ES2219685T3 - Mutante del inhibidor del tipo erythrina caffra y empleo de dicho mutante para la purificacion de las serinproteasas. - Google Patents
Mutante del inhibidor del tipo erythrina caffra y empleo de dicho mutante para la purificacion de las serinproteasas.Info
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Abstract
LA INVENCION TRATA DE UN POLIPEPTIDO QUE POSEE LA ACTIVIDAD DE UN INHIBIDOR DE 3 DE ERITRINA CAFFRA Y QUE AGLUTINA, DE FORMA REVERSIBLE Y SELECTIVA, PROTEASAS DE SERINA DE UNA MEZCLA DE PROTEINAS; SE OBTIENE MEDIANTE CULTIVO DE CELULAS HUESPED PROCARIONTICAS O EUCARIONTICAS, QUE CON UN ACIDO NUCLEINICO, QUE CODIFICA PARA EL MENCIONADO POLIPEPTIDO, HAN SIDO TRANSFORMADAS O TRANSFERIDAS DE TAL MANERA QUE PERMITEN A LAS CELULAS HUESPED, SI SE DAN UNAS CONDICIONES FAVORABLES DE SUSTANCIAS NUTRITIVAS, EXPRIMIR EL POLIPEPTIDO MENCIONADO. LA INVENCION TRATA TAMBIEN DEL AISLAMIENTO DEL MENCIONADO POLIPEPTIDO, Y SE CARACTERIZA PORQUE EL POLIPEPTIDO POSEE UNA SECUENCIA DE AMINO ACIDO QUE FUNCIONALMENTE ES ANALOGA A LA SEQ ID NO:2, EN UNA ZONA PARCIAL ES HOMOLOGO EN MAS DE UN 85 % A LA ZONA DE LOS AMINO ACIDOS 39 139 DE ESTA SECUENCIA, POSEE DOS PUENTES DE DISULFUROS Y COMIENZA N TERMINAL CON SEQ ID NO:4 O CON SEQ ID NO:4 PROLONGADA N TERMINAL POR METIONINA, Y POSEE UNA CAPACIDAD DE AGLUTINAR LOS ACTIVADORES DE PLASMINOGEN DE TEJIDO DE 1,25 MU/ML O MAS. EL POLIPEPTIDO ES ESPECIALMENTE APTO PARA LA PURIFICACION DE ACTIVADORES DE PLASMINOGEN, COMO ACTIVADORES DE PLASMINOGEN DE TEJIDO (T PA Y DERIVADOS).
Description
Mutante del inhibidor del tipo Erythrina
caffra y empleo de dicho mutante para la purificación de las
serinproteasas.
La invención se refiere a un nuevo inhibidor del
tipo Eritrina caffra y su utilización para la purificación
de las serinproteasas.
Los inhibidores inmovilizados de la tripsina,
obtenidos a partir de la Eritrina (ETI), son eficaces reactivos
para la purificación por cromatografía de afinidad, de las
serinproteasas, en particular de los activadores del plasminógeno
(C. Heussen (1984) (22), \beta-tripsina,
\alpha-quimotripsina y trombina (S. Onesti y col.,
(1992) (34). Estos inhibidores de la tripsina son ya
conocidos desde hace tiempo (C. Heussen (1982 (23); F.J.
Joubert (1982) (26); F.J. Joubert (1982)(27).
El inhibidor DE-3 obtenido partir
de E. caffra es particularmente preferido para la apropiada
purificación de los activadores del plasminógeno (F.J. Joubert
(1987)(25). En esta publicación está descrita también la
secuencia completa de aminoácidos de este inhibidor. El
DE-3 puede aislarse de las semillas de E.
caffra y purificarse (F.J. Joubert (1982)(26). Una ETI,
que no es citotóxica está descrita en la patente
EP-B 0 218 479 (15).
Teixeira y col. (1994) (45) describe un
ETI recombinante, cuya actividad inhibidora específica para el
activador del plasminógeno del tejido es de 1,7 x 10^{9}U/mmol.
La actividad inhibidora específica del ETI natural es en cambio de
1,94 x 10^{9}U/mmol. Lo mismo sirve para la actividad inhibidora
respecto a la tripsina (2,63 x 10^{12}/3,21 x 10^{12}). Con ello
la actividad inhibidora específica del ETI obtenido
recombinantemente según Teixeira para la tripsina es un 20% y para
el activador del plasminógeno de tejidos en un 10% más pequeño que
la actividad del ETI natural.
Teixeira y col. (1994) (46) describe una
forma modificada de ETI, en la cual el Val
N-terminal es intercambiado por Asp. El ETI así
modificado no forma un tPA y no muestra ninguna actividad
inhibidora frente a tPA. La actividad inhibidora específica frente
a la tripsina es para el ETI natural y el ETI modificado con Asp
prácticamente igual.
El ETI recombinante se obtiene según Teixeira por
expresión y se purifica mediante precipitación con sulfato de
amonio (80% de saturación), diálisis frente al agua y una escisión
con bromuro de ciano en donde se escinde la secuencia
N-terminal incluida la metionina. A continuación se
purifica por gelfiltración (Sephadex G50).
En la patente DE-A 44 24 171.2
(9) se describe un polipéptido purificado el cual posee la
actividad de un inhibidor DE-3 de Erythrina
caffra (de aquí en adelante llamada también polipéptido de ETI),
el cual por el contrario posee para el inhibidor aislado de fuentes
naturales una especificidad claramente mayor frente a las
serinproteasas.
Otro criterio esencial para la idoneidad de un
polipéptido ETI para la efectiva purificación de serinproteasas es
la capacidad de unión para las serinproteasas.
Es por lo tanto un objetivo de la invención el
mejoramiento de la efectividad de la capacidad de unión de un
polipéptido de ETI para la purificación de las serinproteasas.
Objeto de la invención es un polipéptido que
posee la actividad de un inhibidor DE-3 de
Erythrina caffra, que se une reversible y selectivamente a
una serinproteasa de una mezcla de proteínas y en donde el
polipéptido posee una secuencia de aminoácidos que funcionalmente
es análoga a la secuencia SEQ ID NO:2, en una región parcial que es
homóloga en más del 85% a una región de aminoácidos 39 - 139, posee
dos puentes de disulfuro, y el N-terminal empieza
con Ser, de preferencia con la secuencia SEQ ID NO 4. La capacidad
de unión de este polipéptido con los activadores del plasminógeno
es de 1,25 MU/ml y mayor, y el polipéptido posee una actividad
específica de 1,07 U/mg o mayor, para la tripsina.
De preferencia, se codifica un polipéptido según
la invención:
a) a partir de un ácido nucleico según la
secuencia SEQ ID NO 1,
b) a partir de un ácido nucleico el cual hibrida
con la secuencia de ADN mostrada en SEQ ID NO: 1, en condiciones
restringidas, y el N-terminal empieza con una
secuencia de ácidos nucleicos, la cual codifica la SEQ ID NO: 4.
c) a partir de un ácido nucleico el cual sin la
degeneración del código genético se hibrida con una de las
secuencias citadas en a) o b) bajo condiciones restrictivas.
Se ha mostrado sorprendentemente que con el
intercambio del Val N-terminal por el Ser en un
polipéptido de ETI, la capacidad de unión para las serinproteasas
aumenta claramente. Mientras el conocido N-terminal
del polipéptido ETI empieza con la secuencia de aminoácidos
Val-Leu-Leu-Asp
(SED-ID-NO:3), el polipéptido ETI
según la invención empieza con la secuencia
Ser-Leu-Leu-Asp
(SEQ-ID NO:4).
Estos resultados son particularmente
sorprendentes en opinión de Teixeira y col. (1994) (46).
Según esta publicación, un experto debería esperar que la
modificación del N-terminal de ETI condujera a que
un ETI así modificado perdiera su actividad inhibidora específica
frente a los activadores del plasminógeno y su actividad frente a
la tripsina no variara. Para un ETI modificado según la invención,
es sorprendente tanto la actividad específica para la tripsina como
también la capacidad de unión para los activadores del plasminógeno,
en particular los activadores del plasminógeno de tejido aumenta en
considerable proporción.
Bajo la expresión "un polipéptido con la
actividad de un inhibidor DE-3 de Erythrina
caffra" debe entenderse un polipéptido que se une
específicamente a las serinproteasas, como los activadores del
plasminógeno, \beta-tripsina,
\alpha-quimotripsina y/o trombina. Mediante la
unión, la actividad de la serinproteasa puede inhibirse.
Mediante la expresión polipéptido ETI
"funcionalmente análogo" debe entenderse un polipéptido el
cual posee la actividad de un inhibidor DE-3 de
Erythrina caffra. Son posibles modificaciones de la secuencia
de la proteína en el marco corriente habitual del experto. Sin
embargo, hay que tener en cuenta que el N-terminal
debe ser idéntico a SEQ ID NO:4 (N-terminal Ser) y
el polipéptido debe tener dos puentes de disulfuro, para la
fijación de la estructura espacial. Después de la obtención
recombinante en procariotas, la proteína según la invención puede
contener todavía una metionina N-terminal (SEQ ID
NO:10). Con ello, estos puentes disulfuro deben corresponder en su
posición, a los puentes disulfuro del polipéptido ETI (Cys 39 - Cys
83 y Cys 132 - Cys 139, Lehle, K. y col. (1994) (30).
Igualmente el polipéptido ETI debe ser homólogo en una región
parcial en más de un 85% a la región de la secuencia 39 - 139 de
SEQ ID NO:2. Esta región parcial es de preferencia igualmente la
región de secuencias 39 - 139 de la proteína según la invención, y
de preferencia, es idéntica o esencialmente idéntica a la región de
secuencias 39 - 139 de SEQ ID NO:2.
De forma particularmente preferida se emplea un
polipéptido ETI (o un ácido nucleico que codifica dicho
polipéptido), cuya secuencia de aminoácidos es idéntica o
esencialmente idéntica a la SEQ ID NO:2. Se ha demostrado de nuevo
sorprendentemente que la capacidad de unión del inhibidor para las
serinproteasas es particularmente alta cuando después de la
obtención recombinante en procariotas se escinde la metionina del N
terminal completamente o por lo menos en gran parte (de preferencia
más del 85% en la preparación del polipéptido ETI). El polipéptido
ETI puede ser de diferentes tamaños. De preferencia comprende sin
embargo 100 - 200 aminoácidos, con particular preferencia
aproximadamente 139 - 173 aminoácidos.
Con la expresión capacidad de unión del inhibidor
para las serinproteasas debe entenderse la cantidad de una
serinproteasa (de preferencia un activador de plasminógeno), la
cual puede eliminarse de una solución mediante un inhibidor
inmovilizado. La capacidad de unión se expresa habitualmente como
actividad/ml de una matriz [en los activadores de plasminógeno como
actividad amidolítica en U/ml de la matriz]. La actividad del
activador de plasminógeno se determina convenientemente después de
la elución de la serinproteasa unida anteriormente.
La determinación de la actividad tiene lugar
según U. Kohnert y col., (1992) (29). Para ello se mide
fotométricamente la velocidad de la escisión del dihidrocloruro de
H-D-Ile-Pro-Arg-p-nitroanilida
(S2288, Kabi Vitrum, Suecia) mediante la absorción a 405 nm.
Otro objeto de la invención es un procedimiento
para la purificación de una serinproteasa de una mezcla de
proteínas mediante la unión de la serinproteasa a un polipéptido
ETI inmovilizado, el cual se une selectiva y reversiblemente a las
serinproteasas, se elimina la parte sin unir de la mezcla de
proteínas, se separa la serinproteasa del inhibidor, se separa el
inhibidor inmovilizado de la serinproteasa soluble y se aisla la
serinproteasa, la cual se caracteriza porque se utiliza un
polipéptido ETI según la invención, las cuales serinproteasas se
unen reversible y selectivamente a partir de una mezcla de
proteínas y en donde el polipéptido posee de preferencia una
secuencia de aminoácidos, la cual es funcionalmente análoga a la SEQ
ID NO:2, en una región parcial es homóloga en más de un 85% con la
región de aminoácidos 39 – 139 de esta secuencia, posee dos puentes
disulfuro, empieza con un N-terminal con la SEQ ID
NO:4 o con una SEQ ID NO:4 prolongada con un
N-terminal de metionina, y posee una actividad
específica de 1,07 U/mg o mayor, frente a la tripsina y una
capacidad de unión de 1,25 MU/ml o mayor, para los activadores del
plasminógeno.
De preferencia se obtiene este polipéptido ETI
mediante la expresión procariótica o eucariótica de un ADN exógeno.
La purificación y aislamiento tiene lugar de preferencia
cromatográficamente mediante un intercambiador de aniones, un
intercambiador de cationes o una columna de quelato de níquel.
El procedimiento según la inversión es
particularmente ventajoso y apropiado para la purificación de
activadores de plasminógeno como los activadores del plasminógeno
de tejidos (t-PA) y derivados (p. ej., mutaciones y
deleciones) de los mismos. El t-PA está descrito en
la patente EP-B 0 093 619 (13), y los
derivados de t-PA lo están en las patentes U.S.
5.223.256 (53), WO 90/09437 (54) y T.J.R. Harris
(1987) (20).
La obtención del polipéptido ETI puede efectuarse
mediante los métodos utilizados habitualmente por el experto. Para
ello se obtiene en primer lugar una molécula de ácido nucleico (de
preferencia ADN), el cual codifica un polipéptido ETI, cuyo
N-terminal empieza con la secuencia SEQ ID NO:4 o
con la secuencia SEQ ID NO:4 prolongada con un
N-terminal de metionina, y codifica un polipéptido
ETI. El polipéptido ETI posee una secuencia de aminoácidos la cual
es funcionalmente análoga a la SEQ ID NO:2, y contiene una región
parcial la cual en más del 85%, de preferencia completamente, es
homóloga a la región de aminoácidos 39 - 139 de la secuencia SEQ ID
NO:2 y tiene dos puentes disulfuro. Además, puede también
utilizarse una secuencia, que en el marco de la degeneración del
código genético, codifica el mismo polipéptido y/o es
complementaria a esta secuencia. De preferencia se emplea también un
ácido nucleico que híbrida con la secuencia SEQ ID NO:1 bajo
condiciones restrictivas y codifica la SEQ ID NO:4 con un
N-terminal o la SEQ ID NO:4 prolongada con un N
terminal de metionina. El ADN se clona en un vector que puede ser
transferido a una célula anfitriona y allí es replicado. Un vector
de este tipo contiene adicionalmente los elementos operadores para
la secuencia del polipéptido ETI, los cuales son necesarios para la
expresión del ADN. Este vector, que contiene el ADN inhibidor y los
elementos operadores, se transfiere a un vector el cual es capaz de
expresar el ADN del polipéptido ETI. La célula anfitriona se cultiva
en condiciones que permiten la expresión del polipéptido ETI. El
polipéptido ETI se separa de estas células. Además se asegura
mediante medidas apropiadas, que el polipéptido ETI pueda tomar una
estructura terciaria activa, en la cual muestra unas propiedades
inhibidoras.
Además, como ya se ha indicado, no es necesario
que el polipéptido ETI tenga exactamente la secuencia de
aminoácidos correspondiente a SEQ ID NO:2 y SEQ ID NO:4. Son
igualmente apropiados los polipéptidos ETI que tienen esencialmente
la misma secuencia y son polipéptidos con la actividad de un
inhibidor DE-3 de Erythrina caffra. Es
esencial sin embargo, que en el N-terminal esté
intercambiado el Val por Ser. De preferencia, se emplean las
secuencias de aminoácidos SEQ ID NO:2 y 4 en donde, en caso de la
expresión en células anfitrionas procarióticas, aunque no después
de la expresión eucariótica, pueda estar contenida una metionina
N-terminal (SEQ ID NO:10). Habitualmente sin
embargo, se escinde la metionina en E. coli, puesto que la
secuencia N-terminal empieza con
Met-Ser (Dalborge H. y col. (1970) (7). Se
prefiere un polipéptido de este tipo, en el cual el Met se ha
escindido.
Otro objeto de la invención es un ácido nucleico
aislado, el cual codifica un polipéptido ETI, el cual se une
selectivamente a serinproteasas reversibles a partir de una mezcla
de proteínas, y en donde la proteína tiene una secuencia de
aminoácidos que funcionalmente es análoga a la SEQ ID NO:2, en una
región parcial es homóloga en más del 85% a la región de
aminoácidos 39 - 139 de esta secuencia, tiene dos puentes disulfuro
y el N-terminal empieza con la secuencia SEQ ID
NO:4 o con la secuencia SEQ ID NO:4 prolongada con un
N-terminal de metionina. Un tal ácido nucleico
aislado es de preferencia idéntico con la SEQ ID NO:1 o con un
ácido nucleico, que en el marco de la degeneración del código
genético, codifica el mismo polipéptido. Para la expresión en
células anfitrionas eucarióticas o procarióticas, el ácido nucleico
tiene en el extremo 5' las señales eucarióticas o procarióticas de
transcripción y traducción habituales para el experto.
De preferencia se emplea un ácido nucleico el
cual bajo condiciones restrictivas híbrida con la SEQ ID NO:1 bajo
condiciones estándar. Estas condiciones estándar y los
procedimientos para la hibridación son ya conocidas por el experto
y por ejemplo en J. Sambrook y col. (1989) (38) y B.D. Hames,
S.G. Higgins (1985) (19). Los protocolos estándar descritos
en los mismos se emplean aquí habitualmente. En particular se llama
la atención sobre Sambrook, sección IX (40), siendo ambos
documentos objeto de la publicación de esta invención. Las
condiciones restrictivas estandarizadas se describen igualmente en
Höltke y Kessler (1990) (24).
Las condiciones restrictivas preferidas se dan en
una hibridación en presencia de 1 mol/litro de NaCl, 1% de SDS y
10% de sulfato de dextrano, los subsiguientes lavados en dos veces,
del filtro a temperatura ambiente durante 5 minutos con 2 x SSC y
otro paso de lavado durante 30 minutos. Este otro paso de lavado
puede efectuarse con 0,5 x SSC, 0,1% de SDS, de preferencia con 0,2
x SSC, 0,1% de SDS y con particular preferencia con 0,1 x SSC, 0,1%
de SDS, a 65ºC.
Para facilitar la obtención de los vectores u
optimizar la expresión, pueden introducirse modificaciones. Estas
modificaciones son por ejemplo:
- -
- Modificación del ácido nucleico para introducir diferentes secuencias de reconocimiento de enzimas de restricción para facilitar los pasos de ligación, clonación y mutagénesis
- -
- Modificación del ácido nucleico para la construcción de codones preferidos para la célula hospedadora
- -
- Incorporación al ácido nucleico de elementos operadores adicionales para optimizar la expresión en la célula anfitriona.
La expresión del inhibidor tiene lugar de
preferencia en microorganismos como E. coli. También es
posible una expresión en células eucariotas como levaduras, células
CHO o células de insectos.
Para ello se utilizan plásmidos biológicamente
funcionales o vectores de ADN vírico, los cuales contienen el ácido
nucleico según la invención. Con estos vectores se transforman o
transfieren establemente las células anfitrionas procarióticas o
eucarióticas.
Los vectores de expresión deben contener un
promotor, el cual permite la expresión de la proteína inhibidora en
el organisno anfitrión. Tales promotores son ya conocidos por el
experto y son por ejemplo el promotor lac (Chang y col. (1977)
(26)), trp (Goeddel y col. (1980) (18)), el promotor
\lambdaPL (Shimatake y col. (1981) (41)) y el promotor T5
(patente US 4.689.406 (49)). Son igualmente apropiados, los
promotores sintéticos como por ejemplo el promotor tac (patente US
4.551.433 (48)). Igualmente apropiados son los sistemas de
promotores acoplados como por ejemplo el sistema promotor
T7-ARN-polimerasa (Studier y col.
(1986) (44)). Son igualmente apropiados, los promotores
híbridos de un promotor bacteriófago y la región operadora del
microorganismo (patente EP-A 0 267 851 (11)).
Además del promotor es necesario un sitio que sea efectivo para la
formación de ribosomas. Para el E. coli este sitio de
formación de ribosomas recibe el nombre de secuencia de
Shine-Dalgarno (SD) (Shine y col. (1975)
(42); J. Sambrook y col. (1989) (39)).
Para mejorar la expresión es posible expresar la
proteína inhibidora como una proteína de fusión. En este caso se
fusiona habitualmente una secuencia de ADN, la cual codifica la
parte N-terminal de una proteína bacteriana endógena
u otra proteína estable, en el extremo 5' de la secuencia
codificadora de la proteína de inhibición. Ejemplos de las mismas
son lacZ, trpE.
Después de la expresión, se escinden las
proteínas de fusión de preferencia con enzimas (p. ej., factor Xa)
(Nagai y col. (1984). Otros ejemplo para los sitios de escisión son
el sitio de escisión IgA-proteasa (WO 91/11520
(55)) y el sitio de escisión ubiquitina (Miller y col. (1989)
(31). En estos casos el polipéptido ETI según la invención
puede contener todavía en el N-terminal uno o
varios aminoácidos adicionales. Sin embargo se prefiere utilizar un
polipéptido EPI que no contenga ningún aminoácido
N-terminal adicional y empiece el
N-terminal con la secuencia SEQ ID NO:4.
La proteína recombinante obtenida en primer lugar
como cuerpos de inclusión inactivos puede transformarse mediante
procedimientos habituales para el experto, en proteína activa
soluble. Para ello se solubilizan los cuerpos de inclusión por
ejemplo en hidrocloruro de guanidina o urea en presencia de un
medio reductor, se reduce, se elimina el medio reductor p. ej., por
diálisis y se renaturaliza la proteína solubilizada, de preferencia
mediante el empleo de un sistema redox, como el glutatión reducido
y oxidado o mediante una mezcla de disulfuros.
Estos métodos están descritos por ejemplo en las
patentes US 4.933.434 (52), EP-B 0 241 022
(16) y EP-A 0 219 874 (10).
Es igualmente posible segregar las proteínas como
proteínas activas de los microorganismos. Para ello se utiliza de
preferencia la proteína de fusión, la cual consta de la secuencia
señal que es apropiada para la segregación de proteínas en el
organismo anfitrión empleado (patente US 4.336.336 (47)) y
del ácido nucleico el cual codifica la proteína de inhibición. Con
ello se segrega la proteína, bien en el medio (en las bacterias
gram positivas) o bien en el espacio periplasmático (en las
bacterias gram negativas). Entre la secuencia señal y la secuencia
codificadora del inhibidor se aplica convenientemente un sitio de
escisión, el cual o bien permite el procesado o bien permite en un
paso adicional la escisión de la proteína del inhibidor. Estas
secuencias señal son por ejemplo ompA (Ghrayeb y col. (1984)
(17)), y phoA (Oka y col. (1985) (33)).
Los vectores contienen adicionalmente, los
terminadores. Los terminadores son secuencias de ADN que señalizan
el final de un proceso de transcripción. Se muestran la mayor parte
de las veces mediante dos peculariedades estructurales de una
región inversamente repetitiva rica en G/C, la cual puede formar
intramolecularmente una doble hélice, así como un número de
radicales U (o respectivamente T). Ejemplos son el atenuador y
terminador trp en el ADN del fago fd así como rrnB (Brosius y col.
(1981) (5)).
Adicionalmente los vectores de expresión
contienen habitualmente un marcador seleccionable para seleccionar
las células transformadas. Estos marcadores seleccionables son por
ejemplo los genes de resistencia a la ampicilina, cloranfenicol,
eritromicina, canamicina, neomicina y tetraciclina (Davies y col.
(1978) (8). Igualmente, son marcadores apropiados
seleccionables los genes para substancias esenciales de la
biosíntesis de las substancias necesarias para las células como p.
ej., la histidina, el triptófano y la leucina.
Se conoce un gran número de vectores bacterianos
apropiados. Por ejemplo se han descrito para vectores bacterianos,
los siguientes: Bacillus subtilis (Palva y col. (1982)
(35)), E. coli (Aman y col. (1985) (1));
Studier y col. (1986) (44)), Streptococcus cremoris (Powell y
col. (1988) (37)), Streptococcus lividans y Streptomyces
lividans (patente US 4.747.056 (50)).
La expresión de la proteína inhibidora es posible
además de efectuarse en microorganismos procariotas, también en
eucariotas (como por ejemplo las células CHO, levaduras o células
de insectos). Como sistema de expresión eucariótica se prefieren
las células de levaduras y las de insectos. La expresión en
levaduras puede efectuarse mediante tres clases de vectores de
levaduras (vectores YI_{p} integradores (plásmidos que integran
levaduras), vectores YR_{p} replicadores (plásmidos que replican
levaduras), y vectores YE_{p} episomales (plásmidos episomales de
levadura)). Lo anterior se describe con más exactitud, por ejemplo,
en S.M. Kingsman y col. (1987) (28).
Otros procedimientos de tecnología genética para
la obtención y expresión de vectores apropiados, están descritos en
J. Sambrook y col. (1989) (39).
Después de la obtención se efectúa la
purificación del ETI recombinante cromatográficamente mediante un
intercambiador aniónico, p. ej., una columna de
Q-Sepharose®, un intercambiador catiónico (p. ej.,
sobre una base de sulfopropilo) o mediante una columna de quelato
de níquel, como se describe por ejemplo en Porath, J. & Olin,
B. (1983) (36). Sorprendentemente se ha obtenido según este
procedimiento de purificación un polipéptido ETI recombinante, el
cual inmovilizado en BrCN-Sepharose, posee una
elevada capacidad de unión y una elevada actividad específica
inhibidora para t-PA y derivados de tPA.
Un polipéptido ETI así obtenido y purificado
puede obtenerse mediante el cultivo de células anfitrionas
procarióticas o eucarióticas, las cuales con una secuencia de ADN
exógena la cual codifica un polipéptido ETI, se une selectivamente
a serinproteasas reversibles a partir de una mezcla de proteínas, y
en donde la proteína posee una secuencia de aminoácidos la cual es
funcionalmente análoga a SEQ ID NO:2, una región parcial homóloga en
más del 85% a la región de aminoácidos 39 - 139 de esta secuencia,
posee dos puentes disulfuro, y empieza con la secuencia SEQ ID NO:4
con un N-terminal o con una SEQ ID NO:4 prolongada
con un N-terminal de metionina, las cuales se
transforman o transfieren de manera que permiten a las células
anfitrionas, bajo condiciones nutritivas apropiadas, expresar el
polipéptido y aislar el polipéptido deseado, el cual posee frente
al polipéptido ETI natural a partir de Erythrina caffra, una
elevada capacidad de unión para el activador del plasminógeno de
tejidos humanos. La capacidad de unión es de preferencia entre 1,25
y 1,6 MU/ml.
Un tal derivado del inhibidor posee
adicionalmente de preferencia una actividad inhibidora específica
de 1,07 U/mg, de preferencia de 1,5 U/mg o mayor frente a la
tripsina. Esta alta actividad se obtiene mediante la purificación
cromatográfica en un intercambiador aniónico, un intercambiador de
cationes o una columna de quelato de níquel.
Otro objeto de la invención es un procedimiento
para la obtención de un polipéptido ETI recombinante, mediante el
cultivo de células anfitrionas procarióticas o eucarióticas, las
cuales con una secuencia de ADN exógena que codifica un polipéptido
ETI, el cual se une selectivamente a serinproteasas reversibles a
partir de una mezcla de proteínas, y en donde la proteína posee una
secuencia de aminoácidos la cual es funcionalmente análoga a SEQ ID
NO:2, en una región parcial es homóloga en más de un 85% con la
región de aminoácidos 39 - 139 de esta secuencia, posee dos puentes
disulfuro y empieza con un N-terminal con la
secuencia SEQ ID NO:4 y posee una actividad específica de 1,07 U/mg
ó mayor, frente a la tripsina, y una capacidad de unión de 1,25
MU/ml o mayor, para los activadores del plasminógeno, se
trans-forman o transfieren de manera que permiten a
las células anfitrionas bajo condiciones nutritivas apropiadas, la
expre-sión del polipéptido ETI y el aislamiento del
polipéptido ETI de las células anfitrionas, la purificación
cromatográfica con un intercambiador aniónico, un intercambiador
catiónico o una columna de quelato de níquel.
La purificación de las serinproteasas mediante el
empleo del polipéptido ETI recombinante tiene lugar mediante el
procedimiento ya habitual para el experto (ver p. ej., F.J. Joubert
(1987) (25). Para ello el polipéptido ETI se une
covalentemente a una matriz (p. ej., una columna de
CNBr-Sepharose) y la mezcla de proteínas que
contiene la serinproteasa, se añade en condiciones neutras o
ligeramente alcalinas a la columna y se efectúa la cromatografía. La
elución tiene lugar mediante la disminución del pH = 5,5 o mediante
el empleo de soluciones tampón que contienen agentes caótropos,
como p. ej., KSCN. El eluato tiene una pureza en proteína superior
al 95% referida a la serinproteasa.
La inmovilización del inhibidor y todos los otros
pasos de procedimientos para la purificación de la serinproteasa y
t-PA, pueden efectuarse de manera análoga al
inhibidor DE-3 aislado de E. caffra. Estos
procedimientos están por ejemplo descritos en las patentes
EP-B 0 218 479 (15), EP-B 0
112 122 (14), patente US 4.902.623 (51). La
inmovilización tiene lugar convenientemente en un soporte inerte,
de preferencia en CNBr-Sepharose®.
Los microorganismos citados en la descripción,
DSM 3689 y DSM 5443 fueron depositados en fecha 09.04.1986 (DSM
3689) o respectivamente 13.07.1989 (DSM 5443) en la Deutschen
Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen ("Colección alemana
de microorganismos y cultivos celulares") GmbH, Mascheroder Weg
1B, D-38124 Braunschweig.
Los ejemplos siguientes, publicaciones y
protocolos de las secuencias describen la invención cuya amplitud
protectora se deriva de las reivindicaciones de la patente. Los
procedimientos descritos deben entenderse como ejemplos, los cuales
aún después de ser modificados, describen el objeto de la
invención.
Mediante la utilización del codon preferido del
E. coli, se derivó de la secuencia de aminoácidos del
polipéptido ETI de Erythrina caffra (Joubert, F.J. (1987)
(25), la correspondiente secuencia de ácidos nucleicos, la
cual se preparó sintéticamente según el método de Beattie y Fowler
(1991) (2). Para facilitar la clonación se añadió en el
extremo 5' un sitio de corte para la enzima de restricción EcoRI, y
en el extremo 3' un sitio de corte para la enzima de restricción
HindIII. El ácido nucleico sintético se restringió con las enzimas
EcoRI y HindIII y se ligó con el vector de clonación pBS+
(Stratagene, US, catálogo nº 211201 (43)), el derivado del
fago fl y el plásmido pBS de Stratagene con el gen promotor T_{3}
y T_{7}, el gen de resistencia a la ampicilina, de origen fl, de
origen CoIE-1, gen lacI, gen lacZ, y un sitio
múltiple de clonación), el cual fue digerido previamente también con
EcoRI y HindIII. La mezcla de ligación se transformó en la
Escherichia coli. Los clones obtenidos se seleccionaron con
ampicilina y se analizaron mediante restricción con las enzimas
EcoRI y HindIII. El clon resultante pBS+ETI contiene un fragmento
adicional EcoRi/HindIII con un tamaño de aproximadamente 539 bp
(SEQ ID NO:9).
El plásmido pBS+ETI se restringió con las enzimas
de restricción EcoRI y HindIII, y se aisló el fragmento de tamaño
539 bp. El vector de expresión pBTacI (Boehringer Mannheim GmbH
catálogo nº 1081365 (3), sobre la base de pUC8, H. Haymerle
y col.(1986) (21) se digirió igualmente con las enzimas EcoRI
y HindIII, y se aisló el fragmento vector aproximadamente de 4,6 kb
de tamaño. Ambos fragmentos se ligaron y juntamente con el plásmido
auxiliar pUBS520 (Brinkmann y col. (1989) (4)), el cual
contiene el gen represor lac, se transformaron en E. coli
(DSM 5443). La selección de los clones se efectuó mediante la
resistencia proporcionada por el plásmido a la ampicilina o
respectivamente canamicina. El Palsmido obtenido pBTETI contiene, en
comparación con el vector de partida pBTacI, un fragmento adicional
EcoRI/ HindIII con un tamaño de 539 bp y puede utilizarse para la
expresión de ETI recombinante, no modificado (recETI).
De manera análoga, puede utilizarse también en
lugar del DSM 5443, el DSM 3689, el cual ya contiene el plásmido
I^{q}. En este caso no es necesario el plásmido auxiliar
pUBS520.
Con la finalidad de una mutación en el
N-terminal e introducción de un nuevo promotor, se
efectuó una PCR de fusión. Con los oligonucleótidos
ETI-1 y ETI-2 se amplificó el
promotor del plásmido pDS56/RBII (comercialmente obtenible de la
firma Qiagen con el nombre de pQE-6) (producto de
amplificación A). Empleando los cebadores de PCR,
ETI-3 y ETI-4, se aisló del plásmido
pBTETI la secuencia sintética la cual codifica un polipéptido ETI,
en donde el cebador ETI-3 fue concebido de forma
que el producto amplificado codifique un polipéptido ETI con el
cambio deseado de aminoácidos (Ser) (producto de amplificación B).
Los dos productos de amplificación se fusionaron mediante una PCR y
con ayuda del cebador ETI-1 y ETI-4.
El producto de la fusión se escindió con las dos enzimas de
restricción BamHI y HindIII y se purificó. El plásmido pA27fd,
EP-A 0 382 174 (USP 5.223.256) (12) se trató
con las dos enzimas de restricción BamHI y HindIII (parcialmente) y
se aisló el fragmento vector de un tamaño aproximado de 4600 bp. El
fragmento vector y el fragmento de fusión fueron ligados y
transformados juntamente con el plásmido auxiliar pUBS520
(Brinkmann y col. 1989 (4)) en E. coli C600+ (DSM
5443). La selección de los clones tuvo lugar mediante la
resistencia a la ampicilina y canamicina proporcionada por el
plásmido. El plásmido obtenido
pE-TI-T2Lvs contiene a diferencia
del plásmido de partida pBTETI un fragmento HindIII adicional de
aproximadamente 350 bp.
Para comprobar el rendimiento de la expresión, se
cultivó la cepa DSM 5443 con los plásmidos
pETI-T2Lvs y pUBS520 en medio LB (Sambrook y col.
(1989) (38) en presencia de ampicilina y canamicina (50
\mug/ml de concentración final cada una) hasta una densidad
óptica (OD) de 0,6 a 550 nm. La expresión se inició con la adición
de 5 mM de IPTG. El cultivo se incubó durante 4 horas más. Al final
se reunieron las E. coli mediante centrifugación y se
resuspendieron en tampón (50 mM de Tris-HCl pH 8, 50
mM de EDTA); mediante ultrasonidos se provocó la lisis de las E.
coli. Mediante una nueva centrifugación se reunieron las
fracciones de proteínas insolubles (cuerpos de inclusión) y se
resuspendieron en el tampón citado más arriba mediante
ultrasonidos. La suspensión se mezcló con 1/4 de volumen de tampón
de aplicación (250 mM de Tris-HCl pH 6,8, 0,01 M de
EDTA, 5% de SDS, 5% de mercaptoetanol, 50% de glicerina y 0,005% de
azul de bromofenol) y se analizó con ayuda de un 12,5% de gel de
SDS-poliacrilamida. Como control se efectuó la misma
preparación con un cultivo de E. coli
(pETI-T2Lvs/pUBS520) que no había sido mezclada con
IPTG, y se aplicó a un gel de poliacrilamida. En la preparación del
cultivo inducido por IPTG se puede reconocer claramente, después de
teñir el gel con 0,2% de azul de Coomassie R250 (disuelto en 30% de
metanol y 10% de ácido acético) y decoloración del gel en una
mezcla de metanol-ácido acético, una banda con un peso molecular de
aproximadamente 22 kD. Esta banda no se encuentra en la preparación
de las células de E. coli no inducidas.
50 g de cuerpos de inclusión (IBs) se
solubilizaron con 0,1 M de Tris/HCl, pH 8,5, 6 M de guanidina, 0,1
M de DTE, 1 mM de EDTA (90 minutos a 25ºC) y después de ajustar el
valor del pH a 2,5 (HCl) se dializaron frente a 3 moles/litro de
guanidina/HCl. El dializado se centrifugó (SS34, 13.000 rpm) y por
concentración con YM 10 se ajustó a C_{Prot}.= 36,9 mg/ml. Se
cargó un recipiente de reacción de 1 litro con 0,1 M de Tris/HCl,
pH 8,5, 1 mM de EDTA, 1 mM de GSH, 0,1 mM de GSSG. La
renaturalización se efectuó a 20ºC con 16 veces la adición del
dializado en períodos de tiempo de 30 minutos.
SerETI se renaturaliza en 0,1 M de Tris/HCl, pH
8,5, 1 mM de EDTA, 1 mM de GSH. El renaturalizado se diluye con
H_{2}O 1:2, se ajusta con HCl a pH 8,0 y se aplica (5 mg
proteína/ml de gel) sobre una columna de
Q-Sepharose® equilibrada con 50 mM de Tris/HCl, pH
8,0. Después de lavar la columna con el tampón de equilibrado y 50
mM de Na_{2}HPO_{4}/H_{3}PO_{4}, pH 8,0 (en cada caso con
cinco veces el volumen de la columna) se efectúa la elución con 50
mM de Na_{2}HPO_{4}/H_{3}PO_{4}, pH 8,0, 0,2 mM de NaCl.
El Ser-ETI renaturalizado se
ajustó por adición de HCl a pH 4,0 y se dializó ("cross flow")
frente a 50 mM de NaOAc/HCl, pH 4,0. El dializado se centrifugó
(13.000 rpm, 30 minutos, SS 34) y se aplicó sobre una columna
TSK-SP equilibrada con 50 mM de NaOAc/HCl, pH 4,0
(intercambiador catiónico con grupos laterales de sulfopropilo,
Merck, Darmstadt, Alemania, volumen 15 ml). Después de lavar la
columna con tampón de equilibrio y con 50 mM de NaOAc/HCl, pH 4,0, y
0,1 M de NaCl se efectúa la elución con 50 mM de NaOAc/HCl, pH 4,0,
y 0,2 M de NaCl.
La pureza del eluato se comprobó mediante
SDS-PAGE y con RP-HPLC.
El Ser-ETI se une bajo las
condiciones empleadas a la columna TSK-SP y puede
eluirse con NaCl 0,2 M. El SDS-PAGE y el análisis
RP-HPLC confirman una pureza > 95%.
SerETI, recETI y ETI, aislados de la semilla de
E. caffra [(ETI (semillas)] se dializaron frente a 50 mM de
Na_{2}HPO_{4}/H_{3}PO_{4}, pH 8,0, y 0,25 M de NaCl, y se
ajustó a una concentración de proteína de 1,0 mg/ml. La
concentración de proteína se determinó por medición de la absorción
UV a 280 nm (\varepsilon = 1,46 cm^{2}/mg).
La inhibición de la tripsina mediante el ETI se
mide con
N-\alpha-benzoil-L-arginin-4-nitroanilida
(BAPA) como substrato. Se mezclan 40 \mul de una solución de
tripsina (0,13 mg/ml de HCl 2 mM) en una cubeta de cuarzo con 60
\mul de tampón de ensayo (0,1 M de Tris/HCl pH 8,0) y 100 \mul
de solución de ETI, y se incuba durante 5 minutos a 30ºC. Después de
la adición de 800 \mul de solución de BAPA (10 mg de BAPA x
HCl/10 ml de tampón de ensayo) se determina el aumento de la
extinción/minuto a 405 nm.
La actividad-ETI se determina
mediante la siguiente fórmula:
U/ml = [1 -
E_{muestra}/E_{tripsina}] \cdot C_{tripsina} \cdot 0,328 \cdot
V
E_{muestra} : aumento de la extinción/minuto de
la muestra inhibida.
E_{tripsina} : aumento de la extinción/minuto
de la tripsina no inhibida.
C_{tripsina} : concentración de la tripsina en
la mezcla de ensayo.
V : Previa dilución de la solución de ETI
Proteína | Actividad específica U/mg |
ETI (semilla) | 0,88 |
Ser (ETI) | 1,5 |
rec. ETI | 1,07 |
La actividad específica de SerETI es
aproximadamente el 50% mayor que la actividad específica del ETI
aislado de la semilla de E. caffra según el procedimiento
clásico.
170 mg de SerETI purificado o respectivamente ETI
(de semilla) o ETI recombinante (obtenido análogamente al ejemplo 1
y 2) se dializaron frente a 0,05 M de H_{3}BO_{3}/NaOH, PH 8,0,
0,5 M de NaCl (tampón de acoplamiento), y se mezclaron con 7,5 g de
CNBr-Sepharose® (ablandada durante la noche en 500
ml de HCl 1 mM, a continuación filtrada por aspiración y suspendida
en tampón de acoplamiento). La suspensión se incubó durante 90
minutos a temperatura ambiente, se filtró por aspiración y se agitó
durante la noche con 400 ml de Tris/HCl 0,1 M, pH 8,0. La
SerETI-Sepharose® se filtró por aspiración y se
equilibró con 0,7 M de arginina/H_{3}PO_{4}, pH 7,5.
rPA : derivado de tPA recombinante, que
consta de los dominios Kringel 2 y proteasa (obtención según la
patente EP-A 0382 174 (patente US 5.223.256)
(12).
54 mg del activador recombinante rPA del
plasminógeno, (concentración de la proteína determinada mediante
absorción a 280 nm, coeficiente de extinción 1,69 cm^{2}/mg), se
añadieron a una ETI-Sepharose equilibrada con 0,7 M
de arginina/H_{3}PO_{4}, pH 7,5. Después de lavar con tampón de
equilibrado y con 0,3 M de arginina/H_{3}PO_{4}, pH 7,0 (con
cinco volúmenes de columna cada vez) se efectuó la elución con 0,3
M de arginina/H_{3}PO_{4}, pH 4,5. El contenido de activador de
plasminógeno en el eluato se determinó con S 2288 como substrato,
ver ejemplo 6.
El ETI (de semillas) y Ser-ETI en
correspondencia con las recomendaciones del fabricante de la
Sepharose (Pharmacia, Friburgo), se acoplaron a la
CNBr-Sepharose ff. Las columnas acabadas se
equilibraron con 0,7 moles/litro de Arg/H_{3}PO_{4}, pH 7,5, se
cargaron con 2 MU r-PA/ml de gel, y después de
lavar con 5 SV 0,7 moles/litro de Arg/H_{3}PO_{4}, pH 7,5, NaCl
0,5 M y con 5 SV 0,3 moles/litro de Arg/H_{3}PO_{4}, pH 7,0, se
eluyó con 0,3 moles/litro de Arg/H_{3}PO_{4}, pH 4,5. La
capacidad de unión se determinó como rPA eluído (MU/ml de gel).
Cada gel se cargó cinco veces y se eluyó. Entre los pasos aislados
se regeneraron los geles en condiciones estándar.
Los datos compendiados en la tabla muestran que
la Ser-ETI-Sepharose obtenida por
acoplamiento de Ser-ETI a la
CNBr-Sepharose, posee para r-PA una
capacidad de unión de 1 a 5 veces mayor que la
ETI-Sepharose de semillas, obtenida por
acoplamiento de ETI de semillas a la
CNBr-Sepharose.
200 \mul de tampón (0,1 moles/Tris HCl pH 7,5,
0,15% de Tween 80®) y 200 \mul de solución de rPA, diluidos con
tampón a una concentración de 1-12 \mug/ml, se
incuban durante 5 minutos a 37ºC. El ensayo da comienzo con la
adición de 200 \mul de S 2288 (6 mmoles/litro (deshidrocloruro de
H-D-Ile-Pro-Arg-P-nitroanilida,
Kabi Vitrum, Suecia)), el cual se ha igualmente atemperado a 37ºC.
La actividad amidolítica se calcula a partir del aumento de la
absorción a 405 nm durante los 2,5 primeros minutos, con un
coeficiente de extinción para la p-nitroanilina de
9750 l/moles/cm.
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48) US-Patent 4,551,433
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50) US-Patent 4,747,056
51) US-Patent 4,902,623
52) US-Patent 4,933,434
53) US-Patent 5,223,256
54) WO 90/09437
55) WO 91/11520.
a. DATOS GENERALES:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: BOEHRINGER MANNHEIM GMBH
\vskip0.500000\baselineskip
- 1. CALLE: Sandhofer Str. 116
\vskip0.500000\baselineskip
- 2. POBLACIÓN: Mannheim
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Alemania
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: D-68305
\vskip0.500000\baselineskip
- (G)
- TELÉFONO: 08856/60-3446
\vskip0.500000\baselineskip
- (H)
- TELEFAX: 08856/60-3451
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Nuevo inhibidor del tipo Erythrina caffra y su utilización para la purificación de serinproteasas
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ORDENADOR - FORMATO DE LECTURA :
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- SOPORTE DE DATOS: disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release # 1,0, versión # 1.30B (EPA)
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: DE 195 12 937.7
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE SOLICITUD: 06-ABRIL-1995
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 1 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 516 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble cadena
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN: 1.516
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1 :
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 2 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 172 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2 :
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 3 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: cadena única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3 :
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Leu Leu Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 4 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: cadena única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4 :
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Leu Leu Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 5 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERISTÍCAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: cadena única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5 :
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGGATCCC TCGAGAAATC ATAAAAA
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 6 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: cadena única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6 :
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATAAGAATT CTGTTTCCTC TTTAATGAAT TCTG
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 7 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA :
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: cadena única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7 :
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGAATTCTT ATGTCATTAT TAGA
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 8 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- TIPO DE CADENA: cadena única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8 :
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAAGCTTTT ATCAGCTG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 9 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA :
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 541 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: cadena doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN: 11..529
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: mat_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN: 11
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9 :
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DATOS DE LA SEQ ID NO: 10 :
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 173 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10 :
Claims (11)
1. Procedimiento para la purificación de una
serinproteasa a partir de una mezcla de proteínas, mediante la unión
de la serinproteasa a un polipéptido inmovilizado que tiene la
actividad de un inhibidor DE-3, de la Erythrina
caffra, eliminación de los componentes no unidos de la mezcla de
proteína, separación de la serinproteasa del inhibidor, separación
del inhibidor inmovilizado de la serinproteasa soluble y aislamiento
de la serinproteasa, caracterizado porque como polipéptido se
utiliza un polipéptido el cual posee una secuencia de aminoácidos
que es funcionalmente análoga a SEQ ID NO:2, posee dos puentes
disulfuro, y en una región parcial, es homóloga en más del 85%, con
la región 39-139 de esta secuencia de aminoácidos,
el N-terminal empieza con una SEQ ID NO:4 o con una
SEQ ID NO:4 prolongada con un N-terminal de
metionina, y posee una actividad específica de 1,07 U/mg o mayor,
frente a la tripsina y una capacidad de unión de 1,25 MU/ml o mayor
para los activadores del plasminógeno.
2. Procedimiento según la reivindicación 1,
caracterizado porque se utiliza un polipéptido cuyo
N-terminal empieza con la SEQ ID NO:4.
3. Procedimiento según la reivindicación 1 ó 2,
caracterizado porque el polipéptido es codificado:
a) por un ácido nucleico según la SEQ ID NO:1
b) por un ácido nucleico el cual hibrida con una
secuencia complementaria a la secuencia de ADN mostrada en SEQ ID
NO:1, bajo condiciones restrictivas, y el N-terminal
empieza con una secuencia de ácidos nucleícos que codifican la SEQ
ID NO:4.
c) por un ácido nucleico, el cual híbrida sin la
degeneración del código genético con una secuencia que es
complementaria a la secuencia indicada en a) o b), bajo condiciones
restrictivas.
4. Procedimiento según las reivindicaciones 1 a
3, caracterizado porque la serinproteasa es un activador del
plasminógeno.
5. Procedimiento para la obtención de un
polipéptido que posee la actividad de un inhibidor
DE-3 de la Eritrina caffra, el cual se une
reversible y selectivamente a las serinproteasas a partir de una
mezcla de proteínas, se obtiene mediante el cultivo de células
anfitrionas procarióticas o eucarióticas, las cuales se transforman
o transfieren con un ácido nucleico el cual codifica el citado
polipéptido, de manera que permite que las células anfitrionas, bajo
apropiadas condiciones nutritivas, expresen el citado polipéptido, y
que se aisle dicho polipéptido, caracterizado porque el
polipéptido posee una secuencia de aminoácidos la cual es
funcionalmente análoga a la SEQ ID NO:2, en una región parcial es
homóloga en más de un 85% a la región de aminoácidos 39 - 139 de
esta secuencia, posee dos puentes disulfuro, empieza con el
N-terminal de la secuencia SEQ ID NO:4 o con la
secuencia SEQ ID NO:4 prolongada con un N-terminal
de metionina, y posee una actividad específica de 1,07 U/mg o mayor,
frente a la tripsina y una capacidad de unión de 1,25 MU/ml o mayor
para los activadores del plasminógeno.
6. Procedimiento según la reivindicación 5,
caracterizado porque el polipéptido
N-terminal empieza con la secuencia SEQ ID NO:4.
7. Procedimiento según la reivindicación 5 ó 6,
caracterizado porque el polipéptido es codificado por:
a) por un ácido nucleico según la secuencia SEQ
ID NO:1
b) por un ácido nucleico el cual hibrida bajo
condiciones restrictivas con una secuencia la cual es complementaria
a la secuencia de ADN mostrada en SEQ ID NO:1, y empieza el terminal
N con una secuencia de ácidos nucleicos la cual codifica la
secuencia SEQ ID NO:4
c) por un ácido nucleico el cual, sin
degeneración del código genético, hibrida bajo condiciones
restrictivas con una secuencia la cual es complementaria con una de
las secuencias citadas en a) o b).
8. Acido nucleico aislado según SEQ ID NO:1, el
cual codifica un polipéptido que tiene la actividad de un inhibidor
DE-3 de la Erythrina caffra.
9. Polipéptido, el cual posee la actividad de un
inhibidor DE-3 de la @Erythrina caffra y se
une reversible y selectivamente a las serinproteasas de una mezcla
de proteínas, y se obtiene mediante el cultivo de células
anfitrionas procarióticas o eucarióticas, las cuales con un ácido
nucleico el cual codifica el citado polipéptido, se transforman o
transfieren de manera que permite que las células anfitrionas, bajo
condiciones nutritivas apropiadas, expresen el citado polipéptido, y
se aisle dicho polipéptido, caracterizado porque el
polipéptido posee una secuencia de aminoácidos la cual es
funcionalmente análoga a la SEQ ID NO:2, en una región parcial que
es homóloga en más de un 85% a la región de aminoácidos 39 - 139 de
esta secuencia, posee dos puentes disulfuro, el
N-terminal empieza con una SEQ ID NO:4 o con una SEQ
ID NO:4 prolongada con un N-terminal de metionina,
y posee una actividad específica de 1,07 U/mg o mayor, frente a la
tripsina y una capacidad de unión de 1,25 MU/ml o mayor para los
activadores del plasminógeno.
10. Polipéptido según la reivindicación 9,
caracterizado porque el N-terminal empieza
con la secuencia SEQ ID NO:4.
11. Polipéptido según la reivindicación 9 ó 10,
caracterizado porque posee una capacidad de unión para los
activadores del plasminógeno de tejidos de 1,25 MU/ml y mayor.
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