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ES2276416T3 - Genes de la rafinosa sinteasa y su uso. - Google Patents

Genes de la rafinosa sinteasa y su uso. Download PDF

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ES2276416T3
ES2276416T3 ES97122417T ES97122417T ES2276416T3 ES 2276416 T3 ES2276416 T3 ES 2276416T3 ES 97122417 T ES97122417 T ES 97122417T ES 97122417 T ES97122417 T ES 97122417T ES 2276416 T3 ES2276416 T3 ES 2276416T3
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ES
Spain
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raffinose
sequence
gene
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ES97122417T
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Eijiro Wantanabe
Kenji Oeda
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Sumitomo Chemical Co Ltd
Original Assignee
Sumitomo Chemical Co Ltd
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Abstract

SE AISLARON DE VARIAS PLANTAS GENES DE RAFINOSA SINTETASA QUE CODIFICAN PROTEINAS CAPACES DE PRODUCIR RAFINOSA AL COMBINAR UN GRUPO D - GALACTOSILO A TRAVES DE UN ENLACE AL (1->6) CON UN GRUPO HIDROXILO UNIDO AL ATOMO DE CARBONO SITUADO EN POSICION 6 DE UN RESIDUO D - GLUCOSA PRESENTE EN UNA MOLECULA DE SUCROSA. ESTOS GENES DE RAFINOSA SINTETASA SON UTILES PARA MODIFICAR EL CONTENIDO DE OLIGOSACARIDOS DE LA FAMILIA DE LA RAFINOSA PRESENTE EN LAS PLANTAS.

Description

Genes de la rafinosa sinteasa y su uso.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a genes de la rafinosa sintetasa y a su uso.
Antecedentes de la invención
Los oligosacáridos de la familia de la rafinosa son derivados de sacarosa, que están representados por o-\alpha-D-galactopiranosil-(1\rightarrow6)n-o-\alpha-D-glucopiranosil-(1\rightarrow2)-\beta-D-flucto-furanósido como fórmula general, y se denominan "rafinosa" cuando n = 1, "estaquiosa" cuando n = 2, "verbascosa" cuando n = 3, y "ajugosa" cuando n = 4.
Los contenidos más altos de semejantes oligosacáridos de la familia de la rafinosa se encuentran en las plantas, excepto para la sacarosa, y se ha sabido que están contenidos no sólo en plantas superiores incluyendo gimnospermas tales como plantas pináceas (v.g., pícea) y angiospermas tales como plantas leguminosas (v.g., soja, judía), plantas brasicáceas (v.g., colza), plantas quenopodiáceas (v.g., remolacha azucarera), plantas malváceas (v.g., algodón), y plantas salicáceas (v.g., chopo), sino también en algas verdes, clorella. Así, se producen ampliamente en el reino de las plantas de una manera similar a la sacarosa.
Los oligosacáridos de la familia de la rafinosa juegan un papel como azúcares de reserva en los órganos de almacenamiento o las semillas de muchas plantas como azúcares de traslocación en el fenómeno del transporte de azúcares entre los tejidos de algunas plantas.
Además, se ha sabido que los oligosacáridos de la familia de la rafinosa tienen el efecto de ofrecer buenas condiciones para la flora enterobacteriana, si estuviera presente en una cantidad adecuada en los alimentos. Por consiguiente, los oligosacáridos de la familia de la rafinosa ya han sido utilizados como sustancia alimenticia funcional para la adición a algunas clases de alimentos y se utilizan en el campo de los alimentos saludables especificados.
Los oligosacáridos de la familia de la rafinosa que tienen semejante papel y utilidad son producidos por el sistema de síntesis de oligosacáridos de rafinosa que comienza con la sacarosa en muchas plantas. El sistema de biosíntesis implica usualmente una reacción para la adición sucesiva de grupos galactosilo a partir de galactinol a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) a un grupo hidroxilo del átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa.
En la primera etapa de este sistema de biosíntesis, la rafinosa sintetasa es una enzima implicada en la reacción de producción de rafinosa combinando un grupo galactosilo del galactinol a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa. Se ha sugerido que esta enzima constituye la etapa limitante de la velocidad en el sistema de síntesis anterior, y se ha revelado que esta enzima es bastante importante en el control de la biosíntesis de los oligosacáridos de la familia de la rafinosa.
El control del nivel de expresión o de la actividad de la rafinosa sintetasa en plantas hace posible cambiar los contenidos de oligosacáridos de la familia de la rafinosa en estas plantas. No obstante, la rafinosa sintetasa, aunque la presencia de esta misma enzima ya fue confirmada en muchas plantas mediante la medición de su actividad con una técnica bioquímica, todavía no ha sido aislada y purificada con éxito en forma de una proteína homogénea. Castillo E. et al., en el Journal of Agricultural and Food Chemistry, vol. 38. núm. 2, pág. 351.5, los autores informan de una purificación doble de rafinosa sintetasa a partir de semillas de soja. Además, la secuencia de aminoácidos de esta enzima es todavía desconocida, y no existe ningún informe sobre el intento de comenzar a aislar un gen que codifique esta enzima.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 muestra la construcción de plásmidos utilizados para la expresión de un gen de la rafinosa sintetasa en Escherichia coli. pBluescriptKS-RS es un plásmido que contiene clonado el gen de la rafinosa sintetasa. RS representa el gen de la rafinosa sintetasa, y las secuencias de nucleótidos mostradas en la porción superior de esta figura son las de ambas porciones terminales del gen de la rafinosa sintetasa. Una secuencia parcial representada por letras pequeñas es una secuencia de nucleótidos derivada del vector pBluescriptII KS-. Las secuencias de nucleótidos enmarcadas son el codón de iniciación (ATG) y el codón de terminación (TGATAA) del gen de la rafinosa sintetasa, respectivamente. Los sitios de reconocimiento para las diferentes endonucleasas de restricción se muestran encima de las secuencias de nucleótidos. pGEX-RS y pTcr-RS son plásmidos utilizados para la expresión del gen de la rafinosa sintetasa en E. coli. Ptac, Ptrc, GST, lacI^{q}, y rrnB representan el promotor tac, el promotor tcr, el gen de la glutation-S-transferasa, el gen represor de la lactosa, y la señal de terminación de la transcripción del ARN ribosómico, respectivamente.
La Figura 2 muestra la construcción de los vectores de expresión utilizados para la expresión en plantas de genes mixtos que tienen cada uno un gen de la rafinosa sintetasa y un promotor conectado. El mapa de endonucleasas de restricción del gen de la rafinosa sintetasa clonado en el plásmido pBluescriptKS-RS se muestra en la porción inferior de esta figura. pBI221RS y pBI221(-)RS indican los mapas de endonucleasas de restricción de los vectores de expresión utilizados en la transformación de la soja. 35S y NOS representan el promotor 35S derivado del virus del mosaico de la coliflor y el terminador del gen de la nopalina sintetasa, respectivamente.
La Figura 3 muestra la construcción de vectores de expresión utilizados para la expresión en plantas de genes mixtos que tienen cada uno un gen de la rafinosa sintetasa y un promotor conectado. El mapa de endonucleasas de restricción del gen de la rafinosa sintetasa clonado en el plásmido pBluescriptKS-RS se muestra en la porción superior de esta figura. pBI121RS y pBI121(-)RS indican los mapas de endonucleasas de restricción de los vectores binarios utilizados para la transformación de la mostaza. Para el vector binario, únicamente se muestra una región entre el límite derecho y el límite izquierdo. 35S, NOS y NPT representan el promotor 35S derivado del virus del mosaico de la coliflor, el terminador del gen de la nopalina sintetasa y el gen de resistencia a la kanamicina, respectivamente.
Descripción detallada de la invención
Los métodos para construir genes descritos más abajo se pueden llevar a cabo según métodos ordinarios, por ejemplo, como se describe en "Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2^{a} edición" (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press, ISBN 0-87969-309-6; "Current Protocols In Molecular Biology" (1987), John Wiley & Sons, Inc. ISBN 0-471-50338-X; y "Current Protocols In Protein Science" (1995), John Wiley & Sons, Inc. ISBN 0-471-11184-8. El término "gen de la rafinosa sintetasa" según se utiliza aquí hace referencia a un gen que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de una proteína capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado a un átomo de carbono en la posición 6 del un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa (referido más adelante como el presente gen), y semejante gen se puede preparar, por ejemplo, a partir de plantas.
Más específicamente, el presente gen se puede preparar a partir de dicotiledóneas tales como plantas leguminosas (v.g., haba, soja) y plantas lamiáceas (v.g., alcachofa) o de plantas monocotiledóneas tales como las plantas gramíneas (v.g., maíz). Los ejemplos específicos del presente gen son un "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1"; un "gen la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene una secuencia de aminoácidos derivada mediante deleción, sustitución, modificación o adición de un aminoácido en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1, y capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa"; un "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 3"; un "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene una secuencia de aminoácidos derivada mediante deleción, sustitución, modificación o adición de un aminoácido en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 3, y capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa"; un "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 5"; y un "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 7."
Adicionalmente, se mencionan las moléculas de ácido nucleico de al menos 15 moléculas de longitud, que hibridan específicamente con una molécula de ácido nucleico como se ha descrito antes o con una hebra complementaria de la misma. La hibridación específica ocurre preferiblemente en condiciones restrictivas e implica una poca o ninguna hibridación cruzada con secuencias de nucleótidos que no codifican (oligo)péptidos o los codifican sustancialmente diferentes. Tales moléculas de ácido nucleico se pueden utilizar como sondas y/o para el control de la expresión génica. La tecnología de sondas de ácido nucleico es bien conocida por los expertos en la técnica que apreciarán fácilmente que tales sondas pueden variar en longitud. Son preferidas las sondas de ácido nucleico de 17 a 50, particularmente preferidas de 21 a 50 nucleótidos de longitud. Por supuesto, también pueden ser apropiado utilizar ácidos nucleicos de hasta 100 y más nucleótidos de longitud. Las sondas de ácido nucleico son útiles para diferentes aplicaciones. Por un lado, pueden ser utilizadas como cebadores de PCR para la amplificación de secuencias reguladoras. Otra aplicación es el uso como sonda de hibridación para identificar moléculas de ácido nucleico que hibridan con una molécula de ácido nucleico de la invención mediante el rastreo de homología de genotecas de ADN genómico. Las secuencias de ácido nucleico que son complementarias a una molécula de ácido nucleico descrita antes también se pueden utilizar para la represión de la expresión de un gen que comprende tales secuencias reguladoras, por ejemplo, debido a un efecto antisentido o de triple hélice o para la construcción de las ribozimas apropiadas (ver, v.g., EP-B1 0 291 533, EP-A1 0 321 201, EP-A2 0 360 257) que escinde específicamente el (pre)-ARNm de un gen que comprende una molécula de ácido nucleico de la invención. La elección de los sitios diana apropiados y de las correspondientes ribozimas se puede realizar como describe por ejemplo Steinecke, Ribozymes, Methods in Cell Biology 50, Galbraith et al. eds. Academic Press, Inc. (1995), 449-460. Además, la persona experta en la técnica está bien enterada de si también es posible marcar semejante sonda de ácido nucleico con un marcador apropiado para aplicaciones específicas, tales como la detección de la presencia de una molécula de ácido nucleico de la invención en una muestra derivada de un organismo.
Las moléculas de ácido nucleico descritas anteriormente pueden ser ADN o ARN o un híbrido de los mismos. Adicionalmente, dicha molécula de ácido nucleico puede contener, por ejemplo, enlaces tioéster y/o análogos de nucleótidos, utilizados comúnmente en enfoques con nucleótidos antisentido. Dichas modificaciones pueden ser útiles para la estabilización de la molécula de ácido nucleico frente a endo- y/o exonucleasas en la célula. Dichas moléculas de ácido nucleico pueden ser transcritas mediante un vector apropiado que contiene un gen mixto que permite la transcripción de dicha molécula de ácido nucleico en la célula. Tales moléculas de ácido nucleico pueden contener adicionalmente secuencias de ribozimas que escinden específicamente el (pre)ARNm que comprende la molécula de ácido nucleico de la invención. Adicionalmente, se pueden diseñar oligonucleótidos que son complementarios a una molécula de ácido nucleico de la invención (triple hélice; ver Lee, Nucl. Acids Res. 6 (1979), 3073; Cooney, Science 241 (1988), 456 y Dervan, Science 251 (1991), 1360), evitándose de ese modo la transcripción y la producción del oligopéptido codificado.
El presente gen se puede obtener, por ejemplo, mediante el siguiente método.
Los tejidos de una planta leguminosa tal como el haba (Vicia faba) o la soja (Glycine max) se congelan en nitrógeno líquido y se trituran físicamente con un mortero u otros medios a restos de tejido en polvo fino. De los restos de tejido, el ARN se extrae mediante un método corriente. Los estuches de extracción de ARN asequibles comercialmente pueden ser utilizados en la extracción. El ARN completo se separa del extracto de ARN mediante precipitación en etanol. Del ARN completo separado, el ARN con colas de poli-A se fracciona mediante un método corriente. Las columnas de oligo-dT asequibles comercialmente se pueden utilizar en el fraccionamiento. El ADNc se sintetiza a partir de la fracción obtenida (es decir, el ARN con colas de poli-A) mediante un método corriente. En la síntesis se pueden utilizar los estuches para la síntesis de ADNc asequibles comercialmente.
Por ejemplo, los fragmentos de ADNc del "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1" como el presente gen se pueden obtener mediante amplificación por PCR utilizando el ADNc obtenido antes como molde y los cebadores 1 a 3 mostrado en la lista 1 de más abajo. Los cebadores utilizados aquí pueden ser diseñados y sintetizados sobre la base de la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 2, dependiendo del propósito. Por ejemplo, con el fin de amplificar la región del marco de lectura abierto del "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1," se pueden diseñar y sinterizar los cebadores 1 a 4 mostrados en la lista 2 de más abajo.
De la misma manera, los fragmentos de ADNc del "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 3" se puede obtener mediante amplificación por PCR con el ADNc derivado de la soja obtenido antes como molde y, por ejemplo, los cebadores 4 a 6 mostrados en la lista 1 de más abajo. Los cebadores utilizados aquí se pueden diseñar y sintetizar sobre la base de la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 4, dependiendo del propósito. Por ejemplo, con el fin de amplificar la región del marco de lectura abierto del "gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 3," se pueden diseñar y sintetizar los cebadores 5 a 8 mostrados en la lista 2 de más abajo.
Los fragmentos de ADN amplificados se pueden subclonar según métodos corrientes, por ejemplo, como se describe en "Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2^{a} edición" (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press; y "Current Protocols In Molecular Biology" (1987), John Wiley & Sons, Inc. ISBN 0-471-50338-X. Más específicamente, la clonación se puede efectuar, por ejemplo, utilizando un estuche de clonación TA (Invitrogen) y un vector plasmídico tal como pBluescript II (Stratagene). Las secuencias de nucleótidos de los fragmentos de ADN clonados se pueden determinar mediante el método de terminación didesoxi, por ejemplo, como describen F. Sanger, S. Nicklen, A.R. Coulson, Proceedings of National Academy of Science U.S.A. (1977), 74, págs. 5463-5467. Por ejemplo, se puede utilizar preferiblemente el estuche ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit comercialmente asequible de Perkin-Elmer.
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Lista 2
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El término "fragmento génico" según se utiliza aquí hace referencia a un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del presente gen (referido de aquí en adelante simplemente como el presente fragmento génico). Por ejemplo, puede ser un fragmento génico derivado de una planta que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del gen que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa. Los ejemplos específicos del presente fragmento génico son un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del gen que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 y un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del gen que tiene una secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 2, más específicamente un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos o una secuencia de nucleótidos parcial del mismo, que codifica cualquiera de las secuencias de aminoácidos mostradas en la lista 3 de más abajo.
Estos fragmentos génicos se pueden utilizar como sondas en el método de hibridación o como cebadores en el método PCR. Para cebadores en el método PCR, se prefiere generalmente que el número de nucleótidos sea mayor desde el punto de vista de que se asegure la especificidad de la hibridación; también se prefiere, no obstante, que el número de nucleótidos no sea mayor desde los puntos de vista de que los propios cebadores tengan la tendencia a tener una estructura mayor haciendo posibles el deterioro de la eficacia de hibridación y de que se requieran procedimientos complicados en la purificación tras la síntesis. En los casos habituales, se prefiere un fragmento génico que consta de un ADN monocatenario, donde el número de nucleótidos está en el intervalo de 15 a 50.
Lista 3
4
5
El presente fragmento génico está marcado, y se utiliza como sonda en el método de hibridación e hibrida con un ADN derivado de un organismo, de manera que se puede detectar el fragmento de ADN que tiene unida específicamente la sonda. Así, a partir de una genoteca génica derivada de un Organismo, se pueden detectar un gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de una enzima capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa; o un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del mismo, (referido más adelante simplemente como el presente método detección).
En cuanto al ADN derivado del Organismo, por ejemplo, se puede utilizar una genoteca de ADNc o una genoteca de ADN genómico de una planta deseada. La genoteca génica puede ser también una genoteca génica asequible comercialmente tal cual o un genoteca preparada según un método de preparación de genotecas corriente, por ejemplo, como se describe en "Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2^{a} edición" (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press; "Current Protocols In Molecular Biology" (1987), John Wiley & Sons, Inc. ISBN 0-471-50338-X.
En cuanto al método de hibridación, se puede emplear hibridación en placa o hibridación de colonias, dependiendo de la clase de vector utilizado en la preparación de la genoteca. Más específicamente, cuando se construye una genoteca que se va a utilizar con un fago vector, un microorganismo huésped adecuado se mezcla con el fago bajo condiciones de infección, que se mezcla adicionalmente con un medio de agar blando, y la mezcla se cultiva en placa sobre un medio de agar. Después de eso, se hace crecer un cultivo a 37ºC hasta que aparece una placa del tamaño apropiado. Cuando una genoteca que se va a utilizar se construye con un vector plasmídico, el plásmido es transformado en un microorganismo huésped adecuado para formar un transformante. El transformante obtenido se diluye hasta una concentración adecuada, y la dilución se cultiva en placa sobre un medio de agar, después de lo cual el cultivo se hace crecer a 37ºC hasta que aparece una colonia del tamaño apropiado.
En cualquiera de los casos de las genotecas anteriores, se coloca un filtro de membrana sobre la superficie del medio de agar después del cultivo, de manera que el fago o el transformante sean transferidos a la membrana. Esta membrana se desnaturaliza con un álcali, seguido de neutralización, y por ejemplo, cuando se utiliza una membrana de nailon, la membrana se irradia con luz ultravioleta, de manera que el ADN se fije sobre la membrana. Esta membrana se somete después a hibridación con el presente fragmento génico marcado mediante un método corriente como sonda. Para este método, se puede hacer referencia, por ejemplo, a D.M. Glover ed., "DNA cloning, a practical approach" IRL PRESS (1985), ISBN 0-947946-18-7. Existen diferentes reactivos y condiciones de reacción que se van a utilizar en la hibridación; por ejemplo, la prehibridación se lleva a cabo mediante la adición de 6 x SSC (NaCl 0,9 M, ácido cítrico 0,9 M), SDS al 0,1-1%, ADN de esperma de salmón de 100 \mug/ml, e incubación a 65°C durante 1 hora. El presente fragmento génico marcado se añade después como sonda, y se mezcla. La hibridación se lleva a cabo a 42-68°C durante 4 a 16 horas. La membrana se lava con 2 x SSC, SDS al 0,1-1%, se enjuaga adicionalmente con 0.2 x SSC, SDS al 0-0,1% SDS, y después se seca. La membrana se analiza, por ejemplo, mediante autorradiografía u otra técnica, para detectar la posición de la sonda sobre la membrana y detectar de ese modo la posición del ADN que tiene una secuencia de nucleótidos homóloga a la de la sonda utilizada. Así, se puede detectar el presente gen o el presente fragmento génico. El clon correspondiente a la posición del ADN detectado de este modo sobre la membrana se identifica sobre gel medio de agar original, y se selecciona el clon positivo, de manera que se pueda aislar el clon que tiene el ADN. Se repiten los mismos procedimientos de detección para purificar el clon que tiene el ADN.
También se pueden utilizar otros métodos de detección, por ejemplo, GENE TRAPPER cDNA Positive Selection System Kit asequible comercialmente de Gibco BRL. En este método, una genoteca de ADN monocatenario se hibrida con el presente fragmento génico biotinilado (es decir, la sonda), seguido de la adición de cuentas magnéticas unidas a estreptavidina y mezclado. De la mezcla, se recogen con un imán las cuentas magnéticas unidas a estreptavidina, de manera que se recoge y se detecta el ADN monocatenario que tiene una secuencia de nucleótidos homóloga a la de la sonda utilizada, que se ha unido a estas cuentas a través del presente fragmento génico, la biotina y la estreptavidina. De este modo, se puede detectar el presente gen o el presente fragmento génico. El ADN monocatenario recogido se puede cambiar a una forma bicatenaria mediante tratamiento con una polimerasa de ADN adecuada utilizando un oligonucleótido adecuado como cebador.
También se puede utilizar el presente método de detección en el análisis de una planta. Más específicamente, se prepara un ADN genómico vegetal según un método corriente, por ejemplo, como se describe en "Cloning and Sequence (Plant Biotechnology Experiment Manual)" compilado bajo la supervisión de Itaru Watanabe, editado por Masahiro Sugiura, publicado por Noson Bunka-sha, Tokyo (1989). El ADN genómico vegetal se digiere con varias clases de endonucleasas de restricción adecuadas, seguido de electroforesis, y el ADN sometido a electroforesis se transfiere a un filtro según un método corriente. Este filtro se somete a hibridación con una sonda preparada a partir del presente fragmento génico mediante un método corriente, y se detectan los fragmentos de ADN con los que hibrida la sonda. La longitud de los fragmentos de ADN detectados se compara entre las diferentes variedades de una especie de planta especificada. Las diferencias de longitud hacen posible el análisis de las diferencias de las características fenotípicas acompañadas de la expresión de los oligosacáridos de la familia de la rafinosa entre estas variedades. Además, cuando se compara la longitud de los fragmentos de ADN detectados mediante el método anterior entre la planta con genes recombinantes y la planta sin genes recombinantes de la misma variedad, la primera planta puede ser diferenciada de la segunda planta por la detección de bandas de hibridación en mayor número o en mayor concentración para la primera planta que para la última planta. Este método se puede llevar a cabo según el método RFLP (polimorfismo en la longitud de los fragmentos de restricción), por ejemplo, como se describe en "Plant PCR Experiment Protocols" compilado bajo la supervisión de Ko Shimamoto y Takuji Sasaki, publicado por Shujun-sha, Tokyo (1995), ISBN 4-87962-144-7, págs. 90-94.
El método PCR que utiliza un cebador que tiene una secuencia de nucleótidos del presente fragmento génico hace posible amplificar a partir de un ADN derivado de un Organismo, un gen de la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de una enzima capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa; o un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del mismo (referido más adelante simplemente como el presente método de amplificación).
Más específicamente, por ejemplo, se sintetiza químicamente un oligonucleótido que tiene de 15 a 50 nucleótidos en la secuencia de nucleótidos del presente fragmento génico en el extremo 3' mediante un método de síntesis corriente. Basándose en la tabla de codones siguiente, que muestra la correspondencia de los aminoácidos codificados en una secuencia de nucleótidos, también se puede sintetizar un cebador mixto de manera que un resto en una posición especificada en el cebador se cambia a una mezcla de varias bases, dependiendo de la variación de codones que pueden codificar un cierto aminoácido.
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(Tabla pasa a página siguiente)
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Tabla de codones
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Además, también se puede utilizar una base capaz de formar un par con clases plurales de bases, tales como la inosina, en lugar de la anterior mezcla de varias bases. Más específicamente, por ejemplo, se pueden utilizar cebadores que tienen una secuencia de nucleótidos como las mostradas en la lista 4. En este contexto, un oligonucleótido que tiene la misma secuencia de nucleótidos que la hebra codificadora del presente gen que consiste en ADN bicatenario se designa "cebador efector", y un oligonucleótido que tiene una secuencia de nucleótidos complementaria a la hebra codificadora, "cebador antisentido".
Un cebador efector que tiene la misma secuencia de nucleótidos que la presente sobre el lado aguas arriba 5' en la hebra codificadora de un gen de la rafinosa sintetasa o un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del mismo que se va a amplificar, y un cebador antisentido que tiene una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos sobre el lado corriente abajo 3' en esta hebra codificadora, se utilizan combinados para la reacción PCR para amplificar un fragmento de ADN, por ejemplo, con una genoteca génica, un ADN genómico o un ADNc como molde. En este momento, la amplificación del fragmento de ADN se puede confirmar mediante un método corriente con electroforesis. Para el fragmento de ADN amplificado, su mapa de endonucleasas de restricción se construye o su secuencia de nucleótidos se determina mediante un método corriente, de manera que se puede identificar el presente gen o el presente fragmento génico. En cuanto a la genoteca génica utilizada aquí, por ejemplo, se puede utilizar una genoteca de ADN genómico de una planta deseada. Para la genoteca génica vegetal, se puede utilizar tal cual una genoteca asequible comercialmente derivada de una planta; o también se puede utilizar una genoteca preparada según un método de preparación de genotecas corriente, por ejemplo, como se describe en "Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2^{a} edición" (1989), Cold Spring Harbor laboratory Press o "Current Protocols in Molecular Biology" (1987), John Wiley & Sons, Inc., ISBN 0-471-50338-X. En cuanto al ADN genómico o al ADNc utilizado en el presente método de amplificación, por ejemplo, se puede utilizar el ADNc o el ADN genómico preparado a partir de una planta deseada.
Más específicamente, por ejemplo, se utiliza un cebador diseñado sobre la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 para el presente método de amplificación con ADNc derivado de la alcachofa japonesa, que es una planta lamiácea, como molde, de manera que se puede amplificar un fragmento génico de la rafinosa sintetasa que tiene la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 6. Además, por ejemplo, se utiliza un cebador diseñado sobre la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 para el presente método de amplificación con ADNc derivado de maíz, que es una planta gramínea, como molde, de manera que se puede amplificar un fragmento génico de la rafinosa sintetasa que tiene la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 8.
Lista 4
7
El presente método de amplificación también se puede utilizar para el análisis de un gen vegetal. Más específicamente, por ejemplo, se utiliza como molde un ADN genómico vegetal preparado a partir de diferentes variedades de una especie vegetal especificada para el presente método de amplificación para amplificar un fragmento de ADN. El fragmento de ADN amplificado se mezcla con una solución de formaldehído, que se desnaturaliza calentando a 85ºC durante 5 minutos, seguido de enfriamiento rápido sobre hielo. Esta muestra se somete a electroforesis, por ejemplo, sobre un gel de poliacrilamida al 60% que contiene el 0% o el 10% de glicerol. En esta electroforesis, se puede utilizar un aparato de electroforesis asequible comercialmente para el SSCP (polimorfismo de la conformación de la hebra sencilla), y la electroforesis se lleva a cabo, mientras que el gel se mantiene a una temperatura constante, v.g., 5ºC, 25ºC o 37ºC. A partir del gel sometido a electroforesis, se detecta un fragmento de ADN, por ejemplo, mediante un método tal como el método de tinción con plata con reactivos asequibles comercialmente.
A partir de las diferencias de comportamiento entre las variedades en la electroforesis del fragmento de ADN detectado, se detecta una mutación en el gen de la rafinosa sintetasa, y se lleva a cabo un análisis en cuanto a las diferencias causadas por la mutación en las características genotípicas acompañadas con la expresión de los oligosacáridos de la familia de la rafinosa. Este método se puede llevar a cabo según el método SSPC, por ejemplo, como se describe en "Plant PCR Experiment Protocols" compilado bajo la supervisión de Ko Shimamoto y Takuji Sasaki, publicado por Shujun-sha, Tokyo (1995), ISBN 4-87962-144-7, págs. 141-146.
También se pueden utilizar el presente método de detección o el presente método de amplificación descritos antes para identificar un gen de la rafinosa sintetasa o un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del mismo y después aislar y purificar el gen o el fragmento génico identificado para obtener el presente gen (referido más adelante simplemente como el presente método de adquisición de genes).
Se puede obtener el presente gen o el presente fragmento génico, por ejemplo, detectando una sonda que consta del presente fragmento génico hibridado a ADN en la genoteca génica derivada del Organismo mediante el presente método de detección como se ha descrito antes para identificar ADN que tiene una secuencia de nucleótidos homóloga a la de la sonda utilizada; purificar un clon que porta el ADN; y aislar y purificar un ADN plasmídico o de fago a partir del clon. Cuando el ADN obtenido de este modo es un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del gen de la rafinosa sintetasa, el rastreo adicional de la genoteca génica mediante el presente método de detección de genes utilizando el ADN como sonda produce el presente gen completo.
El presente gen o el presente fragmento génico pueden ser identificados, por ejemplo, efectuando una reacción en cadena de la polimerasa utilizando un cebador que tenga la secuencia de nucleótidos del presente fragmento génico para amplificar el fragmento de ADN del ADN derivado del Organismo mediante el presente método de amplificación como se ha descrito antes; y después construir un mapa de endonucleasas de restricción o determinar una secuencia de nucleótidos para el fragmento de ADN amplificado. Basándose en la secuencia de nucleótidos del fragmento génico obtenido, se sintetiza un cebador antisentido para el análisis de las secuencias 5' terminales, y se sintetiza un cebador efector para el análisis de las secuencias 3' terminales. La secuencia de nucleótidos del presente gen completo se puede determinar mediante el método RACE utilizando estos cebadores y un estuche asequible comercialmente, v.g., Marathon Kit de Clontech. El presente gen completo se puede obtener sintetizando nuevos cebadores basados en ambas secuencias terminales de la secuencia de nucleótidos así determinada y efectuando de nuevo una reacción en cadena de la polimerasa.
El presente método de adquisición de genes descrito antes hace posible obtener genes de la rafinosa sintetasa como el presente gen de diferentes Organismos. Por ejemplo, un gen que codifica la rafinosa sintetasa que tiene una secuencia de aminoácidos que tiene una homología del 50% o mayor, en la región correspondiente a la longitud de 400 o más aminoácidos, con la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1, y capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa. Más específicamente, por ejemplo, se puede obtener un gen de la rafinosa sintetasa que tiene la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 4 amplificando e identificando un fragmento de ADN que contiene un fragmento génico que tiene una secuencia de nucleótidos parcial del gen de la rafinosa sintetasa mediante el presente método de amplificación utilizando los cebadores diseñados a partir de la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 y un ADNc de soja como molde; aislando y purificando el fragmento de ADN identificado, seguido de los procedimientos anteriores para obtener un gen completo que contiene el fragmento de ADN.
Se pueden construir un gen mixto que comprende el presente gen y un promotor conectado a él (referido más adelante simplemente como el presente gen mixto).
El promotor que se va a utilizar no está particularmente limitado, con tal que funcione en un Organismo huésped que se vaya a transformar. Entre los promotores se pueden incluir, por ejemplo, promotores sintéticos que funcionen en Escherichia coli, tales como el promotor del operón lactosa de E. coli, el promotor del operón triptófano de E. coli y el promotor tac, el promotor del gen de la alcohol deshidrogenasa de levaduras (ADH), el promotor tardío principal de adenovirus (Ad.ML), el promotor temprano de SV40, y el promotor de baculovirus.
Cuando el Organismo huésped es una planta o una célula de la misma, entre los promotores se pueden incluir, por ejemplo, promotores constitutivos derivados de ADN-T tales como el promotor del gen de la nopalina sintetasa (NOS) y el promotor del gen de la octopina sintetasa (OCS); promotores derivados de virus vegetales tales como los promotores 19S y 35S derivados del virus del mosaico de la coliflor (CaMV); promotores derivados tales como el promotor del gen de la fenilalanina-amonio-liasa (PAL), el promotor del gen de la chalcona sintetasa (CHS) y el promotor del gen de la proteína relacionada con la patogénesis (PR). Además, también se puede utilizar el vector pSUM-GY1 (ver JP-A 06-189777/1994), que tiene un promotor que produce una expresión específica en un tejido vegetal especificado, v.g., un promotor del gen de la proteína glicinina de almacenamiento en las semillas derivado de la soja. El uso de un gen mixto construido de manera que tenga semejante promotor hace posible incrementar o disminuir el contenido de oligosacáridos de la familia de la rafinosa en un tejido especificado de una planta.
El presente gen mixto es introducido después en un Organismo huésped según un método de ingeniería genética corriente para dar un transformante. Si fuera necesario, el presente gen mixto se puede utilizar en forma de un plásmido dependiendo del método de transformación para introducir el gen en el Organismo huésped. Además, el presente gen mixto puede contener un terminador. En este caso, se prefiere generalmente que el gen mixto se construya de manera que tenga un terminador aguas abajo del gen de la rafinosa sintetasa. El terminador que se va a utilizar no está particularmente limitado, con tal que funcione en un Organismo huésped que se vaya a transformar. Por ejemplo, cuando el Organismo huésped es una planta o una célula de la misma, entre los terminadores se pueden incluir, por ejemplo, los terminadores constitutivos derivados de ADN-T tales como el terminador del gen de la nopalina sintetasa (NOS); y terminadores derivados de plantas tales como los terminadores GV1 o GV2 de virus de allium.
Si fuera necesario, el presente gen se puede utilizar en forma de plásmido. Por ejemplo, cuando el Organismo huésped es un microorganismo, el plásmido construido es introducido en el microorganismos mediante un método corriente, por ejemplo, como se describe en "Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2^{a} edición" (1989), Cold Spring Harbor laboratory Press o "Current Protocols in Molecular Biology" (1987). John Wiley & Sons, Inc., ISBN 0-471-50338-X. El microorganismo transformado de este modo se selecciona con un marcador tal como resistencia a antibióticos o auxotrofía. Cuando el Organismo huésped es una planta, el plásmido construido es introducido en una célula vegetal mediante un método corriente tal como infección con Agrobacterium (ver JP-B 2-58917/1990 y JP-A 60-70080/1985), electroporación en protoplastos (ver JP-A 60-251887/1985 y JP-B 5-68575/1993) o el método con pistola de partículas (ver JP-A 5-508316/1993 y JP-A 63-258525/1988). La célula vegetal transformada mediante la introducción de un plásmido se selecciona con un antibiótico tal como la kanamicina o la higromicina. A partir de la célula vegetal transformada de este modo, se puede regenerar una planta transformada mediante un método de cultivo de células vegetales corriente, por ejemplo, como se describe en "Plant Gene Manipulation Manual (How to Produce Transgenic Plants)" escrito por Uchimiya, 1990, Kodan-sha Scientific (ISBN 4-06-153513-7), págs. 27-55. Además, la colección de semillas de la planta transformada también hace posible la proliferación de la planta transformada. Además, el cruzamiento entre la planta transformada obtenida y la planta no transformada hace posible producir plantas de progenie con el carácter de la planta transformada.
El contenido de oligosacáridos de la familia de la rafinosa se puede cambiar introduciendo el presente gen en un Organismo huésped o en una célula del mismo, y modificando el metabolismo en el Organismo huésped o en una célula del mismo. En cuanto a semejante método, por ejemplo, se puede utilizar un método de modificación metabólica para incrementar la cantidad de oligosacáridos de la familia de la rafinosa en un Organismo huésped o en una célula del mismo construyendo el presente gen mixto que comprende el presente gen y un promotor conectado, en cuyo caso el presente gen está conectado al promotor en una dirección original adecuada para la transcripción, la traducción, y la expresión como proteína, y después introduciendo el presente gen mixto en el Organismo huésped o en una célula del mismo; o un método para la modificación metabólica para disminuir la cantidad de oligosacáridos de la familia de la rafinosa en un Organismo huésped o una célula del mismo construyendo el presente gen mixto que comprende el presente gen y un promotor conectado, en cuyo caso el presente gen se conecta a un promotor en una dirección inversa inadecuada para la traducción y la expresión como proteína, y después introduciendo el presente gen mixto en el Organismo huésped o en una célula del mismo.
El término "rafinosa sintetasa: proteína" según se utiliza así hace referencia a una proteína codificada en el presente gen (referida más adelante simplemente como la presente proteína). Por ejemplo, puede incluir una proteína enzimática que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 o SEQ ID NO: 3, o que tiene una secuencia de aminoácidos derivada mediante deleción, sustitución, modificación o adición de un aminoácido en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 o SEQ ID NO: 3; y capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo a través de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa.
Los ejemplos específicos de la presente proteína son una proteína enzimática que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 1 (799 aminoácidos; peso molecular, 89 kDa) y una proteína enzimática que tiene el aminoácido del SEQ ID NO: 3 (781 aminoácidos; peso molecular, 87 kDa).
La presente proteína, si bien se puede preparar, por ejemplo, a partir de plantas leguminosas tales como el haba, (Vicia faba), mediante un método bioquímico corriente tal como precipitación con (NH_{4})_{2}SO_{4}, columna de intercambio iónico, columna hidrófoba o columna de filtración en gel, también se puede preparar a partir del Organismo huésped transformado con el presente plásmido, o de una célula del mismo. Más específicamente, por ejemplo, utilizando el GST Gene Fusion Vectors Kit de Pharmacia, el presente gen es insertado en un plásmido vector de expresión anclado al estuche. El plásmido vector resultante es introducido en un microorganismo tal como E. coli según un método de ingeniería genética corriente. Se hace crecer un cultivo del transformante obtenido en un medio con la adición de IPTG (isopropiltio-\beta-D-galactosido), de manera que la presente proteína pueda ser expresada y derivada en forma de una proteína fusionada en el cultivo. La proteína fusionada expresada e inducida se puede aislar y purificar mediante un método corriente tal como rotura de células bacterianas, operación en columna o electroforesis SDS-PAGE. La digestión de la proteína fusionada con una proteína tal como la trombina o el factor Xa de coagulación de la sangre produce la presente proteína. Esto se puede realizar preferiblemente, por ejemplo, según el método descrito en "Current Protocols In Protein Science" (1995), John Wiley & Sons, Inc. ISBN 0-471-11184-8. La actividad de la presente proteína se puede medir, por ejemplo, mediante el método descrito por L. Lehle y W. Tanner, Eur. J. Biochem., 38, 103-110 (1973).
Se puede producir un anticuerpo anti-rafinosa sintetasa capas de unirse a una proteína rafinosa sintetasa (referido más adelante simplemente como el presente anticuerpo) mediante un método inmunológico corriente utilizando la presente proteína preparada antes, como antígeno. Más específicamente, se puede producir el presente anticuerpo, por ejemplo, según el método descrito por Ed Harlow y David Lane, "Antibodies: A Laboratory Manual" (1988), Cold Spring Harbor Laboratory Press, ISBN 0-87969-314-2.
La presente proteína se puede detectar tratando las proteínas de ensayo con el presente anticuerpo y detectando una proteína que tiene el presente anticuerpo unido específicamente. Semejante método de detección se puede llevar a cabo según una técnica inmunológica tal como el método de transferencia Western o el análisis de inmunoabsorción con enzimas ligadas (ELISA), por ejemplo, como describen Ed Harlow y David Lane, "Antibodies: A Laboratory Manual" (1988), Cold Spring Harbor Laboratory Press.
El método de transferencia Western se lleva a cabo, por ejemplo, como sigue: Se extraen las proteínas de una planta, por ejemplo, según el método descrito en Methods in Enzymology, volumen 182, "Guide to Protein Purification," págs. 174-193, ISBN 9-12-182083-1. La composición de un tampón de extracción se puede cambiar adecuadamente dependiendo del tejido vegetal utilizado. Las proteínas extraídas son sometidas a electroforesis según un método SDS-PAGE. Las proteínas sometidas a electroforesis en el gel son transferidas a una membrana mediante transferencia Western con un método eléctrico corriente. Más específicamente, por ejemplo, el gel se sumerge en un tampón de transferencia (Tris 25 mM, glicina 192 mM, metanol al 20%) durante 10 minutos, y después se colocan sobre una membrana PVDF con corte al mismo tamaño que el gel. El gel junto con la membrana se coloca en un aparato de transferencia asequible comercialmente de tipo semi-seco. La transferencia se lleva a cabo a una corriente constante de 0,8 a 2 mA/cm^{2} durante 45 minutos a 1 hora. Las proteínas transferidas a la membrana se pueden detectar inmunológicamente con un estuche para la detección de la transferencia Western utilizando un anticuerpo primario, y un anticuerpo secundario o proteína A, que ha sido marcado con fosfatasa alcalina o peroxidasa de rábano picante. En este momento, la presente proteína sobre la membrana se puede detectar mediante el uso del presente anticuerpo como anticuerpo primario.
En el método ELISA, por ejemplo, la propiedad de las proteínas que se unen a la superficie de una placa ELISA de 96 pocillos elaborada de reina se utiliza en principio para la detección inmunológica de un antígeno que se une por último a la superficie de la placa de ELISA. Las proteínas de ensayo se añaden en forma de solución y se unen a una placa de ELISA, seguido de bloqueo, por ejemplo, mediante la adición de PBS conteniendo una proteína tal como seralbúmina bovina al 5%. Después de eso, el pocillo se lava con PBS, a lo que se añade una solución que contiene el presente anticuerpo para efectuar la reacción. Después de lavar el pocillo, se añade adicionalmente al pocillo una solución que contiene un anticuerpo secundario marcado con fosfatasa alcalina o peroxidasa de rábano picante, seguido de lavado. Finalmente, se añade al pocillo una solución sustrato para la detección, y se detecta el desarrollo de color con un lector de ELISA.
Ejemplos
La presente invención se ilustrará adicionalmente mediante los siguientes ejemplos.
Ejemplo 1 Purificación de Galactinol
Aproximadamente 250 ml de melazas residuales de remolacha azucarera se diluyeron cinco veces con metanol. La dilución se centrifugó a 21.400 x g durante 15 minutos a la temperatura ambiente para eliminar la materia insoluble. El sobrenadante obtenido se transfirió a un matraz Erlenmeyer de 2 litros, a lo que se añadió en porciones isopropanol a la mitad de su volumen agitando. El matraz se dejó a la temperatura ambiente durante un momento hasta que el precipitado resultante se adhirió al matraz. El sobrenadante se descartó después mediante decantación. Al precipitado se le añadieron 500 ml de etanol, y la mezcla se lavó agitando con un aparato de sacudimiento rotatorio. El lavado se repitió adicionalmente varias veces. El precipitado lavado se separó de la pared del matraz rascando, seguido de secado con aire sobre un papel de filtro. El precipitado secado con aire (polvo seco) se disolvió en agua purificada hasta aproximadamente el 40% (p/v). A esta solución se le añadió AG501-X8(D) de BioRad, seguido de agitación. Esta operación se repitió hasta que casi no se observó color en la solución. La solución resultante se trató con una columna Sep-Pak QMA de Millipore, y se pretrató adicionalmente con columnas Sep-Pak CM, Sep Pak C18 y Sep Pak Silica de Millipore. La solución resultante se cargó a un volumen de 5 ml en una columna Wako-gel LP40C18 (Wako Pure Chemical Industries, 2,6 cm x 85 cm), y se hizo eluir con agua purificada. El contenido de azúcar del eluato se midió con un refractómetro para azúcares portátil, y se analizó la composición de azúcares mediante cromatografía líquida de alta resolución (HPLC) con una columna Sugar-pak Na (7,8 mm x 300 mm) de Millipore. La detección de los azúcares se llevó a cabo con un Refractómetro Diferencial modelo 410 de Waters. El eluato que contenía galactinol se liofilizó, y el polvo liofilizado resultante se disolvió en 5 ml de agua purificada. La solución se cargó en una columna TOYOPEARL HW40(S) (Toso, 2,6 cm x 90 cm), y se hizo eluir con agua purificada. El eluato se analizó de la misma manera que se ha descrito antes, de manera que se obtuvo galactinol purificado.
El galactinol obtenido se mantuvo a 25ºC durante 40 minutos en la mezcla de reacción que pasó a contener tampón fosfato 80 mM (pH 6,5), galactinol de 2 mg/ml, y 8,3 U de \alpha-galactosidasa (Boehringer Mannheim, E. coli productor en exceso 662038). La mezcla de reacción se extrajo con cloroformo, y la capa de agua se analizó mediante HPLC. Se confirmó que el galactinol resultante era hidrolizado en galactosa y mio-inositol.
Ejemplo 2 Medición de la Actividad Rafinosa Sintasa
Se midió la actividad de la rafinosa sintetasa en las siguientes condiciones según la descripción de L. Lehle y W. Tanner, Eur. J. Biochem., 38, 103-110 (1973).
Primero, se añadieron 2 \mul de una muestra que se iba a utilizar en la medición de la actividad a 18 \mul de la mezcla de reacción que pasó a contener Tris-HCl 100 mM (pH 7,4), DTT (ditiotreitol) 5 mM, BSA al 0,01%, sacarosa 200 \muM, galactinol 5 mM, sacarosa[C^{14}] de 740 kBq/ml (31,7 \muM), y la mezcla de reacción se mantuvo a 37ºC durante 3 a 20 horas. Tras la reacción, se añadieron 30 \mul de etanol a la mezcla de reacción, seguido de agitación y centrifugación a 15.000 rpm durante 5 minutos. El sobrenadante se aplicó a un volumen de 5 \mul sobre una placa de HPTLC de celulosa para la cromatografía en capa fina (Merck, 10 cm x 20 cm), y se desarrolló con n-butanol : piridina : agua : ácido acético = 60 : 40 : 30 : 3. La placa desarrollada se secó y después se analizó cuantitativamente con un analizador de imágenes (Fuji Photographic Film, FUJIX Bio Imaging Analyzer BAS-2000II) para la determinación de la rafinosa[C^{14}] producida.
Ejemplo 3 Purification de la Rafinosa Sintasa
La purificación de la rafinosa sintetasa a partir de haba se llevó a cabo como sigue: Para cada solución de proteína purificada, las proteínas presentes en la solución de proteína se analizaron mediante SDS-PAGE (Daiichi Kagaku Yakuhin), y se midió la actividad enzimática de la misma según el método descrito en el Ejemplo 2.
Primero, se descongelaron y se pelaron 300 de semillas inmaduras de haba (Nintoku Issun) almacenadas a -80ºC. Las semillas peladas se colocaron en 600 ml de Tris-HCl 100 mM (pH 7,4), DTT (ditiotreitol) 5 mM, EDTA 1 mM, PMSF 1 mM (fluoruro de fenilmetilsulfonilo) y benzamida 1 mM, y se trituraron sobre hielo con un mortero. El material triturado se centrifugó a 21.400 x g durante 50 minutos a 4ºC. Al sobrenadante resultante se le añadieron polietilenimina al 10% (pH 8,0) a 1/20 en volumen. La mezcla se agitó a 4ºC durante 15 minutos, y se centrifugó a 15.700 x g durante 20 minutos a 4ºC. Al sobrenadante resultante se le añadieron 196 g/l de (NH_{4})_{2}SO_{4} agitando. La mezcla se agito sobre hielo durante 30 minutos, y se centrifugó a 15.700 x g durante 20 minutos a 4ºC. Al sobrenadante resultante se le añadieron adicionalmente 142 g/l of (NH_{4})_{2}SO_{4} agitando. Después de la agitación en hielo durante 30 minutos, la mezcla se centrifugó a 15.700 x g durante 20 minutos a 4ºC. El precipitado resultante se disolvió en 50 ml de Tris-HCl 100 mM (pH 7,4) y DTT (ditiotreitol) 5 mM, y la solución se sometió a diálisis frente a Tris-HCl 20 mM (pH 7,4), DTT (ditiotreitol) 1 mM y EDTA 1 mM a 4ºC durante la noche. Tras la diálisis, la suspensión se centrífugo a 70.000 x g durante 60 minutos a 4ºC. Al sobrenadante resultante se le añadió benzamidina 1 mM \cdot HCl, ácido \varepsilon-amino-n-capróico 5 mM, antipaína de 1 \mug/ml, leupeptina de 1 \mug/ml y EGTA 10 mM, y se añadió adicionalmente KCl 2 M en porciones a un volumen de 1/40. La mezcla se cargó en una columna DEAE-Sephacell (Pharmacia, 2,5 cm x 21,5 cm) equilibrada con KCl 0,05 M, Tris-HCl 20 mM (pH 7,4), DTT (ditiotreitol) 1 mM y EDTA 1 mM, y las proteínas absorbidas se hicieron eluir con un gradiente de KCl de 0,05 a 0,5 M. Las etapas de purificación hasta esta fase se repitieron tres veces, y las fracciones que tenían actividad rafinosa sintasa se combinaron y después se purificaron como sigue:
A la fracción eluida que tenía actividad rafinosa sintetasa se le añadió en porciones (NH_{4})_{2}SO_{4} saturado a un volumen de 1/4. La solución se cargó en una columna Phenyl-Sepharose (Pharmacia, 2,5 cm x 10,2 cm) equilibrada con (NH_{4})_{2}SO_{4} saturado al 20%, Tris-HCl 20 mM (pH 7,4), DTT (ditiotreitol) 1 mM y EDTA 1 mM, y las proteínas absorbidas se hicieron eluir con un gradiente de (NH_{4})_{2}SO_{4} del 20% al 0%. La fracción activa resultante se diluyó mediante la adición de tampón fosfato de potasio 0,01 M (pH 7,5) al doble del volumen. La solución diluida se cargó en una columna Econo-Pac 10DG (BioRad, 5 ml) equilibrada previamente con tampón fosfato de potasio 0.01 M (pH 7,5) y DTT (ditiotreitol) 2 mM, y las proteínas absorbidas se hicieron eluir con un gradiente de tampón fosfato de potasio de 0,01 a 0,5 M (pH 7,5) y DTT (ditiotreitol) 2 mM. Se encontró que la fracción activa obtenida en esta fase había sido purificada hasta 6.500 veces o una actividad específica superior. Parte de la solución de proteína purificada que tenía actividad rafinosa sintetasa se cargó en una columna Superdex 200 (Pharmacia, 1,6 cm x 60 cm) equilibrada con KCl 0,2 M, Tris-HCl 20 mM (pH 7,4), DTT (ditiotreitol) 1 mM y EDTA 1 mM. Las proteínas purificadas separadas de este modo se sometieron a SDS-PAGE, y se midió la actividad rafinosa sintetasa. Se identificó que una banda de proteína que tenía actividad rafinosa sintetasa tenía un peso molecular de aproximadamente 90 kDa en la SDS-PAGE.
Ejemplo 4 Análisis de la Secuencia de Aminoácidos Parcial de la Rafinosa Sintasa
A aproximadamente 1 ml de la solución de proteína purificada, que había sido purificada con una columna Econo-Pac 10DG (BioRad, 5 ml) en el Ejemplo 3, se le añadió TCA al 100% a un volumen de 1/9, y la mezcla se dejó sobre hielo durante 30 minutos. Después de la centrifugación a 10.000 x g durante 15 minutos, el precipitado resultante se suspendió en 500 \mul de acetona fría (-20ºC), seguido de centrifugación adicional. Se repitió este lavado con acetona, y el precipitado recogido se secó y después se disolvió en 200 \mul de tampón de muestra de SDS, seguido de SDS-PAGE. Se efectúo una tinción CBB para el gel sometido a electroforesis, del cual se cortó la banda de una proteína rafinosa sintetasa.
Al gel recogido de este modo se le añadió 1 ml de acetonitrilo al 50% y carbonato de amonio 0,2 M (pH 8,9), y el lavado continuó agitando a la temperatura ambiente durante 20 minutos. El gel se lavó de nuevo una vez de la misma manera, y se secó a presión reducida hasta un grado que produjo una reducción de volumen. A este gel se le añadieron 1 ml de Tween-20 al 0,02% y carbonato de amonio 0,2 M (pH 8,9), y la mezcla se agitó a la temperatura ambiente durante 15 minutos. Después de separar la solución, se añadieron 400 \mul de urea 8 M y NH_{4}HCO_{3} 0,4 M, a la se que se añadieron adicionalmente 40 \mul de DTT (ditiotreitol) 45 mM, y la mezcla se dejó a 50°C durante 20 minutos. Tras el retorno completo a la temperatura ambiente, se añadieron 4 \mul de ácido yodoacético 1 M, y la mezcla se agitó en la oscuridad a la temperatura ambiente durante 20 minutos. Tras la separación de la solución, se añadió 1 ml de agua purificada, y la mezcla se agitó a la temperatura ambiente durante 5 minutos, seguido de lavado. Tras dos lavados adicionales, se añadió 1 ml de acetonitrilo al 50% y carbonato de amonio 0,2 M (pH 8,9), y la mezcla se agitó a la temperatura ambiente durante 15 minutos. Se repitió el mismo tratamiento de nuevo una vez, después de lo cual se separó la solución, y el gel se secó a presión reducida hasta el grado que se produjo una reducción de volumen.
A este gel se le añadió una solución de Proteasa I de Acromobacter (Takara, Residue-specific Protease Kit) a un volumen de 100 \mul. Se añadió nuevamente Tween-20 al 0,02% y carbonato de amonio 0,2 M (pH 8,9) hasta un grado que el gel no era expuesto desde la superficie de la solución, y la mezcla se dejó a 37ºC durante 42 horas. Se añadieron adicionalmente 500 \mul de TFA al 0,09% y acetonitrilo al 70%, y la mezcla se agitó a la temperatura ambiente durante 30 minutos. La mezcla resultante contenida en un tubo de muestra se hizo flotar en un baño ultrasónico, seguido de tratamiento ultrasónico (BRANSON, potencia de entrada 60 W) durante 5 minutos. El tubo y el contenido tratado de este modo se centrifugaron, y el extracto resultante se recogió en otro tubo de muestra recubierto de silicona. Por otro lado, se añadieron de nuevo 500 \mul de TFA al 0,09% y acetonitrilo al 70% al precipitado, seguido de la extracción repetida de la misma manera que se ha descrito antes. Los extractos resultantes se combinaron y después se concentraron a presión reducida hasta el grado que se producía una solución que permanecía a un volumen de 200 a 300 \mul. Al producto concentrado se le añadieron 25 \mul de urea 8 M y NH_{4}HCO_{3} 0.4 M, y la mezcla se concentró hasta el punto que se produjo una solución que permanecía a un volumen de 100 \mul o menos. El producto concentrado se llevó a aproximadamente 100 \mul con agua purificada, y la mezcla se filtró a través de un filtro Ultrafree C3 GV (Millipore). El producto filtrado obtenido se sometió después a elución a través de una columna Aquapore BU-300 C-4 (2.1 mm x 300 mm) con un gradiente de TFA al 0,1%/acetonitrilo del 2,1% al 68,6%. Se verificó la absorbancia a 215 nm para recoger una fracción en un pico de la misma. La muestra recogida se evaporó a presión reducida hasta una sequedad completa, y después se analizó con un Protein Sequencer 473A de ABI para determinar la secuencia de aminoácidos parcial de una rafinosa sintetasa.
Ejemplo 5 Preparación de ADNc
Se congelaron aproximadamente 2 g de semillas inmaduras de haba (Nintoku Issun) en nitrógeno líquido y después se trituraron con un mortero, al cual se añadieron 20 ml de Isogen (Nippon gene), y la mezcla se trituró más cuidadosamente. El material triturado se transfirió a un tubo de centrifugación, al cual se añadieron 4 ml cloroformo, y la mezcla se agitó con un mezclador de vórtice y después se centrifugó a 6.500 x g durante 10 minutos a 4ºC. El precipitado resultante se lavó con 10 ml de etanol al 70% y después se disolvió en 1 ml de tampón de elución (Tris-HCl 10 mM (pH 7,5), EDTA 1 mM, SDS al 0,1%). La solución se dejó a 60ºC durante 10 minutos y después se centrifugó a 10.000 x g durante 1 minuto para eliminar la materia insoluble. Al sobrenadante resultante se le añadió un volumen equivalente de Oligotex-dT30 (Takara), y la mezcla se agitó y después se dejó a 65ºC durante 5 minutos. La mezcla se colocó sobre hielo y después se dejó 3 minutos, a lo que se añadieron 200 \mul de NaCl 5 M, y la mezcla se dejó a 37ºC durante 10 minutos. La mezcla se centrifugó después a 10.000 x g a 4ºC durante 3 minutos. El precipitado se recogió y después se suspendió en 1 ml de tampón TE, y la suspensión se dejó a 65ºC durante 5 minutos, que se colocó sobre hielo y después se dejó durante 3 minutos, seguido de centrifugación a 10.000 x g durante 3 minutos a 4ºC para eliminar el precipitado.
Al sobrenadante resultante se le añadieron 100 \mul de acetato de sodio 3 M y 2 ml de etanol, y el ARN se precipitó con etanol y se recogió. El ARN recogido se lavó dos veces con etanol al 70% y después se disolvió en 20 \mul de agua esterilizada, que se utilizó para la posterior síntesis de ADNc. La cantidad de ARN obtenida se determinó mediante la medida de la absorbancia a 260 nm.
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Para la síntesis de ADNc, se utilizaron First Strand Synthesis Kit para RT-PCR (Amercham) y cDNA Synthesis Kit (Takara), y todas las operaciones se realizaron según el protocolo.
Ejemplo 6 Análisis de la secuencia de nucleótidos del Gen de la Rafinosa Sintasa a partir de ADNc
Basándose en la secuencia de aminoácidos obtenida en el Ejemplo 4, se sintetizaron cebadores de ADN sintéticos mixtos que tenían las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 5 más abajo. Se llevó a cabo el método de la PCR con Gene Amp PCR Systems 2400 y DNA Thermal Cycler Model 480 de Perkin-Elmer utilizando Advantage Klen Taq cDNA Kit de Clontech. La reacción en cadena de la polimerasa se efectuó con los cebadores anteriores a 94ºC durante 1 minuto, a 50ºC durante 3 minutos, y a 72ºC durante 3 minutos, y esta reacción se repitió cuarenta veces. Como resultado, las combinaciones de cebadores 8.2 y 13.3RV, cebadores 13.4 y 10.3RV, y cebadores 7.4 y 10,3RV, que tenían las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 5 más abajo, daban una amplificación de las bandas de 1,2 kb, 0,5 kb, y 1,2 kb, respectivamente. Estos fragmentos de ADN amplificados se clonaron con un estuche de clonación TA (Invitrogen), seguido de reacción de la secuencia utilizando ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit de Perkin-Elmer y el análisis de la secuencia de nucleótidos con un secuenciador de ADN 373S de ABI. Como resultado, se encontró que estos fragmentos de ADN tenían una secuencia de nucleótidos que se extendía desde la base 813 a la base 1915, de la base 1936 a la base 2413, y de la base 1226 a la base 2413, respectivamente, en la secuencia de nucleótidos del SEC ID NUM: 2. Basándose en estas secuencias de nucleótidos, se prepararon los cebadores de ADN sintéticos que tenían las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 6 más abajo, y se analizaron las secuencias de nucleótidos de ambas regiones terminales de ADNc con Marathon cDNA Amplification Kit de Clontech. Como resultado, se determinó finalmente la secuencia de nucleótidos del SEC ID NUM: 2.
Lista 5
9
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Lista 6
10
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Ejemplo 7 Clonación del Gen de la Rafinosa Sintetasa de ADNc de Haba
Se sintetizaron los cebadores diseñados a partir de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NO: 1, es decir, los cebadores que tienen la secuencia de nucleótidos mostrada en la lista 7 más abajo. Utilizando estos cebadores y el ADNc obtenido en el Ejemplo 5 como molde, se amplificó mediante PCR un fragmento de ADN de la región del marco de lectura abierto en las condiciones descritas en el Ejemplo 6. El fragmento de ADN amplificado se digirió con las endonucleasas de restricción Bam HI y Xba I cuyas secuencias de reconocimiento estaban contenidas en los cebadores utilizados. Utilizando el Ligation Kit (Takara), se clonó el fragmento de ADN digerido de este modo en el plásmido pBluescriptII KS- (Stratagene) previamente digerido con Bam HI y Xba I. La secuencia de nucleótidos del fragmento de ADN clonado se confirmó con el ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit de Perkin-Elmer. En el clon obtenido de este modo, se encontró que la base de la posición 1591 de la secuencia de nucleótidos de SEC ID NO: 2 se había cambiado de timina (T) a citosina (C). Esta era, no obstante, una mutación terminadora sin cambio de aminoácido; por lo tanto, este clon se denominó pBluescriptKS-RS, y se utilizó en el siguiente experimento.
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Lista 7
12
Ejemplo 8 Expresión del Gen de la Rafinosa Sintetasa de Haba en E. coli
El plásmido pBluescriptKS-RS que tenía el gen de la rafinosa sintetasa de haba obtenido en el Ejemplo 7 se digirió con Bam HI y Not I, y se clonó en el plásmido pGEX-4T3 (Pharmacia) digerido con Bam HI y Not I para dar el plásmido pGEX-RS como se muestra en la Figura 1.
El plásmido pBluescriptKS-RS se digirió con Nco I y Xba I, y se clonó en el plásmido pTrc99A (Pharmacia) digerido con Nco I y Xba I para dar el plásmido pTrc-RS como se muestra en la Figura 1.
Estos plásmidos se introdujeron en la cepa HB101 de E. coli, y los transformantes resultantes se utilizaron para la confirmación de la expresión de la rafinosa sintetasa. Los cultivos de los transformantes de una noche se inocularon a un volumen de 1 ml cada uno en 100 ml de medio LB y se incubaron a 37ºC durante aproximadamente 3 horas, seguido de la adición de IPTG (isopropiltio-\beta-D-galactosido) a una concentración final de 1 mM y de una incubación adicional de 5 horas. Los cultivos se centrifugaron a 21.400 x g durante 10 minutos, y se recogieron las células bacterianas. Las células bacterianas recogidas se almacenaron a -80ºC. A las células bacterianas se añadió diez veces el volumen de Tris-HCl 100 mM (pH 7,4), EDTA 1 mM, DTT 5 mM (ditiotreitol), PMSF 1 mM (fluoruro de feniltrimetilsulfonilo) y benzamida 1 mM, y las células bacterianas se descongelaron y se suspendieron. Estas suspensiones se trataron con una desorganizador ultrasónico (Branson) para efectuar la desorganización de las células bacterianas. Las mezclas de células desorganizadas obtenidas se centrifugaron a 16.000 x g durante 10 minutos, y se recogieron las soluciones de proteína soluble.
Las soluciones de proteínas obtenidas de este modo se utilizaron a un volumen de 4 \mul cada una para la medida de la actividad de la rafinosa sintetasa según el método descrito antes. La reacción se efectuó a 37ºC durante 64 horas. Como control, se utilizó la cepa HB101 de E. coli que había sido transformada con uno de los vectores, pGEX-4T3. Los resultados se muestran en la Tabla 1. La síntesis de la rafinosa se detectó en las muestras de los transformantes HB101 (pGEX-RS) y HB101 (pTrc-RS).
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TABLA 1
13
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Ejemplo 9 Clonación del Gen de la Rafinosa Sintetasa a partir de ADNc de Soja)
De la misma manera que se describe en el Ejemplo 5, se obtuvo ADNc de semillas inmaduras de soja (Glycine max) Williams 82. Utilizando este ADNc como molde y los cebadores diseñados a partir de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NO: 1, es decir, cebadores que tienen las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 8 más abajo, se amplificó un fragmento de ADN mediante PCR en las condiciones descritas en el Ejemplo 6. El fragmento de ADN amplificado de este modo mediante PCR se clonó con un estuche de clonación TA (Invitrogen), seguido de reacción de la secuencia utilizando el ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit de Perkin-Elmer y el análisis de la secuencia de nucleótidos con un secuenciador 373S DNA de ABI. Basándose en esta secuencia, se sintetizaron cebadores que tenían las secuencias de nucleótidos mostradas en el lista 9 más abajo. La síntesis de ADNc se llevó a cabo con Marathon Kit de Clontech utilizando el ARNm obtenido de la misma manera que en el Ejemplo 1 a partir de hojas de soja Williams 82. El ADNc obtenido se ligó aun adaptador contenido en este estuche con ligasa. Esta operación se realizó según el protocolo adjunto. Utilizando el ADNc ligado al adaptador preparado de este modo, se efectuó la reacción en cadena de la polimerasa con los cebadores utilizados en la lista 9 más abajo. Las secuencias de nucleótidos de ambas regiones terminales del gen se analizaron según el protocolo adjunto al Marathon Kit de Clontech. Como resultado, se determinó la secuencia de nucleótidos del SEC ID NO: 4.
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Lista 8
14
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Lista 9
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Ejemplo 10 Adquisición del Gen de la Rafinosa Sintetasa a partir de ADNc de alcachofa Japonesa
De la misma manera que se ha descrito en el Ejemplo 5, se obtuvo ADNc de hojas de alcachofa Japonesa (Stachys sieboldii). Utilizando esta ADNc como molde y los cebadores diseñados a partir de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NO: 1, es decir, los cebadores que tienen las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 10 más abajo, se amplificó un fragmento de ADN mediante PCR en las condiciones descritas en el Ejemplo 6. El fragmento de ADN amplificado de este modo mediante PCR se clonó con un estuche de clonación TA (Invitrogen), seguido de reacción de la secuencia utilizando el ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit de Perkin-Elmer y el análisis de la secuencia de nucleótidos con un secuenciador 373S DNA de ABI. Como resultado, se determinó la secuencia del SEC ID NO: 6.
Basándose la secuencia de nucleótidos obtenida de este modo, se prepararon los cebadores de ADN sintetizado, y de la misma manera que se describe en el Ejemplo 9, se analizan las secuencias de nucleótidos en ambas regiones terminales del gen con el Marathon Kit de Clontech.
Lista 10
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Ejemplo 11 Adquisición del Gen de la Rafinosa Sintetasa a partir de ADNc
De la misma manera que se describe en el Ejemplo 5, se obtuvo ADNc a partir de hojas de maíz (Zea mays) Pioneer 3358. Utilizando este ADNc como molde y los cebadores diseñados a partir de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NO: 1, es decir, cebadores que tienen las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 11 más abajo, se amplificó un fragmento de ADN mediante PCR en las condiciones descritas en el Ejemplo 6. El fragmento de ADN amplificado de este modo mediante PCR se clonó con un estuche de clonación TA (Invitrogen), seguido de reacción de la secuencia utilizando el ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit de Perkin-Elmer y el análisis de la secuencia de nucleótidos con un secuenciador 373S DNA de ABI. Basándose en esta secuencia, se sintetizaron cebadores que tenían las secuencias de nucleótidos mostradas en el lista 12 más abajo. De la misma manera que se describe en el Ejemplo 5, se conectó el ARNm obtenido de hojas de maíz (Zea mays) Pioneer 3358 con un adaptador contenido en el Marathon Kit de Clontech con ligasa. Esta operación se realizó según el protocolo adjunto. Utilizando el ADNc ligado al adaptador preparado de este modo, se efectuó la reacción en cadena de la polimerasa de la misma manera que se ha descrito antes con los cebadores mostrados en la lista 12 más abajo. Como resultado, se determinó la secuencia de nucleótidos del SEC ID NO: 8.
Basándose en la secuencia de nucleótidos obtenida de esta modo, se preparan cebadores de ADN sintetizados, y de la misma manera que se describe en el Ejemplo 9, se analiza la secuencia de nucleótidos de la región 5'-terminal con el Marathon Kit of Clontech.
Lista 11
18
Lista 12
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Ejemplo 12 Construcción de Vectores de Expresión en Plantas para Genes Mixtos, Gen de la Rafinosa Sintetasa de Haba 35S
El plásmido pBluescriptKS-RS que tenía el gen de la rafinosa sintetasa de haba obtenido en el Ejemplo 7 se digirió con las endonucleasas de restricción Bam HI y Sac I. Utilizando el Ligation Kit (Takara), el fragmento de ADN digerido de este modo se clonó en el vector binario Pbi121 (Clontech) previamente digerido con Bam HI y Sac I. El vector obtenido de este modo se designó pBI121-RS.
Para un experimento antisentido, se ligó el plásmido pBI121 (Clontech) previamente digerido con Bam HI y Sac I con los conectores mostrados en la lista 13 más abajo para dar pBI121(-). Este pBI121(-) se utilizó para preparar pBI121(-)RS de la misma manera que se ha descrito para la preparación de pBI121-RS antes.
Se preparó un vector similar con pBI221. El plásmido pBluescriptKS-RS obtenido en el Ejemplo 7 se digirió con las endonucleasa de restricción Bam HI y Sac I. Utilizando el Ligation Kit (Takara), se clonó el fragmento de ADN digerido de este modo en el vector pNI221 (Clontech) previamente digerido con Bam HI y Sac I. El vector obtenido de este modo se designó pBI221-RS.
Para un experimento antisentido, se ligó el plásmido pBI221 (Clontech) previamente digerido con Bam HI y Sac I a los conectores mostrados en la lista 13 más abajo para dar pBI221(-). Este pBI221(-) se utilizó para preparar pBI221(-)-RS de la misma manera que se descrito para la preparación de pBI221-RS anterior.
La construcción de estos vectores de expresión se muestra en las Figuras 2 y 3.
Lista 13
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Ejemplo 13 Transformación de Mostaza con el Gen de la Rafinosa Sintetasa de Haba
Se utilizaron los vectores pBI121-RS y pBI121(-)-RS preparados en el Ejemplo 12 para la transformación de mostaza (Brassica juncia) mediante el método de infección con Agrobacterium.
Se transformó Agrobacterium tumefaciens (cepa C58C1, resistente a rifampicina) que se había hecho pasar previamente a un estado competente mediante tratamiento con cloruro de calcio independientemente con dos plásmidos pBI121-RS y pBI121(-)-RS preparados en el Ejemplo 12. Se llevó a cabo la selección de los transformantes en medio LV que contenía 50 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina utilizando el carácter de resistencia a kanamicina conferido por el gen de resistencia a la kanamicina (neomicin fosfotransferasa, NPTII) de los plásmidos introducidos.
El Agrobacterium transformante obtenido (cepa C58 de Agrobacterium tumefaciens, resistente a rifampicina) se cultivó sobre medio LB que contenía 50 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina a 28ºC durante un día y una noche completos, y se utilizó el cultivo para la transformación de la mostaza mediante el método descrito más abajo.
Las semillas de mostaza se sembraron asépticamente en medio 1/2 MS, sacarosa al 2%, agar al 0,7%. Al cabo de una semana, se cortaron los cotiledones y los pecíolos de las plantas con retoños con un escalpelo, y se transfirieron a medio MS, sacarosa al 3%, agar al 0,7%, MBA 4,5 \muM, 2,4-D 0,05 \muM, AgNO_{3} 3,3 \muM, seguido de cultivo previo durante 1 día. Los cotiledones y los pecíolos precultivados se transfirieron a una dilución a la milésima del cultivo de Agrobacterium para causar la infección durante 5 minutos. Los cotiledones y los peciolos infectados se transfirieron de nuevo al mismo medio y se utilizaron en el cultivo previo, y se cultivaron durante 3 a 4 días. Los cotiledones y peciolos cultivados se transfirieron a medio MS, sacarosa al 3%, BA 4,5 \muM, 2,4-D0,05 \muM, AgNO_{3} 3,3 \muM, 500 mg/litro de cefotaxim, y se esterilizaron con sacudimiento durante 1 día. Los cotiledones y peciolos esterilizados se transfirieron a medio MS, sacarosa al 3%, agar al 0,7%, BA 4,5 \muM, 2,4-D 0,05 \muM, AgNO_{3} 3,3 \muM, 100 mg/litro de cefotaxim, 20 mg/litro de kanamicina, y se cultivaron durante 3 a 4 semanas. Los cotiledones y peciolos se transfirieron a medio MS, sacarosa al 3%, agar al 0,7%, BA 4,5 \muM, 2,4-D 0,05 \muM, 100 mg/litro de cefotaxim, 20 mg/litro de kanamicina, y se cultivaron. El cultivo de este medio continuó con subcultivos a intervalos de 3 a 4 semanas. Cuando se empezaba a producir la regeneración de los vástagos, estos vástagos se subcultivaron en medio MS, sacarosa al 3%, agar al 0,7%, 20 mg/litro de kanamicina, y se cultivaron durante 3 a 4 semanas. Las plantas arraigadas se transfirieron a vermiculita:esfagno = 1:1, y se acondicionaron de 21ºC a 22ºC en un ciclo de día/noche = 12 horas:12 horas. Con el progreso del crecimiento del cuerpo vegetal, las plantas se hicieron crecer adecuadamente tierra de cultivo. De las hojas de las plantas regeneradas, se extrajo ADN genómico según el método descrito antes, y se confirmó la inserción del gen en el genoma de la planta mediante PCR utilizando los cebadores mostrados en la lista 14 más abajo.
Lista 14
21
Ejemplo 14 Transformación de Embriones Somáticos de Soja con el Gen de la Rafinosa Sintetasa de Haba
Se dispusieron células cultivadas de embriones somáticos de soja "Fayette" (400 a 500 mg FW) en una capa dentro de un círculo que tenía un diámetro de 20 mm en la parte central de una placa de agar de 6 cm. Se introdujeron dos plásmidos pBI221-RS y pBI221(-)-RS que tenían genes mixtos preparados a partir del gen de la rafinosa sintetasa de haba y promotor 35S en el Ejemplo 12 en los embriones somáticos de soja según la descripción de la Solicitud de Patente Japonesa Núm. 3-291501/1991. Esto es, se mezclaron estos plásmidos con el vector de coexpresión de \beta-glucuronidasa (GUS)/gen resistente a la higromicina (HPT) pSUM-GH:NotI para la selección descrito en Soshiki Baiyo, 20, 323-327 (1994). Estos plásmidos mixtos se utilizaron para la introducción del gen en embriones somáticos de soja con una pistola de partículas (800 mg/partículas de oro de recubrimiento 200 \mug/disparo; distancia del tapón del proyectil-muestra, 100 mm). Después de la introducción, se hicieron crecer cultivos giratorios en el medio líquido de crecimiento modificado MS (Sigma) que contenía de 25 a 50 \mug/ml de higromicina con iluminación a 25ºC durante 16 horas, y se seleccionaron los embriones somáticos transformados.
Para los embriones somáticos de soja resistentes a la higromicina que tenían un color verde amarillento y capacidad de crecer, que se habían seleccionado después de aproximadamente 3 meses, se efectúa una reacción en cadena por polimerización con los cebadores mostrados en la lista 14 anterior para determinar si la región del gen de la rafinosa sintetasa de haba se ha amplificado o no. Esto confirma que el gen de la rafinosa sintetasa de haba está insertado en el genoma de la soja.
Además, se utilizan los embriones somáticos obtenidos para la regeneración de plantas para dar soja transformante con el gen de la rafinosa sintetasa de haba.
Composición del Medio
Los medios LB y MS utilizados en los Ejemplos anteriores tienen las siguientes composiciones respectivas.
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Medio LB
22
Medio MS
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Breve Descripción de las Secuencias
1. SEQ ID NO: 1
La secuencia del SEQ ID NO: 1 muestra una secuencia de aminoácidos de una proteína rafinosa sintetasa codificada en el gen de la rafinosa sintetasa obtenido de haba.
2. SEQ ID NO: 2
La secuencia del SEQ ID NO: 2 muestra una secuencia de nucleótidos de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa obtenido de haba.
3. SEQ ID NO: 3
La secuencia del SEQ ID NO: 3 muestra una secuencia de aminoácidos de una proteína rafinosa sintetasa codificada en el gen de la rafinosa sintetasa obtenido de la soja.
4. SEQ ID NO: 4
La secuencia del SEQ ID NO: 4 muestra una secuencia de nucleótidos de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa obtenido de la soja.
5. SEQ ID NO: 5
La secuencia del SEQ ID NO: 5 muestra una secuencia de aminoácidos de una proteína rafinosa sintetasa codificada en el gen de la rafinosa sintetasa obtenido de la alcachofa Japonesa.
6. SEQ ID NO: 6
La secuencia del SEQ ID NO: 6 muestra una secuencia de ADNc de nucleótidos del gen de la rafinosa sintetasa obtenido de la alcachofa Japonesa.
7. SEQ ID NO: 7
La secuencia del SEQ ID NO: 7 muestra una secuencia de aminoácidos de una proteína rafinosa sintetasa codificada en el gen de la rafinosa sintetasa obtenido del maíz.
8. SEQ ID NO: 8
La secuencia del SEQ ID NO: 8 muestra una secuencia de ADNc de nucleótidos del gen de la rafinosa sintetasa obtenido del maíz.
9. Lista 1
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 1 son los cebadores típicos utilizados en la amplificación de un fragmento de ADNc de un gen de rafinosa sintetasa. Todas estas secuencias se basan en la secuencia de nucleótidos de la región no codificadora del gen. El cebador 1 es un cebador efector correspondiente al extremo 5' de un fragmento de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa derivado de haba. Los cebadores 2 y 3 son cebadores antisentido correspondientes al extremo 3' del fragmento de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa derivado de haba. El cebador 4 es un cebador efector correspondiente al extremo 5' de un fragmento de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa derivado de soja. Los cebadores 5 y 6 son cebadores antisentido correspondientes al extremo 3' del fragmento de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa derivado de soja. Dependiendo del propósito, se pueden añadir las secuencias de reconocimiento para endonucleasas de restricción adecuadas a los extremos 5' de estas secuencias de nucleótidos de una manera apropiada.
10. Lista 2
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 2 son de los cebadores típicos utilizados en la amplificación de un marco de lectura abierto que codifica la secuencia de aminoácidos de una proteína rafinosa sintetasa en la secuencia de ADNc de un gen de rafinosa sintetasa. Los cebadores 1 y 2 son cebadores efectores correspondientes al extremo N de la proteína rafinosa sintetasa derivada de haba. Los cebadores 3 y 4 son cebadores antisentido correspondientes al extremo C de la proteína rafinosa sintetasa derivada de haba. Los cebadores 5 y 6 son cebadores efectores correspondientes al extremo N de la proteína rafinosa sintetasa derivada de soja. Los cebadores 7 y 8 son cebadores antisentido correspondientes al extremo C de la proteína rafinosa sintetasa derivada de soja. Dependiendo del propósito, se pueden añadir secuencias de reconocimiento para endonucleasas adecuadas a los extremos 5' de estas secuencias de una manera apropiada.
\newpage
11. Lista 3
Las secuencias de aminoácidos mostradas en la lista 3 son secuencias de aminoácidos parciales de una proteína rafinosa sintetasa.
El Núm. 1 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 110 al aminoácido 129 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 2 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 234 al aminoácido 247 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 3 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 265 al aminoácido 279 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 4 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 296 al aminoácido 312 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 5 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 346 al aminoácido 361 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 6 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 383 al aminoácido 402 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 7 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 411 al aminoácido 433 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 8 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 440 al aminoácido 453 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 9 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 457 al aminoácido 468 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 10 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 471 al aminoácido 516 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 11 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 517 al aminoácido 559 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 12 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 574 al aminoácido 582 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 13 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 586 al aminoácido 609 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 14 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 615 al aminoácido 627 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
El Núm. 15 es equivalente a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 716 al aminoácido 724 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1.
12. Lista 4
Las secuencias de aminoácidos mostradas en la lista 4 son de los cebadores típicos sintetizados en algunas de las secuencias de aminoácidos mostradas en la lista 3. El símbolo "F" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia efectora. El símbolo "RV" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido. El cebador 1 corresponde a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 119 al aminoácido 129 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1. El cebador 2 corresponde a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 234 al aminoácido 247 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1. El cebador 3 corresponde a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 265 al aminoácido 279 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1. El cebador 4 corresponde a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 458 al aminoácido 468 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1. El cebador 5 corresponde a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 522 al aminoácido 534 de la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1. El cebador 6 corresponde a la secuencia de aminoácidos parcial que se extiende desde el aminoácido 716 al aminoácido 724 de la secuencia de aminoácidos del
SEC ID NUM: 1.
\newpage
13. Lista 5
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 5 son de los cebadores típicos sintetizados en secuencias de aminoácidos parciales de la proteína rafinosa sintetasa de haba purificada. Las bases mostradas entre paréntesis significan que se utilizó una mezcla de aquellas bases en la síntesis. El símbolo "RV" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido.
14. Lista 6
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 6 son de los cebadores típicos utilizados en el análisis de ambas regiones terminales de una secuencia de nucleótidos de ADNc del gen de la rafinosa sintetasa de haba mediante el método RACE. El símbolo "RV" utilizado después del número de cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido.
15. Lista 7
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 7 son de los cebadores típicos utilizados en la clonación del gen de la rafinosa sintetasa de haba. RS-N corresponde al extremo N del marco de lectura abierto y contiene dos sitios de reconocimiento para las endonucleasas de restricción Xba I del lado 5'-terminal.
16. Lista 8
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 8 son de los cebadores típicos utilizados en la clonación de un fragmento del gen de la rafinosa sintetasa de soja. La base representada por el símbolo "I" era la inosina utilizada en la síntesis. El símbolo "RV" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido.
17. Lista 9
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 9 son de los cebadores típicos utilizados en el análisis de la secuencia de nucleótidos de un fragmento del gen de la rafinosa sintetasa de soja. El símbolo "RV" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido.
El análisis de las secuencias de nucleótidos se llevó a cabo mediante reacción en cadena de la polimerasa utilizando SN-1 y SC-3RV. Se utilizaron SC-5 y SC-6 en el análisis de una secuencia de nucleótidos en la región 3'-terminal, y se utilizaron SN-3RV y SN-4RV en el análisis de una secuencia de nucleótidos en la región 5'-terminal.
18. Lista 10
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 10 son de los cebadores típicos utilizados en el análisis de la secuencia de nucleótidos del ADNc de un fragmento del gen de la rafinosa sintetasa de alcachofa Japonesa. La base representada por el símbolo "I" era la inosina utilizada en la síntesis. El símbolo "RV" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido.
19. Lista 11
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 11 son de los cebadores típicos utilizados en el análisis de la secuencia de nucleótidos del ADNc de un fragmento del gen de la rafinosa sintetasa de maíz. La base representada por el símbolo "I" era la inosina utilizada en la síntesis. El símbolo "RV" utilizado después del número del cebador significa que el cebador referido por este símbolo tiene una secuencia antisentido.
20. Lista 12
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 12 son de los cebadores típicos utilizados en el análisis de la secuencia de nucleótidos del ADNc de un fragmento del gen de la rafinosa sintetasa de maíz. Se utilizaron M-10 y M-11 en el análisis de una secuencia de nucleótidos en la región 3'-terminal.
21. Lista 13
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 13 son de los adaptadores típicos utilizados en la construcción de vectores para experimentos antisentido. Estos fragmentos de ADN sintético adoptan una doble forma cuando se mezclan entre sí porque son hebras complementarias. Este fragmento de ADN bicatenario tiene extremos cohesivos de los sitios de escisión para las endonucleasas de restricción Bam HI y Sac I en ambos extremos, y contiene los sitios de restricción para las endonucleasa de restricción Bam HI y Sac I en la región bicatenaria.
\newpage
22. Lista 14
Las secuencias de nucleótidos mostradas en la lista 14 son de los cebadores típicos utilizados en el experimento de PCR para confirmar la introducción del gen en el genoma de una planta recombinante. 35S es un cebador hacia la región aguas abajo en el sitio del promotor 35S, y NOS es un cebador hacia la región aguas arriba en el sitio del terminador NOS. RS-F es un cebador efector del gen de la rafinosa sintetasa de haba, y RS-RV es un cebador antisentido del gen de la rafinosa sintetasa de haba.
NUMERO DE SECUENCIAS: 8
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 799 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: haba (Vicia faba)
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: Nintoku Issun
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
TIPO DE TEJIDO: semillas
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
24
25
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2746 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CUALIDAD DE LA HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: péptido
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 101..2500
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: experimento
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
27
28
29
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 781 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: soja (Glycine max)
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: Williams 82
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
TIPO DE TEJIDO: semillas y hojas
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
31
32
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2598 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CUALIDAD DE LA HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: péptido
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 62..2407
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: experimento
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
34
35
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 587 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Alcachofa Japonesa (Stachys sieboldii)
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
TIPO DE TEJIDO: hojas
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
37
38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1762 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CUALIDAD DE LA HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: péptido
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 2..1762
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: experimento
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
39
40
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 271 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: maíz (Zea mays L.)
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: Pioneer 3358
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
TIPO DE TEJIDO: hojas
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN PARA EL SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 996 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CUALIDAD DE LA HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: péptido
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 2..817
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: experimento
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
43
44
<110> Sumitomo Chemical Company, Limited
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Gen de la rafinosa sintetasa y uso del mismo
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140> 97122417.5
\vskip0.400000\baselineskip
<141> 1997-12-18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP 338673/1996
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 1996-12-18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 84
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 799
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
45
46
47
48
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2746
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (101) .. (2500)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
49
50
51
52
53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 781
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
54
55
56
57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2498
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221>CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (62) .. (2407)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
58
59
60
61
62
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 587
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Stachys sieboldii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
63
64
65
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1762
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Stachys sieboldii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (2) .. (1762)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
66
67
68
69
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 271
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
70
\hskip1,6cm71
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 993
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (2) .. (817)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
72
73
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 1 (de la lista 1)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aattttcaag catagccaag ttaaccacct
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 2 (de la lista 1)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctcacaaga taatgatgtt agtc
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 3 (de la lista 1)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atacaagtga ggaacttgac ca
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 4 (de la lista 1)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccaaaccata gcaaacctaa gcac
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 5 (de la lista 1)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
acaacagaaa aatatgactc ttattact
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 6 (de la lista 1)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aaaagagagt caaacatcat agtatc
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 1 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atggcaccac caagcataac caaaactgc
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 2 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atggcaccac caagcataac caaaactgca accctccaag acg
\hfill
43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 3 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcaaaataaa aactggacca aagac
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 4 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcaaaataaa aactggacca aagacaatgt
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 5 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atggctccaa gcataagcaa aactg
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 6 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atggctccaa gcataagcaa aactgtggaa ct
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 7 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcaaaataaa aactcaacca ttgac
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 8 (de la lista 2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcaaaataaa aactcaacca ttgacaattt tgaagcact
\hfill
39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ile Lys Phe Met Ser Ile Phe Arg Phe Lys Val Trp Trp Thr Thr}
\sac{His Trp Val Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Ile Asp Lys Phe Gly Trp Cys Thr Trp Asp Ala Phe Tyr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Cys Pro Pro Gly Phe Val Ile Ile Asp Asp Gly Trp Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Ser Ala Gly Glu Gln Met Pro Cys Arg Leu Val Lys Tyr Glu Glu}
\sac{Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Tyr Val Trp His Ala Leu Cys Gly Tyr Trp Gly Gly Val Arg Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Met Glu Asp Leu Ala Val Asp Lys Ile Val Glu Asn Gly Val Gly}
\sac{Leu Val Pro Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Leu His Ser His Leu Glu Ser Ala Gly Ile Asp Gly Val Lys Val}
\sac{Asp Val Ile His Leu Leu Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Arg Val Glu Leu Ala Arg Ala Tyr Tyr Lys Ala Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Lys Lys His Phe Lys Gly Asn Gly Val Ile Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
74
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
75
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Pro Asp Gly Ser Ile Leu Arg Cys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Leu Pro Thr Arg Asp Cys Leu Phe Glu Asp Pro Leu His Asn Gly}
\sac{Lys Thr Met Leu Lys Ile Trp Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Val Leu Gly Leu Phe Asn Cys Gln Gly Gly Gly Trp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Vicia faba
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Ala Pro Ile Gly Leu Val Asn Met}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 1-F (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttnaangtnt ggtggacnac ncantgggtn gg
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (41)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 2-F (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atnatngana anttnggntg gtgnacntgg gangcnttnt a
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (41)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 2-RV (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tanaangcnt cccangtnca ccanccnaan ttntcnatna t
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (44)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 3-F (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggnggntgnc cnccnggntt ngtnatnatn ganganggnt ggca
\hfill
44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (44)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 3-RV (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgccanccnt cntcnatnat nacnaanccn ggnggncanc cncc
\hfill
44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 4-F (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aanaancant tnaanggnaa nggngtnatn gc
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 4-RV (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gcnatnacnc cnttnccntt naantgnttn tt
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (38)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 5-F (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tggatgggna anttnatnca nccngantgg ganatgtt
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (38)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 5-RV (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aacatntccc antcnggntg natnaanttn cccatcca
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 6-RV (de la lista 4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catnttnacn arnccnatng gngcnaa
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (26)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = a, g, t o c
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético #8.2 (de la lista 5)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aaracngcnc cnagyathat hgacaa
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = a, g, t o c
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético #13.4 (de la lista 5)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aarathtgga ayctnaacaa
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = a, g, t o c
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético #7.4 (de la lista 5)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aargcnagrg tngtngtncc naag
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = a, g, t o c
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético #13.3RV (de la lista 5)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
yttrttnagr ttccadattt t
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = a, g, t o c
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético #10.3RV (de la lista 5)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
yttrtcytcr tanagraatt t
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-2RV (de la lista 6)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggctgaggtt cggttcattc ctgaatcatc
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-7 (de la lista 6)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccaaatggta catattggct ccaaggttgt
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-8 (de la lista 6)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aagagtgtat ctgaattttc acgcgcggtg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-9 (de la lista 6)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tggtgcaatg ggaaaactcc aatgagcacc
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-10 (de la lista 6)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atgaagtgtt ctgatagatt gaaagtttcg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-11 (de la lista 6)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cagtctctgg agtttgatga taatgcaagt
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-N (de la lista 7)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcggatcca ccatggcacc accaagcata accaaaactg c
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-C (de la lista 7)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgctctagat tatcaaaata aaaactggac caaagac
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (35)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 1-F (de la lista 8)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgattnaang tntggtggac nacncantgg gtngg
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 62
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (45)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 2-RV (de la lista 8)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 62
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggcctanaan gcntcccang tncaccancc naanttntcn atnat
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 63
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (41)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 5-F (de la lista 8)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 63
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgatggatgg gnaanttnat ncanccngan tggganatgt t
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 64
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 6-RV (de la lista 8)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 64
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggccacatnt tnacnarncc natnggngcn aa
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 65
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético SN-1 (de la lista 9)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 65
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cacgaactgg ggcacgagac acagatgatg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 66
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético SC-3RV (de la lista 9)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 66
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aagcaagtca cggagtgtga atagtcagag
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 67
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético SC-5 (de la lista 9)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 67
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
acacgagact gtttgtttga agaccccttg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 68
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético SC-6 (de la lista 9)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 68
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tggaatctca acaaatatac aggtg
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 69
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético SN-3RV (de la lista 9)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 69
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gggtcatggc caacgtggac gtataagcac
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 70
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético SN-4RV (de la lista 9)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 70
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatgatcact ggcgcggttt tctcctcgag
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 71
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (35)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 1-F (de la lista 10)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 71
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgattnaang tntggtggac nacncantgg gtngg
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 72
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (37)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 4-RV (de la lista 10)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 72
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggccagcnat nacnccnttn ccnttnaant gnttntt
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 73
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (44)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 2-F (de la lista 10)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 73
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgaatnatng anaanttngg ntggtgnacn tgggangcnt tnta
\hfill
44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 74
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 6-RV (de la lista 10)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 74
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggccacatnt tnacnarncc natnggngcn aa
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 75
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (41)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 5-F (de la lista 11)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 75
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgatggatgg gnaanttnat ncanccngan tggganatgt t
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 76
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 6-RV (de la lista 11)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 76
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggccacatnt tnacnarncc natnggngcn aa
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 77
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético M-10 (de la lista 12)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 77
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gacgtcgagt ggaagagcgg caagg
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 78
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético M-11 (de la lista 12)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 78
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cacctacgag ctcttcgtcg ttgcc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 79
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:conector sintético BamSac-(+) (de la lista 13)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 79
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatcgagctc gtgtcggatc cagct
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 79
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:conector sintético BamSac-(+) (de la lista 13)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 79
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatcgagctc gtgtcggatc cagct
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 80
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:conector sintético BamSac-(-) (de la lista 13)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 80
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggatccgaca cgagctc
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 81
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético 35S (de la lista 14)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 81
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttccagtatg gacgattcaa ggcttgcttc
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 82
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético NOS (de la lista 14)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 82
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atgtataatt gcgggactct aatca
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 83
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-F (de la lista 14)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 83
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aagagtgtat ctgaattttc acgcgcggtg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 84
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial:cebador sintético RS-RV (de la lista 14)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 84
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
accttcccat acaccttttg gatgaacctt caa
\hfill
33

Claims (16)

1. Una molécula de ácido nucleico aislada que codifica una rafinosa sintetasa vegetal que es capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo por medio de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono en la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa, donde dicha molécula de ácido nucleico se selecciona del grupo formado por:
(a)
moléculas de ácido nucleico que codifican una proteína con una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo formado por el SEC ID NUM: 3, SEC ID NUM: 5, y SEC ID NUM: 7;
(b)
moléculas de ácido nucleico que comprenden la región codificadora de la secuencia de nucleótidos seleccionada del grupo formado por el SEC ID NUM: 4, SEC ID NUM: 6, y SEC ID NUM: 8;
(c)
moléculas de ácido nucleico que hibridan con la hebra complementaria de una molécula de ácido nucleico indicada en (a) o (b), en condiciones restrictivas, donde la planta es una planta leguminosa, una planta lamiácea o una monocotiledónea;
(d)
moléculas de ácido nucleico cuya secuencia difiere de la secuencia de una molécula de ácido nucleico de uno cualquiera de (a) a (c) debido a la degeneración del código genético;
(e)
un fragmento de una cualquiera de las moléculas de ácido nucleico de uno cualquiera de (a) a (d) que codifica una proteína capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo por medio de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa;
(f)
moléculas de ácido nucleico de (d) o (e) donde la planta es una planta leguminosa, una planta lamiácea, o una monocotiledónea;
(g)
moléculas de ácido nucleico que codifican una proteína con la secuencia de aminoácidos del SEC ID NUM: 1;
(h)
moléculas de ácido nucleico que comprenden la región codificadora de la secuencia de nucleótidos del SEC ID NUM: 2;
(i)
moléculas de ácido nucleico que hibridan con la hebra complementaria de una molécula de ácido nucleico indicada en (g) o (h), en condiciones restrictivas;
(j)
un fragmento de cualquiera de las moléculas de ácido nucleico de uno cualquiera de (g) a (i) que codifica una proteína capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo por medio de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa; y
(k)
moléculas de ácido nucleico de (i) o (j), donde la planta es una planta leguminosa.
2. Las moléculas de ácido nucleico de la reivindicación 1, donde la planta leguminosa es una planta de haba o de soja.
3. Las moléculas de ácido nucleico de la reivindicación 1, donde la planta lamiácea es una alcachofa Japonesa.
4. Las moléculas de ácido nucleico de la reivindicación 1, donde la monocotiledónea es una planta gramínea.
5. Las moléculas de ácido nucleico de la reivindicación 4, donde la planta gramínea es el maíz.
6. Una molécula de ácido nucleico que comprende la molécula de ácido nucleico de la reivindicación 1, conectada funcionalmente a un promotor.
7. Un plásmido que comprende una molécula de ácido nucleico de la reivindicación 1 opcionalmente en una combinación funcional con un promotor, o una molécula de ácido nucleico de la reivindicación 6.
8. Un organismo huésped que contiene la molécula de ácido nucleico de la reivindicación 6 o el plásmido de la reivindicación 7.
9. El organismo huésped de la reivindicación 8 que es un microorganismo, una célula vegetal o una planta.
10. Un método para la producción de una proteína rafinosa sintetasa o una porción de la misma, que comprende las etapas de aislar y purificar una proteína rafinosa sintetasa o una porción de la misma de un cultivo obtenido cultivando el organismo huésped de la reivindicación 8 o 9.
11. Una proteína rafinosa sintetasa aislada codificada por la molécula de ácido nucleico de la reivindicación 1.
12. Una molécula de ácido nucleico antisentido o una ribozima que hibrida o se une específicamente a una molécula de ácido nucleico de la reivindicación 1.
13. Un método para modificar el metabolismo de un organismo huésped, que comprende introducir la molécula de ácido nucleico de la reivindicación 1 o 6 o una molécula de ácido nucleico antisentido o una ribozima de la reivindicación 12 en dicho organismo huésped o una célula del mismo, de manera que cambie el contenido de oligosacáridos de la familia de la rafinosa en dicho organismo huésped o célula del mismo.
14. Una proteína rafinosa sintetasa aislada que es capaz de producir rafinosa combinando un grupo D-galactosilo por medio de un enlace \alpha(1\rightarrow6) con un grupo hidroxilo anclado al átomo de carbono de la posición 6 de un resto D-glucosa en una molécula de sacarosa, donde dicha proteína está relacionada con la proteína rafinosa sintetasa del SEC ID NUM: 1 o el SEC ID NUM:3, mediante deleción, sustitución, modificación o adición de un aminoácido.
15. Un anticuerpo anti-rafinosa sintetasa capaz de unirse específicamente a la proteína rafinosa sintetasa de la reivindicación 11 o 14.
16. El uso de un anticuerpo anti-rafinosa sintetasa de la reivindicación 15 para la detección de una proteína rafinosa sintetasa.
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