EA046157B1 - COMPOSITIONS AND METHODS FOR SELECTIVE REGULATION OF GENE EXPRESSION - Google Patents
COMPOSITIONS AND METHODS FOR SELECTIVE REGULATION OF GENE EXPRESSION Download PDFInfo
- Publication number
- EA046157B1 EA046157B1 EA202193162 EA046157B1 EA 046157 B1 EA046157 B1 EA 046157B1 EA 202193162 EA202193162 EA 202193162 EA 046157 B1 EA046157 B1 EA 046157B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- certain embodiments
- seq
- scn1a
- dbd
- etf
- Prior art date
Links
Abstract
) В настоящем изобретении представлены сконструированные факторы транскрипции для селективной активации SCNla и их применение для лечения заболеваний и нарушений, таких как синдром Драве. Также представлены сайты связывания микроРНК и их применение для селективной экспрессии в парвальбумин-содержащих нейронах.) The present invention provides engineered transcription factors for selective activation of SCN1a and their use in the treatment of diseases and disorders such as Dravet syndrome. Also provided are microRNA binding sites and their use for selective expression in parvalbumin-containing neurons.
Description
СсылкаLink
По заявке на настоящий патент испрашивается приоритет в соответствии с предварительной заявкой на патент США № 62/854238, поданной 29 мая 2019 г.; предварительной заявкой на патент США № 62/857727, поданной 5 июня 2019 г.; и предварительной заявкой на патент США № 63/008569, поданной 10 апреля 2020 г., каждая из которых полностью включена в настоящий документ посредством ссылки.This patent application claims priority to U.S. Provisional Patent Application No. 62/854,238, filed May 29, 2019; US Provisional Patent Application No. 62/857727, filed June 5, 2019; and U.S. Provisional Patent Application No. 63/008569, filed April 10, 2020, each of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Перечень последовательностейList of sequences
Настоящая заявка содержит Перечень последовательностей, который был представлен в электронном виде в формате ASCII и полностью включен в настоящий документ посредством ссылки. Указанная копия ASCII, созданная 28 мая 2020 г., называется 46482-724_601_SL.txt и имеет размер 418483 байта.This application contains a Sequence Listing that has been submitted electronically in ASCII format and is incorporated herein by reference in its entirety. The ASCII copy in question, created on May 28, 2020, is called 46482-724_601_SL.txt and is 418483 bytes in size.
Предшествующий уровень техники настоящего изобретенияBACKGROUND OF THE INVENTION
Широкий спектр заболеваний человека связан с аномальной экспрессией генов. В некоторых случаях генетическая мутация в гене вызывает нарушение его регуляции, подавление или отсутствие экспрессии вообще, что приводит к гаплонедостаточности. В некоторых случаях генетическая мутация в гене вызывает его активацию, что приводит к сверхэкспрессии гена. При лечении генетических нарушений или заболеваний существует множество проблем. Один из подходов - генная терапия, которая включает в себя терапевтическую доставку нуклеиновой кислоты в клетки пациента. Тем не менее, различные проблемы, связанные с генной терапией, остаются нерешенными, такие как нежелательный иммунный ответ, вызванный генной терапией, нецелевые эффекты, ограничения клонирующей способности носителей генной терапии (например, вирусов), поддержание терапевтического эффекта в течение более длительного периода времени и т.д. Центральная нервная система (ЦНС) ставит множество уникальных задач для разработки терапии, направленной на устранение основного нарушения экспрессии гена и/или белка. Хотя существуют лекарственные средства, которые помогают управлять симптомами заболеваний/нарушений ЦНС, многие заболевания/нарушения ЦНС, например, синдром Драве, не имеют специальных способов лечения или устранения. Таким образом, существует потребность в новых композициях и способах, способных модулировать экспрессию любого эндогенного гена, чтобы помочь обратить вспять эффекты заболевания или нарушения, в частности, в терапии со сниженной иммуногенностью, уменьшенными нецелевыми эффектами, повышенной специфичностью для целевого гена и/или повышенной терапевтической эффективностью.A wide range of human diseases are associated with abnormal gene expression. In some cases, a genetic mutation in a gene causes its dysregulation, suppression, or lack of expression at all, resulting in haploinsufficiency. In some cases, a genetic mutation in a gene causes it to become activated, resulting in overexpression of the gene. There are many challenges when treating genetic disorders or diseases. One approach is gene therapy, which involves the therapeutic delivery of a nucleic acid into a patient's cells. However, various problems associated with gene therapy remain unresolved, such as unwanted immune response caused by gene therapy, off-target effects, limitations in the cloning ability of gene therapy carriers (such as viruses), maintenance of therapeutic effect over a longer period of time, and etc. The central nervous system (CNS) poses many unique challenges to the development of therapies that address the underlying disorder of gene and/or protein expression. Although there are medications that help manage the symptoms of CNS diseases/disorders, many CNS diseases/disorders, such as Dravet syndrome, have no specific treatment or cure. Thus, there is a need for new compositions and methods capable of modulating the expression of any endogenous gene to help reverse the effects of a disease or disorder, in particular, therapies with reduced immunogenicity, reduced off-target effects, increased specificity for the target gene and/or increased therapeutic efficiency.
Сущность настоящего изобретенияSummary of the present invention
Согласно одному аспекту в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая последовательность, кодирующую не встречающийся в природе фактор транскрипции, который увеличивает экспрессию гена SCN1A в клетке, причем не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит ДНК-связывающий домен (DBD), функционально связанный по меньшей мере с двумя активирующими транскрипцию доменами (TAD) следующим образом: TAD1-TAD2-DBD, DBD-TAD3-TAD4 или TAD1TAD2-DBD-TAD3-TAD4. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1, TAD2, TAD3 и TAD4 независимо выбраны из следующего: VP16, VP64, Viper, CITED2, CITED4, CREB3 или их функциональных фрагментов. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1 и TAD2 представляют собой один и тот же TAD. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1 и TAD2 представляют собой CITED2 или его функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1 и TAD2 представляют собой CITED4 или его функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления TAD3 и TAD4 представляют собой один и тот же TAD. Согласно определенным вариантам осуществления TAD3 и TAD4 представляют собой CITED2 или его функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления TAD3 и TAD4 представляют собой CITED4 или его функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1, TAD2, TAD3 и TAD4 представляют собой один и тот же TAD. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1, TAD2, TAD3 и TAD4 представляют собой CITED2 или его функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления TAD1, TAD2, TAD3 и TAD4 представляют собой CITED4 или его функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления линкер отсутствует по меньшей мере между двумя доменами TAD.In one aspect, the present application provides an expression cassette comprising a sequence encoding a non-naturally occurring transcription factor that increases expression of the SCN1A gene in a cell, wherein the non-naturally occurring transcription factor contains a DNA binding domain (DBD) operably linked to at least with two transcription-activating domains (TADs) as follows: TAD1-TAD2-DBD, DBD-TAD3-TAD4, or TAD1TAD2-DBD-TAD3-TAD4. In certain embodiments, TAD1, TAD2, TAD3, and TAD4 are independently selected from the following: VP16, VP64, Viper, CITED2, CITED4, CREB3, or functional fragments thereof. In certain embodiments, TAD1 and TAD2 are the same TAD. In certain embodiments, TAD1 and TAD2 are CITED2 or a functional fragment thereof. In certain embodiments, TAD1 and TAD2 are CITED4 or a functional fragment thereof. In certain embodiments, TAD3 and TAD4 are the same TAD. In certain embodiments, TAD3 and TAD4 are CITED2 or a functional fragment thereof. In certain embodiments, TAD3 and TAD4 are CITED4 or a functional fragment thereof. In certain embodiments, TAD1, TAD2, TAD3, and TAD4 are the same TAD. In certain embodiments, TAD1, TAD2, TAD3, and TAD4 are CITED2 or a functional fragment thereof. In certain embodiments, TAD1, TAD2, TAD3, and TAD4 are CITED4 or a functional fragment thereof. In certain embodiments, there is no linker between at least two TAD domains.
Согласно определенным вариантам осуществления существует линкер по меньшей мере между двумя доменами TAD. Согласно определенным вариантам осуществления линкер содержит или состоит из GGSGGGSG (SEQ ID NO: 177) или GGSGGGSGGGSGGGSG (SEQ ID NO: 178).In certain embodiments, there is a linker between at least two TAD domains. In certain embodiments, the linker comprises or consists of GGSGGGSG (SEQ ID NO: 177) or GGSGGGSGGGSGGGSG (SEQ ID NO: 178).
Согласно определенным вариантам осуществления DBD связывается с областью генома, содержащей 18-27 нуклеотидов.In certain embodiments, the DBD binds to a region of the genome containing 18-27 nucleotides.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к его ближайшему человеческому аналогу. Согласно определенным вариантам осуществления DBD характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к его ближайшему человеческому аналогу. Согласно определенным вариантам осуществления каждый из DBD и по меньшей мере двух TAD характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к их ближайшим человеческим аналогам. Согласно определенным вариантам осуществления каждый из DBD и по меньшей мере двух TAD характеризуется идентичностью последовательности, составIn certain embodiments, the DBD has at least 80% sequence identity to its closest human counterpart. In certain embodiments, the DBD has at least 90% sequence identity to its closest human counterpart. In certain embodiments, each of the DBDs and at least two TADs has at least 80% sequence identity to their closest human counterparts. In certain embodiments, each of the DBDs and at least two TADs is characterized by sequence identity, composition
- 1 046157 ляющей по меньшей мере 90%, по отношению к их ближайшим человеческим аналогам.- 1 046157 lying at least 90% in relation to their closest human analogues.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит направляющую РНК и инактивированный нуклеазами белок Cas. Согласно определенным вариантам осуществления инактивированный нуклеазой белок Cas представляет собой инактивированный нуклеазой белок Cas9.In certain embodiments, the DBD comprises a guide RNA and a nuclease-inactivated Cas protein. In certain embodiments, the nuclease-inactivated Cas protein is a nuclease-inactivated Cas9 protein.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит домен типа цинковые пальцы. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит от шести до девяти доменов типа цинковые пальцы. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит шесть цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления DBD связывается с областью генома, содержащей 18 нуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит девять цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления DBD связывается с областью генома, содержащей 27 нуклеотидов.In certain embodiments, the DBD comprises a zinc finger domain. In certain embodiments, the DBD contains six to nine zinc finger domains. In certain embodiments, the DBD contains six zinc fingers. In certain embodiments, the DBD binds to a region of the genome containing 18 nucleotides. In certain embodiments, the DBD contains nine zinc fingers. In certain embodiments, the DBD binds to a 27 nucleotide region of the genome.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 148-151. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит последовательность, содержащую любую из SEQ ID NO: 148-151.In certain embodiments, the DBD contains a sequence having at least 95% sequence identity to any of SEQ ID NOs: 148-151. In certain embodiments, the DBD comprises a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 148-151.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD получен из EGR1 человека или EGR3 человека.In certain embodiments, the DBD is derived from human EGR1 or human EGR3.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 77-98. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит SEQ ID NO: 77-98.In certain embodiments, the DBD contains a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 77-98. In certain embodiments, the DBD contains SEQ ID NO: 77-98.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к SEQ ID NO: 92. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит SEQ ID NO: 92.In certain embodiments, the DBD comprises a sequence having at least 90% identity to SEQ ID NO: 92. In certain embodiments, the DBD comprises SEQ ID NO: 92.
Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к SEQ ID NO: 130 или 131. Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит SEQ ID NO: 130 или 131.In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises a sequence having at least 90% identity to SEQ ID NO: 130 or 131. In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises SEQ ID NO: 130 or 131.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии содержит нуклеотидную последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 72 или 73. Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии содержит нуклеотидную последовательность любой из SEQ ID NO: 72 или 73.In certain embodiments, the expression cassette comprises a nucleotide sequence having at least 90% identity to either SEQ ID NO: 72 or 73. In certain embodiments, the expression cassette comprises a nucleotide sequence in either SEQ ID NO: 72 or 73.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии дополнительно содержит регуляторный элемент, который управляет экспрессией фактора транскрипции на более высоком уровне в PV-содержащих нейронах, чем в других типах клеток. Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит любую из SEQ ID NO: 1-4. Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит SEQ ID NO: 2 или 3.In certain embodiments, the expression cassette further comprises a regulatory element that directs expression of the transcription factor at a higher level in PV-containing neurons than in other cell types. In certain embodiments, the regulatory element comprises any of SEQ ID NOs: 1-4. In certain embodiments, the regulatory element comprises SEQ ID NO: 2 or 3.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии дополнительно содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК характеризуется идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 7, 14 или 15. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК содержит любую из SEQ ID NO: 7, 14 или 15.In certain embodiments, the expression cassette further comprises a PV-selective microRNA binding site. In certain embodiments, the PV-selective miRNA binding site has at least 90% identity to any of SEQ ID NO: 7, 14, or 15. In certain embodiments, the PV-selective miRNA binding site comprises any of SEQ ID NO: 7, 14 or 15.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии представляет собой часть вирусного вектора. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой вирус AAV. Согласно определенным вариантам осуществления вирус AAV представляет собой вирус AAV9 или вирус scAAV9. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой лентивирус.In certain embodiments, the expression cassette is part of a viral vector. In certain embodiments, the viral vector is an AAV virus. In certain embodiments, the AAV virus is an AAV9 virus or a scAAV9 virus. In certain embodiments, the viral vector is a lentivirus.
Согласно другому аспекту в заявке представлена кассета экспрессии, содержащая последовательность, кодирующую не встречающийся в природе фактор транскрипции, который увеличивает экспрессию гена SCN1A в клетке, причем не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит ДНКсвязывающий домен, функционально связанный с активирующим транскрипцию доменом, причем ДНКсвязывающий домен представляет собой белок типа цинковые пальцы, содержащий последовательность LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147), и причем тег HA отсутствует (SEQ ID NO: 303) между ДНК-связывающим доменом и активирующим транскрипцию доменом. Согласно определенным вариантам осуществления активирующий транскрипцию домен содержит последовательность VP16, VPR или VP64 или их функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления активирующий транскрипцию домен содержит VP64.In another aspect, the application provides an expression cassette comprising a sequence encoding a non-naturally occurring transcription factor that increases expression of the SCN1A gene in a cell, wherein the non-naturally occurring transcription factor comprises a DNA binding domain operably linked to a transcription activating domain, wherein the DNA binding domain represents is a zinc finger protein containing the sequence LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147), and where there is no HA tag (SEQ ID NO: 303) between the DNA binding domain and the activating domain transcription domain. In certain embodiments, the transcription activating domain comprises a VP16, VPR, or VP64 sequence or a functional fragment thereof. In certain embodiments, the transcription activating domain comprises VP64.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен связывается с геномной областью, содержащей 18-27 нуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления ДНКсвязывающий домен представляет собой домен типа цинковые пальцы, содержащий SEQ ID NO: 147, где n=6-9. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен представляетIn certain embodiments, the DNA binding domain binds to a genomic region containing 18-27 nucleotides. In certain embodiments, the DNA binding domain is a zinc finger domain comprising SEQ ID NO: 147, where n=6-9. In certain embodiments, the DNA binding domain is
- 2 046157 собой домен типа цинковые пальцы, содержащий SEQ ID NO: 147, где n=6. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен связывается с областью генома, содержащей 18 нуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен представляет собой домен типа цинковые пальцы, содержащий SEQ ID NO: 147, где n=9. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен связывается с геномной областью, содержащей 27 нуклеотидов.- 2 046157 is a zinc finger domain containing SEQ ID NO: 147, where n=6. In certain embodiments, the DNA binding domain binds to a region of the genome containing 18 nucleotides. In certain embodiments, the DNA binding domain is a zinc finger domain comprising SEQ ID NO: 147, where n=9. In certain embodiments, the DNA binding domain binds to a genomic region containing 27 nucleotides.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 148-151. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, содержащую любую из SEQ ID NO: 148-151.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 95% sequence identity to any of SEQ ID NOs: 148-151. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 148-151.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 77-91. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит любую из SEQ ID NO: 77-91.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 77-91. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises any of SEQ ID NOs: 77-91.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии дополнительно содержит регуляторный элемент, который управляет экспрессией фактора транскрипции на более высоком уровне в PV-содержащих нейронах, чем в других типах клеток. Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит любую из SEQ ID NO: 1-4. Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит SEQ ID NO: 2 или 3.In certain embodiments, the expression cassette further comprises a regulatory element that directs expression of the transcription factor at a higher level in PV-containing neurons than in other cell types. In certain embodiments, the regulatory element comprises any of SEQ ID NOs: 1-4. In certain embodiments, the regulatory element comprises SEQ ID NO: 2 or 3.
Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к SEQ ID NO: 127. Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит SEQ ID NO: 127.In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises a sequence having at least 90% identity to SEQ ID NO: 127. In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises SEQ ID NO: 127.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии содержит нуклеотидную последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 93 или 71. Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии содержит нуклеотидную последовательность любой из SEQ ID NO: 93 или 71.In certain embodiments, the expression cassette comprises a nucleotide sequence having at least 90% identity to either SEQ ID NO: 93 or 71. In certain embodiments, the expression cassette comprises a nucleotide sequence in either SEQ ID NO: 93 or 71.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии дополнительно содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК характеризуется идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 7, 14 или 15. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК содержит любую из SEQ ID NO: 7, 14 или 15.In certain embodiments, the expression cassette further comprises a PV-selective microRNA binding site. In certain embodiments, the PV-selective miRNA binding site has at least 90% identity to any of SEQ ID NO: 7, 14, or 15. In certain embodiments, the PV-selective miRNA binding site comprises any of SEQ ID NO: 7, 14 or 15.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии представляет собой часть вирусного вектора. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой вирус AAV. Согласно определенным вариантам осуществления вирус AAV представляет собой вирус AAV9 или вирус scAAV9. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой лентивирус. Согласно другому аспекту в заявке представлен полинуклеотид, содержащий селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий последовательность, характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к SEQ ID NO: 14 или 15, причем сайт связывания микроРНК снижает экспрессию трансгена в возбуждающих нейронах. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК содержит SEQ ID NO: 14. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК содержит SEQ ID NO: 15. Согласно другому аспекту в заявке представлена кассета экспрессии, содержащая селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и промотор и/или энхансер. Согласно определенным вариантам осуществления промотор и/или энхансер представляет собой селективный в отношении PV регуляторный элемент, который управляет экспрессией трансгена на более высоком уровне в парвальбумин-содержащих нейронах (PV), чем в других типах клеток. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отношении PV регуляторный элемент функционально связан с трансгеном. Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, и по меньшей мере один сайт связывания микроРНК, причем регуляторный элемент управляет экспрессией трансгена на более высоком уровне в парвальбумин-содержащих (PV) нейронах, чем в других типах клеток, и причем сайт связывания микроРНК снижает экспрессию трансгена в возбуждающих нейронах. Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии не содержит SEQ ID NO: 67. Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR128 (SEQ ID NO: 9). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR221 (SEQ ID NO: 11). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR222 (SEQ ID NO: 13). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере один сайт связывания для MIR221 (SEQ ID NO:In certain embodiments, the expression cassette is part of a viral vector. In certain embodiments, the viral vector is an AAV virus. In certain embodiments, the AAV virus is an AAV9 virus or a scAAV9 virus. In certain embodiments, the viral vector is a lentivirus. In another aspect, the application provides a polynucleotide comprising a PV-selective miRNA binding site comprising a sequence having at least 80% sequence identity to SEQ ID NO: 14 or 15, wherein the miRNA binding site reduces transgene expression in excitatory neurons. In certain embodiments, the PV-selective miRNA binding site comprises SEQ ID NO: 14. In certain embodiments, the PV-selective miRNA binding site comprises SEQ ID NO: 15. In another aspect, the application provides an expression cassette comprising a PV-selective microRNA binding site and promoter and/or enhancer. In certain embodiments, the promoter and/or enhancer is a PV-selective regulatory element that drives expression of the transgene at a higher level in parvalbumin-containing neurons (PVs) than in other cell types. In certain embodiments, the PV-selective regulatory element is operably linked to the transgene. In another aspect, the present application provides an expression cassette comprising a regulatory element operably linked to a transgene and at least one microRNA binding site, wherein the regulatory element controls expression of the transgene at a higher level in parvalbumin-containing (PV) neurons than in other neurons. cell types, and where the microRNA binding site reduces transgene expression in excitatory neurons. In certain embodiments, the expression cassette does not contain SEQ ID NO: 67. In certain embodiments, the microRNA binding site contains at least one binding site for MIR128 (SEQ ID NO: 9). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR221 (SEQ ID NO: 11). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR222 (SEQ ID NO: 13). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR128 (SEQ ID NO: 9) and at least one binding site for MIR221 (SEQ ID NO:
- 3 046157- 3 046157
11). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR128 (SEQ ID NO: 9), по меньшей мере один сайт связывания для MIR221 (SEQ ID NO: 11) и по меньшей мере один сайт связывания для MIR222 (SEQ ID NO: 13). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 7, 14 или 15. Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит SEQ ID NO: 7, 14 или 15.eleven). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR128 (SEQ ID NO: 9), at least one binding site for MIR221 (SEQ ID NO: 11), and at least one binding site for MIR222 (SEQ ID NO: 13). In certain embodiments, the miRNA binding site comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NO: 7, 14, or 15. In certain embodiments, the miRNA binding site comprises SEQ ID NO: 7, 14 or 15.
Согласно определенным вариантам осуществления трансген кодирует полипептид, содержащий не встречающийся в природе фактор транскрипции, который увеличивает экспрессию гена SCN1A в клетке. Согласно определенным вариантам осуществления фактор транскрипции связывается с областью генома, содержащей 18-27 нуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления фактор транскрипции содержит ДНК-связывающий домен. Согласно определенным вариантам осуществления фактор транскрипции содержит ДНК-связывающий домен и активирующий транскрипцию домен. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к его ближайшему человеческому аналогу. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к его ближайшему человеческому аналогу. Согласно определенным вариантам осуществления как ДНКсвязывающий домен, так и активирующий транскрипцию домен характеризуются идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к их ближайшим человеческим аналогам. Согласно определенным вариантам осуществления как ДНК-связывающий домен, так и активирующий транскрипцию домен характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к их ближайшим человеческим аналогам.In certain embodiments, the transgene encodes a polypeptide containing a non-naturally occurring transcription factor that increases expression of the SCN1A gene in a cell. In certain embodiments, the transcription factor binds to a region of the genome containing 18-27 nucleotides. In certain embodiments, the transcription factor comprises a DNA binding domain. In certain embodiments, the transcription factor comprises a DNA binding domain and a transcription activating domain. In certain embodiments, the DNA binding domain has at least 80% sequence identity to its closest human counterpart. In certain embodiments, the DNA binding domain has at least 90% sequence identity to its closest human counterpart. In certain embodiments, both the DNA binding domain and the transcription activating domain have at least 80% sequence identity to their closest human counterparts. In certain embodiments, both the DNA binding domain and the transcription activating domain have at least 90% sequence identity to their closest human counterparts.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит направляющую РНК и инактивированный нуклеазой белок Cas. Согласно определенным вариантам осуществления инактивированный нуклеазой белок Cas представляет собой инактивированный нуклеазой белок Cas9.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a guide RNA and a nuclease-inactivated Cas protein. In certain embodiments, the nuclease-inactivated Cas protein is a nuclease-inactivated Cas9 protein.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит домен типа цинковые пальцы. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит от шести до девяти доменов типа цинковые пальцы. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит шесть цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен связывается с областью генома, содержащей 18 нуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит девять цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен связывается с геномной областью, содержащей 27 нуклеотидов.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a zinc finger domain. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises six to nine zinc finger domains. In certain embodiments, the DNA binding domain contains six zinc fingers. In certain embodiments, the DNA binding domain binds to a region of the genome containing 18 nucleotides. In certain embodiments, the DNA binding domain contains nine zinc fingers. In certain embodiments, the DNA binding domain binds to a genomic region containing 27 nucleotides.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 148-151. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, содержащую любую из SEQ ID NO: 148-151. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 92-98. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит любую из SEQ ID NO: 92-98.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 95% sequence identity to any of SEQ ID NOs: 148-151. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 148-151. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 92-98. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises any of SEQ ID NOs: 92-98.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен представляет собой белок типа цинковые пальцы, содержащий последовательность LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147).In certain embodiments, the DNA binding domain is a zinc finger protein containing the sequence LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147).
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 77-91. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит любую из SEQ ID NO: 77-91.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 77-91. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises any of SEQ ID NOs: 77-91.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен происходит от EGR1 человека или EGR3 человека.In certain embodiments, the DNA binding domain is derived from human EGR1 or human EGR3.
Согласно определенным вариантам осуществления активирующий транскрипцию домен содержит последовательность VP16, VPR, VP64, CITED2, CITED4 или CREB3 или их функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления активирующий транскрипцию домен содержит последовательность CITED2, CITED4 или CREB3 человека или их функциональный фрагмент.In certain embodiments, the transcription activating domain comprises a VP16, VPR, VP64, CITED2, CITED4, or CREB3 sequence or a functional fragment thereof. In certain embodiments, the transcription activating domain comprises a human CITED2, CITED4, or CREB3 sequence or a functional fragment thereof.
Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит последовательность, содержащую любую из SEQ ID NO: 1-4. Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит последовательность, содержащую SEQ ID NO: 2 или 3.In certain embodiments, the regulatory element comprises a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 1-4. In certain embodiments, the regulatory element comprises a sequence comprising SEQ ID NO: 2 or 3.
Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 105, 106 и 127-129. Согласно определенным вариантамIn certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 105, 106, and 127-129. According to certain options
- 4 046157 осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит любую из SEQ ID NO: 105, 106 и 127-129.- 4 046157 implementation of a non-naturally occurring transcription factor contains any of SEQ ID NOs: 105, 106 and 127-129.
Согласно определенным вариантам осуществления трансген содержит нуклеотидную последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76 или 184. Согласно определенным вариантам осуществления трансген содержит любую из SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76 или 184.In certain embodiments, the transgene comprises a nucleotide sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76, or 184. In certain embodiments, the transgene comprises any of SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76 or 184.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии представляет собой часть вирусного вектора. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой вирус AAV. Согласно определенным вариантам осуществления вирус AAV представляет собой вирус AAV9 или вирус scAAV9. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой лентивирус.In certain embodiments, the expression cassette is part of a viral vector. In certain embodiments, the viral vector is an AAV virus. In certain embodiments, the AAV virus is an AAV9 virus or a scAAV9 virus. In certain embodiments, the viral vector is a lentivirus.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлен способ селективной экспрессии трансгена в парвальбумин-содержащих нейронах (PV) приматов, предусматривающий введение примату вирусного вектора, содержащего трансген и по меньшей мере один сайт связывания микроРНК, причем сайт связывания микроРНК снижает экспрессию трансгена в возбуждающих нейронах.In another aspect, the present application provides a method for selectively expressing a transgene in parvalbumin-containing neurons (PVs) of primates, comprising administering to the primate a viral vector containing the transgene and at least one miRNA binding site, wherein the miRNA binding site reduces expression of the transgene in excitatory neurons.
Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор дополнительно содержит регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, причем регуляторный элемент управляет экспрессией трансгена на более высоком уровне в парвальбумин-содержащих нейронах (PV), чем в других типах клеток. Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR128 (SEQ ID NO: 9). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR221 (SEQ ID NO: 11). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR222 (SEQ ID NO: 13). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере один сайт связывания для MIR221 (SEQ ID NO: 11). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит по меньшей мере один сайт связывания для MIR128 (SEQ ID NO: 9), по меньшей мере один сайт связывания для MIR221 (SEQ ID NO: 11) и по меньшей мере один сайт связывания для MIR222 (SEQ ID NO: 13). Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 7, 14 или 15. Согласно определенным вариантам осуществления сайт связывания микроРНК содержит SEQ ID NO: 7, 14 или 15.In certain embodiments, the viral vector further comprises a regulatory element operably linked to the transgene, wherein the regulatory element controls expression of the transgene at a higher level in parvalbumin-containing neurons (PVs) than in other cell types. In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR128 (SEQ ID NO: 9). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR221 (SEQ ID NO: 11). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR222 (SEQ ID NO: 13). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR128 (SEQ ID NO: 9) and at least one binding site for MIR221 (SEQ ID NO: 11). In certain embodiments, the microRNA binding site comprises at least one binding site for MIR128 (SEQ ID NO: 9), at least one binding site for MIR221 (SEQ ID NO: 11), and at least one binding site for MIR222 (SEQ ID NO: 13). In certain embodiments, the miRNA binding site comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NO: 7, 14, or 15. In certain embodiments, the miRNA binding site comprises SEQ ID NO: 7, 14 or 15.
Согласно определенным вариантам осуществления трансген содержит последовательность, кодирующую не встречающийся в природе фактор транскрипции, который увеличивает экспрессию гена SCNIA в клетке.In certain embodiments, the transgene comprises a sequence encoding a non-naturally occurring transcription factor that increases expression of the SCNIA gene in a cell.
Согласно определенным вариантам осуществления фактор транскрипции связывается с областью генома, содержащей 18-27 нуклеотидов.In certain embodiments, the transcription factor binds to a region of the genome containing 18-27 nucleotides.
Согласно определенным вариантам осуществления фактор транскрипции содержит ДНКсвязывающий домен.In certain embodiments, the transcription factor comprises a DNA binding domain.
Согласно определенным вариантам осуществления фактор транскрипции содержит ДНКсвязывающий домен и активирующий транскрипцию домен.In certain embodiments, the transcription factor comprises a DNA binding domain and a transcription activating domain.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к его ближайшему человеческому аналогу. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к его ближайшему человеческому аналогу. Согласно определенным вариантам осуществления как ДНК-связывающий домен, так и активирующий транскрипцию домен характеризуются идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, по отношению к их ближайшим человеческим аналогам. Согласно определенным вариантам осуществления как ДНК-связывающий домен, так и активирующий транскрипцию домен характеризуются идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к их ближайшим человеческим аналогам.In certain embodiments, the DNA binding domain has at least 80% sequence identity to its closest human counterpart. In certain embodiments, the DNA binding domain has at least 90% sequence identity to its closest human counterpart. In certain embodiments, both the DNA binding domain and the transcription activating domain have at least 80% sequence identity to their closest human counterparts. In certain embodiments, both the DNA binding domain and the transcription activating domain have at least 90% sequence identity to their closest human counterparts.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит направляющую РНК и инактивированный нуклеазой белок Cas. Согласно определенным вариантам осуществления инактивированный нуклеазой белок Cas представляет собой инактивированный нуклеазой белок Cas9.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a guide RNA and a nuclease-inactivated Cas protein. In certain embodiments, the nuclease-inactivated Cas protein is a nuclease-inactivated Cas9 protein.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит домен типа цинковые пальцы. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит от шести до девяти доменов типа цинковые пальцы. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит шесть цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен связывается с областью генома, содержащей 18 нуклеотидов. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит девять цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен свяIn certain embodiments, the DNA binding domain comprises a zinc finger domain. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises six to nine zinc finger domains. In certain embodiments, the DNA binding domain contains six zinc fingers. In certain embodiments, the DNA binding domain binds to a region of the genome containing 18 nucleotides. In certain embodiments, the DNA binding domain contains nine zinc fingers. In certain embodiments, the DNA binding domain
- 5 046157 зывается с геномной областью, содержащей 27 нуклеотидов.- 5 046157 is called with a genomic region containing 27 nucleotides.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 148-151. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, имеющую любую из SEQ ID NO: 148-151.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 95% sequence identity to any of SEQ ID NOs: 148-151. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having any of SEQ ID NOs: 148-151.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен происходит из EGR1 человека или EGR3 человека.In certain embodiments, the DNA binding domain is derived from human EGR1 or human EGR3.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 92-98. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит любую из SEQ ID NO: 92-98.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 92-98. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises any of SEQ ID NOs: 92-98.
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен представляет собой белок типа цинковые пальцы, содержащий последовательность LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147).In certain embodiments, the DNA binding domain is a zinc finger protein containing the sequence LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147).
Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 77-91. Согласно определенным вариантам осуществления ДНК-связывающий домен содержит любую из SEQ ID NO: 77-91.In certain embodiments, the DNA binding domain comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 77-91. In certain embodiments, the DNA binding domain comprises any of SEQ ID NOs: 77-91.
Согласно определенным вариантам осуществления активирующий транскрипцию домен содержит последовательность VP16, VPR, VP64, CITED2, CITED4 или CREB3 или их функциональный фрагмент. Согласно определенным вариантам осуществления активирующий транскрипцию домен содержит последовательность CITED2, CITED4 или CREB3 человека или их функциональный фрагмент.In certain embodiments, the transcription activating domain comprises a VP16, VPR, VP64, CITED2, CITED4, or CREB3 sequence or a functional fragment thereof. In certain embodiments, the transcription activating domain comprises a human CITED2, CITED4, or CREB3 sequence or a functional fragment thereof.
Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит последовательность, содержащую любую из SEQ ID NO: 1-4. Согласно определенным вариантам осуществления регуляторный элемент содержит последовательность, содержащую SEQ ID NO: 2 или 3.In certain embodiments, the regulatory element comprises a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 1-4. In certain embodiments, the regulatory element comprises a sequence comprising SEQ ID NO: 2 or 3.
Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 105, 106 и 127-129. Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит любую из SEQ ID NO: 105, 106 и 127-129.In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises a sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NOs: 105, 106, and 127-129. In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises any of SEQ ID NOs: 105, 106, and 127-129.
Согласно определенным вариантам осуществления трансген содержит нуклеотидную последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к любой из SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76 или 184. Согласно определенным вариантам осуществления трансген содержит любую из SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76 или 184.In certain embodiments, the transgene comprises a nucleotide sequence having at least 90% identity to any of SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76, or 184. In certain embodiments, the transgene comprises any of SEQ ID NO: 71, 74, 75, 76 or 184.
Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой вирус AAV. Согласно определенным вариантам осуществления вирус AAV представляет собой вирус AAV9 или вирус scAAV9. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный вектор представляет собой лентивирус.In certain embodiments, the viral vector is an AAV virus. In certain embodiments, the AAV virus is an AAV9 virus or a scAAV9 virus. In certain embodiments, the viral vector is a lentivirus.
Согласно определенным вариантам осуществления притма представляет собой человека. Согласно определенным вариантам осуществления примат представляет собой отличного от человека примата. Согласно определенным вариантам осуществления отличный от человека примат представляет собой обезьяну старого мира, орангутана, гориллу, шимпанзе, мартышку, яванского макака, макака-резус или свинохвостого макака.In certain embodiments, the primo is a human. In certain embodiments, the primate is a non-human primate. In certain embodiments, the non-human primate is an old world monkey, an orangutan, a gorilla, a chimpanzee, a marmoset, a cynomolgus monkey, a rhesus monkey, or a pig-tailed monkey.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая последовательность, кодирующую не встречающийся в природе фактор транскрипции, который увеличивает экспрессию гена SCN1A в клетке, причем не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 90%, по отношению к SEQ ID NO: 128 или 129. Согласно определенным вариантам осуществления не встречающийся в природе фактор транскрипции содержит SEQ ID NO: 128 или 129.In another aspect, the present application provides an expression cassette comprising a sequence encoding a non-naturally occurring transcription factor that increases expression of the SCN1A gene in a cell, wherein the non-naturally occurring transcription factor contains a sequence having at least 90% identity to with respect to SEQ ID NO: 128 or 129. In certain embodiments, the non-naturally occurring transcription factor comprises SEQ ID NO: 128 or 129.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлен способ увеличения экспрессии SCNIA в клетке путем введения любой из кассет экспрессии, представленных в настоящем документе. Согласно определенным вариантам осуществления клетка представляет собой нервную клетку. Согласно определенным вариантам осуществления нервная клетка выбрана из группы, состоящей из униполярных, биполярных, мультиполярных или псевдоуниполярных нейронов. Согласно определенным вариантам осуществления клетка представляет собой ГАМКергический нейрон. Согласно определенным вариантам осуществления клетка представляет собой PV-содержащий нейрон. Согласно определенным вариантам осуществления клетка не представляет собой нервную клетку. Согласно определенным вариантам осуществления клетка представляет собой глиальную клетку. Согласно определенным вариантам осуществления глиальная клетка выбрана из группы, состоящей из астроцитов, олигодендроцитов, эпендимных клеток, шванновских клеток и сателлитных клеток. Согласно определенным вариантам осуществления клетка находится внутри субъекта. Согласно определенным вариантам осуществления субъект представляет собой млекопитающее. Согласно определенным вариантам осуществления субъект представляетIn another aspect, the present application provides a method of increasing the expression of SCNIA in a cell by introducing any of the expression cassettes provided herein. In certain embodiments, the cell is a nerve cell. In certain embodiments, the nerve cell is selected from the group consisting of unipolar, bipolar, multipolar, or pseudounipolar neurons. In certain embodiments, the cell is a GABAergic neuron. In certain embodiments, the cell is a PV-containing neuron. In certain embodiments, the cell is not a nerve cell. In certain embodiments, the cell is a glial cell. In certain embodiments, the glial cell is selected from the group consisting of astrocytes, oligodendrocytes, ependymal cells, Schwann cells, and satellite cells. In certain embodiments, the cell is located within a subject. In certain embodiments, the subject is a mammal. In certain embodiments, the subject represents
- 6 046157 собой человека. Согласно определенным вариантам осуществления увеличение экспрессии SCN1A лечит заболевание, нарушение или симптом. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой нарушение центральной нервной системы. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой эпилепсию, связанную с гаплонедостаточностью SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления гаплонедостаточность является результатом того, что субъект является гетерозиготным по мутации потери функции гена SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой эпилепсию, связанную со вставкой, делецией или заменой в гене SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой эпилепсию, связанную с точечной мутацией в гене SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой синдром Драве. Согласно определенным вариантам осуществления симптом нарушение центральной нервной системы представляет собой гиперактивность нейронов. Согласно определенным вариантам осуществления лечение нарушения центральной нервной системы предусматривает снижение гиперактивности нейронов. Согласно определенным вариантам осуществления симптомом нарушения центральной нервной системы являются припадки. Согласно определенным вариантам осуществления лечение нарушения центральной нервной системы предусматривает снижение частоты припадков. Согласно определенным вариантам осуществления лечение нарушения центральной нервной системы предусматривает уменьшение тяжести припадков.- 6 046157 a person. In certain embodiments, increasing the expression of SCN1A treats a disease, disorder, or symptom. In certain embodiments, the disorder is a disorder of the central nervous system. In certain embodiments, the disorder is epilepsy associated with SCN1A haploinsufficiency. In certain embodiments, the haploinsufficiency results from the subject being heterozygous for a loss of function mutation in the SCN1A gene. In certain embodiments, the disorder is epilepsy associated with an insertion, deletion, or substitution in the SCN1A gene. In certain embodiments, the disorder is epilepsy associated with a point mutation in the SCN1A gene. In certain embodiments, the disorder is Dravet syndrome. In certain embodiments, the symptom of a central nervous system disorder is neuronal hyperactivity. In certain embodiments, treatment of a central nervous system disorder involves reducing neuronal hyperactivity. In certain embodiments, the symptom of the central nervous system disorder is seizures. In certain embodiments, treatment of a central nervous system disorder involves reducing the frequency of seizures. In certain embodiments, treatment of a central nervous system disorder involves reducing the severity of seizures.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлен способ увеличения экспрессии SCNIA в ЦНС путем введения любой из кассет экспрессии, представленных в настоящем документе. Согласно определенным вариантам осуществления кассету экспрессии вводят посредством одностороннего интрацеребровентрикулярного (ICV) введения. Согласно определенным вариантам осуществления кассету экспрессии вводят посредством двустороннего интрацеребровентрикулярного (ICV) введения. Согласно определенным вариантам осуществления повышенная экспрессия SCN1A происходит в головном мозге. Согласно определенным вариантам осуществления повышенная экспрессия SCN1A происходит во фронтальной коре, теменной коре, височной коре, гиппокампе, продолговатом мозге и/или затылочной коре. Согласно определенным вариантам осуществления повышенная экспрессия SCN1A происходит в позвоночнике. Согласно определенным вариантам осуществления повышенная экспрессия SCN1A происходит в спинном мозге и/или межпозвонковом узле.In another aspect, the present application provides a method of increasing the expression of SCNIA in the CNS by introducing any of the expression cassettes provided herein. In certain embodiments, the expression cassette is administered via unilateral intracerebroventricular (ICV) administration. In certain embodiments, the expression cassette is administered via bilateral intracerebroventricular (ICV) administration. In certain embodiments, increased expression of SCN1A occurs in the brain. In certain embodiments, increased expression of SCN1A occurs in the frontal cortex, parietal cortex, temporal cortex, hippocampus, medulla oblongata, and/or occipital cortex. In certain embodiments, increased expression of SCN1A occurs in the spine. In certain embodiments, increased expression of SCN1A occurs in the spinal cord and/or intervertebral ganglion.
Включение по ссылкеInclusion by link
Все публикации, патенты и заявки на патенты, упомянутые в настоящем описании, включены в настоящий документ посредством ссылки в той же степени, как если бы каждая отдельная публикация, патент или заявка на патент были специально и индивидуально указаны для включения посредством ссылки.All publications, patents and patent applications referenced herein are incorporated herein by reference to the same extent as if each individual publication, patent or patent application had been specifically and individually designated for inclusion by reference.
Краткое описание графических материаловBrief description of graphic materials
Новые особенности настоящего изобретения подробно изложены в прилагаемой формуле изобретения. Лучшее понимание особенностей и преимуществ настоящего изобретения будет получено при обращении к нижеследующему подробному описанию, в котором излагаются иллюстративные случаи, в которых используются принципы настоящего изобретения, и прилагаемым графическим материалам, на которых показано следующее.The novel features of the present invention are set forth in detail in the accompanying claims. A better understanding of the features and advantages of the present invention will be obtained by reference to the following detailed description, which sets forth illustrative cases in which the principles of the present invention are used, and the accompanying drawings, which show the following.
На фиг. 1 показана активация эндогенного SCN1A с использованием сконструированных факторов транскрипции, которые связываются с различными областями на хромосоме 2 (со ссылкой на GRCh38.p12). Данные представлены в виде кратного изменения экспрессии SCN1A по сравнению с контрольным (EGFP-KASH) состоянием.In fig. Figure 1 shows activation of endogenous SCN1A using engineered transcription factors that bind to different regions on chromosome 2 (referring to GRCh38.p12). Data are presented as fold change in SCN1A expression compared to the control (EGFP-KASH) condition.
На фиг. 2A, фиг. 2B и фиг. 2C показана относительная экспрессия эндогенного SCN1A в клетках HEK293 с использованием SCN1A-специфических активаторов транскрипции (смотрите табл. 1). Данные представлены в виде кратного изменения относительно контрольных условий и показаны на шкале Logi0.In fig. 2A, FIG. 2B and FIG. Figure 2C shows the relative expression of endogenous SCN1A in HEK293 cells using SCN1A-specific transcriptional activators (see Table 1). Data are presented as fold change relative to control conditions and shown on a Logi 0 scale.
На фиг. 3A показана относительная экспрессия эндогенного SCN1A в нейронах ГАМК с использованием SCN1A-специфического активатора транскрипции (конструкция 30). Данные представлены в виде кратного изменения относительно контрольных условий (CBA-EGFP).In fig. Figure 3A shows the relative expression of endogenous SCN1A in GABA neurons using an SCN1A-specific transcriptional activator (construct 30). Data are presented as fold change relative to control conditions (CBA-EGFP).
На фиг. 3B показана относительная экспрессия эндогенного SCN1A в нейронах ГАМК с использованием SCN1A-специфических активаторов транскрипции (конструкции 25 и 16). Данные представлены в виде кратного изменения относительно контрольных условий (CBA-EGFP) в Log10.In fig. Figure 3B shows the relative expression of endogenous SCN1A in GABA neurons using SCN1A-specific transcriptional activators (constructs 25 and 16). Data are presented as fold change relative to control conditions (CBA-EGFP) in Log 10 .
На фиг. 4 показана относительная экспрессия эндогенного SCN1A и 40 ближайших соседних генов, управляемых специфическим фактором транскрипции SCN1A (конструкция 30). Данные представлены в виде кратного изменения относительно контрольных условий (CBA-EGFP-KASH) в Log10.In fig. Figure 4 shows the relative expression of endogenous SCN1A and 40 immediate neighboring genes driven by the specific transcription factor SCN1A (construct 30). Data are presented as fold change relative to control conditions (CBA-EGFP-KASH) in Log 10 .
На фиг. 5A и фиг. 5B показана экспрессия SCN1A-специфического активатора транскрипции in vivo по сравнению с контрольной кассетой экспрессии, которая экспрессировала eGFP. На фиг. 5A показана относительная экспрессию гена SCN1A у мышей, которым инъецировали либо контрольный eGFP, либо конструкцию 4, содержащую активатор транскрипции SCN1A. На фиг. 5B показано изменение экспрессии SCN1A с точки зрения среднего процента eGFP. Эти эксперименты показывают, что активация транскрипции с помощью конструкции 4 привела к усилению экспрессии SCN1A приблизительно на 20-30%.In fig. 5A and FIG. 5B shows expression of the SCN1A-specific transcriptional activator in vivo compared to a control expression cassette that expressed eGFP. In fig. 5A shows the relative expression of the SCN1A gene in mice injected with either control eGFP or construct 4 containing the SCN1A transcriptional activator. In fig. Figure 5B shows the change in SCN1A expression in terms of the average percentage of eGFP. These experiments indicate that transcriptional activation by construct 4 resulted in an approximately 20-30% increase in SCN1A expression.
На фиг. 6A, фиг. 6B, фиг. 6C, фиг. 6D, фиг. 6E, фиг. 6F и фиг. 6G показано влияние на гипертерми- 7 046157 ческие припадки на мышиной модели синдрома Драве с нокаутом Scn1atm1Kea с использованием различных факторов транскрипции, специфических для SCN1A, по сравнению с контролем. Мышам P1 Scn1a +/- (гетерозиготные; HET) вводили либо AAV9-EGFP, либо вектор AAV9, экспрессирующий фактор транскрипции, специфический для SCN1A (одна из конструкций 31-34, 42 и 43). Мышей P26-P28, подвергнутых инфузии, подвергали тесту на припадки, вызванные гипертермией, и регистрировали внутреннюю температуру, при которой они испытывали тонико-клонический припадок. На фиг. 6D показано прямое сравнение между конструкцией 32, которая содержит тег HA, расположенным между DBD и TAD, и конструкцией 34, которая не содержит тега HA. На фиг. 6E показано прямое сравнение между конструкцией 31, которая содержит сайт связывания микроРНК m1, расположенный между кодирующей областью и хвостом полиА, и конструкцией 32, которая не содержит сайт связывания микроРНК m1. На фиг. 6H проиллюстрировано влияние на гипертермические припадки в модели синдрома Драве у мышей с мутантным Scn1aRX использованием конструкции 31 (по сравнению с контролем в виде введенного PBS).In fig. 6A, FIG. 6B, FIG. 6C, FIG. 6D, FIG. 6E, FIG. 6F and FIG. Figure 6G shows the effect on hyperthermic seizures in the Scn1a tm1Kea knockout mouse model of Dravet syndrome using different SCN1A-specific transcription factors compared to controls. P1 Scn1a +/− (heterozygous; HET) mice were injected with either AAV9-EGFP or an AAV9 vector expressing a SCN1A-specific transcription factor (one of constructs 31–34, 42, and 43). Infused P26-P28 mice were subjected to a hyperthermia-induced seizure test and the core temperature at which they experienced a tonic-clonic seizure was recorded. In fig. 6D shows a direct comparison between design 32, which contains an HA tag located between the DBD and TAD, and design 34, which does not contain an HA tag. In fig. 6E shows a direct comparison between construct 31, which contains the miRNA m1 binding site located between the coding region and the polyA tail, and construct 32, which does not contain the miRNA m1 binding site. In fig. 6H illustrates the effect on hyperthermic seizures in the Scn1a RX mutant mouse model of Dravet syndrome using construct 31 (compared to PBS-infused control).
На фиг. 7A, фиг. 7B, фиг. 7C и фиг. 7D показана выживаемость в модели синдрома Драве у мышей с нокаутом Scn1atm1Kea в различных условиях. На фиг. 7A показано сравнение мышей дикого типа (PBS WT) и Scn1a +/- (PBS HET) в анализе выживаемости. Мышам P1 Scn1a +/- (N=53) и Scn1a +/+ (N=54) вливали PBS. Мышей наблюдали в их домашней клетке ежедневно, и в случае какой-либо смертности регистрировали дату. Наблюдалась значительная разница в выживаемости между животными Scn1a +/- и Scn1a +/+ (P<0,0001). На фиг. 7B-D показано влияние на выживаемость в мышиной модели синдрома Драве для мышей, обработанных различными факторами транскрипции, специфическими для SCN1A, по сравнению с контролем. Мышам P1 Scn1a +/- вливали либо PBS, либо вектор AAV9, экспрессирующий фактор транскрипции, специфический для SCN1A (конструкции 31 или 33). Мышей наблюдали в их домашней клетке ежедневно, и в случае какой-либо смертности регистрировали дату. На фиг. 7D показано прямое сравнение между конструкцией 31, которая содержит сайт связывания микроРНК m1, расположенным между кодирующей областью и хвостом полиА, и конструкцией 33, которая не содержит сайт связывания микроРНК m1. На фиг. 7E показана выживаемость в модели синдрома Драве у мышей с мутантным Scn1aRX с использованием конструкции 31 (по сравнению с контролем, инъецированным PBS).In fig. 7A, FIG. 7B, FIG. 7C and FIG. Figure 7D shows survival in the Scn1a tm1Kea knockout mouse model of Dravet syndrome under various conditions. In fig. 7A shows a comparison of wild type (PBS WT) and Scn1a +/- (PBS HET) mice in a survival assay. P1 Scn1a +/− (N=53) and Scn1a +/+ (N=54) mice were infused with PBS. Mice were observed in their home cage daily and the date of any mortality was recorded. There was a significant difference in survival between Scn1a +/- and Scn1a +/+ animals (P<0.0001). In fig. 7B-D shows the effect on survival in a mouse model of Dravet syndrome for mice treated with various SCN1A-specific transcription factors compared to controls. P1 Scn1a +/− mice were infused with either PBS or an AAV9 vector expressing a transcription factor specific for SCN1A (constructs 31 or 33). Mice were observed in their home cage daily and the date of any mortality was recorded. In fig. 7D shows a direct comparison between construct 31, which contains the miRNA m1 binding site located between the coding region and the polyA tail, and construct 33, which does not contain the miRNA m1 binding site. In fig. 7E shows survival in the Scn1a RX mutant mouse model of Dravet syndrome using construct 31 (compared to PBS-injected control).
На фиг. 8 показана относительная экспрессия мРНК Scn1A в различных тканях головного мозга после интрапаренхимальной доставки вектора AAV9, кодирующего SCN1A-специфический фактор транскрипции (конструкция 33), введенного двум яванским макакам в дозе 1,2х1012 копий генома/животное, нормализованных по двум необработанным контрольным животным. Всех животных умерщвляли через 28 дней после инъекции и количественно определяли мРНК Scn1A в образцах тканей с помощью Taqman PCR. Данные представлены как нормализованная экспрессия целевой мРНК в различных срезах ткани головного мозга. Аналогичные результаты были зарегистрированы с другим набором праймеров/зонда, полученных из гена Scn1a.In fig. 8 shows the relative expression of Scn1A mRNA in various brain tissues following intraparenchymal delivery of an AAV9 vector encoding a SCN1A-specific transcription factor (construct 33) administered to two cynomolgus monkeys at a dose of 1.2 x 10 12 genome copies/animal, normalized to two untreated control animals. All animals were sacrificed 28 days postinjection, and Scn1A mRNA was quantified in tissue samples using Taqman PCR. Data are presented as normalized target mRNA expression in different brain tissue sections. Similar results were reported with a different primer/probe set derived from the Scn1a gene.
На фиг. 9A-F показан характер экспрессии EGFP в области зубчатой извилины гиппокампа мартышки после обработки векторами AAV9, содержащими трансген EGFP под контролем промотора EF1a, промотора RE 2 (SEQ ID NO: 2) или промотора RE 2 (SEQ ID NO: 2) с сайтом связывания микроРНК m1 (SEQ ID NO: 7), расположенным между кодирующей областью EGFP и сайтом polyA. Типичная область зубчатой извилины гиппокампа показана для каждого вектора обработки. В верхнем ряду показаны ядра клеток, окрашенные DAPI, а в нижнем ряду показаны GFP-положительные области, окрашенные антителом к GFP. На фиг. 9A (обработка EF1a) область hylus CA4 гиппокампа обведена, а стрелки указывают на слой тела гранулярных клеток зубчатых клеток (DG). Фиг. 9B и фиг. 9C сосредоточены в той же области. Область CA4, которая представляет собой смесь возбуждающих и тормозных интернейронов, выделена, поскольку это была единственная область со значительной экспрессией в условии RE 2 + m1. При управляемой EF1a и RE 2 экспрессии трансгена экспрессия GFP была более распространенной и включала в себя другие области гиппокампа. Считается, что слой клеток DG содержит в основном возбуждающие нейроны. Экспрессия GFP, управляемая EF1a и RE 2, видна в слое клеток DG (фиг. 9D и фиг. 9E), но не присутствует у животных, обработанных RE 2 + m1 (фиг. 9F) (белые стрелки).In fig. 9A-F show the expression pattern of EGFP in the dentate gyrus region of the marmoset hippocampus following treatment with AAV9 vectors containing the EGFP transgene under the control of the EF1a promoter, the RE 2 promoter (SEQ ID NO: 2), or the RE 2 promoter (SEQ ID NO: 2) with a binding site. microRNA m1 (SEQ ID NO: 7), located between the EGFP coding region and the polyA site. A representative region of the hippocampal dentate gyrus is shown for each processing vector. The top row shows cell nuclei stained with DAPI, and the bottom row shows GFP-positive areas stained with anti-GFP antibody. In fig. 9A (EF1a treatment), the hylus CA4 region of the hippocampus is circled and the arrows point to the dentate cell granule cell body (DG) layer. Fig. 9B and FIG. 9C are concentrated in the same area. Region CA4, which is a mixture of excitatory and inhibitory interneurons, is highlighted because it was the only region with significant expression in the RE 2 + m1 condition. During EF1a and RE 2 driven transgene expression, GFP expression was more widespread and included other areas of the hippocampus. The DG cell layer is thought to contain mainly excitatory neurons. GFP expression driven by EF1a and RE 2 is visible in the DG cell layer (Fig. 9D and Fig. 9E) but is not present in RE 2 + m1-treated animals (Fig. 9F) (white arrows).
На фиг. 10A-L показано, что характер экспрессии EGFP в области зубчатой извилины гиппокампа мартышки после обработки векторами AAV9, содержащими трансген EGFP под контролем промотора EF1a, промотора RE 2 (SEQ ID NO: 2) или промотора RE 2 (SEQ ID NO: 2) с сайтом связывания микроРНК m1 (SEQ ID NO: 7), расположенным между кодирующей областью EGFP и сайтом polyA, в первую очередь локализован на парвальбумин-положительных (PV) клетках у животных, получавших RE 2 и RE 2 + m1. Типичная область зубчатой извилины гиппокампа показана для каждого вектора обработки. В верхнем ряду показаны GFP-положительные области, а в следующем нижнем ряду показаны те же области, окрашенные ингибирующим маркером интернейронов для PV. Область в рамке на фиг. 10A-F показана при большем увеличении на фиг. 10G-L. Экспрессия GFP, управляемая RE 2 и RE 2 + m1, в основном совмещена с ингибирующим маркером PV-содержащих интернейронов (белые стрелки на фиг. 10H и 10K, 10I и 10L), тогда как в EG-EF1a экспрессия GFP не так легко локализуется в PVположительных клетках (белые стрелки на фиг. 10G и 10J). Кроме того, GFP-положительные клетки характеризуются отчетливо выраженной морфологией интернейронов высокоразветвленных клеток с пиIn fig. 10A-L show the expression pattern of EGFP in the dentate gyrus region of the marmoset hippocampus after treatment with AAV9 vectors containing the EGFP transgene under the control of the EF1a promoter, the RE 2 promoter (SEQ ID NO: 2) or the RE 2 promoter (SEQ ID NO: 2) with The microRNA m1 binding site (SEQ ID NO: 7), located between the EGFP coding region and the polyA site, is primarily localized to parvalbumin-positive (PV) cells in RE 2 and RE 2 + m1-treated animals. A representative region of the hippocampal dentate gyrus is shown for each processing vector. The top row shows GFP-positive areas, and the next bottom row shows the same areas stained with the inhibitory interneuron marker for PV. The boxed area in FIG. 10A-F is shown at higher magnification in FIG. 10G-L. GFP expression driven by RE 2 and RE 2 + m1 is mainly colocalized with the inhibitory marker of PV-containing interneurons (white arrows in Figs. 10H and 10K, 10I and 10L), whereas in EG-EF1a GFP expression is not as readily localized to PV-positive cells (white arrows in Fig. 10G and 10J). In addition, GFP-positive cells are characterized by a distinct interneuron morphology of highly branched cells with pi
- 8 046157 рамидным клеточным телом у животных, получавших RE 2 и RE 2 + ml (стрелки на фиг. 10H и 10I), по сравнению с менее отчетливой морфологией клеточного тела у животных, получавших EF1a (стрелки на фиг. 10G).- 8 046157 ramid cell body in animals treated with RE 2 and RE 2 + ml (arrows in Fig. 10H and 10I), compared with less distinct cell body morphology in animals treated with EF1a (arrows in Fig. 10G).
На фиг. 11 показан VG/диплоидный геном в образцах тканей фронтальной коры (FC), ростральной теменной коры (Rostral PC), височной коры (TC), каудальной теменной коры (Caudal PC), гиппокампа (Hip), продолговатого мозга (Med) и затылочной коры (OC) животных, получавших AAV9-REgabaeTFSCNiA, вводимые в дозе 4,8E+13 или 8E+13 мкг/животное посредством одностороннего интрацеребровентрикулярного (ICV) введения (пример 10 и пример 11). Каждая точка данных представляет VG/диплоидный геном для образца ткани, а горизонтальные полосы представляют средний VG/диплоидный геном для всех образцов ткани для каждого животного.In fig. 11 shows the VG/diploid genome in tissue samples from the frontal cortex (FC), rostral parietal cortex (Rostral PC), temporal cortex (TC), caudal parietal cortex (Caudal PC), hippocampus (Hip), medulla oblongata (Med), and occipital cortex. (OC) animals treated with AAV9-RE gaba eTF SC NiA administered at a dose of 4.8E+13 or 8E+13 μg/animal via unilateral intracerebroventricular (ICV) administration (Example 10 and Example 11). Each data point represents the VG/diploid genome for a tissue sample, and the horizontal bars represent the average VG/diploid genome across all tissue samples for each animal.
На фиг. 12 показаны транскрипты/мкг РНК в образцах тканей фронтальной коры (FC), ростральной теменной коры (Rostral PC), височной коры (TC), каудальной теменной коры (Caudal PC), гиппокампа (Hip), продолговатого мозга (Med) и затылочной коры (OC) животных, получавших AAV9-REgabaeTFSCN1A, вводимые в дозе 4,8E+13 или 8E+13 геномов вектора/животное посредством одностороннего интрацеребровентрикулярного (ICV) введения (пример 10 и пример 11). Каждая точка данных представляет геномы вектора/диплоидный геном для образца ткани, а горизонтальные полосы представляют собой среднее отношение геномы вектора/диплоидный геном для всех образцов ткани для каждого животного. Средние транскрипты для ARFGAP2 составляли 1,85Е+6/мкг РНК и обозначены пунктирной верхней граничной линией. Предел обнаружения обозначен пунктирной нижней граничной линией.In fig. Figure 12 shows transcripts/μg RNA in tissue samples from the frontal cortex (FC), rostral parietal cortex (Rostral PC), temporal cortex (TC), caudal parietal cortex (Caudal PC), hippocampus (Hip), medulla oblongata (Med), and occipital cortex. (OC) animals treated with AAV9-RE gaba eTF SC N 1A administered at a dose of 4.8E+13 or 8E+13 vector genomes/animal via unilateral intracerebroventricular (ICV) administration (Example 10 and Example 11). Each data point represents the vector genomes/diploid genome for a tissue sample, and the horizontal bars represent the average vector genomes/diploid genome ratio across all tissue samples for each animal. Average transcripts for ARFGAP2 were 1.85E+6/μg RNA and are indicated by the dashed upper limit line. The detection limit is indicated by the dashed lower limit line.
На фиг. 13 показано биораспределение вектора (геномы вектора/диплоидный геном) и экспрессия трансгена (транскрипты/мкг РНК) в образцах периферической ткани вне головного мозга. Показанные образцы периферической ткани представляют собой спинной мозг C2/L4 (SC C2/L4), межпозвонковый узел C2/L4 (DRG C2/L4), печень, селезенка, сердце, почки, легкие, поджелудочная железа и семенники/яичники. Среднее значение VCN (векторное биораспределение) и транскрипта (экспрессия трансгена) в головном мозге приматов показано пунктирной линией.In fig. Figure 13 shows vector biodistribution (vector genomes/diploid genome) and transgene expression (transcripts/μg RNA) in peripheral tissue samples outside the brain. Peripheral tissue samples shown are spinal cord C2/L4 (SC C2/L4), intervertebral ganglion C2/L4 (DRG C2/L4), liver, spleen, heart, kidney, lung, pancreas, and testes/ovaries. The average VCN (vector biodistribution) and transcript (transgene expression) values in the primate brain are shown by the dotted line.
Подробное описание настоящего изобретенияDetailed Description of the Present Invention
В настоящем документе представлены сконструированные факторы транскрипции или eTF, которые не встречаются в природе и были разработаны для связывания с целевым сайтом генома и модуляции экспрессии представляющего интерес эндогенного гена. Такие eTF могут быть созданы для усиления или подавления экспрессии (экспрессии РНК и/или белка) представляющего интерес гена. В настоящем документе также представлены сайты связывания микроРНК, которые могут быть включены в вирусный вектор и обеспечивать селективную экспрессию трансгена в парвальбумин-содержащих нейронах (PV).Presented herein are engineered transcription factors or eTFs that are not naturally occurring and have been designed to bind to a target site in the genome and modulate the expression of an endogenous gene of interest. Such eTFs can be designed to enhance or suppress the expression (RNA and/or protein expression) of a gene of interest. This document also provides microRNA binding sites that can be incorporated into a viral vector and allow selective expression of the transgene in parvalbumin-containing neurons (PVs).
Согласно одному аспекту в настоящей заявке представлены eTF, которые способны повышать экспрессию гена альфа-субъединицы 1 натриевого потенциалзависимого канала (SCN1A) и повышать экспрессию его соответствующего белкового продукта Nav1.1, a также способы их применения для лечения заболеваний или нарушений, связанных с дефицитом Nav1.1, такие как, например, синдром Драве.In one aspect, the present application provides eTFs that are capable of increasing the expression of the sodium voltage channel alpha subunit 1 (SCN1A) gene and increasing the expression of its corresponding protein product Nav1.1, as well as methods of using them to treat diseases or disorders associated with Nav1 deficiency .1, such as Dravet syndrome.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке предусмотрены сайты связывания микроРНК, которые снижают экспрессию мРНК, содержащей сайт связывания микроРНК, в возбуждающих нейронах, тем самым приводя к селективной экспрессии гена в ГАМКергических нейронах или парвальбуминсодержащих нейронах (PV), и способы их применения для селективной экспрессии представляющего интерес гена в нейронах PV.In another aspect, the present application provides microRNA binding sites that reduce the expression of miRNA binding site-containing mRNA in excitatory neurons, thereby leading to selective gene expression in GABAergic neurons or parvalbumin containing neurons (PV), and methods of using them to selectively express a representative gene. gene of interest in PV neurons.
Определения.Definitions.
Используемые в настоящем документе формы единственного числа предназначены для включения и форм множественного числа, если контекст явно не указывает на иное. Кроме того, в той степени, в которой термины включая в себя, включает в себя, имеющий, имеет, с или их варианты используются либо в подробном описании, либо в формуле изобретения, такие термины предназначены для включения аналогично термину содержащий.The singular forms used herein are intended to include the plural unless the context clearly indicates otherwise. Moreover, to the extent that the terms including, includes, having, has, with, or variants thereof are used either in the detailed description or in the claims, such terms are intended to be included in the same manner as the term containing.
Термин приблизительно или примерно означает в пределах допустимого диапазона ошибок для конкретного значения, определенного специалистом в настоящей области техники, который будет частично зависеть от того, как значение измеряется или определяется, т.е. ограничения системы измерения. Например, приблизительно может означать в пределах одного или более чем одного стандартного отклонения в соответствии с практикой в настоящей области техники. В качестве альтернативы приблизительно может означать диапазон до 20%, до 15%, до 10%, до 5% или до 1% от заданного значения.The term approximately or roughly means within the acceptable range of error for a particular value as determined by one skilled in the art, which will depend in part on how the value is measured or determined, i.e. limitations of the measurement system. For example, approximately may mean within one or more than one standard deviation in accordance with practice in the art. Alternatively, approximately may mean a range of up to 20%, up to 15%, up to 10%, up to 5%, or up to 1% of the target value.
Термины определение, измерение, оценка, оценивание, анализ и их грамматические эквиваленты могут использоваться в настоящем документе взаимозаменяемо для обозначения любой формы измерения и включают в себя определение того, присутствует элемент или нет (например, обнаружение). Эти термины могут включать в себя как количественные, так и/или качественные определения. Оценка может быть относительной или абсолютной.The terms definition, measurement, assessment, evaluation, analysis, and their grammatical equivalents may be used interchangeably herein to refer to any form of measurement and include determining whether an item is present or not (eg, detection). These terms may include both quantitative and/or qualitative definitions. The rating can be relative or absolute.
Термин экспрессия относится к процессу, с помощью которого последовательность нуклеиновой кислоты или полинуклеотид транскрибируется с матрицы ДНК (например, в мРНК или другой транскрипт РНК), и/или процессу, посредством которого транскрибированная мРНК впоследствии транслируется в пептиды, полипептиды или белки. Транскрипты и кодируемые полипептиды можно вместе назыThe term expression refers to the process by which a nucleic acid sequence or polynucleotide is transcribed from a DNA template (eg, into mRNA or other RNA transcript), and/or the process by which the transcribed mRNA is subsequently translated into peptides, polypeptides or proteins. Transcripts and encoded polypeptides can be called together
- 9 046157 вать генным продуктом. Если полинуклеотид происходит из геномной ДНК, экспрессия может включать в себя сплайсинг мРНК в эукариотической клетке.- 9 046157 to produce a gene product. If the polynucleotide is derived from genomic DNA, expression may involve splicing of the mRNA in the eukaryotic cell.
Используемые в настоящем документе термины функционально связанный, функциональная связь или их грамматические эквиваленты относятся к сопоставлению генетических элементов, например, промотора, энхансера, последовательности полиаденилирования и т.д., причем элементы находятся во взаимосвязи, позволяющей им работать ожидаемым образом. Например, регуляторный элемент, который может включать в себя промоторные и/или энхансерные последовательности, функционально связан с кодирующей областью, если регуляторный элемент помогает инициировать транскрипцию кодирующей последовательности. Между регуляторным элементом и кодирующей областью могут быть промежуточные остатки, пока сохраняется эта функциональная связь. Используемый в настоящем документе термин вектор относится к макромолекуле или ассоциации макромолекул, которая содержит полинуклеотид или ассоциируется с ним и которая может использоваться для опосредования доставки полинуклеотида в клетку. Примеры векторов включают в себя плазмиды, вирусные векторы, липосомы и другие носители для доставки генов. Вектор, как правило, содержит генетические элементы, например, регуляторные элементы, функционально связанные с геном для облегчения экспрессии гена в мишени.As used herein, the terms operably linked, functionally linked, or their grammatical equivalents refer to the juxtaposition of genetic elements, eg, promoter, enhancer, polyadenylation sequence, etc., where the elements are in a relationship that allows them to function in the expected manner. For example, a regulatory element, which may include promoter and/or enhancer sequences, is operably linked to a coding region if the regulatory element helps initiate transcription of the coding sequence. There may be intermediate residues between the regulatory element and the coding region as long as this functional relationship is maintained. As used herein, the term vector refers to a macromolecule or association of macromolecules that contains or is associated with a polynucleotide and that can be used to mediate delivery of the polynucleotide into a cell. Examples of vectors include plasmids, viral vectors, liposomes and other gene delivery vehicles. The vector typically contains genetic elements, for example, regulatory elements, operably linked to the gene to facilitate expression of the gene in the target.
Используемые в настоящем документе термины кассета экспрессии и кассета нуклеиновой кислоты взаимозаменяемо относятся к комбинации последовательностей нуклеиновых кислот или элементов, которые экспрессируются вместе или функционально связаны для экспрессии. В некоторых случаях кассета экспрессии относится к комбинации регуляторных элементов и гена или генов, с которыми они функционально связаны для экспрессии.As used herein, the terms expression cassette and nucleic acid cassette interchangeably refer to a combination of nucleic acid sequences or elements that are expressed together or operably linked for expression. In some cases, an expression cassette refers to a combination of regulatory elements and the gene or genes to which they are operably linked for expression.
Термин AAV представляет собой сокращение от аденоассоциированного вируса и может использоваться для обозначения самого вируса или его производного. Термин охватывает все серотипы, подтипы, а также встречающиеся в природе и рекомбинантные формы, если не требуется иное. Сокращение rAAV относится к рекомбинантному аденоассоциированному вирусу, также называемому рекомбинантным вектором AAV (или вектором rAAV). Термин AAV включает в себя AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, rh10 и их гибриды, AAV птиц, AAV крупного рогатого скота, AAV собак, AAV лошадей, AAV приматов, AAV не приматов и AAV овец. Геномные последовательности различных серотипов AAV, а также последовательности нативных концевых повторов (TR), белков Rep и субъединиц капсида известны в настоящей области техники. Такие последовательности можно найти в литературе или в общедоступных базах данных, таких как GenBank. Используемый в настоящем документе термин вектор rAAV относится к вектору AAV, содержащему полинуклеотидную последовательность, не имеющую происхождения AAV (т.е. полинуклеотид, гетерологичный AAV), как правило, последовательность, представляющую интерес для генетической трансформации клетки. В общем, гетерологичный полинуклеотид фланкирован по меньшей мере одной, а обычно двумя последовательностями инвертированных концевых повторов AAV (ITR). Вектор rAAV может быть одноцепочечным (ssAAV) или самокомплементарным (scAAV). Вирус AAV или вирусная частица AAV относится к вирусной частице, состоящей по меньшей мере из одного капсидного белка AAV и инкапсидированного полинуклеотидного вектора rAAV. Если частица содержит гетерологичный полинуклеотид (т.е. полинуклеотид, отличный от генома AAV дикого типа, такой как трансген, который должен быть доставлен в клетку млекопитающего), ее обычно называют векторной частицей rAAV или просто частицей rAAV. Таким образом, получение частицы rAAV обязательно включает в себя производство вектора rAAV, поскольку такой вектор содержится в частице rAAV.The term AAV is an abbreviation for adeno-associated virus and can be used to refer to the virus itself or a derivative of it. The term covers all serotypes, subtypes, and naturally occurring and recombinant forms, unless otherwise stated. The abbreviation rAAV refers to recombinant adeno-associated virus, also called recombinant AAV vector (or rAAV vector). The term AAV includes AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, rh10 and their hybrids, avian AAV, bovine AAV, canine AAV, equine AAV, primate AAV , non-primate AAV and sheep AAV. The genomic sequences of various AAV serotypes, as well as the sequences of native terminal repeats (TRs), Rep proteins and capsid subunits are known in the art. Such sequences can be found in the literature or in public databases such as GenBank. As used herein, the term rAAV vector refers to an AAV vector containing a polynucleotide sequence not of AAV origin (ie, a polynucleotide heterologous to AAV), typically a sequence of interest for the genetic transformation of a cell. In general, a heterologous polynucleotide is flanked by at least one, and usually two, AAV inverted terminal repeat (ITR) sequences. The rAAV vector can be single-stranded (ssAAV) or self-complementary (scAAV). An AAV virus or AAV viral particle refers to a viral particle consisting of at least one AAV capsid protein and an encapsidated rAAV polynucleotide vector. If the particle contains a heterologous polynucleotide (ie, a polynucleotide different from the wild-type AAV genome, such as a transgene to be delivered into a mammalian cell), it is commonly referred to as an rAAV vector particle or simply an rAAV particle. Thus, production of an rAAV particle necessarily involves production of an rAAV vector, since such a vector is contained within the rAAV particle.
Используемые в настоящем документе термины лечить, лечение, терапия и т.п. относятся к облегчению, задержке или замедлению прогрессирования, профилактике, ослаблению, уменьшению эффектов или симптомов, предотвращению возникновения, ингибированию или облегчению начало заболеваний или нарушений. Способы настоящего раскрытия можно использовать с любым млекопитающим. Примеры млекопитающих включают в себя, без ограничения, крыс, кошек, собак, лошадей, коров, овец, свиней и, более предпочтительно, людей. Терапевтический эффект включает в себя искоренение или улучшение основного подлежащего лечению заболевания. Кроме того, терапевтический эффект достигается за счет устранения или облегчения одного или нескольких физиологических симптомов, связанных с основным заболеванием, так что улучшение наблюдается у субъекта, несмотря на то, что субъект все еще может страдать от основного нарушения. В некоторых случаях с профилактической целью терапевтическое средство можно вводить субъекту с риском развития определенного заболевания или субъекту, сообщающему об одном или нескольких физиологических симптомах заболевания, даже если диагноз этого заболевания не был поставлен. Способы настоящего раскрытия можно использовать с любым млекопитающим. В некоторых случаях лечение может привести к уменьшению или прекращению симптомов (например, снижению частоты, продолжительности и/или тяжести припадков). Профилактический эффект включает в себя отсрочку или устранение появления заболевания или состояния, отсрочку или устранение появления симптомов заболевания или состояния, замедление, остановку или обращение вспять прогрессирования заболевания или состояния или любую их комбинацию.As used herein, the terms treat, treatment, therapy, etc. refer to alleviating, delaying or delaying the progression of, preventing, mitigating, reducing the effects or symptoms of, preventing the occurrence of, inhibiting or alleviating the onset of diseases or disorders. The methods of the present disclosure can be used with any mammal. Examples of mammals include, but are not limited to, rats, cats, dogs, horses, cows, sheep, pigs, and, more preferably, humans. The therapeutic effect includes eradication or improvement of the underlying disease being treated. In addition, a therapeutic effect is achieved by eliminating or alleviating one or more physiological symptoms associated with the underlying disorder, such that improvement is observed in the subject although the subject may still be suffering from the underlying disorder. In some cases, for prophylactic purposes, a therapeutic agent can be administered to a subject at risk of developing a particular disease or to a subject reporting one or more physiological symptoms of a disease, even if the diagnosis of that disease has not been made. The methods of the present disclosure can be used with any mammal. In some cases, treatment may result in a reduction or cessation of symptoms (eg, reduction in the frequency, duration, and/or severity of seizures). A prophylactic effect includes delaying or eliminating the onset of a disease or condition, delaying or eliminating the onset of symptoms of a disease or condition, slowing, stopping or reversing the progression of a disease or condition, or any combination thereof.
Термин эффективное количество или терапевтически эффективное количество относится к тому количеству описанной в настоящем документе композиции, которого достаточно для воздействия наThe term effective amount or therapeutically effective amount refers to that amount of a composition described herein that is sufficient to affect
- 10 046157 предполагаемое применение, включая в себя, без ограничения, лечение заболевания, как определено ниже. Терапевтически эффективное количество может варьироваться в зависимости от предполагаемого лечебного применения (in vivo) или субъекта и подвергаемого лечению патологического состояния, например, массы и возраста субъекта, тяжести патологического состояния, способа введения и т.п., что может легко определить специалист в настоящей области техники. Этот термин также применяется к дозе, которая вызовет конкретный ответ в целевой клетке. Конкретная доза будет варьироваться в зависимости от конкретной выбранной композиции, схемы дозированного введения, которую необходимо соблюдать, вводится ли она в комбинации с другими соединениями, времени введения, ткани, в которую ее вводят, и физической системы доставки, в которой она вводится.- 10 046157 intended use, including, without limitation, the treatment of a disease as defined below. The therapeutically effective amount may vary depending on the intended therapeutic use (in vivo) or the subject and the pathological condition being treated, for example, the weight and age of the subject, the severity of the pathological condition, the route of administration, etc., as can be readily determined by one skilled in the art. technology. The term also applies to the dose that will produce a specific response in the target cell. The specific dosage will vary depending on the particular composition chosen, the dosage schedule to be followed, whether it is administered in combination with other compounds, the time of administration, the tissue into which it is administered, and the physical delivery system in which it is administered.
Фрагмент нуклеотидной или пептидной последовательности относится к последовательности, которая короче эталонной или полноразмерной последовательности.A nucleotide or peptide sequence fragment refers to a sequence that is shorter than the reference or full-length sequence.
Вариант молекулы относится к аллельным вариациям таких последовательностей, т.е. к последовательности, по существу сходной по структуре и биологической активности либо со всей молекулой, либо с ее фрагментом.Molecule variant refers to allelic variations of such sequences, i.e. to a sequence substantially similar in structure and biological activity to either the entire molecule or a fragment thereof.
Функциональный фрагмент последовательности ДНК или белка относится к фрагменту, который сохраняет биологическую активность (функциональную или структурную), которая по существу аналогична биологической активности полноразмерной последовательности ДНК или белка. Биологическая активность последовательности ДНК может заключаться в ее способности влиять на экспрессию способом, который, как известно, приписывается полноразмерной последовательности.A functional fragment of a DNA or protein sequence refers to a fragment that retains biological activity (functional or structural) that is substantially similar to the biological activity of the full-length DNA or protein sequence. The biological activity of a DNA sequence may lie in its ability to influence expression in a manner known to be attributable to the full-length sequence.
Термины субъект и индивидуум используются в настоящем документе взаимозаменяемо для обозначения позвоночного животного, предпочтительно, млекопитающего, более предпочтительно, человека. Описанные в настоящем документе способы могут быть применимы в терапевтических целях для человека, в ветеринарии и/или в доклинических исследованиях на животных моделях заболевания или состояния.The terms subject and individual are used interchangeably herein to refer to a vertebrate animal, preferably a mammal, more preferably a human. The methods described herein may be useful for human therapeutic purposes, veterinary medicine, and/or preclinical studies in animal models of a disease or condition.
Термин in vivo относится к событию, которое происходит в организме субъекта.The term in vivo refers to an event that occurs in the body of a subject.
Термин in vitro относится к событию, которое происходит вне тела субъекта. Например, анализ in vitro включает в себя любой анализ, проводимый вне субъекта. Анализы in vitro включают в себя анализы на основе клеток, в которых используются живые или мертвые клетки. Анализы in vitro также включают в себя бесклеточный анализ, в котором не используются интактные клетки.The term in vitro refers to an event that occurs outside the subject's body. For example, an in vitro assay includes any assay performed outside the subject. In vitro assays include cell-based assays that use live or dead cells. In vitro assays also include cell-free assays, which do not use intact cells.
В общем, идентичность последовательностей или гомология последовательностей, которые могут использоваться взаимозаменяемо, относятся к точному соответствию нуклеотид-нуклеотид или аминокислота-аминокислота двух полинуклеотидных или полипептидных последовательностей, соответственно. Как правило, способы определения идентичности последовательностей включают в себя сравнение двух нуклеотидных или аминокислотных последовательностей и определение их процентной идентичности. Сравнение последовательностей, например, с целью оценки идентичности, может быть выполнено с помощью любого подходящего алгоритма выравнивания, включая в себя, без ограничения, алгоритм Нидлмана-Вунша (см., например, выравниватель EMBOSS Needle, доступный на www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/, необязательно с настройками по умолчанию), алгоритм BLAST (см., например, инструмент выравнивания BLAST, доступный на blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi, необязательно с настройками по умолчанию) и алгоритм Смита-Уотермана (см., например, выравниватель EMBOSS Water, доступный на www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_water/, необязательно с настройками по умолчанию). Оптимальное выравнивание можно оценить с использованием любых подходящих параметров выбранного алгоритма, включая в себя параметры по умолчанию. Процент идентичности, также называемый процент гомологии, между двумя последовательностями может быть рассчитан как количество точных совпадений между двумя оптимально выровненными последовательностями, деленное на длину эталонной последовательности и умноженное на 100. Процент идентичности также может быть определен, например, путем сравнения информации о последовательностях с использованием усовершенствованной компьютерной программы BLAST, включая в себя версию 2.2.9, доступную в Национальных институтах здравоохранения. Программа BLAST основана на способе совмещения Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-2268 (1990) и как описано в Altschul, et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990); Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877 (1993) и Altschul et al., Nucleic Acids Res. 25:3389-3402 (1997). Вкратце, программа BLAST определяет идентичность как количество идентичных выровненных символов (т.е. нуклеотидов или аминокислот), деленное на общее количество символов в более короткой из двух последовательностей. Программа может использоваться для определения процента идентичности по всей длине сравниваемых последовательностей. Параметры по умолчанию предоставляются для оптимизации поиска с помощью коротких последовательностей запросов, например, с помощью программы blastp. Программа также позволяет использовать фильтр SEG для маскировки сегментов последовательностей запросов, как это определено программой SEG Wootton and Federhen, Computers and Chemistry 17: 149-163 (1993). Высокая идентичность последовательностей, как правило, включает в себя диапазоны идентичности последовательностей от приблизительно 80% до 100% и целые числа между ними. Используемый в настоящем документе термин сконструированный применительно к белку относится к не встречающемуся в природе белку, включая в себя, без ограничеIn general, sequence identity or sequence homology, which can be used interchangeably, refers to the exact nucleotide-nucleotide or amino acid-amino acid match of two polynucleotide or polypeptide sequences, respectively. Typically, methods for determining sequence identity involve comparing two nucleotide or amino acid sequences and determining their percentage identity. Comparison of sequences, for example for the purpose of identity assessment, can be performed using any suitable alignment algorithm, including, without limitation, the Needleman-Wunsch algorithm (see, for example, the EMBOSS Needle aligner, available at www.ebi.ac.uk /Tools/psa/emboss_needle/, optional with default settings), the BLAST algorithm (see, for example, the BLAST alignment tool available at blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi, optional with default settings), and Smith-Waterman algorithm (see, for example, the EMBOSS Water equalizer, available at www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_water/, optionally with default settings). Optimal alignment can be assessed using any appropriate parameters of the selected algorithm, including default parameters. Percent identity, also called percent homology, between two sequences can be calculated as the number of exact matches between two optimally aligned sequences divided by the length of the reference sequence and multiplied by 100. Percent identity can also be determined, for example, by comparing sequence information using improved BLAST computer program, including version 2.2.9, available from the National Institutes of Health. The BLAST program is based on the alignment method of Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-2268 (1990) and as described in Altschul, et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990); Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877 (1993) and Altschul et al., Nucleic Acids Res. 25:3389–3402 (1997). Briefly, the BLAST program defines identity as the number of identical aligned characters (i.e., nucleotides or amino acids) divided by the total number of characters in the shorter of the two sequences. The program can be used to determine the percentage of identity over the entire length of the sequences being compared. Default parameters are provided to optimize searches using short sequences of queries, such as using the blastp program. The program also allows the SEG filter to be used to mask segments of query sequences, as defined by the SEG program Wootton and Federhen, Computers and Chemistry 17: 149-163 (1993). High sequence identity generally includes sequence identity ranges from approximately 80% to 100% and integers in between. As used herein, the term engineered protein refers to a non-naturally occurring protein, including, but not limited to
- 11 046157 ния, белок, полученный из встречающегося в природе белка, или когда встречающийся в природе белок модифицирован или перепрограммирован, чтобы иметь определенное свойство.- 11 046157 nia, a protein derived from a naturally occurring protein, or when a naturally occurring protein is modified or reprogrammed to have a specific property.
Используемые в настоящем документе термины синтетический и искусственный используются взаимозаменяемо для обозначения белка или его домена, который характеризуется низкой идентичностью последовательности (например, идентичность последовательности составляет менее чем 50%) по отношению к встречающемуся в природе белку человека. Например, домены VPR и VP64 представляют собой синтетические домены трансактивации.As used herein, the terms synthetic and artificial are used interchangeably to refer to a protein or domain thereof that has low sequence identity (eg, less than 50% sequence identity) to a naturally occurring human protein. For example, the VPR and VP64 domains are synthetic transactivation domains.
Используемый в настоящем документе термин сконструированный фактор транскрипции или eTF относится к не встречающемуся в природе ДНК-связывающему белку или не встречающемуся в природе модулятору транскрипции, который был модифицирован или перепрограммирован для связывания со специфическим целевым сайтом связывания и/или включения модифицированного или замененного эффекторного домена транскрипции.As used herein, the term engineered transcription factor or eTF refers to a non-naturally occurring DNA-binding protein or non-naturally occurring transcription modulator that has been modified or reprogrammed to bind to a specific target binding site and/or to include a modified or replaced transcription effector domain. .
Используемый в настоящем документе термин ДНК-связывающий домен может использоваться для обозначения одного или нескольких ДНК-связывающих мотивов, таких как цинковый палец или основной мотив спираль-петля-спираль (bHLH), индивидуально или вместе как часть ДНКсвязывающего белка.As used herein, the term DNA binding domain can be used to refer to one or more DNA binding motifs, such as a zinc finger or a basic helix-loop-helix (bHLH) motif, individually or together as part of a DNA-binding protein.
Термины активирующий транскрипцию домен, домен активации транскрипции, домен трансактивации, транс-активирующий домен и TAD используются в настоящем документе взаимозаменяемо и относятся к домену белка, который вместе с ДНК-связывающим доменом может активировать транскрипцию с промотора, контактируя с транскрипционным аппаратом (например, с общими факторами транскрипции и/или РНК-полимеразой) либо напрямую, либо через другие белки, известные как коактиваторы.The terms transcription activation domain, transcription activation domain, transactivation domain, trans-activation domain, and TAD are used interchangeably herein and refer to a protein domain that, together with a DNA binding domain, can activate transcription from a promoter by contacting the transcription machinery (e.g. general transcription factors and/or RNA polymerase) either directly or through other proteins known as coactivators.
Термины домен репрессора транскрипции и TRD используются в настоящем документе взаимозаменяемо и относятся к домену белка, который в сочетании с ДНК-связывающим доменом может репрессировать транскрипцию с промотора, контактируя с транскрипционным механизмом (например, общие факторы транскрипции и/или РНК-полимераза) либо напрямую, либо через другие белки, известные как корепрессоры.The terms transcriptional repressor domain and TRD are used interchangeably herein and refer to a protein domain that, in combination with a DNA-binding domain, can repress transcription from a promoter by contact with transcription machinery (e.g., general transcription factors and/or RNA polymerase) or directly , or through other proteins known as corepressors.
Термин GRCh38.p12 относится к заплаточному релизу 12 Консорциума эталонных геномов Human Build 38 (GRCh38.p12), имеющему регистрационный номер сборки GenBank GCA_000001405.27 и датированному 21 декабря 2017 года.The term GRCh38.p12 refers to Human Genome Reference Consortium Build 38 patch release 12 (GRCh38.p12), having GenBank build accession number GCA_000001405.27 and dated December 21, 2017.
Если не указано иное, все термины, использованные в настоящем документе, характеризуются тем же значением, что и для специалиста в настоящей области техники, и в практике настоящего изобретения будут использоваться традиционные способы молекулярной биологии, микробиологии и технологии рекомбинантных ДНК, которые находятся в пределах знания специалистов в настоящей области техники.Unless otherwise specified, all terms used herein have the same meaning as those of ordinary skill in the art, and the practice of the present invention will utilize conventional techniques of molecular biology, microbiology, and recombinant DNA technology that are within the scope of knowledge specialists in the present field of technology.
Сконструированные факторы транскрипции (eTF), которые активируют SCN1AEngineered transcription factors (eTFs) that activate SCN1A
Согласно одному аспекту в настоящей заявке представлены eTF, которые способны повышать экспрессию гена альфа-субъединицы 1 натриевого канала с регулируемым напряжением (SCN1A) и увеличивать экспрессию его соответствующего белкового продукта Nav1.1. Ген SCN1A принадлежит к семейству генов, кодирующих субъединицы, используемые для сборки натриевых каналов. Эти каналы, которые транспортируют положительно заряженные ионы натрия в клетки, играют ключевую роль в способности клетки генерировать и передавать электрические сигналы. Ген SCN1A кодирует одну часть (альфасубъединицу) натриевого канала, называемого Nav1.1. Эти каналы в основном находятся в головном мозге, где они контролируют поток ионов натрия в клетки. Каналы Nav1.1 участвуют в передаче сигналов от одной нервной клетки (или нейрона) к другой. Было обнаружено, что несколько мутаций в гене SCN1A вызывают генетическую эпилепсию с фебрильными припадками плюс (GEFS+), которая представляет собой спектр припадочных расстройств различной степени тяжести. Эти состояния включают в себя простые фебрильные (связанные с лихорадкой) припадки, которые начинаются в младенчестве и обычно прекращаются к 5 годам, и фебрильные припадки плюс (FS+). FS+ включает в себя фебрильные и другие типы припадков, в том числе не связанные с лихорадкой (афебрильные припадки), которые продолжаются во взрослом возрасте. Спектр GEFS+ также включает в себя другие состояния, такие как синдром Драве (также известный как тяжелая миоклоническая эпилепсия младенчества или SMEI), которые вызывают более серьезные припадки, которые длятся дольше и которые трудно контролировать. Эти повторяющиеся припадки (эпилепсия) могут со временем обостряться и часто сопровождаются снижением функции головного мозга. Многие другие мутации были связаны с семейной гемиплегической мигренью, формой мигренозной головной боли, которая передается в семье, и по меньшей мере одна мутация была связана с эффективностью некоторых противосудорожных лекарственных средств. Таким образом, представленный в настоящем документе eTF, который увеличивает экспрессию SCN1A, можно использовать для лечения множества заболеваний или нарушений, связанных с мутациями в канале Nav1.1.In one aspect, the present application provides eTFs that are capable of increasing the expression of the voltage-regulated sodium channel alpha subunit 1 (SCN1A) gene and increasing the expression of its corresponding protein product Nav1.1. The SCN1A gene belongs to a family of genes that encode subunits used to assemble sodium channels. These channels, which transport positively charged sodium ions into cells, play a key role in the cell's ability to generate and transmit electrical signals. The SCN1A gene encodes one part (alpha subunit) of a sodium channel called Nav1.1. These channels are primarily found in the brain, where they control the flow of sodium ions into cells. Nav1.1 channels are involved in transmitting signals from one nerve cell (or neuron) to another. Several mutations in the SCN1A gene have been found to cause genetic epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+), which is a spectrum of seizure disorders of varying severity. These conditions include simple febrile (fever-associated) seizures, which begin in infancy and usually resolve by age 5, and febrile seizures plus (FS+). FS+ includes febrile and other types of seizures, including those not associated with fever (afebrile seizures) that continue into adulthood. The GEFS+ spectrum also includes other conditions, such as Dravet syndrome (also known as severe myoclonic epilepsy of infancy, or SMEI), which cause more severe seizures that last longer and are difficult to control. These recurring seizures (epilepsy) can get worse over time and are often accompanied by decreased brain function. Many other mutations have been linked to familial hemiplegic migraine, a form of migraine headache that runs in families, and at least one mutation has been linked to the effectiveness of some anticonvulsant drugs. Thus, the eTF presented herein, which increases SCN1A expression, can be used to treat a variety of diseases or disorders associated with mutations in the Nav1.1 channel.
Факторы транскрипции (TF) представляют собой белки, которые связываются с определенными последовательностями в геноме и контролируют экспрессию генов. Сконструированные факторы транскрипции или eTF, представленные в настоящем документе, которые активируют SCN1A, представляют собой не встречающиеся в природе белки, которые содержат ДНК-связывающий домен (DBD) и поTranscription factors (TFs) are proteins that bind to specific sequences in the genome and control gene expression. The engineered transcription factors or eTFs provided herein that activate SCN1A are non-naturally occurring proteins that contain a DNA binding domain (DBD) and
- 12 046157 меньшей мере один домен, который является модулятором транскрипции, например, либо домен активации транскрипции (TAD), либо транскрипционный репрессорный домен (TRD). Согласно одному варианту осуществления eTF, который активирует SCN1A, может содержать DBD и TAD (например, TADDBD или DBD-TAD), причем DBD и TAD могут происходить из одного и того же белка или из разных белков. Согласно другому варианту осуществления eTF, который активирует SCN1A, может содержать DBD и два TAD, причем DBD и TAD происходят из одного и того же белка, DBD происходит из первого белка, и оба TAD происходят из второго белка, DBD и один TAD происходит из первого белка, а второй TAD происходит из второго белка, или DBD происходит из первого белка, один TAD происходит из второго белка, а второй TAD происходит из третьего белка (например, TAD1-DBD-TAD1, TAD1-DBDTAD2, TAD1-TAD1-DBD, TAD1-TAD2-DBD, DBD-TAD1-TAD1 или DBD-TAD1-TAD2). Согласно другому варианту осуществления eTF, который активирует SCN1A, может содержать DBD и три TAD, причем DBD и TAD происходят из одного и того же белка, DBD происходит из первого белка, a TAD происходят из одного или нескольких разных белков, или причем DBD и все TAD происходят из разных белков, например, TADX-TADX-TADX-DBD, TADX-TADX-DBD-TADX, TADX-DBD-TADX-TADX или DBDTADX-TADX-TADX, где каждый X выбран независимо и может быть таким же или отличным от одного или всех других TAD. Примеры включают в себя, например, TAD1-TAD1-DBD-TAD1, TAD1-TAD1DBD-TAD2, TAD1-TAD2-DBD-TAD1, TAD1-TAD2-DBD-TAD2, TAD1-TAD2-DBD-TAD3, TAD1-DBDTAD1-TAD1, TAD1- DBD-TAD2-TAD2, TAD1-DBD-TAD1-TAD2, TAD2-DBD-TAD1-TAD2, TAD1DBD-TAD2-TAD3, TAD1-TAD1-TAD1-DBD, TAD1-TAD2-TAD2-DBD, TAD1-TAD2-TAD2-DBD, TAD1TAD2-TAD3-DBD, DBD-TAD1-TAD1-TAD1, DBD-TAD1-TAD1-TAD2, DBD-TAD1-TAD2-TAD2 или- 12 046157 at least one domain that is a transcription modulator, for example, either a transcription activation domain (TAD) or a transcription repressor domain (TRD). In one embodiment, the eTF that activates SCN1A may comprise a DBD and a TAD (eg, TADDBD or DBD-TAD), wherein the DBD and TAD may be derived from the same protein or from different proteins. In another embodiment, an eTF that activates SCN1A may comprise a DBD and two TADs, wherein the DBD and one TAD are derived from the same protein, the DBD is derived from the first protein and both TADs are derived from the second protein, the DBD and one TAD are derived from the first protein and a second TAD is derived from a second protein, or a DBD is derived from a first protein, one TAD is derived from a second protein, and a second TAD is derived from a third protein (e.g., TAD1-DBD-TAD1, TAD1-DBDTAD2, TAD1-TAD1-DBD, TAD1-TAD2-DBD, DBD-TAD1-TAD1 or DBD-TAD1-TAD2). In another embodiment, an eTF that activates SCN1A may comprise a DBD and three TADs, wherein the DBD and TAD are derived from the same protein, the DBD is derived from the first protein, and the TADs are derived from one or more different proteins, or the DBD and all TADs come from different proteins, for example TAD X -TAD X -TAD X -DBD, TAD X -TAD X -DBD-TAD X , TAD X -DBD-TAD X -TAD X or DBDTAD X -TAD X -TAD X. where each X is independently selected and may be the same or different from one or all other TADs. Examples include, for example, TAD1-TAD1-DBD-TAD1, TAD1-TAD1DBD-TAD2, TAD1-TAD2-DBD-TAD1, TAD1-TAD2-DBD-TAD2, TAD1-TAD2-DBD-TAD3, TAD1-DBDTAD1-TAD1 , TAD1-DBD-TAD2-TAD2, TAD1-DBD-TAD1-TAD2, TAD2-DBD-TAD1-TAD2, TAD1DBD-TAD2-TAD3, TAD1-TAD1-TAD1-DBD, TAD1-TAD2-TAD2-DBD, TAD1-TAD2 -TAD2-DBD, TAD1TAD2-TAD3-DBD, DBD-TAD1-TAD1-TAD1, DBD-TAD1-TAD1-TAD2, DBD-TAD1-TAD2-TAD2 or
DBD-TAD1-TAD2-TAD3 и т.д. Согласно другому варианту осуществления eTF, который активирует SCN1A, может содержать DBD и четыре TAD, причем DBD и TAD происходят из одного и того же белка, DBD происходит из первого белка, a TAD происходят из одного или нескольких разных белки, или причем DBD и все TAD происходят из разных белков, например, TADX-TADX-TADX-TADX-DBD, TADXTADX-TADX-DBD-TADX, TADX-TADX-DBD-TADX-TADX, TADX- DBD-TADX-TADX-TADX или DBDTADX-TADX-TADX-TADX, где каждый X выбирается независимо и может быть таким же или отличаться от одного или всех других TAD. Примеры включают в себя, например, TAD1-TAD1-DBD-TAD1-TAD1,DBD-TAD1-TAD2-TAD3, etc. In another embodiment, an eTF that activates SCN1A may comprise a DBD and four TADs, wherein the DBD and TAD are derived from the same protein, the DBD is derived from the first protein, and the TADs are derived from one or more different proteins, or wherein the DBD and all TADs come from different proteins, for example TADX-TADX-TADX-TADX-DBD, TADXTADX-TADX-DBD-TADX, TADX-TADX-DBD-TADX-TADX, TADX-DBD-TADX-TADX-TADX or DBDTAD X -TAD X -TAD X -TAD X , where each X is independently selected and may be the same or different from one or all other TADs. Examples include, for example, TAD1-TAD1-DBD-TAD1-TAD1,
TAD 1 -TAD 1-DBD-TAD2-TAD2, TAD1-TAD2-DBD-TAD1-TAD3, TAD 1 -TAD 1 -TAD 1-DBD-TAD2, TAD 1-DBD-TAD2-TAD3-TAD4, TAD 1-DBD-TAD2-TAD3-TAD4,TAD 1 -TAD 1-DBD-TAD2-TAD2, TAD1-TAD2-DBD-TAD1-TAD3, TAD 1 -TAD 1 -TAD 1-DBD-TAD2, TAD 1-DBD-TAD2-TAD3-TAD4, TAD 1-DBD -TAD2-TAD3-TAD4,
TAD 1-TAD2-DBD-TAD1-TAD2, TAD 1-TAD3-DBD-TAD1-TAD2, TAD 1-TAD2-TAD3-DBD-TAD4, TAD 1 -DBD-TAD 1-TAD2-TAD3, TAD 1 -TAD 1 -TAD 1 -TAD 1 -DBD,TAD 1-TAD2-DBD-TAD1-TAD2, TAD 1-TAD3-DBD-TAD1-TAD2, TAD 1-TAD2-TAD3-DBD-TAD4, TAD 1 -DBD-TAD 1-TAD2-TAD3, TAD 1 -TAD 1 -TAD 1 -TAD 1 -DBD,
TAD 1-TAD2-DBD-TAD2-TAD1, TAD 1-TAD2-DBD-TAD3-TAD4, TAD 1 -DBD-TAD 1 -TAD 1-TAD2, TAD2-DBD-TAD1-TAD2-TAD3, TAD 1-TAD2-TAD2-TAD3-DBD,TAD 1-TAD2-DBD-TAD2-TAD1, TAD 1-TAD2-DBD-TAD3-TAD4, TAD 1 -DBD-TAD 1 -TAD 1-TAD2, TAD2-DBD-TAD1-TAD2-TAD3, TAD 1-TAD2- TAD2-TAD3-DBD,
TAD1-TAD2-TAD3-TAD4-DBD, DBD-TAD1-TAD1-TAD1-TAD1, DBD-TAD1-TAD1-TAD2-TAD2, DBDTAD1-TAD2-TAD3-TAD4 или DBD-TAD1-TAD2-TAD3-TAD3 и т.д. Согласно одному варианту осуществления eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD и два TAD, которые расположены на одном конце DBD (например, N-конце или C-конце), причем DBD происходит из первого белка, и оба TAD происходят из второго белка, или DBD происходит из первого белка, один TAD происходит из второго белка, а второй TAD происходит из третьего белка (например, TAD1-TAD1-DBD, TAD1-TAD2-DBD, DBD-TAD1-TAD1 или DBD-TAD1-TAD2). Согласно определенным вариантам осуществления DBD может представлять собой синтетическую конструкцию, содержащую домены из нескольких белков.TAD1-TAD2-TAD3-TAD4-DBD, DBD-TAD1-TAD1-TAD1-TAD1, DBD-TAD1-TAD1-TAD2-TAD2, DBDTAD1-TAD2-TAD3-TAD4 or DBD-TAD1-TAD2-TAD3-TAD3, etc. d. In one embodiment, the eTF that activates SCN1A comprises a DBD and two TADs that are located at one end of the DBD (e.g., the N-terminus or the C-terminus), wherein the DBD is derived from a first protein and both TADs are derived from a second protein, or A DBD is derived from a first protein, one TAD is derived from a second protein, and a second TAD is derived from a third protein (e.g., TAD1-TAD1-DBD, TAD1-TAD2-DBD, DBD-TAD1-TAD1, or DBD-TAD1-TAD2). In certain embodiments, the DBD may be a synthetic construct comprising domains from multiple proteins.
Согласно определенным вариантам осуществления DBD и TAD и/или два TAD могут быть напрямую конъюгированы, например, без промежуточной аминокислотной последовательности, DBD и TAD и/или два TAD могут быть конъюгированы с использованием пептидного линкера или их комбинаций. Согласно определенным вариантам осуществления DBD конъюгирован с TAD и/или один TAD конъюгирован со вторым TAD через линкер, содержащий 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 75, 80, 90 или 100 аминокислот или 1-5, 1-10, 1-20, 1-30, 1-40, 1-50, 1-75,In certain embodiments, the DBD and the TAD and/or the two TADs can be directly conjugated, eg, without an intervening amino acid sequence, the DBD and the TAD and/or the two TADs can be conjugated using a peptide linker or combinations thereof. In certain embodiments, the DBD is conjugated to a TAD and/or one TAD is conjugated to a second TAD via a linker containing 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 , 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 75, 80, 90 or 100 amino acids or 1-5, 1-10, 1-20, 1-30, 1-40, 1-50, 1-75,
1-100, 5-10, 5-20, 5-30, 5-40, 5-50, 5-75, 5-100, 10-20, 10-30, 10-40, 10-50, 10-75, 10-100, 20-30, 20-40, 2050, 20-75 или 20-100 аминокислот. В некоторых случаях DBD и TAD и/или два TAD конъюгированы через встречающиеся в природе промежуточные остатки, обнаруженные во встречающихся в природе белках, из которых происходят домены. Согласно другим вариантам осуществления DBD и TAD и/или два TAD конъюгированы через синтетическую или экзогенную линкерную последовательность. Подходящие линкеры могут быть гибкими, расщепляемыми, нерасщепляемыми, гидрофильными и/или гидрофобными. Согласно определенным вариантам осуществления DBD и TAD и/или два TAD могут быть слиты вместе через линкер, содержащий множество остатков глицина и/или серина. Примеры пептидных линкеров глицина/серина включают в себя [GS]n, [GGGS]n (SEQ ID NO: 179), [GGGGS]n (SEQ ID NO: 180), [GGSG]n (SEQ ID NO: 181), где n представляет собой целое число, равное или больше 1. Согласно определенным вариантам осуществления линкер, используемый для конъюгирования DBD и TAD и/или двух TAD, представляет собой GGSGGGSG (SEQ ID NO: 177). Согласно определенным вариантам осуществления линкер, используемый для конъюгирования DBD и TAD и/или двух TAD, представляет собой GGSGGGSGGGSGGGSG (SEQ ID NO: 178). Согласно определенным вариантам осуществления, когда DBD конъюгирован с двумя TAD, первый и второй TAD могут быть конъюгированы с DBD с одинаковыми или разными линкерами, или один TAD может быть конъюгирован с DBD с помощью линкера, а1-100, 5-10, 5-20, 5-30, 5-40, 5-50, 5-75, 5-100, 10-20, 10-30, 10-40, 10-50, 10- 75, 10-100, 20-30, 20-40, 2050, 20-75 or 20-100 amino acids. In some cases, a DBD and a TAD and/or two TADs are conjugated through naturally occurring intermediate residues found in the naturally occurring proteins from which the domains are derived. In other embodiments, the DBD and the TAD and/or two TADs are conjugated through a synthetic or exogenous linker sequence. Suitable linkers can be flexible, cleavable, non-cleavable, hydrophilic and/or hydrophobic. In certain embodiments, a DBD and a TAD and/or two TADs can be fused together through a linker containing multiple glycine and/or serine residues. Examples of glycine/serine peptide linkers include [GS]n, [GGGS]n (SEQ ID NO: 179), [GGGGS]n (SEQ ID NO: 180), [GGSG]n (SEQ ID NO: 181), where n is an integer equal to or greater than 1. In certain embodiments, the linker used to conjugate a DBD and a TAD and/or two TADs is GGSGGGSG (SEQ ID NO: 177). In certain embodiments, the linker used to conjugate a DBD and a TAD and/or two TADs is GGSGGGSGGGSGGGSG (SEQ ID NO: 178). In certain embodiments, when a DBD is conjugated to two TADs, the first and second TAD may be conjugated to the DBD with the same or different linkers, or one TAD may be conjugated to the DBD by a linker and
- 13 046157 другой TAD может быть конъюгирован напрямую с DBD (например, без промежуточной линкерной последовательности), или оба TAD могут быть непосредственно конъюгированы с DBD (например, без промежуточных линкерных последовательностей). Согласно определенным вариантам осуществления, когда DBD конъюгирован с двумя TAD на одном и том же конце (например, N-конце или C-конце), линкер, соединяющий два TAD, может быть таким же или отличаться от линкера, соединяющего TAD с DBD, или TAD могут быть конъюгированы друг с другом с помощью линкера, но TAD напрямую конъюгированы с DBD (например, без промежуточной линкерной последовательности), или TAD могут быть напрямую конъюгированы друг с другом (например, без промежуточных линкерных последовательностей), но TAD конъюгированы с DBD с помощью линкера. Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, не содержат один или несколько тегов HA (например, SEQ ID NO: 171), расположенных между DBD и одним или несколькими TAD.- 13 046157 the other TAD may be conjugated directly to the DBD (eg, without intervening linker sequences), or both TADs may be directly conjugated to the DBD (eg, without intervening linker sequences). In certain embodiments, when a DBD is conjugated to two TADs at the same end (e.g., N-terminus or C-terminus), the linker connecting the two TADs may be the same or different from the linker connecting the TAD to the DBD, or TADs can be conjugated to each other by a linker, but TADs are directly conjugated to a DBD (e.g., without an intervening linker sequence), or TADs can be directly conjugated to each other (e.g., without intervening linker sequences), but TADs are conjugated to a DBD with using a linker. In certain embodiments, eTFs provided herein that activate SCN1A do not contain one or more HA tags (eg, SEQ ID NO: 171) located between the DBD and one or more TADs.
Представленные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, обладают свойствами, отличными от природных факторов транскрипции. Согласно определенным вариантам осуществления eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, полученный из встречающегося в природе белка, который был модифицирован таким образом, что DBD связывается с другим целевым сайтом по сравнению с встречающимся в природе белком, из которого он получен, и eTF, содержащий такой модифицированный DBD модулирует экспрессию другого гена (например, SCN1A) по сравнению с природным белком, из которого получен DBD (например, геном, отличным от SCN1A). Согласно другим вариантам осуществления eTF, представленный в настоящем документе, который активирует SCN1A, содержит TAD, полученный из встречающегося в природе белка, который был модифицирован таким образом, что eTF, содержащий такой модифицированный TAD, модулирует экспрессию другого гена (например, SCN1A) по сравнению с встречающимся в природе белком, из которого получен TAD (например, ген, отличный от SCN1A), и/или eTF, содержащий такой модифицированный TAD, по-разному модулирует экспрессию SCN1A (например, активирует или подавляет) по сравнению с встречающимся в природе белком, из которого получен TAD. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, полученный из встречающегося в природе белка, и TAD, полученный из встречающегося в природе белка (одного и того же или разных белков), причем как DBD, так и TAD были модифицированы. Согласно таким вариантам осуществления DBD может связываться с другим целевым сайтом по сравнению с встречающимся в природе белком, из которого он был получен, eTF, содержащий такой модифицированный DBD и TAD, модулирует экспрессию другого гена (например, SCN1A) по сравнению с встречающимся в природе белком, из которых получены домены (например, ген(-ы), отличный от SCN1A), и/или eTF, содержащий такие модифицированные DBD и TAD, по-разному модулирует экспрессию SCN1A (например, активирует или подавляет) по сравнению с встречающимися в природе белками, из которых получены домены DBD и TAD.The eTFs presented herein that activate SCN1A have properties distinct from natural transcription factors. In certain embodiments, an eTF that activates SCN1A comprises a DBD derived from a naturally occurring protein that has been modified such that the DBD binds to a different target site than the naturally occurring protein from which it is derived, and an eTF comprising such a modified DBD modulates the expression of a different gene (eg, SCN1A) compared to the native protein from which the DBD is derived (eg, a non-SCN1A gene). In other embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A contains a TAD derived from a naturally occurring protein that has been modified such that the eTF containing such modified TAD modulates the expression of another gene (e.g., SCN1A) relative to with the naturally occurring protein from which the TAD is derived (e.g., a non-SCN1A gene), and/or the eTF containing such a modified TAD modulates SCN1A expression differently (e.g., upregulates or represses) compared to the naturally occurring protein , from which the TAD is derived. In certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A comprises a DBD derived from a naturally occurring protein and a TAD derived from a naturally occurring protein (the same or different proteins), wherein both the DBD and the TAD have been modified. In such embodiments, the DBD may bind to a different target site compared to the naturally occurring protein from which it was derived, the eTF containing such a modified DBD and TAD modulates the expression of a different gene (eg, SCN1A) compared to the naturally occurring protein , from which the domains are derived (e.g., gene(s) other than SCN1A), and/or eTF containing such modified DBDs and TADs, modulate SCN1A expression differently (e.g., activate or repress) compared to naturally occurring proteins from which the DBD and TAD domains are derived.
ДНК-связывающие домены (DBD).DNA binding domains (DBDs).
Приведенные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, могут содержать любой подходящий DBD, который связывается с представляющим интерес целевым сайтом (например, целевой сайт, который приводит к положительной регуляции SCN1A при связывании с помощью eTF, представленного в настоящем документе). Согласно определенным вариантам осуществления DBD может представлять собой синтетически разработанный DBD. Согласно другим вариантам осуществления DBD может быть получен из встречающегося в природе белка. Семейства DBD включают в себя основную спираль-петлю-спираль (bHLH) (например, c-Myc), основную лейциновую молнию (например, C/EBP), спираль-поворот-спираль (например, Oct-1) и цинковые пальцы (например, EGR1 или EGR3). Эти семейства демонстрируют широкий спектр специфичностей связывания ДНК и генных мишеней. Как предполагается в настоящем документе, любой из известных белков фактора транскрипции человека может служить в качестве белковой платформы для конструирования и/или перепрограммирования DBD для распознавания конкретного целевого сайта, что приводит к модуляции экспрессии эндогенного гена SCN1A. Согласно иллюстративным вариантам осуществления DBD, представленный в настоящем документе, содержит домен типа цинковые пальцы, связывающий домен TALEN или комплекс gRNA/Cas.eTFs provided herein that activate SCN1A may comprise any suitable DBD that binds to a target site of interest (eg, a target site that results in up-regulation of SCN1A when bound by an eTF provided herein). In certain embodiments, the DBD may be a synthetically engineered DBD. In other embodiments, the DBD may be derived from a naturally occurring protein. DBD families include basic helix-loop-helix (bHLH) (e.g., c-Myc), basic leucine zipper (e.g., C/EBP), helix-turn-helix (e.g., Oct-1), and zinc fingers (e.g. , EGR1 or EGR3). These families exhibit a wide range of DNA binding and gene target specificities. As contemplated herein, any of the known human transcription factor proteins can serve as a protein platform to engineer and/or reprogram the DBD to recognize a specific target site, resulting in modulation of endogenous SCN1A gene expression. In exemplary embodiments, the DBD provided herein comprises a zinc finger domain binding a TALEN domain or a gRNA/Cas complex.
Представленный в настоящем документе DBD может быть разработан для распознавания любого целевого сайта, который приводит к активации SCN1A. Согласно иллюстративным вариантам осуществления DBD разработан для распознавания местоположения в геноме и повышения экспрессии эндогенного гена SCN1A, связанного с eTF. Сайты связывания, способные модулировать экспрессию эндогенного гена SCNIA при связывании с помощью представленного в настоящем документе eTF, могут быть расположены в любом месте генома, что приводит к модуляции экспрессии гена SCN1A. Согласно различным вариантам осуществления сайт связывания может быть расположен на хромосоме, отличной от SCN1A, на той же хромосоме, что и SCN1A, выше против хода транскрипции от сайта начала транскрипции (TSS) гена SCN1A, ниже по ходу транскрипции от TSS гена SCN1A, проксимальнее от TSS гена SCN1A, дистальнее от TSS гена SCN1A, в кодирующей области гена SCN1A, в интроне гена SCN1A, ниже по ходу транскрипции от полиА-хвоста гена SCN1A, в промоторной последовательности, которая регулирует ген SCN1A, или в последовательности энхансера, которая регулирует ген SCN1A.The DBD presented herein can be designed to recognize any target site that leads to activation of SCN1A. In exemplary embodiments, the DBD is designed to recognize a genomic location and enhance expression of an endogenous SCN1A gene associated with an eTF. Binding sites capable of modulating the expression of the endogenous SCNIA gene when bound by the eTF provided herein can be located anywhere in the genome, resulting in modulation of SCN1A gene expression. In various embodiments, the binding site may be located on a chromosome other than SCN1A, on the same chromosome as SCN1A, upstream of the transcription start site (TSS) of the SCN1A gene, downstream of the TSS of the SCN1A gene, proximal to TSS of the SCN1A gene, distal to the TSS of the SCN1A gene, in the coding region of the SCN1A gene, in the intron of the SCN1A gene, downstream of the polyA tail of the SCN1A gene, in the promoter sequence that regulates the SCN1A gene, or in the enhancer sequence that regulates the SCN1A gene .
- 14 046157- 14 046157
DBD может быть разработан для связывания с целевым сайтом связывания любой длины при условии, что он обеспечивает специфическое распознавание последовательности целевого сайта связывания посредством DBD, например, с минимальным или нулевым связыванием вне мишени. Согласно определенным вариантам осуществления целевой сайт связывания может модулировать экспрессию SCN1A при связывании с eTF на уровне, который является по меньшей мере 2-кратным, 5-кратным, 10-кратным, 20-кратным, 50-кратным, 75-кратным, 100-кратным, 150-кратным, 200-кратным, 250-кратным, 500кратным или более по сравнению со всеми другими генами. Согласно определенным вариантам осуществления целевой сайт связывания может модулировать экспрессию SCNIA при связывании с eTF на уровне, который является по меньшей мере 2-кратным, 5-кратным, 10-кратным, 20-кратным, 50-кратным, 75-кратным, 100-кратным, 150-кратным, 200-кратным, 250-кратным, 500-кратным или более по сравнению с 40 ближайшими соседними генами (например, 40 генов, расположенных ближе всего к хромосоме, выше против хода транскрипции или ниже по ходу транскрипции от кодирующей последовательности SCN1A). Согласно определенным вариантам осуществления целевой сайт связывания может составлять по меньшей мере 5 п.н., 10 п.н., 15 п.н., 20 п.н., 25 п.н., 30 п.н., 35 п.н., 40 п.н., 45 п.н. или 50 п.н. или более. Конкретная длина сайта связывания определяется типом DBD в eTF. В общем, чем больше длина сайта связывания, тем выше специфичность связывания и модуляции экспрессии гена (например, более длинные сайты связывания характеризуются меньшим количеством нецелевых эффектов). Согласно определенным вариантам осуществления, eTF, содержащий DBD, распознающий более длинный целевой сайт связывания, имеет меньше нецелевых эффектов, связанных с неспецифическим связыванием (таких как, например, модуляция экспрессии нецелевого гена или отличного от SCN1A гена) относительно нецелевых эффектов, наблюдаемых с eTF, имеющим DBD, который связывается с более коротким целевым сайтом. В некоторых случаях снижение нецелевого связывания по меньшей мере в 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 раз ниже по сравнению с сопоставимым eTF, имеющим DBD, который распознает более короткий целевой сайт связывания.A DBD can be designed to bind to a target binding site of any length, as long as it provides specific sequence recognition of the target binding site by the DBD, for example, with minimal or no off-target binding. In certain embodiments, the target binding site may modulate SCN1A expression upon binding to eTF at a level that is at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 20-fold, 50-fold, 75-fold, 100-fold , 150-fold, 200-fold, 250-fold, 500-fold or more compared to all other genes. In certain embodiments, the target binding site may modulate SCNIA expression upon binding to eTF at a level that is at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 20-fold, 50-fold, 75-fold, 100-fold , 150-fold, 200-fold, 250-fold, 500-fold, or more than the 40 nearest neighboring genes (e.g., the 40 genes closest to the chromosome, upstream or downstream of the SCN1A coding sequence ). In certain embodiments, the target binding site may be at least 5 bp, 10 bp, 15 bp, 20 bp, 25 bp, 30 bp, 35 bp .n., 40 bp, 45 bp. or 50 bp or more. The specific length of the binding site is determined by the type of DBD in the eTF. In general, the longer the binding site, the greater the specificity of binding and modulation of gene expression (e.g., longer binding sites have fewer off-target effects). In certain embodiments, an eTF comprising a DBD recognizing a longer target binding site has fewer off-target effects associated with non-specific binding (such as, for example, modulation of off-target or non-SCN1A gene expression) relative to the off-target effects observed with the eTF. having a DBD that binds to a shorter target site. In some cases, the reduction in off-target binding is at least 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10 times lower compared to comparable eTF , having a DBD that recognizes a shorter target binding site.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе DBD может быть модифицирован, чтобы иметь повышенную аффинность связывания, так что он связывается с целевым сайтом связывания в течение более длительного периода времени, так что TAD, конъюгированный с DBD, может рекрутировать больше факторов транскрипции и/или рекрутировать такой фактор транскрипции на более длительный период времени, чтобы оказывать большее влияние на уровень экспрессии эндогенного гена SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления DBD может быть модифицирован для увеличения его специфического связывания (или целевого связывания) с желаемым целевым сайтом и/или модифицирован для уменьшения его неспецифического или нецелевого связывания.In certain embodiments, the DBD provided herein can be modified to have increased binding affinity such that it binds to the target binding site for a longer period of time so that the TAD conjugated to the DBD can recruit more transcription factors and/or recruit such a transcription factor for a longer period of time to have a greater impact on the expression level of the endogenous SCN1A gene. In certain embodiments, the DBD may be modified to increase its specific binding (or on-target binding) to a desired target site and/or modified to reduce its non-specific or off-target binding.
Согласно различным вариантам осуществления связывание между DBD или eTF и целевым сайтом связывания может быть определено с использованием различных способов. Согласно определенным вариантам осуществления специфическое связывание между DBD или eTF и целевым сайтом связывания может быть определено с использованием анализа определения изменения подвижности, анализа защиты от ДНКазы или любого другого способа in vitro, известного в настоящей области техники для анализа связывания белок-ДНК. Согласно другим вариантам осуществления специфическое связывание между eTF и целевым сайтом связывания можно определить с помощью функционального анализа, например, путем измерения экспрессии (РНК или белка) гена (например, SCN1A), когда целевой сайт связывания связан с eTF. Например, целевой сайт связывания может быть расположен выше против хода транскрипции от репортерного гена (такого как, например, eGFP) или гена SCN1A в векторе, содержащемся в клетке или интегрированном в геном клетки, причем клетка экспрессирует eTF. Альтернативно, экспрессирующий eTF вектор может быть введен в тип клеток, который в природе содержит ген SCN1A. Более высокие уровни экспрессии репортерного гена (или SCN1A) в присутствии eTF по сравнению с контролем (например, без eTF или eTF, который распознает другой целевой сайт) указывают на то, что DBD eTF связывается с целевым сайтом. Подходящие in vitro (например, неклеточные) системы транскрипции и трансляции также могут быть использованы аналогичным образом. Согласно определенным вариантам осуществления eTF, который связывается с целевым сайтом, может характеризоваться по меньшей мере 2-кратной, 3-кратной, 5-кратной, 10-кратной, 15-кратной, 20-кратной, 30-кратной, 50-кратной, 75кратной, 100-кратной, 150-кратной или большей экспрессией репортерного гена или SCN1A по сравнению с контролем (например, без eTF или с eTF, который распознает другой целевой сайт).In various embodiments, the binding between the DBD or eTF and the target binding site can be determined using various methods. In certain embodiments, specific binding between a DBD or eTF and a target binding site can be determined using a mobility shift assay, a DNase protection assay, or any other in vitro method known in the art for protein-DNA binding assays. In other embodiments, the specific binding between the eTF and the target binding site can be determined using a functional assay, for example, by measuring the expression (RNA or protein) of a gene (eg, SCN1A) when the target binding site is bound to the eTF. For example, the target binding site may be located upstream of a reporter gene (such as eGFP) or the SCN1A gene in a vector contained in a cell or integrated into the genome of a cell where the cell expresses the eTF. Alternatively, the eTF expression vector can be introduced into a cell type that naturally contains the SCN1A gene. Higher levels of reporter gene (or SCN1A) expression in the presence of eTF compared to a control (e.g., no eTF or an eTF that recognizes a different target site) indicates that the DBD of the eTF binds to the target site. Suitable in vitro (eg, non-cellular) transcription and translation systems can also be used in a similar manner. In certain embodiments, the eTF that binds to the target site may have at least a 2-fold, 3-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 30-fold, 50-fold, 75-fold , 100-fold, 150-fold, or greater expression of a reporter gene or SCN1A compared to a control (eg, without eTF or with an eTF that recognizes a different target site).
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, размер которого составляет по меньшей мере 9 п.н., 12 п.н., 15 п.н., 18 п.н., 21 п.н., 24 п.н., 27 п.н., 30 п.н., 33 п.н. или 36 п.н.; более чем 9 п.н., 12 п.н., 15 п.н., 18 п.н., 21 п.н., 24 п.н., 27 п.н. или 30 п.н.; или 9-33 п.н., 9-30 п.н., 9-27 п.н., 9-24 п.н., 9-21 п.н., 9-18 п.н., 9-15 п.н., 9-12 п.н., 12-33 п.н., 12-30 п.н., 12-27 п.н., 12-24 п.н., 12-21 п.н., 12-18 п.н., 12-15 п.н., 15-33 п.н., 15-30 п.н., 15-27 п.н., 15-24 п.н., 15-21 п.н., 15-18 п.н., 18-33 п.н., 18-30 п.н., 18-27 п.н., 1824 п.н., 18-21 п.н., 21-33 п.н., 21-30 п.н., 21-27 п.н., 21-24 п.н., 24-33 п.н., 24-30 п.н., 24-27 п.н., 27-33 п.н., 27-30 п.н. или 30-33 п.н.. Согласно иллюстративным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который составляетIn certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is at least 9 bp, 12 bp, 15 bp, 18 bp, 21 bp, 24 bp, 27 bp, 30 bp, 33 bp. or 36 bp; more than 9 bp, 12 bp, 15 bp, 18 bp, 21 bp, 24 bp, 27 bp or 30 bp; or 9-33 bp, 9-30 bp, 9-27 bp, 9-24 bp, 9-21 bp, 9-18 bp, 9 -15 bp, 9-12 bp, 12-33 bp, 12-30 bp, 12-27 bp, 12-24 bp, 12-21 bp, 12-18 bp, 12-15 bp, 15-33 bp, 15-30 bp, 15-27 bp, 15-24 bp. n., 15-21 bp., 15-18 bp., 18-33 bp., 18-30 bp., 18-27 bp., 1824 bp., 18 -21 bp, 21-33 bp, 21-30 bp, 21-27 bp, 21-24 bp, 24-33 bp, 24-30 bp, 24-27 bp, 27-33 bp, 27-30 bp. or 30-33 bp. In exemplary embodiments, the eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that constitutes
- 15 046157- 15 046157
18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н.18-27 bp, 18 bp or 27 bp
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, расположенный на хромосоме 2. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, расположенный на хромосоме 2 в пределах 110 т.п.н., 100 т.п.н., 90 т.п.н., 80 т.п.н., 70 т.п.н., 60 т.п.н., 50 т.п.н., 40 т.п.н., 30 т.п.н., 20 т.п.н., 10 т.п.н., 5 т.п.н., 4 т.п.н., 3 т.п.н., 2 т.п.н. или 1 т.п.н. выше против хода транскрипции или ниже по ходу транскрипции от ТСС SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который расположен на хромосоме 2 в пределах 110 т.п.н. выше против хода транскрипции от TSS SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который расположен на хромосоме 2 в пределах 110 т.п.н. ниже по ходу транскрипции от TSS SCN1A. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие целевые сайты связывания составляют 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site located on chromosome 2. In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site located on chromosome 2 within 110 kb, 100 kb, 90 kb, 80 kb, 70 kb, 60 kb, 50 k. bp, 40 kb, 30 kb, 20 kb, 10 kb, 5 kb, 4 kb. b., 3 kb., 2 kb. or 1 kb. upstream or downstream of TCC SCN1A. In certain embodiments, the eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is located within 110 kb on chromosome 2. upstream of the TSS of SCN1A. In certain embodiments, the eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is located within 110 kb on chromosome 2. downstream of the TSS SCN1A. In exemplary embodiments, such target binding sites are 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который расположен на хромосоме 2 в пределах положений 166179652-165989571, в пределах положений 166128050-166127958, в пределах положений 166155414-166140590, в пределах положений 166179652-1661777272 или в пределах положений 1659990246-165989592 (все со ссылкой на GRCh38.p12). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие целевые сайты связывания составляют 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н.In certain embodiments, the eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is located on chromosome 2 within positions 166179652-165989571, within positions 166128050-166127958, within positions 166155414-166140590, within positions 166179652- 1661777272 or within the provisions of 1659990246-165989592 (all with reference to GRCh38.p12). In exemplary embodiments, such target binding sites are 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н., (ii) перекрывается с положением на хромосоме 2, выбранным из 166178880, 166177369, 166177362, 166177299, 166177299, 166155393, 166155264, 166149373, 166149176, 166149165, 166149118, 166148953, 166148565, 166142396, 166142391, 166142344, 166142239, 166141162, 166140928, 166140590, 165990076, 165989684, 165989571, 166155255, 166155099, 166148843, 166148361, 166142219, 166141090, 165990246, 165990193, 166149168, 166127991, 166128002, 166128037 или 166128025 (все со ссылкой на GRCh38.p12) и (iii) способен вызывать по меньшей мере 1,2-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp, (ii) overlaps with a position on chromosome 2 selected from 166178880, 166177369, 166177362, 166177299, 166177299, 166155393, 166155264, 166149373, 166149176 , 166149165, 166149118, 166148953, 166148565, 166142396, 166142391, 166142344 , 166142239, 166141162, 166140928, 166140590, 165990076, 165989684, 165989571, 166155255, 166155099, 166148843, 166148361, 166142219, 166141090, 165990246, 165990193, 166149168, 166127991, 166128002, 166128037 or 166128025 (all referencing GRCh38.p12) and (iii) is capable of causing at least a 1.2-fold increase in SCN1A expression upon binding to an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, (i) связывается с целевым сайтом, содержащим любую из SEQ ID NO: 18, 25, 30, 31 или 35-66 или состоящим из нее, и (ii) способен вызывать по меньшей мере 1,2-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A (i) binds to a target site containing or consisting of any of SEQ ID NOs: 18, 25, 30, 31, or 35-66, and (ii) is capable of cause at least a 1.2-fold increase in SCN1A expression upon binding to an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н., (ii) перекрывается с положением на хромосоме 2, выбранным из 166155255, 166155099, 166148843, 166148361, 166142219, 166141090, 165990246, 165990193, 166149168, 166127991, 166128002, 166128037 или 166128025 (все со ссылкой на GRCh38.p12), и (iii) способен вызывать как минимум 2кратное увеличение экспрессии SCNIA при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp, (ii) overlaps with a position on chromosome 2 selected from 166155255, 166155099, 166148843, 166148361, 166142219, 166141090, 165990246, 165990193, 166149168 , 166127991, 166128002, 166128037 or 166128025 (all referring to GRCh38 .p12), and (iii) is capable of causing at least a 2-fold increase in SCNIA expression upon binding to the eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, (i) связывается с целевым сайтом, содержащим любую из SEQ ID NO: 18, 30, 31, 37, 38, 45, 47, 48, 49, 55, 61, 62 или 64 или состоящим из нее, и (ii) способен вызывать по меньшей мере 2-кратное увеличение экспрессии SCNIA при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A (i) binds to a target site comprising any of SEQ ID NO: 18, 30, 31, 37, 38, 45, 47, 48, 49, 55, 61 , 62 or 64 or consisting of it, and (ii) is capable of causing at least a 2-fold increase in SCNIA expression upon binding to an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н., и (ii) перекрывается с положением на хромосоме 2, выбранным из 166149168, 166127991, 166128002, 166128037 или 166128025 (все со ссылкой на GRCh38.p12), и (iii) способен вызывать по меньшей мере 5-кратное увеличение экспрессии SCNIA при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp, and (ii) overlaps with a position on chromosome 2 selected from 166149168, 166127991, 166128002, 166128037 or 166128025 (all referring to GRCh38.p12), and (iii) is capable of causing at least 5- fold increase in SCNIA expression upon binding of the eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, (i) связывается с целевым сайтом, содержащим любую из SEQ ID NO: 18, 30, 31, 37 или 38 или состоящим из нее, и (ii) способен вызывать по меньшей мере 5-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A (i) binds to a target site containing or consisting of any of SEQ ID NOs: 18, 30, 31, 37, or 38, and (ii) is capable of inducing at least a 5-fold increase in SCN1A expression upon binding to the eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н., (ii) перекрывается с положением на хромосоме 2, выбранным из 166128002, 166128037, или 166128025 (все со ссылкой на GRCh38.p12), и (iii) способен вызывать по меньшей мере 15-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp, (ii) overlaps with a position on chromosome 2 selected from 166128002, 166128037, or 166128025 (all referring to GRCh38.p12), and (iii) is capable of causing at least a 15-fold increase in SCN1A expression when linked to the eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, (i) связывается с целевым сайтом, содержащим любую из SEQ ID NO: 30, 37 или 38 или состоящим из нее, и (ii) способен вызывать по меньшей мере 15-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A (i) binds to a target site containing or consisting of any of SEQ ID NO: 30, 37, or 38, and (ii) is capable of inducing at least 15- fold increase in SCN1A expression upon binding of the eTF disclosed herein.
- 16 046157- 16 046157
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н., (ii) перекрывается с положением на хромосоме 2, выбранным из 166128037 или 166128025 (все со ссылкой на GRCh38.p12), и (iii) способен вызывать по меньшей мере 20-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp, (ii) overlaps with a position on chromosome 2 selected from 166128037 or 166128025 (all referring to GRCh38.p12), and (iii) is capable of causing at least a 20-fold increase in SCN1A expression when bound open in this eTF document.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, (i) связывается с целевым сайтом, содержащим любую из SEQ ID NO: 30 или 38 или состоящим из нее, и (ii) способен вызывать по меньшей мере 20-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A (i) binds to a target site containing or consisting of any of SEQ ID NO: 30 or 38, and (ii) is capable of causing at least a 20-fold increase in expression of SCN1A upon binding of an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н., (ii) перекрывается с положением на хромосоме 2 в положении 166128025 и (iii) способен вызывать по меньшей мере 25-кратное увеличение экспрессии SCNIA при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp, (ii) overlaps with a position on chromosome 2 at position 166128025 and (iii) is capable of causing at least a 25-fold increase in SCNIA expression when bound by an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, (i) связывается с целевым сайтом, содержащим или состоящим из SEQ ID NO: 30, и (ii) способен вызывать по меньшей мере 25-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A (i) binds to a target site containing or consisting of SEQ ID NO: 30, and (ii) is capable of causing at least a 25-fold increase in SCN1A expression when bound by the disclosed in this eTF document.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н. и (ii) связывается с геномной областью, которая находится в пределах по меньшей мере 1 т.п.н., 750 п.н., 500 п.н., 400 п.н., 300 п.н., 200 п.н., 100 п.н. или 50 п.н. геномного местоположения, имеющего последовательность любой из SEQ ID NO: 18, 25, 30, 31 или 35-66. Согласно определенным вариантам осуществления целевой сайт связывания способен вызывать по меньшей мере 1,2-кратное, 2кратное, 5-кратное, 15-кратное, 20-кратное или 25-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp and (ii) binds to a genomic region that is within at least 1 kb, 750 bp, 500 bp, 400 bp, 300 bp, 200 bp .b., 100 bp. or 50 bp genomic location having the sequence of any of SEQ ID NO: 18, 25, 30, 31 or 35-66. In certain embodiments, the target binding site is capable of causing at least a 1.2-fold, 2-fold, 5-fold, 15-fold, 20-fold, or 25-fold increase in SCN1A expression upon binding to an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, который (i) составляет 18-27 п.н., 18 п.н. или 27 п.н. и (ii) связывается с областью генома, которая по меньшей мере частично перекрывается с геномным местоположением, имеющим последовательность любой из SEQ ID NO: 18, 25, 30, 31 или 35-66. Согласно определенным вариантам осуществления целевой сайт связывания способен вызывать по меньшей мере 1,2-кратное, 2-кратное, 5-кратное, 15-кратное, 20-кратное или 25-кратное увеличение экспрессии SCNIA при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site that is (i) 18-27 bp, 18 bp. or 27 bp and (ii) binds to a genomic region that at least partially overlaps with a genomic location having the sequence of any of SEQ ID NOs: 18, 25, 30, 31, or 35-66. In certain embodiments, the target binding site is capable of causing at least a 1.2-fold, 2-fold, 5-fold, 15-fold, 20-fold, or 25-fold increase in SCNIA expression upon binding to an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, распознает целевой сайт связывания, имеющий любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 18, 25, 30, 31 или 35-66. Согласно определенным вариантам осуществления целевой сайт связывания способен вызывать по меньшей мере 1,2-кратное, 2-кратное, 5-кратное, 15кратное, 20-кратное или 25-кратное увеличение экспрессии SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A recognizes a target binding site having any of the following sequences: SEQ ID NO: 18, 25, 30, 31, or 35-66. In certain embodiments, the target binding site is capable of causing at least a 1.2-fold, 2-fold, 5-fold, 15-fold, 20-fold, or 25-fold increase in SCN1A expression upon binding to an eTF disclosed herein.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, приводит по меньшей мере к 1,5-кратному, 2-кратному, 3-кратному, 4-кратному, 5-кратному, 6-кратному, 7-кратному, 8-кратному, 9-кратному, 10-кратному, 15-кратному, 20-кратному, 25-кратному, 50-кратному, 100-кратному или более или по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более активации экспрессии SCN1A (РНК SCN1A и/или белок Nav1.1) в клетке или in vivo по сравнению с контролем (например, без eTF или с eTF, который не распознает целевой сайт). Согласно различным вариантам осуществления активация экспрессии SCNIA может быть обнаружена с помощью способов ПЦР, вестерн-блоттинга или иммуноанализов.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A results in at least 1.5-fold, 2-fold, 3-fold, 4-fold, 5-fold, 6-fold, 7-fold, 8 -x, 9x, 10x, 15x, 20x, 25x, 50x, 100x or more or at least 50%, 60%, 70%, 75%, 80% , 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400%, or 500% or more activation of SCN1A expression (SCN1A RNA and/or Nav1.1 protein) in cell or in vivo vs. with control (eg, without eTF or with eTF that does not recognize the target site). In various embodiments, activation of SCNIA expression can be detected using PCR, Western blotting, or immunoassay methods.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, связывается с целевым сайтом, который способен увеличивать экспрессию SCNIA по меньшей мере в 1,2 раза, 1,3 раза, 1,4 раза, 1,5 раз, 1,6 раз, 1,7 раз, 1,8 раз, 1,9 раз, 2 раза, 3 раза, 4 раза, 5 раз, 8 раз, 10 раз, 12 раз, 15 раз, 18 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз, 75 раз, 100 раз или больше или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более относительно контроля в анализе активации транскрипции. Иллюстративный анализ активации транскрипции SCN1A представлен в настоящем документе в примере 3. Вкратце, HEK293 трансфицируют плазмидой, несущей eTF или контрольную репортерную конструкцию eGFP. Через 48 часов после трансфекции клетки собирают, выделяют РНК и подвергают обратной транскрипции, а полученные образцы кДНК анализируют с помощью кПЦР (например, с использованием праймеров, имеющих SEQ ID NO: 185 и 186) для количественного определения содержания эндогенного транскрипта SCN1A. GAPDH можно использовать в качестве эталонного гена для определения относительных уровней экспрессии SCN1A.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A binds to a target site that is capable of increasing SCNIA expression by at least 1.2-fold, 1.3-fold, 1.4-fold, 1.5-fold, 1. 6 times, 1.7 times, 1.8 times, 1.9 times, 2 times, 3 times, 4 times, 5 times, 8 times, 10 times, 12 times, 15 times, 18 times, 20 times, 25 times , 30 times, 40 times, 50 times, 75 times, 100 times or more or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100 %, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400%, or 500% or more relative to the control in the transcription activation assay. An exemplary SCN1A transcriptional activation assay is presented herein in Example 3. Briefly, HEK293 was transfected with a plasmid carrying eTF or an eGFP control reporter construct. 48 hours after transfection, cells are harvested, RNA is isolated and reverse transcribed, and the resulting cDNA samples are analyzed by qPCR (eg, using primers having SEQ ID NOs: 185 and 186) to quantify endogenous SCN1A transcript content. GAPDH can be used as a reference gene to determine the relative expression levels of SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, котоIn certain embodiments, an eTF disclosed herein that
- 17 046157 рый активирует SCN1A, характеризуется минимальными нецелевыми эффектами, например, нецелевыми эффектами, связанными с неспецифическим связыванием, такими как, например, модуляция экспрессии нецелевого гена или отличного от SCN1A гена. Согласно одному варианту осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, специфически активирует SCN1A по сравнению с контролем, по меньшей мере в 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз или 50 раз больше, чем экспрессия, произведенная eTF для одного или нескольких нецелевых генов по сравнению с контролем. Согласно иллюстративному варианту осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, специфически активирует транскрипцию гена SCN1A по сравнению с контролем, по меньшей мере, в 15 раз больше, чем транскрипция 40 ближайших соседних генов (например, 40 ближайших генов, расположенных к кодирующей последовательности SCN1A на хромосоме 2), производимая eTF относительно контроля, например, PLA2R1, ITGB6, RBMS1, TANK, PSMD14, TBR1, SLC4A10, DPP4, FAP, IFIH1, GCA, FIGN, GRB14, COBLL1, SLC38A11, SCN3A, SCN2A, CSRNP3, GALNT3, TTC21B, SCN9A, SCN7A, B3GALT1, STK39, CERS6, NOSTRIN, SPC25, ABCB11, DHRS9, BBS5, KLHL41, FASTKD1, PPIG, CCDC173, PHOSPHO2, KLHL23, SSB, METTL5, UBR3 и MYO3B (смотрите табл. 14). Согласно различным вариантам осуществления активация транскрипции гена SCN1A может быть обнаружена с помощью способов ПЦР.- 17 046157 activates SCN1A, is characterized by minimal off-target effects, for example, off-target effects associated with non-specific binding, such as, for example, modulation of the expression of a non-target gene or a gene other than SCN1A. In one embodiment, an eTF disclosed herein that activates SCN1A specifically activates SCN1A relative to control by at least 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold, or 50-fold more than the expression produced by eTF for one or more non-target genes compared to the control. In an exemplary embodiment, an eTF disclosed herein that activates SCN1A specifically activates transcription of the SCN1A gene relative to control to at least 15 times greater than transcription of the 40 nearest neighboring genes (e.g., the 40 closest genes located to the coding sequence SCN1A on chromosome 2) produced by eTF relative to control, e.g. PLA2R1, ITGB6, RBMS1, TANK, PSMD14, TBR1, SLC4A10, DPP4, FAP, IFIH1, GCA, FIGN, GRB14, COBLL1, SLC38A11, SCN3A, SCN2A, CSRNP3, GALNT3 , TTC21B, SCN9A, SCN7A, B3GALT1, STK39, CERS6, NOSTRIN, SPC25, ABCB11, DHRS9, BBS5, KLHL41, FASTKD1, PPIG, CCDC173, PHOSPHO2, KLHL23, SSB, METTL5, UBR3 and MYO3B (see Table 14). In various embodiments, transcriptional activation of the SCN1A gene can be detected using PCR methods.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, способен снижать частоту припадков в анализе гипертермических припадков (HTS) в модели синдрома Драве на мышах Scn1atm1kea. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF способен снижать частоту припадков при температуре 42,6°C в анализе HTS по меньшей мере в 1,2 раза, 1,3 раза, 1,4 раза, 1,5 раз, 1,6 раз, 1,7 раз, 1,8 раз, 1,9 раз, 2,0 раза или более или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100% или более по сравнению с контролем (например, обработанный PBS или воздействие вектором AAV, содержащим последовательность, кодирующую eGFP). Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF способен снижать частоту припадков при температуре 42,6°C в анализе HTS, так что по меньшей мере у 60%, 62%, 65%, 70%, 75%, 76%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% мышей, участвовавших в анализе, не наблюдалось припадков при температуре 42,6°C. Иллюстративный анализ HTS описан в настоящем документе в примере 6. Вкратце, пометам детенышей, полученным от самцов мышей Scn1a +/-, скрещенных с самками мышей C57Bl/6J, может быть введен вектор AAV9, кодирующий eTF, который активирует SCN1A, как предусмотрено в настоящем документе, или контрольный вектор, кодирующий eGFP, посредством двустороннего ICV в P1. Мышам можно вводить дозу ~1,0E10-5,0E12 копий геномов/мышь. Анализ HTS проводят на гетерозиготных мышах P26-P28 SCNIA и SCNIA дикого типа на смешанном фоне 129Stac X C57BL/6 путем повышения температуры тела мышей (в контролируемых условиях и с контролем температуры тела) на ~0,5°C каждые 2 минуты до начала первого тоникоклонического припадка, сопровождающегося потерей положения тела, или до достижения температуры тела 43°C. Считается, что у мыши не было припадка, если не было обнаружено припадка с потерей положения тела в течение всего периода эксперимента.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A is capable of reducing seizure frequency in a hyperthermic seizure (HTS) assay in the Scn1a tm1kea mouse model of Dravet syndrome. In certain embodiments, an eTF disclosed herein is capable of reducing seizure frequency at 42.6°C in the HTS assay by at least 1.2-fold, 1.3-fold, 1.4-fold, 1.5-fold, 1.6-fold times, 1.7 times, 1.8 times, 1.9 times, 2.0 times or more or by at least 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70 %, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100% or more compared to control (eg, treated with PBS or exposed to an AAV vector containing an eGFP coding sequence). In certain embodiments, an eTF disclosed herein is capable of reducing seizure frequency at 42.6°C in an HTS assay such that at least 60%, 62%, 65%, 70%, 75%, 76%, 80% , 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% of mice analyzed , no seizures were observed at a temperature of 42.6°C. An exemplary HTS assay is described herein in Example 6. Briefly, litters of pups generated from male Scn1a +/- mice crossed with female C57Bl/6J mice can be injected with an AAV9 vector encoding an eTF that activates SCN1A as provided herein document, or a control vector encoding eGFP via bilateral ICV in P1. Mice can be dosed with ~1.0E10-5.0E12 genome copies/mouse. The HTS assay is performed on heterozygous P26-P28 SCNIA and wild-type SCNIA mice on a mixed 129Stac X C57BL/6 background by increasing the body temperature of the mice (under controlled conditions and with body temperature controlled) by ~0.5°C every 2 minutes until the first a tonic-clonic seizure accompanied by loss of body position, or until the body temperature reaches 43°C. A mouse was considered to be seizure-free if no seizure with loss of body position was detected during the entire experimental period.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, способен увеличивать выживаемость мыши, гетерозиготной по SCN1A, например, линии мышей Scn1atm1kea. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF способен увеличивать выживаемость гетерозиготных мышей SCN1A при P100 по меньшей мере в 1,2 раза, 1,3 раза, 1,4 раза, 1,5 раз, 1,6 раз, 1,7 раз, 1,8 раз, 1,9 раз, 2,0 раза или более, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100% или более, как по сравнению с контролем (например, обработанным PBS или обработанным вектором AAV, содержащим последовательность, кодирующую eGFP). Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF способен увеличивать выживаемость гетерозиготных мышей SCN1A при P100, так что по меньшей мере 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% мышей, задействованных в анализе, все еще живы при P100. Иллюстративный анализ выживаемости описан в настоящем документе в примере 7. Вкратце, пометам детенышей, полученным от самцов мышей Scn1a +/-, скрещенных с самками мышей C57Bl/6J, может быть введен вектор AAV9 посредством двустороннего ICV в точке P1. Мышам можно вводить дозу ~1,0E10-5,0E12 копий геномов/мышь. Определяют количество мышей, доживших до P100.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A is capable of increasing the survival of a mouse heterozygous for SCN1A, for example, the Scn1a tm1kea mouse strain. In certain embodiments, an eTF disclosed herein is capable of increasing survival of heterozygous SCN1A mice at P100 by at least 1.2-fold, 1.3-fold, 1.4-fold, 1.5-fold, 1.6-fold, 1.7-fold , 1.8 times, 1.9 times, 2.0 times or more, or by at least 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100% or more, as compared to a control (eg, treated with PBS or treated with an AAV vector containing an eGFP coding sequence). In certain embodiments, an eTF disclosed herein is capable of increasing the survival of SCN1A heterozygous mice at P100 such that at least 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% of mice in the assay are still alive at P100. An exemplary survival assay is described herein in Example 7. Briefly, litters of pups generated from male Scn1a +/- mice crossed with female C57Bl/6J mice can be administered the AAV9 vector via bilateral ICV at P1. Mice can be dosed with ~1.0E10-5.0E12 genome copies/mouse. The number of mice surviving to P100 is determined.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, может содержать DBD из белка типа цинковые пальцы, полученного из белка типа цинковые пальцы, или нуклеаза представляет собой инактивированный белок типа цинковые пальцы. Цинковый палец представляет собой небольшой структурный мотив белка, который характеризуется координацией одного или нескольких ионов цинка (Zn2+) для стабилизации складки. Домены типа цинковые пальцы (Znf) представляют собой относительно небольшие белковые мотивы, которые содержат несколько пальцевидных выступов, которые создают тандемные контакты с целевым участком ДНК. Модульная природа мотива цинкового пальца позволяет связывать большое количество комбинаций последовательностей ДНК с высокой степенью аффинности и специфичности, и поэтомуIn certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A may comprise a DBD of a zinc finger protein derived from a zinc finger protein, or the nuclease is an inactivated zinc finger protein. The zinc finger is a small protein structural motif that is characterized by the coordination of one or more zinc ions (Zn 2+ ) to stabilize the fold. Zinc finger (Znf) domains are relatively small protein motifs that contain multiple finger-like protrusions that make tandem contacts with a target region of DNA. The modular nature of the zinc finger motif allows it to bind a large number of DNA sequence combinations with high affinity and specificity, and therefore
- 18 046157 идеально подходит для создания белка, который может быть нацелен на определенные последовательности ДНК и связывать их. Многие сконструированные наборы цинковых пальцев основаны на домене типа цинковые пальцы мышиного фактора транскрипции Zif268. Zif268 содержит три отдельных мотива цинковые пальцы, которые вместе связывают последовательность из 9 п.н. с высокой аффинностью. Было идентифицировано большое количество белков типа цинковые пальцы, и они были охарактеризованы на различные типы на основе структуры, которая дополнительно описана в настоящем документе. Любой такой белок типа цинковые пальцы применим в связи с описанными в настоящем документе DBD.- 18 046157 is ideal for creating a protein that can target and bind specific DNA sequences. Many engineered zinc finger arrays are based on the zinc finger domain of the mouse transcription factor Zif268. Zif268 contains three distinct zinc finger motifs that together bind a 9-bp sequence. with high affinity. A large number of zinc finger proteins have been identified and have been characterized into different types based on structure, which are further described herein. Any such zinc finger protein is useful in connection with the DBDs described herein.
Доступны различные способы конструирования белков типа цинковые пальцы. Например, описаны способы создания белков типа цинковые пальцы для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, Liu Q, et al., Design of polydactyl zinc-finger proteins for unique addressing within complex genomes, Proc Natl Acad Sci USA. 94 (11): 5525-30 (1997); Wright DA et al., Standardized reagents and protocols for engineering zinc finger nucleases by modular assembly, Nat Protoc. Nat Protoc. 2006; 1(3): 1637-52 и CA Gersbach and T Gaj, Synthetic Zinc Finger Proteins: The Advent of Targeted Gene Regulation and Genome Modification Technologies, Am Chem Soc 47: 2309-2318 (2014). Кроме того, общедоступны различные веб-инструменты для создания белков типа цинковые пальцы для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, программные инструменты для разработки нуклеаз типа цинковые пальцы и веб-сайт анализа сконструированных данных генома от OmicX, доступный в Интернете по адресу omictools.com/zfns-category; и вебсайт дизайна Zinc Finger Tools от Scripps, доступный в Интернете по адресу scripps.edu/barbas/zfdesign/zfdesignhome.php. Кроме того, доступны различные коммерчески доступные услуги по разработке белков типа цинковые пальцы для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, коммерчески доступные услуги или наборы, предлагаемые Creative Biolabs (в Интернете по адресу creative-biolabs.com/Design-and-Synthesis-of-ArtificialZinc-Finger-Proteins.html), Modular Assembly Kit Zinc Finger Consortium, доступный от Addgene (в Интернете по адресу addgene.org/kits/zfc-modular-assembly/), или the CompoZr Custom ZFN Service от Sigma Aldrich (в Интернете по адресу sigmaaldrich.com/life-science/zinc-finger-nuclease-technology/customzfn.html).Various methods are available to construct zinc finger proteins. For example, methods for designing zinc finger proteins to bind to a target DNA sequence of interest have been described, see, for example, Liu Q, et al., Design of polydactyl zinc-finger proteins for uniquely addressing within complex genomes, Proc Natl Acad Sci USA. 94 (11): 5525-30 (1997); Wright D. A. et al., Standardized reagents and protocols for engineering zinc finger nucleases by modular assembly, Nat Protoc. Nat Protoc. 2006; 1(3): 1637-52 and C. A. Gersbach and T Gaj, Synthetic Zinc Finger Proteins: The Advent of Targeted Gene Regulation and Genome Modification Technologies, Am Chem Soc 47: 2309-2318 (2014). In addition, various web-based tools for designing zinc finger proteins to bind to a target DNA sequence of interest are publicly available, see, for example, software tools for designing zinc finger nucleases and OmicX's engineered genome data analysis website, available online at omictools.com/zfns-category; and Scripps' Zinc Finger Tools design website, available online at scripps.edu/barbas/zfdesign/zfdesignhome.php. In addition, various commercially available services are available to design zinc finger proteins to bind to a target DNA sequence of interest, see for example the commercially available services or kits offered by Creative Biolabs (online at creative-biolabs.com/Design-and -Synthesis-of-ArtificialZinc-Finger-Proteins.html), the Zinc Finger Consortium Modular Assembly Kit available from Addgene (online at addgene.org/kits/zfc-modular-assembly/), or the CompoZr Custom ZFN Service from Sigma Aldrich (Online at sigmaaldrich.com/life-science/zinc-finger-nuclease-technology/customzfn.html).
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, содержат DBD, содержащий один или несколько цинковых пальцев, или получены из DBD белка типа цинковые пальцы. В некоторых случаях DBD содержит несколько цинковых пальцев, причем каждый цинковый палец связан с другим цинковым пальцем или другим доменом либо на своем N-конце, либо на C-конце, или на обоих через аминокислотный линкер. В некоторых случаях представленный в настоящем документе DBD содержит один или несколько цинковых пальцев из одного или нескольких типов цинковых пальцев, описанных в табл. 9. В некоторых случаях представленный в настоящем документе DBD содержит множество структур или мотивов цинковых пальцев или множество цинковых пальцев, имеющих одну или несколько из SEQ ID NO: 152-167 или любую их комбинацию. Согласно определенным вариантам осуществления DBD содержит X-[ZF-X]n и/или [X-ZF]n-X, причем ZF представляет собой домен типа цинковые пальцы, содержащий любой из мотивов, перечисленных в табл. 9 (например, любой из SEQ ID NO: 136-146), X представляет собой аминокислотный линкер, содержащий 1-50 аминокислот, и n представляет собой целое число от 1 до 15, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 или 15, причем каждый ZF может независимо иметь ту же последовательность или последовательность, отличную от других последовательностей ZF в DBD, и причем каждый линкер X может независимо иметь такую же последовательность или последовательность, отличную от других последовательностей X в DBD. Каждый цинковый палец может быть связан с другой последовательностью, цинковым пальцем или доменом на своем C-конце, N-конце или с обоими. В DBD каждый линкер X может быть идентичным по последовательности, длине и/или свойству (например, гибкости или заряду) или отличаться по последовательности, длине и/или свойству. В некоторых случаях два или более линкера могут быть идентичными, в то время как другие линкеры различны. Согласно иллюстративным вариантам осуществления линкер может быть получен или быть производным от последовательностей, соединяющих цинковые пальцы, обнаруженных в одном или нескольких встречающихся в природе белках типа цинковые пальцы, представленных в табл. 9. Согласно другим вариантам осуществления подходящие линкерные последовательности включают в себя, например, линкеры из 5 или более аминокислот в длину. См. также патент США № 6479626; 6903185 и 7153949 для иллюстративных линкерных последовательностей из 6 или более аминокислот в длину, каждая из которых полностью включена в настоящий документ. Предлагаемые в настоящем документе белки DBD могут включать в себя любую комбинацию подходящих линкеров между отдельными цинковыми пальцами белка. Описанные в настоящем документе белки DBD могут включать в себя любую комбинацию подходящих линкеров между отдельными цинковыми пальцами белка.In certain embodiments, eTFs provided herein that activate SCN1A contain a DBD containing one or more zinc fingers, or are derived from a zinc finger protein DBD. In some cases, the DBD contains multiple zinc fingers, with each zinc finger linked to another zinc finger or other domain at either its N-terminus, C-terminus, or both via an amino acid linker. In some cases, the DBD provided herein contains one or more zinc fingers from one or more of the types of zinc fingers described in table. 9. In some cases, the DBD provided herein contains a plurality of zinc finger structures or motifs or a plurality of zinc fingers having one or more of SEQ ID NOs: 152-167 or any combination thereof. In certain embodiments, the DBD comprises X-[ZF-X]n and/or [X-ZF]n-X, wherein the ZF is a zinc finger domain containing any of the motifs listed in Table 1. 9 (for example, any of SEQ ID NO: 136-146), X is an amino acid linker containing 1-50 amino acids, and n is an integer from 1 to 15, for example, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 or 15, wherein each ZF may independently have the same sequence or a different sequence from other ZF sequences in the DBD, and wherein each linker X may independently have the same sequence or sequence different from other X sequences in the DBD. Each zinc finger may be linked to another sequence, a zinc finger, or a domain at its C-terminus, N-terminus, or both. In a DBD, each linker X may be identical in sequence, length and/or property (eg, flexibility or charge) or different in sequence, length and/or property. In some cases, two or more linkers may be identical while other linkers are different. In exemplary embodiments, the linker may be derived from or derived from zinc finger linking sequences found in one or more of the naturally occurring zinc finger proteins presented in Table 1. 9. In other embodiments, suitable linker sequences include, for example, linkers of 5 or more amino acids in length. See also US Patent No. 6479626; 6903185 and 7153949 for exemplary linker sequences of 6 or more amino acids in length, each of which is incorporated herein in its entirety. DBD proteins provided herein may include any combination of suitable linkers between individual zinc fingers of the protein. The DBD proteins described herein may include any combination of suitable linkers between individual zinc fingers of the protein.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, содержат DBD, содержащий один или несколько классических цинковых пальцев. Классический цинковый палец C2H2 содержит два цистеина в одной цепи и два остатка гисIn certain embodiments, eTFs provided herein that activate SCN1A comprise a DBD containing one or more classical zinc fingers. The classical zinc finger C2H2 contains two cysteines in one chain and two his residues
- 19 046157 тидина в другой цепи, координируемых ионом цинка. Классический домен типа цинковый палец содержит два β-листа и одну α-спираль, причем а-спираль взаимодействует с молекулой ДНК и формирует основу связывания DBD с целевым сайтом и может называться спиралью распознавания. Согласно иллюстративным вариантам осуществления спираль распознавания цинковых пальцев содержит по меньшей мере одну аминокислотную замену в положении -1, 2, 3 или 6, тем самым изменяя специфичность связывания домена типа цинковые пальцы. Согласно другим вариантам осуществления представленный в настоящем документе DBD содержит один или несколько неклассических цинковых пальцев, например, C2-H2, C2-CH и C2-C2.- 19 046157 tidine in another chain, coordinated by a zinc ion. The classical zinc finger domain contains two β-sheets and one α-helix, with the α-helix interacting with the DNA molecule and forming the basis for DBD binding to the target site and can be called the recognition helix. In exemplary embodiments, the zinc finger recognition helix contains at least one amino acid substitution at position -1, 2, 3, or 6, thereby altering the binding specificity of the zinc finger domain. In other embodiments, the DBD provided herein contains one or more non-classical zinc fingers, such as C2-H2, C2-CH, and C2-C2.
Согласно другому варианту осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, содержащий мотив типа цинковые пальцы, имеющий следующую структуру: LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147), где n представляет собой целое число от 1 до 15, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 или 15, и каждый X независимо представляет собой последовательность распознавания (например, спираль распознавания), способную связываться с 3 п.н. целевой последовательности. Согласно иллюстративным вариантам осуществления n равно 3, 6 или 9. Согласно особенно предпочтительному варианту осуществления n равно 6. Согласно различным вариантам осуществления каждый X может независимо иметь одинаковую аминокислотную последовательность или отличную аминокислотную последовательность по сравнению с другими последовательностями X в DBD. Согласно иллюстративному варианту осуществления каждый X представляет собой последовательность, содержащую 7 аминокислот, которая была разработана для взаимодействия с 3 п.н. представляющего интерес целевого сайта связывания с использованием Zinger Finger Design Tool от Scripps, расположенного в Интернете по адресу scripps.edu/barbas/ zfdesign/zfdesignhome.php.In another embodiment, an eTF provided herein that activates SCN1A contains a DBD containing a zinc finger motif having the following structure: LEPGEKP - [YKCPECGKSFS X HQRTH TGEKP]n - YKCPECGKSFS X HQRTH - TGKKTS (SEQ ID NO: 147), where n is an integer from 1 to 15, such as 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15, and each X is independently a sequence recognition helix (e.g., recognition helix) capable of binding to 3 bp. target sequence. In exemplary embodiments, n is 3, 6, or 9. In a particularly preferred embodiment, n is 6. In various embodiments, each X may independently have the same amino acid sequence or a different amino acid sequence compared to other X sequences in the DBD. In an exemplary embodiment, each X is a sequence containing 7 amino acids that was designed to interact with 3 bp. target binding site of interest using Scripps' Zinger Finger Design Tool located on the Internet at scripps.edu/barbas/zfdesign/zfdesignhome.php.
Поскольку каждый цинковый палец в DBD распознает 3 п.н., количество цинковых пальцев, включенных в DBD, сообщает длину сайта связывания, распознаваемого DBD, например, DBD с 1 цинковым пальцем распознает целевой сайт связывания, имеющий 3 п.н., DBD с 2 цинковыми пальцами распознает целевой сайт связывания, имеющий 6 п.н., DBD с 3 цинковыми пальцами распознает целевой сайт связывания, имеющий 9 п.н., DBD с 4 цинковыми пальцами распознает целевой сайт связывания, имеющий 12 п.н., DBD с 5 цинковыми пальцами распознает целевой сайт связывания, имеющий 15 п.н., DBD с 6 цинковыми пальцами распознает целевой сайт связывания, имеющий 18 п.н., DBD с 9 цинковыми пальцами распознает целевой сайт связывания, имеющий 27 п.н., и т. д. В общем, DBD, которые распознают более длинные целевые сайты связывания, будут проявлять большую специфичность связывания (например, меньшее нецелевое связывание или неспецифическое связывание).Since each zinc finger in a DBD recognizes 3 bp, the number of zinc fingers included in the DBD informs the length of the binding site recognized by the DBD, e.g., a DBD with 1 zinc finger recognizes a target binding site that is 3 bp, a DBD with 2 zinc finger DBD recognizes a 6 bp target binding site, 3 zinc finger DBD recognizes a 9 bp target binding site, 4 zinc finger DBD recognizes a 12 bp target binding site, DBD 5 zinc finger DBD recognizes a 15 bp target binding site, 6 zinc finger DBD recognizes a 18 bp target binding site, 9 zinc finger DBD recognizes a 27 bp target binding site, etc. In general, DBDs that recognize longer target binding sites will exhibit greater binding specificity (e.g., less off-target binding or nonspecific binding).
Согласно другим вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, который происходит из встречающегося в природе белка типа цинковые пальцы путем выполнения одной или нескольких аминокислотных замен в одной или нескольких спиралях распознавания доменов типа цинковые пальцы для изменения специфичности связывания DBD (например, изменение целевого сайта, распознаваемого DBD). Представленный в настоящем документе DBD может быть получен из любого встречающегося в природе белка типа цинковые пальцы. Согласно различным вариантам осуществления такой DBD может быть получен из белка типа цинковые пальцы любого вида, например, мыши, крысы, человека и т.д. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленный в настоящем документе DBD получен из белка типа цинковые пальцы человека. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе DBD получен из встречающегося в природе белка, перечисленного в табл. 9. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленный в настоящем документе белок DBD получен из белка типа цинковые пальцы EGR человека, например, EGR1, EGR2, EGR3 или EGR4.In other embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A comprises a DBD that is derived from a naturally occurring zinc finger protein by making one or more amino acid substitutions in one or more zinc finger domain recognition helices to alter the binding specificity of the DBD ( for example, changing the target site recognized by the DBD). The DBD presented herein can be derived from any naturally occurring zinc finger protein. In various embodiments, such a DBD may be derived from any species of zinc finger protein, such as mouse, rat, human, etc. In an exemplary embodiment, the DBD provided herein is derived from human zinc finger protein. In certain embodiments, the DBD provided herein is derived from a naturally occurring protein listed in Table. 9. In an exemplary embodiment, the DBD protein provided herein is derived from a human EGR zinc finger protein, such as EGR1, EGR2, EGR3, or EGR4.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, который происходит из встречающегося в природе белка, путем модификации DBD для увеличения количества доменов типа цинковые пальцы в белке DBD путем повторения одного или нескольких цинковые пальцев в пределах DBD встречающегося в природе белка. Согласно определенным вариантам осуществления такие модификации включают в себя дупликацию, утроение, учетверение или дальнейшее умножение цинковых пальцев в пределах DBD встречающегося в природе белка. В некоторых случаях умножается один цинковый палец из DBD человеческого белка, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или более копий одного и того же мотива цинкового пальца повторяется в DBD eTF. В некоторых случаях набор цинковых пальцев из DBD встречающегося в природе белка умножается, например, набор из 3 цинковых пальцев из DBD встречающегося в природе белка дублируется, чтобы получить eTF, имеющий DBD с 6 цинковыми пальцами, троекратно повторяется для получения DBD eTF с 9 цинковыми пальцами или повторяется четыре раза для получения DBD eTF с 12 цинковыми пальцами и т.д. В некоторых случаях набор цинковых пальцев из DBD встречающегося в природе белка частично реплицируется для формирования DBD eTF, имеющего большее количество цинковых пальцев, например, DBD eTF содержит четыре цинковых пальца, причем цинковые пальцы представляют собой одну копию первого цинкового пальца, одну копию второго цинкового пальца и две копии третьего цинкового пальца из встречающегося в природе белка,In certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A contains a DBD that is derived from a naturally occurring protein by modifying the DBD to increase the number of zinc finger domains in the DBD protein by repeating one or more zinc fingers within the DBD found in nature of protein. In certain embodiments, such modifications include duplication, tripling, quadrupling, or further multiplication of zinc fingers within the DBD of a naturally occurring protein. In some cases, one zinc finger is multiplied from the DBD of a human protein, for example, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 or more copies of the same zinc finger motif are repeated in the DBD of eTF. In some cases, a set of zinc fingers from the DBD of a naturally occurring protein is multiplied, for example, a set of 3 zinc fingers from the DBD of a naturally occurring protein is duplicated to produce an eTF having a DBD with 6 zinc fingers, repeated three times to produce a DBD of an eTF with 9 zinc fingers or repeated four times to obtain DBD eTF with 12 zinc fingers, etc. In some cases, a set of zinc fingers from the DBD of a naturally occurring protein is partially replicated to form a DBD eTF having more zinc fingers, e.g., a DBD eTF contains four zinc fingers, with the zinc fingers being one copy of the first zinc finger, one copy of the second zinc finger and two copies of the third zinc finger from a naturally occurring protein,
- 20 046157 всего четыре цинковых пальца в DBD eTF. Затем такие DBD дополнительно модифицируют, производя одну или несколько аминокислотных замен в одной или нескольких спиралях распознавания доменов типа цинковые пальцы, чтобы изменить специфичность связывания DBD (например, изменяя целевой сайт, распознаваемый DBD). Согласно иллюстративным вариантам осуществления DBD получают из встречающегося в природе человеческого белка, такого как белок типа цинковые пальцы EGR человека, например, EGR1, EGR2, EGR3 или EGR4.- 20 046157 only four zinc fingers in DBD eTF. Such DBDs are then further modified by making one or more amino acid substitutions in one or more zinc finger domain recognition helices to change the binding specificity of the DBD (eg, changing the target site recognized by the DBD). In exemplary embodiments, the DBD is derived from a naturally occurring human protein, such as a human EGR zinc finger protein, such as EGR1, EGR2, EGR3, or EGR4.
EGR1 и EGR3 человека характеризуются трехпальцевым DBD типа цинковые пальцы C2H2. Общие правила связывания для цинковых пальцев предусматривают, что все три пальца взаимодействуют со своей родственной последовательностью ДНК с аналогичной геометрией, используя одни и те же аминокислоты в альфа-спирали каждого цинкового пальца для определения специфичности или распознавания последовательности целевого сайта связывания. Такие правила связывания позволяют изменять DBD EGR1 или EGR3 для создания DBD, который распознает желаемый целевой сайт связывания. В некоторых случаях спираль распознавания ДНК из 7 аминокислот в мотиве цинкового пальца EGR1 или EGR3 модифицируется в соответствии с опубликованными правилами разработки цинковых пальцев. Согласно определенным вариантам осуществления каждый цинковый палец в DBD с тремя пальцами EGR1 или EGR3 модифицируется, например, путем изменения последовательности одной или нескольких спиралей распознавания и/или путем увеличения количества цинковых пальцев в DBD. Согласно определенным вариантам осуществления EGR1 или EGR3 перепрограммированы для распознавания целевого сайта связывания по меньшей мере из 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 или более пар оснований в желаемом целевом сайте. Согласно определенным вариантам осуществления такой DBD, полученный из ERG1 или EGR3, содержит по меньшей мере 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или более цинковых пальцев. Согласно иллюстративному варианту осуществления один или несколько цинковых пальцев в DBD содержат по меньшей мере одну аминокислотную замену в положении -1, 2, 3 или 6 спирали распознавания.Human EGR1 and EGR3 are characterized by a three-fingered C2H2 zinc finger DBD. The general binding rules for zinc fingers stipulate that all three fingers interact with their cognate DNA sequence of similar geometry, using the same amino acids in the alpha helix of each zinc finger to determine the specificity or sequence recognition of the target binding site. Such binding rules allow the DBD of EGR1 or EGR3 to be modified to create a DBD that recognizes the desired target binding site. In some cases, the 7 amino acid DNA recognition helix in the EGR1 or EGR3 zinc finger motif is modified according to published zinc finger design rules. In certain embodiments, each zinc finger in a three-finger EGR1 or EGR3 DBD is modified, for example, by changing the sequence of one or more recognition helices and/or by increasing the number of zinc fingers in the DBD. In certain embodiments, EGR1 or EGR3 is reprogrammed to recognize a target binding site of at least 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36, or more base pairs in the desired target site. In certain embodiments, such a DBD derived from ERG1 or EGR3 contains at least 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 or more zinc fingers. In an exemplary embodiment, the one or more zinc fingers in the DBD contain at least one amino acid substitution at position -1, 2, 3, or 6 of the recognition helix.
Согласно различным вариантам осуществления eTF, который активирует SCN1A, содержащий DBD, полученный из EGR1 или EGR3, характеризуется специфичностью связывания ДНК, которая отличается от специфичности связывания встречающихся в природе EGR1 или EGR3, например, DBD распознает целевой сайт связывания, имеющий последовательность, отличную от последовательности сайта связывания, распознаваемой Лмодифицированными EGR1 или EGR3: (GCG(T/G)GGGCG) (SEQ ID NO: 182).In various embodiments, an eTF that activates SCN1A containing a DBD derived from EGR1 or EGR3 has a DNA binding specificity that is different from the binding specificity of naturally occurring EGR1 or EGR3, e.g., the DBD recognizes a target binding site having a sequence different from the sequence binding site recognized by L modified EGR1 or EGR3: (GCG(T/G)GGGCG) (SEQ ID NO: 182).
Согласно другим вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, который представляет собой комплекс gRNA/Cas. CRISPR (кластеризованные регулярные промежуточные короткие палиндромные повторы)/Cas9 представляет собой инструмент для редактирования генома, который позволяет направленно воздействовать на сайтспецифический геном. Система CRISPR/Cas типа II представляет собой прокариотическую систему адаптивного иммунного ответа, которая использует некодирующие РНК, чтобы направлять нуклеазу Cas9 для индукции сайт-специфического расщепления ДНК. Система CRISPR/Cas9 была использована для создания простого, программируемого с помощью РНК способа, обеспечивающего редактирование генома в клетках млекопитающих. Одна направляющая РНК (sgRNA) может быть создана для направления нуклеазы Cas9 в конкретное место генома, которое затем связывается комплексом gRNA/Cas9. gRNA может быть сконструирована для связывания с представляющим интерес целевым сайтом с использованием различных способов и инструментов. Например, способы создания gRNA для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК описаны в Aach, et al. Flexible algorithm for identifying specific Cas9 targets in genomes. BioRxiv, Cold Spring Harbor Labs, doi: http://dx.doi.org/10.1101/005074 (2014); Bae, et al. Cas-OFFinder: a fast and versatile algorithm that searches for potential off-target sites of Cas9 RNA-guided endonucleases. Bioinformatics. 30(10): 1473-1475 (2014); Doench, J. G. et al. Optimized sgRNA design to maximize activity and minimize off-target effects of CRISPRCas9. Nat Biotech 34, 184-191 (2016); Gratz, et al. Highly specific and efficient CRISPR/Cas9-catalyzed homology-directed repair in Drosophila. Genetics. 196(4):961-971 (2014); Heigwer, et al. E-CRISP: fast CRISPR target site identification. Nat Methods. 11(2):122-123 (2014); Ma, et al. A guide RNA sequence design platform for the CRISPR/Cas9 system for model organism genomes. Biomed Res Int. doi:http://doi.org/10.1155/2013/270805 (2013); Montague, et al. CHOPCHOP: a CRISPR/Cas9 and TALEN web tool for genome editing. Nucleic Acids Res. 42(W1):W401-W407 (2014); Liu, et al. CRISPR-ERA: a comprehensive design tool for CRISPR-mediated gene editing, repression and activation. Bioinformatics. 31(22):3676-3678 (2015); Ran, et al. In vivo genome editing using Staphylococcus aureus Cas9. Nature. 520(7546):186-191 (2015); Wu, et al. Target specificity of the CRISPR-Cas9 system. Quant Biol. 2(2):59-70 (2015); Xiao, et al. CasOT: a genome-wide Cas9/gRNA off-target searching tool. Bioinformatics. 30(8):11801182 (2014); Zetsche, et al. Cpf1 is a single RNA-guided endonuclease of a Class 2 CRISPR-Cas System. Cell. 163(3):759-771 (2105). Кроме того, общедоступны различные веб-инструменты для создания gRNA для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, инструмент разработки CRISPR gRNA, доступный от AUTM в Интернете по адресу atum.bio/eCommerce/cas9/input?multipleContacts=false; инструмент разработки CRISPRa/i gRNA, доступIn other embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A contains a DBD, which is a gRNA/Cas complex. CRISPR (Clustered Regular Intermediate Short Palindromic Repeats)/Cas9 is a genome editing tool that allows site-specific targeting of the genome. The CRISPR/Cas type II system is a prokaryotic adaptive immune response system that uses non-coding RNAs to direct the Cas9 nuclease to induce site-specific DNA cleavage. The CRISPR/Cas9 system has been used to create a simple, RNA-programmable method for genome editing in mammalian cells. A single guide RNA (sgRNA) can be designed to direct Cas9 nuclease to a specific location in the genome, which is then bound by the gRNA/Cas9 complex. gRNA can be designed to bind to a target site of interest using a variety of methods and tools. For example, methods for creating a gRNA to bind to a target DNA sequence of interest are described in Aach, et al. Flexible algorithm for identifying specific Cas9 targets in genomes. BioRxiv, Cold Spring Harbor Labs, doi: http://dx.doi.org/10.1101/005074 (2014); Bae, et al. Cas-OFFinder: a fast and versatile algorithm that searches for potential off-target sites of Cas9 RNA-guided endonucleases. Bioinformatics. 30(10): 1473-1475 (2014); Doench, J. G. et al. Optimized sgRNA design to maximize activity and minimize off-target effects of CRISPRCas9. Nat Biotech 34, 184-191 (2016); Gratz, et al. Highly specific and efficient CRISPR/Cas9-catalyzed homology-directed repair in Drosophila. Genetics. 196(4):961-971 (2014); Heigwer, et al. E-CRISP: fast CRISPR target site identification. Nat Methods. 11(2):122-123 (2014); Ma, et al. A guide RNA sequence design platform for the CRISPR/Cas9 system for model organism genomes. Biomed Res Int. doi:http://doi.org/10.1155/2013/270805 (2013); Montague, et al. CHOPCHOP: a CRISPR/Cas9 and TALEN web tool for genome editing. Nucleic Acids Res. 42(W1):W401-W407 (2014); Liu, et al. CRISPR-ERA: a comprehensive design tool for CRISPR-mediated gene editing, repression and activation. Bioinformatics. 31(22):3676-3678 (2015); Ran, et al. In vivo genome editing using Staphylococcus aureus Cas9. Nature. 520(7546):186-191 (2015); Wu, et al. Target specificity of the CRISPR-Cas9 system. Quant Biol. 2(2):59-70 (2015); Xiao et al. CasOT: a genome-wide Cas9/gRNA off-target searching tool. Bioinformatics. 30(8):11801182 (2014); Zetsche, et al. Cpf1 is a single RNA-guided endonuclease of a Class 2 CRISPR-Cas System. Cell. 163(3):759–771 (2105). In addition, various web-based tools are publicly available to design gRNAs to bind to a target DNA sequence of interest, see for example the CRISPR gRNA design tool available from AUTM online at atum.bio/eCommerce/cas9/input?multipleContacts=false; CRISPRa/i gRNA design tool, access
- 21 046157 ный от Broad Institute в Интернете по адресу portals.broadinstitute.org/gpp/public/analysis-tools/sgrnadesign-crisprai; инструмент разработки E-CRISP, доступный в Немецком онкологическом исследовательском центре DKFZ, доступный в Интернете по адресу e-crisp.org/E-CRISP/; и инструмент Knockout Guide Design, доступный от Synthego в Интернете по адресу design.synthego.com/#/. Кроме того, доступны различные коммерчески доступные сервисы для создания gRNA для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, коммерчески доступные услуги, предлагаемые IDT (в Интернете по адресу idtdna.com/site/order/designtool/index/CRISPR_SEQUENCE), ThermoFisher (в Интернете по адресу thermofisher.com/order/custom-oligo/crispr) и GenScript (в Интернете по адресу genscript. com/gRNA-design-tool. html).- 21 046157 ny from the Broad Institute on the Internet at portals.broadinstitute.org/gpp/public/analysis-tools/sgrnadesign-crisprai; the E-CRISP development tool available from the German Cancer Research Center DKFZ, accessible online at e-crisp.org/E-CRISP/; and the Knockout Guide Design tool, available from Synthego online at design.synthego.com/#/. In addition, various commercially available services are available to design a gRNA to bind to a target DNA sequence of interest, see for example the commercially available services offered by IDT (online at idtdna.com/site/order/designtool/index/CRISPR_SEQUENCE). ThermoFisher (online at thermofisher.com/order/custom-oligo/crispr) and GenScript (online at genscript.com/gRNA-design-tool.html).
Согласно иллюстративным вариантам осуществления DBD, который представляет собой комплекс gRNA/Cas, содержит дезактивированный нуклеазой белок Cas или dCas, такой как, например, dCas9, такой как дезактивированный нуклеазой Staphylococcus aureus (dSaCas9) или дезактивированный нуклеазой Streptococcus pyogenes Cas9 (dSpCas9). gRNA представлена в виде последовательности, содержащей нацеливающую область, которая нацеливает комплекс gRNA/Cas на желаемый целевой сайт, и каркасную область, которая облегчает взаимодействие с белком Cas. Любой подходящий каркас gRNA может использоваться в связи с представленными в настоящем документе gRNA. Согласно иллюстративному варианту осуществления gRNA представляет собой одиночную gRNA или sgRNA и содержит следующую каркасную последовательность: 5'-GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTAAAACAAGGCA AAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGA-3' (SEQ ID NO: 183). Нацеливающая область направляющей РНК присоединяется к 5'-концу каркасной последовательности с образованием полной sgRNA. Согласно определенным вариантам осуществления gRNA и белок dCas могут экспрессироваться из одной и той же кассеты экспрессии. Согласно определенным вариантам осуществления промотор U6 используется для экспрессии gRNA. Согласно другим вариантам осуществления gRNA может быть экспрессирована в клетке, которая была сконструирована для стабильной экспрессии белка dCas-TAD, например, либо путем стабильной интеграции dCas в геном, либо на плазмиде, которая стабильно поддерживается вне хромосом.In exemplary embodiments, a DBD that is a gRNA/Cas complex comprises a nuclease-deactivated Cas or dCas protein, such as, for example, dCas9, such as Staphylococcus aureus nuclease-deactivated (dSaCas9) or Streptococcus pyogenes nuclease-deactivated Cas9 (dSpCas9). The gRNA is presented as a sequence containing a targeting region that targets the gRNA/Cas complex to the desired target site and a scaffold region that facilitates interaction with the Cas protein. Any suitable gRNA framework may be used in connection with the gRNAs provided herein. In an exemplary embodiment, the gRNA is a single gRNA or sgRNA and contains the following framework sequence: 5'-GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTAAAACAAGGCA AAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGA-3' (SEQ ID NO: 183). The targeting region of the guide RNA is added to the 5' end of the scaffold sequence to form the complete sgRNA. In certain embodiments, the gRNA and the dCas protein may be expressed from the same expression cassette. In certain embodiments, the U6 promoter is used for gRNA expression. In other embodiments, the gRNA can be expressed in a cell that has been engineered to stably express the dCas-TAD protein, for example, either by stably integrating dCas into the genome or on a plasmid that is stably maintained off chromosomes.
Согласно другим вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, может содержать DBD из TALEN, полученный из TALEN, или который представляет собой инактивированную нуклеазой TALEN. Подобные активатору транскрипции эффекторные нуклеазы (TALEN) представляют собой рестрикционные ферменты, которые содержат DBD и домен нуклеазы, которые могут быть сконструированы для разрезания определенных последовательностей ДНК. TALEN создаются путем конъюгирования эффекторного ДНК-связывающего домена TAL с доменом расщепления ДНК (например, нуклеазой). Эффекторы, подобные активатору транскрипции (TALE), могут быть сконструированы так, чтобы связываться с желаемой целевой последовательностью ДНК, тем самым направляя домен нуклеазы в определенное место.In other embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A may comprise a DBD from TALEN, derived from TALEN, or which is a nuclease-inactivated TALEN. Transcription activator-like effector nucleases (TALENs) are restriction enzymes that contain a DBD and a nuclease domain that can be engineered to cut specific DNA sequences. TALENs are created by conjugating a TAL effector DNA-binding domain to a DNA cleavage domain (e.g., nuclease). Transcription activator-like effectors (TALEs) can be designed to bind to a desired target DNA sequence, thereby targeting the nuclease domain to a specific location.
Эффекторы TAL представляют собой бактериальные белки из бактерий Xanthomonas. ДНКсвязывающий домен содержит повторяющуюся высококонсервативную последовательность из 33-34 аминокислот с расходящимися 12-ой и 13-ой аминокислотами. Эти два положения, называемые Repeat Variable Diresidue (RVD), сильно изменчивы и показывают сильную корреляцию со специфическим распознаванием нуклеотидов. Эта прямая взаимосвязь между аминокислотной последовательностью и распознаванием ДНК позволяет конструировать DBD, которые специфически нацелены на желаемую последовательность, путем выбора комбинации повторяющихся сегментов, содержащих соответствующие RVD.TAL effectors are bacterial proteins from Xanthomonas bacteria. The DNA binding domain contains a highly conserved repeat sequence of 33-34 amino acids with diverging amino acids 12 and 13. These two positions, called Repeat Variable Diresidue (RVD), are highly variable and show a strong correlation with specific nucleotide recognition. This direct relationship between amino acid sequence and DNA recognition allows the design of DBDs that specifically target the desired sequence by selecting a combination of repeat segments containing the corresponding RVDs.
Существуют разные способы разработки TALE. Например, способы разработки TALE для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК описаны в T. Cermak et al., Nucleic Acids Research. 39 (12):e82 (2011); F. Zhang F et al., Nature Biotechnology. 29 (2):149-53 (2011); R. Morbitzer et al., Nucleic Acids Research. 39 (13):5790-9 (2011); T. Li et al., Nucleic Acids Research. 39 (14):631525 (2011); R. Geissler et al., PLOS One. 6(5): e19509 (2011) и E. Weber et al., PLOS One. 6(5): e19722 (2011). Кроме того, общедоступны различные веб-инструменты для разработки TALE для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, E-Talen, доступный в Интернете по адресу e-talen.org/E-TALEN/TAL и инструмент Effector Nucleotide Targeter 2.0, доступный в Интернете по адресу tall-nt.cac.cornell.edu/node/add/single-tale. Кроме того, доступны различные коммерчески доступные сервисы для создания TALE для связывания с представляющей интерес целевой последовательностью ДНК, смотрите, например, коммерчески доступные услуги, предлагаемые OmicX (в Интернете по адресу omictools.com/), Addgene (в Интернете по адресу addgene.org/talen/guide/ или ThermoFisher (в Интернете: thermofisher.com/us/en/home/life-science/genome-editing/geneart-tals/tal-designtool.html). Кроме того, общедоступная программа (DNAWorks) может использоваться для создания олигонуклеотидов, подходящих для сборки TALE, смотрите, например, D. Hoover D Methods in Molecular Biology. 852: 215-23 (2012).There are different ways to develop TALE. For example, methods for designing a TALE to bind to a target DNA sequence of interest are described in T. Cermak et al., Nucleic Acids Research. 39 (12):e82 (2011); F. Zhang F et al., Nature Biotechnology. 29 (2):149-53 (2011); R. Morbitzer et al., Nucleic Acids Research. 39 (13):5790-9 (2011); T. Li et al., Nucleic Acids Research. 39 (14):631525 (2011); R. Geissler et al., PLOS One. 6(5): e19509 (2011) and E. Weber et al., PLOS One. 6(5): e19722 (2011). In addition, various web-based tools are publicly available for designing TALEs to bind to a target DNA sequence of interest, see for example E-Talen, available online at e-talen.org/E-TALEN/TAL and the Effector Nucleotide Targeter 2.0 tool. , available online at tall-nt.cac.cornell.edu/node/add/single-tale. In addition, various commercially available services are available for generating TALEs to bind to a target DNA sequence of interest, see for example commercially available services offered by OmicX (online at omictools.com/), Addgene (online at addgene.org /talen/guide/ or ThermoFisher (online: thermofisher.com/us/en/home/life-science/genome-editing/geneart-tals/tal-designtool.html) Alternatively, a publicly available program (DNAWorks) can be used for designing oligonucleotides suitable for TALE assembly, see, for example, D. Hoover D Methods in Molecular Biology.852:215-23 (2012).
Домены модуляции транскрипции.Transcription modulation domains.
Приведенные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, могут содержать любой подходящий домен, который способен рекрутировать один или несколько белковых факторов, которыеeTFs provided herein that activate SCN1A may contain any suitable domain that is capable of recruiting one or more protein factors that
- 22 046157 могут модулировать транскрипцию (например, РНК-полимеразу II, CBP/p300, CREB или KRAB) или уровень экспрессии гена от представляющего интерес гена, когда eTF связан с целевым сайтом через DBD (например, DBD с цинковыми пальцами, gRNA/Cas DBD или TALE DBD). Согласно определенным вариантам осуществления такой домен рекрутирует белковые факторы, которые увеличивают уровень транскрипции или экспрессии представляющего интерес гена, и представляет собой домен активации транскрипции (TAD). Согласно другим вариантам осуществления такой домен рекрутирует белковые факторы, которые снижают уровень транскрипции или экспрессии представляющего интерес гена, и представляет собой домен репрессора транскрипции (TRD). Согласно определенным вариантам осуществления домен модуляции транскрипции (TAD или TRD) может представлять собой синтетически сконструированный домен. Согласно другим вариантам осуществления домен модуляции транскрипции (TAD или TRD) может происходить из встречающегося в природе белка, например, фактора транскрипции, коактиватора транскрипции, корепрессора транскрипции или белка-сайленсера. Согласно различным вариантам осуществления домен модуляции транскрипции (TAD или TRD) может происходить из белка любого вида, например, мыши, крысы, обезьяны, вируса или человека.- 22 046157 can modulate transcription (eg, RNA polymerase II, CBP/p300, CREB or KRAB) or gene expression level from a gene of interest when the eTF is bound to a target site via a DBD (eg, zinc finger DBD, gRNA/Cas DBD or TALE DBD). In certain embodiments, such a domain recruits protein factors that increase the level of transcription or expression of a gene of interest, and is a transcription activation domain (TAD). In other embodiments, such a domain recruits protein factors that reduce the level of transcription or expression of a gene of interest, and is a transcriptional repressor domain (TRD). In certain embodiments, the transcription modulation domain (TAD or TRD) may be a synthetically engineered domain. In other embodiments, the transcription modulation domain (TAD or TRD) may be derived from a naturally occurring protein, such as a transcription factor, transcription coactivator, transcription corepressor, or silencer protein. In various embodiments, the transcription modulation domain (TAD or TRD) can be derived from any type of protein, such as mouse, rat, monkey, virus, or human.
Согласно одному иллюстративному варианту осуществления TAD, подходящий для применения в представленных в настоящем документе eTF, которые активируют SNC1A, происходит из вирусного белка. Иллюстративные TAD, полученные из вирусных белков, включают в себя, например, TAD-домен VP64 (SEQ ID NO: 133), VPR (SEQ ID NO: 132), VP16, VP128, p65, p300 или любой его функциональный фрагмент или вариант, или последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к ней.In one exemplary embodiment, a TAD suitable for use in eTFs provided herein that activate SNC1A is derived from a viral protein. Exemplary TADs derived from viral proteins include, for example, the TAD domain of VP64 (SEQ ID NO: 133), VPR (SEQ ID NO: 132), VP16, VP128, p65, p300, or any functional fragment or variant thereof, or a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% identity to it .
Согласно другому иллюстративному варианту осуществления TAD, подходящий для применения в представленных в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A, происходит из белка человека. Иллюстративные TAD, полученные из белков человека, включают в себя, например, TAD-домен взаимодействующего с CBP/p300 трансактиватора 2 (CITED2) (SEQ ID NO: 134), взаимодействующего с CBP/p300 трансактиватора 4 (CITED4) (SEQ ID NO: 135), EGR1 (SEQ ID NO: 176), CREB3 (SEQ ID NO: 224) или EGR3 (SEQ ID NO: 175), или любой их функциональный фрагмент или вариант, или последовательность, характеризующуюся идентичностью, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к ней.In another exemplary embodiment, a TAD suitable for use in eTFs provided herein that activate SCN1A is derived from a human protein. Exemplary TADs derived from human proteins include, for example, CBP/p300-interacting transactivator 2 (CITED2) TAD domain (SEQ ID NO: 134), CBP/p300-interacting transactivator 4 (CITED4) TAD (SEQ ID NO: 135), EGR1 (SEQ ID NO: 176), CREB3 (SEQ ID NO: 224) or EGR3 (SEQ ID NO: 175), or any functional fragment or variant thereof, or a sequence having at least 80% identity , 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to it.
Согласно определенным вариантам осуществления eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD типа цинковые пальцы, который конъюгирован с доменом активации транскрипции или TAD. Согласно различным вариантам осуществления DBD типа цинковые пальцы может быть конъюгирован с TAD из вирусного белка, такого как VP64 или VPR, или с TAD из человеческого белка, такого как CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно определенным вариантам осуществления DBD типа цинковые пальцы, полученный из человеческого белка, например, EGR1 или EGR3, конъюгирован с TAD, полученным из человеческого белка, например, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно определенным вариантам осуществления DBD типа цинковые пальцы, полученный из человеческого белка, например, EGR1 или EGR3, конъюгирован с VP64 или VPR TAD. Согласно определенным вариантам осуществления синтетический DBD типа цинковые пальцы или DBD типа цинковые пальцы, характеризующийся идентичностью последовательности, составляющей менее чем 75%, по отношению к человеческому белку, например, EGR1 или EGR3, конъюгирован с TAD, полученным из человеческого белка, например, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно определенным вариантам осуществления синтетический DBD типа цинковые пальцы или DBD типа цинковые пальцы, характеризующийся идентичностью последовательности, составляющей менее чем 75%, по отношению к человеческому белку, например, EGR1 или EGR3, конъюгирован с VP64 или VPR TAD.In certain embodiments, the eTF that activates SCN1A contains a zinc finger DBD that is conjugated to a transcription activation domain or TAD. In various embodiments, the zinc finger DBD may be conjugated to a TAD from a viral protein, such as VP64 or VPR, or to a TAD from a human protein, such as CITED2, CITED4, or CREB3. In certain embodiments, a zinc finger DBD derived from a human protein, such as EGR1 or EGR3, is conjugated to a TAD derived from a human protein, such as CITED2, CITED4, or CREB3. In certain embodiments, a zinc finger DBD derived from a human protein, such as EGR1 or EGR3, is conjugated to a VP64 or VPR TAD. In certain embodiments, a synthetic zinc finger DBD or zinc finger DBD having less than 75% sequence identity to a human protein, e.g., EGR1 or EGR3, is conjugated to a TAD derived from a human protein, e.g., CITED2, CITED4 or CREB3. In certain embodiments, a synthetic zinc finger DBD or zinc finger DBD having less than 75% sequence identity to a human protein, such as EGR1 or EGR3, is conjugated to a VP64 or VPR TAD.
Согласно определенным вариантам осуществления белок dCas конъюгирован с TAD. Согласно различным вариантам осуществления dCas9 может быть конъюгирован с TAD из вирусного белка, такого как VP64 или VPR, или с TAD из человеческого белка, такого как CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно иллюстративным вариантам осуществления dCas9 конъюгирован с VP64 или VPR TAD.In certain embodiments, the dCas protein is conjugated to a TAD. In various embodiments, dCas9 may be conjugated to a TAD from a viral protein, such as VP64 or VPR, or to a TAD from a human protein, such as CITED2, CITED4, or CREB3. In exemplary embodiments, dCas9 is conjugated to a VP64 or VPR TAD.
Согласно определенным вариантам осуществления белок TALE конъюгирован с TAD. Согласно различным вариантам осуществления TALE может быть конъюгирован с TAD из вирусного белка, такого как VP64 или VPR, или с TAD из человеческого белка, такого как CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно иллюстративным вариантам осуществления TALE конъюгирован с VP64 или VPR TAD.In certain embodiments, the TALE protein is conjugated to a TAD. In various embodiments, the TALE may be conjugated to a TAD from a viral protein, such as VP64 or VPR, or to a TAD from a human protein, such as CITED2, CITED4, or CREB3. In exemplary embodiments, TALE is conjugated to VP64 or VPR TAD.
eTF, которые активируют SCN1A и высокогомологичны человеческим белкам.eTFs that activate SCN1A and are highly homologous to human proteins.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, характеризуется высоким процентом идентичности по отношению к одному или нескольким белкам человека (как дополнительно описано ниже). Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, имеющим более низкий общий процент идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно изIn certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A has a high percentage of identity to one or more human proteins (as further described below). In certain embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be achieved by
- 23 046157 мерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF могут содержать DBD, полученный из EGR1 или EGR3 человека, и TAD, полученный из EGR1, EGR3, CITED2, CITED4 или CREB3 человека. Такие eTF практически не обладают иммуногенностью при введении субъекту или обладают пониженной иммуногенностью по сравнению с eTF, характеризующимися более низким процентом идентичности по отношению к последовательностям белков человека.- 23 046157 measure using elispot assay, immunoassay or in silico method. In certain embodiments, such eTFs may comprise a DBD derived from human EGR1 or EGR3 and a TAD derived from human EGR1, EGR3, CITED2, CITED4 or CREB3. Such eTFs have little or no immunogenicity when administered to a subject compared to eTFs that have a lower percentage of identity to human protein sequences.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SNC1A, характеризуется идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Когда представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD и TAD, происходящие из одного и того же белка, процент идентичности с человеческим белком может быть определен путем расчета общего количества аминокислотных остатков в eTF, которые соответствуют человеческому белку, из которого он был получен (например, EGR1 или EGR3), разделенного на общее количество аминокислотных остатков в eTF. Когда eTF, обеспечивающий активную регуляцию SCN1A, содержит DBD из одного человеческого белка и TAD, полученный из другого человеческого белка, процент идентичности с человеком может быть определен путем отдельного расчета процента идентичности с человеческим для каждого домена и суммирования этих двух показателей вместе, например, (i) вычисление общего количества аминокислотных остатков в DBD, которые соответствуют человеческому белку, из которого он был получен (например, EGR1 или EGR3), деленного на общее количество аминокислотных остатков в eTF; (ii) вычисление общего количества аминокислотных остатков в TAD, которые соответствуют человеческому белку, из которого он был получен (например, CITED2, CITED4 или CREB3), деленного на общее количество аминокислотных остатков в eTF; и (iii) суммирование суммы (i) и (ii). Согласно такому варианту осуществления домены делятся следующим образом: первый домен проходит от N-конца eTF до начала кодирующей последовательности для второго домена, а второй домен проходит от начала кодирующей последовательности для второго домена через C-конец eTF (например, для eTF, имеющего конфигурацию NLS-DBD-линкер-NLS-TAD, первый домен будет NLS-DBD-линкер, а второй домен будет NLS-TAD). Когда представленный в настоящем документе eTF, который активирует SNC1A, содержит DBD из одного человеческого белка и двух TAD, полученных из одного или нескольких различных человеческих белков, процент идентичности с человеком может быть определен путем отдельного расчета процента идентичности с человеческим для каждого домена и суммирования всех троих вместе, например, (i) вычисление общего количества аминокислотных остатков в DBD, которые соответствуют белку человека, из которого он был получен (например, EGR1 или EGR3), деленного на общее количество аминокислотных остатков в eTF; (ii) вычисление общего количества аминокислотных остатков в первом TAD, которые соответствуют человеческому белку, из которого он был получен (например, CITED2, CITED4 или CREB3), деленного на общее количество аминокислотных остатков в eTF; (iii) вычисление общего количества аминокислотных остатков во втором TAD, которые соответствуют человеческому белку, из которого он был получен (например, CITED2, CITED4 или CREB3), деленного на общее количество аминокислотных остатков в eTF; и (iv) суммирование суммы (i), (ii) и (iii). Согласно такому варианту осуществления домены делятся следующим образом: первый домен проходит от N-конца eTF до начала кодирующей последовательности для второго домена, второй домен проходит от начала кодирующей последовательности для второго домена через начало кодирующей последовательности для третьего домена, а третий домен проходит от начала кодирующей последовательности для третьего домена через C-конец eTF (например, для eTF, имеющего конфигурацию NLSTAD1-линкер-NLS-DBD-линкер-NLS-TAD2, первый домен будет ^S-TADI^uh^p, второй домен будет NLS-DBD-линкер, а третий домен будет NLS-TAD2). Процент идентичности по отношению к одному или нескольким человеческим белкам, как описано в этом разделе, может быть определен с использованием выходного процента идентичности, полученного с помощью стандартного инструмента BLAST для белков, доступного в NCBI (например, инструмента выравнивания набора blastp, используя алгоритм blastp (белок -> белок) с параметрами по умолчанию) доступен в Интернете на веб-сайте NCBI по адресу blast. ncbi. nlm. nih. gov/.In certain embodiments, an eTF provided herein that activates SNC1A has a sequence identity of at least 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84 %, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, relative to one or more human proteins. When an eTF provided herein that activates SCN1A contains a DBD and a TAD derived from the same protein, the percentage identity with the human protein can be determined by calculating the total number of amino acid residues in the eTF that correspond to the human protein from which it was derived obtained (eg EGR1 or EGR3) divided by the total number of amino acid residues in the eTF. When the eTF conferring active regulation of SCN1A contains a DBD from one human protein and a TAD derived from another human protein, the percent human identity can be determined by separately calculating the percent human identity for each domain and summing the two together, e.g. i) calculating the total number of amino acid residues in the DBD that correspond to the human protein from which it was derived (eg, EGR1 or EGR3) divided by the total number of amino acid residues in the eTF; (ii) calculating the total number of amino acid residues in the TAD that correspond to the human protein from which it was derived (eg, CITED2, CITED4, or CREB3) divided by the total number of amino acid residues in the eTF; and (iii) summing the sum of (i) and (ii). In such an embodiment, the domains are divided as follows: a first domain extends from the N-terminus of the eTF to the beginning of the coding sequence for the second domain, and a second domain extends from the beginning of the coding sequence for the second domain through the C-terminus of the eTF (for example, for an eTF having an NLS configuration -DBD-linker-NLS-TAD, the first domain will be NLS-DBD-linker and the second domain will be NLS-TAD). When the eTF provided herein that activates SNC1A contains a DBD from one human protein and two TADs derived from one or more different human proteins, the percent identity to human can be determined by separately calculating the percent identity to human for each domain and summing all three together, for example, (i) calculating the total number of amino acid residues in the DBD that correspond to the human protein from which it was derived (eg, EGR1 or EGR3) divided by the total number of amino acid residues in the eTF; (ii) calculating the total number of amino acid residues in the first TAD that correspond to the human protein from which it was derived (eg, CITED2, CITED4, or CREB3) divided by the total number of amino acid residues in the eTF; (iii) calculating the total number of amino acid residues in the second TAD that correspond to the human protein from which it was derived (eg, CITED2, CITED4, or CREB3) divided by the total number of amino acid residues in the eTF; and (iv) summing the sum of (i), (ii) and (iii). In such an embodiment, the domains are divided as follows: a first domain extends from the N-terminus of the eTF to the start of the coding sequence for the second domain, a second domain extends from the start of the coding sequence for the second domain through the start of the coding sequence for the third domain, and a third domain extends from the start of the coding sequence sequences for the third domain through the C-terminus of the eTF (for example, for an eTF having the configuration NLSTAD1-linker-NLS-DBD-linker-NLS-TAD2, the first domain would be ^S-TADI^uh^p, the second domain would be NLS-DBD- linker, and the third domain will be NLS-TAD2). Percent identity to one or more human proteins, as described in this section, can be determined using the percent identity output obtained from the standard protein BLAST tool available from NCBI (e.g., the blastp set alignment tool using the blastp algorithm ( protein -> protein) with default parameters) is available online at the NCBI website at blast. ncbi. nlm. nih. gov/.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, имеет преимущество в том, что вызывает слабый, минимальный или нулевой неблагоприятный иммунный ответ у человека из-за высокой степени идентичности последовательностей с природными белками человека. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, вызывает пониженную иммуногенность, например, снижение иммуногенности по меньшей мере в 0,5, 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50 или более раз по сравнению с иммуногенностью, наблюдаемой с eTF, имеющим более низкий процент идентичности по отношению к одному или нескольким белкам человека, например, eTF, характеризующимся идентичностью последовательности, составляющей менее чем 50%, 55%, 65% или 70%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. В некоторых случаях снижение иммуногенности можно измерить с помощью анализа elispot, иммуноанализа или способа inIn certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A has the advantage of eliciting little, minimal, or no adverse immune response in humans due to high sequence identity to naturally occurring human proteins. In certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A causes decreased immunogenicity, e.g., a decrease in immunogenicity of at least 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4. 4.5, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 or 50 times or more the immunogenicity observed with an eTF having a lower percentage identity to one or more human proteins, e.g. , an eTF having less than 50%, 55%, 65%, or 70% sequence identity to one or more human proteins. In some cases, reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in
- 24 046157 silico. Генная терапия, обладающая низкой или минимальной иммуногенностью, имеет несколько преимуществ, включая в себя улучшенную переносимость пациентом, уменьшенную дозу, необходимую для достижения терапевтического эффекта, пролонгированные терапевтические эффекты после одного введения, возможность вводить несколько раз или в нескольких дозах, если необходимо, устойчивую терапевтическую эффективность в течение более длительного периода времени на одно введение, повышенную безопасность и/или повышенную эффективность генной терапии.- 24 046157 silico. Gene therapy that is low or minimally immunogenic has several advantages, including improved patient tolerability, reduced dosage required to achieve therapeutic effect, prolonged therapeutic effects after a single administration, ability to be administered multiple times or in multiple doses if necessary, sustained therapeutic benefit. efficacy over a longer period of time per administration, increased safety and/or increased efficacy of gene therapy.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A и характеризуются высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включают в себя DBD и TAD, полученные из одного или нескольких встречающихся в природе белков человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF могут содержать DBD, полученный из любого встречающегося в природе белка человека, содержащего DBD. Согласно иллюстративным вариантам осуществления, представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуются высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включает в себя DBD, полученный из встречающегося в природе белка типа цинковые пальцы, такого как, например, любая из конструкций 5-27, 36-41 или 44-53, перечисленные в табл. 1. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуются высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включает в себя DBD, полученный из белка EGR человека, такого как EGR1, EGR2, EGR3 или EGR4. Согласно иллюстративным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуются высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включает в себя DBD, полученный из EGR1 или EGR3 человека. Согласно различным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуются высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включает в себя DBD, полученный из белка типа цинковые пальцы человека, в котором минимальные аминокислотные изменения (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 1-2, 1-3, 1-4, 1-5, 1-6, 1-7, 2-3, 2-4, 2-5, 2-6, 27, 3-4, 3-5, 36 или 3-7 аминокислотных замен) были сделаны в одном или нескольких доменах типа цинковые пальцы DBD, чтобы изменить специфичность связывания DBD для распознавания представляющего интерес целевого сайта связывания. Такие модификации последовательности предпочтительно выполняются в спиралях распознавания доменов типа цинковые пальцы DBD, в то время как остальная часть DBD или белка типа цинковые пальцы человека (включая в себя TAD) остается немодифицированной, чтобы сохранить как можно больше идентичности последовательности с природным человеческим белок по возможности.In certain embodiments, eTFs provided herein that activate SCN1A and have a high percentage of sequence identity to one or more human proteins include DBDs and TADs derived from one or more naturally occurring human proteins. In certain embodiments, such eTFs may comprise a DBD derived from any naturally occurring human protein containing a DBD. In illustrative embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins includes a DBD derived from a naturally occurring zinc finger protein, such as, for example, any from designs 5-27, 36-41 or 44-53, listed in table. 1. In certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins includes a DBD derived from a human EGR protein, such as EGR1, EGR2, EGR3, or EGR4 . In illustrative embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins includes a DBD derived from human EGR1 or EGR3. In various embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins includes a DBD derived from a human zinc finger protein in which there are minimal amino acid changes (e.g., 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 1-2, 1-3, 1-4, 1-5, 1-6, 1-7, 2-3, 2-4, 2-5, 2 -6, 27, 3-4, 3-5, 36, or 3-7 amino acid substitutions) were made in one or more zinc finger domains of the DBD to alter the binding specificity of the DBD to recognize the target binding site of interest. Such sequence modifications are preferably made in the recognition helices of the DBD zinc finger domains, while the rest of the DBD or human zinc finger protein (including the TADs) remains unmodified to maintain as much sequence identity with the native human protein as possible.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе eTF, которые активируют SCN1A и характеризуются высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, содержат один или несколько доменов модуляции транскрипции (например, TAD), полученных из человеческого белка, конъюгированного с DBD, полученным из белка человека. Согласно различным вариантам осуществления домен модуляции транскрипции может происходить из любого встречающегося в природе человеческого белка, имеющего домен, способный рекрутировать один или несколько белковых факторов, которые могут модулировать транскрипцию (например, РНК-полимераза II, коактиваторный белок или ко-репрессорный белок) или уровень экспрессии гена из представляющего интерес гена, когда eTF связывается с целевым сайтом через DBD. Согласно иллюстративным вариантам осуществления TAD получен из белка EGR человека, такого как, например, EGR1, EGR2, EGR3 или EGR4 человека, или из указанного белка человека, такого как, например, белок CITED2 или CITED4 человека. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуется высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включает в себя TAD из белка EGR1 или EGR3 человека. Согласно другому иллюстративному варианту осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуется высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, включает в себя TAD из белка CITED2 или CITED4 человека.In certain embodiments, eTFs provided herein that activate SCN1A and have a high percentage of sequence identity to one or more human proteins contain one or more transcriptional modulation domains (e.g., TADs) derived from a human protein conjugated to a DBD, derived from human protein. In various embodiments, the transcription modulation domain may be derived from any naturally occurring human protein having a domain capable of recruiting one or more protein factors that can modulate transcription (e.g., RNA polymerase II, coactivator protein, or co-repressor protein) or level gene expression from the gene of interest when the eTF binds to the target site through the DBD. In exemplary embodiments, the TAD is derived from a human EGR protein, such as, for example, human EGR1, EGR2, EGR3, or EGR4, or from a human protein, such as, for example, human CITED2 or CITED4 protein. In an exemplary embodiment, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins includes a TAD from a human EGR1 or EGR3 protein. In another exemplary embodiment, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins includes a TAD from a human CITED2 or CITED4 protein.
Согласно одному варианту осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуется высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, может содержать DBD человека (hDBD) и TAD человека (hTAD) (например, hTAD-hDBD или hDBD-hTAD), причем hDBD и hTAD могут происходить из одного и того же человеческого белка или из разных человеческих белков. Согласно другому варианту осуществления представленный в настоящем документе eTF, характеризующийся высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, может содержать hDBD и два hTAD, причем hDBD и hTAD происходят из одного и того же человеческого белка, hDBD происходит из первого человеческого белка и оба hTAD происходят из второго человеческого белка, hDBD и один hTAD происходят из первого человеческого белка, а второй hTAD происходит изIn one embodiment, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins may comprise a human DBD (hDBD) and a human TAD (hTAD) (e.g., hTAD-hDBD or hDBD- hTAD), and hDBD and hTAD can be derived from the same human protein or from different human proteins. In another embodiment, an eTF provided herein having a high percentage of sequence identity to one or more human proteins may comprise an hDBD and two hTADs, wherein the hDBD and hTAD are derived from the same human protein, the hDBD being derived from the first human protein and both hTADs are derived from a second human protein, hDBD and one hTAD are derived from the first human protein, and the second hTAD is derived from
- 25 046157 второго человеческого белка, или hDBD происходит из первого человеческого белка, один hTAD происходит из второго человеческого белка, а второй hTAD происходит из третьего человеческого белка (например, hTAD1-hDBD-hTAD1, hTAD1-hDBD-hTAD2, hTAD1-hTAD1-hDBD, hTAD1-hTAD2-hDBD, hDBD-hTAD1-hTAD1 или hDBD-hTAD1-hTAD2).- 25 046157 a second human protein, or hDBD is derived from a first human protein, one hTAD is derived from a second human protein, and a second hTAD is derived from a third human protein (for example, hTAD1-hDBD-hTAD1, hTAD1-hDBD-hTAD2, hTAD1-hTAD1- hDBD, hTAD1-hTAD2-hDBD, hDBD-hTAD1-hTAD1 or hDBD-hTAD1-hTAD2).
Согласно иллюстративным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, характеризующийся высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, содержит любую из следующих конфигураций: (i) hDBD и hTAD, оба получены из EGR1 человека; (ii) hDBD и hTAD, оба получены из EGR3 человека; (iii) hDBD, полученный из EGR1 человека, и hTAD, полученный из CITED2 (например, hEGR1 DBD-hCITED2 TAD или hCITED2 TAD-hEGR1 DBD); (iv) hDBD, полученный из EGR1 человека, и hTAD, полученный из CITED4 человека (например, hEGR1 DBD-hCITED4 TAD или hCITED4 TAD-hEGR1 DBD); (v) hDBD, полученный из EGR3 человека, и hTAD, полученный из CITED2 (например, hEGR3 DBD-hCITED2 TAD или hCITED2 TAD-hEGR3 DBD); (vi) hDBD, полученный из EGR3 человека, и hTAD, полученный из CITED4 человека (например, hEGR3 DBD-hCITED4 TAD или hCITED4 TAD-hEGR3 DBD); (vii) hDBD, полученный из EGR1 человека, и два hTAD, полученные из CITED2 (например, hCITED2 TAD-hEGR1 DBDhCITED2 TAD, hCITED2 TAD-hCITED2 TAD-hEGR1 DBD или hEGR1 DBD-hCITED2 TAD-hCITED2 TAD); (viii) hDBD, полученный из EGR1 человека, и два hTAD, полученные из CITED4 человека (например, hCITED4 TAD-hEGR1 DBD-hCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hCITED4 TAD-hEGR1 DBD или hEGR1 DBD-hCITED4 TAD-hCITED4 TAD); (ix) hDBD, полученный из EGR3 человека, и два hTAD, полученные из CITED2 человека (например, hCITED2 TAD-hEGR3 DBD-hCITED2 TAD, hCITED2 TADhCITED2 TAD-hEGR3 DBD или hEGR3 DBD-hCITED2 TAD-hCITED2 TAD); (x) hDBD, полученный из EGR3 человека, и два hTAD, полученные из CITED4 человека (например, hCITED4 TAD-hEGR3 DBDhCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hCITED4 TAD-hEGR3 DBD или hEGR3 DBD-hCITED4 TAD-hCITED4 TAD); (xi) hDBD, полученный из EGR1 человека, первый hTAD, полученный из CITED2 человека, второй hTAD, полученный из CITED4 человека (например, hCITED2 TAD-hEGR1 DBD-hCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hEGR1 DBD-hCITED2 TAD, hCITED2 TAD-hCITED4 TAD-hEGR1 DBD, hCITED4 TADhCITED2 TAD-hEGR1 DBD, hEGR1 DBD-hCITED4 TAD-hCITED2 TAD или hEGR1 DBD-hCITED2 TADhCITED4 TAD); или (xii) hDBD, полученный из EGR3 человека, первый hTAD, полученный из CITED2 человека, второй hTAD, полученный из CITED4 человека (например, hCITED2 TAD-hEGR3 DBDhCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hEGR3 DBD-hCITED2 TAD, hCITED2 TAD-hCITED4 TAD-hEGR3 DBD, hCITED4 TAD-hCITED2 TAD-hEGR3 DBD, hEGR3 DBD-hCITED4 TAD-hCITED2 TAD или hEGR3 DBDhCITED2 TAD-hCITED4 TAD).In exemplary embodiments, an eTF provided herein having a high percentage of sequence identity to one or more human proteins comprises any of the following configurations: (i) hDBD and hTAD, both derived from human EGR1; (ii) hDBD and hTAD, both derived from human EGR3; (iii) hDBD derived from human EGR1 and hTAD derived from CITED2 (eg, hEGR1 DBD-hCITED2 TAD or hCITED2 TAD-hEGR1 DBD); (iv) hDBD derived from human EGR1 and hTAD derived from human CITED4 (eg, hEGR1 DBD-hCITED4 TAD or hCITED4 TAD-hEGR1 DBD); (v) hDBD derived from human EGR3 and hTAD derived from CITED2 (eg, hEGR3 DBD-hCITED2 TAD or hCITED2 TAD-hEGR3 DBD); (vi) hDBD derived from human EGR3 and hTAD derived from human CITED4 (eg, hEGR3 DBD-hCITED4 TAD or hCITED4 TAD-hEGR3 DBD); (vii) hDBD derived from human EGR1 and two hTADs derived from CITED2 (e.g., hCITED2 TAD-hEGR1 DBDhCITED2 TAD, hCITED2 TAD-hCITED2 TAD-hEGR1 DBD, or hEGR1 DBD-hCITED2 TAD-hCITED2 TAD); (viii) hDBD derived from human EGR1 and two hTADs derived from human CITED4 (eg, hCITED4 TAD-hEGR1 DBD-hCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hCITED4 TAD-hEGR1 DBD, or hEGR1 DBD-hCITED4 TAD-hCITED4 TAD); (ix) hDBD derived from human EGR3 and two hTADs derived from human CITED2 (eg, hCITED2 TAD-hEGR3 DBD-hCITED2 TAD, hCITED2 TADhCITED2 TAD-hEGR3 DBD, or hEGR3 DBD-hCITED2 TAD-hCITED2 TAD); (x) hDBD derived from human EGR3 and two hTADs derived from human CITED4 (eg, hCITED4 TAD-hEGR3 DBDhCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hCITED4 TAD-hEGR3 DBD, or hEGR3 DBD-hCITED4 TAD-hCITED4 TAD); (xi) hDBD derived from human EGR1, first hTAD derived from human CITED2, second hTAD derived from human CITED4 (e.g. hCITED2 TAD-hEGR1 DBD-hCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hEGR1 DBD-hCITED2 TAD, hCITED2 TAD-hCITED4 TAD-hEGR1 DBD, hCITED4 TADhCITED2 TAD-hEGR1 DBD, hEGR1 DBD-hCITED4 TAD-hCITED2 TAD or hEGR1 DBD-hCITED2 TADhCITED4 TAD); or (xii) an hDBD derived from human EGR3, a first hTAD derived from human CITED2, a second hTAD derived from human CITED4 (e.g., hCITED2 TAD-hEGR3 DBDhCITED4 TAD, hCITED4 TAD-hEGR3 DBD-hCITED2 TAD, hCITED2 TAD-hCITED4 TAD -hEGR3 DBD, hCITED4 TAD-hCITED2 TAD-hEGR3 DBD, hEGR3 DBD-hCITED4 TAD-hCITED2 TAD or hEGR3 DBDhCITED2 TAD-hCITED4 TAD).
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуется высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; (ii) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 92-98; (iii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii); или (iv) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i), (ii) или (iii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или больше по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или больше по сравнению с контролем. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, характеризующимся более низким общим процентом идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно измерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico.In certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins comprises any of the following: (i) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 103-124, 128 -131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223; (ii) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 92-98; (iii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, relative to any of the sequences (i) or (ii); or (iv) a functional fragment or variant of any of sequences (i), (ii) or (iii). In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold, 50-fold, or greater than control, or at least at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control. In exemplary embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98% or 99% relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in silico method.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A и характеризуется высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, может дополнительно содержать одну или несколько аминокислотных последовательностей или доменов в дополнение к доменам DBD и TAD, например, сигнал ядерной локализации или линкер и т.д. Кроме того, полинуклеотид, кодирующий представленный в настоящем документе eTF, характеризующийся высоким процентом идентичности последовательности по отношению к одному или нескольким белкам человека, может дополнительно содержать одну или несколько последовательностей нуклеиновых кислот в дополнение к кодирующей последовательности для eTF, например, промотор, энхансер, полиА-хвост и т.д. Согласно таким вариантам осуществления одна или несколько дополнительных аминокислотных последовательностей и/или послеIn certain embodiments, an eTF provided herein that activates SCN1A and has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins may further comprise one or more amino acid sequences or domains in addition to the DBD and TAD domains, e.g., a nuclear signal localization or linker, etc. In addition, a polynucleotide encoding an eTF provided herein that has a high percentage of sequence identity to one or more human proteins may further comprise one or more nucleic acid sequences in addition to the coding sequence for the eTF, e.g., a promoter, an enhancer, a polyA -tail, etc. In such embodiments, one or more additional amino acid sequences and/or following
- 26 046157 довательностей нуклеиновых кислот предпочтительно представляют собой человеческие последовательности, происходящие из человеческих последовательностей, или характеризуются идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% по отношению к белку человека.- 26 046157 nucleic acid sequences are preferably human sequences derived from human sequences, or have a sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% relative to human protein.
Иллюстративные eTF SCN1A.Exemplary SCN1A eTFs.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий один или несколько доменов типа цинковые пальцы, содержащих спираль распознавания, содержащую любую из SEQ ID NO: 152167. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий по меньшей мере один, два, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, одиннадцать или двенадцать доменов типа цинковые пальцы, причем каждый домен типа цинковые пальцы независимо содержит спираль распознавания, содержащую любую из SEQ ID NO: 152-167. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий шесть доменов типа цинковые пальцы, причем каждый домен типа цинковые пальцы независимо содержит спираль распознавания, содержащую любую из SEQ ID NO: 152-167. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий девять доменов типа цинковые пальцы, причем каждый домен типа цинковые пальцы независимо содержит спираль распознавания, содержащую любую из SEQ ID NO: 152-167. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF содержат ДНК-связывающий домен, содержащий SEQ ID NO: 147, где каждый X независимо выбран из любой из SEQ ID NO: 152-167, а n равно 6 или 9.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising one or more zinc finger domains containing a recognition helix comprising any of SEQ ID NO: 152167. In certain embodiments, disclosed herein The eTF that activates SCN1A contains a DNA binding domain containing at least one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven, or twelve zinc finger domains, each zinc finger domain independently contains a recognition helix containing any of SEQ ID NOs: 152-167. In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising six zinc finger domains, with each zinc finger domain independently comprising a recognition helix comprising any of SEQ ID NOs: 152-167. In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising nine zinc finger domains, with each zinc finger domain independently comprising a recognition helix comprising any of SEQ ID NOs: 152-167. In exemplary embodiments, such eTFs comprise a DNA binding domain comprising SEQ ID NO: 147, wherein each X is independently selected from any of SEQ ID NOs: 152-167, and n is 6 or 9.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий любое из следующего: (i) последовательность, содержащая RSDNLVR x REDNLHT x RSDELVR x QSGNLTE x TSGHLVR x QNSTLTE (SEQ ID NO: 148), где x может представлять собой линкер из 1-50 аминокислот, (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 148, или (ii) функциональный фрагмент из (i) или (ii). Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF дополнительно содержит один или несколько TAD, выбранных из VP64, VPR, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно одному варианту осуществления такой eTF содержит домен TAD VPR, конъюгированный с C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит CITED2 TAD, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит TAD CITED4, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит два TAD CITED4, конъюгированных с N-концом или C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF способен связываться с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 18, и повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более раз по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising any of the following: (i) a sequence comprising RSDNLVR x REDNLHT x RSDELVR x QSGNLTE x TSGHLVR x QNSTLTE (SEQ ID NO: 148), where x may be a linker of 1-50 amino acids, (ii) a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% sequence identity, according to with respect to SEQ ID NO: 148, or (ii) a functional fragment from (i) or (ii). In certain embodiments, such an eTF further comprises one or more TADs selected from VP64, VPR, CITED2, CITED4, or CREB3. In one embodiment, such an eTF comprises a VPR TAD domain conjugated to the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED2 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED4 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises two CITED4 TADs conjugated to the N-terminus or C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such eTF is capable of binding to the target site comprising SEQ ID NO: 18 and increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold , 50 times or more times compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150 %, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий любое из следующего: (i) последовательность, содержащая RSDNLVR x HRTTLTN x REDNLHT x TSHSLTE x QSSSLVR x REDNLHT (SEQ ID NO: 149), где x может представлять собой линкер из 1-50 аминокислот, (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 149, или (ii) функциональный фрагмент из (i) или (ii). Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF дополнительно содержит один или несколько TAD, выбранных из VP64, VPR, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно одному варианту осуществления такой eTF содержит домен TAD VPR, конъюгированный с C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит CITED2 TAD, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит TAD CITED4, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит два TAD CITED4, конъюгированных с N-концом или C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF способен связываться с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 30, и повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более раз по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising any of the following: (i) a sequence comprising RSDNLVR x HRTTLTN x REDNLHT x TSHSLTE x QSSSLVR x REDNLHT (SEQ ID NO: 149), where x may be a linker of 1-50 amino acids, (ii) a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% sequence identity, according to with respect to SEQ ID NO: 149, or (ii) a functional fragment from (i) or (ii). In certain embodiments, such an eTF further comprises one or more TADs selected from VP64, VPR, CITED2, CITED4, or CREB3. In one embodiment, such an eTF comprises a VPR TAD domain conjugated to the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED2 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED4 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises two CITED4 TADs conjugated to the N-terminus or C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such eTF is capable of binding to the target site comprising SEQ ID NO: 30 and increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold , 50 times or more times compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150 %, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий любое из следующего: (i) последовательность, содержащая RRDELNV x RSDHLTN x RSDDLVR x RSDNLVR x HRTTLTN x REDNLHT x TSHSLTE x QSSSLVR x REDNLHT (SEQ ID NO: 151), (ii) последовательность, характеризуюIn certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising any of the following: (i) a sequence comprising RRDELNV x RSDHLTN x RSDDLVR x RSDNLVR x HRTTLTN x REDNLHT x TSHSLTE x QSSSLVR x REDNLHT (SEQ ID NO: 151), (ii) sequence, characterize
- 27 046157 щаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 151, или (ii) функциональный фрагмент (i) или (ii). Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF дополнительно содержит один или несколько TAD, выбранных из VP64, VPR, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно одному варианту осуществления такой eTF содержит домен TAD VPR, конъюгированный с C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит CITED2 TAD, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит TAD CITED4, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит два TAD CITED4, конъюгированных с Nконцом или C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF способен связываться с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 32, и повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.- 27 046157 having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% sequence identity to SEQ ID NO: 151, or (ii) a functional fragment (i) or (ii). In certain embodiments, such an eTF further comprises one or more TADs selected from VP64, VPR, CITED2, CITED4, or CREB3. In one embodiment, such an eTF comprises a VPR TAD domain conjugated to the C terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED2 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED4 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises two CITED4 TADs conjugated to the N-terminus or C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such eTF is capable of binding to the target site comprising SEQ ID NO: 32 and increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold , 50 times or more compared to control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150% , 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит ДНК-связывающий домен, содержащий любое из следующего: (i) последовательность, содержащая DPGALVR x RSDNLVR x QSGDLRR x THLDLIR x TSGNLVR x RSDNLVR (SEQ ID NO: 150), (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 89%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 150, или (ii) функциональный фрагмент (i) или (ii). Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF дополнительно содержит один или несколько TAD, выбранных из VP64, VPR, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно одному варианту осуществления такой eTF содержит домен TAD VPR, конъюгированный с C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит CITED2 TAD, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит TAD CITED4, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит два TAD CITED4, конъюгированных с N-концом или C-концом DBD. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF способен связываться с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 31, и повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DNA binding domain comprising any of the following: (i) a sequence comprising DPGALVR x RSDNLVR x QSGDLRR x THLDLIR x TSGNLVR x RSDNLVR (SEQ ID NO: 150), (ii) a sequence having at least 89%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% sequence identity to SEQ ID NO: 150, or (ii) functional fragment (i) or (ii). In certain embodiments, such an eTF further comprises one or more TADs selected from VP64, VPR, CITED2, CITED4, or CREB3. In one embodiment, such an eTF comprises a VPR TAD domain conjugated to the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED2 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED4 TAD conjugated to the N-terminus, the C-terminus, or the N-terminus and the C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such an eTF comprises two CITED4 TADs conjugated to the N-terminus or C-terminus of a DBD. In certain embodiments, such eTF is capable of binding to the target site comprising SEQ ID NO: 31 and increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold , 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150% , 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 99-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; (ii) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 77-98; (iii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii); или (iv) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i), (ii) или (iii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 99-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221, or 223 ; (ii) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 77-98; (iii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, with respect to any of the sequences (i) or (ii); or (iv) a functional fragment or variant of any of sequences (i), (ii) or (iii). In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold, 50-fold or more relative to control or at least by 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500 % or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 99-102 или 125-127; (ii) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 77-91; (iii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii); или (iv) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i), (ii) или (iii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 99-102 or 125-127; (ii) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 77-91; (iii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, with respect to any of the sequences (i) or (ii); or (iv) a functional fragment or variant of any of sequences (i), (ii) or (iii). In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold, 50-fold or more compared to control, or at least at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; (ii) последовательность, содержащая любую из SEQ ID NO: 92-98; (iii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii); или (iv) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i), (ii) или (iii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCN1A по меньшейIn certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising any of SEQ ID NOs: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219 , 221 or 223; (ii) a sequence containing any of SEQ ID NO: 92-98; (iii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, relative to any of the sequences (i) or (ii); or (iv) a functional fragment or variant of any of sequences (i), (ii) or (iii). In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCN1A expression by at least
- 28 046157 мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, характеризующимся более низким общим процентом идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно измерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico.- 28 046157 at least 2 times, 5 times, 10 times, 15 times, 20 times, 25 times, 30 times, 40 times, 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40 %, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control. In exemplary embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in silico method.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая SEQ ID NO: 127; (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 127; или (iii) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF содержат SEQ ID NO: 77 и связываются с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 18. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCNIA по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising SEQ ID NO: 127; (ii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, relative to SEQ ID NO: 127; or (iii) a functional fragment or variant of any of sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such eTFs contain SEQ ID NO: 77 and bind to a target site containing SEQ ID NO: 18. In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCNIA expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold , 20 times, 25 times, 30 times, 40 times, 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80% , 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая SEQ ID NO: 128; (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% по отношению к SEQ ID NO: 128; или (iii) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF содержат SEQ ID NO: 92 и связываются с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 18. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCNIA по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, характеризующимся более низким общим процентом идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно измерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising SEQ ID NO: 128; (ii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99% relative to SEQ ID NO: 128; or (iii) a functional fragment or variant of any of sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such eTFs contain SEQ ID NO: 92 and bind to a target site containing SEQ ID NO: 18. In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCNIA expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold , 20 times, 25 times, 30 times, 40 times, 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80% , 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control. In exemplary embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in silico method.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая SEQ ID NO: 129; (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 129; или (iii) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF содержат SEQ ID NO: 92 и связываются с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 18. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCNIA по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, характеризующимся более низким общим процентом идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно измерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising SEQ ID NO: 129; (ii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, relative to SEQ ID NO: 129; or (iii) a functional fragment or variant of any of sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such eTFs contain SEQ ID NO: 92 and bind to a target site containing SEQ ID NO: 18. In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCNIA expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold , 20 times, 25 times, 30 times, 40 times, 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80% , 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control. In exemplary embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in silico method.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая SEQ ID NO: 130; (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 130; или (iii) функциональный фрагмент или вариант любой изIn certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising SEQ ID NO: 130; (ii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, relative to SEQ ID NO: 130; or (iii) a functional fragment or variant of any of
- 29 046157 последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF содержат SEQ ID NO: 92 и связываются с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 18. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCNIA по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, характеризующимся более низким общим процентом идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно измерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico.- 29 046157 sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such eTFs contain SEQ ID NO: 92 and bind to a target site containing SEQ ID NO: 18. In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCNIA expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold , 20 times, 25 times, 30 times, 40 times, 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80% , 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control. In exemplary embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in silico method.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит любое из следующего: (i) последовательность, содержащая SEQ ID NO: 131; (ii) последовательность, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к SEQ ID NO: 131; или (iii) функциональный фрагмент или вариант любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF содержат SEQ ID NO: 92 и связываются с целевым сайтом, содержащим SEQ ID NO: 18. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCNIA по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или более по сравнению с контролем, или по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% или 500% или более по сравнению с контролем. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF характеризуются общей идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно определенным вариантам осуществления такие eTF проявляют пониженную иммуногенность по сравнению с eTF, характеризующимся более низким общим процентом идентичности последовательностей по отношению к одному или нескольким белкам человека. Согласно различным вариантам осуществления снижение иммуногенности можно измерить с использованием анализа elispot, иммуноанализа или способа in silico.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises any of the following: (i) a sequence comprising SEQ ID NO: 131; (ii) a sequence having a sequence identity of at least 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98% or 99%, relative to SEQ ID NO: 131; or (iii) a functional fragment or variant of any of sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such eTFs contain SEQ ID NO: 92 and bind to a target site containing SEQ ID NO: 18. In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCNIA expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold , 20 times, 25 times, 30 times, 40 times, 50 times or more compared to the control, or at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80% , 90%, 100%, 125%, 150%, 200%, 250%, 300%, 400% or 500% or more compared to control. In exemplary embodiments, such eTFs have an overall sequence identity of at least 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94% , 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, relative to one or more human proteins. In certain embodiments, such eTFs exhibit reduced immunogenicity compared to eTFs having a lower overall percentage of sequence identity to one or more human proteins. In various embodiments, the reduction in immunogenicity can be measured using an elispot assay, an immunoassay, or an in silico method.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытый в настоящем документе eTF, который активирует SCN1A, содержит DBD, содержащий комплекс gRNA/Cas, причем gRNA содержит нацеливающую последовательность, содержащую любую из SEQ ID NO: 35-66. Целевая последовательность gRNA прикреплена к 5'-концу последовательности каркаса, содержащей последовательность: 5'GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTAAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACT TGTTGGCGAGA-3' (SEQ ID NO: 183). Согласно иллюстративным вариантам осуществления белок Cas представляет собой дезактивированный нуклеазой белок Cas9. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF дополнительно содержит один или несколько TAD, конъюгированных с белком Cas, причем TAD выбран из VP64, VPR, CITED2, CITED4 или CREB3. Согласно одному варианту осуществления такой eTF содержит домен VPR TAD, конъюгированный с C-концом белка Cas. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит CITED2 TAD, конъюгированный с Nконцом, C-концом или N-концом и C-концом белка Cas. Согласно определенным вариантам осуществления такой eTF содержит TAD CITED4, конъюгированный с N-концом, C-концом или N-концом и Cконцом белка Cas. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие eTF способны повышать экспрессию SCN1A по меньшей мере в 2 раза, 5 раз, 10 раз, 15 раз, 20 раз, 25 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз или больше по сравнению с контролем.In certain embodiments, an eTF disclosed herein that activates SCN1A comprises a DBD containing a gRNA/Cas complex, wherein the gRNA comprises a targeting sequence comprising any of SEQ ID NOs: 35-66. The gRNA target sequence is attached to the 5' end of the scaffold sequence containing the sequence: 5'GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTAAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACT TGTTGGCGAGA-3' (SEQ ID NO: 183). In exemplary embodiments, the Cas protein is a nuclease-deactivated Cas9 protein. In certain embodiments, such eTF further comprises one or more TADs conjugated to a Cas protein, wherein the TAD is selected from VP64, VPR, CITED2, CITED4, or CREB3. In one embodiment, such an eTF comprises a VPR TAD domain conjugated to the C terminus of the Cas protein. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED2 TAD conjugated to the N terminus, C terminus, or N terminus and C terminus of the Cas protein. In certain embodiments, such an eTF comprises a CITED4 TAD conjugated to the N-terminus, C-terminus, or N-terminus and C-terminus of a Cas protein. In exemplary embodiments, such eTFs are capable of increasing SCN1A expression by at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, 15-fold, 20-fold, 25-fold, 30-fold, 40-fold, 50-fold, or more compared to a control.
Полинуклеотиды.Polynucleotides.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, кодирующие любой из eTF, которые активируют SNC1A, раскрытые в настоящем документе. Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие последовательность, кодирующую eTF, которая активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе, и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, кодирующим eTF, который активирует SCN1A, и селективный в отношении PV регуляторный элемент.In another aspect, provided herein are polynucleotides encoding any of the eTFs that activate SNC1A disclosed herein. In another aspect, the present application provides polynucleotides comprising a PV-selective miRNA binding site. In certain embodiments, the present application provides polynucleotides comprising a PV-selective regulatory element operably linked to a transgene and a PV-selective microRNA binding site. In certain embodiments, the present application provides polynucleotides comprising a sequence encoding an eTF that activates SCN1A as disclosed herein and a PV-selective miRNA binding site. In certain embodiments, the present application provides a PV-selective regulatory element operably linked to a transgene encoding an eTF that activates SCN1A and a PV-selective regulatory element.
Полинуклеотиды, кодирующие eTF, которые активируют SCN1A.Polynucleotides encoding eTFs that activate SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид,In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide
- 30 046157 содержащий любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая eTF, который активирует SCN1A, содержащий любую из SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223, или их вариант или функциональный фрагмент; (ii) нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный фрагмент eTF, который активирует SCN1A, содержащий любую из SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; или (iii) нуклеиновая кислота, кодирующая eTF, который активирует SCN1A, характеризующийся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к eTF, который активирует SCN1A, содержащий любую из SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223, или их вариант или функциональный фрагмент.- 30 046157 containing any of the following: (i) a nucleic acid sequence encoding an eTF that activates SCN1A containing any of SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223, or their variant or functional fragment; (ii) a nucleic acid encoding a functional eTF fragment that activates SCN1A containing any of SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223; or (iii) a nucleic acid encoding an eTF that activates SCN1A having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91 %, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, relative to an eTF that activates SCN1A containing any of SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223, or a variant or functional fragment thereof.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, содержащий любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая DBD, содержащий любую из SEQ ID NO: 92-98, или ее вариант или функциональный фрагмент; (ii) нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный фрагмент DBD, содержащий любую из SEQ ID NO: 92-98; или (iii) нуклеиновая кислота, кодирующая DBD, характеризующийся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к DBD, содержащему любую из SEQ ID NO: 92-98, или ее вариант или функциональный фрагмент, причем DBD способен связываться с целевым сайтом, связанным любой из SEQ ID NO: 92-98.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence encoding a DBD containing any of SEQ ID NOs: 92-98, or a variant or functional fragment thereof; (ii) a nucleic acid encoding a functional DBD fragment containing any of SEQ ID NOs: 92-98; or (iii) a nucleic acid encoding a DBD having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92% , 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to a DBD containing any of SEQ ID NOs: 92-98, or a variant or functional fragment thereof, wherein the DBD is capable of contact the target site associated with any of SEQ ID NO: 92-98.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, который активирует эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая eTF, содержащий любую из SEQ ID NO: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; (ii) нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный фрагмент eTF, содержащий любую из SEQ ID NO: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; или (iii) нуклеиновая кислота, кодирующая eTF, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к eTF, содержащему любую из SEQ ID NO: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223, причем eTF способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF that activates endogenous SCN1A, wherein the polynucleotide comprises any of the following: (i) a nucleic acid sequence encoding an eTF comprising any of SEQ ID NOs: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223; (ii) a nucleic acid encoding a functional eTF fragment containing any of SEQ ID NOs: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223; or (iii) a nucleic acid encoding an eTF having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92% , 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to eTF containing any of SEQ ID NO: 103-124, 128-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223, with eTF being able to activate SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий DBD, который связывается с целевым сайтом генома, способным повышать регуляцию эндогенного SCN1A при связывании с помощью раскрытого в настоящем документе eTF, причем полинуклеотид содержит любой из следующих элементов: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая DBD, содержащий любую из SEQ ID NO: 77-98; (ii) нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный фрагмент DBD, содержащий любую из SEQ ID NO: 77-98; или (iii) нуклеиновая кислота, кодирующая eTF, характеризующийся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к DBD, содержащему любую из SEQ ID NO: 77-98, причем DBD способен связываться с целевым сайтом, связанным любой из SEQ ID NO: 77-98.In certain embodiments, provided herein is a polynucleotide encoding a DBD that binds to a genomic target site capable of upregulating endogenous SCN1A when bound by an eTF disclosed herein, wherein the polynucleotide comprises any of the following: (i) a nucleic acid sequence, encoding a DBD containing any of SEQ ID NO: 77-98; (ii) a nucleic acid encoding a functional DBD fragment containing any of SEQ ID NOs: 77-98; or (iii) a nucleic acid encoding an eTF having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92% , 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to a DBD containing any of SEQ ID NOs: 77-98, wherein the DBD is capable of binding to a target site bound by any from SEQ ID NO: 77-98.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий DBD, который связывается с целевым сайтом генома, способным активировать эндогенный SCN1A при связывании раскрытым в настоящем документе eTF, причем полинуклеотид содержит любой из следующих элементов: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая DBD, содержащий любую из SEQ ID NO: 148-151; (ii) нуклеиновая кислота, кодирующая функциональный фрагмент DBD, содержащий любую из SEQ ID NO: 148-151; или (iii) нуклеиновая кислота, кодирующая eTF, характеризующийся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к DBD, содержащему любую из SEQ ID NO: 148-151, причем DBD способен связываться с целевым сайтом, связанным любой из SEQ ID NO: 92-98.In certain embodiments, provided herein is a polynucleotide encoding a DBD that binds to a genomic target site capable of activating endogenous SCN1A upon binding by an eTF disclosed herein, wherein the polynucleotide comprises any of the following: (i) a nucleic acid sequence encoding the DBD, containing any of SEQ ID NO: 148-151; (ii) a nucleic acid encoding a functional DBD fragment containing any of SEQ ID NOs: 148-151; or (iii) a nucleic acid encoding an eTF having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92% , 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to a DBD containing any of SEQ ID NOs: 148-151, wherein the DBD is capable of binding to a target site bound by any from SEQ ID NO: 92-98.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая любую из SEQ ID NO: 70-76 или 184; (ii) нуклеиновая кислота, содержащая функциональный фрагмент любой из последовательностей (i); или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii), причем полинуклеотид кодирует eTF, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising any of SEQ ID NOs: 70-76 or 184; (ii) a nucleic acid containing a functional fragment of any of the sequences (i); or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of sequences (i) or (ii), wherein the polynucleotide encodes an eTF that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 70; (ii) нуклеиновая кислота, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 70; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношеIn certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 70; (ii) a nucleic acid containing a functional fragment of SEQ ID NO: 70; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, relative to
- 31 046157 нию к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 127, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.- 31 046157 connection to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 127, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 71; (ii) нуклеиновая кислота, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 71; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 127, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 71; (ii) a nucleic acid containing a functional fragment of SEQ ID NO: 71; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 127, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 72; (ii) нуклеиновая кислота, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 72; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 130, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 72; (ii) a nucleic acid containing a functional fragment of SEQ ID NO: 72; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 130, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 73; (ii) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 73; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 131, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 73; (ii) a nucleic acid sequence containing the functional fragment of SEQ ID NO: 73; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 131, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 74; (ii) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 74; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 127, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 74; (ii) a nucleic acid sequence containing the functional fragment of SEQ ID NO: 74; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 127, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 75; (ii) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 75; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 127, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 75; (ii) a nucleic acid sequence containing the functional fragment of SEQ ID NO: 75; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 127, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 76; (ii) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 76; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 106, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.In certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 76; (ii) a nucleic acid sequence containing the functional fragment of SEQ ID NO: 76; or (iii) a nucleic acid having a sequence identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 106, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен полинуклеотид, кодирующий eTF, способный регулировать эндогенный SCN1A, причем полинуклеотид содержит любое из следующего: (i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO: 184; (ii) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая функциональный фрагмент SEQ ID NO: 184; или (iii) нуклеиновая кислота, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньIn certain embodiments, the present application provides a polynucleotide encoding an eTF capable of regulating endogenous SCN1A, the polynucleotide comprising any of the following: (i) a nucleic acid sequence comprising SEQ ID NO: 184; (ii) a nucleic acid sequence containing the functional fragment of SEQ ID NO: 184; or (iii) a nucleic acid having sequence identity equal to or less than
- 32 046157 шей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более, по отношению к любой из последовательностей (i) или (ii). Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие полинуклеотиды кодируют eTF, содержащий SEQ ID NO: 106, или его функциональный фрагмент или вариант, который способен активировать SCN1A.- 32 046157 at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more, with respect to any of the sequences (i) or (ii). In exemplary embodiments, such polynucleotides encode an eTF comprising SEQ ID NO: 106, or a functional fragment or variant thereof, that is capable of activating SCN1A.
Полинуклеотиды, содержащие сайты связывания микроРНК для селективной экспрессии в PVсодержащих нейронах.Polynucleotides containing microRNA binding sites for selective expression in PV-containing neurons.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие сайты связывания микроРНК, которые приводят к селективной экспрессии представляющего интерес гена в парвальбумин-содержащих нейронах (PV). МикроРНК или миРНК представляют собой небольшие некодирующие РНК (~20 нуклеотидов), которые регулируют экспрессию генов посттранскрипционно путем гибридизации с комплементарными сайтами узнавания в молекуле мРНК и приводят к ингибированию экспрессии генов, способствуя деградации транскрипта мРНК или подавляя трансляцию белка, кодируемого мРНК. Предусмотренные в настоящем документе сайты связывания микроРНК ингибируют экспрессию представляющего интерес гена в возбуждающих нейронах, тем самым способствуя селективной экспрессии представляющего интерес гена в PV-содержащих нейронах (например, селективные к PV сайты связывания микроРНК). Согласно определенным вариантам осуществления возбуждающие нейроны представляют собой нейроны, которые экспрессируют один или несколько из STAC, Slc17a7, Car12, Syt17, ITPKA, Col6a1, CamKII, Sv2b, INHBA и/или DKK3. Согласно иллюстративному варианту осуществления возбуждающие нейроны представляют собой нейроны, экспрессирующие CamKII.In another aspect, the present application provides polynucleotides containing microRNA binding sites that lead to selective expression of a gene of interest in parvalbumin-containing neurons (PV). MicroRNAs or miRNAs are small non-coding RNAs (~20 nucleotides) that regulate gene expression post-transcriptionally by hybridizing to complementary recognition sites in the mRNA molecule and lead to inhibition of gene expression by promoting the degradation of the mRNA transcript or inhibiting the translation of the protein encoded by the mRNA. MicroRNA binding sites provided herein inhibit expression of a gene of interest in excitatory neurons, thereby promoting selective expression of the gene of interest in PV-containing neurons (eg, PV-selective miRNA binding sites). In certain embodiments, excitatory neurons are neurons that express one or more of STAC, Slc17a7, Car12, Syt17, ITPKA, Col6a1, CamKII, Sv2b, INHBA, and/or DKK3. In an exemplary embodiment, the excitatory neurons are CamKII-expressing neurons.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие один или несколько сайтов связывания микроРНК для одной или нескольких микроРНК, которые способствуют селективной экспрессии PV, например, способствуют деградации мРНК, содержащей сайт связывания микроРНК, в возбуждающих нейронах. Примеры микроРНК, которые способствуют селективной экспрессии PV, включают в себя, например, miR-128, miR-221 и miR-222. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более селективных в отношении PV сайтов связывания микроРНК. Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более сайтов связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более сайтов связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более сайтов связывания miR-222 (SEQ ID NO: 13). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 1 сайт связывания miR-128, по меньшей мере один сайт связывания miR-221 и по меньшей мере один сайт связывания miR-222. Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере один сайт связывания miR-128 и по меньшей мере один сайт связывания miR-222. Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере один сайт связывания miR-221 и по меньшей мере один сайт связывания miR-222. Согласно иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере один сайт связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере один сайт связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 2 сайта связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере 2 сайта связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 3 сайта связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере 3 сайта связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 4 сайта связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере 4 сайта связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11). Согласно одному варианту осуществления в настоящей заявке представлены полинуклеотиды, содержащие по меньшей мере 5 сайтов связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9) и по меньшей мере 5 сайтов связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11). Согласно таким вариантам осуществления сайты связывания могут быть расположены в любом порядке. Например, для конструкции, содержащей 2 сайта связывания miR-128 и 2 сайта связывания miR-221, сайты связывания могут быть расположены в любой из следующих конфигураций: miR-128 - miR-128 - miR-221 - miR221, miR-128 - miR-221 - miR-128 - miR-221, miR-128 - miR221 - miR221 - miR-128, miR-221 - miR128 - miR221 - miR128, miR-221 - miR128 - miR128 - miR221 или miR221 - miR221 - miR128 - miR128. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат последовательность, содержащую 4 сайта связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9), за которыми следуют четыре сайта связывания miR-221 (SEQ ID NO: 11), например, miR-128 - miR-128 - miR128 - miR-128 - miR221 - miR221 - miR-221 - miR221. Согласно другому иллюстративному варианту осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат последовательность, содержащую 1 последовательность miR-221 (SEQ ID NO: 11), 1 последовательность miR-222 (SEQ ID NO: 13) и 1 сайт связывания miR-128 (SEQ ID NO: 9), например, miRIn certain embodiments, the present application provides polynucleotides comprising one or more miRNA binding sites for one or more miRNAs that promote selective PV expression, for example, promoting the degradation of miRNA binding site-containing mRNA in excitatory neurons. Examples of miRNAs that promote selective PV expression include, for example, miR-128, miR-221 and miR-222. In certain embodiments, the present application provides polynucleotides containing at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more PV-selective miRNA binding sites. In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more miR-128 binding sites (SEQ ID NO: 9). In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more miR-221 binding sites (SEQ ID NO: 11). In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more miR-222 binding sites (SEQ ID NO: 13). In one embodiment, the present application provides polynucleotides comprising at least 1 miR-128 binding site, at least one miR-221 binding site, and at least one miR-222 binding site. In one embodiment, the present application provides polynucleotides comprising at least one miR-128 binding site and at least one miR-222 binding site. In one embodiment, the present application provides polynucleotides comprising at least one miR-221 binding site and at least one miR-222 binding site. In an exemplary embodiment, the present application provides polynucleotides comprising at least one miR-128 binding site (SEQ ID NO: 9) and at least one miR-221 binding site (SEQ ID NO: 11). In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 2 miR-128 binding sites (SEQ ID NO: 9) and at least 2 miR-221 binding sites (SEQ ID NO: 11). In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 3 miR-128 binding sites (SEQ ID NO: 9) and at least 3 miR-221 binding sites (SEQ ID NO: 11). In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 4 miR-128 binding sites (SEQ ID NO: 9) and at least 4 miR-221 binding sites (SEQ ID NO: 11). In one embodiment, the present application provides polynucleotides containing at least 5 miR-128 binding sites (SEQ ID NO: 9) and at least 5 miR-221 binding sites (SEQ ID NO: 11). In such embodiments, the binding sites may be arranged in any order. For example, for a construct containing 2 miR-128 binding sites and 2 miR-221 binding sites, the binding sites can be located in any of the following configurations: miR-128 - miR-128 - miR-221 - miR221, miR-128 - miR -221 - miR-128 - miR-221, miR-128 - miR221 - miR221 - miR-128, miR-221 - miR128 - miR221 - miR128, miR-221 - miR128 - miR128 - miR221 or miR221 - miR221 - miR128 - miR128 . In an exemplary embodiment, the polynucleotides provided herein comprise a sequence comprising 4 miR-128 binding sites (SEQ ID NO: 9) followed by four miR-221 binding sites (SEQ ID NO: 11), for example, miR-128 - miR-128 - miR128 - miR-128 - miR221 - miR221 - miR-221 - miR221. In another exemplary embodiment, the polynucleotides provided herein comprise a sequence comprising 1 miR-221 sequence (SEQ ID NO: 11), 1 miR-222 sequence (SEQ ID NO: 13), and 1 miR-128 binding site (SEQ ID NO : 9), for example miR
- 33 046157- 33 046157
221 - miR222 - miR128. Согласно другому иллюстративному варианту осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат последовательность, содержащую 2 последовательности miR-221 (SEQ ID NO: 11), 2 последовательности miR-222 (SEQ ID NO: 13) и 2 сайта связывания miR128 (SEQ ID NO: 9) расположены в следующем порядке: miR-221 - miR222 - miR128 - miR-221 - miR222 miR128.221 - miR222 - miR128. In another exemplary embodiment, the polynucleotides provided herein comprise a sequence comprising 2 miR-221 sequences (SEQ ID NO: 11), 2 miR-222 sequences (SEQ ID NO: 13), and 2 miR128 binding sites (SEQ ID NO: 9 ) are arranged in the following order: miR-221 - miR222 - miR128 - miR-221 - miR222 miR128.
В полинуклеотидах, содержащих более одного сайта связывания микроРНК, сайты связывания могут быть непосредственно примыкающими друг к другу в полинуклеотидной последовательности (например, без линкера или промежуточной последовательности между сайтами связывания) или могут быть отделены друг от друга по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более нуклеотидами или 1-20, 1-15, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3 или 1-2 нуклеотидами. Согласно иллюстративным вариантам осуществления сайты связывания микроРНК разделены приблизительно 5 нуклеотидами или 5 нуклеотидами. Согласно иллюстративным вариантам осуществления последовательности, разделяющие сайты связывания микроРНК (а также соединения, образованные между сайтами связывания микроРНК, или соединения, образованные между сайтами связывания микроРНК и последовательностями, разделяющими сайты связывания микроРНК), не комплементарны никаким другим микроРНК или любым другим нейрональным микроРНК.In polynucleotides containing more than one miRNA binding site, the binding sites may be immediately adjacent to each other in the polynucleotide sequence (e.g., without a linker or intervening sequence between the binding sites) or may be separated from each other by at least 1, 2, 3. 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or more nucleotides or 1-20, 1-15, 1-10, 1 -9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3 or 1-2 nucleotides. In exemplary embodiments, miRNA binding sites are separated by approximately 5 nucleotides or 5 nucleotides. In exemplary embodiments, the sequences separating miRNA binding sites (as well as junctions formed between miRNA binding sites, or junctions formed between miRNA binding sites and sequences separating miRNA binding sites) are not complementary to any other miRNA or any other neuronal miRNA.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат сайт связывания микроРНК, характеризующийся идентичностью, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100%, по отношению к SEQ ID NO: 7. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат сайт связывания микроРНК, содержащий SEQ ID NO: 7.In certain embodiments, polynucleotides provided herein comprise a microRNA binding site having an identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99%, or 100%, relative to SEQ ID NO: 7. In an exemplary embodiment, the polynucleotides provided herein comprise a microRNA binding site comprising SEQ ID NO: 7.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат сайт связывания микроРНК, характеризующийся идентичностью, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100%, по отношению к SEQ ID NO: 14. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат сайт связывания микроРНК, содержащий SEQ ID NO: 14.In certain embodiments, polynucleotides provided herein comprise a miRNA binding site having an identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99%, or 100%, relative to SEQ ID NO: 14. In an exemplary embodiment, the polynucleotides provided herein comprise a microRNA binding site comprising SEQ ID NO: 14.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат сайт связывания микроРНК, характеризующийся идентичностью, составляющей по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100%, по отношению к SEQ ID NO: 15. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленные в настоящем документе полинуклеотиды содержат сайт связывания микроРНК, содержащий SEQ ID NO: 15.In certain embodiments, polynucleotides provided herein comprise a miRNA binding site having an identity of at least 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99%, or 100%, relative to SEQ ID NO: 15. In an exemplary embodiment, the polynucleotides provided herein comprise a microRNA binding site comprising SEQ ID NO: 15.
Согласно определенным вариантам осуществления указанные в настоящем документе сайты связывания микроРНК расположены в 3'-нетранслируемой области транскрипта мРНК, например, после кодона терминации трансляции (т.е. TAA, TGA или TAG) и перед полиА-хвостом. Сайт связывания микроРНК может быть расположен непосредственно рядом с кодоном терминации трансляции или может быть отделен от кодона терминации трансляции по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более нуклеотидами или 1-20, 1-15, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3 или 1-2 нуклеотидами, и/или может быть расположен рядом с полиА-хвостом или может быть отделен от полиАхвоста по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более нуклеотидами или 1-20, 1-15, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3 или 1-2 нуклеотидами.In certain embodiments, microRNA binding sites as defined herein are located in the 3' untranslated region of the mRNA transcript, for example, after a translation termination codon (i.e., TAA, TGA, or TAG) and before the polyA tail. The miRNA binding site may be located directly adjacent to the translation termination codon or may be separated from the translation termination codon by at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 , 15, 16, 17, 18, 19, 20 or more nucleotides or 1-20, 1-15, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1- 4, 1-3 or 1-2 nucleotides, and/or may be located adjacent to the polyA tail or may be separated from the polyA tail by at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 , 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 or more nucleotides or 1-20, 1-15, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1- 6, 1-5, 1-4, 1-3 or 1-2 nucleotides.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе сайт связывания микроРНК приводит к селективной экспрессии гена в PV-содержащей клетке по сравнению с нецелевыми типами клеток. В некоторых случаях нецелевые типы клеток включают в себя, без ограничения, возбуждающие нейроны, не содержащие PV типы клеток ЦНС и ненейрональные типы клеток ЦНС. Согласно определенным вариантам осуществления селективные в отношении PV сайты связывания микроРНК приводят к селективной экспрессии генов в PV-содержащих нейронах по меньшей мере для одного, двух, трех, четырех, пяти или более не-PV типов клеток ЦНС. В некоторых случаях не-PV клетка ЦНС представляет собой возбуждающий нейрон, дофаминергический нейрон, астроцит, микроглию, мотонейрон, сосудистую клетку или не-ГАМКергический нейрон (например, клетку, которая не экспрессирует один или более GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1, DLX5, SST и VIP), не-PV нейрон (например, ГАМКергический нейрон, который не экспрессирует парвальбумин) или другие клетки ЦНС (например, типы клеток ЦНС, которые никогда не экспрессируют любой из PV, GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1, DLX5, SST и VIP). Согласно иллюстративному варианту осуществления представленный в настоящем документе селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК приводит к повышенной селективности экспрессии генов в PV-содержащих нейронах по сравнению с возбуждающими нейронами (например, нейронами, которые экспрессируют один или несколько из STAC, Slc17a7, Car12, Syt17, ITPKA, Col6a1, CamKII, Sv2b, INHBA и/или DKK3) за счет уменьшения экспрессии в возбуждающих нейронах. В некоторых случаях типы клеток различают по разным клеточным маркерам, морфологии, фенотипу, генотипу, функции и/или любым другим средствам классификации типов клеток.In certain embodiments, a microRNA binding site provided herein results in selective gene expression in a PV-containing cell compared to non-target cell types. In some cases, non-target cell types include, but are not limited to, excitatory neurons, non-PV CNS cell types, and non-neuronal CNS cell types. In certain embodiments, PV-selective miRNA binding sites result in selective gene expression in PV-containing neurons for at least one, two, three, four, five, or more non-PV CNS cell types. In some cases, the non-PV CNS cell is an excitatory neuron, dopaminergic neuron, astrocyte, microglia, motor neuron, vascular cell, or non-GABAergic neuron (e.g., a cell that does not express one or more of GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1, DLX5, SST, and VIP), non-PV neuron (eg, a GABAergic neuron that does not express parvalbumin), or other CNS cells (eg, CNS cell types that never express any of PV, GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1 , DLX5, SST and VIP). In an exemplary embodiment, the PV-selective miRNA binding site provided herein results in increased selectivity of gene expression in PV-containing neurons compared to excitatory neurons (e.g., neurons that express one or more of STAC, Slc17a7, Car12, Syt17, ITPKA, Col6a1, CamKII, Sv2b, INHBA and/or DKK3) by decreasing expression in excitatory neurons. In some cases, cell types are distinguished by different cellular markers, morphology, phenotype, genotype, function, and/or any other means of classifying cell types.
Селективность экспрессии, управляемая селективным в отношении PV сайтом связывания микроРНК, может быть измерена несколькими способами. Согласно одному варианту осуществления селективность экспрессии гена в PV-клетке по сравнению с не содержащими PV клетками может быть измеExpression selectivity driven by the PV-selective miRNA binding site can be measured in several ways. In one embodiment, the selectivity of gene expression in a PV cell compared to non-PV cells can be varied
- 34 046157 рена путем сравнения количества PV-клеток, которые экспрессируют обнаруживаемый уровень транскрипта из гена, который содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, с общим количеством клеток, которые экспрессируют ген (например, отношение PV-содержащих к общему количеству клеток (PV + не-PV клеток), экспрессирующих ген). Например, селективность в отношении PVсодержащих нейронов может быть определена с использованием анализа колокализации на основе иммуногистохимии с использованием кассеты экспрессии, содержащей ген, кодирующий флуоресцентный белок (например, eGFP), и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК для измерения экспрессии гена и антитела, которое идентифицирует PV-содержащие клетки (например, антитело к PV, которое специфически взаимодействует с PV-содержащими нейронами), связанное со второй флуоресцентной меткой (например, красным флуоресцентным белком). Селективность экспрессии в PVсодержащих клетках можно рассчитать путем деления количества клеток, которые экспрессируют как PV, так и eGFP (например, PV-содержащие клетки), на общее количество клеток, экспрессирующих eGFP (например, PV-содержащие клетки и не содержащие PV клетки), и умножения на 100, чтобы преобразовать в проценты. В другом примере селективность в отношении PV-содержащих нейронов может быть определена с использованием анализа колокализации на основе иммуногистохимии с использованием кассеты экспрессии, содержащей ген, кодирующий флуоресцентный белок (например, eGFP), и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК для измерения экспрессии гена, и первое антитело, которое идентифицирует PV-содержащие клетки (например, антитело к PV, которое специфически взаимодействует с PV-содержащими нейронами), связанное со второй флуоресцентной меткой (например, красным флуоресцентным белком) и вторым антителом, которое идентифицирует возбуждающие клетки (например, антитело к CamKII, которое специфически взаимодействует с возбуждающими нейронами). Селективность экспрессии в PV-содержащих клетках можно рассчитать путем деления количества клеток, экспрессирующих как PV, так и eGFP (например, PV-клетки), на количество клеток, экспрессирующих eGFP + PV и eGFP + CamKII (например, PV-содержащие клетки и возбуждающие клетки), и умножения на 100 для преобразования в процент. Чем выше процент PV-содержащих клеток, экспрессирующих трансген, тем более селективным является сайт связывания микроРНК в отношении PVсодержащих клеток. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК может быть высокоселективным для экспрессии в PV-содержащих клетках. Например, представленный в настоящем документе селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК может характеризоваться селективностью, составляющей приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более чем приблизительно 99%, для PV-содержащих нейронов (например, PVсодержащие нейроны/все клетки х 100 или PV-содержащие нейроны/PV + возбуждающие нейроны х 100).- 34 046157 rena by comparing the number of PV cells that express a detectable level of transcript from a gene that contains a PV-selective miRNA binding site with the total number of cells that express the gene (for example, the ratio of PV-containing to total cells (PV + non-PV cells) expressing the gene). For example, selectivity for PV-containing neurons can be determined using an immunohistochemistry-based colocalization assay using an expression cassette containing a gene encoding a fluorescent protein (e.g., eGFP) and a PV-selective microRNA binding site to measure expression of the gene and antibody that identifies PV-containing cells (eg, an anti-PV antibody that specifically interacts with PV-containing neurons) coupled to a second fluorescent tag (eg, red fluorescent protein). Expression selectivity in PV-containing cells can be calculated by dividing the number of cells that express both PV and eGFP (eg, PV-containing cells) by the total number of cells expressing eGFP (eg, PV-containing cells and non-PV-containing cells). and multiplying by 100 to convert to a percentage. In another example, selectivity for PV-containing neurons can be determined using an immunohistochemistry-based colocalization assay using an expression cassette containing a gene encoding a fluorescent protein (e.g., eGFP) and a PV-selective microRNA binding site to measure gene expression. and a first antibody that identifies PV-containing cells (e.g., an anti-PV antibody that specifically interacts with PV-containing neurons) coupled to a second fluorescent tag (e.g., red fluorescent protein) and a second antibody that identifies excitatory cells (e.g., antibody to CamKII, which specifically interacts with excitatory neurons). Expression selectivity in PV-containing cells can be calculated by dividing the number of cells expressing both PV and eGFP (e.g., PV cells) by the number of cells expressing eGFP + PV and eGFP + CamKII (e.g., PV-containing cells and excitatory cells), and multiplying by 100 to convert to a percentage. The higher the percentage of PV-containing cells expressing the transgene, the more selective the microRNA binding site is for PV-containing cells. In certain embodiments, a PV-selective miRNA binding site provided herein can be highly selective for expression in PV-containing cells. For example, a PV-selective miRNA binding site provided herein may have a selectivity of approximately 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92 %, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or greater than about 99%, for PV-containing neurons (e.g., PV-containing neurons/all cells x 100 or PV-containing neurons/ PV + excitatory neurons x 100).
В некоторых случаях представленный в настоящем документе селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК является коротким. В некоторых случаях размер селективного в отношении PV сайта связывания микроРНК совместим с клонирующей способностью вектора, например, вирусного вектора или rAAV, так что комбинированный размер трансгена, промотора (и необязательного энхансера) и сайта связывания микроРНК не превышает клонирующую способность вектора. В некоторых случаях селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК составляет в длину до приблизительно 500 п.н., 400 п.н., 300 п.н., 250 п.н., 225 п.н., 215 п.н., 210 п.н., 200 п.н., 150 п.н., 140 п.н., 135 п.н., 130 п.н., 125 п.н., 120 п.н., 115 п.н., 110 п.н., 100 п.н., 90 п.н., 80 п.н., 75 п.н., 70 п.н., 65 п.н., 60 п.н. или 50 п.н.. В некоторых случаях селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК составляет приблизительно 50-500 п.н., 50-400 п.н., 50-300 п.н., 50-250 п.н., 50-200 п.н., 50-100 п.н., 50-75 п.н., 50-70 п.н., 100-500 п.н., 100-400 п.н., 100-300 п.н., 100-250 п.н., 100-200 п.н., 100-150 п.н., 100-140 п.н., 100-135 п.н., 200-500 п.н., 200-400 п.н., 200-300 п.н. или 200-250 п.н..In some cases, the PV-selective miRNA binding site presented herein is short. In some cases, the size of the PV-selective miRNA binding site is compatible with the cloning ability of a vector, such as a viral vector or rAAV, such that the combined size of the transgene, promoter (and optional enhancer), and miRNA binding site does not exceed the cloning ability of the vector. In some cases, the PV-selective miRNA binding site is up to approximately 500 bp, 400 bp, 300 bp, 250 bp, 225 bp, 215 bp in length. , 210 bp, 200 bp, 150 bp, 140 bp, 135 bp, 130 bp, 125 bp, 120 bp, 115 bp, 110 bp, 100 bp, 90 bp, 80 bp, 75 bp, 70 bp, 65 bp, 60 bp. n. or 50 bp. In some cases, the PV selective miRNA binding site is approximately 50-500 bp, 50-400 bp, 50-300 bp, 50-250 bp. , 50-200 bp, 50-100 bp, 50-75 bp, 50-70 bp, 100-500 bp, 100-400 bp, 100 -300 bp, 100-250 bp, 100-200 bp, 100-150 bp, 100-140 bp, 100-135 bp, 200-500 bp, 200-400 bp, 200-300 bp. or 200-250 bp.
Согласно иллюстративным вариантам осуществления представленный в настоящем документе полинуклеотид, который содержит один или несколько селективных в отношении PV сайтов связывания микроРНК не содержит SEQ ID NO: 67.In exemplary embodiments, a polynucleotide provided herein that contains one or more PV-selective miRNA binding sites does not contain SEQ ID NO: 67.
Кассеты экспрессии.Expression cassettes.
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, которая активирует SCNIA и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК) и один или несколько регуляторных элементов. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, которая активирует SCN1A и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК) и селективный в отношении PV промотор.In another aspect, the present application provides expression cassettes comprising a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a sequence encoding an eTF that activates SCNIA and/or contains a PV-selective miRNA binding site) and one or more regulatory elements. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes comprising a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a sequence encoding an eTF that activates SCN1A and/or contains a PV-selective microRNA binding site) and a PV-selective promoter.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК) представляет собой часть кассеты экспрессии, содержащей один или несколько регуляторных элементов в добавок кIn certain embodiments, a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a sequence encoding an eTF that activates SCN1A and/or contains a PV-selective miRNA binding site) is part of an expression cassette containing one or more regulatory elements in addition to
- 35 046157 последовательности, кодирующей eTF. Согласно иллюстративным вариантам осуществления представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК), представляет собой часть кассеты экспрессии, содержащей промотор, расположенный выше против хода транскрипции от трансгенной последовательности, чтобы быть способным управлять экспрессией трансгена (например, eTF, который избирательно активирует SCN1A) в клетке.- 35 046157 eTF coding sequence. In exemplary embodiments, a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a coding sequence for an eTF that activates SCN1A and/or contains a PV-selective miRNA binding site) is part of an expression cassette comprising an upstream promoter from a transgene sequence to be capable of driving the expression of a transgene (eg, an eTF that selectively activates SCN1A) in a cell.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытая в настоящем документе кассета экспрессии содержит представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, которая активирует регуляцию SCNIA и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК) и конститутивный промотор, расположенный выше против хода транскрипции от последовательности, кодирующей трансген, чтобы быть способным управлять экспрессией трансгена (например, eTF, который избирательно активирует SCN1A) в клетке. Примеры конститутивных промоторов включают в себя промотор GAD2, промотор синапсина человека, промотор CBA, промотор CMV, промотор minCMV, TATA-бокс, супер основной промотор или промотор EF1a, или их комбинацию. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытая в настоящем документе кассета экспрессии содержит представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, которая активирует SCN1A и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК) и короткий промотор, способный управлять экспрессией, трансгена (например, eTF, который избирательно активирует SCN1A) в клетке. Согласно определенным вариантам осуществления короткий промотор, подходящий для применения в соответствии с описанными в настоящем документе молекулами нуклеиновой кислоты, содержит менее чем 500 п.н., 450 п.н., 400 п.н., 350 п.н., 300 п.н., 250 п.н., 225 п.н., 200 п.н., 175 п.н., 150 п.н., 145 п.н., 140 п.н., 135 п.н., 130 п.н., 125 п.н., 120 п.н., 115 п.н., 110 п.н., 105 п.н., 100 п.н., 95 п.н., 90 п.н., 85 п.н., 80 п.н. или 75 п.н. или приблизительно 80-300 п.н., 80-275 п.н., 80-250 п.н., 80-200 п.н., 80-150 п.н., 80-125 п.н., 80-120 п.н., 80-115 п.н., 80-110 п.н., 80-105 п.н., 80-100 п.н., 85-300 п.н., 85-275 п.н., 85-250 п.н., 85-200 п.н., 85-150 п.н., 85-125 п.н., 85-120 п.н., 85-115 п.н., 85-110 п.н., 85-105 п.н., 85100 п.н., 90-300 п.н., 90-275 п.н., 90-250 п.н., 90-200 п.н., 90-150 п.н., 90-125 п.н., 90-120 п.н., 90-115 п.н., 90-110 п.н., 90-105 п.н., 90-100 п.н., 95-300 п.н., 95-275 п.н., 95-250 п.н., 95-200 п.н., 95-150 п.н., 95-125 п.н., 95-120 п.н., 95-115 п.н., 95-110 п.н., 95-105 п.н., 95-100 п.н., 100-300 п.н., 100-275 п.н., 100-250 п.н., 100-200 п.н., 100-150 п.н., 100-125 п.н., 100-120 п.н., 100-115 п.н., 100-110 п.н. или 100-105 п.н. Согласно иллюстративным вариантам осуществления короткий промотор, подходящий для применения в соответствии с описанными в настоящем документе кассетами экспрессии, содержит приблизительно 100-120 п.н., приблизительно 117 п.н. или приблизительно 100 п.н.In certain embodiments, an expression cassette disclosed herein comprises a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a sequence encoding an eTF that activates SCNIA regulation and/or contains a PV-selective miRNA binding site) and a constitutive promoter located upstream of transcriptional sequence from the transgene coding sequence to be able to direct the expression of the transgene (eg, eTF that selectively activates SCN1A) in the cell. Examples of constitutive promoters include the GAD2 promoter, the human synapsin promoter, the CBA promoter, the CMV promoter, the minCMV promoter, the TATA box, the super basic promoter or the EF1a promoter, or a combination thereof. In certain embodiments, an expression cassette disclosed herein comprises a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a sequence encoding an eTF that activates SCN1A and/or contains a PV-selective miRNA binding site) and a short promoter capable of driving expression, transgene (for example, an eTF that selectively activates SCN1A) in a cell. In certain embodiments, a short promoter suitable for use with the nucleic acid molecules described herein comprises less than 500 bp, 450 bp, 400 bp, 350 bp, 300 bp .b., 250 bp., 225 bp., 200 bp., 175 bp., 150 bp., 145 bp., 140 bp., 135 bp. ., 130 bp, 125 bp, 120 bp, 115 bp, 110 bp, 105 bp, 100 bp, 95 bp, 90 bp, 85 bp, 80 bp or 75 bp or approximately 80-300 bp, 80-275 bp, 80-250 bp, 80-200 bp, 80-150 bp, 80-125 bp, 80-120 bp, 80-115 bp, 80-110 bp, 80-105 bp, 80-100 bp, 85-300 bp, 85- 275 bp, 85-250 bp, 85-200 bp, 85-150 bp, 85-125 bp, 85-120 bp, 85-115 p .n., 85-110 bp, 85-105 bp, 85100 bp, 90-300 bp, 90-275 bp, 90-250 bp, 90-200 bp, 90-150 bp, 90-125 bp, 90-120 bp, 90-115 bp, 90-110 bp, 90- 105 bp, 90-100 bp, 95-300 bp, 95-275 bp, 95-250 bp, 95-200 bp, 95-150 p .n., 95-125 bp, 95-120 bp, 95-115 bp, 95-110 bp, 95-105 bp, 95-100 bp ., 100-300 bp, 100-275 bp, 100-250 bp, 100-200 bp, 100-150 bp, 100-125 bp, 100-120 bp, 100-115 bp, 100-110 bp. or 100-105 bp. In exemplary embodiments, a short promoter suitable for use in accordance with the expression cassettes described herein comprises approximately 100-120 bp, approximately 117 bp. or approximately 100 bp.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытая в настоящем документе кассета экспрессии содержит короткий промотор, содержащий или состоящий из следующего: (i) SEQ ID NO: 1; (ii) его вариант или функциональный фрагмент или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), функционально связанная с полинуклеотидом, кодирующим любой из eTF, который избирательно активирует раскрытый в настоящем документе SCN1A и необязательно содержащая раскрытый в настоящем документе сайт связывания микроРНК. Другие примеры короткой промоторной последовательности можно найти в публикации PCT №WO 2018/213786.In certain embodiments, an expression cassette disclosed herein comprises a short promoter comprising or consisting of the following: (i) SEQ ID NO: 1; (ii) a variant or functional fragment thereof; or (iii) a nucleic acid sequence having sequence identity of at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88% , 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, with respect to any of (i) or (ii), functionally related to a polynucleotide encoding any of the eTFs that selectively activate SCN1A disclosed herein and optionally comprising a miRNA binding site disclosed herein. Other examples of short promoter sequences can be found in PCT Publication No. WO 2018/213786.
Согласно определенным вариантам осуществления раскрытая в настоящем документе кассета экспрессии содержит представленный в настоящем документе полинуклеотид (например, полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую eTF, которая активирует SCN1A и/или содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК) и селективный промотор клеточного типа, расположенный выше против хода транскрипции от последовательности, кодирующей трансген (например, eTF, который избирательно активирует SCN1A), чтобы иметь возможность избирательно управлять экспрессией трансгена в представляющей интерес клетке. Согласно определенным вариантам осуществления селективный промотор клеточного типа может быть селективным (например, избирательно управлять экспрессией) в отношении любого представляющего интерес типа клеток, такого как, например, клетка сердца, клетка печени, мышечная клетка, костная клетка, нейрон или их субпопуляции. Согласно иллюстративному варианту осуществления раскрытая в настоящем документе кассета экспрессии содержит полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, и селективный в отношении PV регуляторный элемент (например, промотор, энхансер и/или промотор и энхансер), расположенный выше против хода транскрипции от последовательности, кодирующей eTF, так чтобы быть способным избирательно управлять экспрессией eTF в PV-клетке, и, необязательно, селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Селективный в отношении PV регуляторный элемент относится к регуляторному элементу, который специфически модулирует экспрессию гена в PV-содержащем нейроне. Согласно определенным вариантам осуществления селективные в отношении PV регуляторные элементы усиливают экспрессию в PV-содержащем нейроне по сравнению с одним или несколькими другими типами клеток ЦНС. Согласно определенным вариантам осуществления селективный в отноше- 36 046157 нии PV регуляторный элемент подавляет процессы транскрипции и/или трансляции в нецелевых типах клеток.In certain embodiments, an expression cassette disclosed herein comprises a polynucleotide provided herein (e.g., a polynucleotide containing a sequence encoding an eTF that activates SCN1A and/or contains a PV-selective microRNA binding site) and a cell type-selective promoter located upstream upstream of the sequence encoding the transgene (eg, an eTF that selectively activates SCN1A) to be able to selectively control the expression of the transgene in the cell of interest. In certain embodiments, a cell type selective promoter may be selective (eg, selectively drive expression) for any cell type of interest, such as, for example, a heart cell, a liver cell, a muscle cell, a bone cell, a neuron, or subpopulations thereof. In an exemplary embodiment, an expression cassette disclosed herein comprises a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, and a PV-selective regulatory element (e.g., a promoter, enhancer, and/or promoter and enhancer) located upstream of the sequence encoding eTF so as to be capable of selectively driving eTF expression in a PV cell, and optionally a PV-selective miRNA binding site. A PV-selective regulatory element refers to a regulatory element that specifically modulates gene expression in a PV-containing neuron. In certain embodiments, the PV-selective regulatory elements enhance expression in a PV-containing neuron relative to one or more other CNS cell types. In certain embodiments, the PV-selective regulatory element inhibits transcription and/or translation processes in non-target cell types.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе селективный в отношении PV регуляторный элемент приводит к селективной экспрессии гена в PV-клетке по сравнению с нецелевыми типами клеток. В некоторых случаях нецелевые типы клеток включают в себя, без ограничения, возбуждающие нейроны, не-PV типы клеток ЦНС и ненейрональные типы клеток ЦНС. Согласно определенным вариантам осуществления селективные в отношении PV регуляторные элементы приводят к селективной экспрессии генов в PV-содержащих нейронах по меньшей мере одного, двух, трех, четырех, пяти или более не содержащих PV типов клеток ЦНС. В некоторых случаях не содержащая PV клетка ЦНС представляет собой возбуждающий нейрон, дофаминергический нейрон, астроцит, микроглию, мотонейрон, сосудистую клетку или не-ГАМКергический нейрон, (например, клетка, которая не экспрессирует один или несколько из GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1, DLX5, SST и VIP), не содержащий PV нейрон (например, ГАМКергический нейрон, который не экспрессирует парвальбумин) или другие клетки ЦНС (например, типы клеток ЦНС, которые никогда не экспрессируют любой из PV, GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1, DLX5, SST и VIP). В некоторых случаях представленный в настоящем документе селективный в отношении PV регуляторный элемент приводит к повышенной селективности экспрессии генов в PV-содержащих нейронах по сравнению с не содержащими PV ГАМКергическими клетками. В некоторых случаях типы клеток различают по разным клеточным маркерам, морфологии, фенотипу, генотипу, функции и/или любым другим средствам классификации типов клеток.In certain embodiments, a PV-selective regulatory element provided herein results in selective gene expression in a PV cell over non-target cell types. In some cases, non-target cell types include, but are not limited to, excitatory neurons, non-PV CNS cell types, and non-neuronal CNS cell types. In certain embodiments, the PV-selective regulatory elements result in selective gene expression in PV-containing neurons of at least one, two, three, four, five, or more non-PV cell types of the CNS. In some cases, the non-PV CNS cell is an excitatory neuron, dopaminergic neuron, astrocyte, microglia, motoneuron, vascular cell, or non-GABAergic neuron (e.g., a cell that does not express one or more of GAD2, GAD1, NKX2.1, DLX1, DLX5, SST, and VIP), a non-PV neuron (eg, a GABAergic neuron that does not express parvalbumin) or other CNS cells (eg, CNS cell types that never express any of PV, GAD2, GAD1, NKX2.1 , DLX1, DLX5, SST and VIP). In some cases, the PV-selective regulatory element presented herein results in increased selectivity of gene expression in PV-containing neurons compared to non-PV GABAergic cells. In some cases, cell types are distinguished by different cellular markers, morphology, phenotype, genotype, function, and/or any other means of classifying cell types.
Селективность экспрессии, управляемую селективным в отношении PV регуляторным элементом, можно измерить несколькими способами. Согласно одному варианту осуществления селективность экспрессии гена в PV-содержащей клетке по сравнению с не содержащими PV клетками может быть измерена путем сравнения количества PV-содержащих клеток, которые экспрессируют обнаруживаемый уровень транскрипта от гена, который функционально связан с селективным в отношении PV регуляторным элементом, с общим количеством клеток, которые экспрессируют ген (например, отношение PV к общему количеству клеток (PV + не-PV клеток), экспрессирующих ген). Например, селективность в отношении PV-содержащих нейронов может быть определена с использованием анализа колокализации на основе иммуногистохимии с использованием гена, кодирующего флуоресцентный белок (например, eGFP), функционально связанный с селективным в отношении PV регуляторным элементом для измерения экспрессии гена и антитела, которое идентифицирует PV-содержащие клетки (например, антитело к PV, которое специфически взаимодействует с PV-содержащими нейронами), связанное со второй флуоресцентной меткой (например, красным флуоресцентным белком). Селективность экспрессии в PVсодержащих клетках можно рассчитать путем деления количества клеток, которые экспрессируют как PV, так и eGFP (например, PV-содержащие клетки), на общее количество клеток, экспрессирующих eGFP (например, PV-содержащие клетки и не содержащие PV клетки), и умножения на 100, чтобы преобразовать в проценты. Чем выше процент PV-содержащих клеток, экспрессирующих трансген, тем более селективным является регуляторный элемент для PV-содержащих клеток. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе селективный в отношении PV регуляторный элемент может быть высокоселективным в отношении экспрессии в PV-содержащих клетках. Например, представленный в настоящем документе селективный в отношении PV регуляторный элемент может характеризоваться селективностью, составляющей приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более чем приблизительно 99%, в отношении PV-содержащих нейронов (например, PV-содержащие нейроны/все клетки х 100).Expression selectivity controlled by a PV-selective regulatory element can be measured in several ways. In one embodiment, the selectivity of gene expression in a PV-containing cell compared to non-PV cells can be measured by comparing the number of PV-containing cells that express a detectable level of transcript from a gene that is operably linked to the PV-selective regulatory element with the total number of cells that express the gene (eg, the ratio of PV to the total number of cells (PV + non-PV cells) expressing the gene). For example, selectivity for PV-containing neurons can be determined using an immunohistochemistry-based colocalization assay using a gene encoding a fluorescent protein (e.g., eGFP) operably linked to a PV-selective regulatory element to measure gene expression and an antibody that identifies PV-containing cells (eg, an anti-PV antibody that specifically interacts with PV-containing neurons) bound to a second fluorescent tag (eg, red fluorescent protein). Expression selectivity in PV-containing cells can be calculated by dividing the number of cells that express both PV and eGFP (eg, PV-containing cells) by the total number of cells expressing eGFP (eg, PV-containing cells and non-PV-containing cells). and multiplying by 100 to convert to a percentage. The higher the percentage of PV-containing cells expressing the transgene, the more selective the regulatory element is for PV-containing cells. In certain embodiments, a PV-selective regulatory element provided herein may be highly selective for expression in PV-containing cells. For example, a PV selective regulatory element provided herein may have selectivity of approximately 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92% , 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or greater than about 99%, with respect to PV-containing neurons (eg, PV-containing neurons/total cells x 100).
В некоторых случаях представленный в настоящем документе селективный в отношении PV регуляторный элемент является коротким. В некоторых случаях размер селективного в отношении PV регуляторного элемента совместим с клонирующей способностью вектора, например, вирусного вектора или rAAV, так что комбинированный размер трансгена и одного или нескольких селективных в отношении PV регуляторных элементов не превышает клонирующую способность вектора. В некоторых случаях селективный в отношении PV регуляторный элемент составляет в длину приблизительно до 2050 п.н., 2000 п.н., 1900 п.н., 1800 п.н., 1700 п.н., 1600 п.н., 1500 п.н., 1400 п.н., 1300 п.н., 1200 п.н., 1100 п.н., 1000 п.н., 900 п.н., 800 п.н., 700 п.н., 600 п.н., 500 п.н., 400 п.н., 300 п.н., 200 п.н. или 100 п.н. В некоторых случаях селективный в отношении PV регуляторный элемент составляет приблизительно 500-600 п.н., 500-700 п.н., 500-800 п.н., 500-900 п.н., 500-1000 п.н., 500-1500 п.н., 500-2000 п.н. или 500-2050 п.н.In some cases, the PV-selective regulatory element presented herein is short. In some cases, the size of the PV-selective regulatory element is compatible with the cloning ability of the vector, such as a viral vector or rAAV, such that the combined size of the transgene and one or more PV-selective regulatory elements does not exceed the cloning ability of the vector. In some cases, the PV selective regulatory element is up to approximately 2050 bp, 2000 bp, 1900 bp, 1800 bp, 1700 bp, 1600 bp in length. 1500 bp, 1400 bp, 1300 bp, 1200 bp, 1100 bp, 1000 bp, 900 bp, 800 bp, 700 bp .b., 600 bp, 500 bp, 400 bp, 300 bp, 200 bp. or 100 bp In some cases, the PV selective regulatory element is approximately 500-600 bp, 500-700 bp, 500-800 bp, 500-900 bp, 500-1000 bp. , 500-1500 bp, 500-2000 bp or 500-2050 bp.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе селективный в отношении PV регуляторный элемент содержит или состоит из любого из следующего: (i) SEQ ID NO: 2-4; (ii) вариант, функциональный фрагмент или их комбинация или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующаяся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% по отношению к любому из (i) или (ii). В некоторых случаях регуляторный элемент включает в себя любую из SEQ ID NO: 2-4. Другие примеры селективных в отношении PV регуляторных элементов можно найти в публикации PCT № WO 2018/187363.In certain embodiments, a PV selective regulatory element provided herein comprises or consists of any of the following: (i) SEQ ID NO: 2-4; (ii) a variant, functional fragment, or combination thereof, or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87% sequence identity, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% in relation to any of (i) or (ii). In some cases, the regulatory element includes any of SEQ ID NO: 2-4. Further examples of PV-selective regulatory elements can be found in PCT Publication No. WO 2018/187363.
Согласно иллюстративным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассетыAccording to illustrative embodiments, this application provides cassettes
- 37 046157 экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, содержащий DBD, содержащий любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 77-98 под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента, содержащего любую одна из SEQ ID NO: 2-4. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, содержащий любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 99-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223 под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента, содержащего любую из SEQ ID NO: 2-4. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 67-73 под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента, содержащего любую из SEQ ID NO: 2-4. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, содержащий DBD, содержащий любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 148-151 под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента, содержащего любую из SEQ ID NO: 2. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, содержащий любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 99-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223 под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента, содержащего любую из SEQ ID NO: 2. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую любую из следующих последовательностей: SEQ ID NO: 67-76 или 316 под контролем селективного в отношении PV регуляторного элемента, содержащего любую из SEQ ID NO: 2.- 37 046157 expressions containing a nucleic acid sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A under the control of a PV-selective regulatory element. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes comprising a nucleic acid sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A containing a DBD containing any of the following sequences: SEQ ID NO: 77-98 under the control of a PV-selective regulatory element comprising any one of SEQ ID NO: 2-4. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes containing a nucleic acid sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, comprising any of the following sequences: SEQ ID NO: 99-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 or 223 under the control of a PV-selective regulatory element comprising any of SEQ ID NOs: 2-4. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes comprising a nucleic acid sequence comprising any of the following sequences: SEQ ID NO: 67-73 under the control of a PV selective regulatory element comprising any of SEQ ID NO: 2-4. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes comprising a nucleic acid sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A containing a DBD comprising any of the following sequences: SEQ ID NO: 148-151 under the control of a PV-selective regulatory element comprising any of SEQ ID NO: 2. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes containing a nucleic acid sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, comprising any of the following sequences: SEQ ID NO: 99-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221, or 223 under the control of a PV-selective regulatory element comprising any of SEQ ID NO: 2. In certain embodiments, provided herein are expression cassettes comprising a nucleic acid sequence comprising any of the following sequences : SEQ ID NO: 67-76 or 316 under the control of a PV-selective regulatory element containing any of SEQ ID NO: 2.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены кассеты экспрессии, содержащие селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и последовательность промотора и/или энхансера. Любой из описанных в настоящем документе промоторов может быть включен в кассету экспрессии. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и селективный в отношении PV регуляторный элемент. Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 2-4; (ii) вариант, функциональный фрагмент или их комбинацию или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит (1) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 7, 14 или 15; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), и (2) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 2-4; (ii) вариант, функциональный фрагмент или их комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит (1) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 7; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), и (2) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно одному варианту осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит сайт связывания микроРНК, содержащий SEQ ID NO: 7, и селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий SEQ ID NO: 2. Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе полинуклеотид, содержит (1) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК,In certain embodiments, the present application provides expression cassettes comprising a PV-selective miRNA binding site and a promoter and/or enhancer sequence. Any of the promoters described herein may be included in an expression cassette. In an exemplary embodiment, an expression cassette provided herein comprises a PV-selective miRNA binding site and a PV-selective regulatory element. In certain embodiments, an expression cassette provided herein comprises a PV-selective miRNA binding site and a PV-selective regulatory element comprising (i) any of SEQ ID NO: 2-4; (ii) a variant, functional fragment, or combination thereof, or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87% sequence identity, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii). In certain embodiments, an expression cassette provided herein comprises (1) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) any of SEQ ID NO: 7, 14, or 15; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (2) a PV-selective regulatory element comprising (i) any of SEQ ID NOs: 2-4; (ii) a variant, functional fragment, or combination thereof; (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86% sequence identity, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii ). In certain embodiments, an expression cassette provided herein comprises (1) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 7; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (2) a PV-selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . In one embodiment, an expression cassette provided herein comprises a microRNA binding site comprising SEQ ID NO: 7 and a PV selective regulatory element comprising SEQ ID NO: 2. In certain embodiments, a polynucleotide provided herein comprises (1 ) PV-selective miRNA binding site,
- 38 046157 содержащий (i) SEQ ID NO: 14; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (2) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно одному варианту осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит сайт связывания микроРНК, содержащий SEQ ID NO: 15, и селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий SEQ ID NO: 2. Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит (1) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 15; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (2) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно одному варианту осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит сайт связывания микроРНК, содержащий SEQ ID NO: 15, и селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий SEQ ID NO: 2.- 38 046157 containing (i) SEQ ID NO: 14; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (2) a PV-selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . In one embodiment, an expression cassette provided herein comprises a microRNA binding site comprising SEQ ID NO: 15 and a PV selective regulatory element comprising SEQ ID NO: 2. In certain embodiments, an expression cassette provided herein comprises (1 ) a PV-selective miRNA binding site containing (i) SEQ ID NO: 15; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (2) a PV-selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . In one embodiment, an expression cassette provided herein comprises a miRNA binding site comprising SEQ ID NO: 15 and a PV selective regulatory element comprising SEQ ID NO: 2.
Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и последовательность, кодирующую eTF, который стимулирует экспрессию SCN1A, как предусмотрено в настоящем документе. Согласно иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая селективный в отношении PV регуляторный элемент, eTF, который активирует экспрессию SCN1A, как предусмотрено в настоящем документе, и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 2-4; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221 или 223; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 7, 14 или 15; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно другому иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 77 или 127; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 7; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно другому иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, хаIn certain embodiments, an expression cassette provided herein comprises a PV-selective miRNA binding site and a sequence encoding an eTF that promotes expression of SCN1A as provided herein. In an exemplary embodiment, the present application provides an expression cassette comprising a PV-selective regulatory element, an eTF, that activates the expression of SCN1A as provided herein, and a PV-selective microRNA binding site. According to an illustrative embodiment, the present application provides an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) any of SEQ ID NO: 2-4; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A, comprising (i) any of SEQ ID NO: 77-131, 205, 207, 209, 213, 217, 219, 221, or 223; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) any of SEQ ID NO: 7, 14 or 15; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . According to another illustrative embodiment, provided herein is an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A, containing (i) any of SEQ ID NO: 77 or 127; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 7; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . According to another illustrative embodiment, provided herein is an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) nucleic acid sequence, ha
- 39 046157 растеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 77 или 127; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 14; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно другому иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 77 или 127; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 15; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно другому иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 92 или 106; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 7; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно другому иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 92 или 106; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 14; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii). Согласно другому иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлена кассета экспрессии, содержащая (1) селективный в отношении PV регуляторный элемент, содержащий (i) SEQ ID NO: 2; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любой из (i) или (ii), (2) последовательность, кодирующую eTF, который активирует SCN1A, содержащий (i) любую из SEQ ID NO: 92 или 106; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбина- 39 046157 rasterizable sequence identity of at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, relative to any of (i) or (ii), (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A containing (i) any of SEQ ID NO: 77 or 127; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 14; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . According to another illustrative embodiment, provided herein is an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A, containing (i) any of SEQ ID NO: 77 or 127; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 15; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . According to another illustrative embodiment, provided herein is an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A, containing (i) any of SEQ ID NO: 92 or 106; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 7; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . According to another illustrative embodiment, provided herein is an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A, containing (i) any of SEQ ID NO: 92 or 106; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 14; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) . According to another illustrative embodiment, provided herein is an expression cassette comprising (1) a PV selective regulatory element comprising (i) SEQ ID NO: 2; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) , (2) a sequence encoding an eTF that activates SCN1A, containing (i) any of SEQ ID NO: 92 or 106; (ii) variant, functional fragment or combination
- 40 046157 цию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любым из (i) или (ii), и (3) селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, содержащий (i) SEQ ID NO: 15; (ii) вариант, функциональный фрагмент или комбинацию (i) или (iii) последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, по отношению к любому из (i) или (ii).- 40 046157 tion (i) or (iii) a nucleic acid sequence characterized by a sequence identity of at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii), and (3) a PV-selective miRNA binding site comprising (i) SEQ ID NO: 15; (ii) a variant, functional fragment or combination of (i) or (iii) a nucleic acid sequence having at least 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87 sequence identity %, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%, in relation to any of (i) or (ii) .
Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии, содержащая селективный в отношении PV регуляторный элемент и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, характеризующийся размером менее чем 5 т.п.н., 4,9 т.п.н., 4,8 т.п.н., 4,7 т.п.н., 4,6 т.п.н., 4,5 т.п.н., 4,4 т.п.н., 4,3 т.п.н., 4,2 т.п.н., 4,1 т.п.н., 4,0 т.п.н., 3,9 т.п.н., 3,8 т.п.н., 3,7 т.п.н., 3,6 т.п.н., 3,5 т.п.н., 3,4 т.п.н., 3,3 т.п.н., 3,2 т.п.н., 3,1 т.п.н., 3,0 т.п.н., 2,9 т.п.н., 2,8 т.п.н., 2,7 т.п.н., 2,6 т.п.н., 2,5 т.п.н., 2,4 т.п.н., 2,3 т.п.н., 2,2 т.п.н., 2,1 т.п.н., 2,0 т.п.н., 1,9 т.п.н., 1,8 т.п.н., 1,7 т.п.н., 1,6 т.п.н. или 1,5 т.п.н. или менее, или приблизительно 1,5-5 т.п.н., 1,5-4,7 т.п.н., 1,5-4,5 т.п.н., 1,5-4,0 т.п.н., 1,5-3,5 т.п.н., 1,5-3,0 т.п.н., 1,5-2,5 т.п.н., 1,5-2,0 т.п.н.In certain embodiments, an expression cassette provided herein comprising a PV-selective regulatory element and a PV-selective miRNA binding site characterized by a size of less than 5 kb, 4.9 kb, 4 ,8 kb, 4.7 kb, 4.6 kb, 4.5 kb, 4.4 kb, 4 ,3 kb, 4.2 kb, 4.1 kb, 4.0 kb, 3.9 kb, 3 ,8 kb, 3.7 kb, 3.6 kb, 3.5 kb, 3.4 kb, 3 ,3 kb, 3.2 kb, 3.1 kb, 3.0 kb, 2.9 kb, 2 ,8 kb, 2.7 kb, 2.6 kb, 2.5 kb, 2.4 kb, 2 ,3 kb, 2.2 kb, 2.1 kb, 2.0 kb, 1.9 kb, 1 ,8 kb, 1.7 kb, 1.6 kb. or 1.5 kb. or less, or about 1.5-5 kb, 1.5-4.7 kb, 1.5-4.5 kb, 1.5-4 ,0 kb, 1.5-3.5 kb, 1.5-3.0 kb, 1.5-2.5 kb. , 1.5-2.0 kb.
Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии может содержать еще один дополнительный регуляторный элемент в дополнение к промотору, такой как, например, последовательности, связанные с инициацией или окончанием транскрипции, энхансерные последовательности и эффективные сигналы процессинга РНК. Иллюстративные регуляторные элементы включают в себя, например, интрон, энхансер, UTR, элемент стабильности, последовательность WPRE, консенсусную последовательность Kozak, посттрансляционный элемент ответа, сайт связывания микроРНК или последовательность полиаденилирования (полиА) или их комбинацию. Регуляторные элементы могут функционировать, чтобы модулировать экспрессию генов на фазе транскрипции, посттранскрипционной фазе или на фазе трансляции экспрессии генов. На уровне РНК регуляция может происходить на уровне трансляции (например, элементы стабильности, которые стабилизируют мРНК для трансляции), расщепления РНК, сплайсинга РНК и/или терминации транскрипции. Согласно различным вариантам осуществления регуляторные элементы могут рекрутировать факторы транскрипции в кодирующую область, которые повышают избирательность экспрессии генов в представляющем интерес типе клеток, увеличивают скорость, с которой производятся транскрипты РНК, повышают стабильность производимой РНК и/или увеличивают скорость образования синтеза белка из транскриптов РНК. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленная в настоящем документе кассета экспрессии содержит по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, как предусмотрено в настоящем документе.In certain embodiments, an expression cassette provided herein may contain further additional regulatory elements in addition to a promoter, such as, for example, sequences associated with transcription initiation or termination, enhancer sequences, and effective RNA processing signals. Exemplary regulatory elements include, for example, an intron, an enhancer, a UTR, a stability element, a WPRE sequence, a Kozak consensus sequence, a post-translational response element, a microRNA binding site, or a polyadenylation (polyA) sequence, or a combination thereof. Regulatory elements can function to modulate gene expression during the transcriptional phase, posttranscriptional phase, or translational phase of gene expression. At the RNA level, regulation can occur at the level of translation (eg, stability elements that stabilize mRNA for translation), RNA cleavage, RNA splicing, and/or transcription termination. In various embodiments, regulatory elements may recruit transcription factors to the coding region that increase the selectivity of gene expression in the cell type of interest, increase the rate at which RNA transcripts are produced, increase the stability of the RNA produced, and/or increase the rate of production of protein synthesis from RNA transcripts. In an exemplary embodiment, an expression cassette provided herein comprises at least one PV-selective miRNA binding site as provided herein.
Согласно определенным вариантам осуществления описанные в настоящем документе кассеты экспрессии дополнительно содержат последовательность полиА. Подходящие последовательности полиА включают в себя, например, искусственный полиА длиной приблизительно 75 п.н. (PA75) (см., например, WO 2018/126116), полиА бычьего гормона роста, ранний сигнал полиА SV40, поздний сигнал полиА SV40, полиА бета-глобина кролика, полиА тимидинкиназы HSV, полиА гена протамина, полиА аденовируса 5 EIb, полиА гормона роста или полиА PBGD. Согласно иллюстративным вариантам осуществления последовательность полиА, подходящая для применения в представленных в настоящем документе кассетах экспрессии, представляет собой полиА hGH (SEQ ID NO: 17) или синтетический полиА (SEQ ID NO: 16). Как правило, последовательность полиА расположена ниже по ходу транскрипции от полинуклеотида, кодирующего eTF, в описанных в настоящем документе кассетах экспрессии.In certain embodiments, the expression cassettes described herein further comprise a polyA sequence. Suitable polyA sequences include, for example, an artificial polyA of approximately 75 bp in length. (PA75) (see e.g. WO 2018/126116), bovine growth hormone polyA, SV40 polyA early signal, SV40 late polyA signal, rabbit beta-globin polyA, HSV thymidine kinase polyA, protamine gene polyA, adenovirus 5 EIb polyA, polyA growth hormone or polyA PBGD. In exemplary embodiments, a polyA sequence suitable for use in the expression cassettes provided herein is hGH polyA (SEQ ID NO: 17) or synthetic polyA (SEQ ID NO: 16). Typically, the polyA sequence is located downstream of the polynucleotide encoding the eTF in the expression cassettes described herein.
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе кассеты экспрессии дополнительно содержат одну или несколько последовательностей нуклеиновых кислот, кодирующих один или несколько сигналов ядерной локализации (NLS). Может быть использован любой пептид NLS, который облегчает импорт белка, к которому прикреплен, в ядро клетки. Примеры NLS включают в себя, например, NLS большого T-антигена SV40, NLS нуклеоплазмина, NLS EGL-13, NLS cMyc и NLS TUS-белка. Смотрите, например, C. Dingwall et al., J. Cell Biol. 107: 841-9 (1988); J.P. Makkerh et al., Curr Biol. 6: 1025-7 (1996) и M. Ray et al., Bioconjug. Chem. 26: 1004-7 (2015). NLS может быть расположен в любом месте последовательности белка eTF, но согласно предпочтительным вариантам осуществления он конъюгирован с N-концом eTF или доменом eTF. Согласно иллюстративным вариантам осуществления представленные в настоящем документе кассеты нуклеиновых кислот кодируют eTF с NLS, слитым с N-концом eTF. Согласно другим вариантам осуществления представленные в настоящем документе кассеты нуклеиновых кислот кодируют eTF с первым NLS, слитым с N-концом eTF, и вторым NLS, расположенным между DBD и доменом TAD eTF.In certain embodiments, expression cassettes provided herein further comprise one or more nucleic acid sequences encoding one or more nuclear localization signals (NLS). Any NLS peptide that facilitates the import of the protein to which it is attached into the cell nucleus can be used. Examples of NLSs include, for example, SV40 large T antigen NLS, nucleoplasmin NLS, EGL-13 NLS, cMyc NLS, and TUS protein NLS. See, for example, C. Dingwall et al., J. Cell Biol. 107: 841-9 (1988); J.P. Makkerh et al., Curr Biol. 6: 1025-7 (1996) and M. Ray et al., Bioconjug. Chem. 26: 1004-7 (2015). The NLS can be located anywhere in the eTF protein sequence, but in preferred embodiments it is conjugated to the N-terminus of the eTF or an eTF domain. In exemplary embodiments, the nucleic acid cassettes provided herein encode an eTF with an NLS fused to the N-terminus of the eTF. In other embodiments, the nucleic acid cassettes provided herein encode an eTF with a first NLS fused to the N-terminus of the eTF and a second NLS located between the DBD and the TAD domain of the eTF.
Векторы экспрессии.Expression vectors.
Согласно определенным вариантам осуществления описанные в настоящем документе кассеты экспрессии могут быть включены в вектор экспрессии. Векторы экспрессии можно использовать для доставки кассеты экспрессии в целевую клетку посредством трансфекции или трансдукции. Вектор может представлять собой интегрирующий или неинтегрирующий вектор, что относится к способности вектораIn certain embodiments, expression cassettes described herein may be included in an expression vector. Expression vectors can be used to deliver an expression cassette to a target cell through transfection or transduction. A vector may be an integrating or non-integrating vector, which refers to the vector's ability
- 41 046157 интегрировать кассету экспрессии или трансген в геном клетки-хозяина. Примеры векторов экспрессии включают в себя, без ограничения, (a) невирусные векторы, такие как векторы нуклеиновых кислот, включая в себя линейные олигонуклеотиды и кольцевые плазмиды; искусственные хромосомы, такие как искусственные хромосомы человека (HAC), искусственные хромосомы дрожжей (YAC) и бактериальные искусственные хромосомы (BAC или PAC)); эписомальные векторы; транспозоны (например, PiggyBac); и (b) вирусные векторы, такие как ретровирусные векторы, лентивирусные векторы, аденовирусные векторы и аденоассоциированные вирусные векторы.- 41 046157 integrate an expression cassette or transgene into the genome of the host cell. Examples of expression vectors include, but are not limited to, (a) non-viral vectors such as nucleic acid vectors, including linear oligonucleotides and circular plasmids; artificial chromosomes such as human artificial chromosomes (HAC), yeast artificial chromosomes (YAC) and bacterial artificial chromosomes (BAC or PAC)); episomal vectors; transposons (eg PiggyBac); and (b) viral vectors, such as retroviral vectors, lentiviral vectors, adenoviral vectors and adeno-associated viral vectors.
Векторы экспрессии могут представлять собой линейные олигонуклеотиды или кольцевые плазмиды и могут быть доставлены в клетку с помощью различных способов трансфекции, включая в себя физические и химические способы. Физические способы, как правило, относятся к способам доставки, использующим физическую силу для противодействия барьеру клеточной мембраны для облегчения внутриклеточной доставки генетического материала. Примеры физических способов включают в себя использование иглы, баллистической ДНК, электропорацию, сонопорацию, фотопорацию, магнитофекцию и гидропорацию. Химические способы, как правило, относятся к способам, при которых химические носители доставляют молекулу нуклеиновой кислоты в клетку, и могут включать в себя неорганические частицы, векторы на основе липидов, векторы на основе полимеров и векторы на основе пептидов.Expression vectors can be linear oligonucleotides or circular plasmids and can be delivered into cells using a variety of transfection methods, including physical and chemical methods. Physical methods generally refer to delivery methods that use physical force to counteract a cell membrane barrier to facilitate intracellular delivery of genetic material. Examples of physical methods include the use of a needle, ballistic DNA, electroporation, sonoporation, photoporation, magnetofection and hydroporation. Chemical methods generally refer to methods in which chemical vehicles deliver a nucleic acid molecule into a cell, and may include inorganic particles, lipid-based vectors, polymer-based vectors and peptide-based vectors.
Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии вводят в целевую клетку с использованием катионного липида (например, катионной липосомы). Для доставки генов были исследованы различные типы липидов, такие как, например, липидная наноэмульсия (например, которая представляет собой дисперсию одной несмешивающейся жидкости в другой, стабилизированной эмульгирующим средством) или твердые липидные наночастицы.In certain embodiments, the expression vector is introduced into the target cell using a cationic lipid (eg, a cationic liposome). Various types of lipids have been explored for gene delivery, such as lipid nanoemulsion (eg, which is a dispersion of one immiscible liquid in another, stabilized by an emulsifying agent) or solid lipid nanoparticles.
Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии вводят в целевую клетку с использованием носителя для доставки на основе пептидов. Носители на основе пептидов могут иметь преимущества, заключающиеся в защите доставляемого генетического материала, нацеливании на специфические клеточные рецепторы, разрушении эндосомных мембран и доставке генетического материала в ядро. Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии вводят в целевую клетку с использованием носителя для доставки на основе полимера. Носители на основе полимеров могут содержать природные белки, пептиды и/или полисахариды или синтетические полимеры. Согласно одному варианту осуществления средство доставки на основе полимера содержит полиэтиленимин (PEI). PEI может конденсировать ДНК в положительно заряженные частицы, которые связываются с остатками анионной поверхности клетки и попадают в клетку посредством эндоцитоза. Согласно другим вариантам осуществления носитель для доставки на основе полимера может содержать поли-Ь-лизин (PLL), поли(DL-молочную кислоту) (PLA), поли^Ь-лактид-ко-гликозид) (PLGA), полиорнитин, полиаргинин, гистоны, протамины, дендримеры, хитозаны, синтетические аминопроизводные декстрана и/или катионные акриловые полимеры. Согласно определенным вариантам осуществления носители для доставки на основе полимеров могут включать в себя смесь полимеров, такую как, например, PEG и PLL.In certain embodiments, the expression vector is introduced into a target cell using a peptide-based delivery vehicle. Peptide-based carriers may have the advantages of protecting the delivered genetic material, targeting specific cellular receptors, disrupting endosomal membranes, and delivering genetic material to the nucleus. In certain embodiments, the expression vector is introduced into the target cell using a polymer-based delivery vehicle. Polymer-based carriers may contain natural proteins, peptides and/or polysaccharides or synthetic polymers. In one embodiment, the polymer-based delivery vehicle comprises polyethylenimine (PEI). PEI can condense DNA into positively charged particles that bind to anionic cell surface remnants and enter the cell through endocytosis. In other embodiments, the polymer-based delivery vehicle may comprise poly-L-lysine (PLL), poly(DL-lactic acid) (PLA), poly-L-lactide-co-glycoside (PLGA), polyornithine, polyarginine, histones, protamines, dendrimers, chitosans, synthetic amine derivatives of dextran and/or cationic acrylic polymers. In certain embodiments, polymer-based delivery vehicles may include a mixture of polymers, such as, for example, PEG and PLL.
Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии может представлять собой вирусный вектор, подходящий для генной терапии. Предпочтительные характеристики векторов вирусной генной терапии или векторов доставки генов могут включать в себя способность воспроизводимо и стабильно размножаться и очищаться до высоких титров; для опосредования направленной доставки (например, для доставки трансгена конкретно в представляющую интерес ткань или орган без широкого распространения вектора в другом месте); и опосредовать доставку гена и экспрессию трансгена, не вызывая вредных побочных эффектов.In certain embodiments, the expression vector may be a viral vector suitable for gene therapy. Preferred characteristics of viral gene therapy vectors or gene delivery vectors may include the ability to be reproducibly and stably propagated and purified to high titers; to mediate targeted delivery (eg, to deliver a transgene specifically to a tissue or organ of interest without widespread distribution of the vector elsewhere); and mediate gene delivery and transgene expression without causing harmful side effects.
Несколько типов вирусов, например, непатогенный парвовирус, называемый аденоассоциированным вирусом, были сконструированы для целей генной терапии, используя путь вирусной инфекции, но избегая последующей экспрессии вирусных генов, которая может привести к репликация и токсичности. Такие вирусные векторы можно получить путем удаления всех или некоторых кодирующих областей из вирусного генома, но оставив нетронутыми те последовательности (например, концевые повторяющиеся последовательности), которые могут быть необходимы для таких функций, как упаковка векторного генома в вирусный капсид или интеграция векторной нуклеиновой кислоты (например, ДНК) в хроматин хозяина.Several types of viruses, such as a non-pathogenic parvovirus called adeno-associated virus, have been engineered for gene therapy purposes, exploiting the viral infection pathway but avoiding subsequent viral gene expression, which can lead to replication and toxicity. Such viral vectors can be produced by removing all or some of the coding regions from the viral genome but leaving intact those sequences (e.g., terminal repeat sequences) that may be required for functions such as packaging the vector genome into the viral capsid or integrating the vector nucleic acid ( e.g. DNA) into host chromatin.
Согласно различным вариантам осуществления подходящие вирусные векторы включают в себя ретровирусы (например, вирусы A-типа, B-типа, C-типа и D-типа), аденовирус, парвовирус (например, аденоассоциированные вирусы или AAV), коронавирус, вирусы с отрицательно-полярной нитью РНК, такие как ортомиксовирус (например, вирус гриппа), рабдовирус (например, вирус бешенства и везикулярного стоматита), парамиксовирус (например, корь и Сендай), вирусы с положительно-полярной нитью РНК, такие как пикорнавирус и альфавирус, и двухцепочечные ДНК-вирусы, включая в себя аденовирус, вирус герпеса (например, вирус простого герпеса типов 1 и 2, вирус Эпштейна-Барра, цитомегаловирус) и поксвирус (например, коровьей оспы, оспы птиц и оспы канареек). Примеры ретровирусов включают в себя вирус лейкемии-саркомы птиц, человеческий T-лимфотрофный вирус типа 1 (HTLV-1), вирус лейкемии крупного рогатого скота (BLV), лентивирус и спумавирус. Другие вирусы включают в себя, например, вирус Норуолк, тогавирус, флавивирус, реовирусы, паповавирус, гепаднавирус и вирусIn various embodiments, suitable viral vectors include retroviruses (eg, A-type, B-type, C-type, and D-type viruses), adenovirus, parvovirus (eg, adeno-associated viruses or AAV), coronavirus, negative-infective viruses polar strand RNA such as orthomyxovirus (eg, influenza virus), rhabdovirus (eg, rabies and vesicular stomatitis virus), paramyxovirus (eg, measles and Sendai), positive strand RNA viruses such as picornavirus and alphavirus, and double-stranded DNA viruses, including adenovirus, herpes virus (eg, herpes simplex virus types 1 and 2, Epstein-Barr virus, cytomegalovirus), and poxvirus (eg, cowpox, fowlpox, and canarypox). Examples of retroviruses include avian leukemia-sarcoma virus, human T-lymphotrophic virus type 1 (HTLV-1), bovine leukemia virus (BLV), lentivirus, and spumavirus. Other viruses include, for example, Norwalk virus, togavirus, flavivirus, reoviruses, papovavirus, hepadnavirus, and
- 42 046157 гепатита. Вирусные векторы можно разделить на две группы в зависимости от их способности интегрироваться в геном хозяина - интегрирующиеся и неинтегрирующиеся. Онкоретровирусы и лентивирусы могут интегрироваться в хроматин клетки-хозяина, в то время как аденовирусы, аденоассоциированные вирусы и вирусы герпеса преимущественно сохраняются в ядре клетки в виде внехромосомных эписом.- 42 046157 hepatitis. Viral vectors can be divided into two groups depending on their ability to integrate into the host genome - integrating and non-integrating. Oncoretroviruses and lentiviruses can integrate into the chromatin of the host cell, while adenoviruses, adeno-associated viruses, and herpes viruses are predominantly retained in the cell nucleus as extrachromosomal episomes.
Согласно определенным вариантам осуществления подходящий вирусный вектор представляет собой ретровирусный вектор. Ретровирусы относятся к вирусам семейства Retroviridae. Примеры ретровирусов включают в себя онкоретровирусы, такие как вирус лейкемии мышей (MLV), и лентивирусы, такие как вирус иммунодефицита человека 1 (HIV-1). Ретровирусные геномы представляют собой одноцепочечные (оц) РНК и содержат различные гены, которые могут быть в цис- или транс-форме. Например, ретровирусный геном может содержать цис-действующие последовательности, такие как два длинных концевых повтора (LTR), с элементами для экспрессии генов, обратной транскрипции и интеграции в хромосомы хозяина. Другие компоненты включают в себя сигнал упаковки (psi или Ψ) для специфической упаковки РНК во вновь образованные вирионы и полипуриновый тракт (PPT), место инициации синтеза положительно-полярной нити ДНК во время обратной транскрипции. Кроме того, ретровирусный геном может содержать гены gag, pol и env. Ген gag кодирует структурные белки, ген pol кодирует ферменты, которые сопровождают оцРНК и осуществляют обратную транскрипцию вирусной РНК в ДНК, а ген env кодирует вирусную оболочку. Как правило, gag, pol и env предоставляются в транс для вирусной репликации и упаковки.In certain embodiments, a suitable viral vector is a retroviral vector. Retroviruses belong to the viruses of the Retroviridae family. Examples of retroviruses include oncoretroviruses such as murine leukemia virus (MLV) and lentiviruses such as human immunodeficiency virus 1 (HIV-1). Retroviral genomes are single-stranded (ss) RNAs and contain various genes that can be in cis or trans form. For example, a retroviral genome may contain cis-acting sequences, such as two long terminal repeats (LTRs), with elements for gene expression, reverse transcription, and integration into host chromosomes. Other components include the packaging signal (psi or Ψ) for the specific packaging of RNA into newly formed virions and the polypurine tract (PPT), the site of initiation of positive-strand DNA synthesis during reverse transcription. In addition, the retroviral genome may contain gag, pol and env genes. The gag gene encodes structural proteins, the pol gene encodes enzymes that accompany ssRNA and reverse transcription of viral RNA into DNA, and the env gene encodes the viral envelope. Typically, gag, pol, and env are provided in trans for viral replication and packaging.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе ретровирусный вектор может представлять собой лентивирусный вектор. Распознаются по меньшей мере пять серогрупп или серотипов лентивирусов. Вирусы разных серотипов могут по-разному инфицировать определенные типы клеток и/или хозяев. Лентивирусы, например, включают в себя ретровирусы приматов и ретровирусы неприматов. Ретровирусы приматов включают в себя HIV и вирус иммунодефицита обезьян (SIV). Ретровирусы неприматов включают в себя вирус иммунодефицита кошек (FIV), вирус иммунодефицита крупного рогатого скота (BIV), вирус артрита-энцефалита коз (CAEV), вирус инфекционной анемии лошадей (EIAV) и виснавирус. Лентивирусы или лентивекторы могут быть способны трансдуцировать покоящиеся клетки. Как и в случае онкоретровирусных векторов, конструкция лентивекторов может быть основана на разделении цис- и транс-действующих последовательностей.In certain embodiments, a retroviral vector provided herein may be a lentiviral vector. At least five serogroups or serotypes of lentiviruses are recognized. Viruses of different serotypes may infect certain types of cells and/or hosts differently. Lentiviruses, for example, include primate retroviruses and non-primate retroviruses. Primate retroviruses include HIV and simian immunodeficiency virus (SIV). Non-primate retroviruses include feline immunodeficiency virus (FIV), bovine immunodeficiency virus (BIV), caprine arthritis-encephalitis virus (CAEV), equine infectious anemia virus (EIAV), and visnavirus. Lentiviruses or lentivectors may be capable of transducing resting cells. As with oncoretroviral vectors, the design of lentivectors can be based on the separation of cis- and trans-acting sequences.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены векторы экспрессии, которые были разработаны для доставки с помощью оптимизированного терапевтического ретровирусного вектора. Ретровирусный вектор может представлять собой лентивирус, содержащий левый (5') LTR; последовательности, которые способствуют упаковке и/или ядерному импорту вируса; промотор; необязательно, один или несколько дополнительных регуляторных элементов (таких как, например, энхансер или последовательность полиА); необязательно лентивирусный элемент обратного ответа (RRE); конструкция, содержащая селективный регуляторный элемент PV, функционально связанный с последовательностью, кодирующей eTF; необязательно инсулятор и правый (3') ретровирусный LTR.In certain embodiments, the present application provides expression vectors that have been designed for delivery using an optimized therapeutic retroviral vector. The retroviral vector may be a lentivirus containing a left-handed (5') LTR; sequences that promote packaging and/or nuclear import of the virus; promoter; optionally, one or more additional regulatory elements (such as, for example, an enhancer or polyA sequence); optionally a lentiviral reverse response element (RRE); a construct containing a PV selective regulatory element operably linked to an eTF coding sequence; optionally an insulator and a right (3') retroviral LTR.
Согласно иллюстративным вариантам осуществления представленный в настоящем документе вирусный вектор представляет собой аденоассоциированный вирус (AAV). AAV представляет собой небольшой вирус животных без оболочки, дефектной репликации, который поражает людей и некоторые другие виды приматов. Известно, что AAV вызывает заболевание человека и вызывает умеренный иммунный ответ. Векторы AAV могут также инфицировать как делящиеся, так и покоящиеся клетки, не встраиваясь в геном клетки-хозяина.In exemplary embodiments, the viral vector provided herein is an adeno-associated virus (AAV). AAV is a small, non-enveloped, replication-defective animal virus that infects humans and several other primate species. AAV is known to cause human disease and induce a mild immune response. AAV vectors can also infect both dividing and quiescent cells without integrating into the host cell genome.
Геном AAV состоит из линейной одноцепочечной ДНК длиной ~4,7 т.п.н. Геном состоит из двух открытых рамок считывания (ORF), фланкированных последовательностью инвертированного концевого повтора (ITR) длиной приблизительно 145 п.н. ITR состоит из нуклеотидной последовательности на 5'конце (5' ITR) и нуклеотидной последовательности, расположенной на 3'-конце (3' ITR), которые содержат палиндромные последовательности. ITR функционируют в цис-системе путем сворачивания с образованием T-образных шпилечных структур за счет комплементарного спаривания оснований, которые действуют как праймеры во время инициации репликации ДНК для синтеза второй цепи. Две открытые рамки считывания кодируют гены rep и cap, которые участвуют в репликации и упаковке вириона. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленный в настоящем документе вектор AAV не содержит генов rep или cap. Такие гены могут быть представлены в транс для производства вирионов, как описано ниже.The AAV genome consists of linear single-stranded DNA ∼4.7 kb in length. The genome consists of two open reading frames (ORFs) flanked by an approximately 145-bp inverted terminal repeat (ITR) sequence. The ITR consists of a nucleotide sequence at the 5' end (5' ITR) and a nucleotide sequence located at the 3' end (3' ITR), which contain palindromic sequences. ITRs function in cis by folding to form T-shaped hairpin structures through complementary base pairing, which act as primers during the initiation of DNA replication for second-strand synthesis. Two open reading frames encode the rep and cap genes, which are involved in virion replication and packaging. In an exemplary embodiment, the AAV vector provided herein does not contain rep or cap genes. Such genes can be presented in trans to produce virions, as described below.
Согласно определенным вариантам осуществления вектор AAV может включать в себя лишнюю нуклеиновую кислоту. Согласно определенным вариантам осуществления лишняя нуклеиновая кислота может кодировать зеленый флуоресцентный белок или ген устойчивости к антибиотикам, таким как канамицин или ампициллин. Согласно определенным вариантам осуществления лишняя нуклеиновая кислота может быть расположена вне последовательностей ITR (например, по сравнению с последовательностью трансгена eTF и регуляторными последовательностями, которые расположены между 5' и 3' ITR-последовательностями).In certain embodiments, the AAV vector may include excess nucleic acid. In certain embodiments, the excess nucleic acid may encode a green fluorescent protein or an antibiotic resistance gene such as kanamycin or ampicillin. In certain embodiments, the excess nucleic acid may be located outside of the ITR sequences (eg, compared to the eTF transgene sequence and regulatory sequences that are located between the 5' and 3' ITR sequences).
Существуют различные серотипы AAV, включая в себя AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12 и AAV13. Эти серотипы различаются по своему тропизмуThere are different serotypes of AAV, including AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, and AAV13. These serotypes differ in their tropism
- 43 046157 или по типам клеток, которые они заражают. AAV могут содержать геном и капсиды из множества серотипов (например, псевдотипов). Например, AAV может содержать геном серотипа 2 (например, ITR), упакованный в капсид серотипа 5 или серотипа 9. Псевдотипы могут повышать эффективность трансдукции, а также изменять тропизм.- 43 046157 or by the types of cells they infect. AAVs may contain genomes and capsids from multiple serotypes (eg, pseudotypes). For example, AAV may contain a serotype 2 genome (eg, ITR) packaged within a serotype 5 or serotype 9 capsid. Pseudotypes may increase transduction efficiency as well as alter tropism.
В некоторых случаях предпочтителен серотип AAV, который может пересекать гематоэнцефалический барьер или инфицировать клетки ЦНС. В некоторых случаях AAV9 или его вариант используется для доставки кассеты экспрессии согласно настоящему раскрытию, содержащей селективный регуляторный элемент PV, функционально связанный с трансгеном, кодирующим eTF, который избирательно активирует SCN1A. В некоторых случаях AAV9 или его вариант используется для доставки кассеты экспрессии согласно настоящему раскрытию, содержащей селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. В некоторых случаях AAV9 или его вариант используется для доставки кассеты экспрессии согласно настоящему раскрытию, содержащей селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, кодирующим eTF, который селективно активирует SCN1A, и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК.In some cases, the AAV serotype is favored and can cross the blood-brain barrier or infect CNS cells. In some cases, AAV9 or a variant thereof is used to deliver an expression cassette of the present disclosure containing a PV selective regulatory element operably linked to a transgene encoding an eTF that selectively activates SCN1A. In some cases, AAV9 or a variant thereof is used to deliver an expression cassette of the present disclosure containing a PV-selective miRNA binding site. In some cases, AAV9 or a variant thereof is used to deliver an expression cassette of the present disclosure comprising a PV-selective regulatory element operably linked to a transgene encoding an eTF that selectively activates SCN1A and a PV-selective miRNA binding site.
Согласно иллюстративным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены векторы экспрессии, которые были разработаны для доставки с помощью AAV. AAV может быть любого серотипа, например, AAV1, AAV2, AAV3, AAV3b, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, AAV-DJ, или химерным, гибридным или вариантом AAV. AAV также может представлять собой самокомплементарный AAV (scAAV). Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии, разработанный для доставки с помощью AAV, содержит 5' ITR и 3' ITR. Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии, разработанный для доставки с помощью AAV, содержит 5' ITR, промотор, трансген, кодирующий eTF, и 3' ITR. Согласно определенным вариантам осуществления вектор экспрессии, разработанный для доставки с помощью AAV, содержит 5' ITR, энхансер, промотор, трансген, кодирующий eTF, последовательность полиА и 3' ITR.In exemplary embodiments, the present application provides expression vectors that have been designed for delivery by AAV. AAV can be of any serotype, for example, AAV1, AAV2, AAV3, AAV3b, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, AAV-DJ, or a chimeric, hybrid, or variant AAV. AAV may also be a self-complementary AAV (scAAV). In certain embodiments, an expression vector designed for delivery by AAV contains a 5' ITR and a 3' ITR. In certain embodiments, an expression vector designed for delivery by AAV comprises a 5' ITR, a promoter, a transgene encoding an eTF, and a 3' ITR. In certain embodiments, an expression vector designed for delivery by AAV comprises a 5' ITR, an enhancer, a promoter, a transgene encoding an eTF, a polyA sequence, and a 3' ITR.
Клетки-хозяева.Host cells.
Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к клетке-хозяину, содержащей кассету экспрессии или вектор экспрессии, как раскрыто в настоящем документе. Клетки-хозяева могут представлять собой бактериальную клетку, дрожжевую клетку, клетку насекомого или клетку млекопитающего. Согласно иллюстративному варианту осуществления под клеткой-хозяином понимается любая линия клеток, которая восприимчива к заражению представляющим интерес вирусом и поддается культивированию in vitro.In another aspect, the present invention relates to a host cell containing an expression cassette or expression vector as disclosed herein. The host cell may be a bacterial cell, a yeast cell, an insect cell, or a mammalian cell. In an exemplary embodiment, a host cell is any cell line that is susceptible to infection by the virus of interest and can be cultured in vitro.
Согласно определенным вариантам осуществления предложенная в настоящем документе клеткахозяин может использоваться для целей генной терапии ex vivo. Согласно таким вариантам осуществления клетки трансфицируют молекулой нуклеиновой кислоты или вектором экспрессии, содержащим селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, которая избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и затем трансплантируют пациенту или субъекту. Трансплантированные клетки могут иметь аутологичное, аллогенное или гетерологичное происхождение. Для клинического применения выделение клеток, как правило, проводят в условиях надлежащей производственной практики (GMP). Перед трансплантацией, как правило, проверяется качество клеток и отсутствие микробов или других загрязнителей, и может проводиться предварительное кондиционирование, такое как облучение и/или иммуносупрессивное лечение. Кроме того, клетки-хозяева можно трансплантировать вместе с факторами роста для стимуляции пролиферации и/или дифференцировки клеток.In certain embodiments, a host cell provided herein can be used for ex vivo gene therapy purposes. In such embodiments, cells are transfected with a nucleic acid molecule or expression vector containing a PV-selective miRNA binding site and/or an eTF coding sequence that selectively activates SCN1A, as described herein, and then transplanted into a patient or subject. The transplanted cells can be of autologous, allogeneic or heterologous origin. For clinical applications, cell isolation is typically performed under good manufacturing practice (GMP) conditions. Before transplantation, cell quality and absence of microbes or other contaminants are typically checked, and preconditioning such as radiation and/or immunosuppressive treatment may be performed. In addition, host cells can be transplanted along with growth factors to stimulate cell proliferation and/or differentiation.
Согласно определенным вариантам осуществления клетка-хозяин может использоваться для генной терапии ex vivo. Предпочтительно указанные клетки представляют собой эукариотические клетки, такие как клетки млекопитающих, они включают в себя, без ограничения, людей, отличных от людей приматов, таких как обезьяны; шимпанзе; мартышки и орангутаны, домашних животных, включая в себя собак и кошек, а также домашний скот, такой как лошади, крупный рогатый скот, свиньи, овцы и козы, или другие виды млекопитающих, включая в себя, без ограничения, мышей, крыс, морских свинок, кроликов, хомяков и т.п. Специалист в настоящей области техники выберет более подходящие клетки в соответствии с пациентом или объектом трансплантации.In certain embodiments, the host cell can be used for ex vivo gene therapy. Preferably, said cells are eukaryotic cells, such as mammalian cells, these include, without limitation, humans other than human primates such as monkeys; chimpanzee; monkeys and orangutans, domestic animals, including dogs and cats, and livestock such as horses, cattle, pigs, sheep and goats, or other species of mammals, including, but not limited to, mice, rats, sea pigs, rabbits, hamsters, etc. One skilled in the art will select more appropriate cells according to the patient or transplant recipient.
Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе клеткахозяин может представлять собой клетку со свойствами самообновления и плюрипотентности, например, стволовые клетки или индуцированные плюрипотентные стволовые клетки. Стволовые клетки предпочтительно представляют собой мезенхимальные стволовые клетки. Мезенхимальные стволовые клетки (MSC) способны дифференцироваться по меньшей мере в один из остеобластов, хондроцитов, адипоцитов или миоцитов и могут быть выделены из любого типа ткани. Как правило, MSC выделяют из костного мозга, жировой ткани, пуповины или периферической крови. Способы их получения хорошо известны специалисту в настоящей области техники. Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (также известные как iPS-клетки или iPSC) представляют собой тип плюрипотентных стволовых клеток, которые могут быть получены непосредственно из взрослых клеток. Yamanaka с соавт. индуцировали iPSклетки путем переноса генов Oct3/4, Sox2, Klf4 и c-Myc в фибробласты мыши и человека и вынуждаяIn certain embodiments, a host cell provided herein may be a cell with self-renewal and pluripotency properties, such as stem cells or induced pluripotent stem cells. The stem cells are preferably mesenchymal stem cells. Mesenchymal stem cells (MSCs) are capable of differentiating into at least one of osteoblasts, chondrocytes, adipocytes or myocytes and can be isolated from any tissue type. Typically, MSCs are isolated from bone marrow, adipose tissue, umbilical cord or peripheral blood. Methods for their preparation are well known to one skilled in the art. Induced pluripotent stem cells (also known as iPS cells or iPSCs) are a type of pluripotent stem cells that can be derived directly from adult cells. Yamanaka et al. induced iPS cells by transferring the Oct3/4, Sox2, Klf4 and c-Myc genes into mouse and human fibroblasts and forcing
- 44 046157 клетки экспрессировать гены (WO 2007/069666). Thomson с соавт. впоследствии производили iPS-клетки человека с использованием Nanog и Lin28 вместо Klf4 и c-Myc (WO 2008/118820).- 44 046157 cells to express genes (WO 2007/069666). Thomson et al. subsequently generated human iPS cells using Nanog and Lin28 instead of Klf4 and c-Myc (WO 2008/118820).
Согласно иллюстративному варианту осуществления представленная в настоящем документе клетка-хозяин представляет собой упаковывающую клетку. Указанные клетки могут представлять собой прикрепленные или суспензионные клетки. Упаковывающая клетка и вспомогательный вектор или вирус, или конструкция(и) ДНК обеспечивают вместе в транс все недостающие функции, которые требуются для полной репликации и упаковки вирусного вектора.In an exemplary embodiment, the host cell provided herein is a packaging cell. These cells may be adherent or suspension cells. The packaging cell and the helper vector or virus or DNA construct(s) provide together in trans all the missing functions that are required for complete replication and packaging of the viral vector.
Предпочтительно указанные упаковывающие клетки представляют собой эукариотические клетки, такие как клетки млекопитающих, включая в себя клетки обезьян, человека, собак и грызунов. Примерами клеток человека являются клетки PER.C6 (WO01/38362), MRC-5 (ATCC CCL-171), WI-38 (ATCC CCL-75), клетки HEK-293 (ATCC CRL-1573), клетки HeLa (ATCC CCL2) и фетальные клетки легких резус (ATCC CL-160). Примерами клеток отличных от людей приматов являются клетки Vero (ATCC CCL81), клетки COS-1 (ATCC CRL-1650) или клетки COS-7 (ATCC CRL-1651). Примерами клеток собаки являются клетки MDCK (ATCC CCL-34). Примерами клеток грызунов являются клетки хомяка, такие как BHK21-F, клетки HKCC или клетки CHO.Preferably, said packaging cells are eukaryotic cells, such as mammalian cells, including monkey, human, canine and rodent cells. Examples of human cells are PER.C6 cells (WO01/38362), MRC-5 (ATCC CCL-171), WI-38 (ATCC CCL-75), HEK-293 cells (ATCC CRL-1573), HeLa cells (ATCC CCL2 ) and fetal rhesus lung cells (ATCC CL-160). Examples of non-human primate cells are Vero cells (ATCC CCL81), COS-1 cells (ATCC CRL-1650) or COS-7 cells (ATCC CRL-1651). Examples of canine cells are MDCK cells (ATCC CCL-34). Examples of rodent cells are hamster cells such as BHK21-F cells, HKCC cells or CHO cells.
В качестве альтернативы источникам млекопитающих клеточные линии для применения в настоящем изобретении могут быть получены из источников птиц, таких как курица, утка, гусь, перепел или фазан. Примеры птичьих клеточных линий включают в себя птичьи эмбриональные стволовые клетки (WO01/85938 и WO03/076601), иммортализованные клетки сетчатки утки (WO2005/042728) и клетки, полученные из птичьих эмбриональных стволовых клеток, включая в себя клетки курицы (WO2006/108846) или клетки утки, такие как клеточная линия EB66 (WO2008/129058 и WO2008/142124).As an alternative to mammalian sources, cell lines for use in the present invention can be obtained from avian sources, such as chicken, duck, goose, quail or pheasant. Examples of avian cell lines include avian embryonic stem cells (WO01/85938 and WO03/076601), immortalized duck retinal cells (WO2005/042728) and cells derived from avian embryonic stem cells, including chicken cells (WO2006/108846) or duck cells such as the EB66 cell line (WO2008/129058 and WO2008/142124).
Согласно другому варианту осуществления указанные клетки-хозяева представляют собой клетки насекомых, такие как клетки SF9 (ATCC CRL-1711), клетки Sf21 (IPLB-Sf21), клетки MG1 (BTI-TNMG1) или клетки High Five™ (BTI-TN-5B1-4).In another embodiment, said host cells are insect cells, such as SF9 cells (ATCC CRL-1711), Sf21 cells (IPLB-Sf21), MG1 cells (BTI-TNMG1) or High Five™ cells (BTI-TN-5B1 -4).
Согласно определенным вариантам осуществления представленные в настоящем документе клеткихозяева, содержащие рекомбинантный вектор/геном AAV по настоящему изобретению (например, содержащие селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A), могут дополнительно содержать одну или несколько конструкций нуклеиновых кислот, такие как, например, (i) конструкция нуклеиновой кислоты (например, плазмида-помощник AAV), которая кодирует гены rep и cap, но не несет последовательностей ITR; и/или (ii) конструкция нуклеиновой кислоты (например, плазмида), обеспечивающая аденовирусные функции, необходимые для репликации AAV. Согласно иллюстративному варианту осуществления представленная в настоящем документе клетка-хозяин содержит: i) вектор экспрессии, содержащий селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, как предусмотрено в настоящем документе (т.е. рекомбинантный геном AAV); ii) конструкцию нуклеиновой кислоты, кодирующую гены rep и cap AAV, которая не несет последовательности ITR; и iii) конструкцию нуклеиновой кислоты, содержащую аденовирусные гены-помощники (как описано ниже).In certain embodiments, host cells provided herein containing a recombinant AAV vector/genome of the present invention (e.g., containing a PV-selective miRNA binding site and/or a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A) may further comprise one or more nucleic acid constructs, such as, for example, (i) a nucleic acid construct (eg, an AAV helper plasmid) that encodes the rep and cap genes but does not carry ITR sequences; and/or (ii) a nucleic acid construct (eg, a plasmid) providing the adenoviral functions required for AAV replication. In an exemplary embodiment, a host cell provided herein comprises: i) an expression vector comprising a PV-selective miRNA binding site and/or a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as provided herein (i.e., recombinant AAV genome); ii) a nucleic acid construct encoding the AAV rep and cap genes that does not carry an ITR sequence; and iii) a nucleic acid construct containing adenoviral helper genes (as described below).
Согласно определенным вариантам осуществления гены-помощники rep, cap и аденовируса могут быть объединены в одной плазмиде (Blouin V et al. J Gene Med. 2004; 6(suppl): S223-S228; Grimm D. et al. Hum. Gene Ther. 2003; 7: 839-850). Таким образом, согласно другому иллюстративному варианту осуществления представленная в настоящем документе клетка-хозяин содержит: i) вектор экспрессии, содержащий селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, которая избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе (т.е. рекомбинантный геном AAV); и ii) плазмиду, кодирующую гены rep и cap AAV, которая не несет последовательности ITR и дополнительно содержит гены-помощники аденовирусов.In certain embodiments, rep, cap, and adenovirus helper genes can be combined in a single plasmid (Blouin V et al. J Gene Med. 2004; 6(suppl): S223-S228; Grimm D. et al. Hum. Gene Ther. 2003;7:839-850). Thus, in another exemplary embodiment, a host cell provided herein comprises: i) an expression vector comprising a PV-selective miRNA binding site and/or an eTF coding sequence that selectively activates SCN1A as disclosed herein (i.e. i.e. recombinant AAV genome); and ii) a plasmid encoding the rep and cap genes of AAV, which does not carry the ITR sequence and additionally contains adenovirus helper genes.
Согласно другому варианту осуществления представленная в настоящем документе клетка-хозяин содержит: a) вектор экспрессии, содержащий селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, которая избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе (т.е. геном рекомбинантного AAV); b) плазмиду, кодирующую гены rep и cap AAV, которая не несет последовательности ITR; и c) плазмиду, содержащую аденовирусные РНК геновпомощников E2a, E4 и VA; причем котрансфекция выполняется в клетках, предпочтительно в клетках млекопитающих, которые конститутивно экспрессируют и характеризуются транскомплементацией к аденовирусному гену E1, как клетки HEK-293 (ATCC CRL-1573).In another embodiment, a host cell provided herein comprises: a) an expression vector containing a PV-selective miRNA binding site and/or a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein (i.e., a genome recombinant AAV); b) a plasmid encoding the rep and cap genes of AAV, which does not carry the ITR sequence; and c) a plasmid containing adenoviral RNA helper genes E2a, E4 and VA; wherein the cotransfection is performed in cells, preferably mammalian cells, that constitutively express and are transcomplemented to the adenoviral E1 gene, such as HEK-293 cells (ATCC CRL-1573).
Согласно определенным вариантам осуществления клетка-хозяин, подходящая для крупномасштабного производства векторов AAV, представляет собой клетки насекомых, которые можно инфицировать комбинацией рекомбинантных бакуловирусов (Urabe et al. Hum. Gene Ther. 2002; 13: 1935-1943). Например, клетки SF9 могут быть совместно инфицированы тремя бакуловирусными векторами, соответственно экспрессирующими rep AAV, cap AAV и упаковываемый вектор AAV. Рекомбинантные бакуловирусные векторы будут обеспечивать функции вирусного гена-помощника, необходимые для репликации и/или упаковки вируса.In certain embodiments, a host cell suitable for large-scale production of AAV vectors is insect cells that can be infected with a combination of recombinant baculoviruses (Urabe et al. Hum. Gene Ther. 2002; 13: 1935-1943). For example, SF9 cells can be co-infected with three baculovirus vectors, respectively expressing AAV rep, AAV cap and AAV packaging vector. Recombinant baculovirus vectors will provide viral helper gene functions necessary for viral replication and/or packaging.
Дополнительное руководство по конструированию и производству вирионов для генной терапииAdditional guidance on the design and production of virions for gene therapy
- 45 046157 согласно настоящему изобретению можно найти в: Viral Vectors for Gene Therapy, Methods and Protocols. Series: Methods in Molecular Biology, Vol. 737. Merten and Al-Rubeai (Eds.); 2011 Humana Press (Springer); Gene Therapy. M. Giacca. 2010 Springer-Verlag; Heilbronn R. and Weger S. Viral Vectors for Gene Transfer: Current Status of Gene Therapeutics. In: Drug Delivery, Handbook of Experimental Pharmacology 197; M. Schafer-Korting (Ed.). 2010 Springer-Verlag; pp. 143-170; Adeno-Associated Virus: Methods and Protocols. R. O. Snyder and P. Moulllier (Eds). 2011 Humana Press (Springer); Bunning H. et al. Recent developments in adeno-associated virus technology. J. Gene Med. 2008; 10:717-733 и Adenovirus: Methods and Protocols. M. Chillon and A. Bosch (Eds.); Third. Edition. 2014 Humana Press (Springer).- 45 046157 according to the present invention can be found in: Viral Vectors for Gene Therapy, Methods and Protocols. Series: Methods in Molecular Biology, Vol. 737. Merten and Al-Rubeai (Eds.); 2011 Humana Press (Springer); Gene Therapy. M. Giacca. 2010 Springer-Verlag; Heilbronn R. and Weger S. Viral Vectors for Gene Transfer: Current Status of Gene Therapeutics. In: Drug Delivery, Handbook of Experimental Pharmacology 197; M. Schafer-Korting (Ed.). 2010 Springer-Verlag; pp. 143-170; Adeno-Associated Virus: Methods and Protocols. R. O. Snyder and P. Moullier (Eds). 2011 Humana Press (Springer); Bunning H. et al. Recent developments in adeno-associated virus technology. J. Gene Med. 2008; 10:717-733 and Adenovirus: Methods and Protocols. M. Chillon and A. Bosch (Eds.); Third. Edition. 2014 Humana Press (Springer).
Вирионы и способы получения вирионов.Virions and methods for obtaining virions.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены вирусные частицы, содержащие вирусный вектор, содержащий селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе. Термины вирусная частица и вирион используются в настоящем документе взаимозаменяемо и относятся к инфекционной и, как правило, дефектной по репликации вирусной частице, содержащей вирусный геном (например, вектор вирусной экспрессии), упакованный внутри капсида, и, в зависимости от случая, например, для ретровирусов - липидную оболочку, окружающую капсид. Капсид относится к структуре, в которую упакован вирусный геном. Капсид состоит из нескольких олигомерных структурных субъединиц, состоящих из белков. Например, у AAV есть икосаэдрический капсид, образованный взаимодействием трех капсидных белков: VP1, VP2 и VP3. Согласно одному варианту осуществления представленный в настоящем документе вирион представляет собой рекомбинантный вирион AAV или вирион rAAV, полученный путем упаковки вектора AAV, содержащего селективный в отношении PV регуляторный элемент и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно другому варианту осуществления представленный в настоящем документе вирион представляет собой рекомбинантный вирион AAV или вирион rAAV, полученный путем упаковки вектора AAV, содержащего селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с последовательностью, кодирующей eTF, которая избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, в белковой оболочке. Согласно другому варианту осуществления представленный в настоящем документе вирион представляет собой рекомбинантный вирион AAV или вирион rAAV, полученный путем упаковки вектора AAV, содержащего селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с последовательностью, кодирующей eTF, которая избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК в белковой оболочке.In certain embodiments, the present application provides viral particles comprising a viral vector comprising a PV-selective miRNA binding site and/or a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein. The terms viral particle and virion are used interchangeably herein and refer to an infectious and typically replication-defective viral particle containing a viral genome (e.g., a viral expression vector) packaged within a capsid and, as appropriate, e.g. retroviruses - a lipid membrane surrounding the capsid. Capsid refers to the structure in which the viral genome is packaged. The capsid consists of several oligomeric structural subunits consisting of proteins. For example, AAV has an icosahedral capsid formed by the interaction of three capsid proteins: VP1, VP2, and VP3. In one embodiment, the virion provided herein is a recombinant AAV virion or rAAV virion produced by packaging an AAV vector containing a PV-selective regulatory element and a PV-selective miRNA binding site. In another embodiment, the virion provided herein is a recombinant AAV virion or rAAV virion produced by packaging an AAV vector containing a PV-selective regulatory element operably linked to an eTF coding sequence that selectively activates SCN1A, as described herein , in a protein shell. In another embodiment, the virion provided herein is a recombinant AAV virion or rAAV virion produced by packaging an AAV vector containing a PV-selective regulatory element operably linked to an eTF coding sequence that selectively activates SCN1A, as described herein , and a PV-selective miRNA binding site in the protein shell.
Согласно определенным вариантам осуществления представленный в настоящем документе рекомбинантный вирион AAV может быть получен путем инкапсидации генома AAV, полученного из определенного серотипа AAV, в вирусную частицу, образованную природными белками Cap, соответствующими AAV того же конкретного серотипа. Согласно другим вариантам осуществления представленная в настоящем документе вирусная частица AAV содержит вирусный вектор, содержащий ITR данного серотипа AAV, упакованный в белки из другого серотипа. Смотрите, например, Bunning H et al. J Gene Med 2008; 10: 717-733. Например, вирусный вектор, имеющий ITR из данного серотипа AAV, может быть упакован в: a) вирусную частицу, состоящую из капсидных белков, полученных из того же или другого серотипа AAV (например, ITR AAV2 и капсидных белков AAV9; ITR AAV2 и капсидных белков AAV8 и т.п.); b) мозаичную вирусную частицу, состоящую из смеси капсидных белков из различных серотипов или мутантов AAV (например, ITR AAV2 с капсидными белками AAV1 и AAV9); c) химерную вирусную частицу, состоящую из капсидных белков, которые были усечены перестановкой доменов между различными серотипами или вариантами AAV (например, ITR AAV2 с белками капсида AAV8 с доменами AAV9); или d) нацеленную вирусную частицу, сконструированную для отображения селективных связывающих доменов, обеспечивающих строгое взаимодействие со специфическими рецепторами целевой клетки (например, ITR AAV5 с капсидными белками AAV9, генетически усеченными путем вставки пептидного лиганда; или капсидные белки AAV9, не модифицированные генетически путем связывания пептидного лиганда на поверхности капсида).In certain embodiments, a recombinant AAV virion provided herein can be produced by encapsidating an AAV genome derived from a specific AAV serotype into a viral particle formed by naturally occurring Cap proteins corresponding to AAVs of the same specific serotype. In other embodiments, an AAV viral particle provided herein comprises a viral vector containing the ITR of a given AAV serotype packaged into proteins from a different serotype. See for example Bunning H et al. J Gene Med 2008; 10: 717-733. For example, a viral vector having an ITR from a given AAV serotype can be packaged into: a) a viral particle consisting of capsid proteins derived from the same or a different AAV serotype (e.g., AAV2 ITR and AAV9 capsid proteins; AAV2 ITR and capsid proteins AAV8, etc.); b) a mosaic viral particle consisting of a mixture of capsid proteins from different AAV serotypes or mutants (eg, ITR AAV2 with capsid proteins AAV1 and AAV9); c) a chimeric viral particle consisting of capsid proteins that have been truncated by domain shuffling between different AAV serotypes or variants (eg, AAV2 ITR with AAV8 capsid proteins with AAV9 domains); or d) a targeted viral particle designed to display selective binding domains that ensure strict interaction with specific target cell receptors (e.g., AAV5 ITR with AAV9 capsid proteins genetically truncated by insertion of a peptide ligand; or AAV9 capsid proteins not genetically modified by binding a peptide ligand on the surface of the capsid).
Квалифицированному специалисту будет понятно, что представленный в настоящем документе вирион AAV может содержать капсидные белки любого серотипа AAV. Согласно одному варианту осуществления вирусная частица содержит капсидные белки из серотипа AAV, выбранного из группы, состоящей из AAV1, AAV2, AAV5, AAV8 и AAV9, которые более подходят для доставки в ЦНС (M. Hocquemiller et al., Hum Gene Ther 27(7): 478-496 (2016)). Согласно конкретному варианту осуществления вирусная частица содержит кассету экспрессии по настоящему изобретению, в которой последовательности 5'ITR и 3'ITR кассеты экспрессии относятся к серотипу AAV2, а белки капсида относятся к серотипу AAV9.One of ordinary skill in the art will appreciate that the AAV virion provided herein may contain capsid proteins of any AAV serotype. In one embodiment, the viral particle contains capsid proteins from an AAV serotype selected from the group consisting of AAV1, AAV2, AAV5, AAV8 and AAV9, which are more suitable for delivery to the CNS (M. Hocquemiller et al., Hum Gene Ther 27(7 ): 478-496 (2016)). In a specific embodiment, the viral particle comprises an expression cassette of the present invention, wherein the 5'ITR and 3'ITR sequences of the expression cassette are serotype AAV2 and the capsid proteins are serotype AAV9.
В настоящей области техники известны многочисленные способы получения вирионов rAAV, включая в себя трансфекцию, получение стабильных клеточных линий и системы производства инфекционных гибридных вирусов, которые включают в себя гибриды аденовирус-AAV, гибриды герпесвирус-AAV (Conway, J E et al., (1997) J. Virology 71(11):8780-8789) и гибриды бакуловирус-AAV. Все кульNumerous methods for producing rAAV virions are known in the art, including transfection, production of stable cell lines, and infectious hybrid virus production systems that include adenovirus-AAV hybrids, herpesvirus-AAV hybrids (Conway, J E et al., (1997) ) J. Virology 71(11):8780–8789) and baculovirus-AAV hybrids. Everything is cool
- 46 046157 туры производства rAAV для производства вирусных частиц rAAV требуют: 1) подходящие клеткихозяева, включая в себя, например, клеточные линии человеческого происхождения, такие как клетки HeLa, A549 или 293, или клеточные линии, полученные из насекомых, такие как SF-9, в случае систем производства бакуловирусов; 2) подходящей функции вируса-помощника, обеспечиваемой аденовирусом дикого типа или мутантным аденовирусом (таким как чувствительный к температуре аденовирус), вирусом герпеса, бакуловирусом или плазмидной конструкцией, обеспечивающей вспомогательные функции; 3) гены rep и cap AAV и генные продукты; 4) трансген (например, содержащий один или несколько из: селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, последовательность, кодирующую eTF, которая избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективный в отношении PV промотор), фланкированный последовательностями ITR AAV; и 5) подходящие носители и компоненты среды для поддержки производства rAAV.- 46 046157 rAAV production rounds for the production of rAAV viral particles require: 1) suitable host cells, including, for example, cell lines of human origin, such as HeLa, A549 or 293 cells, or cell lines derived from insects, such as SF- 9, in the case of baculovirus production systems; 2) a suitable helper virus function provided by a wild-type or mutant adenovirus (such as a temperature-sensitive adenovirus), a herpes virus, a baculovirus, or a plasmid construct providing helper functions; 3) AAV rep and cap genes and gene products; 4) a transgene (eg, containing one or more of: a PV-selective microRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein, and/or a PV-selective promoter) flanked by AAV ITR sequences ; and 5) suitable media and media components to support rAAV production.
Согласно различным вариантам осуществления описанные в настоящем документе клетки-хозяева содержат следующие три компонента: (1) ген rep и ген cap, (2) гены, обеспечивающие вспомогательные функции, и (3) трансген (например, содержащий один или несколько из: селективного в отношении PV сайта связывания микроРНК, последовательности, кодирующей eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективного в отношении PV промотора), фланкированных ITR. Ген rep AAV, ген cap AAV и гены, обеспечивающие вспомогательные функции, могут быть введены в клетку путем включения указанных генов в вектор, такой как, например, плазмида, и введения указанного вектора в клетку-хозяина. Гены rep, cap и гены, обеспечивающие вспомогательные функции, могут быть включены в одну и ту же плазмиду или в разные плазмиды. Согласно предпочтительному варианту осуществления гены rep и cap AAV включены в одну плазмиду, а гены, обеспечивающие вспомогательные функции, включены в другую плазмиду. Различные плазмиды для создания клетки-хозяина для производства вирионов (например, содержащие гены rep и cap AAV, вспомогательных функций или трансген) могут быть введены в клетку с использованием любого подходящего способа, хорошо известного в настоящей области техники. Примеры способов трансфекции включают в себя, без ограничения, соосаждение с фосфатом кальция, DEAE-декстраном, полибреном, электропорацию, микроинъекцию, опосредованное липосомами слияние, липофекцию, ретровирусную инфекцию и биолистическую трансфекцию. Согласно определенным вариантам осуществления плазмиды, обеспечивающие гены rep и cap, вспомогательные функции и трансген, фланкированный ITR, могут быть введены в клетку одновременно. Согласно другому варианту осуществления плазмиды, обеспечивающие гены rep и cap и вспомогательные функции, могут быть введены в клетку до или после введения плазмиды, содержащей трансген. Согласно иллюстративному варианту осуществления клетки трансфицируют одновременно тремя плазмидами (например, способом тройной трансфекции): (1) плазмидой, содержащей трансген (например, содержащей один или несколько из: селективного в отношении PV сайта связывания микроРНК, последовательности, кодирующей eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективного в отношении PV промотора), фланкированного ITR, (2) плазмидой, содержащей гены rep и cap AAV, и (3) плазмидой, содержащей гены, обеспечивающие вспомогательные функции. Иллюстративные клетки-хозяева могут представлять собой клетки 293, A549 или HeLa.In various embodiments, the host cells described herein contain the following three components: (1) a rep gene and a cap gene, (2) genes providing accessory functions, and (3) a transgene (for example, containing one or more of: a selective regarding a PV miRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein, and/or a PV-selective promoter) flanked by the ITR. The AAV rep gene, the AAV cap gene, and genes providing accessory functions can be introduced into a cell by incorporating the genes into a vector, such as a plasmid, and introducing the vector into a host cell. The rep, cap, and accessory function genes may be included in the same plasmid or in different plasmids. In a preferred embodiment, the AAV rep and cap genes are included on one plasmid, and the genes providing accessory functions are included on another plasmid. Various plasmids to create a host cell for virion production (eg, containing AAV rep and cap genes, accessory functions, or a transgene) can be introduced into the cell using any suitable method well known in the art. Examples of transfection methods include, but are not limited to, coprecipitation with calcium phosphate, DEAE-dextran, polybrene, electroporation, microinjection, liposome-mediated fusion, lipofection, retroviral infection, and biolistic transfection. In certain embodiments, plasmids providing rep and cap genes, accessory functions, and an ITR-flanked transgene can be introduced into a cell simultaneously. In another embodiment, plasmids providing rep and cap genes and accessory functions can be introduced into the cell before or after introduction of the plasmid containing the transgene. In an exemplary embodiment, cells are simultaneously transfected with three plasmids (e.g., in a triple transfection manner): (1) a plasmid containing a transgene (e.g., containing one or more of: a PV-selective microRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A , as described herein, and/or a PV-selective promoter) flanked by an ITR, (2) a plasmid containing the AAV rep and cap genes, and (3) a plasmid containing genes providing accessory functions. Exemplary host cells may be 293, A549, or HeLa cells.
Согласно другим вариантам осуществления один или несколько из (1) генов rep и cap AAV, (2) генов, обеспечивающих вспомогательные функции, и (3) трансгена (например, содержащего один или несколько из: селективного в отношении PV сайта связывания микроРНК, последовательности, кодирующей eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективного в отношении PV промотора), фланкированного ITR, может переноситься упаковывающей клеткой либо эписомально, либо интегрироваться в геном упаковывающей клетки. Согласно одному варианту осуществления клетки-хозяева могут представлять собой упаковывающие клетки, в которых гены rep и cap AAV и гены, обеспечивающие вспомогательные функции, стабильно поддерживаются в клеткехозяине, и клетка-хозяин временно трансфицируется плазмидой, содержащей трансген (например, содержащей один или несколько из: селективного в отношении PV сайта связывания микроРНК, последовательности, кодирующей eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективного в отношении PV промотора), фланкированный ITR. Согласно другому варианту осуществления клетки-хозяева представляют собой упаковывающие клетки, в которых гены rep и cap AAV стабильно поддерживаются в клетке-хозяине, и клетка-хозяин временно трансфицируется плазмидой, содержащей трансген (например, содержащей один или несколько из следующего: селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, последовательность, кодирующая eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективный в отношении PV промотор), фланкированный ITR и плазмидой, содержащей вспомогательные функции. Согласно другому варианту осуществления клетки-хозяева могут представлять собой упаковывающие клетки, в которых вспомогательные функции стабильно поддерживаются в клетке-хозяине, и клетка-хозяин временно трансфицируется плазмидой, содержащей трансген (например, содержащий один или несколько из следующего: селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, последовательность, кодирующая eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективныйIn other embodiments, one or more of (1) the AAV rep and cap genes, (2) genes providing accessory functions, and (3) a transgene (e.g., comprising one or more of: a PV-selective miRNA binding site, a sequence, encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein and/or a PV-selective promoter) flanked by an ITR can be carried by the packaging cell either episomally or integrated into the genome of the packaging cell. In one embodiment, the host cells may be packaging cells in which the AAV rep and cap genes and genes providing accessory functions are stably maintained in the host cell, and the host cell is transiently transfected with a plasmid containing the transgene (e.g., containing one or more of : a PV-selective miRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein, and/or a PV-selective promoter) flanked by an ITR. In another embodiment, the host cells are packaging cells in which the AAV rep and cap genes are stably maintained in the host cell, and the host cell is transiently transfected with a plasmid containing the transgene (e.g., containing one or more of the following: PV-selective a microRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein, and/or a PV-selective promoter) flanked by an ITR and a plasmid containing accessory functions. In another embodiment, the host cells may be packaging cells in which accessory functions are stably maintained in the host cell, and the host cell is transiently transfected with a plasmid containing a transgene (e.g., containing one or more of the following: a PV-selective binding site miRNA, sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as described herein, and/or selective
- 47 046157 в отношении PV промотор), фланкированный ITR, и плазмидой, содержащей гены rep и cap. Согласно другому варианту осуществления клетки-хозяева могут представлять собой клеточные линиипродуценты, которые стабильно трансфицируются генами rep и cap, генами, обеспечивающими вспомогательные функции, и последовательностью трансгена (например, содержащего одно или несколько из следующего: селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, последовательность, кодирующая eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективный в отношении PV промотор), фланкированного ITR. Иллюстративные упаковывающие клетки и клетки-продуценты могут происходить из клеток 293, A549 или HeLa.- 47 046157 in relation to the PV promoter), flanked by ITR, and a plasmid containing the rep and cap genes. In another embodiment, the host cells may be producer cell lines that are stably transfected with rep and cap genes, genes providing accessory functions, and a transgene sequence (e.g., containing one or more of the following: a PV-selective miRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as described herein, and/or a PV-selective promoter) flanked by an ITR. Exemplary packaging and production cells may be derived from 293, A549, or HeLa cells.
Согласно другому варианту осуществления линия клеток-продуцентов представляет собой линию клеток насекомых (как правило, клетки Sf9), которые инфицированы векторами экспрессии бакуловируса, которые обеспечивают белки Rep и Cap. Для этой системы не требуются гены-помощники аденовируса (Ayuso E, et al., Curr. Gene Ther. 2010, 10:423-436).In another embodiment, the producer cell line is an insect cell line (typically Sf9 cells) that is infected with baculovirus expression vectors that provide Rep and Cap proteins. This system does not require adenovirus helper genes (Ayuso E, et al., Curr. Gene Ther. 2010, 10:423-436).
Используемый в настоящем документе термин белок cap относится к полипептиду, обладающему по меньшей мере одной функциональной активностью нативного белка cap AAV (например, VP1, VP2, VP3). Примеры функциональной активности белков cap включают в себя способность индуцировать образование капсида, способствовать накоплению одноцепочечной ДНК, облегчать упаковку ДНК AAV в капсиды (т.е. инкапсидацию), связываться с клеточными рецепторами и облегчать проникновение вириона в клетки-хозяева. В принципе, в контексте настоящего изобретения можно использовать любой белок Cap.As used herein, the term cap protein refers to a polypeptide having at least one functional activity of the native AAV cap protein (eg, VP1, VP2, VP3). Examples of the functional activities of cap proteins include the ability to induce capsid formation, promote the accumulation of single-stranded DNA, facilitate packaging of AAV DNA into capsids (ie, encapsidation), bind to cellular receptors, and facilitate virion entry into host cells. In principle, any Cap protein can be used in the context of the present invention.
Сообщалось, что белки cap влияют на тропизм хозяина, специфичность клеток, тканей или органов, использование рецепторов, эффективность заражения и иммуногенность вирусов AAV. Соответственно, cap AAV для применения в rAAV может быть выбран с учетом, например, вида субъекта (например, человека или не человека), иммунологического состояния субъекта, его пригодности для длительного или краткосрочного лечения или конкретного терапевтического применения (например, лечение конкретного заболевания или нарушения или доставка в определенные клетки, ткани или органы). Согласно определенным вариантам осуществления белок cap происходит из группы AAV, состоящей из серотипов AAV1, AAV2, AAV5, AAV8 и AAV9. Согласно иллюстративному варианту осуществления белок cap происходит из AAV9.Cap proteins have been reported to influence host tropism, cell, tissue, or organ specificity, receptor utilization, infection efficiency, and immunogenicity of AAVs. Accordingly, the AAV cap for use in rAAV may be selected based on, for example, the species of the subject (eg, human or non-human), the immunological condition of the subject, its suitability for long-term or short-term treatment, or the particular therapeutic use (eg, treatment of a particular disease or disorder or delivery to specific cells, tissues or organs). In certain embodiments, the cap protein is from the AAV group consisting of serotypes AAV1, AAV2, AAV5, AAV8, and AAV9. In an exemplary embodiment, the cap protein is derived from AAV9.
Согласно некоторым вариантам осуществления cap AAV для применения в способе по настоящему изобретению может быть получен путем мутагенеза (т.е. путем вставок, делеций или замен) одного из вышеупомянутых cap AAV или кодирующей его нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления cap AAV по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% или 99% или более аналогичен одному или нескольким из вышеупомянутых cap AAV.In some embodiments, a cap AAV for use in a method of the present invention can be produced by mutagenesis (ie, insertions, deletions, or substitutions) of one of the above cap AAVs or the nucleic acid encoding it. In certain embodiments, the cap AAV is at least 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, or 99% or more similar to one or more of the aforementioned cap AAV.
Согласно некоторым вариантам осуществления cap AAV является химерным и содержит домены из двух, трех, четырех или более из вышеупомянутых cap AAV. Согласно определенным вариантам осуществления cap AAV представляет собой мозаику мономеров VP1, VP2 и VP3, происходящих из двух или трех различных AAV или рекомбинантного AAV. Согласно определенным вариантам осуществления композиция rAAV содержит более одного из вышеупомянутых cap.In some embodiments, cap AAV is chimeric and contains domains from two, three, four, or more of the above cap AAVs. In certain embodiments, cap AAV is a mosaic of VP1, VP2, and VP3 monomers derived from two or three different AAVs or recombinant AAV. In certain embodiments, the rAAV composition contains more than one of the above-mentioned caps.
Согласно некоторым вариантам осуществления cap AAV для применения в вирионе rAAV сконструирован таким образом, чтобы он содержал гетерологичную последовательность или другую модификацию. Например, последовательность пептида или белка, обеспечивающая избирательное нацеливание или уклонение от иммунитета, может быть преобразована в белок cap. В качестве альтернативы или в дополнение, cap может быть химически модифицирован так, чтобы поверхность rAAV была полиэтиленгликолированной (т.е. пегилированной), что может способствовать уклонению от иммунитета. Белок cap также может быть мутагенизирован (например, для удаления его естественного связывания с рецептором или для маскировки иммуногенного эпитопа).In some embodiments, the AAV cap for use in an rAAV virion is designed to contain a heterologous sequence or other modification. For example, a peptide or protein sequence that provides selective targeting or immune evasion can be converted into a cap protein. Alternatively or in addition, cap can be chemically modified so that the surface of rAAV is polyethylene glycolated (i.e., PEGylated), which may facilitate immune evasion. The cap protein can also be mutagenized (eg, to remove its natural receptor binding or to mask an immunogenic epitope).
Используемый в настоящем документе термин белок rep относится к полипептиду, обладающему по меньшей мере одной функциональной активностью нативного белка rep AAV (например, rep 40, 52, 68, 78). Примеры функциональной активности белка rep включают в себя любую активность, связанную с физиологической функцией белка, включая в себя облегчение репликации ДНК посредством распознавания, связывания и отсечения ориджина AAV репликации ДНК, а также активности ДНК-геликазы. Дополнительные функции включают в себя модуляцию транскрипции с промоторов AAV (или других гетерологичных) и сайт-специфическую интеграцию ДНК AAV в хромосому хозяина. Согласно конкретному варианту осуществления гены rep AAV могут происходить из серотипов AAV1, AAV2, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10 или AAVrh10; более предпочтительно из серотипа AAV, выбранного из группы, состоящей из AAV1, AAV2, AAV5, AAV8 и AAV9.As used herein, the term rep protein refers to a polypeptide having at least one of the functional activities of the native AAV rep protein (eg, rep 40, 52, 68, 78). Examples of the functional activity of rep protein include any activity associated with the physiological function of the protein, including facilitating DNA replication by recognizing, binding and terminating the AAV origin of DNA replication, as well as DNA helicase activity. Additional functions include modulation of transcription from AAV (or other heterologous) promoters and site-specific integration of AAV DNA into the host chromosome. In a specific embodiment, the AAV rep genes may be from serotypes AAV1, AAV2, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, or AAVrh10; more preferably from an AAV serotype selected from the group consisting of AAV1, AAV2, AAV5, AAV8 and AAV9.
Согласно определенным вариантам осуществления белок rep AAV для применения в способе по настоящему изобретению может быть получен путем мутагенеза (т.е. путем вставок, делеций или замен) одного из вышеупомянутых rep AAV или его кодирующей нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления rep AAV по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% или 99% или более аналогичен одному или нескольким из вышеупомянутых rep AAV.In certain embodiments, the rep AAV protein for use in the method of the present invention can be obtained by mutagenesis (ie, insertions, deletions, or substitutions) of one of the above rep AAVs or its encoding nucleic acid. In certain embodiments, the rep AAV is at least 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, or 99% or more similar to one or more of the above rep AAVs.
Использованные в настоящем документе выражения вспомогательные функции или геныThe expressions used herein for auxiliary functions or genes
- 48 046157 помощники относятся к вирусным белкам, репликация которых зависит от AAV. Вспомогательные функции включают в себя те белки, которые необходимы для репликации AAV, включая в себя, без ограничения, те белки, которые участвуют в активации транскрипции гена AAV, стадиеспецифическом сплайсинге мРНК AAV, репликации ДНК AAV, синтезе продуктов экспрессии cap и сборке капсида AAV. Вспомогательные функции на основе вирусов могут быть получены из любого из известных вспомогательных вирусов, таких как аденовирус, вирус герпеса (кроме вируса простого герпеса типа 1) и вирус осповакцины. Вспомогательные функции включают в себя, без ограничения, аденовирус E1, E2a, VA и E4 или герпесвирус UL5, ULB, UL52 и UL29 и герпесвирусную полимеразу. Согласно предпочтительному варианту осуществления белки, от которых зависит репликация AAV, происходят от аденовируса.- 48 046157 helpers refer to viral proteins whose replication depends on AAV. Accessory functions include those proteins that are required for AAV replication, including, but not limited to, those proteins that are involved in AAV gene transcription activation, stage-specific AAV mRNA splicing, AAV DNA replication, synthesis of cap expression products, and AAV capsid assembly. Virus-based helper functions can be derived from any of the known helper viruses, such as adenovirus, herpes virus (other than herpes simplex virus type 1), and vaccinia virus. Accessory functions include, but are not limited to, adenovirus E1, E2a, VA and E4 or herpesvirus UL5, ULB, UL52 and UL29 and herpesvirus polymerase. In a preferred embodiment, the proteins on which AAV replication depends are derived from the adenovirus.
Согласно определенным вариантам осуществления вирусный белок, репликация которого зависит от AAV, для применения в способе по настоящему изобретению может быть получен путем мутагенеза (т.е. путем вставок, делеций или замен) одного из вышеупомянутых вирусных белков или кодирующей его нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления вирусный белок по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% или 99% или более аналогичен одному или нескольким из вышеупомянутых вирусных белков.In certain embodiments, a viral protein dependent on AAV for replication for use in a method of the present invention may be produced by mutagenesis (ie, insertions, deletions, or substitutions) of one of the aforementioned viral proteins or the nucleic acid encoding the same. In certain embodiments, the viral protein is at least 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, or 99% or more similar to one or more of the aforementioned viral proteins.
Способы анализа функций белков cap, белков rep и вирусных белков, от которых зависит репликация AAV, хорошо известны в настоящей области техники.Methods for analyzing the functions of cap proteins, rep proteins, and viral proteins on which AAV replication depends are well known in the art.
Клетки-хозяева для экспрессии представляющего интерес трансгена (например, содержащие одно или несколько из следующего: селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, последовательность, кодирующая eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, и/или селективный в отношении PV промотор) могут быть выращены в условиях, подходящих для сборки вирионов AAV. Согласно определенным вариантам осуществления клетки-хозяева выращивают в течение подходящего периода времени, чтобы способствовать сборке вирионов AAV и высвобождению вирионов в среду. Как правило, клетки можно выращивать в течение приблизительно 24 часов, приблизительно 36 часов, приблизительно 48 часов, приблизительно 72 часов, приблизительно 4 дней, приблизительно 5 дней, приблизительно 6 дней, приблизительно 7 дней, приблизительно 8 дней, приблизительно 9 дней или до приблизительно 10 дней. Приблизительно через 10 дней (или раньше, в зависимости от условий культивирования и конкретной используемой клетки-хозяина) уровень продукции, как правило, значительно снижается. Как правило, время культивирования измеряется с момента образования вируса. Например, в случае AAV производство вируса, как правило, начинается после обеспечения функции вируса-помощника в соответствующей клетке-хозяине, как описано в настоящем документе. Как правило, клетки собирают от приблизительно 48 до приблизительно 100, предпочтительно от приблизительно 48 до приблизительно 96, предпочтительно от приблизительно 72 до приблизительно 96, предпочтительно от приблизительно 68 до приблизительно 72 часов после заражения вирусом-помощником (или после начала производства вируса).Host cells for expression of the transgene of interest (e.g., containing one or more of the following: a PV-selective microRNA binding site, a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A as described herein, and/or a PV-selective promoter ) can be grown under conditions suitable for the assembly of AAV virions. In certain embodiments, host cells are grown for a suitable period of time to facilitate the assembly of AAV virions and the release of virions into the medium. Typically, cells can be grown for about 24 hours, about 36 hours, about 48 hours, about 72 hours, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 7 days, about 8 days, about 9 days, or up to about 10 days. After approximately 10 days (or sooner, depending on culture conditions and the specific host cell used), production levels typically decrease significantly. Typically, culture time is measured from the time the virus is produced. For example, in the case of AAV, virus production typically begins after the viral helper function has been established in the appropriate host cell, as described herein. Typically, cells are harvested from about 48 to about 100, preferably from about 48 to about 96, preferably from about 72 to about 96, preferably from about 68 to about 72 hours after infection with the helper virus (or after the start of virus production).
Культуры-продуценты rAAV можно выращивать в различных условиях (в широком диапазоне температур, в течение различных периодов времени и т.п.), подходящих для конкретной используемой клетки-хозяина. Культуры производства rAAV включают в себя культуры, зависящие от прикрепления, которые можно культивировать в подходящих емкостях, зависящих от прикрепления, таких как, например, вращающиеся флаконы, фильтры из полого волокна, микроносители и биореакторы с уплотненным слоем или с псевдоожиженным слоем. Культуры производства вектора rAAV могут также включать в себя адаптированные к суспензии клетки-хозяева, такие как клетки HeLa, 293 и SF-9, которые можно культивировать различными способами, включая в себя, например, вращающиеся колбы, биореакторы с мешалкой и одноразовые системы, такие как система одноразовых реакторов фирмы Wave.rAAV-producing cultures can be grown under a variety of conditions (a wide range of temperatures, for varying periods of time, etc.) suitable for the particular host cell used. rAAV production cultures include attachment-dependent cultures that can be cultured in suitable attachment-dependent containers, such as, for example, spinner flasks, hollow fiber filters, microcarriers, and packed-bed or fluidized-bed bioreactors. rAAV vector production cultures may also include suspension-adapted host cells, such as HeLa, 293, and SF-9 cells, which can be cultured in a variety of ways, including, for example, spinner flasks, stirred tank bioreactors, and single-use systems such as as a system of disposable reactors from Wave.
Подходящие среды, известные в настоящей области техники, могут использоваться для производства вирионов rAAV. Эти среды включают в себя, без ограничения, среды, производимые Hyclone Laboratories и JRH, включая в себя модифицированную среду Игла (MEM), модифицированную Дульбекко среду Игла (DMEM), каждая из которых полностью включена в настоящий документ посредством ссылки. Согласно определенным вариантам осуществления культуральная среда для производства rAAV может быть дополнена сывороткой или полученными из сыворотки рекомбинантными белками на уровне 0,5-20% (в объемном отношении или массово-объемном отношении). Альтернативно, векторы rAAV могут быть получены в бессывороточных условиях, которые также могут называться средами без продуктов животного происхождения.Suitable media known in the art can be used to produce rAAV virions. These media include, without limitation, media manufactured by Hyclone Laboratories and JRH, including modified Eagle's medium (MEM), Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM), each of which is incorporated herein by reference in its entirety. In certain embodiments, the rAAV production culture medium may be supplemented with serum or serum-derived recombinant proteins at a level of 0.5-20% (vol/vol or w/v). Alternatively, rAAV vectors can be produced under serum-free conditions, which may also be referred to as animal product-free environments.
После культивирования клеток-хозяев, чтобы обеспечить производство вирионов AAV, полученные вирионы могут быть собраны и очищены. Согласно определенным вариантам осуществления вирионы AAV могут быть получены из (1) клеток-хозяев производственной культуры путем лизиса клеток-хозяев и/или (2) культуральной среды указанных клеток через период времени после трансфекции, предпочтительно 72 часа. Вирионы rAAV могут быть собраны из отработанной среды из производственной культуры при условии, что клетки культивируются в условиях, которые вызывают высвобождение вирионов rAAV в среду из интактных клеток (см., например, патент США № 6566118). Подходящие способы лизирования клеток также известны в настоящей области техники и включают в себя, например, несколько циклов замораживания/оттаивания, обработку ультразвуком, микрофлюидизацию и обработку химичеAfter culturing the host cells to allow production of AAV virions, the resulting virions can be collected and purified. In certain embodiments, AAV virions can be obtained from (1) production culture host cells by lysis of the host cells and/or (2) the culture medium of said cells over a period of time after transfection, preferably 72 hours. rAAV virions can be collected from waste medium from a production culture, provided that the cells are cultured under conditions that cause rAAV virions to be released into the medium from intact cells (see, for example, US Pat. No. 6,566,118). Suitable methods for lysing cells are also known in the art and include, for example, multiple freeze/thaw cycles, sonication, microfluidization, and chemical treatment.
- 49 046157 скими веществами, такими как детергенты и/или протеазы.- 49 046157 chemical substances such as detergents and/or proteases.
После сбора вирионы rAAV могут быть очищены. Используемый в настоящем документе термин очищенный включает в себя препарат вирионов rAAV, лишенный по меньшей мере некоторых других компонентов, которые также могут присутствовать там, где вирионы rAAV встречаются в природе или из которых изначально получены. Таким образом, например, очищенные вирионы rAAV могут быть получены с использованием способа выделения для обогащения их из исходной смеси, такой как лизат культуры или супернатант производственной культуры. Обогащение можно измерить множеством способов, например, по доле устойчивых к ДНКазам частиц (DRP) или копий генома (gc), присутствующих в растворе, или по инфекционности, или его можно измерить по отношению к второму, потенциально мешающему веществу, присутствующему в исходной смеси, такому как загрязняющие вещества, включая в себя загрязняющие вещества производственной культуры или технологические загрязняющие вещества, включая в себя вирус-помощник, компоненты среды и т.п.Once harvested, rAAV virions can be purified. As used herein, the term purified includes a preparation of rAAV virions that is devoid of at least some other components that may also be present where rAAV virions occur naturally or from which they are originally derived. Thus, for example, purified rAAV virions can be obtained using an isolation method to enrich them from a starting mixture such as a culture lysate or production culture supernatant. Enrichment can be measured in a variety of ways, for example by the proportion of DNase-resistant particles (DRPs) or genome copies (gc) present in a solution, or by infectivity, or it can be measured relative to a second, potentially interfering substance present in the original mixture. such as pollutants, including industrial culture pollutants or technological pollutants, including a helper virus, environmental components, etc.
Согласно определенным вариантам осуществления выход культуры производства rAAV можно осветлить для удаления остатков клеток-хозяев. Согласно некоторым вариантам осуществления выход культуры производства можно осветлить с использованием множества стандартных технологий, таких как центрифугирование или фильтрация через фильтр с размером пор 0,2 мкм или более (например, фильтр из ацетата целлюлозы или серия глубинных фильтров).In certain embodiments, the rAAV production culture yield can be clarified to remove host cell debris. In some embodiments, the production culture yield can be clarified using a variety of standard technologies, such as centrifugation or filtration through a filter with a pore size of 0.2 μm or larger (eg, a cellulose acetate filter or a series of depth filters).
Согласно определенным вариантам осуществления выход культуры для производства rAAV дополнительно обрабатывают бензоназой™ для расщепления любой высокомолекулярной ДНК, присутствующей в производственной культуре. Согласно некоторым вариантам осуществления расщепление бензоназой™ проводят в стандартных условиях, например, при конечной концентрации 1-2,5 единиц/мл бензоназы™ при температуре от температуры окружающей среды до 37°C в течение периода от 30 минут до нескольких часов.In certain embodiments, the rAAV production culture yield is further treated with Benzonase™ to digest any high molecular weight DNA present in the production culture. In some embodiments, the benzonase™ digestion is performed under standard conditions, for example, at a final concentration of 1-2.5 units/ml benzonase™ at a temperature between ambient temperature and 37°C for a period of 30 minutes to several hours.
Согласно определенным вариантам осуществления вирионы rAAV могут быть выделены или очищены с использованием одной или нескольких из следующих стадий очистки: равновесное центрифугирование; проточная анионообменная фильтрация; тангенциальная проточная фильтрация (TFF) для концентрирования частиц rAAV; захват rAAV с помощью апатитовой хроматографии; тепловая инактивация вируса-помощника; захват rAAV с помощью хроматографии гидрофобного взаимодействия; замена буфера с помощью эксклюзионной хроматографии (SEC); нанофильтрация и захват rAAV с помощью анионообменной хроматографии, катионообменной хроматографии или аффинной хроматографии. Эти стадии можно использовать по отдельности, в различных комбинациях или в разном порядке. Способы очистки частиц rAAV можно найти, например, в Xiao et al., (1998) Journal of Virology 72:2224-2232; патентах США № 6989264 и 8137948 и WO 2010/148143.In certain embodiments, rAAV virions can be isolated or purified using one or more of the following purification steps: equilibrium centrifugation; flow anion exchange filtration; tangential flow filtration (TFF) to concentrate rAAV particles; rAAV capture by apatite chromatography; heat inactivation of the helper virus; capture of rAAV by hydrophobic interaction chromatography; buffer exchange using size exclusion chromatography (SEC); nanofiltration and capture of rAAV using anion exchange chromatography, cation exchange chromatography or affinity chromatography. These steps can be used individually, in different combinations, or in different orders. Methods for purifying rAAV particles can be found, for example, in Xiao et al., (1998) Journal of Virology 72:2224-2232; US patents No. 6989264 and 8137948 and WO 2010/148143.
Согласно определенным вариантам осуществления очищенные вирионы AAV можно подвергнуть диализу против PBS, отфильтровать и хранить при температуре -80°C. Титры вирусных геномов можно определить с помощью количественной ПЦР с использованием линеаризованной плазмидной ДНК в качестве стандартной кривой (см., например, Lock M, et al., Hum. Gene Ther. 2010; 21:1273-1285).In certain embodiments, purified AAV virions can be dialyzed against PBS, filtered, and stored at -80°C. Viral genome titers can be determined by quantitative PCR using linearized plasmid DNA as a standard curve (see, for example, Lock M, et al., Hum. Gene Ther. 2010; 21:1273-1285).
Фармацевтические композиции.Pharmaceutical compositions.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены композиции, содержащие селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, и фармацевтически приемлемый носитель. Согласно другим вариантам осуществления в настоящей заявке представлены вирионы, содержащие селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или последовательность, кодирующую eTF, который избирательно активирует SCN1A, и фармацевтически приемлемый носитель. Согласно иллюстративным вариантам осуществления такие композиции подходят для применения в генной терапии. Фармацевтические композиции предпочтительно стерильны и стабильны в условиях производства и хранения. Стерильные растворы могут быть получены, например, путем фильтрации через стерильные фильтрующие мембраны.In certain embodiments, the present application provides compositions comprising a PV-selective miRNA binding site and/or a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, and a pharmaceutically acceptable carrier. In other embodiments, the present application provides virions comprising a PV-selective miRNA binding site and/or a sequence encoding an eTF that selectively activates SCN1A, and a pharmaceutically acceptable carrier. In exemplary embodiments, such compositions are suitable for use in gene therapy. The pharmaceutical compositions are preferably sterile and stable under conditions of manufacture and storage. Sterile solutions can be prepared, for example, by filtration through sterile filter membranes.
Приемлемые носители и вспомогательные вещества в фармацевтических композициях предпочтительно нетоксичны для реципиентов в используемых дозировках и концентрациях. Приемлемые носители и вспомогательные вещества могут включать в себя такие буферы, как фосфатный, цитратный, HEPES и TAE, такие антиоксиданты, как аскорбиновая кислота и метионин, такие консерванты, как гексаметоний хлорид, октадецилдиметилбензиламмонийхлорид, резорцин и хлорид бензалкония, такие белки, как сывороточный альбумин человека, желатин, декстран и иммуноглобулины, такие гидрофильные полимеры, как поливинилпирролидон, такие аминокислоты, как глицин, глутамин, гистидин и лизин, и такие углеводы, как глюкоза, манноза, сахароза и сорбитол. Фармацевтические композиции по настоящему раскрытию можно вводить парентерально в форме инъекционной композиции. Фармацевтические композиции для инъекций могут быть составлены с использованием стерильного раствора или любой фармацевтически приемлемой жидкости в качестве носителя. Фармацевтически приемлемые носители включают в себя, без ограничения, стерильную воду и физиологический раствор.Acceptable carriers and excipients in pharmaceutical compositions are preferably non-toxic to recipients at the dosages and concentrations used. Acceptable carriers and excipients may include buffers such as phosphate, citrate, HEPES and TAE, antioxidants such as ascorbic acid and methionine, preservatives such as hexamethonium chloride, octadecyldimethylbenzylammonium chloride, resorcinol and benzalkonium chloride, proteins such as serum albumin human, gelatin, dextran and immunoglobulins, hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone, amino acids such as glycine, glutamine, histidine and lysine, and carbohydrates such as glucose, mannose, sucrose and sorbitol. The pharmaceutical compositions of the present disclosure can be administered parenterally in the form of an injectable composition. Pharmaceutical compositions for injection can be formulated using a sterile solution or any pharmaceutically acceptable liquid as a carrier. Pharmaceutically acceptable carriers include, but are not limited to, sterile water and saline.
Фармацевтические композиции по настоящему раскрытию могут быть приготовлены в микрокапThe pharmaceutical compositions of the present disclosure can be formulated in microcaps
- 50 046157 сулах, таких как гидроксилметилцеллюлозные или желатиновые микрокапсулы и микрокапсулы из полиметилметакрилата. Фармацевтические композиции по настоящему раскрытию также могут быть приготовлены в других системах доставки лекарственных средств, таких как липосомы, микросферы альбумина, микроэмульсии, наночастицы и нанокапсулы. Фармацевтическая композиция для генной терапии может быть в приемлемом разбавителе или может содержать матрицу с медленным высвобождением, в которую встроен носитель для доставки гена.- 50 046157 sulakh, such as hydroxyl methylcellulose or gelatin microcapsules and polymethyl methacrylate microcapsules. The pharmaceutical compositions of the present disclosure can also be formulated in other drug delivery systems such as liposomes, albumin microspheres, microemulsions, nanoparticles and nanocapsules. The pharmaceutical composition for gene therapy may be in a suitable diluent or may comprise a slow release matrix into which a gene delivery vehicle is embedded.
Представленные в настоящем документе фармацевтические композиции могут быть составлены для парентерального введения, подкожного введения, внутривенного введения, внутримышечного введения, внутриартериального введения, интрапаренхимального введения, интратекального введения, введения в мостомозжечковую цистерну, интрацеребровентрикулярного введения или внутрибрюшинного введения. Фармацевтическая композиция также может быть приготовлена или вводиться путем назального введения, посредством спрея, перорального, аэрозольного, ректального или вагинального введения. Согласно одному варианту осуществления представленная в настоящем документе фармацевтическая композиция вводится в ЦНС или спинномозговую жидкость (CSF), т.е. путем интрапаренхимальной инъекции, интратекальной инъекции, инъекции в мостомозжечковую цистерну или интрацеребровентрикулярной инъекции. Тканевая мишень может быть специфической, например, ЦНС, или может представлять собой комбинацию нескольких тканей, например, мышечных тканей и тканей ЦНС. Иллюстративная ткань или другие мишени могут включать в себя печень, скелетные мышцы, сердечную мышцу, жировые отложения, почки, легкие, эндотелий сосудов, эпителиальные клетки, кроветворные клетки, ЦНС и/или CSF. Согласно предпочтительному варианту осуществления представленная в настоящем документе фармацевтическая композиция, содержащая селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или eTF, который избирательно активирует SCN1A, вводится инъекцией в ЦНС или спинномозговую жидкость, т.е. путем интрапаренхимальной инъекции, интратекальной инъекции, инъекции в мостомозжечковую цистерну или интрацеребровентрикулярной инъекции. Один или несколько из этих способов можно использовать для введения фармацевтической композиции по настоящему раскрытию.The pharmaceutical compositions provided herein may be formulated for parenteral administration, subcutaneous administration, intravenous administration, intramuscular administration, intraarterial administration, intraparenchymal administration, intrathecal administration, intracerebellopontine administration, intracerebroventricular administration, or intraperitoneal administration. The pharmaceutical composition may also be prepared or administered by nasal, spray, oral, aerosol, rectal or vaginal administration. In one embodiment, a pharmaceutical composition provided herein is administered into the CNS or cerebrospinal fluid (CSF), i.e. by intraparenchymal injection, intrathecal injection, injection into the cerebellopontine cistern, or intracerebroventricular injection. The tissue target may be specific, such as the CNS, or may be a combination of several tissues, such as muscle and CNS tissues. Exemplary tissue or other targets may include liver, skeletal muscle, cardiac muscle, fat, kidney, lung, vascular endothelium, epithelial cells, hematopoietic cells, CNS and/or CSF. In a preferred embodiment, a pharmaceutical composition provided herein comprising a PV-selective miRNA and/or eTF binding site that selectively activates SCN1A is injected into the CNS or cerebrospinal fluid, i.e. by intraparenchymal injection, intrathecal injection, injection into the cerebellopontine cistern, or intracerebroventricular injection. One or more of these methods can be used to administer the pharmaceutical composition of the present disclosure.
Согласно определенным вариантам осуществления представленная в настоящем документе фармацевтическая композиция содержит эффективное количество или терапевтически эффективное количество. В контексте настоящего описания такие количества относятся к количеству, эффективному в дозировках и в течение периодов времени, необходимых для достижения желаемого терапевтического результата, такого как повышение уровня экспрессии SCN1A и/или уменьшение частоты и/или продолжительности припадков.In certain embodiments, a pharmaceutical composition provided herein comprises an effective amount or a therapeutically effective amount. As used herein, such amounts refer to an amount effective in dosages and for periods of time necessary to achieve the desired therapeutic effect, such as increasing the level of SCN1A expression and/or reducing the frequency and/or duration of seizures.
Дозировка фармацевтических композиций по настоящему раскрытию зависит от факторов, включающих в себя путь введения, заболевание, которое необходимо лечить, и физические характеристики (например, возраст, массу, общее состояние здоровья) субъекта. Дозировка может быть скорректирована для обеспечения оптимального терапевтического ответа. Как правило, дозировка может представлять собой количество, которое эффективно лечит заболевание, не вызывая значительной токсичности. Согласно одному варианту осуществления представленный в настоящем документе вектор AAV можно вводить пациенту для лечения дефицита SCNIA (включая в себя, например, синдром Драве) в количестве или дозе в диапазоне от 5х 1011 до 1 х 1014 гк/кг (количество геномных копий на килограмм массы тела пациента (гк/кг)). Согласно более конкретному варианту осуществления вектор AAV вводят в количестве, которое находится в диапазоне от приблизительно 5х 1011 гк/кг до приблизительно 3х1013 гк/кг или от приблизительно 1х1012до приблизительно 1 х 1014 гк/кг, или от приблизительно 1 х 1012 до приблизительно 1х1013 гк/кг, или приблизительно 5х1011 гк/кг, 1х1012 гк/кг, 1,5х1012 гк/кг, 2,0х1012 гк/кг, 2,5х1012 гк/кг, 3х1012 гк/кг, 3,5х1012 гк/кг, 4х1012 гк/кг, 4,5х1012 гк/кг, 5х1012 гк/кг, 5,5х1012 гк/кг, 6х1012 гк/кг, 6,5х1012 гк/кг, 7х1012 гк/кг, 7,5х1012 гк/кг, 8х1012 гк/кг, 8,5х1012 гк/кг, 9х1012 гк/кг или 9,5х1012 гк/кг. гк/кг можно определить, например, с помощью кПЦР или цифровой капельной ПЦР (ddPCR) (см., например, M. Lock et al, Hum Gene Ther Methods. 2014 Apr;25(2): 115-25). Согласно другому варианту осуществления представленный в настоящем документе вектор AAV можно вводить пациенту для лечения дефицита SCNIA (включая в себя, например, синдром Драве) в количестве или дозе в диапазоне от 1х 109 до 1х 1011 iu/кг (инфекционные единицы вектора (ш)/масса тела субъекта или пациента (кг)). Согласно определенным вариантам осуществления фармацевтическая композиция может быть приготовлена в виде стандартной дозы по мере необходимости. Такие единичные дозированные единицы могут содержать от приблизительно 1х109 gc до приблизительно 1 х 1015 gc.The dosage of the pharmaceutical compositions of the present disclosure depends on factors including the route of administration, the disease to be treated, and the physical characteristics (eg, age, weight, general health) of the subject. Dosage may be adjusted to ensure optimal therapeutic response. Typically, the dosage may be an amount that effectively treats the disease without causing significant toxicity. In one embodiment, the AAV vector provided herein can be administered to a patient for the treatment of SCNIA deficiency (including, for example, Dravet syndrome) in an amount or dose ranging from 5 x 10 11 to 1 x 10 14 gc/kg (number of genomic copies per kilogram of patient's body weight (gk/kg)). In a more specific embodiment, the AAV vector is administered in an amount that ranges from about 5 x 10 11 gc/kg to about 3 x 10 13 gc/kg, or from about 1 x 10 12 to about 1 x 10 14 gc/kg, or from about 1 x 10 12 to approximately 1x10 13 gk/kg, or approximately 5x10 11 gk/kg, 1x10 12 gk/kg, 1.5x10 12 gk/kg, 2.0x10 12 gk/kg, 2.5x10 12 gk/kg, 3x10 12 gk/kg, 3.5x10 12 gk/kg, 4x10 12 gk/kg, 4.5x10 12 gk/kg, 5x10 12 gk/kg, 5.5x10 12 gk/kg, 6x10 12 gk/kg, 6.5x10 12 gk/kg, 7x10 12 gk/kg, 7.5x10 12 gk/kg, 8x10 12 gk/kg, 8.5x10 12 gk/kg, 9x10 12 gk/kg or 9.5x10 12 gk/kg. gc/kg can be determined, for example, using qPCR or digital droplet PCR (ddPCR) (see, for example, M. Lock et al, Hum Gene Ther Methods. 2014 Apr;25(2): 115-25). In another embodiment, the AAV vector provided herein can be administered to a patient for the treatment of SCNIA deficiency (including, for example, Dravet syndrome) in an amount or dose ranging from 1x 109 to 1x 10 11 iu/kg (infectious vector units (v) /body weight of the subject or patient (kg)). In certain embodiments, the pharmaceutical composition can be formulated as a unit dose as needed. Such unit dosage units may contain from about 1 x 10 9 gc to about 1 x 10 15 gc.
Фармацевтические композиции по настоящему раскрытию можно вводить нуждающемуся в этом субъекту, например, один или несколько раз (например, 1-10 раз или более) ежедневно, еженедельно, ежемесячно, два раза в год, ежегодно или по медицинским показаниям. Согласно иллюстративному варианту осуществления достаточно однократного введения. Согласно одному варианту осуществления фармацевтическая композиция, содержащая кассету экспрессии, кодирующую селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и/или eTF, который избирательно активирует SCN1A, подходит для применения у людей и вводится путем интрапаренхимальной инъекции, интратекальной инъекции, инъекции в мостомозжечковую цистерну или интрацеребровентрикулярной инъекции. Согласно одному вари- 51 046157 анту осуществления фармацевтическая композиция доставляется через периферическую вену путем болюсной инъекции. Согласно другим вариантам осуществления фармацевтическая композиция доставляется через периферическую вену путем инфузии в течение приблизительно 10 минут (±5 минут), в течение приблизительно 20 минут (±5 минут), в течение приблизительно 30 минут (±5 минут), в течение приблизительно 60 минут (±5 минут) или в течение более чем 90 минут (±10 минут).The pharmaceutical compositions of the present disclosure can be administered to a subject in need thereof, for example, one or more times (eg, 1-10 times or more) daily, weekly, monthly, biannually, annually, or as medically indicated. In an exemplary embodiment, a single administration is sufficient. In one embodiment, a pharmaceutical composition comprising an expression cassette encoding a PV-selective miRNA and/or eTF binding site that selectively activates SCN1A is suitable for use in humans and is administered by intraparenchymal injection, intrathecal injection, pontocerebellar cistern injection, or intracerebroventricular injection. . In one embodiment, the pharmaceutical composition is delivered via a peripheral vein by bolus injection. In other embodiments, the pharmaceutical composition is delivered via a peripheral vein by infusion over about 10 minutes (±5 minutes), over about 20 minutes (±5 minutes), over about 30 minutes (±5 minutes), over about 60 minutes (±5 minutes) or for more than 90 minutes (±10 minutes).
Согласно другому аспекту в настоящей заявке дополнительно представлен набор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, вектор, клетку-хозяина, вирион или фармацевтическую композицию, как описано в настоящем документе, в одном или нескольких контейнерах. Набор может содержать инструкции или упаковочные материалы, которые описывают, как вводить пациенту молекулу нуклеиновой кислоты, вектор, клетку-хозяина или вирион, содержащиеся в наборе. Контейнеры набора могут быть из любого подходящего материала, например, стекла, пластика, металла и т.д., и быть любого подходящего размера, формы или конфигурации. Согласно определенным вариантам осуществления наборы могут содержать одну или несколько ампул или шприцев, которые содержат молекулу нуклеиновой кислоты, вектор, клетку-хозяина, вирион или фармацевтическую композицию в подходящей жидкости или форме раствора.In another aspect, the present application further provides a kit comprising a nucleic acid molecule, vector, host cell, virion, or pharmaceutical composition as described herein in one or more containers. The kit may contain instructions or packaging materials that describe how to administer to a patient the nucleic acid molecule, vector, host cell, or virion contained in the kit. The kit containers may be of any suitable material, such as glass, plastic, metal, etc., and be of any suitable size, shape or configuration. In certain embodiments, kits may contain one or more vials or syringes that contain a nucleic acid molecule, vector, host cell, virion, or pharmaceutical composition in a suitable liquid or solution form.
Способы лечения.Methods of treatment.
Согласно одному аспекту в настоящей заявке представлены способы применения eTF, которые избирательно активируют SCN1A, как раскрыто в настоящем документе. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы введения кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе, для усиления экспрессии SCNIA в клетке. Согласно различным вариантам осуществления eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе, можно использовать для модуляции экспрессии SCNIA в клетке in vitro, in vivo или ex vivo.In one aspect, the present application provides methods of using eTFs that selectively activate SCN1A, as disclosed herein. In certain embodiments, provided herein are methods of introducing an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein, to enhance expression of SCNIA in a cell. In various embodiments, an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein, can be used to modulate SCNIA expression in a cell in vitro, in vivo, or ex vivo.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы лечения заболевания или нарушения, связанного с SCN1A, путем введения субъекту кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе, при необходимости. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой нарушение центральной нервной системы. Согласно иллюстративным вариантам осуществления заболевание или нарушение связано с гаплонедостаточностью SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой эпилепсию, связанную с гаплонедостаточностью SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления гаплонедостаточность является результатом того, что субъект является гетерозиготным по мутации потери функции гена SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой эпилепсию, связанную со вставкой, делецией или заменой в гене SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления нарушение представляет собой эпилепсию, связанную с точечной мутацией в гене SCN1A. Согласно определенным вариантам осуществления способ лечения заболевания или нарушения предусматривает введение кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе, так что недостаточная экспрессия SCN1A корректируется, доводится до пределов уровня здорового человека или доводится до нормального диапазона, определенного стандартом медицинской помощи. Согласно определенным вариантам осуществления раскрытые в настоящем документе способы применяются для лечения заболевания или нарушения, связанного с эндогенным SCN1A, содержащим одну или несколько мутаций, которые приводят к аномальной экспрессии SCN1A.In certain embodiments, provided herein are methods of treating a disease or disorder associated with SCN1A by administering to a subject an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein, as appropriate. In certain embodiments, the disorder is a disorder of the central nervous system. In exemplary embodiments, the disease or disorder is associated with SCN1A haploinsufficiency. In certain embodiments, the disorder is epilepsy associated with SCN1A haploinsufficiency. In certain embodiments, the haploinsufficiency results from the subject being heterozygous for a loss of function mutation in the SCN1A gene. In certain embodiments, the disorder is epilepsy associated with an insertion, deletion, or substitution in the SCN1A gene. In certain embodiments, the disorder is epilepsy associated with a point mutation in the SCN1A gene. In certain embodiments, a method of treating a disease or disorder comprises administering an expression cassette, expression vector, or viral particle comprising a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein, such that underexpression of SCN1A is corrected to normal levels. or brought within the normal range as defined by the standard of care. In certain embodiments, the methods disclosed herein are used to treat a disease or disorder associated with endogenous SCN1A containing one or more mutations that result in abnormal expression of SCN1A.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы облегчения симптома, связанного с заболеванием или нарушением, путем введения кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе, нуждающемуся в этом субъекту.In certain embodiments, this application provides methods for alleviating a symptom associated with a disease or disorder by administering an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein, to a subject in need thereof. .
Согласно иллюстративному варианту осуществления в настоящей заявке представлены способы лечения заболевания, нарушения или симптома, связанного с мутацией в SCN1A (например, точечной мутацией, заменой, делецией, инверсией и т.д.), дефицитом в Nav1.1 и/или снижением активности Nav1.1 путем введения нуждающемуся в этом субъекту кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно усиливает экспрессию гена SCN1A или его белкового продукта Nav1.1. Управляемые напряжением ионные натриевые каналы важны для генерации и распространения потенциалов действия в поперечнополосатых мышцах и нервных тканях. Управляемые напряжением ионные натриевые каналы представляют собой гетеромерные комплексы, состоящие из большой центральной порообразующей гликозилированной альфасубъединицы и двух меньших вспомогательных бета-субъединиц. Большая альфа-субъединица субъединица Nav1.1, кодируемая геном SCN1A, актуальна для различных заболеваний или нарушений, таких как синдром Драве. Nav1.1 экспрессируется в нейронах и может быть собрана с различными бета- 52 046157 субъединицами, включая в себя Νανβΐ, экспрессируемую геном SCN1B.In an exemplary embodiment, the present application provides methods for treating a disease, disorder, or symptom associated with a mutation in SCN1A (e.g., point mutation, substitution, deletion, inversion, etc.), deficiency in Nav1.1, and/or reduced Nav1 activity .1 by administering to a subject in need thereof an expression cassette, expression vector or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively enhances the expression of the SCN1A gene or its protein product Nav1.1. Voltage-gated sodium ion channels are important for the generation and propagation of action potentials in striated muscle and neural tissues. Voltage-gated sodium ion channels are heteromeric complexes consisting of a large central pore-forming glycosylated alpha subunit and two smaller accessory beta subunits. The large alpha subunit Nav1.1 subunit, encoded by the SCN1A gene, is relevant for various diseases or disorders such as Dravet syndrome. Nav1.1 is expressed in neurons and can be assembled with various beta 52 046157 subunits, including the Νανβΐ expressed by the SCN1B gene.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы лечения заболеваний, связанных с мутацией в SCN1A (например, делецией, вставкой, инверсией, точечной мутацией (например, нонсенс-мутацией, миссенс-мутацией) и т.д.) или сниженной активностью Nav1.1 с использованием eTF, который избирательно повышает экспрессию эндогенного гена SCN1A. Заболевания и нарушения, связанные с мутациями SCN1A, включают в себя, без ограничения: синдром Драве, синдром Охтахара, эпилепсию, раннюю детскую эпилептическую энцефалопатию 6 (EIEE6), семейные фебрильные припадки 3A (FEB3A), трудноизлечимую детскую эпилепсию с генерализованными тоникоклоническими припадками (ICEGTC), мигрень, семейную гемиплегию 3 (FHM3), синдром Панайотопулоса, семейную фибрилляцию предсердий 13 (ATFB13), генерализованную эпилепсию с фебрильными судорогами плюс типа 1 (gefs + тип 1), синдром Бругада, неспецифический дефект сердечной проводимости, генерализованную эпилепсию плюс, доброкачественный ранний младенческий эпилептический синдром, раннюю детскую эпилептическую энцефалопатию (EIEE11), доброкачественную семейную детскую эпилепсию, нейродегенерацию, таупатии и болезнь Альцгеймера. В некоторых случаях неврологическим заболеванием является синдром Драве. Мутации или аномалии в SCN1A также были связаны с судорожными расстройствами, эпилепсией, аутизмом, семейной гемиплегической мигренью 3 типа (FHM3), генетической эпилепсией с фебрильными припадками плюс (GEFS+) и эффективностью некоторых противосудорожных лекарственных средств. Например, мутация ICS5N+5G>A в SCN1A связана с максимально безопасным количеством (дозой) противосудорожных лекарственных средств фенитоина и карбамазепина.In certain embodiments, provided herein are methods of treating diseases associated with a mutation in SCN1A (eg, deletion, insertion, inversion, point mutation (eg, nonsense mutation, missense mutation), etc.) or reduced Nav1 activity. 1 using an eTF that selectively increases the expression of the endogenous SCN1A gene. Diseases and disorders associated with SCN1A mutations include, but are not limited to: Dravet syndrome, Ohtahara syndrome, epilepsy, early childhood epileptic encephalopathy 6 (EIEE6), familial febrile seizures 3A (FEB3A), intractable childhood epilepsy with generalized tonic-clonic seizures (ICEGTC ), migraine, familial hemiplegia 3 (FHM3), Panagiotopoulos syndrome, familial atrial fibrillation 13 (ATFB13), generalized epilepsy with febrile seizures plus type 1 (gefs + type 1), Brugada syndrome, nonspecific cardiac conduction defect, generalized epilepsy plus, benign early infantile epileptic syndrome, early childhood epileptic encephalopathy (EIEE11), benign familial childhood epilepsy, neurodegeneration, tauopathies and Alzheimer's disease. In some cases, the neurological disorder is Dravet syndrome. Mutations or abnormalities in SCN1A have also been associated with seizure disorders, epilepsy, autism, familial hemiplegic migraine type 3 (FHM3), genetic epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+), and the effectiveness of certain anticonvulsant drugs. For example, the ICS5N+5G>A mutation in SCN1A is associated with the maximum safe amount (dose) of the anticonvulsant drugs phenytoin and carbamazepine.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен способ лечения субъекта с синдромом Драве или с риском его развития путем введения кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A. Синдром Драве характеризуется продолжительными фебрильными и нефебрильными припадками в течение первого года жизни ребенка. Это заболевание прогрессирует до других типов припадков, таких как миоклонические и парциальные припадки, задержка психомоторного развития и атаксия. Оно характеризуется когнитивными нарушениями, поведенческими нарушениями и двигательными нарушениями. Поведенческие нарушения часто включают в себя гиперактивность и импульсивность, а в более редких случаях - аутистическое поведение. Синдром Драве также связан с нарушениями сна, включая в себя сонливость и бессонницу. У многих пациентов синдром Драве вызван генетическими мутациями, которые приводят к выработке нефункциональных белков. При лечении заболеваний, связанных с генетическими причинами, существует множество проблем. Таким образом, большинство существующих способов лечения было направлено на профилактическое лечение припадков и других симптомов.In certain embodiments, the present application provides a method of treating a subject with or at risk of developing Dravet syndrome by administering an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A. Dravet syndrome is characterized by prolonged febrile and nonfebrile seizures during the first year of a child's life. This disease progresses to other types of seizures such as myoclonic and partial seizures, psychomotor retardation, and ataxia. It is characterized by cognitive impairment, behavioral disturbances and movement disorders. Behavioral disorders often include hyperactivity and impulsivity, and in rarer cases, autistic behavior. Dravet syndrome is also associated with sleep disturbances, including drowsiness and insomnia. In many patients, Dravet syndrome is caused by genetic mutations that lead to the production of nonfunctional proteins. There are many challenges in treating diseases associated with genetic causes. Thus, most existing treatments have been aimed at preventing seizures and other symptoms.
У 70-90% пациентов синдром Драве вызывается нонсенс-мутациями в гене SCN1A, что приводит к преждевременному стоп-кодону и, следовательно, к нефункциональному белку. Как правило, миссенсмутация в сегменте S5 или S6 поры натриевого канала приводит к потере функции канала и развитию синдрома Драве. Гетерозиготное наследование мутации SCN1A, например, нонсенс-мутация, миссенсмутация, делеция, вставка, инверсия и т.д. - это все, что необходимо для развития дефектного натриевого канала; у пациентов с синдромом Драве останется одна нормальная копия гена. Таким образом, заболевание характеризуется как гаплонедостаточность, и, таким образом, увеличение экспрессии функционирующей копии SCN1A может восстанавливать нормальные уровни продукции Nav1.1.In 70-90% of patients, Dravet syndrome is caused by nonsense mutations in the SCN1A gene, which results in a premature stop codon and therefore a nonfunctional protein. Typically, a missense mutation in the S5 or S6 segment of the sodium channel pore results in loss of channel function and the development of Dravet syndrome. Heterozygous inheritance of SCN1A mutation, such as nonsense mutation, missense mutation, deletion, insertion, inversion, etc. - this is all that is necessary for the development of a defective sodium channel; Patients with Dravet syndrome will have one normal copy of the gene. Thus, the disease is characterized as haploinsufficiency, and thus increasing the expression of a functional copy of SCN1A may restore normal levels of Nav1.1 production.
Симптомы, связанные с синдромом Драве, включают в себя судороги, дефекты памяти, задержку развития, низкий мышечный тонус и/или когнитивные проблемы. Лечение кассетой экспрессии, вектором экспрессии или вириальной частицей, описанными в настоящем документе, может привести к улучшению одного или нескольких симптомов, таких как уменьшение количества, продолжительности и/или интенсивности припадков. Введение генной терапии, как описано в настоящем документе, субъекту с риском развития синдрома Драве может предотвратить развитие или замедлить прогрессирование одного или нескольких симптомов Драве.Symptoms associated with Dravet syndrome include seizures, memory defects, developmental delays, low muscle tone and/or cognitive problems. Treatment with an expression cassette, expression vector, or virial particle described herein may result in improvement in one or more symptoms, such as a reduction in the number, duration, and/or intensity of seizures. Administration of gene therapy, as described herein, to a subject at risk of developing Dravet syndrome may prevent the development or slow the progression of one or more Dravet symptoms.
Согласно определенным вариантам осуществления лечение кассетой экспрессии, вектором экспрессии или вириальной частицей, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, снижает продолжительность и/или частоту припадков, например, припадков, связанных с синдромом Драве, по меньшей мере на 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 95% или более по сравнению с не подвергнутым лечению контролем или по сравнению с уровнем до лечения.In certain embodiments, treatment with an expression cassette, expression vector, or virial particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as described herein, reduces the duration and/or frequency of seizures, such as seizures associated with Dravet syndrome, by at least at least 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33% , 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90 % 95% or more compared to untreated controls or compared to pre-treatment levels.
У некоторых пациентов с болезнью Альцгеймера выработка амилоида β (Ae) с участием многих пептидов и протеаз может влиять на возбудимость нейронов, вызывая припадки и подавляя регуляцию натриевого канала Nav1.1 в нейронах PV. Согласно другому варианту осуществления в настоящей заявке представлены способы лечения субъекта, страдающего болезнью Альцгеймера, путем введения описанIn some patients with Alzheimer's disease, amyloid β (Ae) production involving many peptides and proteases can influence neuronal excitability, causing seizures and downregulating the Nav1.1 sodium channel in PV neurons. In another embodiment, the present application provides methods for treating a subject suffering from Alzheimer's disease by administering the described
- 53 046157 ной в настоящем документе кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, которая содержит полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A. Симптомы, связанные с болезнью Альцгеймера, включают в себя кратковременную потерю памяти, когнитивные трудности, припадки и трудности с речью, исполнительными функциями, восприятием (агнозия) и выполнением движений (апраксия). Лечение кассетой экспрессии, вектором экспрессии или вирусной частицей, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, может привести к улучшению одного или нескольких симптомов болезни Альцгеймера, таких как снижение прогрессирования потери памяти или предотвращение одного или нескольких симптомов. В некоторых случаях лечение может привести к коррекции активности головного мозга с высокой мощностью гаммаизлучения. Лечение может привести к снижению частоты припадков и/или тяжести припадков или снижению активности высокой мощности гамма-излучения по меньшей мере на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70% или более, как по сравнению с отсутствием лечения. В некоторых случаях лечение может привести к улучшению когнитивных функций. Обучение и/или память могут быть улучшены по меньшей мере на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100% или более чем на 100% по сравнению с отсутствием лечения или перед лечением полинуклеотидом, кодирующим eTF, который избирательно активирует SCN1A, как раскрыто в настоящем документе.- 53 046157 herein an expression cassette, expression vector or viral particle that contains a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A. Symptoms associated with Alzheimer's disease include short-term memory loss, cognitive difficulties, seizures, and difficulties with speech, executive function, perception (agnosia), and motor performance (apraxia). Treatment with an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A may result in improvement of one or more symptoms of Alzheimer's disease, such as reducing the progression of memory loss or preventing one or more symptoms. In some cases, treatment can lead to correction of brain activity with high gamma radiation output. Treatment may result in a reduction in seizure frequency and/or severity of seizures or a reduction in high-power gamma radiation activity by at least 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70% or more, as compared with no treatment. In some cases, treatment may lead to improvements in cognitive function. Learning and/or memory may be improved by at least 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, or greater than 100% compared to without treatment or before treatment with a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as disclosed herein.
В некоторых случаях лечение кассетой экспрессии, вектором экспрессии или вирусной частицей, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, снижает активность высокой мощности гамма-излучения (например, активность высокой мощности гаммаизлучения, связанную с болезнью Альцгеймера) по меньшей мере на 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% или 95% по сравнению с не подвергнутым лечению контролем или по сравнению с уровнем до лечения.In some cases, treatment with an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A reduces high-gamma activity (eg, high-gamma activity associated with Alzheimer's disease) by at least 1% , 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18 %, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% or 95% compared to untreated controls or compared to pre-treatment levels.
Паркинсонизм относится к совокупности признаков и симптомов, обнаруживаемых при болезни Паркинсона (PD), включая в себя медлительность (брадикинезию), тугоподвижность (ригидность), тремор и дисбаланс (постуральную нестабильность). В некоторых случаях введение кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе, субъекту с риском развития или страдающим болезнью Паркинсона может предотвратить развитие одного или нескольких симптомов или замедлить прогрессирование болезни Паркинсона по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 80% или по меньшей мере на 90% по сравнению с отсутствием лечения.Parkinsonism refers to the collection of signs and symptoms found in Parkinson's disease (PD), including slowness (bradykinesia), stiffness (rigidity), tremors, and imbalance (postural instability). In some cases, administration of an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates SCN1A, as described herein, to a subject at risk for or suffering from Parkinson's disease may prevent the development of one or more symptoms or slow the progression of Parkinson's disease. by at least 10%, by at least 20%, by at least 30%, by at least 40%, by at least 50%, by at least 60%, by at least 70%, according to at least 80% or at least 90% compared to no treatment.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы, которые можно применять для лечения субъекта, который находится в группе риска развития заболевания. Может быть известно, что субъект предрасположен к заболеванию, например, неврологическому заболеванию или заболеванию, связанному с эпилепсией, припадками и/или энцефалопатией. Субъект может быть предрасположен к заболеванию из-за генетического события или из-за известных факторов риска. Например, субъект может нести мутацию в SCN1A, которая связана с эпилепсией (такой как, например, синдром Драве). Любая мутация в гене SCN1A, которая снижает его активность (за счет снижения уровней экспрессии, нарушения функции белка или комбинации обоих), может предрасполагать субъекта к заболеванию, включая в себя любое одно или несколько из вставок, делеций, инверсий, транслокаций или замен (например, точечные мутации, включая в себя нонсенс-мутации и/или миссенс-мутации) в гене SCN1A. В некоторых случаях субъект может быть предрасположен к такому заболеванию, как болезнь Альцгеймера, из-за возраста субъекта. В некоторых случаях у субъекта может быть недостаточное количество белка SCN1A, и лечение заболевания, связанного с SCN1A, предусматривает введение кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует эндогенный SCN1A, как описано в настоящем документе.In certain embodiments, this application provides methods that can be used to treat a subject who is at risk of developing a disease. The subject may be known to be predisposed to a disease, such as a neurological disease or a disease associated with epilepsy, seizures and/or encephalopathy. A subject may be predisposed to a disease due to a genetic event or known risk factors. For example, a subject may carry a mutation in SCN1A that is associated with epilepsy (such as Dravet syndrome). Any mutation in the SCN1A gene that reduces its activity (by reducing expression levels, disrupting protein function, or a combination of both) may predispose a subject to the disease, including any one or more of insertions, deletions, inversions, translocations, or substitutions (eg , point mutations, including nonsense mutations and/or missense mutations) in the SCN1A gene. In some cases, a subject may be predisposed to a disease such as Alzheimer's disease due to the age of the subject. In some cases, a subject may have insufficient amounts of SCN1A protein, and treatment of the SCN1A-associated disease involves administration of an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates endogenous SCN1A, as described herein.
Согласно определенным вариантам осуществления лечение с использованием кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей полинуклеотид, кодирующий eTF, который избирательно активирует эндогенный SCN1A, представленный в настоящем документе, может привести к уменьшению или прекращению симптомов, связанных с синдромом Драве или другим заболеванием, связанным с SCN1A, или нарушением, например, эпилепсией, связанной с гаплонедостаточностью SCN1A. Например, лечение может улучшить обучение, память, когнитивные и/или двигательные функции; уменьшить частоту и/или продолжительность припадков; и/или снизить температурную чувствительность (или увеличить температурный порог для запуска припадка).In certain embodiments, treatment using an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a polynucleotide encoding an eTF that selectively activates endogenous SCN1A as provided herein may result in a reduction or resolution of symptoms associated with Dravet syndrome or other disease associated with with SCN1A, or a disorder such as epilepsy associated with SCN1A haploinsufficiency. For example, treatment may improve learning, memory, cognitive and/or motor function; reduce the frequency and/or duration of seizures; and/or reduce temperature sensitivity (or increase the temperature threshold for triggering a seizure).
Согласно другому аспекту в настоящей заявке представлены способы селективной экспрессии трансгена в PV-содержащих нейронах путем введения кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы селективной экспрессии трансгена в PV-содержащих нейронах приматов путем введения кассеты эксIn another aspect, the present application provides methods for selectively expressing a transgene in PV-containing neurons by introducing an expression cassette, expression vector, or viral particle containing at least one PV-selective miRNA binding site. In certain embodiments, the present application provides methods for selectively expressing a transgene in primate PV-containing neurons by introducing an ex cassette.
- 54 046157 прессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей трансген и по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлены способы селективной экспрессии трансгена в PV-содержащих нейронах путем введения кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, и по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно иллюстративным вариантам осуществления трансген содержит последовательность, кодирующую любой из eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе.- 54 046157 press, expression vector or viral particle containing a transgene and at least one PV-selective microRNA binding site. In certain embodiments, the present application provides methods for selectively expressing a transgene in PV-containing neurons by introducing an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a PV-selective regulatory element operably linked to the transgene and at least one PV-selective regulatory element. microRNA binding site. In exemplary embodiments, the transgene comprises a sequence encoding any of the eTFs that selectively activate SCN1A as described herein.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен способ генной терапии, предусматривающий введение субъекту кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей трансген и по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в заявке представлены способы генной терапии, предусматривающие введение субъекту кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, и по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно иллюстративным вариантам осуществления трансген содержит последовательность, кодирующую любой из eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе.In certain embodiments, the present application provides a method of gene therapy comprising administering to a subject an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and at least one PV-selective miRNA binding site. In certain embodiments, the application provides gene therapy methods comprising administering to a subject an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a PV-selective regulatory element operably linked to a transgene and at least one PV-selective miRNA binding site. In exemplary embodiments, the transgene comprises a sequence encoding any of the eTFs that selectively activate SCN1A as described herein.
Согласно определенным вариантам осуществления в настоящей заявке представлен способ лечения заболевания или нарушения, предусматривающий введение кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей трансген и по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно определенным вариантам осуществления в заявке представлены способы лечения заболевания или нарушения, предусматривающие введение субъекту кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей селективный в отношении PV регуляторный элемент, функционально связанный с трансгеном, и по меньшей мере один селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК. Согласно иллюстративным вариантам осуществления трансген содержит последовательность, кодирующую любой из eTF, который избирательно активирует SCN1A, как описано в настоящем документе. Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии, вектор экспрессии или вирусная частица, содержащая трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, и, необязательно, селективный в отношении PV регуляторный элемент, могут быть использованы для лечения заболевания или нарушения, в которое вовлечены PV-содержащие нейроны. Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии, вектор экспрессии или вирусная частица, содержащая трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и, возможно, селективный в отношении PV регуляторный элемент, используются для лечения состояния нейронов. Нейрональные заболевания или нарушения, подходящие для лечения, включают в себя, без ограничения, синдром Драве, болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, болезнь Хантингтона, боковой амиотрофический склероз (ALS), спинальную мышечную атрофию (SMA), эпилепсию, нейродегенеративные нарушения, двигательные нарушения, нарушения настроения, болезни двигательных нейронов, прогрессирующую мышечную атрофию (PMA), прогрессирующий бульбарный паралич, псевдобульбарный паралич, первичный боковой склероз, неврологические последствия СПИДа, нарушения развития, рассеянный склероз, нейрогенетические нарушения, инсульт, травму спинного мозга, черепно-мозговую травму, таупатию, гиповозбудимость нейронов и/или припадки. Согласно некоторым вариантам осуществления вирусный вектор, вирусная частица или фармацевтическая композиция, содержащая трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и необязательно селективный в отношении PV регуляторный элемент, используются для лечения психического расстройства (например, шизофрении, обсессивно-компульсивного расстройства, наркомании, депрессии, тревоги, психоза); расстройства аутистического спектра (например, синдрома ломкой X-хромосомы, синдрома Ретта); эпилепсии (например, синдрома Драве, хронической травматической энцефалопатии, генерализованной эпилепсии с фебрильными припадками плюс (GEFS+), эпилептической энцефалопатии, височной эпилепсии, фокальной эпилепсии, туберозного склероза, эпилепсии, связанной с гаплонедостаточностью SCN1A); и/или нейродегенерации (например, болезни Альцгеймера, болезни Паркинсона). Заболевания, связанные с дисфункциональными нейронами PV, например, вызванные мутациями потери функции в SCN1A или Nav1.1, включают в себя: синдром Драве, синдром Охтахара, эпилепсию, раннюю детскую эпилептическую энцефалопатию 6 (EIEE6), семейные фебрильные припадки 3A (FEB3A), трудноизлечимую детскую эпилепсию с генерализованными тонико-клоническими припадками (ICEGTC), мигрень, семейную гемиплегию 3 (FHM3), синдром Панайотопулоса, семейную фибрилляцию предсердий 13 (ATFB13), генерализованную эпилепсию с фебрильными припадками плюс типа 1 (gefs + тип 1), неспецифический кардиальный синдром, неспецифический синдром Бругада дефект проводимости, генерализованную эпилепсию с фебрильными припадками плюс, доброкачественный ранний младенческий эпилептический синдром, раннюю детскую эпилептическую энцефалопатию 11 (EIEE11), доброкачественную семейную детскую эпилепсию, нейродегенерацию, таупатии и болезнь Альцгеймера.In certain embodiments, the present application provides a method of treating a disease or disorder comprising administering an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and at least one PV-selective miRNA binding site. In certain embodiments, the application provides methods of treating a disease or disorder comprising administering to a subject an expression cassette, expression vector, or viral particle comprising a PV-selective regulatory element operably linked to a transgene and at least one PV-selective microRNA binding site . In exemplary embodiments, the transgene comprises a sequence encoding any of the eTFs that selectively activate SCN1A as described herein. In certain embodiments, an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and a PV-selective miRNA binding site, and optionally a PV-selective regulatory element, can be used to treat a disease or disorder that involves PV-containing neurons. In certain embodiments, an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and a PV-selective miRNA binding site and optionally a PV-selective regulatory element is used to treat a neuronal condition. Neuronal diseases or disorders suitable for treatment include, but are not limited to, Dravet syndrome, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Huntington's disease, amyotrophic lateral sclerosis (ALS), spinal muscular atrophy (SMA), epilepsy, neurodegenerative disorders, movement disorders, mood disorders, motor neuron diseases, progressive muscular atrophy (PMA), progressive bulbar palsy, pseudobulbar palsy, primary lateral sclerosis, neurological effects of AIDS, developmental disorders, multiple sclerosis, neurogenetic disorders, stroke, spinal cord injury, traumatic brain injury, tauopathy , neuronal hypoexcitability and/or seizures. In some embodiments, a viral vector, viral particle, or pharmaceutical composition comprising a transgene and a PV-selective microRNA binding site and optionally a PV-selective regulatory element is used to treat a mental disorder (e.g., schizophrenia, obsessive-compulsive disorder, drug addiction, depression , anxiety, psychosis); autism spectrum disorders (eg, fragile X syndrome, Rett syndrome); epilepsy (eg, Dravet syndrome, chronic traumatic encephalopathy, generalized epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+), epileptic encephalopathy, temporal lobe epilepsy, focal epilepsy, tuberous sclerosis, epilepsy associated with SCN1A haploinsufficiency); and/or neurodegeneration (eg, Alzheimer's disease, Parkinson's disease). Diseases associated with dysfunctional PV neurons, such as those caused by loss-of-function mutations in SCN1A or Nav1.1, include: Dravet syndrome, Ohtahara syndrome, epilepsy, early childhood epileptic encephalopathy 6 (EIEE6), familial febrile seizures 3A (FEB3A), intractable childhood epilepsy with generalized tonic-clonic seizures (ICEGTC), migraine, familial hemiplegia 3 (FHM3), Panagiotopoulos syndrome, familial atrial fibrillation 13 (ATFB13), generalized epilepsy with febrile seizures plus type 1 (gefs + type 1), nonspecific cardiac syndrome, nonspecific Brugada syndrome conduction defect, generalized epilepsy with febrile seizures plus, benign early infantile epileptic syndrome, early childhood epileptic encephalopathy 11 (EIEE11), benign familial childhood epilepsy, neurodegeneration, tauopathies and Alzheimer's disease.
Согласно определенным вариантам осуществления лечение с использованием кассеты экспрессии, вектора экспрессии или вирусной частицы, содержащей трансген и селективный в отношении PV сайтIn certain embodiments, treatment using an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and a PV selective site
- 55 046157 связывания микроРНК, и, возможно, селективный в отношении PV регуляторный элемент, описанный в настоящем документе, приводит к улучшению симптомов, связанных с заболеванием или нарушением нейронов. Например, за пациентом с болезнью Паркинсона можно наблюдать симптоматически на предмет улучшения двигательных функций, что указывает на положительный ответ на лечение. Введение терапии с использованием описанного в настоящем документе способа субъекту с риском развития нейронального нарушения может предотвратить развитие или замедлить прогрессирование одного или нескольких симптомов.- 55 046157 microRNA binding, and possibly the PV-selective regulatory element described herein, leads to improvement of symptoms associated with a neuronal disease or disorder. For example, a patient with Parkinson's disease may be monitored symptomatically for improvement in motor function, indicating a positive response to treatment. Administration of therapy using the method described herein to a subject at risk of developing a neuronal disorder may prevent the development or slow the progression of one or more symptoms.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии, вектор экспрессии или вирусная частица, содержащая трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, и, необязательно, селективный в отношении PV регуляторный элемент, представленные в настоящем документе, могут быть использованы для лечения субъекта, у которого было диагностировано заболевание нейронов, например, эпилепсия, связанная с гаплонедостаточностью SCN1A, такая как, например, синдром Драве. Согласно различным вариантам осуществления любое из нейрональных заболеваний или нарушений, описанных в настоящем документе, вызвано известным генетическим событием (например, любой из мутаций SCN1A, известных в настоящей области техники) или имеет неизвестную причину.In certain embodiments, an expression cassette, expression vector, or viral particle comprising a transgene and a PV-selective miRNA binding site, and optionally a PV-selective regulatory element, provided herein can be used to treat a subject who has A neuronal disease has been diagnosed, such as epilepsy associated with SCN1A haploinsufficiency, such as Dravet syndrome. In various embodiments, any of the neuronal diseases or disorders described herein are caused by a known genetic event (eg, any of the SCN1A mutations known in the art) or have an unknown cause.
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии, вектор экспрессии или вирусная частица, содержащая трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, и, возможно, селективный в отношении PV регуляторный элемент, представленные в настоящем документе, могут быть использованы для лечения субъекта, который находится в группе риска развития заболевания или нарушения. Согласно определенным вариантам осуществления может быть известно, что субъект предрасположен к заболеванию, например, нейрональному заболеванию (например, эпилепсии, связанной с гаплонедостаточностью SCN1A, такой как, например, синдром Драве). Согласно определенным вариантам осуществления субъект может быть предрасположен к заболеванию из-за генетического события или из-за известных факторов риска. Например, субъект может нести мутацию в SCN1A, которая связана с эпилепсией или синдромом Драве, например, вставку, делецию, инверсию, транслокацию или замену (например, точечную мутацию, включая в себя нонсенс-мутацию и/или миссенс-мутацию).In certain embodiments, an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and a PV-selective miRNA binding site, and optionally a PV-selective regulatory element provided herein, can be used to treat a subject who is in group at risk of developing a disease or disorder. In certain embodiments, it may be known that the subject is predisposed to a disease, such as a neuronal disease (eg, epilepsy associated with SCN1A haploinsufficiency, such as, for example, Dravet syndrome). In certain embodiments, the subject may be predisposed to a disease due to a genetic event or due to known risk factors. For example, a subject may carry a mutation in SCN1A that is associated with epilepsy or Dravet syndrome, such as an insertion, deletion, inversion, translocation or substitution (eg, a point mutation, including a nonsense mutation and/or a missense mutation).
Согласно определенным вариантам осуществления кассета экспрессии, вектор экспрессии или вирусная частица, содержащая трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК, и, возможно, селективный регуляторный элемент PV, представленные в настоящем документе, могут быть использованы для уменьшения одного или нескольких симптомов, связанных с заболеванием или нарушением. Например, симптомы, связанные с синдромом Драве, включают в себя судороги, дефекты памяти, задержку развития, плохой мышечный тонус и/или когнитивные проблемы. Лечение вирусным вектором, вирусной частицей или фармацевтической композицией, содержащей трансген и селективный в отношении PV сайт связывания микроРНК и, необязательно, селективный в отношении PV регуляторный элемент, представленные в настоящем документе, может привести к улучшению одного или нескольких симптомов, таких как уменьшение количества, продолжительности и/или интенсивность припадков.In certain embodiments, an expression cassette, expression vector, or viral particle containing a transgene and a PV-selective miRNA binding site, and optionally a PV selective regulatory element, provided herein can be used to reduce one or more symptoms associated with disease or disorder. For example, symptoms associated with Dravet syndrome include seizures, memory defects, developmental delays, poor muscle tone, and/or cognitive problems. Treatment with a viral vector, viral particle, or pharmaceutical composition comprising a transgene and a PV-selective miRNA binding site and, optionally, a PV-selective regulatory element provided herein may result in improvement of one or more symptoms, such as a decrease in the number, duration and/or intensity of seizures.
Согласно определенным вариантам осуществления описанные в настоящем документе способы используются для увеличения экспрессии трансгена в нейроне PV, генной терапии или лечения заболевания или нарушения у приматов. Согласно определенным вариантам осуществления примат представляет собой человека. Согласно определенным вариантам осуществления примат представляет собой отличного от человека примата. Согласно определенным вариантам осуществления отличный от человека примат представляет собой обезьяну старого мира, орангутана, гориллу, шимпанзе, яванского макака, макака-резус или свинохвостого макака.In certain embodiments, the methods described herein are used to increase transgene expression in a PV neuron, gene therapy, or treat a disease or disorder in primates. In certain embodiments, the primate is a human. In certain embodiments, the primate is a non-human primate. In certain embodiments, the non-human primate is an old world monkey, an orangutan, a gorilla, a chimpanzee, a cynomolgus monkey, a rhesus monkey, or a pig-tailed monkey.
Термины субъект и индивидуум используются в настоящем документе взаимозаменяемо для обозначения позвоночного животного, предпочтительно млекопитающего, более предпочтительно человека. Описанные в настоящем документе способы могут быть применимы в терапевтических целях для человека, в ветеринарии и/или в доклинических исследованиях на животных моделях заболевания или состояния. Согласно различным вариантам осуществления субъект, которого можно лечить в соответствии с описанными в настоящем документе способами, представляет собой млекопитающее, такое как, например, мышь, крыса, хомяк, морская свинка, песчанка, корова, овца, свинья, коза, осел, лошадь, собака, кошка, лама, обезьяна (например, обезьяна старого мира, мартышка или макак, такой как макак-резус, свинохвостый макак или яванский макак (например, макак-крабоед)), обезьяна (например, орангутан, горилла или шимпанзе) или человек. Согласно иллюстративному варианту осуществления субъект представляет собой человека.The terms subject and individual are used interchangeably herein to refer to a vertebrate animal, preferably a mammal, more preferably a human. The methods described herein may be useful for human therapeutic purposes, veterinary medicine, and/or preclinical studies in animal models of a disease or condition. In various embodiments, the subject that can be treated in accordance with the methods described herein is a mammal, such as, for example, a mouse, rat, hamster, guinea pig, gerbil, cow, sheep, pig, goat, donkey, horse, dog, cat, llama, monkey (such as an old world monkey, a marmoset, or a macaque such as a rhesus macaque, pig-tailed macaque, or cynomolgus macaque (such as a cynomolgus macaque)), an ape (such as an orangutan, a gorilla, or a chimpanzee), or a human . In an exemplary embodiment, the subject is a human.
В следующих таблицах представлены раскрытые в настоящем документе последовательности.The following tables present the sequences disclosed herein.
Таблица 1. Раскрытые в настоящем документе иллюстративные сконструированные факторы транскрипции. Последовательности регуляторных элементов (RE) раскрыты ниже в табл. 2 и 8. Для RE, когда указан m1, это означает, что сайт связывания микроРНК m1 (SEQ ID NO: 7, табл. 8) включен между кодирующей областью и полиА-хвостом. Последовательности ДНК-связывающих доменов (DBD) раскрыты ниже в табл. 3. Для DBD сконструированный цинковый палец (eZF) указывает на то, что конструкция имеет формулу, изложенную в SEQ ID NO: 147 (табл. 10); EGR1 указывает на то, что DBD происхоTable 1. Exemplary engineered transcription factors disclosed herein. The sequences of regulatory elements (RE) are disclosed below in table. 2 and 8. For RE, when m1 is specified, this means that the miRNA binding site m1 (SEQ ID NO: 7, Table 8) is included between the coding region and the polyA tail. The DNA binding domain (DBD) sequences are disclosed in Table 1 below. 3. For DBD, the engineered zinc finger (eZF) indicates that the design has the formula set forth in SEQ ID NO: 147 (Table 10); EGR1 indicates that DBD is occurring
- 56 046157 дит от человеческого EGR1 дикого типа (SEQ ID NO: 176; табл. 12); и EGR3 указывает на то, что DBD происходит от человеческого EGR3 дикого типа (SEQ ID NO: 175, табл. 12). Последовательности для целевых сайтов (например, последовательности, связанные с DBD) представлены в табл. 4 ниже. Последовательности для доменов активации транскрипции (TAD) раскрыты ниже в табл. 5. Для TAD (c) указывает на то, что TAD расположен на c-конце DBD, (n) указывает на то, что TAD расположен на n-конце DBD, (n/c) означает, что существует TAD, расположенный как на n-конце, так и на c-конце DBD, a 2x CITED4 (n) указывает на то, что есть 2 копии TAD CITED4, расположенные на n-конце DBD. Последовательности сконструированных факторов транскрипции полной длины (DBD + TAD) представлены в табл. 6 ниже.- 56046157 dit from wild type human EGR1 (SEQ ID NO: 176; Table 12); and EGR3 indicates that the DBD is derived from wild-type human EGR3 (SEQ ID NO: 175, Table 12). Sequences for target sites (eg, sequences associated with the DBD) are presented in Table. 4 below. The sequences for transcription activation domains (TADs) are disclosed below in table. 5. For TAD (c) indicates that the TAD is located at the c-terminus of the DBD, (n) indicates that the TAD is located at the n-terminus of the DBD, (n/c) indicates that there is a TAD located both at the n-terminus and the c-terminus of the DBD, and 2x CITED4 (n) indicates that there are 2 copies of the CITED4 TAD located at the n-terminus of the DBD. The sequences of the designed full-length transcription factors (DBD + TAD) are presented in Table. 6 below.
Таблица 1Table 1
- 57 046157- 57 046157
Таблица 2 Последовательности нуклеиновых кислот для различных регуляторных элементов (RE), ____________________раскрытых в настоящем документе____________________Table 2 Nucleic acid sequences for various regulatory elements (RE) ____________________disclosed herein____________________
- 58 046157- 58 046157
- 59 046157- 59 046157
- 60 046157- 60 046157
Таблица 3. Аминокислотные последовательности для иллюстративных ДНК-связывающих доменов (DBD), представленных в настоящем документе. Для DBD сконструированный цинковый палец (eZF) указывает на то, что конструкция имеет формулу, изложенную в SEQ ID NO: 147 (табл. 10); EGR1 указывает на то, что DBD происходит от человеческого EGR1 дикого типа (SEQ ID NO: 176; табл. 12); и EGR3 указывает на то, что DBD происходит от человеческого EGR3 дикого типа (SEQ ID NO: 175, табл. 12). Целевые сайты представляют собой последовательности, связанные с DBD, и представлены в табл. 4 ниже.Table 3. Amino acid sequences for exemplary DNA binding domains (DBDs) presented herein. For DBD, the engineered zinc finger (eZF) indicates that the design has the formula set forth in SEQ ID NO: 147 (Table 10); EGR1 indicates that the DBD is derived from wild-type human EGR1 (SEQ ID NO: 176; Table 12); and EGR3 indicates that the DBD is derived from wild-type human EGR3 (SEQ ID NO: 175, Table 12). The target sites are sequences associated with the DBD and are presented in Table. 4 below.
- 61 046157- 61 046157
Таблица 3Table 3
- 62 046157- 62 046157
- 63 046157- 63 046157
Таблица 4 Последовательности целевых сайтов и хромосомная локализация иллюстративных целевых сайтов, связанных с раскрытыми в настоящем документе ДНК-связывающими доменамиTable 4 Target site sequences and chromosomal locations of exemplary target sites associated with DNA binding domains disclosed herein
- 64 046157- 64 046157
Таблица 5 Аминокислотные последовательности для раскрытых в настоящем документе иллюстративных доменов ______________________активации транскрипции (TAD)______________________Table 5 Amino acid sequences for exemplary transcription activation domains (TADs) disclosed herein______________________________
- 65 046157- 65 046157
Таблица 6Table 6
Аминокислотные последовательности для раскрытых в настоящем документе иллюстративных сконст____________руированных факторов транскрипции (DBD + TAD) __________Amino acid sequences for exemplary designed transcription factors (DBD + TAD) disclosed herein __________
- 66 046157- 66 046157
- 67 046157- 67 046157
- 68 046157- 68 046157
- 69 046157- 69 046157
- 70 046157- 70 046157
- 71 046157- 71 046157
- 72 046157- 72 046157
- 73 046157- 73 046157
- 74 046157- 74 046157
- 75 046157- 75 046157
- 76 046157- 76 046157
- 77 046157- 77 046157
- 78 046157- 78 046157
- 79 046157- 79 046157
- 80 046157- 80 046157
Таблица 7Table 7
Последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие раскрытые в настоящем документе иллюстративные сконструированные факторы транскрипцииNucleic acid sequences encoding exemplary engineered transcription factors disclosed herein
- 81 046157- 81 046157
- 82 046157- 82 046157
- 83 046157- 83 046157
- 84 046157- 84 046157
- 85 046157- 85 046157
- 86 046157- 86 046157
- 87 046157- 87 046157
- 88 046157- 88 046157
- 89 046157- 89 046157
- 90 046157 (RE + кодирующая) ggaggaagccatcaactaaactacaatgactgtaagatacaaaattgggaatggt aacatattttgaagttctgttgacataaagaatcatgatattaatgcccatggaaatg aaagggcgatcaacactatggtttgaaaagggggaaattgtagagcacagatgt gttcgtgtggcagtgtgctgtctctagcaatactcagagaagagagagaacaatg aaattctgattggccccagtgtgagcccagatgaggttcagctgccaactttctctt tcacatcttatgaaagtcatttaagcacaactaactttttttttttttttttttttttgagaca gagtcttgctctgttgcccaggacagagtgcagtagtgactcaatctcggctcact gcagcctccacctcctaggctcaaacggtcctcctgcatcagcctcccaagtagc tggaattacaggagtggcccaccatgcccagctaatttttgtatttttaatagatacg ggggtttcaccatatcacccaggctggtctcgaactcctggcctcaagtgatcca cctgcctcggcctcccaaagtgctgggattataggcgtcagccactatgcccaac ccgaccaaccttttttaaaataaatatttaaaaaattggtatttcacatatatactagta tttacatttatccacacaaaacggacgggcctccgctgaaccagtgaggcccca gacgtgcgcataaataacccctgcgtgctgcaccacctggggagagggggag gaccacggtaaatggagcgagcgcatagcaaaagggacgcggggtccttttct ctgccggtggcactgggtagctgtggccaggtgtggtactttgatggggcccag ggctggagctcaaggaagcgtcgcagggtcacagatctgggggaaccccgg ggaaaagcactgaggcaaaaccgccgctcgtctcctacaatatatgggagggg gaggttgagtacgttctggattactcataagaccttttttttttccttccgggcgcaaa accgtgagctggatttataatcgccctataaagctccagaggcggtcaggcacct gcagaggagccccgccgctccgccgactagctgcccccgcgagcaacggcct cgtgatttccccgccgatccggtccccgcctccccactctgcccccgcctacccc ggagccgtgcagccgcctctccgaatctctctcttctcctggcgctcgcgtgcga gagggaactagcgagaacgaggaagcagctggaggtgacgccgggcagatt acgcctgtcagggccgagccgagcggatcgctgggcgctgtgcagaggaaa ggcgggagtgcccggctcgctgtcgcagagccgaggtgggtaagctagcgac cacctggacttcccagcgcccaaccgtggcttttcagccaggtcctctcctcccg cggcttctcaaccaaccccatcccagcgccggccacccaacctcccgaaatga gtgcttcctgccccagcagccgaaggcgctactaggaacggtaacctgttacttt tccaggggccgtagtcgacccgctgcccgagttgctgtgcgactgcgcgcgcg gggctagagtgcaaggtgactgtggttcttctctggccaagtccgagggagaac gtaaagatatgggcctttttccccctctcaccttgtctcaccaaagtccctagtccc cggagcagttagcctctttctttccagggaattagccagacacaacaacgggaac cagacaccgaaccagacatgcccgccccgtgcgccctccccgctcgctgccttt cctccctcttgtctctccagagccggatcttcaaggggagcctccgtgcccccgg ctgctcagtccctccggtgtgcaggaccccggaagtcctccccgcacagctctc gcttctctttgcagcctgtttctgcgccggaccagtcgaggactctggacagtaga ggccccgggacgaccgagctgGAATTCGCCACCATGGCCCC AAAGAAGAAGCGGAAGGTCGGTATCCACGGAGT CCCAGCAGCCCTCGAACCAGGTGAAAAACCTTA CAAATGTCCTGAATGTGGGAAATCATTCAGTCGC AGCGACAACCTGGTGAGACATCAACGCACCCAT ACAGGAGAAAAACCTTATAAATGTCCAGAATGT GGAAAGTCCTTCTCACGAGAGGATAACTTGCAC ACTCATCAACGAACACATACTGGTGAAAAACCA TACAAGTGTCCCGAATGTGGTAAAAGTTTTAGCC GGAGCGATGAACTTGTCCGACACCAACGAACCC ATACAGGCGAGAAGCCTTACAAATGTCCCGAGT GTGGCAAGAGCTTCTCACAATCAGGGAATCTGA CTGAGCATCAACGAACTCATACCGGGGAAAAAC- 90 046157 (RE + encoding) ggaggaagccatcaactaaactacaatgactgtaagatacaaaattgggaatggt aacatattttgaagttctgttgacataaagaatcatgattaatgcccatggaaatg aaagggcgatcaacactatggtttgaaaaagggggaaattgtagagcacagatgt gttcgtgtggca gtgtgctgtctctagcaatactcagagaagagagagaacaatg aaattctgattggccccagtgtgagcccagatgaggttcagctgccaactttctctt tcacatcttatgaaagtcatttaagcacaactaacttttttttttttttttttttttttgagaca gagtcttgctctgttgcccaggacagagtgcag tagtgactcaatctcggctcact gcagcctccacctcctaggctcaaacggtcctcctgcatcagcctcccaagtagc tggaattacaggagtggcccaccatgcccagctaatttttgtatttttaatagatacg ggggtttcaccatatcacccaggctggtctcgaactcctggcctcaagtgatcca cctgcctcggcctcccaaagt gctgggattataggcgtcagccactatgcccaac ccgaccaaccttttttaaaataaatatttaaaaaattggtatttcacatatatactagta tttacatttatccacacaaaacggacgggcctccgctgaaccagtgaggcccca gacgtgcgcataaataacccctgcgtgctgcaccacctggggagagggggag gaccacggtaaatggagc gagcgcatagcaaaagggacgcggggtccttttct ctgccggtggcactgggtagctgtggccaggtgtggtactttgatggggcccag ggctggagctcaaggaagcgtcgcagggtcacagatctgggggaaccccgg ggaaaagcactgaggcaaaaccgccgctcgtctcctacaatatatggagagggg gaggttgagt acgttctggattactcataagacctttttttttccttccgggcgcaaa accgtgagctggatttataatcgccctataaagctccagaggcggtcaggcacct gcagaggagccccgccgctccgccgactagctgcccccgcgagcaacggcct cgtgatttccccgccgatccggtccccgcctccccactctgcccccgcc tacccc ggagccgtgcagccgcctctccgaatctctctcttctcctggcgctcgcgtgcga gagggaactagcgagaacgaggaagcagctggaggtgacgccgggcagatt acgcctgtcagggccgagccgagcggatcgctgggcgctgtgcagaggaaa ggcgggagtgcccggctcgctgtcgc agagccgaggtgggtaagctagcgac cacctggacttcccagcgcccaaccgtggcttttcagccaggtcctctcctcccg cggcttctcaaccaaccccatcccagcgccggccacccaacctcccgaaatga gtgcttcctgccccagcagccgaaggcgctactaggaacggtaacctgttacttt tccaggggccgtagtcgacccg ctgcccgagttgctgtgcgactgcgcgcgcg gggctagagtgcaaggtgactgtggttcttctctggccaagtccgagggaac gtaaagatatgggcctttttccccctctcaccttgtctcaccaaagtccctagtccc cggagcagttagcctcttttctttccagggaattagccagacacaacaacgggaac caga caccgaaccagacatgcccgccccgtgcgccctccccgctcgctgccttt cctccctcttgtctctccagagccggatcttcaaggggagcctccgtgcccccgg ctgctcagtccctccggtgtgcaggaccccggaagtcctccccgcacagctctc gcttctctttgcagcctgtttctgcgccggaccagtcga ggactctggacagtaga ggccccgggacgaccgagctgGAATTCGCCACCATGGCCCC AAAGAAGAAGCGGAAGGTCGGTATCCACGGAGT CCCAGCAGCCCTCGAACCAGGTGAAAAACCTTA CAAATGTCCTGAATGTGGGAAATCATTCAGTCGC AGCGACAACCTGGTGAGACATCAACGCACCCAT ACAGGAGAAAACCTTATAAATGTCCAGAATGT GGAAAGTCCTTCTCACGAGAGGATAACTTGCAC ACTCATCAACGAACACATACTGGTGAAAAACCA TACAAGTGTCCCGAATGTGGTAAAAGTTTTAGCC GGAGCGATGAACTTGTCCGACACCAACGAACCC ATACAGGCGAGAAGCCTTACAAATGTCCCGAGT GTGGCAAGAGCTTCTCACAATCAGGGAATCTGA CTGAGCAT CAACGAACTCATACCGGGGAAAAAC
- 91 046157- 91 046157
- 92 046157- 92 046157
- 93 046157- 93 046157
- 94 046157- 94 046157
- 95 046157- 95 046157
- 96 046157- 96 046157
- 97 046157- 97 046157
- 98 046157- 98 046157
- 99 046157- 99 046157
- 100 046157- 100 046157
- 101 046157- 101 046157
- 102 046157- 102 046157
Таблица 8Table 8
Последовательности нуклеиновых кислот для иллюстративных сайтов связывания микроРНК и микроРНКNucleic acid sequences for exemplary miRNA and miRNA binding sites
Таблица 9Table 9
Различные типы структур с цинковыми пальцами и иллюстративные белки типа цинковые пальцы для производства eTFVarious types of zinc finger structures and illustrative zinc finger proteins for eTF production
- 103 046157- 103 046157
- 104 046157- 104 046157
- 105 046157- 105 046157
Таблица 10 Аминокислотные последовательности иллюстративных ДНК-связывающих доменов типа цинковые пальцыTable 10 Amino acid sequences of exemplary zinc finger DNA binding domains
Таблица 11Table 11
Аминокислотные последовательности для раскрытых в настоящем документе иллюстративных последовательностей распознавания типа цинковые пальцыAmino acid sequences for exemplary zinc finger recognition sequences disclosed herein
- 106 046157- 106 046157
Таблица 12Table 12
Другие раскрытые в настоящем документе нуклеотидные и аминокислотные последовательностиOther nucleotide and amino acid sequences disclosed herein
- 107 046157- 107 046157
- 108 046157- 108 046157
- 109 046157- 109 046157
- 110 046157- 110 046157
ПримерыExamples
Следующие ниже примеры включены для дальнейшего описания некоторых аспектов настоящего раскрытия и не должны использоваться для ограничения объема настоящего изобретения.The following examples are included to further describe certain aspects of the present disclosure and should not be used to limit the scope of the present invention.
Пример 1.Example 1.
Идентификация целевых областей, способных активировать SCN1A, с использованием SCN1Aспецифических активаторов транскрипции.Identification of target regions capable of activating SCN1A using SCN1A-specific transcriptional activators.
Чтобы идентифицировать области генома, способные повышать экспрессию эндогенного SCN1A, разрабатывали различные сконструированные факторы транскрипции (либо нуклеазы типа цинковые пальцы, либо конструкции gRNA/daCas9), которые нацелены на различные области генома, как указано в табл. 4 и 13 выше. Для конструкций gRNA/daCas9 эта gRNA имела ту же последовательность, что и целевая область, потому что gRNA разрабатывали для нацеливания на комплементарную геномную цепь. Белок dCas9 представлял собой конструкцию dCAS9-VP64 (SEQ ID NO: 174). Клетки HEK293 культивиTo identify regions of the genome capable of upregulating the expression of endogenous SCN1A, various engineered transcription factors (either zinc finger nucleases or gRNA/daCas9 constructs) have been developed that target different regions of the genome, as listed in Table 1. 4 and 13 above. For gRNA/daCas9 constructs, this gRNA had the same sequence as the target region because the gRNA was designed to target the complementary genomic strand. The dCas9 protein was the construct dCAS9-VP64 (SEQ ID NO: 174). HEK293 cell culture
- 111 046157 ровали стандартными способами и трансфицировали (FugeneHD, Promega) 3 мкг плазмиды, несущей сконструированный фактор транскрипции или контрольную конструкцию, на лунку 6-луночного планшета. Клетки трансфицировали плазмидами, экспрессирующими конструкции, указанные в табл. 13 ниже. Через 48 часов после трансфекции клетки собирали, выделяли РНК (набор Qiagen RNeasy Mini) и обрабатывали ДНКазой. РНК (3 мкг) подвергали обратной транскрипции с использованием праймеров OligoDT (Superscript IV, Invitrogen). Образцы кДНК анализировали с помощью кПЦР с использованием Phusion Polymerase (New England Biolabs) и SYBR Green I: (30 секунд при температуре 98°C, 40-кратно [10 секунд при температуре 98°C, 15 секунд при температуре 66°C, 15 секунд при температуре 72°C]). Праймеры против SCN1A (5'-TGTCTCGGCATTGAGAACATTC-3' (SEQ ID NO: 185); 5'ATTGGTGGGAGGCCATTGTAT-3' (SEQ ID NO: 186)) использовали для количественной оценки уровней эндогенного транскрипта SCN1A, а относительные уровни экспрессии SCN1A определяли способом дельта-дельта Ct с GAPDH в качестве эталонного гена (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'-3' (SEQ ID NO: 187); 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' (SEQ ID NO: 188)). Данные представлены в виде кратных изменений относительно контрольного условия.- 111 046157 were prepared using standard methods and transfected (FugeneHD, Promega) with 3 μg of plasmid carrying the engineered transcription factor or control construct per well of a 6-well plate. Cells were transfected with plasmids expressing the constructs indicated in the table. 13 below. 48 hours after transfection, cells were harvested, RNA was isolated (Qiagen RNeasy Mini kit) and treated with DNase. RNA (3 μg) was reverse transcribed using OligoDT primers (Superscript IV, Invitrogen). cDNA samples were analyzed by qPCR using Phusion Polymerase (New England Biolabs) and SYBR Green I: (30 seconds at 98°C, 40 times [10 seconds at 98°C, 15 seconds at 66°C, 15 seconds at 72°C]). Primers against SCN1A (5'-TGTCTCGGCATTGAGAACATTC-3' (SEQ ID NO: 185); 5'ATTGGTGGGAGGCCATTGTAT-3' (SEQ ID NO: 186)) were used to quantify endogenous SCN1A transcript levels, and relative SCN1A expression levels were determined by the delta method -delta Ct with GAPDH as the reference gene (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'-3' (SEQ ID NO: 187); 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' (SEQ ID NO: 188)). Data are presented as fold changes relative to the control condition.
Результаты показаны на фиг. 1 и в табл. 13 ниже в виде кратного изменения транскрипции SCN1A относительно контрольных условий (например, репортерная конструкция EGFP-KASH). В табл. 13 приведены значения для конструкций, которые привели по меньшей мере к 1,5-кратному увеличению транскрипции по сравнению с контрольными условиями.The results are shown in Fig. 1 and in table. 13 below as the fold change in SCN1A transcription relative to control conditions (eg, EGFP-KASH reporter construct). In table Figure 13 shows values for constructs that resulted in at least a 1.5-fold increase in transcription compared to control conditions.
Таблица 13. Влияние различных целевых сайтов генома и соответствующих eTF на транскрипцию. CON указывает на конструкцию типа цинковые пальцы, которая использовалась в эксперименте (смотрите табл. 1). Для конструкций gRNA целевой сайт и последовательность gRNA являются одинаковыми, поскольку gRNA разрабатывали для нацеливания на комплементарную цепь ДНК.Table 13. Effect of different genomic target sites and corresponding eTFs on transcription. CON indicates the zinc finger design that was used in the experiment (see Table 1). For gRNA constructs, the target site and gRNA sequence are the same because the gRNA was designed to target the complementary strand of DNA.
Таблица13Table13
- 112 046157- 112 046157
Пример 2.Example 2.
Активация эндогенного SCN1A в клетках HEK293 с использованием специфических для SCN1A факторов транскрипции.Activation of endogenous SCN1A in HEK293 cells using SCN1A-specific transcription factors.
Клетки HEK293 культивировали стандартными способами и высевали в 6-луночные планшеты. Клетки в каждой лунке трансфицировали (FugeneHD, Promega) 3 мкг плазмиды, несущей либо единственную сконструированную конструкцию фактора транскрипции, CREB3 WT человека (SEQ ID NO: 211), либо контрольную конструкцию EGFP. Исследуемые сконструированные конструкции фактора транскрипции включали в себя: конструкции 1-27 и 46-53 (табл. 1) и плазмиду, экспрессирующую CREB3-TRE (SEQ ID NO: 215; CREB3 с ДНК-связывающим доменом bZIP, замененным синтетическим доменом ZF, нацеленным на промотор TET) (каждый исследовали отдельно). Через 48 часов после трансфекции клетки собирали и выделяли РНК (набор Qiagen RNeasy Mini) и обрабатывали ДНКазой. РНК (3 мкг) подвергали обратной транскрипции с использованием праймеров OligoDT (Superscript IV, Invitrogen). Образцы кДНК анализировали с помощью кПЦР с использованием Phusion Polymerase (New England Biolabs) и SYBR Green I: (30 секунд при температуре 98°C, 40-кратно [10 секунд при температуре 98°C, 15 секунд при температуре 66°C, 15 секунд при температуре 72°C]). Праймеры против SCN1A (5'-TGTCTCGGCATTGAGAACATTC-3' (SEQ ID NO: 185); 5'-ATTGGTGGGAGGCCATTGTAT-3' (SEQ ID NO: 186)) использовали для количественной оценки уровней эндогенного транскрипта SCN1A, и относительные уровни экспрессии SCN1A определяли способом дельта-дельта Ct с GAPDH в качестве эталонного гена (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'3' (SEQ ID NO: 187); 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA3' (SEQ ID NO: 188)). Данные представлены в виде кратных изменений относительно контрольного условия (смотрите фиг. 2A, фиг. 2B и фиг. 2C). Контрольная конструкция состояла из EGFP, экспрессированного под контролем RE 1 (SEQ ID NO: 1). Доставка сконструированных факторов транскрипции индуцировала различную степень активации эндогенного транскрипта SCNIA по отношению к состоянию EGFP.HEK293 cells were cultured using standard methods and seeded in 6-well plates. Cells in each well were transfected (FugeneHD, Promega) with 3 μg of plasmid carrying either a single engineered transcription factor construct, human CREB3 WT (SEQ ID NO: 211), or a control EGFP construct. The engineered transcription factor constructs studied included: constructs 1-27 and 46-53 (Table 1) and a plasmid expressing CREB3-TRE (SEQ ID NO: 215; CREB3 with the bZIP DNA binding domain replaced by a synthetic ZF targeting domain on the TET promoter) (each was studied separately). 48 hours after transfection, cells were harvested and RNA was isolated (Qiagen RNeasy Mini kit) and treated with DNase. RNA (3 μg) was reverse transcribed using OligoDT primers (Superscript IV, Invitrogen). cDNA samples were analyzed by qPCR using Phusion Polymerase (New England Biolabs) and SYBR Green I: (30 seconds at 98°C, 40 times [10 seconds at 98°C, 15 seconds at 66°C, 15 seconds at 72°C]). Primers against SCN1A (5'-TGTCTCGGCATTGAGAACATTC-3' (SEQ ID NO: 185); 5'-ATTGGTGGGAGGCCATTGTAT-3' (SEQ ID NO: 186)) were used to quantify endogenous SCN1A transcript levels, and relative SCN1A expression levels were determined by the method delta-delta Ct with GAPDH as the reference gene (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'3' (SEQ ID NO: 187); 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA3' (SEQ ID NO: 188)). Data are presented as fold changes relative to the control condition (see Fig. 2A, Fig. 2B and Fig. 2C). The control construct consisted of EGFP expressed under the control of RE 1 (SEQ ID NO: 1). Delivery of engineered transcription factors induced varying degrees of activation of the endogenous SCNIA transcript relative to the EGFP state.
Пример 3.Example 3.
Активация эндогенного SCN1A в ГАМК-нейронах с использованием специфических для SCN1A факторов транскрипции.Activation of endogenous SCN1A in GABA neurons using SCN1A-specific transcription factors.
ГАМК-нейроны iCell (Cellular Dynamics) помещали в 6-луночный планшет (~1E6 клеток/лунку) и поддерживали в соответствии с протоколом, рекомендованным производителем. Через 72 часа после посева рекомбинантный AAV (серотип AAV-DJ), экспрессирующий EGFP, или конструкцию активатора 30 на фиг. 3A, или конструкцию 25, или конструкцию 16 на фиг. 3B под контролем универсального промотора (промотор CBA) добавляли в культуральную среду приблизительно в количестве 2E11 копий генома на лунку. Через одну неделю (фиг. 3A) или две недели (фиг. 3B) после инфицирования РНК выделяли из культивированных клеток (набор Qiagen RNeasy Mini) и обрабатывали ДЦКазой. Восстановленную РНК подвергали обратной транскрипции с использованием праймеров OligoDT (Superscript IV, Invitrogen). Образцы кДНК анализировали с помощью кПЦР с использованием Phusion Polymerase (New England Biolabs) и SYBR Green I: (30 секунд при температуре 98°C, 40-кратно [10 секунд при температуре 98°C, 15 секунд при температуре 66°C, 15 секунд при температуре 72°C]). Праймеры против SCN1A (5'-TGTCTCGGCATTGAGAACATTC-3' (SEQ ID NO: 185); 5'-ATTGGTGGGAGGCCATTGTAT-3' (SEQ ID NO: 186)) использовали для количественной оценки уровней эндогенного транскрипта SCN1A, а относительные уровни экспрессии SCN1A определяли способом дельта-дельта Ct с GAPDH в качестве контрольного гена (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'3' (SEQ ID NO: 187); 5'TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' (SEQ ID NO: 188)). Данные представлены в виде кратных измененийiCell GABA neurons (Cellular Dynamics) were plated in a 6-well plate (~1E6 cells/well) and maintained according to the protocol recommended by the manufacturer. 72 hours after seeding, recombinant AAV (serotype AAV-DJ) expressing EGFP or activator construct 30 in FIG. 3A, or structure 25, or structure 16 in FIG. 3B under the control of a universal promoter (CBA promoter) was added to the culture medium at approximately 2E11 genome copies per well. One week (Fig. 3A) or two weeks (Fig. 3B) postinfection, RNA was isolated from cultured cells (Qiagen RNeasy Mini kit) and treated with DCCase. The recovered RNA was reverse transcribed using OligoDT primers (Superscript IV, Invitrogen). cDNA samples were analyzed by qPCR using Phusion Polymerase (New England Biolabs) and SYBR Green I: (30 seconds at 98°C, 40 times [10 seconds at 98°C, 15 seconds at 66°C, 15 seconds at 72°C]). Primers against SCN1A (5'-TGTCTCGGCATTGAGAACATTC-3' (SEQ ID NO: 185); 5'-ATTGGTGGGAGGCCATTGTAT-3' (SEQ ID NO: 186)) were used to quantify endogenous SCN1A transcript levels, and relative SCN1A expression levels were determined by the method delta-delta Ct with GAPDH as the reference gene (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'3' (SEQ ID NO: 187); 5'TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' (SEQ ID NO: 188)). Data are presented as fold changes
- 113 046157 относительно контрольного условия (смотрите фиг. 3A и 3B). Управляемая AAV экспрессия сконструированных факторов транскрипции вызывала значительную активацию эндогенного транскрипта SCNIA в культивируемых полученных из iPS ГАМК-нейронах.- 113 046157 relative to the control condition (see Fig. 3A and 3B). AAV-driven expression of engineered transcription factors caused significant activation of the endogenous SCNIA transcript in cultured iPS-derived GABA neurons.
Пример 4.Example 4.
Специфическая активация эндогенного SCN1A в ГАМК-нейронах с использованием специфического для SCN1A фактора транскрипции.Specific activation of endogenous SCN1A in GABA neurons using a SCN1A-specific transcription factor.
ГАМК-нейроны iCell (Cellular Dynamics) помещали в 6-луночный планшет (~1E6 клеток/лунку) и поддерживали в соответствии с протоколом, рекомендованным производителем. Через 72 часа после посева в культуральную среду добавляли рекомбинантный AAV (серотип AAV-DJ), экспрессирующий EGFP или активатор (конструкция 30), который содержит DBD типа цинковые пальцы, слитый с VPR TAD, управляемый промотором CBA под контролем промотора CBA приблизительно в количестве 2E11 копиях генома на лунку.iCell GABA neurons (Cellular Dynamics) were plated in a 6-well plate (~1E6 cells/well) and maintained according to the protocol recommended by the manufacturer. At 72 hours post-plating, recombinant AAV (serotype AAV-DJ) expressing EGFP or an activator (construct 30) that contains a zinc finger DBD fused to a VPR TAD driven by approximately 2E11 CBA promoter was added to the culture medium. copies of the genome per well.
Через неделю после инфицирования РНК выделяли из культивированных клеток (набор Qiagen RNeasy Mini) и обрабатывали ДНКазой. Библиотеки RNAseq получали из восстановленной РНК с использованием набора библиотек TruSeq Stranded mRNA (Illumina) и секвенировали на Illumina NextSeq (секвенирование парных концов 2x75 циклов). Считанные данные секвенирования сопоставляли с геномом человека (RNASTAR), и анализ дифференциальной экспрессии выполняли с помощью DESeq2. Данные представлены в виде кратного изменения относительно контрольных (AAVDJ-CBA-EGFP) образцов (смотрите фиг. 4). Результаты показаны в табл. 14, а на фиг. 4 показана относительная экспрессия эндогенного SCN1A и транскриптов 40 ближайших соседних генов, представленная в виде кратных изменений относительно контрольного условия. Конструкция 30, как описано в табл. 1, была способна специфически увеличивать экспрессию гена SCN1A или белка Nav1.1 по сравнению с другими исследованными генами. Это указывает на то, что целевой сайт, распознаваемый активатором транскрипции конструкции 30, специфичен для гена SCN1A, что приводит к увеличению экспрессии гена SCNIA в нейронах ГАМК.One week after infection, RNA was isolated from cultured cells (Qiagen RNeasy Mini kit) and treated with DNase. RNAseq libraries were prepared from recovered RNA using the TruSeq Stranded mRNA Library Kit (Illumina) and sequenced on Illumina NextSeq (2x75 cycle paired-end sequencing). Sequencing reads were mapped to the human genome (RNASTAR) and differential expression analysis was performed using DESeq2. Data are presented as fold change relative to control (AAVDJ-CBA-EGFP) samples (see Fig. 4). The results are shown in table. 14, and in FIG. Figure 4 shows the relative expression of endogenous SCN1A and transcripts of the 40 nearest neighboring genes, presented as fold changes relative to the control condition. Design 30, as described in table. 1 was able to specifically increase the expression of the SCN1A gene or Nav1.1 protein compared to other genes tested. This indicates that the target site recognized by transcription activator construct 30 is specific to the SCN1A gene, resulting in increased expression of the SCNIA gene in GABA neurons.
Таблица 14Table 14
Влияние на транскрипцию эндогенного SCN1A и 40 ближайших соседних генов в ГАМК-нейронах, обработанных специфическим для SCN1A фактором транскрипции (конструкция 30)Effects on transcription of endogenous SCN1A and 40 immediate neighboring genes in GABA neurons treated with a SCN1A-specific transcription factor (construct 30)
- 114 046157- 114 046157
Пример 5.Example 5.
Экспрессия SCN1A из кассеты экспрессии in vivo.Expression of SCN1A from an expression cassette in vivo.
Чтобы проверить экспрессию активаторов транскрипции SCN1A in vivo, создавали рекомбинантные векторы AAV9 компанией VectorBiolabs (Malvern, PA). Самцам мышей C57Bl/6 (N=5 на группу, возраст 7-8 недель) проводили двустороннюю инфузию 1,5 мкл очищенного вектора AAV в дорсальный гиппокамп (AP -2,0 мм, латерально ±1,5, DV -1,4 мм от твердой мозговой оболочки) и вентральный гиппокамп (AP -3,1 мм, латерально ± 2,8, DV -3,8 мм от твердой мозговой оболочки), всего 4 места инъекции. AAV доставляли со скоростью 0,3 мкл/мин с периодом отдыха 4 мин после каждой инъекции. Через четыре недели после воздействия мышей умерщвляли и иссекали ткань гиппокампа. Для каждой группы ткань левого и правого гиппокампа собирали вместе для гомогенизации у большинства животных (N=4), за исключением одного животного, у которого собирали и гомогенизировали только левый гиппокамп. РНК выделяли из гомогената (набор Qiagen RNeasy Mini) и обрабатывали ДНКазой. РНК (3 мкг) подвергали обратной транскрипции с использованием праймеров OligoDT (Superscript IV, Invitrogen). Образцы кДНК анализировали с помощью кПЦР на экспрессию мышиного SCN1A с использованием Phusion Polymerase (New England Biolabs) и SYBR Green I: 30 секунд при температуре 98°C, 40-кратно [10 секунд при температуре 98°C, 15 секунд при температуре 64°C, 15 секунд при температуре 72°C]. Праймеры против SCN1A мыши (5'-CAAAAAAGCCACAAAAGCCT-3' (SEQ ID NO: 189); 5'TTAGCTCCGCAAGAAACATC-3' (SEQ ID NO: 190)) использовали для количественной оценки уровней эндогенного транскрипта SCN1A, а относительные уровни экспрессии SCN1A in vivo определяли способом дельта-дельта Ct с GAPDH в качестве эталонного гена (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'3' (SEQ ID NO: 187); 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' (SEQ ID NO: 188)).To test the expression of SCN1A transcriptional activators in vivo, recombinant AAV9 vectors were generated by VectorBiolabs (Malvern, PA). Male C57Bl/6 mice (N=5 per group, 7-8 weeks old) received a bilateral infusion of 1.5 μl of purified AAV vector into the dorsal hippocampus (AP -2.0 mm, lateral ±1.5, DV -1.4 mm from the dura mater) and ventral hippocampus (AP -3.1 mm, lateral ± 2.8, DV -3.8 mm from the dura mater), a total of 4 injection sites. AAV was delivered at a rate of 0.3 μl/min with a rest period of 4 min after each injection. Four weeks after exposure, mice were sacrificed and hippocampal tissue was excised. For each group, tissue from the left and right hippocampus was collected together for homogenization in most animals (N=4), with the exception of one animal in which only the left hippocampus was collected and homogenized. RNA was isolated from the homogenate (Qiagen RNeasy Mini kit) and treated with DNase. RNA (3 μg) was reverse transcribed using OligoDT primers (Superscript IV, Invitrogen). cDNA samples were analyzed by qPCR for mouse SCN1A expression using Phusion Polymerase (New England Biolabs) and SYBR Green I: 30 seconds at 98°C, 40 times [10 seconds at 98°C, 15 seconds at 64°C C, 15 seconds at 72°C]. Primers against mouse SCN1A (5'-CAAAAAAGCCACAAAAGCCT-3' (SEQ ID NO: 189); 5'TTAGCTCCGCAAGAAACATC-3' (SEQ ID NO: 190)) were used to quantify endogenous SCN1A transcript levels, and relative SCN1A expression levels in vivo determined by the delta-delta Ct method with GAPDH as the reference gene (5'-ACCACAGTCCATGCCATCAC'3' (SEQ ID NO: 187); 5'-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3' (SEQ ID NO: 188)).
На фиг. 5A и фиг. 5B показаны средние результаты для пяти животных, каждому из которых вводили конструкцию AAV9. Контрольная конструкция eGFP содержала репортерный трансген eGFP. Конструкция 4 (смотрите табл. 1) содержала активатор транскрипции, который распознавал целевую последовательность, содержащую SEQ ID NO: 18, как описано в табл. 1 выше. На фиг. 5A показана относительная экспрессия SCN1A in vivo. На фиг. 5B показано изменение экспрессии SCN1A in vivo в процентах от средней экспрессии eGFP. Эти результаты показали, что активатор транскрипции SCN1A экспрессионной кассеты A приводил к усилению экспрессии SCNIA приблизительно на 20-30% in vivo.In fig. 5A and FIG. 5B shows the average results for five animals each treated with the AAV9 construct. The eGFP control construct contained the eGFP reporter transgene. Construct 4 (see Table 1) contained a transcription activator that recognized the target sequence containing SEQ ID NO: 18, as described in Table. 1 above. In fig. 5A shows the relative expression of SCN1A in vivo. In fig. Figure 5B shows the change in SCN1A expression in vivo as a percentage of average eGFP expression. These results indicated that transcriptional activator of SCN1A expression cassette A resulted in an approximately 20-30% increase in SCNIA expression in vivo.
Такие кассеты экспрессии могут быть адаптированы для применения на людях для лечения синдрома Драве, эпилепсии, судорог, болезни Альцгеймера, болезни Паркинсона и/или любых других заболеваний или состояний, связанных с дефицитом и/или нарушением активности SCN1A.Such expression cassettes may be adapted for use in humans to treat Dravet syndrome, epilepsy, seizures, Alzheimer's disease, Parkinson's disease and/or any other diseases or conditions associated with deficiency and/or impairment of SCN1A activity.
- 115 046157- 115 046157
Пример 6.Example 6.
Анализ гипертермических припадков (HTS) на мышах с синдромом Драве.Analysis of hyperthermic seizures (HTS) in mice with Dravet syndrome.
A. Гетерозиготная модель мыши с нокаутом Scn1a.A. Heterozygous Scn1a knockout mouse model.
Лечение синдрома Драве и/или его симптомов с использованием кассет экспрессии исследовали на линии мышей Scn1atm1Kea Эта линия мышей представляет собой признанную мышиную модель для синдрома Драве. Линии мыши Scn1atm1Kea не требуют рекомбиназы CRE. Мышь Scn1atm1Kea (доступная из лаборатории the Jackson Laboratory; описанная в Hawkins et al., Scientific Reports, vol. 7: 15327 (2017)) содержит делецию первого кодирующего экзона SCN1A. Мыши, гомозиготные по аллелю нокаута SCN1A, характеризуются тремором, атаксией, припадками и умирают к 16-му дню после рождения. У гетерозиготных мышей на фоне C57BL/6 развиваются спонтанные припадки, и большая часть их умирает в течение нескольких недель. Такая линия мышей может быть использована для изучения безопасности и эффективности лечения эпилепсии и синдрома Драве. См. Miller et al., Genes Brain Behav. 2014 Feb;13(2):163-72 для дополнительной информации.Treatment of Dravet syndrome and/or its symptoms using expression cassettes was investigated in the Scn1a tm1Kea mouse line. This mouse line is an established mouse model for Dravet syndrome. Scn1a tm1Kea mouse lines do not require CRE recombinase. The Scn1a tm1Kea mouse (available from the Jackson Laboratory; described in Hawkins et al., Scientific Reports, vol. 7: 15327 (2017)) contains a deletion of the first coding exon of SCN1A. Mice homozygous for the SCN1A knockout allele are characterized by tremors, ataxia, seizures, and die by 16 days after birth. Heterozygous mice on a C57BL/6 background develop spontaneous seizures and most die within a few weeks. This mouse line can be used to study the safety and effectiveness of treatment for epilepsy and Dravet syndrome. See Miller et al., Genes Brain Behav. 2014 Feb;13(2):163-72 for more information.
Чтобы исследовать эффективность активаторов транскрипции в линии мышей Scn1atm1Kea, в пометы детенышей, полученных от самцов Scn1a +/-, скрещенных с самками C57Bl/6J, вводили вектор AAV посредством двусторонней ICV в точке P1. Мышам вводили дозы конструкций 31-34 (табл. 1). Мышей оставляли без воздействий вместе с их матерью до отлучения в P18, а затем снова не трогали до P26-P28, когда начинали анализ гипертермического припадка (HTS). Отдельные пометы мышей, которым вводили дозу в P1, отсеивали на P18 и ежедневно наблюдали за смертностью. Индукцию гипертермического припадка проводили у гетерозиготных (HET) мышей и мышей WT Scn1a на смешанном фоне 129Stac X C57BL/6 в P26-P28. Перед исследованием мышам вставляли смазанный ректальный датчик температуры (Ret-4) и подсоединяли к модулю контроля температуры (TCAT 2DF, Physitemp), который был последовательно соединен с нагревательной лампой (HL-1). Затем мышей помещали в большой стеклянный стакан и на короткое время давали уравновеситься с окружающей средой. После этого температура тела повышалась на ~0,5°C каждые 2 минуты до начала первого тонико-клонического припадка, сопровождающегося потерей положения стоя или до достижения температуры 43°C. Если у мыши случался припадок с потерей положения тела, эксперимент заканчивали и регистрировали внутреннюю температуру тела мыши. Если в течение всего эксперимента не было обнаружено приступов с потерей положения тела, эта мышь считалась без припадков, и анализ завершали. Образцы тканей получали от мышей в точке P1, a генотипирование мышей выполняли в ходе эксперимента с использованием ПЦР в реальном времени. После завершения анализа генотипирование было не слепым, и статус мышей как HET или WT коррелировал с полученными данными. Данные наносили на кривую выживаемости Каплана-Мейера, а значимость определяли с помощью теста Мантеля-Кокса. Результаты показаны в табл. 15 и 16 и на фиг. 6A-E.To examine the efficacy of transcriptional activators in the Scn1a tm1Kea mouse line, litters of pups derived from Scn1a +/− males crossed with C57Bl/6J females were injected with the AAV vector via bilateral ICV at P1. Mice were administered doses of constructs 31–34 (Table 1). Mice were left undisturbed with their mother until weaning at P18 and then left undisturbed again until P26–P28, when the hyperthermic seizure (HTS) assay began. Individual litters of mice dosed at P1 were screened out at P18 and monitored for mortality daily. Hyperthermic seizure induction was performed in heterozygous (HET) mice and WT Scn1a mice on a mixed 129Stac X C57BL/6 background at P26-P28. Before the study, mice were inserted with a lubricated rectal temperature probe (Ret-4) and connected to a temperature control module (TCAT 2DF, Physitemp), which was connected in series with a heat lamp (HL-1). The mice were then placed in a large glass beaker and allowed to equilibrate with the environment for a short time. Thereafter, body temperature increased by ~0.5°C every 2 minutes until the onset of the first tonic-clonic seizure accompanied by loss of standing position or until the temperature reached 43°C. If a mouse experienced a seizure with loss of body position, the experiment was terminated and the mouse's core body temperature was recorded. If no postural seizures were detected throughout the experiment, that mouse was considered seizure-free and the analysis was completed. Tissue samples were obtained from mice at P1, and genotyping of mice was performed during the experiment using real-time PCR. Once the analysis was completed, genotyping was not blinded, and the status of the mice as HET or WT was correlated with the data obtained. Data were plotted on a Kaplan-Meier survival curve, and significance was determined using the Mantel-Cox test. The results are shown in table. 15 and 16 and in fig. 6A-E.
Таблица 15Table 15
Обобщение условий, использованных в примере 6Summary of conditions used in Example 6
Таблица 16Table 16
Обобщение результатов анализа на гипертермические припадкиSummary of test results for hyperthermic seizures
Дополнительные эксперименты проводили на мышах Scn1atm1Kea, как описано выше, чтобы проверить влияние конструкций 42 и 43 на припадки в анализе HTS. В этих экспериментах конструкцию 42 вводили в дозе 9x1010 копий генома/мышь посредством двусторонней ICV в P1, а конструкцию 43 вводили в дозе 6x1010 копий генома/мышь посредством двусторонней ICV в P1 или P5. Результаты показаны на фиг. 6F (конструкция 42) и фиг. 6G (конструкция 43). Обе конструкции показали значительное снижение припадков по сравнению с контрольными EGFP (P<0,0001 как для конструкции 42, так и для конструкции 43).Additional experiments were performed in Scn1a tm1Kea mice as described above to test the effects of constructs 42 and 43 on seizures in the HTS assay. In these experiments, construct 42 was administered at a dose of 9x1010 genome copies/mouse via bilateral ICV in P1, and construct 43 was administered at a dose of 6x1010 genome copies/mouse via bilateral ICV in P1 or P5. The results are shown in Fig. 6F (structure 42) and FIG. 6G (design 43). Both constructs showed a significant reduction in seizures compared to EGFP controls (P<0.0001 for both construct 42 and construct 43).
- 116 046157- 116 046157
B. Гетерозиготная мутантная модель мыши ScnlaRX.B. ScnlaRX heterozygous mutant mouse model.
Лечение синдрома Драве и/или его симптомов с использованием кассеты экспрессии по настоящему раскрытию исследовали на линии мышей Scn1aRX. Эта линия мышей представляет собой признанную модель мышей для синдрома Драве. Линии мыши Scn1aRX не требуют рекомбиназы CRE. Мышь Scn1aRX (доступная из лаборатории Jackson Laboratory; описанная в Ogiwara et al., J. Neuroscience, vol. 27: 59035914 (2007)), содержит нонсенс-мутацию с потерей функции в экзоне 21 гена SCN1A (CgG на TgA; R1407X). У гетерозиготных мышей на фоне C57BL/6 развиваются спонтанные припадки, и большой процент мышей умирает в течение нескольких недель.Treatment of Dravet syndrome and/or its symptoms using the expression cassette of the present disclosure was studied in the Scn1a RX mouse line. This mouse strain is an established mouse model for Dravet syndrome. Scn1aRX mouse lines do not require CRE recombinase. The Scn1aRX mouse (available from the Jackson Laboratory; described in Ogiwara et al., J. Neuroscience, vol. 27: 59035914 (2007)) contains a loss-of-function nonsense mutation in exon 21 of the SCN1A gene (CgG to TgA; R1407X). Heterozygous mice on a C57BL/6 background develop spontaneous seizures, and a large percentage of mice die within a few weeks.
Для проверки эффективности активаторов транскрипции в линии мышей Scn1aRX в пометы детенышей, полученных от скрещивания посредством ЭКО сперматозоидов самцов Scn1aRX/+ с яйцеклеткой C57Bl/6J с эмбрионами, имплантированными самкам CD-1, вводили вектор AAV (конструкция 31) в дозе 5,1х1010 копий генома ^сУмышь или контроль PBS посредством двусторонней ICV в P1. Мышей оставляли без воздействий вместе с их матерью до отлучения в P18, а затем снова оставляли без воздействий до P26-P28, когда начинали анализ HTS. Отдельные пометы мышей, которым вводили дозу в P1, осматривали в P18 и ежедневно наблюдали за смертностью. Индукцию гипертермического припадка проводили у гетерозиготных (HET) мышей P26-P28 и мышей WT Scn1a на фоне C57BL/6. Перед исследованием мышам вставляли смазанный ректальный датчик температуры (Ret-4) и подсоединяли к модулю контроля температуры (TCAT 2DF, Physitemp), который был последовательно соединен с нагревательной лампой (HL-1). Затем мышей помещали в большой стеклянный стакан и на короткое время давали уравновеситься с окружающей средой. После этого температура тела повышалась на ~0,5°C каждые 2 минуты до начала первого тонико-клонического припадка, сопровождающегося потерей положения тела, или до достижения температуры 43°C. Если у мыши случался припадок с потерей положения тела, эксперимент заканчивали и регистрировали внутреннюю температуру тела мыши. Если в течение всего эксперимента не было обнаружено припадков с потерей положения тела, эта мышь считалась без припадков, и анализ завершался. Образцы тканей получали от мышей в точке P1, и генотипирование мышей выполняли в ходе эксперимента с использованием ПЦР в реальном времени. После завершения анализа генотипирование было не слепым, и статус мышей как HET или WT коррелировал с полученными данными. Ни у одной из исследованных мышей WT Scna1 не было припадка. Данные для мышей HET, обработанных конструкцией 31 (n=13) и обработанных PBS контролем (n=14), наносили на кривую выживаемости Каплана-Мейера, и значимость определяли с помощью критерия Кокса-Мантеля. Как показано на фиг. 6H, мыши HET, обработанные конструкцией 31, показывают значительное снижение индукции гипертермического припадка по сравнению с мышами HET, получавшими контрольный PBS (P<0,01).To test the effectiveness of transcription activators in the Scn1aRX mouse line, the AAV vector (design 31) was introduced into litters of pups obtained through IVF crossing of Scn1a RX/+ male sperm with C57Bl/6J eggs with embryos implanted into CD-1 females at a dose of 5.1x10 10 copies of the mouse genome or PBS control via bilateral ICV in P1. Mice were left unexposed with their mother until weaning at P18 and then left unexposed again until P26–P28, when the HTS assay began. Individual litters of mice dosed at P1 were examined at P18 and monitored daily for mortality. Hyperthermic seizure induction was performed in heterozygous (HET) P26-P28 mice and WT Scn1a mice on a C57BL/6 background. Before the study, mice were inserted with a lubricated rectal temperature probe (Ret-4) and connected to a temperature control module (TCAT 2DF, Physitemp), which was connected in series with a heat lamp (HL-1). The mice were then placed in a large glass beaker and allowed to equilibrate with the environment for a short time. Thereafter, body temperature increased by ~0.5°C every 2 minutes until the onset of the first tonic-clonic seizure, accompanied by loss of body position, or until the temperature reached 43°C. If a mouse experienced a seizure with loss of body position, the experiment was terminated and the mouse's core body temperature was recorded. If no postural seizures were detected throughout the experiment, that mouse was considered seizure-free and the analysis was completed. Tissue samples were obtained from mice at P1, and genotyping of mice was performed during the experiment using real-time PCR. Once the analysis was completed, genotyping was not blinded, and the status of the mice as HET or WT was correlated with the data obtained. None of the WT Scna1 mice studied had a seizure. Data for HET mice treated with construct 31 (n=13) and PBS control (n=14) were plotted on a Kaplan-Meier survival curve and significance was determined using the Cox-Mantel test. As shown in FIG. 6H, HET mice treated with construct 31 show a significant reduction in hyperthermic seizure induction compared to HET mice treated with control PBS (P<0.01).
Пример 7.Example 7.
Анализ выживаемости на мышиной модели синдрома Драве.Survival analysis in a mouse model of Dravet syndrome.
A. Гетерозиготная модель мыши с нокаутом Scn1a.A. Heterozygous Scn1a knockout mouse model.
Для проверки эффективности активаторов транскрипции в линии мышей Scn1atmlKea в пометы детенышей, полученных от самцов Scn1a +/-, скрещенных с самками C57Bl/6J, вводили вектор AAV посредством двусторонней ICV в точке P1. Мышей не оставляли без воздействия с их матерью до отлучения. Наблюдение за состоянием здоровья мышей Scn1a +/- проводили ежедневно после отлучения в P18. Мышам, которые были найдены мертвыми в своей домашней клетке по любой причине, была записана дата. Данные наносили на кривую выживаемости Каплана-Мейера, а значимость определяли с помощью критерия Кокса-Мантеля.To test the efficacy of transcriptional activators in the Scn1a tmlKea mouse line, litters of pups derived from Scn1a +/− males crossed with C57Bl/6J females were injected with the AAV vector via bilateral ICV at P1. Mice were left unexposed with their mother until weaning. Health monitoring of Scn1a +/− mice was performed daily after weaning at P18. Mice that were found dead in their home cage for any reason were dated. Data were plotted on a Kaplan-Meier survival curve and significance was determined using the Cox-Mantel test.
Результаты показаны в табл. 17 и на фиг. 7A-D.The results are shown in table. 17 and FIG. 7A-D.
Таблица 17Table 17
Обобщение условий и результатов анализа выживаемостиSummary of conditions and results of survival analysis
_~ .RX_~.RX
B. Гетерозиготная модель мутантной мыши Scn1a .B. Heterozygous Scn1a mutant mouse model.
Чтобы проверить эффективность активаторов транскрипции в линии мышей Scn1aRX, в пометы детенышей, полученных от самцов и скрещивания ЭКО сперматозоидов Scn1aRX/+ с яйцеклетками C57Bl/6J, в эмбрионы, имплантированных самками CD-1, вводили вектор AAV (конструкция 31) при 5,1х1010 копий генома ^сУмышь или контроль PBS посредством двусторонней ICV в P1. Мышей оставляли без воздействия с их матерью до отлучения. Наблюдение за состоянием здоровья мышей Scn1aTo test the effectiveness of transcriptional activators in the Scn1a RX mouse line, litters of pups generated from males and IVF crosses of Scn1aRX/+ sperm with C57Bl/6J eggs were injected into embryos implanted with CD-1 females with the AAV vector (construct 31) at 5. 1x10 10 copies of the genome ^cMouse or PBS control via bilateral ICV in P1. Mice were left unexposed with their mother until weaning. Health Monitoring of Scn1a Mice
- 117 046157- 117 046157
RX/+ проводили ежедневно после отлучения в P18. Мышам, которые были найдены мертвыми в своей домашней клетке по любой причине, была записана дата. Данные для обработанных конструкцией 31 (n=27) и обработанных контролем (n=18) наносили на кривую выживаемости Каплана-Мейера, а значимость определяли с помощью критерия Кокса-Мантеля.RX/+ was performed daily after weaning at P18. Mice that were found dead in their home cage for any reason were dated. Data for construct 31 treated (n=27) and control treated (n=18) were plotted on a Kaplan-Meier survival curve and significance was determined using the Cox-Mantel test.
Как показано на фиг. 7E, мыши Scn1aRX/+, получившие конструкцию 31, характеризовались повышенной выживаемостью по сравнению с мышами Scn1aRX/+, получавшими контрольный PBS (P<0,0001).As shown in FIG. 7E, Scn1aRX /+ mice receiving construct 31 had increased survival compared to Scn1aRX /+ mice receiving control PBS (P<0.0001).
Пример 8.Example 8.
Уровни транскрипции SCN1A у отличных от человека приматов после лечения AAV, кодирующим специфический фактор транскрипции SCN1A.Transcription levels of SCN1A in non-human primates following treatment with AAV encoding the specific transcription factor SCN1A.
В исследовании использовали самцов яванского макака (macaca fascicularis) в возрасте от 2 до 3 лет. Животных перед включением в исследование предварительно проверяли на наличие перекрестнореактивных антител к AAV9 с помощью клеточного анализа нейтрализующих антител. AAV9, экспрессирующий фактор транскрипции, специфический для SCN1A (конструкция 33), или контроль разводили в PBS и вводили интрапаренхимально в концентрации 1,2E12 gc/животное. Для инъекций определяли три различных стереотаксических координаты в каждом полушарии, шесть участков инъекции на животное. В каждую точку вводили объем 10 мкл. Инъекции в правое полушарие были симметричны левым. Два необработанных животных использовали в качестве контроля.The study used male cynomolgus monkeys (macaca fascicularis) aged 2 to 3 years. Animals were prescreened for the presence of cross-reactive antibodies to AAV9 using a cellular neutralizing antibody assay before inclusion in the study. AAV9 expressing a transcription factor specific for SCN1A (construct 33) or control was diluted in PBS and injected intraparenchyally at a concentration of 1.2E12 gc/animal. For injections, three different stereotaxic coordinates were determined in each hemisphere, six injection sites per animal. A volume of 10 μl was injected into each point. Injections into the right hemisphere were symmetrical to the left. Two untreated animals were used as controls.
Для оценки экспрессии мРНК Scn1A проводили обратную транскрипцию с последующим способом кПЦР. При вскрытии трупа через 28 дней после введения дозы срезы тканей из различных областей головного мозга (лобная кора, теменная кора, височная кора, затылочная кора, гиппокамп, продолговатый мозг, мозжечок; по 200 мг каждого) от контрольных и обработанных животных собирали в RNAlater, а затем замораживали. Вкратце, иссекали 30 мг ткани, экстрагировали РНК (с помощью мини-набора для ткани Qiagen Rneasy Lipid, номер по каталогу 1023539), преобразовывали в кДНК путем обратной транскрипции (с использованием набора для обратной транскрипции кДНК высокой емкости Applied Biosystems, номер по каталогу 4368814) и проводили кПЦР с использованием набора праймеров/зондов для Scn1A и гена домашнего хозяйства GAPDH (Applied Biosystems, номер по каталогу Rh02621745-gI FAM).To evaluate Scn1A mRNA expression, reverse transcription followed by qPCR was performed. At necropsy 28 days after dosing, tissue sections from various brain regions (frontal cortex, parietal cortex, temporal cortex, occipital cortex, hippocampus, medulla oblongata, cerebellum; 200 mg each) from control and treated animals were collected in RNAlater. and then frozen. Briefly, 30 mg of tissue was dissected, RNA extracted (using Qiagen Rneasy Lipid Mini Tissue Kit, part number 1023539), converted to cDNA by reverse transcription (using Applied Biosystems High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit, part number 4368814 ) and qPCR was performed using a primer/probe set for Scn1A and the housekeeping gene GAPDH (Applied Biosystems, catalog number Rh02621745-gI FAM).
Наборы праймеров/зондов для SCNIA приведены ниже.Primer/probe sets for SCNIA are given below.
Таблица 18Table 18
Последовательности праймеров, использованные в примере 8Primer sequences used in example 8
Экспрессию гена Scn1A в каждом исследуемом образце определяли относительным количественным анализом (RQ) с использованием способа сравнительного Ct (ΔΟ). Этот способ измеряет разность Ct (ΔΟ0 между целевым геном и геном домашнего хозяйства, а затем сравнивает значения ΔΟ образцов для лечения с контрольными образцами.Scn1A gene expression in each test sample was determined by relative quantitation (RQ) using the comparative Ct (ΔΟ) method. This method measures the difference in Ct(ΔΟ0) between a target gene and a housekeeping gene, and then compares the ΔΟ values of treatment samples with control samples.
ACt = среднее Ct целевого гена - среднее Ct гена домашнего хозяйства.ACt = average Ct of target gene - average Ct of housekeeping gene.
ΔΔ(ΐ = Δ(ΐ образца лечения - Δ(ΐ контрольного образца.ΔΔ(ΐ = Δ(ΐ treatment sample - Δ(ΐ control sample.
Относительная экспрессия (образец лечения) = 2 - ΔΔ(ΐRelative expression (treatment sample) = 2 - ΔΔ(ΐ
Данные представлены в виде нормализованной экспрессии целевой мРНК в различных тканях головного мозга (см. фиг. 8). Как показано на фиг. 8, участки головного мозга, проксимальные к участкам интрапаренхиматозных инъекций, показали самые высокие уровни экспрессии транскрипта SCN1A.Data are presented as normalized target mRNA expression in different brain tissues (see Fig. 8). As shown in FIG. 8, brain regions proximal to intraparenchymal injection sites showed the highest levels of SCN1A transcript expression.
Пример 9.Example 9.
Селективная экспрессия трансгена в PV-содержащих нейронах у отличных от человека приматов после лечения AAV, имеющего селективный в отношении PV промотор и сайт связывания микроРНК.Selective transgene expression in PV-containing neurons in non-human primates following treatment with AAV having a PV-selective promoter and microRNA binding site.
В исследовании использовали шесть мартышек (Callithrix jacchus), которых предварительно проверяли на перекрестно-реактивные антитела к AAV9 перед включением в исследование. Двум обезьянам вводили AAV9, содержащий трансген EGFP под контролем промотора EF1alpha, двум обезьянам вводили AAV9, содержащий трансген EGFP, под контролем RE 2 (SEQ ID NO: 2), и двум обезьянам вводили AAV9, содержащий трансген EGFP под контролем RE 2 (SEQ ID NO: 2), а также содержащий сайт связывания микроРНК (SEQ ID NO: 7), расположенный между кодирующей областью EGFP и полиАхвостом. Векторы AAV9 разводили в PBS и животным вводили три внутримозговые инъекции (2 мкл каждая) в гиппокамп/энторинальную кору каждого полушария, всего 6 участков инъекции на животное. Два животных получали вектор AAV9, содержащий EF1alpha-EGFP, каждое получило общую дозу 5,8E+11 копий генома/животное, два животных получали вектор AAV9, содержащий RE 2-EGFP, каждое получило общую дозу 3,0E+11 копий генома/животное, и два животных получали вектор AAV9, содержащий RE 2 + m1-EGFP, каждое получило общую дозу 2,3E+11 копий генома/животное.The study used six marmosets (Callithrix jacchus), which were pretested for cross-reactive antibodies to AAV9 before inclusion in the study. Two monkeys were administered AAV9 containing the EGFP transgene under the control of the EF1alpha promoter, two monkeys were administered AAV9 containing the EGFP transgene under the control of RE 2 (SEQ ID NO: 2), and two monkeys were administered AAV9 containing the EGFP transgene under the control of RE 2 (SEQ ID NO: 2), and also containing a microRNA binding site (SEQ ID NO: 7), located between the EGFP coding region and the polyTail. AAV9 vectors were diluted in PBS and animals received three intracerebral injections (2 μl each) into the hippocampus/entorhinal cortex of each hemisphere, for a total of 6 injection sites per animal. Two animals received an AAV9 vector containing EF1alpha-EGFP, each receiving a total dose of 5.8E+11 genome copies/animal, two animals received an AAV9 vector containing RE 2-EGFP, each receiving a total dose of 3.0E+11 genome copies/animal , and two animals received the AAV9 vector containing RE 2 + m1-EGFP, each receiving a total dose of 2.3E+11 genome copies/animal.
- 118 046157- 118 046157
Иммуногистохимию использовали для оценки селективной экспрессии парвальбумина (PV). При вскрытии трупа, через 28 дней после введения дозы, собирали срезы тканей из различных областей головного мозга. Плавающие срезы головного мозга мартышек (35 мкм) фиксировали в 4% параформальдегиде, блокировали буфером (PBS, 3% BSA, 3% ослиная сыворотка, 0,3% Triton-X 100, 0,2% Tween-20), а затем окрашивали анти-GFP (Abcam ab290) ,а затем вторичным антителом, конъюгированным с Alexa488 (Thermo A21206). За этим последовали антитело к PV (Swant) и вторичное антитело, конъюгированное с Alexa-647 (Thermo A31571) и 4',6-диамидино-2-фенилиндолом (DAPI). Срезы монтировали и визуализировали с помощью PerkinElmer Vectra3.Immunohistochemistry was used to evaluate the selective expression of parvalbumin (PV). At autopsy, 28 days after dosing, tissue sections were collected from various areas of the brain. Floating sections of marmoset brains (35 μm) were fixed in 4% paraformaldehyde, blocked with buffer (PBS, 3% BSA, 3% donkey serum, 0.3% Triton-X 100, 0.2% Tween-20), and then stained anti-GFP (Abcam ab290) followed by a secondary antibody conjugated to Alexa488 (Thermo A21206). This was followed by an anti-PV antibody (Swant) and a secondary antibody conjugated to Alexa-647 (Thermo A31571) and 4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI). Sections were mounted and imaged using a PerkinElmer Vectra3.
Результаты показаны на фиг. 9A-F и 10A-L.The results are shown in Fig. 9A-F and 10A-L.
Пример 10.Example 10.
Биораспространение eTFSCN1A Biodistribution of eTF SCN1A
Целью этого исследования было сравнить биораспределение eTFSCN1A в центральной нервной системе (ЦНС) молодых обезьян яванского макака при введении в дозе 4,8E+13 посредством односторонней интрацеребровентрикулярной (ICV) инъекции. Каждому животному инъецировали AAV9, содержащий кассету экспрессии, кодирующую eTFSCN1A, под контролем селективного регуляторного элемента ГАМК (GABA) (REGABA-eTFSCN1A). Частицы AAV9 составляли в PBS + 0,001% плюроновой кислоты и вводили в дозе 4,8E+13 или 8E+13 vg/животное. Каждому животному вводили 2 мл приготовленных вирусных частиц. Дизайн исследования представлен в табл. 19.The aim of this study was to compare the biodistribution of eTF SCN1A in the central nervous system (CNS) of juvenile cynomolgus monkeys when administered at a dose of 4.8E+13 via unilateral intracerebroventricular (ICV) injection. Each animal was injected with AAV9 containing an expression cassette encoding eTF SCN1A under the control of a GABA selective regulatory element (RE GABA -eTF SCN1A ). AAV9 particles were formulated in PBS + 0.001% pluronic acid and administered at a dose of 4.8E+13 or 8E+13 vg/animal. Each animal was injected with 2 ml of prepared viral particles. The study design is presented in Table. 19.
Яванских макаков в возрасте двадцать четыре месяца группировали, как указано в табл. 19. Перед началом исследования образцы крови животных исследовали на уровни титра нейтрализующих антител к AAV9 с использованием анализа титра NAb, описанного выше. Для исследования выбирали животных с низкими или отрицательными результатами на антитела. Образцы вводили посредством инъекции ICV с использованием стандартных хирургических процедур. Размороженный дозируемый материал ненадолго хранили на влажном льду и нагревали до комнатной температуры непосредственно перед дозированием. Животных анестезировали, готовили к операции и помещали в стереотаксическую рамку, совместимую с MPT (Kopf). Для определения координат цели выполняли базовую МРТ. Делали разрез и просверливали одно отверстие в черепе над целевым участком. Шприц BD объемом 3 мл, прикрепленный к набору удлинителей с микроканальным отверстием длиной 36 дюймов, подготавливали с образцом и помещали в инфузионный насос. Линию экстензии примировали. Твердую мозговую оболочку открывали, и дозирующую иглу продвигали на глубину от 13,0 до 18,1 мм от мягкой мозговой оболочки. Инъекцию контрастного вещества и рентгеноскопию использовали для подтверждения введения спинномозговой иглы в правый боковой желудочек. В иглу Quinke BD размером 3,0 дюйма 22 г для спинномозговой хирургии добавляли контраст, чтобы определить ее расположение, перед тем, как прикрепить заправленную линию экстензии и шприц. Настройки насоса составляли 0,1 мл/мин в течение 19-20 минут. Буфер вводили вручную после введения дозы, чтобы очистить линию экстензии. Иглу оставляли на месте в течение 1-2 минут после завершения инфузии, а затем иглу извлекали. Носитель и исследуемое вещество вводили один раз в день 1, и субъектов поддерживали в течение 27- или 29-дневного периода восстановления.Cynomolgus macaques at twenty-four months of age were grouped as indicated in Table. 19. Before the start of the study, animal blood samples were tested for levels of neutralizing antibody titre to AAV9 using the NAb titer assay described above. Animals with low or negative antibody results were selected for the study. Samples were administered via ICV injection using standard surgical procedures. Thawed dispense material was briefly stored on wet ice and warmed to room temperature immediately before dispensing. Animals were anesthetized, prepared for surgery, and placed in an MPT-compatible stereotactic frame (Kopf). Baseline MRI was performed to determine target coordinates. An incision was made and one hole was drilled into the skull above the target area. A 3 mL BD syringe attached to a 36-inch microchannel extension set was prepared with the sample and placed into the infusion pump. The extension line was primed. The dura mater was opened and the dosing needle was advanced to a depth of 13.0 to 18.1 mm from the pia mater. Contrast injection and fluoroscopy were used to confirm insertion of the spinal needle into the right lateral ventricle. Contrast was added to the Quinke BD 3.0 inch 22 g spinal surgery needle to determine its location before attaching the primed extension line and syringe. Pump settings were 0.1 ml/min for 19-20 minutes. Buffer was manually injected after dosing to clear the extension line. The needle was left in place for 1-2 minutes after completion of the infusion, and then the needle was removed. Vehicle and test substance were administered once on day 1, and subjects were maintained during a 27- or 29-day recovery period.
Таблица 19Table 19
Дизайн исследования биораспределенияBiodistribution Study Design
После введения дозы за животными регулярно наблюдали на протяжении всего исследования, и периодически отбирали образцы крови. Введение eTFSCN1A не было связано с неожиданной смертностью, клиническими данными или макроскопическими наблюдениями. Животные, получившие AAV9-REgabaeTFSCN1A, выживали до запланированного вскрытия трупа на 28 ± 2 дня. Никаких клинических или поведенческих признаков, повышения температуры тела или снижения массы тела во время ежедневных или еженедельных медицинских осмотров не наблюдалось. Временное повышение печеночных трансаминаз (АЛТ и ACT) у животных, получавших AAV9-REGABA-eTFSCN1A, наблюдалось, но полностью исчезало к концу исследования без иммуномодуляции, и не было отмечено сопутствующего повышения сывороточного билирубина или щелочной фосфатазы. Ни один из других измеренных результатов клинической химии не был выдающимся. В гистопатологических исследованиях печени не сообщалось о микроскопических наблюдениях. Лейкоциты CSF были повышены при окончательном сборе по сравнению со значениями до воздействия, но сравнимы между контрольными животными и животными, получившими AAV9-REGABA-eTFSCN1A Плеоцитоза, связанного с AAV9-REGABA-eTFSCN1A, не наблюдалось. Макрообследование и подробное микрогистопатологическое исследование ненейрональных тканей у всех животных не было примечательным. Ткани включали в себя основные периферические органы (например,Following dosing, animals were monitored regularly throughout the study and blood samples were collected periodically. Administration of eTF SCN1A was not associated with unexpected mortality, clinical findings, or macroscopic observations. Animals receiving AAV9-RE gaba eTFS CN1A survived until scheduled necropsy for 28 ± 2 days. No clinical or behavioral signs, fever, or weight loss were observed during daily or weekly medical examinations. A transient increase in hepatic transaminases (ALT and AST) was observed in animals treated with AAV9-RE GABA -eTF SCN1A , but completely resolved by the end of the study without immunomodulation, and no concomitant increase in serum bilirubin or alkaline phosphatase was noted. None of the other clinical chemistry results measured were outstanding. No microscopic observations were reported in histopathological studies of the liver. CSF leukocytes were elevated at final collection compared to pre-exposure values, but comparable between control and AAV9-RE GABA -eTF SCN1A -treated animals. No AAV9-RE GABA -eTF SCN1A- associated pleocytosis was observed. Gross examination and detailed microhistopathological examination of non-neuronal tissues in all animals were unremarkable. Tissues included major peripheral organs (e.g.
- 119 046157 сердце, легкие, селезенку, печень и гонады). Макрообследования и подробная микрогистопатология нейрональных тканей не показали каких-либо заметных результатов. Ткани включали в себя головной, спинной мозг и связанные с ним межпозвонковые узлы (из шейного, грудного и поясничного отделов).- 119 046157 heart, lungs, spleen, liver and gonads). Macroexamination and detailed microhistopathology of neuronal tissues did not show any significant findings. Tissues included the brain, spinal cord, and associated intervertebral nodes (from the cervical, thoracic, and lumbar regions).
Исследования проводились тремя независимыми патологами, в том числе одним в специализированном центре невропатологии.The studies were performed by three independent pathologists, including one at a specialized neuropathology center.
ICV введение AAV9 не предотвращало постдозовый иммунный ответ в сыворотке, поскольку через четыре недели после введения дозы наблюдались нейтрализующие антитела к капсиду AAV9. Однако уровни нейтрализующих антител к AAV9 в CSF оставались неизменными и сравнимыми с уровнями до введения дозы (табл. 20).ICV administration of AAV9 did not prevent the post-dose immune response in serum, as neutralizing antibodies to the AAV9 capsid were observed four weeks post-dose. However, CSF levels of neutralizing antibodies to AAV9 remained unchanged and comparable to predose levels (Table 20).
Таблица 20Table 20
Титр сывороточных NAb к AAV9Serum NAb titer to AAV9
Образцы собирали через 27-29 дней после введения дозы из основных органов (желудочков сердца, долей печени, долей сердца легких, почек, селезенки, поджелудочной железы и шейных лимфатических узлов) во время плановой некроскопии. Прицельную биопсию собирали с помощью восьмимиллиметровых биопсийных щипцов и обрабатывали, как описано ниже.Specimens were collected 27 to 29 days after dosing from major organs (cardiac ventricles, liver lobes, cardiac lobes, lungs, kidneys, spleen, pancreas, and cervical lymph nodes) during routine necroscopy. Targeted biopsies were collected using eight-mm biopsy forceps and processed as described below.
Пример 11.Example 11.
Биораспределение eTFSCN1A в головном мозге.Biodistribution of eTF SCN1A in the brain.
ddPCR использовали для измерения биораспределения eTFSCN1A в головном мозге. Образцы из различных областей ткани головного мозга яванского макака (FC: лобная кора; PC: теменная кора; TC: височная кора; Hip: гиппокамп; Med: продолговатый мозг; OC: затылочная кора) измеряли на количество копий вектора для оценки биораспределения eTFSCN1A под контролем селективного регуляторного элемента ГАМК (REGABA-eTFSCN1A) при введении AAV9 посредством односторонней ICV. Тканевую ДНК выделяли с помощью наборов DNeasy Blood & Tissues (Qiagen). Количество ДНК определяли и нормализовали с помощью УФ-спектрофотометра. 20 нанограмм тканевой ДНК добавляли к реакционной смеси объемом 20 микролитров вместе с ddPCR Super Mix for Probes (без dUTP) (Bio-Rad) и праймерами TaqMan и зондами, направленными против областей последовательности eTFSCN1A. Создавали капли и амплифицировали шаблоны с использованием автоматического генератора капель и термоциклера (BioRad). После этапа ПЦР планшет загружали и считывали с помощью QX2000 Droplet Reader для определения числа копий вектора в тканях. Ген обезьяньего альбумина (MfAlb) служил внутренним контролем для нормализации содержания геномной ДНК и был амплифицирован в той же реакции. Праймеры и зонды для eTFSCN1A и MfAlb представлены в табл. 21.ddPCR was used to measure the biodistribution of eTF SCN1A in the brain. Samples from different regions of cynomolgus brain tissue (FC: frontal cortex; PC: parietal cortex; TC: temporal cortex; Hip: hippocampus; Med: medulla; OC: occipital cortex) were measured for vector copy number to assess the biodistribution of eTF SCN1A under control of the selective regulatory element GABA (RE GABA -eTF SCN1A ) upon administration of AAV9 via unilateral ICV. Tissue DNA was isolated using DNeasy Blood & Tissues kits (Qiagen). The amount of DNA was determined and normalized using a UV spectrophotometer. 20 nanograms of tissue DNA were added to a 20 microliter reaction mixture along with ddPCR Super Mix for Probes (no dUTP) (Bio-Rad) and TaqMan primers and probes directed against eTF sequence regions of SCN1A . Droplets were generated and templates were amplified using an automated droplet generator and thermal cycler (BioRad). After the PCR step, the plate was loaded and read using a QX2000 Droplet Reader to determine the vector copy number in tissues. The simian albumin gene (MfAlb) served as an internal control to normalize genomic DNA content and was amplified in the same reaction. Primers and probes for eTF SCN1A and MfAlb are presented in Table. 21.
Таблица 21Table 21
Праймеры и зонды для eTFSCN1A и MfAlbPrimers and probes for eTF SCN1A and MfAlb
eTFSCN1A широко распределялся по всему головному мозгу при дозировке 4,8E+13 вирусных геномов на животное со средним значением 1,3-3,5 вирусных геномов/диплоидный геном (фиг. 11). Кроме того, при сравнении переноса гена по всему головному мозгу REGABA-eTFSCN1A, после дозированного вве- 120 046157 дения 4,8E+13 вирусных геномов на животное, с переносом гена через головной мозг eGFP, веденного посредством ICV в различных дозах, увеличение вирусного генома/диплоидного генома наблюдалось с увеличением дозы. Это указывает на то, что перенос гена в головном мозге происходит дозозависимым образом при введении в AAV9 через ICV.The SCN1A eTF was widely distributed throughout the brain at a dose of 4.8E+13 viral genomes per animal with an average of 1.3-3.5 viral genomes/diploid genome (Fig. 11). In addition, when comparing brain-wide gene transfer RE GABA -eTF SCN1A , following dosing of 120 046157 4.8E+13 viral genomes per animal, with brain-wide gene transfer eGFP induced by ICV at various doses, the increase viral genome/diploid genome was observed with increasing dose. This indicates that gene transfer in the brain occurs in a dose-dependent manner when administered to AAV9 via the ICV.
Пример 12.Example 12.
Транскрипция eTFSCN1A в головном мозге.Transcription of the SCN1A eTF in the brain.
Транскрипцию eTFSCN1A под контролем селективного регуляторного элемента ГАМК, REGABA (REGABA-eTFSCN1A), оценивали путем измерения мРНК eTFSCN1A с использованием анализа экспрессии генов на основе ddPCR. Тканевую РНК выделяли с помощью наборов RNeasy Plus Mini (Qiagen) или RNeasy Lipid Tissue Mini (Qiagen) для тканей головного мозга. Количество РНК определяли и нормализовали с помощью УФ-спектрофотометра, а качество РНК (RIN) проверяли с помощью Bioanalyzer RNA Chip. Один микрограмм тканевой РНК использовали для обработки ДНКазой и синтеза кДНК с помощью набора для синтеза кДНК SuperScript VILO с наборами ферментов ezDNase™ (Thermo Fisher). 50 микрограммов РНК преобразовывали в кДНК. кДНК добавляли в реакционную смесь объемом 20 микролитров вместе с ddPCR Super Mix for Probes (без dUTP) (Bio-Rad) и праймерами и зондами TaqMan, направленными против областей последовательности eTFSCN1A (табл. 22). Создавали капли и амплифицировали шаблоны с использованием автоматического генератора капель и термоциклера (Bio-Rad). После ПЦР-амплификации планшет загружали и считывали с помощью QX2000 Droplet Reader, чтобы получить уровни экспрессии генов в тканях. Ген обезьяны ARFGAP2 (MfARFGAP2) (Thermo Fisher Scientific) служил эндогенным контролем для нормализации уровней экспрессии гена и был амплифицирован в той же реакции. Среднее количество транскриптов для ARFGAP2 составляло 1,85E+6 мкг РНК (фиг. 12, верхняя граница). Предел обнаружения обозначен нижней границей.Transcription of the SCN1A eTF under the control of a selective GABA regulatory element, RE GABA (RE GABA -eTF SCN1A ), was assessed by measuring eTF SCN1A mRNA using ddPCR-based gene expression analysis. Tissue RNA was isolated using the RNeasy Plus Mini (Qiagen) or RNeasy Lipid Tissue Mini (Qiagen) brain tissue kits. RNA quantity was determined and normalized using a UV spectrophotometer, and RNA quality (RIN) was checked using a Bioanalyzer RNA Chip. One microgram of tissue RNA was used for DNase treatment and cDNA synthesis using the SuperScript VILO cDNA Synthesis Kit with ezDNase™ Enzyme Kits (Thermo Fisher). 50 micrograms of RNA was converted to cDNA. The cDNA was added to a 20 microliter reaction mixture along with ddPCR Super Mix for Probes (no dUTP) (Bio-Rad) and TaqMan primers and probes directed against the SCN1A eTF sequence regions (Table 22). Droplets were generated and templates were amplified using an automated droplet generator and thermal cycler (Bio-Rad). After PCR amplification, the plate was loaded and read using a QX2000 Droplet Reader to obtain tissue gene expression levels. The monkey ARFGAP2 (MfARFGAP2) gene (Thermo Fisher Scientific) served as an endogenous control to normalize gene expression levels and was amplified in the same reaction. The average transcript abundance for ARFGAP2 was 1.85E+6 μg RNA (Fig. 12, upper limit). The detection limit is indicated by the lower limit.
мРНК eTFSCN1A наблюдалась по всему головному мозгу у всех животных, что указывает на то, что ГАМК-селективный промотор, REGABA, был транскрипционно активен в ткани головного мозга для всех макак, получивших AAV9-REGABA-eTFSCN1A (фиг. 12). FC: лобная кора; PC: теменная кора; TC: височная кора; Hip: гиппокамп; Med: продолговатый мозг; OC: затылочная кора.eTF SCN1A mRNA was observed throughout the brain in all animals, indicating that the GABA-selective promoter, RE GABA , was transcriptionally active in brain tissue for all macaques that received AAV9-RE GABA -eTF SCN1A (Figure 12) . FC: frontal cortex; PC: parietal cortex; TC: temporal cortex; Hip: hippocampus; Med: medulla oblongata; OC: occipital cortex.
Таблица 22 и зонды областей последовательности eTFSCN1A Table 22 and SCN1A eTF sequence region probes
Пример 13.Example 13.
Биораспределение и транскрипция eTFSCN1A в периферических тканях.Biodistribution and transcription of the SCN1A eTF in peripheral tissues.
Число копий вектора дополнительно измеряли в различных органах для оценки трансдукции REGABA-eTFSCN1A в тканях по всему организму при введении AAV9 посредством односторонней ICV. Уровни транскрипции eTFSCN1A также измеряли с помощью ddPCR для оценки транскрипционной активности eTFSCN1A под контролем GABA-селективного регуляторного элемента REGABA в тканях по всему организму при введении в AAV9 посредством односторонней ICV. Оба способа выполняли, как в общем описано выше. Трансдукция REGABA-eTFSCN1A и транскрипция eTFSCN1A в спинном мозге (SC) и межпозвонковом узле (DRG) были сопоставимы с уровнями, наблюдаемыми в головном мозге. За исключением печени, трансдукция REGABA-eTFSCN1A была ниже в периферических тканях за пределами головного мозга (фиг. 13). Трансдукция REGABA-eTFSCN1A в печени была выше, чем в головном мозге. Транскрипция eTFSCN1A не была обнаружена в периферических тканях, включая в себя сердце, легкие и гонады. Однако уровни транскрипта eTFSCN1A в печени были сопоставимы с уровнями eTFSCN1A, измеренными в головном мозге. Кроме того, транскрипция eTFSCN1A в печени является чрезвычайно низкой, если ее нормализовать по количеству присутствующих копий вектора (приблизительно в 1000 раз ниже по сравнению с транскрипцией eTFSCN1A в головном мозге). В целом это продемонстрировало, что транскрипция eTFSCN1A под контролем ГАМК-селективного регуляторного элемента REGABA ограничена ЦНС.Vector copy number was further measured in various organs to assess RE GABA -eTF SCN1A transduction in tissues throughout the body upon administration of AAV9 via unilateral ICV. Transcription levels of the SCN1A eTF were also measured by ddPCR to assess the transcriptional activity of the SCN1A eTF under the control of the GABA-selective regulatory element RE GABA in tissues throughout the body when introduced into AAV9 via unilateral ICV. Both methods were performed as generally described above. RE GABA -eTF SCN1A transduction and SCN1A eTF transcription in the spinal cord (SC) and intervertebral ganglion (DRG) were comparable to the levels observed in the brain. With the exception of the liver, RE GABA -eTF SCN1A transduction was lower in peripheral tissues outside the brain (Fig. 13). RE GABA -eTF SCN1A transduction was higher in liver than in brain. Transcription of the eTF SCN1A was not detected in peripheral tissues, including the heart, lungs, and gonads. However, eTF SCN1A transcript levels in the liver were comparable to eTF SCN1A levels measured in the brain. In addition, eTFSCN1A transcription in the liver is extremely low when normalized to the number of vector copies present (approximately 1000-fold lower compared to eTF SCN1A transcription in the brain). Overall, this demonstrated that transcription of the eTF SCN1A under the control of the GABA-selective regulatory element RE GABA is restricted to the CNS.
- 121 046157- 121 046157
Перечень последовательностей <110> ИНКОУДИД ТЕРАПЬЮТИКС, ИНК.Sequence Listing <110> INCOUDID THERAPEUTICS, INC.
<120> КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ СЕЛЕКТИВНОЙ РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ <130> 46482-724.601 <140><120> COMPOSITIONS AND METHODS FOR SELECTIVE REGULATION OF GENE EXPRESSION <130> 46482-724.601 <140>
<141><141>
<150> 63/008,569 <151> 2020-04-10 <150> 62/857,727 <151> 2019-06-05 <150> 62/854,238 <151> 2019-05-29 <160> 226 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 259 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><150> 63/008,569 <151> 2020-04-10 <150> 62/857,727 <151> 2019-06-05 <150> 62/854,238 <151> 2019-05-29 <160> 226 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 259 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 1 gtgatgcggt tttggcagta catcaatggg cgtggatagc ggtttgactc acggggattt60 ccaagtctcc accccattga cgtcaatggg agtttgtttt ggcaccaaaa tcaacgggac120 tttccaaaat gtcgtaacaa ctccgcccca ttgacgcaaa tgggcggtag gcgtgtacgg180 tgggaggtct atataagcag agctggtacc gtgtgtatgc tcaggggctg ggaaaggagg240 ggagggagct ccggctcag259 <210> 2 <211> 2051 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 1 gtgatgcggt tttggcagta catcaatggg cgtggatagc ggtttgactc acggggattt60 ccaagtctcc accccattga cgtcaatggg agtttgtttt ggcaccaaaa tcaacgggac120 tttccaaaat gtcgtaacaa ctccgcccca ttgacgcaaa tgggcggtag gcgtgtacgg180 tgggaggtct atataagcag agctggtacc gtgtgtatgc tcaggggctg ggaaggagg240 ggagggagct ccggctcag259 <210> 2 <211> 2051 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 2 ggaggaagcc atcaactaaa ctacaatgac tgtaagatac aaaattggga atggtaacat60 attttgaagt tctgttgaca taaagaatca tgatattaat gcccatggaa atgaaagggc120 gatcaacact atggtttgaa aagggggaaa ttgtagagca cagatgtgtt cgtgtggcag180 tgtgctgtct ctagcaatac tcagagaaga gagagaacaa tgaaattctg attggcccca240<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 2 ggaggaagcc atcaactaaa ctacaatgac tgtaagatac aaaattggga atggtaacat60 attttgaagt tctgttgaca taaagaatca tgatattaat gcccatggaa atgaaagggc120 gatcaacact atggtttgaa aagggggaaa ttgtag agca cagatgtgtt cgtgtggcag180 tgtgctgtct ctagcaatac tcagagaaga gagagaacaa tgaaattctg attggcccca240
- 122 046157- 122 046157
cgaccgagct g 2051cgaccgagct g 2051
- 123 046157 <210> 3 <211> 1878 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 123 046157 <210> 3 <211> 1878 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 124 046157- 124 046157
<210> 4 <211> 509 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 4 <211> 509 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 4 gccctctagg ccacctgacc aggtcccctc agtccccccc ttcccacact cccacactca60 gcccccctcc cccccccccg acccctgcag gattatcctg tctgtgttcc tgactcagcc120 tgggagccac ctgggcagca ggggccaagg gtgtcctaga agggacctgg agtccacgct180 gggccaagcc tgccctttct ccctctgtct tccgtccctg cttgcggttc tgctgaatgt240 ggttatttct ctggctcctt ttacagagaa tgctgctgct aattttatgt ggagctctga300 ggcagtgtaa ttggaagcca gacaccctgt cagcagtggg ctcccgtcct gagctgccat360 gcttcctgct ctcctcccgt cccggctcct catttcatgc agccacctgt cccagggaga420 gaggagtcac ccaggcccct cagtccgccc cttaaataag aaagcctccg ttgctcggca480 cacataccaa gcagccgctg gtgcaatct509 <210> 5 <211> 1644 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 4 gccctctagg ccacctgacc aggtcccctc agtccccccc ttcccacact cccacactca60 gcccccctcc cccccccccg acccctgcag gattatcctg tctgtgttcc tgactcagcc120 tgggagccac ctgggcagca ggggccaagg g tgtcctaga agggacctgg agtccacgct180 gggccaagcc tgccctttct ccctctgtct tccgtccctg cttgcggttc tgctgaatgt240 ggttatttct ctggctcctt ttacagagaa tgctgctgct aattttatgt ggagctctga300 ggcagtgtaa ttggaagcca g acaccctgt cagcagtggg ctcccgtcct gagctgccat360 gcttcctgct ctcctcccgt cccggctcct catttcatgc agccacctgt cccagggaga420 gaggagtcac ccaggcccct cagtccgccc cttaaataag aaagcctccg ttgctcggca480 cacataccaa gcagccgctg gtgcaatct509 <210> 5 <211> 1644 <212> DNA <2 13> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 5 cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt60 gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca120 atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc180 aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta240 catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac300 catgggtcga ggtgagcccc acgttctgct tcactctccc catctccccc ccctccccac360<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 5 cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt60 gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca120 atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttgg cagta catcaagtgt atcatatgcc180 aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta240 catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac300 catgggtcga ggtgagcccc acgttctgct tcactctccc catctcc cccccctccccac360
- 125 046157- 125 046157
<210> 6 <211> 1335 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 6 <211> 1335 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 6<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 6
- 126 046157- 126 046157
<210> 7 <211> 214 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 7 <211> 214 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 7 aaagagaccg gttcactgtg acagtaaaag agaccggttc actgtgagaa tgaaagagac60 cggttcactg tgatcggaaa agagaccggt tcactgtgag cggccttgaa acccagcaga120 caatgtagct cagtagaaac ccagcagaca atgtagctga atggaaaccc agcagacaat180 gtagcttcgg agaaacccag cagacaatgt agct214 <210> 8 <211> 21 <212> РНК <213> Homo sapiens<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 7 aaagagaccg gttcactgtg acagtaaaag agaccggttc actgtgagaa tgaaagagac60 cggttcactg tgatcggaaa agagaccggt tcactgtgag cggccttgaa acccagcaga120 caatgtagct cagtagaaac ccagcagaca atgtagctga atggaaaccc agcagacaat180 gtagcttcgg agaaacccag cagacaatgt agct214 <210> 8 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens
- 127 046157 <400> 8 ucacagugaa ccggucucuu u <210> 9 <211> 21 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 127 046157 <400> 8 ucacagugaa ccggucucuu u <210> 9 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид <400> 9 aaagagaccg gttcactgtg a 21 <210> 10 <211> 23 <212> РНК <213> Homo sapiens <400> 10 agcuacauug ucugcugggu uuc 23 <210> 11 <211> 23 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 9 aaagagaccg gttcactgtg a 21 <210> 10 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 10 agcuacauug ucugcugggu uuc 23 <210> 11 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид <400> 11 gaaacccagc agacaatgta gct 23 <210> 12 <211> 23 <212> РНК <213> Homo sapiens <400> 12 agcuacaucu ggcuacuggg ucu <210> 13 <211> 23 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 11 gaaacccagc agacaatgta gct 23 <210> 12 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 12 agcuacaucu ggcuacuggg ucu <210> 13 <211> 23 < 212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид <400> 13 agacccagta gccagatgta gct 23 <210> 14 <211> 67<223> Description of the artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 13 agaccagta gccagatgta gct 23 <210> 14 <211> 67
- 128 046157 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 128 046157 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид <400> 14 gaaacccagc agacaatgta gctagaccca gtagccagat gtagctaaag agaccggttc 60 actgtga 67 <210> 15 <211> 134 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 14 gaaacccagc agacaatgta gctagaccca gtagccagat gtagctaaag agaccggttc 60 actgtga 67 <210> 15 <211> 134 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 15 gaaacccagc agacaatgta gctagaccca gtagccagat gtagctaaag agaccggttc60 actgtgagaa acccagcaga caatgtagct agacccagta gccagatgta gctaaagaga120 ccggttcact gtga134 <210> 16 <211> 62 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 15 gaaacccagc agacaatgta gctagaccca gtagccagat gtagctaaag agaccggttc60 actgtgagaa acccagcaga caatgtagct agacccagta gccagatgta gctaaagaga120 ccggttcact gtga134 <210> 16 <211 > 62 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид <400> 16 aataaaagat ctttattttc attagatctg tgtgttggtt ttttgtgtgc ggaccgcacg 60 tg 62 <210> 17 <211> 477 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 16 aataaaagat ctttattttc attagatctg tgtgttggtt ttttgtgtgc ggaccgcacg 60 tg 62 <210> 17 <211> 477 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 17 gggtggcatc cctgtgaccc ctccccagtg cctctcctgg ccctggaagt tgccactcca60 gtgcccacca gccttgtcct aataaaatta agttgcatca ttttgtctga ctaggtgtcc120 ttctataata ttatggggtg gaggggggtg gtatggagca aggggcaagt tgggaagaca180 acctgtaggg cctgcggggt ctattgggaa ccaagctgga gtgcagtggc acaatcttgg240<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 17 gggtggcatc cctgtgaccc ctccccagtg cctctcctgg ccctggaagt tgccactcca60 gtgcccacca gccttgtcct aataaaatta agttgcatca ttttgtctga ctaggtgtcc120 ttctataata ttatggggtg gagg ggggtg gtatggagca aggggcaagt tgggaagaca180 acctgtaggg cctgcggggt ctattgggaa ccaagctgga gtgcagtggc acaatcttgg240
- 129 046157- 129 046157
<210> 18 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 18 ctaggtcaag tgtaggag <210> 19 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 19 acttgaccta gacagcct <210> 20 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 20 tgaataactc attagtga <210> 21 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 21 aaagtacatt aggctaat <210> 22 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 22 ccagcactgg tgcttcgt <210> 23 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 23 aaggctgtct aggtcaag<210> 18 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 18 ctaggtcaag tgtaggag <210> 19 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 19 acttgaccta gacagcct <210> 20 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 20 tgaataactc attagtga <210> 21 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 21 aaagtacatt aggctaat <210> 22 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 22 ccagcactgg tgcttcgt <210> 23 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 23 aaggctgtct aggtcaag
- 130 046157 <210> 24 <211> 24 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 24 ctaggtcaag tgtaggagac acac <210> 25 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 25 ggtcaagtgt aggagaca <210> 26 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 26 caagtgtagg agacacac <210> 27 <211> 24 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 27 agtgtaggag acacactgct ggcc <210> 28 <211> 18 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 28 agtgtaggag acacactg <210> 29 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 29 aggagacaca ctgctggcct g- 130 046157 <210> 24 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 24 ctaggtcaag tgtaggagac acac <210> 25 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 25 ggtcaagtgt aggagaca <210> 26 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 26 caagtgtagg agacacac <210> 27 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 27 agtgtaggag acacactgct ggcc <210> 28 <211> 18 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 28 agtgtaggag acacactg <210> 29 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 29 aggagacaca ctgctggcct g
sapiens <400> 30 taggtaccat agagtgagsapiens <400> 30 taggtaccat agagtgag
- 131 046157- 131 046157
gaggatactg cagaggtc <210> 32 <211> 27 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 32 taggtaccat agagtgaggc gaggatg <210> 33 <211> 27 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 33 atagagtgag gcgaggatga agccgag <210> 34 <211> 27 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 34 tgaagccgag aggatactgc agaggtc <210> 35 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 35 aaggctgtct aggtcaagtg t <210> 36 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 36 tgttcctcca gattaacact t <210> 37 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 37 gatgaagccg agaggatact ggaggatactg cagaggtc <210> 32 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 32 taggtaccat agagtgaggc gaggatg <210> 33 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 33 atagagtgag gcgaggatga agccga g <210> 34 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 34 tgaagccgag aggatactgc agaggtc <210> 35 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 35 aaggctgtct aggtcaagtg t <210 > 36 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 36 tgttcctcca gattaacact t <210> 37 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 37 gatgaagccg agaggatact g
- 132 046157 <210> 38 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 38 gctgatttgt attaggtacc a <210> 39 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 39 agaaagctga tacagataca a <210> 40 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 40 ggtacgggca aagatttctt g <210> 41 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 41 agaaagctga tacagataca a <210> 42 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 42 acacaatgag ccacctacaa g <210> 43 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 43 gtggctcatt gtgtgtgtgc c <210> 44 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 44 catatccctg caggttcaga a- 132 046157 <210> 38 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 38 gctgatttgt attaggtacc a <210> 39 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 39 agaaagctga tacagataca a <210> 40 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 40 ggtacgggca aagatttctt g <210> 41 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 41 agaaagctga tacagataca a < 210> 42 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 42 acacaatgag ccacctacaa g <210> 43 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 43 gtggctcatt gtgtgtgtgc c <210> 44 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 44 catatccctg caggttcaga a
- 133 046157 <210> 45 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 45 agagagagag agagagagag a <210> 46 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 46 ttctcagttt tgaaattaaa a <210> 47 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 47 tggattctct tctgaacctg c <210> 48 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 48 tgctgaggca ggacacagtg t <210> 49 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 49 atcatctgta accatcaagg a <210> 50 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 50 tcctgcctac ttagtttcaa g <210> 51 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 51 attacagttc tgtcagcatg c- 133 046157 <210> 45 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 45 agagagagag agagagagag a <210> 46 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 46 ttctcagttt tgaaattaaa a <210> 47 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 47 tggattctct tctgaacctg c <210> 48 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 48 tgctgaggca ggacacagtg t < 210> 49 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 49 atcatctgta accatcaagg a <210> 50 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 50 tcctgcctac ttagtttcaa g <210> 51 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 51 attacagttc tgtcagcatg c
- 134 046157 <210> 52 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 52 tggtctcatt ctttttgtgg g <210> 53 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 53 cgatattttc atggattcct t <210> 54 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 54 ctgacactta ctttgtctaa a <210> 55 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 55 aaaactggaa ccgcattccc a <210> 56 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 56 acaaagtaag tgtcagtgtg g <210> 57 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 57 ataatagttg tgtctttata a <210> 58 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 58 tgtacaagca gggctgcaaa g- 134 046157 <210> 52 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 52 tggtctcatt ctttttgtgg g <210> 53 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 53 cgatattttc atggattcct t <210> 54 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 54 ctgacactta ctttgtctaa a <210> 55 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 55 aaaactggaa ccgcattccc a < 210> 56 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 56 acaaagtaag tgtcagtgtg g <210> 57 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 57 aatagttg tgtcttttata a <210> 58 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 58 tgtacaagca gggctgcaaa g
- 135 046157 <210> 59 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 59 gttaacaaat acactaaaca c <210> 60 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 60 ttcaacaagc tcccaagaag t <210> 61 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 61 atgttcaagg tgcagaagga a <210> 62 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 62 tgtttgctca aacgtgcacc a <210> 63 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 63 aaataagaca tgaaaacaag a <210> 64 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 64 aaatatgtac cacaagaaat g <210> 65 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 65 tatctggttt ctctcactgc t- 135 046157 <210> 59 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 59 gttaacaaat acactaaaca c <210> 60 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 60 ttcaacaagc tcccaagaag t <210> 61 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 61 atgttcaagg tgcagaagga a <210> 62 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 62 tgtttgctca aacgtgcacc a < 210> 63 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 63 aaataagaca tgaaaacaag a <210> 64 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 64 aaatatgtac cacaagaaat g <210> 65 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 65 tatctggttt ctctcactgc t
- 136 046157 <210> 66 <211> 21 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 66 attgcaaagc ataatttgga t <210> 67 <211> 3585 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 136 046157 <210> 66 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 66 attgcaaagc aatttgga t <210> 67 <211> 3585 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 137 046157- 137 046157
- 138 046157- 138 046157
<210> 68 <211> 3371 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 68 <211> 3371 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 139 046157 actctgcccc cgcctacccc ggagccgtgc agccgcctct ccgaatctct ctcttctcct 1260 ggcgctcgcg tgcgagaggg aactagcgag aacgaggaag cagctggagg tgacgccggg1320 cagattacgc ctgtcagggc cgagccgagc ggatcgctgg gcgctgtgca gaggaaaggc1380 gggagtgccc ggctcgctgt cgcagagccg aggtgggtaa gctagcgacc acctggactt1440 cccagcgccc aaccgtggct tttcagccag gtcctctcct cccgcggctt ctcaaccaac1500 cccatcccag cgccggccac ccaacctccc gaaatgagtg cttcctgccc cagcagccga1560 aggcgctact aggaacggta acctgttact tttccagggg ccgtagtcga cccgctgccc1620 gagttgctgt gcgactgcgc gcgcggggct agagtgcaag gtgactgtgg ttcttctctg1680 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa ccagacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280 gaacacatac tggtgaaaaa ccatacaagt gtcccgaatg tggtaaaagt tttagccgga2340 gcgatgaact tgtccgacac caacgaaccc atacaggcga gaagccttac aaatgtcccg2400 agtgtggcaa gagcttctca caatcaggga atctgactga gcatcaacga actcataccg2460 gggaaaaacc ttacaagtgt ccagagtgtg ggaagagctt ttccacaagt ggacatctgg2520 tacgccacca gaggacacat acaggggaga agccctacaa atgccccgaa tgcggtaaaa2580 gtttctctca gaatagtacc ctgaccgaac accagcgaac acacactggg aaaaaaacga2640 gtaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg gccaggcaaa aaagaaaaag ggatcctacc2700 catacgacgt accagattac gctctcgagg acgcgctgga cgatttcgat ctcgacatgc2760 tgggttctga tgccctcgat gactttgacc tggatatgtt gggaagcgac gcattggatg2820 actttgatct ggacatgctc ggctccgatg ctctggacga tttcgatctc gatatgttat2880 aaactagtaa gcttgggtgg catccctgtg acccctcccc agtgcctctc ctggccctgg2940 aagttgccac tccagtgccc accagccttg tcctaataaa attaagttgc atcattttgt3000 ctgactaggt gtccttctat aatattatgg ggtggagggg ggtggtatgg agcaaggggc3060- 139 046157 actctgcccc cgcctacccc ggagccgtgc agccgcctct ccgaatctct ctcttctcct 1260 ggcgctcgcg tgcgagaggg aactagcgag aacgaggaag cagctggagg tgacccggg1320 cagattacgc ctgtcagggc cgagccgagc gg atcgctgg gcgctgtgca gaggaaaggc1380 gggagtgccc ggctcgctgt cgcagagccg aggtgggtaa gctagcgacc acctggactt1440 cccagcgccc aaccgtggct tttcagccag gtcctctcct cccgcggctt ctcaaccaac1500 cccacccag cgccggccac ccaacctccc gaaatgagtg cttcctgccc cagcagccga1560 aggcgctact aggaacggta acctgttact tttccagggg ccgtagtcga cccgctgccc1620 gagttgctgt gcgactgcgc gcgcggggct agagtgcaag gtgactgtgg ttcttctctg1680 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa cgacacaccg aaccagacat gccc gccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgttt ctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280 gaacacatac tggtgaaaaa ccatacaagt gtcccgaatg tggtaaaagt tttagccgg a2340 gcgatgaact tgtccgacac caacgaaccc atacaggcga gaagccttac aaatgtcccg2400 agtgtggcaa gagcttctca caatcaggga atctgactga gcatcaacga actcataccg2460 gggaaaaacc ttacaagtgt ccagagtgtg ggaagagctt ttccacaagt ggacatctgg2 520 tacgccacca gaggacacat acaggggaga agccctacaa atgccccgaa tgcggtaaaa2580 gtttctctca gaatagtacc ctgaccgaac accagcgaac acacactggg aaaaaaacga2640 gtaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg gccaggcaaa aaagaaaaag ggatcctacc2700 catacgacgt accagattac gctctcgagg acgcgctgga cgatttcgat ctcgacatgc2760 tgggttctga tgccctcgat gactttgacc tggatatgtt gggaagcgac gcattggatg2820 actttgatct g gacatgctc ggctccgatg ctctggacga tttcgatctc gatatgttat2880 aaactagtaa gcttgggtgg catccctgtg acccctcccc agtgcctctc ctggccctgg2940 aagttgccac tccagtgccc accagccttg tcctaataaa attaagttgc atcattttgt3000 ctgactaggt gtccttctat aatattatgg ggtggagggg ggtggtatgg agcaaggggc3060
- 140 046157- 140 046157
<210> 69 <211> 4380 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 69 <211> 4380 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 141 046157- 141 046157
- 142 046157- 142 046157
<210> 70 <211> 3332 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 70 <211> 3332 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 70 ggaggaagcc atcaactaaa ctacaatgac tgtaagatac aaaattggga atggtaacat60 attttgaagt tctgttgaca taaagaatca tgatattaat gcccatggaa atgaaagggc120 gatcaacact atggtttgaa aagggggaaa ttgtagagca cagatgtgtt cgtgtggcag180 tgtgctgtct ctagcaatac tcagagaaga gagagaacaa tgaaattctg attggcccca240 gtgtgagccc agatgaggtt cagctgccaa ctttctcttt cacatcttat gaaagtcatt300<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 70 ggaggaagcc atcaactaaa ctacaatgac tgtaagatac aaaattggga atggtaacat60 attttgaagt tctgttgaca taaagaatca tgatattaat gcccatggaa atgaaagggc120 gatcaacact atggtttgaa aagggggaaa ttg tagagca cagatgtgtt cgtgtggcag180 tgtgctgtct ctagcaatac tcagagaaga gagagaacaa tgaaattctg attggcccca240 gtgtgagccc agatgaggtt cagctgccaa ctttctcttt cacatcttat gaaagtcatt300
- 143 046157- 143 046157
- 144 046157- 144 046157
<210> 71 <211> 3546 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 71 <211> 3546 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 71 ggaggaagcc atcaactaaa ctacaatgac tgtaagatac aaaattggga atggtaacat60 attttgaagt tctgttgaca taaagaatca tgatattaat gcccatggaa atgaaagggc120 gatcaacact atggtttgaa aagggggaaa ttgtagagca cagatgtgtt cgtgtggcag180 tgtgctgtct ctagcaatac tcagagaaga gagagaacaa tgaaattctg attggcccca240 gtgtgagccc agatgaggtt cagctgccaa ctttctcttt cacatcttat gaaagtcatt300 taagcacaac taactttttt tttttttttt tttttttgag acagagtctt gctctgttgc360<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 71 ggaggaagcc atcaactaaa ctacaatgac tgtaagatac aaaattggga atggtaacat60 attttgaagt tctgttgaca taaagaatca tgatattaat gcccatggaa atgaaagggc120 gatcaacact atggtttgaa aagggggaaa ttg tagagca cagatgtgtt cgtgtggcag180 tgtgctgtct ctagcaatac tcagagaaga gagagaacaa tgaaattctg attggcccca240 gtgtgagccc agatgaggtt cagctgccaa ctttctcttt cacatcttat gaaagtcatt300 taagcacaac taactttttt tttttttt ttt tttttttgag acaagtctt gctctgttgc360
- 145 046157 ccaggacaga gtgcagtagt gactcaatct cggctcactg cagcctccac ctcctaggct 420 caaacggtcc tcctgcatca gcctcccaag tagctggaat tacaggagtg gcccaccatg480 cccagctaat ttttgtattt ttaatagata cgggggtttc accatatcac ccaggctggt540 ctcgaactcc tggcctcaag tgatccacct gcctcggcct cccaaagtgc tgggattata600 ggcgtcagcc actatgccca acccgaccaa ccttttttaa aataaatatt taaaaaattg660 gtatttcaca tatatactag tatttacatt tatccacaca aaacggacgg gcctccgctg720 aaccagtgag gccccagacg tgcgcataaa taacccctgc gtgctgcacc acctggggag780 agggggagga ccacggtaaa tggagcgagc gcatagcaaa agggacgcgg ggtccttttc840 tctgccggtg gcactgggta gctgtggcca ggtgtggtac tttgatgggg cccagggctg900 gagctcaagg aagcgtcgca gggtcacaga tctgggggaa ccccggggaa aagcactgag960 gcaaaaccgc cgctcgtctc ctacaatata tgggaggggg aggttgagta cgttctggat1020 tactcataag accttttttt tttccttccg ggcgcaaaac cgtgagctgg atttataatc1080 gccctataaa gctccagagg cggtcaggca cctgcagagg agccccgccg ctccgccgac1140 tagctgcccc cgcgagcaac ggcctcgtga tttccccgcc gatccggtcc ccgcctcccc1200 actctgcccc cgcctacccc ggagccgtgc agccgcctct ccgaatctct ctcttctcct1260 ggcgctcgcg tgcgagaggg aactagcgag aacgaggaag cagctggagg tgacgccggg1320 cagattacgc ctgtcagggc cgagccgagc ggatcgctgg gcgctgtgca gaggaaaggc1380 gggagtgccc ggctcgctgt cgcagagccg aggtgggtaa gctagcgacc acctggactt1440 cccagcgccc aaccgtggct tttcagccag gtcctctcct cccgcggctt ctcaaccaac1500 cccatcccag cgccggccac ccaacctccc gaaatgagtg cttcctgccc cagcagccga1560 aggcgctact aggaacggta acctgttact tttccagggg ccgtagtcga cccgctgccc1620 gagttgctgt gcgactgcgc gcgcggggct agagtgcaag gtgactgtgg ttcttctctg1680 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa ccagacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280- 145 046157 ccaggacaga gtgcagtagt gactcaatct cggctcactg cagcctccac ctcctaggct 420 caaacggtcc tcctgcatca gcctcccaag tagctggaat tacaggagtg gcccaccatg480 cccagctaat ttttgtattt ttaatagata cgggggtttc accatatcac cca ggctggt540 ctcgaactcc tggcctcaag tgatccacct gcctcggcct cccaaagtgc tgggattata600 ggcgtcagcc actatgccca acccgaccaa ccttttttaa aataaatatt taaaaaattg660 gtatttcaca tatatactag tatttacatt tatccacaca aaacggacgg gcctccgctg72 0 aaccagtgag gccccagacg tgcgcataaa taacccctgc gtgctgcacc acctggggag780 agggggagga ccacggtaaa tggagcgagc gcatagcaaa agggacgcgg ggtccttttc840 tctgccggtg gcactggggta gctgtggcca ggtgtggtac tttgatgggg cccaggctg900 gagctcaagg aagcgtcgca gggtcacaga tctgggggaa ccccggggaa aagcactgag960 gcaaaaccgc cgctcgtctc ctacaatata tgggagggg aggttgagta cgttctggat1020 tactcataag accttttttt tttccttccg ggcgcaaaac cgtgagctgg atttataatc1080 gccctataaa gctccagagg cggtcaggca cctgcagagg agccccgccg ctccgccgac1140 tagctgcccc cgcgagcaac ggcctcgtga tttccccgcc gatccggtcc ccgcctcccc1200 actctgcccc cgcctacccc ggagccgtgc agccgcctct ccgaatctct ctcttctcct1260 ggcgctcgcg tgcgagaggg aactagcgag aacgaggaag cagctggagg tgacgccggg1320 cagattacgc ctgtcagggc cgagccgagc ggatcgctgg gcgctgtgca gaggaaaggc1380 gggagtgccc ggctcgctgt cgcagagccg aggtgggtaa gctagcgacc acctggactt1440 cccagcgccc aaccgtggct tttcagccag gtcctctcct cccgcgg ctt ctcaaccaac1500 cccacccag cgccggccac ccaacctccc gaaatgagtg cttcctgccc cagcagccga1560 aggcgctact aggaacggta acctgttact tttccagggg ccgtagtcga cccgctgccc1620 gagttgctgt gcgactgcgc gcgcggggct agag tgcaag gtgactgtgg ttcttctctg1680 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa cgacacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttg cagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280
- 146 046157- 146 046157
<210> 72 <211> 1707 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 72 <211> 1707 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 72 atggccgcag atcacctgat gctggctgaa ggctacagac tggtgcagcg gcctccatct60 gccgctgccg cccacggccc ccacgccctg agaacactgc ccccctacgc cggccctggt120 cttgatagcg gactcagacc tagaggcgcc cctctgggcc ctccacctcc aagacagcct180 ggagccctgg cctacggcgc cttcggccct ccttctagct tccagccctt ccccgccgtg240<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 72 atggccgcag atcacctgat gctggctgaa ggctacagac tggtgcagcg gcctccatct60 gccgctgccg cccacggccc ccacgccctg agaacactgc ccccctacgc cggccctggt120 cttgatagcg gactcagacc tagaggcgcc cctctgggcc ctccacctcc aagacagcct180 ggagccctgg cctacggcgc cttcggccct ccttctagct tccagccctt ccccgccgtg240
- 147 046157- 147 046157
<210> 73 <211> 1755 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 73 <211> 1755 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 73 atggccgcag atcacctgat gctggctgaa ggctacagac tggtgcagcg gcctccatct 60<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 73 atggccgcag atcacctgat gctggctgaa ggctacagac tggtgcagcg gcctccatct 60
- 148 046157 gccgctgccg cccacggccc ccacgccctg agaacactgc ccccctacgc cggccctggt 120 cttgatagcg gactcagacc tagaggcgcc cctctgggcc ctccacctcc aagacagcct 180 ggagccctgg cctacggcgc cttcggccct ccttctagct tccagccctt ccccgccgtg 240 cctcctccag ctgctggcat cgcccacctg cagcctgtgg ccacccctta ccccggaaga 300 gccgccgccc ctccaaacgc ccctggcgga cctcctggcc cccagcctgc tccaagcgcc 360 gctgcccctc cacctcctgc tcatgccctg ggcggcatgg acgccgagct gatcgacgag 420 gaagccctga ccagcctgga actggaactg ggcctgcaca gagtgcggga actgcctgag 480 ctgttcctgg gacagagcga gttcgactgc ttcagcgacc tgggcagcgc ccctcctgcc 540 ggctctgtgt cctgcggcgg cagcggcggc ggaagcggcg ccgaccacct gatgctcgcc 600 gagggctacc gcctggtgca gaggccgccg tccgccgccg ccgcccatgg ccctcatgcg 660 ctccggactc tgccgccgta cgcgggcccg ggcctggaca gtgggctgag gccgcggggg 720 gctccgctgg ggccgccgcc gccccgccaa cccggggccc tggcgtacgg ggccttcggg 780 ccgccgtcct ccttccagcc ctttccggcc gtgcctccgc cggccgcggg catcgcgcac 840 ctgcagcctg tggcgacgcc gtaccccggc cgcgcggccg cgccccccaa cgctccggga 900 ggccccccgg gcccgcagcc ggccccaagc gccgcagccc cgccgccgcc cgcgcacgcc 960 ctgggcggca tggacgccga actcatcgac gaggaggcgc tgacgtcgct ggagctggag 1020 ctggggctgc accgcgtgcg cgagctgccc gagctgttcc tgggccagag cgagttcgac 1080 tgcttctcgg acttggggtc cgcgccgccc gccggctccg tgagctgcgg tggttctggt 1140 ggtggttctg gtcagtccca gctcatcaaa cccagccgca tgcgcaagta ccccaaccgg 1200 cccagcaaga cgccccccca cgaacgccct tacgcttgcc cagtggagtc ctgtgatcgc 1260 cgcttctccc gcagcgacaa cctggtgaga cacatccgca tccacacagg ccagaagccc 1320 ttccagtgcc gcatctgcat gagaaacttc agccgagagg ataacttgca cactcacatc 1380 cgcacccaca caggcgaaaa gcccttcgcc tgcgacatct gtggaagaaa gtttgcccgg 1440 agcgatgaac ttgtccgaca taccaagatc cacttgcggc agaaggaccg cccttacgct 1500 tgcccagtgg agtcctgtga tcgccgcttc tcccaatcag ggaatctgac tgagcacatc 1560 cgcatccaca caggccagaa gcccttccag tgccgcatct gcatgagaaa cttcagcaca 1620 agtggacatc tggtacgcca catccgcacc cacacaggcg aaaagccctt cgcctgcgac 1680 atctgtggaa gaaagtttgc ccagaatagt accctgaccg aacataccaa gatccacttg 1740 cggcagaagg acaag 1755 <210> 74 <211> 3438 <212> ДНК- 148 046157 gccgctgccg cccacggccc ccacgccctg agaacactgc ccccctacgc cggccctggt 120 cttgatagcg gactcagacc tagaggcgcc cctctgggcc ctccacctcc aagacagcct 180 ggagccctgg cctacggcgc cttcggccct ccttctagct tccag ccctt ccccgccgtg 240 cctcctccag ctgctggcat cgcccacctg cagcctgtgg ccacccctta ccccggaaga 300 gccgccgccc ctccaaacgc ccctggcgga cctcctggcc cccagcctgc tccaagcgcc 360 gctgcccctc cacctcctgc tcatgccctg ggcgg catgg acgccgagct gatcgacgag 420 gaagccctga ccagcctgga actggaactg ggcctgcaca gagtgcggga actgcctgag 480 ctgttcctgg gacagagcga gttcgactgc ttcagcgacc tgggcagcgc ccctcctgcc 540 ggctctgtgt cctgcggcgg cagcggcggc ggaagcggcg ccgaccacct gatgctcgcc 600 gagggctacc gcctggtgca gagccgccg t ccgccgccg ccgcccatgg ccctcatgcg 660 ctccggactc tgccgccgta cgcgggcccg ggcctggaca gtgggctgag gccgcggggg 720 gctccgctgg ggccgccgcc gccccgccaa cccggggccc tggcgtacgg ggccttcggg 780 ccgccgtcct ccttcca gcc ctttccggcc gtgcctccgc cggccgcggg catcgcgcac 840 ctgcagcctg tggcgacgcc gtaccccggc cgcgcggccg cgccccccaa cgctccggga 900 ggccccccgg gcccgcagcc ggccccaagc gccgcagccc cgccgccgcc cgcgcacgcc 960 ctgggcggca tggacgccga actcatcgac gaggaggcgc tgacgtcgct ggagctggag 1020 ctggggctgc accgcgtgcg cgagctgccc gagctgttcc t gggccagag cgagttcgac 1080 tgcttctcgg acttggggtc cgcgccgccc gccggctccg tgagctgcgg tggttctggt 1140 ggtggttctg gtcagtccca gctcatcaaa cccagccgca tgcgcaagta ccccaaccgg 1200 cccagcaaga cgccccccca cgaacgccct tacgcttgcc cagtggagtc ctgtgatcgc 1260 cgcttctccc gcagcgacaa cctggtgaga cacatccgca tccacacagg ccagaagccc 1320 ttccagtgcc gcatctgcat gagaaacttc agccgagagg ataacttgca cactcacatc 1380 cgcacccaca caggcgaaaa gcccttcgcc tgcgacatct gtggaagaaa gtttgcccgg 1440 agcgatgaac ttgtccgaca taccaagatc cacttgcggc agaaggaccg cccttac gct 1500 tgcccagtgg agtcctgtga tcgccgcttc tcccaatcag ggaatctgac tgagcacatc 1560 cgcatccaca caggccagaa gcccttccag tgccgcatct gcatgagaaa cttcagcaca 1620 agtggacatc tggtacgcca catccgcacc cacacaggcg aaaagccctt c gcctgcgac 1680 atctgtggaa gaaagtttgc ccagaatagt accctgaccg aacataccaa gatccacttg 1740 cggcagaagg acaag 1755 <210> 74 <211> 3438 <212> DNA
- 149 046157 <213> Искусственная последовательность <220>- 149 046157 <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 150 046157 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac 1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa ccagacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280 gaacacatac tggtgaaaaa ccatacaagt gtcccgaatg tggtaaaagt tttagccgga2340 gcgatgaact tgtccgacac caacgaaccc atacaggcga gaagccttac aaatgtcccg2400 agtgtggcaa gagcttctca caatcaggga atctgactga gcatcaacga actcataccg2460 gggaaaaacc ttacaagtgt ccagagtgtg ggaagagctt ttccacaagt ggacatctgg2520 tacgccacca gaggacacat acaggggaga agccctacaa atgccccgaa tgcggtaaaa2580 gtttctctca gaatagtacc ctgaccgaac accagcgaac acacactggg aaaaaaacga2640 gtaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg gccaggcaaa aaagaaaaag ggatcctacc2700 catacgacgt accagattac gctctcgagg acgcgctgga cgatttcgat ctcgacatgc2760 tgggttctga tgccctcgat gactttgacc tggatatgtt gggaagcgac gcattggatg2820 actttgatct ggacatgctc ggctccgatg ctctggacga tttcgatctc gatatgttat2880 aaactagtga aacccagcag acaatgtagc tagacccagt agccagatgt agctaaagag2940 accggttcac tgtgaaagct tgggtggcat ccctgtgacc cctccccagt gcctctcctg3000 gccctggaag ttgccactcc agtgcccacc agccttgtcc taataaaatt aagttgcatc3060 attttgtctg actaggtgtc cttctataat attatggggt ggaggggggt ggtatggagc3120 aaggggcaag ttgggaagac aacctgtagg gcctgcgggg tctattggga accaagctgg3180 agtgcagtgg cacaatcttg gctcactgca atctccgcct cctgggttca agcgattctc3240 ctgcctcagc ctcccgagtt gttgggattc caggcatgca tgaccaggct cagctaattt3300 ttgttttttt ggtagagacg gggtttcacc atattggcca ggctggtctc caactcctaa3360 tctcaggtga tctacccacc ttggcctccc aaattgctgg gattacaggc gtgaaccact 3420 gctcccttcc ctgtcctt3438 <210> 75 <211> 3505- 150 046157 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac 1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa cgagacaccg aaccagacat gcccgccccg t gcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280 gaacacatac tggtgaaaaa ccatacaagt g tcccgaatg tggtaaaagt tttagccgga2340 gcgatgaact tgtccgacac caacgaaccc atacaggcga gaagccttac aaatgtcccg2400 agtgtggcaa gagcttctca caatcaggga atctgactga gcatcaacga actcataccg2460 gggaaaaacc ttacaagtgt cccagtgtg ggaagagctt ttccacaagt ggacatctgg2520 tacgccacca gaggacacat acaggggaga agccctacaa atgccccgaa tgcggtaaaa2580 gtttctctca gaatagtacc ctgaccgaac accagcgaac acacactggg aaaaaaacga2640 gtaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg gccaggcaaa aaagaaaaag ggatcctacc2700 catacgacgt accagattac gctctcgagg acgcgctgga cgatttcgat ctcgacatgc2760 tgggttctga tgccctcgat gactttgacc tggatatgtt gggaagcgac gcatt ggatg2820 actttgatct ggacatgctc ggctccgatg ctctggacga tttcgatctc gatatgttat2880 aaactagtga aacccagcag acaatgtagc tagacccagt agccagatgt agctaaagag2940 accggttcac tgtgaaagct tgggtggcat ccctgtgacc cctccccagt gcctctcctg3000 gccctggaag ttgccactcc agtgcccacc agccttgtcc taataaaatt aagttgcatc3060 attttgtctg actaggtgtc cttctataat attatggggt ggaggggggt ggtatggagc3120 aaggggcaag ttgggaagac aacctgtagg gcctgcgggg tctattggga accaagctgg3180 agtgcagtgg cacaatcttg gctcactgca atctccgcct cctgggttca agcgattctc3240 ctgcctcagc ctcccgagtt gttgggattc caggcatgca tgaccaggct cagctaattt3300 ttgttttttt ggtagagacg gggtttcacc atattggcca ggctggtctc caactcctaa3360 tctcaggtga tctacccacc ttggcctccc aaattgctgg gattacaggc gtgaaccact 3420 gctcccttcc ctgtcctt3438 <210> 75 <211> 3505
- 151 046157 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 151 046157 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 152 046157 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac 1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa ccagacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280 gaacacatac tggtgaaaaa ccatacaagt gtcccgaatg tggtaaaagt tttagccgga2340 gcgatgaact tgtccgacac caacgaaccc atacaggcga gaagccttac aaatgtcccg2400 agtgtggcaa gagcttctca caatcaggga atctgactga gcatcaacga actcataccg2460 gggaaaaacc ttacaagtgt ccagagtgtg ggaagagctt ttccacaagt ggacatctgg2520 tacgccacca gaggacacat acaggggaga agccctacaa atgccccgaa tgcggtaaaa2580 gtttctctca gaatagtacc ctgaccgaac accagcgaac acacactggg aaaaaaacga2640 gtaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg gccaggcaaa aaagaaaaag ggatcctacc2700 catacgacgt accagattac gctctcgagg acgcgctgga cgatttcgat ctcgacatgc2760 tgggttctga tgccctcgat gactttgacc tggatatgtt gggaagcgac gcattggatg2820 actttgatct ggacatgctc ggctccgatg ctctggacga tttcgatctc gatatgttat2880 aaactagtga aacccagcag acaatgtagc tagacccagt agccagatgt agctaaagag2940 accggttcac tgtgagaaac ccagcagaca atgtagctag acccagtagc cagatgtagc3000 taaagagacc ggttcactgt gaaagcttgg gtggcatccc tgtgacccct ccccagtgcc3060 tctcctggcc ctggaagttg ccactccagt gcccaccagc cttgtcctaa taaaattaag3120 ttgcatcatt ttgtctgact aggtgtcctt ctataatatt atggggtgga ggggggtggt3180 atggagcaag gggcaagttg ggaagacaac ctgtagggcc tgcggggtct attgggaacc3240 aagctggagt gcagtggcac aatcttggct cactgcaatc tccgcctcct gggttcaagc3300 gattctcctg cctcagcctc ccgagttgtt gggattccag gcatgcatga ccaggctcag3360 ctaatttttg tttttttggt agagacgggg tttcaccata ttggccaggc tggtctccaa3420 ctcctaatct caggtgatct acccaccttg gcctcccaaa ttgctgggat tacaggcgtg3480 aaccactgct cccttccctg tcctt3505- 152 046157 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac 1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa cgagacaccg aaccagacat gcccgccccg t gcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccc caaagaagaa gcggaaggtc ggtatccacg2100 gagtcccagc agccctcgaa ccaggtgaaa aaccttacaa atgtcctgaa tgtgggaaat2160 cattcagtcg cagcgacaac ctggtgagac atcaacgcac ccatacagga gaaaaacctt2220 ataaatgtcc agaatgtgga aagtccttct cacgagagga taacttgcac actcatcaac2280 gaacacatac tggtgaaaaa ccatacaagt g tcccgaatg tggtaaaagt tttagccgga2340 gcgatgaact tgtccgacac caacgaaccc atacaggcga gaagccttac aaatgtcccg2400 agtgtggcaa gagcttctca caatcaggga atctgactga gcatcaacga actcataccg2460 gggaaaaacc ttacaagtgt ccagagtgtg ggaagagctt ttccacaagt ggacatctgg2520 tacgccacca gaggacacat acaggggaga agccctacaa atgccccgaa tgcggtaaaa2580 gtttctctca gaatagtacc ctgaccgaac accagcgaac acacactggg aaaaaaacga2640 gtaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg gccaggcaaa aaagaaaaag ggatcctacc2700 catacgacgt accagattac gctctcgagg acgcgctgga cgatttcgat ctcgacatgc2760 tgggttctga tgccctcgat gactttgacc tggatatgtt gggaagcgac gcatt ggatg2820 actttgatct ggacatgctc ggctccgatg ctctggacga tttcgatctc gatatgttat2880 aaactagtga aacccagcag acaatgtagc tagacccagt agccagatgt agctaaagag2940 accggttcac tgtgagaaac ccagcagaca atgtagctag acccagtagc cagat gtagc3000 taaagagacc ggttcactgt gaaagcttgg gtggcatccc tgtgacccct ccccagtgcc3060 tctcctggcc ctggaagttg ccactccagt gcccaccagc cttgtcctaa taaaattaag3120 ttgcatcatt ttgtctgact aggtgtcctt ctataatatt atggggtgga ggggggtggt3180 atggagcaag gggcaagttg ggaagacaac ctgtagggcc tgcggggtct attgggaacc3240 aagctggagt gcagtggcac aatcttggct cactgcaatc tccgcctcct gggttcaagc3300 gattctcctg cctcagcct c ccgagttgtt gggattccag gcatgcatga ccaggctcag3360 ctaatttttg tttttttggt agagacgggg tttcaccata ttggccaggc tggtctccaa3420 ctcctaatct caggtgatct acccaccttg gcctcccaaa ttgctgggat tacaggcgtg3480 aaccactgct cc cttccctg tcctt3505
- 153 046157 <210> 76 <211> 3804 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 153 046157 <210> 76 <211> 3804 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 154 046157- 154 046157
- 155 046157- 155 046157
<210> 77 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 77 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 77<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 77
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 1 5 1015Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 1 5 1015
Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly 20 2530Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly 20 2530
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu 35 4045Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu 35 4045
Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val 65 70 7580Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val 65 70 7580
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 85 9095Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 85 9095
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln ArgCys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg
100 105110100 105110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
115 120125115 120125
Phe Ser Thr Ser Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyPhe Ser Thr Ser Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
130 135140130 135140
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln AsnGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Asn
145 150 155160145 150 155160
- 156 046157- 156 046157
Ser Thr Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr SerSer Thr Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr Ser
165 170 175 <210> 78 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>165 170 175 <210> 78 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 78<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 78
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
5 10155 1015
Phe Ser Thr Lys Asn Ser Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His ThrGlyPhe Ser Thr Lys Asn Ser Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His ThrGly
25302530
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ala 35 4045Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ala 35 4045
Asp Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560Asp Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Leu Ala His LeuArgLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Leu Ala His LeuArg
70 758070 7580
Ala His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGluAla His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGlu
90959095
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Lys Asn Ser Leu Thr Glu His Gln Arg 100 105110Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Lys Asn Ser Leu Thr Glu His Gln Arg 100 105110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 115 120125Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 115 120125
Phe Ser Gln Ala Gly His Leu Ala Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly 130 135140Phe Ser Gln Ala Gly His Leu Ala Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly 130 135140
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser ThrHisGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser ThrHis
145 150 155160145 150 155160
Leu Asp Leu Ile Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys ThrSerLeu Asp Leu Ile Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys ThrSer
165 170175 <210> 79 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность165 170175 <210> 79 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence
- 157 046157 <220>- 157 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 79<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 79
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Gln Ala Gly His Leu Ala Ser His Gln Arg 20 25Phe Ser Gln Ala Gly His Leu Ala Ser His Gln Arg 20 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser Arg Glu 45Phe Ser Arg Glu 45
Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr GlyAsp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser 65 70 75
Gly Asn Leu ThrGly Asn Leu Thr
Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrGlu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr His Leu Asp Leu IleCys Gly Lys Ser Phe Ser Thr His Leu Asp Leu Ile
100 105100 105
Arg His Gln Arg 110Arg His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Gln Lys Ser Ser Leu Ile Ala His Gln ArgPhe Ser Gln Lys Ser Ser Leu Ile Ala His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Gln AlaPhe Ser Gln Ala
160160
Gly His Leu Ala Ser His Gln Arg Thr His Thr GlyGly His Leu Ala Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr Ser 175 <210> 80 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Lys Lys Thr Ser 175 <210> 80 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 80<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 80
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
- 158 046157- 158 046157
Phe Ser Thr Thr Gly Asn Leu ThrPhe Ser Thr Thr Gly Asn Leu Thr
Val His Gln ArgVal His Gln Arg
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser Thr Ser 45Phe Ser Thr Ser 45
Gly Glu Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyGly Glu Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu 65 70 75
Asp Asn Leu His 80Asp Asn Leu His 80
Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrThr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser Gly Asn Leu ThrCys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser Gly Asn Leu Thr
100 105100 105
Glu His Gln Arg 110Glu His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Gln ArgPhe Ser Gln Arg
160160
Ala Asn Leu Arg Ala His Gln Arg Thr His Thr GlyAla Asn Leu Arg Ala His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr SerLys Lys Thr Ser
175 <210> 81 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 81 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 81Synthetic polypeptide <400> 81
Leu Glu Pro Gly Glu LysLeu Glu Pro Gly Glu Lys
55
Phe Ser Ser Arg Arg ThrPhe Ser Ser Arg Arg Thr
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys 35Glu Lys Pro Tyr Lys Cys 35
Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 10Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 10
Cys Arg Ala His Gln Arg 25Cys Arg Ala His Gln Arg 25
Pro Glu Cys Gly Lys Ser 40Pro Glu Cys Gly Lys Ser 40
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Phe Ser Thr Thr 45Phe Ser Thr Thr 45
- 159 046157- 159 046157
Gly Ala Leu Thr Glu His Gln ArgGly Ala Leu Thr Glu His Gln Arg
5555
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser 65 70 75
Asp Glu Leu Val 80Asp Glu Leu Val 80
Arg His Gln Arg Thr His 85Arg His Gln Arg Thr His 85
Thr Gly Glu Lys Pro TyrThr Gly Glu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly LysCys Gly Lys
Ser PheSer Phe
100100
Ser Arg Asn Asp Ala Leu ThrSer Arg Asn Asp Ala Leu Thr
105105
Glu His Gln Arg 110Glu His Gln Arg 110
Thr HisThr His
Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 115 120Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Gln Ser Gly Asp Leu Arg Arg His Gln ArgPhe Ser Gln Ser Gly Asp Leu Arg Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Thr SerPhe Ser Thr Ser
160160
His Ser Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr GlyHis Ser Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr Ser 175 <210> 82 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Lys Lys Thr Ser 175 <210> 82 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 82Synthetic polypeptide <400> 82
Leu Glu Pro Gly 1Leu Glu Pro Gly 1
Glu Lys Pro Tyr 5Glu Lys Pro Tyr 5
Lys Cys Pro Glu 10Lys Cys Pro Glu 10
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Arg LysPhe Ser Arg Lys
Asp Asn Leu LysAsp Asn Leu Lys
Asn His Gln Arg 25Asn His Gln Arg 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr 35Glu Lys Pro Tyr 35
Lys Cys Pro Glu 40Lys Cys Pro Glu 40
Cys Gly Lys SerCys Gly Lys Ser
Phe Ser Asp Pro 45Phe Ser Asp Pro 45
Gly Ala Leu Val 50Gly Ala Leu Val 50
Arg His Gln Arg 55Arg His Gln Arg 55
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu 65Lys Cys Pro Glu 65
Cys Gly Lys Ser 70Cys Gly Lys Ser 70
Phe Ser Arg Glu 75Phe Ser Arg Glu 75
Asp Asn Leu His 80Asp Asn Leu His 80
Thr His Gln ArgThr His Gln Arg
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
- 160 046157- 160 046157
9090
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Asp Pro Gly Ala Leu ValCys Gly Lys Ser Phe Ser Asp Pro Gly Ala Leu Val
100 105100 105
Arg His Gln Arg 110Arg His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Thr Ser Gly Glu Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Thr Ser Gly Glu Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Arg LysPhe Ser Arg Lys
160160
Asp Asn Leu Lys Asn His Gln Arg Thr His Thr GlyAsp Asn Leu Lys Asn His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr SerLys Lys Thr Ser
175 <210> 83 <211> 232 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 83 <211> 232 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 83Synthetic polypeptide <400> 83
Leu Glu Pro Gly 1Leu Glu Pro Gly 1
Glu Lys Pro Tyr 5Glu Lys Pro Tyr 5
Lys Cys Pro Glu 10Lys Cys Pro Glu 10
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Ser Lys 20Phe Ser Ser Lys 20
Lys Ala Leu ThrLys Ala Leu Thr
Glu His Gln Arg 25Glu His Gln Arg 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr 35Glu Lys Pro Tyr 35
Lys Cys Pro Glu 40Lys Cys Pro Glu 40
Cys Gly Lys SerCys Gly Lys Ser
Phe Ser Ser Pro 45Phe Ser Ser Pro 45
Ala Asp Leu Thr 50Ala Asp Leu Thr 50
Arg His Gln Arg 55Arg His Gln Arg 55
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu 65Lys Cys Pro Glu 65
Cys Gly Lys Ser 70Cys Gly Lys Ser 70
Phe Ser Arg Ser 75Phe Ser Arg Ser 75
Asp Asn Leu Val 80Asp Asn Leu Val 80
Arg His Gln ArgArg His Gln Arg
Thr His Thr Gly 85Thr His Thr Gly 85
Glu Lys Pro Tyr 90Glu Lys Pro Tyr 90
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys SerCys Gly Lys Ser
100100
Phe Ser Arg GluPhe Ser Arg Glu
Asp Asn Leu His 105Asp Asn Leu His 105
Thr His Gln ArgThr His Gln Arg
110110
Thr His Thr Gly 115Thr His Thr Gly 115
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
120120
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys SerCys Gly Lys Ser
125125
- 161 046157- 161 046157
Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyPhe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
130 135140130 135140
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser
145 150 155160145 150 155160
Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrGly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
165 170175165 170175
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser Gly His Leu ValLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser Gly His Leu Val
180 185190180 185190
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluArg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
195 200205195 200205
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu His Gln ArgCys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu His Gln Arg
210 215220210 215220
Thr His Thr Gly Lys Lys Thr SerThr His Thr Gly Lys Lys Thr Ser
225230 <210> 84 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>225230 <210> 84 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 84<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 84
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
5 10155 1015
Phe Ser Ser Pro Ala Asp Leu Thr Arg His Gln Arg Thr His ThrGlyPhe Ser Ser Pro Ala Asp Leu Thr Arg His Gln Arg Thr His ThrGly
25302530
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser 35 4045Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser 35 4045
Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu Asp Asn LeuHisLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu Asp Asn LeuHis
70 758070 7580
Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGluThr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGlu
90959095
- 162 046157- 162 046157
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg SerCys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser
100100
Asp Glu Leu ValAsp Glu Leu Val
105105
Arg His Gln Arg 110Arg His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln ArgPhe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Thr SerPhe Ser Thr Ser
160160
Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyGly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr SerLys Lys Thr Ser
175 <210> 85 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 85 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 85<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 85
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Ser Lys Lys Ala Leu Thr Glu His Gln Arg 20 25Phe Ser Ser Lys Lys Ala Leu Thr Glu His Gln Arg 20 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser Ser Pro 45Phe Ser Ser Pro 45
Ala Asp Leu Thr Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyAla Asp Leu Thr Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser 65 70 75
Asp Asn Leu Val 80Asp Asn Leu Val 80
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrArg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu HisCys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His
100 105100 105
Thr His Gln Arg 110Thr His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys SerCys Gly Lys Ser
125125
- 163 046157- 163 046157
Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Gln SerPhe Ser Gln Ser
160160
Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr GlyGly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr SerLys Lys Thr Ser
175 <210> 86 <211> 232 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 86 <211> 232 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 86<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 86
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Asp Cys Arg Asp Leu Ala Arg His Gln Arg 20 25Phe Ser Asp Cys Arg Asp Leu Ala Arg His Gln Arg 20 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser Arg Asn 45Phe Ser Arg Asn 45
Asp Ala Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr GlyAsp Ala Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Asn 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Asn 65 70 75
Asp Ala Leu ThrAsp Ala Leu Thr
Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrGlu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Ser Pro Ala Asp Leu ThrCys Gly Lys Ser Phe Ser Ser Pro Ala Asp Leu Thr
100 105100 105
Arg His Gln Arg 110Arg His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Asp Pro Gly Asn Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Asp Pro Gly Asn Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Gln ArgPhe Ser Gln Arg
160160
Ala His Leu Glu Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyAla His Leu Glu Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
- 164 046157- 164 046157
165165
170170
175175
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln SerLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser
180 185180 185
Ser Ser Leu ValSer Ser Leu Val
190190
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrArg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
195 200195 200
Lys Cys Pro Glu 205Lys Cys Pro Glu 205
Cys Gly Lys Ser Phe Ser His Arg Thr Thr Leu ThrCys Gly Lys Ser Phe Ser His Arg Thr Thr Leu Thr
210 215 220210 215 220
Asn His Gln ArgAsn His Gln Arg
Thr His Thr Gly Lys Lys Thr SerThr His Thr Gly Lys Lys Thr Ser
225 230 <210> 87 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>225 230 <210> 87 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 87<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 87
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Arg Asn Asp Ala Leu Thr Glu His Gln Arg 20 25Phe Ser Arg Asn Asp Ala Leu Thr Glu His Gln Arg 20 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser Ser Pro 45Phe Ser Ser Pro 45
Ala Asp Leu Thr Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyAla Asp Leu Thr Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Asp Pro 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Asp Pro 65 70 75
Gly Asn Leu ValGly Asn Leu Val
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrArg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Arg Ala His Leu GluCys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Arg Ala His Leu Glu
100 105100 105
Arg His Gln Arg 110Arg His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
- 165 046157- 165 046157
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser His ArgGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser His Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Thr Leu Thr Asn His Gln Arg Thr HisThr Thr Leu Thr Asn His Gln Arg Thr His
165 170165 170
Thr Gly Lys Lys Thr SerThr Gly Lys Lys Thr Ser
175 <210> 88 <211> 204 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 88 <211> 204 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 88<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 88
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
5 10155 1015
Phe Ser Arg Asn Asp Ala Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His ThrGlyPhe Ser Arg Asn Asp Ala Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His ThrGly
25302530
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Asp Pro 35 4045Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Asp Pro 35 4045
Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 50 5560
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser Gly Glu LeuValLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser Gly Glu LeuVal
70 758070 7580
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGluArg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGlu
90959095
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr His Leu Asp Leu Ile Arg His Gln Arg 100 105110Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr His Leu Asp Leu Ile Arg His Gln Arg 100 105110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 115 120125Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 115 120125
Phe Ser Ser Lys Lys Ala Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly 130 135140Phe Ser Ser Lys Lys Ala Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly 130 135140
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser GlnLeuGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser GlnLeu
145 150 155160145 150 155160
Ala His Leu Arg Ala His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProTyrAla His Leu Arg Ala His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProTyr
165 170175165 170175
- 166 046157- 166 046157
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg SerLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser
180 185180 185
Asp His Leu Thr 190Asp His Leu Thr 190
Asn His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr SerAsn His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr Ser
195 200 <210> 89 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>195 200 <210> 89 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 89<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 89
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg 20 25Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg 20 25
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser His Arg 45Phe Ser His Arg 45
Thr Thr Leu Thr Asn His Gln Arg Thr His Thr GlyThr Thr Leu Thr Asn His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu 65 70 75
Asp Asn Leu His 80Asp Asn Leu His 80
Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrThr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser His Ser Leu ThrCys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser His Ser Leu Thr
100 105100 105
Glu His Gln Arg 110Glu His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Arg GluPhe Ser Arg Glu
160160
Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr GlyAsp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr SerLys Lys Thr Ser
175175
- 167 046157 <210> 90 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 167 046157 <210> 90 <211> 176 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 90<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 90
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
5 105 10
Phe Ser Asp Pro Gly Ala Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Asp Pro Gly Ala Leu Val Arg His Gln Arg
2525
СинтетическийSynthetic
Cys Gly Lys Ser 15Cys Gly Lys Ser 15
Thr His Thr Gly 30Thr His Thr Gly 30
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser 35 40
Phe Ser Arg Ser 45Phe Ser Arg Ser 45
Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyAsp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
55 6055 60
Glu Lys Pro TyrGlu Lys Pro Tyr
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser 65 70 75Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser 65 70 75
Gly Asp Leu Arg 80Gly Asp Leu Arg 80
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrArg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
9090
Lys Cys Pro GluLys Cys Pro Glu
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr His Leu Asp Leu IleCys Gly Lys Ser Phe Ser Thr His Leu Asp Leu Ile
100 105100 105
Arg His Gln Arg 110Arg His Gln Arg 110
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
115 120115 120
Cys Gly Lys Ser 125Cys Gly Lys Ser 125
Phe Ser Thr Ser Gly Asn Leu Val Arg His Gln ArgPhe Ser Thr Ser Gly Asn Leu Val Arg His Gln Arg
130 135 140130 135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
145 150 155145 150 155
Phe Ser Arg SerPhe Ser Arg Ser
160160
Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr GlyAsp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly
165 170165 170
Lys Lys Thr Ser 175 <210> 91 <211> 260 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Lys Lys Thr Ser 175 <210> 91 <211> 260 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
СинтетическийSynthetic
- 168 046157 <400> 91- 168 046157 <400> 91
Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr LysLeu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys
55
Phe Ser Arg Arg Asp Glu Leu Asn ValPhe Ser Arg Arg Asp Glu Leu Asn Val
2525
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu CysGlu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys
4040
Asp His Leu Thr Asn His Gln Arg ThrAsp His Leu Thr Asn His Gln Arg Thr
5555
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe 65 70Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe 65 70
Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu 85Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu 85
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser AspCys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser Asp
100 105100 105
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr LysThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys
115 120115 120
Phe Ser His Arg Thr Thr Leu Thr AsnPhe Ser His Arg Thr Thr Leu Thr Asn
130 135130 135
Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys 145 150Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys 145 150
Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg ThrAsp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr
165165
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser PheLys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe
180 185180 185
Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly GluGlu His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu
195 200195 200
Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser SerCys Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser Ser
210 215210 215
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr LysThr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys
225 230225 230
Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His ThrPhe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His Thr
245245
Pro Glu Cys Gly Lys Ser 15Pro Glu Cys Gly Lys Ser 15
Gln Arg Thr His Thr Gly 30Gln Arg Thr His Thr Gly 30
Lys Ser Phe Ser Arg Ser 45Lys Ser Phe Ser Arg Ser 45
Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 60Thr Gly Glu Lys Pro Tyr 60
Arg Ser Asp Asp Leu Val 75 80Arg Ser Asp Asp Leu Val 75 80
Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 95Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 95
Leu Val Arg His Gln ArgLeu Val Arg His Gln Arg
110110
Pro Glu Cys Gly Lys SerPro Glu Cys Gly Lys Ser
125125
Gln Arg Thr His Thr Gly 140Gln Arg Thr His Thr Gly 140
Lys Ser Phe Ser Arg GluLys Ser Phe Ser Arg Glu
155 160155 160
Thr Gly Glu Lys Pro TyrThr Gly Glu Lys Pro Tyr
175175
Thr Ser His Ser Leu ThrThr Ser His Ser Leu Thr
190190
Pro Tyr Lys Cys Pro GluPro Tyr Lys Cys Pro Glu
205205
Leu Val Arg His Gln ArgLeu Val Arg His Gln Arg
220220
Pro Glu Cys Gly Lys SerPro Glu Cys Gly Lys Ser
235 240235 240
Gln Arg Thr His Thr GlyGln Arg Thr His Thr Gly
255255
- 169 046157- 169 046157
Lys Lys Thr SerLys Lys Thr Ser
260 <210> 92 <211> 177 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>260 <210> 92 <211> 177 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 92<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 92
Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp ArgArg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Phe Ser Arg 15Arg Phe Ser Arg 15
Ser Asp Asn Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr 20 25Ser Asp Asn Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr 20 25
Gly Gln Lys Pro 30Gly Gln Lys Pro 30
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg 35 40Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg 35 40
Glu Asp Asn Leu 45Glu Asp Asn Leu 45
His Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProHis Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
55 6055 60
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu LeuIle Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu
70 7570 75
Val Arg His ThrVal Arg His Thr
Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Arg Pro Tyr AlaLys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala
9090
Cys Pro Val GluCys Pro Val Glu
Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Gln Ser Gly Asn LeuSer Cys Asp Arg Arg Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu
100 105100 105
Thr Glu His IleThr Glu His Ile
110110
Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys ArgArg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg
115 120115 120
Ile Cys Met Arg 125Ile Cys Met Arg 125
Asn Phe Ser Thr Ser Gly His Leu Val Arg His IleAsn Phe Ser Thr Ser Gly His Leu Val Arg His Ile
130 135 140130 135 140
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly ArgGly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg
145 150 155145 150 155
Lys Phe Ala GlnLys Phe Ala Gln
160160
Asn Ser Thr Leu Thr Glu His Thr Lys Ile His LeuAsn Ser Thr Leu Thr Glu His Thr Lys Ile His Leu
165 170165 170
Arg Gln Lys AspArg Gln Lys Asp
175175
LysLys
- 170 046157 <210> 93 <211> 177 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 170 046157 <210> 93 <211> 177 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 93<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 93
Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp ArgArg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Phe Ser Arg 15Arg Phe Ser Arg 15
Ser Asp Asn Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr 20 25Ser Asp Asn Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr 20 25
Gly Gln Lys Pro 30Gly Gln Lys Pro 30
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser His 35 40Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser His 35 40
Arg Thr Thr Leu 45Arg Thr Thr Leu 45
Thr Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProThr Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
55 6055 60
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu 65 70 75Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu 65 70 75
His Thr His ThrHis Thr His Thr
Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala 85 90Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala 85 90
Cys Pro Val GluCys Pro Val Glu
Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Thr Ser His Ser LeuSer Cys Asp Arg Arg Phe Ser Thr Ser His Ser Leu
100 105100 105
Thr Glu His IleThr Glu His Ile
110110
Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys ArgArg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg
115 120115 120
Ile Cys Met Arg 125Ile Cys Met Arg 125
Asn Phe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His IleAsn Phe Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Ile
130 135 140130 135 140
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly ArgGly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg
145 150 155145 150 155
Lys Phe Ala ArgLys Phe Ala Arg
160160
Glu Asp Asn Leu His Thr His Thr Lys Ile His LeuGlu Asp Asn Leu His Thr His Thr Lys Ile His Leu
165 170165 170
Arg Gln Lys AspArg Gln Lys Asp
175175
Lys <210> 94 <211> 264 <212> Белок <213> Искусственная последовательностьLys <210> 94 <211> 264 <212> Protein <213> Artificial sequence
- 171 046157 <220>- 171 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 94Synthetic polypeptide <400> 94
Arg Pro Tyr Ala 1Arg Pro Tyr Ala 1
Cys Pro Val Glu Ser 5Cys Pro Val Glu Ser 5
Arg Asp Glu LeuArg Asp Glu Leu
Asn Val His Ile ArgAsn Val His Ile Arg
Phe Gln Cys ArgPhe Gln Cys Arg
Ile Cys Met Arg AsnIle Cys Met Arg Asn
Thr Asn His IleThr Asn His Ile
Arg Thr His Thr Gly 55Arg Thr His Thr Gly 55
Cys Asp Arg 10Cys Asp Arg 10
Ile His ThrIle His Thr
Phe Ser ArgPhe Ser Arg
Glu Lys Pro 60Glu Lys Pro 60
Arg Phe Ser Arg 15Arg Phe Ser Arg 15
Gly Gln Lys Pro 30Gly Gln Lys Pro 30
Ser Asp His Leu 45Ser Asp His Leu 45
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
Ile Cys 65Ile Cys 65
Lys IleLys Ile
Ser CysSer Cys
Arg IleArg Ile
Asn PheAsn Phe
130130
Gly Glu 145Gly Glu 145
Glu AspGlu Asp
Arg ProArg Pro
Ser HisSer His
Phe GlnPhe Gln
210210
Val ArgVal Arg
Gly ArgGly Arg
His LeuHis Leu
Asp ArgAsp Arg
100100
His Thr 115His Thr 115
Ser HisSer His
Lys ProLys Pro
Asn LeuAsn Leu
Tyr AlaTyr Ala
180180
Ser LeuSer Leu
195195
Cys ArgCysArg
His IleHis Ile
Lys PheLys Phe
Arg Gln 85Arg Gln 85
Arg PheArg Phe
Gly GlnGly Gln
Arg ThrArg Thr
Phe AlaPhe Ala
150150
His Thr 165His Thr 165
Cys ProCys Pro
Thr GluThr Glu
Ile CysIle Cys
Arg ThrArg Thr
Ala ArgAla Arg
Lys AspLys Asp
Ser ArgSer Arg
Lys ProLys Pro
120120
Thr Leu 135Thr Leu 135
Cys AspCys Asp
His ThrHis Thr
Val GluVal Glu
His IleHis Ile
200200
Met Arg 215Met Arg 215
His ThrHis Thr
Ser AspSer Asp
Arg ProArg Pro
Ser Asp 105Ser Asp 105
Phe GlnPhe Gln
Thr AsnThr Asn
Ile CysIle Cys
Lys IleLys Ile
170170
Ser Cys 185Ser Cys 185
Arg IleArg Ile
Asn PheAsn Phe
Gly GluGly Glu
Asp Leu 75Asp Leu 75
Tyr AlaTyr Ala
Asn LeuAsn Leu
Cys ArgCysArg
His IleHis Ile
140140
Gly Arg 155Gly Arg 155
His LeuHis Leu
Asp ArgAsp Arg
His ThrHis Thr
Ser GlnSer Gln
220220
Lys ProLys Pro
Val Arg His ThrVal Arg His Thr
Cys Pro Val GluCys Pro Val Glu
Val Arg His IleVal Arg His Ile
110110
Ile Cys Met Arg 125Ile Cys Met Arg 125
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
Lys Phe Ala ArgLys Phe Ala Arg
160160
Arg Gln Lys AspArg Gln Lys Asp
175175
Arg Phe Ser Thr 190Arg Phe Ser Thr 190
Gly Gln Lys Pro 205Gly Gln Lys Pro 205
Ser Ser Ser LeuSer Ser Ser Leu
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
- 172 046157- 172 046157
225 230 235225 230 235
240240
Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn LeuIle Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu
245 250245 250
His Thr His ThrHis Thr His Thr
255255
Lys Ile His Leu Arg Gln Lys AspLys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp
260 <210> 95 <211> 264 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>260 <210> 95 <211> 264 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 95<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 95
Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp ArgArg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Phe Ser AspArg Phe Ser Asp
Pro Gly Ala Leu Val ArgPro Gly Ala Leu Val Arg
His Ile Arg Ile His Thr 25His Ile Arg Ile His Thr 25
Gly Gln Lys Pro 30Gly Gln Lys Pro 30
Phe Gln Cys Arg Ile Cys 35Phe Gln Cys Arg Ile Cys 35
Met Arg Asn Phe Ser Arg 40Met Arg Asn Phe Ser Arg 40
Ser Asp Asn Leu 45Ser Asp Asn Leu 45
Val Arg His Ile Arg Thr 50Val Arg His Ile Arg Thr 50
His Thr Gly Glu Lys Pro 55 60His Thr Gly Glu Lys Pro 55 60
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
Ile Cys Gly Arg Lys Phe 65 70Ile Cys Gly Arg Lys Phe 65 70
Ala Gln Ser Gly Asp Leu 75Ala Gln Ser Gly Asp Leu 75
Arg Arg His ThrArg Arg His Thr
Lys Ile His Leu Arg Gln 85Lys Ile His Leu Arg Gln 85
Lys Asp Arg Pro Tyr Ala 90Lys Asp Arg Pro Tyr Ala 90
Cys Pro Val GluCys Pro Val Glu
Ser Cys Asp Arg Arg PheSer Cys Asp Arg Arg Phe
100100
Ser Thr His Leu Asp LeuSer Thr His Leu Asp Leu
105105
Ile Arg His Ile 110Ile Arg His Ile 110
Arg Ile His Thr Gly Gln 115Arg Ile His Thr Gly Gln 115
Lys Pro Phe Gln Cys ArgLys Pro Phe Gln Cys Arg
120120
Ile Cys Met Arg 125Ile Cys Met Arg 125
Asn Phe Ser Thr Ser GlyAsn Phe Ser Thr Ser Gly
130130
Asn Leu Val Arg His IleAsn Leu Val Arg His Ile
135 140135 140
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
Gly Glu Lys Pro Phe AlaGly Glu Lys Pro Phe Ala
145 150145 150
Cys Asp Ile Cys Gly ArgCys Asp Ile Cys Gly Arg
155155
Lys Phe Ala ArgLys Phe Ala Arg
160160
Ser Asp Asn Leu Val ArgSer Asp Asn Leu Val Arg
165165
His Thr Lys Ile His Leu 170His Thr Lys Ile His Leu 170
Arg Gln Lys AspArg Gln Lys Asp
175175
- 173 046157- 173 046157
Arg Pro Tyr Ala Cys ProArg Pro Tyr Ala Cys Pro
180180
Val Glu Ser Cys Asp ArgVal Glu Ser Cys Asp Arg
185185
Arg Phe Ser GlnArg Phe Ser Gln
190190
Ser Gly His Leu Thr GluSer Gly His Leu Thr Glu
195195
His Ile Arg Ile His ThrHis Ile Arg Ile His Thr
200200
Gly Gln Lys Pro 205Gly Gln Lys Pro 205
Phe Gln Cys Arg Ile CysPhe Gln Cys Arg Ile Cys
210210
Met Arg Asn Phe Ser GluMet Arg Asn Phe Ser Glu
215 220215 220
Arg Ser His LeuArg Ser His Leu
Arg Glu His Ile Arg ThrArg Glu His Ile Arg Thr
225 230225 230
His Thr Gly Glu Lys ProHis Thr Gly Glu Lys Pro
235235
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
240240
Ile Cys Gly Arg Lys PheIle Cys Gly Arg Lys Phe
245245
Ala Gln Ala Gly His LeuAla Gln Ala Gly His Leu
250250
Ala Ser His ThrAla Ser His Thr
255255
Lys Ile His Leu Arg GlnLys Ile His Leu Arg Gln
260260
Lys Asp <210> 96 <211> 175 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Lys Asp <210> 96 <211> 175 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 96<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 96
Arg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp ArgArg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Phe Ser Arg 15Arg Phe Ser Arg 15
Ser Asp Asn Leu Val Arg His Leu Arg Ile His Thr 20 25Ser Asp Asn Leu Val Arg His Leu Arg Ile His Thr 20 25
Gly His Lys Pro 30Gly His Lys Pro 30
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Arg 35 40Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Arg 35 40
Glu Asp Asn Leu 45Glu Asp Asn Leu 45
His Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProHis Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
55 6055 60
Phe Ala Cys GluPhe Ala Cys Glu
Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu 65 70 75Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu 65 70 75
Val Arg His AlaVal Arg His Ala
Lys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu His Ala Cys ProLys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu His Ala Cys Pro
9090
Ala Glu Gly CysAla Glu Gly Cys
Asp Arg Arg Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr GluAsp Arg Arg Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu
100 105100 105
His Leu Arg Ile 110His Leu Arg Ile 110
- 174 046157- 174 046157
His Thr Gly His Lys Pro 115His Thr Gly His Lys Pro 115
Phe Gln Cys Arg Ile CysPhe Gln Cys Arg Ile Cys
120120
Met Arg Ser Phe 125Met Arg Ser Phe 125
Ser Thr Ser Gly His LeuSer Thr Ser Gly His Leu
130130
Val Arg His Ile Arg ThrVal Arg His Ile Arg Thr
135 140135 140
His Thr Gly GluHis Thr Gly Glu
Lys Pro Phe Ala Cys GluLys Pro Phe Ala Cys Glu
145 150145 150
Phe Cys Gly Arg Lys PhePhe Cys Gly Arg Lys Phe
155155
Ala Gln Asn SerAla Gln Asn Ser
160160
Thr Leu Thr Glu His AlaThr Leu Thr Glu His Ala
165165
Lys Ile His Leu Lys GlnLys Ile His Leu Lys Gln
170170
Lys Glu LysLys Glu Lys
175 <210> 97 <211> 175 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 97 <211> 175 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 97<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 97
Arg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp ArgArg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Phe Ser Arg 15Arg Phe Ser Arg 15
Ser Asp Asn Leu Val Arg His Leu Arg Ile His Thr 20 25Ser Asp Asn Leu Val Arg His Leu Arg Ile His Thr 20 25
Gly His Lys Pro 30Gly His Lys Pro 30
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser His 35 40Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser His 35 40
Arg Thr Thr Leu 45Arg Thr Thr Leu 45
Thr Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProThr Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
55 6055 60
Phe Ala Cys GluPhe Ala Cys Glu
Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu 65 70 75Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu 65 70 75
His Thr His AlaHis Thr His Ala
Lys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu His Ala Cys ProLys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu His Ala Cys Pro
9090
Ala Glu Gly CysAla Glu Gly Cys
Asp Arg Arg Phe Ser Thr Ser His Ser Leu Thr GluAsp Arg Arg Phe Ser Thr Ser His Ser Leu Thr Glu
100 105100 105
His Leu Arg Ile 110His Leu Arg Ile 110
His Thr Gly His Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile CysHis Thr Gly His Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys
115 120115 120
Met Arg Ser Phe 125Met Arg Ser Phe 125
Ser Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Ile Arg ThrSer Gln Ser Ser Ser Leu Val Arg His Ile Arg Thr
130 135 140130 135 140
His Thr Gly GluHis Thr Gly Glu
- 175 046157- 175 046157
Lys Pro Phe Ala Cys Glu Phe Cys Gly Arg Lys PheLys Pro Phe Ala Cys Glu Phe Cys Gly Arg Lys Phe
145 150 155145 150 155
Ala Arg Glu AspAla Arg Glu Asp
160160
Asn Leu His Thr His Ala Lys Ile His Leu Lys GlnAsn Leu His Thr His Ala Lys Ile His Leu Lys Gln
165 170165 170
Lys Glu LysLys Glu Lys
175 <210> 98 <211> 261 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 98 <211> 261 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 98<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 98
Arg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp ArgArg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Phe Ser Arg 15Arg Phe Ser Arg 15
Arg Asp Glu Leu Asn Val His Leu Arg Ile His Thr 20 25Arg Asp Glu Leu Asn Val His Leu Arg Ile His Thr 20 25
Gly His Lys Pro 30Gly His Lys Pro 30
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Arg 35 40Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Arg 35 40
Ser Asp His Leu 45Ser Asp His Leu 45
Thr Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProThr Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
55 6055 60
Phe Ala Cys GluPhe Ala Cys Glu
Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Asp Leu 65 70 75Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Asp Leu 65 70 75
Val Arg His AlaVal Arg His Ala
Lys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu His Ala Cys ProLys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu His Ala Cys Pro
9090
Ala Glu Gly CysAla Glu Gly Cys
Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val ArgAsp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg
100 105100 105
His Leu Arg Ile 110His Leu Arg Ile 110
His Thr Gly His Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile CysHis Thr Gly His Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys
115 120115 120
Met Arg Ser Phe 125Met Arg Ser Phe 125
Ser His Arg Thr Thr Leu Thr Asn His Ile Arg ThrSer His Arg Thr Thr Leu Thr Asn His Ile Arg Thr
130 135 140130 135 140
His Thr Gly GluHis Thr Gly Glu
Lys Pro Phe Ala Cys Glu Phe Cys Gly Arg Lys PheLys Pro Phe Ala Cys Glu Phe Cys Gly Arg Lys Phe
145 150 155145 150 155
Ala Arg Glu AspAla Arg Glu Asp
160160
Asn Leu His Thr His Ala Lys Ile His Leu Lys GlnAsn Leu His Thr His Ala Lys Ile His Leu Lys Gln
165 170165 170
Lys Glu His Ala 175Lys Glu His Ala 175
Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg Arg Phe Ser ThrCys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg Arg Phe Ser Thr
Ser His Ser LeuSer His Ser Leu
- 176 046157- 176 046157
180 185180 185
190190
Thr Glu His Leu Arg Ile His Thr Gly His Lys ProThr Glu His Leu Arg Ile His Thr Gly His Lys Pro
195 200195 200
Phe Gln Cys Arg 205Phe Gln Cys Arg 205
Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Gln Ser Ser Ser LeuIle Cys Met Arg Ser Phe Ser Gln Ser Ser Ser Leu
210 215 220210 215 220
Val Arg His IleVal Arg His Ile
Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys GluArg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Glu
225 230 235225 230 235
Phe Cys Gly ArgPhe Cys Gly Arg
240240
Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His AlaLys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His Ala
245 250245 250
Lys Ile His LeuLys Ile His Leu
255255
Lys Gln Lys Glu LysLys Gln Lys Glu Lys
260 <210> 99 <211> 753 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>260 <210> 99 <211> 753 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 99Synthetic polypeptide <400> 99
Met Ala Pro Lys 1Met Ala Pro Lys 1
Lys Lys Arg Lys 5Lys Lys Arg Lys 5
Val Gly Ile His 10Val Gly Ile His 10
Gly Val Pro Ala 15Gly Val Pro Ala 15
Ala Leu Glu ProAla Leu Glu Pro
Gly Glu Lys ProGly Glu Lys Pro
Tyr Lys Cys Pro 25Tyr Lys Cys Pro 25
Glu Cys Gly Lys 30Glu Cys Gly Lys 30
Ser Phe Ser ArgSer Phe Ser Arg
Ser Asp Asn Leu 40Ser Asp Asn Leu 40
Val Arg His GlnVal Arg His Gln
Arg Thr His Thr 45Arg Thr His Thr 45
Gly Glu Lys Pro 50Gly Glu Lys Pro 50
Tyr Lys Cys Pro 55Tyr Lys Cys Pro 55
Glu Cys Gly Lys 60Glu Cys Gly Lys 60
Ser Phe Ser HisSer Phe Ser His
Arg Thr Thr Leu 65Arg Thr Thr Leu 65
Thr Asn His GlnThr Asn His Gln
Arg Thr His Thr 75Arg Thr His Thr 75
Gly Glu Lys Pro 80Gly Glu Lys Pro 80
Tyr Lys Cys ProTyr Lys Cys Pro
Glu Cys Gly Lys 85Glu Cys Gly Lys 85
Ser Phe Ser Arg 90Ser Phe Ser Arg 90
Glu Asp Asn LeuGlu Asp Asn Leu
His Thr His GlnHis Thr His Gln
100100
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
Gly Glu Lys Pro 105Gly Glu Lys Pro 105
Tyr Lys Cys Pro 110Tyr Lys Cys Pro 110
Glu Cys Gly LysGlu Cys Gly Lys
115115
Ser Phe Ser ThrSer Phe Ser Thr
120120
Ser His Ser LeuSer His Ser Leu
Thr Glu His Gln 125Thr Glu His Gln 125
- 177 046157- 177 046157
Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProArg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
130 135130 135
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys GlyTyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly
140140
Ser Phe Ser GlnSer Phe Ser Gln
145145
Ser Ser Ser Leu Val Arg His Gln Arg Thr HisSer Ser Ser Leu Val Arg His Gln Arg Thr His
150 155150 155
Gly Glu Lys ProGly Glu Lys Pro
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly LysTyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys
165 170165 170
Ser Phe SerSer Phe Ser
175175
Glu Asp Asn Leu HisGlu Asp Asn Leu His
180180
Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys LysThr His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys
185 190185 190
Ser Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys LysSer Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys
195 200 205195 200 205
Lys Gly Ser Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Leu Glu GluLys Gly Ser Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Leu Glu Glu
210 215 220210 215 220
Ser Gly Ser Gly Arg Ala Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu AspSer Gly Ser Gly Arg Ala Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp
225 230 235225 230 235
Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu GlyLeu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly
245 250 255245 250 255
Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp AlaAsp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala
260 265 270260 265 270
Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Ile Asn Ser Arg Ser Ser GlyAsp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Ile Asn Ser Arg Ser Ser Gly
275 280 285275 280 285
Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ser Gln Tyr Leu Pro Asp ThrPro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ser Gln Tyr Leu Pro Asp Thr
290 295 300290 295 300
Asp Arg His Arg Ile Glu Glu Lys Arg Lys Arg Thr Tyr Glu ThrAsp Arg His Arg Ile Glu Glu Lys Arg Lys Arg Thr Tyr Glu Thr
305 310 315305 310 315
Lys Ser Ile Met Lys Lys Ser Pro Phe Ser Gly Pro Thr Asp ProLys Ser Ile Met Lys Lys Ser Pro Phe Ser Gly Pro Thr Asp Pro
325 330 335325 330 335
Pro Pro Pro Arg Arg Ile Ala Val Pro Ser Arg Ser Ser Ala SerPro Pro Pro Arg Arg Ile Ala Val Pro Ser Arg Ser Ser Ala Ser
340 345 350340 345 350
Pro Lys Pro Ala Pro Gln Pro Tyr Pro Phe Thr Ser Ser Leu SerPro Lys Pro Ala Pro Gln Pro Tyr Pro Phe Thr Ser Ser Leu Ser
355 360 365355 360 365
Ile Asn Tyr Asp Glu Phe Pro Thr Met Val Phe Pro Ser Gly GlnIle Asn Tyr Asp Glu Phe Pro Thr Met Val Phe Pro Ser Gly Gln
LysLys
Thr 160Thr 160
ArgArg
ThrThr
LysLys
AlaAla
Met 240Met 240
SerSer
LeuLeu
SerSer
AspAsp
Phe 320Phe 320
ArgArg
ValVal
ThrThr
IleIle
- 178 046157- 178 046157
370370
375375
380380
Ser Gln Ala Ser Ala Leu Ala Pro Ala Pro Pro Gln Val Leu ProSer Gln Ala Ser Ala Leu Ala Pro Ala Pro Pro Gln Val Leu Pro
385 390 395385 390 395
Ala Pro Ala Pro AlaAla Pro Ala Pro Ala
405405
Pro Ala Pro Ala MetPro Ala Pro Ala Met
410410
Val Ser Ala Leu AlaVal Ser Ala Leu Ala
415415
Ala Pro Ala Pro ValAla Pro Ala Pro Val
420420
Pro Val Leu Ala ProPro Val Leu Ala Pro
425425
Gly Pro Pro Gln AlaGly Pro Pro Gln Ala
430430
Ala Pro Pro Ala ProAla Pro Pro Ala Pro
435435
Lys Pro Thr Gln AlaLys Pro Thr Gln Ala
440440
Gly Glu Gly Thr Leu 445Gly Glu Gly Thr Leu 445
Glu Ala Leu Leu GlnGlu Ala Leu Leu Gln
450450
Leu Gln Phe Asp AspLeu Gln Phe Asp Asp
455455
Glu Asp Leu Gly AlaGlu Asp Leu Gly Ala
460460
Leu Gly Asn Ser Thr 465Leu Gly Asn Ser Thr 465
Asp Pro Ala Val Phe 470Asp Pro Ala Val Phe 470
Thr Asp Leu Ala Ser 475Thr Asp Leu Ala Ser 475
Asp Asn Ser Glu PheAsp Asn Ser Glu Phe
485485
Gln Gln Leu Leu AsnGln Gln Leu Leu Asn
490490
Gln Gly Ile Pro ValGln Gly Ile Pro Val
495495
Pro His Thr Thr GluPro His Thr Thr Glu
500500
Pro Met Leu Met GluPro Met Leu Met Glu
505505
Tyr Pro Glu Ala IleTyr Pro Glu Ala Ile
510510
Arg Leu Val Thr Gly 515Arg Leu Val Thr Gly 515
Ala Gln Arg Pro Pro 520Ala Gln Arg Pro Pro 520
Asp Pro Ala Pro Ala 525Asp Pro Ala Pro Ala 525
Leu Gly Ala Pro GlyLeu Gly Ala Pro Gly
530530
Leu Pro Asn Gly LeuLeu Pro Asn Gly Leu
535535
Leu Ser Gly Asp GluLeu Ser Gly Asp Glu
540540
Phe Ser Ser Ile Ala 545Phe Ser Ser Ile Ala 545
Asp Met Asp Phe Ser 550Asp Met Asp Phe Ser 550
Ala Leu Leu Gly Ser 555Ala Leu Leu Gly Ser 555
Ser Gly Ser Arg AspSer Gly Ser Arg Asp
565565
Ser Arg Glu Gly MetSer Arg Glu Gly Met
570570
Phe Leu Pro Lys ProPhe Leu Pro Lys Pro
575575
Ala Gly Ser Ala IleAla Gly Ser Ala Ile
580580
Ser Asp Val Phe GluSer Asp Val Phe Glu
585585
Gly Arg Glu Val CysGly Arg Glu Val Cys
590590
Pro Lys Arg Ile Arg 595Pro Lys Arg Ile Arg 595
Pro Phe His Pro ProPro Phe His Pro Pro
600600
Gly Ser Pro Trp Ala 605Gly Ser Pro Trp Ala 605
Arg Pro Leu Pro AlaArg Pro Leu Pro Ala
610610
Ser Leu Ala Pro ThrSer Leu Ala Pro Thr
615615
Pro Thr Gly Pro ValPro Thr Gly Pro Val
620620
Gln 400Gln 400
GlnGln
ValVal
SerSer
LeuLeu
Val 480Val 480
AlaAla
ThrThr
ProPro
AspAsp
Gly 560Gly 560
GluGlu
GlnGln
AsnAsn
HisHis
- 179 046157- 179 046157
Glu Pro Val 625Glu Pro Val 625
Pro Ala ProPro Ala Pro
Asp Glu GluAsp Glu Glu
Thr Val Ile 675Thr Val Ile 675
Leu Ser His 690Leu Ser His 690
Leu Glu Ser 705Leu Glu Ser 705
Glu Leu AsnGlu Leu Asn
His Ala MetHis Ala Met
PhePhe
Gly Ser LeuGly Ser Leu
630630
Ala Val ThrAla Val Thr
645645
Thr Ser Gln 660Thr Ser Gln 660
Pro Gln LysPro Gln Lys
Pro Pro ProPro Pro Pro
Met Thr GluMet Thr Glu
710710
Glu Ile LeuGlu Ile Leu
725725
His Ile Ser 740His Ile Ser 740
Thr Pro AlaThr Pro Ala
Pro Glu AlaPro Glu Ala
Ala Val Lys 665Ala Val Lys 665
Glu Glu Ala 680Glu Glu Ala 680
Arg Gly His 695Arg Gly His 695
Asp Leu AsnAsp Leu Asn
Asp Thr PheAsp Thr Phe
Thr Gly LeuThr Gly Leu
745745
Pro Val ProPro Val Pro
635635
Ser His Leu 650Ser His Leu 650
Ala Leu ArgAla Leu Arg
Ala Ile CysAla Ile Cys
Leu Asp GluLeu Asp Glu
700700
Leu Asp SerLeu Asp Ser
715715
Leu Asn Asp 730Leu Asn Asp 730
Ser Ile PheSer Ile Phe
Gln Pro Leu AspGln Pro Leu Asp
640640
Leu Glu Asp ProLeu Glu Asp Pro
655655
Glu Met Ala AspGlu Met Ala Asp
670670
Gly Gln Met Asp 685Gly Gln Met Asp 685
Leu Thr Thr ThrLeu Thr Thr Thr
Pro Leu Thr ProPro Leu Thr Pro
720720
Glu Cys Leu LeuGlu Cys Leu Leu
735735
Asp Thr Ser Leu 750 <210> 100 <211> 753 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Asp Thr Ser Leu 750 <210> 100 <211> 753 <212> Protein <213> Artificial Sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 100<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 100
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile HisMet Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His
510510
Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro 2025Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro 2025
Ser Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln 3540Ser Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln 3540
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 50 5560Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 50 5560
Glu Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His ThrGlu Asp Asn Leu His Thr His Gln Arg Thr His Thr
СинтетическийSynthetic
Gly Val Pro Ala 15Gly Val Pro Ala 15
Glu Cys Gly Lys 30Glu Cys Gly Lys 30
Arg Thr His Thr 45Arg Thr His Thr 45
Ser Phe Ser ArgSer Phe Ser Arg
Gly Glu Lys ProGly Glu Lys Pro
- 180 046157- 180 046157
70 7570 75
Tyr Lys Cys Pro Glu 85Tyr Lys Cys Pro Glu 85
Cys Gly Lys Ser PheCys Gly Lys Ser Phe
Ser Arg Ser Asp GluSer Arg Ser Asp Glu
Val Arg His Gln ArgVal Arg His Gln Arg
100100
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
105105
Lys Pro Tyr Lys CysLys Pro Tyr Lys Cys
110110
Glu Cys Gly Lys Ser 115Glu Cys Gly Lys Ser 115
Phe Ser Gln Ser Gly 120Phe Ser Gln Ser Gly 120
Asn Leu Thr Glu HisAsn Leu Thr Glu His
125125
Arg Thr His Thr Gly 130Arg Thr His Thr Gly 130
Glu Lys Pro Tyr Lys 135Glu Lys Pro Tyr Lys 135
Cys Pro Glu Cys GlyCys Pro Glu Cys Gly
140140
Ser Phe Ser Thr Ser 145Ser Phe Ser Thr Ser 145
Gly His Leu Val Arg 150Gly His Leu Val Arg 150
His Gln Arg Thr His 155His Gln Arg Thr His 155
Gly Glu Lys Pro TyrGly Glu Lys Pro Tyr
165165
Lys Cys Pro Glu CysLys Cys Pro Glu Cys
170170
Gly Lys Ser Phe SerGly Lys Ser Phe Ser
175175
Asn Ser Thr Leu ThrAsn Ser Thr Leu Thr
180180
Glu His Gln Arg ThrGlu His Gln Arg Thr
185185
His Thr Gly Lys LysHis Thr Gly Lys Lys
190190
Ser Lys Arg Pro AlaSer Lys Arg Pro Ala
195195
Ala Thr Lys Lys Ala 200Ala Thr Lys Lys Ala 200
Gly Gln Ala Lys Lys 205Gly Gln Ala Lys Lys 205
Lys Gly Ser Tyr ProLys Gly Ser Tyr Pro
210210
Tyr Asp Val Pro AspTyr Asp Val Pro Asp
215215
Tyr Ala Leu Glu GluTyr Ala Leu Glu Glu
220220
Ser Gly Ser Gly Arg 225Ser Gly Ser Gly Arg 225
Ala Asp Ala Leu Asp 230Ala Asp Ala Leu Asp 230
Asp Phe Asp Leu Asp 235Asp Phe Asp Leu Asp 235
Leu Gly Ser Asp AlaLeu Gly Ser Asp Ala
245245
Leu Asp Asp Phe AspLeu Asp Asp Phe Asp
250250
Leu Asp Met Leu GlyLeu Asp Met Leu Gly
255255
Asp Ala Leu Asp AspAsp Ala Leu Asp Asp
260260
Phe Asp Leu Asp MetPhe Asp Leu Asp Met
265265
Leu Gly Ser Asp AlaLeu Gly Ser Asp Ala
270270
Asp Asp Phe Asp Leu 275Asp Asp Phe Asp Leu 275
Asp Met Leu Ile Asn 280Asp Met Leu Ile Asn 280
Ser Arg Ser Ser GlySer Arg Ser Ser Gly
285285
Pro Lys Lys Lys Arg 290Pro Lys Lys Lys Arg 290
Lys Val Gly Ser GlnLys Val Gly Ser Gln
295295
Tyr Leu Pro Asp ThrTyr Leu Pro Asp Thr
300300
Asp Arg His Arg Ile 305Asp Arg His Arg Ile 305
Glu Glu Lys Arg Lys 310Glu Glu Lys Arg Lys 310
Arg Thr Tyr Glu Thr 315Arg Thr Tyr Glu Thr 315
LeuLeu
ProPro
GlnGln
LysLys
Thr 160Thr 160
GlnGln
ThrThr
LysLys
AlaAla
Met 240Met 240
SerSer
LeuLeu
SerSer
AspAsp
Phe 320Phe 320
- 181 046157- 181 046157
LysLys
Ser Ile Met Lys Lys Ser ProSer Ile Met Lys Lys Ser Pro
325325
Phe Ser Gly Pro Thr Asp ProPhe Ser Gly Pro Thr Asp Pro
330 335330 335
Pro Pro Pro Arg Arg Ile Ala Val ProPro Pro Pro Arg Arg Ile Ala Val Pro
340 345340 345
Ser Arg SerSer Arg Ser
Ser Ala SerSer Ala Ser
350350
Pro Lys Pro Ala Pro Gln Pro Tyr Pro Phe Thr Ser Ser Leu SerPro Lys Pro Ala Pro Gln Pro Tyr Pro Phe Thr Ser Ser Leu Ser
355 360 365355 360 365
Ile Asn Tyr Asp GluIle Asn Tyr Asp Glu
370370
Phe Pro Thr Met ValPhe Pro Thr Met Val
375375
Phe Pro Ser Gly Gln 380Phe Pro Ser Gly Gln 380
Ser Gln Ala Ser Ala 385Ser Gln Ala Ser Ala 385
Leu Ala Pro Ala Pro 390Leu Ala Pro Ala Pro 390
Pro Gln Val Leu Pro 395Pro Gln Val Leu Pro 395
Ala Pro Ala Pro AlaAla Pro Ala Pro Ala
405405
Pro Ala Pro Ala MetPro Ala Pro Ala Met
410410
Val Ser Ala Leu AlaVal Ser Ala Leu Ala
415415
Ala Pro Ala Pro ValAla Pro Ala Pro Val
420420
Pro Val Leu Ala ProPro Val Leu Ala Pro
425425
Gly Pro Pro Gln AlaGly Pro Pro Gln Ala
430430
Ala Pro Pro Ala ProAla Pro Pro Ala Pro
435435
Lys Pro Thr Gln AlaLys Pro Thr Gln Ala
440440
Gly Glu Gly Thr Leu 445Gly Glu Gly Thr Leu 445
Glu Ala Leu Leu GlnGlu Ala Leu Leu Gln
450450
Leu Gln Phe Asp Asp 455Leu Gln Phe Asp Asp 455
Glu Asp Leu Gly AlaGlu Asp Leu Gly Ala
460460
Leu Gly Asn Ser Thr 465Leu Gly Asn Ser Thr 465
Asp Pro Ala Val Phe 470Asp Pro Ala Val Phe 470
Thr Asp Leu Ala Ser 475Thr Asp Leu Ala Ser 475
Asp Asn Ser Glu PheAsp Asn Ser Glu Phe
485485
Gln Gln Leu Leu AsnGln Gln Leu Leu Asn
490490
Gln Gly Ile Pro ValGln Gly Ile Pro Val
495495
Pro His Thr Thr GluPro His Thr Thr Glu
500500
Pro Met Leu Met GluPro Met Leu Met Glu
505505
Tyr Pro Glu Ala IleTyr Pro Glu Ala Ile
510510
Arg Leu Val Thr Gly 515Arg Leu Val Thr Gly 515
Ala Gln Arg Pro Pro 520Ala Gln Arg Pro Pro 520
Asp Pro Ala Pro Ala 525Asp Pro Ala Pro Ala 525
Leu Gly Ala Pro GlyLeu Gly Ala Pro Gly
530530
Leu Pro Asn Gly LeuLeu Pro Asn Gly Leu
535535
Leu Ser Gly Asp Glu 540Leu Ser Gly Asp Glu 540
Phe Ser Ser Ile Ala 545Phe Ser Ser Ile Ala 545
Asp Met Asp Phe Ser 550Asp Met Asp Phe Ser 550
Ala Leu Leu Gly Ser 555Ala Leu Leu Gly Ser 555
Ser Gly Ser Arg AspSer Gly Ser Arg Asp
565565
Ser Arg Glu Gly MetSer Arg Glu Gly Met
570570
Phe Leu Pro Lys ProPhe Leu Pro Lys Pro
575575
ArgArg
ValVal
ThrThr
IleIle
Gln 400Gln 400
GlnGln
ValVal
SerSer
LeuLeu
Val 480Val 480
AlaAla
ThrThr
ProPro
AspAsp
Gly 560Gly 560
GluGlu
- 182 046157- 182 046157
Ala Gly SerAla Gly Ser
Ala Ile Ser 580Ala Ile Ser 580
Asp Val PheAsp Val Phe
585585
Glu Gly ArgGlu Gly Arg
Glu Val Cys Gln 590Glu Val Cys Gln 590
Pro Lys Arg 595Pro Lys Arg 595
Arg Pro Leu 610Arg Pro Leu 610
Ile Arg ProIle Arg Pro
Phe His ProPhe His Pro
600600
Pro Gly SerPro Gly Ser
Pro Trp Ala Asn 605Pro Trp Ala Asn 605
Pro Ala SerPro Ala Ser
Leu Ala Pro 615Leu Ala Pro 615
Thr Pro ThrThr Pro Thr
620620
Gly Pro Val HisGly Pro Val His
Glu Pro Val 625Glu Pro Val 625
Gly Ser LeuGly Ser Leu
630630
Thr Pro AlaThr Pro Ala
Pro Val ProPro Val Pro
635635
Gln Pro Leu AspGln Pro Leu Asp
640640
Pro Ala ProPro Ala Pro
Asp Glu GluAsp Glu Glu
Thr Val Ile 675Thr Val Ile 675
Leu Ser His 690Leu Ser His 690
Leu Glu Ser 705Leu Glu Ser 705
Glu Leu AsnGlu Leu Asn
Ala Val ThrAla Val Thr
645645
Pro Glu AlaPro Glu Ala
Ser His Leu 650Ser His Leu 650
Leu Glu Asp ProLeu Glu Asp Pro
655655
His Ala MetHis Ala Met
PhePhe
Thr Ser Gln 660Thr Ser Gln 660
Pro Gln LysPro Gln Lys
Pro Pro ProPro Pro Pro
Met Thr GluMet Thr Glu
710710
Glu Ile LeuGlu Ile Leu
725725
His Ile Ser 740His Ile Ser 740
Ala Val LysAla Val Lys
665665
Ala Leu ArgAla Leu Arg
Glu Met Ala AspGlu Met Ala Asp
670670
Glu Glu AlaGlu Glu Ala
680680
Ala Ile CysAla Ile Cys
Gly Gln Met Asp 685Gly Gln Met Asp 685
Arg Gly His 695Arg Gly His 695
Asp Leu AsnAsp Leu Asn
Asp Thr PheAsp Thr Phe
Thr Gly LeuThr Gly Leu
745745
Leu Asp GluLeu Asp Glu
700700
Leu Asp SerLeu Asp Ser
715715
Leu Asn Asp 730Leu Asn Asp 730
Ser Ile Phe <210> 101 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Ser Ile Phe <210> 101 <211> 272 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 101<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 101
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile HisMet Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His
5 105 10
Leu Thr Thr ThrLeu Thr Thr Thr
Pro Leu Thr ProPro Leu Thr Pro
720720
Glu Cys Leu LeuGlu Cys Leu Leu
735735
Asp Thr Ser Leu 750Asp Thr Ser Leu 750
СинтетическийSynthetic
Gly Val Pro Ala 15Gly Val Pro Ala 15
- 183 046157- 183 046157
Ala Leu Glu Pro GlyAla Leu Glu Pro Gly
Glu Lys Pro Tyr Lys 25Glu Lys Pro Tyr Lys 25
Cys Pro Glu Cys Gly 30Cys Pro Glu Cys Gly 30
Ser Phe Ser Arg Ser 35Ser Phe Ser Arg Ser 35
Asp Asn Leu Val Arg 40Asp Asn Leu Val Arg 40
His Gln Arg Thr His 45His Gln Arg Thr His 45
Gly Glu Lys Pro Tyr 50Gly Glu Lys Pro Tyr 50
Lys Cys Pro Glu Cys 55Lys Cys Pro Glu Cys 55
Gly Lys Ser Phe Ser 60Gly Lys Ser Phe Ser 60
Arg Thr Thr Leu Thr 65Arg Thr Thr Leu Thr 65
Asn His Gln Arg Thr 70Asn His Gln Arg Thr 70
His Thr Gly Glu Lys 75His Thr Gly Glu Lys 75
Tyr Lys Cys Pro Glu 85Tyr Lys Cys Pro Glu 85
Cys Gly Lys Ser PheCys Gly Lys Ser Phe
Ser Arg Glu Asp AsnSer Arg Glu Asp Asn
His Thr His Gln ArgHis Thr His Gln Arg
100100
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
105105
Lys Pro Tyr Lys CysLys Pro Tyr Lys Cys
110110
Glu Cys Gly Lys Ser 115Glu Cys Gly Lys Ser 115
Phe Ser Thr Ser HisPhe Ser Thr Ser His
120120
Ser Leu Thr Glu HisSer Leu Thr Glu His
125125
Arg Thr His Thr Gly 130Arg Thr His Thr Gly 130
Glu Lys Pro Tyr Lys 135Glu Lys Pro Tyr Lys 135
Cys Pro Glu Cys GlyCys Pro Glu Cys Gly
140140
Ser Phe Ser Gln Ser 145Ser Phe Ser Gln Ser 145
Ser Ser Leu Val Arg 150Ser Ser Leu Val Arg 150
His Gln Arg Thr His 155His Gln Arg Thr His 155
Gly Glu Lys Pro TyrGly Glu Lys Pro Tyr
165165
Lys Cys Pro Glu CysLys Cys Pro Glu Cys
170170
Gly Lys Ser Phe SerGly Lys Ser Phe Ser
175175
Glu Asp Asn Leu HisGlu Asp Asn Leu His
180180
Thr His Gln Arg ThrThr His Gln Arg Thr
185185
His Thr Gly Lys LysHis Thr Gly Lys Lys
190190
Ser Lys Arg Pro AlaSer Lys Arg Pro Ala
195195
Ala Thr Lys Lys AlaAla Thr Lys Lys Ala
200200
Gly Gln Ala Lys Lys 205Gly Gln Ala Lys Lys 205
Lys Gly Ser Tyr ProLys Gly Ser Tyr Pro
210210
Tyr Asp Val Pro AspTyr Asp Val Pro Asp
215215
Tyr Ala Leu Glu AspTyr Ala Leu Glu Asp
220220
Leu Asp Asp Phe Asp 225Leu Asp Asp Phe Asp 225
Leu Asp Met Leu Gly 230Leu Asp Met Leu Gly 230
Ser Asp Ala Leu Asp 235Ser Asp Ala Leu Asp 235
Phe Asp Leu Asp MetPhe Asp Leu Asp Met
245245
Leu Gly Ser Asp AlaLeu Gly Ser Asp Ala
250250
Leu Asp Asp Phe AspLeu Asp Asp Phe Asp
255255
Asp Met Leu Gly SerAsp Met Leu Gly Ser
260260
Asp Ala Leu Asp AspAsp Ala Leu Asp Asp
265265
Phe Asp Leu Asp MetPhe Asp Leu Asp Met
270270
LysLys
ThrThr
HisHis
Pro 80Pro 80
LeuLeu
ProPro
GlnGln
LysLys
Thr 160Thr 160
ArgArg
ThrThr
LysLys
AlaAla
Asp 240Asp 240
LeuLeu
LeuLeu
- 184 046157 <210> 102 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 184 046157 <210> 102 <211> 272 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 102<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 102
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys 1 5Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys 1 5
Val Gly Ile His Gly Val Pro AlaVal Gly Ile His Gly Val Pro Ala
1515
Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro 20Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro 20
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 25 30Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 25 30
Ser Phe Ser Arg Ser Asp Asn LeuSer Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu
4040
Val Arg His Gln Arg Thr His Thr 45Val Arg His Gln Arg Thr His Thr 45
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro
5555
Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg 60Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg 60
Glu Asp Asn Leu His Thr His Gln 65 70Glu Asp Asn Leu His Thr His Gln 65 70
Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProArg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
8080
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 85Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 85
Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu LeuSer Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu
9595
Val Arg His Gln Arg Thr His ThrVal Arg His Gln Arg Thr His Thr
100100
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro
105 110105 110
Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser GlnGlu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln
115 120115 120
Ser Gly Asn Leu Thr Glu His GlnSer Gly Asn Leu Thr Glu His Gln
125125
Arg Thr His Thr Gly Glu Lys ProArg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
130 135130 135
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly LysTyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys
140140
Ser Phe Ser Thr Ser Gly His LeuSer Phe Ser Thr Ser Gly His Leu
145 150145 150
Val Arg His Gln Arg Thr His ThrVal Arg His Gln Arg Thr His Thr
155 160155 160
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys ProGly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro
165165
Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser GlnGlu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Gln
170 175170 175
Asn Ser Thr Leu Thr Glu His GlnAsn Ser Thr Leu Thr Glu His Gln
180180
Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr 185 190Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr 185 190
Ser Lys Arg Pro Ala Ala Thr LysSer Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys
195 200195 200
Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys LysLys Ala Gly Gln Ala Lys Lys Lys
205205
- 185 046157- 185 046157
Lys Gly Ser Tyr Pro TyrLys Gly Ser Tyr Pro Tyr
210210
Asp Val Pro Asp Tyr AlaAsp Val Pro Asp Tyr Ala
215 220215 220
Leu Glu Asp AlaLeu Glu Asp Ala
Leu Asp Asp Phe Asp LeuLeu Asp Asp Phe Asp Leu
225 230225 230
Asp Met Leu Gly Ser AspAsp Met Leu Gly Ser Asp
235235
Ala Leu Asp AspAla Leu Asp Asp
240240
Phe Asp Leu Asp Met LeuPhe Asp Leu Asp Met Leu
245245
Gly Ser Asp Ala Leu AspGly Ser Asp Ala Leu Asp
250250
Asp Phe Asp LeuAsp Phe Asp Leu
255255
Asp Met Leu Gly Ser AspAsp Met Leu Gly Ser Asp
260260
Ala Leu Asp Asp Phe AspAla Leu Asp Asp Phe Asp
265265
Leu Asp Met Leu 270 <210>Leu Asp Met Leu 270 <210>
<211><211>
<212><212>
103103
580 Белок <213> Искусственная последовательность <220>580 Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 103<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 103
СинтетическийSynthetic
Met Ala Ala 1Met Ala Ala 1
Arg Pro ProArg Pro Pro
Leu Pro ProLeu Pro Pro
Gly Ala Pro 50Gly Ala Pro 50
Tyr Gly Ala 65Tyr Gly Ala 65
Pro Pro ProPro Pro Pro
Tyr Pro GlyTyr Pro Gly
Gly Pro GlnGly Pro Gln
115115
Ala Leu GlyAla Leu Gly
130130
Ser Leu GluSer Leu Glu
Asp His Leu 5Asp His Leu 5
Ser Ala Ala 20Ser Ala Ala 20
Tyr Ala GlyTyr Ala Gly
Leu Gly ProLeu Gly Pro
Phe Gly Pro 70Phe Gly Pro 70
Ala Ala Gly 85Ala Ala Gly 85
Arg Ala Ala 100Arg Ala Ala 100
Pro Ala ProPro Ala Pro
Gly Met AspGly Met Asp
Leu Glu LeuLeu Glu Leu
Met Leu AlaMet Leu Ala
Ala Ala HisAla Ala His
Pro Gly Leu 40Pro Gly Leu 40
Pro Pro Pro 55Pro Pro Pro 55
Pro Ser SerPro Ser Ser
Ile Ala HisIle Ala His
Ala Pro ProAla Pro Pro
105105
Ser Ala AlaSer Ala Ala
120120
Ala Glu Leu 135Ala Glu Leu 135
Gly Leu HisGly Leu His
Glu Gly Tyr 10Glu Gly Tyr 10
Gly Pro HisGly Pro His
Asp Ser GlyAsp Ser Gly
Arg Gln Pro 60Arg Gln Pro 60
Phe Gln Pro 75Phe Gln Pro 75
Leu Gln Pro 90Leu Gln Pro 90
Asn Ala ProAsn Ala Pro
Ala Pro ProAla Pro Pro
Ile Asp GluIle Asp Glu
140140
Arg Val ArgArg Val Arg
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Ala Leu Arg Thr 30Ala Leu Arg Thr 30
Leu Arg Pro Arg 45Leu Arg Pro Arg 45
Gly Ala Leu AlaGly Ala Leu Ala
Phe Pro Ala ValPhe Pro Ala Val
Val Ala Thr ProVal Ala Thr Pro
Gly Gly Pro Pro 110Gly Gly Pro Pro 110
Pro Pro Ala His 125Pro Pro Ala His 125
Glu Ala Leu ThrGlu Ala Leu Thr
Glu Leu Pro GluGlu Leu Pro Glu
- 186 046157- 186 046157
145145
150150
155155
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlySer Val Ser Cys Gly
185185
Gly Ser Gly Gly GlyGly Ser Gly Gly Gly
190190
Gly Gln Ser Gln LeuGly Gln Ser Gln Leu
195195
Ile Lys Pro Ser Arg 200Ile Lys Pro Ser Arg 200
Met Arg Lys Tyr Pro 205Met Arg Lys Tyr Pro 205
Arg Pro Ser Lys Thr 210Arg Pro Ser Lys Thr 210
Pro Pro His Glu Arg 215Pro Pro His Glu Arg 215
Pro Tyr Ala Cys Pro 220Pro Tyr Ala Cys Pro 220
Glu Ser Cys Asp Arg 225Glu Ser Cys Asp Arg 225
Arg Phe Ser Arg Ser 230Arg Phe Ser Arg Ser 230
Asp Asn Leu Val Arg 235Asp Asn Leu Val Arg 235
Ile Arg Ile His ThrIle Arg Ile His Thr
245245
Gly Gln Lys Pro PheGly Gln Lys Pro Phe
250250
Gln Cys Arg Ile CysGln Cys Arg Ile Cys
255255
Arg Asn Phe Ser HisArg Asn Phe Ser His
260260
Arg Thr Thr Leu ThrArg Thr Thr Leu Thr
265265
Asn His Ile Arg ThrAsn His Ile Arg Thr
270270
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
275275
Phe Ala Cys Asp Ile 280Phe Ala Cys Asp Ile 280
Cys Gly Arg Lys PheCys Gly Arg Lys Phe
285285
Arg Glu Asp Asn LeuArg Glu Asp Asn Leu
290290
His Thr His Thr LysHis Thr His Thr Lys
295295
Ile His Leu Arg GlnIle His Leu Arg Gln
300300
Asp Arg Pro Tyr Ala 305Asp Arg Pro Tyr Ala 305
Cys Pro Val Glu Ser 310Cys Pro Val Glu Ser 310
Cys Asp Arg Arg Phe 315Cys Asp Arg Arg Phe 315
Thr Ser His Ser LeuThr Ser His Ser Leu
325325
Thr Glu His Ile ArgThr Glu His Ile Arg
330330
Ile His Thr Gly GlnIle His Thr Gly Gln
335335
Pro Phe Gln Cys ArgPro Phe Gln Cys Arg
340340
Ile Cys Met Arg AsnIle Cys Met Arg Asn
345345
Phe Ser Gln Ser SerPhe Ser Gln Ser Ser
350350
Leu Val Arg His Ile 355Leu Val Arg His Ile 355
Arg Thr His Thr Gly 360Arg Thr His Thr Gly 360
Glu Lys Pro Phe Ala 365Glu Lys Pro Phe Ala 365
Asp Ile Cys Gly ArgAsp Ile Cys Gly Arg
370370
Lys Phe Ala Arg GluLys Phe Ala Arg Glu
375375
Asp Asn Leu His Thr 380Asp Asn Leu His Thr 380
Thr Lys Ile His Leu 385Thr Lys Ile His Leu 385
Arg Gln Lys Asp Lys 390Arg Gln Lys Asp Lys 390
Leu Glu Met Ala Asp 395Leu Glu Met Ala Asp 395
160160
SerSer
SerSer
AsnAsn
ValVal
His 240His 240
MetMet
HisHis
AlaAla
LysLys
Ser 320Ser 320
LysLys
SerSer
CysCys
HisHis
His 400His 400
- 187 046157- 187 046157
Leu Met LeuLeu Met Leu
Ala Glu GlyAla Glu Gly
405405
Tyr Arg LeuTyr Arg Leu
Val Gln Arg 410Val Gln Arg 410
Pro Pro Ser AlaPro Pro Ser Ala
415415
Ala Ala AlaAla Ala Ala
His Gly Pro 420His Gly Pro 420
His Ala LeuHis Ala Leu
425425
Arg Thr LeuArg Thr Leu
Pro Pro Tyr AlaPro Pro Tyr Ala
430430
Gly Pro GlyGly Pro Gly
435435
Leu Asp SerLeu Asp Ser
Gly Leu ArgGly Leu Arg
440440
Pro Arg GlyPro Arg Gly
Ala Pro Leu Gly 445Ala Pro Leu Gly 445
Pro Pro ProPro Pro Pro
450450
Pro Arg GlnPro Arg Gln
Pro Gly Ala 455Pro Gly Ala 455
Leu Ala TyrLeu Ala Tyr
460460
Gly Ala Phe GlyGly Ala Phe Gly
Pro Pro Ser 465Pro Pro Ser 465
Ser Phe GlnSer Phe Gln
470470
Pro Phe ProPro Phe Pro
Ala Val ProAla Val Pro
475475
Pro Pro Ala AlaPro Pro Ala Ala
480480
Gly Ile AlaGly Ile Ala
His Leu GlnHis Leu Gln
485485
Pro Val AlaPro Val Ala
Thr Pro Tyr 490Thr Pro Tyr 490
Pro Gly Arg AlaPro Gly Arg Ala
495495
Ala Ala ProAla Ala Pro
Pro Asn Ala 500Pro Asn Ala 500
Pro Gly GlyPro Gly Gly
505505
Pro Pro GlyPro Pro Gly
Pro Gln Pro AlaPro Gln Pro Ala
510510
Pro Ser AlaPro Ser Ala
515515
Ala Ala ProAla Ala Pro
Pro Pro ProPro Pro Pro
520520
Ala His AlaAla His Ala
Leu Gly Gly Met 525Leu Gly Gly Met 525
Asp Ala GluAsp Ala Glu
530530
Leu Ile AspLeu Ile Asp
Glu Glu Ala 535Glu Glu Ala 535
Leu Thr SerLeu Thr Ser
540540
Leu Glu Leu GluLeu Glu Leu Glu
Leu Gly Leu 545Leu Gly Leu 545
His Arg ValHis Arg Val
550550
Arg Glu LeuArg Glu Leu
Pro Glu LeuPro Glu Leu
555555
Phe Leu Gly GlnPhe Leu Gly Gln
560560
Ser Glu PheSer Glu Phe
Asp Cys PheAsp Cys Phe
565565
Ser Asp LeuSer Asp Leu
Gly Ser Ala 570Gly Ser Ala 570
Pro Pro Ala GlyPro Pro Ala Gly
575575
Ser Val Ser CysSer Val Ser Cys
580 <210> 104 <211> 394 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>580 <210> 104 <211> 394 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
Синтетический <400> 104Synthetic <400> 104
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr 1 5 10Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr 1 5 10
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro HisArg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His
Ala Leu Arg ThrAla Leu Arg Thr
- 188 046157- 188 046157
Leu Pro Pro Tyr Ala 35Leu Pro Pro Tyr Ala 35
Gly Pro Gly Leu Asp 40Gly Pro Gly Leu Asp 40
Ser Gly Leu Arg Pro 45Ser Gly Leu Arg Pro 45
Gly Ala Pro Leu Gly 50Gly Ala Pro Leu Gly 50
Pro Pro Pro Pro Arg 55Pro Pro Pro Pro Arg 55
Gln Pro Gly Ala Leu 60Gln Pro Gly Ala Leu 60
Tyr Gly Ala Phe Gly 65Tyr Gly Ala Phe Gly 65
Pro Pro Ser Ser Phe 70Pro Pro Ser Ser Phe 70
Gln Pro Phe Pro Ala 75Gln Pro Phe Pro Ala 75
Pro Pro Pro Ala AlaPro Pro Pro Ala Ala
Gly Ile Ala His LeuGly Ile Ala His Leu
Gln Pro Val Ala ThrGln Pro Val Ala Thr
Tyr Pro Gly Arg AlaTyr Pro Gly Arg Ala
100100
Ala Ala Pro Pro AsnAla Ala Pro Pro Asn
105105
Ala Pro Gly Gly ProAla Pro Gly Gly Pro
110110
Gly Pro Gln Pro AlaGly Pro Gln Pro Ala
115115
Pro Ser Ala Ala AlaPro Ser Ala Ala Ala
120120
Pro Pro Pro Pro AlaPro Pro Pro Pro Ala
125125
Ala Leu Gly Gly MetAla Leu Gly Gly Met
130130
Asp Ala Glu Leu Ile 135Asp Ala Glu Leu Ile 135
Asp Glu Glu Ala Leu 140Asp Glu Glu Ala Leu 140
Ser Leu Glu Leu Glu 145Ser Leu Glu Leu Glu 145
Leu Gly Leu His Arg 150Leu Gly Leu His Arg 150
Val Arg Glu Leu Pro 155Val Arg Glu Leu Pro 155
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlySer Val Ser Cys Gly
185185
Gly Ser Gly Gly GlyGly Ser Gly Gly Gly
190190
Gly Gln Ser Gln Leu 195Gly Gln Ser Gln Leu 195
Ile Lys Pro Ser Arg 200Ile Lys Pro Ser Arg 200
Met Arg Lys Tyr Pro 205Met Arg Lys Tyr Pro 205
Arg Pro Ser Lys Thr 210Arg Pro Ser Lys Thr 210
Pro Pro His Glu Arg 215Pro Pro His Glu Arg 215
Pro Tyr Ala Cys Pro 220Pro Tyr Ala Cys Pro 220
Glu Ser Cys Asp Arg 225Glu Ser Cys Asp Arg 225
Arg Phe Ser Arg Ser 230Arg Phe Ser Arg Ser 230
Asp Asn Leu Val Arg 235Asp Asn Leu Val Arg 235
Ile Arg Ile His ThrIle Arg Ile His Thr
245245
Gly Gln Lys Pro PheGly Gln Lys Pro Phe
250250
Gln Cys Arg Ile CysGln Cys Arg Ile Cys
255255
Arg Asn Phe Ser HisArg Asn Phe Ser His
260260
Arg Thr Thr Leu ThrArg Thr Thr Leu Thr
265265
Asn His Ile Arg ThrAsn His Ile Arg Thr
270270
ArgArg
AlaAla
Val 80Val 80
ProPro
ProPro
HisHis
ThrThr
Glu 160Glu 160
SerSer
SerSer
AsnAsn
ValVal
His 240His 240
MetMet
HisHis
- 189 046157- 189 046157
Thr Gly GluThr Gly Glu
275275
Lys Pro PheLys Pro Phe
Ala Cys AspAla Cys Asp
280280
Arg Glu AspArg Glu Asp
290290
Asn Leu HisAsn Leu His
Thr His Thr 295Thr His Thr 295
Asp Arg Pro 305Asp Arg Pro 305
Thr Ser HisThr Ser His
Pro Phe GlnPro Phe Gln
Leu Val ArgLeu Val Arg
355355
Asp Ile CysAsp Ile Cys
370370
Thr Lys Ile 385Thr Lys Ile 385
Tyr Ala Cys 310Tyr Ala Cys 310
Ser Leu Thr 325Ser Leu Thr 325
Cys Arg Ile 340Cys Arg Ile 340
His Ile ArgHis Ile Arg
Gly Arg LysGly Arg Lys
His Leu Arg 390His Leu Arg 390
Pro Val GluPro Val Glu
Glu His IleGlu His Ile
Cys Met ArgCys Met Arg
345345
Thr His ThrThr His Thr
360360
Phe Ala Arg 375Phe Ala Arg 375
Gln Lys AspGln Lys Asp
Ile Cys GlyIle Cys Gly
Lys Ile His 300Lys Ile His 300
Ser Cys Asp 315Ser Cys Asp 315
Arg Ile His 330Arg Ile His 330
Asn Phe SerAsn Phe Ser
Gly Glu LysGly Glu Lys
Glu Asp AsnGlu Asp Asn
380380
LysLys
Arg Lys Phe Ala 285Arg Lys Phe Ala 285
Leu Arg Gln LysLeu Arg Gln Lys
Arg Arg Phe SerArg Arg Phe Ser
320320
Thr Gly Gln LysThr Gly Gln Lys
335335
Gln Ser Ser SerGln Ser Ser Ser
350350
Pro Phe Ala Cys 365Pro Phe Ala Cys 365
Leu His Thr His <210> 105 <211> 580 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Leu His Thr His <210> 105 <211> 580 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 105Synthetic polypeptide <400> 105
Met Ala Ala Asp 1Met Ala Ala Asp 1
His Leu Met Leu 5His Leu Met Leu 5
Ala Glu Gly Tyr 10Ala Glu Gly Tyr 10
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Arg Pro Pro SerArg Pro Pro Ser
Ala Ala Ala AlaAla Ala Ala Ala
His Gly Pro His 25His Gly Pro His 25
Ala Leu Arg Thr 30Ala Leu Arg Thr 30
Leu Pro Pro Tyr 35Leu Pro Pro Tyr 35
Ala Gly Pro Gly 40Ala Gly Pro Gly 40
Leu Asp Ser GlyLeu Asp Ser Gly
Leu Arg Pro Arg 45Leu Arg Pro Arg 45
Gly Ala Pro Leu 50Gly Ala Pro Leu 50
Gly Pro Pro Pro 55Gly Pro Pro Pro 55
Pro Arg Gln ProPro Arg Gln Pro
Gly Ala Leu AlaGly Ala Leu Ala
Tyr Gly Ala Phe 65Tyr Gly Ala Phe 65
Gly Pro Pro Ser 70Gly Pro Pro Ser 70
Ser Phe Gln ProSer Phe Gln Pro
Phe Pro Ala ValPhe Pro Ala Val
Pro Pro Pro AlaPro Pro Pro Ala
Ala Gly Ile AlaAla Gly Ile Ala
His Leu Gln ProHis Leu Gln Pro
Val Ala Thr ProVal Ala Thr Pro
- 190 046157- 190 046157
Tyr Pro Gly Arg AlaTyr Pro Gly Arg Ala
100100
Ala Ala Pro Pro AsnAla Ala Pro Pro Asn
105105
Ala Pro Gly Gly ProAla Pro Gly Gly Pro
110110
Gly Pro Gln Pro AlaGly Pro Gln Pro Ala
115115
Pro Ser Ala Ala AlaPro Ser Ala Ala Ala
120120
Pro Pro Pro Pro AlaPro Pro Pro Pro Ala
125125
Ala Leu Gly Gly MetAla Leu Gly Gly Met
130130
Asp Ala Glu Leu Ile 135Asp Ala Glu Leu Ile 135
Asp Glu Glu Ala Leu 140Asp Glu Glu Ala Leu 140
Ser Leu Glu Leu Glu 145Ser Leu Glu Leu Glu 145
Leu Gly Leu His Arg 150Leu Gly Leu His Arg 150
Val Arg Glu Leu Pro 155Val Arg Glu Leu Pro 155
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlySer Val Ser Cys Gly
185185
Gly Ser Gly Gly GlyGly Ser Gly Gly Gly
190190
Gly Gln Ser Gln Leu 195Gly Gln Ser Gln Leu 195
Ile Lys Pro Ser Arg 200Ile Lys Pro Ser Arg 200
Met Arg Lys Tyr Pro 205Met Arg Lys Tyr Pro 205
Arg Pro Ser Lys ThrArg Pro Ser Lys Thr
210210
Pro Pro His Glu Arg 215Pro Pro His Glu Arg 215
Pro Tyr Ala Cys Pro 220Pro Tyr Ala Cys Pro 220
Glu Ser Cys Asp Arg 225Glu Ser Cys Asp Arg 225
Arg Phe Ser Arg Ser 230Arg Phe Ser Arg Ser 230
Asp Asn Leu Val Arg 235Asp Asn Leu Val Arg 235
Ile Arg Ile His ThrIle Arg Ile His Thr
245245
Gly Gln Lys Pro PheGly Gln Lys Pro Phe
250250
Gln Cys Arg Ile CysGln Cys Arg Ile Cys
255255
Arg Asn Phe Ser ArgArg Asn Phe Ser Arg
260260
Glu Asp Asn Leu HisGlu Asp Asn Leu His
265265
Thr His Ile Arg ThrThr His Ile Arg Thr
270270
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
275275
Phe Ala Cys Asp Ile 280Phe Ala Cys Asp Ile 280
Cys Gly Arg Lys PheCys Gly Arg Lys Phe
285285
Arg Ser Asp Glu LeuArg Ser Asp Glu Leu
290290
Val Arg His Thr LysVal Arg His Thr Lys
295295
Ile His Leu Arg GlnIle His Leu Arg Gln
300300
Asp Arg Pro Tyr Ala 305Asp Arg Pro Tyr Ala 305
Cys Pro Val Glu Ser 310Cys Pro Val Glu Ser 310
Cys Asp Arg Arg Phe 315Cys Asp Arg Arg Phe 315
Gln Ser Gly Asn LeuGln Ser Gly Asn Leu
325325
Thr Glu His Ile ArgThr Glu His Ile Arg
330330
Ile His Thr Gly GlnIle His Thr Gly Gln
335335
ProPro
HisHis
ThrThr
Glu 160Glu 160
SerSer
SerSer
AsnAsn
ValVal
His 240His 240
MetMet
HisHis
AlaAla
LysLys
Ser 320Ser 320
LysLys
- 191 046157- 191 046157
Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met ArgPro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg
340 345340 345
Leu Val Arg His Ile Arg Thr His ThrLeu Val Arg His Ile Arg Thr His Thr
355 360355 360
Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala GlnAsp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln
370 375370 375
Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys AspThr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp
385 390385 390
Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg LeuLeu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu
405405
Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala LeuAla Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu
420 425420 425
Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu ArgGly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg
435 440435 440
Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly AlaPro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala
450 455450 455
Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe ProPro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro
465 470465 470
Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala 485Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala 485
Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly GlyAla Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly
500 505500 505
Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro ProPro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro
515 520515 520
Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu AlaAsp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala
530 535530 535
Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu LeuLeu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu
545 550545 550
Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp LeuSer Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu
565565
Phe Ser Thr Ser Gly HisPhe Ser Thr Ser Gly His
350350
Glu Lys Pro Phe Ala Cys 365Glu Lys Pro Phe Ala Cys 365
Ser Thr Leu Thr Glu HisSer Thr Leu Thr Glu His
380380
Leu Glu Met Ala Asp HisLeu Glu Met Ala Asp His
395 400395 400
Gln Arg Pro Pro Ser AlaGln Arg Pro Pro Ser Ala
415415
Thr Leu Pro Pro Tyr AlaThr Leu Pro Pro Tyr Ala
430430
Arg Gly Ala Pro Leu GlyArg Gly Ala Pro Leu Gly
445445
Ala Tyr Gly Ala Phe GlyAla Tyr Gly Ala Phe Gly
460460
Val Pro Pro Pro Ala AlaVal Pro Pro Pro Ala Ala
475 480475 480
Pro Tyr Pro Gly Arg AlaPro Tyr Pro Gly Arg Ala
495495
Pro Gly Pro Gln Pro AlaPro Gly Pro Gln Pro Ala
510510
His Ala Leu Gly Gly MetHis Ala Leu Gly Gly Met
525525
Thr Ser Leu Glu Leu GluThr Ser Leu Glu Leu Glu
540540
Glu Leu Phe Leu Gly GlnGlu Leu Phe Leu Gly Gln
555 560555 560
Ser Ala Pro Pro Ala GlySer Ala Pro Pro Ala Gly
575575
Ser Val Ser CysSer Val Ser Cys
580580
- 192 046157 <210> 106 <211> 394 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 192 046157 <210> 106 <211> 394 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 106<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 106
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu 1 5Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu 1 5
Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val GlnAla Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln
1515
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala 20Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala 20
His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 25 30His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 25 30
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro GlyLeu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly
4040
Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 45Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 45
Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro ProGly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro
5555
Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 60Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 60
Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser 65 70Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser 65 70
Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala ValSer Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val
8080
Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala 85Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala 85
His Leu Gln Pro Val Ala Thr ProHis Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro
9595
Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala ProTyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro
100100
Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro ProPro Asn Ala Pro Gly Gly Pro Pro
105 110105 110
Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser AlaGly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala
115 120115 120
Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala HisAla Ala Pro Pro Pro Pro Ala His
125125
Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala GluAla Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu
130 135130 135
Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu ThrLeu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr
140140
Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly LeuSer Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu
145 150145 150
His Arg Val Arg Glu Leu Pro GluHis Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu
155 160155 160
Leu Phe Leu Gly Gln Ser Glu PheLeu Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe
165165
Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly SerAsp Cys Phe Ser Asp Leu Gly Ser
170 175170 175
Ala Pro Pro Ala Gly Ser Val SerAla Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser
180180
Cys Gly Gly Ser Gly Gly Gly SerCys Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
185 190185 190
Gly Gln Ser Gln Leu Ile Lys ProGly Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro
195 200195 200
Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro AsnSer Arg Met Arg Lys Tyr Pro Asn
205205
- 193 046157- 193 046157
Arg ProArg Pro
210210
Ser LysSer Lys
Thr ProThr Pro
Glu Ser 225Glu Ser 225
Cys AspCys Asp
Arg ArgArg Arg
230230
Ile ArgIle Arg
Ile HisIle His
Thr Gly 245Thr Gly 245
Arg AsnArg Asn
Phe SerPhe Ser
260260
Arg GluArg Glu
Pro His 215Pro His 215
Phe SerPhe Ser
Gln LysGln Lys
Asp AsnAsp Asn
Glu ArgGlu Arg
Arg SerArg Ser
Pro PhePro Phe
250250
Leu His 265Leu His 265
Thr GlyThr Gly
Glu Lys 275Glu Lys 275
Pro PhePro Phe
Ala CysAla Cys
280280
Asp IleAsp Ile
Pro Tyr 220Pro Tyr 220
Asp Asn 235Asp Asn 235
Gln CysGln Cys
Thr HisThr His
Cys GlyCys Gly
Ala Cys Pro ValAla Cys Pro Val
Leu Val Arg HisLeu Val Arg His
240240
Arg Ile Cys MetArg Ile Cys Met
255255
Ile Arg Thr HisIle Arg Thr His
270270
Arg Lys Phe Ala 285Arg Lys Phe Ala 285
Arg SerArg Ser
290290
Asp GluAsp Glu
Leu ValLeu Val
Arg His 295Arg His 295
Thr LysThr Lys
Ile HisIle His
300300
Leu Arg Gln LysLeu Arg Gln Lys
Asp Arg 305Asp Arg 305
Pro TyrPro Tyr
Ala CysAla Cys
310310
Pro ValPro Val
Glu SerGlu Ser
Cys Asp 315Cys Asp 315
Arg Arg Phe SerArg Arg Phe Ser
320320
Gln SerGln Ser
Gly AsnGly Asn
Leu Thr 325Leu Thr 325
Glu HisGlu His
Ile ArgIle Arg
330330
Ile HisIle His
Thr Gly Gln LysThr Gly Gln Lys
335335
Pro PhePro Phe
Gln CysGln Cys
340340
Arg IleArg Ile
Cys MetCys Met
Arg Asn 345Arg Asn 345
Phe SerPhe Ser
Thr Ser Gly His 350Thr Ser Gly His 350
Leu ValLeu Val
Arg His 355Arg His 355
Ile ArgIle Arg
Thr HisThr His
360360
Thr GlyThr Gly
Glu LysGlu Lys
Pro Phe Ala Cys 365Pro Phe Ala Cys 365
Asp IleAsp Ile
370370
Cys GlyCys Gly
Arg LysArg Lys
Phe Ala 375Phe Ala 375
Gln AsnGln Asn
Ser ThrSer Thr
380380
Leu Thr Glu HisLeu Thr Glu His
Thr Lys 385Thr Lys 385
Ile HisIle His
Leu ArgLeu Arg
390390
Gln LysGln Lys
Asp Lys <210> 107 <211> 388 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Asp Lys <210> 107 <211> 388 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
Синтетический <400> 107Synthetic <400> 107
Met Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg 1 5 10Met Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg 1 5 10
Lys Tyr Pro AsnLys Tyr Pro Asn
Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg Pro TyrArg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg Pro Tyr
Ala Cys Pro ValAla Cys Pro Val
- 194 046157- 194 046157
Glu Ser Cys Asp Arg 35Glu Ser Cys Asp Arg 35
Arg Phe Ser Arg Ser 40Arg Phe Ser Arg Ser 40
Asp Asn Leu Val Arg 45Asp Asn Leu Val Arg 45
Ile Arg Ile His Thr 50Ile Arg Ile His Thr 50
Gly Gln Lys Pro Phe 55Gly Gln Lys Pro Phe 55
Gln Cys Arg Ile Cys 60Gln Cys Arg Ile Cys 60
Arg Asn Phe Ser Arg 65Arg Asn Phe Ser Arg 65
Glu Asp Asn Leu His 70Glu Asp Asn Leu His 70
Thr His Ile Arg Thr 75Thr His Ile Arg Thr 75
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
Phe Ala Cys Asp IlePhe Ala Cys Asp Ile
Cys Gly Arg Lys PheCys Gly Arg Lys Phe
Arg Ser Asp Glu LeuArg Ser Asp Glu Leu
100100
Val Arg His Thr LysVal Arg His Thr Lys
105105
Ile His Leu Arg GlnIle His Leu Arg Gln
110110
Asp Arg Pro Tyr Ala 115Asp Arg Pro Tyr Ala 115
Cys Pro Val Glu Ser 120Cys Pro Val Glu Ser 120
Cys Asp Arg Arg Phe 125Cys Asp Arg Arg Phe 125
Gln Ser Gly Asn LeuGln Ser Gly Asn Leu
130130
Thr Glu His Ile ArgThr Glu His Ile Arg
135135
Ile His Thr Gly GlnIle His Thr Gly Gln
140140
Pro Phe Gln Cys Arg 145Pro Phe Gln Cys Arg 145
Ile Cys Met Arg Asn 150Ile Cys Met Arg Asn 150
Phe Ser Thr Ser Gly 155Phe Ser Thr Ser Gly 155
Leu Val Arg His IleLeu Val Arg His Ile
165165
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
170170
Glu Lys Pro Phe AlaGlu Lys Pro Phe Ala
175175
Asp Ile Cys Gly ArgAsp Ile Cys Gly Arg
180180
Lys Phe Ala Gln AsnLys Phe Ala Gln Asn
185185
Ser Thr Leu Thr GluSer Thr Leu Thr Glu
190190
Thr Lys Ile His Leu 195Thr Lys Ile His Leu 195
Arg Gln Lys Asp LysArg Gln Lys Asp Lys
200200
Leu Glu Met Ala AspLeu Glu Met Ala Asp
205205
Leu Met Leu Ala GluLeu Met Leu Ala Glu
210210
Gly Tyr Arg Leu ValGly Tyr Arg Leu Val
215215
Gln Arg Pro Pro SerGln Arg Pro Pro Ser
220220
Ala Ala Ala His Gly 225Ala Ala Ala His Gly 225
Pro His Ala Leu Arg 230Pro His Ala Leu Arg 230
Thr Leu Pro Pro Tyr 235Thr Leu Pro Pro Tyr 235
Gly Pro Gly Leu AspGly Pro Gly Leu Asp
245245
Ser Gly Leu Arg ProSer Gly Leu Arg Pro
250250
Arg Gly Ala Pro LeuArg Gly Ala Pro Leu
255255
Pro Pro Pro Pro ArgPro Pro Pro Pro Arg
260260
Gln Pro Gly Ala LeuGln Pro Gly Ala Leu
265265
Ala Tyr Gly Ala PheAla Tyr Gly Ala Phe
270270
HisHis
MetMet
His 80His 80
AlaAla
LysLys
SerSer
LysLys
His 160His 160
CysCys
HisHis
HisHis
AlaAla
Ala 240Ala 240
GlyGly
GlyGly
- 195 046157- 195 046157
Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val ProPro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val Pro
275 280275 280
Pro Pro Ala Ala 285Pro Pro Ala Ala 285
Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro TyrGly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro Tyr
290 295 300290 295 300
Pro Gly Arg AlaPro Gly Arg Ala
Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro Pro GlyAla Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro Pro Gly
305 310 315305 310 315
Pro Gln Pro AlaPro Gln Pro Ala
320320
Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala His AlaPro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala His Ala
325 330325 330
Leu Gly Gly MetLeu Gly Gly Met
335335
Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr SerAsp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr Ser
340 345340 345
Leu Glu Leu GluLeu Glu Leu Glu
350350
Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu LeuLeu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu Leu
355 360355 360
Phe Leu Gly Gln 365Phe Leu Gly Gln 365
Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly Ser AlaSer Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly Ser Ala
370 375 380370 375 380
Pro Pro Ala GlyPro Pro Ala Gly
Ser Val Ser Cys 385 <210> 108 <211> 479 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Ser Val Ser Cys 385 <210> 108 <211> 479 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 108Synthetic polypeptide <400> 108
Met Gln Ser Gln 1Met Gln Ser Gln 1
Leu Ile Lys Pro 5Leu Ile Lys Pro 5
Ser Arg Met Arg 10Ser Arg Met Arg 10
Lys Tyr Pro Asn 15Lys Tyr Pro Asn 15
Arg Pro Ser LysArg Pro Ser Lys
Thr Pro Pro HisThr Pro Pro His
Glu Arg Pro Tyr 25Glu Arg Pro Tyr 25
Ala Cys Pro Val 30Ala Cys Pro Val 30
Glu Ser Cys Asp 35Glu Ser Cys Asp 35
Arg Arg Phe Ser 40Arg Arg Phe Ser 40
Arg Ser Asp AsnArg Ser Asp Asn
Leu Val Arg His 45Leu Val Arg His 45
Ile Arg Ile His 50Ile Arg Ile His 50
Thr Gly Gln Lys 55Thr Gly Gln Lys 55
Pro Phe Gln Cys 60Pro Phe Gln Cys 60
Arg Ile Cys MetArg Ile Cys Met
Arg Asn Phe Ser 65Arg Asn Phe Ser 65
Arg Glu Asp Asn 70Arg Glu Asp Asn 70
Leu His Thr HisLeu His Thr His
Ile Arg Thr HisIle Arg Thr His
Thr Gly Glu LysThr Gly Glu Lys
Pro Phe Ala CysPro Phe Ala Cys
Asp Ile Cys GlyAsp Ile Cys Gly
Arg Lys Phe AlaArg Lys Phe Ala
- 196 046157- 196 046157
90 9590 95
ArgArg
AspAsp
GlnGln
Pro 145Pro 145
LeuLeu
AspAsp
ThrThr
GluGlu
Gly 225Gly 225
GlnGln
PhePhe
AsnAsn
GlyGly
Ser 305Ser 305
AlaAla
Ser Asp Glu Leu ValSer Asp Glu Leu Val
100100
Arg His Thr Lys Ile 105Arg His Thr Lys Ile 105
His Leu Arg Gln Lys 110His Leu Arg Gln Lys 110
Arg Pro Tyr Ala Cys 115Arg Pro Tyr Ala Cys 115
Pro Val Glu Ser CysPro Val Glu Ser Cys
120120
Asp Arg Arg Phe Ser 125Asp Arg Arg Phe Ser 125
Ser Gly Asn Leu Thr 130Ser Gly Asn Leu Thr 130
Glu His Ile Arg Ile 135Glu His Ile Arg Ile 135
His Thr Gly Gln Lys 140His Thr Gly Gln Lys 140
Phe Gln Cys Arg IlePhe Gln Cys Arg Ile
150150
Cys Met Arg Asn PheCys Met Arg Asn Phe
155155
Ser Thr Ser Gly HisSer Thr Ser Gly His
160160
Val Arg His Ile ArgVal Arg His Ile Arg
165165
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
170170
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
175175
Ile Cys Gly Arg LysIle Cys Gly Arg Lys
180180
Phe Ala Gln Asn SerPhe Ala Gln Asn Ser
185185
Thr Leu Thr Glu HisThr Leu Thr Glu His
190190
Lys Ile His Leu ArgLys Ile His Leu Arg
195195
Gln Lys Asp Lys LeuGln Lys Asp Lys Leu
200200
Glu Met Ser Gly Leu 205Glu Met Ser Gly Leu 205
Met Ala Asp His Met 210Met Ala Asp His Met 210
Met Ala Met Asn His 215Met Ala Met Asn His 215
Gly Arg Phe Pro Asp 220Gly Arg Phe Pro Asp 220
Thr Asn Gly Leu HisThr Asn Gly Leu His
230230
His His Pro Ala HisHis His Pro Ala His
235235
Arg Met Gly Met GlyArg Met Gly Met Gly
240240
Phe Pro Ser Pro HisPhe Pro Ser Pro His
245245
His His Gln Gln GlnHis His Gln Gln Gln
250250
Gln Pro Gln His AlaGln Pro Gln His Ala
255255
Asn Ala Leu Met Gly 260Asn Ala Leu Met Gly 260
Ala Thr Ser Gly Ile 275Ala Thr Ser Gly Ile 275
Gly His Pro Pro Ser 290Gly His Pro Pro Ser 290
Gln Phe Met Gly ProGln Phe Met Gly Pro
310310
Ser Met Gln Leu GlnSer Met Gln Leu Gln
325325
Glu His Ile His Tyr 265Glu His Ile His Tyr 265
Gly Ala Gly Asn Met 270Gly Ala Gly Asn Met 270
Arg His Ala Met Gly 280Arg His Ala Met Gly 280
Ala Leu Ala Pro Ala 295Ala Leu Ala Pro Ala 295
Pro Val Ala Ser GlnPro Val Ala Ser Gln
315315
Lys Leu Asn Asn GlnLys Leu Asn Asn Gln
330330
Pro Gly Thr Val AsnPro Gly Thr Val Asn
285285
Ala Arg Phe Asn Asn 300Ala Arg Phe Asn Asn 300
Gly Gly Ser Leu ProGly Gly Ser Leu Pro
320320
Tyr Phe Asn His HisTyr Phe Asn His His
335335
- 197 046157- 197 046157
Pro Tyr Pro His Asn His Tyr Met Pro Asp Leu HisPro Tyr Pro His Asn His Tyr Met Pro Asp Leu His
340 345340 345
Pro Ala Ala GlyPro Ala Ala Gly
350350
His Gln Met Asn Gly Thr Asn Gln His Phe Arg AspHis Gln Met Asn Gly Thr Asn Gln His Phe Arg Asp
355 360355 360
Cys Asn Pro Lys 365Cys Asn Pro Lys 365
His Ser Gly Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser GlyHis Ser Gly Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser Gly
370 375 380370 375 380
Gly Ser Ser ThrGly Ser Ser Thr
Pro Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly Gly AlaPro Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly Gly Ala
385 390 395385 390 395
Gly Ser Ser AsnGly Ser Ser Asn
400400
Ser Gly Gly GlySer Gly Gly Gly
Ser Gly Ser Gly Asn Met Pro AlaSer Gly Ser Gly Asn Met Pro Ala
405 410405 410
Ser Val Ala HisSer Val Ala His
415415
Val Pro Ala Ala Met Leu Pro Pro Asn Val Ile AspVal Pro Ala Ala Met Leu Pro Pro Asn Val Ile Asp
420 425420 425
Thr Asp Phe Ile 430Thr Asp Phe Ile 430
Asp Glu Glu Val Leu Met Ser Leu Val Ile Glu MetAsp Glu Glu Val Leu Met Ser Leu Val Ile Glu Met
435 440435 440
Gly Leu Asp Arg 445Gly Leu Asp Arg 445
Ile Lys Glu Leu Pro Glu Leu Trp Leu Gly Gln AsnIle Lys Glu Leu Pro Glu Leu Trp Leu Gly Gln Asn
450 455 460450 455 460
Glu Phe Asp PheGlu Phe Asp Phe
Met Thr Asp Phe Val Cys Lys Gln Gln Pro Ser ArgMet Thr Asp Phe Val Cys Lys Gln Gln Pro Ser Arg
465 470 475465 470 475
Val Ser Cys <210> 109 <211> 476 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Val Ser Cys <210> 109 <211> 476 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 109Synthetic polypeptide <400> 109
Met Ser Gly Leu 1Met Ser Gly Leu 1
Glu Met Ala Asp 5Glu Met Ala Asp 5
His Met Met AlaHis Met Met Ala
Met Asn His Gly 15Met Asn His Gly 15
Arg Phe Pro AspArg Phe Pro Asp
Gly Thr Asn GlyGly Thr Asn Gly
Leu His His His 25Leu His His His 25
Pro Ala His Arg 30Pro Ala His Arg 30
Met Gly Met Gly 35Met Gly Met Gly 35
Gln Phe Pro SerGln Phe Pro Ser
Pro His His HisPro His His His
Gln Gln Gln Gln 45Gln Gln Gln Gln 45
Pro Gln His Ala 50Pro Gln His Ala 50
Phe Asn Ala LeuPhe Asn Ala Leu
Met Gly Glu HisMet Gly Glu His
Ile His Tyr GlyIle His Tyr Gly
Ala Gly Asn MetAla Gly Asn Met
Asn Ala Thr SerAsn Ala Thr Ser
Gly Val Arg HisGly Val Arg His
Ala Met Gly ProAla Met Gly Pro
- 198 046157- 198 046157
GlyGly
ArgArg
GlyGly
PhePhe
Pro 145Pro 145
CysCys
GlyGly
GlyGly
SerSer
Thr 225Thr 225
GlyGly
GluGlu
ValVal
ProPro
Pro 305Pro 305
75 8075 80
Thr Val Asn Gly GlyThr Val Asn Gly Gly
Phe Asn Asn Ser GlnPhe Asn Asn Ser Gln
100100
Ser Leu Pro Ala SerSer Leu Pro Ala Ser
115115
Asn His His Pro Tyr 130Asn His His Pro Tyr 130
Ala Ala Gly His GlnAla Ala Gly His Gln
150150
Asn Pro Lys His SerAsn Pro Lys His Ser
165165
Ser Ser Thr Pro Gly 180Ser Ser Thr Pro Gly 180
Ser Ser Asn Ser GlySer Ser Asn Ser Gly
195195
Val Ala His Val Pro 210Val Ala His Val Pro 210
Asp Phe Ile Asp GluAsp Phe Ile Asp Glu
230230
Leu Asp Arg Ile LysLeu Asp Arg Ile Lys
245245
Phe Asp Phe Met Thr 260Phe Asp Phe Met Thr 260
Ser Cys Gln Ser GlnSer Cys Gln Ser Gln
275275
Asn Arg Pro Ser Lys 290Asn Arg Pro Ser Lys 290
Val Glu Ser Cys AspVal Glu Ser Cys Asp
310310
His Pro Pro Ser AlaHis Pro Pro Ser Ala
Phe Met Gly Pro Pro 105Phe Met Gly Pro Pro 105
Met Gln Leu Gln LysMet Gln Leu Gln Lys
120120
Pro His Asn His Tyr 135Pro His Asn His Tyr 135
Met Asn Gly Thr AsnMet Asn Gly Thr Asn
155155
Gly Gly Ser Ser ThrGly Gly Ser Ser Thr
170170
Gly Ser Gly Ser Ser 185Gly Ser Gly Ser Ser 185
Gly Gly Ser Gly Ser 200Gly Gly Ser Gly Ser 200
Ala Ala Met Leu Pro 215Ala Ala Met Leu Pro 215
Glu Val Leu Met SerGlu Val Leu Met Ser
235235
Glu Leu Pro Glu LeuGlu Leu Pro Glu Leu
250250
Asp Phe Val Cys Lys 265Asp Phe Val Cys Lys 265
Leu Ile Lys Pro Ser 280Leu Ile Lys Pro Ser 280
Thr Pro Pro His Glu 295Thr Pro Pro His Glu 295
Arg Arg Phe Ser ArgArg Arg Phe Ser Arg
315315
Leu Ala Pro Ala AlaLeu Ala Pro Ala Ala
Val Ala Ser Gln GlyVal Ala Ser Gln Gly
110110
Leu Asn Asn Gln TyrLeu Asn Asn Gln Tyr
125125
Met Pro Asp Leu His 140Met Pro Asp Leu His 140
Gln His Phe Arg AspGln His Phe Arg Asp
160160
Pro Gly Gly Ser GlyPro Gly Gly Ser Gly
175175
Ser Gly Gly Gly AlaSer Gly Gly Gly Ala
190190
Gly Asn Met Pro Ala 205Gly Asn Met Pro Ala 205
Pro Asn Val Ile Asp 220Pro Asn Val Ile Asp 220
Leu Val Ile Glu MetLeu Val Ile Glu Met
240240
Trp Leu Gly Gln AsnTrp Leu Gly Gln Asn
255255
Gln Gln Pro Ser Arg 270Gln Gln Pro Ser Arg 270
Arg Met Arg Lys TyrArg Met Arg Lys Tyr
285285
Arg Pro Tyr Ala Cys 300Arg Pro Tyr Ala Cys 300
Ser Asp Asn Leu ValSer Asp Asn Leu Val
320320
- 199 046157- 199 046157
Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys ProArg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro
325 330325 330
PhePhe
Gln Cys Arg IleGln Cys Arg Ile
335335
Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu HisCys Met Arg Asn Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His
340 345340 345
Thr His Ile ArgThr His Ile Arg
350350
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp IleThr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile
355 360355 360
Cys Gly Arg Lys 365Cys Gly Arg Lys 365
Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg HisPhe Ala Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His
370 375370 375
Thr LysThr Lys
380380
Ile His Leu ArgIle His Leu Arg
Gln Lys Asp 385Gln Lys Asp 385
Arg Pro TyrArg Pro Tyr
390390
Phe Ser GlnPhe Ser Gln
Ser Gly AsnSer Gly Asn
405405
Gln Lys ProGln Lys Pro
Phe Gln Cys 420Phe Gln Cys 420
Gly His LeuGly His Leu
435435
Val Arg HisVal Arg His
Ala Cys AspAla Cys Asp
450450
Ile Cys GlyIle Cys Gly
Glu His Thr 465Glu His Thr 465
Lys Ile HisLys Ile His
470470
Ala Cys ProAla Cys Pro
Leu Thr GluLeu Thr Glu
Arg Ile Cys 425Arg Ile Cys 425
Ile Arg Thr 440Ile Arg Thr 440
Arg Lys Phe 455Arg Lys Phe 455
Leu Arg GlnLeu Arg Gln
Val Glu SerVal Glu Ser
395395
His Ile Arg 410His Ile Arg 410
Met Arg AsnMet Arg Asn
His Thr GlyHis Thr Gly
Ala Gln AsnAla Gln Asn
460460
Lys Asp LysLys Asp Lys
475 <210> 110 <211> 554 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>475 <210> 110 <211> 554 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 110<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 110
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly TyrMet Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr
5 105 10
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His 20 25Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His 20 25
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly 35 40Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly 35 40
Cys Asp Arg ArgCys Asp Arg Arg
400400
Ile His Thr Gly 415Ile His Thr Gly 415
Phe Ser Thr SerPhe Ser Thr Ser
430430
Glu Lys Pro Phe 445Glu Lys Pro Phe 445
Ser Thr Leu ThrSer Thr Leu Thr
СинтетическийSynthetic
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Ala Leu Arg Thr 30Ala Leu Arg Thr 30
Leu Arg Pro Arg 45Leu Arg Pro Arg 45
Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln ProGly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro
Gly Ala Leu AlaGly Ala Leu Ala
- 200 046157- 200 046157
55 6055 60
Tyr 65Tyr 65
ProPro
TyrTyr
GlyGly
AlaAla
Ser 145Ser 145
LeuLeu
AlaAla
GlyGly
ArgArg
Pro 225Pro 225
LeuLeu
GluGlu
AlaAla
CysCys
Gly Ala Phe Gly Pro Pro 70Gly Ala Phe Gly Pro Pro 70
Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala ValSer Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val
8080
Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His 85Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His 85
Leu Gln Pro Val Ala Thr ProLeu Gln Pro Val Ala Thr Pro
9595
Pro Gly Arg Ala AlaPro Gly Arg Ala Ala
100100
Pro Gln Pro Ala ProPro Gln Pro Ala Pro
115115
Leu Gly Gly Met Asp 130Leu Gly Gly Met Asp 130
Leu Glu Leu Glu LeuLeu Glu Leu Glu Leu
150150
Phe Leu Gly Gln SerPhe Leu Gly Gln Ser
165165
Pro Pro Ala Gly SerPro Pro Ala Gly Ser
180180
Arg Pro His Ala Cys 195Arg Pro His Ala Cys 195
Ser Asp Asn Leu Val 210Ser Asp Asn Leu Val 210
Phe Gln Cys Arg IlePhe Gln Cys Arg Ile
230230
His Thr His Ile ArgHis Thr His Ile Arg
245245
Phe Cys Gly Arg Lys 260Phe Cys Gly Arg Lys 260
Lys Ile His Leu Lys 275Lys Ile His Leu Lys 275
Asp Arg Arg Phe Ser 290Asp Arg Arg Phe Ser 290
Ala Pro Pro Asn AlaAla Pro Pro Asn Ala
105105
Pro Gly Gly Pro ProPro Gly Gly Pro Pro
110110
Ser Ala Ala Ala ProSer Ala Ala Ala Pro
120120
Pro Pro Pro Ala HisPro Pro Pro Ala His
125125
Ala Glu Leu Ile Asp 135Ala Glu Leu Ile Asp 135
Glu Glu Ala Leu Thr 140Glu Glu Ala Leu Thr 140
Gly Leu His Arg ValGly Leu His Arg Val
155155
Glu Phe Asp Cys PheGlu Phe Asp Cys Phe
170170
Val Ser Cys Gly GlyVal Ser Cys Gly Gly
185185
Pro Ala Glu Gly Cys 200Pro Ala Glu Gly Cys 200
Arg His Leu Arg Ile 215Arg His Leu Arg Ile 215
Cys Met Arg Ser PheCys Met Arg Ser Phe
235235
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
250250
Phe Ala Arg Ser AspPhe Ala Arg Ser Asp
265265
Gln Lys Glu His AlaGln Lys Glu His Ala
280280
Gln Ser Gly Asn Leu 295Gln Ser Gly Asn Leu 295
Arg Glu Leu Pro GluArg Glu Leu Pro Glu
160160
Ser Asp Leu Gly SerSer Asp Leu Gly Ser
175175
Ser Gly Gly Gly SerSer Gly Gly Gly Ser
190190
Asp Arg Arg Phe Ser 205Asp Arg Arg Phe Ser 205
His Thr Gly His Lys 220His Thr Gly His Lys 220
Ser Arg Glu Asp AsnSer Arg Glu Asp Asn
240240
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
255255
Glu Leu Val Arg His 270Glu Leu Val Arg His 270
Cys Pro Ala Glu GlyCys Pro Ala Glu Gly
285285
Thr Glu His Leu Arg 300Thr Glu His Leu Arg 300
- 201 046157- 201 046157
Ile His Thr Gly His 305Ile His Thr Gly His 305
Lys Pro Phe Gln Cys 310Lys Pro Phe Gln Cys 310
Arg Ile Cys Met Arg 315Arg Ile Cys Met Arg 315
Phe Ser Thr Ser GlyPhe Ser Thr Ser Gly
325325
His Leu Val Arg HisHis Leu Val Arg His
330330
Ile Arg Thr His ThrIle Arg Thr His Thr
335335
Glu Lys Pro Phe AlaGlu Lys Pro Phe Ala
340340
Cys Glu Phe Cys GlyCys Glu Phe Cys Gly
345345
Arg Lys Phe Ala GlnArg Lys Phe Ala Gln
350350
Ser Thr Leu Thr GluSer Thr Leu Thr Glu
355355
His Ala Lys Ile His 360His Ala Lys Ile His 360
Leu Lys Gln Lys Glu 365Leu Lys Gln Lys Glu 365
Leu Glu Met Ala AspLeu Glu Met Ala Asp
370370
His Leu Met Leu AlaHis Leu Met Leu Ala
375375
Glu Gly Tyr Arg Leu 380Glu Gly Tyr Arg Leu 380
Gln Arg Pro Pro Ser 385Gln Arg Pro Pro Ser 385
Ala Ala Ala Ala His 390Ala Ala Ala Ala His 390
Gly Pro His Ala Leu 395Gly Pro His Ala Leu 395
Thr Leu Pro Pro TyrThr Leu Pro Pro Tyr
405405
Ala Gly Pro Gly LeuAla Gly Pro Gly Leu
410410
Asp Ser Gly Leu ArgAsp Ser Gly Leu Arg
415415
Arg Gly Ala Pro LeuArg Gly Ala Pro Leu
420420
Gly Pro Pro Pro ProGly Pro Pro Pro Pro
425425
Arg Gln Pro Gly AlaArg Gln Pro Gly Ala
430430
Ala Tyr Gly Ala Phe 435Ala Tyr Gly Ala Phe 435
Gly Pro Pro Ser Ser 440Gly Pro Pro Ser Ser 440
Phe Gln Pro Phe ProPhe Gln Pro Phe Pro
445445
Val Pro Pro Pro AlaVal Pro Pro Pro Ala
450450
Ala Gly Ile Ala His 455Ala Gly Ile Ala His 455
Leu Gln Pro Val AlaLeu Gln Pro Val Ala
460460
Pro Tyr Pro Gly Arg 465Pro Tyr Pro Gly Arg 465
Ala Ala Ala Pro Pro 470Ala Ala Ala Pro Pro 470
Asn Ala Pro Gly Gly 475Asn Ala Pro Gly Gly 475
Pro Gly Pro Gln ProPro Gly Pro Gln Pro
485485
Ala Pro Ser Ala AlaAla Pro Ser Ala Ala
490490
Ala Pro Pro Pro ProAla Pro Pro Pro Pro
495495
His Ala Leu Gly GlyHis Ala Leu Gly Gly
500500
Met Asp Ala Glu LeuMet Asp Ala Glu Leu
505505
Ile Asp Glu Glu AlaIle Asp Glu Glu Ala
510510
Thr Ser Leu Glu LeuThr Ser Leu Glu Leu
515515
Glu Leu Gly Leu His 520Glu Leu Gly Leu His 520
Arg Val Arg Glu Leu 525Arg Val Arg Glu Leu 525
Glu Leu Phe Leu GlyGlu Leu Phe Leu Gly
530530
Gln Ser Glu Phe Asp 535Gln Ser Glu Phe Asp 535
Cys Phe Ser Asp LeuCys Phe Ser Asp Leu
540540
Ser 320Ser 320
GlyGly
AsnAsn
LysLys
ValVal
Arg 400Arg 400
ProPro
LeuLeu
AlaAla
ThrThr
Pro 480Pro 480
AlaAla
LeuLeu
ProPro
GlyGly
Ser Ala Pro Pro Ala 545Ser Ala Pro Pro Ala 545
Gly Ser Val Ser Cys 550Gly Ser Val Ser Cys 550
- 202 046157 <210> 111 <211> 362 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 202 046157 <210> 111 <211> 362 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 111Synthetic polypeptide <400> 111
Met Arg Pro His Ala Cys 1 5Met Arg Pro His Ala Cys 1 5
Pro Ala Glu Gly Cys Asp 10Pro Ala Glu Gly Cys Asp 10
Arg Arg Phe Ser 15Arg Arg Phe Ser 15
Arg Ser Asp Asn Leu Val 20Arg Ser Asp Asn Leu Val 20
Arg His Leu Arg Ile His 25Arg His Leu Arg Ile His 25
Thr Gly His Lys 30Thr Gly His Lys 30
Pro Phe Gln Cys Arg Ile 35Pro Phe Gln Cys Arg Ile 35
Cys Met Arg Ser Phe Ser 40Cys Met Arg Ser Phe Ser 40
Arg Glu Asp Asn 45Arg Glu Asp Asn 45
Leu His Thr His Ile Arg 50Leu His Thr His Ile Arg 50
Thr His Thr Gly Glu Lys 55 60Thr His Thr Gly Glu Lys 55 60
Pro Phe Ala CysPro Phe Ala Cys
Glu Phe Cys Gly Arg Lys 65 70Glu Phe Cys Gly Arg Lys 65 70
Phe Ala Arg Ser Asp Glu 75Phe Ala Arg Ser Asp Glu 75
Leu Val Arg HisLeu Val Arg His
Ala Lys Ile His Leu Lys 85Ala Lys Ile His Leu Lys 85
Gln Lys Glu His Ala Cys 90Gln Lys Glu His Ala Cys 90
Pro Ala Glu GlyPro Ala Glu Gly
Cys Asp Arg Arg Phe SerCys Asp Arg Arg Phe Ser
100100
Gln Ser Gly Asn Leu ThrGln Ser Gly Asn Leu Thr
105105
Glu His Leu Arg 110Glu His Leu Arg 110
Ile His Thr Gly His Lys 115Ile His Thr Gly His Lys 115
Pro Phe Gln Cys Arg IlePro Phe Gln Cys Arg Ile
120120
Cys Met Arg Ser 125Cys Met Arg Ser 125
Phe Ser Thr Ser Gly HisPhe Ser Thr Ser Gly His
130130
Leu Val Arg His Ile ArgLeu Val Arg His Ile Arg
135 140135 140
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
Glu Lys Pro Phe Ala CysGlu Lys Pro Phe Ala Cys
145 150145 150
Glu Phe Cys Gly Arg LysGlu Phe Cys Gly Arg Lys
155155
Phe Ala Gln AsnPhe Ala Gln Asn
160160
Ser Thr Leu Thr Glu HisSer Thr Leu Thr Glu His
165165
Ala Lys Ile His Leu LysAla Lys Ile His Leu Lys
170170
Gln Lys Glu Lys 175Gln Lys Glu Lys 175
Leu Glu Met Ala Asp HisLeu Glu Met Ala Asp His
180180
Leu Met Leu Ala Glu GlyLeu Met Leu Ala Glu Gly
185185
Tyr Arg Leu Val 190Tyr Arg Leu Val 190
Gln Arg Pro Pro Ser AlaGln Arg Pro Pro Ser Ala
195195
Ala Ala Ala His Gly Pro 200Ala Ala Ala His Gly Pro 200
His Ala Leu Arg 205His Ala Leu Arg 205
- 203 046157- 203 046157
Thr Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp SerThr Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser
210 215 220210 215 220
Gly Leu Arg ProGly Leu Arg Pro
Arg Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg GlnArg Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln
225 230 235225 230 235
Pro Gly Ala LeuPro Gly Ala Leu
240240
Ala Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe GlnAla Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln
245 250245 250
Pro Phe Pro AlaPro Phe Pro Ala
255255
Val Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu GlnVal Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln
260 265260 265
Pro Val Ala ThrPro Val Ala Thr
270270
Pro Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn AlaPro Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala
275 280275 280
Pro Gly Gly Pro 285Pro Gly Gly Pro 285
Pro Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala ProPro Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro
290 295 300290 295 300
Pro Pro Pro AlaPro Pro Pro Ala
His Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile AspHis Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp
305 310 315305 310 315
Glu Glu Ala LeuGlu Glu Ala Leu
320320
Thr Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg ValThr Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val
325 330325 330
Arg Glu Leu ProArg Glu Leu Pro
335335
Glu Leu Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys PheGlu Leu Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe
340 345340 345
Ser Asp Leu GlySer Asp Leu Gly
350350
Ser Ala Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser CysSer Ala Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys
355 360 <210> 112 <211> 479 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>355 360 <210> 112 <211> 479 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 112<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 112
Met Arg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys AspMet Arg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp
510510
Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Leu Arg Ile His 2025Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His Leu Arg Ile His 2025
Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser 3540Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser 3540
Leu His Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu LysLeu His Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys
СинтетическийSynthetic
Arg Arg Phe Ser 15Arg Arg Phe Ser 15
Thr Gly His Lys 30Thr Gly His Lys 30
Arg Glu Asp Asn 45Arg Glu Asp Asn 45
Pro Phe Ala CysPro Phe Ala Cys
- 204 046157- 204 046157
55 6055 60
Glu Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg 65 70 75Glu Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg 65 70 75
Ala Lys Ile His LeuAla Lys Ile His Leu
Lys Gln Lys Glu HisLys Gln Lys Glu His
Ala Cys Pro Ala GluAla Cys Pro Ala Glu
Cys Asp Arg Arg PheCys Asp Arg Arg Phe
100100
Ser Gln Ser Gly AsnSer Gln Ser Gly Asn
105105
Leu Thr Glu His LeuLeu Thr Glu His Leu
110110
Ile His Thr Gly His 115Ile His Thr Gly His 115
Lys Pro Phe Gln CysLys Pro Phe Gln Cys
120120
Arg Ile Cys Met Arg 125Arg Ile Cys Met Arg 125
Phe Ser Thr Ser GlyPhe Ser Thr Ser Gly
130130
His Leu Val Arg HisHis Leu Val Arg His
135135
Ile Arg Thr His Thr 140Ile Arg Thr His Thr 140
Glu Lys Pro Phe Ala 145Glu Lys Pro Phe Ala 145
Cys Glu Phe Cys Gly 150Cys Glu Phe Cys Gly 150
Arg Lys Phe Ala Gln 155Arg Lys Phe Ala Gln 155
Ser Thr Leu Thr GluSer Thr Leu Thr Glu
165165
His Ala Lys Ile HisHis Ala Lys Ile His
170170
Leu Lys Gln Lys GluLeu Lys Gln Lys Glu
175175
Lys Ala Glu Lys GlyLys Ala Glu Lys Gly
180180
Gly Ala Pro Ser AlaGly Ala Pro Ser Ala
185185
Ser Ser Ala Pro ProSer Ser Ala Pro Pro
190190
Ser Leu Ala Pro ValSer Leu Ala Pro Val
195195
Val Thr Thr Cys AlaVal Thr Thr Cys Ala
200200
Leu Glu Met Ser GlyLeu Glu Met Ser Gly
205205
Glu Met Ala Asp His 210Glu Met Ala Asp His 210
Met Met Ala Met AsnMet Met Ala Met Asn
215215
His Gly Arg Phe ProHis Gly Arg Phe Pro
220220
Gly Thr Asn Gly Leu 225Gly Thr Asn Gly Leu 225
His His His Pro Ala 230His His His Pro Ala 230
His Arg Met Gly Met 235His Arg Met Gly Met 235
Gln Phe Pro Ser ProGln Phe Pro Ser Pro
245245
His His His Gln GlnHis His His Gln Gln
250250
Gln Gln Pro Gln HisGln Gln Pro Gln His
255255
Phe Asn Ala Leu MetPhe Asn Ala Leu Met
260260
Gly Glu His Ile HisGly Glu His Ile His
265265
Tyr Gly Ala Gly AsnTyr Gly Ala Gly Asn
270270
Asn Ala Thr Ser GlyAsn Ala Thr Ser Gly
275275
Ile Arg His Ala Met 280Ile Arg His Ala Met 280
Gly Pro Gly Thr Val 285Gly Pro Gly Thr Val 285
Gly Gly His Pro ProGly Gly His Pro Pro
290290
Ser Ala Leu Ala ProSer Ala Leu Ala Pro
295295
Ala Ala Arg Phe AsnAla Ala Arg Phe Asn
300300
His 80His 80
GlyGly
ArgArg
SerSer
GlyGly
Asn 160Asn 160
LysLys
ValVal
LeuLeu
AspAsp
Gly 240Gly 240
AlaAla
MetMet
AsnAsn
AsnAsn
- 205 046157- 205 046157
Ser Gln Phe Met Gly Pro Pro Val Ala Ser Gln GlySer Gln Phe Met Gly Pro Pro Val Ala Ser Gln Gly
305 310 315305 310 315
Gly Ser Leu ProGly Ser Leu Pro
320320
Ala Ser Met Gln Leu Gln Lys Leu Asn Asn Gln TyrAla Ser Met Gln Leu Gln Lys Leu Asn Asn Gln Tyr
325 330325 330
Phe Asn His HisPhe Asn His His
335335
Pro Tyr Pro His Asn His Tyr Met Pro Asp Leu HisPro Tyr Pro His Asn His Tyr Met Pro Asp Leu His
340 345340 345
Pro Ala Ala GlyPro Ala Ala Gly
350350
His Gln Met Asn Gly Thr Asn Gln His Phe Arg AspHis Gln Met Asn Gly Thr Asn Gln His Phe Arg Asp
355 360355 360
Cys Asn Pro Lys 365Cys Asn Pro Lys 365
His Ser Gly Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser GlyHis Ser Gly Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser Gly
370 375 380370 375 380
Gly Ser Ser ThrGly Ser Ser Thr
Pro Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly Gly AlaPro Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly Gly Ala
385 390 395385 390 395
Gly Ser Ser AsnGly Ser Ser Asn
400400
Ser Gly Gly Gly Ser Gly Ser Gly Asn Met Pro AlaSer Gly Gly Gly Ser Gly Ser Gly Asn Met Pro Ala
405 410405 410
Ser Val Ala HisSer Val Ala His
415415
Val Pro Ala Ala Met Leu Pro Pro Asn Val Ile AspVal Pro Ala Ala Met Leu Pro Pro Asn Val Ile Asp
420 425420 425
Thr Asp Phe IleThr Asp Phe Ile
430430
Asp Glu Glu Val Leu Met Ser Leu Val Ile Glu MetAsp Glu Glu Val Leu Met Ser Leu Val Ile Glu Met
435 440435 440
Gly Leu Asp Arg 445Gly Leu Asp Arg 445
Ile Lys Glu Leu Pro Glu Leu Trp Leu Gly Gln AsnIle Lys Glu Leu Pro Glu Leu Trp Leu Gly Gln Asn
450 455 460450 455 460
Glu Phe Asp PheGlu Phe Asp Phe
Met Thr Asp Phe Val Cys Lys Gln Gln Pro Ser ArgMet Thr Asp Phe Val Cys Lys Gln Gln Pro Ser Arg
465 470 475465 470 475
Val Ser Cys <210> 113 <211> 476 <212> Белок <213>Val Ser Cys <210> 113 <211> 476 <212> Protein <213>
Искусственная последовательность <220>Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический <400>Synthetic <400>
Met 1Met 1
Arg полипептидArg polypeptide
113113
SerSer
PhePhe
GlyGly
ProPro
LeuLeu
Glu 5Glu 5
MetMet
AlaAla
AspAsp
HisHis
Met 10Met 10
MetMet
AlaAla
Met Asn His Gly 15Met Asn His Gly 15
Asp 20Asp 20
GlyGly
ThrThr
AsnAsn
GlyGly
Leu 25Leu 25
HisHis
HisHis
HisHis
Pro Ala His Arg 30Pro Ala His Arg 30
MetMet
GlyGly
MetMet
GlyGly
GlnGln
PhePhe
ProPro
SerSer
ProPro
HisHis
HisHis
HisHis
Gln Gln Gln GlnGln Gln Gln Gln
- 206 046157- 206 046157
40 4540 45
ProPro
Ala 65Ala 65
GlyGly
ArgArg
GlyGly
PhePhe
Pro 145Pro 145
CysCys
GlyGly
GlyGly
SerSer
Thr 225Thr 225
GlyGly
GluGlu
ValVal
Gln His Ala Phe Asn 50Gln His Ala Phe Asn 50
Gly Asn Met Asn AlaGly Asn Met Asn Ala
Thr Val Asn Gly GlyThr Val Asn Gly Gly
Phe Asn Asn Ser GlnPhe Asn Asn Ser Gln
100100
Ser Leu Pro Ala SerSer Leu Pro Ala Ser
115115
Asn His His Pro Tyr 130Asn His His Pro Tyr 130
Ala Ala Gly His GlnAla Ala Gly His Gln
150150
Asn Pro Lys His SerAsn Pro Lys His Ser
165165
Ser Ser Thr Pro Gly 180Ser Ser Thr Pro Gly 180
Ser Ser Asn Ser GlySer Ser Asn Ser Gly
195195
Val Ala His Val Pro 210Val Ala His Val Pro 210
Asp Phe Ile Asp GluAsp Phe Ile Asp Glu
230230
Leu Asp Arg Ile LysLeu Asp Arg Ile Lys
245245
Phe Asp Phe Met Thr 260Phe Asp Phe Met Thr 260
Ser Cys Arg Pro HisSer Cys Arg Pro His
275275
Ala Leu Met Gly Glu 55Ala Leu Met Gly Glu 55
Thr Ser Gly Val Arg 75Thr Ser Gly Val Arg 75
His Pro Pro Ser AlaHis Pro Pro Ser Ala
Phe Met Gly Pro Pro 105Phe Met Gly Pro Pro 105
Met Gln Leu Gln LysMet Gln Leu Gln Lys
120120
Pro His Asn His Tyr 135Pro His Asn His Tyr 135
Met Asn Gly Thr AsnMet Asn Gly Thr Asn
155155
Gly Gly Ser Ser ThrGly Gly Ser Ser Thr
170170
Gly Ser Gly Ser Ser 185Gly Ser Gly Ser Ser 185
Gly Gly Ser Gly SerGly Gly Ser Gly Ser
200200
Ala Ala Met Leu Pro 215Ala Ala Met Leu Pro 215
Glu Val Leu Met SerGlu Val Leu Met Ser
235235
Glu Leu Pro Glu LeuGlu Leu Pro Glu Leu
250250
Asp Phe Val Cys Lys 265Asp Phe Val Cys Lys 265
Ala Cys Pro Ala GluAla Cys Pro Ala Glu
280280
His Ile His Tyr Gly 60His Ile His Tyr Gly 60
His Ala Met Gly ProHis Ala Met Gly Pro
Leu Ala Pro Ala AlaLeu Ala Pro Ala Ala
Val Ala Ser Gln GlyVal Ala Ser Gln Gly
110110
Leu Asn Asn Gln TyrLeu Asn Asn Gln Tyr
125125
Met Pro Asp Leu His 140Met Pro Asp Leu His 140
Gln His Phe Arg AspGln His Phe Arg Asp
160160
Pro Gly Gly Ser GlyPro Gly Gly Ser Gly
175175
Ser Gly Gly Gly AlaSer Gly Gly Gly Ala
190190
Gly Asn Met Pro AlaGly Asn Met Pro Ala
205205
Pro Asn Val Ile Asp 220Pro Asn Val Ile Asp 220
Leu Val Ile Glu MetLeu Val Ile Glu Met
240240
Trp Leu Gly Gln AsnTrp Leu Gly Gln Asn
255255
Gln Gln Pro Ser Arg 270Gln Gln Pro Ser Arg 270
Gly Cys Asp Arg ArgGly Cys Asp Arg Arg
285285
- 207 046157- 207 046157
Phe Ser ArgPhe Ser Arg
290290
Ser Asp AsnSer Asp Asn
Leu Val Arg 295Leu Val Arg 295
His Leu ArgHis Leu Arg
300300
Ile His Thr GlyIle His Thr Gly
His Lys Pro 305His Lys Pro 305
Phe Gln CysPhe Gln Cys
310310
Arg Ile CysArg Ile Cys
Met Arg SerMet Arg Ser
315315
Phe Ser Arg GluPhe Ser Arg Glu
320320
Asp Asn LeuAsp Asn Leu
His Thr HisHis Thr His
325325
Ile Arg ThrIle Arg Thr
His Thr Gly 330His Thr Gly 330
Glu Lys Pro PheGlu Lys Pro Phe
335335
Ala Cys GluAla Cys Glu
Phe Cys Gly 340Phe Cys Gly 340
Arg Lys PheArg Lys Phe
345345
Ala Arg SerAla Arg Ser
Asp Glu Leu ValAsp Glu Leu Val
350350
Arg His AlaArg His Ala
355355
Lys Ile HisLys Ile His
Leu Lys GlnLeu Lys Gln
360360
Lys Glu HisLys Glu His
Ala Cys Pro Ala 365Ala Cys Pro Ala 365
Glu Gly CysGlu Gly Cys
370370
Asp Arg ArgAsp Arg Arg
Phe Ser Gln 375Phe Ser Gln 375
Ser Gly AsnSer Gly Asn
380380
Leu Thr Glu HisLeu Thr Glu His
Leu Arg Ile 385Leu Arg Ile 385
His Thr GlyHis Thr Gly
390390
His Lys ProHis Lys Pro
Phe Gln CysPhe Gln Cys
395395
Arg Ile Cys MetArg Ile Cys Met
400400
Arg Ser PheArg Ser Phe
Ser Thr SerSer Thr Ser
405405
Gly His LeuGly His Leu
Val Arg His 410Val Arg His 410
Ile Arg Thr His 415Ile Arg Thr His 415
Thr Gly GluThr Gly Glu
Lys Pro Phe 420Lys Pro Phe 420
Ala Cys GluAla Cys Glu
425425
Phe Cys GlyPhe Cys Gly
Arg Lys Phe AlaArg Lys Phe Ala
430430
Gln Asn SerGln Asn Ser
435435
Thr Leu ThrThr Leu Thr
Glu His AlaGlu His Ala
440440
Lys Ile HisLys Ile His
Leu Lys Gln Lys 445Leu Lys Gln Lys 445
Glu Lys LysGlu Lys Lys
450450
Ala Glu LysAla Glu Lys
Gly Gly Ala 455Gly Gly Ala 455
Pro Ser AlaPro Ser Ala
460460
Ser Ser Ala ProSer Ser Ala Pro
Pro Val Ser 465Pro Val Ser 465
Leu Ala ProLeu Ala Pro
470470
Val Val ThrVal Val Thr
Thr Cys AlaThr Cys Ala
475 <210> 114 <211> 559 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>475 <210> 114 <211> 559 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
Синтетический <400> 114Synthetic <400> 114
Met Thr Gly Lys Leu Ala Glu Lys Leu Pro Val Thr 1 5 10Met Thr Gly Lys Leu Ala Glu Lys Leu Pro Val Thr 1 5 10
Met Ser Ser LeuMet Ser Ser Leu
Leu Asn Gln Leu Pro Asp Asn Leu Tyr Pro Glu GluLeu Asn Gln Leu Pro Asp Asn Leu Tyr Pro Glu Glu
Ile Pro Ser AlaIle Pro Ser Ala
- 208 046157- 208 046157
Leu Asn Leu Phe SerLeu Asn Leu Phe Ser
Gly Ser Ser Asp Ser 40Gly Ser Ser Asp Ser 40
Val Val His Tyr Asn 45Val Val His Tyr Asn 45
Met Ala Thr Glu AsnMet Ala Thr Glu Asn
Val Met Asp Ile Gly 55Val Met Asp Ile Gly 55
Leu Thr Asn Glu Lys 60Leu Thr Asn Glu Lys 60
Asn Pro Glu Leu Ser 65Asn Pro Glu Leu Ser 65
Tyr Ser Gly Ser Phe 70Tyr Ser Gly Ser Phe 70
Gln Pro Ala Pro Gly 75Gln Pro Ala Pro Gly 75
Lys Thr Val Thr TyrLys Thr Val Thr Tyr
Leu Gly Lys Phe AlaLeu Gly Lys Phe Ala
Phe Asp Ser Pro SerPhe Asp Ser Pro Ser
Trp Cys Gln Asp AsnTrp Cys Gln Asp Asn
100100
Ile Ile Ser Leu MetIle Ile Ser Leu Met
105105
Ser Ala Gly Ile LeuSer Ala Gly Ile Leu
110110
Val Pro Pro Ala SerVal Pro Pro Ala Ser
115115
Gly Ala Leu Ser Thr 120Gly Ala Leu Ser Thr 120
Gln Thr Ser Thr AlaGln Thr Ser Thr Ala
125125
Met Val Gln Pro ProMet Val Gln Pro
130130
Gln Gly Asp Val GluGln Gly Asp Val Glu
135135
Ala Met Tyr Pro Ala 140Ala Met Tyr Pro Ala 140
Pro Pro Tyr Ser Asn 145Pro Pro Tyr Ser Asn 145
Cys Gly Asp Leu Tyr 150Cys Gly Asp Leu Tyr 150
Ser Glu Pro Val Ser 155Ser Glu Pro Val Ser 155
His Asp Pro Gln GlyHis Asp Pro Gln Gly
165165
Asn Pro Gly Leu AlaAsn Pro Gly Leu Ala
170170
Tyr Ser Pro Gln AspTyr Ser Pro Gln Asp
175175
Gln Ser Ala Lys ProGln Ser Ala Lys Pro
180180
Ala Leu Asp Ser AsnAla Leu Asp Ser Asn
185185
Leu Phe Pro Met IleLeu Phe Pro Met Ile
190190
Asp Tyr Asn Leu Tyr 195Asp Tyr Asn Leu Tyr 195
His His Pro Asn AspHis His Pro Asn Asp
200200
Met Gly Ser Ile Pro 205Met Gly Ser Ile Pro 205
His Lys Pro Phe GlnHis Lys Pro Phe Gln
210210
Gly Met Asp Pro Ile 215Gly Met Asp Pro Ile 215
Arg Val Asn Pro Pro 220Arg Val Asn Pro Pro 220
Ile Thr Pro Leu Glu 225Ile Thr Pro Leu Glu 225
Thr Ile Lys Ala Phe 230Thr Ile Lys Ala Phe 230
Lys Asp Lys Gln Ile 235Lys Asp Lys Gln Ile 235
Pro Gly Phe Gly SerPro Gly Phe Gly Ser
245245
Leu Pro Gln Pro ProLeu Pro Gln Pro Pro
250250
Leu Thr Leu Lys ProLeu Thr Leu Lys Pro
255255
Arg Pro Arg Lys TyrArg Pro Arg Lys Tyr
260260
Pro Asn Arg Pro SerPro Asn Arg Pro Ser
265265
Lys Thr Pro Leu HisLys Thr Pro Leu His
270270
GlnGln
ProPro
Asn 80Asn 80
AsnAsn
GlyGly
SerSer
LeuLeu
Phe 160Phe 160
TyrTyr
ProPro
GluGlu
ProPro
His 240His 240
IleIle
GluGlu
- 209 046157- 209 046157
Arg Pro His Ala Cys 275Arg Pro His Ala Cys 275
Pro Ala Glu Gly Cys 280Pro Ala Glu Gly Cys 280
Asp Arg Arg Phe Ser 285Asp Arg Arg Phe Ser 285
Arg Asp Glu Leu AsnArg Asp Glu Leu Asn
290290
Val His Leu Arg IleVal His Leu Arg Ile
295295
His Thr Gly His Lys 300His Thr Gly His Lys 300
Phe Gln Cys Arg Ile 305Phe Gln Cys Arg Ile 305
Cys Met Arg Ser Phe 310Cys Met Arg Ser Phe 310
Ser Arg Ser Asp His 315Ser Arg Ser Asp His 315
Thr Asn His Ile ArgThr Asn His Ile Arg
325325
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
330330
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
335335
Phe Cys Gly Arg LysPhe Cys Gly Arg Lys
340340
Phe Ala Arg Ser AspPhe Ala Arg Ser Asp
345345
Asp Leu Val Arg HisAsp Leu Val Arg His
350350
Lys Ile His Leu Lys 355Lys Ile His Leu Lys 355
Gln Lys Glu His Ala 360Gln Lys Glu His Ala 360
Cys Pro Ala Glu GlyCys Pro Ala Glu Gly
365365
Asp Arg Arg Phe SerAsp Arg Arg Phe Ser
370370
Arg Ser Asp Asn LeuArg Ser Asp Asn Leu
375375
Val Arg His Leu ArgVal Arg His Leu Arg
380380
His Thr Gly His Lys 385His Thr Gly His Lys 385
Pro Phe Gln Cys Arg 390Pro Phe Gln Cys Arg 390
Ile Cys Met Arg Ser 395Ile Cys Met Arg Ser 395
Ser His Arg Thr ThrSer His Arg Thr Thr
405405
Leu Thr Asn His IleLeu Thr Asn His Ile
410410
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
415415
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
420420
Glu Phe Cys Gly ArgGlu Phe Cys Gly Arg
425425
Lys Phe Ala Arg GluLys Phe Ala Arg Glu
430430
Asn Leu His Thr HisAsn Leu His Thr His
435435
Ala Lys Ile His Leu 440Ala Lys Ile His Leu 440
Lys Gln Lys Glu His 445Lys Gln Lys Glu His 445
Cys Pro Ala Glu GlyCys Pro Ala Glu Gly
450450
Cys Asp Arg Arg PheCys Asp Arg Arg Phe
455455
Ser Thr Ser His SerSer Thr Ser His Ser
460460
Thr Glu His Leu Arg 465Thr Glu His Leu Arg 465
Ile His Thr Gly His 470Ile His Thr Gly His 470
Lys Pro Phe Gln Cys 475Lys Pro Phe Gln Cys 475
Ile Cys Met Arg SerIle Cys Met Arg Ser
485485
Phe Ser Gln Ser SerPhe Ser Gln Ser Ser
490490
Ser Leu Val Arg HisSer Leu Val Arg His
495495
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
500500
Glu Lys Pro Phe AlaGlu Lys Pro Phe Ala
505505
Cys Glu Phe Cys GlyCys Glu Phe Cys Gly
510510
Lys Phe Ala Arg GluLys Phe Ala Arg Glu
515515
Asp Asn Leu His Thr 520Asp Asn Leu His Thr 520
His Ala Lys Ile His 525His Ala Lys Ile His 525
ArgArg
ProPro
Leu 320Leu 320
GluGlu
AlaAla
CysCys
IleIle
Phe 400Phe 400
GluGlu
AspAsp
AlaAla
LeuLeu
Arg 480Arg 480
IleIle
ArgArg
LeuLeu
- 210 046157- 210 046157
Lys Gln Lys Glu Lys Lys Ala GluLys Gln Lys Glu Lys Lys Ala Glu
Lys Gly Gly AlaLys Gly Gly Ala
Pro Ser Ala SerPro Ser Ala Ser
530530
535535
540540
Ser Ala Pro Pro ValSer Ala Pro Pro Val
Ser Leu Ala Pro Val Val ThrSer Leu Ala Pro Val Val Thr
Thr Cys AlaThr Cys Ala
545 550 555 <210> 115 <211> 631 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>545 550 555 <210> 115 <211> 631 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 115<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 115
Met Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met SerMet Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met Ser
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Pro Leu Gln IlePro Leu Gln Ile
Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro Thr 20 25Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro Thr 20 25
Met Asp Asn Tyr 30Met Asp Asn Tyr 30
Pro Lys Leu Glu Glu Met Met Leu Leu Ser Asn Gly 35 40Pro Lys Leu Glu Glu Met Met Leu Leu Ser Asn Gly 35 40
Ala Pro Gln Phe 45Ala Pro Gln Phe 45
Leu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly SerLeu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser
55 6055 60
Asn Ser Ser SerAsn Ser Ser Ser
Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 65 70 75Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 65 70 75
Ser Asn Ser SerSer Asn Ser Ser
Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp ThrSer Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr
9090
Gly Glu Gln ProGly Glu Gln Pro
Tyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp IleTyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile
100 105100 105
Ser Leu Asn AsnSer Leu Asn Asn
110110
Glu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser GlnGlu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln
115 120115 120
Thr Thr Arg Leu 125Thr Thr Arg Leu 125
Pro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu GluPro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu
130 135 140130 135 140
Pro Ala Pro AsnPro Ala Pro Asn
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe SerSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser
145 150 155145 150 155
Leu Val Ser GlyLeu Val Ser Gly
160160
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser SerLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser
165 170165 170
Ser Ala Pro SerSer Ala Pro Ser
175175
- 211 046157- 211 046157
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser AlaPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala
Ser Gln Ser Pro Pro Leu SerSer Gln Ser Pro Pro Leu Ser
180 185 190180 185 190
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
195 200 205195 200 205
Phe ProPhe Pro
210210
Thr Pro AsnThr Pro Asn
Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnThr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
215 220215 220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro AlaPhe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala
225 230 235225 230 235
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp TyrPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr
245 250 255245 250 255
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp GlnPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp Gln
260 265 270260 265 270
Pro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu ThrPro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu Thr
275 280 285275 280 285
Leu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln AspLeu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln Asp
290 295 300290 295 300
Lys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro SerLys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser
305 310 315305 310 315
Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His GluMet Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu
325 330 335325 330 335
Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser ArgPro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg
340 345 350340 345 350
Asp Asn Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys ProAsp Asn Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro
355 360 365355 360 365
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser His Arg Thr Thr LeuGln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser His Arg Thr Thr Leu
370 375 380370 375 380
Asn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys AspAsn His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp
385 390 395385 390 395
Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His ThrCys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His Thr
405 410 415405 410 415
Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val GluIle His Leu Arg Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu
420 425 430420 425 430
CysCys
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
LysLys
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
ArgArg
SerSer
PhePhe
ThrThr
Ile 400Ile 400
LysLys
SerSer
- 212 046157- 212 046157
Cys AspCys Asp
Ile HisIle His
450450
Phe Ser 465Phe Ser 465
Glu LysGlu Lys
Arg Arg 435Arg Arg 435
Thr GlyThr Gly
Gln SerGln Ser
Pro PhePro Phe
Phe SerPhe Ser
Gln LysGln Lys
Ser SerSer Ser
470470
Ala Cys 485Ala Cys 485
Asp AsnAsp Asn
Leu HisLeu His
500500
Thr HisThr His
Thr Ser 440Thr Ser 440
Pro Phe 455Pro Phe 455
Leu ValLeu Val
Asp IleAsp Ile
Thr LysThr Lys
His SerHis Ser
Gln CysGln Cys
Arg HisArg His
Cys GlyCys Gly
490490
Ile HisIle His
505505
Leu ThrLeu Thr
Arg IleArg Ile
460460
Ile Arg 475Ile Arg 475
Arg LysArg Lys
Leu ArgLeu Arg
Lys AlaLys Ala
Asp Lys 515Asp Lys 515
Ser ValSer Val
Val AlaVal Ala
520520
Ser SerSer Ser
Ala ThrAla Thr
Glu His Ile Arg 445Glu His Ile Arg 445
Cys Met Arg AsnCys Met Arg Asn
Thr His Thr GlyThr His Thr Gly
480480
Phe Ala Arg GluPhe Ala Arg Glu
495495
Gln Lys Asp Lys 510Gln Lys Asp Lys 510
Ser Ser Leu Ser 525Ser Ser Leu Ser 525
Ser TyrSer Tyr
530530
Pro SerPro Ser
Pro ValPro Val
Ala Thr 535Ala Thr 535
Ser TyrSer Tyr
Pro SerPro Ser
540540
Pro Val Thr ThrPro Val Thr Thr
Ser Tyr 545Ser Tyr 545
Pro SerPro Ser
Pro AlaPro Ala
550550
Thr ThrThr Thr
Ser TyrSer Tyr
Pro Ser 555Pro Ser 555
Pro Val Pro ThrPro Val Pro Thr
560560
Ser PheSer Phe
Ser SerSer Ser
Pro Gly 565Pro Gly 565
Ser SerSer Ser
Thr TyrThr Tyr
570570
Pro SerPro Ser
Pro Val His SerPro Val His Ser
575575
Gly PheGly Phe
Pro SerPro Ser
580580
Pro SerPro Ser
Val AlaVal Ala
Thr ThrThr Thr
585585
Tyr SerTyr Ser
Ser Val Pro ProSer Val Pro Pro
590590
Ala PheAla Phe
Pro Ala 595Pro Ala 595
Gln ValGln Val
Ser SerSer Ser
600600
Phe ProPhe Pro
Ser SerSer Ser
Ala Val Thr Asn 605Ala Val Thr Asn 605
Ser PheSer Phe
610610
Ser AlaSer Ala
Ser ThrSer Thr
Gly Leu 615Gly Leu 615
Ser AspSer Asp
Met ThrMet Thr
620620
Ala Thr Phe SerAla Thr Phe Ser
Pro Arg 625Pro Arg 625
Thr IleThr Ile
Glu IleGlu Ile
630630
Cys <210> 116 <211> 719 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys <210> 116 <211> 719 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 116<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 116
СинтетическийSynthetic
- 213 046157- 213 046157
Met Ala 1Met Ala 1
Ala AlaAla Ala
Lys Ala 5Lys Ala 5
Glu MetGluMet
Gln LeuGln Leu
Met SerMet Ser
Pro LeuProLeu
Ser AspSer Asp
Pro PhePro Phe
Gly SerGly Ser
Phe ProPhe Pro
His Ser 25His Ser 25
Pro ThrPro Thr
Met AspMet Asp
Pro LysPro Lys
Leu Glu 35Leu Glu 35
Glu MetGluMet
Met LeuMet Leu
Leu SerLeu Ser
Asn GlyAsn Gly
Ala Pro 45Ala Pro 45
Gln Ile 15Gln Ile 15
Asn TyrAsn Tyr
Gln PheGln Phe
Leu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser Ser 50 5560Leu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser Ser 50 5560
Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser Ser 65 70 7580Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser Ser 65 70 7580
Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln Pro 85 9095Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln Pro 85 9095
Tyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn AsnTyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn Asn
100 105110100 105110
Glu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg LeuGlu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg Leu
115 120125115 120125
Pro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro AsnPro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro Asn
130 135140130 135140
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser GlySer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser Gly
145 150 155160145 150 155160
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro SerLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro Ser
165 170175165 170175
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser CysPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser Cys
180 185190180 185190
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro ThrAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro Thr
195 200205195 200205
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln AlaPhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln Ala
210 215220210 215220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala TyrPhe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala Tyr
225 230 235240225 230 235240
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr LeuPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr Leu
245 250255245 250255
- 214 046157- 214 046157
PhePhe
ProPro
LeuLeu
Lys 305Lys 305
MetMet
ProPro
AspAsp
GlnGln
Asn 385Asn 385
CysCys
IleIle
CysCys
IleIle
Phe 465Phe 465
GluGlu
AspAsp
Pro Gln Gln Gln Gly 260Pro Gln Gln Gln Gly 260
Phe Gln Gly Leu GluPhe Gln Gly Leu Glu
275275
Ser Thr Ile Lys Ala 290Ser Thr Ile Lys Ala 290
Ala Leu Asn Thr SerAla Leu Asn Thr Ser
310310
Arg Lys Tyr Pro AsnArg Lys Tyr Pro Asn
325325
Tyr Ala Cys Pro ValTyr Ala Cys Pro Val
340340
Glu Leu Asn Val HisGlu Leu Asn Val His
355355
Cys Arg Ile Cys Met 370Cys Arg Ile Cys Met 370
His Ile Arg Thr HisHis Ile Arg Thr His
390390
Gly Arg Lys Phe AlaGly Arg Lys Phe Ala
405405
His Leu Arg Gln Lys 420His Leu Arg Gln Lys 420
Asp Arg Arg Phe SerAsp Arg Arg Phe Ser
435435
His Thr Gly Gln Lys 450His Thr Gly Gln Lys 450
Ser His Arg Thr ThrSer His Arg Thr Thr
470470
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
485485
Asn Leu His Thr HisAsn Leu His Thr His
500500
Asp Leu Gly Leu Gly 265Asp Leu Gly Leu Gly 265
Ser Arg Thr Gln GlnSer Arg Thr Gln Gln
280280
Phe Ala Thr Gln Ser 295Phe Ala Thr Gln Ser 295
Tyr Gln Ser Gln LeuTyr Gln Ser Gln Leu
315315
Arg Pro Ser Lys ThrArg Pro Ser Lys Thr
330330
Glu Ser Cys Asp Arg 345Glu Ser Cys Asp Arg 345
Ile Arg Ile His ThrIle Arg Ile His Thr
360360
Arg Asn Phe Ser Arg 375Arg Asn Phe Ser Arg 375
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
395395
Arg Ser Asp Asp LeuArg Ser Asp Asp Leu
410410
Asp Arg Pro Tyr Ala 425Asp Arg Pro Tyr Ala 425
Arg Ser Asp Asn LeuArg Ser Asp Asn Leu
440440
Pro Phe Gln Cys Arg 455Pro Phe Gln Cys Arg 455
Leu Thr Asn His IleLeu Thr Asn His Ile
475475
Asp Ile Cys Gly ArgAsp Ile Cys Gly Arg
490490
Thr Lys Ile His Leu 505Thr Lys Ile His Leu 505
Thr Pro Asp Gln LysThr Pro Asp Gln Lys
270270
Pro Ser Leu Thr ProPro Ser Leu Thr Pro
285285
Gly Ser Gln Asp Leu 300Gly Ser Gln Asp Leu 300
Ile Lys Pro Ser ArgIle Lys Pro Ser Arg
320320
Pro Pro His Glu ArgPro Pro His Glu Arg
335335
Arg Phe Ser Arg ArgArg Phe Ser Arg Arg
350350
Gly Gln Lys Pro PheGly Gln Lys Pro Phe
365365
Ser Asp His Leu Thr 380Ser Asp His Leu Thr 380
Phe Ala Cys Asp IlePhe Ala Cys Asp Ile
400400
Val Arg His Thr Lys 415Val Arg His Thr Lys 415
Cys Pro Val Glu SerCys Pro Val Glu Ser
430430
Val Arg His Ile Arg 445Val Arg His Ile Arg 445
Ile Cys Met Arg Asn 460Ile Cys Met Arg Asn 460
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
480480
Lys Phe Ala Arg GluLys Phe Ala Arg Glu
495495
Arg Gln Lys Asp Arg 510Arg Gln Lys Asp Arg 510
- 215 046157- 215 046157
Pro TyrPro Tyr
His SerHis Ser
530530
Gln Cys 545Gln Cys 545
Arg HisArg His
Ala Cys 515Ala Cys 515
Leu ThrLeu Thr
Arg IleArg Ile
Ile ArgIle Arg
Pro ValPro Val
Glu HisGlu His
Cys MetCys Met
550550
Thr His 565Thr His 565
Cys GlyCys Gly
Arg LysArg Lys
580580
Phe AlaPhe Ala
Ile HisIle His
Leu Arg 595Leu Arg 595
Gln LysGln Lys
Ser SerSer Ser
610610
Ala ThrAla Thr
Ser SerSer Ser
Ser Tyr 625Ser Tyr 625
Pro SerPro Ser
Pro ValPro Val
630630
Ser TyrSer Tyr
Pro SerPro Ser
Pro Val 645Pro Val 645
Thr TyrThr Tyr
Pro SerPro Ser
660660
Pro ValPro Val
Thr ThrThr Thr
Tyr Ser 675Tyr Ser 675
Ser ValSer Val
Glu SerGlu Ser
520520
Ile Arg 535Ile Arg 535
Arg AsnArg Asn
Thr GlyThr Gly
Arg GluArg Glu
Asp LysAsp Lys
600600
Leu Ser 615Leu Ser 615
Thr ThrThr Thr
Pro ThrPro Thr
His SerHis Ser
Pro ProPro Pro
680680
Cys AspCys Asp
Ile HisIle His
Phe SerPhe Ser
Glu LysGlu Lys
570570
Asp Asn 585Asp Asn 585
Lys AlaLys Ala
Ser TyrSer Tyr
Ser TyrSer Tyr
Ser PheSer Phe
650650
Gly Phe 665Gly Phe 665
Ala PheAla Phe
Arg ArgArg Arg
Thr GlyThr Gly
540540
Gln Ser 555Gln Ser 555
Pro PhePro Phe
Leu HisLeu His
Asp LysAsp Lys
Pro SerPro Ser
620620
Pro Ser 635Pro Ser 635
Ser SerSer Ser
Pro SerPro Ser
Pro AlaPro Ala
Phe Ser Thr Ser 525Phe Ser Thr Ser 525
Gln Lys Pro PheGln Lys Pro Phe
Ser Ser Leu ValSer Ser Leu Val
560560
Ala Cys Asp IleAla Cys Asp Ile
575575
Thr His Thr LysThr His Thr Lys
590590
Ser Val Val Ala 605Ser Val Val Ala 605
Pro Val Ala ThrPro Val Ala Thr
Pro Ala Thr ThrPro Ala Thr Thr
640640
Pro Gly Ser SerPro Gly Ser Ser
655655
Pro Ser Val AlaPro Ser Val Ala
670670
Gln Val Ser Ser 685Gln Val Ser Ser 685
Phe ProPhe Pro
690690
Ser SerSer Ser
Ala ValAla Val
Thr Asn 695Thr Asn 695
Ser PheSer Phe
Ser AlaSer Ala
700700
Ser Thr Gly LeuSer Thr Gly Leu
Ser Asp 705Ser Asp 705
Met ThrMet Thr
Ala ThrAla Thr
710710
Phe SerPhe Ser
Pro ArgPro Arg
Thr Ile 715Thr Ile 715
Glu Ile Cys <210> 117 <211> 627 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Glu Ile Cys <210> 117 <211> 627 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
СинтетическийSynthetic
- 216 046157 <400> 117 Met Ala Ala 1- 216 046157 <400> 117 Met Ala Ala 1
Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met Ser Pro Leu GlnAla Lys Ala Glu Met Gln Leu Met Ser Pro Leu Gln
10 1510 15
Ser Asp ProSer Asp Pro
Phe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro Thr Met Asp AsnPhe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro Thr Met Asp Asn
25 3025 30
Pro Lys Leu 35Pro Lys Leu 35
Glu Glu Met Met Leu Leu Ser Asn Gly Ala Pro GlnGlu Glu Met Met Leu Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln
4545
Leu Gly Ala 50Leu Gly Ala 50
Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser 55 60Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser 55 60
Ser Ser Ser 65Ser Ser Ser 65
Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser 70 75Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser 70 75
Ser Ser SerSer Ser Ser
Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu GlnSer Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln
90 9590 95
Tyr Glu HisTyr Glu His
Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu AsnLeu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn
100 105 110100 105 110
Glu Lys ValGlu Lys Val
115115
Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr ArgLeu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg
120 125120 125
Pro Pro IlePro Pro Ile
130130
Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala ProThr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro
135 140135 140
Ser Gly Asn 145Ser Gly Asn 145
Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val SerThr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser
150 155150 155
Leu Val SerLeu Val Ser
Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala ProMet Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro
165 170 175165 170 175
Pro Ala AlaPro Ala Ala
Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu SerSer Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser
180 185 190180 185 190
Ala Val ProAla Val Pro
195195
Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProSer Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
200 205200 205
Phe Pro ThrPhe Pro Thr
210210
Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnPro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
215 220215 220
Phe Pro Gly 225Phe Pro Gly 225
Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro AlaSer Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala
230 235230 235
Pro Ala AlaPro Ala Ala
Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp TyrLys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr
245 250 255245 250 255
IleIle
TyrTyr
PhePhe
SerSer
Ser 80Ser 80
ProPro
AsnAsn
LeuLeu
AsnAsn
Gly 160Gly 160
SerSer
CysCys
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
- 217 046157- 217 046157
Phe Pro GlnPhe Pro Gln
Gln Gln Gly 260Gln Gln Gly 260
Asp Leu GlyAsp Leu Gly
265265
Leu Gly ThrLeu Gly Thr
Pro Asp GlnPro Asp Gln
270270
Pro Phe GlnPro Phe Gln
275275
Gly Leu GluGly Leu Glu
Ser Arg ThrSer Arg Thr
280280
Gln Gln ProGln Gln Pro
Ser Leu Thr 285Ser Leu Thr 285
Leu Ser ThrLeu Ser Thr
290290
Ile Lys AlaIle Lys Ala
Phe Ala Thr 295Phe Ala Thr 295
Gln Ser GlyGln Ser Gly
300300
Ser Gln AspSer Gln Asp
Lys Ala Leu 305Lys Ala Leu 305
Asn Thr SerAsn Thr Ser
310310
Tyr Gln SerTyr Gln Ser
Gln Leu IleGln Leu Ile
315315
Lys Pro SerLys Pro Ser
Met Arg LysMet Arg Lys
Tyr Pro AsnTyr Pro Asn
325325
Arg Pro SerArg Pro Ser
Lys Thr Pro 330Lys Thr Pro 330
Pro His GluPro His Glu
335335
Pro Tyr AlaPro Tyr Ala
Cys Pro Val 340Cys Pro Val 340
Glu Ser CysGlu Ser Cys
345345
Asp Arg ArgAsp Arg Arg
Phe Ser ArgPhe Ser Arg
350350
Asp Asn LeuAsp Asn Leu
355355
Val Arg HisVal Arg His
Ile Arg IleIle Arg Ile
360360
His Thr GlyHis Thr Gly
Gln Lys Pro 365Gln Lys Pro 365
Gln Cys ArgGln Cys Arg
370370
Ile Cys MetIle Cys Met
Arg Asn Phe 375Arg Asn Phe 375
Ser His ArgSer His Arg
380380
Thr Thr LeuThr Thr Leu
Asn His Ile 385Asn His Ile 385
Arg Thr HisArg Thr His
390390
Thr Gly GluThr Gly Glu
Lys Pro PheLys Pro Phe
395395
Ala Cys AspAla Cys Asp
Cys Gly ArgCys Gly Arg
Lys Phe AlaLys Phe Ala
405405
Arg Glu AspArg Glu Asp
Asn Leu His 410Asn Leu His 410
Thr His IleThr His Ile
415415
Thr His ThrThr His Thr
Gly Glu Lys 420Gly Glu Lys 420
Pro Phe AlaPro Phe Ala
425425
Cys Asp IleCys Asp Ile
Cys Gly ArgCys Gly Arg
430430
Phe Ser ThrPhe Ser Thr
435435
Ser His SerSer His Ser
Leu Thr GluLeu Thr Glu
440440
His Ile ArgHis Ile Arg
Ile His Thr 445Ile His Thr 445
Gln Lys ProGln Lys Pro
450450
Phe Gln CysPhe Gln Cys
Arg Ile Cys 455Arg Ile Cys 455
Met Arg AsnMet Arg Asn
460460
Phe Ser GlnPhe Ser Gln
Ser Ser Leu 465Ser Ser Leu 465
Val Arg HisVal Arg His
470470
Ile Arg ThrIle Arg Thr
His Thr Gly 475His Thr Gly 475
Glu Lys ProGlu Lys Pro
Ala Cys AspAla Cys Asp
Ile Cys GlyIle Cys Gly
485485
Arg Lys PheArg Lys Phe
Ala Arg Glu 490Ala Arg Glu 490
Asp Asn LeuAsp Asn Leu
495495
Thr His ThrThr His Thr
Lys Ile HisLys Ile His
Leu Arg GlnLeu Arg Gln
Lys Asp LysLys Asp Lys
Lys Ala AspLys Ala Asp
LysLys
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
ArgArg
SerSer
PhePhe
ThrThr
Ile 400Ile 400
ArgArg
LysLys
GlyGly
SerSer
Phe 480Phe 480
HisHis
LysLys
- 218 046157- 218 046157
Ser ValSer Val
Pro ValPro Val
530530
Pro Ala 545Pro Ala 545
Pro GlyPro Gly
Pro SerPro Ser
Gln ValGln Val
Ser ThrSer Thr
610610
500500
Val Ala 515Val Ala 515
Ala ThrAla Thr
Thr ThrThr Thr
Ser SerSer Ser
Val AlaVal Ala
580580
Ser Ser 595Ser Ser 595
Gly LeuGly Leu
Ser SerSer Ser
Ser TyrSer Tyr
Ser TyrSer Tyr
550550
Thr Tyr 565Thr Tyr 565
Thr ThrThr Thr
Phe ProPhe Pro
Ser AspSer Asp
Ala ThrAla Thr
520520
Pro Ser 535Pro Ser 535
Pro SerPro Ser
Pro SerPro Ser
Tyr SerTyr Ser
Ser SerSer Ser
600600
Met Thr 615Met Thr 615
505505
Ser SerSer Ser
Pro ValPro Val
Pro ValPro Val
Pro ValPro Val
570570
Ser ValSer Val
585585
Ala ValAla Val
Ala ThrAla Thr
510510
Leu SerLeu Ser
Thr ThrThr Thr
540540
Pro Thr 555Pro Thr 555
His SerHis Ser
Pro ProPro Pro
Thr AsnThr Asn
Phe SerPhe Ser
620620
Ser Tyr Pro Ser 525Ser Tyr Pro Ser 525
Ser Tyr Pro SerSer Tyr Pro Ser
Ser Phe Ser SerSer Phe Ser Ser
560560
Gly Phe Pro SerGly Phe Pro Ser
575575
Ala Phe Pro AlaAla Phe Pro Ala
590590
Ser Phe Ser Ala 605Ser Phe Ser Ala 605
Pro Arg Thr IlePro Arg Thr Ile
Glu Ile Cys 625 <210> 118 <211> 631 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Glu Ile Cys 625 <210> 118 <211> 631 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический полипептид <400> 118Synthetic polypeptide <400> 118
Met Ala Ala Ala 1Met Ala Ala Ala 1
Lys Ala Glu Met 5Lys Ala Glu Met 5
Gln Leu Met SerGln Leu Met Ser
Pro Leu Gln IlePro Leu Gln Ile
Ser Asp Pro PheSer Asp Pro Phe
Gly Ser Phe ProGly Ser Phe Pro
His Ser Pro Thr 25His Ser Pro Thr 25
Met Asp Asn Tyr 30Met Asp Asn Tyr 30
Pro Lys Leu Glu 35Pro Lys Leu Glu 35
Glu Met Met LeuGlu Met Met Leu
Leu Ser Asn GlyLeu Ser Asn Gly
Ala Pro Gln Phe 45Ala Pro Gln Phe 45
Leu Gly Ala Ala 50Leu Gly Ala Ala 50
Gly Ala Pro Glu 55Gly Ala Pro Glu 55
Gly Ser Gly Ser 60Gly Ser Gly Ser 60
Asn Ser Ser SerAsn Ser Ser Ser
Ser Ser Ser Gly 65Ser Ser Ser Gly 65
Gly Gly Gly Gly 70Gly Gly Gly Gly 70
Gly Gly Gly Gly 75Gly Gly Gly Gly 75
Ser Asn Ser SerSer Asn Ser Ser
- 219 046157- 219 046157
Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn ProSer Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro
Gln Ala Asp Thr Gly Glu GlnGln Ala Asp Thr Gly Glu Gln
9595
Tyr Glu HisTyr Glu His
Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu AsnLeu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn
100 105 110100 105 110
Glu Lys ValGlu Lys Val
115115
Leu Val Glu ThrLeu Val Glu Thr
Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr ArgSer Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg
120 125120 125
Pro ProPro Pro
130130
Ile ThrIle Thr
Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala ProTyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro
135 140135 140
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val SerSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser
145 150 155145 150 155
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala ProLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro
165 170 175165 170 175
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu SerPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser
180 185 190180 185 190
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
195 200 205195 200 205
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnPhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
210 215 220210 215 220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro AlaPhe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala
225 230 235225 230 235
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp TyrPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr
245 250 255245 250 255
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp GlnPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp Gln
260 265 270260 265 270
Pro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu ThrPro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu Thr
275 280 285275 280 285
Leu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln AspLeu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln Asp
290 295 300290 295 300
Lys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro SerLys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser
305 310 315305 310 315
ProPro
AsnAsn
LeuLeu
AsnAsn
Gly 160Gly 160
SerSer
CysCys
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
LysLys
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
ArgArg
Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His GluMet Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu
- 220 046157- 220 046157
325325
330 335330 335
ProPro
AspAsp
GlnGln
Thr 385Thr 385
CysCys
IleIle
CysCys
IleIle
Phe 465Phe 465
GluGlu
SerSer
LysLys
SerSer
Ser 545Ser 545
SerSer
Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser 340Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser 340
Cys Asp Arg Arg Phe Ser ArgCys Asp Arg Arg Phe Ser Arg
345 350345 350
Asn Leu Val Arg His Ile ArgAsn Leu Val Arg His Ile Arg
355 360355 360
Cys Arg Ile Cys Met Arg AsnCys Arg Ile Cys Met Arg Asn
370 375370 375
His Ile Arg Thr His Thr GlyHis Ile Arg Thr His Thr Gly
390390
Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser 405Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser 405
His Leu Arg Gln Lys Asp Arg 420His Leu Arg Gln Lys Asp Arg 420
Asp Arg Arg Phe Ser Gln SerAsp Arg Arg Phe Ser Gln Ser
435 440435 440
His Thr Gly Gln Lys Pro PheHis Thr Gly Gln Lys Pro Phe
450 455450 455
Ser Thr Ser Gly His Leu Val 470Ser Thr Ser Gly His Leu Val 470
Lys Pro Phe Ala Cys Asp IleLys Pro Phe Ala Cys Asp Ile
485485
Thr Leu Thr Glu His Thr LysThr Leu Thr Glu His Thr Lys
500500
Ala Asp Lys Ser Val Val AlaAla Asp Lys Ser Val Val Ala
515 520515 520
Tyr Pro Ser Pro Val Ala ThrTyr Pro Ser Pro Val Ala Thr
530 535530 535
Tyr Pro Ser Pro Ala Thr ThrTyr Pro Ser Pro Ala Thr Thr
550550
Phe Ser Ser Pro Gly Ser Ser 565Phe Ser Ser Pro Gly Ser Ser 565
Ile His Thr Gly Gln Lys ProIle His Thr Gly Gln Lys Pro
365365
Phe Ser Arg Glu Asp Asn LeuPhe Ser Arg Glu Asp Asn Leu
380380
Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp 395Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp 395
Asp Glu Leu Val Arg His ThrAsp Glu Leu Val Arg His Thr
410 415410 415
Pro Tyr Ala Cys Pro Val GluPro Tyr Ala Cys Pro Val Glu
425 430425 430
Gly Asn Leu Thr Glu His Ile 445Gly Asn Leu Thr Glu His Ile 445
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg 460Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg 460
Arg His Ile Arg Thr His Thr 475Arg His Ile Arg Thr His Thr 475
Cys Gly Arg Lys Phe Ala GlnCys Gly Arg Lys Phe Ala Gln
490 495490 495
Ile His Leu Arg Gln Lys AspIle His Leu Arg Gln Lys Asp
505 510505 510
Ser Ser Ala Thr Ser Ser LeuSer Ser Ala Thr Ser Ser Leu
525525
Ser Tyr Pro Ser Pro Val Thr 540Ser Tyr Pro Ser Pro Val Thr 540
Ser Tyr Pro Ser Pro Val Pro 555Ser Tyr Pro Ser Pro Val Pro 555
Thr Tyr Pro Ser Pro Val HisThr Tyr Pro Ser Pro Val His
570 575570 575
SerSer
PhePhe
HisHis
Ile 400Ile 400
LysLys
SerSer
ArgArg
AsnAsn
Gly 480Gly 480
AsnAsn
LysLys
SerSer
ThrThr
Thr 560Thr 560
SerSer
- 221 046157- 221 046157
Gly PheGly Phe
Pro SerPro Ser
580580
Pro SerPro Ser
Val AlaVal Ala
Ala PheAla Phe
Pro Ala 595Pro Ala 595
Gln ValGln Val
Ser SerSer Ser
600600
Ser PheSer Phe
610610
Ser AlaSer Ala
Ser ThrSer Thr
Gly Leu 615Gly Leu 615
Thr Thr 585Thr Thr 585
Phe ProPhe Pro
Ser AspSer Asp
Tyr SerTyr Ser
Ser SerSer Ser
Met ThrMet Thr
620620
Ser Val Pro ProSer Val Pro Pro
590590
Ala Val Thr Asn 605Ala Val Thr Asn 605
Ala Thr Phe SerAla Thr Phe Ser
Pro Arg Thr Ile Glu Ile CysPro Arg Thr Ile Glu Ile Cys
625 630 <210> 119 <211> 473 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>625 630 <210> 119 <211> 473 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 119<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 119
СинтетическийSynthetic
Met Thr Gly 1Met Thr Gly 1
Leu Asn GlnLeu Asn Gln
Leu Asn LeuLeu Asn Leu
Met Ala ThrMet Ala Thr
Asn Pro Glu 65Asn Pro Glu 65
Lys Thr ValLys Thr Val
Trp Cys GlnTrp Cys Gln
Val Pro ProVal Pro Pro
115115
Met Val GlnMet Val Gln
130130
Pro Pro TyrPro Pro Tyr
Lys Leu Ala 5Lys Leu Ala 5
Leu Pro Asp 20Leu Pro Asp 20
Phe Ser GlyPhe Ser Gly
Glu Asn ValGlu Asn Val
Leu Ser Tyr 70Leu Ser Tyr 70
Thr Tyr Leu 85Thr Tyr Leu 85
Asp Asn Ile 100Asp Asn Ile 100
Ala Ser GlyAla Ser Gly
Pro Pro GlnPro Pro Gln
Ser Asn CysSer Asn Cys
Glu Lys LeuGlu Lys Leu
Asn Leu TyrAsn Leu Tyr
Ser Ser Asp 40Ser Ser Asp 40
Met Asp Ile 55Met Asp Ile 55
Ser Gly SerSer Gly Ser
Gly Lys PheGly Lys Phe
Ile Ser LeuIle Ser Leu
105105
Ala Leu SerAla Leu Ser
120120
Gly Asp Val 135Gly Asp Val 135
Gly Asp LeuGly Asp Leu
Pro Val Thr 10Pro Val Thr 10
Pro Glu GluPro Glu Glu
Ser Val ValSer Val Val
Gly Leu Thr 60Gly Leu Thr 60
Phe Gln Pro 75Phe Gln Pro 75
Ala Phe Asp 90Ala Phe Asp 90
Met Ser AlaMet Ser Ala
Thr Gln ThrThr Gln Thr
Glu Ala MetGlu Ala Met
140140
Tyr Ser GluTyr Ser Glu
Met Ser Ser LeuMet Ser Ser Leu
Ile Pro Ser AlaIle Pro Ser Ala
His Tyr Asn Gln 45His Tyr Asn Gln 45
Asn Glu Lys ProAsn Glu Lys Pro
Ala Pro Gly Asn 80Ala Pro Gly Asn 80
Ser Pro Ser AsnSer Pro Ser Asn
Gly Ile Leu Gly 110Gly Ile Leu Gly 110
Ser Thr Ala Ser 125Ser Thr Ala Ser 125
Tyr Pro Ala LeuTyr Pro Ala Leu
Pro Val Ser PhePro Val Ser Phe
- 222 046157- 222 046157
145145
150150
155155
His Asp Pro Gln GlyHis Asp Pro Gln Gly
165165
Asn Pro Gly Leu AlaAsn Pro Gly Leu Ala
170170
Tyr Ser Pro Gln AspTyr Ser Pro Gln Asp
175175
Gln Ser Ala Lys ProGln Ser Ala Lys Pro
180180
Ala Leu Asp Ser AsnAla Leu Asp Ser Asn
185185
Leu Phe Pro Met IleLeu Phe Pro Met Ile
190190
Asp Tyr Asn Leu Tyr 195Asp Tyr Asn Leu Tyr 195
His His Pro Asn AspHis His Pro Asn Asp
200200
Met Gly Ser Ile Pro 205Met Gly Ser Ile Pro 205
His Lys Pro Phe Gln 210His Lys Pro Phe Gln 210
Gly Met Asp Pro Ile 215Gly Met Asp Pro Ile 215
Arg Val Asn Pro Pro 220Arg Val Asn Pro Pro 220
Ile Thr Pro Leu Glu 225Ile Thr Pro Leu Glu 225
Thr Ile Lys Ala Phe 230Thr Ile Lys Ala Phe 230
Lys Asp Lys Gln Ile 235Lys Asp Lys Gln Ile 235
Pro Gly Phe Gly SerPro Gly Phe Gly Ser
245245
Leu Pro Gln Pro ProLeu Pro Gln Pro Pro
250250
Leu Thr Leu Lys ProLeu Thr Leu Lys Pro
255255
Arg Pro Arg Lys TyrArg Pro Arg Lys Tyr
260260
Pro Asn Arg Pro SerPro Asn Arg Pro Ser
265265
Lys Thr Pro Leu HisLys Thr Pro Leu His
270270
Arg Pro His Ala Cys 275Arg Pro His Ala Cys 275
Pro Ala Glu Gly Cys 280Pro Ala Glu Gly Cys 280
Asp Arg Arg Phe Ser 285Asp Arg Arg Phe Ser 285
Ser Asp Asn Leu ValSer Asp Asn Leu Val
290290
Arg His Leu Arg Ile 295Arg His Leu Arg Ile 295
His Thr Gly His LysHis Thr Gly His Lys
300300
Phe Gln Cys Arg Ile 305Phe Gln Cys Arg Ile 305
Cys Met Arg Ser Phe 310Cys Met Arg Ser Phe 310
Ser His Arg Thr Thr 315Ser His Arg Thr Thr 315
Thr Asn His Ile ArgThr Asn His Ile Arg
325325
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
330330
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
335335
Phe Cys Gly Arg LysPhe Cys Gly Arg Lys
340340
Phe Ala Arg Glu AspPhe Ala Arg Glu Asp
345345
Asn Leu His Thr HisAsn Leu His Thr His
350350
Lys Ile His Leu Lys 355Lys Ile His Leu Lys 355
Gln Lys Glu His Ala 360Gln Lys Glu His Ala 360
Cys Pro Ala Glu GlyCys Pro Ala Glu Gly
365365
Asp Arg Arg Phe SerAsp Arg Arg Phe Ser
370370
Thr Ser His Ser LeuThr Ser His Ser Leu
375375
Thr Glu His Leu ArgThr Glu His Leu Arg
380380
His Thr Gly His Lys 385His Thr Gly His Lys 385
Pro Phe Gln Cys Arg 390Pro Phe Gln Cys Arg 390
Ile Cys Met Arg Ser 395Ile Cys Met Arg Ser 395
160160
TyrTyr
ProPro
GluGlu
ProPro
His 240His 240
IleIle
GluGlu
ArgArg
ProPro
Leu 320Leu 320
GluGlu
AlaAla
CysCys
IleIle
Phe 400Phe 400
- 223 046157- 223 046157
Ser GlnSer Gln
Ser SerSer Ser
Lys ProLys Pro
Phe AlaPhe Ala
420420
Asn LeuAsn Leu
His Thr 435His Thr 435
Ala GluAla Glu
450450
Lys GlyLys Gly
Leu Ala 465Leu Ala 465
Pro ValPro Val
Ser Leu 405Ser Leu 405
Cys GluCys Glu
His AlaHis Ala
Gly AlaGly Ala
Val ThrVal Thr
470470
Val ArgVal Arg
Phe CysPhe Cys
Lys Ile 440Lys Ile 440
Pro Ser 455Pro Ser 455
Thr CysThr Cys
His IleHis Ile
410410
Gly Arg 425Gly Arg 425
His LeuHis Leu
Ala SerAla Ser
AlaAla
Arg ThrArg Thr
Lys PheLys Phe
Lys GlnLys Gln
Ser AlaSer Ala
460460
His Thr Gly Glu 415His Thr Gly Glu 415
Ala Arg Glu AspAla Arg Glu Asp
430430
Lys Glu Lys Lys 445Lys Glu Lys Lys 445
Pro Pro Val Ser <210> 120 <211> 719 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Pro Pro Val Ser <210> 120 <211> 719 <212> Protein <213> Artificial Sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический <400>Synthetic <400>
MetMet
SerSer
ProPro
LeuLeu
Ser 65Ser 65
SerSer
TyrTyr
GluGlu
Pro полипептидPro polypeptide
120120
AlaAla
AspAsp
LysLys
Gly 50Gly 50
SerSer
SerSer
GluGlu
LysLys
ProPro
AlaAla
AlaAla
Lys 5Lys 5
AlaAla
GluGlu
MetMet
GlnGln
LeuLeu
MetMet
SerSer
Pro Leu Gln IlePro Leu Gln Ile
ProPro
Phe 20Phe 20
GlyGly
SerSer
PhePhe
ProPro
His 25His 25
SerSer
ProPro
ThrThr
Met Asp Asn Tyr 30Met Asp Asn Tyr 30
Leu 35Leu 35
GluGlu
GluGlu
MetMet
MetMet
Leu 40Leu 40
LeuLeu
SerSer
AsnAsn
GlyGly
Ala Pro Gln Phe 45Ala Pro Gln Phe 45
AlaAla
AlaAla
GlyGly
AlaAla
Pro 55Pro 55
GluGlu
GlyGly
SerSer
GlyGly
Ser 60Ser 60
Asn Ser Ser SerAsn Ser Ser Ser
SerSer
SerSer
HisHis
ValVal
115115
IleIle
GlyGly
GlyGly
Gly 70Gly 70
GlyGly
GlyGly
GlyGly
GlyGly
Gly 75Gly 75
GlyGly
Ser Asn Ser SerSer Asn Ser Ser
SerSer
Thr 85Thr 85
PhePhe
AsnAsn
ProPro
GlnGln
Ala 90Ala 90
AspAsp
ThrThr
Gly Glu Gln Pro 95Gly Glu Gln Pro 95
LeuLeu
100100
LeuLeu
ThrThr
ThrThr
ValVal
TyrTyr
AlaAla
GluGlu
ThrThr
GluGlu
ThrThr
GlyGly
SerSer
SerSer
120120
ArgArg
PhePhe
105105
ProPro
AspAsp
IleIle
Ser Leu Asn AsnSer Leu Asn Asn
110110
TyrTyr
PhePhe
ProPro
SerSer
SerSer
LeuLeu
GlnGln
GluGlu
Thr Thr Arg Leu 125Thr Thr Arg Leu 125
Pro Ala Pro AsnPro Ala Pro Asn
- 224 046157- 224 046157
130130
135135
140140
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val SerSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser
145 150 155145 150 155
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala ProLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro
165 170 175165 170 175
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu SerPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser
180 185 190180 185 190
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
195 200 205195 200 205
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnPhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
210 215 220210 215 220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro AlaPhe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala
225 230 235225 230 235
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp TyrPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr
245 250 255245 250 255
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp GlnPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp Gln
260 265 270260 265 270
Pro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu ThrPro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu Thr
275 280 285275 280 285
Leu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln AspLeu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln Asp
290 295 300290 295 300
Lys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro SerLys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser
305 310 315305 310 315
Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His GluMet Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu
325 330 335325 330 335
Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser AspPro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Asp
340 345 350340 345 350
Gly Ala Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys ProGly Ala Leu Val Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro
355 360 365355 360 365
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp Asn LeuGln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu
370 375 380370 375 380
Gly 160Gly 160
SerSer
CysCys
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
LysLys
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
ArgArg
ProPro
PhePhe
ValVal
- 225 046157- 225 046157
Arg 385Arg 385
CysCys
IleIle
CysCys
IleIle
Phe 465Phe 465
GluGlu
AspAsp
ProPro
GlyGly
Gln 545Gln 545
GluGlu
CysCys
IleIle
SerSer
Ser 625Ser 625
His Ile Arg Thr HisHis Ile Arg Thr His
390390
Gly Arg Lys Phe AlaGly Arg Lys Phe Ala
405405
His Leu Arg Gln Lys 420His Leu Arg Gln Lys 420
Asp Arg Arg Phe SerAsp Arg Arg Phe Ser
435435
His Thr Gly Gln Lys 450His Thr Gly Gln Lys 450
Ser Thr Ser Gly AsnSer Thr Ser Gly Asn
470470
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
485485
Asn Leu Val Arg His 500Asn Leu Val Arg His 500
Tyr Ala Cys Pro ValTyr Ala Cys Pro Val
515515
His Leu Thr Glu His 530His Leu Thr Glu His 530
Cys Arg Ile Cys MetCys Arg Ile Cys Met
550550
His Ile Arg Thr HisHis Ile Arg Thr His
565565
Gly Arg Lys Phe AlaGly Arg Lys Phe Ala
580580
His Leu Arg Gln LysHis Leu Arg Gln Lys
595595
Ser Ala Thr Ser Ser 610Ser Ala Thr Ser Ser 610
Tyr Pro Ser Pro ValTyr Pro Ser Pro Val
630630
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
395395
Gln Ser Gly Asp LeuGln Ser Gly Asp Leu
410410
Asp Arg Pro Tyr Ala 425Asp Arg Pro Tyr Ala 425
Thr His Leu Asp LeuThr His Leu Asp Leu
440440
Pro Phe Gln Cys Arg 455Pro Phe Gln Cys Arg 455
Leu Val Arg His IleLeu Val Arg His Ile
475475
Asp Ile Cys Gly ArgAsp Ile Cys Gly Arg
490490
Thr Lys Ile His Leu 505Thr Lys Ile His Leu 505
Glu Ser Cys Asp Arg 520Glu Ser Cys Asp Arg 520
Ile Arg Ile His Thr 535Ile Arg Ile His Thr 535
Arg Asn Phe Ser GluArg Asn Phe Ser Glu
555555
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
570570
Gln Ala Gly His Leu 585Gln Ala Gly His Leu 585
Asp Lys Lys Ala Asp 600Asp Lys Lys Ala Asp 600
Leu Ser Ser Tyr Pro 615Leu Ser Ser Tyr Pro 615
Thr Thr Ser Tyr ProThr Thr Ser Tyr Pro
635635
Phe Ala Cys Asp IlePhe Ala Cys Asp Ile
400400
Arg Arg His Thr Lys 415Arg Arg His Thr Lys 415
Cys Pro Val Glu SerCys Pro Val Glu Ser
430430
Ile Arg His Ile Arg 445Ile Arg His Ile Arg 445
Ile Cys Met Arg Asn 460Ile Cys Met Arg Asn 460
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
480480
Lys Phe Ala Arg SerLys Phe Ala Arg Ser
495495
Arg Gln Lys Asp Arg 510Arg Gln Lys Asp Arg 510
Arg Phe Ser Gln SerArg Phe Ser Gln Ser
525525
Gly Gln Lys Pro Phe 540Gly Gln Lys Pro Phe 540
Arg Ser His Leu ArgArg Ser His Leu Arg
560560
Phe Ala Cys Asp IlePhe Ala Cys Asp Ile
575575
Ala Ser His Thr Lys 590Ala Ser His Thr Lys 590
Lys Ser Val Val AlaLys Ser Val Val Ala
605605
Ser Pro Val Ala Thr 620Ser Pro Val Ala Thr 620
Ser Pro Ala Thr ThrSer Pro Ala Thr Thr
640640
- 226 046157- 226 046157
Ser TyrSer Tyr
Pro SerPro Ser
Thr TyrThr Tyr
Pro SerPro Ser
660660
Thr ThrThr Thr
Tyr Ser 675Tyr Ser 675
Phe ProPhe Pro
690690
Ser SerSer Ser
Pro Val 645Pro Val 645
Pro ValPro Val
Ser ValSer Val
Ala ValAla Val
Pro ThrPro Thr
His SerHis Ser
Pro ProPro Pro
680680
Thr Asn 695Thr Asn 695
Ser PheSer Phe
650650
Gly Phe 665Gly Phe 665
Ala PheAla Phe
Ser PheSer Phe
Ser Asp Met Thr Ala Thr Phe Ser Pro ArgSer Asp Met Thr Ala Thr Phe Ser Pro Arg
705 710 <210> 121 <211> 627 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>705 710 <210> 121 <211> 627 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
Ser SerSer Ser
Pro SerPro Ser
Pro AlaPro Ala
Ser AlaSer Ala
700700
Thr Ile 715 <223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 121 Met Ala Ala 1Thr Ile 715 <223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 121 Met Ala Ala 1
Ser Asp ProSer Asp Pro
Pro Lys Leu 35Pro Lys Leu 35
Leu Gly Ala 50Leu Gly Ala 50
Ala Lys Ala 5Ala Lys Ala 5
Phe Gly Ser 20Phe Gly Ser 20
Glu Glu MetGlu Glu Met
Ala Gly AlaAla Gly Ala
Glu Met GlnGlu Met Gln
Phe Pro HisPhe Pro His
Met Leu LeuMet Leu Leu
Pro Glu Gly 55Pro Glu Gly 55
Leu Met Ser 10Leu Met Ser 10
Ser Pro ThrSer Pro Thr
Ser Asn GlySer Asn Gly
Ser Gly Ser 60Ser Gly Ser 60
Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 65 70 75Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 65 70 75
SerSer
Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp ThrSer Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr
9090
Tyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp IleTyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile
100 105100 105
Glu Lys Val Leu Val Glu Thr SerGlu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser
115 120115 120
Tyr Pro Ser GlnTyr Pro Ser Gln
Pro Gly Ser SerPro Gly Ser Ser
655655
Pro Ser Val AlaPro Ser Val Ala
670670
Gln Val Ser Ser 685Gln Val Ser Ser 685
Ser Thr Gly LeuSer Thr Gly Leu
Glu Ile CysGlu Ile Cys
СинтетическийSynthetic
Pro Leu Gln IlePro Leu Gln Ile
Met Asp Asn Tyr 30Met Asp Asn Tyr 30
Ala Pro Gln Phe 45Ala Pro Gln Phe 45
Asn Ser Ser SerAsn Ser Ser Ser
Ser Asn Ser SerSer Asn Ser Ser
Gly Glu Gln ProGly Glu Gln Pro
Ser Leu Asn AsnSer Leu Asn Asn
110110
Thr Thr Arg Leu 125Thr Thr Arg Leu 125
- 227 046157- 227 046157
Pro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg PhePro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe
130 135130 135
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu ProSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro
145 150145 150
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro AlaLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala
165165
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala SerPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser
180 185180 185
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro
195 200195 200
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile PhePhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe
210 215210 215
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu 225 230Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu 225 230
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln ValPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val
245245
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu GlyPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly
260 265260 265
Pro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg ThrPro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr
275 280275 280
Leu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala ThrLeu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr
290 295290 295
Lys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln SerLys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser
305 310305 310
Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro SerMet Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser
325325
Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser CysPro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys
340 345340 345
Asp Asn Leu Thr Arg His Ile Arg IleAsp Asn Leu Thr Arg His Ile Arg Ile
355 360355 360
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn PheGln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe
370 375370 375
Leu Glu Pro Ala Pro AsnLeu Glu Pro Ala Pro Asn
140140
Phe Ser Leu Val Ser GlyPhe Ser Leu Val Ser Gly
155 160155 160
Ser Ser Ser Ala Pro SerSer Ser Ser Ala Pro Ser
175175
Ser Pro Pro Leu Ser CysSer Pro Pro Leu Ser Cys
190190
Tyr Ser Ala Ala Pro ThrTyr Ser Ala Ala Pro Thr
205205
Glu Pro Gln Ser Gln AlaGlu Pro Gln Ser Gln Ala
220220
Tyr Pro Pro Pro Ala TyrTyr Pro Pro Pro Ala Tyr
235 240235 240
Met Ile Pro Asp Tyr LeuMet Ile Pro Asp Tyr Leu
255255
Gly Thr Pro Asp Gln LysGly Thr Pro Asp Gln Lys
270270
Gln Pro Ser Leu Thr ProGln Pro Ser Leu Thr Pro
285285
Ser Gly Ser Gln Asp LeuSer Gly Ser Gln Asp Leu
300300
Leu Ile Lys Pro Ser ArgLeu Ile Lys Pro Ser Arg
315 320315 320
Thr Pro Pro His Glu ArgThr Pro Pro His Glu Arg
335335
Arg Arg Phe Ser Arg SerArg Arg Phe Ser Arg Ser
350350
Thr Gly Gln Lys Pro PheThr Gly Gln Lys Pro Phe
365365
His Ser Thr Thr Leu ThrHis Ser Thr Thr Leu Thr
380380
- 228 046157- 228 046157
Asn 385Asn 385
CysCys
ThrThr
PhePhe
GlnGln
Ser 465Ser 465
AlaAla
ThrThr
SerSer
ProPro
Pro 545Pro 545
ProPro
ProPro
GlnGln
SerSer
Glu 625Glu 625
His IleHis Ile
Gly ArgGly Arg
His ThrHis Thr
Ser ThrSer Thr
435435
Lys Pro 450Lys Pro 450
Ser LeuSer Leu
Cys AspCys Asp
His ThrHis Thr
Val ValVal Val
515515
Val Ala 530Val Ala 530
Ala ThrAla Thr
Gly SerGly Ser
Ser ValSer Val
Val SerVal Ser
595595
Thr Gly 610Thr Gly 610
Ile CysIle Cys
Arg ThrArg Thr
Lys PheLys Phe
405405
Gly Glu 420Gly Glu 420
Ser HisSer His
Phe GlnPhe Gln
Thr ArgThr Arg
Ile CysIle Cys
485485
Lys Ile 500Lys Ile 500
Ala SerAla Ser
Thr SerThr Ser
Thr SerThr Ser
Ser ThrSer Thr
565565
Ala Thr 580Ala Thr 580
Ser PheSer Phe
Leu SerLeu Ser
His Thr 390His Thr 390
Ala ArgAla Arg
Lys ProLys Pro
Ser LeuSer Leu
Cys ArgCysArg
455455
His Ile 470His Ile 470
Gly ArgGly Arg
His LeuHis Leu
Ser AlaSer Ala
Tyr ProTyr Pro
535535
Tyr Pro 550Tyr Pro 550
Tyr ProTyr Pro
Thr TyrThr Tyr
Pro SerPro Ser
Asp MetAsp Met
615615
Gly GluGly Glu
Ser AspSer Asp
Phe AlaPhe Ala
425425
Thr Glu 440Thr Glu 440
Ile CysIle Cys
Arg ThrArg Thr
Lys PheLys Phe
Arg GlnArg Gln
505505
Thr Ser 520Thr Ser 520
Ser ProSer Pro
Ser ProSer Pro
Ser ProSer Pro
Ser SerSer Ser
585585
Ser Ala 600Ser Ala 600
Thr AlaThr Ala
Lys ProLys Pro
395395
Phe AlaPhe Ala
Cys AspCys Asp
Asn Arg 410Asn Arg 410
Cys AspCys Asp
His IleHis Ile
Met ArgMet Arg
His ThrHis Thr
475475
Ala Arg 490Ala Arg 490
Lys AspLys Asp
Ser LeuSer Leu
Val ThrVal Thr
Val ProVal Pro
555555
Val His 570Val His 570
Val ProVal Pro
Val ThrVal Thr
Thr PheThr Phe
Lys ThrLys Thr
Ile CysIle Cys
Arg IleArg Ile
445445
Asn Phe 460Asn Phe 460
Gly GluGly Glu
Ser AspSer Asp
Lys LysLys Lys
Ser SerSer Ser
525525
Thr Ser 540Thr Ser 540
Thr SerThr Ser
Ser GlySer Gly
Pro AlaPro Ala
Asn SerAsn Ser
605605
Ser Pro 620Ser Pro 620
His IleHis Ile
415415
Gly Arg 430Gly Arg 430
His ThrHis Thr
Ser GlnSer Gln
Lys ProLys Pro
Asn ArgAsn Arg
495495
Ala Asp 510Ala Asp 510
Tyr ProTyr Pro
Tyr ProTyr Pro
Phe SerPhe Ser
Phe ProPhe Pro
575575
Phe Pro 590Phe Pro 590
Phe SerPhe Ser
Arg ThrArg Thr
Ile 400Ile 400
ArgArg
LysLys
GlyGly
SerSer
Phe 480Phe 480
LysLys
LysLys
SerSer
SerSer
Ser 560Ser 560
SerSer
AlaAla
AlaAla
IleIle
- 229 046157 <210> 122 <211> 473 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 229 046157 <210> 122 <211> 473 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 122<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 122
Met Thr Gly Lys Leu Ala Glu Lys Leu Pro Val ThrMet Thr Gly Lys Leu Ala Glu Lys Leu Pro Val Thr
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Met Ser Ser LeuMet Ser Ser Leu
Leu Asn Gln Leu Pro Asp 20Leu Asn Gln Leu Pro Asp 20
Asn Leu Tyr Pro Glu Glu 25Asn Leu Tyr Pro Glu Glu 25
Ile Pro Ser AlaIle Pro Ser Ala
Leu Asn Leu Phe Ser Gly 35Leu Asn Leu Phe Ser Gly 35
Ser Ser Asp Ser Val Val 40Ser Ser Asp Ser Val Val 40
His Tyr Asn Gln 45His Tyr Asn Gln 45
Met Ala Thr Glu Asn ValMet Ala Thr Glu Asn Val
Met Asp Ile Gly Leu Thr 55 60Met Asp Ile Gly Leu Thr 55 60
Asn Glu Lys ProAsn Glu Lys Pro
Asn Pro Glu Leu Ser Tyr 65 70Asn Pro Glu Leu Ser Tyr 65 70
Ser Gly Ser Phe Gln Pro 75Ser Gly Ser Phe Gln Pro 75
Ala Pro Gly Asn 80Ala Pro Gly Asn 80
Lys Thr Val Thr Tyr Leu 85Lys Thr Val Thr Tyr Leu 85
Gly Lys Phe Ala Phe Asp 90Gly Lys Phe Ala Phe Asp 90
Ser Pro Ser AsnSer Pro Ser Asn
Trp Cys Gln Asp Asn IleTrp Cys Gln Asp Asn Ile
100100
Ile Ser Leu Met Ser AlaIle Ser Leu Met Ser Ala
105105
Gly Ile Leu Gly 110Gly Ile Leu Gly 110
Val Pro Pro Ala Ser GlyVal Pro Pro Ala Ser Gly
115115
Ala Leu Ser Thr Gln ThrAla Leu Ser Thr Gln Thr
120120
Ser Thr Ala Ser 125Ser Thr Ala Ser 125
Met Val Gln Pro Pro GlnMet Val Gln Pro Pro Gln
130130
Gly Asp Val Glu Ala MetGly Asp Val Glu Ala Met
135 140135 140
Tyr Pro Ala LeuTyr Pro Ala Leu
Pro Pro Tyr Ser Asn CysPro Pro Tyr Ser Asn Cys
145 150145 150
Gly Asp Leu Tyr Ser GluGly Asp Leu Tyr Ser Glu
155155
Pro Val Ser PhePro Val Ser Phe
160160
His Asp Pro Gln Gly AsnHis Asp Pro Gln Gly Asn
165165
Pro Gly Leu Ala Tyr SerPro Gly Leu Ala Tyr Ser
170170
Pro Gln Asp TyrPro Gln Asp Tyr
175175
Gln Ser Ala Lys Pro AlaGln Ser Ala Lys Pro Ala
180180
Leu Asp Ser Asn Leu PheLeu Asp Ser Asn Leu Phe
185185
Pro Met Ile ProPro Met Ile Pro
190190
Asp Tyr Asn Leu Tyr HisAsp Tyr Asn Leu Tyr His
195195
His Pro Asn Asp Met GlyHis Pro Asn Asp Met Gly
200200
Ser Ile Pro Glu 205Ser Ile Pro Glu 205
- 230 046157- 230 046157
His Lys Pro Phe Gln 210His Lys Pro Phe Gln 210
Gly Met Asp Pro Ile 215Gly Met Asp Pro Ile 215
Arg Val Asn Pro Pro 220Arg Val Asn Pro Pro 220
Ile Thr Pro Leu Glu 225Ile Thr Pro Leu Glu 225
Thr Ile Lys Ala Phe 230Thr Ile Lys Ala Phe 230
Lys Asp Lys Gln Ile 235Lys Asp Lys Gln Ile 235
Pro Gly Phe Gly SerPro Gly Phe Gly Ser
245245
Leu Pro Gln Pro ProLeu Pro Gln Pro Pro
250250
Leu Thr Leu Lys ProLeu Thr Leu Lys Pro
255255
Arg Pro Arg Lys TyrArg Pro Arg Lys Tyr
260260
Pro Asn Arg Pro SerPro Asn Arg Pro Ser
265265
Lys Thr Pro Leu HisLys Thr Pro Leu His
270270
Arg Pro His Ala Cys 275Arg Pro His Ala Cys 275
Pro Ala Glu Gly Cys 280Pro Ala Glu Gly Cys 280
Asp Arg Arg Phe Ser 285Asp Arg Arg Phe Ser 285
Ser Asp Asn Leu ValSer Asp Asn Leu Val
290290
Arg His Leu Arg Ile 295Arg His Leu Arg Ile 295
His Thr Gly His LysHis Thr Gly His Lys
300300
Phe Gln Cys Arg Ile 305Phe Gln Cys Arg Ile 305
Cys Met Arg Ser Phe 310Cys Met Arg Ser Phe 310
Ser Arg Glu Asp Asn 315Ser Arg Glu Asp Asn 315
His Thr His Ile ArgHis Thr His Ile Arg
325325
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
330330
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
335335
Phe Cys Gly Arg LysPhe Cys Gly Arg Lys
340340
Phe Ala Arg Ser AspPhe Ala Arg Ser Asp
345345
Glu Leu Val Arg HisGlu Leu Val Arg His
350350
Lys Ile His Leu Lys 355Lys Ile His Leu Lys 355
Gln Lys Glu His Ala 360Gln Lys Glu His Ala 360
Cys Pro Ala Glu Gly 365Cys Pro Ala Glu Gly 365
Asp Arg Arg Phe SerAsp Arg Arg Phe Ser
370370
Gln Ser Gly Asn Leu 375Gln Ser Gly Asn Leu 375
Thr Glu His Leu ArgThr Glu His Leu Arg
380380
His Thr Gly His Lys 385His Thr Gly His Lys 385
Pro Phe Gln Cys Arg 390Pro Phe Gln Cys Arg 390
Ile Cys Met Arg Ser 395Ile Cys Met Arg Ser 395
Ser Thr Ser Gly HisSer Thr Ser Gly His
405405
Leu Val Arg His IleLeu Val Arg His Ile
410410
Arg Thr His Thr Gly 415Arg Thr His Thr Gly 415
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
420420
Glu Phe Cys Gly ArgGlu Phe Cys Gly Arg
425425
Lys Phe Ala Gln AsnLys Phe Ala Gln Asn
430430
Thr Leu Thr Glu HisThr Leu Thr Glu His
435435
Ala Lys Ile His Leu 440Ala Lys Ile His Leu 440
Lys Gln Lys Glu Lys 445Lys Gln Lys Glu Lys 445
Ala Glu Lys Gly Gly 450Ala Glu Lys Gly Gly 450
Ala Pro Ser Ala SerAla Pro Ser Ala Ser
455455
Ser Ala Pro Pro ValSer Ala Pro Pro Val
460460
ProPro
His 240His 240
IleIle
GluGlu
ArgArg
ProPro
Leu 320Leu 320
GluGlu
AlaAla
CysCys
IleIle
Phe 400Phe 400
GluGlu
SerSer
LysLys
SerSer
- 231 046157- 231 046157
Leu Ala Pro Val Val Thr Thr Cys AlaLeu Ala Pro Val Val Thr Thr Cys Ala
465465
470 <210> 123 <211> 627 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>470 <210> 123 <211> 627 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 123<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 123
Met Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met 1 5Met Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met 1 5
Gln Leu Met Ser Pro Leu Gln IleGln Leu Met Ser Pro Leu Gln Ile
1515
Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro 20Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro 20
His Ser Pro Thr Met Asp Asn Tyr 25 30His Ser Pro Thr Met Asp Asn Tyr 25 30
Pro Lys Leu Glu Glu Met Met LeuPro Lys Leu Glu Glu Met Met Leu
4040
Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln Phe 45Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln Phe 45
Leu Gly Ala Ala Gly Ala Pro GluLeu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu
5555
Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser Ser 60Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser Ser 60
Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly 65 70Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly 65 70
Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser SerGly Gly Gly Gly Ser Asn Ser Ser
8080
Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn ProSer Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro
Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln ProGln Ala Asp Thr Gly Glu Gln Pro
9595
Tyr Glu His Leu Thr Ala Glu SerTyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser
100100
Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn AsnPhe Pro Asp Ile Ser Leu Asn Asn
105 110105 110
Glu Lys Val Leu Val Glu Thr SerGlu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser
115 120115 120
Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg LeuTyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg Leu
125125
Pro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly ArgPro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg
130 135130 135
Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro AsnPhe Ser Leu Glu Pro Ala Pro Asn
140140
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro GluSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu
145 150145 150
Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser GlyPro Leu Phe Ser Leu Val Ser Gly
155 160155 160
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro ProLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro
165165
Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro SerAla Ser Ser Ser Ser Ala Pro Ser
170 175170 175
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser AlaPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala
180180
Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser CysSer Gln Ser Pro Pro Leu Ser Cys
185 190185 190
- 232 046157- 232 046157
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
195 200 205195 200 205
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnPhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
210 215 220210 215 220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala 225 230 235Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala 225 230 235
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp TyrPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr
245 250 255245 250 255
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp GlnPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp Gln
260 265 270260 265 270
Pro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu ThrPro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu Thr
275 280 285275 280 285
Leu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln AspLeu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln Asp
290 295 300290 295 300
Lys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro SerLys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser
305 310 315305 310 315
Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His GluMet Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu
325 330 335325 330 335
Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser ArgPro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg
340 345 350340 345 350
Asp Asn Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys ProAsp Asn Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro
355 360 365355 360 365
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp Asn LeuGln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu
370 375 380370 375 380
Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys AspThr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp
385 390 395385 390 395
Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His IleCys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Ile
405 410 415405 410 415
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly ArgThr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg
420 425 430420 425 430
Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Ile Arg Ile His ThrPhe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Ile Arg Ile His Thr
435 440 445435 440 445
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
LysLys
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
ArgArg
SerSer
PhePhe
ThrThr
Ile 400Ile 400
ArgArg
LysLys
GlyGly
- 233 046157- 233 046157
Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg AsnGln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
450 455 460450 455 460
Phe Ser Thr SerPhe Ser Thr Ser
Gly His Leu Thr Arg His Ile Arg Thr His Thr GlyGly His Leu Thr Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly
465 470 475465 470 475
Glu Lys Pro PheGlu Lys Pro Phe
480480
Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln SerAla Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Ser
485 490485 490
Ser Thr Arg LysSer Thr Arg Lys
495495
Glu His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp LysGlu His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Lys
500 505500 505
Lys Ala Asp LysLys Ala Asp Lys
510510
Ser Val Val Ala Ser Ser Ala Thr Ser Ser Leu SerSer Val Val Ala Ser Ser Ala Thr Ser Ser Leu Ser
515 520515 520
Ser Tyr Pro Ser 525Ser Tyr Pro Ser 525
Pro Val Ala Thr Ser Tyr Pro Ser Pro Val Thr ThrPro Val Ala Thr Ser Tyr Pro Ser Pro Val Thr Thr
530 535 540530 535 540
Ser Tyr Pro SerSer Tyr Pro Ser
Pro Ala Thr Thr Ser Tyr Pro Ser Pro Val Pro ThrPro Ala Thr Thr Ser Tyr Pro Ser Pro Val Pro Thr
545 550 555545 550 555
Ser Phe Ser SerSer Phe Ser Ser
560560
Pro Gly Ser Ser Thr Tyr Pro Ser Pro Val His SerPro Gly Ser Ser Thr Tyr Pro Ser Pro Val His Ser
565 570565 570
Gly Phe Pro SerGly Phe Pro Ser
575575
Pro Ser Val Ala Thr Thr Tyr Ser Ser Val Pro ProPro Ser Val Ala Thr Thr Tyr Ser Ser Val Pro Pro
580 585580 585
Ala Phe Pro AlaAla Phe Pro Ala
590590
Gln Val Ser Ser Phe Pro Ser Ser Ala Val Thr AsnGln Val Ser Ser Phe Pro Ser Ser Ala Val Thr Asn
595 600595 600
Ser Phe Ser Ala 605Ser Phe Ser Ala 605
Ser Thr Gly Leu Ser Asp Met Thr Ala Thr Phe SerSer Thr Gly Leu Ser Asp Met Thr Ala Thr Phe Ser
610 615 620610 615 620
Pro Arg Thr IlePro Arg Thr Ile
Glu Ile Cys 625 <210> 124 <211> 627 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Glu Ile Cys 625 <210> 124 <211> 627 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 124<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 124
Met Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met SerMet Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met Ser
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Pro Leu Gln IlePro Leu Gln Ile
- 234 046157- 234 046157
Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro His Ser ProSer Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro
2525
Thr Met Asp AsnThr Met Asp Asn
Pro LysPro Lys
Leu Glu Glu Met Met 35Leu Glu Glu Met Met 35
Leu Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln 40 45Leu Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln 40 45
Leu Gly Ala AlaLeu Gly Ala Ala
Gly Ala Pro Glu GlyGly Ala Pro Glu Gly
Ser Gly Ser Asn SerSer Gly Ser Asn Ser
SerSer
Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser 65 70 75Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser 65 70 75
Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln 85 90 95Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln 85 90 95
Tyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu AsnTyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn
100 105 110100 105 110
Glu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr ArgGlu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg
115 120 125115 120 125
Pro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala ProPro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro
130 135 140130 135 140
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val SerSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser
145 150 155145 150 155
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala ProLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro
165 170 175165 170 175
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu SerPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser
180 185 190180 185 190
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
195 200 205195 200 205
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnPhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
210 215 220210 215 220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro AlaPhe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala
225 230 235225 230 235
Pro Ala Ala LysPro Ala Ala Lys
Gly Gly Phe Gln ValGly Gly Phe Gln Val
245245
Pro Met 250Pro Met 250
Ile Pro Asp TyrIle Pro Asp Tyr
255255
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp LeuPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu
260260
Gly Leu Gly Thr Pro Asp GlnGly Leu Gly Thr Pro Asp Gln
265 270265 270
TyrTyr
PhePhe
SerSer
Ser 80Ser 80
ProPro
AsnAsn
LeuLeu
AsnAsn
Gly 160Gly 160
SerSer
CysCys
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
LysLys
- 235 046157- 235 046157
Pro Phe Gln Gly LeuPro Phe Gln Gly Leu
275275
Glu Ser Arg Thr Gln 280Glu Ser Arg Thr Gln 280
Gln Pro Ser Leu ThrGln Pro Ser Leu Thr
285285
Leu Ser Thr Ile Lys 290Leu Ser Thr Ile Lys 290
Ala Phe Ala Thr GlnAla Phe Ala Thr Gln
295295
Ser Gly Ser Gln AspSer Gly Ser Gln Asp
300300
Lys Ala Leu Asn Thr 305Lys Ala Leu Asn Thr 305
Ser Tyr Gln Ser Gln 310Ser Tyr Gln Ser Gln 310
Leu Ile Lys Pro Ser 315Leu Ile Lys Pro Ser 315
Met Arg Lys Tyr ProMet Arg Lys Tyr Pro
325325
Asn Arg Pro Ser LysAsn Arg Pro Ser Lys
330330
Thr Pro Pro His GluThr Pro Pro His Glu
335335
Pro Tyr Ala Cys ProPro Tyr Ala Cys Pro
340340
Val Glu Ser Cys AspVal Glu Ser Cys Asp
345345
Arg Arg Phe Ser ArgArg Arg Phe Ser Arg
350350
Asp Asn Leu Val Arg 355Asp Asn Leu Val Arg 355
His Ile Arg Ile His 360His Ile Arg Ile His 360
Thr Gly Gln Lys Pro 365Thr Gly Gln Lys Pro 365
Gln Cys Arg Ile CysGln Cys Arg Ile Cys
370370
Met Arg Asn Phe Ser 375Met Arg Asn Phe Ser 375
Arg Glu Asp Asn Leu 380Arg Glu Asp Asn Leu 380
Thr His Ile Arg Thr 385Thr His Ile Arg Thr 385
His Thr Gly Glu Lys 390His Thr Gly Glu Lys 390
Pro Phe Ala Cys Asp 395Pro Phe Ala Cys Asp 395
Cys Gly Arg Lys PheCys Gly Arg Lys Phe
405405
Ala Arg Ser Asp GluAla Arg Ser Asp Glu
410410
Leu Val Arg His IleLeu Val Arg His Ile
415415
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
420420
Lys Pro Phe Ala CysLys Pro Phe Ala Cys
425425
Asp Ile Cys Gly ArgAsp Ile Cys Gly Arg
430430
Phe Ser Gln Ser GlyPhe Ser Gln Ser Gly
435435
Asn Leu Thr Glu HisAsn Leu Thr Glu His
440440
Ile Arg Ile His Thr 445Ile Arg Ile His Thr 445
Gln Lys Pro Phe Gln 450Gln Lys Pro Phe Gln 450
Cys Arg Ile Cys MetCys Arg Ile Cys Met
455455
Arg Asn Phe Ser ThrArg Asn Phe Ser Thr
460460
Gly His Leu Val Arg 465Gly His Leu Val Arg 465
His Ile Arg Thr His 470His Ile Arg Thr His 470
Thr Gly Glu Lys Pro 475Thr Gly Glu Lys Pro 475
Ala Cys Asp Ile CysAla Cys Asp Ile Cys
485485
Gly Arg Lys Phe AlaGly Arg Lys Phe Ala
490490
Gln Asn Ser Thr LeuGln Asn Ser Thr Leu
495495
Glu His Thr Lys IleGlu His Thr Lys Ile
500500
His Leu Arg Gln LysHis Leu Arg Gln Lys
505505
Asp Lys Lys Ala AspAsp Lys Lys Ala Asp
510510
Ser Val Val Ala SerSer Val Val Ala Ser
Ser Ala Thr Ser SerSer Ala Thr Ser Ser
Leu Ser Ser Tyr ProLeu Ser Ser Tyr Pro
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
ArgArg
SerSer
PhePhe
HisHis
Ile 400Ile 400
ArgArg
LysLys
GlyGly
SerSer
Phe 480Phe 480
ThrThr
LysLys
SerSer
- 236 046157- 236 046157
Pro ValPro Val
530530
Pro Ala 545Pro Ala 545
Pro GlyPro Gly
Pro SerPro Ser
Gln ValGln Val
Ser ThrSer Thr
610610
515515
Ala ThrAla Thr
Thr ThrThr Thr
Ser SerSer Ser
Val AlaVal Ala
580580
Ser Ser 595Ser Ser 595
Gly LeuGly Leu
Ser TyrSer Tyr
Ser TyrSer Tyr
550550
Thr Tyr 565Thr Tyr 565
Thr ThrThr Thr
Phe ProPhe Pro
Ser AspSer Asp
520520
Pro Ser 535Pro Ser 535
Pro SerPro Ser
Pro SerPro Ser
Tyr SerTyr Ser
Ser SerSer Ser
600600
Met Thr 615Met Thr 615
525525
Pro ValPro Val
Pro ValPro Val
Pro ValPro Val
570570
Ser ValSer Val
585585
Ala ValAla Val
Ala ThrAla Thr
Glu Ile Cys 625Glu Ile Cys 625
Thr ThrThr Thr
540540
Pro Thr 555Pro Thr 555
His SerHis Ser
Pro ProPro Pro
Thr AsnThr Asn
Phe SerPhe Ser
620 <210> 125 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>620 <210> 125 <211> 272 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 125<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 125
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile HisMet Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His
5 105 10
Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro 20 25Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro 20 25
Ser Phe Ser Ser Pro Ala Asp Leu Thr Arg His GlnSer Phe Ser Ser Pro Ala Asp Leu Thr Arg His Gln
4040
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly LysGly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys
55 6055 60
Ser Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His ThrSer Asp Asn Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr
70 7570 75
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser ArgTyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg
9090
Ser Tyr Pro SerSer Tyr Pro Ser
Ser Phe Ser SerSer Phe Ser Ser
560560
Gly Phe Pro SerGly Phe Pro Ser
575575
Ala Phe Pro AlaAla Phe Pro Ala
590590
Ser Phe Ser Ala 605Ser Phe Ser Ala 605
Pro Arg Thr IlePro Arg Thr Ile
СинтетическийSynthetic
Gly Val Pro Ala 15Gly Val Pro Ala 15
Glu Cys Gly Lys 30Glu Cys Gly Lys 30
Arg Thr His Thr 45Arg Thr His Thr 45
Ser Phe Ser ArgSer Phe Ser Arg
Gly Glu Lys Pro 80Gly Glu Lys Pro 80
Glu Asp Asn LeuGlu Asp Asn Leu
- 237 046157- 237 046157
His Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu LysHis Thr His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys
100 105100 105
Pro Tyr Lys Cys ProPro Tyr Lys Cys Pro
110110
Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His GlnGlu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln
115 120 125115 120 125
Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly LysArg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys
130 135 140130 135 140
Ser Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His ThrSer Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser ThrGly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr
165 170 175165 170 175
Ser Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys ThrSer Gly His Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Lys Lys Thr
180 185 190180 185 190
Ser Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys LysSer Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys Lys
195 200 205195 200 205
Lys Gly Ser Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Leu Glu Asp AlaLys Gly Ser Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Leu Glu Asp Ala
210 215 220210 215 220
Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp AspLeu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp
225 230 235 240225 230 235 240
Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp LeuPhe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu
245 250 255245 250 255
Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met LeuAsp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu
260 265 270 <210> 126 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>260 265 270 <210> 126 <211> 272 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 126<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 126
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His Gly Val Pro AlaMet Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His Gly Val Pro Ala
5 10 155 10 15
Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro TyrAla Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr
2525
Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 30Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys 30
- 238 046157- 238 046157
Ser Phe Ser Asp Pro 35Ser Phe Ser Asp Pro 35
Gly Ala Leu Val Arg 40Gly Ala Leu Val Arg 40
His Gln Arg Thr His 45His Gln Arg Thr His 45
Gly Glu Lys Pro Tyr 50Gly Glu Lys Pro Tyr 50
Lys Cys Pro Glu Cys 55Lys Cys Pro Glu Cys 55
Gly Lys Ser Phe Ser 60Gly Lys Ser Phe Ser 60
Ser Asp Asn Leu Val 65Ser Asp Asn Leu Val 65
Arg His Gln Arg Thr 70Arg His Gln Arg Thr 70
His Thr Gly Glu Lys 75His Thr Gly Glu Lys 75
Tyr Lys Cys Pro Glu 85Tyr Lys Cys Pro Glu 85
Cys Gly Lys Ser PheCys Gly Lys Ser Phe
Ser Gln Ser Gly AspSer Gln Ser Gly Asp
Arg Arg His Gln ArgArg Arg His Gln Arg
100100
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
105105
Lys Pro Tyr Lys CysLys Pro Tyr Lys Cys
110110
Glu Cys Gly Lys Ser 115Glu Cys Gly Lys Ser 115
Phe Ser Thr His LeuPhe Ser Thr His Leu
120120
Asp Leu Ile Arg His 125Asp Leu Ile Arg His 125
Arg Thr His Thr Gly 130Arg Thr His Thr Gly 130
Glu Lys Pro Tyr Lys 135Glu Lys Pro Tyr Lys 135
Cys Pro Glu Cys GlyCys Pro Glu Cys Gly
140140
Ser Phe Ser Thr Ser 145Ser Phe Ser Thr Ser 145
Gly Asn Leu Val Arg 150Gly Asn Leu Val Arg 150
His Gln Arg Thr His 155His Gln Arg Thr His 155
Gly Glu Lys Pro TyrGly Glu Lys Pro Tyr
165165
Lys Cys Pro Glu CysLys Cys Pro Glu Cys
170170
Gly Lys Ser Phe SerGly Lys Ser Phe Ser
175175
Ser Asp Asn Leu ValSer Asp Asn Leu Val
180180
Arg His Gln Arg ThrArg His Gln Arg Thr
185185
His Thr Gly Lys LysHis Thr Gly Lys Lys
190190
Ser Lys Arg Pro AlaSer Lys Arg Pro Ala
195195
Ala Thr Lys Lys Ala 200Ala Thr Lys Lys Ala 200
Gly Gln Ala Lys Lys 205Gly Gln Ala Lys Lys 205
Lys Gly Ser Tyr ProLys Gly Ser Tyr Pro
210210
Tyr Asp Val Pro AspTyr Asp Val Pro Asp
215215
Tyr Ala Leu Glu AspTyr Ala Leu Glu Asp
220220
Leu Asp Asp Phe Asp 225Leu Asp Asp Phe Asp 225
Leu Asp Met Leu Gly 230Leu Asp Met Leu Gly 230
Ser Asp Ala Leu Asp 235Ser Asp Ala Leu Asp 235
Phe Asp Leu Asp MetPhe Asp Leu Asp Met
245245
Leu Gly Ser Asp AlaLeu Gly Ser Asp Ala
250250
Leu Asp Asp Phe AspLeu Asp Asp Phe Asp
255255
Asp Met Leu Gly SerAsp Met Leu Gly Ser
260260
Asp Ala Leu Asp AspAsp Ala Leu Asp Asp
265265
Phe Asp Leu Asp MetPhe Asp Leu Asp Met
270270
ThrThr
ArgArg
Pro 80Pro 80
LeuLeu
ProPro
GlnGln
LysLys
Thr 160Thr 160
ArgArg
ThrThr
LysLys
AlaAla
Asp 240Asp 240
LeuLeu
Leu <210> 127 <211> 261Leu <210> 127 <211> 261
- 239 046157 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 239 046157 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 127<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 127
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile HisMet Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His
5 105 10
Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro 20 25Ala Leu Glu Pro Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro 20 25
СинтетическийSynthetic
Gly Val Pro Ala 15Gly Val Pro Ala 15
Glu Cys Gly Lys 30Glu Cys Gly Lys 30
Ser Phe Ser Arg Ser Asp 35Ser Phe Ser Arg Ser Asp 35
Asn Leu Val Arg His Gln 40Asn Leu Val Arg His Gln 40
Arg Thr His Thr 45Arg Thr His Thr 45
Gly Glu Lys Pro Tyr Lys 50Gly Glu Lys Pro Tyr Lys 50
Cys Pro Glu Cys Gly Lys 55 60Cys Pro Glu Cys Gly Lys 55 60
Ser Phe Ser ArgSer Phe Ser Arg
Glu Asp Asn Leu His Thr 65 70Glu Asp Asn Leu His Thr 65 70
His Gln Arg Thr His Thr 75His Gln Arg Thr His Thr 75
Gly Glu Lys Pro 80Gly Glu Lys Pro 80
Tyr Lys Cys Pro Glu Cys 85Tyr Lys Cys Pro Glu Cys 85
Gly Lys Ser Phe Ser Arg 90Gly Lys Ser Phe Ser Arg 90
Ser Asp Glu Leu 95Ser Asp Glu Leu 95
Val Arg His Gln Arg ThrVal Arg His Gln Arg Thr
100100
His Thr Gly Glu Lys ProHis Thr Gly Glu Lys Pro
105105
Tyr Lys Cys Pro 110Tyr Lys Cys Pro 110
Glu Cys Gly Lys Ser Phe 115Glu Cys Gly Lys Ser Phe 115
Ser Gln Ser Gly Asn LeuSer Gln Ser Gly Asn Leu
120120
Thr Glu His Gln 125Thr Glu His Gln 125
Arg Thr His Thr Gly Glu 130Arg Thr His Thr Gly Glu 130
Lys Pro Tyr Lys Cys ProLys Pro Tyr Lys Cys Pro
135 140135 140
Glu Cys Gly LysGlu Cys Gly Lys
Ser Phe Ser Thr Ser GlySer Phe Ser Thr Ser Gly
145 150145 150
His Leu Val Arg His Gln 155His Leu Val Arg His Gln 155
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
160160
Gly Glu Lys Pro Tyr LysGly Glu Lys Pro Tyr Lys
165165
Cys Pro Glu Cys Gly LysCys Pro Glu Cys Gly Lys
170170
Ser Phe Ser GlnSer Phe Ser Gln
175175
Asn Ser Thr Leu Thr GluAsn Ser Thr Leu Thr Glu
180180
His Gln Arg Thr His ThrHis Gln Arg Thr His Thr
185185
Gly Lys Lys Thr 190Gly Lys Lys Thr 190
Ser Lys Arg Pro Ala AlaSer Lys Arg Pro Ala Ala
195195
Thr Lys Lys Ala Gly GlnThr Lys Lys Ala Gly Gln
200200
Ala Lys Lys Lys 205Ala Lys Lys Lys 205
Lys Gly Ser Asp Ala LeuLys Gly Ser Asp Ala Leu
210210
Asp Asp Phe Asp Leu AspAsp Asp Phe Asp Leu Asp
215 220215 220
Met Leu Gly SerMet Leu Gly Ser
- 240 046157- 240 046157
Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu GlyAsp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly
225 230 235225 230 235
Ser Asp Ala LeuSer Asp Ala Leu
240240
Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp AlaAsp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala
245 250245 250
Leu Asp Asp PheLeu Asp Asp Phe
255255
Asp Leu Asp Met LeuAsp Leu Asp Met Leu
260 <210> 128 <211> 386 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>260 <210> 128 <211> 386 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 128<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 128
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly TyrMet Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr
5 105 10
СинтетическийSynthetic
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His 20 25Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His 20 25
Ala Leu Arg Thr 30Ala Leu Arg Thr 30
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser GlyLeu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly
4040
Leu Arg Pro Arg 45Leu Arg Pro Arg 45
Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln ProGly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro
55 6055 60
Gly Ala Leu AlaGly Ala Leu Ala
Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro 65 70 75Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro 65 70 75
Phe Pro Ala ValPhe Pro Ala Val
Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro 85 90Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro 85 90
Val Ala Thr ProVal Ala Thr Pro
Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala ProTyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro
100 105100 105
Gly Gly Pro Pro 110Gly Gly Pro Pro 110
Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro ProGly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro
115 120115 120
Pro Pro Ala His 125Pro Pro Ala His 125
Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp GluAla Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu
130 135 140130 135 140
Glu Ala Leu ThrGlu Ala Leu Thr
Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val ArgSer Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg
145 150 155145 150 155
Glu Leu Pro GluGlu Leu Pro Glu
160160
- 241 046157- 241 046157
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlnSer Val Ser Cys Gln
185185
Ser Gln Leu Ile LysSer Gln Leu Ile Lys
190190
Ser Arg Met Arg LysSer Arg Met Arg Lys
195195
Tyr Pro Asn Arg ProTyr Pro Asn Arg Pro
200200
Ser Lys Thr Pro ProSer Lys Thr Pro Pro
205205
Glu Arg Pro Tyr AlaGlu Arg Pro Tyr Ala
210210
Cys Pro Val Glu SerCys Pro Val Glu Ser
215215
Cys Asp Arg Arg Phe 220Cys Asp Arg Arg Phe 220
Arg Ser Asp Asn Leu 225Arg Ser Asp Asn Leu 225
Val Arg His Ile Arg 230Val Arg His Ile Arg 230
Ile His Thr Gly Gln 235Ile His Thr Gly Gln 235
Pro Phe Gln Cys ArgPro Phe Gln Cys Arg
245245
Ile Cys Met Arg AsnIle Cys Met Arg Asn
250250
Phe Ser Arg Glu AspPhe Ser Arg Glu Asp
255255
Leu His Thr His IleLeu His Thr His Ile
260260
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
265265
Glu Lys Pro Phe AlaGlu Lys Pro Phe Ala
270270
Asp Ile Cys Gly Arg 275Asp Ile Cys Gly Arg 275
Lys Phe Ala Arg Ser 280Lys Phe Ala Arg Ser 280
Asp Glu Leu Val Arg 285Asp Glu Leu Val Arg 285
Thr Lys Ile His Leu 290Thr Lys Ile His Leu 290
Arg Gln Lys Asp Arg 295Arg Gln Lys Asp Arg 295
Pro Tyr Ala Cys Pro 300Pro Tyr Ala Cys Pro 300
Glu Ser Cys Asp Arg 305Glu Ser Cys Asp Arg 305
Arg Phe Ser Gln Ser 310Arg Phe Ser Gln Ser 310
Gly Asn Leu Thr Glu 315Gly Asn Leu Thr Glu 315
Ile Arg Ile His ThrIle Arg Ile His Thr
325325
Gly Gln Lys Pro PheGly Gln Lys Pro Phe
330330
Gln Cys Arg Ile CysGln Cys Arg Ile Cys
335335
Arg Asn Phe Ser ThrArg Asn Phe Ser Thr
340340
Ser Gly His Leu ValSer Gly His Leu Val
345345
Arg His Ile Arg ThrArg His Ile Arg Thr
350350
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
355355
Phe Ala Cys Asp Ile 360Phe Ala Cys Asp Ile 360
Cys Gly Arg Lys Phe 365Cys Gly Arg Lys Phe 365
Gln Asn Ser Thr LeuGln Asn Ser Thr Leu
370370
Thr Glu His Thr LysThr Glu His Thr Lys
375375
Ile His Leu Arg GlnIle His Leu Arg Gln
380380
SerSer
ProPro
HisHis
SerSer
Lys 240Lys 240
AsnAsn
CysCys
HisHis
ValVal
His 320His 320
MetMet
HisHis
AlaAla
LysLys
Asp Lys 385 <210> 129 <211> 402 <212> БелокAsp Lys 385 <210> 129 <211> 402 <212> Protein
- 242 046157 <213> Искусственная последовательность <220>- 242 046157 <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 129<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 129
СинтетическийSynthetic
Met Ala Ala 1Met Ala Ala 1
Asp His Leu 5Asp His Leu 5
Met Leu AlaMet Leu Ala
Glu Gly Tyr 10Glu Gly Tyr 10
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Arg Pro ProArg Pro Pro
Ser Ala Ala 20Ser Ala Ala 20
Ala Ala HisAla Ala His
Gly Pro HisGly Pro His
Ala Leu Arg Thr 30Ala Leu Arg Thr 30
Leu Pro ProLeu Pro Pro
Tyr Ala GlyTyr Ala Gly
Pro Gly Leu 40Pro Gly Leu 40
Asp Ser GlyAsp Ser Gly
Leu Arg Pro Arg 45Leu Arg Pro Arg 45
Gly Ala Pro 50Gly Ala Pro 50
Leu Gly ProLeu Gly Pro
Pro Pro Pro 55Pro Pro Pro 55
Arg Gln ProArg Gln Pro
Gly Ala Leu AlaGly Ala Leu Ala
Tyr Gly Ala 65Tyr Gly Ala 65
Phe Gly ProPhe Gly Pro
Pro Ser SerPro Ser Ser
Phe Gln ProPhe Gln Pro
Phe Pro Ala ValPhe Pro Ala Val
Pro Pro ProPro Pro Pro
Ala Ala Gly 85Ala Ala Gly 85
Ile Ala HisIle Ala His
Leu Gln Pro 90Leu Gln Pro 90
Val Ala Thr ProVal Ala Thr Pro
Tyr Pro GlyTyr Pro Gly
Arg Ala Ala 100Arg Ala Ala 100
Ala Pro ProAla Pro Pro
105105
Asn Ala ProAsn Ala Pro
Gly Gly Pro Pro 110Gly Gly Pro Pro 110
Gly Pro GlnGly Pro Gln
115115
Pro Ala ProPro Ala Pro
Ser Ala AlaSer Ala Ala
120120
Ala Pro ProAla Pro Pro
Pro Pro Ala His 125Pro Pro Ala His 125
Ala Leu GlyAla Leu Gly
130130
Gly Met AspGly Met Asp
Ala Glu Leu 135Ala Glu Leu 135
Ile Asp GluIle Asp Glu
140140
Glu Ala Leu ThrGlu Ala Leu Thr
Ser Leu Glu 145Ser Leu Glu 145
Leu Glu LeuLeu Glu Leu
150150
Gly Leu HisGly Leu His
Arg Val ArgArg Val Arg
155155
Glu Leu Pro GluGlu Leu Pro Glu
160160
Leu Phe LeuLeu Phe Leu
Gly Gln SerGly Gln Ser
165165
Glu Phe AspGlu Phe Asp
Cys Phe Ser 170Cys Phe Ser 170
Asp Leu Gly SerAsp Leu Gly Ser
175175
Ala Pro ProAla Pro Pro
Ala Gly Ser 180Ala Gly Ser 180
Val Ser CysVal Ser Cys
185185
Gly Gly SerGly Gly Ser
Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser
190190
Gly Gly GlyGly Gly Gly
195195
Ser Gly GlySer Gly Gly
Gly Ser GlyGly Ser Gly
200200
Gln Ser GlnGln Ser Gln
Leu Ile Lys Pro 205Leu Ile Lys Pro 205
Ser Arg MetSer Arg Met
210210
Arg Lys TyrArg Lys Tyr
Pro Asn Arg 215Pro Asn Arg 215
Pro Ser LysPro Ser Lys
220220
Thr Pro Pro HisThr Pro Pro His
- 243 046157- 243 046157
Glu Arg Pro 225Glu Arg Pro 225
Arg Ser AspArg Ser Asp
Pro Phe GlnPro Phe Gln
Leu His ThrLeu His Thr
275275
Tyr Ala CysTyr Ala Cys
230230
Pro Val GluPro Val Glu
Ser Cys AspSer Cys Asp
235235
Arg Arg Phe SerArg Arg Phe Ser
240240
Asp IleAsp Ile
290290
Thr Lys 305Thr Lys 305
Glu SerGlu Ser
Ile ArgIle Arg
Arg AsnArg Asn
Thr GlyThr Gly
370370
Gln Asn 385Gln Asn 385
Asp Lys <210>Asp Lys <210>
<211><211>
<212><212>
Asn Leu ValAsn Leu Val
245245
Arg His IleArg His Ile
Arg Ile His 250Arg Ile His 250
Thr Gly Gln LysThr Gly Gln Lys
255255
Cys Arg Ile 260Cys Arg Ile 260
His Ile ArgHis Ile Arg
Cys Met ArgCys Met Arg
265265
Thr His ThrThr His Thr
280280
Asn Phe SerAsn Phe Ser
Gly Glu LysGly Glu Lys
Cys GlyCys Gly
Arg LysArg Lys
Ile HisIle His
Leu ArgLeu Arg
310310
Cys AspCys Asp
Arg Arg 325Arg Arg 325
Ile HisIle His
340340
Thr GlyThr Gly
Phe Ser 355Phe Ser 355
Glu LysGlu Lys
Ser ThrSer Thr
130130
569 Белок569 Protein
Thr SerThr Ser
Pro PhePro Phe
Leu ThrLeu Thr
390390
Phe Ala 295Phe Ala 295
Gln LysGln Lys
Phe SerPhe Ser
Gln LysGln Lys
Gly His 360Gly His 360
Ala Cys 375Ala Cys 375
Glu HisGlu His
Arg SerArg Ser
Asp GluAsp Glu
300300
Asp ArgAsp Arg
Pro Tyr 315Pro Tyr 315
Arg Glu Asp Asn 270Arg Glu Asp Asn 270
Pro Phe Ala Cys 285Pro Phe Ala Cys 285
Leu Val Arg HisLeu Val Arg His
Ala Cys Pro ValAla Cys Pro Val
320320
Gln SerGln Ser
330330
Gly AsnGly Asn
Leu Thr Glu HisLeu Thr Glu His
335335
Pro Phe 345Pro Phe 345
Gln CysGln Cys
Arg Ile Cys MetArg Ile Cys Met
350350
Leu ValLeu Val
Arg HisArg His
Ile Arg Thr His 365Ile Arg Thr His 365
Asp IleAsp Ile
Cys GlyCys Gly
380380
Arg Lys Phe AlaArg Lys Phe Ala
Thr LysThr Lys
Ile HisIle His
395395
Leu Arg Gln LysLeu Arg Gln Lys
400 <213> Искусственная последовательность <220>400 <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
Синтетический <400> 130Synthetic <400> 130
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly TyrMet Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr
5 105 10
Arg Leu Val Gln 15Arg Leu Val Gln 15
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro HisArg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His
Ala Leu Arg ThrAla Leu Arg Thr
- 244 046157- 244 046157
Leu Pro Pro Tyr Ala 35Leu Pro Pro Tyr Ala 35
Gly Pro Gly Leu Asp 40Gly Pro Gly Leu Asp 40
Ser Gly Leu Arg Pro 45Ser Gly Leu Arg Pro 45
Gly Ala Pro Leu Gly 50Gly Ala Pro Leu Gly 50
Pro Pro Pro Pro Arg 55Pro Pro Pro Pro Arg 55
Gln Pro Gly Ala Leu 60Gln Pro Gly Ala Leu 60
Tyr Gly Ala Phe Gly 65Tyr Gly Ala Phe Gly 65
Pro Pro Ser Ser Phe 70Pro Pro Ser Ser Phe 70
Gln Pro Phe Pro Ala 75Gln Pro Phe Pro Ala 75
Pro Pro Pro Ala AlaPro Pro Pro Ala Ala
Gly Ile Ala His LeuGly Ile Ala His Leu
Gln Pro Val Ala ThrGln Pro Val Ala Thr
Tyr Pro Gly Arg AlaTyr Pro Gly Arg Ala
100100
Ala Ala Pro Pro AsnAla Ala Pro Pro Asn
105105
Ala Pro Gly Gly ProAla Pro Gly Gly Pro
110110
Gly Pro Gln Pro AlaGly Pro Gln Pro Ala
115115
Pro Ser Ala Ala AlaPro Ser Ala Ala Ala
120120
Pro Pro Pro Pro AlaPro Pro Pro Pro Ala
125125
Ala Leu Gly Gly MetAla Leu Gly Gly Met
130130
Asp Ala Glu Leu Ile 135Asp Ala Glu Leu Ile 135
Asp Glu Glu Ala Leu 140Asp Glu Glu Ala Leu 140
Ser Leu Glu Leu Glu 145Ser Leu Glu Leu Glu 145
Leu Gly Leu His Arg 150Leu Gly Leu His Arg 150
Val Arg Glu Leu Pro 155Val Arg Glu Leu Pro 155
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys AlaSer Val Ser Cys Ala
185185
Asp His Leu Met LeuAsp His Leu Met Leu
190190
Glu Gly Tyr Arg Leu 195Glu Gly Tyr Arg Leu 195
Val Gln Arg Pro ProVal Gln Arg Pro Pro
200200
Ser Ala Ala Ala AlaSer Ala Ala Ala Ala
205205
Gly Pro His Ala LeuGly Pro His Ala Leu
210210
Arg Thr Leu Pro Pro 215Arg Thr Leu Pro Pro 215
Tyr Ala Gly Pro GlyTyr Ala Gly Pro Gly
220220
Asp Ser Gly Leu Arg 225Asp Ser Gly Leu Arg 225
Pro Arg Gly Ala Pro 230Pro Arg Gly Ala Pro 230
Leu Gly Pro Pro Pro 235Leu Gly Pro Pro Pro 235
Arg Gln Pro Gly AlaArg Gln Pro Gly Ala
245245
Leu Ala Tyr Gly AlaLeu Ala Tyr Gly Ala
250250
Phe Gly Pro Pro SerPhe Gly Pro Pro Ser
255255
Phe Gln Pro Phe ProPhe Gln Pro Phe Pro
260260
Ala Val Pro Pro ProAla Val Pro Pro Pro
265265
Ala Ala Gly Ile AlaAla Ala Gly Ile Ala
270270
ArgArg
AlaAla
Val 80Val 80
ProPro
ProPro
HisHis
ThrThr
Glu 160Glu 160
SerSer
AlaAla
HisHis
LeuLeu
Pro 240Pro 240
SerSer
HisHis
- 245 046157- 245 046157
Leu Gln Pro Val AlaLeu Gln Pro Val Ala
275275
Thr Pro Tyr Pro GlyThr Pro Tyr Pro Gly
280280
Arg Ala Ala Ala Pro 285Arg Ala Ala Ala Pro 285
Asn Ala Pro Gly GlyAsn Ala Pro Gly Gly
290290
Pro Pro Gly Pro GlnPro Pro Gly Pro Gln
295295
Pro Ala Pro Ser AlaPro Ala Pro Ser Ala
300300
Ala Pro Pro Pro Pro 305Ala Pro Pro Pro Pro 305
Ala His Ala Leu Gly 310Ala His Ala Leu Gly 310
Gly Met Asp Ala Glu 315Gly Met Asp Ala Glu 315
Ile Asp Glu Glu AlaIle Asp Glu Glu Ala
325325
Leu Thr Ser Leu GluLeu Thr Ser Leu Glu
330330
Leu Glu Leu Gly LeuLeu Glu Leu Gly Leu
335335
Arg Val Arg Glu LeuArg Val Arg Glu Leu
340340
Pro Glu Leu Phe LeuPro Glu Leu Phe Leu
345345
Gly Gln Ser Glu PheGly Gln Ser Glu Phe
350350
Cys Phe Ser Asp LeuCys Phe Ser Asp Leu
355355
Gly Ser Ala Pro Pro 360Gly Ser Ala Pro Pro 360
Ala Gly Ser Val Ser 365Ala Gly Ser Val Ser 365
Gln Ser Gln Leu IleGln Ser Gln Leu Ile
370370
Lys Pro Ser Arg MetLys Pro Ser Arg Met
375375
Arg Lys Tyr Pro AsnArg Lys Tyr Pro Asn
380380
Pro Ser Lys Thr Pro 385Pro Ser Lys Thr Pro 385
Pro His Glu Arg Pro 390Pro His Glu Arg Pro 390
Tyr Ala Cys Pro Val 395Tyr Ala Cys Pro Val 395
Ser Cys Asp Arg ArgSer Cys Asp Arg Arg
405405
Phe Ser Arg Ser AspPhe Ser Arg Ser Asp
410410
Asn Leu Val Arg HisAsn Leu Val Arg His
415415
Arg Ile His Thr GlyArg Ile His Thr Gly
420420
Gln Lys Pro Phe GlnGln Lys Pro Phe Gln
425425
Cys Arg Ile Cys MetCys Arg Ile Cys Met
430430
Asn Phe Ser Arg Glu 435Asn Phe Ser Arg Glu 435
Asp Asn Leu His Thr 440Asp Asn Leu His Thr 440
His Ile Arg Thr His 445His Ile Arg Thr His 445
Gly Glu Lys Pro PheGly Glu Lys Pro Phe
450450
Ala Cys Asp Ile Cys 455Ala Cys Asp Ile Cys 455
Gly Arg Lys Phe AlaGly Arg Lys Phe Ala
460460
Ser Asp Glu Leu Val 465Ser Asp Glu Leu Val 465
Arg His Thr Lys Ile 470Arg His Thr Lys Ile 470
His Leu Arg Gln Lys 475His Leu Arg Gln Lys 475
Arg Pro Tyr Ala CysArg Pro Tyr Ala Cys
485485
Pro Val Glu Ser CysPro Val Glu Ser Cys
490490
Asp Arg Arg Phe SerAsp Arg Arg Phe Ser
495495
Ser Gly Asn Leu ThrSer Gly Asn Leu Thr
500500
Glu His Ile Arg IleGlu His Ile Arg Ile
505505
His Thr Gly Gln LysHis Thr Gly Gln Lys
510510
Phe Gln Cys Arg Ile 515Phe Gln Cys Arg Ile 515
Cys Met Arg Asn PheCys Met Arg Asn Phe
520520
Ser Thr Ser Gly HisSer Thr Ser Gly His
525525
ProPro
AlaAla
Leu 320Leu 320
HisHis
AspAsp
CysCys
ArgArg
Glu 400Glu 400
IleIle
ArgArg
ThrThr
ArgArg
Asp 480Asp 480
GlnGln
ProPro
LeuLeu
- 246 046157- 246 046157
Val Arg His Ile Arg Thr His ThrVal Arg His Ile Arg Thr His Thr
530 535530 535
Gly Glu LysGly Glu Lys
Pro Phe Ala Cys Asp 540Pro Phe Ala Cys Asp 540
Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu His ThrIle Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu His Thr
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp LysLys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Lys
565 <210> 131 <211> 585 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>565 <210> 131 <211> 585 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 131<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 131
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val GlnMet Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln
5 10155 1015
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 20 2530Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 20 2530
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 35 4045Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 35 4045
Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 50 5560Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 50 5560
Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val 65 70 7580Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val 65 70 7580
Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro 85 9095Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro 85 9095
Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro ProTyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro Pro
100 105110100 105110
Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala HisGly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala His
115 120125115 120125
Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu ThrAla Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr
130 135140130 135140
Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro GluSer Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu
145 150 155160145 150 155160
- 247 046157- 247 046157
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlySer Val Ser Cys Gly
185185
Gly Ser Gly Gly GlyGly Ser Gly Gly Gly
190190
Gly Ala Asp His LeuGly Ala Asp His Leu
195195
Met Leu Ala Glu Gly 200Met Leu Ala Glu Gly 200
Tyr Arg Leu Val Gln 205Tyr Arg Leu Val Gln 205
Pro Pro Ser Ala AlaPro Pro Ser Ala Ala
210210
Ala Ala His Gly Pro 215Ala Ala His Gly Pro 215
His Ala Leu Arg ThrHis Ala Leu Arg Thr
220220
Pro Pro Tyr Ala Gly 225Pro Pro Tyr Ala Gly 225
Pro Gly Leu Asp Ser 230Pro Gly Leu Asp Ser 230
Gly Leu Arg Pro Arg 235Gly Leu Arg Pro Arg 235
Ala Pro Leu Gly ProAla Pro Leu Gly Pro
245245
Pro Pro Pro Arg GlnPro Pro Pro Arg Gln
250250
Pro Gly Ala Leu AlaPro Gly Ala Leu Ala
255255
Gly Ala Phe Gly ProGly Ala Phe Gly Pro
260260
Pro Ser Ser Phe GlnPro Ser Ser Phe Gln
265265
Pro Phe Pro Ala ValPro Phe Pro Ala Val
270270
Pro Pro Ala Ala GlyPro Pro Ala Ala Gly
275275
Ile Ala His Leu GlnIle Ala His Leu Gln
280280
Pro Val Ala Thr ProPro Val Ala Thr Pro
285285
Pro Gly Arg Ala Ala 290Pro Gly Arg Ala Ala 290
Ala Pro Pro Asn AlaAla Pro Pro Asn Ala
295295
Pro Gly Gly Pro Pro 300Pro Gly Gly Pro Pro 300
Pro Gln Pro Ala Pro 305Pro Gln Pro Ala Pro 305
Ser Ala Ala Ala Pro 310Ser Ala Ala Ala Pro 310
Pro Pro Pro Ala His 315Pro Pro Pro Ala His 315
Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu ThrLeu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr
325 330 335325 330 335
Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro GluLeu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu
340 345 350340 345 350
Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly SerPhe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly Ser
355 360 365355 360 365
Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys Gly Gly Ser Gly Gly Gly SerPro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
370 375 380370 375 380
Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro AsnGln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro Asn
385 390 395385 390 395
Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg Pro Tyr Ala Cys Pro ValPro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val
405 410 415405 410 415
SerSer
SerSer
ArgArg
LeuLeu
Gly 240Gly 240
TyrTyr
ProPro
TyrTyr
GlyGly
Ala 320Ala 320
SerSer
LeuLeu
AlaAla
GlyGly
Arg 400Arg 400
GluGlu
- 248 046157- 248 046157
Ser Cys AspSer Cys Asp
Arg Arg Phe 420Arg Arg Phe 420
Ser Arg SerSer Arg Ser
425425
Asp Asn LeuAsp Asn Leu
Val Arg His IleVal Arg His Ile
430430
Arg Ile HisArg Ile His
435435
Thr Gly GlnThr Gly Gln
Lys Pro PheLys Pro Phe
440440
Gln Cys ArgGln Cys Arg
Ile Cys Met Arg 445Ile Cys Met Arg 445
Asn Phe SerAsn Phe Ser
450450
Arg Glu AspArg Glu Asp
Asn Leu His 455Asn Leu His 455
Thr His IleThr His Ile
460460
Arg Thr His ThrArg Thr His Thr
Gly Glu Lys 465Gly Glu Lys 465
Pro Phe AlaPro Phe Ala
470470
Cys Asp IleCys Asp Ile
Cys Gly ArgCys Gly Arg
475475
Lys Phe Ala ArgLys Phe Ala Arg
480480
Ser Asp GluSer Asp Glu
Leu Val ArgLeu Val Arg
485485
His Thr LysHis Thr Lys
Ile His Leu 490Ile His Leu 490
Arg Gln Lys AspArg Gln Lys Asp
495495
Arg Pro TyrArg Pro Tyr
Ala Cys Pro 500Ala Cys Pro 500
Val Glu SerVal Glu Ser
505505
Cys Asp ArgCys Asp Arg
Arg Phe Ser GlnArg Phe Ser Gln
510510
Ser Gly AsnSer Gly Asn
515515
Leu Thr GluLeu Thr Glu
His Ile ArgHis Ile Arg
520520
Ile His ThrIle His Thr
Gly Gln Lys Pro 525Gly Gln Lys Pro 525
Phe Gln CysPhe Gln Cys
530530
Arg Ile CysArg Ile Cys
Met Arg Asn 535Met Arg Asn 535
Phe Ser ThrPhe Ser Thr
540540
Ser Gly His LeuSer Gly His Leu
Val Arg His 545Val Arg His 545
Ile Arg ThrIle Arg Thr
550550
His Thr GlyHis Thr Gly
Glu Lys Pro 555Glu Lys Pro 555
Phe Ala Cys AspPhe Ala Cys Asp
560560
Ile Cys GlyIle Cys Gly
Arg Lys PheArg Lys Phe
565565
Ala Gln AsnAla Gln Asn
Ser Thr Leu 570Ser Thr Leu 570
Thr Glu His ThrThr Glu His Thr
575575
Lys Ile HisLys Ile His
Leu Arg Gln 580Leu Arg Gln 580
Lys Asp LysLys Asp Lys
585 <210> 132 <211> 523 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>585 <210> 132 <211> 523 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
Синтетический <400> 132Synthetic <400> 132
Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu GlyAsp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly
5 105 10
Ser Asp Ala Leu 15Ser Asp Ala Leu 15
Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala 20 25Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala 20 25
Leu Asp Asp Phe 30Leu Asp Asp Phe 30
- 249 046157- 249 046157
AspAsp
MetMet
Val 65Val 65
GluGlu
SerSer
AlaAla
ProPro
Pro 145Pro 145
AlaAla
AlaAla
ValVal
ProPro
Gln 225Gln 225
ProPro
GlnGln
MetMet
Leu Asp MetLeu Asp Met
Leu Gly Ser AspLeu Gly Ser Asp
Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp 45Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp 45
Leu Ile Asn Ser Arg Ser Ser Gly Ser Pro Lys Lys Lys Arg Lys 50 55 60Leu Ile Asn Ser Arg Ser Ser Gly Ser Pro Lys Lys Lys Arg Lys 50 55 60
Gly Ser GlnGly Ser Gln
TyrTyr
Leu Pro Asp Thr Asp Asp Arg His Arg Ile Glu 70 75 80Leu Pro Asp Thr Asp Asp Arg His Arg Ile Glu 70 75 80
Lys Arg Lys Arg Thr 85Lys Arg Lys Arg Thr 85
Pro Phe Ser Gly ProPro Phe Ser Gly Pro
100100
Val Pro Ser Arg Ser 115Val Pro Ser Arg Ser 115
Tyr Pro Phe Thr Ser 130Tyr Pro Phe Thr Ser 130
Thr Met Val Phe ProThr Met Val Phe Pro
150150
Pro Ala Pro Pro GlnPro Ala Pro Pro Gln
165165
Pro Ala Met Val SerPro Ala Met Val Ser
180180
Leu Ala Pro Gly ProLeu Ala Pro Gly Pro
195195
Thr Gln Ala Gly Glu 210Thr Gln Ala Gly Glu 210
Phe Asp Asp Glu AspPhe Asp Asp Glu Asp
230230
Ala Val Phe Thr AspAla Val Phe Thr Asp
245245
Leu Leu Asn Gln Gly 260Leu Leu Asn Gln Gly 260
Leu Met Glu Tyr ProLeu Met Glu Tyr Pro
275275
Tyr Glu Thr Phe LysTyr Glu Thr Phe Lys
Thr Asp Pro Arg ProThr Asp Pro Arg Pro
105105
Ser Ala Ser Val ProSer Ala Ser Val Pro
120120
Ser Leu Ser Thr Ile 135Ser Leu Ser Thr Ile 135
Ser Gly Gln Ile SerSer Gly Gln Ile Ser
155155
Val Leu Pro Gln AlaVal Leu Pro Gln Ala
170170
Ala Leu Ala Gln AlaAla Leu Ala Gln Ala
185185
Pro Gln Ala Val AlaPro Gln Ala Val Ala
200200
Gly Thr Leu Ser Glu 215Gly Thr Leu Ser Glu 215
Leu Gly Ala Leu LeuLeu Gly Ala Leu Leu
235235
Leu Ala Ser Val AspLeu Ala Ser Val Asp
250250
Ile Pro Val Ala ProIle Pro Val Ala Pro
265265
Glu Ala Ile Thr ArgGlu Ala Ile Thr Arg
280280
Ser Ile Met Lys LysSer Ile Met Lys Lys
Pro Pro Arg Arg IlePro Pro Arg Arg Ile
110110
Lys Pro Ala Pro GlnLys Pro Ala Pro Gln
125125
Asn Tyr Asp Glu Phe 140Asn Tyr Asp Glu Phe 140
Gln Ala Ser Ala LeuGln Ala Ser Ala Leu
160160
Pro Ala Pro Ala ProPro Ala Pro Ala Pro
175175
Pro Ala Pro Val ProPro Ala Pro Val Pro
190190
Pro Pro Ala Pro Lys 205Pro Pro Ala Pro Lys 205
Ala Leu Leu Gln Leu 220Ala Leu Leu Gln Leu 220
Gly Asn Ser Thr AspGly Asn Ser Thr Asp
240240
Asn Ser Glu Phe GlnAsn Ser Glu Phe Gln
255255
His Thr Thr Glu ProHis Thr Thr Glu Pro
270270
Leu Val Thr Gly AlaLeu Val Thr Gly Ala
285285
- 250 046157- 250 046157
Gln Arg Pro Pro AspGln Arg Pro Pro Asp
290290
Pro Ala Pro Ala ProPro Ala Pro Ala Pro
295295
Leu Gly Ala Pro Gly 300Leu Gly Ala Pro Gly 300
Pro Asn Gly Leu Leu 305Pro Asn Gly Leu Leu 305
Ser Gly Asp Glu Asp 310Ser Gly Asp Glu Asp 310
Phe Ser Ser Ile Ala 315Phe Ser Ser Ile Ala 315
Met Asp Phe Ser AlaMet Asp Phe Ser Ala
325325
Leu Leu Gly Ser GlyLeu Leu Gly Ser Gly
330330
Ser Gly Ser Arg AspSer Gly Ser Arg Asp
335335
Arg Glu Gly Met PheArg Glu Gly Met Phe
340340
Leu Pro Lys Pro GluLeu Pro Lys Pro Glu
345345
Ala Gly Ser Ala IleAla Gly Ser Ala Ile
350350
Asp Val Phe Glu Gly 355Asp Val Phe Glu Gly 355
Arg Glu Val Cys Gln 360Arg Glu Val Cys Gln 360
Pro Lys Arg Ile Arg 365Pro Lys Arg Ile Arg 365
Phe His Pro Pro GlyPhe His Pro Pro Gly
370370
Ser Pro Trp Ala AsnSer Pro Trp Ala Asn
375375
Arg Pro Leu Pro Ala 380Arg Pro Leu Pro Ala 380
Leu Ala Pro Thr Pro 385Leu Ala Pro Thr Pro 385
Thr Gly Pro Val His 390Thr Gly Pro Val His 390
Glu Pro Val Gly Ser 395Glu Pro Val Gly Ser 395
Thr Pro Ala Pro ValThr Pro Ala Pro Val
405405
Pro Gln Pro Leu AspPro Gln Pro Leu Asp
410410
Pro Ala Pro Ala ValPro Ala Pro Ala Val
415415
Pro Glu Ala Ser HisPro Glu Ala Ser His
420420
Leu Leu Glu Asp ProLeu Leu Glu Asp Pro
425425
Asp Glu Glu Thr SerAsp Glu Glu Thr Ser
430430
Ala Val Lys Ala Leu 435Ala Val Lys Ala Leu 435
Arg Glu Met Ala Asp 440Arg Glu Met Ala Asp 440
Thr Val Ile Pro GlnThr Val Ile Pro Gln
445445
Glu Glu Ala Ala IleGlu Glu Ala Ala Ile
450450
Cys Gly Gln Met AspCys Gly Gln Met Asp
455455
Leu Ser His Pro ProLeu Ser His Pro Pro
460460
Arg Gly His Leu Asp 465Arg Gly His Leu Asp 465
Glu Leu Thr Thr Thr 470Glu Leu Thr Thr Thr 470
Leu Glu Ser Met Thr 475Leu Glu Ser Met Thr 475
Asp Leu Asn Leu AspAsp Leu Asn Leu Asp
485485
Ser Pro Leu Thr ProSer Pro Leu Thr Pro
490490
Glu Leu Asn Glu IleGlu Leu Asn Glu Ile
495495
Asp Thr Phe Leu AsnAsp Thr Phe Leu Asn
500500
Asp Glu Cys Leu LeuAsp Glu Cys Leu Leu
505505
His Ala Met His IleHis Ala Met His Ile
510510
LeuLeu
Asp 320Asp 320
SerSer
SerSer
ProPro
SerSer
Leu 400Leu 400
ThrThr
GlnGln
LysLys
ProPro
Glu 480Glu 480
LeuLeu
SerSer
Thr Gly Leu Ser Ile 515Thr Gly Leu Ser Ile 515
Phe Asp Thr Ser Leu 520Phe Asp Thr Ser Leu 520
Phe <210> 133 <211> 50Phe <210> 133 <211> 50
- 251 046157 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 251 046157 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 133<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 133
Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu GlyAsp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly
510510
Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala 2025Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala 2025
Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp 3540Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp 3540
СинтетическийSynthetic
Ser Asp Ala Leu 15Ser Asp Ala Leu 15
Leu Asp Asp Phe 30Leu Asp Asp Phe 30
Phe Asp Leu Asp 45Phe Asp Leu Asp 45
Met Leu <210> 134 <211> 275 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Met Leu <210> 134 <211> 275 <212> Protein <213> Artificial Sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 134<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 134
СинтетическийSynthetic
Met Ser Gly 1Met Ser Gly 1
Arg Phe ProArg Phe Pro
Met Gly Met 35Met Gly Met 35
Pro Gln His 50Pro Gln His 50
Ala Gly Asn 65Ala Gly Asn 65
Gly Thr ValGly Thr Val
Leu Glu MetLeu Glu Met
Asp Gly Thr 20Asp Gly Thr 20
Gly Gln PheGly Gln Phe
Ala Phe AsnAla Phe Asn
Met Asn AlaMet Asn Ala
Asn Gly Gly 85Asn Gly Gly 85
Arg Phe AsnArg Phe Asn
Asn Ser Gln 100Asn Ser Gln 100
Gly Ser LeuGly Ser Leu
Pro Ala SerPro Ala Ser
Ala Asp HisAla Asp His
Asn Gly Leu 25Asn Gly Leu 25
Pro Ser Pro 40Pro Ser Pro 40
Ala Leu Met 55Ala Leu Met 55
Thr Ser GlyThr Ser Gly
His Pro ProHis Pro Pro
Phe Met GlyPhe Met Gly
105105
Met Gln LeuMet Gln Leu
Met Met Ala 10Met Met Ala 10
His His HisHis His His
His His HisHis His His
Gly Glu His 60Gly Glu His 60
Ile Arg His 75Ile Arg His 75
Ser Ala Leu 90Ser Ala Leu 90
Pro Pro ValPro Pro Val
Gln Lys LeuGln Lys Leu
Met Asn His Gly 15Met Asn His Gly 15
Pro Ala His Arg 30Pro Ala His Arg 30
Gln Gln Gln Gln 45Gln Gln Gln Gln 45
Ile His Tyr GlyIle His Tyr Gly
Ala Met Gly Pro 80Ala Met Gly Pro 80
Ala Pro Ala AlaAla Pro Ala Ala
Ala Ser Gln Gly 110Ala Ser Gln Gly 110
Asn Asn Gln TyrAsn Asn Gln Tyr
- 252 046157- 252 046157
115 120125115 120125
Phe Asn His His Pro Tyr Pro His Asn His Tyr Met Pro Asp Leu HisPhe Asn His Pro Tyr Pro His Asn His Tyr Met Pro Asp Leu His
130 135140130 135140
Pro Ala Ala Gly His Gln Met Asn Gly Thr Asn Gln His Phe Arg AspPro Ala Ala Gly His Gln Met Asn Gly Thr Asn Gln His Phe Arg Asp
145 150 155160145 150 155160
Cys Asn Pro Lys His Ser Gly Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser GlyCys Asn Pro Lys His Ser Gly Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser Gly
165 170175165 170175
Gly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly Gly AlaGly Ser Ser Thr Pro Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly Gly Ala
180 185190180 185190
Gly Ser Ser Asn Ser Gly Gly Gly Ser Gly Ser Gly Asn Met Pro AlaGly Ser Ser Asn Ser Gly Gly Gly Ser Gly Ser Gly Asn Met Pro Ala
195 200205195 200205
Ser Val Ala His Val Pro Ala Ala Met Leu Pro Pro Asn Val Ile AspSer Val Ala His Val Pro Ala Ala Met Leu Pro Pro Asn Val Ile Asp
210 215220210 215220
Thr Asp Phe Ile Asp Glu Glu Val Leu Met Ser Leu Val Ile Glu MetThr Asp Phe Ile Asp Glu Glu Val Leu Met Ser Leu Val Ile Glu Met
225 230 235240225 230 235240
Gly Leu Asp Arg Ile Lys Glu Leu Pro Glu Leu Trp Leu Gly Gln AsnGly Leu Asp Arg Ile Lys Glu Leu Pro Glu Leu Trp Leu Gly Gln Asn
245 250255245 250255
Glu Phe Asp Phe Met Thr Asp Phe Val Cys Lys Gln Gln Pro Ser ArgGlu Phe Asp Phe Met Thr Asp Phe Val Cys Lys Gln Gln Pro Ser Arg
260 265270260 265270
Val Ser CysVal Ser Cys
275 <210> 135 <211> 183 <212> Белок <213>275 <210> 135 <211> 183 <212> Protein <213>
Искусственная последовательность <220>Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 135<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 135
Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln Arg ProAla Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln Arg Pro
5 10155 1015
Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr LeuProPro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr LeuPro
25302530
Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg Gly Ala 35 4045Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg Gly Ala 35 4045
- 253 046157- 253 046157
Pro LeuProLeu
Gly ProGly Pro
Pro ProPro Pro
Ala Phe 65Ala Phe 65
Gly ProGly Pro
Pro SerPro Ser
Pro AlaPro Ala
Ala GlyAla Gly
Ile Ala 85Ile Ala 85
Gly ArgGly Arg
Ala AlaAla Ala
100100
Ala ProAla Pro
Gln ProGlin Pro
Ala Pro 115Ala Pro 115
Ser AlaSer Ala
Gly GlyGly Gly
130130
Met AspMet Asp
Ala GluAla Glu
Glu Leu 145Glu Leu 145
Glu LeuGlu Leu
Gly LeuGly Leu
150150
Leu GlyLeu Gly
Gln SerGln Ser
Glu Phe 165Glu Phe 165
Pro AlaPro Ala
Gly SerGly Ser
180180
Val SerVal Ser
Pro Arg 55Pro Arg 55
Ser PheSer Phe
His LeuHis Leu
Pro AsnPro Asn
Ala AlaAla Ala
120120
Leu Ile 135Leu Ile 135
His ArgHis Arg
Asp CysAsp Cys
CysCys
Gln ProGlin Pro
Gln ProGlin Pro
Gln ProGlin Pro
Ala Pro 105Ala Pro 105
Pro ProPro Pro
Asp GluAsp Glu
Val ArgVal Arg
Phe SerPhe Ser
170170
Gly Ala 60Gly Ala 60
Phe Pro 75Phe Pro 75
Val AlaVal Ala
Gly GlyGly Gly
Pro ProPro Pro
Glu AlaGlu Ala
140140
Glu Leu 155Glu Leu 155
Asp LeuAsp Leu
Leu Ala Tyr GlyLeu Ala Tyr Gly
Ala Val Pro ProAla Val Pro Pro
Thr Pro Tyr Pro 95Thr Pro Tyr Pro 95
Pro Pro Gly ProPro Pro Gly Pro
110110
Ala His Ala Leu 125Ala His Ala Leu 125
Leu Thr Ser LeuLeu Thr Ser Leu
Pro Glu Leu PhePro Glu Leu Phe
160160
Gly Ser Ala ProGly Ser Ala Pro
175 <210> 136 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>175 <210> 136 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности<223> Description of the artificial sequence
Синтетический пептид <220>Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid
- 254 046157 <400> 136- 254 046157 <400> 136
Cys Xaa Cys Xaa His Xaa His 1 5 <210> 137 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys Xaa Cys Xaa His Xaa His 1 5 <210> 137 <211> 17 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Любая аминокислота <400> 137<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Any amino acid <400> 137
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa His Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys XaaCys Xaa Cys Xaa Cys Xaa His Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa
5 10 155 10 15
Cys <210> 138 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательностьCys <210> 138 <211> 17 <212> Protein <213> Artificial sequence
- 255 046157 <220>- 255 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Любая аминокислота <400> 138<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Any amino acid <400> 138
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa His Xaa Cys Xaa Cys XaaCys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa His Xaa Cys Xaa Cys Xaa
5 10 155 10 15
Cys <210> 139 <211> 15 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys <210> 139 <211> 15 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2)<221> MOD_RES <222> (2)..(2)
- 256 046157 <223> Любая аминокислота <220>- 256 046157 <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(8) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(8) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (10)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (10)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (15) . . (15) <223> Cys, His, or Asp <400> 139<221> MOD_RES <222> (15) . . (15) <223> Cys, His, or Asp <400> 139
Cys Xaa Cys Xaa His Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa XaaCys Xaa Cys Xaa His Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa
5 10 15 <210> 140 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 10 15 <210> 140 <211> 17 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
- 257 046157 <221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220>- 257 046157 <221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14) .. (14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14) .. (14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Любая аминокислота <400> 140<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Any amino acid <400> 140
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys XaaCys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa
5 10 155 10 15
Cys <210> 141 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys <210> 141 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <400> 141<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <400> 141
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa His 1 5Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa His 1 5
- 258 046157 <210> 142 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 258 046157 <210> 142 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <400> 142<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <400> 142
Cys Xaa Cys Xaa His Xaa Cys 1 5 <210> 143 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys Xaa Cys Xaa His Xaa Cys 1 5 <210> 143 <211> 17 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12)<221> MOD_RES <222> (12)..(12)
- 259 046157 <223> Любая аминокислота <220>- 259 046157 <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14) .. (14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14) .. (14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Любая аминокислота <400> 143<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Any amino acid <400> 143
Cys Xaa Cys Xaa His Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa His XaaCys Xaa Cys Xaa His Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa His Xaa
5 10 155 10 15
Cys <210> 144 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys <210> 144 <211> 17 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14)..(14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES<221> MOD_RES
- 260 046157 <222> (16)..(16) <223> Любая аминокислота <400> 144- 260 046157 <222> (16)..(16) <223> Any amino acid <400> 144
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa His XaaCys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Cys Xaa His Xaa
5 10 155 10 15
Cys <210> 145 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys <210> 145 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <400> 145<221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <400> 145
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys 1 5 <210> 146 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys 1 5 <210> 146 <211> 17 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (2)..(2) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Any amino acid <220>
- 261 046157 <221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Любая аминокислота <220>- 261 046157 <221> MOD_RES <222> (6)..(6) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8)..(10) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (12)..(12) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (14) .. (14) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (14) .. (14) <223> Any amino acid <220>
<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Любая аминокислота <400> 146<221> MOD_RES <222> (16)..(16) <223> Any amino acid <400> 146
Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa His Xaa His XaaCys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa His Xaa His Xaa
5 10 155 10 15
Cys <210> 147 <211> 344 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Cys <210> 147 <211> 344 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (8)..(322) <223> Эта область может содержать 1-15 повторяющихся звеньев Tyr Lys Cys Pro Glu Cys<221> MISC_FEATURE <222> (8)..(322) <223> This region may contain 1-15 repeat units Tyr Lys Cys Pro Glu Cys
Gly Lys Ser Phe Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro <220>Gly Lys Ser Phe Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro <220>
<221> NON_CONS <222> (18)..(19) <220><221> NON_CONS <222> (18)..(19) <220>
<221> NON_CONS <222> (39)..(40) <220><221> NON_CONS <222> (39)..(40) <220>
<221> NON_CONS <222> (60)..(61)<221> NON_CONS <222> (60)..(61)
- 262 046157- 262 046157
NON_CONS (81) .. (82)NON_CONS (81) .. (82)
NON_CONS (102) .. (103)NON_CONS (102) .. (103)
NON_CONS (123)..(124)NON_CONS (123)..(124)
NON_CONS (144) .. (145)NON_CONS (144) .. (145)
NON_CONS (165)..(166)NON_CONS (165)..(166)
NON_CONS (186)..(187)NON_CONS (186)..(187)
NON_CONS (207)..(208)NON_CONS (207)..(208)
NON_CONS (228)..(229)NON_CONS (228)..(229)
NON_CONS (249)..(250)NON_CONS (249)..(250)
NON_CONS (270)..(271)NON_CONS (270)..(271)
NON_CONS (291)..(292)NON_CONS (291)..(292)
NON_CONS (312)..(313)NON_CONS (312)..(313)
NON_CONS (333)..(334)NON_CONS (333)..(334)
Смотри первоначальное описание заявки для подробного описания замен и предпочтительных вариантов осуществления <400>See the original application description for a detailed description of substitutions and preferred embodiments <400>
147147
Leu Glu Pro 1Leu Glu Pro 1
GlyGly
Glu Lys Pro Tyr Lys 5Glu Lys Pro Tyr Lys 5
Cys Pro Glu Cys Gly 10Cys Pro Glu Cys Gly 10
Lys Ser 15Lys Ser 15
Phe Ser HisPhe Ser His
Gln 20Gln 20
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr LysGlu Lys Pro Tyr Lys
Cys ProCys Pro
- 263 046157- 263 046157
Glu Cys Gly Lys Ser 35Glu Cys Gly Lys Ser 35
Phe Ser His Gln Arg 40Phe Ser His Gln Arg 40
Thr His Thr Gly Glu Lys 45Thr His Thr Gly Glu Lys 45
Pro Tyr Lys Cys Pro 50Pro Tyr Lys Cys Pro 50
Glu Cys Gly Lys Ser 55Glu Cys Gly Lys Ser 55
Phe Ser His Gln Arg Thr 60Phe Ser His Gln Arg Thr 60
His Thr Gly Glu Lys 65His Thr Gly Glu Lys 65
Pro Tyr Lys Cys Pro 70Pro Tyr Lys Cys Pro 70
Glu Cys Gly Lys Ser Phe 75 80Glu Cys Gly Lys Ser Phe 75 80
Ser His Gln Arg ThrSer His Gln Arg Thr
His Thr Gly Glu LysHis Thr Gly Glu Lys
Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 95Pro Tyr Lys Cys Pro Glu 95
Cys Gly Lys Ser PheCys Gly Lys Ser Phe
100100
Ser His Gln Arg ThrSer His Gln Arg Thr
105105
His Thr Gly Glu Lys ProHis Thr Gly Glu Lys Pro
110110
Tyr Lys Cys Pro Glu 115Tyr Lys Cys Pro Glu 115
Cys Gly Lys Ser Phe 120Cys Gly Lys Ser Phe 120
Ser His Gln Arg Thr HisSer His Gln Arg Thr His
125125
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
130130
Tyr Lys Cys Pro GluTyr Lys Cys Pro Glu
135135
Cys Gly Lys Ser Phe Ser 140Cys Gly Lys Ser Phe Ser 140
His Gln Arg Thr His 145His Gln Arg Thr His 145
Thr Gly Glu Lys Pro 150Thr Gly Glu Lys Pro 150
Tyr Lys Cys Pro Glu CysTyr Lys Cys Pro Glu Cys
155 160155 160
Gly Lys Ser Phe SerGly Lys Ser Phe Ser
165165
His Gln Arg Thr HisHis Gln Arg Thr His
170170
Thr Gly Glu Lys Pro TyrThr Gly Glu Lys Pro Tyr
175175
Lys Cys Pro Glu CysLys Cys Pro Glu Cys
180180
Gly Lys Ser Phe SerGly Lys Ser Phe Ser
185185
His Gln Arg Thr His ThrHis Gln Arg Thr His Thr
190190
Gly Glu Lys Pro TyrGly Glu Lys Pro Tyr
195195
Lys Cys Pro Glu Cys 200Lys Cys Pro Glu Cys 200
Gly Lys Ser Phe Ser HisGly Lys Ser Phe Ser His
205205
Gln Arg Thr His ThrGln Arg Thr His Thr
210210
Gly Glu Lys Pro TyrGly Glu Lys Pro Tyr
215215
Lys Cys Pro Glu Cys GlyLys Cys Pro Glu Cys Gly
220220
Lys Ser Phe Ser His 225Lys Ser Phe Ser His 225
Gln Arg Thr His Thr 230Gln Arg Thr His Thr 230
Gly Glu Lys Pro Tyr LysGly Glu Lys Pro Tyr Lys
235 240235 240
Cys Pro Glu Cys GlyCys Pro Glu Cys Gly
245245
Lys Ser Phe Ser HisLys Ser Phe Ser His
250250
Gln Arg Thr His Thr GlyGln Arg Thr His Thr Gly
255255
Glu Lys Pro Tyr LysGlu Lys Pro Tyr Lys
260260
Cys Pro Glu Cys GlyCys Pro Glu Cys Gly
265265
Lys Ser Phe Ser His GlnLys Ser Phe Ser His Gln
270270
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
Glu Lys Pro Tyr LysGlu Lys Pro Tyr Lys
Cys Pro Glu Cys Gly LysCys Pro Glu Cys Gly Lys
- 264 046157- 264 046157
275275
280280
Ser Phe Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu LysSer Phe Ser His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys
290 295300290 295300
Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser His Gln Arg ThrPro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser His Gln Arg Thr
305 310315305 310315
Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser PheLys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe
325330325330
285285
Pro Tyr Lys CysPro Tyr Lys Cys
His Thr Gly GluHis Thr Gly Glu
320320
Ser His Gln ArgSer His Gln Arg
335335
Thr His Thr Gly Lys Lys Thr SerThr His Thr Gly Lys Lys Thr Ser
340 <210> 148 <211> 292 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>340 <210> 148 <211> 292 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
< 223> Описание искусственной последовательности полипептид<223> Description of the artificial polypeptide sequence
Синтетический <220>Synthetic <220>
< 221> MOD_RES < 222> (8) .. (57) < 223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8) .. (57) <223> Any amino acid <220>
< 221> MISC_FEATURE < 222> (8)..(57) < 223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220>< 221> MISC_FEATURE < 222> (8)..(57) < 223> This region can contain 1-50 residues <220>
< 221> MOD_RES < 222> (65).. (114) < 223> Любая аминокислота <220>< 221> MOD_RES < 222> (65).. (114) < 223> Any amino acid <220>
< 221> MISC_FEATURE < 222> (65)..(114) < 223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220>< 221> MISC_FEATURE < 222> (65)..(114) < 223> This region can contain 1-50 residues <220>
< 221> MOD_RES < 222> (122)..(171) < 223> Любая аминокислота <220>< 221> MOD_RES < 222> (122)..(171) < 223> Any amino acid <220>
< 221> MISC_FEATURE < 222> (122)..(171) < 223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220>< 221> MISC_FEATURE < 222> (122)..(171) < 223> This region can contain 1-50 residues <220>
< 221> MOD_RES < 222> (179)..(228) < 223> Любая аминокислота< 221> MOD_RES < 222> (179)..(228) < 223> Any amino acid
- 265 046157 <220>- 265 046157 <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> Эта область может содержать 1<220><221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> This area can contain 1<220>
<221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> Эта область может содержать 1<400> 148<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> This area can contain 1<400> 148
Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg Xaa Xaa 1 5Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg Xaa Xaa 1 5
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
2525
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
4040
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
5555
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 65 70Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 65 70
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 85Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 85
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
100 105100 105
Xaa Xaa Arg Ser Asp Glu Leu Val ArgXaa Xaa Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg
115 120115 120
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
130 135130 135
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
145 150145 150
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 165Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 165
Thr Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaThr Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 статков статков180 185 statok statok
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 30Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 30
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 45Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 45
Glu Asp Asn Leu His Thr 60Glu Asp Asn Leu His Thr 60
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
8080
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 95Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 95
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
110110
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
125125
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
140140
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
155 160155 160
Xaa Gln Ser Gly Asn Leu 175Xaa Gln Ser Gly Asn Leu 175
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
190190
- 266 046157- 266 046157
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
210210
Xaa Xaa 225Xaa Xaa 225
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 195Xaa Xaa 195
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 260Xaa Xaa 260
Xaa Xaa 275Xaa Xaa 275
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Thr SerThr Ser
230230
Xaa Xaa 245Xaa Xaa 245
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
200200
Xaa Xaa 215Xaa Xaa 215
Gly HisGly His
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
280280
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
220220
Leu Val Arg XaaLeu Val Arg Xaa
235235
Xaa XaaXaa Xaa
250250
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 265Xaa Xaa 265
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 205Xaa Xaa 205
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
270270
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
240240
Xaa Xaa 255Xaa Xaa 255
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Gln Asn SerXaa Gln Asn Ser
285285
Thr Leu Thr GluThr Leu Thr Glu
290 <210> 149 <211> 292 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>290 <210> 149 <211> 292 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <220>
< 221> MOD_RES < 222> (8) .. (57) < 223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8) .. (57) <223> Any amino acid <220>
< 221> MISC_FEATURE < 222> (8)..(57) < 223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220>< 221> MISC_FEATURE < 222> (8)..(57) < 223> This region can contain 1-50 residues <220>
< 221> MOD_RES < 222> (65)..(114) < 223> Любая аминокислота <220>< 221> MOD_RES < 222> (65)..(114) < 223> Any amino acid <220>
< 221> MISC_FEATURE < 222> (65)..(114) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220>< 221> MISC_FEATURE < 222> (65)..(114) <223> This region can contain 1-50 residues <220>
<221> MOD_RES <222> (122)..(171)<221> MOD_RES <222> (122)..(171)
- 267 046157 <223> Любая аминокислота <220>- 267 046157 <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (122)..(171) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220><221> MISC_FEATURE <222> (122)..(171) <223> This region can contain 1-50 residues <220>
<221> MOD_RES <222> (179)..(228) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (179)..(228) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220><221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> This region can contain 1-50 residues <220>
<221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <400> 149 Arg Ser Asp 1<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> This region can contain 1-50 residues <400> 149 Arg Ser Asp 1
Asn Leu ValAsn Leu Val
Arg Xaa XaaArg Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 10Xaa Xaa Xaa 10
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 20Xaa Xaa Xaa 20
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 45Xaa Xaa Xaa 45
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 55Xaa Xaa Xaa 55
His Arg ThrHis Arg Thr
Thr Leu ThrThr Leu Thr
Xaa Xaa Xaa 65Xaa Xaa Xaa 65
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 90Xaa Xaa Xaa 90
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 100Xaa Xaa Xaa 100
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
105105
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
110110
Xaa Xaa ArgXaa Xaa Arg
115115
Glu Asp AsnGlu Asp Asn
Leu His ThrLeu His Thr
120120
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 125Xaa Xaa Xaa 125
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
130130
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 135Xaa Xaa Xaa 135
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
140140
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
AsnAsn
Xaa 80Xaa 80
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
- 268 046157- 268 046157
Xaa Xaa 145Xaa Xaa 145
Xaa XaaXaa Xaa
Thr GluThr Glu
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 210Xaa Xaa 210
Xaa Xaa 225Xaa Xaa 225
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
180180
Xaa Xaa 195Xaa Xaa 195
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
260260
Xaa Xaa 275Xaa Xaa 275
Asn Leu His ThrAsn Leu His Thr
290 <210> 150 <211> 292 <212> Белок290 <210> 150 <211> 292 <212> Protein
Xaa XaaXaa Xaa
150150
Xaa Xaa 165Xaa Xaa 165
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Gln SerGln Ser
230230
Xaa Xaa 245Xaa Xaa 245
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
200200
Xaa Xaa 215Xaa Xaa 215
Ser SerSer Ser
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
280280
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
170170
Xaa Xaa 185Xaa Xaa 185
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 155Xaa Xaa 155
Xaa ThrXaa Thr
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 220Xaa Xaa 220
Xaa XaaXaa Xaa
Ser HisSer His
Xaa XaaXaa Xaa
190190
Xaa Xaa 205Xaa Xaa 205
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
160160
Ser Leu 175Ser Leu 175
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Leu Val Arg XaaLeu Val Arg Xaa
235235
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
240240
Xaa XaaXaa Xaa
250250
Xaa Xaa 265Xaa Xaa 265
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
270 <213> Искусственная последовательность <220>270 <213> Artificial sequence <220>
Xaa Xaa 255Xaa Xaa 255
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Arg Glu Asp 285 <223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <220>Xaa Arg Glu Asp 285 <223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <220>
<221> MOD_RES <222> (8) .. (57) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (8) .. (57) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (8)..(57) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <221> MOD_RES <220><221> MISC_FEATURE <222> (8)..(57) <223> This region can contain 1-50 residues <221> MOD_RES <220>
- 269 046157 <222> (65) .. (114) <223> Любая аминокислота <220>- 269 046157 <222> (65) .. (114) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (65)..(114) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220><221> MISC_FEATURE <222> (65)..(114) <223> This region can contain 1-50 residues <220>
<221> MOD_RES <222> (122)..(171) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (122)..(171) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (122)..(171) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220><221> MISC_FEATURE <222> (122)..(171) <223> This region can contain 1-50 residues <220>
<221> MOD_RES <222> (179)..(228) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (179)..(228) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <220><221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> This region can contain 1-50 residues <220>
<221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> Эта область может содержать 1-50 остатков <400> 150<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> This region can contain 1-50 residues <400> 150
Asp Pro Gly Ala Leu Val Arg Xaa 1 5Asp Pro Gly Ala Leu Val Arg Xaa 1 5
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 25Xaa Xaa 25
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 35Xaa Xaa 35
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 45Xaa Xaa 45
Xaa Xaa 15Xaa Xaa 15
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 55Xaa Xaa 55
Xaa Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg 60Xaa Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg 60
Xaa Xaa 65Xaa Xaa 65
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 75Xaa Xaa 75
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 85Xaa Xaa 85
Xaa XaaXaa Xaa
XaaXaa
Xaa Xaa Xaa 90Xaa Xaa Xaa 90
Xaa XaaXaa Xaa
Xaa Xaa 80Xaa Xaa 80
Xaa Xaa 95Xaa Xaa 95
- 270 046157- 270 046157
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
100100
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
105105
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
110110
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
GlnGln
115115
SerSer
GlyGly
AspAsp
LeuLeu
Arg 120Arg 120
ArgArg
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
125125
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
130130
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
135135
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
140140
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
145145
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
150150
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
155155
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
160160
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
165165
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
170170
XaaXaa
ThrThr
HisHis
LeuLeu
Asp 175Asp 175
LeuLeu
IleIle
ArgArg
XaaXaa
XaaXaa
180180
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
185185
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
190190
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
195195
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
200200
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
205205
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
210210
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
215215
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
220220
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
225225
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
ThrThr
SerSer
230230
GlyGly
AsnAsn
LeuLeu
ValVal
Arg 235Arg 235
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
240240
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
245245
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
250250
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
255255
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
260260
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
265265
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
270270
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
275275
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
280280
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
285285
ArgArg
SerSer
AspAsp
Asn Leu Val ArgAsn Leu Val Arg
290 <210> 151 <211> 463 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>290 <210> 151 <211> 463 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <220>
- 271 046157 <221> MOD_RES <222> (8) .. (57) <223> Любая аминокислота <220>- 271 046157 <221> MOD_RES <222> (8) .. (57) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (8)..(57) <223> Эта область может содержать 1-5 <220><221> MISC_FEATURE <222> (8)..(57) <223> This area can contain 1-5 <220>
<221> MOD_RES <222> (65).. (114) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (65).. (114) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (65)..(114) <223> Эта область может содержать 1-5 <220><221> MISC_FEATURE <222> (65)..(114) <223> This area can contain 1-5 <220>
<221> MOD_RES <222> (122)..(171) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (122)..(171) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (122)..(171) <223> Эта область может содержать 1-5 <220><221> MISC_FEATURE <222> (122)..(171) <223> This area can contain 1-5 <220>
<221> MOD_RES <222> (179)..(228) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (179)..(228) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> Эта область может содержать 1-5 <220><221> MISC_FEATURE <222> (179)..(228) <223> This area can contain 1-5 <220>
<221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (236)..(285) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> Эта область может содержать 1-5 <220><221> MISC_FEATURE <222> (236)..(285) <223> This area can contain 1-5 <220>
<221> MOD_RES <222> (293)..(342) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (293)..(342) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (293)..(342) <223> Эта область может содержать 1-5 <220><221> MISC_FEATURE <222> (293)..(342) <223> This area can contain 1-5 <220>
<221> MOD_RES <222> (350)..(399) <223> Любая аминокислота остатков остатков остатков остатков остатков остатков<221> MOD_RES <222> (350)..(399) <223> Any amino acid residues residues residues residues residues
- 272 046157 <220>- 272 046157 <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (350)..(399) <223> Эта область может содержать 1<220><221> MISC_FEATURE <222> (350)..(399) <223> This area can contain 1<220>
<221> MOD_RES <222> (407)..(456) <223> Любая аминокислота <220><221> MOD_RES <222> (407)..(456) <223> Any amino acid <220>
<221> MISC_FEATURE <222> (407)..(456) <223> Эта область может содержать 1<400> 151<221> MISC_FEATURE <222> (407)..(456) <223> This area can contain 1<400> 151
Arg Arg Asp Glu Leu Asn Val Xaa Xaa 1 5Arg Arg Asp Glu Leu Asn Val Xaa Xaa 1 5
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
2525
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
4040
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
5555
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 65 70Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 65 70
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 85Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 85
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
100 105100 105
Xaa Xaa Arg Ser Asp Asp Leu Val ArgXaa Xaa Arg Ser Asp Asp Leu Val Arg
115 120115 120
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
130 135130 135
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
145 150145 150
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 165Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 165
Val Arg Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaVal Arg Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 статков статков180 185 statok statok
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 30Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 30
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 45Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 45
Ser Asp His Leu Thr Asn 60Ser Asp His Leu Thr Asn 60
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
8080
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 95Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 95
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
110110
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
125125
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
140140
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
155 160155 160
Xaa Arg Ser Asp Asn Leu 175Xaa Arg Ser Asp Asn Leu 175
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
190190
- 273 046157- 273 046157
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
195195
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
200200
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 205Xaa Xaa Xaa 205
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
210210
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 215Xaa Xaa Xaa 215
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
220220
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 225Xaa Xaa Xaa 225
Xaa His ArgXaa His Arg
230230
Thr Thr LeuThr Thr Leu
Thr Asn XaaThr Asn Xaa
235235
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
245245
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 250Xaa Xaa Xaa 250
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
255255
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 260Xaa Xaa Xaa 260
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
265265
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
270270
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
275275
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
280280
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Arg Glu 285Xaa Arg Glu 285
Asn Leu HisAsn Leu His
290290
Thr Xaa XaaThr Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 295Xaa Xaa Xaa 295
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
300300
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 305Xaa Xaa Xaa 305
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
310310
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
315315
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
325325
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 330Xaa Xaa Xaa 330
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
335335
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 340Xaa Xaa Xaa 340
Thr Ser HisThr Ser His
345345
Ser Leu ThrSer Leu Thr
Glu Xaa XaaGlu Xaa Xaa
350350
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
355355
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
360360
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 365Xaa Xaa Xaa 365
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
370370
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 375Xaa Xaa Xaa 375
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
380380
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 385Xaa Xaa Xaa 385
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
390390
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
395395
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Ser Ser SerSer Ser Ser
Leu Val ArgLeu Val Arg
405405
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 410Xaa Xaa Xaa 410
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
415415
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa 420Xaa Xaa Xaa 420
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
425425
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
430430
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
Xaa Xaa XaaXaa Xaa Xaa
XaaXaa
XaaXaa
Xaa 240Xaa 240
XaaXaa
XaaXaa
AspAsp
XaaXaa
Xaa 320XAA 320
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
Gln 400Gln 400
XaaXaa
XaaXaa
XaaXaa
- 274 046157- 274 046157
435435
440440
445445
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Glu Asp Asn Leu His ThrXaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Glu Asp Asn Leu His Thr
450 455 460 <210> 152 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>450 455 460 <210> 152 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 152<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 152
Arg Ser Asp Asn Leu Val ArgArg Ser Asp Asn Leu Val Arg
5 <210> 153 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 153 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 153<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 153
Arg Glu Asp Asn Leu His ThrArg Glu Asp Asn Leu His Thr
5 <210> 154 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 154 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 154 Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg 1 5 <210> 155 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic peptide <400> 154 Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg 1 5 <210> 155 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 155 Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu 1 5<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 155 Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu 1 5
- 275 046157 <210> 156 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 275 046157 <210> 156 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 156<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 156
Thr Ser Gly His Leu Val ArgThr Ser Gly His Leu Val Arg
5 <210> 157 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 157 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 157<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 157
Gln Asn Ser Thr Leu Thr GluGln Asn Ser Thr Leu Thr Glu
5 <210> 158 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 158 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 158<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 158
Asp Pro Gly Ala Leu Val ArgAsp Pro Gly Ala Leu Val Arg
5 <210> 159 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 159 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 159<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 159
His Arg Thr Thr Leu Thr AsnHis Arg Thr Thr Leu Thr Asn
5 <210> 160 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 160 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический<223> Description of artificial sequence: Synthetic
- 276 046157 пептид <400> 160- 276 046157 peptide <400> 160
Gln Ser Gly Asp Leu Arg Arg <210> 161 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Gln Ser Gly Asp Leu Arg Arg <210> 161 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 161<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 161
Thr Ser His Ser Leu Thr GluThr Ser His Ser Leu Thr Glu
5 <210> 162 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 162 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 162<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 162
Thr His Leu Asp Leu Ile ArgThr His Leu Asp Leu Ile Arg
5 <210> 163 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 163 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 163<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 163
Gln Ser Ser Ser Leu Val ArgGln Ser Ser Ser Leu Val Arg
5 <210> 164 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 164 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 164<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 164
Thr Ser Gly Asn Leu Val ArgThr Ser Gly Asn Leu Val Arg
55
- 277 046157 <210> 165 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 277 046157 <210> 165 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 165<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 165
Arg Arg Asp Glu Leu Asn ValArg Arg Asp Glu Leu Asn Val
5 <210> 166 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 166 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 166<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 166
Arg Ser Asp Asp Leu Val ArgArg Ser Asp Asp Leu Val Arg
5 <210> 167 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 167 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 167<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 167
Arg Ser Asp His Leu Thr AsnArg Ser Asp His Leu Thr Asn
5 <210> 168 <211> 16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 168 <211> 16 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 168<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 168
Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys 1 5 10 15 <210> 169 <211> 7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys 1 5 10 15 <210> 169 <211> 7 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический<223> Description of artificial sequence: Synthetic
- 278 046157 пептид <400> 169- 278 046157 peptide <400> 169
Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val <210> 170 <211> 16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val <210> 170 <211> 16 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 170<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 170
Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys Lys Lys 1 5 10 15 <210> 171 <211> 9 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys Lys Lys 1 5 10 15 <210> 171 <211> 9 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 171<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 171
Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr AlaTyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
5 <210> 172 <211> 2009 <212> Белок <213> Homo sapiens <400> 1725 <210> 172 <211> 2009 <212> Protein <213> Homo sapiens <400> 172
Met Glu Gln Thr Val Leu Val Pro Pro Gly Pro Asp Ser Phe Asn PheMet Glu Gln Thr Val Leu Val Pro Pro Gly Pro Asp Ser Phe Asn Phe
5 10155 1015
Phe Thr Arg Glu Ser Leu Ala Ala Ile Glu Arg Arg Ile Ala Glu Glu 20 2530Phe Thr Arg Glu Ser Leu Ala Ala Ile Glu Arg Arg Ile Ala Glu Glu 20 2530
Lys Ala Lys Asn Pro Lys Pro Asp Lys Lys Asp Asp Asp Glu Asn Gly 35 4045Lys Ala Lys Asn Pro Lys Pro Asp Lys Lys Asp Asp Asp Glu Asn Gly 35 4045
Pro Lys Pro Asn Ser Asp Leu Glu Ala Gly Lys Asn Leu Pro Phe Ile 50 5560Pro Lys Pro Asn Ser Asp Leu Glu Ala Gly Lys Asn Leu Pro Phe Ile 50 5560
Tyr Gly Asp Ile Pro Pro Glu Met Val Ser Glu Pro Leu Glu Asp Leu 65 70 7580Tyr Gly Asp Ile Pro Pro Glu Met Val Ser Glu Pro Leu Glu Asp Leu 65 70 7580
Asp Pro Tyr Tyr Ile Asn Lys Lys Thr Phe Ile Val Leu Asn Lys Gly 85 9095Asp Pro Tyr Tyr Ile Asn Lys Lys Thr Phe Ile Val Leu Asn Lys Gly 85 9095
- 279 046157- 279 046157
Lys Ala Ile Phe ArgLys Ala Ile Phe Arg
100100
Phe Ser Ala Thr SerPhe Ser Ala Thr Ser
105105
Ala Leu Tyr Ile LeuAla Leu Tyr Ile Leu
110110
Pro Phe Asn Pro LeuPro Phe Asn Pro Leu
115115
Arg Lys Ile Ala Ile 120Arg Lys Ile Ala Ile 120
Lys Ile Leu Val His 125Lys Ile Leu Val His 125
Leu Phe Ser Met LeuLeu Phe Ser Met Leu
130130
Ile Met Cys Thr IleIle Met Cys Thr Ile
135135
Leu Thr Asn Cys Val 140Leu Thr Asn Cys Val 140
Met Thr Met Ser Asn 145Met Thr Met Ser Asn 145
Pro Pro Asp Trp Thr 150Pro Pro Asp Trp Thr 150
Lys Asn Val Glu Tyr 155Lys Asn Val Glu Tyr 155
Phe Thr Gly Ile TyrPhe Thr Gly Ile Tyr
165165
Thr Phe Glu Ser LeuThr Phe Glu Ser Leu
170170
Ile Lys Ile Ile AlaIle Lys Ile Ile Ala
175175
Gly Phe Cys Leu GluGly Phe Cys Leu Glu
180180
Asp Phe Thr Phe LeuAsp Phe Thr Phe Leu
185185
Arg Asp Pro Trp AsnArg Asp Pro Trp Asn
190190
Leu Asp Phe Thr Val 195Leu Asp Phe Thr Val 195
Ile Thr Phe Ala TyrIle Thr Phe Ala Tyr
200200
Val Thr Glu Phe ValVal Thr Glu Phe Val
205205
Leu Gly Asn Val SerLeu Gly Asn Val Ser
210210
Ala Leu Arg Thr Phe 215Ala Leu Arg Thr Phe 215
Arg Val Leu Arg AlaArg Val Leu Arg Ala
220220
Lys Thr Ile Ser Val 225Lys Thr Ile Ser Val 225
Ile Pro Gly Leu Lys 230Ile Pro Gly Leu Lys 230
Thr Ile Val Gly Ala 235Thr Ile Val Gly Ala 235
Ile Gln Ser Val LysIle Gln Ser Val Lys
245245
Lys Leu Ser Asp ValLys Leu Ser Asp Val
250250
Met Ile Leu Thr ValMet Ile Leu Thr Val
255255
Cys Leu Ser Val PheCys Leu Ser Val Phe
260260
Ala Leu Ile Gly LeuAla Leu Ile Gly Leu
265265
Gln Leu Phe Met GlyGln Leu Phe Met Gly
270270
Leu Arg Asn Lys CysLeu Arg Asn Lys Cys
275275
Ile Gln Trp Pro ProIle Gln Trp Pro Pro
280280
Thr Asn Ala Ser LeuThr Asn Ala Ser Leu
285285
Glu His Ser Ile GluGlu His Ser Ile Glu
290290
Lys Asn Ile Thr ValLys Asn Ile Thr Val
295295
Asn Tyr Asn Gly ThrAsn Tyr Asn Gly Thr
300300
Ile Asn Glu Thr Val 305Ile Asn Glu Thr Val 305
Phe Glu Phe Asp Trp 310Phe Glu Phe Asp Trp 310
Lys Ser Tyr Ile Gln 315Lys Ser Tyr Ile Gln 315
Ser Arg Tyr His TyrSer Arg Tyr His Tyr
325325
Phe Leu Glu Gly PhePhe Leu Glu Gly Phe
330330
Leu Asp Ala Leu LeuLeu Asp Ala Leu Leu
335335
Gly Asn Ser Ser AspGly Asn Ser Ser Asp
Ala Gly Gln Cys ProAla Gly Gln Cys Pro
Glu Gly Tyr Met CysGlu Gly Tyr Met Cys
ThrThr
SerSer
PhePhe
Thr 160Thr 160
ArgArg
TrpTrp
AspAsp
LeuLeu
Leu 240Leu 240
PhePhe
AsnAsn
GluGlu
LeuLeu
Asp 320Asp 320
CysCys
ValVal
- 280 046157- 280 046157
340340
345345
350350
Lys Ala Gly Arg AsnLys Ala Gly Arg Asn
355355
Pro Asn Tyr Gly Tyr 360Pro Asn Tyr Gly Tyr 360
Thr Ser Phe Asp Thr 365Thr Ser Phe Asp Thr 365
Ser Trp Ala Phe LeuSer Trp Ala Phe Leu
370370
Ser Leu Phe Arg LeuSer Leu Phe Arg Leu
375375
Met Thr Gln Asp Phe 380Met Thr Gln Asp Phe 380
Glu Asn Leu Tyr Gln 385Glu Asn Leu Tyr Gln 385
Leu Thr Leu Arg Ala 390Leu Thr Leu Arg Ala 390
Ala Gly Lys Thr Tyr 395Ala Gly Lys Thr Tyr 395
Ile Phe Phe Val LeuIle Phe Phe Val Leu
405405
Val Ile Phe Leu GlyVal Ile Phe Leu Gly
410410
Ser Phe Tyr Leu IleSer Phe Tyr Leu Ile
415415
Leu Ile Leu Ala ValLeu Ile Leu Ala Val
420420
Val Ala Met Ala TyrVal Ala Met Ala Tyr
425425
Glu Glu Gln Asn GlnGlu Glu Gln Asn Gln
430430
Thr Leu Glu Glu AlaThr Leu Glu Glu Ala
435435
Glu Gln Lys Glu Ala 440Glu Gln Lys Glu Ala 440
Glu Phe Gln Gln MetGlu Phe Gln Gln Met
445445
Glu Gln Leu Lys Lys 450Glu Gln Leu Lys Lys 450
Gln Gln Glu Ala AlaGln Gln Glu Ala Ala
455455
Gln Gln Ala Ala ThrGln Gln Ala Ala Thr
460460
Thr Ala Ser Glu His 465Thr Ala Ser Glu His 465
Ser Arg Glu Pro Ser 470Ser Arg Glu Pro Ser 470
Ala Ala Gly Arg Leu 475Ala Ala Gly Arg Leu 475
Asp Ser Ser Ser GluAsp Ser Ser Ser Glu
485485
Ala Ser Lys Leu SerAla Ser Lys Leu Ser
490490
Ser Lys Ser Ala LysSer Lys Ser Ala Lys
495495
Arg Arg Asn Arg ArgArg Arg Asn Arg Arg
500500
Lys Lys Arg Lys GlnLys Lys Arg Lys Gln
505505
Lys Glu Gln Ser GlyLys Glu Gln Ser Gly
510510
Glu Glu Lys Asp Glu 515Glu Glu Lys Asp Glu 515
Asp Glu Phe Gln Lys 520Asp Glu Phe Gln Lys 520
Ser Glu Ser Glu AspSer Glu Ser Glu Asp
525525
Ile Arg Arg Lys GlyIle Arg Arg Lys Gly
530530
Phe Arg Phe Ser Ile 535Phe Arg Phe Ser Ile 535
Glu Gly Asn Arg LeuGlu Gly Asn Arg Leu
540540
Tyr Glu Lys Arg Tyr 545Tyr Glu Lys Arg Tyr 545
Ser Ser Pro His Gln 550Ser Ser Pro His Gln 550
Ser Leu Leu Ser Ile 555Ser Leu Leu Ser Ile 555
Gly Ser Leu Phe SerGly Ser Leu Phe Ser
565565
Pro Arg Arg Asn SerPro Arg Arg Asn Ser
570570
Arg Thr Ser Leu PheArg Thr Ser Leu Phe
575575
Phe Arg Gly Arg AlaPhe Arg Gly Arg Ala
580580
Lys Asp Val Gly SerLys Asp Val Gly Ser
585585
Glu Asn Asp Phe AlaGlu Asn Asp Phe Ala
590590
PhePhe
TrpTrp
Met 400Met 400
AsnAsn
AlaAla
IleIle
AlaAla
Ser 480Ser 480
GluGlu
GlyGly
SerSer
ThrThr
Arg 560Arg 560
SerSer
AspAsp
- 281 046157- 281 046157
Asp Glu His Ser Thr Phe Glu Asp AsnAsp Glu His Ser Thr Phe Glu Asp Asn
595 600595 600
Phe Val Pro Arg Arg His Gly Glu ArgPhe Val Pro Arg Arg His Gly Glu Arg
610 615610 615
Thr Ser Arg Ser Ser Arg Met Leu AlaThr Ser Arg Ser Ser Arg Met Leu Ala
625 630625 630
Met His Ser Thr Val Asp Cys Asn Gly 645Met His Ser Thr Val Asp Cys Asn Gly 645
Pro Ser Val Pro Thr Ser Pro Val GlyPro Ser Val Pro Thr Ser Pro Val Gly
660 665660 665
Ile Asp Lys Pro Ala Thr Asp Asp AsnIle Asp Lys Pro Ala Thr Asp Asp Asn
675 680675 680
Met Arg Lys Arg Arg Ser Ser Ser PheMet Arg Lys Arg Arg Ser Ser Ser Phe
690 695690 695
Glu Asp Pro Ser Gln Arg Gln Arg AlaGlu Asp Pro Ser Gln Arg Gln Arg Ala
705 710705 710
Thr Asn Thr Val Glu Glu Leu Glu GluThr Asn Thr Val Glu Glu Leu Glu Glu
725725
Cys Trp Tyr Lys Phe Ser Asn Ile PheCys Trp Tyr Lys Phe Ser Asn Ile Phe
740 745740 745
Tyr Trp Leu Lys Val Lys His Val ValTyr Trp Leu Lys Val Lys His Val Val
755 760755 760
Phe Val Asp Leu Ala Ile Thr Ile CysPhe Val Asp Leu Ala Ile Thr Ile Cys
770 775770 775
Met Ala Met Glu His Tyr Pro Met Thr 785 790Met Ala Met Glu His Tyr Pro Met Thr 785 790
Thr Val Gly Asn Leu Val Phe Thr GlyThr Val Gly Asn Leu Val Phe Thr Gly
805805
Leu Lys Ile Ile Ala Met Asp Pro TyrLeu Lys Ile Ile Ala Met Asp Pro Tyr
820 825820 825
Asn Ile Phe Asp Gly Phe Ile Val ThrAsn Ile Phe Asp Gly Phe Ile Val Thr
835 840835 840
Ser Arg Arg Asp Ser LeuSer Arg Arg Asp Ser Leu
605605
Asn Ser Asn Leu Ser GlnAsn Ser Asn Leu Ser Gln
620620
Phe Pro Ala Asn Gly LysPhe Pro Ala Asn Gly Lys
635 640635 640
Val Ser Leu Val Gly GlyVal Ser Leu Val Gly Gly
655655
Leu Leu Pro Glu Val IleLeu Leu Pro Glu Val Ile
670670
Thr Thr Thr Glu Thr GluThr Thr Thr Glu Thr Glu
685685
Val Ser Met Asp Phe LeuVal Ser Met Asp Phe Leu
700700
Ser Ile Ala Ser Ile LeuSer Ile Ala Ser Ile Leu
715 720715 720
Arg Gln Lys Cys Pro ProArg Gln Lys Cys Pro Pro
735735
Ile Trp Asp Cys Ser ProIle Trp Asp Cys Ser Pro
750750
Leu Val Val Met Asp Pro 765Leu Val Val Met Asp Pro 765
Val Leu Asn Thr Leu PheVal Leu Asn Thr Leu Phe
780780
His Phe Asn Asn Val LeuHis Phe Asn Asn Val Leu
795 800795 800
Phe Thr Ala Glu Met PhePhe Thr Ala Glu Met Phe
815815
Tyr Phe Gln Glu Gly TrpTyr Phe Gln Glu Gly Trp
830830
Ser Leu Val Glu Leu Gly 845Ser Leu Val Glu Leu Gly 845
- 282 046157- 282 046157
LeuLeu
Arg 865Arg 865
LysLys
LeuLeu
GlyGly
LeuLeu
Phe 945Phe 945
GluGlu
ValVal
SerSer
MetMet
AlaAla
IleIle
LeuLeu
IleIle
SerSer
Ala Asn Val Glu Gly 850Ala Asn Val Glu Gly 850
Val Phe Lys Leu AlaVal Phe Lys Leu Ala
870870
Ile Ile Gly Asn SerIle Ile Gly Asn Ser
885885
Ala Ile Ile Val PheAla Ile Ile Val Phe
900900
Lys Ser Tyr Lys AspLys Ser Tyr Lys Asp
915915
Pro Arg Trp His Met 930Pro Arg Trp His Met 930
Arg Val Leu Cys GlyArg Val Leu Cys Gly
950950
Val Ala Gly Gln AlaVal Ala Gly Gln Ala
965965
Ile Gly Asn Leu Val 980Ile Gly Asn Leu Val 980
Leu Ser Val Leu Arg 855Leu Ser Val Leu Arg 855
Lys Ser Trp Pro ThrLys Ser Trp Pro Thr
875875
Val Gly Ala Leu GlyVal Gly Ala Leu Gly
890890
Ile Phe Ala Val ValIle Phe Ala Val Val
905905
Cys Val Cys Lys Ile 920Cys Val Cys Lys Ile 920
Asn Asp Phe Phe His 935Asn Asp Phe Phe His 935
Glu Trp Ile Glu ThrGlu Trp Ile Glu Thr
955955
Met Cys Leu Thr ValMet Cys Leu Thr Val
970970
Val Leu Asn Leu PheVal Leu Asn Leu Phe
985985
Ser Phe Ser Ala Asp AsnSer Phe Ser Ala Asp Asn
995995
Ser Phe Arg Leu Leu 860Ser Phe Arg Leu Leu 860
Leu Asn Met Leu IleLeu Asn Met Leu Ile
880880
Asn Leu Thr Leu ValAsn Leu Thr Leu Val
895895
Gly Met Gln Leu Phe 910Gly Met Gln Leu Phe 910
Ala Ser Asp Cys Gln 925Ala Ser Asp Cys Gln 925
Ser Phe Leu Ile Val 940Ser Phe Leu Ile Val 940
Met Trp Asp Cys MetMet Trp Asp Cys Met
960960
Phe Met Met Val MetPhe Met Met Val Met
975975
Leu Ala Leu Leu LeuLeu Ala Leu Leu Leu
990990
Leu Ala Ala Thr Asp Asp Asp Asn Glu 1000 1005Leu Ala Ala Thr Asp Asp Asp Asn Glu 1000 1005
- 283 046157- 283 046157
- 284 046157- 284 046157
1325 1330 13351325 1330 1335
1550 1555 15601550 1555 1560
- 285 046157- 285 046157
- 286 046157- 286 046157
- 287 046157- 287 046157
Lys Arg Asn Tyr Ile Leu Gly Leu Ala 1 5Lys Arg Asn Tyr Ile Leu Gly Leu Ala 1 5
Tyr Gly Ile Ile Asp Tyr Glu Thr ArgTyr Gly Ile Ile Asp Tyr Glu Thr Arg
2525
Arg Leu Phe Lys Glu Ala Asn Val GluArg Leu Phe Lys Glu Ala Asn Val Glu
4040
Lys Arg Gly Ala Arg Arg Leu Lys ArgLys Arg Gly Ala Arg Arg Leu Lys Arg
5555
Arg Val Lys Lys Leu Leu Phe Asp Tyr 65 70Arg Val Lys Lys Leu Leu Phe Asp Tyr 65 70
Glu Leu Ser Gly Ile Asn Pro Tyr Glu 85Glu Leu Ser Gly Ile Asn Pro Tyr Glu 85
Gln Lys Leu Ser Glu Glu Glu Phe SerGln Lys Leu Ser Glu Glu Glu Phe Ser
100 105100 105
Lys Arg Arg Gly Val His Asn Val AsnLys Arg Arg Gly Val His Asn Val Asn
115 120115 120
Asn Glu Leu Ser Thr Lys Glu Gln IleAsn Glu Leu Ser Thr Lys Glu Gln Ile
130 135130 135
Glu Glu Lys Tyr Val Ala Glu Leu GlnGlu Glu Lys Tyr Val Ala Glu Leu Gln
145 150145 150
Gly Glu Val Arg Gly Ser Ile Asn ArgGly Glu Val Arg Gly Ser Ile Asn Arg
165165
Lys Glu Ala Lys Gln Leu Leu Lys ValLys Glu Ala Lys Gln Leu Leu Lys Val
180 185180 185
Asp Gln Ser Phe Ile Asp Thr Tyr IleAsp Gln Ser Phe Ile Asp Thr Tyr Ile
195 200195 200
Thr Tyr Tyr Glu Gly Pro Gly Glu GlyThr Tyr Tyr Glu Gly Pro Gly Glu Gly
210 215210 215
Ile Lys Glu Trp Tyr Glu Met Leu MetIle Lys Glu Trp Tyr Glu Met Leu Met
225 230225 230
Glu Glu Leu Arg Ser Val Lys Tyr AlaGlu Glu Leu Arg Ser Val Lys Tyr Ala
245245
Gly Ile Thr Ser Val Gly 15Gly Ile Thr Ser Val Gly 15
Val Ile Asp Ala Gly ValVal Ile Asp Ala Gly Val
Asn Glu Gly Arg Arg Ser 45Asn Glu Gly Arg Arg Ser 45
Arg Arg His Arg Ile Gln 60Arg Arg His Arg Ile Gln 60
Leu Leu Thr Asp His Ser 75 80Leu Leu Thr Asp His Ser 75 80
Arg Val Lys Gly Leu Ser 95Arg Val Lys Gly Leu Ser 95
Ala Leu Leu His Leu AlaAla Leu Leu His Leu Ala
110110
Val Glu Glu Asp Thr GlyVal Glu Glu Asp Thr Gly
125125
Arg Asn Ser Lys Ala LeuArg Asn Ser Lys Ala Leu
140140
Glu Arg Leu Lys Lys AspGlu Arg Leu Lys Lys Asp
155 160155 160
Lys Thr Ser Asp Tyr ValLys Thr Ser Asp Tyr Val
175175
Lys Ala Tyr His Gln LeuLys Ala Tyr His Gln Leu
190190
Leu Leu Glu Thr Arg ArgLeu Leu Glu Thr Arg Arg
205205
Pro Phe Gly Trp Lys AspPro Phe Gly Trp Lys Asp
220220
His Cys Thr Tyr Phe ProHis Cys Thr Tyr Phe Pro
235 240235 240
Asn Ala Asp Leu Tyr AsnAsn Ala Asp Leu Tyr Asn
255255
- 288 046157- 288 046157
Ala Leu Asn Asp LeuAla Leu Asn Asp Leu
260260
Asn Asn Leu Val IleAsn Asn Leu Val Ile
265265
Thr Arg Asp Glu AsnThr Arg Asp Glu Asn
270270
Lys Leu Glu Tyr Tyr 275Lys Leu Glu Tyr Tyr 275
Glu Lys Phe Gln IleGlu Lys Phe Gln Ile
280280
Ile Glu Asn Val PheIle Glu Asn Val Phe
285285
Gln Lys Lys Lys Pro 290Gln Lys Lys Lys Pro 290
Thr Leu Lys Gln IleThr Leu Lys Gln Ile
295295
Ala Lys Glu Ile LeuAla Lys Glu Ile Leu
300300
Asn Glu Glu Asp Ile 305Asn Glu Glu Asp Ile 305
Lys Gly Tyr Arg Val 310Lys Gly Tyr Arg Val 310
Thr Ser Thr Gly Lys 315Thr Ser Thr Gly Lys 315
Glu Phe Thr Asn LeuGlu Phe Thr Asn Leu
325325
Lys Val Tyr His AspLys Val Tyr His Asp
330330
Ile Lys Asp Ile ThrIle Lys Asp Ile Thr
335335
Arg Lys Glu Ile IleArg Lys Glu Ile Ile
340340
Glu Asn Ala Glu LeuGlu Asn Ala Glu Leu
345345
Leu Asp Gln Ile AlaLeu Asp Gln Ile Ala
350350
Ile Leu Thr Ile TyrIle Leu Thr Ile Tyr
355355
Gln Ser Ser Glu Asp 360Gln Ser Ser Glu Asp 360
Ile Gln Glu Glu LeuIle Gln Glu Glu Leu
365365
Asn Leu Asn Ser GluAsn Leu Asn Ser Glu
370370
Leu Thr Gln Glu GluLeu Thr Gln Glu Glu
375375
Ile Glu Gln Ile SerIle Glu Gln Ile Ser
380380
Leu Lys Gly Tyr Thr 385Leu Lys Gly Tyr Thr 385
Gly Thr His Asn Leu 390Gly Thr His Asn Leu 390
Ser Leu Lys Ala Ile 395Ser Leu Lys Ala Ile 395
Leu Ile Leu Asp GluLeu Ile Leu Asp Glu
405405
Leu Trp His Thr AsnLeu Trp His Thr Asn
410410
Asp Asn Gln Ile AlaAsp Asn Gln Ile Ala
415415
Phe Asn Arg Leu LysPhe Asn Arg Leu Lys
420420
Leu Val Pro Lys LysLeu Val Pro Lys Lys
425425
Val Asp Leu Ser GlnVal Asp Leu Ser Gln
430430
Lys Glu Ile Pro ThrLys Glu Ile Pro Thr
435435
Thr Leu Val Asp AspThr Leu Val Asp Asp
440440
Phe Ile Leu Ser ProPhe Ile Leu Ser Pro
445445
Val Lys Arg Ser PheVal Lys Arg Ser Phe
450450
Ile Gln Ser Ile Lys 455Ile Gln Ser Ile Lys 455
Val Ile Asn Ala IleVal Ile Asn Ala Ile
460460
Lys Lys Tyr Gly Leu 465Lys Lys Tyr Gly Leu 465
Pro Asn Asp Ile Ile 470Pro Asn Asp Ile Ile 470
Ile Glu Leu Ala Arg 475Ile Glu Leu Ala Arg 475
Lys Asn Ser Lys AspLys Asn Ser Lys Asp
485485
Ala Gln Lys Met IleAla Gln Lys Met Ile
490490
Asn Glu Met Gln LysAsn Glu Met Gln Lys
495495
Asn Arg Gln Thr AsnAsn Arg Gln Thr Asn
500500
Glu Arg Ile Glu GluGlu Arg Ile Glu Glu
505505
Ile Ile Arg Thr ThrIle Ile Arg Thr Thr
510510
GluGlu
LysLys
ValVal
Pro 320Pro 320
AlaAla
LysLys
ThrThr
AsnAsn
Asn 400Asn 400
IleIle
GlnGln
ValVal
IleIle
Glu 480Glu 480
ArgArg
GlyGly
- 289 046157- 289 046157
LysLys
GlnGln
Leu 545Leu 545
SerSer
GluGlu
SerSer
AsnAsn
Leu 625Leu 625
IleIle
AsnAsn
LysLys
PhePhe
Leu 705Leu 705
AspAsp
AlaAla
PhePhe
Glu Asn Ala Lys Tyr 515Glu Asn Ala Lys Tyr 515
Glu Gly Lys Cys Leu 530Glu Gly Lys Cys Leu 530
Leu Asn Asn Pro PheLeu Asn Asn Pro Phe
550550
Val Ser Phe Asp AsnVal Ser Phe Asp Asn
565565
Glu Ala Ser Lys LysGlu Ala Ser Lys Lys
580580
Ser Asp Ser Lys IleSer Asp Ser Lys Ile
595595
Leu Ala Lys Gly Lys 610Leu Ala Lys Gly Lys 610
Leu Glu Glu Arg AspLeu Glu Glu Arg Asp
630630
Asn Arg Asn Leu ValAsn Arg Asn Leu Val
645645
Leu Leu Arg Ser Tyr 660Leu Leu Arg Ser Tyr 660
Ser Ile Asn Gly GlySer Ile Asn Gly Gly
675675
Lys Lys Glu Arg Asn 690Lys Lys Glu Arg Asn 690
Ile Ile Ala Asn AlaIle Ile Ala Asn Ala
710710
Lys Ala Lys Lys ValLys Ala Lys Lys Val
725725
Glu Ser Met Pro GluGlu Ser Met Pro Glu
740740
Ile Thr Pro His GlnIle Thr Pro His Gln
Leu Ile Glu Lys Ile 520Leu Ile Glu Lys Ile 520
Tyr Ser Leu Glu Ala 535Tyr Ser Leu Glu Ala 535
Asn Tyr Glu Val AspAsn Tyr Glu Val Asp
555555
Ser Phe Asn Asn LysSer Phe Asn Asn Lys
570570
Gly Asn Arg Thr Pro 585Gly Asn Arg Thr Pro 585
Ser Tyr Glu Thr PheSer Tyr Glu Thr Phe
600600
Gly Arg Ile Ser Lys 615Gly Arg Ile Ser Lys 615
Ile Asn Arg Phe SerIle Asn Arg Phe Ser
635635
Asp Thr Arg Tyr AlaAsp Thr Arg Tyr Ala
650650
Phe Arg Val Asn Asn 665Phe Arg Val Asn Asn 665
Phe Thr Ser Phe LeuPhe Thr Ser Phe Leu
680680
Lys Gly Tyr Lys His 695Lys Gly Tyr Lys His 695
Asp Phe Ile Phe LysAsp Phe Ile Phe Lys
715715
Met Glu Asn Gln MetMet Glu Asn Gln Met
730730
Ile Glu Thr Glu GlnIle Glu Thr Glu Gln
745745
Ile Lys His Ile LysIle Lys His Ile Lys
Lys Leu His Asp MetLys Leu His Asp Met
525525
Ile Pro Leu Glu Asp 540Ile Pro Leu Glu Asp 540
His Ile Ile Pro ArgHis Ile Ile Pro Arg
560560
Val Leu Val Lys GlnVal Leu Val Lys Gln
575575
Phe Gln Tyr Leu Ser 590Phe Gln Tyr Leu Ser 590
Lys Lys His Ile Leu 605Lys Lys His Ile Leu 605
Thr Lys Lys Glu Tyr 620Thr Lys Lys Glu Tyr 620
Val Gln Lys Asp PheVal Gln Lys Asp Phe
640640
Thr Arg Gly Leu MetThr Arg Gly Leu Met
655655
Leu Asp Val Lys ValLeu Asp Val Lys Val
670670
Arg Arg Lys Trp LysArg Arg Lys Trp Lys
685685
His Ala Glu Asp Ala 700His Ala Glu Asp Ala 700
Glu Trp Lys Lys LeuGlu Trp Lys Lys Leu
720720
Phe Glu Glu Lys GlnPhe Glu Glu Lys Gln
735735
Glu Tyr Lys Glu Ile 750Glu Tyr Lys Glu Ile 750
Asp Phe Lys Asp TyrAsp Phe Lys Asp Tyr
- 290 046157- 290 046157
755 760 765755 760 765
LysLys
Asp 785Asp 785
ValVal
LysLys
ProPro
GluGlu
Thr 865Thr 865
TyrTyr
ProPro
PhePhe
AsnAsn
Cys 945Cys 945
PhePhe
LeuLeu
ValVal
Tyr Ser His Arg Val Asp Lys Lys Pro Asn Arg Glu Leu Ile AsnTyr Ser His Arg Val Asp Lys Lys Pro Asn Arg Glu Leu Ile Asn
770 775 780770 775 780
Thr Leu Tyr Ser Thr Arg Lys Asp Asp Lys Gly Asn Thr Leu IleThr Leu Tyr Ser Thr Arg Lys Asp Asp Lys Gly Asn Thr Leu Ile
790 795 800790 795 800
Asn Asn Leu Asn Gly Leu Tyr Asp Lys Asp Asn Asp Lys Leu LysAsn Asn Leu Asn Gly Leu Tyr Asp Lys Asp Asn Asp Lys Leu Lys
805 810 815805 810 815
Leu Ile Asn Lys Ser Pro Glu Lys Leu Leu Met Tyr His His AspLeu Ile Asn Lys Ser Pro Glu Lys Leu Leu Met Tyr His His Asp
820 825 830820 825 830
Gln Thr Tyr Gln Lys Leu Lys Leu Ile Met Glu Gln Tyr Gly AspGln Thr Tyr Gln Lys Leu Lys Leu Ile Met Glu Gln Tyr Gly Asp
835 840 845835 840 845
Lys Asn Pro Leu Tyr Lys Tyr Tyr Glu Glu Thr Gly Asn Tyr LeuLys Asn Pro Leu Tyr Lys Tyr Tyr Glu Glu Thr Gly Asn Tyr Leu
850 855 860850 855 860
Lys Tyr Ser Lys Lys Asp Asn Gly Pro Val Ile Lys Lys Ile LysLys Tyr Ser Lys Lys Asp Asn Gly Pro Val Ile Lys Lys Ile Lys
870 875 880870 875 880
Tyr Gly Asn Lys Leu Asn Ala His Leu Asp Ile Thr Asp Asp TyrTyr Gly Asn Lys Leu Asn Ala His Leu Asp Ile Thr Asp Asp Tyr
885 890 895885 890 895
Asn Ser Arg Asn Lys Val Val Lys Leu Ser Leu Lys Pro Tyr ArgAsn Ser Arg Asn Lys Val Val Lys Leu Ser Leu Lys Pro Tyr Arg
900 905 910900 905 910
Asp Val Tyr Leu Asp Asn Gly Val Tyr Lys Phe Val Thr Val LysAsp Val Tyr Leu Asp Asn Gly Val Tyr Lys Phe Val Thr Val Lys
915 920 925915 920 925
Leu Asp Val Ile Lys Lys Glu Asn Tyr Tyr Glu Val Asn Ser LysLeu Asp Val Ile Lys Lys Glu Asn Tyr Tyr Glu Val Asn Ser Lys
930 935 940930 935 940
Tyr Glu Glu Ala Lys Lys Leu Lys Lys Ile Ser Asn Gln Ala GluTyr Glu Glu Ala Lys Lys Leu Lys Lys Ile Ser Asn Gln Ala Glu
950 955 960950 955 960
Ile Ala Ser Phe Tyr Asn Asn Asp Leu Ile Lys Ile Asn Gly GluIle Ala Ser Phe Tyr Asn Asn Asp Leu Ile Lys Ile Asn Gly Glu
965 970 975965 970 975
Tyr Arg Val Ile Gly Val Asn Asn Asp Leu Leu Asn Arg Ile GluTyr Arg Val Ile Gly Val Asn Asn Asp Leu Leu Asn Arg Ile Glu
980 985 990980 985 990
Asn Met Ile Asp Ile Thr Tyr Arg Glu Tyr Leu Glu Asn Met AsnAsn Met Ile Asp Ile Thr Tyr Arg Glu Tyr Leu Glu Asn Met Asn
995 1000 1005995 1000 1005
- 291 046157- 291 046157
AspAsp
Lys 1010Lys 1010
ArgArg
ProPro
ProPro
ArgArg
Ile 1015Ile 1015
IleIle
LysLys
ThrThr
IleIle
AlaAla
10201020
SerSer
Lys ThrLys Thr
GlnGln
SerSer
10251025
IleIle
LysLys
LysLys
TyrTyr
SerSer
10301030
ThrThr
AspAsp
IleIle
LeuLeu
Gly 1035Gly 1035
AsnAsn
Leu TyrLeu Tyr
GluGlu
ValVal
10401040
LysLys
SerSer
LysLys
LysLys
HisHis
10451045
ProPro
GlnGln
IleIle
IleIle
Lys 1050Lys 1050
LysLys
Gly <210> 174 <211> 1148 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Gly <210> 174 <211> 1148 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 174<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 174
Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His Gly Val Pro AlaMet Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ile His Gly Val Pro Ala
5 10155 1015
Ala Lys Arg Asn Tyr Ile Leu Gly Leu Ala Ile Gly Ile Thr Ser Val 20 2530Ala Lys Arg Asn Tyr Ile Leu Gly Leu Ala Ile Gly Ile Thr Ser Val 20 2530
Gly Tyr Gly Ile Ile Asp Tyr Glu Thr Arg Asp Val Ile Asp Ala Gly 35 4045Gly Tyr Gly Ile Ile Asp Tyr Glu Thr Arg Asp Val Ile Asp Ala Gly 35 4045
Val Arg Leu Phe Lys Glu Ala Asn Val Glu Asn Asn Glu Gly Arg Arg 50 5560Val Arg Leu Phe Lys Glu Ala Asn Val Glu Asn Asn Glu Gly Arg Arg 50 5560
Ser Lys Arg Gly Ala Arg Arg Leu Lys Arg Arg Arg Arg His Arg Ile 65 70 7580Ser Lys Arg Gly Ala Arg Arg Leu Lys Arg Arg Arg Arg His Arg Ile 65 70 7580
Gln Arg Val Lys Lys Leu Leu Phe Asp Tyr Asn Leu Leu Thr Asp His 85 9095Gln Arg Val Lys Lys Leu Leu Phe Asp Tyr Asn Leu Leu Thr Asp His 85 9095
Ser Glu Leu Ser Gly Ile Asn Pro Tyr Glu Ala Arg Val Lys Gly LeuSer Glu Leu Ser Gly Ile Asn Pro Tyr Glu Ala Arg Val Lys Gly Leu
100 105110100 105110
Ser Gln Lys Leu Ser Glu Glu Glu Phe Ser Ala Ala Leu Leu His LeuSer Gln Lys Leu Ser Glu Glu Glu Phe Ser Ala Ala Leu Leu His Leu
115 120125115 120125
Ala Lys Arg Arg Gly Val His Asn Val Asn Glu Val Glu Glu Asp ThrAla Lys Arg Arg Gly Val His Asn Val Asn Glu Val Glu Glu Asp Thr
130 135140130 135140
Gly Asn Glu Leu Ser Thr Lys Glu Gln Ile Ser Arg Asn Ser Lys AlaGly Asn Glu Leu Ser Thr Lys Glu Gln Ile Ser Arg Asn Ser Lys Ala
145 150 155160145 150 155160
Leu Glu Glu Lys Tyr Val Ala Glu Leu Gln Leu Glu Arg Leu Lys LysLeu Glu Glu Lys Tyr Val Ala Glu Leu Gln Leu Glu Arg Leu Lys Lys
- 292 046157- 292 046157
165165
170170
175175
Asp Gly Glu Val ArgAsp Gly Glu Val Arg
180180
Gly Ser Ile Asn ArgGly Ser Ile Asn Arg
185185
Phe Lys Thr Ser AspPhe Lys Thr Ser Asp
190190
Val Lys Glu Ala LysVal Lys Glu Ala Lys
195195
Gln Leu Leu Lys Val 200Gln Leu Leu Lys Val 200
Gln Lys Ala Tyr His 205Gln Lys Ala Tyr His 205
Leu Asp Gln Ser PheLeu Asp Gln Ser Phe
210210
Ile Asp Thr Tyr IleIle Asp Thr Tyr Ile
215215
Asp Leu Leu Glu ThrAsp Leu Leu Glu Thr
220220
Arg Thr Tyr Tyr Glu 225Arg Thr Tyr Tyr Glu 225
Gly Pro Gly Glu Gly 230Gly Pro Gly Glu Gly 230
Ser Pro Phe Gly Trp 235Ser Pro Phe Gly Trp 235
Asp Ile Lys Glu TrpAsp Ile Lys Glu Trp
245245
Tyr Glu Met Leu MetTyr Glu Met Leu Met
250250
Gly His Cys Thr TyrGly His Cys Thr Tyr
255255
Pro Glu Glu Leu ArgPro Glu Glu Leu Arg
260260
Ser Val Lys Tyr AlaSer Val Lys Tyr Ala
265265
Tyr Asn Ala Asp LeuTyr Asn Ala Asp Leu
270270
Asn Ala Leu Asn Asp 275Asn Ala Leu Asn Asp 275
Leu Asn Asn Leu ValLeu Asn Asn Leu Val
280280
Ile Thr Arg Asp GluIle Thr Arg Asp Glu
285285
Glu Lys Leu Glu TyrGlu Lys Leu Glu Tyr
290290
Tyr Glu Lys Phe Gln 295Tyr Glu Lys Phe Gln 295
Ile Ile Glu Asn ValIle Ile Glu Asn Val
300300
Lys Gln Lys Lys Lys 305Lys Gln Lys Lys Lys 305
Pro Thr Leu Lys Gln 310Pro Thr Leu Lys Gln 310
Ile Ala Lys Glu Ile 315Ile Ala Lys Glu Ile 315
Val Asn Glu Glu AspVal Asn Glu Glu Asp
325325
Ile Lys Gly Tyr ArgIle Lys Gly Tyr Arg
330330
Val Thr Ser Thr GlyVal Thr Ser Thr Gly
335335
Pro Glu Phe Thr AsnPro Glu Phe Thr Asn
340340
Leu Lys Val Tyr HisLeu Lys Val Tyr His
345345
Asp Ile Lys Asp IleAsp Ile Lys Asp Ile
350350
Ala Arg Lys Glu Ile 355Ala Arg Lys Glu Ile 355
Ile Glu Asn Ala GluIle Glu Asn Ala Glu
360360
Leu Leu Asp Gln Ile 365Leu Leu Asp Gln Ile 365
Lys Ile Leu Thr Ile 370Lys Ile Leu Thr Ile 370
Tyr Gln Ser Ser Glu 375Tyr Gln Ser Ser Glu 375
Asp Ile Gln Glu Glu 380Asp Ile Gln Glu Glu 380
Thr Asn Leu Asn Ser 385Thr Asn Leu Asn Ser 385
Glu Leu Thr Gln Glu 390Glu Leu Thr Gln Glu 390
Glu Ile Glu Gln Ile 395Glu Ile Glu Gln Ile 395
Asn Leu Lys Gly TyrAsn Leu Lys Gly Tyr
405405
Thr Gly Thr His AsnThr Gly Thr His Asn
410410
Leu Ser Leu Lys AlaLeu Ser Leu Lys Ala
415415
TyrTyr
GlnGln
ArgArg
Lys 240Lys 240
PhePhe
TyrTyr
AsnAsn
PhePhe
Leu 320Leu 320
LysLys
ThrThr
AlaAla
LeuLeu
Ser 400Ser 400
IleIle
- 293 046157- 293 046157
Asn Leu Ile Leu AspAsn Leu Ile Leu Asp
420420
Glu Leu Trp His ThrGlu Leu Trp His Thr
425425
Asn Asp Asn Gln IleAsn Asp Asn Gln Ile
430430
Ile Phe Asn Arg LeuIle Phe Asn Arg Leu
435435
Lys Leu Val Pro LysLys Leu Val Pro Lys
440440
Lys Val Asp Leu SerLys Val Asp Leu Ser
445445
Gln Lys Glu Ile Pro 450Gln Lys Glu Ile Pro 450
Thr Thr Leu Val AspThr Thr Leu Val Asp
455455
Asp Phe Ile Leu SerAsp Phe Ile Leu Ser
460460
Val Val Lys Arg Ser 465Val Val Lys Arg Ser 465
Phe Ile Gln Ser Ile 470Phe Ile Gln Ser Ile 470
Lys Val Ile Asn Ala 475Lys Val Ile Asn Ala 475
Ile Lys Lys Tyr GlyIle Lys Lys Tyr Gly
485485
Leu Pro Asn Asp IleLeu Pro Asn Asp Ile
490490
Ile Ile Glu Leu AlaIle Ile Glu Leu Ala
495495
Glu Lys Asn Ser LysGlu Lys Asn Ser Lys
500500
Asp Ala Gln Lys MetAsp Ala Gln Lys Met
505505
Ile Asn Glu Met GlnIle Asn Glu Met Gln
510510
Arg Asn Arg Gln Thr 515Arg Asn Arg Gln Thr 515
Asn Glu Arg Ile Glu 520Asn Glu Arg Ile Glu 520
Glu Ile Ile Arg Thr 525Glu Ile Ile Arg Thr 525
Gly Lys Glu Asn AlaGly Lys Glu Asn Ala
530530
Lys Tyr Leu Ile Glu 535Lys Tyr Leu Ile Glu 535
Lys Ile Lys Leu His 540Lys Ile Lys Leu His 540
Met Gln Glu Gly Lys 545Met Gln Glu Gly Lys 545
Cys Leu Tyr Ser Leu 550Cys Leu Tyr Ser Leu 550
Glu Ala Ile Pro Leu 555Glu Ala Ile Pro Leu 555
Asp Leu Leu Asn AsnAsp Leu Leu Asn Asn
565565
Pro Phe Asn Tyr GluPro Phe Asn Tyr Glu
570570
Val Asp His Ile IleVal Asp His Ile Ile
575575
Arg Ser Val Ser PheArg Ser Val Ser Phe
580580
Asp Asn Ser Phe AsnAsp Asn Ser Phe Asn
585585
Asn Lys Val Leu ValAsn Lys Val Leu Val
590590
Gln Glu Glu Ala SerGln Glu Glu Ala Ser
595595
Lys Lys Gly Asn ArgLys Lys Gly Asn Arg
600600
Thr Pro Phe Gln TyrThr Pro Phe Gln Tyr
605605
Ser Ser Ser Asp Ser 610Ser Ser Ser Asp Ser 610
Lys Ile Ser Tyr Glu 615Lys Ile Ser Tyr Glu 615
Thr Phe Lys Lys His 620Thr Phe Lys Lys His 620
Leu Asn Leu Ala Lys 625Leu Asn Leu Ala Lys 625
Gly Lys Gly Arg Ile 630Gly Lys Gly Arg Ile 630
Ser Lys Thr Lys Lys 635Ser Lys Thr Lys Lys 635
Tyr Leu Leu Glu GluTyr Leu Leu Glu Glu
645645
Arg Asp Ile Asn ArgArg Asp Ile Asn Arg
650650
Phe Ser Val Gln LysPhe Ser Val Gln Lys
655655
Phe Ile Asn Arg AsnPhe Ile Asn Arg Asn
660660
Leu Val Asp Thr ArgLeu Val Asp Thr Arg
665665
Tyr Ala Thr Arg GlyTyr Ala Thr Arg Gly
670670
AlaAla
GlnGln
ProPro
Ile 480Ile 480
ArgArg
LysLys
ThrThr
AspAsp
Glu 560Glu 560
ProPro
LysLys
LeuLeu
IleIle
Glu 640Glu 640
AspAsp
LeuLeu
- 294 046157- 294 046157
MetMet
ValVal
Lys 705Lys 705
AlaAla
LeuLeu
GlnGln
IleIle
Tyr 785Tyr 785
AsnAsn
IleIle
LysLys
AspAsp
Asp 865Asp 865
LeuLeu
LysLys
TyrTyr
Asn Leu Leu Arg Ser 675Asn Leu Leu Arg Ser 675
Lys Ser Ile Asn Gly 690Lys Ser Ile Asn Gly 690
Phe Lys Lys Glu ArgPhe Lys Lys Glu Arg
710710
Leu Ile Ile Ala AsnLeu Ile Ile Ala Asn
725725
Asp Lys Ala Lys Lys 740Asp Lys Ala Lys Lys 740
Ala Glu Ser Met ProAla Glu Ser Met Pro
755755
Phe Ile Thr Pro His 770Phe Ile Thr Pro His 770
Lys Tyr Ser His ArgLys Tyr Ser His Arg
790790
Asp Thr Leu Tyr SerAsp Thr Leu Tyr Ser
805805
Val Asn Asn Leu AsnVal Asn Asn Leu Asn
820820
Lys Leu Ile Asn LysLys Leu Ile Asn Lys
835835
Pro Gln Thr Tyr Gln 850Pro Gln Thr Tyr Gln 850
Glu Lys Asn Pro LeuGlu Lys Asn Pro Leu
870870
Thr Lys Tyr Ser LysThr Lys Tyr Ser Lys
885885
Tyr Tyr Gly Asn Lys 900Tyr Tyr Gly Asn Lys 900
Pro Asn Ser Arg Asn 915Pro Asn Ser Arg Asn 915
Tyr Phe Arg Val Asn 680Tyr Phe Arg Val Asn 680
Gly Phe Thr Ser Phe 695Gly Phe Thr Ser Phe 695
Asn Lys Gly Tyr LysAsn Lys Gly Tyr Lys
715715
Ala Asp Phe Ile PheAla Asp Phe Ile Phe
730730
Val Met Glu Asn GlnVal Met Glu Asn Gln
745745
Glu Ile Glu Thr GluGlu Ile Glu Thr Glu
760760
Gln Ile Lys His Ile 775Gln Ile Lys His Ile 775
Val Asp Lys Lys ProVal Asp Lys Lys Pro
795795
Thr Arg Lys Asp AspThr Arg Lys Asp Asp
810810
Gly Leu Tyr Asp Lys 825Gly Leu Tyr Asp Lys 825
Ser Pro Glu Lys LeuSer Pro Glu Lys Leu
840840
Lys Leu Lys Leu Ile 855Lys Leu Lys Leu Ile 855
Tyr Lys Tyr Tyr GluTyr Lys Tyr Tyr Glu
875875
Lys Asp Asn Gly ProLys Asp Asn Gly Pro
890890
Leu Asn Ala His LeuLeu Asn Ala His Leu
905905
Lys Val Val Lys Leu 920Lys Val Val Lys Leu 920
Asn Leu Asp Val LysAsn Leu Asp Val Lys
685685
Leu Arg Arg Lys Trp 700Leu Arg Arg Lys Trp 700
His His Ala Glu AspHis His Ala Glu Asp
720720
Lys Glu Trp Lys LysLys Glu Trp Lys Lys
735735
Met Phe Glu Glu Lys 750Met Phe Glu Glu Lys 750
Gln Glu Tyr Lys Glu 765Gln Glu Tyr Lys Glu 765
Lys Asp Phe Lys Asp 780Lys Asp Phe Lys Asp 780
Asn Arg Glu Leu IleAsn Arg Glu Leu Ile
800800
Lys Gly Asn Thr LeuLys Gly Asn Thr Leu
815815
Asp Asn Asp Lys Leu 830Asp Asn Asp Lys Leu 830
Leu Met Tyr His His 845Leu Met Tyr His His 845
Met Glu Gln Tyr Gly 860Met Glu Gln Tyr Gly 860
Glu Thr Gly Asn TyrGlu Thr Gly Asn Tyr
880880
Val Ile Lys Lys IleVal Ile Lys Lys Ile
895895
Asp Ile Thr Asp Asp 910Asp Ile Thr Asp Asp 910
Ser Leu Lys Pro TyrSer Leu Lys Pro Tyr
925925
- 295 046157- 295 046157
Arg Phe Asp Val Tyr Leu Asp Asn Gly Val Tyr Lys Phe Val Thr ValArg Phe Asp Val Tyr Leu Asp Asn Gly Val Tyr Lys Phe Val Thr Val
930 935940930 935940
Lys Asn Leu Asp Val Ile Lys Lys Glu Asn Tyr Tyr Glu Val Asn SerLys Asn Leu Asp Val Ile Lys Lys Glu Asn Tyr Tyr Glu Val Asn Ser
945 950 955960945 950 955960
Lys Cys Tyr Glu Glu Ala Lys Lys Leu Lys Lys Ile Ser Asn Gln AlaLys Cys Tyr Glu Glu Ala Lys Lys Leu Lys Lys Ile Ser Asn Gln Ala
965 970975965 970975
Glu Phe Ile Ala Ser Phe Tyr Asn Asn Asp Leu Ile Lys Ile Asn GlyGlu Phe Ile Ala Ser Phe Tyr Asn Asn Asp Leu Ile Lys Ile Asn Gly
980 985990980 985990
Glu Leu Tyr Arg Val IleGlu Leu Tyr Arg Val Ile
995995
Gly Val Asn Asn Asp Leu Leu Asn Arg IleGly Val Asn Asn Asp Leu Leu Asn Arg Ile
1000100510001005
Asp Leu Asp Met LeuAsp Leu Asp Met Leu
1145 <210> 1751145 <210> 175
- 296 046157 <211> 387 <212> Белок <213> Homo sapiens <400> 175- 296 046157 <211> 387 <212> Protein <213> Homo sapiens <400> 175
Met Thr Gly Lys Leu 1 5Met Thr Gly Lys Leu 1 5
Ala Glu Lys Leu ProAla Glu Lys Leu Pro
Val Thr Met Ser SerVal Thr Met Ser Ser
Leu Asn Gln Leu ProLeu Asn Gln Leu Pro
Asp Asn Leu Tyr ProAsp Asn Leu Tyr Pro
Glu Glu Ile Pro SerGlu Glu Ile Pro Ser
Leu Asn Leu Phe SerLeu Asn Leu Phe Ser
Gly Ser Ser Asp Ser 40Gly Ser Ser Asp Ser 40
Val Val His Tyr Asn 45Val Val His Tyr Asn 45
Met Ala Thr Glu Asn 50Met Ala Thr Glu Asn 50
Val Met Asp Ile Gly 55Val Met Asp Ile Gly 55
Leu Thr Asn Glu Lys 60Leu Thr Asn Glu Lys 60
Asn Pro Glu Leu Ser 65Asn Pro Glu Leu Ser 65
Tyr Ser Gly Ser Phe 70Tyr Ser Gly Ser Phe 70
Gln Pro Ala Pro Gly 75Gln Pro Ala Pro Gly 75
Lys Thr Val Thr TyrLys Thr Val Thr Tyr
Leu Gly Lys Phe AlaLeu Gly Lys Phe Ala
Phe Asp Ser Pro SerPhe Asp Ser Pro Ser
Trp Cys Gln Asp AsnTrp Cys Gln Asp Asn
100100
Ile Ile Ser Leu MetIle Ile Ser Leu Met
105105
Ser Ala Gly Ile LeuSer Ala Gly Ile Leu
110110
Val Pro Pro Ala SerVal Pro Pro Ala Ser
115115
Gly Ala Leu Ser Thr 120Gly Ala Leu Ser Thr 120
Gln Thr Ser Thr AlaGln Thr Ser Thr Ala
125125
Met Val Gln Pro ProMet Val Gln Pro
130130
Gln Gly Asp Val Glu 135Gln Gly Asp Val Glu 135
Ala Met Tyr Pro Ala 140Ala Met Tyr Pro Ala 140
Pro Pro Tyr Ser Asn 145Pro Pro Tyr Ser Asn 145
Cys Gly Asp Leu Tyr 150Cys Gly Asp Leu Tyr 150
Ser Glu Pro Val Ser 155Ser Glu Pro Val Ser 155
His Asp Pro Gln GlyHis Asp Pro Gln Gly
165165
Asn Pro Gly Leu AlaAsn Pro Gly Leu Ala
170170
Tyr Ser Pro Gln AspTyr Ser Pro Gln Asp
175175
Gln Ser Ala Lys ProGln Ser Ala Lys Pro
180180
Ala Leu Asp Ser AsnAla Leu Asp Ser Asn
185185
Leu Phe Pro Met IleLeu Phe Pro Met Ile
190190
Asp Tyr Asn Leu Tyr 195Asp Tyr Asn Leu Tyr 195
His His Pro Asn AspHis His Pro Asn Asp
200200
Met Gly Ser Ile Pro 205Met Gly Ser Ile Pro 205
His Lys Pro Phe Gln 210His Lys Pro Phe Gln 210
Gly Met Asp Pro Ile 215Gly Met Asp Pro Ile 215
Arg Val Asn Pro Pro 220Arg Val Asn Pro Pro 220
Ile Thr Pro Leu Glu 225Ile Thr Pro Leu Glu 225
Thr Ile Lys Ala Phe 230Thr Ile Lys Ala Phe 230
Lys Asp Lys Gln Ile 235Lys Asp Lys Gln Ile 235
LeuLeu
AlaAla
GlnGln
ProPro
Asn 80Asn 80
AsnAsn
GlyGly
SerSer
LeuLeu
Phe 160Phe 160
TyrTyr
ProPro
GluGlu
ProPro
His 240His 240
- 297 046157- 297 046157
Pro Gly Phe Gly Ser Leu Pro Gln Pro Pro Leu Thr Leu Lys Pro IlePro Gly Phe Gly Ser Leu Pro Gln Pro Pro Leu Thr Leu Lys Pro Ile
245 250255245 250255
Arg Pro Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Leu His GluArg Pro Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Leu His Glu
260 265270260 265270
Arg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg Arg Phe Ser ArgArg Pro His Ala Cys Pro Ala Glu Gly Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg
275 280285275 280285
Ser Asp Glu Leu Thr Arg His Leu Arg Ile His Thr Gly His Lys ProSer Asp Glu Leu Thr Arg His Leu Arg Ile His Thr Gly His Lys Pro
290 295300290 295300
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Arg Ser Asp His LeuPhe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Ser Phe Ser Arg Ser Asp His Leu
305 310 315320305 310 315320
Thr Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys GluThr Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Glu
325 330335325 330335
Phe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His AlaPhe Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Ala
340 345350340 345350
Lys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu Lys Lys Ala Glu Lys Gly Gly AlaLys Ile His Leu Lys Gln Lys Glu Lys Lys Ala Glu Lys Gly Gly Ala
355 360365355 360365
Pro Ser Ala Ser Ser Ala Pro Pro Val Ser Leu Ala Pro Val Val ThrPro Ser Ala Ser Ser Ala Pro Pro Val Ser Leu Ala Pro Val Val Thr
370 375380370 375380
Thr Cys Ala 385 <210> 176 <211> 543 <212> Белок <213> Homo sapiens <400> 176Thr Cys Ala 385 <210> 176 <211> 543 <212> Protein <213> Homo sapiens <400> 176
Met Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met Ser Pro Leu Gln IleMet Ala Ala Ala Lys Ala Glu Met Gln Leu Met Ser Pro Leu Gln Ile
5 10155 1015
Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro Thr Met Asp Asn Tyr 20 2530Ser Asp Pro Phe Gly Ser Phe Pro His Ser Pro Thr Met Asp Asn Tyr 20 2530
Pro Lys Leu Glu Glu Met Met Leu Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln Phe 35 4045Pro Lys Leu Glu Glu Met Met Leu Leu Ser Asn Gly Ala Pro Gln Phe 35 4045
Leu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser Ser 50 5560Leu Gly Ala Ala Gly Ala Pro Glu Gly Ser Gly Ser Asn Ser Ser Ser 50 5560
- 298 046157- 298 046157
Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser 65 70 75Ser Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Asn Ser 65 70 75
Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln 85 90 95Ser Ser Ser Ser Thr Phe Asn Pro Gln Ala Asp Thr Gly Glu Gln 85 90 95
Tyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu AsnTyr Glu His Leu Thr Ala Glu Ser Phe Pro Asp Ile Ser Leu Asn
100 105 110100 105 110
Glu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr ArgGlu Lys Val Leu Val Glu Thr Ser Tyr Pro Ser Gln Thr Thr Arg
115 120 125115 120 125
Pro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala ProPro Pro Ile Thr Tyr Thr Gly Arg Phe Ser Leu Glu Pro Ala Pro
130 135 140130 135 140
Ser Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val SerSer Gly Asn Thr Leu Trp Pro Glu Pro Leu Phe Ser Leu Val Ser
145 150 155145 150 155
Leu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala ProLeu Val Ser Met Thr Asn Pro Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro
165 170 175165 170 175
Pro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu SerPro Ala Ala Ser Ser Ala Ser Ala Ser Gln Ser Pro Pro Leu Ser
180 185 190180 185 190
Ala Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala ProAla Val Pro Ser Asn Asp Ser Ser Pro Ile Tyr Ser Ala Ala Pro
195 200 205195 200 205
Phe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser GlnPhe Pro Thr Pro Asn Thr Asp Ile Phe Pro Glu Pro Gln Ser Gln
210 215 220210 215 220
Phe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro AlaPhe Pro Gly Ser Ala Gly Thr Ala Leu Gln Tyr Pro Pro Pro Ala
225 230 235225 230 235
Pro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp TyrPro Ala Ala Lys Gly Gly Phe Gln Val Pro Met Ile Pro Asp Tyr
245 250 255245 250 255
Phe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp GlnPhe Pro Gln Gln Gln Gly Asp Leu Gly Leu Gly Thr Pro Asp Gln
260 265 270260 265 270
Pro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu ThrPro Phe Gln Gly Leu Glu Ser Arg Thr Gln Gln Pro Ser Leu Thr
275 280 285275 280 285
Leu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln AspLeu Ser Thr Ile Lys Ala Phe Ala Thr Gln Ser Gly Ser Gln Asp
290 295 300290 295 300
Lys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro SerLys Ala Leu Asn Thr Ser Tyr Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser
305 310 315305 310 315
Ser 80Ser 80
ProPro
AsnAsn
LeuLeu
AsnAsn
Gly 160Gly 160
SerSer
CysCys
ThrThr
AlaAla
Tyr 240Tyr 240
LeuLeu
LysLys
ProPro
LeuLeu
Arg 320Arg 320
- 299 046157- 299 046157
Met Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu ArgMet Arg Lys Tyr Pro Asn Arg Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg
325 330335325 330335
Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg SerPro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser
340 345350340 345350
Asp Glu Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro PheAsp Glu Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe
355 360365355 360365
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp His Leu ThrGln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp His Leu Thr
370 375380370 375380
Thr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp IleThr His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile
385 390 395400385 390 395400
Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Thr LysCys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Thr Lys
405 410415405 410415
Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Lys Lys Ala Asp Lys Ser Val Val AlaIle His Leu Arg Gln Lys Asp Lys Lys Ala Asp Lys Ser Val Val Ala
420 425430420 425430
Ser Ser Ala Thr Ser Ser Leu Ser Ser Tyr Pro Ser Pro Val Ala ThrSer Ser Ala Thr Ser Ser Leu Ser Ser Tyr Pro Ser Pro Val Ala Thr
435 440445435 440445
Ser Tyr Pro Ser Pro Val Thr Thr Ser Tyr Pro Ser Pro Ala Thr ThrSer Tyr Pro Ser Pro Val Thr Thr Ser Tyr Pro Ser Pro Ala Thr Thr
450 455460450 455460
Ser Tyr Pro Ser Pro Val Pro Thr Ser Phe Ser Ser Pro Gly Ser SerSer Tyr Pro Ser Pro Val Pro Thr Ser Phe Ser Ser Pro Gly Ser Ser
465 470 475480465 470 475480
Thr Tyr Pro Ser Pro Val His Ser Gly Phe Pro Ser Pro Ser Val AlaThr Tyr Pro Ser Pro Val His Ser Gly Phe Pro Ser Pro Ser Val Ala
485 490495485 490495
Thr Thr Tyr Ser Ser Val Pro Pro Ala Phe Pro Ala Gln Val Ser SerThr Thr Tyr Ser Ser Val Pro Pro Ala Phe Pro Ala Gln Val Ser Ser
500 505510500 505510
Phe Pro Ser Ser Ala Val Thr Asn Ser Phe Ser Ala Ser Thr Gly LeuPhe Pro Ser Ser Ala Val Thr Asn Ser Phe Ser Ala Ser Thr Gly Leu
515 520525515 520525
Ser Asp Met Thr Ala Thr Phe Ser Pro Arg Thr Ile Glu Ile CysSer Asp Met Thr Ala Thr Phe Ser Pro Arg Thr Ile Glu Ile Cys
530 535540 <210> 177 <211> 8 <212> Белок <213> Искусственная последовательность530 535540 <210> 177 <211> 8 <212> Protein <213> Artificial sequence
- 300 046157 <220>- 300 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 177<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 177
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser GlyGly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly
5 <210> 178 <211> 16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>5 <210> 178 <211> 16 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <400> 178<223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <400> 178
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 <210> 179 <211> 4 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 <210> 179 <211> 4 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<223> Смотри первоначальное описание заявки для подробного описания замен и предпочтительных вариантов осуществления <400> 179<223> See the original application description for a detailed description of substitutions and preferred embodiments <400> 179
Gly Gly Gly Ser <210> 180 <211> 5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Gly Gly Gly Ser <210> 180 <211> 5 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<223> Смотри первоначальное описание заявки для подробного описания замен и предпочтительных вариантов осуществления <400> 180<223> See original application description for detailed description of substitutions and preferred embodiments <400> 180
Gly Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Gly Ser
5 <210> 181 <211> 4 <212> Белок <213> Искусственная последовательность5 <210> 181 <211> 4 <212> Protein <213> Artificial sequence
- 301 046157 <220>- 301 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический пептид <220><223> Description of artificial sequence: Synthetic peptide <220>
<223> Смотри первоначальное описание заявки для подробного описания замен и предпочтительных вариантов осуществления <400> 181<223> See the original application description for a detailed description of substitutions and preferred embodiments <400> 181
Gly Gly Ser Gly <210> 182 <211> 9 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 182 gcgkgggcg 9 <210> 183 <211> 76 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>Gly Gly Ser Gly <210> 182 <211> 9 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 182 gcgkgggcg 9 <210> 183 <211> 76 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид <400> 183 gttttagtac tctggaaaca gaatctacta aaacaaggca aaatgccgtg tttatctcgt 60 caacttgttg gcgaga 76 <210> 184 <211> 3871 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 183 gttttagtac tctggaaaca gaatctacta aaacaaggca aaatgccgtg tttatctcgt 60 caacttgttg gcgaga 76 <210> 184 <211> 3871 <212> DNA <213> Artificial sequence <2 20>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 302 046157 cccagctaat ttttgtattt ttaatagata cgggggtttc accatatcac ccaggctggt 540 ctcgaactcc tggcctcaag tgatccacct gcctcggcct cccaaagtgc tgggattata600 ggcgtcagcc actatgccca acccgaccaa ccttttttaa aataaatatt taaaaaattg660 gtatttcaca tatatactag tatttacatt tatccacaca aaacggacgg gcctccgctg720 aaccagtgag gccccagacg tgcgcataaa taacccctgc gtgctgcacc acctggggag780 agggggagga ccacggtaaa tggagcgagc gcatagcaaa agggacgcgg ggtccttttc840 tctgccggtg gcactgggta gctgtggcca ggtgtggtac tttgatgggg cccagggctg900 gagctcaagg aagcgtcgca gggtcacaga tctgggggaa ccccggggaa aagcactgag960 gcaaaaccgc cgctcgtctc ctacaatata tgggaggggg aggttgagta cgttctggat1020 tactcataag accttttttt tttccttccg ggcgcaaaac cgtgagctgg atttataatc1080 gccctataaa gctccagagg cggtcaggca cctgcagagg agccccgccg ctccgccgac1140 tagctgcccc cgcgagcaac ggcctcgtga tttccccgcc gatccggtcc ccgcctcccc1200 actctgcccc cgcctacccc ggagccgtgc agccgcctct ccgaatctct ctcttctcct1260 ggcgctcgcg tgcgagaggg aactagcgag aacgaggaag cagctggagg tgacgccggg1320 cagattacgc ctgtcagggc cgagccgagc ggatcgctgg gcgctgtgca gaggaaaggc1380 gggagtgccc ggctcgctgt cgcagagccg aggtgggtaa gctagcgacc acctggactt1440 cccagcgccc aaccgtggct tttcagccag gtcctctcct cccgcggctt ctcaaccaac1500 cccatcccag cgccggccac ccaacctccc gaaatgagtg cttcctgccc cagcagccga1560 aggcgctact aggaacggta acctgttact tttccagggg ccgtagtcga cccgctgccc1620 gagttgctgt gcgactgcgc gcgcggggct agagtgcaag gtgactgtgg ttcttctctg1680 gccaagtccg agggagaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttctttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa ccagacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccg ccgaccacct gatgctcgcc gagggctacc2100 gcctggtgca gaggccgccg tccgccgccg ccgcccatgg ccctcatgcg ctccggactc2160 tgccgccgta cgcgggcccg ggcctggaca gtgggctgag gccgcggggg gctccgctgg2220 ggccgccgcc gccccgccaa cccggggccc tggcgtacgg ggccttcggg ccgccgtcct2280 ccttccagcc ctttccggcc gtgcctccgc cggccgcggg catcgcgcac ctgcagcctg2340- 302 046157 cccagctaat tttttattt ttaatagata cgggggtttc accatatcac ccaggctggt 540 ctcgaactcc tggcctcaag tgatccacct gcctcggcct cccaaagtgc tgggattata600 ggcgtcagcc actatgccca acccgaccaa ccttttttaa aataaat att taaaaaattg660 gtatttcaca tatatactag tatttacatt tatccacaca aaacggacgg gcctccgctg720 aaccagtgag gccccagacg tgcgcataaa taacccctgc gtgctgcacc acctggggag780 agggggagga ccacggtaaa tggagcgagc gcatagcaaa agggacgcgg ggtccttttc840 tctgccggtg gcactgggta gctgtggcca ggtgtggtac tttgatgggg cccagggctg900 gagctcaagg aagcgtcgca gggtcacaga tctgggggaa ccccggggaa aagcactgag960 gcaaaaccgc cgctcgtctc ctacaatata tgggagggggg aggttgagta cgttctggat1020 tactcataag accttttttt tttccttccg ggcgcaaaac cgtgagctgg atttataatc1080 gccctataaa gctccagagg cggtcaggca cctgcagagg agccccgccg ctccgccgac1140 tagctgcccc cgcgagcaac ggcctcgtga tttccccgcc gatccggtcc ccgcctcccc1200 actctgcccc cgcctacccc ggagccgtgc agccgcctct ccgaatctct ctcttctcct1260 ggcgctcgcg tgcgaga ggg aactagcgag aacgaggaag cagctggagg tgacgccggg1320 cagattacgc ctgtcagggc cgagccgagc ggatcgctgg gcgctgtgca gaggaaaggc1380 gggagtgccc ggctcgctgt cgcagagccg aggtgggtaa gctagcgacc acctggactt1440 cccagcgccc aaccgtggct tttcagccag gtcctctcct cccgcggctt ctcaaccaac1500 cccatcccag cgccggccac ccaacctccc gaaatgagtg cttcctgccc cagcagccga1560 aggcgctact aggaacggta acctgttact tttccagggg ccgtagtcga cccgct gccc1620 gagttgctgt gcgactgcgc gcgcggggct agagtgcaag gtgactgtgg ttcttctctg1680 gccaagtccg agggaacg taaagatatg ggcctttttc cccctctcac cttgtctcac1740 caaagtccct agtccccgga gcagttagcc tctttct ttc cagggaatta gccagacaca1800 acaacgggaa cgacacaccg aaccagacat gcccgccccg tgcgccctcc ccgctcgctg1860 cctttcctcc ctcttgtctc tccagagccg gatcttcaag gggagcctcc gtgcccccgg1920 ctgctcagtc cctccggtgt gcaggacccc ggaagtcctc cccgcacagc tctcgcttct1980 ctttgcagcc tgtttctgcg ccggaccagt cgaggactct ggacagtaga ggccccggga2040 cgaccgagct ggaattcgcc accatggccg ccgaccacct gatgctcgcc gagggctacc2100 gcctggtgca gaggcc gccg tccgccgccg ccgcccatgg ccctcatgcg ctccggactc2160 tgccgccgta cgcgggcccg ggcctggaca gtgggctgag gccgcggggg gctccgctgg2220 ggccgccgcc gccccgccaa cccggggccc tggcgtacgg ggccttcggg ccgccgtcct2280 ccttccagcc ctttccggcc gtgcctccgc cggccgcggg catcgcgcac ctgcagcctg2340
- 303 046157 tggcgacgcc gtaccccggc cgcgcggccg cgccccccaa cgctccggga ggccccccgg 2400 gcccgcagcc ggccccaagc gccgcagccc cgccgccgcc cgcgcacgcc ctgggcggca2460 tggacgccga actcatcgac gaggaggcgc tgacgtcgct ggagctggag ctggggctgc2520 accgcgtgcg cgagctgccc gagctgttcc tgggccagag cgagttcgac tgcttctcgg2580 acttggggtc cgcgccgccc gccggctccg tgagctgcgg tggttctggt ggtggttctg2640 gtcagtccca gctcatcaaa cccagccgca tgcgcaagta ccccaaccgg cccagcaaga2700 cgccccccca cgaacgccct tacgcttgcc cagtggagtc ctgtgatcgc cgcttctccc2760 gcagcgacaa cctggtgaga cacatccgca tccacacagg ccagaagccc ttccagtgcc2820 gcatctgcat gagaaacttc agccgagagg ataacttgca cactcacatc cgcacccaca2880 caggcgaaaa gcccttcgcc tgcgacatct gtggaagaaa gtttgcccgg agcgatgaac2940 ttgtccgaca taccaagatc cacttgcggc agaaggaccg cccttacgct tgcccagtgg3000 agtcctgtga tcgccgcttc tcccaatcag ggaatctgac tgagcacatc cgcatccaca3060 caggccagaa gcccttccag tgccgcatct gcatgagaaa cttcagcaca agtggacatc3120 tggtacgcca catccgcacc cacacaggcg aaaagccctt cgcctgcgac atctgtggaa3180 gaaagtttgc ccagaatagt accctgaccg aacataccaa gatccacttg cggcagaagg3240 acaagtaact cgaggaaacc cagcagacaa tgtagctaga cccagtagcc agatgtagct3300 aaagagaccg gttcactgtg agaaacccag cagacaatgt agctagaccc agtagccaga3360 tgtagctaaa gagaccggtt cactgtgaaa gcttgggtgg catccctgtg acccctcccc3420 agtgcctctc ctggccctgg aagttgccac tccagtgccc accagccttg tcctaataaa3480 attaagttgc atcattttgt ctgactaggt gtccttctat aatattatgg ggtggagggg3540 ggtggtatgg agcaaggggc aagttgggaa gacaacctgt agggcctgcg gggtctattg3600 ggaaccaagc tggagtgcag tggcacaatc ttggctcact gcaatctccg cctcctgggt3660 tcaagcgatt ctcctgcctc agcctcccga gttgttggga ttccaggcat gcatgaccag3720 gctcagctaa tttttgtttt tttggtagag acggggtttc accatattgg ccaggctggt3780 ctccaactcc taatctcagg tgatctaccc accttggcct cccaaattgc tgggattaca3840 ggcgtgaacc actgctccct tccctgtcct t3871 <210> 185 <211> 22 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 303 046157 tggcgacgcc gtaccccggc cgcgcggccg cgccccccaa cgctccggga ggccccccgg 2400 gcccgcagcc ggccccaagc gccgcagccc cgccgccgcc cgcgcacgcc ctgggcggca2460 tggacgccga actcatcgac gaggaggcgc tgacg tcgct ggagctggag ctggggctgc2520 accgcgtgcg cgagctgccc gagctgttcc tgggccagag cgagttcgac tgcttctcgg2580 acttggggtc cgcgccgccc gccggctccg tgagctgcgg tggttctggt ggtggttctg2640 gtcagtccca gctcat caaa cccagccgca tgcgcaagta ccccaaccgg cccagcaaga2700 cgccccccca cgaacgccct tacgcttgcc cagtggagtc ctgtgatcgc cgcttctccc2760 gcagcgacaa cctggtgaga cacatccgca tccacacagg ccagaagccc ttccagtgcc2820 gcatctgcat gagaaacttc agccgagagg ataacttgca cactcacatc cgcacccaca2880 caggcgaaaa gcccttcgcc tgcgacatct gtggaagaaa gtttgcccgg agcgatgaac2940 ttgtccgaca taccaagatc cacttgcggc agaa ggaccg cccttacgct tgcccagtgg3000 agtcctgtga tcgccgcttc tcccaatcag ggaatctgac tgagcacatc cgcatccaca3060 caggccagaa gcccttccag tgccgcatct gcatgagaaa cttcagcaca agtggacatc3120 tggtacgcca catccgcacc cacacaggcg aaa agccctt cgcctgcgac atctgtggaa3180 gaaagtttgc ccagaatagt accctgaccg aacataccaa gatccacttg cggcagaagg3240 acaagtaact cgaggaaacc cagcagacaa tgtagctaga cccagtagcc agatgtagct3300 aaagagaccg gttcactgtg agaaacccag cagacaatgt agctagaccc agtagccaga3360 tgtagctaaa gagaccggtt cactgtgaaa gcttgggtgg catccctgtg acccctcccc3420 agtgcctctc ctggccctgg aagttgccac tccagtgccc accagccttg tcctaataa a3480 attaagttgc atcattttgt ctgactaggt gtccttctat aatattatgg ggtggagggg3540 ggtggtatgg agcaaggggc aagttgggaa gacaacctgt agggcctgcg gggtctattg3600 ggaaccaagc tggagtgcag tggcacaatc ttggctcact gcaatctcc g cctcctgggt3660 tcaagcgatt ctcctgcctc agcctcccga gttgttggga ttccaggcat gcatgaccag3720 gctcagctaa tttttgtttt tttggtagag acggggtttc accatattgg ccaggctggt3780 ctccaactcc taatctcagg tgatctaccc accttggcct cccaaattgc tgggattaca3840 ggcgtgaacc actgctccct tccctgtcct t3871 <210> 185 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 185<223> Description of artificial sequence: Synthetic primer <400> 185
- 304 046157 tgtctcggca ttgagaacat tc <210> 186 <211> 21 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 304 046157 tgtctcggca ttgagaacat tc <210> 186 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 186 attggtggga ggccattgta t 21 <210> 187 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 186 attggtggga ggccattgta t 21 <210> 187 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 187 accacagtcc atgccatcac 20 <210> 188 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 187 accaccagtcc atgccatcac 20 <210> 188 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 188 tccaccaccc tgttgctgta 20 <210> 189 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 188 tccaccaccc tgttgctgta 20 <210> 189 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 189 caaaaaagcc acaaaagcct 20 <210> 190 <211> 20 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 189 caaaaaagcc acaaaagcct 20 <210> 190 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Description of artificial sequence: Synthetic primer
- 305 046157 <400> 190 ttagctccgc aagaaacatc <210> 191 <211> 23 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 305 046157 <400> 190 ttagctccgc aagaaacatc <210> 191 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 191 ccatggaact ggctcgattt cac 23 <210> 192 <211> 21 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 191 ccatggaact ggctcgattt cac 23 <210> 192 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 192 attggtggga ggccactgta t 21 <210> 193 <211> 27 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 192 attggtggga ggccactgta t 21 <210> 193 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический probe <400> 193 aggcctgaaa accattgtgg gagccct 27 <210> 194 <211> 24 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic probe <400> 193 aggcctgaaa accattgtgg gagccct 27 <210> 194 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 194 gaatgtggga aatcattcag tcgc 24 <210> 195 <211> 24 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 194 gaatgtggga aatcattcag tcgc 24 <210> 195 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
- 306 046157 <223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 195 gcaagttatc ctctcgtgag aagg <210> 196 <211> 29 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 306 046157 <223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 195 gcaagttatc ctctcgtgag aagg <210> 196 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический probe <400> 196 gcgacaacct ggtgagacat caacgcacc 29 <210> 197 <211> 22 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic probe <400> 196 gcgacaacct ggtgagacat caacgcacc 29 <210> 197 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 197 gctgttatct cttgtgggct gt 22 <210> 198 <211> 22 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 197 gctgttatct cttgtgggct gt 22 <210> 198 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 198 aaactcatgg gagctgccgg tt 22 <210> 199 <211> 25 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 198 aaactcatgg gagctgccgg tt 22 <210> 199 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический probe <400> 199 ccacacaaat ctctccctgg cattg 25 <210> 200 <211> 24 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность<223> Description of the artificial sequence: Synthetic probe <400> 199 ccacacaaat ctctccctgg cattg 25 <210> 200 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial sequence
- 307 046157 <220>- 307 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 200 gaatgtggga aatcattcag tcgc 24 <210> 201 <211> 24 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 200 gaatgtggga aatcattcag tcgc 24 <210> 201 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер <400> 201 gcaagttatc ctctcgtgag aagg 24 <210> 202 <211> 29 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic primer <400> 201 gcaagttatc ctctcgtgag aagg 24 <210> 202 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический probe <400> 202 gcgacaacct ggtgagacat caacgcacc 29 <210> 203 <211> 1182 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic probe <400> 202 gcgacaacct ggtgagacat caacgcacc 29 <210> 203 <211> 1182 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 203<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 203
- 308 046157- 308 046157
<210> 204 <211> 1206 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220><210> 204 <211> 1206 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 204 atggccgccg accacctgat gctcgccgag ggctaccgcc tggtgcagag gccgccgtcc60 gccgccgccg cccatggccc tcatgcgctc cggactctgc cgccgtacgc gggcccgggc120 ctggacagtg ggctgaggcc gcggggggct ccgctggggc cgccgccgcc ccgccaaccc180 ggggccctgg cgtacggggc cttcgggccg ccgtcctcct tccagccctt tccggccgtg240 cctccgccgg ccgcgggcat cgcgcacctg cagcctgtgg cgacgccgta ccccggccgc300 gcggccgcgc cccccaacgc tccgggaggc cccccgggcc cgcagccggc cccaagcgcc360 gcagccccgc cgccgcccgc gcacgccctg ggcggcatgg acgccgaact catcgacgag420 gaggcgctga cgtcgctgga gctggagctg gggctgcacc gcgtgcgcga gctgcccgag480 ctgttcctgg gccagagcga gttcgactgc ttctcggact tggggtccgc gccgcccgcc540 ggctccgtga gctgcggtgg ttctggtggt ggttctggtg gtggcagcgg gggaggttct600 ggtcagtccc agctcatcaa acccagccgc atgcgcaagt accccaaccg gcccagcaag660 acgccccccc acgaacgccc ttacgcttgc ccagtggagt cctgtgatcg ccgcttctcc720 cgcagcgaca acctggtgag acacatccgc atccacacag gccagaagcc cttccagtgc780 cgcatctgca tgagaaactt cagccgagag gataacttgc acactcacat ccgcacccac840 acaggcgaaa agcccttcgc ctgcgacatc tgtggaagaa agtttgcccg gagcgatgaa900<223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 204 atggccgccg accacctgat gctcgccgag ggctaccgcc tggtgcagag gccgccgtcc60 gccgccgccg cccatggccc tcatgcgctc cggactctgc cgccgtacgc gggcccgggc120 ctggacagtg ggctgaggcc g cggggggct ccgctggggc cgccgccgcc ccgccaaccc180 ggggccctgg cgtacggggc cttcgggccg ccgtcctcct tccagccctt tccggccgtg240 cctccgccgg ccgcgggcat cgcgcacctg cagcctgtgg cgacgccgta ccccggccgc300 gcggccgcg c cccccaacgc tccgggaggc cccccggggcc cgcagccggc cccaagcgcc360 gcagccccgc cgccgcccgc gcacgccctg ggcggcatgg acgccgaact catcgacgag420 gaggcgctga cgtcgctgga gctggagctg gggctgcacc gcgtgcgcga gctgcccgag480 ctgttcctgg gccagagcga gttcgactgc ttctcggact tggggtccgc gccgcccgcc5 40 ggctccgtga gctgcggtgg ttctggtggt ggttctggtg gtggcagcgg gggaggttct600 ggtcagtccc agctcatcaa acccagccgc atgcgcaagt accccaaccg gcccagcaag660 acgccccccc acgaacgccc ttacgcttgc ccagtggagt cctgtgatcg ccgcttctcc720 cgcagcgaca acctggtgag acacatccgc atccacacag gccagaagcc cttccagtgc780 cgcatctgca tgagaaactt cagccgagag gataacttgc acactcacat ccgcacccac840 acaggcgaaa agcccttcgc ctgcgacatc tgtggaagaa agtttgcccg gagcgatgaa900
- 309 046157- 309 046157
<210> 205 <211> 402 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 205 <211> 402 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 205<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 205
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val GlnMet Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln
5 10155 1015
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 20 2530Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 20 2530
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 35 4045Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 35 4045
Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 50 5560Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 50 5560
Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val 65 70 7580Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val 65 70 7580
Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro 85 9095Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro 85 9095
Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro ProTyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro Pro
100 105110100 105110
Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala HisGly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala His
115 120125115 120125
Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu ThrAla Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr
130 135140130 135140
Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro GluSer Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu
145 150 155160145 150 155160
- 310 046157- 310 046157
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlySer Val Ser Cys Gly
185185
Gly Ser Gly Gly GlyGly Ser Gly Gly Gly
190190
Gly Gly Gly Ser Gly 195Gly Gly Gly Ser Gly 195
Gly Gly Ser Gly Gln 200Gly Gly Ser Gly Gln 200
Ser Gln Leu Ile LysSer Gln Leu Ile Lys
205205
Ser Arg Met Arg LysSer Arg Met Arg Lys
210210
Tyr Pro Asn Arg ProTyr Pro Asn Arg Pro
215215
Ser Lys Thr Pro ProSer Lys Thr Pro Pro
220220
Glu Arg Pro Tyr Ala 225Glu Arg Pro Tyr Ala 225
Cys Pro Val Glu Ser 230Cys Pro Val Glu Ser 230
Cys Asp Arg Arg Phe 235Cys Asp Arg Arg Phe 235
Arg Ser Asp Asn LeuArg Ser Asp Asn Leu
245245
Val Arg His Ile ArgVal Arg His Ile Arg
250250
Ile His Thr Gly GlnIle His Thr Gly Gln
255255
Pro Phe Gln Cys ArgPro Phe Gln Cys Arg
260260
Ile Cys Met Arg AsnIle Cys Met Arg Asn
265265
Phe Ser Arg Glu AspPhe Ser Arg Glu Asp
270270
Leu His Thr His IleLeu His Thr His Ile
275275
Arg Thr His Thr GlyArg Thr His Thr Gly
280280
Glu Lys Pro Phe Ala 285Glu Lys Pro Phe Ala 285
Asp Ile Cys Gly Arg 290Asp Ile Cys Gly Arg 290
Lys Phe Ala Arg SerLys Phe Ala Arg Ser
295295
Asp Glu Leu Val Arg 300Asp Glu Leu Val Arg 300
Thr Lys Ile His Leu 305Thr Lys Ile His Leu 305
Arg Gln Lys Asp Arg 310Arg Gln Lys Asp Arg 310
Pro Tyr Ala Cys Pro 315Pro Tyr Ala Cys Pro 315
Glu Ser Cys Asp ArgGlu Ser Cys Asp Arg
325325
Arg Phe Ser Gln SerArg Phe Ser Gln Ser
330330
Gly Asn Leu Thr GluGly Asn Leu Thr Glu
335335
Ile Arg Ile His ThrIle Arg Ile His Thr
340340
Gly Gln Lys Pro PheGly Gln Lys Pro Phe
345345
Gln Cys Arg Ile CysGln Cys Arg Ile Cys
350350
Arg Asn Phe Ser Thr 355Arg Asn Phe Ser Thr 355
Ser Gly His Leu Val 360Ser Gly His Leu Val 360
Arg His Ile Arg Thr 365Arg His Ile Arg Thr 365
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
370370
Phe Ala Cys Asp Ile 375Phe Ala Cys Asp Ile 375
Cys Gly Arg Lys Phe 380Cys Gly Arg Lys Phe 380
Gln Asn Ser Thr Leu 385Gln Asn Ser Thr Leu 385
Thr Glu His Thr Lys 390Thr Glu His Thr Lys 390
Ile His Leu Arg Gln 395Ile His Leu Arg Gln 395
SerSer
SerSer
ProPro
HisHis
Ser 240Ser 240
LysLys
AsnAsn
CysCys
HisHis
Val 320Val 320
HisHis
MetMet
HisHis
AlaAla
Lys 400Lys 400
Asp LysAsp Lys
- 311 046157 <210> 206 <211> 1707 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>- 311 046157 <210> 206 <211> 1707 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 312 046157- 312 046157
<210> 207 <211> 569 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 207 <211> 569 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 207<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 207
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val GlnMet Ala Ala Asp His Leu Met Leu Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln
5 10155 1015
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 20 2530Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 20 2530
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 35 4045Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 35 4045
Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 50 5560Gly Ala Pro Leu Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln Pro Gly Ala Leu Ala 50 5560
Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val 65 70 7580Tyr Gly Ala Phe Gly Pro Pro Ser Ser Phe Gln Pro Phe Pro Ala Val 65 70 7580
Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro 85 9095Pro Pro Pro Ala Ala Gly Ile Ala His Leu Gln Pro Val Ala Thr Pro 85 9095
Tyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro ProTyr Pro Gly Arg Ala Ala Ala Pro Pro Asn Ala Pro Gly Gly Pro Pro
100 105110100 105110
Gly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala HisGly Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala His
115 120125115 120125
Ala Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu ThrAla Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu Ile Asp Glu Glu Ala Leu Thr
130 135140130 135140
Ser Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro GluSer Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu
145 150 155160145 150 155160
Leu Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly SerLeu Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly Ser
165 170175165 170175
Ala Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys Ala Asp His Leu Met Leu AlaAla Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys Ala Asp His Leu Met Leu Ala
180 185190180 185190
- 313 046157- 313 046157
Glu Gly Tyr Arg LeuGlu Gly Tyr Arg Leu
195195
Val Gln Arg Pro ProVal Gln Arg Pro Pro
200200
Ser Ala Ala Ala AlaSer Ala Ala Ala Ala
205205
Gly Pro His Ala LeuGly Pro His Ala Leu
210210
Arg Thr Leu Pro Pro 215Arg Thr Leu Pro Pro 215
Tyr Ala Gly Pro GlyTyr Ala Gly Pro Gly
220220
Asp Ser Gly Leu Arg 225Asp Ser Gly Leu Arg 225
Pro Arg Gly Ala Pro 230Pro Arg Gly Ala Pro 230
Leu Gly Pro Pro Pro 235Leu Gly Pro Pro Pro 235
Arg Gln Pro Gly AlaArg Gln Pro Gly Ala
245245
Leu Ala Tyr Gly AlaLeu Ala Tyr Gly Ala
250250
Phe Gly Pro Pro SerPhe Gly Pro Pro Ser
255255
Phe Gln Pro Phe ProPhe Gln Pro Phe Pro
260260
Ala Val Pro Pro ProAla Val Pro Pro Pro
265265
Ala Ala Gly Ile AlaAla Ala Gly Ile Ala
270270
Leu Gln Pro Val AlaLeu Gln Pro Val Ala
275275
Thr Pro Tyr Pro GlyThr Pro Tyr Pro Gly
280280
Arg Ala Ala Ala Pro 285Arg Ala Ala Ala Pro 285
Asn Ala Pro Gly Gly 290Asn Ala Pro Gly Gly 290
Pro Pro Gly Pro Gln 295Pro Pro Gly Pro Gln 295
Pro Ala Pro Ser AlaPro Ala Pro Ser Ala
300300
Ala Pro Pro Pro Pro 305Ala Pro Pro Pro Pro 305
Ala His Ala Leu Gly 310Ala His Ala Leu Gly 310
Gly Met Asp Ala Glu 315Gly Met Asp Ala Glu 315
Ile Asp Glu Glu AlaIle Asp Glu Glu Ala
325325
Leu Thr Ser Leu GluLeu Thr Ser Leu Glu
330330
Leu Glu Leu Gly LeuLeu Glu Leu Gly Leu
335335
Arg Val Arg Glu LeuArg Val Arg Glu Leu
340340
Pro Glu Leu Phe LeuPro Glu Leu Phe Leu
345345
Gly Gln Ser Glu PheGly Gln Ser Glu Phe
350350
Cys Phe Ser Asp LeuCys Phe Ser Asp Leu
355355
Gly Ser Ala Pro Pro 360Gly Ser Ala Pro Pro 360
Ala Gly Ser Val Ser 365Ala Gly Ser Val Ser 365
Gln Ser Gln Leu IleGln Ser Gln Leu Ile
370370
Lys Pro Ser Arg MetLys Pro Ser Arg Met
375375
Arg Lys Tyr Pro Asn 380Arg Lys Tyr Pro Asn 380
Pro Ser Lys Thr Pro 385Pro Ser Lys Thr Pro 385
Pro His Glu Arg Pro 390Pro His Glu Arg Pro 390
Tyr Ala Cys Pro Val 395Tyr Ala Cys Pro Val 395
Ser Cys Asp Arg ArgSer Cys Asp Arg Arg
405405
Phe Ser Arg Ser AspPhe Ser Arg Ser Asp
410410
Asn Leu Val Arg HisAsn Leu Val Arg His
415415
Arg Ile His Thr GlyArg Ile His Thr Gly
420420
Gln Lys Pro Phe GlnGln Lys Pro Phe Gln
425425
Cys Arg Ile Cys MetCys Arg Ile Cys Met
430430
Asn Phe Ser Arg GluAsn Phe Ser Arg Glu
Asp Asn Leu His ThrAsp Asn Leu His Thr
His Ile Arg Thr HisHis Ile Arg Thr His
HisHis
LeuLeu
Pro 240Pro 240
SerSer
HisHis
ProPro
AlaAla
Leu 320Leu 320
HisHis
AspAsp
CysCys
ArgArg
Glu 400Glu 400
IleIle
ArgArg
ThrThr
- 314 046157- 314 046157
Gly GluGly Glu
450450
Ser Asp 465Ser Asp 465
Arg ProArg Pro
435435
Lys ProLys Pro
Glu LeuGlu Leu
Tyr AlaTyr Ala
Phe AlaPhe Ala
Val ArgVal Arg
470470
Cys Pro 485Cys Pro 485
Ser GlySer Gly
Asn LeuAsn Leu
500500
Thr GluThr Glu
440440
Cys Asp 455Cys Asp 455
His ThrHis Thr
Val GluVal Glu
His IleHis Ile
Ile CysIle Cys
Lys IleLys Ile
Ser CysSer Cys
490490
Arg Ile 505Arg Ile 505
Phe GlnPhe Gln
Cys Arg 515Cys Arg 515
Ile CysIle Cys
Met ArgMet Arg
520520
Asn PheAsn Phe
Gly ArgGly Arg
460460
His Leu 475His Leu 475
Asp ArgAsp Arg
His ThrHis Thr
Ser ThrSer Thr
Val ArgVal Arg
530530
His IleHis Ile
Arg ThrArg Thr
His Thr 535His Thr 535
Gly GluGly Glu
Lys ProLys Pro
540540
Ile Cys 545Ile Cys 545
Gly ArgGly Arg
Lys PheLys Phe
550550
Ala GlnAla Gln
Asn SerAsn Ser
Thr Leu 555Thr Leu 555
445445
Lys PheLys Phe
Arg GlnArg Gln
Arg PheArg Phe
Gly GlnGly Gln
510510
Ser Gly 525Ser Gly 525
Phe AlaPhe Ala
Thr GluThr Glu
Ala ArgAla Arg
Lys AspLys Asp
480480
Ser GlnSer Gln
495495
Lys ProLys Pro
His LeuHis Leu
Cys AspCys Asp
His ThrHis Thr
560560
Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp LysLys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Lys
565 <210> 208 <211> 1755 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>565 <210> 208 <211> 1755 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
120120
180180
240240
300300
360360
420420
480480
540540
- 315 046157- 315 046157
<210> 209 <211> 585 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 209 <211> 585 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 209<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 209
Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu 1 5Met Ala Ala Asp His Leu Met Leu 1 5
Ala Glu Gly Tyr Arg Leu Val GlnAla Glu Gly Tyr Arg Leu Val Gln
1515
Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala 20Arg Pro Pro Ser Ala Ala Ala Ala 20
His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 25 30His Gly Pro His Ala Leu Arg Thr 25 30
Leu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro GlyLeu Pro Pro Tyr Ala Gly Pro Gly
4040
Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 45Leu Asp Ser Gly Leu Arg Pro Arg 45
- 316 046157- 316 046157
Gly Ala Pro Leu Gly 50Gly Ala Pro Leu Gly 50
Pro Pro Pro Pro Arg 55Pro Pro Pro Pro Arg 55
Gln Pro Gly Ala Leu 60Gln Pro Gly Ala Leu 60
Tyr Gly Ala Phe Gly 65Tyr Gly Ala Phe Gly 65
Pro Pro Ser Ser Phe 70Pro Pro Ser Ser Phe 70
Gln Pro Phe Pro Ala 75Gln Pro Phe Pro Ala 75
Pro Pro Pro Ala AlaPro Pro Pro Ala Ala
Gly Ile Ala His LeuGly Ile Ala His Leu
Gln Pro Val Ala ThrGln Pro Val Ala Thr
Tyr Pro Gly Arg AlaTyr Pro Gly Arg Ala
100100
Ala Ala Pro Pro AsnAla Ala Pro Pro Asn
105105
Ala Pro Gly Gly ProAla Pro Gly Gly Pro
110110
Gly Pro Gln Pro AlaGly Pro Gln Pro Ala
115115
Pro Ser Ala Ala AlaPro Ser Ala Ala Ala
120120
Pro Pro Pro Pro AlaPro Pro Pro Pro Ala
125125
Ala Leu Gly Gly MetAla Leu Gly Gly Met
130130
Asp Ala Glu Leu Ile 135Asp Ala Glu Leu Ile 135
Asp Glu Glu Ala Leu 140Asp Glu Glu Ala Leu 140
Ser Leu Glu Leu Glu 145Ser Leu Glu Leu Glu 145
Leu Gly Leu His Arg 150Leu Gly Leu His Arg 150
Val Arg Glu Leu Pro 155Val Arg Glu Leu Pro 155
Leu Phe Leu Gly GlnLeu Phe Leu Gly Gln
165165
Ser Glu Phe Asp CysSer Glu Phe Asp Cys
170170
Phe Ser Asp Leu GlyPhe Ser Asp Leu Gly
175175
Ala Pro Pro Ala GlyAla Pro Pro Ala Gly
180180
Ser Val Ser Cys GlySer Val Ser Cys Gly
185185
Gly Ser Gly Gly GlyGly Ser Gly Gly Gly
190190
Gly Ala Asp His LeuGly Ala Asp His Leu
195195
Met Leu Ala Glu GlyMet Leu Ala Glu Gly
200200
Tyr Arg Leu Val Gln 205Tyr Arg Leu Val Gln 205
Pro Pro Ser Ala AlaPro Pro Ser Ala Ala
210210
Ala Ala His Gly Pro 215Ala Ala His Gly Pro 215
His Ala Leu Arg ThrHis Ala Leu Arg Thr
220220
Pro Pro Tyr Ala Gly 225Pro Pro Tyr Ala Gly 225
Pro Gly Leu Asp Ser 230Pro Gly Leu Asp Ser 230
Gly Leu Arg Pro Arg 235Gly Leu Arg Pro Arg 235
Ala Pro Leu Gly ProAla Pro Leu Gly Pro
245245
Pro Pro Pro Arg GlnPro Pro Pro Arg Gln
250250
Pro Gly Ala Leu AlaPro Gly Ala Leu Ala
255255
Gly Ala Phe Gly ProGly Ala Phe Gly Pro
260260
Pro Ser Ser Phe GlnPro Ser Ser Phe Gln
265265
Pro Phe Pro Ala ValPro Phe Pro Ala Val
270270
Pro Pro Ala Ala GlyPro Pro Ala Ala Gly
275275
Ile Ala His Leu GlnIle Ala His Leu Gln
280280
Pro Val Ala Thr ProPro Val Ala Thr Pro
285285
Pro Gly Arg Ala AlaPro Gly Arg Ala Ala
Ala Pro Pro Asn AlaAla Pro Pro Asn Ala
Pro Gly Gly Pro ProPro Gly Gly Pro Pro
AlaAla
Val 80Val 80
ProPro
ProPro
HisHis
ThrThr
Glu 160Glu 160
SerSer
SerSer
ArgArg
LeuLeu
Gly 240Gly 240
TyrTyr
ProPro
TyrTyr
GlyGly
- 317 046157- 317 046157
290290
295295
300300
Pro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala HisPro Gln Pro Ala Pro Ser Ala Ala Ala Pro Pro Pro Pro Ala His
305 310 315305 310 315
Leu Gly Gly Met Asp Ala Glu LeuLeu Gly Gly Met Asp Ala Glu Leu
325325
Ile Asp Glu Glu Ala Leu ThrIle Asp Glu Glu Ala Leu Thr
330 335330 335
Leu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro GluLeu Glu Leu Glu Leu Gly Leu His Arg Val Arg Glu Leu Pro Glu
340 345 350340 345 350
Phe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly SerPhe Leu Gly Gln Ser Glu Phe Asp Cys Phe Ser Asp Leu Gly Ser
355 360 365355 360 365
Pro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys Gly Gly Ser Gly Gly Gly SerPro Pro Ala Gly Ser Val Ser Cys Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
370 375 380370 375 380
Gln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro AsnGln Ser Gln Leu Ile Lys Pro Ser Arg Met Arg Lys Tyr Pro Asn
385 390 395385 390 395
Pro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg Pro Tyr Ala Cys Pro ValPro Ser Lys Thr Pro Pro His Glu Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val
405 410 415405 410 415
Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg HisSer Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val Arg His
420 425 430420 425 430
Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys MetArg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met
435 440 445435 440 445
Asn Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His Ile Arg Thr HisAsn Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His Ile Arg Thr His
450 455 460450 455 460
Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe AlaGly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala
465 470 475465 470 475
Ser Asp Glu Leu Val Arg His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln LysSer Asp Glu Leu Val Arg His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys
485 490 495485 490 495
Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val GluArg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu
500500
Ser Cys Asp Arg Arg Phe SerSer Cys Asp Arg Arg Phe Ser
505 510505 510
Ser Gly Asn Leu Thr Glu His 515Ser Gly Asn Leu Thr Glu His 515
Ile Arg Ile His Thr Gly Gln LysIle Arg Ile His Thr Gly Gln Lys
520 525520 525
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe SerPhe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser
530 535530 535
Thr Ser Gly His 540Thr Ser Gly His 540
Ala 320Ala 320
SerSer
LeuLeu
AlaAla
GlyGly
Arg 400Arg 400
GluGlu
IleIle
ArgArg
ThrThr
Arg 480Arg 480
AspAsp
GlnGln
ProPro
LeuLeu
- 318 046157- 318 046157
Val Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys AspVal Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp
545545
550550
555555
560560
Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu His ThrIle Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu His Thr
565565
570570
575575
Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp LysLys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Lys
580580
585 <210> 210 <211> 1113 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400> 210 atggagctgg aattggatgc tggtgaccaa gacctgctgg ccttcctgct agaggaaagt60 ggagatttgg ggacggcacc cgatgaggcc gtgagggccc cactggactg ggcgctgccg120 ctttctgagg tgccgagcga ctgggaagta gatgatttgc tgtgctccct gctgagtccc180 ccagcgtcgt tgaacattct cagctcctcc aacccctgcc ttgtccacca tgaccacacc240 tactccctcc cacgggaaac tgtctctatg gatctagaga gtgagagctg tagaaaagag300 gggacccaga tgactccaca gcatatggag gagctggcag agcaggagat tgctaggcta360 gtactgacag atgaggagaa gagtctattg gagaaggagg ggcttattct gcctgagaca420 cttcctctca ctaagacaga ggaacaaatt ctgaaacgtg tgcggaggaa gattcgaaat480 aaaagatctg ctcaagagag ccgcaggaaa aagaaggtgt acgttggggg tttagagagc540 cgggtcttga aatacacagc ccagaatatg gagcttcaga acaaagtaca gcttctggag600 gaacagaatt tgtcccttct agatcaactg aggaaactcc aggccatggt gattgagatc660 tcaaacaaaa ccagcagcag cagcacctgc atcttggtcc tgctagtctc cttctgcctc720 ctccttgtac ctgctatgta ctcctctgac acaaggggga gcctgccagc tgagcatgga780 gtgttgtccc gccagcttcg tgccctcccc agtgaggacc cttaccagct ggagctgcct840 gccctgcagt cagaagtgcc gaaagacagc acacaccagt ggttggacgg ctcagactgt900 gtactccagg cccctggcaa cacttcctgc ctgctgcatt acatgcctca ggctcccagt960 gcagagcctc ccctggagtg gcccttccct gacctcttct cagagcctct ctgccgaggt1020 cccatcctcc ccctgcaggc aaatctcaca aggaagggag gatggcttcc tactggtagc1080 ccctctgtca ttttgcagga cagatactca ggc1113 <210> 211 <211> 371 <212> Белок <213> Homo sapiens <400> 211585 <210> 210 <211> 1113 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 210 atggagctgg aattggatgc tggtgaccaa gacctgctgg ccttcctgct agaggaaagt60 ggagatttgg ggacggcacc cgatgaggcc gtgagggccc cactggactg ggcgctgcc g120 ctttctgagg tgccgagcga ctgggaagta gatgatttgc tgtgctccct gctgagtccc180 ccagcgtcgt tgaacattct cagctcctcc aacccctgcc ttgtccacca tgaccacacc240 tactccctcc cacgggaaac tgtctctatg gatctagaga gtgagagctg tagaaaagag300 gggacccaga tgactccaca gcatatggag gagctggcag agcaggagat tgctaggcta360 gtactgacag atgaggagaa gagtctattg gagaaggagg ggcttattct gcctgagaca420 cttcctctca ctaagacaga ggaacaaatt ctgaaacgtg tgcggaggaa g attcgaaat480 aaaagatctg ctcaagagag ccgcaggaaa aagaaggtgt acgttggggg tttagagagc540 cgggtcttga aatacacagc ccagaatatg gagcttcaga acaaagtaca gcttctggag600 gaacagaatt tgtcccttct agatcaactg aggaaactcc aggccatggt gattg agatc660 tcaaacaaaa ccagcagcag cagcacctgc atcttggtcc tgctagtctc cttctgcctc720 ctccttgtac ctgctatgta ctcctctgac acaaggggga gcctgccagc tgagcatgga780 gtgttgtccc gccagcttcg tgccctcccc agtgaggacc cttaccagct ggagctgcct840 gccctgcagt cagaagtgcc gaaagacagc acacaccagt ggttggacgg ctcagactgt900 gtactccagg cccctggcaa cacttcctgc ctgctgcatt acatgcctca ggctcccagt 960 gcagagcctc ccctggagtg gcccttccct gacctcttct cagagcctct ctgccgaggt1020 cccatcctcc ccctgcaggc aaatctcaca aggaagggag gatggcttcc tactggtagc1080 ccctctgtca ttttgcagga cagatactca ggc1113 <210> 211 <21 1> 371 <212> Protein <213> Homo sapiens <400> 211
- 319 046157- 319 046157
Met 1Met 1
LeuLeu
AlaAla
GluGlu
Asn 65Asn 65
TyrTyr
CysCys
AlaAla
LeuLeu
Lys 145Lys 145
LysLys
GlyGly
GlnGln
GlnGln
Ser 225Ser 225
LeuLeu
Glu Leu Glu Leu Asp 5Glu Leu Glu Leu Asp 5
Glu Glu Ser Gly Asp 20Glu Glu Ser Gly Asp 20
Pro Leu Asp Trp Ala 35Pro Leu Asp Trp Ala 35
Val Asp Asp Leu Leu 50Val Asp Asp Leu Leu 50
Ile Leu Ser Ser SerIle Leu Ser Ser Ser
Ser Leu Pro Arg Glu 85Ser Leu Pro Arg Glu 85
Arg Lys Glu Gly Thr 100Arg Lys Glu Gly Thr 100
Glu Gln Glu Ile AlaGlu Gln Glu Ile Ala
115115
Leu Glu Lys Glu Gly 130Leu Glu Lys Glu Gly 130
Thr Glu Glu Gln IleThr Glu Glu Gln Ile
150150
Arg Ser Ala Gln GluArg Ser Ala Gln Glu
165165
Leu Glu Ser Arg ValLeu Glu Ser Arg Val
180180
Asn Lys Val Gln Leu 195Asn Lys Val Gln Leu 195
Leu Arg Lys Leu Gln 210Leu Arg Lys Leu Gln 210
Ser Ser Ser Thr CysSer Ser Ser Thr Cys
230230
Leu Val Pro Ala MetLeu Val Pro Ala Met
245245
Ala Gly Asp Gln AspAla Gly Asp Gln Asp
Leu Gly Thr Ala Pro 25Leu Gly Thr Ala Pro 25
Leu Pro Leu Ser Glu 40Leu Pro Leu Ser Glu 40
Cys Ser Leu Leu Ser 55Cys Ser Leu Leu Ser 55
Asn Pro Cys Leu Val 75Asn Pro Cys Leu Val 75
Thr Val Ser Met AspThr Val Ser Met Asp
Gln Met Thr Pro GlnGln Met Thr Pro Gln
105105
Arg Leu Val Leu Thr 120Arg Leu Val Leu Thr 120
Leu Ile Leu Pro Glu 135Leu Ile Leu Pro Glu 135
Leu Lys Arg Val ArgLeu Lys Arg Val Arg
155155
Ser Arg Arg Lys LysSer Arg Arg Lys Lys
170170
Leu Lys Tyr Thr AlaLeu Lys Tyr Thr Ala
185185
Leu Glu Glu Gln AsnLeu Glu Glu Gln Asn
200200
Ala Met Val Ile Glu 215Ala Met Val Ile Glu 215
Ile Leu Val Leu LeuIle Leu Val Leu Leu
235235
Tyr Ser Ser Asp ThrTyr Ser Ser Asp Thr
250250
Leu Leu Ala Phe LeuLeu Leu Ala Phe Leu
Asp Glu Ala Val Arg 30Asp Glu Ala Val Arg 30
Val Pro Ser Asp Trp 45Val Pro Ser Asp Trp 45
Pro Pro Ala Ser Leu 60Pro Pro Ala Ser Leu 60
His His Asp His ThrHis His Asp His Thr
Leu Glu Ser Glu SerLeu Glu Ser Glu Ser
His Met Glu Glu LeuHis Met Glu Glu Leu
110110
Asp Glu Glu Lys Ser 125Asp Glu Glu Lys Ser 125
Thr Leu Pro Leu Thr 140Thr Leu Pro Leu Thr 140
Arg Lys Ile Arg AsnArg Lys Ile Arg Asn
160160
Lys Val Tyr Val GlyLys Val Tyr Val Gly
175175
Gln Asn Met Glu LeuGln Asn Met Glu Leu
190190
Leu Ser Leu Leu AspLeu Ser Leu Leu Asp
205205
Ile Ser Asn Lys Thr 220Ile Ser Asn Lys Thr 220
Val Ser Phe Cys LeuVal Ser Phe Cys Leu
240240
Arg Gly Ser Leu ProArg Gly Ser Leu Pro
255255
- 320 046157- 320 046157
Ala Glu His Gly Val Leu Ser ArgAla Glu His Gly Val Leu Ser Arg
260260
Gln Leu Arg Ala Leu Pro Ser GluGln Leu Arg Ala Leu Pro Ser Glu
265 270265 270
Asp Pro Tyr Gln Leu Glu Leu Pro Ala Leu Gln Ser Glu Val Pro LysAsp Pro Tyr Gln Leu Glu Leu Pro Ala Leu Gln Ser Glu Val Pro Lys
275 280285275 280285
Asp Ser Thr His Gln Trp Leu Asp Gly Ser Asp Cys Val Leu Gln AlaAsp Ser Thr His Gln Trp Leu Asp Gly Ser Asp Cys Val Leu Gln Ala
290 295300290 295300
Pro Gly Asn Thr Ser Cys Leu Leu His Tyr Met Pro Gln Ala Pro SerPro Gly Asn Thr Ser Cys Leu Leu His Tyr Met Pro Gln Ala Pro Ser
305 310 315320305 310 315320
Ala Glu Pro Pro Leu Glu Trp Pro Phe Pro Asp Leu Phe Ser Glu ProAla Glu Pro Pro Leu Glu Trp Pro Phe Pro Asp Leu Phe Ser Glu Pro
325 330335325 330335
Leu Cys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu Thr Arg LysLeu Cys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu Thr Arg Lys
340 345350340 345350
Gly Gly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu Gln Asp ArgGly Gly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu Gln Asp Arg
355 360365355 360365
Tyr Ser GlyTyr Ser Gly
370 <210> 212 <211> 1590 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>370 <210> 212 <211> 1590 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 212<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 212
- 321 046157- 321 046157
<210> 213 <211> 530 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 213 <211> 530 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 213<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 213
Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe LeuMet Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu
5 10155 1015
Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala ValArgLeu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala ValArg
25302530
Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 35 4045Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 35 4045
Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu 50 5560Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu 50 5560
Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His Thr 65 70 7580Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His Thr 65 70 7580
- 322 046157- 322 046157
TyrTyr
CysCys
AlaAla
LeuLeu
Lys 145Lys 145
LysLys
AsnAsn
CysCys
HisHis
Gly 225Gly 225
HisHis
SerSer
LysLys
HisHis
Cys 305Cys 305
HisHis
Ser Leu Pro Arg GluSer Leu Pro Arg Glu
Thr Val Ser Met AspThr Val Ser Met Asp
Leu Glu Ser Glu SerLeu Glu Ser Glu Ser
Arg Lys Glu Gly Thr 100Arg Lys Glu Gly Thr 100
Glu Gln Glu Ile AlaGlu Gln Glu Ile Ala
115115
Leu Glu Lys Glu Gly 130Leu Glu Lys Glu Gly 130
Thr Glu Glu Gln IleThr Glu Glu Gln Ile
150150
Pro Tyr Lys Cys ProPro Tyr Lys Cys Pro
165165
Leu Val Arg His Gln 180Leu Val Arg His Gln 180
Pro Glu Cys Gly Lys 195Pro Glu Cys Gly Lys 195
Gln Arg Thr His Thr 210Gln Arg Thr His Thr 210
Lys Ser Phe Ser ArgLys Ser Phe Ser Arg
230230
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
245245
Gln Ser Gly Asn LeuGln Ser Gly Asn Leu
260260
Pro Tyr Lys Cys ProPro Tyr Lys Cys Pro
275275
Leu Val Arg His Gln 290Leu Val Arg His Gln 290
Pro Glu Cys Gly LysPro Glu Cys Gly Lys
310310
Gln Arg Thr His ThrGln Arg Thr His Thr
Gln Met Thr Pro GlnGln Met Thr Pro Gln
105105
His Met Glu Glu LeuHis Met Glu Glu Leu
110110
Arg Leu Val Leu Thr 120Arg Leu Val Leu Thr 120
Asp Glu Glu Lys Ser 125Asp Glu Glu Lys Ser 125
Leu Ile Leu Pro Glu 135Leu Ile Leu Pro Glu 135
Thr Leu Pro Leu Thr 140Thr Leu Pro Leu Thr 140
Leu Lys Arg Val ArgLeu Lys Arg Val Arg
155155
Glu Cys Gly Lys SerGlu Cys Gly Lys Ser
170170
Arg Thr His Thr Gly 185Arg Thr His Thr Gly 185
Ser Phe Ser Arg GluSer Phe Ser Arg Glu
200200
Gly Glu Lys Pro Tyr 215Gly Glu Lys Pro Tyr 215
Ser Asp Glu Leu ValSer Asp Glu Leu Val
235235
Tyr Lys Cys Pro GluTyr Lys Cys Pro Glu
250250
Thr Glu His Gln ArgThr Glu His Gln Arg
265265
Glu Cys Gly Lys Ser 280Glu Cys Gly Lys Ser 280
Arg Thr His Thr Gly 295Arg Thr His Thr Gly 295
Ser Phe Ser Gln AsnSer Phe Ser Gln Asn
315315
Gly Lys Lys Thr SerGly Lys Lys Thr Ser
Leu Glu Pro Gly GluLeu Glu Pro Gly Glu
160160
Phe Ser Arg Ser AspPhe Ser Arg Ser Asp
175175
Glu Lys Pro Tyr LysGlu Lys Pro Tyr Lys
190190
Asp Asn Leu His Thr 205Asp Asn Leu His Thr 205
Lys Cys Pro Glu Cys 220Lys Cys Pro Glu Cys 220
Arg His Gln Arg ThrArg His Gln Arg Thr
240240
Cys Gly Lys Ser PheCys Gly Lys Ser Phe
255255
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
270270
Phe Ser Thr Ser Gly 285Phe Ser Thr Ser Gly 285
Glu Lys Pro Tyr Lys 300Glu Lys Pro Tyr Lys 300
Ser Thr Leu Thr GluSer Thr Leu Thr Glu
320320
Val Tyr Val Gly GlyVal Tyr Val Gly Gly
- 323 046157- 323 046157
325 330325 330
335335
Leu Glu Ser Arg Val Leu Lys Tyr Thr Ala Gln AsnLeu Glu Ser Arg Val Leu Lys Tyr Thr Ala Gln Asn
340 345340 345
Met Glu Leu GlnMet Glu Leu Gln
350350
Asn Lys Val Gln Leu Leu Glu Glu Gln Asn Leu SerAsn Lys Val Gln Leu Leu Glu Glu Gln Asn Leu Ser
355 360355 360
Leu Leu Asp Gln 365Leu Leu Asp Gln 365
Leu Arg Lys Leu Gln Ala Met Val Ile Glu Ile SerLeu Arg Lys Leu Gln Ala Met Val Ile Glu Ile Ser
370 375 380370 375 380
Asn Lys Thr SerAsn Lys Thr Ser
Ser Ser Ser Thr Cys Ile Leu Val Leu Leu Val SerSer Ser Ser Thr Cys Ile Leu Val Leu Leu Val Ser
385 390 395385 390 395
Phe Cys Leu LeuPhe Cys Leu Leu
400400
Leu Val Pro Ala Met Tyr Ser Ser Asp Thr Arg GlyLeu Val Pro Ala Met Tyr Ser Ser Asp Thr Arg Gly
405 410405 410
Ser Leu Pro AlaSer Leu Pro Ala
415415
Glu His Gly Val Leu Ser Arg Gln Leu Arg Ala LeuGlu His Gly Val Leu Ser Arg Gln Leu Arg Ala Leu
420 425420 425
Pro Ser Glu AspPro Ser Glu Asp
430430
Pro Tyr Gln Leu Glu Leu Pro Ala Leu Gln Ser GluPro Tyr Gln Leu Glu Leu Pro Ala Leu Gln Ser Glu
435 440435 440
Val Pro Lys Asp 445Val Pro Lys Asp 445
Ser Thr His Gln Trp Leu Asp Gly Ser Asp Cys ValSer Thr His Gln Trp Leu Asp Gly Ser Asp Cys Val
450 455 460450 455 460
Leu Gln Ala ProLeu Gln Ala Pro
Gly Asn Thr Ser Cys Leu Leu His Tyr Met Pro GlnGly Asn Thr Ser Cys Leu Leu His Tyr Met Pro Gln
465 470 475465 470 475
Ala Pro Ser AlaAla Pro Ser Ala
480480
Glu Pro Pro Leu Glu Trp Pro Phe Pro Asp Leu PheGlu Pro Pro Leu Glu Trp Pro Phe Pro Asp Leu Phe
485 490485 490
Ser Glu Pro LeuSer Glu Pro Leu
495495
Cys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn LeuCys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu
500 505500 505
Thr Arg Lys GlyThr Arg Lys Gly
510510
Gly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile LeuGly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu
515 520515 520
Gln Asp Arg Tyr 525Gln Asp Arg Tyr 525
Ser GlySer Gly
530 <210> 214 <211> 1590 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>530 <210> 214 <211> 1590 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полинуклеотид<223> Description of the artificial polynucleotide sequence
СинтетическийSynthetic
- 324 046157 <400> 214 atggagctgg aattggatgc tggtgaccaa gacctgctgg ccttcctgct agaggaaagt 60 ggagatttgg ggacggcacc cgatgaggcc gtgagggccc cactggactg ggcgctgccg120 ctttctgagg tgccgagcga ctgggaagta gatgatttgc tgtgctccct gctgagtccc180 ccagcgtcgt tgaacattct cagctcctcc aacccctgcc ttgtccacca tgaccacacc240 tactccctcc cacgggaaac tgtctctatg gatctagaga gtgagagctg tagaaaagag300 gggacccaga tgactccaca gcatatggag gagctggcag agcaggagat tgctaggcta360 gtactgacag atgaggagaa gagtctattg gagaaggagg ggcttattct gcctgagaca420 cttcctctca ctaagacaga ggaacaaatt ctgaaacgtg tgcggcttga gcccggagag480 aagccgtaca agtgccctga gtgcggcaag tcttttagca gaagagacga acttaatgtc540 caccagcgaa cgcatactgg tgaaaagccc tataaatgtc ctgaatgtgg gaaatcattc600 tccagccgca gaacctgtag ggctcaccag cgaacacaca ccggcgaaaa accatacaaa660 tgtccagaat gcgggaaatc cttttctcag tcatccaact tggtgagaca tcaacgcacg720 cacactggag aaaagcctta caaatgcccg gaatgtggaa agtctttttc ccaattggcc780 catttgcgag cccatcagag gactcacacg ggcgagaaac cttacaaatg cccggaatgc840 gggaaatctt tttcaacgag tggcaacctc gtaagacacc aaagaacgca tacaggcgaa900 aagccatata agtgtcctga gtgtggtaaa tcattctcac acaggaccac cctgacaaat960 caccagcgca cgcacaccgg caagaagaca agcgtgtacg ttgggggttt agagagccgg1020 gtcttgaaat acacagccca gaatatggag cttcagaaca aagtacagct tctggaggaa1080 cagaatttgt cccttctaga tcaactgagg aaactccagg ccatggtgat tgagatctca1140 aacaaaacca gcagcagcag cacctgcatc ttggtcctgc tagtctcctt ctgcctcctc1200 cttgtacctg ctatgtactc ctctgacaca agggggagcc tgccagctga gcatggagtg1260 ttgtcccgcc agcttcgtgc cctccccagt gaggaccctt accagctgga gctgcctgcc1320 ctgcagtcag aagtgccgaa agacagcaca caccagtggt tggacggctc agactgtgta1380 ctccaggccc ctggcaacac ttcctgcctg ctgcattaca tgcctcaggc tcccagtgca1440 gagcctcccc tggagtggcc cttccctgac ctcttctcag agcctctctg ccgaggtccc1500 atcctccccc tgcaggcaaa tctcacaagg aagggaggat ggcttcctac tggtagcccc1560 tctgtcattt tgcaggacag atactcaggc1590 <210> 215 <211> 530 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>- 324 046157 <400> 214 atggagctgg aattggatgc tggtgaccaa gacctgctgg ccttcctgct agaggaaagt 60 ggagatttgg ggacggcacc cgatgaggcc gtgaggccc cactggactg ggcgctgccg120 ctttctgagg tgccgagcga ctgggaagta gat gatttgc tgtgctccct gctgagtccc180 ccagcgtcgt tgaacattct cagctcctcc aacccctgcc ttgtccacca tgaccacacc240 tactccctcc cacgggaaac tgtctctatg gatctagaga gtgagagctg tagaaaagag300 gggacccaga tgactccaca gcatatggag gagctggcag agca ggagat tgctaggcta360 gtactgacag atgaggagaa gagtctattg gagaaggagg ggcttattct gcctgagaca420 cttcctctca ctaagacaga ggaacaaatt ctgaaacgtg tgcggcttga gcccggagag480 aagccgtaca agtgccctga gtgcggcaag tcttttagca gaagagacga acttaatgtc540 caccagcgaa cgcatactgg tgaaaagccc tataaatgtc ctgaatgtgg gaaatcattc60 0 tccagccgca gaacctgtag ggctcaccag cgaacacaca ccggcgaaaa accatacaaa660 tgtccagaat gcgggaaatc cttttctcag tcatccaact tggtgagaca tcaacgcacg720 cacactggag aaaagcctta caaatgcccg gaatgtggaa agtctcttttc ccaattggcc7 80 catttgcgag cccatcagag gactcacacg ggcgagaaac cttacaaatg cccggaatgc840 gggaaatctt tttcaacgag tggcaacctc gtaagacacc aaagaacgca tacaggcgaa900 aagccatata agtgtcctga gtgtggtaaa tcattctcac acaggaccac cctgacaaat960 caccagcgca cgcacaccgg caagaagaca agcgtgtacg ttgggggttt agagagccgg1020 gtcttgaaat acacagccca gaatatggag cttcagaaca aagtacagct tctggaggaa1080 cagaatttgt cccttctaga tcaactgagg aaactccagg ccatggtgat tgagatctca1140 aacaaaacca gcagcagcag cacctgcatc ttggtcctgc tagtctcctt ctgcctcctc1200 cttgtacctg ctatgtactc ctctgacaca agggggagcc tgccagctga gcatggagtg1260 ttgtcccgcc ag cttcgtgc cctccccagt gaggaccctt accagctgga gctgcctgcc1320 ctgcagtcag aagtgccgaa agacagcaca caccagtggt tggacggctc agactgtgta1380 ctccaggccc ctggcaacac ttcctgcctg ctgcattaca tgcctcaggc tcccagtgca1440 gagcctcccc tggagtggcc cttccctgac ctcttctcag agcctctctg ccgaggtccc1500 atcctccccc tgcaggcaaa tctcacaagg aagggaggat ggcttcctac tggtagcccc1560 tctgtcattt tgcaggacag atactcaggc159 0 <210> 215 <211> 530 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
- 325 046157 <223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 215- 325 046157 <223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 215
Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu 1 5 10Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu 1 5 10
СинтетическийSynthetic
Leu Ala Phe LeuLeu Ala Phe Leu
Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp 20 25Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp 20 25
Glu Ala Val Arg 30Glu Ala Val Arg 30
Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu ValAla Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val
4040
Pro Ser Asp Trp 45Pro Ser Asp Trp 45
Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser ProGlu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro
55 6055 60
Pro Ala Ser LeuPro Ala Ser Leu
Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His 65 70 75Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His 65 70 75
His Asp His ThrHis Asp His Thr
Tyr Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp LeuTyr Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu
9090
Glu Ser Glu SerGlu Ser Glu Ser
Cys Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln HisCys Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His
100 105100 105
Met Glu Glu LeuMet Glu Glu Leu
110110
Ala Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr AspAla Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp
115 120115 120
Glu Glu Lys Ser 125Glu Glu Lys Ser 125
Leu Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu ThrLeu Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr
130 135 140130 135 140
Leu Pro Leu ThrLeu Pro Leu Thr
Lys Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg LeuLys Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Leu
145 150 155145 150 155
Glu Pro Gly GluGlu Pro Gly Glu
160160
Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser PheLys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe
165 170165 170
Ser Arg Arg AspSer Arg Arg Asp
175175
Glu Leu Asn Val His Gln Arg Thr His Thr Gly GluGlu Leu Asn Val His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu
180 185180 185
Lys Pro Tyr LysLys Pro Tyr Lys
190190
Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Ser Arg ArgCys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Ser Arg Arg
195 200195 200
Thr Cys Arg Ala 205Thr Cys Arg Ala 205
His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr LysHis Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys
210 215 220210 215 220
Cys Pro Glu CysCys Pro Glu Cys
Gly Lys Ser Phe Ser Gln Ser Ser Asn Leu Val ArgGly Lys Ser Phe Ser Gln Ser Ser Asn Leu Val Arg
225 230 235225 230 235
His Gln Arg ThrHis Gln Arg Thr
240240
- 326 046157- 326 046157
HisHis
SerSer
LysLys
AsnAsn
Cys 305Cys 305
HisHis
LeuLeu
AsnAsn
LeuLeu
Ser 385Ser 385
LeuLeu
GluGlu
ProPro
SerSer
Gly 465Gly 465
GluGlu
Thr Gly Glu Lys ProThr Gly Glu Lys Pro
245245
Gln Leu Ala His LeuGln Leu Ala His Leu
260260
Pro Tyr Lys Cys ProPro Tyr Lys Cys Pro
275275
Leu Val Arg His Gln 290Leu Val Arg His Gln 290
Pro Glu Cys Gly LysPro Glu Cys Gly Lys
310310
Gln Arg Thr His ThrGln Arg Thr His Thr
325325
Glu Ser Arg Val LeuGlu Ser Arg Val Leu
340340
Lys Val Gln Leu LeuLys Val Gln Leu Leu
355355
Arg Lys Leu Gln Ala 370Arg Lys Leu Gln Ala 370
Ser Ser Thr Cys IleSer Ser Thr Cys Ile
390390
Val Pro Ala Met TyrVal Pro Ala Met Tyr
405405
His Gly Val Leu SerHis Gly Val Leu Ser
420420
Tyr Gln Leu Glu LeuTyr Gln Leu Glu Leu
435435
Thr His Gln Trp Leu 450Thr His Gln Trp Leu 450
Asn Thr Ser Cys LeuAsn Thr Ser Cys Leu
470470
Pro Pro Leu Glu TrpPro Pro Leu Glu Trp
485485
Tyr Lys Cys Pro GluTyr Lys Cys Pro Glu
250250
Cys Gly Lys Ser PheCys Gly Lys Ser Phe
255255
Arg Ala His Gln Arg 265Arg Ala His Gln Arg 265
Glu Cys Gly Lys SerGlu Cys Gly Lys Ser
280280
Arg Thr His Thr Gly 295Arg Thr His Thr Gly 295
Ser Phe Ser His ArgSer Phe Ser His Arg
315315
Gly Lys Lys Thr SerGly Lys Lys Thr Ser
330330
Lys Tyr Thr Ala GlnLys Tyr Thr Ala Gln
345345
Glu Glu Gln Asn LeuGlu Glu Gln Asn Leu
360360
Met Val Ile Glu Ile 375Met Val Ile Glu Ile 375
Leu Val Leu Leu ValLeu Val Leu Leu Val
395395
Ser Ser Asp Thr ArgSer Ser Asp Thr Arg
410410
Arg Gln Leu Arg Ala 425Arg Gln Leu Arg Ala 425
Pro Ala Leu Gln SerPro Ala Leu Gln Ser
440440
Asp Gly Ser Asp Cys 455Asp Gly Ser Asp Cys 455
Leu His Tyr Met ProLeu His Tyr Met Pro
475475
Pro Phe Pro Asp LeuPro Phe Pro Asp Leu
490490
Thr His Thr Gly GluThr His Thr Gly Glu
270270
Phe Ser Thr Ser Gly 285Phe Ser Thr Ser Gly 285
Glu Lys Pro Tyr Lys 300Glu Lys Pro Tyr Lys 300
Thr Thr Leu Thr AsnThr Thr Leu Thr Asn
320320
Val Tyr Val Gly GlyVal Tyr Val Gly Gly
335335
Asn Met Glu Leu GlnAsn Met Glu Leu Gln
350350
Ser Leu Leu Asp GlnSer Leu Leu Asp Gln
365365
Ser Asn Lys Thr Ser 380Ser Asn Lys Thr Ser 380
Ser Phe Cys Leu LeuSer Phe Cys Leu Leu
400400
Gly Ser Leu Pro AlaGly Ser Leu Pro Ala
415415
Leu Pro Ser Glu Asp 430Leu Pro Ser Glu Asp 430
Glu Val Pro Lys Asp 445Glu Val Pro Lys Asp 445
Val Leu Gln Ala Pro 460Val Leu Gln Ala Pro 460
Gln Ala Pro Ser AlaGln Ala Pro Ser Ala
480480
Phe Ser Glu Pro LeuPhe Ser Glu Pro Leu
495495
- 327 046157- 327 046157
Cys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu Thr Arg Lys Gly 500 505 510Cys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu Thr Arg Lys Gly 500 505 510
Gly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu Gln Asp Arg Tyr 515 520 525Gly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu Gln Asp Arg Tyr 515 520 525
Ser Gly 530 <210> 216 <211> 1590 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>Ser Gly 530 <210> 216 <211> 1590 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 328 046157- 328 046157
<210> 217 <211> 530 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 217 <211> 530 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 217<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 217
Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu 1 5 1015Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu 1 5 1015
Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 2530Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 2530
Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 35 4045Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 35 4045
Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu 50 5560Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu 50 5560
Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His Thr 65 70 7580Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His Thr 65 70 7580
Tyr Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu Glu Ser Glu Ser 85 9095Tyr Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu Glu Ser Glu Ser 85 9095
Cys Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His Met Glu Glu LeuCys Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His Met Glu Glu Leu
100 105110100 105110
Ala Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp Glu Glu Lys SerAla Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp Glu Glu Lys Ser
115 120125115 120125
Leu Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr Leu Pro Leu ThrLeu Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr Leu Pro Leu Thr
130 135140130 135140
Lys Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Arg Pro Tyr Ala CysLys Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Arg Pro Tyr Ala Cys
- 329 046157- 329 046157
145145
ProPro
ArgArg
CysCys
ThrThr
Phe 225Phe 225
GlnGln
PhePhe
GlnGln
GlyGly
Ala 305Ala 305
GluGlu
LeuLeu
AsnAsn
LeuLeu
Ser 385Ser 385
150150
155155
160160
Val Glu Ser Cys AspVal Glu Ser Cys Asp
165165
Arg Arg Phe Ser ArgArg Arg Phe Ser Arg
170170
Ser Asp Asn Leu ValSer Asp Asn Leu Val
175175
His Ile Arg Ile HisHis Ile Arg Ile His
180180
Met Arg Asn Phe Ser 195Met Arg Asn Phe Ser 195
His Thr Gly Glu Lys 210His Thr Gly Glu Lys 210
Ala Arg Ser Asp GluAla Arg Ser Asp Glu
230230
Lys Asp Arg Pro TyrLys Asp Arg Pro Tyr
245245
Ser Gln Ser Gly Asn 260Ser Gln Ser Gly Asn 260
Lys Pro Phe Gln CysLys Pro Phe Gln Cys
275275
His Leu Val Arg His 290His Leu Val Arg His 290
Cys Asp Ile Cys GlyCys Asp Ile Cys Gly
310310
His Thr Lys Ile HisHis Thr Lys Ile His
325325
Glu Ser Arg Val LeuGlu Ser Arg Val Leu
340340
Lys Val Gln Leu LeuLys Val Gln Leu Leu
355355
Arg Lys Leu Gln Ala 370Arg Lys Leu Gln Ala 370
Ser Ser Thr Cys IleSer Ser Thr Cys Ile
390390
Thr Gly Gln Lys Pro 185Thr Gly Gln Lys Pro 185
Phe Gln Cys Arg IlePhe Gln Cys Arg Ile
190190
Arg Glu Asp Asn LeuArg Glu Asp Asn Leu
200200
Pro Phe Ala Cys Asp 215Pro Phe Ala Cys Asp 215
Leu Val Arg His ThrLeu Val Arg His Thr
235235
Ala Cys Pro Val GluAla Cys Pro Val Glu
250250
Leu Thr Glu His IleLeu Thr Glu His Ile
265265
Arg Ile Cys Met Arg 280Arg Ile Cys Met Arg 280
Ile Arg Thr His Thr 295Ile Arg Thr His Thr 295
Arg Lys Phe Ala GlnArg Lys Phe Ala Gln
315315
Leu Arg Gln Lys AspLeu Arg Gln Lys Asp
330330
Lys Tyr Thr Ala GlnLys Tyr Thr Ala Gln
345345
Glu Glu Gln Asn LeuGlu Glu Gln Asn Leu
360360
Met Val Ile Glu Ile 375Met Val Ile Glu Ile 375
Leu Val Leu Leu ValLeu Val Leu Leu Val
395395
His Thr His Ile ArgHis Thr His Ile Arg
205205
Ile Cys Gly Arg Lys 220Ile Cys Gly Arg Lys 220
Lys Ile His Leu ArgLys Ile His Leu Arg
240240
Ser Cys Asp Arg ArgSer Cys Asp Arg Arg
255255
Arg Ile His Thr Gly 270Arg Ile His Thr Gly 270
Asn Phe Ser Thr SerAsn Phe Ser Thr Ser
285285
Gly Glu Lys Pro Phe 300Gly Glu Lys Pro Phe 300
Asn Ser Thr Leu ThrAsn Ser Thr Leu Thr
320320
Val Tyr Val Gly GlyVal Tyr Val Gly Gly
335335
Asn Met Glu Leu GlnAsn Met Glu Leu Gln
350350
Ser Leu Leu Asp GlnSer Leu Leu Asp Gln
365365
Ser Asn Lys Thr Ser 380Ser Asn Lys Thr Ser 380
Ser Phe Cys Leu LeuSer Phe Cys Leu Leu
400400
- 330 046157- 330 046157
Leu ValLeu Val
Pro AlaPro Ala
Glu HisGlu His
Gly ValGly Val
420420
Pro TyrPro Tyr
Gln Leu 435Gln Leu 435
Ser ThrSer Thr
450450
His GlnHis Gln
Met Tyr 405Met Tyr 405
Leu SerLeu Ser
Glu LeuGlu Leu
Trp LeuTrp Leu
Gly Asn 465Gly Asn 465
Thr SerThr Ser
Cys LeuCys Leu
470470
Glu ProGlu Pro
Pro LeuProLeu
Glu Trp 485Glu Trp 485
Cys ArgCysArg
Gly ProGly Pro
500500
Ile LeuIle Leu
Gly TrpGly Trp
Leu Pro 515Leu Pro 515
Thr GlyThr Gly
Ser SerSer Ser
Arg GlnArg Gln
Pro Ala 440Pro Ala 440
Asp Gly 455Asp Gly 455
Leu HisLeu His
Pro PhePro Phe
Pro LeuProLeu
Ser ProSer Pro
520520
Asp ThrAsp Thr
410410
Leu Arg 425Leu Arg 425
Leu GlnLeu Gln
Ser AspSer Asp
Tyr MetTyr Met
Pro AspPro Asp
490490
Gln Ala 505Gln Ala 505
Ser ValSer Val
Arg GlyArg Gly
Ala LeuAla Leu
Ser GluSer Glu
Cys ValCys Val
460460
Pro Gln 475Pro Gln 475
Leu PheLeu Phe
Asn LeuAsn Leu
Ile LeuIle Leu
Ser LeuSer Leu
Pro SerPro Ser
430430
Val Pro 445Val Pro 445
Leu GlnLeu Gln
Ala ProAla Pro
Ser GluSer Glu
Thr ArgThr Arg
510510
Gln Asp 525Gln Asp 525
Pro Ala 415Pro Ala 415
Glu AspGlu Asp
Lys AspLys Asp
Ala ProAla Pro
Ser AlaSer Ala
480480
Pro Leu 495Pro Leu 495
Lys GlyLys Gly
Arg TyrArg Tyr
Ser GlySer Gly
530 <210> 218 <211> 1590 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>530 <210> 218 <211> 1590 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
120120
180180
240240
300300
360360
420420
480480
540540
- 331 046157- 331 046157
<210> 219 <211> 530 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><210> 219 <211> 530 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 219<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 219
Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu 1 5 1015Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu 1 5 1015
Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 2530Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 2530
Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 35 4045Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 35 4045
Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu 50 5560Glu Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu 50 5560
- 332 046157- 332 046157
Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val 65 7075Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val 65 7075
His His Asp His ThrHis His Asp His Thr
Tyr Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu Glu Ser Glu Ser 85 9095Tyr Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu Glu Ser Glu Ser 85 9095
Cys Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His Met Glu Glu Leu 100 105110Cys Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His Met Glu Glu Leu 100 105110
Ala Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp Glu Glu Lys Ser 115 120125Ala Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp Glu Glu Lys Ser 115 120125
Leu Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr Leu Pro Leu Thr 130 135140Leu Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr Leu Pro Leu Thr 130 135140
Lys Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Arg Pro Tyr Ala CysLys Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Arg Pro Tyr Ala Cys
145 150 155160145 150 155160
Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu ValPro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Val
165 170175165 170175
Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg IleArg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile
180 185190180 185190
Cys Met Arg Asn Phe Ser His Arg Thr Thr Leu Thr Asn His Ile ArgCys Met Arg Asn Phe Ser His Arg Thr Thr Leu Thr Asn His Ile Arg
195 200205195 200205
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg LysThr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys
210 215220210 215220
Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His Thr Lys Ile His Leu ArgPhe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His Thr His Thr Lys Ile His Leu Arg
225 230 235240225 230 235240
Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg ArgGln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg
245 250255245 250255
Phe Ser Thr Ser His Ser Leu Thr Glu His Ile Arg Ile His Thr GlyPhe Ser Thr Ser His Ser Leu Thr Glu His Ile Arg Ile His Thr Gly
260 265270260 265270
Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln SerGln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln Ser
275 280285275 280285
Ser Ser Leu Val Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro PheSer Ser Leu Val Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe
290 295300290 295300
Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu HisAla Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg Glu Asp Asn Leu His
305 310 315320305 310 315320
- 333 046157- 333 046157
Thr His Thr Lys Ile His Leu ArgThr His Thr Lys Ile His Leu Arg
325325
Gln Lys Asp Val Tyr Val Gly GlyGln Lys Asp Val Tyr Val Gly Gly
330 335330 335
Leu GluLeu Glu
Ser Arg ValSer Arg Val
340340
Leu Lys Tyr Thr Ala Gln Asn Met Glu Leu GlnLeu Lys Tyr Thr Ala Gln Asn Met Glu Leu Gln
345 350345 350
Asn Lys Val GlnAsn Lys Val Gln
355355
Leu Leu Glu Glu Gln Asn Leu Ser Leu Leu Asp GlnLeu Leu Glu Glu Gln Asn Leu Ser Leu Leu Asp Gln
360 365360 365
Leu Arg Lys Leu Gln Ala Met ValLeu Arg Lys Leu Gln Ala Met Val
370 375370 375
Ile Glu Ile Ser Asn Lys Thr SerIle Glu Ile Ser Asn Lys Thr Ser
380380
Ser Ser Ser Thr CysSer Ser Ser Thr Cys
385385
Ile Leu Val Leu Leu Val Ser Phe Cys Leu LeuIle Leu Val Leu Leu Val Ser Phe Cys Leu Leu
390 395400390 395400
Leu Val Pro Ala Met Tyr Ser Ser Asp Thr Arg Gly Ser Leu Pro AlaLeu Val Pro Ala Met Tyr Ser Ser Asp Thr Arg Gly Ser Leu Pro Ala
405 410415405 410415
Glu His Gly Val Leu Ser Arg Gln Leu Arg Ala Leu Pro Ser Glu AspGlu His Gly Val Leu Ser Arg Gln Leu Arg Ala Leu Pro Ser Glu Asp
420 425430420 425430
Pro Tyr Gln Leu Glu Leu Pro Ala Leu Gln Ser Glu Val Pro Lys AspPro Tyr Gln Leu Glu Leu Pro Ala Leu Gln Ser Glu Val Pro Lys Asp
435 440445435 440445
Ser Thr His Gln Trp Leu Asp Gly Ser Asp Cys Val Leu Gln Ala ProSer Thr His Gln Trp Leu Asp Gly Ser Asp Cys Val Leu Gln Ala Pro
450 455460450 455460
Gly Asn Thr Ser Cys Leu Leu His Tyr Met Pro Gln Ala Pro Ser AlaGly Asn Thr Ser Cys Leu Leu His Tyr Met Pro Gln Ala Pro Ser Ala
465 470 475480465 470 475480
Glu Pro Pro Leu Glu Trp Pro Phe Pro Asp Leu Phe Ser Glu Pro LeuGlu Pro Pro Leu Glu Trp Pro Phe Pro Asp Leu Phe Ser Glu Pro Leu
485 490495485 490495
Cys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu Thr Arg Lys GlyCys Arg Gly Pro Ile Leu Pro Leu Gln Ala Asn Leu Thr Arg Lys Gly
500 505510500 505510
Gly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu Gln Asp Arg TyrGly Trp Leu Pro Thr Gly Ser Pro Ser Val Ile Leu Gln Asp Arg Tyr
515 520525515 520525
Ser GlySer Gly
530 <210> 220 <211> 1140 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность530 <210> 220 <211> 1140 <212> DNA <213> Artificial sequence
- 334 046157 <220>- 334 046157 <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид <400> 220 atggagctgg aattggatgc tggtgaccaa gacctgctgg ccttcctgct agaggaaagt60 ggagatttgg ggacggcacc cgatgaggcc gtgagggccc cactggactg ggcgctgccg120 ctttctgagg tgccgagcga ctgggaagta gatgatttgc tgtgctccct gctgagtccc180 ccagcgtcgt tgaacattct cagctcctcc aacccctgcc ttgtccacca tgaccacacc240 tactccctcc cacgggaaac tgtctctatg gatctagaga gtgagagctg tagaaaagag300 gggacccaga tgactccaca gcatatggag gagctggcag agcaggagat tgctaggcta360 gtactgacag atgaggagaa gagtctattg gagaaggagg ggcttattct gcctgagaca420 cttcctctca ctaagacaga ggaacaaatt ctgaaacgtg tgcggctcga accaggtgaa480 aaaccttaca aatgtcctga atgtgggaaa tcattcagtc gcagcgacaa cctggtgaga540 catcaacgca cccatacagg agaaaaacct tataaatgtc cagaatgtgg aaagtccttc600 tcacgagagg ataacttgca cactcatcaa cgaacacata ctggtgaaaa accatacaag660 tgtcccgaat gtggtaaaag ttttagccgg agcgatgaac ttgtccgaca ccaacgaacc720 catacaggcg agaagcctta caaatgtccc gagtgtggca agagcttctc acaatcaggg780 aatctgactg agcatcaacg aactcatacc ggggaaaaac cttacaagtg tccagagtgt840 gggaagagct tttccacaag tggacatctg gtacgccacc agaggacaca tacaggggag900 aagccctaca aatgccccga atgcggtaaa agtttctctc agaatagtac cctgaccgaa960 caccagcgaa cacacactgg gaaaaaaacg agtgtgtacg ttgggggttt agagagccgg1020 gtcttgaaat acacagccca gaatatggag cttcagaaca aagtacagct tctggaggaa1080 cagaatttgt cccttctaga tcaactgagg aaactccagg ccatggtgat tgagatatca1140 <210> 221 <211> 380 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220><223> Description of the artificial sequence: Synthetic polynucleotide <400> 220 atggagctgg aattggatgc tggtgaccaa gacctgctgg ccttcctgct agaggaaagt60 ggagatttgg ggacggcacc cgatgaggcc gtgaggccc cactggactg ggcgctgccg120 ctttctgagg tgccgagcga ctgggaag ta gatgatttgc tgtgctccct gctgagtccc180 ccagcgtcgt tgaacattct cagctcctcc aacccctgcc ttgtccacca tgaccacacc240 tactccctcc cacgggaaac tgtctctatg gatctagaga gtgagagctg tagaaaagag300 gggacccaga tgactccaca gcatatggag gagctggcag agcaggagat tgctaggcta360 gtactgacag atgaggagaa gagtctattg gagaaggagg ggcttattct gcctgagaca420 cttcctctca ctaagacaga ggaacaaatt ctgaaacgtg tgcggctcga accaggtgaa480 aaaccttaca aatgtcctga atgtgggaaa tcattcagtc gcagcgacaa cctggtgaga540 catcaacgca cccata cagg agaaaaacct tataaatgtc cagaatgtgg aaagtccttc600 tcacgagagg ataacttgca cactcatcaa cgaacacata ctggtgaaaa accatacaag660 tgtcccgaat gtggtaaaag ttttagccgg agcgatgaac ttgtccgaca ccaacgaacc720 catacaggcg agaagcctta caaatgtccc gagtgtggca agagcttctc acaatcaggg780 aatctgactg agcatcaacg aactcatacc ggggaaaaac cttacaagtg tccagagtgt840 gggaagagct tttccacaag tggacatctg gtacgccacc agaggacaca tacaggggag900 aagccctaca aatgccccga atgcggtaaa agtttctctc agaatagtac cctgaccgaa960 caccagcgaa cacacactgg gaaaaaaacg agtgtgtacg ttggggggttt agagagccgg1020 gtcttgaaat acacagccca ga atatggag cttcagaaca aagtacagct tctggaggaa1080 cagaatttgt cccttctaga tcaactgagg aaactccagg ccatggtgat tgagatatca1140 <210> 221 <211> 380 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 221<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 221
Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe LeuMet Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu
5 10 155 10 15
Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 25 30Leu Glu Glu Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 25 30
Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp TrpAla Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp
- 335 046157- 335 046157
40 4540 45
GluGlu
Asn 65Asn 65
TyrTyr
CysCys
AlaAla
LeuLeu
Lys 145Lys 145
LysLys
AsnAsn
CysCys
HisHis
Gly 225Gly 225
HisHis
SerSer
LysLys
Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser 50 55 60Val Asp Asp Leu Leu Cys Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser 50 55 60
Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His 70 75Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His 70 75
Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu Glu Ser Glu 85 90 95Ser Leu Pro Arg Glu Thr Val Ser Met Asp Leu Glu Ser Glu 85 90 95
Arg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His Met Glu GluArg Lys Glu Gly Thr Gln Met Thr Pro Gln His Met Glu Glu
100 105 110100 105 110
Glu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp Glu Glu LysGlu Gln Glu Ile Ala Arg Leu Val Leu Thr Asp Glu Glu Lys
115 120 125115 120 125
Leu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr Leu Pro LeuLeu Glu Lys Glu Gly Leu Ile Leu Pro Glu Thr Leu Pro Leu
130 135 140130 135 140
Thr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Leu Glu Pro GlyThr Glu Glu Gln Ile Leu Lys Arg Val Arg Leu Glu Pro Gly
150 155150 155
Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg SerPro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Ser
165 170 175165 170 175
Leu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro TyrLeu Val Arg His Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr
180 185 190180 185 190
Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu HisPro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His
195 200 205195 200 205
Gln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro GluGln Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu
210 215 220210 215 220
Lys Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln ArgLys Ser Phe Ser Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His Gln Arg
230 235230 235
Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys SerThr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser
245 250 255245 250 255
Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr GlyGln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Gln Arg Thr His Thr Gly
260 265 270260 265 270
Pro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr SerPro Tyr Lys Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe Ser Thr Ser
275 280 285275 280 285
LeuLeu
Thr 80Thr 80
SerSer
LeuLeu
SerSer
ThrThr
Glu 160Glu 160
AspAsp
LysLys
ThrThr
CysCys
Thr 240Thr 240
PhePhe
GluGlu
GlyGly
- 336 046157- 336 046157
His Leu Val Arg His Gln Arg ThrHis Leu Val Arg His Gln Arg Thr
290 295290 295
His Thr Gly Glu Lys Pro Tyr LysHis Thr Gly Glu Lys Pro Tyr Lys
300300
Cys Pro Glu Cys Gly Lys Ser PheCys Pro Glu Cys Gly Lys Ser Phe
305 310305 310
Ser Gln Asn Ser Thr Leu Thr GluSer Gln Asn Ser Thr Leu Thr Glu
315 320315 320
His Gln Arg Thr His Thr Gly LysHis Gln Arg Thr His Thr Gly Lys
325325
Lys Thr Ser Val Tyr Val Gly GlyLys Thr Ser Val Tyr Val Gly Gly
330 335330 335
Leu Glu Ser Arg Val Leu Lys TyrLeu Glu Ser Arg Val Leu Lys Tyr
340340
Thr Ala Gln Asn Met Glu Leu GlnThr Ala Gln Asn Met Glu Leu Gln
345 350345 350
Asn Lys Val Gln Leu Leu Glu GluAsn Lys Val Gln Leu Leu Glu Glu
355 360355 360
Gln Asn Leu Ser Leu Leu Asp GlnGln Asn Leu Ser Leu Leu Asp Gln
365365
Leu Arg Lys Leu Gln Ala Met ValLeu Arg Lys Leu Gln Ala Met Val
370 375370 375
Ile Glu Ile SerIle Glu Ile Ser
380 <210> 222 <211> 1140 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>380 <210> 222 <211> 1140 <212> DNA <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Description of artificial sequence: Synthetic polynucleotide
- 337 046157 gaaaagccct gaacatacca gtcttgaaat cagaatttgt tcgcctgcga agatccactt acacagccca cccttctaga catctgtgga gcggcagaag gaatatggag tcaactgagg agaaagtttg gacgtgtacg cttcagaaca aaactccagg cccagaatag ttgggggttt aagtacagct ccatggtgat taccctgacc agagagccgg tctggaggaa tgagatctca- 337 046157 gaaaagccct gaacatacca gtcttgaaat cagaatttgt tcgcctgcga agatccactt acacagccca cccttctaga catctgtgga gcggcagaag gaatatggag tcaactgagg agaaagtttg gacgtgtacg cttcagaaca aaactccagg cccagaatag ttggggggt tt aagtacagct ccatggtgat taccctgacc agagagccgg tctggaggaa tgagatctca
960960
10201020
10801080
1140 <210> 223 <211> 380 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>1140 <210> 223 <211> 380 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полипептид <400> 223<223> Description of artificial sequence: Synthetic polypeptide <400> 223
Met Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe LeuMet Glu Leu Glu Leu Asp Ala Gly Asp Gln Asp Leu Leu Ala Phe Leu
5 10 155 10 15
Leu Glu GluLeu Glu Glu
Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 25 30Ser Gly Asp Leu Gly Thr Ala Pro Asp Glu Ala Val Arg 20 25 30
Ala Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro LeuAla Pro Leu Asp Trp Ala Leu Pro Leu
4040
Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 45Ser Glu Val Pro Ser Asp Trp 45
Glu Val Asp Asp Leu Leu CysGlu Val Asp Asp Leu Leu Cys
5555
Ser Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser LeuSer Leu Leu Ser Pro Pro Ala Ser Leu
Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His Thr 65 70 75 80Asn Ile Leu Ser Ser Ser Asn Pro Cys Leu Val His His Asp His Thr 65 70 75 80
Tyr SerTyr Ser
Leu ProLeu Pro
Cys ArgCysArg
Lys GluLys Glu
100100
Ala GluAla Glu
Gln Glu 115Gln Glu 115
Leu LeuLeu Leu
130130
Glu LysGlu Lys
Lys Thr 145Lys Thr 145
Glu GluGlu Glu
Pro ValPro Val
Glu SerGlu Ser
Arg Glu 85Arg Glu 85
Gly ThrGly Thr
Ile AlaIle Ala
Glu GlyGlu Gly
Gln IleGln Ile
150150
Cys Asp 165Cys Asp 165
Thr ValThr Val
Ser MetSerMet
Asp LeuAsp Leu
Glu SerGlu Ser
Gln MetGln Met
Thr Pro 105Thr Pro 105
Gln HisGln His
Met GluMet Glu
110110
Arg LeuArg Leu
120120
Val LeuVal Leu
Thr AspThr Asp
Glu Glu 125Glu Glu 125
Leu Ile 135Leu Ile 135
Leu ProLeu Pro
Glu ThrGlu Thr
140140
Leu ProLeu Pro
Leu LysLeu Lys
Arg ValArg Val
Arg Arg 155Arg Arg 155
Pro TyrPro Tyr
Arg ArgArg Arg
Phe SerPhe Ser
170170
Arg SerArg Ser
Asp AsnAsp Asn
Glu Ser 95Glu Ser 95
Glu LeuGlu Leu
Lys SerLys Ser
Leu ThrLeu Thr
Ala Cys 160Ala Cys 160
Leu Val 175Leu Val 175
- 338 046157- 338 046157
Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro PheArg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe
180 185180 185
Gln Cys Arg IleGln Cys Arg Ile
190190
Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu HisCys Met Arg Asn Phe Ser Arg Glu Asp Asn Leu His
195 200195 200
Thr His Ile Arg 205Thr His Ile Arg 205
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp IleThr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile
210 215 220210 215 220
Cys Gly Arg LysCys Gly Arg Lys
Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His 225 230Phe Ala Arg Ser Asp Glu Leu Val Arg His 225 230
Thr Lys 235Thr Lys 235
Ile His Leu ArgIle His Leu Arg
240240
Gln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu SerGln Lys Asp Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser
245 250245 250
Cys Asp Arg ArgCys Asp Arg Arg
255255
Phe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Ile ArgPhe Ser Gln Ser Gly Asn Leu Thr Glu His Ile Arg
260 265260 265
Ile His Thr Gly 270Ile His Thr Gly 270
Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg AsnGln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
275 280275 280
Phe Ser Thr Ser 285Phe Ser Thr Ser 285
Gly His Leu Val Arg His Ile Arg Thr His Thr GlyGly His Leu Val Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly
290 295 300290 295 300
Glu Lys Pro PheGlu Lys Pro Phe
Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln AsnAla Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Asn
305 310 315305 310 315
Ser Thr Leu ThrSer Thr Leu Thr
320320
Glu His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp ValGlu His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp Val
325 330325 330
Tyr Val Gly GlyTyr Val Gly Gly
335335
Leu Glu Ser Arg Val Leu Lys Tyr Thr Ala Gln AsnLeu Glu Ser Arg Val Leu Lys Tyr Thr Ala Gln Asn
340 345340 345
Met Glu Leu GlnMet Glu Leu Gln
350350
Asn Lys Val Gln Leu Leu Glu Glu Gln Asn Leu SerAsn Lys Val Gln Leu Leu Glu Glu Gln Asn Leu Ser
355 360355 360
Leu Leu Asp Gln 365Leu Leu Asp Gln 365
Leu Arg Lys Leu Gln Ala Met Val Ile Glu Ile SerLeu Arg Lys Leu Gln Ala Met Val Ile Glu Ile Ser
370 375 380 <210> 224 <211> 155 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>370 375 380 <210> 224 <211> 155 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 224<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 224
СинтетическийSynthetic
- 339 046157- 339 046157
Met Glu 1Met Glu 1
Leu GluLeu Glu
Leu Asp 5Leu Asp 5
Ala GlyAla Gly
Asp GlnAsp Gln
Asp LeuAsp Leu
Leu Ala Phe LeuLeu Ala Phe Leu
Leu GluLeu Glu
Glu SerGlu Ser
Gly AspGly Asp
Leu GlyLeu Gly
Thr Ala 25Thr Ala 25
Pro AspPro Asp
Glu Ala Val Arg 30Glu Ala Val Arg 30
Ala ProAla Pro
Leu Asp 35Leu Asp 35
Trp AlaTrp Ala
Leu ProLeu Pro
Leu SerLeu Ser
Glu ValGlu Val
Pro Ser Asp Trp 45Pro Ser Asp Trp 45
Glu ValGlu Val
Asp AspAsp Asp
Leu LeuLeu Leu
Cys Ser 55Cys Ser 55
Leu LeuLeu Leu
Ser ProSer Pro
Pro Ala Ser LeuPro Ala Ser Leu
Asn Ile 65Asn Ile 65
Leu SerLeu Ser
Ser SerSer Ser
Asn ProAsn Pro
Cys LeuCys Leu
Val His 75Val His 75
His Asp His ThrHis Asp His Thr
Tyr SerTyr Ser
Leu ProLeu Pro
Arg Glu 85Arg Glu 85
Thr ValThr Val
Ser MetSerMet
Asp LeuAsp Leu
Glu Ser Glu SerGlu Ser Glu Ser
Cys ArgCysArg
Lys GluLys Glu
100100
Gly ThrGly Thr
Gln MetGln Met
Thr Pro 105Thr Pro 105
Gln HisGln His
Met Glu Glu LeuMet Glu Glu Leu
110110
Ala GluAla Glu
Gln Glu 115Gln Glu 115
Ile AlaIle Ala
Arg LeuArg Leu
120120
Val LeuVal Leu
Thr AspThr Asp
Glu Glu Lys Ser 125Glu Glu Lys Ser 125
Leu LeuLeu Leu
130130
Glu LysGlu Lys
Glu GlyGlu Gly
Leu Ile 135Leu Ile 135
Leu ProLeu Pro
Glu ThrGlu Thr
140140
Leu Pro Leu ThrLeu Pro Leu Thr
Lys Thr 145Lys Thr 145
Glu GluGlu Glu
Gln IleGln Ile
150150
Leu LysLeu Lys
Arg ValArg Val
Arg 155 <210> 225 <211> 199 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Arg 155 <210> 225 <211> 199 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 225<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 225
СинтетическийSynthetic
Val Tyr Val Gly Gly Leu 1 5Val Tyr Val Gly Gly Leu 1 5
Glu Ser Arg Val Leu Lys 10Glu Ser Arg Val Leu Lys 10
Tyr Thr Ala Gln 15Tyr Thr Ala Gln 15
Asn Met Glu Leu Gln AsnAsn Met Glu Leu Gln Asn
Lys Val Gln Leu Leu Glu 25Lys Val Gln Leu Leu Glu 25
Glu Gln Asn LeuGlu Gln Asn Leu
Ser Leu Leu Asp Gln Leu 35Ser Leu Leu Asp Gln Leu 35
Arg Lys Leu Gln Ala Met 40Arg Lys Leu Gln Ala Met 40
Val Ile Glu Ile 45Val Ile Glu Ile 45
Ser Asn Lys Thr Ser SerSer Asn Lys Thr Ser Ser
Ser Ser Thr Cys Ile LeuSer Ser Thr Cys Ile Leu
Val Leu Leu ValVal Leu Leu Val
- 340 046157- 340 046157
55 6055 60
Ser Phe 65Ser Phe 65
Gly SerGly Ser
Leu ProLeu Pro
Glu ValGlu Val
Cys LeuCys Leu
Leu ProLeu Pro
Ser GluSer Glu
100100
Pro Lys 115Pro Lys 115
Leu LeuLeu Leu
Val ProVal Pro
Ala MetAla Met
Ala Glu 85Ala Glu 85
Asp ProAsp Pro
Asp SerAsp Ser
His GlyHis Gly
Val LeuVal Leu
Tyr GlnTyr Gln
Leu Glu 105Leu Glu 105
Thr HisThr His
120120
Gln TrpGln Trp
Val LeuVal Leu
130130
Gln AlaGln Ala
Pro GlyPro Gly
Asn Thr 135Asn Thr 135
Ser CysSer Cys
Gln Ala 145Gln Ala 145
Pro SerPro Ser
Ala GluAla Glu
150150
Pro ProPro Pro
Leu GluLeu Glu
Phe SerPhe Ser
Glu ProGlu Pro
Leu Cys 165Leu Cys 165
Arg GlyArg Gly
Pro IlePro Ile
170170
Leu ThrLeu Thr
Arg LysArg Lys
180180
Gly GlyGly Gly
Trp LeuTrp Leu
Pro Thr 185Pro Thr 185
Tyr Ser 75Tyr Ser 75
Ser ArgSer Arg
Leu ProLeu Pro
Leu AspLeu Asp
Leu LeuLeu Leu
140140
Trp Pro 155Trp Pro 155
Leu ProLeu Pro
Gly SerGly Ser
Ser Asp Thr Arg 80Ser Asp Thr Arg 80
Gln Leu Arg Ala 95Gln Leu Arg Ala 95
Ala Leu Gln SerAla Leu Gln Ser
110110
Gly Ser Asp Cys 125Gly Ser Asp Cys 125
His Tyr Met ProHis Tyr Met Pro
Phe Pro Asp LeuPhe Pro Asp Leu
160160
Leu Gln Ala AsnLeu Gln Ala Asn
175175
Pro Ser Val IlePro Ser Val Ile
190190
Leu GlnLeu Gln
Asp Arg 195Asp Arg 195
Tyr SerTyr Ser
Gly <210> 226 <211> 49 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>Gly <210> 226 <211> 49 <212> Protein <213> Artificial sequence <220>
<223> Описание искусственной последовательности полипептид <400> 226<223> Description of the artificial sequence polypeptide <400> 226
СинтетическийSynthetic
Val Tyr Val Gly Gly Leu 1 5Val Tyr Val Gly Gly Leu 1 5
Asn Met Glu Leu Gln AsnAsn Met Glu Leu Gln Asn
Ser Leu Leu Asp Gln Leu 35Ser Leu Leu Asp Gln Leu 35
Glu Ser Arg Val Leu Lys 10Glu Ser Arg Val Leu Lys 10
Lys Val Gln Leu Leu Glu 25Lys Val Gln Leu Leu Glu 25
Arg Lys Leu Gln Ala Met 40Arg Lys Leu Gln Ala Met 40
Tyr Thr Ala Gln 15Tyr Thr Ala Gln 15
Glu Gln Asn LeuGlu Gln Asn Leu
Val Ile Glu Ile 45Val Ile Glu Ile 45
SerSer
Claims (24)
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US62/854,238 | 2019-05-29 | ||
| US62/857,727 | 2019-06-05 | ||
| US63/008,569 | 2020-04-10 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EA046157B1 true EA046157B1 (en) | 2024-02-12 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| AU2020282352B2 (en) | Compositions and methods for selective gene regulation | |
| AU2018375192B2 (en) | Engineered DNA binding proteins | |
| KR102604159B1 (en) | Tissue-selective transgene expression | |
| US20230365963A1 (en) | Methods for treating neurological disease | |
| JP2022522196A (en) | Compositions and Methods for Treating Laminopathy | |
| CN112639108A (en) | Method of treating non-syndromic sensorineural hearing loss | |
| EA046157B1 (en) | COMPOSITIONS AND METHODS FOR SELECTIVE REGULATION OF GENE EXPRESSION | |
| TW202545971A (en) | Capsid polypeptides and methods of use thereof |