FI115725B - HCV:n genomisia sekvenssejä diagnostiikkaan - Google Patents
HCV:n genomisia sekvenssejä diagnostiikkaan Download PDFInfo
- Publication number
- FI115725B FI115725B FI934937A FI934937A FI115725B FI 115725 B FI115725 B FI 115725B FI 934937 A FI934937 A FI 934937A FI 934937 A FI934937 A FI 934937A FI 115725 B FI115725 B FI 115725B
- Authority
- FI
- Finland
- Prior art keywords
- nucleic acid
- sequence
- seq
- hcv
- type
- Prior art date
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 287
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 262
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 262
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 195
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 195
- 241000711549 Hepacivirus C Species 0.000 claims abstract description 108
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 41
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 24
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 24
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims description 18
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 16
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 9
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 claims description 5
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims description 4
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims 4
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 claims 2
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 claims 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 claims 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims 1
- RYXPMWYHEBGTRV-UHFFFAOYSA-N Omeprazole sodium Chemical compound [Na+].N=1C2=CC(OC)=CC=C2[N-]C=1S(=O)CC1=NC=C(C)C(OC)=C1C RYXPMWYHEBGTRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 claims 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 claims 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 claims 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 claims 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 claims 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 claims 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 162
- 230000004907 flux Effects 0.000 description 89
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 49
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 35
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 29
- 239000000047 product Substances 0.000 description 25
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 23
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 21
- 238000009413 insulation Methods 0.000 description 19
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 12
- 229920001184 polypeptide Chemical group 0.000 description 12
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 11
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 10
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 9
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 9
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 9
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 7
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 7
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 7
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 6
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 5
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 5
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 5
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 5
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 5
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 4
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 4
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 4
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 4
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 4
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 4
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 4
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 4
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 4
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 4
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 3
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 3
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 3
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 3
- TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 3-(trimethylsilyl)propane-1-sulfonic acid Chemical compound C[Si](C)(C)CCCS(O)(=O)=O TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150026173 ARG2 gene Proteins 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000724709 Hepatitis delta virus Species 0.000 description 2
- 241000709721 Hepatovirus A Species 0.000 description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 2
- 101100005166 Hypocrea virens cpa1 gene Proteins 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100039019 Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1 Human genes 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- -1 Polyethylene Polymers 0.000 description 2
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 2
- 101100404032 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) arg6 gene Proteins 0.000 description 2
- 102000019197 Superoxide Dismutase Human genes 0.000 description 2
- 108010012715 Superoxide dismutase Proteins 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100379634 Xenopus laevis arg2-b gene Proteins 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 2
- 239000010836 blood and blood product Substances 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N hydroxybenzotriazole Substances O=C1C=CC=C2NNN=C12 NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 1-Hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QCVGEOXPDFCNHA-UHFFFAOYSA-N 5,5-dimethyl-2,4-dioxo-1,3-oxazolidine-3-carboxamide Chemical compound CC1(C)OC(=O)N(C(N)=O)C1=O QCVGEOXPDFCNHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102100030356 Arginase-2, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 101150111062 C gene Proteins 0.000 description 1
- 101100121600 Caenorhabditis elegans gcy-33 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000744472 Cinna Species 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 102000013138 Drug Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010065556 Drug Receptors Proteins 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000002322 Egg Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010000912 Egg Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100027723 Endogenous retrovirus group K member 6 Rec protein Human genes 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical class NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 108700039791 Hepatitis C virus nucleocapsid Proteins 0.000 description 1
- 208000037262 Hepatitis delta Diseases 0.000 description 1
- 101000792835 Homo sapiens Arginase-2, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010067125 Liver injury Diseases 0.000 description 1
- 108090001074 Nucleocapsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 238000009004 PCR Kit Methods 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-STQMWFEESA-N Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 229940125691 blood product Drugs 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 244000309464 bull Species 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 231100000012 chronic liver injury Toxicity 0.000 description 1
- 239000012050 conventional carrier Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002274 desiccant Substances 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- ZWIBGKZDAWNIFC-UHFFFAOYSA-N disuccinimidyl suberate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCCCCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O ZWIBGKZDAWNIFC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 235000014103 egg white Nutrition 0.000 description 1
- 210000000969 egg white Anatomy 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 239000004931 filters and membranes Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 208000029570 hepatitis D virus infection Diseases 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 208000019423 liver disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 230000000379 polymerizing effect Effects 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000037452 priming Effects 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/04—Peptides having up to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- A61K38/08—Peptides having 5 to 11 amino acids
- A61K38/09—Luteinising hormone-releasing hormone [LHRH], i.e. Gonadotropin-releasing hormone [GnRH]; Related peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/162—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from virus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
- C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/24011—Flaviviridae
- C12N2770/24211—Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
- C12N2770/24222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oncology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Description
1 115725 HCV:n qenomisia sekvenssejä diagnostiikkaan
Keksintö koskee koostumuksia ja menetelmiä hepatiitti C-vi-rus (HCV) -infektion ilmaisemiseksi, jota aikaisemmin
5 nimitettiin veren välityksellä leviäväksi ei-A, ei-B
hepatiittivirus (NANBV) -infektioksi. Keksinnön mukaiset suoritusmuodot koskevat erityisemmin koostumuksia ja menetelmiä HCV:n ilmaisemiseksi.
10 HCV:n prototyyppieristys karakterisoitiin US-patenttiha-kemuksessa 122 714 (lähemmin myös EPO-julkaisussa 318 216) . Tässä yhteydessä käytettynä ilmaus "HCV" käsittää myös saman viruslajin uudet eristykset. Ilmaukseen "HCV-1" viitataan US-patenttihakemuksessa 122 714.
15 HCV on välittyvä sairaus, joka on erotettavissa muista viruksiin liittyvistä maksasairausmuodoista, mukaan lukien sairaudet, jonka aiheuttavat tunnetut hepatiittivirukset, se on, hepatiitti A -virus (HAV), hepatiitti B -virus (HBV) ja 20 delta-hepatiittivirus (HDV), samoin kuin hepatiitti, jonka aiheuttavat sytomegalovirus (CMV) tai Epstein-Barr -virus (EBV). HCV identifioitiin ensimmäisen kerran henkilöistä, jotka olivat saaneet verensiirtoja.
25 On olemassa merkittävä tarve löytää herkkiä, spesifisiä menetelmiä HCV:n kantajien, ja HCV:n kontaminoiman veren tai verituotteiden seulomiseksi ja identifioimiseksi. Verensiir- ,··, toa seuraavaa hepatiittia (PTH) esiintyy suunnilleen 10 • * %:illa verensiirron saaneista henkilöistä ja HCV aiheuttaa , 30 jopa 90 % näistä tapauksista. Tauti aiheuttaa usein < » * ·;;· kroonisen maksavaurion (25-55 %) .
• » n’·; Potilashuolto samoin kuin HCV:n leviämisen estäminen veren ja verituotteiden välityksellä tai läheisen henkilökontaktin , \ 35 kautta edellyttävät luotettavia seulonta-, diagnostiikka- ja » 1 k · ennustevälineitä HCV:hen liittyvien nukleiinihappojen, anti geenien ja vasta-aineiden ilmaisemiseksi.
2 115725 Tämän patenttihakemuksen mukaisesti esitetään, että HCVrllä on useita genotyyppejä. Sen mukaisesti HCV-viruksen geneettinen informaatio ei ehkä kaiken kaikkiaan ole identtinen kaikilla HCV-kannoilla vaan käsittää ryhmiä, 5 joilla on erilainen geneettinen informaatio.
Geneettinen informaatio kätkeytyy DNA:n ja RNA:n juostemai-siin molekyyleihin. DNA käsittää kovalenttisesti sidottuja deoksiribonukleotidiketjuja ja RNA käsittää kovalenttisesti 10 sidottuja ribonukleotidiketjuja. Kullekin nukleotidille on tunnusomaista yksi neljästä emäksestä: adeniini (A), guaniini (G), tyrniini (T) ja sytosiini (C) . Emäkset ovat komplementaariset siten, että funktionaalisten ryhmien orientaatiosta johtuen tietyt emäsparit vetävät toisiaan 15 puoleensa ja sitovat toisiaan vetysidoksilla ja n- sidosvuorovaikutuksilla. Adeniini toisessa DNA-juosteessa pariutuu vastakkaisen komplementaarisen juosteen tymiinin kanssa. Toisen DNA-juosteen guaniini pariutuu vastakkaisen komplementaarisen juosteen sytosiinin kanssa. RNA:ssa 20 tymiiniemäs on korvattu urasiililla (U) , joka pariutuu vastakkaisen komplementaarisen juosteen adeniinin kanssa. Elävän organismin geneettinen koodi sisältyy emäsparijärjestykseen. Elävät solut tunnistavat, kopioivat ja lukevat nukleiinihappoon sisältyvän informaation val-25 mistaakseen proteiineja ja peptidejä.
V, HCV-genomi käsittää yhden positiivisen RNA-juosteen. HCV- genomissa on yhtenäinen translationaalinen avoin lukukehys (ORF), joka koodittaa noin 3000 aminohappoa sisältävää poly-30 proteiinia. ORFrissa rakenneproteiini(t) näyttää olevan koo-ditettuna suunnilleen N-pään alueen ensimmäisessä neljännek-sessä, suurimman osan polyproteiinista vastatessa ei-·; · rakenneproteiineista.
35 HCV-polyproteiini käsittää aminopäästä karboksipäähän mentä- *· · essä nukleokapsidiproteiinin (C), vaippaproteiinin (E) ja ‘ ’ ei-rakenneproteiinit (NS) 1, 2 (b), 3, 4 (b) ja 5.
3 115725
Genotyypiltään erilaiset HCV:t voivat koodittaa proteiineja, jotka reagoivat muuntuvasti isännän immuunisysteemeihin. Genotyypiltään erilaiset HCV:t voi olla vaikea ilmaista immu-nodiagnostisilla menetelmillä ja nukleiinihappokoetinmene-5 telmillä, joita ei ole spesifisesti kohdistettu sellaiseen genotyyppiin.
Patenttihakemuksessa käytettyjen ilmausten määrittelyt esitetään jäljempänä keksinnön ymmärtämisen helpottamiseksi. 10 Ilmaus "vastaava" tarkoittaa tietylle nukleiinihapposekvens-sille homologista tai komplementaarista. Kuten nukleiinihappojen ja peptidien kesken, vastaava viittaa peptidin aminohappoihin järjestyksessä, joka on peräisin nukleiinihapon tai sen komplementin sekvenssistä.
15
Ilmaus "ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo" tarkoittaa genomisen nukleiinihapon osaa, cDNA:ta, puolisynteettistä nukleiinihappoa tai synteettistä nukleiinihappoa, joka alkuperänsä tai manipuloinnin johdosta: (1) ei liity 20 koko nukleiinihappoon, jonka yhteydessä se on luonnossa, (2) on kytkeytynyt nukleiinihappoon tai muuhun kemialliseen aineeseen, joka on muu kuin johon se on kytkeytynyt luonnossa, tai (3) joka ei esiinny luonnossa.
; 25 Vastaavasti ilmaus "ei-luonnollisena esiintyvä peptidi" tar koittaa osaa suuresta luonnossa esiintyvästä peptidistä tai :v, proteiinista tai puolisynteettistä tai synteettistä • » | peptidiä, joka alkuperänsä tai manipuloinnin johdosta (1) ei • i » liity koko peptidiin, johon se kytkeytyy luonnossa, (2) on 30 kytkeytynyt peptideihin, funktionaalisiin ryhmiin tai *; : kemiallisiin aineisiin, jotka ovat muita kuin ne, johon se on kytkeytynyt luonnossa, tai (3) joka ei esiinny luonnossa.
Ilmaus "aluke" tarkoittaa nukleiinihappoa, jonka avulla on 35 mahdollista aloittaa suuremman nukleiinihapon synteesi >: : sijoitettuna sopiviin olosuhteisiin. Aluke on kokonaan tai ’ ' olennaisilta osiltaan komplementaarinen kopioitavan nukleiinihapon alueen kanssa. Näin ollen, hybridisaatioon 4 115725 vaikuttavissa olosuhteissa aluke pariutuu suuremman nukleiinihapon komplementaarisen alueen kanssa. Sopivia reaktantteja lisättäessä aluke pitenee polymeroivan aineen vaikutuksesta, jolloin muodostuu kopio suuremmasta 5 nukleiinihaposta.
Ilmaus "sitoutumispari" tarkoittaa mitä tahansa molekyylipa-ria, joilla on keskinäistä affiniteettia tai sitoutumiska-pasiteettia. Tämän patenttihakemuksen mukaisesti ilmaus "li-10 gandi" tarkoittaa sitoutumisparin toista molekyyliä, ja ilmaukset "antiligandi" tai "reseptori" tai "kohde" tarkoittavat sitoutumisparin vastamolekyyliä. Esimerkiksi nukleiinihappojen ollessa kysymyksessä, sitoutumispari voi käsittää kaksi komplementaarista nukleiinihappoa. Toista nukleiiniha-15 poista voidaan nimittää ligandiksi ja toista juostetta nimitetään antiligandiksi, reseptoriksi tai kohteeksi. Nimitys ligandi tai antiligandi on vapaavalintainen sopimuskysymys. Muita sitoutumispareja ovat esimerkiksi antigeenit ja vasta-aineet, lääkeaineet ja lääkeaineiden reseptorikohdat ja 20 entsyymit ja entsyymien substraatit, muiden muassa.
; Ilmauksella "leima" tarkoitetaan molekyyliosaa, jonka avulla • on mahdollista detektoida, esimerkiksi, niihin : * : rajoittumatta, radioaktiiviset isotoopit, entsyymit, lull'; 25 minesoivat aineet, presipitoivat aineet ja väriaineet.
♦ * ♦
Ilmaus "kantaja" sisältää tavanomaiset kantajat kuten suo-timet ja membraanit samoin kuin talteenotettavat kantajat, jotka voidaan olennaisilta osiltaan dispergoida alustaan, ja 30 poistaa tai erottaa alustasta immobilisoimalla, suodattamal-la, osittamalla tai vastaavasti. Ilmaus "kantaj aväline" '*··’ tarkoittaa kantajia, jotka kyetään liittämään nukleiinihap- \ poihin, peptideihin tai vasta-aineisiin sitoutumisparien avulla tai kovalenttisten tai ei-kovalenttisten sidosten . 35 avulla.
Joitakin HCV-kantoja ja -eristyksiä on identifioitu. Verrattaessa USA:sta peräisin olevan alkuperäisen eristyksen s 115725 sekvenssiin ("HCV-1"; lähemmin Q.-L. Choo et ai. (1989) Science 244:359-362, Q.-L. Choo et ai. (1990) Brit. Med.
Bull. £6:423-441, Q.-L. Choo et ai., Proc. Natl. Acad. Sei. £8:2451-2455 (1991) ja EPO-patentti 318 216, (siteerattu 5 edellä), todettiin, että japanilainen eristys ("HCV Jl") poikkesi merkittävästi sekä nukleotidi- että polypeptidisek-venssiltään NS3- ja NS4-alueilla. Tämä johtopäätös laajennettiin myöhemmin koskemaan myös NS5- ja vaippa ((El/S ja E2/NS1) -alueita (lähemmin K. Takeuchi et ai., J. Gen. 10 Virol. (1990) 71:3027-3033, Y. Kubo, Nucl. Acids. Res.
(1989) 17:10367-10372 ja K. Takeuchi et ai., Gene (1990) ££:287-291). Edellinen eristysryhmä, alunperin
Yhdysvalloissa identifioituna, on nimeltään "Genotyyppi I" tämän julkaisun puitteissa, kun taas jälkimmäinen, alunperin 15 Japanissa identifioitu eristysryhmä on nimeltään "Genotyyppi II" tässä yhteydessä.
Tämä keksintö koskee ainekoostumuksia, jotka käsittävät nukleiinihappoja, jotka vastaavat HCV-virusgenomia, jossa 20 määräytyy erilaisia genotyyppejä. Keksintö koskee myös koostumusten käyttömenetelmiä, jotka koostumukset vastaavat HCV-virusgenomin sekvenssejä, jossa genomissa määräytyy eri-• '·. laisia tässä kuvailtuja genotyyppejä.
25 A. Nukleiinihappo koostumukset •h Tämän keksinnön mukaisella nukleiinihapolla, joka vastaa HCV-virusgenomia, jossa määräytyy erilaisia genotyyppejä, on ,käyttöä koettimina nukleiinihappohybridisaatiomäärityksissä, alukkeina nukleiinihapposynteesiä koskevissa reaktioissa, 30 sitoutumispareina HCV-virusnukleiinihapon erottamiseksi ;;; muista mahdollisesti läsnä olevista aineosista ja koodittavana nukleiinihappona (anti-sense) viruksen ·;·; nukleiinihapon transkription ja translaation estämiseksi.
, 35 Keksintö koskee yhdessä suoritusmuodossaan ei-luonnollisena ; esiintyvää nukleiinihappoa, joka sisältää ei-HCV-1 nukleotidisekvenssin, joka koostuu 8-252 peräkkäisestä nukleotidistä, jotka ovat täysin homologisia tai täysin 6 115725 komplementaarisia hepatitti C-viruksen 5'UT-alueelta olevan nukleotidisekvenssin kanssa ja jotka valitaan sekvensseistä SEQ ID nrot 34-49 ja jossa mainittu sekvenssi ei ole HCV-J1 tai HCV-J4.
5
Mitä tulee sekvensseihin, jotka vastaavat 5'UT-alueita, sekvenssi on edullisesti sekvenssialueella 34-51. Sekvenssi 33 vastaa HCV-l:tä. Sekvenssit 33-51 esitetään tämän patenttihakemuksen Sekvenssiluettelossa.
10 Tämän keksinnön mukaiset koostumukset muodostavat hybri-disaatiotuotteita nukleiinihapon kanssa, joka vastaa erilaisia HCV-genotyyppejä.
15 HCV:llä on ainakin viisi genotyyppiä, joihin viitataan tässä patenttihakemuksessa merkinnöillä GI-GV. Ensimmäinen geno-tyyppi, GI, esitetään sekvensseillä numeroilla 33-38. Toinen genotyyppi, Gil, esitetään sekvensseillä numeroituna 39-45. Kolmas genotyyppi, GUI, esitetään sekvensseillä numeroituna 20 46-47. Neljäs genotyyppi, GIV, esitetään sekvensseillä numeroituna 48-49. Viides genotyyppi, GV, esitetään sekvensseillä numeroituna 50 ja 51.
: ·': Tämä keksintö koskee yhdessä suoritusmuodossaan koostu- 25 muksia, jotka sisältävät nukleiinihapon, jolla on sekvenssi, joka vastaa yhtä tai useampaa HCV-genotyypin mukaista sekvenssiä.
• * »
» I
***** 7 115725 B. Menetelmä hybridisaatiotuotteen muodostamiseksi Tämän keksinnön mukaiset suoritusmuodot koskevat myös menetelmää hybridisaatiotuotteen muodostamiseksi nukleiinihapon kanssa, jolla on HCV:n nukleiinihappoa vastaava sekvenssi.
5 Yksi menetelmä käsittää vaiheet, joissa asetetaan ei- luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo, jolla on HCV:n nukleiinihappoa vastaava ei-HCV-1 -sekvenssi, olosuhteisiin, joissa hybridisaatio voi tapahtua. Ei-luonnossa esiintyvä nukleiinihappo kykenee muodostamaan hybridisaatiotuotteen 10 HCV:n nukleiinihapon kanssa hybridisaatio-olosuhteissa.
Menetelmä käsittää lisäksi vaiheen hybridisaatio-olosuhteiden asettamiseksi, hybridisaatiotuotteen muodostamiseksi HCV-genomin aluetta vastaavan nukleiinihapon läsnäollessa.
15
Hybridisaatiotuotteen muodostamisesta on hyötyä ilmaistaessa yhden tai useamman HCV-genotyypin läsnäoloa. Ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo muodostaa hybridisaatiotuotteen edullisesti HCV:n nukleiinihapon kanssa 20 5'UT-alueella. Hybridisaatiotuotteen ilmaisemiseksi on hyödyllistä liittää ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo leimaan. Hybridisaatiotuotteen muodostuminen • ·· ilmaistaan erottamalla hybridisaatiotuote leimatusta ei- : : luonnollisena esiintyvästä nukleiinihaposta, joka ei ole 25 muodostanut hybridisaatiotuotetta.
:·.·. Hybridisaatiotuotteen muodostamisella on käyttöä keinona erottaa yksi tai useampi HCV-nukleiinihappogenotyyppi muista mahdollisesti läsnäolevista aineosista. Sellaisiin käyttö-30 sovellutuksiin on käyttökelpoista yhdistää ei-luonnollisena ·;;; esiintyvä nukleiinihappo kantajaan, tuloksena saadun hybri- ‘ disaatiotuotteen erottamiseksi muista aineosista.
Nukleiinihappojen kerrosmäärityksissä ("sandwich") käytetään 35 yhtä nukleiinihappoa liitettynä leimaan ja toista nukleiini-* * happoa kinnitettynä kantajaan. Tämän keksinnön mukainen yksi suoritusmuoto koskee kerrosmääritystä, joka käsittää kaksi nukleiinihappoa, joista kummallakin on HCV:n 8 115725 nukleiinihappoja vastaavat sekvenssit; vähintään toisella ei-luonnollisena esiintyvällä nukleiinihapolla ollessa kuitenkin sekvenssi, joka vastaa ei-HCV-1 HCV nukleiinihappoa. Vähintään toinen nukleiinihappo kykenee 5 yhdistymään leiman kanssa ja toinen kykenee kiinnittymään kantajaan. Kantajaan kiinnittynyttä ei-luonnollisena esiintyvää nukleiinihappoa käytetään hybridisaatiotuotteiden erottamiseksi, jotka sisältävät HCV:n nukleiinihapon ja ei-luonnollisena esiintyvän nukleiinihapon, jolla on ei-HCV-1 -10 sekvenssi.
Tämä keksintö koskee yhdessä suoritusmuodossaan menetelmää yhden tai useamman HCV-genotyypin ilmaisemiseksi. Menetelmä käsittää vaiheet, joissa ei-luonnollisena esiintyvä nukle-15 iinihappo asetetaan olosuhteisiin, joissa hybridisaatio voi tapahtua. Ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo kykenee muodostamaan hybridisaatiotuotteen nukleiinihapon kanssa yhdestä tai useammasta HCV-genotyypistä. Ensimmäinen geno-tyyppi, GI, esitetään sekvensseillä numeroilla 33-38. Toinen 20 genotyyppi, Gil, esitetään sekvensseillä numeroituna 39-45.
Kolmas genotyyppi, GUI, esitetään sekvensseillä numeroituna 46-47. Neljäs genotyyppi, GIV, esitetään sekvensseillä numeroituna 48-49. Viides genotyyppi, GV, esitetään sekvensseillä numeroituna 50 ja 51.
25 HCV-nukleiinihapon hybridisaatiotuotteella ei-luonnollisena esiintyvän nukleiinihapon kanssa, joka sisältää ei-HCV-1 • · [..! -sekvenssin, joka vastaa HCV-genomiin sisältyviä sek venssejä, on käyttöä nukleiinihapposynteesireaktion 30 aloittamiseksi.
HCV-nukleiinihapon hybridisaatiotuotteella ei-luonnollisena *: * esiintyvän nukleiinihapon kanssa, jolla on sekvenssi, joka vastaa tiettyä HCV-genotyyppiä, on käyttöä reaktion aloitta-35 miseksi sellaisen genotyypin käsittävän nukleiinihapon syn- : teesiä varten. Yhdessä suoritusmuodossa syntetisoitu nukle- ‘ ‘ iinihappo indikoi yhden tai useamman HCV-genotyypin läsnä olon .
5 9 115725
Nukleiinihapon synteesi voi myös helpottaa nukleiinihapon kloonausta ekspressiovektoreihin, jotka syntetisoivat virus-proteiineja.
Näiden menetelmien mukaisilla suoritusmuodoilla on käyttöä "anti-sense"-aineina virusnukleiinihapon transkription tai translaation estämiseksi. Ei-luonnollisena esiintyvän nukleiinihapon käsittävän hybridisaatiotuotteen muodostaminen, 10 joka nukleiinihappo sisältää sekvenssejä, jotka vastaavat tiettyä genotyyppiä HCV-genomin HCV-nukleiinihapposekvens-seistä, voi estää sellaisen genotyypin translaation tai transkription. Terapeuttiset aineet voidaan muokata sisältämään kaikki viisi genotyyppiä kaikkinensa.
15
Keksintöä kuvaillaan edelleen seuraavissa kuvissa, joissa kuvataan sekvenssejä, jotka esittävät HCV-genotyyppejä. Sekvenssit on merkitty numeroilla 1-145, jotka numerot ja sekvenssit vastaavat Sekvenssiluettelossa esitettyjä numeroita 20 ja sekvenssejä. Sekvenssit 146 ja 147 helpottavat määrityksen pohdintaa, jotka numerot ja sekvenssit vastaavat Sekvenssiluettelossa esitettyjä numeroita ja sekvenssejä.
: ‘ : Kuvioiden ja Sekvenssiluettelon lyhyt kuvailu : 25 Kuviossa 1 kuvataan kaaviomaisesti HCV:n geneettistä sys- ·· teemiä; » * #
Kuviossa 2 esitetään nukleiinihapposekvenssit 33-51, jotka sekvenssit ovat peräisin HCV-virusgenomin 5'UT-alueelta.
30 *;;; Sekvenssiluettelossa esitetään sekvenssit 1-147.
·;·; Tätä keksintöä kuvaillaan yksityiskohtaisesti koskien nukle- ;·· iinihappoa, joka sisältää sekvenssejä, jotka vastaavat HCV- , 35 genomia, ja siihen liittyviä peptidejä ja sitoutumispareja ··· ; diagnostisiin ja terapeuttisiin sovellutuksiin.
Keksinnön mukaisessa käytännössä käytetään, ellei toisin ole 10 1 1 5725 osoitettu, tavanomaisia kemian, molekyylibiologian, mikrobiologian, yhdistelmä-DNA -tekniikan ja immunologian menetelmiä, jotka ovat alaa tuntevien tiedossa. Sellaisia menetelmiä selvitetään täydellisesti kirjallisuudessa.
5 Lähemmin esimerkiksi, Maniatis, Fitsch & Sambrook, Molecular Cloning; A Laboratory Manual (1982); DNA Cloning, Volyymit I ja II (D.N. Glover toim. 1985); Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait toim. 1984); Nucleic Acid Hybridization (B.D. Hames & S.J. Higgins toim. 1984); sarja, Methods in 10 Enzymology (Academic Press, Inc.), erityisesti voi. 154 ja voi. 155 (Wu ja Grossman, toim.).
cDNA-kirjastot ovat peräisin nukleiinihapposekvensseistä, jotka ovat läsnä HCV-infektoidun simpanssin plasmassa. Yhden 15 näistä kirjastoista konstruointia, "c"-kirjaston (ATCC 40394), kuvaillaan PCT-julkaisussa WO90/14436. Tämän keksinnön kannalta asiaankuuluvat sekvenssit esitetään tässä yhteydessä sekvenssinumeroilla 1, 23, 33 ja 52.
20 Tämän keksinnön mukaisesti eristetyt tai syntetisoidut nukleiinihapot ovat käyttökelpoisia esimerkiksi ilman rajoitusta, koettimina, alukkeina, "anti-sense" -geeneinä ja ekspressiosysteemien kehittämiseksi sellaisia sekvenssejä vastaavien peptidien synteesiä varten.
25
Kuvaillut nukleiinihapposekvenssit määräävät HCV-genotyypit virusgenomin neljän alueen osalta. Kuvio 1 kuvaa kaaviomai-sesti HCV:n rakennelmaa. Erityisen kiinnostavat neljä aluetta ovat NS5-alue, vaippa-1 -alue, 5'UT-alue ja 30 ydinalue.
Tässä patenttihakemuksessa numeroilla 1-22 esitetyt sekvens-· sit osoittavat vähintään viisi genotyyppiä NS5-alueella.
Sekvenssit 1-22 on kuvattuna Sekvenssiluettelossa. Kukin 35 sekvensseistä 1-22 on peräisin 340 nukleotidiä sisältävästä • nukleiinihaposta NS5-alueelta.
Viisi genotyyppiä määräytyvät sekvenssiryhmittymien perus- n 115725 teella, jotka määräytyvät sekvenssien 1-22 perusteella. Mukavuussyistä tässä patenttihakemuksessa eri genotyyppejä merkitään roomalaisilla numeroilla ja kirjaimella "G".
5 Ensimmäistä genotyyppiä (Gl) kuvaillaan sekvensseillä sek-venssialueella 1-6. Toista genotyyppiä (Gil) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 7-12. Kolmatta genotyyppiä (GUI) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 13-17. Neljättä genotyyppiä (GIV) kuvaillaan sekvensseillä sekvens-10 sialueella 20-22. Viidettä genotyyppiä kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 18 ja 19.
Tässä patenttihakemuksessa sekvenssit 23-32 viittaavat vähintään neljään genotyyppiin HCV:n vaippa-1 -alueella. 15 Sekvenssejä 23-32 kuvataan Sekvenssiluettelossa. Kukin sekvensseistä 23-32 on peräisin 100 nukleotidiä sisältävästä nukleiinihaposta vaippa-1 -alueelta.
20 Ensimmäistä vaippa-1 -genotyyppiryhmää (Gl) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 23-25. Toista vaippa-1 -geno-tyyppialuetta (Gil) kuvaillaan sekvensseillä sekvens sialueella 26-28. Kolmatta vaippa-1 -genotyyppiä (GUI) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 32. Neljättä : :: 25 vaippa-1 -genotyyppiä (GIV) kuvaillaan sekvensseillä sek- venssialueella 29-31.
Tässä patenttihakemuksessa esille tuodut sekvenssit 33-51 viittaavat vähintään kolmeen genotyyppiin HCV:n 5'UT-alu- 30 eella. Sekvenssejä 33-51 kuvataan kuviossa 2 samoin kuin Sekvenssiluettelossa. Kukin sekvensseistä 33-51 on peräisin i ;·* 252 nukleotidiä sisältävästä nukleiinihaposta 5'UT-alueelta, '> : vaikkakin sekvenssit 50 ja 51 ovat jonkin verran lyhyempiä, \ · suunnilleen 180 nukleotidiä.
: 35 ’“ ; Ensimmäistä 51UT-genotyyppiä (Gl) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 33-38. Toista 5’UT-genotyyppiä (Gil) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 39-45. Kolmatta 115725 12 5 'UT-genotyyppiä (GUI) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssi-alueella 46-47. Neljättä 5'UT-genotyyppiä (GIV) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 48 ja 49. Viidettä 5'UT-ge-notyyppiä (GV) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 50 5 ja 51.
Sekvenssit 48-62 viittaavat vähintään kolmeen genotyyppiin HCV: n ydinalueella. Sekvenssejä 52-66 kuvataan Sekvenssiluettelossa.
10
Ensimmäistä ydinalueen genotyyppiä (GI) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 52-57. Toista ydinalueen genotyyppiä (Gil) kuvaillaan sekvensseillä sekvenssialueella 58-64. Kolmatta ydinalueen genotyyppiä (GUI) kuvaillaan 15 sekvensseillä sekvenssialueella 65 ja 66. Sekvenssit 52-65 sisältävät 549 nukleotidiä. Sekvenssi 66 sisältää 510 nukleotidiä.
Kuvaillut eri genotyypit kunkin alueen osalta ovat yhdenmu-20 kaiset. Se tarkoittaa, että HCV:n ominaisuudet ensimmäisellä genotyypillä NS5-alueen osalta ovat olennaisesti yhdenmukaiset ominaisuuksien suhteen ensimmäisellä genotyypillä * '>· vaippa-1 -alueen, 5'UT-alueen ja ydinalueen osalta.
t > I I * ;V: 25 Sekvensseissä 1-66 esille tuotujen sekvenssien mukaisina eristetyt tai syntetisoidut nukleiinihapot ovat käyttö- ;· ·, kelpoisia koettimina, alukkeina, kiinnitysligandeina ja ' "anti-sense"-aineina. Koettimina, alukkeina, kiinnitysli- > » gandeina ja "anti-sense"-aineina nukleiinihapot käsittävät 30 tavallisesti suunnilleen kahdeksan tai useampia nukleotidejä spesifisyyden osalta samoin kuin kyvyltään muodostaa pysyviä hybridisaatiotuotteita.
: Koettimet 35 Nukleiinihappoa, joka on eristetty tai syntetisoitu sekvens-’ sin mukaisesti, joka määrää HCV-genomin alueen tietyn geno- tyypin, voidaan käyttää koettimena sellaisen genotyypin ilmaisemiseksi, tai käyttää yhdessä muiden nukleiinihappokoet- 115725 13 timien kanssa olennaisesti kaikkien HCV-genotyyppien ilmaisemiseksi.
Tässä patenttihakemuksessa esille tuodun sekvenssi-informaa-5 tion yhteydessä kahdeksan tai useampia nukleotidejä sisältävät sekvenssit identifioidaan, jotka saavat aikaan halutun sisällyttämisen tai poissulkemisen HCV:n eri genotyyppien osalta, ja asiaankuulumattomat nukleiinihapposekvenssit, jotka todennäköisesti tavataan hybridisaatio-olosuhteiden 10 aikana.
Alaa tuntevat henkilöt käsittävät helposti, että koettimina käytettävät nukleiinihapposekvenssit voidaan varustaa leimalla hybridisaatiotuotteen ilmaisemisen helpottamiseksi. 15
Kiinnitysliqandi Käytettäessä kiinnitysligandina (capture), edellä koettimien osalta kuvaillulla tavalla valikoitu nukleiinihappo voidaan helposti kiinnittää kantajiin. Tapa, jolla nukleiinihappo 20 liitetään kantajiin, on hyvin tunnettu. Nukleiinihapoilla, jotka sisältävät sekvenssejä, jotka vastaavat sekvenssiä sekvenssialueella 1-66, on käyttöä, kun erotetaan yhtä genotyyppiä edustava viruksen nukleiinihappo eri genotyyppiä ·': edustavan HCV:n nukleiinihaposta. Nukleiinihapoilla, jotka 25 on eristetty tai syntetisoitu sekvenssien mukaisesti sekvenssialueella 1-66, käytettäessä yhdistelmänä, on ·. käyttöä kaikkien HCV-genotyyppien kaiken nukleiinihapon sieppaamiseksi olennaisilta osiltaan.
» 1 115725 14
Alukkeet
Nukleiinihapoilla, jotka on eristetty tai syntetisoitu tässä yhteydessä kuvailtujen sekvenssien mukaisesti, on käyttöä alukkeina HCV-sekvenssien monistamiseksi. Polymeraasiketju-5 reaktio (PCR) -menetelmien osalta kahdeksan tai useampia nukleotidejä sisältävillä nukleiinihapposekvensseillä, jotka vastaavat yhtä tai useampaa sekvensseistä 1-66, on käyttöä yhdessä sopivien entsyymien ja reagenssien kanssa virusnukleiinihappokopioiden muodostamiseksi. Useita 10 alukkeita, jotka sisältävät erilaisia sekvenssejä, jotka vastaavat useampaa kuin yhtä genotyyppiä, voidaan käyttää kopioiden luomiseksi virusnukleiinihaposta sellaisten genotyyppien osalta.
15 Kopioita voidaan käyttää diagnostisissa määrityksissä HCV-viruksen ilmaisemiseksi. Kopiot voidaan liittää myös kloonaus- ja ekspressiovektoreihin polypeptidien muodostamiseksi, jotka vastaavat PCR:n avulla syntetisoitua nukleiinihappoa kuten jäljempänä kuvaillaan yksityiskoh-20 taisemmin.
"Anti-sense" ; ·· Nukleiinihapolla, joka on eristetty tai syntetisoitu tässä * yhteydessä kuvailtujen sekvenssien mukaisesti, on käyttöä : : 25 "anti-sense"-geeneinä (kooditusgeeneinä) HCV:n ilmentymisen J· estämiseksi.
,1 , HCV:n genotyyppiä vastaava nukleiinihappo ladataan sopivaan I | kantajaan kuten liposomiin, HCV:llä infektoituneeseen soluun 30 viemistä varten. Kahdeksan tai useampia nukleotidejä ’I ; sisältävä nukleiinihappo kykenee sitoutumaan viruksen nukleiinihappoon tai viruksen lähetti-RNA:hän. "Anti-sense" : nukleiinihappo sisältää edullisesti 30 tai useampia ; ; nukleotidejä, jotta saadaan aikaan tarpeellinen pysyvyys s, 35 viruksen nukleiinihapon tai viruksen lähetti-RNA:n ! ; hybridisaatiotuotteelle. Menetelmät "anti-sense"-nukle- iinihapon lataamiseksi tunnetaan alalla kuten US-patentissa 4 241 046 esitetään, julkaistu 23. joulukuuta, 1980 115725 lb
Papahadjopoulos et al.'lle.
Peptidisynteesi
Nukleiinihapolla, joka on eristetty tai syntetisoitu tässä 5 yhteydessä kuvailtujen sekvenssien mukaisesti, on käyttöä peptidien muodostamisessa. Sekvenssit, joita kuvaavat sekvenssit 1-32 ja 52-66, voidaan kloonata sopiviin vektoreihin tai käyttää nukleiinihapon eristämiseen. Eristetty nukleiinihappo yhdistetään sopivien DNA-kytkijoiden avulla ja kloo-10 nataan sopivaan vektoriin. Vektoria voidaan käyttää sopivan isäntäorganismin kuten E. colin transformointiin ja sekvenssien koodittama peptidi eristää.
Molekulaarista kloonaustekniikkaa kuvaillaan julkaisussa 15 Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Maniatis et al.,
Cold Spring Harbor Laboratory (1982).
Eristetyllä peptidillä on käyttöä antigeenisenä aineena rokotteiden ja tiettyä HCV-genotyyppiä kohtaan kohdistettujen 20 vasta-aineiden kehittämisessä.
Jäljempänä olevat esimerkit ovat keksintöä kuvaavia eikä niitä ole tarkoitettu rajoittamaan tämän keksinnön piiriä.
i i » S t ;1;:; 25 I. HCV RNA:n ilmaiseminen seerumista RNA uutettiin seerumista käyttäen guanidiniumsuolaa, fenolia ; V, ja kloroformia reagenssipakkauksen valmistajan ohjeiden
,*·, mukaisesti (RNAzol™ B -pakkaus, Cinna/Biotecx) . Uutettu RNA
! : t säestettiin isopropanolilla ja pestiin etanolilla. Kaikkiaan 30 25 μΐ seerumia käytettiin RNA:n eristämiseen ja puhdistettu RNA suspendoitiin uudelleen 5 pl:aan dietyylipyrokarbonaatilla käsiteltyä vettä myöhempää cDNA-; synteesiä varten.
35 II. cDNA-synteesi ja polymeraasiketjureaktio (PCR) -monista- ; minen
Taulukossa 1 luetellaan kaikkien näissä esimerkeissä käytettyjen PCR-alukkeiden ja koettimien sekvenssi ja paikka 16 1 1 5725 (HCVl:n suhteen). Kirjainmerkinnät nukleotideille vastaavat standardia 37 C.F.R. §§1.821-1.825. Kirjaimia A, C, G, T ja U käytetään siten tavallisessa merkityksessä adeniinille, sytosiinille, guaniinille, tymiinille ja urasiilille. 5 Kirjain M tarkoittaa A:ta tai C:tä; R tarkoittaa A:ta tai G:tä; W tarkoittaa A:ta tai T/U:ta; S tarkoittaa C:tä tai G:tä; Y tarkoittaa C:tä tai T/U:ta; K tarkoittaa G:tä tai T/U:ta; V tarkoittaa A:ta tai C:tä tai G:tä, ei T/U:ta; H tarkoittaa A:ta tai C:tä tai T/U:ta, ei G:tä; D tarkoittaa 10 A:ta tai G:tä tai T/U:ta, ei C:tä; B tarkoittaa C:tä tai G:tä tai T/U:ta, ei A:ta; N tarkoittaa (A:ta tai C:tä tai G:tä tai T/U:ta) tai (tuntematonta tai muuta). Taulukko 1 esitetään jäljempänä: 15
Taulukko 1
Sekv. no.Sekvenssi (5'-3') Nukleotidipaikka 67 CAAACGTAACÄCCAACCGRCGCCCACAGG 374-402 20 68 ACAGAYCCGCAKAGRTCCCCCACG 1192-1169 69 GCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCC 509-538 70 GCAACCTCGTGGAAGGCGACAACCTATCCC 509-538 ; ·.. 71 GTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATT 948-977 * 72 GTCACGAACGACTGCTCCAACTCAAG 948-973 ; 25 73 TGGACATGATCGCTGGWGCYCACTGGGG 1375-1402 74 TGGAYATGGTGGYGGGGGCYCACTGGGG 1375-1402 7 5 ATGATGAACTGGTCVCCYAC 1308-1327 ^ 76 ACCTTVGCCCAGTTSCCCRCCATGGA 1453-1428 77 AACCCACTCTATGYCCGGYCAT 205-226 30 78 GAATCGCTGGGGTGACCG 171-188 7 9 CCATGAATCACTCCCCTGTGAGGAACTA 30-57 ; 80 TTGCGGGGGCACGCCCAA 24 4-227 cDNA-synteesissä käytettiin toimintaohjetta, jonka on kehit-35 tänyt Perkin-Elmer/Cetus (GeneAmpR RNA PCR -pakkaus). Sekä : sattumanvaraista heksameeriä että alukkeita, jotka sisälsivät spesifisiä HCV:lle komplementaarisia sekvenssejä, käytettiin käänteistranskriptio (RT) -reaktion 115725 17 aloittamiseen. Kaikki prosessit, lukuunottamatta reak-tiokomponenttien lisäystä ja sekoittamista, suoritettiin lämpötilajaksolaitteessa (MJ Research, Inc.). Ensimmäisen juosteen cDNA-synteesireaktio inaktivoitiin 99°C:ssa 5 min.
5 ajan ja jäähdytettiin sen jälkeen 50°C:ssa 5 min. ajan ennen reaktiokomponenttien lisäämistä myöhempää monistamista varten. Viiden ensimmäisen jakson jälkeen 97°C:ssa 1 min., 50°C:ssa 2 min. ja 72°C:sa 3 min., 30 jaksoa 94°C:ssa 1 min., 55°C:ssa 2 min. ja 72°C:ssa 3 min. seurasi ja sen jälkeen 10 viimeinen 7 min. pidennys 72°C:ssa.
Genotyyppianalyysiä varten PCR-reaktion alukkeina käytettiin sekvenssejä 67 ja 68. Nämä alukkeet monistavat osan, joka vastaa ydin- ja vaippa-alueita. Monistamisen jälkeen reak-15 tiotuotteet erotettiin agaroosigeelillä ja siirrettiin sen jälkeen nailonmembraanille. Immobilisoitujen reaktiotuotteiden annettiin hybridisoitua 32P-leimatun nukleiinihapon kanssa, joka vastasi joko genotyyppi I:tä (ydin tai vaippa-1) tai genotyyppi II:ta (ydin tai vaippa-1). Genotyyppi II:ta 20 vastaava nukleiinihappo sisälsi sekvenssit 70 (ydin) ja 72 (vaippa) ja 74 (vaippa).
.. Genotyyppi I:n koettimet hybridisoituivat vain tuotteeseen, : joka oli monistettu eristyksistä, joissa oli genotyyppi I:n 25 sekvenssi. Vastaavasti genotyyppi II :n koettimet hybridisoi tuivat vain tuotteeseen, joka oli monistettu eristyksistä, joissa oli genotyyppi II:n sekvenssi.
Toisessa kokeessa PCR-tuotteet muodostettiin käyttäen sek-30 venssejä 79 ja 80. Tuotteet analysoitiin kuten edellä on •y kuvailtu, paitsi että sekvenssi 73:a käytettiin genotyyppi ·.·’ I:n ilmaisemiseksi, sekvenssi 74:ää käytettiin genotyyppi *;·; II:n ilmaisemiseksi, sekvenssi 77:ää (5' UT) käytettiin geno- tyyppi III:n ilmaisemiseksi ja sekvenssi 78:aa (5'UT) 35 käytettiin genotyyppi IV: n ilmaisemiseksi. Jokainen : sekvenssi hybridisoitui genotyyppispesifisellä tavalla.
ib 1 1 5725 III. HCV GI-GIV:n ilmaiseminen käyttäen kerroshybridisaa-tiomääritystä HCV RNA:lle
Liuosfaasista monistetun nukleiinihapon kerroshybridisaa-tiomäärityksen suoritustapaa kuvaillaan tässä esimerkissä.
5 Määritystavassa käytetään useita nukleiinihappokoettimia, jotta saadaan aikaan sieppaus ja ilmaisu. Kiinnityskoetinnu-kleiinihappo kykenee liittämään kiinteään kantajaan sitoutuneen komplementaarisen koettimen ja HCV nukleiinihapon kiinnittymisen aikaansaamiseksi. Ilmaisukoetinnukleiinihapossa 10 on ensimmäinen osa (A) , joka sitoutuu HCV-nukleiinihappoon, ja toinen osa (B), joka hybridisoituu toiseen monistajanukleiinihappoon. Monistajanukleiinihapossa on ensimmäinen osa (B1), joka hybridisoituu koetinnukleiinihapon osaan (B) ja sisältää myös viisitoista 15 toistoa osasta (C) . Monistajanukleiinihapon osa C kykenee hybridisoitumaan kolmeen leimattuun nukleiinihappoon.
Nukleiinihapposekvenssit, jotka vastaavat ryhmä I:n HCV-eristysten vaippa-1 -geenin nukleotidisekvenssejä, esitetään 20 sekvensseissä 81-99. Taulukossa 2 esitetään HCV-genomin alue, jota nukleiinihapposekvenssit vastaavat, ja sekvenssien edullinen käyttö.
> · : 25 < ► 1 t i 30 35
Taulukko 2
Koetinlaji Sekvenssi n:o Nukleotidinumeroalue i9 1 1 5725
Leima 81 879-911 5 Leima 82 912-944
Kiinnitys 83 945-977
Leima 84 978-1010
Leima 85 1011-1043
Leima 86 1044-1076 10 Leima 87 1077-1109
Kiinnitys 88 1110-1142
Leima 89 1143-1175
Leima 90 1176-1208
Leima 91 1209-1241 15 Leima 92 1242-1274
Kiinnitys 93 1275-1307
Leima 94 1308-1340
Leima 95 1341-1373
Leima 96 1374-1406 20 Leima 97 1407-1439
Kiinnitys 98 1440-1472
Leima 99 1473-1505 '·; Nukleiinihapposekvenssit, jotka vastaavat ryhmä II: n vaippa- 25 1 -geenin nukleotidisekvenssejä, esitetään sekvensseissä 100-118. Taulukossa 3 esitetään HCV-genomin alue, jota nukleiinihapposekvenssit vastaavat, ja sekvenssien edullinen käyttö. 1 »
Taulukko 3
Koetinlaji Sekvenssi n:o Nukleotidinumeroalue 20 1 1 5725
Leima 100 879-911 5 Leima 101 912-944
Kiinnitys 102 945-977
Leima 103 978-1010
Leima 104 1011-1043
Leima 105 1044-1076 10 Leima 106 1077-1109
Kiinnitys 107 1110-1142
Leima 108 1143-1175
Leima 109 1176-1208
Leima 110 1209-1241 15 Leima 111 1242-1274
Kiinnitys 112 1275-1307
Leima 113 1308-1340
Leima 114 1341-1373
Leima 115 1374-1406 20 Leima 116 1407-1439
Kiinnitys 117 1440-1472
Leima 118 1473-1505 f * 25 Nukleiinihapposekvenssit, jotka vastaavat nukleotidisekvens-sejä C-geenisssä ja 5'UT-alueella, esitetään sekvensseissä 119-145. Taulukossa 4 identifioidaan sekvenssi ja edullinen • » .· ·, käyttö.
Taulukko 4
Koetintyyppi Sekvenssinumero 115725 21
Kiinnitys 119 5 Leima 120
Leima 121
Leima 122
Kiinnitys 123
Leima 124 10 Leima 125
Leima 126
Kiinnitys 127
Leima 128
Leima 129 15 Leima 130
Kiinnitys 131
Leima 132
Leima 133
Leima 134 20 Leima 135
Kiinnitys 136
Leima 137 • ’·. Leima 138 : ·’: Leima 139 25 Kiinnitys 140
Leima 141
Leima 142
Leima 14 3
Kiinnitys 144 30 Leima 14 5
Ilmaisu- ja kiinityskoettimen HCV-spesifiset osat ja niitä v; vastaavat nimet tässä määrityksessä käytettynä olivat seu- raavat.
35 • : : Kiinnityssekvenssit ovat sekvenssejä numeroilla 119-122 ja 141-144.
22 1 1 5725
Ilmaisusekvenssit ovat sekvenssejä numeroilla 119-140.
Kukin ilmaisusekvenssi sisälsi HCV-sekvenssien suhteen olennaisesti komplementaaristen sekvenssien lisäksi 5'-pidennyk-5 sen (B) , joka pidennys (B) on komplementaarinen toisen monistajanukleiinihapon osan kanssa. Pidennys (B) identifioidaan Sekvenssiluettelossa sekvenssi 146:11a ja toistetaan jäljempänä.
10 AGGCATAGGACCCGTGTCTT
Kukin kiinnityssekvenssi sisälsi HCV-sekvenssien kanssa olennaisesti komplementaaristen sekvenssien lisäksi kiinteään faasiin sidotun DNA:n kanssa komplementaarisen sek-15 venssin. Kiinteään kantajaan sidotun DNA:n kanssa komplementaarinen sekvenssi sijoittui kiinnityssekvenssin alapuolelle. Kantajaan sidotun DNA:n kanssa komplementaarinen sekvenssi esitetään sekvenssillä 147 ja toistetaan jäjempänä.
20
CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG
J Mikrotitrauslevyt preparoitiin seuraavasti. Valkoiset Micro- lite 1 Removawell levyt (polystyreeni mikrotitrauslevyt, 96 25 kaivoa/levy) ostettiin Dynatech Inc.'lta.
Kukin kaivo täytettiin 200 pl:lla 1 N HC1:ää ja inkuboitiin ! huoneenlämpötilassa 15-20 min. ajan. Levyt pestiin sen jäl
keen neljä kertaa IX PBS:llä ja kaivot aspiroitiin nesteen 30 poistamiseksi. Kaivot täytettiin sen jälkeen 200 piillä 1 N
NaOH:a ja inkuboitiin huoneenlämpötilassa 15-20 min. ajan. Levyt pestiin jälleen 4 kertaa IX PBS:llä ja kaivot aspiroi- tiin nesteen poistamiseksi.
t t 35 Poly(phe-lys) ostettiin Sigma Chemicals Inc.'lta. Tämän po- lypeptidin phe:lys -moolisuhde on 1:1 ja keskimääräinen mo- ' ' lekyylipaino 47 900 g/mooli. Sen keskipituus on 309 aminohappoa ja se sisältää 155 amiinia/mooli. 1 mg/ml 23 1 1 5725 polypeptidiliuos sekoitettiin 2 M NaCl/lX PBS:n kanssa loppupitoisuuteen 0,1 mg/ml (pH 6,0). 200 μ1:η tilavuus tätä liuosta lisättiin kuhunkin kaivoon. Levy käärittiin muoviin kuivumisen estämiseksi ja inkuboitiin 30°C:ssa yli yön. Levy 5 pestiin sen jälkeen 4 kertaa IX PBS:llä ja kaivot aspiroitiin nesteen poistamiseksi.
Seuraavaa menettelyä käytettiin nukleiinihapon, komplementaarinen sekvenssi sekvenssille 147, liittämiseksi 10 levyihin, jota tämän jälkeen nimitetään immobilisoiduksi nukleiinihapoksi. Immobilisoidun nukleiinihapon synteesiä, jonka sekvenssi oli komplementaarinen sekvenssi 133: n suhten, kuvailtiin EPA-julkaisussa 883096976. 20 mg:n määrä disukkinimidyylisuberaattia liuotettiin 300 pl:aan 15 dimetyyliformamidia (DMF) . Määrällisesti 26 OD26o-yksikköä
immobilisoitua nukleiinihappoa lisättiin 100 pl:aan kytkentäpuskuria (50 mM natriumfosfaatti, pH 7,8). Kytkentäseos lisättiin sitten DSS-DMF -liuokseen ja sekoitettiin magneettisekoittajalla 30 min. NAP-25 -kolonni 20 tasapainotettiin 10 mM natriumfosfaatilla, pH 6,5. DSS-DMF
kytkentäseos lisättiin 2 ml:aan 10 mM natriumfosfaattia, pH
6,5 4°C:ssa. Seosta pyörresekoitettin ja se ladattiin tasapainotettuun NAP-25 -kolonniin. DSS-aktivoitu immobilisoitu nukleiinihappo-DNA eluoitiin kolonnista 3,5 : 25 ml:11a 10 mM natriumfosfaattia, pH 6,5. Määrällisesti 5,6 OD26o-yksikköä eluoitua DSS-aktivoitua immobilisoitua nuk-leiinihappo-DNA: ta lisättiin 1500 ml: aan 50 mM natriumfos-faattia, pH 7,8. Tilavuudeltaan 50 μΐ tätä liuosta lisättiin kuhunkin kaivoon ja levyjä inkuboitiin yli yön. Levy pestiin 30 sen jälkeen 4 kertaa IX PBS:llä ja kaivot aspiroitiin nesteen poistamiseksi.
; Levyjen lopullinen pohjustus suoritettiin seuraavasti. 200 : μ1:η tilavuus 0,2 N NaOH:a, joka sisälsi 0,5 % (paino/tila- 35 vuus) SDS:ää, lisättiin kuhunkin kaivoon. Levy käärittiin : muoviin ja sitä inkuboitiin 65°C:ssa 60 min. Levy pestiin sen ' jälkeen 4 kertaa IX PBS:llä ja kaivot aspiroitiin nesteen poistamiseksi. Pohjustettua levyä säilytettiin kuivausaine- 24 115725 helmien kanssa 2-8°C:ssa.
Määritettävät seeruminäytteet analysoitiin käyttäen PCR:ää, jota seurasi sekvenssianalyysi genotyypin määrittämiseksi.
5 Näytteen preparointi käsitti 50 pl:n seeruminäytteen ja 150 μ1:η P-K -puskurin annostelun (2 mg/ml proteinaasi K: ta liuoksessa 53 mM Tris-HCl, pH 8,0/0,6 M NaCl/0,06 M natrium-sitraatti/8 mM EDTA, pH 8,0/1,3 % SDS/16 pg/ml sonikoitu 10 lohen sperman DNA/7 % formamidi/50 fmoolia kiinnityskoetti-mia/160 fmoolia ilmaisukoettimia) kuhunkin kaivoon. Levyjä ravisteltiin kaivojen sisällön sekoittamiseksi, ne suljettiin ja niitä inkuboitiin 16 tuntia 62°C:ssa.
15 Vielä 10 minuutin jakson jälkeen huoneenlämpötilassa jo
kaisen kaivon sisältö aspiroitiin kaiken nesteen poistamiseksi ja kaivot pestiin 2X pesupuskurilla (0,1 % SDS/0,015 M NaCl/0,0015 M natriumsitraatti). Kuhunkin kaivoon lisättiin sen jälkeen monistajanukleiinihappo (50 μΐ 0,7 20 fmoolia/μΐ liuosta liuoksesa 0..48 M Nacl/0,048 M
natriumsitraatti/0,1 % SDS/0,5 % "sulkureagenssi" (Boeh- ringer Mannheim, luettelon n:o 1096 176)). Levyjen sulkemisen ja kaivojen sisällön ravistelun jälkeen levyjä in- : kuboitiin 30 min. ajan 52°C:ssa.
25
Vielä 10 min. jakson jälkeen huoneen lämpötilassa kaivot pestiin kuten edellä on kuvailtu.
Alkalisella fosfataasilla leimattu nukleiinihappo, esitetty 30 EP 883096976:ssa, lisättiin sen jälkeen kuhunkin kaivoon (50 ·; ; μΐ/kaivo pitoisuudessa 2,66 fmoolia/μΐ). Inkuboinnin jälkeen ’· ·’ 52°C:ssa 15 min. ajan ja 10 min. ajan huoneen lämpötilassa ; I kaivot pestiin kahdesti kuten edellä ja sen jälkeen kolmesti : 0,015 M NaCl/0,0015 M natriumsitraatissa.
35
Entsyymin laukaisemaa dioksetaania (Schaap et ai., Tet.
‘ Lett. (1987) 28μ1159-1162 ja EPA-julkaisu 0254051), saatuina
Lumigen Inc.'Itä, käytettiin. 50 μ1:η määrä Lumiphos 530:tä 25 115725 (Lumigen) lisättiin kuhunkin kaivoon. Kaivoja kopautettiin kevyesti niin, että reagenssi vajoaisi pohjalle, ja pyöriteltiin kevyesti reagenssin jakamiseksi tasaisesti pohjapinnalle. Kaivot suljettiin ja inkuboitiin 37°C:ssa 20-5 40 min.
Levyt luettiin sen jälkeen Dynatech ML 1000 -luminometrillä. Ulostulo (tulostus) esitettiin valon kokonaisintegraalina, joka muodostui reaktion aikana.
10 Määritys ilmaisi positiivisesti kunkin seeruminäytteen, genotyypistä riippumatta.
IV. Eri genotyyppien määräävien sekvenssien koodittaman 15 polypeptidin ilmentäminen
Sekvenssialueella 1-66 olevan sekvenssin koodittamat HCV-polypeptidit ilmentyvät fuusiopolypeptidinä superoksidi-dismutaasin (SOD) kanssa. Sellaisia sekvenssejä sisältävä cDNA subkloonataan ekspressiovektoriin pSODcfl (Steimer et 20 ai., 1986)).
Ensiksi, pSODcflrstä eristettyä DNA:ta käsitellään BamHI:llä ja EcoRI:llä ja seuraava kytkijä liitettiin rest-- ·’: riktioentsyymeillä muodostettuun lineaariseen DNArhan: : 25
\ 5 GAT CCT GGA ATT CTG ATA AGA
!1.·. CCT TAA GAC TAT TTT AA 3 i t t 1
Kloonauksen jälkeen insertin sisältämä plasmidi eristetään.
30
Inserin sisältävä plasmidi pilkotaan EcoRI:llä. HCV cDNA
liitetään tähän EcoRI:llä lineaariseksi tehtyyn plasmidi-• DNA:hän. DNA-seosta käytetään transformoitaessa E. coli : D1210 -kanta (Sadler et ai., (1980)). Polypeptidit eris- 35 tetään geeleillä.
26 115725 V. Polypeptidien antigeenisyys
Jaksossa IV muodostettujen polypeptidien antigeenisyys arvioidaan seuraavalla tavalla. Polyetyleenikärjet, järjestettyinä kasettiin 8 12 järjestyksessä (Coselco Mime- 5 topes, Victoria, Australia) preparoidaan sijoittamalla kärjet hauteeseen (20 % tilavuus/tilavuus piperidiini dimetyyliformamidissa (DMF) ) 30 min. ajaksi huoneenläm pötilassa. Kärjet poistetaan, pestään DMF:ssä 5 minuutin ajan, pestään sen jälkeen metanolissa neljä kertaa (2 10 min/pesu). Kärkien annetaan ilmakuivua vähintään 10 minuutin ajan ja pestään sen jälkeen viimeisen kerran DMF:ssä (5 min.). 1-hydroksibentsotriatsolia (HOBt, 367 mg) liuotetaan DMFrään (80 μΐ) käytettäväksi jaksossa IV valmistettujen Fmoc-suojattujen polypeptidien kytkemiseen.
15
Suojatut aminohapot sijoitetaan mikrotitrauslevyn kaivoihin HOBt:n kanssa ja kärkikasetti asetetaan levyn päälle, upottaen kärjet kaivoihin. Kokoonpano suljetaan sitten muovipussiin ja sen annetaan reagoida 25°C:ssa 18 tunnin ajan 20 ensimmäisten aminohappojen liittämiseksi kärkiin. Kasetti poistetaan sitten ja kärjet pestään DMFrllä /2 min.), MeOHrlla (4x2 min.) ja jälleen DMFrllä (2 min.) sitoutuneiden aminohappojen puhdistamiseksi ja suojauksen poistamiseksi. Menettely toistetaan kunkin lisäksi kytketyn : 25 aminohapon osalta kunnes kaikki oktameerit on valmistettu.
> »
Vapaat N-päät asetyloidaan sen jälkeen vapaalla amidilla kompensoimiseksi, koska useimmat epitoopeista eivät sijaitse N-päässä eikä se siten sisältäisi siihen liittyvää positii-30 vista varausta. Asetylointi suoritetaan täyttämällä mikrotitrauslevyn kaivot liuoksella DMF/asetanhydri-‘ di/trietyyliamiini (5:2:1 tilavuus/tilavuus/tilavuus) ja • antamalla kärkien reagoida kaivoissa 90 minuuttia 20°C:ssa. Kärjet pestään sen jälkeen DMF:llä (2 min.) ja MeOH:lla (4x, 35 2 min.) ja ilmakuivataan vähintään 10 minuuttia. 1
Sivuketjujen suojaryhmät poistetaan käsittelemällä kärkiä trifluorietikkahappo/fenoli/ditioetaanilla (95:2,5:1,5, ti- 1 1 5725 27 lavuus/tilavuus/tilavuus) polypropyleenipusseissa 4 tunnin ajan huoneenlämpötilassa. Kärjet pestään sitten dikloorime-taanissa (2x, 2 min.), 5 %:isessa di-isopropyylietyyliamii- ni/dikloorimetaanissa (2x, 5 min.), dikloorimetaanissa ja 5 ilmakuivataan vähintään 10 minuutin ajan. Kärjet pestään sitten vedessä (2 min.), MeOH:ssa (18 tuntia), kuivataan alipaineessa ja säilytetään tiiviisti suljetuissa muovipusseissa silikageelin päällä. IV.B.15.b Assay of Peptides.
10 Oktameerin omaavat kärjet käsitellään sonikoimalla 30 minuuttia hajotuspuskurissa (1 % natriumdodekyylisulfaattia, 0,1 % 2-merkaptoetanolia, 0,1 M NaH2P04:ää) 60°C:ssa, jota seuraa keittäminen MeOHrssa (2 min.), ja annetaan ilmakuivua.
15 Kärkiä esipäällystetään sitten 1 tunnin ajan 25°C:ssa mik-rotitrauskaivoissa sekoituksessa, jotka sisältävät 200 μΐ sulkupuskuria (1 % munanvalkuaista, 1 % BSArta, 0,1 %
Tweeniä ja 0,05 % NaN3ia PBSrssä). Kärjet upotetaan sitten 20 mikrotitrauskaivoihin, jotka sisältävät 175 μΐ antiseeru- meita, jotka on saatu ihmispotilaista, joista on diagnosoitu HCV, ja annetaan inkuboitua 4°C:ssa yli yön. Kompleksin muodostuminen seerumin polyklonaalisten vasta-aineiden ja j ‘ : polypeptidin välille osoittaa, että peptidit saavat aikaan 25 immuunivasteen in vivo. Sellaiset peptidit ovat ehdolla » . j. rokotteiden kehittämiselle.
Tätä keksintöä on siten kuvailtu ja valaistu. Alaa tunteville on selvää, että variaatioita ja modifikaatioita voi-30 daan tehdä poikkeamatta oheisten patenttivaatimuksien ; ; piiristä ja poikkeamatta tämän keksinnön mukaisesta ope tuksesta ja alueesta.
* 28 1 1 5725
Sakvenssiluettelo (1) Yleistiedot: (i) APPLICANT: Tai-An Cha 5
(ίί) TITLE OF INVENTION: HCV GENOMIC SEQUENCES
FOR DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS
(iii) NUMBER OF SEQUENCES: 147 10 (iv) CORRESPONDENCE ADDRESS: (A) ADDRESSEE: Wolf, Greenfield & Sacks, P.C.
(B) STREET: 600 Atlantic Avenue (C) CITY: Boston 15 (D) STATE: Massachusetts
(E) COUNTRY: USA
(F) ZIP: 02210 (v) COMPUTER READABLE FORM: 20 (A) MEDIUM TYPE: Diskette, 5.25 inch (3) COMPUTER: IBM compatible (C) OPERATING SYSTEM: MS-DOS Version 3.3 (D) SOFTWARE: WordPerfect 5.1 ,.25 (is) TELECOMMUNICATION INFORMATION: (A) TELEPHONE: (617) 720-3500 (B) TELEFAX: (617) 720-2441
30 (C) TELEX: EZEKIEL
• I
(2) INFORMATION FOR S2Q ID NO: 1: ;·1'; (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: .1··. 35 (A) LENGTH: 340 nucleotides (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear / 29 1 1 57:2 5 (vi) CURRENT APPLICATION DATA: (A) APPLICATION NUMBER: Not Available 5 (3) PILING DATE: Not Available (C) CLASSIFICATION: Not Available (vii) PRIOR APPLICATION DATA: (A) APPLICATION NUMBER: 07/597,326 ίο (B) FILING DATE: 8 May 1991 (viii) ATTORNEY/AGENT INFORMATION: (A) NAME: Janiuk, Anthony J.
(B) REGISTRATION NUMBER: 29,809 is (C) REFERENCE/DOCXET NUMBER: C0772/7000 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 1 (i) Sekvenssiominaisuudet: 20 (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
: 25 (ii) Molekyylityyppi: DNA
..,·;' (vi) Alkuperäinen lähde: (ATCC # 40394) : (C) Yksittäinen eristys: ns5hcvl 30 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:c 1 • · • # • · · I t · • ·
t I
35 # 1 » · 115725 CTCCACÄGTC ACTGAGAGCG ACATCCGTAC GGAGGAGGGA 40
ATCTACCAAT GTTGTGACCT CGACCCCCAA GCCCGCGTGG SO
5 CCATCAAGTC CCTCACCGAG AGGCTTTATG TTGGGGGCCC 120 TCTTACCAAT TCÄAGGGGGG AGAACTGCGG CTATCGCAGG 160 TGCCGCGCGA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTAACA 200 CCCTCACTTG CTACATCAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGAGC 240 CGCAGGGCTC CAGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC 280 10 GACTTAGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGG GTCCAGGAGG 320 ACGCGGCGAG CCTGAGAGCC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 2 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 20 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
; · (vi) Alkuperäinen lähde: * "25 (C) Yksittäinen eristys: ns5i21 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 2 CTCCACÄGTC ACTGAGAGCG ACATCCGTAC GGAGGAGGCA 40 • · · ATTTACCAAT GTTGTGACCT GGACCCCCAA GCCCGCATGG 80 30 CCATCAAGTC CCTCACTGAG AGGCTTTATG TCGGGGGCCC 120
: TCTTACCAAT TCAAGGGGGG AGAACTGCGG CTACCGCAGG ISO
TGCCGCGCGA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTAACA' 200 CCCTCACTTG CTACATCAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGAGC 240 J5 CGCAGGGCTC CAGGACTGCA CCATGCTTGT GTGTGGCGAC 280 Λ GACTTAGTCG TTATCTGTGA AAGTGCGGGG GTCCAGGAGG 320 v*; ACGCGGCGAG CCTGAGAGCC 340 ,1 3i 1 1 5725 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 3 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
10 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5ptl (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 3 15 CTCCACAGTC ACTGÄGASCG ACATCCGTAC GGAGGAGSCA 40 ATCTACCAAT GTTGTGATCT GGACCCCCAA GCCCGCGTGG 80 .
CCATCAAGTC CCTCACTGA9 AGGCTTTACG TTGGGGGCCC 120 TCTTACCAAT TCAAGGGGGG AGAACTGCGG CTACCGCAGG 160 20 TGCCGGGCGA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTAATA 200 CCCTCACTTG GTACATCAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGÄGC 240 CGGAGGGCTC CGGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGTGAC 280 GACTTGGTCG TTATCTGTGA GAGTGCGGGG GTCCAGGAGG 320 : ’·· ACGCGGCGAG CCTGAGAGCC 340 : =25 ·’.· · (2) Informaatio Sekvenssille n:o 4 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 3 40 nukleotidiä το (B) Tyyppi: nukleiinihappo : (C) Juosteisuus: yksinkertainen .···. (D) Topologia: lineaarinen
: (ii) Molekyylityyppi: DNA
J5 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5gm2 / (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 4 32 1 1 5725 CTCTACAGTC ACTGAGÄACG ACATCCGTAC GGAGGAGGCA 40 ATTTACCAAT GTTGTGACCT GGACCCCCAA GCCCGCGTGG 80 CCATCAAGTC CCTCACTGAG AGGCTTTATG TTGGGGGCCC 120 5 CCTTACCAAT TCAAGGGGGG AAAACTGCGG CTATCGCAGG' 160 TGCCGCGCGA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTÄACA 200 CCCTCACTTG CIACATIAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGAGC 240 CGCAGGGCTC CAGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC 280 GACTTAGTCG TTATCTGTGA GAGTGCGGGA GTCCAGGAGG 320 10 ACGCGGCGAA CTTGAGAGCC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 5 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 20 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
'· (vi) Alkuperäinen lähde: • 125 (C) Yksittäinen eristys: nsSusi7
• » I
·;· (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 5 : CTCCACAGTC-ACTGAGAGCG ATATCCGTAC GGAGGAGGCA 40 ATCTACCAGT GTTGTGACCT GGACCCCCAA GCCCGCGTGG 80 10 CCATCAAGTC CCTCACCGAG AGGCTTTATG TCGGGGGCCC 120 i.:‘: TCTTACCAAT TCAAGGGGGG AAAACTGCGG CTATCGCAGG 160 TGCCGCGCAA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTÄACA 200 CCCTCACTTG TTACATCAAG GCCCAAGCAG CCTGTCGAGC 240 • » CGCAGGGCTC CGGGÄCTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC 280 GACTTAGTCG TTATCTGTGA AAGTCAGGGA GTCCAGGAGG 320 ATGCAGCGAA CCTGAGÄGCC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 6 > 33 1 1 5725 (i) Sekvanssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 5 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: 10 (C) Yksittäinen eristys: ns5sp2 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 6 CTCTACAGTC ACTGAGAGCG ATATCCGTAC GGAGGAGGCA 40 15 ATCTACCAAT GTTGTGACCT GGACCCCGAA GCCCGTGTGG 80 CCATCAAGTC CCTCACTGAG AGGCTTTATG TTGGGGGCCC 120 TCTTACCAAT TCAAGGGGGG AGAACTGCGG CTACCGCÄGG 160 TGCCGCGCAA GCGGCGTACT GACGACTAGC TGTGGTAATA 200 CCCTCACTTG TTACATCAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGAGC 240 20 CGCAGGGCTC CAGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC 280 GÄCCTAGTCG TTATCTGCGA AAGTGCGGGG GTCCAGGAGG 320 ACGCGGCGAG CCTGAGAGCC .340 : (2) Informaatio Sekvenssille n:o 7 i 25 • t » 1 V · (i) Sekvenssiominaisuudet: ..‘j1 (A) Pituus: 340 nukleotidiä :v: (B) Tyyppi: nukleiinihappo :1·1; (C) Juosteisuus: yksinkertainen , in (D) Topologia: lineaarinen
,··1. (ii) Molekyyli tyyppi: DNA
• · » : (vi) Alkuperäinen lähde: 35 (C) Yksittäinen eristys: ns5jl » » · • ♦ 1 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 7 / · 34 1 1 5725 CTCCACAGTC ACTGÄGAATG ACACCCGTGT TGAGGAGTCA 40 ATTTACCAAT G'ITGTGACTT GGCCCCCGAA GCCAGACAGG 80 5 CCATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTCTATG TCGGGGGTCC 120 TATGACTAAC TCCAAAGGGC AGAACTGCGG CTATCGCCGG 160 TGCCGCGCGA GCGGCGTGCT GACGACTAGC TGCGGTÄATA 200 I CCCTCACATG CTACCTGAAG GCCACAGCGG CCTGTCGAGC 240 TGCCAAGCTC CAGGACTGCA CGATGCTCGT GAACGGAGAC 280 10 GACCTTGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGG AACCAAGAGG 320 ACGCGGCAAG CCTACGAGCC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 8 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: ! ** (C) Yksittäinen eristys: ns5kl *» · : 25 •«· ·’ (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 8 * % » ctcaacggtc actgagaatg acatccgtgt tgaggagtca 40 • « · ATTTACCAAA GTTGTGACTT GGCCCCCGAG GCCAGACAAG 80 ' CCATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTTTACÄ TCGGGGGCCC 120 30 CCTGACTÄAT TCAAAAOGGC AGAACTGCGG CTATCGCCGA 160 » 1 " : TGCCGCGCCA GCGGTGTGCT GACGACTAGC TGCGGTÄATA 200 * 1 » CCCTCACATG TTACTTGAAG GCCACTGCGG CCTGTAGAGC 240 ·1·1: TGCGAAGCTC CAGGACTGCA CGATGCTCGT GTGCGGAGAC 280 35 GACCTTGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGA ACCCAGGAGG 320 ÄTGCGGCGAG CCTACGAGTC 340 } « | (2) informaatio Sekvenssille n:o 9 · ♦ · 1 35 1 1 5725 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 5 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: 10 (C) Yksittäinen eristys: ns5kl.l (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 9 CTCAACGGTC ACCGAGAATG ACATCCGTGT TGAGGAGTCA 40 ÄTTTATCAAT GTTGTGCCTT GGCCCCCGAG GCTAGACAGG 80 15 CCATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTTTATA TCGGGGGCCC 120 CCTGACCAAT TCAÄAGGGGC AGAACTGCGG TTATCGCCGG 160 TGCCGCGCCA GCGGCGTACT GACGACCAGC TGCGGTAATA 200 CCCTTACATG TTACTTGAAG GCCTCTGCAG CCTGTCGAGC 240 CGCGAAGCTC CAGGACTGCA CGATGCTCGT GTGTGGGGAC 280 20 GACCTTGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGA ACCCAGGAGG 320 ACGCGGCGAA CCTACGAGTC , 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 10 .25 : : (i) Sekvenssiominaisuudet: ·:· (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: . nukleiinihappo * » (C) Juosteisuus: yksinkertainen 2Q (D) Topologia: lineaarinen t » * • » ·
(ii) Molekyylityyppi: DNA
» » * * * : (vi) Alkuperäinen lähde: 35 (C) Yksittäinen eristys: ns5gh6 ;l > I · (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 10 36 1 1 5725 CTCAACGGTC ACTGAGAG7G ACATCCGTGT CGASGAGTCG 40 ATTTACCAAT GTTGTGACTT GGCCCCCGÄA GCCAGGCAGG 80 5 CCATAAGGTC GCTCACCGAG CGACTTTATA TCGGGGGCCC 120 CCTGACTAAT TCAAAAGGGC AGAACTGCGG TTATCGCCGG 180 TGCCGCGCGA GCGGCGTGCT GACGACTAGC TGCGGTAATA 200 CCCTCACATG TTACTTGAAG GCCTCTGCAG CCTGTCGAGC 240 TGCAÄÄGCTC CÄGGACTGCA CGATGCTCGT GAACGGGGAC 280 10 GACCTTGTCG TTATCTGCGA GAGCGCGGGA ACCCAAGAGG 320 ACGCGGCGAG CCTACGAGTC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 11 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen .
(D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: ·' (C) Yksittäinen eristys: nsSspl 25 /· > (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 11 ctccacagtc actgagagtg acatccgtgt tgaggagtca 4o ATTTACCAAT GTTGTGACTT GGCCCCCGAA GCCÄGACAGG 80 CTATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTGTACA TCGGGGGTCC 120 30 CCTGACTAAT TCAAAAGGGC AGAACTGCGG CTATCGCCGG 16fl_
• I
: TGCCGCGCAA GCGGCGTGCT GACGACTAGC TGCGGTAACA 200 CCCTCACATG TTACTTGAAG GCCTCTGCGG CCTGTCGAGC 240 :v. TSCGAAGCTC CAGGÄCTGCA CGATGCTCGT GTGCGGTGAC 230 35 GACCTTGTCG TTATCTGTGA GAGCGCGGGA ACCCAAGAGG 320 ‘‘‘ ACGCGGCGAG CCTACGAGTC 340 » i i • · (2) Informaatio Sekvenssille n:o 12 ^ 37 1 1 5725 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 5 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
; (vi) Alkuperäinen lähde: io (C) Yksittäinen eristys: ns5sp3 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 12 CTCSACAGTC ACTGAGÄGTG ACATCCGTGT TGAGGAGTCA 40 15 ÄICTACCAAT GTTGTGACTT GGCCCCCGAA GCCAGACAGG 80 CTAIAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTTTACA TCGGGGGTCC 120 CCTGACTAAT TCAAAAGGGC AGAACTGCGG CTATCGCCGG 160 TGCCGCGCAA GCGGCGTGCT GACGACTAGC TGCGGTAATA 200 CCCTCACATG TTACCTGAAG GCCAGTGCGG CCTGTCGAGC 240 20 TGCGAAGCTC CAGGACTGCA CAATGCTCGT GTGCGGTGAC 280 GACCTTGTCG TTATCTGTGA GÄGCGCGGGG ACCCAAGAGG 320 ACGCGGCGAG CCTACGAGTC 340 • · » * '-25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 13 I » (i) Sekvenssiominaisuudet: : (A) Pituus: 340 nukleotidiä :'i‘: (B) Tyyppi: nukleiinihappo .30 (C) Juosteisuus: yksinkertainen I (D) Topologia: lineaarinen <· > i * I < t I ·
(ii) Molekyylityyppi: DNA
• · ·
ϊ I
• · » t t 35 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5k2
• F
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 13 f 38 115725 CTCÄACCGTC ACTGAGÄGAG ACATCAGAAC TGAGGAGTCC 40 ATATACCGAG CCTGCTCCCT GCCTGAGGAG GCTCACATTG 80 5 CCATACACTC GCTGACTGAG ÄGGCTCTACG TSGGAGGGCC 120 CATGTTCAAC AGCAAGGGCC AGACCTGCGG STACAGGCGT 160 TGCCGCGCCA GCGGGGTGCT CACCÄCTAGC ATGGGGAACA 200 CCATCACATG CTATGTAAAA GCCCTAGCGG CTTGCAAGGC 240 TGCAGGGATA GTTGCACCCT CAATGCTGGT ATGCGGCGÄC 280 10 GACTTAGTTG TCATCTCAGA AAGCCAGGGG ACTGAGGAGG 320 ACGAGCGGAA CCTGAGAGCT . 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 14 is (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5arg8 -£5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 14 ctctacagtc acgtaaaagg acatcacatc ctaggastcc 40 :,.;’ ATCTACCÄGT CCTGTTCACT GCCCGAGGAG GCTCGAACTG 8 0 * · * 30 CTATACACTC ACTGACTGAG AGACTATACG TAGGGGGGCC 120 CÄ2S&CAAAC AGCAAGGGCC ÄATCCTOCGG GTACAGGCGT ISO } IGCCGCGCGA GCGCAGTGCT CACCÄCCAGC ATGGGGAACA 200 CACTCACGTG CTACGTAAAA GCCAGGGCGG CGTGTAACGC 240 CGCGGGGATT GTTGCTCCCA CCATGCTGGT GTGCGGTGAC 280 !·". .is GACCTGSTCG TCATCTCAGA GAGTCAAGGG GCTGAGGAGG 320 ACGAGCAGÄA CCTGAGAGTC 340 ’ * (2) Informaatio Sekvenssille n:o 15 / 39 1 1 5725 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 5 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: 10 (C) Yksittäinen eristys: ns5il0 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 15 CTCTACAGTC ACAGAGAGGG ACATCAGAAC CGAGGAGTCC 40 ATCTATCTGT CCTGCTCACT GCCTGAGGAG GCCCGAACTG 80 CTATACÄCTC ACTGACTGAG AGACTGTACG TAGGGGGGCC 120 CATGACAAAC AGCAAGGGGC AATCCTGCGG GTACAGGCGT 160 TGCCGCGCGA GCGGAGTGCT CACCACCAGC ATGGGCAACA 200 CGCTCACGTG CTACGTGAAA GCCAGAGCGG CGTGTAACGC 240 CGCGGGCÄTT GTTGCTCCCA CCATGTTGGT GTGCGGCGAC 280 20 sacctggttg TCATCTCAGA GAGTCAGGGG GTCGAGGAAG 320 ATGAGCGGAA CCTGAGAGTC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 16 ’.: 25 ,· · (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä l · : (B) Tyyppi: nukleiinihappo ;V: (C) Juosteisuus: yksinkertainen 30 (D) Topologia: lineaarinen * * »Il
.···, (ii) Molekyylityyppi: DNA
• · · : (vi) Alkuperäinen lähde: 35 (C) Yksittäinen eristys: ns5arg6 • · * » » (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 16 / 40 115725 CTCTACAGTC ACGGAGAGGO ACATCAGAAC CGAGGAGTCC 40 ATCTATCTGT CCTGTTCACT GCCTGAGGAG GCTCGAACTG 30 5 CCATACACTC ACTGACTGÄG A5GCTGTACG TAGGGGGGCC 120 CAIGACAAAC AGCAAAGGGC AATCCTGCGG GTACAGGCGT 160 TGCCGCOCGA GCGGAGTGCT CACCACCAGC ATGGGTAACA 200 CACTCACGTG CTACGTGAAA GCTAAAGCGG CATGTAACGC 240 CGCGGGCATT GTTGCCCCCA CCATGTTGGT GTGCGGCGAC 280 20 GACCTAGTCG TCATCTCAGA GAGTCAAGGG GTCGAGGAGG 320 ATGAGCGÄAA CCTGAGAGCT 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 17 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: ; " (C) Yksittäinen eristys: ns5k2b : 25 '.· * (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 17 :v. CTCAACCGTC ACGGAGAGGG ACATAAGAAC AGAAGAATCC 40 ATATATCASG GTTGTTCCCT GCCTCAGGAG GCTASAACTG 30 w CTATCCACTC GCTCACTGAG AGACTCTACG TAGGAGGGCC 120 CATGACAAAC AGCAAGGGAC AATCCTGCGG TTACAGGCGT 160 • · t TGCCGCGCCA GCGGGGTCTT CACCACCAGC ATGGGGAATA 200 ·:·* CCATGACATG CTACATCAÄA GCCCTTGCAG CGTGCAAAGC 240 TGCAGGGÄTC GTGGACCCTA TCATGCTGGT GTGTGGÄGAC 280 35 GÄCCTGGTCG TCATCTCGGA GAGCGAAGGT AACGAGGAGG 320 ACGÄGCGAAA CCTGAGAGCT 340 > I « (2) Informaatio Sekvenssille n:o 18 f
• I
41 11 £725 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 5 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: 10 (C) Yksittäinen eristys: ns5sa283 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 18 CTCGACCGTT ACCGAACATG ACATAATGAC TGAAGAGTCT 40 15 ATTTACCAAT CATTGTACTT GCAGCCTGAG GCGCGTGTGG 80 CAATACGGTC ACTCACCCAA CGCCTGTACT GTGGAGGCCC 120 CATGTATÄAC AGCÄAGGGGC AACAATGTGG TTATCGTAGA 160 TGCCGCGCCA GCGGCGTCTT CACCACTAGT ATGGGCAACA 200 CCATGACGTG CTACATTAAG GCTTTAGCCT CCTGTAGAGC 240 20 CGCAAAGCTC CAGGACTGCA CGCTCCTGGT GTGTGGTGAT 320 GATAÄAGCGA CCTGAGAGCC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 19 ·' ·'" λ5 ·,· ·’ (i) Sekvenssiominaisuudet: (i‘j* (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo
t I
(C) Juosteisuus: yksinkertainen 30 (D) Topologia: lineaarinen » » ·
(ii) Molekyylityyppi: DNA
• I > * · • (vi) Alkuperäinen lähde: : is (C) Yksittäinen eristys: ns5sal56
• t I
' \ (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 19 * · 42 1 1 5725 CTCGACCGTT ACCGAACATG ACATAATGAC TGAAGAGTCC 40 ATTTACCAAT CATTGTACTT GCAGCCTGAG GCACGCGCGG 80 5 CAATACGGTC ACTCACCCAA CGCCTGTACT GTGGAGGCCC 120
CATGTATAAC ÄGCAÄGGGGC ÄACAATGTGG TTACCGTAGA ISO
TGCCGCGCCA GCGGCGTCTT CACCACCAGT ATGGGCAÄCA 200 CCATGACGTG CTACATCAAG GCTTCAGCCG CCTGTAGAGC 240 TGCAAAGCTC CAGGACTGCÄ CGCTCCTGGT GTGTGGTGTG 280 10 ACCTTGGTGG CCATTTGCGA GAGCCAAGGG ACGCACGAGG 320 ATGAAGCGTG CCTGAGAGTC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 20 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5ill : V 25 v · (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 20 CTCTACTGTC ACTGAACAGG ACATCAGGGT GGAAGAGGAG 40 ATATACCÄQT GCTGTAACCT TGAACCGGAG GCCAGGAÄAG 80 30 TGATCTCCTC CCTCACGGÄG CGGCTTTACT GCGGGGGCCC 120
.... TATGTTCAAC AGCAAGGGGÖ CCCAGTGTGG TTATCSCCST ISO
tgccgtgcia gtgsagtcct gcctaccagc ttcggcaaca 200 ' CAATCACTTG TTACÄTCAAG GCTAGAGCGG CTTCGÄAGGC 240 Γν CGCAGGCCTC CGGAACCCGG ÄCTTTCTTGT CTGCGGAGAT 280 35 GATCTGGTCG TGGTGGCTGA GAGTGATGGC GTCGACGAGG 320 ATAGAGCAGC CCTGAGÄGCC 340 / « 115725 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 21 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 340 nukleotidiä 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
10 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5i4 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 21 15 CTCGACTGTC ACTGAACAGG ACATCAGGGT GGAAGAGGAG 40 ATATACCAAT GCTGTAACCT TGAACCGGAG GCCAGGAAAG 80 TGATCTCCTC CCTCACGGAG CGGCTTTACT GCGGGGGCCC 120 TATGTTCAAT AGCAAGGGGG CCCAGTGTGG TTATCGCCGT 160 20 TGCCGTGCTA GTGGAGTTCT GCCTACCAGC TTCGGCAACA 200 CAATCAGTTG TTACA2CAAG GCTAGAGCGG CTGCGAAGGC 240 - CGCAGGGCTC CGGACCCCGG ACTTTCTCGT CTGCGGAGAT 280 GATCTGGTTG TGGTGGCTGA GAGTGATGGC GTCGACGAGG 320 '/ ATAGAACAGC CCTGCGAGCC 340 ; ·' -25 ' (2) Informaatio Sekvenssille n:o 22 * (i) Sekvenssiominaisuudet: ; (A) Pituus: 340 nukleotidiä 30 (B) Tyyppi: nukleiinihappo * (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
* (ii) Molekyylityyppi: DNA
55 ;V: (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ns5gh8 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 22 / 44 1 1 5725 CTCAACTGTC ACTGAACAGG ACATCAGGGT GGAAGAGGAG 40 ATATACCÄAT GCTGTAACCT TGAACCGGAG GCCAGGAAAG 30 TGATCTCCTC CCTCACGGAA CGGCTTTACT GCGGGGGCCC 120
5 TATGTTCAAC AGCAAGGGGG CCCASTGTGG TTATCGCCGT ISO
TGCCGTGCCA GTGGAGTTCT GCCTACCAGC TTCGGCAACA 200 CMTCACTTG TTACATCÄAA GCTAGAGCGG CTGCCGAAGC 240 CGCAGGCCTC CGGAACCCGG ACTTTCTTGT CTGCGGAGAT 230 ! SATCTGG2TG TGGTSGCTGA GAGTGATGGC GTCAATGAGG 320 I io ATAGAGCAGC CCTGGGAGCC 340 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 23 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (ATCC # 40394) (C) Yksittäinen eristys: hevi ! ’,25 v : (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 23 GACGGCGTTG GTAATGGCTC AGCTGCTCCG GATCCCACAA 40
GCCATCTTGG ACATGATCGC TGGTGCTCAC TGGGGAGTCC SO
* * » ,30 TGGCGGGCAT AGCGTATTTC 100 • · ·
1 » I
1 * · » (2) Informaatio Sekvenssille n:o 24 ~5 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen !>
(ii) Molekyylityyppi: DNA
45 1 1 5725 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) yksittäinen eristys: US5 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 24 GACGGCGTTG GTGGTAGCTC AGGTACTCCG GATCCCACÄA 40 GCCATCATGG ACATGATCGC TGGAGCCCÄC TGGGGÄGTCC 80 10 TGGCGGGCAT AGCGTATTTC 10° (2) Informaatio Sekvenssille n:o 25 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: AUS5 • »· ·' ·' '25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 25 • · · ;:· AACGGCGCTG GTAGTAGCTC AGCTGCTCAG GGTCCCGCÄA 40 GCCATC3TGG ACATGATCGC TGGTGCCCAC TGGGGÄGTCC 80 • · TAGCGGGCAT AGCGTATTTT 100 30 • I — • · · * · · · .*·. (2) Informaatio Sekvenssille n:o 26 • tl : ·* (i) Sekvenssiominaisuudet: • » '···' 35 (A) Pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo » * ·...: (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
46 1 1 5725 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: US4 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 26 GACAGCCCTA GTGGTATCGC AGTTACTCCG GATCCCACAA 40 GCCGTCATGG ATATGGTGGC GGGGGCCCAC TGGGGAGTCC 80 10 TGGCGGGCCT TGCCTACTAT 100 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 27 is (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: '·· (C) Yksittäinen eristys: ARG2 i v J5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 27 iv, AGCÄGCCCTA GTGGTGTCGC AGTTACTCCG GATCCCACAA 40 :,. I* AGCATCGTGG ACATGGTGGC GGGGGCCCAC TGGGGAGTCC 80 20 TGGCGGGCCT TGCTTACTÄT 100 * * · · * » #
> I
(2) Informaatio Sekvenssille n:o 28 * * * : : 35 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 100 nukleotidiä » » * (B) Tyyppi: nukleiinihappo • I · * > (C) Juosteisuus: yksinkertainen // (D) Topologia: lineaarinen 47 (ii) Molekyylityyppi: DNA 115725 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: 115 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 28 GGCAGCCCTA STGGTGTCGC AGTTACTCCG GATCCCGCAA 40 GCTGTCGTGG ACATGGTGGC GGGGGCCCAC TGGGGAATCC 80 10 TAGCGGGTCT TGCCTACTAT 100 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 29 15 (i) Sekvenssioainaisuudet: (A) Pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: i '* (C) Yksittäinen eristys: GH8 : \: 25 v (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 29 jv, TGTGGGTATG GTGGTGGCGC ACGTCCTGCG TTTGCCCCAG 40 ÄCCTTGTTCG ACATAATAGC CGGGGCCCAT TGGGGCATCT 80 • * · 30 TGGCGGGCTT GGCCTÄTTAC 10° • I | (2) Informaatio Sekvenssille n:o 30 I t t I (i) Sekvenssiominaisuudet: 35 (A) Pituus: 100 nukleotidiä .·!·. (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen • t (D) Topologia: lineaarinen /
(ii) Molekyylityyppi: DNA
« 115725 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: 14 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 30 TGTGGGTATG GTGGTAGCAC ACGTCCTGCG TCTGCCCCAG 40 ACCTTGTTCG ÄCATAATAGC CGGGGCCCAT TGGGGCATCT 80 TGGCAGGCCT AGCCTATTAC 100 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 31 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 100 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: 111 * * · 25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 31 • * · TGTGGGTATG GTGGTGGCGC AAGTCCTGCG TTTGCCCCAG 40 accttgttcg acgtgctagc cggggcccat tggggcatct 8o * » t TGGCGGGCCT GGCCTATTAC 100 • * » 30 j (2) Informaatio Sekvenssille n:o 32 ♦ > » · I t *
• I
(i) Sekvenssiominaisuudet: ; ·’ (A) Pituus: 100 nukleotidiä S5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo :Y: (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA f/ 49 1 1 5725 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: 110 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 32 5 TACCACTÄTG CTCCTGGCAT ACTTGGTGCG CATCCCGGAG 40 GTCATCCTGG ACATTATCAC GGGAGGACAC TGGGGCGTGA 80 TGTTTGGCCT GGCTTATTTC 100 iq (2) Informaatio Sekvenssille n:o 33 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 mikleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo 15 (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
20 (vi) Alkuperäinen lähde: (ATCC # 40394) (C) Yksittäinen eristys: hevi (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 33 * ♦ GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCA5GA CCCCCCCTCC 40 ‘*7 CGGGAGAGCCATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCÄACCC 120 7;*’ GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCÄAGACTG 160 : CTÄGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 '30 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240
Li : AGACCGTOCA CC 252 > · » I » » zs (2) Informaatio Sekvenssille n:o 34 t * LL: (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä , (B) Tyyppi: nukleiinihappo 50 1 1 5725 (C) Jucsteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 5 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: us5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 34 10 GTTAGTATGA GTGTCGTGCÄ GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG 160 15 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 35 (i) Sekvenssiominaisuudet: i ’·· (A) Pituus: 252 nukleotidiä • 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo : : : (C) Jucsteisuus: yksinkertainen ··· (D) Topologia: lineaarinen I I It M * (ii) Molekyylityyppi: DNA 30 . (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ausl
• I
M f • (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 35 » » • I * I » * » *
< M > I
/ 5i 1 1 5725 GTTAGTATGA 0TGTCGTGCA GCCTCCAGGÄ CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 5 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 GCTCAATGCC TGGAGÄTTTG GGCACGCCCC CGCAAGATCA ISO CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAÄGGC CTTGTGGTÄC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 36 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys:sp2 * : » 9 * : 25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 36 GTTAGTATGÄ GTGTCGTGCÄ GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 f · · CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC 120
v : GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG ISO
30 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTÄC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 C.1 AGACCGTGCA CC 252 * » • * 9 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 37 > » * (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä 115725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Jucsteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: gm2 10 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 37 GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTÄCACC 80 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 15 GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 “XGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 38 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo *’ (C) Juosteisuus: yksinkertainen .;* (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyyli tyyppi: DNA
30 : (vi) Alkuperäinen lähde: ,··, (C) Yksittäinen eristys: i21 * » » t · · * · · .* .* (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 38 » » // * I | 53 1 1 5725 GTTAGTATGÄ GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 5 GGAATTGCCA GGACGÄCCGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC 120 GCTCAATGCC TGGÄGATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 39 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: us4 * 25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 39 GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 : CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 ! I. GGAATTGCCA GGACGÄCCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 GCTCAATGCC TGGÄGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTSÄTÄG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 • « > • » *
» I
» * ·...· 35 :Y: (2) Informaatio Sekvenssille n:o 40 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä 54 1 1 5 7 2 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: jhl 10 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 40 GTTASTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ÄTÄGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGCCA GGÄCGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 15 GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGÄAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA TC 252 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 41 (i) Sekvenssiominaisuudet: „ (A) Pituus: 252 nukleotidiä 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen ·* ·’ (D) Topologia: lineaarinen
V ' (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 : (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: nac5 * · · (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 41 35 .·!·. GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGCCA GGÄCGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160 / 55 115725 GTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 42 5 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 10 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Moiekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: is (C) Yksittäinen eristys: arg2 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 42 GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 20 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGCCA GGÄCGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAÄCCC 120 GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 25 AGACCGTGCA CC 252 » *' *j (2) Informaatio Sekvenssille n:o 43 • < · » · · 30 (i) Sekvenssiominaisuudet: . . (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo • · ’·;** (C) Juosteisuus: yksinkertainen I * .* (D) Topologia: lineaarinen • · » 35
(ii) Moiekyylityyppi: DNA
» I ·
II li I
(vi) Alkuperäinen lähde: .
/' (C) Yksittäinen eristys: spl 115725 56 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 43 GTTAGTATGA STGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTÄCACC 30 5 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 44 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ghl (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 44 GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 : CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGÄGTACACC 80 30 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120 ,; j GCTCAATGCC CG GAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 :v. TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA CC 252 m
• I
·;··· (2) Informaatio Sekvenssille n:o 45 (l) Sekvenssiominaisuudet: il S7 1 1 5725 (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 5
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: il5 10 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 45 GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 25 GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG ISO
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT. 240 AGACCGTGCA CC 252 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 46 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä _ 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo • 1 · ’·’ ‘ (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen * · · • · (ii) Molekyylityyppi: DNA 30 | (vi) Alkuperäinen lähde: • 1 · · .···. (C) Yksittäinen eristys: ilo * · » : ·’ (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 46 il » 58 115725 GCTAGTATCA GTGTCGTACA GCCTCCAGGC CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 5 GGAATTGCCG GGAAGACTGO GTCCTTTCTT GGATAAACCC 120 ACTCTATGCC CGGCCATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG 160 CTAGCCGAGT AGCGTTGGGT TGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA TC 252 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 47 (i) Sekvenssiominaisuudet: i5 (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: arg6 • *·*; 25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 47 GTTAGTATGA GTCTCGTACA GCCTCCAGGC CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 30 V. GGÄATTGCTG GGAAGACTGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC 120 ACTCTATGCC CAGCCATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG 160 30 CTAGCCGAGT AGCGTTGGGT TGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG-GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 : AGACCGTGCA TC 252 » · · .*··. 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 48 (i) Sekvenssiominaisuudet: ' · (A) Pituus: 252 nukleotidiä / (B) Tyyppi: nukleiinihappo 59 1 1 5725 (C) Jucsteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 5 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: s21 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 48 10 GTTAGTACGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CTCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATCGCTG GGGTGACCGG GTCCTTTCTT GGAGCAACCC 120 GCTCAATACC CAGAAATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGATCA 160 15 CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 AGACCGTGCA AC 252 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 49 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 252 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo 25 (C) Jucsteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
V (ii) Molekyylityyppi: DNA
• » * 30 (vi) Alkuperäinen lähde: : (C) -Yksittäinen eristys: gj51329 * * (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 49 * * il i » * 60 1U725 GTTAGTACGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGÄGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 5 GGAATCGCTG GGGTGACCGG GTCCTTTCTT GGAGTAACCC 120 GCTCAATACC CAGAAATTTG GGCGTGCCCC CGCGASAICA 160 CTAGCCGAOT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200 TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240 ÄGACCGTGCA AC 252 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 50 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 180 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: sa3 : : 25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 50 gttagtatga gtgtcgaaca gcctccagga ccccccctcc 4o • I > ·' ;* CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 :·: : GGAATTGCCG GGATGACCGG GTCCTTTCTT GGATAAACOC 120 30 GCTCAATGCC CGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACT5 ISO CTÄGCCGAGT AGTGTTGGGT 180 » » > i · * 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 51 • · · ' (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 180 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo 61 115725 (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylitvyppi: DNA 5 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: sa4 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 51 10 GTTAGTATGA GTGTCGAACA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40 CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80 GGAATTGOCG GGATGACCGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC 120
15 GCTCAAT3CC CGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG ISO
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT 180 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 52 20 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen '25 (D) Topologia: lineaarinen * t
11*! (ii) Molekyylityyppi: DNA
• » · • · » » ’*’ ’ (vi) Alkuperäinen lähde: (ATCC # 40394) 30 (C) Yksittäinen eristys: ncvl 1 * » (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 52
M I
ATGÄGCACGA ATCCTAAACC TCAAAAAAAA AACÄAACGTA 40 • · 35 ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG 80 :V: CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 ·;· ; GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGA AAGACTTCCG 160 AGCGGTCGCA ÄCCTCGAGGT AGACGTCAGC CTATCCCCAA 200 /7 115725 ! - GGCTCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGC TGCGGGTGGG 280 5 CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGCTG 320 GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 AAGGTCÄTCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC 480 10 GGCGTGAAC'T ATGCAACAGG GAACCTTCCT GGTTGCTCTT 520 TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT 549 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 53 15 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 20
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: us5 • ·*’ 25 ’ (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 53 ÄTGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 : ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG 80 CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 30 GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAGACTTCCG 160 f : : AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CTATCCCCAA 200 » » * · GGCGCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG 240 ,/,’ TACCCTTGGC CCCTCTATGG C.AATGAGGGT TGCGGGTGGG 280 : CGGSATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGTTG 320 35 GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCACA 400
f t I
TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC 440 TGCCAGGGCT CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCCT GGTTGCTCTT 520 « TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT 549 53 1 1 5 7 2 5 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 54 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä 5 (8) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
10 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ausl (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 54 15 ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 - ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTTAAGT TCCCGGGTGG 80 CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAGACTTCCG 160 20 AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CTATCCCTAA 200 GGCGCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCCTGGC CCCTCTATGG TAATGAGGGT TGCGGATGGG 280 CGGGATGGCT CCTGTCCCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGTTG 320 GGGCCCTACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 25 AAGGTCATCG ATACCCTCAC GTGCGGCTTC GCCGACCACA 400 V : TGGGGTACAT TCCGCTCGTT GC-CGCCCCTC TTGGGGGCGC 440 ;:· TGCCAGG6CC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACÄGG GAATCTTCCT GGTTGCTCTT 520 TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTTCTCTCT 549 30
f i I
(2) Informaatio Sekvenssille n:o 55 f * * * * • i I k 35 (i) Sekvenssiominaisuudet: : : : (A) Pituus: 549 nukleotidiä ·;· : (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen , / (D) Topologia: lineaarinen 64 1 1 5725
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: sp2 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 55 ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG TCGCCCÄCAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG ' 80 10 CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CACGACGAGG AAGACTTCCG 160 ÄGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CCATCCCCAA 200 GGCTCGTCGA CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCTTGGC ’ CCCTCTATGG CAATGAGGGC TGCGGGTGGG 280 CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGCTG 320 GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC 440 TGCCAGAGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCGC GGTTGCTCTT 520 20 TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT 549 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 56 * » 25 (i) Sekvenssiominaisuudet: • (A) Pituus: 549 nukleotidiä :’· (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen ·. (D) Topologia: lineaarinen 30
; i-> . (ii) Molekyyli tyyppi: DNA
I * f i i · (vi) Alkuperäinen lähde: l V (C) Yksittäinen eristys: gm2 35 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 56
• » I
«IMI
I 1 il 65 1 1 5725 ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAÄAGAAGA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG 80 5 CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCIAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAGACTTCCG 160 ÄGCGGTCGCÄ ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CTATCCCCAA 200 GGCACGTCGG CCCGAGGGTA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT TGCGGGTGGG 280 CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGCGGCTCTC GGCCTAACTG 320 10 GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 ÄAGGTCATCG ATACGGTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT ÄCCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGÄGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GÄACCTTCCT GGTTGCTCTT 520 15 TCTCIATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT 549 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 57 20 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen ; ” (D) Topologia: lineaarinen ; / ,25
; (ii) Molekyylityyppi: DNA
:* * (vi) Alkuperäinen lähde: ;‘j’; (C) Yksittäinen eristys: i21 * 30 : , , (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 57 i » * * · * · ATGAGCACGÄ ATCCTAAACC TCAAAGAÄAA ACCAAACGTA 40 i‘V .ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG 80 25 CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAGACTTCCG 160 V\ AGCGGTCGCA ÄCCTCGTGGT AGACGCCAGC CTATCCCCAA 200 ' ‘ GGCGCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG 240 il 66 1 1 5725 TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT TGCGGGTGGG 280 CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGCTG 320 GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 5 AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TQGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCGCÄTG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCCT GGTTGCTCTT 520 TTTCTATTTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT 549 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 58 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä 15 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
20 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: us4 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 58 -‘ 25 ÄTGAGCACGA ÄTCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTTAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGCCAGGTC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG 120 : GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG 160 • · ÄGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 30 GGCTCGCCAG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGO 240
t I
: TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT ATGGGGTGGG 230 :,,,· CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGTGGCTCTC GGCCTÄGTTG 320 GGGCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG TÄATTTGGGT 360 • * ]···. AAGGTCATCG ATACCCTCAC ATQCOGCTTC GCCGACCTCA 400 35 TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TTAGGGGCGC 440
I I
TGCCAGGGCC TTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 ·:··: GGCGTGAACT ACGCAACAGG GAATCTGCCC GGTTGCTCCT 520 TTTCTATCTT CCTCTTGGCT CTGCTGTCC 549 n 67 1 1 5725 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 59 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
10 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: jhl (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 59 15 ÄTGAGCACAA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG 160 20 ÄGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 GGCTCGCCAG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAACGAGGGT ATGGGGTGGG 280 CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGTGGCTCTC GGCCTAGTTG 320 GGGCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG TAATTTGGGT 360 25 AAGGTCATCG ATACCCTCAC ATGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT TCCGCTTGTC GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC 440 ·· TGCCAGGGCC CTGGCACATG GTGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATTTGCCC GGTTGCTCTT 520 :V: TCTCTATCTT CCTCTTGGCT CTGCTGTCC 549 30 t * » * i * · · · * ·
* I
(2) Informaatio Sekvenssille n:o 60 * # » *·’ 35 (i) Sekvenssiominaisuudet: :Y; (A) Pituus: 549 nukleotidiä ·; | (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen ι 68 1 1 5725 (ii) Molekyylityyppi: dna (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: nacl 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 60 ATGAGCACAA ATCCTAAACC CCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG 120 10 GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG ÄAGACTTCCG 160 AGCGGTCGCÄ ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 GGCTCGCCGG CCCGAGGGCA GGTCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAACGAGGGT ATGGGGTGGG 280 CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGCGGCTCCC GGCCTAGTTG 320 15 GGGCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG TAATTTGGGT 360 AAGGTCATCG ATACCCTCAC ATGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCACATG GTGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATTTGCCT GGTTGCTCTT 520 20 TCTCTATCTT CCTCTTGGCT CTGCTGTCC 549 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 61 25 (i) Sekvenssiominaisuudet: : (A) Pituus: 549 nukleotidiä 'i* (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen :·; (D) Topologia: lineaarinen 30 • (ii) Molekyylityyppi: DNA ........
(vi) Alkuperäinen lähde: : (C) Yksittäinen eristys: arg2 35 :Y: (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 61
II
69 "115725 ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAÄGAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120
5 GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG ISO
AGCGGTC5CA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 GGCTCGCCAG CCCGAGGGTA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT ATGGGGTGGG 280 CAGGGTGGCT CCTGTCCCCC CGCGGCTCCC GGCCTAGTTG 320 10 GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG TAATTTGGGT 360 AAGGTCATCG ATACCCTCAC ATGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TSGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATCTGCCC GGTTGCTCTT S20 15 TCTCTATCTT CCTCTTGGCT TTGCTGTCC 549 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 62 20 (i) Sekvenssioroinaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen ** 25
: (ii) Molekyylityyppi: DNA
»»» ; ‘ : (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: spl 30 j (xi) S sk ven s s ikuvau s: Sekvenssille n; o 62 ti* · ' ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAÄGAAAA ACCAAACGTA 40 Γ·': ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAÄC-T TCCCGGGCGG 80 35 CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG 120 Λ GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG 160 ' AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 : GGCTCGCCGG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TATCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT CTGGGGTGGG 280 70 1 1 5725 CAG<3AT<5<3CT CCTGTCACCC CGCGGCTCTC GGCCTAGCTG 320 GGGCCCTACC GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAACTTGGGT 360 5 ÄAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC SCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TTAGGGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATTTGCCC GGTTGCTCTT 520 TCTCTATCTT CCTCTTGGCT TTGCTGTCC 549
iO
(2) Informaatio Sekvenssille n:o 63 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä is (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
20 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: ghl , (xi) -Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 63 25 .· : ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 ,,.Γ ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG 120 :'i‘; GSCCCCAGG? TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG 160 30 AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 : GGCTCGCCGG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 5ÄCCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT ATGGGGTGGG 280 ' CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGTGGTTCTC GGCCTAGTTG 320 i ',· GGSCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT 360 AAGATCATCG ÄTACCCTCAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 ·♦· 35 TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC 440 • \ TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC 430 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATCTGCCC GGTTGCTCCT 520 TTTCTATCTT CCTTCTGGCT TTGCTGTCC 549 / 71 1 1 5725 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 64 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 549 nukleotidiä 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
10 (vi) Alkuperäinen lähde: (C) Yksittäinen eristys: il5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 64 15 ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAASAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAÄCCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCG5 80 TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCGAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG 160 AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 20 ÖGCTCGCCAG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 ’TACCCCTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT ATGGGGTGGG 280 CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGCGGCTCCC GGCCTASTTG 320 GGGCCCCAAA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG TAATTTGGGT 360 ·. ÄAGGTCATCG ATACCCTCAC ATGCGGCTTC OCCGACCTCA 400 ·. 25 TGGGSTACAT TCCGCTCGTC OGCGCCCCCT TAGGGGGCGC 440 fGCGAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 ; I GGCGTGAÄCT ATGCAACAGG GAATCTACCC GGTTGCTCTT 520 ·’ f' TCTCTATCTT· CCTCTTGGCT TTGCTGTCC 549 • t 30 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 65
• * I
(i) Sekvenssiominaisuudet: • * * # • · · (A) Pituus: 549 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo 55 (C) Juosteisuus: yksinkertainen :V: (D) Topologia: lineaarinen 1
Molekyylityyppi: DNA
72 1 1 5 7 2 5 (vi) Alkuperäinen lähde:
(C) Yksittäinen eristys: ilO
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 65 5 ATGAGCÄCAA ÄTCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAAAGAA 40 ACACTAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGCCÄGATC GTTGGCGGAG TATACTTGCT GCCGCGCAGG 120 GGCCCGAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAAACTTCCG 160 10 ÄACGATCCCA GCCACGCGGÄ AGGCGTCAGC CCAICCCTAA 200 AGATCGTCGC ACCGCTGGCA ÄGTCCTGGGG AAGGCCAGGA 240 TATCCTTGGC CCCTGTATGG GAATGAGGGT CTCGGCTGGG 280 • CÄGGGTGGCT CCTGTCCCCC CGTGGCTCTC GCCCTTCATG 320 GGGCCCCACT GACCCCCGGC ATAGATCGCG CÄACTTGGGT 360 AAGGICATCG ATACCCTAAC GTGCGGTTTT GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT TCCCGTCATC GGCGCCCCCG TTGGAGGCGT 440 TGCCAGAGCT CTCGCCCACG GAGTGAGGGT TCTGGAGGAT 480 GGGGTAAATT ATGCAACAGG GAATTTGCCC GGTTGCTCTT 520 TCTCTATCTT TCTCTTAGCC CTCTTGTCT 549 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 66 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 510 nukleotidiä ’ ’* (B) Tyyppi: nukleiinihappo ί V :25 (C) Jucsteisuus: yksinkertainen ; (D) Topologia: lineaarinen »
< i I
Γ (li) Molekyylityyppi: DNA
* * · * » » 30 (vi) Alkuperäinen lähde: : (c) Yksittäinen eristys: arg6 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 66 • · · • * » » * · ·
H
35 73 1 1 5725 ATGAGCACAA ATCCTCAACC TCAAAGAAAA ACCAAAAGAA 40 ACACTAACCG CCGCCCACAG GACGTCÄAGT TCCCGGGCGG 80 5 TGGTCAGATC GTTGGCGGAG TATACTTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCCAGGT IGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAAACTTCCG 160 AACGGTCCCA GCCACGTGGG AGGCGCCAGC CCATCCCCAA 200 AGATCGGCGC ·ACCACTGGCA.AGTCCTGGGG GAAGCCAGGA 240 TACCCTTGGC CCCTGTATGG GAATGAGGGT CTCGGCTGGG 280 20 CAGGGTGGCT CCTGTCCCCC CGCGGTTCTC GCCCTTCATG 320 GGGCCCCACT GACCCCCGGC ATAGATCACG CAACTTGGGT 360 AAGGTCATCG ATACCCTAAC GTGTGGTTTT GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT TCCCGTCOGT GGTGCCCCCG TTGGTGGTGT 440 CGCCAGAGCC CTTGCCCATG GGGTGAGGGT TCTGGAAGAC 480 GGGATAAATT ATGCAACAGG GAATCTGCCC 510 15 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 67 (i) Sekvenssiominaisuudet: 20 (A) Pituus: 29 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen * 25 (ii) Molekyylityyppi: (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 67 f 1 ; caäacgtaac accaaccgrc gcccacagg 29 30 • » > t · 1 » (2) Informaatio Sekvenssille n:o 68
I t I
: ·* (i) "sekvenssiominaisuudet: 35 (A) Pituus: 24 nukleotidiä :Y: (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen // 74 1 1 5725 (ii) Molekyylityyppi: DNA (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 68 5 ACAQAYCCGC AKAGRTCCCC CACG 24 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 69 10 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 30 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 15 (ii) Molekyylityyppi: DNA (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 69 20 CGAACCTCGA GGTAGACGTC AGCCTATCCC 30 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 70 25 (i) Sekvenssiominaisuudet: : (A) Pituus: 30 nukleotidiä 7 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 30
,', (2.x) Mg I s kyy i x tyypp i: DNA
Ή | ’·' (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 70 J 35 GCAACCTCGT GGAAGGCGAC ÄACCTATCCC 30 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 71 (i) Sekvenssiominaisuudet: ;7 vs 1 1 5725 (A) Pituus: 30 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 5
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 71 10 GTCACCAATG ATTGCCCTAA CTCGAGTATT 30 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 72 15 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 26 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 20 (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 72 25 OTCACGÄACG ACTGCTCCAA CTCAAG 26 * (2) Informaatio Sekvenssille n:o 73 30 *,· j (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 28 nukleotidiä ;v, (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen T 35 (D) Topologia: lineaarinen
: : (ii) Molekyylityyppi: DNA
il (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 73 76 115725 TGGÄCATGAT CGCTGGWGCY CACTGGGG 28 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 74 5 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 28 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen io (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 74 15 TGGAYATGGT GGYGGGGGCY CACTGGGG 28 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 75 20 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 20 nukleotidiä . (B) Tyyppi: nukleiinihappo * · (C) Juosteisuus: yksinkertainen ! 25 (D) Topologia: lineaarinen
; (ii) Molekyylityyppi: DNA
» • (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 75 30
: ATGATGAACT GGTCVCCYAC 3Q
* 1 > 1 1 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 76 35 :,v (i) Sekvenssiominaisuudet: i (A) Pituus: 26 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen 77 1 1 5725 (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 5 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 76 ACCTTVGCCC AGTTSCCCRC CATGGA 26 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 77 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 22 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo 15 (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
20 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 77 AACCCACTCT ATGYCCGGYC AT 22 • f » • t * 1 • «
• I
.> 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 78 • > ;; ; (i) Sekvenssiominaisuudet: ’ ** (A) Pituus: . 18 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo 30 (C) Juosteisuus: yksinkertainen , * (D; Topologia: lineaarinen"
(ii) Molekyylityyppi: DNA
35 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 78 ,·· · 6AÄTCGCTGG GGTGACCG ’ 18 ;/ 78 1 1 5725 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 79 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 28 nukleotidiä 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Holekyylityyppi: DNA
10 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 79 CCATGÄATCA CTCCCCTGTG AGGAACTA 28 15 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 80 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 18 nukleotidiä 20 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen * t (ii) Holekyylityyppi: DNA 25 f * (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 80 ,: TTGCGGGGGC.ÄCGCCCAA 18 * 30 : (2) Informaatio Sekvenssille n:o 81 (i) Sekvenssiominaisuudet: \ (A) Pituus: 33 nukleotidiä 35 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen >;·>;' (D) Topologia: lineaarinen //
(ii) Holekyylityyppi: DNA
79 1 1 5725 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 81 YGAAGCGGGC ACAGTCAPLRC AAGARAGCÄG GGC 33 5 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 82 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 82 RTARAGCCCY GWGGAGTTGC GCACTXGGTR GGC 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 83 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ’°25 (3) Tyyppi: nukleiinihappo * ' (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
: (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 \ (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 83 RATACTCGAG TTAGGGCAAT CATTGGTGAC RTG 33 *... * 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 84 (i) Sekvenssiominaisuudet: ^ (A) Pituus: 33 nukleotidiä so 1 1 5725 (B) Tyypp i: nuk 1 e i in ihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 84 AGYRTGCAGG ATGGYATCRK BCGYCTCGTA CAC 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 85 (1) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyyli tyyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 85 GTTRCCCTCR CGAACGCAÄG GGACRCACCC CGG 33 : 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 86 : (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä • —(B) Tyyppi: nukleiinihappo .···, (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 86 CQTRQGQQTi AYCGCCACCC AACACCTCGA GKC 33 / 81 1 1 5725 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 87 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 5 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
10 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 87 CGTYGYOGGG AGTTTGCCRT CCCTGGTGGC YAC 33 15 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 88 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 20 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
·' ' 25 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 88 OCCGÄCAAGC agatcsatgt GACGTCGAAG CTG 33 30 ; ;’· (2) Informaatio Sekvenssille n:o 89 (i) Sekvenssiominaisuudet: • *' (A) Pituus: 33 nukleotidiä 35 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen /
(ii) Molekyylityyppi: DNA
82 115725 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 89 CCCCACGTAG ARGGCCGARC AGAGRGTGGC GCY 33 5 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 90 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 90 YTGRCCGACA AGAAAGACAG ACCCGCAYAR GTC 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 91 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä : '25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo · (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
30 - : .*. (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille niö: 91 t ( · CGTCCAGTGG YGCCTGGGAG AGAAGGTGAA CAG 33 » * » 35 . (2) Informaatio Sekvenssille n:o 92 (i) Sekvenssiominaisuudet: ^ (A) Pituus: 33 nukleotidiä 83 1 1 5 725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 92 GCCGGGATAG ATRGARCAAT TGCARYCTTG CGT 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 93 (i) Sekvenssioainaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 93 CATATCCCAT GCCATGCGGT GACCCGTTAY ATG 33 25 ···· (2) Informaatio Sekvenssille n:o 94 * t * : (i) Sekvenssioainaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä ; : (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
/ : (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 94 84 1 1 5 7 2 5 YACCAAYGCC GTCGTAGGGG ACCARTTCAT CAT 33 5 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 95 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 95 GATGGCTTGT GGGATCCGGA GYASCTGAGC TAY 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 96 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ! 25 (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen : (D) Topologia: lineaarinen
v · (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 : : : (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 96 GACTCCCCAG TGRGCWCCAG CGATCATKTC CAW 33 * · · '*:** 35 v i (2) Informaatio Sekvenssille n:o 97 » » (i) Sekvenssiominaisuudet: z (A) Pituus: 33 nukleotidiä 85 1 1 5725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Jucsteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 97 CCCCACCATG GAGAAATACG CTATGCCCGC YAG 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 98 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 98 TAGYAGCAGY ACTACXARGA CCTTCGCCCA GTT 33 ',, f 25 -·>' (2) Informaatio Sekvenssille n:o 99 v ' (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä ' * (2) Tyyppi: nukleiimhcippo ; (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen • >
'···* 35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
·;· · (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 99 86 1 1 5725 GSTGACGTSR GTXTeYGCGT CRACGCCGGC SAA 33 5 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 100 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 10 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 100 GGAAGYTGGG ATGGTYARRC ARGASAGCAR AGC 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 101 (i) Sekvenssiominaisuudet: : · (A) Pituus: 33 nukleotidiä l ·' 25 (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen ·· (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
30 . , (xi) Sekvenssikuvaus; Sekvenssille n:o: 101 GTAYAYYCCG GACHCGTTGC GCACTTCRTA AGC 33 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 102 (i) Sekvenssiominaisuudet: ^ (A) Pituus: 33 nukleotidiä 87 1 1 5725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 102 MTRCTTGMG 'TTGGAGCART CGTTYGTGAC ATG 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 103 (i) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 103 .RGYRTGCATG ATCAYGTCCG YYGCCTCATA CAC 33 25 ’·* (2) Informaatio Sekvenssille n:o 104 .(i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus; 33 nukleotidiä : (B) Tyyppi; nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen - (D) Topologia: lineaarinen
35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
I t I
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 104 / 88 115725 5 RTTGTYYTCC CGRACGCARG GCACGCACCC ZGG 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 105 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 105 CGTGGGSGTS AGCGCYACCC AGCÄRCGGGA GSW 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 106 ; (i) Sekvenssiominaisuudet: • * * ;· _ (A) Pituus: 33 nukleotidiä ! 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo * , (C) Juosteisuus: yksinkertainen · (D) Topologia: lineaarinen
• I
• ·
* I
v * (ii) Molekyylityyppi: DNA
30
Il l (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 106 « * YGTRGTGGGG AYGCTGKHRT TCCTGGCCGC VAS. 33 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 107 * · (i) Sekvenssiominaisuudet: ,·/ (A) Pituus: 33 nukleotidiä 89 1 1 5725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 107 CCCHACGAGC AÄRTCGACRT GECGTCGTAW TGT 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 108 (1) Sekvenssiominaisuudet: is (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 108 YCCCACGTAC ÄTAGCSGAMS AGARÄGYAGC CGY 33 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 109 ’/· - (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä ; ; ; (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen * *
35 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
·;· i (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o 109 90 1 1 5725 5 CTGGGAGAYR AGRAAÄACAG ATCCGCARAG RTC 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 110 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 110 YGTCTCRTGC CGGCCAGSBG ÄGAAGGTGAA YAG 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 111 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä : *' 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo V * (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen * * t
(ii) Molekyylityyppi: DNA
30 > · . (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssiu.6 n:o; 111 GCCGGGATAG AKKGAGC&RT TGCAKTCCTG YAC 33 I · | * * 35 :y; (2) Informaatio Sekvenssille n:o 112 » » < ^ » • » (i) Sekvanssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä / 115725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 112 } CATATCCCAA GCCATRCGRT GGCCTGAYAC CTG 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 113
Ci) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) ‘Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 113 '· CACTASGGCT GYYGTRGGYG ACCAGTTCAT CAT 33 f 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 114 • (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä : : : (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen t * » »*
t I
35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
I < » I > (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 114 / 92 1 1 5 7 2 5 5 GACRGCTTGT GGGATCCGGA GTAACTGCGA YÄC 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 115 (1) Sekvenssiominaisuudat: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
(ii) Molekyylityyppi: DNA
15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 115 GACTCCCCAG TGRGCCCCCG CCACCATRTC- CAT 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 116 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ; ·' 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo ·, * (C) Juosteisuus: yksinkertainen ,, (D) Topologia: lineaarinen
: (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 * . (Xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:oi 1Ϊ6 ’·;· SCCCACCATG GAWWAGTAGG CAAGGCCCGC YAG 33
• I
35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 117 (i) Sekvenssiominaisuudet: Γ (A) Pituus: 33 nukleotidiä 93 1 1 5725 (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 117 GAGTAGCATC ACAATCAADA CCTTAGCCCA GTT 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 118 (i) Sekvenssiominaisuudet: is (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 118 YGWCRYGYRG GTRTKCCCGT CAACGCCGGC AAA 33 f 25 ··> (2) Informaatio Sekvenssille n:o 119 v * (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä i (B) Tyyppi: nukleiinihappo —" (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
’*;* 35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
*;· - (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 119 94 1 1 5725 5 TCCTCAGAGG GGAGTGATTC ATGGTGGAGT GTC 33 (2) Informaatio Sekvenssillä n:o 120 (1) Sekvenss iominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 10 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 120 ATGGCTAGAC GCTTTCTGCG TGAAGACAGT AGT 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 121 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä : 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo · (C) Juosteisuus: yksinkertainen :* (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 30 (xi) Sekvenssikuvaus: S-ekvenssille n:o: 121 GCCTGGAGGC TGCACGRCAC TCATACTAAC GCC 33 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 122 (A) Pituus: 33 nukleotidiä 115725 95 (3) ‘Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 122 CGCÄGACCAC TATGGCTGTY CCGGGAGGGG GGG 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 123 (1) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 123 ; ’* TCRTCCYGGC AATTCCGGTG TACTCACCGG TTC 33 \’ 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 124 I t i ’’ (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä : (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
·; 35 (ii) Molekyyli tyyppi: DNA
/ ; (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 124 96 115725 5 GCATIGAGCG GGTTDATCCA AGAAAGGACC CSG 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 125 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 10 (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 125 AGCAGTCTYG CGGGGGCACG CCCAARTCTC CAG 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 126 (i) Sekvenssiominaisuudet: !. , (A) Pituus: 33 nukleotidiä 25 (3) Tyyppi: nukleiinihappo '·* ' (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
v * (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille' n:o: 126 : ‘ ACäAGGCCTT TCGCGACCCA ACACTACTCG GCT 33 35 :V: (2) Informaatio Sekvenssille n;o 127 * » (i) Sekvenssiominaisuudet: , i1 (A) Pituus: 33 nukleotidiä 97 11 5725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 127 ÖGGSCÄCTCG CAAGCACCCT ATCAGGCAGT ACC 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 128 (i) Sekvenssioxninaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 128 j ’·· YGTGCTCATG RTGCACGGTC TACGAGACCT CCC 33 : ’.· 25 _ (2) Informaatio Sekvenssille n:o 129 i'l’: (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä ; (B) Tyyppi; nukleiinihappo w (C) Juosteisuus: yksinkertainen T (D) Topologia: lineaarinen
1 I
35 (ii) Molekyylityyppi: DNA.
ii .[,*; (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 129 98 1 1 5 7 2 5 5 GTTACGTTTG KTTYTTYTTT GRGGTTTRGG AWT 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 130 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 10 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 130 CGGGAACTTR ACGTCCTGTG GGCGRCGGTT GGT 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 131 (i) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä > » 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen » ·
v · (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 : (xi) Sekveiissikuvaus: Sekvenssille n:o: 131 ’·[ ] CARGTAAACT CCACCRACGA TCTGRCCRCC RCC 33 • t *...· 35 *.V: (2) Informaatio Sekvenssille n:o 132 » * (i) Sekvenssiominaisuudet: , (A) Pituus: 33 nukleotidiä 99 Π 5725 (S) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Jucsteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 132 RCGCACACCC AAYCTRGGGC CCCTGCSCGG G&A 33 t , 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 133 (i) Sekvenssiozainaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 133 I. " AGGTTGCGAC CGCTCGGAAG TCTTYCTRGT CGC 33 25 ·- (2) Informaatio Sekvenssille n:o 134 • · v · (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä : : : (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
35 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
;/ ;·· (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 134 5 100 1 1 5725 RCGHRCCTTG GGGATAGGCT GACGTCWACC TCG 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 135 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 10 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (0) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 135 RCGHRCCTTG GGGATAGGTT GTCGCCWTCC ACG 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 136 (1) Sekvenssiominaisuudet: »· , (A) Pituus: 33 nukleotidiä ;* 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo ' (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen 5 t * *
v (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 f;’; (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o; 136 * » » » *;·' YCCRGGCTGR GCCCAGRYCC TRCCCTCGSR YYG 33 i » · • · » · '···* 35 :Y: (2) Informaatio Sekvenssille n:o 137 (i) Sekvenssiominaisuudet: f (A) Pituus: 33 nukleotidiä ιοί 11 5725 (3) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juostaisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
(xi) Sekvanssikuvaus: Sekvenssille n:o: 137 SSHRCCCTCR TTRCCRTASA GGGGCCADGG STA 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 138 (1) Sekvenssiominaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
(xi) Sekvanssikuvaus: Sekvenssille n:o: 138 GCCRCGG0GW GACAGGAGCC ATCCYGCCCA CCC 33 : 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 139 ; (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappc-···, (C) Juosteisuus: yksinkertainen 'y (D) Topologia: lineaarinen
...* 35 (ii) Molekyyiityyppi: DNA
/ (xi) Sekvanssikuvaus: Sekvenssille n:o: 139 5 115725 CCGGGGGTCY GTGGGGCCCC AYCTAGGCCG RGA 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 140 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä ίο (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 140 ATCSATGACC TTACCCAART TRCGCGACCT RCG 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 141 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
·, (ii) Molekyylityyppi: DNA
30 , , (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 141 1 t » CCCCATGAGR TCGGCGAAGC CGCAYG1RAG GGT 33 I | 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 142 (i) Sekvenssiominaisuudet: , (A) Pituus: 33 nukleotidiä 103 1 15725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 142 GCCYCCWARR GGGGCGCCGA CGAGCGGWAT &TA 33 10 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 143 (1) Sekvenssioninaisuudet: 15 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
20 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 143 i ** AACCCGGACR CCRTGYGCCA RGGCCCTGGC ÄGC 33 : * 25 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 144 : (i) Sekvenssiominaisuudet: 30 (A) Pituus: 33 nukleotidiä (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
...* 35 (ii) Molekyylityyppi: DNA
• » (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 144 5 104 1 1 5 7 2 5 &TTCCCTGTT GCATAGTTCA CGCCGTCYTC CAG 33 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 145 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 33 nukleotidiä 10 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen (ii) Molekyylityyppi: DNA 15 (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 145 CA3SAGGAAG AKAGAGAAAG AGCAACC3.GG HAR 33 20 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 146 (1) Sekvenssiominaisuudet: (A) Pituus: 20 nukleotidiä 25 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juosteisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
v : (ii) Molekyylityyppi: DNA
3° : (xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 146 A3GCATAGGA CCCGTGTCTT 20 t >;·’ 35 (2) Informaatio Sekvenssille n:o 147 * » (i) Sekvenssiominaisuudet: ./ (A) Pituus: 20 nukleotidiä 105 1 1 5725 (B) Tyyppi: nukleiinihappo (C) Juostaisuus: yksinkertainen (D) Topologia: lineaarinen
5 (ii) Molekyylityyppi: DNA
(xi) Sekvenssikuvaus: Sekvenssille n:o: 147 CTTCTTTGGA GAAAGTGGTG 20 10 ' « · - 1 t ii
Claims (12)
1. En icke-naturligt förekommande nukleinsyra, kännetecknad is därav, att den innehäller en icke-HCV-1 -nukleotidsekvens, som bestär av 8-252 successiva nukleotider, vilka är helt homologa eller helt komplementära med en nukleotidsekvens frän 5'UT-omrädet av hepatitis C virus och vilka väljs ur sekvenserna SEQ ID nr 34-49 och väri nämnda sekvens inte är 20 HCV-J1 eller HCV-J4.
1. Ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo, tunnettu siitä, että se sisältää ei-HCV-1 -nukleotidisekvenssin, joka 5 koostuu 8-252 peräkkäisestä nukleotidista, jotka ovat täysin homologisia tai täysin komplementaarisia hepatiitti C -viruksen 5'UT-alueelta olevan nukleotidisekvenssin kanssa ja jotka valitaan sekvensseistä SEQ ID nrot 34-49 ja jossa mainittu sekvenssi ei ole HCV-J1 tai HCV-J4. 10
2. En icke-naturligt förekommande nukleinsyra, kännetecknad därav, att den innehäller en icke-HCV-1 -nukleotidsekvens, som bestär av 8-180 successiva nukleotider, vilka är helt 25 homologa eller helt komplementära med en nukleotidsekvens frän 5'UT-omrädet av hepatitis C-virus och vilka väljs ur ! sekvenserna SEQ ID nr 50 och 51 och väri nämnda sekvens inte ‘ är HCV-J1 eller HCV-J4.
2. Ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo, tunnettu siitä, että se sisältää ei-HCV-1 -nukleotidisekvenssin, joka koostuu 8-180 peräkkäisestä nukleotidista, jotka ovat täysin homologisia tai täysin komplementaarisia hepatiitti C - 15 viruksen 5'UT-alueelta olevan nukleotidisekvenssin kanssa ja jotka valitaan sekvensseistä SEQ ID nrot 50 ja 51 ja jossa mainittu sekvenssi ei ole HCV-J1 tai HCV-J4.
3. Nukleinsyran enligt patentkravet 1, kännetecknad därav, · • : att den motsvarar en nukleotidsekvens frän 5'UT-omrädet av den första hepatitis C-virusgenotypen, varvid nämnda icke-HCV-1 -nukleotidsekvens väljs ur sekvenserna SEQ ID nr 34-38. 35 *.' 4. Nukleinsyran enligt patentkravet 1, kännetecknad därav, **” * att den motsvarar en nukleotidsekvens frän 5'UT-omrädet av den andra hepatitis C-virusgenotypen, varvid nämnda icke·/ 109 1 1 5725 HCV-l -nukleotidsekvens väljs ur sekvenserna SEQ ID nr 39-45.
3. Patenttivaatimuksen 1 mukainen nukleiinihappo, 20 tunnettu siitä, että se vastaa nukleotidisekvenssiä ensimmäisen hepatiitti C -virusgenotyypin 5'UT-alueella, jolloin mainittu ei-HCV-1 -nukleotidisekvenssi valitaan sekvensseistä SEQ ID nrot 34-38. • · * • · · • * • *
4. Patenttivaatimuksen 1 mukainen nukleiinihappo, tunnettu * · · siitä, että se vastaa nukleotidisekvenssiä toisen hepatiitti C -virusgenotyypin 5'UT-alueella, jolloin mainittu ei-HCV-1 -nukleotidisekvenssi valitaan sekvensseistä SEQ ID nrot 39- 45. 30
5. Nukleinsyran enligt patentkravet 1, kännetecknad därav, 5 att den motsvarar en nukleotidsekvens frän 5'UT-omrädet av den tredje hepatitis C-virusgenotypen, varvid nämnda icke-HCV-1 -nukleotidsekvens väljs ur sekvenserna SEQ ID nr 46 och 47.
5. Patenttivaatimuksen 1 mukainen nukleiinihappo, tunnettu siitä, että se vastaa nukleotidisekvenssiä kolmannen :v. hepatiitti C -virusgenotyypin 5'UT-alueella, jolloin ,·*·, mainittu ei-HCV-1 -nukleotidisekvenssi valitaan » | 35 sekvensseistä SEQ ID nrot 46 ja 47.
6. Nukleinsyran enligt patentkravet 1, kännetecknad darav, att den motsvarar en nukleotidsekvens frän 5'UT-omrädet av den fjärde hepatitis C-virusgenotypen, varvid nämnda icke-HCV-1 -nukleotidsekvens väljs ur sekvenserna SEQ ID nr. 48 och 49. is
6. Patenttivaatimuksen 1 mukainen nukleiinihappo, tunnettu siitä, että se vastaa nukleotidisekvenssiä neljännen / 107 1^ 5725 hepatiitti C -virusgenotyypin 51UT-alueella, jolloin mainittu ei-HCV-1 -nukleotidisekvenssi valitaan sekvensseistä SEQ ID nrot 48 ja 49.
7. Nukleinsyran enligt nägot av patentkraven 1-6, som kan borja en nukleinsyrasyntesreaktion för bildande av en nukleinsyra, vars nukleotidsekvens motsvarar hepatitis C-virus. 20
7. Jonkin patenttivaatimuksista 1-6 mukainen nukleiinihappo, joka kykenee aloittamaan nukleiinihapposynteesireaktion nukleiinihapon muodostamiseksi, jonka nukleotidisekvenssi vastaa hepatiitti C -virusta. ίο 8. Jonkin patenttivaatimuksista 1-6 mukainen nukleiinihappo, tunnettu siitä, että siinä on leima hybridisaatiotuotteen havaitsemiseksi.
8. Nukleinsyran enligt nägot av patentkraven 1-6, kännetecknad därav, att den har en stämpel för detektering av en hybridisationsprodukt.
9. Nukleinsyran enligt nägot av patentkraven 1-6, .:. kännetecknad därav, att den omfattar stödmedel för isolering av hybridisationsprodukten frän lösningen. * ·
9. Jonkin patenttivaatimuksista 1-6 mukainen is nukleiinihappo, tunnettu siitä, että se käsittää tukikeinot hybridisaatiotuotteen erottamiseksi liuoksesta.
10. Nukleinsyran enligt nägot av patentkraven 1-6, som kan , , 30 hindra transkription eller translation av virusets ·· · nukleinsyra. * »
10. Jonkin patenttivaatimuksista 1-6 mukainen nukleiinihappo, joka pystyy estämään viruksen nukleiinihapon 20 transkription tai translaation.
11. Förfarande för bildning av en hybridisationsprodukt med hepatis C-virusets nukleinsyra, kännetecknat därav, att det 35 omfattar följande steg: I I I *·’·’ a. man sätter en icke-naturligt förekommande nukleinsyra ’ * enligt nägot av patentkraven 1-9 under förhällanden, väri hybridisationsförhällanden kan ästadkommas och väri nämnda no 115725 icke-naturligt förekommande nukleinsyra kan bilda en hybridisationsprodukt med nämnda nukleinsyra av hepatitis C-virus under hybridi sat ions förhäl1anden; och b. man ästadkommer hybridisationsförhällanden för bildande 5 av en hybridisationsprodukt i närvaro av hepatitis C-virusets nukleinsyra.
11. Menetelmä hybridisaatiotuotteen muodostamiseksi hepa-*· tiitti C -viruksen nukleiinihapon kanssa, tunnettu siitä, että se käsittää seuraavat vaiheet: , 25 a. asetetaan jonkin patenttivaatimuksista 1-9 mukainen ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo olosuhteisiin, joissa hybridisaatio-olosuhteet voidaan saada aikaan, maini- * * , tun ei-luonnollisena esiintyvän nukleiinihapon kyetessä muodostamaan hybridisaatiotuotteen mainitun hepatiitti C - , . 30 viruksen nukleiinihapon kanssa hybridisaatio-olosuhteissa; ja b. aikaansaadaan hybridisaatio-olosuhteet hybridisaatio-tuotteen muodostamiseksi hepatiitti C -viruksen nukleiiniha-pon läsnäollessa. 35 * I I
12. Menetelmä yhden tai useamman hepatiitti C -viruksen · genotyypin ilmaisemiseksi, tunnettu siitä, että se käsittää seuraavat vaiheet: / 108 1 1 5725 a. asetetaan jonkin patenttivaatimuksista 1-9 mukainen ei-luonnollisena esiintyvä nukleiinihappo olosuhteisiin, joissa hybridisaatio-olosuhteet voidaan saada aikaan, b. aikaansaadaan hybridisaatio-olosuhteet hybridisaatio-5 tuotteen muodostamiseksi hepatiitti C -viruksen nukleiinihapon läsnäollessa ja c. seurataan ei-luonnollisena esiintyvää nukleiinihappoa hybridisaatiotuotteen muodostumisen osalta, joka hybridisaa-tiotuote on osoitus hepatiitti C -viruksen genotyypin läsnä- 10 olosta.
12. Förfarande för detektering av en eller flera genotyper av hepatitis C-virus, kännetecknat därav, att det omfattar io följande steg: a. man sätter en icke-naturligt förekommande nukleinsyra enligt nägot av patentkraven 1-9 under förhällanden, väri hybridisationsförhä11anden kan ästadkommas, b. man ästadkommer hybridisationsförhällanden för bildning 15 av en hybridisationsprodukt i närvaro av hepatitis C- virusets nukleinsyra och c. man följer den icke-naturligt förekommande nukleinsyran för bildande av en hybridisationsprodukt, vilken hybridisationsprodukt visar närvaron av hepatitis C-virusets 20 genotyp. » 1 » · • 1 » / 1 ·
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US69732691A | 1991-05-08 | 1991-05-08 | |
| US69732691 | 1991-05-08 | ||
| PCT/US1992/004036 WO1992019743A2 (en) | 1991-05-08 | 1992-05-08 | Hcv genomic sequences for diagnostics and therapeutics |
| US9204036 | 1992-05-08 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| FI934937A0 FI934937A0 (fi) | 1993-11-08 |
| FI934937A FI934937A (fi) | 1994-01-05 |
| FI115725B true FI115725B (fi) | 2005-06-30 |
Family
ID=24800701
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| FI934937A FI115725B (fi) | 1991-05-08 | 1993-11-08 | HCV:n genomisia sekvenssejä diagnostiikkaan |
Country Status (20)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (2) | EP0585398B1 (fi) |
| JP (7) | JPH06508026A (fi) |
| KR (1) | KR100193801B1 (fi) |
| AT (1) | ATE252154T1 (fi) |
| BG (3) | BG62142B1 (fi) |
| CA (1) | CA2108466C (fi) |
| CZ (2) | CZ288722B6 (fi) |
| DE (1) | DE69233234T2 (fi) |
| DK (1) | DK0585398T3 (fi) |
| ES (1) | ES2207633T3 (fi) |
| FI (1) | FI115725B (fi) |
| HU (1) | HU227548B1 (fi) |
| IE (1) | IE921482A1 (fi) |
| NO (1) | NO309532B1 (fi) |
| PL (2) | PL169880B1 (fi) |
| PT (1) | PT100472B (fi) |
| RO (1) | RO117267B1 (fi) |
| RU (1) | RU2155228C2 (fi) |
| SK (1) | SK284205B6 (fi) |
| WO (1) | WO1992019743A2 (fi) |
Families Citing this family (34)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0532167A3 (en) * | 1991-08-09 | 1993-03-31 | Immuno Japan Inc. | Non-a, non-b hepatitis virus genome, polynucleotides, polypeptides, antigen, antibody and detection systems |
| US5428145A (en) * | 1991-08-09 | 1995-06-27 | Immuno Japan, Inc. | Non-A, non-B, hepatitis virus genome, polynucleotides, polypeptides, antigen, antibody and detection systems |
| US5427909A (en) * | 1991-09-09 | 1995-06-27 | Immuno Japan Inc. | Oligonucleotides and determination system of HCV genotypes |
| AU671967B2 (en) | 1991-11-21 | 1996-09-19 | Common Services Agency | Hepatitis-C virus testing |
| US6667387B1 (en) | 1996-09-30 | 2003-12-23 | N.V. Innogenetics S.A. | HCV core peptides |
| US6709828B1 (en) | 1992-03-06 | 2004-03-23 | N.V. Innogenetics S.A. | Process for the determination of peptides corresponding to immunologically important epitopes and their use in a process for determination of antibodies or biotinylated peptides corresponding to immunologically important epitopes, a process for preparing them and compositions containing them |
| CA2136764A1 (en) * | 1992-05-29 | 1993-12-09 | Ronald L. Marshall | Ligase chain reaction starting with rna sequences |
| US6423489B1 (en) * | 1992-09-10 | 2002-07-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for treatment of Hepatitis C virus-associated diseases |
| NZ286209A (en) * | 1992-09-10 | 2000-09-29 | Isis Pharmaceuticals Inc | Use of HCV RNA anti-sense nucleotide sequences for treating Hepatitis C virus related disease |
| US7258977B1 (en) | 1992-11-27 | 2007-08-21 | Innogenetics N.V. | Process for typing of HCV isolates |
| EP0905258A3 (en) | 1992-11-27 | 2001-01-31 | Innogenetics N.V. | Method for detecting nucleic acid sequences based on the use of solid phase immobilised nucleotide probes (line probe assay) |
| JPH06153961A (ja) * | 1992-11-27 | 1994-06-03 | Imuno Japan:Kk | Ｃ型肝炎ウイルス部分遺伝子、ならびにｃ型肝炎ウイルス遺 伝子の高感度検出法 |
| CA2139100C (en) * | 1993-04-27 | 2009-06-23 | Geert Maertens | New sequences of hepatitis c virus genotypes and their use as therapeutic and diagnostic agents |
| US7255997B1 (en) | 1993-04-27 | 2007-08-14 | N.V. Innogenetics S.A. | Sequences of hepatitis C virus genotypes and their use as therapeutic and diagnostic agents |
| JPH0775585A (ja) * | 1993-06-14 | 1995-03-20 | Immuno Japan:Kk | Ｃ型肝炎ウイルス関連オリゴヌクレオチドならびにｃ型肝炎 ウイルス遺伝子型判定方法 |
| US5882852A (en) * | 1993-06-29 | 1999-03-16 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Hepatitic C virus (HCV) core gene nucleotide sequences and related methods of detecting major and minor genotypes of HCV isolates |
| US7070790B1 (en) | 1993-06-29 | 2006-07-04 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Nucleotide and deduced amino acid sequences of the envelope 1 and core genes of isolates of hepatitis C virus and the use of reagents derived from these sequences in diagnostic methods and vaccines |
| US5514539A (en) * | 1993-06-29 | 1996-05-07 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Nucleotide and deduced amino acid sequences of the envelope 1 gene of 51 isolates of hepatitis C virus and the use of reagents derived from these sequences in diagnostic methods and vaccines |
| US5885771A (en) * | 1993-10-29 | 1999-03-23 | Srl, Inc. | Antigenic peptide compound and immunoassay |
| JPH10503364A (ja) * | 1994-05-10 | 1998-03-31 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレーション | Ｃ型肝炎ウイルスのアンチセンス阻害 |
| DK0804584T3 (da) | 1994-10-21 | 2002-09-23 | Innogenetics Nv | Sekvenser af hepatitis C virus genotype 7 og deres anvendelse som profylaktiske, terapeutiske og diagnostiske midler |
| US5851759A (en) * | 1996-04-19 | 1998-12-22 | Chiron Corporation | Heteroduplex tracking assay (HTA) for genotyping HCV |
| IT1284847B1 (it) * | 1996-06-07 | 1998-05-22 | Sorin Biomedica Diagnostics Sp | Procedimento per la rivelazione di acidi nucleici specifici di hcv |
| WO1999024606A2 (de) | 1997-11-04 | 1999-05-20 | Roche Diagnostics Gmbh | Spezifisches und sensitives nukleinsäurenachweisverfahren |
| US6680059B2 (en) | 2000-08-29 | 2004-01-20 | Tripep Ab | Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof |
| US6858590B2 (en) | 2000-08-17 | 2005-02-22 | Tripep Ab | Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof |
| EP1311289B1 (en) | 2000-08-17 | 2007-10-17 | Tripep Ab | Vaccines containing ribavirin |
| US7022830B2 (en) | 2000-08-17 | 2006-04-04 | Tripep Ab | Hepatitis C virus codon optimized non-structural NS3/4A fusion gene |
| US6586584B2 (en) | 2001-01-29 | 2003-07-01 | Becton, Dickinson And Company | Sequences and methods for detection of Hepatitis C virus |
| US7196183B2 (en) | 2001-08-31 | 2007-03-27 | Innogenetics N.V. | Hepatitis C virus genotype, and its use as prophylactic, therapeutic and diagnostic agent |
| ES2596753T3 (es) | 2003-08-29 | 2017-01-11 | Fujirebio Europe N.V. | Nuevo clado del virus de la hepatitis C y secuencias prototipo del mismo |
| US7473773B2 (en) | 2004-01-07 | 2009-01-06 | Third Wave Technologies, Inc. | Determination of hepatitis C virus genotype |
| KR100733186B1 (ko) * | 2005-05-31 | 2007-06-27 | 재단법인 목암생명공학연구소 | Ｈｃｖ 유전자에 특이적인 작은 간섭 ｒｎａ 및 그를유효성분으로 포함하는 ｃ형 간염 치료제 |
| EP2185195A2 (en) | 2007-08-16 | 2010-05-19 | Tripep Ab | Immunogen platform |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2012739T5 (es) * | 1987-11-18 | 2001-12-01 | Chiron Corp | Diagnosticos para nanbv. |
| UA50829C2 (uk) * | 1989-03-17 | 2002-11-15 | Чірон Корпорейшн | Очищений поліпептид, що містить антиген вірусу гепатиту с, полінуклеотид, вектор, клітини, система експресії, моноклональне антитіло, препарат поліклональних антитіл, нуклеотидна проба, аналітичні набори, спосіб виявлення нуклеїнових кислот, способи імуноаналізу, вакцина, спосіб одержання антитіл |
| AR243239A1 (es) * | 1989-12-18 | 1993-07-30 | Wellcome Found | Procedimiento para preparar polipeptido. |
| WO1991014779A1 (en) * | 1990-03-28 | 1991-10-03 | Mitsui Toatsu Chemicals, Incorporated | Diagnostic for hepatitis virus |
| ES2152922T3 (es) * | 1990-04-06 | 2001-02-16 | Genelabs Tech Inc | Epitopos del virus de la hepatitis c. |
| EP0464287A1 (en) * | 1990-06-25 | 1992-01-08 | The Research Foundation for Microbial Diseases of Osaka University | Non-A, non-B hepatitis virus genomic cDNA and antigen polypeptide |
| CA2045326A1 (en) * | 1990-06-25 | 1991-12-26 | Hiroto Okayama | Non-a, non-b, hepatitis virus particles |
| EP0510952A1 (en) * | 1991-04-26 | 1992-10-28 | Immuno Japan Inc. | Oligonucleotide primers and their application for high-fidelity detection of non-a, non-b hepatitis virus |
-
1992
- 1992-05-08 PL PL92301282A patent/PL169880B1/pl unknown
- 1992-05-08 CZ CZ19961210A patent/CZ288722B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 AT AT92913881T patent/ATE252154T1/de not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 KR KR1019930703367A patent/KR100193801B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 EP EP92913881A patent/EP0585398B1/en not_active Revoked
- 1992-05-08 SK SK1232-93A patent/SK284205B6/sk not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 EP EP03013389A patent/EP1394256A3/en not_active Withdrawn
- 1992-05-08 ES ES92913881T patent/ES2207633T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1992-05-08 WO PCT/US1992/004036 patent/WO1992019743A2/en not_active Application Discontinuation
- 1992-05-08 DE DE69233234T patent/DE69233234T2/de not_active Revoked
- 1992-05-08 CZ CZ19932377A patent/CZ288720B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 PL PL92312096A patent/PL170151B1/pl unknown
- 1992-05-08 PT PT100472A patent/PT100472B/pt not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 RU RU93058449/13A patent/RU2155228C2/ru active
- 1992-05-08 CA CA002108466A patent/CA2108466C/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-05-08 JP JP4512055A patent/JPH06508026A/ja not_active Withdrawn
- 1992-05-08 DK DK92913881T patent/DK0585398T3/da active
- 1992-05-08 RO RO93-01493A patent/RO117267B1/ro unknown
- 1992-05-08 HU HU9303166A patent/HU227548B1/hu unknown
- 1992-07-01 IE IE148292A patent/IE921482A1/en not_active IP Right Cessation
-
1993
- 1993-11-05 BG BG98200A patent/BG62142B1/bg unknown
- 1993-11-05 NO NO934019A patent/NO309532B1/no not_active IP Right Cessation
- 1993-11-05 BG BG101876A patent/BG64627B1/bg unknown
- 1993-11-08 FI FI934937A patent/FI115725B/fi not_active IP Right Cessation
-
1997
- 1997-09-04 BG BG101876A patent/BG101876A/xx unknown
-
2002
- 2002-05-10 JP JP2002134997A patent/JP2003009891A/ja not_active Withdrawn
- 2002-05-10 JP JP2002135000A patent/JP2003009893A/ja not_active Withdrawn
- 2002-05-10 JP JP2002134999A patent/JP2003009892A/ja not_active Withdrawn
- 2002-05-10 JP JP2002134998A patent/JP2003024090A/ja not_active Withdrawn
-
2004
- 2004-06-04 JP JP2004167859A patent/JP2004290204A/ja not_active Withdrawn
-
2008
- 2008-03-05 JP JP2008055639A patent/JP2008178416A/ja active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| FI115725B (fi) | HCV:n genomisia sekvenssejä diagnostiikkaan | |
| US6214583B1 (en) | HCV genomic sequences for diagnostics and therapeutics | |
| JP3911022B2 (ja) | Ｃ型肝炎ウイルスゲノムの新規な３’末端配列並びにその診断及び治療使用 | |
| IE83867B1 (en) | HCV genomic sequences for diagnostics and therapeutics | |
| FI112249B (fi) | Hepatitis G virus ja sen molekyylikloonaus | |
| US20020081574A1 (en) | Methods for identifying inhibitors of helicase C virus | |
| US20020160936A1 (en) | Hcv e2 protein binding agents for treatment of hepatitis c virus infection | |
| US20020102534A1 (en) | Exhaustive analysis of viral protein interactions by two-hybrid screens and selection of correctly folded viral interacting polypeptides | |
| AU684177C (en) | Hepatitis G virus and molecular cloning thereof | |
| AU668355C (en) | HCV genomic sequences for diagnostics and therapeutics |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FG | Patent granted |
Ref document number: 115725 Country of ref document: FI |
|
| PC | Transfer of assignment of patent |
Owner name: NOVARTIS VACCINES AND DIAGNOSTICS, INC. Free format text: NOVARTIS VACCINES AND DIAGNOSTICS, INC. |
|
| MA | Patent expired |