ES2261226T3 - Promotores especificos de la semilla de lino. - Google Patents
Promotores especificos de la semilla de lino.Info
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Abstract
Método para la expresión de una secuencia de ácido nucleico de interés en las semillas de lino que comprende las etapas siguientes: (a) preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5¿ a 3¿ de la transcripción como componentes ligados funcionalmente: (1) un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y (2) dicha secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino; (b) introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y (c) cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla es un promotor específico de la semilla de lino se selecciona de entre el grupo constituido por promotores de oleosina, promotores de la proteína de almacenamiento 2S y promotores de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
Description
Promotores específicos de la semilla de
lino.
La presente invención se refiere a los métodos
de ingeniería genética de vegetales útiles para la alteración de los
constituyentes de las semillas vegetales. Más específicamente, la
invención se refiere a promotores que se han obtenido a partir del
lino y que son capaces de dirigir la expresión de genes no nativos
en semillas de lino así como en semillas de otras plantas.
El lino o la semilla de lino (Linum
usitatissimum) es un cultivo de semillas oleaginosas importante
comercialmente. El aceite y la harina de lino son materias primas
valiosas procedentes de la semilla de lino. Una materia prima más
económicamente significativa, la fibra de lino, puede obtenerse a
partir del tallo de la planta. La fracción de aceite de linaza se
utiliza con fines no comestibles, por ejemplo para la preparación de
barnices y pinturas y más recientemente se ha aconsejado para su
utilización en la preparación de una gama de productos comestibles
tales como margarinas y aceites para ensalada y salsas, en virtud de
los recién producidos denominados cultivos de Linola (Green (1986)
Can. J. Plant Sci., 66: 499-503). La harina
de lino se utiliza principalmente como constituyente de los piensos
para rumiantes mientras que las fibras de lino se utilizan para la
preparación de tejidos de lino. Dada su importancia económica como
fuente de materias primas, es deseable además mejorar y diversificar
el catálogo disponible de cultivo de lino tanto con respecto al
rendimiento agronómico, por ejemplo el rendimiento de la semilla, la
resistencia a los patógenos y a las temperaturas climáticas bajas
como con respecto al rendimiento y calidad de las materias primas
para satisfacer las aplicaciones posteriores. Aunque es posible
obtener cultivos de lino mejorados por cruce convencional de
plantas, como se puso de manifiesto por el desarrollo de los
cultivos de Linola, el desarrollo de una línea vegetal agronómica de
élite requiere grandes inversiones en el cruce de plantas debido a
la duración prolongada implicada. La tecnología de ingeniería
genética vegetal permite el aislamiento de los genes directamente de
las especies no afines y la transferencia de estos genes en los
antecedentes agronómicos de elite, reduciendo de este modo
significativamente el tiempo requerido para desarrollar nuevos
cultivos. Además, la modificación genética vegetal permite la
preparación de productos que no pueden obtenerse naturalmente a
partir del lino, por ejemplo los agentes
terapéuticos.
terapéuticos.
Para desarrollar nuevos cultivos de lino
mediante ingeniería genética vegetal, es de importancia crítica el
control sobre la expresión del gen extraño o no nativo introducido.
Las características de la expresión deseada para el gen no nativo,
tal como el nivel de expresión del gen no nativo, el tejido u órgano
vegetal concreto en el cual se expresa el gen no nativo, y la
duración en concreto en el ciclo de crecimiento de la planta en la
que se expresa el gen no nativo, variará dependiendo de la
aplicación para la cual se desarrolla la línea vegetal. Por ejemplo,
la modificación de la composición del aceite de semillas puede
requerir bajos niveles de expresión específica para la semilla de
una enzima implicada en el metabolismo de los ácidos grasos en una
etapa inicial en el desarrollo de la semilla (véase por ejemplo la
patente US nº 5.420.034). Por otra parte la expresión de una
proteína farmacéutica podría requerir preferentemente altos niveles
de expresión específica para la hoja en el momento de la cosecha de
las hojas vegetales (véase p. ej. la patente US nº 5.929.304).
Para manipular las características de la
expresión de los genes no nativos pueden estar influidos numerosos
factores. Un factor es la selección del promotor de transcripción
utilizado. Actualmente está disponible un amplio intervalo de
promotores vegetales compatibles y algunos de los promotores mejor
documentados comprenden los promotores constitutivos tal como el
promotor 35-S CaMV (Rothstein et al. (1987),
Gene 53: 152-161) y el promotor de ubiquitina
(patente US nº 5.614.399), los promotores específicos del tejido
tales como los promotores específicos de semillas, por ejemplo el
promotor de faseolina (Sengupta-Gopalan et
al., (1985), PNAS USA 82: 3320-3324) y los
promotores inducibles, tales como los inducibles por calor
(Czarnencka et al., (1989), Mol. Cell. Biol. 9 (8):
3457-3464), luz UV, provocadores y que causan daño
(Lois et al. (1989) EMBO J. 8 (6):
1641-1648), o productos químicos tales como las
hormonas endógenas (Skriver et al. (1991), Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 88(16): 7266-7270). Otros
factores que pueden manipularse para controlar las características
de la expresión del gen no nativo en los vegetales incluyen los
factores de modificación de la transcripción tales como los
intrones, secuencias de poliadenilación y secuencias de terminación
de la transcripción. Las características de la expresión del gen no
nativo pueden además manipularse mediante los factores que afectan a
la traducción, tales como las secuencias de unión del ribosoma y el
sesgo del codón que es presentado por el huésped. Además, el propio
gen no nativo puede afectar la viabilidad del vegetal transgénico,
limitando de este modo particularmente los niveles de expresión que
pueden alcanzarse. En algunos casos puede ser posible solucionar
este problema, expresando la proteína de un modo específico para el
tejido, p. ej. en las hojas o la semilla o restringiendo la
acumulación de la proteína en los diferentes compartimentos
subcelulares tales como por ejemplo el citoplasma, el retículo
endoplásmico o las vacuolas, normalmente por la presencia o ausencia
de secuencias de direccionamiento específico capaces de dirigir la
proteína a estos compartimentos. Otro factor que afectará las
características de la expresión es la situación en la que el propio
constructo se inserta en el cromosoma del huésped. Este efecto
podría proporcionar una explicación como por qué diferentes plantas,
transformadas con el mismo constructo recombinante, pueden poseer
niveles fluctuantes de la expresión recombinante de la
proteína.
proteína.
Según el conocimiento de los inventores, la
expresión de los genes no nativos en semillas de lino está
documentada únicamente en la solicitud de patente PCT WO 98/18948.
Esta solicitud da a conocer dos genes de portador
estearoil-acil proteína desaturasa (SAD) procedentes
del lino. Las secuencias del activado SAD asociadas son útiles para
la modificación del lino y otras plantas para la expresión de los
genes endógenos o extraños. Sin embargo los métodos dados a conocer
por el documento WO 98/18948 están limitados por el hecho de que los
promotores SAD no son específicos para las semillas en el lino y
comunican la expresión a las hojas, tallos, flores y semillas. La
expresión de los genes no nativos puede producir por lo tanto
efectos secundarios indeseables en los tejidos distintos de
semillas. Además la utilización de promotores SAD permite el control
limitado sobre el nivel de expresión y el desarrollo cronológico de
la expresión.
Existe una necesidad en la técnica de mejorar
más los métodos para la expresión de genes no nativos en semillas de
lino y de otras semillas vegetales.
La presente invención se refiere a métodos
mejorados para la expresión específica de la semilla de genes no
nativos en vegetales. En particular, la invención se refiere a
métodos mejorados para la expresión específica de la semilla de
genes no nativos en lino.
Por consiguiente, en un aspecto, la invención
proporciona un método para la expresión de una secuencia de ácido
nucleico de interés en las semillas de lino que comprende:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- la secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula de planta de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula de la planta de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla de lino, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla es un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
En una forma de realización preferida de la
invención, por lo menos una característica de la expresión, (p. ej.
el desarrollo cronológico de la expresión en el ciclo vital de la
planta, comunicado por el promotor a la secuencia de ácido nucleico
no nativo es similar al de la expresión característica cuando se
confiere a una secuencia de ácido nucleico nativo.
En otro aspecto, la presente invención
proporciona semillas transgénicas de lino preparadas por un método
que comprende:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla es un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
\newpage
En un aspecto adicional, la presente invención
proporciona plantas de lino capaces de plantar semillas preparadas
por un método que comprende:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla es un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
En la presente memoria se dan a conocer nuevos
promotores específicos para la semilla de lino útiles para la
expresión de genes no nativos en semillas de lino y en las semillas
de otras especies vegetales, útiles por ejemplo para la modificación
de la proteína o de la composición de aceite de la semilla.
En una forma de realización preferida, el
promotor específico de la semilla comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1) en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4) en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6) en la que T puede ser asimismo U o los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8) en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
En otro aspecto, la invención proporciona una
secuencia aislada de ácido nucleico híbrido que comprende:
- (a)
- una primera secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico para la semilla obtenido a partir del lino que comprende:
- (1)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1) en la que T puede ser asimismo U; una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4) en la que T puede ser asimismo U; una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6) en la que T puede ser asimismo U; o una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8) en la que T puede ser asimismo U;
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (3)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (4)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (b)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico para la semilla de lino; en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales.
Otras características y ventajas de la presente
invención resultarán evidentes a partir de la siguiente descripción
detallada. Debe entenderse, sin embargo, que aunque la descripción
detallada y los ejemplos específicos indican formas de realización
preferidas de la invención se proporcionan únicamente a título de
ilustración, ya que varios cambios y modificaciones de esta
descripción detallada dentro del alcance de la invención serán
evidentes para los expertos en la materia.
La invención se describirá a continuación
haciendo referencia a los dibujos en la que:
La Figura 1 presenta la secuencia de ADN (SEC.
ID nº: 1) de un clon genómico de lino que codifica una proteína
oleosina de 16,0 kDa (SEC. ID nº: 2 y 3).
La Figura 2 presenta la secuencia de ADN (SEC.
ID nº: 4) de un clon genómico de lino que codifica una proteína
oleosina de 18,6 kDa (SEC. ID nº: 5).
La Figura 3 presenta la secuencia de ADN (SEC.
ID nº: 6) de un clon genómico de lino que codifica una proteína de
almacenamiento 2S (SEC. ID nº: 7).
La Figura 4 presenta la secuencia de ADN (SEC.
ID nº: 8) de un clon genómico de lino que codifica una proteína de
almacenamiento de tipo legúmina de 54,5 kDa (SEC. ID nº: 9 a
12).
La Figura 5 presenta el análisis por
transferencia Southern del ADN genómico de lino sondado con las
secuencias de ADN de oleosina de lino.
La Figura 6 presenta un análisis por
transferencia Northern de la expresión específica de la semilla de
oleosinas de lino.
La Figura 7 presenta un análisis por
transferencia Northern de la expresión del desarrollo de las
oleosinas de lino durante el desarrollo de la semilla.
La Figura 8 presenta la actividad de GUS de los
embriones de lino bombardeados con constructos promotor de oleosina
de lino-GUS-gen terminador del
lino.
La Figura 9 presenta la expresión de GUS en el
desarrollo de los embriones de lino y semillas de Arabidopsis
de las plantas transformadas con una fusión de GUS con el promotor
del gen de la proteína 2S.
La Figura 10 presenta la expresión específica
para el tejido de GUS en plantas de lino transgénicas transformadas
con un constructo promotor de
linina-GUS-gen terminador de
linina.
La Figura 11 presenta la expresión terminal de
GUS en plantas de lino transgénicas transformadas con un constructo
promotor de linina-GUS-gen
terminador de linina.
La Figura 12 presenta la expresión de GUS en las
plantas transgénicas de Brassica napus (L1 a L9) transformada
con un constructo promotor de
linina-GUS-gen terminador de
linina.
La Figura 13 presenta la expresión de GUS en las
plantas transgénicas de Arabidopsis transformadas con un
constructo promotor de
linina-GUS-gen terminador de linina
en diferentes etapas del desarrollo de la semilla.
Como se mencionó en la presente memoria
anteriormente, la presente invención se refiere a métodos mejorados
para la expresión de genes no nativos en plantas, en particular el
lino. La invención proporciona métodos que permiten la expresión
específica de la semilla de los genes no nativos en el lino. Los
métodos de la invención presentan ventajas porque se obtiene el
control mejorado sobre la expresión de genes no nativos en semillas
de lino. La expresión del gen no nativo está limitada a las
semillas, limitando de este modo los efectos potenciales indeseables
procedentes de la expresión en otros órganos o tejidos de la planta.
Además, la metodología proporcionada permite un mejor control sobre
las características de la expresión, tales como el nivel de
expresión del gen no nativo y el desarrollo cronológico de la
expresión del gen no nativo en el ciclo de desarrollo de la planta.
Los métodos de la presente invención son particularmente útiles
porque según la presente invención la composición de la semilla con
respecto a las materias primas valiosas, tales como el aceite, las
proteínas y los polisacáridos, pueden alterarse tanto cualitativa
como cuantitativamente.
Por consiguiente, la presente invención
proporciona un método para la expresión de una secuencia de ácido
nucleico de interés en semillas de lino que comprende:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- la secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla de lino, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla de lino es un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
Tal como se utiliza en la presente memoria, la
expresión "no nativo" se refiere a cualquier secuencia de ácido
nucleico, incluyendo cualquier secuencia de ARN o de ADN, que no
esté asociada normalmente con el promotor específico de la semilla.
Ésta incluye las secuencias heterólogas de ácido nucleico que se
obtienen a partir de diferentes especies vegetales como el promotor
así como las secuencias homólogas de ácido nucleico que se obtienen
de la misma especie vegetal como promotor pero no están asociadas al
promotor en la planta nativa (no transgénica).
La secuencia de ácido nucleico no nativo cuando
se une a un promotor específico de la semilla obtenido del lino
produce un constructo híbrido. El constructo híbrido se introduce en
una célula vegetal de lino para crear una célula vegetal de lino
transgénica que produce un fenotipo detectable de forma diferente de
la célula vegetal de lino o de la planta de lino desarrollada a
partir de ella cuando se compara con una célula vegetal de lino no
transgénica o una planta de lino desarrollada a partir de ella. Una
secuencia de ácido nucleico contigua idéntica a la secuencia de
ácido nucleico del constructo híbrido no está presente en la célula
vegetal de lino no transformada o en la planta de lino desarrollada
a partir de ella. A este respecto, las secuencias híbridas de ácido
nucleico incluyen las secuencias que contienen un promotor de lino
unido a una secuencia de ácido nucleico obtenida a partir de otra
especie vegetal o de una secuencia de ácido nucleico del lino pero
normalmente no asociada con este promotor. Las secuencias de ácido
nucleico como las utilizadas en la presente memoria incluyen además
secuencias que comprenden un promotor de lino y una secuencia de
ácido nucleico que está normalmente unida al promotor pero que
contiene además una secuencia de ácido nucleico no nativo. Por
ejemplo, si el promotor es un promotor de oleosina específico de la
semilla de lino, las secuencias "no nativos" para el promotor
de oleosina de lino incluyen asimismo una secuencia que comprende
una fusión entre el gen de oleosina de lino naturalmente asociado al
promotor de oleosina, y una secuencia de codificación de interés que
no está asociada de forma nativa al promotor. La expresión no nativo
significa también que incluye un gen de fusión como el mencionado
anteriormente en la presente memoria que incluye además una
secuencia de escisión que separa la secuencia de ácido nucleico que
está normalmente unida a la secuencia del promotor y el gen que
codifica la proteína de interés.
La expresión "secuencia de ácido nucleico"
se refiere a una secuencia de monómeros de nucleótidos o de
nucleósidos que está constituida por bases nativos, enlaces de
azúcares e interazúcar (eje central). La expresión incluye asimismo
secuencias modificadas o sustituidas que comprenden monómeros no
nativos o fragmentos de los mismos, que funcionan de manera similar.
Las secuencias de ácido nucleico de la presente invención pueden ser
ácidos ribonucleico (ARN) o desoxirribonucleico (ADN) y pueden
contener bases nativos incluyendo adenina, guanina, citosina,
timidina y uracilo. Las secuencias pueden contener también bases
modificadas tales como xantina, hipoxantina,
2-aminoadenina, 6-metil,
2-propil y otras alquiladeninas,
5-halouracilo, 5-halocitosina,
6-azauracilo, 6-azacitosina y
6-azatimidina, pseudouracilo,
4-tiouracilo, 8-haloadenina,
8-aminoadenina, 8-tioladenina,
8-tio-alquiladeninas,
8-hidroxiladenina y otras adeninas
8-sustituidas, 8-haloguaninas,
8-aminoguanina, 8-tiolguanina,
8-tioalquilguaninas,
8-hidroxilguanina y otras guaninas
8-sustituidas, otros aza y deaza uracilos,
timidinas, citosinas, adeninas o guaninas,
5-trifluorometil uracilo y
5-trifluorcitosina.
En la presente memoria se dan a conocer nuevos
promotores específicos para semillas de lino útiles para la
expresión de genes no nativos en semillas de lino y semillas de
otras especies vegetales. Los promotores pueden utilizarse para
modificar, por ejemplo, la composición de las proteínas, aceite o
polisacárido de las semillas. En una forma de realización preferida,
el promotor específico de la semilla comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1) en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4) en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6) en la que T puede ser asimismo U o los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8) en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
La expresión "secuencia que presenta homología
de secuencia sustancial" se refiere a las secuencias de ácido
nucleico que presentan variaciones de secuencia ligeras o sin
importancia de las secuencias en (a) o (b), es decir, la función de
las secuencias en sustancialmente la misma manera y son capaces de
dirigir la expresión específica de la semilla de secuencias de ácido
nucleico no nativo. Las variaciones pueden ser atribuibles a
mutaciones locales o a modificaciones estructurales. Las secuencias
de ácido nucleico que presentan homología sustancial incluyen las
secuencias de ácido nucleico que presentan por lo menos 65%, más
preferentemente por lo menos 85% y más preferentemente del 90 al 95%
de identidad con las secuencias de ácido nucleico que comprenden los
nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1)
en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 21 a 1.852 como se
muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4) en la que T puede ser
asimismo U, los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3
(SEC. ID nº: 6) en la que T puede ser asimismo U o los nucleótidos 1
a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8) en la que T
puede ser asimismo U.
La expresión "secuencia que hibrida" hace
referencia a una secuencia de ácido nucleico que puede hibridar una
secuencia de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación
severas. Las "condiciones de hibridación severas" apropiadas
que favorecen la hibridación del ADN son conocidas por los expertos
en la materia, o pueden encontrarse en Current Protocols in
Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989),
6.3.1-6.3.6. Por ejemplo, pueden emplearse las
siguientes: 6,0 \times cloruro de sodio/citrato de sodio (SSC) a
aproximadamente 45ºC, seguido de un lavado de 2,0 \times SSC a
50ºC. La severidad puede seleccionarse basándose en las condiciones
utilizadas en la etapa de lavado. Por ejemplo, la concentración de
sal en la etapa de lavado puede seleccionarse de entre una gran
severidad de aproximadamente 0,2 \times SSC a 50ºC. Además, la
temperatura en la etapa de lavado puede ser en condiciones de alta
severidad, de aproximadamente 65ºC.
La expresión "una secuencia de ácido nucleico
que es un análogo" significa una secuencia de ácido nucleico que
ha sido modificada en comparación con la secuencia de (a), (b) o (c)
en la que la modificación no altera la utilidad de la secuencia (es
decir, como promotor específico de la semilla) como se describe en
la presente memoria. La secuencia o análogo modificado puede
presentar propiedades mejoradas sobre la secuencia representada en
(a), (b) o (c). Un ejemplo de una modificación para preparar un
análogo consiste en sustituir una de las bases nativos (es decir,
adenina, guanina, citosina o timidina) de la secuencia representada
en la Figura 1, Figura 2, Figura 3 o Figura 4 por una base
modificada tal como xantina, hipoxantina,
2-aminoadenina, 6-metil,
2-propil y otras alquiladeninas,
5-halouracilo, 5-halocitosina,
6-azauracilo, 6-azacitosina y
6-azatimidina, pseudouracilo,
4-tiouracilo, 8-haloadenina,
8-aminoadenina, 8-tioladenina,
8-tiol-alquiladeninas,
8-hidroxiladenina y otras adeninas
8-sustituidas, 8-haloguaninas, 8
aminoguanina, 8-tiolguanina,
8-tioalquilguaninas,
8-hidroxilguanina y otras guaninas
8-sustituidas, otros aza y deaza uracilos,
timidinas, citosinas, adeninas o guaninas,
5-trifluorometil uracilo y
5-trifluorcitosina.
Otro ejemplo de una modificación consiste en
incluir heteroátomos modificados de fósforo u oxígeno en el eje
central del fosfato, enlaces interazúcar de alquilo de cadena corta
o cicloalquilo o enlaces interazúcar heteroatómicos de cadena corta
o heterocíclico en la molécula de ácido nucleico representada en la
Figura 1, Figura 2, Figura 3 o Figura 4. Por ejemplo, las secuencias
de ácido nucleico pueden contener fosforotioatos, fosfotriésteres,
fosfonatos de metilo y fosforoditioatos.
Otro ejemplo de un análogo de una molécula de
ácido nucleico de la invención consiste en un ácido nucleico
peptídico (ANP) en el que el eje central de fosfato de desoxirribosa
(o ribosa) en el ADN (o ARN), se sustituye por un eje central de
poliamida que es similar al encontrado en los péptidos (P.E.
Nielsen, et al. Science 1991, 254, 1497). Se ha
demostrado que los análogos de APN son resistentes a la degradación
por enzimas y tienen vidas prolongadas in vivo e in
vitro. Los APN también se unen más fuerte a una secuencia de ADN
complementario debido a la falta de repulsión de carga entre la
cadena de APN y la cadena de ADN. Otros análogos de ácido nucleico
pueden contener ejes centrales de polímero que contienen
nucleótidos, ejes centrales cíclicos o ejes centrales acíclicos. Por
ejemplo, los nucleótidos pueden presentar estructuras con eje
central de morfolino (patente US nº 5.034.506). Los análogos pueden
contener también grupos tales como grupos indicadores, un grupo para
mejorar las propiedades farmacocinéticas o farmacodinámicas de la
secuencia de ácido nucleico.
En otro aspecto, la invención proporciona una
secuencia aislada de ácido nucleico híbrido que comprende:
- (a)
- una primera secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico para la semilla obtenido a partir del lino que comprende:
- (1)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1) en la que T puede ser asimismo U; una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4) en la que T puede ser asimismo U; una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6) en la que T puede ser asimismo U; o una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8) en la que T puede ser asimismo U;
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (3)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (4)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (b)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico para la semilla de lino; en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales.
Según la presente invención, las secuencias
híbridas de ácido nucleico pueden incorporarse de forma conocida en
un vector de expresión recombinante que asegura una buena expresión
en la célula de la semilla. Por consiguiente, la presente invención
incluye un vector de expresión recombinante que comprende una
secuencia de ácido nucleico híbrida de la presente invención
adecuada para la expresión en una célula de semilla.
La expresión "adecuado para la expresión en
una célula de semilla" significa que los vectores con expresión
recombinante contienen la secuencia híbrida de los ácidos nucleicos
de la invención, una zona reguladora y una zona de terminación,
seleccionada basándose en la célula de semilla que se debe utilizar
para la expresión, que está operativamente unida a la secuencia de
ácido nucleico que codifica el polipéptido de la composición de
aminoácidos deseable. Operativamente unida significa que la
secuencia de ácido nucleico quimérica que codifica el polipéptido
está unida a una secuencia reguladora y la zona de terminación que
permite la expresión en la célula de la semilla. Un constructo
típico consta, en la dirección 5' a 3' de una zona reguladora
completa de un promotor capaz de dirigir la expresión en una planta,
una zona de codificación del polipéptido y una zona funcional de
terminación de la transcripción en las células vegetales. Estos
constructos pueden prepararse según la metodología bien conocida por
los expertos en biología molecular (véase por ejemplo: Sambrook
et al. (1990), Molecular Cloning, 2ª ed. Cold Spring
Harbor Press). La preparación de los constructos puede implicar
técnicas tales como la digestión con restricción, ligadura,
electroforesis en gel, secuenciado de ADN y PCR. Está disponible una
amplia variedad de vectores de clonación para realizar las etapas de
clonación necesarias. Con este objeto son especialmente adecuados
los vectores de clonación con un sistema de replicación que es
operativo en Escherichia coli tal como pBR322, la serie pUC,
la serie M13mp, pACYC184, pBluescript, etc. Pueden introducirse
secuencias de ácido nucleico en estos vectores y pueden utilizarse
vectores para transformar E. coli que puede desarrollarse en
un medio apropiado. Pueden recuperarse los plásmidos de las células
en la recogida y lisado de las células. Pueden introducirse
constructos finales en vectores vegetales compatibles con la
integración en la planta tal como los plásmidos Ti y Ri.
En las formas de realización preferidas de la
presente invención, el promotor específico de la semilla de lino
confiere a la secuencia de ácido nucleico no nativo por lo menos una
característica de expresión que es similar o idéntica a una
característica de expresión comunicada a la secuencia de ácido
nucleico nativo por el promotor nativo. La expresión
"característica de la expresión" tal como se utiliza en la
presente memoria se refiere a cualquier propiedad o efecto
mensurable comunicado por el promotor específico de la semilla de
lino a la secuencia de ácido nucleico operativamente unida al
promotor específico de la semilla de lino. Por lo tanto en las
formas de realización preferidas, el desarrollo cronológico de la
expresión en el ciclo vital de la planta, de la secuencia de ácido
nucleico no nativo es similar o idéntico al desarrollo cronológico
de expresión de la secuencia de ácido nucleico nativo. En las formas
de realización preferidas adicionales, el nivel de expresión de la
secuencia de ácido nucleico heteróloga es similar o idéntico al
nivel de expresión de la secuencia de ácido nucleico nativo. En las
formas de realización específicas adicionales todavía, la respuesta
del gen no nativo a las alteraciones en las condiciones de
iluminación, cambios de la longitud de onda o de la intensidad de
la luz por ejemplo, cambios de temperatura, dañado del tejido,
cambios de concentración de agentes químicos, tal como por ejemplo
fitohormonas y plaguicidas, es similar a la respuesta de la
secuencia del ácido nucleico nativo a estos estímulos. Otras
características de expresión deseadas comunicadas por un promotor
específico de la semilla de lino pueden ser reconocidas por los
expertos en la materia y por consiguiente puede seleccionarse un
promotor específico de la semilla de lino.
En la presente invención, el promotor específico
de la semilla utilizado es un promotor de oleosina, un promotor de
la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina o un
promotor de la proteína de almacenaje 2S. En las formas de
realización particularmente preferidas el promotor específico de
semilla presenta la secuencia que comprende los nucleótidos 1 a
2.023 representados en la Figura 1 en la que T puede ser asimismo U,
los nucleótidos 21 a 1.852 como se presentan en la Figura 2 en la
que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 1 a 400 representados en
la Figura 3 en la que T puede ser asimismo U o los nucleótidos 1 a
2.034 como se presentan en la Figura 4 en la que T puede también ser
U o cualquiera de las secuencias de ácido nucleico obtenibles a
partir del lino e hibridación hasta una cualquiera de estas cuatro
secuencias de ácido nucleico en condiciones severas.
\newpage
Pueden utilizarse promotores específicos de la
semilla de lino adicionales según la presente invención. Estos
promotores pueden obtenerse de numerosas formas. Cuando se ha
aislado una proteína de la semilla de lino, puede secuenciarse
parcialmente, de modo que puede diseñarse una sonda de ácido
nucleico para identificar el ARN específico para la semilla. Para
aumentar más el ARN específicamente asociado con la semilla, puede
prepararse ADNc a partir de células de semilla y el ADNc puede
sustraerse con ARNm o ADNc de las células que no sean de semilla. El
ADNc de la semilla restante puede utilizarse a continuación para
sondar un banco de ADN genómico para las secuencias complementarias.
Pueden obtenerse posteriormente secuencias que hibridan el ADNc y
puede aislarse la zona asociada del promotor. Es posible también
cribar los bancos de ADN genómico preparados a partir de tejidos de
semilla de lino que utilizan conocidos genes específicos para la
semilla de otras especies vegetales y posteriormente aislar sus
promotores asociados. Debido a la abundancia relativa de las
proteínas de almacenamiento de la semilla en semillas también es
posible obtener la información de la secuencia por secuenciado al
azar de los bancos de ADNc de proteínas de almacenamiento en la
semilla. Estas secuencias de ADNc que corresponden a la secuencia de
proteínas conocidas de almacenamiento de la semilla pudieron
utilizarse para identificar el promotor asociado. Las bases de datos
que contienen la información de la secuencia del secuenciado a gran
escala del ejemplo de Arabidopsis y maíz pueden investigarse
para las proteínas y/o promotores específicos de la semilla
conocidos y la información puede utilizarse para identificar las
secuencias del promotor en el lino que comparten la similitud de
secuencia. Pueden utilizarse métodos alternativos para aislar
promotores específicos de la semilla de lino adicionales y los
expertos en la materia pueden descubrir nuevos promotores
específicos de la semilla de lino y utilizarse según la presente
invención.
La secuencia de ácido nucleico de interés unida
al promotor puede ser cualquier secuencia de ácido nucleico de
interés incluyendo cualquier secuencia de ARN o ADN que codifique un
péptido o proteína de interés, por ejemplo, una enzima o una
secuencia complementaria a una secuencia genómica, donde la
secuencia genómica puede ser por lo menos una de entre un marco de
lectura abierto, un intrón, una secuencia principal no codificadora
o cualquier secuencia en la que la secuencia complementaria inhiba
la transcripción, el tratamiento del ARN mensajero, por ejemplo
corte y empalme o traducción. La secuencia de ácido nucleico de
interés puede ser sintética, derivada de forma nativa o una
combinación de ésta. La secuencia de ácido nucleico de interés
podría ser asimismo un fragmento de la secuencia nativa, por ejemplo
incluir sólo el dominio catalítico o una estructura de particular
importancia. Dependiendo de la secuencia de ácido nucleico de
interés, puede ser deseable sintetizar la secuencia con codones
preferidos de la planta. Los codones preferidos de la planta pueden
determinarse a partir de los codones de mayor frecuencia en las
proteínas expresadas en la cantidad mayor en determinadas especies
vegetales de interés.
La secuencia de ácido nucleico de interés puede
codificar cualquiera de las variedades de proteínas recombinantes.
Ejemplos de proteínas recombinantes que pueden expresarse por los
métodos de la presente invención comprenden las proteínas con una
función catalítica favorable o una proteína valiosa que se acumule
en grandes cantidades y se extraiga si se desea. Las proteínas con
una función catalítica, incluyen, pero no se limitan a, las
proteínas que confieren un nuevo fenotipo bioquímico en las semillas
en desarrollo. Los nuevos fenotipos podrían incluir modificaciones
tales como la proteína de la semilla alterada o la composición de
aceite de la semilla o la composición de polisacárido de la semilla,
el aumento de producción de los productos deseables preexistentes o
propiedades y la reducción o incluso la supresión en un producto
génico indeseable utilizando tecnologías de cadena complementaria,
ribozimas o supresión conjunta (Izant y Weintraub (1984) Cell
26: 1007-1015, cadena complementaria; Hazelhoff y
Gerlach (1988) Nature 334: 585-591,
ribozimas; Napoli et al. (1990) Plant Cell 2:
279-289, supresión conjunta).
Es de esperar que las proteínas deseadas se
expresen en todos los tejidos embrionarios, aunque la expresión
celular variable puede detectarse en diferentes tejidos embrionarios
tal como el eje embrionario y los cotiledones. La secuencia de ácido
nucleico de interés puede expresarse en cualquier etapa en el
desarrollo de la semilla. El desarrollo cronológico de la expresión
puede depender de la utilización en concreto de la invención. La
expresión de enzimas implicadas en la modificación del aceite puede
ser deseable inicialmente en el desarrollo de la semilla, por
ejemplo antes de la acumulación de la proteína de almacenamiento de
la semilla.
Además de la zona del promotor y de la secuencia
de ácido nucleico de interés, una secuencia de ácido nucleico capaz
de terminar la transcripción está incluida normalmente en los
vectores de expresión. Los terminadores de la transcripción son
preferentemente de aproximadamente 200 a aproximadamente 1.000 pares
de bases de nucleótidos y pueden comprender cualquiera de dichas
secuencias operativas en las plantas, tal como la zona de
terminación de nopalina sintetasa (Bevan et al. (1983)
Nucl. Acid. Res. 11: 369-385), el terminador
de faseolina (van der Geest et al., (1994) Plant J.
6(3): 413-423), el terminador para el gen de
octopina sintetasa de Agrobacterium tumefaciens u otros
elementos que operen de manera similar. Estas zonas del terminador
de transcripción pueden obtenerse tal como describe An (1987),
Methods in Enzym. 153: 292 o están ya presentes en los
plásmidos disponibles en fuentes comerciales tal como ClonTech, Palo
Alto, California. La selección del terminador apropiado puede tener
un efecto de la velocidad de transcripción.
El constructo híbrido puede comprender además
potenciadores tal como el AMV principal (Jobling y Gehrke (1987),
Nature 325: 622-625) o intrones. Debería
entenderse que el diseño del vector de expresión puede depender de
factores tales como la selección de la especie vegetal y/o el tipo
de polipéptido que debe expresarse.
Los vectores de expresión normalmente contendrán
además un gen marcador. Los genes marcadores comprenden todos los
genes que permitan la distinción de células vegetales transformadas
de las células no transformadas, incluyendo los genes marcadores
seleccionables e identificables. De manera conveniente, un marcador
puede ser un marcador de resistencia para un herbicida, por ejemplo,
glifosato o fosfinotricina, o para un antibiótico tal como
kanamicina, G418, bleomicina, higromicina, cloranfenicol y
similares, que confieren un rasgo que puede seleccionarse por
medios químicos. Pueden emplearse marcadores identificables para
identifica los transformantes por observación. Incluyen pero no se
limitan a la b-glucuronidasa o al gen uidA, a un gen
de b-lactamasa o a una proteína verde fluorescente
(Niedz et al. (1995) Plant Cell Rep. 14: 403).
Para introducir las secuencias de ácido nucleico
en las células vegetales en general están a disposición del
especialista experto varias técnicas. Se ha publicado la
transformación mediada por Agrobacterium para las células
vegetales de lino y pueden obtenerse transformantes de lino mediante
los métodos dados a conocer por Dong y McHughen (1993) Plant
Science 88: 61-77, aunque pueden utilizarse
asimismo otras varias técnicas (véase a continuación) para
introducir los constructos de ADN híbrido en las células de lino si
así se desea.
Las plantas de lino transformadas son cultivadas
según las prácticas agrícolas convencionales conocidas por un
experto en la materia se deja que planten la semilla. La semilla de
lino puede extraerse a continuación de las plantas de lino maduras y
analizarse las propiedades alteradas deseadas con respecto a la
semilla nativa.
Pueden cultivarse dos o más generaciones de
plantas y cruzarse o autopolinizarse para permitir la identificación
de las plantas y cepas con las características fenotípicas deseadas
que incluyen la producción del polipéptido recombinante. Puede ser
deseable asegurar la homozigosidad en las plantas para asegurar la
herencia continua de la característica recombinante. Los métodos
para seleccionar las plantas homocigóticas son bien conocidos por
los expertos en materia de cultivo vegetal e incluyen la
autopolinización repetida y la selección y cultivo de anteras y
microsporas. Las plantas homozigóticas pueden obtenerse asimismo por
transformación de células o tejidos haploides seguida de la
regeneración de los plantones haploides convertidos posteriormente
en plantas diploides mediante cualquiera de los numerosos medios
conocidos (p. ej. tratamiento con colchicina u otros agentes
microtubulares de destrucción).
La presente invención proporciona además
semillas de lino transgénicas preparadas según un método que
comprende:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- la secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla de lino es un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
Las secuencias específicas del promotor
comprenden los nucleótidos 1 a 2.023 representados en la Figura 1
(SEC. ID. nº: 1) en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos
21 a 1.852 como se presentan en la Figura 2 (SEC. ID. nº: 4) en la
que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 1 a 400 representados en
la Figura 3 (SEC. ID. nº: 6) en la que T puede ser asimismo U y los
nucleótidos 1 a 2.034 representados en la Figura 4 (SEC. ID. nº: 8)
en la que T puede también ser U.
La presente invención proporciona además plantas
de lino capaces de plantar semillas preparadas según un método que
comprende:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico de interés en el que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla de lino es un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
La presente invención proporciona además métodos
de utilización de nuevos promotores que comprenden los nucleótidos 1
a 2.023 representados en la Figura 1 (SEC. ID. nº: 1) en la que T
puede ser asimismo U, los nucleótidos 21 a 1.852 representados en la
Figura 2 (SEC. ID. nº: 4) en la que T puede ser asimismo U, los
nucleótidos 1 a 400 representados en la Figura 3 (SEC. ID. nº: 6) en
la que T puede ser asimismo U y los nucleótidos 1 a 2.034
representados en la Figura 4 (SEC. ID. nº: 8) en la que T puede
también ser U, en otras especies vegetales aparte del lino. Por
consiguiente, en la presente memoria se dan a conocer la preparación
de constructos híbridos de ácido nucleico que comprenden un
promotor seleccionado de entre el grupo de promotores que comprenden
los nucleótidos 1 a 2.023 representados en la Figura 1 en la que T
puede ser asimismo U, los nucleótidos 21 a 1.852 representados en la
Figura 2 en la que T puede ser asimismo U, los nucleótidos 1 a 400
representados en la Figura 3 en la que T puede ser asimismo U y los
nucleótidos 1 a 2.034 representados en la Figura 4 en la que T puede
también ser U, y una secuencia de ácidos nucleicos de interés y la
expresión de manera específica para la semilla de la secuencia de
ácido nucleico de interés en otras especies vegetales aparte del
lino y bajo el control del promotor del lino.
En otro aspecto de la presente invención se
proporciona un método para la expresión de una secuencia de ácido
nucleico de interés en las semillas vegetales que comprende:
- (a)
- introducir la secuencia de ácido nucleico híbrida que comprende
- (1)
- una primera secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico para la semilla obtenido a partir del lino que comprende:
- (i)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 representados en la Figura 1 (SEC. ID. nº: 1) en la que T puede ser asimismo U; los nucleótidos 21 a 1.852 representados en la Figura 2 (SEC. ID. nº: 4) en la que T puede ser asimismo U; una secuencia de ácidos nucleicos que comprende los nucleótidos 1 a 400 representados en la Figura 3 (SEC. ID. nº: 6) en la que T puede ser asimismo U; o una secuencia de ácidos nucleicos que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 representados en la Figura 4 (SEC. ID. nº: 8) en la que T puede también ser U;
- (ii)
- una secuencia de ácido nucleico que hibrida una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (iii)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria con la secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (iv)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (2)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico de semillas de lino; en el que el medio específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor está predominantemente expresado en las semillas vegetales con menos del 5% del nivel de expresión global en otros tejidos vegetales en una célula vegetal,
- (b)
- cultivar dicha célula vegetal en una planta madura capaz de plantar la semilla, en la que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla.
Están disponibles una variedad de técnicas para
la introducción de secuencias de ácido nucleico, en particular de
ADN, en las células huésped vegetales en general. Por ejemplo,
pueden introducirse constructos híbridos de ADN en las células
huésped extraídas de plantas dicotiledóneas, tal como el tabaco, y
de especies oleaginosas, tal como Brassica napus utilizando
vectores normales de Agrobacterium mediante un protocolo de
transformación tal como el descrito por Moloney et al.
(1989), Plant Cell Rep. 8: 238-242 o Hinchee
et al. (1988) Bio/Technol. 6: 915-922;
u otras técnicas conocidas por los expertos en la materia. Por
ejemplo, la utilización de T-ADN para la
transformación de células vegetales ha recibido extensos estudios y
está ampliamente descrita en el documento EP 0 120 516, Hoekema
et al., (1985), capítulo V en: The Binary Plant Vector
System Offset-drukkerij Kanters BV,
Alblasserdam); Knauf et al. (1983), Genetic Analysis of
Host Expression by Agrobacterium, pág. 245, en: Molecular
Genetics of Bacteria-Plant Interaction, Puhler,
A. ed. Springer-Verlag, NY); y An et al.,
(1985), (EMBO J., 4: 277-284). La transformación de
Agrobacterium puede utilizarse también para transformar
especies vegetales de monocotiledóneas (patente U.S. nº
5.591.616).
De forma conveniente, pueden cultivarse
explantes con Agrobacterium tumefaciens o Agrobacterium
rhizogenes que permitan la transferencia del constructo de
transcripción en la célula huésped. Siguiendo la transformación que
utiliza Agrobacterium las células vegetales se dispersan en
un medio apropiado para la selección, posteriormente se recuperan
los callos, los brotes y finalmente las plantas. El huésped de
Agrobacterium albergará un plásmido que comprende los genes
vir necesarios para la transferencia del T-ADN a las
células vegetales. Para la inyección y electroporación (véase a
continuación) pueden introducirse plásmidos Ti sin brazos (que
carecen de genes tumorales, particularmente la zona del
T-ADN) en la célula vegetal.
La utilización de técnicas sin
Agrobacterium permite la utilización de constructos descritos
en la presente memoria para obtener la transformación y expresión en
una amplia variedad de especies vegetales monocotiledóneas y
dicotiledóneas. Estas técnicas son especialmente útiles para la
transformación de especies vegetales que son intratables en un
sistema de transformación con Agrobacterium. Otras técnicas
para la transferencia génica comprenden el bombardeo con partículas
(Sanford, (1988), Trends in Biotechn. 6:
299-302), electroporación (Fromm et al.,
(1985), PNAS USA, 82: 5824-5828; Riggs y Bates,
(1986), PNAS USA 83: 5602-5606), absorción de ADN
mediada por PEG (Potrykus et al., (1985), Mol. Gen.
Genetics., 199: 169-177), microinyección (Reich
et al., Bio/Tech. (1986) 4: 1001-1004)
y filamentos de carburo de silicona (Kaeppler et al. (1990)
Plant Cell Rep. 9: 415-418).
En una aplicación específica adicional tal como
para B. napus, las células huésped dirigidas para recibir
constructos de ADN recombinante procederán típicamente de peciolos
de cotiledónea como describe Moloney et al. (1989) Plant
Cell Rep. 8: 238-242. Otros ejemplos que
utilizan semillas de aceite comercial incluyen la transformación del
cotiledón en explantes de soja (Hinchee et al., (1988)
Bio/Technol. 6: 915-922) y las
transformaciones del tallo del algodón (Umbeck et al., (1987)
Bio/Technol. 5: 263-266).
Después de la transformación, las células, por
ejemplo discos foliares, se cultivan en medio selectivo. Una vez
comienzan a salir los brotes, se escinden y se colocan en medio de
enraizamiento. Una vez se han formado suficientes raíces, se
transplantan las plantas al suelo. Se ha demostrado la presencia de
un marcador en supuestas plantas transformadas. La transferencia
Southern en ADN genómico se realiza utilizando una sonda apropiada,
para mostrar la integración en el genoma de la célula huésped.
Los métodos proporcionados por la presente
invención pueden utilizarse juntamente con una amplia gama de
especies vegetales. Las células vegetales particularmente preferidas
empleadas de acuerdo con la presente invención incluyen las células
de las plantas siguientes: soja (Glycine max), semilla de
colza (Brassica napus, Brassica campestris), girasol
(Helianthus annuus), algodón (Gossypium hirsutum),
maíz (Zea mays), tabaco (Nicotiana tobacum), alfalfa
(Medicago sativa), trigo (Triticum sp.), cebada
(Hordeum vulgare), avena (Avena sativa L.), sorgo
(Sorghum bicolor), Arabidopsis thaliana, patata
(Solanum sp.), lino/semilla de lino (Linum
usitatissimum), cártamo (Carthamus tinctorius), palma de
aceite (Eleais guineeis), cacahuete (Arachis
hypogaea), nuez de Brasil (Bertholletia excelsa), coco
(Cocus nucifera), ricino (ricinos communis), cilantro
(Coriandrum sativum), calabaza (Cucurbita maxima),
jojoba (Simmondsia chinensis) y arroz (Oryza
sativa).
La presente invención presenta una variedad de
utilizaciones que incluyen la mejora del valor intrínseco de las
semillas vegetales mediante su acumulación de polipéptidos alterados
o de nuevos péptidos recombinantes o mediante la incorporación o
eliminación o una etapa metabólica. La utilización de la invención
puede producir mejor calidad de proteína (por ejemplo, aumento de
concentraciones o de aminoácidos esenciales o raros), mejor calidad
del líquido mediante una modificación de la composición del ácido
graso o mejora o aumento de la composición de carbohidratos. Los
ejemplos incluyen la expresión de las proteínas ricas en azúcar,
tales como las que se encuentran en los altramuces o en las nueces
de Brasil en una semilla deficiente en aminoácidos sulfurosos.
Podría también conseguirse una mejor calidad de proteína mediante la
expresión de una proteína o de un fragmento de proteína que está
enriquecido en aminoácidos esenciales incluyendo lisina, cisteína,
metionina y triptófano. Como alternativa, podría expresarse una
acilcoenzima A grasa, una enzima transferasa capaz de modificar las
proporciones de ácido graso en los triglicéridos (almacenamiento de
lípido). En los casos en los que se permite que se acumule en la
semilla una proteína recombinante, la proteína podría ser también un
péptido que presenta un valor farmacéutico o industrial. En este
caso, el péptido podría extraerse de la semilla y utilizarse en
bruto o purificada, según proceda, para la utilización deseada.
También, los polipéptidos que se expresan en las semillas pueden ser
fragmentos, derivados o la proteína nativa. Las proteínas
farmacéuticamente útiles pueden incluir, pero no se limitan a,
anticoagulantes, tales como hirudina, anticuerpos, incluyendo los
anticuerpos monoclonales y los fragmentos de anticuerpo, vacunas,
citocinas o factor de crecimiento tales como el factor de
crecimiento bovino, el factor de diferenciación colinérgica (CDF),
el factor neurótropo ciliar (CNTF), el factor de crecimiento de
fibroblastos (FGF), el factor de crecimiento de peces,
gonadotropina, el factor estimulante de
granulocitos-colonias (G-CSF), el
factor estimulante de colonias de
granulocitos-macrófagos (GM-CSF), la
hormona de crecimiento humano, interferón alfa
(IFN-a), interferón beta (IFN-b),
interferón gamma (IFN-g), interleucina
1-alfa (IL1-a), interleucina
1-beta (IL1-b),
interleucina-2 (IL-2),
interleucina-3 (IL-3),
interleucina-4 (IL-4),
interleucina-5 (IL-5),
interleucina-6 (IL-6),
interleucina-10 (IL-10), factor
inhibidor de leucemia (LIF), tiorredoxina, factor estimulante de
colonias de macrófagos (M-CSF), factor de
crecimiento mielomonocítico, factor de crecimiento de nervios (NGF),
oncostatina M, factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF),
prolactina, factor alfa transformante del crecimiento
(TGF-a), factor beta2 transformante del crecimiento
(TGF-b2), factor alfa de necrosis tumoral
(TNF-a) y factor beta de la necrosis tumoral
(TNF-b). Las proteínas farmacéuticamente útiles
pueden también incluir proteínas de mamífero, por ejemplo, pero no
limitadas a a-1-antitripsina,
proteínas antiobesidad, proteínas de la sangre, colágeno,
colagenasa, elastina, elastasa, enteropeptidasa, fibrinógeno,
hemoglobina, albúmina del suero humano, insulina, lactoferrina,
mioglobina y proteínas tensioactivas pulmonares.
Los péptidos útiles en la industria pueden
incluir, pero no están limitados a a-amilasa u otras
amilasas, amiloglucosidasa, arabinasa, catalasa, celobiohidrolasa,
celulasas, quitinasas, quimiotripsina, deshidrogenasas,
endo-glucanasa, quimiosina,
endo-galactanasa, esterasas,
b-galactosidasa, a-galactosidasa u
otras galactosidasas, lipasas gástricas, glucanasas, glucosa
isomerasa, hemicelulasas, hidrolasas, isomerasa, ligninasas,
lipasas, liasas, lisozimas, oxidasas, oxidorreductasa, papaína,
pectinasas, pectina liasa, peroxidasas, fosfatasas, fitasa,
proteasas, pululanasas, reductasas, serina proteasas, tiorredoxina,
transferasa, tripsina y xilanasa.
Los siguientes ejemplos no limitativos son
ilustrativos de la presente invención:
Ejemplo
1
Se aislaron clones de ADNc específicos de la
semilla para formar un banco de ADNc específico de la semilla de
lino. Se secuenciaron estos clones de ADNc y se utilizó la Basic
Local Alignment Search Tool (BLAST) para comparar estas secuencias
frente a otras en las bases de datos públicas tales como Genbank.
Esta comparación puso de manifiesto que la secuencia de aminoácidos
deducida de varios de los ADNc aislados presentaba un grado elevado
de similitud con la clase de oleosinas tanto de bajo como de alto
peso molecular, proteínas de almacenamiento
2S-albúmina y de tipo legúmina. Se prepararon sondas
individualmente de (fracciones de) los ADNc que codifican oleosinas,
albúmina 2S y proteínas de almacenamiento de tipo legúmina y éstas
se utilizaron para cribar un banco genómico preparado a partir de la
línea Forge de lino que es homocigótica para cuatro genes con
resistencia al enmohecimiento (Anderson et al. (1997), The
Plant Cell 9: 641-651). Se identificaron varios
clones lambda positivos para cada sonda después de la identificación
por alta severidad. Se subclonaron las inserciones en el vector del
plásmido pBluescript y se secuenciaron. La información de la
secuencia puso de manifiesto que los autores habían aislado las
contrapartidas genómicas a las oleosinas, albúmina 2S y ADNc de tipo
legúmina de los ADNc. La información de la secuencia de los clones
genómicos que contienen secuencias que codifican unas isoformas de
oleosina de alto y bajo peso molecular, la albúmina 2S y el gen de
tipo legúmina se presenta en las Figuras 1 a 4 respectivamente.
La Figura 1 y la SEC. ID nº: 1 presentan la
secuencia de ADN de un clon genómico de lino que codifica una
proteína de oleosina de 16,0 kDa (de peso molecular bajo o
L-isoforma). Se identifican y se indican los
supuestos elementos reguladores. Éstos incluyen las repeticiones
invertidas (pares de bases 805 a 813 y 821 a 829; pares de bases
1.858 a 1.866 y 1.877 a 1.885), repeticiones directas (pares de
bases 184 a 193 y 1.102 y 1.111; pares de bases 392 a 402 y 1.701 a
1.710; pares de bases 683 a 692 y 1.546 a 1.555; pares de bases 770
a 781 y 799 a 810; pares de bases 955 a 964 y 1.936 a 1.945; pares
de bases 1.483 a 1.496 y 1.513 a 1.526), elemento sensible al ácido
abscísico (ABRE) (pares de bases 1.859 a 1.866), secuencia CACA
(pares de bases 1.933 a 1.936), secuencia TATA (pares de bases 1.925
a 1.931) y secuencia CAT (pares de bases 1.989 a 1.993). También se
indica la señal de poliadenilación (pares de bases 3.020 a 3.025).
El marco de lectura abierto está interrumpido por 1 intrón corto
(que están marcados) y los 2 exones están traducidos e indicados en
códigos de IUPAC de aminoácidos con una sola letra.
La Figura 2 y la SEC. ID nº: 4 presentan la
secuencia de ADN de un clon genómico de lino que codifica una
proteína de oleosina de 18,6 kDa (de peso molecular alto o isoforma
H). Se identifican y se indican los supuestos elementos reguladores.
Éstos incluyen las repeticiones directas (pares de bases 14 a 25 y
1427 a 1438; pares de bases 80 a 89 y 1.242 a 1.251; pares de bases
177 a 186 y 837 a 846; pares de bases 1.281 a 1.290 y 1,242 a 1.251;
pares de bases 1.591 a 1.600 y 1.678 a 1.287). El marco de lectura
abierto no está interrumpido por intrones y está traducido e
indicado en códigos de IUPAC de aminoácidos con una sola letra.
La Figura 3 y la SEC. ID nº: 6 presentan la
secuencia de ADN del clon genómico de lino que codifica una proteína
de almacenamiento 2S. El secuenciado de los nucleótidos de este clon
puso de manifiesto que tiene un marco de lectura abierto de 174
aminoácidos que presentaba homología con el grupo de proteínas de
almacenamiento 2S de la planta. La secuencia codifica un marco de
lectura abierto con el 38% de similitud global con una proteína de
almacenamiento 2S de Brassica oleracea, que incluye la
conservación completa de la ampliación rica en glutamina QQQGQQQGQQQ
(SEC. ID nº: 13). Además, el promotor del gen de la proteína de
almacenamiento 2S contenía varios elementos reguladores del promotor
supuesto. Éstos comprenden repeticiones ricas en AT (pares de bases
25-36, 97-108 y
167-190), repetición de tipo RY (pares de bases
240-247), elemento de tipo secuencia G (pares de
bases 274-280), motivo de tipo secuencia específica
de la semilla (pares de bases 285-290) y secuencia
TATA (pares de bases 327-333).
La Figura 4 y la SEC. ID nº: 8 presentan la
secuencia de ADN de un clon genómico de lino que codifica una
proteína de almacenamiento de semillas de tipo legúmina de lino de
54,4 kDa. Este gen de la proteína de almacenamiento de la semilla
tipo legúmina también se denomina "linina". La secuencia
deducida de aminoácidos del gen de linina se comparó con la
proteína de tipo legúmina de R. communis, con el precursor de
legúmina de M. salicifolia, vQ. robur y G.
hirsutum, con el precursor de glutelina de O. sativa y
con una proteína de almacenamiento de la semilla 12 S de A.
thaliana. El gen de linina presenta una identidad/similitud de
secuencia con las proteínas correspondientes de R. communis, M.
salicifolia, Q. robur, G. hirsutum, O. sativa y A.
thaliana de 59/15, 47/16, 50/17, 45/17, 43/18 y 43/18 por ciento
respectivamente. Se identifican y se indican los supuestos elementos
reguladores en la zona del promotor. Éstos incluyen las repeticiones
invertidas (pares de bases 265 a 276 y 281 a 292; pares de bases 513
a 524 y 535 a 545), repeticiones (pares de bases 1349 a 1360 y 1.367
a 1.378; pares de bases 1.513 a 1.529 y 1.554 a 1.572), elemento
sensible al ácido abscísico (ABRE) (pares de bases 1.223 y 1.231),
secuencia de legúmina (repeticiones de RY), (entre los pares de
bases 1.223 y 1.231) y la posible zona de la secuencia de vicilina
(pares de bases 1.887 a 1.894), secuencia CAAT (pares de bases 1.782
a 1.785) y secuencia TATA (pares de bases 1.966 a 1.970). Así mismo,
se indica el péptido señal para el direccionamiento a la membrana ER
(pares de bases 2.034 a 2.080). El marco de lectura abierto está
interrumpido por 3 intrones cortos (que están marcados) y los 4
exones están traducidos e indicados en códigos de IUPAC de
aminoácidos con una sola letra.
La Figura 5 presenta el análisis de
transferencia Southern del ADN genómico de lino. Se aislaron de las
hojas 60 \mug de ADN genómico de lino, se digirió con EcoRI (banda
I), HindIII (banda 2) y BamHI (banda 3) y se cargó en las
respectivas bandas. A) Se realizaron hibridaciones con ADNc de 3T
marcado con 32P cebado al azar (isoforma de oleosina de lino de alto
peso molecular). B) Se realizaron hibridaciones con ADNc de 7R
marcado con 32P cebado al azar (isoforma de oleosina de lino de bajo
peso molecular). Los resultados demuestran que tanto los ADNc de
oleosina 3T (isoforma de oleosina de alto peso molecular) como de 7R
(isoforma de oleosina de bajo peso molecular) se hibridan con el ADN
genómico de lino. Más específicamente los resultados indican que 3T
probablemente representa un gen de 2 copias en el lino, como se
observa por las dos bandas en cada banda de digestión. Asimismo, 7R
representa probablemente una familia multigén en el lino ya que se
detectaron bandas múltiples en cada digestión.
Ejemplo
2
La Figura 6 presenta un análisis por
transferencia Northern de la expresión específica de la semilla de
oleosinas de lino. La hibridación Northern de los dos ARNm de
oleosina en diferentes tejidos. Se extrajeron diez mg de ARN total
de diferentes tejidos, R, raíz; C, cotiledón; L, hoja; S, cápsula de
la semilla; E, embrión. Se sondó la membrana con (A) ADNc que
codifica la isoforma (H) de alto peso molecular (idéntica a la
secuencia de codificación presentada en la Figura 2) y (B) ADNc que
codifica la isoforma (L) de bajo peso molecular (idéntica a la
secuencia de codificación presentada en la Figura 1). Ambos
transcritos se expresan solamente en el embrión y en la cápsula de
la semilla, que contiene embriones.
Ejemplo
3
La Figura 7 presenta un análisis por
transferencia Northern de la expresión del desarrollo de las
oleosinas de lino durante el desarrollo de la semilla. Se cargaron
15 \mug por banda del ARN total en cada banda en gel de
agarosa/formaldehído y se transfirieron a una membrana HybondN+.
10J: Esta membrana se sondó utilizando el clon del ADNc de oleosina
de lino marcado con 32P dCTP (isoforma de bajo peso molecular). Las
etapas indicadas son el número de días después de la antesis (DPA).
3T) Se cargaron 15 \mug de ARN completo por banda en cada banda en
gel de agarosa/formaldehído y se transfirieron a una membrana
HybondN+. 3T: Esta membrana se sondó utilizando el clon del ADNc de
oleosina de lino marcado con 32P dCTP (isoforma de alto peso
molecular). Ambos transcritos se expresaron muy al principio en el
desarrollo (6DPA, etapa inicial de los cotiledones). La expresión es
máxima a 16 hasta 20 DPA (etapa final de cotiledones) y disminuye a
22 DPA (embriones maduros).
Ejemplo
4
Se prepararon dos constructos utilizando
técnicas de biología molecular normalizadas (p. ej. véase Sambrook
et al. (1990), Molecular Cloning, 2ª ed., Cold Spring
Harbor Press, incluyendo las digestiones con enzima de restricción,
ligadura y reacción en cadena de polimerasa (PCR).
Constructo pSC54: Se colocó la secuencia de
codificación del indicador de \beta-glucuronidasa
procedente del vector GUSN358>S (Clontech Laboratories) entre la
secuencia del promotor desde el nucleótido 21 al 1.852 y la
secuencia del terminador desde 2.395 a 3.501 (descritas en la Figura
2). Esta inserción se clonó en pBluescript y el vector resultante se
denomina pSC54.
Constructo pSC60: Se colocó la secuencia de
codificación del indicador de \beta-glucuronidasa
procedente del vector GUSN358>S (Clontech Laboratories) entre la
secuencia del promotor desde el nucleótido 1 al 2.023 y la secuencia
del terminador desde 2.867 a 3.925 (descritas en la Figura 1). Esta
inserción se clonó en pBluescript y el vector resultante se denomina
pSC60.
Se introdujeron pSC54, pSC60 y un constructo GUS
sin promotor (referencia) en el embrión de lino utilizando bombardeo
de partículas que utiliza protocolos normalizados (p. ej. véase
Abenes et al. (1997) Plant Cell informes 17:
1-7). La Figura 8 presenta la actividad de GUS del
bombardeo de embriones de lino con pSC54, pSC60 y el constructo GUS
sin promotor medido 48 horas después del bombardeo de partículas.
Como puede observarse las secuencias reguladoras de oleosina de lino
son suficientes para dirigir la expresión de GUS en los embriones
de
lino.
lino.
Ejemplo
5
Se preparó el constructo del gen indicador GUS
incorporando las zonas 5' y 3' del fragmento de ADN descrito en la
Figura 3 en el vector pBI101 de GUS sin promotor de la forma
siguiente.
Un amplicón de 400 bp del extremo 5' del
fragmento de ADN descrito en la Figura 3 se amplió por PCR
utilizando los siguientes cebadores (situación representada en la
Fig. 3):
- Cebador (1) en 5': \hskip0,3cm 5'-TCCACTATGTAGGTCATA-3'
- (SEC. ID nº: 14)
- Cebador (1) en 3': \hskip0,3cm 5'-CTTTAAGGTGTGAGAGTC-3'
- (SEC. ID nº: 15)
Los cebadores para PCR también contenían zonas
de restricción para HindIII y BamHI que se utilizaron para clonar el
amplicón 5'UTR de 400 bp en las secuencias HindIII/BamHI del vector
pBI101 enfrente del gen indicador GUS. Se amplió por PCR el amplicón
de 736 bp de la zona 3' no traducida (3'UTR) del fragmento de ADN
descrito en la Figura 3 utilizando los siguientes cebadores
(posición representada en la Fig. 3):
- Cebador (2) en 5': \hskip0,3cm 5'-AGGGGTGATCGATTA-3'
- (SEC. ID nº: 16)
- Cebador (2) en 3': \hskip0,3cm 5'-GATAGAACCCACACGAGC-3'
- (SEC. ID nº: 17)
Los cebadores para PCR también contenían
secuencias de restricción para SacI y EcoRI. La zona del terminador
NOS del vector pBI101 se cortó con digestión de SacI/EcoRI y se
sustituyó con el amplicón 3'UTR de 736 bp digerido igualmente del
fragmento de ADN descrito en la Figura 3.
Se realizó a continuación la electroporación del
constructo del indicador GUS en la cepa AGLI de Agrobacterium
tumefaciens y la transformación de lino (Finnegan et al.
(1993) Plant Mol. Biol. 22(4):
625-633) y Arabidopsis (Valvekens et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. 85: 5536-5540) se realizó
según los protocolos descritos anteriormente.
Para demostrar la actividad de GUS se analizaron
histológicamente varios tejidos de plantas de lino y
Arabidopsis que llevan el constructo indicador GUS. En el
caso del lino, el tejido de la hoja, el tejido de la raíz y los
embriones de madurez media disecados de semillas en desarrollo se
tiñeron para la actividad de GUS. Para Arabidopsis, se
tiñeron las semillas en desarrollo para GUS in situ en sus
silicuas.
Se realizó la tinción de GUS sumergiendo los
tejidos en tampón histoquímico que contiene X-gluc
0,5 mM, tampón de fosfato de potasio 0,5 M (pH 7,0), EDTA 1 mM,
sorbital 0,5 M, ferricianuro potásico 0,5 mM y ferrocianuro potásico
0,5 mM. La reacción de tinción se realizó durante 12 a 16 h a 37ºC y
la reacción se interrumpió añadiendo etanol al 95%. Se purificaron
posteriormente los tejidos de clorofila mediante lavados repetidos
en etanol al 95% antes de fotografiarlos. La Figura 9 presenta
pruebas evidentes de la actividad acusada de GUS en los embriones de
lino en desarrollo y de semillas de Arabidopsis y ninguna
prueba de la expresión del gen indicador de GUS en las raíces u
hojas de lino o en las paredes de las silicuas de
Arabidopsis.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
6
Se preparó un constructo utilizando técnicas de
biología molecular normalizadas, que incluyen digestiones con enzima
de restricción, ligadura y reacción en cadena de polimerasa (PCR).
Para obtener un fragmento de ADN que contiene aproximadamente 2
kilobases en la zona de iniciación de la transcripción en 5' de la
proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina de lino en
una configuración adecuada para la ligadura a una secuencia de
codificación de GUS, se utilizó un método basado en PCR. Éste
implicaba la utilización de la reacción en cadena de polimerasa para
ampliar la secuencia exacta deseada para el análisis de la
expresión. Para realizar la ampliación por PCR necesaria, se
sintetizaron dos cebadores de oligonucleótido (sintetizador de ADN
Oligo 1000M de Beckman) que presentan las secuencias siguientes:
Cebador 5': | 5'TATCTAGACTCAAGCATACGGACAAGGGT 3' (SJ-634) | (SEC. ID nº: 18) |
Las bases en cursiva corresponden a las
posiciones 1 a 21 de nucleótidos de la secuencia indicada en la
Figura 4. Los demás nucleótidos 5' de esta secuencia en el cebador
no son idénticos a la secuencia del indicador, pero se incluyeron
para colocar una secuencia XbaI en el extremo 5' del producto de la
ampliación. La secuencia XbaI
(5'-TCTAGA-3') (SEC. ID nº: 19) está
subrayada.
Se sintetizó un segundo cebador (3') que tenía
la secuencia siguiente:
Cebador 3': | 5'GGTTATCATTGTATGAACTGA3' (SJ-618) | (SEC. ID nº: 20) |
Este cebador contiene el complemento exacto
(representado en cursiva) para la secuencia indicada en la Figura 4
desde las bases 2.343 a 2.363. Este cebador no se diseñó con una
secuencia de la enzima de restricción adicional debido al hecho de
que la secuencia NcoI nativa
(5'-CCATGG-3') (SEC. ID nº: 21)
comprende el codón de iniciación entre los pares de bases 2.034 y
2.039, permitiendo de este modo la inserción del promotor de la
proteína de almacenamiento en el vector de clonación apropiado.
Estos dos cebadores se utilizaron en una
reacción de ampliación por PCR para producir un fragmento de ADN que
contiene la secuencia entre los nucleótidos 1 y 2.342 del gen de la
proteína de almacenamiento de la semilla de lino con una secuencia
XbaI en el extremo 5' y una secuencia NcoI de 302 pares de bases en
el extremo 3'. Se realizó la ampliación por PCR utilizando la enzima
Pfu (Stratagene) que utiliza las condiciones recomendadas por el
fabricante de la enzima y un programa de temperatura de 94ºC
(desnaturalización) durante 1 minuto, 55ºC (hibridación) durante 1
minuto y 72ºC (elongación) durante 3,5 minutos. La plantilla era el
clon genómico de la proteína de almacenamiento de la semilla de
legúmina representado en la Figura 4.
El producto de la ampliación resultante se
digirió posteriormente con XbaI y NcoI para eliminar la zona del
promotor de 2 kb deseada. Este fragmento de promotor se clonó en las
secuencias XbaI y NcoI de un plásmido denominado pGUS1318 digerido
con XbaI y NcoI (plásmido pGUSN358S (Clontech Laboratories) que se
cortó con NcoI y EcoRI y la inserción GUS se clonó en pBluescriptKS+
(Stratagene) que fue adaptado para contener una secuencia NcoI en la
secuencia de clonación múltiple). El plásmido resultante que
contiene la fusión promotor-GUS se denominó
pPGUS1318. El terminador de la proteína de almacenamiento de la
semilla de legúmina del lino se amplió también en el clon genómico
mencionado anteriormente. Para realizar la ampliación de PCR
necesaria, se sintetizaron cebadores de oligonucleótido que
presentan las secuencias siguientes:
Cebador 5': | 5' GCAAGCTTAATGTGACGGTGAAATAATAACGG 3' (SJ620) | (SEC. ID nº: 22) |
Las bases en cursiva corresponden a las
posiciones 3.780 a 3.803 de nucleótidos de la secuencia indicada en
la Figura 4. Los demás nucleótidos 5' de esta secuencia en el
cebador no son idénticos a la secuencia del indicador, pero se
incluyeron para colocar una secuencia HindIII en el extremo 5' del
producto de la ampliación. La secuencia HindIII
(5'-AAGCTT-3') (SEC. ID nº: 23) está
subrayada.
Se sintetizó un segundo cebador (3') que tenía
la secuencia siguiente:
Cebador 3': | 5'TAGGTACCTGGCAGGTAAAGACTCTGCTC3' (SJ-618) | (SEC. ID nº: 24) |
Este cebador contiene el complemento exacto
(representado en cursiva) para la secuencia indicada en la Figura 4
desde las bases 4.311 A 4.290. Los nucleótidos 5' adicionales de
esta secuencia en el cebador no son idénticos a la secuencia del
promotor, pero se incluyeron para colocar una secuencia KpnI en el
extremo 5' del producto de amplificación. La secuencia KpnI
(5'-GGTACC-3') (SEC. ID nº: 25) está
subrayada.
Estos dos cebadores se utilizaron en una
reacción de ampliación por PCR para producir un fragmento de ADN que
contiene la secuencia entre los nucleótidos 3.779 y 4.311 del gen
terminador de la proteína de almacenamiento de la semilla de lino
con una secuencia HindIII en el extremo 5' y una secuencia KpnI en
el extremo 3'. La ampliación que utiliza PCT fue la descrita
anteriormente. El vector pPGUS1318 que contiene el promotor ampliado
se digirió con XhoI y se trató con Klenow para crear un extremo
truncado. El vector se digirió posteriormente con KpnI y la
secuencia anterior del terminador ampliada se insertó de modo que se
situó en 3' de la secuencia de codificación de GUS. El vector
resultante que contiene el promotor de la proteína de almacenamiento
de la semilla de lino, GUS y el terminador de la proteína de
almacenamiento de la semilla de lino se denomina pPGUST.
La inserción XbaI-KpnI de pPGUST
que contiene la secuencia promotor de
linina-secuencia de codificación de
GUS-secuencia del terminador de linina se ligó en
las secuencias XbaI-KpnI de pSBS3000 (este vector es
un derivado del plásmido pPZP221 binario de Agrobacterium
(Hajdukiewicz et al., 1994, Plant Molec. Biol. 25:
989-994). En pSBS3000 el gen de resistencia a la
gentamicina de la planta de pPZP221 se sustituyó por la secuencia
promotor de ubiquitina del perejil-gen de
fosfinotricina acetil transferasa-secuencia de
terminación de ubiquitina del perejil para comunicar resistencia al
glufosinato amónico del herbicida). El vector resultante se denomina
pSBS2089. Además de la inserción XbaI-KpnI de pPGUST
que contiene la secuencia promotor de
linina-secuencia de codificación de
GUS-secuencia del terminador de linina se ligó en
las secuencias XbaI-KpnI del plásmido binario
pCGN1559 de Agrobacterium (MacBride y Summerfield, 1990, Plant
Molec. Biol. 14: 269-276, confiere resistencia
al antibiótico kanamicina)). El vector resultante se denominó
pSBS2083. Se realizó la electroporación de los plásmidos pSBS2089 y
pSBS2083 en la cepa EHA101 de Agrobacterium. Se utilizó la
cepa EHA101 (pSBS2089) de Agrobacterium para transformar el
lino y se utilizó Arabidopsis, la cepa EHA101 (pSBS2083) de
Agrobacterium para transformar Brassica napus. La
transformación del lino se realizó esencialmente como se describe en
Jordan y McHughen (1988) Plant cell informes 7:
281-284, excepto que se seleccionaron tallos
transgénicos en L-fosfinotricina 10 \muM en lugar
de kanamicina. Se realizó la transformación de Arabidopsis
esencialmente como se describe en "Arabidopsis Protocols;
Methods in Molecular Biology" vol. 82 editado por
Martínez-Zapater J.M. y Salinas J. ISBN
0-89603-391-0 págs.
259-266 (1998) excepto que se seleccionaron
supuestas plantas transgénicas en placas de agarosa que contienen
L-fosfinotricina 80 \muM. La transformación de
Brassica napus se realizó esencialmente como se describe en
Moloney et al. (1989). Plant Cell informes 8:
238-242.
La Figura 10 presenta la expresión específica
del tejido de GUS en plantas de lino transgénicas transformadas con
un constructo del gen linina-GUS (pSBS2089). Se
midió la expresión de GUS en raíces (R), tallos (S), hojas (L),
brotes (B) y embrión (E). Se observó alguna expresión en los brotes
y se consiguió la expresión máxima en los tejidos del embrión. No se
observó ninguna expresión detectable en ninguno de los tejidos no
transformados (WT).
La Figura 11 presenta la expresión temporal de
GUS en plantas de lino transgénicas transformadas con un constructo
del gen linina-GUS (pSBS2089). Como se puede
apreciar, la expresión máxima se consigue en los embriones maduros
de lino (predisecados).
La Figura 12 presenta la expresión absoluta de
GUS en plantas de Brassica napus transgénicas (L1 a L9)
transformadas con un constructo del gen linina-GUS
(pSBS2083). Como puede apreciarse puede conseguirse un alto nivel de
expresión en las plantas de Brassica napus. Cuando se
comparan las plantas transgénicas individuales, puede apreciarse
también una variación típica en la expresión debida al efecto de la
posición.
La Figura 13 presenta la expresión de GUS en las
silicuas de Arabidopsis transgénicas (transformadas con un
constructo (pSBS2089) del gen de linina-GUS) durante
el desarrollo de la semilla. Como puede apreciarse se puede
conseguir expresión de alto nivel en los tejidos de las semillas de
Arabidopsis. La máxima expresión se consigue en la etapa 4
(madura pero no totalmente disecada) del desarrollo de la semilla.
No se observó ninguna expresión detectable en los tejidos distintos
a los de la semilla tales como hojas, ramas, brotes y paredes de
silicua (resultados no representados).
Aunque la presente invención se ha descrito
haciendo referencia a los que se consideran actualmente que son los
ejemplos preferidos, debe entenderse que la invención no se limita a
los ejemplos expuestos. Por el contrario, la invención está
destinada a cubrir varias modificaciones y disposiciones
equivalentes incluidas dentro del alcance de las reivindicaciones
adjuntas.
<110> Chaudhary, Sarita
\hskip1cmvan Rooijen, Gijs
\hskip1cmMoloney, Maurice
\hskip1cmSingh, Surinder
\hskip1cmSemBioSys Genetics Inc.
\hskip1cmCommonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Promotores específicos de semillas
de lino
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 9369-147
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> 60/151044
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
1999-08-27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> 60/161,722
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
1999-10-27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.0
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4305
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 109
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3501
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 180
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1676
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 174
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4999
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 96
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 85
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 165
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 141
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Linum usitatissimum
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gly Gln Gln
Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptccactatgt aggtcata
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctttaaggtg tgagagtc
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaggggtgatc gatta
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgatagaaccc acacgagc
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptatctagact caagcatacg gacaagggt
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: sitio XbaI
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptctaga
\hfill6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggttatcatt gtatgaactg a
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: sitio NcoI
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccatgg
\hfill6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgcaagcttaa tgtgacggtg aaataataac gg
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: sitio HindIII
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagctt
\hfill6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptaggtacctg gcaggtaaag actctgctc
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: sitio KpnI
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggtacc
\hfill6
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (33)
1. Método para la expresión de una secuencia
de ácido nucleico de interés en las semillas de lino que comprende
las etapas siguientes:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- dicha secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor específico de la semilla es un promotor específico de la semilla de lino se selecciona de entre el grupo constituido por promotores de oleosina, promotores de la proteína de almacenamiento 2S y promotores de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
2. Método según la reivindicación 1, en el
que por lo menos una expresión característica conferida por dicho
promotor a su secuencia de ácido nucleico nativo se confiere a dicha
secuencia de ácido nucleico no nativo.
3. Método según la reivindicación 2, en el
que dicha expresión característica es el desarrollo cronológico de
la expresión, el nivel de expresión, la respuesta a un cambio en las
condiciones de iluminación, la respuesta a un cambio de temperatura,
la respuesta a un cambio de concentración de un agente químico.
4. Método según la reivindicación 1, en el
que dicho promotor de lino específico de la semilla comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
5. Método según la reivindicación 1, en el
que dicho promotor de lino específico de la semilla comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
6. Método según la reivindicación 1, en el
que dicho promotor de lino específico de la semilla comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
7. Método según la reivindicación 1, en el
que dicho promotor de lino específico de la semilla comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
8. Método según la reivindicación 1, en el
que la la expresión de dicha secuencia de ácido nucleico de interés
produce una alteración en la composición de la proteína o del ácido
graso en dicha semilla.
9. Semilla transgénica de lino preparada
según un método que comprende las etapas siguientes:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en el que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en el que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor es un promotor de la proteína de almacenamiento se milla, un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
10. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 9, en la que por lo menos una expresión
característica conferida por dicho promotor específico de la semilla
a su secuencia de ácido nucleico nativo se confiere a dicha
secuencia de ácido nucleico no nativo.
11. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 10, en la que dicha expresión característica es el
desarrollo cronológico de la expresión o del nivel de expresión.
12. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 10, en la que dicho promotor específico de la semilla
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
13. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 10, en la que dicho promotor específico de la semilla
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
14. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 10, en la que dicho promotor específico de la semilla
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
15. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 10, en la que dicho promotor específico de la semilla
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas.
16. Semilla transgénica de lino según la
reivindicación 10, en la expresión de dicho gen no nativo de interés
produce una alteración en la composición de la proteína o del ácido
graso de la semilla.
17. Plantas transgénicas de lino capaces de
plantar semillas preparadas por un método que comprende las etapas
siguientes:
- (a)
- preparar un constructo híbrido de ácido nucleico que comprende en la dirección 5' a 3' de la transcripción como componentes ligados funcionalmente:
- (1)
- un promotor específico de la semilla obtenido del lino; y
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico de interés en la que dicho ácido nucleico de interés no es nativo de dicho promotor específico de la semilla;
- (b)
- introducir dicho constructo híbrido de ácido nucleico en una célula vegetal de lino; y
- (c)
- cultivar dicha célula vegetal de lino en una planta de lino madura capaz de plantar la semilla, en la que dicha secuencia de ácido nucleico de interés se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla, en la que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales y en el que dicho promotor es un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla, un promotor de oleosina, un promotor de la proteína de almacenamiento 2S o un promotor de la proteína de almacenamiento de la semilla de tipo legúmina.
18. Secuencia de ácido nucleico aislada capaz
de dirigir la expresión específica de la semilla en una planta, que
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b);
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas,
en la que expresión específica de la semilla
significa que un gen expresado bajo el control de dicho ácido
nucleico aislado se expresa principalmente en las semillas de la
planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros
tejidos vegetales.
19. Secuencia de ácido nucleico aislada capaz
de dirigir la expresión específica de la semilla en una planta, que
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b); o
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas;
en la que expresión específica de la semilla
significa que un gen expresado bajo el control de dicho ácido
nucleico aislado se expresa principalmente en las semillas de la
planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros
tejidos vegetales.
20. Secuencia de ácido nucleico aislada capaz
de dirigir la expresión específica de la semilla en una planta, que
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b); o
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas;
en la que expresión específica de la semilla
significa que un gen expresado bajo el control de dicho ácido
nucleico aislado se expresa principalmente en las semillas de la
planta con menos del 5% del nivel de expresión general en otros
tejidos vegetales.
21. Secuencia de ácido nucleico aislada capaz
de dirigir la expresión específica de la semilla en una planta, que
comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8), en la que T puede ser asimismo U;
- (b)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a);
- (c)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a) o (b); o
- (d)
- una secuencia de ácido nucleico que es un análogo de una secuencia de ácido nucleico de (a), (b) o (c); o
- (e)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) en condiciones de hibridación severas;
en la que expresión específica de la semilla
significa que un gen expresado bajo el control de dicho ácido
nucleico aisladose expresa principalmente en las semillas de la
planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros
tejidos vegetales.
22. Secuencia aislada de ácido nucleico híbrido
que comprende:
- (a)
- una primera secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico para la semilla obtenido del lino que comprende:
- (1)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.023 como se muestra en la Figura 1 (SEC. ID nº: 1), en la que T puede ser asimismo U;
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico que se híbrida con una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (3)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (4)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (b)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino; en la que específica de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales.
23. Secuencia aislada de ácido nucleico híbrido
que comprende:
- (a)
- una primera secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico para la semilla extraída del lino que comprende:
- (1)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 21 a 1.852 como se muestra en la Figura 2 (SEC. ID nº: 4), en la que T puede ser asimismo U;
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (3)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (4)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (b)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino; en la que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales.
24. Secuencia aislada de ácido nucleico
híbrido, que comprende:
- (a)
- una primera secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico de la semilla extraído del lino que comprende:
- (1)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 400 como se muestra en la Figura 3 (SEC. ID nº: 6), en la que T puede ser asimismo U;
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (3)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (4)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (b)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino; en la que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales.
25. Secuencia aislada de ácido nucleico híbrido
que comprende:
- (a)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende un promotor específico de la semilla extraída del lino que comprende:
- (1)
- una secuencia de ácido nucleico que comprende los nucleótidos 1 a 2.034 como se muestra en la Figura 4 (SEC. ID nº: 8) en la que T puede ser asimismo U;
- (2)
- una secuencia de ácido nucleico que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de (a) en condiciones de hibridación severas;
- (3)
- una secuencia de ácido nucleico que es complementaria de una secuencia de ácido nucleico de (a); o
- (4)
- una secuencia de ácido nucleico que presenta por lo menos 65% de identidad con una secuencia de ácido nucleico de (a); y
- (b)
- una segunda secuencia de ácido nucleico no nativo de dicho promotor específico de la semilla de lino; en la que específico de la semilla significa que un gen expresado bajo el control del promotor se expresa principalmente en las semillas de la planta con menos de 5% del nivel de expresión general en otros tejidos vegetales.
26. Método para la expresión de una secuencia
de ácido nucleico de interés en una semilla vegetal, que comprende
las etapas siguientes:
- (a)
- introducir la secuencia híbrida de ácido nucleico según cualquiera de las reivindicaciones 22 a 25 en una célula vegetal; y
- (b)
- cultivar dicha célula vegetal en una planta madura capaz de plantar la semilla, en el que la segunda secuencia de ácido nucleico se expresa en la semilla bajo el control de dicho promotor específico de la semilla.
27. Método según la reivindicación 26, en el
que dicha célula vegetal se selecciona de entre el grupo constituido
por soja (Glycine max), semilla de colza (Brassica
napus, Brassica campestris), girasol (Helianthus
annuus), algodón (Gossypium hirsutum), maíz (Zea
mays), tabaco (Nicotiana tobacum), alfalfa (Medicago
sativa), trigo (Triticum sp.), cebada (Hordeum
vulgare), avena (Avena sativa L.), sorgo (Sorghum
bicolor), Arabidopsis thaliana, patata (Solanum
sp.), lino/semilla de lino (Linum usitatissimum), cártamo
(Carthamus tinctorius), palma de aceite (Eleais guineeis),
cacahuete (Arachis hypogaea), nuez de Brasil (Bertholletia
excelsa), coco (Cocus nucifera), ricino (ricinos
communis), cilantro (Coriandrum sativum), calabaza
(Cucurbita maxima), jojoba (Simmondsia chinensis) y
arroz (Oryza sativa).
28. Planta preparada según el método de la
reivindicación 26.
29. Célula vegetal que comprende la secuencia
híbrida de ácido nucleico según cualquiera de las reivindicaciones
22 a 25.
30. Semilla vegetal que comprende la secuencia
híbrida de ácido nucleico según las reivindicaciones 22 a 25.
31. Semilla vegetal obtenida de una planta
preparada según el método de la reivindicación 26.
32. Vector de expresión recombinante que
comprende una secuencia de ácido nucleico según las reivindicaciones
18 a 21.
33. Vector de expresión recombinante que
comprende una secuencia de ácido nucleico según las reivindicaciones
22 a 25.
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