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DE19937241A1 - Nachweis des Toxin-Operons nhe aus Bacillus cereus durch PCR - Google Patents

Nachweis des Toxin-Operons nhe aus Bacillus cereus durch PCR

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DE19937241A1
DE19937241A1 DE19937241A DE19937241A DE19937241A1 DE 19937241 A1 DE19937241 A1 DE 19937241A1 DE 19937241 A DE19937241 A DE 19937241A DE 19937241 A DE19937241 A DE 19937241A DE 19937241 A1 DE19937241 A1 DE 19937241A1
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DE
Germany
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operon
nhe
bacillus cereus
toxin
bacillus
Prior art date
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Ceased
Application number
DE19937241A
Other languages
English (en)
Inventor
Per Einar Granum
Terje Lund
Kristin O'sullivan
Siegfried Scherer
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Individual
Original Assignee
Individual
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Publication date
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Publication of DE19937241A1 publication Critical patent/DE19937241A1/de
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Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria

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Abstract

Bacillus cereus ist ein ubiquitär verbreitetes Bakterium, welches aufgrund seiner Sporenbildung auch Pasteurisierungsprozesse überlebt und deshalb in vielen Lebensmitteln verbreitet ist. Manche Bacillus cereus Stämmen bilden Toxine, was zu Lebensmittelintoxikationen und Lebensmittelinfektionen führt. DOLLAR A Das NHE Enterotoxin kann bisher auf immunologischer Basis durch einen kommerziellen Nachweis detektiert werden. Nachteil ist der Zeitaufwand sowie die relativ schlechte Nachweisgrenze. Der Nachweis des nhe Operons ist bisher nicht möglich, weil die zugehörige Nukleinsäuresequenz unbekannt war. Die Nukleinsäuresequenz des für die Synthese des nicht-hemolytischen Enterotoxins NHE verantwortlichen Operons wird in dieser Erfindung offenbart. Aufgrund dieser Sequenz wurden PCR Primer entwickelt, durch welche die Präsenz des nhe Operons nachgewiesen werden kann. Auf diese Weise kann zwischen potentiell NHE-toxischen und nicht-toxischen Bacillus cereus Isolaten sehr schnell unterschieden werden. DOLLAR A Im Ausführungsbeispiel wird die Amplifikation des nhe Operons gezeigt sowie der Test von 19 Bacillus cereus Isolaten aus Lebensmittelvergiftungen auf nhe demonstriert. Davon waren 18 Stämme nhe-positiv. Die parallele Untersuchung dieser 19 Stämme durch einen immunologischen Test ergab volle Übereinstimmung mit dem hier beschriebenen PCR Test.

Description

Gebiet der Erfindung
Eine Aufgabe der Lebensmittelmikrobiologie ist der Nachweis der hygienischen Unbedenklichkeit von Mikroorganismen in Lebensmitteln. Der Hersteller von Lebensmitteln ist verpflichtet, nur gesundheitlich unbedenkliche Lebensmittel in Verkehr zu bringen. Zu diesem Zweck muß ausgeschlossen werden, daß Toxin­ bildner im Lebensmittel vorhanden sind. Der Nachweis von Toxinbildnern ist unter anderem dadurch möglich, daß die für die Toxine codierenden Gene durch PCR amplifiziert und detektiert werden. Voraussetzung dafür ist die Kenntnis der Nukleinsäuresequenz der Toxingene. In dieser Erfindung werden spezifische Primer für den Nachweis des nhe Toxinoperons von Bacillus cereus vorgestellt.
Stand der Technik
Bacillus cereus ist ein wichtiges Lebensmittelpathogen und verursacht zwei unterschiedliche lebensmittelbedingte Erkrankungen durch ein emetisches Toxin sowie durch Enterotoxine (Granum PE, Lund T, 1997, FEMS Microbiology Letters 157, 223-228). Enterotoxine verursachen Durchfallerkrankungen. Für die Präsenz von Enterotoxinen in Bacillus cereus sind Nachweismethoden auf immunolog­ ischer Basis verfügbar (Beecher D J, Wong A C L, 1994, Appl. Environ. Microbiol. 60, 4614-4616; Granum, PE and Lund, T, 1997, FEMS Microbiol. Letters 157, 223-228). Zwei Enterotoxine wurden auf DNS-Ebene charakterisiert: Das bceT Gen (Agata et al. 1995, Microbiology 141, 983-988) sowie das hemolytische hbl Gen (Heinrichs et al. 1993, Journal of Bacteriology 175, 6760-6766; Ryan PA et al. Journal of Bacteriology 179, 2551-2556). Ein PCR Nachweis für hblA ist publiziert (Mäntynen V, Lindström K, 1998, Applied and Environmental Microbiology 64: 1643-1639), ebenso für bceT (Granum PE et al. 1996, FEMS Microbiology Letters 141, 145-149). Das dritte von Bacillus cereus gebildete Enterotoxin ist das nicht-hämolytische NHE (Lund T, Granum PE, 1997, Microbiology 143, 3329-3336), dessen codierende DNS- Sequenz zur Publikation eingereicht ist (Granum PE et al. 1999, FEMS Microbiol.Lett., zur Publikation eingereicht am 7.6.99). Diese Sequenz bildet die Grundlage für den hier beschriebenen PCR-Nachweis.
Beschreibung der Erfindung
Der Stamm Bacillus cereus 1230-88 wurde aus einem durch Lebensmittel verur­ sachten Ausbruch in Norwegen isoliert (Granum et al. 1993, International Journal of Food Microbiology 117, 269-297). Drei von diesem Stamm gebildete Enterotoxinproteine mit der Größe von 45 kDa, 39 kDa und 105 kDa wurden isoliert und durch Edman-Abbau die N-terminalen Aminosäuresequenzen bestimmt. Diese dienten der Synthese von degenerierten Primern, durch welche zwei 1.3 bp und 4 bp lange DNA-Fragmente amplifiziert werden konnte. Die Sequenzierung dieser Fragmente ergab insgesamt die im Anhang wiedergegebene Nukleotid­ sequenz des nhe Operons. Das Operon codiert drei Proteine: NheA (41 kDa), NheB (39 kDa) und NheC (36 kDa) und ist flankiert von einem möglichen Promoter und einem möglichen Terminator (Abb. 1).
Die Sequenz des nhe Operons wurde mit den bekannten Sequenzen anderer Enterotoxinoperons verglichen. Es zeigte sich, daß Sequenzähnlichkeiten auftauchen, welche sich besonders auf bestimmte Motive konzentrieren. Aus dem Vergleich konnten spezifische Sequenzen für das nhe operon bestimmt und zugehörige Primer abgeleitet werden. Mit diesen Primern ist der Nachweis des nhe Operons möglich. Aus den Sequenzvergleichen können verschiedene Primer abgeleitet werden. Vier mögliche Primer sind:
45-3F: 5'acgttacaaacgttgaagtac
39-2F: 5'ccaatggtacacaatgggatc
39'-2R: 5'cgacttctgcttgtgctcctg
39-2R: 5'aagcctttcgtaagagttgc
Die Bindungsstellen dieser Primer sind in Abb. 2 wiedergegeben. Der Gebrauch dieser Primer ist in Abschnitt 5, Ausführungsbeispiel beschrieben.
Ausführungsbeispiel
Mit den unter Abschnitt 4 beschriebenen Primern wurden Amplifikations­ experimente durchgeführt. Dabei wurden zwei Primerpaare eingesetzt. Das Primerpaar 45-3F/39-2R ergibt ein Amplicon von 550 bp, das Primerpaar 39-2F­ /39'-2R ein Amplicon der Größe 1125 bp. Das Ergebnis eines Experimentes mit Bacillus cereus 0075-95 ist in Abb. 3 dargestellt. Die PCR-Bedingungen für beide Primer-Paare sind wie folgt: 95°C 1 min, (95°C 1 min, 45°C 1 min, 72°C, 1 min) × 30 cycles, 72°C 7 min, dann 4°C.
Insgesamt wurden 19 Bacillus cereus Stämme aus Lebensmittelvergiftungen untersucht. Von 19 untersuchten Stämmen waren 18 positiv für nhe mit beiden Primersystemem. Die Untersuchung mit dem immunologischen Test der Fa. Tecra ergab Übereinstimmung in allen Fällen.

Claims (5)

1. Verwendung der Primer 45-3F/39-2R und 2F/39'-2R zum Nachweis des Toxinoperons nhe oder einzelner Gene davon in Bacillus cereus.
2. Verwendung aller anderen, auf der in dieser Erfindung offenbarten Sequenz des nhe Operons beruhenden Primerkombinationen zum Nachweis des Toxinoperons nhe, oder einzelner Gene hiervon, in Bacillus cereus.
3. Verwendung von allen PCR-Primern, die auf der in dieser Erfindung offenbarten nhe Sequenz beruhen, zum Nachweis des Toxinoperons nhe oder einzelner Gene hiervon, in allen Arten der Bacillus cereus Gruppe, darunter Bacillus cereus, Bacillus weihenstephanensis, Bacillus mycoides, Bacillus thuringiensis und Bacillus anthracis.
4. Verwendung der unter Patentanspruch 1-3 genannten Primer in irgend einem kombinierten Nachweissystem, welches parallel auch andere Bacillustoxine erfasst.
5. Verwendung der in dieser Erfindung offenbarten Nukleinsäuresequenz für den Nachweis jeglicher Art des nhe Operons, oder einzelner Gene hieraus, z. B. auch durch DNA/DNA oder DNA/RNA Hybridisierungsgestützte Nachweissysteme.
DE19937241A 1999-08-06 1999-08-06 Nachweis des Toxin-Operons nhe aus Bacillus cereus durch PCR Ceased DE19937241A1 (de)

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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1508622A1 (de) * 2003-08-22 2005-02-23 Siegfried Prof. Dr. Scherer Nachweis des Peptidsynthase verantwortlich für die emetische Toxinproduktion in Bacillus cereus
EP1512740A1 (de) * 2002-05-17 2005-03-09 Bio Control Institute Limited Von bacillus cereus produzierte cereulid-synthase, diese codierendes gen und verfahren zum nachweis von cereulid

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5763226A (en) * 1995-02-17 1998-06-09 Wisconsin Alumni Research Foundation Bacillus cereus enterotoxin and method of use

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5763226A (en) * 1995-02-17 1998-06-09 Wisconsin Alumni Research Foundation Bacillus cereus enterotoxin and method of use

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1512740A1 (de) * 2002-05-17 2005-03-09 Bio Control Institute Limited Von bacillus cereus produzierte cereulid-synthase, diese codierendes gen und verfahren zum nachweis von cereulid
EP1512740A4 (de) * 2002-05-17 2005-09-21 Bio Control Inst Ltd Von bacillus cereus produzierte cereulid-synthase, diese codierendes gen und verfahren zum nachweis von cereulid
US7264959B2 (en) 2002-05-17 2007-09-04 Bio Control Institute Limited Synthase of cereulide produced by Bacillus cereus, gene encoding the same and method of detecting cereulide
EP1508622A1 (de) * 2003-08-22 2005-02-23 Siegfried Prof. Dr. Scherer Nachweis des Peptidsynthase verantwortlich für die emetische Toxinproduktion in Bacillus cereus

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