[go: up one dir, main page]

FI117098B - Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns. - Google Patents

Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns. Download PDF

Info

Publication number
FI117098B
FI117098B FI950202A FI950202A FI117098B FI 117098 B FI117098 B FI 117098B FI 950202 A FI950202 A FI 950202A FI 950202 A FI950202 A FI 950202A FI 117098 B FI117098 B FI 117098B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
phytase
sequence
seq
leu
ser
Prior art date
Application number
FI950202A
Other languages
Finnish (fi)
Swedish (sv)
Other versions
FI950202A (en
FI950202A0 (en
Inventor
John A Rambosek
Helena K M Nevalainen
Marja T Paloheimo
Richard B Fagerstroem
Arja S K Miettinen-Oinonen
Marja K Turunen
Christopher S Piddington
Christine S Houston
Tuula K Torkkeli
Michael Cantrell
Original Assignee
Roal Oy
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US07/923,724 external-priority patent/US5780292A/en
Application filed by Roal Oy filed Critical Roal Oy
Priority to FI950202A priority Critical patent/FI117098B/en
Publication of FI950202A0 publication Critical patent/FI950202A0/en
Publication of FI950202A publication Critical patent/FI950202A/en
Application granted granted Critical
Publication of FI117098B publication Critical patent/FI117098B/en

Links

Landscapes

  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

(A) a novel compsn. comprises a phytate degrading enzyme (PDC) produced by (a) transferring a Trichoderma host cell with a gene encoding the PDE and (b) expressing the gene encoding the PDE in the Trichoderma host cell. Also claimed are: (B) a recombinant construct comprising a genetic sequence encoding a phytase having the amine acid sequence shown or an enzymatically active; (C) a recombinant construct comprising a genetic sequence encoding a pH 2.5 AP having the amino acid sequence shown and further comprising a genetic sequence encoding a signal sequence operably linked to the first genetic sequence, where the signal sequence is selected from the signal sequence of Trichoderma CHBI, Trichoderma CBHII, Trichoderma EGO and Trichoderma EGII and the homologous phytase signal sequence; (D) a vector comprising a recombinant construct as in (B) or (C); (E) a Trichoderma host cell transferred with a genetic sequence encoding a phytase degrading enzyme.

Description

1 11 1

FYTAATTIA HAJOTTAVIEN ENTSYYMIEN TUOTTO TRICHODERMANPRODUCTION OF PHYTHATIC DEGRADING ENZYMES TRICHODERMAN

Oheisen keksinnön kohteena on menetelmä se 5 koostumuksen tuottamiseksi, joka käsittää yli-iln fytaattia hajottavan entsyymin.The present invention relates to a process for the production of a composition comprising an excess of phytate-degrading enzyme.

Mesofiilinen filamenttisieni Trichoderma erittää tehokkaasti seilulaasientsyymejä kasvualus Optimikasvuolosuhteissa on ilmoitettu saadun jopa pitoi 10 40 g/1 ekstrasellulaarista sellulaa-sia {Durand et ai.,Mesophilic filamentous fungus Trichoderma efficiently secretes salivase enzymes substrate Under optimum growth conditions, it has been reported to even contain 10 40 g / L extracellular cellulose {Durand et al.,

Microb- Technol. 10:341-346 (1988); Durand et ai., te Biochemistry and Genetics of Cellulose Degradation, A Press, 1988, 135-151).Microb-Technol. 10: 341-346 (1988); Durand et al., Biochemistry and Genetics of Cellulose Degradation, A Press, 1988, 135-151).

T. reesein transformointimenetelmien kehittym 15 mahdollistanut geeniteknisten menetelmien käytön s (Knowles et ai. , EP244,234; Penttilä et ai., Gene 61: (1987); Berka et ai., EP215,594). Geenitekniikan avu sellulaasien tuotantoprofiileja on muunneltu esim. sei kantojen tuottamiseksi, jotka tuottavat suurempia 20 endoglukanaasi I entsyymiä. Voimakasta cbhl promootti • · ♦ 9 Ψ '*" käytetty endoglukanaasin ilmentymisen lisäämiseksi (Ne\ • · *;·** et ai,, "The molecular biology of Trichoderma and its appi * * * to the expression of both homologous and heterologous j * teoksessa Molecular Industrial Mycology, Leong and Berka • * · ···/ 25 Marcel Dekker Inc., New York, 129-148 (1991); ja Harkki • · · V* al^, Enzyme Microb. Technol. 13:227-233 (1991)).The development of T. reesei transformation methods enabled the use of genetic engineering techniques (Knowles et al., EP244,234; Penttilä et al., Gene 61: (1987); Berka et al., EP215,594). The genetic engineering aids in the production profiles of cellulases have been modified, for example, to produce strains that produce larger endoglucanase I enzymes. The intense cbhl promoter used to increase endoglucanase expression (Ne \ • · *; · ** et al ,, The Molecular Biology of Trichoderma and its Help * * * to the expression of both homologous and heterologous Molecular Industrial Mycology, Leong and Berka, Marcel Dekker Inc., New York, 129-148 (1991); and Harkki, V, < - > Enzyme Microb. Technol. 13: 227 -233 (1991).

. . Sen lisäksi, että homologisten prot • · · • · ♦ mll.* tuotantoprofiileja on käsitelty, T. reesein tuotantopote ♦ *. . In addition to the processing of homologous protoforms, the production coefficient of T. reesei ♦ *

Ml -I... Λ 2 vastaisia (Nyyssönen et ai., WO92/01797) ja sieni] ligninolyyttiset entsyymit {Saloheimo, M. ja Niku-Paavo 1 Bio/Technol. 9:987-990 (1991)). Paremman ilmei aikaansaamiseksi haluttu geeni on liitetty 5 ilmentymiskasettiin ja liitetty T. reeseihin prot< transformaatiolla (Harkki, A. et ai. , Bio/Technol. 7: (1989); Nyyssönen et ai. , WO92/01797; (Saloheimo,M1-I ... ... 2 (Nyyssönen et al., WO92 / 01797) and fungal] ligninolytic enzymes {Saloheimo, M. and Niku-Paavo 1 Bio / Technol. 9: 987-990 (1991)). For better expression, the desired gene is inserted into 5 expression cassettes and ligated into T. reese by prot transformation (Harkki, A. et al., Bio / Technol. 7: (1989); Nyyssönen et al., WO92 / 01797; (Saloheimo,

Niku-Paavola, M.-L. Bio/Technol. 9:987-990 (1991)).Niku-Paavola, M.-L. Bio / Technol. 9: 987-990 (1991)).

heterologiset filamenttisienipromoottorit kuten Asp* 10 amdS, arqB ja glukoamylaasi (GA) voivat toimia Ί\_r< ainakin jossain määrin, (Penttilä et ai., Gene 61; (1987); Knowles et ai. , EP244,234) tehokas ilmei edellyttää homologisen promoottorin käyttöä. Lisäksi j< tapauksissa paremmat saannot on saatu tuottamalla halutt 15 fuusioproteiinina (Harkki, A. et aiBio/Technol. 7: (1989); Nyyssönen et ai, , WO92/01797). T. reeseiste heterologisten proteiinien saannot ovat olleet 10 - 15< Fytaatti, joka on kasvisiementen f os f ori varasto, osa ihmisten ja eläinten ruokavaliota. Fytaattifos 20 vaikeasti yksimahaisten saatavissa, koska se mi # * komplekseja moniarvoisten metalli-ionien kanssa ja s m proteiineihin. Tämän vuoksi fytaatin hajottami] • ·* kiinnostuksen kohde. Kasvifytiiniä hajottavia ents • · : fytaasia ja happofosfataasia, jotka muuttavat j ·,ί ϊ 25 inositoliksi ja epäorgaaniseksi fosforiksi, tuottaa bakteerit (Powar, V.K. ja Jagannathan, V.J., J. Bac :*· : 15:1102-1108 (1982); Cosgrove, D. J. , Aust. J. Bio!heterologous filamentous fungal promoters such as Asp * 10 amdS, arqB and glucoamylase (GA) may function at least to some extent, (Penttilä et al., Gene 61; (1987); Knowles et al., EP244,234) requires homologous expression. use of the promoter. In addition, better yields have been obtained by producing the desired fusion protein (Harkki, A. et al. Bio / Technol. 7: (1989); Nyyssönen et al., WO92 / 01797). The yields of T. reeseiste heterologous proteins have been 10-15 <Phytate, which is a f os f ori store of plant seeds, part of the human and animal diet. Phytate Phos 20 is difficult to obtain in monogamies because it mixes with polyvalent metal ions and s m proteins. Therefore, the phytate degradation] • · * is of interest. Plant-phytin-degrading enzymes: phytase and acid phosphatase, which convert β, β 25 to inositol and inorganic phosphorus, produce bacteria (Powar, VK and Jagannathan, VJ, J. Bac: *: 15: 1102-1108 (1982); Cosgrove, DJ, Aust J. Bio!

23:1207-1220 (1970) ja Cosgrove, D.J. et ai., Aust. J23: 1207-1220 (1970) and Cosgrove, D.J. et al., Aust. J

1^6:1348-1351 (1968)). Kasvifytiinin täydelliseen hajott tarvitaan sekä fytaasi että pH 2.5 happo-fosfataasi.1 ^ 6: 1348-1351 (1968)). Both phytase and pH 2.5 acid phosphatase are required for complete degradation of plant phytin.

Teollisiin sovelluksiin tarvitaan huomat suuremmat tuottosaannot kuin mitä luonnossa esiintyvät 5 tuottavat. Fytaasia koodaava geeni on vähän aikaa eristetty ja karakterisoitu A. f icuum-sienestä (Van Gorco EP420/358 tai W091/05053) ja fytaasin tuottoa on lis niqerissä lisäämällä geenin kopionumeroa voimakkaan home Aspergillus promoottorin esim. GA:n sisältävässä ilme 10 kasetissa (Van Gorcom et ai., EP420,358 tai W091/ Happofosfataasia koodaava geeni on eristetty ja karakte A. niqer-sienestä (MacRae et ai. , Gene 71:339-348 (198i Tietäessään fytaasin ja pH 2.5 happof osf ataasin sisältävien koostumusten parempien tuotantomenetelmien 15 keksijät ovat kehittäneet hyvin tehokkaan rekombj tuotantomenetelmän näiden koostumusten tuottamiseksi.Industrial applications require significantly higher yields than naturally occurring ones. The gene encoding the phytase has been isolated and characterized for a short time from A. f icuum (Van Gorco EP420 / 358 or WO91 / 05053) and the phytase production is lis niqer by inserting the gene copy number in a cassette 10 containing a strong home Aspergillus promoter e.g. The gene encoding Gorcom et al., EP420,358 or WO91 / acid phosphatase has been isolated and characterized from A. niqer (MacRae et al., Gene 71: 339-348 (198i) Knowing the better production methods for compositions containing phytase and pH 2.5 acid phosphatase. the inventors have developed a highly efficient recombinant production method for producing these compositions.

Keksinnön mukaisesti on kehitetty menetelmä s€ koostumuksen tuottamiseksi, joka käsittää yli-iin fytaaattia hajottavan entsyymin ja vähintään 20 Trichoderma-entsyymin valittuna β-glukaania hajot • ·According to the invention, there is provided a process for producing a composition comprising an excess of phytate-degrading enzyme and at least 20 Trichoderma enzymes selected from β-glucan.

·*’*: aktiivisuudesta, CBHI:sta, CBHII:sta, EGI:sta ja EC· * '*: Activity, CBHI, CBHII, EGI and EC

Koostumuksen tuottamiseksi valmistetaan yhdistelmäkonst joka sisältää geenin, joka koodittaa fytaattia haj \9\\ entsyymiä valittuna fytaasista ja pH 2,5 hapoofosfatc * * ψ ·.· · 25 jolloin mainitulla fytaasilla on aminohapposekvenssi No. : 8: ] ja mainitulla pH 2,5 happof osf ataasi • * · aminohapposekvenssi [SEQ ID No. :2: ] , ja toiminnal • * mainittuun geeniin liitetyn signaali sekvenssin. Koost 4 1To produce the composition, a recombinant constant comprising a gene encoding a phytate digested enzyme selected from a phytase and a pH 2.5 acidophosphate * * · · · · 25 is prepared wherein said phytase has the amino acid sequence No. : 8:] and at a pH of 2.5 acidophosphase • * · amino acid sequence [SEQ ID NO: 8:]. : 2:], and function * * the signal sequence associated with said gene. Composition 4 1

Kuva 1. Peptidin #816 sekvenssi ([SEQ ID No. oligo PHY-31 ([SEQ ID No. : 64 :]), peptidi #1110 ([SEQ ID No oligo PHY-34 ([SEQ ID No. :65:]) ja oligo PHY-35 ( No. :52:]). pH2.5 happofosfataasioligonukleotidi PH 5 17meeri seos, jolla on 64-kertainen degeneraatio inosiini. Peptidi #816 on johdettu natiivin happofosJ endoproteinaasi Lys-C-hajoamisesta. PHY-34 on 17meer jolla on 128 kertainen degeneraatio. PHY-35 on 17meei jolla on 64 kertainen degeneraatio. Sekä PHY-34 ja PHY 10 välttämättömiä peptidi #1110:n täydelliseen tuotte Peptidi #1110 on johdettu natiivin happofos: trypsiinihajoamisesta.Figure 1. Sequence of peptide # 816 ([SEQ ID NO: oligo PHY-31 ([SEQ ID No: 64:]), peptide # 1110 ([SEQ ID NO: oligo PHY-34 ([SEQ ID NO: 65: ]) and oligo PHY-35 (No.: 52:]) pH2.5 acid phosphatase oligonucleotide PH 5 17 mer mixture with 64-fold degeneration of inosine Peptide # 816 is derived from the degradation of native acid phospho endoproteinase Lys-C PHY-34 is 17meer with 128-fold degeneration PHY-35 is 17me not with 64-fold degeneration Both PHY-34 and PHY 10 are essential for the complete product of peptide # 1110 Peptide # 1110 is derived from native acidophos: trypsin degradation.

Kuva 2 . Nukleotidi sekvenssi 2.1 kb: n Sphl fragi jossa on pH 2.5 happofos f a taasigeeni [SEQ ID No. :1:], ; 15 johdettu aminohappotranslaatio [SEQ ID No.Figure 2. Nucleotide sequence 2.1 kb Sphl fragment with pH 2.5 acidophos f a re gene [SEQ ID NO. : 1:],; 15 derived amino acid translation [SEQ ID NO: 15

Introniluovuttaja-, lariaatti- ja akseptoris* määritettynä cDNA sekvenssoinnilla on yliv:Intron donor, lariate and acceptor * as determined by cDNA sequencing are

Nukleotidisekvenssi, joka vastaa peptidejä #816 (Nucleotide sequence corresponding to peptides # 816 (

No. : 57 : ] ) ja #1110 ([SEQ ID No . : 62 : ] ) on allev; 20 Genominukleotidisekvenssi määritettiin Ml3-d; :*”j menetelmällä (Sanger, F., et ai., Proc. Natl. Acad, £ • ·» - - 74:5463-5467 (1977) käyttäen United States Bioc * 9 - :***! Sequencase II-kittiä.Well. : 57:]) and # 1110 ([SEQ ID No: 62:]) are below; The genomic nucleotide sequence was determined with M13-d; : * "(Sanger, F., et al., Proc. Natl. Acad., 1974) using United States Bioc * 9 -: ***! Sequencase II- putty.

|t:": Kuva 3. Fytaasin tryptisten p< 25 aminohapposekvenssit #792 [SEQ ID No, :43:] ja #420 No. :23:] ja johdetut oligonukleotidit [SEQIDNos. :3:, * * 5 ja : 6: ] , joita käytettiin fytaasikoettimen 1 *** •2 saria-PCR-amolifikaatiossa.| t: ": Figure 3. Phytase tryptic p <25 amino acid sequences # 792 [SEQ ID No:: 43:] and # 420 No.: 23:] and derived oligonucleotides [SEQ ID NO: 3 :, * * 5 and: 6 :] used in the 1 *** • 2 serial PCR amplification of the phytase probe.

55

Kuva 5. Fytaasigeenin nukleotidisek1 [SEQ ID Nos. :7: (DNA) ja :8: (aminohappo)].Figure 5. Nucleotide sequence of the phytase gene [SEQ ID Nos. : 7: (DNA) and: 8: (amino acid)].

Kuva 6. PCR-alukkeet, joita käytettiii fytaasifuusiofragmenttien valmistuksessa [SEQ ] 5 :9: ja :10: ja :11: ja :12:j.Figure 6. PCR primers used in the preparation of phytase fusion fragments [SEQ] 5: 9: and: 10: and: 11: and: 12: j.

Kuva 7. pALK171:n rakenne. Fytaas; jolla oli oma signaalisekvenssi, fuusioitiin cbl moottoriin. Vain oleellisimmat restriktiokohc esitetty.Figure 7. Structure of pALK171. phytase; which had its own signal sequence, was fused to the cbl motor. Only the most relevant restriction sites are shown.

10 Kuva 8. pALK172:n rakenne. Fytaasigeeni oitiin cbhl signaalisekvensiin. Vain oleell: restriktiokohdat on esitetty.10 Figure 8. Structure of pALK172. The phytase gene was inserted into the cbhl signal sequence. Only relevant: restriction sites are shown.

Kuva 9. Plasmidit pALK173A ja pAJ Niiden plasmidien, joilla on fytaasigeeni, jossa 15 promoottori ja selektioleima, amdS geeni, kar esitetty. Plasmidissa pALK173A fytaasi- ja amdS c transkriptionaalinen orientoituminen on sama; je midissa pALK173B, näiden kahden geenin transkript linen orientoituminen on vastakkainen toisilleen 20 Kuva 10. Trichoderma-isäntäkantojen ja siä tuottavien transformanttien kasvatusliuosten natanttien näytteiden Western blot-tulokset. VyÖl 50 ng puhdistettua Aspergillus ALKO 243 fytaasie • ·Figure 9. Plasmids pALK173A and pAJ The plasmids carrying the phytase gene with the promoter and the selection label, the amdS gene, are shown. In plasmid pALK173A, the transcriptional orientation of phytase and amdSc is the same; je mid pALK173B, the transcriptome orientation of the two genes is opposite to each other. Figure 10. Western blot results of samples of native strains of Trichoderma host strains and transformant-producing transformants. Belt 50 ng purified Aspergillus ALKO 243 phytase • ·

,·*, hyke 2: 15 ng endoF-käsiteltyä Aspergillus AL, · *, Pulse 2: 15 ng of endoF-treated Aspergillus AL

25 fytaasia; Vyöhykkeet 3 ja 10: T. reesei ALKO 23^ hykkeet 4-5 ia 11-12: T. reesei ALKO 233 transfoi /**/ 171FR/ A4 ja A13, vastaavasti; Vyöhykkeet 6 ja ; reesei ALKO 2221? Vyöhykkeet 7-8 ja 14-15: T\_ : ALKO 2221 transformantti 171FR/A5 ja A9, vastac 30 Vyöhyke 9: T. reesei ALKO 2221 transformantti D2 1.: ’: hyke 16: T. reesei ATCC56765; Vyöhykkeet 17, 18,25 phytase; Lanes 3 and 10: T. reesei ALKO 23 ^ lanes 4-5 and 11-12: T. reesei ALKO 233 transfected with ** / 171FR / A4 and A13, respectively; Zones 6 and; reesei ALKO 2221? Lanes 7-8 and 14-15: T1: ALKO 2221 transformant 171FR / A5 and A9, respectively 30 Lane 9: T. reesei ALKO 2221 transformant D2 1: ': lane 16: T. reesei ATCC56765; Zones 17, 18,

raaeai »HiPPRCTCi f yanef/NMnani· 4 I· niPD/AOl Λ 1 1 Araaeai »HiPPRCTCi f yanef / NMnani · 4 I · niPD / AOl Λ 1 1 A

11 6 pH 2.5 happofosfataasin fuusiofragmentteihin [ Nos. :13: ja :14: ja il5:].11 6 pH 2.5 for acid phosphatase fusion fragments [Nos. : 13: and: 14: and il5:].

Kuva 12 . Plasmidi pALK533:n rakenne. happofosfataasigeeni, jolla oma signaalisekvenss 5 sioituna cbhl promoottoriin.Picture 12. Structure of plasmid pALK533. acid phosphatase gene having its own signal sequence inserted into the cbhl promoter.

Kuva 13. Plasmidi pALK532:n rakenne, happofosfataasigeeni fuusioituna cbhl- signaalisi siin ja promoottoriin.Figure 13. Structure of plasmid pALK532, acid phosphatase gene fused to your cbh1 signal here and to the promoter.

Kuva 14. Trichoderma- trans f ormanttien, 10 tuottavat pH 2.5 happofosfataasia, Western blot-i sin tulokset. Vyöhyke 1: 10 ng puhdistettua Asj lus ALKO 243 pH 2.5 happofosfataasia; Vyöhyke ; endoF käsiteltyä Aspergillus ALKO 243 pH 2.5 ha] fataasia; ja Vyöhykkeet 3-9: 60ng proteiinia jo] 15 ta Trichoderma reesein ALKO 2221 transformantir KA-31, KA-17, KB-44, KB-18, SB-4 ja KA-28 kasvi uossupernatantista.Figure 14. Western blot of Trichoderma trans formants, 10 producing pH 2.5 acid phosphatase. Lane 1: 10 ng purified Asjus ALKO 243 pH 2.5 acid phosphatase; Zone; endoF treated Aspergillus ALKO 243 pH 2.5 ha] phytase; and Lanes 3-9: 60 µg of protein already transformed with Trichoderma reesei ALKO 2221 transformant KA-31, KA-17, KB-44, KB-18, SB-4 and KA-28 from supernatant.

Määritelmät 20 Jäljempänä esitettävässä kuvauksessa kä^ runsaasti useita rekombinantti-DNA teknologian termejä. Jotta selitysosasta ja patenttivaatimi ···, saataisiin selkeä ja yhdenmukainen käsitys, * V'· 25 lukien alue, jonka kyseiset termit kattavat, es: • · * ..." seuraavat määritelmät.Definitions 20 Many of the terms used in recombinant DNA technology are described in the description below. For the purpose of the Explanatory Note and the Claim ···, a clear and uniform understanding, * V '· 25 including the area covered by these terms, is given by the following definitions: es.

* j ]··; Geeni. DNA-sekvenssi, joka sisältää tern] S.: : (mallin) RNA-polymeraasille. RNA, joka on kopion : nistä koodittaa tai ei koodita proteiinia. RNA:t< 30 koodittaa proteiinia kutsutaan lähetti-RNA:ksi l.f: eukaryooteissa se kopioituu RNA-polymeraa! 11 7 lähtien "antisense-RNA-geeniksi" ja sellaista I piota "antisense-RNA:ksi". Antisense-RNAt eivät lisesti ole luettavissa, koska antisense-RNA-s< sissä on translaation loppukodoneita {stop codor 5 Komplementaarinen DNA tai cDNA sisältää binanttigeenejä, jotka ovat syntetisoituneet esii si mRNA:n käänteistranskriptiossa ja täten niiltä tuu välisekvekvenssit (intronit). Genomi-DNA-geei neilla on tai ei ole introneita.* j] ··; Gene. DNA sequence containing tern] S.: (template) for RNA polymerase. RNA, which is a copy of or does not encode a protein. RNAs <30 encoding a protein called messenger RNA in l.f: eukaryotes it copies RNA polymer! 11 7 and the so-called "antisense RNA". Further, the antisense RNAs are not readable because the antisense RNA contains end-translational codons {stop codor 5 Complementary DNA or cDNA contains banting genes that are synthesized by reverse transcription of the first mRNA and thus give rise to intermediate sequences (introns). Genomic DNA genes have or do not have introns.

10 Kloonausvektori. Plasmidi, faagi DNA t DNA-sekvenssi, joka kykenee kuljettamaan gene< informaatiota, erityisesti DNA:ta, isäntäsoluun* nausvektorille on tunnusomaista, että sillä on y] useampi endonukleaasin tunnistuskohta, jossa DI 15 venssit voidaan pilkkoa määrättyyn malliin ilma kittävää vektorin biologisen toiminnan vähenemis johon haluttu DNA voidaan liittää tarkoituksena s sen klooni isäntäsoluun. Kloonausvektorilla vo myös leima, joka soveltuu kloonausvektoriin tr* 20 moitujen solujen tunnistukseen, ja replikaation tuskohta, joka sallii vektorin ylläpidon ja repii on yhdessä tai useammassa prokaryoottisessa tai e oottisessa isännässä. Leimoja ovat esimerkiksi 4···, sykliiniresistenssi tai ampisilliiniresistenssi, • Γ*. 25 nausvektorista" käytetään myös nimutystä "vel· "Plasmidi" on kloonausvektori, tavallisimmin renc * * **·/ nen DNA, jota ylläpidetään ja joka replikoituu ** näisesti ainakin yhdessä isäntäsolussa.10 Cloning vector. Plasmid, phage DNA t A DNA sequence capable of delivering gene information, especially DNA, to a host cell *, characterized by having y] more endonuclease recognition sites where the DI 15 sequences can be cleaved into a specific model without reducing the biological activity of the vector. to which the desired DNA can be inserted in order to clone it into a host cell. The cloning vector may also have a label suitable for the identification of the cells mapped to the cloning vector tr * 20, and an origin of replication that allows the vector to be maintained and repeats in one or more prokaryotic or eotic hosts. Labels include, for example, 4 ···, cyclin resistance or ampicillin resistance, • Γ *. Of the 25 expression vectors "is also referred to as" vel · "Plasmid" is a cloning vector, most commonly a renc * * ** / / DNA, which is maintained and replicated ** in at least one host cell.

«· V ! Ilmentymisvektori. Kuljetin tai vektori 30 on samankaltainen kuin kloonausvektori, mutte j tehostaa siihen kloonatun geenin ilmentymistä se *!*. lfoon lrnn rrQön -i Λ-r» -I- r* a r» 4* n rm λ -f -I-1» {(?än4-9en1niin If 1 /« 8 r vaihtelevat riippuen siitä, onko vektori tark< ilmentämään liitettyä geeniä prokaryoottises! eukaryoottisessa isäntäsolussa ja se saattaa sisältää transkriptionaalisia elementtejä kuten i 5 tajaelementtejä (yläpuoliset aktivaatiosekvenss päätössekvenssejä ja/tai translaation aloitus- ; töskohtia.«· V! The expression vector. The transporter or vector 30 is similar to a cloning vector but does not enhance expression of the gene cloned into it *! *. lfoon lrnn rrQön -i r-r »-I-r * ar» 4 * n rm λ -f -I-1 »{(? 4 4-9en1in If 1 /« 8 r vary depending on whether the vector is mapped to express gene in a prokaryotic eukaryotic host cell and may contain transcriptional elements such as transcriptional elements (upstream activation sequence decision sequences and / or translation initiation sites).

Isäntä. Isäntä on prokaryoottinen tai ( oottinen solu, jota käytetään rekonbinanttimate] 10 kantajana tai vastaanottajana.Host. The host is a prokaryotic or (ootic cell used as a carrier or recipient of the recombinant).

Eukaryoottinen isäntä. Eukaryoottinen voi olla mikä hyvänsä solu eukaryoottisesta orgai ta, mukaanlukien esimerkiksi eläin, kasvi, sie hiiva, 15 Keksinnönmukainen isäntä. "Keksinnönmi isäntä" on filamenttisieni-isäntä, jota on modj tuottamaan fytaasia ja/tai pH 2.5 happofosfc keksinnönmukaisilla menetelmillä.Eukaryotic host. A eukaryotic can be any cell of a eukaryotic organ, including, for example, an animal, a plant, a yeast, a host of the invention. An "inventive host" is a filamentous fungal host that is modj to produce phytase and / or pH 2.5 acid phosphate by the methods of the invention.

Funktionaalinen johdannainen. Proteiin 20 nukleiinihapon "funktionaalinen johdannainen" or kyyli, joka on kemiallisesti tai biokemiallisest dettu (tai saatu) proteiinista tai nukleiinihapc joka säilyttää biologisen aktiivisuutensa (funkt k * lisen tai rakenteellisen), joka on tunnusomaista * * 25 ville proteiinille tai nukleiinihapolle. Proteiii 4 *·· nukleiinihapon mutantti on proteiinin tai nuklei * i /*·/ pon biokemiallinen tai kemiallinen johdannainen { ·** : miin "funktionaalinen johdannainen" sisällytetääi * tt f.: : kyylin "mutantit", "fragmentit", "variantit", " 30 git" tai "kemialliset johdannaiset", jotka säilj jj*: natiivin molekyylin halutun aktiivisuuden.Functional derivative. A "functional derivative" or protein of a nucleic acid of protein 20 which is chemically or biochemically (or derived) from a protein or nucleic acid which retains its biological activity (functional or structural), which is characteristic of a * 25 protein or nucleic acid. Protein 4 * ·· A nucleic acid mutant is a biochemical or chemical derivative of a protein or nucleic acid {@ **, a "functional derivative" includes * tt f .:: "mutants", "fragments", "variants of the" "," 30 git "or" chemical derivatives "that retain the desired activity of the native molecule.

• Ί'. Täef ä 1 aht ΐ an cal laicfa τηα 1 λΙγτπγΙ -S ä -la 11 9 hentää molekyylin toksisuutta, poistaa tai li< mitä hyvänsä ei-toivottua molekyylin sivuvai] jne. Lisäosia, jotka välittävät tämänkaltaisia tuksia on kuvattu julkaisussa Remington's Pharm; 5 cal Sciences (1980). Menetelmät lisäosien liittäi molekyyliin ovat tunnettua tekniikkaa.• Ί '. The present invention is directed to reducing the toxicity of the molecule, removing or removing any unwanted side of the molecule, etc. Additives that mediate such effects are described in Remington's Pharm; 5 Cal Sciences (1980). Methods for attachment to the molecule are known in the art.

Fragmentti. Molekyylin, kuten proteiin nukleiinihapon "fragmentilla" tarkoitetaan n« aminohapon tai nukleotidin geneettisen sekvenssi 10 ja erityisesti keksinnönmukaisia funktionaalisi dannaisia.Fragment. By "fragment" of a molecule, such as a nucleic acid of a protein, is meant the genetic sequence of n «amino acid or nucleotide, and in particular the functional derivatives of the invention.

Variantti tai analogi. Proteiinin tai iinihapon "variantilla" tai "analogilla" tarkoi molekyyliä, joka on oleellisesti samankaltainen 15 teeltaan ja biologiselta aktiivisuudeltaan kuin i molekyyli kuten esim. sellainen, jota koodaa fi naalinen alleeli.Variant or analog. By "variant" or "analog" of a protein or tartaric acid is meant a molecule which is substantially similar in structure and biological activity to an i molecule, such as that encoded by a fatal allele.

Keksinnönmukaiset isännät 20 T. reesei ei tuota endogeenistä fytaasi sijaan se tuottaa suuria määriä muita entsy^ : ponentteja, kuten betaglukaanihajottamisaktiivis # * · I*/ joka on tärkeä esim. rehusovellutuksissa. Tä: « * 25 reesein käyttö tuotto-organismina sieniperäisel * * — taasille ja pH 2.5 fosfataasille saa aikaan ·* *The hosts according to the invention instead of producing endogenous phytase, T. reesei produces large amounts of other enzyme components, such as betaglucan degradation activator, which is important e.g. in feed applications. Here: «* The use of 25 reesees as a production organism for fungal * * reptiles and pH 2.5 phosphatase results in · * *

'··· erilaisten entsyymikoostusten erittymisen kuin J'··· secretion of different enzyme compositions than J

i.: : täessä Aspergillusta. Lisäksi, käytettäessä Triei .: Aspergillus. Also, when using Trie

; maa fytaattia hajottavien entsyymikoostumusten J; earth phytate-degrading enzyme compositions J

30 nä, muutamat Aspergillus-koostumusten yhteydessä • käsittelyssä ilmenevät hankalat ongelmat (esim.30 some difficult handling problems with Aspergillus compositions (e.g.

» · * * Λ Λ Λ Λ 7_ _ ^ \ L* 1 i. i- m ti ti * t— Λ *«_!_!* Λ— Λ— ti .. 11 pahtuu Asperqillien usein limaisen ja paksun m; tapauksessa.»· * * Λ Λ Λ Λ 7_ _ ^ \ L * 1 i. I-m ti ti * t— Λ *« _! _! * Λ— Λ— ti .. 11 swells Asperqilli often mucoid and thick m; case.

Suurempia määriä fytaasia ja pH 2.5 ha] fataasia (verrattuna Asperqilluksessa tapahtuva* 5 teesiin) voidaan tuottaa T. reesei ilmentymisin* mällä liittämällä A. niqeristä saatu DNA-sekvenä kaa koodaa fytaasi- tai pH 2.5 happofosfataasia] suutta, T. reesei ilmentymiskasettiin, joka sii cbhl promoottorin ja Aspergillus amdS geenin tri 10 maatioleimana. Näin saadun konstruktion transfo] T. reesei-isäntiin tuottaa stabiileja transformai jotka ilmentävät fytaasia tai pH 2.5 happofosfi suurina määrinä uudessa entsyymiaktiivisuuskooi sessa.Larger amounts of phytase and pH 2.5 ha] phytase (as compared to * 5 theses in Asperqillus) can be produced by expressing T. reesei by inserting a DNA sequence from A. niqer coding for the phytase or pH 2.5 acid phosphatase into the T. reesei expression cassette. sii the cbhl promoter and the Aspergillus amdS gene tri10. The transfection of the resulting construct into T. reesei hosts produces stable transformants that express phytase or pH 2.5 acid phosphate in large amounts in a novel enzyme activity assay.

15 T. reesein tuottama seos sisältää ] betaglukanaasiaktiivisuuden, mutta alhaisen gli laasiaktiivisuuden. Lisäksi, rekombinantti T._j kantojen tuottomäärä ravistelukasvatuksissa on ttavissa pääsellulaasin, endogeenisen sellobi< 20 laasi I:n eritystasoon, joka on yli 1 g/1. pH2.5 fosfataasin määrä ravistelukasvatuksella tuot rekombinanttikannoilla on vähemmän kuin 0.5 g/1.The mixture produced by T. reesei contains] betaglucanase activity but low glycase activity. In addition, the amount of recombinant T.sub.1 strain produced by shaking cultures is found to have a secretion level of the major cellulase, endogenous cellobiase <20 g, greater than 1 g / L. The pH2.5 amount of phosphatase by shaking cultures of the recombinant strains is less than 0.5 g / L.

·,*·· Aspergillus niqer var. awamori ALKO 24: 38854) (IFO4033)-fytaasi ja -happofosfataasi (opi .*·.· 25 2.5) yli-ilmentyivät Trichoderma reeseissä Tricl·, * ·· Aspergillus niqer var. awamori ALKO 24: 38854) (IFO4033) phytase and acid phosphatase (op. * ·. · 25 2.5) were overexpressed in Trichoderma reese Tricl.

.*·*. sellobiohydrolaasi 1 (cbhl) promoottorin kontroJ. * · *. cellobiohydrolase 1 (cbh1) promoter control

«•e • ·. Lisaksi fytaasigeeni ilmennetiin omalla promoot i S i i « * laan » t s « * Molemmille geeneille tehtiin kaksi cbh 30 moottorin sisältävää konstruktiota: toisessa kor * J.5 · tiossa käytettiin fytaasi- tai happofosfataasis * I « ί .__1_______i m « .__« _ . .__. . , . „ 11«• e • ·. In addition, the phytase gene was expressed under its own promoter i S ii «* la» ts «* Two genes containing the cbh 30 engine were made for both genes: phytase or acid phosphatase * I« ί .__ 1_______i m «.__« _ . .__. . ,. "11

sekvensseillä (eikä koko vektorilla, jota käyi sekvenssien ylläpitämiseen) ja saada kantoja, eivät sisältäneet mitään "vieraita" sekvenssejä laiset kannat olivat sopivia teollisiin tarkoiti 5 Kolmea Trichoderma reesei-kantaa, ATCCsequences (and not the entire vector used to maintain the sequences) and obtain strains did not contain any "foreign" sequences such strains were suitable for industrial purposes. The three strains of Trichoderma reesei, ATCC

(RutC-30), ALKO 233 (VTT-D-79125) ja alhaisen as] liproteaasipitoisuuden tuottavaa kantaa ALKO käytettiin isäntinä fytaasin ilmentämisessä. Ha] fataasia ilmennettäessä vain T. reesei ALKO 2221 10 formoitiin. Kun fytaasia ilmennettiin cbhl:n < promoottori Trichodermassa, paras transformaatio ei ollut lainkaan E. coli-sekvenssejä, tuotti r« lukasvatuksessa noin 3,600 kertaa enemmän fytaas: ei-transformoitu A. niqer ALKO 243. Kun käy1 15 fytaasipromoottoria, paras saanto ravistelukasval sa T. reesei-transformantei11a oli noin 120-kej verrattuna siihen mitä saatiin A. niqer ALKO 2* Parhaat happofosfataasiaktiivisuudet, jotka Se olivat noin 240 kertaa suuremmat verrattuna A. 20 ALKO 243-kannalla saatuihin tasoihin.(RutC-30), ALKO 233 (VTT-D-79125) and the low ascoproteinase producing strain ALKO were used as hosts for phytase expression. When expressing phagease, only T. reesei ALKO 2221 10 was formed. When the phytase was expressed on the cbh1 <promoter in Trichoderma, the best transformation was devoid of any E. coli sequences yielded approximately 3,600 times more phytase: untransformed A. niqer ALKO 243 in lysis cultures. When using the 15 phytase promoter, The reesei transformant11a was about 120 µg compared to A. niqer ALKO 2 * Best acid phosphatase activities, which was about 240 times higher than the levels obtained with A. 20 ALKO 243 strain.

Trichoderman erittämien fytaasin ja ] happofosfataasin molekyylipainot (SDS'PAGE :11a) j m * !/·· sivat Asperqilluksen erittämien vastaavien ents molekyylipainoista. Ero näytti johtuvan erilc Λ.ϊ 25 glykosylaatiosta.The molecular weights (by SDS'PAGE) of the phytase and] acid phosphatase secreted by Trichoderma are those of the corresponding enzymes secreted by Asperqillus. The difference appeared to be due to differential Λ.ϊ 25 glycosylation.

,*··# Fytaasin tuottoaste, joka saatiin, kun ·’**. gillus-geeni ilmentyi Trichodermassa Trichoderm I t a ™ moottorin valvonnassa, oli yllättävän korkea., * ·· # The rate of return of phytase obtained when · '**. gillus gene expressed in Trichoderm under Trichoderm I t a ™ motor control was surprisingly high.

T. reesein käyttö isäntänä sienifytaasi 30 pH 2.5 happofosfataasille johtaa täysin eril J.! ! entsyymikoostumuksiin kuin käytettäessä Aspergil i·· » » I ry____, , _ , « * . , . , ! _ · 11 12 kaikkia Trichodermia. Trichodermat on luokiteli fologisen samankaltaisuuden perusteella. T._ tunnettiin aiemmin nimellä T. viride Pers. tai ninqii Oudem; joskus se luokiteltiin erillisenä 5 T. lonqibrachiatum-ryhmästä. Koko Trichoderma-i on tunnusomaista nopeasti kasvavat pesäkkeet, jo. pensasmaiset tai märkärakkulamaiset, haarautuvat dioforit, joissa on pullonmuotoiset fialidit ja sissa päissä läpinäkyvät tai vihreät konidiat (Bj 10 J., Can. J. Bot. 62:924-931 (1984)).The use of T. reesei as a host for fungal phosphatase 30 pH 2.5 leads to a completely different J.! ! enzyme compositions as with Aspergil i ·· »» I ry____,, _, «*. ,. ,! _ · 11 12 all Trichoderms. Trichodermat is categorized on the basis of their physical similarity. T._ was previously known as T. viride Pers. it ninqii Oudem; it was sometimes classified as a separate group of 5 T. lonqibrachiatum. The whole Trichoderma-i is characterized by fast-growing colonies, already. bushy or pustular, branched diophores with vial-shaped fialides and transparent or green conidia at those ends (Bj 10 J., Can. J. Bot. 62: 924-931 (1984)).

T. reesei-sieni määritellään selkeästi ( tiseksi perheeksi, joka on peräisin kannasta Ql· on, kantaperhe, jolla on yhteinen geneettinen t joka on peräisin tietyn QM6a isolaatin yksinkertc 15 ytimestä. Vain näitä kantoja kutsutaan nime reesei.T. reesei fungi are clearly defined (the genus T lineage derived from strain Ql · on, a common genetic lineage derived from the simple nucleus of a particular QM6a isolate. Only these strains are called reesei.

Luokittelu morfologisin keinoin on one lista ja viime aikoina julkaistu molekulaarinen DNA-sormenjälkianalyysistä ja sellobiohydrola 20 (cbh2) geenin hybridisaatiomalli T. Teeseissä lonqibrachiatumissa selkeästi osoittaa näiden k< erilaistumisen (Meyer, W. et ai., Curr. Genet. 2J !/·; (1992)? Morawetz, R. et ai., Curr. Genet. 21 (1992)).Classification by morphological means is a single list and recently published molecular DNA fingerprinting and hybridization model of the cellobiohydrol 20 (cbh2) gene in T. Theses in the lonqibrachiatum clearly demonstrates their differentiation (Meyer, W. et al., Curr. Genet. 2J! (1992)? Morawetz, R. et al., Curr. Genet. 21 (1992).

\j 25 On kuitenkin olemassa todisteita eri 1 ,···* derma-lajien samankaltaisuudesta molekuläärisel • * solia, mikä on havaittu makromolekulaaristen osv I . » ΊΙ/ nukleiinihappo- ja aminohapposekvenssien säilymiHowever, there is evidence for the similarity of the different 1, ··· * derma species in molecular * cells observed in macromolecular osv I. »ΊΙ / nucleic acid and amino acid sequence conservation

* jotka ovat yhteisiä eri Trichoderma-lajeille. E* Common to different Trichoderma species. E

30 kiksi Cheng, C., et ai., Nucl. Acids. Res. 1 ··*· · ( 1990), esittää T. viride cbhl nukleotidisekve »·« ~~ · ·—30 Why Cheng, C., et al., Nucl. Acids. Res. 1 ·· * · · (1990), presents the nucleotide sequence of T. viride cbhl »-« ~~ · · -

> f · - . ****** t M *. i_ » t M 1 *_*_* M> f · -. ****** t M *. i_ »t M 1 * _ * _ * M

13 detulla aminohapposekvenssillä oli 81% homolo reesein fosfoglyseraattigeenin kanssa. Täten jotka on luokiteltu T. viride-lajiksl ja T. lajiksi täytyy geneettisesti olla hyvin lähellä 5 aan.The 13 identified amino acid sequences had 81% homolo reesei with the phosphoglycerate gene. Thus, those classified as T. viride species and T. species must be genetically very close to 5 a.

Lisäksi on olemassa suuri samankalIn addition, there is a great similar

Trichodermien transformointiolosuhteissa. Vaiki tännöllisesti katsoen kaikki teollisesti tärkeäi hoderma-lajit ovat aiemmin esitetyssä Trichodei 10 jissa Lonqibrachiatum, on olemassa muita Trie] lajeja, joita ei lueta tähän osioon. Tällaisia ovat esim. Trichoderma harzianum, joka toimii b.Under Trichoderma Transformation Conditions. Although virtually all industrially important hoderma species are present in the Trichodei 10 lonqibrachiatum described above, there are other Trie] species not included in this section. Such are, for example, Trichoderma harzianum, which b.

rolliaineena kasvipatogeeneja vastaan. Transfon menetelmä myös tälle Trichoderma-lajille on kel 15 (Herrera-Estrella, A. et ai., Molec. Microbiol.as a roller against plant pathogens. The Transfo method for this Trichoderma species also is kel 15 (Herrera-Estrella, A. et al., Molec. Microbiol.

843 (1990)) ja se on oleellisesti sama kuin hakei sa esitetty. Täten vaikka Trichoderma harzianu katsota kuuluvan Lonqibrachiatum-osioon, Herre] rellan käyttämä menetelmä spheroplastien valmi; 20 tuksessa ennen transformointia on sama. Herre] rellan esitys osoittaa, ettei Trichoderma spp.-li ole mitään sellaista merkittävää erilaisuutta *ί antaisi olettaa, ettei keksi nnönmukainen trans f < ··· timenetelmä toimisi kaikissa Trichodermoissa.843 (1990)) and is substantially the same as those disclosed in the applications. Thus, although Trichoderma harzianu is considered to belong to the Lonqibrachiatum section, the method used by Herre] rella for the preparation of spheroplasts; 20 before transformation is the same. Herre] rella's presentation shows that there is no such significant difference in Trichoderma spp. * Ί would suggest that the inventive trans f <··· method would not work in all Trichoderma.

**.: 25 Lisäksi sienilajeissa on yhteinen funkl ·'*'· lisuus sienten transkriptionaalisessa kontrollii m i · j .·. lissa. Ainakin kolmen A. nidulans promoottorisi .···! sin amdS, arqB ja qpd on havaittu saavan aikaa i * » niekspression T. reeseissä. amdS:lie ja arqB:1J . . 30 yksi tai kaksi geenin kopiota riittää selektoj « i · ••j ‘ fenotyyppien ilmentämiseen (Penttilä et ai., ill 14 1 r erilaisissa tietokannoissa. Nämä laitokset ja tit nat on lueteltu teoksessa O'Donnell, K. et ai., hemistry of Filamentous Fungi; Technology and Pr< D.B. Finkelstein et al.t toim., Butterworth-Heir 5 Stoneham, MA, USA, 1992, 3-39.** .: 25 In addition, fungal species share a common function in the transcriptional control of fungi. glycol. At least three of your A. nidulans promoters. ···! sin amdS, arqB, and qpd have been found to give time to i * »nick expression in T. reese. amdS: lie ja arqB: 1J. . One or two copies of the gene are sufficient for expression of selection phenotypes (Penttilä et al., Ill 14 1r in various databases. These institutions and titles are listed in O'Donnell, K. et al., Hemistry of Filamentous Fungi; Technology and Pr <DB Finkelstein et al., Butterworth-Heir 5 Stoneham, MA, USA, 1992, 3-39.

Keksinnönmukaisten isäntien konstruointConstruction of hosts according to the invention

Keksinnönmukaisten isäntien geenit* 10 käsittely keksinnön mukaisesti, on mahdollista * mällä entsyymiä koodaava puhdas proteiini tai s soimalla osittain tai kloonaamalla polymeraasJ reaktio (PCR)-tekniikalla geneettiset sekvenssit, kykenevät koodaamaan haluttua proteiinia? ja 15 geneettisten sekvenssien ilmentämisen avulla, lähtien termillä "geneettinen sekvenssi" vii nukleiinihappomolekyyliin (mieluiten DNA). Gene« sekvenssit, jotka kykenevät koodaamaan proteiin johdettu eri lähteistä. Näitä lähteitä ovat esim. 20 mi-DNA, cDNA, synteettinen DNA ja näiden yhdist Suositeltavin genorai-DNA-lähde on sienten genomi* to. cDNA:n suositeltavin lähde on cDNA-kirjasto • · on valmistettu sieni-mRNA:sta, joka on kasvanut c teissä, joiden tiedetään indusoivan halutun mRNA 25 proteiinin ilmentymistä.Processing of the genes * of the hosts according to the invention according to the invention is possible by * purifying a protein encoding the enzyme or by partially or cloning the genetic sequences by polymerase reaction (PCR) technology, capable of encoding the desired protein? and by expression of the genetic sequences, starting with the term "genetic sequence" into a vi nucleic acid molecule (preferably DNA). Gene «sequences capable of encoding protein derived from various sources. These sources include, for example, 20 mi-DNA, cDNA, synthetic DNA and their combination The most preferred genorai DNA source is the fungal genome * to. The most preferred source of cDNA is a cDNA library • · made from fungal mRNA grown in c pathways known to induce expression of the desired mRNA protein.

·*"· Keksinnönmukainen genomiDNA sisältää 1 ··· { sisällä luonnossa esiintyviä introneja. Lisäksi ·$*, lainen genomi-DNA voidaan saada geenisekvenssi! I * « promoottorialueen ja/tai 3'-transskriptionaalise . , 30 tösalueen avulla. Lisäksi, tällainen genomi-DNA v "j/ saada geneettisten sekvenssien avulla, jotka koo v ! ·· * "· The genomic DNA of the invention contains 1 ··· {naturally occurring introns. In addition, · $ *, genomic DNA can be obtained by means of the gene sequence! I *« promoter region and / or the 3'-transcriptional region. genomic DNA v "j / obtained with the help of genetic sequences that construct v! ·

* * * C f A 4 _ 1 A4 ^41« «M DATA A 1 A « A / X « MA. A A A X* * * C f A 4 _ 1 A4 ^ 41 «« M DATA A 1 A «A / X« MA. A A A X

1 · 15 transkriptoidut alueet ja/tai mRNA: n 5 ja/tai transloidut alueet voidaan ylläpitää ja käyttää skriptionaaliseen ja translationaaliseen sää Genomi-DNA voidaan uuttaa ja puhdistaa mistä 5 isäntäsolusta, erityisesti sieni-isäntäsolusta luonnollisesti ilmentää haluttua proteiinia, t, jotka ovat tunnettua tekniikkaa.1 · 15 transcribed regions and / or mRNA 5 and / or translated regions can be maintained and used for scriptural and translational weather Genomic DNA can be extracted and purified from which 5 host cells, especially fungal host cells, naturally express the desired protein (s). technology.

Vektorin kloonaamiseksi sopivia DNA-väli ta (joko genomi-DNA tai cDNA) leikataan satunne 10 tai pilkotaan entsymaattisesti, tai vastaavasti tään sopiviin vektoreihin rekombinanttigeeniki: (joko genomi- tai cDNA) muodostamiseksi* DNA-sekvenssi, joka koodaa haluttua proi tai sen funktionaalista johdannaista, voidaan ; 15 DNA-vektoriin tavanomaisilla menetelmillä, tel sekvenssin pää tasaiseksi tai epätasaiseksi lig< varten, pilkkomalla restriktioentsyymillä sopivi tuottamiseksi, sopivien koheesivisten päiden tä^ sellä, alkalisella fosfataasikäsittelyllä ei-t< 20 yhdistymisen estämiseksi ja ligatoimalla sopivi gaasien avulla. Tämänkaltaisia menetelmiä on es: Maniatis, T., (Maniatis, T. et ai., Molecular ( (A Laboratory Manual), Cold Spring Harbor Laboj K.J second edition, 1988) ja ne ovat hyvin tunnetti *· J 25 nilkkaa.Suitable DNA sequences (either genomic DNA or cDNA) for cloning the vector are randomly excised or cleaved enzymatically or into suitable vectors to generate a recombinant gene: (either genomic or cDNA) * DNA sequence encoding the desired proi or a functional derivative thereof. , can be; 15 to the DNA vector by conventional methods, end of the tel sequence for smooth or uneven ligation, digestion with a restriction enzyme to produce suitable expression, proper cohesive ends, alkaline phosphatase treatment to prevent non-integration and ligation with suitable gasses. Such methods are es: Maniatis, T., (Maniatis, T. et al., Molecular ((A Laboratory Manual), Cold Spring Harbor Laboj K.J. Second Edition, 1988)) and are well known * 25 J ankles.

·*“: Haluttua geeniä koodaavia sekvenssejä s: *-t * { **. vät kirjastot voidaan seuloa ja haluttu geenise) ·*, identifioida millä hyvänsä menetelmällä, joka s% i * sesti valitsee sekvenssin, joka koodaa sellaista . , 30 tai proteiinia esimerkiksi a) hybridisaatiolla s « · i nukleiinihappokoettimen tai -koettimien kanssa, • 4 * 11 16 mRNA:ta, immunosaostamalla kloonin sisältävän tuottama transloitu proteiinituote.· * “: Sequences encoding the desired gene s: * -t * {**. These libraries can be screened and the desired gene) · *, identified by any method that s% i * s select the sequence encoding one. , 30, or a protein, for example, by a) hybridization with a transcription protein product produced by immunoprecipitation of a s-nucleic acid probe or probes, 4 * 11 16 mRNA.

Tietyn proteiinin tunnistavia oligonukl koettimia, joita voidaan käyttää tunnistamaan 5 proteiinin klooneja, voidaan valmistaa, kun ti proteiinin aminohapposekvenssi tai tällaista ti taavaa proteiinia koodaavan DNA:n nukleiiniha; venssi. Vaihtoehtoisesti voidaan valmistaa puhdii proteiinia vastaan olevia vasta-aineita ja 10 niitä tunnistamaan ainutlaatuisten proteiin minanttien läsnäolo haluttua kloonattua pro ilmentävissä transformanteissa. Peptidien amin< tähteiden sekvenssi on tästä lähtien määritelty 1 mällä kolmikirjaimista tai yksikirjaimista lyhe: 15 Luettelo tämänkaltaisista kolmikirjaimisista ta: kirjaimisista lyhenteistä on löydettävissä oppik: ta esimerkiksi teoksesta Biochemistry, Lehningc Worth Publishers, New York, NY (1970). Kun am; posekvenssi on esitetty vaakasuorassa, ellei toil 20 määritelty, on aminopää vasemmalla ja karboksij kealla. Samoin, ellei toisin ole mainittu tai ί teydestä selkeästi ilmene, nukleiinihapposekven * * · esitetty 5'-pää vasemmalla.Oligonucleotide probes recognizing a particular protein, which can be used to identify clones of a protein, may be prepared when the amino acid sequence of the protein or the nucleic acid of the DNA encoding such a particular protein; sequence. Alternatively, pure antibodies to the protein can be prepared and identified to detect the presence of unique protein minants in transformants expressing the desired clone. The sequence of the residues of the peptides Amin <is now defined by 1 alpha or single alpha short: A list of such alpha-alphabetic abbreviations can be found in, for example, Biochemistry, Lehningc Worth Publishers, New York, NY (1970). When am; the posterior sequence is shown horizontally, unless defined, with the amino terminus to the left and the carboxy terminus. Similarly, unless otherwise noted or clearly apparent, the 5 'end of the nucleic acid sequence * * · is shown on the left.

Koska geneettinen koodi on degenero: • # *·* 25 useampi kuin yksi kodoni voi koodata tiettyä ant poa (Watson, J.D., In: Molecular Biology of the * :*: 3rd Ed., W.A. Benjamin, Inc., Menlo Park, CA | et· ·Because the genetic code is degenero: • # * · * More than one codon can encode a particular ant po (Watson, JD, In: Molecular Biology of the *: *: 3rd Ed., WA Benjamin, Inc., Menlo Park, CA | et · ·

356-357). Peptidi fragmentit analysoidaan selJ356-357). Peptide fragments are analyzed for selI

a aminohapposekvenssien tunnistamiseksi, joita koe . 30 oligonukleotidit, joilla on alhaisin degeneraatd • · · *11/ Tämä voidaan suosi tel tavimmin suorittaa identific • e ♦ 17 että vaikka kaikki tämän ryhmän jäsenet sis oligonukleotidisekvenssejä, jotka kykenevät ko maan samaa peptidifragmenttia ja täten sisältäv dollisesti saman oligonukleotidisekvenssin kuin 5 difragmenttia koodittava geeni, vain ryhmän yks sisältää nukleotidisekvenssin, joka on identtin nin sekvenssiä koodaavan eksonin kanssa. Kosi jäsen sisältyy ryhmään ja kykenee hybridiso DNA:hän jopa muiden ryhmän jäsenten läsnäolles 10 mahdollista käyttää fraktioimatonta oligonukleot mää samalla tavoin kuin käytetään yksittäistä oi leotidä peptidiä koodaavan geenin kloonaamiseksi Geneettistä koodia käyttämällä voidaan fioida yksi tai useampi aminohapposekvenssin oi 15 leotidi, joista jokainen olisi kykenevä koo< halutun proteiinin. Todennäköisyys, että tiett gonukleotidi todellisuudessa sisältää todellisen iinia koodaavan sekvenssin, voidaan arvioida tut; epänormaalia emäsparisuhdetta ja frekvenssiä, 20 tiettyä kodonia käytetään (koodittamaan tiettyä happoa) eukaryoottisissa soluissa. Käyttämällä "1 käyttösääntöjä” identifioidaan yksittäinen olig< otidisekvenssi tai kokoelma nukleotidisekve: joilla on teoreettisesti "mitä todennäköisin" nu] 25 disekvenssi, joka kykenee koodaamaan proteiinisi sit.a to identify the amino acid sequences tested. The oligonucleotides with the lowest degenerates can be best performed by identifying that although all members of this group contain oligonucleotide sequences capable of the same peptide fragment and thus contain the same oligonucleotide sequence as the 5 fragment encoding gene. , only one group contains a nucleotide sequence identical to an exon encoding a nin sequence. Any member is included in a group and is capable of hybridizing DNA, even in the presence of other members of the group, to use an unfractionated oligonucleotide in the same manner as used to clone a single oligonucleotide encoding a peptide using one or more oligonucleotides of each amino acid sequence. <the desired protein. The likelihood that a particular gonucleotide actually contains the actual Iine coding sequence can be estimated by tut; abnormal base pair ratio and frequency, 20 specific codons are used (to encode a particular acid) in eukaryotic cells. Using the "1 rules of use" identifies a single olig <RTI ID = 0.0> otid </RTI> sequence or collection of nucleotide sequences: which, in theory, have the "most likely" nu] 25 sequence capable of encoding your protein.

Sopiva oligonukleotidi tai oligonukleot: • 4 * : mä, joka kykenee koodaamaan tietyn geenin fra< ... · (tai joka on komplementaarinen tällaiselle olig< 30 otidille tai oligonukleotidiryhmälle) voidaan . . tisoida alalla tunnetuilla menetelmillä (katso < ‘ · 4 · • · * 11 18 ai., teoksessa Molecular Cloning, A Laboratory l· Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harl (1982)), ja Haraes, B.D., et ai., teoksessa l Acid Hybridization, A Practical Approach, IRL 5 Washington, DC (1985)). Edellä kuvatun geenikii jäsenet, joiden on havaittu kykenevän hybridisoit analysoidaan niiden sisältämien koodaavien sekv€ määrän ja laadun määrittämiseksi.A suitable oligonucleotide or oligonucleotide: 4 * capable of encoding a particular gene fra <... · (or which is complementary to such olig <30 otide or oligonucleotide group) may be. . tis by methods known in the art (see &quot; 4 · 4 · 6 * 18 18, et al., Molecular Cloning, A Laboratory 1, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harl (1982)), and Haraes, BD, et al., Acid Hybridization, A Practical Approach, IRL 5 Washington, DC (1985). The members of the above gene that have been found to be capable of hybridization are analyzed to determine the amount and quality of the coding sequences they contain.

Halutun DNA koodaavan sekvenssin havai 10 seksi, edellä mainittu DNA-koetin merkitään ha\ valla ryhmällä. Tällainen havaittava ryhmä vo mitä hyvänsä materiaalia, jolla on fysikaalises kemiallisesti havaittava ominaisuus. Tällaisia n aaleja on kehitetty nukleiinihappohybridisaatic 15 ja yleensä leima, joka on käyttökelpoinen niissä telmissä, soveltuu myös esillä olevaan keksi Erityisen käyttökelpoisia ovat radioaktiiviset kuten 3ZP, 3H, 14C, 35S, 125I tai vastaavat. Mitä h radioaktiivista leimaa, jolla on soveltuva signa 20 riittävä puoliintumisaika, voidaan käyttää, oligonukleotidi on yksijuosteinen, se voidaan 1 käyttämällä kinaasireaktiota. Vaihtoehtoisesti polynukleotidit ovat käyttökelpoisia nukleilnihap • * * ** *! ridisaatiokoettimina, kun ne leimataan ei-radio 4·« 25 visella leimalla kuten biotiinilla, entsyymil] * « ♦ *·· fluoresoivalla ryhmällä.To detect the desired DNA coding sequence, the aforementioned DNA probe is labeled with a wound group. Such a detectable group can be any material that has a physico-chemical detectable property. Such n ations have been developed for nucleic acid hybridisation and generally a label useful in those colonies is also suitable for the present invention. Particularly useful are radioactive agents such as 3ZP, 3H, 14C, 35S, 125I or the like. Whatever radioactive label having a suitable Signa 20 sufficient half-life can be used, the oligonucleotide is single-stranded, it can be 1 using a kinase reaction. Alternatively, polynucleotides are useful nucleic acid * * * ** *! as radiation probes when labeled with a non-radio-labeled fluorescent group such as biotin, enzyme] * «♦ * ··.

Yhteenvetona osittaisen proteiinisekv * ·*· määrittäminen mahdollistaa teoreettisen "todennäk laa a män" DNA sekvenssin tai kokoelman sellaisia sekve • · * 30 identifioimisen, joka tai jotka kykenevät kood . . kyseisen peptidin. Konstruoimalla oligonukleotidiIn summary, the determination of a partial protein sequence * · * · allows the identification of a theoretical "probable" DNA sequence or collection of DNA capable of coding. . the peptide in question. By constructing the oligonucleotide

IIIIII

a«A ^ — 1 — . 1 1 ^ a - - i_i_ ^ Ί 1 a. ^ 1 1, 11 si .a «A ^ - 1 -. 1 1 ^ a - - i_i_ ^ Ί 1 a. ^ 1 1, 11 si.

Vaihtoehtoisessa geenin kloonausmeneti kirjasto valmistetaan käyttämällä ilmentymisvel kloonaamalla ilmentymisvektoriin DNA tai mi* 5 cDNA, joka on valmistettu proteiinia ilmentämä kenevästä solusta. Tämän jälkeen kirjasto sei niiden jäsenten selvittämiseksi, jotka ilmentäv luttua proteiinia esimerkiksi seulomalla kirjast teiinin vasta-aineilla.In an alternative gene cloning procedure, the library is prepared using the expression velocity by cloning into the expression vector DNA or mi * 5 cDNA prepared from a cell expressing the protein. The library then monitors for members expressing the expressed protein, for example, by screening the library for antibodies to the protein.

10 Edellä esitetyillä menetelmillä kyetäär identifioimaan geneettisiä sekvenssejä, jotka kyi koodaamaan proteiinia tai proteiinin biologises tiivistä tai antigeenistä fragmenttia. Tällaist neettisten sekvenssien karakterisoimiseksi edell 15 rekombinanttiproteiinin tuottamiseksi, on toive ilmentää näiden sekvenssien koodaamat proteiinit lainen ilmentäminen paljastaa ne kloonit, jotka tävät proteiineja, jolla on halutun proteiinin c suudet. Näihin ominaisuuksiin saattaa kuulua muur 20 sa kyky spesifisesti sitoutua vasta-aineeseen, k^ kaansaada vasta-aineen tuotto, joka kykenee sitou natiiviin, ei-rekombinanttiin proteiiniin, kyky t . . entsymaattista aktiivisuutta soluun, joka on prot • · · ’·./ osa, ja kyky tuottaa ei-entsymaattinen (mutta sp • * *···* 25 nen) funktio vastaanottavaan soluun.The methods set forth above are capable of identifying genetic sequences that encode a protein or a biological or antigenic fragment of a protein. Such characterization of the aesthetic sequences to produce the recombinant protein above, the desire for expression of the proteins encoded by these sequences reveals those clones that find proteins having the c protein of the desired protein. These properties may include the ability to specifically bind to an antibody, including the ability to produce an antibody capable of binding to a non-recombinant protein. . enzymatic activity in a cell that is a prot · · · · · / part, and the ability to produce a non-enzymatic (but sp * * * ··· * 25) function in the receiving cell.

• i *! DNA-sekvenssi voidaan lyhentää alalla tuilla menetelmillä halutun geenin eristämiseks ! mosomaalisesta alueesta, joka sisältää enemmän »»» f .*·*; maat iota kuin tarvitaan geenin hyödyntämiseksi k m 30 nonmukaisessa isännässä. Esimerkiksi restriktiop ; taa voidaan käyttää lohkaisemaan täysipituinen se m 4 · *** * β ΐ U a 1 e a 4 α1%4- a j a ^ «t « 1 11 20• i *! The DNA sequence can be truncated by methods known in the art to isolate the desired gene! a mosomal area containing more »» »f. * · *; countries as needed to utilize the gene in a k m 30 compliant host. For example, restriction op; can be used to cleave full length m 4 · *** * β ΐ U a 1 e a 4 α1% 4- a j ^ «t« 1 11 20

Eksonukleaasi III ja Bal31. Muut nukleaasit ovat hyvin tunnettuja.Exonuclease III and Bal31. Other nucleases are well known.

Jos koodaava sekvenssi ja toiminnal liitetty promoottori liitetään vastaanottavaan 5 oottiseen soluun ei-replikoivana DNA:na (tai R ei-integroituvana molekyylinä, koodatun pro ilmentyminen voi tapahtua liitetyn sekvenssin : lisenä (ei-stabiilina) ilmentymänä.If the coding sequence and the functionally linked promoter are inserted into the receiving 5 ootic cell as a non-replicating DNA (or R as a non-integrating molecule), the encoded pro-expression may take the form of a linked (non-stable) expression.

Mieluiten koodaava sekvenssi liitetää 10 (tai RNA) molekyyliin, esimerkiksi suljettuun ko^ tiseen rengasmaiseen molekyyliin, joka ei kyk€ senäiseen replikaatioon, tai mielellään linea< molekyyliin, joka liittyy isäntäkromosomiin. Gei sesti stabiileja transformantteja voidaan konsi 15 vektorimenetelmillä tai transformointimenete: joissa haluttu DNA liitetään isäntäkromosomii mämkaItäinen liittyminen voi tapahtua de novo sisällä tai transformaation avulla, jossa käy1 vektoria, joka liittää itsensä funktionaalisest: 20 nän kromosomiin, esimerkiksi transposonia tai DNA-elementtejä, ja jotka edistävät DNA-sekv< liittymistä kromosomeihin. Käytetään sellaista : ria, joka kykenee liittämään halutut geeniseta ♦ +* !./ sieni-isännän solun kromosomiin.Preferably, the coding sequence is linked to a 10 (or RNA) molecule, for example, a closed cytosolic annular molecule that is incapable of native replication, or preferably a lineage molecule linked to the host chromosome. Gene-stable transformants can be obtained by Konsi 15 vector methods or the transformation method: wherein the desired DNA is inserted into the host chromosome, such as by insertion into a de novo or by transformation of a vector that incorporates itself into a functional chromosome, for example transposon or DNA elements. DNA sequence incorporation into chromosomes. Use is made of one that is capable of linking the desired gene set to the ♦ + *! / Fungal host cell chromosome.

* '**, 25 Geenit, jotka koodaavat fytaasia tai * * (>*: happofosfataasia sopivan promoottorin valvonnass; daan yhdistää plasmidikonstruktiossa ja liittää m « : täsoluun transformaatiolla. Vektorin tyyppi i V : isäntäorganismista. Keksinnön käytännön toteuti 30 käytettiin filamenttisieni Trichodermaa mallina.* '**, 25 Genes encoding phytase or * * (> *: acid phosphatase under the control of a suitable promoter) are linked in a plasmid construct and inserted into the m' cell by transformation. Vector type i from V host. A practical embodiment of the invention was used as a filamentous fungus Trichoderma.

: Trichodermalla, erityisesti T. reesei:llä sue 21 n: maan yhdistymisen tähän lokukseen relevantille venssillä.: Trichoderma, in particular T. reesei, the association of Sue 21 n with the locus relevant to this locus.

Solut, jotka ovat stabiilisti yhdi liitetyt DNA:t kromosomeihinsa, valitaan liit 5 yksi tai useampi leima, joka mahdollistaa isäntä valinnan, joissa on ilmentymisvektori kromos* leima voi saada aikaan esimerkiksi biosidiresist< esim. resistenssin antibiooteille tai raskasmet* le, kuten kuparille tai vastaaville. Valikoi 10 oleva leimageeni voi olla joko suoraan liitetty nettäviin DNA-geenisekvensseihin tai olla lii samaan soluun kotransfektiolla. Keksinnönmu! isäntien geneettinen leima on amds, joka koodaa midaasia ja mahdollistaa Trichoderman kasvun as< 15 ainoana typpilähteenä.Cells that stably link the linked DNA to their chromosomes are selected from one or more tags that allow the host to select which expression vector the chromosome label can confer, for example, biocide resistance <e.g. . The marker gene of choice 10 can either be directly linked to the DNA gene sequences to be introduced or be co-transfected into the same cell. Keksinnönmu! the genetic tag of the hosts is amds, which encodes what is involved and allows Trichoderma to grow as <15 the only nitrogen source.

Halutun proteiinin ja/tai sen akti: johdannaisten ilmentämiseksi, transkriptionaan translationaaliset signaalit, jotka sopiva isäni nistaa, ovat tarpeen. Kloonatut koodaavat sekvt 20 jotka on saatu edellä mainituilla menetelmillä ; luiten kakssoisjuostemuodossa, voidaan toimlnnai: liittää sekvensseihin, jotka kontrolloivat trai ^. tionaalista ilmentymistä ilmentymisvektorissa, * »« voidaan liittää isäntäsoluun, joko prokaryoottis* * 4 **··[ 25 eukaryoottiseen, tuottamaan rekombinanttiproteii • # ‘ sen funktionaalinen johdannainen. Riippuen siitä koodaavan sekvenssin juoste on toiminnallisesti j • * ·.· · ty transkriptionasiista ilmentymistä koodaavaa venssiin, on myös mahdollista ilmentää antisense 30 tai sen funktionaalista johdannaista.In order to express the desired protein and / or its Akti: derivatives, transcriptional signals that are suitable for my father to transcribe are required. The cloned coding sequences obtained by the above methods; read in double stranded form, can be functionally linked to sequences that control trai. thionic expression in the expression vector, * »« can be linked to a host cell, either prokaryotic * * 4 ** ·· [25 eukaryotic, to produce a recombinant protein • # 'a functional derivative thereof. Depending on this, the strand of the coding sequence is functionally linked to the transcriptional expression coding gene, it is also possible to express antisense 30 or a functional derivative thereof.

; ·'. Proteiinin ilmentäminen eri isännissä v< • « t • f* ♦ 11 22 olevan "kykenevä ilmentämään" polypeptidiä, mi] sisältää ilmentämiskontrollisekvenssit, jotka s vät transkriptionaalisen säätelyinformaation ja set sekvenssit on toiminnallisesti liitetty pol 5 diä koodaavaan nukleotidisekvenssiin.; · '. Expression of a protein in various hosts "capable of expressing" a polypeptide, containing expression control sequences containing transcriptional regulatory information and sequences operably linked to the nucleotide sequence encoding the pol 5.

Toiminnallinen sidos on sidos, jossa se: on liitetty säätelevään sekvenssiin (sekvens; siten, että sekvenssin ilmentyminen tapahtuu sää sekvenssin vaikutuksesta tai valvonnassa. Kahc 10 sekvenssin (esim. koodaavan sekvenssin ja 5’ liitetyn promoottorisäätelysekvenssin) sanotaan toiminnallisesti liitetty, mikäli promoottorin nan indusointi johtaa haluttua proteiinia koi mRNA:n transkriptioon ja mikäli kahden DNA sek1 15 välillä olevan sidoksen luonne ei (1) johda pisti tioon, (2) ei häiritse säätelevien ilmentymissi sien kykyä ohjata proteiinin, antisense RNA:n i; mistä tai (3) häiritse DNA-templaatin transkri] mistä. Täten promoottorialue on toiminnallisest 20 tetty DNA-sekvenssiin, mikäli promoottori kykeni kuttamaan tämän DNA-sekvenssin transkriptioon.A functional linkage is a linkage in which it: is linked to a regulatory sequence (sequence; such that expression of the sequence occurs by or under the control of the weather sequence. A Kahc 10 sequence (e.g., coding sequence and 5 'linked promoter control sequence) is said to be operably linked the desired protein was transcribed by the mRNA and if the nature of the linkage between the two DNA secs1 does not (1) result in a junction, (2) does not interfere with the ability of regulatory expression to direct the protein, antisense RNA; Thus, the promoter region is functionalized into a DNA sequence if the promoter was able to use this DNA sequence for transcription.

Geenin ilmentymiseen tarvittavien sääti ; alueiden täsmällinen luonne voi vaihdella eri 1< * »* ja solutyypeillä, mutta niillä on yleensä 5'-ρέ • * *;··’ 25 transkripoivia ja 5*-pään ei-transloivia (ei-kooc *· sekvenssejä, jotka sisältävät transkription tai * laation aloituksen esim. TATA koodin, peitesekvi {,· · CAAT sekvenssin tai vastaavan. Erityisesti tämän}The regulator needed for gene expression; the exact nature of the regions may vary with different 1 <* »* and cell types, but generally have 5'-ρέ • * *; ·· '25 transcriptional and 5 * terminal non-translational (non-cooc * · sequences containing transcription) or * initialization eg TATA code, mask sequence {, · · CAAT sequence or similar.

:T: set 5'- ei-transkripoivat kontrollisekvenssit sJ: T: set 5'-non-transcriptional control sequence sJ

« 30 vät alueen, jossa on promoottori toiminnallisest : .·, tettynä geenin transkriptionaaliseen kontrolliin A _ — * 11 / 23 nissä, ja mieluiten sienisäätelysysteemejä. 1 käyttää erilaisia transkriptionaalisia ja tram naalisia sääteleviä sekvenssejä, isäntäsolun t^ riippuen. Mieluiten nämä säätelevät signaalit li: 5 natiivissa tilassa erityiseen geeniin, joka ] ilmentymään runsaasti isäntäsolussa.<30 regions containing the promoter functional, as applied to the transcriptional control of the gene in A - 11/23, and preferably fungal regulatory systems. 1 uses a variety of transcriptional and Tramal regulatory sequences, depending on the host cell t1. Preferably, these regulate signals in the li: 5 native state to a specific gene that is abundantly expressed in the host cell.

Eukaryooteilla, joilla transkriptio < liittynyt translaatioon, tällaiset kontrolli sisältävät tai eivät sisällä initiaattori-metj 10 (AUG) kodonin, riippuen siitä sisältääkö kloonatl venssi tällaisen metioniinin. Tällaiset alueet sJ vät yleensä promoottorialueen, joka on riittävä lemään RNA-synteesin aloitusta isäntäsolussa. FiJ tisienigeenien promoottorit, jotka koodaavat tra 15 tioon kykenevää mRNA:n tuotetta, ovat suositeltc ja erityisesti voidaan käyttää vahvoja promoott edellyttäen että ne toimivat promoottoreina myös täsolussa. Suositeltavia vahvoja promoottoreja Ί dermalle ovat T. reesei cbhl geenipromoottori ta 20 sen sellulaasigeenin promoottori esim. cbh2, eq eq!2. Trichoderman säätelevien elementtien käyt säksi, proteiinien ilmentäminen voi tapahtua Asy . lus nidulansin säätelevien elementtien valve I./ (esimerkiksi arqB qeenipromoottori 1a amdS qee • a *···* 25 moottori), Aspergillus niqerin säätelevien eleme • · *5 valvonnassa (esimerkiksi fytaasipromoottori tai « ·♦ amyl aasi promoott ori). Ilmentyminen tällaisten ei-l\ \ odermaa säätelevien elementtien vaikutuksesta s :T: olla hyvin vähäistä verrattuna käytettäessä Trich 30 -elementtejä ja erityisesti käytettäessä T. rees : elementtejä.In eukaryotes with transcriptional translation, such controls contain or do not contain an initiator-meth (10-AUG) codon, depending on whether such a methionine is contained in the cloning gene. Such regions generally contain a promoter region sufficient to initiate RNA synthesis in the host cell. Promoters of the Fis tis fungal genes encoding a trait-capable mRNA product are preferred and, in particular, strong promoters can be used provided they also function as promoters in the cell. Preferred strong promoters for Ί dermal include the T. reesei cbhl gene promoter or its cellulase gene promoter, e.g., cbh2, eq eq! 2. Using Trichoderma regulatory elements, protein expression can take place in Asy. lus nidulans regulatory elements I. / (e.g., arqB gene promoter 1a amdS qee • a * ··· * 25 motor), Aspergillus niqer regulatory elements • · * 5 (e.g., phytase promoter or · · ♦ amylase promoter ori). The expression of such non-lipid controlling elements by s: T: is very low compared to the use of Trich 30 elements and in particular to the use of T. Rees: elements.

• ·* · 11 24 tioniinia koodaavaa väliintulevaa kodonia. Täi kodonien läsnäolo johtaa joko fuusioproteiinin (jos AUG kodonl on samassa lukukehyksessä kuin Unia koodaava DNA-sekvenssi) tai pistemutaatio· 5 AUG kodoni ei ole samassa lukukehyksessä kuin p nia koodaava sekvenssi).• · * · 11 24 intervening codons encoding thionine. The full presence of codons results in either a fusion protein (if the AUG codon is in the same reading frame as the DNA coding for dreams) or a point mutation (5 AUG codons are not in the same reading frame as the p n coding sequence).

Voi olla toivottavaa konstruoida fuu, teiini, joka sisältää proteiinin osittaisen ko< sekvenssin (tavallisesti aminopäätteisessä pääs 10 toisen koodaavan sekvenssin (osittaisen tai kokoi keksinnönmukaista fytaasia hajottavasta entsy Sekvenssi, joka ei koodaa fytaasia hajottavaa eni saattaa toimia signaalisekvenssinä eritettäessä iinia isäntäsolusta. Haluttua proteiinia koodaa^ 15 venssi voi esimerkiksi olla sidottu signaalisi siin, joka mahdollistaa proteiinin erittämisen t: isännästä tai proteiinin lokeroitumisen tietyssi nässä. Tämänkaltaiset fuusioproteiinisekvenssit i suunnitella joko spesifisten proteaasikohtien 20 tai ilman niitä, siten että haluttu peptidisekvei vastaanottavainen myöhemmälle poistolle. Soj sovellutuksessa käytetään sieniproteiinin n; ^ . signaalisekvenssiä tai tämän sekvenssin funktion* johdannaista, joka säilyttää kyvyn ohjata tähän 1 « «It may be desirable to construct a fuu, a tein containing a partial coding sequence of a protein (usually at the amino terminus of the 10 coding sequences (partial or assembly of the phytase-degrading enzyme of the invention) which may not function as a signaling sequence for secretion of Hal. For example, a fusion protein sequence may or may not be designed for subsequent deletion of the desired peptide sequence, and may be designed to allow secretion of the protein from the t-host or to localize the protein therein. a signal sequence or a derivative of a function * of this sequence that retains the ability to direct this 1 ««

25 nallisesti liitetyn peptidin eritystä. AspergiJSecretion of 25 peptides. AspergiJ

* "· johto/erityssignaalisekvenssit toimivat myös Trie \..5 massa.* "· Wire / secretion signal sequences also work for Trie \ .. 5 mass.

* ·* ·

J Voidaan valita transkriptionaalisia aJJ Transcriptional aJ can be selected

ΓΓ: sensäätelysignaaleja, jotka mahdollistavat repi 30 tai aktivaation, niin että toiminnallisesti liite : geenien ilmentymistä voidaan moduloida. Säätelyg t«* * 25ΓΓ: sensory signals that allow for repi or activation so that functionally the expression of the appendix: genes can be modulated. Adjust t «* * 25

Mikäli halutaan, ei-kopioidut ja/tai ei haluttua proteiinia koodaavan sekvenssin 3’-pään voidaan saada edellä kuvatuilla kloonausmenete 3'-pään ei-kopioitu alue voidaan säilyttää sei 5 skriptionaalisen lopetussäätelysekvenssielem osalta tai niiden elementtien osalta, jotka o polyadenylaatiota eukaryoottisissa soluissa. Kun vit ilmentymiskontrollisekvenssit eivät toimi ty västi isäntäsolussa, isäntäsolussa olevat funkti 10 set sekvenssit voidaan korvata.If desired, the 3'-end of the non-transcribed and / or unwanted protein coding sequence can be obtained by cloning the 3'-end untranslated region for either the scriptural termination control element or those elements that are polyadenylated in eukaryotic cells. When the vit expression control sequences do not function properly in the host cell, the functional sequences in the host cell can be replaced.

Keksinnönmukaiset vektorit voivat koostua muista toiminnallisesti liitetyistä säät menteistä kuten DNA-elementeistä, jotka saavat antibioottiresistenssin tai replikaation aloitu 15 vektorin ylläpitämiseksi yhdessä tai useammassa täsolussa.The vectors of the invention may consist of other functionally linked regulators, such as DNA elements, that receive antibiotic resistance or replication to maintain the Started vector in one or more plaque cells.

Toisessa sovellutuksessa, erityisesti ; nonmukaisten vektoreiden ylläpitämiseksi prokar sissa soluissa tai S. cerevisiae-soluissa, 1 20 sekvenssi sisällytetään plasmidiin tai virusvek joka kykenee itsenäiseen replikaatioon vastaanot isännässä. Mitä tahansa vektoria voidaan käyttäi ; tarkoitukseen. Bacillus-isännissä halutun DNA: n • «· I./ minen voi olla tarpeellista.In another embodiment, in particular; In order to maintain the appropriate vectors in procary cells or S. cerevisiae cells, the I20 sequence is included in a plasmid or virecek capable of independent replication in the host host. Any vector can be used; purpose. In Bacillus hosts, the desired DNA may be necessary.

*;·** 25 Tietyn plasmidin tai virus vektorin vai; * 9 e sessa tärkeitä tekijöitä ovat:helppous, jolla vi *«··“ sisältävät vastaanottavat solut voidaan tunnis !.j i valikoida niiden vastaanottavien solujen joi ti : joissa ei ole vektoria; haluttu vektoreiden koj 30 tietyssä isännässä; ja onko haluttua "sukkuloidc : ·'; toria eri lajisten isäntäsolujen välillä.*; · ** 25 The amount of a particular plasmid or virus vector; Important factors in this context are: the ease with which the receiving cells containing the vi * «··“ can be identified by selecting one of the receiving cells without the vector; desired vector instrument in 30 specific hosts; and whether there is a desired "sukkuloidc: ·" between different host cell types.

t«· · 26t «· · 26

Cycle and Inheritance, Cold Spring Harbor Labo Cold Spring Harbor, NY, sivut 445-470 (1981); J.R., Cell 28i203-204 (1982); Bollon, D.P., et__ Clin. Hematol. Oncol. 10:39-48 (1980)? Maniati 5 teoksessa: Cell Biologyi A comprehensive TrCycle and Inheritance, Cold Spring Harbor Labo Cold Spring Harbor, NY, pages 445-470 (1981); J.R., Cell 281203-204 (1982); Bollon, D.P., et__ Clin. Hematol. Oncol. 10: 39-48 (1980)? Maniati in 5: Cell Biology A Comprehensive Tr

Vol. 3, Gene Expression, Academic Press, NY, (1980)), ja ne ovat kaupallisesti saatavilla.Vol. 3, Gene Expression, Academic Press, NY (1980)) and are commercially available.

Kun vektori tai DNA-sekvenssi, joka s konstruktion tai konstruktiot, on valmistettu i 10 mistä varten, DNA-rakenne tai -rakenteet li sopivaan isäntäsoluun millä tahansa sopivalla mi mällä, esimerkiksi transformaatiolla. Vektorin misen jälkeen vastaanottaneita soluja kasvateta lektiivisella alustalla, joka suosii vektorin s 15 vien solujen kasvua. Kloonatun geenisekvenssin sekvenssien ilmentyminen saa aikaan halutun pro-tai tämän proteiinin fragmentin tuoton. Tämä i. minen voi tapahtua jatkuvatoimisesti transformo: soluissa tai ohjatusti esimerkiksi ilmentymisen 20 tion kautta.Once the vector or DNA sequence of the constructs or constructs has been prepared for the purpose, the DNA construct (s) will be introduced into a suitable host cell by any suitable means, for example by transformation. Following vector digestion, the receiving cells are grown on a lective medium that favors the growth of vector s 15 cells. Expression of the sequences of the cloned gene sequence results in production of the desired pro or fragment of this protein. This i. E. Can take place continuously in transformo cells or controlled, for example, through expression.

Sienten transformaatio tehdään myös tunnettujen menetelmien mukaisesti esimerkiksi k· β·β · esimerkiksi homologista rekombinaatiota liiti * *m *./ geeni stabiilisti sieni-isäntään ja/tai tuh< i · 25 isäntäsolun kyky ilmentää tiettyä proteiinia.Fungal transformation is also carried out according to known methods, for example, k · β · β · for example homologous recombination with the lithium * * m *. / Gene stably into a fungal host and / or the ability of a thousand cells to express a particular protein.

¥· * * **¥ · * * **

Vasta-aineiden valmistus « » * · « • * ? *.. · :Γ: Seuraavassa selityksessä viitataan eri] 30 menetelmiin, jotka ovat tunnettuja immunologian « j ,*· Immunologian yleisperiaatteita esitteleviä perui • f* · 11 27Production of Antibodies «» * · «• *? * .. ·: Γ: The following description refers to the various] 30 methods known in the art of immunology «j, * · General Principles of Immunology • f * · 11 27

Plenum Press, New York (1980)); Campbell, A. ("M nal Antibody Technology," teoksessa: Laborator niques in Biochemistry and Molecular Biology, Vo (Burdon, R., et al., eds.), Elsevier, Amsterdam 5 )); ja Eisen, H.N., teoksessa: Microbiology, (Davis, B.D., et al,, Harper & Row, Philadelphi 0)).Plenum Press, New York (1980)); Campbell, A. ("Antibody Technology," in Laboratories in Biochemistry and Molecular Biology, Vo (Burdon, R., et al., Eds.), Elsevier, Amsterdam 5)); and Eisen, H.N., in Microbiology, (Davis, B.D., et al., Harper & Row, Philadelphi 0)).

Vasta-aineen sanotaan olevan "kykenevä tumaan" molekyyliin, mikäli se kykenee spesi 10 reagoimaan molekyylin kanssa ja täten sitomaan m Iin vasta-aineeseen. Termillä "epitooppi" tarko hapteenin sitä osaa, joka voidaan tunnistaa j< vasta-aine voi sitoutua. Antigeenillä voi olla y useampia epitooppeja. "Antigeeni" kykenee saam« 15 kaan antigeenin epitooppiin sitoutvan vasta tuoton eläimessä. Edellä mainitulla spesifisellä tiolla tarkoitetaan, että antigeeni reagoi hyvin tiivisesti vastaavan vasta-aineen kanssa eikä vasta-aineiden kanssa, jotka ovat muiden anti1 20 aikaansaamia.An antibody is said to be "capable of nuclear" if it is able to react with the molecule and thereby bind to the antibody. By "epitope" is meant the portion of the hapten that can be recognized and the antibody can bind. An antigen may have γ more epitopes. An "antigen" is capable of producing an epitope that binds to an antigen only in an animal. By the aforementioned specific thio is meant that the antigen reacts very closely with the corresponding antibody and not with antibodies raised by other anti.

Termiä "vasta-aine" (Ab) tai "monoklon< vasta-aine" (Mab) käytetään tässä tarkoittamaar naista molekyyliä kuin myös sen fragmentteja , , esimerkiksi Fab- ja F(ab') -fragmentteja), jotka ] * 1 1 1 25 vät sitoutumaan antigeeniin. Fab- ja F(ab')2-f] :··.1 teiltä puuttuu kokonaisessa vasta-aineessa ole • 1 fragmentti, ne poistuvat nopeamman verenkierros • · 1 2.,,! ne saattavt olla vähemmän epäspesifisesti sitout : kudokseen kuin kokonainen vasta-aine (Wahl et a 30 Nucl, Med. 24:316-325 (1983)).The term "antibody" (Ab) or "monoclonal <antibody" (Mab) is used herein to mean any molecule as well as fragments thereof, for example Fab and F (ab ') fragments) which * 1 25 antigen binding. Fab and F (ab ') 2-f]: ·· .1 you lack the • 1 fragment in the whole antibody, they are eliminated for faster circulation • · 1 2. ,,! they may be less nonspecifically bound to tissue than whole antibody (Wahl et al. 30 Nucl. Med. 24: 316-325 (1983)).

Esillä olevan keksinnön mukaiset vasta- 28 neet kykenevät sitomaan fytaasin tai pH 2.5 ha fataasin.The antibodies of the present invention are capable of binding phytase or pH 2.5 ha phytase.

Solut, jotka ilmentävät fytaasia tai happofosfataasia, tai niiden fragmenttia tai 5 iiniseosta, joka sisältää fytaasia tai pH 2.5 ha fataasia tai fragmentteja, voidaan myös antaa el indusoimaan polyklonaalisia vasta-aineita sis seerumin tuotto, jotka vasta-aineet kykenevät s fytaasi- tai pH 2.5 happofosfataasiproteiinin. H 10 essa fytaasi- tai pH 2.5 happofosfataasi-vas voidaan puhdistaa muista polyklonaalisistä va neista standardiproteiinipuhdistusmenetelmillä tyisesti affiniteettikromatografiällä käyttäen ] tettua fytaasia tai pH 2.5 happofosfataaisia tai 15 fragmentteja.Cells expressing phytase or acid phosphatase, or a fragment or mixture thereof containing phytase or pH 2.5 ha phagease or fragments, can also be elicited to induce serum production of polyclonal antibodies capable of s phytase or pH 2.5 happofosfataasiproteiinin. At pH 10, the phytase or pH 2.5 acid phosphatase can be purified from other polyclonal media by standard protein purification methods, in particular by affinity chromatography using phytase or pH 2.5 acid phosphatase or fragments.

Fytaasi- tai pH 2.5 happofosfataasiproti ragmentti voidaan myös syntetisoida kemiallise puhdistaa HPLC:n avulla vapaaksi kontaminam Tällaista valmistetta annetaan eläimelle korkean 20 fisen aktiivisuuden omaavan polyklonaalisten aineiden tuottamiseksi.The phytase or pH 2.5 acid phosphatase protease may also be synthesized by chemical purification by HPLC for free contamination. Such a preparation is administered to an animal to produce polyclonal substances of high physical activity.

Monoklonaalisia vasta-aineita voidaan 1 käyttäen hybridoomatekniikkaa (Kohler et ai., . . 256:495 (1975Ϊ; Kohler et ai., Eur. J. Immunol.Monoclonal antibodies can be 1 using hybridoma technology (Kohler et al., 256: 495 (1975); Kohler et al., Eur. J. Immunol.

......

25 (1976); Kohler et ai., Eur. J. Immunol. 6:292 * * **·* Hammerling et ai. , teoksessa: Monoclonal Ant: ' '·: and T-Cell Hybridomas, Elsevier, N.Y., sivut ! • · * (1981)). Tavallisesti tällaisissa menetelmissä : immunisoidaan fytaasi- tai pH 2.5 happofosfataas: 30 iiniantigeenilla. Tällaisen eläimen pernasolut nosyytit) uutetaan ja liitetään sopivaan i 11 29 koivasti HAT-alustassa ja kloonataan rajoitus noksella kuten on esittänyt Wands, J.R., et ai. roenteroloqy 80;225-232 (1981), joka julkaisi viittauksella liitetään hakemukseen. Valikoimal 5 dut hybridoomasolut analysoidaan niiden klooni» nistamiseksi, jotka erittävät vasta-aineita, kykenevät sitomaan fytaasi- tai pH 2.5 happ taasiproteiiniantigeenin.25 (1976); Kohler et al., Eur. J. Immunol. 6: 292 * * ** · * Hammerling et al. , in: Monoclonal Ant: '':: and T-Cell Hybridomas, Elsevier, N.Y., pages! • · * (1981)). Usually in such methods: phytase or pH 2.5 acid phosphatase: 30 is immunized with an antigen. Spleen cells from such an animal are extracted and ligated into a suitable I 11 29 bitter HAT medium and cloned with restriction dose as described by Wands, J.R., et al. roenteroloqy 80; 225-232 (1981), the disclosure of which is hereby incorporated by reference. A variety of hybridoma cells are analyzed to clone those that secrete antibodies capable of binding the phytase or pH 2.5 happ re-protein antigen.

Edellä mainittuja menetelmiä sovel 10 voidaan saada lisää solulinjoja, jotka kykenevä tamaan vasta-aineita, jotka tunnistavat fytaasi- 2.5 happofosfataasiproteiinin epitoopin.Further cell lines capable of producing antibodies recognizing the epitope of the phytase-2.5 acid phosphatase protein may be obtained by applying the above methods.

Vasta-aineet fytaasin tai pH 2.5 happ taasin sekä korkeasti säilöttyä että heikosti sä 15 aluetta vastaan ovat käyttökelpoisia fytaasin ja happofosfataasin biosynteesin ja katabolian kon tutkimisessa, ja tutkimuksissa, joissa on tarpee tifioida tai kvantifioida proteiiniin antigeeni läsnäolo koostumuksessa.Antibodies against phytase or pH 2.5 hap, on both the highly conserved and weak regions, are useful in studying the biosynthesis and catabolism of phytase and acid phosphatase, and in studies requiring the protein to be antigenized or quantified in the composition.

2020

Fytaasin ja happofosfataasin tuottoProduction of phytase and acid phosphatase

Parhaat fytaasituottotasot saatiin Tri» . , mailla, johon oli transformoitu lineaarinen DNA ] * · * 11 25 mällä cbhl promoottoria (noin 3,800 PNU/ml, kati lukko 8). Noin 3,500 ja 3,600 PNU/ml kasvati * **: saatiin parhaalla T. reesei ALK02221 ja ALK0233 ·*»The highest levels of phytase yield were obtained by Tri ». , countries transformed with linear DNA] * · * 11 with the cbhl promoter (about 3,800 PNU / ml, Kati lock 8). About 3,500 and 3,600 PNU / ml were grown * **: best T. reesei ALK02221 and ALK0233 were obtained · * »

formanteilla, jotka eivät sisältäneet E. coli-s< sejä. Sekä fytaasin että cbhl: n signaalise] 30 näyttivät toimivan yhtä hyvin ja samankaltaiset sin tuottotasot saatiin käyttämällä T. reesei AIformants that did not contain E. coli. Both phytase and cbh1 signaling] appeared to work equally well and similar levels of sin production were obtained using T. reesei AI

30 kuin mikään tähän mennessä ilmoitettu määrä he gista proteiinia, joka on ilmennetty Trichodermi Niiden entsyymien kirjo, jotka esi yhdessä fytaasin kanssa keksinnönmukaisilla Trie 5 kannoilla, on erilainen ja edullisempi kuin va Asperqillus-kasvatusliuosvalmisteet. Sekä endogl si- että sellobiohydrolaasiaktiivisuudet ovat o sesti korkeampia käytettäessä keksinnönmukaista derma-isäntää. Fytaasin glykosylaatiomalli o: 10 erilainen, kun fytaasi ilmennetään Trichodermall saa aikaan fytaasiproteiinin, joka kulkeutuu vyöhykkeenä Western-analyysissa.30 than any hitherto reported amount of hygene protein expressed Trichodermi The range of enzymes which precede co-phytase with the strains of Trie 5 according to the invention is different and less expensive than the Asperqillus broth preparations. Both endoglucose and cellobiohydrolase activities are substantially higher when using the derma host of the invention. Phytase Glycosylation Model o: 10 Different When Phytase Expressed Trichodermall produces a phytase protein which passes as a band in Western analysis.

Paras pH 2.5 happofosfataasin tuottotai sinnönmukaisessa Trichoderma-trans formantis sa c 15 APNU/ml kasvatusliuosta, ravistelukasvatuksessa toosipohjäisellä alustalla. Kuten fytaasilla, se pofosfataasin että cbhl:n signaalisekvenssi t< yhtä hyvin.Best pH 2.5 for the production of acid phosphatase or Trichoderma-trans formant sa c 15 APNU / ml broth in shake culture on a toose-based medium. As with the phytase, the signal sequence of phosphatase and cbh1 is as well.

Keksinnönmukaisia koostumuksia, jotka s 20 vät fytaasia, voidaan käyttää fytiinihapon tai ii liheksafosforihapon poistoon raaka-aineesta, < sesti fytiinipitoisesta raaka-aineesta ja erit; kasvimateriaalista. Fytaasi poistaa fosfaatt . . fytiinihaposta ja tuhoaa sen kyvyn häiritä mini « « · 25 imeytymistä. Eläinrehun lisäaineena käytettäessä • · sinnönmukaiset fytaasikoostumukset vapauttava • · * *·; tiiniin sitoutuneen fosforin viljaan ja täten me: » * * västi vähentävät lisäfosforin tarvetta rehukoo: : sissa ja vähentävät ympäristön kuormitusta.The compositions of the invention which contain phytase may be used to remove phytic acid or ii-hexaphosphoric acid from a raw material, i.e. a phytin-containing raw material, and in batches; plant material. Phytase removes phosphate. . phytinic acid and destroys its ability to interfere with mini «« · 25 absorption. When used as an animal feed additive, the phytase compositions of the invention release · · * *; phosphorus bound to cereals and thus we: »* * significantly reduce the need for additional phosphorus in feed rations and reduce the environmental load.

• · * * ·'**; 30 Keksinnönmukaisesti tuotetut fytaasi ja m happofosfataasi voidaan puhdistaa tunnetuilla pi 31 ESIMERKKI 1• · * * · '**; 30 The phytase and m acid phosphatase produced according to the invention can be purified using known pi 31 EXAMPLE 1

Fvtaasin aktiivisuuden mittausmenetelmäMethod for measuring phthase activity

Periaate Fytaasi vaikuttaa fytaattiin ( 5 oliheksafosfaattiin) vapauttaen epäorgaanista f tia. Vapautuneen epäorgaanisen fosfaatin määri rustuu väriin, joka muodostuu fosfomolybdaattik sin pelkistyessä.Principle Phytase acts on phytate (5 olhexaphosphate) to liberate inorganic phytate. The amount of inorganic phosphate liberates becomes dye, which is formed when the phosphomolybdate is reduced.

10 Aktiivisuusyksikkö Yksi fytaasiyksikkö se määrä entsyymiä, joka vapauttaa standardiolos sa 1 nmol:n epäorgaanista fosfaattia natriumfyt yhdessä minuuutissa.Unit of activity One unit of phytase is the amount of enzyme which liberates 1 nmol of inorganic phosphate sodium phytate per minute in a standard solution.

15 Mittausolosuhteet15 Measuring conditions

Substraatti Natriumfyta* pH 5.0Substrate Sodium phyta * pH 5.0

inkubointilämpötila 37°C ± 0.5°Cincubation temperature 37 ° C ± 0.5 ° C

inkubointiaika 15 minuuttia 20incubation time 15 minutes 20

Laitteistotinstallations

vesihaude 37 °Cwater bath 37 ° C

vesihaude 50°Cwater bath at 50 ° C

. # Spektrofotometri t φ « 25 Koeputkisekoitin (vortex) 5...# Fosfaatittomia lasitavaroita • * • *. # Spectrophotometer t φ «25 Test tube mixer (vortex) 5 ... # Phosphate-free glassware • * • *

Reagenssit Kaikki liuokset on valm: : deionisoituun, Milli-Q tai vastaavaan veteen.Reagents All solutions are prepared in: deionized water, Milli-Q or similar water.

30 1. Sitraattipuskuri (0.2 M. pH 5.0). Va! taan 0.2 M liuokset veteen sekä natriums!tr< 11 32 2. Substraatti. Liuotetaan 1,00 g nat: taattia (Sigma P-3168) 70 ml:aan sitraattipu; Säädetään pH arvoon 5 0.2 M sitruunahapolla ja tään tilavuus 100 ml:ksi sitraattipuskurilla.1. Citrate buffer (0.2 M. pH 5.0). Va! 0.2 M solutions in water and sodium tr <11 32 2. Substrate. Dissolve 1.00 g of natate (Sigma P-3168) in 70 ml of citrate; Adjust the pH to 5 with 0.2 M citric acid and make up to 100 ml with citrate buffer.

5 substraattiliuosta pitää valmistaa päivittäin.5 substrate solutions should be prepared daily.

3. 15 %(w/v) TCA-liuos. Valmistetaan t] rietikkahaposta (Merck 807).3. 15% (w / v) TCA solution. It is prepared from acetic acid (Merck 807).

4. 10 %(w/v) Askorbiinihappoliuos. Va; taan askorbiinihaposta (Merck 127). Säilytetää 10 leässä. Liuos säilyy stabiilina seitsemän päivää 5. 2.5 %(w/v) Ammoniummolybdaattiliuos, tetaan 2.5 g (NH4)6Mo7024* 4H20, Merck 1182) veteen tilavuuteen 100 ml.4. 10% (w / v) ascorbic acid solution. Va; ascorbic acid (Merck 127). Store in 10 loaves. The solution remains stable for seven days at 5. 2.5% (w / v) Ammonium molybdate solution, made up to 2.5 g (NH4) 6Mo7024 * 4H2O, Merck 1182) in water to 100 ml.

6. 1 M Rikkihappo. Lisätään 55.6 ml k< 15 roitua H2SOd (Merck 731) noin 800 ml:aan vettä ja tetaan. Annetaan jäähtyä ja tilavuus säädetää ml:ksi vedellä.6.1 M sulfuric acid. Add 55.6 mL k <15 of H 2 SO 2 (Merck 731) to about 800 mL water and make up. Allow to cool and make up to one ml with water.

7. Reagenssi C. Sekoitetaan 3 osaa 1 M happoa ja 1 osa 2.5 % ammoniummolybdaattia, lisä 20 osa 10 % askorbiinihappoa ja sekoitetaan hyvin, reagenssia C pitää valmistaa päivittäin.7. Reagent C. Mix 3 parts 1 M acid and 1 part 2.5% ammonium molybdate, add 20 parts 10% ascorbic acid and mix well, reagent C must be prepared daily.

Näytteen laimennus Näytteet laimennetac raattipuskurilla. Jokaisesta laimennoksesta t \ " 25 rinnakkaisnäyte. Enstsyymijauhetta punnitaan te 9 99 noin 250 mg näytteeseen, liuotetaan puskuriin ja '·· tään 25 ml:aan mittapullossa, lisälaimennoksia t tarvittaessa.Dilution of the sample Dilute the samples with the buffer. Weigh duplicate samples of each dilution. Weigh out 9 999 mg of the enzyme powder in a sample of approximately 250 mg, dissolve in buffer and make up to 25 ml in a volumetric flask, diluting as necessary.

999 • » • 99 9 9 9 999 9 9 0 9 Ψ · 9 9 9 9 33999 • »• 99 9 9 9 999 9 9 0 9 Ψ · 9 9 9 9 33

Laimennustaulukko_Laimennustaulukko_

Arvioitu aktii- Suositeltu Laimennuste visuus PU/ml__laimennus__jä_ 2000 1+19 20 5 20000 1 + 199 200 40000 1 + 399 400 100000 1 + 999 1000 500000 1 + 4999 5000 10Estimated Active Recommended Dilution Volume PU / ml__dilution__ja_ 2000 1 + 19 20 5 20000 1 + 199 200 40000 1 + 399 400 100000 1 + 999 1000 500000 1 + 4999 5000 10

AnalyysiAnalysis

Hydrolyysi Pipetoidaan 1.0 ml näyteli joka sisältää 20-190 PU kahteen koeputkeen. Li 15 2.0 ml 15 % TCA-liuosta toiseen koeputkeen (soke ja sekoitetaan. Ilman TCA:ta olevat koeputket lai vesihauteeseen 37 °C lämpötilaan ja niiden an tasapainottua 5 minuuttia. Käyttäen sekuntikelloa tetaan hydrolyysi lisäämällä peräkkäin sopivi 20 liajoin 1.0 ml substraattia (tasapainotettu 10 mi ajan 37 °C lämpötilassa) jokaiseen koeputkeen ja tetaan. Tasan 15 minuutin inkuboinnin jälkeen r lopetetaan lisäämällä 2.0 ml TCA:ta jokaiseen k keen. Sekoitetaan ja jäähdytetään huoneenlämpöt *: 25 Lisätään 1.0 ml substraattia myös sokea koe-p • »1 (joita on pidetty huoneen lämpötilassa) ja sekoit m · '1· Mikäli muodostuu sakkaa, se täytyy erottaa sentri maila 10 minuuttia 2000xq.Hydrolysis Pipette 1.0 ml sample containing 20-190 PU into two test tubes. Li 15 2.0 ml of 15% TCA solution in another tube (blind and mix. Tubes without TCA in a water bath at 37 ° C and equilibrated for 5 minutes. Using a stopwatch, hydrolyze by successive addition of 1.0 ml of substrate (equilibrated 10 at 37 ° C) into each tube and mix, After incubation for exactly 15 minutes, r is stopped by adding 2.0 mL of TCA to each tube Mix and cool to room temperature *: 25 1.0 mL of substrate is also added to the blind test p has been kept at room temperature) and stirred m · '1 · If a precipitate forms, it must be separated by a centipede for 10 minutes at 2000xq.

• f · .'· Vapautunut ortofosfaatti Pipetoidaan ( ··♦ · j1;·. 30 jokaista näytettä hydrolyysin jälkeen koeputkiin.• · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·

tään 3.6 ml vettä jokaiseen koeputkeen. Inkub lämnnt-i lacca 9Π minimi ΐ n aian na -iäähHv 11 34 (Merck 4873, kuivattu eksikaattorissa silikall ml:aan mittapuliossa. Tehdään seuraavat laimei veteen varastoliuoksesta ja käytetään niitä stan< na.3.6 ml of water for each test tube. Inkub warm-up lacca 9 imi minimum na n na na h v 34 34 34 11 v 34 34 (Merck 4873, dried in a desiccator to a volume of 1 ml. Make the following dilute with water from a stock solution and use as a standard.

55

Laimennus Fosfori konsen- Fytaasi akt traatio nmol/ml visuus PU/m 1:100 90 240 1:200 45 120 1:400 22.5 60 10 * Vastaava fytaasiaktiivisuus (PU/ml) on sa< jakamalla fosforikonsentraatio (nmol/ml) hydro lyysiajalla (15 minuuttia) ja kertomalla neljä (kokonaistilavuus hydrolyysireaktion jälkeen / tetilavuus) ja 10:llä (laimennus ennen epäorga 15 sen fosforin analyysia)Dilution Phosphorus concentration Phytase activity in nmol / ml PU / m 1: 100 90 240 1: 200 45 120 1: 400 22.5 60 10 * The corresponding phytase activity (PU / ml) is calculated by dividing the phosphorus concentration (nmol / ml) by the hydrolysis time. (15 minutes) and multiplying by four (total volume after hydrolysis reaction / tet volume) and 10 (dilution before inorganic 15 analysis of its phosphorus)

Pipetoidaan 4.0 ml jokaista laimennust teen koeputkeen. Pipetoidaan myös 4.0 ml vettä koeputkeen (reagenssi-sokea koe). Lisätään 4.0 π 20 genssi C:tä ja sekoitetaan. Inkuboidaan 50°C Is lassa 20 minuutin ajan ja jäähdytetään huoneenläPipette 4.0 ml of each dilution into a test tube. Pipette also 4.0 ml of water into a test tube (reagent blank test). Add 4.0 π of 20 g C and mix. Incubate at 50 ° C for 20 minutes and cool at room temperature

·***· laan. Mitataan absorbanssit aallonpituudella I· *** · laan. Measure the absorbances at wavelength I

« · · \J reagenssi-sokea koetta vastaan. Tehdään standard«· · \ J reagent-blind test. Let's make a standard

.···, piirtämällä absorbanssi vs fytaasiaktiivisuus (E···, plotting absorbance vs. phytase activity (E

* * 25 Jokaista koesarjaa varten täytyy tehdä uusi st disuora.* * 25 A new st disassembly must be made for each test set.

·' * Laskenta Sokea kokeen absorbanssi vähen näytteen absorbanssista (eron pitäisi olla 0.Calculation The blank absorbance of the test is reduced by the absorbance of the sample (the difference should be 0.

3535

Rehun ia muiden liukenemattomien näy valmistus fytaasianalyysia varten Punnitaan t.Preparation of feed and other insoluble matter for phytase analysis Weigh t.

2.5 g perusnäytettä kahteen 50 ml:n dekantteri Lisätään 20.0 ml sitraattipuskuria. Sekoitetaan ] 5 mällä mageneettisekoittajaa 30 minuutin ajan hi lämpötilassa. Siirretään noin 10 ml kummastakin ! fuugiputkiin ja erotetaan kiintoaines sentrifugi 10 minuuttia 2000xg. Laitetaan 2.5 ml supernal PD-10 geelisuodatuskolonneihin (Sephadex G-25M, 1 10 cia 17-0851-01), jotka on tasapainotettu 25 sitraattipuskuria. Poistetaan eluaatti. Tämän ; lisätään 3.5 ml sitraattipuskuria kolonniin ja k< eluaatti mitta-asteikolla varustettuun lieriöön, tään tilavuuteen 5.0 ml sitraattipuskurilla (lain 15 tekijä 2) ja määritetään fytaasiaktiivisuus. A) suus PU/g saadaan kertomalla mitattu aktiivisuus ml) 40:llä (laimennustekijä x uutepuskurin tilavi jakamalla näytteen tarkalla painolla (g). Viite et ai. Anal. Chem. 28:1756-1758 (1956).2.5 g aliquot in two 50 ml beakers Add 20.0 ml citrate buffer. Stir] with a magnetic stirrer for 30 minutes at hi. Transfer about 10 ml of each! and centrifuge the solids for 10 minutes at 2000 x g. Place 2.5 ml supernal PD-10 gel filtration columns (Sephadex G-25M, 1010 and 17-0851-01) equilibrated in 25 citrate buffers. Remove the eluate. This; add 3.5 ml of citrate buffer to the column and k <eluate to a graduated cylinder, make up to 5.0 ml with citrate buffer (Law 15 Factor 2) and determine the phytase activity. A) Oral PU / g is obtained by multiplying the measured activity by ml) 40 (dilution factor x volume of extract buffer divided by the exact weight of the sample (g). Reference et al. Anal. Chem. 28: 1756-1758 (1956).

20 ESIMERKKI 220 EXAMPLE 2

Happofosfataasin aktiivisuuden määritys , , Periaate Happofosfataasi vaikuttaa p- 4 * * 25 fenyyli fosfaatti in vapauttamalla epäorgaanista fc *··«* tia. Vapautuneen epäorgaanisen fosfaatin määrit ' '*S rustuu väriin, joka muodostuu fosofmolybdaattikc sin pelkistyessä.Determination of acid phosphatase activity, Principle Acid phosphatase acts on p-4 * * 25 phenylphosphate by releasing inorganic fc * ··· *. The specific amount of liberated inorganic phosphate turns to a color formed by the reduction of phospho-molybdate.

| Aktiivlsuusyksikkö Yksi happofosfataasi? i*·’: 30 (HFU) on se määrä entsyymiä, joka standardi oi osuh vapauttaa 1 nmol;n epäorgaanista fosforia p-nitrc 36 inkubointilämpötila 37°C ± 0.5°< inkubointiaika 15 minuutti· 5 Laitteistot| Activity unit One acid phosphatase? i * · ': 30 (HFU) is the amount of enzyme which liberates 1 nmol of inorganic phosphorus p-nitrc 36 incubation temperature 37 ° C ± 0.5 ° <incubation time 15 minutes · 5 Equipment

vesihaude 37°Cwater bath 37 ° C

vesihaude 50°Cwater bath at 50 ° C

Spektrofotometri Koeputkisekoitin (vortex) 10 Sentrifugi (Hereaus Biofuge 17S. 3090 1 vastaava)Spectrophotometer Vortex Mixer 10 Centrifuge (Hereaus Biofuge 17S. 3090 1 equivalent)

Fosfaatittomia lasitavaroitaPhosphate-free glassware

Reaqenssit Kaikki liuokset on valmistel 15 deionisoituun, Milli-Q tai vastaavaan ^ 1. Glysiinipuskuri (0.2 M, pH 2.5) Liuotetaan 15.014 g glysiiniä (Merck 4' noin 800 ml:aan vettä. Säädetään pH arv 1 M suolahapolla (kulutuksen pitäisi oi 20 80 ml) ja laimennetaan 1000 ml:ksi vedt 2. Substraatti (30 mM)Reagents All solutions are prepared in deionized, Milli-Q or similar 1: 1. Glycine buffer (0.2 M, pH 2.5) Dissolve 15.014 g of glycine (Merck 4 'in about 800 ml of water. Adjust pH to 1 M with hydrochloric acid. 80 ml) and dilute to 1000 ml with hydrogen 2. Substrate (30 mM)

Liuotetaan 1.114 g p-nitrofenyylifos (Boehringer, 738 352) glysiinipuskur säädetään tilavuus 100 ml:ksi puskuril] f f · '· 25 Uutta puskuria on valmistettava päivitt 3. 15 % (w/v) TCA-liuos • * *·; Valmistetaan trikloorietikkahaposta (Me 807) J ;*< 4. 10 %(w/v) Askorbiinihappoliuos l«* * t*r, 30 Valmistetaan askorbiinihaposta (Merck ] Säilytetään viileässä. Liuos säilyy sta] 37 731) noin 800 ml:aan vettä ja sekoi Annetaan jäähtyä ja tilavuus säädetään ml:ksi vedellä.Dissolve 1.114 g of p-nitrophenylphos (Boehringer, 738 352) glycine buffer in a volume of 100 ml buffer] f f · '· 25 A new buffer must be prepared daily with 3.15% (w / v) TCA solution • * * ·; Prepared from trichloroacetic acid (Me 807) J; * <4. 10% (w / v) Ascorbic acid solution 1 '* * t * r, 30 Prepared from ascorbic acid (Merck) Keep cool. The solution is stored in approximately 7,731 ml of water. Allow to cool and adjust the volume to ml with water.

5 7. Reagenssi C7. Reagent C

Sekoitetaan 3 osaa 1 M rikkihappoa ja 2.5 % ammoniummolybdaattia, lisätään 1 % askorbiinihappoa ja sekoitetaan hyvin reagenssia C pitää valmistaa päivittäii 10 Näytteen laimennus Näytteet laimenneta, siinipuskuriin. Jokaisesta laimennoksesta tehdäi nakkaisnäyte. Entsyymijauhetta punnitaan tarkasi 250 mg näytteeseen, liuotetaan puskuriin ja tä; 15 25 ml:aan mittapullossa, lisälaimennoksia tehdäi vittaessa.Mix 3 parts of 1 M sulfuric acid and 2.5% ammonium molybdate, add 1% ascorbic acid and mix well with reagent C. Daily dilution of specimens Dilute the specimens in a sine buffer. Each dilution was spiked. Weigh accurately 250 mg of the enzyme powder into the sample, dissolve in buffer and; 15 in a 25 ml volumetric flask;

Laimennustaulukko: 20 Arvioitu ak- Suositeltu Laimen- tiivisuus laimennus nus- HFU/ml tekijä 20000 1+19 20 V·: 200000 1 + 199 200 O 25 400000 1 + 399 400 -\t 1000000 1 + 999 1000 :*··; 5000000 1 + 4999 5000 ··* t I- • · • · * • · · •tl · • It it · • t 30 Analyysi 38 sekuntikelloa aloitetaan hydrolyysi lisäämällä käin sopivin väliajoin 0.1 ml entsyymilaimennos kaiseen koeputkeen ja sekoitetaan. Tasan 15 m: kuluttua reaktio pysäytetään lisäämällä 2.0 ml 5 jokaiseen koeputkeen. Sekoitetaan ja annetaan ; huoneenlämpötilaan. Lisätään 0.1 ml näytettä myö: koe-koeputkiin (joita on pidetty huoneenlämpötj ja sekoitetaan. Mikäli muodostuu sakkaa, se erottaa sentrifugoimalla 10 minuuttia 2000xg.Dilution Table: 20 Estimated Ac- Recommended Dilution Dilution HFU / ml Factor 20000 1 + 19 20 V ·: 200000 1 + 199 200 O 25 400000 1 + 399 400 - \ t 1000000 1 + 999 1000: * ··; 5000000 1 + 4999 5000 ·· * t I-30 t Analyze The 38-second clock is started by hydrolysis by adding 0.1 ml of enzyme dilution into the test tube at appropriate intervals and mixing. After exactly 15 m, the reaction is stopped by adding 2.0 ml 5 to each test tube. Mix and let; to room temperature. Also add 0.1 ml of sample to test tubes (kept at room temperature and mixed. If precipitate forms, centrifuge at 2000 x g for 10 minutes.

10 Vapautunut ortofosfori: Pipetoidaan l näytettä hydrolyysin jälkeen koeputkiin. Lisätä ml vettä jokaiseen koeputkeen. Lisätään 4.0 ml n siä C ja sekoitetaan. Inkuboidaan 50°C lämpötila; minuutin ajan ja jäähdytetään huoneenlämpötilaan 15 taan absorbanssi reagenssi-sokea koetta vastaan edellä) aallonpituudella 820 nm.10 Liberated orthophosphorus: Pipette 1 sample after hydrolysis into test tubes. Add ml of water to each test tube. Add 4.0 ml of C and mix. Incubate at 50 ° C; and cool to room temperature for 15 minutes against absorbance reagent blind assay above) at 820 nm.

Standardi Valmistetaan 9.0 mM fosfaatti-toliuos. Liuotetaan ja laimennetaan 612.4 mg (Merck 4873, kuivattu eksikaattorissa silikall 20 ml:aan mittapullossa. Tehdään seuraavat laimer veteen varastoliuoksesta ja käytetään niitä stanc na.Standard Prepare a 9.0 mM phosphate-toluene solution. Dissolve and dilute 612.4 mg (Merck 4873, dried in a desiccator, silica gel in a 20 ml graduated flask. Make the following Laimer in water from the stock solution and use as a stock.

: Laimennus Fosforikonsentraa- Happofosfata I./ tio aktiivisuu • ft nmol /ml HFU/ml* ft ft ^ ^ mb· __ ft ! 25 1:100 90 2400 • « 1:200 45 1200 1:400 22.5 600 * · * ♦Vastaava happofosfataasi aktiivisuus (H saadaan iakamalla fosforikonsentraatin inmol/ιηΐΐ 39 koeputkeen. Pipetoidaan myös 4.0 ml vettä yhte< putkeen (reagenssi-sokea koe) Lisätään 4.0 ml r siä C ja sekoitetaan. Inkuboidaan 50°C lämpötila minuuttia ja jäähdytetään huoneenlämpötilaan. M 5 absorbanssit aallonpituudella 820 nm reagenssi koetta vastaan. Tehdään standardikäyrä piir absorbanssi vs fosfataasiaktiivisuus (HFU/ml). Ji koesarjaa varten täytyy tehdä uusi standardisuoi Laskenta Sokea kokeen absorbanssi vähei 10 näytteen absorbanssista (eron pitäisi olla 0 1.000). Fosfataasiaktiivisuus (HFU/ml) katsotaaj dardisuoralta ja kerrotaan laimennustekijällä. 1 mijauheen aktiivisuuden (HFU/g) laskemiseksi, tulos (HFU/ml) täytyy kertoa 25:llä (ml) ja jaka< 15 teen tarkalla painolla (g).: Dilution Phosphorus Concentrate- Happophosphate I. / thio Activity • ft nmol / ml HFU / ml * ft ft ^ ^ mb · __ ft! 25 1: 100 90 2400 • «1: 200 45 1200 1: 400 22.5 600 * · * ♦ Corresponding acid phosphatase activity (H obtained by inoculating phosphorus concentrate inmol / ιηΐΐ 39 test tubes. Also pipette 4.0 ml water into a single tube (reagent blank test) Add 4.0 ml of C and mix, Incubate at 50 ° C for 1 minute and cool to room temperature M 5 absorbances at 820 nm against the reagent Assay Plot the standard curve of absorbance vs. phosphatase activity (HFU / ml) and make a new standard for the Ji series. the absorbance of the assay was reduced from the absorbance of 10 samples (difference should be 0 to 1000) Phosphatase activity (HFU / ml) is plotted versus dilution factor To calculate the activity of 1 powder (HFU / g), the result (HFU / ml) must be multiplied by 25 (ml) and divide by <15 tea with exact weight (g).

Rehun ja muiden liukenemattomien näy1 valmistus fosfataasianalyysia varten Punnitaan tiPreparation of feed and other insoluble matter for phosphatase analysis Weigh ti

2.5 g perusnäytettä kahteen 50 ml:n dekantteri: Lisätään 20.0 ml glysiinipuskuria. Sekoitetaan ] 20 mällä mageneettisekoittajaa 30 minuutin ajan hi lämpötilassa. Siirretään noin 10 ml kummastakin t fuugiputkiin ja erotetaan kiintoaines sentrifugc 10 minuuttia 200Oxg. Laitetaan 2.5 ml supernal PD-10 geelisuodatuskolonneihin (Sephadex G-25M, I2.5 g of stock sample into two 50 ml beakers: Add 20.0 ml of glycine buffer. Stir] with 20 magnetic stirrers for 30 minutes at hi. Transfer about 10 ml into each of the t fugue tubes and centrifuge the solids for 10 minutes at 200 x g. Place 2.5 ml supernal PD-10 gel filtration columns (Sephadex G-25M, I

• * :.v: 25 cia 17-0851-01), jotka on tasapainotettu 25 glysiinipuskuria. Poistetaan eluaatti. Tämän ; lisätään 3.5 ml glysiinipuskuria kolonniin ja k€ eluaatti mitta-asteikolla varustettuun lieriöön.• *: .v: 25 cia 17-0851-01) equilibrated with 25 glycine buffers. Remove the eluate. This; 3.5 ml of glycine buffer is added to the column and the eluate is added to a graduated cylinder.

** * : .*. tään tilavuuteen 5.0 ml glysiinipuskurilla (lain ,···] 30 tekijä 2) ja määritetään fytaasiaktiivisuus. Al· * · · suus HFU/g saadaan kertomalla mitattu aktiivisu ptt \ ji n . i τ a /1-,.: au .. i .: _ i. j i 40 ESIMERKKI 3** *:. *. to 5.0 ml with glycine buffer (Law, ···] 30 factor 2) and assay for phytase activity. The HFU / g Al is obtained by multiplying the measured activity ptt. i τ a / 1 -,.: au .. i .: _ i. j i 40 EXAMPLE 3

Fytaasin ja pH 2«5 happofosfataasin puiPhytase and pH 2? 5 acid phosphatase pool

Viittamaan kuinka alan ammattimies puhdistaisi f 5 ja pH 2.5 happofosfataasin, esitetään seuraavaa, 1. FytaasiTo indicate how one of ordinary skill in the art would purify f 5 and pH 2.5 acid phosphatase, the following is provided, 1. Phytase

Entsyymin puhdistus. Toimenpiteet tehti 10 pötilassa 4 - 8 °C ellei toisin ole mainittu. Lä] oli soluton Aspergillus niqer var. awamori ALK( tuottama kasvatusliuoskonsentraatti.Enzyme purification. Operations were performed at 10 ° C at 4-8 ° C unless otherwise noted. The cell-free Aspergillus niqer var. awamori ALK (Concentrated broth concentrate.

Ammoniumsulfaattisaostus. Kasvatusliuosi konsentraatti (990 ml) pidettiin jäähauteessa j. 15 g ammoniumsul f aattia per ml lisättiin (70 % kyll, nen). Sakka erotettiin 30 minuutin jälkeen sentr maila 15 minuuttia 10 000 x g ja heitettiin poisAmmonium sulfate precipitation. The culture medium concentrate (990 ml) was kept in an ice bath j. 15 g of ammonium sulphate per ml were added (70% saturated). After 30 minutes, the precipitate was separated from the centrifuge for 15 minutes at 10,000 x g and discarded

Hydrofobinen interaktiokromatoqrafia. Si tantti laitettiin Octyl-Sepharose CL-4B (Pha: 20 kolonniin (5 cm x 17 cm), joka oli tasapainotel uoksella, jossa oli 0.436 g (NH4)2S04 per ml 20 i Tris/HCl (pH 6.2). Kolonni pestiin 500 ml:11a ti notusliuosta ja kehitettiin 500 ml:11a lineaaris* dienttia, jossa oli 70-^0% ammoniumsul f aattia 20 i 25 Tris/HCl-liuoksessa (pH 6.2).Hydrophobic interaction chromatography. The sieve was placed on an Octyl-Sepharose CL-4B (Pha: 20 column (5 cm x 17 cm) equilibrated with 0.436 g (NH4) 2 SO4 per ml in 20 L Tris / HCl, pH 6.2). The column was washed with 500 ml of stock solution and developed with 500 ml of a linear gradient of 70-0.0% ammonium sulfate in 20 of 25 Tris / HCl (pH 6.2).

10 ml fraktiot kerättiin ja niistä an* . *.· tiin fytaasi- ja happofosfataasiaktiivisuus. Suu: fytaasin aktiivisuudesta eluoitui gradientien < • Fraktiot yhdistettiin seuraavaa toimenpidettä i * · * * 30 Fytaasiaktiivisuusfraktion jälkeen eluoituvat frt ja jotka sisälsivät suurimman osan happofosfatc 41 1 ' lisuodatuskolonneilla, jotka oli tasapainotettu bis-Tris/HCl-liuoksella (pH 6.2). Näyte 24.5 laitettiin DEAE-Sepharose (Pharmacia)-kolonniin 7 cm), joka oli tasapainotettu 50 mM bis-Tris/l 5 uoksella (pH 6.2). Kolonni pestiin tasapainotus rilla (100 ml) ja kehitettiin 200 ml:11a line* gradienttia, joka sisälsi 0*0.5 M NaCl tasapainol kurissa.10 ml fractions were collected and collected. Phytase and acid phosphatase activity was detected. Mouth: Phytase activity eluted with gradients <• Fractions eluted with the following procedure i * · * * 30 eluted fractions after the phytase activity fraction and containing most of the acid phosphate on 41 1 'filtration columns equilibrated with bis-Tris / HCl solution (pH 6.2). Sample 24.5 was applied to a DEAE-Sepharose (Pharmacia) column (7 cm) equilibrated with 50 mM bis-Tris / L 5 (pH 6.2). The column was washed with equilibration (100 ml) and developed with 200 ml line * gradient containing 0 * 0.5 M NaCl in equilibrium.

Geelisuodatus. Yhdistetyt aktiiviset fi 10 konsentroitiin käyttämällä Centricon -30-mikrokc roijaa kokonaistilavuuteen 600 μΐ, 100 μ1:η ar ajettiin noin 23 °C ja virtausnopeudella 0.3 Superose 12 HR 10/30 HPLC -kolonnin läpi (Phai joka oli tasapainotettu 50 mM bis-Tris/HCl-liuc 15 (pH 6.2).Gel filtration. The combined active fi 10 was concentrated using a Centricon -30 microcontroller to a total volume of 600 μΐ, 100 μ1: η ar run at about 23 ° C and 0.3 Superose 12 HR 10/30 HPLC column (Phai equilibrated with 50 mM bis-Tris / HCl-luc 15 (pH 6.2).

Kationivaihto Yhdistetyt aktiivifraktioi rettiin 50 mM natriumformiaattiin (pH 3.8) käytt Centricon -30-mikrokonsentraattoria. Näyte lait kahdessa 2 ml:n annoksessa Mono S HR 5/5 FPLC-koJ 20 (Pharmacia), joka oli tasapainotettu 50 mM ns formiaatilla (pH 3.8) noin 23°C lämpötilassa. £ pestiin tasapainotuspuskurilla (10 ml) ja sidott teiini eluoitiin virtausnopeudella 60 ml/h 20 lineaarista gradienttia, joka sisälsi 0*430 mJ *.**: 25 tasapainotuspuskurissa.Cation Exchange The combined active fraction was retained in 50 mM sodium formate (pH 3.8) using a Centricon -30 microconcentrator. The sample was applied in two 2 ml portions of Mono S HR 5/5 FPLC CoJ (Pharmacia) equilibrated with 50 mM ns formate (pH 3.8) at about 23 ° C. The washes were washed with equilibration buffer (10 ml) and the bound protein was eluted at a flow rate of 60 ml / h for 20 linear gradients containing 0 * 430 mJ *. **: 25 in equilibration buffer.

»M ♦ · » 9 2. Happofosfataasi * « « * M· : Geelisuodatus. Hydrofobisesta interaktio »M * /:. 30 tografiasta yhdistetyt fraktiot, jotka sisälsivä * · · rimman osan happofosfataasiaktiivisuudesta, konse -hiin n 1 -h racimHat ulrcol la Iräirf f aan Äm ϊ ρππ UM 1 Π ma 42 (48 ml) laitettiin DEAE-Sepharose (Pharmacia)-ko (5 cm x 7 cm), joka oli tasapainotettu 50 mM hi /HC1 (pH 6.2). Kolonni pestiin 100 ml tasapaino kuria ja kehitettiin 200 ml lineaarista gradi< 5 joka sisälsi 0^0.5 M NaCl tasapainotuspuskurissc»M ♦ ·» 9 2. Acid phosphatase * «« * M ·: Gel filtration. Hydrophobic Interaction »M * /:. Fractions from 30 tographs containing * · · most of the acid phosphatase activity were loaded with DEAE-Sepharose (Pharmacia) (5 ml) in Konse chin n 1 -h racim Hat ulcol la Irfirma (42 ml). cm x 7 cm) equilibrated in 50 mM hi / HCl (pH 6.2). The column was washed with 100 mL equilibrium discipline and developed with 200 mL linear gradient <5 containing 0 ^ 0.5 M NaCl in equilibration buffer

Anionivaihtokromatoqrafia. Yhdistetyt a! set fraktiot konsentroitiin ja siirrettiin 20 r Tris/HCl (pH 6.0) ultrasuodattamalla käyttäen Am 10-membraania. Näyte ajettiin neljässä 3.5 ml:n 10 sessa Mono Q HR 5/5 HPLOkolonnissa (Pharmacia] oli tasapainotettu 20 mM bis-Tris/HCl (pH 6.0), tilassa noin 23°C ja virtausnopeudella 60 ml/h. ni pestiin 10 ml tasapainotuspuskuria ja sidottu iini eluoitiin 20 ml lineaarista gradienttia 15 sisälsi 0->350 mM NaCl tasapainotuspuskurissa.Anionivaihtokromatoqrafia. Combined a! The fractions were concentrated and transferred to 20 r Tris / HCl (pH 6.0) by ultrafiltration using an Am 10 membrane. The sample was run on four 3.5 mL 10 Mono Q HR 5/5 HPLO columns (Pharmacia) equilibrated with 20 mM bis-Tris / HCl (pH 6.0) at about 23 ° C and 60 mL / h washed with 10 mL equilibration buffer and the bound inin was eluted with 20 ml linear gradient containing 0 to 350 mM NaCl in equilibration buffer.

Geelisuodatus. Aktiiviset fraktiot yh< tiin, konsentroitiin ja siirrettiin 20 mM bis-T] (pH 6.0)-liuokseen, joka sisälsi 150 mM NaCl, Cei -30-mikrokonsentraattorilla kokonaistilavuuteen < 20 100 μΐ annokset ajettiin 23°C lämpötilassa ja v: nopeudella 18 ml/h Superose 12 HR 10/30 HPLC-k< läpi (Pharmacia), joka oli tasapainotettu näyt< rilla.Gel filtration. The active fractions were pooled, concentrated and transferred to 20 mM bis-T] (pH 6.0) containing 150 mM NaCl, with a Cei -30 microconcentrator to a total volume of <20 100 μ 100, the portions were run at 23 ° C and v: 18 ml. / h Superose 12 HR 10/30 via HPLC (Pharmacia) equilibrated on a screen.

Anionivaihtokromatoqrafia. Yhdistetyt a] 25 fraktiot siirrettiin 20 mM histidiini/HCl (pH 5 \„s 10-geelisudatuskolonnissa. Näytteet ajettiin n« *\i 1 ml:n annoksissa Mono Q HR 5/5 HPLC-kolonnissa macia) tasapainotettuna näytepuskurilla, noii : lämpötilassa ja virtausnopeudella 60 ml/h. ϊ 30 pestiin 5 ml näytepuskuria ja sidottu proteiini tiin 20 ml lineaarista gradienttia, joka sisälsiAnionivaihtokromatoqrafia. The combined α] 25 fractions were transferred to 20 mM histidine / HCl (pH 5 on a 10 gel gel column. Samples were run in 1 ml portions of Mono Q HR 5/5 HPLC column on Mac) equilibrated with sample buffer, noii: and at a flow rate of 60 ml / h. ϊ 30 was washed with 5 mL of sample buffer and bound protein with 20 mL of linear gradient containing

43 H43 H

Taulukko 1. Aspergillus niger fytaasin puhdistuksen yht _veto_Table 1. Summary of purification of Aspergillus niger phytase

Vaihe Koko- Koko- Spesifi- Saan- Puhd: naisak- nais- nen ak- to {ken tii- prote- tii- (%) nen) visuus iini visuus __(PU) (mg) (PU/mg)___Step Size - Size - Specific - Available - Pure: Female Window Act (Ken Ti Protein (%)) Visibility Visibility __ (PU) (mg) (PU / mg) ___

Kasvatus- 44866S0 2119 2117 100 1 suodos______Education- 44866S0 2119 2117 100 1 filtrate______

Ammonium- 3771750 1263 2986 84.1 1.4 sulfaatti- superna- tantti_________Ammonium 3771750 1263 2986 84.1 1.4 Sulphate Supernatant_________

Octyl Sep- 1765881 32.3 54671 39.4 26 harose___ _____ DEAE-Sepha- 1453470 8.4 173032 32.4 82 - rose___Octyl Sep- 1765881 32.3 54671 39.4 26 harose___ _____ DEAE-Sepha- 1453470 8.4 173032 32.4 82 - rose___

Superose 12 1010888 5.7__177349 22.5 84Superose 12 1010888 5.7__177349 22.5 84

Mono S__827566 3.0__275885 18.4 130Mono S__827566 3.0__275885 18.4 130

Taulukko 2. Aspergillus niger happofosfataasin puhdistuksen yhteenvetoTable 2. Summary of purification of Aspergillus niger acid phosphatase

Vaihe Koko- Koko- Spesi- Saan- Puhd: naisak- naispro- finen to tus(] : tiivi- teiini aktii- (¾) tain* suus (mg) visuus O__(ΗΓ0)___(PU/mg)___ • eStep Size- Koko- Species- Pure: Female Acne Prophylaxis (]: Sorbitin Active (¾) Oral (mg) Volume O __ (ΗΓ0) ___ (PU / mg) ___ • e

Kasvatus- 11652- 2119 54990 100 1 ; suodos 3000 ** * —— - ™ “Education- 11652-2119 54990 100 1; filtrate 3000 ** * —— - ™

Ammoniumsul- 88275000 1263 69893 75.8 1.3 ,*!*. faatti su- • S f pernatantti_____ 44 ESIMERKKI 4Ammonium sul- 88275000 1263 69893 75.8 1.3, *! *. fate su- • S f supernatant_____ 44 EXAMPLE 4

Puhdistetun fytaasln 1a pH 2.5 happofoi sin peptidihajotteiden karakterisointi 5 Natiivi puhdistettu fytaasi (70 pg)Characterization of Purified Phytase 1a pH 2.5 Acid Phase Peptide Digestion 5 Native Purified Phytase (70 pg)

Tris-HCl-liuoksessa pH 7.9 pilkottiin 2% (w/w) siinillä (TPCK-käsitelty, Sigma) 2 tunnin ajan li lassa 37°C, jonka jälkeen vielä 2% (w/w) trypsi 21 tunnin ajan. Yksi erä natiivia puhdistettua 10 taasia 100 mM Tris-HCl-liuoksessa pH 8.0 kasit 2% (w/w) trypsiinillä 20 tunnin ajan lämpötilassa jonka jälkeen vielä 2% (w/w) trypsiinillä 6 ajan. Peptidit on puhdistettu kuten edellä on kuIn Tris-HCl, pH 7.9 was digested with 2% (w / w) cin (TPCK treated, Sigma) for 2 hours at 37 ° C, followed by a further 2% (w / w) trypsinization for 21 hours. One batch of native purified 10 volumes in 100 mM Tris-HCl pH 8.0 was treated with 2% (w / w) trypsin for 20 hours at a temperature followed by 2% (w / w) trypsin for 6 hours. The peptides have been purified as described above

Toinen erä puhdistettua natiivia fosfe 15 alkyloitiin käyttämällä 4-vinyylipyridiiniä seui ti: Lyofilisoituun fosfataasiin (75 μg) lisättiii 0.5 M Tris-HCl pH 7.5, joka sisälsi 6 M guanidii rokloridia, 2 mM EDTA ja 34 mM DTT. 1 pl:n 4-vJ pyridiini (Sigma) lisäyksen jälkeen, reaktioseo 20 dettiin huoneenlämmössä (22°C) 1 tunnin ajan. FAnother batch of purified native phosphate was alkylated using 4-vinylpyridine as follows: To lyophilized phosphatase (75 μg) was added 0.5 M Tris-HCl pH 7.5 containing 6 M guanidine hydrochloride, 2 mM EDTA and 34 mM DTT. After addition of 1 µl of 4-pyridine (Sigma), the reaction mixture was detected at room temperature (22 ° C) for 1 hour. F

pysäytettiin lisäämällä 10 μΐ 1.4 M DTT. AI* fosfataasi puhdistettiin HPLCrllä C-l käänteistä lonnilla (TSK TMS 250; 0.46 x 4 cm) käyttämällä 70% ACN/0.06% TFA gradienttia (80% - 30% 0.1% TFwas stopped by the addition of 10 μΐ 1.4 M DTT. Al * phosphatase was purified by HPLC on a C-1 reverse column (TSK TMS 250; 0.46 x 4 cm) using a 70% ACN / 0.06% TFA gradient (80% to 30% 0.1% TF).

" 25 minuutissa. Ne fraktiot, jotka absorboivat aallon **· della 218 nm, yhdistettiin ja haihdutettiin Spe * ψ - vakuumisentrifuugissa. Kuivattu näyte suspendoit s*”: pl:aan 70 mM Tris-HCl pH 9.1 ja pilkottiin 2% j lysyyliendopeptidaasi C:llä (Wako Chemicals) 2 • *. * t’:\ 30 ajan 37°C lämpötilassa. Vielä toisen 2% (w/w) liendopeptidaasi C lisäyksen jälkeen, inkuboin ISmnnfi laaea T7 niHannaff i in OC fnnf ΐ in Tie 45The fractions that absorbed the wave at 218 nm were pooled and evaporated in a Spe * ψ vacuum centrifuge. The dried sample was suspended in s * 'p 70 mM Tris-HCl pH 9.1 and digested with 2% lysyl endopeptidase C. (Wako Chemicals) for 2 hours at 37 [deg.] C. After another 2% (w / w) addition of lendopeptidase C, I incubated ISmnnfi broad T7 niHannaff in OC fnnf Tie in Tie 45

tiin HPLC C-18 -käänteisfaasikolonnilla (Vydac B5; 0.46 x 25 cm) 90 minuuttia gradientilla Cwas performed on a C-18 reverse phase HPLC column (Vydac B5; 0.46 x 25 cm) for 90 minutes with a gradient C

ACN/0.06% TFA (100 - 40% jossa 0.1% TFA) . Pe] detektointiin käytettiin aallonpituutta 218 nm.ACN / 0.06% TFA (100-40% with 0.1% TFA). A wavelength of 218 nm was used for P 1 detection.

5 Puhdistettujen peptidien samoin kuin nai proteiinien aminopään sekvensointi tehtiin pilki ne gas-pulsed-liquid sekvensorilla (Kalkkinen j* mann, Journal of Protein Chemistry 7:242-243 (: Vapautuneet PTH-aminohapot analysoitiin on-lin< 10 telmällä käyttäen kapeakanava-käänteisfaasi-HPl tetta.5 Amino-terminal sequencing of the purified peptides as well as the nai proteins was performed by cleavage of the ne gas-pulsed-liquid sequencer (Calcium J * mann, Journal of Protein Chemistry 7: 242-243 (: PTH amino acids released were analyzed online using a narrow channel reverse phase). -HPl tetta.

Fytaasin karboksipään sekvensointiSequencing of the carboxyl terminus of phytase

Yksi erä puhdistettua fytaasia (53 μg) i 15 tiin karboksipeptidaasi Y:llä (Sigma, 0.6 U) natriumasetaatissa pH 5.6, joka sisälsi 10% ur 0.05% SDS:a huoneenlämpötilassa (22°C). Näytteiti koutumisesta otettiin eri ajankohtina. Näytteet l tiin Speed^Vac vakuumisentrifuugissa ja niistä t 20 johdannaiset fenyyli-isotiosyanaatilla (PITC) Pj (Waters association) aminohappoanalyysikitin mu} ti. Aminohappojohdannaiset analysoitiin käänteis HPLC-laitteella, jossa oli Pico-Tag C-18-kolo; näytteiden määrät analysoitiin samalla tavoin joi * :Λ: 25 jen standardiaminohappojen avulla.One batch of purified phytase (53 μg) was added with carboxypeptidase Y (Sigma, 0.6 U) in sodium acetate pH 5.6 containing 10% ur 0.05% SDS at room temperature (22 ° C). Samples of the seizure were taken at different times. Samples were plated in a Speed ^ Vac vacuum centrifuge and derivatized with a phenyl isothiocyanate (PITC) Pj (Waters association) amino acid analysis kit. The amino acid derivatives were analyzed by a reverse HPLC apparatus with a Pico-Tag C-18 well; sample volumes were similarly analyzed with some * 25 standard amino acids.

ti» • » » · »» ·ti »•» »·» »·

Tulokset ia niiden tarkastelu « «« i » • « » « « : ,\ Sekvenssit voitiin uuttaa peptideistä, 30 oli "kaksoissekvenssi" (sekä fytaasille että fos t * » sille, taulukot 3 ja 4) koska ne määrällisesti p ai' f λϊ a ΐ cfaan -ia /tai f λϊ nan ΒΔίττιαηββΐ 1 i f n 117 46Results and Their Review «« «i» • «» ««:, \ The sequences could be extracted from the peptides, 30 was the "double sequence" (for both phytase and phos t * », Tables 3 and 4) because they quantitatively p a 'f λϊ a ΐ cfaan -ia / or f λϊ nan ΒΔίττιαηββΐ 1 ifn 117 46

Fytaasista saadut aminopään sekvenssit #1081; [SEQ. ID NO.:50:]) olivat samankaltaisia eivät identtisiä, kuin A. ficuum fytaasin am sekvenssit (LAVPASRNQSSGDT) [SEQ ID No.:17:], y 5 esitetty artikkelissa Ullah, A. H.J. Prep. B _18:459-471 (1988). Trypsiinipilkkomisessa saadut dit on esitetty taulukossa 3. Yhdellä peptidi] phy) [SEQ ID NO.:23:] oli identtisiä sekvenss ficuum fytaasin sisäisten peptidien kanssa (Ml 10 QEPLVRVLVNDR); Ullah, A.H.J. Prep. Blochem. 18: (1988). Fytaasin karboksipään sekvensointi antoi seksi sekvenssin XSA-OH.Amino-end sequences derived from phytase # 1081; [SEQ. ID NO.:50:]) were similar not identical to the A. ficuum phytase am sequences (LAVPASRNQSSGDT) [SEQ ID No.:17:], y 5 presented in Ullah, A.H.J. Prep. B-18: 459-471 (1988). The dit obtained by trypsin digestion is shown in Table 3. One peptide] phy) [SEQ ID NO: 23:] was identical to the peptides within the sequence ficuum phytase (M110 QEPLVRVLVNDR); Ullah, A.H.J. Prep. Biochem. 18: (1988). Sequencing of the carboxyl terminus of the phytase yielded the sequence XSA-OH.

Natiivin ja alkyloidun fosfataasin am sekvensoinnista ei saatu tuloksia (taulukko 4) 15 peptidi (7Lpho, #817 [SEQ. ID NO.:53;]) oli ku identtinen A. ficuum-happofosfataasi (pH optiit FSYGAAIPQSTQEKQFSQEFRDG) aminopään sekvenssin 1 esitetty julkaisussa Ullah, A.H.J. ja Cummings, Prep, Biochem. 17:397-422 (1987) ja toinen (1CNo results were obtained from the sequencing of native and alkylated phosphatase am (Table 4) The peptide (7Lpho, # 817 [SEQ. ID NO.:53;]) was identical to the amino acid sequence of amino acid sequence of A. ficuum acid phosphatase (pH optic FSYGAAIPQSTQEKQFSQEFRDG). , AHJ and Cummings, Prep, Biochem. 17: 397-422 (1987) and another (1C

20 #941 [SEQ. ID NO.:54:]) näyttää olevan tämän20 # 941 [SEQ. ID NO.:54:]) seems to be this

Peptidi 3Tpho (peptidi #1106 taulukossa 4; SEQ I] 61:) saattaisi myös olla peptidi ULpho jatke (] #943-2 taulukossa 4; SEQ ID No.:60:) koska si neljä kombinoivaa (overlapping) aminohappoa: FSE " 25 Peptidi ILpho (peptidi #816 taulukossa f** ID No. :57:) sisältää fytaasien ja fosfataasienPeptide 3Tpho (peptide # 1106 in Table 4; SEQ I] 61 :) could also be a peptide ULpho extension (] # 943-2 in Table 4; SEQ ID No.:60 :) because of its four overlapping amino acids: FSE "25 The peptide ILpho (peptide # 816 in Table f ** ID No.: 57 :) contains phytases and phosphatases

’·· visen kohdan konsensussekvenssin RHGXRXP [SEQ'·· I set forth the RHGXRXP [SEQ

:18:]# jotka on esitetty julkaisussa Ullah, * **· et ai., Biochem. Biophys. Res. Comun. 178:45-53 i ··· · j·:·. 30 Peptidi oli hyvin homologinen, mutta ei idenl: 18:] # reported in Ullah, * ** · et al., Biochem. Biophys. Res. Comun. 178: 45-53 i ··· · j ·: ·. The peptide was very homologous but not idenl

Yksi fytaasin peptidi (#675, [SEQ. ID NO.:37:], 47 117One phytase peptide (# 675, [SEQ. ID NO.:37:], 47,117

Tulokset osoittavat, että A. niqer fyt homologinen A. ficuum fytaasin kanssa, muttei i nen. Sama tulos on havaittavissa happofosfataai pauksessa (pH-optimi 2.5).The results show that A. niqer fyt is homologous to A. ficuum phytase but not. The same result is observed with acid phosphatase (pH optimum 2.5).

55

Taulukko 4. pH 2.5 happofosfataasin pepti dlsekvenssit, jotka on saatu distetun entsyymin joko tryps ni~ (T) tai endoproteinaasi I c- (L) hajotuksella. Vastaav nukleotidiasemat on myös luet __tU.__Table 4. Peptide sequences of pH 2.5 acid phosphatase obtained by digestion of either trypsin (T) or endoproteinase Ic (L) with the isolated enzyme. The corresponding nucleotide positions are also read in __tU .__

Pepti- Peptidisekvenssi Nukleotidia dinumero_ N-terminal FSYGAAlPQSTQEK 193...234 #8I7;7LphoPeptide-Peptide Sequence Nucleotide Numeric_N-Terminal FSYGAAlPQSTQEK 193 ... 234 # 8I7; 7Lpho

fSEO ID No.:53:IfSEO ID No.:53:I

QFSQEFRDGY 235...264 #941; lOLpbo [SEQ ID No.:54;| YGGNGPY 280...300 #938: 2Lpbo (SEQ ID No. :55:1 VSYGIA 310...327 #1111: 4Tpho (SEQ ID No.:56:l RHGERYPSPSAGK 376...414 #816: ILpho l'\l |SEQ ID No.:57:j DIEEALAK 415...438 #847:5Lpbo % : {SEQ ID No.:58:1 ‘ *: ARYGHLWNGET 595...627 #943-1: ilLpbo [SEQ ID No.:59:|QFSQEFRDGY 235 ... 264 # 941; lOLpbo [SEQ ID No.: 54; | YGGNGPY 280 ... 300 # 938: 2Lpbo {SEQ ID No.: 55: 1 VSYGIA 310 ... 327 # 1111: 4Tpho {SEQ ID No.:56:l RHGERYPSPSAGK 376 ... 414 # 816: ILpho l ' \ l | SEQ ID No.:57:j DIEEALAK 415 ... 438 # 847: 5Lpbo%: {SEQ ID No.:58:1 '*: ARYGHLWNGET 595 ... 627 # 943-1: ilLpbo [SEQ ID No. 59: |

; VVPFFSSG 628...65I; VVPFFSSG 628 ... 65I

#943-2: IlLpbo (SEQ ID No.:60:) FSSGYGR 640...660 11' 48# 943-2: IlLpbo (SEQ ID No.:60 :) FSSGYGR 640 ... 660 11 '48

:<d I: <d I

-- Jc ω I 3 — 4j C g 01 Vi 0) rj -P O g -P (D i-3 <d to , ^ a > ai I >- Jc ω I 3 - 4j C g 01 Vi 0) rj -P O g -P (D i-3 <d to, ^ a> ai I>

CO -M C - :r0 I O ICO -M C -: r0 I O I

n 3 P U Vi 3 φ Ό —I Ρ . M Q| (1, a)n 3 P U Vi 3 φ Ό —I Ρ. M Q | (1, a)

5 * p £ ο φ w i J5 * p £ ο φ w i J

,¾ p <d ® r „ -π I —. I, ¾ p <d ® r „-π I -. I

φ g· g 2 p c * c u p (0 ® ® -S x; H :0 H x: Vi fv O £4 O r-l U E4 (¾φ g · g 2 p c * c u p {0 ® ® -S x; H: 0 H x: Vi fv O £ 4 O r-l U E4 {¾

® “T; T I ι — I® “T; T I ι - I

a * & .J 0 Vi -P >i I 3 ® -5 * U ΧΪΦ Π C I-*a * & .J 0 Vi -P> i I 3 ® -5 * U ΧΪΦ Π C I- *

JoS -5 « ? - ? 5 ? " & ii 5 - 2 S 1 “ 25¾ o <? *5 ΐ 5 ? m P 7J ^ 3 >t >—i c o 3JoS -5 «? -? 5? "& ii 5 - 2 S 1" 25¾ o <? * 5 ΐ 5? m P 7J ^ 3> t> —i c o 3

P ^ P ft * J rtC. Ο I OP ^ P ft * J rtC. Ο I O

w ο £ φ -rl V ii I ® i β α λ ft 2 o 3+j <fl ή <dw ο £ φ -rl V ii I ® i β α λ ft 2 o 3 + j <fl ή <d

03 O *P 2 ϋ φ φ rH < rH03 O * P 2 ϋ φ φ rH <rH

g ft Λ 5 § £ 3 2 < I <$g ft Λ 5 § £ 3 2 <I <$

J ft s Ϊ I II “ 3 IJ ft s Ϊ I II „3 I

>cO>»® 5 c 03 ·-· 3 Ä £ +J 4J ^ ¢5 Vj r-i CO O r-tl § g 3 ί s f t ? 5 i ? j> cO> »® 5 c 03 · - · 3 Ä £ + J 4J ^ ¢ 5 Vj r-i CO O r-tl § g 3 ί s f t? 5 i? j

ft g p · ίτ —I tom ο * >ι Ift g p · ίτ —I tom ο *> ι I

ft S v c g* o *! > u < u « cQ ;c0 td 2 I ti di \ * nC:SJ2 Ο «* >* Μ I I Ö , ο φ £ .¾ 2 <—I r-i >, m 3 r-i 3-4 13 5 rtj tSH H H Ol P -d *P S ö I II rt! O Itft S v c g * o *! > u <u «cQ; c0 td 2 I ti di \ * nC: SJ2 Ο« *> * Μ II Ö, ο φ £ .¾ 2 <—I ri>, m 3 ri 3-4 13 5 rtj tSH HH. Ol P -d * PS ö I II rt! Oh It

£ -Ρ Φ J >, (d-^ I 1 P£ -Ρ Φ J>, {d- ^ I 1 P

® P m C“ £L --1 <-4 3 Λ P 5'® P m C „£ L --1 <-4 3 Λ P 5 '

Qj Q) h pii dj 0) rH 0) 33 ** c ® φ φ t irt < s it tn φ n. m m „ Λ. LS- I I +> r{ *ρ ρ o -4 3 3 p ® < 9^5 *d j « φ o r-ι r-ι φ ψ i W -P (d *P 0 j io d 2 I* £ -p 3 J4 ® c — to I I I 3, t3g<4J®0 φ a —4 γΊ >1 3 t3 Φ >» s -p >λ*η a« ή 9: D ft m -P -X I > C5 O It < - ^S φ:ΛΙ >1 I *— I I *d.Qj Q) h pii dj 0) rH 0) 33 ** c ® φ φ t irt <s it tn φ n .m m „Λ. LS- II +> r {* ρ ρ o -4 3 3 p ® <9 ^ 5 * dj «φ o r-ι r-ι φ ψ i W -P {d * P 0 j io d 2 I * £ -p 3 J4 ® c - to III 3, t3g <4J®0 φ a —4 γΊ> 1 3 t3 Φ> »s -p> λ * η a« ή 9: D ft m -P -XI> C5 O It <- ^ S φ: ΛΙ> 1 I * - II * d.

3 C Φ t04J>« «H Vi rt 0 fp h2' φφ -p o ® <h o>ifflp ® !> ; *P *«-> * S ft-H ΰ I H ffl ft > > t3 C Φ t04J> «« H Vi rt 0 fp h2 'φφ -p o ® <h o> ifflp ®!>; * P * «-> * S ft-H ΰ I H ffl ft>> t

S3<IJV| QitOI 14 I « 1^1 PS3 <IJV | QitOI 14 I «1 ^ 1 P

P -p ® ^ fdoop >,>,(< a to p £*' P Id 5 ^ XJ3 >1 E-I -12 rH >, >1 EH*·P -p ® ^ fdoop>,>, {<a to p £ * 'P Id 5 ^ XJ3> 1 E-I -12 rH>,> 1 EH * ·

®«Ρ3 ΟΦΗ IOQOP1H® «Ρ3 ΟΦΗ IOQOP1H

p to S φ 3>l PI III 3 to Λί ΟΙ ·Ρ^Ρ >ip4J(d0 3'-»<li(p to S φ 3> l PI III 3 to Λί ΟΙ · Ρ ^ Ρ> ip4J {d0 3 '- »<li {

•H ® -I -H g <5 i; ^ Λ Ο Ή P ®IdP3J• H ® -I -H g <5 i; ^ Λ Ο Ή P ®IdP3J

* . jj s 8 a £ 8 & “ ^ c < ^ ^ ( (d > >1 ® *·* "k ® ϋ p * « 01 jj -P c * · ·Ρ φ 1-4 m <d p *p * \ : g " ·=· - s *· id rp m id s ^3*2.^ s - i !...! k?gi,i 3: ft I ft ) ·’, 3 . f a ft 4 cm oi on cn °9 c > » · Λ|ΗθεΦ3ΓηΉ rn ^fiHO|i-t r /;·* S g gj p________ Ϊ * · to S EC p*. jj s 8 a £ 8 & “^ c <^ ^ {(d>> 1 ® * · *" k ® ϋ p * «01 jj -P c * · · Ρ φ 1-4 m <dp * p * \ : g "· = · - s * · id rp m id s ^ 3 * 2. ^ s - i! ...! k? gi, i 3: ft I ft) · ', 3. fa ft 4 cm oi. on cn ° 9 c> »· Λ | ΗθεΦ3ΓηΉ rn ^ fiHO | it r /; · * S g gj p________ Ϊ * · to S EC p

.p P O.p P O

Jj Id -—· -n to > £* g ~ :id Si £ *·.Jj Id -— · -n to> £ * g ~: id Si £ * ·.

49 1170 f 'S ° o S p c C *H -H 3 O'49 1170 f 'S ° o S p c C * H -H 3 O'

0) Ό *P fj P0) Ό * P fj P

> -P P V, — < itLS | S, Λ> -P P V, - <itLS | S, Λ

*ί" J, f S* ί «J, f S

a · >t ^ 3 va ·> t ^ 3 v

rt js *1 o JSrt js * 1 o JS

. -n 04 r* _ Y a.. -n 04 r * _ Y a.

-p o — o o* >t i •a ft - vi )-* p m ftp S »a: o « m 2 *p q il » ö .c -o o «I m i φ O -P π φ (¾ > c p λ w n-p o - o o *> t i • a ft - vi) - * p m ftp S »a: o« m 2 * p q il »ö .c -o o« I m i φ O -P π φ (¾> c p λ w n

-p j* p ft T — i I-p j * p ft T - i I

Q φ ε Φ m tn Φ rt __ ra ra rt ft ® >. x! h ·0Q φ ε Φ m tn Φ rt __ ra ra rt ft ®>. x! h · 0

20-« 2 J ft «rt C20- «2 J ft« rt C

C o,:rt O 5 111 rt ω &-prt S ~ 3 p ® > rt Nrt S m Φ Φ p -C o,: rt O 5 111 rt ω & -prt S ~ 3 p ®> rt Nrt S m Φ Φ p -

«SS* s 5 Ϋ 7 V S«SS * s 5 Ϋ 7 V S

® c mb 5 ιφ 3 h —* o O P P g, ft JS O rt Ο» Λ ft s τ' · S « ft pi > y rt & rt PC rt rt! I l “ rt! rt =rt rt 2 irt> i ' Äcirtrt -S p p m C >t O fl) S -« g <D < β tn p £ c-h i 3 .5 «si — >* 9 ft c IP J I **>® c mb 5 ιφ 3 h - * o O P P g, ft JS O rt Ο »Λ ft s τ '· S« ft pi> y rt & rt PC rt rt! I ll! rt = rt rt 2 irt> i 'Äcirtrt -S p p m C> t O fl) S - «g <D <β tn p £ c-h i 3 .5« si -> * 9 ft c IP J I **>

a-H o 5 C >i I Pa-H o 5 C> i I P

« p -r Zl eh o» 3 >i * CL o c rn .—I Li r-l H 00«P -r Zl eh o» 3> i * CL o c rn. — I Li r-l H 00

C φ Φ Φ Y rt! O I HC φ Φ Φ Y rt! O I H

ΓΠ Q) q, ID fl m | | φ ^ΓΠ Q) q, ID fl m | | φ ^

Λ *p -p-p S p £ ra rt >9 JS YΛ * p -p-p S p £ ra rt> 9 JS Y

0*0tn*PX m cl >i p p ft il m \ A A O “ — k P rt p rt c >< i i i D ftp S p (D rHS Φ p O* O' jflo>,ep >n o φ js « p y SS ft «H P .jrt —' I i-4 ft M < rt! rt! ^ X g ® :rt 3 I I I j. · h is e ® ra p p ® p rt c e0 * 0tn * PX m cl> ipp ft il m \ AAO «- k P rt p rt c> <iii D ftp S p {D rHS Φ p O * O 'jflo>, ep> no φ js« py SS ft. «HP .jrt - 'I i-4 ft M <rt! Rt! ^ X g ®: rt 3 III j. · H is e ® ra pp ® p rt ce

ΦφΡ o Dl O JS Φ P 1-t PΦφΡ o Dl O JS Φ P 1-t P

r^λ” i ai w < o 9r ^ λ ”i ai w <o 9

>93 rt p ft® φ i i i i I> 93 rt p ft® φ i i i i I

Ppra— rt (0 r-trt 3 Φ P Ρ P rt ra _ jCC h r-l Q) rH >1 >»Ppra— rt (0 r-trt 3 Φ P Ρ P rt ra _ jCC h r-l Q) rH> 1> »

® rt *p g ΟΦ f rt! 4J m H H® rt * p g ΟΦ f rt! 4J m H H

p ra g ® c > Φ 1 i i i i ® ^ ® -4Λ ϋ l >i p g ® p rt p *p Ρφ ft>i ι-i rt js jc ·· P p g H S ra — E-t O > ft ft * ** rt > >ira saisi i ** *P φ P kn ^ ·. : 853·* o £ ra * ·: rtH ra rt » f- £ ... p d ® » J Ä ^ w ~ ~ 2 : : ft Id C o rt -0- >9 >« c >. 3 ·" So ·ΠΗ -p*p JS JS rt X jC ft *· «rtP P6 ft ft ft ft — : : ; 3 ^ ι « ft-ρ ^ σ> ο ω ^ ϊ ·· Ä mu c rae uito c-cn ^im ¢0 i) ä ... ;(d u rt ft'- rt· — ^ — «> - rt· — i> — ft ·.· Slap J P op ra g ® c> Φ 1 iiii ® ^ ® -4Λ ϋ l> ipg ® p rt p * p Ρφ ft> i ι-i rt js jc ·· P pg HS ra - Et O> ft ft * ** rt >> ira saisi i ** * P φ P kn ^ ·. : 853 · * o £ ra * ·: rtH ra rt »f- £ ... p d ®» J Ä ^ w ~ ~ 2:: ft Id C o rt -0-> 9> «c>. 3 · "So · ΠΗ -p * p JS JS rt X jC ft * ·« rtP P6 ft ft ft ft -::; 3 ^ ι «ft-ρ ^ σ> ο ω ^ ϊ ·· Ä mu c rae uito. c-cn ^ im ¢ 0 i) ä ...; (two rt ft'- rt · - ^ - «> - rt · - i> - ft ·. · Slap JP o

Jj ίβ —' -i—* m > >« rt —Jj ίβ - '-i— * m>> «rt -

>4 :rt JS JS> 4: rt JS JS

117C117C

50 v c k '5 a fiä-S 3 -Λ50 v c k '5 a f-S 3 -Λ

φ Ό -Η +[ ι—Iφ Ό -Η + [ι — I

> *W -Ρ +* 4-1 ιΗ * -JJ 3 -O >· Ο) ft 3 Ό c m Φ m -c Φ CU 0 g Ό ω Τ' ο» σν s * >1 J — (d t- d£ *7 c p • Ό ft „ (d ·—< U-l (O'—' H 0“ 0 A θ' ·ΓΊ g> •H Qi .. lj c >1> * W -Ρ + * 4-1 ιΗ * -JJ 3 -O> · Ο) ft 3 Ό cm Φ m -c Φ CU 0 g Ό ω Τ 'ο »σν s *> 1 J - (d t- d £ * 7 cp • Ό ft „{d · - <Ul (O'— 'H 0„ 0 A θ' · ΓΊ g> • H Qi .. lj c> 1

® frt! 3 < rt O J® frt! 3 <rt O J

tD «* n Z I S C" ItD «* n Z I S C« I

C£O 0 Q p £, \D UC £ O 0 Q p £, \ D U

φ O ·*4 ° A >* *0»φ O · * 4 ° A> * * 0 »

£ C 4J H 01 — H W£ C 4J H 01 - H W

-ρ jSi ··* ft _7 jj i u o» ι “mi® *m 3 3 c n;te 3 (ft φ 3 ft “ vj Q) 0) rt M -*-ρ jSi ·· * ft _7 jj i u o »ι« mi® * m 3 3 c n; te 3 (ft φ 3 ft «vj Q) 0) rt M - *

M o ·Η ® S 3 * I :Λ OM o · Η ® S 3 * I: Λ O

C ¢1,:(0 tn md) | c O :<ö IC ¢ 1, :( 0 tn md) | c O: <ö I

® ft *17 « S > Ui-HUS^i® ft * 17 «S> Ui-HUS ^ i

> 3 >· 3 5 φ -P ft -C> 3> · 3 5 φ -P ft -C

^ J3 +i u *5 m to m ι -p fr·^ J3 + i u * 5 m to m ι -p fr ·

Φ O 4J >1 Φ 4J I ft ft C IΦ O 4J> 1 Φ 4J I ft ft C I

® c d) fc 5 o p >1 01 ® o Q *H tj -H >—< V) rt n* fte-^ * S m o a I a a ft S-l C B* _i ι - öl 1 3 =3 3 So il N S* .C c :3 3 «Ti >ί J >· 0®5Λ g S H 14 in fr* C-4 I 3 .5 3 — Φ 3¾1 “ §'A Ό ’* e e S W 0) i-l® cd) fc 5 op> 1 01 ® o Q * H tj -H> - <V) rt n * fte- ^ * S moa I aa ft Sl CB * _i ι - öl 1 3 = 3 3 So il NS * .C c: 3 3 «Ti> ί J> · 0®5Λ g SH 14 in fr * C-4 I 3 .5 3 - Φ 3¾1« §'A Ό '* ee SW 0) il

4 ® 5 f *J I4 ® 5 f * J I

4J « 21 -p O' ö *-· 3 «4J «21 -p O 'ö * - · 3«

ft ® G d) V4 A Ή Sft ® G d) V4 A Ή S

G φ Φ ® — .<4 O G1G φ Φ ® -. <4 O G1

(1 e ft B Tl - 11 II{1 e ft B Tl - 11 II

4 .4 41 O .j q, g U 3 O' >1 M4 .4 41 O .j q, g U 3 O '> 1 M

O *Q 2 *d * ΐα o $ £ S n ^ ® ^ "i ® Ή ’d o rt OH iJ <0 wO * Q 2 * d * ΐα o $ £ S n ^ ® ^ "i ® Ή 'd o rt OH iJ <0 w

2 4J (0 S-l <0 r; ι I I II I2 4J {0 S-l <0 r; ι I I II I

Ö ftjj ® O g e 33 M 0¾ 3 J 0) >,Ε·4 >n O ai CD Φ P ® «-*Ö ftjj ® O g e 33 M 0¾ 3 J 0)>, Ε · 4> n O ai CD Φ P ® «- *

g βΗΜ * £ Ä ^ 8 3 3 M ft w Og βΗΜ * £ Ä ^ 8 3 3 M ft w O

rt, λ C rti *#rt t I I I I ] H C C Φ m 4J P P <0 ft(Ö u 0)0)4J O 01 (0 Φ ® H £rt, λ C rti * # rt t I I I I] H C C Φ m 4J P P <0 ft (Ö u 0) 0) 4J O 01 (0 Φ ® H £

*7**0 J φ ft-p > to co rt! rt! rt H* 7 ** 0 J φ ft-p> to co rt! rt! rt H

>· 3 3 14 ftoil I I II I> · 3 3 14 ftoil I I II I

^41 ®w (0 01 3 3 3 3 rn O o P 3 ® f- C dl rHr-4 H >1 rH h ® 3 *^ 3 Οφ 3 OO rt ^ +J o ® Φ c > 1 1 1 1 1^ 41 ®w (0 01 3 3 3 3 rn O o P 3 ® f- C dl rHr-4 H> 1 rH h ® 3 * ^ 3 Οφ 3 OO rt ^ + J o ® Φ c> 1 1 1 1 1

«Λ» -53Λ u u u 3 -h W«Λ» -53Λ u u u 3 -h W

T* 3 - ΐ S® 3 >»>i ® ttl3 >1T * 3 - ΐ S® 3> »> i ® ttl3> 1

. . Nh3| 2»> HH M <J > H. . NH3 | 2 »> HH M <J> H

\ *: ^ 3. jj --------- 3 > >1 n ··*·. 3 g • * m 4_> +J ε *** -H « rH Ä Λ : 3^33 S 3 3 3 ... 4J 3 ® m ^ e S S — ;··;· fciSÄ3 s? ä f & & I; • · * 3 - ™ * ä-H 00-1 « m -H jjj -jj **· · Ä3ug die 3*® oomr·® ω®3· ... ;«J M-q 3 ft'" CM’-' Γ·. -~r : : : 3 o cu ___________\ *: ^ 3. jj --------- 3>> 1 n ·· * ·. 3 g • * m 4_> + J ε *** -H «rH Ä Λ: 3 ^ 33 S 3 3 3 ... 4J 3 ® m ^ e S S -; ··; · fciSÄ3 s? ä f &&I; • · * 3 - ™ * ä-H 00-1 «m -H jjj -jj ** · · Ä3ug die 3 * ® oomr · ® ω®3 · ...;« J Mq 3 ft '"CM'- 'Γ ·. - ~ r::: 3 o cu ___________

o) 6 SS -Po) 6 SS -P

-H g O-H g O

1) 3 ^·η tn > >. 3 — u 'Λ r c ·.1) 3 ^ · η tn>>. 3 - u 'Λ r c ·.

117 51117 51

- L rt TT- L rt TT

+j C g I m Φ i DO α re Ή I —* »+JC - — > >=»o+ j C g I m Φ i DO α re Ή I - * »+ JC - ->> =» o

d R I I <o Φ Id R I I <o Φ I

φ Ό f: 3 >» -u t-3 dφ Ό f: 3> »-u t-3 d

>'H4J m Φ <H JJI*H> 'H4J m Φ <H JJI * H

+J ® J O Q» rH ϋ <3 ft rt ^ I I T3«ei n«® o n ö -c > t4 A j3 iH 0 1 Ä O)"'· r-t ο ·γί C E-*+ J ® J O Q »rH ϋ <3 ft rt ^ I I T3« ei n «® o n ö -c> t4 A j3 iH 0 1 Ä O)" '· r-t ο · γί C E- *

2 · >1 , , I rH I2 ·> 1,, I rH I

ΆΛ ^ Λ U +JOOΆΛ ^ Λ U + JOO

. *n a Γ* (rt χ; (d I Vi 4-> 0 0 > Eh. * n a Γ * {rt χ; {d I Vi 4-> 0 0> Eh

•H ft \ I O H I• H ft \ I O H I

00 A+J 3 φ 0 « , < >*00 A + J 3 φ 0 «, <> *

DO Λ -H *5 ,C 14 *r% JJ Ϊ ·—IDO Λ -H * 5, C 14 * r% JJ Ϊ · —I

e .c *σ 0 cu cu -η φ oe .c * σ 0 cu cu -η φ o

φ O -H ^ IMI — rt .C Iφ O -H ^ IMI - rt .C I

> C 4j 3 i* >, 01 CU 3 Λ * a J· φ (H *H —Cl® tD d) 6 11 T| iJIO φφΗι-3 id n a di 2 'v.ci u>jsi m O H 2 >, φ 3 rt ,¾ B p C ft:re to £ ^7πΐΦ ΦΦΙΗ si«*cs ® o i s > ® rj * > (rt >i ti S I u I <D lal> C 4j 3 i *>, 01 CU 3 Λ * a J · φ (H * H —Cl® tD d) 6 11 T | iJIO φφΗι-3 id na di 2 'v.ci u> jsi m OH 2>, φ 3 rt, ¾ B p C ft: re to £ ^ 7πΐΦ ΦΦΙΗ si «* cs ® ois> ® rj *> {rt> i ti SI u I <D lal

P H *g UX!0 H +> > CP H * g UX! 0 H +>> C

‘ +>>1 S Φ H £ O «* “ 3 y®fc 2 οι i o* Λ)> rt +} S N l-Η I ^3,1'+ >> 1 S Φ H £ O «*“ 3 y®fc 2 οι i o * Λ)> rt +} S N l-Η I ^ 3,1

Sr cuaJG iH rt 14 SSr cuaJG iH rt 14 S

U C S* 00>ai >, U Φ -jU C S * 00> ai>, U Φ -j

aiirtai ® <lrt 3 oi Oaiirtai ® <lrt 3 oi O

£ ClDllD *5 I >1 | +J φ I I£ ClDllD * 5 I> 1 | + J φ I I

ΟφβΛ 9 3 ^ N Φ » 3ΟφβΛ 9 3 ^ N Φ »3

C *M Id H ΦΟΉ Ή <13r-JC * M Id H ΦΟΉ Ή <13r-J

-H *o -H 6 ‘d j I O o ·· *J rt-H * o -H 6 'd j I O o ·· * J rt

§ 3 Φ § lilt 3 Λ I I§ 3 Φ § lilt 3 Λ I I

rt+i — 5. Φ Φ rt A 4J >· ft <D G £Wr-i ^ m rt --hrt + i - 5. Φ Φ rt A 4J> · ft <D G £ Wr-i ^ m rt --h

C φ Φ Φ Slrt -H > OC φ Φ Φ Slrt -H> O

« ® ft ® « ^311 <N m I i —— d -H ^ 9 -4 CU Φ >1 3 ^ g C ®«® ft ®« ^ 311 <N m I i —— d -H ^ 9 -4 CU Φ> 1 3 ^ g C ®

O Ό (0 -H H! M ® J rH rH rH ® rH -HO Ό {0 -H H! M ® J rH rH rH ® rH -H

&£ *H rt ^ qj rtilOÖ s»*>c5!B& £ * H rt ^ qj rtilOÖ s »*> c5! B

1 0.5 go g o to i c II Φ e >.1 0.5 go g o to i c II Φ e>.

ä 8.^3 i·- H ϊ ί iä - 333ä 8. ^ 3 i · - H ϊ ί iä - 333

Hdc® MJJ rt c S >« rt rt o e h ® Φ +} O® rH 0} rt rU rH Γί 2 £Hdc® MJJ rt c S> «rt rt o e h ® Φ +} O® rH 0} rt rU rH Γί 2 £

p*n * Φ ft-H (CrtJIOrt rt^ftHp * n * Φ ft-H {CrtJIOrt rt ^ ftH

>1 3 rt Jh q. jo 1311 I rt I I> 1 3 rt Jh q. his 1311 I rt I I

+j+j®w rttD o 3 r-ι H H Φ ^ ^ ^ ><+ j + j®w rttD o 3 r-ι H H Φ ^ ^ ^> <

4J rt rt 4£C M rH C5 >i >1 rH j3>nrH4J rt rt 4 £ C M rH C5> i> 1 rH j3> nrH

®rt-j{G ΟΦ CU O I HEH®rt-j {G ΟΦ CU O I HEH

H O) IMI c> | 3 I I +i I IH O) IMI c> | 3 I I + i I I

» Λ « a q, 3 Φ i4 >1 3 ® rj "S ri»Λ« a q, 3 Φ i4> 1 3 ® rj «S ri

t1 rt ^ 'c! e φ α φ tj >t ·-> ^ :2 «S S *St1 rt ^ 'c! e φ α φ tj> t · -> ^: 2 «S S * S

.. rt m rt h£ ·— £h o H54J>rt> : **: 5_________ * * rt > >i a • * tn +j +J S ... rt m rt h £ · - £ h o H54J> rt>: **: 5_________ * * rt>> i a • * tn + j + J S.

*· ^ (DH L* · ^ {DH L

\ : 2 rt 44-H > -g • ·: 33® «ι S 3 - £3 * 3 . .H ί C i fcsg£3 3^ s rt i |!r^ - «ie « ···· ^rtos ® e cr\ cn Hi Φ <-h ,·;·, :rt*nH( rt Λ'-' ^ ^ w > ^ • · > to O CU 4-t ________-- —- i - — ~ • 01 £ DC -p •rH 0 ij rt —-r~t tn > >1 rt ~ . . x-ajcs: 52 11 7l\: 2 rt 44-H> -g • ·: 33® «ι S 3 - £ 3 * 3. .H ί C i fcsg £ 3 3 ^ s rt i |! R ^ - «ie« ···· ^ rtos ® e cr \ cn Hi Φ <-h, ·; ·,: rt * nH {rt Λ ' - '^^ w> ^ • ·> to O CU 4-t ________-- —- i - - ~ • 01 £ DC -p • rH 0 ij rt —-r ~ t tn>> 1 rt ~. x. -cs: 52 11 7l

“γ· Jc UΓ · Jc U

P £ 3 J3 -i Ο Ξ H I l a α i c a »+JC u — a c«*1 5 φ a O <P £ 3 J3 -i Ο Ξ H I l a α i c a »+ JC u - a c« * 1 5 φ a O <

® *0 τί £ wi >i i I® * 0 τί £ wi> i i I

> *H p tJ --, < j 0) C> * H p tJ -, <j 0) C

3 ij <TJ C I SX M3 ij <TJ C I SX M

® ft ® 2 r-w fH a a < “2 o < f 3 {, Λ 5® ft ® 2 r-w fH a a <“2 o <f 3 {, Λ 5

φ'Τ' <D Q) I Mφ'Τ '<D Q) I M

2 ‘ <H X! M CU > I2 '<H X! M CU> I

a -C 7 h CL. φ I I ft O 11 « 3 3 5 P Q ° 3 >ι I Η φΛίa -C 7 h CL. φ I I ft O 11 «3 3 5 P Q ° 3> ι I Η φΛί

•H ft t (rt Φ -H G P ι-l I• H ft t {rt Φ -H G P ι-l I

a ft4J S j o <-* I I Xa ft4J S j o <- * I I X

tD flj ‘H 7? II p φ Ή ItD flj 'H 7? II p φ Ή I

e-c-o o sdtrH * p Q) O *H n iH rH P Μ > Λe-c-o o sdtrH * p Q) O * H n iH rH P Μ> Λ

> G P C90<UI '—1 H> G P C90 <UI '—1 H

~4 £ ~4 ft J· II (J C I~ 4 £ ~ 4 ft J · II {J C I

0 III E tl C<UI O u «««ft 5 OH P < ^ ® »o ^ g 4 h s *2 “0 III E tl C <UI O u «« «ft 5 OH P <^ ®» o ^ g 4 h s * 2 «

S ft:rt 5 m 1 1 Eh LS ft: rt 5 m 1 1 Eh L

Φ ft·!-! rt ¥ flj Q) I — ·-* GΦ ft ·! -! rt ¥ flj Q) I - · - * G

ä m >* 2 jS «-π jz a a 5h rjä m> * 2 jS «-π jz a a 5h rj

^ij3+J4J ·¥ rtift to M ' O^ ij3 + J4J · ¥ rtift to M 'O

Φ O P >, ® I ZL 4 a :rt IΦ O P>, ® I ZL 4 a: rt I

me®1** 2 Li u— -h a oo ft o p p 2 >. G a ^ a ft g P > ft EhLi a C P <N rf! ftlyc S* — r N ft a * * rt :rt rt 2 g. j o a .e C :m « *S I i a d il t* OOJ Ε-Ϊ 2 « U P C Φ ϋ c P 13 5 p φ 0) ® >^rt! p -a ft e 2 c w j > λ -me®1 ** 2 Li u— -h a oo ft o p p 2>. G a ^ a ft g P> ft EhLi a C P <N rf! ftlyc S * - r N ft a * * rt: rt rt 2 g. j o a .e C: m «* S I i a d il t * OOJ Ε-Ϊ 2« U P C Φ ϋ c P 13 5 p φ 0) ®> ^ rt! p -a ft e 2 c w j> λ -

§% I 7 I I * ® m I§% I 7 I I * ® m I

rt p rV Old Μ Φ a O' w ft 0) c p p a) m I u Φ d φ φ Φ So « ft rijrt w η φ ft m -n I, I *0 21 t „ d-SVs ft 3 Φ C ft Q ft * Ο Ό a ft ·* α φ js p p a ft S iSi‘3 g f ΐ ? S’ :2 f f 3 gftiS ^ 3 Ä S a -3 S 2 p fttM « j a > f 7 rtj X C a) mj I I I *<! :π) I 1rt p rV Old Μ Φ a O 'w ft 0) cppa) m I u Φ d φ φ Φ So «ft rijrt w η φ ft m -n I, I * 0 21 t« d-SVs ft 3 Φ C ft. Q ft * Ο Ό a ft · * α φ js ppa ft S iSi'3 gf ΐ? S ': 2 f f 3 gftiS ^ 3 Ä S a -3 S 2 p fttM «j a> f 7 rtj X C a) mj I I I * <! : π) I 1

Hdc® m -p cp Li a +j^ Φφ-Ρ omar-4 >t X 5 ® •n-n » Φ CL-h rt! O l·* P Φ > > *3 an ä s II I 3 -σι < +J 4J ® ^ d n <d Φ G *-j g >· 3 ® -p « ® _ j3d rHr-i ω fl a :o Φ rjHdc® m -p cp Li a + j ^ Φφ-Ρ Omar-4> t X 5 ® • n-n »Φ CL-h rt! O l · * P Φ>> * 3 an ä s II I 3 -σι <+ J 4J ® ^ dn <d Φ G * -jg> · 3 ® -p «® _ j3d rHr-i ω fl a: o Φ rj

-ΡφΦΦ Cj> || \ dl •'ZL-ΡφΦΦ Cj> || \ dl • 'ZL

ΜΛί® ·ιΗϋ Li® ft (OH Ή ιΗ O' 3 T*®d= 6® >i ä 5 ffi d Φ ® ii ^ΜΛί® · ιΗϋ Li® ft (OH Ή ιΗ O '3 T * ®d = 6®> i ä 5 ffi d Φ ® ii ^

*· P I-( 3 S Sffl HCU rt! '!>^-j!>ri!iJ* · P I- {3 S Sffl HCU rt! '!> ^ - j!> Ri! IJ

·>. φ^Φ>1 • φ 4J — "' -—— - • * Φ > >i a·>. φ ^ Φ> 1 • φ 4J - "'-—— - • * Φ>> i a

·"· t!2+iS· „· T! 2 + iS

• · ro 4j -P E• · ro 4j -P E

*»· -Η φ rH* »· -Η φ rH

• · Φ φ P -H *• · Φ φ P -H *

<0 _j Η O<0 _j Η O

* *ϊ m r-t a ® 2 .·". £jj ® S . ·η * * - ;···· hs§.^ 23 a §. I; w] j 3 * ?* rt ftH Ofnr*mm cr> Si : ^fljos φ c OHOii-tm σ»ωο< ... -n) 1-it-i § (¾ — co — t-.—· r- " ::: a o a, --------- • o» s ä p* * ϊ m rt a ® 2. · ". £ jj ® S. · η * * -; ···· hs§. ^ 23 a §. i; w] j 3 *? * rt ftH Ofnr * mm cr. > Si: ^ fljos φ c OHOii-tm σ »ωο <... -n) 1-it-i § (¾ - co - t -.— · r-" ::: aoa, ------ --- • o »s ä p

H ij OH ij O

.μ rt ·—.τι « > >. rt ·—· X :(B Λ 3 ♦ 9 *ϊϊ Λ. Λ 53 4 p g k Ji.μ rt · —.τι «>>. rt · - · X: (B Λ 3 ♦ 9 * ϊϊ Λ. Λ 53 4 p g k Ji

m O P Om O P O

W P Ö _ OPW P Ö _ OP

c P P 3 « > « *0 P o o * +ί * Ä ~ +! ° *“c P P 3 «>« * 0 P o o * + ί * Ä ~ +! ° * "

m ft ui " jj ffl Pm ft ui «jj ffl P

® O) W >5 r- ® A H® O) W> 5 r- ® A H

Λ O £ Ό S) OΛ O £ Ό S) O

Φ — >π V ϋ n <dΦ -> π V ϋ n <d

a · >i , ft <fl P Ca ·> i, ft <fl P C

rt JC * m Ji rt D»rt JC * m She rt D »

,-nft P 5 J< P, -nft P 5 J <P

•ti g. - n ft 3 Λ CD ftP 2 >, g rt o DJ rt Ή *5ί rj O Ji• ti g. - n ft 3 Λ CD ftP 2>, g rt o DJ rt Ή * 5ί rj O Ji

C Ä Ό O I ^ Il JIC Ä Ό O I ^ Il JI

(J) O P jj P P(J) O P jj P P

> C +j 5 ft ~ rt h^q. _7 5 g js m φ S o r| j o — rt ta rt ft 5 V4 *n p o O p 2 <u *· *-*> C + j 5 ft ~ rt h ^ q. _7 5 g js m φ S o r | j o - rt ta rt ft 5 V4 * n p o O p 2 <u * · * - *

rt ftrtl <a S S il rt Ort ftrtl <a S S il rt O

« ft-nrt S I ® > ίβ >i rt > cr^ ^ c rt«Ft-nrt S I ®> ίβ> i rt> cr ^ ^ c rt

Ji ,β P P -¾ ^ Ό '— P PJi, β P P -¾ ^ Ό '- P P

*a«t g ? e ags. | g ; $ i a 84½ S f f 3 S S & Äpirtrt -g Oil > O ** a «t g? e ags. | g; $ i a 84½ S f f 3 S S & Äpirtrt -g Oil> O *

G ® F 3 g rtrt 8 S S JG ® F 3 g rtrt 8 S S J

gs®E 3 i, ? Si ftOirt1 — ®?, - ° Ä ä G ψ rt rt I o >« p h c m rt ft ra *n - rt — P rt (¾ rt •H JJ O % ® rJ ^ > OÄo-rlJi m *c 0)-1-1 «JÄ ϊ4 p rt * p g IB p ® ·* ® I as 8 S S 2 ? a S 8 l g airss fr- t 3 lii £ cc*S S3 if B S O ® ÄÄ.i II ? g g «S3gs®E 3 i,? Si ftOirt1 - ® ?, - ° Ä ä G ψ rt rt I o> «phcm rt ft ra * n - rt - P rt (¾ rt • H JJ O% ® rJ ^> OÄo-rlJi m * c 0) - 1-1 «JÄ ϊ4 p rt * pg IB p ® · * ® I as 8 SS 2? a S 8 l g airss fr- t 3 lii £ cc * S S3 if B S O ® ÄÄ.i II? g g «S3

J?3Si Is h f s g 3 SJ? 3Si Is h f s g 3 S

jj rt rt 43C rti— O e m rt ra p e o rt ID» & rt S fijj rt rt 43C rti— O e m rt ra p e o rt ID »& rt S fi

-M m rt ai § > a u ft p £ O-M m rt ai §> a u ft p £ O

j-aj II ί | - § r */·: »äse. SS i . gi»5 * ? ns---at! * · p ra P rt S .h o p ··· rt 2 p e o -i ω • · P *rt P , ll>Ortj-aj II ί | - § r * / ·: »ace. SS i. gi »5 *? the so-called --- at! * · P ra P rt S .h o p ··· rt 2 p e o -i ω • · P * rt P, ll> Ort

.: rt rt P -> * * :rtC.: rt rt P -> * *: rtC

* rt ™ p 2 5 Xrtört ·»· rt^trtrt ä 5 p « > ; * jj ra rt ra G *rj ra :rt Ji m Sjj «- p p ^ ® O p ® . , ftrtrtOrt T3—' e^-r-raft ra * « * >0 ΉΗ P **j Jj f ϊ< G rt c p :.:: 5 «p ^ e 2 2 £ ® -5 ® ^* rt ™ p 2 5 Xrtört · »· rt ^ trtrt ä 5 p«>; * jj ra rt ra G * rj ra: rt Ji m Sjj «- p p ^ ® O p ®. , ftrtrtOrt T3— 'e ^ -r-raft ra * «*> 0 ΉΗ P ** j Jj f ϊ <G rt c p:. :: 5« p ^ e 2 2 £ ® -5 ® ^

v w I rt ftp p C ft > o ti Pv w I rt ftp p C ft> o ti P

,*:\ ^rtus ®c Λ 2 E * 5 S £ * · I -r-% *J Λ At 'M' U H ^ ftJ .J Oi Oi 54 11 ESIMERKKI 5, *: \ ^ rtus ®c Λ 2 E * 5 S £ * · I -r-% * J Λ At 'M' U H ^ ftJ .J Oh Oi 54 11 EXAMPLE 5

Aspergillus niger pH 2.5 optimi happc taasigeenin kloonaus ja sekvensointi 5 1. Yhteenveto pH 2.5 optimi happofosfataasigeeni kloor ja sekvensoitiin Aspergillus niger-sienessä. \ happofosfataasin transloitu nukleotidisekvenssi c 10 aminohappoa. Tämän proteiinin geeni eristettiin k mällä oligonukleotidikoettimia, jotka perustuiva distetun proteiinin peptidisekvenssiin.Cloning and Sequencing of Aspergillus niger pH 2.5 Optimal Happc 5 Gene 1. Summary of pH 2.5 optimal acid phosphatase gene chlorine and sequenced in Aspergillus niger fungus. Translated nucleotide sequence c 10 amino acids of acid phosphatase. The gene for this protein was isolated by a set of oligonucleotide probes based on the peptide sequence of the isolated protein.

A. Oligonukleotidikoettimien suunnittel 15 pH 2.5 happofosfataasia (AF) koodaavan eristäminen tehtiin hybridisoimalla peptidisekven tä saatuja degeneroituja oligonukleotidejä.A. Design of oligonucleotide probes pH 2.5 coding for acid phosphatase (AF) was done by hybridizing the degenerate oligonucleotides obtained from the peptide sequence.

A. niger var. awamori-kannan ALKO 243 (ATCC 388 20 2.5 AP:n sisäisiä peptidifragmentteja on aiemmin tetty ja sekvensoitu kuten on kuvattu aiemmin patentissa.A. niger var. awamori strain ALKO 243 (ATCC 388 20 2.5 AP internal peptide fragments have been previously identified and sequenced as described previously in the patent.

17meeri degeneroitu oligonukleotidi, F17 mer degenerate oligonucleotide, F

* tehtiin happofosfataasipeptidistä #816 (ILpho tau * * · !..* 25 sa 4 [SEQ. NO.:57;]). Neutraalia inosiinia sisäl mällä saadaan yksi täydellisesti yhteensopiva 6 “· dollisesta yhdistelmästä PHY-31:ssä. Kuvassa 1 o tetty oligonukleotidin PHY-31 nukleotidisekvem 9 * ; vastaava peptidisekvenssi.* was made from acid phosphatase peptide # 816 (ILpho tau * * ·! .. * 25? 4 [SEQ. NO.:57;]). Containing neutral inosine gives one perfectly compatible $ 6 combination in the PHY-31. Figure 1 shows the nucleotide sequence 9 * of the oligonucleotide PHY-31; corresponding peptide sequence.

30 B. Oligonukleotidikoettimien hybridisaai ! ,·. spesifisyys 117 55 tettiin koettimina kokonaisgenomi-DNA:n tutki ALKO 243:sta. Genomi-DNA eristettiin neutraalil simenetelmällä. Hienoksijauhettu, kylmäkuivattu hajotettiin 4% SDS-TE-puskuri11a. Solujäänne p 5 tiin ja supernatantti poistettiin ja uutettiin k samalla määrällä Tris-saturoitua fenoli:kloformi liuosta. Genomi-DNA saostettiin NH4OAC- ja EtOH silla. Pelletoitu DNA puhdistettiin ultrasentrifi CsCl-liuoksella ja käsiteltiin kuten on kuvatt 10 kaisussa Maniatis et ai. Molecular Cloning/ A La] ry Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Harbor, NY, USA (1982)). Hybridisaatio genomi-1 [y32P] ATP-leima tuilla degeneroiduilla oligonu] deilla Maniatis et al. Molecular Cloning, A Lab< 15 Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Harbor, NY, USA (1982) tehtiin 42°C lämpötilas yli suodattimille oligonukleotidihybridisaatiolii s a (6X SSPE, 0.5% SDS, 3X Denhardts, 100 μq/ml Ei-spesifisesti sitoutuneet poistettiin pesemäi: 20 dattimet kahdesti 30 minuutin ajan huoneen lämpöl 2XSSC:llä, 0.1% SDS:11a ja kerran 5 minuutin aj« lämpötilassa tuoreella liuoksella. Yön yli i Kodak X-Omat Ar -filmille vahvistusvarjostimella . ti positiivisesti hybridisoivat juovat.30 B. Hybridization of Oligonucleotide Probes! ·. specificity 117 55 was probed as whole genomic DNA was examined from ALKO 243. Genomic DNA was isolated by a neutral method. Finely powdered, freeze-dried was digested with 4% SDS-TE buffer. The residual cells were p 5 and the supernatant was removed and extracted with the same amount of Tris-saturated phenol: chloroform solution. The genomic DNA was precipitated with NH4OAC and EtOH. The pelleted DNA was purified with ultracentrifuge CsCl solution and treated as described in Maniatis et al. Molecular Cloning / A La] ry Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Harbor, NY, USA (1982)). Hybridization with genomic-1 [γ32P] ATP-tagged degenerate oligons] Maniatis et al. Molecular Cloning, A Lab <15 Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Harbor, NY, USA (1982) was performed at 42 ° C over filters on oligonucleotide hybridization (6X SSPE, 0.5% SDS, 3X Denhardts, 100 μq / ml the binders were washed twice: for 30 minutes twice at room temperature with 2XSSC, 0.1% SDS, and once for 5 minutes at fresh temperature overnight on Kodak X-Omat Ar film with a reinforcement shade.

25 A. niqer ALKO 243 genomi-DNA testattiii • * **··] tämällä koettimena pH 2.5 oligonukleotidia 1 • * ' *· Hybridisaatio tehtiin kuten genomihybridisaatio.25 A. niqer ALKO 243 genomic DNA was tested by probing pH 2.5 oligonucleotide 1 * * * * Hybridization was performed as genomic hybridization.

AP:n oligonukleotideistä vain PHY-31 osoitti suh1 m 9 * sen spesifistä hybridisaatiota genomi-DNA:hän.Of the AP oligonucleotides, only PHY-31 showed specificity for its hybridization to genomic DNA.

:T: 30 disaatio yhteen vallitsevaan ja yhteen pienempää vaan osoitti riittävää spesifisyyttä käytett : kiriastoien seulomiseen.: T: 30 dissection into one prevailing and one smaller, but showed sufficient specificity for screening the strings.

56 23kb pituisten fragmenttien tuottamiseksi. Pilke liitettiin BamHI-katkaistuun defosforyloituun Dash II vektoriin (Stratagene). Liitetty DNA pa in vitro käyttämällä Gigapack Gold pakkausu 5 (Stratagene). Pakattua faagia käytettiin E. coli P2392 infektoimiseen. Lambdakirjasto seulotti] gonukleotidilla PHY-31 pH 2.5 AP-geenin löytä olosuhteissa, jotka osoitettiin genomihybridisa (B)-osassa. Kaksitoista hybridisoivaa täplää va 10 lisäkarakterisointia varten. Jokaisesta ehdo eristetty bakteeriofaagi-DNA pilkottiin restri donukleaasilla ja testattiin joko PHY-31:llä ta sella PHY-31:tä ja PHY-35:tä, jotka oli johdett pumattomasta pH 2.5 AP -peptidistä (kuva 1). Yks 15 neista, AP99, sisälsi 2.1 kb Sphl fragmentin, j aiemmin identifioitu genomin Southern-analyysis joka hybridisoitui voimakkaasti molempiin koet Voimakas hybridisaatio eri peptidisekvensseistä tuihin kahteen oligonukleotidiin antaa olettas 20 AP99 sisältää pH 2.5 AP:a koodaavan sekvenssi: 2.1 kb Sphl fragmentti kloonattiin sen vuoksi Ml aan ja M13mpl9:ään sekvensointia varten. Tämän : nukleotidisekvenssin translaatio paljasti pept ^ . venssit, joilla oli N-päätteinen peptidi (taulu] 25 Välittömästi N-terminaalisen peptidin yläpuole · ’·«** tyypillinen sienen erityssignaalisekvenssi, joki **: metioniinialoituskodonista asemassa 136. Kaikki t·· disekvenssit olivat läsnä yksinkertaisessa 01 paitsi #1108 (peptidi 9Tpho taulukossa 4 [SEQ. I] 30 63:]), joka alkaa nukleotidiasemassa 1384. Lop< m donit identifioitiin kaikissa kolmessa lukuketr 57 fikaatiolla käyttämällä pH 2.5 AP spesifisiä alli A. niqer var. awamori ALKO 243 kasvatettiin Rl tealustalla, joka sisälsi per litra 2.0 % maissi lystä (Sigma), 1.0% proteaasipeptonia (Difco), 5 glukoosia, 5.0g NH4N03, 0.5g MgS04-7H20, O.SgKCl, FeS04· 7H20. Kokonais-RNA eristettiin McAda ja Doi menetelmällä LiCl-saostuksella (McAda, P.C. e Meth. Enzymol. 97i337-344 (1983)). Polyadenylod hetti-RNA affiniteettipuhdistettiin kokonais-1 10 käyttämällä oligonukleotidi(dT)-selluloosako: (Pharmacia), kuten valmistaja on spesifioinut gonukleotidi- PCR-alukkeet UPPHOS (5' GAATTCCGAGTi TCATGGGCGCG-3' ) [SEQ ID No.:66:] ja DOWNPHOS (5' TCCCGGGACCTACCCCTCTGCAT-3' ) [ SEQ ID No.:16:] 15 tisoitiin genomisekvenssien mukaisesti, joil] sivulla EcoRI-restrlktiokohta. UPPHOS ja DOWNPHC sijoittunet käänteisesti ja ovat erotettuna 97S sellä genomikloonissa. First Strand -synteesi 1 BMB cDNA -kitillä valmistajan suositusten muki 20 1.0 Mg:lla mRNA:ta ja DOWNPHOS:a. cDNA-mRNA-komi PCR -amplifikaatio oligonukleotidialukkeilla UPI DOWNFOS tuotti 850 bp:n spesifisen tuotteen, plasmidi- DNA:n PCR-amplifikaatio samoilla alu) . tuotti odotetun 1006 bp:n tuotteen. Geelipuhdj 25 cDNA-PCR-tuote pilkottiin EcoRI:llä ja kloonatti; 9 * ***·’ 18 kaksois juostesekvensointia varten käyttämällä *·: States Biochemical Sequencase II -kittiä. Alukkei • * * lifioivat 850 bp:n fragmentin cDNA: s ta ja odoteti jj*: bp:n fragmentin kloonatusta genomi-DNA:sta. Amp] :T: 30 dun cDNA-fragmentin sekvensointi osoitti kolmen ♦ intronin läsnäolon, joista jokaisella oli kons ; * sienidonori. lariaatti ia aksentorisekvenssi. Ke 58 11 vissa nukleotidisekvenssistä, oli laskettu Mr ! 2.1 kb Sphl fragmentti pUC18:ssa (pAP-1) sisälsi pH 2.5 AP sekvenssin yläpuolella.56 23kb fragments. The fragment was ligated with BamHI-cleaved dephosphorylated Dash II vector (Stratagene). Attached DNA pa in vitro using Gigapack Gold kit 5 (Stratagene). The packaged phage was used to infect E. coli P2392. The lambda library screened] with the gonucleotide PHY-31 pH 2.5, found the AP gene under the conditions indicated in the genomic hybridization (B) section. Twelve hybridizing spots for additional characterization. Bacterial phage DNA isolated from each condition was digested with restri donuclease and assayed with either PHY-31 and PHY-31 and PHY-35 derived from the unrelated pH 2.5 AP peptide (Figure 1). One of the 15, AP99, contained a 2.1 kb Sphl fragment and a previously identified Southern analysis of the genome that strongly hybridized to both assays. Strong hybridization to the two oligonucleotides from different peptide sequences gives the assumption that 20 AP99 contains the pH 2.5 AP encoding sequence at 2.1 kb. therefore to M1 and M13mp19 for sequencing. Translation of this: nucleotide sequence revealed a peptide. sequences with the N-terminated peptide (Table] 25 Immediately upstream of the N-terminal peptide · '· «** typical fungal secretion signal sequence, river **: from the methionine start codon at position 136. All t ·· sequences were present in simple 01 except # 1108 (peptide) 9Tpho in Table 4 [SEQ. I] 30 63:]) starting at nucleotide position 1384. Lobmids were identified by all three readings 57 using pH 2.5 AP specific alli A. niqer var. Awamori ALKO 243 were grown on Rl medium containing liter 2.0% maize (Sigma), 1.0% protease peptone (Difco), 5 glucose, 5.0g NH4NO3, 0.5g MgSO4-7H2O, O.SgKCl, FeSO4 · 7H2O Total RNA was isolated by McAda and Doi by LiCl precipitation (McAda PC e Meth. Enzymol. 97: 337-344 (1983). Polyadenylod hetti RNA affinity purification was performed on a total of 10 using an oligonucleotide (dT) cellulose probe: (Pharmacia) as specified by the manufacturer for gonucleotide PCR primers. UPPHOS (5 'GAATTCCGAGTi TCATGGGCGCG-3') [SEQ ID No.:66:] and DOWNPHOS (5 'TCCCGGGACCTACCCCTCTGCAT-3') [SEQ ID No.:16:] were sequenced according to the genome sequences to which the EcoRI restriction site was located. UPPHOS and DOWNPHC are located in reverse and are separated by 97S in the genomic clone. First Strand Synthesis with 1 BMB cDNA Kit by Manufacturer's Recommendations for Mug 20 1.0 Mg mRNA and DOWNPHOS. PCR amplification of cDNA mRNA Komi with oligonucleotide primers UPI DOWNFOS gave a 850 bp specific product, PCR amplification of plasmid DNA with the same sequence). produced the expected 1006bp product. The gel purified 25 cDNA PCR product was digested with EcoRI and cloned; 9 * *** · '18 for double strand sequencing using * ·: States Biochemical Sequencase II kit. The primer * * * lifted the 850 bp fragment of cDNA and waited for the jj *: bp fragment from the cloned genomic DNA. Amp]: T: Sequencing of a 30 dun cDNA fragment showed the presence of three ♦ introns, each with a cons; * mushroom donor. lariate and accentor sequence. Wed 58 11 in the nucleotide sequence, was calculated for Mr! The 2.1 kb Sph1 fragment in pUC18 (pAP-1) contained a pH of 2.5 above the AP sequence.

5 ESIMERKKI 6EXAMPLE

Aspergillus niqer fytaasin tuotto Tricl reesein avullaProduction of Aspergillus niqer phytase by Tricl reesei

Koejärjestelyt 10 1. Bakteerikannat, faagit ja plasmiditExperimental Arrangements 10 1. Bacterial strains, phages and plasmids

Kloonauksessa ja sekvensoinnissa käytett coli kantoja DH5a (Hanahan, D., "Techniques for 15 formation of E. coli," teoksessa DNA Cloning, v Glover, D.M., ed., IRL Press, Oxford, 109-135 ( Bethesda Research Laboratories, Gaithersburg, ME ja XL-l-Blue (Bullock, W.O. , et ai., BioTecli 5^:376-378 (1987); Stratagene, La Jolla, CA,The coli strains DH5α used in cloning and sequencing (Hanahan, D., "Techniques for 15 Formation of E. coli," in DNA Cloning, v. Glover, DM, ed., IRL Press, Oxford, 109-135 (Bethesda Research Laboratories, Gaithersburg) , ME and XL-1-Blue (Bullock, WO, et al., BioTecli 5: 376-378 (1987); Stratagene, La Jolla, CA.

20 E. coli Y1090 (r~) (Huynh, D.S., et ai., "Consti and screening cDNA libraries in gtl and gtll Cloning, voi. 1, Glover, D.M., ed., IRL Press, C 49-57 (1985); Promega Biotec Protoclone GT S20 E. coli Y1090 (r ~) (Huynh, DS, et al., "Constrain and screening cDNA libraries in gtl and gtll cloning, vol. 1, Glover, DM, ed., IRL Press, C 49-57 (1985). ); Promega Biotec Protoclone GT S

; Madison, WI, USA) isäntänä gtll-faagin kasvatuk e il 25 Aspergillus niger var. awamori ALKO 243 38854) käytettiin fytaasigeenin luovuttajana. T sei kantoja ATCC56765 (RutC-30), ALKO 233 (VTT-E 56, Bailey ja Nevalainen, Enzyme Microb. Te \S: 3:153-157 (1981)) ja ALKO 2221 käytettiin fytaasi ·) : 30 vastaanottajana. ALKO 2221 on alhaisen aspartyyli aasi-aktiivisuuden omaava mutantti, joka on jo l UV-mutageneesillä ALKO 233-kannasta.; Madison, WI, USA) as a host for the cultivation of the gtll phage Aspergillus niger var. awamori ALKO 243 38854) was used as a donor of the phytase gene. The strains ATCC56765 (RutC-30), ALKO 233 (VTT-E 56, Bailey and Nevalainen, Enzyme Microb. TeS: 3: 153-157 (1981)) and ALKO 2221 were used as the phytase (): 30 recipients. ALKO 2221 is a mutant with low aspartyl assay activity that is already 1 by UV mutagenesis from the strain ALKO 233.

11 59 1 1 USA (1984)).11, 59, 1 USA (1984).

Kloonauksessa vektoreina käytettiin (Boehringer, Mannheim, FRG) ja pALK307:ä, pIBI76: dannaista (IBI, New Haven, Conn., USA). pALK307 5 rin muodostamiseksi, noin 940 bp Nael-PvuI frac (oikeastaan 941 bp) on poistettu plBI76:sta. T ainoa muutos pIB176:ssa. Plasmidi pAMHHO (Neva! H., et ai., "The molecular biology of Trichoder its application to the expression of both home 10 and heterologous genes," teoksessa Molecular Indu Mycology, Leong and Berka, eds., Marcel Dekker New York, 129-148 (1991)) sisältää Trichoderma cbhl promoottorin ja päätösalueet. Plasmidi (Kelly and Hynes, EMBO J. 4:475-479 (1985)) si 15 Aspergillus nidulansin asetamidaasigeenin. p3SR2 raidin on ystävällisesti luovuttanut Dr. M. Hynes versity of Melbourne, Australia).The vectors used for cloning were (Boehringer, Mannheim, FRG) and pALK307, pIBI76 (IBI, New Haven, Conn., USA). To form pALK307 5, about 940 bp of NaI-PvuI frac (941 bp actually) has been deleted from pBI76. T only change in pIB176. Plasmid pAMHHO (Neva! H., et al., "The Molecular Biology of Trichoder Application to the Expression of Both Homes and Heterologous Genes," in Molecular Indu Mycology, Leong and Berka, eds., Marcel Dekker New York, 129 -148 (1991)) contains the Trichoderma cbhl promoter and decision regions. The plasmid (Kelly and Hynes, EMBO J. 4: 475-479 (1985)) contains the acetamidase gene of Aspergillus nidulans. The p3SR2 raid was kindly provided by Dr. M. Hynes versity of Melbourne, Australia).

2. Kasvatusalusta ja kasvatusolosuhteet 20 E. coli kasvatukset tehtiin 37°C lämpöt yön yli ja filamenttisienten kasvatukset tehtiin lämpötilassa 5:stä 7:ään päivää entsyymin tuotta /,· si ja 2 päivää, kun myseeliä kasvatettiin DNA-eri 4 »fl 25 varten.2. Culture medium and growth conditions 20 cultures of E. coli were performed at 37 ° C overnight and filamentous fungi were grown at 5 to 7 days for enzyme production, and for 2 days when mycelium was grown for 4 µl of DNA. .

E. coli kasvatettiin L-alustalla (Man • sE. coli was grown on L medium (Man

..!* T., et ai,, Molecular Cloning, A Laboratory M..! * T., et al., Molecular Cloning, A Laboratory M

Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbo * % :,:: USA (1982)) täydennettynä tarvittaessa ampisilli ti ! 30 (50 - 100 μς/τιιΐ). PD-vinopinta-agaria (Potato De broth, Difco, Detroit, MI, USA) käytettiin Asperg : ia Trirhoderma-kantoien kasvatnksppn. Asnar 11' 60 esitetty julkaisussa Penttilä et ai. (Pentti! et ai., Gene 61;155-164 (1987)). Transformantit i tettiin selektiivisellä asetamidi-CsCl-alustallc ttilä, M., et a!, Gene 61:155-164 (1987)) enner 5 toa PD-vinopinnoille.Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbo *%:, :: USA (1982)) supplemented as needed with ampicillin! 30 (50 - 100 μς / τιιΐ). Inclined PD agar (Potato De Broth, Difco, Detroit, MI, USA) was used to grow Asperg in Trirhoderma strains. Asnar 11 '60 disclosed in Penttilä et al. (Pentti et al., Gene 61; 155-164 (1987)). Transformants were plated on a selective acetamide-CsCl medium, M., et al., Gene 61: 155-164 (1987)) on PD inclined surfaces.

Korkean fytaasimäärän tuottavien tuo1 maljaseulontaa (plate screening) varten, cbhl pj tori/fytaasi fuusiolla transformoidut T. reesei } kasvatettiin 3:sta 5:een päivää Trichoderma minin 10 tamaljoilla, joissa ei ollut glukoosia ja jot täydennetty 1% natriumfytaatilla (Sigma, St. MO, USA), 1% Solka Floc:lla ja 1% proteoosipept (Difco). Kun fytaasipromoottorin sisältävää kor tiota käytettiin transformaatioon, fytaasia rur 15 tuottavien tuottajien seulonta tehtiin maljoilla, sa oli 1% natriumfytaattia ja 1 % proteoosipef mutta ei natriumfosfaattia.For plate-screening high-phytase-producing products, cbh1 ptor / phytase transformed T. reesei} were grown for 3 to 5 days in 10 Trichoderma minin-10 non-glucose plates supplemented with 1% sodium phytate (Sigma, St. MO, USA), 1% Solka with Floc and 1% protease peptide (Difco). When the phytase promoter-containing correction was used for transformation, the producers of phytase rur 15 were screened on plates containing 1% sodium phytate and 1% proteose pef but no sodium phosphate.

A. niqer ALKO 243 kasvatettin fytaasin t miseksi 5 päivää soijajauhoalustalla, jossa oli q 20 siä ja mineraalisuoloja (kaikki Merck*Itä, Darn FRG):pH säädettiin arvoon 5.0. Fytaasin ilmentän cbhl promoottorista, T. reesei-transformantteja tettiin 7 päivää (250 rpm) laktoosipohjaisella #*f · tusalustalla. Fytaasipromoottorin sisältävällä * *· l,.' 25 mentilla transformoitua T. reeseitä kasvatettiin * i “1 hoderma-minimialustalla, joka oli täydennetty ! ψ e ^ soijajauholla, mutta johon ei oltu lisätty natri *.·.* faattia.For 5 days for growth of phytase by A. niqer ALKO 243 in soybean meal medium containing q 20 and mineral salts (all Merck * East, Darn FRG): pH was adjusted to 5.0. From the phytase expression cbh1 promoter, T. reesei transformants were plated for 7 days (250 rpm) on lactose-based # * f medium. With a phytase promoter containing * * · l, ' Twenty-five transformed T. reesees were grown on * 1 in 1 hoderma medium supplemented! ψ e ^ soybean meal, but no sodium *. ·. * phate was added.

» * !J : Soijakukka-alustan (soya flower medium) »»· : 30 tumus on seuraava (per litra): 50 g soijakukkaa glukoosia, 5.0 g NH4N03, 0.5 g MgS04* 7H20, 0.5 < : 0.183 σ FeSO*7HO. dH 5.0. LaktoosiDohiäinen 11 61»*! J: Soya flower medium (soya flower medium)» »:: 30 dye is as follows (per liter): 50g soybean glucose, 5.0g NH4NO3, 0.5g MgSO4 * 7H2O, 0.5 <: 0.183 σ FeSO * 7HO. dH 5.0. LactoseDohiininen 11 61

Plasmidi-DNA E. colista (suuri mittaka-ristettiin käyttämällä Qiagen kolonneja (Diagei Dusseldorf, FRG) valmistajan ohjeen mukaan, seulontaan käytettiin Holmes'n ja Quigley'n men 5 (Anal. Biochem. 114:193-197 (1981)). Kromosomi DNA Asperqilluksesta eristettiin lyofilisoidusta listä kuten on kuvattu julkaisuissa Clements ja ] (Curr. Genet. 9:293-298 (1986)) ja Raeder ja (Lett. Appi. Microbiol. 1:17-20 (1985)).Plasmid DNA from E. coli (large scaled using Qiagen columns (Diagei Dusseldorf, FRG) according to the manufacturer's instructions, screened using Holmes and Quigley Men 5 (Anal. Biochem. 114: 193-197 (1981)). Chromosomal DNA from Asperqillus was isolated from a lyophilized list as described in Clements and] (Curr. Genet. 9: 293-298 (1986)) and Raeder and (Lett. Appl. Microbiol. 1: 17-20 (1985)).

10 4. Kloonausmenetelmät Pääasiassa käytettiin standardi-DNA-m< miä, jotka on kuvattu julkaisussa Maniatis et a' 15 lecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Sprii bor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, USA (: Restriktioentsyymit, T4-DNA-ligaasi, DNA polymei Klenow fragmentti, T4 DNA polymeraasi, polynukl* kinaasi ja EcoRl metylaasi, joita käytettiin DNJ 20 pulaatioissa olivat Boehringeriltä (Mannheim, I New England Biolabsiltä (Beverly, MA, USA). Mui nukleaasi oli BRL:Itä (Gaithersburg, MD, USA) ja Pharmacialta (Uppsala, Sweden). Kutakin entsyymi . . tettiin valmistajan ohjeen mukaisesti.4. Cloning Methods The standard DNAs described in Maniatis et al. 15 Lecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spray Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, USA (Restriction enzymes, T4 DNA) were mainly used. ligase, DNA polymerase Klenow fragment, T4 DNA polymerase, polynucleotide kinase, and EcoR1 methylase used in DNJ 20 rations were from Boehringer (Mannheim, New York Biolabs (Beverly, MA, USA). The other nuclease was from BRL (Gaithersburg, MD). , USA) and Pharmacia (Uppsala, Sweden), each enzyme was tested according to the manufacturer's instructions.

* · ♦ ***: 25 Geenipankin valmistamiseksi kromosomi DNA pilkottiin osittain Haelll:11a. EcoRl met^ • *·; käsittely, kokofraktiointi ja pakkaaminen tehtiii « * * on esitetty julkaisussa Paloheimo et ai. (Palc : M., et ai.. Appi. Microbiol. Biotechnol. 36:: m · ——— — - — - 30 (1992)). 2-8 kb fragmentteja käytettiin geeni m valmistuksessa.* · ♦ ***: To prepare the gene bank, chromosomal DNA was partially digested with Haell1. EcoRl met ^ • * ·; processing, size fractionation, and packing are carried out in accordance with Paloheimo et al. (Palc: M., et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 36 :: m · ——— - - - - 30 (1992)). 2-8 kb fragments were used in the construction of gene m.

• · Tf 1 o on ^ ami πρπ o Ί a rvti i H i volr f· πτί ί ti foht iin 62 n: tä (FMC Bioproducts, Rockland, ME, USA) jäädyty tus-fenoli-menetelmällä (Benson, S.A., Bio/Tec 2:66-68 (1984)) tai käyttämällä GeneClean®- tc maid™-kittiä (BIO 101 Inc., La Jolla, CA, USA) 5 tajan ohjeen mukaan.• · Tf 1 o on ^ ami πρπ o Ί a rvti i H i volr f · πτί ί ti fohtin 62 n (FMC Bioproducts, Rockland, ME, USA) by the frozen phenol method (Benson, SA, Bio / Tec 2: 66-68 (1984)) or by using the GeneClean® tc maid ™ kit (BIO 101 Inc., La Jolla, CA, USA) according to the teacher's instructions.

Sekvensointi tehtiin suoraan plasm Sangerin menetelmällä (Sanger, F., et ai., Proc Acad. Sei. USA 74:5463-5467 (1977)) käyttämällä T7-, pUC/M13-alukkeita ja monistusalukkeita ja ] 10 Sequenase sekvensointikittiä (United States Bioc] Corporation, Cleveland, OH, USA), cbhl promoott< fytaasigeenin fuusiot sekvensoitiin automaatl sekvenaattorilla (Applied Biosystems 373A, Foste: CA, USA) käyttämällä Taq DyeDeoxy™ Terminator 15 Sequencing-kittiä (Applied Biosystems). Käyt* oligonukleotidit syntetisoitiin Applied Biosystei Synthesizer-syntetisaattorilla, paitsi pUC-ali jotka saatiin United States Biochemical Corporal ta.Sequencing was performed directly by the plasmid Sanger method (Sanger, F., et al., Proc Acad. Sci. USA 74: 5463-5467 (1977)) using T7, pUC / M13 primers and amplification primers and] Sequenase sequencing kit (United States) Bioc] Corporation, Cleveland, OH, USA), cbhl promoted phytase gene fusions were sequenced on an automated sequencer (Applied Biosystems 373A, Foste: CA, USA) using a Taq DyeDeoxy ™ Terminator 15 Sequencing Kit (Applied Biosystems). The oligonucleotides used were synthesized on an Applied Biosyste Synthesizer except for the pUC aliquoted from the United States Biochemical Corporation.

20 DNA-koettimet leimattiin käyttämällä Bc gerin ei-radioaktiivista DIG-DNA Labelling and Di on-kittiä valmistajan ohjeen mukaan.The DNA probes were labeled using the Bc ger non-radioactive DIG DNA Labeling and Di on kit according to the manufacturer's instructions.

Hybridisaatiot tehtiin 68°C lämpötilassa .·, : valmistajan ohjeissa (Boehringer) . Täpläseulonno: * 25 Southern blot -hybridisaatioissa käytettiin Amei Hybond N nylon-suodattimia.Hybridizations were performed at 68 ° C. ·,: Manufacturer's instructions (Boehringer). Spot Screening: * Amei Hybond N nylon filters were used for 25 Southern blot hybridizations.

• * Kun täplät oli seulottu antiseerumilla tettiin fytaasispesifistä polyklonaalista antis* * KH1236. KH1236 oli tehty puhdistettua ja deglykc * * · : 30 tua fytaasivalmistetta vastaan (M. Turunen, AlkcAfter screening the spots with antiserum, phytase-specific polyclonal Antis * * KH1236 was prepared. KH1236 was made against purified and deglycc * * ·: 30 phytase preparation (M. Turunen, Alkc.

Kansanterveyslaitoksella (Helsinki, Finland).At the National Public Health Institute (Helsinki, Finland).

» ψ 1- * — ί Y r— Π J « i ** > i » ♦ ♦ ä i 63 5. Transformaatiot E. coli-kannat transformoitiin Hanahani telmän mukaan ("Techniques for transformation of 5 li/" teoksessa DNA Cloning, voi. 1, Glover, D.M IRL Press, Oxford, 109-135 (1985)), ja T. reesei kuten julkaisussa Penttilä et ai. (Gene 61: (1987)). Kun ligatoidut fragmentit transformoit transformantti taulukossa 7), ligaatioseosta ei 10 tettu vaan sitä käytettiin sellaisenaan transfo oissa. Ennen itiöntiä perunadekstroosi-agar(PD pinnoille, T. reesei transformantit siirrettiin tiiviselle alustalle ja puhdistettiin konidioisi 15 6. Entsyymi- ja proteiinimittaukset5. Transformations E. coli strains were transformed according to Hanahan's method ("Techniques for Transformation of 5 li /" in DNA Cloning, Vol. 1, Glover, DM IRL Press, Oxford, 109-135 (1985)), and T. reesei as in Penttila et al. (Gene 61: (1987)). When the ligated fragments were transformed by the transformant in Table 7), the ligation mixture was not transformed but used as such in the transfections. Prior to sporulation, potato dextrose agar (for PD surfaces, T. reesei transformants were transferred to a dense medium and purified for conidia. 15 6. Enzyme and protein measurements

Entsyymianalyysiä varten T. reesei-; erotettiin kasvatusalustasta sentrifugoimalla ] minuuttia nopeudella 5,000 - 10,000 rpm (Sorvali 20 Dupont Company, Wilmington, Delaware, USA). A. viljelmät sentrifugoitiin 40 minuuttia nopeudelJFor enzyme analysis, T. reesei; was separated from the culture medium by centrifugation] for 5,000 to 10,000 rpm (Sorvali 20 Dupont Company, Wilmington, Delaware, USA). A. The cultures were centrifuged for 40 minutes

10,000 rpm (Sorvali SS-34). Fytaasiaktiivisuus ti in viljelmäsupernatantista määränä epäorg< ,·. ; fosfaattia, joka vapautuu natriumfytaattisubs • ··10,000 rpm (Sorval SS-34). Phytase activity ti from culture supernatant in an amount of inorganic <, ·. ; phosphate released by sodium phytate subunits • ··

I.,* 25 entsymaattisessa hydrolyysissä lämpötilassa 37°CI., * 25 in enzymatic hydrolysis at 37 ° C

f · *·„ aiemmin on kuvattu. Yksi fytaasi normalisoitu ; i « * "5 (PNU) on määritelty määränä fytaasiaktiivisuutta tuottaa A. niqer ALKO 243-kanta käytetyissä · tusolosuhteissa.f · * · „previously described. One phytase normalized; i «*" 5 (PNU) is defined as the amount of phytase activity produced by the A. niqer strain ALKO 243 under the conditions of use.

30 Fytaasin tuotto natriumfytaatti-analy;30 Phytase production sodium phytate analyte;

joila visualisoitiin kaatamalla reagenssia Cthe joila was visualized by pouring reagent C

6464

Amyloglukosidaasiaktiivisuus (AGU) mi käyttämällä 1% Zulkowsky tärkkelystä (Merck) sub tina ja niittämällä vapautuneen glukoosiyksikköje DNS-reagenssin kanssa keittämisen jälkeen (katsAmyloglucosidase activity (AGU) mi using 1% Zulkowsky starch (Merck) as a tin and riveting glucose units released after boiling with DNA reagent (see

5 lä), kun reaktio on kestänyt 10 minuuttia 60°C5) after 10 minutes at 60 ° C

tilassa pH:ssa 4.8. Proteaasit (HUT) mitattiin 4.7 kuten teoksessa Food Chemicals Codex (1981)at pH 4.8. Proteases (HUT) were measured 4.7 as in the Food Chemicals Codex (1981).

mällä 2% hemoglobiinia (Sigma) substraattina. E2% hemoglobin (Sigma) as substrate. E

kanaasin (ECU) ja sellobiohydrolaasin (FPU) akti 10 mitattiin kuten IUPAC*in julkaisussa Measurencanase (ECU) and cellobiohydrolase (FPU) Act 10 were measured as in IUPAC * in Measure

Cellulase Activities (IUPAC Commission on Biote gy, Measurement of Cellulase Activities, BiocCellulase Activities (IUPAC Commission on Biote gy, Measurement of Cellulase Activities, Bioc

Engineering Research Centre, Indian Institute o nology, Delhi, India, sivut 5-7 ja 10-11 (1981; 15 hydroksietyyliselluloosaa (Fluka AG) 50 mM natr raattipuskurissa (pH4.8) ja Whatman no. 1 paper tettiin substraatteina. Käytetty DNS erosi menetelmässä esitetystä ja tehtiin liuottamalli 50.0 g 2-hydroksi-3,5-dinitrobentsoehappoa (Mei 20 l:aan deionisoitua vettä. Sitten lisättiin 80.0 hitaasti käyttämällä magneettisekoittajaa ja ] natrium-kaliumtartraattia (Merck) lisättiin ja 1 tiin kuumentamalla liuos (maksimilämpötila 45°C) : naistilavuus säädettiin 5 Isaan, liuos suoda1 • «« e···* 25 Whatman no. 1 läpi ja suojattiin valolta.Engineering Research Center, Indian Institute ofology, Delhi, India, pages 5-7 and 10-11 (1981; 15 hydroxyethylcellulose (Fluka AG) in 50 mM sodium buffer, pH4.8) and Whatman No. 1 was printed as substrates. differed from that described in the method and a solution of 50.0 g of 2-hydroxy-3,5-dinitrobenzoic acid (Mei in 20 L of deionized water) was prepared. Then 80.0 was added slowly using a magnetic stirrer and sodium potassium tartrate (Merck) was added and the solution was heated to C): The female volume was adjusted to 5 Isa, the solution was filtered through 1 What was No. 1 and protected from light.

CBHI-proteiini määritettiin viljelysupe: tista ajamalla SDS-polyakryyliamidigeelillä ja 1 [··;* tamalla CBHI-proteiinijuova (T. reesei ALKO 233 : 2221 kannat) tai dot blotting-näytteillä käyti V Σ 30 Schleicher & Schuell's (Dassel, FRG) Minifold™ Sample Filtration Manifold (T. reesei ATCC56765) 65 7. SDS-PAGE ja Western blot-analyysiCBHI protein was determined from culture supernatants by running on SDS-polyacrylamide gel and 1 [···; * CBHI protein band (T. reesei ALKO 233: 2221 strains) or by dot blotting with V Σ 30 Schleicher & Schuell's (Dassel, FRG) Minifold. ™ Sample Filtration Manifold (T. reesei ATCC56765) 65 7. SDS-PAGE and Western Blot Analysis

Natriundodekyylisulfatti-polyakryyliam lielektroforeesi (SDS-PAGE) ja Western blot-a 5 tehtiin kuten Laenunli (Laemmli, U.K., Nature 2 685 (1970)) ja kuten Towbin et al. (Towbin, H., . Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76:4350-4354 (1979) taasiproteiinin visualisointi Western blot-anal tehtiin käyttämällä polyklonaalista kani-antis< 10 KH1236. Immunokompleksien visualisointi tehtiir täpläseulonnassa.Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide electrophoresis (SDS-PAGE) and Western blot were performed as described by Laenunli (Laemmli, U.K., Nature 2885 (1970)) and as described by Towbin et al. (Towbin, H., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76: 4350-4354 (1979). Western blot visualization of the re-protein was done using polyclonal rabbit Antis <10 KH1236. Immunocomplexes were visualized by spot screening.

8. Polymeraasiketjureaktio (PCR) 15 PCR-reaktiot tehtiin Techne Thermal PHC-2-laitteella (Techne Ltd., Cambridge, UK) 1' tilavuudessa. Reaktioseokset sisälsivät 0.2 mM I dNTP (3'-deoksinuklosidi-5'-trifosfaattia, Pha] 10 mM Tris-puskurissa (pH 8.3), 50 mM KC1, 1.5-20 MgCl2 ja 0.01% (w/v) gelatiinia. Käytettävä mei 011 seuraavanlainen: 95°C (plasmidi) tai 100°C mosomaalinen DNA)/5 minuuttia ennen Tag DNA pol^ sin lisäystä (1-2 yksikköä, Cetus Corp., Emeri , , CA, USA) ja 100 μ1:η parafiiniöljypaällyste, c '· 25 rointi 95°C/1 min, lämpökäsittely 60°C/1 min • ft# !...: teisPCRissä 52°C), monistus 72°C/2 min (käänteisl * '·· min) 30 sykliä. Lopullinen monistusaika oli 9 mil täydellisen juosteiden synteesin varmistamiseks : plasmidia tai DNA-fragmenttia käytetään templae * * · · 30 käytettävän templaatin määrä on 5-10 ng ja jc aluketta lisätään 20-50 pmol. Kun kromosomaalisti hfl ään homnl λλΗ· i n λ trj» ef aavat· määräf 66 tions, Innis, M.A., et al., eds., Academic Pre; Diego, sivut 219-227 (1990)). PCR-fragmentit puh tiin GeneClean®- tai Mermaid^-kitillä (agaroosig tarvittaessa) tai Qiagen-kärjillä. Fragment! 5 täytettiin käyttämällä DNA-polymeraasi I Klenoi menttia.8. Polymerase Chain Reaction (PCR) 15 PCR reactions were performed on a Techne Thermal PHC-2 (Techne Ltd., Cambridge, UK) in a 1 'volume. The reaction mixtures contained 0.2 mM I dNTP (3'-deoxynucloside-5'-triphosphate, Pha] in 10 mM Tris buffer (pH 8.3), 50 mM KCl, 1.5-20 MgCl 2, and 0.01% (w / v) gelatin. as follows: 95 ° C (plasmid) or 100 ° C mosomal DNA) / 5 minutes before addition of Tag DNA pole (1-2 units, Cetus Corp., Emeri, CA, USA) and 100 μ1: η paraffin oil coating, c 25 cycles of 95 ° C / 1 min, heat treatment of 60 ° C / 1 min • ft #! ...: 52 ° C on a self-PCR, amplification 72 ° C / 2 min (reverse * '·· min) for 30 cycles. The final amplification time was 9 mil to ensure complete strand synthesis: the plasmid or DNA fragment used is temple * * · 30 the amount of template used is 5 to 10 ng and 20 to 50 pmol of primer is added. When chromosomally hfl to homnl λλΗ · i n λ trj »ef aav · 66 tions, Innis, M.A., et al., Eds., Academic Pre; Diego, pp. 219-227 (1990)). The PCR fragments were purified with the GeneClean® or Mermaid® kit (agarose as needed) or with Qiagen tips. Fragment! 5 was filled using DNA polymerase I Clenolent.

TULOKSETSCORE

10 A. Aspergillus niger fytaasin molekuläi kloonaus 1. Fytaasikoettimen tuotto peräkkäisil] amplifikaatiolla 15 PCR-reaktioissa käytettävät oligonui dialukkeet ja vastaavat ALKO 243 fytaasin pe] #792 (15 phy) ja #420 (10 phy) aminohapposek1 (taulukko 3, kuten on kuvattu aiemmin) on ei 20 kuvassa 3 (nukleotidit 1409-1480 ja 1727-171 taasisekvenssissä, katso kuva 5). Tehtiin kaksi ] ri PCR-reaktiota. Reaktiossa A käytettiin sens gonukleotidia 1 (#792) ja antisense oligonukleoi (#420); reaktiossa B käytettiin sense oligonukli 25 3 (#420) ja antisense oligonukleotidiä 2 (#792] • · *···[ määri PCR-reaktiossa A muodostui yksinkertain ♦ * bp:n juova, kun taas PCR-amplifikaatioreaktioss muodostunut tuotetta. Täten pääteltiin, että alu< j koodaa peptidiä #792 sijaitsi fytaasisekvenss :T: 30 osassa verrattuna alueeseen, joka koodaa peptidi·10 A. Molecular Cloning of Aspergillus niger Phytase 1. Production of Phasease Probe by Sequential Amplification 15 oligonucleotides used in PCR reactions and corresponding ALKO 243 phytase pe] # 792 (15 phy) and # 420 (10 phy) amino acid sequences (Table 3) previously) is not 20 in Figure 3 (nucleotides 1409-1480 and 1727-171 in the restart sequence, see Figure 5). Two PCR reactions were performed. In reaction A, sens gonucleotide 1 (# 792) was used and antisense oligonucleotide (# 420) was used; reaction B used sense oligonucleotide 25 3 (# 420) and antisense oligonucleotide 2 (# 792) • · * ··· [PCR reaction A generated a single band of ♦ * bp, whereas the product formed in the PCR amplification reaction was concluded. that region <j encodes peptide # 792 was located in the phytase sequence: T: 30 moiety compared to the region encoding peptide ·

Primääri PCR-fragmenttia (A) käytettiin tempi.The primary PCR fragment (A) was used as a template.

_ * 4- A « M A AA n^O «M A A Ta 4. i A A M AA A n -M. A«h^ m « M A 1··· A A M A 1 67 johdettu DNA-sekvenssistä, sisälsi myös tunnetu ohapot peptidistä #792 ja #420, joita ei oltu k alukesekvenseillä. 350 bp:n PCR-fragmenttia käy DNApankin koettimena._ * 4- A «M A AA n ^ O« M A A Ta 4. i A A M AA A n -M. The DNA sequence derived from the DNA sequence also contained the known acid acids from peptide # 792 and # 420 which were not present in the primer sequences. The 350 bp PCR fragment serves as a probe for DNAbank.

5 2· DNApankin seulonta5 2 · Screening of DNA Bank

Geenipankki sisälsi noin 1.9 x 106 pfu forming units-täplää muodostavaa yksikköä)/ml, 10 noin 99.5%:11a oli insertti. 80,000 täplästä, seulottiin, löydettiin kaksi positiivista klooni 6 ja Hael-5. Kloonit eristettiin, puhdistett insertit (5.6 ja 5.2 kb) kloonattiin EcoRI:llä tuun pALK307:ään. Kloonit reagoivat myös fyta 15 tiseerumi KH1236:n kanssa. Insertit restriktio tettiin ja PCR-fragmentin havaittiin hybridis kloonien noin 1 kb:n BamHI-Sphl restriktiofragm (katso kuvasta 4 fytaasisekvenssin hybrdisaati Kloonin Hae2-6 sekvenssi, joka sisälsi suuren os 20 sekvenssistä koodasi 15 sisäistä tryptistä pept venssiä, mutta N-päätteistä aminohapposekvens löydetty. N-pään ja promoottorialueen sisältäv gikloonit seulottiin geenipankista käyttämällä , . tinta, joka oli tehty käänteisPCR:lla (Ochma • « « '· ^ 25 et ai., "Amplification of flanking sequences by PCR," teoksessa PCR Protocols, A Guide to Meth< ♦ « * *· Applications, Innis, M.A., et ai,, eds., Academ ss, San Diego, sivut 219-227 (1990)).The gene bank contained about 1.9 x 10 6 pfu forming units) / ml, with about 99.5% being an insert. From 80,000 spots, screened, two positive clones 6 and Hael-5 were found. Clones were isolated, purified inserts (5.6 and 5.2 kb) were cloned into EcoRI-introduced pALK307. The clones also reacted with the phytase 15 serum KH1236. Inserts were restricted and a BamHI-Sphl restriction fragment of about 1 kb of the hybrid clones was detected (see Figure 4 Hybridization of the Phytase Sequence Clone Hae2-6, which contained a large portion of the 20 sequences encoding 15 internal tryptic peptides found at Napp terminus. The N-terminal and promoter region containing giclones were screened from a gene bank using Ink reverse PCR (Ochma), "Amplification of flanking sequences by PCR," in PCR Protocols, A Guide to Meth <♦ <RTI ID = 0.0> * * </RTI> Applications, Innis, MA, et al., Eds., Academic ss, San Diego, pp. 219-227 (1990).

• « * • i · »o * 30 3. 5' -pään amplif ikaatio ja fytaasigeei promoottorisekvenssi käänteis-PCR: 68 r• «* • i ·» o * 30 3.5 'end amplification and phytase gel promoter sequence reverse PCR: 68 r

käytettävät alukkeet olivat emäksiä fytaasisek alueilta 1243-1257 (antisense aluke) ja 1304-132 se aluke) (katso kuva 5) . Käänteis-PCR:ssä Sthe primers used were bases from the phytase regions 1243-1257 (antisense primer) and 1304-132 that primer) (see Figure 5). In reverse PCR, S

pilkottu ALKO 243 DNA:sta muodostui 1.2 kb:n PCR 5 350 bp:n PCR-fragmentti hybridisoituna käänte fragmenttiin ja kloonatun fragmentin sekvensoin vistivat, että se sisälsi fytaasigeenin yläp osia ja myös N-terminaalisen peptidisekvenssin.the digested ALKO 243 DNA was a 1.2 kb PCR 5,350 bp PCR fragment hybridized to the reverse fragment and the cloned sequence was found to contain the upper parts of the phytase gene as well as the N-terminal peptide sequence.

10 4. Kokonaisen fytaasigeenin eristäminer Käänteis-PCR:llä saatua 1.2 kb:n PCR-fr. tia käytettiin koettimena seulottaessa 80.000 1 joista identifioitiin seitsemän positiivista 1 15 Täydellinen fytaasigeeni eristettiin 6 kb faagi] insertillä.4. Isolator of the whole phytase gene 1.2 kb PCR fr obtained by reverse PCR. thi was used as a probe for screening 80,000 l of which seven positives were identified. The complete phytase gene was isolated with a 6 kb phage] insert.

Noin 2.4 kb:n Sphl-fragmentti, joka : fytaasigeenin ja promoottorialueen, kloonattiin 307:ään (katkaistu Sphl-entsyymillä), jolloin mu< 20 pALK169 (Kuva 4). Sphl-fragmentin sisältävän f] restriktiokartta ja fytaasigeenin paikka fragnu on esitetty plasmidikartassa.The 2.4 kb Sph1 fragment, which: the phytase gene and promoter region, was cloned into 307 (digested with Sph1), giving mu <20 pALK169 (Figure 4). The restriction map of f] containing the Sph1 fragment and the position of the phytase gene in the fragment are shown in the plasmid map.

Fytaasisekvenssi on esitetty kuvassa 5 . venssi, joka koodaa fytaasiproteiinia vastaa « «·The phytase sequence is shown in Figure 5. the gene encoding the phytase protein corresponds to «« ·

„e 25 gillus ficuumin fytaasisekvenssiä, joka on juJE 25 gillus ficuum phytase sequence, which is juJ

• *• *

Gist brocades (Delft, Netherlands) PCT-patenttihc sessa (EP420,358 tai W091/05053), jossa on 1 • · · johdetuissa aminohapoissa. Jokainen ero johd« \Λ\\ aminohapoissa johtui nukleotidin muutoksesta ja s :T: 30 johtua kantojen erosta. Myöskin rakennegeeniä 1 vassa sekvenssissä havaittiin 33 nukleotidieroa, 69 TAG) kahden sekvenssin välillä oli 96.3 % Eroava kahden fytaasisekvenssin välillä ; Gist-brocad Alkon, on esitetty taulukossa 5.Gist brocades (Delft, The Netherlands) in PCT Patent Publication No. EP420,358 or WO91 / 05053 which has 1 · · · derived amino acids. Each difference in amino acids results from a nucleotide change and s: T: 30 results from a difference in strains. Also, 33 nucleotide differences (69 TAG) between the two sequences in the structural gene 1 sequence were found to be 96.3% different between the two phytase sequences; Gist-brocad Alkon, is shown in Table 5.

• * « 4 « • ft · • ft ft ·· • ft • » • ft * • ft ft ft ν « • ft ft* • » • · ftftft « « ftftft ft ft ft ftftft ft ftft» tft * ft ft ft 70• * «4« • ft · • ft ft ·· • ft • »• ft * • ft ft ft« »ftftft« «ftftft ft ft ft ftftft ft ftft» tft * ft ft ft. 70

Taulukko 5. Gist’n ja Alkon fytaasien sekvenssien dien ja aminohappojen erot» : alueΛ- ;:. nt;no ah no : i Giist'n nt \ Alkon=nt i. Gistrn : -:--—= .—aa--, aa-a^=^^= SSSS3=S^^= 5 signaa- 39 (-7) CT G CT A Leu lisek- 40 (-6) T CT GCT Ser venssi_________ oletettu 59 (-) A G (-) introni 61 (-) A T (-) 65 (-) A T (-) 72 (-) A G (-) 85 (-) C T (-) 86 (-) C T (-) 88 <-) T G (-) __136 (-) T__A__(") 10 rakenne- 191 11 AGT ACT Ser geeni 210 17 CAG CAA Gin 258 33 GCA GCG Ala 287 43 GTC GCC Vai 300 47 GAG GAT Glu 312 51 GGA GGT Gly 369 70 GAC GAG Asp 419 87 GCG GTG Ala 369 91 GAC GAT Asp 501 114 G AA GAG Glu 549 127 CGG CGA Arg 565 136 GTT ATT Vai 570 137 CCA CCG Pro 613 152 AAG GAG Lys 624 155 ATC ATT Ile 669 170 CCC CCG Pro f\: 756 199 TTC TTT Phe 809 217 GTC GCC Vai : : 846 229 TCC TCT Ser 849 230 GGT GGC Gly 976 273 AAC CAC Asn .*·% 997 280 TTG CTG Leu • · « « 1 ! i Λ i I I — 1 * « * • t I M* * M·Table 5. Sequence and amino acid differences between Gist and Alko phytase sequences »: regionΛ;:. nt; no ah no: i Giist'n nt \ Alkon = nt i. Gistrn: -: --— =. — aa--, aa-a ^ = ^^ = SSSS3 = S ^^ = 5 signa- 39 ( -7) CT G CT A Leu lis- 40 (-6) T CT GCT Ser vein _________ presumed 59 (-) AG (-) intron 61 (-) AT (-) 65 (-) AT (-) 72 (-) AG (-) 85 (-) CT (-) 86 (-) CT (-) 88 <-) TG (-) __136 (-) T__A __ (") 10 construct- 191 11 AGT ACT Ser gene 210 17 CAG CAA Gin 258 33 GCA GCG Ala 287 43 GTC GCC Vai 300 47 GAG GAT Glu 312 51 GGA GGT Gly 369 70 GAC GAG Asp 419 87 GCG GTG Ala 369 91 GAC GAT Asp 501 114 G AA GAG Glu 549 127 CGG CGA Arg 565 136 GTT ATT Vai 570 137 CCA CCG Pro 613 152 AAG GAG Lys 624 155 ATC ATT Ile 669 170 CCC CCG Pro f \: 756 199 TTC TTT Phe 809 217 GTC GCC Vai:: 846 229 TCC TCT Ser 849 230 GGT GGC Gly 976 273 AAC CAC Asn. * ·% 997 280 TTG CTG Leu • · «« 1! I Λ i II - 1 * «* • t IM * * M ·.

Ja a • a 71 rakenne- 1005 282 AAG AAA Lys geeni 1008 283 TAT TAC Tyr (jatkoa) 1020 287 GGT GGC Gly 1083 308 CTG CTC Leu 1113 318 AGT AGC Ser 1125 322 ACT ACC Thr 5 1136 326 AGC AAC Ser 1140 327 CCG CCA Pro 1149 330 TTT TTC Phe 1182 341 TCG TCC Ser 1185 342 CAT CAC His 1188 343 GAC GAT Asp 1203 348 TCC TCT Ser 1206 349 ATT ATC Ile 10 1218 353 TTA TTG Leu 1245 362 CTA CTG Leu 1284 375 GGA GGG Gly 1321 388 TTG CTG Leu 1344 395 TGT TGC Cys 1350 397 GCG GCC Ala 1413 418 CCG CCA Pro , _ 1414 419 GTT ATT Vai 15 |_ 1499 I 447 TTT | TCT I PheAnd a 71 a construct- 1005 282 AAG AAA Lys gene 1008 283 TAT TAC Tyr (continued) 1020 287 GGT GGC Gly 1083 308 CTG CTC Leu 1113 318 AGT AGC Ser 1125 322 ACT ACC Thr 5 1136 326 AGC AAC Ser 1140 327 CCG CCA Pro 1149 330 TTT TTC Phe 1182 341 TCG TCC Ser 1185 342 CAT CAC His 1188 343 GAC GAT Asp 1203 348 TCC TCT Ser 1206 349 ATT ATC Ile 10 1218 353 TTA TTG Leu 1245 362 CTA CTG Leu 1284 375 GGA GGG Gly 1321 388 TTG CTG Leu 1344 395 TGT TGC Cys 1350 397 GCG GCC Ala 1413 418 CCG CCA Pro, _ 1414 419 GTT ATT Vai 15 | _ 1499 I 447 TTT | TCT I Phe

Taulukko 5. Gist'n ja Alkon fytaasien sek nukleotidi- ja aminohappoerot. Nukleotidinumerot on lasket ensimmäisestä metioniinistä Met (AUG) signaalisekven: aminohapponumerot N-terminaalin leusiinista Leu (katso Sekvenssien erilaiset aminohapot on kirjoitettu tummi 20 tekstillä.Table 5. Nucleotide and amino acid differences between Gist and Alko phytases. Nucleotide numbers are calculated from the first methionine Met (AUG) signal sequence: amino acid numbers from the N-terminal leucine Leu (see Different amino acids in sequences written in dark 20 text).

♦ « V · 9 • ♦* • * 25 :»··* B. Plasmidien konstruointi fytaasin yl • · **. tämiseksi Trichoderma Teeseissä ♦ · » ' • t • » «·« j ϊ*; 1. PCR- fragment it tarkkoihin cbhl-fyte t*!*! 30 fuusioihin * 4 72 et ai., Bio/Technology 1:691-696 (1983)). Kuvas esitetty PCR-fragmenteille käytettävät alukkeet 171:n (fytaasisignaalisekvenssi) konstruointiin tiin SacII kohtaa cbhl promoottorialueella 5'-PC 5 keessa. XhoI- kohtaa (14 nukleotidia fytaasige< päästä) käytettiin 3'-alukkeessa. 5'- aluke < meeri, joka sisälsi 19 nukleotidin "hännän" cb moottorisekvenssistä (edeltäen signalisekvenssia nukleotidiä fytaasisignaalisekvenssistä. 3'-ali 10 22-meeri. pALK172:n fcbhl signaalisekvenssi) k oinnissa käytettiin Sfil-kohtaa cbhl-signaalis sissä 5'-alukkeessa ja fytaasin Sali-kohtaa (7 leotidiä N-päästä) 3'-alukkeessa. Tässä tapaukse aluke oli 46-meeri, joka sisälsi 28 nukleotidin 15 ja 18 nukleotidiä fytaasin N-paän sekvenssist aluke oli 24-meeri. Kaikkiin alukkeisiin li kolmesta viiteen ylimääräistä nukleotidiä PCR-fr tien päihin restriktiokohtasekvenssien jälkeen tamaan oikea katkaisu. pALK169:ä käytettiin temp 20 na PCR-reaktioissa.♦ «V · 9 • ♦ * • * 25:» ·· * B. Construction of plasmids by phytase yl • · **. to fulfill the Trichoderma Theses ♦ · »'• t •» «·« j ϊ *; 1. PCR fragments it for exact cbhl-fyte t *! *! 30 fusions * 4 72 et al., Bio / Technology 1: 691-696 (1983)). Figure shows primers for construction of PCR fragments 171 (phytase signal sequence) was constructed at SacII site in the cbh1 promoter region in the 5 'PC 5 lane. The XhoI site (14 nucleotides from the phytase gene) was used in the 3 'primer. The 5 'primer <mer containing 19 nucleotides of the "tail" cb motor sequence (preceded by a signal sequence from the phytase signal sequence. 3'-sub102-mer. PALK172 fcbhl signal sequence) was constructed by using the Sfil-5b cis sh1 cis in the primer and the Sali site of the phytase (7 leukides at the N-terminus) in the 3 'primer. In this case, the primer was 46-mer, which contained 28 nucleotides 15 and 18 nucleotides of the phytase N-terminal sequence, the primer was 24-mer. For all primers, three to five additional nucleotides at the ends of the PCR fragments after restriction site sequences to provide proper cleavage. pALK169 was used as temp 20 na in PCR reactions.

PCR-reaktioissa saatiin odotetun p fragmentit: halutun fuusion sisältävä fragmentti 71:llä oli 202 bp ja pALK172:lla 800 bp.The PCR reactions yielded the expected β fragments: the fragment containing the desired fusion had 71 bp and 800 bp for pALK172.

*.**: 25 2. cbhl promoottorin omaavan plasmidin ··· ruointi: pALK171 (fytaasisignaalisekver \j ja pALK172 (cbhl signaalisekvenssi) * * « * e·· : ··; Plasmidi pALKl70L tehtiin katkaisemal 30 taasigeeni pALK169:stä Sphl-Xhol-fragmenttina j< toimalla se Sphl-Xhol:llä katkaistuun pALK307:ää 73 ettei PCR-amplifikaatiossa ollut tapahtunut vi Fytaasifragmentti, joka sisälsi fuusion, eris Sphl (käsitelty T4 DNA polymeraasilla)- Sacll fr tina ja lisättiin cbhl-promoottorin ja plasmid: 5 110:n, joka aiemmin oli hajotettu Ndel:llä (li DNA polymeraasin I Klenow fragmentilla) ja Sac päätösalueiden väliin. Saatu plasmidi (pALKl713 7) sisältää fytaasigeenin tarkasti fuusioitune promoottoriin. pALK171:n konstruoimiseksi, amdE 10 (valikoitavissa oleva leima) eristettiin p3;*. **: 25 2. Feeding of the plasmid with the cbhl promoter ···: pALK171 (phytase signal sequence and pALK172 (cbhl signal sequence)) * * * * · Plasmid pALKl70L was made by cleavage of 30 recombinant pALK169 genes in Sph. As an XhoI fragment by working with SphI-XhoI-cleaved pALK307 73, no phytase fragment containing the fusion Eris SphI (treated with T4 DNA polymerase) was present in the PCR amplification - Sac11 and the cbhl promoter and Plasmid were added: 5,101, previously cleaved between NdeI (the Klenow fragment of DNA polymerase I) and the Sac terminus, The resulting plasmid (pALK177 7) contains a phytase gene fused to the promoter, to construct pALK171, an selectable label was isolated. p3;

SphI-Kpnl fragmenttina, loppupäät käsiteltiin polymeraasilla, jonka jälkeen amdS ligatoitiin 17IX;n (käsitelty T4 DNA polymeraasilla) Sphl k< Noin 7.5 kb lineaarinen fragmentti, joka ei sis^ 15 bakteeriperäisiä sekvenssejä, eristettiin pALKAs a SphI-Kpn1 fragment, the ends were treated with polymerase, followed by amdS ligation with a SphI k <17 7.5 (treated with T4 DNA polymerase) of a linear fragment containing no bacterial sequences, isolated with pALK.

katkaisemalla Xbal:llä ja sitä käytettiin trans: tioihin.cleavage with Xbal and it was used for transitions.

pALK172 konstruoitiin oleellisesti ! tavoin kuin pALK171 (katso kuva 8). 800 bp:n PCI 20 mentti katkaistiin Sali:llä ja ligatoitiin Xl (täydennettynä DNA polymeraasi I Klenow fragmenl Sali:llä katkaistuun pALK170L:ään. Myöskin täs pauksessa fuusiot ja PCR-fragmenttien sekvenssi kastettiin sekvensoimalla. Fytaasi-PCR fragmentti 25 eristettiin pALK170S:stä Sphl (käsitelty T4 DNA j :*’*! raasilla)-SfiI fragmenttina ja ligatoitiin pAMH; *·.; joka oli katkaistu Ndel- (täydennettynä DNA pölyn /·“» I Klenow fragmentilla)-Sfil:llä. pALK172:n konst] seksi fragmentti, joka sisälsi amdS geenin, liqat f # * *r|/ 30 pALK172S:ään samalla tavoin kuin konstruoitaesse ' 171:tä. Myös tässä tapauksessa käytettiin Xbal:t L· a ί eama a n τγλ1γ+· λτ»ϊ e+ a f t'anp f Anna af ί λι osa lra.mf f> 74pALK172 was constructed essentially! like pALK171 (see Figure 8). The 800 bp PCI 20 ment was cleaved with SalI and ligated with X1 (supplemented with DNA polymerase I Klenow fragmentmenl SalI cleaved pALK170L. Also, fusions and PCR fragment sequence were dipped by sequencing. Phytase PCR fragment 25 was isolated from pALK170. Sph1 (treated with T4 DNA j: * '* Rase) -SfiI fragment and ligated with pAMH; * ·; which had been cleaved with NdeI (supplemented with DNA dust / Klenow fragment) -SfiI. ] sex fragment containing the amdS gene, liqat f # * * r | / 30 to pALK172S in the same way as constructing '171. In this case too, Xbal's L · a ί eama an τγλ1γ + · λτ ϊ e + af t'anp f Anna af ί λι osa lra.mf f> 74

3. Fytaasipromoottorin sisältävien plaj konstruointi:pALK173A ja pALK173B3. Construction of plaques containing the phytase promoter: pALK173A and pALK173B

Fytaasigeeni, jolla oli oma promoottori 5 tettiin Sphl-fragmenttina pALKl69:stä ja liga p3SR2:n Kpnl kohtaan (kummassakin tapauksessa f tin päät oli täydennetty T4-polymeraasilla), mik ti noin 11.2 kb:n plasmidit pALK173A ja pALK173B kuvasta 4 pALK169:n ja kuvista 7 ja 8 p3SR2:n k 10 pALK173A:ssa kaksi geeniä, fytaasi ja amdS ovat suuntaisessa asemassa, pALK173B:ssä ne ovat vas sissa asemissa (Kuva 9). EcoRI:stä käytetti nearisoimaan pALK173A ja pALK173B, kun käytettj nearisoituja plasmideja transformaatioissa.The phytase gene with its own promoter was inserted as a Sph1 fragment from pALK169 and the Kpn1 site of Liga p3SR2 (in both cases, the fti ends were complemented with T4 polymerase), the approximately 11.2 kb plasmids pALK173A and pALK173B16 in Figure 4. and Figures 7 and 8 in pALS172A of p3SR2, the two genes, phytase and amdS, are in the upstream position, in pALK173B they are in the opposite position (Figure 9). EcoRI was used to unpolarize pALK173A and pALK173B when using unpolarized plasmids in transformations.

15 C. Trichoderma reesein transformointi transformanttien seulonta T. reesei ATCC56765-? ALKO 233- ja ALK 20 kantoihin transformoitiin rengasmainen plasmic Xbal-fragmentit plasmideista pALK171 ja pALK172 promoottori). T. reesei ALKO 233 ja 2221 kai transformoitiin myös linearisoidut pALK171 ja j plasmidit kuin myös rengasmaiset ja lineaariset % *1 25 73A ja pALK173B (fytaasipromoottori) plasmidit.15 C. Transformation of Trichoderma reesei Screening for Transformants T. reesei ATCC56765-? The circular plasmic Xba I fragments from pALK171 and pALK172 promoter were transformed into strains ALKO 233 and ALK 20. The linearized pALK171 and j plasmids as well as the circular and linear% * 12573A and pALK173B (phytase promoter) plasmids were also transformed with T. reesei ALKO 233 and 2221.

««I«« I

·,„· formaatio frekvenssi (transformantity^g DNA) v<·, “· Format frequency (transformantity ^ g DNA) v <

*'· 3: s ta 60:een, kun käytettiin pALK171:stä tai pALI* '· 3 to 60 when using pALK171 or PALI

ta eristettyjä transformantteja. Kun transformaat • «*· käytettiin pALK171 tai pALK172 rengasmaisia plass u» « 30 frekvenssit olivat noin 50/μg T. reesei ALKO 233 ALKO 2221:lie ja noin 100/μq T. reesei ATCC567* 75 4.5%:sta 13.2 %:iin T. reesei ALKO 233 ja AL kannoille ja oli 1-2% T. reesei ATCC56765 kan: Taulukossa 6 on esitetty niiden transf tien määrä, jotka seulottiin fytaasia maljalla 5 vista transformanteista. Ne kloonit, jotka tu sinisen halorenkaan pesäkkeen ympärille, määri positiivisiksi klooneiksi.isolated transformants. When transformants were used, the frequencies of pALK171 or pALK172 annular plasmas were about 50 / μg T. reesei ALKO 233 for ALKO 2221 and about 100 / μq T. reesei ATCC567 * 75 from 4.5% to 13.2%. T. reesei for ALKO 233 and AL strains and 1-2% of T. reesei ATCC56765 kan: Table 6 shows the number of transfections screened for the transformants from the phytase plate. The clones that surrounded the blue halo ring colony defined as positive clones.

• » • m · • ·1 ♦ · • 1 0 · · ♦ · m · « 0 · • ··· • 1 • 1 ·· # • m • 1 0 «·» « • 1« • 1 · • 00 0 76• »• m · • · 1 ♦ · • 1 0 · · ♦ · m ·« 0 · • ··· • 1 • 1 ·· # • m • 1 0 «·» «• 1« • 1 · • 00 0 76

Taulukko 6. Malja-analyysissä positiiviset transformantit ja testattujen k: _onien kokonaismääräTable 6. Positive transformants and total number of k-ions tested in plate analysis

SBSBBSBSSaSBSSSBSBBqsaSSSS^BSSBBaBBySBBaB^BBSSIBSBdSBBBaeBBaBBSBSBBSBSSaSBSSSBSBBqsaSSSS ^ ^ BSSBBaBBySBBaB BBSSIBSBdSBBBaeBBaBB

PALK171 fragmentti 49% (47/96) 46% (33/71) 23% (15/6 rengasmainen plasmi- di 35% (6/17) 23% (5/22) 32% (22/6 lineaarinenPALK171 fragment 49% (47/96) 46% (33/71) 23% (15/6 annular plasmid 35% (6/17) 23% (5/22) 32% (22/6 linear)

plasmidi 41% (29/71) 49% (27/55)__NDplasmid 41% (29/71) 49% (27/55) __ ND

PALK172 fragmentti 47%(48/103) 30%(34/113) 11% (8/7 rengasmainen plasmi-PALK172 fragment 47% (48/103) 30% (34/113) 11% (8/7 annular plasma

di 17% (4/23) 13% (2/15) 12%(12/1Cdi 17% (4/23) 13% (2/15) 12% (12 / 1C

lineaarinenlinear

plasmidi 37% (22/59) 24% (11/45)__NDplasmid 37% (22/59) 24% (11/45) __ ND

PALK173APALK173A

rengasmainen plasmidi 75% (9/12) 70% (14/20) NDannular plasmid 75% (9/12) 70% (14/20) ND

lineaarinenlinear

plasmidi 67% (10/15) 64% (14/22)__NDplasmid 67% (10/15) 64% (14/22) __ ND

pALK173B rengasmainen plasmidi 40% (4/10) 63% (15/24) NDpALK173B annular plasmid 40% (4/10) 63% (15/24) ND

, . lineaarinen,. linear

**.*·: plasmidi 63% (10/16) 67% (8/12) ND**. * ·: Plasmid 63% (10/16) 67% (8/12) ND

·«» • · ’···' Taulukko 6. Malja-analyysissä positiivis ,\s transformantit ja testattujen kloonien kokonaismäärTable 6. Positive, \ s transformants and total number of clones tested in plate analysis

Taulukossa on esitetty malja-analyysissä positiivist transformanttien lukumäärä ja malja-analyysissä f : taasiaktiivisuuden suhteen testattujen transforman :·|β: tien kokonaislukumäärää. Vain ne transformantit :T: esitetty, jotka kasvoivat hyvin valintavinopinnoil ja malja-analyysissä. Positiivisia fytaasin tuottaj katsottiin olevan niiden kantojen, jotka selkeäs : osoittivat fvtaasiaktiivisuutta malia-analvvsissä.The table shows the number of positive transformants in the plate assay and the total number of transformants tested for f reactivation: · β in the plate assay. Only those transformants: T: shown, which grew well in choice studies and plate analysis. Positive phytase producers were considered to be strains that showed clear phytase activity in Malia analogues.

7777

Niitä transformantteja, jotka näyttivät parhaita tuotajiamaljalla, kasvatettiin raviste oissa. Siirrosteet otettiin joko suoraan ase vinopinnoilta tai PD-vinopinnoilta konidioista 5 tamisen jälkeen. Kannoista T. reesei ATCC5676! 233 ja ALKO 2221, jotka oli transformoitu pALK ja pALKl72:sta saaduilla fragmenteilla, 7:stä kloonia jokaisesta transformointisetistä puhdis ja fytaasin tuotto testattiin ravistelukasvatu 10 Kun transformaatioissa käytettiin rengasmaisia deja pALK171 tai pALK172, 13 ja 12 puhdistettua esei ATCC56765, ja neljästä seitsemään T. rees< 233 ja ALKO 2221 transformanttikantaa kasvatetti käytettiin linearisoituja pALKl71 tai pALK172 pl 15 ja noin 20 transformanttikantaa jokaisesta kasva ravisteluastioissa. T. reesei ALKO 233 -kloo; jotka oli transformoitu lineaarisella pALK!73A/] mideilla, seitsemän pALK173A ja kaksi pALK17 rengasmaisista plasmideista neljä pALK173A ja 20 pALK173B) transformanttia, jotka osoittivat fyti tiivisuutta maljoilla, puhdistettiin ja tes1 ravistelukasvatuksissa. T. reesei ALKO 2221-tr< mänteillä ravistelukasvatuksissa testatut vaj ; määrät olivat seuraavat: lineaarisilla plasm,The transformants that looked the best on the producer dish were grown in shakes. Inoculations were taken either directly from the inclined surfaces or from the inclined PD surfaces after conidia. Strains of T. reesei ATCC5676! 233 and ALKO 2221 transformed with pALK and fragments derived from pALK172, 7 clones from each transformation set were tested for purity and phytase production using a shake culture 10 When transformed using the circular dots pALK171 or pALK172, 13 and 12 purified esses ATCC56765 and Rees <233 and ALKO 2221 transformant strains were grown using linearized pALK171 or pALK172 p15 and about 20 transformant strains each in growth shake dishes. T. reesei ALKO 233 strain; transformed with linear pALK? 73A /? mids, seven of the pALK173A and two pALK173A circular plasmids, four pALK173A and 20 pALK173B) transformants, which showed phytin activity on the plates, were purified and tes1 shake cultures. T. reesei Tested in ALKO 2221-tr piston shaker cultures; the quantities were as follows:

4 M4M

!..* 25 kolme pALK173A ja viisi pALK173B ja rengasiru *;·** plasmideilla kuusi pALK173A ja kuusi pALK173B tr< mänttiä.! .. * 25 three pALK173A and five pALK173B and ring chip *; · ** plasmids, six pALK173A and six pALK173B tr <pistons.

« · ♦ · ··· • · ; D. Trichoderma transformanttien fytaasi t*Yl 30 tuotto * * m 4 aC ^^r c at νΛ « * at Tr, Λ 78 S(sD-Qo-QQQQQ oo ° Q Ξ S D o ς^<η2Γ·ΐ2<·η — 22222 ntNM-ZdZlZ^ZfN ö V v 2 2 V V 2 ö«· ♦ · ··· • ·; D. Trichoderma Transformant Phytase t * Yl 30 Yield * * m 4 aC ^^ rc at νΛ «* at Tr, Λ 78 S {sD-Qo-QQQQQ oo ° Q Ξ SD o ς ^ <η2Γ · ΐ2 <· η - 22222 ntNM-ZdZlZ ^ ZfN ö V v 2 2 VV 2 ö

iSiS

B - f I § finOQ^Q^^Q^QQQ OOOOQOQQOQO o «n m o OOO ^[ϋ'ώ^ηΖίΛα^ν 222 r-rfTtm2rf22<^)2^ <n — — — Ό — — — <-λ § U0 .s 3 ° Q® 9SI2ÖQQQQ ^<n^^9<n95ovQ — μγοο^νμ9- 31 — 2 — 2 — (N22222 V 1t v V2niZZN2m ^10^22^^2^ ™ _ ’5Γ "cB - f I § finOQ ^ Q ^^ Q ^ QQQ OOOOQOQQOQO o «nmo OOO ^ [ϋ'ώ ^ ηΖίΛα ^ ν 222 r-rfTtm2rf22 <^) 2 ^ <n - - - Ό - - - <-λ § U0 .s 3 ° Q® 9SI2ÖQQQQ ^ <n ^^ 9 <n95ovQ - μγοο ^ νμ9- 31 - 2 - 2 - (N22222 V 1t v V2niZZN2m ^ 10 ^ 22 ^^ 2 ^ ™ _ '5Γ "c.

en Gen G

g a ovQ^floo^PS000 ScsSSDSQQt.QS - SSSSSSS^ ^<^2os2oooo2-222 V S v v2vZZnZv -vvvvvvv^ o> (Λ <jj g 5 J S £3££££££££3££££3££££££££££££££§ !s jd jd .2 iga ovQ ^ floo ^ PS000 ScsSSDSQQt.QS - SSSSSSS ^ ^ <^ 2os2oooo2-222 VS v v2vZZnZv -vvvvvvv ^ o> {Λ <jj g 5 JS £ 3 ££££££££ 3 ££££ 3 £ £££££££££££££! S jd jd .2 i

« i: OOOOOOOOOO OOOOOOOOOO OOOOOOO«I: OOOOOOOOOO OOOOOOOOOO OOOOOOO

« (-7 asrs-d-oor-oor-Om od'cr'aoo^oosooo <n 0 00 0 00 00 oo — 2 ^ 00 »η ιλ q a ιλ -ςτ n 00 vq rn ^ 00 in cn vd rn cn o — 0 '0 CL, V tn nf ηί rs" (N nf —' — " V <n <n <n ri ri rn r-ί nf of (N V — — — — —“ — — — .. 1 919 £1 9 99 ξ I i **··1 ¢2 p * » w § « 1· c3 ' ' -b 5 10 n (S m o (N _ 0 o , ^ r~ __ Ό — — mo — , , (- £ h-hO — <n — 1 — 5 t'· «0 (S ^ (N n — — vo^ooOn — —· (N f\| — — — • ,S H W<D<<U3<QWW D<<UQffluQW< OQ < < CD CQ ffi ffl > • · cd 999 g«(-7 asrs-d-oor-oor-Om od'cr'aoo ^ oosooo <n 0 00 0 00 00 oo - 2 ^ 00» η ιλ qa ιλ -ςτ n 00 vq rn ^ 00 in cn vd rn cn o - 0 '0 CL, V tn nf ηί rs "{N nf -' -" V <n <n <n ri ri rn r-ί nf of (NV - - - - - '- - - .. 1 919 £ 1 9 99 ξ I i ** ·· 1 ¢ 2 p * »w §« 1 · c3 '' -b 5 10 n {S mo {N _ 0 o, ^ r ~ __ Ό - - mo -,, (- £ h-hO - <n - 1 - 5 t '· «0 {S ^ {N n - - vo ^ ooOn - - · {N f \ | - - - •, SHW <D << U3 <QWW D << UQffluQW <OQ <<CD CQ ffi ffl> • · cd 999 g

9 9 9 O9 9 9 O

9 9 9 9 O9 9 9 9 O

9 9 9 <M9 9 9 <M

: : : « s * s S j 1 1 > 1 1 it1 ^ ^ ^::: «S * s S j 1 1> 1 1 it1 ^^^

<C1 Sf 1”3 — d N H — rd(N "d — -J fN<C1 Sf 1 ”3 - d N H - rd {N" d - -J fN

. .„, Ξ ._ < r~~ < t-- < r~~ < r- < t— <tj t-.__. . ", Ξ ._ <r ~~ <t-- <r ~~ <r- <t— <tj t -.__

. . , <u w ex— & — <U ex — Oh — <D CX— &— <U. . , <u w ex— & - <U ex - Oh - <D CX— & - <U

• · · w ··· s «f 4 Ϊ-Η · · ΓΠ Λ Λ Γ _.• · · w ··· s «f 4 Ϊ-Η · · ΓΠ Λ Λ _.

7979

Parhaalla transformanti11a saatiin no: PNU/ml. Käyttämällä T. reesei ALKO 233- ja ALI kantoja saatiin suunnilleen sama tuottoaste, fytaasia tuottava T. reesei ATCC56765 transfo 5 tuotti noin 1,800 PNU/ml. Sekä fytaasi että cb naalisekvenssi näyttivät toimivan yhtä hyvin ; fytaasin tuottomäärä saatiin käyttämällä T. rees 2221:tä tai ATCC56765:tä isäntänä. T. reesei AL] :11a saadun fytaasin aktiivisuus oli korkeampi 10 täessä fytaasisignaalisekvenssiä.The best transformant 11a gave no: PNU / ml. Using T. reesei strains ALKO 233 and ALI yielded approximately the same degree of production, the phytase-producing T. reesei ATCC56765 transfo 5 produced approximately 1,800 PNU / ml. Both the phytase and the cb female sequence appeared to work equally well; phytase yield was obtained using T. Rees 2221 or ATCC56765 as host. The activity of the phytase obtained with T. reesei AL1 was higher at 10 in the phytase signal sequence.

Jotkut transformanteista eivät tuo mitään havaittavissa olevaa CBHI-proteiiniä, mi] todennäköisimmin osoittaa trasnformoitavan DNAm tymisen cbhl-lokukseen. CBHI-proteiinin puuttum: 15 vaikuttanut seulottujen transformanttien tuottoi esim. sekä normaalisti CBHI:tä tuottavien kui CBHI-negatiivisten transformanttien joukosta löy< hyviä tuottajia.Some of the transformants do not produce any detectable CBHI protein, which is most likely to indicate the transformation of the DNA to be transformed into the cbh1 locus. CBHI deficiency: The influenced screened transformants produced, for example, and among the normally CBHI producing non-CBHI negative transformants, there are good producers.

Parhaat fytaasin tuottotasot käytl 20 pALK171:n ja pALK172:n rengasmaista ja linei plasmidia on esitetty taulukossa 8. Parhaat tuotl not saatiin T. reesei ALKO 2221:llä, johon oli formoitu lineaarinen plasmidi pALK171 (fytaasii : lisekvenssi).The highest levels of phytase production using the circular and line plasmids of pALK171 and pALK172 are shown in Table 8. The best yields were obtained with T. reesei ALKO 2221, which has been formed with the linear plasmid pALK171 (phytase: additional sequence).

• ·· 25 : : ··· • · • ·• ·· 25:: ··· • · · ·

MM

• · · » · • · ··· « · ♦ · · • ♦ ♦ II· ·• · · »· • · ···« · ♦ · · • ♦ ♦ II · ·

Ml I · · • I I • 80Ml I · · • I I • 80

Taulukko 8. TtengaRmaigoiin tai lineaarisella plasmidilla pALK171 tai pALK172 transformoitujen T. reesej-kantojen fytaasin tuotto______ f PläBatidi- Transform •' · : \ flf ·':W8m -: Bittcytoi·. mäntti.'.'i f·'·' · ^116 ALKO 233 pALK171 rengasmai- C13 650 nen C23 530 C4 240 lineaarinen A22 1,610 A21 1,270 AI 7 1,180 pALK172 rengasmai- C13 1,360 nen C21 540Table 8. Phytase production of T. reesej strains transformed with TtengaRmaigos or with the linear plasmid pALK171 or pALK172______ f PlaBatid Transform • '·: \ flf ·': W8m -: Bittcytoi ·. pine. '.' i f · '·' · ^ 116 ALCO 233 pALK171 annular maize- C13 650 nen C23 530 C4 240 linear A22 1,610 A21 1,270 AI 7 1,180 pALK172 annular maize- C13 1,360 nen C21 540

Cl 500 lineaarinen A20 1,420 A27 1,330 ____A32__980 ALKO 2221 pALK171 rengasmai- C2 1,630 nen C8 1,290 C32 810 lineaarinen A14 3,800 A8 3,660 B14 3,610 pALK172 rengasmai- C3 480 nen C4 190 C6 170 * · ♦ · · \ * lineaarinen B18 2,060 ·/ A36 1,790 B9 1,390 1 TU ' *··] ATCC5- pALK171 rengasmai- A74 2,030 6765 nen A75 1,980 : Bll 1,870 t*« * it ! pALK172 rengasmai- B3 2,250 nen B23 1,970 B1 1,030 81Cl 500 linear A20 1,420 A27 1,330 ____A32__980 ALKO 2221 pALK171 annular maize- C2 1,630 nen C8 1,290 C32 810 linear A14 3,800 A8 3,660 B14 3,610 pALK172 annular maize- C3,480 nen C4 190 C6 170 * · ♦ · · \ *60 linear · 1,790 B9 1,390 1 TU '* ··] ATCC5- pALK171 ringasmai- A74 2,030 6765 nen A75 1,980: Bll 1,870 t * «* it! pALK172 ringasmai- B3 2,250 nen B23 1,970 B1 1,030 81

Myös A. niqer-fytaasipromoottori voi geenin ilmentymistä Trlchodermassa. Kuitenkin entsyymisaannot ovat paljon alhaisempia kuin cb moottorin, joka on homologinen T. reeseiille, 1 5 lessa: kasvatusliuossupernatanteista saadut, f oman promoottorin omaavan transformanttien akti det olivat noin l:stä noin 14:ään PNU/ml T. rees 233-transformanteilla ja noin 6:sta noin 120:een T. reesei ALKO 2221-transformanteilla (Taulukko 10 a · a 1 a a 1a • a : : • a» f · a a • a a • aa : : a aa • 1 # a a a a a a1 a · a·· a · a a a a a a 82The A. niqer phytase promoter can also express the gene in Trlchoderma. However, the enzyme yields are much lower than those of the cb engine homologous to T. reesei: Transformants from the culture supernatants having the promoter having their own promoter had from about 1 to about 14 PNU / ml with T. Rees 233 transformants and ca. From 6 to about 120 T. reesei with ALKO 2221 transformants (Table 10a · a 1 aa 1a • a:: • a »f · aa • aa •: aa • 1 # aaaaa a1 a · a · · A · aaaaaa 82

Taulukko 9. Rengasmaisella tai lineaarisella plas- midilla pALK173A tai pALK173B transformoitujen T. reesei-kantojen fy-__taasin tuotto __Table 9. Re-production of the phy -__ of T. reesei strains transformed with the circular or linear plasmid pALK173A or pALK173B

Kanta - ^lasmidi Plasmidi- Twuasfox^ II;ί:: ·v · Ϊtilli f liitp m•'•'^^iiiiuoto y^^ll 1P; mäntti;="· |i ί jllljl ALKO 233 pALK- rengasmai- C25 14.2 173A nen C29 6.6 C23 1.2 lineaarinen D4 8.8 D18 5.8 D6 3.9 pALK- rengasmai- C8 3.5 173B nen C6 < E10 < lineaarinen D13 5.5 ____D31__< ALKO 2221 pALK- rengasmai- E3 32.5 173A nen E5 31.7 C22 25.0 lineaarinen D24 37.5 D36 8.3 D17 5.8 .·. : pALK- rengasmai- Cl3 115.8 "· 173B nen C28 65.0 ·/**: C27 50.8 * «4 # e lineaarinen D9 36.7 D26 22.5 *···* D21 18.3 . f% ----- I » * ««· · '··. Taulukko 9. Rengasmaisella tai lineaarisella plasmidi *’ * pALK173A tai pALK1738 (fytaasipromoottori) transformoitujen reesei-transformanttien fytaasin tuotto. Taulukossa on esite . . transformanttien kasvatusliuossupernatanttien fytaasiaktiivisu 83 E. T. reesein tuottamien fytaasi-valmisteiden entsyymikoostumusKanta - ^ lasmidi Plasmidi- Twuasfox ^ II; ί :: · v · Ϊtilli f littp m • '•' ^^ iiiiuoto y ^^ ll 1P; pine; = "· | i ί jllljl ALKO 233 pALK- annular bag- C25 14.2 173A nen C29 6.6 C23 1.2 linear D4 8.8 D18 5.8 D6 3.9 pALK- annular bag- C8 3.5 173B nen C6 <E10 <linear D13 5.5 ____ D31 __ <ALKO 2221 - annular- E3 32.5 173A nen E5 31.7 C22 25.0 linear D24 37.5 D36 8.3 D17 5.8. ·.: pALK- annular- Cl3 115.8 "· 173B nen C28 65.0 · / **: C27 50.8 *« 4 # e linear D9 36.7 D26 22.5 * ··· * D21 18.3. f% ----- I »*« «· · '··. Table 9. Phasease production of reesei transformants transformed with annular or linear plasmid * '* pALK173A or pALK1738 (phytase promoter). The table contains a brochure. . phytase activity of transformant broth supernatants 83 enzyme composition of phytase preparations produced by E. T. reesei

Fytaasia ilmentyy T. reesei-kannoissa 5 määriä ja entsyymiaktiivisuuksien koostumus T. transformanttien supernatanteissa on erilaine Aspergillus-supernatanteissa (Taulukko 7). Seki glukanaasi- että sellobiohydrolaasiaktiivisuudi oleellisesti korkeampia käytettäessä T. reesei 10 tuottoisantänä verrattuna A» niqer-kantaan. Käyt reesei-kannat tuottivat myös suhteessa vähemmän amylaasiaktiivisuutta kuin A. niqer ALKO 243-kai F. Trichoderma-trans formanttien tuottai 15 fytaasiproteiiniPhytase is expressed in 5 volumes in T. reesei strains and the composition of enzyme activities in the supernatants of T. transformants is different in Aspergillus supernatants (Table 7). Both glucanase and cellobiohydrolase activity were substantially higher when used as T. reesei 10 as a production host compared to the A? Niqer strain. Useful reesei strains also produced relatively less amylase activity than A. phytase protein produced by A. niqer ALKO 243-cat F. Trichoderma trans formants.

Transformanttien (ALK171 fragmentti) transformoitujen T. reesei-kantoien ATCC56765, A ja ALKO 2221 kasvatusliuosnäytteet analysoitiin i 20 blot-analyysillä (Kuva 10). Seuraavat näyttee lysoitiin: Vyöhyke 1: 50 ng puhdistettua Aspe: ALKO 243-fytaasia; Vyöhyke 2: 15 ng endoF-käsMedia samples of transformed T. reesei strains ATCC56765, A and ALKO 2221 of transformants (ALK171 fragment) were analyzed by i blot analysis (Figure 10). The following sample was lysed: Zone 1: 50 ng purified Aspe: ALKO 243 phytase; Zone 2: 15 ng endoF hand

Aspergillus ALKO 243-fytaasia; Vyöhykkeet 3 ja ; reesei ALKO 233; Vyöhykkeet 4-5 ja 11-12: T»_ V.: 25 ALKO 233 transformantti 171FR/ A4 ja A13, vasta.Aspergillus ALKO 243 phytase; Zones 3 and; reesei ALKO 233; Lanes 4-5 and 11-12: T: 25 ALKO 233 transformant 171FR / A4 and A13, cont.

Vyöhykkeet 6 ja 13: T. reesei ALKO 2221; Vyöhyke 8 ia 14-15: T. reesei ALKO 2221 transformantti 1' 5,,.: ja A9, vastaavasti; Vyöhyke 9: T. reesei ALKO 2; !#! · ansformantti D2; Vyöhyke 16: T. reesei ATCC5676! *T: 30 hykkeet 17, 18, 19: T. reesei ATCC56765 transfoi 171FR/A21, Ali, ja A23, vastaavasti. Jokaisessa 1 ft M A Mmm Λ . . 1 1. A M · _ _ i- * * M 1 Jaaaa-MMaa m. m ^ . —a X. «3 _ 1 . 1 Λ 1^1 m. m a 84 kosylaatiotasoilla. T. reesei ALKO 233 kannan t fytaasi oli näkyvissä Western blot-analyysissä ja T. reesei ALKO 2221 kannan erittämä 6 - 9 pä iinijuovana, joiden koko oli noin 45-65 kDal, 5 alhaisin vastaa kooltaan deglykosyloitua Aspe fytaasia (45-48 kDal SDS-PAGE:ssa). T. reesei ATi kannan erittämä fytaasi oli kooltaan 65-80 k muodostui kolmesta viiteen proteiinijuovasta. N< Aspergillus fytaasin molekyylipaino SDS-PAGE: 10 noin 80-85 kDal. Transformantin, joka oli transfi PALK172 fragmentilla tai pALK173A/B:llä, tuot proteiinilla oli samankaltainen juovanmuodostus.Zones 6 and 13: T. reesei ALKO 2221; Lane 8 and 14-15: T. reesei ALKO 2221 transformant 1.5 'and A9, respectively; Zone 9: T. reesei ALCO 2; ! #! · Ansformant D2; Zone 16: T. reesei ATCC5676! * T: 30 lanes 17, 18, 19: T. reesei ATCC56765 transfected 171FR / A21, Ali, and A23, respectively. Each 1 ft M A Mmm Λ. . 1 1. A M · _ _ i- * * M 1 Jaaaa-MMaa m. M ^. —A X. «3 _ 1. 1 Λ 1 ^ 1 m. M a 84 at cosylation levels. The t-phytase of T. reesei ALKO 233 strain was visible by Western blot and the 6 to 9 end lines secreted by T. reesei ALKO 2221 strain of about 45-65 kDal, the lowest being the deglycosylated Aspe phytase (45-48 kDal SDS). -PAGE C.). The phytase secreted by the T. reesei ATi strain was 65-80k composed of three to five protein bands. N? Aspergillus Phytase Molecular Weight SDS-PAGE: 10 about 80-85 kDal. The protein produced by the transformant transfected with the PALK172 fragment or pALK173A / B had similar banding.

Johtopäätökset 15Conclusions

Aspergillus fytaasin tuottotaso käytei T. reesei-kantaa tuotto isäntänä, oli hämmästy korkea. Käyttämällä T. reeseitä, fytaasi tu< uudessa koostumuksessa, joka poikkeaa Aspergi^ 20 tuottamasta ja sisältää entsyymejä, jotka ovat ti rehusovellutuksissa. Aspergillus -fytaasiprot< joka on tuotettu Trichodermassa, molekyylipa erilainen kuin Aspergllluksen tuottaman» Tämä ] näytti johtuvan erilaisesta glykosylaatiosta, mi .*·«. 25 vaikuttanut entsyymiaktiivisuuteen.The level of production of Aspergillus phytase utilized T. reesei as the host for the production was astonished high. Using T. reesees, the phytase is produced in a novel composition different from that produced by Aspergi ^ 20 and contains enzymes found in feed applications. Aspergillus phytase prot produced in Trichoderma, a molecule different from that produced by Aspergillus »This] appeared to be due to a different glycosylation, mi. * ·«. 25 enzyme activity.

* « • · * • · • 9 ESIMERKKI 7.* «• · * • · • 9 EXAMPLE 7.

• 9• 9

Aspergillus niger pH 2.5 happofosfataas 9 9 9 ··· · tuotto Trichoderma reesei s sä ·«* — : 30Aspergillus niger pH 2.5 acid phosphatase 9 9 9 ··· · production in Trichoderma reesei · «* -: 30

Koejärjestelyt • ♦ 85 (1990); Stratagene, La Jolla, CA, USA) käy isäntinä valmistettaessa konstruktioita plasm pALK601 (kuvat 12 ja 13) ja pAP-1 (kuvat 12 j< Flasmidi pALKöOl sisältää T. reesein cbhl-promo 5 ja päätössekvenssit ja Aspergillus nldulans -a daasigeenin. Plasmid pAP-1 sisältää Asperqillu; var. awamori ALKO 243 (ATCC 38854) pH 2.5 happ taasigeenin.Experimental Arrangements ♦ 85 (1990); Stratagene, La Jolla, CA, USA) hosts the construction of the constructs pALK601 (Figures 12 and 13) and pAP-1 (Figures 12 and 5) The plasmid pALK610 contains the T. reesei cbhl-promoto 5 and the decision sequences and the Aspergillus nldulans -a plasmid. pAP-1 contains the Asperqillu; var. awamori ALKO 243 (ATCC 38854) pH 2.5 happ again gene.

Trichoderma reesei kantaa ALKO 2221, ;Trichoderma reesei strain ALKO 2221,;

10 alhainen aspartyyliproteaasimutantti, joka on j T. reesei -kannasta ALKO 233 (VTT-D-79125) U10 low aspartyl protease mutant from T. reesei strain ALKO 233 (VTT-D-79125) U

geneesillä, käytettiin pH 2.5 happofosfataas vastaanottajana.genesis, pH 2.5 was used as the receptor for the acid phosphatase.

15 2. Kasvatusalusta ja viljelyolosuhteet E. coli—kannat kasvatettiin L-alustalJ niatis, T., et ai., Molecular Cloning, A Lab< Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold 20 Harbor, NY, USA (1982)), joka tarvittaessa oli netty ampisiliinilla (50 μ9/αι1) . E. coli kasvi tehtiin 37°C lämpötilassa yön yli.2. Culture medium and culture conditions E. coli strains were grown on L-medium Niatis, T., et al., Molecular Cloning, A Lab <Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold 20 Harbor, NY, USA (1982)). if necessary, had been treated with ampicillin (50 μ9 / αι1). The E. coli plant was made at 37 ° C overnight.

PD-agarvinopintoja (Potato Dextrose-»PD Agarino Studies (Potato Dextrose- »

Difco, Detroit, Michigan, USA) käytettiin Trich< .***; 25 kantojen varastointiin. Maljat ja alustat, joi1 ** * *. : tettiin T. reesei transformaatioissa, olivat ki « «« --—-- .··] esitetty julkaisussa Penttilä et ai. (Penttil et ai., Gene 61:155-164 (1987)). Transformants *;!/ distettiin selektiivisellä asetamidi-CsCl-ali : 30 (Penttilä, M. et ai., Gene 61:155-164 (1987) siirtoa PD-vinopinnoille. T. reesei transfoj * * 86 3. DNA:n käsittely DNAin käsittely tehtiin kuten edellä < tetty fytaasille, pääasiasiassa standardimen 5 (Maniatis, T., et ai., Molecular Cloning, A Lab Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, ColdDifco, Detroit, Michigan, USA) was used Trich <. ***; 25 stocking. Bowls and trays, joi1 ** * *. were transformed by T. reesei, were reported in Penttilä et al. (Penttil et al., Gene 61: 155-164 (1987)). Transformants * were transfected with selective acetamide-CsCl ali: 30 (Penttilä, M. et al., Gene 61: 155-164 (1987)) onto sloping PD surfaces. T. reesei transf * * 86 3. DNA treatment DNA treatment was performed as above for phytase, mainly standard 5 (Maniatis, T., et al., Molecular Cloning, A Lab Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold

Harbor, NY, USA (1982)). Plasmidi-DNA E_._ eristettiin käyttäen Qiagen kolonneja (Diagei Dusseldorf, FRG) valmistajan ohjeen mukaan. El 10 plasmidi DNA:n nopeaan seulontaan käytettiin H ja Quigley'n menetelmää, (Holmes and Quigley, Biochem. 114:193-197 (1981)) RestriktioentsyynHarbor, NY, USA (1982)). Plasmid DNA E was isolated using Qiagen columns (Diagei Dusseldorf, FRG) according to the manufacturer's instructions. H and Quigley's method was used for rapid screening of E110 plasmid DNA (Holmes and Quigley, Biochem. 114: 193-197 (1981)).

DNA ligaasi, DNA polymeraasin I Klenow fragmentt DNA polymeraasi, joita käytettiin DNA:n käsitt 15 olivat Boehringeriltä (Mannheim, FRG) ja New Biolabsiltä (Beverly, MA, USA). Kutakin en käytettiin valmistajan suositusten mukaisesti. naukseen tai transformointiin käytettävät DNA-f tit eristettiin alhaisen sulamispisteen omaavil 20 roosigeeleiltä (FMC Bioproducts, Rockland, ME jäädytys-sulatus-fenolimenetelmallä (Benson, S.A Techni ques 2:66-68 (1984)) tai käyttämällä MDNA ligase, a Klenow fragment of DNA polymerase I, used for DNA purification from Boehringer (Mannheim, FRG) and New Biolabs (Beverly, MA, USA). Each one was not used according to the manufacturer's recommendations. DNA flasks used for digestion or transformation were isolated from low melting point rose gels (FMC Bioproducts, Rockland, ME by freeze-thaw phenol method (Benson, S.A. Techniques 2: 66-68 (1984)) or

Kit-pakkausta (BIO 101 Inc., La Jolla, CA, USA) tajän ohjeen mukaisesti.Kit (BIO 101 Inc., La Jolla, CA, USA) as directed by the person skilled in the art.

,···. 25 cbhl promoottorin ja pH 2.5 happ taasigeenin fuusion sekvensointi tehtiin pUC/Ml « ·· keiden ja monistusalukkeiden avulla käyttämäl /··* DyeDeoxy™ Terminator Cycle Sequencing Kit-pa: • ♦ 9, ···. Sequencing of the fusion of the 25 cbhl promoter and the pH 2.5 hap again gene was performed using pUC / Ml «·· and amplification primers using / ·· * DyeDeoxy ™ Terminator Cycle Sequencing Kit: • ♦ 9

Lt : (Applied Biosystems) ja automaattista sekvena< *«« : 30 (Applied Biosystems 373A, Foster City, CA, USA) Käytettävät oligonukleotidit synteti; • « . . __ _ _ . ___ 87 4. TransformaatiotLt: (Applied Biosystems) and Automatic Sequence <* ««: 30 (Applied Biosystems 373A, Foster City, CA, USA) The oligonucleotides used were synthesized; • «. . __ _ _. ___ 87 4. Transformations

Transformaatiot suoritettiin kuten aie esitetty fytaasilla. E. coli kantojen XLl-Blue t 5 transformaatio suoritettiin valmistajan men mukaisesti (Stratagene La Jolla, CA, USA), T. kantojen transformointi tehtiin olennaisesti P et ai. *n menetelmän mukaan (Penttilä, M-, et ai 61:155-164 (1987)). Novozym 234, jota käytetti 10 niprotoplastivalmisteissa oli Novo Industri AS penhagen, Denmark). Ennen itiöintiä PD-vinopi T. reesei transformantit puhdistettiin koni selektiivisellä asetamidialustalla.Transformations were performed as shown on the phytase. Transformation of E. coli strains XL1-Blue t5 was performed according to the manufacturer's (Stratagene La Jolla, CA, USA), T. strain transformation was performed essentially according to P et al. * (Penttilä, M-, et al., 61: 155-164 (1987)). Novozym 234 used in 10 niprotoplastics was Novo Industri AS penhagen, Denmark). Prior to sporulation, transformants of PD-vinopi T. reesei were purified on cone selective acetamide medium.

15 5. Entsyymiaktiivisuusanalyysi15 5. Enzyme activity assay

Entsyymianalyysiä varten myseeli ero kasvatusalustasta sentrifugoimalla 15 minuutt peudella 3,000 rpm (Sorvali SS-34, Dupont C 20 Wilmington, Delaware, USA). pH 2.5 happofos entsyymiaktiivisuus mitattiin kasvatusliuossupe: tista käyttämällä paranitrofenyylifosfaattia St. Louis, USA) substraattina kuten aiemmin on ki : Yksi pH 2.5 happofosfataasi aktiivisuusyksikkö ' ♦ «« *···] 25 taa 1 nmol epäorgaanista fosfaattia minuutissa Γ*. rofenyylifosfaattisubstraatista pH 2.5 lämpöi • # 37°C. Yksi happofosfataasi normalisoitu yksikkö • * *··* on määritelty määränä happofosfataasiaktiivi: « 9 !.: : jonka tuottaa A. niger ALKO 243-kanta käytetyisi »«« V : 30 vatusolosuhteissa (katso esimerkki 6, kappale 2)For enzyme analysis, mycelia differed from the culture medium by centrifugation for 15 minutes at 3,000 rpm (Sorvali SS-34, Dupont C 20 Wilmington, Delaware, USA). The pH 2.5 acid phospho enzyme activity was measured from a culture supernatant using paranitrophenyl phosphate (St. Louis, USA) as substrate as before: One pH 2.5 acid phosphatase activity unit '♦ «* · ·] 25 µl 1 nmol inorganic phosphate per minute Γ *. of rophenyl phosphate substrate pH 2.5 warms • # 37 ° C. One unit normalized to acid phosphatase • * * ·· * is defined as the amount of acid phosphatase active: «9!:: Produced by the A. niger strain ALKO 243 to be used» «« V: 30 under nutrition conditions (see Example 6, Section 2)

Amyloglukosidaasiaktiivisuus (AGU) mäi • · j- j i - i_ ** -λ. j.ams:i 1 u ία, i_ __ i . m - - Ί . ·* ... . |.Amyloglucosidase activity (AGU) decay • · j - j - i_ ** -λ. j.ams: i 1 u ία, i_ __ i. m - - Ί. · * .... |.

8888

Chemicals Codex, National Academy Press, Wash DC, USA, pp. 496-497 (1981)) käyttämällä 2% hemo nia (Sigma) substraattina. Endoglukanaasi- (I sellobiohydrolaasi- (FPU) aktiivisuudet mitattii 5 IUPAC'n ohjeessa Measurement of cellulase act (IUPAC Commission on Biotechnology, Measurem Cellulase Activities, Biochemical Engineering R Centre, Indian Institute of Technology, Delhi, pp. 5-7 and 10-11 {1981)). 1% hydroksietyyl 10 loosaa (Fluka AG) 50 mM Na-sitraattipuskurissa ( ja Whatman no. 1 paperia käytettiin substraa Käytettävä DNS erosi IUPAC'n Measurement of ce activities (IUPAC Commission on Biotechnology, M ment of Cellulase Activities, Biochemical Engi 15 Research Centre, Indian Institute of Technology, India, sivut 5-7 ja 10-11 (1984)) menetelmässä tystä ja tehtiin liuottamalla ensin 50.Og 2-hy 3,5-dinitrobentsoehappoa (Merck) 4 litraan deion vettä. Tämän jälkeen 80.Og NaOH lisättiin h 20 käyttäen magneettisekoittajaa ja l,500g K-Na-ta tia (Merck) lisättiin ja liuotettiin kuumen liuos (maksimilämpötila 45°C). Kokonaistilavui dettiin 5 litraan, liuos suodatettiin Whatman i ·’·,· läpi ja suojattiin valolta.Chemicals Codex, National Academy Press, Wash DC, USA, p. 496-497 (1981)) using 2% heme (Sigma) as substrate. Endoglucanase (I cellobiohydrolase (FPU) activities were measured by 5 IUPAC guideline Measurement of cellulase act, IUPAC Commission on Biotechnology, Measurem Cellulase Activities, Indian Institute of Technology, Delhi, pp. 5-7 and 10- 11 (1981)). 1% hydroxyethyl 10 lose (Fluka AG) in 50 mM Na citrate buffer (and Whatman no. 1 paper was used as substrate. The DNA used differed from the IUPAC Commission on Biotechnology, Ment. Of Cellulase Activities, Biochemical Engi 15 Research Center , Indian Institute of Technology, India, pp. 5-7 and 10-11 (1984)) and was made by first dissolving 50 g of 2-hy 3,5-dinitrobenzoic acid (Merck) in 4 liters of Deion water followed by 80 g of Ogon. NaOH was added over h 2 using a magnetic stirrer and 1.500 g of K-Na (Merck) was added and dissolved in a hot solution (maximum temperature 45 ° C). The entire volume was made up to 5 liters, filtered through Whatman, protected from light.

25 9 * ·"· 6. SDS-PAGE ja Western blot-analyysi * · « « « » i * /·** Natriumdodekyylisulfaatti-polyakryyl i · · '·" · geelielektroforeesi (SDS-PAGE) ja Western blot-ai V : 30 suoritettiin Laemmli'n menetelmien mukaisesti (Li U.K., Nature 227:680-685 (1970)) ja Towbin et ai « · 89 toimitti Kansanterveyslaboratorio (Helsinki, CBHI-proteiinin visualisointi pH 2.5 happofosf transformanteista Western blot-analyysissä hiiren monoklonaalisen vasta-aineen CI-261 (Ah< 5 ai., Eur, J. Biochem 200:643-649 (1991)) avulla toBlot™ lmmunosiirtojärjestelmän (Promega, M USA) anti-kani-IgG ja anti-hiiri-IgG emäksistä f tikonjugaattia ja värinmuodostussubstraatteja tiin immunokompleksien toteamiseen.6. SDS-PAGE and Western Blot Analysis * Sodium dodecylsulfate-polyacryl · · · · · · gel electrophoresis (SDS-PAGE) and Western blot : 30 were performed according to Laemmli methods (Li UK, Nature 227: 680-685 (1970)) and Towbin et al., 89 provided by Public Health Laboratory (Helsinki, CBHI visualization of pH 2.5 acid phosphate transformants by Western blot analysis of mouse monoclonal antibody). an anti-rabbit IgG and an anti-mouse IgG alkaline phono-conjugate using agent CI-261 (Ah <5 al., Eur, J. Biochem 200: 643-649 (1991)) and the toBlot ™ Immune Transfer System (Promega, M USA); color-forming substrates were provided for the detection of immune complexes.

1010

7. PCR7. PCR

PCR -reaktiot tehtiin Techne thermal PHC-2-laitteella (Techne Ltd., Cambridge, UK) li 15 tilavuudessa. Reaktioseokset sisälsivät 0.2 mM i dNTP (Pharmacia pH 8.3), 20 - 50 pmol kutakin a. ja 10 ng plasmiditemplaattia 10 mM Tris-puskuri:PCR reactions were performed on a Techne thermal PHC-2 (Techne Ltd., Cambridge, UK) in a volume of 15 volumes. Reaction mixtures contained 0.2 mM i dNTP (Pharmacia pH 8.3), 20-50 pmol each of a, and 10 ng of plasmid template in 10 mM Tris buffer:

8.3), 50 mM KC1, 1.5 mM MgCl2 ja 100 *ig/ml gelai Seuraavaa järjestelyä käytettiin: 96°C/ 10 mir 20 Taq DNA polymeraasin lisäystä (2 yksikköä, Boe] Mannheim, FRG) ja 100 μΐ parafiiniöljyä, denati 95°C / 1 min, lämmitys 60°C /1 min, monistus ' min 30 syklin ajan. Lopullinen monistusaika minuuttia juosteen synteesin varmistamiseksi. PCI8.3), 50 mM KCl, 1.5 mM MgCl 2 and 100 µg / ml Gelai The following arrangement was used: 96 ° C / 10 mir 20 Taq DNA polymerase addition (2 units, Boe] Mannheim, FRG) and 100 μΐ paraffin oil, denat 95 ° C / 1 min, heating at 60 ° C / 1 min, amplification 'min for 30 cycles. Final amplification time in minutes to confirm lane synthesis. PCI

« · .··*, 25 mentit puhdistettiin Mermaid™ Kit-pakkauksella.«·. ·· *, 25 blades were cleaned with Mermaid ™ Kit.

\ : mentin päät täytettiin käyttämällä DNA polymer « · φ.·/ Klenow fragmenttia.The ends of the \: ment were filled in using the DNA polymer · ·. / Klenow fragment.

ft m • Ψ « · tft m • Ψ «· t

·'·" : TULOKSET· '· ": RESULTS

·«· • · · A. Vektorikonstruktiot pH 2.5 happol 30 e 90 var. awamori ALKO 243 pH2.5 happofosfataasigeen signaalisekvenssinsä kanssa liitettynä Trie reesein ilmentymiskasettiin, joka sisältää cbl·: moottorin ja päätössekvenssit. pALK533 sisältä 5 Aspergillus nidulansin amdS-geenin transformantt lintaleimana.A. Vector constructs pH 2.5 acidol 30 e 90 var. awamori ALKO 243 pH2.5 linked to its acid phosphatase gene signal sequence in a Trie reesei expression cassette containing the cbl ·: engine and decision sequences. pALK533 contains 5 transformants of the AmdS gene of Aspergillus nidulans as a mammalian tag.

cbhl promoottorin ja pH 2.5 happofosf< signaalisekvenssin välinen fuusio tehtiin PCR:11 fragmenteille käytettävät alukkeet on esitetty ] 10 11. cbhl promoottorialueen SacII kohtaa käytetti alukkeessa ja happofosfataasigeenin MluI kohta nukleotidia alaspäin happofosfataasigeenin N-] käytettiin 3'-alukkeessa. 5'-aluke oli 39-meer: sisälsi cbhl promoottorisekvenssin signaaliseki 15 edeltävän 19 nukleotidin hännän, liittyneenä täsi happofosfataasin signaalisekvenssin 20 ensimi nukleotidiin. 3'-aluke oli pH 2.5 happofosfataasj 30-meeri. pAP-l:tä (Kuva 12) käytettiin templ< PCR-reaktioissa. PCR-reaktiossa saatiin odotetun 20 nen 466 bp:n fragmentti, 466 bp:n PCR-fragmentti, joka sisälsi happofosfataasin signaalisekvenssin, pilkottiin llä ja ligatoitiin pAF-l:een, joka oli pilkott diilillä, käsitelty DNA polymeraasi I Klenow fι 25 tiliä ja pilkottu MluI: llä plasmidi pl02:n saan • * (Kuva 15). Fuusio ja PCR-fragmentti sekvensc jotta varmistuttiin, ettei PCR-amplifikaatiossa . * *···* tapahtunut virheitä.A fusion between the cbh1 promoter and the pH 2.5 acid phospho signal sequence was made. The primers used for the PCR fragments are shown in Figure 11. The SacII site of the cbh1 promoter region was used in the primer, and the N pha N1 of the acid phosphatase gene was downlinked. The 5 'primer was 39-mer: contained the cbh1 promoter sequence signal sequence of the preceding 19 nucleotides of the tail, linked to the first 20 nucleotides of this acid phosphatase signal sequence. The 3 'primer was pH 2.5 acid phosphatase and 30 mer. pAP-1 (Figure 12) was used in templ <PCR reactions. The PCR reaction yielded the expected 206 bp 466 bp fragment, the 466 bp PCR fragment containing the acid phosphatase signal sequence, and ligated into pAF-1 digested with DNA, Klenow fι 25 DNA and plasmid digested with MluI to give p102 * (Figure 15). Fusion and PCR fragment sequences to ensure no PCR amplification. * * ··· * errors occurred.

: Plasmidi pALK533:n konstruoimiseksi (Km V · 30 pH 2.5 happofosfataasigeeni, joka sisälsi fi; eristettiin plasmidi pl02:sta Sphl (täydennetty * rtrt 1 * »n A Vt 3 n β -ί T VI A «A..* m mm am 4- J 1 1 m \ _ C a T T ««m 91 polymeraasl I Klenow fragmenttia. Transformaa käytettävä lineaarinen fragmentti erotettiin vek Xbal:llä.: Plasmid for construction of pALK533 (Km V · 30 pH 2.5 acid phosphatase gene containing fi; isolated from plasmid pl02 Sphl (amplified * rtrt 1 * »n A Vt 3 n β -ί T VI A« A .. * m mm am 4 µl of 1 µm C of TT polymerase Klenow fragment The linear fragment used for the transform was separated with Vek Xbal.

5 2. Plasmidin pALK532 konstruointi5 2. Construction of plasmid pALK532

Plasmidi pALK532 koostuu Aspergillus var, awamori ALKO 243 pH 2,5 happofosfaataasige joka on liitetty Trichoderma reesein CBHI ilme 10 kasettiin, joka sisältää cbhl promoottorin ja lisekvenssin ja päätössekvenssit. pALK532 s myös Aspergillus nidulansin amdS geenin transf tien valintaleimana.Plasmid pALK532 consists of Aspergillus var, awamori ALKO 243 pH 2.5 acid phosphatase ligated into a Trichoderma reesei CBHI expression 10 cassette containing the cbh1 promoter and additional sequence and decision sequences. pALK532 s also serves as a selection marker for the transduction of the Aspergillus nidulans amdS gene.

cbhl signaalisekvenssin ja pH 2.5 happ 15 taasigeenin fuusio tehtiin PCR:llä. PCR-fragme käytettävät alukkeet on esitetty kuvassa 11. Sf taa cbhl signaalisekvenssissä käytettiin 5;-aluk 5' -aluke oli 46-meeri, joka sisälsi 28 nukl hännän liittyneenä tarkasti happofosfataasln N-; 20 ensimmäiseen nukleotidiin. 3'-aluke oli sama 3 kuin pALK533 konstruktiossa. pAP-l:tä käytettii laattina PCR-reaktiossa. PCR-reaktiossa saatiin tun pituinen 418 bp:n fragmentti.The fusion of the cbh1 signal sequence and the pH 2.5 happ 15 gene was performed by PCR. The primers to be used for the PCR fragment are shown in Figure 11. The 5f primer used in the Sf ta cbh1 signal sequence was a 46-mer containing 28 nucleotides of the tail fused precisely to the acid phosphatase N-; 20 to the first nucleotide. The 3 'primer was the same as in the pALK533 construct. pAP-1 was used as a template in the PCR reaction. The PCR reaction yielded a 418 bp fragment of length.

; 418:n bp PCR-fragmentti, joka sisäls * *« 25 signaalisekvenssin pilkottiin MluI:llä ja liga pAP-l:een, joka oli hajotettu HindiII: 11a, kä; DNA polymeraasi I Klenow fragmentilla ja pilkott *«·* :llä plasmidi p51:n saamiseksi (Kuva 13), Fui • * : PCR-fragmentti sekvensoitiin sen varmistamiseksi ϊ 30 PCR-amplifikaation aikana ollut tapahtunut vi;; A 418 bp PCR fragment containing * * 25 signal sequence was digested with MluI and Liga pAP-1 digested with HindIII; DNA polymerase I with Klenow fragment and digested with * «· * to obtain plasmid p51 (Fig. 13), Fui *: PCR fragment was sequenced to confirm ϊ 30 vi amplifications during PCR amplification;

Plasmidi pALK532:n (Kuva 13) konstruoimiseksi, 92 fragmentilla ja hajotettu Sfil:llä. pALK532:st tettiin restriktioimalla Xbal;11a noin 7.8 kb li nen fragmentti, joka ei sisältänyt bakteerip sekvenssejä, jota fragmenttia käytettiin transfo 5 oihin.Plasmid for construction of pALK532 (Figure 13) with 92 fragments and digested with SfiI. pALK532 was made by restriction with Xba I a 7.8 kb fragment which did not contain bacterial sequences, which fragment was used for transfoins.

B. Trichoderma reesein transformointi transformanttien seulonta 10 Trichoderma reesei ALKO 2221 transfor erikseen plasmidien pALK532 ja pALK533 lineaa Xbal -fragmenteilla. Transformaatiofrekvenssi formantit / μ<$ DNA) vaihteli 2:sta 30:een.B. Transformation of Trichoderma reesei Screening for transformants Trichoderma reesei transforms ALKO 2221 separately with the Xba I fragments of plasmids pALK532 and pALK533. The transformation frequency (formants / μ <$ DNA) ranged from 2 to 30.

44 T. reesei ALKO 2221/pALK532 transfon 15 ja 103 pALK533 transformanttia puhdistettiin kon ta ja kasvatettiin ravistelukasvatusastioissa.44 transformants of T. reesei ALKO 2221 / pALK532 transfon and 103 pALK533 were purified and grown in shake flasks.

C. pH 2.5 happofosfataasin tuotto Tricl transformanttien avulla 20C. Production of pH 2.5 Acid Phosphatase by Tricl Transformants 20

Parhaat pH 2.5 happofosfataasia tu< transformantit on esitetty taulukossa 10. Paras < miaktiivisuustaso oli 240 APNU ravistelukasvati oissa laktoosipohjäisellä alustalla.The best pH 2.5 acid phosphatase transformants are shown in Table 10. The best level of activity was 240 APNU in shake cultures on lactose-based medium.

« · ««* f · 9 999 • 9 9 | 9 · f 999 I · V 9 999 9 9 9 9 9 9 9 9 999 9 M· 9 9 9 9 9 9 9 9 9 93 ö I e O M P-t ^ S ai CO Jd Ή«·« «* F · 9 999 • 9 9 | 9 · f 999 I · V 9 999 9 9 9 9 9 9 9 999 9 M · 9 9 9 9 9 9 9 9 9 93 ö I e O M P-t ^ S ai CO Jd Ή

M ^ MM ^ M

tn — ω ------o Q> έ ^+-1^ Ä' 9.2 - 1¾ « ^Oi-jpQQQQQQ O g g + l.g « «whZ222222 o E-» ^ w .¾ . » 2 S So fi Cö ϋ O OOOOqOqqOQ ^ g S *3tn - ω ------ o Q> έ ^ + - 1 ^ Ä '9.2 - 1¾ «^ Oi-jpQQQQQQ O g g + l.g« «whZ222222 o E-» ^ w .¾. »2 S So fi Cö ϋ O OOOOqOqqOQ ^ g S * 3

25 O OOffiCOÖJCOldSNS m o^.S25 O OOffiCOÖJCOldSNS m o ^ .S

ti to n^c*^Zio2Zu)Z £ ί -Sti to n ^ c * ^ Zio2Zu) Z £ ί -S

m 1 5 Sm 1 5 S

fi s p, :JS ^ r ~ .::¾ 00 (NCDWCOQ^QQhQ r-1 J-g '9 »Jf :¾ S « g:0«fi s p,: JS ^ r ~. :: ¾ 00 {NCDWCOQ ^ QQhQ r-1 J-g '9 »Jf: ¾ S« g: 0 «

·* ·::* 5J f±M CJ· * · :: * 5J f ± M CJ

m 9«, (J ^ li t -s £+2“ oo MNTTNflinflQofl CD Φ S — rt· w « ^ co z « 2 2 ^ 2 ^ S^E-t 8 2i§ ^ < T3 : .>"* j_» rt Ä 3 o 3m 9 «, (J ^ li t -s £ + 2" oo MNTTNflinflQofl CD Φ S - rt · w «^ co z« 2 2 ^ 2 ^ S ^ Et 8 2i§ ^ <T3:.> "* j_» rt Ä 3 o 3

::¾4 S M:: ¾4 S M

:::¾ + + +I+C+ + + +· ä «S -£ pu ,:S -_< WW^rtW^'rtW'rtWW 6 m 2«i3 ___λ > ϋ rsrr :fl td ;: B S Λ::: ¾ ++ ++ I + C ++ ++ · ä «S - £ pu,: S -_ <WW ^ rtW ^ 'rtW'rtWW 6 m 2« i3 ___ λ> ϋ rsrr: fl td ;: B S Λ

-¾ w OOOOOOOOOO rt .2 O-¾ w OOOOOOOOOO rt .2 O

. · * ..; P: . TfTiMrtCJrtOJOioro i-t m bO. · * ..; P:. TfTiMrtCJrtOJOioro i-t m bO

ΐ ψ. :1¾.¾ o (N <N (N M W W rt rt rtrt «M F ^ i‘“‘i li _ 1¾ ·. : ft ® ^ * *· ;w wcoeorteowMcoMN 2 ö 3 ... Ή Mrtcortnnwnnn ^'Sw • · · «a· in ιο m m tn in m m m tn ^w-j-ι : ... S φ ►JhdhdrtJj.Jrti.djjj φ «55ΐ ψ. : 1¾.¾ o {N <N {NMWW rt rt rtrt «MF ^ i '"' i li _ 1¾ ·.: Ft ® ^ * * ·; w wcoeorteowMcoMN 2 ö 3 ... Ή Mrtcortnnwnnn ^ 'Sw • · · «A · in ιο mm tn in mmm tn ^ wj-ι: ... S φ ►JhdhdrtJj.Jrti.djjj φ« 55

: : # «jcccccc^cc tccSS:: # «Jcccccc ^ cc tccSS

*;;.* : ft aftftftftftftftftft αm 9 .:. .0 1 ·*· rt <m ¢0 * :---::-':'.'.V______(β O rt cd ft a - _ d ft? 3 =t 0 fa g 5 94* ;;. *: ft aftftftftftftftftft αm 9 .:. .0 1 · * · rt <m ¢ 0 *: --- :: - ':'. '. V ______ {β O rt cd ft a - _ d ft? 3 = t 0 fa g 5 94

Sekä happofosfataasi- että cbhl-signa venssi toimivat yhtä hyvin ja suunnilleen sama happofosfataasiaktiivisuustaso saavutettiin. ] derma transformantti SC-9 tuotti parhaimman 5 happofosfataasiaktiivisuustason, joka oli no kertaa enemmän kuin natiivin Aspergillus nige awamori ALKO 243 kannan tuottama vastaavissa i teissä.Both acid phosphatase and cbhl-Signa acted equally well and approximately the same level of acid phosphatase activity was achieved. ] derma transformant SC-9 produced the best 5 levels of acid phosphatase activity, which was no more than that of the native Aspergillus Nige awamori strain ALKO 243 in the corresponding strains.

Kaksi yhdeksästä parhaasta tuottajäi 10 reagoinut monoklonaalisen CBHI vasta-aineen Western blot-analyysissä, mikä antaa olettaa ilmentymiskasetti oli liittynyt näiden kahden tr< mäntin cbhl lokukseen (Taulukko 10).Two of the nine top 10 producers responded by Western blot analysis of CBHI monoclonal antibody, suggesting that the expression cassette was associated with the cbhl locus of these two trp mins (Table 10).

15 D. T. reesein tuottamien pH 2.5 happo- fosfataasivalmisteiden entsyymikoos pH 2.5 happofosfataasi ilmentyy T. transformanteissa suurina pitoisuuksina ja T.15 pH 2.5 acid phosphatase preparations produced by D. T. reesei pH 2.5 acid phosphatase is expressed in high concentrations in T. transformants and T.

20 transformantei11a joidenkin muiden entsyymien a] suudet supernatanteissa poikkeavat Aspergillus st tanttien aktiivisuuksista (Taulukko 10). Sekä ei kanaasi- että sellobiohydrolaasiaktiivisuudet merkittävästi korkeammat käytettäessä tuottoi! « f 25 T. reesei'ta. T. reesei- trans formant it tuottivc a · .....The activity of some other enzymes in the supernatants differs from that of Aspergillus stants (Table 10). Both canase and cellobiohydrolase activities were significantly higher when used! «F 25 T. reesei'ta. T. reesei-trans formant it yields .....

\ ; suhteessa vähemmän glukoamylaasiaktiivisuutta kv • * · e...* niger ALKO 243-kanta.\; relative to less glucoamylase activity kv • * · e ... * niger ALKO 243 strain.

• Ψ • · » • « « « t ·· : E. Tr ichoderma-trans formant ti en tuettani • it — V * 30 pH2.5 happofosfataasin identifiointi ψ · • · ♦ 2 4« m ^ j ÄTt/Λ 95• Ψ • · »•« «« t ··: E. Trichoderma-trans formant ti en support • it - V * 30 pH2.5 identification of acid phosphatase ψ · • · ♦ 2 4 «m ^ j ÄTt / Λ 95

Trichoderma reesei ALKO 2221 transformanttien SC 31, KA-17, KB-44, KB-18, SB-4 ja KA-28 kasvatusl pernatantista (Kuva 14).Trichoderma reesei was grown from the supernatant of transformants SC 31, KA-17, KB-44, KB-18, SB-4 and KA-28 (Figure 14).

T. reesei -transformanttien erittämä 5 happofosfataasi havaittiin neljänä 50 - 66 kD:n iinijuovana. Tämä todennäköisesti johtuu erite 2.5 happofosfataasin proteiinin erilaisesta glyk< tioasteesta. Verrattuna Aspergillus niqer var. « ALKO 243-kannan (66 kD) tuottamaan pH 2.5 happi 10 taasin kokoon, suurin osa T. reesein tuottamista happofosfataasiproteiineista on pienempiä kuin gilluksen tuottamat.5 acid phosphatase secreted by T. reesei transformants was detected as four 50-66 kD lines. This is probably due to the different degree of glycation of the secreted 2.5 acid phosphatase protein. Compared to Aspergillus niqer var. At pH 2.5 produced by the ALKO 243 (66 kD) strain, most of the acid phosphatase proteins produced by T. reesei are smaller than those produced by gillus.

Kaikki viitteet sisällytetään tällä vi: sella. Kun keksintö on nyt täysin kuvattu, o 15 ammattimiehelle selvää, että suojapiiri voidaan t laajana ja vastavana sarjana konsentraatioita, p< rejä ja vastaavia, vaikuttamatta keksinnön tai i vellutusesimerkkien keksinnölliseen ajatuksee suojaan.All references are included with this vi. Once the invention has been fully described, it will be apparent to one skilled in the art that the scope of protection may be broad and corresponding to a range of concentrations, values, and the like without affecting the inventive concept of the invention or embodiments.

« t • * · • * »M 9 · 9 · • * • · * 9 9 99 • · ·· » 9 9 9 9* 9 9* 99· * 9 99 9 · 9 9 9 9 9 9 96«T • * · • *» M 9 · 9 · • * • · * 9 9 99 • · ·· »9 9 9 9 * 9 9 * 99 · * 9 99 9 · 9 9 9 9 9 9 96

SEKVENSSILISTAUSSequence Listing

(1) YLEISET TIEDOT: (i} HAKIJA: (A) NIMI: Roal Oy (B) KATU: Tykkimäentie 15 (C) KAUPUNKI: Rajamäki (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: (E) MAA: Finland (F) POSTINUMERO: FI-05200 (i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: NEVALAINEN, Helena K.M.(1) GENERAL INFORMATION: (i} APPLICANT: (A) NAME: Roal Oy (B) STREET: Tykkimäentie 15 (C) CITY: Rajamäki (D) STATE OR COUNTRY: (E) COUNTRY: Finland (F) POSTAL CODE: FI -05200 (i) INVENTOR: (A) NAME: NEVALAINEN, Helena KM

(B) KATU: 20/105-113 Stapleton Street (C) KAUPUNKI: Pendle Hill (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: NSW 2145 (E) MAA: Australia (F) POSTINUMERO: (i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: PALOHEIMO, Marja T.(B) STREET: 20 / 105-113 Stapleton Street (C) CITY: Pendle Hill (D) STATE OR COUNTY: NSW 2145 (E) COUNTRY: Australia (F) ZIP Code: (i) INVENTOR: (A) NAME: PALOHEIMO , Mary T.

: (B) KATU: Riekkopolku 5 • ftft (C) KAUPUNKI: Vantaa *;·*] (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: V*: (E) MAA: Finland :***: (F) POSTINUMERO: FI-014 50 ft · « · « • · * !·;·! (i) KEKSIJÄ: ‘ (A) NIMI: MIETTINEN-OINONEN, Arja S.K, (B) KATU: Latvatie 10 \:V (C) KAUPUNKI: Klaukkala (Dl OSAVALTIO TÄI LÄÄNI : 97 (i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: TORKKELI, Tuula K.: (B) STREET: Riekkopolku 5 • ftft (C) CITY: Vantaa *; · *] (D) STATE OR COUNTY: V *: (E) COUNTRY: Finland: ***: (F) POSTAL CODE: FI-014 50 ft · «·« • · *! ·; ·! (i) INVENTOR: '(A) NAME: MIETTINEN-OINONEN, Arja SK, (B) STREET: Latvatie 10 \: V (C) CITY: Klaukkala (Dl STATE TO COUNTY: 97 (i) INVENTOR: (A) NAME : TORKKELI, Tuula K.

(B) KATU: Koillisväylä 17 C 27 (C) KAUPUNKI: Helsinki (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: (E) MAA: Finland (F) POSTINUMERO: FI-00200 (i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: CANTRELL, Michael (B) KATU: 622 East B Street (C) KAUPUNKI: Moscow (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: Idaho (E) MAA: U.S.A.(B) STREET: Northeast Passage 17 C 27 (C) CITY: Helsinki (D) STATE OR COUNTRY: (E) COUNTRY: Finland (F) POSTAL CODE: FI-00200 (i) INVENTOR: (A) NAME: CANTRELL, Michael ( B) STREET: 622 East B Street (C) CITY: Moscow (D) STATE OR COUNTRY: Idaho (E) COUNTRY: USA

(F) POSTINUMERO: US-83843 (i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: PIDDINGTON, Cristopher (B) KATU: 736 N 70th Street (C) KAUPUNKI: Seattle (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: Washington (E) MAA: U.S.A.(F) ZIP code: US-83843 (i) INVENTOR: (A) NAME: PIDDINGTON, Cristopher (B) STREET: 736 N 70th Street (C) CITY: Seattle (D) STATE OR COUNTRY: Washington (E) COUNTRY: U.S.A.

(F) POSTINUMERO: US-98103 • m V*: (i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: RAMBOSEK, John A. ΐB) KATU: 7701 17th Avenue N.E.(F) POSTAL NUMBER: US-98103 • m V *: (i) INVENTOR: (A) NAME: RAMBOSEK, John A. ΐB) STREET: 7701 17th Avenue N.E.

;··\ (C) KAUPUNKI: Seattle /;;* (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: Washington :·: : (E) MAA: U.S.A.; ·· \ (C) CITY: Seattle / ;; * (D) STATE OR COUNTY: Washington: ·:: (E) COUNTRY: U.S.A.

: (F) POSTINUMERO: US-98115 ; (i) KEKSIJÄ: | .···. (A) NIMI: TURUNEN, Marja K.: (F) POSTIN NUMBER: US-98115; (i) INVENTOR: . ···. (A) NAME: TURUNEN, Marja K.

98 ΐ i) KEKSIJÄ: (A) NIMI: FAGERSTRÖM, Richard B.98 (i) INVENTOR: (A) NAME: FAGERSTRÖM, Richard B.

(B) KATU: Kielotie 18 A(B) STREET: Kielotie 18 A

(C) KAUPUNKI: Espoo (D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: (E) MAA: Finland {F) POSTINUMERO: FI-02260 (ii) KEKSINNöNNIMITYS: Fytaasia hajottavien entsyymie tuotto Trichoderman avulla ΐiii) SEKVENSSIEN LUKUMÄÄRÄ: 66 (iv) KIRJEENVAIHTO-OSOITE:(C) CITY: Espoo (D) STATE OR COUNTRY: (E) COUNTRY: Finland {F) POSTAL NUMBER: FI-02260 (ii) NAME OF THE INVENTION: Production of Phytase-Degrading Enzyme by Trichoderma ΐiii) NUMBER OF SEQUENCES: :

{A) VASTAANOTTAJA: Borenius & Co Oy Ab <B) KATU: Tallberginkatu 2 A{A) TO: Borenius & Co Oy Ab <B) STREET: Tallberginkatu 2 A

(C) KAUPUNKI: Helsinki (D) OSAVALTIO: (E) MAA: Finland (F) POSTINUMERO: FI-00180 (v) KONEKOODIMUOTO: (A) VÄLINETYYPPI: Levyke (B) TIETOKONE: IBM PC compatible(C) CITY: Helsinki (D) STATE: (E) COUNTRY: Finland (F) ZIP Code: FI-00180 (v) MACHINE CODE FORMAT: (A) TOOL TYPE: Diskette (B) COMPUTER: IBM PC compatible

V·: (C) KÄYTTÖJÄRJESTELMÄ: PC-DOS/MS-DOSV ·: (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS

(D) OHJELMISTO: Patentin Release #1.0, Version # * · * · · * · t .···[ (vi) NYKYISEN HAKEMUKSEN TIEDOT: !*·;’ (A) HAKEMUSNUMERO: (B) JÄTTÖPÄIVÄ: 0 : (C) LUOKITUS: ; (vii) ETUOIKEUSHAKEMUKSEN TIEDOT: (A) HAKEMUSNUMERO: US 07/923,724 99 (ix) TIETOLIIKENNEYHTEYSTIEDOT: ^ (A) PUHELIN: (B) TELEFAX: (2) SEKVENSSIN ID NO:l TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 2071 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen juoste (D) TOPOLOGIA: molemmat (ix) OMINAISPIIRRE:(D) SOFTWARE: Patent Release # 1.0, Version # * · * · · * · t. ··· [(vi) CURRENT APPLICATION DETAILS:! * ·; '(A) APPLICATION NUMBER: (B) SUBMISSION DATE: 0: ( (C) CLASSIFICATION:; (vii) PRIORITY APPLICATION INFORMATION: (A) APPLICATION NUMBER: US 07 / 923,724 99 (ix) TELECOMMUNICATION CONTACT INFORMATION: ^ (A) PHONE: (B) TELEFAX: (2) SEQUENCE ID NO: 1 DETAILS: (i) SEQUENCE ) LENGTH: 2071 base pairs (B) TYPE: Nucleic Acid (C) STRENGTH: Single strand (D) TOPOLOGY: Both (ix) FEATURES:

(A) NIMI/SELITYS: CDS(A) NAME / EXPLANATION: CDS

(B) SIJAINTI: väli(136..916, 971..1088, 11 1305..1737) (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:l: GCATGCTGGA CCGCAATCTC CGATCGCCGG GTATAAAAGG TCCTCCAAAC C 60 ... . CGATATGTAC CCCGCTCGTC ATCTCCAATC CTCTCGAGAG CACCTTCTCC A i2o * I I ♦ • »· * i(B) LOCATION: Field (136..916, 971..1088, 11 1305..1737) (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 1: GCATGCTGGA CCGCAATCTC CGATCGCCGG GTATAAAAGG TCCTCCAAAC C 60 .... CGATATGTAC CCCGCTCGTC ATCTCCAATC CTCTCGAGAG CACCTTCTCC A i2o * I I ♦ • »· * i

AATTGTACCT TCGCA ATG CCT CGC ACC TCT CTC CTC ACC CTG GCAATTGTACCT TCGCA ATG CCT CGC ACC TCT CTC CTC ACC CTG GC

·«· 171 « *· «· 171« *

!.· : Met Pro Arg Thr Ser Leu Leu Thr Leu AI!. ·: Met Pro Arg Thr Ser Leu Leu Thr Leu AI

»M»M

I · · * ♦ « 15 1 ft · lift loo Ί - TCA ACC CAG GAG AAG CAG TTC TCT CAG GAG TTC CGC GAT GGC 267I · · * ♦ «15 1 ft · lift loo Ί - TCA ACC CAG GAG AAG CAG TTC TCT CAG GAG TTC CGC GAT GGC 267

Ser Thr Gin Glu Lys Gin Phe Ser Gin Glu Phe Arg Asp Gly 30 35 40 ATC CTC AAG CAC TAC GGT GGT AAC GGA CCC TAC TCC GAG CG*) 315 lie Leu Lys His Tyr Gly Gly Asn Gly Pro Tyr Ser Glu Arg 45 50 55 TAC GGT ATC GCT CGC GAT CCC CCG ACC AGC TGC GAG GTC GA1 363Ser Thr Gin Glu Lys Gin Phe Ser Gin Glu Phe Arg Asp Gly 30 35 40 ATC CTC AAG CAC TAC GGT GGT AAC GGA CCC TAC TCC GAG CG *) 315 lie Leu Lys His Tyr Gly Gly Asn Gly Pro Tyr Ser Glu Arg 45 50 55 TAC GGT ATC GCT CGC GAT CCC CCG ACC AGC TGC GAG GTC GA1 363

Tyr Gly lie Ala Arg Asp Pro Pro Thr Ser Cys Glu Val Asp 65 70 ATC ATG GTC AAG CGT CAC GGA GAG CGC TAC CCG TCC CCT TCi 411 lie Met Val Lys Arg His Gly Glu Arg Tyr Pro Ser Pro Ser 80 85 90 AAG GAC ATC GAA GAG GCC CTG GCC AAG GTC TAC AGC ATC AAC 459Tyr Gly lie Ala Arg Asp Pro Pro Thr Ser Cys Glu Val Asp 65 70 ATC ATG GTC AAG CGT CAC GGA GAG CGC TAC CCG TCC CCT TCi 411 lie Met Val Lys Arg His Gly Glu Arg Tyr Pro Ser Pro Ser 80 85 90 AAG GAC ATC GAA GAG GCC CTG GCC AAG GTC TAC AGC ATC AAC 459

Lys Asp lie Glu Glu Ala Leu Ala Lys Val Tyr Ser lie Asn 95 100 105 , , GAA TAC AAG GGC GAC CTG GCC TTC CTG AAC GAC TGG ACC TAC • * # *· 507 • I» '...· Glu Tyr Lys Gly Asp Leu Ala Phe Leu Asn Asp Trp Thr Tyr 110 115 120 «*· * · « ·Lys Asp lie Glu Glu Ala Leu Ala Lys Val Tyr Ser lie Asn 95 100 105,, GAA TAC AAG GGC GAC CTG GCC TTC CTG AAC GAC TGG ACC TAC • * # * · 507 • I »'... · Glu Tyr Lys Gly Asp Leu Ala Phe Leu Asn Asp Trp Thr Tyr 110 115 120 «* · * ·« ·

Icct aat gag tgc tac tac aac gcc gag acc acc agc ggc ccc :7: 555Icct aat gag tgc tac tac aac gcc gag acc acc agc ggc ccc: 7: 555

Pro Asn Glu Cys Tyr Tyr Asn Ala Glu Thr Thr Ser Gly Pro . . 125 130 135 ιοί *| ^ GGC CAC CTC TGG AAC GGT GAG ACG GTC GTG CCC TTC TTT TC'] 651Pro Asn Glu Cys Tyr Tyr Asn Ala Glu Thr Thr Ser Gly Pro. . 125 130 135 ιοί * | ^ GGC CAC CTC TGG AAC GGT GAG ACG GTC GTG CCC TTC TTT TC '] 651

Gly His Leu Trp Asn Gly Glu Thr Vai Val Pro Phe Phe Ser 160 165 170 TAC GGA CGT GTC ATC GAG ACG GCC CGC AAG TTC GGT GAG GGI 699Gly His Leu Trp Asn Gly Glu Thr Vai Val Pro Phe Phe Ser 160 165 170 TAC GGA CGT GTC ATC GAG ACG GCC CGC AAG TTC GGT GAG GGI 699

Tyr Gly Arg Val lie Glu Thr Ala Arg Lys Phe Gly Glu Gly 175 180 185 GGC TAC AAC TAC TCC ACC AAC GCT GCC CTC AAC ATC ATC TCC 747Tyr Gly Arg Val lie Glu Thr Ala Arg Lys Phe Gly Glu Gly 175 180 185 GGC TAC AAC TAC TCC ACC AAC GCT GCC CTC AAC ATC ATC TCC 747

Gly Tyr Asn Tyr Ser Thr Asn Ala Ala Leu Asn Ile He Ser 190 195 200 GAG GTC ATG GGC GCG GAC AGC CTC ACG CCC ACC TGT GAC ACC 795Gly Tyr Asn Tyr Ser Thr Asn Ala Ala Leu Asn Ile He Ser 190 195 200 GAG GTC ATG GGC GCG GAC AGC CTC ACG CCC ACC TGT GAC ACC 795

Glu Val Met Gly Ala Asp Ser Leu Thr Pro Thr Cys Asp Thr 205 210 215 GAC CAG ACC ACC TGC GAC AAC CTG ACT TAC CAG CTG CCC CAG 843Glu Val Met Gly Ala Asp Ser Leu Thr Pro Thr Cys Asp Thr 205 210 215 GAC CAG ACC ACC TGC GAC AAC CTG ACT TAC CAG CTG CCC CAG 843

Asp Gin Thr Thr Cys Asp Asn Leu Thr Tyr Gin Leu Pro Gin 225 230 . . GTC GCT GCT GCC CGC CTA AAC TCC CAG AAC CCC GGC ATG AAC » » « • · 891 • •aAsp Gin Thr Thr Cys Asp Asn Leu Thr Tyr Gin Leu Pro Gin 225 230. . GTC GCT GCT GCC CGC CTA AAC TCC CAG AAC CCC GGC ATG AAC »» «• · 891 • • a

Val Ala Ala Ala Arg Leu Asn Ser Gin Asn Pro Gly Met Asn *·! 240 245 250 « * a · • « · i !*: GCA TCT GAT GTC TAC AAC CTG ATG G GTATGTGAT TACGGTACAA Ί *«· * 945 * a ♦Val Ala Ala Ala Arg Leu Asn Ser Gin Asn Pro Gly Met Asn * ·! 240 245 250 «* a · •« · i! *: GCA TCT GAT GTC TAC AAC CTG ATG G GTATGTGAT TACGGTACAA Ί * «· * 945 * a ♦

Ala Ser Asp Val Tyr Asn Leu Met » . 255 260 i 4 102 >| Ί CGT CCC TTC TCC AAC TGG ATC AAC GCC TTT ACC CAG GAC GAi 1044Ala Ser Asp Val Tyr Asn Leu Met ». 255 260 i 4 102> | Ί CGT CCC TTC TCC AAC TGG ATC AAC GCC TTT ACC CAG GAC GAi 1044

Arg Pro Phe Ser Asn Trp Ile Asn Ala Phe Thr Gin Asp Glu 270 275 280 AGC TTC GGT TAC GTT GAG GAT TTG AAC TAC TAC TAC TGC GCl 1089Arg Pro Phe Ser Asn Trp Ile Asn Ala Phe Thr Gin Asp Glu 270 275 280 AGC TTC GGT TAC GTT GAG GAT TTG AAC TAC TAC TAC TGC GCl 1089

Ser Phe Gly Tyr Vai Glu Asp Leu Asn Tyr Tyr Tyr Cys Ala 290 295 TGAGTTTACC ATTTGATCCA TTATTGTCTT GGATCAGCTA ACGATCGATA 1144 GGT GAC AAG AAC ATG GCT GCT GTG GGT GCC GTC TAC GCC AAC 1192Ser Phe Gly Tyr Vai Glu Asp Leu Asn Tyr Tyr Tyr Cys Ala 290 295 TGAGTTTACC ATTTGATCCA TTATTGTCTT GGATCAGCTA ACGATCGATA 1144 GGT GAC AAG AAC ATG GCT GCT GTG GGT GCC GTC TAC GCC AAC 1192

Gly Asp Lys Asn Met Ala Ala Vai Gly Ala Vai Tyr Ala Asn 305 310 315 CTC ACC CTC CTG AAC CAG GGA CCC AAG GAA GCC GGC TCC TTG 1240Gly Asp Lys Asn Met Ala Ala Vai Gly Ala Vai Tyr Ala Asn 305 310 315 CTC ACC CTC CTG AAC CAG GGA CCC AAG GAA GCC GGC TCC TTG 1240

Leu Thr Leu Leu Asn Gin Gly Pro Lys Glu Ala Gly Ser Leu 320 325 330Leu Thr Leu Leu Asn Gin Gly Pro Lys Glu Lower Gly Ser Leu 320 325 330

, AAC TT GTACGTTCTCG GCAGAATCAG AGTCTCACAA AAAGAAACTC TTC, AAC TT GTACGTTCTCG GCAGAATCAG AGTCTCACAA AAAGAAACTC TTC

1296 ♦ · *···* Asn Phe *1 335 «« « f f • « • «e1296 ♦ · * ··· * Asn Phe * 1 335 «« «f f •« • «e

ί TATAGTAG T GCC CAC GAC ACC AAC ATC ACC CCC ATC CTC GCCί TATAGTAG T GCC CAC GAC ACC AAC ATC ACC CCC ATC CTC GCC

Ala His Asp Thr Asn Ile Thr Pro Ile Leu Ala 1 i ♦ 340 345 103 11 GGC AAC CCC TAC TCG ATC GGC AAC ATC GTG CCC ATG GGT GGC 1440Ala His Asp Thr Asn Ile Thr Pro Ile Leu Ala 1 i ♦ 340 345 103 11 GGC AAC CCC TAC TCG ATC GGC AAC ATC GTG CCC ATG GGT GGC 1440

Gly Asn Pro Tyr Ser Ile Gly Asn Ile Val Pro Met Gly Gly 365 370 375 ACC ATC GAG CGT CTC AGC TGC CAG GCC ACC GCC CTC TCG GAC 1488Gly Asn Pro Tyr Ser Ile Gly Asn Ile Val Pro Met Gly Gly 365 370 375 ACC ATC GAG CGT CTC AGC TGC CAG GCC ACC GCC CTC TCG GAC 1488

Thr lie Glu Arg Leu Ser Cys Gin Ala Thr Ala Leu Ser Asp 385 390 ACC TAC GTG CGT CTG GTG CTG AAC GAG GCT GTA CTC CCC TTC 1536Thr lie Glu Arg Leu Ser Cys Gin Ala Thr Ala Leu Ser Asp 385 390 ACC TAC GTG CGT CTG GTG CTG AAC GAG GCT GTA CTC CCC TTC 1536

Thr Tyr Val Arg Leu Val Leu Asn Glu Ala Val Leu Pro Phe 400 405 410 TGC ACC TCC GGA CCG GGC TAC TCC TGC CCT CTG GCC AAC TAC 1584Thr Tyr Val Arg Leu Val Leu Asn Glu Ala Val Leu Pro Phe 400 405 410 TGC ACC TCC GGA CCG GGC TAC TCC TGC CCT CTG GCC AAC TAC 1584

Cys Thr Ser Gly Pro Gly Tyr Ser Cys Pro Leu Ala Asn Tyr 415 420 425 ATC CTG AAC AAG AAT CTG CCA GAC TAC ACG ACC ACC TGC AAT 1632 lie Leu Asn Lys Asn Leu Pro Asp Tyr Thr Thr Thr Cys Asn 430 435 440Cys Thr Ser Gly Pro Gly Tyr Ser Cys Pro Leu Ala Asn Tyr 415 420 425 ATC CTG AAC AAG AAT CTG CCA GAC TAC ACG ACC ACC TGC AAT 1632 lie Leu Asn Lys Asn Leu Pro Asp Tyr Thr Thr Cys Asn 430 435 440

, , GCG TCC TAC CCG CAG TAT CTG AGC TTC TGG TGG AAC TAC AAC,, GCG TCC TAC CCG CAG TAT CTG AGC TTC TGG TGG AAC TAC AAC

it· * · 1680 '...· Ala Ser Tyr Pro Gin Tyr Leu Ser Phe Trp Trp Asn Tyr Asn ’1·! 445 450 455 «·· » I I · ···it · * · 1680 '... · Ala Ser Tyr Pro Gin Tyr Leu Ser Phe Trp Trp Asn Tyr Asn' 1 ·! 445 450 455 «··» I I · ···

• ACG GAG CTG AAC TAC CGC TCT AGC CCT ATT GCC TGC CAG GAG• ACG GAG CTG AAC TAC CGC TCT AGC CCT ATT GCC TGC CAG GAG

•II 1 T. 1728 ► · ·• II 1 T. 1728 ► · ·

Thr Glu Leu Asn Tyr Arg Ser Ser Pro lie Ala Cys Gin Glu . 1 465 470Thr Glu Leu Asn Tyr Arg Ser Ser Pro lie Ala Cys Gin Glu. 1,465,470

104 H104 H

TTGATATTCA AGTTTGGTGG TGACGATCAC CTTGTTAATA GTCTTGTACA C 1837 GAATGTAAAT AATGATAATA GCAATGATAC ATGTTGGAAT CTCGTTTTGT Ί 1897 CATAGGCGCT TTGGGGGTGT ATTTTTAGGC GTTAGACTTA TTTTCAATTC C 1957 CGGTCAGTAA ATGAATCATC AATTATTCAA ATGCAATGCT GTATACGTGA fl 2017 TTAAGACGCA GCTACTAGCT,GACTGCTTGG TTACTTTCTG TGTACACCGC 2071 (2) SEKVENSSIN ID NO:2 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 479 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: lineaarinen (ii) MOLEKYYLITYYPPI: proteiini • 1 V·: (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO: 2: ««t • f • 4 4 4 !/·· Met Pro Arg Thr Ser Leu Leu Thr Leu Ala Cys Ala Leu Ala i 5 10 • 4« I · • 4 4 ϊTTGATATTCA AGTTTGGTGG TGACGATCAC CTTGTTAATA GTCTTGTACA C 1837 GAATGTAAAT AATGATAATA GCAATGATAC ATGTTGGAAT CTCGTTTTGT Ί 1897 CATAGGCGCT TTGGGGGTGT ATTTTTAGGC GTTAGACTTA TTTTCAATTC C 1957 CGGTCAGTAA ATGAATCATC AATTATTCAA ATGCAATGCT GTATACGTGA fl 2017 TTAAGACGCA GCTACTAGCT, GACTGCTTGG TTACTTTCTG TGTACACCGC 2071 (2) SEQ ID NO: 2 INFORMATION: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS : (A) LENGTH: 479 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECYL TYPE: protein • 1 V ·: (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 2: «« t • f • 4 4 4! / ·· Met Pro Arg Thr Ser Leu Leu Thr Leu Ala Cys Ala Leu Ala i 5 10 • 4 «I · • 4 4 ϊ

Ala Ser Ala Phe Ser Tyr Gly Ala Ala Ile Pro Gin Ser Thr • · · 20 25 30 · · lii Lys Gin Phe Ser Gin Glu Phe Arg Asp Gly Tyr Ser Ile Leu * · ·...· “ίς Art Ac.Ala Ser Ala Phe Ser Tyr Gly Ala Ala Ile Pro Gin Ser Thr • · · 20 25 30 · · lii Lys Gin Phe Ser Gin Glu Phe Arg Asp Gly Tyr Ser Ile Leu * · ... ... ς Art Art Ac.

105 1105 1

Arg His Gly Glu Arg Tyr Pro Ser Pro Ser Ala Gly Lys As 85 90Arg His Gly Glu Arg Tyr Pro Ser Pro Ser Ala Gly Lys As 85 90

Glu Ala Leu Ala Lys Val Tyr Ser lie Asn Thr Thr Glu Ty 100 105 11Glu Ala Leu Ala Lys Val Tyr Ser lie Asn Thr Thr Glu Ty 100 105 11

Asp Leu Ala Phe Leu Asn Asp Trp Thr Tyr Tyr Val Pro As 115 120 125 ’Asp Leu Area Phe Leu Asn Asp Trp Thr Tyr Tyr Val Pro As 115 120 125 '

Tyr Tyr Asn Ala Glu Thr Thr Ser Gly Pro Tyr Ala Gly Le 130 135 140Tyr Tyr Asn Ala Glu Thr Thr Ser Gly Pro Tyr Ala Gly Le 130 135 140

Ala Tyr Asn His Gly Asn Asp Tyr Lys Ala Arg Tyr Gly Hi 145 150 155Ala Tyr Asn His Gly Asn Asp Tyr Lys Ala Arg Tyr Gly Hi 145 150 155

Asn Gly Glu Thr Val Val Pro Phe Phe Ser Ser Gly Tyr G] 165 170Asn Gly Glu Thr Val Val Pro Phe Phe Ser Ser Gly Tyr G] 165 170

Ile Glu Thr Ala Arg Lys Phe Gly Glu Gly Phe Phe Gly T} 180 185 1«Ile Glu Thr Ala Arg Lys Phe Gly Glu Gly Phe Phe Gly T} 180 185 1 «

Ser Thr Asn Ala Ala Leu Asn lie lie Ser Glu Ser Glu V< 195 200 205 • ♦ · 4 1 • · .·2. Ala Asp Ser Leu Thr Pro Thr Cys Asp Thr Asp Asn Asp G] ·1» .·. : 210 215 220 • it • 1 • ·Ser Thr Asn Ala Ala Leu Asn lie lie Ser Glu Ser Glu V <195 200 205 • ♦ · 4 1 • ·. · 2. Ala Asp Ser Leu Thr Pro Thr Cys Asp Thr Asp Asn Asp G] · 1 ». ·. : 210 215 220 • it • 1 • ·

/2 Cys Asp Asn Leu Thr Tyr Gin Leu Pro Gin Phe Lys Vai AJ/ 2 Cys Asp Asn Leu Thr Tyr Gin Leu Pro Gin Phe Lys Vai AJ

:-· 2 225 230 235 • · 1 • · t «: - · 2 225 230 235 • · 1 • · t «

Arg Leu Asn Ser Gin Asn Pro Gly Met Asn Leu Thr Ala Se 2 245 250Arg Leu Asn Ser Gin Asn Pro Gly Met Asn Leu Thr Ala Se 2,245,250

Ml 41 2 • « 106 1 'Ml 41 2 • «106 1 '

Tyr Vai Glu Asp Leu Asn Tyr Tyr Tyr Cys Ala Gly Pro Gly 290 295 300Tyr Vai Glu Asp Leu Asn Tyr Tyr Tyr Cys Ala Gly Pro Gly 290 295 300

Asn Met Ala Ala Vai Gly Ala Val Tyr Ala Asn Ala Ser Leu 305 310 315Asn Met Ala Ala Vai Gly Ala Val Tyr Ala Asn Ala Ser Leu 305 310 315

Leu Asn Gin Gly Pro Lys Glu Ala Gly Ser Leu Phe Phe Asn 325 330Leu Asn Gin Gly Pro Lys Glu Lower Gly Ser Leu Phe Phe Asn 325 330

His Asp Thr Asn lie Thr Pro lie Leu Ala Ala Leu Gly Val 340 345 350His Asp Thr Asn lie Thr Pro lie Leu Ala Ala Leu Gly Val 340 345 350

Pro Asn Glu Asp Leu Pro Leu Asp Arg Val Ala Phe Gly Asn 355 360 365Pro Asn Glu Asp Leu Pro Leu Asp Arg Val Ala Phe Gly Asn 355 360 365

Ser lie Gly Asn lie Val Pro Met Gly Gly His Leu Thr lie 370 375 380Ser lie Gly Asn lie Val Pro Met Gly Gly His Leu Thr lie 370 375 380

Leu Ser Cys Gin Ala Thr Ala Leu Ser Asp Glu Gly Thr Tyr 385 390 395Leu Ser Cys Gin Ala Thr Ala Leu Ser Asp Glu Gly Thr Tyr 385 390 395

Leu Val Leu Asn Glu Ala Val Leu Pro Phe Asn Asp Cys Thr 405 410 • · « « « • · · • · .·"· Pro Gly Tyr Ser Cys Pro Leu Ala Asn Tyr Thr Ser lie Leu 420 425 430 • · 9 • · * * .···* Asn Leu Pro Asp Tyr Thr Thr Thr Cys Asn Val Ser Ala Ser ··· * 435 440 445 ·« · ♦ * · * * ·Leu Val Leu Asn Glu Ala Val Leu Pro Phe Asn Asp Cys Thr 405 410 • · «« «• · · •. ·" · Pro Gly Tyr Ser Cys Pro Leu Ala Asn Tyr Thr Ser lie Leu 420 425 430 • · 9 • · * *. ··· * Asn Leu Pro Asp Tyr Thr Thr Thr Cys Asn Val Ser Ala Ser ··· * 435 440 445 · «· ♦ * · * * ·

Gin Tyr Leu Ser Phe Trp Trp Asn Tyr Asn Thr Thr Thr Glu : 450 455 460 *«· 1 • · • » 107 1 (A) PITUUS: 17 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen juoste (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:3: TAYTAYGGNC AYGGNGC 17 (2) SEKVENSSIN ID NO:4 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 17 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen juoste (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:4: • · 4 • »4 • »Gin Tyr Leu Ser Phe Trp Trp Asn Tyr Asn Thr Thr Thr Glu: 450 455 460 * «· 1 • · •» 107 1 (A) LENGTH: 17 base pairs (B) TYPE: Nucleic Acid (C) STRENGTH: Single strand (D) ) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 3: TAYTAYGGNC AYGGNGC 17 (2) SEQ ID NO: 4 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 17 bp (B) ) STRENGTH: Simple strand (D) TOPOLOGY: Both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 4: • · 4 • »4 •»

:" CARGGNGTNG GNTAYGC: “CARGGNGTNG GNTAYGC

• ·* ·'. : 1 7 • ·♦ 1 9 • · M* * * (2) SEKVENSSIN ID NO:5 TIEDOT: • 4 «• · * · '. : 1 7 • · ♦ 1 9 • · M * * * (2) SEQ ID NO: 5 DETAILS: • 4 «

·« t S· «T S

4 4 4 • * · ’** ’ (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 20 emäsparia :.i.: (B) TYYPPI: nukleiinihappo ··· * fC) JUOSTEISUUS: yksinkertainen 108 (2) SEKVENSSIN ID NO:6 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 23 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:6: ATGATGCAAA ATCAAGCTGA ACA 23 (2) SEKVENSSIN ID NO:7 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 2363 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat (ix) OMINAISPIIRRE:4 4 4 • * · '**' (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 20 base pairs: .i .: (B) TYPE: nucleic acid ··· * fC) SPECTACY: Simple 108 (2) SEQ ID NO: : 6 DATA: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 23 base pairs (B) TYPE: Nucleic Acid (C) JURITY: Simple (D) TOPOLOGY: Both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 6 23 (2) SEQ ID NO: 7 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 2363 base pairs (B) TYPE: Nucleic Acid (C) JURITY: Simple (D) TOPOLOGY: Both (ix) FEATURES:

(A) NIMI/SELITYS: CDS(A) NAME / EXPLANATION: CDS

: (B) SIJAINTI: väli(404. .447, 550..1906) • aa • a a aa • a "*! (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:7: a a a • ·: (B) LOCATION: space (404 .447, 550..1906) • aa • a aa • a "*! (Xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 7: a a • ·

|··;: CATCCAGGCA CCCTTTCCCA ACGGGGGAAC TTCCGTTGTC CACGTGCCCI| ·· ;: CATCCAGGCA CCCTTTCCCA ACGGGGGAAC TTCCGTTGTC CACGTGCCCI

: 60 * a · • a a a · · • ATCAAAGCGT CCCACGGCAA TGCTGGATCA ACGATCAACT TGAATGCAAI 120 • a a • · · • a • a a 109 1 CCATTGCACG TGGGCCACCT TTGTGAGCTT CTAACCTGAA CTGGTAGAGT 300 ATGCGAAAGT GGGATGAAGG GGTTATATGA GGACCGTCCG GTCCGGCGCG 360 CTGCCAATCG CTGCTGTGCA AGAAATTTCT TCTCATAGGC ATC ATG G( 41560 * a · • a a · • ATCAAAGCGT CCCACGGCAA TGCTGGATCA ACGATCAACT TGAATGCAAI 120 • A A • · · • a • a a 109 1 CCATTGCACG TGGGCCACCT TTGTGAGCTT CTAACCTGAA CTGGTAGAGT 300 ATGCGAAAGT GGGATGAAGG GGTTATATGA GGACCGTCCG GTCCGGCGCG 360 CTGCCAATCG CTGCTGTGCA AGAAATTTCT TCTCATAGGC ATC ATG G (415

Met Gl GCT GTT CTA CTT CCT TTG TAT CTC CTA GCT GG GTATGCTAJ 457Met Gl GCT GTT CTA CTT CCT TTG TAT CTC CTA GCT GG GTATGCTAJ 457

Ala Val Leu Leu Pro Leu Tyr Leu Leu Ala Gly 5 10 15 CACCGGTATC TAAGTCTGAT AAGGACCCTC TTTGCCGAGG GCCCCTGAAG 517 GTGGGACTAC TGATCGCTGA CAATCTGTGC AG A GTC ACC TCC GGA 568Ala Val Leu Leu Pro Leu Tyr Leu Leu Ala Gly 5 10 15 CACCGGTATC TAAGTCTGAT AAGGACCCTC TTTGCCGAGG GCCCCTGAAG 517 GTGGGACTAC TGATCGCTGA CAATCTGTGC AG A GTC ACC TCC GGA 568

Val Thr Ser Gly no ^ GGT TGC AGA GTC ACT TTC GCT CAG GTC CTC TCC CGT CAT GC 760Val Thr Ser Gly no ^ GGT TGC AGA GTC ACT TTC GCT CAG GTC CTC TCC CGT CAT GC 760

Gly Cys Arg Vai Thr Phe Ala Gin Val Leu Ser Arg His GL· 70 75 80 TAT CCG ACC GAG TCC AAG GGC AAG AAA TAC TCC GCT CTC ΑΊ 808Gly Cys Arg Vai Thr Phe Ala Gin Val Leu Ser Arg His GL · 70 75 80 TAT CCG ACC GAG TCC AAG GGC AAG AAA TAC TCC GCT CTC ΑΊ 808

Tyr Pro Thr Glu Ser Lys Gly Lys Lys Tyr Ser Ala Leu 11< 90 95 ATC CAG CAG AAC GTG ACC ACC TTT GAT GGA AAA TAT GCC ΤΊ 856Tyr Pro Thr Glu Ser Lys Gly Lys Lys Tyr Ser Ala Leu 11 <90 95 ATC CAG CAG AAC GTG ACC ACC TTT GAT GGA AAA TAT GCC ΤΊ 856

He Gin Gin Asn Val Thr Thr Phe Asp Gly Lys Tyr Ala Phi 105 no 11: ACA TAC AAC TAC AGC TTG GGT GCA GAT GAC CTG ACT CCC Tr 904He Gin Gin Asn Val Thr Thr Phe Asp Gly Lys Tyr Ala Phi 105 no 11: ACA TAC AAC TAC AGC TTG GGT GCA GAT GAC CTG ACT CCC Tr 904

Thr Tyr Asn Tyr Ser Leu Gly Ala Asp Asp Leu Thr Pro Phi 120 125 130 CAG GAG CTA GTC AAC TCC GGC ATC AAG TTC TAC CAG CGA T1 952 : Gin Glu Leu Val Asn Ser Gly lie Lys Phe Tyr Gin Arg Ty: λ/ 135 140 145 • « >»· • t • · · ’· CTC ACA AGG AAC ATC ATT CCG TTC ATC CGA TCC TCT GGC T< • #· 1000 :.: : Leu Thr Arg Asn Ile He Pro Phe Ile Arg Ser Ser Gly Se: :T: 150 155 160 . .·. GTG ATC GCC TCC GGC GAG AAA TTC ATT GAG GGC TTC CAG A< .···. 1048 • ♦Thr Tyr Asn Tyr Ser Leu Gly Ala Asp Asp Leu Thr Pro Phi 120 125 130 CAG GAG CTA GTC AAC TCC GGC ATC AAG TTC TAC CAG CGA T1 952: Gin Glu Leu Val Asn Ser Gly lie Lys Phe Tyr Gin Arg Ty: λ / 135 140 145 • «>» · • t • · · '· CTC ACA AGG AAC ATC ATT CCG TTC ATC CGA TCC TCT GGC T <• # · 1000:.:: Leu Thr Arg Asn Ile He Pro Phe Ile Arg Ser Ser Gly Se:: T: 150 155 160. . ·. GTG ATC GCC TCC GGC GAG AAA TTC ATT GAG GGC TTC CAG A <. ···. 1048 • ♦

Λ A AΛ A

m V1 GTG GTC ATT TCC GAG GCC AGO TCA TCC AAC AAC ACT CTC Gl 1144m V1 GTG GTC ATT TCC GAG GCC AGO TCA TCC AAC AAC ACT CTC Gl 1144

Vai Vai Ile Ser Glu Ala Ser Ser Ser Asn Asn Thr Leu Asj 200 205 210 ACC TGC ACT GTC TTT GAA GAC AGC GAA TTG GCC GAT ACC G1 1192Or Vai Ile Ser Glu Ala Ser Ser Ser Asn Asn Thr Leu Asj 200 205 210 ACC TGC ACT GTC TTT GAA GAC AGC GAA TTG GCC GAT ACC G1 1192

Thr Cys Thr Vai Phe Glu Asp Ser Glu Leu Ala Asp Thr Va! 215 220 225 AAT TTC ACC GCC ACG TTC GCC CCC TCC ATT CGT CAA CGT Cl 1240Thr Cys Thr Vai Phe Glu Asp Ser Glu Leu Ala Asp Thr Va! 215 220 225 AAT TTC ACC GCC ACG TTC GCC CCC TCC ATT CGT CAA CGT Cl 1240

Asn Phe Thr Ala Thr Phe Ala Pro Ser Ile Arg Gin Arg Lei 230 235 240 GAC CTG TCT GGC GTG ACT CTC ACA GAC ACA GAA GTG ACC Tl 1288Asn Phe Thr Ala Thr Phe Ala Pro Ser Ile Arg Gin Arg Lei 230 235 240 GAC CTG TCT GGC GTG ACT CTC ACA GAC ACA GAA GTG ACC Tl 1288

Asp Leu Ser Gly Vai Thr Leu Thr Asp Thr Glu Vai Thr Tyi 250 255 GAC ATG TGC TCC TTC GAC ACC ATC TCC ACC AGC ACC GTC Gl 1336Asp Leu Ser Gly Vai Thr Leu Thr Asp Thr Glu Vai Thr Tyi 250 255 GAC ATG TGC TCC TTC GAC ACC ATC TCC ACC AGC ACC GTC Gl 1336

Asp Met Cys Ser Phe Asp Thr Ile Ser Thr Ser Thr Vai As] . . 265 270 27JAsp Met Cys Ser Phe Asp Thr Ile Ser Thr Ser Thr Vai As]. . 265 270 27J

• t · * ·· * * • ·# CTG TCC CCC TTC TGT GAC CTG TTC ACC CAT GAC GAA TGG A^ 1384 *·· ·...· Leu Ser Pro Phe Cys Asp Leu Phe Thr His Asp Glu Trp Il< I.:’;' 280 285 290 • · · * · · « » · GAC TAC CTC CAG TCC CTG AAA AAA TAC TAC GGC CAT GGC GC 1432 • · · .···, Asp Tyr Leu Gin Ser Leu Lys Lys Tyr Tyr Gly His Gly Al< ··» ΛΛ — * A _ _ _ _ 112 ^ CGT CTC ACC CAC TCG CCT GTC CAC GAT GAC ACC AGC TCC Aj 1528• t · * ·· * * • · # CTG TCC CCC TTC TGT GAC CTG TTC ACC CAT GAC GAA TGG A ^ 1384 * ·· · ... · Leu Ser Pro Phe Cys Asp Leu Phe Thr His Asp Glu Trp Il < I .: ';' 280 285 290 • · · * · · «» · GAC TAC CTC CAG TCC CTG AAA AAA TAC TAC GGC CAT GGC GC 1432 • · ·. ···, Asp Tyr Leu Gin Ser Leu Lys Lys Tyr Tyr Gly His Gly Al < ·· »ΛΛ - * A _ _ _ _ 112 ^ CGT CTC ACC CAC TCG CCT GTC CAC GAT GAC ACC AGC TCC Aj 1528

Arg Leu Thr His Ser Pro Val His Asp Asp Thr Ser Ser As 330 335 TTG GAC TCG AAC CCA GCT ACC TTC CCG CTC AAC TCT ACT Cf 1576Arg Leu Thr His Ser Pro Val His Asp Asp Thr Ser Ser As 330 335 TTG GAC TCG AAC CCA GCT ACC TTC CCG CTC AAC TCT ACT Cf 1576

Leu Asp Ser Asn Pro Ala Thr Phe Pro Leu Asn Ser Thr Le 345 350 35 GAC TTT TCC CAC GAT AAC GGC ATC ATC TCT ATC CTC TTT G< 1624Leu Asp Ser Asn Pro Ala Thr Phe Pro Leu Asn Ser Thr Le 345 350 35 GAC TTT TCC CAC GAT AAC GGC ATC ATC TCT ATC CTC TTT G <1624

Asp Phe Ser His Asp Asn Gly He lie Ser He Leu Phe Al 360 365 370 CTG TAC AAC GGC ACT AAG CCG CTG TCT ACC ACG ACC GTG G 1672Asp Phe Ser His Asp Asn Gly He lie Ser He Leu Phe Al 360 365 370 CTG TAC AAC GGC ACT AAG CCG CTG TCT ACC ACG ACC GTG G 1672

Leu Tyr Asn Gly Thr Lys Pro Leu Ser Thr Thr Thr Vai G1 375 380 385 ACC CAG ACA GAT GGG TTC TCG TCT GCT TGG ACG GTT CCG Τ’ 1720 • *Leu Tyr Asn Gly Thr Lys Pro Leu Ser Thr Thr Thr Vai G1 375 380 385 ACC CAG ACA GAT GGG TTC TCG TCT GCT TGG ACG GTT CCG Τ '1720 • *

Thr Gin Thr Asp Gly Phe Ser Ser Ala Trp Thr Val Pro Ph O 390 395 400 • » * · » * »»Thr Gin Thr Asp Gly Phe Ser Ser Ala Trp Thr Val Pro Ph O 390 395 400 • »* ·» * »»

.···. CGT CTG TAC GTC GAG ATG ATG CAG TGC CAG GCC GAG CAG G. ···. CGT CTG TAC GTC GAG ATG ATG CAG TGC CAG GCC GAG CAG G

:7. 1768 ♦ · *7. 1768 ♦ · *

Arg Leu Tyr Val Glu Met Met Gin Cys Gin Ala Glu Gin G1 *** * 410 415Arg Leu Tyr Val Glu Met Met Gin Cys Gin Ala Glu Gin G1 *** * 410 415

GTC CGT GTC TTG GTT AAT GAT CGC GTT GTC CCG CTG CAT GGTC CGT GTC TTG GTT AAT GAT CGC GTT GTC CCG CTG CAT G

t·· 1816 113 AGC TTT GCT AGA TCT GGG GGT GAT TGG GCG GAG TGT TCT GC 1906t ·· 1816 113 AGC TTT GCT AGA TCT GGG GGT GAT TGG GCG GAG TGT TCT GC 1906

Ser Phe Ala Arg Ser Gly Gly Asp Trp Ala Glu Cys Ser Ale 455 460 465 TAGCTGAACT ACCTTGATGG ATGGTATGTA TCAATCAGAG TACATATCAT 1966 ATGTATTTAC GAAGATGTAC ATATCGAAAT ATCGATGATG ACTACTCCGG 2026 GTCCCCTTCT ATCCTTCGTT CCACAACCAT CGCACTCGAC GTACAGCATA 2086 AGCATTAACA AACGAACAAA TAATATTATA CACTCCTCCC CAATGCAATA 2146 TTCATACCTC ATATAGATAC AATACAATAC ATCCATCCCT ACCCTCAAGT 2206 CATAATCAAA TCCCTACTTA CTCCTCCCCC TTCCCAGAAC CCACCCCCGA 2266 :\j GTAGTAGTAG AAGAAGCAGA CGACCTCTCC ACCAACCTCT TCGGCCTCTT 2326 • · • f · • »fSer-Phe Ala Arg Ser-Gly-Gly-Asp-Trp Ala Glu Cys Ser Ale 455 460 465 TAGCTGAACT ACCTTGATGG ATGGTATGTA TCAATCAGAG TACATATCAT 1966 ATGTATTTAC GAAGATGTAC ATATCGAAAT ATCGATGATG ACTACTCCGG 2026 GTCCCCTTCT ATCCTTCGTT CCACAACCAT CGCACTCGAC GTACAGCATA 2086 AGCATTAACA AACGAACAAA TAATATTATA CACTCCTCCC CAATGCAATA 2146 TTCATACCTC ATATAGATAC AATACAATAC ATCCATCCCT ACCCTCAAGT 2206 CATAATCAAA TCCCTACTTA CTCCTCCCCC TTCCCAGAAC CCACCCCCGA 2266: \ j GTAGTAGTAG AAGAAGCAGA CGACCTCTCC ACCAACCTCT TCGGCCTCTT 2326 • · • f · • »f

'···[ GCTATACACA CACGAACACA CCAAATAGTC AGCATGC'··· [GCTATACACA CACGAACACA CCAAATAGTC AGCATGC

/•f 2363 • # · « · · *·* · ··· • · · • * · (2) SEKVENSSIN ID NO:8 TIEDOT: • · · « φ · ·»· (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: 114/ • f 2363 • # · «· · * · · · · · (2) SEQ ID NO: 8 DETAILS: • · · · φ · · · (i) SEQUENCE FEATURES: 114

Met Gly Vai Ser Ala Vai Leu Leu Pro Leu Tyr Leu Leu AJ 1 5 10Met Gly Vai Ser Ala Vai Leu Leu Pro Leu Tyr Leu Leu AJ 1 5 10

Thr Ser Gly Leu Ala Val Pro Ala Ser Arg Asn Gin Ser Tt 20 25 :Thr Ser Gly Leu Ala Val Pro Ala Ser Arg Asn Gin Ser Tt 20 25:

Thr Vai Asp Gin Gly Tyr Gin Cys Phe Ser Glu Thr Ser H: 35 40 45Thr Vai Asp Gin Gly Tyr Gin Cys Phe Ser Glu Thr Ser H: 35 40 45

Gly Gin Tyr Ala Pro Phe Phe Ser Leu Ala Asn Glu Ser AJ 50 55 60Gly Gin Tyr Ala Pro Phe Phe Ser Leu Ala Asn Glu Ser AJ 50 55 60

Pro Asp Val Pro Ala Gly Cys Arg Val Thr Phe Ala Gin V< 65 70 75Pro Asp Val Pro Ala Gly Cys Arg Val Thr Phe Ala Gin V <65 70 75

Arg His Gly Ala Arg Tyr Pro Thr Glu Ser Lys Gly Lys L^ 85 90Arg His Gly Ala Arg Tyr Pro Thr Glu Ser Lys Gly Lys L ^ 85 90

Ala Leu Ile Glu Glu Ile Gin Gin Asn Vai Thr Thr Phe Ai 100 105 rAla Leu Ile Glu Glu Ile Gin Gin Asn Vai Thr Thr Phe Ai 100 105 r

Tyr Ala Phe Leu Lys Thr Tyr Asn Tyr Ser Leu Gly Ala Ai 115 120 125 ft·· ♦ » • ·Tyr Ala Phe Leu Lys Thr Tyr Asn Tyr Ser Leu Gly Ala Ai 115 120 125 ft ·· ♦ »• ·

Thr Pro Phe Gly Glu Gin Glu Leu Vai Asn Ser Gly Ile L} I./ 130 135 140 • · ft # • · · • · ft ft iThr Pro Phe Gly Glu Gin Glu Leu Vai Asn Ser Gly Ile L} I. / 130 135 140 • · ft # • · · • ft ft i

•*j · Gin Arg Tyr Glu Ser Leu Thr Arg Asn lie lie Pro Phe IJ• * j · Gin Arg Tyr Glu Ser Leu Thr Arg Asn lie lie Pro Phe IJ

\s : 145 1 50 155\ s: 145 1 50 155

Ser Gly Ser Ser Arg Val lie Ala Ser Gly Glu Lys Phe IJ ***** 165 170 115Ser Gly Ser Ser Arg Val lie Ala Ser Gly Glu Lys Phe IJ ***** 165 170 115

Thr Leu Asp Pro Gly Thr Cys Thr Vai Phe Glu Asp Ser G1 210 21 5 220Thr Leu Asp Pro Gly Thr Cys Thr Vai Phe Glu Asp Ser G1 210 21 5 220

Asp Thr Val Glu Ala Asn Phe Thr Ala Thr Phe Ala Pro Se 225 230 235Asp Thr Val Glu Ala Asn Phe Thr Ala Thr Phe Ala Pro Se 225 230 235

Gin Arg Leu Glu Asn Asp Leu Ser Gly Val Thr Leu Thr As 245 250Gin Arg Leu Glu Asn Asp Leu Ser Gly Val Thr Leu Thr As 245 250

Val Thr Tyr Leu Met Asp Met Cys Ser Phe Asp Thr lie Se 260 265 27Val Thr Tyr Leu Met Asp Met Cys Ser Phe Asp Thr lie Se 260 265 27

Thr Val Asp Thr Lys Leu Ser Pro Phe Cys Asp Leu Phe Th 275 280 285Thr Val Asp Thr Lys Leu Ser Pro Phe Cys Asp Leu Phe Th 275 280 285

Glu Trp lie His Tyr Asp Tyr Leu Gin Ser Leu Lys Lys Ty 290 295 300Glu Trp lie His Tyr Asp Tyr Leu Gin Ser Leu Lys Lys Ty 290 295 300

His Gly Ala Gly Asn Pro Leu Gly Pro Thr Gin Gly Vai Gl 305 310 315His Gly Ala Gly Asn Pro Leu Gly Pro Thr Gin Gly Vai Gl 305 310 315

Asn Glu Leu lie Ala Arg Leu Thr His Ser Pro Val His As 325 330 « « » · · • »· • *Asn Glu Leu lie Ala Arg Leu Thr His Ser Pro Val His As 325 330 «« »· · •» · *

Ser Ser Asn His Thr Leu Asp Ser Asn Pro Ala Thr Phe Pi 340 345 35 ♦ · ♦ ·Ser Ser Asn His Thr Leu Asp Ser Asn Pro Ala Thr Phe Pi 340 345 35 ♦ · ♦ ·

.**; Ser Thr Leu Tyr Ala Asp Phe Ser His Asp Asn Gly Ile II. **; Ser Thr Leu Tyr Ala Asp Phe Ser His Asp Asn Gly Ile II

:;|j 355 360 365 • · · # · ·:; | j 355 360 365 • · · # · ·

Leu Phe Ala Leu Gly Leu Tyr Asn Gly Thr Lys Pro Leu S« 370 375 380 ··· 4 · • · * * » 4 116Leu Phe Ala Leu Gly Leu Tyr Asn Gly Thr Lys Pro Leu S «370 375 380 ··· 4 · • · * *» 4 116

Glu Gin Glu Pro Leu Vai Arg Val Leu Val Asn Asp Arg V< 420 425 4;Glu Gin Glu Pro Leu Vai Arg Val Leu Val Asn Asp Arg V <420,425 4;

Leu His Gly Cys Pro lie Asp Ala Leu Gly Arg Cys Thr A: 435 440 445Leu His Gly Cys Pro lie Asp Ala Leu Gly Arg Cys Thr A: 435 440 445

Phe Val Arg Gly Leu Ser Phe Ala Arg Ser Gly Gly Asp T: 450 455 460Phe Val Arg Gly Leu Ser Phe Val Arg Gly Gly Asp T: 450 455 460

Cys Ser Ala 465 (2) SEKVENSSIN ID NO:9 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 39 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:9: • * • * · • m«Cys Ser Ala 465 (2) SEQ ID NO: 9 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 39 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) SENSITIVITY: simple (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQ ID NO: 9 : SEQ ID NO: 9: • * • * · • m «

,··% CAACCGCGGA CTGCGCATCA TGGGCGTCTC TGCTGTTCT, ··% CAACCGCGGA CTGCGCATCA TGGGCGTCTC TGCTGTTCT

39 • » · « » · • ψ • » /·;* (2) SEKVENSSIN ID NO: 10 TIEDOT: • · m • · · • · ♦ « ·*· : (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 22 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo :***; (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen 117 ^ (2) SEKVENSSIN ID NO:11 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 46 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappoa (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:11: CTCGGCCTTC TTGGCGAGAG CTCGTGCTCT GGCAGTCCCC GCCTCG 46 (2) SEKVENSSIN ID NO:12 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 24 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappoa (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat • » « * · • ·· • 9 • « » • 9 9 9 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO: 12: • ·· • 9 99 9 9 939 (*) SEQ ID NO: 10 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 22 base pairs (B) TYPE: nucleic acid: ***; (C) SEQUENCE: Simple 117 ^ (2) SEQ ID NO: 11 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 46 base pairs (B) TYPE: Nucleic acid (C) SEQUENCE: Simple (D) TOPOLOGY: xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 11: CTCGGCCTTC TTGGCGAGAG CTCGTGCTCT GGCAGTCCCC GCCTCG 46 (2) SEQUENCE ID NO: 12 DETAILS: (i) SEQ ID NO: 12 (c) T : simple (D) TOPOLOGY: both • «* · 9 • • 9 9 9 9 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 12: · · 9 99 9 9 9

/*;' TTGGTGTCGA CGGTGCTGGT GGAG/ *; ' TTGGTGTCGA CGGTGCTGGT GGAG

• · ♦ • · * Λ ... · 24 • · · • · · (2) SEKVENSSIN ID NO: 1 3 TIEDOT: 9 9 9 9 9 9 9 999 999 (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: 118 1 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:13: CTCGGCCTTC TTGGCCACAG CTCGTGCTTT CTCCTACGGC GCTGCC 46 (2) SEKVENSSIN ID NO:14 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 30 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:14: GCCATGGTTG TACGCGTCCA GCAAACCGGC 30 (2) SEKVENSSIN ID NO:15 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 39 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo ,···] (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat * · * • «· ♦ · m ·* • • · 999 • 9 : (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:15: • · · t t ft ft ft · 9(2) SEQ ID NO: 1 3 DETAILS: 9 9 9 9 9 9 9 999 999 (i) SEQUENCE FEATURES: 118 1 (xi) SEQ ID NO: 1 DESCRIPTION: SEQ ID NO: 13: CTCGGCCTTC TTGGCCACAG CTCGTGCTTT CTCCTACGGC GCTGCC 46 (2) SEQ ID NO: 14 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 30 bases (B) D) TOPOLOGY: Both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 14: GCCATGGTTG TACGCGTCCA GCAAACCGGC 30 (2) SEQ ID NO: 15 DETAILS: (i) SEQ ID NO: 15 Length: (b) , ···] (C) DRAINAGE: simple (D) TOPOLOGY: both * · * • «· ♦ · m · * • • 999 • 9: (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 15: • · · tt ft ft ft · 9

CAACCGCGGA CTGCGCATCA TGCCTCGCAC CTCTCTCCTCAACCGCGGA CTGCGCATCA TGCCTCGCAC CTCTCTCCT

• ·*< 39 • « ft ^ ^• · * <39 • «ft ^^

Ifft • « · • · 119 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:16: GAATTCCCGG GACCTACCCC TCTGCAT 27 (2) SEKVENSSIN ID NO:17 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 14 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:17:119 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 16: GAATTCCCGG GACCTACCCC TCTGCAT 27 (2) SEQ ID NO: 17 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH (B): : amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 17:

Leu Ala Vai Pro Ala Ser Arg Asn Gin Ser Ser Gly 7 1 5 10 (2) SEKVENSSIN ID NO:18 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 7 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo • * .···. (D) TOPOLOGIA: molemmat « 4 ♦ ♦· 9 9 9 9 9 9 99 9 9 994 4 · /•f (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:18: • · · 4 9 9 999 9 4 99 '·* * Arg His Gly Xaa Arg Xaa Pro 1 5 • * · i · · ··· :**: (2) SEKVENSSIN ID NO: 19 TIEDOT: (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:19: 1 20Leu Ala Vai Pro Ala Ser Arg Asn Gin Ser Ser Gly 7 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 18 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 7 amino acids (B) TYPE: amino acid • *. ·· ·. (D) TOPOLOGY: Both «4 ♦ ♦ · 9 9 9 9 9 9 99 9 9 994 4 · / • f (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 18: • · · 4 9 9 999 9 4 99 '· * * Arg His Gly Xaa Arg Xaa Pro 1 5 • * · i · · ···: **: (2) SEQ ID NO: 19 DETAILS: (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 19: 1 20

Lys Asp Pro Arg Ala 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:20 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 15 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:20:Lys Asp Pro Arg Ala 1 5 (2) SEQ ID NO: 20 DATA: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 15 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQ ID NO: 20 NO: 20:

Tyr Tyr Gly His Leu Gly Ala Gly Asn Pro Leu Gly P 1 5 10 (2) SEKVENSSIN ID NO:21 TIEDOT: • ft » ftft ft ft ft ft (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: • · · (A) PITUUS: 11 aminohappoa mmml (B) TYYPPI: aminohappo • # » (D) TOPOLOGIA: molemmat • * · • ft · * • · ft • t · ··· • # • · • · · 121 (2) SEKVENSSIN ID NO:22 TIEDOT: ii) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 9 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (ix) OMINAISPIIRRE: (A) NIMI/SELITYS: Peptidi (B) SIJAINTI: 6..7 (D) MUU INFORMAATIO: /leima= Peptidi /huomaa= "Johdettaessa DNA-sekvenssistä ppojen asemassa 6 ja 7 havaittiin olevan seriini." (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:22:Tyr Tyr Gly His Leu Gly Ala Gly Asn Pro Leu Gly P 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 21 DETAILS: • ft »ftft ft ft ft (i) SEQUENCE FEATURES: • · · (A) LENGTH: 11 amino acids mmml (B) TYPE: amino acid • # »(D) TOPOLOGY: both • * · • ft · * • · ft • t · ··· • # • · · · 121 (2) SEQ ID NO: 22 DETAILS: ii) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 9 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (ix) FEATURES: (A) NAME / DESCRIPTION: Peptide (B) LOCATION: 6..7 (D) OTHER INFORMATION: / Stamp = Peptide / Note = "When deduced from the DNA sequence at positions 6 and 7, serine was found." (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 22:

Ala Gin Pro Gly Gin Ala Ala Pro Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:23 TIEDOT: . . (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: » » · " (A) PITUUS: 16 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo ♦ φ :.*·· (D) TOPOLOGIA: molemmat • •t * ♦ • · • « • · · • ♦ # · ··· • · · * · · (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:23: ♦ • ♦ ·Ala Gin Pro Gly Gin Ala Pro Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 23 DETAILS:. . (i) SEQUENCE FEATURES: »» · "(A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: amino acid ♦ φ:. * ·· (D) TOPOLOGY: both • • t * ♦ • · •« • · · • ♦ (Xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 23: ♦ • ♦ ·

Leu Tyr Vai Glu Met Met Gin Asn Gin Ala Glu Gin TYLeu Tyr Vai Glu Met Met Gin Asn Gin Ala Glu Gin TY

*·*·* Vai (2) SEKVENSSIN ID NO:24 TIEDOT: 122 (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 16 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:24:* · * · * Vai (2) SEQ ID NO: 24 DATA: 122 (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 16 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 24 NO: 24:

Leu Tyr Vai Glu Met Met Gin Cys Gin Ala Glu Gin GLeu Tyr Vai Glu Met Met Gin Cys Gin Ala Glu Gin G

Vai 1 5 10 (2) SEKVENSSIN ID NO:25 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 9 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat • « • · « (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:25: * » • · · • « · · *·*· Phe Ile Glu Gly Phe Gin Ser Asp Lys 1 5 • * ♦ * · • ie • · e · :T: (2) SEKVENSSIN ID NO:26 TIEDOT: . (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: • * * .*·*. (A) PITUUS: 9 aminohappoa • m •«« , . , 123 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:26:Vai 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 25 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 9 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both • «• ·« (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 25: * »• · · •« · · * · Phe Ile Glu Gly Phe Gin Ser Asp Lys 1 5 • * ♦ * · • ie • · e ·: T: (2) SEQ ID NO: 25 : 26 DETAILS:. (i) SEQUENCE FEATURES: • * *. * · *. (A) LENGTH: 9 amino acids • m • ««,. , 123 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 26:

Phe Ile Glu Gly Phe Gin Ser Asp Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:27 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 5 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:27:Phe Ile Glu Gly Phe Gin Ser Asp Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 27 DATA: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 5 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 27:

Tyr Ala Phe Leu Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:28 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 6 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo * # (D) TOPOLOGIA: molemmat • « « * « * ψ · 9 9 9 9 9 9 *9 9 9 * ·9 • 9 9 9 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:28: • · · ··· * ··· 9 9 9 9 9 9Tyr Ala Phe Leu Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 28 DATA: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: amino acid * # (D) TOPOLOGY: both • «« * «* ψ · 9 9 9 9 9 9 * 9 9 9 * · 9 • 9 9 9 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 28: • · · ··· * ··· 9 9 9 9 9 9

Gly Leu Ser Phe Ala Arg 1 5 ♦ • 9 9 9 9 9 999 «<· ·. * /91 ςρκν^κς.ςτΜ τη νπ·5q φττγπλφ* 124 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:29:Gly Leu Ser Phe Ala Arg 1 5 ♦ • 9 9 9 9 9 999 «<· ·. * / 91 ςρκν ^ κς.ςτΜ τη νπ · 5q φττγπλφ * 124 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 29:

Vai Ile Ala Ser Gly Glu Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:30 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 4 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:30:Vai Ile Ala Ser Gly Glu Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 30 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 4 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 30:

Phe Tyr Gin Arg (2) SEKVENSSIN ID NO:31 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 9 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo v·: (D) TOPOLOGIA: molemmat • i« « · ♦ » • · t V · • t · • » * 1 · • · « · 9 · ♦ : (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:31: • · « · • · » • ♦ « • 1 ·Phe Tyr Gin Arg (2) SEQ ID NO: 31 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 9 amino acids (B) TYPE: amino acid v ·: (D) TOPOLOGY: both • i «« · ♦ »• · T V · • t · • »* 1 · • ·« · 9 · ♦: (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 31: • · «· • · • ♦« • 1 ·

Phe Tyr Gin Arg Asp Ser Phe Vai Arg 1 5 • · « • 1 · • · · ··· • · ___· / 1> ΐ cuirucMCCTM τη μπ· n φτγπλπι.Phe Tyr Gin Arg Asp Ser Phe Vai Arg 1 5 • · «• 1 · • · · ··· • · ___ · / 1> ΐ cuirucMCCTM τη μπ · n φτγπλπι.

125 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:32:125 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 32:

Asp Ser Phe Vai Arg 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:33 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 5 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:33:Asp Ser Phe Vai Arg 1 5 (2) SEQ ID NO: 33 DATA: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 5 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 33 NO: 33:

Vai Leu Vai Asn Asp 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:34 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 5 aminohappoa β·β ; (B) TYYPPI: aminohappo *;./ (D) TOPOLOGIA: molemmat • « • » »·· • ♦ (2) SEKVENSSIN ID NO:35 TIEDOT: 126 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:35:Vai Leu Vai Asn Asp 1 5 (2) SEQ ID NO: 34 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 5 amino acids β · β; (B) TYPE: amino acid *; ./ (D) TOPOLOGY: both • «•» »··· ♦ (2) SEQ ID NO: 35 DETAILS: 126 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 35:

Tyr Glu Ser Leu Thr Arg 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:36 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 7 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:36:Tyr Glu Ser Leu Thr Arg 1 5 (2) SEQ ID NO: 36 DATA: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 7 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: ID NO: 36:

Ser Ala Ala Ser Leu Asn Ser 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:37 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 5 aminohappoa . (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat • » • 1 • 1« • · • · · • ·♦ •Ser Ala Ala Ser Leu Asn Ser 1 5 (2) SEQ ID NO: 37 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 5 amino acids. (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both • »• 1 • 1« • · • · · · ♦ •

»M»M

• ♦ *·· : (xi) sekvenssin kuvaus: sekvenssi id NO:37: *·· I «·»• ♦ * ··: (xi) Sequence Description: Sequence ID NO: 37: * ·· I «·»

• · I• · I

• i · •• i · •

Leu Lys Asp Pro Arg 1 5 • · · • · ♦ ♦ ·· *···* :2) SEKVENSSIN ID Noise TIEDOT: » (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:38: 127Leu Lys Asp Pro Arg 1 5 • · · • · ♦ ♦ ·· * ··· *: 2) SEQUENCE ID Noise DETAILS: »(xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 38: 127

Vai Ile Ala Ser Gly Glu Lys 1 ' 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:39 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 6 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:39:Vai Ile Ala Ser Gly Glu Lys 1 '5 (2) SEQ ID NO: 39 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQ ID NO: 39 : SEQ ID NO: 39:

Tyr Pro Thr Glu Ser Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:40 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 5 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat • · • ♦ » • i· I · • « • « ··« • · • · · • ·· * « (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:40: **i • · • · ♦ # · 9 **· ·Tyr Pro Thr Glu Ser Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 40 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 5 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both • · • ♦ »• i · I · • «•« · · · · · · (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 40: ** i • · • · ♦ # · 9 ** · ·

Tyr Phe Asn Xaa Gly # · · * 1 5 ^ * i«« • · • f (2) SEKVENSSIN ID NO: 41 TIEDOT: 128 (ix) OMINAISPIIRRE: (A) NIMI/SELITYS: Peptidi (B) SIJAINTI: 3..8 (D) MUU INFORMAATIO: /leima= Peptidi /huomaa= "Seuraavassa luetellut ovat va siä aminohappoja seuraavissa asemissa: Proliini as fenyylialaniini asemassa 4, seriini asemassa 6, leusiin 7, ja vallini asemassa 8." (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:41:Tyr Phe Asn Xaa Gly # · · * 1 5 ^ * i «« • · • f (2) SEQ ID NO: 41 DETAILS: 128 (ix) FEATURES: (A) NAME / DESCRIPTION: Peptide (B) LOCATION: 3 ..8 (D) OTHER INFORMATION: / Stamp = Peptide / Note = "The following are the free amino acids at position 4: Proline as phenylalanine at position 4, Serine at position 6, Leucine at position 7, and Wallin at position 8." (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 41:

Leu Glu Asn Asp Leu Asp Gly Phe Thr Leu 1 5 10 (2) SEKVENSSIN ID NO:42 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: Π aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat ***·· \v (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:42: * f • · *· *5 Leu Glu Asn Asp Leu Ser Gly Vai Thr Leu Thr *·· 1 5 10 : (2) sekvenssin id no:43 tiedot: . (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: ♦ · · ,···β (A) PITUUS: 20 aminohappoa • * ··· fry \ mvvnnT . ___ 129 (D) MUU INFORMAATIO: /leima» Peptidi /huomaa= "Aminohappo asemassa 15 saatt olla tyrosiini." (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:43:Leu Glu Asn Asp Leu Asp Gly Phe Thr Leu 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 42 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: Π amino acid (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both ** * ·· \ v (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 42: * f • · * · * 5 Leu Glu Asn Asp Leu Ser Gly Vai Thr Leu Thr * ·· 1 5 10: (2) sequence id no: 43 Information:. (i) SEQUENCE FEATURES: ♦ · ·, ··· β (A) LENGTH: 20 amino acids • * ··· fry \ mvvnnT. ___ 129 (D) OTHER INFORMATION: / Stamp »Peptide / Note =" The amino acid at position 15 may be tyrosine. " (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 43:

Tyr Tyr Gly His Gly Ala Gly Asn Pro Leu Gly Pro TiTyr Tyr Gly His Gly Ala Gly Asn Pro Leu Gly Pro Ti

Vai 1 5 10Or 1 5 10

Gly Ala Asn Glu 20 (2) SEKVENSSIN ID NO:44 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 3 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo {D) TOPOLOGIA: molemmat a * *· (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO: 44: aa· • aGly Ala Asn Glu 20 (2) SEQ ID NO: 44 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 3 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both a * * · (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 44: aa · • a

• K• Q.

• aa• aa

Leu Ile Ala • aa • * 1Leu Ile Ala • aa • * 1

• a I• a I

• aa • a • * a • a * «a· · • aa • · a • aa (2) SEKVENSSIN ID NO:45 TIEDOT: a a e (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: a a *** ( Δ \ DTTnriC R ami τ-ιar\r\r\z> (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID N0:45: 130• aa • a • * a • a * «a · · • aa • · a • aa (2) SEQ ID NO: 45 DETAILS: aae (i) SEQUENCE FEATURES: aa *** (Δ \ DTTnriC R ami τ- ιar \ r \ r \ z> (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 45: 130

Vai Thr Phe Ala Gin Vai Leu Ser 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:46 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 8 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:46:Vai Thr Phe Ala Gin Vai Leu Ser 1 5 (2) SEQ ID NO: 46 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 8 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQ ID NO: 46 : SEQ ID NO: 46:

Phe Ile Glu Gly Phe Gin Ser Thr 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:47 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: • · (A) PITUUS: 7 aminohappoa ««· (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmatPhe Ile Glu Gly Phe Gin Ser Thr 1 5 (2) SEQ ID NO: 47 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: • · (A) LENGTH: 7 amino acids «« · (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both

• •I• • I

• f • * • · I ** * .··% (ix) OMINAISPIIRRE: • * « (A) NIMI/SELITYS: Peptidi . (B) SIJAINTI: 1 • · · (D) MUU INFORMAATIO: /leima- Peptidi * · /Vmnina a— aoomacoa 1 n 4- -5 131 (2) SEKVENSSIN ID NO:48 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 8 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:48:• f • * • · I ** *. ··% (ix) FEATURES: • * «(A) NAME / DESCRIPTION: Peptide. (B) LOCATION: 1 • · · (D) OTHER INFORMATION: / Stamp Peptide * · / Vmnina a— aoomacoa 1 n 4- -5 131 (2) SEQ ID NO: 48 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: ( A) LENGTH: 8 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 48:

Asn Ile Glu Pro Phe Gin Vai Asn 1 5 (2) SEKVENSSIN ID N0:49 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 6 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:49: * · · • • ♦ .··*. Vai Leu Vai Asn Asp Arg • - · 1 5 • · · • i· * » • »t (2) SEKVENSSIN ID NO: 50 TIEDOT: « * · « « 4 «44 4 V : (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 14 aminohappoa : (B) TYYPPI: aminohappo 4«ft .·*·. (D) TOPOLOGIA: molemmat * & * 132 (2) SEKVENSSIN ID NO:51 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 3 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (ix) OMINAISPIIRRE: (A) NIMI/SELITYS: Peptidi (B) LOCATION: 1 (D) MUU INFORMAATIO: /leima= Peptidi /huomaa= "Johdettaessa DNA-sekvensistä pon asemassa 1 todettiin olevan kysteiini." (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID N0:51:Asn Ile Glu Pro Phe Gin Vai Asn 1 5 (2) SEQ ID NO: 49 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE : SEQ ID NO: 49: * · · • • ♦. ·· *. Vai Leu Vai Asn Asp Arg • - · 1 5 • · · • i · * »•» t (2) SEQ ID NO: 50 DETAILS: «* ·« «4« 44 4 V: (i) SEQUENCE FEATURES: ( A) LENGTH: 14 amino acids: (B) TYPE: amino acid 4 «ft. · * ·. (D) TOPOLOGY: both * & * 132 (2) SEQ ID NO: 51 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 3 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (ix) FEATURES: (A) NAME / DESCRIPTION: Peptide (B) LOCATION: 1 (D) OTHER INFORMATION: / Stamp = Peptide / Note = "Cysteine was found at position 1 of the DNA sequence." (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 51:

Arg Ser Ala 1 (2) SEKVENSSIN ID NO:52 TIEDOT: . . (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: • « * *·"/ (A) PITUUS: 17 emäsparia *··.* (B) TYYPPI: nukleiinihappo • · \··: (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen :***: (D) TOPOLOGIA: molemmat • » ·* # • « · ft · ft ft • · · • ft · ft · · (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:52: ft · ·Arg Ser Ala 1 (2) SEQ ID NO: 52 DETAILS:. . (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: • «* * ·" / (A) LENGTH: 17 base pairs * ··. * (B) TYPE: nucleic acid • · \ ··: (C) DURABILITY: simple: ***: (D ) TOPOLOGY: Both • »· * # •« · ft · ft ft · · · ft · ft · · (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 52: ft · ·

CARTTRCCNC ARTTYAACARTTRCCNC ARTTYAA

ft · **.i* 1 *7 133 (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 14 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:53:ft · **. i * 1 * 7 133 (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 14 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 53:

Phe Ser Tyr Gly Ala Ala Ile Pro Gin Ser Thr Gin GJ 1 5 10 (2) SEKVENSSIN ID NO:54 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 10 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (DJ TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:54:Phe Ser Tyr Gly Bottom Ile Pro Gin Ser Thr Gin GJ 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 54 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 10 amino acids (B) TYPE: amino acid (DJ TOPOLOGY: both) (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 54:

Gin Phe Ser Gin Glu Phe Arg Asp Gly Tyr : 1 5 10 • «i • ·· • ♦ V"! (2) SEKVENSSIN ID NO:55 TIEDOT: * · · • · • * » :···: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: • » : (A) PITUUS: 7 aminohappoa \·’* (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat * · · ♦ · * *· · • * · • > * * 134 (2) SEKVENSSIN ID NO:56 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 6 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:56:Gin Phe Ser Gin Glu Phe Arg Asp Gly Tyr: 1 5 10 • «i • ·· • ♦ V„! (2) SEQUENCE ID NO: 55 DETAILS: * · · • · • * »: ···: (i ) SEQUENCE FEATURES: • »: (A) LENGTH: 7 amino acids \ · '* (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both * · · ♦ · * * · · * · •> * * 134 (2) SEQ ID NO: 56 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 56:

Vai Ser Tyr Gly Ile Ala 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:57 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 13 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat . . (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:57: * * » • · * * m '·*·* Arg His Gly Glu Arg Tyr Pro Ser Pro Ser Ala Gly : • * 1 5 10 • · • · • · · : (2) SEKVENSSIN ID NO:58 TIEDOT: ··* * • •I • · * ** * * (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: . (A) PITUUS: 8 aminohappoa • · »Vai Ser Tyr Gly Ile Ala 1 5 (2) SEQ ID NO: 57 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 13 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both. . (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 57: * * »• · * * m '· * · * Arg His Gly Glu Arg Tyr Pro Ser Pro Ser Ala Gly: • * 1 5 10 • · • · • · · : (2) SEQ ID NO: 58 DETAILS: ·· * * • i (*) (*) (i) SEQUENCE FEATURES:. (A) LENGTH: 8 amino acids • · »

Jill (B) TYYPPI: aminohappo t a (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:58: 135Jill (B) TYPE: amino acid t a (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 58: 135

Asp Ile Glu Glu Ala Leu Ala Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:59 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 11 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:59:Asp Ile Glu Glu Ala Leu Ala Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 59 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 11 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE : SEQ ID NO: 59:

Ala Arg Tyr Gly His Leu Trp Asn Gly Glu Thr 1 5 10 (2) SEKVENSSIN ID NO:60 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 8 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo V*: (D) TOPOLOGIA: molemmat ·*· • · * 9 • · · « 9 9 9« 4 ·« • 9 • 44 9 · • 9 « 9 « : (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:60: 9·# 9 9 9 9 9 9 * 4 9 9 4 9 9Ala Arg Tyr Gly His Leu Trp Asn Gly Glu Thr 1 5 10 (2) SEQ ID NO: 60 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 8 amino acids (B) TYPE: amino acid V *: (D) TOPOLOGY : both · * · • · * 9 • · · «9 9 9« 4 · «• 9 • 44 9 · • 9« 9 «: (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 60: 9 · # 9 9 9 9 9 9 * 4 9 9 4 9 9

Vai Vai Pro Phe Phe Ser Ser Gly 1 5 4 9 9 4 9 9 949 4 9 4 (2) SEKVENSSIN ID NO: 61 TIEDOT: 136 (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:61:Vai Vai Pro Phe Phe Ser Ser Gly 1 5 4 9 9 4 9 9 949 4 9 4 (2) SEQ ID NO: 61 DETAILS: 136 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 61:

Phe Ser Ser Gly Tyr Gly Arg 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:62 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 6 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:62:Phe Ser Ser Gly Tyr Gly Arg 1 5 (2) SEQ ID NO: 62 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 6 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 62:

Gin Leu Pro Gin Phe Lys 1 5 (2) SEKVENSSIN ID NO:63 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 7 aminohappoa (B) TYYPPI: aminohappo (D) TOPOLOGIA: molemmat 9 9 • 99 • 99 • · • · • * 999 9 9 •99 9 9 9 !·;! (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO: 63: « · ·Gin Leu Pro Gin Phe Lys 1 5 (2) SEQ ID NO: 63 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 7 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: both 9 9 • 99 • 99 • · • · • * 999 9 9 • 99 9 9 9! ·;! (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 63: «· ·

Vai Ala Phe Gly Asn Pro Tyr 9 9 9 9 9 9 ··· 1 5 «M • · • ♦ 999 (2) SEKVENSSIN ID NO:64 TIEDOT: 137 (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 17 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen (D) TOPOLOGIA: molemmat (ix) OMINAISPIIRRE: (A) NIMI/SELITYS: modifioitu emäs (B) ASEMA: 12 (D) MUU INFORMAATIO: /mod emäs= i (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:64: GTRCCNCTYK CNATRGG 17 (2) SEKVENSSIN ID NO:65 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 17 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksinkertainen • 99 (D) TOPOLOGIA: molemmat • i • * » • ** • * • · 9 9 999 : (xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:65: «*« * 99* 9 9 9 9 9 9 CARCTNCCNC ARTTYAA 17 • i « • · · ··· 999 9 9 ***·' { 7 ) SRfn/FNCQTM ΤΓΊ ΜΠ * - (xx) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI ID NO:66: 138 GAATTCCGAG TCCGAGGTCA TGGGCGCG 28 • a • « «Vai A Phe Gly Asn Pro Tyr 9 9 9 9 9 9 ··· 1 5 «M • · • ♦ 999 (2) SEQ ID NO: 64 DETAILS: 137 (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 17 base pairs ( B) TYPE: Nucleic Acid (C) DRAINAGE: Simple (D) TOPOLOGY: Both (ix) FEATURES: (A) NAME / DESCRIPTION: Modified Base (B) STATUS: 12 (D) OTHER INFORMATION: / mod Base = i (xi) ) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 64: GTRCCNCTYK CNATRGG 17 (2) SEQ ID NO: 65 DETAILS: (i) SEQUENCE FEATURES: (A) LENGTH: 17 base pairs (B) TYPE: Nucleic acid (D) TOPOLOGY: Both • i • * »• ** • * • · 9 9,999: (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 65:« * «* 99 * 9 9 9 9 9 9 CARCTNCCNC ARTTYAA 17 • i «• · · ··· 999 9 9 *** · '{7) SRfn / FNCQTM ΤΓΊ ΜΠ * - (xx) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQUENCE ID NO: 66: 138 GAATTCCGAG TCCGAGGTCA TGGGCGCG 28 • a •« «

• M• M

• β • t« • · • · ··♦ • a » • «a • a• β • t «• · • · · · ♦ • a» • «a • a

• •I• • I

• a • a »· a a a a a a a a a • aa a a aa • a a a a a a • a a a a a a ai· a a a a · a a a a a• a • a »· a a a a a a • a a a a a a • a a a a a • a a a a a · a a a a · a a a a

Claims (3)

1. Ett förfarande för framställning av en komposition, som omfattar ett < fytatspjälkande enzym, samt minst ett Trichoderma-enzym, som valts frär bestäende av en β-glukannedbrutande aktivitet, CBHI, CBHII, EGI och EGII, däi är kännetecknat av, att det omfattar följande steg, där man a. framställer en rekombinant konstruktion, som innehlller en gen, ^ ett fytatspjälkande enzym som valts bland fytas och pH 2,5 suit fosfatas, fytas har aminosyrasekvensen SEQ ID NO: 8, och där nämnda pH 2,5 s har aminosyrasekvensen SEQ ID NO; 2, samt en tili nämnda gen funkl kopplad signalsekvens; b. transformerar en Trichoderma reesei-värd med nämnda DNA-kons c. odlar den transformerade Trichoderma /*ease*-värden under 1 Trichoderma reesei-vä.rd och för expression av nämnda fytatspjälka gynnsamma fbrhällanden; • · « · 9 • «I • · * *· d. avlägsnar mycelet frän odlingsmediet. » ψ • 9 9 • * * • 9 • a#A process for preparing a composition comprising a phytate digestive enzyme, and at least one Trichoderma enzyme selected from the residue of a β-glucone degrading activity, CBHI, CBHII, EGI and EGII, characterized in that it comprises the following steps wherein a. preparing a recombinant construct containing a gene, a phytate digesting enzyme selected from phytase and pH 2.5 suit phosphatase, phytase having the amino acid sequence SEQ ID NO: 8, and wherein said pH 2.5 s has the amino acid sequence SEQ ID NO; 2, and a signal sequence associated with said gene; b. transforms a Trichoderma reesei host with said DNA cone c. cultivates the transformed Trichoderma / * ease * values below 1 Trichoderma reesei host and for expression of said phytate cleavage favorable conditions; • · · · 9 • «I • · * * · d. Removes the mycelium from the culture medium. »Ψ • 9 9 • * * • 9 • a # 1. Menetelmä koostumuksen tuottamiseksi, joka koostumus käsittää yl fytaattia hajottavan entsyymin ja vähintään yhden Trichoderma-enXsyymin glukaania hajottavasta aktiivisuudesta, CBHIistä, CBHII:sta, EGIrsta ja EGII: siitä, että menetelmä käsittää seuraavat vaiheet: a. valmistetaan yhdistelmäkonstruktio, joka sisältää geenin, jok fytaattia hajottavaa entsyymiä valittuna fytaasista ja happofosfataasista, jolloin mainitulla fytaasilla on aminohapposel ID NO: S ja mainitulla pH 2,5- happofosfataasilla on aminoha]: SEQ ID NO: 2, ja toiminnallisesti mainittuun geen signaalisekvenssin; b. transformoidaan Trichoderma reesei-isäntä mainitulla DNA-konsI c. viljellään transformoitu Trichoderma reesei-isanlä olosuhteissa sopivia mainitulle Trichoderma reesej-isärmälle ja fytaattia entsyymin ilmentämiselle; m* • « t a !.*·: d. poistetaan kasvualustasta sienirihmasto. • »· • $ · * * : 2. Patenttivaatimuksen 1 mukainen menetelmä, tunnettu siitä, että mai Vs konstruktio saatetaan mainittuun isäntään lineaarisessa muodossa. * * : 3. Patenttivaatimuksen 1 mukainen menetelmä, tunnettu siitä, että mai • ψ · « · ♦ · 1 i 1.* . . - *,, . «1. menetelmä koostumuksen tuottamiseksi, joka koostumus käsittää yl fytaattia hajottavan entsyymin yes Vähintään ylidene Trichoderma enXsyymin glukaania hajottavasta aktiivisuudesta, CBHIistä, CBHII: STA, EGIrsta yes EGII: siitä, että menetelmä käsittää seuraavat vaiheet text. Valmistetaan yhdistelmäkonstruktio, joka sisältää geenin, yok fytaattia hajottavaa entsyymiä valittuna phytaasista ja happofosfataasista, jolloin mainitulla phytaasilla on aminohapposel ID NO: S yes mainitulla pH 2,5- happofosfataasilla on aminoha]: SEQ ID NO: 2, yes toiminnallisesti main signal no sequence; b. transformoid Trichoderma reesei-isäntä mainitulla DNA consi c. viljellään transformoitu Trichoderma reesei-isanlä olosuhteissa sopivia mainitulle Trichoderma reesei-ismälle ja fytaattia entsyymin ilmentämiselle; m * • «t a !. * ·: d. poistetaan kasvualustasta sienirihmasto. • »· • $ · * *: 2. Patenttivaatimuksen 1 mukainen menetelmä, tunnettu siitä, etä mai Vs constructio saatetaan mainittuun isäntään linearessa muodossa. * *: 3. Patenttivaatimuksen 1 mukainen menetelmä, tunnettu siitä, one May • ψ · «· ♦ · 1 in 1. *. . - * ,,. « 2. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat av, att man inför den när • · : konstruktionen i linjär form i nämnda värd. • ♦ ♦ • · ·Method according to claim 1, characterized in that it is introduced when the structure in linear form in said host. • ♦ ♦ • · · 3. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat av, att man inför den när • ·*· :·: : konstruktionen som en ringformad plasmid i nämnda värd. • · • *3. A method according to claim 1, characterized in that it is introduced when the structure as an annular plasmid in said host. • · • *
FI950202A 1992-07-31 1995-01-17 Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns. FI117098B (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI950202A FI117098B (en) 1992-07-31 1995-01-17 Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns.

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US07/923,724 US5780292A (en) 1987-04-29 1992-07-31 Production of phytate degrading enzymes in trichoderma
US92372492 1992-07-31
FI9300310 1993-07-30
PCT/FI1993/000310 WO1994003612A1 (en) 1992-07-31 1993-07-30 PRODUCTION OF PHYTATE DEGRADING ENZYMES IN $i(TRICHODERMA)
FI950202 1995-01-17
FI950202A FI117098B (en) 1992-07-31 1995-01-17 Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns.

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI950202A0 FI950202A0 (en) 1995-01-17
FI950202A FI950202A (en) 1995-03-17
FI117098B true FI117098B (en) 2006-06-15

Family

ID=26159875

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI950202A FI117098B (en) 1992-07-31 1995-01-17 Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns.

Country Status (1)

Country Link
FI (1) FI117098B (en)

Also Published As

Publication number Publication date
FI950202A (en) 1995-03-17
FI950202A0 (en) 1995-01-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0659215B1 (en) Production of phytate degrading enzymes in trichoderma
FI108299B (en) Composition containing microbial phytase and its use
JP3281508B2 (en) Thermostable phytase
FI119437B (en) Non-Toxic, Non-Toxicogenic, Non-Pathogenic Fusarium Expression System and Promoters and Terminators Used in it
Margolles-Clark et al. Improved production of Trichoderma harzianum endochitinase by expression in Trichoderma reesei
Roldán-Arjona et al. Tomatinase from Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici defines a new class of saponinases
EP0898618B1 (en) Method of providing novel dna sequences
JPH10501137A (en) Purified Myceliophthora laccase and nucleic acid encoding the same
DE69728878T2 (en) METHOD FOR IMPROVING HEMOPROTEIN PRODUCTION IN FILAMENTOUS FUNGI
Dumonceaux et al. Cloning and sequencing of a gene encoding cellobiose dehydrogenase from Trametes versicolor
WO2020123845A1 (en) Methods for increasing the productivity of a filamentous fungal cell in the production of a polypeptide
FI110614B (en) Cloning, expression and use of acetylxyl anesterases of fungal origin
Müller et al. Cel1, probably encoding a cellobiohydrolase lacking the substrate binding domain, is expressed in the initial infection phase of Claviceps purpurea on Secale cereale
US8609386B2 (en) Polypeptides having tyrosinase activity and polynucleotides encoding same
Sexton et al. Cloning, characterization and chromosomal location of three genes encoding host-cell-wall-degrading enzymes in Leptosphaeria maculans, a fungal pathogen of Brassica spp.
FI103133B (en) A method for modifying glucose repression
FI117098B (en) Compsns. contg. phytate degrading enzymes - obtd. by expression of their genes in Trichoderma, used partic. for producing animal feed compsns.
JP2002506638A (en) Haloperoxidase with modified pH characteristics
WO2002079400A2 (en) Methods for isolating genes from microorganisms
WO1998023642A1 (en) Genes encoding transcriptional regulatory proteins from trichoderma reesei and uses thereof
JP2000175698A (en) Pyranose oxidase-containing reagent for measuring pyranose
JP3752267B2 (en) Epoxidase gene
Kurt Gür Cloning Of The Laccase cDNAs From Pycnoporus sanguineus Mucl 38531, Expression in Pichia pastoris and Characterization Of Recombinant Laccases
CA2240390C (en) Novel xylanases, genes encoding them, and uses thereof
WO2010106068A1 (en) Polypeptides having tyrosinase activity and polynucleotides encoding same

Legal Events

Date Code Title Description
GB Transfer or assigment of application

Owner name: R!HM ENZYME FINLAND OY

FG Patent granted

Ref document number: 117098

Country of ref document: FI

MA Patent expired