ES2548980T3 - Neural viability factor and its use - Google Patents
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Abstract
Un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos indicada en la SEC ID Nº 4.A polypeptide comprising the amino acid sequence indicated in SEQ ID NO: 4.
Description
5 5
15 fifteen
25 25
35 35
45 Four. Five
55 55
65 65
E09782880 E09782880
30-09-2015 09-30-2015
puntual discreta o truncamiento. Spot discrete or truncation.
Los polipéptidos de la invención pueden presentar modificaciones postraduccionales incluyendo, pero sin limitación, glicosilaciones (por ejemplo, N- u O-glicosilaciones), miristilaciones, palmitilaciones, acetilaciones y fosforilaciones (por ejemplo, serina/treonina o tirosina). The polypeptides of the invention may have post-translational modifications including, but not limited to, glycosylations (for example, N- or O-glycosylations), myristylations, palmitylations, acetylations and phosphorylations (for example, serine / threonine or tyrosine).
Los polipéptidos de la invención pueden producirse por cualquier técnica conocida per se en este campo, tal como, sin limitación, cualquier técnica química, biológica, genética o enzimática, sola o en combinación. The polypeptides of the invention can be produced by any technique known per se in this field, such as, without limitation, any chemical, biological, genetic or enzymatic technique, alone or in combination.
Conociendo la secuencia de aminoácidos de la secuencia deseada, un experto en la materia puede producir fácilmente dichos polipéptidos mediante técnicas convencionales para la producción de polipéptidos. Por ejemplo, pueden sintetizarse usando métodos en fase sólida bien conocidos, preferentemente usando un aparato de síntesis de péptidos disponible en el mercado (tal como el fabricado por Applied Biosystems, Foster City, California) y siguiendo las instrucciones del fabricante. By knowing the amino acid sequence of the desired sequence, one skilled in the art can easily produce said polypeptides by conventional techniques for the production of polypeptides. For example, they can be synthesized using well-known solid phase methods, preferably using a commercially available peptide synthesis apparatus (such as that manufactured by Applied Biosystems, Foster City, California) and following the manufacturer's instructions.
Como alternativa, los polipéptidos de la invención pueden sintetizarse por técnicas de ADN recombinante como es bien conocido en la técnica. Por ejemplo, estos fragmentos pueden obtenerse como productos de expresión de ADN después de la incorporación de secuencias de ADN que codifican el polipéptido deseado en vectores de expresión y de la introducción de dichos vectores en hospedadores eucariotas o procariotas adecuados que expresarán el polipéptido deseado, a partir del cual pueden aislarse posteriormente usando técnicas bien conocidas. Alternatively, the polypeptides of the invention can be synthesized by recombinant DNA techniques as is well known in the art. For example, these fragments can be obtained as DNA expression products after the incorporation of DNA sequences encoding the desired polypeptide into expression vectors and the introduction of said vectors into suitable eukaryotic or prokaryotic hosts that will express the desired polypeptide, to from which they can be subsequently isolated using well known techniques.
Los polipéptidos de la invención pueden usarse en una forma aislada (por ejemplo, purificada) o están incluidos en un vector, tal como una vesícula de membrana o de lípidos (por ejemplo, un liposoma). The polypeptides of the invention can be used in an isolated form (for example, purified) or are included in a vector, such as a membrane or lipid vesicle (for example, a liposome).
Moléculas de ácido nucleico de la invención Nucleic acid molecules of the invention
Un aspecto de la invención se refiere a moléculas de ácido nucleico aisladas que codifican un polipéptido de la invención, así como a moléculas de ácido nucleico suficientes para usarse como sondas de hibridación para identificar moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido de la invención y a fragmentos de dichas moléculas de ácido nucleico adecuados para usarse como cebadores de PCR para la amplificación o mutación de moléculas de ácido nucleico. One aspect of the invention relates to isolated nucleic acid molecules encoding a polypeptide of the invention, as well as to nucleic acid molecules sufficient to be used as hybridization probes to identify nucleic acid molecules encoding a polypeptide of the invention and fragments. of said nucleic acid molecules suitable for use as PCR primers for amplification or mutation of nucleic acid molecules.
La invención también se refiere a una molécula de ácido nucleico aislada que codifica un polipéptido de la invención. The invention also relates to an isolated nucleic acid molecule encoding a polypeptide of the invention.
En una realización particular, la invención se refiere a una molécula de ácido nucleico aislada que tiene la secuencia de nucleótidos indicada en la SEC ID Nº 5. In a particular embodiment, the invention relates to an isolated nucleic acid molecule having the nucleotide sequence indicated in SEQ ID NO: 5.
Una molécula de ácido nucleico de la presente invención puede aislarse usando técnicas de biología molecular convencionales y la información de secuencia proporcionada en el presente documento. Usando todo o una parte de las secuencias de ácido nucleico de la invención como sonda de hibridación, las moléculas de ácido nucleico de la invención pueden aislarse usando técnicas de hibridación y clonación convencionales (por ejemplo, como se describe en Sambrook et al., eds., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989). A nucleic acid molecule of the present invention can be isolated using conventional molecular biology techniques and the sequence information provided herein. Using all or a part of the nucleic acid sequences of the invention as a hybridization probe, the nucleic acid molecules of the invention can be isolated using conventional hybridization and cloning techniques (for example, as described in Sambrook et al., Eds ., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989).
Una molécula de ácido nucleico de la invención puede amplificarse usando ADNc, ARNm o ADN genómico como molde y cebadores oligonucleotídicos apropiados de acuerdo con… convencionales A nucleic acid molecule of the invention can be amplified using cDNA, mRNA or genomic DNA as a template and appropriate oligonucleotide primers in accordance with ... conventional
El ácido nucleico amplificado de esta manera puede clonarse en un vector apropiado y caracterizarse por análisis de la secuencia de ADN. Además, pueden prepararse oligonucleótidos correspondientes a todo o a parte de una molécula de ácido nucleico de la invención por técnicas de síntesis convencionales, por ejemplo, usando un sintetizador de ADN automático. The nucleic acid amplified in this way can be cloned into an appropriate vector and characterized by DNA sequence analysis. In addition, oligonucleotides corresponding to all or part of a nucleic acid molecule of the invention can be prepared by conventional synthesis techniques, for example, using an automatic DNA synthesizer.
En otra realización preferida, una molécula de ácido nucleico aislada de la invención comprende una molécula de ácido nucleico que es un complemento de la secuencia de nucleótidos de la SEC ID Nº 5. Una molécula de ácido nucleico que es complementaria a una secuencia de nucleótidos dada es una que es suficientemente complementaria a la secuencia de nucleótidos dada como para hibridar con la secuencia de nucleótidos dada formando de esta manera un dúplex estable. In another preferred embodiment, an isolated nucleic acid molecule of the invention comprises a nucleic acid molecule that is a complement to the nucleotide sequence of SEQ ID NO. 5. A nucleic acid molecule that is complementary to a given nucleotide sequence. it is one that is sufficiently complementary to the given nucleotide sequence to hybridize with the given nucleotide sequence thus forming a stable duplex.
Además, la molécula de ácido nucleico de la invención puede comprender únicamente una parte de una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido de la invención, por ejemplo, un fragmento que puede usarse como sonda o cebador o un fragmento que codifica una parte biológicamente activa de un polipéptido de la invención. La secuencia de nucleótidos determinada por la clonación de un gen permite la generación de sondas y cebadores diseñados para usarse en la identificación y/o clonación de homólogos en otros tipos celulares, por ejemplo, procedentes de otros tejidos, así como homólogos de otros mamíferos. La sonda/cebador típicamente comprende oligonucleótidos sustancialmente purificados. In addition, the nucleic acid molecule of the invention may comprise only a part of a nucleic acid sequence encoding a polypeptide of the invention, for example, a fragment that can be used as a probe or primer or a fragment encoding a biologically active part. of a polypeptide of the invention. The nucleotide sequence determined by the cloning of a gene allows the generation of probes and primers designed for use in the identification and / or cloning of homologs in other cell types, for example, from other tissues, as well as homologs of other mammals. The probe / primer typically comprises substantially purified oligonucleotides.
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tirosina, cisteína), cadenas laterales no polares (por ejemplo, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina, triptófano), cadenas laterales ramificadas en beta (por ejemplo, treonina, valina, isoleucina) y cadenas laterales aromáticas (por ejemplo, tirosina, fenilalanina, triptófano, histidina). Como alternativa, pueden introducirse mutaciones aleatoriamente a lo largo de toda o parte de la secuencia codificante, tal como por mutagénesis de saturación y en los mutantes resultantes pueden explorarse la actividad biológica para identificar mutantes que conserven la actividad. tyrosine, cysteine), non-polar side chains (e.g., alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine, tryptophan), branched beta side chains (e.g. threonine, valine, isoleucine) and aromatic side chains ( for example, tyrosine, phenylalanine, tryptophan, histidine). Alternatively, mutations may be introduced randomly throughout all or part of the coding sequence, such as by saturation mutagenesis and in the resulting mutants biological activity can be explored to identify mutants that retain the activity.
Después de la mutagénesis, la proteína codificada puede expresarse de forma recombinante y puede determinarse la actividad de la proteína. After mutagenesis, the encoded protein can be expressed recombinantly and the activity of the protein can be determined.
En una realización preferida, un polipéptido mutante que es una variante de la invención puede ensayarse con respecto a su capacidad de presentar actividad de rescate de neuronas. In a preferred embodiment, a mutant polypeptide that is a variant of the invention can be tested for its ability to exhibit neuron rescue activity.
La presente invención incluye moléculas de ácido nucleico antisentido, es decir, moléculas que son complementarias a un ácido nucleico con sentido que codifica un polipéptido de la invención, por ejemplo, complementarias a la cadena codificante de una molécula de ADNc bicatenaria o complementarias a una secuencia de ARNm. El ácido nucleico antisentido puede ser complementario a una cadena codificante entera, o solo a una parte de la misma, por ejemplo, todo o parte de la región codificante de la proteína (o fase de lectura abierta). Una molécula de ácido nucleico puede ser antisentido a todo o parte de una región no codificante de la cadena codificante de una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido de la invención. Las regiones no codificantes (“regiones 5’ y 3’ no traducidas") son las secuencias 5’ y 3’ que flanquean la región codificante y no se traducen en aminoácidos. The present invention includes antisense nucleic acid molecules, that is, molecules that are complementary to a sense nucleic acid encoding a polypeptide of the invention, for example, complementary to the coding chain of a double stranded cDNA molecule or complementary to a sequence. mRNA The antisense nucleic acid may be complementary to an entire coding chain, or only a part thereof, for example, all or part of the protein coding region (or open reading phase). A nucleic acid molecule can be antisense to all or part of a non-coding region of the coding chain of a nucleotide sequence encoding a polypeptide of the invention. The non-coding regions ("5’ and 3 ’untranslated regions") are the 5 ’and 3’ sequences that flank the coding region and do not translate into amino acids.
Un oligonucleótido antisentido puede ser, por ejemplo, de aproximadamente 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 o 50 nucleótidos o más de longitud. Un ácido nucleico antisentido de la invención puede construirse usando reacciones de síntesis química y ligamiento enzimático usando procedimientos conocidos en la técnica. Por ejemplo, un ácido nucleico antisentido (por ejemplo, un oligonucleótido antisentido) puede sintetizarse químicamente usando nucleótidos naturales o nucleótidos modificados de diversa forma diseñados para aumentar la estabilidad biológica de las moléculas o para aumentar la estabilidad física del dúplex formado entre los ácidos nucleicos antisentido y con sentido, por ejemplo, derivados de fosforotioato y nucleótidos sustituidos con acridina. Los ejemplos de nucleótidos modificados que pueden usarse para generar el ácido nucleico antisentido incluyen 5-fluorouracilo, 5bromouracilo, 5-clorouracilo, 5-yodouracilo, hipoxantina, xantina, 4-acetilcitosina, 5-(carboxihidroxilmetilo)uracilo, 5carboximetilaminometil-2-tiouridina, 5-carboximetilaminometiluracilo, dihidrouracilo, beta-D-galactosilqueosina, inosina, N6-isopenteniladenina, 1-metilguanina, 1-metilinosina, 2,2-dimetilguanina, 2-metiladenina, 2-metilguanina, 3metilcitosina, 5-metilcitosina, N6-adenina, 7-metilguanina, 5-metilaminometiluracilo, 5-metoxiaminometil-2-tiouracilo, beta-D-manosilqueosina, 5’-metoxicarboximetiluracilo, 5-metoxiuracilo, 2-metiltio-N6-isopenteniladenina, ácido uracil5-oxiacético (v), wibutoxosina, pseudouracilo, queosina, 2-tiocitosina, 5-metil-2-tiouracilo, 2-tiouracilo, 4-tiouracilo, 5metiluracilo, metiléster del ácido uracil-5-oxiacético, ácido uracil-5-oxiacético (v), 5-metil-2-tiouracilo, 3-(3-amino-3-N2-carboxipropil)uracilo, (acp3)w y 2,6-diaminopurina. Como alternativa, el ácido nucleico antisentido puede producirse biológicamente usando un vector de expresión dentro del cual se ha subclonado un ácido nucleico en una orientación antisentido (es decir, el ARN transcrito a partir del ácido nucleico insertado tendrá una orientación antisentido con respecto a un ácido nucleico diana de interés descrito adicionalmente en la siguiente subsección). An antisense oligonucleotide can be, for example, about 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 or 50 nucleotides or more in length. An antisense nucleic acid of the invention can be constructed using chemical synthesis reactions and enzymatic ligation using methods known in the art. For example, an antisense nucleic acid (for example, an antisense oligonucleotide) can be chemically synthesized using natural nucleotides or differently modified nucleotides designed to increase the biological stability of the molecules or to increase the physical stability of the duplex formed between the antisense nucleic acids. and with sense, for example, phosphorothioate derivatives and acridine substituted nucleotides. Examples of modified nucleotides that can be used to generate the antisense nucleic acid include 5-fluorouracil, 5bromouracil, 5-chlorouracil, 5-iodouracil, hypoxanthine, xanthine, 4-acetylcytosine, 5- (carboxyhydroxymethyl) uracil, 5-carboxymethylaminomethyl 5-carboxymethylaminomethyluracil, dihydrouracil, beta-D-galactosylkeosine, inosine, N6-isopentenyladenine, 1-methylguanine, 1-methylinosine, 2,2-dimethylguanine, 2-methyladenine, 2-methylguanine, 3methylcytosine, 5-methylcytosine, N-6-adenytosine 7-methylguanine, 5-methylaminomethyluracil, 5-methoxyaminomethyl-2-thiouracil, beta-D-mannosylkeosine, 5'-methoxycarboxymethyluracil, 5-methoxyuracil, 2-methylthio-N6-isopentenyladenine, uracil5-oxyacetic acid (v), poucyloxyl (v) , cheosin, 2-thiocytosine, 5-methyl-2-thiouracil, 2-thiouracil, 4-thiouracil, 5-methyluracil, methyl ester of uracil-5-oxyacetic acid, uracil-5-oxyacetic acid (v), 5-methyl-2- thiouracil, 3- (3-amino-3-N2-carboxypropyl) uracil, (acp 3) w and 2,6-diaminopurine. Alternatively, the antisense nucleic acid can be produced biologically using an expression vector into which a nucleic acid has been subcloned in an antisense orientation (i.e., the RNA transcribed from the inserted nucleic acid will have an antisense orientation with respect to an acid target nucleic of interest further described in the following subsection).
Vectores de expresión recombinante y células hospedadoras: Recombinant expression vectors and host cells:
Otro aspecto de la invención se refiere a vectores, preferentemente vectores de expresión que contienen un ácido nucleico que codifica un polipéptido de la invención (o una parte del mismo). Another aspect of the invention relates to vectors, preferably expression vectors containing a nucleic acid encoding a polypeptide of the invention (or a part thereof).
Como se usa en el presente documento, el término “vector” se refiere a una molécula de ácido nucleico capaz de transportar otro ácido nucleico al que se ha unido. Un tipo de vector es un “plásmido”, que se refiere a un bucle de ADN bicatenario circular al que pueden ligarse segmentos de ADN adicionales. Otro tipo de vector es un vector viral, donde pueden ligarse segmentos de ADN adicionales al genoma viral. Ciertos vectores son capaces de replicarse de forma autónoma en una célula hospedadora en la que se introducen (por ejemplo, vectores bacterianos que tienen un origen de replicación bacteriano y vectores episomales de mamífero). Otros vectores (por ejemplo, vectores no episomales de mamífero) se integran en el genoma de una célula hospedadora tras la introducción en la célula hospedadora y, por lo tanto, se replican junto con el genoma del hospedador. Además, ciertos vectores, los vectores de expresión, son capaces de dirigir la expresión de genes a los que están unidos operativamente. En general, los vectores de expresión de utilidad en las técnicas de ADN recombinante con frecuencia están en forma de plásmidos (vectores). Sin embargo, la invención pretende incluir otras formas de vectores de expresión tales como vectores virales (por ejemplo, retrovirus con defectos en la replicación, adenovirus y virus adenoasociados), que tienen funciones equivalentes. As used herein, the term "vector" refers to a nucleic acid molecule capable of transporting another nucleic acid to which it has been linked. One type of vector is a "plasmid", which refers to a circular double stranded DNA loop to which additional DNA segments can be linked. Another type of vector is a viral vector, where additional DNA segments can be linked to the viral genome. Certain vectors are capable of replicating autonomously in a host cell into which they are introduced (for example, bacterial vectors having an origin of bacterial replication and mammalian episomal vectors). Other vectors (eg, non-episomal mammalian vectors) are integrated into the genome of a host cell after introduction into the host cell and, therefore, replicated together with the host genome. In addition, certain vectors, the expression vectors, are capable of directing the expression of genes to which they are operatively linked. In general, expression vectors useful in recombinant DNA techniques are often in the form of plasmids (vectors). However, the invention is intended to include other forms of expression vectors such as viral vectors (eg, retroviruses with replication defects, adenoviruses and adeno-associated viruses), which have equivalent functions.
Los vectores de expresión recombinantes de la invención comprenden un ácido nucleico de la invención en una forma adecuada para la expresión del ácido nucleico en una célula hospedadora. Esto significa que los vectores de expresión recombinantes incluyen una o más secuencias reguladoras, seleccionadas basándose en las células hospedadoras a usar para la expresión, que están unidas operativamente a la secuencia de ácido nucleico a expresar. Dentro de un vector de expresión recombinante, se entiende que “unido operativamente” significa que la The recombinant expression vectors of the invention comprise a nucleic acid of the invention in a form suitable for the expression of the nucleic acid in a host cell. This means that the recombinant expression vectors include one or more regulatory sequences, selected based on the host cells to be used for expression, that are operably linked to the nucleic acid sequence to be expressed. Within a recombinant expression vector, it is understood that "operably linked" means that the
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forma que esté unido operativamente con y active la expresión de genes endógenos, usando técnicas, tales como recombinación homóloga dirigida, que son bien conocidas por los expertos en la materia, y se describen, por ejemplo en Chappel, Patente de Estados Unidos Nº 5.272.071; publicación PCT Nº WO 91/06667, publicado el 16 de mayo de 1991. so that it is operatively linked to and activates the expression of endogenous genes, using techniques, such as homologously directed recombination, which are well known to those skilled in the art, and are described, for example in Chappel, US Patent No. 5,272. 071; PCT Publication No. WO 91/06667, published May 16, 1991.
Para producir un polipéptido de la invención puede usarse una célula hospedadora de la invención, tal como una célula hospedadora procariota o eucariota en cultivo. Por consiguiente, la invención proporciona además métodos para producir un polipéptido de la invención usando las células hospedadoras de la invención. En una realización, el método comprende cultivar la célula hospedadora de la invención (en la que se ha introducido un vector de expresión recombinante que codifica un polipéptido de la invención) en un medio adecuado de tal forma que se produzca el polipéptido. En otra realización, el método comprende además aislar el polipéptido del medio o la célula hospedadora. To produce a polypeptide of the invention a host cell of the invention can be used, such as a prokaryotic or eukaryotic host cell in culture. Accordingly, the invention further provides methods for producing a polypeptide of the invention using the host cells of the invention. In one embodiment, the method comprises culturing the host cell of the invention (into which a recombinant expression vector encoding a polypeptide of the invention has been introduced) in a suitable medium such that the polypeptide is produced. In another embodiment, the method further comprises isolating the polypeptide from the medium or the host cell.
La presente invención también se refiere a un método para producir una célula hospedadora recombinante que expresa un polipéptido de acuerdo con la invención, comprendiendo dicho método las etapas que consisten en: (i) introducir in vitro o ex vivo un ácido nucleico recombinante o un vector como se ha descrito anteriormente en una célula hospedadora competente, (ii) cultivar in vitro o ex vivo la célula hospedadora recombinante obtenida y (iii), opcionalmente, seleccionar las células que expresan y/o secretan dicho polipéptido. Dichas células hospedadoras recombinantes pueden usarse para la producción de polipéptidos de acuerdo con la presente invención, como se ha descrito previamente. The present invention also relates to a method for producing a recombinant host cell that expresses a polypeptide according to the invention, said method comprising the steps consisting of: (i) introducing in vitro or ex vivo a recombinant nucleic acid or a vector as described above in a competent host cell, (ii) culturing in vitro or ex vivo the obtained recombinant host cell and (iii), optionally, selecting the cells that express and / or secrete said polypeptide. Such recombinant host cells can be used for the production of polypeptides according to the present invention, as previously described.
La invención se refiere además a un método para producir un polipéptido de acuerdo con la invención, comprendiendo dicho método las etapas que consisten en: (i) cultivar una célula hospedadora transformada de acuerdo con la invención en condiciones adecuadas para permitir la expresión de dicho polipéptido; y (ii) recuperar el polipéptido expresado. The invention further relates to a method for producing a polypeptide according to the invention, said method comprising the steps consisting of: (i) culturing a host cell transformed according to the invention under conditions suitable to allow the expression of said polypeptide ; and (ii) recover the expressed polypeptide.
Las células hospedadoras de la invención también pueden usarse para producir animales transgénicos no humanos. Por ejemplo, en una realización, una célula hospedadora de la invención es un oocito fertilizado o una célula madre embrionaria en la que se ha introducido una secuencia que codifica un polipéptido de la invención. Después, dichas células hospedadoras pueden usarse para crear animales transgénicos no humanos en los que se han introducido secuencias exógenas que codifican un polipéptido de la invención en su genoma o animales recombinantes homólogos en los que se han alterado secuencias endógenas que codifican un polipéptido de la invención. Dichos animales son útiles para estudiar la función y/o actividad del polipéptido y para identificar y/o evaluar moduladores de la actividad del polipéptido. The host cells of the invention can also be used to produce non-human transgenic animals. For example, in one embodiment, a host cell of the invention is a fertilized oocyte or an embryonic stem cell into which a sequence encoding a polypeptide of the invention has been introduced. Then, said host cells can be used to create non-human transgenic animals in which exogenous sequences encoding a polypeptide of the invention have been introduced into their genome or homologous recombinant animals in which endogenous sequences that encode a polypeptide of the invention have been altered. . Such animals are useful for studying the function and / or activity of the polypeptide and for identifying and / or evaluating modulators of the activity of the polypeptide.
Como se usa en el presente documento, un “animal transgénico” es un animal no humano, preferentemente un mamífero, más preferentemente un roedor tal como una rata o ratón, en el que una o más de las células del animal incluye un transgén. As used herein, a "transgenic animal" is a non-human animal, preferably a mammal, more preferably a rodent such as a rat or mouse, in which one or more of the animal's cells includes a transgene.
Otros ejemplos de animales transgénicos incluyen primates no humanos, ovejas, perros, vacas, cabras, pollos, anfibios, etc. Un transgén es ADN exógeno que está integrado en el genoma de una célula a partir de la cual se desarrolla un animal transgénico y que permanece en el genoma del animal maduro, dirigiendo de esta manera la expresión de un producto génico codificado en uno o más tipos celulares o tejidos del animal transgénico. Other examples of transgenic animals include nonhuman primates, sheep, dogs, cows, goats, chickens, amphibians, etc. A transgene is exogenous DNA that is integrated into the genome of a cell from which a transgenic animal develops and that remains in the genome of the mature animal, thus directing the expression of a gene product encoded in one or more types Cells or tissues of the transgenic animal.
Como se usa en el presente documento, un “animal recombinante homólogo” es un animal no humano, preferentemente un mamífero, más preferentemente un ratón, en el que se ha alterado un gen endógeno por recombinación homóloga entre el gen endógeno y una molécula de ADN exógena introducida en una célula del animal, por ejemplo, una célula embrionaria del animal, antes del desarrollo del animal. As used herein, a "homologous recombinant animal" is a non-human animal, preferably a mammal, more preferably a mouse, in which an endogenous gene has been altered by homologous recombination between the endogenous gene and a DNA molecule. exogenously introduced into an animal cell, for example, an embryonic cell of the animal, before the development of the animal.
Un animal transgénico de la invención puede crearse introduciendo un ácido nucleico que codifica un polipéptido de la invención en el pronúcleo masculino de un oocito fertilizado, por ejemplo, por microinyección, infección retroviral, y dejando que el oocito se desarrolle en un animal de acogida hembra pseudoembarazada. En el transgén también pueden incluirse secuencias intrónicas y señales de poliadenilación para aumentar la eficacia de la expresión del transgén. Al transgén se le pueden unir operativamente una o más secuencias reguladoras específicas de tejido para dirigir la expresión del polipéptido de la invención en células particulares. Se han hecho convencionales en la técnica métodos para generar animales transgénicos mediante manipulación embrionaria y microinyección, particularmente animales tales como ratones, y se describen, por ejemplo, en las Patentes de Estados Unidos Nº A transgenic animal of the invention can be created by introducing a nucleic acid encoding a polypeptide of the invention into the male pronucleus of a fertilized oocyte, for example, by microinjection, retroviral infection, and allowing the oocyte to develop in a female host animal. Pseudo Pregnant. In the transgene, intronic sequences and polyadenylation signals can also be included to increase the efficiency of transgene expression. One or more tissue-specific regulatory sequences can be operatively linked to the transgene to direct expression of the polypeptide of the invention in particular cells. Methods for generating transgenic animals by embryonic manipulation and microinjection, particularly animals such as mice, have been made conventional in the art and are described, for example, in US Pat.
4.736.866 y 4.870.009, 4.873.191 y en Hogan, Manipulating the Mouse Embryo, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1986). Se usan métodos similares para la producción de otros animales transgénicos. Un animal de acogida transgénico puede identificarse basándose en la presencia del transgén en su genoma y/o la expresión del ARNm que codifica el transgén en tejidos o células de los animales. Un animal de acogida transgénico después puede usarse para criar animales adicionales que lleven el transgén. Además, los animales transgénicos que llevan el transgén pueden cruzarse adicionalmente con otros animales transgénicos que lleven otros transgenes. 4,736,866 and 4,870,009, 4,873,191 and in Hogan, Manipulating the Mouse Embryo, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1986). Similar methods are used for the production of other transgenic animals. A transgenic host animal can be identified based on the presence of the transgene in its genome and / or the expression of the mRNA encoding the transgene in animal tissues or cells. A transgenic host animal can then be used to raise additional animals carrying the transgene. In addition, transgenic animals that carry the transgene can additionally cross over with other transgenic animals that carry other transgenes.
Para crear un animal recombinante homólogo, se prepara un vector que contiene al menos una parte de un gen que To create a homologous recombinant animal, a vector is prepared that contains at least a part of a gene that
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218; Nishimura et al. (1987) Cane. Res. 47: 999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314: 446-449; y Shaw et al. (1988) 218; Nishimura et al. (1987) Cane. Res. 47: 999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314: 446-449; and Shaw et al. (1988)
J. Natl. Cancer Inst. 80: 1553-1559); Morrison (1985) Science 229: 1202-1207; Oi et al. (1986) Bio/Techniques 4: 214; Patente de Estados Unidos Nº 5.225.539; Jones et al. (1986) Nature 321: 552-525; Verhoeyan et al. (1988) Science 239: 1534; y Beidler et al. (1988) J. Immunol. 141: 4053-4060. J. Natl. Cancer Inst. 80: 1553-1559); Morrison (1985) Science 229: 1202-1207; Oi et al. (1986) Bio / Techniques 4: 214; U.S. Patent No. 5,225,539; Jones et al. (1986) Nature 321: 552-525; Verhoeyan et al. (1988) Science 239: 1534; and Beidler et al. (1988) J. Immunol. 141: 4053-4060.
Pueden producirse anticuerpos completamente humanos, por ejemplo, usando ratones transgénicos que son incapaces de expresar genes de cadenas pesada y ligera de inmunoglobulinas endógenas, pero que pueden expresar genes de cadena pesada y ligera humanas. Los ratones transgénicos se inmunizan de la forma normal con un antígeno seleccionado, por ejemplo, todo o parte de un polipéptido de la invención. Pueden obtenerse anticuerpos monoclonales dirigidos contra el antígeno usando la tecnología de hibridoma convencional. Los transgenes de inmunoglobulina humana portados por el ratón transgénico se transponen durante la diferenciación de células B y posteriormente experimentan un cambio de clase y mutación somática. De esta manera, usando dicha técnica, es posible producir anticuerpos IgG, IgA e IgE terapéuticamente útiles. Como revisión general de esta tecnología para producir anticuerpos humanos, véase Lonberg y Huszar (1995, Int. Rev. Immunol. 13: 65-93). Para una discusión detallada de esta tecnología para producir anticuerpos humanos y anticuerpos monoclonales humanos y protocolos para producir dichos anticuerpos, véanse, por ejemplo, la Patente de Estados Unidos Nº 5.625.126; y las Patentes de Estados Unidos Nº 5.633.425; 5.569.825; 5.661.016; y 5.545.806. Además, es posible contactar con compañías tales como Abgenix, Inc. (Fremont, Calif.) para que proporcionen anticuerpos humanos dirigidos contra un antígeno seleccionado usando una tecnología similar a la descrita anteriormente. Completely human antibodies can be produced, for example, using transgenic mice that are unable to express heavy and light chain genes of endogenous immunoglobulins, but that can express human heavy and light chain genes. Transgenic mice are immunized in the normal way with a selected antigen, for example, all or part of a polypeptide of the invention. Monoclonal antibodies directed against the antigen can be obtained using conventional hybridoma technology. Human immunoglobulin transgenes carried by the transgenic mouse are transposed during B cell differentiation and subsequently undergo a class change and somatic mutation. Thus, using said technique, it is possible to produce therapeutically useful IgG, IgA and IgE antibodies. For a general review of this technology to produce human antibodies, see Lonberg and Huszar (1995, Int. Rev. Immunol. 13: 65-93). For a detailed discussion of this technology for producing human antibodies and human monoclonal antibodies and protocols for producing said antibodies, see, for example, US Patent No. 5,625,126; and United States Patents No. 5,633,425; 5,569,825; 5,661,016; and 5,545,806. In addition, it is possible to contact companies such as Abgenix, Inc. (Fremont, Calif.) To provide human antibodies directed against a selected antigen using technology similar to that described above.
Un anticuerpo dirigido contra un polipéptido de la invención (por ejemplo, anticuerpo monoclonal) puede usarse para aislar el polipéptido por técnicas convencionales, tales como cromatografía de afinidad o inmunoprecipitación. Además, dicho anticuerpo puede usarse para detectar la proteína (por ejemplo, en un lisado celular o sobrenadante celular) para evaluar la abundancia y patrón de expresión del polipéptido. Los anticuerpos también pueden usarse como diagnóstico para supervisar los niveles de proteínas en tejidos como parte de un procedimiento de ensayo clínico, por ejemplo, para determinar la eficacia de un régimen de tratamiento dado. La detección puede facilitarse acoplando el anticuerpo a una sustancia detectable. Los ejemplos de sustancias detectables incluyen diversas enzimas, grupos prostéticos, materiales fluorescentes, materiales luminiscentes, materiales bioluminiscentes y materiales radiactivos. Los ejemplos de enzimas adecuadas incluyen peroxidasa de rábano picante, fosfatasa alcalina, beta galactosidasa o acetilcolinesterasa; los ejemplos de complejos de grupos prostéticos adecuados incluyen estreptavidina/biotina y avidina/biotina; los ejemplos de materiales fluorescentes adecuados incluyen umbeliferona, fluoresceína, isotiocianato de fluoresceína, rodamina, diclorotriazinilamina fluoresceína, cloruro de dansilo o ficoeritrina; un ejemplo de un material luminiscente incluye luminol; los ejemplos de materiales bioluminiscentes incluyen luciferasa, luciferina y aequorina, y los ejemplos de materiales radiactivos adecuados incluyen 125I, 131I, 35S o 3H. An antibody directed against a polypeptide of the invention (eg, monoclonal antibody) can be used to isolate the polypeptide by conventional techniques, such as affinity chromatography or immunoprecipitation. In addition, said antibody can be used to detect the protein (for example, in a cell lysate or cell supernatant) to evaluate the abundance and expression pattern of the polypeptide. Antibodies can also be used as a diagnostic to monitor protein levels in tissues as part of a clinical trial procedure, for example, to determine the efficacy of a given treatment regimen. Detection can be facilitated by coupling the antibody to a detectable substance. Examples of detectable substances include various enzymes, prosthetic groups, fluorescent materials, luminescent materials, bioluminescent materials and radioactive materials. Examples of suitable enzymes include horseradish peroxidase, alkaline phosphatase, beta galactosidase or acetylcholinesterase; Examples of suitable prosthetic group complexes include streptavidin / biotin and avidin / biotin; Examples of suitable fluorescent materials include umbelliferone, fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine, dichlorotriazinylamine fluorescein, dansyl chloride or phycoerythrin; An example of a luminescent material includes luminol; Examples of bioluminescent materials include luciferase, luciferin and aequorin, and examples of suitable radioactive materials include 125I, 131I, 35S or 3H.
La presente invención incluye fragmentos de anticuerpo de los anticuerpos de la invención. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpo incluyen Fv, Fab, F(ab’)2, Fab’, dsFv, scFv, sc(Fv)2, diacuerpos y anticuerpos multiespecíficos formados a partir de fragmentos de anticuerpo. The present invention includes antibody fragments of the antibodies of the invention. Examples of antibody fragments include Fv, Fab, F (ab ’) 2, Fab’, dsFv, scFv, sc (Fv) 2, multispecific diabodies and antibodies formed from antibody fragments.
El término “Fab” denota un fragmento de anticuerpo que tiene un peso molecular de aproximadamente 50.000 y actividad de unión a antígenos, en el que aproximadamente una mitad del lado N-terminal de la cadena H y la cadena L entera, entre los fragmentos obtenidos por tratamiento de IgG con una proteasa, papaína, están unidos entre sí a través de un enlace disulfuro. The term "Fab" denotes an antibody fragment having a molecular weight of approximately 50,000 and antigen binding activity, in which approximately one half of the N-terminal side of the H chain and the entire L chain, between the obtained fragments By treatment of IgG with a protease, papain, they are linked together through a disulfide bond.
El término “F(ab’)2” se refiere a un fragmento de anticuerpo que tiene un peso molecular de aproximadamente The term "F (ab’) 2 "refers to an antibody fragment having a molecular weight of approximately
100.000 y actividad de unión a antígenos, que es ligeramente más grande que el Fab unido a través de un enlace disulfuro de la región de bisagra, entre fragmentos obtenidos por tratamiento de IgG con una proteasa, la pepsina. 100,000 and antigen binding activity, which is slightly larger than the Fab bound through a disulfide bond of the hinge region, between fragments obtained by treatment of IgG with a protease, pepsin.
El término “Fab” se refiere a un fragmento de anticuerpo que tiene un peso molecular de aproximadamente 50.000 y actividad de unión a antígenos, que se obtiene cortando un enlace disulfuro de la región de bisagra del F(ab’)2. The term "Fab" refers to an antibody fragment having a molecular weight of approximately 50,000 and antigen binding activity, which is obtained by cutting a disulfide bond from the hinge region of F (ab ’) 2.
Un polipéptido Fv monocatenario (“scFv”) es un heterodímero VH::VL unido covalentemente que normalmente se expresa a partir de una fusión génica que incluye genes codificantes de VH y VL ligados por un enlazador que codifica un péptido. El fragmento scFv humano de la invención incluye CDR que se mantienen en la conformación apropiada, preferentemente mediante el uso de técnicas de recombinación génica. “dsFv” es un heterodímero VH::VL estabilizado por un enlace disulfuro. Los fragmentos de anticuerpo divalentes y multivalentes pueden formarse espontáneamente por asociación de scFv monovalentes, o pueden generarse por acoplamiento de scFv monovalentes por un enlazador peptídico, tal como sc(Fv)2 divalente. A single chain Fv polypeptide ("scFv") is a covalently linked VH :: VL heterodimer that is normally expressed from a gene fusion that includes VH and VL encoding genes linked by a linker encoding a peptide. The human scFv fragment of the invention includes CDRs that are maintained in the proper conformation, preferably by the use of gene recombination techniques. "DsFv" is a VH :: VL heterodimer stabilized by a disulfide bond. Divalent and multivalent antibody fragments can be formed spontaneously by association of monovalent scFv, or they can be generated by coupling of monovalent scFv by a peptide linker, such as divalent sc (Fv) 2.
El término “diacuerpos” se refiere a fragmentos de anticuerpo pequeños con dos sitios de unión a antígeno, comprendiendo dichos fragmentos un dominio variable de cadena pesada (VH) conectado a un dominio variable de cadena ligera (VL) en la misma cadena polipeptídica (VH-VL). Mediante el uso de un enlazador que es demasiado corto para permitir el emparejamiento entre los dos dominios en la misma cadena, los dominios se ven forzados a emparejarse con los dominios complementarios de otra cadena y crear dos sitios de unión a antígeno. The term "diabody" refers to small antibody fragments with two antigen binding sites, said fragments comprising a heavy chain variable domain (VH) connected to a light chain variable domain (VL) in the same polypeptide chain (VH). -VL). By using a linker that is too short to allow pairing between the two domains in the same chain, the domains are forced to pair with the complementary domains of another chain and create two antigen binding sites.
16 5 16 5
15 fifteen
25 25
35 35
45 Four. Five
55 55
65 65
E09782880 E09782880
30-09-2015 09-30-2015
Aptámeros de la invención: Aptamers of the invention:
En otra realización, la invención se refiere a un aptámero dirigido contra un polipéptido de la invención. In another embodiment, the invention relates to an aptamer directed against a polypeptide of the invention.
Los aptámeros son una clase de molécula que representa una alternativa a los anticuerpos en términos de reconocimiento molecular. Los aptámeros son secuencias oligonucleotídicas u oligopeptídicas con la capacidad de reconocer prácticamente cualquier clase de molécula diana con alta afinidad y especificidad. Dichos ligandos pueden aislarse mediante evolución sistemática de ligandos por enriquecimiento exponencial (SELEX) de una biblioteca de secuencias aleatorias, como se describe en Tuerk C. 1997. La biblioteca de secuencias aleatorias se puede obtener por síntesis de química combinatoria de ADN. En esta biblioteca, cada miembro es una oligómero lineal, eventualmente modificado químicamente, de una sola secuencia. Se han revisado posibles modificaciones, usos y ventajas de esta clase de moléculas en Jayasena S. D., 1999. Los aptámeros peptídicos consisten en regiones variables de anticuerpo conformacionalmente limitadas presentadas por una proteína en plataforma, tal como la Tiorredoxina A de E. coli, que se seleccionan a partir de bibliotecas combinatorias por métodos de dos híbridos (Colas et al., 1996). Aptamers are a class of molecule that represents an alternative to antibodies in terms of molecular recognition. Aptamers are oligonucleotide or oligopeptide sequences with the ability to recognize virtually any kind of target molecule with high affinity and specificity. Such ligands can be isolated by systematic evolution of exponential enrichment ligands (SELEX) from a random sequence library, as described in Tuerk C. 1997. The random sequence library can be obtained by synthesis of combinatorial DNA chemistry. In this library, each member is a linear oligomer, possibly chemically modified, of a single sequence. Possible modifications, uses and advantages of this class of molecules have been reviewed in Jayasena SD, 1999. Peptide aptamers consist of conformationally limited antibody variable regions presented by a platform protein, such as E. coli thioredoxin A, which is selected from combinatorial libraries by two hybrid methods (Colas et al., 1996).
Métodos de exploración: Scanning Methods:
La invención proporciona un método (también denominado en el presente documento “método de exploración”) para identificar moduladores, es decir, compuestos o agentes candidatos o de ensayo (por ejemplo, péptidos, peptidomiméticos, moléculas pequeñas u otros fármacos) que se unen al polipéptido de la invención o tienen una acción estimuladora sobre, por ejemplo, la expresión o actividad de un polipéptido de la invención. The invention provides a method (also referred to herein as "scanning method") for identifying modulators, that is, candidate or test compounds or agents (for example, peptides, peptidomimetics, small molecules or other drugs) that bind to the polypeptide of the invention or have a stimulatory action on, for example, the expression or activity of a polypeptide of the invention.
En una realización, la invención proporciona ensayos para explorar compuestos candidatos o de ensayo que aumentan la actividad de un polipéptido de la invención o parte biológicamente activa del mismo. Más particularmente, la invención proporciona ensayos para explorar candidatos o compuestos de ensayo que pueden estimular la expresión de los polipéptidos de la invención. In one embodiment, the invention provides assays to explore candidate or test compounds that increase the activity of a polypeptide of the invention or biologically active part thereof. More particularly, the invention provides assays to explore candidates or test compounds that can stimulate the expression of the polypeptides of the invention.
Los compuestos candidatos o de ensayo pueden ensayarse con respecto a su capacidad de estimular la expresión de los polipéptidos de la invención. Por ejemplo, puede usarse un ensayo de sistema indicador para medir la expresión del polipéptido de la invención. Para este fin puede usarse una célula hospedadora de la invención. En una realización particular, el vector puede codificar una proteína de fusión que comprende un polipéptido de la invención y una proteína fluorescente. Las proteínas fluorescentes, bioluminiscentes o fosforescentes de forma natural incluyen GFP derivada de Aequorea Victoria y un número creciente de variantes de secuencia de GFP con propiedades útiles. La lista también incluye la proteína roja fluorescente (RFP) derivada de Discosoma; y la proteína fluorescente kindling (KFP1) derivada de Anemonia. Estas proteínas son enzimas autocatalíticas que son capaces todas ellas de generar fluoróforos internos que emiten de forma eficaz, altamente visibles, como resultado de la endociclación de restos de aminoácidos centrales. Otra característica común de las proteínas fluorescentes es que la señal es estable, independiente de la especie y no requieren ningún sustrato o cofactor para la generación de una señal. La detección directa de fluorescencia por observación visual (por ejemplo, con luz UV de amplio espectro) puede usarse para cuantificar la cantidad de la proteína de fusión producida en presencia o ausencia del compuesto candidato o de ensayo. Candidate or test compounds can be tested for their ability to stimulate expression of the polypeptides of the invention. For example, an indicator system assay can be used to measure the expression of the polypeptide of the invention. For this purpose a host cell of the invention can be used. In a particular embodiment, the vector can encode a fusion protein comprising a polypeptide of the invention and a fluorescent protein. Naturally fluorescent, bioluminescent or phosphorescent proteins include GFP derived from Aequorea Victoria and an increasing number of GFP sequence variants with useful properties. The list also includes the red fluorescent protein (RFP) derived from Discosoma; and kindling fluorescent protein (KFP1) derived from Anemonia. These proteins are autocatalytic enzymes that are all capable of generating internal fluorophores that emit efficiently, highly visible, as a result of endocycling of central amino acid residues. Another common characteristic of fluorescent proteins is that the signal is stable, independent of the species and does not require any substrate or cofactor for the generation of a signal. Direct fluorescence detection by visual observation (for example, with broad-spectrum UV light) can be used to quantify the amount of fusion protein produced in the presence or absence of the candidate or test compound.
Los compuestos candidatos o de ensayo después pueden ensayarse con respecto a su capacidad de inhibir la degeneración de fotorreceptores de los conos. Para supervisar dichos efectos puede usarse cualquier ensayo adecuado conocido para un experto en la materia (tales como el descrito en el Ejemplo). The candidate or test compounds can then be tested for their ability to inhibit the degeneration of cone photoreceptors. Any suitable test known to a person skilled in the art (such as that described in the Example) can be used to monitor such effects.
Los compuestos de ensayo de la presente invención pueden obtenerse usando cualquiera de varias estrategias en métodos de bibliotecas combinatorias conocidas en la técnica, incluyendo: bibliotecas biológicas; bibliotecas en fase sólida o en fase de solución paralelas dirigibles espacialmente; métodos de bibliotecas sintéticas que requieren desconvolución; el método de biblioteca (una perla - un compuesto); y métodos de bibliotecas sintéticas que usan selección por cromatografía de afinidad. La estrategia de bibliotecas biológicas está limitada a bibliotecas de péptidos, mientras que las otras cuatro estrategias son aplicables a péptidos, oligómeros no peptídicos o bibliotecas de compuestos de molécula pequeña. The test compounds of the present invention can be obtained using any of several strategies in combinatorial library methods known in the art, including: biological libraries; libraries in solid phase or in spatially manageable parallel solution phase; synthetic library methods that require deconvolution; the library method (a pearl - a compound); and synthetic library methods that use affinity chromatography selection. The biological library strategy is limited to peptide libraries, while the other four strategies are applicable to peptides, non-peptide oligomers or libraries of small molecule compounds.
Métodos de diagnóstico de la invención: Diagnostic methods of the invention:
La presente invención también se refiere a ensayos de diagnóstico, ensayos de pronóstico y ensayos de supervisión. The present invention also relates to diagnostic tests, prognostic tests and supervisory tests.
Por consiguiente, un aspecto de la presente invención se refiere a ensayos de diagnóstico para determinar la expresión de un polipéptido o ácido nucleico de la invención y/o la actividad de un polipéptido de la invención, en el contexto de una muestra biológica (por ejemplo, sangre, suero, células, tejidos) para determinar de esta manera si un individuo padece una enfermedad o trastorno, o tiene riesgo de desarrollar un trastorno, asociado con una expresión o actividad aberrante de un polipéptido de la invención (por ejemplo, trastornos neurodegenerativos). Accordingly, one aspect of the present invention relates to diagnostic assays for determining the expression of a polypeptide or nucleic acid of the invention and / or the activity of a polypeptide of the invention, in the context of a biological sample (for example , blood, serum, cells, tissues) to determine in this way if an individual suffers from a disease or disorder, or is at risk of developing a disorder, associated with an aberrant expression or activity of a polypeptide of the invention (eg, neurodegenerative disorders ).
17 17
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