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CN116710430A - 用于恢复突变p53功能的方法和化合物 - Google Patents

用于恢复突变p53功能的方法和化合物 Download PDF

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CN116710430A
CN116710430A CN202180061006.8A CN202180061006A CN116710430A CN 116710430 A CN116710430 A CN 116710430A CN 202180061006 A CN202180061006 A CN 202180061006A CN 116710430 A CN116710430 A CN 116710430A
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CN
China
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substituted
unsubstituted
compound
hydrogen
alkyl
Prior art date
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Pending
Application number
CN202180061006.8A
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English (en)
Inventor
吴平
鲁米尔·多米尼克
李宏举
布鲁斯·法尔
安德鲁·古德
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PMV Pharmaceuticals Inc
Original Assignee
PMV Pharmaceuticals Inc
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Publication date
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Abstract

致癌基因和肿瘤抑制因子中的突变有助于癌症的显现和进展。本公开描述了用以恢复p53突变体的野生型功能的化合物和方法。本公开的化合物能够结合至突变p53，并且恢复所述p53突变体结合DNA以及激活涉及于肿瘤抑制中的下游效应物的能力。所公开的化合物能够用于降低含有p53突变的癌症的进展。

Description

用于恢复突变p53功能的方法和化合物
交叉引用
本申请要求2020年5月12日提交的美国临时申请第63/023,601号的权益，所述美国临时申请通过引用并入本文。
序列表
本申请含有已以ASCII格式电子提交，并且在此通过引用以它的整体并入本文的序列表。2021年5月10日创建的所述ASCII副本名为44727706201SL_1.txt，并且大小是2,540字节。
背景技术
癌症，即细胞增殖不受控制，是一种特征在于肿瘤形成、生长，并且在一些情况下转移的多因素疾病。可通过精巧的肿瘤抑制网络阻止携带激活的致癌基因、受损的基因组或其他促进癌症的改变的细胞复制。这个肿瘤抑制网络的一种中心组分是p53，其是细胞中最强力肿瘤抑制因子中的一者。p53的野生型构象与突变构象两者均牵涉于癌症的进展中。
援引并入
本申请中引用的每个专利、出版物和非专利文献在此通过引用以它的整体并入本文，就好像各自单独地通过引用并入本文一样。
发明内容
在一些实施方案中，本文提供了一种化合物，所述化合物包含：吲哚基团，其中所述吲哚基团包含：a)在所述吲哚基团的1位处的卤代烷基；b)在所述吲哚基团的2位处的第一取代基，其中所述第一取代基是环状基团；和c)第二取代基，其中所述第二取代基被至少卤基-取代；或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文提供了一种包含吲哚基团的化合物，其中所述吲哚基团包含：a)在所述吲哚基团的3位处的被取代的或未被取代的非环状基团；和b)在所述吲哚基团的2位处的被取代的或未被取代的环状基团，其中相对于在不存在所述化合物下p53突变体的生物活性构象的稳定性，所述化合物增加所述p53突变体的生物活性构象的稳定性；或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文提供了一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-A是被取代的或未被取代的环；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文提供了一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Ar是未被取代的或被取代的芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-n是0、1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-每个Rx和R1独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文提供了一种诱导细胞的凋亡的方法，所述方法包括使所述细胞与治疗有效量的下式化合物接触：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Ar是未被取代的或被取代的芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-n是0、1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-每个Rx和R1独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文提供了一种治疗癌症的方法，所述方法包括向有需要的对象施用治疗有效量的化合物，其中所述化合物具有下式：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Ar是未被取代的或被取代的芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-n是0、1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-每个Rx和R1独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文公开了一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Het是被取代的或未被取代的杂芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文描述了一种诱导细胞的凋亡的方法，所述方法包括使所述细胞与治疗有效量的下式化合物接触：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Het是被取代的或未被取代的杂芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文公开了一种治疗癌症的方法，所述方法包括向有需要的对象施用治疗有效量的化合物，其中所述化合物具有下式：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Het是被取代的或未被取代的杂芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本文公开了一种诱导细胞的凋亡的方法，所述方法包括使所述细胞与治疗有效量的结合p53突变体的本公开的化合物接触，其中所述化合物增加所述p53突变体结合DNA的能力，其中所述细胞表达所述p53突变体。
在一些实施方案中，本文公开了一种治疗癌症的方法，所述方法包括向有需要的对象施用治疗有效量的本公开的化合物。
附图说明
图1显示4-((2-(4-(氨基甲基)苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物的1H NMR图谱。
图2显示4-((2-(4-氯苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物的1H NMR图谱。
图3显示3-(4-((1,1-二氧代四氢-2H-噻喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲酸的1H NMR图谱。
图4显示3-(4-((1,1-二氧代四氢-2H-噻喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-N-甲基苯甲酰胺的1H NMR图谱。
图5显示4-((2-(4-(羟基甲基)苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物的1H NMR图谱。
图6显示2-(4-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)苯基)-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的1H NMR图谱。
图7显示6-甲基-N-(4-(5-(((1-甲基哌啶-4-基)氨基)甲基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲基)吡啶-3-胺的1H NMR图谱。
图8显示N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(4-(1-((6-(甲基磺酰基)吡啶-3-基)氨基)乙基)苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的1H NMR图谱。
图9显示6-(4-((1-(2-羟基-3-甲氧基丙基)哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)吲哚啉-2-酮的1H NMR图谱。
图10显示N-(3-(4-((1-(2-羟基-3-甲氧基丙基)哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯基)乙酰胺的1H NMR图谱。
图11显示4-((2-(6-(二甲基氨基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物的1H NMR图谱。
图12显示4-((2-(喹啉-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物的1H NMR图谱。
图13显示4-((2-(1-(2-羟基乙基)-1H-吡唑-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物的1H NMR图谱。
图14显示N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-((丙-1-烯-2-基氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的1H NMR图谱。
图15显示N-((5-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)乙酰胺的1H NMR图谱。
图16显示N-((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺的1H NMR图谱。
图17显示N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基)甲基)环丙烷甲酰胺的1H NMR图谱。
图18显示N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基)甲基)环丙烷甲酰胺的1H NMR图谱。
图19显示1-甲基-N-((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)-1H-吡唑-4-甲酰胺的1H NMR图谱。
图20显示N-((3-(4-((四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺的1H NMR图谱。
具体实施方式
本公开提供了用于恢复突变p53的野生型功能的化合物和方法。本公开的化合物可结合至突变p53，并且恢复所述p53突变体结合DNA的能力。p53突变体的活性的恢复可允许激活p53的下游效应物，从而导致抑制癌症进展。本公开还提供了治疗具有p53突变的癌性病变或肿瘤的方法。
癌症是特征在于细胞增殖不受控制，具有全身转移的可能性的一系列相关疾病。癌症可分类成五大类，包括例如：上皮癌，其可由覆盖身体的内部和外部部分诸如肺、乳腺和结肠的细胞产生；肉瘤，其可由位于骨、软骨，脂肪、结缔组织、肌肉和其他支持组织中的细胞产生；淋巴瘤，其可在淋巴结和免疫系统组织中产生；白血病，其可在骨髓中产生，并且在血流中积累；以及腺瘤，其可在甲状腺、垂体腺、肾上腺和其他腺组织中产生。
尽管不同癌症可在几乎任何身体组织中显现，并且含有独特特征，但导致癌症的基本过程在该疾病的所有形式中都可为类似的。当细胞逃脱对细胞分裂的正常约束，并且开始不受控制地生长和分裂时，癌症就开始了。细胞中的遗传突变可阻碍细胞修复受损DNA或引发凋亡的能力，并且可导致细胞的生长和分裂不受控制。
肿瘤细胞群体繁殖的能力不仅由细胞增殖的速率决定，而且还由细胞消耗的速率决定。程序性细胞死亡或凋亡代表细胞消耗的主要机制。癌细胞可通过多种策略逃避凋亡，例如通过抑制p53功能，由此抑制促凋亡蛋白的表达。
致癌基因和肿瘤抑制基因可调节细胞的增殖。遗传突变可影响致癌基因和肿瘤抑制因子，从而潜在地异常激活或抑制活性，进一步促进不受控制的细胞分裂。尽管致癌基因有助于细胞生长，但肿瘤抑制基因通过修复受损DNA和激活凋亡来减缓细胞分裂。在癌症中可突变的细胞致癌基因包括例如Cdk1、Cdk2、Cdk3、Cdk4、Cdk6、EGFR、PDGFR、VEGF、HER2、Raf激酶、K-Ras和myc。在癌症中可突变的肿瘤抑制基因包括例如BRCA1、BRCA2、周期蛋白依赖性激酶抑制因子1C、视网膜母细胞瘤蛋白(pRb)、PTEN、p16、p27、p53和p73。
肿瘤抑制因子p53。
肿瘤抑制蛋白p53是一种具有393个氨基酸的转录因子，其可响应于细胞应激来调节细胞生长，所述细胞应激包括例如紫外辐射、低氧、致癌基因激活和DNA损伤。p53具有各种用于抑制癌症进展的机制，包括例如引发凋亡、维持基因组稳定性、细胞周期阻滞、诱导衰老和抑制血管生成。归因于p53在肿瘤抑制中的关键作用，p53在几乎所有癌症中都通过直接突变或通过涉及于肿瘤抑制中的相关信号传导通路的扰动而失活。p53基因的纯合性丧失发生在几乎所有类型的癌症中，包括乳腺癌、结肠癌和肺癌。在若干类型的人类癌症中，某些p53突变的存在可与不太有利的患者预后相关联。
在不存在应激信号下，通过p53与E3泛素连接酶Mdm2的相互作用，p53水平维持在低水平下。在未受应激的细胞中，Mdm2可靶向p53以通过蛋白酶体进行降解。在应激条件下，Mdm2与p53之间的相互作用被破坏，并且p53积累。导致p53激活的关键事件是由蛋白激酶对p53的N末端结构域的磷酸化，由此转导上游应激信号。p53的磷酸化导致构象变化，所述构象变化可促进由p53进行的DNA结合，并且允许下游效应物的转录。p53的激活可诱导例如内在凋亡通路、外在凋亡通路、细胞周期阻滞、衰老和DNA修复。p53可激活涉及于以上通路中的蛋白质，包括例如Fas/Apo1、KILLER/DR5、Bax、Puma、Noxa、Bid、胱天蛋白酶-3、胱天蛋白酶-6、胱天蛋白酶-7、胱天蛋白酶-8、胱天蛋白酶-9和p21(WAF1)。另外，p53可阻遏包括例如c-MYC、周期蛋白B(Cyclin B)、VEGF、RAD51和hTERT的多种基因的转录。
p53四聚体的每个链由包括反式激活结构域(氨基酸1-100)、DNA结合结构域(氨基酸101-306)和四聚化结构域(氨基酸307-355)的若干功能性结构域组成，所述若干功能性结构域可高度移动，并且基本上是非结构化的。大多数p53癌症突变位于蛋白质的DNA结合核心结构域中，所述DNA结合核心结构域含有反平行β-片层的中心β-夹层结构，所述中心β-夹层结构充当DNA结合表面的基本支架。DNA结合表面由例如在Arg175和Arg248处通过锌离子来稳定的两个β-转角环L2和L3以及环-片层-螺旋基序组成。总之，这些结构元件形成富含带正电荷的氨基酸，并且与各种p53应答元件进行特异性接触的延伸的DNA结合表面。
归因于p53突变在几乎每种类型的癌症中的普遍性，再激活癌性细胞中的野生型p53功能可为一种有效疗法。p53中位于蛋白质的DNA结合结构域或DNA结合表面的周边中的突变导致为DNA识别和结合所需的蛋白质折叠异常。p53中的突变可例如发生在氨基酸Val143、His168、Arg175、Tyr220、Gly245、Arg248、Arg249、Phe270、Arg273和Arg282处。可消除p53的活性的p53突变包括例如R175H、Y220C、G245S、R248Q、R248W、R273H和R282H。这些p53突变可扭曲DNA结合位点的结构，或使折叠的蛋白质在体温下在热力学上去稳定。p53突变体的野生型功能可通过p53突变体与可使折叠-解折叠平衡朝向折叠状态转移，由此降低解折叠和去稳定的速率的化合物的结合来恢复。
氨基酸的非限制性实例包括：丙氨酸(A，Ala)；精氨酸(R，Arg)；天冬酰胺(N，Asn)；天冬氨酸(D，Asp)；半胱氨酸(C，Cys)；谷氨酸(E，Glu)；谷氨酰胺(Q，Gln)；甘氨酸(G，Gly)；组氨酸(H，His)；异亮氨酸(I，Ile)；亮氨酸(L，Leu)；赖氨酸(K，Lys)；甲硫氨酸(M，Met)；苯丙氨酸(F，Phe)；脯氨酸(P，Pro)；丝氨酸(S，Ser)；苏氨酸(T，Thr)；色氨酸(W，Trp)；酪氨酸(Y，Tyr)；以及缬氨酸(V，Val)。
本公开的化合物的机制。
本公开的化合物可选择性结合至p53突变体，并且可恢复所述p53突变体的野生型活性，包括例如DNA结合功能和激活涉及于肿瘤抑制中的下游靶标。在一些实施方案中，本公开的化合物选择性结合至p53Y220C突变体。Y220C突变体是一种温度敏感性突变体，其在较低温度下结合至DNA，并且在体温下变性。本公开的化合物可使Y220C突变体稳定以降低蛋白质在体温下变性的可能性。
位于连接β-折叠股S7和S8的p53β-夹层结构的周边中，Y220的芳族环是β-夹层结构的疏水性核心的不可缺少的部分。由于内表面空腔的形成，所以Y220C突变可为高度致使去稳定的。本公开的化合物可结合至并占据这个表面裂缝以使β-夹层结构稳定，由此恢复野生型p53 DNA结合活性。
为确定本公开的化合物结合和稳定突变p53的能力，可采用测定来检测例如p53突变体的构象变化或野生型p53靶标的激活。p53的构象变化可通过例如差示扫描荧光测定法(DSF)、等温滴定量热法(ITC)、核磁共振波谱法(NMR)或X射线晶体照相术来测量。另外，可使用对p53的突变构象的野生型具有特异性的抗体来通过例如免疫沉淀(IP)、免疫荧光(IF)或免疫印迹检测构象变化。
用于检测p53突变体结合DNA的能力的方法可包括例如DNA亲和免疫印迹、改良酶联免疫吸附测定(ELISA)、电泳迁移率变动测定(EMSA)、荧光共振能量转移(FRET)、均相时间分辨荧光(HTRF)和染色质免疫沉淀(ChIP)测定。
为确定本文所述的化合物是否能够再激活p53的转录活性，可测量p53信号传导级联中的下游靶标的激活。p53效应蛋白的激活可通过例如免疫组织化学分析(IHC-P)、逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和western印迹来检测。p53的激活还可通过对经由胱天蛋白酶级联达成的凋亡的诱导以及使用包括例如膜联蛋白V染色、TUNEL测定、胱天蛋白酶原和胱天蛋白酶水平和细胞色素c水平的方法来测量。p53激活的另一结果是衰老，其可使用诸如β-半乳糖苷酶染色的方法测量。
可用于确定本公开的化合物增加p53突变体的DNA结合能力的有效性的p53突变体是p53截短突变体，其仅含有氨基酸94-312，涵盖p53的DNA结合结构域。举例来说，用于测试化合物功效的p53 Y220C突变体的序列可为：
SSSVPSQ KTYQGSYGFR LGFLHSGTAK SVTCTYSPAL
NKMFCQLAKT CPVQLWVDST PPPGTRVRAM
AIYKQSQHMT EVVRRCPHHE RCSDSDGLAP
PQHLIRVEGN LRVEYLDDRN TFRHSVVVPC
EPPEVGSDCT TIHYNYMCNS SCMGGMNRRP
ILTIITLEDS SGNLLGRNSF EVHVCACPGR
DRRTEEENLR KKGEPHHELP PGSTKRALSN NT(SEQ ID NO.1)
相较于在不存在本公开的化合物下p53突变体结合DNA的能力，本公开的化合物可使所述p53突变体结合DNA的能力增加至少或至多约0.1％、至少或至多约0.2％、至少或至多约0.3％、至少或至多约0.4％、至少或至多约0.5％、至少或至多约0.6％、至少或至多约0.7％、至少或至多约0.8％、至少或至多约0.9％、至少或至多约1％、至少或至多约2％、至少或至多约3％、至少或至多约4％、至少或至多约5％、至少或至多约6％、至少或至多约7％、至少或至多约8％、至少或至多约9％、至少或至多约10％、至少或至多约11％、至少或至多约12％、至少或至多约13％、至少或至多约14％、至少或至多约15％、至少或至多约16％、至少或至多约17％、至少或至多约18％、至少或至多约19％、至少或至多约20％、至少或至多约21％、至少或至多约22％、至少或至多约23％、至少或至多约24％、至少或至多约25％、至少或至多约26％、至少或至多约27％、至少或至多约28％、至少或至多约29％、至少或至多约30％、至少或至多约31％、至少或至多约32％、至少或至多约33％、至少或至多约34％、至少或至多约35％、至少或至多约36％、至少或至多约37％、至少或至多约38％、至少或至多约39％、至少或至多约40％、至少或至多约41％、至少或至多约42％、至少或至多约43％、至少或至多约44％、至少或至多约45％、至少或至多约46％、至少或至多约47％、至少或至多约48％、至少或至多约49％、至少或至多约50％、至少或至多约51％、至少或至多约52％、至少或至多约53％、至少或至多约54％、至少或至多约55％、至少或至多约56％、至少或至多约57％、至少或至多约58％、至少或至多约59％、至少或至多约60％、至少或至多约61％、至少或至多约62％、至少或至多约63％、至少或至多约64％、至少或至多约65％、至少或至多约66％、至少或至多约67％、至少或至多约68％、至少或至多约69％、至少或至多约70％、至少或至多约71％、至少或至多约72％、至少或至多约73％、至少或至多约74％、至少或至多约75％、至少或至多约76％、至少或至多约77％、至少或至多约78％、至少或至多约79％、至少或至多约80％、至少或至多约81％、至少或至多约82％、至少或至多约83％、至少或至多约84％、至少或至多约85％、至少或至多约86％、至少或至多约87％、至少或至多约88％、至少或至多约89％、至少或至多约90％、至少或至多约91％、至少或至多约92％、至少或至多约93％、至少或至多约94％、至少或至多约95％、至少或至多约96％、至少或至多约97％、至少或至多约98％、至少或至多约99％、至少或至多约100％、至少或至多约125％、至少或至多约150％、至少或至多约175％、至少或至多约200％、至少或至多约225％或至少或至多约250％。
本文所述的化合物可增加p53突变体的活性，所述活性是在不存在所述化合物下p53突变体的活性的例如至少或至多约2倍、至少或至多约3倍、至少或至多约4倍、至少或至多约5倍、至少或至多约6倍、至少或至多约7倍、至少或至多约8倍、至少或至多约9倍、至少或至多约10倍、至少或至多约11倍、至少或至多约12倍、至少或至多约13倍、至少或至多约14倍、至少或至多约15倍、至少或至多约16倍、至少或至多约17倍、至少或至多约18倍、至少或至多约19倍、至少或至多约20倍、至少或至多约25倍、至少或至多约30倍、至少或至多约35倍、至少或至多约40倍、至少或至多约45倍、至少或至多约50倍、至少或至多约55倍、至少或至多约60倍、至少或至多约65倍、至少或至多约70倍、至少或至多约75倍、至少或至多约80倍、至少或至多约85倍、至少或至多约90倍、至少或至多约95倍、至少或至多约100倍、至少或至多约110倍、至少或至多约120倍、至少或至多约130倍、至少或至多约140倍、至少或至多约150倍、至少或至多约160倍、至少或至多约170倍、至少或至多约180倍、至少或至多约190倍、至少或至多约200倍、至少或至多约250倍、至少或至多约300倍、至少或至多约350倍、至少或至多约400倍、至少或至多约450倍、至少或至多约500倍、至少或至多约550倍、至少或至多约600倍、至少或至多约650倍、至少或至多约700倍、至少或至多约750倍、至少或至多约800倍、至少或至多约850倍、至少或至多约900倍、至少或至多约950倍、至少或至多约1,000倍、至少或至多约1,500倍、至少或至多约2,000倍、至少或至多约3,000倍、至少或至多约4,000倍、至少或至多约5,000倍、至少或至多约6,000倍、至少或至多约7,000倍、至少或至多约8,000倍、至少或至多约9,000倍或至少或至多约10,000倍。
本公开的化合物可例如用于诱导细胞的凋亡、细胞周期阻滞或衰老。在一些实施方案中，细胞是癌细胞。在一些实施方案中，细胞携带p53中的突变。
本公开的化合物。
在一些实施方案中，本公开提供了一种化合物，所述化合物包含：吲哚基团，其中所述吲哚基团包含：a)在所述吲哚基团的1位处的卤代烷基；b)在所述吲哚基团的2位处的第一取代基，其中所述第一取代基是环状基团；和c)第二取代基，其中所述第二取代基被至少卤基-取代；或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，环状基团是芳基、杂芳基或杂环基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，环状基团是未被取代的芳基。在一些实施方案中，环状基团是被取代的芳基。在一些实施方案中，环状基团是被取代的苯基。在一些实施方案中，环状基团是被取代的或未被取代的杂芳基。在一些实施方案中，杂芳基是芳族5元或6元单环。在一些实施方案中，杂芳基是噻唑基、噻二唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基。在一些实施方案中，杂芳基是吡啶基或嘧啶基。
在一些实施方案中，第二取代基在吲哚基团的4位处。在一些实施方案中，第二取代基是被取代的或未被取代的第二环状基团。在一些实施方案中，第二环状基团是杂环基。在一些实施方案中，杂环基是哌啶基。在一些实施方案中，杂环基是四氢吡喃基。在一些实施方案中，杂环基被氟基-取代。在一些实施方案中，杂环基被氯基-取代。在一些实施方案中，卤代烷基是三氟乙基。
在一些实施方案中，本公开提供了一种化合物，所述化合物包含吲哚基团，其中所述吲哚基团包含：a)在所述吲哚基团的3位处的被取代的或未被取代的非环状基团；和b)在所述吲哚基团的2位处的被取代的或未被取代的环状基团，其中相对于在不存在所述化合物下p53突变体的生物活性构象的稳定性，所述化合物增加所述p53突变体的生物活性构象的稳定性；或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，非环状基团是氢。在一些实施方案中，非环状基团是卤基-。在一些实施方案中，环状基团是芳基、杂芳基、杂环基或亚环烷基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，环状基团是芳基或杂芳基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，环状基团是被取代的芳基。在一些实施方案中，环状基团是被取代的苯基。在一些实施方案中，环状基团是被以下取代的苯基：烷基、环烷基、烷氧基、胺基团、羧基、羧酸基团、碳酰胺基团或酰胺基团，其各自是被取代的或未被取代的；氰基、卤基-或氢。
在一些实施方案中，环状基团是被取代的杂芳基。在一些实施方案中，环状基团是包含1、2或3个杂原子作为环成员的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。在一些实施方案中，环状基团是吡啶基、嘧啶基、噻二唑基、噻唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基，在一些实施方案中，环状基团是1,3,5-噻二唑-2-基。在一些实施方案中，环状基团是1,3,4-噁二唑-2-基或1,2,4-噁二唑-2-基。在一些实施方案中，环状基团是吡啶基。
在一些实施方案中，吲哚基团还包含在吲哚基团的4位处的取代基。在一些实施方案中，取代基是被取代的或未被取代的氨基。在一些实施方案中，氨基被第二环状基团取代。在一些实施方案中，第二环状基团是被至少卤基-取代的杂环基。在一些实施方案中，杂环基被至少氟基-取代。在一些实施方案中，杂环基被至少氯基-取代。在一些实施方案中，杂环基是哌啶基。在一些实施方案中，杂环基是四氢吡喃基。
本公开的化合物的非限制性实例包括具有下式中的任一者的化合物：
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-A是被取代的或未被取代的环；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，A是被取代的或未被取代的芳基、杂芳基、杂环基、亚环烷基。在一些实施方案中，A是6碳单环或10碳双环芳族环系统，其中每个环的0、1、2、3或4个原子任选地被取代。在一些实施方案中，A是萘基。在一些实施方案中，A是吲唑基。
在一些实施方案中，A是被取代的芳基。在一些实施方案中，A是被取代的苯基。在一些实施方案中，A是被以下取代的苯基：烷基、环烷基、烷氧基、胺基团、羧基、羧酸基团、碳酰胺基团或酰胺基团，其各自是被取代的或未被取代的；氰基、卤素或氢。在一些实施方案中，A是被烷基取代的苯基，其中烷基是被取代的。在一些实施方案中，A是被烷基取代的苯基，其中烷基被氨基取代，所述氨基是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，A是被胺基团取代的苯基，所述胺基团是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，A是被羧基取代的苯基，所述羧基是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，A是被氰基取代的苯基。在一些实施方案中，A是被卤基-取代的苯基。
在一些实施方案中，A是被取代的或未被取代的杂环基。在一些实施方案中，A是被取代的杂环基。
在一些实施方案中，A是包含1、2或3个杂原子作为环成员的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。在一些实施方案中，A是包含1、2、3、4、5或6个杂原子的芳族8元、9元、10元、11元或12元双环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。在一些实施方案中，A是包含1、2或3个杂原子的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，并且所述芳族5元、6元、7元或8元单环环系统是被取代的。在一些实施方案中，A是具有1、2、3、4、5或6个杂原子的8元、9元、10元、11元或12元双环环系统，并且所述8元、9元、10元、11元或12元双环环系统是被取代的。
在一些实施方案中，A是吡啶基、嘧啶基、噻二唑基、噻唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，A是1,3,5-噻二唑-2-基。在一些实施方案中，A是1,3,4-噁二唑-2-基或1,2,4-噁二唑-2-基。在一些实施方案中，A是1,3,4-噁二唑-2-基。
在一些实施方案中，m是1。在一些实施方案中，m是2。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是键。在一些实施方案中，Y是N。
在一些实施方案中，R2是氢。在一些实施方案中，R2是被取代的或未被取代的烷基。在一些实施方案中，R2是三氟乙基。在一些实施方案中，R2是环烷基。
在一些实施方案中，R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、烷基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或卤素。在一些实施方案中，R1是-NR16R17。在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。
在一些实施方案中，每个R3和R4独立地是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是氢，并且R4是至少被卤基-取代的杂环基。在一些实施方案中，R4是被氟基取代的杂环基。在一些实施方案中，R4是被氯基取代的杂环基。
在一些实施方案中，R13是烷基、烯基、氢或卤素。在一些实施方案中，R13是氢。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被取代的羧基。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中R25是-C(O)R16、-C(O)NR16R17、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R25是被取代的或未被取代的芳基。在一些实施方案中，R25是被取代的苯基。在一些实施方案中，R25是-C(O)R16，其中R16是烷基、芳基、杂芳基或杂环基。在一些实施方案中，R25是-C(O)R16，其中R16是被取代的苯基。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Ar是未被取代的或被取代的芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-n是0、1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-每个Rx和R1独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，
或其药学上可接受的盐。
可选择虚线键的模式以提供芳族系统，例如吲哚、吲哚啉、吡咯并吡啶、吡咯并嘧啶或吡咯并吡嗪。在一些实施方案中，X1是CR5、CR5R6或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X2是CR7、CR7R8或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X3是CR9、CR9R10或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X4是CR11、CR11R12或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X5是CR13、N或NR13。在一些实施方案中，X1是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X2是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X3是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X4是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X5是N。
在一些实施方案中，Ar是6碳单环或10碳双环芳族环系统，其中每个环的0、1、2、3或4个原子任选地被取代。在一些实施方案中，Ar是苯基。在一些实施方案中，Ar是萘基。在一些实施方案中，Ar是吲唑基。
R1可为-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是烷基、亚烷基、烷氧基、-NR21R22或芳基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；卤基或氢。在一些实施方案中，R1是甲基、环己基、亚甲基、甲氧基或苯甲基。在一些实施方案中，R1是氟基或氯基。在一些实施方案中，R1是苯基。在一些实施方案中，R1是氢。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。R1可被一个或多个选自以下的取代基取代：羟基、氢硫基、卤素、氨基、硝基、亚硝基、氰基、叠氮基、亚砜基团、砜基团、磺酰胺基团、羧基、羧醛基团、亚胺基团、烷基、卤代烷基、环状烷基、烯基、卤代烯基、炔基、卤代炔基、烷氧基、芳基、芳基氧基、芳烷基、芳基烷氧基、杂环基、酰基、酰基氧基、氨基甲酸酯基团、酰胺基团、氨基甲酸乙酯基团和酯基团。
在一些实施方案中，R1是被胺基团取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被-C(O)NR16R17取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被-C(O)NR16R17取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被-C(O)OR16取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被COOH取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被杂芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被5元杂芳基环取代的羧基，所述5元杂芳基环是被取代的。
在一些实施方案中，m是1、2、3或4。在一些实施方案中，m是1。在一些实施方案中，X3是连接于Q1的碳原子，并且m是1。在一些实施方案中，n是1、2或3。在一些实施方案中，n是1。在一些实施方案中，n是2。在一些实施方案中，n是0。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是键。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。
在一些实施方案中，R2是氢或烷基。在一些实施方案中，R13是烷基、烯基、氢或卤素。在一些实施方案中，R2是烷基，并且R13是烷基。在一些实施方案中，R2是氢，并且R13是烷基。在一些实施方案中，R2是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R13是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R2是氢，并且R13是氢。在一些实施方案中，R2是三氟乙基，并且R13是氢。
在一些实施方案中，R3是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
其中：
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-Ar是未被取代的或被取代的芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-n是0、1、2、3或4；
-每个Rx和R1独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，Ar是6碳单环或10碳双环芳族环系统，其中每个环的0、1、2、3或4个原子任选地被取代。在一些实施方案中，Ar是苯基。在一些实施方案中，Ar是萘基。在一些实施方案中，Ar是吲唑基。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。R1可被一个或多个选自以下的取代基取代：羟基、氢硫基、卤素、氨基、硝基、亚硝基、氰基、叠氮基、亚砜基团、砜基团、磺酰胺基团、羧基、羧醛基团、亚胺基团、烷基、卤代烷基、环状烷基、烯基、卤代烯基、炔基、卤代炔基、烷氧基、芳基、芳基氧基、芳烷基、芳基烷氧基、杂环基、酰基、酰基氧基、氨基甲酸酯基团、酰胺基团、氨基甲酸乙酯基团和酯基团。
在一些实施方案中，R1是被胺基团取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被-C(O)NR16R17取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被-C(O)NR16R17取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被-C(O)OR16取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被COOH取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被杂芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被5元杂芳基环取代的羧基，所述5元杂芳基环是被取代的。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是键。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。
在一些实施方案中，R2是氢或烷基。在一些实施方案中，R13是烷基、烯基、氢或卤素。在一些实施方案中，R2是烷基，并且R13是烷基。在一些实施方案中，R2是氢，并且R13是烷基。在一些实施方案中，R2是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R13是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R2是氢，并且R13是氢。在一些实施方案中，R2是三氟乙基，并且R13是氢。
在一些实施方案中，R3是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-每个R1、Rx、Rx1、Rx2、Rx3和Rx4独立地是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-n是0、1、2、3或4；
每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。R1可被一个或多个选自以下的取代基取代：羟基、氢硫基、卤素、氨基、硝基、亚硝基、氰基、叠氮基、亚砜基团、砜基团、磺酰胺基团、羧基、羧醛基团、亚胺基团、烷基、卤代烷基、环状烷基、烯基、卤代烯基、炔基、卤代炔基、烷氧基、芳基、芳基氧基、芳烷基、芳基烷氧基、杂环基、酰基、酰基氧基、氨基甲酸酯基团、酰胺基团、氨基甲酸乙酯基团和酯基团。
在一些实施方案中，R1是被胺基团取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是烷基、芳基、杂芳基、氨基、羧基或酯基团，其中的任一者都是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的或未被取代的烷基、芳基或杂芳基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的或未被取代的苯基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的或未被取代的吡啶基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被杂芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被5元杂芳基环取代的羧基，所述5元杂芳基环是被取代的。
在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17。在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17，其中R16和R17是氢。在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17，其中R16是氢，并且R17是烷基。在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17，其中R16是氢，并且R17是甲基。在一些实施方案中，R1是-C(O)OR16。在一些实施方案中，R1是-C(O)OH。在一些实施方案中，R1是甲基。在一些实施方案中，R1是卤素。在一些实施方案中，R1是氯基或氟基。
在一些实施方案中，n是0、1、2或3。在一些实施方案中，n是1。在一些实施方案中，n是2。在一些实施方案中，n是0。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是键。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。
在一些实施方案中，R2是氢或烷基。在一些实施方案中，R13是烷基、烯基、氢或卤素。在一些实施方案中，R2是烷基，并且R13是烷基。在一些实施方案中，R2是氢，并且R13是烷基。在一些实施方案中，R2是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R13是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R2是氢，并且R13是氢。在一些实施方案中，R2是三氟乙基，并且R13是氢。
在一些实施方案中，R3是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。R1可被一个或多个选自以下的取代基取代：羟基、氢硫基、卤素、氨基、硝基、亚硝基、氰基、叠氮基、亚砜基团、砜基团、磺酰胺基团、羧基、羧醛基团、亚胺基团、烷基、卤代烷基、环状烷基、烯基、卤代烯基、炔基、卤代炔基、烷氧基、芳基、芳基氧基、芳烷基、芳基烷氧基、杂环基、酰基、酰基氧基、氨基甲酸酯基团、酰胺基团、氨基甲酸乙酯基团和酯基团。
在一些实施方案中，R1是被胺基团取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是烷基、芳基、杂芳基、氨基、羧基或酯基团，其中的任一者都是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的或未被取代的烷基、芳基或杂芳基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的或未被取代的苯基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的或未被取代的吡啶基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被杂芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被5元杂芳基环取代的羧基，所述5元杂芳基环是被取代的。
在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17。在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17，其中R16和R17是氢。在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17，其中R16是氢，并且R17是烷基。在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17，其中R16是氢，并且R17是甲基。在一些实施方案中，R1是-C(O)OR16。在一些实施方案中，R1是-C(O)OH。在一些实施方案中，R1是甲基。在一些实施方案中，R1是卤素。在一些实施方案中，R1是氯基或氟基。
在一些实施方案中，n是1、2或3。在一些实施方案中，n是1。在一些实施方案中，n是2。在一些实施方案中，n是0。
在一些实施方案中，R3是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是： 在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是
本公开的化合物的非限制性实例包括具有下式中的任一者的化合物：
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Het是被取代的或未被取代的杂芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
可选择虚线键的模式以提供芳族系统，例如吲哚、吲哚啉、吡咯并吡啶、吡咯并嘧啶或吡咯并吡嗪。在一些实施方案中，X1是CR5、CR5R6或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X2是CR7、CR7R8或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X3是CR9、CR9R10或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X4是CR11、CR11R12或连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X5是CR13、N或NR13。在一些实施方案中，X1是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X2是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X3是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X4是连接于Q1的碳原子。在一些实施方案中，X5是N。
在一些实施方案中，Het是包含1、2或3个杂原子作为环成员的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。在一些实施方案中，Het是包含1、2、3、4、5或6个杂原子的芳族8元、9元、10元、11元或12元双环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。在一些实施方案中，Het是包含1、2或3个杂原子的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，并且所述芳族5元、6元、7元或8元单环环系统是被取代的。在一些实施方案中，Het是具有1、2、3、4、5或6个杂原子的8元、9元、10元、11元或12元双环环系统，并且所述8元、9元、10元、11元或12元双环环系统是被取代的。
在一些实施方案中，Het是吡啶基、嘧啶基、噻二唑基、噻唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Het是1,3,5-噻二唑-2-基。在一些实施方案中，Het是1,3,4-噁二唑-2-基或1,2,4-噁二唑-2-基。在一些实施方案中，Het是1,3,4-噁二唑-2-基。在一些实施方案中，Het是1,2,4-噁二唑-2-基。
在一些实施方案中，R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是烷基、亚烷基、烷氧基、-NR21R22或芳基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；卤基或氢。在一些实施方案中，R1是甲基、环己基、亚甲基、甲氧基或苯甲基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R1是氟基或氯基。在一些实施方案中，R1是苯基。在一些实施方案中，R1是氢。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基或被取代的或未被取代的亚烷基。R1可被一个或多个选自以下的取代基取代：羟基、氢硫基、卤素、氨基、硝基、亚硝基、氰基、叠氮基、亚砜基团、砜基团、磺酰胺基团、羧基、羧醛基团、亚胺基团、烷基、卤代烷基、环状烷基、烯基、卤代烯基、炔基、卤代炔基、烷氧基、芳基、芳基氧基、芳烷基、芳基烷氧基、杂环基、酰基、酰基氧基、氨基甲酸酯基团、酰胺基团、氨基甲酸乙酯基团和酯基团。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被杂芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被5元杂芳基环取代的羧基，所述5元杂芳基环是被取代的。
在一些实施方案中，m是1、2、3或4。在一些实施方案中，m是1。在一些实施方案中，X1是连接于Q1的碳原子，并且m是1。在一些实施方案中，X2是连接于Q1的碳原子，并且m是1。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基，R16是芳基，并且R17是烷基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基，R16是芳基，并且R17是氢。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基，R16是杂芳基，并且R17是烷基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基，R16是杂芳基，并且R17是氢。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基，R16是被取代的杂芳基，并且R17是氢。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基，R16是被取代的烷基，并且R17是氢。在一些实施方案中，R17是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地被卤素、烷基或羟基取代或未被取代。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是芳基或杂芳基，被卤素或烷基取代或未被取代。在一些实施方案中，R16是烷基，并且R17是被卤素或烷基取代的杂芳基。在一些实施方案中，R17是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地被烷基取代或未被取代。在一些实施方案中，R17是芳基或杂芳基，其各自独立地被烷基取代，其中所述烷基任选地被氟、氯、溴、碘或氰基取代。
在一些实施方案中，R2是氢或烷基。在一些实施方案中，R2是被取代的烷基。在一些实施方案中，R2是三氟乙基。在一些实施方案中，R13是烷基、烯基、氢或卤素。在一些实施方案中，R13是甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或叔丁基。在一些实施方案中，R2是三氟乙基，并且R13是氢。
在一些实施方案中，R3是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成被取代的杂环。在一些实施方案中，R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成被羟基、卤素、氨基或烷基取代的杂环。在一些实施方案中，R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成杂环，其中所述杂环经被取代的或未被取代的杂环取代。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是烷基、亚烷基、烷氧基、-NR21R22或芳基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；卤基或氢。
在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被杂芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的甲基，其中R16是氢，并且R17是被5元杂芳基环取代的羧基，所述5元杂芳基环是被取代的。
在一些实施方案中，R2是氢或烷基。在一些实施方案中，R2是被取代的烷基。在一些实施方案中，R2是三氟乙基。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，本公开提供了一种下式化合物：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被取代的羧基。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中R25是-C(O)R16、-C(O)NR16R17、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R25是被取代的或未被取代的芳基。在一些实施方案中，R25是被取代的苯基。在一些实施方案中，R25是-C(O)R16，其中R16是烷基、芳基、杂芳基或杂环基。在一些实施方案中，R25是-C(O)R16，其中R16是被取代的苯基；或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
变量如上所定义，并且其中o是1、2、3或4。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-每个R1、R1a和R1b独立地是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-o是0、1、2、3或4；
-每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，每个R1a和R1b独立地是烷基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或NR16R17。在一些实施方案中，R1a是未被取代的苯基，并且R1b是氨基。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，R1是-C(O)NR16R17、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是烷基、烷氧基、芳基或卤基。在一些实施方案中，R1是甲氧基、甲基或苯基。在一些实施方案中，每个R1a和R1b独立地是烷基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或NR16R17。在一些实施方案中，R1a是未被取代的苯基，并且R1b是氨基。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被取代的羧基。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-每个R1c和R1d独立地是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，每个R1c和R1d独立地是-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，每个R1c和R1d独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1c是氨基，并且R1d是苯基。在一些实施方案中，R1c是氨基，并且R1d是环烯基。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-每个R1e和R1f独立地是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，每个R1e和R1f独立地是烷基、NR16R17、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1e是被取代的烷基，并且R1f是氢。在一些实施方案中，R1e是氢，并且R1f是NR16R17，其中每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1e是氢，并且R1f是NR16R17，其中R16是氢，并且R17是烷基。在一些实施方案中，R1e是氢，并且R1f是NR16R17，其中R16是氢，并且R17是苯基。在一些实施方案中，R1e是氢，并且R1f是氨基。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-每个R1、R1g和R1h独立地是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的烷基，其中每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被取代的羧基。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被烷基或芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被环烷基或苯基取代的羧基。在一些实施方案中，R16和R17是氢。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的烷基，其中每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被取代的羧基。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被烷基或芳基取代的羧基。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被环烷基或苯基取代的羧基。在一些实施方案中，R16和R17是氢。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。在一些实施方案中，Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基。在一些实施方案中，Q1是C1亚烷基。在一些实施方案中，每个R16和R17独立地是烷基、烯基、芳基、杂芳基、杂环基或氢。在一些实施方案中，Q1是键。
在一些实施方案中，R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R4是杂环基。在一些实施方案中，R4是哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、吗啉基或吡咯烷基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R4是环，所述环是： 其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，Ra是亚烷基。在一些实施方案中，Ra是甲基。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R3是H，并且R4是环，所述环是其中所述环是被取代的或未被取代的。
在一些实施方案中，R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。在一些实施方案中，R1是被取代的烷基。在一些实施方案中，R1是被NR16R17取代的烷基，其中每个R16和R17独立地是烷基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基、烷氧基、羧基、氨基、酰基、酰基氧基或酰胺基团，其中的任一者都是未被取代的或被取代的；或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是芳基、杂芳基、羧基或氢。在一些实施方案中，R16是氢，并且R17是被芳基、杂芳基、环烷基或烷基取代的羧基。在一些实施方案中，R16和R17是氢。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
或其药学上可接受的盐，其中变量如上所定义。
在一些实施方案中，化合物具有下式：
其中：
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-每个R1c和R1d独立地是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，
-R25是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，R25是杂环基、环烷基、芳基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R25是苯基或环丙基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R25是被取代的环丙基。在一些实施方案中，R25是杂芳基或杂环基，其各自是被取代的或未被取代的。在一些实施方案中，R25是噻吩基、假吲哚基(indolenyl)或吡咯基，其各自是被取代的或未被取代的。
本公开的化合物的非限制性实例包括具有下式中的任一者的化合物：
或其药学上可接受的盐。
本公开的化合物的非限制性实例包括具有下式中的任一者的化合物：
或其药学上可接受的盐。
本文中的化合物可包括其所有立体异构体、对映异构体、非对映异构体、混合物、外消旋物、阻转异构体和互变异构体。
任选的取代基的非限制性实例包括羟基、氢硫基、卤素、氨基、硝基、亚硝基、氰基、叠氮基、亚砜基团、砜基团、磺酰胺基团、羧基、羧醛基团、亚胺基团、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、炔基、卤代炔基、烷氧基、芳基、芳基氧基、芳烷基、芳基烷氧基、杂环基、酰基、酰基氧基、氨基甲酸酯基团、酰胺基团、脲基、环氧基和酯基团。
烷基和亚烷基的非限制性实例包括直链、支链和环状烷基和亚烷基。烷基或亚烷基可为例如C1、C2、C3、C4、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、C20、C21、C22、C23、C24、C25、C26、C27、C28、C29、C30、C31、C32、C33、C34、C35、C36、C37、C38、C39、C40、C41、C42、C43、C44、C45、C46、C47、C48、C49或C50基团，所述基团是被取代的或未被取代的。
直链烷基的非限制性实例包括甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基和癸基。
支链烷基包括被任何数目的烷基取代的任何直链烷基。支链烷基的非限制性实例包括异丙基、异丁基、仲丁基和叔丁基。
被取代的烷基的非限制性实例包括羟基甲基、氯甲基、三氟甲基、三氟乙基、氨基甲基、1-氯乙基、2-羟基乙基、1,2-二氟乙基和3-羧基丙基。
环状烷基的非限制性实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基。环状烷基还包括稠合、桥接和螺接双环以及更高级的稠合、桥接和螺接系统。环状烷基可被任何数目的直链、支链或环状烷基取代。环状烷基的非限制性实例包括环丙基、2-甲基-环丙-1-基、环丙-2-烯-1-基、环丁基、2,3-二羟基环丁-1-基、环丁-2-烯-1-基、环戊基、环戊-2-烯-1-基、环戊-2,4-二烯-1-基、环己基、环己-2-烯-1-基、环庚基、环辛烷基、2,5-二甲基环戊-1-基、3,5-二氯环己-1-基、4-羟基环己-1-基、3,3,5-三甲基环己-1-基、八氢并环戊二烯基、八氢-1H-茚基、3a,4,5,6,7,7a-六氢-3H-茚-4-基、十氢薁基、双环[2.1.1]己烷基、双环[2.2.1]庚烷基、双环[3.1.1]庚烷基、1,3-二甲基[2.2.1]庚烷-2-基、双环[2.2.2]辛烷基和双环[3.3.3]十一烷基。
烯基和亚烯基的非限制性实例包括直链、支链和环状烯基。烯基的一种或多种烯烃可呈例如以下形式：E、Z、顺式、反式、末端或外型-亚甲基。烯基或亚烯基可为例如C2、C3、C4、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、C20、C21、C22、C23、C24、C25、C26、C27、C28、C29、C30、C31、C32、C33、C34、C35、C36、C37、C38、C39、C40、C41、C42、C43、C44、C45、C46、C47、C48、C49或C50基团，所述基团是被取代的或未被取代的。烯基和亚烯基的非限制性实例包括乙烯基、丙-1-烯-1-基、异丙烯基、丁-1-烯-4-基；2-氯乙烯基、4-羟基丁烯-1-基、7-羟基-7-甲基辛-4-烯-2-基和7-羟基-7-甲基辛-3,5-二烯-2-基。
炔基或亚炔基的非限制性实例包括直链、支链和环状炔基。炔基或亚炔基的三键可在内部或在末端。炔基或亚炔基可为例如C2、C3、C4、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12、C13、C14、C15、C16、C17、C18、C19、C20、C21、C22、C23、C24、C25、C26、C27、C28、C29、C30、C31、C32、C33、C34、C35、C36、C37、C38、C39、C40、C41、C42、C43、C44、C45、C46、C47、C48、C49或C50基团，所述基团是被取代的或未被取代的。炔基或亚炔基的非限制性实例包括乙炔基、丙-2-炔-1-基、丙-1-炔-1-基和2-甲基-己-4-炔-1-基；5-羟基-5-甲基己-3-炔-1-基、6-羟基-6-甲基庚-3-炔-2-基和5-羟基-5-乙基庚-3-炔-1-基。
卤代烷基可为被任何数目的卤素原子例如氟、氯、溴和碘原子取代的任何烷基。卤代烯基可为被任何数目的卤素原子取代的任何烯基。卤代炔基可为被任何数目的卤素原子取代的任何炔基。
烷氧基可为例如被烷基、烯基或炔基取代的氧原子。醚或醚基团包含烷氧基。烷氧基的非限制性实例包括甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基和异丁氧基。
芳基可为杂环的或非杂环的。芳基可为单环的或多环的。芳基可被任何数目的本文所述的取代基取代，所述取代基例如是烃基、烷基、烷氧基和卤素原子。芳基的非限制性实例包括苯基、甲苯甲酰基、萘基、吡咯基、吡啶基、咪唑基、噻吩基和呋喃基。被取代的芳基的非限制性实例包括3,4-二甲基苯基、4-叔丁基苯基、4-环丙基苯基、4-二乙基氨基苯基、4-(三氟甲基)苯基、4-(二氟甲氧基)-苯基、4-(三氟甲氧基)苯基、3-氯苯基、4-氯苯基、3,4-二氯苯基、2-氟苯基、2-氯苯基、2-碘苯基、3-碘苯基、4-碘苯基、2-甲基苯基、3-氟苯基、3-甲基苯基、3-甲氧基苯基、4-氟苯基、4-甲基苯基、4-甲氧基苯基、2,3-二氟苯基、3,4-二氟苯基、3,5-二氟苯基、2,3-二氯苯基、3,4-二氯苯基、3,5-二氯苯基、2-羟基苯基、3-羟基苯基、4-羟基苯基、2-甲氧基苯基、3-甲氧基苯基、4-甲氧基苯基、2,3-二甲氧基苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二甲氧基苯基、2,4-二氟苯基、2,5-二氟苯基、2,6-二氟苯基、2,3,4-三氟苯基、2,3,5-三氟苯基、2,3,6-三氟苯基、2,4,5-三氟苯基、2,4,6-三氟苯基、2,4-二氯苯基、2,5-二氯苯基、2,6-二氯苯基、3,4-二氯苯基、2,3,4-三氯苯基、2,3,5-三氯苯基、2,3,6-三氯苯基、2,4,5-三氯苯基、3,4,5-三氯苯基、2,4,6-三氯苯基、2,3-二甲基苯基、2,4-二甲基苯基、2,5-二甲基苯基、2,6-二甲基苯基、2,3,4-三甲基苯基、2,3,5-三甲基苯基、2,3,6-三甲基苯基、2,4,5-三甲基苯基、2,4,6-三甲基苯基、2-乙基苯基、3-乙基苯基、4-乙基苯基、2,3-二乙基苯基、2,4-二乙基苯基、2,5-二乙基苯基、2,6-二乙基苯基、3,4-二乙基苯基、2,3,4-三乙基苯基、2,3,5-三乙基苯基、2,3,6-三乙基苯基、2,4,5-三乙基苯基、2,4,6-三乙基苯基、2-异丙基苯基、3-异丙基苯基和4-异丙基苯基。
被取代的芳基的非限制性实例包括2-氨基苯基、2-(N-甲基氨基)苯基、2-(N,N-二甲基氨基)苯基、2-(N-乙基氨基)苯基、2-(N,N-二乙基氨基)苯基、3-氨基苯基、3-(N-甲基氨基)苯基、3-(N,N-二甲基氨基)苯基、3-(N-乙基氨基)苯基、3-(N,N-二乙基氨基)苯基、4-氨基苯基、4-(N-甲基氨基)苯基、4-(N,N-二甲基氨基)苯基、4-(N-乙基氨基)苯基和4-(N,N-二乙基氨基)苯基。
杂环可为含有不是碳的环原子例如N、O、S、P、Si、B或任何其他杂原子的任何环。杂环可被任何数目的取代基例如烷基和卤素原子取代。杂环可为芳族的(杂芳基)或非芳族的。杂环的非限制性实例包括吡咯、吡咯烷、吡啶、哌啶、丁二酰胺、顺丁烯二酰亚胺、吗啉、咪唑、噻吩、呋喃、四氢呋喃、吡喃和四氢吡喃。
杂环的非限制性实例包括：具有含有一个或多个杂原子的单一环的杂环单元，其非限制性实例包括二氮杂环丙烯基、氮杂环丙烷基、氮杂环丁烷基、吡唑烷基、咪唑烷基、噁唑烷基、异噁唑啉基、噻唑烷基、异噻唑啉基、噁噻唑烷酮基、噁唑烷酮基、乙内酰脲基、四氢呋喃基、吡咯烷基、吗啉基、哌嗪基、哌啶基、二氢吡喃基、四氢吡喃基、哌啶-2-酮基、2,3,4,5-四氢-1H-氮杂环庚三烯基、2,3-二氢-1H-吲哚和1,2,3,4-四氢喹啉；以及ii)具有2个或更多个环，其中的一者是杂环的杂环单元，其非限制性实例包括六氢-1H-吡咯嗪基、3a,4,5,6,7,7a-六氢-1H-苯并[d]咪唑基、3a,4,5,6,7,7a-六氢-1H-吲哚基、1,2,3,4-四氢喹啉基和十氢-1H-环辛四烯并[b]吡咯基。
杂芳基的非限制性实例包括：i)含有单一环的杂芳基环，其非限制性实例包括1,2,3,4-四唑基、[1,2,3]三唑基、[1,2,4]三唑基、三嗪基、噻唑基、1H-咪唑基、噁唑基、异噁唑基、异噻唑基、呋喃基、噻吩基、嘧啶基、2-苯基嘧啶基、吡啶基、3-甲基吡啶基和4-二甲基氨基吡啶基；以及ii)含有2个或更多个稠环，其中的一者是杂芳基环的杂芳基环，其非限制性实例包括：7H-嘌呤基、9H-嘌呤基、6-氨基-9H-嘌呤基、5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶基、7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶基、吡啶并[2,3-d]嘧啶基、4,5,6,7-四氢-1-H-吲哚基、喹喔啉基、喹唑啉基、喹啉基、8-羟基-喹啉基和异喹啉基。
本文中的任何化合物都可为纯化的。本文中的化合物可为至少1％纯的，至少2％纯的，至少3％纯的，至少4％纯的，至少5％纯的，至少6％纯的，至少7％纯的，至少8％纯的，至少9％纯的，至少10％纯的，至少11％纯的，至少12％纯的，至少13％纯的，至少14％纯的，至少15％纯的，至少16％纯的，至少17％纯的，至少18％纯的，至少19％纯的，至少20％纯的，至少21％纯的，至少22％纯的，至少23％纯的，至少24％纯的，至少25％纯的，至少26％纯的，至少27％纯的，至少28％纯的，至少29％纯的，至少30％纯的，至少31％纯的，至少32％纯的，至少33％纯的，至少34％纯的，至少35％纯的，至少36％纯的，至少37％纯的，至少38％纯的，至少39％纯的，至少40％纯的，至少41％纯的，至少42％纯的，至少43％纯的，至少44％纯的，至少45％纯的，至少46％纯的，至少47％纯的，至少48％纯的，至少49％纯的，至少50％纯的，至少51％纯的，至少52％纯的，至少53％纯的，至少54％纯的，至少55％纯的，至少56％纯的，至少57％纯的，至少58％纯的，至少59％纯的，至少60％纯的，至少61％纯的，至少62％纯的，至少63％纯的，至少64％纯的，至少65％纯的，至少66％纯的，至少67％纯的，至少68％纯的，至少69％纯的，至少70％纯的，至少71％纯的，至少72％纯的，至少73％纯的，至少74％纯的，至少75％纯的，至少76％纯的，至少77％纯的，至少78％纯的，至少79％纯的，至少80％纯的，至少81％纯的，至少82％纯的，至少83％纯的，至少84％纯的，至少85％纯的，至少86％纯的，至少87％纯的，至少88％纯的，至少89％纯的，至少90％纯的，至少91％纯的，至少92％纯的，至少93％纯的，至少94％纯的，至少95％纯的，至少96％纯的，至少97％纯的，至少98％纯的，至少99％纯的，至少99.1％纯的，至少99.2％纯的，至少99.3％纯的，至少99.4％纯的，至少99.5％纯的，至少99.6％纯的，至少99.7％纯的，至少99.8％纯的，或至少99.9％纯的。
在一些实施方案中，本公开的化合物可用于治疗对象的癌症。本公开的化合物可例如减缓癌细胞系的增殖，或杀灭癌细胞。可通过本公开的化合物治疗的癌症的非限制性实例包括：急性淋巴母细胞性白血病、急性髓样白血病、肾上腺皮质癌、AIDS相关的癌症、AIDS相关的淋巴瘤、肛门癌、阑尾癌、星形细胞瘤、基底细胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、脑肿瘤(诸如小脑星形细胞瘤、大脑星形细胞瘤/恶性胶质瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、幕上原始神经外胚层肿瘤、视路和下丘脑胶质瘤)、乳腺癌、支气管腺瘤、伯基特淋巴瘤(Burkittlymphoma)、原始起源未知的癌、中枢神经系统淋巴瘤、小脑星形细胞瘤、子宫颈癌、儿童期癌症、慢性淋巴细胞性白血病、慢性髓性白血病、慢性骨髓增生性病症、结肠癌、皮肤T细胞淋巴瘤、结缔组织增生性小圆细胞肿瘤、子宫内膜癌、室管膜瘤、食管癌、尤因氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、生殖细胞肿瘤、胆囊癌、胃癌、胃肠类癌肿瘤、胃肠道间质瘤、胶质瘤、毛细胞白血病，头颈癌、心脏癌、肝细胞(肝)癌、霍奇金淋巴瘤(Hodgkin lymphoma)、下咽癌、眼内黑素瘤、胰岛细胞癌、卡波西肉瘤(Kaposi sarcoma)、肾癌、喉癌、唇和口腔癌、脂肪肉瘤、肝癌、肺癌(诸如非小细胞肺癌和小细胞肺癌)、淋巴瘤、白血病、巨球蛋白血症、恶性骨纤维组织细胞瘤/骨肉瘤、髓母细胞瘤、黑素瘤、间皮瘤、原发灶隐匿的转移性鳞状颈部癌、口癌、多发性内分泌瘤形成综合征、骨髓增生异常综合征、髓样白血病、鼻腔和鼻旁窦癌、鼻咽癌、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤/恶性骨纤维组织细胞瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌、卵巢生殖细胞肿瘤、胰腺癌、胰岛细胞胰腺癌、鼻旁窦和鼻腔癌、甲状旁腺癌、阴茎癌、咽癌、嗜铬细胞瘤、松果体星形细胞瘤、松果体生殖细胞瘤、垂体腺瘤、胸膜肺母细胞瘤、浆细胞瘤形成、原发性中枢神经系统淋巴瘤、前列腺癌、直肠癌、肾细胞癌、肾盂和输尿管移行细胞癌、视网膜母细胞瘤、横纹肌肉瘤、唾液腺癌、肉瘤、皮肤癌、梅克尔细胞皮肤癌(skin carcinoma merkel cell)、小肠癌、软组织肉瘤、鳞状细胞癌、胃癌、T细胞淋巴瘤、咽喉癌、胸腺瘤、胸腺癌、甲状腺癌、滋养细胞肿瘤(妊娠性)、原发部位未知的癌症、尿道癌、子宫肉瘤、阴道癌、外阴癌、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症(macroglobulinemia)和威尔姆斯肿瘤(Wilms tumor)。
在一些实施方案中，本公开的化合物显示非致死毒性。
药学上可接受的盐。
本公开提供了本文所述的任何治疗性化合物的药学上可接受的盐的用途。药学上可接受的盐包括例如酸加成盐和碱加成盐。添加至化合物中以形成酸加成盐的酸可为有机酸或无机酸。添加至化合物中以形成碱加成盐的碱可为有机碱或无机碱。在一些实施方案中，药学上可接受的盐是金属盐。在一些实施方案中，药学上可接受的盐是铵盐。
金属盐可由将无机碱添加至本公开的化合物中产生。无机碱由金属阳离子与碱性反离子配对组成，所述碱性反离子诸如像是氢氧根、碳酸根、碳酸氢根或磷酸根。金属可为碱金属、碱土金属、过渡金属或主族金属。在一些实施方案中，金属是锂、钠、钾、铯、铈、镁、锰、铁、钙、锶、钴、钛、铝、铜、镉或锌。
在一些实施方案中，金属盐是锂盐、钠盐、钾盐、铯盐、铈盐、镁盐、锰盐、铁盐、钙盐、锶盐、钴盐、钛盐、铝盐、铜盐、镉盐或锌盐。
铵盐可由将氨或有机胺添加至本公开的化合物中产生。在一些实施方案中，有机胺是三乙胺、二异丙胺、乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、吗啉、N-甲基吗啉、哌啶、N-甲基哌啶、N-乙基哌啶、二苄胺、哌嗪、吡啶、吡唑、哌吡唑、咪唑、吡嗪或哌吡嗪。
在一些实施方案中，铵盐是三乙胺盐、二异丙胺盐、乙醇胺盐、二乙醇胺盐、三乙醇胺盐、吗啉盐、N-甲基吗啉盐、哌啶盐、N-甲基哌啶盐、N-乙基哌啶盐、二苄胺盐、哌嗪盐、吡啶盐、吡唑盐、哌吡唑盐、咪唑盐、吡嗪盐或哌吡嗪盐。
酸加成盐可由将酸添加至本公开的化合物中产生。在一些实施方案中，酸是有机的。在一些实施方案中，酸是无机的。在一些实施方案中，酸是盐酸、氢溴酸、氢碘酸、硝酸、亚硝酸、硫酸、亚硫酸、磷酸、异烟酸、乳酸、水杨酸、酒石酸、抗坏血酸、龙胆酸、葡萄糖酸、葡萄糖醛酸、糖二酸、甲酸、苯甲酸、谷氨酸、泛酸(pantothenic acid)、乙酸、丙酸、丁酸、反丁烯二酸、丁二酸、甲烷磺酸、乙烷磺酸、苯磺酸、对甲苯磺酸、柠檬酸、草酸或顺丁烯二酸。
在一些实施方案中，盐是盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐、硫酸盐、亚硫酸盐、磷酸盐、异烟酸盐、乳酸盐、水杨酸盐、酒石酸盐、抗坏血酸盐、龙胆酸盐、葡萄糖酸盐、葡萄糖醛酸盐、糖二酸盐、甲酸盐、苯甲酸盐、谷氨酸盐、泛酸盐、乙酸盐、丙酸盐、丁酸盐、反丁烯二酸盐、丁二酸盐、甲烷磺酸盐(甲磺酸盐)、乙烷磺酸盐、苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐、柠檬酸盐、草酸盐或顺丁烯二酸盐。
本公开的药物组合物。
本公开的药物组合物可例如在用例如另一药剂治疗对象之前、期间或之后使用。
对象可为例如年长的成人、成人、青少年、青春期前的少年、儿童、学步儿、婴儿、新生儿以及非人动物。在一些实施方案中，对象是患者。
本公开的药物组合物可为本文所述的任何药物化合物与其他化学组分诸如载体、稳定剂、稀释剂、分散剂、助悬剂、增稠剂和/或赋形剂的组合。药物组合物有助于化合物向生物体的施用。药物组合物可通过各种形式和途径(包括例如静脉内、皮下、肌肉内、口服、胃肠外、经眼、皮下、经皮、经鼻、经阴道和经表面(topical)施用)以药物组合物形式以治疗有效量施用。
药物组合物可以局部(local)方式施用，例如通过将化合物直接注射至器官中，任选地以储库或持续释放制剂或植入物形式。药物组合物可以快速释放制剂的形式，以延长释放制剂的形式，或以中等释放制剂的形式提供。快速释放形式可提供立即释放。延长释放制剂可提供控制释放或持续延迟释放。
对于口服施用，药物组合物可通过将活性化合物与药学上可接受的载体或赋形剂组合来配制。此类载体可用于配制液体、凝胶剂、糖浆、酏剂、浆液或混悬剂，用于由对象口服摄取。用于口服可溶解制剂中的溶剂的非限制性实例可包括水、乙醇、异丙醇、盐水、生理盐水、DMSO、二甲基甲酰胺、磷酸钾缓冲液、磷酸盐缓冲盐水(PBS)、磷酸钠缓冲液、4-2-羟基乙基-1-哌嗪乙烷磺酸缓冲液(HEPES)、3-(N-吗啉代)丙烷磺酸缓冲液(MOPS)、哌嗪-N,N′-双(2-乙烷磺酸)缓冲液(PIPES)和盐水柠檬酸钠缓冲液(SSC)。用于口服可溶解制剂中的共溶剂的非限制性实例可包括蔗糖、脲、克列莫佛(cremaphor)、DMSO和磷酸钾缓冲液。
药物制剂可被配制用于静脉内施用。药物组合物可呈作为在油性或水性媒介物中的无菌混悬剂、溶液或乳剂的适于胃肠外注射的形式，并且可含有配制剂，诸如助悬剂、稳定剂和/或分散剂。用于胃肠外施用的药物制剂包括呈水溶性形式的活性化合物的水溶液。活性化合物的混悬剂可制备成油性注射混悬剂。适合亲脂性溶剂或媒介物包括脂肪油诸如芝麻油，或合成脂肪酸酯诸如油酸乙酯或甘油三酯，或脂质体。混悬剂还可含有适合稳定剂或增加化合物的溶解性以允许制备高度浓缩溶液的剂。或者，活性成分可呈用于在使用之前用适合媒介物例如无菌无热原水复原的粉末形式。
活性化合物可经局部施用，并且可配制成多种可经局部施用的组合物，诸如溶液、混悬剂、洗剂、凝胶剂、糊剂、含药棒、香膏剂、乳膏剂和软膏剂。此类药物组合物可含有增溶剂、稳定剂、张力增强剂、缓冲剂和防腐剂。
本公开的化合物可经局部施加至对象的皮肤或体腔，例如口腔、阴道腔、膀胱腔、颅腔、脊髓腔、胸腔或骨盆腔。本公开的化合物可施加至可及的体腔。
化合物还可配制成含有常规栓剂基质(诸如可可脂或其他甘油酯)以及合成聚合物(诸如聚乙烯吡咯烷酮和PEG)的直肠组合物，诸如灌肠剂、直肠凝胶剂、直肠泡沫剂、直肠气雾剂、栓剂、胶冻栓剂或保留灌肠剂。在组合物的栓剂形式中，低熔点蜡(诸如任选地与可可脂组合的脂肪酸甘油酯的混合物)可熔化。
在实践本文提供的治疗或使用方法时，将治疗有效量的本文所述的化合物以药物组合物形式施用至患有待治疗的疾病或病况的对象。在一些实施方案中，对象是哺乳动物，诸如人。治疗有效量可视疾病的严重性、对象的年龄和相对健康状况、所用化合物的效能以及其他因素而广泛变化。化合物可单独使用，或作为混合物的组分与一种或多种治疗剂组合使用。
药物组合物可使用一种或多种有助于将活性化合物加工成可在药学上使用的制剂的生理上可接受的载体来配制，所述载体包括赋形剂和助剂。视所选施用途径而定，配方可加以修改。包含本文所述的化合物的药物组合物可例如通过混合、溶解、乳化、包封、包埋或压制工艺来制造。
药物组合物可包括至少一种药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂以及呈游离碱或药学上可接受的盐形式的本文所述的化合物。药物组合物可含有增溶剂、稳定剂、张力增强剂、缓冲剂和防腐剂。
用于制备包含本文所述的化合物的组合物的方法包括将化合物与一种或多种惰性的药学上可接受的赋形剂或载体一起配制以形成固体、半固体或液体组合物。固体组合物包括例如粉剂、片剂、可分散颗粒剂、胶囊和扁囊剂。液体组合物包括例如化合物溶解在其中的溶液，包含化合物的乳剂，或含有包含如本文公开的化合物的脂质体、胶束或纳米粒子的溶液。半固体组合物包括例如凝胶剂、混悬剂和乳膏剂。组合物可呈以下形式：液体溶液或混悬剂；适于在使用之前在液体中溶解或悬浮的固体形式；或乳剂。这些组合物还可含有少量无毒辅助物质，诸如湿润剂或乳化剂、pH缓冲剂以及其他药学上可接受的添加剂。
适用于本公开中的剂型的非限制性实例包括液体、粉剂、凝胶剂、纳米混悬剂、纳米粒子、微凝胶剂、水性或油性混悬剂、乳剂以及它们的任何组合。
适用于本公开中的药学上可接受的赋形剂的非限制性实例包括粘合剂、崩解剂、抗粘附剂、抗静电剂、表面活性剂、抗氧化剂、包衣剂、着色剂、增塑剂、防腐剂、助悬剂、乳化剂、抗微生物剂、球化剂以及它们的任何组合。
本公开的组合物可为例如立即释放形式或控制释放制剂。立即释放制剂可被配制以允许化合物快速起作用。立即释放制剂的非限制性实例包括可易于溶解的制剂。控制释放制剂可为已被调整以致活性剂的释放速率和释放概况可与生理和时间治疗要求匹配，或替代地，已被配制以实现以程序化速率释放活性剂的药物制剂。控制释放制剂的非限制性实例包括颗粒剂、延迟释放颗粒剂、水凝胶(例如具有合成或天然来源)、其他胶凝剂(例如形成凝胶的膳食纤维)、基于基质的制剂(例如包含具有至少一种分散在其中的活性成分的聚合材料的制剂)、在基质内的颗粒、聚合物混合物和颗粒团。
在一些实施方案中，控制释放制剂是延迟释放形式。延迟释放形式可被配制以延迟化合物的作用，持续延长时期。延迟释放形式可被配制以延迟有效剂量的一种或多种化合物的释放，例如持续约4、约8、约12、约16或约24小时。
控制释放制剂可为持续释放形式。持续释放形式可被配制以例如在延长时期内维持化合物的作用。持续释放形式可被配制以在约4、约8、约12、约16或约24小时内提供有效剂量的本文所述的任何化合物(例如提供生理上有效的血液概况)。
药学上可接受的赋形剂的非限制性实例可例如见于以下中：Remington:TheScience and Practice of Pharmacy,第十九版(Easton,Pa.:Mack Publishing Company,1995)；Hoover,John E.,Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pennsylvania 1975；Liberman,H.A.和Lachman,L.编,Pharmaceutical DosageForms,Marcel Decker,New York,N.Y.,1980；以及Pharmaceutical Dosage Forms andDrug Delivery Systems,第七版(Lippincott Williams and Wilkins1999)，所述文献中的每一者通过引用以它的整体并入本文。
可以任何顺序或同时施用多种治疗剂。在一些实施方案中，本公开的化合物与用另一治疗剂进行的治疗组合，在所述治疗之前，或在所述治疗之后施用。如果同时，那么多种治疗剂可以单一联合形式或以多个形式例如以多个单独丸剂形式提供。剂可一起或单独包装在单一包装中或多个包装中。治疗剂中的一者或全部可以多次剂量给与。如果不同时，那么多次剂量之间的时间选择可变化，直至多达约一个月。
本文所述的治疗剂可在疾病或病况发生之前、期间或之后施用，并且施用含有治疗剂的组合物的时间选择可变化。举例来说，化合物可用作预防剂，并且可连续施用至具有病况或疾病倾向的对象以减小疾病或病况发生的可能性。组合物可在症状发作期间或在症状发作之后尽可能快地施用至对象。治疗剂的施用可在症状发作的前48小时内，在症状发作的前24小时内，在症状发作的前6小时内，或在症状发作的3小时内开始。初始施用可使用本文所述的任何制剂通过任何实用途径来进行，诸如通过本文所述的任何途径。
化合物可在检测到或怀疑疾病或病况发作之后一旦可行即加以施用，并且持续为治疗所述疾病所必需的时长，诸如像从约1个月至约3个月。在一些实施方案中，可施用化合物的时长可为约1天、约2天、约3天、约4天、约5天、约6天、约1周、约2周、约3周、约4周、约1个月、约5周、约6周、约7周、约8周、约2个月、约9周、约10周、约11周、约12周、约3个月、约13周、约14周、约15周、约16周、约4个月、约17周、约18周、约19周、约20周、约5个月、约21周、约22周、约23周、约24周、约6个月、约7个月、约8个月、约9个月、约10个月、约11个月、约1年、约13个月、约14个月、约15个月、约16个月、约17个月、约18个月、约19个月、约20个月、约21个月、约22个月、约23个月、约2年、约2.5年、约3年、约3.5年、约4年、约4.5年、约5年、约6年、约7年、约8年、约9年或约10年。治疗的时长可针对每个对象有所变化。
本文所述的药物组合物可呈适于单次施用精确剂量的单位剂型。在单位剂型中，制剂被分成含有适量的一种或多种化合物的单位剂量。单位剂量可呈含有分立的制剂量的包装的形式。非限制性实例是包装可注射剂、小瓶剂或安瓿剂。水性悬浮液组合物可包装在单次剂量非可再闭合容器中。可使用多次剂量可再闭合容器，例如与或不与防腐剂组合使用。注射用制剂可以例如在安瓿中或在具有防腐剂的多剂量容器中的单位剂型提供。
本文提供的药物组合物可与其他疗法联合施用，所述其他疗法例如是化学疗法、放射、手术、消炎剂和所选的维生素。其他剂可在药物组合物之前、之后或与药物组合物相伴施用。
视预定施用模式而定，药物组合物可呈固体、半固体或液体剂型的形式，诸如像片剂、栓剂、丸剂、胶囊、粉剂、液体、混悬剂、洗剂、乳膏剂或凝胶剂，例如呈适于单次施用精确剂量的单位剂型。
对于固体组合物，无毒固体载体包括例如药品级甘露糖醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、滑石、纤维素、葡萄糖、蔗糖和碳酸镁。
适于与本公开的组合物组合的药物活性剂的非限制性实例包括抗感染剂，即氨基糖苷，抗病毒剂、抗微生物剂、抗胆碱能剂/解痉药、抗糖尿病剂、抗高血压剂、抗赘生剂、心血管剂、中枢神经系统剂、凝血调节剂、激素、免疫剂、免疫抑制剂和眼用制剂。
化合物可通过脂质体技术递送。使用脂质体作为药物载体可增加化合物的治疗指数。脂质体由天然磷脂组成，并且可含有具有表面活性剂性质的混合脂质链(例如卵磷脂酰乙醇胺)。脂质体设计可采用用于附接至不健康组织的表面配体。脂质体的非限制性实例包括多层囊泡(MLV)、小单层囊泡(SUV)和大单层囊泡(LUV)。可调节脂质体物理化学性质以优化通过生物屏障的穿透和在施用部位处的滞留，并且降低显现过早降解和对非靶标组织的毒性的可能性。最优的脂质体性质取决于施用途径：大尺寸脂质体在局部注射后显示良好滞留，小尺寸脂质体更加适合于实现被动靶向。聚乙二醇化降低由肝和脾对脂质体的摄取，并且增加循环时间，从而由于增强的渗透性和滞留(EPR)效应而导致在发炎部位处的定位增加。另外，可修饰脂质体表面以实现所包封的药物选择性递送至特定靶标细胞。靶向性配体的非限制性实例包括对集中在与疾病相关的细胞的表面上的受体具有特异性的单克隆抗体、维生素、肽和多糖。
适用于本公开中的剂型的非限制性实例包括液体、酏剂、纳米混悬剂、水性或油性混悬剂、滴剂、糖浆以及它们的任何组合。适用于本公开中的药学上可接受的赋形剂的非限制性实例包括粒化剂、粘合剂、润滑剂、崩解剂、甜味剂、助流剂、抗粘附剂、抗静电剂、表面活性剂、抗氧化剂、树胶、包衣剂、着色剂、调味剂、包衣剂、增塑剂、防腐剂、助悬剂、乳化剂、植物纤维素材料和球化剂以及它们的任何组合。
本公开的组合物可以试剂盒形式包装。在一些实施方案中，试剂盒包括关于组合物的施用/使用的书面说明书。书面材料可为例如标签。书面材料可建议施用的条件和方法。说明书对对象和主管医师提供关于从疗法的施用中获得最优临床结局的最佳指导。书面材料可为标签。在一些实施方案中，标签可由监管机构例如美国食品与药物管理局(Foodand Drug Administration，FDA)、欧洲药品管理局(European Medicines Agency，EMA)或其他监管机构核准。
给药。
本文所述的药物组合物可呈适于单次施用精确剂量的单位剂型。在单位剂型中，制剂被分成含有适量的一种或多种化合物的单位剂量。单位剂量可呈含有分立的制剂量的包装的形式。非限制性实例是在小瓶或安瓿中的液体。水性悬浮液组合物可包装在单次剂量非可再闭合容器中。可使用多次剂量可再闭合容器，例如与防腐剂组合使用。胃肠外注射用制剂可以例如在安瓿中或在具有防腐剂的多剂量容器中的单位剂型提供。
本文所述的化合物可以约1mg至约2000mg；约100mg至约2000mg；约10mg至约2000mg；约5mg至约1000mg、约10mg至约500mg、约50mg至约250mg、约100mg至约200mg、约1mg至约50mg、约50mg至约100mg、约100mg至约150mg、约150mg至约200mg、约200mg至约250mg、约250mg至约300mg、约300mg至约350mg、约350mg至约400mg、约400mg至约450mg、约450mg至约500mg、约500mg至约550mg、约550mg至约600mg、约600mg至约650mg、约650mg至约700mg、约700mg至约750mg、约750mg至约800mg、约800mg至约850mg、约850mg至约900mg、约900mg至约950mg或约950mg至约1000mg的范围存在于组合物中。
本文所述的化合物可以约1mg、约2mg、约3mg、约4mg、约5mg、约10mg、约15mg、约20mg、约25mg、约30mg、约35mg、约40mg、约45mg、约50mg、约55mg、约60mg、约65mg、约70mg、约75mg、约80mg、约85mg、约90mg、约95mg、约100mg、约125mg、约150mg、约175mg、约200mg、约250mg、约300mg、约350mg、约400mg、约450mg、约500mg、约550mg、约600mg、约650mg、约700mg、约750mg、约800mg、约850mg、约900mg、约950mg、约1000mg、约1050mg、约1100mg、约1150mg、约1200mg、约1250mg、约1300mg、约1350mg、约1400mg、约1450mg、约1500mg、约1550mg、约1600mg、约1650mg、约1700mg、约1750mg、约1800mg、约1850mg、约1900mg、约1950mg或约2000mg的量存在于组合物中。
在一些实施方案中，剂量可以药物的量除以对象的质量表示，例如每千克对象体重的药物毫克数。在一些实施方案中，以在约5mg/kg至约50mg/kg、250mg/kg至约2000mg/kg、约10mg/kg至约800mg/kg、约50mg/kg至约400mg/kg、约100mg/kg至约300mg/kg或约150mg/kg至约200mg/kg的范围内的量施用化合物。
实施例
实施例1：具有4-((1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物核心的化合物的合成。
在二噁烷(1.2mL)和H2O(300μL)的混合物中制备4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物(50mg，105.87μmol，1当量)的溶液。在氮气氛围下，将RB(OH)2(2当量)、Cs2CO3(103.48mg，317.61μmol，3当量)和Pd(PPh3)4(24.47mg，21.17μmol，0.2当量)添加至所述溶液中。在100℃下将所得反应混合物搅拌1h。使用LC-MS分析来监测反应的完成。将反应混合物倾倒至饱和EDTA溶液(5mL)中，搅拌2小时，并且用二氯甲烷(5mL)萃取两次。将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用硫酸钠干燥，并且真空浓缩。使用制备型HPLC纯化所得残余物以提供所需R取代的产物。
4-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯甲酰胺(化合物1A)的合成：向4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物(40mg，84.70μmol，1当量)在二噁烷(1.60mL)和H2O(400μL)中的溶液中添加(4-氨基甲酰基苯基)硼酸(27.94mg，169.40μmol，2当量)、Cs2CO3(82.79mg，254.10μmol，3当量)和Pd(PPh3)4(9.79mg，8.47μmol，0.10当量)。在100℃下，在氮气氛围下，将所得混合物搅拌1h。将混合物倾倒至饱和EDTA溶液(5mL)中，并且搅拌2h。接着将混合物用DCM(5mL×2)萃取，并且将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的4-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯甲酰胺(化合物1A)(18.60mg，39.16μmol，46.23％产率)。LC-MS(ES+,m/z):466.2。
额外化合物：4-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-N-甲基苯甲酰胺(化合物5A)，23.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):496.2；3-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯甲腈(化合物10A)，32.5％产率，LC-MS(ES+,m/z):448.0；4-{[2-(2-氟-4-甲基苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物11A)，31％产率，LC-MS(ES+,m/z):455.2；4-{[2-(3-氯苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物12A)，34.5％产率，LC-MS(ES+,m/z):457.1；4-{[2-(3-甲氧基苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物13A)，24.9％产率，LC-MS(ES+,m/z):453.2；4-{[2-(4-氯苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物14A)，51.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):457.1；3-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯甲酸(化合物20A)，14.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):467.2；4-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯甲酸(化合物23AB)，8.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):467.2；4-({2-[3-(二甲基氨基)苯基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基}氨基)-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物21A)，17.6％产率，LC-MS(ES+,m/z):466.2；3-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-N-甲基苯甲酰胺(化合物22A)，18.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):480.2；4-[(2-{4-[(吗啉-4-基)甲基]苯基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基]-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物24A)，18.9％产率，LC-MS(ES+,m/z):522.3；1-(4-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯基)环丙烷-1-甲腈(化合物26A)，26.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):488.1；4-({2-[4-(羟基甲基)苯基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基}氨基)-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物27A)，9.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):453.2。
实施例2：4-({2-[4-(氨基甲基)苯基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基}氨基)-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物2A)和4-[(2-{4-[(甲基氨基)甲基]苯基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基]-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物3A)的合成。
向4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物(200mg，423.5μmol，1当量)在二噁烷(2.40mL)和H2O(600μL)中的溶液中添加(4-(((叔丁氧基羰基)氨基)甲基)苯基)硼酸或甲基(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(212.67mg，847μmol，2当量)、Cs2CO3(413.95mg，1.27mmol，3当量)和Pd(PPh3)4(97.88mg，84.70μmol，0.20当量)。在100℃下，在氮气氛围下，将所得混合物搅拌1h。将混合物倾倒至饱和EDTA(5mL)中，并且搅拌2h。接着将混合物用DCM(5mL×2)萃取，并且将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需产物。4-({2-[4-(氨基甲基)苯基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基}氨基)-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物2A)，42.5％产率，LC-MS(ES+,m/z):452.2；4-[(2-{4-[(甲基氨基)甲基]苯基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基]-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物3A)，36.2％产率，LC-MS(ES+,m/z):466.2。
实施例3：具有4-((2-(4-(氨基甲基)苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物核心的化合物的合成。
向2-(5-氨基吡啶-2-基)-2-甲基丙腈(999.44mg，6.20mmol，1当量)在二噁烷(10mL)中的溶液中添加Boc2O(4.06g，18.60mmol，4.27mL，3当量)。在100℃下，在N2下，将反应搅拌12h。添加水，并且将反应混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(PE:EA＝10:1)来纯化以提供(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)氨基甲酸叔丁酯(1.50g，5.74mmol，92.58％产率)。LC-MS(ES+,m/z):262.2。
向(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)氨基甲酸叔丁酯(1.50g，5.74mmol，1当量)在DMF(15mL)中的溶液中添加NaH(688.81mg，17.22mmol，60％纯度，3当量)。将反应搅拌0.5h，并且添加1-溴-4-(溴甲基)苯(1.43g，5.74mmol，1当量)。在N2下将反应再搅拌1.5h。将混合物倾倒至饱和NH4Cl溶液(15mL)中，并且用DCM(15mL×2)萃取。将有机相用水(15mL)和盐水(15mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(PE:EA＝10:1)来纯化以提供(4-溴苯甲基)(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)氨基甲酸叔丁酯(1.50g，3.49mmol，60.73％产率)。
向(4-溴苯甲基)(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)氨基甲酸叔丁酯(498.63mg，1.51mmol，1当量)在DMSO(5mL)中的溶液中添加KOAc(474.21mg，4.83mmol，3.20当量)、B2Pin2(766.90mg，3.02mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(36.99mg，45.30μmol，0.03当量)。在90℃下，在N2下，将反应搅拌2h。将反应倾倒至2M EDTA中，并且搅拌。将反应混合物用DCM(15mL×2)萃取，并且将有机相用水(15mL)和盐水(15mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(PE:EA＝10:1)来纯化以提供(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(300mg，795.14μmol，52.66％产率)。LC-MS(ES+,m/z):478.4。
向4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物(100mg，211.75μmol，1当量)在二噁烷(1.20mL)和H2O(300μL)中的溶液中添加(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(202.18mg，423.50μmol，2当量)、Cs2CO3(206.98mg，635.25μmol，3当量)和Pd(PPh3)4(24.47mg，21.18μmol，0.10当量)。在100℃下，在N2下，将反应搅拌1h。将混合物倾倒至饱和EDTA溶液(5mL)中，并且搅拌2h。接着将混合物用DCM(5mL×2)萃取。将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(PE:EA＝1:1)来纯化以提供(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)(4-(4-((1,1-二氧代四氢-2H-噻喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，143.72μmol，67.87％产率)。LC-MS(ES+,m/z):696.3。
在HCl/EA(4M，10mL，278.32当量)中制备(6-(2-氰基丙烷-2-基)吡啶-3-基)(4-(4-((1,1-二氧代四氢-2H-噻喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，143.72μmol，1当量)的溶液，并且在25℃下，在N2下搅拌1h。真空移除溶剂以产生粗产物。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需产物。2-(5-{[(4-{4-[(1,1-二氧代-1λ6-硫杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}苯基)甲基]氨基}吡啶-2-基)-2-甲基丙腈(化合物7A)：37.35％产率。LC-MS(ES+,m/z):596.1。
额外化合物：使用以上所述的方法来合成4-{[2-(4-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物8A)：33.03％产率。LC-MS(ES+,m/z):606.0；以及4-[(2-{4-[(苯基氨基)甲基]苯基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基]-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物9A)：27.66％产率。LC-MS(ES+,m/z):528.2。
实施例4：具有2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺核心的化合物的合成。
路线1：向2-碘-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(100mg，167.54μmol，1当量)在二噁烷(2.40mL)和H2O(600μL)中的溶液中添加(4-甲酰基苯基)硼酸(50.24mg，335.09μmol，2当量)、Cs2CO3(163.77mg，502.63μmol，3当量)和Pd(PPh3)4(38.72mg，33.51μmol，0.20当量)。在90℃下将反应搅拌2h。将混合物倾倒至饱和EDTA溶液(5mL)中，并且搅拌2h。接着将混合物用DCM(5mL×2)萃取，并且将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供4-(4-((1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲醛(50mg，102.98μmol，61.46％产率)。LC-MS(ES+,m/z):486.4。
向4-(4-((1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲醛(40mg，82.38μmol，1当量)在甲醇(2mL)中的溶液中添加RNH2(3-氯苯胺；10.51mg，82.38μmol，8.76μL，1当量)和MgSO4(49.58mg，411.90μmol，5当量)。在80℃下将反应搅拌1.5h。接着，添加CH3COOH(4.95mg，82.38μmol，4.71μL，1当量)和NaBH4(15.58mg，411.90μmol，5当量)，并且在25℃下将混合物再搅拌0.5h。将混合物倾倒至2M NaOH中，并且用DCM(5mL×2)萃取。将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供R取代的2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺产物。2-(4-(((3-氯苯基)氨基)甲基)苯基)-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物12A)(13.50mg，22.52μmol，27.33％产率)。LC-MS(ES+,m/z):597.0。
路线2：向4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯甲醛(1当量)在DCM中的溶液中添加NHR、MgSO4(5当量)和NaBH3CN(5当量)。在25℃下，在N2下，将反应搅拌2h。添加水，并且将反应混合物用DCM(5mL×2)萃取。将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法或制备型TLC(DCM:甲醇＝20:1)来纯化以提供所需R取代的4,4,5,5-四甲基-2-(对甲苯基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷产物。
向2-碘-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)和N-(R-取代的)-1-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)甲胺(2当量)在二噁烷(1.20mL)和H2O(300μL)中的溶液中添加Cs2CO3(96.34mg，295.68μmol，3当量)和Pd(PPh3)4(22.78mg，19.71μmol，0.20当量)。在90℃下，在N2下，将反应搅拌2h。将混合物倾倒至饱和EDTA溶液(10mL)中，并且搅拌2h。接着将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需R取代的2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-(1-(四氢-2H-吡喃-4-基)哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺产物。
2-(4-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}苯基)-N-[1-(氧杂环己烷-4-基)哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物30A)，LC-MS(ES+,m/z):641.4；2-(4-{[(6-甲基吡啶-3-基)氨基]甲基}苯基)-N-[1-(氧杂环己烷-4-基)哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物31A)，LC-MS(ES+,m/z):578.4；2-(4-{[(4-甲氧基苯基)氨基]甲基}苯基)-N-[1-(氧杂环己烷-4-基)哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物33A)，LC-MS(ES+,m/z):593.4。
实施例5：具有1-甲氧基-3-(4-((2-苯基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-基)丙-2-醇核心的化合物的合成。
向1-(4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-基)-3-甲氧基丙-2-醇(1当量)在二噁烷(20mL)和H2O(5mL)中的溶液中添加R取代的硼酸或R取代的硼酸酯(2当量)、Cs2CO3(1当量)和Pd(PPh3)4(1当量)。在90℃下将反应搅拌2h。将饱和EDTA溶液(20mL)和EA(30mL)添加至反应中，并且将所得混合物搅拌1h。将水相用EA(10mL×3)萃取，用无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来再纯化以提供呈黄色固体的所需R取代的1-甲氧基-3-(4-((1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-基)丙-2-醇产物。
1-甲氧基-3-(4-{[2-(3-甲基-2H-吲唑-6-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}哌啶-1-基)丙-2-醇(化合物47A)，LC-MS(ES+,m/z):516.2；1-(4-{[2-(2H-吲唑-6-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}哌啶-1-基)-3-甲氧基丙-2-醇(化合物48A)，LC-MS(ES+,m/z):502.2；以及4-{[1-(2-羟基-3-甲氧基丙基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-2',3'-二氢-1H,1'H-[2,6'-联吲哚]-2'-酮(化合物49A)，LC-MS(ES+,m/z):517.2。
实施例6：具有2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺核心的化合物的合成。
向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(12g，1当量)在乙醇(120mL)中的溶液中添加1-甲基哌啶-4-酮(3当量)和Ti(OEt)4(3当量)。在50℃下将混合物搅拌1h，并且添加NaBH3CN(5当量)。在50℃下将所得混合物搅拌0.5h。将残余物用饱和NaHCO3溶液(200mL)淬灭，并且将混合物用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×2)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
向2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(200mg，1当量)和(4-甲酰基苯基)硼酸(2当量)在二噁烷(1.6mL)和H2O(0.4mL)中的溶液中添加Na2CO3(3当量)和Pd(dppf)Cl2(0.1当量)。在80℃下将混合物搅拌0.5h。将残余物倾倒至2M EDTA(50mL)中，并且将所得混合物搅拌60min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供4-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲醛。
向4-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲醛(50mg，1当量)在甲醇(3mL)中的溶液中添加R-NH2(2当量)和AcOH(10当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。接着添加NaBH3CN(5当量)，并且在50℃下将所得反应混合物搅拌15min。将残余物倾倒至饱和NaHCO3水溶液(100mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需R取代的2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺产物。
2-(4-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}苯基)-N-[1-(氧杂环己烷-4-基)哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物35A)，5.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):522.2；2-{4-[(环戊基氨基)甲基]苯基}-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物40A)，LC-MS(ES+,m/z):485.4；2-(4-{1-[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]乙基}苯基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物41A)，2.25％产率，LC-MS(ES+,m/z):585.4。
实施例7：具有2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺核心的化合物的合成。
在0℃下，向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺盐酸盐(10g，29.40mmol，1当量)和3-氟-4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(31.93g，147mmol，5当量)在DMF(100mL)中的溶液中添加TMSCl(15.97g，147mmol，18.66mL，5当量)。将反应搅拌1h，并且添加BH3·THF(1M，294mL，10当量)。在0℃下将反应再搅拌2h。将混合物用Na2CO3(10mL)淬灭。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供(3R,4S)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯。
向(3R,4S)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(1当量)在DCM中的溶液中添加TFA(12.19当量)。在25℃下将反应搅拌1h。将混合物用饱和Na2CO3溶液(20mL)淬灭，并且用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供N-((3R,4S)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
向N-((3R,4S)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(800mg，1.81mmol，1当量)和多聚甲醛(108.89mg，3.63mmol，99.90μL，2当量)在甲醇(10mL)中的溶液中添加NaBH3CN(569.71mg，9.07mmol，5当量)和AcOH(108.88ug，1.81μmol，1.04e-1μL，0.001当量)。在50℃下将反应搅拌0.5h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法来纯化以提供N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
向N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)在二噁烷和H2O中的溶液中添加(4-甲酰基苯基)硼酸(2当量)、Na2CO3(3当量)和Pd(dppf)Cl2(0.05当量)。在110℃下将反应搅拌0.5h。将混合物倾倒至2M EDTA中，并且搅拌2h。将混合物用DCM萃取(×2)，并且将有机相用水和盐水洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(PE/EA＝1:1)来纯化以提供4-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲醛。
向4-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯甲醛(1当量)和R-NH2(2当量)在甲醇中的溶液中添加AcOH(75.79当量)。将反应搅拌0.5h，并且添加NaBH3CN(5当量)。在50℃下将反应再搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需R取代的2-(4-(氨基甲基)苯基)-N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺产物。
(+/-)-2-{4-[(环丙基氨基)甲基]苯基}-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物41A)，11％产率，LC-MS(ES+,m/z):475.3；(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(4-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物43A)，8％产率，LC-MS(ES+,m/z):619.2；N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(4-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物44A)，11.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):589.2；(+/-)-N-{[4-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯基]甲基}苯甲酰胺(化合物45A)，73.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):589.2；539.2；(+/-)-N-{[4-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)苯基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物46A)，7.92％产率，LC-MS(ES+,m/z):503.2。
表1显示具有2-苯基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚核心的化合物。
表1
实施例8：(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺；(+/-)-N-((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺；以及2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备
在0℃下，向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(2g，5.88mmol，1当量)和3-氟-4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(6.39g，29.40mmol，5当量)在1,2-二氯乙烷(20mL)和乙酸(60mL)的混合物中的溶液中添加三乙酰氧基硼氢化钠(6.23g，29.40mmol，5当量)。将反应加热至50℃，并且搅拌5h。将残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液中以将混合物的pH调整至7～8。将水相用EA(500mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(500mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC(碱性条件)来纯化以提供呈浅黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-Boc中间体(9.5g，17.55mmol，59.7％产率)。LC-MS(M+H+)＝542.0。还从HPLC分离中获得(3R,4R)-异构体。
向以上(+/-)-(3S,4R)-Boc中间体(7g，12.93mmol，1当量)在DCM(500mL)中的溶液中添加TFA(17.97g，157.57mmol，11.67mL，12.19当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将混合物通过添加饱和碳酸钠水溶液(500mL)来淬灭，并且将混合物用DCM(500mL×2)萃取。将有机相用盐水(500mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供所需(3S,4R)-脱保护的哌啶化合物(4g，粗品)。LC-MS(M+H+)＝441.9。
向以上(3S,4R)-脱保护的哌啶化合物(1g，2.27mmol，1当量)和多聚甲醛(340.27mg，11.33mmol，312.2μL，5当量)在MeOH(10mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(712.14mg，11.33mmol，5当量)和乙酸(136.10ug，2.27μmol，0.13μL，0.001当量)。在50℃下将混合物搅拌30min。将混合物用DCM(100mL×2)萃取。将有机相用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.8g，粗品)。LC-MS(M+H+)＝456.0。
使用与以上顺序相同的顺序，采用(3R,4R)-异构体获得(+/-)-N-((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(12g，35.29mmol，1当量)在乙醇(120mL)中的溶液中添加N-甲基-4-哌啶酮(11.98g，105.86mmol，12.31mL，3当量)和乙醇钛(24.15g，105.86mmol，21.95mL，3当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。接着，添加氰基硼氢化钠(11.09g，176.43mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌0.5h。将反应通过添加饱和碳酸氢钠水溶液(200mL)来淬灭。将混合物用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×2)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(PE:EA＝1:0至1:1，接着DCM:MeOH＝10:1至20:1)来纯化以提供呈红棕色固体的2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(12.5g，26.30mmol，74.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z)＝438.1。
实施例9：用于合成化合物1B、2B、3B、4B、8B、14B、15B、16B和17B的一般性程序。
在二噁烷(1.2mL)和H2O(300μL)的混合物中制备4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃-1,1-二氧化物(50mg，105.87μmol，1当量)的溶液。在氮气氛围下，将RB(OH)2、Cs2CO3(103.48mg，317.61μmol，3当量)和Pd(PPh3)4(24.47mg，21.17μmol，0.2当量)添加至所述溶液中。在100℃下，在氮气氛围下，将所得反应混合物搅拌1h。使用LC-MS分析来监测反应完成。将反应混合物倾倒至2.0M EDTA水溶液(5mL)中，搅拌2h，并且用DCM(5mL)萃取两次。将有机相用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型HPLC纯化粗残余物以提供所需R取代的4-((1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃-1,1-二氧化物化合物。
4-((2-(6-甲氧基吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃-1,1-二氧化物(化合物1B)，34.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):454.2；4-((2-(6-甲基吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃-1,1-二氧化物(化合物2B)，39.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):438.2；4-((2-(6-(二甲基氨基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃-1,1-二氧化物(化合物3B)，28.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):467.1；4-((2-(喹啉-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃-1,1-二氧化物(化合物4B)，30.5％产率，LC-MS(ES+,m/z):474.3；5-(4-((1,1-二氧代四氢-2H-噻喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-N-甲基吡啶甲酰胺(化合物8B)，21.0％产率，LC-MS(ES+,m/z):481.2；4-{[2-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基]氨基}-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物14B)，36.6％产率，LC-MS(ES+,m/z):427.2；4-({2-[1-(2-羟基乙基)-1H-吡唑-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基}氨基)-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物15B)，22.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):456.9；4-[(2-{1-[(吡啶-3-基)甲基]-1H-吡唑-4-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基]-1λ6-硫杂环己烷-1,1-二酮(化合物16B)，37.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):504.3；4-((2-(1-(2-甲氧基乙基)-1H-吡唑-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)四氢-2H-噻喃1,1-二氧化物(化合物17B)，19.0％产率，LC-MS(ES+,m/z):471.2。
实施例10：化合物7B的合成。
向4,6-二氯吡啶-2-胺(1g，6.13mmol，1当量)和苯基硼酸(1.12g，9.20mmol，1.5当量)在二噁烷(20mL)和水(10mL)的混合物中的溶液中添加碳酸铯(6g，18.40mmol，3当量)和双(三苯基膦)二氯钯(861.20mg，1.23mmol，0.2当量)。在70℃下将混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(硅胶，PE:EA＝10:1)来纯化以提供中间体4-氯-6-苯基吡啶-2-胺，57％产率。
向在二噁烷(2mL)中的4-氯-6-苯基吡啶-2-胺(200mg，977.3μmol，1当量)中添加双(频哪醇合)二硼(496.32mg，1.95mmol，2当量)、乙酸钾(287.72mg，2.93mmol，3当量)、三环己基膦(20.55mg，73.3μmol，23.8μL，0.075当量)和三(二苯亚甲基丙酮)二钯(44.74mg，48.86μmol，0.05当量)。在120℃下将所得反应混合物搅拌0.5h，并且将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供6-苯基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-胺。LC-MS(M+H+)＝297.3。
向6-苯基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-胺(50mg，114.4μmol，1当量)和2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(36.71mg，171.53μmol，1.5当量)在二噁烷(2mL)中的溶液中添加水(0.5mL)、碳酸钠(36.36mg，343.06μmol，3当量)和双(三苯基膦)二氯钯(4.18mg，5.72μmol，0.05当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将混合物倾倒至2M EDTA(10mL)中并搅拌2h，接着用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC在甲酸条件下来纯化以提供所需产物2-(2-氨基-6-苯基吡啶-4-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
实施例11：1-叔丁基-N-{[6-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)吡啶-3-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物285B)
在25℃下，在氮气下，向甲基三丁基(1-乙氧基乙烯基)锡烷(342mmol，115mL，1.25当量)和6-溴吡啶-3-甲腈(50g，273mmol，1当量)在甲苯(500mL)中的混合物中一次性添加Pd(PPh3)2Cl2(19.18g，27.32mmol，0.1当量)。在130℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物倾倒至饱和EDTA(100mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(3×100mL)萃取。添加10M HCl(100mL)，并且将反应搅拌2h，接着添加饱和碳酸钠以将溶液的pH调整至7～8。将水相用EA(3×100mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在25℃下，将粗产物用甲醇湿磨30min。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝4:1至1:1)来纯化以提供呈白色固体的6-乙酰基吡啶-3-甲腈(36g，246mmol，90.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):147.0[(M+H)+]。
将6-乙酰基吡啶-3-甲腈(10g，68mmol，1当量)、(3-溴苯基)肼盐酸盐(15.3g，68mmol，1当量)在乙醇(100mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在80℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h。将混合物蒸发以提供呈红色固体的粗产物6-[(E)-N-(3-溴苯胺基)-C-甲基-(亚氨基)甲基]吡啶-3-甲腈(20g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):316.9[(M+H)+]。
将6-[(E)-N-(3-溴苯胺基)-C-甲基-(亚氨基)甲基]吡啶-3-甲腈(20g，63.5mmol，1当量)、PPA(63.5mmol，10mL，1当量)的混合物脱气和用氮气吹扫3次，并且在140℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，接着用饱和碳酸氢钠将混合物调整至pH约9。将水层用EA(4×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×200mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250mm×100mm×10um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：30％-60％，24min)来纯化以提供呈浅黄色固体的6-(4-溴-1H-吲哚-2-基)吡啶-3-甲酰胺(1g，5.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):317.9[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向6-(4-溴-1H-吲哚-2-基)吡啶-3-甲酰胺(1g，3.16mmol，1当量)、三氟甲烷磺酸2,2,2-三氟乙酯(881mg，3.80mmol，1.2当量)在DMF(10mL)中的混合物中一次性添加碳酸铯(721.4mg，2.21mmol，0.7当量)，接着将反应加热至100℃，并且搅拌4h。将残余物倾倒至水(30mL)中。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(1×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18(250×70mm，15um)；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：27％-57％，30min)来纯化以提供呈黄色固体的6-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]吡啶-3-甲酰胺(400mg，1mmol，31.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):400.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.12(d,J＝1.9Hz,1H),8.33(dd,J＝2.1,8.3Hz,1H),8.23(t,J＝8.4Hz,2H),7.80(d,J＝8.3Hz,1H),7.69(br s,1H),7.41(d,J＝7.5Hz,1H),7.31-7.29(m,1H),7.28-7.23(m,1H),6.05(q,J＝8.3Hz,2H),4.02(q,J＝7.1Hz,1H),1.99(s,1H),1.17(t,J＝7.1Hz,1H)。
在0℃下，在氮气下，向6-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]吡啶-3-甲酰胺(400mg，1mmol，1当量)在THF(8mL)中的混合物中一次性添加硼烷-二甲基硫醚络合物(10M，40mL，398当量)，接着将混合物加热至50℃，并且搅拌1h。将反应混合物缓慢倾倒至甲醇(15mL)中，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的[6-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-3-吡啶基]甲胺(300mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):386.0[(M+H)+]。
在条件A下，使[6-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-3-吡啶基]甲胺(270mg，703μmol，1当量)和1-叔丁基吡唑-4-甲酸(130mg，774μmol，1.1当量)在DMF(3mL)中偶联。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物1-叔丁基-N-{[6-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)吡啶-3-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(120mg，28.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):535.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.68(br t,J＝5.7Hz,1H),8.62(d,J＝1.6Hz,1H),8.31(s,1H),8.06(d,J＝8.2Hz,1H),7.95(s,1H),7.91(s,1H),7.83(dd,J＝2.1,8.3Hz,1H),7.77(d,J＝8.3Hz,1H),7.38(d,J＝7.6Hz,1H),7.22(t,J＝8.0Hz,1H),7.10(s,1H),6.02(br d,J＝8.9Hz,2H),4.51(d,J＝5.7Hz,2H),1.53(s,9H)。
表2显示以2-(吡啶-3-基)-1H-吲哚核心制备的化合物的清单。
表2
实施例12：化合物9B、11B、12B和13B的合成。
化合物11B：向4,6-二氯吡啶-2-胺(2g，12.20mmol，1当量)和环己-1-烯-1-基硼酸(1.38g，10.98mmol，0.9当量)在二噁烷(10mL)和水(5mL)的混合物中的溶液中添加碳酸铯(11.92g，36.59mmol，3当量)和双(三苯基膦)二氯钯(428.01mg，609.78μmol，0.05当量)。在70℃下将混合物搅拌1h。将混合物倾倒至50mL的水中，并且用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的4-氯-6-(环己-1-烯-1-基)嘧啶-2-胺(1.3g，6.20mmol，50.84％产率)。
将4-氯-6-(环己-1-烯-1-基)嘧啶-2-胺用乙酸酐(5当量)在甲苯(2mL)中处理，并且在120℃下搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供N-乙酰基-N-(4-氯-6-(环己-1-烯-1-基)嘧啶-2-基)乙酰胺。LC-MS(M+H+)＝252.2。
化合物9B、12B和13B：将N-乙酰基-N-(4-氯-6-(环己-1-烯-1-基)嘧啶-2-基)乙酰胺(1当量)用2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1.5当量)、碳酸钾(2当量)、Pd(dppf)Cl2(0.1当量)和双(频哪醇合)二硼(1.5当量)在DMA(2mL)和水(0.5mL)中处理。将反应加热至140℃，并且搅拌0.1h以在通过制备型TLC纯化之后提供单乙酰基中间体N-(4-(环己-1-烯-1-基)-6-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)嘧啶-2-基)乙酰胺，42％产率。LC-MS(ES+,m/z)＝527.2。
向N-(4-(环己-1-烯-1-基)-6-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)嘧啶-2-基)乙酰胺(1当量)在THF(1mL)中的溶液中添加钯/炭(1当量)。在25℃下，在15psi的氢气下，将反应搅拌0.5h。将混合物过滤并倾倒至2M EDTA水溶液(10mL)中，并且搅拌2h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过TLC来纯化以提供N-(4-环己基-6-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)嘧啶-2-基)乙酰胺，66％产率。
向N-(4-环己基-6-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)嘧啶-2-基)乙酰胺(1当量)在MeOH(1mL)中的溶液中添加水(1mL)和氢氧化钠(3当量)。在25℃下将反应搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC在甲酸条件下来纯化以提供所需化合物2-(2-氨基-6-环己基嘧啶-4-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，16％产率。LC-MS(M+H+)＝487.4。
2-(2-氨基-6-苯基嘧啶-4-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物9B)，10％产率，LC-MS(ES+,m/z):481.3；2-(2-(甲基氨基)嘧啶-4-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物12B)，4％产率，LC-MS(ES+,m/z):419.3；2-(2-氨基嘧啶-4-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物13B)，4％产率，LC-MS(ES+,m/z):405.1。
表3显示以2-(嘧啶-4-基)-1H-吲哚核心制备的化合物的清单。
表3
实施例13：化合物21B的合成。
3-溴-5-((叔丁氧基羰基)氨基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯的制备：向3-溴-1H-吡唑-5-胺(800mg，4.94mmol，1当量)和(Boc)2O(2.16g，9.88mmol，2.27mL，2当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加DMAP(60.3mg，493.9μmol，0.1当量)和TEA(999.5mg，9.88mmol，1.37mL，2当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。TLC分析显示一个主要的新斑点，其极性低于起始物料的极性。将反应混合物用水(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈白色固体的3-溴-5-((叔丁氧基羰基)氨基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯(1g，2.76mmol，55.90％产率)。
5-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯的制备：向2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(531.1mg，1.21mmol，1.1当量)、双(频哪醇合)二硼(420.6mg，1.66mmol，1.5当量)和3-溴-5-((叔丁氧基羰基)氨基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯(400mg，1.10mmol，1当量)在DMA(2mL)和H2O(0.5mL)的混合物中的混合物中添加碳酸钾(305.3mg，2.21mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(808mg，1.10mmol，1当量)。在140℃下将混合物加热和搅拌5min。LC-MS分析显示几个新峰。将反应混合物用H2O(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黑棕色固体的5-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯(50mg，84.37μmol，7.64％产率)。
2-(5-氨基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺：向5-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯(50mg，84.4μmol，1当量)在EA(5mL)中的溶液中添加HCl(12M，7.0μL，1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。LC-MS分析检测到已形成约60％的所需化合物。将反应混合物过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝20:1)来纯化以提供呈白色固体的2-(5-氨基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物21B)(5.6mg，13.41μmol，15.90％产率)。LC-MS(ES+,m/z):393.2。
实施例14：化合物23B的合成。
3-溴-5-((叔丁氧基羰基)氨基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯的制备：向3-溴-1H-吡唑-5-胺(5g，30.87mmol，1当量)和(Boc)2O(13.47g，61.73mmol，14.18mL，2当量)在DCM(20mL)中的溶液中添加DMAP(377.1mg，3.09mmol，0.1当量)和TEA(6.25g，61.73mmol，8.59mL，2当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。TLC分析指示一个主要的新斑点，其极性低于起始物料的极性。将反应混合物用水(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5:1)来纯化以提供呈白色固体的3-溴-5-((叔丁氧基羰基)氨基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯(10g，27.61mmol，89.44％产率)。
(3-溴-1H-吡唑-5-基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向3-溴-5-((叔丁氧基羰基)氨基)-1H-吡唑-1-甲酸叔丁酯(10g，27.61mmol，1当量)在MeOH(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(19.08g，138.04mmol，5当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。TLC分析(PE:EA＝3:1，Rf＝0.2)指示剩余约80％的起始物料，并且检测到一个主要的新斑点，其极性低于起始物料的极性。将反应混合物用水(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的(3-溴-1H-吡唑-5-基)氨基甲酸叔丁酯(7g，粗品)。
(3-溴-1-(4-甲氧基苯甲基)-1H-吡唑-5-基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(3-溴-1H-吡唑-5-基)氨基甲酸叔丁酯(7g，26.71mmol，1当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(11.07g，80.12mmol，3当量)、碘化钠(8.01g，53.41mmol，2当量)和4-甲氧基苯甲基氯(4.18g，26.71mmol，3.64mL，1当量)。在60℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用水(80mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈白色固体的(3-溴-1-(4-甲氧基苯甲基)-1H-吡唑-5-基)氨基甲酸叔丁酯(4.2g，10.99mmol，41.14％产率)。LC-MS(ES+,m/z):383.9。
(3-溴-1-(4-甲氧基苯甲基)-1H-吡唑-5-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(3-溴-1-(4-甲氧基苯甲基)-1H-吡唑-5-基)氨基甲酸叔丁酯(4.2g，10.99mmol，1当量)在DMF(1mL)中的溶液中添加氢化钠(659.3mg，16.5mmol，60％纯度，1.5当量)和碘代甲烷(2.34g，16.5mmol，1.03mL，1.5当量)。在0℃下将混合物搅拌1h。LC-MS分析显示几个新峰，并且检测到约70％的所需化合物。将反应混合物用水(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈白色油状物的(3-溴-1-(4-甲氧基苯甲基)-1H-吡唑-5-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(4g，10.09mmol，91.87％产率)。LC-MS(ES+,m/z):396.0。
(1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑-5-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(242.74mg，555.17μmol，1.1当量)、双(频哪醇合)二硼(192.2mg，757.0μmol，1.5当量)和(3-溴-1-(4-甲氧基苯甲基)-1H-吡唑-5-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(200mg，504.7μmol，1当量)在DMA(2mL)和水(0.5mL)的混合物中的溶液中添加碳酸钾(139.5mg，1.01mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(369.3mg，504.7μmol，1当量)。在140℃下将混合物搅拌5min。将反应混合物用水(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黑棕色固体的(1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑-5-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(80mg，127.65μmol，25.29％产率)。LC-MS(ES+,m/z):627.3。
2-(1-(4-甲氧基苯甲基)-5-(甲基氨基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向(1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1H-吡唑-5-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(80mg，127.65μmol，1当量)在EA(2mL)中的溶液中添加4N HCl的EA溶液。在25℃下将混合物搅拌1h。LC-MS分析显示几个新峰，并且检测到约90％的所需化合物。将反应混合物过滤，并且真空浓缩以提供呈黑棕色固体的2-(1-(4-甲氧基苯甲基)-5-(甲基氨基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(60mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):527.1。
2-(5-(甲基氨基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向2-(1-(4-甲氧基苯甲基)-5-(甲基氨基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(60mg，113.94μmol，1当量)在DCM中的溶液中添加硫酸(11.2mg，113.9μmol，2.11μL，1当量)和TFA(13mg，113.9μmol，8.4μL，1当量)。在100℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用水(60mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的2-(5-(甲基氨基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物23B)(6.5mg，16.0μmol，14.04％产率)。LC-MS(ES+,m/z):407.1。
实施例15：化合物22B的合成
3,5-二溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑的制备：在0℃下，向3,5-二溴-1H-吡唑在DMF(20mL)中的溶液中添加氢化钠(缓慢添加，708.3mg，17.7mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将反应混合物搅拌0.5h，并且在0℃下逐滴添加SEMCl(1.92g，11.5mmol，2.04mL，1.3当量)。在0℃下将所得混合物搅拌2h，并且检测到一个新斑点。将反应混合物用饱和氯化铵水溶液(35mL)淬灭，并且用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝1:0至0:1)来纯化以提供呈无色油状物的3,5-二溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑(3.1g，6.53mmol，73.73％产率)。
3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲醛的制备：向3,5-二溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑在THF(3mL)中的溶液中添加异丙基溴化镁(2M，1.68mL，2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将DMF(369mg，5.05mmol，390μL，3当量)添加至反应中，并且在25℃下将混合物再搅拌1h。将反应混合物用水(20mL)稀释，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈无色油状物的3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲醛(0.4g，1.18mmol，70％产率)。
3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲醛的制备：向3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲醛和2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(374.4mg，1.47mmol，1.5当量)在DMA(2mL)和H2O(0.5mL)的混合物中的溶液中添加双(频哪醇合)二硼(374.4mg，1.47mmol，1.5当量)、碳酸钾(271.7mg，1.97mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(719.1mg，982.8μmol，1当量)。在140℃下将混合物搅拌5min。将反应混合物用水(20mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，EA:TEA:MeOH＝20:1:1)来纯化以提供呈黄色油状物的3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲醛(0.03g，47.60μmol，70％产率)。
N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在55℃下，向3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲醛和4-(甲基磺酰基)苯胺在MeOH(3mL)中的溶液中添加乙酸(5.6mg，93.3μmol，5.34μL，1当量)。将混合物搅拌，并且在55℃下添加氰基硼氢化钠(29.3mg，466.7μmol，5当量)。在55℃下将所得混合物再搅拌1h。将反应混合物用水(10mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，EA:TEA:MeOH＝20:1:1)来纯化以提供呈白色固体的N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.055g，67.7μmol，72.5％产率)。
N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在乙醇(1mL)中制备N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺和盐酸(12M，36.2μL，5当量)的溶液。在20℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加饱和碳酸氢钠水溶液来淬灭。将混合物的pH调整至7～8，并且将反应混合物用水(10mL)稀释并用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物22B)，24.7％产率。LC-MS(ES+,m/z):561.3。
实施例16：化合物19B的合成
3-溴-1-苯基-1H-吡唑-5-胺的制备：向3-溴-1H-吡唑-5-胺(1.75g，1.1当量)在甲苯(5mL)中的溶液中添加碘化铜(I)(93.4mg，0.05当量)、碘苯(2g，1当量)和碳酸钾(2.85g，2.1当量)。在110℃下将混合物搅拌1h。将饱和EDTA水溶液(20mL)添加至混合物中，并且将混合物搅拌1h。将反应混合物用水(10mL)稀释，并且用EA(20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝1:0至5:1)来纯化以提供呈棕色固体的3-溴-1-苯基-1H-吡唑-5-胺，40.7％产率。
3-溴-1-苯基-1H-吡唑-5-二(叔丁氧基羰基)-胺的制备：向3-溴-1-苯基-1H-吡唑-5-胺(300mg，1当量)、TEA(191.3mg，1.5当量)和DMAP(7.70mg，0.05当量)在DCM(5mL)中的溶液中添加Boc2O(825mg，3当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用H2O(10mL)稀释，并且用EA(20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈白色固体的3-溴-1-苯基-1H-吡唑-5-二(叔丁氧基羰基)-胺，86.9％产率。
(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)硼酸的制备：在25℃下，在氮气下，向2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.6g，1.37mmol，1当量)和硼酸三异丙酯(387.1mg，2.06mmol，473.25μL，1.5当量)在THF(5mL)中的混合物中一次性添加异丙基氯化镁(2M，3.4mL，5当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将所得混合物搅拌5min。将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)硼酸，18.5％产率。LC-MS(ES+,m/z):356.1。
2-(5-(二(叔丁氧基羰基)氨基)-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在N2下，向(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)硼酸(80mg，225.25μmol，1当量)在水(0.5mL)和二噁烷(2mL)的混合物中的溶液中添加3-溴-1-苯基-1H-吡唑-5-二(叔丁氧基羰基)-胺(118.48mg，1.2当量)、碳酸钠(47.75mg，2当量)和Pd(dppf)Cl2(16.48mg，0.1当量)。在100℃下将混合物搅拌10min。将2M EDTA水溶液(20mL)添加至混合物中，并且将所得混合物再搅拌1h。将反应混合物用水(10mL)稀释，并且用EA(20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的2-(5-(二(叔丁氧基羰基)氨基)-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，13.28％产率。LC-MS(ES+,m/z):669.4。
2-(5-氨基-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向2-(5-(二(叔丁氧基羰基)氨基)-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(20mg，29.9μmol，1当量)在DCM(1mL)中的混合物添加TFA(1mL)。将混合物脱气和用氮气吹扫(×3)，并且在25℃下，在氮气下，将混合物搅拌30min。将反应混合物倾倒至饱和碳酸氢钠水溶液(10mL)中，用水(10mL)稀释，并且用EA(10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的2-(5-氨基-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物19B)。LC-MS(ES+,m/z):469.2。
实施例17：合成化合物19B的替代性方法。
2-(5-(二(叔丁氧基羰基)氨基)-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在二噁烷(2mL)和水(0.5mL)的混合物中制备2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(100mg，228.71μmol，1当量)、3-溴-N,N-二(叔丁氧基羰基)-1-苯基-1H-吡唑-5-胺(100.3mg，228.7μmol，1当量)、双(频哪醇合)二硼(87.1mg，343.1μmol，1.5当量)和碳酸钾(63.2mg，457.4μmol，2当量)的溶液。将溶液脱气和用氮气吹扫3次。接着将Pd(dppf)Cl2(33.5mg，45.7μmol，0.2当量)添加至混合物中，并且在80℃下，在氮气下搅拌2h。将2M EDTA水溶液(20mL)添加至混合物中，并且将所得混合物搅拌1h。将混合物用水(10mL)稀释，并且用EA(20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的2-(5-(二(叔丁氧基羰基)氨基)-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，14.4％产率。LC-MS(ES+,m/z):669.3。
2-(5-氨基-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向2-(5-(二(叔丁氧基羰基)氨基)-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(20mg，29.91μmol，1当量)在DCM(1mL)中的混合物中添加TFA(1mL)。将混合物脱气和用氮气吹扫3次，并且在25℃下，在氮气下搅拌30min。将反应混合物倾倒至饱和碳酸氢钠水溶液(10mL)中，用水(10mL)稀释，并且用EA(10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的2-(5-氨基-1-苯基-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物19B)。LC-MS(ES+,m/z):469.2。
实施例18：化合物20B的合成。
3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酸甲酯的制备：在0℃下，在N2下，向3-溴-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(4.5g，21.95mmol，1当量)和SEMCl(7.32g，43.90mmol，7.77mL，2当量)在DMF(30mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(1.76g，43.90mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h。将残余物倾倒至2M NH4Cl水溶液:水(w/w＝1/1)的溶液(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(PE:EA＝10:1至5:1)来纯化以提供呈黄色油状物的5-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-3-甲酸甲酯(2g，5.97mmol，27.18％产率)和呈黄色油状物的3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(6g，17.90mmol，81.53％产率)。
3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酸的制备：在25℃下，在氮气下，向3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(6g，17.90mmol，1当量)在MeOH(50mL)和水(10mL)的混合物中的混合物中一次性添加氢氧化钠(1.43g，35.79mmol，2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(300mL)中，并且搅拌5min。接着，使用2M HCl水溶液将残余物的pH调整至3。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酸(5.7g，粗品)。
3-溴-N-甲氧基-N-甲基-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酰胺的制备：在25℃下，在氮气下，将HATU(585.9mg，1.54mmol，1.5当量)和TEA(312mg，3.08mmol，429μL，3当量)各自一次性添加至3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酸(0.33g，1.03mmol，1当量)在DMF(5mL)中的混合物中。在25℃下将混合物搅拌5min，并且添加N,O-二甲基羟胺盐酸盐(200.41mg，2.05mmol，2当量)。将反应混合物搅拌55min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将混合物搅拌5min。将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色油状物的3-溴-N-甲氧基-N-甲基-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酰胺(0.15g，411.7μmol，40.1％产率)。
(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲酮的制备：在-20℃下，在氮气下，向3-溴-N-甲氧基-N-甲基-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-甲酰胺(0.15g，411.7μmol，1当量)在THF(1mL)中的混合物中一次性添加苯基溴化镁(3M，165μL，1.2当量)。在-20℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将混合物搅拌5min。将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈黄色油状物的(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲酮(0.1g，262.23μmol，63.69％产率)。LC-MS(ES+,m/z):381.4
(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲酮肟的制备：在80℃下，在氮气下，向(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲酮(4g，10.5mmol，1当量)在乙醇(40mL)中的混合物中一次性添加羟胺盐酸盐(1.46g，21mmol，2当量)和吡啶(1.66g，20.98mmol，1.69mL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将混合物真空浓缩以提供粗产物。将残余物通过硅胶色谱法(PE:EA＝10:1至5:1)来纯化以提供呈黄色油状物的(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲酮肟(4.1g，10.34mmol，98.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):396.1。
(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲胺的制备：在70℃下，在氮气下，向(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲酮肟(0.1g，252.3μmol，1当量)在乙酸(1mL)中的溶液中一次性添加锌粉(82.5mg，1.26mmol，5当量)。在70℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至2M碳酸钠水溶液(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色油状物的(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲胺(0.05g，130.8μmol，51.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):382.1。
((3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在25℃下，在氮气下，向(3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲胺(0.8g，2.09mmol，1当量)和Boc2O(547.9mg，2.51mmol，577μL，1.2当量)在DCM(10mL)中的混合物中一次性添加TEA(1.06g，10.5mmol，1.46mL，5当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用DCM(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈黄色油状物的((3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(0.4g，829.0μmol，39.63％产率)。LC-MS(ES+,m/z):484.1。
((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在室温下，在氮气下，向2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.2g，457.41μmol，1当量)、((3-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(220.70mg，457.41μmol，1当量)和双(频哪醇合)二硼(174.2mg，686.1μmol，1.5当量)在DMA(1mL)和水(0.25mL)的混合物中的混合物中一次性添加碳酸钾(126.4mg，914.8μmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(33.5mg，45.7μmol，0.10当量)。在140℃下将混合物加热和搅拌5min。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝20:1)来纯化以提供呈黄色油状物的((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(0.043g，60.3μmol，13.2％产率)。
2-(5-(氨基(苯基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在25℃下，在氮气下，向((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)(苯基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(0.043g，60.3μmol，1当量)在乙醇(0.5mL)中的混合物中一次性添加HCl(12M，4.30mL，855当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至2M碳酸钠水溶液(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的化合物20B 2-(5-(氨基(苯基)甲基)-1H-吡唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(8.7mg，17.7μmol，29％产率)。LC-MS(ES+,m/z):483.2。
表4显示以2-(1H-吡唑-3-基)-1H-吲哚核心制备的化合物的清单。
表4
实施例19：化合物30B、31B、32B、33B、34B和35B的合成。
4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸乙酯的制备：在25℃下，向4-溴-1H-吲哚-2-甲酸乙酯(10g，37.30mmol，1当量)在DCM(100mL)中的溶液中添加TBAI(2.76g,7.46mmol，0.2当量)和氢氧化钾(6.28g，111.90mmol，3当量)。在25℃下将混合物搅拌10min，并且将CF3CH2OTf(17.31g，74.60mmol，2当量)添加至反应中。在25℃下将混合物搅拌50min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(500mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(150mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(150mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的所需产物(26g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):351.9。
4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸乙酯(26g，74.26mmol，1当量)在乙醇(150mL)中的溶液中添加水合肼(154.50g，3.09mol，150mL，41.56当量)。在80℃下将所得混合物搅拌1h，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将反应倾倒至水(1000mL)中，并且将所得白色沉淀过滤并真空干燥以提供呈白色固体的4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(23.4g，粗品)。
(2-(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向((苯甲基氧基)羰基)甘氨酸(3.11g，14.88mmol，1当量)在DMF(100mL)中的溶液中添加TEA(7.53g，74.38mmol，10.35mL，5当量)和HATU(11.31g，29.75mmol，2当量)。将4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(5g，14.9mmol，1当量)添加至混合物中，并且在25℃下将反应混合物搅拌0.5h。使用TLC分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(500mL)中，并且用EA(150mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将DCM添加至残余物中，并且将所得白色沉淀过滤并真空干燥以提供呈白色固体的(2-(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯(14g，26.55mmol，59.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):529.1。
((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(2-(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯(5g，9.48mmol，1当量)在甲苯(50mL)中的溶液中添加劳森氏试剂(Lawesson’s reagent)(7.67g，18.96mmol，2当量)。在110℃下将反应混合物搅拌2h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(250mL)中，并且用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用1M硫酸铜(II)溶液(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10:1至4:1)来纯化以提供呈白色固体的((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(10.2g，19.4mmol，77.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):525.0。
((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：在氮气氛围下，向((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1g，1.90mmol，1当量)和1-甲基哌啶-4-胺(1.09g，9.52mmol，5当量)在THF(10mL)中的混合物中添加t-BuONa(2M，1.90mL，2当量)和第3代t-BuXPhos钯(300mg，377.66μmol，0.2当量)。在100℃下将混合物搅拌60min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(50mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(30mL×2)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(硅胶，DCM:MeOH＝40:1至10:1)来纯化以提供呈黄色固体的((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(0.81g，1.45mmol，76.17％产率)。LC-MS(ES+,m/z):559.2。
2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在25℃下，在氮气氛围下，将((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(0.7g，1.26mmol，1当量)用溴化氢的乙酸溶液(14.90g，55.25mmol，10mL，30％，43.77当量)处理。在25℃下将混合物搅拌30min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至2M碳酸钠水溶液(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，并且过滤。接着，将10mL的4M HCl的EA溶液添加至残余物中，并且将混合物真空浓缩以提供呈黄色固体的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.55g，粗品，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):425.1。
化合物30B、31B、32B、33B、34B和35B的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向RCOOH(0.8当量)在DMF中的混合物中一次性添加TEA(3当量)和HATU(1.5当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，并且将2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量，HCl)添加至反应中。在25℃下将所得反应混合物搅拌5min。使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且将混合物搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×2)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC DCM:MeOH＝4:1纯化粗产物以提供化合物30B、31C、32C、33C、34C和35C。-(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(化合物30B)，LC-MS(ES+,m/z):553.1；1-氟-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物31B)，LC-MS(ES+,m/z):511.1；2,2-二氟-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物32B)，LC-MS(ES+,m/z):529.1；(1R,2S)-2-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物33B)，LC-MS(ES+,m/z):507.1；(1R,2R)-2-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物34B)，LC-MS(ES+,m/z):507.2；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物35B)，LC-MS(ES+,m/z):493.2。
用于合成N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的程序：在20℃下，在氮气氛围下，将HATU(205.9mg，541.4μmol，2当量)和TEA(137mg，1.35mmol，188μL，5当量)各自一次性添加至4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(100mg，270.7μmol，1当量)和(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(62.1mg，270.7μmol，1当量)在DMF(1mL)中的混合物中。在20℃下将混合物搅拌30min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝8:1)纯化粗产物以提供化合物4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，25.5％产率。LC-MS(ES+,m/z):581.3。
N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在110℃下，在氮气氛围下，向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(30mg，51.67μmol，1当量)在甲苯(1mL)中的混合物中一次性添加劳森氏试剂(41.8mg，103.3μmol，2当量)。在130℃下将混合物搅拌4h。将反应混合物真空浓缩，并且使用制备型HPLC纯化以提供N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物24B)。LC-MS(ES+,m/z):579.1。
实施例20：化合物41B、42B、45B、46B、49B、57B、58B、59B、60B、63B、64B、65B、66B和67B的合成。
((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.3g，2.47mmol，1当量)和1-甲基哌啶-4-胺(1.41g，12.37mmol，5当量)在THF(13mL)中的混合物中添加t-BuONa(2M，2.47mL，2当量)和第3代t-BuXPhos钯(196.6mg，247.5μmol，0.1当量)。在100℃下将反应混合物加热和搅拌1h，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(100mL)中，并且搅拌2h，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝1:1至DCM:MeOH＝10:1)来纯化以产生呈棕色固体的((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.8g，3.22mmol，65.11％产率)。
2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺盐酸盐的制备：在25℃下，在氮气氛围下，将((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(0.9g，1.61mmol，1当量)在HBr(18.50g，75.44mmol，12.41mL，33％纯度，46.82当量)中的溶液搅拌0.5h。使用TLC分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至MTBE(200mL)中，并且将黄色沉淀滤出。将所得溶液真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以产生呈黄色固体的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺氢溴酸盐(725.1mg，1.58mmol，49.0％产率，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):425.2。
用于制备化合物41B、42B、45B、46B、49B、57B、58B、59B、60B、63B、64B、65B、66B和67B的一般性程序：在25℃下，在氮气氛围下，向RCO2H(1当量)在DMF中的混合物中一次性添加TEA(5当量)和HATU(2当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，并且在25℃下，将2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺氢溴酸盐添加至反应中，再搅拌5min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且将所得混合物搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝4:1)或制备型HPLC来纯化以提供所需产物。
N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]吡啶-2-甲酰胺(化合物41B)，18.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):530.2；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]吡啶-3-甲酰胺(化合物42B)，18.9％产率，LC-MS(ES+,m/z):530.3；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-4-[(吗啉-4-基)甲基]苯甲酰胺(化合物45B)，15.4％产率，LC-MS(ES+,m/z):628.3；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-3-[(吗啉-4-基)甲基]苯甲酰胺(化合物46B)，15.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):628.3；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]吡啶-4-甲酰胺(化合物49B)，25.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):530.2；2-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]丙酰胺(化合物57B)，26.2％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]乙酰胺(化合物58B)，29.9％产率，LC-MS(ES+,m/z):467.1；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-2-苯基乙酰胺(化合物59B)，24.5％产率，LC-MS(ES+,m/z):543.3；2-甲氧基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]乙酰胺(化合物60B)，27.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):497.1；4-甲氧基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]苯甲酰胺(化合物63B)，17.5％产率，LC-MS(ES+,m/z):559.2；3-甲氧基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]苯甲酰胺(化合物64B)，22.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):559.2；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]丁酰胺(化合物65B)，22.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；2-甲氧基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]苯甲酰胺(化合物66B)，17.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):559.2。
实施例21：4-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}苯甲酸(化合物54B)的合成
用于制备4-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)苯甲酸甲酯的程序：在25℃下，在氮气氛围下，向4-(甲氧基羰基)苯甲酸(18.5mg，102.5μmol，1当量)在DMF(1mL)中的混合物中一次性添加TEA(31.1mg，307.5μmol，42.8μL，3当量)和HATU(58.5mg，153.8μmol，1.5当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，并且在25℃下添加2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.05g，102.5μmol，HCl)。将混合物搅拌10min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC纯化粗产物以提供呈黄色固体的4-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)苯甲酸甲酯(5mg，8.52μmol，8.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):587.3。
4-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}苯甲酸的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向4-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)苯甲酸甲酯(0.05g，85.23μmol，1当量)在MeOH(0.5mL)和水(0.1mL)的混合物中的溶液中一次性添加氢氧化钠(6.82mg，170.47μmol，2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。移除溶剂，并且使用制备型HPLC纯化所得粗残余物以提供呈黄色固体的4-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}苯甲酸(化合物54B)(5.4mg，9.11μmol，10.69％产率)。LC-MS(ES+,m/z):573.1。
实施例22：N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-1H-吲唑-5-甲酰胺(化合物55B)的合成
1-(叔丁氧基羰基)-1H-吲唑-5-甲酸的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向1H-吲唑-5-甲酸(0.8g，4.93mmol，1当量)和Boc2O(1.29g，5.92mmol，1.36mL，1.2当量)在二噁烷(22mL)和水(8mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(236.8mg，5.92mmol，1.2当量)。在25℃下将混合物搅拌12h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至2M氯化铵水溶液(30mL)中，并且搅拌5min。使用1M HCl水溶液将水相调整至pH＝4，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC来纯化以提供呈白色固体的1-(叔丁氧基羰基)-1H-吲唑-5-甲酸(0.2g，762.60μmol，15.46％产率)。LC-MS(ES+,m/z):547.2。
5-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向1-(叔丁氧基羰基)-1H-吲唑-5-甲酸(33.8mg，128.9μmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中一次性添加TEA(39mg，387μmol，53.8μL，3当量)和HATU(73.54mg，193.41μmol，1.5当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，并且在25℃下添加2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.08g，128.9μmol，1当量，2HBr)。将所得混合物再搅拌5min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC纯化粗产物以提供呈黄色固体的5-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯(0.05g，72.5μmol，56.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):669.3。
N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-1H-吲唑-5-甲酰胺的制备：在25℃下，在氮气氛围下，将5-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯(0.05g，72.53μmol，1当量)一次性添加至4NHCl/EA混合物(20mL)中。在25℃下将混合物搅拌10min，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至2M碳酸钠水溶液(100mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(30mL×2)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-1H-吲唑-5-甲酰胺(化合物55B)(20.4mg，35.6μmol，49.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):569.2。
实施例23：3-甲基-1-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]脲(化合物56B)的合成。
异氰基甲烷的制备：在70℃下，在氮气氛围下，向乙酸(2g，33.30mmol，1.90mL，1当量)在甲苯(15mL)中的溶液中一次性添加TEA(3.37g，33.30mmol，4.64mL，1当量)。在70℃下将混合物搅拌30min，并且在70℃下逐滴添加二苯基磷酰基叠氮化物(DPPA)(11.92g，43.3mmol，9.38mL，1.3当量)。将所得混合物加热至110℃，并且搅拌2h。将溶液的等分试样用苯甲胺淬灭，并且使用TLC分析来确认反应的完成。接着将反应蒸馏以提供约5mL的呈无色油状物的在甲苯中的异氰酸基甲烷。
3-甲基-1-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]脲的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.08g，178.10μmol，1当量)在DMF(1.5mL)中的混合物中一次性添加TEA(54.1mg，534.3μmol，74.4μL，3当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，并且在25℃下添加异氰酸基甲烷(101.6mg，178.1μmol，1当量)。将所得反应混合物搅拌25min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈黄色固体的3-甲基-1-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]脲(化合物56B)(20.1mg，40.07μmol，22.50％产率)。LC-MS(ES+,m/z):482.2。
实施例24：3,3-二甲基-1-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]脲(化合物68B)的合成
在氮气氛围下，向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(80mg，173.56μmol，1当量，HCl)和二甲基氨基甲酰氯(16.8mg，156.2μmol，14.4μL，0.9当量)在DCM(1mL)中的混合物中一次性添加TEA(52.7mg，520.7μmol，72.5μL，3当量)。在50℃下将混合物加热和搅拌2h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的3,3-二甲基-1-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]脲(化合物68B)(20.9mg，41.88μmol，24.13％产率)。LC-MS(ES+,m/z):496.2。
实施例25：N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-1H-吲唑-6-甲酰胺(化合物69B)的合成
1-(叔丁氧基羰基)-1H-吲唑-6-甲酸的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向1H-吲唑-6-甲酸(0.3g，1.85mmol，1当量)和Boc2O(605.7mg，2.78mmol，1.5当量)在THF(6mL)中的混合物中一次性添加TEA(561.7mg，5.55mmol，772.6μL，3当量)和DMAP(22.6mg，185.0μmol，0.1当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(60mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝1:1)来纯化以产生呈白色固体的1-(叔丁氧基羰基)-1H-吲唑-6-甲酸(0.16g，610.1μmol，33.0％产率)。
6-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯的制备：向1-(叔丁氧基羰基)-1H-吲唑-6-甲酸(45.5mg，173.6μmol，19.8μL，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(99mg，260.3μmol，1.5当量)、TEA(87.8mg，867.8μmol，120.8μL，5当量)和2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(80mg，173.6μmol，1当量，HCl)。在20℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝5:1)来纯化以产生呈黄色固体的6-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯(100mg，149.5μmol，86.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):669.0。
N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-1H-吲唑-6-甲酰胺的制备：在25℃下，将6-(((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酰基)-1H-吲唑-1-甲酸叔丁酯(100mg，149.54μmol，1当量)在1M HCl的EA溶液(20mL，133.75当量)中的溶液搅拌1h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝4:1)来纯化以产生呈黄色固体的N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]-1H-吲唑-6-甲酰胺(化合物69B)(23.3mg，41.0μmol，27.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):569.3。
实施例26：2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物24B)的合成
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯和4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸叔丁酯的制备：在氮气下，向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(2g，5.95mmol，1当量)和1-甲基哌啶-4-胺(1.36g，11.90mmol，2当量)在THF(20mL)中的混合物中添加第3代t-BuXPhos钯(472.7mg，595.1μmol，0.1当量)和t-BuONa(2M，5.95mL，2当量)。在100℃下将混合物加热和搅拌15min。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(150mL)中，并且搅拌1h。接着将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯和4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸叔丁酯。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(1g，2.71mmol，1当量)和4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸叔丁酯(1.11g，2.71mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(15.40g，135.1mmol，10mL，49.9当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。将混合物真空浓缩，并且将氢氧化钠(2g，50mmol，18.47当量)、MeOH(20mL)和水(2mL)添加至粗残余物中。在20℃下将所得混合物搅拌18h。将反应过滤，真空浓缩，并且通过制备型HPLC来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸。LC-MS(ES+,m/z):356.1。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸(1g，2.81mmol，1当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加HATU(2.14g，5.63mmol，2当量)和TEA(1.42g，14.1mmol，1.96mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，并且添加水合肼(287.50mg，5.63mmol，279.12μL，2当量)。在20℃下将混合物搅拌5min。将残余物倾倒至水(150mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼。
(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸的制备：向4-(甲基磺酰基)苯胺(10g，58.41mmol，1当量)在水(100mL)中的溶液中添加2-氯乙酸(11.04g，116.8mmol，13.14mL，2当量)。在110℃下将混合物搅拌18h。将反应混合物倾倒至6M氢氧化钠水溶液(500mL)中，并且用EA(300mL×3)萃取。在0℃下，用4M HCl水溶液将合并的水相酸化至pH＝2。将所得沉淀过滤，并且用水洗涤以产生(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸，55.3％产率。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(1.74g，7.58mmol，2当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加HATU(2.88g，7.58mmol，2当量)和TEA(1.92g，18.95mmol，2.64mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，并且添加4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(1.4g，3.79mmol，1当量)。在20℃下将所得混合物搅拌5min。将残余物倾倒至水(150mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，13.6％产率。LC-MS(ES+,m/z):581.3。
2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(200mg，344.46μmol，1当量)在甲苯(5mL)中的溶液中添加劳森氏试剂(278.64mg，688.92μmol，2当量)。在130℃下将混合物搅拌5h。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物24B)，9.69％产率。LC-MS(ES+,m/z):579.2.
实施例27：1-乙基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物74B)的合成
向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(100mg，235.6μmol，1当量，HCl)在DMF(2mL)中的溶液中添加羟基苯并三唑(HOBt)(63.7mg，471μmol，2当量)、1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(EDCI)(90.3mg，472μmol，2当量)、TEA(23.8mg，236μmol，32.8μL，1当量)和1-乙基环丙烷-1-甲酸(26.9mg，235.6μmol，1当量)。在50℃下将混合物搅拌4h。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝4:1)和制备型HPLC来纯化以提供1-乙基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物74B)。LC-MS(ES+,m/z):521.2。
实施例28：(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸甲酯(化合物75B)和(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸(化合物76B)的合成
(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸的制备：向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺盐酸盐(150mg，353.4μmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加HOBt(95.5mg，706.74μmol，2当量)、EDCI(135.5mg，706.7μmol，2当量)、TEA(179mg，1.77mmol，246μL，5当量)和(1R,2R)-2-(甲氧基羰基)环丙烷-1-甲酸(50.9mg，353.4μmol，1当量)。在50℃下将混合物搅拌6h。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝4:1)和制备型HPLC来纯化以提供(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸(化合物76BC)，12.2％产率。LC-MS(ES+,m/z):551.2。
(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸酯的制备：向(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸(1当量)在水和MeOH中的溶液中添加氢氧化钠(2当量)。在20℃下搅拌混合物直至反应完成，如使用TLC分析所监测。将残余物溶解于MeOH中，并且使用制备型HPLC纯化以产生产物(1R,2R)-2-{[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基]氨基甲酰基}环丙烷-1-甲酸酯(化合物75B)，31.8％产率。LC-MS(ES+,m/z):537.1。
实施例29：N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物88B)的合成。
N-((3S,4S)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在20℃下，向(3S,4S)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(10g，18.5mmol，1当量)在DCM(30mL)中的混合物中一次性添加TFA(7.70g，67.5mmol，5mL，3.66当量)，持续30min。使用TLC监测反应的完成。将所得残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液中以将残余物的pH调整至7～8。将水相用DCM(200mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将浓缩的残余物用DCM(30mL)和PE(60mL)洗涤以提供N-((3S,4S)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在50℃下，在氮气氛围下，向N-((3S,4S)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(5g，11.33mmol，1当量)和多聚甲醛(1.70g，56.7mmol，1.56mL，5当量)在MeOH(80mL)中的混合物中一次性添加氰基硼氢化钠(3.56g，56.7mmol，5当量)和乙酸(2.10g，35mmol，2mL，3.09当量)。在50℃下将混合物搅拌2h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将反应残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，58.2％产率。LC-MS(ES+,m/z):456.0。
4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：在60℃下，在氮气氛围下，向N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(3g，6.59mmol，1当量)在DMF(20mL)和MeOH(10mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2(1.45g，1.98mmol，0.3当量)和TEA(3.33g，33mmol，4.59mL，5当量)。在60℃下，在15psi一氧化碳下，将混合物搅拌2h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(100mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用EA(20mL)和PE(60mL)洗涤以提供4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯，78.4％产率。LC-MS(ES+,m/z):388.1。
4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：在氮气氛围下，向4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(2g，5.16mmol，1当量)在乙醇(15mL)中的溶液中一次性添加水合肼(10.51g，205.8mmol，10.20mL，98％纯度，39.9当量)。在80℃下将混合物加热和搅拌3h。使用TLC确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，51.6％产率。LC-MS(ES+,m/z):388.2。
4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(796.5mg，3.07mmol，2当量)在DMF(10mL)中的混合物中一次性添加HATU(1.17g，3.07mmol，2当量)和TEA(777.1mg，7.68mmol，1.07mL，5当量)。在20℃下将所得反应混合物搅拌5min。添加4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(0.7g，1.54mmol，1当量)，并且在20℃下将混合物搅拌15min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(80mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，41.1％产率。
N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在氮气氛围下，向4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(1当量)在甲苯(4mL)中的溶液中一次性添加劳森氏试剂(772.1mg，1.91mmol，4当量)。在130℃下将混合物加热和搅拌12h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌20min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物88B)。LC-MS(ES+,m/z):627.2
实施例30：N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环戊烷甲酰胺(化合物83B)的合成。
(+/-)(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：在0℃下，向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(5g，14.70mmol，1当量，HCl)和3-氟-4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(15.97g，73.51mmol，5当量)在DCE(50mL)和乙酸(150mL)中的溶液中添加三乙酰氧基硼氢化钠(15.58g，73.51mmol，5当量)。接着将反应混合物加热至50℃，并且在50℃下搅拌4h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(150mL)中，并且用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈浅黄色固体的(+/-)(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(6.26g，11.47mmol，79.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):542.0。
(+/-)4-(((3S,4R)-1-(叔丁氧基羰基)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：向(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(5g，9.24mmol，1当量)在MeOH(50mL)和DMF(100mL)中的溶液中添加TEA(1.87g，18.47mmol，2.57mL，2当量)和Pd(dppf)Cl2(2.26g，2.77mmol，0.3当量)。将反应混合物用一氧化碳脱气3次，并且在60℃下，在一氧化碳氛围下，将所得混合物搅拌2h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物倾倒至2M EDTA水溶液(1000mL)中，并且搅拌2h，接着用EA(500mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5:1至2:1)和制备型HPLC来纯化以提供呈浅黄色固体的(+/-)4-(((3S,4R)-1-(叔丁氧基羰基)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(6.2g，13.1mmol，71.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):474.1。
(+/-)(3S,4R)-3-氟-4-((2-(肼羰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向4-(((3S,4R)-1-(叔丁氧基羰基)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(2.6g，5.49mmol，1当量)在EtOH(10mL)中的溶液中添加水合肼(10.30g，205.8mmol，10mL，37.5当量)。在80℃下将反应混合物加热和搅拌1h，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应倾倒至水(60mL)中，用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的(+/-)(3S,4R)-3-氟-4-((2-(肼羰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.4g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):474.3。
(+/-)(3S,4R)-4-((2-(2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)甘氨酰基)肼-1-羰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)甘氨酸(1.57g，5.28mmol，1当量)在DMF(75mL)中的溶液中添加TEA(2.67g，26.40mmol，3.67mL，5当量)和HATU(4.02g，10.56mmol，2当量)。接着将(3S,4R)-3-氟-4-((2-(肼羰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.5g，5.28mmol，1当量)添加至混合物中，并且在25℃下将所得反应混合物搅拌1h。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(200mL)中，并且用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5:1至1:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的(+/-)(3S,4R)-4-((2-(2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)甘氨酰基)肼-1-羰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(4.6g，6.11mmol，57.87％产率)。LC-MS(ES+,m/z):753.2。
(+/-)(3S,4R)-4-((2-(5-(((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(3S,4R)-4-((2-(2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)甘氨酰基)肼-1-羰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.1g，2.79mmol，1当量)在甲苯(44mL)中的溶液中添加劳森氏试剂(2.26g，5.58mmol，2当量)。在80℃下将混合物搅拌40min，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(200mL)中，并且用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5:1至1:1，Rf＝0.39)来纯化以提供呈浅黄色固体的(+/-)(3S,4R)-4-((2-(5-(((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(800mg，1.07mmol，38.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):751.3。
(3S,4R)-4-((2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(3S,4R)-4-((2-(5-(((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(800mg，1.07mmol，1当量)在DMF(3mL)中的溶液中添加哌啶(3623mg，4.26mmol，421μL，4当量)。在25℃下将反应搅拌4h，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(60mL)中，并且用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝3:1至0:1，Rf＝0.17)来纯化以提供呈黄色油状物的(+/-)(3S,4R)-4-((2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(500mg，945.96μmol，88.78％产率)。LC-MS(ES+,m/z):551.2。
(+/-)(3S,4R)-4-((2-(5-(环戊烷甲酰胺基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向环戊烷甲酸(51.83mg，454.06μmol，49.4μL，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加TEA(230mg，2.27mmol，316μL，5当量)和HATU(345.3mg，908μmol，2当量)。接着将(3S,4R)-4-((2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(240mg，454μmol，1当量)添加至反应中，并且在25℃下将混合物搅拌1h。使用LC-MS分析监测反应的完成。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，并且用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1，Rf＝0.50)来纯化以提供呈浅黄色固体的(+/-)(3S,4R)-4-((2-(5-(环戊烷甲酰胺基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(275mg，440.22μmol，96.95％产率)。LC-MS(ES+,m/z):625.3。
(+/-)N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环戊烷甲酰胺的制备：在25℃下，将(3S,4R)-4-((2-(5-(环戊烷甲酰胺基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(265mg，424μmol，1当量)在TFA(2mL)和DCM(20mL)中的溶液搅拌1h。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(30mL)中，并且用DCM(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈浅黄色油状物的(+/-)N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环戊烷甲酰胺(260mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):525.2。
(+/-)N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环戊烷甲酰胺(化合物83C)的制备：向N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环戊烷甲酰胺(210mg，400μmol，1当量)和多聚甲醛(60.1mg，2mmol，5当量)在MeOH(15mL)中的混合物中添加乙酸(1.05g，17.5mmol，1mL，43.7当量)和氰基硼氢化钠(125.8mg，2mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌1.5h，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，并且用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环戊烷甲酰胺(化合物83B)(20.2mg，37.2μmol，9.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):539.2。
实施例31：(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物84B)的合成。
在氮气氛围下，向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(0.3g，477μmol，1当量)在甲苯(4mL)中的混合物中一次性添加劳森氏试剂(772mg，1.91mmol，4当量)。在130℃下将混合物加热和搅拌12h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌20min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物84B)(27mg，42.0μmol，8.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):627.1。
实施例32：N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物85B)和N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环丙烷甲酰胺(化合物86B)的合成。
((5-(4-(((3S,4R)-3-氨基-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在110℃下，在氮气氛围下，向(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(1g，1.84mmol，1当量)在吡啶(20mL)中的混合物中一次性添加P2S5(816.4mg，3.67mmol，390.61μL，2当量)。在110℃下将混合物搅拌60min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且将水相用EA(25mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(25mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供((5-(4-(((3S,4R)-3-氨基-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯。LC-MS(ES+,m/z):627.1。
2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向((5-(4-(((3S,4R)-3-氨基-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(300mg，552.90μmol，1当量)在DCM(2mL)中的混合物中一次性添加TFA(3.08g，27.01mmol，2mL，48.86当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。,并且使用TLC分析确认反应的完成。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用DCM(10mL×3)萃取。将水相倾倒至饱和碳酸氢钠水溶液中以将残余物的pH调整至7～8。将水相用EA(25mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(25mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。
N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物85B)和N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环丙烷甲酰胺(化合物86B)的合成：在20℃下，在氮气氛围下，向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)在DMF中的溶液中一次性添加HATU(2当量)和TEA(114mg，1.13mmol，157μL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，并且添加RCO2H(100mg，226μmol，1当量)。在20℃下将所得混合物搅拌15min，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(40mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取，并且将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物85B)和N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环丙烷甲酰胺(化合物86B)。化合物85B，LC-MS(ES+,m/z):547.1。化合物86B，LC-MS(ES+,m/z):511.2。
实施例33：(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}氧杂环丁烷-3-甲酰胺(化合物36B)、(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丁烷甲酰胺(化合物37B)和(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1-甲基哌啶-4-甲酰胺(化合物40B)的合成。
(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(+/-)-(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺(629mg，3.07mmol，3.2当量，HCl)在THF(8mL)中的溶液中添加t-BuONa(2M(THF)，2.86mL，6当量)、((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(500mg，952μmol，1当量)和第3代t-BuXPhos钯(75.6mg，95.2μmol，0.1当量)。在微波中，在100℃下，将密封小瓶照射10min。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(100mL)中，并且在25℃下搅拌2h，接着用EA(60mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝1:1至DCM:MeOH＝10:1)来纯化以产生呈棕色固体的(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.1g，1.91mmol，50.1％产率)。
(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺氢溴酸盐的制备：向(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1g，1.73mmol，1当量)的溶液中添加溴化氢的乙酸溶液(37.25g，151.9mmol，25mL，33wt％，87.60当量)。在25℃下将混合物搅拌1h，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(150mL)中以将混合物的pH调整至9。将混合物搅拌15min，并且用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，并且过滤。将4M HCl的EA溶液(4M，15mL)添加至滤液中，并且将滤液溶液真空浓缩。在25℃下，将粗产物用甲基叔丁基醚(MTBE)(40mL)湿磨10min，并且过滤以产生呈黄色固体的(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(650mg，粗品，HCl盐)，78％产率。LC-MS(ES+,m/z):443.0。
(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}氧杂环丁烷-3-甲酰胺(化合物36B)、(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丁烷甲酰胺(化合物37B)和(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1-甲基哌啶-4-甲酰胺(化合物40B)的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向RCOOH(1当量)在DMF中的溶液中一次性添加TEA(5当量)和HATU(2当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，并且在25℃下，将(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量，HCl)添加至反应中。将混合物搅拌5min，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取，并且将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(DCM:MeOH＝4:1)或制备型HPLC来纯化以提供(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}氧杂环丁烷-3-甲酰胺(化合物36B)，35％产率(LC-MS(ES+,m/z):568.3)；(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丁烷甲酰胺(化合物37B)，38％产率(LC-MS(ES+,m/z):525.2)；以及(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1-甲基哌啶-4-甲酰胺(化合物40B)，32％产率(LC-MS(ES+,m/z):527.2)。
实施例34：(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[(甲基氨基)甲基]-1,3,4-噻二唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物43B)的合成。
((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：在0℃下，向((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(650mg，1.24mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加氢化钠(99mg，2.47mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h，并且添加碘代甲烷(351.2mg，2.47mmol，2当量)。在25℃下将所得混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵溶液(30mL)中，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10:1至2:1)来纯化以产生呈黄色固体的((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(400mg，741.6μmol，60％产率)。LC-MS(ES+,m/z):539.1。
(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺(428.55mg，2.09mmol，3.22当量，2HCl)在THF(5mL)中的溶液中添加t-BuONa(2M(THF)，1.95mL，6当量)、((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(350mg，648.9μmol，1当量)和第3代t-BuXPhos钯(51.6mg，64.9μmol，0.1当量)。将所得混合物脱气和用氮气吹扫。在微波中，在100℃下，将密封小瓶照射10min。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(50mL)中，并且搅拌2h，接着用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:MeOH＝40:1至10:1)来纯化以产生呈黑棕色固体的(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(140mg，237μmol，36.5％产率)。
(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[(甲基氨基)甲基]-1,3,4-噻二唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物43B)的制备：在25℃下，在氮气氛围下，将(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(120mg，203μmol，1当量)在HBr(8.94g，36.5mmol，6mL，33％纯度，179.5当量)中的溶液搅拌1h。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(50mL)中以将混合物的pH调整至9。将混合物用EA(40mL×3)萃取，用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(碱性条件)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[(甲基氨基)甲基]-1,3,4-噻二唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物43B)(23.2mg，50.8μmol，25.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):457.2。
实施例35：(+/-)2-(5-((二甲基氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-
基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物87B)的合成。
向(+/-)2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(20mg，29.46μmol，1当量，HBr)和多聚甲醛(4.42mg，147μmol，4.06μL，5当量)在MeOH(2mL)中的混合物中添加乙酸(77mg，1.29mmol，74μL，43.7当量)和氰基硼氢化钠(9.25mg，147.3μmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌1.5h。将反应混合物倾倒至水(30mL)中，接着用EA(15mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC(碱性条件)来纯化以产生呈黄色固体的2-(5-((二甲基氨基)甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物87B)(1.9mg，4.0μmol，13.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):471.1。
实施例36：(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}氨基甲酸甲酯(化合物38B)的合成。
向(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(100mg，147.28μmol，1当量，2HBr)在DCM(4mL)中的溶液中添加TEA(59.61mg，589.11μmol，82μL，4当量)。将氯甲酸甲酯(13.92mg，147.28μmol，11.41μL，1当量)添加至混合物中，并且在25℃下将合并的混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至水(30mL)中，并且用DCM(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}氨基甲酸甲酯(化合物38B)(20.5mg，39.03μmol，26.50％产率)。LC-MS(ES+,m/z):501.1。
实施例37：N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物47B)和N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物48B)的合成。
向环丙烷甲酸(166.30mg，375.83μmol，1当量，HCl)在DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(214.35mg，563.75μmol，1.5当量)、TEA(190.15mg，1.88mmol，261.56μL，5当量)和(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(32.36mg，375.83μmol，29.69μL，1当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。TLC分析检测到一个主要的新斑点，其极性低于起始物料的极性。将反应混合物用H2O(50mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝4:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需化合物，将其通过手性SFC来进一步分离以产生呈黄色固体的N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物47B)(19mg，37.21μmol，9.90％产率；LC-MS(ES+,m/z):511.1)和N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物48B)(26mg，50.93μmol，13.55％产率；LC-MS(ES+,m/z):511.1)。
实施例38：N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物61B)和N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物62B)的合成。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(4g，10.33mmol，1当量)在乙醇(20mL)中的溶液中添加水合肼(20mL)。在80℃下将混合物搅拌1h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物用DCM(50mL×2)萃取，并且将有机相用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤。将合并的有机相用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩。使用柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:1)纯化粗残余物以提供呈黄色固体的(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，75％产率。LC-MS(ES+,m/z):388.2。
(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(1g，2.58mmol，1当量)和N-(叔丁氧基羰基)-N-(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(1.39g，3.87mmol，1.5当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加TEA(1.31g，12.9mmol，1.80mL，5当量)。将HATU(1.47g，3.87mmol，1.5当量)添加至混合物中，并且在25℃下将所得反应搅拌1h。将反应用水稀释，并且将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)纯化残余物以提供呈黄色固体的(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(600mg)，31.8％产率。
(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(200mg，274.44μmol，1当量)在甲苯(3mL)中的溶液中添加劳森氏试剂(222mg，549μmol，2当量)。在130℃下将反应混合物加热和搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(50mg)。
N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺和N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(150mg，206.4μmol，1当量)在DCM(5mL)中的溶液中添加TFA(2.31g，20.26mmol，1.50mL，98.2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将混合物倾倒至水和饱和碳酸氢钠溶液中，，接着用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物依次通过制备型HPLC和SFC来纯化以提供所需化合物。N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物61B)，29.5mg；LC-MS(ES+,m/z):627.1；N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噻二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物62B)，28.9mg，22.5％产率；LC-MS(ES+,m/z):627.2。
实施例39：N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物25B)和N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}苯甲酰胺(化合物26B)的合成。
将((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(500mg，951.76μmol，1当量)、(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺二盐酸盐(629.01mg，3.07mmol，3.22当量)、第2代t-BuXPhos钯(75.61mg，95.18μmol，0.1当量)和叔丁醇钠(1M，5.71mL，6当量)在THF(2mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫。通过微波在100℃下将密封小瓶照射10min。将残余物倾倒至碱性(pH＝8)2M EDTA水溶液(50mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(30mL×2)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(DCM:MeOH＝40:1至10:1)来纯化以提供呈黄色固体的((5-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.1g，50％产率)。LC-MS(M+H+)＝577.2。
制备((5-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(800mg，1.39mmol，1当量)在HBr的乙酸溶液(30wt％)中的溶液。在20℃下将溶液搅拌1h。将反应溶液逐滴添加至MTBE(100mL)中，接着过滤以产生呈黄色固体的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(680mg，1.20mmol，86.4％产率)。LC-MS(M+H+)＝443.0。
在20℃下，在氮气下，向RCOOH(1当量)在DMF(1mL)中的溶液中一次性添加HATU(2当量)和TEA(5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，接着一次性添加2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-N-((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)。在20℃下将混合物搅拌15min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(40mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供所需酰胺产物。N-((5-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)环丙烷甲酰胺(化合物25B)，LC-MS(M+H+)＝511.1；N-((5-(4-(((3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物26B)，产率9％，LC-MS(M+H+)＝547.1。
实施例40：N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物287B)
向1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酸(24.9mg，119μmol，1当量)在乙腈(2mL)中的溶液中添加2-[5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(90mg，119μmol，1当量，2HBr)和[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基-六氟磷酸铵(50.1mg，179μmol，1.5当量)、1-甲基咪唑(357μmol，29μL，3当量)。在25℃下将混合物搅拌0.5h，接着倾倒至水(50mL)中，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Waters Xbridge Prep OBD C18 150×40mm×10um；流动相：[水(0.05％NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：30％-55％，8min)来纯化以产生所需产物N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(21.7mg，33.6μmol，28.2％产率，98％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):634.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.83(t,J＝6.0Hz,1H),7.84(s,1H),7.59(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),7.03(t,J＝2.6Hz,1H),6.89(d,J＝8.2Hz,1H),6.56(d,J＝1.9Hz,1H),6.30(d,J＝7.8Hz,1H),5.82-5.66(m,3H),4.93-4.73(m,3H),3.72-3.51(m,5H),3.10-3.00(m,1H),2.83(br d,J＝10.9Hz,1H),2.36-2.28(m,1H),2.20(s,3H),2.18-2.10(m,3H),1.97-1.87(m,3H),1.78-1.68(m,1H),1.44(s,3H)。
实施例41：1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物386B)
向2-[5-(氨基甲基)-1,3,4-噻二唑-2-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(60mg，91.7μmol，1当量，HBr盐)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(18.4mg，110μmol，1.2当量)在DMF(2mL)中的混合物中添加TEA(920mmol，130μL 10当量)、HOBt(37.18mg，275.13μmol，3当量)和EDCI(52.74mg，275.13μmol，3当量)，并且在氮气下将反应加热至50℃，持续2h。将残余物用水(50mL)稀释，并且用EA(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生产物1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑-2-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(22.6mg，41.7％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):592.4[(M+H)+]。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)8.78(t,J＝5.8Hz,1H),8.19(s,1H),7.80(s,1H),7.52(t,J＝2.0Hz,1H),7.09(t,J＝8.0Hz,1H),6.95-6.97(t,J＝2.6Hz,1H),6.86(d,J＝8.4Hz,1H),6.48(dd,J＝2.8,1.9Hz,1H),6.27(d,J＝7.9Hz,1H),5.66-5.75(m,3H),4.73-4.81(m,2H),3.55-3.62(m,1H),3.02(br t,J＝10.5Hz,1H),2.79(br d,J＝11.0Hz,1H),2.25-2.30(m,1H),2.17(s,3H),2.05-2.13(m,1H),1.90(br dd,J＝12.0,3.4Hz,1H),1.69(br d,J＝9.9Hz,1H),1.47(s,9H)。
表5显示以2-(1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噻二唑核心制备的化合物。
表5
实施例42：2-(4-(氨基甲基)噻唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物97B)、N-{[2-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-4-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物89B)和N-{[2-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-4-基]甲基}苯甲酰胺(化合物90B)的合成。
(+/-)(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(+/-)(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(5g，9.24mmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加氰化锌(3.25g，27.7mmol，3当量)和四(三苯基膦)钯(0)(3.20g，2.77mmol，0.3当量)。在80℃下，在氮气下，将混合物搅拌2h。TLC分析指示起始物料被消耗，并且已形成一个新斑点。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(50mL)中，并且搅拌1h。将反应混合物用EA(50mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5:1至3:1)来纯化以提供呈棕色固体的(+/-)(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(6g，13.62mmol)。LC-MS(ES+,m/z):441.3。
(+/-)(3S,4R)-4-((2-氨基硫代甲酰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(5g，11.4mmol，1当量)在吡啶(50mL)和水(2mL)中的溶液中添加TEA(1.26g，12.5mmol，1.74mL，1.1当量)和硫化铵(10.64g，12.49mmol，1.1当量)。在50℃下将混合物搅拌16h。TLC分析指示起始物料被消耗，并且已形成一个新斑点。将反应混合物用EA(50mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5/1至3/1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-4-((2-氨基硫代甲酰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(5g，10.54mmol，92.8％产率)。
(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-1-(叔丁氧基羰基)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸的制备：向2-(3-氯-2-氧代-丙基)异吲哚啉-1,3-二酮(325.5mg，1.37mmol，1.3当量)在乙腈(15mL)中的溶液中添加(+/-)-(3R,4S)-4-[[2-氨基硫代甲酰基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(500mg，1.05mmol，1当量)。在85℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物用EA(50mL×2)萃取。将合并的有机层用饱和盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的(+/-)-(3R,4S)-4-[[2-[4-[(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甲基]噻唑-2-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(600mg，粗品)。
(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸的制备；路线A：将(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-1-(叔丁氧基羰基)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(800mg，1.22mmol，1当量)添加至4N氯化氢的EA溶液(5mL)中。在25℃下将混合物搅拌10min。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(10mL)中。将反应混合物用水(10mL)稀释，并且用EA(5mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(270mg，484μmol，39.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):542.1。
(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸的制备；路线B：向在乙腈(105mL)中的2-(((3-氯-2-氧代丙基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(2.45g，10.33mmol，1.4当量)中添加(+/-)-(3S,4R)-4-((2-氨基硫代甲酰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(3.5g，7.38mmol，1当量)。在85℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物用EA稀释，用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:MeOH＝100/1至10/1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(1.5g，2.28mmol，30.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):542.1。
2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸的制备：向2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(1.60g，2.87mmol，1当量)在MeOH(6mL)中的溶液中添加多聚甲醛(430.8mg，14.4mmol，5当量)、乙酸(27.98mmol，1.60mL，9.75当量)和氰基硼氢化钠(901.7mg，14.4mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用EA稀释，用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(400mg，700μmol，24.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):572.2。
(+/-)-2-(4-(氨基甲基)噻唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物97B)的制备：向(+/-)-2-((((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-4-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(230mg，402μmol，1当量)在乙醇(3mL)中的溶液中添加水合肼(3mL)。在80℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)或制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-2-(4-(氨基甲基)噻唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物97B)(70mg，154.4μmol，38.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):442.1。
(+/-)-N-{[2-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-4-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物89B)和N-{[2-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-4-基]甲基}苯甲酰胺(化合物90B)的制备：向RCOOH(1.5当量)在DMF中的溶液中添加TEA(5当量)和HATU(2当量)。接着将(+/-)-2-(4-(氨基甲基)噻唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(90mg，203.86μmol，1当量)添加至混合物中。在25℃下将混合物搅拌10min。将反应混合物用EA稀释，用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供所需产物。(+/-)-N-{[2-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-4-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物89B)，18.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):546.2；(+/-)-N-{[2-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-4-基]甲基}苯甲酰胺(化合物90B)，19.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):510.1。
2-(3-氯-2-羟基丙基)异吲哚啉-1,3-二酮的制备：将异吲哚啉-1,3-二酮(15g，101.95mmol，1当量)、2-(氯甲基)氧杂环丙烷(16.98g，183.51mmol，14.4mL，1.8当量)、N-苯甲基-N,N-二乙基乙铵(3.92g，20.4mmol，0.2当量)和碳酸钠(2.16g，20.4mmol，0.2当量)在异丙醇(5mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫(×3)，并且在25℃下，在氮气下，将混合物搅拌18h。TLC分析指示起始物料被消耗，并且已形成一个新斑点。将反应混合物用EA稀释，用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物用PE(30mL)洗涤以提供呈白色固体的2-(3-氯-2-羟基丙基)异吲哚啉-1,3-二酮(21g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):240.0。
2-(3-氯-2-氧代丙基)异吲哚啉-1,3-二酮的制备：向2-(3-氯-2-羟基丙基)异吲哚啉-1,3-二酮(6g，25mmol，1当量)在丙酮(50mL)中的溶液中添加琼斯试剂(Jonesreagent)的溶液(2.68M，11.21mL，1.2当量)。在25℃下将混合物搅拌16h。TLC分析指示起始物料被消耗，并且已形成一个新斑点。将反应混合物用EA稀释，用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法来纯化以提供呈白色固体的2-(3-氯-2-氧代丙基)异吲哚啉-1,3-二酮(5g，21mmol，84.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):256.0。
实施例43：(+/-)-N-{[2-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-5-基]甲基}苯甲酰胺(化合物91B)和N-[(2-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3-噻唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物92B)的合成。
4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-硫代甲酰胺的制备：向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(1g，3.30mmol，1当量)在吡啶(10mL)和水(5mL)中的溶液中添加TEA(667.75mg，6.60mmol，918.50μL，2当量)和硫化铵(224.8mg，3.30mmol，225.5μL，1当量)。在50℃下将混合物加热和搅拌12h。TLC分析显示一个主要的新斑点，其极性大于起始物料的极性。将反应混合物用水(200mL)稀释，并且用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-硫代甲酰胺(5.1g，粗品，80％产率)。
2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-甲酸乙酯的制备：将4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-硫代甲酰胺(2g，5.93mmol，1当量)、2-氯-3-氧代丙酸乙酯(937.8mg，6.23mmol，1.05当量)和TsOH(92.7mg，593μmol，0.1当量)在乙酸(20mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫(×3)。接着在110℃下，在氮气下，将混合物搅拌12h。TLC分析指示起始物料被消耗，并且已形成一个新斑点。将混合物添加至水(50mL)中，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE(10mL)洗涤，并且浓缩以提供呈棕色固体的2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-甲酸乙酯(1.9g，粗品，80％产率)。
(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇的制备：向2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-甲酸乙酯(1g，2.31mmol，1当量)在THF(5mL)中的溶液中添加氢化铝锂(105.1mg，2.77mmol，1.2当量)在THF(5mL)中的溶液。在-20℃下将混合物搅拌30min。在-20℃下将反应混合物用水(0.1mL)淬灭，用15％氢氧化钠溶液(0.1mL)稀释，并且用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×2)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE(5mL)洗涤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇(740mg，1.89mmol，81.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):390.9。
2-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)异吲哚啉-1,3-二酮的制备：在0℃下，将DIAD(573.8mg，2.84mmol，552μL，1.5当量)添加至邻苯二甲酰亚胺(417.5mg，2.84mmol，1.5当量)、(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇(740mg，1.89mmol，1当量)和三苯基膦(744.22mg，2.84mmol，1.5当量)在THF(10mL)中的溶液中。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈黄色固体的2-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)异吲哚啉-1,3-二酮(650mg，1.25mmol，66.0％产率)。
(2-(4-溴-1-(((二氟-l3-甲基)-l2-氟烷基)甲基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺的制备：向2-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)异吲哚啉-1,3-二酮(300mg，576.57μmol，1当量)在水合肼(5mL)中的混合物中添加乙醇(5mL)。在80℃下将混合物加热和搅拌1h。将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈白色固体的(2-(4-溴-1-(((二氟-l3-甲基)-l2-氟烷基)甲基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺(200mg，513μmol，88.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):389.9。
R取代的N-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)甲酰胺的制备：向苯甲酸(46.9mg，384.40μmol，1.5当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加TEA(130mg，1.28mmol，178μL，5当量)和HATU(194.9mg，512.5μmol，2当量)。接着，将(2-(4-溴-1-(((二氟-l3-甲基)-l2-氟烷基)甲基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺(100mg，256μmol，1当量)添加至混合物中。在25℃下将混合物搅拌10min。将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将产物用PE:EA＝3:1的溶液(3mL)洗涤，并且浓缩以提供呈黄色固体的所需产物(110mg，粗品，85％产率)。
(+/-)-N-{[2-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-5-基]甲基}苯甲酰胺(化合物91B)和N-[(2-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3-噻唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物92B)的制备：在氮气下，将第3代t-BuXPhos钯(约0.1当量)和t-BuONa(约5当量)各自一次性添加至R取代的N-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)甲酰胺(100mg，202.30μmol，1当量)和(+/-)-(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺(约3当量)在THF(3mL)中的混合物中。在100℃下将混合物搅拌30min。将2M EDTA水溶液(30mL)添加至混合物中，并且将所得混合物搅拌1h。将反应混合物用EA(20mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈棕色固体的所需化合物。(+/-)-N-{[2-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-5-基]甲基}苯甲酰胺(化合物91B)，10.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):546.2；遵循相同程序，使用4-氨基-1-甲基哌啶，获得N-[(2-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3-噻唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物92B)，40.6％产率，LC-MS(ES+,m/z):528.2。
实施例44：(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(1,3-噻唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物93B)的合成。
向(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇(30mg，76.69μmol，1当量)和(+/-)-(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺(23.83mg，180.32μmol，2.35当量，HCl)在THF(2mL)中的混合物中添加t-BuONa(22.11mg，230.06μmol，3当量)和第3代t-BuXPhos钯(6.09mg，7.67μmol，0.1当量)。在100℃下将所得反应混合物搅拌1h。将混合物倾倒至2M EDTA水溶液(10mL)中，并且搅拌2h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇。还获得了呈黄色固体的副产物(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(1,3-噻唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物93B)(9.8mg，30.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):413.2。
实施例45：(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,3-噻唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物98B)的合成。
(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇的制备：使用实施例44中所述的方法制备(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇。
2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-甲醛的制备：向(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲醇(200mg，452μmol，1当量)在氯仿(5mL)中的溶液中添加二氧化锰(196.5mg，2.26mmol，5当量)。在50℃下将反应混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)稀释，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-甲醛(130mg)。
(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,3-噻唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物98B)的制备：向(+/-)-2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-甲醛(80mg，182μmol，1当量)和苯胺(50.7mg，544.9μmol，49.8μL，3当量)在MeOH(1mL)、乙酸(3mL)中的混合物中添加三乙酰氧基硼氢化钠(115.5mg，545μmol，3当量)。在50℃下将反应混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)稀释，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,3-噻唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物98B)(16.5mg，16.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):518.1。
实施例46：(+/-)-2-[5-(氨基甲基)-1,3-噻唑-2-基]-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物96B)的合成。
((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺(160mg，410.02μmol，1当量)在DCM(8mL)中的溶液中添加TEA(83mg，820.05μmol，114μL，2当量)。接着，添加CbzCl(83.9mg，492μmol，70μL，1.2当量)，并且在25℃下将所得混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1，Rf＝0.65)来纯化以提供呈白色固体的((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯，65.1％产率。LC-MS(ES+,m/z):524.1。
(+/-)-((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(120mg，229μmol，1当量)和(+/-)-(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺(150.2mg，732μmol，3.2当量，HCl)在THF(4mL)中的混合物中添加第3代t-BuXPhos钯(18.2mg，22.9μmol，0.1当量)和t-BuONa(2M(THF)，572μL，5当量)。在100℃下将反应混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(100mL)中，并且搅拌2h。接着将反应混合物用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈浅黄色油状物的(+/-)-((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(60mg，104.2μmol，45.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):576.2。
(+/-)-2-[5-(氨基甲基)-1,3-噻唑-2-基]-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物96B)的制备：在25℃下，将(+/-)-((2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(50mg，86.86μmol，1当量)在HBr(33％，在乙酸中)(2mL)中的溶液搅拌1h。将混合物倾倒至MTBE(10mL)中并过滤，并且将2M碳酸钠水溶液(10mL)(pH约8)添加至固体中。将反应混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-2-[5-(氨基甲基)-1,3-噻唑-2-基]-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物96B)(21.5mg，53.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):442.1。
实施例47：N-[(2-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3-噻唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物94B)和(+/-)-N-{[2-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物95B)的合成。
(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺的制备：向2-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)异吲哚啉-1,3-二酮(1g，1.92mmol，1当量)在乙醇(5mL)中的溶液中添加水合肼(97.7mmol，5mL，95％纯度，50.9当量)。在80℃下将混合物搅拌1h。将混合物用水(10mL)稀释，用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺(600mg)。
N-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺的制备：向环丙烷甲酸(132.4mg，1.54mmol，121μL，2当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加HATU(438.48mg，1.15mmol，1.5当量)、TEA(3.84mmol，535μL，5当量)和(2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲胺(300mg，769μmol，1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应用水稀释。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的N-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺(300mg)。
N-[(2-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3-噻唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物94B)和(+/-)-N-{[2-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物95B)的制备：向N-((2-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺(1当量)和R-NH2(5当量)在THF(2mL)中的溶液中添加t-BuONa(2M，在THF中，87μL，1当量)和第3代t-BuXPhos钯(13.9mg，17.5μmol，0.1当量)。在100℃下将混合物搅拌1h。将混合物倾倒至2M EDTA水溶液(10mL)中，并且搅拌。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供所需产物。(+/-)-N-{[2-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3-噻唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物95B)，23.4％产率，LC-MS(ES+,m/z):510.2；以及N-[(2-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3-噻唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物94B)，28.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):492.2。
表6显示具有2-(1H-吲哚-2-基)噻唑核心的化合物。
表6
实施例48：(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物103B)和N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物105B)的合成。
(5-溴噻吩-2-基)甲醇的制备：向5-溴噻吩-2-甲醛(3g，15.70mmol，1.86mL，1当量)在异丙醇(30mL)中的溶液中添加NaBH4(297.04mg，7.85mmol，0.5当量)。在0℃下将混合物搅拌1.5h。将反应混合物用水淬灭，并且用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5/1至1:1)来纯化以提供呈无色油状物的(5-溴噻吩-2-基)甲醇(2.8g，14.5mmol，92.4％产率)。
2-((((5-溴噻吩-2-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸的制备：在0℃下，将DIAD(4.24g，20.98mmol，4.08mL，1.5当量)添加至异吲哚啉-1,3-二酮(3.09g，20.98mmol，1.5当量)、(5-溴噻吩-2-基)甲醇(2.7g，13.99mmol，1当量)和三苯基膦(5.50g，20.98mmol，1.5当量)在THF(20mL)中的溶液中。在0℃下将混合物搅拌1h。添加水，并且将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝0:1至3:1)来纯化以提供呈白色固体的2-((((5-溴噻吩-2-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(3.1g，9.62mmol，68.8％产率)。
(5-溴噻吩-2-基)甲胺的制备：将2-((((5-溴噻吩-2-基)甲基)-l2-氮烷基)羰基)苯甲酸(2.3g，7.14mmol，1当量)添加至水合肼(10mL)和乙醇(10mL)的混合物中。在80℃下将混合物加热和搅拌1h。将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的(5-溴噻吩-2-基)甲胺(1.3g，粗品)。
N-[(5-溴噻吩-2-基)甲基]苯甲酰胺的制备：向(5-溴噻吩-2-基)甲胺(600mg，3.12mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TEA(6.25mmol，870μL，2当量)。接着，将苯甲酰氯(6.25mmol，726μL，2当量)添加至混合物中。在0℃下将混合物搅拌5min。添加水，并且将反应混合物用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈白色固体的所需产物(550mg，1.86mmol，59.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):297.9。
N-[(5-溴噻吩-2-基)甲基]环丙烷甲酰胺的制备：向(5-溴噻吩-2-基)甲胺(500mg，2.60mmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加TEA(5.21mmol，725μL，2当量)、环丙烷甲酸(336.2mg，3.90mmol，308.4μL，1.5当量)和HATU(1.98g，5.21mmol，2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至水中，并且用EA(10mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈白色固体的N-[(5-溴噻吩-2-基)甲基]环丙烷甲酰胺(0.6g，2.31mmol，88.60％产率)。LC-MS(ES+,m/z):259.9。
(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物103B)和N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物105B)的制备：向(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1.1当量)、双(频哪醇合)二硼(1.5当量)和N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)苯胺或N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)环丙胺(1当量)在DMA(2mL)和水(0.5mL)中的溶液中添加碳酸钾(187mg，1.35mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(1当量)。在140℃下将混合物加热和搅拌5min。将反应冷却并将2M EDTA水溶液(30mL)添加至混合物中，并且将所得反应混合物搅拌1h。将反应混合物用水稀释，并且用EA(40mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC来纯化以提供所需产物。(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物103B)，LC-MS(ES+,m/z):509.2；遵循相同程序：N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物105B),LC-MS(ES+,m/z):545.1。
实施例49：(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物106B)的合成。
2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺的制备：将(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(8g，26.55mmol，1当量)添加至HCl/MeOH(80mL；4M)中。在25℃下将混合物搅拌1h。将饱和碳酸氢钠水溶液添加至混合物中直至pH被调整至8-9。将反应混合物用EA(30mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺。LC-MS(ES+,m/z):219.0。
N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)-2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺的制备：向5-溴噻吩-2-甲醛(700.6mg，3.67mmol，1.2当量)和2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺(615mg，3.06mmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加氯三甲基硅烷(7.64mmol，970μL，2.5当量)。在0℃下将混合物搅拌2h。接着在氮气下，将硼烷-THF络合物(1M，15.3mL，5当量)添加至反应混合物中。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用水(20mL)稀释，并且用EA(20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物用PE洗涤，并且浓缩以提供呈棕色固体的N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)-2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺，87.0％产率。
N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物106B)的制备：向N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(266.2mg，585μmol，1.1当量)、(BPin)2(202.5mg，797μmol，1.5当量)和N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)-2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺(200mg，532μmol，1当量)在DMA(8mL)和水(2mL)中的溶液中添加碳酸钾(146.9mg，1.06mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(388.9mg，52μmol，1当量)。在140℃下将混合物加热和搅拌5min。添加2M EDTA水溶液(30mL)，并且将反应混合物搅拌1h。将反应混合物用EA(20mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以获得呈白色固体的N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物106B)，18％产率。LC-MS(ES+,m/z):625.2。
实施例50：N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物104B)的合成。
向5-溴噻吩-2-甲醛(5g，26.17mmol，3.11mL，1当量)和4-(甲基硫基)苯胺(3.64g，26.2mmol，3.20mL，1当量)在MeOH(50mL)中的溶液中添加乙酸(8.70mmol，497μL，1当量)。在55℃下将混合物搅拌0.5h，并且添加氰基硼氢化钠(9.87g，157mmol，6当量)。在55℃下将混合物搅拌1.5h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝0/1至20/1)来纯化以产生呈红色油状物的甲基硫基中间体(5.3g，16.9mmol，64％产率)。LC-MS(ES+,m/z):313.9。
在0℃下，向甲基硫基中间化合物(5.18g，13.7mmol，1当量)在MeOH(20mL)、水(20mL)和乙腈(20mL)中的溶液中添加过硫酸氢钾制剂(oxone)(12.62g，20.5mmol，1.5当量)。在0℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)-4-(甲基磺酰基)苯胺(1.6g，4.62mmol，33％产率)。
向N-((5-溴噻吩-2-基)甲基)-4-(甲基磺酰基)苯胺(250mg，722μmol，1当量)、双(频哪醇合)二硼(183.3mg，722μmol，1当量)和2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(315.7mg，722μmol，1当量)在DMA(10mL)和水(2.5mL)中的溶液中添加碳酸钾(200mg，1.44mmol，2当量)和Pd(dppf)Cl2(52.8mg，72.2μmol，0.1当量)。在140℃下将混合物加热和搅拌10min。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(50mL)中，接着用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈棕色油状物的N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物104B)(25.3mg，42.5μmol，5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):577.1。
实施例51：1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-3-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物283B)
向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚啉-2-酮(2.2g，7.48mmol，1当量)和(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-胺(1.11g，8.23mmol，1.1当量，游离碱)在THF(22mL)中的溶液中添加第3代叔丁基-XPhos钯(1.19g，1.50mmol，0.2当量)和叔丁醇钠(2M，在THF中，7.5mL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物真空浓缩，并且将所得残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:MeOH＝100/1至40/1)来纯化以提供呈黄色固体的4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚啉-2-酮(1.0g，2.64mmol，35.2％产率，91％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):360.2[(M+H)+]。
向4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚啉-2-酮(1g，2.66mmol，1当量)的溶液中添加三氯氧磷(215.2mmol，20mL，80.8当量)。在110℃下将混合物搅拌9h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物，其直接用于下一反应中。获得了呈黄色固体的2-氯-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺和(2-氯-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基磷酰二氯(1.4g，粗品)。
向2-氯-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺和(2-氯-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基磷酰二氯的混合物(0.3g，1当量)中添加(4-甲氧基羰基-2-噻吩基)硼酸(30mg，1.65mmol，2当量)、THF(15mL)和水(3.75mL)，随后添加第3代BrettPhos钯(74.8mg，82.5μmol，0.1当量)和磷酸钾(2.45g，11.6mmol，14当量)。在80℃下将混合物搅拌4h。将反应混合物通过添加饱和EDTA(30mL)来淬灭，并且在20℃下搅拌1h，用水(30mL)稀释，并且用eEA/THF(1/1)(5×40mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的5-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]噻吩-3-甲酸甲酯(140mg，36.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):470.2[(M+H)+]。
在-20℃下，向5-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]噻吩-3-甲酸甲酯(140mg，298μmol，1e当量)在THF(2mL)中的溶液中添加氢化铝锂(13.6mg，357μmol，1.2当量)。在-20℃下将混合物搅拌0.5h。在-20℃下将反应混合物通过添加水(0.1mL)来淬灭，接着用15％氢氧化钠溶液(0.1mL)和EA(20mL)稀释，用硅藻土过滤以产生混合物，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的[5-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-3-噻吩基]甲醇(110mg，83.6％产率)。
在0℃下，将DIAD(374μmol，73μL 1.5当量)添加至[5-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-3-噻吩基]甲醇(110mg，249μmol，1当量)、异吲哚啉1,3-二酮(55mg，374μmol，1.5当量)和三苯基膦(98mg，374μmol，1.5当量)在THF(2mL)中的溶液中。在20℃下将混合物搅拌0.5h。TLC(DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.41)指示已形成一个新斑点。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的2-[[5-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-3-噻吩基]甲基]异吲哚啉-1,3-二酮(90mg，63.3％产率)。
向2-[[5-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-3-噻吩基]甲基]异吲哚啉-1,3-二酮(90mg，158μmol，1当量)在乙醇(1mL)中的溶液中添加水合肼(2.2g，43.1mmol，2.14mL，98％纯度，273当量)。在80℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(10mL)来稀释，并且用EA(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的粗产物2-[4-(氨基甲基)-2-噻吩基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(90mg，粗品)。
向2-[4-(氨基甲基)-2-噻吩基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(40mg，90.8μmol，1当量)、1-叔丁基吡咯-3-甲酸(18.2mg，109μmol，1.2当量)在DMF(1mL)中的溶液中添加PYBOP(94.5mg，181.6μmol，2当量)和DIEA(908μmol，160μL 10当量)。在20℃下将混合物搅拌0.5h。LCMS和TLC分析(DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.48)指示已形成一个主要的新斑点。将反应混合物通过添加水(30mL)来淬灭，并且用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化，接着通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 75×30mm×3um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：1％-50％，8min)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)噻吩-3-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(23.9mg，22.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):590.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.32-8.20(m,1H),7.54-7.44(m,1H),7.37-7.30(m,1H),7.25-7.17(m,1H),7.13-7.07(m,1H),7.01-6.95(m,1H),6.94-6.90(m,1H),6.85-6.79(m,1H),6.51-6.41(m,1H),6.30-6.18(m,1H),5.60-5.46(m,1H),5.21-5.02(m,2H),4.92-4.72(m,1H),4.51-4.30(m,2H),3.67-3.46(m,1H),3.10-2.96(m,1H),2.84-2.76(m,1H),2.29-2.14(m,4H),2.13-2.03(m,1H),2.00-1.84(m,1H),1.76-1.63(m,1H),1.48-1.43(m,9H)。
实施例52：化合物284B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(4-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
向先前制备的2-[4-(氨基甲基)-2-噻吩基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(70mg，159μmol，1当量)和1-溴-4-甲基磺酰基-苯(35.1mg，149μmol，0.94当量)在THF(7mL)中的溶液中添加叔丁醇钠(2M，在THF中，0.35mL，4.4当量)、叔丁基Xphos(35mg，82μmol，5.19e-1当量)和第3代叔丁基-XPhos钯(35mg，44μmol，2.77e-1当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物通过添加水(30mL)来淬灭，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化，随后通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 75×30mm×3um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：1％-50％，8min)来进一步纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(4-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}噻吩-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(20.9mg，22.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):595.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.64-7.52(m,2H),7.49-7.42(m,1H),7.28-7.24(m,1H),7.23-7.18(m,1H),7.17-7.10(m,1H),7.04-6.96(m,1H),6.88-6.82(m,1H),6.80-6.70(m,2H),6.31-6.24(m,1H),5.58-5.48(m,1H),5.18-5.01(m,2H),4.93-4.69(m,1H),4.41-4.33(m,2H),3.63-3.57(m,1H),3.03(s,4H),2.82-2.80(m,1H),2.19(s,4H),2.10(br s,1H),1.98-1.94(m,1H),1.74-1.69(m,1H)。
表7显示具有2-(噻吩-2-基)-1H-吲哚核心的化合物。
表7
实施例53：用于噁二唑苄型的酰胺和胺的一般性程序
方法A：在25℃或20℃下，在氮气下，向R1取代的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)和R2COOH(1当量)在DMF(1mL)中的混合物中添加HATU(1.5～2当量)和TEA(3～5当量)。在20℃或25℃下搅拌混合物直至LC-MS分析显示反应完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)中，并且搅拌5min。将水相用EA萃取(×3)。将合并的有机相用盐水洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供所需酰胺产物。
方法B：在50℃下，在氮气下，向R1取代的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)和R3-醛(0.5当量)在MeOH(2mL)中的混合物中一次性添加乙酸(2当量)和氰基硼氢化钠(17.68mg，281.4μmol，3当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供所需产物。
使用如上所述的方法A合成(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基]甲基}苯甲酰胺(化合物118B)。产率25％。LC-MS(M+H+)＝531.2。
使用如上所述的方法A合成(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(化合物120B)。产率5％。LC-MS(M+H+)＝537.1。
实施例54：2-(5-(氨基(环己基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物107B)和2-(5-(氨基(四氢-2H-吡喃-4-基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物109B)的合成。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸钠的制备：制备4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(1g，2.71mmol，1当量)和4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸叔丁酯(1.11g，2.71mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液。在25℃下，在氮气氛围下，向所述溶液中一次性添加TFA(135.1mmol，10mL，49.9当量)。在25℃下将所得混合物搅拌60min，并且将MeOH(10mL)、水(2mL)和氢氧化钠(108.29mg，2.71mmol，1当量)添加至反应混合物中。在25℃下将所得混合物搅拌11小时。使用TLC确认反应的完成。将反应混合物过滤，并且真空浓缩以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸钠。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸钠(2g，5.30mmol，1当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加HATU(4.03g，10.60mmol，2当量)和TEA(2.68g，26.50mmol，3.69mL，5当量)。在25℃下将混合物搅拌5min。将水合肼(10.60mmol，526μL，2当量)添加至混合物中，并且在25℃下将所得溶液搅拌30min。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(200mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，61.3％产率。LC-MS(ES+,m/z):370.2。
R取代的(2-(2-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(278.65mg，1.08mmol，2当量)在DMF(3mL)中的溶液中一次性添加HATU(411.75mg，1.08mmol，2当量)和TEA(2.71mmol，377μL，5当量)。在20℃下将反应混合物搅拌10min，并且将R取代的(叔丁氧基羰基)甘氨酸(200mg，541μmol，1当量)添加至混合物中。在20℃下将所得混合物搅拌50min。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC纯化残余物以提供所需R取代的(2-(2-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯，75.9％产率。
R取代的((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向R取代的(2-(2-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(200mg，328.57μmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中一次性添加四溴化碳(217.9mg，657.1μmol，2当量)和三苯基膦(172.4mg，657.1μmol，2当量)。在20℃下将反应混合物搅拌2h。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC纯化粗物质以提供所需R取代的((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯产物，51.5％产率。
2-(5-(氨基(环己基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物107B)和2-(5-(氨基(四氢-2H-吡喃-4-基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物109B)的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向R取代的((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，169μmol，1当量)在DCM(0.5mL)中的混合物中一次性添加TFA(6.75mmol，0.5mL，39.9当量)。在20℃下将混合物搅拌30min，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至碳酸氢钠的水溶液中以将反应的pH调整至7～8。将水相用DCM(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型HPLC纯化粗残余物以提供所需产物。2-(5-(氨基(环己基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物107B)，LC-MS(ES+,m/z):491.2；2-(5-(氨基(四氢-2H-吡喃-4-基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物109B)，LC-MS(ES+,m/z):493.3。
实施例55：N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物129B)、N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)噻吩-2-甲酰胺(化合物130B)、N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)-2-甲氧基苯甲酰胺(化合物131B)、N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)-3-甲氧基苯甲酰胺(化合物132B)、N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酰胺(化合物133B)和2-(5-(((环丙基甲基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物134B)的合成。
(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：在0℃下，向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺盐酸盐(10g，29.4mmol，1当量)和3-氟-4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(31.9g，147mmol，5当量)在DMF(100mL)中的溶液中添加TMSCl(147mmol，18.7mL，5当量)。在搅拌1h之后，添加BH3·THF(1M，294mL，10当量)，并且在0℃下将所得反应混合物搅拌2h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物用饱和碳酸钠水溶液(500mL)淬灭。将反应混合物用DCM(500mL×2)萃取，将有机相用盐水(500mL)洗涤，使用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩。使用制备型HPLC纯化粗残余物以提供(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯，44.0％产率。LC-MS(ES+,m/z):542.0。
用于合成(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的替代性程序：在0℃下，向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(2g，5.88mmol，1当量，HCl)和3-氟-4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(6.39g，29.4mmol，5当量)在DCE(20mL)和乙酸(60mL)中的溶液中添加NaBH(OAc)3(6.23g，29.4mmol，5当量)。将反应混合物加热至50℃，并且在50℃下搅拌5h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物用饱和碳酸钠水溶液处理以将残余物的pH调整至7～8，并且将水相用EA(500mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(500mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型HPLC纯化粗产物以提供呈浅黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯，59.7％产率。LC-MS(ES+,m/z):542.0。
(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(7g，12.93mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(157.6mmol，11.67mL，12.19当量)。在25℃下将反应混合物搅拌1h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物用饱和碳酸钠(20mL)淬灭，并且用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，使用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩以提供(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。LC-MS(ES+,m/z):441.9。
(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1g，2.27mmol，1当量)和多聚甲醛(340.3mg，11.33mmol，5当量)在MeOH(10mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(712.1mg，11.33mmol，5当量)和乙酸(2μmol，0.1μL，0.001当量)。在50℃下将反应搅拌30min，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物用DCM(100mL×2)萃取。将有机相用盐水(100mL)洗涤，使用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩以提供(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。LC-MS(ES+,m/z):456.0。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：向(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1g，10.98mmol，1当量)在MeOH(5mL)和DMF(5mL)中的溶液中添加TEA(4.39mmol，612μL，2当量)和Pd(dppf)Cl2(160.7mg，219.7μmol，0.1当量)。在60℃下，在15psi的一氧化碳下，将混合物搅拌2h。使用HPLC分析确认反应的完成。将混合物用DCM(50mL×2)萃取，并且将有机相用盐水(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩以提供(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(500mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):388.1。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(4g，10.3mmol，1当量)在EtOH(20mL)中的溶液中添加N2H4·H2O(20mL)。在80℃下将反应混合物搅拌1h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物用DCM(50mL×2)萃取。将有机相用盐水(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，75％产率(3g，7.74mmol)。LC-MS(ES+,m/z):388.2。
(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(1当量)和(N-叔丁氧基羰基)甘氨酸(1～2.76当量)在DMF(30mL)中的混合物中一次性添加HATU(2～3.5当量)和TEA(5～6当量)。在25℃下将反应混合物搅拌60min，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)中，并且搅拌5min。将水相用EA萃取三次。将合并的有机相用盐水洗涤(×3)，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯，95％产率。LC-MS(ES+,m/z):545.3
(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在0℃下，在氮气氛围下，向(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(1当量)在DCM中的混合物中添加CBr4(2当量)和PPh3(2当量)。在0℃下搅拌混合物，并且使用LC-MS分析监测反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中，并且搅拌5min。将水相用DCM(30mL×3)萃取，并且将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(DCM:MeOH＝40:1至10:1)或制备型TLC来纯化以提供(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯，62.1％产率。LC-MS(ES+,m/z):527.3。
(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(30mg，57μmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中添加TFA(13.5mmol，1mL，237当量)。在20℃下将混合物搅拌30min，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至饱和碳酸氢钠溶液(水溶液)中以将残余物的pH调整至7～8。将水相用DCM(10mL×3)萃取，并且将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺。LC-MS(ES+,m/z):427.1。
用于R取代的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的一般性程序；条件1：在25℃或20℃下，在氮气氛围下，向(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)和RCOOH(1当量)在DMF(1mL)中的混合物中一次性添加HATU(1.5～2当量)和TEA(3～5当量)。在20℃或25℃下搅拌混合物，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)中，并且搅拌5min。将水相用EA萃取(×3)。将合并的有机相用盐水洗涤(×3)，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需R取代的(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺化合物。
用于R取代的2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的一般性程序；条件2：在50℃下，在氮气氛围下，向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)和RCHO(0.5当量)在MeOH(2mL)中的溶液中一次性添加乙酸(2当量)和氰基硼氢化钠(17.68mg，281.42μmol，3当量)。在50℃下将混合物搅拌1h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC来纯化以提供所需R取代的(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺化合物。
(+/-)-N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)苯甲酰胺(化合物129B)，LC-MS(ES+,m/z):531.2；(+/-)-N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)噻吩-2-甲酰胺(化合物130B)，LC-MS(ES+,m/z):537.1；(+/-)-N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)-2-甲氧基苯甲酰胺(化合物131B)，LC-MS(ES+,m/z):561.2；(+/-)-N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)-3-甲氧基苯甲酰胺(化合物132B)，LC-MS(ES+,m/z):561.2；(+/-)-N-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酰胺(化合物133B)，LC-MS(ES+,m/z):561.2；(+/-)-2-(5-(((环丙基甲基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物134B)，LC-MS(ES+,m/z):481.1。
实施例56：(+/-)-N-[(3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物123B)的合成。
在0℃下，向(2-(2-(4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(300mg，477.22μmol，1当量)在DCM(6mL)中的溶液中添加三苯基膦(250.34mg，954.45μmol，2当量)和四溴化碳(316.52mg，954.45μmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至水(60mL)中，并且用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生呈白色固体的(+/-)-N-[(3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基-2-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物123B)(25.8mg，42.25μmol，8.85％产率)。
实施例57：(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物126B)的合成。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：向N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(500mg，1.10mmol，1当量)在MeOH(5mL)和DMF(10mL)中的溶液中添加TEA(2.20mmol，306μL，2当量)和Pd(dppf)Cl2(89.7mg，110μmol，0.1当量)。将所得混合物用CO(1.10mmol，1当量)冲洗3次，并且在60℃下，在CO氛围下搅拌2h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将混合物倾倒至2M EDTA水溶液(80mL)中，并且搅拌2h，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈棕色油状物的(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(500mg，粗品)。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(1.8g，2.79mmol，1当量)在乙醇(10mL)中的溶液中添加水合肼(170.93mmol，8.31mL，61.3当量)。在80℃下将所得混合物搅拌1h，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应倾倒至水(60mL)中并用EA(30mL×3)萃取，并且将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:MeOH＝1:0至10:1)来纯化以提供呈棕色固体的(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(920mg，1.73mmol，62.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):388.0
N-(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸的制备：向2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯胺(1.4g，7mmol，1当量)在MeOH(30mL)中的溶液中添加2-氧代乙酸(566.5mg，7.65mmol，1.1当量)和乙酸(4.18mg，69.57μmol，3.98μL，0.01当量)。在25℃下将反应混合物搅拌2h，接着添加氰基硼氢化钠(1.09g，17.4mmol，2.5当量)，并且在25℃下将所得混合物搅拌1h。通过TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至氢氧化钠溶液(6M，60mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。在0℃下，用4M HCl的溶液将合并的萃取物水溶液酸化至pH＝2。将所得沉淀过滤，并且用水洗涤以提供呈白色固体的N-(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(1g，3.47mmol，49.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):257.9。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向N-(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(195.4mg，753.8μmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加TEA(3.77mmol，524.6μL，5当量)和HATU(573.2mg，1.51mmol，2当量)。将4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(400mg，754μmol，1当量)添加至混合物中，并且在25℃下将所得反应混合物搅拌1h。使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，并且用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.41)来纯化以提供呈棕色固体的(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(350mg，557μmol，73.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):629.1。
(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物126B)的合成：在0℃下，向4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(300mg，477μmol，1当量)在DCM(6mL)中的溶液中添加三苯基膦(250.34mg，954.45μmol，2当量)和四溴化碳(316.52mg，954.45μmol，2当量)。在0℃下将反应混合物搅拌0.5h。通过TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(60mL)中，并且用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈白色固体的N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物126B)(25.8mg，42.3μmol，8.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):611.2。
实施例58：N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((3-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物125B)的合成。
(3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸的制备：向2-氧代乙酸(648.6mg，8.76mmol，1当量)在MeOH(15mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(3.30g，52.6mmol，6当量)和乙酸(8.76mmol，500μL，1当量)。将3-(甲基磺酰基)苯胺(1.5g，8.76mmol，1当量)添加至混合物中。在25℃下将所得反应混合物搅拌2h，并且使用LC-MS分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至氢氧化钠的溶液(50mL)中，并且用150mL EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的(3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(1.5g，6.54mmol，74％产率)。
(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(438.9mg，872.4μmol，1当量)和(3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(200mg，872μmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加TEA(4.36mmol，607.1μL，5当量)和HATU(663mg，1.74mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(60mL)中，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝5:1)来纯化以提供呈浅黄色油状物的(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(50mg，83.5μmol，27.8％产率)。
(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((3-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物125B)的合成：在0℃下，向4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(40mg，67μmol，1当量)在DCM(8mL)中的溶液中添加PPh3(35.1mg，134μmol，2当量)和CBr4(44.3mg，134μmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(60mL)中，并且用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈白色固体的(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((3-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物125B)(5.6mg，9.65μmol，14.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):581.2。
实施例59：N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,3,4-噁二唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物108B)的合成。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-(苯基甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：向苯基甘氨酸(90mg，595.59μmol，2当量)在DMF(3mL)中的溶液中添加HATU(226.5mg，596μmol，2当量)和TEA(1.49mmol，207.3μL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，并且将4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(110mg，298μmol，1当量)添加至混合物中。在20℃下将所得反应混合物搅拌30min。使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-(苯基甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，33.4％产率(50mg，99.5μmol)。
N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,3,4-噁二唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物108B)的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-(苯基甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(50mg，99.5μmol，1当量)在DCM(3mL)中的溶液中添加三苯基膦(52.2mg，199μmol，2当量)和四溴化碳(66mg，199μmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h，接着在20℃下搅拌3h。使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈浅黄色固体的N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,3,4-噁二唑-2-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物108B)(5.4mg，11.0μmol，11.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):485.3。
实施例60：N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物110B)的合成。
2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(40mg，78.7μmol 1当量)在DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(27mmol，2mL，343当量)。在20℃下将混合物搅拌15min，并且使用TLC分析确认反应的完成。将反应混合物倾倒至饱和碳酸氢钠水溶液(50mL)中，并且将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC来纯化以提供2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，49.8％产率(16mg，39μmol)。
N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物110B)的制备：向2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(15mg，36.7μmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中添加TEA(10.8mmol，1.50mL，293.4当量)和环丙烷甲酰氯(36.73μmol，3.3μL，1当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至水(50mL)中，并且将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩，将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈浅黄色固体的N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,3,4-噁二唑-2-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物110B)(4.1mg，8.6μmol，23.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):477.3。
实施例61：2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物111B)的合成。
4-溴-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向4-溴-1H-吲哚-2-甲酸(5g，20.8mmol，1当量)在DMF(100mL)中的混合物中一次性添加碳酸氢钠(3.50g，41.7mmol，2当量)和碘代甲烷(80.32mmol，5mL，3.9当量)。在20℃下将混合物搅拌12小时，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中，并且将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供4-溴-1H-吲哚-2-甲酸甲酯，66.1％产率。
4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：在25℃下，在氮气氛围下，向4-溴-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(7g，27.6mmol，1当量)和三氟甲烷磺酸2,2,2-三氟乙酯(12.8g，55.1mmol，2当量)在DCM(20mL)中的混合物中一次性添加压碎的氢氧化钾(4.64g，82.7mmol，3当量)和TBAI(2.04g，5.51mmol，0.2当量)。在25℃下将混合物搅拌60min，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(300mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯，66.8％产率。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯的制备：在氮气氛围下，向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(1g，3mmol，1当量)和1-甲基哌啶-4-胺(407.7mg，3.57mmol，1.2当量)在THF(2mL)中的混合物中添加第3代t-BuXPhos钯(118.2mg，148.8μmol，0.05当量)和甲醇钠(321mg，5.95mmol，2当量)。在100℃下将混合物加热和搅拌15min，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(40mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过硅胶色谱法来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯，72.8％产率。LC-MS(ES+,m/z):370.1。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：在氮气氛围下，向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(1当量)在乙醇(2～5mL)中的混合物中一次性添加水合肼(2～5mL，98％纯度)。在80℃下将混合物加热和搅拌60min，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将水相用EA(15mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，87.5％产率。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(100mg，271μmol，1当量)和(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(62.1mg，271μmol，1当量)在DMF(1mL)中的混合物中一次性添加HATU(205.9mg，541.4μmol，2当量)和TEA(1.35mmol，188μL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌30min，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(30mL)中，并且将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝8:1)来纯化以提供4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼，72.8％产率。LC-MS(ES+,m/z):581.2。
2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物111B)的制备：在0℃下，在氮气氛围下，向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(20mg，34μmol，1当量)在DCM(1mL)中的混合物中添加三苯基膦(18.1mg，68.9μmol，2当量)和四溴化碳(22.9mg，68.9μmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌15min，并且LC-MS分析显示反应完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(40mL)中，并且将水相用DCM(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC和制备型HPLC来纯化以提供2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物111B)。LC-MS(ES+,m/z):563.2。
实施例62：2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物113B)的合成。
向N-Boc-甘氨酸(94.9mg，541μmol，1当量)在DMF(3mL)中的溶液中添加HATU(411.7mg，1.08mmol，2当量)和TEA(2.71mmol，377μL，5当量)。在25℃下将混合物搅拌5min，接着添加4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(200mg，541μmol，1当量)。在25℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至水(50mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈黄色固体的二酰基中间体(90mg，171μmol，31.6％产率)。LC-MS(M+H+)＝527.3。
向二酰基中间体(90mg，170.9μmol，1当量)在DCM(2mL)中的溶液中添加三苯基膦(89.7mg，342μmol，2当量)和四溴化碳(113.4mg，341.8μmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h，接着在25℃下搅拌0.5h。将残余物倾倒至水(50mL)中。将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈黄色固体的噁唑Boc中间体(60mg，118μmol，69.0％产率)。
向噁唑Boc中间体(40mg，78.66μmol 1当量)在DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(27mmol，2mL，343当量)。在20℃下将混合物搅拌15min。将残余物倾倒至饱和碳酸氢钠溶液(50mL)中。将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供所需2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物113B)(16mg，39.2μmol，49.8％产率)。
实施例63：(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物127B)的合成。
向(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1g，11mmol，1当量)在MeOH(5mL)、DMF(10mL)中的溶液中添加TEA(4.39mmol，612μL，2当量)和Pd(dppf)Cl2(160.7mg，220μmol，0.1当量)。在60℃下，在一氧化碳氛围(15psi)下，将混合物搅拌2h。将混合物用DCM(50mL×2)萃取，并且将有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(500mg，粗品)。
向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(4g，10.3mmol，1当量)在乙醇(20mL)中的溶液中添加水合肼(20mL)。在80℃下将混合物搅拌1h。将混合物用DCM(50mL×2)萃取，并且将有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(硅胶，PE/EA＝1:1)来纯化以提供所需(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(3g，7.74mmol，75.0％产率)。LC-MS(M+H+)＝388.2。
向(+/-)-4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(3g，6.20mmol，1当量)和N-Boc甘氨酸(3g，17mmol，2.8当量)在DMF(30mL)中的混合物中添加HATU(8.25g，21.7mmol，3.5当量)。接着，添加TEA(37.2mmol，5.17mL，6当量)，并且在25℃下，在氮气下搅拌反应混合物。在25℃下将混合物搅拌60min，此时LC-MS分析显示反应完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(3.2g，5.88mmol，94.9％产率)。LC-MS(M(-tBu)+H+)＝486.3。
在0℃下，在氮气下，向(+/-)-(2-(2-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)肼基)-2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(4g，7.35mmol，1当量)在DCM(30mL)中的溶液中添加四溴化碳(4.87g，14.7mmol，2当量)和三苯基膦(3.85g，14.7mmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中，并且搅拌5min。将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(DCM:MeOH＝40:1至10:1)来纯化以提供中间体Boc噁二唑(1.6g，3.04mmol，41.4％产率)。
在20℃下，在氮气下，向Boc噁二唑中间体(1.5g，2.85mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中一次性添加TFA(127mmol，9.38mL，44.5当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至水(50mL)中。将水相用DCM(10mL×3)洗涤，并且丢弃有机洗涤液。将水相倾倒至饱和碳酸氢钠溶液中以将pH调整至7～8。将水相用EA(25mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(25mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物127B)(1g，粗品)。LC-MS(M+H+)＝427.1。
实施例64：(+/-)-N-((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物135B)的合成。
在20℃下，在氮气下，向(+/-)-(3R,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(10g，18.5mmol，1当量)在DCM(30mL)中的溶液中添加TFA(68mmol，5mL，3.7当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至饱和碳酸钠(水溶液)中以将pH调整至7～8。将水相用DCM(200mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物依次用DCM(30mL)和PE(60mL)洗涤以提供所需哌啶中间体(6.5g，14.7mmol，79.8％产率)。
在50℃下，在氮气氛围下，向(+/-)-N-[(3S)-3-氟-4-哌啶基]-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(5g，11.3mmol，1当量)和多聚甲醛(1.70g，56.7mmol，5当量)在MeOH(80mL)中的混合物中添加氰基硼氢化钠(3.56g，56.7mmol，5当量)和乙酸(35mmol，2mL，3.09当量)。在50℃下将混合物搅拌2h。使用LC-MS分析确认反应的完成。将反应残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供N-((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，58.2％产率。LC-MS(ES+,m/z):456.0。
在60℃下，向甲基哌啶碘化物中间体(3g，6.6mmol，1当量)在DMF(20mL)和MeOH(10mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(1.45g，1.98mmol，0.3当量)、TEA(32.95mmol，4.59mL，5当量)和一氧化碳(1ATM)。在60℃下将混合物搅拌2小时。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(100mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用EA(20mL)和PE(60mL)洗涤以提供所需甲酯中间体(2g，5.16mmol，78.4％产率)。LC-MS(M+H+)＝388.1。
在氮气下，向甲酯中间体(2g，5.16mmol，1当量)在乙醇(15mL)中的溶液中添加水合肼(205.8mmol，10.20mL，39.9当量)。在80℃下将混合物搅拌3小时。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供(+/-)-4-(((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(1.2g，2.66mmol，51.6％产率)。LC-MS(M+H+)＝388.2。
(+/-)-N-((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物135B)的制备：在0℃下，在氮气下，向4-(((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(70mg，111μmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中添加四溴化碳(73.9mg，223μmol，2当量)和三苯基膦(58.4mg，223μmol，2当量)。在0℃下将混合物搅拌15min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(40mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供(+/-)-N-((3R,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-2-(5-(((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(6.1mg，10.0μmol，9.0％产率)。LC-MS(M+H+)＝611.3。
实施例65：(+/-)-4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼中间化合物的合成。
在20℃下，在氮气下，向(2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(796.5mg，3.07mmol，2当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加HATU(1.17g，3.07mmol，2当量)和TEA(7.68mmol，1.07mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，接着添加4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(0.7g，1.5mmol，1当量)。在20℃下将混合物搅拌15min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(80mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供呈黄色固体的二酰基中间体4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(0.4g，636μmol，41.4％产率)。
实施例66：(+/-)-2-(5-{[(环丙基甲基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物121B)的合成
使用实施例65中所述的方法制备(+/-)-4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼。(3-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(438.9mg，872.4μmol，1当量)、HATU(663.4mg，1.74mmol，2当量)和TEA(4.36mmol，607μL，5当量)提供了呈浅黄色油状物的所需二酰基中间体。
遵循实施例64中所述的方法，使(+/-)-4-(((3S,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-N'-((2-甲氧基-4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酰肼(40mg，67μmol，1当量)与三苯基膦(35.1mg，134μmol，2当量)和四溴化碳(44.3mg，134μmol，2当量)反应以提供呈白色固体的(+/-)-(+/-)-2-(5-{[(环丙基甲基)氨基]甲基}-1,3,4-噁二唑-2-基)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物121B)(5.6mg，9.7μmol，14.4％产率)。LC-MS(M+H+)＝581.2。
实施例67：1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物552B)
按照方法A，使2-[3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(50mg，108μmol，1当量，HCl)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(19.9mg，118μmol，1.1当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供所需产物1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(25.8mg，38.3％产率，92.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.43(t,J＝5.73Hz,1H),8.17(s,1H),7.52(t,J＝1.87Hz,1H),7.18(t,J＝8.05Hz,1H),6.96(t,J＝2.65Hz,1H),6.91(d,J＝8.38Hz,1H),6.48(dd,J＝2.76,1.87Hz,1H),6.32(d,J＝7.94Hz,1H),6.10(br d,J＝8.38Hz,1H),5.61(q,J＝8.89Hz,2H),4.94-4.77(m,1H),4.58(d,J＝5.73Hz,2H),3.70-3.54(m,1H),3.10-3.00(m,1H),2.83(br d,J＝9.70Hz,1H)2.33-2.17(m,4H),2.12(br t,J＝11.36Hz,1H),2.06-1.93(m,1H),1.72(br d,J＝11.03Hz,1H),1.48(s,9H)。
实施例68：1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物288B)
按照方法A，使2-[5-(氨基甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(100mg，235μmol，1当量)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(78.4mg，469μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型HPLC(中性条件，柱：WatersXbridge Prep OBD C18 150×40mm×10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：35％-60％，8min)来纯化以提供呈白色固体的1-叔丁基-N-{[5-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑-2-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(18.7mg，13.9％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.52(t,J＝5.5Hz,1H),7.86(s,1H),7.53(t,J＝2.0Hz,1H),7.14(t,J＝8.0Hz,1H),6.97(t,J＝2.7Hz,1H),6.89(d,J＝8.2Hz,1H),6.49(dd,J＝1.8,2.8Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.07(d,J＝8.3Hz,1H),5.62(q,J＝8.9Hz,2H),4.94-4.75(m,1H),4.71(d,J＝5.6Hz,2H),3.69-3.49(m,1H),3.11-2.97(m,1H),2.81(br d,J＝10.5Hz,1H),2.33-2.25(m,1H),2.19(s,3H),2.14-2.05(m,1H),2.03-1.92(m,1H),1.69(br d,J＝9.7Hz,1H),1.48(s,9H)。
表8显示具有2-(1H-吲哚-2-基)-1,3,4-噁二唑核心的化合物。
表8
实施例69：化合物143B-152B和154B-156B的合成。
4-溴-1H-吲哚-2-甲酰胺的制备：在0℃下，在氮气下，向4-溴-1H-吲哚-2-甲酸(15g，62.5mmol，1当量)和草酰氯(81.23mmol，7.11mL，1.3当量)在THF(40mL)中的混合物中一次性添加DMF(6.25mmol，481μL，0.1当量)。在0℃下将混合物搅拌5min。在20℃下将反应再搅拌115min，并且添加氢氧化铵(62.5mmol，8.59mL，28％纯度，1当量)。在0℃下将所得混合物搅拌5min，并且在20℃下搅拌10min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE(60mL)和EA(20mL)洗涤以提供呈浅黄色固体的4-溴-1H-吲哚-2-甲酰胺(11g，46mmol，73.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):239.0。
4-溴-1H-吲哚-2-甲腈的制备：在氮气下，向4-溴-1H-吲哚-2-甲酰胺(11g，46.01mmol，1当量)在甲苯(20mL)中的混合物中一次性添加三氯氧磷(184.1mmol，17.10mL，4当量)。在120℃下将混合物加热和搅拌30min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(PE/EA＝1:0至2:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的4-溴-1H-吲哚-2-甲腈，88.5％产率。
4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈的制备：在20℃下，在氮气下，向4-溴-1H-吲哚-2-甲腈(9g，40.7mmol，1当量)和CF3CH2OTf(18.9g，81.4mmol，2当量)在DMF(90mL)中的混合物中添加碳酸钾(16.88g，122.1mmol，3当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(300mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供呈白色固体的4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(11g，36.3mmol，89.1％产率)。
4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒的制备：在氮气下，向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(4g，13.20mmol，1当量)在乙醇(40mL)中的混合物中一次性添加羟胺盐酸盐(1.38g，19.80mmol，1.5当量)和TEA(2.67g，26.40mmol，3.67mL，2当量)。在80℃下将混合物加热和搅拌30min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(300mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈浅黄色固体的4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒(4g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):336.0。
(2-(((氨基(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯的制备：在20℃下，在氮气下，向((苯甲基氧基)羰基)甘氨酸(2.80g，13.4mmol，1.5当量)在DMF(30mL)中的溶液中一次性添加HATU(4.07g，10.7mmol，1.2当量)和TEA(44.6mmol，6.21mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，接着添加4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒(3g，8.9mmol，1当量)。在20℃下将混合物搅拌5min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(150mL)中。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过硅胶色谱法来纯化以提供呈白色固体的(2-(((氨基(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯(4g，7.59mmol，85.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):527.0。
((3-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：在氮气下，将(2-(((氨基(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯(4g，7.6mmol，1当量)添加至吡啶(10mL)中。在110℃下将混合物加热和搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应用DCM(30mL)和PE(50mL)洗涤以提供呈白色固体的((3-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(3g，5.9mmol，77.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):509.1。
((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向((3-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(2.3g，4.5mmol，1当量)和1-甲基哌啶-4-胺(5.16g，45.2mmol，10当量)在THF(20mL)中的混合物中添加第3代t-BuXPhos钯(1.08g，1.35mmol，0.3当量)和碳酸铯(4.41g，13.55mmol，3当量)。在100℃下将混合物加热和搅拌4小时。TLC分析显示剩余约10％的起始物料。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(w/w＝1/1)(100mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供呈棕色油状物的((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.4g，2.58mmol，57.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):543.2。
2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在20℃下，将((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.4g，2.6mmol，1当量)添加至溴化氢/乙酸(2.58mmol，5mL，1当量)中。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至2M碳酸钠水溶液(50mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，并且过滤。将4M HCl/EA(10mL)添加至滤液中，并且将滤液真空浓缩以提供呈棕色固体的2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1.1g，粗品，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):409.1。
化合物143B-152B和154B-156B的制备：在20℃下，在氮气下，向RCOOH(1当量)在DMF(1～3mL)中的溶液中一次性添加HATU(2当量)和TEA(5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，并且添加2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(100mg，195.3μmol，1当量，2HCl)。在20℃下将混合物搅拌5min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物。N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物146B)，20.4％产率，LC-MS(ES+,m/z):577.1；N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物144B)，19.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):513.2；N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]噻吩-2-甲酰胺(化合物143B)，19.4％产率，LC-MS(ES+,m/z):519.2；(1S,2R)-2-氟-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物145B)，19.4％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；(1S,2S)-2-氟-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]环丙烷-1-甲酰胺(化合物147B)，16.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；(+/-)-(1R,2R)-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-2-苯基环丙烷-1-甲酰胺(化合物156B)，17.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):553.3；1-甲基-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物152B)，19.55％产率，LC-MS(ES+,m/z):516.2；N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1,3-噻唑-2-甲酰胺(化合物149B)，26.9％产率，LC-MS(ES+,m/z):520；4-氟-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物150B)，19.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):531.2；4-氰基-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物151B)，18.9％产率，LC-MS(ES+,m/z):538.1；4-氯-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]苯甲酰胺(化合物148B)，19.4％产率，LC-MS(ES+,m/z):547；1-甲基-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物154B)，35.90％产率，LC-MS(ES+,m/z):517.2；1-甲基-N-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡唑-3-甲酰胺(化合物155B)，35.44％产率，LC-MS(ES+,m/z):517.2。
实施例70：3-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1-苯基脲(化合物153B)的合成。
异氰酸基苯的制备：在0℃下，在氮气下，向苯胺(500mg，5.37mmol，490.20μL，1当量)和三光气(1.59g，5.37mmol，1当量)在DCM(5mL)中的混合物中添加TEA(4.67mmol，650μL，0.87当量)。在0℃下将混合物搅拌1小时。将溶液用苯甲胺淬灭。将反应真空浓缩以提供呈红色固体的异氰酸基苯(0.3g，粗品)。
3-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1-苯基脲(化合物153B)的制备：在20℃下，在氮气下，向2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(100mg，245μmol，1当量)和异氰酸基苯(87.5mg，735μmol，79.5μL，3当量)在DMF(1mL)中的混合物中添加TEA(735μmol，102μL，3当量)。在20℃下将混合物搅拌10min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC来纯化以提供呈浅黄色固体的3-[(3-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1-苯基脲(化合物153B)(19.5mg，36.3μmol，14.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):528.3。
实施例71：化合物(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物171B)、(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}苯甲酰胺(化合物172B)、(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(化合物175B)、(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-3-甲酰胺(化合物176B)和(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺(化合物178B)的合成。
(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：在25℃下，向2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(30g，79.7mmol，1当量，HCl)和3-氟-4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(86.54g，398.4mmol，5当量)在乙酸(900mL)和1,2-二氯乙烷(300mL)中的溶液中添加三乙酰氧基硼氢化钠(25.33g，119.5mmol，1.5当量)。在搅拌30min之后，分三等份(每半小时一份)再次添加三乙酰氧基硼氢化钠(25.33g，119.5mmol，1.5当量)。在20-50℃下将所得反应混合物搅拌1.5h。将混合物用DCM(1000mL×2)萃取。将有机相用水(1000mL)和盐水(1000mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(28g，64.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):542.1。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(5.0g，9.24mmol，1当量)在DMF(50mL)中的溶液中添加氰化锌(3.25g，27.7mmol，3当量)和四(三苯基膦)钯(0)(3.20g，2.77mmol，0.3当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将混合物倾倒至2M EDTA水溶液(10mL)中，并且搅拌2h。将反应用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(3.5g，86.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):441.2。
(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-(N'-羟基甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(+/-)-(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(5.0g，11.4mmol，1当量)在乙醇(50mL)中的溶液中添加羟胺盐酸盐(1.18g，17.03mmol，1.5当量)和TEA(22.70mmol，3.16mL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)中。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-(N'-羟基甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(4g)。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(N'-((((苯甲基氧基)羰基)甘氨酰基)氧基)甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(+/-)-((苯甲基氧基)羰基)甘氨酸(2.98g，14.26mmol，1.5当量)在DMF(50mL)中的溶液中添加HATU(5.42g，14.3mmol，1.5当量)和TEA(47.5mmol，6.61mL，5当量)。将(3S,4R)-3-氟-4-((2-(N'-羟基甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(4.5g，9.50mmol，1当量)添加至反应中，并且在25℃下将所得反应混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)中。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(N'-((((苯甲基氧基)羰基)甘氨酰基)氧基)甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(5g，79.2％产率)。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(5-((((苯甲基氧基)羰基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：将(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(N'-((((苯甲基氧基)羰基)甘氨酰基)氧基)甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(3.5g，5.27mmol，1当量)溶解于吡啶(20mL)中，并且在110℃下搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(5-((((苯甲基氧基)羰基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(2g，58.7％产率)。
(+/-)-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(5-((((苯甲基氧基)羰基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.8g，2.78mmol，1当量)在DCM(18mL)中的溶液中添加TFA(121.56mmol，9mL，43.7当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液中。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的(+/-)-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1g，65.7％产率)。
(+/-)-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(+/-)-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(500mg，914.89μmol，1当量)和多聚甲醛(137.35mg，4.57mmol，126.01μL，5当量)在MeOH(2mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(287.5mg，4.57mmol，5当量)和乙酸(8.74mmol，0.5mL，9.56当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的(+/-)-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(350mg)。LC-MS(ES+,m/z):561.3。
(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：将(+/-)-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(100mg，178.4μmol，1当量)溶解于溴化氢的溶液(2mL)中，并且在25℃下搅拌1h。将混合物倾倒至MTBE(10mL)中并搅拌10min，过滤，并且浓缩以提供呈黄色固体的(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(30mg)。LC-MS(ES+,m/z):427.1
用于制备化合物171B、172B、175B、176B和178B的一般性程序：向RCOOH(469μmol，2当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(351.8μmol，1.5当量)、TEA(163μL，5当量)和2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(235μmol，1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供所需化合物。(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物171B)，12.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}苯甲酰胺(化合物172B)，15.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):531.3；(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(化合物175B)，16.6％产率，LC-MS(ES+,m/z):537.2；(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-3-甲酰胺(化合物176B)，21.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):537.2；(+/-)-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺(化合物178B)，20.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):538.2。
实施例72：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物173B)和N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物174B)的合成。
向环丙烷甲酸(100.9mg，1.17mmol，92.6μL，2当量)在DMF(3mL)中的溶液中添加HATU(334mg，879μmol，1.5当量)、TEA(2.93mmol，408.02μL，5当量)和(+/-)-2-(5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(250mg，586μmol，1当量)。在25℃下将反应混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈黄色固体的化合物的混合物(50mg，16.4％产率)。使用手性超临界流体色谱法来分离混合物以提供呈黄色固体的N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物173B)(16.5mg)和N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物174B)(18.4mg)。N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物173B)，35.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物174B)，LC-MS(ES+,m/z):495.2。
实施例73：(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物177B)的合成。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(3S,4R)-3-氟-4-((2-碘-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(3g，5.54mmol，1当量)在DMF(30mL)中的溶液中添加氰化锌(1.95g，16.6mmol，3当量)和四(三苯基膦)钯(0)(640.4mg，554.2μmol，0.1当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(200mL)中，并且搅拌1h。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用EA和PE洗涤，并且浓缩以提供粗产物，94.2％产率。
(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-(N'-羟基甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向(3S,4R)-4-((2-氰基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.3g，5.2mmol，1当量)在乙醇(46mL)中的溶液中添加羟胺盐酸盐(544mg，7.83mmol，1.5当量)和TEA(10.4mmol，1.45mL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至水(200mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用EA和PE洗涤以提供(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-(N'-羟基甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯，89％产率。LC-MS(ES+,m/z):474.2。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(N'-((N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)氧基)甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：向N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸(1.25g，3.80mmol，1.5当量)在DMF(24mL)中的溶液中添加(+/-)-(3S,4R)-3-氟-4-((2-(N'-羟基甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.2g，2.53mmol，1当量)和TEA(12.67mmol，1.76mL，5当量)。接着添加HATU(1.93g，5.07mmol，2当量)，并且在20℃下将所得反应混合物搅拌0.5h。将残余物倾倒至水(100mL)中，并且将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(N'-((N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)氧基)甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯，65.4％产率。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(5-(((叔丁氧基羰基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：将化合物(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(N'-((N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酰基)氧基)甲脒基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(800mg，1.02mmol，1当量)溶解于吡啶(8mL)中，并且在110℃下将混合物加热和搅拌4h。将残余物倾倒至水(100mL)中，并且将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物用PE和EA洗涤，并且浓缩以提供(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(5-(((叔丁氧基羰基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯，70.4％产率。
(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：向(3S,4R)-4-((2-(5-(((叔丁氧基羰基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(550mg，717μmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(67.53mmol，5mL，94当量)。在20℃下将混合物搅拌0.5h。将残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(100mL)中，并且将水相用DCM(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE和EA洗涤，并且浓缩以提供(+/-)-N-((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺，73.8％产率。
N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物177B)的制备：向N-((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)-2-(5-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(150mg，265μmol，1当量)在MeOH(3mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(83.2mg，1.32mmol，5当量)、乙酸(17.5mmol，1mL，66当量)和多聚甲醛(39.75mg，1.32mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(水溶液)(50mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供(+/-)-N-[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物177B)，13.6％产率。LC-MS(ES+,m/z):581.2。
向4-(甲基磺酰基)苯胺(5.3g，31mmol，1当量)在1,4-二噁烷(53mL)中的溶液中添加(Boc)2O(20.27g，92.9mmol，3当量)。在110℃下将混合物搅拌18h。将残余物倾倒至水(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE和EA洗涤以提供(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯，85.7％产率。
N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸甲酯的制备：向(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(3.5g，12.9mmol，1当量)在DMF(70mL)中的溶液中添加碳酸铯(12.61g，38.70mmol，3当量)。在20℃下将混合物搅拌10min。接着添加2-溴乙酸甲酯(23.22mmol，2.19mL，1.8当量)，并且在20℃下将所得混合物搅拌1h。将残余物倾倒至水(200mL)中。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE和EA洗涤，并且浓缩以提供N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸甲酯，70.4％产率。
N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸的制备：向N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸甲酯(3g，8.74mmol，1当量)在MeOH(48mL)中的溶液中添加氢氧化钠(1g，25mmol，2.86当量)和水(12mL)。在20℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物真空浓缩，并且将粗残余物通过制备型HPLC来纯化以提供N-(叔丁氧基羰基)-N-(4-(甲基磺酰基)苯基)甘氨酸。
实施例74：N-[(3-{4-[(氧杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物159B)的合成。
(环丙烷羰基)甘氨酸的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向甘氨酸(6g，79.9mmol，1当量)在THF(100mL)和水(100mL)中的溶液中一次性添加氢氧化钠(3.84g，96mmol，1.20当量)和碳酸钠(10.20g，96.2mmol，1.20当量)。在0℃下，将环丙烷甲酰氯(88.4mmol，8.03mL，1.11当量)添加至混合物中，并且在20℃下将所得反应混合物搅拌4小时。使用TLC分析确认反应的完成。将残余物倾倒至1N HCl中以将混合物的pH调整至2。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应用EA(20mL)洗涤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的(环丙烷羰基)甘氨酸(10g，69.9mmol，87.4％产率)。
4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈的制备：在氮气氛围下，向2-碘-4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(20g，54mmol，1当量)在DMF(200mL)中的溶液中一次性添加氰化锌(19.04g，162.1mmol，3当量)和四(三苯基膦)钯(0)(12.49g，10.81mmol，0.2当量)。在80℃下将混合物加热和搅拌2小时，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至2M EDTA水溶液(300mL)中，，并且搅拌60min。将水相用EA(200mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用硅胶色谱法纯化粗产物以提供呈黄色固体的4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(9g，33.4mmol，61.9％产率)。
N'-羟基-4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒的制备：在氮气氛围下，向4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(9g，33.4mmol，1当量)在乙醇(70mL)中的溶液中添加羟胺盐酸盐(3.49g，50.15mmol，1.5当量)和TEA(66.9mmol，9.31mL，2当量)。在80℃下将混合物加热和搅拌2小时，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用PE(50mL)洗涤，并且浓缩以提供呈黄色固体的N'-羟基-4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒(8g，26.5mmol，79.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):303.0。
N-(2-(((氨基(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)环丙烷甲酰胺的制备：在20℃下，在氮气氛围下，向(环丙烷羰基)甘氨酸(5.68g，39.7mmol，1.5当量)在DMF(160mL)中的混合物中一次性添加HATU(15.10g，39.7mmol，1.5当量)和TEA(132.4mmol，18.42mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌5min，并且添加N'-羟基-4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒(8g，26.5mmol，1当量)。在20℃下将所得反应混合物搅拌5min，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(500mL)中，并且将水相用EA(200mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物用EA(100mL)洗涤，并且浓缩以提供呈黄色固体的N-(2-(((氨基(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)环丙烷甲酰胺(7.5g，17.6mmol，66.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):428.1
N-((3-(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺的制备：在氮气氛围下，将N-(2-(((氨基(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)环丙烷甲酰胺(7.5g，17.6mmol，1当量)添加至吡啶(100mL)中，接着在110℃下加热，并且搅拌2h。使用TLC分析来确认反应的完成。将残余物倾倒至1N HCl中以将残余物的pH调整至2～3。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应用EA(20mL)洗涤，并且浓缩以提供呈黄色固体的N-((3-(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺(5.5g，13.4mmol，76.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):410.0。
N-((3-(4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺的制备：在50℃下，在氮气下，向N-((3-(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺(0.5g，1.22mmol，1当量)和氯化铵(326.7mg，6.11mmol，5当量)在乙醇(4mL)和水(1mL)中的混合物中一次性添加铁粉(341.1mg，6.11mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌10min，接着加热至80℃，并且再搅拌50min。将残余物通过过滤，并且倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用硅胶色谱法纯化粗产物以提供呈浅黄色固体的N-((3-(4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺(100mg，263.6μmol，21.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):380.0。
N-[(3-{4-[(氧杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物159B)的制备：在氮气氛围下，向N-((3-(4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)环丙烷甲酰胺(100mg，263.6μmol，1当量)和四氢-4H-吡喃-4-酮(132mg，1.32mmol，5当量)在乙醇(3mL)中的混合物中一次性添加乙醇钛(IV)(300.7mg，1.32mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌2小时，并且添加氰基硼氢化钠(82.8mg，1.32mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌1小时。将残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液中以将残余物的pH调整至约7。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供呈浅黄色固体的N-[(3-{4-[(氧杂环己烷-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物159B)(20.3mg，42.3μmol，16.05％产率)。LC-MS(ES+,m/z):464.1。
实施例75：N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物142B)的合成。
4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈的制备：向2-碘-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1g，2.29mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加氰化锌(805.7mg，6.86mmol，3当量)和四(三苯基膦)钯(0)(264.3mg，229μmol，0.1当量)。在80℃下将反应混合物搅拌1h，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至2M EDTA水溶液(50mL)中，并且搅拌2h，接着用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.34)来纯化以产生呈浅黄色油状物的4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(650mg，1.93mmol，84.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):337.2。
N'-羟基-4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲腈(650mg，1.93mmol，1当量)在乙醇(10mL)中的溶液中添加TEA(3.86mmol，538μL，2当量)和羟胺盐酸盐(201.4mg，2.90mmol，1.5当量)。在80℃下将混合物搅拌2h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(30mL)中，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.17)来纯化以产生呈棕色固体的N'-羟基-4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒(420mg，1.14mmol，58.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):370.0。
N-(叔丁氧基羰基)-N-苯基甘氨酸的制备：向N-苯基甘氨酸(2g，13.2mmol，1当量)在二噁烷(24mL)和水(12mL)中的溶液中添加氢氧化钠(1M，13.2mL，1当量)和Boc2O(3.18g，14.55mmol，1.1当量)。在25℃下将混合物搅拌16h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至柠檬酸溶液(1M，50mL)中，并且用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝10/1至3:1，PE:EA＝1:1，Rf＝0.39)来纯化以产生呈浅黄色油状物的N-(叔丁氧基羰基)-N-苯基甘氨酸(1.6g，6.37mmol，48.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):250.0[M+]。
(2-(((氨基(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)(苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向N-(叔丁氧基羰基)-N-苯基甘氨酸(251.7mg，1mmol，1当量)在DMF(6mL)中的溶液中添加TEA(5.01mmol，697.1μL，5当量)和HATU(761.7mg，2mmol，2当量)。将N'-羟基-4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲脒(370mg，1mmol，1当量)添加至这个混合物中，并且在25℃下将反应搅拌0.5h。使用TLC分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(40mL)中，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.41)来纯化以产生呈红色油状物的(2-(((氨基(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)(苯基)氨基甲酸叔丁酯(180mg，299μmol，29.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):603.2。
((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)(苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(2-(((氨基(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)亚甲基)氨基)氧基)-2-氧代乙基)(苯基)氨基甲酸叔丁酯(180mg，299μmol，1当量)在THF(4mL)中的溶液中添加TBAF(1M，448μL，1.5当量)。在25℃下将反应混合物搅拌0.5h，并且使用TLC分析来确认反应的完成。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.46)纯化粗产物以产生呈浅黄色油状物的((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)(苯基)氨基甲酸叔丁酯(120mg，205μmol，68.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):585.1。
N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物142B)的制备：在25℃下搅拌((3-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)(苯基)氨基甲酸叔丁酯(110mg，188μmol，1当量)在TFA(0.6mL)和DCM(6mL)中的溶液，直至LC-MS分析确认反应完成。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠水溶液(30mL)中，并且用DCM(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将粗残余物通过制备型HPLC和制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1，Rf＝0.35)来纯化以提供呈红色固体的N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-{5-[(苯基氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物142B)(5.8mg，11.5μmol，6.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):485.1。
实施例76：N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(3-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物136B)的合成。
(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向4-(甲基磺酰基)苯胺(5g，29.2mmol，1当量)在DCM(50mL)中的溶液中添加(Boc)2O(7.65g，35mmol，1.2当量)、DMAP(356.76mg，2.92mmol，0.1当量)和TEA(58.4mmol，8.13mL，2当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，接着用300mL EA(100mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5:1至3:1至1:1，Rf＝0.6)来纯化以提供以白色固体形式获得的(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(2.6g，9.58mmol，32.8％产率)。
(氰基甲基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(1g，3.69mmol，1当量)在DCM(2mL)中的溶液中添加氢氧化钾(620mg，11.1mmol，3当量)、TBAI(2.04g，5.53mmol，1.5当量)和2-溴乙腈(663.1mg，5.53mmol，1.5当量)。在25℃下将混合物搅拌1h，并且使用LC-MS分析来确认反应的完成。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈白色固体的(氰基甲基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(500mg，1.61mmol，43.7％产率)。
(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：在25℃下，向(氰基甲基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(450mg，1.45mmol，1当量)在乙醇(5mL)中的溶液中添加羟胺盐酸盐(151.1mg，2.17mmol，1.5当量)和TEA(2.90mmol，403.6μL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至水(20mL)中，并且用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝8:1至1:1，DCM:MeOH＝30:1至20:1，EA＝1，Rf＝0.35)来纯化以提供呈白色固体的(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(490mg，1.43mmol，98.4％产率)。
(2-氨基-2-(((4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)氧基)亚氨基)乙基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸(248.4mg，699μmol，1当量)在DMF(1mL)中的溶液中添加HATU(398.61mg，1.05mmol，1.5当量)和TEA(3.49mmol，486μL，5当量)。在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌5min。将(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(240mg，699μmol，1当量)添加至反应中，并且在25℃下，在氮气氛围下搅拌混合物，直至根据LC-MS分析，反应完成50％。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的(2-氨基-2-(((4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)氧基)亚氨基)乙基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(200mg，293.8μmol，42.0％产率)。
((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯的制备：向(2-氨基-2-(((4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)氧基)亚氨基)乙基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(200mg，293.8μmol，1当量)在THF(0.5mL)中的溶液中添加四丁基氢氧化铵(76.2mg，293.8μmol，1当量)。在25℃下将混合物搅拌0.5h。LC-MS分析显示几个新峰，并且检测到约40％的所需化合物。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(60mg，90.5μmol，30.8％产率)。
2-(3-{[(4-甲烷磺酰基苯基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物136B)的制备：向((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)(4-(甲基磺酰基)苯基)氨基甲酸叔丁酯(45mg，67.9μmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。在25℃下搅拌混合物，直至通过LC-MS分析检测到约70％的所需化合物。将反应混合物用水(20mL)稀释，并且用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的N-(1-甲基哌啶-4-基)-2-(3-(((4-(甲基磺酰基)苯基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(5.2mg，8.50μmol，12.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):563.2。
实施例77：(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物275B)、(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}苯甲酰胺(化合物276B)、(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(化合物277B)、(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}噻吩-3-甲酰胺(化合物278B)和(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺(化合物279B)的合成。
(氰基甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向2-氨基乙腈盐酸盐(20g，216mmol，1当量，HCl)在二噁烷(250mL)和水(450mL)中的溶液中添加碳酸氢钠(54.48g，648.46mmol，25.22mL，3当量)和氯甲酸苯甲酯(432.3mmol，61.46mL，2当量)。在0-25℃下将混合物搅拌2h。将混合物用DCM(1000mL×2)萃取，并且将有机相用水(1000mL)和盐水(1000mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的(氰基甲基)氨基甲酸苯甲酯(35g，184mmol，85.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):190.1。
(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(氰基甲基)氨基甲酸苯甲酯(33g，173.5mmol，1当量)在乙醇(250mL)中的溶液中添加羟胺盐酸盐(18.09g，260.3mmol，1.5当量)和TEA(347mmol，48.3mL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将混合物用DCM(1000mL×2)萃取，并且将有机相用水(1000mL)和盐水(1000mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供呈白色固体的(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯(35g，156.8mmol，90.4％产率)。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(4-氨基-7-氧代-9-苯基-2,8-二氧杂-3,6-二氮杂壬-3-烯酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：在20℃下，在氮气下，向(+/-)-4-(((3S,4R)-1-(叔丁氧基羰基)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸(3g，6.53mmol，1当量)、(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯(4.37g，19.6mmol，3当量)和PyBOP(3.74g，7.18mmol，1.1当量)在THF(20mL)中的混合物中添加DIEA(16.3mmol，2.84mL，2.5当量)。在20℃下将混合物搅拌10min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈棕色油状物的(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(4-氨基-7-氧代-9-苯基-2,8-二氧杂-3,6-二氮杂壬-3-烯酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(3.5g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):665.2。
(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(3-((((苯甲基氧基)羰基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备：在20℃下，在氮气下，向(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(4-氨基-7-氧代-9-苯基-2,8-二氧杂-3,6-二氮杂壬-3-烯酰基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(3.5g，5.27mmol，1当量)在THF(40mL)中的混合物中一次性添加四丁基氢氧化铵(2.73g，10.5mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌3小时。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中，并且将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供呈棕色油状物的(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(3-((((苯甲基氧基)羰基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.6g，2.47mmol，47.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):647.1
(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：在20℃下，在氮气下，向(+/-)-(3S,4R)-4-((2-(3-((((苯甲基氧基)羰基)氨基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-基)氨基)-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.6g，2.47mmol，1当量)在DCM(20mL)中的混合物中添加TFA(15.40g，135.1mmol，10mL，54.6当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液中以将残余物的pH调整至7～8。将水相用DCM(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.2g，粗品)。
(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：在50℃下，在氮气下，向((5-(4-(((3S,4R)-3-氟哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(1g，1.83mmol，1当量)和多聚甲醛(274.7mg，9.15mmol，5当量)在MeOH(20mL)中的混合物中依序添加氰基硼氢化钠(574.9mg，9.15mmol，5当量)和乙酸(26.23mmol，1.5mL，14.3当量)。在50℃下将混合物搅拌5小时。将残余物倾倒至饱和碳酸钠水溶液中以将残余物的pH调整至7～8。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应用PE(20mL)和EA(5mL)洗涤以提供呈黄色固体的(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(0.9g，1.61mmol，87.8％产率)。
(+/-)-2-(3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：在20℃下，在氮气下，将(+/-)-((5-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(0.9g，1.61mmol，1当量)溶解于HBr/乙酸(2mL)中。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至MTBE(200mL)中，并且搅拌10min。将混合物过滤以提供呈浅绿色固体的(+/-)-2-(3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(0.7g，粗品，HBr)。LC-MS(ES+,m/z):427.2。
用于制备化合物275B、276B、277B、278B和279B的一般性程序：在20℃下，在氮气下，将HATU(2当量)和TEA(5当量)各自一次性添加至RCOOH(1当量)在DMF(2mL)中的混合物中。在20℃下将混合物搅拌5min，并且添加(+/-)-2-(3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量)。在20℃下将所得反应混合物搅拌5min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，用无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供所需化合物。(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}环丙烷甲酰胺(化合物275B)，28.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):495.2；(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}苯甲酰胺(化合物276B)，26.1％产率，LC-MS(ES+,m/z):531.2；(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(化合物277B)，13.8％产率，LC-MS(ES+,m/z):537.0；(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}噻吩-3-甲酰胺(化合物278B)，20.2％产率，LC-MS(ES+,m/z):537.2；(+/-)-N-{[5-(4-{[(3R,4S)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺(化合物279B)，18.2％产率，LC-MS(ES+,m/z):538.2。
实施例78：N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物137B)、N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]苯甲酰胺(化合物138B)、N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]噻吩-2-甲酰胺(化合物139B)、1-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物140B)和1-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]-1H-吡唑-3-甲酰胺(化合物141B)的合成。
4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸的制备：向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸甲酯(5g，14.9mmol，1当量)在THF(50mL)中的溶液中添加2M氢氧化钠(46.1mL，6.2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。接着将1M HCl(20mL)添加至反应中。将反应用DCM(50mL×2)萃取，并且将有机相用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸(4.5g)。LC-MS(ES+,m/z):322.0。
(2-氨基-2-(((4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)氧基)亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-甲酸(3g，9.31mmol，1当量)在THF(10mL)中的溶液中添加(2-氨基-2-(羟基亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯(6.24g，27.9mmol，3当量)、DIEA(23.3mmol，4.06mL，2.5当量)和PyBOP(5.33g，10.25mmol，1.1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的(2-氨基-2-(((4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)氧基)亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯(4.5g)。
((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向(2-氨基-2-(((4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-羰基)氧基)亚氨基)乙基)氨基甲酸苯甲酯(4g，7.59mmol，1当量)在THF(10mL)中的溶液中添加TBAH(3.94g，15.17mmol，2当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(3.5g)。
((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯的制备：向((5-(4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(200mg，393μmol，1当量)和1-甲基哌啶-4-胺(448.4mg，3.93mmol，10当量)在THF(2mL)中的溶液中添加第3代t-BuXPhos钯(93.6mg，117.8μmol，0.3当量)和碳酸铯(383.9mg，1.18mmol，3当量)。在100℃下将混合物搅拌12h。将混合物倾倒至2M EDTA水溶液(10mL)中，并且搅拌2h，将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)纯化残余物以提供((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(500mg)，29.3％产率。
2-(3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺的制备：将((5-(4-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基)氨基甲酸苯甲酯(500mg，921.6μmol，1当量)溶解于HBr/乙酸(2mL)中，并且在25℃下搅拌1h。将混合物倾倒至MTBE(10mL)中，并且搅拌10min，接着过滤。将混合物倾倒至水(10mL)中，并且逐滴添加EA和HCl的溶液以将pH调整至3。真空移除溶剂以提供呈黄色固体的2-(3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(330mg)盐酸盐。
化合物137B、138B、139B、140B和141B的制备：向RCOOH在DMF中的溶液中添加HATU(1.5当量),TEA(5当量)和2-(3-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1当量，HCl)。在25℃下将混合物搅拌1h。接着将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。使用制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝5:1)纯化残余物以提供所需化合物。N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]环丙烷甲酰胺(化合物137B)，32.6％产率，LC-MS(ES+,m/z):477.2；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]苯甲酰胺(化合物138B)，22.2％产率，LC-MS(ES+,m/z):513.1；N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]噻吩-2-甲酰胺(化合物139B)，23.3％产率，LC-MS(ES+,m/z):519.0；1-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物140B)，23.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):517.2；1-甲基-N-[(5-{4-[(1-甲基哌啶-4-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-3-基)甲基]-1H-吡唑-3-甲酰胺(化合物141B)，9.7％产率，LC-MS(ES+,m/z):517.3。
实施例79：2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺双(盐酸盐)，胺1的制备
步骤1：4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲脒：在25℃下，在氮气下，向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲腈(100g，330mmol，1当量)在乙醇(1L)中的混合物中添加羟胺盐酸盐(34.39g，494.9mmol，1.5当量)和TEA(660mmol，91.9mL，2当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(1L)中，并且将水相用EA(3×300mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×300mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在25℃下，将粗产物用PE:EA＝20:1湿磨12h，接着通过过滤收集产物并真空干燥以提供呈白色固体的4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲脒(110g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):336.0/337.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.97(s,1H),7.67(d,J＝8.4Hz,1H),7.35(d,J＝8Hz,1H),7.20(t,J＝7.9Hz,1H),7.01(s,1H),6.06(s,2H),5.70(q,J＝9.2Hz,2H)。
步骤2：2-(叔丁氧基羰基氨基)乙酸2-[[氨基-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]亚甲基]氨基]酯：在25℃下，在氮气下，向4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲脒(92g，273mmol，1当量)和2-(叔丁氧基羰基氨基)乙酸(71.93g，410.6mmol，1.5当量)在DMF(2L)中的混合物中添加PYBOP(170.93g，328.5mmol，1.2当量)和DIEA(821.2mmol，143mL，3当量)。在25℃下将混合物搅拌60min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(1L)中。将水相用EA(3×300mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×300mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在25℃下，将粗产物用PE:EA＝10:1湿磨2h，接着通过过滤收集固体并真空干燥以提供呈白色固体的中间体2-(叔丁氧基羰基氨基)乙酸2-[[氨基-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]亚甲基]氨基]酯(111g，粗品)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.76(d,J＝8.3Hz,1H),7.42(d,J＝7.3Hz,1H),7.32-7.25(m,2H),7.18(br s,1H),5.76(q,J＝9.0Hz,2H),3.93(d,J＝6.1Hz,2H),1.45-1.33(m,9H)。
步骤3-N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯：在25℃下，在氮气下，将2-(叔丁氧基羰基氨基)乙酸2-[[氨基-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]亚甲基]氨基]酯(111g，225.03mmol，1当量)用吡啶(8.25mol，666mL，36.7当量)处理。在110℃下将混合物加热和搅拌12h。将残余物倾倒至柠檬酸(饱和，1L)中，并且搅拌30min。将水相用EA(3×300mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×300mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在25℃下，将粗产物用PE:EA＝10:1湿磨12h。通过过滤收集产物，并且真空干燥以提供呈白色固体的N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(100g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):375.0/377.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.84(d,J＝8.3Hz,1H),7.77(br t,J＝5.8Hz,1H),7.48(d,J＝7.5Hz,1H),7.39-7.32(m,1H),7.27(s,1H),5.68(q,J＝8.7Hz,2H),4.63-4.46(m,2H),3.02(dt,J＝3.9,6.6Hz,1H),1.42(s,9H)。
步骤4：N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸酯：向(3S,4R)-3-氟-1-甲基-哌啶-4-胺(11.43g，78.69mmol，游离碱，1.1当量)和N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(34g，71.54mmol，1当量)在THF(380mL)中的溶液中添加第3代t-Bu-XPhos Pd(11.37g，14.31mmol，0.2当量)和叔丁醇钠(2M，在THF中，71.5mL，2当量)。在80℃下，在氮气下，将混合物搅拌2h。在20℃下将反应混合物通过添加饱和EDTA水溶液(400mL)来淬灭。在20℃下将混合物搅拌1h，接着用EA(3×250mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。在这个规模上进行两次这个程序，并且在这个阶段合并所得粗产物。接着将粗物质通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5/1至2/1至DCM/甲醇＝100/1至60/1)来纯化以提供呈黄色固体的标题化合物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(34g，64.57mmol，45.1％产率)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.99-7.87(m,1H),7.78-7.62(m,1H),7.17-7.04(m,1H),6.97-6.76(m,1H),6.45-6.17(m,1H),6.10-5.95(m,1H),5.67-5.41(m,2H),4.91(br s,1H),4.58-4.37(m,2H),3.71-3.46(m,1H),3.12-2.96(m,1H),2.90-2.72(m,1H),2.14(br d,J＝4.1Hz,1H),2.13-1.99(m,2H),1.80-1.58(m,1H),1.48-1.23(m,1H)。
步骤5：2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺盐酸盐，(胺1)：在20℃下，在氮气氛围下，将N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(40g，68.4mmol，90％纯度，1当量)在HCl/二噁烷(4M，720mL，42当量)中的混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以提供呈黄色固体的标题化合物2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(胺1，HCl盐)(50g，96.6％产率，90％纯度，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):427.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.99-7.87(m,1H),7.26-7.08(m,1H),7.07-6.89(m,1H),6.47-6.28(m,1H),5.64-5.48(m,2H),5.26-5.01(m,1H),4.58(br d,J＝3.9Hz,2H),4.50-4.04(m,14H),4.00-3.91(m,1H),3.83-3.74(m,1H),3.69-3.59(m,1H),3.51-3.44(m,1H),3.28-3.17(m,1H),2.88(br d,J＝4.4Hz,1H),2.39-2.22(m,1H),2.03-1.93(m,1H)。
实施例80：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物194B)
将2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚4-胺(胺1)(23.5g，30.7mmol，89％纯度，1当量，HCl盐)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(5.64g，33.8mmol，1.1当量)的混合物用HOBt(8.29g，61.37mmol，2当量)、EDCI(11.76g，61.37mmol，2当量)和DIEA(307mmol，53.5mL，10当量)在DMF(230mL)中处理。接着将混合物脱气和用氮气吹扫3次，并且在50℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌12h。TLC(DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.5)指示已形成一个新斑点。在20℃下将反应混合物通过添加水(800mL)来淬灭，接着用EA(3×350mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×200mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝5/1至2/1，接着使用DCM/甲醇＝100/1至60/1)来纯化。将获得的产物通过制备型HPLC(碱性条件：柱：Agela DuraShell C18250×80mm×10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：55％-55％，20min)来进一步纯化以提供呈黄色固体的化合物194 1-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺(20.32g，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.4[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.73-8.59(m,1H),7.95-7.80(m,1H),7.59-7.47(m,1H),7.21-7.08(m,1H),7.01-6.96(m,1H),6.93-6.84(m,1H),6.54-6.45(m,1H),6.34-6.24(m,1H),6.12-5.94(m,1H),5.62-5.33(m,2H),4.99-4.68(m,3H),3.71-3.49(m,1H),3.10-2.95(m,1H),2.88-2.75(m,1H),2.31-2.15(m,4H),2.13-2.05(m,1H),2.05-1.92(m,1H),1.73-1.62(m,1H),1.54-1.45(m,9H)。
实施例81：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物231B)
在25℃下，向(3S,4R)-3-氟-1-甲基-哌啶-4-胺(18g，87.8mmol，1当量，2HCl)在DCM(30mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(6M，56.3mL，3.85当量)。在25℃下将混合物搅拌30min。将反应混合物用DCM(30mL×8)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤，并且在不加热下真空浓缩以产生残余物。获得了呈黄色油状物的(3S,4R)-3-氟-1-甲基-哌啶-4-胺(9.7g，粗品)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝5.76(s,1H),4.57-4.40(m,1H),2.96-2.76(m,1H),2.74-2.54(m,2H),2.17-2.03(m,4H),2.00-1.91(m,1H),1.58-1.31(m,4H)。
向(3S,4R)-3-氟-1-甲基-哌啶-4-胺(7.61g，56.9mmol，1.15当量)和4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲腈(15g，49.49mmol，1当量)在THF(150mL)中的混合物中添加XPhos(2.36g，4.95mmol，0.1当量)。通过用氮气鼓泡1min来将反应脱气，接着一次性添加第3代XPhos-Pd(4.19g，4.95mmol，0.1当量)，并且通过氮气鼓泡1min来将反应再次脱气。
接着将碳酸铯(32.25g，98.98mmol，2当量)添加至反应中，并且通过氮气鼓泡1min来将反应最后一次脱气，接着将密封的反应加热至100℃，并且搅拌8h。在0℃下，将残余物倾倒至饱和EDTA水溶液中，并且搅拌1h(150mL)。将水相用EA(50mL×4)萃取，接着用3M HCl将有机相调整至pH＝2，并且将混合物用300mL水(50mL×6)萃取。用6M NaOH将水相(含有产物)调整至pH＝10。将混合物用EA(80mL×6)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在25℃下，将产物用PE:EA＝20:1(100mL)湿磨30min，并且通过过滤收集产物。将滤饼用PE:EA＝20:1(50mL)洗涤，并且将固体真空干燥以提供呈黄色固体的中间体4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲腈(16g，88％产率，96.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):355.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.95(s,1H),7.21(t,J＝8.0Hz,1H),6.92(d,J＝8.3Hz,1H),6.34(d,J＝7.7Hz,1H),5.93(d,J＝8.5Hz,1H),5.23(q,J＝9.2Hz,2H),4.91-4.75(m,1H),3.69-3.56(m,1H),3.09-3.00(m,1H),2.82(br d,J＝11.2Hz,1H),2.33-2.19(m,4H),2.14-2.07(m,1H),2.01-1.90(m,1H),1.72(br dd,J＝3.2,12.9Hz,1H)。
在25℃下，在氮气下，向4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲腈(16g，43.5mmol，1当量)在乙醇(80mL)中的混合物中添加羟胺(水溶液)(43.5mmol，80mL，50％纯度，1当量)，并且将反应加热至60℃并搅拌10min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(60mL×6)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在25℃下，将产物用PE:EA＝20:1(120mL)湿磨30min。将混合物过滤，并且将滤饼用PE(50mL)洗涤，接着真空干燥以提供呈黄色固体的中间体羟基脒4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲脒(15.8g，92.2％产率，98.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):388.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.75(s,1H),7.23(s,1H),7.05-6.97(m,1H),6.82(d,J＝8.2Hz,1H),6.28(d,J＝7.7Hz,1H),5.78(s,2H),5.51(q,J＝8.9Hz,2H),5.23(d,J＝8.8Hz,1H),4.94-4.71(m,1H),4.03(q,J＝7.1Hz,1H),3.71-3.51(m,1H),3.10-2.97(m,1H),2.81(br d,J＝11.0Hz,1H),2.33-2.18(m,4H),2.10(br t,J＝10.8Hz,1H),1.99(s,1H),1.96-1.83(m,1H),1.80-1.70(m,1H),1.17(t,J＝7.1Hz,1H)。
代表性程序：方法A。将2-氨基乙酸甲酯盐酸盐(35.83g，285.4mmol，1.2当量)和1-叔丁基吡唑-4-甲酸(40g，237.82mmol，1当量)的混合物用HOBT(64.27g，475.7mmol，2当量)、EDCI(91.18g，475.7mmol，2当量)和DIEA(2.38mol，414mL，10当量)在DMF(400mL)中处理，接着在50℃下，在氮气氛围下搅拌和加热2h。将混合物冷却，并且在25℃下通过添加盐水(1000mL)来淬灭，接着用EA(200mL×5)萃取。将合并的有机层用盐水(500mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。残余物是无色油状物(53g，粗产物)。将无色油状物(53g，粗产物)用己烷(200mL)湿磨，并且在60℃下搅拌1h，接着搅拌，并且使其在12小时内冷却至25℃。接着将反应过滤以收集固体，并且将固体真空干燥以提供呈白色固体的所需中间体2-[(1-叔丁基吡唑-4-羰基)氨基]乙酸甲酯(46g，81％产率，98.5％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):240.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.49(br t,J＝5.81Hz,1H)8.28(s,1H)7.87(s,1H)3.95(d,J＝5.99Hz,2H)3.64(s,3H)1.53(s,9H)。
代表性程序：方法C。在25℃下，在氮气下，向2-[(1-叔丁基吡唑-4-羰基)氨基]乙酸甲酯(23.75g，97.76mmol，98.5％纯度，1.7当量)和4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲脒(23.8g，57.5mmol，1当量)在甲苯(240mL)中的混合物中添加碳酸铯(56.21g，172.5mmol，3当量)，并且将混合物加热至110℃并搅拌0.5h。将反应冷却，并且倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(60mL×4)萃取。用3M HCl将有机相调整至pH＝2。将混合物用水(80mL×6)萃取，并且用6M NaOH将水相(含有产物)调整至pH＝9。将混合物用EA(100mL×6)萃取。将合并的有机相用盐水(300mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Titank C18 Bulk 250×100mm，10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：40％-65％，20min)来纯化以提供以绿色固体形式获得的1-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑-4-甲酰胺(20.79g，55.1％产率，99.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):577.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.97(t,J＝5.7Hz,1H),8.34(s,1H),7.93(s,1H),7.89(s,1H),7.15-7.08(m,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.01(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝9.0Hz,2H),4.93-4.74(m,3H),3.69-3.50(m,1H),3.08-2.98(m,1H),2.81(brd,J＝9.9Hz,1H),2.31-2.17(m,4H),2.12-2.06(m,1H),2.05-1.97(m,1H),1.72-1.64(m,1H),1.54(s,9H)。
实施例82：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲氧基乙基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物290B)
在0℃下，在氮气下，向吡唑酯(1g，7.93mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中添加氢化钠(634.3mg，15.9mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌5min，随后添加溴化物(1.10g，7.93mmol，1当量)。在0℃下将混合物搅拌55h。将残余物倾倒至氯化铵(饱和，200mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过硅胶色谱法来纯化以提供呈黄色油状物的产物(1g，68.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):185.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向酯(1g，5.43mmol，1当量)在甲醇(5mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(5M，4.7mL，4.30当量)。在20℃下将混合物搅拌5h。将残余物用1N HCl处理以调整pH＝5～6。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色固体的中间体(0.7g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):171.1[(M+H)+]。
方法B：在20℃下，在氮气下，向在DMF(2mL)中的羧酸(30.7mg，180μmol，2当量)中一次性添加HATU(68.5mg，180μmol，2当量)、TEA(900μmol，125μL 10当量)。在20℃下将混合物搅拌10min，随后添加胺1(50mg，90.1μmol，1当量，2HCl)。在20℃下将混合物搅拌10min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供浅黄色固体(20mg，36.8％产率，95.9％纯度)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm1.68(br d,J＝9.78Hz,1H)2.00(br d,J＝11.37Hz,1H)2.06-2.13(m,1H)2.20(br s,3H)2.27(br s,1H)2.82(br d,J＝9.05Hz,1H)3.05(br d,J＝8.68Hz,1H)3.24(s,3H)3.50-3.63(m,1H)3.69(t,J＝5.07Hz,2H)4.30(t,J＝5.07Hz,2H)4.74-4.93(m,3H)5.50(q,J＝8.76Hz,2H)6.03(br d,J＝8.19Hz,1H)6.28(d,J＝7.95Hz,1H)6.88(br d,J＝7.95Hz,1H)7.11(t,J＝8.07Hz,1H)7.91(d,J＝10.88Hz,2H)8.22(s,1H)9.01(t,J＝5.50Hz,1H)。
实施例83：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物289B)
在0℃下，向吡咯(1g，7.99mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加氢化钠(639mg，16mmol，60％纯度，2当量)，并且在0℃下将反应搅拌0.5h。接着添加溴醇(2.22g，16mmol，2当量)，并且搅拌混合物并在16h内升温至25℃。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供呈浅黄色油状物的中间体酯(1g，68.3％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.41(t,J＝1.90Hz,1H)6.76-6.82(m,1H)6.37(dd,J＝2.81,1.71Hz,1H)4.85-4.92(m,1H)3.82-3.91(m,2H)3.74-3.81(m,1H)3.67(s,3H)0.99(d,J＝5.99Hz,3H)。
在0℃下，向中间体醇(300mg，1.64mmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加氢化钠(328mg，8.19mmol，60％纯度，5当量)，并且在0℃下将反应搅拌0.5h，随后添加碘代甲烷(3.28mmol，204μL 2当量)。搅拌混合物，并且在1.5h内升温至25℃。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈浅黄色油状物的中间体甲基醚(200mg，61.9％产率)。LCMS(ES+,m/z):198.1[(M+H)+]。
向以上中间体(200mg，1.01mmol，1当量)在甲醇(3mL)和水(3mL)中的溶液中添加氢氧化钠(81.1mg，2.03mmol，2当量)，接着在50℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物倾倒至水(30mL)中，并且添加HCl水溶液(1N)以达到pH＝4，接着将水溶液用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的羧酸(150mg，粗品)。LCMS(ES+,m/z):184.1[(M+H)+]。
向羧酸(66mg，360μmol，2当量)和胺1(100mg，180.2μmol，1当量，2HCl)在DMF(5mL)中的溶液中添加TEA(1.80mmol，251μL 10当量)、EDCI(172.76mg，901.20μmol，5当量)和HOBt(121.77mg，901.20μmol，5当量)，接着在50℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物倾倒至水(150mL)中，接着用EA(60mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈白色固体的N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(28.4mg，25.8％产率)。LCMS(ES+,m/z):592.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(t,J＝5.69Hz,1H)7.89(s,1H)7.35(t,J＝1.83Hz,1H)7.11(t,J＝8.01Hz,1H)6.88(d,J＝8.31Hz,1H)6.77(t,J＝2.45Hz,1H)6.49(dd,J＝2.63,1.90Hz,1H)6.28(d,J＝7.82Hz,1H)6.01(d,J＝8.31Hz,1H)5.50(q,J＝8.97Hz,2H)4.76-4.91(m,1H)4.72(d,J＝5.75Hz,2H)3.96-4.03(m,1H)3.83-3.91(m,1H)3.51-3.67(m,2H)3.21(s,3H)2.99-3.08(m,1H)2.82(brd,J＝11.00Hz,1H)2.17-2.31(m,4H)1.95-2.13(m,2H)1.64-1.72(m,1H)1.02(d,J＝6.24Hz,3H)。
实施例84：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物291B)
步骤1：在0℃下，向以上获得的中间体醇(500mg，2.73mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加DAST(527.9mg，3.28mmol，432.71μL 1.2当量)，并且接着在25℃下将反应搅拌1h。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(150mL)中，接着用EA(60mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈浅黄色油状物的所需氟化酯(360mg，71.2％产率)。LCMS(ES+,m/z):186.0[(M+H)+]。
步骤2：向二氟化酯中间体(200mg，1.08mmol，1当量)在甲醇(3mL)和水(3mL)中的溶液中添加氢氧化钠(172.8mg，4.32mmol，4当量)，接着在50℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物倾倒至水(80mL)中，添加1M HCl水溶液以达到pH＝4，接着用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的中间体酸(150mg，粗品)。LCMS(ES+,m/z):172.1[(M+H)+]。
向氟代酸(37mg，216μmol，2当量)和胺1(60mg，108.1μmol，1当量，2HCl)在DMF(5mL)中的溶液中添加TEA(1.08mmol，150μL 10当量)、EDCI(103.7mg，541μmol，5当量)和HOBt(73.1mg，541μmol，5当量)，接着在50℃下将混合物加热和搅拌16h。将反应混合物倾倒至水(150mL)中，接着用EA(60mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈白色固体的化合物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(21.3mg，32.7％产率)。LCMS(ES+,m/z):580.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.70(t,J＝5.75Hz,1H)7.89(s,1H)7.38(s,1H)7.11(t,J＝8.01Hz,1H)6.88(d,J＝8.19Hz,1H)6.80(t,J＝2.32Hz,1H)6.53(dd,J＝2.69,1.83Hz,1H)6.28(d,J＝7.82Hz,1H)6.02(br d,J＝8.31Hz,1H)5.50(q,J＝9.01Hz,2H)4.78-4.99(m,2H)4.73(d,J＝5.75Hz,2H)4.15-4.27(m,1H)4.02-4.13(m,1H)3.51-3.68(m,1H)3.00-3.10(m,1H)2.83(br d,J＝9.29Hz,1H)2.17-2.28(m,4H)1.99-2.14(m,2H)1.69(br d,J＝10.88Hz,1H)1.21-1.29(m,3H)。
实施例85：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物292B)
向先前制备的(Z)-3-(二甲基氨基)-2-异氰基-丙-2-烯酸乙酯(1.18g，5.95mmol，1当量)的混合物中添加2-甲基丙-2-胺(23.8mmol，2.50mL，4当量)，并且在密封管中，在140℃下将反应加热10h。将残余物倾倒至冰水(200mL)中。将水相用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(硅胶，PE/EA＝1/0，0/1)来纯化以提供呈棕色固体的1-叔丁基咪唑-4-甲酸乙酯(0.5g，2.55mmol，42.9％产率)。
在标准条件下，在MeOH(2mL)中，用NaOH水溶液(5M，2mL，3.9当量)使1-叔丁基咪唑-4-甲酸乙酯(500mg，2.55mmol，1当量)皂化。将反应混合物倾倒至3N HCl中以调整pH＝6～7，接着真空浓缩以提供呈棕色固体的1-叔丁基咪唑-4-甲酸(250mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):169.1[(M+H)+]。从以上羧酸制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺以提供产物。LCMS(ES+,m/z):577.1[(M+H)+]。
实施例86：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物293B)
向胺(300mg，0.44mmol，1当量)、(74.3mg，0.44mmol，1当量)在DMF(8mL)中的溶液中添加TEA(4.39mmol，611μL 10当量)、EDCI(252.5mg，1.32mmol，3当量)和HOBt(178mg，1.32mmol，3当量)，并且在50℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(20mL)中，接着用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(100mg，25.3％产率)，其是白色固体，呈对映异构体的混合物形式。用手性SFC拆分两种对映异构体提供了所需纯对映异构体N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-吡咯-3-甲酰胺。LCMS(ES+,m/z):535.1[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝1.63-1.72(m,1H),1.92-2.14(m,2H),2.15-2.31(m,4H),2.82(brd,1H),2.96-3.10(m,1H),3.50-3.70(m,1H),3.87(s,3H),4.69-4.96(m,3H),5.50(q,2H),6.02(d,1H),6.28(d,1H),6.88(d,1H),7.11(t,1H),7.89(d,2H),8.19(s,1H),9.00(t,1H)。
实施例87：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物294B)
N-烷基哌啶类似物的手性中间体的合成：向2-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)乙酸(9.75g，47.5mmol，1.5当量)在DMF(250mL)中的溶液中添加PYBOP(19.78g，38mmol，1.2当量)、DIEA(95mmol，16.6mL，3当量)和外消旋(3S,4R)-3-氟-4-[[2-[(Z)-N'-羟基甲脒基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(15g，31.7mmol，1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至水(600mL)中，接着过滤，并且将滤饼真空干燥以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10/1至1/1)来纯化以产生产物(17g，81.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):661.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.02-7.87(m,4H),7.71-7.53(m,2H),7.52-7.42(m,1H),7.09(t,J＝8.0Hz,1H),6.90(d,J＝8.4Hz,1H),6.40-6.30(m,1H),5.70(d,J＝8.8Hz,1H),5.61-5.46(m,2H),5.01-4.79(m,1H),4.70(s,2H),4.23(br s,1H),4.16-4.03(m,1H),3.95-3.78(m,1H),3.19-2.90(m,2H),1.91-1.68(m,2H),1.42(s,9H)。
将外消旋(3S,4R)-4-[[2-[(Z)-N'-[2-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)乙酰基]氧基甲脒基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(17g，25.7mmol，1当量)溶解于吡啶(170mL)中，并且在120℃下将反应搅拌2.5小时。将反应倾倒至水(300mL)中，过滤，并且将固体真空浓缩以产生残余物。将残余物通过用300mL(PE:EA＝5:1)湿磨来纯化以产生呈棕色固体的环化产物(12g，72.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):643.6[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.03-7.89(m,4H),7.81(s,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.87(d,J＝8.2Hz,1H),6.30(d,J＝7.9Hz,1H),6.09(br d,J＝8.6Hz,1H),5.46(q,J＝8.7Hz,2H),5.25(s,2H),4.93-4.74(m,1H),4.32-4.13(m,1H),4.10-4.00(m,1H),3.91-3.71(m,1H),2.88(br s,2H),1.92-1.72(m,1H),1.64(br d,J＝10.4Hz,1H),1.39(s,11H)。
将在乙醇(65mL)中的外消旋(3S,4R)-4-[[2-[5-[(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(9g，14mmol，1当量)用水合肼(65mL，98％纯度)处理，并且在80℃下将反应搅拌1h。将混合物添加至水(300mL)中，过滤，并且将固体真空干燥以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝5/1至1/3)来纯化。接着将外消旋产物通过SFC来进一步纯化以拆分成单独对映异构体(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×50mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2OIPA]；B％：50％-50％，7min)，从而产生Boc-哌啶A(2.8g，39.0％产率)和Boc-哌啶B(2.9g，40.4％产率)。
实施例88：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物298B)和1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物299B)
根据实施例64制备哌啶起始物料。向哌啶(1.2g，2.20mmol，1当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.52g，11mmol，3当量)和碘代乙烷(3.29mmol，263μL 1.5当量)，接着在室温下将反应搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法来纯化以产生呈黄色固体的所需N-乙基中间体外消旋物(1.1g，87.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):575.3[(M+H)+]。
向外消旋N-乙基哌啶(1g，1.74mmol，1当量)在THF(0.3mL)中的溶液中添加溴化氢(29.80g，122mmol，69.8当量，33％)，并且在室温下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至MTBE(200mL)中，并且通过过滤收集黄色固体，接着用EA(30mL×3)洗涤。将固体真空干燥以产生呈黄色固体的所需中间体(1.6g，88.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):441.1[(M+H)+]。
向叔丁基吡咯酸(122.4mg，732μmol，1当量)和以上中间体(556mg，732μmol，1当量，HBr)在DMF(15mL)中的溶液中添加TEA(7.32mmol，1.02mL，10当量)、EDCI(701.5mg，3.66mmol，5当量)和HOBT(494.5mg，3.66mmol，5当量)，并且在50℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至水(150mL)中，接着用EA(60mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化，并且用EA:PE＝1:2洗涤以得到呈外消旋物形式的黄色固体。将外消旋物通过SFC来分离以产生所需对映异构体1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物298B)。LC-MS(ES+,m/z):590.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝0.83(br s,1H),1.00(br s,3H),1.49(br s,9H),1.71(br s,1H),1.98(br s,1H),2.02-2.25(m,2H),2.37(br s,2H),2.89(br s,1H),3.12(br s,1H),3.52-3.62(m,1H),4.59-5.09(m,3H),5.50(br d,2H),6.01(br d,1H),6.29(br s,1H),6.50(br s,1H),6.77-7.26(m,3H),7.55(br s,1H),7.89(br s,1H),8.66(br s,1H)(53mg，86.3μmol，26.8％产率，96％纯度)；1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物299B)(53mg，26.2％产率，94％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):590.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝1.00(br t,3H),1.49(s,9H),1.70(br d,1H),1.90-2.00(m,1H),2.00-2.11(m,1H),2.11-2.34(m,2H),2.37(br d,2H),2.91(br d,1H),3.12(br t,1H),3.51-3.70(m,1H),4.68-4.95(m,3H),5.44-5.56(m,2H),6.01(br d,1H),6.28(br d,1H),6.50(br s,1H),6.88(br d,1H),6.99(br s,1H),7.11(br t,1H),7.54(br s,1H),7.89(s,1H),8.66(br t,1H)。
实施例89：1-苯甲基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物300B)
从必需的N-苯甲基吡唑甲酸和胺1制备该类似物。LC-MS(ES+,m/z):610.9[(M+H)+]。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ9.09(t,J＝5.7Hz,1H),8.38(s,1H),8.00(s,1H),7.93(s,1H),7.47–7.30(m,5H),7.16(t,J＝8.0Hz,1H),6.93(d,J＝8.3Hz,1H),6.33(d,J＝7.9Hz,1H),6.08(d,J＝8.3Hz,1H),5.55(q,J＝8.8Hz,2H),5.43(s,2H),4.97–4.76(m,3H),3.73–3.56(m,2H),3.09(s,1H),2.87(d,J＝11.0Hz,1H),2.32(d,J＝13.3Hz,0H),2.24(s,3H),2.13(d,J＝10.1Hz,1H),2.09–1.99(m,1H),1.86–1.77(m,1H),1.73(d,J＝12.3Hz,1H)。
从胺1和相应吡唑酸制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物301B)。LCMS(ES+,m/z):567.1[(M+H)]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm1.65-1.76(m,1H),1.89-2.07(m,1H),2.08-2.31(m,1H),2.09-2.29(m,3H),2.33-2.48(m,1H),2.34(br s,1H),2.34-2.47(m,1H),2.35-2.42(m,1H),2.77-2.95(m,1H),3.00-3.17(m,1H),3.01-3.14(m,1H),3.55-3.68(m,1H),3.55-3.66(m,1H),4.45(t,J＝4.74Hz,1H),4.41-4.47(m,1H),4.48-4.56(m,1H),4.67-4.98(m,5H),5.44-5.56(m,2H),6.00-6.09(m,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.88(d,J＝7.94Hz,1H),7.06-7.17(m,1H),7.89(s,1H),7.97(s,1H),8.29(s,1H),9.06(t,J＝5.62Hz,1H)。
实施例90：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物302B)
在0℃下，持续1h向先前制备的1-(2-羟基-1-甲基-乙基)吡唑-4-甲酸甲酯(500mg，2.71mmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加氢化钠(217.1mg，5.43mmol，60％纯度，2当量)，随后添加碘代甲烷(5.43mmol，340μL 2当量)。在0-25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌2h。在0℃下将反应混合物通过添加氯化铵(10mL)来淬灭，接着倾倒至水(50mL)中，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈白色油状物的所需产物1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡唑-4-甲酸酯(400mg，粗品)，其不经进一步纯化即使用。LC-MS(ES+,m/z):199.1[(M+H)+]。
向1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酸甲酯(200mg，1.01mmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(0.5mL)中的溶液中添加氢氧化钠(81.1mg，2.03mmol，2当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，并且用HCl(5M)将混合物调整至pH 2，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。粗产物不经进一步纯化即使用。获得了呈白色固体的1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酸(180mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):183.0[(M+H)+]。使用方法B，从以上酸获得N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):593.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 9.03(t,J＝5.69Hz,1H),8.19(s,1H),7.91(d,J＝9.29Hz,2H),7.12(t,J＝8.07Hz,1H),6.88(d,J＝8.31Hz,1H),6.28(d,J＝7.95Hz,1H),6.02(d,J＝8.31Hz,1H),5.50(q,J＝8.84Hz,2H),4.73-4.93(m,3H),4.09-4.26(m,2H),3.70(td,J＝6.39,4.34Hz,1H),3.51-3.66(m,1H),3.20(s,3H),2.99-3.10(m,1H),2.82(br d,J＝10.39Hz,1H),2.17-2.34(m,4H),2.06-2.16(m,1H),2.00(br dd,J＝11.98,3.18Hz,1H),1.68(br d,J＝10.27Hz,1H),1.06(d,J＝6.36Hz,3H)。
实施例91：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物303B)
在0℃下，向以上醇在DCM(5mL)中的溶液中添加DAST(9.77mmol，1.29mL，3当量)。在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌2h。在0℃下将反应混合物通过添加氯化铵(10mL)来淬灭，接着倾倒至水(50mL)中，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，从而产生产物(400mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):186.0[(M+H)+]。
向酯(200mg，1.07mmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(129mg，3.22mmol，3当量)。在25℃下将混合物搅拌5h。用HCl(2M)将反应混合物调整至pH7，接着过滤，并且真空浓缩以产生所需酸中间体(180mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):172.0[(M+H)+]。
从以上酸和胺1获得N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):581.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 9.03(br t,J＝5.62Hz,1H),8.23(s,1H),8.21-8.24(m,1H),7.94(s,1H),7.92-7.92(m,1H),7.87(s,1H),7.10(t,J＝7.94Hz,1H),6.86(d,J＝8.16Hz,1H),6.26(d,J＝7.94Hz,1H),5.99(brd,J＝8.38Hz,1H),5.48(q,J＝8.75Hz,2H),5.07(br d,J＝2.65Hz,1H),4.73-4.90(m,3H),4.29-4.47(m,2H),3.50-3.66(m,1H),3.02(br t,J＝10.36Hz,1H),2.80(br d,J＝10.36Hz,1H),2.16-2.30(m,1H),2.15-2.32(m,4H),2.04-2.12(m,1H),1.98(br dd,J＝11.36,2.98Hz,1H),1.66(br d,J＝11.47Hz,1H),1.24-1.34(m,3H)。
使用方法B，从N-乙基哌啶中间体获得1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物304B)。LC-MS(ES+,m/z):591.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.95(s,1H),8.32(s,1H),7.91(s,1H),7.87(s,1H),7.00-7.16(m,1H),6.86(d,J＝8.16Hz,1H),6.27(d,J＝7.94Hz,1H),5.99(br d,J＝8.38Hz,1H),5.48(br d,J＝8.82Hz,2H),4.76(d,J＝5.51Hz,3H),3.49-3.71(m,1H),3.12(br d,J＝9.70Hz,1H),2.90(br d,J＝10.36Hz,1H),2.36(br d,J＝6.17Hz,2H),2.14-2.27(m,1H),2.07(br d,J＝10.14Hz,1H),1.91-2.01(m,1H),1.69(br d,J＝9.26Hz,1H),1.52(s,10H)。
使用方法B，从咪唑酸获得1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物305B)。LC-MS(ES+,m/z):591.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.79(t,J＝5.99Hz,1H),7.92-7.94(m,2H),7.89(s,1H),7.05-7.18(m,1H),6.88(d,J＝8.31Hz,1H),6.29(d,J＝7.95Hz,1H),6.03(br d,J＝8.31Hz,1H),5.42-5.59(m,2H),4.75-4.94(m,3H),3.47-3.73(m,2H),3.07-3.20(m,1H),2.87-2.97(m,1H),2.38(br d,J＝5.14Hz,1H),2.17-2.31(m,1H),2.05-2.16(m,1H),1.93-2.04(m,1H),1.65-1.76(m,1H)。
实施例92：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物306B)
在70℃下，将(Z)-3-(二甲基氨基)-2-异氰基-丙-2-烯酸乙酯(10g，50.5mmol，1当量)和2-氨基乙醇(101mmol，6.11mL，2当量)的混合物搅拌5h。将残余物直接通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝25/1至15/1)来纯化以提供呈黄色油状物的1-(2-羟基乙基)-1H-咪唑-4-甲酸乙酯(5.5g，54.4％产率，92％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):185.1[(M+H)+]。
在0℃下，向1-(2-羟基乙基)咪唑-4-甲酸乙酯(2g，9.99mmol，1当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加DAST(99.9mmol，13.2mL，10当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将混合物逐滴添加至碳酸氢钠水溶液(50mL)中，接着用DCM(3×30mL)萃取。将有机相用盐水(1×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝8:1)来纯化以提供呈黄色油状物的1-(2-氟乙基)-1H-咪唑-4-甲酸乙酯(120mg，4.8％产率，90％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):187.0[(M+H)+]。
在标准条件下，使用氢氧化钠水溶液(1M，1.92mL，3.9当量)和甲醇(4mL)使1-(2-氟乙基)-1H-咪唑-4-甲酸乙酯(102.2mg，494μmol，1当量)皂化以在将反应冻干之后提供呈白色固体的所需羧酸(250mg，64.0％产率)，其直接用于下一步骤中。LC-MS(ES+,m/z):159.0[(M+H)+]。
使用方法B，从氟乙基咪唑酸获得N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-咪唑-4-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):567.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝1.68(brd,1H),1.92-2.14(m,2H),2.19(s,3H),2.25-2.36(m,1H),2.82(br d,1H),3.04(br t,1H),3.48-3.72(m,1H),4.30-4.45(m,2H),4.63-4.94(m,5H),5.50(q,2H),6.04(br d,1H),6.28(br d,1H),6.88(br d,1H),7.11(br t,1H),7.81(br d,2H),7.88(s,1H),8.80(br t,1H)。
实施例93：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物307B)
在20℃下，在氮气下，向1-(2,2-二氟乙基)吡唑-4-甲酸甲酯(300mg，1.58mmol，1当量)在甲醇(3mL)中的混合物中添加氢氧化钠(5M，3mL，9.51当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。添加1N盐酸以将pH调整至中性，并且将反应真空浓缩以提供呈白色固体的1-(2,2-二氟乙基)吡唑-4-甲酸。LC-MS(ES+,m/z):176.12[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.63-1.69(m,1H),1.88-2.03(m,1H),2.03-2.12(m,1H),2.12-2.19(m,3H),2.19-2.29(m,1H),2.77-2.84(m,1H),2.97-3.07(m,1H),3.49-3.64(m,1H),4.69(td,J＝15.27,3.42Hz,2H),4.74-4.90(m,3H),5.48(q,J＝9.41Hz,2H),6.01(br d,J＝8.16Hz,1H),6.19-6.56(m,2H),6.80-6.91(m,1H),7.09(t,J＝8.05Hz,1H),7.87(s,1H),7.98(s,1H),8.29(s,1H),9.10(t,J＝5.62Hz,1H)。
使用方法B制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-咪唑-4-甲酰胺，31％产率。LC-MS(ES+,m/z):585.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝1.68(br d,1H),1.92-2.14(m,2H),2.19(s,3H),2.25-2.36(m,1H),2.82(br d,1H),3.04(br t,1H),3.48-3.72(m,1H),4.30-4.45(m,2H),4.63-4.94(m,5H),5.50(q,2H),6.04(br d,1H),6.28(br d,1H),6.88(br d,1H),7.11(br t,1H),7.81(br d,2H),7.88(s,1H),8.80(br t,1H)。
使用方法B制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-苯基-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物308B)，以提供所需产物，40％产率。LC-MS(ES+,m/z):597.1。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.68(br d,J＝10.27Hz,1H)1.99(br d,J＝11.86Hz,1H)2.08(br d,J＝11.37Hz,1H)2.19(s,3H)2.28(br d,J＝13.69Hz,1H)2.81(br d,J＝8.80Hz,1H)3.03(br s,1H)3.51-3.66(m,1H)4.75-4.90(m,3H)5.51(br d,J＝8.68Hz,2H)6.01(br d,J＝7.70Hz,1H)6.28(br d,J＝7.95Hz,1H)6.88(br d,J＝8.56Hz,1H)7.12(br t,J＝7.95Hz,1H)7.36-7.41(m,1H)7.54(br t,J＝7.58Hz,2H)7.85-7.94(m,3H)8.23(s,1H)9.00(s,1H)9.19(br s,1H)。
使用方法B制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-苯基-1H-咪唑-5-甲酰胺(化合物309B)。LC-MS(ES+,m/z):597.1。
实施例94：1-(2,2-二氟乙基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物310B)
用于合成1-N-烷基-4-羧基咪唑的一般性程序：制备2,2-二氟乙胺(965mg，11.9mmol，2当量)和(Z)-3-(二甲基氨基)-2-异氰基-丙-2-烯酸乙酯(1g，5.95mmol，1当量)的混合物，并且在70℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，并且用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/0至1/1)来纯化以产生中间体酯(1g，3.92mmol，65.9％产率，80％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):152.0。
在25℃下，将酯(536.9mg，2.63mmol，1当量)和氢氧化钠(105mg，2.63mmol，1当量)在水(3mL)和甲醇(3mL)中的溶液搅拌2h。将反应混合物用HCl中和至pH 7。将反应过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将固相用DCM(60mL×2)萃取。将反应混合物过滤，并且经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。粗产物不经进一步纯化即使用(300mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):174.0。
使用方法B制备1-(2,2-二氟乙基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺，以提供所需产物，22％产率。LC-MS(ES+,m/z):585.1。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.83-8.87(m,1H),8.85(t,J＝5.95Hz,1H),8.82-8.87(m,1H),7.88(s,1H),7.80(d,J＝9.26Hz,2H),7.11(t,J＝8.05Hz,1H),6.88(d,J＝8.38Hz,1H),6.33-6.67(m,1H),6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.04(br d,J＝8.16Hz,1H),5.50(q,J＝8.97Hz,2H),4.73-5.03(m,3H),4.60(td,J＝15.93,2.98Hz,2H),3.46-3.77(m,1H),3.07(br s,1H),2.85(br dd,J＝8.49,1.21Hz,1H),2.08-2.32(m,5H),1.88-2.05(m,1H),1.69(br d,J＝11.69Hz,1H)。
使用方法B制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-3-甲基-1-(丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物311B)，19％产率。LC-MS(ES+,m/z):577.1。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.66-8.73(m,1H),8.25(s,1H),7.88(s,1H),7.04-7.14(m,1H),6.86(d,J＝8.16Hz,1H),6.27(d,J＝7.94Hz,1H),5.99(br d,J＝8.38Hz,1H),5.48(br d,J＝8.82Hz,2H),4.69-4.91(m,3H),4.35-4.48(m,1H),3.46-3.73(m,1H),3.01(br s,1H),2.78(br s,1H),2.30(s,4H),2.15-2.19(m,3H),2.08(br s,1H),2.03-2.12(m,1H),1.94-2.03(m,1H),1.66(brd,J＝10.36Hz,1H),1.39(d,J＝6.62Hz,7H)。
实施例95：1-环戊基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物312B)
在20℃下，在氮气下，向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(1g，7.93mmol，1当量)和溴环戊烷(15.9mmol，1.70mL，2当量)在DMF(8mL)中的混合物中添加碳酸铯(5.17g，15.9mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以产生呈白色固体的1-环戊基吡唑-4-甲酸甲酯，88.8％产率。LC-MS(ES+,m/z):194.2[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向1-环戊基吡唑-4-甲酸甲酯(500mg，2.57mmol，1当量)中添加氢氧化钠溶液(5M，3mL，5.83当量)和甲醇(5mL)。在20℃下将混合物搅拌30min。添加1N盐酸以将pH调整至中性，并且接着将反应真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供1-环戊基吡唑-4-甲酸，71％产率。
使用方法B制备1-环戊基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺，33％产率。LC-MS(ES+,m/z):589.3。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.55-1.70(m,3H),1.71-1.82(m,2H),1.84-2.01(m,3H),2.07(td,J＝12.84,7.39Hz,3H),2.19(s,3H),2.21-2.29(m,1H),2.82(br d,J＝10.36Hz,1H),2.99-3.09(m,1H),3.50-3.66(m,1H),4.67-4.73(m,1H),4.74-4.91(m,3H),5.48(q,J＝8.97Hz,2H),6.00(br d,J＝8.16Hz,1H),6.26(d,J＝7.94Hz,1H),6.86(d,J＝8.38Hz,1H),7.09(t,J＝8.05Hz,1H),7.87(s,1H),7.89(s,1H),8.26(s,1H),8.96(t,J＝5.62Hz,1H)。
实施例96：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物314B)
在20℃下，在氮气下，向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(800mg，6.34mmol，1当量)和3-碘四氢呋喃(1.51g，7.61mmol，1.2当量)在DMF(8mL)中的混合物中添加碳酸铯(4.13g，12.7mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌4h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以产生呈白色固体的1-环戊基吡唑-4-甲酸甲酯，71.1％产率。LC-MS(ES+,m/z):198.0[(M+H)+]。
在20℃下，向1-四氢呋喃-3-基吡唑-4-甲酸甲酯(670mg，3.41mmol，1当量)和氢氧化钠(5M，3mL，4.39当量)的混合物中添加甲醇(4mL)。在20℃下将混合物搅拌1h。添加1N盐酸以使pH达到中性，并且将反应真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法来纯化以提供1-四氢呋喃-3-基吡唑-4-甲酸，75.8％产率。
向哌啶(1.2g，2.20mmol，1当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.52g，11mmol，3当量)和碘代乙烷(3.29mmol，263μL 1.5当量)，接着在室温下将反应搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法来纯化以产生呈黄色固体的乙基哌啶(1.1g，87.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):575.3[(M+H)+]
向N-乙基哌啶(1g，1.74mmol，1当量)在THF(0.3mL)中的溶液中添加溴化氢(29.80g，121.5mmol，69.83当量，33％)，并且在室温下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至MTBE(200mL)中，并且通过过滤收集黄色固体并用EA(30mL×3)洗涤，接着真空浓缩以产生呈黄色固体的中间体胺氢溴酸盐(1.6g，88.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):441.1[(M+H)+]。
使用方法B，从胺1获得N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺，35％产率。LC-MS(ES+,m/z):605.1。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 0.98(t,J＝7.17Hz,3H),1.68(br d,J＝10.36Hz,1H),1.87-2.01(m,1H),2.07(br t,J＝10.91Hz,1H),2.15-2.31(m,2H),2.32-2.44(m,3H),2.89(br d,J＝10.14Hz,1H),3.10(brt,J＝10.03Hz,1H),3.52-3.66(m,1H),3.80(td,J＝8.38,5.29Hz,1H),3.85-3.90(m,1H),3.91-3.99(m,2H),4.67-4.93(m,3H),5.00-5.09(m,1H),5.48(q,J＝8.89Hz,2H),6.00(brd,J＝8.38Hz,1H),6.26(d,J＝7.94Hz,1H),6.86(d,J＝8.16Hz,1H),7.02-7.14(m,1H),7.87(s,1H),7.92(s,1H),8.29(s,1H),9.01(t,J＝5.62Hz,1H)。
实施例97：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-环丙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物315B).
在70℃下，在空气氛围下，将哌啶(0.4g，517μmol，1当量)、环丙基硼酸(221.9mg，2.58mmol，5当量)、乙酸铜(II)(187.7mg，1.03mmol，2当量)、2,2'-联吡啶(161.4mg，1.03mmol，2当量)和碳酸钠(273.8mg，2.58mmol，5当量)在DCE(50mL)中的混合物加热和搅拌3h。将反应混合物倾倒至水(20mL)中。将混合物用EA(20mL×3)萃取。将有机相用盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需环丙基哌啶(240mg，36.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):587.2[(M+H)+]。
向环丙基哌啶(0.24g，409μmol，1当量)在THF(3mL)中的溶液中添加HBr(18.2mmol，3mL，33％，44.6当量)和乙酸(157mmol，9mL)。在20℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物逐滴添加至乙醚(10mL)中以使产物沉淀，通过过滤收集所述产物，并且真空干燥以提供呈灰色固体的伯胺(240mg，粗品，HBr盐)。
通过方法B，从以上胺制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-环丙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺，11％产率。LC-MS(ES+,m/z):603.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98-8.97(d,J＝2.4Hz,1H),8.33(s,1H),7.93(s,1H),7.87(s,1H),7.13–7.12(m,1H),6.89-6.86(m,1H),6.30-6.28(m,1H),5.99-5.97(d,J＝8.0Hz,1H),5.53-5.49(m,2H),4.90-4.77(m,3H),3.62-3.58(m,1H),3.18-3.10(m,1H),1.90-1.75(m,2H),1.67-1.66(m,1H),1.59(s,9H),1.26-1.23(m,2H),0.76-0.56(m,1H),0.43-0.42(m,2H),0.43-0.42(m,2H)。
实施例98：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(丙烷-2-基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物316B)
向哌啶(657.2mg，875μmol，1当量，HCl)在DMF(9mL)中的混合物中添加2-碘丙烷(1.75mmol，175μL 2当量)和碳酸钾(604.5mg，4.37mmol，5当量)。在50℃下将混合物加热和搅拌16h。将混合物通过添加水(20mL)来淬灭，接着用EA(30mL×3)萃取。将有机相用盐水(30mL)洗涤，经硫酸钠干燥，真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:甲醇＝30/1至10/1)来纯化以产生呈黄色油状物的所需异丙基哌啶(600mg，823.7μmol，94.2％产率，80.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):589.2[(M+H)+]。
向异丙基哌啶(743.5mg，1.19mmol，1当量)在THF(10mL)中的混合物中添加HBr/AcOH(10mL，33％纯度)。在25℃下将混合物搅拌2h。将混合物添加至MTBE(50mL)中，并且搅拌10min，接着通过过滤收集产物并真空干燥以提供呈黄色固体的伯胺(500mg，54.6％产率，80％纯度，2HBr)。LC-MS(ES+,m/z):455.3[(M+H)+]。
使用方法B制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(丙烷-2-基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺，以提供所需产物，44％产率。LC-MS(ES+,m/z):605.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝0.97(dd,6H),1.54(s,9H),1.71(br d,1H),1.99(s,1H),2.26-2.36(m,1H),2.39-2.46(m,1H),2.65-2.86(m,2H),3.04(br s,1H),3.49-3.70(m,1H),4.71-4.97(m,3H),5.50(brd,2H),5.98(br d,1H),6.28(d,1H),6.88(d,1H),7.11(t,1H),7.91(d,2H),8.34(s,1H),8.97(t,1H)。
使用方法B，从异丙基哌啶中间体制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(丙烷-2-基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物317B)，46％产率。LC-MS(ES+,m/z):604.2[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝0.98(dd,6H),1.49(s,9H),1.71(br d,1H),1.93(br dd,1H),2.26-2.37(m,2H),2.64-2.87(m,2H),2.99-3.10(m,1H),3.49-3.67(m,1H),4.69-4.94(m,3H),5.50(q,2H),5.97(br d,1H),6.28(d,1H),6.50(dd,1H),6.87(d,1H),6.99(t,1H),7.11(t,1H),7.54(t,1H),7.88(s,1H),8.63(t,1H)。
使用方法B，从异丙基哌啶中间体制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(丙烷-2-基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物318B)，41％产率。LC-MS(ES+,m/z):605.2[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝0.98(br s,6H),1.54(s,9H),1.71(br d,1H),1.93(br d,1H),2.24-2.37(m,2H),2.63-2.89(m,2H),3.04(br s,1H),3.55(br s,1H),4.70-4.96(m,3H),5.50(q,2H),5.99(br d,1H),6.28(br d,1H),6.88(br d,1H),7.11(br t,1H),7.88(s,1H),7.92(d,2H),8.77(br t,1H)。
使用方法B，利用胺1制备1-环戊基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物319B)，以提供所需产物。LC-MS(ES+,m/z):588.2[(M+H)+]。
使用方法A，从N-乙基哌啶中间体制备1-环戊基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物320B)，39％产率。LC-MS(ES+,m/z):602.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝1.01(t,3H),1.57-1.86(m,7H),1.89-2.04(m,1H),2.11(br d,2H),2.26-2.43(m,4H),2.91(br d,1H),3.05-3.20(m,1H),3.50-3.74(m,1H),4.40-4.52(m,1H),4.73(d,3H),5.50(br d,2H),5.99(br d,1H),6.29(d,1H),6.49(dd,1H),6.82-6.93(m,2H),7.12(t,1H),7.45(t,J＝1.90Hz,1H),7.88(s,1H),8.63(t,1H)。
使用方法B，从胺1和先前制备的THF-吡唑酸制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物321B)，24％产率。LC-MS(ES+,m/z):591.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.71(br d,J＝10.80Hz,1H)1.96-2.10(m,2H)2.27(br s,4H)2.37(br s,4H)2.88(br s,5H)3.06-3.21(m,2H)3.52-3.70(m,1H)4.74-4.94(m,3H)4.97(br s,1H)5.50(q,J＝9.19Hz,2H)6.05(br d,J＝8.38Hz,1H)6.29(d,J＝7.94Hz,1H)6.89(br d,J＝8.16Hz,1H)7.04-7.18(m,1H)7.89(s,1H)7.92(s,1H)8.33(s,1H)9.03(t,J＝5.51Hz,1H)。
使用方法B，从胺1制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物322B)，32％产率。LC-MS(ES+,m/z):591.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.82(t,J＝5.73Hz,1H),8.79-8.87(m,1H),7.87(s,2H),7.05-7.13(m,1H),6.86(d,J＝8.38Hz,1H),6.26(d,J＝7.72Hz,1H),6.00(br d,J＝8.38Hz,1H),5.48(q,J＝8.67Hz,2H),4.73-4.75(m,1H),4.58-4.97(m,3H),3.48-3.66(m,1H),2.95-3.11(m,1H),2.76-2.86(m,1H),2.65-2.69(m,3H),2.14-2.30(m,4H),2.04-2.13(m,1H),1.91-2.02(m,1H),1.67(br d,J＝9.04Hz,1H),1.57(s,9H)。
实施例99：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物323B)
向3-羟基四氢呋喃(5g，4.6mL，1当量)在DCM(50mL)中的溶液中添加TEA(39.5mL，5当量)。在0℃下将混合物搅拌0.5h，接着将p-TsCl(5.41g，0.5当量)添加至混合物中。在0℃下将混合物搅拌0.5h，此时添加另一份TsCl(5.41g，0.5当量)。在0℃下再搅拌0.5h之后，添加最后一份TsCl(5.41g，0.5当量)。将混合物升温，并且在25℃下搅拌10.5h。将反应混合物通过添加水(50mL)来淬灭，并且用DCM(50mL×2)萃取。将合并的有机层用DCM(50mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝100/1至10/1)来纯化以产生呈黄色油状物的产物，80％产率。
向甲基吡咯-3-甲酸(500mg，1当量)和碳酸铯(3.91g，3当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加中间体甲苯磺酸酯(3.87g，4当量)。在100℃下将反应搅拌和加热16h。将反应混合物用水(100mL)稀释，并且用EA(150mL)(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝50/1至5/1)来纯化以产生呈浅黄色液体的产物，83％产率。LCMS(ES+,m/z):196.1[(M+H)+]。
在25℃下，将甲酯(1.8g，1当量)和氢氧化钠(5M，8.30mL，5.42当量)在甲醇(10mL)中的混合物搅拌12h。将反应混合物真空浓缩以移除甲醇。在0℃下，用HCl(12M)将混合物调整至pH＝2。将混合物用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的酸。LCMS(ES+,m/z):182.1[(M+H)+]。
使用方法B，从胺1制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺，30％产率。LCMS(ES+,m/z):196.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.77-8.63(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.51-7.44(t,J＝1.6Hz,1H),7.15-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),6.93-6.81(m,2H),6.53-6.49(m,1H),6.34-6.23(d,J＝8.8Hz,1H),6.11-5.97(d,J＝8.4Hz,,1H),5.56-5.40(m,2H),4.90(brs,1H),4.87-4.81(m,1H),4.78(brs,1H),4.75-4.69(d,J＝6.0Hz,,2H),4.06-3.97(m,1H),3.91-3.83(m,1H),3.82-3.74(m,2H),3.68-3.51(m,1H),3.09-2.99(t,J＝9.8Hz,1H),2.87-2.78(d,J＝9.6Hz,1H),2.46-2.38(m,1H),2.31-2.29(m,4H),2.13-1.96(m,3H),1.73-1.64(m,1H)。
使用方法B，从N-乙基哌啶中间体制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物324B)，12％产率。LCMS(ES+,m/z):604.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.75-8.66(t,J＝5.6Hz,1H),7.92-7.84(d,J＝7.6Hz,1H),7.50-7.41(d,J＝2.0Hz,1H),7.15-7.05(t,J＝8.0Hz,1H),6.92-6.80(m,2H),6.56-6.46(t,J＝2.0Hz,1H),6.34-6.23(d,J＝8.0Hz,1H),6.06-5.97(d,J＝8.0Hz,1H),5.64-5.39(m,2H),4.90(brs,1H),4.88-4.81(m,1H),4.79(brs,1H),4.75-4.68(d,J＝5.6Hz,,2H),4.06-3.96(m,1H),3.92-3.84(m,1H),3.83-3.73(m,2H),3.68-3.53(m,1H),3.18-3.07(t,J＝9.4Hz,1H),2.96-2.85(d,J＝10.0Hz,1H),2.46–2.21(m,4H),2.14-1.91(m,3H),1.76-1.65(d,J＝10.8Hz,1H),1.00(t,J＝7.1Hz,3H)。
实施例100：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物325B)
将吡唑-4-甲酸甲酯(1g，7.93mmol，1当量)、碳酸铯(7.75g，23.8mmol，3当量)和4-溴四氢吡喃(2.62g，15.9mmol，2当量)在DMF(10mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌7h。将反应混合物通过添加水(100mL)来淬灭，并且用EA(50mL×6)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝10/1至3/1)来纯化以产生呈白色固体的产物，12％产率。LCMS(ES+,m/z):211.3[(M+H)+]。
将THP酯(200mg，951μmol，1当量)、氢氧化钠(114mg，2.85mmol，3当量)、甲醇(2mL)和水(2mL)的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌3h。将反应混合物通过添加HCl以调整pH＝7来淬灭，并且将混合物冷冻和冻干以产生呈白色固体的酸。LCMS(ES+,m/z):197.0[(M+H)+]。
使用方法B，从胺1制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺，34％产率。LCMS(ES+,m/z):605.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.08-8.92(t,J＝5.2Hz,1H),8.31(s,1H),7.95(s,1H),7.89(s,1H),7.18-7.01(t,J＝8.0Hz,1H),6.94-6.80(d,J＝8.4Hz,1H),6.35-6.24(d,J＝8.0Hz,1H),6.08-5.94(d,J＝11.6Hz,1H),5.62-5.41(m,2H),4.95-4.75(m,3H),4.57-4.37(m,1H),4.02-3.92(d,J＝10.0Hz,2H),3.68-3.55(m,1H),3.46(br t,J＝10.8Hz,2H),3.10-3.02(m,1H),2.88-2.80(m,1H),2.29-2.18(m,4H),2.16-2.09(m,1H),2.05-1.97(m,3H),1.96-1.87(m,2H),1.73-1.64(m,1H)。
实施例101：1-环己基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物326B)
将吡唑酯(1g，7.93mmol，1当量)、碳酸铯(7.75g，23.8mmol，3当量)和溴环己烷(15.9mmol，1.96mL，2当量)在DMF(10mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，并且在40℃下，在氮气氛围下，将混合物加热和搅拌15h。将反应混合物通过添加水(100mL)来淬灭，接着用EA(50mL×6)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝3:1)来纯化以产生呈白色固体的产物，11％产率。LCMS(ES+,m/z):209.3[(M+H)]。
将酯(0.15g，720μmol，1当量)、氢氧化钠(144.04mg，3.60mmol，5当量)在甲醇(1mL)和水(1mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h。在0℃下将反应混合物通过添加1N HCl水溶液以达到pH<7来淬灭，接着用水(10mL)稀释，并且真空浓缩以移除甲醇。冷冻干燥产生呈白色固体的产物，18％产率。LCMS(ES+,m/z):195.1[(M+H)]。
使用方法B，从胺1制备1-环己基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺，以提供所需产物，29％产率。LCMS(ES+,m/z):603.1[(M+H)]。
实施例102：用于通过异氰化物合成咪唑的一般性程序：1-环丙基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物327B)
在25℃下，将异氰化物(88.4mmol，9.71mL，1当量)和1-叔丁氧基-N,N,N',N'-四甲基-甲烷二胺(177mmol，36.5mL，2当量)的混合物搅拌24h。反应不经进一步纯化即直接用于下一步骤。
在70℃下，将环丙胺(965mg，11.9mmol，2当量)和(Z)-3-(二甲基氨基)-2-异氰基-丙-2-烯酸乙酯(1g，5.95mmol，1当量)的混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，并且用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤。经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/0至1/1)来纯化以产生产物(1g，3.92mmol，46.2％产率，80％纯度)。
在25℃下，将酯(537mg，2.63mmol，1当量)、氢氧化钠(105.2mg，2.63mmol，1当量)、水(3mL)和甲醇(3mL)的溶液搅拌2h。将反应混合物用1N HCl酸化至pH 7。将反应过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将固体用DCM(60mL×2)萃取。将有机溶液经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生所需产物。
使用方法B，从胺1制备1-环丙基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺，以提供所需产物，33％产率。LCMS(ES+,m/z):603.1[(M+H)]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.75(t,J＝6.06Hz,1H),7.86(s,1H),7.85-7.87(m,1H),7.83(d,J＝1.10Hz,1H),7.73(d,J＝1.10Hz,1H),7.04-7.13(m,1H),6.86(d,J＝8.38Hz,1H),6.26(d,J＝7.72Hz,1H),6.01(d,J＝8.38Hz,1H),5.48(q,J＝8.97Hz,2H),4.68-4.91(m,3H),3.48-3.64(m,2H),3.02(br t,J＝10.03Hz,1H),2.80(br d,J＝10.36Hz,1H),2.32-2.36(m,1H),2.16-2.34(m,4H),2.05-2.13(m,1H),1.95-2.04(m,1H),1.59-1.71(m,1H)。
实施例103：1-叔丁基-N-[(3-{4-[(4,4-二氟环己基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物328B)
在50℃下，在氮气下，向伯胺(200mg，420μmol，1当量，2HCl)和吡咯酸(77.2mg，462μmol，1.1当量)在DMF(4mL)中的混合物中添加HOBt(170.1mg，1.26mmol，3当量)、EDCI(241.3mg，1.26mmol，3当量)和TEA(4.2mmol，0.58mL，10当量)。在50℃下将混合物搅拌2h。将反应倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以提供呈浅黄色固体的所需溴吲哚酰胺中间体(80mg，152μmol，36.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):524.0/526.0[(M+H)+]。
向以上溴化物中间体(80mg，153μmol，1当量)和4,4-二氟环己胺(82.5mg，610μmol，4当量)在THF(1mL)中的混合物中添加第3代t-BuXPhos(48.5mg，61.0μmol，0.4当量)、叔丁醇钠(2M，305μL 4当量)，并且在80℃下，在氮气下，将反应加热4h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈浅黄色固体的产物1-叔丁基-N-[(3-{4-[(4,4-二氟环己基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(19.6mg，20.8％产率，93.8％纯度)。LCMS(ES+,m/z):603.1[(M+H)]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.49(s,9H)1.54-1.68(m,2H)1.92-2.04(m,4H)2.09(br d,J＝10.03Hz,2H)3.62(br d,J＝5.75Hz,1H)4.73(d,J＝5.75Hz,2H)5.49(q,J＝9.05Hz,2H)5.99(d,J＝7.95Hz,1H)6.27(d,J＝7.95Hz,1H)6.47-6.57(m,1H)6.85(d,J＝8.07Hz,1H)6.99(t,J＝2.63Hz,1H)7.12(t,J＝8.07Hz,1H)7.54(t,J＝2.02Hz,1H)7.78(s,1H)8.63(t,J＝5.75Hz,1H)。
使用方法B，从先前制备的N-环丙基哌啶制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-环丙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物329B)，28％产率。LCMS(ES+,m/z):603.4[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.77(s,1H),7.91-7.86(m,3H),7.14-7.01(m,1H),6.88-6.86(m,1H),6.29-6.27(m,1H),6.00-5.97(m,1H),5.50-5.47(m,2H),4.90-4.75(m,3H),3.65-3.56(m,1H),3.20-3.17(m,1H),2.96-2.93(m,1H),2.67-2.56(m,1H),2.49-2.33(m,1H),1.91-1.88(m,1H),1.67-1.63(m,2H),1.53(s,9H),0.43-0.27(m,4H)。
使用方法B，从先前制备的N-环丙基哌啶制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-环丙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物330B)，20％产率。LCMS(ES+,m/z):602.2[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65-8.62(m,1H),7.87(s,1H),7.55(s,1H),7.34–7.22(m,1H),7.14-7.10(m,1H),6.89-6.87(m,1H),6.51-6.49(m,1H),6.30-6.28(m,1H),5.51-5.49(m,2H),4.90-4.78(d,J＝8.0Hz,1H),4.73-4.72(m,2H),3.67-3.60(m,1H),3.32(t,1H),2.96-2.90(m,1H),2.67-2.66(m,1H),2.49-2.33(m,1H),1.68-1.67(m,1H),1.67-1.66(m,2H),1.49(s,9H),0.44-0.27(m,4H)。
实施例104：1-叔丁基-N-({3-[4-({4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡啶-5-基}氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基}甲基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物332B)
向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡咯-3-甲酰胺(RBr)(150mg，286μmol，1当量)和胺(117.7mg，858μmol，3当量)在THF(3mL)中的溶液中添加叔丁醇钠(2M，570μL 4当量)和第3代t-BuXPhos Pd(113.6mg，143μmol，0.5当量)。在80℃下，在氮气下，将混合物搅拌2h。将混合物倾倒至EDTA(饱和水溶液，50mL)中，并且在25℃下搅拌1h。将混合物用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用150mL盐水(50mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过制备型TLC(PE:EA:TEA＝50:100:3，Rf＝0.3)来纯化以提供呈浅黄色固体的1-叔丁基-N-({3-[4-({4H,5H,6H,7H-吡唑并[1,5-a]吡啶-5-基}氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基}甲基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(22.9mg，13.7％产率，99.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):581.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(t,J＝5.8Hz,1H),7.78(s,1H),7.54(t,J＝2.0Hz,1H),7.36(d,J＝1.7Hz,1H),7.15(t,J＝8.0Hz,1H),6.99(t,J＝2.7Hz,1H),6.90(d,J＝8.2Hz,1H),6.50(dd,J＝1.8,2.8Hz,1H),6.37(d,J＝7.9Hz,1H),6.18(d,J＝7.8Hz,1H),6.02(s,1H),5.51(q,J＝8.6Hz,2H),4.73(d,J＝5.6Hz,2H),4.36-4.24(m,1H),4.22-4.11(m,1H),4.00(br s,1H),3.21(br dd,J＝4.9,15.9Hz,1H),2.79(dd,J＝9.4,16.1Hz,1H),2.36(br s,1H),2.08-1.89(m,1H),1.52-1.46(m,9H)。
使用方法B，从先前制备的N-乙基哌啶和1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酸制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物333B)，26％产率。LCMS(ES+,m/z):618.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.64(t,J＝5.73Hz,1H),7.86(s,1H),7.46(t,J＝1.87Hz,1H),7.04-7.13(m,1H),6.91(t,J＝2.54Hz,1H),6.86(d,J＝8.38Hz,1H),6.49(dd,J＝2.65,1.76Hz,1H),6.26(d,J＝7.72Hz,1H),6.00(br d,J＝8.38Hz,1H),5.48(q,J＝9.04Hz,2H),4.75-4.91(m,1H),4.74-4.92(m,1H),4.71(d,J＝5.73Hz,1H),4.66-4.74(m,1H),4.09-4.24(m,1H),3.94(br dd,J＝10.80,3.97Hz,2H),3.51-3.66(m,1H),3.41(td,J＝11.63,2.09Hz,1H),3.36(br s,1H),3.04-3.13(m,1H),2.83-2.94(m,1H),2.28-2.38(m,2H),2.02-2.25(m,1H),1.77-2.00(m,5H),1.62-1.74(m,1H),1.61-1.72(m,1H),0.98(br t,J＝7.06Hz,2H),0.92-1.04(m,1H)。
使用方法B，利用先前制备的N-乙基哌啶和先前制备的1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡唑-4-甲酸制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物334B)，33.9％产率。LC-MS(ES+,m/z):619.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.98(t,J＝5.73Hz,1H),8.28(s,1H),7.93(s,1H),7.86-7.88(m,1H),7.87(s,1H),7.05-7.13(m,1H),6.86(d,J＝8.16Hz,1H),6.26(d,J＝7.72Hz,1H),5.99(br d,J＝8.16Hz,1H),5.48(q,J＝9.04Hz,2H),4.73-4.91(m,3H),4.38-4.48(m,1H),3.94(br dd,J＝10.69,2.98Hz,2H),3.52-3.67(m,1H),3.39-3.50(m,3H),3.04-3.16(m,1H),2.89(br d,J＝9.48Hz,1H),2.31-2.39(m,2H),2.04-2.22(m,1H),1.85-2.02(m,6H),1.68(br d,J＝10.14Hz,1H)。
按照方法B，使用以上制备的羧酸和胺1合成N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物335B)，以提供所需产物，37％产率。LC-MS(ES+,m/z):604.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.63(t,J＝5.62Hz,1H),7.86(s,1H),7.46(s,1H),7.09(t,J＝8.05Hz,1H),6.91(t,J＝2.43Hz,1H),6.86(d,J＝8.16Hz,1H),6.50(dd,J＝2.65,1.76Hz,1H),6.26(d,J＝7.94Hz,1H),5.99(br d,J＝8.16Hz,1H),5.48(q,J＝8.89Hz,2H),4.73-4.93(m,1H),4.73-4.92(m,1H),4.71(d,J＝5.73Hz,2H),4.11-4.24(m,1H),3.94(br dd,J＝11.25,3.31Hz,2H),3.49-3.65(m,1H),3.36-3.46(m,2H),3.02(br t,J＝10.36Hz,1H),2.80(br d,J＝10.36Hz,1H),2.16-2.33(m,1H),2.04-2.13(m,1H),1.94-2.03(m,1H),1.78-1.91(m,4H),1.66(br d,J＝10.80Hz,1H)。
实施例105：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(丙烷-2-基)-1H-咪唑-2-甲酰胺(化合物336B)
在0℃下，向甲基2-咪唑甲酸(0.5g，3.96mmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加氢化钠(316.8mg，7.92mmol，60％纯度，2当量)，接着添加2-碘丙烷(4.75mmol，475μL 1.2当量)。在25℃下将混合物搅拌12h。在0℃下将反应混合物通过添加饱和氯化铵(40mL)来淬灭，接着用10mL水稀释，并且用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以产生呈无色油状物的中间体，15％产率。
向酯(0.1g，590μmol，1当量)在甲醇(3mL)和水(3mL)中的溶液中添加氢氧化钠(119mg，2.97mmol，5当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。在0℃下将反应混合物通过添加1NHCl以达到pH<7来淬灭，接着用水(10mL)稀释，并且真空浓缩以移除过量甲醇。将溶液真空冷冻干燥以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：1％-10％，10min)来纯化以产生呈无色油状物的产物，51％产率。LCMS(ES+,m/z):155.1[(M+H)+。
使用方法B，从以上羧酸和胺1制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(丙烷-2-基)-1H-咪唑-2-甲酰胺，23％产率。LC-MS(ES+,m/z):563.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.31-9.15(t,J＝5.2Hz,1H),7.89(s,1H),7.64(s,1H),7.18-7.07(m,2H),6.93-6.83(d,J＝8.4Hz,,1H),6.31-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.04-5.93(d,J＝8.0Hz,1H),5.64-5.43(m,3H),4.94-4.69(m,3H),3.68-3.52(m,1H),3.09-2.99(m,1H),2.86-2.75(m,1H),2.33-2.27(m,1H),2.20-2.15(m,3H),2.12-2.06(m,1H),2.04-1.96(m,1H),1.68(br d,J＝10.3Hz,1H),1.43-1.36(d,J＝6.8Hz,6H)。
实施例106：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(2-甲氧基乙基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物337B)
在25℃下，将Boc-哌啶(1g，1.55mmol，1当量)在HCl/EA(4M，10mL，25.9当量)中的混合物搅拌2h。将反应混合物真空浓缩以移除HCl/EA。将残余物用碳酸钠(饱和，100mL)稀释，并且用EA(90mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(60mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA/TEA＝2/1/0.001至1/2/0.01)来纯化以产生呈黄色固体的产物。LCMS(ES+,m/z):605.3[(M+H)+]。
将哌啶中间体(0.3g，549μmol，1当量)、溴乙基甲基醚(1.10mmol，103μL 2当量)、碳酸钾(379.3mg，2.74mmol，5当量)在DMF(3mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在50℃下，在氮气氛围下，将混合物加热和搅拌3h。将反应混合物通过添加水(30mL)来淬灭，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(PE:EA:TEA＝60:60:5)来纯化以产生呈黄色油状物的产物，45％产率。
向甲氧基乙基哌啶中间体(0.2g，331μmol，1当量)中添加HBr(AcOH)(330μmol，5mL，33％纯度，1当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将残余物用TBME(10mL)湿磨，接着过滤以收集粗产物。在25℃下，将粗产物用PE:EA＝20:1湿磨12h，接着通过过滤收集并真空干燥以产生呈黄色固体的产物。LCMS(ES+,m/z):471.2[(M+H)+]，57％产率。使用方法D，利用吡咯甲酸制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(2-甲氧基乙基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺，28％产率。LCMS(ES+,m/z):471.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.70-8.57(m,1H),7.88(s,1H),7.55(s,1H),7.19-7.08(t,J＝7.6Hz,1H),6.99(s,1H),6.94-6.80(d,J＝7.2Hz,1H),6.57-6.39(d,J＝7.6Hz,1H),6.34-6.20(m,1H),6.08-5.94(m,1H),5.67-5.45(m,2H),4.94-4.69(m,3H),3.64-3.53(m,1H),3.46-3.41(m,2H),3.24(s,3H),3.15(m,1H),2.92(m,1H),2.44-2.31(m,3H),2.28-2.12(m,1H),,2.02-1.91(m,1H),1.71-1.63(m,1H),1.49(s,9H)。
实施例107：方法D-1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-(2-甲氧基乙基)哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物338B)
向吡唑甲酸在DMF(2mL)中的溶液中添加TEA(522μmol，73μL5当量)和PyBOP(81.6mg，157μmol，1.5当量)。在50℃下将混合物搅拌15min，接着将以上胺(0.08g，104μmol，1当量，HBr)添加至混合物中。在50℃下将所得混合物搅拌4.75h。将反应混合物通过添加水(10mL)来淬灭，并且用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化以产生产物，30％产率。LCMS(ES+,m/z):621.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.08-8.90(m,1H),8.35(s,1H),8.06-7.80(d,J＝17.6Hz,2H),7.20-7.01(m,1H),6.96-6.78(m,1H),6.36-6.22(d,J＝8.4Hz,1H),6.09-5.92(m,1H),5.60-5.43(m,2H),4.97-4.70(m,3H),3.68-3.54(m,1H),3.46-3.41(m,2H),3.26-3.20(m,3H),3.18-3.10(m,1H),2.97-2.87(m,1H),2.48-2.31(m,3H),2.25-2.16(m,1H),2.03-1.91(m,1H),1.74-1.63(m,1H),1.58-1.47(m,9H)。
实施例108：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-氟环戊基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物339B)
在0℃下，在5min内，向环戊烷-1,3-二醇(0.5g，4.9mmol，1当量)和吡啶(18.6mmol，1.5mL，3.8当量)在DCM(3mL)中的溶液中逐滴添加4-甲基苯磺酰氯(886mg，4.7mmol，0.9当量)在DCM(9mL)中的溶液。在15℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物用DCM(50mL)稀释，并且用1N HCl(5mL×3)洗涤。将有机层用盐水洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以产生呈黄色油状物的单甲苯磺酸酯(0.5g，1.9mmol，39.8％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3-d)δ＝7.84-7.76(m,2H),7.35(d,J＝8.0Hz,2H),5.06(tt,J＝3.3,6.3Hz,1H),4.51-4.41(m,1H),2.46(s,3H),2.12-2.03(m,2H),1.97-1.77(m,3H),1.64-1.54(m,1H)。
向中间体甲苯磺酸酯(250mg，975μmol，1当量)和1H-吡唑-4-甲酸甲酯(184mg，1.5mmol，1.5当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加碳酸铯(635mg，1.9mmol，2当量)。在90℃下将混合物加热和搅拌5h。在20℃下将反应通过添加10mL水来淬灭，接着用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL×2)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以产生呈黄色油状物的产物(200mg，951μmol，97.5％产率)。LC-MS:(ES+,m/z):211.1[(M+H)+]。
在-60℃下，向1-(3-羟基环戊基)吡唑-4-甲酸甲酯(200mg，951μmol，1当量)在DCM(5mL)中的溶液中添加DAST(951μmol，125μL 1当量)。在-60℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物用DCM(10mL)稀释，并且在0℃下以添加氯化铵水溶液(10mL)淬灭，接着将混合物用DCM(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL×2)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝3:1)来纯化以产生呈黄色固体的产物(130mg，613μmol，64.3％产率)。LC-MS:(ES+,m/z):213.0[(M+H)+]。
向1-(3-氟环戊基)吡唑-4-甲酸甲酯(130mg，612μmol，1当量)在甲醇(0.2mL)和水(0.1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(49mg，1.2mmol，2当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物用2N HCl酸化至pH＝3，并且用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的羧酸(110mg，90.9％产率)。LC-MS:(ES+,m/z):197.1[(M-H)+]。
实施例109：方法E-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-氟环戊基)-1H-吡唑-4-甲酰胺
将1-(3-氟环戊基)吡唑-4-甲酸(36mg，182μmol，1.3当量)、胺1(60mg，140μmol，1当量)、1-甲基咪唑(1.8mmol，145μL13当量)、[氯(二甲基氨基)亚甲基]二甲基六氟磷酸铵(TFCH，394mg，1.4mmol，10当量)在乙腈(5mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在20℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌2h。将反应混合物用水(10mL)稀释，接着用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生呈浅黄色固体的产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-氟环戊基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(23mg，35.8μmol，25.4％产率)。LC-MS:(ES+,m/z):607.1[(M+H)+]。
实施例110：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(1S,2S)-2-氟环己基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物340B)
方法F：在20℃下，在氮气下，向溴化物(100mg，0.191mmol，1当量)、(+/-)-反式-2-氟环己胺(62.3mg，531μmol，2.79当量)、第3代t-BuXPhos钯(60.6mg，76.μmol，0.4当量)和叔丁醇钠(2M，380uL(THF)，4当量)的混合物中添加二噁烷(2mL)。在80℃下将混合物加热和搅拌3h，将混合物冷却至20℃，并且在20℃下真空浓缩。将残余物倾倒至EDTA(50mL)中，并且搅拌1h。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(FA条件，柱：Phenomenex Luna C18200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：60％-100％，10min)来纯化以提供所需产物(20.1mg，18.2％产率，96.6％纯度)。LC-MS:(ES+,m/z):561.1[(M+H)+]。
化合物341B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环己烷-4-基)-1H-咪唑-4-甲酰胺。使用用于合成1-N-烷基-4-羧基咪唑的一般性程序制备咪唑酸。按照方法B，使这个酸与胺1偶联以提供所需产物。LC-MS:(ES+,m/z):605.1[(M+H)+]。
实施例111：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟-2-甲基丙烷-2-基)-1H-咪唑-4-甲酰胺(化合物342B)
在100℃下，将异氰化物(1g，5.95mmol，1当量)在2-氨基-2-甲基-丙-1-醇(119mmol，11.4mL，20当量)中的混合物加热和搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生产物(440mg，1.66mmol，27.9％产率，80％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):212.1[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向以上咪唑(300mg，1.41mmol，1当量)在DCM(12mL)中的混合物中添加DAST(31.8mmol，4.20mL，22当量)。在25℃下将混合物搅拌1h，接着在50℃下搅拌4h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生氟代中间体酯(100mg，467μmol，33.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):214.1[(M+H)+]。
向酯中间体(50mg，210μmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(25.2mg，630μmol，3当量)。在25℃下将混合物搅拌2.5h。用HCl(2M)将混合物调整至pH7。将反应混合物过滤，并且真空浓缩以产生残余物(40mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):186.0[(M+H)+]。使用方法B，使以上羧酸与胺1偶联以提供所需产物。LC-MS(ES+,m/z):595.2[(M+H)+]。
实施例112：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(1s,4s)-4-氟环己基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物343B)
使用一般性布赫瓦尔德(Buchwald)方法F来提供呈顺式和反式的混合物形式的所需粗产物，接着将其通过制备型TLC来纯化，然后通过制备型HPLC(FA条件，柱：PhenomenexLuna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：40％-80％，10min)来纯化以提供分离的立体异构体。
顺式-1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(1s,4s)-4-氟环己基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):561.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.33(s,9H),1.38-1.46(m,2H),1.47-1.62(m,2H),1.63-1.73(m,2H),1.75-1.86(m,2H),3.25-3.33(m,1H),4.56(d,J＝5.73Hz,2H),4.59-4.75(m,1H),5.32(q,J＝8.89Hz,2H),5.83(d,J＝7.94Hz,1H),6.07(d,J＝7.94Hz,1H),6.30-6.37(m,1H),6.65(d,J＝8.16Hz,1H),6.83(t,J＝2.54Hz,1H),6.94(t,J＝8.05Hz,1H),7.38(t,J＝1.87Hz,1H),7.64(s,1H),8.48(t,J＝5.62Hz,1H)。
反式-1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(1s,4s)-4-氟环己基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):561.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.33-1.42(m,2H),1.49(s,9H),1.56-1.66(m,2H),2.00-2.10(m,4H),3.41-3.47(m,1H),4.51-4.69(m,1H),4.72(d,J＝5.75Hz,2H),5.49(q,J＝9.05Hz,2H),5.92(d,J＝7.70Hz,1H),6.22(d,J＝7.82Hz,1H),6.50(dd,J＝2.81,1.83Hz,1H),6.83(d,J＝8.07Hz,1H),6.99(t,J＝2.63Hz,1H),7.11(t,J＝8.07Hz,1H),7.54(t,J＝2.02Hz,1H),7.77(s,1H),8.63(t,J＝5.69Hz,1H)。
实施例113：1-(3,3-二氟环戊基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物344B)
在70℃下，在氮气下加热1H-吡唑-4-甲酸甲酯(500mg，3.96mmol，1当量)和环戊-2-烯-1-酮(7.93mmol，665μL 2当量)在氯仿(7mL)中的混合物，并且搅拌16h。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗品通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1/1)来纯化以提供呈黄色油状物的1-(3-氧代环戊基)吡唑-4-甲酸甲酯(600mg，2.88mmol，72.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):209.1[(M+H)+]。
在40℃下，在氮气下，向1-(3-氧代环戊基)吡唑-4-甲酸甲酯(500mg，2.40mmol，1当量)和DCE(2.5mL)的混合物中一次性添加DAST(2M，2.50mL，2.08当量)。在密封管中将溶液搅拌2h。将残余物倾倒至冰-氯化铵的混合物(20mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1/1)来纯化以提供呈黄色油状物的1-(3,3-二氟环戊基)吡唑-4-甲酸甲酯(300mg，1.30mmol，54.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):231.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，将在甲醇(2mL)中的1-(3,3-二氟环戊基)吡唑-4-甲酸甲酯(300mg，1.30mmol，1当量)用氢氧化钠(104.24mg，2.61mmol，2当量)和水(2mL)处理，并且搅拌2h。将混合物冷却至0℃。将残余物倾倒至氯化铵(20mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈白色油状物的中间体1-(3,3-二氟环戊基)吡唑-4-甲酸(250mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):217.1[(M+H)+]。
使用方法E，使以上酸与胺1偶联以提供呈黄色固体的所需产物(22mg，0.35mmol，37.4％产率，99.7％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):625.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.03(t,J＝5.56Hz,1H),8.33(s,1H),7.99(s,1H),7.89(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),6.88(d,J＝8.31Hz,1H),6.29(d,J＝7.95Hz,1H),6.01(d,J＝8.31Hz,1H),5.50(d,J＝8.84Hz,2H),5.01(d,J＝7.55Hz,1H),4.72-4.93(m,3H),3.64(s,1H),3.05(t,J＝10.39Hz,1H),2.54-2.89(m,4H),2.23-2.46(m,4H),2.20(s,4H),2.09-2.18(m,2H),1.95-2.07(m,1H),1.95-2.07(m,1H)。
实施例114：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-氟环戊基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物345B)
向先前制备的单甲苯磺酸酯(900mg，3.51mmol，1当量)和3-吡咯甲酸甲酯(439mg，3.51mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加碳酸铯(2.29g，7.02mmol，2当量)，并且在90℃下将反应加热和搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经硫酸钠干燥。真空移除溶剂以提供呈黄色固体的中间体(600mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):209.2[(M+H)+]。
向以上中间体(400mg，1.91mmol，1当量)在DCM(15mL)中的溶液中添加在DCM(5mL)中的DAST(19.1mmol，2.53mL，10当量)，并且在室温下将反应搅拌1h。将反应用氯化铵(10mL)淬灭，并且将混合物用DCM(10mL×2)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经硫酸钠干燥，并且真空移除溶剂。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/1)来纯化以提供呈黄色固体的氟环戊基酯(200mg，947μmol，49.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):211.2[(M+H)+]。
向以上酯(200mg，947μmol，1当量)在甲醇(4mL)、水(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(113.6mg，2.84mmol，3当量)，并且在60℃下将反应搅拌3h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤。将溶液经硫酸钠干燥，并且真空移除溶剂以提供呈黄色固体的羧酸中间体(100mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):197.2[(M+H)+]。
使用方法E，使羧酸与胺1偶联以提供呈黄色固体的所需产物(23.6mg，26.6％产率，96％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):605.6[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.65(brt),7.88(s),7.43-7.59(m),7.05-7.18(m),6.83-6.96(m),6.52(br s),6.28(d),6.01(brd),5.50(q),5.14-5.42(m),4.75-4.95(m),4.73(br d),3.64(s),3.57(br s),2.99-3.13(m),2.84(br d),2.28-2.34(m),2.25(br s),2.19(br s),2.09-2.18(m),1.97-2.09(m),1.78-1.96(m),1.63-1.77(m)。
实施例115：1-(3,3-二氟环戊基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物346B)
在20℃下，在氮气下，向1-(3-羟基环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(600mg，2.87mmol，1当量)在DCM(15mL)中的混合物中一次性添加PCC(1.24g，5.74mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌3h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中，并且搅拌2min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈黄色固体的1-(3-氧代环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(200mg，965μmol，33.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):208.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向1-(3-氧代环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(200mg，965μmol，1当量)在1,2-二氯乙烷(1mL)中的混合物中一次性添加DAST(18.9mmol，2.50mL，19.6当量)。在40℃下将混合物加热和搅拌12h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈黄色油状物的1-(3,3-二氟环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(90mg，393μmol，40.7％产率)。
在20℃下，在氮气下，向1-(3,3-二氟环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(150mg，654μmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(0.5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(78.5mg，1.96mmol，3当量)。在60℃下将混合物加热和搅拌5h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以提供呈黄色油状物的1-(3,3-二氟环戊基)吡咯-3-甲酸(120mg，558μmol，85.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):216.1[(M+H)+]。
使用方法E，从先前制备的N-乙基哌啶中间体合成1-(3,3-二氟环戊基)-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-1-乙基-3-氟-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺，以提供呈黄色固体的产物，22％产率。LC-MS(ES+,m/z):638.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.68(t,J＝5.81Hz,1H),8.14(s,1H),7.89(s,1H),7.52(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),6.95(d,J＝2.45Hz,1H),6.88(d,J＝8.44Hz,1H),6.54(br s,1H),6.29(d,J＝7.83Hz,1H),6.01(br d,J＝7.95Hz,1H),5.42-5.55(m,2H),4.79-4.96(m,1H),4.73(br d,J＝5.50Hz,2H),3.48-3.74(m,1H),3.14(br s,1H),2.66-2.99(m,4H),2.40(br s,4H),1.94-2.26(m,5H),1.73(br s,1H),1.01(t,J＝7.03Hz,3H)。
使用方法E，从先前合成的吡咯甲酸和胺1制备1-(3,3-二氟环戊基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物347B)，以提供呈白色固体的所需产物(27.4mg，32.1μmol，13.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):2.235[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.70(t,J＝5.62Hz,1H),8.14(s,1H),7.89(s,1H),7.52(t,J＝1.87Hz,1H),7.11(t,J＝8.05Hz,1H),6.95(t,J＝2.54Hz,1H),6.88(d,J＝8.16Hz,1H),6.54(dd,J＝2.87,1.76Hz,1H),6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.03(br d,J＝8.38Hz,1H),5.45-5.56(m,2H),4.74-4.95(m,2H),4.67-4.74(m,2H),3.50-3.70(m,1H),3.05(br d,J＝9.26Hz,1H),2.57-2.90(m,4H),2.24-2.47(m,4H),2.19-2.24(m,3H),1.93-2.17(m,3H),1.69(br d,J＝10.36Hz,1H)。
实施例116：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物348B)
向氧化环戊烯(5.94mmol，519μL 2当量)和1H-吡唑-4-甲酸甲酯(374.8mg，2.97mmol，1当量)在乙腈(5mL)中的溶液中添加碳酸铯(2.42g，7.43mmol，2.5当量)。通过微波加热混合物，并且在90℃下搅拌1h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生醇产物(250mg，1.19mmol，40.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):210.1[(M+H)+]。
在0℃下，持续0.5h向醇在DMF(4mL)中的溶液中添加氢化钠(76.1mg，1.90mmol，60％纯度，2当量)，随后添加碘代甲烷(4.76mmol，296μL 5当量)。搅拌混合物，并且在2h内升温至25℃。将反应混合物用氯化铵(50mL)淬灭，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以产生甲基醚产物(60mg，28.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):224.1[(M+H)+]。
向以上中间体(60mg，268μmol，1当量)在甲醇(5mL)和水(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(32.1mg，803μmol，3当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。用HCl(2M)将反应混合物调整至pH 7，接着过滤，并且真空浓缩以产生羧酸(100mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):210.1[(M+H)+]。使用方法B，从胺1制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺，以提供所需产物(18.6mg，23.4％产率，98.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):618.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.99(t,J＝5.62Hz,1H),8.30(s,1H),7.93(s,1H),7.87(s,1H),7.03-7.14(m,1H),6.85(d,J＝8.38Hz,1H),6.26(d,J＝7.72Hz,1H),6.00(br d,J＝8.60Hz,1H),5.32-5.64(m,2H),4.70-4.99(m,3H),4.42-4.66(m,1H),3.84-4.01(m,1H),3.84-4.01(m,1H),3.67-4.04(m,1H),3.48-3.66(m,1H),3.48-3.66(m,1H),3.46-3.67(m,1H),3.46-3.67(m,1H),3.20-3.26(m,1H),3.16(s,3H),2.95-3.07(m,1H),2.76-2.83(m,1H),2.16-2.18(m,1H),2.15-2.28(m,2H),2.15-2.21(m,1H),2.04-2.13(m,1H),1.92-2.02(m,3H),1.86-2.12(m,1H),1.86-2.12(m,1H),1.55-1.82(m,4H)。
实施例117：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基哌啶-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物350B)
向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(250mg，1.98mmol，1当量)和4-甲基苯磺酸(1-甲基-4-哌啶基)酯(640.8mg，2.38mmol，1.2当量)在DMF(3mL)中的溶液中添加碳酸铯(1.94g，5.95mmol，3当量)，并且在90℃下将混合物加热和搅拌3h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经硫酸钠干燥，并且真空移除溶剂以提供呈黄色固体的1-(1-甲基-4-哌啶基)吡唑-4-甲酸甲酯(180mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):223.2[(M+H)+]。
向1-(1-甲基-4-哌啶基)吡唑-4-甲酸甲酯(100mg，448μmol，1当量)在甲醇(4mL)和水(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(53.75mg，1.34mmol，3当量)，并且在60℃下将反应搅拌3h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经硫酸钠干燥，并且真空移除溶剂。将残余物通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以提供呈黄色固体的1-(1-甲基-4-哌啶基)吡唑-4-甲酸(30mg，143μmol，10.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):209.2[(M+H)+]。
使用方法E，从以上羧酸和胺1制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基哌啶-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺，并且通过制备型HPLC(中性条件)来纯化以提供呈黄色固体的产物(24.5mg，37.7μmol，26.8％产率，95.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):617.6[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.97(t),8.27(s),7.92(s),7.88(s),7.10(t),6.87(d),6.27(d),6.00(d),5.49(q),4.89(br s),4.76(br d),4.06-4.23(m),3.49-3.69(m),3.02(br t),2.76-2.88(m),2.27(br d),2.18(d),1.88-2.10(m),1.67(br d)。
N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基吡咯烷-3-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物349B)：使用以上用于制备以上1-(1-甲基-4-哌啶基)吡唑-4-甲酸的相同方法制备所需羧酸。使用方法E，使这个酸与胺1偶联以提供所需产物。
实施例118：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基吡咯烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物351B)
在0℃下，在氮气下，向醇(4g，39.6mmol，1当量)在DCM(40mL)中的混合物中添加TEA(39.6mmol，5.50mL，1当量)，随后添加p-TosCl(7.58g，39.7mmol，1当量)。将混合物升温，并且在20℃下搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(500mL)中。将水相用EA(200mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(200mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝1/0，0/1)来纯化以提供呈黄色油状物的4-甲基苯磺酸(1-甲基吡咯烷-3-基)酯(5g，19.6mmol，49.5％产率)。
在氮气下，向吡咯-3-甲酸甲酯(500mg，4mmol，1当量)和甲苯磺酸酯(1.53g，5.99mmol，1.5当量)在DMF(5mL)中的混合物中添加碳酸铯(2.60g，7.99mmol，2当量)。在90℃下将混合物加热和搅拌5h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝1/0，0/1)来纯化以提供呈黄色油状物的所需中间体(0.6g，2.88mmol，72.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):209.1[(M+H)+]。
在50℃下，向酯中间体(0.6g，2.88mmol，1当量)在甲醇(8mL)、水(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(230mg，5.76mmol，2当量)。在50℃下将混合物搅拌10h。将残余物倾倒至1NHCl中以调整至pH约7，接着真空浓缩以提供呈白色固体的羧酸(450mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):195.2[(M+H)+]
在20℃下，在氮气下，向胺1(70mg，126μmol，1当量，2HCl)和以上羧酸(36.8mg，189μmol，1.5当量)在ACN(2mL)中的混合物中一次性添加TCFH(42.5mg，151μmol，1.2当量)、NMI(442μmol，35μL3.5当量)。在20℃下将混合物搅拌3h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型HPLC来纯化以提供呈浅黄色固体的N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基吡咯烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(6.5mg，10.5μmol，8.3％产率，97.5％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):603.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.67(br d,J＝12.13Hz,1H)1.80-1.90(m,1H)1.94-2.03(m,1H)2.03-2.13(m,1H)2.19(s,3H)2.24-2.32(m,4H)2.32-2.45(m,1H)2.63-2.66(m,1H)2.67(s,1H)2.67-2.72(m,1H)2.81(br d,J＝10.58Hz,1H)2.84-2.91(m,1H)3.03(br t,J＝9.92Hz,1H)3.48-3.70(m,1H)4.64-4.70(m,1H)4.72(d,J＝5.73Hz,2H)4.75-4.93(m,1H)5.50(q,J＝8.89Hz,2H)6.02(d,J＝8.38Hz,1H)6.28(d,J＝7.94Hz,1H)6.48(dd,J＝2.65,1.76Hz,1H)6.85-6.93(m,2H)7.08-7.15(m,1H)7.50(t,J＝1.87Hz,1H)7.89(s,1H)8.68(t,J＝5.73Hz,1H)。
使用方法E，从N-乙基哌啶中间体(81.5mg，0.18mmol，1当量)和1-(3,3-二氟环戊基)吡唑-4-甲酸(40mg，0.18mmol，1当量)制备N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基吡咯烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物352B)，以提供呈黄色固体的所需产物(10.5mg，0.02mmol，8.9％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):639.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.03(t,J＝5.62Hz,1H),8.33(s,1H),8.13(s,1H),7.99(s,1H),7.88(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),6.89(d,J＝8.44Hz,1H),6.30(d,J＝7.82Hz,1H),6.04(d,J＝6.85Hz,1H),5.44-5.55(m,2H),4.82-5.07(m,2H),4.78(d,J＝5.62Hz,2H),3.63-3.74(m,1H),2.95-3.18(m,1H),2.55-2.95(m,4H),2.35-2.43(m,4H),2.07-2.31(m,5H),1.70-2.00(m,2H),1.05(s,3H)。
实施例119：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S)-哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物353B)
将溴化物(207.1mg，0.436mmol)溶解至二噁烷(2mL)中，并且添加4N HCl/二噁烷(2mL，8mmol)。在1.5h之后，通过过滤收集固体，并且真空干燥以提供呈白色固体的所需中间体(136mg，76％)。
向胺盐(98mg，0.238mmol，1当量)中添加1-叔丁基-1H-吡唑-4-甲酸(51.8mg，0.308mmol，1.3当量)、HATU(144.7mg，0.381mmol，1.6当量)和DMF(2mL)。添加DIEA(0.10mL，0.575mmol，2.4当量)，并且将反应搅拌15min。将反应用DCM稀释，并且用10％柠檬酸洗涤。将有机层移除，并且将水层用DCM萃取。将有机溶液经硫酸镁干燥，过滤，并且浓缩。将粗产物通过二氧化硅柱(30-80％EA/己烷)来纯化以提供呈白色固体的所需中间体(90.4mg，72％)。
将以上酰胺(45.7mg，0.087mmol，1当量)、(S)-1-Boc-3-氨基哌啶(35mg，0.174mmol，2当量)、第3代tBuXPhos(18.2mg，0.023mmol，0.26当量)和叔丁醇钠(16.6mg，0.173mmol，2当量)称重至具有隔垫盖的小瓶中。通过针用氮气冲洗小瓶，并且通过注射器添加脱气二噁烷。放置小瓶以在预加热的块体中在80℃下搅拌16h。接着将反应过滤，并且将滤液通过二氧化硅柱(20-80％EA/己烷)来纯化以提供所需中间体(25.7mg，46％)。
将以上中间体(25.7mg)溶解于二噁烷(1mL)中，并且用4N HCl/二噁烷(1mL)处理0.5h，接着浓缩以获得固体。将粗固体通过反相HPLC来纯化，并且使用Strata X-C磺酸柱中和所得甲酸盐以提供呈游离碱形式的所需产物(13.4mg，62％产率)。LC-MS(ES+,m/z):545.2[(M+H)+]。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ8.97(t,J＝5.8Hz,1H),8.35(s,1H),7.94(s,1H),7.78(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.84(d,J＝8.4Hz,1H),6.25(dd,J＝15.1,7.7Hz,1H),5.92(d,J＝8.2Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.79(d,J＝5.6Hz,2H),3.43(s,1H),3.17(d,J＝12.3Hz,1H),2.88(d,J＝12.1Hz,1H),2.40(dd,J＝20.5,9.5Hz,2H),1.98(d,J＝12.2Hz,1H),1.68(d,J＝6.5Hz,1H),1.55(s,9H),1.50–1.35(m,2H)。
实施例120：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物355B)
在0℃下，向吡咯-3-甲酸甲酯(500mg，4mmol，1当量)在DMF(7mL)中的溶液中添加氢化钠(320mg，7.99mmol，60％纯度，2当量)，并且将反应搅拌0.5h，随后添加氧化环戊烯(336mg，4mmol，1当量)。接着在80℃下将混合物加热和搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以提供所需产物(170mg，812μmol，20.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):209.1[(M+H)+]。
在0℃下，向以上醇(150mg，717μmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加氢化钠(57.4mg，1.43mmol，60％纯度，2当量)，并且将反应搅拌0.5h，随后添加碘代甲烷(3.58mmol，223μL 5当量)。将混合物升温至室温，并且在25℃下搅拌2h。将反应混合物用饱和氯化铵(50mL)淬灭，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以提供所需产物(100mg，448μmol，62.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):223.1[(M+H)+]。
向以上中间体(100mg，448μmol，1当量)在甲醇(5mL)和水(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(53.7mg，1.34mmol，3当量)。在50℃下将混合物加热和搅拌5h。用HCl(2M)将反应混合物调整至pH＝7，接着过滤，并且真空浓缩以提供作为残余物的粗产物(130mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):209.1[(M+H)+]。
按照方法E处理胺1(60mg，108μmol，1当量，2HCl)和以上羧酸(33.9mg，162μmol，1.5当量)以在制备型TLC纯化之后提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.67(t,J＝5.69Hz,1H),7.90(s,1H),7.48(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),6.85-6.93(m,2H),6.52(d,J＝1.83Hz,1H),6.29(d,J＝7.95Hz,1H),6.02(d,J＝8.31Hz,1H),5.51(q,J＝8.93Hz,2H),4.65-4.95(m,3H),4.26-4.35(m,1H),3.83(q,J＝6.24Hz,1H),3.51-3.68(m,1H),3.19(s,3H),3.04(br t,J＝10.88Hz,1H),2.82(br d,J＝10.39Hz,1H),2.19-2.35(m,4H),1.97-2.14(m,3H),1.66-1.89(m,4H),1.55-1.65(m,1H)。
实施例121：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S)-6-氧代哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物356B)
使中间体溴化物(20mg，0.038mmol，1当量)与氨基哌啶酮(87.1mg，0.76mmol，20当量)在布赫瓦尔德条件下反应以提供呈白色固体的所需产物(3.3mg，14.2％产率，91.7％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):558.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.58-8.70(m,1H),7.78(s,1H),7.54(s,1H),7.41(s,1H),7.14(t,J＝8.07Hz,1H),6.97-7.02(m,1H),6.89(d,J＝8.44Hz,1H),6.50(s,1H),6.31(d,J＝7.95Hz,1H),6.07(d,J＝7.70Hz,1H),5.50(d,J＝9.09Hz,2H),4.73(d,J＝5.62Hz,2H),3.78-3.93(m,1H),3.04-3.17(m,1H),1.96-2.15(m,3H),1.70-1.86(m,2H),1.45-1.57(m,11H),1.45-1.57(m,1H)。
实施例122：rac-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物357B)和rac-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物358B)
将[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(2.5g，6.07mmol，1当量，HCl)和1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酸(1.33g，7.28mmol，1.20当量)在DMF(30mL)中的混合物用EDCI(3.49g，18.2mmol，3当量)、HOBt(2.46g，18.22mmol，3当量)和TEA(60.7mmol，8.45mL，10当量)处理。在50℃下将混合物搅拌12h。将混合物倾倒至水(300mL)中，并且用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝50:1至1:1)来纯化以提供呈黄色固体的N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(2.3g，63.8％产率，91％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):540.1[(M+H)+]。
在25℃下，向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基乙基)吡咯-3-甲酰胺(1.3g，2.19mmol，1当量)和氨基甲酸叔丁酯(384.7mg，3.28mmol，1.5当量)在THF(30mL)中的溶液中添加叔丁醇钠(2M，2.19mL，2当量)和t-BuXphos(347.8mg，438μmol，0.2当量)。在80℃下，在氮气下，将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至EDTA(饱和水溶液，100mL)中。在25℃下将混合物搅拌1h。接着将混合物用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝10/1至1/2)来纯化以提供呈黄色固体的所需化合物N-[2-[5-[[[1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基甲酸叔丁酯(0.6g，35.7％产率，75％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):521.1[(M+H)+]。
在25℃下，将N-[2-[5-[[[1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基甲酸叔丁酯(600mg，780.5μmol，1当量)在HCl/EA(4M，1当量)中的混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以提供呈黄色固体的N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(0.5g，粗品，HCl)。
在50℃下，向N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基乙基)吡咯-3-甲酰胺(500mg，975μmol，1当量，HCl)和1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(613.2mg，2.92mmol，3当量，HCl)在乙醇(10mL)中的溶液中添加乙醇钛(9.75mmol，2.02mL，10当量)。在50℃下将混合物搅拌12h，接着将氰基硼氢化钠(306.3mg，4.87mmol，5当量)添加至混合物中。在50℃下将混合物搅拌30min。将反应混合物用EA(200mL)稀释，并且倾倒至碳酸氢钠(饱和，50mL)中。在25℃下将混合物搅拌1h。接着将混合物用EA(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(300mL×2)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过制备型TLC(DCM:甲醇＝20:1，Rf＝0.3)来纯化以提供呈黄色固体的N-[[3-[4-[(1-叔丁基-3-氟-4-哌啶基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(0.3g，48.6％产率)。
将异构体的混合物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：20％-40％，10min)来分离以提供分离的顺式和反式异构体：呈黄色固体的顺式-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(21.9mg，97.3％纯度，FA盐)。LC-MS(ES+,m/z):634.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.68(t,J＝5.6Hz,1H),8.22(s,1H),7.89(s,1H),7.35(s,1H),7.17-7.07(m,1H),6.87(d,J＝8.4Hz,1H),6.77(t,J＝2.3Hz,1H),6.49(d,J＝1.8Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),5.97(br d,J＝8.2Hz,1H),5.50(q,J＝9.0Hz,2H),4.96-4.76(m,1H),4.72(d,J＝5.5Hz,2H),4.00(br dd,J＝4.0,13.9Hz,1H),3.87(br dd,J＝6.5,14.0Hz,1H),3.67-3.51(m,2H),3.30-3.20(m,4H),3.03(br d,J＝8.8Hz,1H),2.47-2.35(m,1H),2.24(br t,J＝11.0Hz,1H),1.99-1.86(m,1H),1.73(br d,J＝10.4Hz,1H),1.07-0.98(m,12H)；呈黄色固体的反式-N-[[3-[4-[[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(22.4mg，98.6％纯度，FA盐)。LC-MS(ES+,m/z):634.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.66(t,J＝5.7Hz,1H),8.22(s,1H),7.78(s,1H),7.35(t,J＝1.8Hz,1H),7.10(t,J＝8.1Hz,1H),6.84(d,J＝8.2Hz,1H),6.77(t,J＝2.4Hz,1H),6.49(dd,J＝1.8,2.7Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.11(d,J＝8.2Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.73(d,J＝5.6Hz,2H),4.62-4.34(m,1H),4.06-3.96(m,1H),3.93-3.83(m,1H),3.63-3.51(m,2H),3.21(s,4H),2.93(br d,J＝10.8Hz,1H),2.25-2.11(m,2H),2.03(br s,1H),1.46-1.30(m,1H),1.12-0.95(m,12H)。
N-叔丁基哌啶酮的制备：向3-氟-4-氧代-哌啶-1-甲酸叔丁酯(20g，92.1mmol，1当量)在EA(30mL)中的溶液中添加HCl/EA(4M，200mL，8.69当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以提供呈白色固体的3-氟哌啶-4-酮(14g，80.0％产率，2HCl)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝5.56-5.26(m,1H),3.85-3.75(m,1H),3.06(br d,J＝11.9Hz,1H),2.92-2.85(m,1H),2.60-2.51(m,1H),1.97-1.84(m,1H),1.77-1.64(m,1H)。
在25℃下，向3-氟哌啶-4-酮(10g，85.4mmol，1当量，HCl)在DMF(50mL)中的溶液中分批添加碳酸钾(59.0g，427mmol，5当量)。接着，在0℃下，将苯甲基溴(170.8mmol，20.3mL，2当量)逐滴添加至混合物中。在50℃下将所得混合物加热和搅拌2h。将反应混合物通过添加水(400mL)来淬灭，并且用EA(400mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(400mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝10/1至4/1)来纯化以提供呈黄色油状物的1-苯甲基-3-氟-哌啶-4-酮(9g，50.9％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)d＝7.40-7.31(m,4H),7.31-7.26(m,1H),5.37-5.08(m,1H),3.71-3.66(m,2H),3.37(br s,1H),3.06-2.96(m,1H),2.66(td,J＝6.5,13.2Hz,1H),2.42-2.32(m,2H),2.31-2.23(m,1H)。
在25℃下，将1-苯甲基-3-氟-哌啶-4-酮(9g，43.4mmol，1当量)和碘代甲烷(651mmol，40.6mL，15当量)在丙酮(20mL)中的混合物搅拌16h。将反应混合物过滤，并且将滤饼用PE(20mL)洗涤。将滤饼真空干燥以提供呈白色固体的1-苯甲基-3-氟-1-甲基-哌啶-1-鎓-4-酮盐酸盐(7g，粗品)。
在0℃下，向1-苯甲基-3-氟-1-甲基-哌啶-1-鎓-4-酮盐酸盐(5g，22.5mmol，1当量)在甲苯(20mL)和水(2mL)中的溶液中添加碳酸钠(2.38g，22.5mmol，1当量)和2-甲基丙-2-胺(45mmol，4.73mL，2当量)。在80℃下将混合物搅拌12h。将反应混合物真空浓缩以移除溶剂，从而产生残余物，将所述残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 100×30mm×5um；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：1％-18％，12min)来纯化以提供1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(500mg，2.89mmol，12.8％产率)，其是立体异构体的混合物，呈黄色固体形式。LC-MS(ES+,m/z):206.2[(M+MeOH)+]。
实施例123：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3S)-3-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物359B)和N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3R)-3-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物360B)
在0℃下，在氮气下，向1-(3-羟基环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(1.5g，7.2mmol，1当量)在DMF(20mL)中的混合物中添加氢化钠(573mg，14.3mmol，60％纯度，2当量)和碘代甲烷(35.8mmol，2.23mL，5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着加热至25℃，并且搅拌1.5h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(30mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，接着过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以提供呈黄色油状物的1-(3-甲氧基环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(900mg，4.03mmol，56.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):1.054[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向1-(3-甲氧基环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(500mg，2.24mmol，1当量)在甲醇(6mL)和水(1.5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(269mg，6.72mmol，3当量)。接着在60℃下将混合物加热和搅拌5h。将残余物倾倒至HCl(2M，20mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，接着过滤并真空浓缩而不经进一步纯化，以提供呈黄色油状物的1-(3-甲氧基环戊基)吡咯-3-甲酸(200mg，956μmol，42.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):0.927[(M+H)+]。
按照方法E，使1-(3-甲氧基环戊基)吡咯-3-甲酸(100mg，477.92μmol，1当量)和胺1(203.8mg，478μmol，1当量)反应，随后通过SFC分离顺式和反式立体异构体，以提供所需产物。顺式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3S)-3-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(30mg，48.6μmol，10.2％产率)，白色固体。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.67(t,J＝5.62Hz,1H),7.89(s,1H),7.46(s,1H),7.11(t,J＝8.16Hz,1H),6.83-6.93(m,2H),6.49(br s,1H),6.28(d,J＝8.16Hz,1H),6.03(br d,J＝8.60Hz,1H),5.50(q,J＝8.75Hz,2H),4.75-4.93(m,1H),4.72(d,J＝5.95Hz,2H),4.45-4.54(m,1H),3.84(br s,1H),3.50-3.67(m,1H),3.05(br s,1H),2.83(br s,1H),2.40-2.46(m,1H),2.20(br s,3H),2.02-2.19(m,3H),1.88-2.02(m,1H),1.60-1.88(m,5H)；反式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3S)-3-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(30mg，48.6μmol，10.2％产率)，白色固体。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.64(t,J＝5.62Hz,1H),7.89(s,1H),7.43-7.48(m,1H),7.11(t,J＝8.05Hz,1H),6.85-6.93(m,2H),6.48-6.52(m,1H),6.48-6.52(m,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.01(d,J＝8.16Hz,1H),5.50(q,J＝9.04Hz,2H),4.75-4.92(m,1H),4.72(d,J＝5.73Hz,2H),4.52-4.61(m,1H),3.95(dt,J＝5.73,2.87Hz,1H),3.50-3.67(m,1H),2.98-3.09(m,1H),2.76-2.85(m,1H),2.16-2.31(m,6H),1.89-2.15(m,4H),1.61-1.78(m,3H)。
实施例124：1-[(1R,3R)-3-(二甲基氨基)环戊基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物361B)
在50℃下，在氮气下，向先前制备的酮(300mg，1.45mmol，1当量)和二甲胺盐酸盐(472.2mg，5.79mmol，4当量)在DCE(4mL)中的混合物中添加乙酸(6.51mmol，373μL 4.5当量)和三乙酰氧基硼氢化钠(614mg，2.90mmol，2当量)。在50℃下将混合物搅拌5h。将残余物用饱和碳酸钠稀释至最终pH＝7～8。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以提供呈无色油状物的叔胺产物(150mg，635μmol，43.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):237.1[(M+H)+]。
将中间体酯(150mg，635μmol，1当量)用甲醇(2mL)和水(0.5mL)处理以形成混合物，在50℃下，在氮气下，向其中一次性添加氢氧化钠(101.6mg，2.54mmol，4当量)。在50℃下将混合物搅拌5h。添加1N HCl以调整pH＝7，并且将反应真空浓缩以提供呈白色固体的羧酸(120mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):223.1[(M+H)+]。
向胺1(200mg，360μmol，1当量，2HCl)和以上羧酸(96.2mg，433μmol，1.2当量)在DMF(2mL)中的混合物中添加HOBt(146.1mg，1.08mmol，3当量)、EDCI(207.3mg，1.08mmol，3当量)、TEA(3.60mmol，0.50L,10当量)。在50℃下将混合物加热和搅拌5h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以提供分离的顺式和反式立体异构体。
反式-1-[(1R,3R)-3-(二甲基氨基)环戊基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物361B)(22.2mg，9.3％产率，95.6％纯度)，白色固体。LC-MS(ES+,m/z):631.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.52-1.62(m,1H)1.69(br d,J＝12.96Hz,1H)1.77-1.86(m,1H)1.89-2.06(m,3H)2.10(br d,J＝12.47Hz,2H)2.20(s,3H)2.23-2.33(m,6H)2.41(br s,1H)2.83(br d,J＝10.51Hz,1H)2.92-3.14(m,3H)3.63(br s,1H)4.50-4.66(m,1H)4.70-4.95(m,2H)5.38-5.77(m,2H)6.02(br d,J＝8.44Hz,1H)6.28(d,J＝7.95Hz,1H)6.50(br s,1H)6.84-6.93(m,2H)7.11(t,J＝8.01Hz,1H)7.46(s,1H)7.88(s,1H)8.67(br t,J＝5.50Hz,1H)；顺式-1-[(1R,3R)-3-(二甲基氨基)环戊基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物362B)(27mg，11.8％产率，98.9％纯度)，白色固体。LC-MS(ES+,m/z):631.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.64-1.79(m,3H)1.80-1.91(m,2H)1.95-2.05(m,1H)2.07-2.15(m,2H)2.20(br d,J＝6.62Hz,9H)2.28-2.41(m,2H)2.61(br s,1H)2.82(br d,J＝10.36Hz,1H)2.98-3.10(m,1H)3.51-3.66(m,1H)4.41-4.55(m,1H)4.68-4.96(m,3H)5.50(q,J＝8.82Hz,2H)6.01(d,J＝8.38Hz,1H)6.28(d,J＝7.72Hz,1H)6.50(dd,J＝2.87,1.76Hz,1H)6.85-6.95(m,2H)7.11(t,J＝8.05Hz,1H)7.49(t,J＝1.76Hz,1H)7.89(s,1H)8.66(t,J＝5.73Hz,1H)。
实施例125：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基哌啶-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物363B)
向1-甲基哌啶-4-醇(86.8mmol，10.2mL，1当量)在DCM(200mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酰氯(33.1g，174mmol，2当量)和TEA(86.8mmol，12.1mL，1当量)，并且在25℃下将反应搅拌1h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经无水硫酸钠干燥。真空移除溶剂以提供呈黄色固体的4-甲基苯磺酸(1-甲基-4-哌啶基)酯(10g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):269.3[(M+H)+]。
向1H-吡咯-3-甲酸甲酯(100mg，800μmol，1当量)、4-甲基苯磺酸(1-甲基-4-哌啶基)酯(258.3mg，959μmol，1.2当量)在DMF(15mL)中的溶液中添加碳酸铯(781mg，2.40mmol，3当量)，并且在90℃下将反应加热和搅拌3h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经无水硫酸钠干燥。真空移除溶剂以提供呈黄色固体的1-(1-甲基-4-哌啶基)吡咯-3-甲酸甲酯(50mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):222.2[(M+H)+]。
向1-(1-甲基-4-哌啶基)吡咯-3-甲酸甲酯(30mg，135μmol，1当量)在甲醇(4mL)、水(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(16.2mg，405μmol，3当量)，并且在60℃下将反应加热和搅拌3h。将混合物用DCM(10mL×2)萃取，并且将有机相用水(10mL)、盐水(10mL)洗涤，接着用硫酸钠干燥。真空移除溶剂，并且将残余物通过制备型HPLC(甲酸条件)来纯化以提供呈黄色固体的1-(1-甲基-4-哌啶基)吡咯-3-甲酸(28mg，134μmol，99.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):208.2[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(50mg，100μmol，1当量，2HCl)和1-(1-甲基-4-哌啶基)吡咯-3-甲酸(20.9mg，100μmol，1当量)的溶液反应，随后通过制备型HPLC(中性条件)来纯化以提供呈黄色固体的N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(1-甲基-4-哌啶基)吡咯-3-甲酰胺(6.2mg，9.79μmol，9.8％产率，97.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):617.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.63(t),7.88(s),7.46(s),7.11(t),6.81-6.95(m),6.50(br s),6.28(d),6.00(brd),5.50(q),4.76-4.94(m),4.72(d),3.83-3.99(m),3.46-3.65(m),3.03(br t),2.79-2.89(m),2.52-2.54(m),2.28(br d),2.19(s),2.06-2.14(m),1.96-2.05(m),1.89-1.95(m),1.86(br d),1.83(br d),1.68(br d)。
实施例126：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2S)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物364B)
在0℃下，在氮气下，向氧化环戊烯(40mmol，3.49mL，1当量)和吡咯-3-甲酸甲酯(5g，40mmol，1当量)在DMF(50mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(3.20g，79.9mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌1h，接着加热至80℃，并且搅拌4h。将残余物倾倒至氯化铵溶液(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩，接着通过硅胶色谱法来纯化以产生反式醇(68.0％产率，97.5％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):210.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-羟基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(1.3g，6.21mmol，1当量)在DCM(2mL)中的混合物中一次性添加PCC(2.68g，12.4mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生产物，LC-MS(ES+,m/z):208.0[(M+H)+]。
在0℃下，向1-[(1R)-2-氧代环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(400mg，1.93mmol，1当量)在甲醇(3mL)中的混合物中一次性添加硼氢化钠(73mg，1.93mmol，1当量)。在0℃下将混合物搅拌15min，接着加热至25℃，并且搅拌30min。将残余物倾倒至碳酸钠(水溶液)中以调整pH＝9～11。将水相用EA(3×80mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化。LC-MS(ES+,m/z):210.0[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向1-[(1R,2S)-2-羟基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(185mg，884.15μmol，1当量)在DMF(2mL)中的混合物中添加氢化钠(106.1mg，2.65mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着添加碘代甲烷(1.77mmol，110μL 2当量)，并且在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至氯化铵(50mL)中。将水相用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以提供产物，LC-MS(ES+,m/z):224.2[(M+H)+]。
方法H：在0℃下，在氮气下，向胺1(84mg，197μmol，1.1当量)在DCM(1mL)和甲苯(1mL)中的混合物中一次性添加三甲基铝(2M，450μL 5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加1-[(1R,2S)-2-甲氧基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(40mg，179.16μmol，1当量)，并且将反应加热至50℃并搅拌10h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2S)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(20.2mg，17.8％产率，97.5％纯度)，LC-MS(ES+,m/z):618.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(t,J＝5.62Hz,1H),7.89(s,1H),7.43(s,1H),7.15-7.07(m,1H),6.92-6.81(m,2H),6.48(dd,J＝2.65,1.76Hz,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.01(br d,J＝8.38Hz,1H),5.54-5.45(m,2H),4.41(td,J＝8.71,4.63Hz,1H),4.92-4.76(m,1H),4.72(d,J＝5.73Hz,2H),3.78-3.71(m,1H),3.64-3.54(m,1H),3.02(s,3H),2.86-2.80(m,1H),2.20(br s,3H),2.08-1.94(m,3H),1.86-1.74(m,3H),1.72-1.55(m,2H)。
实施例127：1-[(二甲基氨基甲酰基)甲基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-乙基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物365B)
在0℃下，在氮气下，向1H-吡咯-3-甲酸甲酯(1g，8mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(352mg，8.79mmol，60％纯度，1.1当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加2-氯-N,N-二甲基-乙酰胺(7.95mmol，820μL 1当量)，并且将反应加热至25℃并搅拌1h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(50mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝10:1至0:1)来纯化以产生呈白色固体的产物(1g，4.76mmol，59.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):211.2[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向先前制备的N-乙基哌啶胺(83.8mg，190μmol，1当量，游离碱)在DCM(5mL)和甲苯(5mL)中的混合物中一次性添加三甲基铝(2M，0.48mL，5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加1-[2-(二甲基氨基)-2-氧代-乙基]吡咯-3-甲酸甲酯(40mg，190μmol，1当量)，并且将反应加热至50℃并搅拌2h。将混合物冷却至0℃。将残余物倾倒至氢氧化钠(4M，5mL)中，并且搅拌3min。将水相用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以产生产物(30mg，48.5μmol，25.5％产率)，LC-MS(ES+,m/z):619.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.66(t,J＝5.84Hz,1H),8.14(s,1H),7.90(s,1H),7.30-7.25(m,1H),7.11(t,J＝8.05Hz,1H),6.87(d,J＝8.38Hz,1H),6.69(t,J＝2.43Hz,1H),6.48(dd,J＝2.65,1.76Hz,1H),6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.07(br d,J＝8.38Hz,1H),5.50(q,J＝9.11Hz,2H),4.92(s,3H),4.72(d,J＝5.73Hz,2H),3.67-3.55(m,1H),3.21-3.11(m,1H),3.01(s,3H),2.94(br d,J＝10.80Hz,1H),2.85(s,3H),2.40(br d,J＝7.06Hz,2H),2.32-1.91(m,3H),1.71(br d,J＝11.25Hz,1H),1.01(t,J＝7.06Hz,3H)。
实施例128：1-叔丁基-N-({3-[4-({5H,6H,7H,8H-咪唑并[1,2-a]吡啶-7-基}氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基}甲基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物366B)
向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡咯-3-甲酰胺(10mg，19.1μmol，1当量)和5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-7-胺(7.9mg，57μmol，3当量)在THF(3mL)中的溶液中添加叔丁醇钠(2M，40μL 4当量)和[2-(2-氨基苯基)苯基]-甲基磺酰基氧基-钯二叔丁基-[2-(2,4,6-三异丙基苯基)苯基]磷烷(第3代叔丁基-XPhos)(7.6mg，9.54μmol，0.5当量)。在80℃下，在氮气下，将混合物搅拌2h。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将这个过程重复八次，并且将所得物质合并。将这个物质通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：30％-70％，8min)来进一步纯化以产生所需产物1-叔丁基-N-({3-[4-({5H,6H,7H,8H-咪唑并[1,2-a]吡啶-7-基}氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基}甲基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(12mg，20.7μmol，13.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):581.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65-8.62(t,J＝5.6Hz,1H),8.14(s,1H),7.78(s,1H),7.55-7.54(t,J＝2.2Hz,1H),7.17-7.13(t,J＝8.0Hz,1H),7.034-7.032(d,J＝0.8Hz,1H),7.00-6.98(t,J＝2.8Hz,1H),6.91-6.89(d,J＝8.0Hz,1H),6.843-6.840(d,J＝1.2Hz,1H),6.51-6.50(m,1H),6.37-6.35(d,J＝7.6Hz,1H),6.21-6.19(d,J＝8.0Hz,1H),5.55-5.48(m,2H),4.74-4.72(d,J＝5.6Hz,2H),4.15-4.11(m,1H),4.06-3.99(m,2H),3.20-3.14(m,1H),2.82-2.76(m,1H),2.32-2.25(m,1H),1.92-1.87(m,1H),1.49(s,9H)。
使用与用于以上相对的对映异构体的方法相同的方法F，利用N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡咯-3-甲酰胺(20mg，38.1μmol，1当量)和(5S)-5-氨基哌啶-2-酮盐酸盐(23mg，152μmol，4当量)制备1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R)-6-氧代哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物367B)，以提供呈白色固体的产物(9.1mg，15.7μmol，8.2％产率，96％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):558.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(t,J＝5.7Hz,1H),7.78(s,1H),7.54(t,J＝2.08Hz,1H),7.40(s,1H),7.14(t,J＝8.08Hz,1H),6.99(t,J＝2.68Hz,1H),6.89(d,J＝8.32Hz,1H),6.50(dd,J＝2.94,1.83Hz,1H),6.31(d,J＝7.82Hz,1H),6.07(d,J＝7.70Hz,1H),5.50(d,J＝8.84Hz,2H),4.73(d,J＝5.74Hz,2H),3.77-3.88(m,1H),3.33-3.49(m,1H),3.11(dd,J＝10.94,8.50Hz,1H),2.31-2.36(m,2H),2.05(dd,J＝12.90,5.20Hz,1H),1.72-1.85(m,1H),1.49(s,9H)。
实施例129：1-叔丁基-N-[(3-{4-[(2-甲基-4,5,6,7-四氢-1,3-苯并噻唑-6-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物368B)
向2-(4-氧代环己基)异吲哚啉-1,3-二酮(5g，20.6mmol，1当量)在EA(50mL)中的溶液中添加氯化铝(150mg，1.1mmol)。接着在0℃下，在5min内滴加溴(985.4mg，6.2mmol，1当量)在EA(8mL)中的溶液。在这个温度下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物通过添加饱和硫代硫酸钠(50mL)来淬灭，接着用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×15mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的产物(6g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):321.9,323.9[(M+H)+]。
向硫代乙酰胺(1.2g，16.1mmol，1.3当量)在DMF(40mL)中的溶液中添加2-(3-溴-4-氧代环己基)异吲哚啉-1,3-二酮(4.0g，12.4mmol，1当量)。在100℃下将反应混合物搅拌10h。将反应混合物通过添加水(100mL)来淬灭，接着用EA(3×80mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:0至10:1)来纯化以产生呈浅黄色固体的产物(3g，10.1mmol，81.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):299.0[(M+H)+]。
向2-(2-甲基-4,5,6,7-四氢-1,3-苯并噻唑-6-基)异吲哚啉-1,3-二酮(3g，10.1mmol，1当量)在乙醇(50mL)中的溶液中添加水合肼(3.4g，20.1mmol，3.3mL，30％纯度，2当量)。在60℃下将反应混合物搅拌2h。将反应混合物过滤以移除固体。将滤液真空浓缩以移除溶剂，并且产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Welch Xtimate C18 250×50mm×10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：5％-30％，20min)来纯化。获得了呈深棕色固体的产物(0.3g，1.8mmol，17.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):169.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝3.27(br s,1H),2.97(br dd,J＝4.3,15.8Hz,1H),2.92-2.82(m,1H),2.81-2.71(m,1H),2.61(s,3H),2.48(br dd,J＝8.1,15.8Hz,1H),2.06-1.94(m,1H),1.77-1.66(m,1H)。
将N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(51mg，107μmol，1当量)、2-甲基-4,5,6,7-四氢-1,3-苯并噻唑-6-胺(27.1mg，161μmol，1.5当量)、XPhos Pd G3(13.6mg，16.1μmol，0.2当量)、叔丁醇钠(2M，270μL 5当量)在2-甲基丁-2-醇(2mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在80℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌4h。将这个过程重复7次，并且将混合物合并，并通过添加50mL水来淬灭，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:2)来纯化以产生呈黄色固体的化合物产物(50mg，88.9μmol，82.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):563.2[(M+H)+]。
在标准条件下处理中间体以移除Boc(HCl/EA)产生了所需伯胺(40mg)。LC-MS(ES+,m/z):463.0[(M+H)+]。按照方法A，使N-[2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]-2-甲基-4,5,6,7-四氢-1,3-苯并噻唑-6-胺(40mg，86.5μmol，1当量)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(21.7mg，129.7μmol，1.5当量)反应以提供呈浅黄色固体的所需产物1-叔丁基-N-[(3-{4-[(2-甲基-4,5,6,7-四氢-1,3-苯并噻唑-6-基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基}-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(5.2mg，7.9μmol，9.1％产率，92.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):612.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.71-8.58(m,1H),7.78(s,1H),7.55(s,1H),7.13(t,J＝7.9Hz,1H),6.99(s,1H),6.87(d,J＝8.8Hz,1H),6.50(br s,1H),6.32(d,J＝8.2Hz,1H),6.14(d,J＝8.2Hz,1H),5.56-5.45(m,2H),4.72(d,J＝5.7Hz,2H),3.90(br s,1H),3.18-3.11(m,1H),2.83-2.71(m,3H),2.57(s,3H),2.16(br s,1H),1.77(br s,1H),1.49(s,9H)。
1-环丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物369B)：按照方法B，使胺1(47mg，0.099mmol，1当量，HCl)与1-环丁基-4-吡唑甲酸(22.3mg，0.134mmol.1.43当量)偶联以在反相HPLC纯化之后提供所需酰胺产物(10.3mg，18％)。LC-MS(ES+,m/z):575.3[(M+H)+]。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ9.05(t,J＝5.7Hz,1H),8.37(s,1H),8.00(s,1H),7.94(s,1H),7.17(t,J＝8.0Hz,1H),6.93(d,J＝8.3Hz,1H),6.33(d,J＝7.8Hz,1H),6.09(d,J＝8.2Hz,1H),5.81(s,0H),5.55(d,J＝8.9Hz,2H),5.01–4.86(m,1H),4.82(d,J＝5.7Hz,2H),3.65(d,J＝28.9Hz,1H),3.10(s,1H),2.88(s,1H),2.51–2.39(m,4H),2.33-1.95(m,4H),1.85(ddt,J＝14.0,10.3,5.4Hz,2H),1.74(d,J＝11.9Hz,1H)。
实施例130：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2S)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物370B)
在-78℃下，在氮气下，向DMSO(9.51mmol，740μL 2当量)在DCM(5mL)中的混合物中添加草酰氯(9.51mmol，833μL 2当量)。在-78℃下将混合物搅拌15min，随后在-78℃下，在氮气下添加在DCM(2mL)中的先前制备的外消旋1-[(1R,2R)-2-羟基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(1g，4.76mmol，1当量)。在-78℃下将混合物搅拌35min，随后在-78℃下添加TEA(23.8mmol，3.3mL，5当量)。搅拌混合物，并且在10min内升温至0℃。将残余物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以产生产物(633mg，3.04mmol，63.9％产率)。
在0℃下，在氮气下，向1-[(1R)-2-氧代环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(630mg，3.03mmol，1当量)在甲醇(10mL)中的混合物中一次性添加硼氢化钠(57.2mg，1.51mmol，0.5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至碳酸钠中以调整pH＝7～8。将水相用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(3×100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生醇产物(200mg，951μmol，31.4％产率)。
在0℃下，在氮气下，向外消旋1-[(1R,2S)-2-羟基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(100mg，476μmol，1当量)在DMF(2mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(57.1mg，1.43mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(950μmol，60μL 2当量)。在25℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以产生产物(63mg，281μmol，59.1％产率)。
在0℃下，在氮气下，向先前制备的胺1(99mg，178μmol，1当量，2HCl)在DCM(1mL)和甲苯(1mL)中的混合物中一次性添加三甲基铝(2M，890μL 10当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加1-[(1R,2S)-2-甲氧基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(40mg，179μmol，1当量)，并且接着加热至50℃并搅拌10h。将残余物倾倒至氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC来纯化以产生呈黄色固体的产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2S)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(20.2mg，17％产率，92.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z)619.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 9.00(t,J＝5.62Hz,1H),8.25(s,1H),7.89(d,J＝2.20Hz,2H),7.14-7.07(m,1H),6.88(d,J＝8.38Hz,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.04(br d,J＝8.16Hz,1H),5.50(q,J＝8.82Hz,2H),4.92-4.74(m,3H),4.70(td,J＝7.99,4.96Hz,1H),3.83(q,J＝4.78Hz,1H),3.65-3.51(m,1H),3.30(s,7H),3.05(s,3H),2.85-2.78(m,1H),2.19(br s,3H),2.15-2.06(m,3H),2.05-1.94(m,1H),1.91-1.76(m,3H),1.70-1.59(m,2H)。
实施例131：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物371B)
将2,5-二甲氧基四氢呋喃(434mmol，56.2mL，5当量)和4-甲基四氢吡喃-4-胺(10g，86.8mmol，1当量)的混合物用乙酸(60mL)分批处理，并且接着在80℃下搅拌24h。将反应混合物真空浓缩以移除溶剂。将残余物用EA(300mL)稀释，用氢氧化钠(3M，2×200mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna c18 250mm×100mm×10um；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：20％-50％，40min)来纯化。将混合物真空浓缩以移除乙腈，随后添加碳酸钠(饱和水溶液)以达到pH>9。将混合物用EA(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×300mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生产物(5g，27.2mmol，31.4％产率)，LC-MS(ES+,m/z):166.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝6.84(t,J＝2.2Hz,2H),6.22(t,J＝2.2Hz,2H),3.80-3.71(m,4H),2.26(td,J＝5.6,13.4Hz,2H),1.95(td,J＝5.3,13.5Hz,2H),1.50(s,3H)。
在0℃下，向2,2,2-三氯乙酰氯(16.3mmol，1.8mL，3当量)在THF(10mL)中的溶液中添加1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯(1g，5.5mmol，1当量)。在0℃下将混合物搅拌1h，接着在70℃下搅拌3h。将混合物倾倒至碳酸钠(饱和，20mL)中。将混合物用EA(60mL)萃取。将合并的有机层用盐水(60mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(PE:EA＝10:1，Rf＝0.4)来纯化以产生呈浅黄色固体的产物(1.5g，4.4mmol，79.8％产率)。1H NMR(399MHz,DMSO-d6)δ＝7.95(t,J＝2.0Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),6.76(dd,J＝1.8,3.1Hz,1H),3.71-3.61(m,2H),3.61-3.54(m,2H),2.20-2.11(m,2H),2.02-1.92(m,2H),1.49(s,3H)。
向2,2,2-三氯-1-[1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-基]乙酮(1g，3.22mmol，1当量)在THF(5mL)和水(5mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，5mL，4.7当量)，并且在25℃下将混合物搅拌1h。在0℃下将反应混合物通过添加1N HCl以达到pH<5来淬灭，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生产物(0.5g，2.39mmol，74.2％产率)。
按照方法E，使1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酸(68.7mg，328μmol，2当量)与胺1(0.07g，164μmol，1当量)偶联，接着通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：30％-70％，8min)来进一步纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(23mg，36.4μmol，22.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):138.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝8.71-8.60(t,J＝5.6Hz,1H),7.92-7.84(s,1H),7.61-7.53(t,J＝2.0Hz,1H),7.16-7.07(t,J＝8.0Hz,1H),7.04-7.00(t,J＝2.4Hz,1H),6.93-6.83(d,J＝8.0Hz,1H),6.58-6.48(dt,J＝2.0Hz,1H),6.35-6.24(d,J＝6.0Hz,1H),6.04-5.94(d,J＝8.4Hz,,1H),5.60-5.38(dt,J＝8.8Hz,2H),4.96-4.67(m,3H),3.69-3.52(m,5H),3.07-2.99(m,1H),2.85-2.77(m,1H),2.31-2.26(m,1H),2.23-2.17(m,3H),2.17-2.06(m,3H),2.05-1.97(m,1H),1.95-1.88(m,2H),1.72-1.64(m,1H),1.47-1.37(s,3H)。
实施例132：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环丁烷-3-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物372B)
在0℃下，向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(500mg，3.96mmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加碳酸铯(1.29g，3.96mmol，1当量)。在90℃下将混合物搅拌1h，随后添加3-溴氧杂环丁烷(652mg，4.76mmol，1.2当量)，在90℃下将混合物搅拌5h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以产生预期产物(400mg，2.20mmol，55.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):182.1[(M+H)+]。
在0℃下，向1-(氧杂环丁烷-3-基)吡唑-4-甲酸甲酯(200mg，1.10mmol，1当量)在水(3mL)和甲醇(6mL)中的溶液中添加氢氧化钠(87.8mg，2.20mmol，2当量)。将混合物升温，并且在25℃下搅拌1h。将合并的有机层用1N HCl酸化，过滤，并且真空浓缩以产生残余物(140mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):168.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(80mg，144μmol，1当量，2HCl)和1-(氧杂环丁烷-3-基)吡唑-4-甲酸(36.37mg，216.29μmol，1.5当量)反应。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环丁烷-3-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(12mg，20μmol，13.8％产率，95.9％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.2[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.08(t,J＝5.69Hz,1H),8.40(s,1H),8.08(s,1H),7.89(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),6.89(d,J＝8.31Hz,1H),6.29(d,J＝7.83Hz,1H),6.02(br d,J＝8.19Hz,1H),5.64(quin,J＝6.88Hz,1H),5.51(q,J＝8.80Hz,2H),4.98-4.85(m,5H),4.79(d,J＝5.62Hz,2H),3.71-3.50(m,1H),3.70-3.49(m,1H),3.13–2.99(m,1H),3.19-2.98(m,1H),2.89-2.79(m,1H),2.89-2.79(m,1H),2.30-2.26(m,1H),2.21(s,4H),2.13(br d,J＝11.98Hz,1H),2.06-1.98(m,1H),1.96(br s,1H),2.06-1.96(m,1H),1.69(br d,J＝10.76Hz,1H),1.74-1.64(m,1H)。
实施例133：反式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3R)-3-羟基-3-甲基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物373B)和顺式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3S)-3-羟基-3-甲基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物374B)
在-78℃下，在氮气下，向先前制备的1-(3-氧代环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(0.4g，1.93mmol，1当量)在THF(5mL)中的混合物中添加溴(甲基)镁(3M，3.22mL，5当量)。在-78℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化以产生产物(90mg，403μmol，20.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):224.1[(M+H)+]。
在50℃下，在氮气下，向1-(3-羟基-3-甲基-环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(60mg，269μmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(0.5mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(43mg，1.07mmol，4当量)。在50℃下将混合物搅拌12h。将残余物倾倒至2M HCl中以调整pH＝7～8，接着真空浓缩以产生呈顺式和反式的混合物形式的所需产物(250mg，粗品)，LC-MS(ES+,m/z):210.0[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(100mg，180.24μmol，1当量，2HCl)和以上羧酸(226.3mg，216μmol，1.2当量)反应。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化，以产生呈分离的顺式和反式异构体形式的产物。反式(8.2mg，12.6μmol，7.0％产率，95.1％纯度)。LC-MS:ES+,m/z:618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.64(t,J＝5.60Hz,1H),7.89(s,1H),7.48(s,1H),7.06-7.21(m,1H),6.92-6.88(m,2H),6.59-6.44(m,1H),6.30(d,J＝7.80Hz,1H),6.06(br s,1H),5.58-5.45(m,2H),5.04-4.49(m,1H),4.76-4.66(m,3H),4.51(s,1H),3.68(br s,1H),3.12(br s,1H),2.90(br s,1H),2.30(br d,J＝6.24Hz,3H),2.15(br s,2H),2.13-2.03(m,2H),1.92-1.82(m,2H),1.81-1.76(m,2H),1.65-1.75(m,2H),1.32(s,3H)；顺式(17.5％产率)。LC-MS:ES+,m/z:618.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.64(t,J＝5.60Hz,1H),7.89(s,1H),7.47-7.58(m,1H),7.11(t,J＝8.00Hz,1H),6.95-6.85(m,2H),6.53-6.44(m,1H),6.28(d,J＝7.80Hz,1H),6.02(br d,J＝8.30Hz,1H),5.50(q,J＝8.40Hz,2H),4.94-4.77(m,1H),4.72(d,J＝5.60Hz,2H),4.64(s,1H),4.6.-4.50(m,1H),3.75-3.49(m,1H),3.06(br s,1H),2.83(br s,1H),2.25-2.20(m,3H),2.19-2.12(m,3H),2.10–1.91(m,3H),1.85-1.76(m,2H),1.69(br d,J＝10.40Hz,1H),1.54(td,J＝12.00,7.27Hz,1H),1.27(s,3H)。
实施例134：化合物375B：1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物375B)
在0℃下，在氮气下，向先前制备的1-[(1R,2R)-2-羟基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(150mg，714μmol，1当量)在DMF(2mL)中的混合物中添加氢化钠(85.6mg，2.14mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代乙烷(1.43mmol，114μL 2当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生所需产物(130mg，57.4％产率)。
在20℃下，向1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(100mg，420μmol，1当量)在甲醇(5mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(5M，170μL 2当量)。在20℃下将混合物搅拌4h。将残余物倾倒至1N HCl(水溶液)中以调整pH＝7，接着真空浓缩以提供羧酸(760mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):225.0[(M+H)+]。
按照方法B，使在DMF(1mL)中的1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]吡唑-4-甲酸(323mg，216μmol，2当量)与胺1(60mg，108.1μmol，1当量，2HCl)反应，接着通过制备型TLC来纯化以产生所需产物(20.5mg，28.6％产率，95.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):633.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.04(t,J＝6.95Hz,1H),9.00(t,J＝5.73Hz,1H)8.32(s,1H),7.94-7.92(m,1H),7.89(s,1H),7.17-7.05(m,1H),6.88(d,J＝8.16Hz,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.02(br d,J＝8.16Hz,1H),5.50-5.41(m,1H),4.92-4.74(m,1H),4.63-4.52(m,1H),4.06(q,J＝5.95Hz,1H),3.66-3.52(m,1H),3.36(q,J＝7.20Hz,1H),3.09-2.96(m,1H),2.89-2.79(m,1H),2.27-2.18(m,1H),2.18-2.10(m,1H),2.10-2.00(m,1H),2.00-1.82(m,1H),1.77(dt,J＝17.92,7.14Hz,1H),1.72-1.56(m,1H)。
实施例135：1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物376B)
在0℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-羟基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(200mg，956μmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中一次性添加氢化钠(114.7mg，2.87mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代乙烷(1.91mmol，153μL 2.0当量)，并且将混合物升温并在20℃下搅拌30min。将残余物倾倒至氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生产物(140mg，61.7％产率)。
在50℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(130mg，548μmol，1当量)在甲醇(5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(5M，1mL，9.1当量)。在50℃下将混合物搅拌10h。将残余物倾倒至1N HCl(水溶液)中以调整pH＝7，接着真空浓缩以产生所需羧酸产物(823mg，粗品)，LC-MS(ES+,m/z):238.0[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(60mg，108μmol，1当量，2HCl)和1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]吡咯-3-甲酸(644mg，433μmol，4当量)偶联。将反应通过制备型TLC来纯化以提供所需产物1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(23.2mg，33.2％产率，97.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):632.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.47(s,1H),7.15-7.06(m,1H),6.94-6.84(m,2H),6.53-6.48(m,1H),6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.03(br d,J＝8.16Hz,1H),5.50(q,J＝9.04Hz,1H),4.93-4.75(m,1H),4.72(d,J＝5.73Hz,1H),4.33-4.20(m,1H),3.91(q,J＝6.39Hz,1H),3.70-3.51(m,1H),3.42-3.32(m,1H),3.11-2.97(m,1H),2.87-2.77(m,1H),2.19(br s,1H),2.17-2.08(m,1H),2.08-2.00(m,1H),2.00-1.85(m,1H),1.62-1.51(m,1H),1.04(t,J＝6.95Hz,1H)。
实施例136：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-(2-氟乙氧基)环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物377B)
在0℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-羟基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(150mg，714μmol，1当量)在DMF(2mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(85.6mg，2.14mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加1-氟-2-碘乙烷(1.43mmol，114μL 2当量)。在20℃下将混合物搅拌30min，接着将残余物倾倒至氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化，以产生产物(48mg，13.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):257.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(100mg，420μmol，1当量)在甲醇(5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(5M，170μL 2当量)。在20℃下将混合物搅拌4h。向反应中添加1N HCl以调整pH＝7，接着将反应真空浓缩。按照方法B，使以上酸与胺1偶联以提供粗产物。将反应通过制备型TLC来纯化以提供所需产物(23.7mg，32.5％产率，96.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):651.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δppm8.02(s,1H)7.90(s,1H),7.41(s,1H),7.22-7.21(m,1H),6.81(br d,J＝8.16Hz,1H),6.53(br s,1H),6.32(br d,J＝7.50Hz,1H),5.27(br d,J＝7.50Hz,1H),4.95-4.80(m,1H),4.55(br s,1H),4.43(br s,1H),4.19(br d,J＝5.73Hz,1H),3.26(br t,J＝9.70Hz,1H),2.97(br d,J＝10.14Hz,1H),2.37(br s,1H),1.79(dt,J＝12.84,6.48Hz,1H),2.32-2.21(m,1H),2.19-2.11(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.96-1.88(m,1H),1.79(dt,J＝12.84,6.48Hz,1H)。
实施例137：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(5-甲氧基吡啶-2-基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物378B)
使胺1和2-溴-5-甲氧基吡啶在布赫瓦尔德条件下偶联以提供所需产物，5.0％产率，LC-MS(ES+,m/z):534.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 7.86(s,1H),7.68(d,J＝2.87Hz,1H),7.21(dd,J＝8.93,2.98Hz,1H),7.14-7.09(m,1H),7.06(t,J＝6.06Hz,1H),6.87(d,J＝8.16Hz,1H),6.64(d,J＝9.04Hz,1H),6.28(d,J＝7.50Hz,1H),5.97(br d,J＝8.82Hz,1H),5.48(q,J＝9.04Hz,2H),4.92-4.77(m,3H),3.67(s,3H),3.57(br s,1H),3.05(br s,1H),2.83(br s,1H),2.30-2.23(m,1H),2.21(br s,3H),2.12(br s,1H),2.00(brd,J＝10.58Hz,1H),1.71(br s,1H)。
实施例138：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环丁烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物379B)
在0℃下，向1H-吡咯-3-甲酸甲酯(300mg，2.40mmol，1当量)在DMF(5mL)中的溶液中添加碳酸铯(1.56g，4.80mmol，2当量)，随后添加3-溴氧杂环丁烷(394mg，2.88mmol，1.2当量)，并且在80℃下将混合物加热和搅拌4h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝2:1)来纯化以产生产物(200mg，1.10mmol，46％产率)。LC-MS(ES+,m/z):182.1[(M+H)+]。
向1-(氧杂环丁烷-3-基)吡咯-3-甲酸甲酯(90mg，497μmol，1当量)在水(2mL)和甲醇(4mL)中的溶液中添加氢氧化钠(39.7mg，993μmol，2当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将反应过滤，并且真空浓缩以产生残余物。反应不如同先前那样进行进一步后处理而产生产物(100mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):166.0[(M+H)+]。
使用方法E，使胺1(50mg，90.12μmol，1当量，2HCl)与以上1-(氧杂环丁烷-3-基)吡咯-3-甲酸(22.60mg，135.18μmol，1.5当量)偶联。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(氧杂环丁烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(20.4mg 36.8％产率，93.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.75(t,J＝5.62Hz,1H),7.90(s,1H),7.68(t,J＝1.77Hz,1H),7.16-7.08(m,2H),6.89(d,J＝8.44Hz,1H),6.60(dd,J＝2.69,1.83Hz,1H),6.29(d,J＝7.82Hz,1H),6.18-6.07(m,1H),6.01(br d,J＝8.31Hz,1H),5.51(q,J＝8.72Hz,2H),5.39(quin,J＝6.85Hz,1H),5.43-5.35(m,1H),4.95(t,J＝7.27Hz,1H),4.98-4.93(m,1H),4.92-4.78(m,1H),4.91-4.77(m,1H),4.77-4.72(m,4H),3.67-3.53(m,1H),3.04(br t,J＝10.21Hz,1H),2.82(br d,J＝10.39Hz,1H),2.35-2.27(m,1H),2.20(s,4H),2.15-2.07(m,1H),2.06–1.97(m,1H),1.73-1.62(m,1H)。
实施例139：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(4-甲氧基苯基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物380B)
在50℃下，在氮气下，向胺1(100mg，235μmol，1当量)和1-溴-4-甲氧基-苯(280μmol，35μL 1.2当量)在甲苯(2mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(31.6mg，328μmol，1.4当量)、XPhos(13.4mg，28.1μmol，0.1当量)和Pd2(dba)3(12.9mg，14.1μmol，0.1当量)。在50℃下将混合物搅拌3h。将残余物倾倒至EDTA(饱和，100mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝20:1)来纯化以提供呈白色固体的产物(10.3mg，18.41μmol，7.9％产率，95.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):533.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 7.91(s,1H),7.13(t,J＝8.00Hz,1H),6.90(br d,J＝7.88Hz,1H),6.76(br d,J＝8.88Hz,2H),6.65(br d,J＝8.50Hz,2H),6.12(br t,J＝6.32Hz,1H),6.02(br d,J＝8.00Hz,1H),5.57-5.42(m,2H),4.96-4.78(m,1H),4.74-4.65(m,2H),3.65(s,3H),3.58(br s,1H),3.06(br t,J＝11.26Hz,1H),2.84(br d,J＝9.76Hz,1H),2.32(br s,1H),2.21(s,3H),2.10(br d,J＝11.76Hz,1H),2.02(br d,J＝9.63Hz,1H),1.71(br d,J＝10.76Hz,1H)。
实施例140：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-(2-氟乙氧基)环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物381B)
在0℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-羟基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(200mg，956μmol，1当量)在DMF(2mL)中的混合物中添加氢化钠(114.7mg，2.87mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着添加1-氟-2-碘乙烷(1.91mmol，153μL 2当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至氯化铵(100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生产物(42mg，164.5μmol，13.2％产率)。
在50℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-乙氧基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(130mg，548μmol，1当量)在甲醇(5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(5M，1mL，9.1当量)。在50℃下将混合物搅拌10h。将残余物倾倒至HCl(水溶液)中以调整pH＝7，接着真空浓缩以产生酸产物(400mg，粗品)。
按照方法A，使胺1和以上酸偶联以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-(2-氟乙氧基)环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):650.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.66(t,J＝5.62Hz,1H),7.89(s,1H),7.48(t,J＝1.76Hz,1H),7.16-7.06(m,1H),6.92(t,J＝2.54Hz,1H),6.87(d,J＝8.16Hz,1H),6.52(dd,J＝2.65,1.76Hz,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.00(br d,J＝8.38Hz,1H),5.50(q,J＝8.75Hz,1H),4.92-4.75(m,1H),4.73(d,J＝5.73Hz,1H),4.51(t,J＝4.08Hz,1H),4.39(t,J＝3.97Hz,1H),4.37-4.29(m,1H),4.00(q,J＝6.17Hz,1H),3.65-3.55(m,1H),3.54-3.49(m,1H),3.09-2.96(m,1H),2.86-2.76(m,1H),2.26(br d,J＝11.25Hz,1H),2.21-2.13(m,1H),2.12-1.93(m,1H),1.89-1.72(m,1H),1.71-1.58(m,1H)。
实施例141：rac-1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物382B)
向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡咯-3-甲酰胺(120mg，229μmol，1当量)和(3R,4S–3–氨基–4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(59.9mg，275μmol，1.2当量)在THF(5mL)中的溶液中添加碳酸铯(223.7mg，687μmol，3当量)、第4代XPhos(21.1mg，22.9μmol，0.1当量)和二环己基-[2-(2,6-二异丙氧基苯基)苯基]磷烷(21.4mg，45.8μmol，0.2当量)，并且在90℃下将反应搅拌2h。将混合物倾倒至EDTA(饱和，10mL)中，并且搅拌2h。接着将混合物用DCM(2×10mL)萃取，并且将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，并且浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化以提供呈黄色固体的(3R,4S)-3-[[2-[5-[[(1-叔丁基吡咯-3-羰基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(10.4mg，15.26μmol，6.7％产率，97.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):662.7[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(t,J＝5.7Hz,1H),7.88(s,1H),7.54(t,J＝2.0Hz,1H),7.13(t,J＝8.1Hz,1H),6.99(t,J＝2.6Hz,1H),6.93(d,J＝8.3Hz,1H),6.50(dd,J＝1.8,2.8Hz,1H),6.36(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(br d,J＝7.2Hz,1H),5.52(q,J＝8.8Hz,2H),5.12-4.91(m,1H),4.73(d,J＝5.7Hz,2H),3.74(br s,2H),3.31(s,2H),3.06(br t,J＝11.4Hz,1H),2.12-1.74(m,2H),1.49(s,9H),1.33(br s,9H)。
将(3R,4S)-3-[[2-[5-[[(1-叔丁基吡咯-3-羰基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]–4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(35mg，52.9μmol，1当量)用HCl/EA(4M，5mL)处理，并且在25℃下搅拌2h。真空移除溶剂。将残余物通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以提供1-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺(21.6mg，72.7％产率，100％纯度)，LC-MS(ES+,m/z):562.5[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(t,J＝5.6Hz,1H),8.18(s,1H),7.86(s,1H),7.55(t,J＝2.1Hz,1H),7.17-7.09(m,1H),6.99(t,J＝2.6Hz,1H),6.91(d,J＝8.2Hz,1H),6.51(dd,J＝2.0,2.9Hz,1H),6.31(d,J＝7.9Hz,1H),5.98(d,J＝8.4Hz,1H),5.51(q,J＝8.9Hz,2H),5.15-4.88(m,1H),4.74(d,J＝5.7Hz,2H),3.89-3.60(m,1H),2.98-2.87(m,2H),2.81(br d,J＝6.0Hz,2H),2.04-1.73(m,2H),1.50(s,9H)。
实施例142：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物383B)
向1-甲氧基-2-甲基-丙-2-胺(3g，29.1mmol，1当量)在DCE(20mL)、水(12mL)和乙酸(4mL)中的溶液中添加乙酸钠(3.58g，43.6mmol，1.5当量)。在30分钟之后，添加2,5-二甲氧基四氢呋喃(29.1mmol，3.77mL，1当量)，并且在90℃下将反应搅拌11.5h。将残余物倾倒至冰水(w:w＝1:1)(10mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供吡咯产物(3g，粗品)，LC-MS(ES+,m/z):154.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝6.86(t,J＝2.1Hz,2H),5.96(t,J＝2.2Hz,2H),3.41(s,2H),3.17(s,3H),1.43(s,6H)。
在0℃下，向1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯(300mg，1.96mmol，1当量)在THF(5mL)中的溶液中添加2,2,2-三氯乙酰氯(5.87mmol，655μL 3当量)。在30之后，将反应加热至70℃，持续2.5h。将残余物倾倒至冰/水(w:w＝1:1)(10mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供酮产物(200mg，粗品)，LC-MS(ES+,m/z):298.0[(M+H)+]。
向2,2,2-三氯-1-[1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-基]乙酮(200mg，670μmol，1当量)在THF(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，13.3mL，60当量)，并且在25℃下将反应搅拌2h。将残余物倾倒至HCl(4M)(10mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供酸(90mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):198.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.42(s,1H),6.94(t,J＝2.5Hz,1H),6.35(dd,J＝1.8,2.6Hz,1H),3.45(s,2H),3.19(s,4H),1.45(s,6H)。
使用方法E，使胺1(200mg，401μmol，1当量，2HCl)与1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-甲酸(79mg，401μmol，1当量)偶联。将残余物通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(87.5mg，36.0％产率，99.7％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):606.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.66(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.52(s,1H),7.17-7.06(m,1H),6.96(t,J＝2.5Hz,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.49(br s,1H),6.28(d,J＝7.7Hz,1H),6.02(br d,J＝8.4Hz,1H),5.55-5.45(m,2H),4.94-4.77(m,1H),4.73(d,J＝5.5Hz,2H),3.69-3.52(m,1H),3.46(s,2H),3.21(s,3H),3.11-2.98(m,1H),2.83(br d,J＝9.3Hz,1H),2.35-2.24(m,1H),2.20(s,3H),2.17-1.94(m,2H),1.68(br d,J＝11.0Hz,1H),1.47(s,6H)。
实施例143：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物384B)
在0℃下，在氮气下，向1H-吡咯-3-甲酸甲酯(2g，16mmol，1当量)和氧化环己烯(16mmol，1.62mL，1当量)在DMF(25mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(1.28g，32mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着加热至80℃，并且搅拌4h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(20mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:0至0:1)来纯化以提供醇产物(800mg，3.58mmol，22.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):224.2[(M+H)+]。
在0℃下，向1-[(1R,2R)-2-羟基环己基]吡咯-3-甲酸甲酯(500mg，2.24mmol，1当量)在DMF(5mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(268.7mg，6.72mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(4.48mmol，280μL 2当量)，并且将反应升温至室温并搅拌30min。将残余物倾倒至氯化铵(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供甲基醚产物(420mg，1.77mmol，79.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):238.2[(M+H)+]。
在20℃下，向1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]吡咯-3-甲酸甲酯(420mg，1.77mmol，1当量)在甲醇(6mL)和水(1.5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(212.4mg，5.31mmol，3当量)。在50℃下将混合物搅拌12h。将残余物倾倒至HCl(2M，5mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。反应不经进一步纯化(390mg，1.75mmol，98.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):224.1[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(40mg，80.11μmol，1当量，2HCl)与1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]吡咯-3-甲酸(21.5mg，96.1μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(29mg，45.9μmol，57.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):632.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.63(t,J＝5.62Hz,1H),8.14(s,1H),7.90(s,1H),7.44(s,1H),7.11(t,J＝7.95Hz,1H),6.91-6.84(m,2H),6.49(br s,1H),6.28(d,J＝7.83Hz,1H),6.01(br d,J＝8.19Hz,1H),5.57-5.43(m,2H),4.94-4.68(m,3H),3.82-3.70(m,1H),3.65-3.54(m,1H),3.08-3.01(m,1H),2.98(s,3H),2.83(br d,J＝10.27Hz,1H),2.32-2.22(m,1H),2.21(s,3H),2.19-2.15(m,1H),2.15-1.90(m,1H),1.88(br s,1H),1.72(br d,J＝6.85Hz,4H),1.31(br t,J＝9.78Hz,2H),1.16(br d,J＝9.90Hz,1H)。
实施例144：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物385B)
向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(3g，23.8mmol，1当量)和氧化环己烯(47.6mmol，4.81mL，2当量)在乙腈(25mL)中的混合物中添加在乙腈(10mL)中的碳酸铯(19.38g，59.5mmol，2.5当量)。在微波下，在90℃下将密封管加热4h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:0至0:1)来纯化以提供呈白色固体的醇产物(2g，8.92mmol，37.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):225.2[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向1-[(1R,2R)-2-羟基环己基]吡唑-4-甲酸甲酯(500mg，2.23mmol，1当量)在DMF(5mL)中的混合物中分批添加氢化钠(267.6mg，6.69mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(4.46mmol，280μL 2当量)，并且加热至20℃。将残余物倾倒至氯化铵(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(500mg，2.10mmol，94.1％产率)。
在20℃下，向1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]吡唑-4-甲酸甲酯(200mg，839μmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(0.5mL)中的混合物中添加氢氧化钠(100.7mg，2.52mmol，3当量)。在20℃下将混合物搅拌5h。将反应倾倒至HCl(2M，5mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。产物不经进一步纯化，呈黄色油状物(170mg，90.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):225.1[(M+H)+]。
使用方法B，使1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]吡唑-4-甲酸(53.9mg，240.3μmol，1.2当量)与胺1(100mg，200.27μmol，1当量，2HCl)偶联以提供产物。将粗品通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环己基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(24mg，18.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):633.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.99(t,J＝5.73Hz,1H),8.22(s,1H),7.94(s,1H),7.90(s,1H),7.15-7.07(m,1H),6.88(d,J＝8.38Hz,1H),6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.02(d,J＝8.16Hz,1H),5.50(q,J＝9.04Hz,2H),4.92-4.75(m,3H),4.11-4.01(m,1H),3.67-3.52(m,1H),3.48(td,J＝10.31,4.30Hz,1H),3.09-3.01(m,1H),2.99(s,3H),2.82(br d,J＝10.36Hz,1H),2.29(br d,J＝13.01Hz,1H),2.19(s,3H),2.18-2.04(m,2H),2.04-1.89(m,2H),1.86-1.65(m,4H),1.37-1.28(m,2H),1.23-1.13(m,1H)。
实施例145：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物386B)
在90℃下，将2,5-二甲氧基四氢呋喃(230mmol，29.7mL，5当量)和3-甲基氧杂环丁烷-3-胺(4g，45.9mmol，1当量)在乙酸(18mL)中的混合物搅拌24h。将反应混合物用EA(100mL)稀释，并且用氢氧化钠(3M，2×200mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将粗产物真空蒸馏(120℃，压力)。将残余物通过制备型HPLC(TFA条件：柱：Phenomenex luna C18 250mm×100mm×10um；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：10％-40％，30min)来进一步纯化以产生产物(49g，17.9mmol，24.5％产率)。由于产物的挥发性，所以将产物以乙腈溶液形式维持，并且由溶液的1H NMR纯度估计数量。LC-MS(ES+,m/z):138.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝6.77-6.70(t,J＝2.0Hz,2H),6.14-6.06(t,J＝2.0Hz,2H),4.88-4.82(d,J＝6.0Hz,2H),4.59-4.49(d,J＝6.4Hz,2H),1.78(s,3H)。
在0℃下，向1-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)吡咯(2g，14.6mmol，1当量)在THF(20mL)中的溶液中添加2,2,2-三氯乙酰氯(8.0g，43.7mmol，4.9mL，3当量)。在70℃下将混合物搅拌3h。在0℃下，将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex luna C18 250×80mm×10um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：20％-50％，20min)来纯化以产生酮产物(0.1g，320μmol，2.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):284.0[(M+H)+]1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝7.80-7.69(t,J＝2.0Hz,1H),6.99-6.87(m,2H),5.08-4.91(d,J＝6.4Hz,2H),4.80-4.62(d,J＝6.8Hz,2H),1.95(s,3H)。
向2,2,2-三氯-1-[1-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)吡咯-3-基]乙酮(0.1g，354μmol，1当量)在THF(1mL)、水(1mL)、甲醇(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，120μL 1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以移除甲醇，用HCl酸化，接着用水(5mL)稀释，并且用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将合并的水层用盐水(3×10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的羧酸(50mg，276μmol，78.0％产率)，LC-MS(ES+,m/z):180.0[(M+H)+]。
使用方法E，使1-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)吡咯-3-甲酸(41.1mg，227μmol，1.5当量)与胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)偶联。将粗品通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝14:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(23mg，23.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):590.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝8.84-8.65(t,J＝5.6Hz,1H),7.95-7.84(s,1H),7.65-7.56(s,1H),7.18-7.01(m,2H),6.93-6.84(d,J＝8.4Hz,1H),6.66-6.53(s,1H),6.33-6.19(d,J＝7.6Hz,1H),6.08-5.94(d,J＝8.4Hz,1H),5.62-5.41(dt,J＝8.8Hz,2H),4.96-4.71(m,5H),4.66-4.57(d,J＝6.8Hz,2H),3.64-3.53(m,1H),3.12-3.00(m,1H),2.87–2.76(m 1H),2.32-2.16(m,4H),2.16-2.07(m,1H),2.06-1.94(m,1H),1.77(s,3H),1.72-1.65(m,1H)。
实施例146：顺式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3S)-3-甲氧基-3-甲基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物387B)和反式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,3R)-3-甲氧基-3-甲基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物388B)
在0℃下，在氮气下，向在DMF(3mL)中的1-(3-羟基-3-甲基-环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(160mg，717μmol，1当量)的顺式/反式混合物中一次性添加氢化钠(86mg，2.15mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(3.58mmol，220μL 5当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物倾倒至氯化铵(水溶液，100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC来纯化以产生呈顺式/反式混合物形式的醚产物(130mg，76.5％产率)，LC-MS(ES+,m/z):238.2[(M+H)+]。
在50℃下，在氮气下，向1-(3-甲氧基-3-甲基-环戊基)吡咯-3-甲酸甲酯(130mg，548μmol，1当量)在甲醇(2mL)和水(1mL)中的混合物中添加氢氧化钠(131.5mg，3.29mmol，6当量)。在50℃下将混合物搅拌10h。将残余物倾倒至HCl中以达到pH＝7～8，过滤，并且真空浓缩以产生产物(0.7g，粗品)。
按照方法E，使1-(3-甲氧基-3-甲基-环戊基)吡咯-3-甲酸(79.7mg，357μmol，1.1当量)与胺1(180mg，324μmol，1当量，2HCl)偶联。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化，接着通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×30mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O ETOH]；B％：60％-60％，15min)再次纯化以获得外消旋的、分离的顺式和反式异构体。顺式：(20.7mg，32.8μmol，10.1％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):632.3[(M+H)+]1HNMR(DMSO-d6,400MHz):δ＝,8.69(t,J＝5.9Hz,1H),7.91(s,1H),7.48(s,1H),7.16-7.10(m,1H),6.93-6.86(m,2H),6.52-6.47(m,1H),6.30(d,J＝7.9Hz,1H),6.06(br d,J＝7.9Hz,1H),5.52(q,J＝8.9Hz,2H),4.93(m,1H),4.74(d,J＝5.6Hz,2H),4.66-4.52(m,1H),3.65-3.58(M,1H),3.16(s,3H),3.08(br s,1H),2.84(br s,1H),2.22-2.19(m,7H),2.19-2.16(m,4H),1.72(br s,1H),1.63-1.38(m,1H),1.28(s,3H)。反式：(11.5mg，18.21μmol，5.61％产率，97.7％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):632.3[(M+H)+]。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ＝8.61(br t,1H),7.85(s,1H),7.46(s,1H),7.08(t,1H),6.95-6.78(m,2H),6.46(br s,1H),6.25(br d,1H),6.01(br d,1H),5.52–5.35(m,2H),4.88(br dd,1H),4.80-4.64(m,2H),4.59-4.52(m,1H),3.59-3.51(m,1H),3.12-3.03(m,4H),2.60-2.59(m,1H),2.35-2.29(m,7H),1.99-1.83(m,1H),1.82-1.65(m,4H),1.26(s,3H)。
实施例147：rac-1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物389B)
向先前制备的哌啶(40mg，71.2μmol，1当量)和多聚甲醛(21.4mg，712μmol，10当量)在甲醇(2mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(13.4mg，214μmol，3当量)，接着添加乙酸(710μmol，41mL，10当量)，并且在50℃下将反应搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(10mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化以提供呈白色固体的1-叔丁基–N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-1-甲基-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺(15.8mg，38.5％产率，99.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.6[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(t,J＝5.7Hz,1H),7.87(s,1H),7.54(s,1H),7.15-7.09(m,1H),6.99(t,J＝2.6Hz,1H),6.89(d,J＝8.4Hz,1H),6.50(br s,1H),6.31(d,J＝7.9Hz,1H),5.97(br d,J＝8.6Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.98(br s,1H),4.73(d,J＝5.5Hz,2H),3.91-3.63(m,1H),2.69(br s,1H),2.60-2.55(m,1H),2.32-2.27(m,1H),2.22(s,3H),2.15(br s,1H),2.02-1.85(m,2H),1.49(s,9H)。
实施例148：2-(5-{[(1-叔丁基-1H-吡唑-3-基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物390B)
将胺1(30mg，70.4μmol，1当量)和5-溴-1-叔丁基-吡唑(28.6mg，141μmol，2当量)添加至甲苯(1mL)中，在20℃下，在氮气下，向其中添加叔丁醇钠(9.5mg，98.5μmol，1.4当量)、Pd2(dba)3(6.4mg，7.04μmol，0.1当量)和XPhos(4mg，8.4μmol，0.1当量)。在50℃下将混合物搅拌15h。将残余物倾倒至(1M)EDTA(10mL)中，并且搅拌2h。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物2-(5-{[(1-叔丁基-1H-吡唑-3-基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(1.8mg，4.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):549.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 7.87(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),7.04(d,J＝1.71Hz,1H),6.88(d,J＝8.44Hz,1H),6.30(d,J＝7.82Hz,1H),5.97(br d,J＝8.19Hz,1H),5.86(t,J＝5.99Hz,1H),5.56-5.44(m,3H),4.95-4.75(m,1H),4.62(d,J＝5.99Hz,2H),3.70-3.50(m,1H),3.05(br s,1H),2.83(br d,J＝9.41Hz,1H),2.28(br s,1H),2.20(s,3H),2.10(br d,J＝11.25Hz,1H),2.06-1.99(m,1H),1.71(br d,J＝13.94Hz,1H),1.57(s,9H),1.31-1.19(m,4H),0.91-0.84(m,1H)。
实施例149：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物391B)
向4-溴-1H-吡唑(5.0g，34mmol，1当量)和2-溴-2-甲基-丙酸甲酯(12.3g，68mmol，8.8mL，2当量)在DMF(50mL)中的溶液中添加碳酸铯(33.3g，102.1mmol，3当量)，并且在80℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(300mL)中，接着用EA(150mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20/1至5/1)来纯化以产生呈无色油状物的酯产物(6.0g，24.3mmol，71.4％产率)。LCMS(ES+,m/z):246.9[(M+H)+]。
在0℃下，向2-(4-溴-1H-吡唑-1-基)-2-甲基丙酸甲酯(3.0g，12.1mmol，1当量)在甲醇(50mL)中的溶液中添加硼氢化钠(918.6mg，24.3mmol，2当量)，接着在50℃下将混合物搅拌4h。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠(200mL)中，接着用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(80mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20/1至5/1)来纯化以产生呈无色油状物的产物(1.8g，8.2mmol，67.7％产率)。LCMS(ES+,m/z):218.9[(M+H)+]。
在0℃下，向2-(4-溴-1H-吡唑-1-基)-2-甲基丙-1-醇(1.8g，8.2mmol，1当量)在DMF(30mL)中的溶液中添加氢化钠(1.64g，41.1mmol，60％纯度，5当量)，并且在0℃下将反应搅拌0.5h，接着添加碘代甲烷(16.4mmol，1.02mL，2当量)，并且在25℃下将混合物搅拌1.5h。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中，接着用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝40/1至8/1)来纯化以产生呈无色油状物的甲基醚产物(900mg，3.86mmol，47.0％产率)。LCMS(ES+,m/z):232.9[(M+H)+]。
在-78℃下，向4-溴-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑(300mg，1.29mmol，1当量)在THF(12mL)中的溶液中添加正丁基锂(2.5M，1.03mL，2当量)，并且在-78℃下将反应搅拌0.5h，随后添加氯甲酸甲酯(1.16mmol，90μL 0.9当量)，并且在-78℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(150mL)中，并且接着用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(80mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20/1至8/1)来纯化以产生呈无色油状物的甲酯产物(280mg，1.32mmol，51.3％产率)。LCMS(ES+,m/z):213.1[(M+H)+]。
向1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酸甲酯(280mg，1.32mmol，1当量)在甲醇(4mL)和水(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(158.3mg，3.96mmol，3当量)，并且在25℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物倾倒至水(150mL)中，接着添加1N HCl溶液以达到pH＝4，并且将混合物用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(80mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的产物(200mg，粗品)。
按照方法B，使1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酸(142.9mg，721μmol，2当量)与胺1(200mg，360.5μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.53)来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(74.5mg，33.6％产率)。LCMS(ES+,m/z):607.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.00(br t,J＝5.62Hz,1H)8.30(s,1H),7.91(d,J＝12.13Hz,2H),7.12(t,J＝8.05Hz,1H),6.88(br d,J＝8.16Hz,1H),6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.04(br d,J＝8.16Hz,1H),5.46-5.55(m,2H),4.77-4.91(m,3H),3.53-3.65(m,3H),3.15-3.23(m,3H),3.01-3.08(m,1H),2.80-2.86(m,1H),2.18-2.32(m,4H),2.08-2.15(m,1H),1.95-2.04(m,1H),1.68(br d,J＝10.36Hz,1H),1.51(s,6H)。
实施例150：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物392B)
在0℃下，将先前通过还原先前描述的酮来制备的顺式-1-[(1R,2S)-2-羟基环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(150mg，717μmol，1当量)用DCM(2mL)和DAST(231.11mg，1.43mmol，189.43μL 2当量)处理。在25℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至碳酸钠(50mL)中，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以产生反式-氟代产物(80mg，52.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):212.2[(M+H)+]。
向1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(80mg，379μmol，1当量)在甲醇(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(75.8mg，1.89mmol，5当量)。在50℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物过滤，并且真空浓缩以产生残余物。反应不经进一步纯化而产生产物(80mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):198.2[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(70mg，126μmol，1当量，2HCl)与反式-1-[(1R)-2-氟环戊基]吡咯-3-甲酸(37.3mg，189μmol，1.5当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(21.4mg，27.5％产率，98.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):606.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.70(t,J＝5.69Hz,1H),7.89(s,1H),7.50(t,J＝1.77Hz,1H),7.16-7.09(m,1H),6.94(t,J＝2.51Hz,1H),6.89(d,J＝8.44Hz,1H),6.56(dd,J＝2.63,1.77Hz,1H),6.29(d,J＝7.95Hz,1H),6.01(br d,J＝8.31Hz,1H),5.51(q,J＝8.93Hz,2H),5.23-5.03(m,1H),4.91-4.77(m,1H),4.74(d,J＝5.62Hz,2H),4.68-4.54(m,1H),3.56(brs,1H),3.67-3.50(m,1H),3.09-3.00(m,1H),3.04(br t,J＝10.45Hz,1H),2.82(br d,J＝10.03Hz,1H),2.33(br d,J＝1.71Hz,1H),2.29(br d,J＝12.47Hz,1H),2.25(br s,1H),2.20(s,3H),2.16-2.06(m,2H),2.00(br dd,J＝11.80,3.24Hz,1H),2.04-1.97(m,1H),1.94-1.89(m,1H),1.86-1.82(m,2H),1.73-1.65(m,1H),1.73-1.63(m,1H)。
实施例151：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物393B)
在25℃下，向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡咯-3-甲酰胺(910mg，1.74mmol，1当量)和氨基甲酸叔丁酯(305mg，2.60mmol，1.5当量)在THF(23mL)中的溶液中添加叔丁醇钠(2M，1.74mL，2当量)和[2-(2-氨基苯基)苯基]-甲基磺酰基氧基-钯二叔丁基-[2-(2,4,6-三异丙基苯基)苯基]磷烷(第3代叔丁基-XPhos)(276mg，347μmol，0.2当量)。在80℃下，在氮气下，将混合物搅拌2h。将反应混合物用EDTA(饱和，100mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝20:1至1:2)来纯化，以产生氨基甲酸酯产物(0.45g，803μmol，46.2％产率)，LC-MS(ES+,m/z):561.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.41(s,1H),8.65(br t,J＝5.6Hz,1H),7.86(s,1H),7.65-7.47(m,2H),7.38(br d,J＝8.3Hz,1H),7.34-7.24(m,1H),6.99(t,J＝2.5Hz,1H),6.51(br s,1H),5.59(q,J＝8.8Hz,2H),4.74(br d,J＝5.5Hz,2H),1.49(s,18H)。
在25℃下，将N-[2-[5-[[(1-叔丁基吡咯-3-羰基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基甲酸叔丁酯(0.45g，803μmol，1当量)在HCl/EA(4M，20mL)中的溶液搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以产生产物(0.35g，粗品，HCl)，LC-MS(ES+,m/z):461.3[(M+H)+]。
在50℃下，向N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡咯-3-甲酰胺(0.1g，201μmol，1当量，HCl)和1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(127mg，604μmol，3当量，HCl)在乙醇(4mL)中的溶液中添加乙醇钛(2.01mmol，417μL10当量)。在50℃下将混合物搅拌12h，接着将氰基硼氢化钠(63mg，1.01mmol，5当量)添加至混合物中。在50℃下将混合物搅拌30min。将反应混合物用碳酸氢钠(饱和，150mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(PE:EA＝2:1，接着DCM:甲醇＝10:1)来纯化，并且接着通过制备型HPLC来进一步纯化以分离顺式和反式非对映异构体(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：30％-70％，8mi)。
顺式(化合物393B)(0.03g，45.2μmol，22.5％产率，FA盐)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.74-8.55(t,J＝5.6Hz,1H),7.88(s,1H),7.65-7.49(m,1H),7.18-7.07(t,J＝8.0Hz,1H),7.01-6.95(t,J＝2.4Hz,1H),6.93-6.82(d,J＝8.4Hz,1H),6.57-6.46(m,1H),6.37-6.21(d,J＝8.0Hz,1H),6.06-5.85(d,J＝8.0Hz,1H),5.63-5.42(dt,J＝8.8Hz,2H),4.95-4.68(m,3H),3.68-3.53(m,1H),3.24–3.15(m,1H),3.08-2.97(m,1H),2.41-2.16(m,2H),1.98-1.84(m,1H),1.78-1.66(m,1H),1.49(s,9H),1.04(s,9H)。反式(化合物394B)(15mg，22.6μmol，11.2％产率，FA)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.72-8.56(t,J＝5.6Hz,1H),8.17(s,1H),7.77(s,1H),7.55(s,1H),7.15-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),7.02-6.94(t,J＝2.4Hz,1H),6.92-6.76(d,J＝8.4Hz,1H),6.52-6.45(d,J＝2.0Hz,1H),6.34-6.25(d,J＝8.0Hz,1H),6.16-6.04(d,J＝8.4Hz,1H),5.59-5.36(dt,J＝8.4Hz,2H),4.82-4.67(d,J＝5.6Hz,2H),4.62-4.37(m,1H),3.59-3.48(m,1H),3.26-3.20(m,1H),3.00-2.87(m,1H),2.23-2.11(m,2H),2.08-2.00(m,1H),1.49(s,9H),1.43-1.33(m,1H),1.05(s,9H)。
实施例152：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(化合物395B)
在0℃下，在氮气下，向顺式/反式1-[(1R,2S)-2-羟基环戊基]吡唑-4-甲酸甲酯(300mg，1.43mmol，1当量)的混合物中添加DCM(1mL)，接着添加DAST(2.85mmol，377μL 2当量)。在0℃下将混合物搅拌2.5h。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(50mL)中，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝5:1)来纯化以产生产物。分离出反式异构体作为所需产物(160mg，754μmol，52.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):212.1[(M+H)+]。
向1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]吡咯-3-甲酸甲酯(80mg，379μmol，1当量)在水(1mL)和甲醇(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(75.8mg，1.89mmol，5当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。用HCl(2M)将反应混合物调整至pH 7，接着过滤，并且真空浓缩以产生残余物，从而产生产物(80mg，粗品)。
按照方法B，使1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]吡唑-4-甲酸(25.7mg，130μmol，1.2当量)与胺1(60mg，108.14μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-氟环戊基]-1H-吡唑-4-甲酰胺(25.7mg，37.1％产率，94.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):606.2[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.02(t,J＝5.73Hz,1H),9.07–8.95(m,1H),8.35(s,1H),7.97(s,1H),7.87(s,1H),7.13-7.07(m,1H),6.86(d,J＝8.38Hz,1H),6.26(d,J＝7.94Hz,1H),6.00(d,J＝8.38Hz,1H),5.53-5.43(m,2H),5.32-5.12(m,1H),4.94-4.72(m,4H),3.66-3.49(m,1H),3.02(br t,J＝10.36Hz,1H),2.80(br d,J＝10.58Hz,1H),2.31-2.21(m,2H),2.17(s,3H),2.13-2.04(m,2H),2.03-1.95(m,2H),1.94-1.79(m,3H),1.70-1.62(m,1H)。
实施例153：2-(5-{[(1-叔丁基-1H-吡唑-5-基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(化合物396B)
在20℃下，在氮气下，向胺1(30mg，70μmol，1当量，游离碱)和5-溴-1-叔丁基-吡唑(28.6mg，141μmol，2当量)在甲苯(1mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(9.5mg，99μmol，1.4当量)、Pd2(dba)3(6.4mg，7.0μmol，0.1当量)和XPhos(4mg，8.4μmol，0.1当量)。在50℃下将混合物搅拌15h。将残余物倾倒至(1M)EDTA(10mL)中，并且搅拌2h。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的产物(1.8mg，3.28μmol，4.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):549.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 7.87(s,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),7.04(d,J＝1.71Hz,1H),6.88(d,J＝8.44Hz,1H),6.30(d,J＝7.82Hz,1H),5.97(br d,J＝8.19Hz,1H),5.86(t,J＝5.99Hz,1H),5.56-5.44(m,3H),4.95-4.75(m,1H),4.62(d,J＝5.99Hz,2H),3.70-3.50(m,1H),3.05(br s,1H),2.83(br d,J＝9.41Hz,1H),2.28(br s,1H),2.20(s,3H),2.10(br d,J＝11.25Hz,1H),2.06-1.99(m,1H),1.71(br d,J＝13.94Hz,1H),1.57(s,9H),1.31-1.19(m,4H),0.91-0.84(m,1H)。
实施例154：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物397B)
向N-[[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(5.0g，11.3mmol，1当量)在EA(10mL)中的溶液中添加HCl/EA(4M，40mL，14.1当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以产生产物(3.9g，9.4mmol，83.1％产率，2HCl)，LC-MS(ES+,m/z):342.0[(M+H)+]。
将[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(906mg，2.4mmol，1当量，HCl)、1-甲基吡咯-3-甲酸(0.3g，2.4mmol，1当量)、HOBt(648mg，4.8mmol，2当量)、EDCI(919mg，4.8mmol，2当量)、TEA(12mmol，1.7mL，5当量)在DMF(9mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在50℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌4h。将反应混合物通过添加水(90mL)来淬灭，减压过滤以产生残余物。将粗产物用EA(20mL)湿磨12h以产生产物(0.73g，1.6mmol，67.9％产率)，LC-MS(ES+,m/z):449.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.81-8.59(t,J＝6.0Hz,1H),8.43-8.29(d,J＝8.0Hz,1H),8.27-8.21(d,J＝8.0Hz,1H),7.88(s,1H),7.73-7.57(t,J＝8.0Hz,1H),7.38-7.23(t,J＝1.6Hz,1H),6.82-6.70(t,J＝2.4Hz,1H),6.56-6.42(t,J＝2.2Hz,1H),5.87-5.75(dt,J＝8.0Hz,2H),4.84-4.68(d,J＝5.6Hz,2H),3.65(s,3H)。
向1-甲基-N-[[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺(0.7g，1.4mmol，1当量)和氯化铵(451mg，8.4mmol，6当量)在乙醇(60mL)和水(6mL)中的溶液中添加铁粉(235mg，4.2mmol，3当量)。在90℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以移除乙醇。将残余物用水(50mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，EA＝1)来纯化以产生产物(0.4g，60.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):419.3[(M+H)+]。
向1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(484.4mg，2.8mmol，6当量)在乙醇(60mL)中的溶液中添加N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-甲基-吡咯-3-甲酰胺(195mg，466μmol，1当量)和乙醇钛(9.3mmol，1.9mL，20当量)。在50℃下将混合物搅拌10h。接着添加氰基硼氢化钠(87.9mg，1.40mmol，3当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加碳酸钠水溶液(50mL)来淬灭，接着将固体滤除，并且将滤液用EA(4×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以获得产物，LC-MS(ES+,m/z):576.4[(M+H)+]。
将粗产物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:5)来纯化以产生300mg。接着将混合物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250×80mm×10um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：15％-45％，20min)来进一步纯化。通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×30mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O甲醇]；B％：60％)来拆分顺式异构体的对映异构体以产生拆分的顺式对映异构体。
顺式-(化合物397B)：(71mg，5.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):576.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(t,J＝5.6Hz,1H),7.88(s,1H),7.32(s,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.87(br d,J＝8.3Hz,1H),6.74(d,J＝2.0Hz,1H),6.49(s,1H),6.28(br d,J＝7.6Hz,1H),5.96(br d,J＝8.1Hz,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.93-4.76(m,1H),4.72(d,J＝5.6Hz,2H),3.65(s,3H),3.54(br s,1H),3.24(br d,J＝11.8Hz,1H),3.02(br d,J＝10.4Hz,1H),2.38-2.31(m,1H),2.22(br t,J＝11.0Hz,1H),1.97-1.84(m,1H),1.72(br d,J＝11.6Hz,1H),1.03(s,9H)。顺式-(化合物398B)：(83mg，6.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):576.3[(M+H)+]1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(br t,J＝5.6Hz,1H),7.88(s,1H),7.32(s,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.87(br d,J＝8.1Hz,1H),6.74(br s,1H),6.49(br s,1H),6.28(br d,J＝7.8Hz,1H),5.94(br d,J＝7.8Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.94-4.76(m,1H),4.72(br d,J＝5.6Hz,2H),3.65(s,3H),3.55(br s,1H),3.27-3.16(m,1H),3.02(br d,J＝8.1Hz,1H),2.45-2.35(m,1H),2.22(br t,J＝9.9Hz,1H),1.91(br d,J＝9.8Hz,1H),1.74(br s,1H),1.04(br s,9H)。
N-{[3-(4-{[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡咯-3-甲酰胺(化合物399B)：进一步纯化来自以上反应的反式异构体以获得纯的反式外消旋物(20mg，24.1％产率)。制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)。LC-MS(ES+,m/z):576.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(br t,J＝5.6Hz,1H),7.77(s,1H),7.32(s,1H),7.10(t,J＝8.0Hz,1H),6.84(brd,J＝8.2Hz,1H),6.75(t,J＝2.2Hz,1H),6.49(br s,1H),6.28(br d,J＝7.7Hz,1H),6.12(br d,J＝6.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.72(d,J＝5.5Hz,2H),4.63-4.39(m,1H),3.65(s,3H),3.49(br d,J＝17.0Hz,1H),3.41-3.36(m,1H),2.99-2.87(m,1H),2.17(br d,J＝7.3Hz,2H),2.05(br s,1H),1.46-1.31(m,1H),1.13-0.96(m,9H)。
实施例155：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺。(化合物400B)
向[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(0.3g，88μmol，1当量)和1-叔丁基吡唑-4-甲酸(148mg，879μmol，1当量)在乙腈(3mL)中的溶液中添加1-甲基咪唑(2.6mmol，210μL 3当量)，接着添加[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基-六氟磷酸铵(370mg，1.3mmol，1.5当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。将混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。在25℃下，将粗产物用PE/EA＝1:1(20mL)湿磨30min以产生产物(0.3g，610μmol，69.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):492.2[(M+H)+]。
向1-叔丁基-N-[[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑-4-甲酰胺(0.3g，48μmol，1当量，2HCl)和氯化铵(154mg，2.9mmol，6当量)在水(4mL)和乙醇(40mL)中的溶液中添加铁粉(80.2mg，1.4mmol，3当量)。在90℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物减压过滤以移除乙醇。将残余物用水(50mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以产生产物(0.15g，315μmol，65.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):462.3[(M+H)+]。
向N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡唑-4-甲酰胺(50mg，108μmol，1当量)和1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(68.2mg，325μmol，3当量，HCl)在乙醇(6mL)中的溶液中添加乙醇钛(1.1mmol，225μL 10当量)。在50℃下将混合物搅拌12h，接着将氰基硼氢化钠(34.1mg，542μmol，5当量)添加至混合物中。在50℃下将所得混合物搅拌0.5h。将反应混合物通过添加碳酸钠(水溶液)以达到pH>7来淬灭，并且减压过滤以产生残余物，接着用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将这个残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化。接着将粗产物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18100×30mm×5um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：25％-55％，9min)来进一步纯化以产生产物。
顺式(化合物400B)(31mg，49.9μmol，23.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):619.4[(M+H)+]1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.04-8.88(t,J＝5.6Hz,1H),8.34(s,1H),7.93(s,1H),7.88(s,2H),7.20-7.02(t,J＝8.0Hz,1H),6.97-6.81(d,J＝8.4Hz,1H),6.31-6.20(d,J＝8.0Hz,1H),6.03-5.88(d,J＝8.4Hz,1H),5.62-5.39(dt,J＝8.8Hz,2H),4.98-4.67(m,3H),3.67-3.52(m,1H),3.24-3.19(m,1H),3.07-2.97(m,1H),2.40-2.33(m,1H),2.26-2.19(m,1H),1.96-1.85(m,1H),1.77-1.69(m,1H),1.54(s,9H),1.04(s,9H)。反式(化合物402B)(12mg，19.3μmol，8.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):619.4[(M+H)+]1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.05-8.89(t,J＝5.6Hz,1H),8.34(s,1H),7.93(s,1H),7.77(s,1H),7.15-7.04(t,J＝8.0Hz,1H),6.90-6.76(d,J＝8.4Hz,1H),6.34-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.16-6.03(d,J＝8.4Hz,1H),5.58-5.40(dt,J＝8.4Hz,2H),4.86-4.72(d,J＝5.6Hz,2H),4.63-4.35(m,1H),3.57-3.49(m,1H),3.25-3.20(m,1H),2.97-2.90(m,1H),2.22-2.13(m,2H),2.09-2.01(m,1H),1.54(s,9H),1.43-1.33(m,1H),1.05(s,9H)。
实施例156：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-甲基氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺。(化合物401B)
向3-甲基四氢呋喃-3-胺(1g，9.89mmol，1当量)在DCE(5mL)和水(3mL)中的溶液中添加乙酸钠(1.22g，14.8mmol，1.5当量)和乙酸(1mL)，并且在0℃下将混合物搅拌0.5h，接着添加2,5-二甲氧基四氢呋喃(9.89mmol，1.28mL，1当量)。在90℃下将混合物搅拌12h。将反应混合物倾倒至氯化铵(饱和，50mL)中，接着用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物(700mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):152.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝6.81(t,J＝2.20Hz,1H),6.82-6.80(m,1H),6.81(br d,J＝11.91Hz,1H),6.18(t,J＝2.20Hz,1H),6.23-6.10(m,1H),4.11(brs,1H),4.12(d,J＝8.82Hz,1H),4.07-3.99(m,1H),3.84(d,J＝8.82Hz,1H),3.86-3.81(m,1H),2.47-2.38(m,1H),2.24-2.15(m,1H),2.20(ddd,J＝12.68,7.72,6.73Hz,1H),2.01(s,1H),2.05(s,1H),1.67(s,3H),1.68(br s,1H),1.26(t,J＝7.06Hz,1H)。
向1-(3-甲基四氢呋喃-3-基)吡咯(200mg，1.32mmol，1当量)在THF(1mL)中的溶液中添加2,2,2-三氯乙酰氯(3.97mmol，440μL 3当量)。在70℃下将混合物搅拌8h。将反应混合物倾倒至碳酸钠(50mL)中，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝2:1)来纯化以产生酮产物(150mg，38.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):295.9[(M+H)+]。
向2,2,2-三氯-1-[1-(3-甲基四氢呋喃-3-基)吡咯-3-基]乙酮(150mg，506μmol，1当量)在THF(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，2.50mL，14.8当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。用2M HCl将反应混合物调整至pH<7，接着倾倒至水(50mL)中，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，从而产生羧酸产物(85mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):194.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(100mg，160μmol，1当量，2HCl)和1-(3-甲基四氢呋喃-3-基)吡咯-3-甲酸(37.5mg，192μmol，1.2当量)偶联。将粗品通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(3-甲基氧杂环戊烷-3-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(58.5mg，59.5％产率，98.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):604.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.70(t,J＝5.62Hz,1H),8.72-8.67(m,1H),7.90(s,1H),7.92-7.86(m,1H),7.59-7.53(m,1H),7.56(d,J＝1.71Hz,1H),7.15-7.09(m,1H),7.15-7.09(m,1H),6.99(t,J＝2.57Hz,1H),7.01-6.97(m,1H),6.89(d,J＝8.31Hz,1H),6.91-6.86(m,1H),6.55-6.52(m,1H),6.56-6.52(m,1H),6.31-6.27(m,1H),6.29(d,J＝7.82Hz,1H),6.08-6.00(m,1H),6.03(br d,J＝8.31Hz,1H),5.58-5.42(m,1H),5.51(q,J＝8.72Hz,1H),4.92-4.77(m,1H),4.94-4.77(m,1H),4.74(d,J＝5.62Hz,1H),4.76-4.72(m,1H),4.00(d,J＝9.17Hz,1H),4.02-3.98(m,1H),3.93-3.87(m,1H),3.93-3.87(m,1H),3.77-3.73(m,1H),3.75(d,J＝9.05Hz,1H),3.67-3.52(m,1H),3.68-3.51(m,1H),3.09-2.99(m,1H),3.04(brt,J＝10.82Hz,1H),2.82(br d,J＝9.90Hz,1H),2.82-2.79(m,1H),2.85-2.79(m,1H),2.86-2.78(m,1H),2.41(dt,J＝13.14,6.76Hz,1H),2.45-2.37(m,1H),2.26(br d,J＝7.70Hz,1H),2.27-2.22(m,1H),2.23(br d,J＝2.08Hz,1H),2.21-2.19(m,1H),2.20(s,2H),2.15-2.07(m,1H),2.04-1.97(m,1H),1.96(br d,J＝2.93Hz,1H),1.91(s,1H),1.72-1.65(m,1H),1.68(br d,J＝10.27Hz,1H),1.59(s,3H)。
实施例157：化合物403B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺；化合物420B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺；化合物421B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺和化合物416B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺
在20℃下，在氮气下，向先前制备的1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酸(934mg，4.46mmol，2当量)和[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(1g，2.23mmol，1当量，2HCl)在乙腈(30mL)中的混合物中一次性添加1-甲基咪唑(6.70mmol，530μL 3当量)和[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基-六氟磷酸铵(940mg，3.35mmol，1.5当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以提供呈黄色固体的产物(900mg，1.59mmol，71.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):566.2[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酰胺(200mg，353μmol，1当量)和顺式-3-氨基-4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(231.2mg，1.06mmol，3当量)在THF(4mL)中的混合物中添加碳酸铯(345mg，1.06mmol，3当量)和甲烷磺酸[2-(2-氨基苯基)苯基]钯(1+)；二环己基-[2-(2,4,6-三异丙基苯基)苯基]磷烷(89.7mg，106μmol，0.3当量)。将反应加热至110℃，并且搅拌12h。将残余物倾倒至EDTA(1M，50mL)中，并且搅拌2h。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝20:1)来纯化以提供呈黄色固体的产物(190mg，25.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):604.4[(M+H)+]。
在20℃下，向(3R,4S)-4-氟-3-[[2-[5-[[[1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(190mg，270μmol，1当量)的混合物中添加4N HCl/EA(10mL)，并且将反应加热至20℃并搅拌4h。将反应浓缩以提供呈黄色固体的产物(160mg，265μmol，98％产率)。将通过以上方法制备的这个外消旋物质的一部分通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×30mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O IPA]；B％：60％，40min)来进一步分离以提供拆分的对映异构体。
化合物420B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.67(br t,J＝5.69Hz,1H),8.21(br s,1H),7.87(s,1H),7.59(s,1H),7.12(t,J＝8.07Hz,1H),7.02(t,J＝2.51Hz,1H),6.89(br d,J＝8.07Hz,1H),6.55(br s,1H),6.30(d,J＝7.82Hz,1H),5.93(br d,J＝8.44Hz,1H),5.58-5.44(m,2H),5.08-4.48(m,1H),4.74(br d,J＝5.62Hz,2H),3.75(br s,1H),3.69-3.63(m,2H),3.59-3.52(m,2H),2.88(br s,2H),2.73(br s,2H),2.16-2.09(m,2H),2.02-1.85(m,4H),1.75(br s,1H),1.43(s,3H)。
化合物421B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.66(br t,J＝5.56Hz,1H),8.20(br s,1H),7.86(s,1H),7.59(s,1H),7.12(t,J＝8.07Hz,1H),7.02(t,J＝2.57Hz,1H),6.89(br d,J＝8.07Hz,1H),6.55(br s,1H),6.31(d,J＝7.95Hz,1H),5.94(br d,J＝7.70Hz,1H),5.51(q,J＝8.48Hz,2H),5.11-4.88(m,1H),4.74(d,J＝5.62Hz,2H),3.77(br s,1H),3.68-3.62(m,2H),3.60-3.52(m,2H),2.89(br s,2H),2.75(br s,2H),2.19-2.08(m,2H),1.98-1.87(m,4H),1.75(br s,1H),1.43(s,3H)。
化合物403B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺和化合物416B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺：在25℃下，在氮气下，向外消旋N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酰胺(160mg，265μmol，1当量)和多聚甲醛(79.6mg，2.65mmol，10当量)在甲醇(4mL)中的混合物中添加氰基硼氢化钠(50mg，795.μmol，3当量)和乙酸(2.65mmol，150μL10当量)。在50℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(10mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝20:1)来纯化以提供呈黄色固体的外消旋产物(120mg，69.1μmol，52.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。将残余物通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×30mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O IPA])来进一步分离以提供拆分的对映异构体。
化合物403B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(42.8mg，26.1％产率，99.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.68(t,J＝5.62Hz,1H),7.87(s,1H),7.58(s,1H),7.12(t,J＝7.94Hz,1H),7.02(t,J＝2.54Hz,1H),6.90(d,J＝8.16Hz,1H),6.55(br s,1H),6.31(d,J＝7.72Hz,1H),5.98(br d,J＝8.82Hz,1H),5.51(q,J＝8.75Hz,2H),5.01-4.82(m,1H),4.74(d,J＝5.51Hz,2H),3.87-3.75(m,1H),3.69-3.62(m,2H),3.59-3.53(m,2H),2.69(br d,J＝15.66Hz,2H),2.57(br s,2H),2.25(br s,3H),2.14(dt,J＝13.40,3.67Hz,2H),2.01-1.79(m,4H),1.43(s,3H)。
化合物419B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(33.4mg，20.0％产率，97.93％纯度)，黄色固体。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.68(t,J＝5.29Hz,1H),7.87(s,1H),7.58(s,1H),7.16-7.07(m,1H),7.02(br s,1H),6.90(br d,J＝8.16Hz,1H),6.55(br s,1H),6.32(d,J＝7.94Hz,1H),6.00(br d,J＝7.28Hz,1H),5.51(q,J＝8.82Hz,2H),5.03-4.83(m,1H),4.74(d,J＝5.73Hz,2H),3.87-3.74(m,1H),3.68-3.62(m,2H),3.60-3.53(m,2H),2.83-2.53(m,4H),2.28(br s,3H),2.17-2.10(m,2H),2.03-1.82(m,4H),1.43(s,3H)。
实施例158：化合物404B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺。
在90℃下，在氮气下，向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(0.6g，4.8mmol，1当量)和4-甲基四氢吡喃-4-醇(3.81g，32.8mmol，6.9当量)的混合物中一次性添加硫酸(4.85mmol，260μL1.02当量)。在90℃下将混合物搅拌12h。将反应真空浓缩，并且将残余物通过制备型HPLC(TFA条件，柱：Nano-micro Kromasil C18 100×40mm 10um；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：1％-28％，8min)来纯化以提供呈白色固体的所需产物(160mg，16.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):211.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡唑-4-甲酸(80.8mg，385μmol，1.2当量)在DMF(3mL)中的混合物中添加HATU(243.7mg，640.9μmol，2当量)和TEA(3.20mmol，445μL 10当量)。在20℃下将混合物搅拌10min，随后添加胺1(200mg，320.4μmol，1当量，2HCl)。在20℃下将混合物搅拌10min。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(58.8mg，29.3％产率，98.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):619.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 9.00(t,J＝5.60Hz,1H),8.43(s,1H),7.98(s,1H),7.90(s,1H),7.12(t,J＝8.00Hz,1H),6.88(d,J＝8.40Hz,1H),6.28(d,J＝8.00Hz,1H),6.03(br d,J＝8.00Hz,1H),5.50(q,J＝9.00Hz,2H),4.94-4.75(m,3H),3.75-3.64(m,2H),3.56(br s,1H),3.49-3.42(m,2H),3.04(br s,1H),2.82(br d,J＝9.20Hz,1H),2.39-2.32(m,2H),2.20(br s,4H),2.09(br d,J＝10.40Hz,1H),2.05-1.96(m,1H),1.96-1.87(m,2H),1.68(br d,J＝10.00Hz,1H),1.45(s,3H)。
实施例159：化合物405B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺；化合物406B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺和化合物407B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺
在25℃下，在氮气氛围下，将[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(1.5g，3.97mmol，1当量，HCl)、1-甲基吡唑-4-甲酸(601mg，4.77mmol，1.2当量)、[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基六氟磷酸铵(1.67g，5.96mmol，1.5当量)和1-甲基咪唑(11.9mmol，950μL 3当量)在乙腈(15mL)中的混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(50mL)来淬灭，接着真空过滤以产生残余物。将粗产物用EA(20mL)湿磨12h，接着过滤并干燥以产生产物(1.1g，2.45mmol，61.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):450.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.14-9.00(t,J＝5.6Hz,1H),8.40-8.30(d,J＝8.4Hz,1H),8.27-8.23(d,J＝8.0Hz,1H),8.20(s,1H),7.90(s,1H),7.88(s,1H),7.69-7.61(t,J＝8.4Hz,1H),5.88-5.71(dt,J＝8.4Hz,2H),4.95-4.76(d,J＝5.6Hz,2H),3.88(s,3H)。
向1-甲基-N-[[3-[4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑-4-甲酰胺(1g，2mmol，1当量)和氯化铵(642.8mg，12mmol，6当量)在乙醇(100mL)和水(10mL)中的混合物中添加铁粉(335.6mg，6.01mmol，3当量)。在90℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物真空浓缩以移除乙醇。将残余物用水(50mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10:1至0:1)来纯化以产生产物(0.55g，1.27mmol，63.5％产率，97％纯度)，LC-MS(ES+,m/z):420.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.06-8.90(t,J＝5.6Hz,1H),8.19(s,1H),7.90(s,1H),7.61(s,1H),7.11-6.93(t,J＝8.0Hz,1H),6.87-6.66(d,J＝8.0Hz,1H),6.42-6.14(d,J＝7.6Hz,1H),5.70(s,2H),5.55-5.34(dt,J＝8.4Hz,2H),4.83-4.68(d,J＝5.6Hz,2H),3.87(s,3H)。
在50℃下，向N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-甲基-吡唑-4-甲酰胺(250mg，596μmol，1当量)和1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(620mg，3.6mmol，6.0当量)在乙醇(15mL)中的溶液中添加乙醇钛(1.7g，6mmol，1.2mL，10当量)。在50℃下将混合物搅拌12h，接着将氰基硼氢化钠(187mg，3.0mmol，5.0当量)添加至混合物中。在50℃下将混合物搅拌30min。将混合物用碳酸钠(100mL)稀释，并且在25℃下搅拌1h。将混合物过滤，并且将滤饼用EA(3×100mL)洗涤。将滤液真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝10:1)来纯化，接着通过制备型HPLC(柱：Phenomenex LunaC18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-50％，8min)来纯化以提供纯的外消旋化合物407B：反式-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺(30mg，8.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):577.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.10-8.82(t,J＝5.6Hz,1H),8.19(s,1H),7.90(s,1H),7.77(s,1H),7.18-7.01(t,J＝8.0Hz,1H),6.90-6.71(d,J＝8.0Hz,1H),6.35-6.21(d,J＝7.6Hz,1H),6.19-6.02(d,J＝8.4Hz,1H),5.60-5.37(dt,J＝8.4Hz,2H),4.84-4.73(d,J＝5.6Hz,2H),4.61-4.33(m,1H),3.88(s,3H),3.58-3.47(m,1H),3.31-3.26(m,1H),2.99-2.89(m,1H),2.24-2.02(m,3H),1.42-1.33(m,1H),1.05(s,9H)。
将顺式非对映异构体的外消旋混合物通过SFC(柱：DAICEL CHIRALCELOD(250mm×50mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O ETOH]；B％：38％-38％，min)来进一步纯化以拆分对映异构体。
化合物405B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺(110mg，190.78μmol，16.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):577.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.09-8.95(t,J＝6.0Hz,1H),8.20(s,1H),7.94-7.79(d,J＝7.2Hz,2H),7.17-7.02(t,J＝8.0Hz,1H),6.93-6.81(d,J＝8.0Hz,1H),6.34-6.23(d,J＝8.0Hz,1H),6.09-5.91(d,J＝8.4Hz,1H),5.62-5.44(dt,J＝8.8Hz,2H),4.96-4.74(m,3H),3.87(s,3H),3.65-3.53(m,1H),3.25-3.20(m,1H),3.06-2.98(m,1H),2.43–2.35(m,1H),2.26-2.18(t,J＝11.2Hz,1H),1.97-1.86(m,1H),1.77-1.67(m,1H),1.03(s,9H)。
化合物406B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡唑-4-甲酰胺(30mg，52.0μmol，8.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):577.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.10-8.82(t,J＝5.6Hz,1H),8.19(s,1H),7.90(s,1H),7.77(s,1H),7.18-7.01(t,J＝8.0Hz,1H),6.90-6.71(d,J＝8.0Hz,1H),6.35-6.21(d,J＝7.6Hz,1H),6.19-6.02(d,J＝8.4Hz,1H),5.60-5.37(dt,J＝8.4Hz,2H),4.84-4.73(d,J＝5.6Hz,2H),4.61-4.33(m,1H),3.88(s,3H),3.58-3.47(m,1H),3.31-3.26(m,1H),2.99-2.89(m,1H),2.24-2.02(m,3H),1.42-1.33(m,1H),1.05(s,9H)。
实施例160：化合物408B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺
将先前制备的N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-叔丁基-吡唑-4-甲酰胺(200mg，381μmol，1当量)、外消旋(3R,4S)-3-氨基-4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(249.3mg，1.14mmol，3当量)、碳酸铯(372.1mg，1.14mmol，3当量)和第3代XPhos钯(96.7mg，114μmol，0.3当量)在THF(4mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在密封管中，在110℃下将混合物加热和搅拌15h。将饱和EDTA(20mL)添加至混合物中，搅拌1h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(2×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以产生产物(280mg，22.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):663.3[(M+H)+]。
将(3R,4S)-3-[[2-[5-[[(1-叔丁基吡唑-4-羰基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(320mg，483μmol，1当量)添加至4N HCl/EA(6mL)中，并且在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌10min。将反应混合物真空浓缩以产生产物(310mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):563.2[(M+H)+]。
将1-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑-4-甲酰胺(310mg，551μmol，1当量)、多聚甲醛(165.5mg，5.51mmol，10当量)、氰基硼氢化钠(103.9mg，1.65mmol，3当量)、乙酸(5.51mmol，315μL 10当量)在甲醇(10mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在50℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h。将反应混合物倾倒至碳酸氢钠(饱和水溶液，20mL)中。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(2×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化，并且通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×50mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O ETOH]；B％：50％)来拆分对映异构体以提供产物。
化合物408B：获得了呈白色固体的叔丁基-N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-1-甲基-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑-4-甲酰胺(69.1mg，32.6％产率，99.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):577.3[(M+H)+]。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)8.98(t,J＝5.6Hz,1H),8.35(s,1H),7.99-7.84(m,2H),7.13(t,J＝8.1Hz,1H),6.90(d,J＝8.3Hz,1H),6.32(d,J＝7.9Hz,1H),5.97(br d,J＝8.8Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),5.05-4.73(m,3H),3.91-3.69(m,1H),2.74-2.68(m,1H),2.36-2.27(m,2H),2.23(s,3H),2.17(br d,J＝9.6Hz,1H),2.00-1.95(m,1H),1.83(br s,1H),1.55(s,9H)。
化合物409B：获得了呈白色固体的叔丁基-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-4-氟-1-甲基-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑-4-甲酰胺(56.6mg，26.8％产率，99.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):577.3[(M+H)+]。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ＝9.00(t,J＝5.6Hz,1H),8.36(s,1H),7.98-7.86(m,2H),7.21-7.08(m,1H),6.91(d,J＝8.4Hz,1H),6.33(d,J＝7.9Hz,1H),6.00(br d,J＝8.8Hz,1H),5.52(q,J＝8.8Hz,2H),5.05-4.73(m,3H),3.93-3.68(m,1H),2.69(br s,1H),2.35(br s,2H),2.25(brs,3H),2.19(br d,J＝8.3Hz,1H),2.02-1.82(m,2H),1.56(s,9H)。
实施例161：化合物410B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺。
将先前制备的[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(0.5g，1.1mmol，1当量，2HCl)和先前制备的1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]吡咯-3-甲酸(280mg，1.34mmol，1.2当量)、[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基-六氟磷酸铵(470mg，1.67mmol，1.5当量)和1-甲基咪唑(3.35mmol，270μL 3当量)在乙腈(6mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在20℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h。将混合物过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将这个残余物用水(50mL)稀释，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10:1至1:1，DCM:甲醇＝20:1，Rf＝0.5)来纯化以产生产物(0.5g，70.4％产率)。
将N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]吡咯-3-甲酰胺(0.2g，35μmol，1当量)、顺式-(3R,4S)-3-氨基-4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(231mg，1.06mmol，3当量)、碳酸铯(345mg，1.06mmol，3当量)和第3代XPhos钯(89.7mg，106μmol，0.3当量)在THF(2mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在110℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌15h。将反应混合物通过添加水(20mL)来淬灭，并且用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝10:1，Rf＝0.1)来纯化以产生产物(0.06g，24.1％产率)。
向(3R,4S)-4-氟-3-[[2-[5-[[[1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]吡咯-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(80mg，114μmol，1当量)在EA(2mL)中的溶液中添加HCl/EA(4M，6mL，210当量)。在20℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物真空浓缩以产生产物(50mg，68.7％产率，HCl)。
向N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]吡咯-3-甲酰胺(50mg，78.1μmol，1当量，HCl)、多聚甲醛(23.5mg，781μmol，10当量)在甲醇(2mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(14.7mg，234μmol，3当量)和乙酸(781μmol，45μL 10当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(10mL)来淬灭，并且用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1，Rf＝0.3)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1R,2R)-2-甲氧基环戊基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(21mg，40.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.73-8.62(t,J＝5.6Hz,1H),7.87(s,1H),7.53-7.43(m,1H),7.18-7.08(t,J＝8.0Hz,1H),6.95-6.83(m,2H),6.57-6.45(m,1H),6.37-6.26(d,J＝7.6Hz,1H),6.05-5.93(d,J＝8.8Hz,1H),5.58-5.42(dt,J＝8.8Hz,2H),5.03-4.81(m,1H),4.77-4.70(d,J＝5.6Hz,2H),4.37-4.25(dt,J＝8.0Hz,1H),3.90-3.71(m,2H),3.19(s,3H),2.79-2.68(m,1H),2.59-2.53(m,1H),2.35-2.22(br s,4H),2.22-2.10(m,2H),2.09-1.92(m,2H),1.90-1.66(m,4H),1.64-1.54(m,1H)1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.87-8.69(t,J＝5.6Hz,1H),7.81(s,1H),7.53-7.39(m,1H),7.20-7.04(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.76(m,2H),6.55-6.42(m,1H),6.37-6.20(d,J＝8.0Hz,1H),5.58-5.36(dt,J＝8.8Hz,2H),5.01-4.78(m,1H),4.74-4.66(m,2H),4.38-4.17(dt,J＝8.0Hz,1H),3.89-3.72(m,2H),3.16(s,3H),2.72-2.62(m,1H),2.31-2.23(m,1H),2.22-2.09(m,5H),2.07-1.90(m,3H),1.87-1.64(m,4H),1.62-1.52(m,1H)。
实施例162：化合物411B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺；化合物412B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺和化合物413B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺。
向先前制备的1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酸(387.7mg，1.96mmol，2当量)在DMF(4mL)中的溶液中添加TEA(9.78mmol，1.36mL，10当量)和HATU(743.6mg，1.96mmol，2当量)，随后添加(3-(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲胺盐酸盐(450mg，978μmol，1当量，2HCl)。在25℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物倾倒至水(200mL)中，接着用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(60mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20/1至2/1)来纯化以产生呈黄色固体的产物(450mg，88.3％产率)。LCMS(ES+,m/z):522.2[(M+H)+]。
向1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-N-((3-(4-硝基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(350mg，671μmol，1当量)在乙醇(15mL)和水(1.5mL)中的溶液中添加铁粉(112.5mg，2.01mmol，3当量)和氯化铵(215.4mg，4.03mmol，6当量)，并且在90℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物过滤，并且倾倒至水(100mL)中，接着用EA(80mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE:EA＝10:1至1:2)来纯化以产生呈黄色固体的产物(200mg，60.6％产率)。LCMS(ES+,m/z):492.2[(M+H)+]。
向N-((3-(4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(150mg，305μmol，1当量)和1-叔丁基-3-氟-哌啶-4-酮(192mg，916μmol，3当量，HCl)在乙醇(12mL)中的溶液中添加乙醇钛(3.05mmol，630μL 10当量)。将反应加热至50℃，并且搅拌16h，接着添加氰基硼氢化钠(95.9mg，1.53mmol，5当量)，并且在50℃下将反应搅拌1h。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠溶液(250mL)中，接着用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：30％-56％，8min)来纯化以产生是白色固体的呈外消旋物形式的顺式产物(70mg，35.4％产率)，以及呈白色固体的外消旋反式异构体(14.6mg，22.51μmol，7.4％产率)。LCMS(ES+,m/z):649.3[(M+H)+]。
化合物411B：反式-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(14.6mg，22.51μmol，7.4％产率)，白色固体。LCMS(ES+,m/z):649.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98(t,J＝5.62Hz,1H),8.29(s,1H),7.93(s,1H),7.77(s,1H),7.10(t,J＝8.07Hz,1H),6.84(br d,J＝8.44Hz,1H),6.28(d,J＝7.70Hz,1H),6.11(br d,J＝8.19Hz,1H),5.50(q,J＝8.76Hz,2H),4.78(d,J＝5.62Hz,2H),4.39-4.62(m,1H),3.41-3.60(m,3H),3.28-3.30(m,1H),3.19(s,3H),2.93(br d,J＝9.78Hz,1H),2.11-2.23(m,2H),1.98-2.09(m,1H),1.51(s,6H),1.32-1.43(m,1H),1.05(s,9H)。
通过SFC(柱：REGIS(s,s)WHELK-O1(250mm×50mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2OEtOH]；B％：39％)来拆分外消旋顺式异构体。
化合物412B：顺式-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(24mg，33.9％产率)。LCMS(ES+,m/z):592.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98(t,J＝5.62Hz,1H),8.29(s,1H),7.91(d,J＝15.89Hz,2H),7.11(t,J＝8.01Hz,1H),6.88(br d,J＝8.31Hz,1H),6.28(d,J＝7.82Hz,1H),5.95(br d,J＝7.82Hz,1H),5.50(q,J＝8.76Hz,2H),4.73-4.94(m,3H),3.47-3.69(m,3H),3.19(s,4H),3.02(br d,J＝8.56Hz,1H),2.36-2.44(m,1H),2.22(br t,J＝10.09Hz,1H),1.83-1.97(m,1H),1.65-1.78(m,1H),1.51(s,6H),1.04(br s,9H)。
化合物413B：顺式-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1-叔丁基-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(21.2mg，29.9％产率)，呈白色固体形式。LCMS(ES+,m/z):592.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98(t,J＝5.62Hz,1H),8.29(s,1H),7.91(d,J＝15.89Hz,2H),7.11(t,J＝8.01Hz,1H),6.88(br d,J＝8.31Hz,1H),6.28(d,J＝7.82Hz,1H),5.95(br d,J＝7.82Hz,1H),5.50(q,J＝8.76Hz,2H),4.73-4.94(m,3H),3.47-3.69(m,3H),3.19(s,4H),3.02(br d,J＝8.56Hz,1H),2.36-2.44(m,1H),2.22(br t,J＝10.09Hz,1H),1.83-1.97(m,1H),1.65-1.78(m,1H),1.51(s,6H),1.04(br s,9H)。
化合物414B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺和化合物415B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺：使用用于制备先前描述的类似类似物的相同程序制备该等类似物。
化合物414B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(32.2mg，20.0％产率，99.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):575.6[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(br t,J＝5.7Hz,1H),7.86(s,1H),7.54(s,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.99(t,J＝2.6Hz,1H),6.89(d,J＝8.4Hz,1H),6.50(br s,1H),6.31(d,J＝7.9Hz,1H),5.96(br d,J＝8.8Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),5.00-4.83(m,1H),4.73(d,J＝5.6Hz,2H),3.88-3.68(m,1H),2.75-2.66(m,1H),2.33-2.30(m,1H),2.22(s,3H),2.16(br d,J＝10.3Hz,1H),1.96(br d,J＝10.9Hz,2H),1.86(br d,J＝17.9Hz,1H),1.49(s,9H)。
化合物415B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
(55.8mg，34.9％产率，100％纯度)，呈黄色固体形式。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(t,J＝5.6Hz,1H),7.86(s,1H),7.54(s,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.99(t,J＝2.5Hz,1H),6.89(d,J＝8.3Hz,1H),6.50(d,J＝2.2Hz,1H),6.31(d,J＝7.9Hz,1H),5.96(brd,J＝8.6Hz,1H),5.51(q,J＝9.0Hz,2H),5.00-4.83(m,1H),4.73(d,J＝5.6Hz,2H),3.94-3.68(m,1H),2.72-2.66(m,1H),2.47-2.44(m,1H),2.32(br d,J＝7.6Hz,1H),2.22(s,3H),2.16(br d,J＝10.9Hz,1H),2.01-1.83(m,2H),1.49(s,9H)。
实施例163：化合物416B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲基丁烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺。
向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(0.5g，3.96mmol，1当量)和2-甲基丁-2-醇(27.4mmol，3mL，6.92当量)的混合物中添加硫酸(4.04mmol，220μL1.02当量)，并且在90℃下，在氮气下，将反应加热12h。将残余物真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(TFA条件，柱：Nano-micro Kromasil C18 100×40mm 10um；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：1％-44％，8min)来纯化以提供产物(110mg，604μmol，15.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):183.1[(M+H)+]。使用用于类似酯的标准条件(氢氧化钠、甲醇、水)使以上酯皂化。
按照方法D，使胺1(100mg，160μmol，1当量，2HCl)与1-(1,1-二甲基丙基)吡唑-4-甲酸(58.4mg，320μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲基丁烷-2-基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(25mg，26.1％产率，98.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):591.3.[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.97(br t,J＝5.62Hz,1H),8.31(s,1H),7.94(s,1H),7.89(s,1H),7.15-7.08(m,1H),6.88(d,J＝8.38Hz,1H,6.28(d,J＝7.94Hz,1H),6.03(br d,J＝8.60Hz,1H),5.60-5.93(m,2H),4.95-4.71(m,3H),3.67-3.51(m,1H),3.05(br s,1H),2.81(br s,1H),2.20(br s,4H),2.13-1.93(m,2H),1.84(q,J＝7.28Hz,2H),1.68(br d,J＝10.14Hz,1H),1.51(s,6H),0.61(t,J＝7.39Hz,3H)。
实施例164：化合物417B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺和化合物418B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺。
在20℃下，在氮气下，向先前制备的1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-甲酸(704.3mg，3.57mmol，2当量)和[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲胺(800mg，1.79mmol，1当量，2HCl)在乙腈(1mL)中的混合物中添加1-甲基咪唑(5.36mmol，430μL 3当量)，接着添加[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基六氟磷酸铵(751.4mg，2.68mmol，1.5当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:0至0:1)来纯化以提供酰胺产物(860mg，1.55mmol，86.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):554.2[(M+H)+]。
将N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(200mg，361μmol，1当量)和(3R,4S)-3-氨基-4-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(236.2mg，1.08mmol，3当量)、碳酸铯(352.6mg，1.08mmol，3当量)和第3代XPhos Pd(91.6mg，108.2μmol，0.3当量)在THF(4mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在密封管中，在110℃下将混合物搅拌12h。将混合物冷却至20℃，并且在20℃下真空浓缩。将残余物倾倒至EDTA(20mL，饱和水溶液)中，并且搅拌1h。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:2)来纯化以产生产物(10mg)。LC-MS(ES+,m/z):592.4[(M+H)+]。
向(3R,4S)-4-氟-3-[[2-[5-[[[1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(10mg，13.7μmol，1当量，HCl)在HCl/EA(4M，1mL，1当量)中的混合物中。在20℃下将混合物搅拌30min。将反应浓缩以产生粗产物(7mg)。
向N-[[3-[4-[[(3R,4S)-4-氟-3-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-甲酰胺(7mg，12μmol，1当量)和多聚甲醛(3.6mg，118μmol，10当量)在甲醇(1mL)中的溶液中添加氰基硼氢化钠(2.2mg，36μmol，3当量)和乙酸(118μmol，7μL 10当量)，并且在50℃下将反应搅拌1h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(30mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化。接着将如上制备的更大规模的一批外消旋物质通过SFC来纯化以拆分对映异构体。
化合物417B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺，LC-MS(ES+,m/z):606.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.66(t,J＝5.73Hz,1H),7.87(s,1H),7.51(t,J＝1.87Hz,1H),7.17-7.07(m,1H),6.96(t,J＝2.65Hz,1H),6.89(d,J＝8.16Hz,1H),6.58-6.42(m,1H),6.31(d,J＝7.94Hz,1H),5.98(brd,J＝8.60Hz,1H),5.51(q,J＝8.97Hz,2H),5.03-4.80(m,1H),4.73(d,J＝5.73Hz,2H),3.88-3.70(m,1H),3.46(s,2H),3.21(s,3H),2.76-2.67(m,1H),2.61-2.55(m,1H),2.34-2.20(m,4H),2.15(br s,1H),2.02-1.79(m,2H),1.47(s,6H)。
化合物418B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-4-氟-1-甲基哌啶-3-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺，LC-MS(ES+,m/z):606.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.66(t,J＝5.73Hz,1H),7.87(s,1H),7.56-7.45(m,1H),7.18-7.08(m,1H),6.96(t,J＝2.54Hz,1H),6.89(d,J＝8.38Hz,1H),6.23-6.46(m,1H),6.31(d,J＝7.94Hz,1H),5.98(br d,J＝8.82Hz,1H),5.51(q,J＝8.82Hz,2H),4.99-4.82(m,1H),4.73(d,J＝5.51Hz,2H),3.86-3.71(m,1H),3.46(s,2H),3.21(s,3H),2.72-2.66(m,1H),2.62-2.54(m,1H),2.34-2.20(m,4H),2.15(br s,1H),2.01–1.79(m,2H),1.47(s,6H)。
实施例165：化合物422B：5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺
按照方法E，使胺1(70mg，121μmol，1当量，HCl)和5-叔丁基噻吩-2-甲酸(33.4mg，181μmol，1.5当量)偶联。将粗品通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10/1)来纯化以提供呈白色固体的5-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]噻吩-2-甲酰胺(30.6mg，41.1％产率，96.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):593.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.31(t,J＝5.56Hz,1H),7.89(s,1H),7.68(d,J＝3.80Hz,1H),7.12(t,J＝8.00Hz,1H),6.99(d,J＝3.80Hz,1H),6.88(d,J＝8.30Hz,1H),6.28(d,J＝7.96Hz,1H),6.03(d,J＝8.20Hz,1H),5.50(q,J＝8.76Hz,2H),4.75-4.93(m,3H),3.50-3.69(m,1H),3.03(t,J＝10.40Hz,1H),2.81(d,J＝10.14Hz,1H),2.15-2.35(m,4H),1.93-2.15(m,2H),1.68(d,J＝10.64Hz,1H),1.35(s,9H)。
实施例166：化合物423B：1-(2-环丙基丙烷-2-基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
在0℃下，向2-环丙基丙-2-胺(150mg，1.11mmol，1当量，HCl)在DCE(4.5mL)、乙酸(0.9mL)和水(2.7mL)中的溶液中添加乙酸钠(136mg，1.66mmol，1.5当量)，接着在0℃下将混合物搅拌0.5h，随后添加2,5-二甲氧基四氢呋喃(1.11mmol，143μL 1当量)，并且接着在90℃下将混合物加热和搅拌12h。将反应混合物倾倒至水(100mL)中，接着用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(80mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Welch Xtimate C18 150×25mm×5um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：40％-70％，8min)来纯化以产生所需吡咯产物(100mg，60.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):150.1[(M+H)+]。
在0℃下，向1-(1-环丙基-1-甲基-乙基)吡咯(100mg，670.10μmol，1当量)在THF(3mL)中的溶液中添加2,2,2-三氯乙酰氯(2mmol，220μL3当量)，接着在70℃下将混合物搅拌7h。将反应混合物倾倒至饱和碳酸钠溶液(150mL)中，接着用DCM(3×80mL)萃取。将合并的有机相用盐水(80mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝5:1，Rf＝0.62)来纯化以产生酮产物(100mg，50.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):295.9[(M+H)+]。
向2,2,2-三氯-1-[1-(1-环丙基-1-甲基-乙基)吡咯-3-基]乙酮(150mg，509μmol，1当量)在THF(3mL)中的溶液中添加氢氧化钠(6M，250μL 3当量)，接着在25℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物用HCl溶液(1.0M)酸化至pH＝5，接着用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，接着过滤，并且真空浓缩以产生产物(80mg，粗品)，LC-MS(ES+,m/z):194.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(90mg，180μmol，1当量，2HCl)和1-(1-环丙基-1-甲基-乙基)吡咯-3-甲酸(87.1mg，451μmol，2.5当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.3)来纯化，并且通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-50％，8min)来进一步纯化以产生所需产物1-(2-环丙基丙烷-2-基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(30mg，27.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):620.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.76-8.58(t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.68-7.52(m,1H),7.18-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),7.05-7.02(t,J＝2.4Hz,1H),6.91-6.84(d,J＝7.6Hz,1H),6.56-6.46(m,1H),6.31-6.25(d,J＝8.0Hz,1H),6.12-5.97(d,J＝8.4Hz,1H),5.57-5.37(dt,J＝8.4Hz,2H),4.93-4.67(m,3H),3.64-3.56(m,1H),3.09-3.01(m,1H),2.86-2.78(m,1H),2.33-2.16(m,4H),2.13-1.93(m,2H),1.73-1.64(m,1H),1.37(S,6H),1.26-1.16(m,1H),0.54-0.34(m,4H)。
实施例167：化合物424B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-羟基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
在-20℃下，在氮气下，向5-乙酰基噻吩-2-甲酸(2g，11.8mmol，1当量)在THF(10mL)中的混合物中添加溴(甲基)镁(3M，9.8mL，2.5当量)。在-20℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物通过缓慢添加氯化铵(饱和溶液，10mL)来淬灭，接着用HCl(12M)稀释至pH<5，并且用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈白色固体的5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(1.9g，粗品)。
按照方法B，使5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(96.6mg，519μmol，1.2当量)与胺1(200mg，432μmol，HCl)偶联。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝1:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酰胺(55mg，20.2％产率，94.5％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):595.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.27(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.66(d,J＝3.9Hz,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.97(d,J＝3.8Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(brd,J＝8.3Hz,1H),5.62(s,1H),5.50(q,J＝9.0Hz,2H),4.94-4.76(m,3H),3.68-3.52(m,1H),3.07(br s,1H),2.84(br s,1H),2.22(br s,4H),2.12-1.90(m,2H),1.69(br d,J＝10.1Hz,1H),1.50(s,6H)。
实施例168：化合物425B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-羟基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
在60℃下，在一氧化碳氛围下，将1-(4-溴-2-噻吩基)乙酮(2.5g，12.2mmol，1当量)、甲醇(5mL)、DMF(1mL)、Pd(dppf)Cl2(2.68g，3.66mmol，0.3当量)和TEA(61mmol，85.mL，5当量)的溶液搅拌1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(10mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的5-乙酰基噻吩-3-甲酸甲酯(1.5g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):185.2[(M+H)+]。
向5-乙酰基噻吩-3-甲酸甲酯(1.5g，8.14mmol，1当量)在甲醇(20mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，60mL，22当量)，并且在25℃下将反应搅拌2h。将混合物用HCl(3M，10mL)酸化至pH约3，并且接着用DCM(2×10mL)萃取。将有机相用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤，接着经硫酸钠干燥，并且真空移除溶剂以产生呈黄色固体的5-乙酰基噻吩-3-甲酸(900mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):171.1。
在-20℃下，持续0.5h向5-乙酰基噻吩-3-甲酸(600mg，3.53mmol，1当量)在THF(5mL)中的溶液中添加溴(甲基)镁(3M，2.94mL，2.5当量)。接着将反应升温，并且在20℃下搅拌2.5h。将混合物用氯化铵(10mL)淬灭，并且添加HCl(3M，5mL)直至pH约3。将混合物用DCM(2×10mL)萃取，并且将有机相用水(10mL)、盐水(10mL)洗涤，接着用硫酸钠干燥。真空移除溶剂以提供呈黄色固体的5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(300mg，粗品)。
按照方法E，使胺1(80mg，160μmol，1当量，2HCl)和5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(59.7mg，320μmol，2当量)偶联。将粗反应通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以提供呈白色固体的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酰胺(20mg，19.7％产率，94％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):595.6[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.16(t,J＝5.5Hz,1H),8.15(s,1H),8.01(d,J＝1.1Hz,1H),7.90(s,1H),7.35(d,J＝1.1Hz,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(d,J＝8.4Hz,1H),5.58(s,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.90(br s,1H),4.79(d,J＝5.7Hz,2H),3.71-3.48(m,1H),3.05(br t,J＝10.3Hz,1H),2.82(br d,J＝10.1Hz,1H),2.35-2.27(m,1H),2.20(s,3H),2.14-1.95(m,2H),1.68(br d,J＝10.6Hz,1H),1.52(s,6H)。
实施例169：化合物426B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺。
在0℃下，在氮气下，向(1-氨基环丙基)甲醇(3g，24.3mmol，1当量，HCl)在DCE(20mL)、乙酸(4mL)和水(12mL)中的混合物中添加乙酸钠(2.99g，36.4mmol，1.5当量)。接着添加2,5-二甲氧基四氢呋喃(3.21g，24.28mmol，3.15mL，1当量)，并且将反应加热至90℃并搅拌16h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(饱和，100mL)中。将水相用DCM(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(FA条件，柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：1％-30％，8min)来纯化以提供呈黄色油状物的(1-吡咯-1-基环丙基)甲醇(2.2g，16mmol，66.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):138.2[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向(1-吡咯-1-基环丙基)甲醇(2.2g，16mmol，1当量)在DMF(20mL)中的混合物中添加氢化钠(1.92g，48.1mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(32.1mmol，2mL，2当量)。在20℃下将混合物搅拌1h 30min。将残余物倾倒至氯化铵(饱和溶液，100mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(饱和溶液，30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的甲基醚1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯(2.9，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):152.2[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯(2g，13.2mmol，1当量)在THF(30mL)中的混合物中一次性添加2,2,2-三氯乙酰氯(39.7mmol，4.43mL，3当量)。在70℃下将混合物搅拌16h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(饱和，100mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝100/，95/5)来纯化以提供呈红棕色油状物的酮2,2,2-三氯-1-[1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-基]乙酮(580mg，14.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):296.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.86(t,J＝1.9Hz,1H),7.03(dd,J＝2.1,3.1Hz,1H),6.65(dd,J＝1.8,3.1Hz,1H),3.50(s,2H),3.22(s,3H),1.22-1.14(m,2H),1.07-0.99(m,2H)。
在20℃下，在氮气下，向2,2,2-三氯-1-[1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-基]乙酮(580mg，1.96mmol，1当量)在THF(3mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(3M，2.10mL，3.25当量)。在20℃下将混合物搅拌3h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1，30mL)中。将水相用DCM(3×10mL)萃取。通过添加1M HCl将水相调整至pH＝5～6，接着用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈棕色固体的1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(300mg，粗品)。
按照方法A，使胺1(200mg，432μmol，1当量，HCl)与1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(101.2mg，519μmol，1.2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝8:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酰胺(77.2mg，29.6％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):604.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.71(t,J＝5.7Hz,1H),7.90(s,1H),7.45(s,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.92-6.85(m,2H),6.46(br s,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.06(brd,J＝8.5Hz,1H),5.51(q,J＝8.7Hz,2H),4.92-4.78(m,1H),4.72(br d,J＝5.6Hz,2H),3.72-3.52(m,1H),3.46(s,2H),3.21(s,3H),3.05(br s,1H),2.83(br d,J＝9.4Hz,1H),2.20(br s,4H),2.11(br s,1H),2.05-1.96(m,1H),1.68(br d,J＝10.1Hz,1H),1.12-1.07(m,2H),1.03-0.97(m,2H)。
实施例170：化合物427B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲基丁烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺
向2-甲基丁-2-胺(57.4mmol，6.70mL，1当量)在DCE(20mL)、水(12mL)和乙酸(4mL)中的溶液中添加乙酸钠(7.06g，86mmol，1.5当量)。将混合物搅拌30min，接着将2,5-二甲氧基四氢呋喃(57.3mmol，7.4mL，1当量)添加至混合物中。在90℃下将混合物搅拌11.5h。将反应混合物倾倒至碳酸钠(饱和水溶液，10mL)中。将反应混合物用水(100mL)稀释，并且用100mL EA(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生产物(200mg，1.46mmol，2.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):138.1[(M+H)+]。
在0℃下，向1-(1,1-二甲基丙基)吡咯(200mg，1.46mmol，1当量)在THF(3mL)中的溶液中添加2,2,2-三氯乙酰氯(4.37mmol，490μL 3当量)，接着在70℃下将反应搅拌3h。将反应混合物倾倒至碳酸钠(饱和，10mL)中。将反应混合物用水(10mL)稀释，并且用EA(2×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC来纯化以产生产物(80mg，19.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):281.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.86(t,J＝1.9Hz,1H),7.16(dd,J＝2.4,3.1Hz,1H),6.75(dd,J＝1.8,3.1Hz,1H),1.81(q,J＝7.4Hz,2H),1.52(s,6H),0.64(t,J＝7.4Hz,3H)。
向2,2,2-三氯-1-[1-(1,1-二甲基丙基)吡咯-3-基]乙酮(80mg，283μmol，1当量)在THF(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，2mL，21当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将2MHCl添加至混合物中直至pH 6-7。将反应混合物用60mL EA(2×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生产物(50mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):182.1[(M+H)+]。
按照方法E，使1-(1,1-二甲基丙基)吡咯-3-甲酸(40mg，221μmol，1当量)与胺1(144.7mg，231.8μmol，1.1当量，2HCl)偶联。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲基丁烷-2-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(28.6mg，21.1％产率，94.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):590.3[(M+H)+]。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ＝8.66(br t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.51(s,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.98-6.83(m,2H),6.52(br d,J＝1.6Hz,1H),6.29(d,J＝7.8Hz,1H),6.02(br d,J＝8.3Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.93-4.72(m,3H),3.71-3.46(m,1H),3.04(br t,J＝10.6Hz,1H),2.82(br d,J＝9.9Hz,1H),2.29(br d,J＝13.0Hz,1H),2.20(s,3H),1.92-2.12(m,2H),1.81-1.67(m,3H),1.47(s,6H),0.62(m,3H)。
实施例171：化合物428B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基环丙基)-1H-吡咯-3-甲酰胺。
在0℃下，在氮气下，向1-甲基环丙胺(2g，18.6mmol，1当量，HCl)在DCE(20mL)、乙酸(4mL)和水(12mL)中的混合物中添加乙酸钠(2.29g，27.9mmol，1.5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加2,5-二甲氧基四氢呋喃(18.6mmol，2.4mL，1当量)，并且接着加热至90℃并搅拌16h。将残余物倾倒至氢氧化钠(2M，20mL)中。将水相用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，接着过滤，并且在不加热下在弱真空下浓缩以提供呈黄色液体的产物(2g，粗品)，其用于下一步骤。LC-MS(ES+,m/z):122.1[(M+H)+]。
将1-(1-甲基环丙基)吡咯(2g，16.5mmol，1当量)溶解于THF(10mL)中，并且在0℃下用2,2,2-三氯乙酰氯(99mmol，11.1mL，6当量)处理，接着加热至70℃，并且搅拌16h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(30mL)中。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：50％-80％，8min)来纯化以提供呈黄色油状物的酮产物(1.5g，34.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):265.9/267.9[(M+H)+]。
在20℃下，向2,2,2-三氯-1-[1-(1-甲基环丙基)吡咯-3-基]乙酮(500mg，1.88mmol，1当量)在THF(3mL)中的混合物中添加氢氧化钠(3M，3mL，4.8当量)，并且将反应搅拌2h。使用HCl(2M)将反应调整至pH＝5。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗品通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(280mg，90.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):166.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(80mg，172.83μmol，1当量，HCl)与1-(1-甲基环丙基)吡咯-3-甲酸(42.83mg，259.25μmol，1.5当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基环丙基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(41.8mg，41.3％产率，98％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):574.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.67(t,J＝5.69Hz,1H),7.88(s,1H),7.46(t,J＝1.96Hz,1H),7.11(t,J＝8.00Hz,1H),6.91-6.82(m,2H),6.46(dd,J＝2.81,1.83Hz,1H),6.28(d,J＝7.82Hz,1H),6.01(d,J＝8.32Hz,1H),5.50(q,J＝8.84Hz,2H),4.93-4.76(m,1H),4.72(d,J＝5.76Hz,2H),3.68-3.50(m,1H),3.10-2.97(m,1H),2.81(d,J＝10.28Hz,1H),2.30-2.17(m,4H),2.13-1.93(m,2H),1.68(d,J＝12.96Hz,1H),1.53-1.45(m,3H),1.08-1.02(m,2H),0.90-0.81(m,2H)。
实施例172：化合物429B：5-氨基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-3-甲酰胺
按照方法E，使5-硝基噻吩-3-甲酸(99.9mg，577μmol，2当量)和胺1 2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(0.2g，288μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生产物(0.1g，59.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):582.1[(M+H)+]。
向N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-硝基-噻吩-3-甲酰胺(90mg，155μmol，1当量)和氯化铵(49.7mg，929μmol，6当量)在乙醇(2mL)和水(0.2mL)中的溶液中添加铁粉(25.9mg，464μmol，3当量)。在90℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(30mL)来淬灭，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(碱性条件：柱：Waters Xbridge Prep OBDC18 150×40mm×10um；流动相：[水(0.05％NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：25％-55％，8min)来纯化以产生所需产物5-氨基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-3-甲酰胺(26mg，46.0μmol，29.7％产率，97.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):552.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.96-8.80(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.21-7.02(m,2H),6.98-6.80(d,J＝8.0Hz,1H),6.37-6.20(m,2H),6.05-5.93(m,1H),5.66(s,2H),5.55-5.46(dt,J＝8.8Hz,2H),4.95-4.64(m,3H),3.68-3.51(m,2H),3.10-3.01(m,2H),2.89-2.78(m,1H),2.30-2.22(m,1H),2.20(s,3H),2.15-1.97(m,3H),1.74-1.61(m,1H)。
实施例173：化合物430B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(丙烷-2-基)-1,3-噁唑-4-甲酰胺
将胺1(2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺)(70mg，126μmol，1当量，2HCl)和2-异丙基噁唑-4-甲酸(23.5mg，151μmol，1.2当量)置于乙腈(2mL)中，向其中添加[氯(二甲基氨基)亚甲基]-二甲基-六氟磷酸铵(53.1mg，189μmol，1.5当量)和1-甲基咪唑(31.1mg，379μmol，30.2μL 3当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(30mL)来淬灭，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：10％-50％，8min)来进一步纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(丙烷-2-基)-1,3-噁唑-4-甲酰胺(0.03g，41.8％产率，99.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):564.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.03-8.93(t,J＝5.6Hz,1H),8.59(s,1H),7.89(s,1H),7.19-7.02(t,J＝8.0Hz,1H),6.92-6.82(d,J＝8.4Hz,1H),6.39-6.20(d,J＝8.0Hz,1H),6.07-5.92(d,J＝8.4Hz,1H),5.57-5.43(dt,J＝8.4Hz,2H),4.92-4.74(m,3H),3.65-3.57(m,1H),3.21-3.12(m,1H),3.07–3.02(m,1H),2.86-2.79(m,1H),2.30-2.18(m,4H),2.17-2.07(m,1H),2.05-1.91(m,1H),1.74-1.66(m,1H),1.37-1.27(d,J＝6.8Hz,6H)。
实施例174：化合物431B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(丙烷-2-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺。
向2-溴噻唑-5-甲酸(1g，4.81mmol，1当量)和2-异丙烯基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(807.8mg，4.81mmol，1当量)在二噁烷(10mL)和水(2.5mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2(392.5mg，481μmol，0.1当量)和碳酸钠(1.53g，14.4mmol，3当量)，接着在100℃下将混合物搅拌15min。将反应混合物倾倒至饱和EDTA溶液(200mL)中，并且搅拌2h，接着用EA(100mL×3)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(100mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈棕色固体的2-(丙-1-烯-2-基)噻唑-5-甲酸(600mg，粗品)。LCMS(ES+,m/z):170.0[(M+H)+]。
向2-(丙-1-烯-2-基)噻唑-5-甲酸(600mg，3.55mmol，1当量)在甲醇(30mL)中的溶液中添加10％Pd(C)(100mg)，接着将混合物用氢气脱气，并且在25℃下，在氢气氛围下搅拌0.5h。将反应混合物过滤，接着倾倒至饱和EDTA溶液(100mL)中，并且搅拌2h，接着将水相用HCl(1.0M)酸化至pH＝4。将混合物用EA(60mL×3)萃取，并且将合并的有机相用盐水(60mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈白色固体的2-异丙基噻唑-5-甲酸(300mg，粗品)。LCMS(ES+,m/z):172.0[(M+H)+]。
按照方法B，使2-异丙基噻唑-5-甲酸(44.6mg，261μmol，2当量)与胺1(70mg，130.37μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.5)来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)-2-异丙基噻唑-5-甲酰胺(20mg，26.5％产率，100％纯度)。LCMS(ES+,m/z):580.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.54(t,J＝5.56Hz,1H)8.35(s,1H)7.89(s,1H)7.12(t,J＝8.07Hz,1H)6.88(d,J＝8.31Hz,1H)6.29(d,J＝7.95Hz,1H)6.01(br d,J＝8.31Hz,1H)5.50(q,J＝8.97Hz,2H)4.77-4.92(m,3H)3.52-3.67(m,1H)2.99-3.11(m,1H)2.83(br d,J＝10.27Hz,1H)2.20(s,4H)2.07-2.16(m,1H)1.94-2.05(m,1H)1.69(br d,J＝10.39Hz,1H)1.34(d,J＝6.85Hz,6H)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6+D2O)δ＝8.30(s,1H)7.82(s,1H)7.12(t,J＝8.01Hz,1H)6.85(d,J＝8.44Hz,1H)6.28(d,J＝7.82Hz,1H)5.45(q,J＝8.80Hz,2H)4.75-4.89(m,3H)3.51-3.64(m,1H)3.29(dt,J＝13.69,6.85Hz,1H)3.01(br t,J＝10.09Hz,1H)2.79(br d,J＝10.64Hz,1H)2.19-2.31(m,1H)2.16(s,3H)2.09(br t,J＝11.31Hz,1H)1.91-2.01(m,1H)1.63-1.71(m,1H)1.32(d,J＝6.85Hz,6H)。
实施例175：化合物432B 2-(二甲基氨基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺。
向2-溴噻唑-5-甲酸(1g，4.81mmol，1当量)和二甲胺盐酸盐(1.96g，24mmol)在二噁烷(10mL)中的溶液中添加碳酸钾(6.64g，48.1mmol，10当量)，接着在密封管中，在110℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：1％-30％，10min)来纯化以产生呈白色固体的化合物2-(二甲基氨基)噻唑-5-甲酸(200mg，1.16mmol，24.2％产率)。LCMS(ES+,m/z):173.0[(M+H)+]。
按照方法B，使2-(二甲基氨基)噻唑-5-甲酸(44.9mg，261μmol，2当量)与胺1(70mg，130μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.46)来纯化以产生呈白色固体的所需产物2-(二甲基氨基)-N-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)噻唑-5-甲酰胺(37.1mg，48.2％产率，98.4％纯度)。LCMS(ES+,m/z):581.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.08(t,J＝5.62Hz,1H)7.91(s,2H)7.12(t,J＝8.01Hz,1H)6.88(d,J＝8.31Hz,1H)6.29(d,J＝7.95Hz,1H)6.02(br d,J＝8.31Hz,1H)5.50(q,J＝8.76Hz,2H)4.73-4.94(m,3H)3.50-3.68(m,1H)3.01-3.13(m,7H)2.83(br d,J＝10.27Hz,1H)2.20(s,4H)2.07-2.15(m,1H)1.95-2.06(m,1H)1.69(br d,J＝11.00Hz,1H)。
实施例176：化合物433B N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-咪唑-4-甲酰胺。
使用从异氰化物合成咪唑的一般性方法，随后进行酯水解来制备所需羧酸。使用方法B，使1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)咪唑-4-甲酸(530.5mg，252μmol，2当量)与胺1(70mg，126μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-咪唑-4-甲酰胺(32.2mg，39.2％产率，95％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):619.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.81(t,J＝5.95Hz,1H),8.00(d,J＝1.32Hz,1H),7.95(d,J＝1.10Hz,1H),7.89(s,1H),7.14-7.07(m,1H),6.88(d,J＝8.38Hz,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.02(br d,J＝8.16Hz,1H),5.50(q,J＝8.89Hz,2H),4.92-4.72(m,3H),3.72-3.63(m,2H),3.56-3.49(m,2H),3.08-2.98(m,1H),2.81(br d,J＝10.36Hz,1H),2.30-2.21(m,2H),2.19(s,3H),2.08-2.18(m,2H),2.08-1.99(m,2H),1.99-1.92(m,2H),1.67(br d,J＝10.36Hz,1H),1.49(s,3H)。
实施例177：化合物434B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
通过氢氧化钠皂化从乙酯制备2-异丙基噻唑-4-甲酸。接着按照方法A，使2-异丙基噻唑-4-甲酸(30.2mg，176μmol，1.1当量)与胺1(88.9mg，160μmol，1当量，2HCl)偶联。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺(20.9mg，22.0％产率，97.9％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):580.3[(M+H)+]。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ＝9.10(t,J＝6.0Hz,1H),8.22(s,1H),7.87(s,1H),7.10(t,J＝8.0Hz,1H),6.86(d,J＝8.2Hz,1H),6.26(d,J＝7.9Hz,1H),5.99(d,J＝8.4Hz,1H),5.48(br d,J＝9.0Hz,2H),4.72-4.90(m,3H),3.48-3.67(m,1H),3.48-3.67(m,1H),3.02(br t,J＝10.1Hz,1H),2.79(br s,1H),2.24-2.34(m,1H),2.18(s,3H),2.07(br d,J＝12.6Hz,1H),1.91-2.03(m,1H),1.66(br d,J＝10.1Hz,1H),1.38(d,J＝6.8Hz,6H)。
实施例178：化合物435B：2-(二甲基氨基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
向2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和二甲胺盐酸盐(980mg，12mmol，5当量)在二噁烷(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(3.32g，24mmol，10当量)，并且在密封管中，在130℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：1％-30％，10min)来纯化以产生呈浅黄色固体的2-(二甲基氨基)噻唑-4-甲酸(120mg，40.0％产率)。LCMS(ES+,m/z):173.0[(M+H)+]。
按照方法B，使2-(二甲基氨基)噻唑-4-甲酸(44.9mg，261μmol，2当量)与胺1(70mg，130.37μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.45)来纯化以提供呈白色固体的所需产物2-(二甲基氨基)-N-((3-(4-(((3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)噻唑-4-甲酰胺(33.2mg，43.3％产率，98.8％纯度)。LCMS(ES+,m/z):581.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.86(t,J＝6.05Hz,1H)7.89(s,1H)7.43(s,1H)7.12(t,J＝8.01Hz,1H)6.88(d,J＝8.31Hz,1H)6.28(d,J＝7.95Hz,1H)6.02(d,J＝8.31Hz,1H)5.50(q,J＝8.97Hz,2H)4.77-4.92(m,3H)3.52-3.67(m,1H)3.02-3.11(m,7H)2.83(br d,J＝10.03Hz,1H)2.20(s,4H)2.12(br t,J＝11.13Hz,1H)1.95-2.06(m,1H)1.69(br d,J＝10.64Hz,1H)。
实施例179：化合物436B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(吗啉-4-基)噻吩-3-甲酰胺
在标准条件下使乙酯皂化以提供羧酸。在20℃下，在氮气下，向吗啉(12.1mmol，1.06mL，5当量)和5-溴噻吩-3-甲酸(500mg，2.41mmol，1当量)在甲苯(6mL)中的混合物中添加二叔丁基-(2-苯基苯基)磷烷(JohnPhos)(144.1mg，483μmol，0.2当量)、二乙酰氧基钯(54.2mg，241.49μmol，0.1当量)、叔丁醇钠(2M，3.6mL，3当量)。接着将反应加热至100℃，并且搅拌16h。将反应倾倒至EDTA(饱和，30mL)中，并且搅拌2h。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：10％-50％，8min)来纯化以产生呈黄色固体的所需中间体(100mg，19.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):214.1[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(80mg，173μmol，1当量，HCl)和5-吗啉代噻吩-3-甲酸(47.9mg，225μmol，1.3当量)偶联。将粗产物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：10％-60％，8min)来纯化以产生呈白色固体的所需产物(27mg，24.6％产率，98％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):622.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.05(t,J＝5.62Hz,1H),8.14(s,1H),7.89(s,1H),7.48(d,J＝1.59Hz,1H),7.12(t,J＝8.01Hz,1H),6.88(d,J＝8.31Hz,1H),6.60(d,J＝1.59Hz,1H),6.29(d,J＝7.95Hz,1H),6.01(d,J＝8.19Hz,1H),5.45-5.56(m,2H),4.71-4.93(m,3H),3.69-3.78(m,4H),3.51-3.68(m,1H),2.98-3.12(m,5H),2.83(d,J＝10.64Hz,1H),2.17-2.30(m,4H),2.07-2.16(m,1H),1.94-2.05(m,1H),1.69(d,J＝9.90Hz,1H)。
实施例180：化合物437B：2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺
向2,2-二甲基丙烷硫代酰胺(300mg，2.56mmol，1当量)和2-氯-3-氧代-丙酸乙酯(404.6mg，2.69mmol，1.05当量)在乙酸(3mL)中的混合物中添加4-甲基苯磺酸水合物(97.4mg，512μmol，0.2当量)。在110℃下将混合物搅拌12h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈浅黄色油状物的噻唑产物(350mg，64.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):214.0[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,氯仿-d)δ＝8.27(s,1H),4.35(q,J＝7.15Hz,2H),1.46(s,9H),1.37(t,J＝7.15Hz,3H)。在标准条件下，使用添加的氢氧化钠(6M，1mL，3.66当量)使在甲醇(1mL)中的2-叔丁基噻唑-5-甲酸乙酯(350mg，1.64mmol，1当量)皂化以提供呈白色固体的羧酸中间体(150mg，粗品)。
按照方法B，使2-叔丁基噻唑-5-甲酸(29mg，156μmol，1.2当量)与胺1(70mg，130.37μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型HPLC(FA,柱：Phenomenex Luna C18200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：10％-60％，8min)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-5-甲酰胺(23.4mg，30.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):594.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm9.55(t,J＝5.62Hz,1H),8.35(s,1H),8.28(s,1H),7.89(s,1H),7.12(t,J＝8.16Hz,1H),6.88(d,J＝8.16Hz,1H),6.29(d,J＝7.94Hz,1H),6.01(d,J＝8.38Hz,1H),5.50(q,J＝9.04Hz,2H),4.75-4.92(m,3H),3.67-3.51(m,1H),3.09-2.99(m,1H),2.81(br d,J＝10.58Hz,1H),2.31-2.16(m,4H),2.14-2.05(m,1H),2.05-1.93(m,1H),1.68(br d,J＝10.58Hz,1H),1.40(s,9H)。
实施例181：化合物438B：2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
向3-溴-2-氧代-丙酸乙酯(1g，5.13mmol，1当量)在乙醇(10mL)中的溶液中添加2,2-二甲基丙烷硫代酰胺(601mg，5.13mmol，1当量)。在80℃下，在回流下，将混合物搅拌16h。将反应混合物倾倒至水(200mL)中，接着用EA(300mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将粗产物通过在25℃下从EA(10mL×3)重结晶来纯化以产生噻唑酯产物(800mg，73.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):214.2[(M+H)+]。
在标准条件下，使用氢氧化钠(75mg，1.88mmol，1当量)使在甲醇(2mL)和水(1mL)中的2-叔丁基噻唑-4-甲酸乙酯(400mg，1.88mmol，1当量)皂化。由此获得的粗产物不经纯化即直接使用。LC-MS(ES+,m/z):186.2[(M+H)+]。使用方法B，使2-叔丁基噻唑-4-甲酸(27.3mg，134μmol，1.2当量)与胺1(60mg，112μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺(30mg，43.9％产率，97％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):594.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.08(t,J＝6.0Hz,1H),8.24(s,1H),7.90(s,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.89(d,J＝8.3Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.01(d,J＝8.3Hz,1H),5.51(q,J＝9.0Hz,2H),4.91-4.77(m,3H),3.68-3.52(m,1H),3.10-2.99(m,1H),2.83(br d,J＝10.5Hz,1H),2.29-2.16(m,4H),2.15-2.07(m,1H),2.05-1.97(m,1H),1.69(br d,J＝10.3Hz,1H),1.46(s,9H)。
实施例182：化合物439B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
在0℃下，向先前制备的5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(0.1g，540μmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加氢化钠(258mg，6.44mmol，60％纯度，12当量)和碘代甲烷(5.37mmol，330μL 10当量)。搅拌混合物，并且在1h内升温至20℃。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(10mL)来淬灭，接着用1N HCl稀释至pH<5，并且用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以产生产物(60mg，52.1％产率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝7.68-7.64(d,J＝4.0Hz,1H),6.95-6.91(d,J＝4.0Hz,1H),3.88(s,3H),3.16(s,3H),1.61(s,6H)。
向5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸甲酯(80mg，373μmol，1当量)在甲醇(5mL)中的溶液中添加氢氧化钠(5M，4mL，54当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(10mL)来淬灭，接着用HCl(1N)稀释至pH<5，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生产物(60mg，80.3％产率)。
按照方法E，使胺1(70mg，126μmol，1.0当量，2HCl)与5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(50.5mg，252μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-60％，8min)来进一步纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺(25mg，32.2％产率，99％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):609.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.45-9.32(t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.76-7.63(d,J＝3.6Hz,1H),7.16-7.03(m,2H),6.95-6.81(d,J＝8.4Hz,1H),6.46-6.21(d,J＝8.0Hz,1H),6.12-5.95(d,J＝8.4Hz,1H),5.58-5.39(dt,J＝8.8Hz,2H),4.93-4.73(m,3H),3.64-3.57(m,1H),3.07-2.99(m,4H),2.87-2.78(m,1H),2.30-2.16(m,4H),2.12-2.04(m,1H),2.04-1.94(m,1H),1.74-1.62(m,1H),1.53(s,6H)。
实施例183：化合物440B：2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噁唑-4-甲酰胺
在90℃下，将2,2-二甲基丙酰胺(3.6g，35.6mmol，1当量)和3-溴-2-氧代-丙酸乙酯(35.6mmol，4.45mL，1当量)在乙醇(50mL)中的混合物搅拌12h。将反应混合物真空浓缩以产生呈黄色固体的产物(8g，粗品)。LC-MS(ES+,m:z):198.5[(M+H)+]。
在25℃下，将2-叔丁基噁唑-4-甲酸乙酯(6.0g，30.4mmol，1当量)和氢氧化钠(3M，30mL)在THF(30mL)中的混合物搅拌1h。将反应混合物用水(30mL)和HCl(12M，10mL)稀释，并且接着用MTBE(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过制备型HLC(柱：Phenomenex luna c18 250mm×100mm×10um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：5％-35％，30min)来纯化。用碳酸钠(饱和水溶液)将HPLC级分调整至pH＝7～8，并且将混合物真空浓缩以移除ACN。接着用HCl(3M)将混合物调整至pH＝3～4，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生所需产物。(0.4g，7.8％产率)，呈黄色油状物形式。LC-MS(ES+,m/z):170.5[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(0.1g，200μmol，1当量，2HCl)与2-叔丁基噁唑-4-甲酸(40.7mg，240μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(EA:TEA＝10:1，Rf＝0.3)来纯化，并且通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-60％，8min)来进一步纯化以产生所需产物2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噁唑-4-甲酰胺(0.035g，30.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):578.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.00-8.90(t,J＝6.0Hz,1H),8.61(s,1H),7.90(s,1H),7.19-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),6.95-6.84(d,J＝8.4Hz,1H),6.36-6.15(d,J＝8.0Hz,1H),6.10-5.96(d,J＝8.4Hz,1H),5.62-5.39(dt,J＝8.8Hz,2H),4.93-4.75(m,3H),3.63-3.58(m,1H),3.08-3.01(m,1H),2.87-2.78(m,1H),2.31-2.17(m,4H),2.15-2.06(m,1H),2.04-1.94(m,1H),1.72-1.57(m,1H),1.38(s,9H)。
实施例184：化合物441B：5-(1-氰基-1-甲基乙基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺
使用用于制备类似甲基醚的相同程序制备羟基酯。在50℃下，将1-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-甲酸甲酯(0.1g，507μmol，1当量)和氢氧化钠(5M，1mL，9.86当量)在甲醇(1mL)中的混合物搅拌2h。用HCl(3M)将反应混合物调整至pH＝3～4。将混合物用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的羧酸产物(0.09g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):184.5[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(0.1g，200μmol，1当量，2HCl)与1-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)吡咯-3-甲酸(44mg，240μmol，1.2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(EA:TEA＝10:1，Rf＝0.1)来纯化，接着通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um)来进一步纯化。(s,1H),7.52(s,1H),7.15-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),6.98-6.91(t,J＝2.4Hz,1H),6.90-6.85(d,J＝8.0Hz,1H),6.52-6.45(m,1H),7.33-6.25(d,J＝7.6Hz,1H),6.10-6.00(d,J＝8.0Hz,1H),5.61-5.41(dt,J＝8.4Hz,2H),5.08(br s,1H),4.92-4.68(m,3H),3.65-3.54(m,1H),3.48(s,2H),3.03(br t,J＝10.0Hz,1H),2.86-2.77(d,J＝10.8Hz,1H),2.31-2.26(m,1H),2.19(s,3H),2.13-2.06(m,1H),2.04-1.95(m,1H),1.71-1.62(m,1H),1.43(s,6H)。
实施例185：化合物442B：5-(1-氰基-1-甲基乙基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向2-(2-噻吩基)乙腈(5g，40.6mmol，4.31mL，1当量)在THF(7mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(4.87g，121.8mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(122mmol，7.6mL，3当量)，接着将反应加热至20℃，并且搅拌1.5h。将残余物倾倒至氯化铵(饱和，30mL)中。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，91/19)来纯化以提供呈白色油状物的产物(3.6g，58.6％产率)。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝7.28(d,J＝0.86Hz,1H),7.27(d,J＝1.10Hz,1H),7.12(dd,J＝3.55,0.98Hz,1H),6.99(dd,J＝5.01,3.67Hz,1H),1.82(s,6H)。
在-78℃下，在氮气下，向2-甲基-2-(2-噻吩基)丙腈(600mg，3.97mmol，1当量)在THF(6mL)中的混合物中逐滴添加叔丁基锂(1.3M，3.80mL，1.2当量)。在-78℃下将混合物搅拌1h，随后逐滴添加在THF(6mL)中的DMF(9.92mmol，760μL 2.5当量)。在-78℃下将混合物搅拌1h。接着将残余物倾倒至氯化铵(20mL，饱和)中。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的产物(600mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):180.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.91(s,1H),7.97(d,J＝3.97Hz,1H),7.43(d,J＝3.97Hz,1H),1.80(s,6H)。
在20℃下，向2-甲基丁-2-烯(42.5mmol，4.5mL，25.4当量)和2-(5-甲酰基-2-噻吩基)-2-甲基-丙腈(300mg，1.67mmol，1当量)在t-BuOH(7.5mL)中的混合物中逐滴添加磷酸钠(二酸)(1.41g，11.7mmol，7当量)和亚氯酸钠(1.37g，18.4mmol，1.13mL，11当量)在水(7mL)中的溶液。在20℃下将混合物搅拌1h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(饱和，20mL)中，并且添加2N HCl以调整pH＝5。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。在20℃下，将粗产物用PE/EA＝5/1湿磨30min以提供呈白色固体的产物(270mg，82.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):196.1[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(80mg，173μmol，1当量，HCl)与5-(1-氰基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(37.1mg，190μmol，1.1当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10/1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物5-(1-氰基-1-甲基乙基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(39.9mg，37.9％产率，99％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):604.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.49(t,J＝5.62Hz,1H),7.89(s,1H),7.78(d,J＝3.91Hz,1H),7.29(d,J＝3.91Hz,1H),7.10(s,1H),6.88(d,J＝8.31Hz,1H),6.28(d,J＝7.82Hz,1H),6.02(d,J＝8.31Hz,1H),5.50(q,J＝8.84Hz,2H),4.72-4.95(m,3H),3.51-3.69(m,1H),3.04(t,J＝9.96Hz,1H),2.82(d,J＝9.90Hz,1H),2.17-2.32(m,4H),2.05-2.15(m,1H),1.93-2.04(m,1H),1.78(s,6H),1.68(d,J＝11.00Hz,1H),1.63-1.73(m,1H)。
实施例186：化合物443B：2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噁唑-5-甲酰胺
在105℃下，在氮气氛围下，将2-氧代丙酸乙酯(1g，8.61mmol，1当量)和4-甲基苯磺酸[羟基(苯基)-碘烷基]酯(HTIB，4.05g，10.3mmol，1.2当量)在三甲基乙腈(7mL)中的溶液搅拌3h，接着将反应冷却至25℃。添加2,6-二甲基吡啶(861μmol，100μL 0.1当量)，再次加热反应，并且在105℃下再搅拌8h。将残余物用水(50mL)稀释，并且用EA(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：40％-80％，8min)来纯化，并且通过HPLC(柱：Phenomenex luna C18(250×70mm，10um)；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：25％-55％，20min)来进一步纯化以产生产物(0.2g，11.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):198.5[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.72(s,1H),4.33-4.23(m,2H),1.33-1.15(m,12H)。
在25℃下，在氮气氛围下，将2-叔丁基噁唑-5-甲酸乙酯(200mg，1.01mmol，1当量)、氢氧化锂水合物(97.9mg，2.33mmol，2.3当量)在THF(1mL)、水(1mL)和乙醇(1mL)中的混合物搅拌2h。将3M HCl添加至混合物中直至pH被调整至3-4。将反应混合物用EA(2×30mL)萃取。因为所需产物保留在水相中，所以将水相冻干以获得粗产物。将残余物在DCM(5mL)中湿磨，并且在25℃下搅拌30min，过滤，并且真空浓缩以产生产物(50mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):170.5[(M+H)+]。按照方法B，使2-(叔丁基)噁唑-5-甲酸(22.7mg，130μmol，1.2当量)与胺1(60mg，108μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物2-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噁唑-5-甲酰胺(26.8mg，42.9％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):578.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.95(t,J＝5.9Hz,1H),8.61(s,1H),7.90(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.03(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(br d,J＝8.9Hz,2H),4.93-4.74(m,3H),3.71-3.51(m,1H),3.04(brt,J＝10.4Hz,1H),2.82(br d,J＝10.8Hz,1H),2.32-2.13(m,4H),2.13-1.95(m,2H),1.69(br s,1H),1.38(s,9H)
实施例187：化合物444B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
按照方法B，使5-异丙基噻吩-2-甲酸与胺1偶联。将粗产物通过反相HPLC来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):579.2[(M+H)+]。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.77(s,1H),9.30–9.12(m,1H),8.07(d,J＝1.4Hz,1H),7.93(s,1H),7.36(s,1H),7.21(t,J＝8.0Hz,1H),7.00(d,J＝8.2Hz,1H),6.38(d,J＝7.9Hz,1H),5.57(d,J＝8.8Hz,1H),5.21(d,J＝47.7Hz,1H),4.84(d,J＝5.6Hz,2H),3.89(s,2H),2.87(d,J＝4.4Hz,3H),2.18(dd,J＝57.3,22.7Hz,2H),1.34(d,J＝6.8Hz,7H)。
实施例188：化合物445B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({噻吩并[2,3-c]吡啶-7-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
将胺1(101.1mg，0.202mmol，1当量)、7-氯噻吩并[2,3-C]吡啶(45.4mg，0.268mmol，1.3当量)、叔丁醇钾(60.5mg，0.539mmol，2.7当量)、第4代BrettPhos-Pd(13.9mg，0.0151mmol，0.075当量)和第3代叔丁基-XPhos(19.4mg，0.0244mmol，0.12当量)置于小瓶中，并且将小瓶用氮气冲洗。添加甲苯(1.2mL)，并且将反应搅拌并加热至80℃，持续1.5h。接着将反应过滤，并且浓缩。将粗产物通过反相HPLC来纯化以提供所需产物N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({噻吩并[2,3-c]吡啶-7-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(15.4mg，13.6％)。LC-MS(ES+,m/z):560.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.02(d,J＝5.3Hz,1H),7.90(d,J＝5.6Hz,2H),7.85(t,J＝5.7Hz,1H),7.49(d,J＝5.3Hz,1H),7.24–7.11(m,2H),6.92(d,J＝8.3Hz,1H),6.32(d,J＝7.8Hz,1H),6.02(d,J＝8.3Hz,1H),5.53(q,J＝8.9Hz,2H),5.04(d,J＝5.6Hz,2H),3.64(d,J＝28.2Hz,1H),3.34(s,1H),3.09(s,1H),2.88(s,1H),2.43–1.90(m,5H),1.74(s,1H),1.29(s,2H)。
实施例189：化合物446B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(1-甲基环丙基)噻吩-2-甲酰胺
向5-溴噻吩-2-甲酸乙酯(3g，12.8mmol，1当量)和2-异丙烯基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(2.14g，12.8mmol，1当量)在二噁烷(30mL)和水(7.5mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(1.04g，1.28mmol，0.1当量)和碳酸钠(4.06g，38.28mmol，3当量)，接着在100℃下将混合物搅拌15min。将反应混合物倾倒至饱和EDTA溶液(200mL)中，并且在25℃下搅拌2h，接着用EA(3×100mL)萃取。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝50:1至10:1，PE:EA＝8:1，Rf＝0.47)来纯化以产生产物(1.7g，67.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):197.0[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，在20min的时期内，向二乙基锌(1M，5.10mL，10当量)在DCM(4mL)中的溶液中逐滴添加TFA(5.10mmol，380μL 10当量)在DCM(2mL)中的溶液，在所述时间期间，将温度维持在0℃以下。逐滴添加二碘代甲烷(2.05g，7.64mmol，15当量)在DCM(2mL)中的溶液，并且将反应再搅拌20min。在0℃下，将5-异丙烯基噻吩-2-甲酸乙酯(0.1g，510μmol，1当量)在DCM(2mL)中的溶液添加至混合物中。在20℃下将反应混合物再搅拌3h。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(50mL)来淬灭，接着用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝10:1，Rf＝0.3)来纯化以产生产物(0.06g，53.2％产率，95％纯度)，LC-MS(ES+,m/z):242.3[(M+H)+]。在标准条件下，使用氢氧化钠(水溶液)和甲醇使酯(60mg，285.32μmol，1当量)皂化以提供羧酸产物(0.03g，57.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):183.4[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(70mg，126μmol，1当量，2HCl)与5-(1-甲基环丙基)噻吩-2-甲酸(46mg，252μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-60％，8min)来进一步纯化以产生所需产物(0.037g，48.7％产率，98％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):591.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.36-9.23(t,J＝5.6Hz,1H),7.96-7.84(s,1H),7.72-7.63(d,J＝3.6Hz,1H),7.19-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.99-6.84(m,2H),6.39-6.18(d,J＝7.6Hz,1H),6.09-5.93(d,J＝8.4Hz,1H),5.59-5.38(dt,J＝8.8Hz,2H),4.94-4.75(m,3H),3.62-3.55(m,1H),3.07-3.00(m,1H),2.82(br d,J＝10.5Hz,1H),2.32-2.15(m,4H),2.14-1.94(m,2H),1.72-1.63(m,1H),1.45(s,3H),0.94(s,4H)。
实施例190：化合物447B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
在-20℃下，在氮气下，向5-乙酰基噻吩-3-甲酸(600mg，3.53mmol，1当量)在THF(10mL)中的混合物中添加溴(甲基)镁(3M，2.9mL，2.5当量)。在-20℃下将混合物搅拌30min，接着加热至20℃，并且搅拌2.5h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(20mL)中，接着添加至HCl(3N)中，并且搅拌3min。将水相用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的产物(600mg，91.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):185.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝12.55(s,1H),8.02(d,J＝1.32Hz,1H),7.18(d,J＝1.32Hz,1H),5.55(s,1H),3.31(s,2H),1.49(s,6H)。
在0℃下，在氮气下，向5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(800mg，4.30mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中添加氢化钠(343.7mg，8.59mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着添加碘代甲烷(21.5mmol，1.34mL，5当量)，并且将反应升温至20℃并搅拌1.5h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(50mL)中，并且搅拌3min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)(饱和)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1:0至0:1)来纯化以产生呈无色油状物的产物(400mg，43.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):183.1[(M+H)+]。
在20℃下，在氮气下，向5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸甲酯(400mg，1.87mmol，1当量)在甲醇(4mL)和水(1mL)中的混合物中一次性添加氢氧化钠(224mg，5.60mmol，3当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将反应倾倒至2N HCl(10mL)中，并且搅拌2min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的产物(200mg，53.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):199.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(80mg，173μmol，1当量，HCl)与5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(41.5mg，207μmol，1.2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10/1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺(22.4mg，20.7％产率，97.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):609.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.21(t,J＝5.29Hz,1H),8.15(d,J＝1.32Hz,1H),7.89(s,1H),7.43(d,J＝1.32Hz,1H),7.17-7.06(m,1H),6.88(d,J＝8.16Hz,1H),6.28(d,J＝7.72Hz,1H),6.01(d,J＝7.94Hz,1H),5.50(q,J＝8.97Hz,2H),4.92-4.75(m,3H),3.68-3.53(m,1H),3.04(s,3H),3.01(s,1H),2.81(d,J＝10.58Hz,1H),2.28(d,J＝13.67Hz,1H),2.19(s,3H),2.11-2.03(m,1H),2.02-1.92(m,1H),1.68(d,J＝13.23Hz,1H),1.54(s,6H)。
实施例191：化合物448B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基环丙基)-1H-吡唑-4-甲酰胺
在20℃和15psi氧气下，向1H-吡唑-4-甲酸甲酯(1g，7.93mmol，1当量)在DCE(20mL)中的混合物中添加2-(2-吡啶基)吡啶(2.48g，15.9mmol，2当量)、乙酸铜、碳酸钠(1.68g，15.9mmol，2当量)、三氟(异丙烯基)硼酸钾(2.35g，15.7mmol，2当量)，接着将反应加热至70℃，并且搅拌12h。将残余物倾倒至EDTA(饱和，20mL)中，并且搅拌120min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，75/25)来纯化以产生呈白色固体的产物(1g，6.02mmol，75.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):167.1[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，将TFA(9.03mmol，670μL 5当量)在DCM(2mL)中的混合物逐滴添加至在DCM(4mL)中的二乙基锌(1M，9mL，5当量)中，并且搅拌20min，接着逐滴添加二碘代甲烷(4.84g，18.1mmol，10当量)在DCM(2mL)中的溶液，并且再搅拌20min。添加1-异丙烯基吡唑-4-甲酸甲酯(300mg，1.81mmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液，并且在20℃下加热16h。将反应用水(20mL)淬灭，接着用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗品通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna 80×30mm×3um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：14％-44％，7min)来纯化以产生呈白色油状物的环丙基产物(50mg，15.4％产率)。
在20℃下，在氮气下，向1-(1-甲基环丙基)吡唑-4-甲酸甲酯(50mg，277μmol，1当量)在甲醇(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(3M，2mL，21.6当量)，并且将反应搅拌2h。向溶液中添加HCl(2N)以达到pH＝5。将反应添加至水(20mL)中，接着用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈白色固体的产物(30mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):167.1[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(60mg，120μmol，1当量，2HCl)与1-(1-甲基环丙基)吡唑-4-甲酸(24mg，144μmol，1.2当量)偶联。将粗品通过制备型TLC(DCM:甲醇＝10:1；Rf＝0.43)来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲基环丙基)-1H-吡唑-4-甲酰胺(23.9mg，32.2％产率，93.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):575.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.99(t,J＝5.7Hz,1H),8.32(s,1H),7.89(d,J＝4.2Hz,2H),7.16-7.05(m,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.03(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.95-4.73(m,3H),3.71-3.51(m,1H),3.09-2.99(m,1H),2.81(d,J＝10.3Hz,1H),2.32-2.16(m,4H),2.13-1.93(m,2H),1.68(d,J＝10.7Hz,1H),1.58(s,3H),1.25-1.17(m,3H),0.99-0.88(m,2H)。
实施例192：化合物449B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1r,3r)-3-甲氧基环丁基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
在0℃下，向3-苯甲基氧基环丁醇(1.0g，5.6mmol，1当量)和TEA(28.1mmol，3.90mL，5当量)在DCM(10mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酰氯(1.60g，8.42mmol，1.5当量)。在25℃下，在氮气下，将混合物搅拌18h。将混合物用水(60mL)稀释，并且用60mL DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20:1至10:1)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(1.7g，87.8％产率，96.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):333.2[(M+H)+]。
向1H-吡咯-3-甲酸甲酯(600mg，4.80mmol，1当量)和碳酸铯(4.69g，14.4mmol，3当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酸(3-苯甲基氧基环丁基)酯(1.76g，5.28mmol，1.1当量)，并且在100℃下，在氮气下，将反应加热16h。将混合物用水(100mL)稀释，并且用(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色油状物的产物(1.4g，粗品)。
在35℃下，在氢气(15Psi)下，将1-(3-苯甲基氧基环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(1.40g，4.91mmol，1当量)和5％Pd(C)(200mg，94.0μmol，1.92e-2当量)在甲醇(10mL)中的混合物搅拌4h。将反应混合物过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20:1至1:1)来纯化以产生呈无色油状物的产物(0.6g，57.1％产率，91.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):196.1[(M+H)+]。
在0℃下，向1-(3-羟基环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(400mg，2.05mmol，1当量)在DMF(4mL)中的溶液中添加氢化钠(122.9mg，3.07mmol，60％纯度，1.5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min。将碘代甲烷(2.66mmol，165μL 1.3当量)添加至混合物中，并且在25℃下，在氮气下，将反应搅拌1h。在0℃下，将混合物用饱和氯化铵(50mL)和EDTA(饱和，50mL)稀释。在25℃下将混合物搅拌1h，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤。经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色油状物的产物(0.45g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):210.1[(M+H)+]。
在50℃下，将1-(3-甲氧基环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(450mg，2.15mmol，1当量)和氢氧化钠(5M，5mL，11.6当量)在甲醇(5mL)中的混合物搅拌1h。在0℃下，将HCl(2M)添加至混合物中以调整pH＝5-6。将混合物用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色固体的产物(0.3g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):196.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝12.69-9.88(m,1H),7.47(t,J＝1.9Hz,1H),6.71-6.68(m,1H),6.66(dd,J＝1.7,2.9Hz,1H),4.81-4.69(m,1H),4.22-4.08(m,1H),3.31(s,3H),2.67-2.50(m,4H)。
按照方法E，使胺1(0.12g，240μmol，1当量，2HCl)与1-(3-甲氧基环丁基)吡咯-3-甲酸(56.3mg，288μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(EA:TEA＝10:1，Rf＝0.2)来纯化，并且通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna 80×30mm×3um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：24％-54％，7min)来进一步纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1r,3r)-3-甲氧基环丁基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(35mg，24.1％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):604.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.78-8.55(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.53(s,1H),7.23-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),6.98-6.91(t,J＝1.6Hz,1H),6.90-6.84(d,J＝8.4Hz,1H),6.63-6.40(t,J＝2.2Hz,1H),6.36-6.23(d,J＝8.0Hz,1H),6.11-5.93(d,J＝8.4Hz,1H),5.61-5.39(dt,J＝8.8Hz,2H),5.00-4.66(m,4H),4.14-3.99(m,1H),3.64-3.54(m,1H),3.19(s,3H),3.04(br t,J＝9.7Hz,1H),2.82(br d,J＝10.0Hz,1H),2.48-2.44(m,4H),2.32-2.17(m,4H),2.14-2.06(m,1H),2.05-1.94(m,1H),1.74-1.59(m,1H)。
实施例193：化合物450B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1s,3s)-3-甲氧基环丁基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
在25℃下，向先前制备的反式1-(3-羟基环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(300mg，1.54mmol，1当量)在DCM(3mL)中的溶液中添加戴斯-马丁高碘烷(Dess-MartinPeriodinane)(977.7mg，2.31mmol，1.5当量)，并且将反应搅拌2h。TLC(PE:EA＝1:1，Rf＝0.3)指示产物的形成。将反应混合物用碳酸钠(饱和，20mL)稀释，并且用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过制备型TLC(PE:EA＝1:1)来纯化以产生呈浅黄色油状物的酮产物(0.2g，67.4％产率)。
在0℃下，向1-(3-氧代环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(0.2g，1.04mmol，1当量)在甲醇(2mL)中的溶液中添加硼氢化钠(195.8mg，5.18mmol，5当量)。在25℃下，在氮气下，将混合物搅拌1h。将反应用水(30mL)稀释，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈浅黄色油状物的顺式产物(0.18g，粗品)。
在0℃下，向顺式1-(3-羟基环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(0.18g，922μmol，1当量)在DMF(4mL)中的溶液中添加氢化钠(55.3mg，1.38mmol，60％纯度，1.5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min。将碘代甲烷(1.20mmol，75μL 1.3当量)添加至反应中，并且在25℃下，在氮气下，将混合物搅拌1h。在0℃下，将混合物用饱和氯化铵(50mL)和EDTA(饱和水溶液，50mL)稀释。在25℃下将混合物搅拌1h，并且用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤。经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色油状物的醚产物(0.15g，粗品)。
在如用于反式异构体的标准条件下使顺式1-(3-甲氧基环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(150mg，717μmol，1当量)皂化以提供呈浅黄色固体的产物羧酸(0.1g，粗品)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝12.63-9.71(m,1H),7.47(s,1H),6.73(t,J＝2.5Hz,1H),6.66-6.62(m,1H),4.27-4.05(m,1H),3.85-3.68(m,1H),3.35-3.22(m,3H),2.91(dtd,J＝3.1,6.8,9.6Hz,2H),2.65-2.50(m,1H),2.38-2.21(m,2H)。
按照方法E，使胺1(0.08g，160μmol，1当量，2HCl)与1-(3-甲氧基环丁基)吡咯-3-甲酸(46.9mg，240μmol，1.5当量)偶联。将粗产物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna 80×30mm×3um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：30％-60％，7min)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[(1s,3s)-3-甲氧基环丁基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(7.3mg，36.2％产率，96.9％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):604.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.77-8.62(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.62-7.47(t,J＝2.0Hz,1H),7.17-7.07(t,J＝8.0Hz,1H),6.95-6.84(m,2H),6.52-6.45(dt,J＝1.6Hz,1H),6.34-6.24(d,J＝7.6Hz,1H),6.11-5.96(d,J＝8.0Hz,1H),5.57-5.38(dt,J＝8.8Hz,2H),4.92-4.71(m,3H),4.40-4.19(m,1H),3.73-3.67(m,1H),3.64-3.55(m,1H),3.21-3.17(t,J＝2.8Hz,3H),3.08-3.00(m,1H),2.86-2.75(m,3H),2.32-2.17(m,4H),2.16-2.06(m,3H),2.05-1.93(m,1H),1.76-1.60(m,1H)。
实施例194：化合物451B：1-(3,3-二氟环丁基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
向先前制备的1-(3-氧代环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(120mg，621μmol，1当量)在DCM(2mL)中的溶液中添加DAST(1.86mmol，245μL3当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝3:1)来纯化以产生二氟代产物(80mg，59％产率)。LC-MS(ES+,m/z):216.0[(M+H)+]。
方法H：在0℃下，向胺1(70mg，153μmol，1当量)在甲苯(2mL)和DCM(2mL)中的溶液中添加三甲基铝(2M，380μL 5当量)，并且将溶液搅拌30min，随后添加1-(3,3-二氟环丁基)吡咯-3-甲酸甲酯(34.6mg，153μmol，1当量)。在50℃下将混合物搅拌6h。将反应混合物倾倒至水(50mL)中，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物1-(3,3-二氟环丁基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(15.2mg，15.1％产率，92.7％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):610.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.73(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.58(d,J＝1.7Hz,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),7.01(t,J＝2.5Hz,1H),6.89(d,J＝8.2Hz,1H),6.57(dd,J＝1.7,2.7Hz,1H),6.29(d,J＝7.8Hz,1H),6.04(br d,J＝8.4Hz,1H),5.51(q,J＝8.6Hz,2H),4.96-4.68(m,4H),3.70-3.53(m,1H),3.24-3.13(m,2H),3.11-2.94(m,3H),2.91-2.80(m,1H),2.36-2.08(m,5H),2.07-1.95(m,1H),1.75-1.65(m,1H)。
实施例195：化合物452B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({1-甲基-1H-吡唑并[4,3-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
向4-氯-1H-吡唑并[4,3-c]吡啶(500mg，3.26mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加氢化钠(195.4mg，4.88mmol，60％纯度，1.5当量)和碘代甲烷(3.91mmol，240μL 1.2当量)，并且在0℃下将反应搅拌2h。将残余物倾倒至饱和氯化铵(10mL)中，并且在0℃下搅拌10min。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化以提供呈黄色固体的产物4-氯-1-甲基-吡唑并[4,3-c]吡啶(250mg，45.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):168.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝8.22(d,J＝6.0Hz,1H),8.17(s,1H),7.29(dd,J＝5.6,6.3Hz,1H),4.13(s,3H)。
向胺1(60mg，141μmol，1当量)和4-氯-1-甲基-吡唑并[4,3-c]吡啶(28.3mg，169μmol，1.2当量)在甲苯(2mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(27mg，281μmol，2当量)和第3代t-Bu-XPhos(11.2mg，14.1μmol，0.1当量)，并且在80℃下将反应搅拌2h。将反应倾倒至EDTA(10mL，饱和)中，并且搅拌2h。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(FA条件)来纯化以提供所需产物(0.022g，24.0％产率，99.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):558.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.31-8.25(t,J＝5.6Hz,1H),8.22(s,1H),7.85(s,1H),7.77-7.62(d,J＝6.0Hz,1H),7.17-7.03(t,J＝8.2Hz,1H),6.92-6.68(t,J＝6.4Hz,2H),6.33-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.05-5.93(d,J＝8.0Hz,1H),5.58-5.36(dt,J＝8.6Hz,2H),5.10-4.96(d,J＝5.6Hz,2H),4.93-4.69(d,J＝49.2Hz,1H),3.95(s,3H),3.65-3.54(m,1H),3.05(br t,J＝10.5Hz,1H),2.86-2.78(m,1H),2.32-2.16(m,4H),2.15-2.07(m,1H),2.04-1.91(m,1H),1.75-1.60(m,1H)。
实施例196：化合物453B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(吗啉-4-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺
向2-溴噻唑-5-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和吗啉(12mmol，1.06mL，5当量)在二噁烷(5mL)中的混合物中添加碳酸钾(3.32g，24mmol，10当量)，并且在110℃下，在氮气下，将反应加热12h。将残余物倾倒至水(30mL)中，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的水相真空浓缩。将混合物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：1％-30％，10min)来纯化以产生产物(260mg，50.5％产率)。
按照方法B，使胺1(70mg，126μmol，1当量，2HCl)和2-吗啉代噻唑-5-甲酸(54.1mg，252μmol，2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(吗啉-4-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺(37.3mg，45.0％产率，94.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):623.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.16(t,J＝5.6Hz,1H),7.94(s,1H),7.90(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.29(d,J＝7.8Hz,1H),6.00(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.95-4.73(m,3H),3.76-3.68(m,4H),3.65-3.52(m,1H),3.50-3.43(m,4H),3.06(br t,J＝10.6Hz,1H),2.83(br d,J＝10.1Hz,1H),2.21(s,4H),2.18-2.07(m,1H),2.06-1.94(m,1H),1.70(br d,J＝9.5Hz,1H)。
实施例197：化合物454B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({1-甲基-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
在0℃下，向在DMF(4mL)中的4-溴-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶(220mg，1.12mmol，1当量)中添加氢化钠(89.3mg，2.23mmol，60％纯度，2当量)，随后将碘代甲烷(1.67mmol，105μL1.5当量)添加至混合物中，并且在0℃下搅拌0.5h。在0℃下将反应混合物通过添加饱和氯化铵(10mL)来淬灭，接着用水(100mL)稀释，并且用EA(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(PE:EA＝2:1)来纯化以产生产物(200mg，84.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):211.1[(M+H)+]。
将4-溴-1-甲基-吡咯并[3,2-c]吡啶(35.6mg，169μmol，1.2当量)、胺1(60mg，141μmol，1当量)、叔丁醇钠(27mg，280μmol，2当量)、第3代t-BuXPhos Pd(11.2mg，14.1μmol，0.1当量)在甲苯(2.5mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在80℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌2h，然后冷却至室温。将EDTA溶液(饱和，100mL)添加至混合物中，并且将混合物搅拌1h。将反应混合物用水(100mL)稀释，并且用EA(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将残余物通过制备型HPLC来进一步纯化以产生所需产物N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({1-甲基-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(20mg，24.6％产率，96.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):557.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.13(s,1H),7.83(s,1H),7.61-7.48(m,2H),7.15(d,J＝3.1Hz,1H),7.11-7.05(m,1H),6.85(d,J＝8.2Hz,1H),6.73(d,J＝6.0Hz,1H),6.65(d,J＝3.1Hz,1H),6.25(d,J＝7.9Hz,1H),5.96(d,J＝8.4Hz,1H),5.46(br d,J＝9.0Hz,2H),4.95(d,J＝5.7Hz,2H),4.90-4.72(m,1H),3.70(s,3H),3.64-3.49(m,1H),3.02(br t,J＝10.0Hz,1H),2.80(brd,J＝10.6Hz,1H),2.32-2.24(m,1H),2.18(s,3H),2.14-2.03(m,1H),2.03-1.89(m,1H),1.65(br d,J＝10.1Hz,1H)。
实施例198：化合物455B：2-{5-[({1-叔丁基-1H-吡唑并[4,3-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺和化合物456B：2-{5-[({2-叔丁基-2H-吡唑并[4,3-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
在90℃下，在氮气下，将4-氯-1H-吡唑并[4,3-c]吡啶(5g，32.6mmol，1当量)和硫酸(33mmol，1.80mL，1.02当量)的混合物在叔丁醇(100mL)中加热12h。将残余物倾倒至碳酸钠(饱和)中以调整pH＝7～8。将水相用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的呈区域异构体的混合物形式的产物(3g，粗品)。
在110℃下，在氮气下，向1-叔丁基-5H-吡唑并[4,3-c]吡啶-4-酮和2-叔丁基-5H-吡唑并[4,3-c]吡啶-4-酮的混合物(3g，15.7mmol，1当量；混合物)中一次性添加三氯氧磷(323mmol，30mL，20.6当量)。在110℃下将混合物搅拌3h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1，100mL)中，随后倾倒至碳酸钠(饱和)中以调整pH＝7～8。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(TFA条件，柱：Phenomenex luna C18(250×70mm，15um)；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：25％-55％，20min)来纯化以提供呈浅黄色固体的1-N-叔丁基异构体(0.5g，15.2％产率)以及呈棕色油状物的2-N-叔丁基异构体(100mg，3.04％产率)。
向胺1(100mg，235μmol，1当量)和1-叔丁基-4-氯-吡唑并[4,3-c]吡啶(59mg，281μmol，1.2当量)在甲苯(2mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(45mg，469μmol，2当量)、第3代叔丁基XPhos(18.6mg，23.5μmol，0.1当量)，并且在80℃下，在氮气下，将反应加热2h。将残余物倾倒至EDTA(饱和，60mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(饱和溶液)(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物1-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡唑并[4,3-c]吡啶-4-胺(22.3mg，15.5％产率，97.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):600.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.30-8.19(m,2H),7.85(s,1H),7.64(d,J＝6.4Hz,1H),7.15-7.07(m,1H),7.01(d,J＝6.2Hz,1H),6.87(d,J＝8.4Hz,1H),6.27(d,J＝7.9Hz,1H),5.99(br d,J＝8.4Hz,1H),5.54-5.41(m,2H),5.00(d,J＝5.7Hz,2H),4.93-4.76(m,1H),3.67-3.52(m,1H),3.05(br s,1H),2.92-2.78(m,1H),2.33-2.14(m,4H),2.03(br s,1H),1.99(br d,J＝9.3Hz,1H),1.71(br d,J＝7.7Hz,1H),1.66(s,9H)。
使用相同条件，利用胺1(100mg，235μmol，1当量)和2-叔丁基-4-氯-吡唑并[4,3-c]吡啶(59mg，281μmol，1.2当量)制备2-叔丁基异构体。将粗反应通过制备型HPLC(FA条件，柱：Phenomenex Luna C18200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]B％：1％-50％，8min)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物化合物456B：2-{5-[({2-叔丁基-2H-吡唑并[4,3-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(20.5mg，14.5％产率，99.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):600.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.63(s,1H),8.28(s,1H),8.12(br s,1H),7.85(s,1H),7.52(d,J＝6.2Hz,1H),7.20-7.04(m,1H),6.87(d,J＝8.4Hz,1H),6.73(d,J＝6.4Hz,1H),6.27(d,J＝7.7Hz,1H),5.97(br d,J＝7.1Hz,1H),5.48(q,J＝8.7Hz,2H),5.02(d,J＝5.7Hz,2H),4.93-4.75(m,1H),3.67-3.50(m,1H),3.07-2.98(m,1H),2.80(br d,J＝10.6Hz,1H),2.31-2.16(m,4H),2.13-2.04(m,1H),2.03-1.93(m,1H),1.68(brd,J＝3.5Hz,1H),1.66(s,9H)。
实施例199：化合物457B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({噻吩并[3,2-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
使用与用于先前描述的其他噻吩并嘧啶区域异构体的条件相同的条件制备该类似物。胺1(105mg，0.21mmol，1当量，HCl盐)和4-氯噻吩并[3,2-c]吡啶(51.8mg，0.305mmol，1.45当量)在反相HPLC之后提供了呈甲酸盐形式的所需产物N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({噻吩并[3,2-c]吡啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺(33.2mg，26.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):600.3[(M+H)+]。1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ8.15(s,1H),8.09(t,J＝5.8Hz,1H),7.85(s,1H),7.79(dd,J＝9.0,5.6Hz,2H),7.71(d,J＝5.5Hz,1H),7.25(d,J＝5.7Hz,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.87(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),5.97(d,J＝8.3Hz,1H),5.48(q,J＝8.9Hz,2H),5.01(d,J＝5.6Hz,2H),4.84(d,J＝49.4Hz,1H),3.60(d,J＝29.7Hz,1H),3.06(t,J＝10.9Hz,1H),2.83(d,J＝11.0Hz,1H),2.41–2.25(m,1H),2.21(d,J＝2.8Hz,3H),2.13(t,J＝11.5Hz,1H),1.99(dd,J＝12.3,3.7Hz,1H),1.68(d,J＝12.9Hz,1H)。
实施例200：化合物458B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(甲氧基甲基)噻吩-2-甲酰胺
按照方法B，胺1(49mg，0.098mmol，1.o0当量)和5-(甲氧基甲基)噻吩-2-甲酸(22.4mg，0.13mmol，1.3当量)在反相HPLC之后提供呈甲酸盐形式的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(甲氧基甲基)噻吩-2-甲酰胺(19.1mg，31％)。LC-MS(ES+,m/z):607.3[(M+H)+]。
实施例201：化合物459B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(吡咯烷-1-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺
在密封管中，在110℃下，将2-溴噻唑-5-甲酸(0.5g，2.40mmol，1当量)、吡咯烷(12mmol，1mL，5当量)和碳酸钾(3.32g，24mmol，10当量)在二噁烷(10mL)中的混合物搅拌12h。将反应混合物用水(10mL)稀释，并且使用HCl(6M)将pH调整至7。将混合物真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 80×40mm×3um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：1％-25％，7min)来纯化以产生产物(0.12g，25.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):199.1[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(80mg，144μmol，1当量，2HCl)与2-吡咯烷-1-基噻唑-5-甲酸(28.6mg，144μmol，1当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-50％，8min)来进一步纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(吡咯烷-1-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺(31mg，34.7％产率，98％纯度)，LC-MS(ES+,m/z):607.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.17-8.99(t,J＝5.6Hz,1H),7.99-7.80(d,J＝5.2Hz,2H),7.17-7.07(t,J＝8.0Hz,1H),6.97-6.77(d,J＝8.4Hz,1H),6.38-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.10-5.97(d,J＝8.0Hz,1H),5.61-5.34(dt,J＝8.2Hz,2H),4.96-4.73(m,3H),3.64-3.55(m,1H),3.40(br s,4H),3.04(br t,J＝10.5Hz,1H),2.82(br d,J＝10.4Hz,1H),2.32-2.17(m,4H),2.16-1.93(m,6H),1.74-1.63(m,1H)。
实施例202：化合物460B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(吡咯烷-1-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
向2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和吡咯烷(7.21mmol，600μL 3当量)在二噁烷(5mL)中的混合物中添加碳酸钾(3.32g，24mmol，10当量)，并且在密封管中，在110℃下，在氮气下，将反应加热12h。将反应浓缩，并且将残余物通过制备型HPLC(HCl条件，柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]B％：1％-30％，10min)来纯化以提供呈浅黄色固体的产物2-吡咯烷-1-基噻唑-4-甲酸(30mg，6.30％产率)。LC-MS(ES+,m/z):199.0[(M+H)+]。
按照方法B，使2-吡咯烷-1-基噻唑-4-甲酸(22.2mg，112μmol，1当量)与胺1(60mg，112μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的(21.1mg，30.6％产率，98.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):607.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.79(t,J＝6.1Hz,1H),7.89(s,1H),7.40(s,1H),7.15-7.08(m,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(br d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.92-4.77(m,3H),3.68-3.52(m,1H),3.44(br t,J＝6.6Hz,4H),3.05(br s,1H),2.82(br s,1H),2.20(br s,4H),2.12(br s,1H),2.00(td,J＝3.4,6.5Hz,5H),1.68(br d,J＝9.9Hz,1H)。
实施例203：化合物461B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-{5-[({噻吩并[2,3-d]嘧啶-4-基}氨基)甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
将胺1(19mg，44.7μmol)、4-氯噻吩并[2,3-d]嘧啶(15.4mg，90.3μmol)称重至具有隔垫盖的20mL EPA小瓶中。添加DMSO(0.6mL)，并且将反应搅拌并加热至80℃，持续2h，此时LCMS显示反应完成。将反应通过反相HPLC来纯化，并且通过用DCM稀释HPLC级分，用以碳酸氢钠溶液使得其呈碱性的水洗涤来以游离碱形式分离出产物。将有机层移除，经硫酸镁干燥，过滤，并且在真空烘箱中浓缩以提供呈游离碱形式的所需N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]噻吩并[2,3-d]嘧啶-4-胺(14.8mg，59.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):561.2[(M+H)+]。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ9.00(t,J＝5.8Hz,1H),8.41(s,1H),7.90(s,1H),7.74(s,2H),7.15(t,J＝8.0Hz,1H),6.92(d,J＝8.4Hz,1H),6.32(d,J＝7.8Hz,1H),6.06(d,J＝8.3Hz,1H),5.53(q,J＝8.9Hz,2H),5.14(d,J＝5.7Hz,2H),4.87(d,J＝48.7Hz,1H),3.74–3.52(m,1H),3.08(s,1H),2.86(d,J＝10.8Hz,1H),2.14(d,J＝99.3Hz,6H),1.71(d,J＝12.5Hz,1H)。
实施例204：化合物462B：N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]-2-(5-{[(1-甲基-1H-吲哚-4-基)氨基]甲基}-1,2,4-噁二唑-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-4-胺
将胺1(59.8mg，120μmol，2HCl)、叔丁醇钾(54mg，481μmol)、第4代BrettPhos Pd(14.5mg，16.1μmol)和第3代叔丁基-XPhos(16.4mg，20.7μmol)称重至具有隔垫盖的20mLEPA小瓶中。通过针用氮气冲洗小瓶。在单独小瓶中，将甲苯通过2min氮气鼓泡来脱气，接着通过注射器在氮气下转移至反应中。放置小瓶以在铝块中在80℃下搅拌1h。将反应冷却，用DCM稀释，经Acrodisc过滤，接着浓缩，并且再溶解于DMSO中。接着将粗溶液通过反相HPLC来纯化，在8min内，乙腈:水10-50％(0.1％甲酸)。将所得级分用DCM稀释，用以饱和碳酸氢钠使得其呈碱性的水洗涤。将有机层移除，并且将水层用DCM萃取。将有机溶液干燥(硫酸镁)，过滤，并且浓缩。将棕色油状物再溶解于乙腈中。将产物溶解于乙腈和1N盐酸中，接着通过冻干以盐酸盐形式分离出来以提供N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-2-[5-[[(1-甲基吲哚-4-基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(29.1mg，43.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):556.2[(M+H)+]。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.79(s,2H),7.89(s,1H),7.24–7.09(m,2H),6.93(dd,J＝15.8,8.0Hz,2H),6.74(d,J＝8.2Hz,1H),6.62(d,J＝3.2Hz,1H),6.34(d,J＝7.8Hz,1H),6.15(d,J＝7.6Hz,1H),5.50(t,J＝9.0Hz,2H),5.16(d,J＝47.4Hz,1H),4.84(s,2H),3.84(s,1H),3.72(s,3H),3.20(d,J＝12.0Hz,1H),2.82(d,J＝4.4Hz,4H),2.33–1.88(m,3H)。
实施例205：化合物463B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吲唑-4-胺
向胺1(100mg，235μmol，1当量)和4-溴-1-甲基-吲唑(59.4mg，281μmol，1.2当量)在甲苯(3mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(45.1mg，469μmol，2当量)、第3代叔丁基-XPhos(18.6mg，23.5μmol，0.1当量)，并且在氮气下将反应加热至80℃，持续2h。将残余物倾倒至EDTA(饱和，50mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吲唑-4-胺(17.8mg，13.6％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):557.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.16(d,J＝0.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.24(t,J＝6.3Hz,1H),7.12(dt,J＝3.9,8.0Hz,2H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.82(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.15(d,J＝7.6Hz,1H),6.02(d,J＝8.3Hz,1H),5.49(q,J＝9.0Hz,2H),4.96-4.75(m,3H),3.95(s,3H),3.70-3.51(m,1H),3.04(br t,J＝10.0Hz,1H),2.82(br d,J＝11.0Hz,1H),2.28(br d,J＝12.7Hz,1H),2.19(s,3H),2.14-2.06(m,1H),2.06-1.96(m,1H),1.68(br d,J＝11.7Hz,1H)。
实施例206：化合物464B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(甲氧基甲基)噻吩-3-甲酰胺
在0℃下，向5-甲酰基噻吩-3-甲酸甲酯(0.1g，588μmol，1当量)在甲醇(6mL)中的溶液中添加硼氢化钠(44.5mg，1.18mmol，2当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(50mL)来淬灭，接着用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用饱和盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色油状物的粗产物(0.06g，34μmol，59.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):173.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.24-8.20(d,J＝1.6Hz,1H),7.31-7.25(d,J＝1.2Hz,1H),5.64-5.55(t,J＝5.6Hz,1H),4.65-4.62(dt,J＝5.6Hz,2H),3.78(s,3H)。
在0℃下，向5-(羟基甲基)噻吩-3-甲酸甲酯(0.2g，1.16mmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加氢化钠(139mg，3.48mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min。在0℃下添加碘代甲烷(2.32mmol，145μL 2当量)。在20℃下将所得混合物搅拌30min。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(50mL)来淬灭，并且用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用饱和盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈无色油状物的产物(0.1g，31.0％产率，67％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):187.1[(M+H)+]
向5-(甲氧基甲基)噻吩-3-甲酸甲酯(0.1g，537μmol，1当量)在甲醇(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(4M，2mL，14.9当量)。在20℃下将混合物搅拌1h。将反应混合物通过添加水(10mL)来淬灭，接着用HCl(1N)稀释至pH<5，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的产物(0.07g，75.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):170.8[(M+H)+]。
按照方法B，使5-(甲氧基甲基)噻吩-3-甲酸(43.5mg，252μmol，2当量)和胺1(70mg，126μmol，90％纯度，1当量，2HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(甲氧基甲基)噻吩-3-甲酰胺产物(0.02g，25.7％产率，94％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):581.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.32-9.22(t,J＝5.2Hz,1H),8.26-8.18(d,J＝1.2Hz,1H),7.90(s,1H),7.61-7.45(d,J＝0.8Hz,1H),7.20-7.08(d,J＝8.0Hz,1H),6.93-6.83(d,J＝8.4Hz,1H),6.40-6.24(d,J＝8.0Hz,1H),6.12-6.00(d,J＝8.4Hz,1H),5.67-5.42(dt,J＝17.6Hz,2H),4.94-4.78(m,3H),4.59(s,2H),3.68-3.54(m,1H),3.29(s,3H),3.17-3.05(m,1H),2.96-2.80(m,1H),2.47-2.07(m,5H),2.07-1.94(m,1H),1.78-1.65(m,1H)。
实施例207：化合物465B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(吗啉-4-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
在110℃下，将2-溴噻唑-4-甲酸(2g，9.61mmol，1当量)和吗啉(227mmol，20mL，23.6当量)的混合物加热和搅拌12h。将反应真空浓缩，接着通过制备型HPLC(中性条件，柱：Xtimate C18 10u 250mm×80mm；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-35％，25min)来纯化以提供呈白色固体的所需产物2-吗啉代噻唑-4-甲酸(68.0％产率)。LC-MS(ES+,m:z):214.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.39(s,1H),3.72-3.67(m,4H),3.38-3.33(m,4H)。
向胺1(6g，10.6mmol，1当量，2HCl)和2-吗啉代噻唑-4-甲酸(4.25g，15.9mmol，1.5当量)在DMF(60mL)中的混合物中添加HOBt(2.86g，21.2mmol，2当量)、EDCI(4.05g，21.2mmol，2当量)和DIEA(105.7mmol，18.4mL，10当量)，并且在氮气下将反应加热至50℃并搅拌3h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(50mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝1/01，23/77，DCM:甲醇＝1/0，95/5)来纯化。将所得产物用EA(10mL)/MTBE(30mL)湿磨，接着真空干燥以提供呈浅黄色固体的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-2-吗啉代-噻唑-4-甲酰胺(3g，45.6％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m:z):623.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.94(t,J＝6.1Hz,1H),7.89(s,1H),7.55(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.03(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.93-4.75(m,3H),3.78-3.70(m,4H),3.66-3.53(m,1H),3.51-3.44(m,4H),3.04(br t,J＝10.1Hz,1H),2.82(br d,J＝10.6Hz,1H),2.31-2.16(m,4H),2.13-2.05(m,1H),2.04-1.94(m,1H),1.68(br d,J＝10.1Hz,1H)。
实施例208：化合物466B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(吡咯烷-1-基)甲基]噻吩-3-甲酰胺
在25℃下，向5-甲酰基噻吩-3-甲酸甲酯(500mg，2.94mmol，1当量)和吡咯烷(2.94mmol，245μL 1当量)在DCE(10mL)中的溶液中添加乙酸(1.25mL)。在50℃下将混合物搅拌30min，接着添加三乙酰氧基硼氢化钠(3.11g，14.7mmol，5当量)，并且在50℃下将所得混合物搅拌12h。将残余物倾倒至饱和碳酸钠(30mL)中，并且搅拌10min。将水相用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过柱色谱法来纯化以产生产物(0.36g，52.2％产率，96％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):226.1[(M+H)+]。
向5-(吡咯烷-1-基甲基)噻吩-3-甲酸甲酯(360mg，1.53mmol，96％纯度，1当量)在甲醇(2mL)中的溶液中添加氢氧化钠(4M，1.90mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物通过添加HCl(3M)水溶液以达到pH＝7来淬灭，接着真空浓缩以产生也含有一些氯化钠的呈黄色固体的粗产物(0.9g，1mmol，65.3％产率)。
按照方法B，使5-(吡咯烷-1-基甲基)噻吩-3-甲酸(45.7mg，216μmol，2当量)与胺1(60mg，108.14μmol，90％纯度，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝7:1)来纯化以产生呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(吡咯烷-1-基)甲基]噻吩-3-甲酰胺(18mg，25.8％产率，96％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):620.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.30-9.04(t,J＝5.6Hz,1H),8.12(s,1H),7.89(s,1H),7.40(s,1H),7.18-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.94-6.75(d,J＝8.0Hz,1H),6.35-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.14-5.96(d,J＝7.6Hz,1H),5.59-5.39(dt,J＝18.0Hz,2H),4.97-4.68(m,3H),3.89-3.73(m,2H),3.67-3.57(m,1H),3.15-3.04(m,1H),2.92-2.82(m,1H),2.67-2.52(m,5H),2.33-2.11(m,4H),2.08-1.93(m,1H),1.83-1.64(m,5H)。
实施例209：化合物467B：5-[(二甲基氨基)甲基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺
在20℃下，在氮气下，向5-甲酰基噻吩-2-甲酸甲酯(300mg，1.76mmol，1当量)在乙醇(5mL)中的混合物中添加二甲胺盐酸盐(718.7mg，8.81mmol，5当量)和THF(1mL)，随后添加乙酸(1.76mmol，100μL 1当量)，接着添加氰基硼氢化钠(553.9mg，8.81mmol，5当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将反应倾倒至碳酸氢钠(饱和，15mL)中。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗品通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝2/1)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(80mg，22.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):200.1[(M+H)+]。
在20℃下，将5-[(二甲基氨基)甲基]噻吩-2-甲酸甲酯(80mg，401μmol，1当量)依次用甲醇(2mL)和氢氧化钠(5M，0.5mL，6.2当量)处理，并且搅拌12h。将溶液直接通过制备型HPLC(柱：Welch Xtimate C18150×25mm×5um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]B％：1％-5％，8min)来纯化以提供呈白色固体的酸产物(60mg，80.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):186.1[(M+H)+]。
按照方法B，使5-[(二甲基氨基)甲基]噻吩-2-甲酸(20mg，108μmol，1当量)与胺1(60mg，108μmol，90％纯度，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝7:1)来纯化以产生呈黄色固体的所需产物5-[(二甲基氨基)甲基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}噻吩-2-甲酰胺(15mg，22.2％产率，95％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):594.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.45-9.25(t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.79-7.63(d,J＝3.6Hz,1H),7.15-7.09(t,J＝8.0Hz,1H),7.05-7.00(d,J＝3.6Hz,1H),6.92-6.86(d,J＝8.4Hz,1H),6.31-6.26(d,J＝7.6Hz,1H),6.09-6.03(d,J＝8.0Hz,1H),5.54-5.47(dt,J＝9.2Hz,2H),4.94-4.80(m,3H),3.66-3.57(m,3H),3.17-3.06(m,1H),2.92-2.84(m,1H),2.33-2.10(m,11H),2.09-1.95(m,1H),1.78-1.65(m,1H)。
实施例210：化合物468B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(吗啉-4-基)甲基]噻吩-3-甲酰胺
在25℃下，在氮气下，向5-甲酰基噻吩-3-甲酸甲酯(200.8mg，1.18mmol，1当量)和吗啉(1.14mmol，100μL 1当量)在DCE(4mL)中的混合物中添加乙酸(0.5mL)。在50℃下将混合物加热和搅拌30min，随后添加三乙酰氧基硼氢化钠(1.25g，5.90mmol，5当量)，并且在50℃下搅拌12h。将残余物倾倒至饱和碳酸钠(30mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE/EA＝4/1)来纯化以提供叔胺产物。
在25℃下，在氮气下，向5-(吗啉代甲基)噻吩-3-甲酸甲酯(200mg，829μmol，1当量)在甲醇(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(4M，2mL，9.6当量)。在25℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至HCl(4M，2mL)中。将混合物真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC来纯化以提供5-(吗啉代甲基)噻吩-3-甲酸(210mg，89.2％产率，80％纯度)。
按照方法B，使胺1(53.3mg，98.1μmol，92％纯度，1当量，2HCl)和5-[(二甲基氨基)甲基]噻吩-3-甲酸(36.4mg，196.3μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC来纯化以提供所需产物5-[(二甲基氨基)甲基]-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]噻吩-3-甲酰胺(28.6mg，45.5％产率，92.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):636.3[(M+H+)]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.22(t,J＝5.7Hz,1H),8.14(d,J＝1.5Hz,1H),7.89(s,1H),7.39(s,1H),7.16-7.07(m,1H),6.89(d,J＝8.2Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.08(br d,J＝8.8Hz,1H),5.58-5.43(m,2H),5.01-4.72(m,3H),3.68(s,3H),3.58(br t,J＝4.4Hz,4H),3.21-2.84(m,2H),2.41(br s,4H),2.30(br d,J＝17.6Hz,2H),2.04(br s,1H),1.73(br s,1H)。
实施例211：化合物469B：N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-(吗啉代甲基)噻吩-2-甲酰胺
使用方法B，使胺1(70mg，1当量，2HCl)和5-(吗啉代甲基)噻吩-2-甲酸(58.6mg，258μmol，2当量)偶联。将残余物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-(吗啉代甲基)噻吩-2-甲酰胺(61mg，71.1％产率，95.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):636.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.37(t,J＝5.7Hz,1H),7.90(s,1H),7.71(d,J＝3.7Hz,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),7.04(d,J＝3.7Hz,1H),6.88(d,J＝8.6Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.05(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.95-4.74(m,3H),3.69(s,2H),3.58(br t,J＝4.5Hz,5H),3.05(br t,J＝10.7Hz,1H),2.83(br d,J＝10.8Hz,1H),2.46-2.32(m,4H),2.29-2.14(m,4H),2.10(br d,J＝10.6Hz,1H),2.03-1.94(m,1H),1.68(br d,J＝9.7Hz,1H)。
实施例212：化合物470B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(吡咯烷-1-基)甲基]噻吩-2-甲酰胺
在与用于以上吗啉代甲基类似物的条件类似的条件下，使5-(二甲基氨基甲基)噻吩-2-甲酸与胺1偶联，从而提供所需产物，40.9％产率。LC-MS(ES+,m/z):620.3[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.44-9.30(m,1H),7.90(s,1H),7.70(d,J＝3.7Hz,1H),7.18-7.09(m,1H),7.06(br s,1H),6.90(d,J＝8.2Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.08(br d,J＝8.2Hz,1H),5.51(q,J＝8.9Hz,2H),5.01-4.74(m,3H),3.86(br s,2H),3.63(br d,J＝7.7Hz,1H),3.25-3.08(m,1H),3.03-2.81(m,1H),2.56(br s,4H),2.32(br d,J＝8.2Hz,4H),2.13-1.97(m,1H),1.73(br s,5H)。
实施例213：化合物471B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丁基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
使用与先前用于制备类似环丙基类似物的顺序相同的顺序，从(1-氨基环丁基)甲醇制备所需吡咯甲酸。
按照方法A，使胺1(180mg，288μmol，1当量，2HCl)与1-[1-(甲氧基甲基)环丁基]吡咯-3-甲酸(72.4mg，346μmol，1.2当量)偶联。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丁基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(75mg，41.7％产率，99％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.77-8.59(t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.41-7.31(t,J＝1.6Hz,1H),7.20-7.05(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.83(t,J＝8.0Hz,1H),6.80-6.71(t,J＝2.0Hz,1H),6.54-6.43(dt,J＝2.8Hz,1H),6.38-6.21(d,J＝8.0Hz,1H),6.06-5.91(d,J＝8.4Hz,1H),5.61-5.37(dt,J＝17.6Hz,2H),4.96-4.69(m,3H),3.66-3.54(m,3H),3.20(s,3H),3.08-2.99(m,1H),2.89-2.76(m,1H),2.39-2.30(m,4H),2.27-2.17(m,4H),2.14-2.07(m,1H),2.05-1.97(m,1H),1.96-1.84(m,2H),1.75-1.62(m,1H)
实施例214：化合物472B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(羟基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向(1-吡咯-1-基环丙基)甲醇(2.5g，18.2mmol，1当量)在THF(30mL)中的混合物中一次性添加2,2,2-三氯乙酰氯(72.9mmol，8.13mL，4当量)。在70℃下将混合物加热和搅拌16h。将残余物用碳酸钠(饱和)处理以调整pH＝7～8。将水相用EA(40mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(40mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝100/1，97/3)来纯化以提供呈黄色固体的2,2,2-三氯乙酸[1-[3-(2,2,2-三氯乙酰基)吡咯-1-基]环丙基]甲酯(900mg，2.10mmol，11.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):427.8[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.91(t,J＝1.7Hz,1H),7.14-7.03(m,1H),6.68(dd,J＝1.9,2.8Hz,1H),4.65(s,2H),1.39-1.34(m,2H),1.32-1.27(m,2H)，以及呈浅黄色固体的另一酮区域异构体2,2,2-三氯乙酸[1-[2-(2,2,2-三氯乙酰基)吡咯-1-基]环丙基]甲酯(3.6g，46.2％产率)。
在30℃下，在氮气下，向2,2,2-三氯乙酸[1-[3-(2,2,2-三氯乙酰基)吡咯-1-基]环丙基]甲酯(200mg，467μmol，1当量)在THF(1mL)中的溶液中添加氢氧化钠(3M，1mL，6.42当量)，并且将混合物搅拌30min。将残余物用HCl(12M)处理以调整pH＝5～6。将残余物真空浓缩。将残余物用DCM:甲醇＝10:1(10×3)洗涤，接着真空浓缩以提供呈黄色油状物的1-[1-(羟基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(70mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):182.1[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(55mg，110μmol，1当量，2HCl)与1-[1-(羟基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(20mg，110μmol，1当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝8:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1-[1-(羟基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酰胺(20.8mg，32.0％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):590.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.69(t,J＝5.4Hz,1H),7.89(s,1H)7.45(t,J＝2.0Hz,1H),7.15-7.07(m,1H),6.88(d,J＝7.9Hz,1H),6.86-6.84(m,1H),6.45(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.06(br d,J＝8.8Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),5.01(t,J＝5.7Hz,1H),4.94-4.77(m,1H),4.71(d,J＝5.7Hz,2H),3.69-3.55(m,1H),3.50(d,J＝5.7Hz,2H),3.06(br s,1H),2.84(br s,1H),2.40-2.18(m,4H),2.16-1.94(m,2H),1.70(br s,1H),1.03-0.99(m,2H),0.98-0.94(m,2H)。
实施例215：化合物473B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺
在0℃下，向四氢吡喃-4-甲腈(5g，45mmol，1当量)在THF(50mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M，54mL，1.2当量)。在0℃下将反应搅拌1.5h，接着将碘代甲烷(135mmol，8.40mL，3.0当量)添加至混合物中。在25℃下将混合物搅拌2h。在0℃下将反应混合物通过添加饱和氯化铵(200mL)来淬灭，接着用水(100mL)和EA(100mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL×2)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生产物(4.8g，粗品)。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ＝3.91-3.79(m,2H),3.44(dt,J＝2.1,12.0Hz,2H),1.86-1.72(m,2H),1.54(ddd,J＝4.4,11.9,13.9Hz,2H),1.34(s,3H)。
在20℃下，向4-甲基四氢吡喃-4-甲腈(0.7g，5.59mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中添加硫化铵(3.81g，11.2mmol，3.82mL，20％纯度，2当量)。在密封管中，在50℃下将混合物搅拌10h。将反应混合物用60mL EA(30mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生粗产物。将这个过程重复三次，并且将粗产物合并。将这些粗产物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来进一步纯化以产生产物(1.6g，59.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):160.1[(M+H)+]。
向4-甲基四氢吡喃-4-硫代甲酰胺(400mg，2.51mmol，1当量)和2-氯-3-氧代-丙酸乙酯(397mg，2.64mmol，1.05当量)在乙酸(13mL)中的混合物中添加4-甲基苯磺酸水合物(95.6mg，502μmol，0.2当量)，并且在110℃下，在氮气下，将反应加热12h。将反应倾倒至50mL饱和碳酸钠中，并且用EA(100mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生噻唑产物(600mg，2.35mmol，93.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):256.0[(M+H)+]。
在标准条件下使2-(4-甲基四氢吡喃-4-基)噻唑-5-甲酸乙酯(600mg，2.35mmol，1当量)皂化以提供羧酸产物。(450mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):228.1[(M+H)+]。
按照方法B，使2-(4-甲基四氢吡喃-4-基)噻唑-5-甲酸(38.23mg，168.22μmol，1.2当量)和胺1(70mg，140μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1,3-噻唑-5-甲酰胺(26.5mg，29.7％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):636.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.55(t,J＝5.7Hz,1H),8.36(s,1H),7.86(s,1H),7.08(t,J＝7.9Hz,1H),6.85(d,J＝8.3Hz,1H),6.25(d,J＝7.9Hz,1H),5.99(d,J＝8.3Hz,1H),5.47(q,J＝9.1Hz,2H),4.92-4.73(m,3H),3.74-3.64(m,2H),3.63-3.52(m,1H),3.47(ddd,J＝3.1,8.2,11.5Hz,2H),3.02(br s,1H),2.80(br d,J＝8.8Hz,1H),2.17(br s,4H),2.09(ddd,J＝3.1,6.0,13.3Hz,3H),1.97(br dd,J＝3.1,12.3Hz,1H),1.77-1.63(m,3H),1.34(s,3H)。
实施例216：化合物474B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
在氮气下，向先前制备的4-甲基四氢吡喃-4-硫代甲酰胺(400mg，2.51mmol，1当量)在乙醇(13mL)中的混合物中添加3-溴-2-氧代-丙酸乙酯(2.64mmol，330μL 1.05当量)。在80℃下将混合物搅拌12h。将反应用水(100mL)和(100mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生噻唑产物(600mg，2.35mmol，93.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):256.0[(M+H)+]。
在标准条件下使2-(4-甲基四氢吡喃-4-基)噻唑-4-甲酸乙酯(600mg，2.35mmol，1当量)皂化以提供羧酸产物(450mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):228.1[(M+H)+]。
按照方法B，使2-(4-甲基四氢吡喃-4-基)噻唑-4-甲酸(38.2mg，168μmol，1.2当量)与胺1(70mg，140μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺(20.8mg，23.3％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):636.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.10(t,J＝6.1Hz,1H),8.27(s,1H),7.86(s,1H),7.08(t,J＝7.9Hz,1H),6.84(d,J＝8.3Hz,1H),6.25(d,J＝7.9Hz,1H),5.98(br d,J＝8.3Hz,1H),5.47(q,J＝8.9Hz,2H),4.91-4.65(m,3H),3.74-3.66(m,2H),3.53(ddd,J＝3.1,8.0,11.3Hz,2H),3.59(br d,J＝3.1Hz,1H),3.06-2.94(m,1H),2.84-2.72(m,1H),2.32-2.22(m,1H),2.19-2.14(m,5H),2.11-2.01(m,1H),1.96-1.76(m,1H),1.79-1.69(m,2H),1.68-1.60(m,1H),1.40(s,3H)。
实施例217：化合物475B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
向1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(41.1mg，211μmol，1.2当量)和先前制备的(3S,4R)-4-[[2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(Boc-哌啶A)(90mg，176μmol，1当量)在DMF(2mL)中的溶液中添加HOBt(47.5mg，351μmol，2当量)和EDCI(67.3mg，351μmol，2当量)以及TEA(874μmol，120μL 5当量)。在50℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物通过添加水(10mL)来淬灭，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以产生呈黄色固体的产物(80mg，62.8％产率，95％纯度)，LC-MS(ES+,m:z):690.2[(M+H)+]。
向以上中间体(80mg，116μmol，1当量)在EA(1mL)中的溶液中添加HCl/EA(4M，2mL，68当量)。在20℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。在20℃下，将残余物用3mL EA湿磨5min，随后过滤和干燥，以产生呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(30mg，43.9％产率)。LC-MS(ES+,m:/z):590.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.36-9.12(m,1H),8.74-8.69(t,J＝5.6Hz,1H),7.79(s,1H),7.62-7.32(t,J＝1.6Hz,1H),7.24-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),6.98-6.91(d,J＝8.4Hz,1H),6.89-6.83(t,J＝2.4Hz,1H),6.51-6.42(t,J＝2.0Hz,1H),6.38-6.32(d,J＝8.0Hz,1H),6.25(br s,1H),5.65-5.39(dt,J＝17.6Hz,2H),5.18-5.00(d,J＝47.6Hz,1H),4.81-4.63(d,J＝5.2Hz,2H),4.03-3.90(m,1H),3.70-3.65(m,1H),3.47(s,2H),3.44-3.30(m,2H),3.22(s,3H),3.13-3.01(m,1H),2.22-2.04(m,1H),1.97-1.85(m,1H),1.17-0.92(m,4H)。
实施例218：化合物476B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
使用与用于先前描述的起始物料的相对对映异构体的程序相同的程序制备3R,4S对映异构体，以提供N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):590.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.36-9.12(m,1H),8.74-8.69(t,J＝5.6Hz,1H),7.79(s,1H),7.62-7.32(t,J＝1.6Hz,1H),7.24-7.06(t,J＝8.0Hz,1H),6.98-6.91(d,J＝8.4Hz,1H),6.89-6.83(t,J＝2.4Hz,1H),6.51-6.42(t,J＝2.0Hz,1H),6.38-6.32(d,J＝8.0Hz,1H),6.25(br s,1H),5.65-5.39(dt,J＝17.6Hz,2H),5.18-5.00(d,J＝47.6Hz,1H),4.81-4.63(d,J＝5.2Hz,2H),4.03-3.90(m,1H),3.70-3.65(m,1H),3.47(s,2H),3.44-3.30(m,2H),3.22(s,3H),3.13-3.01(m,1H),2.22-2.04(m,1H),1.97-1.85(m,1H),1.17-0.92(m,4H)。
实施例219：化合物477B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺
将(3S,4R)-4-[[2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(Boc-哌啶A)(80mg，156.1μmol，1当量)、1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酸(39.6mg，187μmol，99％纯度，1.2当量)、HOBt(42.2mg，312μmol，2当量)、EDCI(59.9mg，312μmol，2当量)和TEA(780μmol，110μL 5当量)在DMF(3mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在50℃下将混合物搅拌2.5h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用50mL EA(2×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以产生产物(90mg，81.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):704.4[(M+H)+]。
将(3S,4R)-3-氟-4-[[2-[5-[[[1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(90mg，128μmol，1当量)添加至4N HCl/EA(3mL)中。在25℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。将残余物通过用EA(5mL)湿磨来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(23.3mg，27.8％产率，97.7％纯度，HCl盐)。LC-MS(ES+,m/z):604.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.35-9.21(m,1H),8.77-8.57(m,2H),7.90(s,1H),7.60(s,1H),7.16(t,J＝8.0Hz,1H),7.03(t,J＝2.6Hz,1H),6.95(d,J＝8.4Hz,1H),6.60-6.52(m,1H),6.35(d,J＝8.0Hz,1H),6.26(brs,1H),5.58-5.48(m,2H),5.04-5.16(m,1H),4.75(br d,J＝5.5Hz,2H),4.06-3.90(m,1H),3.53(br s,4H),3.46(br d,J＝11.3Hz,1H),3.33(br d,J＝11.0Hz,2H),3.17-3.03(m,1H),2.22-2.06(m,3H),1.98-1.86(m,3H),1.44(s,3H)。
实施例220：化合物478B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺
使用与用于先前描述的对映异构体的程序相同的程序从Boc-哌啶B制备3R,4S对映异构体，以提供N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺。LC-MS(ES+,m/z):604.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.58(br s,1H),8.73(brs,2H),7.90(s,1H),7.61(s,1H),7.15(t,J＝8.1Hz,1H),7.03(t,J＝2.5Hz,1H),6.95(brd,J＝8.3Hz,1H),6.56(br s,1H),6.36(br d,J＝7.9Hz,1H),5.53(br d,J＝9.0Hz,2H),5.19-5.01(m,1H),4.74(br d,J＝5.5Hz,2H),4.06-3.90(m,1H),3.66(dt,J＝3.5,7.6Hz,2H),3.61-3.51(m,3H),3.32(br d,J＝11.8Hz,2H),3.08(br d,J＝11.4Hz,1H),2.22-2.08(m,3H),1.98-1.86(m,3H),1.44(s,3H)。
实施例221：化合物479B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
在50℃下，在氮气氛围下，将Boc-哌啶B(80mg，156μmol，1当量)、5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(41.7mg，187μmol，1.2当量)、HOBt(42.2mg，312μmol，2当量)、EDCI(59.9mg，312μmol，2当量)和TEA(780μmol，110μL 5当量)在DMF(3mL)中的混合物搅拌2.5h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(2×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生产物(80mg，73.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):695.3[(M+H)+]。
向(3R,4S)-3-氟-4-[[2-[5-[[[5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-2-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(80mg，115μmol，1当量)在DCM(1mL)中的溶液中添加2,6-二甲基吡啶(345μmol，40μL 3当量)。接着将TMSI(345μmol，47μL3当量)添加至混合物中。在25℃下将混合物搅拌10min。将反应混合物通过添加饱和碳酸钠(10mL)来淬灭，接着用水(100mL)稀释，并且用EA(2×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺(21.8mg，31.8％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):595.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.38(br t,J＝5.6Hz,1H),7.92(s,1H),7.72(d,J＝3.8Hz,1H),7.18-7.03(m,2H),6.89(d,J＝8.2Hz,1H),6.31(d,J＝7.8Hz,1H),6.08(br d,J＝8.0Hz,1H),5.52(q,J＝9.1Hz,2H),4.89-4.65(m,3H),3.83-3.61(m,1H),3.23-3.14(m,1H),3.10-3.01(m,4H),2.94-2.76(m,1H),2.73-2.65(m,1H),1.94-1.74(m,2H),1.83-1.64(m,8H)。
实施例222：化合物480B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
使用与用于相对对映异构体的条件完全相同的条件，利用Boc-哌啶A制备该类似物以提供所需化合物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺，LC-MS(ES+,m/z):595.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.40(br t,J＝5.5Hz,1H),7.92(s,1H),7.72(d,J＝3.6Hz,1H),7.21-7.04(m,2H),6.90(br d,J＝8.3Hz,1H),6.32(d,J＝7.9Hz,1H),6.11(br d,J＝8.3Hz,1H),5.53(q,J＝8.6Hz,2H),4.93-4.67(m,3H),3.88-3.67(m,1H),3.22(br t,J＝11.4Hz,1H),3.07(s,4H),2.98-2.81(m,1H),2.75-2.66(m,1H),1.94-1.80(m,1H),1.69(br d,J＝12.6Hz,1H),1.55(s,6H)。
实施例223：化合物481B：1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向先前制备的(1-吡咯-1-基环丙基)甲醇(1g，7.3mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中一次性添加碘代乙烷(14.6mmol，1.17mL，2当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加氢化钠(875mg，21.9mmol，60％纯度，3当量)。在20℃下将混合物搅拌1h 30min。将残余物倾倒至氯化铵(饱和，100mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]吡咯(1.3g，粗品)。LC-MS(ES+,m:z):166.2[(M+H)+]。
在0℃下，向1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]吡咯(1.3g，7.87mmol，1当量)在THF(20mL)中的溶液中添加2,2,2-三氯乙酰氯(23.6mmol，2.63mL，3当量)。在70℃下将混合物加热和搅拌12h。将残余物倾倒至碳酸钠(饱和)中以调整pH>7。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝100/0，98/2)来纯化以提供呈黄色油状物的2,2,2-三氯-1-[1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]吡咯-3-基]乙酮(400mg，1.29mmol，16.4％产率)。LC-MS(ES+,m:z):310.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.86(t,J＝1.9Hz,1H),7.03(dd,J＝2.0,3.1Hz,1H),6.65(dd,J＝1.8,3.1Hz,1H),3.53(s,2H),3.39(q,J＝7.1Hz,2H),1.20-1.14(m,2H),1.07-1.00(m,5H)。
在30℃下，在氮气下，向2,2,2-三氯-1-[1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]吡咯-3-基]乙酮(420mg，1.35mmol，1当量)在THF(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(2M，2mL，3当量)。在30℃下将混合物搅拌0.5h。将残余物倾倒至水(w/w＝1/1)(30mL)中。将水相用DCM(10mL×3)萃取。将水相用HCl(12M)处理以调整至pH＝5～6，接着用DCM(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈浅黄色油状物的1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(0.2g，粗品)。
按照方法A，使胺1(70mg，140μmol，1当量，2HCl)与1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(35.2mg，168μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝8:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的1-[1-(乙氧基甲基)环丙基]-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺(21.7mg，25.1％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):618.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.68(br t,J＝5.4Hz,1H),7.89(s,1H),7.45(s,1H),7.11(t,J＝8.1Hz,1H),6.95-6.81(m,2H),6.46(br s,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.02(br d,J＝8.4Hz,1H),5.57-5.44(m,2H),4.93-4.70(m,3H),3.64(br s,1H),3.50(s,2H),3.41-3.36(m,2H),3.09-2.98(m,1H),2.82(br d,J＝7.4Hz,1H),2.32-2.14(m,4H),2.13-2.04(m,1H),2.05-1.83(m,1H),1.74-1.63(m,1H),1.13-1.03(m,5H),1.02-0.90(m,2H)。
实施例224：化合物482B：1-{1-[(二甲基氨基)甲基]环丙基}-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向先前制备的1-[1-(羟基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸甲酯(110mg，563μmol，1当量)和甲烷磺酰氯(676μmol，52μL1.2当量)在DCM(1mL)中的混合物中添加TEA(676μmol，94μL 1.2当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(40mL)中。将水相用DCM(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的1-[1-(甲基磺酰基氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸甲酯(140mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):274.1[(M+H)+]。
在密封管中，向1-[1-(甲基磺酰基氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸甲酯(140mg，512μmol，1当量)中添加二甲胺(2M(THF)，770μL 3当量)。在100℃下将混合物搅拌12h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(40mL)中。将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色油状物的1-[1-[(二甲基氨基)甲基]环丙基]吡咯-3-甲酸甲酯(70mg，314.9μmol，61.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):223.1[(M+H)+]。
向1-[1-[(二甲基氨基)甲基]环丙基]吡咯-3-甲酸甲酯(70mg，315μmol，1当量)在甲醇(1mL)中的混合物中添加氢氧化钠(3M，1mL，9.53当量)，并且在50℃下，在氮气下，将反应加热12h。将HCl(12M)逐滴添加至反应中以调整pH＝7～8，接着将反应真空浓缩以提供呈浅黄色固体的1-[1-[(二甲基氨基)甲基]环丙基]吡咯-3-甲酸(360mg，粗品)。
按照方法A，使胺1(70mg，140.2μmol，1当量，2HCl)和1-[1-[(二甲基氨基)甲基]环丙基]吡咯-3-甲酸(233.6mg，168.2μmol，1.2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝7:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的1-[1-[(二甲基氨基)甲基]环丙基]-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]吡咯-3-甲酰胺(21.4mg，24.0％产率，96.9％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.68(t,J＝5.5Hz,1H),7.91(s,1H),7.43(s,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.93-6.79(m,2H),6.44(br s,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.05(br d,J＝8.4Hz,1H),5.59-5.43(m,2H),4.96-4.76(m,1H),4.72(d,J＝5.5Hz,2H),3.69-3.48(m,1H),3.31(s,2H),2.28-2.18(m,4H),2.14(s,6H),2.10-1.97(m,1H),2.09-1.95(m,1H),1.72-1.63(m,1H),1.12-1.03(m,2H),0.91-0.85(m,2H)。
实施例225：化合物483B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向先前制备的5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸甲酯(300mg，1.41mmol，1当量)在DMF(4mL)中的混合物中添加氢化钠(282.6mg，7.07mmol，60％纯度，5当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着加热至20℃，随后添加碘代甲烷(4.24mmol，265μL 3当量)，并且搅拌1.5h。将残余物倾倒至冰水(10mL)和氯化铵(饱和，10mL)中。将水相用EA(3×15mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×15mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸甲酯(300mg，粗品)，其不经纯化即用于下一步骤。LC-MS(ES+,m/z):227.1[(M+H)+]
在标准条件下使5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸甲酯(300mg，1.33mmol，1当量)皂化以提供呈白色固体的羧酸产物(150mg，53.3％产率)。
按照方法B，使胺1(80mg，160μmol，1当量，2HCl)与5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸(40.8mg，192μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/MEOH＝10/1)来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酰胺(44.7mg，45.0％产率)。LC-MS(ES+,m/z):621.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.89(s,1H),7.65(d,J＝4.0Hz,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.93(d,J＝3.7Hz,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.03(d,J＝7.5Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.94-4.75(m,3H),3.69-3.52(m,1H),3.47(s,2H),3.30-3.26(m,3H),3.12-3.00(m,1H),2.90-2.77(m,1H),2.21(s,4H),2.12(s,1H),2.06-1.93(m,1H),1.69(d,J＝10.6Hz,1H),1.08-0.92(m,4H)。
实施例226：化合物484B：5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
按照方法B，使胺1(42.7mg，85.9μmol，2Cl)与5-叔丁基-1H-吡咯-3-甲酸(18.4mg，110μmol)偶联。在使用额外2mL DMF下将反应经Acrodisc过滤，接着通过反相HPLC来纯化，在9min内，乙腈:水10-60％(0.1％甲酸)。将级分合并，用DCM和饱和碳酸氢钠溶液稀释。将有机层移除，并且将水层用DCM萃取。将有机溶液经硫酸镁干燥，过滤，并且浓缩以提供所需产物5-叔丁基-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(12.3mg，24.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):576.3[(M+H)+]。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ11.08(s,1H),8.62(t,J＝5.7Hz,1H),7.93(s,1H),7.31(t,J＝2.2Hz,1H),7.16(t,J＝8.0Hz,1H),6.93(d,J＝8.3Hz,1H),6.33(d,J＝7.9Hz,1H),6.26(t,J＝2.2Hz,1H),6.07(d,J＝8.3Hz,1H),5.81(s,0H),5.55(d,J＝9.0Hz,1H),4.89(d,J＝49.2Hz,1H),4.76(d,J＝5.7Hz,2H),3.65(d,J＝29.2Hz,1H),3.10(s,1H),2.97–2.77(m,1H),2.39–1.97(m,4H),1.74(d,J＝12.8Hz,1H),1.29(s,9H)。
实施例227：化合物485B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
在0-5℃下，在氮气下，向2-(2-噻吩基)乙酸甲酯(15g，96mmol，1当量)在氯仿(100mL)中的混合物中添加氯化铝(32.0g，240mmol，2.5当量)，并且在溶液中逐滴添加溴(96mmol，4.95mL，1当量)。将混合物搅拌30min，接着加热至20℃，并且搅拌2h。将溶液添加在冰水中，用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将粗产物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 250mm×100mm×15um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]B％：40％-75％，30min)来纯化以提供呈黄色油状物的2-(4-溴-2-噻吩基)乙酸甲酯(2.4g，9.19mmol，9.6％产率，90％纯度)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)＝7.13(d,J＝1.5Hz,1H),6.89(d,J＝1.2Hz,1H),3.81(d,J＝0.7Hz,2H),3.78-3.72(m,3H)。
在0℃下，在氮气下，向2-(4-溴-2-噻吩基)乙酸甲酯(1.5g，6.38mmol，1当量)在DMF(10mL)中的混合物中一次性添加氢化钠(510.4mg，12.8mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(19.1mmol，1.19mL，3当量)。在20℃下将混合物搅拌30min。在0℃下将反应混合物通过添加氯化铵饱和溶液(30mL)来淬灭，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用饱和盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/0至50/1)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(1.4g，83.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):263.0[(M+H)+]。
在0℃下，将2-(4-溴-2-噻吩基)-2-甲基-丙酸甲酯(1.4g，5.32mmol，1当量)、氯化钙(590mg，5.32mmol，1当量)、硼氢化钠(1.01g，26.6mmol，5当量)在甲醇(14mL)中的混合物搅拌0.25h，接着加热至50℃，并且搅拌3.25h。将残余物倾倒至冰水(10mL)和HCl(1N)中，搅拌10min。将水相用EA(3×40mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×15mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的产物(1.1g，87.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):236.9[(M+H)+]。
在0℃下，向2-(4-溴-2-噻吩基)-2-甲基-丙-1-醇(1.1g，4.68mmol，1当量)在DMF(11mL)中的溶液中添加氢化钠(374.2mg，9.36mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后在0℃下添加碘代甲烷(14mmol，875μL 3当量)。将所得混合物升温，并且在20℃下搅拌30min。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(30mL)来淬灭，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(硅胶，PE/EA＝1/0至19/1)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(0.9g，77.2％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.53-7.41(d,J＝1.2Hz,1H),7.01-6.85(d,J＝1.6Hz,1H),3.30(s,2H),3.24(s,3H),1.28(s,6H)。
在CO(15psi)氛围下，向4-溴-2-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)噻吩(0.7g，2.81mmol，1当量)在DMF(2mL)、甲醇(0.4mL)中的溶液中添加Pd(dppf)Cl2(1.03g，1.40mmol，0.5当量)和TEA(14.1mmol，1.96mL，5当量)。在80℃下将混合物搅拌16h。将反应混合物通过添加饱和EDTA(10mL)来淬灭，并且在20℃下将混合物搅拌1h，接着用水(10mL)稀释，并且用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/0至17/1)来纯化以提供呈黄色油状物的酯产物(0.6g，93.6％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.22-8.05(d,J＝1.2Hz,1H),7.35-7.06(d,J＝1.2Hz,1H),3.77(S,3H),3.32(s,2H),3.25(S,3H),1.31(s,6H)。
在标准条件下使5-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)噻吩-3-甲酸甲酯(0.6g，2.63mmol，1当量)皂化以提供呈黄色固体的产物羧酸(0.5g，88.8％产率)。
按照方法B，使胺1(70mg，121μmol，1当量，HCl)与5-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(51.9mg，242μmol，2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺(21mg，27.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):623.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.28-9.05(t,J＝5.6Hz,1H),8.03(s,1H),7.89(s,1H),7.35(s,1H),7.19-7.08(t,J＝8.0Hz,1H),6.97-6.81(d,J＝8.0Hz 1H),6.40-6.24(d,J＝7.6Hz 1H),6.09-5.96(t,J＝8.0Hz 1H),5.60-5.39(dt,J＝17.6Hz 2H),4.93-4.73(m,3H),3.65-3.53(m,1H),3.32-3.31(m,2H),3.26(s,3H),3.10-3.01(m,1H),2.88-2.77(m,1H),2.26-2.12(m,5H),2.02-1.97(m,1H),1.72-1.64(m,1H),1.32(s,6H)；1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝7.81-7.79(d,J＝1.2Hz,1H),7.44-7.39(d,J＝0.4Hz,1H),7.26-7.20(m,2H),6.88-6.77(d,J＝8.4Hz,1H),6.65-6.50(t,J＝5.6Hz,1H),6.40-6.27(d,J＝8.0Hz,1H),5.35-5.23(m,2H),4.96-4.81(m,3H),4.47-4.30(d,J＝9.6Hz,1H),3.66-3.52(m,1H),3.38(s,2H),3.36(s,3H),3.31-3.22(m,1H),3.03-2.88(m,1H),2.25(br d,J＝12.8Hz,4H),2.18(br t,J＝11.4Hz,1H),2.11-2.03(m,1H),2.00-1.90(m,1H),1.40(s,6H)。
实施例228：化合物486B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酰胺
在20℃下，在氮气下，向2-(2-噻吩基)乙酸甲酯(4g，25.6mmol，1当量)在氯仿(20mL)和乙酸(20mL)中的混合物中添加NBS(5.47g，30.7mmol，1.2当量)。将反应搅拌2h。使用饱和碳酸钠(20mL)将反应调整至pH达到7。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，97/3)来纯化以产生呈黄色油状物的产物(5g，66.4％产率，80％纯度)。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝6.91(d,J＝3.7Hz,1H),6.70(td,J＝0.9,3.7Hz,1H),3.78(d,J＝0.7Hz,2H),3.74(s,3H)。
在20℃下，将2-(5-溴-2-噻吩基)乙酸甲酯(2.5g，10.6mmol，1当量)和1,2-二溴乙烷(26.6mmol，2mL，2.5当量)、碳酸铯(13.86g，42.5mmol，4当量)的混合物在DMF(20mL)中搅拌4h。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，97/3)来纯化以产生呈黄色油状物的环丙基产物(2.4g，9.19mmol，43.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):261.0/263.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝6.87(d,J＝3.8Hz,1H),6.67(d,J＝3.8Hz,1H),3.70(s,3H),1.72-1.67(m,2H),1.33-1.29(m,2H)。
在0℃下，将1-(5-溴-2-噻吩基)环丙烷甲酸甲酯(2.4g，9.19mmol，1当量)、硼氢化钠(1.74g，45.95mmol，5当量)和氯化钙(510mg，4.60mmol，0.5当量)在乙醇(25mL)中的混合物搅拌10min，接着加热至20℃，并且搅拌18h。将残余物倾倒至冰水(30mL)和1N HCl(30mL)中，并且搅拌10min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，74/26)来纯化以产生呈黄色油状物的产物(2.1g，98.0％产率)。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝6.87(d,J＝3.8Hz,1H),6.69(d,J＝3.8Hz,1H),3.66(s,2H),1.03-0.89(m,4H)。在20℃下，在15psi的一氧化碳下搅拌[1-(5-溴-2-噻吩基)环丙基]甲醇(2.1g，9.01mmol，1当量)、TEA(45.04mmol，6.27mL，5当量)在DMF(20mL)和甲醇(4mL)中的混合物。添加Pd(dppf)Cl2(3.30g，4.50mmol，0.5当量)，并且接着将反应加热至60℃并在一氧化碳下搅拌18h。将残余物倾倒至EA(20mL)和EDTA(30mL)(饱和)中，并且搅拌2h。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，70/30)来纯化以产生呈黄色油状物的产物(1.7g，71.1％产率，80％纯度)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.61(d,J＝3.8Hz,1H),6.96(d,J＝3.8Hz,1H),4.98(t,J＝5.6Hz,1H),3.78(s,3H),3.56(d,J＝5.6Hz,2H),1.05-0.99(m,2H),0.94-0.88(m,2H)。
在标准条件下使5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸甲酯(300mg，1.41mmol，1当量)皂化以提供粗产物，将其通过制备型TLC来纯化以产生呈白色油状物的羧酸产物(230mg，82.1％产率)。
按照方法B，使5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸(38.1mg，192μmol，1.2当量)和胺1(80mg，160μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10/1)来纯化以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酰胺
(35.7mg，36.1％产率，98.4％纯度)，呈白色固体形式。LC-MS(ES+,m/z):607.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.26(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.65(d,J＝3.8Hz,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.94(d,J＝3.8Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.03(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.99-4.72(m,4H),3.71-3.49(m,3H),3.06(s,1H),2.84(d,J＝8.2Hz,1H),2.26-2.07(m,6H),2.06-1.89(m,1H),1.69(d,J＝9.7Hz,1H),1.04-0.96(m,2H),0.92-0.84(m,2H)。
实施例229：化合物487B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向2-(2-噻吩基)乙酸甲酯(10g，64mmol，1当量)在氯仿(100mL)中的混合物中添加氯化铝(21.34g，160.1mmol，2.5当量)。接着逐滴添加溴(64.02mmol，3.30mL，1当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，接着加热至20℃，并且搅拌15.5h。将溶液添加至冰水(50mL)中，用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1至97/3)来纯化以产生呈黄色油状物的溴产物(6g，28％产率)。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝7.13(d,J＝1.5Hz,1H),6.89(d,J＝1.2Hz,1H),3.81(d,J＝0.6Hz,2H),3.75(s,3H)。
在20℃下，向2-(4-溴-2-噻吩基)乙酸甲酯(5g，21.27mmol，1当量)和1,2-二溴乙烷(53.2mmol，4.01mL，2.5当量)在DMF(70mL)中的混合物中添加碳酸铯(27.72g，85.07mmol，4当量)，并且将反应搅拌4h。将水相用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1至97/3)来纯化以产生呈白色油状物的环丙基产物(3g，54.0％产率)。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝7.11(d,J＝1.5Hz,1H),6.86(d,J＝1.5Hz,1H),3.70(s,3H),1.75-1.69(m,2H),1.35-1.30(m,2H)。
在0℃下，向1-(4-溴-2-噻吩基)环丙烷甲酸甲酯(3g，11.5mmol，1当量)在乙醇(30mL)中的混合物中添加硼氢化钠(2.17g，57.4mmol，5当量)和氯化钙(637.5mg，5.74mmol，0.5当量)，接着将反应升温至20℃，并且搅拌18h。TLC(PE:EA＝3:1，Rf＝0.16)显示所需产物。使用HCl(2N)将溶液调整至pH＝7，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1，70/30)来纯化以产生呈白色油状物的醇产物(2.4g，89.6％产率)。1H NMR(400MHz,CHCl3-d)δ＝7.05(s,1H),6.87(s,1H),3.69(s,2H),1.06-0.91(m,4H)。
在20℃下，在15psi的一氧化碳下，向[1-(4-溴-2-噻吩基)环丙基]甲醇(2.4g，10.29mmol，1当量)、TEA(51.5mmol，7.16mL，5当量)在DMF(30mL)和甲醇(6mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(3.77g，5.15mmol，0.5当量)。将混合物加热至60℃，并且搅拌16h。将溶液添加至EDTA(30mL，饱和)中，并且搅拌2h，接着用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝99/1至65/35)来纯化以产生呈灰色油状物的产物(2g，91.5％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.26(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.65(d,J＝3.8Hz,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.94(d,J＝3.8Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.03(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.99-4.72(m,4H),3.71-3.49(m,3H),3.06(s,1H),2.84(d,J＝8.2Hz,1H),2.26-2.07(m,6H),2.06-1.89(m,1H),1.69(d,J＝9.7Hz,1H),1.04-0.96(m,2H),0.92-0.84(m,2H)。
在标准条件下使5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酸甲酯(300mg，1.41mmol，1当量)皂化。将粗品通过制备型TLC来纯化以提供呈白色固体的羧酸(150mg，53.5％产率)。
按照方法B，使5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酸(38.1mg，192μmol，1.2当量)与胺1(80mg，160.2μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗品通过制备型TLC来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酰胺(32.5mg，33.4％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):607.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.14(t,J＝5.7Hz,1H),7.97(d,J＝1.5Hz,1H),7.89(s,1H),7.32(d,J＝1.5Hz,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(d,J＝8.6Hz,1H),5.50(q,J＝9.2Hz,2H),4.99-4.73(m,4H),3.70-3.50(m,3H),3.05(s,1H),2.83(d,J＝10.1Hz,1H),2.21(s,4H),2.17-2.07(m,1H),2.17-2.07(m,1H),2.05-1.93(m,1H),1.69(d,J＝11.0Hz,1H),1.00-0.91(m,2H),0.88-0.78(m,2H)。
实施例230：化合物488：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酰胺。
在0℃下，向先前制备的5-[1-(羟基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酸甲酯(400mg，1.88mmol，1当量)在DMF(4mL)中的混合物中添加氢化钠(376.9mg，9.42mmL,60％纯度，5当量)。将反应搅拌30min，随后添加碘代甲烷(5.65mmol，350μL 3当量)，并且将反应加热至20℃，并且搅拌1.5h。向溶液中添加饱和氯化铵(20mL)，随后用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(3×10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色油状物的甲基醚产物(300mg，粗品)，其不经纯化即被推进至下一步骤。
在标准条件下使5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酸甲酯(300mg，1.33mmol，1当量)皂化。将粗品通过制备型TLC来纯化以产生呈白色固体的产物(150mg，53.3％产率)。
按照方法B，使5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酸(40.8mg，192μmol，1.2当量)与胺1(80mg，160μmol，1当量，2HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酰胺(35.6mg，35.5％产率，99.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):621.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.15(t,J＝5.7Hz,1H),7.98(d,J＝1.3Hz,1H),7.89(s,1H),7.30(d,J＝1.5Hz,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.04(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.96-4.73(m,3H),3.71-3.53(m,1H),3.45(s,2H),3.28(s,3H),3.09(d,J＝10.6Hz,1H),2.85(d,J＝7.3Hz,1H),2.22(s,5H),2.08-1.93(m,1H),1.69(d,J＝11.4Hz,1H),1.01-0.96(m,2H),0.96-0.91(m,2H)。
实施例231：化合物489B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
在一定条件下，使Boc-哌啶A(100mg，195μmol，1当量)与5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(46.9mg，234μmol，1.2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的(3S,4R)-3-氟-4-[[2-[5-[[[5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(90mg，66.4％产率)。
向(3S,4R)-3-氟-4-[[2-[5-[[[5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(70mg，101μmol，1当量)在DCM(1mL)中的混合物中添加2,6-二甲基吡啶(300μmol，35mL，3当量)。在20℃下，在氮气下添加TMSI(30μmol，41mL，3当量)，并且将混合物搅拌20min。使用碳酸氢钠(饱和)将反应调整至pH达到7-8。将水相用DCM(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酰胺(22mg，36.7％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):595.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.21(t,J＝5.6Hz,1H),8.15(d,J＝1.3Hz,1H),7.90(s,1H),7.43(d,J＝1.5Hz,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.30(d,J＝7.9Hz,1H),6.05(d,J＝8.2Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.87-4.68(m,3H),3.20-3.12(m,1H),3.04(s,4H),2.88(br d,J＝14.3Hz,1H),2.78(br d,J＝14.1Hz,1H),2.65-2.59(m,1H),1.89-1.76(m,1H),1.71-1.60(m,1H),1.54(s,6H)。
实施例232：化合物490B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
使用与用于以上另一对映异构体的程序相同的程序从Boc-哌啶B制备该类似物。N-{[3-(4-{[(3R,4S)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺，LC-MS(ES+,m/z):595.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.21(t,J＝5.6Hz,1H),8.15(d,J＝1.3Hz,1H),7.90(s,1H),7.43(d,J＝1.5Hz,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.30(d,J＝7.9Hz,1H),6.05(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.87-4.68(m,3H),3.78-3.64(m,1H),3.19-3.12(m,1H),3.06-2.97(m,4H),2.90-2.74(m,1H),2.07(s,1H),1.91(s,1H),1.89-1.76(m,1H),1.69-1.61(m,1H),1.54(s,6H)。
实施例233：THP-胺A和THP-胺B的制备
在25℃下，在氮气下，向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(3g，6.31mmol，1当量)和3-氟四氢吡喃-4-酮(1.49g，12.6mmol，2当量)在乙酸(45mL)和DCE(15mL)中的混合物中一次性添加三乙酰氧基硼氢化钠(4.01g，18.9mmol，3当量)。在50℃下将混合物加热和搅拌2h。使用饱和碳酸钠将反应混合物调整至pH 9，接着用DCM(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×300mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(中性条件:柱：Welch Xtimate C18 250×70mm#10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]B％：42％-62％，28min)来纯化以提供分离的顺式和反式产物。
顺式产物(6.1g，62.7％产率)，黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.92(s,1H),7.83-7.64(t,J＝5.6Hz,1H),7.17-7.08(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.87(d,J＝8.0Hz,1H),6.49-6.32(d,J＝7.6Hz,1H),6.17-6.02(d,J＝8.4Hz,1H),5.60-5.40(dt,J＝17.6Hz,2H),4.92-4.65(d,J＝48.8Hz,1H),4.60-4.39(d,J＝5.6Hz,2H),4.02-3.79(m,3H),3.73-3.44(m,2H),2.16-2.00(m,1H),1.77-1.62(m,1H),1.41(s,9H)。
反式产物(1.4g，14.4％产率)，黄色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.82(s,1H),7.77-7.71(t,J＝5.6Hz,1H),7.21-7.08(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.82(d,J＝8.4Hz,1H),6.38-6.30(d,J＝7.6H,1H),6.25-6.11(d,J＝8.0Hz,1H),5.59-5.36(dt,J＝17.6Hz,2H),4.67-4.41(m,3H),4.12-4.00(m,1H),3.94-3.78(m,2H),3.59-3.39(m,2H),2.17-2.04(m,1H),1.63-1.52(m,1H),1.43-1.18(m,9H)。
将顺式-((3-(4-(((3R,4R)-3-氟四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯通过SFC(条件：柱：DAICELCHIRALPAK AD(250mm×30mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O IPA]B％：56％-56％)来分离以提供单独对映异构体。
Boc-胺A：顺式-((3-(4-(((3R,4R)-3-氟四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(3.1g，43.7％产率)，呈黄色固体形式。Boc-胺B：顺式-((3-(4-(((3S,4S)-3-氟四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(3.2g，45.1％产率)，呈黄色固体形式。
在相同条件下将拆分的顺式对映异构体中的每一者分别脱保护。向(Boc-胺A)N-[[3-[4-[[(3R,4R)-3-氟四氢吡喃-4-基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(2.0g，3.9mmol，1当量)在甲醇(20mL)中的溶液中添加HCl(甲醇)(4M，120mL，123.2当量)。在20℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物真空浓缩以提供所需胺盐酸盐。
THP-胺A 2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3R,4R)-3-氟四氢吡喃-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(2.0g，98.2％产率，3HCl)，呈黄色固体形式。THP-胺B2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4S)-3-氟四氢吡喃-4-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(2.0g，93.6％产率，3HCl)。
实施例234：化合物491B：N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺
在25℃下，在氮气下，向THP-胺A(100mg，222μmol，1当量，HCl)和先前制备的1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酸(56.4mg，267μmol，1.2当量)在DMF(5mL)中的混合物中一次性添加HOBt(60.1mg，445μmol，2当量)、EDCI(85.2mg，445μmol，2当量)和DIPEA(2.23mmol，390μL 10当量)。在50℃下将混合物搅拌12h。将水(50mL)倾倒至混合物中，并且将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝40:1)来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(4-甲基氧杂环己烷-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺，48.4％产率。LC-MS(ES+,m/z):605.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.68(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.58(t,J＝2.0Hz,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),7.02(t,J＝2.7Hz,1H),6.90(d,J＝8.4Hz,1H),6.55(dd,J＝1.7,2.9Hz,1H),6.35(d,J＝7.8Hz,1H),6.10(d,J＝8.3Hz,1H),5.58-5.43(m,2H),4.87-4.68(m,3H),4.05-3.83(m,3H),3.72-3.61(m,3H),3.60-3.52(m,3H),2.20-2.08(m,3H),1.91(br dd,J＝3.2,9.7Hz,2H),1.67(br d,J＝9.9Hz,1H),1.43(s,3H)。
实施例235：化合物492B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
向1-叔丁基吡咯-3-甲酸(65.7mg，373μmol，1.2当量)在DMF(4mL)中的溶液中添加PYBOP(242.9mg，467μmol，1.5当量)和DIEA(3.11mmol，540μL 10当量)。接着将THP-胺B(140mg，311μmol，1当量，HCl)添加至混合物中，在25℃下搅拌1h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用EA(2×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以产生所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(52.7mg，29.9％产率，99.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):563.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.63(t,J＝5.6Hz,1H),7.86(s,1H),7.52(t,J＝2.0Hz,1H),7.17-7.06(m,1H),6.97(t,J＝2.6Hz,1H),6.87(d,J＝8.4Hz,1H),6.48(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.32(d,J＝7.9Hz,1H),6.07(d,J＝8.4Hz,1H),5.48(q,J＝8.9Hz,2H),4.85-4.66(m,3H),4.04-3.76(m,3H),3.68-3.43(m,2H),2.01(br dd,J＝4.3,12.5Hz,1H),1.65(br dd,J＝4.1,13.6Hz,1H),1.47(s,9H)。
实施例236：化合物493B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
在与另一对映异构体相同的条件下，使用THP-胺A(150mg，1当量，HCl)制备3R,4R对映异构体以提供所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺，29.2％产率。LC-MS(ES+,m/z):563.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.65(t,J＝5.7Hz,1H),7.89(s,1H),7.55(t,J＝2.1Hz,1H),7.18-7.06(m,1H),6.99(t,J＝2.6Hz,1H),6.89(d,J＝8.4Hz,1H),6.50(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.35(d,J＝7.7Hz,1H),6.09(d,J＝8.4Hz,1H),5.51(q,J＝9.0Hz,2H),4.89-4.68(m,3H),4.05-3.90(m,2H),3.83(br s,1H),3.70-3.55(m,1H),3.51(br t,J＝11.4Hz,1H),2.10-1.96(m,1H),1.74-1.63(m,1H),1.49(s,9H)。
实施例237：化合物494B：N-((3-(4-(((3R,4R)-3-氟四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)-1-(4-甲基四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺
在与用于对映异构体的条件相同的条件下使THP-胺B(150mg，333μmol，1当量，HCl)和1-(4-甲基四氢吡喃-4-基)吡咯-3-甲酸(84.6mg，400μmol，1.2当量)偶联，以提供所需产物N-((3-(4-(((3R,4R)-3-氟四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基)甲基)-1-(4-甲基四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡咯-3-甲酰胺(51.2mg，24.2％产率，95.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):605.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.67(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.59(t,J＝2.0Hz,1H),7.17-7.09(m,1H),7.02(t,J＝2.6Hz,1H),6.90(d,J＝8.4Hz,1H),6.55(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.35(d,J＝7.7Hz,1H),6.09(d,J＝8.4Hz,1H),5.51(q,J＝8.9Hz,2H),4.93-4.69(m,3H),4.03-3.79(m,3H),3.71-3.62(m,1H),3.71-3.46(m,5H),2.18-2.09(m,2H),2.06-1.98(m,1H),1.92(ddd,J＝3.3,6.7,13.4Hz,2H),1.67(br dd,J＝3.5,12.8Hz,1H),1.46-1.40(m,3H)。
实施例238：化合物495B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
向THP-胺A(0.14g，311μmol，1当量，HCl)和先前制备的1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(72.9mg，373μmol，1.2当量)在DMF(1mL)中的溶液中添加PYBOP(323.9mg，622.5μmol，2当量)和DIPEA(3.10mmol，540μL 10当量)。在20℃下将混合物搅拌20min。将反应混合物用水(10mL)淬灭，并且用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×3)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺，32.6％产率。LC-MS(ES+,m/z):591.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.79-8.48(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.45(s,1H),7.27-7.07(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.75(m,2H),6.60-6.41(t,J＝2.0Hz,1H),6.39-6.26(d,J＝8.0Hz,1H),6.15-5.99(d,J＝8.4Hz,1H),5.60-5.39(dt,J＝17.6Hz,2H),4.88-4.59(m,3H),4.04-3.77(m,3H),3.71-3.44(m,4H),3.32(s,3H),2.11-1.96(m,1H),1.73-1.61(m,1H),1.14-0.92(m,4H)。
实施例239：化合物496B：N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
使用与用于另一对映异构体的程序相同的程序，从THP-胺B和1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸获得所需产物以提供N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺，29.9％产率。LC-MS(ES+,m/z):591.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.70(t,J＝5.7Hz,1H),7.89(s,1H),7.45(t,J＝1.9Hz,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.94-6.85(m,2H),6.46(dd,J＝1.8,2.8Hz,1H),6.35(d,J＝7.9Hz,1H),6.11(br d,J＝8.4Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.89-4.70(m,3H),3.99(br t,J＝12.2Hz,1H),3.94-3.79(m,2H),3.70-3.55(m,1H),3.54-3.48(m,1H),3.46(s,2H),3.21(s,3H),2.03(br dd,J＝4.5,12.3Hz,1H),1.73-1.61(m,1H),1.13-1.07(m,2H),1.04-0.96(m,2H)。
实施例240：化合物497B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺
遵循与用于以上类似物的程序相同的程序，使用THP-胺A和1-叔丁基吡唑-4-甲酸制备该类似物以产生所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺，39.9％产率。LC-MS(ES+,m/z):564.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.11-8.72(t,J＝5.6Hz,1H),8.34(s,1H),7.93(s,1H),7.89(s,1H),7.18-7.08(t,J＝8.0Hz,1H),6.94-6.82(d,J＝8.0Hz,1H),6.41-6.30(d,J＝8.0Hz,1H),6.14-6.03(d,J＝8.0Hz,1H),5.58-5.42(dt,J＝17.6Hz,2H),4.88-4.71(m,3H),4.05-3.78(m,3H),3.71-3.45(m,2H),2.08-1.97(m,1H),1.72-1.60(m,1H),1.54(s,9H)。
实施例241：化合物498B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺
遵循与用于对映异构体的程序相同的程序，使用THP-胺B和1-叔丁基吡唑-4-甲酸制备该类似物以产生所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺，29.0％产率。LC-MS(ES+,m/z):564.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98(t,J＝5.6Hz,1H),8.34(s,1H),7.93(s,1H),7.89(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.90(d,J＝8.2Hz,1H),6.35(d,J＝7.8Hz,1H),6.11(d,J＝8.3Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.90-4.70(m,3H),3.99(br t,J＝12.2Hz,1H),3.94-3.77(m,1H),3.70-3.55(m,1H),3.51(br t,J＝11.6Hz,1H),2.03(br dd,J＝4.4,12.5Hz,1H),1.73-1.62(m,1H),1.54(s,9H)。
实施例242：化合物557B：6-(二甲基氨基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}吡啶-3-甲酰胺
在20℃下，向6-(二甲基氨基)吡啶-3-甲酸(30.2mg，181.5μmol，1.2当量)在DMF(1mL)中的溶液中添加HATU(115mg，302.4μmol，2当量)和TEA(1.51mmol，210mL，10当量)。在这个温度下将混合物搅拌10min，接着在20℃下添加胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)。在20℃下将所得混合物搅拌10min，接着通过添加水(100mL)来淬灭，并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物6-(二甲基氨基)-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}吡啶-3-甲酰胺(30mg，33.8％产率，98％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):575.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.13(t,J＝5.6Hz,1H),8.74-8.59(d,J＝2.0Hz,1H),8.06-7.95(dt,J＝8.8Hz,1H),7.90(s,1H),7.24-7.08(t,J＝8.0Hz,1H),7.00-6.81(d,J＝8.8Hz,1H),6.75-6.65(d,J＝8.4Hz,1H),6.39-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.10-5.93(d,J＝8.4Hz,1H),5.62-5.38(dt,J＝17.6Hz,2H),4.96-4.70(m,3H),3.66-3.52(m,1H),3.14(br s,6H),3.07-3.00(m,1H),2.87-2.78(m,1H),2.32-2.15(m,4H),2.12-2.06(m,1H),2.04-1.94(m,1H),1.73-1.62(m,1H)。
实施例243：化合物499B：N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
遵循与用于以上类似物的程序相同的程序，按照方法D，使用THP-胺B和先前制备的5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸制备该类似物以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4S)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺，28.6％产率。LC-MS(ES+,m/z):564.2[(M-OMe)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.24(t,J＝5.4Hz,1H),8.16(d,J＝1.2Hz,1H),7.90(s,1H),7.44(d,J＝1.2Hz,1H),7.16-7.09(m,1H),6.90(d,J＝8.3Hz,1H),6.35(d,J＝7.9Hz,1H),6.12(d,J＝8.2Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.88-4.72(m,3H),4.04-3.95(m,1H),3.94-3.79(m,2H),3.70-3.55(m,1H),3.51(br t,J＝11.4Hz,1H),3.04(s,3H),2.02(br dd,J＝4.4,12.5Hz,1H),1.67(br dd,J＝3.0,12.8Hz,1H),1.54(s,6H)。
实施例244：化合物500B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
遵循与用于对映异构体的程序相同的程序，按照方法D，使用THP-胺B和先前制备的5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸制备该类似物以产生所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺，28.6％产率。LC-MS(ES+,m/z):596.2[(M-OMe)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.24(t,J＝5.4Hz,1H),8.16(d,J＝1.2Hz,1H),7.90(s,1H),7.44(d,J＝1.2Hz,1H),7.16-7.09(m,1H),6.90(d,J＝8.3Hz,1H),6.35(d,J＝7.9Hz,1H),6.12(d,J＝8.2Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.88-4.72(m,3H),4.04-3.95(m,1H),3.94-3.79(m,2H),3.70-3.55(m,1H),3.51(br t,J＝11.4Hz,1H),3.04(s,3H),2.02(br dd,J＝4.4,12.5Hz,1H),1.67(br dd,J＝3.0,12.8Hz,1H),1.54(s,6H)。
实施例245：化合物501B：6-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}吡啶-3-甲酰胺
按照方法B，使6-叔丁基吡啶-3-甲酸(32.5mg，181μmol，1.2当量)与胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物6-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}吡啶-3-甲酰胺(30mg，32.8％产率，97％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):588.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.69-9.39(t,J＝5.6Hz,1H),9.12-8.97(d,J＝2.4Hz,1H),8.33-8.14(dt,J＝8.4Hz,1H),7.89(s,1H),7.72-7.54(d,J＝8.4Hz,1H),7.27-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.97-6.82(d,J＝8.4Hz,1H),6.35-6.22(d,J＝8.0Hz,1H),6.08-5.95(d,J＝8.4Hz,1H),5.68-5.39(dt,J＝17.6Hz,2H),5.00-4.69(m,3H),3.67-3.51(m,1H),3.12-2.99(m,1H),2.88-2.76(m,1H),2.29-2.15(m,4H),2.12-1.94(m,2H),1.72-1.62(m,1H),1.34(s,9H)。
实施例246：化合物502B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
按照方法A，使Boc-胺A(60mg，117μmol，1当量)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(23.5mg，140.5μmol，1.2当量)的混合物偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈白色固体的中间体(3S,4R)-4-[[2-[5-[[(1-叔丁基吡咯-3-羰基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(50mg，75.6μmol，64.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):661.3[(M+H)+]。
将(3S,4R)-4-[[2-[5-[[(1-叔丁基吡咯-3-羰基)氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]-3-氟-哌啶-1-甲酸叔丁酯(40mg，60.5μmol，1当量)添加至HCl/EA(4M，1mL，66当量)中，并且在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌0.5h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。将残余物用5mL EA洗涤以提供呈白色固体的1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(23.3mg，64.5％产率，100％纯度，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):561.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.24-9.09(m,1H),8.73-8.56(m,2H),7.88(s,1H),7.59-7.53(m,1H),7.15(t,J＝8.0Hz,1H),7.03-6.90(m,2H),6.54-6.47(m,1H),6.35(d,J＝8.1Hz,1H),6.30-6.15(m,1H),6.31-6.12(m,1H),5.60-5.45(m,2H),5.24-4.98(m,1H),4.73(d,J＝5.5Hz,2H),4.07-3.86(m,1H),3.68-3.52(m,1H),3.50-3.36(m,2H),3.19-3.01(m,1H),2.23-2.04(m,1H),1.98-1.84(m,1H),1.50-1.40(m,9H)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.83(s,1H),7.52(t,J＝2.1Hz,1H),7.18-7.11(m,1H),6.98(t,J＝2.6Hz,1H),6.91(d,J＝8.4Hz,1H),6.49(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.35(d,J＝8.2Hz,1H),5.48(q,J＝8.5Hz,2H),5.03(br s,1H),4.70(s,2H),4.03-3.88(m,1H),3.62-3.58(m,1H),3.43-3.30(m,2H),3.13-3.06(m,1H),3.11-3.03(m,1H),2.20-2.02(m,1H),1.93(br d,J＝11.5Hz,1H),1.45(br s,9H)。
实施例247：化合物503B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酰胺
按照方法B，使5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酸(29mg，137μmol，1当量)与Boc-胺A(70mg，137μmol，1当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(PE/EA＝1:2)来纯化以提供呈黄色固体的中间体(60mg，62.2％产率)。
向(3S,4R)-3-氟-4-[[2-[5-[[[5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-羰基]氨基]甲基]-1,2,4-噁二唑-3-基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-基]氨基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(60mg，84.9μmol，1当量)在EA(2mL)中的溶液中添加HCl(EA)(4M，6mL)。在20℃下将混合物搅拌0.5h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物。将粗产物用EA(10mL)湿磨10min，并且将固体过滤并干燥以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-2-甲酰胺(30mg，55.3％产率，95％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):607.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.37-9.25(t,J＝5.6Hz,1H),9.17-9.03(m,1H),8.83-8.51(m,1H),7.89(s,1H),7.74-7.60(d,J＝4.0Hz,1H),7.23-7.08(d,J＝8.0Hz,1H),6.99-6.88(m,2H),6.45-6.31(d,J＝7.6Hz,1H),6.29-6.19(d,J＝8.0Hz,1H),5.67-5.40(dt,J＝17.6Hz,2H),5.24-4.95(d,J＝46.8Hz,1H),4.85-4.70(d,J＝6.0Hz,2H),4.06-3.86(m,1H),3.64-3.54(m,1H),3.47(s,2H),3.45(br s,1H),3.27(s,3H),3.15-3.03(m,1H),2.20-2.06(m,1H),1.97-1.84(m,1H),1.06-0.94(m,4H)。
实施例248：3-甲基-胺A和3-甲基-胺B的合成
在25℃下，在氮气下，向先前制备的N-[[3-[4-氨基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(3g，7.29mmol，1当量)和1,3-二甲基哌啶-4-酮(2.78g，21.9mmol，3当量)在乙酸(45mL)和DCE(15mL)中的混合物中添加三乙酰氧基硼氢化钠(4.64g，21.9mmol，3当量)。在50℃下将混合物搅拌2h。将碳酸钠(饱和)添加至混合物中，并且将pH调整至8-10，接着用水(500mL)稀释，并且用(250mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，DCM:甲醇＝50/1至10/1)来纯化以提供N-[[3-[4-[(1,3-二甲基-4-哌啶基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(3.2g，84.0％产率)，其是白色固体，呈立体异构体的混合物形式。
将N-[[3-[4-[(1,3-二甲基-4-哌啶基)氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(3.8g)通过SFC(柱：REGIS(s,s)WHELK-O1(250mm×50mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O ETOH]；B％：42％)来纯化。将残余物通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK AD(250mm×30mm，10um)；流动相：[0.1％NH3H2O IPA]；B％：55％)来进一步纯化以提供分离的顺式异构体。获得了呈白色固体的N-[[3-[4-[[(3S,4R)-1,3-二甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(1.3，34.2％产率)。
反式(外消旋)：获得了呈白色固体的N-[[3-[4-[[(3R,4R)-1,3-二甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(0.85g，22.4％产率)。获得了呈白色固体的N-[[3-[4-[[(3R,4S)-1,3-二甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(1.3g，34.2％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.00(s,1H),7.82-7.90(m,1H),7.19-7.15(m,1H),6.91-6.89(d,J＝8.0Hz,1H),6.30-6.26(m,1H),5.86(s,1H),5.59-5.53(m,1H),4.59-4.58(d,J＝8.0Hz,2H),3.64(s,1H),2.79-2.73(m,2H),2.29(s,4H),2.01-1.94(m,1H),1.69-1.63(m,1H),1.35(s,2H),1.00-0.99(d,J＝4Hz,3H)。将N-[[3-[4-[[(3S,4R)-1,3-二甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(1.3g，2.49mmol，1当量)添加至HCl(甲醇)(4M，50.00mL，80.4当量)中，并且在25℃下将反应搅拌0.5h。将反应混合物真空浓缩以产生所需对映异构纯的顺式产物。
3-甲基胺A：获得了呈白色固体的2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3S,4R)-1,3-二甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(1.3g，粗品，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):423.2[(M+H)+]。3-甲基胺B：合成遵循与用于对映异构体的程序相同的程序以提供以白色固体形式获得的2-[5-(氨基甲基)-1,2,4-噁二唑-3-基]-N-[(3R,4S)-1,3-二甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(1.3g，粗品，HCl)。LC-MS(ES+,m/z):423.2[(M+H)+]。
实施例249：化合物504B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺
按照方法A，使3-甲基-胺A(140mg，275μmol，1当量，HCl)与1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]吡咯-3-甲酸(64.3mg，329μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-[1-(甲氧基甲基)环丙基]-1H-吡咯-3-甲酰胺(70mg，42.5％产率)。LC-MS(ES+,m:z):600.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.77-8.61(m,1H),7.96-7.87(m,1H),7.52-7.43(m,1H),7.17-7.07(m,1H),6.89-6.85(m,1H),6.85-6.80(m,1H),6.50-6.44(m,1H),6.27-6.17(m,1H),5.84-5.75(m,1H),5.55-5.42(m,2H),4.76-4.68(m,2H),3.60-3.51(m,1H),3.49-3.45(m,2H),3.41-3.36(m,1H),3.25-3.19(m,3H),2.67(br s,1H),2.61-2.56(m,1H),2.25-2.06(m,5H),1.96-1.82(m,1H),1.66-1.50(m,1H),1.11-0.98(m,4H),0.92(d,J＝6.8Hz,3H)。
实施例250：化合物506B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
按照方法A，使THP-胺A(140mg，339μmol，1当量)与5-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(81.4mg，406.42μmol，1.2当量)在DMF(5mL)中偶联。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝1:1；Rf＝0.3)来纯化以提供所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-甲氧基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺(54.9mg，95.8％纯度，26％产率)。LC-MS(ES+,m/z):596.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.38(t,J＝5.7Hz,1H),7.90(s,1H),7.71(d,J＝3.8Hz,1H),7.13(t,J＝8.0Hz,1H),7.07(d,J＝3.9Hz,1H),6.90(d,J＝8.3Hz,1H),6.35(d,J＝7.9Hz,1H),6.11(br d,J＝8.4Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.90-4.71(m,3H),3.99(brt,J＝12.0Hz,1H),3.94-3.78(m,2H),3.71-3.55(m,1H),3.54-3.46(m,1H),3.06(s,3H),2.02(br dd,J＝4.2,12.7Hz,1H),1.71-1.64(m,1H),1.53(s,6H)。
实施例251：化合物507B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酰胺
按照方法D，使5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酸(36.3mg，171μmol，1.1当量)与THP-胺A(70mg，156μmol，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:2)来纯化以产生呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[1-(甲氧基甲基)环丙基]噻吩-3-甲酰胺(24.3mg，25.7％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):608.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.16(t,J＝5.6Hz,1H),7.99(d,J＝1.2Hz,1H),7.93-7.85(m,1H),7.31(d,J＝1.3Hz,1H),7.13(t,J＝8.0Hz,1H),6.90(d,J＝8.3Hz,1H),6.35(d,J＝7.8Hz,1H),6.12(d,J＝8.3Hz,1H),5.61-5.45(m,2H),4.88-4.69(m,3H),4.05-3.77(m,3H),3.67(br d,J＝13.1Hz,2H),3.46(s,2H),3.28(s,3H),2.02(br s,1H),1.69(br d,J＝2.9Hz,1H),1.06-0.90(m,4H)。
实施例252：化合物508B：N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
按照方法A，使THP-胺A(70mg，153μmol，1当量，HCl)与5-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(65.4mg，305μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3R,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺(30mg，32.0％产率，99％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):610.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.31-9.07(t,J＝5.6Hz,1H),8.17-7.96(d,J＝0.8Hz,1H),7.89(s,1H),7.45-7.25(d,J＝1.2Hz,1H),7.19-7.04(t,J＝8.0Hz,1H),6.95-6.77(t,J＝8.4Hz,1H),6.40-6.27(t,J＝7.6Hz,1H),6.17-5.91(t,J＝7.6Hz,1H),5.74-5.27(dt,J＝17.6Hz,,2H),4.95-4.63(m,3H),4.06-3.78(m,3H),3.68-3.46(m,2H),3.33-3.31(m,2H),3.26(s,3H),2.07-1.97(m,1H),1.71-1.62(m,1H),1.32(s,6H)。
实施例253：化合物509B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-羟基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
按照方法A，使3-甲基胺A(150mg，327μmol，1当量，HCl)与5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-2-甲酸(73.1mg，392μmol，1.2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供以黄色固体形式获得的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-羟基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺(62mg，30.8％产率，96％纯度)。LC-MS(ES+,m:z):591.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.36-9.13(t,J＝4.8Hz,1H),7.91(s,1H),7.71-7.55(d,J＝4.0Hz,1H),7.25-7.04(t,J＝4.0Hz,1H),7.03-6.92(d,J＝4.0Hz,1H),6.89-6.75(d,J＝8.4Hz,1H),6.30-6.14(d,J＝8.4Hz,1H),5.85-5.71(m,1H),5.62(s,1H),5.55-5.40(dt,J＝17.6Hz,2H),4.85-4.72(d,J＝9.6Hz,2H),3.67-3.49(m,1H),2.76-2.66(m,2H),2.29-2.05(m,6H),1.94-1.86(m,1H),1.66-1.56(m,1H),1.50(s,6H),0.95-0.87(d,J＝6.8Hz,3H)。
实施例254：化合物510B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺
按照方法D，使3-甲基胺A(140mg，305μmol，1当量，HCl)与1-叔丁基吡唑-4-甲酸(61.6mg，366μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/甲醇＝10/1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(70.1mg，39.7％产率，99.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):573.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98(t,J＝5.7Hz,1H),8.34(s,1H),7.98-7.86(m,2H),7.19-7.03(m,1H),6.84(d,J＝8.1Hz,1H),6.22(d,J＝7.8Hz,1H),5.79(s,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.78(d,J＝5.6Hz,2H),3.67-3.50(m,1H),2.89-2.67(m,1H),2.30-2.07(m,4H),2.01-1.82(m,1H),1.74-1.59(m,1H),1.54(s,10H),1.58-1.46(m,1H),0.92(d,J＝7.0Hz,3H)。
实施例255：化合物511B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺
使用与用于对映异构体的程序相同的程序制备该类似物。3-甲基胺B(150mg，355μmol，1当量，HCl)和1-叔丁基吡唑-4-甲酸(65.7mg，391μmol，1.1当量)提供了呈黄色固体的所需产物(69.2mg，33.5％产率，98.6％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):573.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98(t,J＝5.6Hz,1H),8.34(s,1H),7.98-7.84(m,2H),7.11(t,J＝8.1Hz,1H),6.85(d,J＝8.1Hz,1H),6.23(d,J＝7.8Hz,1H),5.78(s,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.78(d,J＝5.6Hz,2H),3.64(s,1H),2.88-2.71(m,1H),2.33(s,2H),2.23(s,2H),1.99-1.87(m,1H),1.68(d,J＝13.6Hz,1H),1.54(s,9H),0.92(d,J＝7.0Hz,3H)。
实施例256：化合物512B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟氧杂环己烷-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
使用方法D，使1-叔丁基吡咯-3-甲酸(32.7mg，186μmol，1.1当量)与先前制备的反式3-氟-THP中间体(76mg，169μmol，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以提供所需产物
(20mg，20.2％产率，95.8％纯度)，呈白色固体形式。LC-MS(ES+,m/z):563.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(t,J＝5.6Hz,1H),7.79(s,1H),7.55(t,J＝2.0Hz,1H),7.21-7.05(m,1H),6.99(t,J＝2.7Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.51(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.33(d,J＝7.8Hz,1H),6.17(d,J＝7.9Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.74(d,J＝5.6Hz,2H),4.60(dt,J＝4.5,8.0Hz,1H),4.03(dt,J＝4.3,10.8Hz,1H),3.94-3.73(m,2H),3.58-3.34(m,2H),2.32-2.04(m,1H),1.65-1.42(m,9H)。
实施例257：化合物513B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
按照方法A，使3-甲基胺B(150mg，355μmol，1当量)与1-叔丁基吡咯-3-甲酸(71.2mg，426μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(60mg，28.8％产率，97.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):572.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.72-8.59(m,1H),8.69-8.53(m,1H),7.91(s,1H),7.55(s,1H),7.19-7.05(m,1H),6.99(t,J＝2.6Hz,1H),6.83(br d,J＝8.2Hz,1H),6.57-6.44(m,1H),6.22(br d,J＝7.5Hz,1H),5.88-5.70(m,1H),5.59-5.39(m,2H),4.73(d,J＝5.7Hz,2H),3.69-3.45(m,1H),3.29(s,1H),2.85-2.71(m,1H),2.63-2.57(m,1H),2.33-2.06(m,5H),1.98-1.85(m,1H),1.67-1.55(m,1H),1.49(s,9H),0.92(d,J＝6.8Hz,3H)。
实施例258：化合物514B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
使用与用于对映异构体的程序相同的程序制备该类似物。3-甲基胺A(140mg，305μmol，1当量，HCl)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(61.2mg，366μmol，1.2当量)提供了所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(63.9mg，36.6％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):572.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.64(t,J＝5.6Hz,1H),7.91(s,1H),7.55(t,J＝1.9Hz,1H),7.10(t,J＝8.0Hz,1H),6.99(t,J＝2.5Hz,1H),6.83(br d,J＝8.8Hz,1H),6.50(dd,J＝1.8,2.9Hz,1H),6.27-6.18(m,1H),5.84-5.73(m,1H),5.49(q,J＝9.0Hz,2H),4.73(d,J＝5.5Hz,2H),3.66-3.52(m,1H),3.29(br s,1H),2.79-2.69(m,1H),2.57(br d,J＝1.3Hz,1H),2.36-2.09(m,4H),1.99-1.83(m,1H),1.67-1.56(m,1H),1.49(s,9H),0.92(d,J＝6.8Hz,3H)。
实施例259：化合物515B：N-{[3-(4-{[(3R,4S)-1,3-二甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(2-羟基丙烷-2-基)噻吩-2-甲酰胺
使用与用于对映异构体的程序相同的程序制备该类似物。3-甲基胺A提供了所需产物，32.3％产率。LC-MS(ES+,m/z):591.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.27(brt,J＝5.4Hz,1H),7.91(s,1H),7.66(d,J＝3.7Hz,1H),7.10(t,J＝7.9Hz,1H),6.98(d,J＝3.7Hz,1H),6.83(br d,J＝8.4Hz,1H),6.21(br d,J＝7.7Hz,1H),5.85-5.74(m,1H),5.62(s,1H),5.49(q,J＝8.5Hz,2H),4.80(br d,J＝5.5Hz,2H),3.56(br s,1H),3.31-3.28(m,1H),2.79-2.64(m,2H),2.21(br s,5H),1.90(br d,J＝9.7Hz,1H),1.61(br s,1H),1.50(s,6H),0.92(br d,J＝6.8Hz,3H)。
实施例260：化合物516B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-{8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
在密封管中，在110℃下，将2-溴噻唑-4-甲酸(0.5g，2.40mmol，1当量)、(1R,5S)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷(251.7mg，1.68mmol，0.7当量，HCl)和DIEA(57.4mmol，10mL，23.9当量)的混合物搅拌15h。将反应混合物真空浓缩以产生残余物，将其通过制备型HPLC(柱：Phenomenex luna C18 80×40mm×3um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]B％：4％-24％，7min)来纯化以提供呈黄色固体的产物(0.2g，41.2％产率，96％纯度，HCl)。LC-MS(ES+,m:z):241.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(0.13g，260μmol，1当量，2HCl)与2-(8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)噻唑-4-甲酸(86.5mg，312μmol，1.2当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(PE:EA＝5:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-{8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺(55.2mg，32.7％产率，98.5％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):640.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98-8.83(t,J＝2.0Hz,1H),7.89(s,1H),7.50(s,1H),7.17-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.95-6.81(d,J＝8.0Hz,1H),6.40-6.22(d,J＝7.6Hz,,1H),6.14-5.94(d,J＝8.0Hz,1H),5.66-5.38(dt,J＝17.6Hz,2H),4.94-4.73(m,3H),4.54-4.39(m,2H),3.67-3.51(m,3H),3.26-3.20(m,2H),3.08-2.99(m,1H),2.88-2.76(m,1H),2.31-2.17(m,4H),2.14-2.06(m,1H),2.05-1.96(m,1H),1.93-1.84(m,2H),1.83-1.73(m,2H),1.72-1.63(m,1H)。
实施例261：化合物517B：2-[(2S,6S)-2,6-二甲基吗啉-4-基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用与用于先前描述的8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷类似物的过程相同的过程制备该类似物。2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和外消旋反式-(2S,6S)-2,6-二甲基吗啉(1g，8.68mmol，1mL，3.6当量)在HPLC纯化之后提供了呈黄色固体的产物2-[(2S,6S)-2,6-二甲基吗啉-4-基]噻唑-4-甲酸(300mg，51.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):243.1[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(140mg，280μmol，1当量，2HCl)与2-[(2S,6S)-2,6-二甲基吗啉-4-基]噻唑-4-甲酸(101.9mg，421μmol，1.5当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM/MEOH＝10/1)来纯化以提供呈白色固体的2-[(2S,6S)-2,6-二甲基吗啉-4-基]-N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]噻唑-4-甲酰胺(59.4mg，30.9％产率，95％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):651.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.93(t,J＝6.0Hz,1H),7.89(s,1H),7.51(s,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(d,J＝8.3Hz,1H),5.50(q,J＝9.0Hz,2H),4.96-4.72(m,3H),4.15-4.01(m,2H),3.60(dd,J＝3.3,12.5Hz,3H),3.18(dd,J＝6.1,12.5Hz,2H),3.06(s,1H),2.83(d,J＝9.7Hz,1H),2.29-2.08(m,5H),2.06-1.94(m,1H),2.06-1.94(m,1H),1.69(d,J＝10.9Hz,1H),1.19(d,J＝6.4Hz,6H)。
实施例262：化合物518B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(4-甲氧基哌啶-1-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
在密封管中，将2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和4-甲氧基哌啶(276.8mg，2.40mmol，1当量)添加至DIEA(17.2mmol，3mL，7.2当量)中，并且在110℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物通过氮气流来干燥以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(TFA条件：柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：5％-35％，10min)来纯化以提供呈白色固体的2-(4-甲氧基-1-哌啶基)噻唑-4-甲酸(500mg，85.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):242.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.98-8.52(m,1H),7.61(s,1H),3.70-3.61(m,2H),3.71-3.60(m,1H),3.10(br d,J＝7.1Hz,3H),2.98-2.88(m,1H),2.00-1.85(m,2H),1.71-1.61(m,1H),1.52(dtd,J＝4.1,8.6,12.8Hz,2H)。
按照方法A，使2-(4-甲氧基-1-哌啶基)噻唑-4-甲酸(109.93mg，454μmol，1.5当量)与胺1(140mg，302μmol，1当量，HCl)偶联。
将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝20:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(4-甲氧基哌啶-1-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺(55mg，27.8％产率，99.3％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):650.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.94(t,J＝6.0Hz,1H),7.90(s,1H),7.48(s,1H),7.11(t,J＝8.1Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.8Hz,1H),6.04(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.92-4.72(m,3H),3.79-3.69(m,2H),3.49-3.40(m,1H),3.29(s,3H),3.11-2.98(m,1H),2.82(brd,J＝10.1Hz,1H),1.72-1.63(m,1H),1.59-1.48(m,2H)。
实施例263：化合物519B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用与用于-甲氧基哌啶类似物的程序相同的程序制备氨基噻唑甲酸。2-溴噻唑-4-甲酸(0.5g，2.40mmol，1当量)和(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷(8.09mmol，1mL，3.4当量)提供了粗产物，将其通过制备型HPLC(柱：Welch Xtimate C18 150×25mm×5um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：1％-15％，8min)来纯化以提供呈黄色固体的产物(0.14g，19.9％产率，95.3％纯度，HCl)。LC-MS(ES+,m:z):243.0[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(0.05g，100μmol，1当量，2HCl)与2-[(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]噻唑-4-甲酸(35.2mg，120μmol，1.2当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝5:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺(20.7mg，31.8％产率，98.5％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):651.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.90-8.60(t,J＝6.0Hz,1H),7.89(s,1H),7.42(s,1H),7.19-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.92-6.73(d,J＝8.0Hz,1H),6.35-6.23(d,J＝8.0Hz,1H),6.12-5.97(d,J＝8.0Hz,1H),5.59-5.42(dt,J＝17.6Hz,2H),4.94-4.71(m,3H),4.09-3.94(m,1H),3.65-3.44(m,4H),3.39-3.34(m,1H),3.29(s,3H),3.10-2.99(m,1H),2.90-2.76(m,1H),2.32-2.15(m,4H),2.14-1.91(m,6H),1.75-1.62(m,1H)。
实施例264：化合物520B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(2R)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用与用于对映异构体的程序相同的程序制备该类似物。2-溴噻唑-4-甲酸(0.5g，2.40mmol，1当量)和(2R)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷(829mg，7.20mmol，3当量)在HPLC纯化之后提供了产物(0.5g，74.7％产率，HCl)。呈黄色固体形式。
按照方法E，使胺1(0.05g，100μmol，1当量，2HCl)和2-[(2R)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]噻唑-4-甲酸(33.5mg，120.2μmol，1.2当量，HCl)偶联。TLC(DCM:甲醇＝5:1，Rf＝0.6)指示形成一个新斑点。如同对于对映异构体那样将反应进行后处理和纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(2R)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺(25.6mg，39.3％产率，99.7％纯度)。LC-MS(ES+,m:z):651.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.85-8.67(t,J＝6.0Hz,1H),7.89(s,1H),7.42(s,1H),7.18-7.04(t,J＝8.0Hz,1H),6.93-6.75(d,J＝8.4Hz,1H),6.35-6.21(d,J＝8.0Hz,1H),6.11-5.94(d,J＝8.0Hz,1H),5.65-5.37(dt,J＝17.6Hz,2H),4.97-4.70(m,3H),4.12-3.97(m,1H),3.66-3.43(m,4H),3.40-3.33(m,1H),3.29(s,3H),3.11-3.00(m,1H),2.88-2.76(m,1H),2.33-2.16(m,4H),2.13-1.88(m,6H),1.78-1.62(m,1H)。
实施例265：化合物521B：3-乙基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,2-噁唑-5-甲酰胺
向在乙醇(1mL)中的3-乙基异噁唑-5-甲酸乙酯(80mg，473μmol，1当量)中添加氢氧化钠(3M，1mL，1当量)。在30℃下将混合物搅拌1h。在0℃下将反应混合物通过添加1N HCl以达到pH＝7来淬灭，接着真空浓缩以产生呈黄色固体的羧酸产物(200mg，59.9％产率)。LC-MS(ES+,m:z):139.9[(M+H)+]。
按照方法E，使胺1(70mg，121μmol，1当量，HCl)与3-乙基异噁唑-5-甲酸(85.4mg，120μmol，1当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的产物(22.6mg，34％产率)。LC-MS(ES+,m/z):550.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.62-9.49(t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.23-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.98-6.82(d,J＝8.4Hz,1H),6.65(s,1H),6.36-6.23(d,J＝8.0Hz,1H),6.07-5.93(d,J＝8.0Hz,1H),5.62-5.36(dt,J＝17.6Hz,2H),4.93-4.75(m,3H),3.70-3.50(m,1H),3.12-2.99(m,1H),2.89-2.78(m,3H),2.32-1.94(m,6H),1.75-1.63(m,1H),1.29-1.21(t,J＝7.2Hz,3H)。
实施例266：化合物552B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(3R)-3-甲氧基吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺
如同对于类似类似物诸如4-甲氧基哌啶那样制备氨基噻唑。2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和(3R)-3-甲氧基吡咯烷盐酸盐(500mg，3.63mmol，1.5当量)的反应在制备型HPLC(柱：Phenomenex Luna C18 100×30mm×5um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：1％-18％，10min)之后提供了呈白色固体的所需羧酸产物(250mg，45.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):229.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.58(d,J＝0.7Hz,1H),4.11(br d,J＝2.9Hz,1H),3.61-3.36(m,4H),3.31-3.23(m,3H),2.16-2.05(m,2H)。
按照方法A，使2-[(3R)-3-甲氧基吡咯烷-1-基]噻唑-4-甲酸(44.4mg，194μmol，1.5当量)和胺1(60mg，130μmol，1当量，HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝15:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(3R)-3-甲氧基吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺(25.8mg，30.6％产率，98.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):637.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.81(br t,J＝5.8Hz,1H),7.89(s,1H),7.42(d,J＝1.3Hz,1H),7.16-7.09(m,1H),6.88(br d,J＝8.6Hz,1H),6.28(d,J＝8.2Hz,1H),6.03(br d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.5Hz,2H),4.93-4.77(m,3H),4.16-4.08(m,1H),3.65-3.49(m,6H),3.28(d,J＝1.3Hz,3H),3.11-2.99(m,1H),2.86-2.78(m,1H),2.20(s,3H),2.13(br s,3H),2.05-1.95(m,1H),1.68(br d,J＝11.7Hz,1H)。
实施例267：化合物523B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(3S)-3-甲氧基吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用用于制备对映异构体的相同程序制备该类似物。2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)和(3S)-3-甲氧基吡咯烷(367mg，3.63mmol，1.5当量，HCl)在纯化之后提供了呈白色固体的产物(370mg，67.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):229.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.58(s,1H),4.11(br d,J＝2.4Hz,1H),3.60-3.39(m,4H),3.29-3.22(m,3H),2.17-2.04(m,2H)。
如同对于对映异构体那样使2-[(3S)-3-甲氧基吡咯烷-1-基]噻唑-4-甲酸(44.4mg，194μmol，1.5当量)和胺1(60mg，129.63μmol，纯度不适用，1当量，HCl)偶联，并且纯化以提供呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(3S)-3-甲氧基吡咯烷-1-基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺(4mg，4.7％产率，96.4％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):637.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)位移＝8.81(t,J＝6.1Hz,1H),7.89(s,1H),7.42(s,1H),7.15-7.05(m,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.28(d,J＝7.7Hz,1H),6.03(br d,J＝8.6Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.93-4.71(m,3H),4.12(br s,1H),3.67-3.50(m,4H),3.47-3.37(m,2H),3.27(s,3H),3.04(br s,1H),2.82(br d,J＝9.5Hz,1H),2.19(s,3H),2.13(brt,J＝9.0Hz,3H),2.04-1.94(m,1H),1.68(br d,J＝11.2Hz,1H)。
实施例268：化合物524B：5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-2-甲酰胺
按照方法E，使胺1(50mg，100μmol，1当量，2HCl)与5-叔丁基-1H-吡咯-2-甲酸(20.1mg，120μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(DCM:甲醇＝8:1)来纯化。将粗产物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：10％-60％，8min)来进一步纯化以提供呈黄色固体的所需产物5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-2-甲酰胺(22.6mg，75.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):576.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝11.13(s,1H),8.85-8.69(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.22-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.79(d,J＝8.4Hz,1H),6.77-6.67(dt,J＝3.6Hz,1H),6.30-6.21(d,J＝8.0Hz,1H),6.10-5.96(d,J＝8.4Hz,1H),5.92-5.79(dt,J＝3.4Hz,1H),5.64-5.34(dt,J＝18.0Hz,2H),4.94-4.64(m,3H),3.69-3.52(m,1H),3.03(br t,J＝10.5Hz,1H),2.88-2.74(m,1H),2.32-2.14(m,4H),2.14-2.06(m,1H),2.05-1.92(m,1H),1.72-1.59(m,1H),1.26(s,9H)。
实施例269：化合物525B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-{6-氧杂-3-氮杂双环[3.1.1]庚烷-3-基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用用于制备4-甲氧基哌啶类似物的相同条件制备所需羧酸。2-溴噻唑-4-甲酸(0.5g，2.40mmol，1当量)和6-氧杂-3-氮杂双环[3.1.1]庚烷(0.25g，1.84mmol，7.67e-1当量，HCl)提供了呈黄色油状物的2-(6-氧杂-3-氮杂双环[3.1.1]庚烷-3-基)噻唑-4-甲酸(0.1g，18.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):227.1[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(150mg，324μmol，1当量，HCl)和2-(6-氧杂-3-氮杂双环[3.1.1]庚烷-3-基)噻唑-4-甲酸(80.7mg，356μmol，1.1当量)偶联。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(丙烷-2-基)呋喃-3-甲酰胺(59.1mg，27.6％产率，96.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):651.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.86(t,J＝5.8Hz,1H),7.88(s,1H),7.48(s,1H),7.10(t,J＝8.2Hz,1H),6.87(d,J＝8.2Hz,1H),6.27(d,J＝7.9Hz,1H),6.01(br d,J＝8.6Hz,1H),5.54-5.41(m,2H),4.94-4.74(m,3H),4.71(d,J＝6.6Hz,2H),3.73-3.63(m,4H),3.63-3.49(m,1H),3.22-3.12(m,1H),3.09-2.97(m,1H),2.90-2.76(m,1H),2.38-2.17(m,4H),2.16-2.05(m,1H),2.02-1.91(m,2H),1.79-1.52(m,1H)。
实施例270：化合物526B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(丙烷-2-基)呋喃-3-甲酰胺
向5-溴呋喃-3-甲酸(500mg，2.62mmol，1当量)和2-异丙烯基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(440mg，2.62mmol，1当量)在二噁烷(4mL)和水(1mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(191.6mg，262μmol，0.1当量)和碳酸钠(832.5mg，7.85mmol，3当量)，并且在100℃下，在氮气下，将反应加热1h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(100mL)中。将水相用EA(30mL×3)萃取。向水相中添加HCl(3M)以调整pH＝4～5。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈浅黄色固体的烯烃产物(350mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):151.1[(M+H)+]。
在20℃下，向5-异丙烯基呋喃-3-甲酸(350mg，2.30mmol，1当量)在甲醇(4mL)中的混合物中添加5％Pd(C)(2.30mmol，1当量)，并且在20℃下，在H2(15psi)下，将反应搅拌12h。将残余物经硅藻土过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(HCl条件，柱：Phenomenex luna C18 80×40mm×3um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：22％-42％，7min)来纯化以提供呈白色固体的5-异丙基呋喃-3-甲酸(60mg，389μmol，16.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):153.1[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)和5-异丙基呋喃-3-甲酸(28mg，181μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-(丙烷-2-基)呋喃-3-甲酰胺(23.2mg，27.3％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):563.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.04(t,J＝5.7Hz,1H),8.13(s,1H),7.89(s,1H),7.12(t,J＝8.1Hz,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.51(s,1H),6.29(d,J＝7.8Hz,1H),6.03(d,J＝8.0Hz,1H),5.50(q,J＝9.1Hz,2H),4.93-4.75(m,3H),3.68-3.52(m,1H),3.11-3.02(m,1H),2.94(td,J＝6.6,13.7Hz,1H),2.88-2.79(m,1H),2.32-2.17(m,4H),2.16-2.07(m,1H),2.05-1.95(m,1H),1.69(brd,J＝11.9Hz,1H),1.21(d,J＝6.8Hz,6H)。
实施例271：化合物527B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-{2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷-6-基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
将2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，2.40mmol，1当量)、2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷(682mg，3.61mmol，1.5当量，草酸盐)、Xantphos(139.1mg，240.3μmol，0.1当量)、Pd2(dba)3(440.2mg，0.2当量)和碳酸铯(2.35g，7.21mmol，3当量)在甲苯(0.5mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在110℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌12h。将反应混合物真空浓缩以移除甲苯，接着用甲醇(3mL)稀释。将残余物通过制备型HPLC(柱：Phenomenex Gemini-NXC18 75×30mm×3um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：1％-20％，12min)来纯化。HPLC：ET34794-39-P1B1。接着将产物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/1)来进一步纯化，然后通过柱色谱法(SiO2，甲醇)来进一步纯化。将残余物通过制备型HPLC(柱：PhenomenexGemini-NX C18 75×30mm×3um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：5％-5％，8min)来纯化。获得了呈白色固体的2-(2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷-6-基)噻唑-4-甲酸(13mg，2.4％产率)，LC-MS(ES+,m/z):225.02[(M+H)+]。
按照方法A，使2-(2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷-6-基)噻唑-4-甲酸(9.8mg，43μmol，1当量)和胺1(20mg，43.21μmol，1当量，HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝15:1)来纯化以提供以白色固体形式获得的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-{2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷-6-基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺(12.7mg，23.2％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):635.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.86-8.79(m,1H),7.90-7.84(m,1H),7.59-7.50(m,1H),7.18-7.04(m,1H),6.92-6.83(m,1H),6.34-6.21(m,1H),6.08-5.99(m,1H),5.58-5.41(m,2H),4.93-4.86(m,7H),4.34-4.20(m,4H),3.78-3.50(m,1H),3.08-2.97(m,1H),2.83-2.77(m,1H),2.52-2.32(m,4H),2.21-2.09(m,1H),1.93-1.85(m,1H),1.73-1.62(m,1H)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.82(t,J＝6.1Hz,1H),7.89(s,1H),7.54(s,1H),7.17-7.07(m,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.28(d,J＝7.7Hz,1H),6.03(d,J＝8.6Hz,1H),5.62-5.41(m,2H),4.93-4.72(m,7H),4.26(s,4H),3.70-3.47(m,1H),3.10-2.98(m,1H),2.84-2.78(m,1H),2.24-2.14(m,4H),2.07-2.04(m,1H),2.03-1.93(m,1H),1.67(br d,J＝12.6Hz,1H)。
实施例272：化合物528B：2-[叔丁基(甲基)氨基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺
在手套箱中，将2-溴噻唑-4-甲酸(500mg，3.06mmol，1当量)、叔丁基甲胺(346mg，3.97mmol，1.3当量)、叔丁醇钠(587.5mg，6.11mmol，2当量)和RuPhos Pd G3(255.6mg，306μmol，0.1当量)的混合物用THF(10mL)处理。接着在100℃下，在氮气下，将混合物搅拌12h。使用氮气将反应混合物浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(HCl条件：柱：Phenomenex luna C18 250×50mm×10um；流动相：[水(0.04％HCl)-ACN]；B％：20％-50％，10min)来纯化以提供呈黄色固体的产物(100mg，7.6％产率)。LC-MS(ES+,m:z):215.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.59(s,1H),2.97(s,3H),1.46(s,9H)。
按照方法A，使胺1(56mg，121μmol，1当量，HCl)和2-[叔丁基(甲基)氨基]噻唑-4-甲酸(38.3mg，145μmol，1.2当量，HCl)偶联。TLC(DCM:甲醇＝10:1，Rf＝0.7)指示产物的形成。如同对于先前反应那样将反应进行后处理，接着通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物2-[叔丁基(甲基)氨基]-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,3-噻唑-4-甲酰胺(28mg，37.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):623.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.79-8.59(t,J＝6.0Hz,1H),7.89(s,1H),7.48(s,1H),7.22-7.02(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.78(d,J＝8.4Hz,1H),6.41-6.17(d,J＝8.0Hz,1H),6.11-5.94(d,J＝8.4Hz,1H),5.66-5.37(d,J＝17.6Hz,2H),5.09-4.65(m,3H),3.75-3.50(m,1H),3.13-2.97(m,4H),2.91-2.77(m,1H),2.30-1.96(m,6H),1.76-1.62(m,1H),1.52(s,9H)。
实施例273：化合物529B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-3-甲酰胺
按照方法B，使1-叔丁基吡唑-3-甲酸(28mg，166μmol，1.1当量)与胺1(70mg，151.23μmol，纯度不适用，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-3-甲酰胺(22.8mg，39.5μmol，26.2％产率)，LC-MS(ES+,m/z):577.2[(M+H)+]。
实施例274：化合物530B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(2-甲氧基丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
将噻唑-4-甲酸甲酯(700mg，4.89mmol，1当量)、2-甲氧基-2-甲基-丙酸(866mg，7.33mmol，1.5当量)、硝酸银(830.6mg，4.89mmol，1当量)和过硫酸钾(5.29g，19.56mmol 4当量)在DCM(4mL)和水(4mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在50℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌8h。将反应混合物过滤，并且用水(100mL)稀释并用DCM(30mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生呈浅黄色油状物的产物(220mg，1.02mmol，20.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):216.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝8.16(s,1H),3.94(s,3H),3.28(s,3H),1.66(s,6H)。
向在甲醇(2mL)中的2-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻唑-4-甲酸甲酯(200mg，929μmol，1当量)中添加氢氧化钠(4M，2mL，8.6当量)，并且在25℃下将反应搅拌1h。将4M HCl添加至混合物中以将pH调整至7。将混合物真空浓缩以产生呈白色固体的粗产物。LC-MS(ES+,m/z):201.9[(M+H)+]。
按照方法A，使2-(1-甲氧基-1-甲基-乙基)噻唑-4-甲酸(258.6mg，321μmol，1.3当量)与胺1(130mg，247μmol，1当量，HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(2-甲氧基丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺(51.9mg，33.8％产率，98.2％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):610.3[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.15(t,J＝6.0Hz,1H),8.34(s,1H),7.90(s,1H),7.19-7.04(m,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.06-5.97(m,1H),5.57-5.46(m,2H),4.94-4.72(m,3H),3.69-3.51(m,1H),3.23(s,3H),3.08-2.99(m,1H),2.85-2.77(m,1H),2.28-2.15(m,4H),2.14-2.05(m,1H),2.04-1.94(m,1H),1.61(s,7H)。
实施例275：化合物531B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
将噻唑-4-甲酸甲酯(3.0g，21mmol，1当量)、3-羟基-2,2-二甲基-丙酸(4.95g，41.9mmol，2当量)、过硫酸钾(22.66g，83.8mmol，4当量)、硝酸银(3.56g，21mmol，1当量)在DCM(20mL)和水(20mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在25℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌8h。将反应混合物用水(50mL)稀释，并且用DCM(25mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱：Agela DuraShell C18 250×80mm×10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：5％-35％，20min)来纯化以产生呈棕色油状物的产物(260mg，5.8％产率)。LC-MS(ES+,m/z):215.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ＝8.08(s,1H),3.92(s,3H),3.77(s,2H),3.48(s,1H),1.44(s,6H)。
在0℃下，向在DMF(5mL)中的2-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)噻唑-4-甲酸甲酯(0.2g，929μmol，1当量)中添加氢化钠(74.3mg，1.86mmol，60％纯度，2当量)，并且在0℃下将反应搅拌10min。将碘代甲烷(1.86mmol，115μL 2当量)添加至混合物中，并且在25℃下将反应搅拌20min。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(20mL)来淬灭，接着用水(20mL)稀释，并且用DCM(25mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝1:1)来纯化以产生呈浅黄色油状物的醚产物(70mg，32.9％产率)。LC-MS(ES+,m/z):230.1[(M+H)+]。
向在甲醇(1mL)中的2-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)噻唑-4-甲酸甲酯(70mg，305μmol，1当量)中添加氢氧化钠(4M，1mL，13当量)，并且在25℃下将反应搅拌1h。将4M HCl添加至混合物中，并且调整至pH＝7。将残余物冷冻干燥以产生呈白色固体的产物(610mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):216.0[(M+H)+]。
按照方法A，使2-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)噻唑-4-甲酸(418.6mg，194.4μmol，1.5当量)和胺1(60mg，129.6μmol，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生呈浅黄色固体的所需产物(21.4mg，26.5％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):624.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.10(t,J＝5.9Hz,1H),8.25(s,1H),7.90(s,1H),7.11(t,J＝8.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.04(d,J＝8.1Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),4.92-4.75(m,3H),3.51(s,4H),3.28(s,3H),3.04(br s,1H),2.87-2.78(m,1H),2.19(s,4H),2.14-1.92(m,2H),1.67(brdd,J＝1.9,12.2Hz,1H),1.41(s,6H)。
实施例276：化合物532B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用在标准条件下使其皂化的先前制备的2-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)噻唑-4-甲酸甲酯合成该类似物。
按照方法A，使2-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)噻唑-4-甲酸(21.7mg，518.5μmol，4当量)和胺1(60mg，130μmol，1当量，HCl)偶联。
将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以产生呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺(22.8mg，28.6％产率，99.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):610.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.12(t,J＝6.0Hz,1H),8.24(s,1H),7.91(s,1H),7.12(t,J＝8.0Hz,1H),6.89(d,J＝8.3Hz,1H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.05(d,J＝8.3Hz,1H),5.51(q,J＝8.8Hz,2H),5.07(t,J＝5.6Hz,1H),4.93-4.75(m,3H),3.57(d,J＝5.6Hz,3H),3.04(br t,J＝10.9Hz,1H),2.82(br d,J＝10.3Hz,1H),2.31-2.18(m,4H),2.13-2.08(m,1H),2.03-1.95(m,1H),1.68(br d,J＝11.8Hz,1H),1.39(s,6H)。
实施例277：化合物533B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(丙烷-2-基氧基)甲基]噻吩-2-甲酰胺
按照方法B，使胺1(46.1mg，92.7μmol，2HCl)和5-(异丙氧基甲基)噻吩-2-甲酸(10.6mg，52.9μmol)偶联。在30min之后，在使用额外DMF下将反应经Acrodisk过滤，接着通过反相HPLC来纯化，10-70％乙腈/水(0.1％甲酸)。通过冻干以甲酸盐形式分离出产物以提供N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-5-(异丙氧基甲基)噻吩-2-甲酰胺(6mg，10.6％产率)。
实施例278：化合物534B：1-乙基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-2-甲酰胺
在0℃下，向在DMF(10mL)中的1H-吡咯-2-甲酸甲酯(1g，8mmol，1当量)中添加氢化钠(639.3mg，16mmol，60％纯度，2当量)，在0℃下将反应搅拌10min，接着将碘代乙烷(24mmol，1.92mL，3当量)添加至混合物中，并且在25℃下将反应搅拌20min。将反应倾倒至氯化铵(饱和，100mL)中，并且用DCM(25mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝20/1至10/1)来纯化。获得了呈无色油状物的1-乙基吡咯-2-甲酸甲酯(0.9g，5.88mmol，73.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):154.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.15(d,J＝1.5Hz,1H),6.93-6.68(m,1H),6.09(dd,J＝2.6,3.8Hz,1H),4.29(q,J＝7.1Hz,2H),3.80-3.64(m,3H),1.27(t,J＝7.1Hz,3H)。
在50℃下，将1-乙基吡咯-2-甲酸甲酯(950mg，6.20mmol，纯度不适用，1当量)和氢氧化钠(3M，10mL，4.9当量)在甲醇(5mL)中的混合物搅拌3h。将3M HCl(10mL)添加至混合物中直至pH被调整至4-5。将反应混合物用DCM(30mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生产物。获得了呈白色固体的粗产物1-乙基吡咯-2-甲酸(550mg，粗品)，其不经进一步纯化即用于下一步骤中。LC-MS(ES+,m/z):140.0[(M+H)+]。
按照方法A，使1-乙基吡咯-2-甲酸(27.1mg，194μmol，1.5当量)与胺1(60mg，129.6μmol，1当量，HCl)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物1-乙基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-2-甲酰胺(25.5mg，34.9％产率，97.1％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):548.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.84(t,J＝5.7Hz,1H),7.89(s,1H),7.16-7.06(m,1H),7.03(t,J＝2.1Hz,1H),6.92-6.85(m,2H),6.29(d,J＝7.9Hz,1H),6.08-5.90(dd,J＝2.6,4.0Hz,2H),5.54-5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.95-4.67(m,3H),4.30(q,J＝7.1Hz,2H),3.65-3.51(m,1H),3.04(br s,1H),2.82(br d,J＝11.0Hz,1H),2.32-2.15(m,4H),2.14-1.93(m,2H),1.73-1.64(m,1H),1.24(t,J＝7.1Hz,3H)。
实施例279：化合物535B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲基丙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺
使用用于制备N-乙基吡咯类似物的相同过程，用1-碘-2-甲基-丙烷制备1-异丁基吡咯-2-甲酸以提供所需羧酸。LC-MS(ES+,m/z):168.1[(M+H)+]。
按照方法A，使1-异丁基吡咯-2-甲酸(37.9mg，227μmol，1.5当量)和胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供以白色固体形式获得的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲基丙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺(22.7mg，26.1％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):576.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.80(t,J＝5.6Hz,1H),7.86(s,1H),7.10(t,J＝8.0Hz,1H),6.96(t,J＝2.0Hz,1H),6.91-6.84(m,2H),6.27(d,J＝7.7Hz,1H),6.05(dd,J＝2.8,3.6Hz,1H),5.95(d,J＝8.4Hz,1H),5.49(q,J＝8.9Hz,2H),4.93-4.67(m,3H),4.08(d,J＝7.3Hz,2H),3.66-3.50(m,1H),3.02(br s,1H),2.80(br d,J＝10.6Hz,1H),2.18(s,4H),2.07(br d,J＝11.2Hz,1H),2.02-1.88(m,2H),1.67(br d,J＝10.8Hz,1H),0.73(d,J＝6.6Hz,6H)。
实施例280：化合物536B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-[(2-甲氧基乙基)(甲基)氨基]-1,3-噻唑-4-甲酰胺
使用用于制备4-甲氧基哌啶噻唑类似物的相同条件制备2-[2-甲氧基乙基(甲基)氨基]噻唑-4-甲酸，以提供中间体羧酸，22％产率。LC-MS(ES+,m/z):216.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.09(s,1H),3.61-3.50(m,4H),3.26(s,3H),3.01(s,3H)。
按照方法A，使2-[2-甲氧基乙基(甲基)氨基]噻唑-4-甲酸(39.3mg，181μmol，1.2当量)和胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物(20.2mg，21.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):625.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.91-8.77(t,J＝7.0Hz,1H),7.90(s,1H),7.41(s,1H),7.22-7.07(t,J＝8.0Hz,1H),7.00-6.84(d,J＝8.4Hz,1H),6.39-6.24(d,J＝7.6Hz,1H),6.08-5.91(d,J＝7.6Hz,1H),5.37(br dd,J＝6.1,15.3Hz,2H),4.94-4.75(m,3H),3.72-3.67(m,2H),3.65-3.54(m,3H),3.28(s,3H),3.12-3.00(m,4H),2.89-2.78(m,1H),2.30-2.18(m,4H),2.14-2.07(m,1H),2.04-1.97(m,1H),1.74-1.63(m,1H)。
实施例281：化合物537B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]噻吩-3-甲酰胺
将5-溴噻吩-3-甲酸乙酯(500mg，2.13mmol，1当量)、(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷(270mg，2.34mmol，1.1当量)、BINAP(50.8mg，63.9μmol，0.03当量)、叔丁醇钠(2M，2.13mL，2当量)和Pd2(dba)3(58.5mg，63.9μmol，0.03当量)在甲苯(15mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在100℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌12h。将反应混合物通过添加饱和EDTA溶液(30mL)来淬灭，并且在20℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h，接着用水(10mL)稀释，并且用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝1/0至93/7)来纯化以提供呈黄色油状物的产物(0.13g，22.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):269.9[(M+H)+]。
在标准条件下使酯皂化以提供呈黄色固体的所需羧酸中间体(0.4g，68.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):240.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝6.81-6.63(d,J＝1.2Hz,1H),6.19-5.97(d,J＝1.2Hz,1H),3.59-3.46(m,1H),3.41(dd,J＝3.7,9.4Hz,1H),3.31-3.21(m,5H),3.03-2.92(m,1H),2.03-1.82(m,4H)。
按照方法A，使胺1(60mg，130μmol，1当量，HCl)和5-[(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]噻吩-3-甲酸(187.7mg，155.6μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5-[(2S)-2-(甲氧基甲基)吡咯烷-1-基]噻吩-3-甲酰胺(25.4mg，30.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):650.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.07-8.81(t,J＝5.6Hz,1H),7.90(s,1H),7.28-7.20(d,J＝1.6Hz,1H),7.16-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.94-6.77(d,J＝8.4Hz,1H),6.34-6.21(m,2H),6.09-5.96(d,J＝8.0Hz,1H),5.58-5.35(dt,J＝17.6Hz,2H),4.92-4.71(m,3H),3.64-3.51(m,2H),3.43(dd,J＝3.9,9.5Hz,1H),3.38-3.34(m,1H),3.30(s,1H),3.29-3.27(m,3H),3.09-3.00(m,2H),2.85-2.78(m,1H),2.30-2.17(m,4H),2.12-2.06(m,1H),2.04-1.87(m,5H),1.72-1.64(m,1H)1H NMR(400MHz,CDCl3,298K)δ(ppm)＝7.42(s,1H),7.24(t,J＝8.0Hz,1H),7.07-6.98(d,J＝2.0Hz,1H),6.88-6.78(d,J＝8.4Hz,1H),6.59-6.49(t J＝5.6Hz,1H),6.33(d,J＝7.7Hz,1H),6.22-6.09(d,J＝2.0Hz,1H),5.36-5.16(m,2H),5.01-4.76(m,3H),4.44-4.34(d,J＝9.6Hz,1H),3.75-3.56(m,2H),3.53(dd,J＝4.2,9.5Hz,1H),3.49-3.43(m,1H),3.39(s,3H),3.37-3.32(m,1H),3.22-3.12(m,1H),3.20-3.12(m,1H),3.03-2.88(m,1H),2.42-2.15(m,5H),2.12-1.95(m,6H)。
实施例282：化合物538B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲氧基乙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺
使用用于制备N-乙基吡咯甲酸的相同过程制备1-(2-甲氧基乙基)-1H-吡咯-2-甲酸。
按照方法A，使胺1(60mg，130μmol，1当量，HCl)和1-(2-甲氧基乙基)吡咯-2-甲酸(43.9mg，259μmol，2当量)偶联。将粗反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝1:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-甲氧基乙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺(24.6mg，31.5％产率，95.9％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):578.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.87(t,J＝5.7Hz,1H),7.89(s,1H),7.15-7.08(m,1H),7.00(t,J＝2.1Hz,1H),6.92(dd,J＝1.5,4.0Hz,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.07(dd,J＝2.6,3.7Hz,1H),6.00(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.92-4.72(m,3H),4.44(t,J＝5.5Hz,2H),3.63(br s,1H),3.17(s,3H),3.04(br t,J＝10.4Hz,1H),2.82(br d,J＝10.4Hz,1H),2.31-2.16(m,4H),2.14-2.06(m,1H),2.05-1.94(m,1H),1.68(brd,J＝10.6Hz,1H)。
实施例283：化合物539B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-2-(丙烷-2-基)-1H-咪唑-4-甲酰胺
在80℃下，在氮气下，向1-甲基咪唑-4-甲酸甲酯(200mg，1.43mmol，1当量)、2-甲基丙酸(4.29mmol，400μL 3当量)在10％硫酸(26.8mmol，14.3mL，18.7当量)中的混合物中添加硝酸银(145mg，856μmol，0.6当量)。接着在15min内，逐滴添加在水(14mL)中的过硫酸铵(977mg，4.28mmol，3当量)。将反应混合物用碳酸钠(饱和)淬灭以调整pH＝7～8，接着用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2.PE:EA＝1:2)来纯化以提供呈无色油状物的中间体2-异丙基-1-甲基-咪唑-4-甲酸甲酯(40mg，15.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):183.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.77(s,1H),3.70(s,3H),3.63(s,3H),3.06(td,J＝6.8,13.6Hz,1H),1.20(d,J＝6.7Hz,6H)。
在50℃下，向2-异丙基-1-甲基-咪唑-4-甲酸甲酯(40mg，220μmol，1当量)在甲醇(1mL)中的混合物中添加氢氧化钠(3M，0.5mL，6.8当量)。在50℃下将混合物搅拌1h。在0℃下将反应混合物通过添加1N HCl以达到pH＝5～6来淬灭，接着真空浓缩以产生呈浅黄色固体的残余物(160mg)。LC-MS(ES+,m/z):169.1[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(15mg，32.4μmol，1当量，HCl)与2-叔丁基-1-甲基-咪唑-4-甲酸(22.1mg，48.6μmol，1.5当量)偶联。将反应通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-2-(丙烷-2-基)-1H-咪唑-4-甲酰胺(4.9mg，25.4％产率，99.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):577.2[(M+H)+]。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.46(t,J＝6.1Hz,1H),7.89(s,1H),7.63(s,1H),7.16-7.08(m,1H),6.88(d,J＝8.2Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.02(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝9.0Hz,2H),4.93-4.75(m,3H),3.79(s,3H),3.66-3.51(m,1H),3.04(br t,J＝10.4Hz,1H),2.82(br d,J＝10.4Hz,1H),2.29-2.15(m,4H),2.14-1.95(m,2H),1.68(br d,J＝10.4Hz,1H),1.40(s,9H)。
实施例284：化合物540B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺
使用与用于制备N-乙基吡咯甲酸的程序相同的程序制备所需羧酸。1H-吡咯-2-甲酸甲酯(1g，7.99mmol 1当量)和1-氟-2-碘-乙烷(2.78g，16mmol，2当量)提供了呈无色液体的酯1-(2-氟乙基)吡咯-2-甲酸甲酯(1g，73.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):172.0[(M+H)+]。在标准条件下皂化在HPLC纯化之后提供了呈浅黄色固体的羧酸1-(2-氟乙基)吡咯-2-甲酸(35mg，19.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):158.0[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(70mg，151μmol，1当量，HCl)和1-(2-氟乙基)吡咯-2-甲酸(28.5mg，181μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(2-氟乙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺(23mg，27％产率)。LC-MS(ES+,m/z):566.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.93(t,J＝5.7Hz,1H),7.89(s,1H),7.14-7.08(m,1H),7.04(t,J＝1.9Hz,1H),6.98(dd,J＝1.7,3.9Hz,1H),6.88(d,J＝8.4Hz,1H),6.28(d,J＝7.7Hz,1H),6.11(dd,J＝2.6,4.0Hz,1H),6.00(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),4.92-4.72(m,3H),4.70-4.61(m,2H),4.56(s,2H),3.68-3.52(m,1H),3.09-2.97(m,1H),2.82(br d,J＝9.9Hz,1H),2.19(s,4H),2.14-1.91(m,2H),1.68(br d,J＝10.4Hz,1H)。
实施例285：化合物541B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5H,6H,7H,8H-咪唑并[1,2-a]吡啶-2-甲酰胺
按照方法B，使5,6,7,8-四氢咪唑并[1,2-a]吡啶-2-甲酸(23.2mg，115μmol，HCl)和胺1(49.3mg，99.1μmol，2HCl)偶联。在使用额外DMF下将反应经Acrodisk过滤，接着通过反相HPLC来纯化。将级分通过冻干来干燥以提供呈甲酸盐形式的产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-5H,6H,7H,8H-咪唑并[1,2-a]吡啶-2-甲酰胺(16.8mg，27.3％产率，甲酸盐)。LC-MS(ES+,m/z):556.8[(M+H)+]。
实施例286：化合物542B：5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡咯-2-甲酰胺
在25℃下，向1H-吡咯-2-甲酸乙酯(2g，14mmol，1当量)和氯化铝(4.02g，30mmol，2.1当量)在DCE(133mL)中的混合物中添加2-氯-2-甲基-丙烷(14.4mmol，1.58mL，1当量)，并且在氮气下将反应搅拌1h。在0℃下，将反应混合物缓慢倾倒至碳酸氢钠(饱和，150mL)中。将混合物搅拌0.5h，并且过滤。将滤液用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物，将其通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝50/1至20/1，TLC(SiO2，PE:EA＝5:1，Rf＝0.6))来纯化以提供呈白色固体的产物(2.5g，88.7％产率)。LC-MS(ES+,m/z):196.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝8.84(br s,1H),6.82(dd,J＝2.6,3.7Hz,1H),6.07-5.95(m,1H),4.31(q,J＝7.1Hz,2H),1.36(t,J＝7.1Hz,3H),1.33(s,9H)。
在用于类似类似物的相同条件下将由此获得的吡咯用碘代甲烷烷基化，由此提供所需N-甲基酯。在标准条件下使由此获得的酯皂化以提供所需羧酸中间体。
按照方法E，使胺1(50mg，100μmol，1当量，2HCl)和5-叔丁基-1H-吡咯-2-甲酸(20.1mg，120μmol，1.2当量)偶联。TLC(DCM:甲醇＝5:1，Rf＝0.6)指示产物的形成。将在后处理之后的粗产物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：10％-60％，8min)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-甲基-1H-吡咯-2-甲酰胺(22.6mg，75.3％产率)。LC-MS(ES+,m/z):576.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝11.13(s,1H),8.85-8.69(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.22-7.03(t,J＝8.0Hz,1H),6.96-6.79(d,J＝8.4Hz,1H),6.77-6.67(dt,J＝3.6Hz,1H),6.30-6.21(d,J＝8.0Hz,1H),6.10-5.96(d,J＝8.4Hz,1H),5.92-5.79(dt,J＝3.4Hz,1H),5.64-5.34(dt,J＝18.0Hz,2H),4.94-4.64(m,3H),3.69-3.52(m,1H),3.03(br t,J＝10.5Hz,1H),2.88-2.74(m,1H),2.32-2.14(m,4H),2.14-2.06(m,1H),2.05-1.92(m,1H),1.72-1.59(m,1H),1.26(s,9H)。
实施例287：化合物543B：5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,2-噁唑-3-甲酰胺
将5,5-二甲基-2,4-二氧代-己酸乙酯(1g，4.99mmol，1当量)、羟胺盐酸盐(347mg，4.99mmol，1当量)、TEA(10mmol，1.40mL，2当量)在乙醇(10mL)中的混合物脱气和用氮气吹扫3次，接着在80℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌0.5h。将反应混合物通过添加水(30mL)来淬灭，接着用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×2)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色油状物的粗异噁唑酯(0.2g，20.3％产率)。LC-MS(ES+,m:z):198.1[(M+H)+]。
向在乙醇(2mL)中的5-叔丁基异噁唑-3-甲酸乙酯(400mg，2.03mmol，1当量)中添加氢氧化钠(2mmol，1M，2mL，1当量)。在50℃下将混合物搅拌2h。将反应混合物通过添加3NHCl以达到pH<7来淬灭，接着用水(20mL)稀释，并且用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL×1)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：1％-50％，8min)来纯化以提供呈黄色油状物的羧酸(0.1g，29.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):169.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝6.43(s,1H),1.39(s,9H)。
按照方法A，使胺1(70mg，123μmol，1当量，2HCl)和5-叔丁基异噁唑-3-甲酸(41.7mg，247μmol，2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物5-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1,2-噁唑-3-甲酰胺(24.7mg，32.9％产率，95％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):578.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.70-9.41(t,J＝5.6Hz,1H),7.89(s,1H),7.30-7.04(t,J＝8.0Hz,1H),6.97-6.82(d,J＝8.4Hz,1H),6.64(s,1H),6.36-6.20(d,J＝8.0Hz,1H),6.09-5.97(d,J＝8.4Hz,1H),5.63-5.24(dt,J＝17.6Hz,2H),5.09-4.65(m,3H),3.75-3.44(m,1H),3.08-2.99(m,1H),2.81(m,1H),2.31-2.17(m,4H),2.14-2.06(m,1H),2.05-1.94(m,1H),1.73-1.64(m,1H),1.34(s,9H)。
实施例288：化合物558B：3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-N-[(氧杂环己烷-4-基)甲基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺
在0℃下，向先前制备的4-溴-N'-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲脒(4g，11.9mmol，1当量)在DCM(50mL)中的混合物中一次性添加TEA(23.7mmol，3.3mL，2当量)。添加2-氯-2-氧代-乙酸乙酯(13.09mmol，1.47mL，1.1当量)，并且在20℃下将混合物搅拌5h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1)(200mL)中。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(柱高：250mm，直径：100mm，100-200目硅胶，PE/EA＝1/0，96/4)来纯化以提供呈浅黄色固体的3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酸乙酯(2g，40.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):418.0/420.0[(M+H)+]。
用于酰基噁二唑合成的一般性程序：将3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酸乙酯(200mg，478μmol，1当量)和四氢吡喃-4-基甲胺(110mg，957μmol，2当量)在乙醇(2mL)中组合。在80℃下将混合物搅拌6h。用HCl(1M)将反应调整至pH4-5，接着用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈白色固体的作为残余物的酰胺N-苯甲基-3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(150mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):487.0/489.0。
向(3S,4R)-3-氟-1-甲基-哌啶-4-胺(167.9mg，1.27mmol，3当量)和1-[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]-2-四氢吡喃-4-基-乙酮(200mg，424μmol，1当量)在THF(2mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(1M，850mL，2当量)、第3代叔丁基-XPhos(134.6mg，169μmol，0.4当量)，并且在密封管中，在100℃下将反应加热2h。将残余物倾倒至EDTA(饱和溶液)(40mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-N-[(氧杂环己烷-4-基)甲基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(21mg，8.7％产率，94.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):539.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.50(t,J＝5.9Hz,1H),7.99(s,1H),7.19-7.10(m,1H),6.93(d,J＝8.3Hz,1H),6.31(d,J＝7.9Hz,1H),6.01(d,J＝8.4Hz,1H),5.55(q,J＝9.0Hz,2H),4.98-4.71(m,1H),3.85(br dd,J＝2.4,11.3Hz,2H),3.70-3.53(m,1H),3.30-3.19(m,3H),3.10-3.00(m,1H),2.82(br d,J＝11.5Hz,1H),2.31-2.18(m,4H),2.15-2.07(m,1H),2.05-1.96(m,1H),1.91-1.80(m,1H),1.76-1.67(m,1H),1.61(br d,J＝11.5Hz,2H),1.25-1.19(m,2H)。
实施例289：化合物544B：N-苯甲基-3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺
使用以上一般性程序制备该类似物。3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酸酯(200mg，478μmol，1当量)和苯甲胺(958μmol，105μL 2当量)提供了呈白色固体的中间体N-苯甲基-3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(150mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):479.1/481.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝10.08(br t,J＝6.1Hz,1H),7.87(d,J＝8.3Hz,1H),7.49(d,J＝7.6Hz,1H),7.42-7.33(m,6H),7.32-7.25(m,1H),5.72(q,J＝8.9Hz,2H),4.53(d,J＝6.0Hz,2H)。
这个中间体(190mg，396μmol，1当量)的布赫瓦尔德偶联提供了呈黄色固体的所需产物N-苯甲基-3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(21.1mg，10.0％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):531.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝10.02(br t,J＝6.0Hz,1H),7.99(s,1H),7.46-7.25(m,5H),7.15(t,J＝8.0Hz,1H),6.94(d,J＝8.2Hz,1H),6.32(d,J＝7.8Hz,1H),5.99(br d,J＝8.3Hz,1H),5.68-5.47(m,2H),4.98-4.74(m,1H),4.54(br d,J＝5.9Hz,2H),3.74-3.52(m,1H),3.74-3.52(m,1H),3.11-2.99(m,1H),2.83(br d,J＝11.7Hz,1H),2.32-2.17(m,4H),2.15-2.07(m,1H),2.07-1.95(m,1H),1.72(br d,J＝10.0Hz,1H)。
实施例290：化合物545B：N-(环丙基甲基)-3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺
使用以上一般性程序制备该类似物。3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酸乙酯(200mg，478μmol，1当量)和环丙基甲胺(68mg，956μmol，2当量)提供了呈白色固体的所需中间体N-(环丙基甲基)-3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(190mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):443.1/445.1。中间体(190mg，429μmol，1当量)的布赫瓦尔德偶联在HPLC纯化(FA条件，柱：3_Phenomenex Luna C18 75×30mm×3um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：25％-60％，8min)之后提供了呈黄色固体的所需产物N-(环丙基甲基)-3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(24.3mg，11.5％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):495.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.54(br t,J＝5.4Hz,1H),8.18(s,1H),8.22-8.15(m,1H),8.00(s,1H),7.27-7.06(m,1H),6.93(br d,J＝8.3Hz,1H),6.32(br d,J＝7.8Hz,1H),5.98(br d,J＝8.3Hz,1H),5.55(q,J＝9.1Hz,2H),4.97-4.72(m,1H),3.76-3.50(m,1H),3.20(br t,J＝6.4Hz,2H),3.10-3.00(m,1H),2.87-2.78(m,1H),2.28-2.16(m,4H),2.15-2.07(m,1H),2.06-1.96(m,1H),1.78-1.67(m,1H),1.15-0.99(m,1H),0.58-0.38(m,2H),0.33-0.20(m,2H)。
实施例291：化合物546B：3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-N-[(1-甲基-1H-吡唑-4-基)甲基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺
使用以上一般性程序制备该类似物。3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酸乙酯(200mg，478μmol，1当量)和(1-甲基吡唑-4-基)甲胺(106.3mg，957μmol，2当量)提供了呈白色固体的中间体3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-N-[(1-甲基吡唑-4-基)甲基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(190mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):483.0/485.0。中间体(190mg，393μmol，1当量)的布赫瓦尔德偶联在制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)纯化之后提供了呈黄色固体的所需产物3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-N-[(1-甲基-1H-吡唑-4-基)甲基]-1,2,4-噁二唑-5-甲酰胺(22.4mg，10.7％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):535.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.81(t,J＝5.9Hz,1H),7.97(s,1H),7.66(s,1H),7.39(s,1H),7.14(t,J＝8.0Hz,1H),6.92(d,J＝8.4Hz,1H),6.31(d,J＝7.9Hz,1H),5.97(d,J＝8.3Hz,1H),5.54(q,J＝9.0Hz,2H),4.94-4.75(m,1H),4.34(d,J＝5.9Hz,2H),3.79(s,3H),3.69-3.54(m,1H),3.11-2.98(m,1H),2.82(br d,J＝11.0Hz,1H),2.31-2.17(m,4H),2.15-2.06(m,1H),2.04-1.92(m,1H),1.75-1.67(m,1H)。
实施例292：化合物547B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-3-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向1-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(100mg，605μmol，1当量)在DMF(3mL)中的混合物中添加氢化钠(72.6mg，1.82mmol，60％纯度，3当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加碘代甲烷(3.02mmol，190μL 5当量)。在20℃下将混合物搅拌60min。将反应倾倒至饱和氯化铵(40mL)中。将水相用EA(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈无色油状物的1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(100mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):180.0[(M+H)+]。
向1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(100mg，558μmol，1当量)在乙醇(1mL)中的混合物中添加氢氧化钠(10M，1mL，17.92当量)，并且在100℃下将反应加热7h。将残余物用HCl(12M)处理以调整pH＝3～4。将水相用DCM(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈无色油状物的1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲酸(100mg，粗品)。LC-MS(ES+,m:z):199.0[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(90mg，159μmol，1当量，2HCl)与1-(2-甲氧基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲酸(37.7mg，190μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-甲氧基-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-3-甲酰胺(24.6mg，25.6％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):607.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.85(t,J＝5.9Hz,1H),7.90(d,J＝2.0Hz,2H),7.11(t,J＝8.1Hz,1H),6.87(d,J＝8.4Hz,1H),6.67(d,J＝2.5Hz,1H),6.28(d,J＝8.0Hz,1H),6.00(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.7Hz,2H),4.92-4.74(m,3H),3.66-3.51(m,3H),3.21(s,3H),3.07-2.98(m,1H),2.86-2.77(m,1H),2.29-2.16(m,4H),2.13-2.04(m,1H),2.04-1.93(m,1H),1.71-1.63(m,1H),1.55(s,6H)。
实施例293：化合物548B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-3-甲酰胺
在0℃下，在氮气下，向3-溴-1H-吡唑(4g，27mmol，1当量)在DMF(40mL)中的混合物中添加氢化钠(2.18g，54.4mmol，60％纯度，2当量)。在0℃下将混合物搅拌30min，随后添加2-溴-2-甲基-丙酸乙酯(40.8mmol，6mL，1.5当量)。在20℃下将混合物搅拌2h 30min。将残余物倾倒至饱和氯化铵(200mL)中，并且搅拌5min。将水相用EA(50mL×2)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×2)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型HPLC(TFA条件，柱：Phenomenex luna c18 250mm×100mm×10um；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：35％-65％，25min)来纯化以提供呈棕色油状物的2-(3-溴吡唑-1-基)-2-甲基-丙酸乙酯(5.5g，77.4％产率)。LC-MS(ES+,m/z):261.2/263.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.95(d,J＝2.5Hz,1H),6.43(d,J＝2.5Hz,1H),4.09(q,J＝7.2Hz,2H),1.74(s,6H),1.12(t,J＝7.1Hz,3H)。
在0℃下，在氮气下，向2-(3-溴吡唑-1-基)-2-甲基-丙酸乙酯(5.5g，21mmol，1当量)、CaCl2(1.17g，10.5mmol，0.5当量)在甲醇(55mL)中的混合物中添加硼氢化钠(2.47g，65.3mmol，3.1当量)，接着将反应加热至50℃，并且搅拌2h。将残余物倾倒至HCl(2N)中以调整pH＝7。将水相用EA(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型HPLC(TFA，柱：Phenomenex luna C18(250×70mm，15um)；流动相：[水(0.1％TFA)-ACN]；B％：5％-45％，20min)来纯化以提供呈棕色油状物的2-(3-溴吡唑-1-基)-2-甲基-丙-1-醇(1.9g，41.2％产率)。LC-MS(ES+,m/z):219.0/221.0[(M+H)+]。
在0℃下，在氮气下，向2-(3-溴吡唑-1-基)-2-甲基-丙-1-醇(1.9g，8.67mmol，1当量)在DCM(20mL)中的混合物中添加p-TsOH(149.3mg，867μmol，0.1当量)，随后添加3,4-二氢-2H-吡喃(13.9mmol，1.27mL，1.6当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至碳酸氢钠(饱和，80mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(TFA条件，柱：AgelaDuraShell C18 250×70mm×10um；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：40％)来纯化以提供呈白色固体的3-溴-1-(1,1-二甲基-2-四氢吡喃-2-基氧基-乙基)吡唑(1.2g，45.6％产率)。LC-MS(ES+,m/z):303.0/3.5.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.81(d,J＝2.4Hz,1H),6.35(d,J＝2.4Hz,1H),4.40(t,J＝3.0Hz,1H),3.75(d,J＝10.0Hz,1H),3.49(br d,J＝9.9Hz,2H),3.39-3.35(m,1H),1.63-1.37(m,10H)。
向3-溴-1-(1,1-二甲基-2-四氢吡喃-2-基氧基-乙基)吡唑(500mg，1.65mmol，1当量)在DMF(5mL)中的混合物中添加Pd(PPh3)4(381.1mg，330μmol，0.2当量)、氰化锌(581mg，4.95mmol，3当量)，并且在微波下，在180℃下将反应加热0.5h。将残余物倾倒至EDTA(饱和溶液，50mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将反应通过制备型HPLC(碱性条件，柱：Welch Xtimate C18 250×70mm#10um；流动相：[水(0.04％NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：10％-28％，25min)来纯化以提供呈浅黄色油状物的1-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(0.3g，55.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):166.0[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.06(d,J＝2.6Hz,1H),6.93(d,J＝2.6Hz,1H),5.06(t,J＝5.5Hz,1H),3.58(d,J＝5.7Hz,2H),1.48(s,6H)。
在密封管中，在20℃下，向1-(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(180mg，1.09mmol，1当量)在THF(3mL)中的混合物中添加TEA(13.1mmol，1.82mL，12当量)、N,N-二乙基乙胺三氢氟酸盐(1.41g，8.72mmol，8当量)和1,1,2,2,3,3,4,4,4-九氟丁烷-1-磺酰氟(8.72mmol，1.53mL，8当量)，接着加热至90℃，持续5h。将残余物倾倒至冰水(w/w＝1/1，50mL)中。将水相用EA(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈浅黄色油状物的1-(2-氟-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(140mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):168.0[(M+H)+]。
在20℃下，向1-(2-氟-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲腈(200mg，1.20mmol，1当量)在乙醇(2mL)中的混合物中添加氢氧化钠(10M，940μL7.87当量)，并且接着将反应加热至100℃，持续12h。将残余物倾倒至HCl(12N)中以调整pH＝3～4。将水相用DCM(10mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL×3)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生呈黄色固体的1-(2-氟-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲酸(210mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):168.0[(M+H)+]。
按照方法A，使胺1(90mg，159μmol，1当量，2HCl)和1-(2-氟-1,1-二甲基-乙基)吡唑-3-甲酸(35.4mg，190.3μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-1-(1-氟-2-甲基丙烷-2-基)-1H-吡唑-3-甲酰胺(22.3mg，23.7％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):595.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.91(t,J＝5.9Hz,1H),7.99(d,J＝2.5Hz,1H),7.90(s,1H),7.15-7.08(m,1H),6.88(d,J＝8.1Hz,1H),6.72(d,J＝2.5Hz,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.01(d,J＝8.4Hz,1H),5.50(q,J＝8.8Hz,2H),4.92-4.75(m,3H),4.75-4.60(m,2H),3.67-3.51(m,1H),3.10-2.98(m,1H),2.81(br d,J＝10.6Hz,1H),2.28(br d,J＝12.9Hz,1H),2.14-2.05(m,1H),2.05-1.93(m,1H),1.72-1.65(m,1H),1.60(d,J＝1.9Hz,6H)。
实施例294：化合物549B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-3-(2-羟基丙烷-2-基)苯甲酰胺
在-60℃下，在N2下，在10min内，向3-乙酰基苯甲酸(5g，30.46mmol，1当量)在THF(50mL)中的混合物中添加甲基溴化镁(2.5M，30.5mL，2.5当量)，并且接着将反应搅拌50min。将反应混合物倾倒至饱和氯化铵(100mL)中，并且搅拌5min。使用1M HCl(水溶液)将pH调整至3。将水相用EA(3×50mL)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(2×80mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色油状物的叔醇3-(1-羟基-1-甲基-乙基)苯甲酸(5.8g，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):179.0[(M+H)+]。
在条件A下，使胺1(70mg，140μmol，1当量，2HCl)和3-(1-羟基-1-甲基-乙基)苯甲酸(27.8mg，154.2μmol，1.1当量)在DMF(3mL)中的混合物偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝15:1)来纯化以提供呈浅黄色粉末的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-3-(1-羟基-1-甲基-乙基)苯甲酰胺(19.7mg，23.9％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):589.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.40(s,1H),8.04(s,1H),7.89(s,1H),7.75(s,1H),7.67(s,1H),7.47-7.39(m,1H),7.10(d,J＝8.0Hz,1H),6.89(s,1H),6.28(d,J＝7.9Hz,1H),6.02(d,J＝7.9Hz,1H),5.51(s,2H),5.17(s,1H),4.84(d,J＝5.4Hz,3H),2.69-2.65(m,2H),2.35-2.30(m,2H),2.18(s,4H),2.08(s,1H),1.46(s,6H)。
实施例295：化合物550B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(2-羟基丙烷-2-基)吡啶-4-甲酰胺
向2-乙酰基吡啶-4-甲酸甲酯(2g，11.2mmol，1当量)在THF(20mL)和水(5mL)中的溶液中添加氢氧化锂水合物(1.41g，33.5mmol，3当量)。在25℃下将混合物搅拌1h。在0℃下将反应混合物通过添加3N HCl以调整pH<7来淬灭，随后用EA(3×80mL)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以提供呈黄色固体的2-乙酰基异烟酸(1.5g，9.08mmol，81.4％产率)。
在-50℃下，向2-乙酰基吡啶-4-甲酸(1g，6.06mmol，1当量)在THF(40mL)中的溶液中添加甲基溴化镁(3M，10.1mL，5当量)。在20℃下将混合物搅拌3h。将反应混合物通过添加饱和氯化铵(10mL)来淬灭，并且用1N HCl稀释以调整pH<5，接着用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(FA条件：柱：Phenomenex luna C18(250×70mm，15um)；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：0％-10％，20min)来纯化以提供呈白色固体的2-(2-羟基丙烷-2-基)异烟酸。(0.4g，2.21mmol，36.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):181.9[(M+H)+]。
在条件A下，使5-(1-羟基-1-甲基-乙基)吡啶-3-甲酸(22.9mg，126μmol，1当量)、胺1(70mg，126μmol，1当量，2HCl)在DMF(3mL)中的溶液偶联。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1Rf＝0.45)来纯化以提供呈黄色固体的所需化合物N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(2-羟基丙烷-2-基)吡啶-4-甲酰胺(26.4mg，35.5％产率，100％纯度)，LC-MS(ES+,m/z):590.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.73(t,J＝5.6Hz,1H),8.68(d,J＝5.0Hz,1H),8.15(d,J＝0.7Hz,1H),7.89(s,1H),7.67(dd,J＝1.7,5.1Hz,1H),7.17-7.04(m,1H),6.88(d,J＝8.3Hz,1H),6.29(d,J＝7.8Hz,1H),6.02(br d,J＝8.2Hz,1H),5.50(q,J＝8.9Hz,2H),5.38(s,1H),4.96-4.73(m,3H),3.70-3.53(m,1H),3.08(br s,1H),2.84(br s,1H),2.30-1.91(m,6H),1.70(br d,J＝10.6Hz,1H),1.47(s,6H)。
实施例296：化合物551B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基}-2-(甲氧基甲基)-6-甲基吡啶-4-甲酰胺
将2-甲基吡啶-4-甲酸甲酯(1g，6.62mmol，1当量)、过硫酸铵(4.98g，21.8mmol，3.3当量)在水(12mL)和甲醇(100mL)中的溶液脱气和用氮气吹扫3次，接着在60℃下，在氮气氛围下，将混合物搅拌1h。将反应混合物过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈红色固体的醇2-(羟基甲基)-6-甲基-吡啶-4-甲酸甲酯(450mg，37.5％产率)。LC-MS(ES+,m/z):198.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.64(d,J＝6.2Hz,2H),4.80(s,2H),3.95(s,3H),3.89-3.67(m,1H),3.87-3.47(m,1H),2.65(s,3H)。
在0℃下，向2-(羟基甲基)-6-甲基-吡啶-4-甲酸甲酯(400mg，1.77mmol，1当量)在DMF(10mL)中的溶液中添加氢化钠(211.9mg，5.30mmol，60％纯度，3当量)，接着在0℃下，在N2氛围下，将混合物搅拌0.5h。在0℃下添加碘代甲烷(7.06mmol，0.44mL，4当量)，接着在25℃下，在N2氛围下，将混合物搅拌0.5h。在0℃下将反应混合物通过添加饱和氯化铵(200mL)来淬灭，并且用EA(3×40mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×40mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩以产生残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2，PE:EA＝4:1)来纯化以提供呈无色油状物的2-(甲氧基甲基)-6-甲基-吡啶-4-甲酸甲酯(220mg，56.8％产率，89％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):196.1[(M+H)+]。
使用氢氧化钠(6M，91μL 1当量)在甲醇(2mL)中使2-(甲氧基甲基)-6-甲基-吡啶-4-甲酸甲酯(120mg，547μmol，1当量)皂化。在25℃下，在N2氛围下，将混合物搅拌1h。用3MHCl将反应混合物调整至pH＝7，接着过滤，并且真空浓缩以产生残余物。含有所需产物以及残余试剂的残余物直接用于下一反应。LC-MS(ES+,m/z):182.0[(M+H)+]。
在条件A下，使2-(甲氧基甲基)-6-甲基-吡啶-4-甲酸(259.1mg，粗品)和胺1(70mg，119μmol，1当量，2HCl)偶联。将残余物依次通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1Rf＝0.35)和制备型HPLC((FA条件)，柱：Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um；流动相：[水(0.2％FA)-ACN]；B％：20％-50％，8min)来纯化以提供呈黄色固体的所需化合物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]-1,2,4-噁二唑-5-基]甲基]-2-(甲氧基甲基)-6-甲基-吡啶-4-甲酰胺(22.5mg，32.0％产率，100％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):590.4[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝1.60-1.74(m,1H)1.95-2.04(m,1H)2.06-2.13(m,1H)2.17-2.30(m,4H)2.53-2.55(m,3H)2.74-2.87(m,1H)2.99-3.07(m,1H)3.39-3.41(m,3H)3.52-3.66(m,1H)4.49-4.59(m,2H)4.70-4.96(m,3H)5.39-5.62(m,2H)5.87-6.07(m,1H)6.20-6.37(m,1H)6.69-6.93(m,1H)7.07-7.20(m,1H)7.57-7.63(m,1H)7.64-7.70(m,1H)7.80-7.96(m,1H)9.63-9.75(m,1H)。
实施例297：化合物553B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2-噁唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺
在-40℃下，在氮气下，向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲腈(5g，16.5mmol，1当量)在甲苯(50mL)中的混合物中逐滴添加DIBAL(1M，33mL，2当量)。在20℃下将混合物搅拌2h。将反应倾倒至冰水(40mL)和15％氢氧化钠(40mL)中，并且搅拌10min。将混合物经硅藻土过滤，并且将水相用EA(2×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(1×60mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(PE/EA＝1/0至80/1)来纯化以提供呈浅黄色固体的产物4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲醛(2g，6.53mmol，39.6％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.98(s,1H),7.83(d,J＝8.3Hz,1H),7.60(s,1H),7.52-7.47(m,1H),7.45-7.39(m,1H),5.58(q,J＝9.0Hz,2H)。
在20℃下，在氮气下，向4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲醛(2g，6.53mmol，1当量)在乙醇(25mL)中的混合物中添加吡啶(13.1mmol，1.05mL，2当量)和羟胺盐酸盐(545mg，7.84mmol，1.2当量)。在90℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至柠檬酸(饱和，30mL)中。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(1×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(PE/EA＝1/0，20/1)来纯化以提供呈白色固体的肟4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲醛肟(1.8g，85.8％产率)。
在0℃下，向N-丙-2-炔基氨基甲酸叔丁酯(483.3mg，3.11mmol，1当量)在DCM(10mL)中的混合物中一次性添加次氯酸钠(3.21g，5.61mmol，2.65mL，13％纯度，1.8当量)、TEA(320μmol，45μL 0.1当量)。接着添加在DCM(10mL)中的4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-甲醛肟(1g，3.1mmol，1当量)。在20℃下将混合物搅拌12h。将残余物倾倒至冰水(30mL)中。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(1×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(PE/EA＝100/0，97/3)来纯化以提供呈浅黄色固体的N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]异噁唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(0.5g，27.1％产率，80％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):417.9/149.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝7.77(d,J＝8.3Hz,1H),7.61(br t,J＝5.9Hz,1H),7.42(d,J＝7.7Hz,1H),7.34(s,1H),7.27(t,J＝8.0Hz,1H),7.11(s,1H),5.69(q,J＝8.8Hz,2H),4.35(br d,J＝5.9Hz,2H),1.48-1.35(m,9H)。
在20℃下，在氮气下，向N-[[3-[4-溴-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]异噁唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(400mg，675μmol，1当量)和(3S,4R)-3-氟-1-甲基-哌啶-4-胺(111mg，810μmol，96％纯度，1.2当量，游离碱)在THF(4mL)中的混合物中添加叔丁醇钠(2M，670μL 2当量)、第3代叔丁基-XPhos钯(107.2mg，135μmol，0.2当量)。在80℃下将混合物搅拌2h。将残余物倾倒至EDTA(饱和，50mL)中，并且搅拌60min。将水相用EA(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(1×50mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈浅黄色固体的N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]异噁唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(200mg，粗品)。LC-MS(ES+,m/z):526.2[(M+H)+]。
在20℃下，向N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]异噁唑-5-基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(200mg，381μmol，1当量)在HCl/二噁烷(4M)中的混合物中。在20℃下将混合物搅拌30min。将残余物真空浓缩以提供呈棕色固体的2-[5-(氨基甲基)异噁唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(200mg，粗品，2HCl)。
在20℃下，在氮气下，向2-[5-(氨基甲基)异噁唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(80mg，150μmol，1当量，3HCl)和1-叔丁基吡咯-3-甲酸(30mg，179.5μmol，1.2当量)在DMF(2mL)中的混合物中一次性添加HOBt(40.4mg，300μmol，2当量)、EDCI(57.4mg，300μmol，2当量)、DIEA(1.50mmol，260μL，10当量)。在50℃下将混合物搅拌12h。将残余物倾倒至冰水(40mL)中。将水相用EA(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(1×30mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤，并且真空浓缩。将残余物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2-噁唑-5-基]甲基}-1H-吡咯-3-甲酰胺(23.5mg，27.3％产率，100.0％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):575.2[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝8.51(t,J＝6.0Hz,1H),7.65(s,1H),7.54(t,J＝2.0Hz,1H),7.08(t,J＝8.0Hz,1H),6.98(t,J＝2.6Hz,1H),6.87(d,J＝8.3Hz,1H),6.62(s,1H),6.51(dd,J＝1.8,2.8Hz,1H),6.30(d,J＝7.8Hz,1H),5.59-5.44(m,3H),4.93-4.74(m,1H),4.57(d,J＝5.7Hz,2H),3.70-3.50(m,1H),3.11-2.97(m,1H),2.81(br d,J＝11.5Hz,1H),2.31-2.17(m,4H),2.15-2.06(m,1H),1.97-1.82(m,1H),1.79-1.68(m,1H),1.49(s,9H)。
实施例298：化合物554B：1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2-噁唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺
在条件A下，使先前制备的2-[5-(氨基甲基)异噁唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(50mg，100μmol，1当量，2HCl)和1-叔丁基吡唑-4-甲酸(20.3mg，120μmol，1.2当量)在DMF(1mL)中偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:MeOH＝10:1)来纯化以提供呈白色固体的所需产物1-叔丁基-N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2-噁唑-5-基]甲基}-1H-吡唑-4-甲酰胺(18.8mg，31.8％产率，97.8％纯度)。LC-MS(ES+,m/z):270.9[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.82(br t,J＝5.81Hz,1H)8.34(s,1H)7.93(s,1H)7.64(s,1H)7.08(t,J＝7.89Hz,1H)6.88(br d,J＝8.55Hz,1H)6.66(s,1H)6.30(d,J＝7.89Hz,1H)5.43-5.58(m,3H)4.75-4.92(m,1H)4.61(br d,J＝5.70Hz,2H)3.52-3.72(m,1H)3.05(br d,J＝1.32Hz,1H)2.81(br dd,J＝11.62,1.10Hz,1H)2.20(s,4H)1.87-1.87(m,1H)1.69-1.79(m,1H)1.76(br d,J＝1.32Hz,1H)1.54(s,9H)。
实施例299：化合物555B：N-{[3-(4-{[(3S,4R)-3-氟-1-甲基哌啶-4-基]氨基}-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-1,2-噁唑-5-基]甲基}-5-(2-羟基丙烷-2-基)噻吩-3-甲酰胺
在条件A下，使先前制备的2-[5-(氨基甲基)异噁唑-3-基]-N-[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-4-胺(40mg，94μmol，1当量)和先前制备的5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酸(21mg，113μmol，1.2当量)偶联。将粗产物通过制备型TLC(SiO2，DCM:甲醇＝10:1)来纯化以提供呈黄色固体的所需产物N-[[3-[4-[[(3S,4R)-3-氟-1-甲基-4-哌啶基]氨基]-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-2-基]异噁唑-5-基]甲基]-5-(1-羟基-1-甲基-乙基)噻吩-3-甲酰胺(14mg，25.1％产率)。LC-MS(ES+,m/z):594.1[(M+H)+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ＝9.08-8.93(m,1H),8.05-7.95(m,1H),7.64(s,1H),7.35(d,J＝1.1Hz,1H),7.06(s,1H),6.92-6.85(m,1H),6.72-6.61(m,1H),6.35-6.28(m,1H),5.65-5.39(m,4H),4.95-4.74(m,1H),4.72-4.55(m,2H),3.67-3.58(m,1H),3.12-3.03(m,1H),2.82(br dd,J＝3.5,6.4Hz,1H),2.30-2.09(m,5H),1.95-1.86(m,1H),1.80-1.71(m,1H),1.51(s,6H)。
表9显示具有5-(1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑、3-(1H-吲哚-2-基)-1,2,4-噁二唑或3-(1H-吲哚-2-基)异噁唑核心的化合物。
表9
实施例300：体外DNA结合活性测定
使用TR-FRET(时间分辨荧光共振能量转移)测定来测量化合物的DNA结合活性，其中重组His标签Y220C p53 DBD蛋白结合至经生物素标记的共有DNA。通过在别藻蓝蛋白(APC)缀合的抗His标签抗体与铕-(Eu)缀合的链霉亲和素之间的FRET(荧光共振能量转移)来指示重组His标签Y220C p53 DBD蛋白与经生物素标记的共有DNA的结合。
将表1至表9的化合物(2mM的在二甲亚砜中的储备物)在二甲亚砜中进行3倍连续稀释。将1.2μL的化合物溶液添加至384孔聚丙烯黑色板(NUNC)的每个孔中。添加每孔30μL的在冰冷的测定缓冲液1(50mM Tris-HCl(pH 7.4)、75mM KCl、0.75mM DTT和0.2mg/mLBSA)中的181nM重组His标签Y220C p53 DBD蛋白(氨基酸#94-312；SEQ ID NO:1)和6.1nM的APC缀合的抗His标签抗体(Columbia Biosciences)。作为背景对照，还将30μL的含有6.1nM的APC抗His抗体的测定缓冲液1(无Y220C蛋白)添加至第二组连续稀释的化合物板中。通过在1,200rpm下离心(Eppendorf 5810R板离心机)1分钟来将样品旋转，并且在室温(20℃)下孵育15min。接着在27℃或29℃下将样品再孵育60min。将每孔5微升的在测定缓冲液2(50mMTris-HCl(pH 7.4)、75mM KCl和0.2mg/mL BSA)中的311nM经生物素标记的共有DNA(具有ATTAGGCATGTCTAGGCATGTCTAGG(SEQ ID NO.2)的5′至3′序列和附接于互补性DNA的3′末端的生物素的DNA双链体)和4.9nM铕(Eu)缀合的链霉亲和素(Eu-SA，Perkin Elmer)添加至孔中。通过在1,200rpm下离心1分钟来将样品旋转，并且在室温(20℃)下孵育20min。通过在读取器上读取在340nm下的激发以及在615nm和665nm下的发射荧光来监测测定信号。通过下式计算归一化的TR-FRET(时间分辨荧光共振能量转移)测定信号(Rn)：
Rn＝[(A-Ba-C×(D-Bd))/(D-Bd)]×(Dc-Bd)
其中：
A是在665nm下样品的荧光强度；
D是在615nm下样品的荧光强度；
Ba和Bd分别是在665nm和615nm下的板背景；并且
Dc是在615nm下在测定缓冲液中的0.67nM Eu-SA的荧光强度。
通过下式确定串扰因子(C)：
C＝(Ac-Ba)/(Dc-Bd)
其中Ac是在665nm下在测定缓冲液中的0.67nM铕(Eu)缀合的链霉亲和素的荧光强度。使用Prism(GraphPad)或XLfit软件(IDBS)计算SC150(使DNA结合增加至1.5倍的底物浓度)值。
表10显示表1中所示的化合物的SC150(μM)值。
表10
表11显示表2至表9中所示的化合物的SC150(μM)值。
表11
实施方案
以下非限制性实施方案提供了本发明的说明性实例，但不限制本发明的范围。
实施方案1.一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-A是被取代的或未被取代的环；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20独立地是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
实施方案2.如实施方案1所述的化合物，其中A是被取代的或未被取代的芳基、杂芳基、杂环基、亚环烷基。
实施方案3.如实施方案1或2所述的化合物，其中A是被取代的芳基。
实施方案4.如实施方案1或2所述的化合物，其中A是被取代的苯基。
实施方案5.如实施方案1、2或4中的任一者所述的化合物，其中A是被以下取代的苯基：烷基、环烷基、烷氧基、胺基团、羧基、羧酸基团、碳酰胺基团或酰胺基团，其各自是被取代的或未被取代的；氰基、卤基-或氢。
实施方案6.如实施方案1或2所述的化合物，其中A是被取代的杂芳基。
实施方案7.如实施方案1、2或6中的任一者所述的化合物，其中A是未被取代的或被取代的包含1、2或3个杂原子作为环成员的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。
实施方案8.如实施方案1、2、6或7中的任一者所述的化合物，其中A是吡啶基、嘧啶基、噻二唑基、噻唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
实施方案9.如实施方案1、2或6-8中的任一者所述的化合物，其中A是1,3,5-噻二唑-2-基。
实施方案10.如实施方案1、2或6-8中的任一者所述的化合物，其中A是1,3,4-噁二唑-2-基或1,2,4-噁二唑-2-基。
实施方案11.如实施方案1、2或6-8中的任一者所述的化合物，其中A是吡啶基。
实施方案12.如实施方案1、2或6-8中的任一者所述的化合物，其中A是未被取代的或被取代的包含1、2、3、4、5或6个杂原子的芳族8元、9元、10元、11元或12元双环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。
实施方案13.如实施方案1-12中的任一者所述的化合物，其中m是1。
实施方案14.如实施方案1-13中的任一者所述的化合物，其中Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。
实施方案15.如实施方案1-14中的任一者所述的化合物，其中Q1是键。
实施方案16.如实施方案1-15中的任一者所述的化合物，其中Y是N。
实施方案17.如实施方案1-16中的任一者所述的化合物，其中R2是氢。
实施方案18.如实施方案1-16中的任一者所述的化合物，其中R2是被取代的或未被取代的烷基。
实施方案19.如实施方案1-16或18中的任一者所述的化合物，其中R2是三氟乙基。
实施方案20.如实施方案1-16或18中的任一者所述的化合物，其中R2是环烷基。
实施方案21.如实施方案1-20中的任一者所述的化合物，其中R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、烷基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或卤素。
实施方案22.如实施方案1-21中的任一者所述的化合物，其中R1是-NR16R17。
实施方案23.如实施方案1-21中的任一者所述的化合物，其中R1是被取代的烷基。
实施方案24.如实施方案1-23中的任一者所述的化合物，其中每个R3和R4独立地是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
实施方案25.如实施方案1-24中的任一者所述的化合物，其中R3是氢，并且R4是至少被卤基-取代的杂环基。
实施方案26.如实施方案1-25中的任一者所述的化合物，其中R4是被氟基-取代的杂环基。
实施方案27.如实施方案1-25中的任一者所述的化合物，其中R4是被氯基-取代的杂环基。
实施方案28.如实施方案1-27中的任一者所述的化合物，其中R13是烷基、烯基、氢或卤素。
实施方案29.如实施方案1-28中的任一者所述的化合物，其中R13是氢。
实施方案30.如实施方案1-13、15-27或29中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案31.如实施方案1-13、15-19、21-27、29或30中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案32.如实施方案1-13、15-27或29中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案33.如实施方案1-13、15-19、21-27或29中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案34.一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Ar是未被取代的或被取代的芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-n是0、1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-每个Rx和R1独立地是C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或氢；或R1和Rx与Ar一起形成稠环；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
实施方案35.如实施方案34所述的化合物，其中Ar是被取代的或未被取代的苯基。
实施方案36.如实施方案34或35所述的化合物，其中m是1。
实施方案37.如实施方案34-36中的任一者所述的化合物，其中Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。
实施方案38.如实施方案34-37中的任一者所述的化合物，其中Q1是键。
实施方案39.如实施方案34-38中的任一者所述的化合物，其中Y是N。
实施方案40.如实施方案34-39中的任一者所述的化合物，其中R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、烷基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或卤素。
实施方案41.如实施方案34-40中的任一者所述的化合物，其中每个R3和R4独立地是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
实施方案42.如实施方案34-41中的任一者所述的化合物，其中R3是氢，并且R4是至少被卤基-取代的芳基、杂芳基或杂环基。
实施方案43.如实施方案34-42中的任一者所述的化合物，其中R4是被卤基-取代的杂环基。
实施方案44.如实施方案34-43中的任一者所述的化合物，其中R4是被氟基-取代的杂环基。
实施方案45.如实施方案34-43中的任一者所述的化合物，其中R4是被氯基-取代的杂环基。
实施方案46.如实施方案34-45中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案47.如实施方案46所述的化合物，其中Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。
实施方案48.如实施方案46或47所述的化合物，其中Q1是键。
实施方案49.如实施方案46-48中的任一者所述的化合物，其中R2是被取代的烷基。
实施方案50.如实施方案46-49中的任一者所述的化合物，其中R2是三氟乙基。
实施方案51.如实施方案46-50中的任一者所述的化合物，其中R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、烷基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或卤素。
实施方案52.如实施方案46-51中的任一者所述的化合物，其中R1是-NR16R17。
实施方案53.如实施方案46-51中的任一者所述的化合物，其中R1是被取代的烷基。
实施方案54.如实施方案46-53中的任一者所述的化合物，其中每个R3和R4独立地是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
实施方案55.如实施方案46-54中的任一者所述的化合物，其中R3是氢，并且R4是被取代的杂环基。
实施方案56.如实施方案46-55中的任一者所述的化合物，其中R4是被卤基-取代的杂环基。
实施方案57.如实施方案46-56中的任一者所述的化合物，其中R4是被氟基-取代的杂环基。
实施方案58.如实施方案46-56中的任一者所述的化合物，其中R4是被氯基-取代的杂环基。
实施方案59.如实施方案46-58中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案60.如实施方案59所述的化合物，其中R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、烷基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或卤素。
实施方案61.如实施方案59或60所述的化合物，其中R1是NR16R17。
实施方案62.如实施方案59-61中的任一者所述的化合物，其中R1是-C(O)R16、-C(O)OR16或-C(O)NR16R17。
实施方案63.如实施方案59-62中的任一者所述的化合物，其中R1是被取代的烷基。
实施方案64.如实施方案59-63中的任一者所述的化合物，其中n是0。
实施方案65.如实施方案59-63中的任一者所述的化合物，其中n是1。
实施方案66.如实施方案59、60或62-64中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案67.如实施方案59所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案68.如实施方案59所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案69.如实施方案68所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案70.如实施方案68所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案71.如实施方案68所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案72.一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-Het是被取代的或未被取代的杂芳基；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，
或其药学上可接受的盐。
实施方案73.如实施方案72所述的化合物，其中Het是芳族5元或6元单环。
实施方案74.如实施方案72或73所述的化合物，其中Het是芳族5元环。
实施方案75.如实施方案72-74中的任一者所述的化合物，其中Het是噻唑基、噻二唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基。
实施方案76.如实施方案72或73所述的化合物，其中Het是芳族6元环。
实施方案77.如实施方案72、73或76中的任一者所述的化合物，其中Het是吡啶基或嘧啶基。
实施方案78.如实施方案72-77中的任一者所述的化合物，其中R1是烷基、亚烷基、烷氧基、-NR21R22或芳基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；卤基或氢。
实施方案79.如实施方案72-78中的任一者所述的化合物，其中R1是-NR21R22。
实施方案80.如实施方案72-78中的任一者所述的化合物，其中R1是被取代的烷基。
实施方案81.如实施方案72-80中的任一者所述的化合物，其中Q1是亚烷基、亚烯基、亚炔基或键。
实施方案82.如实施方案72-81中的任一者所述的化合物，其中Q1是键。
实施方案83.如实施方案72-82中的任一者所述的化合物，其中Y是N。
实施方案84.如实施方案72-83中的任一者所述的化合物，其中m是1。
实施方案85.如实施方案72-84中的任一者所述的化合物，其中每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
实施方案86.如实施方案72-85中的任一者所述的化合物，其中R3是氢，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
实施方案87.如实施方案72-86中的任一者所述的化合物，其中R4是被取代的或未被取代的杂环基。
实施方案88.如实施方案72-87中的任一者所述的化合物，其中R4是至少被卤基-取代的杂环基。
实施方案89.如实施方案72-88中的任一者所述的化合物，其中R4是被至少氟基-取代的杂环基。
实施方案90.如实施方案72-88中的任一者所述的化合物，其中R4是被至少氯基-取代的杂环基。
实施方案91.如实施方案72-90中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案92.如实施方案91所述的化合物，其中Q1是键。
实施方案93.如实施方案91或92所述的化合物，其中R2是氢或烷基。
实施方案94.如实施方案91-93中的任一者所述的化合物，其中R2是被取代的烷基。
实施方案95.如实施方案91-94中的任一者所述的化合物，其中R2是三氟乙基。
实施方案96.如实施方案91-95中的任一者所述的化合物，其中R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
实施方案97.如实施方案91-96中的任一者所述的化合物，其中R4是被取代的杂环基。
实施方案98.如实施方案91-97中的任一者所述的化合物，其中R4是被卤基-取代的杂环基。
实施方案99.如实施方案91-98中的任一者所述的化合物，其中R4是被氟基-取代的杂环基。
实施方案100.如实施方案91-98中的任一者所述的化合物，其中R4是被氯基-取代的杂环基。
实施方案101.如实施方案91-100中的任一者所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案102.如实施方案101所述的化合物，其中Het是芳族5元环。
实施方案103.如实施方案101或102所述的化合物，其中Het是噻唑基、噻二唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基。
实施方案104.如实施方案101所述的化合物，其中Het是芳族6元环。
实施方案105.如实施方案101或104所述的化合物，其中Het是吡啶基或嘧啶基。
实施方案106.如实施方案101-105中的任一者所述的化合物，其中Q1是亚烷基、亚烯基、亚炔基或键。
实施方案107.如实施方案101-106中的任一者所述的化合物，其中Q1是键。
实施方案108.如实施方案101-107中的任一者所述的化合物，其中R1是烷基、亚烷基、烷氧基、-NR21R22或芳基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；卤基或氢。
实施方案109.如实施方案101-108中的任一者所述的化合物，其中R1是被取代的烷基或-NR21R22。
实施方案110.如实施方案101-109中的任一者所述的化合物，其中R2是被取代的烷基。
实施方案111.如实施方案101-110中的任一者所述的化合物，其中R2是三氟乙基。
实施方案112.如实施方案101-111中的任一者所述的化合物，其中R3是H，并且R4是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
实施方案113.如实施方案101-112中的任一者所述的化合物，其中R3是氢，并且R4是被取代的或未被取代的杂环基。
实施方案114.如实施方案101-113中的任一者所述的化合物，其中R4是被卤基-取代的杂环基。
实施方案115.如实施方案101-114中的任一者所述的化合物，其中R4是被氟基-取代的杂环基。
实施方案116.如实施方案101-114中的任一者所述的化合物，其中R4是被氯基-取代的杂环基。
实施方案117.如实施方案72所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案118.如实施方案72所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案119.如实施方案72所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案120.如实施方案72所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案121.如实施方案72所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
实施方案122.一种诱导细胞的凋亡的方法，所述方法包括使所述细胞与治疗有效量的结合p53突变体的实施方案1-121中的任一者所述的化合物接触，其中所述化合物增加所述p53突变体结合DNA的能力，其中所述细胞表达所述p53突变体。
实施方案123.如实施方案122所述的方法，其中所述p53突变体在氨基酸220处具有突变。
实施方案124.如实施方案122或123所述的方法，其中所述p53突变体是p53Y220C。
实施方案125.如实施方案122-124中的任一者所述的方法，其中所述化合物诱导所述p53突变体的构象变化。
实施方案126.如实施方案122-125中的任一者所述的方法，其中相较于野生型p53，所述化合物选择性结合所述p53突变体。
实施方案127.如实施方案122-126中的任一者所述的方法，其中所述治疗有效量是约50mg至约3000mg。
实施方案128.一种治疗癌症的方法，所述方法包括向有需要的对象施用治疗有效量的实施方案1-121中的任一者所述的化合物。
实施方案129.如实施方案128所述的方法，其中所述治疗有效量是约20mg至约2000mg。
实施方案130.如实施方案128或129所述的方法，其中所述癌症是卵巢癌。
实施方案131.如实施方案128或129所述的方法，其中所述癌症是乳腺癌。
实施方案132.如实施方案128或129所述的方法，其中病况是肺癌。
实施方案133.如实施方案128-132中的任一者所述的方法，其中所述施用是口服施用。
实施方案134.如实施方案128-132中的任一者所述的方法，其中所述施用是静脉内施用。
实施方案135.如实施方案128-132中的任一者所述的方法，其中所述施用是皮下施用。
实施方案136.如实施方案128-132中的任一者所述的方法，其中所述施用是局部施用。
实施方案137.如实施方案128-136中的任一者所述的方法，其中所述对象是人。
实施方案138.如实施方案128-137中的任一者所述的方法，其中相对于在不存在所述化合物下所述p53突变体的生物活性构象的稳定性，所述化合物增加所述p53突变体的所述生物活性构象的稳定性。
实施方案139.一种化合物，所述化合物包含：
吲哚基团，其中所述吲哚基团包含：
a)在所述吲哚基团的1位处的卤代烷基；
b)在所述吲哚基团的2位处的第一取代基，其中所述第一取代基是环状基团；和
c)第二取代基，其中所述第二取代基被至少卤基-取代；
或其药学上可接受的盐。
实施方案140.如实施方案139所述的化合物，其中所述环状基团是芳基、杂芳基或杂环基，其各自是被取代的或未被取代的。
实施方案141.如实施方案139或140所述的化合物，其中所述环状基团是未被取代的芳基。
实施方案142.如实施方案139或140所述的化合物，其中所述环状基团是被取代的芳基。
实施方案143.如实施方案139、140或142中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是被取代的苯基。
实施方案144.如实施方案139或140所述的化合物，其中所述环状基团是被取代的或未被取代的杂芳基。
实施方案145.如实施方案139、140或144所述的化合物，其中所述杂芳基是芳族5元或6元单环。
实施方案146.如实施方案139、140、144或145中的任一者所述的化合物，其中所述杂芳基是噻唑基、噻二唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基。
实施方案147.如实施方案139、140、144或145中的任一者所述的化合物，其中所述杂芳基是吡啶基或嘧啶基。
实施方案148.如实施方案139-147中的任一者所述的化合物，其中所述第二取代基在所述吲哚基团的4位处。
实施方案149.如实施方案139-148中的任一者所述的化合物，其中所述第二取代基是被取代的或未被取代的第二环状基团。
实施方案150.如实施方案139-149中的任一者所述的化合物，其中所述第二环状基团是杂环基。
实施方案151.如实施方案139-150中的任一者所述的化合物，其中所述杂环基是哌啶基。
实施方案152.如实施方案139-150中的任一者所述的化合物，其中所述杂环基是四氢吡喃基。
实施方案153.如实施方案139-152中的任一者所述的化合物，其中所述杂环基被氟基-取代。
实施方案154.如实施方案139-152中的任一者所述的化合物，其中所述杂环基被氯基-取代。
实施方案155.如实施方案139-154中的任一者所述的化合物，其中所述卤代烷基是三氟乙基。
实施方案156.一种包含吲哚基团的化合物，其中所述吲哚基团包含：
a)在所述吲哚基团的3位处的被取代的或未被取代的非环状基团；和
b)在所述吲哚基团的2位处的被取代的或未被取代的环状基团，其中相对于在不存在所述化合物下p53突变体的生物活性构象的稳定性，所述化合物增加所述p53突变体的生物活性构象的稳定性，或其药学上可接受的盐。
实施方案157.如实施方案156所述的化合物，其中所述非环状基团是氢。
实施方案158.如实施方案156所述的化合物，其中所述非环状基团是卤基-。
实施方案159.如实施方案156-158中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是芳基、杂芳基、杂环基或亚环烷基，其各自是被取代的或未被取代的。
实施方案160.如实施方案156-159中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是芳基或杂芳基，其各自是被取代的或未被取代的。
实施方案161.如实施方案156-160中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是被取代的芳基。
实施方案162.如实施方案156-161中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是被取代的苯基。
实施方案163.如实施方案156-162中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是被以下取代的苯基：烷基、环烷基、烷氧基、胺基团、羧基、羧酸基团、碳酰胺基团或酰胺基团，其各自是被取代的或未被取代的；氰基、卤基-或氢。
实施方案164.如实施方案156-160中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是被取代的杂芳基。
实施方案165.如实施方案156-160或164中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是包含1、2或3个杂原子作为环成员的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。
实施方案166.如实施方案156-160、164或165中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是吡啶基、嘧啶基、噻二唑基、噻唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基。
实施方案167.如实施方案156-160或164-166中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是1,3,5-噻二唑-2-基。
实施方案168.如实施方案156-160或164-166中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是1,3,4-噁二唑-2-基或1,2,4-噁二唑-2-基。
实施方案169.如实施方案156-160或164-166中的任一者所述的化合物，其中所述环状基团是吡啶基。
实施方案170.如实施方案156-160或164-166中的任一者所述的化合物，其中所述吲哚基团还包含在所述吲哚基团的4位处的取代基。
实施方案171.如实施方案170所述的化合物，其中所述取代基是被取代的或未被取代的氨基。
实施方案172.如实施方案171所述的化合物，其中所述氨基被第二环状基团取代。
实施方案173.如实施方案172所述的化合物，其中所述第二环状基团是被至少卤基-取代的杂环基。
实施方案174.如实施方案172所述的化合物，其中所述杂环基被至少氟基-取代。
实施方案175.如实施方案172所述的化合物，其中所述杂环基被至少氯基-取代。
实施方案176.如实施方案174所述的化合物，其中所述杂环基是哌啶基。
实施方案177.如实施方案174所述的化合物，其中所述杂环基是四氢吡喃基。
序列表
<110> 皮姆维制药公司
<120> 用于恢复突变p53功能的方法和化合物
<130> 44727-706.601
<140>Herewith
<141>Herewith
<150> 63/023,301
<151> 2020-05-12
<160> 2
<170> PatentIn版本 3.5
<210> 1
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 对人工序列的描述：合成的
多肽
<400> 1
Ser Ser Ser Val Pro Ser Gln Lys Thr Tyr Gln Gly Ser Tyr Gly Phe
1 5 10 15
Arg Leu Gly Phe Leu His Ser Gly Thr Ala Lys Ser Val Thr Cys Thr
20 25 30
Tyr Ser Pro Ala Leu Asn Lys Met Phe Cys Gln Leu Ala Lys Thr Cys
35 40 45
Pro Val Gln Leu Trp Val Asp Ser Thr Pro Pro Pro Gly Thr Arg Val
50 55 60
Arg Ala Met Ala Ile Tyr Lys Gln Ser Gln His Met Thr Glu Val Val
65 70 75 80
Arg Arg Cys Pro His His Glu Arg Cys Ser Asp Ser Asp Gly Leu Ala
85 90 95
Pro Pro Gln His Leu Ile Arg Val Glu Gly Asn Leu Arg Val Glu Tyr
100 105 110
Leu Asp Asp Arg Asn Thr Phe Arg His Ser Val Val Val Pro Cys Glu
115 120 125
Pro Pro Glu Val Gly Ser Asp Cys Thr Thr Ile His Tyr Asn Tyr Met
130 135 140
Cys Asn Ser Ser Cys Met Gly Gly Met Asn Arg Arg Pro Ile Leu Thr
145 150 155 160
Ile Ile Thr Leu Glu Asp Ser Ser Gly Asn Leu Leu Gly Arg Asn Ser
165 170 175
Phe Glu Val His Val Cys Ala Cys Pro Gly Arg Asp Arg Arg Thr Glu
180 185 190
Glu Glu Asn Leu Arg Lys Lys Gly Glu Pro His His Glu Leu Pro Pro
195 200 205
Gly Ser Thr Lys Arg Ala Leu Ser Asn Asn Thr
210 215
<210> 2
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 对人工序列的描述：合成的
寡核苷酸
<400> 2
attaggcatg tctaggcatg tctagg 26

Claims (33)

1.一种下式化合物：
其中：
-每个独立地是单键或双键；
-X1是CR5、CR5R6、N、NR5、O、S、C＝O、C＝S或连接于
Q1的碳原子；
-X2是CR7、CR7R8、N、NR7、O、S、C＝O、C＝S或连接于
Q1的碳原子；
-X3是CR9、CR9R10、N、NR9、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X4是CR11、CR11R12、N、NR11、O、S、C＝O、C＝S或连接于Q1的碳原子；
-X5是CR13、N或NR13；
其中X1、X2、X3和X4中的至少一者是连接于Q1的碳原子；
-A是被取代的或未被取代的环；
-Q1是C＝O、C＝S、C＝CR14R15、C＝NR14、亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键；
-m是1、2、3或4；
-Y是N、O或不存在；
-R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-SR16、
-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、-SiR16R17R18、烷基、
烯基、炔基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基或卤基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；
-每个R3和R4独立地是-C(O)R19、-C(O)OR19、-C(O)NR19R20、
-SOR19、-SO2R19、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或R3和R4与R3和R4所结合的氮原子一起形成环，其中所述环是被取代的或未被取代的，或R3不存在；
-每个R2、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、
R15、R16、R17和R18独立地是-C(O)R21、-C(O)OR21、
-C(O)NR21R22、-OR21、-SR21、-NR21R22、-NR21C(O)R22、
-OC(O)R21、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R19和R20独立地是-C(O)R23、-C(O)OR23、-C(O)NR23R24、
-OR23、-SR23、-NR23R24、-NR23C(O)R24、-OC(O)R23、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢或卤素；
-每个R21和R22独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢；并
且
-每个R23和R24独立地是烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢，或其药学上可接受的盐。
2.如权利要求1所述的化合物，其中A是被取代的或未被取代的芳基、杂芳基、杂环基、亚环烷基。
3.如权利要求1所述的化合物，其中A是被取代的芳基。
4.如权利要求3所述的化合物，其中A是被取代的苯基。
5.如权利要求4所述的化合物，其中A是被以下取代的苯基：烷基、环烷基、烷氧基、胺基团、羧基、羧酸基团、碳酰胺基团或酰胺基团，其各自是被取代的或未被取代的；氰基、卤基-或氢。
6.如权利要求1所述的化合物，其中A是被取代的杂芳基。
7.如权利要求1所述的化合物，其中A是未被取代的或被取代的包含1、2或3个杂原子作为环成员的芳族5元、6元、7元或8元单环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。
8.如权利要求7所述的化合物，其中A是吡啶基、嘧啶基、噻二唑基、噻唑基、吡唑基、噻吩基或噁二唑基，其各自独立地是被取代的或未被取代的。
9.如权利要求8所述的化合物，其中A是1,3,5-噻二唑-2-基。
10.如权利要求8所述的化合物，其中A是1,3,4-噁二唑-2-基或1,2,4-噁二唑-2-基。
11.如权利要求8所述的化合物，其中A是吡啶基。
12.如权利要求8所述的化合物，其中A是未被取代的或被取代的包含1、2、3、4、5或6个杂原子的芳族8元、9元、10元、11元或12元双环环系统，其中每个杂原子独立地选自O、N或S。
13.如权利要求1所述的化合物，其中m是1。
14.如权利要求1所述的化合物，其中Q1是亚烷基、亚烯基或亚炔基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或键。
15.如权利要求14所述的化合物，其中Q1是键。
16.如权利要求1所述的化合物，其中Y是N。
17.如权利要求1所述的化合物，其中R2是氢。
18.如权利要求1所述的化合物，其中R2是被取代的或未被取代的烷基。
19.如权利要求18所述的化合物，其中R2是三氟乙基。
20.如权利要求18所述的化合物，其中R2是环烷基。
21.如权利要求1所述的化合物，其中R1是-C(O)R16、-C(O)OR16、-C(O)NR16R17、-OR16、-NR16R17、-NR16C(O)R16、-OC(O)R16、烷基、烷氧基、芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；氰基、卤基或卤素。
22.如权利要求21所述的化合物，其中R1是-NR16R17。
23.如权利要求21所述的化合物，其中R1是被取代的烷基。
24.如权利要求1所述的化合物，其中每个R3和R4独立地是芳基、杂芳基或杂环基，其各自独立地是被取代的或未被取代的；或氢。
25.如权利要求24所述的化合物，其中R3是氢，并且R4是至少被卤基-取代的杂环基。
26.如权利要求25所述的化合物，其中R4是被氟基-取代的杂环基。
27.如权利要求25所述的化合物，其中R4是被氯基-取代的杂环基。
28.如权利要求1所述的化合物，其中R13是烷基、烯基、氢或卤素。
29.如权利要求28所述的化合物，其中R13是氢。
30.如权利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
31.如权利要求30所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
32.如权利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
33.如权利要求32所述的化合物，其中所述化合物具有下式：
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