ES2323604T3 - Cepas de vih-1 no-m no-o, fragmentos y aplicaciones. - Google Patents
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Abstract
CEPAS DE RETROVIRUS DEL GRUPO VIH-1, NO-M NO-O, PARTICULARMENTE UNA CEPA LLAMADA YBF30, SUS FRAGMENTOS ASI COMO SUS APLICACIONES, COMO REACTIVO DE DIAGNOSTICO Y COMO AGENTE INMUNOGENO. LOS VIH-1 DISTINTOS A LA VEZ DEL GRUPO M Y DEL GRUPO O PRESENTAN LAS SIGUIENTES CARACTERISTICAS: POCA O NADA DE REACTIVIDAD SEROLOGICA RESPECTO A LAS PROTEINAS DE LOS GRUPOS M Y O Y FUERTE REACTIVIDAD SEROLOGICA RESPECTO A LAS PROTEINAS OBTENIDAS DE LA CEPA YBF30 SEGUN LA INVENCION O DE LA CEPA SIV CPZGAB; AUSENCIA DE AMPLIFICACION GENOMICA MEDIANTE CEBOS DE LAS ZONAS ENV Y GAG DE LOS VIH-1 DE LOS GRUPOS M Y O; AMPLIFICACION GENOMICA EN PRESENCIA DE LOS CEBOS OBTENIDOS EN LA CEPA YBF30, SEGUN LA INVENCION Y HOMOLOGIA DE LOS PRODUCTOS DEL GEN DE ENVOLTURA SUPERIOR A UN 70 % RESPECTO A LA CEPA YBF30.
Description
Cepas de VIH-1
no-M no-O, fragmentos y
aplicaciones.
La presente invención se refiere a cepas de
retrovirus del grupo VIH-1, no M no O,
particularmente a una cepa denominada YBF30, a sus fragmentos así
como a sus aplicaciones, como reactivo de diagnóstico y como agente
inmunógeno.
Los virus de la inmunodeficiencia adquirida
humana, VIH-1 y VIH-2 son
retrolentivirus, virus encontrados en muchos primates africanos.
Todos estos virus parecen tener un ancestro común; sin embargo, es
muy difícil prejuzgar el periodo en el cual estos diferentes virus
se separaron de este precursor. Otros virus más alejados, aunque
formen parte del mismo grupo, se encontraron en otros mamíferos
(ungulados y felinos).
Todos estos virus están asociados a infecciones
de larga duración: la ausencia de síntomas es la norma en monos
infectados de forma natural.
Debido a su gran homología con el virus del
Mangabeye Gris (Oeste de África), el origen del
VIH-2 parece claro, pero ningún virus cercano al
VIH-1 se ha encontrado en monos. Los virus más
cercanos son virus encontrados en dos chimpancés (SIV CPZGAB, SIV
ANT).
Se ha descubierto una gran variabilidad genética
en todos los lentivirus, y el estudio filogenético de estas
variantes obtenidas a partir de numerosos puntos geográficos
diferentes permitió distinguir, para VIH-1, 8
subtipos (clados), todos también equidistantes entre sí. Los clados
son solamente una representación matemática de la expresión de la
variabilidad del análisis fenético, que basada no en los ácidos
nucleicos sino en los aminoácidos, da resultados diferentes (Korber
et al., 1994).
La puesta de manifiesto de subtipos corresponde
a un análisis filogenético que actualmente no tiene correlación
fisiopatológica, sino correspondencia geográfica. En efecto, cada
subtipo se encuentra principalmente en cierto espacio geográfico.
En Europa y en los Estados Unidos, el subtipo B es mayoritario,
mientras que en Tailandia, se descubrieron dos subtipos E y B y que
existe una gran correlación entre el modo de transmisión que, de
hecho, corresponde a cierta población y el subtipo descubierto.
Todos los clados se encontraron en África y su distribución por el
resto del mundo refleja una probabilidad de encuentro entre personas
con comportamiento de alto riesgo. El clado mayoritario, puesto que
está presente en gran proporción en África es el clado A. En
algunos países de África, se ha encontrado una gran variabilidad (G.
Myers, 1994; P.M. Sharp et al., 1994). Varios subtipos se
han caracterizado en los países del centro de África occidental,
como la República Centroafricana (Murphy et al., 1993) y
Camerún (Nkengasong et al., 1994).
Por último, se han caracterizado pacientes
portadores de variantes virales de VIH-1, cuyos
sueros planteaban problemas de detección para algunos kits
comercializados en el mercado francés y cuyas transferencias de
Western de confirmación eran atípicas
(Loussert-Ajaka et al., 1994; Simon et
al., 1994, Solicitud Internacional PCT WO 96/27013).
El análisis de estas variantes permitió
confirmar que los virus VIH de tipo 1, debían subdividirse en dos
grupos, el grupo M (principal (major)) y un grupo O (atípico
(outlier)) que incluye estos aislados, como propusieron
Chameau et al., 1994. El análisis de la proporción de
mutaciones sinónimas (silenciosas)/mutaciones no sinónimas en las
secuencias de los virus del grupo O conocidos, indica que este nuevo
grupo es tan antiguo, sino más, como el grupo M
(Loussert-Ajaka et al., 1995). Su reducida
prevalencia actualmente, el 8% de los pacientes infectados con
VIH-1 en Camerún (Zekeng et al., 1994) y 18
casos caracterizados en Francia, se debería a factores puramente
epidemiológicos.
Estos dos grupos de VIH-1 forman
un árbol en forma de doble estrella (figuras 9 a 19). Dos aislados,
SIV CPZGAB, caracterizado a partir de un chimpancé de Gabón (Huet
et al.,) y CPZANT, caracterizado a partir de un chimpancé
del zoo de Anvers, tienen secuencias y organizaciones génicas muy
próximas al VIH-1, pero no se inscriben en ninguno
de estos dos grupos y forman en el árbol filogenético dos nuevas
ramas.
La puesta de manifiesto de nuevas variantes es
importante para desarrollar reactivos de cribado de infecciones por
VIH, suficientemente sensibles y específicos, es decir que no
conduzcan a resultados falsos negativos o falsos positivos y
composiciones protectoras contra subtipos que no pertenezcan ni al
grupo M, ni al grupo O.
Por consiguiente, el Solicitante se ha fijado
como objetivo proporcionar una cepa no M, no O, así como secuencias
obtenidas de esta cepa, adecuadas para permitir la detección de
variantes del VIH-1 no M y no O, que permiten
evitar la obtención de resultados falsos negativos o falsos
positivos. Para ello, los inventores establecieron particularmente
un algoritmo de diferenciación y de confirmación entre las
infecciones por VIH-1 de los grupos M y O, lo que
les permitió seleccionar variantes no M, no O.
La presente invención se refiere a una cepa de
VIH-1 no M, no O, denominada YBF30, depositada en la
Collection Nationale de Cultures de Mocroorganismes albergada en el
Instituto Pasteur con el número I-1753, el 2 de
julio de 1996.
\global\parskip0.950000\baselineskip
Se entiende por variante no M, no O, un VIH de
tipo 1, que serológica y molecularmente no puede reconocerse como
perteneciente a uno de estos grupos.
La presente invención también se refiere a la
secuencia de nucleótidos completa de la cepa tal como se ha definido
anteriormente (SEC ID Nº 1) así como a los siguientes fragmentos de
ácido nucleico, obtenidos de dicha cepa:
- -
- LTR YBF 30 (SEC ID Nº 2),
- -
- GAG YBF 30 (SEC ID Nº 3), (gen gag),
- -
- POL YBF 30 (SEC ID Nº 5), (gen pol),
- -
- VIF YBF 30 (SEC ID Nº 7), (gen vif),
- -
- VPR YBF 30 (SEC ID Nº 9), (gen vpr),
- -
- VPU YBF 30 (SEC ID Nº 11), (gen pu),
- -
- TAT YBF 30 (SEC ID Nº 13), (gen tat),
- -
- REV YBF 30 (SEC ID Nº 15), (gen rev),
- -
- ENV gp160 YBF 30 (SEC ID Nº 17), (gen env), y
- -
- NEF YBF 30 (SEC ID Nº 19), (gen nef).
\vskip1.000000\baselineskip
La invención también se refiere a un ácido
nucleico aislado constituido por un fragmento de al menos 10
nucleótidos de un ácido nucleico o de un fragmento de ácido
nucleico tal como se ha definido anteriormente. Preferiblemente,
dicho ácido nucleico de acuerdo con la invención se selecciona entre
los ácidos nucleicos de secuencias SEC ID Nº 21 a SEC ID Nº 57,
también denominadas respectivamente YLG, LPBS.1, GAG Y AS1.1, GAG Y
AS1, GAG 6, GAG Y S1, GAG YS1.1, GAG Y S1.2, YRT AS 1.3, YRT AS
1.2, YRT AS 1.1, YRT S, YRT AS 1, YRT 2.1, YRT 2.2, YRT 2.3, YRT
2.4, 4481-1, 4481-2, 4235.1, 4235.2,
4235.3, 4235.4, SK69.6, SK69.5, SK69.4, SK69.3, SK69.2, SK69.1,
SK68.2, SK68.3, LSI AS1.3, LSI AS1.2, LSI AS 1.1, LSI A1, YLPA. Las
secuencias SEC ID Nº 21 a 57 son adecuadas para servir como
cebadores y/o sondas para la detección de un VIH-1
que presenta las características morfológicas e inmunológicas de la
cepa YBF30 de acuerdo con la invención.
Dichas secuencias encuentran aplicación en la
identificación específica de un VIH no M no O, como reactivo de
diagnóstico, en solitario o en forma de conjunto
("pool") con otros reactivos, para la identificación
diferencial de cualquier VIH-1. Estas secuencias
pueden emplearse particularmente en ensayos de diagnóstico que
comprenden, una hibridación directa con la secuencia viral a
detectar o una amplificación de dicha secuencia viral, utilizando
como cebadores o como sondas, un oligonucleótido que comprende al
menos 10 nucleótidos, incluidos en una cualquiera de las secuencias
anteriores y particularmente una de las secuencias SEC ID Nº
21-57 mencionadas anteriormente.
Las características de dicha cepa de
VIH-1 no M no O son las siguientes:
- \bullet
- poca o ninguna reactividad serológica con respecto a proteínas de los grupos M y O y gran reactividad serológica con respecto a proteínas obtenidas de la cepa YBF30 o de la cepa SIV CPZGAB;
- \bullet
- ausencia de amplificación genómica con ayuda de cebadores de las regiones env y gag de los VIH-1 de los grupos M y O;
- \bullet
- amplificación genómica en presencia de los cebadores obtenidos de la cepa YBF30, tales como los definidos anteriormente; y
- \bullet
- homología de los productos del gen de la envuelta > 70% con respecto a la cepa YBF30.
\vskip1.000000\baselineskip
Las secuencias descritas anteriormente pueden
utilizarse para la realización de un procedimiento de hibridación
y/o de amplificación génica de secuencias nucleicas de tipo
VIH-1, siendo estos procedimientos aplicables al
diagnóstico in vitro de la infección potencial de un
individuo por un virus del tipo VIH-1 no M no O.
La presente invención se refiere además a un
procedimiento de diagnóstico in vitro realizado a partir de
una muestra biológica seleccionada entre una muestra de suero y una
muestra de linfocitos circulantes, procedimiento que comprende:
- \bullet
- una etapa de extracción del ácido nucleico a detectar, que pertenece al genoma del virus, posiblemente presente en la muestra biológica y, llegado el caso, una etapa de tratamiento del ácido nucleico, con ayuda de una transcriptasa inversa, si este último está en forma de ARN,
\global\parskip1.000000\baselineskip
- \bullet
- al menos un ciclo que comprende las etapas de desnaturalización del ácido nucleico, de hibridación con al menos una secuencia de acuerdo con la invención y si fuera necesario, extensión del híbrido formado, en presencia de reactivos adecuados que comprenden un agente de polimerización, tal como una ADN polimerasa y dNTP (desoxirribonucleótidos), y
- \bullet
- una etapa de detección de la posible presencia del ácido nucleico que pertenece al genoma de un virus de tipo VIH-1 de grupo no M no O.
\vskip1.000000\baselineskip
Las condiciones empleadas para la PCR con ayuda
de los cebadores obtenidos de la cepa YBF30 son las siguientes:
- -
- Extracción del ADN linfocítico mediante la técnica fenol-cloroformo y cuantificación mediante espectrometría a una longitud de onda de 260 nm. Todas las amplificaciones se realizan en un termociclador 2400 de Perkin Elmer.
- -
- Las PCR largas (9 kb) se realizan con el kit XL PCR (Perkin Elmer) de acuerdo con las condiciones del fabricante y con los dNTP, los tampones suministrados y el "arranque en caliente" ("hot start") de Perkin Elmer; los ciclos de amplificación de esta PCR larga son:
- \circ
- 1 ciclo de desnaturalización durante 2 minutos a 94ºC,
- \circ
- a continuación 16 ciclos: 15 segundos a 94ºC, 15 segundos a 55ºC, 8 minutos a 68ºC,
- \circ
- a continuación 24 ciclos: 15 segundos a 94ºC, 15 segundos a 55ºC, 8 minutos a 68ºC, añadiendo a cada ciclo 15 segundos más (incremento).
- -
- Las PCR anidadas se realizan en los productos de amplificación de las PCR largas. Las condiciones de realización de las PCR anidadas son:
- \circ
- tampón y enzima Taq polimerasa "Expand High Fidelity PCR System" de Boehringer Mannheim de acuerdo con las instrucciones del fabricante, dNTP y "hot start" de Perkin Elmer,
- \circ
- 200 \muM de cada dNTP, 20 pmoles de cada cebador de acuerdo con la invención, 5 \mul de ADN, 10 \mul de tampón PCR 10x, 2,6 unidades de Taq polimerasa en un volumen de 100 \mul,
- \circ
- amplificación: un ciclo de 2 minutos a 94ºC, seguido de 38 ciclos: 15 segundos a 94ºC, 15 segundos a 55ºC, un periodo de elongación a 72ºC variable de acuerdo con el tamaño del producto de PCR a amplificar (de 30 segundos a 2 minutos) y un último ciclo de elongación de 10 minutos a 72ºC.
\vskip1.000000\baselineskip
La detección del producto amplificado se realiza
preferiblemente mediante secuenciación directa.
La presente invención también se refiere a un
péptido obtenido de la cepa YBF30 seleccionado entre el grupo
constituido por: el expresado por el gen gag (SEC ID Nº 4),
el expresado por el gen pol (SEC ID Nº 6), el expresado por
el gen vif (SEC ID Nº 8), el expresado por el gen vpr
(SEC ID Nº 10), el expresado por el gen vpu (SEC ID Nº 12),
el expresado por el gen tat (SEC ID Nº 14), el expresado por
el gen rev (SEC ID Nº 16), el expresado por el gen env
(SEC ID Nº 18), el fragmento de la región del bucle V3
CTRPGNNTGGQVQIGPAMTFYNIEKIVGDIRQAYC (SEC ID Nº 58) y el expresado
por el gen nef (SEC ID Nº 20).
Preferiblemente, el polipéptido de acuerdo con
la invención es codificado por una molécula de ácido nucleico
definida por una secuencia seleccionada entre el grupo constituido
por las secuencias SEC ID Nº 1, SEC ID Nº 3, SEC ID Nº 5, SEC ID Nº
7, SEC ID Nº 9, SEC ID Nº 11, SEC ID Nº 13, SEC ID Nº 15, SEC ID Nº
17 y SEC ID Nº 19.
La invención también se refiere a composiciones
inmunógenas que comprenden uno o más productos de traducción de las
secuencias de nucleótidos de acuerdo con la invención y/o uno de los
péptidos tales como se han definido anteriormente, obtenidos
particularmente de manera sintética.
Los anticuerpos dirigidos contra uno o más de
los péptidos descritos anteriormente pueden utilizarse para la
realización de métodos de diagnóstico in vitro,
particularmente diferencial, de la infección de un individuo por un
virus de tipo VIH-1, de acuerdo con los
procedimientos conocidos por el especialista en la técnica.
La invención se refiere, además, a un método de
diagnóstico in vitro de un VIH-1 no M no O,
caracterizado porque comprende la puesta en contacto de una muestra
biológica extraída de un paciente, con anticuerpos tales como se han
definido anteriormente, opcionalmente asociados a anticuerpos
dirigidos contra el virus SIV CPZGAB y la detección de los complejos
inmunológicos formados entre los antígenos de VIH-1,
posiblemente presentes en la muestra biológica y dichos
anticuerpos.
\newpage
La invención también se refiere a un reactivo de
diagnóstico de un VIH-1 no M no O, caracterizado
porque comprende un ácido nucleico de acuerdo con la invención, o un
péptido de acuerdo con la invención.
La invención se refiere además a un
procedimiento de cribado y de tipificación de un
VIH-1 no M no O caracterizado porque comprende la
puesta en contacto de uno cualquiera de los fragmentos de los ácidos
nucleicos de acuerdo con la invención con el ácido nucleico del
virus a tipificar, y la detección del híbrido formado.
La invención también se refiere a un kit de
diagnóstico de VIH-1 no M no O, caracterizado porque
incluye al menos un reactivo de acuerdo con la invención.
Además de las disposiciones anteriores, la
invención comprende también otras disposiciones, que se verán en la
siguiente descripción, que se refiere a ejemplos de realización del
procedimiento objeto de la presente invención así como a los dibujos
adjuntos, en los que:
- las figuras 1 a 7 ilustran el emplazamiento de
los diferentes cebadores en el genoma de la cepa YBF30;
- la figura 8 ilustra la organización genómica
de la cepa YBF30;
- las figuras 9 a 19 representan el análisis
filogenético de los diferentes genes de la cepa YBF30 con respecto
al VIH-1 de grupo M y de grupo O (figura 9: gen
Itr, figura 10: gen gag, figura 11: gen tat,
figura 12: gen rev, figura 13: gen vif, figura 14: gen
env gp120, figura 15: gen env gap41, figura 16: gen
nef, figura 17: gen pol, figura 18: gen vpr,
figura 19: gen vpu);
- la figura 20 ilustra el porcentaje de
distancia genética entre YBF30 y VIH-1/SIV
CPZGAB.
Debe entenderse, sin embargo, que estos ejemplos
se proporcionan únicamente a título ilustrativo del objeto de la
invención, del que no constituyen en absoluto una limitación.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
Esto ha sido posible en particular estudiando la
epidemiología de la infección por virus de inmunodeficiencia humana
adquirida (VIH) en Camerún, que es particularmente paradójica. En
este país, la diversidad de las cepas es notable, ya que se han
descrito la mayor parte de los subtipos conocidos actualmente de los
virus VIH-1 del grupo M (Principal). Se han
descrito casos de infecciones por virus VIH-1 muy
divergentes del grupo O (O por "outlier"), casi
exclusivamente en pacientes de origen camerunés. También se han
descrito casos de infecciones por VIH-2,
HTLV-1 y HTLV-2 subtipo A y B.
Partiendo de los resultados de las evaluaciones
serológicas y genotípicas anteriores, los inventores establecieron
un algoritmo de diferenciación y de confirmación entre las
infecciones por VIH-1 de los grupos M y O, para
seleccionar variantes no M, no O.
Estos métodos se aplicaron en muestras dirigidas
al Laboratorio Nacional de Referencia de las infecciones por VIH de
Yaoundé y permitieron caracterizar un aislado de VIH muy divergente
y definir las herramientas de caracterización de un nuevo grupo de
VIH-1, teniendo en cuenta homologías observadas
entre esta cepa humana YBF30 y la cepa de simio SIV CPZGAB.
\vskip1.000000\baselineskip
Se estudiaron todos los sueros de pacientes
adultos dirigidos al Laboratorio de referencia de Yaoundé en 1994 y
1995 para cribado o confirmación de una infección por VIH (n =
8831).
\vskip1.000000\baselineskip
En caso de positividad del cribado
anti-VIH (EIA indirecto mixto VIH-1
y VIH-2 Génélavia Mixt,
Sanofi-Pasteur, París, Francia), se asoció un
ensayo EIA (inmunoensayo enzimático) basado en el principio
de la competencia con respecto al antígeno específico del grupo M
(Wellcozyme Rec HIV-1, Murex, Dartford, RU).
En caso de positividad del ensayo de tipo
competitivo Wellcozyme Rec HIV-1, con relación de
reactividad en densidad óptica (DO) con respecto al valor umbral o
cut-off (CO) superior a (CO/DO > 5), el
suero es considerado como VIH-1 positivo, resultado
que debe confirmarse en una nueva extracción.
La elección de una relación de reactividad
superior a 5 para considerar el ensayo por competencia como ensayo
de confirmación de la infección por VIH-1 se basa en
la experiencia adquirida por el laboratorio de virología del
hospital Bichat: en 7200 muestras reactivas con una relación > 5,
todas presentaban una transferencia de Western de
VIH-1 (WB, New Lav Blot 1, SDP, Marnes la Coquette)
muy positiva. Aparte de los casos de
sero-conversiones de VIH-1, las
muestras confirmadas positivas para VIH y que presentan una relación
de Wellcozyme < 5, corresponden a infecciones por
VIH-2 o a infecciones por VIH-1 del
grupo O o de otras variantes.
Para eliminar las reacciones falsas positivas en
cribado EIA mixto, las muestras que presentan una relación CO/DO
< 5 se someten sistemáticamente a un ensayo EIA mixto
VIH-1/VIH-2 de tercera generación
(Enzygost Plus, Marburg, Alemania) que incluye los antígenos de los
VIH-1 de los grupos M y O (recombinante gp41 de la
cepa MVP5180). En caso de positividad de este ensayo, se realizan un
ensayo rápido que discrimina entre VIH-1 y
VIH-2 (Multispot, SDP, Marnes la Coquette) y una
transferencia de Western (WB, New Lav Blot 1 ó 2, SDP,).
\vskip1.000000\baselineskip
Todas las muestras que presentan una relación
CO/DO < 5 diferenciadas como positivas por WB (criterios de
positividad: 2 ENV +/- POL +/- GAG o 1 ENV + POL + GAG) y
VIH-1, se someten a un ensayo inmunoenzimático
indirecto "Dot-blot" utilizando
antígenos peptídicos de las regiones V3 y transmembrana (InnoLia,
Innogenetics, Ghent, Bélgica).
\vskip1.000000\baselineskip
Las células mononucleares de la sangre
periférica (PBMC) de los pacientes seropositivos se aislaron
mediante gradiente de Ficoll-Hypaque en Camerún, se
conservaron y se transportaron a París en nitrógeno líquido.
Después de la descongelación, las PBMC de los
pacientes se co-cultivaron con linfocitos de
donantes caucásicos seronegativos. La replicación viral en los
sobrenadantes de cultivos se demostró mediante la detección de la
actividad transcriptasa inversa y mediante la búsqueda del Antígeno
p24 (Elavia p24 policlonal, SDP) en un periodo de
un mes.
un mes.
\vskip1.000000\baselineskip
Los productos de PCR se visualizan en geles de
agarosa del 1 al 1,4% según el tamaño de los fragmentos, se
precipitan con acetato de sodio 3 M (1:10) y 3 volúmenes de etanol
absoluto, se incuban 30 minutos a -80ºC, se centrifugan 20 minutos
a 13.000 rpm. El sedimento se seca y después se resuspende con 10
\mul de agua destilada (Sigma). La purificación se realiza en
"Qiauquick Gel Extraction kit" (Qiagen) de acuerdo con las
instrucciones del fabricante; los productos se secuencian con el kit
Dye Terminator de Applied Biosystems en un secuenciador de ADN
automatizado (Applied Biosystems, Inc., Foster Cit, CA), como se ha
descrito anteriormente (Loussert-Ajaka et
al., 1995); las secuencias de nucleótidos se analizan en el
programa Sequence Navigator (Applied Biosystems) y se alinean con
el programa GeneWorks (Intelligenetics Inc.).
\vskip1.000000\baselineskip
Las secuencias se alinearon con el programa
CLUSTAL para alineamientos múltiples, tomando como matriz de
referencia los alineamientos de la compilación de secuencias de VIH
del laboratorio de Biología y de Biofísica Teórica de Los Álamos,
Nuevo México, 87545 EEUU.
Los análisis filogenéticos se realizaron con el
programa PHYLIP: en un primer momento, las distancias se calcularon
con DNADIST, y después el análisis filogenético se realizó a
continuación con NEIGHBOR JOINING o FITCH, finalmente, los árboles
se dibujaron con DRAWTREE (figuras 9 a 19). Los porcentajes de
distancia genética también se ilustran en la figura 20.
Para los análisis de muestreo con
reemplazamiento "bootstrapping", en primer lugar se
utilizó SEQBOOT, seguido de DNADIST y NEIGHBOR JOINING o FITCH.
Finalmente los valores de bootstrap se obtuvieron con
CONSENS.
\vskip1.000000\baselineskip
174 muestras, entre 3193 muestras positivas en
cribado, se consideraron o del grupo O o del grupo M, con
reactividad serológica anormal o como variantes.
\vskip1.000000\baselineskip
Los 174 sueros positivos para
VIH-1 por WB (transferencia de Western), pero
reactivos con una relación CO/DO < 5 en EIA de tipo competitivo
se sometieron a un ensayo dot blot LIA (inmunoensayo
lineal) de diferenciación en los péptidos V3 del grupo M, grupo
O y SIV CPZGAB:
- -
- 7 no reaccionan en ninguno de los péptidos (M, O o SIV CPZGAB) representados. La ausencia de recogida celular no permite ninguna conclusión.
- -
- 82 presentan una reactividad con respecto a al menos uno de los péptidos que corresponden al bucle V3 de las cepas del grupo O. La frecuencia de las reacciones cruzadas es reducida y está limitada a los epítopos que corresponden a las regiones V3 de consenso (11%) y SIV-CPZ GAB (43%).
- -
- 84 sueros son no reactivos con respecto a epítopos del grupo O. Estas extracciones se realizaron mayoritariamente en pacientes que presentan SIDA (75/84).
- -
- un suero, extraído de un paciente camerunés (NJ) es reactivo exclusivamente con el péptido SIV CPZGAB. Esta reactividad aislada con respecto a un antígeno del SIV CPZGAB no se ha descrito nunca anteriormente. Al haberse recogido linfocitos de este paciente, se ha podido proseguir la caracterización virológica de esta cepa llamada YBF30.
\vskip1.000000\baselineskip
Criterio de positividad: DO/CO > 1
Génélavia = > 15
Wellcozyme CO/DO = 1,55
Abbott Plus = > 15
Behring Plus = 4,2
\vskip1.000000\baselineskip
WB New Lav 1 Pasteur:
160++, 120++, 68++, 55+, 41+, 40\pm, 34++,
24++, 18+
\vskip1.000000\baselineskip
Negativo para todas las bandas del grupo O y
grupo M excepto V3 SIV CPZGAB
\vskip1.000000\baselineskip
* Se adaptó la técnica del Prof. Francis Barin
del Laboratorio de Virología del Centro Hospitalario Universitario
de Tours (Barin F et al., 1996); se utilizaron péptidos de
las regiones transmembrana sintetizados (BioMérieux), para
desarrollar un ensayo de diferenciación entre los grupo M y O. Esta
técnica se basa en la competencia de unión de los anticuerpos entre
los péptidos transmembrana gp41 de los grupos O y M depositados en
la fase sólida y péptidos transmembrana gp41 del grupo O o del
grupo M en concentración superior en una fase líquida de reacción
hiperosmolar. Los resultados se ilustran en la Tabla I a
continuación, en la que el pocillo CP corresponde al control de
inhibición al 100% y el pocillo CSP corresponde al control con el 0%
de inhibición.
Estos resultados muestran que existe una fuerte
vinculación con respecto a péptidos de la fase sólida (CSP), una
clara inhibición mediante la adición combinada de los péptidos M y O
(CP) pero sin diferenciación clara, con el péptido M o con el
péptido O. Existe por lo tanto una prueba serológica de que la cepa
infectante no pertenece ni al grupo M ni al grupo O.
* Teniendo en cuenta una reactividad aislada en
el ensayo dot blot InnoLia con respecto a antígenos V3 SIV CPZGAB,
en las mismas bases de competencia entre péptidos, se estudió este
suero haciendo competir a los péptidos gp41 M, gp41 O y gp41 SIV
CPZGAB.
La utilización del suero del chimpancé llamado
"Amandine" (donado por M. Peeters, que aisló la cepa SIV
CPZGAB, AIDS 1992) permitió, en un primer momento, validar esta
técnica. En la tabla II, los valores (DO) más bajos indican el mayor
grado de unión a los antígenos.
La reactividad del suero "Amandine"
confirma y valida el ensayo de acuerdo con la invención e indica que
el suero de la paciente reacciona de manera idéntica con respecto a
péptidos M y SIV CPZGAB, pero no presenta reacción cruzada con el
péptido O.
Estos resultados muestran que existe una
inhibición similar con el suero de la paciente por los péptidos gp41
del grupo M y gp41 SIV CPZGAB. Los antígenos de la cepa infectante
dieron origen, por lo tanto, a anticuerpos que reconocen, de forma
similar, los gp41 del grupo M y del SIV CPZGAB.
\vskip1.000000\baselineskip
Se aisló un retrovirus a partir de los
linfocitos extraídos el 22 de mayo de 1995, de acuerdo con las
técnicas convencionales. El cultivo con la línea MT2 muestra que la
cepa YBF30 no forma sincitios (NSI).
\vskip1.000000\baselineskip
Negativo para todas las bandas, excepto V3 SIV
CPZGAB
\vskip1.000000\baselineskip
La Tabla III ilustra los resultados de las
diferenciaciones de gp41 entre grupo O - grupo M - SIV CPZGAB con el
suero 3371.
Estos resultados confirman en esta nueva
extracción (realizada en la misma paciente, en fase terminal de la
enfermedad) que existe una inhibición marcada con el suero de la
paciente por el péptido gp41 SIV CPZGAB.
Los antígenos de la cepa infectante indujeron
por lo tanto anticuerpos que reconocen de forma preferente la gp41
de SIV CPZGAB.
\vskip1.000000\baselineskip
Se aisló un retrovirus a partir de los
linfocitos extraídos en noviembre de 1995, de acuerdo con técnicas
convencionales, y denominada YBF31; los elementos de secuencia son
idénticos a los de YBF30.
\vskip1.000000\baselineskip
El ADN para todas las manipulaciones de PCR se
extrae a partir de células del cultivo positivo finalizado.
Las PCR realizadas con los cebadores
VIH-1 de grupo O en diferentes regiones ensayadas
son negativas (gag, pol, env). Del mismo modo, las realizadas
con los cebadores específicos del VIH-1 de grupo M
son negativas.
Las condiciones de amplificación y de
hibridación para las PCR del grupo O se realizan en las condiciones
descritas en Loussert-Ajaka, 1995. Las condiciones
de amplificación y de hibridación para las PCR del grupo M son las
descritas por los autores mencionados a continuación.
Estos cebadores del grupo M se sitúan de acuerdo
con la secuencia HIV-1-HXB2:
- -
- En env gp120: ED3/ED12 (posición 5956-5985; 7822-7792); EDS/ED14 (6556-6581; 7960-7931), EDS/ED12; ED3/ED14; ES7/ES8 (7001-7020; 7667-7647) (Delwart et al., Science 1993; 262 1257-1261).
- -
- En env gp41: primera PCR ED3/M29, seguida de una PCR anidada M28/M29 (7785-7808; 8099-8124); M28/M29 presentan las siguientes secuencias:
- M28 CGGTTCTT(AG)GGAGCAGC(ACT)GGAAGCA,
- M29: T(CT)T(ACGT)TCCCA(CT)T(AT)(CT)A(AGT)CCA(AGT);
- SK68/SK69 (Ou et al., Science 1988, 239, 295-297).
- -
- En gag: Amplicor Roche Diagnostic systems; cebadores gag anidados (Loussert-Ajaka et al., Lancet 1995, 346, 912-913); SK38/SK39 (Ou et al., Science 1988, 239, 295-297).
- -
- En pol: A/NE1 (Boucher et al., Lancet, 1990; 336 585-590), Pol3/Pol4 (Lauré et al., Lancet 1988, ii, 538-541).
\vskip1.000000\baselineskip
Solamente las PCR realizadas con los cebadores H
Pol son positivas (4235/4538) seguida de una PCR anidada con los
cebadores 4327/4481 (Fransen et al., Molecular and Cellular
Probes 1994; 8: 317-322). Este fragmento H Pol,
localizado en la integrasa (260 pb), se secuenció. La amplificación
con los cebadores HPOL se hace posible, debido al exceso de virus.
En efecto, el ADN utilizado se extrae de las células de cultivo
finalizado fuertemente positivo (transcriptasa inversa > 100.000
cpm). La amplificación del ADN extraído de las nuevas células sin
co-cultivo es imposible debido al gran número de
emparejamientos erróneos entre los cebadores HPOL (sobre todo en la
región 3') y la secuencia del aislado YBF30. La conservación de este
extremo 3' es muy importante para la actividad de extensión de la
Taq polimerasa.
- 1
- Secuencia del gen pol: la utilización de cebadores muy degenerados para la amplificación por RT-PCR del ARN extraído del sobrenadante de cultivo positivo, dio una amplificación positiva. Estos son cebadores comunes a todos los retrovirus (Donehower et al., J. Virol. Methods 1990; 28: 33-46), situados en la región de la transcriptasa inversa del gen pol. El análisis del fragmento después de la secuencia permitió generar un cebador específico YRT2 (SEC ID Nº 32) del aislado YBF30 y amplificar el gen pol utilizando el cebador Hpol 4481 (Fransen et al., 1994 mencionado anteriormente), como cebador anti-sentido. La secuencia del fragmento se realizó sintetizando, a medida que se avanzaba, cebadores específicos para cada fragmento generado (figura 1).
- 2
- Secuencia del gen env: el segundo enfoque ha sido realizar una PCR larga (XL-PCR, Perkin Elmer) amplificando todo el virus (9000 pb) utilizando cebadores situados en el LTR: LPBS 1 (SEC ID Nº 22); LSiGi, seguido de una PCR anidada con YRT2 (SEC ID Nº 32)/SK69 de 6000 pb y secuenciar toda la envuelta siguiendo el mismo procedimiento. La secuencia de la región gp41 se realizó utilizando una PCR anidada con los cebadores SK68/LSiGi.
- 3
- Secuencia del gen gag: utilización de una PCR anidada, realizada mediante PCR larga (LPBS 1/LSiGi), con los cebadores Gag 5 y Gag li, y generando, a medida que se avanzaba, cebadores específicos, para recorrer el genoma viral.
\vskip1.000000\baselineskip
La cepa YBF30 se secuenció completamente (véase
la lista de secuencias). La cepa YBF31 de noviembre de 1995 se
secuenció parcialmente y la ausencia de variación significativa
confirma la validez de las secuencias de YBF30.
\vskip1.000000\baselineskip
El estudio de las secuencias de la región del
bucle V3 permitió sintetizar el péptido correspondiente y comparar
los ácidos nucleicos de esta región de la cepa YBF30 con los de los
otros subtipos M y de las cepas O.
Las secuencias de los péptidos son:
- YBF30
- SEC ID Nº 58
- SIV CPZGAB:
- CHRPGNNTRGEVQIGPGMTFYNIENVYGDTRSAYC (SEC ID Nº 59)
- GRUPO O: (ANT70)
- CIRPGNRTYRNLQIGPGMTFYNVEIATGDIRKAFC (SEC ID Nº 60)
- GRUPO M: (SS-TIPO A)
- CTRPNNNTRKSVRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHC (SEC ID Nº 61)
\vskip1.000000\baselineskip
Se sintetizó el péptido, a partir de las 2
asparaginas de la región 5' del bucle y se utilizó de acuerdo con el
mismo principio que se ha descrito anteriormente (véase IV 4), a
saber en competencia con respecto a los péptidos del grupo M, del
grupo O y del SIV CPZGAB. Los resultados ilustrados en la Tabla IV
confirman la originalidad de esta cepa y la extensión posible de
estas cepas ya que los resultados serológicos están a favor de la
infección del tipo YBF30 en Camerún. Además, el estudio de 200
sueros seleccionados positivos para VIH-1 de Camerún
pone de manifiesto un nuevo caso que presenta un perfil similar al
de YBF30.
\vskip1.000000\baselineskip
En este nuevo ensayo, se confirmó la reactividad
de los sueros 953371 y 956295, que corresponden a la paciente en la
que se aisló la cepa YBF30, con el péptido SIV-CPZ.
La menor reactividad con respecto a su propio antígeno V3 es
convencional en las etapas tardías de la enfermedad. Esta
reactividad sin embargo, sigue siendo superior a la constatada con
respecto al péptido M. Otro paciente camerunés (suero 967321)
presenta el mismo perfil de reactividad peptídica.
\vskip1.000000\baselineskip
* Barin et al., Aids Research and
Human Retroviruses, 1996, 12, 13,
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Peptides Representing Consensus Sequences of HIV Type 1 Genotypes A
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1626-1628, Prevalence of HIV subtype O infection in
Cameroon: preliminary results.
\vskip1.000000\baselineskip
Además de lo observado anteriormente, la
invención no se limita en absoluto a aquellos de sus modos de
implementación, de realización y de aplicación que acaban de
describirse de forma más explícita; al contrario, la invención
abarca todas las variantes que pueden ocurrírsele a un especialista
en la técnica, sin alejarse del marco ni del alcance de la presente
invención.
\global\parskip0.000000\baselineskip
(1) INFORMACIONES GENERALES
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- DEPOSITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: INSTITUTO NACIONAL DE LA SALUD Y DE LA INVESTIGACIÓN MÉDICA - INSERM
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 101 rue de Tolbiac
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 75654 CEDEX 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: ASISTENCIA PÚBLICA-HOSPITALES DE PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 3 avenue Victoria
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 75100 RP
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: INSTITUTO PASTEUR
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 28 rue du Docteur Roux
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 75724 Cedex
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: MAUCLERE Philippe
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 2 rue Buhan
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: BURDEOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 33000
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: LOUSSERT-AJAKA Ibitssam
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 26 avenue de la République
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: SARTROUVILLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 78500
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: SIMON François
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 8 rue Germain Pilon
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 75018
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: SARAGOSTI Sentob
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 69 rue de Billancourt
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: BOULOGNE BILLANCOURT
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 92100
\newpage
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: BARRE-SINOUSSI Françoise
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 104 Le Capricorne, 50 rue d'Erevan
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: ISSY LES MOULINEAUX
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 92130
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: CEPAS DE VIH-1 NO M NO O, FRAGMENTOS Y APLICACIONES.
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 61
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- FORMA LEGIBLE POR EL ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE SOPORTE: Floppy disk
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM compatible con PC
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn release Nº 1.0, Versión 1.30 (OEB)
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9183 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 1:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 813 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1539 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..1536
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 512 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3045 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..3042
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1014 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 6:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 579 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..576
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 192 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 288 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..285
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 9:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 95 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 10:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 252 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..249
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 11:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 83 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 12:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 306 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..303
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 13:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 101 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 14:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 369 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..366
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 122 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2559 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..2556
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 852 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 639 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- EMPLAZAMIENTO: 1..636
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 19:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 212 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTGCGTACT CACACTTCCG
\hfill20
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGCAAGCAGG GAGCTGG
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCTTGAGCA GTCTGGAC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAACAGGAGG ATTAGCAG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCAGAGGCT ATGTCACA
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTAAGGCCC CTAGAAGAG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACAGAGAACT CTCTGTAC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAGAAAAGCA GTTGGTAC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTCTTCCCT GTATGTC
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTATATGGA TCTCAGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGCAGCACA TTATACTGG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATCATTTACC AGTACATGGA CGA
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTCAGGGGT CGTAAAGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCTCTGGAT GGGATATG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTATCCAGG AATCAGAG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAATGAGATCT GCCCATAC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGACAGATAG GGGAAGAC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACCGCCATT TGCACTGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACATGGACCG CCACAAGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 40:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCAACAGAC ATACAGAC
\hfill18
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 41:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGTAGTCC CACGTAGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 42:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATATCCCAGT AGGTCAGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 43:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 43:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTAGCACTA ACAGCCTG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 44:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 44:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACTCTTACTG CTCTGAGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 45:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 45:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCATAGTACA CTGTTACC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 46:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATAGCTATC GTTACAAAGC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 47:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCATAATGGC AAAGCCTG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 48:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTATTCCACA TTGGTTCC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 49:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 49:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTCTAGAAC CAGTCCAG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 50:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 50:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCTTAGGGAT CAGCAAATCC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 51:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 51:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGGACAGTC TGTGGAGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 52:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 52:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTCTCAGCTC TTGTCTGG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 53:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 53:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTAAGCAAG CTGATAGC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 54:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 54:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTGCTTCTA GCCAAG
\hfill16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 55:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 55:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCTCCATGTT GACATATG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 56:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 56:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAGAGACCC AGTACAAG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 57:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "CEBADOR"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 57:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATAAAAGCAG CCGCTTCTCG
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 58:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 58:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 59:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 59:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 60:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 60:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC ID Nº 61:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 61:
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (13)
1. Cepa de VIH-1 no M no O,
denominada YBF30, depositada en la Collection Nationale de Cultures
de Microorganismes alojada en el Instituto Pasteur con el número
I-1753, el 2 de julio de 1996.
2. Ácido nucleico aislado, obtenido de la cepa
de acuerdo con la reivindicación 1, caracterizado porque se
selecciona entre el grupo constituido por los ácidos nucleicos de
las siguientes secuencias: SEC ID Nº 1, SEC ID Nº 2, SEC ID Nº 3,
SEC ID Nº 5, SEC ID Nº 7, SEC ID Nº 9, SEC ID Nº 11, SEC ID Nº 13,
SEC ID Nº 15, SEC ID Nº 17 y SEC ID Nº 19.
3. Ácido nucleico aislado, caracterizado
porque está constituido por un fragmento de al menos 10 nucleótidos
de un ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 2.
4. Ácido nucleico de acuerdo con la
reivindicación 3, caracterizado porque se selecciona entre
los ácidos nucleicos de secuencias SEC ID Nº 21 a 57 y porque es
adecuado para servir como cebador y/o como sonda para la detección
de un VIH-1 que presenta las características
morfológicas e inmunológicas de la cepa de VIH-1 no
M no O de acuerdo con la reivindicación 1.
5. Procedimiento de diagnóstico in vitro
de un VIH-1 de grupo no M no O, mediante hibridación
y/o amplificación génica, realizado a partir de una muestra
biológica seleccionada entre una muestra de suero y una muestra de
linfocitos circulantes, procedimiento caracterizado porque
comprende:
- \bullet
- una etapa de extracción del ácido nucleico a detectar, que pertenece al genoma del virus, posiblemente presente en la muestra biológica y, llegado el caso, una etapa de tratamiento del ácido nucleico, con ayuda de una transcriptasa inversa, si este último está en forma de ARN,
- \bullet
- al menos un ciclo que comprende las etapas de desnaturalización del ácido nucleico, de hibridación con al menos una secuencia de acuerdo con la reivindicación 2 o la reivindicación 4 y, si fuera necesario, extensión del híbrido formado, en presencia de reactivos adecuados que comprenden un agente de polimerización y dNTP, y
- \bullet
- una etapa de detección de la posible presencia del ácido nucleico que pertenece al genoma de un virus de tipo VIH-1 de grupo no M no O.
6. Péptido aislado, caracterizado porque
consiste en una secuencia seleccionada entre el grupo constituido
por las secuencias SEC ID Nº 4, SEC ID Nº 6, SEC ID Nº 8, SEC ID Nº
10, SEC ID Nº 12, SEC ID Nº 14, SEC ID Nº 16, SEC ID Nº 18, SEC ID
Nº 20 y SEC ID Nº 58.
7. Péptido de acuerdo con la reivindicación 6,
caracterizado porque es codificado por una molécula de ácido
nucleico definida por una secuencia seleccionada entre el grupo
constituido por las secuencias SEC ID Nº 1, SEC ID Nº 3, SEC ID Nº
5, SEC ID Nº 7, SEC ID Nº 9, SEC ID Nº 11, SEC ID Nº 13, SEC ID Nº
15, SEC ID Nº 17 y SEC ID Nº 19.
8. Composiciones inmunógenas que comprenden uno
o más productos de traducción de las secuencias de nucleótidos de
acuerdo con la reivindicación 2 y/o uno de los péptidos de acuerdo
con la reivindicación 6 o la reivindicación 7.
9. Método de diagnóstico in vitro de un
VIH-1 no M no O, caracterizado porque
comprende la puesta en contacto de una muestra biológica extraída de
un paciente, con anticuerpos dirigidos contra uno o más de los
péptidos de acuerdo con la reivindicación 6 y la detección de los
complejos inmunológicos formados entre los antígenos de
VIH-1, posiblemente presentes en la muestra
biológica y dichos anticuerpos.
10. Método de acuerdo con la reivindicación 9,
caracterizado porque dichos anticuerpos dirigidos contra uno
o más de los péptidos de acuerdo con la reivindicación 6 se asocian
con anticuerpos dirigidos contra el virus SIV CPZGAB.
11. Reactivo de diagnóstico de un
VIH-1 no M no O, caracterizado porque
comprende un ácido nucleico de acuerdo con una cualquiera de las
reivindicaciones 2 y 4 o un péptido de acuerdo con una cualquiera de
las reivindicaciones 6 y 7.
12. Procedimiento de cribado y de tipificación
de un VIH-1 no M no O, caracterizado porque
comprende la puesta en contacto de uno cualquiera de los fragmentos
de nucleótidos de acuerdo con la reivindicación 3 o la
reivindicación 4 con el ácido nucleico del virus a tipificar y la
detección del híbrido formado.
13. Kit de diagnóstico de VIH-1
no M no O, caracterizado porque incluye al menos un reactivo
de acuerdo con la reivindicación 11.
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