 pour CS et These are Cabernet Franc (abbreviated CF), Cabernet Sauvignon (abbreviated as CS), and Merlot Noir (abbreviated as MN) and clones: N 312, 332, 331, 330, 187 from Blanquefort and, N 312, 332, 331 of Mountain, for CF; N 335, 337, 339, 341, 191 for CS and
N 181, 343, 346, 347, 348 pour MN.N 181, 343, 346, 347, 348 for MN.
Ce protocole opératoire comprend: I. l'extraction des polyphénols; II. l'analyse RMN des extraits obtenus; This operating procedure comprises: I. the extraction of polyphenols; II. NMR analysis of the extracts obtained;
III. l'intégration des données de l'analyse RMN; et IV. III. integration of NMR analysis data; and IV.
une analyse statistique de ces résultats. a statistical analysis of these results.
Chacune de ces étapes est détaillée ci-après. Each of these steps is detailed below.
I. Extraction des polyphénols Trois extraits de chaque clone ont été préparés en procédant comme suit: On fait macérer 50 g de pépins de raisins secs pendant 24 heures à l'abri de la lumière dans 60 ml de I. Extraction of polyphenols Three extracts of each clone were prepared by proceeding as follows: 50 g of seed of raisins were macerated for 24 hours in the dark from 60 ml of
mélange acétone/eau (2/3).acetone / water mixture (2/3).
On soumet le mélange à une étape de lixiviation The mixture is subjected to a leaching step
pendant 15 minutes. On récupère une première fraction. for 15 minutes. We recover a first fraction.
On ajoute 310 ml du même mélange de solvant aux pépins macérés et on le soumet à une lixiviation pendant 310 ml of the same solvent mixture was added to the macerated pips and leached for
à 12 heures. On récupère une deuxième fraction. at 12 o'clock. We recover a second fraction.
On réunit les deux fractions et on évapore We combine the two fractions and evaporate
l'acétone sous pression réduite à 30 C. acetone under reduced pressure at 30 C.
On extrait la solution restante par de l'acétate d'éthyle (AcOEt), selon le schéma suivant: Volume AcOEt (ml) Agitation 10 min 5 min 5 min 50 5 min Les deux couches sont alors centrifugées pour The remaining solution is extracted with ethyl acetate (AcOEt), according to the following scheme: AcOEt volume (ml) Agitation 10 min 5 min 5 min 50 5 min The two layers are then centrifuged for
éliminer l'interface insoluble.eliminate the insoluble interface.
Après évaporation de l'acétate d'éthyle, on After evaporation of the ethyl acetate,
dissout l'extrait dans l'eau, puis on le lyophilise. dissolve the extract in water and freeze-dry.
Le rendement d'extraction est de 2g/lOOg de The extraction yield is 2 g / 100 g of
pépins secs environ.dried seeds about.
Les extraits polyphénoliques des pépins renferment principalement des flavanols, catéchine et épicatéchine, répondant aux formules suivantes, ainsi que The polyphenolic extracts of pips contain mainly flavanols, catechin and epicatechin, corresponding to the following formulas, as well as
leurs polymères.their polymers.
OH OHO HOOH OHO HO
HO OHO O
II.. v_--OHII .. v _-- OH
f OH 01-f OH 01-
OH épicatéchine catuchine II. Analyse par RNm Une quantité d'extrait identique pour chaque clone (100 mg) est dissoute dans du diméthyl sulphoxyde deutérié (DMSO-d6) et analysée par RMN 2D. Trois expériences sont enregistrées pour chaque extrait: On utilise une sonde de détection dite inversée lH-l3C, qui présente l'avantage d'une très grande OH epicatechin catuchin II. NMR Analysis An identical amount of extract for each clone (100 mg) is dissolved in deuterated dimethyl sulphoxide (DMSO-d6) and analyzed by 2D NMR. Three experiments are recorded for each extract: A so-called inverted detection probe 1H-13C is used, which has the advantage of a very large
sensibilité 1H.sensitivity 1H.
On obtient - le spectre du proton par projection sur l'axe horizontal, le spectre du carbone 13 par projection sur l'axe vertical, - les corrélations entre ces deux noyaux (taches de corrélation de la carte 2D) par le biais de We obtain - the proton spectrum by projection on the horizontal axis, the carbon 13 spectrum by projection on the vertical axis, - the correlations between these two nuclei (correlation spots of the 2D map) by means of
leur couplage mutuel.their mutual coupling.
Expérience i: Analyse HMBC (ref 1) donnant les corrélations hétéronucléaires (lH-13C) à longues Experiment i: HMBC analysis (ref 1) giving long heteronuclear (1H-13C) correlations
distances (2JC-H et 3JC-H).distances (2JC-H and 3JC-H).
Les références numériques "ref. 1" et suivantes sont précisées dans la partie "Bibliographie" en fin de The numerical references "ref.1" and following are specified in the "Bibliography" section at the end of
description.description.
La séquence d'impulsion utilisée est celle The pulse sequence used is the one
d'une HMBC -GAS.of an HMBC -GAS.
Les paramètres d'acquisition sont les suivants. The acquisition parameters are as follows.
La fréquence d'excitation dans la dimension 1H est de The excitation frequency in the dimension 1H is
500,14021 MHz et de 125,7728 MHz dans la dimension 13C. 500.14021 MHz and 125.7728 MHz in the 13C dimension.
La fenêtre spectrale est de 5319,15 Hz dans la dimension The spectral window is 5319.15 Hz in the dimension
1H et de 27670,02 Hz dans la dimension 13C. 1H and 27670.02 Hz in the 13C dimension.
Chaque signal de précession libre (FID) est digitalisé sur 2048 points et 512 expériences sont enregistrées dans la dimension 13C. Les données d'acquisition sont tout d'abord multipliées par une sinusoïde carrée pour augmenter le rapport signal/bruit (S/B) et subissent une Transformée de Fourier en Each free precession signal (FID) is digitized on 2048 points and 512 experiments are recorded in the 13C dimension. The acquisition data is first multiplied by a square sinusoid to increase the signal-to-noise ratio (S / N) and undergoes a Fourier Transform in
magnitude. Pour chaque expérience, 16 FID sont accumulés. magnitude. For each experiment, 16 FIDs are accumulated.
Le temps d'expérience est de 4 h. Expérience 2: Analyse HMQC (ref 2) donnant les corrélations hétéronucléaires (1H-l3C) directes (1JC-H). Les principaux paramètres d'acquisition des The experience time is 4 hours. Experiment 2: HMQC analysis (ref 2) giving the heteronuclear correlations (1H-13C) direct (1JC-H). The main acquisition parameters of
données sont les suivants.data are as follows.
La fréquence d'excitation dans la dimension 1H est de 500,139658 MHz et de 125,7672 MHz dans la dimension 13C. La largeur spectrale est de 3787,88 Hz The excitation frequency in the 1H dimension is 500.139658 MHz and 125.7672 MHz in the 13C dimension. The spectral width is 3787.88 Hz
dans la dimension 1H et de 16520,27 Hz dans celle du 13C. in dimension 1H and 16520.27 Hz in that of 13C.
Chaque FID est digitalisé sur 2048 points et 256 expériences sont enregistrées dans la dimension 13C contre 512 expériences pour l'HMBCGAS. Cette réduction du nombre d'expériences détériore la résolution des taches de corrélation dans la dimension 13C, mais permet de conserver un temps d'expérience identique à celui de l'HMBC. Pour chaque expérience, 32 FID sont accumulés pour parvenir & un rapport S/B convenable. Le temps d'expérience est de 5 h. Les données d'acquisition sont tout d'abord multipliées par une fonction sinusoïdale carrée pour augmenter le rapport S/B et subissent une Transformée de Each FID is digitized on 2048 points and 256 experiments are recorded in the 13C dimension against 512 experiments for the HMBCGAS. This reduction in the number of experiments deteriorates the resolution of the correlation spots in the 13C dimension, but makes it possible to maintain an experiment time identical to that of the HMBC. For each experiment, 32 FIDs are accumulated to achieve a proper S / N ratio. The experience time is 5 hours. The acquisition data is first multiplied by a square sinusoidal function to increase the S / N ratio and undergo a Transform of
Fourier en amplitude, puis sont phasées. Fourier in amplitude, then are phased.
Expérience 3: HMQC-HOHAHA (ref. 3) donnant les corrélations hétéronucléaires (lH-13C) relayées aux Experiment 3: HMQC-HOHAHA (ref.3) giving the heteronuclear correlations (1H-13C) relayed to
protons couplés.coupled protons.
Les principaux paramètres expérimentaux correspondent à ceux de 1'HMQC auxquels est ajouté "un The main experimental parameters correspond to those of the HMQC to which is added "a
temps de mélange" (spin-lock).mixing time "(spin-lock).
Les trois expériences sont enregistrées à 303 K. Le spectromètre est équipé d'un système de régulation de la température très stable, ce qui évite des perturbations sur les cartes RMN, comme des traînées au niveau des taches de corrélation. Les cartes de RMN obtenues à l'issue de chacune de ces trois expériences sont données respectivement sur The three experiments are recorded at 303 K. The spectrometer is equipped with a very stable temperature control system, which avoids disturbances on the NMR maps, such as streaks at the correlation spots. The NMR maps obtained at the end of each of these three experiments are respectively given
les figures i à 3.Figures i to 3.
III. ntégration L'information contenue dans les cartes RMN 2D de chaque clone est traduite en données numériques par le calcul du volume de chaque pic de corrélation en III. The information contained in the 2D NMR maps of each clone is translated into numerical data by calculating the volume of each peak of correlation.
utilisant un système informatisé.using a computerized system.
A cet effet, on délimite des secteurs autour de chaque tache de corrélation et le volume est calculé en additionnant tous les points présents dans le secteur (chaque tache de corrélation est digitalisée en points For this purpose, we define sectors around each correlation task and the volume is calculated by adding all the points present in the sector (each correlation task is digitized in points
d'intensité variable).variable intensity).
Les données obtenues font ensuite l'objet d'une The data obtained is then subjected to a
analyse statistique multidimensionnelle. multidimensional statistical analysis.
IV. nalyse statistiqu- mltid ninlle. IV. statistical analysis - mltid ninlle.
données obtenue. avec 1 'HiBC-GASg IV.A. analyse des cépaes: a) analyse de variance (ANOVA) Par analyse de variance, on sélectionne les taches de corrélation (variables) qui apportent le plus data obtained. with the HiBC-GASg IV.A. analysis of cepas: a) analysis of variance (ANOVA) By analysis of variance, we select the correlation spots (variables) that bring the most
d'informations (ref 4 et 5).information (ref 4 and 5).
Pour les données obtenues avec l'HMBC-GAS, qui sont représentées sur la figure 4, les variables les plus discriminantes (F supérieur & 150) sont les suivantes: For the data obtained with the HMBC-GAS, which are represented in FIG. 4, the most discriminating variables (F higher than 150) are the following:
N 22, 25, 27, 28, 31, 32, 34, 35, 37, 38, 42 et 44. N 22, 25, 27, 28, 31, 32, 34, 35, 37, 38, 42 and 44.
Ces variables correspondent principalement & des taches de corrélation de 1H entre 2 et 3 ppm d'une These variables correspond mainly to 1H correlation spots between 2 and 3 ppm of a
part et entre 6 et 7 ppm d'autre part. and between 6 and 7 ppm on the other hand.
b) analyse hiérarchique des individus On procède ensuite & une classification hiérarchique des individus de telle sorte que les distances entre eux soient fonction de leur similarité et b) hierarchical analysis of the individuals Then a hierarchical classification of the individuals is carried out so that the distances between them depend on their similarity and
ceci sans présupposer l'existence de groupes. this without presupposing the existence of groups.
Comme le montre la figure 5, qui représente l'analyse des clusters, les cépages sont assez bien différenciés puisque seuls les échantillons marqués d'un As shown in Figure 5, which represents the cluster analysis, the grape varieties are quite well differentiated since only the samples marked with a
astérisque sont mal classés.asterisk are misclassified.
Ces échantillons correspondent aux clones 191 de CS et 343 de MN. Les données d'intégration mettent en évidence qu'ils présentent des caractéristiques These samples correspond to clones 191 of CS and 343 of MN. The integration data show that they have characteristics
différentes des clones issus des mêmes cépages. different clones from the same grape varieties.
c) analyse en composantes principales (ACP) Cette analyse (ref 6, 7 et 8) permet une analyse des individus (clones) dans un espace à deux dimensions, les individus étant initialement présents dans un espace à N dimensions, N étant le nombre de variables sélectionnées. On étudie ainsi la structure des individus de manière à pouvoir déterminer l'existence c) principal components analysis (PCA) This analysis (refs 6, 7 and 8) allows an analysis of the individuals (clones) in a two-dimensional space, the individuals being initially present in a space with N dimensions, N being the number selected variables. We study the structure of individuals in such a way as to be able to determine the existence
possible de groupes et d'anomalies.possible groups and anomalies.
Les résultats obtenus représentés sur la figure 6, pour F supérieur à 30, montrent que les cépages sont The results obtained represented in FIG. 6, for F greater than 30, show that the grape varieties are
dans l'ensemble bien différenciés. overall well differentiated.
Les clones à l'intérieur du cépage CS sont également bien différenciés, avec une plus ou moins The clones inside the CS grape are also well differentiated, with a more or less
grande similarité des clones.great similarity of the clones.
Il n'en est pas de même pour les autres cépages, ce qui résulte vraisemblablement du choix de variables selon le critère du cépage, qui ne sont pas This is not the case for the other grape varieties, which probably results from the choice of variables according to the grape variety criterion, which are not
discriminantes pour les clones des cépages CF et MN. discriminant for clones of CF and MN varieties.
d) analyse factorielle discriminante (AFD) Cette analyse dispose les échantillons dans un espace à deux dimensions de manière à avoir les barycentres des groupes pré-définis (ref 6, 7 et 8) les plus éloignés possibles, ceci en construisant des axes discriminants qui sont des combinaisons linéaires des variables de départ. On rapporte sur la figure 7 les résultats de l'AFD obtenue à partir des données de d) discriminant factor analysis (DFA) This analysis places the samples in a two-dimensional space so as to have the barycenters of the pre-defined groups (ref 6, 7 and 8) as far as possible, by constructing discriminating axes that are linear combinations of the starting variables. Figure 7 shows the results of the AFD obtained from the data of
l'HMBC-GAS (F supérieur à 150).HMBC-GAS (F greater than 150).
On constate que dans l'ensemble les cépages We see that overall the grape varieties
sont bien séparés.are well separated.
Etuda des modules statistiques Pour valider la technique de discrimination des cépages et des clones, la robustesse des modèles a été testée par des tests statistiques (Test Etuda statistical modules To validate the discrimination technique of grape varieties and clones, the robustness of the models was tested by statistical tests (Test
de Jacknife et Validation croisée). of Jacknife and Cross Validation).
Chaque individu a été enlevé successivement, avec remise à la population de départ puis une AFD a été effectuée et les coordonnées de l'individu enlevé ont été calculées à partir des équations discriminantes. On vérifie alors si l'individu est affecté dans le bon groupe. On considère que la technique est validée lorsqu'on obtient des équations discriminantes stables quelque soit l'individu enlevé et que le pourcentage Each individual was removed successively, handed over to the original population and then AFD was performed and the coordinates of the abducted individual were calculated from the discriminating equations. We then check if the individual is affected in the right group. It is considered that the technique is validated when stable discriminant equations are obtained irrespective of the individual removed and the percentage
d'individus bien classés est élevé. of high ranked individuals is high.
A chaque opération, de nouveaux axes discriminants ont été obtenus: XlallîVarl + al2Var2 +... + alpVarp X2=a2lVarl + a22Var2 +... + a2pVarp Xn-anlVarl + an2Var2 +... + anpVarp Xn: axes discriminants n:nombre d'individus anp: coefficients des axes discriminants Varp: pième variable sélectionnée par ANOVA A partir de ces données, plusieurs calculs ont été effectués: Pour connaître l'importance des coefficients des modèles et leur stabilité, la moyenne (m) et, l'écart- type (EC) At each operation, new discriminant axes were obtained: XlalliVarl + al2Var2 + ... + alpVarp X2 = a2lVarl + a22Var2 + ... + a2pVarp Xn-anlVarl + an2Var2 + ... + anpVarp Xn: discriminating axes n: number of individuals anp: coefficients of the discriminant axes Varp: pth variable selected by ANOVA From these data, several calculations were carried out: To know the importance of the coefficients of the models and their stability, the average (m) and, the standard deviation (EC)
de chaque coefficient ont été calculés. of each coefficient were calculated.
Le barycentre de chaque groupe a également été calculé à chaque opération et chaque individu affecté au groupe dont le centre de gravité était le plus proche de lui. On peut calculer ainsi le pourcentage d'individus bienclassés à chaque fois et étudier le taux de bon classement et la stabilité du classement pour chaque The center of gravity of each group was also calculated for each operation and each individual assigned to the group whose center of gravity was closest to him. We can calculate the percentage of well-ranked individuals each time and study the rate of good ranking and the stability of the ranking for each
groupe et pour tous les groupes réunis. group and for all groups together.
Les moyennes (m) et écart-types (EC) des coefficients des axes i et 2 sont donnés ci-après (nombre The means (m) and standard deviation (EC) of the coefficients of axes i and 2 are given below (number
d'individus: 45 données brutes).of individuals: 45 raw data).
Moy. Axe 1 Coef. m Axe 2 CoeLf.Avg. Axis 1 Coef. m Axis 2 CoeLf.
EC Var. EC Var.EC Var. EC Var.
Cocf. 1 24.2 3.51 14.5 28.8 356 12.4 Cocf. 2 20.5 2.28 11.1 2.75 1.64 59.6 Cocf. 3 13.7 4.17 30.4 42 3.89 9.25 Coef. 4 20.9 2.51 12 21 2.35 11.2 Coef. 5 2.94 2. 36 80.3 2.11 22 105 COCF. 1 24.2 3.51 14.5 28.8 356 12.4 Cocf. 2 20.5 2.28 11.1 2.75 1.64 59.6 Cocf. 3 13.7 4.17 30.4 42 3.89 9.25 Coef. 4 20.9 2.51 12 21 2.35 11.2 Coef. 5 2.94 2. 36 80.3 2.11 22 105
22 022 0
Cocf. 6 32.7 2.56 7.82 30.4 2.07 6.83 Cocf. 7 11.4 3.75 33 23.3 2.54 10.9 Coef. 8 11.4 3.7 32.5 18.2 3.95 21.6 Cocf. 9 13.9 2.15 15.5 5.79 2.19 37.8 Coef.10 23.7 2. 17 9.17 5.56 2.68 48.2 Cocf.ll 4.23 1.34 31.7 12.8 1.84 14.3 Coef.12 4.36 1.44 32. 9 5.84 2.08 35.7 _ Les calculs effectués pour l'HMBC- GAS montrent que pour l'axe 1, les coefficients 1, 2, 4, 6 et 10 sont les plus importants dans le modèle et ont une bonne stabilité (Ecart-types faibles). Compte tenu des valeurs des coefficients, on en déduit que ce sont les variables 22, 25, 28, 32, 37 et 38 qui sont les plus influentes COCF. 6 32.7 2.56 7.82 30.4 2.07 6.83 Cocf. 7 11.4 3.75 33 23.3 2.54 10.9 Coef. 8 11.4 3.7 32.5 18.2 3.95 21.6 Cocf. 9 13.9 2.15 15.5 5.79 2.19 37.8 Coef.10 23.7 2. 17 9.17 5.56 2.68 48.2 Cocf.ll 4.23 1.34 31.7 12.8 1.84 14.3 Coef.12 4.36 1.44 32. 9 5.84 2.08 35.7 _ The calculations made for the HMBC-GAS show that for axis 1, the coefficients 1, 2, 4, 6 and 10 are the most important in the model and have good stability (low standard deviations). Given the values of the coefficients, we deduce that it is the variables 22, 25, 28, 32, 37 and 38 that are the most influential
pour la construction de l'axe 1.for the construction of axis 1.
Pour l'axe 2, les coefficients 1, 3, 4, 6 et 7 sont les plus importants dans le modèle et ont une bonne stabilité (Ecart-types faibles). Compte tenu des valeurs des coefficients, on en déduit que ce sont les variables 22, 27, 28, 32 et 34 qui sont les plus influentes pour la For axis 2, the coefficients 1, 3, 4, 6 and 7 are the most important in the model and have good stability (low standard deviations). Given the values of the coefficients, we deduce that it is the variables 22, 27, 28, 32 and 34 that are the most influential for the
construction de l'axe 2.construction of axis 2.
Les pourcentages d'individus bien classés sont de 99,85 pour les CF et les MN et de 100 pour les CS, les clones CF312mg et CF331Mg sont responsables du Percentages of highly ranked individuals are 99.85 for CF and MN and 100 for CS, CF312mg and CF331Mg clones are responsible for
pourcentage des CF du fait de leur proximité des MN. percentage of CFs because of their proximity to NDs.
La discrimination des cépages de vigne à l'aide des données RMN de 1'HMBC-GAS constitue donc bien une Discrimination of grape vines using the HMBC-GAS NMR data is therefore
technique fiable compte-tenu des résultats statistiques. reliable technique taking into account the statistical results.
IV.2 alyse dem clones Pour la reconnaissance des clones, les cépages IV.2 alyse dem clones For the recognition of clones, the grape varieties
ont été analysés séparémment.were analyzed separately.
- Analyse ANOVA On rapporte sur les figures 8, 9 et 10, les valeurs de F dans l'analyse de variance, obtenues d'après les spectres RMN HMBC-GAS, respectivement pour les clones ANOVA analysis Figures 8, 9 and 10 show the values of F in the analysis of variance, obtained from the HMBC-GAS NMR spectra, respectively for the clones.
des cépages MN, CF et CS.MN, CF and CS grape varieties.
On indique ci-après pour chaque cépage la valeur de F sélectionnée et les variables choisies: Merlot Noir: F > 10; variables choisies: 3, For each variety, the value of F selected and the variables chosen are indicated below: Merlot Black: F> 10; chosen variables: 3,
4, 6, 9, 12, 34, 37;4, 6, 9, 12, 34, 37;
Cabernet Franc: F > 30,5; variables choisies: Cabernet Franc: F> 30.5; selected variables:
7, 22, 23, 25, 34, 36, 37, 38, 39, 43; 7, 22, 23, 25, 34, 36, 37, 38, 39, 43;
Cabernet Sauvignon: F > 55; variables Cabernet Sauvignon: F> 55; variables
choisies: 3, 6, 7, 9, 39, 45, 47.chosen: 3, 6, 7, 9, 39, 45, 47.
- Analyse ACP Les résultats de l'analyse ACP sur l'HMBC-GAS des extraits polyphénoliques de pépins pour MN, CF et CS, sont respectivement rapportés sur les figures 11, 12 et 13. On constate pour le Merlot Noir une tendance à se regrouper par clone excepté les individus MN 181 bt et PCR Analysis The results of the PCR analysis on HMBC-GAS of the polyphenolic extracts of seeds for MN, CF and CS, are respectively reported in FIGS. 11, 12 and 13. There is a tendency for black Merlot to group by clone except individuals MN 181 bt and
MN 346 bt 194.MN 346 bt 194.
Pour le Cabernet Franc, les clones ont tendance & former des groupes avec plus ou moins de similitudes For Cabernet Franc, clones tend to form groups with more or less similarities
entre eux.between them.
Les clones différant uniquement par le terroir Clones differing only in terroir
(312, 331, 332) se différencient très nettement. (312, 331, 332) are very different.
Dans le cas du Cabernet Sauvignon, on remarque In the case of Cabernet Sauvignon, we notice
une bonne séparation des clones.good separation of the clones.
- Analyse AFD Les résultats de l'analyse factorielle discriminante sur 1'HMBC-GAS des extraits de pépins de raisin sont donnés sur les figures 14, 15, et 16 respectivement pour MN (F > 10), CF (F > 30,5) et CS (F > AFD analysis The results of the discriminant factor analysis on HMBC-GAS of grape seed extracts are given in FIGS. 14, 15 and 16 respectively for MN (F> 10), CF (F> 30.5). ) and CS (F>
55).55).
On obtient dans les 3 cas une bonneWe obtain in all 3 cases a good
différenciation des clones.differentiation of clones.
La différenciation des cépages et des clones par intégration des corrélations de l'HMBC-GAS constitue The differentiation of grape varieties and clones by integration of HMBC-GAS correlations constitutes
*donc bien une technique fiable.* so a reliable technique.
V - Analyse statistioue el dnné n tn ave 1 'HMOC d 'une part, avec 1i'HMOC - HOHAHa. d'autre Pmart. On applique les techniques rapportées ci-dessus aux données des spectres de 1'HMQC et de 1 'HMQC- HOHAHA V - Statistical analysis and identification with HMOC on the one hand, with HMOC - HOHAHa. other Pmart. The techniques reported above are applied to the spectral data of HMQC and HMQC-HOHAHA.
pour les cépages et les clones.for grape varieties and clones.
On obtient dans les deux cas une bonne discrimination. Ex1&. 2: Etude d'extraits de feuilles de vigne. On prépare des extraits polyphénoliques de feuilles de vigne à partir des cépages et clones suivants: Cépages Merlot Noir MN clones: 343 et 347 Cabernet Sauvignon CS clones: 335 et 337 Cabernet Franc CF clones: 312 et 187 I. Extraction des polyphénols On fait macérer 50 g de feuilles sèches pendant 24 heures à l'abri de la lumière dans 500 ml de mélange In both cases, good discrimination is obtained. & Ex1. 2: Study of vine leaf extracts. Polyphenolic extracts of grapevine leaves are prepared from the following grape varieties and clones: Merlot Noir MN grapes clones: 343 and 347 Cabernet Sauvignon CS clones: 335 and 337 Cabernet Franc CF clones: 312 and 187 I. Extraction of polyphenols Macerated 50 g of dry leaves for 24 hours protected from light in 500 ml of mixture
acétone/eau (2/3).acetone / water (2/3).
On soumet le mélange à une étape de lixiviation The mixture is subjected to a leaching step
lente pendant 1 à 2 heures.slow for 1 to 2 hours.
On fait évaporer l'acétone sous pression réduite à 30 C. Un précipité vert composé principalement The acetone is evaporated under reduced pressure at 30 ° C. A green precipitate composed mainly
de chlorophylle et de cires se forme. chlorophyll and waxes are formed.
Pour éliminer les cires et la chlorophylle, on a recours & une étape de centrifugation et à une To eliminate waxes and chlorophyll, a centrifugation step is used and a
extraction à l'éther.extraction with ether.
On soumet le mélange à une centrifugation pour The mixture is subjected to centrifugation to
séparer les deux phases.separate the two phases.
La solution restante est extraite par de l'éther éthylique (Et20) selon le shéma suivant: V Et2O (ml) Agitation 10 min 5 min 100 5 min On soumet la phase restante à une étape d'évaporation pour éliminer l'éther résiduel, puis on extrait la solution restante par l'acétate d'éthyle, en opérant comme suit: V AcOEt (ml) Agitation 10 min 5 min 5 min 100 5 min 5 min 5 min 5 min 5 min On évapore ensuite l'acétate d'éthyle sous pression réduite et on reprend le soluté par l'eau pour lyophiliser. Les extraits polyphénoliques obtenus sont essentiellement formés de flavonoïdes, quercétine et isoquercitrine, ces composés répondant aux formules suivantes: The remaining solution is extracted with ethyl ether (Et20) according to the following scheme: Et2O (ml) Agitation 10 min 5 min 100 5 min The remaining phase is subjected to an evaporation step to remove the residual ether, then the remaining solution is extracted with ethyl acetate, proceeding as follows: V AcOEt (ml) Stirring 10 min 5 min 5 min 100 5 min 5 min 5 min 5 min 5 min The acetate is then evaporated under reduced pressure and the solute is taken up with water to lyophilize. The polyphenolic extracts obtained are essentially composed of flavonoids, quercetin and isoquercitrin, these compounds corresponding to the following formulas:
OH OHOH OH
OH OHOH OH
UH O-GlucosUH O-Glucos
HO O HO 0HO O HO 0
quercéine isoquercitine Le rendement d'extraction est de 3g/lOOg de feuilles isoquercitin quercetin The extraction yield is 3g / 100g of leaves
sèches environ.dry around.
II Analyse RMN mg d'extrait sont dissous dans 0,5 ml de DMSO-d6. Pour le premier extrait de chaque clone, trois HMBC-GAS sont enregistrées, et pour le second extrait, une seule expérience est enregistrée pour vérifier la II NMR analysis of the extract are dissolved in 0.5 ml of DMSO-d6. For the first snippet of each clone, three HMBC-GAS are recorded, and for the second snippet, only one experiment is recorded to check the
reproductiblité de la technique d'extraction. reproducibility of the extraction technique.
Les paramètres expérimentaux sont les suivants: fréquence d'excitation de 1H: 500,1412769 MHz et de 13C: 125,7728 MHz; 10. fenêtre spectrale de 1H: 14,489 ppm et de The experimental parameters are as follows: excitation frequency of 1H: 500,1412769 MHz and 13C: 125,7728 MHz; 10. spectral window of 1H: 14.489 ppm and
13C: 220 ppm.13C: 220 ppm.
Le nombre d'accumulations par expérience est de 12. Chaque interférogramme (FID) est digitalisé sur 2048 points et 512 expériences sont enregistrées dans la dimension 13C. La durée de l'expérience est de 2 h. Les données sont multipliées par une fonction sinusoïdale carrée et subissent une Transformée de Fourier en mode magnitude. On a représenté sur la figure 17 la carte de The number of accumulations per experiment is 12. Each interferogram (FID) is digitized on 2048 points and 512 experiments are recorded in the 13C dimension. The duration of the experiment is 2 hours. The data is multiplied by a square sinusoidal function and undergoes a Fourier Transform in magnitude mode. Figure 17 shows the map of
RMN obtenue.NMR obtained.
III Analyse statistique a) ANOVA On rapporte sur la figure 18 les résultats de III Statistical Analysis a) ANOVA Figure 18 shows the results of
l'analyse ANOVA des données des spectres de 1'HMBC-GAS. ANOVA analysis of the HMBC-GAS spectra data.
Les variables les plus discriminantes sont les The most discriminating variables are the
suivantes (F>60): No 113, 115, 117 et 118. following (F> 60): Nos. 113, 115, 117 and 118.
Ces variables correspondent aux taches de corrélation des 1H à = - 12, 5 ppm avec les carbones & i= 99 ppm, These variables correspond to correlation spots of 1H at = -12.5 ppm with carbons & i = 99 ppm,
S= 145 ppm, S= 161 ppm etj= 163 ppm. S = 145 ppm, S = 161 ppm and = 163 ppm.
Ces caractéristiques sont celles d'un proton d'un hydroxyle qui est lié par l'établissemnent d'une liaison hydrogène avec un carbonyle, ce type de protons se retrouve dans les flavonoides qui sont les composés majoritaires des extraits de feuilles de vigne. These characteristics are those of a proton of a hydroxyl which is linked by the establishment of a hydrogen bond with a carbonyl, this type of proton is found in the flavonoids which are the majority compounds of the extracts of vine leaves.
b) Classification hiérarchique.b) Hierarchical classification.
En opérant comme indiqué pour les extraits de pépins de raisin, on obtient une différenciation des By operating as indicated for the extracts of grape seeds, a differentiation of
cépages, en particulier du cépage CS. grape varieties, in particular the CS grape variety.
c) Analyses ACP et AFD Dans ces deux expériences, réalisées comme indiqué plus haut, les clones sont d'une manière générale c) ACP and AFD analyzes In these two experiments, carried out as indicated above, the clones are generally
bien séparés.well separated.
Les résultats montrent que les extraits de feuille permettent également de déceler une spécificité du contenu polyphénolique de chaque cépage, ou de chaque clone, puisque des différences apparaissent entre les The results show that the leaf extracts also make it possible to detect a specificity of the polyphenolic content of each grape variety, or of each clone, since differences appear between them.
clones et les cépages.clones and grape varieties.
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