CN119662581B - 羰基还原酶BsCR突变体、工程菌及合成克唑替尼手性中间体的应用 - Google Patents
羰基还原酶BsCR突变体、工程菌及合成克唑替尼手性中间体的应用Info
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Abstract
本发明公开了一种羰基还原酶BsCR突变体、工程菌及合成克唑替尼手性中间体的应用,本发明羰基还原酶BsCR突变体的活性和稳定性明显提高。本发明所获得的突变体比酶活与野生型BsCR相比显著提高,其中BsCRM2突变体在45℃半衰期为52.1h,相比于母本WT‑BsCR提升了2.9h,比活性与野生型BsCR相比提高了87.7倍,最高底物投料量可达到100g/L 2,6‑二氯‑3‑氟苯乙酮(CFA),产物浓度随反应时间的延长而逐渐增加,6h内绝大部分底物可被转化(底物转化率为92.06%),产物e.e.值始终保持在99.5%以上,时空产率为368.24g/L/d。
Description
(一)技术领域
本发明属于生物制药领域,涉及一种羰基还原酶BsCR突变体、工程菌及催化合成手性克唑替尼中间体的应用。
(二)背景技术
克唑替尼是第一代间变性淋巴瘤激酶(Anaplastic lymphoma kinase,ALK)抑制剂,能有效提高ALK阳性非小细胞肺癌(NSCLC)患者的生存时间。(S)-2,6-二氯-3-氟苯乙醇((S)-CFL)是合成克唑替尼的关键手性中间体,其合成通常是采用化学法不对称还原2,6-二氯-3-氟苯乙酮(CFA)。然而,化学不对称还原工艺通常反应条件苛刻,使用金属催化剂成本高且产物存在金属污染风险。生物催化具有其反应条件温和、催化效率高、立体选择性好等优势,越来越多被应用于制药工业。发展CFA生物不对称还原制备(S)-CFL技术符合绿色化学发展方向。
羰基还原酶(carbonyl reductase,CRs)属于NAD(P)H依赖型氧化还原酶超家族,能不对称还原酮、醛、酮酸(酯)生成醇化合物。自然界中的野生型(WT)羰基还原酶往往对人工合成的非天然化合物表现出低活性、低选择性和低稳定性,难以满足工业应用的技术要求,需要利用酶工程技术改造天然酶的结构、强化其工业属性才能应用于规模化生产。
本发明通过对羰基还原酶实施分子改造,获得具有工业属性的羰基还原酶突变体,构建高时空产率的(S)-CFL生物制造技术。
(三)发明内容
本发明目的是提供一种来源于B.subtilis的羰基还原酶BsCR突变体、重组质粒、重组基因工程菌及在不对称还原CFA合成克唑替尼关键手性中间体(S)-CFL中的应用,通过酶工程改造,获得了活性显著提升的羰基还原酶有益突变体。进一步通过组合突变获得具有高活性、高稳定性的超级突变体,其中突变体BsCR-I178L/T179L(BsCRM2)的活性较WT-BsCR显著提升。本发明有效解决了鲁棒性S-选择性还原CFA酶元件缺乏、天然BsCR活性不高、稳定性差等问题。此外,本发明进一步优化生物催化反应的工艺参数,构建了优选的BsCRM2催化CFA对映选择性还原合成(S)-CFL工艺,有效提高了(S)-CFL生物制造的时空产率。
本发明采用的技术方案是:
第一方面,本发明提供一种羰基还原酶BsCR突变体,所述羰基还原酶BsCR突变体是将SEQ ID No.2所示来源于B.subtilis的羰基还原酶BsCR氨基酸序列第130位点、第178位点、第179位点或第182位点进行单点突变或多位点组合突变获得的。本发明所述羰基还原酶BsCR编码基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
进一步,优选所述的羰基还原酶BsCR突变体是将SEQ ID No.2所示氨基酸序列突变为下列之一:(1)第130位点谷氨酰胺突变为亮氨酸,Q130L;(2)第178位异亮氨酸突变为亮氨酸,I178L;(3)第179位的苏氨酸突变为亮氨酸,T179L;(4)第182位赖氨酸突变为谷氨酸,K182E;(5)上述(1)到(4)中的单点突变任意两两组合获得的双突变;(6)上述(1)到(4)中的单点突变任意三三组合获得的三突变。
进一步,更优选所述的羰基还原酶BsCR突变体是将SEQ ID No.2所示氨基酸序列突变为下列之一:(1)第179位的苏氨酸突变为亮氨酸,T179L;(2)第178位异亮氨酸突变为亮氨酸、第179位的苏氨酸突变为亮氨酸(I178L/T179L)。
本发明还涉及所述羰基还原酶BsCR突变体编码基因、重组表达载体、以及重组基因工程菌。所述重组表达载体优选载体pET28a(+),所述重组基因工程菌优选宿主菌E.coliBL21(DE3)。
第二方面,本发明还涉及所述羰基还原酶BsCR突变体在不对称还原CFA制备克唑替尼关键手性中间体(S)-CFL中的应用。所述应用的方法为:羰基还原酶BsCR突变体菌株经诱导培养获得的湿菌体为催化剂,以CFA为底物,以葡萄糖为辅底物,采用pH 4.0~9.0的缓冲液(优选pH 6.0、100mM的磷酸钠缓冲液(PB))为反应介质构成反应体系,30~80℃(优选60℃)、800~1000rpm条件下进行反应,反应结束,反应液经分离纯化,反应液使用乙酸乙酯萃取,获得(S)-CFL化合物。
进一步,所述前手性CFA结构如下所示:
进一步,所述的反应体系中,底物加入终浓度1~100g/L;葡萄糖添加量为43.5~217.4g/L,葡萄糖与底物摩尔比为1~5:1(优选3:1);催化剂用量以湿菌体重量计为10~50g/L,以湿菌体干重计为2~10g DCW/L(优选10g DCW/L)。
进一步,所述的反应体系中添加二甲基亚砜为助溶剂,二甲基亚砜体积加入浓度为10-80%,优选50%。
进一步,所述湿菌体按如下方法制备:将携带羰基还原酶BsCR突变体基因的基因工程菌接种到含有终浓度50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃培养10h,获得种子液;将种子液以体积浓度1%(V/V)的接种量接种到新鲜的含终浓度50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃、180rpm培养至OD600=0.6~0.8,再向培养液中加入终浓度为0.15mM异丙基β-D-硫代半乳糖苷(Isopropylβ-D-thiogalactoside,IPTG),20℃培养16h后,4℃、8000rpm离心10min,获得湿菌体。
进一步,所述BsCR突变体纯化酶按如下方法制备:(1)细胞裂解液:将湿菌体按50gWCW(湿菌体)/L缓冲液重悬于含300mM氯化钠的pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液中,菌悬液在冰水混合物上超声破碎15min,超声破碎条件:功率250W,破碎1s、暂停1s,取破碎混合液,获得细胞裂解液;(2)细胞裂解液在8000rpm、4℃下离心10min,弃沉淀,上清液即为粗酶液;粗酶液经0.22μm滤膜微滤后使用亲和层析法进行蛋白纯化,具体方法为:将镍-琼脂糖凝胶亲和层析填料加入至层析柱中,待充分沉降后使用含300mM氯化钠的pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液平衡层析柱;上样;使用含300mM氯化钠和50mM咪唑的pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液淋洗5个柱体积,去除未结合杂蛋白;再使用含300mM氯化钠和100mM咪唑的pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液洗脱5个柱体积,收集含目的酶蛋白的洗脱液;洗脱液转移至截留分子量为30kDa的超滤离心管中,4℃、3000rpm将超滤离心管中的洗脱液浓缩至原体积的3%,再加入5个柱体积的pH7.0、20mM磷酸钠缓冲液,继续浓缩至原体积的3%,如此重复三次以去除酶液中的咪唑,得到的浓缩液即为纯酶液。
本发明羰基还原酶BsCR及羰基还原酶BsCR突变体碱基序列全长均为858bp,从第一个碱基起至第858个碱基止,起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,编码285个氨基酸。
本发明所述羰基还原酶BsCR突变体的获取是采用蛋白质工程改造获得,最终获得了4个有益突变体Q130L、T179L、I178L、K182E。通过进一步的迭代组合突变,获得了最佳突变体BsCRM2,将获得的突变体质粒以热击的方式转入E.coli BL21(DE3)感受态细胞,获得重组工程菌。对获得菌株进行接种、转接、诱导培养、菌体回收,利用重悬菌液催化CFA还原,制备(S)-CFL。本发明羰基还原酶BsCR突变体的接种、转接、诱导培养、菌体回收,培养基制备可为本领域任何可使本发明菌体生长的培养基,优选LB培养基:蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,氯化钠10g/L,水溶解。培养方法和培养条件没有特殊限制,培养方法和条件可以根据宿主类型和培养方法等因素的不同,按本领域基本知识进行适当的选择。
与现有技术相比,本发明有益效果主要体现在:
(1)羰基还原酶BsCR突变体的活性明显提高。
本发明所获得的突变体比酶活较WT-BsCR显著提高,其中BsCRM2突变体比酶活比WT-BsCR提高了87.7倍,最大底物投料量100g/L CFA,产物浓度随着时间的延长而逐渐增加,6h内绝大部分底物可被转化(底物转化率为92.06%),产物eep值始终保持在99.5%以上,时空产率为368.24g/L/d。
(2)羰基还原酶BsCR突变体的稳定性得到提高。
与野生型BsCR相比,本发明构建的突变体稳定性均有提高,其中BsCRM2在45℃半衰期(t1/2)为52.1h,相比于母本WT-BsCR提升了2.9h。因此,突变体BsCRM2展示出良好的工业应用前景。
(四)附图说明
图1是以葡萄糖为辅底物,羰基还原酶BsCR及其突变体催化CFA不对称还原制备(S)-CFL的反应示意图。
图2为CFA、(S)-CFL和(R)-CFL的标准品分析气相色谱图。
图3为气相色谱法建立的(S)-CFL检测标准曲线。
图4为WT-BsCR及其突变体SDS-PAGE凝胶电泳图。M,蛋白质标准品;泳道1,E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)(阴性对照);泳道2,WT-BsCR粗酶液;泳道3,BsCRM1粗酶液;泳道4,BsCRM2粗酶液;泳道5,WT-BsCR纯化酶;泳道6为BsCRM1纯化酶;泳道7,BsCRM2纯化酶。
图5为温度对BsCRM2酶活的影响。
图6为pH值对BsCRM2酶活的影响。
图7为葡萄糖添加量对BsCRM2酶活的影响。
图8为助溶剂种类对BsCRM2酶活的影响。
图9为助溶剂DMSO用量对BsCRM2酶活的影响。
图10为突变体BsCRM2以葡萄糖为辅底物不对称还原CFA合成(S)-CFL的反应时间进程曲线。
(五)具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:
本发明所用LB液体培养基:蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,氯化钠10g/L,水溶解。LB固体培养基是LB液体培养基中添加18g/L琼脂。
实施例1:WT-BsCR纯化酶制备
(1)野生型BsCR基因工程菌构建
人工合成GenBank中来源于B.subtilis羰基还原酶的基因序列(GenBank No.NC_000964.3),即WT-BsCR基因(核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,氨基酸序列如SEQ ID No.2所示),连接到载体pET28a(+)的Nde I和Xho I酶切位点之间,构建重组表达载体,并将此重组表达载体转入宿主菌E.coli BL21(DE3),获得WT-BsCR基因工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr。
SEQ ID No.2
MANQKKKTLPPQHQNQQPGFEYLMDPRPVFDKPKKAKKLEGKTAIITGGDSGIGRAVSVLFAKEGANVVIVYLNEHQDAEETKQYVEKEGVKCLLIAGDVGDEAFCNDVVGQASQVFPSIDILVNNAAEQHVQPSIEKITSHQLIRTFQTNIFSMFYLTKAVLPHLKKGSSIINTASITAYKGNKTLIDYSATKGAIVTFTRSLSQSLVQQGIRVNAVAPGPIWTPLIPASFAAKDVEVFGSDVPMERPGQPVEVAPSYLYLASDDSTYVTGQTIHVNGGTIVNG。
(2)湿菌体制备
将步骤(1)构建的野生型羰基还原酶基因工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr接种到含终浓度50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃培养10h,获得种子液;将种子液以体积浓度1%(V/V)的接种量接种到新鲜的含终浓度50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃、180rpm培养至OD600=0.6~0.8,再向培养液中加入终浓度为0.15mM IPTG,20℃培养16h后,4℃、8000rpm离心10min,获得湿菌体。
(3)酶纯化
将步骤(2)的湿菌体细胞按照50g WCW/L缓冲液的量分散于pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液中进行重悬,菌悬液在冰水混合物上超声破碎15min,超声破碎条件:功率250W,破碎1s,暂停1s,获得细胞裂解液,用于后续酶纯化。
酶纯化操作如下:细胞裂解液在8000rpm、4℃下离心10min,弃沉淀、收集上清液。上清液经微滤(滤膜:0.22μm)后得到透过液,透过液使用亲和层析法进行蛋白纯化,具体方法为:将镍-琼脂糖凝胶亲和层析填料(3mL)平铺加入层析柱中,待充分沉降后使用15mL含300mM氯化钠的pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲溶液平衡层析柱;上样;使用含50mM咪唑、300mM氯化钠的pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液淋洗5个柱体积,去除未结合杂蛋白;再使用15mL含100mM咪唑、300mM氯化钠的pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液洗脱5个柱体积,收集含目标酶蛋白的洗脱液;洗脱液转移至截留分子量为30kDa的超滤离心管中,4℃、3000rpm离心,浓缩洗脱液至500μL,再加入15mL pH 7.0、20mM磷酸钠缓冲液,继续浓缩至500μL,如此重复三次以去除酶液中的咪唑,得到的浓缩液即为纯酶液,凝胶电泳见图4。
(4)酶活测定
酶活单位(U)定义为:在最适条件下,每分钟每生成1微摩尔(S)-CFL所需的酶量定义为一个酶活单位,U。比酶活定义为每毫克酶蛋白所具有的活力单位数,U/mg。
酶活检测条件:1mM还原型烟酰胺单核苷酸(NMNH),适量纯酶液(酶蛋白质量为100μg),1mM底物CFA,体积浓度5% DMSO,底物先用DMSO溶解后投料,pH 6.0、100mM磷酸钠缓冲液补至终体积为500μL,在60℃、1000rpm下反应30min,采用安捷伦8860高效气相色谱检测底物的消耗量和产物生成量。
底物转化率、产物得率及产物e.e.值以及得率通过安捷伦8860高效气相色谱仪检测:GC(CYCLOSIL-B,30m×0.25mm,0.25μm)。进样器和检测器都设置在250℃,将柱温箱温度设定在155℃并保持15min,分流比为15:1(V/V),进样量为2μL,其他条件为默认检测条件。CFA、(S)-CFL及(R)-CFL的标准品气相检测图谱示于图2,(S)-CFL气相色谱法检测标准曲线示于图3。
实施例2:WT-BsCR突变体位点的选择及单位点突变体的构建
1、WT-BsCR突变体位点的选择
使用对接软件YASARA将底物CFA对接到WT-BsCR活性口袋内,选取与底物距离为范围内氨基酸残基,这些氨基酸最有可能影响酶促反应的选择性和活性,在排除保守的催化三联体氨基酸残基(S177、Y190、K194)后,选择Q130、I178、T179、K182作为考察突变位点。
2、Q130位饱和突变
(1)Q130位饱和突变流程:提取实施例1野生型羰基还原酶基因工程菌E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)-bscr的质粒pET28a(+)-bscr,利用表1中的引物进行PCR扩增将130位点谷氨酰胺突变成其它19种氨基酸,将PCR产物经Dpn I内切酶消化后,转化至E.coliBL21(DE3)感受态细胞,将转化子涂布至含50μg/mL卡那霉素的LB固体培养基,在37℃培养12h。然后挑取单克隆并转接到10mL含50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,在37℃、200rpm培养10h,收集菌液、提取质粒,测序验证突变。
表1BsCR130位点定点饱和突变引物设计
注:NDT,代表简并密码子;AHN,代表与NDT配对的简并密码子。
PCR反应体系(25μL):0.5μL正向引物(100μM),0.5μL反向引物(100μM),12.5μL 2×Phanta缓冲液,0.5μL dNTP混合物(各10mM),0.5μL质粒模板,0.5μL DNA聚合酶和10μL超纯水。根据Phanta Super-Fidelity DNA聚合酶操作手册设置PCR程序如下:95℃预变性5min,然后30个循环(95℃变性15s,55-65℃退火15s,72℃延伸10s),72℃终延伸10min,16℃保温。
(2)突变体的筛选
突变体筛选反应体系:50g/L步骤(1)制备的各个湿菌体,10g/L CFA,80g/L葡萄糖,反应介质为pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液,并添加10%(V/V)的DMSO作为助溶剂,构成10mL反应体系,在60℃、1000rpm条件下反应4h后,移取1mL反应液,加入1mL乙酸乙酯进行萃取。乙酸乙酯层经离心后使用0.22μm滤膜微滤处理,透过液采用实施例1气相色谱检测产物、底物浓度、计算底物转化率、酶比活力和立体选择性,结果示于表2。每个突变体表征设置3个重复。通过对12个突变体的活性检测,筛选确定最佳突变体为E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L,保存于-80℃冰箱。
表2Q130位点突变体催化性能
注:ND,表示检测不到酶活。
3、T179位饱和突变
(1)T179位饱和突变流程:提取实施例1野生型羰基还原酶基因工程菌E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)-bscr的质粒pET28a(+)-bscr,利用表3中的引物进行PCR扩增将179位点苏氨酸突变成其它19种氨基酸,将PCR产物经Dpn I内切酶消化后,转化至E.coli BL21(DE3)感受态细胞,将转化子涂布至含50μg/mL卡那霉素的LB固体培养基,在37℃培养12h。然后挑取单克隆并转接到10mL含50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,在37℃、200rpm培养10h,收集菌液、提取质粒,并测序验证突变。
表3BsCR179位点定点饱和突变引物设计
注:NDT,代表简并密码子;AHN,代表与NDT配对的简并密码子。
PCR反应体系(25μL):0.5μL正向引物(100μM),0.5μL反向引物(100μM),12.5μL 2×Phanta缓冲液,0.5μL dNTP混合物(各10mM),0.5μL质粒模板,0.5μL DNA聚合酶和10μL超纯水。根据Phanta Super-Fidelity DNA聚合酶操作手册设置PCR程序如下:95℃预变性5min,然后30个循环(95℃变性15s,55~65℃退火15s,72℃延伸10s),72℃终延伸10min,16℃保温。
(2)突变体的筛选
突变体筛选反应体系:50g/L步骤(1)制备的各个湿菌体,10g/L CFA,80g/L葡萄糖,反应介质为pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液,并添加10%(V/V)的DMSO作为助溶剂,构成10mL反应体系,在60℃、1000rpm条件下反应4h后,移取1mL反应液,加入1mL乙酸乙酯进行萃取。乙酸乙酯层经离心后使用0.22μm滤膜微滤处理,透过液采用实施例1气相色谱检测产物、底物浓度、计算底物转化率、酶比活力和立体选择性,结果示于表4。每个突变体表征设置3个重复。通过对12种突变体的活性检测,筛选确定最佳突变体为E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-T179L,保存于-80℃冰箱。
表4T179位点突变体催化性能
注:ND,表示检测不到酶活。
4、I178位饱和突变
(1)I178位饱和突变流程:提取实施例1野生型羰基还原酶基因工程菌E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)-bscr的质粒pET28a(+)-bscr,利用表5中的引物进行PCR扩增将178位点异亮氨酸突变成其它19种氨基酸,将PCR产物经Dpn I内切酶消化后,转化至E.coliBL21(DE3)感受态细胞,将转化子涂布至含50μg/mL卡那霉素的LB固体培养基,在37℃培养12h。然后挑取单克隆并转接到10mL含50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,在37℃、200rpm培养10h,收集菌液、提取质粒,并测序验证突变。
表5BsCR178位点定点饱和突变引物设计
注:NDT,代表简并密码子;AHN,代表与NDT配对的简并密码子。
(2)突变体的筛选
突变体筛选反应体系:50g/L步骤(1)制备的各个湿菌体,10g/L CFA,80g/L葡萄糖,反应介质为pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液,并添加10%(V/V)的DMSO作为助溶剂,构成10mL反应体系,在60℃、1000rpm条件下反应4h后,移取1mL反应液,加入1mL乙酸乙酯进行萃取。乙酸乙酯层经离心后使用0.22μm滤膜微滤处理,透过液采用实施例1气相色谱检测产物、底物浓度、计算底物转化率、酶比活力和立体选择性,结果示于表6。每个突变体表征设置3个重复。通过对12种突变体的活性检测,筛选确定最佳突变体为E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-I178L,保存于-80℃冰箱。
表6I178位点突变体催化性能
注:ND,表示检测不到酶活。
5、K182位饱和突变
(1)K182位饱和突变流程:提取实施例1野生型羰基还原酶基因工程菌E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)-bscr的质粒pET28a(+)-bscr,利用表7中的引物进行PCR扩增将182位点赖氨酸突变成其它19种氨基酸,将PCR产物经Dpn I内切酶消化后,转化至E.coli BL21(DE3)感受态细胞,将转化子涂布至含50μg/mL卡那霉素的LB固体培养基,在37℃培养12h。然后挑取单克隆并转接到10mL含50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,在37℃、200rpm培养10h,收集菌液、提取质粒,并测序验证突变。
表7BsCR182位点定点饱和突变引物设计
注:NDT,代表简并密码子;AHN,代表与NDT配对的简并密码子。
(2)突变体的筛选
突变体筛选反应体系:50g/L步骤(1)制备的各个湿菌体,10g/L CFA,80g/L葡萄糖,反应介质为pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液,并添加10%(V/V)的DMSO作为助溶剂,构成10mL反应体系,在60℃、1000rpm条件下反应4h后,移取1mL反应液,加入1mL乙酸乙酯进行萃取。乙酸乙酯层经离心后使用0.22μm滤膜微滤处理,透过液采用实施例1气相色谱检测产物、底物浓度、计算底物转化率、酶比活力和立体选择性,结果示于表8。每个突变体表征设置3个重复。通过对12种突变体的活性检测,筛选确定最佳突变体为E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-K182E,保存于-80℃冰箱。
表8K182位点突变体催化性能
注:ND,表示检测不到酶活。
实施例3:组合突变体的构建
提取实施例2工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-I178L、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-T179L、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-K182E的质粒为模板,利用表9中的引物,采用实施例2方法和条件进行PCR扩增,分别构建工程菌E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/I178L、E.coliBL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/T179L、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/K182E、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-I178L/T179L、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-I178L/K182E、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-T179L/K182E、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/I178L/T179L、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/I178L/K182E、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/T179L/K182E、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-I178L/T179L/K182E、E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-Q130L/I178L/T179L/K182E。保存于-80℃冰箱。采用实施例1方法制备各个突变体的湿菌体。
表9BsCR组合突变引物设计
采用实施例2方法和条件测试底物转化率和立体选择性,筛选确定最佳突变体为E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-I178L/T179L,记为突变体BsCRM2;E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-bscr-/T179L则记为突变体BsCRM1,保存于-80℃冰箱。
表10突变对BsCR立体选择性和相对活力的影响
注:ND,表示检测不到酶活。
实施例4:突变体的诱导表达
将实施例3获得的E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-BsCRM1和E.coli BL21(DE3)/pET28a(+)-BsCRM2分别接种到含有终浓度50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃培养10h,以体积浓度1.5%(V/V)的接种量接种到新鲜的含有终浓度50μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃、180rpm培养2h,再向培养液中加入终浓度为0.15mM IPTG,20℃培养15h后,4℃、8000rpm离心10min,沉淀用0.9%(w/V)生理盐水洗涤两次,获得BsCRM1湿菌体细胞和BsCRM2湿菌体细胞。以上获得的细胞含有相应的蛋白,可用于酶的纯化,也可用于催化合成(S)-CFL。
实施例5:突变体酶蛋白纯化及酶活测定
分别按照50g湿菌体/L缓冲液的用量加入含300mM氯化钠的pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液进行重悬,在冰水混合物上超声破碎15min,超声破碎条件:功率为250W,破碎1s、暂停1s,破碎混合液即为细胞裂解液。细胞裂解液分别在8000rpm、4℃下离心10min,弃沉淀,收集上清液即为粗酶液,上清液同实施例1方法进行蛋白纯化,分别获得突变体BsCRM1纯酶液和突变体BsCRM2纯酶液,凝胶电泳见图4。WT-BsCR、BsCRM1及BsCRM2的酶活检测方法同实施例1,酶活检测数据见表11。其中,BsCRM2相较于WT-BsCR提升了约87.7倍。
表11BsCR及突变体的立体选择性和比活力
实施例6:BsCR及突变体的半衰期测定
(1)半衰期的测定
半衰期(t1/2)测定反应体系:将实施例1和实施例5中得到的WT-BsCR、BsCRM1及BsCRM2纯化酶稀释至蛋白浓度1μg/μL,每管分装200μL,置于45℃水浴中保温,每隔4h取出一管,待温度恢复至室温,按照实施例1的酶活检测体系检测保温不同时长的残余酶活。
(2)半衰期的拟合
半衰期(t1/2)根据热失活方程计算:At=A0e-kd t。在热失活方程中,kd为失活动力学常数,A0和At分别代表初始酶活和t时刻的酶活。根据热失活方程,以ln(At/A0)为纵坐标,取样时间t为横坐标,使用Origin进行绘图,纵坐标ln(At/A0)=-ln2时的t值即为半衰期t1/2。WT-BsCR及突变体的半衰期见表12。
表12BsCR及突变体在45℃的半衰期
实施例7:BsCRM2最适反应温度、pH、葡萄糖浓度、DMSO体积浓度
1、最适反应温度
在10mL的pH 7.0、100mM PB缓冲液中,加入50g/L的实施例4方法制备的BsCRM2湿菌体细胞,20g/L的底物CFA,80g/L的葡萄糖,10%(V/V)的DMSO,在30~80℃(30℃,35℃,40℃,45℃,50℃,55℃,60℃,65℃,70℃,75℃,80℃)、800rpm反应30min,根据实施例1方法检测不同温度下的酶活,优化BsCRM2的催化温度,以最高酶活为100%计算相对酶活,结果示于图5。结果表明,温度优化范围为30~80℃,通过优化确定BsCRM2最适催化温度为60℃。
2、最适反应pH
分别采用pH4.0~6.0醋酸钠缓冲液、pH6.0~8.0磷酸钠缓冲液、pH7.0~9.0Tris-HCl缓冲液进行突变体最适反应pH的筛选。
反应体系:在10mL的不同pH(pH 4.0,5.0,6.0,7.0,8.0,9.0)、100mM缓冲液中,加入50g/L的实施例4方法制备的BsCRM2湿菌体细胞,20g/L的底物CFA,80g/L的葡萄糖,10%(V/V)的DMSO,在60℃、800rpm反应30min,根据实施例1方法检测不同pH下的酶活,优化BsCRM2的催化反应pH值,以pH 4.0的酶活为100%计算相对酶活,结果示于图6。pH优化范围为4.0~9.0,通过优化确定BsCRM2最适催化pH值为6.0。
3、最适葡萄糖浓度
在10mL的pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液中,加入50g/L的实施例4方法制备的BsCRM2湿菌体细胞,50g/L的底物CFA,葡萄糖与底物的摩尔比(1:1,2:1,3:1,4:1,5:1),10%(V/V)的DMSO,在60℃、800rpm反应30min,根据实施例1方法检测不同温度下的酶活,优化BsCRM2的辅底物葡萄糖浓度,以1:1的酶活为100%计算相对酶活,结果示于图7。结果表明,辅底物葡萄糖的考察范围为1~5倍底物摩尔量,通过优化确定BsCRM2最适反应葡萄糖浓度为3倍底物摩尔量。
4、反应助溶剂
在9mL的pH 6.0、100mM磷酸钠缓冲液中,加入50g/L的实施例4方法制备的BsCRM2湿菌体细胞和80g/L的葡萄糖,体积终浓度10%不同有机溶剂(DMSO、DMF、乙腈、甲醇、乙醇、异丙醇),底物先用有机溶剂溶解后加入反应体系,使底物终浓度为20g/L,在60℃、800rpm反应30min,根据实施例1方法检测不同助溶剂下的酶活,不添加有机溶剂的酶活定义为100%,计算相对酶活,结果示于图8,BsCRM2的最佳反应助溶剂为DMSO。
5、最适DMSO浓度
在10mL的pH 7.0、100mM磷酸钠缓冲液中,加入50g/L的实施例4方法制备的BsCRM2湿菌体细胞,80g/L的葡萄糖,不同体积浓度(V/V)的DMSO(10%,20%,30%,40%,50%,60%,70%,80%),底物先用有机溶剂溶解后加入反应体系,使底物终浓度为20g/L,在60℃、800rpm反应30min,根据实施例1方法检测不同温度下的酶活,优化BsCRM2的助溶剂DMSO浓度,以不添加有机溶剂的对照酶活为100%计算相对酶活,结果示于图9。结果表明,在助溶剂DMSO 10%-80%(v/v)浓度范围内,BsCRM2最适反应DMSO浓度为50%(V/V)。
实施例8:BsCRM2不对称还原CFA合成(S)-CFL
先将按实施例4方法制备的BsCRM2湿菌体细胞用pH 6.0、100mM的磷酸钠缓冲液重悬,反应体系中BsCRM2的湿菌体添加量以干重计为10g DCW/L,底物CFA通过流加补料使总投料量为50g/L,加入3倍底物摩尔量的葡萄糖,以pH 6.0、100mM的磷酸钠缓冲液为反应介质,添加50%(V/V)的DMSO,构成50mL反应体系,在60℃、pH 6.0、800rpm条件下反应5~8h,每隔1h取样,采用实施例1的方法检测(S)-CFL的浓度,计算时空产率。同样条件下,将底物加入浓度改为100g/L,结果见图10所示。
时空产率计算公式:m为生成的产物质量(g);t为反应时间(d);V为反应液体积(L)。BsCRM2能催化生成47.26g/L的产物,同等条件下,当底物浓度为100g/L时,在6h内能达到反应终点,并生成92.06g/L的产物,时空产率为368.24g/L/d。
表13BsCRM2催化不同底物浓度时的时空产率
a,S/C表示底物与湿菌体干重投料质量比。
Claims (8)
1.一种羰基还原酶BsCR突变体,其特征在于,所述的羰基还原酶BsCR突变体是将SEQID No.2所示氨基酸序列突变为下列序列:第178位异亮氨酸突变为亮氨酸、第179位的苏氨酸突变为亮氨酸。
2.一种含权利要求1所述羰基还原酶BsCR突变体编码基因的重组基因工程菌。
3.一种权利要求1所述羰基还原酶BsCR突变体在不对称还原2,6-二氯-3-氟苯乙酮制备克唑替尼关键手性中间体中的应用。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述应用的方法为:以羰基还原酶BsCR突变体的重组基因工程菌经诱导培养获得的湿菌体为催化剂,以2,6-二氯-3-氟苯乙酮为底物,以葡萄糖为辅底物,采用pH 4.0-9.0的缓冲液为反应介质构成反应体系,30~80℃、800-1000 rpm条件下进行反应,反应结束,反应液经分离纯化,反应液使用乙酸乙酯萃取,获得(S)-2,6-二氯-3-氟苯乙醇。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的反应体系中,底物加入终浓度1~100g/L;葡萄糖添加量与底物摩尔比为1~5:1;催化剂用量以湿菌体重量计为10~50 g WCW/L,以湿菌体干重计为2~10 g DCW/L。
6.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的反应体系中添加二甲基亚砜为助溶剂,二甲基亚砜体积加入浓度为10-80%。
7.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述反应介质为pH 6.0、100 mM的磷酸钠缓冲液。
8.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述湿菌体按如下方法制备:将含羰基还原酶BsCR突变体基因的工程菌接种到含有终浓度50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃培养10h,获得种子液;将种子液以体积浓度1%的接种量接种到新鲜的含终浓度50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃、180 rpm培养至OD600=0.6~0.8,再向培养液中加入终浓度为0.15 mM异丙基β-D-硫代半乳糖苷,20℃培养16 h后,4℃、8000 rpm离心10 min,获得湿菌体。
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