[go: up one dir, main page]

ES2903412T3 - Anticuerpos anti-IL-22R - Google Patents

Anticuerpos anti-IL-22R Download PDF

Info

Publication number
ES2903412T3
ES2903412T3 ES17746011T ES17746011T ES2903412T3 ES 2903412 T3 ES2903412 T3 ES 2903412T3 ES 17746011 T ES17746011 T ES 17746011T ES 17746011 T ES17746011 T ES 17746011T ES 2903412 T3 ES2903412 T3 ES 2903412T3
Authority
ES
Spain
Prior art keywords
antibody
seq
antibodies
antigen
domain
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
ES17746011T
Other languages
English (en)
Inventor
Christophe Frederic Jerome Blanchetot
Birgitte Ursø
Tine Skak-Nielsen
Malene Bertelsen
Der Woning Sebastian Van
Michael Saunders
Haard Johannes Joseph Wilhelmus De
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
ArgenX BVBA
Original Assignee
ArgenX BVBA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ArgenX BVBA filed Critical ArgenX BVBA
Application granted granted Critical
Publication of ES2903412T3 publication Critical patent/ES2903412T3/es
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2866Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against receptors for cytokines, lymphokines, interferons
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/02Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06Antipsoriatics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C07K14/54Interleukins [IL]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • C07K16/244Interleukins [IL]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/22Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from camelids, e.g. camel, llama or dromedary
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/33Crossreactivity, e.g. for species or epitope, or lack of said crossreactivity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/34Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/515Complete light chain, i.e. VL + CL
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • C07K2317/732Antibody-dependent cellular cytotoxicity [ADCC]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Physical Education & Sports Medicine (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo que se une a IL-22R, donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo comprende un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera y donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno comprende una combinación de secuencias de CDR de cadena pesada variable: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 36; y HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 34, y una combinación de secuencias de CDR de cadena ligera variable: LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 54; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 47; y LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 16.

Description

DESCRIPCIÓN
Anticuerpos anti-IL-22R
Campo de la invención
La presente invención se refiere a anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen al receptor de citocinas IL-22R, particularmente IL-22R humano. Los anticuerpos para IL-22R y los fragmentos de unión a antígeno de la invención presentan propiedades distintas, en particular distintas combinaciones de propiedades, en comparación con los anticuerpos para IL-22R descritos en la técnica anterior.
Antecedentes de la invención
IL-22R (también conocido como IL-22R1 e IL-22RA) es un receptor de citocinas de tipo II expresado selectivamente en la piel y las células epiteliales. Este receptor media en la señalización a través de tres citocinas: interleucina 22 (IL-22), interleucina 20 (IL-20) e interleucina 24 (IL-24). La señalización de citocinas a través del IL-22R precisa la formación de complejos heterodiméricos en la superficie celular. Como se muestra en la Figura 1, La IL-22 se une a y envía señales a través de un complejo que consiste en IL-22R e IL-10Rp (también conocido como IL-10R2), mientras que IL-20 e IL-24 se unen y señalizan a través de un complejo heterodimérico que consiste en IL-22R e IL-20Rp (también conocido como IL-20R2).
La interleucina-22 es una citocina expresada por células inmunitarias, particularmente linfocitos T y células dendríticas activadas. Una vez producida por el sistema inmunitario, IL-22 ejerce sus efectos biológicos al unirse y activar IL-22R en las células epiteliales. La activación del complejo IL-22R-IL-10Rp aguas abajo de la unión de IL-22 conduce a respuestas proinflamatorias, a la inducción de proteínas antimicrobianas que son cruciales para la defensa del hospedador contra patógenos bacterianos y a efectos protectores en algunos órganos tales como los pulmones y el hígado. También se ha implicado a IL-22 en la patología de enfermedades, particularmente en el desarrollo de trastornos inflamatorios tales como la psoriasis, la artritis psoriásica y la dermatitis atópica (Ma et al. J Clin. Invest. 118: 597-607 (2008); Van Belle et al. J Immunol. 1 de enero; 188(1): 462-9 (2012); Sabat et al. Nat. Rev. Drug Discov. 13(1): 21-38 (2014)).
La estructura cristalina de la IL-22 formando complejo con el dominio extracelular de IL-22R se ha resuelto y ha proporcionado importantes conocimientos sobre cómo este ligando se asocia con su receptor (Jones et al. Estructura 16(9): 1333-1344 (2008)). La región extracelular de IL-22R incluye dos dominios de fibronectina tipo III (FBNIII) (D1 y D2) orientados aproximadamente en ángulos rectos entre sí. Cinco bucles ubicados en la interfaz de estos dominios son los principales responsables de la interacción con los restos de IL-22 en el complejo ligando-receptor. Los restos de IL-22 que contribuyen a la unión al receptor se agrupan en dos sitios del ligando, el sitio 1a y el sitio 1b. Los conocimientos sobre los restos cruciales aportados tanto por el receptor como por el ligando han revelado formas en las que esta interacción podría interrumpirse para anular la señalización de IL-22 como estrategia terapéutica.
La interleucina 20 y la interleucina 24 se expresan en monocitos y queratinocitos y son similares a la IL-22, se ha descubierto que estas citocinas desempeñan un papel en la homeostasis y patología de la piel. De ello se desprende que las estrategias para inhibir o reducir la señalización aguas abajo del IL-22R mediante el bloqueo de la unión de los ligandos que activan este receptor podrían tener utilidad terapéutica, particularmente en el tratamiento de afecciones de la piel tales como psoriasis y dermatitis atópica.
Se han desarrollado anticuerpos que se unen a IL-22R y bloquean la interacción entre IL-22 e IL-22R. Por ejemplo, el documento WO2011/061119 describe un anticuerpo para IL-22R humanizado producido a partir de un anticuerpo monoclonal antihumano de ratón descrito originalmente en el documento WO2006/047249. Se demostró que este anticuerpo humanizado, que se denominará en el presente documento "280-346-TSY", inhibe la señalización de IL-22 a través de IL-22RA en un ensayo de proliferación celular e inhibe la inflamación del oído inducida por IL-23 en un modelo de psoriasis de ratón. Los anticuerpos anti-IL-22R también se describen en el documento WO2004/085476. Dondelinger et al. ((2018) Understanding the significance and implications of antibody numbering and antigenbinding surface/residue definition, Frontiers in Immunology, 9, 2278), describen el efecto de una mutación en la región marco conservada de los anticuerpos que puede alterar la afinidad de unión. Rudikoff et al. ((1982) Single amino acid substitution altering antigenbinding specificity, PNAS, 79, 1979-1983), describen el efecto de una sustitución de un solo aminoácido en una región determinante de complementariedad de una proteína mutante de mieloma de unión a fosfocolina.
Sumario de la invención
La presente invención mejora el estado de la técnica al proporcionar anticuerpos, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R y presentan propiedades que son distintas de las de los anticuerpos para IL-22R descritos en la técnica anterior. Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos presentan normalmente combinaciones de propiedades que son distintas y en determinados casos superiores, a las propiedades de los anticuerpos para IL-22R de la técnica anterior, particularmente el anticuerpo para IL-22R humanizado descrito en el documento WO2011/061119. Las propiedades de estos anticuerpos pueden ser particularmente ventajosas con respecto al uso en terapia humana, particularmente para el tratamiento de afecciones tales como la psoriasis, la artritis psoriásica y la dermatitis atópica.
La presente invención proporciona un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno que se une a IL-22R, donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno comprende un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera y donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno comprende una combinación de secuencias de CDR de cadena pesada variable: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 36; y HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 34, y una combinación de secuencias de CDR de cadena ligera variable: LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 54; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 47; y LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 16.
Además, en el presente documento se describe en general un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al IL-22R humano, donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a un epítopo dentro de la proteína IL-22R que no incluye la Tyr60.
En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos poseen una o más propiedades adicionales seleccionadas de las siguientes:
(i) la capacidad de unirse a un epítopo de IL-22R humano ubicado al menos en parte en el dominio D2 de la proteína IL-22R;
(ii) la capacidad de unirse al IL-22R humano con alta afinidad;
(iii) la capacidad de bloquear la unión de IL-22 a IL-22R humano;
(iv) la capacidad de inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-22;
(v) la capacidad de inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-20;
(vi) la capacidad de inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-22 e IL-20; y
(vii) la falta de reactividad cruzada con IL-22R murino.
Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno pueden presentar una alta homología humana, como se define en otra parte en el presente documento. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos comprenden un dominio variable de cadena pesada (VH) y un dominio variable de cadena ligera (VL) donde los dominios VH y/o VL o una o más regiones determinantes de complementariedad (las CDR) de los mismos se obtienen de un animal de la familia Camelidae, es decir, se obtienen de camélido. Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno que presentan una alta homología humana o que tienen al menos una secuencia de CDR, dominio VH y/o VL obtenidos de camélido pueden ser variantes humanizadas o con modificaciones de estirpe germinal (germlined) de dominios VH o VL de anticuerpos convencionales de camélido, donde las expresiones "humanizado" y "con modificaciones de estirpe germinal" son como se definen en otra parte del presente documento. En ejemplos no limitantes, en el presente documento se describen los siguientes anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se definen por referencia a características estructurales específicas, es decir, secuencias de aminoácidos especificadas de las CDR (una o más de las SEQ ID NO: 2, 4, 6, 9, 11, 13, 34, 36, 41, 43 (las CDR de cadena pesada) o las SEQ ID NO: 16, 18, 20, 23, 25, 27, 47, 54, 57, 59 (las CDR de cadena ligera)) o dominios variables completos (una o más de las SEQ ID NO: 29, 31, 63, 65 (dominios variables de cadena pesada) o las SEQ ID NO: 30, 32, 62, 64, 66 (dominios variables de cadena ligera)). Todos estos anticuerpos se unen al receptor de citocinas IL-22R humano.
En realizaciones particulares, los anticuerpos definidos por las siguientes características estructurales pueden presentar una alta homología humana, como se define en el presente documento. Los anticuerpos pueden ser anticuerpos monoclonales producidos por medios recombinantes. Las CDR de los siguientes anticuerpos para IL-22R pueden obtenerse de camélido, es decir, obtenidas de anticuerpos convencionales producidos por inmunización de camélidos (específicamente, de llama). La invención también proporciona variantes humanizadas o con modificaciones de estirpe germinal humana, variantes de afinidad y variantes que contienen sustituciones conservativas de aminoácidos, como se define en el presente documento.
Los ejemplos de los anticuerpos para IL-22R descritos en el presente documento se describen ahora adicionalmente con referencia a las características estructurales.
En un ejemplo descrito en el presente documento, se proporciona un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno un dominio variable de cadena pesada (VH) que comprende una CDR3 de cadena pesada seleccionada de:
la SEQ ID NO: 6 [VGFSGTYYSES], o variante de secuencia de la misma
la SEQ ID NO: 13 [PPGPFKAHYNGMKY], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 43 [PPGPFKAHYNGAKY], o variante de secuencia de la misma,
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
El dominio variable de cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo puede comprender alternativamente o además una CDR2 de cadena ligera seleccionada de:
la SEQ ID NO: 4 [SIYNDGSNTAYSDSVKG], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 11 [GIHISGGITYYLDSVKG], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 36 [s IYNDASNTAYSDSVkG], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 41 [GIHISGGITYYTDSVKG], o variante de secuencia de la misma,
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
El dominio variable de cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo puede comprender alternativamente o además una CDR1 de cadena ligera seleccionada de:
la SEQ ID NO: 2 [SYDMS], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 9 [SYFMS], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 34 [SYDMN], o variante de secuencia de la misma,
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
De forma alternativa o adicional, los anticuerpos o fragmento de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R, pueden comprender un dominio variable de cadena ligera (VL) que comprende una CDR3 de cadena ligera seleccionada de:
la SEQ ID NO: 20 [QSGSSSANAV], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 27 [ASYRLYADYV], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 54 [QSGSSSSNAV], o variante de secuencia de la misma,
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
El dominio variable de cadena ligera del anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo puede comprender alternativamente o además una CDR2 de cadena ligera seleccionada de:
la SEQ ID NO: 18 [GNNNRPS], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 25 [KVNTRSS], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 47 [GQNNRPS], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 59 [EVNKRSS], o variante de secuencia de la misma,
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
El dominio variable de cadena ligera del anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo puede comprender alternativamente o además una CDR1 de cadena ligera seleccionada de:
la SEQ ID NO: 16 [QGGYYAH], o variante de secuencia de la misma
la SEQ ID NO: 23 [TGTSRDIGDYNYVS], o variante de secuencia de la misma,
la SEQ ID NO: 57 [TGTSSDIGSYNYVS], o variante de secuencia de la misma,
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
En determinados ejemplos, se describe un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R, comprendiendo el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo una combinación de CDR3 de cadena pesada variable (HCDR3), CDR2 de cadena pesada variable (HCDR2) y CDR1 de cadena pesada variable (HCDR1) donde la combinación se selecciona del grupo que consiste en:
(i) HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 36; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 34;
(ii) HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 43; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 41; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 9;
(iii) HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 4; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 2; y
(iv) HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 13; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 11; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 9.
De forma alternativa o adicional, los anticuerpos o fragmento de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R pueden comprender una combinación de CDR3 de cadena ligera variable (LCDR3), CDR2 de cadena ligera variable (LCDR2) y CDR1 de cadena ligera variable (LCDR1) seleccionada del grupo que consiste en:
(i) LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 54; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 47; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 16;
(ii) LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 27; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 59; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 57;
(iii) LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 20; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 47; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 16;
(iv) LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 20; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 18; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 16; y
(v) LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 27; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 25; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 23.
En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R, donde los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno comprenden una combinación de CDR3 de cadena pesada variable (HCDR3), CDR2 de cadena pesada variable (HCDR2) y CDR1 de cadena pesada variable (HCDR1), CDR3 de cadena ligera variable (LCDR3), CDR2 de cadena ligera variable (LCDR2) y CDR1 de cadena ligera variable (LCDR1) de acuerdo con los ejemplos descritos a continuación.
La presente invención proporciona un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R y comprende la combinación de secuencias de CDR de VH y VL: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 36; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 34; LCDR3 que comprende la SEQ ID n O: 54; lCd R2 que comprende la SEQ ID n O: 47; y Lc DR1 que comprende la SEQ ID NO: 16.
En un ejemplo, en el presente documento se describe un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R y comprende la combinación de secuencias de CDR de VH y VL: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 43; HCDr2 que comprende la SEQ ID NO: 41; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 9; LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 27; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 59; y LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 57.
En un ejemplo, en el presente documento se describe un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R y comprende la combinación de secuencias de CDR de VH y VL: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 4; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 2; LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 20; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 47; y Lc Dr 1 que comprende la SEQ ID NO: 16.
En un ejemplo, en el presente documento se describe un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R y comprende la combinación de secuencias de CDR de VH y VL: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 4; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 2; LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 20; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 18; y Lc Dr 1 que comprende la SEQ ID NO: 16.
En un ejemplo, en el presente documento se describe un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une al receptor de citocinas IL-22R y comprende la combinación de secuencias de CDR de VH y VL: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 13; HCDr2 que comprende la SEQ ID NO: 11; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 9; LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 27; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 25; y LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 23.
En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R, donde los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno comprenden un dominio variable de cadena pesada (VH) seleccionado de lo siguiente:
(i) un VH que comprende o que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 29 o 31
(ii) una variante de afinidad o variante con modificaciones de estirpe germinal humana de un VH que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 29 o 31; o
(iii) un VH que comprende o consiste en una secuencia de aminoácidos que tiene al menos el 80 %, al menos el 85 %, al menos el 90 %, al menos el 95 %, al menos el 97 %, al menos el 98 %, al menos el 99 % de identidad con la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 29 o 31.
De forma alternativa o adicional, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno pueden comprender un dominio variable de cadena ligera (VL) seleccionado de lo siguiente:
(i) un VL que comprende o que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 30, 32 o 62
(ii) una variante de afinidad o variante con modificaciones de estirpe germinal humana de un VH que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 30, 32 o 62; o
(iii) un VL que comprende o consiste en una secuencia de aminoácidos que tiene al menos el 80 %, al menos el 85 %, al menos el 90 %, al menos el 95 %, al menos el 97 %, al menos el 98 %, al menos el 99 % de identidad con la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 30, 32 o 62.
Para las realizaciones donde los dominios de los anticuerpos o de los fragmentos de unión a antígeno se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, los dominios VH y/o VL pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo dentro de las regiones marco conservadas.
En determinadas realizaciones, los anticuerpos de la invención pueden incluir el dominio CH1, la región bisagra, el dominio CH2 y el dominio CH3 de un anticuerpo humano, en particular de IgG1, IgG2, IgG3 o IgG4 humana.
Los anticuerpos particularmente preferidos de la presente invención se describen a continuación.
230C9 y anticuerpos relacionados con el mismo
En determinados ejemplos, se proporciona un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a iL-22r , comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno un dominio variable de cadena pesada donde:
la secuencia de CDR3 de cadena pesada variable es la SEQ ID NO: 6 [VGFSGTYYSES] o una variante de secuencia de la misma;
la secuencia de CDR2 de cadena pesada variable es la SEQ ID NO: 36 [SIYNDASNTAYSDSVKG] o una variante de secuencia de la misma; y
la secuencia de CDR1 de cadena pesada variable es la SEQ ID NO: 34 [SYDMN] o una variante de secuencia de la misma, y
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada. El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender además un dominio variable de cadena ligera donde:
la secuencia de CDR3 de cadena ligera variable es la SEQ ID NO: 54 [QSGSSSSNAV] o una variante de secuencia de la misma;
la secuencia de CDR2 de cadena ligera variable es la SEQ ID NO: 47 [GQNNRPS] o una variante de secuencia de la misma; y
la secuencia de CDR1 de cadena ligera variable es la SEQ ID NO: 16 [QGGYYAH] o una variante de secuencia de la misma, y
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada. En la presente invención, se proporciona un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a IL-22R, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno un dominio variable de cadena pesada donde:
la secuencia de CDR3 de cadena pesada variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 6 [VGFSGTYYSES]; la secuencia de CDR2 de cadena pesada variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 36 [SIYNDASNTAYSDSVKG];
la secuencia de CDR1 de cadena pesada variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 34 [SYDMN]; la secuencia de CDR3 de cadena ligera variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 54 [QSGSSSSNAV]; la secuencia de CDR2 de cadena ligera variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 47 [GQNNRPS]; y la secuencia de CDR1 de cadena ligera variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 16 [QGGYYAH].
Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos pueden comprender un dominio variable de cadena pesada (VH) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 63 y opcionalmente un dominio variable de cadena ligera (VL) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 64. En determinadas realizaciones, en el presente documento se proporcionan anticuerpos monoclonales o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera, comprendiendo el dominio variable de cadena pesada una secuencia de VH con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 63 y/o el dominio variable de cadena ligera que comprende una VL con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 64. Para las realizaciones donde los dominios de los anticuerpos o de los fragmentos de unión a antígeno se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, los dominios VH y/o VL pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo dentro de las regiones marco conservadas. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno que comprenden dominios variables de cadena pesada y/o dominios variables de cadena ligera definidos por tener un porcentaje particular de identidad con las SEQ ID NO: 63 y 64, respectivamente, tendrán las siguientes secuencias de CDR:
una secuencia de CDR3 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:6 [VGFSGTYYSES];
una secuencia de CDR2 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:36 [SIYNDASNTAYSDSVKG];
una secuencia de CDR1 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:34 [SYDMN]; una secuencia de CDR3 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la SEQ ID nO:54 [QSGSSSSNAV];
una secuencia de CDR2 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:47 [GQNNRPS]; y
una secuencia de CDR1 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:16 [QGGYYAH].
Los anticuerpos que se unen específicamente a IL-22R pueden comprender al menos una cadena pesada de inmunoglobulina de longitud completa y/o al menos una cadena ligera lambda o kappa de longitud completa. En determinadas realizaciones, los anticuerpos comprenden una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 67 y una cadena ligera que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 68. En determinadas realizaciones, en el presente documento se proporcionan anticuerpos monoclonales que comprenden una cadena pesada con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como la SEQ ID NO: 67 y/o una cadena ligera con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 68. Para las realizaciones donde las cadenas de los anticuerpos se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, la cadena pesada y/o la cadena ligera pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo fuera de las regiones CDR.
223G5 y anticuerpos relacionados con el mismo
En determinados ejemplos, se proporciona un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a iL-22r , comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno un dominio variable de cadena pesada donde:
la secuencia de CDR3 de cadena pesada variable es la SEQ ID NO: 43 [PPGPFKAHYNGAKY] o una variante de secuencia de la misma;
la secuencia de CDR2 de cadena pesada variable es la SEQ ID NO: 41 [GIHISGGITYYTDSVKG] o una variante de secuencia de la misma; y
la secuencia de CDR1 de cadena pesada variable es la SEQ ID NO: 9 [SYFMS] o una variante de secuencia de la misma, y
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada.
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender además un dominio variable de cadena ligera donde:
la secuencia de CDR3 de cadena ligera variable es la SEQ ID NO: 27 [ASYRLYADYV] o una variante de secuencia de la misma;
la secuencia de CDR2 de cadena ligera variable es la SEQ ID NO: 59 [EVNKRSS] o una variante de secuencia de la misma; y
la secuencia de CDR1 de cadena ligera variable es la SEQ ID NO: 57 [TGTSSDIGSYNYVS] o una variante de secuencia de la misma, y
donde la variante de secuencia comprende una, dos o tres sustituciones de aminoácidos (por ejemplo, sustituciones conservativas, sustituciones de humanización o variantes de afinidad) en la secuencia mencionada. En determinados ejemplos descritos en el presente documento, se proporciona un anticuerpo aislado, o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a IL-22R, comprendiendo dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno un dominio variable de cadena pesada donde:
la secuencia de CDR3 de cadena pesada variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 43 [PPGPFKAHYNGAKY];
la secuencia de CDR2 de cadena pesada variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 41 [GIHISGGITYYTDSVKG];
la secuencia de CDR1 de cadena pesada variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 9 [SYFMS]; la secuencia de CDR3 de cadena ligera variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 27 [ASYRLYADYV]; la secuencia de CDR2 de cadena ligera variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 59 [EVNKRSS]; y la secuencia de CDR1 de cadena ligera variable comprende o consiste en la SEQ ID NO: 57 [TGTSSDIGSYNYVS].
Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos pueden comprender un dominio variable de cadena pesada (VH) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 65 y opcionalmente un dominio variable de cadena ligera (VL) que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 66. En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos monoclonales o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera, comprendiendo el dominio variable de cadena pesada una secuencia de Vh con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 65 y/o el dominio variable de cadena ligera que comprende una VL con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 66.
Para las realizaciones donde los dominios de los anticuerpos o de los fragmentos de unión a antígeno se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, los dominios VH y/o VL pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo dentro de las regiones marco conservadas. En determinados ejemplos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno que comprenden dominios variables de cadena pesada y/o dominios variables de cadena ligera definidos por tener un porcentaje particular de identidad con las SEQ ID NO: 65 y 66, respectivamente, tendrán las siguientes secuencias de CDR:
una secuencia de CDR3 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:43 [PPGPFKAHYNGAKY];
una secuencia de CDR2 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:41 [GIHISGGITYYTDSVKG];
una secuencia de CDR1 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:9 [SYFMS]; una secuencia de CDR3 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:27 [ASYRLYADYV];
una secuencia de CDR2 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la SEQ ID NO:59 [EVNKRSS]; y una secuencia de CDR1 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la s Eq ID NO:57 [TGTSSDIGSYNYVS].
Los anticuerpos que se unen específicamente a IL-22R pueden comprender al menos una cadena pesada de inmunoglobulina de longitud completa y/o al menos una cadena ligera lambda o kappa de longitud completa. En determinados ejemplos, los anticuerpos comprenden una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 69 y una cadena ligera que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 70. En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos monoclonales que comprenden una cadena pesada con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como la SEQ ID NO: 69 y/o una cadena ligera con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 70.
Para las realizaciones donde las cadenas de los anticuerpos se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, la cadena pesada y/o la cadena ligera pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo fuera de las regiones CDR.
Cuando se identifique que anticuerpos, o regiones de unión a antígenos, particulares comprenden una combinación de un dominio VH o cadena pesada, definida por referencia a una secuencia de aminoácidos específica, y un dominio VL o una cadena ligera, también definida por referencia a una secuencia de aminoácidos específica, entonces, para cada combinación específica de VH/VL o de cadena pesada/cadena ligera enumerada (a menos que se indique otra cosa), puede considerarse que esta definición incluye anticuerpos o regiones de unión a antígeno, formados por la combinación de un dominio VH/cadena pesada que tiene al menos el 85 %, al menos el 90 %, al menos el 95 %, al menos el 97 %, o al menos el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de cadena pesada/VH indicada y un dominio VL/cadena ligera que tiene al menos el 75 %, al menos el 80 %, al menos el 85 %, al menos el 90 %, al menos el 95 %, al menos el 97 %, o al menos el 99 % de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de VL/cadena ligera indicada. En cada caso, los dominios/cadenas definidas por un % de identidad de secuencia con las secuencias de aminoácidos del dominio/cadena indicados pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en las secuencias de aminoácidos del dominio VH/VL o de la cadena pesada/ligera indicadas, a la vez que presentan variación en la secuencia de aminoácidos dentro de las regiones marco conservadas u otras regiones fuera de las regiones CDR.
A menos que se indique otra cosa en la presente solicitud, el % de identidad de secuencia entre dos secuencias de aminoácidos puede determinarse comparando estas dos secuencias alineadas de una manera óptima y en que la secuencia de aminoácidos a comparar puede comprender adiciones o deleciones con respecto a la secuencia de referencia para un alineamiento óptimo entre estas dos secuencias. El porcentaje de identidad se calcula determinando el número de posiciones idénticas para las que el resto aminoacídico es idéntico entre las dos secuencias, dividiendo este número de posiciones idénticas por el número total de posiciones en la ventana de comparación y multiplicando el resultado obtenido por 100 para obtener el porcentaje de identidad entre estas dos secuencias. Por ejemplo, es posible utilizar el programa BLAST, "Secuencias BLAST 2" (Tatusova et al, "Blast 2 sequences - a new tool for comparing protein and nucleotide sequences", FEMS Microbiol Lett. 174:247-250) disponible en el sitio http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html, siendo los parámetros utilizados los proporcionados por defecto (en particular para los parámetros "penalización por apertura de hueco": 5, y "penalización por extensión de hueco": 2; siendo la matriz elegida, por ejemplo, la matriz "BLOSUM 62" propuesta por el programa), calculándose el porcentaje de identidad entre las dos secuencias a comparar directamente mediante el programa. Los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos proporcionados en el presente documento pueden presentar cada una, o cualquier combinación, de las siguientes propiedades/características: - el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno se puede unir a un epítopo dentro de la proteína IL-22R humana que no incluye la Tyr60;
- el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno puede unirse a un epítopo ubicado al menos en parte en el dominio D2 de la proteína IL-22R humana, donde el dominio D2 es los restos de aminoácidos 125 a 228 de la SEQ ID NO: 71;
- el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede unirse a IL-22R humano con alta afinidad;
- el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede bloquear la unión de IL-22 a IL-22R;
- el anticuerpo o el fragmento de unión al antígeno puede inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-22; - el anticuerpo o el fragmento de unión al antígeno puede inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-20; - el anticuerpo o el fragmento de unión al antígeno puede inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-22 y la activación de IL-22R dependiente de IL-20;
- el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno podría no reaccionar de forma cruzada con IL-22R murino.
Los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos proporcionados en el presente documento presentan preferentemente dos o más de las siguientes propiedades/características:
- el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno se une a un epítopo dentro de la proteína IL-22R humana que no incluye la Tyr60;
- el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno se une a IL-22R humano con alta afinidad;
- el anticuerpo o el fragmento de unión al antígeno inhibe la activación de IL-22R dependiente de IL-22 y la activación de IL-22R dependiente de IL-20.
Los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos, proporcionados en el presente documento, pueden ser anticuerpos quiméricos. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos contienen la región bisagra, el dominio CH2 y/o el dominio CH3 de una IgG humana. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos presentan una alta homología con una IgG humana, preferentemente una IgG1 humana, donde "alta homología humana" es como se define en otra parte del presente documento. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos comprenden un dominio variable de cadena pesada (VH) y un dominio variable de cadena ligera (VL) donde los dominios VH y/o VL o una o más regiones determinantes de complementariedad (las CDR) de los mismos se obtienen de un animal de la familia Camelidae, es decir, se obtienen de camélido, preferentemente donde el camélido es una llama.
En aspectos adicionales, la invención también proporciona moléculas polinucleotídicas que codifican los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno enumerados anteriormente de la invención, además de los vectores de expresión que comprenden los polinucleótidos, células hospedadoras que contienen los vectores y métodos de expresión/producción recombinante de los anticuerpos de la invención.
En un aspecto adicional más, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende los anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención, y un transportador o excipiente farmacéuticamente aceptable.
Otro aspecto más de la invención se refiere a los anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención para su uso como medicamento, particularmente en la profilaxis y/o el tratamiento de afecciones tales como la psoriasis, la artritis psoriásica y la dermatitis atópica.
Estas y otras realizaciones de la invención se apreciarán y comprenderán mejor cuando se consideren junto con la siguiente descripción y los dibujos adjuntos.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 muestra los distintos complejos receptores que median en la señalización a través de las citocinas IL-22, IL-20 e IL-24. IL-22R es capaz de formar un complejo heterodimérico con dos compañeros receptores distintos, IL-10Rp (o IL-10R2) e IL-20Rp (o IL-20R2), y la activación de estos distintos complejos por la unión del ligando desencadena la señalización a través de rutas intracelulares aguas abajo.
La Figura 2 muestra la secuencia de aminoácidos de longitud completa de IL-22R humano (SEQ ID NO: 71). La Figura 3 muestra la secuencia de nucleótidos de longitud completa que codifica a IL-22R humano (SEQ ID NO: 72).
La Figura 4 muestra la inhibición de la señalización mediada por IL-22 e IL-20 a través de IL-22R en ensayos de proliferación basados en células. (A) Se muestra el efecto de los mAb (forma siglada de monoclonal antibody, anticuerpo monoclonal) para IL-22R sobre la proliferación de la línea celular BW-hIL-22R. Las células BW-hIL-22R expresan de manera estable el IL-22R humano y el crecimiento se inhibe/detiene en respuesta al ligando IL-22. Los anticuerpos capaces de bloquear la interacción entre IL-22 y hIL-22R alivian la inhibición del crecimiento mediada por la unión ligando-receptor. (B) Se muestra el efecto de los mAb para IL-22R sobre la proliferación de la línea celular Baf3-hIL-22R/IL2oRb. Las células Baf3-hIL-22R/IL20Rb expresan de manera estable los componentes del complejo receptor IL-22R/IL20Rb de manera que las células proliferan en presencia de IL-20. Los anticuerpos capaces de bloquear la interacción entre IL-20 y este complejo receptor inhiben la proliferación inducida por la unión del ligando.
La Figura 5 muestra el alineamiento del dominio extracelular de IL-22R de diversas especies. (A) muestra las secuencias EST parciales disponibles en Genbank; (B) muestra las secuencias determinadas después de la clonación de IL-22R de cinomolgo y rhesus a partir de la biblioteca de ADNc de mono cinomolgo.
La Figura 6 muestra los resultados de los experimentos de ELISA competitivo llevados a cabo para mapear los epítopos de los mAb para IL-22R. Se identificaron una diversidad de epítopos para los anticuerpos de las familias de VH 1-8, 10, 11, 19 y 22. Los epítopos se agruparon de acuerdo a si los anticuerpos (i) bloquearon la unión de IL-22 in vitro y neutralizaron la señalización de IL-22 en un ensayo basado en células (cuadrante inferior izquierdo); (ii) bloquearon la unión de IL-22 in vitro, pero no tuvieron actividad neutralizante en el ensayo basado en células (cuadrante superior derecho); o (iii) no bloquearon la unión de IL-22 in vitro, pero tenían actividad neutralizante en un ensayo basado en células (cuadrante inferior derecho).
La Figura 7 muestra la estructura cristalina de IL-22R formando complejo con IL-22. (A) Los dominios D1 y D2 de IL-22R aportan restos a la interfaz con el ligando IL-22. (B) Y60 en el dominio D1 es un resto de IL-22R importante que contribuye a la interacción con el sitio 1A del ligando IL-22.
La Figura 8 muestra la inhibición de la señalización mediada por IL-20 a través de IL-22R en un ensayo de proliferación basado en células. Se probaron diversos mAb para IL-22R en cuanto a su capacidad para inhibir la proliferación inducida por IL-20 de células Baf3-hIL-22R/IL20Rb.
La Figura 9 muestra la inhibición de la señalización mediada por IL-22 e IL-20 a través de IL-22R en ensayos basados en células. (A) Se muestra el efecto de los mAb (forma siglada de monoclonal antibody, anticuerpo monoclonal) para IL-22R sobre la proliferación de la línea celular BW-hIL-22R. Las células BW-hIL-22R expresan de manera estable el IL-22R humano y el crecimiento se inhibe/detiene en respuesta al ligando IL-22. Los anticuerpos capaces de bloquear la interacción entre IL-22 y hIL-22R alivian la inhibición del crecimiento mediada por la unión ligando-receptor. (B) Se muestra el efecto de los mAb para IL-22R sobre la proliferación de la línea celular Baf3-hIL-22R/IL20Rb. Las células Baf3-hIL-22R/IL20Rb expresan de manera estable los componentes del complejo receptor IL-22R/IL20Rb de manera que las células proliferan en presencia de IL-20. Los anticuerpos capaces de bloquear la interacción entre IL-20 y este complejo receptor inhiben la proliferación inducida por la unión del ligando.
La Figura 10 muestra esquemáticamente los resultados de los experimentos de mapeo epitópico para los anticuerpos para IL-22R con modificaciones de estirpe germinal 230C9 y 223G5. Obsérvese que "Zymo" es equivalente a 280-346-TSY ".
La Figura 11 muestra la reactividad cruzada de los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal para IL-22R humano y de mono cinomolgo, según lo determinado por análisis FACS. El anticuerpo 230C9 reacciona de forma cruzada con IL-22R humano e IL-22R de cinomolgo (paneles de la izquierda) mientras que el anticuerpo 223G5 se une a IL-22R humano, pero no reacciona de forma cruzada con IL-22R de cinomolgo (paneles de la derecha).
La Figura 12 muestra datos farmacocinéticos para el anticuerpo para IL-22R 230C9. Se inyectaron por vía intravenosa monos cinomolgos una única dosis de anticuerpo de 10 mg/kg. Se tomaron muestras en distintos puntos temporales y se analizaron en cuanto a la concentración plasmática de anticuerpos mediante ELISA. Se descubrió que el anticuerpo 230C9 tiene una semivida de aproximadamente 19,4 días.
La Figura 13 muestra datos farmacocinéticos para el anticuerpo para IL-22R 230C9 a diversas dosis. A dosis más altas (>10 mg/kg), cuando la capacidad de disposición del fármaco mediada por la diana (TMDD, forma siglada de target mediated drug disposition) está saturada, los valores de depuración se acercan a la eliminación no específica por el SRE. B. Depuración de 230C9-N297Q en mono cinomolgo. La depuración total representa la suma de 1) TMDD que es no lineal y saturable y 2) eliminación no específica que es lineal y atribuida al SRE. La semivida plasmática tiene una relación inversa con la depuración, lo que conduce a una semivida prolongada a dosis altas y a una semivida más corta a dosis más bajas debido a la depuración mediada por la diana.
La Figura 14 muestra el efecto farmacodinámico del anticuerpo para IL-22R 230C9. Se expuso un mono cinomolgo a 230C9 en distintas dosis y se evaluaron los efectos sobre un corte de piel tratada con IMQ y un corte de piel normal del mono. Se descubrió que dosis crecientes de anticuerpo 230C9 normalizan el grosor epidérmico (A) y reducen la frecuencia de núcleos positivos para Ki67 (B) en el corte de piel tratada con IMQ. La Figura 15 muestra el efecto del anticuerpo para IL-22R 230C9 (ARGX-112) sobre los niveles de ARNm de FLG2 regulados por IL-22 en biopsias cutáneas en sacabocados. A los monos cinomolgos se les administraron infusiones i.v. únicas de anticuerpo 230C9 en distintas dosis: 1 mg/kg, 5 mg/kg y 30 mg/kg (3 animales por dosis). La IL-22 humana recombinante redujo los niveles totales de ARNm de FLG2 en la piel, mientras que el anticuerpo 230C9 invirtió este efecto. El eje de ordenadas indica la expresión relativa de FLG2 en comparación con un gen de referencia. Las comparaciones estadísticas entre grupos se indican mediante las líneas en la parte superior del gráfico con los siguientes intervalos de confianza: *p<0,05; **p<0,01; ***p<0,001. Los porcentajes mostrados (60 %, 64 %, 60 %, respectivamente) indican el % de inhibición de la señal.
La Figura 16 muestra el efecto del anticuerpo para IL-22R 230C9 (ARGX-112) sobre la expresión génica de DEFB4 regulada por IL-22 en explantes de piel humanos ex vivo. Los explantes de piel abdominal se trataron con concentraciones crecientes de anticuerpo 230C9 antes de la estimulación con rhIL-22 (forma siglada de recombinant human IL-22, IL-22 humana recombinante) 20 ng/ml. El anticuerpo 230C9 pudo invertir el aumento mediado por IL-22 en los niveles de ARNm de DEFB4 de una manera dependiente de la dosis. El eje de ordenadas indica la expresión relativa de DEFB4 en comparación con un gen de referencia. LLOQ significa nivel inferior de cuantificación (lower level of quantification).
La Figura 17 muestra el efecto del anticuerpo para IL-22R 230C9 (ARGX-112) sobre la expresión génica de FLG2 y LOR regulada por IL-22 en explantes de piel de monos cinomolgos ex vivo. Las biopsias de piel se trataron con concentraciones crecientes de anticuerpo 230C9 antes de la estimulación con rhIL-2220 ng/ml. El anticuerpo 230C9 pudo disminuir el aumento mediado por IL-22 en los niveles de ARNm de FLG2 (A) y de LOR (B) de una manera dependiente de la dosis. Los ejes de ordenadas indican la expresión relativa de FLG2 y LOR en comparación con un gen de referencia.
La Figura 18 muestra el efecto del anticuerpo para IL-22R 230C9 (ARGX-112) sobre queratinocitos humanos primarios. Los queratinocitos se pretrataron con anticuerpo 230C9 y luego se estimularon con una mezcla de IL-4, IL-13, IL-22 e IFN-y. Las células de control se trataron con una mezcla de IL-4, IL-13 e IFN-y. El anticuerpo 230C9 mostró una inhibición dependiente de la dosis de la secreción de CCL2.
Descripción detallada
A. Definiciones
"Anticuerpo" o "Inmunoglobulina" - Como se usa en el presente documento, el término "inmunoglobulina" incluye un polipéptido que tiene una combinación de dos cadenas pesadas y dos ligeras posea o no alguna inmunorreactividad específica de interés. "Anticuerpos" se refiere a tales conjuntos que tienen una actividad inmunorreactiva específica conocida significativa para un antígeno de interés (por ejemplo, el receptor de citocinas IL-22R). La expresión "anticuerpos para IL-22R" se usa en el presente documento para hacer referencia a anticuerpos que presentan especificidad inmunológica por la proteína IL-22R, incluyendo IL-22R humana y en algunos casos especies homólogas de la misma. Los anticuerpos e inmunoglobulinas comprenden cadenas ligeras y pesadas, con o sin un enlace covalente intercatenario entre ellas. Las estructuras de inmunoglobulina básicas en sistemas de vertebrados están relativamente bien comprendidas.
El término genérico "inmunoglobulina" comprende cinco clases distintas de anticuerpo que pueden distinguirse bioquímicamente. Las cinco clases de anticuerpos están dentro del alcance de la presente invención. El siguiente análisis se referirá, en líneas generales, a la clase IgG de moléculas de inmunoglobulina. Con respecto a la IgG, las inmunoglobulinas comprenden dos cadenas polipeptídicas ligeras idénticas de un peso molecular de aproximadamente 23.000 daltons y dos cadenas pesadas idénticas de un peso molecular 53.000-70.000. Las cuatro cadenas están unidas mediante enlaces disulfuro en una configuración en "Y" donde las cadenas ligeras enmarcan a las cadenas pesadas comenzando en la boca de la "Y" y continuando a través de la región variable.
Las cadenas ligeras de un anticuerpo se clasifican como kappa o lambda (k,A). Cada clase de cadena pesada puede unirse con una cadena ligera kappa o lambda. En general, las cadenas ligeras y pesadas están unidas covalentemente entre sí, y las porciones de la "cola" de las dos cadenas pesadas se unen entre sí mediante enlaces disulfuro covalentes o enlaces no covalentes cuando las inmunoglobulinas se generan mediante hibridomas, linfocitos B o células hospedadoras modificadas genéticamente. En la cadena pesada, las secuencias de aminoácidos discurren desde un extremo N en los extremos bifurcados de la configuración en Y hasta el extremo C en la parte inferior de cada cadena. Los expertos en la materia apreciarán que las cadenas pesadas se clasifican como gamma, mu, alfa, delta o épsilon, (y, m, a, 8, £) con algunas subclases entre ellas (por ejemplo, y1-y4). La naturaleza de esta cadena es lo que determina la "clase" del anticuerpo como IgG, IgM, IgA, IgD o IgE, respectivamente. Las subclases de inmunoglobulina (isotipos), por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, etc. están bien caracterizadas y son conocidas por conferir especialización funcional. Las versiones modificadas de cada una de estas clases e isotipos son fácilmente discernibles por los expertos en la materia en vista de la presente divulgación y, por consiguiente, están dentro del alcance de la presente invención.
Como se indica anteriormente, la región variable de un anticuerpo permite que el anticuerpo reconozca selectivamente y se una específicamente a epítopos en antígenos. Es decir, el dominio VL y el dominio VH de un anticuerpo se combinan para formar la región variable que define un sitio de unión a antígeno tridimensional. Esta estructura de anticuerpo cuaternaria forma el sitio de unión a antígeno presente en el extremo de cada brazo de la Y. Más específicamente, el sitio de unión a antígeno se define por tres regiones determinantes de complementariedad (las CDR) en cada una de las cadenas VH y VL.
"IL-22R" - Como se usa en el presente documento, el término "IL-22R" significa el receptor de citocinas de tipo II que media la señalización a través de los ligandos IL-22, IL-20 e IL-24. IL-22R es capaz de formar complejos heterodiméricos en la superficie celular con IL-10R2 e IL-20R2. IL-22R también puede denominarse IL22R, IL-22R1, IL22R1, IL22RA, IL-22RA, CRF2-9 y Zcytor 11. El término "IL-22R1" es lo suficientemente amplio como para cubrir la forma humana del receptor y las especies homólogas. La secuencia de aminoácidos de IL-22R humano de longitud completa está representada por la SEQ ID NO: 71 y la secuencia de nucleótidos codificante está representada por la SEQ ID NO: 72 (véanse Figuras 2 y 3). Estas secuencias corresponden a las secuencias depositadas en la base de datos SwissProt como la proteína humana subunidad del receptor de interleucina 22, número de referencia Q8N6P7.
"Sitio de unión" - Como se usa en el presente documento, la expresión "sitio de unión" comprende una región de un polipéptido que es responsable de la unión selectiva a un antígeno diana de interés (por ejemplo, IL-22R). Los dominios de unión comprenden al menos un sitio de unión. Los dominios de unión ilustrativos incluyen un dominio variable de anticuerpo. Las moléculas de anticuerpo de la invención pueden comprender un único sitio de unión o múltiples (por ejemplo, dos, tres o cuatro) sitios de unión.
"Obtenido de" - Como se usa en el presente documento, la expresión "obtenido de" una proteína designada (por ejemplo, un anticuerpo de camélido o un fragmento de unión a antígeno del mismo) se refiere al origen de la secuencia polipeptídica o de aminoácidos. En una realización, el polipéptido o secuencia de aminoácidos que se obtiene de un polipéptido de partida particular es una secuencia de CDR o secuencia relacionada con la misma. En una realización, la secuencia de aminoácidos que se obtiene de un polipéptido de partida particular no es contigua. Por ejemplo, en una realización, uno, dos, tres, cuatro, cinco o seis CDR se obtienen de un anticuerpo de partida. En una realización, el polipéptido o secuencia de aminoácidos que se obtiene de un polipéptido o secuencia de aminoácidos de partida particular tiene una secuencia de aminoácidos que es esencialmente idéntica a la de la secuencia de partida, o una porción de la misma, donde la porción consiste en al menos 3-5 aminoácidos, al menos 5-10 aminoácidos, al menos 10-20 aminoácidos, al menos 20-30 aminoácidos o al menos 30-50 aminoácidos, o que un experto en la materia puede identificar de otro modo como que tiene su origen en la secuencia de partida. En una realización, la una o más secuencias de CDR obtenidas del anticuerpo de partida se alteran para producir secuencias de CDR variantes, por ejemplo, variantes de afinidad, donde las secuencias de CDR variantes mantienen la actividad de unión al antígeno diana.
"Obtenido de camélido" - En determinadas realizaciones preferidas, los anticuerpos de la invención comprenden secuencias de aminoácidos del armazón y/o secuencias de aminoácidos de CDR obtenidas de un anticuerpo convencional de camélido generado por inmunización activa de un camélido. Sin embargo, los anticuerpos de la invención que comprenden secuencias de aminoácidos obtenidas de camélido pueden diseñarse técnicamente para comprender secuencias del armazón y/o de regiones constantes obtenidas de una secuencia de aminoácidos humana (es decir, un anticuerpo humano) u otras especies de mamíferos no camélidos. Por ejemplo, pueden incluirse en los anticuerpos para IL-22R objeto una región marco conservada de primate humano o no humano, una porción de cadena pesada y/o una porción de bisagra. En una realización, pueden estar presentes en la región marco conservada de un anticuerpo "obtenido de camélido" uno o más aminoácidos no de camélido, por ejemplo, una secuencia de aminoácidos de armazón de camélido puede comprender una o más mutaciones de aminoácidos en las que está presente el correspondiente resto de aminoácido de primate humano o no humano. Además, pueden unirse a los dominios constantes de anticuerpos humanos dominios VH y VL obtenidos de camélido, o variantes humanizadas de los mismos, para producir una molécula quimérica, como se describe en otra parte del presente documento.
"Sustitución conservativa de aminoácido" - Una "sustitución conservativa de aminoácido" es una en que el resto de aminoácido se reemplaza por un resto de aminoácidos que tiene una cadena lateral similar. Se han definido en la técnica familias de restos de aminoácidos que tienen cadenas laterales similares, incluyendo cadenas laterales básicas (por ejemplo, lisina, arginina, histidina), cadenas laterales ácidas (por ejemplo, ácido aspártico, ácido glutámico), cadenas laterales polares no cargadas (por ejemplo, glicina, asparagina, glutamina, serina, treonina, tirosina, cisteína), cadenas laterales no polares (por ejemplo, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina, triptófano), cadenas laterales beta ramificadas (por ejemplo, treonina, valina, isoleucina) y cadenas laterales aromáticas (por ejemplo, tirosina, fenilalanina, triptófano, histidina). Por tanto, un resto de aminoácido no esencial en un polipéptido de inmunoglobulina puede remplazarse por otro resto de aminoácido de la misma familia de cadena lateral. En otra realización, una hilera de aminoácidos puede remplazarse por una hilera estructuralmente similar que difiere en el orden y/o la composición de los miembros de la familia de cadena lateral.
"Porción de cadena pesada" - Como se usa en el presente documento, la expresión "porción de cadena pesada" incluye secuencias de aminoácidos obtenidas de los dominios constantes de una cadena pesada de inmunoglobulina. Un polipéptido que comprende una parte de cadena pesada comprende al menos uno de: un dominio CH1, un dominio de bisagra (por ejemplo, región de bisagra superior, media y/o inferior), un dominio CH2, un dominio CH3 o una variante o fragmento de los mismos. En una realización, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de la invención puede comprender la porción Fc de una cadena pesada de inmunoglobulina (por ejemplo, una porción de bisagra, un dominio c H2 y un dominio CH3). En otra realización, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno de la invención puede carecer de al menos una porción de un dominio constante (por ejemplo, todo o parte de un dominio CH2). En determinadas realizaciones, al menos uno, y preferentemente la totalidad, de los dominios constantes se obtienen de una cadena pesada de inmunoglobulina humana. Por ejemplo, en una realización preferida, la porción de cadena pesada comprende un dominio de bisagra completamente humano. En otras realizaciones preferidas, la porción de cadena pesada que comprende una porción Fc completamente humana (por ejemplo, secuencias de dominio de bisagra, CH2 y CH3 de una inmunoglobulina humana).
En determinadas realizaciones, los dominios constantes constituyentes de la porción de la cadena pesada son de distintas moléculas de inmunoglobulina. Por ejemplo, una porción de cadena pesada de un polipéptido puede comprender un dominio CH2 obtenido de una molécula de IgG1 y una región de bisagra obtenida de una molécula de IgG3 o IgG4. En otras realizaciones, los dominios constantes son dominios quiméricos que comprenden porciones de distintas moléculas de inmunoglobulina. Por ejemplo, una bisagra puede comprender una primera porción de una molécula de IgG1 y una segunda porción de una molécula de IgG3 o IgG4. Como se expone anteriormente, un experto en la materia comprenderá que los dominios constantes de la porción de cadena pesada pueden modificarse de modo que varíen en la secuencia de aminoácidos respecto a la molécula de inmunoglobulina de origen natural (de tipo silvestre). Es decir, los polipéptidos de la invención divulgada en el presente documento pueden comprender alteraciones y modificaciones en uno o más dominios constantes de cadena pesada (CH1, bisagra, CH2 o CH3) y/o en el dominio de la región constante de cadena ligera (CL). Las modificaciones ilustrativas incluyen adiciones, deleciones o sustituciones de uno o más aminoácidos en uno o más dominios.
"Quimérico" - Una proteína "quimérica" comprende una primera secuencia de aminoácidos unida a una segunda secuencia de aminoácidos con la que no está unida de forma natural en la naturaleza. Las secuencias de aminoácidos pueden existir normalmente en proteínas separadas que se juntan en el polipéptido de fusión o pueden existir normalmente en la misma proteína, pero se colocan en una nueva disposición en el polipéptido de fusión. Puede crearse una proteína quimérica, por ejemplo, por síntesis química, o creando y traduciendo un polinucleótido en el que las regiones peptídicas están codificadas en la relación deseada. Los anticuerpos quiméricos ilustrativos de la invención incluyen proteínas de fusión que comprenden dominios VH y VL obtenidos de camélido, o variantes humanizadas de los mismos, fusionadas a los dominios constantes de un anticuerpo humano, por ejemplo, una IgG1, IgG2, IgG3 o IgG4 humana.
"Región variable" o "dominio variable" - Las expresiones "región variable" y "dominio variable" se usan en el presente documento indistintamente y se pretende que tengan un significado equivalente. El término "variable" se refiere al hecho de que determinadas porciones de los dominios variables VH y VL difieren ampliamente en la secuencia entre anticuerpos y se usan en la unión y especificidad de cada anticuerpo particular por su antígeno diana. Sin embargo, la variabilidad no está distribuida uniformemente por todos los dominios variables de los anticuerpos. Se concentra en tres segmentos denominados "bucles hipervariables" en cada dominio VL y dominio VH que forman parte del sitio de unión a antígeno. Los primero, segundo y tercero bucles hipervariables del dominio de cadena ligera VLambda se denominan en el presente documento L1(A), L2(A) y L3(A) y pueden definirse como comprendiendo los restos 24-33 (L1(A), que consiste en 9, 10 u 11 restos de aminoácido), 49-53 (L2(A), que consiste en 3 restos) y 90-96 (L3(A), que consiste en 5 restos) en el dominio VL (Morea et al., Methods 20:267-279 (2000)). Los primero, segundo y tercer bucles hipervariables del dominio de cadena ligera Vkappa se denominan en el presente documento l 1(k), L2(k) y L3(k) y pueden definirse como comprendiendo los restos 25-33 (L1(k), que consiste en 6, 7, 8, 11, 12 o 13 restos), 49-53 (L2(k), que consiste en 3 restos) y 90-97 (L3(k), que consiste en 6 restos) en el dominio VL (Morea et al., Methods 20:267-279 (2000)). Los primero, segundo y tercer bucles hipervariables del dominio VH se denominan en el presente documento H1, H2 y H3 y pueden definirse como comprendiendo los restos 25-33 (H1, que consiste en 7, 8 o 9 restos), 52-56 (H2, que consiste en 3 o 4 restos) y 91­ 105 (H3, muy variable en longitud) en el dominio VH (Morea et al., Methods 20:267-279 (2000)).
Salvo que se indique otra cosa, los términos L1, L2 y L3 se refieren respectivamente al primer, segundo y tercer bucles hipervariables de un dominio VL, y abarcan bucles hipervariables obtenidos de ambos isotipos Vkappa y Vlambda. Los términos H1, H2 y H3 se refieren respectivamente al primer, segundo y tercer bucles hipervariables del dominio VH, y abarcan bucles hipervariables obtenidos de cualquiera de los isotipos de cadena pesada conocidos, incluyendo y, £, 6, a o p.
Los bucles hipervariables L1, L2, L3, H1, H2 y H3 pueden comprender, cada uno, parte de una "región determinante de complementariedad" o "CDR", como se define a continuación. Las expresiones "bucle hipervariable" y "región determinante de complementariedad" no son estrictamente sinónimas, ya que los bucles hipervariables (los HV) se definen basándose en la estructura, mientras que las regiones determinantes de complementariedad (CDR) se definen basándose en la variabilidad de secuencia (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5.a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD., 1983) y los límites de los HV y las CDR pueden ser distintos en algunos dominios VH y VL.
Las CDR de los dominios VL y VH pueden definirse normalmente por comprender los siguientes aminoácidos: restos 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCd R2) y 89-97 (LCDR3) en el dominio variable de cadena ligera, y restos 31-35 o 31-35b (HCDR1), 50-65 (HCd R2) y 95-102 (HCDR3) en el dominio variable de cadena pesada; (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5.a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)). Por tanto, los HV pueden estar comprendidos dentro de las CDR correspondientes y las referencias en el presente documento a los "bucles hipervariables" de dominios VH y VL deben interpretarse abarcando también las correspondientes CDR, y viceversa, salvo que se indique otra cosa.
Las porciones más altamente conservadas de los dominios variables se denominan regiones marco conservadas (FR), como se define a continuación. Los dominios variables de cadenas pesadas y ligeras naturales comprenden cada uno cuatro FR (FR1, FR2, FR3 y FR4, respectivamente), que adoptan en gran medida una configuración de lámina p, conectadas por los tres bucles hipervariables. Los bucles hipervariables en cada cadena se mantienen juntos en estrecha proximidad por las FR y, con los bucles hipervariables de la otra cadena, contribuyen a la formación del sitio de unión a antígeno de los anticuerpos. El análisis estructural de los anticuerpos reveló la relación entre la secuencia y la forma del sitio de unión formado por las regiones determinantes de complementariedad (Chothia et al., J. Mol. Biol. 227: 799-817 (1992)); Tramontano et al., J. Mol. Biol, 215:175-182 (1990)). A pesar de su alta variabilidad de secuencia, cinco de los seis bucles adoptan únicamente un pequeño repertorio de conformaciones de cadena principal, denominadas "estructuras canónicas". Estas conformaciones en primera instancia están determinadas por la longitud de los bucles y en segundo lugar por la presencia de restos clave en determinadas posiciones en los bucles y en las regiones marco conservadas que determinan la conformación a través de su compactación, formación de enlaces de hidrógeno o la capacidad de asumir conformaciones de cadena principal inusuales.
"CDR" - Como se usa en el presente documento, el término "CDR" o "región determinante de complementariedad" significa los sitios de combinación con antígeno no contiguos encontrados dentro de la región variable de los polipéptidos de cadena pesada y ligera. Estas regiones particulares se han descrito por Kabat et al., J. Biol. Chem.
252, 6609-6616 (1977) y Kabat et al., Sequences of protein of immunological interest. (1991), y por Chothia et al., J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987) y por MacCallum et al., J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996) en que las definiciones incluyen solapamientos o subconjuntos de restos de aminoácidos cuando se comparan entre sí. Los restos de aminoácidos que abarcan las CDR como se definen por cada una de las referencias citadas anteriormente se exponen para su comparación. Preferentemente, el término "CDR" es una CDR como se define por Kabat basada en comparaciones de secuencia.
Tabla 1: Definiciones de CDR
Figure imgf000015_0002
"Región marco conservada" - La expresión "región marco conservada" o "región FR" como se usa en el presente documento, incluye los restos de aminoácidos que forman parte de la región variable, pero no son parte de las CDR (por ejemplo, utilizando la definición de Kabat de las CDR). Por lo tanto, una región marco conservada variable es de entre aproximadamente 100-120 aminoácidos de longitud, pero incluye solamente los aminoácidos fuera de las CDR. Para el ejemplo específico de un dominio variable de cadena pesada y para las CDR como se definen por Kabat et al., la región marco conservada 1 corresponde al dominio de la región variable que abarca los aminoácidos 1-30; la región marco conservada 2 corresponde al dominio de la región variable que abarca los aminoácidos 36-49; la región marco conservada 3 corresponde al dominio de la región variable que abarca los aminoácidos 66-94, y la región marco conservada 4 corresponde al dominio de la región variable desde el aminoácido 103 hasta el final de la región variable. Las regiones marco conservadas para la cadena ligera están separadas de forma similar por cada una de las CDR de la región variable de cadena ligera. De manera similar, utilizando la definición de las CDR de Chothia et al. o McCallum et al., los límites de la región marco conservada están separados por los extremos respectivos de las CDR como se describe anteriormente. En realizaciones preferidas, las CDR son como se definen por Kabat.
En los anticuerpos de origen natural, las seis CDR presentes en cada anticuerpo monomérico son secuencias cortas, no contiguas de aminoácidos que se posicionan específicamente para formar el sitio de unión a antígeno cuando el anticuerpo asume su configuración tridimensional en un entorno acuoso. El resto de los dominios variables de pesada y ligera muestra menos variabilidad intermolecular en la secuencia de aminoácidos y se denominan regiones marco conservadas. Las regiones marco conservadas adoptan en gran medida una conformación de lámina p y las CDR forman bucles que conectan y, en algunos casos, forman parte de, la estructura de lámina p. Por tanto, estas regiones marco conservadas actúan formando un armazón que proporciona el posicionamiento de las seis CDR en la orientación correcta mediante interacciones intercatenarias, no covalentes. El sitio de unión a antígeno formado por las CDR posicionadas define una superficie complementaria al epítopo en el antígeno inmunorreactivo. Esta superficie complementaria estimula la unión no covalente del anticuerpo al epítopo del antígeno inmunorreactivo. La posición de las CDR puede identificarla fácilmente un experto en la materia.
"Región bisagra" - Como se usa en el presente documento, la expresión "región bisagra" incluye la porción de una molécula de cadena pesada que une el dominio CH1 al dominio CH2. Esta región bisagra comprende aproximadamente 25 restos y es flexible, permitiendo así que las dos regiones de unión a antígeno N-terminales se muevan de forma independiente. Las regiones bisagra se pueden subdividir en tres dominios distintos: dominios de bisagra superior, media e inferior (Roux K.H. et al. J. Immunol. 161:4083-90 1998). Los anticuerpos de la invención que comprenden una región bisagra "completamente humana" pueden contener una de las secuencias de la región bisagra que se muestran a continuación en la Tabla 2.
Tabla 2: Secuencias de bisa ra humana
Figure imgf000015_0001
"Dominio CH2" - Como se usa en el presente documento, la expresión "dominio CH2" incluye la porción de una molécula de cadena pesada que se extiende, por ejemplo, desde aproximadamente el resto 244 al resto 360 de un anticuerpo, utilizando los esquemas de numeración convencionales (restos 244 a 360, sistema de numeración de Kabat; y restos 231-340, sistema de numeración de EU, Kabat EA et al. Sequences of Proteins of Immunological Interest. Bethesda, US Department of Health and Human Services, NIH. 1991). El dominio CH2 es único en el sentido de que no está estrechamente emparejado con otro dominio. Más bien, dos cadenas de hidratos de carbono ramificadas unidas en N se interponen entre los dos dominios CH2 de una molécula de IgG natural intacta. También está bien documentado que el dominio CH3 se extiende desde el dominio CH2 al extremo C-terminal de la molécula de IgG y comprende aproximadamente 108 restos.
"Fragmento" - El término "fragmento", como se usa en el contexto de los anticuerpos de la invención, se refiere a una parte o porción de un anticuerpo o cadena de anticuerpo que comprende menos restos de aminoácidos que el anticuerpo o cadena de anticuerpo intacta o completa. La expresión "fragmento de unión a antígeno" se refiere a un fragmento polipeptídico de una inmunoglobulina o anticuerpo que se une al antígeno o compite con el anticuerpo intacto (es decir, con el anticuerpo intacto del que se obtuvo) por la unión al antígeno (es decir, unión específica a IL-22R). Como se usa en el presente documento, el término "fragmento" de una molécula de anticuerpo incluye fragmentos de unión a antígeno de anticuerpos, por ejemplo, un dominio variable de cadena ligera de anticuerpo (VL), un dominio variable de cadena pesada de anticuerpo (VH), un anticuerpo monocatenario (scFv), un fragmento F(ab')2, un fragmento Fab, un fragmento Fd, un fragmento Fv y un fragmento de anticuerpo de dominio único (DAb). Los fragmentos pueden obtenerse, por ejemplo, mediante tratamiento químico o enzimático de un anticuerpo o cadena de anticuerpo intacta o completa o por medios recombinantes.
"Valencia"- Como se usa en el presente documento, el término "valencia" se refiere al número de posibles sitios de unión a la diana en un polipéptido. Cada sitio de unión a diana se une específicamente a una molécula diana o sitio específico en una molécula diana. Cuando un polipéptido comprende más de un sitio de unión a la diana, cada sitio de unión a diana puede unirse específicamente a la misma molécula o a moléculas distintas (por ejemplo, puede unirse a distintos ligandos o distintos antígenos, o distintos epítopos en el mismo antígeno).
"Especificidad" - el término "especificidad" se refiere a la capacidad de unirse (por ejemplo, inmunorreaccionar con) a una diana dada, por ejemplo, IL-22R. Un polipéptido puede ser monoespecífico y contener uno o más sitios de unión que se unen específicamente a una diana o un polipéptido puede ser multiespecífico y contener dos o más sitios de unión que se unen específicamente a la misma diana o a distintas dianas.
"Sintético" - Como se usa en el presente documento, el término "sintético", con respecto a polipéptidos, incluye polipéptidos que comprenden una secuencia de aminoácidos que no se de origen natural. Por ejemplo, polipéptidos que no son de origen natural que son formas modificadas de polipéptidos de origen natural (por ejemplo, que comprenden una mutación tal como una adición, sustitución o deleción) o que comprenden una primera secuencia de aminoácidos (que puede ser de origen natural o no) que está unida en una secuencia lineal de aminoácidos a una segunda secuencia de aminoácidos (que puede ser de origen natural o no) a la que no está unida de forma natural en la naturaleza.
"Diseñado técnicamente" - Como se usa en el presente documento, la expresión "diseñado técnicamente" incluye la manipulación de moléculas de ácido nucleico o polipeptídicas por medios sintéticos (por ejemplo, por técnicas recombinantes, síntesis peptídica in vitro, por acoplamiento enzimático o químico de péptidos o alguna combinación de estas técnicas). Preferentemente, los anticuerpos de la invención están diseñados técnicamente, incluyendo, por ejemplo, anticuerpos humanizados y/o quiméricos, y anticuerpos que han sido diseñados técnicamente para mejorar una o más propiedades, tal como la unión al antígeno, la estabilidad/semivida o la función efectora.
"Anticuerpo modificado" - Como se usa en el presente documento, la expresión "anticuerpo modificado" incluye formas sintéticas de anticuerpos que se alteran de modo que no sean de origen natural, por ejemplo, anticuerpos que comprenden al menos dos porciones de la cadena pesada, pero no dos cadenas pesadas completas (tales como anticuerpos de dominio delecionado o minicuerpos); formas multiespecíficas de anticuerpos (por ejemplo, biespecíficas, triespecíficas, etc.) alteradas para que se unan a dos o más antígenos distintos o a distintos epítopos en un solo antígeno); moléculas de cadena pesada unidas a moléculas scFv y similares. Las moléculas scFv son conocidas en la técnica y se describen, por ejemplo, en la patente de Estados Unidos 5.892.019. Además, la expresión "anticuerpo modificado" incluye formas multivalentes de anticuerpos (por ejemplo, trivalente, tetravalente, etc., anticuerpos que se unen a tres o más copias del mismo antígeno). En otra realización, un anticuerpo modificado de la invención es una proteína de fusión que comprende al menos una porción de la cadena pesada que carece de un dominio CH2 y que comprende un dominio de unión de un polipéptido que comprende la porción de unión de un miembro de una pareja de ligando y receptor.
La expresión "anticuerpo modificado" también puede usarse en el presente documento para hacer referencia a variantes de secuencia de aminoácidos de los anticuerpos de la invención como se define estructuralmente en el presente documento. Un experto en la materia entenderá que un anticuerpo puede modificarse para que produzca un anticuerpo variante que varía en la secuencia de aminoácidos en comparación con el anticuerpo del que se obtuvo. Por ejemplo, pueden hacerse sustituciones de nucleótidos o aminoácidos que dan lugar a sustituciones o cambios conservativos en restos de aminoácidos "no esenciales" (por ejemplo, en restos de CDR y/o de armazón). Las sustituciones de aminoácidos pueden incluir el reemplazo de uno o más aminoácidos por un aminoácido de origen natural o no natural.
"Sustituciones de humanización" - Como se usa en el presente documento, la expresión "sustituciones de humanización" se refiere a sustituciones de aminoácidos en las que el resto de aminoácido presente en una posición particular en el dominio VH o VL de un anticuerpo (por ejemplo, un anticuerpo para IL-22R obtenido de camélido) se reemplaza por un resto de aminoácido que se produce en una posición equivalente en un dominio VH o VL humano de referencia. El dominio VH o VL humano de referencia puede ser un dominio VH o VL codificado por la estirpe germinal humana. Pueden realizarse sustituciones de humanización en las regiones marco conservadas y/o las CDR de los anticuerpos, definas en el presente documento.
"Variantes humanizadas " - Como se usa en el presente documento, la expresión "variante humanizada" se refiere a un anticuerpo variante que contiene una o más "sustituciones de humanización" en comparación con un anticuerpo de referencia, donde una porción del anticuerpo de referencia (por ejemplo, el dominio VH y/o el dominio VL o partes del mismo que contienen al menos una c Dr ) tiene un aminoácido obtenido de una especie no humana, y las "sustituciones de humanización" se producen dentro de la secuencia de aminoácidos obtenida de una especie no humana.
"Variantes con modificaciones de estirpe germinal" - La expresión "variante con modificaciones de estirpe germinal" se usa en el presente documento para referirse específicamente a "variantes humanizadas" en las que las "sustituciones de humanización" dan como resultado el reemplazo de uno o más restos de aminoácidos presentes en una posición (o posiciones) particular en el dominio VH o VL de un anticuerpo (por ejemplo, un anticuerpo para IL-22R obtenido de camélido) por un resto de aminoácido que se encuentra en una posición equivalente en un dominio VH o VL humano de referencia codificado por la estirpe germinal humana. Es típico que para cualquier "variante con modificaciones de estirpe germinal", los restos de aminoácidos de reemplazo sustituidos en la variante con modificaciones de estirpe germinal se toman exclusiva, o predominantemente, de un único dominio VH o VL codificado por la estirpe germinal humana. Las expresiones "variante humanizada" y "variante con modificaciones de estirpe germinal" se usan a menudo indistintamente en el presente documento. La introducción de una o más "sustituciones de humanización" en un dominio VH o VL obtenido de camélido (por ejemplo, obtenido de llama) da como resultado la producción de una "variante humanizada" del dominio VH o VL obtenido de camélido (Ilama). Si los restos de aminoácidos sustituidos se obtienen predominante o exclusivamente de una única secuencia de dominio VH o VL codificada por la estirpe germinal humana, entonces el resultado puede ser una "variante con modificaciones de estirpe germinal humana" del dominio VH o VL obtenido de camélidos (Ilama).
"Variantes de afinidad" - Como se usa en el presente documento, la expresión "variante de afinidad" se refiere a un anticuerpo variante que presenta uno o más cambios en la secuencia de aminoácidos en comparación con un anticuerpo de referencia, donde la variante de afinidad presenta una afinidad alterada por el antígeno diana comparación con el anticuerpo de referencia. Por ejemplo, las variantes de afinidad presentarán una afinidad cambiada por IL-22R, en comparación con el anticuerpo para IL-22R de referencia. Preferentemente, la variante de afinidad presentará una afinidad mejorada por el antígeno diana, por ejemplo, IL-22R, en comparación con el anticuerpo de referencia. Las variantes de afinidad normalmente presentan uno o más cambios en la secuencia de aminoácidos en las CDR, en comparación con el anticuerpo de referencia. Dichas sustituciones pueden dar como resultado el reemplazo del aminoácido original presente en una posición dada en las CDR por un resto de aminoácido distinto, que puede ser un resto de aminoácido de origen natural o un resto de aminoácido que no es de origen natural. Las sustituciones de aminoácidos pueden ser conservativas o no conservativas.
"Alta homología humana" - Se considerará que un anticuerpo que comprende un dominio variable de cadena pesada (VH) y un dominio variable de cadena ligera (VL) tiene una alta homología humana si los dominios VH y los dominios VL, en conjunto, presentan al menos el 90 % de identidad de secuencia de aminoácidos con las secuencias VH y VL de la estirpe germinal humana coincidentes más cercanas. Los anticuerpos que tienen una alta homología humana pueden incluir anticuerpos que comprenden dominios VH y VL de anticuerpos nativos no humanos que presentan un % de identidad de secuencia suficientemente alto con las secuencias de estirpe germinal humana, incluyendo, por ejemplo, anticuerpos que comprenden dominios VH y VL de anticuerpos convencionales de camélido, así como variantes de diseñadas técnicamente, especialmente humanizadas o con modificaciones de estirpe germinal, de tales anticuerpos y también anticuerpos "totalmente humanos".
En una realización, el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana puede presentar una identidad de secuencia o una homología de secuencia de aminoácidos del 80 % o más con uno o más dominios VH humanos a lo largo de las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 e FR4. En otras realizaciones, la identidad de secuencia o la homología de secuencia de aminoácidos entre el dominio VH del polipéptido de la invención y la secuencia del dominio VH de la estirpe germinal humana coincidente más cercana puede ser del 85 % o más, el 90 % o más, el 95 % o más, el 97 % o más, o hasta del 99 % o incluso del 100 %.
En una realización, el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana puede contener una o más (por ejemplo, 1 a 10) falta de coincidencias de secuencias de aminoácidos en las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 y FR4, en comparación con la secuencia de VH humano coincidente más cercana.
En otra realización, el dominio VL del anticuerpo con alta homología humana puede presentar una identidad de secuencia o una homología de secuencia del 80 % o más con uno o más dominios VL humanos a lo largo de las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 e FR4. En otras realizaciones, la identidad de secuencia o la homología de secuencia de aminoácidos entre el dominio VL del polipéptido de la invención y la secuencia del dominio VL de la estirpe germinal humana coincidente más cercana puede ser del 85 % o más, del 90 % o más, el 95 % o más, el 97 % o más, o hasta del 99 % o incluso del 100 %.
En una realización, el dominio VL del anticuerpo con alta homología humana puede contener una o más (por ejemplo, 1 a 10) falta de coincidencias de secuencias de aminoácidos en las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 y FR4, en comparación con la secuencia de VL humano coincidente más cercana.
Antes de analizar el porcentaje de identidad de secuencia entre el anticuerpo con alta homología humana y los VH y VL de estirpe germinal humana, pueden determinarse los pliegues canónicos, lo que permite la identificación de la familia de segmentos de estirpe germinal humana con la combinación idéntica de pliegues canónicos para H1 y H2 o L1 y L2 (y L3). Posteriormente, el miembro de la familia de la estirpe germinal humana que tiene el mayor grado de homología de secuencia con la región variable del anticuerpo de interés se elige para puntuar la homología de secuencia. La determinación de las clases canónicas de Chothia de bucles hipervariables L1, L2, L3, H1 y H2 se puede realizar con las herramientas de bioinformática disponibles públicamente en la página de internet www.bioinf.org.uk/abs/chothia.html.page. El resultado del programa muestra los requisitos de los restos clave en un archivo de datos. En estos archivos de datos, las posiciones de restos clave se muestran con los aminoácidos permitidos en cada posición. La secuencia de la región variable del anticuerpo de interés se proporciona como entrada y en primer lugar se alinea con una secuencia de anticuerpo consenso para asignar el esquema de numeración de Kabat. El análisis de los pliegues canónicos utiliza un conjunto de plantillas de restos clave obtenidas mediante un método automatizado desarrollado por Martin y Thornton (Martin et al., J. Mol. Biol. 263:800-815 (1996)).
Con el segmento V de estirpe germinal humana particular conocido, que usa la misma combinación de pliegues canónicos para H1 y H2 o L1 y L2 (y L3), se puede determinar el miembro de la familia que coincide mejor en términos de homología de secuencia. Con herramientas bioinformáticas, se puede determinar el porcentaje de identidad de secuencia entre las secuencias de aminoácidos de armazón de los dominios VH y VL del anticuerpo de interés y las secuencias correspondientes codificadas por la estirpe germinal humana, pero en realidad también se puede aplicar la alineación manual de las secuencias. Las secuencias de inmunoglobulinas humanas se pueden identificar a partir de varias bases de datos de proteínas, tales como VBase (http://vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk/) o la base de datos Pluckthun/Honegger (http://www.bioc.unizh.ch/antibody/Sequences/Germlines. Para comparar las secuencias humanas con las regiones V de los dominios VH o VL en un anticuerpo de interés, se puede utilizar un algoritmo de alineamiento de secuencias tal como el disponible en sitios web como www.expasy.ch/tools/#align, pero también se puede realizar un alineamiento manual con el conjunto limitado de secuencias. Las secuencias de las cadenas ligera y pesada de la estirpe germinal humana de las familias con las mismas combinaciones de pliegues canónicos y con el mayor grado de homología con las regiones marco conservadas 1, 2 y 3 de cada cadena se seleccionan y comparan con la región variable de interés; también el FR4 se comprueba con las regiones JH y JK o JL de estirpe germinal humana.
Cabe destacar que, en el cálculo del porcentaje total de homología de secuencia, los restos de FR1, FR2 y FR3 se evalúan utilizando la secuencia de coincidencia más cercana de la familia de estirpe germinal humana con la combinación idéntica de pliegues canónicos. Solo se puntúan los restos distintos de la coincidencia más cercana u otros miembros de la misma familia con la misma combinación de pliegues canónicos (obsérvese, excluyendo cualquier diferencia codificada por el cebador). Sin embargo, a los efectos de la humanización, los restos en regiones marco conservadas idénticas a los miembros de otras familias de estirpe germinal humana, que no tienen la misma combinación de pliegues canónicos, pueden considerarse "humanos", a pesar de que estos se puntúan como "negativos" de acuerdo con las rigurosas condiciones descritas anteriormente. Esta suposición se basa en el enfoque de "mezclar y hacer coincidir" para la humanización, en el que cada uno de FR1, FR2, FR3 y FR4 se comparan por separado con su secuencia de estirpe germinal humana coincidente más cercana y, por lo tanto, la molécula humanizada contiene una combinación de distintos FR, como lo hicieron Qu y colegas (Qu et al., Clin. Cancer Res. 5:3095-3100 (1999)) y Ono y colegas (Ono et al., Mol. Immunol. 36:387-395 (1999)). Los límites de las regiones marco conservadas individuales pueden asignarse utilizando el esquema de numeración IMGT, que es una adaptación del esquema de numeración de Chothia (Lefranc et al., NAR 27: 209-212 (1999); imgt.cines.fr).
Los anticuerpos con alta homología humana pueden comprender bucles hipervariables o CDR que tienen pliegues canónicos humanos o similares a los humanos, como se explica en detalle a continuación.
En una realización, al menos un bucle hipervariable o CDR en el dominio VH o en el dominio VL del anticuerpo con alta homología humana puede obtenerse o proceder de un dominio VH o VL de un anticuerpo no humano, por ejemplo, un anticuerpo convencional de una especie de Camelidae, y sin embargo presentar una estructura de pliegue canónica predicha o real que sea sustancialmente idéntica a una estructura de pliegue canónica que se produce en los anticuerpos humanos.
Está bien establecido en la técnica que, aunque las secuencias de aminoácidos primarias de los bucles hipervariables presentes tanto en los dominios VH como en los dominios VL codificados por la estirpe germinal humana son, por definición, altamente variables, todos los bucles hipervariables, excepto H3 de CDR del dominio VH, adoptan solo unas pocas conformaciones estructurales distintas, denominadas pliegues canónicos (Chothia et al., J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987); Tramontano et al. Proteins 6:382-94 (1989)), que dependen tanto de la longitud del bucle hipervariable como de la presencia de los denominados restos de aminoácidos canónicos (Chothia et al., J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). Las estructuras canónicas reales de los bucles hipervariables en los dominios VH o VL intactos se pueden determinar mediante análisis estructural (por ejemplo, cristalografía de rayos X), pero también es posible predecir la estructura canónica sobre la base de los restos de aminoácidos clave que son característicos de una estructura particular (analizado más adelante). En esencia, el patrón específico de restos que determina cada estructura canónica forma una "firma" que permite reconocer la estructura canónica en bucles hipervariables de un dominio VH o VL de estructura desconocida; por tanto, las estructuras canónicas pueden predecirse basándose únicamente en la secuencia de aminoácidos primaria.
Las estructuras de pliegue canónico predichas para los bucles hipervariables de cualquier secuencia VH o VL dada en un anticuerpo con alta homología humana pueden analizarse utilizando algoritmos que están disponibles públicamente en www.bioinf.org.uk/abs/chothia.html,www.biochem.ucl.ac.uk/martin/antibodies.html y www.bioc.unizh.ch/antibody/Sequences/Germlines/Vbase_hVk.html. Estas herramientas permiten que las secuencias de consulta de VH o VL se alineen con secuencias del dominio VH o VL humanas de estructura canónica conocida, y se haga una predicción de la estructura canónica para los bucles hipervariables de la secuencia de consulta.
En el caso del dominio VH, Los bucles H1 y H2 pueden puntuarse como teniendo una estructura de pliegue canónica "sustancialmente idéntica" a una estructura de pliegue canónica que se sabe que se produce en anticuerpos humanos si se cumple al menos el primero, y preferentemente ambos, de los siguientes criterios:
1. Una longitud idéntica, determinada por el número de restos, a la clase estructural canónica humana coincidente más cercana.
2. Al menos el 33 % de identidad, preferentemente al menos el 50 % de identidad con los restos de aminoácidos clave descritos para las clases estructurales canónicas humanas H1 y H2 correspondientes.
(cabe señalar que, para los fines del análisis anterior, los bucles H1 y H2 se tratan por separado y cada uno se compara con su clase estructural canónica humana coincidente más cercana)
El análisis anterior se basa en la predicción de la estructura canónica de los bucles H1 y H2 del anticuerpo de interés. Si se conocen las estructuras reales de los bucles H1 y H2 en el anticuerpo de interés, por ejemplo, basándose en cristalografía de rayos X, entonces los bucles H1 y H2 en el anticuerpo de interés también pueden puntuarse como si tuvieran una estructura de pliegue canónica "sustancialmente idéntica" a una estructura de pliegue canónica que se sabe que se produce en anticuerpos humanos si la longitud del bucle difiere de la clase estructural canónica humana coincidente más cercana (normalmente en ±1 o ±2 aminoácidos) pero la estructura real de los bucles H1 y H2 en el anticuerpo de interés coincide con la estructura de un pliegue canónico humano.
Los restos de aminoácidos clave encontrados en las clases estructurales canónicas humanas para el primer y segundo bucles hipervariables de los dominios VH humanos (H1 y H2) se describen en Chothia et al., J. Mol. Biol.
227:799-817 (1992. En particular, la Tabla 3 en la página 802 de Chothia et al., enumera los restos de aminoácidos preferidos en sitios clave para las estructuras canónicas de H1 que se encuentran en la estirpe germinal humana, mientras que la Tabla 4 en la página 803, enumera los restos de aminoácidos preferidos en sitios clave para las estructuras canónicas de H2 de CDR que se encuentran en la estirpe germinal humana.
En una realización, tanto H1 como H2 en el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana presentan una estructura de pliegue canónica real o predicha que es sustancialmente idéntica a una estructura de pliegue canónica que se produce en anticuerpos humanos.
Los anticuerpos con alta homología humana pueden comprender un dominio VH en el que los bucles hipervariables H1 y H2 forman una combinación de estructuras de pliegues canónicas que es idéntica a una combinación de estructuras canónicas que se sabe que se producen en al menos un dominio VH de estirpe germinal humana. Se ha observado que solo determinadas combinaciones de estructuras de pliegues canónicas en H1 y H2 se producen realmente en los dominios VH codificados por la estirpe germinal humana. En una realización, H1 y H2 en el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana pueden obtenerse de un dominio VH de una especie no humana, por ejemplo, una especie de Camelidae, sin embargo, forman una combinación de estructuras de pliegues canónicas predichas o reales que es idéntica a una combinación de estructuras de pliegues canónicas que se sabe que se producen en una estirpe germinal humana o en un dominio VH mutado somáticamente. En realizaciones no limitantes, H1 y H2 en el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana pueden obtenerse de un dominio VH de una especie no humana, por ejemplo, una especie de Camelidae, y forman una de las siguientes combinaciones de pliegues canónicos: 1-1, 1-2, 1-3, 1-6, 1-4, 2-1, 3-1 y 3-5.
Un anticuerpo con alta homología humana puede contener un dominio VH que presenta una alta identidad de secuencia/homología de secuencia con VH humano, y que contiene bucles hipervariables que presentan homología estructural con VH humano.
Puede ser ventajoso que los pliegues canónicos presentes en H1 y H2 en el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana, y la combinación de los mismos, sean "correctos" para la secuencia de la estirpe germinal de VH humano que representa la coincidencia más cercana con el dominio VH del anticuerpo con alta homología humana en términos de identidad de secuencia de aminoácidos primaria total. A modo de ejemplo, si la secuencia más cercana coincide con un dominio VH3 de la estirpe germinal humana, entonces puede ser ventajoso que H1 y H2 formen una combinación de pliegues canónicos que también se produzcan naturalmente en un dominio VH3 humano. Esto puede ser particularmente importante en el caso de anticuerpos con alta homología humana que se obtienen de especies no humanas, por ejemplo, anticuerpos que contienen dominios VH y VL que se obtienen de anticuerpos convencionales de camélido, especialmente anticuerpos que contienen dominios VH y VL de camélido humanizados.
Por tanto, en una realización, el dominio VH de un anticuerpo para IL-22R con alta homología humana puede presentar una identidad de secuencia o una homología de secuencia del 80 % o más, el 85 % o más, el 90 % o más, el 95 % o más, el 97 % o más, o hasta el 99 % o incluso el 100 % con un dominio VH humano en las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 y FR4, y además H1 y H2 en el mismo anticuerpo se obtienen de un dominio VH no humano (por ejemplo, procedentes de una especie de Camelidae), pero forman una combinación de estructuras de pliegues canónicos predichas o reales que es la misma que una combinación de pliegues canónicos que se sabe que se produce naturalmente en el mismo dominio VH humano.
En otras realizaciones, L1 y L2 en el dominio VL del anticuerpo con alta homología humana se obtienen cada uno de un dominio VL de una especie no humana (por ejemplo, un dominio VL obtenido de camélido), y cada uno presenta una estructura de pliegue canónica predicha o real que es sustancialmente idéntica a una estructura de pliegue canónico que se produce en los anticuerpos humanos.
Al igual que con los dominios VH, los bucles hipervariables de los dominios VL de los tipos VLambda y VKappa pueden adoptar un número limitado de conformaciones o estructuras canónicas, determinadas en parte por la longitud y también por la presencia de restos de aminoácidos clave en determinadas posiciones canónicas.
Dentro de un anticuerpo de interés que tiene una alta homología humana, los bucles L1, L2 y L3 obtenidos de un dominio VL de una especie no humana, por ejemplo, una especie de Camelidae, pueden puntuarse como teniendo una estructura de pliegue canónica "sustancialmente idéntica" a una estructura de pliegue canónica que se sabe que se produce en anticuerpos humanos si se cumple al menos el primero, y es preferible que ambos, de los siguientes criterios:
1. Una longitud idéntica, determinada por el número de restos, a la clase estructural humana coincidente más cercana.
2. Al menos el 33 % de identidad, preferentemente al menos el 50 % de identidad con los restos de aminoácidos clave descritos para las clases estructurales canónicas humanas L1 o L2 correspondientes, del repertorio de VLambda o VKappa.
(cabe señalar que, para los fines del análisis anterior, los bucles L1 y L2 se tratan por separado y cada uno se compara con su clase estructural canónica humana coincidente más cercana)
El análisis anterior se basa en la predicción de la estructura canónica de los bucles L1, L2 y L3 en el dominio VL del anticuerpo de interés. Si se conoce la estructura real de los bucles L1, L2 y L3, por ejemplo, basándose en cristalografía de rayos X, entonces los bucles L1, L2 y L3 obtenidos del anticuerpo de interés también pueden puntuarse como si tuvieran una estructura de pliegue canónica "sustancialmente idéntica" a una estructura de pliegue canónica que se sabe que se produce en anticuerpos humanos si la longitud del bucle difiere de la clase estructural canónica humana coincidente más cercana (normalmente en ±1 o ±2 aminoácidos) pero la estructura real de los bucles de Camelidae coincide con un pliegue canónico humano.
Los restos de aminoácidos clave encontrados en las clases estructurales canónicas humanas para las CDR de los dominios VLambda y VKappa humanos se describen en Morea et al. Methods, 20: 267-279 (2000) y Martin et al., J. Mol. Biol., 263:800-815 (1996). El repertorio estructural del dominio VKappa humano también se describe en Tomlinson et al. EMBO J. 14:4628-4638 (1995), y el del dominio VLambda en Williams et al. J. Mol. Biol., 264:220-232 (1996).
L1 y L2 en el dominio VL de un anticuerpo con alta homología humana pueden formar una combinación de estructuras de pliegue canónicas predichas o reales, que es idéntica a una combinación de estructuras de pliegue canónica que se sabe que se produce en un dominio VL de la estirpe germinal humana. En realizaciones no limitantes, L1 y L2 en el dominio VLambda de un anticuerpo con alta homología humana (por ejemplo, un anticuerpo que contiene un dominio VL obtenido de camélido o una variante humanizada del mismo) puede formar una de las siguientes combinaciones de pliegues canónicos: 11-7, 13-7(A,B,C), 14-7(A,B), 12-11, 14-11 y 12-12 (como se define en Williams et al. J. Mol. Biol. 264:220 -32 (1996) y como se muestra en http://www.bioc.uzh.ch/antibody/Sequences/Germlines/VBase_hVL.html). En realizaciones no limitantes, L1 y L2 en el dominio Vkappa pueden formar una de las siguientes combinaciones de pliegues canónicos: 2-1, 3-1, 4-1 y 6-1 (como se define en Tomlinson et al. EMBO J. 14:4628-38 (1995) y como se muestra en http://www.bioc.uzh.ch/antibody/Sequences/Germlines/VBase_hVK.html).
En una realización adicional, los tres de L1, L2 y L3 en el dominio VL de un anticuerpo con alta homología humana pueden presentar una estructura sustancialmente humana. Se prefiere que el dominio VL del anticuerpo con alta homología humana presente una alta identidad de secuencia/homología de secuencia con VL humana y también que los bucles hipervariables en el dominio VL presenten homología estructural con VL humana.
En una realización, el dominio VL de un anticuerpo para IL-22R con alta homología humana puede presentar una identidad de secuencia del 80 % o más, el 85 % o más, el 90 % o más, el 95 % o más, el 97 % o más, o hasta el 99 % o incluso el 100 % con un dominio VL humano en las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 y FR4, y además el bucle hipervariable L1 y el bucle hipervariable L2 pueden formar una combinación de estructuras de pliegues canónicos predichas o reales que es lo mismo que una combinación de pliegues canónicos que se sabe que se produce naturalmente en el mismo dominio VL humano.
Por supuesto, está previsto que los dominios VH que presentan alta identidad de secuencia/homología de secuencia con VH humano, y también homología estructural con bucles hipervariables de VH humano se combinarán con dominios VL que presenten alta identidad de secuencia/homología de secuencia con VL humano, y también homología estructural con bucles hipervariables de VL humano para proporcionar anticuerpos con alta homología humana que contengan emparejamientos VH/VL (por ejemplo, emparejamientos VH/VL obtenidos de camélido) con una máxima homología de secuencia y estructural con emparejamientos VH/VL codificados por humanos.
"scFv" o "fragmento scFv" - Un scFv o fragmento scFv significa un fragmento variable monocatenario. Un scFv es una proteína de fusión de un dominio VH y un dominio VL de un anticuerpo conectados a través de un enlazador. B. Anticuerpos para IL-22R
La presente invención se refiere a anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que se unen específicamente a IL-22R humano. Los anticuerpos para IL-22R y los fragmentos de anticuerpo descritos en el presente documento poseen propiedades, en particular combinaciones de propiedades distintas, que son distintas y en determinados casos superiores, a las de los anticuerpos para IL-22R de la técnica anterior. Estas propiedades y características se describirán ahora con más detalle.
Epítopos de IL-22R
Los anticuerpos para IL-22R y los fragmentos de unión a antígeno de la presente invención se unen a un epítopo dentro de la proteína IL-22R humana que no incluye el resto de aminoácido tirosina 60 (Tyr60 o Y60), donde esta posición de aminoácido se define con referencia a la secuencia de IL-22R mostrada en la Figura 2 (SEQ ID NO: 71). Este resto de IL-22R expuesto en superficie se ha identificado previamente como crucial para la unión del ligando, y como se informa en el presente documento (véase, en particular, el Ejemplo 8), el anticuerpo para IL-22R de la técnica anterior 280.346.TSY (como se describe en el documento WO2011/061119) se une a un epítopo que incluye este resto. Los anticuerpos para IL-22R y los fragmentos de unión a antígeno de la presente invención se unen sorprendentemente a un epítopo que no incluye este resto crucial y, sin embargo, en determinadas realizaciones, son capaces de bloquear la unión de IL-22 y/o de inhibir la señalización mediada por IL-22 y/o IL-20 a través de IL-22R.
La interfaz de unión entre el dominio extracelular de IL-22R y su ligando IL-22 se caracteriza en Jones et al. (Structure 16(9): 1333-1344 (2008)). El dominio extracelular de IL-22R consiste en cinco bucles (L2-L6), determinados restos de los cuales son cruciales para mediar interacciones con restos expuestos en la superficie del ligando de IL-22. La tirosina 60 se ubica dentro del bucle L2 formado por restos en el dominio D1 de la proteína IL-22R. En el complejo IL-22/IL-22R soluble, el resto Tyr60 se inserta en una pequeña cavidad en IL-22 creada dentro del sitio 1a del ligando. Más específicamente, esta cavidad se crea en la intersección de la hélice F y el bucle AB, dos estructuras secundarias distintas que se encuentran en el ligando IL-22. Los restos de la hélice F Lys162 y Glu166 en el ligando forman enlaces de hidrógeno al OH de la Tyr60 de IL-22R y, por tanto, la Tyr60 es un resto clave que media la interacción entre el sitio 1a del ligando y el dominio D1 del receptor.
Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno descritos en el presente documento se unen a un epítopo que no incluye a la Tyr60. Como se señaló anteriormente, la Tyr60 se ubica dentro del bucle L2 en el dominio D1 del receptor. En determinadas realizaciones, el epítopo al que se unen los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno se ubica al menos en parte en el dominio D2 de IL-22R, es decir, entre los restos 125 y 228 de la SEQ ID NO: 71. En determinadas realizaciones, el epítopo al que se unen los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión al antígeno comprende al menos uno, al menos dos, al menos tres restos de aminoácidos ubicados dentro del dominio D2 de la proteína IL-22R.
Los inventores creen que el hecho de que los anticuerpos y los fragmentos de unión a antígeno de la presente invención se unan a un epítopo que no incluye la Tyr60 es importante para su modo de acción. Se cree que los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos interactúan con el dominio D2 de IL22R, en lugar de o además de interactuar con el dominio D1. Se sabe que el dominio D2 de IL-22R está implicado en la interacción con el correceptor. Sin desear quedar ligados a teoría alguna, los inventores creen que las moléculas de anticuerpo de la presente invención pueden tener un modo de acción doble, previniendo la unión al ligando y previniendo la interacción con el correceptor.
El epítopo al que se unen los anticuerpos o los fragmentos de unión a antígeno de la invención puede ser un epítopo lineal (es decir, un epítopo que consiste en una secuencia lineal de aminoácidos dentro del antígeno diana) o un epítopo conformacional (es decir, un epítopo que consiste en aminoácidos que son no necesariamente contiguo en el antígeno diana).
Afinidad de unión
En determinadas realizaciones, los anticuerpos y los fragmentos de unión a antígeno de la invención se unen a IL-22R humano con alta afinidad.
Como se usa en el presente documento, la expresión "afinidad" o "afinidad de unión" debe entenderse basándose en el significado habitual en la técnica en el contexto de unión del anticuerpo, y refleja la fuerza y/o la estabilidad de la unión entre un antígeno y un sitio de unión en un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo.
La afinidad de unión de un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo por su antígeno respectivo puede determinarse experimentalmente utilizando técnicas conocidas en la técnica. Por ejemplo, los instrumentos de BIACORE miden la afinidad basándose en la inmovilización de una proteína o antígeno diana en un chip biosensor mientras el anticuerpo o fragmento de anticuerpo pasa sobre la diana inmovilizada en condiciones de flujo específicas. Estos experimentos producen mediciones de la kon y la koff, que se puede traducir en valores de Kd , donde Kd es la constante de equilibrio para la disociación de un antígeno con un anticuerpo o fragmento del mismo. Cuanto menor es el valor de Kd , más fuerte será la interacción de unión entre un anticuerpo y su antígeno diana. Como se señaló anteriormente, la afinidad de un anticuerpo puede determinarse mediante Biacore, por ejemplo, utilizando el protocolo descrito en otra parte en el presente documento (véase el Ejemplo 6). La afinidad del anticuerpo o del fragmento de unión al antígeno por e IL-22R humano, medida mediante Biacore, puede determinarse utilizando una construcción de IL-22R recombinante de longitud completa, como se describe, por ejemplo, en los Ejemplos 3 y 6.
Los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención pueden presentar una constante de disociación (koff) para IL-22R de menos de 2 x 10"3 s"1, de menos de 1,5 x 10"3 s"1, de menos de 1,2 x 10"3s-1, cuando se prueban como mAb, por ejemplo, cuando se prueba la afinidad de un dominio variable de cadena pesada emparejado con un dominio variable de cadena ligera en el contexto de una molécula de IgG1. En realizaciones preferidas, los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención presentan una constante de disociación (koff) para IL-22R de menos de 2,5 x 10"4 s"1, preferentemente, de menos de 1,5 x 10"4 s"1, más preferentemente, de menos de 1 x 10"4s-1, cuando se prueban como mAb, por ejemplo, cuando se prueba la afinidad de un dominio variable de cadena pesada emparejado con un dominio variable de cadena ligera en el contexto de una molécula de IgG1.
Los anticuerpos para IL-22R o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención pueden presentar una constante de disociación (koff) para IL-22R en el intervalo de 1 x 10"6 s"1 a 2 x 10"3 s"1, preferentemente en el 6 1 4 1 5 1 4 1intervalo de 1 x 10' s' a 2,5 x 10' s' , más preferentemente en el intervalo de 1 x 10' s' a 1 x 10' s' .
Los anticuerpos para IL"22R o fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención pueden presentar un valor de Kd de menos de 3 x 10"9 M, de menos de 2,5 x 10'M, de menos de 1 x 10"9 M. En realizaciones preferidas, los anticuerpos para IL"22R o fragmentos de unión a antígeno de los mismos de la invención presentan un valor de Kd de menos de 5 x 10"10 M, preferentemente, de menos de 2 x 10"10 M, preferentemente, de menos de 1,5 x 10" 10 M.
Inhibición de la unión de IL-22 e IL-20 y señalización aguas abajo
En determinadas realizaciones, los anticuerpos y los fragmentos de unión a antígeno de la invención se unen a IL~ 22R humano e inhiben la unión del ligando a este receptor. Esto es particularmente sorprendente dado que los anticuerpos descritos en el presente documento se unen a un epítopo que no incluye la Tyr60. Como se ha descrito anteriormente, la Tyr60 se ha identificado como un resto crucial para la unión del ligando y, por lo tanto, los anticuerpos para IL"22R y los fragmentos de unión al antígeno de la presente invención son sorprendentes por su capacidad para inhibir la unión del ligando y, en determinadas realizaciones, inhiben la señalización aguas abajo de IL"22R.
Los anticuerpos y los fragmentos de unión a antígeno pueden unirse a IL-22R humano e inhibir la unión de IL-22 o inhibir la unión de IL-20. Preferentemente, los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno descritos en el presente documento inhiben la unión de IL-22 e IL-20 al IL-22R.
La unión del ligando a IL-22R en células que expresan el correceptor IL-10R2 o IL-20R2 induce un cambio conformacional en el complejo receptor de manera que se activan las rutas de señalización aguas abajo del receptor. Los anticuerpos o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos como se describe en el presente documento pueden inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-22 o pueden inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-20. Como se usa en el presente documento, la expresión "activación de IL-22R dependiente de IL-22" debe entenderse como la cadena de sucesos de señalización que se producen aguas abajo del complejo receptor IL-22R tras la unión del ligando IL-22 al complejo IL-22R/IL-10R2. Como se usa en el presente documento, la expresión "activación de IL-22R dependiente de IL-20" debe entenderse como la cadena de sucesos de señalización que se producen aguas abajo del complejo receptor IL-22R tras la unión del ligando IL-20 al complejo IL-22R/IL-20R2.
La activación de IL-22R dependiente de IL-22 puede medirse en células o líneas celulares que expresan tanto IL-22R como el correceptor IL-10R2, por ejemplo, la línea celular BW-hIL-22R descrita en Dumoutier et al. J Biol Chem.
25 de septiembre de 2009; 284(39): 26377-84. IL-22 induce la detención del crecimiento en la línea celular BW-hIL-22R y, por lo tanto, la activación de IL-22R dependiente de IL-22 puede determinarse en esta línea celular midiendo la proliferación de células BW-hIL-22R, por ejemplo, como se describe en el Ejemplo 6. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno descritos en el presente documento presentan un CI 50 (concentración a la que se logra el 50 % de inhibición de la activación) en un ensayo de proliferación basado en células dependiente de IL-22 de menos de 650 pM, preferentemente de menos de 600 pM. El ensayo de proliferación basado en células es preferentemente un ensayo que implica a la línea celular BW-hIL-22R como se describe en el presente documento.
La activación de IL-22R dependiente de IL-20 puede medirse en células o líneas celulares que expresan tanto IL-22R como el correceptor IL-20R2, por ejemplo, la línea celular Baf3-hIL-22R/IL20Rb descrita en el presente documento y también en Dumoutier et al. J Biol Chem. 25 de septiembre de 2009; 284(39): 26377-84. IL-20 induce la proliferación en la línea celular Baf3-hIL-22R/IL20Rb y, por lo tanto, la activación de IL-22R dependiente de IL-20 puede determinarse en esta línea celular midiendo la proliferación de células Baf3-hIL-22R/IL20Rb, por ejemplo, como se describe en el Ejemplo 6. En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno descritos en el presente documento presentan un CI50 (concentración a la que se logra el 50 % de inhibición de la activación) en un ensayo de proliferación basado en células dependiente de IL-20 de menos de 1 nM, preferentemente de menos de 800 pM. El ensayo de proliferación basado en células es preferentemente un ensayo que implica a la línea celular Baf3-hIL-22R/IL20Rb como se describe en el presente documento.
Además de los ensayos de proliferación descritos anteriormente, la activación de IL-22R dependiente de IL-22 y/o IL-20 puede medirse utilizando ensayos celulares alternativos, por ejemplo, un ensayo de fosforilación de STAT3 como se describe en el documento WO2011/061119.
Los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de la presente invención se unen a IL-22R humano e inhiben la activación de IL-22R dependiente de IL-22 y la activación de IL-22R dependiente de IL-20. La actividad inhibidora o "neutralizante" de los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno son equipotentes para la activación dependiente de IL-22 e IL-20. En otros ejemplos descritos en el presente documento, la actividad inhibidora o neutralizante de los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno puede ser mayor para la activación de IL-22R mediada por uno de los ligandos en comparación con la activación de IL-22R mediada por el otro ligando. En determinados ejemplos, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de la invención presentarán una actividad inhibidora más potente para la activación de IL-22R dependiente de IL-22 en comparación con la activación de IL-22R dependiente de IL-20. Sin embargo, en tales ejemplos, la actividad inhibidora del anticuerpo o del fragmento de unión a antígeno para la activación de IL-22R dependiente de IL-22 será normalmente menos de 5 veces, preferentemente menos de 4 veces mayor, más preferentemente menos de 2 veces mayor que la actividad inhibidora del anticuerpo o fragmento de unión a antígeno para la activación de IL-22R dependiente de IL-20.
Reactividad cruzada
En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno descritos en el presente documento que se unen a IL-22R humano pueden reaccionar de forma cruzada con una o más especies homólogas de IL-22R, por ejemplo, homólogos de IL-22R de origen en primate.
En determinadas realizaciones, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de la presente invención no reaccionan de forma cruzada con IL-22R murino. De forma alternativa o adicional, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno pueden unirse a uno o más homólogos de IL-22R de origen en primate, por ejemplo, las proteínas IL-22R de monos rhesus y cinomolgos. La reactividad cruzada con homólogos de otras especies puede ser particularmente ventajosa en el desarrollo y análisis de anticuerpos terapéuticos. Por ejemplo, el análisis preclínico de toxicología de anticuerpos terapéuticos se lleva a cabo con frecuencia en especies de primate, incluidos, entre otros, monos rhesus y cinomolgos. Por lo tanto, la reactividad cruzada con estos homólogos de especies puede ser particularmente ventajosa para el desarrollo de anticuerpos como candidatos clínicos.
Anticuerpos obtenidos de camélido
En determinadas realizaciones de la invención, los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos descritos en el presente documento pueden comprender al menos un bucle hipervariable o región determinante de complementariedad obtenida de un dominio VH o un dominio VL de una especie de la familia Camelidae. En particular, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno puede comprender dominios VH y/o VL, o las CDR de los mismos, obtenidos por inmunización activa de camélidos exogámicos, por ejemplo llamas, con un antígeno IL-22R o un fragmento del mismo.
Por "bucle hipervariable o región determinante de complementariedad obtenida de un dominio VH o un dominio VL de una especie de la familia Camelidae" se entiende que el bucle hipervariable (HV) o CDR tiene una secuencia de aminoácidos que es idéntica o sustancialmente idéntica, a la secuencia de aminoácidos de un bucle hipervariable o CDR que está codificado por un gen de inmunoglobulina de Camelidae. En este contexto, "gen de inmunoglobulina" incluye genes de estirpe germinal, genes de inmunoglobulina que han experimentado un reordenamiento y también genes mutados somáticamente. Por tanto, la secuencia de aminoácidos del HV o CDR obtenida de un dominio VH o VL de una especie de Camelidae puede ser idéntica a la secuencia de aminoácidos de un HV o CDR presente en un anticuerpo convencional maduro de Camelidae. La expresión "obtenido de" en este contexto implica una relación estructural, en el sentido de que los HV o las CDR del anticuerpo para IL-22R incorporan una secuencia de aminoácidos (o variantes menores de la misma) que originalmente estaba codificada por un gen de inmunoglobulina de Camelidae. Sin embargo, esto no implica necesariamente una relación particular en términos del procedimiento de producción utilizado para preparar el anticuerpo para IL-22R.
Los anticuerpos para IL-22R obtenidos de camélido pueden obtenerse de cualquier especie de camélido, incluyendo, entre otros, llama, dromedario, alpaca, vicuña, guanaco o camello.
Los anticuerpos para IL-22R que comprenden dominios VH y VL obtenidos de camélido, o CDR de los mismos, son normalmente polipéptidos expresados de forma recombinante y pueden ser polipéptidos quiméricos. La expresión "polipéptido quimérico" se refiere a un polipéptido artificial (que no es de origen natural) que se crea por yuxtaposición de dos o más fragmentos peptídicos que de lo contrario no se encuentran contiguos. En esta definición se incluyen polipéptidos quiméricos de "especies" creados por yuxtaposición de fragmentos peptídicos codificados por dos o más especies, por ejemplo, camélido y ser humano.
Las CDR obtenidas de camélido pueden comprender una de las secuencias de CDR mostradas como las SEQ ID NO: 6 y 13 (CDR3 de cadena pesada), o las SEQ ID NO: 4 y 11 (CDR2 de cadena pesada) o las SEQ ID NO: 2 y 9 (CDR1 de cadena pesada), o una de las secuencias de CDR mostradas como las SEQ ID NO: 20 y 27 (CDR3 de cadena ligera), o las SEQ ID NO: 18, 25 y 47 (CDR2 de cadena ligera), o las SEQ ID NO: 16 y 23 (c Dr 1 de cadena ligera).
En una realización, el dominio VH completo y/o el dominio VL completo pueden obtenerse de una especie de la familia Camelidae. En ejemplos específicos, el dominio VH obtenido de camélido puede comprender la secuencia de aminoácidos seleccionada de las SEQ ID NO: 29 y 31, mientras que el dominio VL obtenido de camélido puede comprender una secuencia de aminoácidos seleccionada de las SEQ ID NO: 30, 32 y 62. El dominio VH obtenido de camélido y/o el dominio VL obtenido de camélido pueden luego someterse a ingeniería de proteínas, en la que se introducen una o más sustituciones, inserciones o deleciones de aminoácidos en la secuencia de aminoácidos de camélido. Estos cambios diseñados técnicamente incluyen preferentemente sustituciones de aminoácidos con respecto a la secuencia de camélido. Dichos cambios incluyen "humanización" o "modificaciones de estirpe germinal (germlining)" donde uno o más restos de aminoácidos en un dominio VH o VL codificado por camélido se reemplazan por restos equivalentes de un dominio VH o VL homólogo codificado por ser humano. En determinados ejemplos, el dominio VH obtenido de camélido puede presentar al menos el 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % de identidad con la secuencia de aminoácidos mostrada como las SEQ ID NO: 29 o 31. De forma alternativa o adicional, el dominio VL obtenido de camélido puede presentar al menos el 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % de identidad con la secuencia de aminoácidos mostrada como las SEQ ID NO: 30, 32 o 62.
Los dominios VH y VL de camélido aislados obtenidos por inmunización activa de un camélido (por ejemplo, llama) con un antígeno IL-22R humano pueden utilizarse como base para el diseño técnico de polipéptidos de unión a antígeno de acuerdo con la invención. Partiendo de los dominios VH y VL de camélido intactos, es posible diseñar técnicamente una o más sustituciones, inserciones o deleciones de aminoácidos que se apartan de la secuencia inicial de camélido. En determinadas realizaciones, tales sustituciones, inserciones o deleciones pueden estar presentes en las regiones marco conservadas del dominio VH y/o del dominio VL. El fin de tales cambios en la secuencia de aminoácidos primaria puede ser reducir propiedades presuntamente desfavorables (por ejemplo, inmunogenicidad en un hospedador humano (la denominada humanización), sitios de potencial heterogeneidad o inestabilidad del producto (glucosilación, desamidación, isomerización, etc.) o para potenciar alguna otra propiedad favorable de la molécula (por ejemplo, solubilidad, estabilidad, biodisponibilidad, etc.). En otras realizaciones, los cambios en la secuencia de aminoácidos primaria pueden diseñarse técnicamente en uno o más de los bucles hipervariables (o CDR) de un dominio VH y/o VL de Camelidae obtenido mediante inmunización activa. Dichos cambios pueden introducirse para potenciar la afinidad y/o la especificidad de unión al antígeno, o para reducir propiedades presuntamente desfavorables, por ejemplo, la inmunogenicidad en un hospedador humano (denominada humanización), sitios de potencial heterogeneidad o inestabilidad del producto, glucosilación, desamidación, isomerización, etc.) o para potenciar alguna otra propiedad favorable de la molécula, por ejemplo, solubilidad, estabilidad, biodisponibilidad, etc.
Por tanto, en una realización, la invención proporciona un anticuerpo para IL-22R variante que contiene al menos una sustitución de aminoácido en al menos una región marco conservada o CDR del dominio VH o del dominio VL en comparación con un dominio VH o VL obtenido de camélido. Los ejemplos descritos en el presente documento incluyen, pero sin limitación, los dominios VH de camélido que comprenden las secuencias de aminoácidos mostradas como las SEQ ID NO: 29 y 31, y los dominios VL de camélido que comprenden las secuencias de aminoácidos mostradas como las SEQ ID NO: 30, 32 o 62.
En otras realizaciones, se proporcionan moléculas de anticuerpos "quiméricas" que comprenden dominios VH y VL obtenidos de camélido (o variantes diseñadas técnicamente de los mismos) y uno o más dominios constantes de un anticuerpo que no es de camélido, por ejemplo, dominios constantes codificados por ser humano (o variantes técnicamente diseñadas de los mismos). En tales realizaciones, se prefiere que tanto el dominio VH como el dominio VL se obtengan de la misma especie de camélido, por ejemplo, tanto el VH como el VL pueden ser de Lama glama o tanto el VH como el VL pueden ser de Lama pacos (antes de la introducción de la variación de la secuencia de aminoácidos diseñada técnicamente). En tales realizaciones, tanto el dominio VH como el VL pueden obtenerse de un único animal, particularmente un único animal que se ha inmunizado activamente con un antígeno IL-22R.
Como alternativa a los cambios diseñados técnicamente en la secuencia de aminoácidos primaria de los dominios VH y/o VL de Camelidae, pueden aislarse bucles hipervariables o CDR individuales obtenidos de camélido, o combinaciones de los mismos, de los dominios VH/VL de camélido y transferirse a un armazón alternativo (es decir, no de Camelidae), por ejemplo, un armazón de VH/VL humano, mediante injerto de CDR. En ejemplos particulares, las CDR obtenidas de camélido pueden seleccionarse de las CDR que tienen las secuencias de aminoácidos que se muestran como las SEQ ID NO: 6 y 13 (CDR3 de cadena pesada), o las SEQ ID NO: 4 y 11 (CDR2 de cadena pesada) o las SEQ ID NO: 2 y 9 (CDR1 de cadena pesada), o una de las secuencias de c Dr mostradas como las SEQ ID NO: 20 y 27 (CDR3 de cadena ligera), o las SEQ ID NO: 18, 25 y 47 (CDR2 de cadena ligera) o las SEQ ID NO:16 y 23 (Cd R1 de cadena ligera).
Los anticuerpos para IL-22R que comprenden dominios VH y VL obtenidos de camélido, o CDR de los mismos, pueden adoptar diversas realizaciones distintas en que está presente tanto un dominio VH como un dominio VL. El término "anticuerpo" en el presente documento se usa en el sentido más amplio y abarca, pero sin limitación, anticuerpos monoclonales (incluyendo anticuerpos monoclonales de longitud completa), anticuerpos policlonales, anticuerpos multiespecíficos (por ejemplo, anticuerpos biespecíficos), siempre que presenten la especificidad inmunológica apropiada para una proteína IL-22R. La expresión "anticuerpo monoclonal" como se usa en el presente documento se refiere a un anticuerpo obtenido a partir de una población de anticuerpos sustancialmente homogénea, es decir, los anticuerpos individuales que comprenden la población son idénticos salvo por las posibles mutaciones de origen natural que pueden estar presentes en cantidades menores. Los anticuerpos monoclonales son altamente específicos, estando dirigidos contra un único sitio antigénico. Adicionalmente, en contraste con las preparaciones de anticuerpos convencionales (policlonales) que normalmente incluyen distintos anticuerpos dirigidos contra distintos determinantes (epítopos) en el antígeno, cada anticuerpo monoclonal está dirigido contra un único determinante o epítopo en el antígeno.
Los "fragmentos de anticuerpo" comprenden una porción de un anticuerpo de longitud completa, en general el dominio de unión a antígeno o variable del mismo. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpo incluyen fragmentos Fab, Fab', F(ab')2, Fab biespecíficos y Fv, diacuerpos, anticuerpos lineales, moléculas de anticuerpo monocatenarios, un fragmento variable monocatenario (scFv) y anticuerpos multiespecíficos formados por fragmento de anticuerpo (véase Holliger y Hudson, Nature Biotechnol. 23:1126-36 (2005)).
En realizaciones no limitantes, Los anticuerpos para IL-22R que comprenden dominios VH y VL obtenidos de camélido, o CDR de los mismos, puede comprender dominios CH1 y/o dominios CL, cuya secuencia de aminoácidos es completa o sustancialmente humana. Cuando el polipéptido de unión a antígeno de la invención es un anticuerpo destinado a uso terapéutico en humanos, es típico que la región constante completa del anticuerpo, o al menos una parte de la misma, tenga una secuencia de aminoácidos completa o sustancialmente humana. Por lo tanto, uno o más o cualquier combinación del dominio CH1, la región bisagra, el dominio CH2, el dominio CH3 y el dominio CL (y el dominio CH4 si está presente) pueden ser completa o sustancialmente humanos con respecto a su secuencia de aminoácidos.
Ventajosamente, el dominio CH1, la región bisagra, el dominio CH2, el dominio CH3 y el dominio CL (y el dominio CH4 si está presente) pueden tener todos una secuencia de aminoácidos completa o sustancialmente humana. En el contexto de la región constante de un anticuerpo humanizado o quimérico, o un fragmento de anticuerpo, la expresión "sustancialmente humano" se refiere a una identidad de secuencia de aminoácidos de al menos el 90 %, o al menos el 92 %, o al menos el 95 % o al menos el 97 %, o al menos el 99 % con una región constante humana. La expresión "secuencia de aminoácidos humana", en este contexto, se refiere a una secuencia de aminoácidos que está codificada por un gen de inmunoglobulina humana, que incluye genes de la estirpe germinal, reordenados y con mutaciones somáticas. La invención también contempla polipéptidos que comprenden dominios constantes de secuencia "humana" que se han alterado, por una o más adiciones, deleciones o sustituciones de aminoácidos con respecto a la secuencia humana, excepto las realizaciones en que se precisa expresamente la presencia de una región bisagra "completamente humana".
La presencia de una región bisagra "completamente humana" en los anticuerpos para IL-22R de la invención puede ser beneficiosa tanto para reducir al mínimo la inmunogenicidad como para optimizar la estabilidad del anticuerpo. Como se analiza en otra parte en el presente documento, se contempla que puedan hacerse una o más sustituciones, inserciones o deleciones de aminoácidos dentro de la región constante de la cadena pesada y/o ligera, particularmente dentro de la región Fc. Las sustituciones de aminoácido pueden dar como resultado el reemplazo del aminoácido sustituido por un aminoácido de origen natural distinto, o por un aminoácido no natural o modificado. También están permitidas otras modificaciones estructurales, tales como, por ejemplo, cambios en el patrón de glucosilación (por ejemplo, mediante adición o deleción de sitios de glucosilación unidos en N u O). Dependiendo del uso pretendido del anticuerpo del anticuerpo, puede ser conveniente modificar el anticuerpo de la invención con respecto a sus propiedades de unión a receptores Fc, por ejemplo, para modular la función efectora. Por ejemplo, pueden introducirse un resto (o restos) de cisteína en la región Fc, permitiendo así la formación de enlaces disulfuro intercatenarios en esta región. El anticuerpo homodimérico así generado puede tener una capacidad de internalización mejorada y/o una destrucción de células mediada por el complemento y una citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC, forma siglada de antibody-dependent cellular cytotoxicity) aumentadas. Véase Caron et al., J. Exp. Med. 176:1191 -1195 (1992) y Shopes, B. J. Immunol. 148:2918-2922 (1992). Además, en el presente documento se describen inmunoconjugados que comprenden un anticuerpo como se describe en el presente documento conjugado con un agente citotóxico tal como un agente quimioterapéutico, una toxina (por ejemplo, una toxina enzimáticamente activa de origen bacteriano, fúngico, vegetal o animal, o fragmentos de la misma) o un isótopo radiactivo (es decir, un radioconjugado). Las regiones Fc también pueden diseñarse técnicamente para prolongar la semivida, como lo describen Chan y Carter, Nature Reviews: Immunology, Vol. 10, pág. 301-316, 2010.
En otra realización más, se modifica la región Fc para aumentar la capacidad del anticuerpo para mediar la citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) y/o para aumentar la afinidad del anticuerpo por un receptor Fcy modificando uno o más aminoácidos. En realizaciones alternativas, la región Fc puede diseñarse técnicamente de manera que no haya función efectora. Un anticuerpo para IL-22R que no tiene función efectora de Fc puede ser particularmente útil como agente bloqueante del receptor. En determinadas realizaciones, los anticuerpos de la invención pueden tener una región Fc obtenida de isotipos de IgG de origen natural que tienen una función efectora reducida, por ejemplo, de IgG4. Las regiones Fc obtenidas de IgG4 pueden modificarse adicionalmente para aumentar la utilidad terapéutica, por ejemplo, mediante la introducción de modificaciones que reducen al mínimo el intercambio de brazos entre moléculas de IgG4 in vivo.
En aún otra realización, se modifica la glucosilación de un anticuerpo. Por ejemplo, puede prepararse un anticuerpo aglucosilado (es decir, el anticuerpo carece de glucosilación). La glucosilación se puede alterar para, por ejemplo, aumentar la afinidad del anticuerpo por el antígeno diana. Dichas modificaciones de hidratos de carbono pueden conseguirse por; por ejemplo, la alteración de uno o más sitios de glucosilación dentro de la secuencia del anticuerpo. Por ejemplo, pueden realizarse una o más sustituciones de aminoácidos que den como resultado la eliminación de uno o más sitios de glucosilación del armazón de la región variable para eliminar así la glucosilación en este sitio. Dicha aglucosilación puede aumentar la afinidad del anticuerpo por el antígeno.
Además, se contemplan anticuerpos para IL-22R variantes que tienen un tipo alterado de glucosilación, tal como un anticuerpo hipofucosilado que tiene cantidades reducidas de restos de fucosilo o un anticuerpo total o parcialmente desfucosilado (como describen Natsume et al., Drug Design Development and Therapy, Vol. 3, pág. 7-16, 2009) o un anticuerpo que tiene estructuras GlcNac bisectadas aumentadas. Se ha demostrado que tales patrones de glucosilación alterada aumentan la capacidad de ADCC de los anticuerpos, produciendo normalmente una potenciación de 10 veces de la ADCC con respecto a un anticuerpo equivalente que comprende un dominio Fc humano "nativo". Dichas modificaciones de hidratos de carbono pueden llevarse a cabo, por ejemplo, expresando el anticuerpo en una célula hospedadora con maquinaria enzimática de glucosilación alterada (como describen Yamane-Ohnuki y Satoh, mAbs 1:3, 230-236, 2009). Los ejemplos de anticuerpos no fucosilados con función de ADCC potenciada son los producidos utilizando la tecnología Potelligent™ de BioWa Inc.
La invención puede, en determinadas realizaciones, abarcan anticuerpos de Camelidae/ser humano quiméricos y, en particular, anticuerpos quiméricos en que los dominios VH y VL son de secuencia completamente de camélido (por ejemplo, llama o alpaca) y el resto del anticuerpo es de secuencia completamente de ser humano. Los anticuerpos para IL-22R pueden incluir anticuerpos que comprenden variantes "humanizadas" o "con modificaciones de estirpe germinal" de dominios VH y VL obtenidos de camélido, o CDR de los mismos, y anticuerpos quiméricos de camélido/ser humano, en que los dominios VH y VL contienen una o más sustituciones de aminoácidos en las regiones marco conservadas en comparación con los dominios VH y VL de camélido obtenidos por inmunización activa de un camélido con un antígeno IL-22R o un fragmento del mismo. Dicha "humanización" aumenta el % de identidad de secuencia con los dominios VH o VL de la estirpe germinal humana reemplazando restos de aminoácidos no coincidentes en un dominio VH o VL de Camelidae de partida por el resto equivalente encontrado en un dominio VH o VL codificado por la estirpe germinal humana. Los anticuerpos para IL-22R también pueden ser anticuerpos injertados con CDR en que las CDR (o bucles hipervariables) obtenidas de un anticuerpo de camélido, o codificadas de otro modo por un gen de camélido, se injertan en un armazón de VH y VL humanos, siendo el resto del anticuerpo también de origen completamente humano. Dichos anticuerpos para IL-22R injertados con CDR pueden contener CDR que tienen las secuencias de aminoácidos mostradas como las SEQ ID NO: 6 y 13 (CDR3 de cadena pesada), o las SEQ ID NO: 4 y 11 (CDR2 de cadena pesada) o las SEQ ID NO: 2 y 9 (CDR1 de cadena pesada), o una de las secuencias de CDR mostradas como las SEQ ID NO: 20 y 27 (CDR3 de cadena ligera), o las SEQ ID NO: 18, 25 y 47 (CDR2 de cadena ligera) o las SEQ ID NO:16 y 23 (CDR1 de cadena ligera).
Los anticuerpos humanizados, quiméricos e injertados con CDR para IL-22R, como se describe anteriormente, particularmente anticuerpos que comprenden bucles hipervariables o CDR obtenidas de la inmunización activa de camélidos, pueden producirse fácilmente utilizando técnicas convencionales de manipulación y expresión de ADN recombinante, haciendo uso de células hospedadoras procarióticas y eucarióticas diseñadas técnicamente para producir el polipéptido de interés y que incluyen, pero sin limitación, células bacterianas, células de levadura, células de mamífero, células de insecto, células vegetales, algunas de ellas como se describen en el presente documento y se ilustran en los ejemplos adjuntos.
Los anticuerpos para IL-22R obtenidos de camélido incluyen variantes donde el bucle (o bucles) hipervariable o la CDR (o las CDR) del dominio VH y/o el dominio VL se obtienen a partir de un anticuerpo de camélido convencional generado contra IL-22R humano, pero donde al menos uno de dichos bucles o CDR hipervariables (obtenidos de camélido) se ha diseñado técnicamente para incluir una o más sustituciones, adiciones o deleciones de aminoácidos con respecto a la secuencia codificada por camélido. Dichos cambios incluyen la "humanización" de los bucles/CDR hipervariables. Los HV/CDR obtenidos de camélido que se han diseñado técnicamente de esta manera todavía pueden presentar una secuencia de aminoácidos que es "sustancialmente idéntica" a la secuencia de aminoácidos de un HV/CDR codificado por camélido. En este contexto, la "identidad sustancial" puede permitir no más de una, o no más de dos faltas de coincidencia de secuencia de aminoácidos con el HV/c Dr codificado por camélido. Los ejemplos particulares del anticuerpo para IL-22R pueden contener variantes humanizadas de las secuencias de CDR mostradas como las SEQ ID NO: 6 y 13 (CDR3 de cadena pesada), o las SEQ ID NO: 4 y 11 (CDR2 de cadena pesada) o las SEQ ID NO: 2 y 9 (CDR1 de cadena pesada), o una de las secuencias de c Dr mostradas como las SEQ ID NO: 20 y 27 (CDR3 de cadena ligera), o las SEQ ID NO: 18, 25 y 47 (CDR2 de cadena ligera) o las SEQ ID NO:16 y 23 (Cd R1 de cadena ligera).
Los anticuerpos para IL-22R obtenidos de camélido proporcionados en el presente documento pueden ser de cualquier isotipo. Los anticuerpos destinados al uso terapéutico en humanos serán normalmente del tipo IgA, IgD, IgE IgG, IgM, a menudo del tipo IgG, en cuyo caso pueden pertenecer a cualquiera de las cuatro subclases IgG1, IgG2a y b, IgG3 o IgG4. Dentro de cada una de estas subclases se permite realizar una o más sustituciones, inserciones o eliminaciones de aminoácidos dentro de la porción Fc, o para realizar otras modificaciones estructurales, por ejemplo, para potenciar o reducir las funcionalidades dependientes del Fc.
Anticuerpos para IL-22R preferidos - 230C9 y 223G5 y anticuerpos relacionados con los mismos
Los anticuerpos para IL-22R preferidos y los fragmentos de unión a antígeno de los mismos de acuerdo con la presente invención son variantes humanizadas y variantes con modificaciones de estirpe germinal de los anticuerpos obtenidos de camélido descritos en el presente documento. Las variantes humanizadas y con modificaciones de estirpe germinal presentan una alta homología humana y, preferentemente, presentan una alta homología con moléculas de IgG humanas, más preferentemente IgG1. En determinadas realizaciones, los anticuerpos para IL-22R preferidos y los fragmentos de unión a antígeno de acuerdo con la presente invención comprenden bucles hipervariables o CDR que tienen pliegues canónicos humanos o similares a los humanos, como se describe en otra parte del presente documento.
Los anticuerpos para IL-22R preferidos de acuerdo con la presente invención pueden presentar una identidad de secuencia de aminoácidos del 93 % o más con uno o más dominios VH humanos, particularmente en las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 e FR4. De forma alternativa o adicional, los anticuerpos para IL-22R preferidos pueden presentar una identidad de secuencia de aminoácidos del 96 % o más con uno o más dominios VL humanos, particularmente en las regiones marco conservadas FR1, FR2, FR3 e FR4. Los anticuerpos para IL-22R preferidos de acuerdo con la presente invención pueden presentar una identidad de secuencia de aminoácidos del 93 % o más con uno o más dominios VH humanos, y una identidad de secuencia de aminoácidos combinada del 93 % o más con uno o más dominios VH humanos y uno o más dominios VL humanos, particularmente cuando la identidad de secuencia se determina a través de las regiones marco conservadas.
Debido a la alta homología humana, los anticuerpos para IL-22R preferidos proporcionados en el presente documento presentan baja inmunogenicidad, según lo evaluado por la plataforma Epibase™ de lonza (puntuación de DRB-1) utilizando la configuración de "HLA class II - Caucasian v3.0". En determinadas realizaciones, los anticuerpos para IL-22R de la invención presentan una puntuación de DRB-1 de menos de 950, preferentemente de menos de 850, más preferentemente de menos de 750, muy preferentemente de menos de 650.
Los anticuerpos para IL-22R preferidos de la invención son anticuerpos monoclonales que contienen una región bisagra, un dominio CH2 y un dominio CH3 de una IgG humana, preferentemente una IgG1. En determinadas realizaciones, la región Fc del anticuerpo monoclonal no tiene función efectora, es decir, es un Fc nulo. Esto es particularmente útil para anticuerpos bloqueantes terapéuticos.
Los anticuerpos para IL-22R preferidos y los fragmentos de unión a antígeno de la invención presentan una combinación de propiedades que los hacen superiores a los anticuerpos para IL-22R descritos en la técnica anterior. Los anticuerpos para IL-22R preferidos y los fragmentos de unión a antígeno de la invención pueden presentar la siguiente combinación de propiedades:
(i) unión a un epítopo dentro de la proteína IL-22R que no incluye la Tyr60;
(ii) unión a un epítopo ubicado al menos en parte en el dominio D2 de la proteína IL-22R;
(iii) alta afinidad de unión a IL-22R humano;
(iv) inhibición de la activación de IL-22R dependiente de IL-22 y activación de IL-22R dependiente de IL-20; (v) sin reactividad cruzada con IL-22R murino; y
(vi) reactividad cruzada con IL-22R de monos rhesus y cinomolgos.
Los anticuerpos para IL-22R de la invención preferidos pueden unirse a un epítopo que no incluye el resto crucial Tyr60. Los anticuerpos para IL-22R de la invención preferidos pueden unirse a un epítopo que se encuentra al menos en parte en el dominio D2 de IL-22R, donde el dominio D2 es del aminoácido 125 al aminoácido 228 de la SEQ ID NO: 71. Los anticuerpos para IL-22R de la invención preferidos también pueden unirse a IL-22R humano con alta afinidad, presentando normalmente una constante de disociación (donde la koff se mide por Biacore) para IL-22R humano de menos de 2,5 x 10-4 s-1 cuando se mide como mAb. En determinadas realizaciones, los anticuerpos para IL-22R de la invención preferidos se unen a IL-22R humano con alta afinidad presentando una constante de disociación (donde la koff se mide por Biacore) para IL-22R humano en el intervalo de 1 x 10-6 s-1 a 2,5 x 10-4 s-1. En determinadas realizaciones, los anticuerpos para IL-22R preferidos de la invención se unen a IL-22R humano presentando un valor de Kd inferior a 5 x 10'10 M.
Los anticuerpos para IL-22R preferidos también pueden inhibir la activación de IL-22R dependiente de IL-22 e IL-20, y normalmente presentan una actividad inhibidora para la activación dependiente de IL-20 que es menos de cuatro veces mayor que la actividad inhibidora presentada para la activación dependiente de IL-22. Los anticuerpos para IL-22R preferidos pueden unirse a IL-22R humano con alta afinidad y reaccionar de forma cruzada con homólogos de especies de IL-22R de monos rhesus y cinomolgos, pero no reaccionan de forma cruzada con IL-22R murino.
Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de acuerdo con la presente invención comprenden al menos un dominio variable de cadena pesada (VH) y al menos un dominio variable de cadena ligera (VL) donde el dominio VH comprende:
- una CDR3 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [VGFSGTYYSES], la SEQ ID NO: 6,
- una CDR2 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [SIYNDASNTAYSDSVKG], la SEQ ID NO: 36,
- una CDR1 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [SYDMN], la SEQ ID NO: 34,
y el dominio VL comprende:
- una CDR3 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [QSGSSSSNAV], la SEQ ID NO: 54,
- una CDR2 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [GQNNRPS], la SEQ ID NO: 47,
- una CDR1 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [QGGYYAH], la SEQ ID NO 16.
Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que tienen las secuencias de CDR de los dominios VH y VL como se definen anteriormente pueden comprender un dominio VH que comprende o consiste en la secuencia de la SEQ ID NO: 63 y/o un dominio VL que comprende o consiste en la secuencia de la SEQ ID NO: 64. En determinadas realizaciones, en el presente documento se proporcionan anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera, comprendiendo el dominio variable de cadena pesada una secuencia de VH con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 63 y/o el dominio variable de cadena ligera que comprende una VL con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 64. Para las realizaciones donde los dominios de los anticuerpos o de los fragmentos de unión a antígeno se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, los dominios VH y/o VL pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo dentro de las regiones marco conservadas.
Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que tienen las secuencias CDR de dominios VH y VL como se definen anteriormente pueden comprender una cadena pesada de inmunoglobulina de longitud completa que comprende o que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 67 y/o una cadena ligera de inmunoglobulina de longitud completa que comprende o que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 68. En determinadas realizaciones, en el presente documento se proporcionan anticuerpos que comprenden una cadena pesada con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como la SEQ ID NO: 67 y/o una cadena ligera con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 68.
Para las realizaciones donde las cadenas de los anticuerpos se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, la cadena pesada y/o la cadena ligera pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo fuera de las regiones CDR.
En determinados ejemplos, determinados anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno descritos en el presente documento comprenden al menos un dominio variable de cadena pesada (VH) y al menos un dominio variable de cadena ligera (VL) donde el dominio VH comprende:
- una CDR3 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [PPGPFKAHYNGAKY], la SEQ ID NO: 43,
- una CDR2 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [GIHISGGITYYTDSVKG], la SEQ ID NO: 41,
- una CDR1 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [SYFMS], la SEQ ID NO: 9,
y el dominio VL comprende:
- una CDR3 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [ASYRLYADYV], la SEQ ID NO: 27,
- una CDR2 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [EVNKRSS], la SEQ ID NO: 59,
- una CDR1 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [TGTSSDIGSYNYVS], la SEQ ID NO 57.
Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que tienen las secuencias de CDR de los dominios VH y VL como se definen anteriormente pueden comprender un dominio VH que comprende o consiste en la secuencia de la SEQ ID NO: 65 y/o un dominio VL que comprende o consiste en la secuencia de la SEQ ID NO: 66. En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que comprenden un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera, comprendiendo el dominio variable de cadena pesada una secuencia de VH con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 65 y/o el dominio variable de cadena ligera que comprende una VL con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 66. Para las realizaciones donde los dominios de los anticuerpos o de los fragmentos de unión a antígeno se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, los dominios VH y/o VL pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo dentro de las regiones marco conservadas.
Los anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno que tienen las secuencias CDR de dominios VH y VL como se definen anteriormente pueden comprender una cadena pesada de inmunoglobulina de longitud completa que comprende o que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 69 y/o una cadena ligera de inmunoglobulina de longitud completa que comprende o que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 70. En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos que comprenden una cadena pesada con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como la SEQ ID NO: 69 y/o una cadena ligera con al menos el 85 % de identidad de secuencia, o al menos el 90 % de identidad de secuencia, o al menos el 95 % de identidad de secuencia, o al menos el 97 %, 98 % o 99 % de identidad de secuencia, con la secuencia de aminoácidos mostrada como SEQ ID NO: 70.
Para las realizaciones donde las cadenas de los anticuerpos se definen mediante un porcentaje particular de identidad de secuencia con una secuencia de referencia, la cadena pesada y/o la cadena ligera pueden conservar secuencias de CDR idénticas a las presentes en la secuencia de referencia, de modo que la variación está presente solo fuera de las regiones CDR.
Anticuerpos que compiten de forma cruzada
Además, se describen anticuerpos (monoclonales) o fragmentos de unión a antígeno de los mismos que compiten de forma cruzada con los anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno divulgados en el presente documento. En particular, en el presente documento se describen anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R y compiten de forma cruzada con anticuerpos o fragmentos de unión a antígenos de los mismos, que comprenden una combinación de CDR3 de cadena pesada variable (HCDR3), CDR2 de cadena pesada variable (HCDR2) y CDR1 de cadena pesada variable (HCDR1), CDR3 de cadena ligera variable (LCDR3), Cd R2 de cadena ligera variable (LCDR2) y CDR1 de cadena ligera variable (LCDR1), donde la combinación se selecciona del grupo que consiste en:
(i) HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 43; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 41; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 9; LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 27; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 59; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 57; y
(ii) HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 13; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 11; HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 9; LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 27; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 25; LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 23.
En determinados ejemplos, en el presente documento se describen anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, que se unen al receptor de citocinas IL-22R y compiten de forma cruzada con anticuerpos o fragmentos de unión a antígenos de los mismos que comprenden al menos un dominio variable de cadena pesada (VH) y al menos un dominio variable de cadena ligera (VL) donde el dominio VH comprende:
- una CDR3 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [PPGPFKAHYNGAKY], la SEQ ID NO: 43,
- una CDR2 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [GIHISGGITYYTDSVKG], la SEQ ID NO: 41,
- una CDR1 de cadena pesada variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [SYFMS], la SEQ ID NO: 9,
y el dominio VL comprende:
- una CDR3 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [ASYRLYADYV], la SEQ ID NO: 27,
- una CDR2 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [EVNKRSS], la SEQ ID NO: 59,
- una CDR1 de cadena ligera variable que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos [TGTSSDIGSYNYVS], la SEQ ID NO 57.
Los anticuerpos que compiten de forma cruzada o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos pueden competir con anticuerpos o fragmentos de unión a antígeno que tienen un dominio VH que comprende o consiste en la secuencia de la SEQ ID NO: 65 y/o un dominio VL que comprende o consiste en la secuencia de la SEQ ID. NO: 66. Los anticuerpos que compiten de forma cruzada o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos pueden competir con anticuerpos que tienen una cadena pesada de inmunoglobulina de longitud completa que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 69 y/o una cadena ligera de inmunoglobulina de longitud completa que comprende o consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 70.
Los anticuerpos que compiten de forma cruzada son los que se unen a IL-22R en un sitio (o sitios) que solapa o es idéntico al sitio (o sitios) en los que se unen los presentes anticuerpos para IL-22R. Los anticuerpos (monoclonales) que compiten o fragmentos de unión a antígeno de los mismos pueden identificarse, por ejemplo, mediante un ensayo de competición de anticuerpos. Por ejemplo, un antígeno para IL-22R o un fragmento del mismo se puede unir a un soporte sólido. A continuación, se añaden un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de la presente invención y un anticuerpo monoclonal o fragmento de unión a antígeno del mismo que se sospecha que puede competir con tal anticuerpo de la invención. Una de las dos moléculas se marca. Si el compuesto marcado y el compuesto no marcado se unen en sitios distintos y diferenciados en el antígeno IL-22R, el compuesto marcado se unirá al mismo nivel esté presente o no el compuesto que se sospecha competidor. Sin embargo, si los sitios de interacción son idénticos (o solapantes), el compuesto no marcado competirá, y la cantidad de compuesto marcado unido al antígeno se reducirá. Si el compuesto no marcado está presente en exceso, muy poco, si es que hay alguno, compuesto etiquetado se unirá. Para los fines de la presente invención, los anticuerpos monoclonales que compiten o los fragmentos de unión a antígeno de los mismos son los que disminuyen la unión de los presentes anticuerpos para IL-22R en aproximadamente el 50 %, aproximadamente el 60 %, aproximadamente el 70 %, aproximadamente el 80 %, aproximadamente el 85 %, aproximadamente el 90 %, aproximadamente el 95 % o aproximadamente el 99 %. Los detalles de procedimientos para llevar a cabo tales ensayos de competición son bien conocidos en la técnica y pueden encontrarse, por ejemplo, en Harlow y Lane (1988) Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Nueva York, páginas 567-569, ISBN 0-87969­ 314-2. Dichos ensayos pueden hacerse cuantitativos usando anticuerpos purificados. Se establece una curva patrón titulando un anticuerpo contra sí mismo, es decir, se usa el mismo anticuerpo tanto para la marca como para el competidor. Se titula la capacidad de un anticuerpo monoclonal que compite no marcado o un fragmento de unión a antígeno del mismo de inhibir la unión de la molécula marcada a la placa. Los resultados se representan gráficamente, y se comparan las concentraciones necesarias para conseguir el grado deseado de inhibición de la unión.
Polinucleótidos que codifican anticuerpos para IL-22R
La invención también proporciona moléculas polinucleotídicas que codifican los anticuerpos para IL-22R de la invención o fragmentos de los mismos, también vectores de expresión que contienen dichas secuencias de nucleótidos de la invención unidas operativamente a secuencias reguladoras que permiten la expresión de los anticuerpos o fragmentos de los mismos en una célula hospedadora o sistema de expresión sin células, y una célula hospedadora o sistema de expresión si células que contiene este vector de expresión.
En los ejemplos particulares descritos en el presente documento, el polinucleótido que codifica el anticuerpo para IL-22R puede comprender una o más de las secuencias polinucleotídicas que se muestran como las SEQ ID NO: 52, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 u 81, cuyas secuencias codifican dominios VH o VL de anticuerpos para IL-22R.
En determinados ejemplos descritos en el presente documento, el polinucleótido que codifica el anticuerpo para IL-22R puede comprender una secuencia variante que codifica un dominio VH o VL funcional de un anticuerpo para IL-22R, donde dicha secuencia variante presenta al menos el 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 % o 99 % de identidad de secuencia cuando se alinea de manera óptima con una cualquiera de las SEQ ID NO: 52, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 u 81.
En este contexto, el % de identidad de secuencia entre dos secuencias de polinucleótido puede determinarse comparando estas dos secuencias alineadas de una manera óptima y en que la secuencia de polinucleótido a comparar puede comprender adiciones o deleciones con respecto a la secuencia de referencia para un alineamiento óptimo entre estas dos secuencias. El porcentaje de identidad se calcula determinando el número de posiciones idénticas para las que el resto nucleotídico es idéntico entre las dos secuencias, dividiendo este número de posiciones idénticas por el número total de posiciones en la ventana de comparación y multiplicando el resultado obtenido por 100 para obtener el porcentaje de identidad entre estas dos secuencias. Por ejemplo, es posible utilizar el programa BLASt , "Secuencias BLAST 2" (Tatusova et al, "Blast 2 sequences - a new tool for comparing protein and nucleotide sequences", FEMS Microbiol Lett. 174:247-250) disponible en el sitio http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ gorf/bl2.html, siendo los parámetros utilizados los proporcionados por defecto (en particular para los parámetros "penalización por apertura de hueco": 5, y "penalización por extensión de hueco": 2; siendo la matriz elegida, por ejemplo, la matriz "BLOSUM 62" propuesta por el programa), calculándose el porcentaje de identidad entre las dos secuencias a comparar directamente mediante el programa.
En determinados ejemplos descritos en el presente documento, el dominio variable de cadena pesada y el dominio variable de cadena ligera de los anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno están codificados por una combinación de primera y segunda secuencias polinucleotídicas, donde la primera y segunda secuencias polinucleotídicas se seleccionan de las siguientes parejas:
(i) un primer polinucleótido que codifica un dominio de cadena pesada variable que comprende la SEQ ID NO: 52 y un segundo polinucleótido que codifica un dominio de cadena ligera variable que comprende la SEQ ID NO: 73; (ii) un primer polinucleótido que codifica un dominio de cadena pesada variable que comprende la SEQ ID NO: 74 y un segundo polinucleótido que codifica un dominio de cadena ligera variable que comprende la SEQ ID NO: 75;
(iii) un primer polinucleótido que codifica un dominio de cadena pesada variable que comprende la SEQ ID NO: 76 y un segundo polinucleótido que codifica un dominio de cadena ligera variable que comprende la SEQ ID NO: 77;
(iv) un primer polinucleótido que codifica un dominio de cadena pesada variable que comprende la SEQ ID NO: 78 y un segundo polinucleótido que codifica un dominio de cadena ligera variable que comprende la SEQ ID NO: 79; o
(v) un primer polinucleótido que codifica un dominio de cadena pesada variable que comprende la SEQ ID NO: 80 y un segundo polinucleótido que codifica un dominio de cadena ligera variable que comprende la SEQ ID NO: 81.
Las moléculas polinucleotídicas que codifican los anticuerpos de la invención incluyen, por ejemplo, moléculas de ADN recombinante. Las expresiones "ácido nucleico", "polinucleótido" o "molécula polinucleotídica" se usan en el presente documento indistintamente y se refieren a cualquier molécula de ADN o ARN, monocatenaria o bicatenaria y, si es monocatenaria, la molécula de su secuencia complementaria. En el análisis de las moléculas de ácido nucleico, una secuencia o estructura de una molécula de ácido nucleico particular puede describirse en el presente documento de acuerdo con la convención normal de proporcionar la secuencia en la dirección de 5' a 3'. En algunas realizaciones de la invención, los ácidos nucleicos o polinucleótidos están "aislados". Este término, cuando se aplica a una molécula de ácido nucleico, se refiere a una molécula de ácido nucleico que está separada de secuencias con las que está inmediatamente contigua en el genoma de origen natural del organismo en que se origina. Por ejemplo, un "ácido nucleico aislado" puede comprender una molécula de ADN insertada en un vector, tal como un plásmido o vector vírico, o integrada en el ADN genómico de una célula procariótica o eucariótica u organismo hospedador no humano. Cuando se aplica a ARN, la expresión "polinucleótido aislado" se refiere principalmente a una molécula de ARN codificada por una molécula de ADN aislada como se define anteriormente. Como alternativa, la expresión puede referirse a una molécula de ARN que se ha purificado/separado de otros ácidos nucleicos con los que estaría asociada en su estado natural (es decir, en células o tejidos). Un polinucleótido aislado (ya sea ADN o a Rn ) puede representar además una molécula producida directamente por medios biológicos o sintéticos y separada de otros componentes presentes durante su producción.
Para la producción recombinante de un anticuerpo de acuerdo con la invención, puede prepararse un polinucleótido recombinante que lo codifica (utilizando técnicas convencionales de biología molecular) e insertarse en un vector replicable para la expresión en una célula hospedadora elegida, o en un sistema de expresión sin células. Las células hospedadoras adecuadas pueden ser procarióticas, levaduras o células eucarióticas superiores, específicamente células de mamífero. Los ejemplos de líneas celulares hospedadoras de mamífero útiles son la línea CV1 de riñón de mono transformada por SV40 (COS-7, ATCC CRL 1651); la línea de riñón embrionario humano (293 o células 293 subclonadas para crecimiento en cultivo en suspensión, Graham et al., J. Gen. Virol.
36:59 (1977)); células de riñón de cría de hámster (BHK, ATCC CCL 10); células de ovario de hámster chino/-DHFR (CHO, vacaciones et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); células de Sertoli de ratón (TM4, Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980)); células de mieloma de ratón SP2/0-AG14 (ATCC CRL 1581; ATCC CRL 8287) o NS0 (colecciones de cultivo la HPA n.° 85110503); células de riñón de mono (CV1 ATCC CCL 70); células de riñón de mono verde africano (VERO-76, ATCC CRL-1587); células de carcinoma de cuello uterino humano (HELA, ATCC CCL 2); células de riñón canino (MDCK, ATCC CCL 34); células de hígado de rata búfalo (BRL 3A, ATCC CRL 1442); células de pulmón humano (W138, ATCC CCL 75); células de hígado humano (Hep G2, HB 8065); tumor mamario de ratón (MMT 060562, ATCC CCL51); células TRI (Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)); células MRC 5; células FS4; y una línea de hepatoma humano (Hep G2), así como la línea celular PERC-6 de DSM. Los vectores de expresión adecuados para su uso en cada una de estas células hospedadoras también son conocidos en general en la técnica.
Debe apreciarse que la expresión "célula hospedadora" en general se refiere a una línea celular cultivada. Los seres humanos completos en que se ha introducido un vector de expresión que codifica un polipéptido de unión a antígeno de acuerdo con la invención se excluyen explícitamente de la definición de una "célula hospedadora".
Producción de anticuerpos
En un aspecto importante, la invención también proporciona un método de producción de anticuerpos de la invención que comprende el cultivo de una célula hospedadora (o sistema de expresión sin células) que contiene un polinucleótido (por ejemplo, un vector de expresión) que codifica el anticuerpo en condiciones que permiten la expresión del anticuerpo y la recuperación del anticuerpo expresado. Este procedimiento de expresión recombinante puede utilizarse para la producción de anticuerpos a gran escala, incluyendo anticuerpos para IL-22R de acuerdo con la invención, incluyendo anticuerpos monoclonales destinados a uso terapéutico humano. Los vectores, líneas celulares y procedimientos de producción adecuados para la fabricación a gran escala de anticuerpos recombinantes adecuados para uso terapéutico in vivo están disponibles en general en la técnica y los expertos en la materia los conocerán.
Utilidad terapéutica de los anticuerpos para IL-22R
Los anticuerpos para IL-22R proporcionados en el presente documento pueden utilizarse como medicamentos, particularmente para su uso en el tratamiento o la profilaxis de trastornos en que la patología es atribuible a la señalización desregulada a través de los complejos de IL-22R de la superficie celular. Dicha señalización desregulada puede estar vinculada con la sobreexpresión o sobreproducción de una cualquiera de las citocinas IL-22, IL-20 y/o IL-24.
El término "tratar" o "tratamiento" significa ralentizar, interrumpir, detener, controlar, parar, reducir la gravedad de un síntoma, trastorno, afección o enfermedad, pero no implica necesariamente una eliminación total de todos los síntomas relacionados con las enfermedades, afecciones o trastornos. El término "profilaxis" significa prevenir la aparición de un trastorno, afección o enfermedad o prevenir la aparición de síntomas asociados con un trastorno, afección o enfermedad.
Los ligandos que señalizan a través de IL-22R se han implicado en una serie de enfermedades y dado que IL-22R se expresa de forma selectiva en la piel y las células epiteliales, las enfermedades clave son las que afectan la piel y el epitelio, incluidas, entre otras, la psoriasis, la artritis psoriásica y la dermatitis atópica. Se han encontrado altos niveles de IL-22 en placas psoriásicas humanas (Boniface et al., Clin Exp Immunol. 150: 407-415 (2007)) y la participación de esta citocina en la patogenia de la psoriasis se ha demostrado experimentalmente en modelos de ratón de inflamación de la piel (Ma et al., J Clin Invest. 118: 597-607 (2008); Van Belle et al. J Immunol. 1 de enero; 188(1):462-9 (2012)).
En el presente documento se proporcionan anticuerpos o antígenos de la presente invención para su uso en el tratamiento o la profilaxis de la psoriasis, la artritis psoriásica o la dermatitis atópica. En determinados ejemplos, el presente documento se describen métodos de tratamiento de enfermedades inflamatorias de la piel. En determinados ejemplos, en el presente documento se describen métodos de tratamiento de enfermedades inflamatorias de la piel seleccionadas de psoriasis, artritis psoriásica, dermatitis de contacto o dermatitis atópica en un sujeto humano. Los métodos comprenden administrar a un paciente que lo necesite una cantidad terapéuticamente eficaz de cualquiera de los anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno como se define en otra parte del presente documento. Todos los ejemplos de anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno como se describen en el presente documento son igualmente aplicables a los métodos de tratamiento descritos en el presente documento.
En determinados ejemplos, en el presente documento se describen métodos de tratamiento del síndrome de Sjorgen, o de cánceres seleccionados de hepatocarcinoma, liposarcoma, carcinoma oral de células escamosas, cáncer de colon y colorrectal, cáncer de páncreas, cáncer de pulmón de células pequeñas y grandes, cáncer de mama, glioblastoma, linfoma cutáneo de linfocitos T, linfoma anaplásico de células grandes, linfoma de células del manto, en un sujeto humano, métodos que comprenden administrar a un paciente que lo necesite una cantidad terapéuticamente eficaz de cualquiera de los anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno como se define en otra parte del presente documento. Todos los ejemplos de anticuerpos para IL-22R o fragmentos de unión a antígeno como se describen en el presente documento son igualmente aplicables a los métodos de tratamiento descritos en el presente documento.
Para el uso terapéutico en seres humanos, los anticuerpos para IL-22R descritos en el presente documento se pueden administrar a un sujeto humano que necesite tratamiento en una "cantidad eficaz". La expresión "cantidad eficaz" se refiere a la cantidad o dosis de un anticuerpo para IL-22R que, tras la administración de una dosis única o múltiple a un paciente humano, proporciona eficacia terapéutica en el tratamiento de la enfermedad. Las cantidades terapéuticamente eficaces del anticuerpo para IL-22R pueden comprender una cantidad en el intervalo de aproximadamente 0,1 mg/kg a aproximadamente 20 mg/kg por dosis única. La cantidad de anticuerpo administrada en cualquier punto de tiempo dado puede variarse para que las cantidades óptimas de anticuerpo para IL-22R, ya sea empleado solo o en combinación con cualquier otro agente terapéutico, se administren durante el transcurso del tratamiento.
Además, se contempla administrar los anticuerpos para IL-22R descritos en el presente documento, o composiciones farmacéuticas que comprenden tales anticuerpos, en combinación con cualquier otro tratamiento adecuado para las enfermedades identificadas anteriormente, como terapia de combinación.
Composiciones farmacéuticas
El alcance de la invención incluye composiciones farmacéuticas, que contienen uno o una combinación de anticuerpos para IL-22R de la invención, o fragmentos de unión a antígeno de los mismos, formuladas con uno o más transportadores o excipientes farmacéuticamente aceptables. Dichas composiciones pueden incluir uno o una combinación de (por ejemplo, dos o más distintos) anticuerpos para IL-22R. Las técnicas para formular anticuerpos monoclonales para uso terapéutico humano son bien conocidas en la técnica y se revisan, por ejemplo, en Wang et al., Journal of Pharmaceutical Sciences, Vol. 96, pág. 1-26, 2007.
En determinadas realizaciones, las composiciones farmacéuticas se formulan para la administración a un sujeto a través de cualquier vía de administración adecuada incluyendo, pero sin limitación, inyección intramuscular, intravenosa, intradérmica, intraperitoneal, administración subcutánea, epidural, nasal, oral, rectal, tópica, inhalatoria, bucal (por ejemplo, sublingual) y transdérmica. En realizaciones preferidas, la composición está formulada para administración subcutánea.
Ejemplos
La invención se entenderá mejor con referencia a los siguientes ejemplos no limitantes.
Ejemplo 1 Inmunización de llama
Se inmunizaron dos llamas con una mezcla de proteína IL22R humana recombinante (R&D systems) y Fn14-Fc humana de acuerdo con el esquema de inmunización que se muestra a continuación en la Tabla 5. Después de seis inyecciones semanales de proteínas recombinantes, se recogió sangre y se utilizaron los sueros de las llamas inmunizadas para medir la respuesta inmunitaria humoral contra IL22R detectando la presencia de anticuerpos contra el antígeno de inmunización antes de la inmunización y después de la inmunización. Ambas llamas produjeron una respuesta inmunitaria significativa y específica contra IL22R.
T l l n ri inm niz i n r ll m
Figure imgf000034_0001
Ejemplo 2 Construcción y selección de bibliotecas
Después de la inmunización, se recogieron las CMSP y se extrajo ARN. Se llevó a cabo una síntesis de ADNc con cebadores aleatorios y se amplificaron por PCR los segmentos génicos de VHCH1, VACA y VkCk de llama. Se utilizaron dos enfoques para amplificar por PCR las cadenas ligeras. El primer enfoque utilizó una amplificación por PCR primaria con cebadores sin enlazadores con sitios de restricción, seguido de amplificación por PCR con cebadores etiquetados con sitios de restricción (ApaLI y AscI). Para el segundo enfoque, se utilizaron cebadores etiquetados para amplificar ADNc directamente. Las bibliotecas de VHCH1 se crearon mediante una PCR de dos etapas, en que se llevaron a cabo 25 ciclos con cebadores no etiquetados seguidos de 10 ciclos utilizando versiones etiquetadas de estos cebadores (que contienen sitios de restricción Sfil y Notl) (véase el documento WO2010/001251).
Las cadenas ligeras amplificadas por PCR se digirieron con ApaLl y Ascl, mientras que las cadenas pesadas amplificadas por PCR se digirieron con Sfil y Notl, y se combinaron en una biblioteca de Fab clonando el inserto de la biblioteca de cadenas ligeras en el vector pCB3 de la biblioteca de cadenas pesadas utilizando los sitios de restricción ApaLl y Ascl. Se descubrió que las bibliotecas de Fab finales tenían la diversidad necesaria de >109 clones distintos).
Después de la construcción de la biblioteca, se produjeron fagos y la selección por presentación de fagos se realizó sobre IL22R humano (Biotechne, 2770-LR). Para la selección de clones específicos para IL22R, se recubrió IL22R humano (i) directamente sobre una placa MaxiSorp™ (Nunc); o (ii) se capturó con un anticuerpo anti-IL22R humano no competitivo (MAB2770, R&D systems); o (iii) se capturó con neutravidina después de biotinilación. El recubrimiento y la captura de IL22R generalmente se realizó en dos concentraciones distintas; por ejemplo, 5 pg/ml y 0,1 pg/ml.
Después de la primera ronda de selección no se observó un enriquecimiento claro, pero después de la segunda y tercera ronda, se observaron enriquecimientos dependientes de la dosis en todas las bibliotecas; hasta 100 veces después de la segunda ronda y 10.000 veces después de la tercera ronda. Se descubrió que los enriquecimientos en el IL22R capturado con anticuerpo eran mayores en comparación con los del IL22R recubierto directamente. Esto podría deberse al hecho de que IL22R tiene solo 25 kDa y el recubrimiento directo afecta su conformación o limita el epítopo disponible. Por lo tanto, se realizó una tercera campaña de selección utilizando hIL22R biotinilado.
Además de las selecciones descritas anteriormente, se realizaron dos rondas adicionales de selección sobre IL22R de ratón recombinante biotinilado después de una primera ronda de selección sobre IL-22R humano capturado con MAB2770. Esta selección se realizó para identificar Fab con reactividad cruzada con IL22R de ratón. Como control positivo de las selecciones, se llevó a cabo en paralelo una selección sobre IL-22R humano-biotina capturado con neutravidina. En general, el procedimiento de selección fue muy satisfactorio con un enriquecimiento significativo observado para moléculas de unión Fab de IL22R.
Ejemplo 3 Cribado de Fab específicos para IL22R
Después de la selección satisfactoria por presentación de fagos, se sometieron a ensayo los Fab presentes en el periplasma en cuanto a su capacidad para bloquear la unión de IL-22 al IL22R. Además, se llevó a cabo un cribado para identificar la unión de clones al IL22R1 de ratón. Se desarrolló un nuevo enfoque basado en resonancia de plasmón superficial (RPS), lo que permitió analizar la competición de ligandos, la afinidad por ser humano y la reactividad cruzada con ratón en un cribado.
Los diferentes canales de un chip de Biacore (CM5) se recubrieron con:
1. Nada (Blanco)
2. IL-22 (3000 UR) para probar la actividad competitiva del Fab (cuando se coinyecta IL22R)
3. IL22R humano (3000 UR) para probar la unión a la diana
4. IL22R de ratón (2500 UR) para probar la reactividad cruzada
Para probar la competición de ligandos, se premezcló una baja concentración de IL22R1 soluble (0,2 |jg/ml) con los extractos periplásmicos antes de la inyección. De esta manera, fue también posible medir la capacidad del Fab para bloquear la interacción ligando-receptor en el canal 2. Los extractos periplásmicos obtenidos se cribaron en cuanto a su unión a IL22R humano (canal 3) e IL22R de ratón (canal 4).
La ventaja de este método en comparación con el ELISA convencional (de unión o competitivo) es que se prueban varias características del Fab al mismo tiempo: 1) unión al IL-22R humano diana; 2) actividad competitiva; y 3) reactividad cruzada. Adicionalmente, la medida de las constantes de disociación da un fuerte indicio de la afinidad de los Fab probados.
Utilizando este método de cribado alternativo, los Fab con todas las características posibles se identificaron y categorizaron basándose en su constante de disociación:
Competitivo o no competitivo
Reactivo de forma cruzada y no reactivo de forma cruzada
Competitivo y reactivo de forma cruzada
No competitivo y reactivo de forma cruzada
A continuación, se enviaron diversos clones para su secuenciación.
Ejemplo 4 Análisis de secuencia de los Fab para IL-22R
Los clones identificados por el análisis de Biacore (por ejemplo, competición de ligandos, máxima unión, baja constante de disociación o reactividad de forma cruzada con ratón) se secuenciaron. A continuación, los clones se agruparon basándose en su identidad de CDR3 para formar familias de VH.
En total, se identificaron 67 VH distintos pertenecientes a 13 familias de VH distintas. Se identificaron muchas más familias de cadenas ligeras (más de 80 secuencias de Vlambda y Vkappa). La gran diversidad en la secuencia y función de los Fab muestra que la inmunización y la selección fueron muy satisfactorias.
Las secuencias de aminoácidos de los dominios VH y VL de los clones de interés particular se muestran a continuación en las Tablas 6 - 8, y las secuencias polinucleotídicas de estos clones se muestran en la Tabla 9.
Figure imgf000036_0001
Figure imgf000037_0001
Figure imgf000038_0001
Figure imgf000039_0001
Ejemplo 5 Caracterización de Fabs
Los clones con las mejores constantes de disociación se reclonaron en pCB4, se expresaron y purificaron por IMAC (Talon de Clonentech). Estos clones se probaron de nuevo utilizando Biacore. Los resultados de la caracterización de Fab adicional se muestran a continuación en la Tabla 10.
Tabla 10 Caracterización de los Fabs de unión a IL-22R
Figure imgf000040_0001
Dependiendo de la diversidad en la familia de VH, la actividad de competición y la afinidad (medida utilizando la koff obtenida en el Biacore) se seleccionaron uno o varios clones de cada familia y se reformatearon en anticuerpos monoclonales (mAb) para su caracterización adicional.
Ejemplo 6 Caracterización de los mAb de unión a IL-22R
Como se señaló anteriormente, se produjeron clones selectivos de cada familia de VH como IgG1. Después de reclonar las regiones variables de hC y lC en vectores de expresión pUPE separados que contenían los dominios constantes humanos, se transfectaron transitoriamente HEK293E con los dos plásmidos, uno que codifica la cadena pesada completa y un segundo que codifica la cadena ligera. Se permitió que las células transfectadas expresaran los anticuerpos durante un período del cultivo celular de 6 días. Después de la purificación de anticuerpos a partir del sobrenadante del cultivo celular utilizando perlas de proteína A, se probó la capacidad de los anticuerpos purificados para neutralizar la señalización de IL22R humano y de ratón utilizando distintas líneas celulares como se describe a continuación.
- Línea celular BW-hIL22R: Se obtuvo de la línea celular BW y tiene una expresión estable de IL22R humano, lo que introduce la detención del crecimiento dependiente de IL22. Por lo tanto, las células proliferarán solo cuando se bloquee la interacción IL22-IL22R. Un anticuerpo potente propiciará la proliferación a concentraciones bajas de anticuerpo. La proliferación se mide mediante la incorporación de timidina.
- Línea celular Baf3-mIL22R: Obtenida de la línea celular Baf3 y tiene una expresión estable de IL22R de ratón que da lugar a una proliferación dependiente de IL22. El anticuerpo que neutraliza el mIL22R (forma siglada de mouse IL22R, IL22R de ratón) bloqueará la proliferación de una manera dependiente de la concentración de anticuerpo.
- Línea celular Baf3-hIL22R/IL20Rb: Se obtuvo de la línea celular Baf3, pero coexpresa hIL22R (forma siglada de human IL22R, IL22R humano) con hIL20Rbeta, permitiendo que las células proliferen en presencia de IL20. El anticuerpo que neutraliza el hIL22R bloqueará la proliferación de células estimuladas con IL20.
Los resultados del análisis de diversos mAb para IL22R contra la línea celular BW-hIL22R y la línea celular Baf3-hIL22R/IL20Rb se muestran en la Figura 4 y la Tabla 11. En la Fig. 4A, se pueden observar los efectos de los anticuerpos neutralizantes de IL22R en la restauración de la proliferación de la línea celular BW-hIL22R. En la figura 4B se pueden ver los efectos de los anticuerpos neutralizantes de IL22R en la inhibición de la proliferación con IL-20 de la línea celular que expresa IL-22R. El anticuerpo IL22R descrito en el documento WO2011/061119 (280.346.TSY) se incluyó en los experimentos como un anticuerpo para IL-22R de referencia o de comparación. Además de la potencia en las células, se midieron en Biacore (3000) la cinética de la unión in vitro y la actividad de bloqueo de los anticuerpos purificados. Para medir la afinidad, se recubrió IL22R recombinante sobre un chip Biacore CM5 a 200 UR utilizando un protocolo de recubrimiento convencional (se inyecta IL22R a 10|jg/ml en tampón acetato pH 4,5). Los anticuerpos probados en un intervalo de concentraciones y preparados en tampón HBSEP a pH 7,4 (Biacore) se inyectaron a 30 jl/min durante 60 segundos y se lavaron con tampón HBSEP a pH 7,4 (Biacore) durante 10-20 min. Los sensogramas obtenidos se analizaron con el programa informático BIAevaluation y la cinética se determinó utilizando un ajuste convencional (Langmuir 1:1 con transferencia de masa).
Para la actividad de bloqueo utilizando Biacore 3000, se recubrió IL22 recombinante (RnD System) a 2000 UR sobre un chip CM5. Los dominios de unión a antígeno (IgG purificada, Fab purificados o extracto periplásmico que contiene los Fab) se preincubaron con IL22R humano recombinante (concentración entre 0,2 y 1 jg ) antes de la inyección en el canal recubierto de hIL22. La detección de la unión (IL22R:IL22) indicó que el dominio de unión a antígeno no competía mientras que cuando no se detectaba unión (IL22R:IL22), esto indicaba que el dominio de unión a antígeno estaba bloqueando la interacción IL22:IL22R in vitro. Los resultados de los ensayos de Biacore y de proliferación se resumen a continuación en la Tabla 11.
T l 11 m ri l r rí i n n l n i r r hIL22R
Figure imgf000041_0001
continuación
Figure imgf000042_0001
Los anticuerpos para IL22R 157A2 y 166G8 presentan una potencia en el orden de picomolar.
Ejemplo 7 Reactividad cruzada de especies de los mAb para IL-22R
Se probaron los mAb para IL22R en cuanto a la reactividad cruzada de especies contra IL-22R murino e IL-22R de primate no humano.
El ADNc para IL22R de cinomolgo no estaba disponible y se tuvo que extraer de bibliotecas de ADNc de cinomolgo. Los cebadores se diseñaron basándose en la base de datos pública del NCBI. Varias secuencias para el ECD (forma silgada de extracellular domain, dominio extracelular) de cynolL22R (forma siglada de cynomolgus IL22R, IL2R de mono cinomolgo) estaban disponibles en bases de datos públicas (Genbank, NCBI) y contenían inserción, eliminación o ambas (véase la Figura 5). La incertidumbre con respecto a la verdadera secuencia de IL22R de cinomolgo justificó la clonación a partir de ADNc de cinomolgo.
El ECD de IL22R de cinomolgo se amplificó mediante PCR a partir de una biblioteca de ADNc y se clonó en marco cadena abajo del péptido señal IgGkappa y cadena arriba del Fc humano en el vector pUPE. Aunque el ADNc utilizado se obtuvo de cinomolgo, la secuenciación de varios clones mostró que también se había clonado el IL22R de rhesus. El ECD de IL22R de rhesus se caracterizó por la ausencia de la deleción e inserción encontradas en cinomolgo (recuadrado en la Figura 5) y por diferencias de 2 aminoácidos entre IL22R de rhesus y cinomolgo (en negrita en la Figura 5).
Después de la producción y purificación de cylL22R-Fc y rhlL22R-Fc, la especificidad de unión al ECD de IL22R de cinomolgo, rhesus y ratón de todos los anticuerpos de la selección primaria se probó en ELISA y por RPS (Biacore). El IL22R de ratón monomérico se adquirió de R&D Systems (cat. 4248-MR). Los resultados se resumen en la Tabla 12.
T l 12 R ivi r z i l mA r IL-22R
Figure imgf000042_0002
Ejemplo 8 Mapeo epitópico
Se emplearon dos métodos para identificar y comparar los epítopos a los que se unen los mAb para IL22R: ELISA competitivo y FACS.
8.1 Mapeo epitópico utilizando ELISA competitivo
Los epítopos reconocidos por los anticuerpos se compararon entre sí mediante ELISA competitivo. Se revistió al menos un mAb representativo de cada familia de VH en una placa Maxisorp. Posteriormente, se añadió IL22R humano biotinilado en presencia de un gran exceso de mAb a probar. La unión de IL22R biotinilado al anticuerpo recubierto se detectó utilizando estreptavidina conjugada con HRP. Cuando no se detectaba IL22R biotinilado, lo que significaba que el mAb impedía la unión al mAb recubierto, se determinó que ambos mAb se unen al mismo epítopo o tienen un epítopo solapante. El mapeo epitópico se refinó aún más utilizando los Fab en lugar de los mAb. El fragmento Fab más pequeño permitió alguna distinción de epítopos muy cercanos.
Se identificaron una diversidad de epítopos para los anticuerpos de las familias de VH 1-8, 10, 11, 19 y 22. El mapeo epitópico muestra una cobertura de epítopos muy amplia para una proteína tan pequeña (25 kDa). Como se muestra en la Figura 6, los epítopos se agruparon de acuerdo a si los anticuerpos (i) bloquearon la unión de IL-22 in vitro y neutralizaron la señalización de IL-22 en un ensayo basado en células (cuadrante inferior izquierdo); (ii) bloquearon la unión de IL-22 in vitro, pero no tuvieron actividad neutralizante (cuadrante superior derecho); o (iii) no bloquearon la unión de IL-22 in vitro, pero tenían actividad neutralizante en un ensayo basado en células (cuadrante inferior derecho). Se descubrió que seis epítopos solapantes pero distinguibles bloquean y neutralizan (véase el cuadrante inferior izquierdo) y, de estos seis epítopos, dos (los mAb de la familia 4 y 22) tenían un epítopo solapante con el anticuerpo de referencia (280.346.t Sy , véase la solicitud de patente WO2011/061119). El epítopo no era idéntico a la referencia ya que estos mAb (de la familia 4 y 22) pudieron competir también con todos los mAb de las familias 1, 5, 6 y 7 aunque estos no pudieron competir con el anticuerpo de referencia. Tomados en conjunto, estos datos sugieren 2 grupos de epítopos distintos, uno formado por la referencia y otro formado por los mAbs de las familias 1, 5, 6 y 7, y un tercer grupo (mAb de las fam. 4 y 22) que se solapan con ambos grupos (figura 6).
Como se muestra en el cuadrante superior derecho de la Figura 6, se identificaron 3 anticuerpos que se unen a IL22R pero que no bloquean la unión de IL22 ni neutralizan la actividad in vivo. Estos anticuerpos probablemente se unen a regiones de IL22r no implicadas en la unión del ligando o la activación de la señalización, y podrían utilizarse para detección pura. Los 3 anticuerpos mostrados en el cuadrante inferior derecho de la Figura 6 son inusuales porque neutralizan la actividad de IL22R in vivo, pero no bloquean a IL22 in vitro, lo que sugiere un nuevo epítopo funcional y un modo de acción inesperado.
8.2 Mapeo epitópico utilizando análisis de FACS
Jones et al. (Structure 16(9): 1333-1344 (2008)) informan sobe la estructura de IL-22 unida al dominio extracelular de IL22R1. En este trabajo, los autores muestran que los dos dominios de IL22R, llamados D1 y D2, interactúan con el ligando IL-22 en el sitio 1A y el sitio 1B, respectivamente (véase la Figura 7). Dos restos clave en IL22R-D1 implicados en la interacción directa con el sitio 1a de IL22 son la lisina 58 (K58) y la tirosina 60 (Y60). El triptófano 208 (W208) de IL22R-D2 está directamente implicado en la interacción con el sitio 1B de IL22 (véase la Figura 7). Se probó la unión de anticuerpos para IL22R y del anticuerpo de referencia (280.346.TSY) a células BW que sobreexpresan diversos mutantes de IL22R. Los mutantes de IL22R tienen mutaciones de aminoácidos que se sabe que están implicados en la interacción IL-22/IL22R. En esta configuración, los anticuerpos se biotinilaron, se añadieron a las células y se detectó la unión del anticuerpo a IL22R con estreptavidina marcada mediante citometría de flujo (FACS). La tabla 13 resume los resultados obtenidos.
Tabla 13 Unión de anticuer os a células ue ex resan mutantes de IL22R
Figure imgf000043_0001
Los resultados de FAC muestran claramente que el anticuerpo de referencia 280.346.TSY interactúa con restos del dominio D1 (K58 e Y60). Lo mismo ocurre con un segundo anticuerpo para IL-22R de control, AMR22, aunque el epítopo no es completamente el mismo, ya que la mutación R112A afecta la unión de AMR22. Como se esperaba del mapeo epitópico por ELISA que muestra que determinados anticuerpos de llama no compiten con 280.346.TSY, los otros anticuerpos probados no se vieron afectados por las mutaciones que afectan la unión de 280.346.TSY a IL22R. Esto confirmó que los anticuerpos tienen como diana a otro epítopo, que incluye posiblemente restos en el dominio D2. De hecho, la mutación A209D en el dominio D2 de IL22R anuló la unión de 198A1, lo que confirma que 198A1 y el anticuerpo de la familia 5 se unen al dominio D2 de IL22R (véase la Figura 7B).
Sorprendentemente, el anticuerpo 166G8, que comparte exactamente el mismo VH que 198A1, pero tiene un VL distinto, no se ve afectado por la mutación A209D, lo que sugiere que el VL está involucrado en la interacción. Presumiblemente, el VL de 166G8 permite un gran resto en la posición 209, mientras que el VL de 198A1 no lo hace. Esta hipótesis se confirma por su especificidad de unión a IL22R de rhesus. En rhesus, IL22R tiene una serina en la posición 209. Dado que 166G8 permite un gran aminoácido en esa posición, puede unirse a IL22R de rhesus mientras que 198A1 no puede unirse a rhIL22R ya que no permite restos grandes.
Ejemplo 9 Neutralización de la señalización de IL20 e IL24 en un ensayo basado en células
Se probó la capacidad de los anticuerpos para IL22R de bloquear la señalización dependiente de IL-20 e IL-24 en células que coexpresan IL22R e IL20Rb. Existe una diferencia de mecanismo entre la activación del receptor dependiente de IL-22, IL-20 e IL-24. Se cree que IL-22 induce la señalización al unirse primero a IL22R, desencadenando el reclutamiento del correceptor IL10R2 y la activación del complejo trimérico. Para IL-20, se cree que esta citocina se une primero al correceptor (IL20R2) antes de reclutar IL22R y de la activación del complejo trimérico. Finalmente, para IL-24, no está claro cómo se recluta y activa el complejo receptor, tampoco está claro dónde se une IL-24.
9.1 Señalización de IL-24
Se utilizaron varias líneas celulares para probar la señalización dependiente de IL-24, Baf3-hIL22R/20R2 o Baf3-mIL22R/20R2. IL-24 indujo la proliferación de estas líneas celulares con una ventana significativa según lo medido por el nivel de hexosaminidasa (lectura utilizada para contar las células) que varía de un DO de 0,17 a 1,5 para las células Baf3-hIL22R/20Rb y varía de 0,15 a 0,8 para las células Baf3-mIL22R/20Rb. Ninguno de los anticuerpos probados tuvo efecto sobre la proliferación inducida por IL-24. Estos resultados sugieren que IL-24 tiene un modo completamente distinto de activación de IL22R al unirse a un sitio muy distinto que IL22 e IL-20, o que IL22R no está implicado en la señalización de IL-24 en la línea celular probada (y el ensayo no predice la actividad neutralizante).
9.2 Señalización de IL-20
La línea Baf3-hIL22R/IL20Rb se obtiene de la línea celular Baf3, pero coexpresa hIL22R con hIL20Rp, lo que permite que las células proliferen en presencia de IL-20. El anticuerpo que neutraliza a hIL22R bloqueará la proliferación de células estimuladas con IL-20. Los resultados producidos al analizar los anticuerpos de llama junto con los anticuerpos de referencia 280.346.TSY y AMR22 se muestran en la Figura 8.
La proliferación por IL-20 en Baf3-hIL22R/IL20Rb se probó en paralelo con el ensayo de proliferación por IL-22 de BW-hIL22R, permitiendo una buena comparación entre las dos citocinas. En la Tabla 14 se muestran los resultados de hasta tres experimentos independientes.
T l 14 P n i l n i r r l r l ñ liz i n IL-22 IL-2 r v IL22R
Figure imgf000044_0001
Se puede concluir que todos los anticuerpos de las familias n.° 1, n.° 4 y n.° 5 pudieron bloquear tanto IL-20 como IL 22. Es difícil comparar la potencia entre la proliferación estimulada por IL-22 e IL-20 debido a la diferencia de sensibilidad, que depende de la concentración de citocinas, del número de receptores y de la variación biológica intracelular. Sin embargo, se descubrió que la mayoría de los anticuerpos son más potentes para bloquear la señalización de IL-22 en comparación con el bloqueo de la de IL-20. La interesante excepción fue 157A2, que tiene la misma potencia para bloquear IL-22 e IL-20.
Ejemplo 10 Selección de anticuerpos destacados y modificaciones de estirpe germinal
La afinidad de los anticuerpos más interesantes (que neutralizan la señalización de IL22) se mejoró adicionalmente mediante el reordenamiento de cadenas ligeras. Durante el reordenamiento de cadenas ligeras, el VHCH1 del anticuerpo seleccionado se combina con la biblioteca de cadenas ligeras de la misma llama en la que se encontró el VHCH. A continuación, se realizan varias rondas de selección de presentación de fagos de constante de disociación para identificar las parejas VHCH:VLCL que tienen la mejor afinidad. En el caso del anticuerpo 166G8, se encontraron varios clones con cinética de unión mejorada, incluido 198A1, pero, desafortunadamente, este clon perdió la mayor parte de su reactividad cruzada con rhesus y, por lo tanto, 166G8 siguió siendo el candidato más atractivo de la familia n.° 5 para el desarrollo. En el caso de 157A2 (de la familia n.° 4), se identificaron varios Fab (por ejemplo, 218A7) con una afinidad mejorada en comparación con 157A2. Los siguientes anticuerpos se han escogido para un desarrollo posterior. Estos anticuerpos se seleccionaron en función de su potencia, su reactividad cruzada con especies y su epítopo o su modo de acción.
• 218A7 (una variante mejorada de 157A2, familia n.° 4) - se descubrió que este anticuerpo tiene muy buena potencia contra IL-22 e iL-20 (subnM), tiene reactividad cruzada con IL22R de primate no humano, pero no tiene reactividad cruzada con IL22R murino. Se descubrió que 157A2 tiene un epítopo en IL22R distinto pero solapante con el anticuerpo de referencia 280.346.TSY.
• 166G8 (familia n.° 5) - se descubrió que este anticuerpo tiene alta potencia (bajo pM) y tiene reactividad cruzada con algunas especies, ya que se une a IL22R de rhesus (pero no a IL22R de cinomolgo ni al murino).
Las características de los anticuerpos para IL22R escogidos se resumen a continuación en la Tabla 15.
Tabla 15 Características de los anticuerpos para IL22R de llama seleccionados para modificaciones de estir e erminal
Figure imgf000045_0001
Ejemplo 11 Modificaciones de estirpe germinal de los anticuerpos para IL-22R 218A7 y 166G8
Las modificaciones de estirpe germinal se llevaron a cabo como se describe en la solicitud de patente internacional n.° WO2011/080350, cuyo contenido se incorpora en el presente documento en su totalidad. Las CDR se mutaron para eliminar posibles modificaciones postraduccionales junto con determinadas otras posiciones, que se descubrió que varían en anticuerpos de las mismas familias de VH y VL con emparejamiento idéntico. Se evaluó la identidad de los dominios VH y VL de los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal producidos a partir de los anticuerpos de llama 218A7 y 166G8 con las secuencias humanas. También se realizó una comparación con el anticuerpo de referencia 280.346.TSY. Los resultados se muestran a continuación en la Tabla 16.
Tabla 16 Identidad humana de anticuerpos para IL-22R con modificaciones de estirpe germinal producidos a artir de 218A7 166G8
Figure imgf000045_0002
continuación
Figure imgf000046_0001
El anticuerpo 230C9 se seleccionó como una variante con modificaciones de estirpe germinal del anticuerpo 218A7, y el anticuerpo 223G5 se seleccionó como una variante con modificaciones de estirpe germinal del anticuerpo 166G8. Las secuencias de los dominios VH y VL de los anticuerpos 218A7, 230C9 y 223G5 se muestran a continuación en las Tablas 17-21. (Las secuencias de 166G8 se muestran en las Tablas 6-9 anteriores.)
Figure imgf000047_0001
Figure imgf000048_0001
Figure imgf000049_0001
Figure imgf000050_0001
Las porciones sombreadas de la secuencia representan las regiones constantes de las cadenas pesada y ligera. El resto "Q" que se muestra en negrita en la región constante de la cadena pesada representa una mutación de "N".
Figure imgf000052_0001
Ejemplo 12 Caracterización de los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal 230C9 y 223G5 12.1 Afinidad de unión de los mAb con modificaciones de estirpe germinal
La afinidad de los anticuerpos 230C9 y 223G5 se midió utilizando RPS (Biacore 300). En resumen, se recubrieron 250 UR de IL22R humano (Biotechne, 2770-LR) sobre un chip CM5 utilizando métodos convencionales (acoplamiento de EDC de IL22R a una concentración de 2 pg/ml en tampón acetato pH 4,5). A continuación, se inyectaron diversas concentraciones de anticuerpo en tampón HBSEP+ (pH 7,4) durante 2 minutos. La unión también se controló durante un lavado de 10 min (HBSEP+).
Las afinidades calculadas utilizando el programa informático BIAevaluation utilizando un ajuste Langmuir 1:1 se muestran a continuación en la Tabla 22.
Tabla 22 Afinidad de unión de anticuer os con modificaciones de estirpe germinal
Figure imgf000053_0003
-Los anticuerpos 223G5 y 224C4 (ambas variantes con modificaciones de estirpe germinal de 166G8) mostraron una afinidad muy alta para IL-22R (10-20 pM) mientras que el anticuerpo 230C9 tenía una afinidad de 0,13 nM. Todos los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal presentaron una mayor afinidad que el anticuerpo de referencia 280.346.TSY (0,69 nM)
Debido al potencial efecto de avidez que se observa cuando se utiliza una molécula bivalente como ligando durante la medición de la afinidad, se probó una configuración experimental inversa. En esta configuración, los anticuerpos se recubrieron a 250 UR utilizando métodos convencionales. Se añadió IL22R humano monomérico en distintas concentraciones, y las afinidades calculadas utilizando el programa informático BIAevaluation utilizando un ajuste Langmuir 1:1 se muestran a continuación en la Tabla 23.
Tabla 23 Afinidad de unión del 230C9 al IL-22R humano
Figure imgf000053_0002
Desafortunadamente, el anticuerpo 223G5 se inactivó mediante el procedimiento de recubrimiento y no se pudo determinar la afinidad utilizando esta configuración.
La afinidad de 230C9 es consistente independientemente de la configuración de la medición de la afinidad, mostrando que el bajo recubrimiento utilizado en ambas condiciones es suficiente para reducir cualquier efecto de avidez.
12.2 Inhibición de la activación y señalización de IL-22R1 dependiente de IL-22 e IL-20
Los anticuerpos 218A7 (sin modificaciones de estirpe germinal) y 230C9 (el equivalente con modificaciones de estirpe germinal) se probaron junto con otros anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal en cuanto a su capacidad para neutralizar la señalización mediada por IL-22 e IL-20 a través de IL-22R1. El análisis se realizó utilizando los ensayos de proliferación basados en células descritos en los Ejemplos 6 y 9.
La Figura 9A muestra la capacidad de 218A7 y 230C9 para neutralizar la activación de IL-22R1 dependiente de IL-22. La Figura 9B muestra la capacidad de diferentes lotes de 230C9 para neutralizar la activación de IL-22R1 dependiente de IL-20. Las potencias relativas de los anticuerpos analizados se muestran a continuación en las Tablas 24 y 25.
Tabla 24 Potencia de los anticuerpos 218A7 y 230C9 en el bloqueo de la señalización de IL-22 a través de IL22R línea celular^ BWhIL22R
Figure imgf000053_0001
continuación
Figure imgf000054_0002
Tabla 24 Potencia del anticuerpo 230C9 en el bloqueo de la señalización de IL-20 a través de IL22R (línea celular Baf3hIL22R/IL20Rb
Figure imgf000054_0001
12.3 Mapeo epitópico confirmatorio
El mapeo epitópico confirmatorio para los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal 230C9 y 223G5 se llevó a cabo mediante análisis de FACS, como se describe en el Ejemplo 8.2. Se descubrió que el anticuerpo 230C9 compite por la unión a IL-22R1 con el anticuerpo de referencia 280.346. TSY y también 223G5. El anticuerpo 223G5 no compitió por la unión a IL-22R1 con el anticuerpo de referencia 280.346. t Sy .
Los resultados del análisis de FACS se combinaron con los resultados de los ensayos de proliferación descritos anteriormente y las conclusiones con respecto a los epítopos se muestran en la Figura 10. Como se indica, se puede concluir que (i) el anticuerpo 230C9 se une a un epítopo distinto pero solapante en comparación con los epítopos a los que se une 280.346.TSY; y (ii) el anticuerpo 223G5 se une a un epítopo distinto que 280.346.TSY.
El análisis de FACS también se llevó a cabo como se describe en el Ejemplo 8.2 para estudiar la unión de los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal a varios mutantes de IL-22R. Los resultados se muestran a continuación en la Tabla 26.
Tabla 26 Unión de anticuer os a células ue ex resan mutantes de IL22R
Figure imgf000054_0003
Estos resultados confirman que los anticuerpos 230C9 y 223G5 se unen a un epítopo que no incluye una Y60. Se descubrió que la mutación A209D afectaba la unión de 223G5 mientras que la unión del anticuerpo de llama 166G8 no se vio afectada por este cambio. Esto es probablemente atribuible a las dificultades para detectar la sensibilidad de 166G8 a la mutación A209D (166G8 se probó solo una vez), y posiblemente atribuible a cambios leves en las secuencias de CDR durante las modificaciones de estirpe germinal de 166G8. Estos datos confirman que 280.346. TSY se une al D1 de IL22R, que 223G5 se une al D2 de IL22R y que 230C9 tiene un epítopo solapante pero distinto.
12.4 Reactividad cruzada con especies de anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal
El anticuerpo 230C9 se une a IL-22R humano, pero no presenta reactividad cruzada para IL-22R del ratón, rata y conejo. Esto es consistente con que 230C9 tiene un epítopo distinto en comparación con el anticuerpo de referencia 280.346. TSY - véase 12.3 arriba.
La capacidad de los anticuerpos para unirse a cyno-IL22R una vez expresados en células se probó haciendo construcciones quiméricas del dominio extracelular (ECD) de IL22R de las distintas especies fusionadas al transmembrana (TM) humano y los dominios intracelulares (ID, forma siglada de intracellular domain) humanos. Aunque la eficacia de la transfección transitoria no fue grande, el análisis de FACS mostró que el anticuerpo 230C9-N297Q, pero no el 223G5-N297Q, se unió al cynoIL22R_ECD-humanTM_humanICD como se observa por la presencia de un pico más amplio en el gráfico de FACS (véase la Figura 11 con las flechas que indican los picos más amplios).
Adicionalmente, cuando las construcciones quiméricas también se cotransfectaron con un gen indicador de STAT3 en células HEK, la actividad del IL22R después de la adición de IL22 humana pudo medirse en presencia o ausencia de anticuerpo neutralizante. Los resultados presentados a continuación en la tabla 27 muestran que todos los anticuerpos probados fueron capaces de neutralizar el IL22R humano y que solo los reactivos de forma cruzadas con primate (230C9 y 280.346.TSY) pudieron unirse y bloquear la actividad de las quimeras de cinomolgo y rhesus, lo que sugiere que estos anticuerpos serán funcionales en estudios con primates.
T l 27 R ivi r z n i r r IL-22R n IL-22R h m n rh in m l
Figure imgf000055_0001
12.5 Análisis de inmunogenicidad
La inmunogenicidad de los anticuerpos con modificaciones de estirpe germinal se evaluó utilizando herramientas de predicción. En particular, la presencia de péptidos inmunogénicos potenciales en los dominios variables se evaluó utilizando la plataforma Epibase™ de lonza (puntuación de DRB-1) utilizando la configuración "HLA class II -Caucasian v3.0". Esta plataforma analiza las especificidades de unión a HLA de todos los péptidos de 10 meros obtenidos de las secuencias de VH y VL. El perfil se realizó a nivel de alotipo para 15 DRB1,6 DRB3/4/5, 12 DQ y 7 DP, es decir, en total 40 receptores HLA de clase II. Se identificaron moléculas de unión a DRB1, DRB3/4/5 fuertes y intermedias, así como moléculas de unión a los epítopos DQ y DP fuertes. El recuento de epítopos se realizó por separado para las moléculas de unión a DRB1 de afinidad intermedia y fuerte. Los péptidos que se unen a múltiples alotipos del mismo grupo se contaron como uno. Se calculó una puntuación aproximada que expresaba un riesgo inmunogénico en el peor de los casos de la siguiente manera: Puntuación = q (recuento de epítopos x frecuencia de alotipos). En otras palabras, el número de epítopos que afectan a un alotipo de HLA particular se multiplica por la frecuencia alélica del alotipo afectado. Para una secuencia dada, los productos se sumaron para todos los alotipos de DRB1 utilizados en el estudio que están presentes en el 2 % o más de la población de raza blanca.
Los resultados se muestran a continuación en la Tabla 28.
Tabla 28 Puntuaciones de DRB1 para los anticuerpos para IL-22R con modificaciones de estirpe germinal en com aración con diversos otros anticuer os comerciales
Figure imgf000055_0002
Como puede observarse a partir de la tabla 28, el anticuerpo 230C9 tiene una puntuación de DRB1 muy baja, muy por debajo de otros anticuerpos comerciales, mientras que 223G5 tiene una puntuación de DRB1 baja comparable a otros anticuerpos humanos o humanizados disponibles en el mercado. Estos datos sugieren que 230C9 (y 223G5) tendrán un perfil de inmunogenicidad preferible.
Ejemplo 13 Estudio farmacocinético (PK) del anticuerpo 230C9-N297Q en monos cinomolgos
Se realizó un análisis farmacocinético del clon de anticuerpo 230C9. Se inyectaron por vía intravenosa dos monos cinomolgos una única dosis de anticuerpo de 10mg/kg durante 2 h. Se tomaron muestras en distintos puntos temporales y se analizaron en cuanto a la concentración plasmática de mAb mediante ELISA. Específicamente, se revistió una placa de microtitulación (Maxisorb Nunc) con hIL22R recombinante 2 pg/ml (Biotechne; cat 2770-LR) en PBS durante una noche a 4 °C. La placa se lavó 3 veces con PBS-Tween y se bloqueó durante 2 horas con 250 pl de PBS-caseína al 1 %. Después de 3 lavados con PBS-Tween, se aplicaron las muestras. Todas las diluciones se realizaron en plasma agrupado al 1 % (este es un agrupamiento de 3 monos cinomolgos sin tratamiento previo). Se dejó que las muestras se unieran durante 2 horas a TA. A continuación, las placas se lavaron 5 veces con PBS-Tween y se aplicaron anticuerpos policlonales adsorbidos en mono anti-cadena ligera y pesada de IgG humanas biotinilado de cabra acoplados a h Rp a una dilución de 50.000 veces (Bethyl, n.° de cat.: A80-319P) y se dejó que se uniera durante 1 hora a TA. Después, las placas se lavaron 5 veces con PBS-Tween y se añadió el debilitador s(HS) TMB (SDT, #sTMB-W). Se dejó que la tinción continuara durante 10 minutos y luego se detuvo con H2SO 1 N, después de lo cual se midió la densidad óptica a 450 nm. Las muestras se analizaron 3 veces y se utilizó 230C9-N297Q (del mismo lote que se inyectó en los animales) para una curva patrón.
Los parámetros PK de interés para un análisis del modelo de infusión i.v. de 2 compartimentos se muestran en la Tabla 29. Los perfiles farmacocinéticos para el anticuerpo 230C9-N297Q se muestran gráficamente en la Figura 12 (el resultado que se muestra es el resultado promedio de los dos monos). Estos datos muestran claramente que el anticuerpo tiene un tiempo medio de permanencia (TMP) largo. Curiosamente, aunque el anticuerpo contiene una región Fc de IgG1 no glucosilada sin ninguna modificación para mejorar la semivida, la semivida de 230C9-N297Q es sorprendentemente larga. Específicamente, 230C9-N297Q tiene una semivida de aproximadamente 19,4 días. Por tanto, la semivida prolongada de los anticuerpos de la invención parece deberse a las propiedades de las regiones Fab.
Tabla 29 Parámetros PK
Figure imgf000056_0002
Se llevó a cabo un estudio PK adicional en monos cinomolgos, administrando dosis únicas i.v. (0,1, 1,3, 10 y 30 mg/kg) de 230C9-N297Q a 10 monos en total. La cinética en los monos cinomolgos presentó una cinética no lineal de dos compartimentos. En dosis inferiores a 10 mg/kg, la depuración (CL) aumentó con la disminución de la dosis, lo que dio como resultado una disminución de la exposición (ABC) más que proporcional a la dosis con la disminución de las dosis. Este es un fenómeno bien conocido de los anticuerpos monoclonales (véanse la Tabla 30 y la Figura 13).
T l P r m r PK n 2 m n r i r i .
Figure imgf000056_0001
El cambio de escala de estos parámetros para predecir la farmacocinética de ser humano da como resultado un perfil humano similar al que se puede esperar en base a los hallazgos empíricos de otras moléculas de IgG1 humanas, incluyendo una estimación puntual de la semivida humana (T /) de aproximadamente 18 días de acuerdo con el estudio anterior informado anteriormente.
Ejemplo 14 Efectos farmacodinámicos (PD) del anticuerpo 230C9 N297Q en un mono cinomolgo
Se analizó el efecto farmacodinámico del anticuerpo 230C9 N297Q (ARGX-112) en un mono cinomolgo administrándolo al mono mediante inyección i.v. de 230C9 a distintas dosis (0,3, 1, 3, 10, 30 mg/kg). Además, se trató un corte de piel del mono con imiquimod (IMQ) para evaluar los efectos de 230C9 N297Q sobre la inflamación de la piel. Se ha informado que IMQ induce inflamación de la piel en ratones (Van Belle et al. 2012, J Immunol. 1 de enero; 188(1):462-9), y un informe también demuestra efectos similares en primates no humanos (Poirier et al, 2016, Exp Dermatol. Mar;25(3):233-4; Poirier et al, 2016, J Immunol. 1 de enero; 196(1):274-83) y en ser humano (Vinter et al, 2015, Br J Dermatol. feb; 172(2):345-53).
Después de 5 días de tratamiento con IMQ, se tomó una biopsia de un área de piel no tratada con IMQ y del área de piel tratada con IMQ para evaluar los efectos de 230C9 N297Q sobre los efectos inducidos por IMQ. Los efectos se evaluaron comparando el grosor epidérmico y la frecuencia de la de núcleos en proliferación en la epidermis (frecuencia de Ki67), y los resultados se muestran en la Figura 14. Las dosis crecientes de anticuerpo 230C9 N297Q pudieron normalizar el grosor epidérmico (Fig. 14A) y reducir la frecuencia de núcleos positivos para Ki67 (Fig. 14B). La CE50 fue de aproximadamente 3 mg/kg.
Ejemplo 15 Relación de la respuesta PK sérica y PD del explante de piel después de una única infusión i.v. de 230C9 N297Q en monos cinomolgos
Se investigó la interacción con la diana en piel en monos cinomolgos a los que se les administró una única infusión intravenosa de 15 minutos (5 ml/kg) de anticuerpo 230C9 N297Q. Cinco monos hembras se dejaron sin tratar o se expusieron a 230C9 1, 5 o 30 mg/kg el día 1 de la prueba (tres animales por grupo). Se recogió sangre de todos los animales dosificados (3 x 150 pl) en distintos puntos temporales y se extrajo la última muestra el día 7. Las muestras

Claims (12)

REIVINDICACIONES
1. Un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo que se une a IL-22R, donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo comprende un dominio variable de cadena pesada y un dominio variable de cadena ligera y donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno comprende una combinación de secuencias de CDR de cadena pesada variable: HCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 6; HCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 36; y HCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 34, y una combinación de secuencias de CDR de cadena ligera variable: LCDR3 que comprende la SEQ ID NO: 54; LCDR2 que comprende la SEQ ID NO: 47; y LCDR1 que comprende la SEQ ID NO: 16.
2. El anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de la reivindicación 1, donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo comprende una combinación de un dominio variable de cadena pesada (VH) y un dominio variable de cadena ligera (VL) seleccionado de lo siguiente: un VH que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 63 o una secuencia de aminoácidos al menos el 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % idéntica a la misma y un VL que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 64 o una secuencia de aminoácidos al menos el 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % idéntica a la misma.
3. Un anticuerpo de acuerdo con la reivindicación 1 que comprende al menos una cadena pesada y al menos una cadena ligera seleccionada de lo siguiente: una cadena pesada que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 67 o una secuencia de aminoácidos al menos el 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % idéntica a la misma y una cadena ligera que comprende la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 68 o una secuencia de aminoácidos al menos el 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % idéntica a la misma.
4. El anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de cualquiera de las reivindicaciones 1-3 que contiene la región bisagra, el dominio CH2 y/o el dominio CH3 de una IgG humana.
5. Un anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-4 que presenta una alta homología con una IgG humana, preferentemente IgG1.
6. Un polinucleótido aislado que codifica el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-5.
7. Un vector de expresión que comprende el polinucleótido de la reivindicación 6 unido operativamente a secuencias reguladoras que permiten la expresión del anticuerpo, el fragmento de unión a antígeno, el dominio de cadena pesada variable o el dominio de cadena ligera variable en una célula hospedadora o sistema de expresión sin células.
8. Una célula hospedadora o un sistema de expresión sin células que contiene el vector de expresión de la reivindicación 7.
9. Un método de producción de un anticuerpo recombinante o fragmento de unión a antígeno del mismo que comprende cultivar la célula hospedadora o el sistema de expresión sin células de la reivindicación 8 en condiciones que permiten la expresión del anticuerpo o fragmento de unión a antígeno y recuperar el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno expresado.
10. Una composición farmacéutica que comprende un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 y al menos un transportador o excipiente farmacéuticamente aceptable.
11. Un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-5 o una composición farmacéutica de acuerdo con la reivindicación 10 para su uso como medicamento.
12. Un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-5 o una composición farmacéutica de acuerdo con la reivindicación 10 para su uso en el tratamiento o profilaxis de la psoriasis, la artritis psoriásica o la dermatitis atópica.
ES17746011T 2016-07-15 2017-07-14 Anticuerpos anti-IL-22R Active ES2903412T3 (es)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GBGB1612337.4A GB201612337D0 (en) 2016-07-15 2016-07-15 Ant-il-22r antibodies
PCT/EP2017/067923 WO2018011420A1 (en) 2016-07-15 2017-07-14 Anti-il-22r antibodies

Publications (1)

Publication Number Publication Date
ES2903412T3 true ES2903412T3 (es) 2022-04-01

Family

ID=56890507

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
ES17746011T Active ES2903412T3 (es) 2016-07-15 2017-07-14 Anticuerpos anti-IL-22R

Country Status (27)

Country Link
US (4) US10696741B2 (es)
EP (2) EP4023674A3 (es)
JP (1) JP7163275B2 (es)
KR (2) KR20230128137A (es)
CN (1) CN109641966B (es)
AU (1) AU2017296094B2 (es)
BR (1) BR112019000788A2 (es)
CA (1) CA3024370A1 (es)
CY (1) CY1125041T1 (es)
DK (1) DK3484921T3 (es)
ES (1) ES2903412T3 (es)
GB (1) GB201612337D0 (es)
HR (1) HRP20220197T1 (es)
HU (1) HUE057615T2 (es)
IL (1) IL264262B2 (es)
LT (1) LT3484921T (es)
MX (1) MX2019000539A (es)
MY (1) MY197821A (es)
PL (1) PL3484921T3 (es)
PT (1) PT3484921T (es)
RS (1) RS62884B1 (es)
RU (1) RU2758721C2 (es)
SA (1) SA519400856B1 (es)
SG (1) SG11201900128XA (es)
SI (1) SI3484921T1 (es)
UA (1) UA125585C2 (es)
WO (1) WO2018011420A1 (es)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB201612337D0 (en) 2016-07-15 2016-08-31 Argen-X N V Ant-il-22r antibodies
JP7473977B2 (ja) * 2018-06-05 2024-04-24 バイオアトラ インコーポレイテッド 抗il22抗体、抗体断片およびそれらの免疫コンジュゲートならびにそれらの使用
CN110302363B (zh) * 2019-07-04 2020-10-09 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) Il-22作为制备治疗pcos药物的应用及药物制剂
EP4531804A1 (en) 2022-06-03 2025-04-09 LEO Pharma A/S Liquid formulation of il-22r antibody
WO2024184333A1 (en) 2023-03-08 2024-09-12 Leo Pharma A/S Il-22r antibody for use in treating atopic dermatitis

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5892019A (en) 1987-07-15 1999-04-06 The United States Of America, As Represented By The Department Of Health And Human Services Production of a single-gene-encoded immunoglobulin
KR20050116390A (ko) * 2003-03-24 2005-12-12 지모제넥틱스, 인코포레이티드 항-il-20 항체 및 결합 파트너 그리고 염증에서의사용방법
AU2005299809B2 (en) * 2004-10-22 2010-12-02 Zymogenetics, Inc. Anti-IL-22RA antibodies and binding partners and methods of using in inflammation
JP2009518314A (ja) * 2005-12-02 2009-05-07 ジェネンテック・インコーポレーテッド Il−22に結合する抗体およびil−22rに結合する抗体を含む、サイトカインシグナリングに関連する疾患および障害の処置のための組成物および方法
GB2461546B (en) 2008-07-02 2010-07-07 Argen X Bv Antigen binding polypeptides
UA105405C2 (ru) * 2009-11-19 2014-05-12 Мерк Сероно С.А. Гуманизированное антитело против человеческого il-22ra
GB2476681B (en) 2010-01-04 2012-04-04 Argen X Bv Humanized camelid VH, VK and VL immunoglobulin domains
GB2504139B (en) * 2012-07-20 2014-12-31 Argen X Bv Antibodies to highly conserved targets produced by the immunisation of Camelidae species
US9573996B2 (en) * 2011-12-16 2017-02-21 Synthon Biopharmaceuticals B.V. Monoclonal antibodies to human proinflammatory cytokines and methods for treating inflammatory diseases
CA2878712A1 (en) * 2012-08-31 2014-03-06 arGEN-X BV Method for producing antibody molecules having inter-species, intra-target cross-reactivity
WO2014133728A2 (en) * 2013-03-01 2014-09-04 Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University Hhla2 as a novel inhibitor of human immune system and uses thereof
CN105601739B (zh) * 2016-02-22 2019-01-18 王晨辉 一种人源化抗白介素22基因工程抗体及其应用
GB201612337D0 (en) 2016-07-15 2016-08-31 Argen-X N V Ant-il-22r antibodies

Also Published As

Publication number Publication date
IL264262A (en) 2019-02-28
US20190127459A1 (en) 2019-05-02
JP2019528046A (ja) 2019-10-10
EP3484921A1 (en) 2019-05-22
IL264262B2 (en) 2024-11-01
PT3484921T (pt) 2022-01-26
CA3024370A1 (en) 2018-01-18
AU2017296094A1 (en) 2018-12-13
WO2018011420A1 (en) 2018-01-18
KR20230128137A (ko) 2023-09-01
IL264262B1 (en) 2024-07-01
HRP20220197T1 (hr) 2022-04-29
GB201612337D0 (en) 2016-08-31
RS62884B1 (sr) 2022-03-31
MY197821A (en) 2023-07-18
SI3484921T1 (sl) 2022-02-28
US11447544B2 (en) 2022-09-20
US20200216528A1 (en) 2020-07-09
US20200157207A1 (en) 2020-05-21
JP7163275B2 (ja) 2022-10-31
PL3484921T3 (pl) 2022-03-28
US20230088269A1 (en) 2023-03-23
HUE057615T2 (hu) 2022-05-28
RU2019103991A (ru) 2020-08-17
SA519400856B1 (ar) 2022-10-25
CY1125041T1 (el) 2023-03-24
BR112019000788A2 (pt) 2019-07-02
EP3484921B1 (en) 2021-11-17
KR102571012B1 (ko) 2023-08-24
CN109641966B (zh) 2022-08-23
EP4023674A2 (en) 2022-07-06
RU2758721C2 (ru) 2021-11-01
LT3484921T (lt) 2022-01-10
RU2019103991A3 (es) 2021-04-29
KR20190026766A (ko) 2019-03-13
SG11201900128XA (en) 2019-02-27
MX2019000539A (es) 2019-10-04
UA125585C2 (uk) 2022-04-27
CN109641966A (zh) 2019-04-16
AU2017296094B2 (en) 2024-02-01
DK3484921T3 (da) 2022-02-07
EP4023674A3 (en) 2022-10-05
US10696741B2 (en) 2020-06-30
US11261246B2 (en) 2022-03-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2594493T3 (es) Anticuerpos anti-c-Met
ES2903412T3 (es) Anticuerpos anti-IL-22R
TWI797609B (zh) 抗pd-1和pd-l1的四價雙特異性抗體
KR102598319B1 (ko) 항-il-25 항체 및 그의 용도
JP7256266B2 (ja) ヒトIL-1βに結合する抗体、その調製方法及び用途
WO2023030511A1 (en) Bi-functional fusion protein and uses thereof
CN119365488A (zh) 抗bdca2抗体及其用途
CN111787980B (zh) 非酒精性脂肪性肝炎的抗huTNFR1疗法
WO2024094017A1 (zh) 一种针对磷脂酰肌醇蛋白聚糖3的双特异性抗体及其应用
US20240343799A1 (en) ANTI-CD79BxCD3 BISPECIFIC ANTIBODY AND USE THEREOF
CN119301153A (zh) 结合il-17a和il-17f的抗体分子及其应用