CN115485565A - 用于预测病毒疾病的过程的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及用于预测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,其基于测量所述受试者中的睾酮和/或雌二醇水平。本发明进一步涉及用于监测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,其包括预测所述受试者中的疾病过程,和如果预期所述病毒疾病的严重过程,则为所述受试者分配预防或治疗措施。本发明进一步涉及芳香酶抑制剂,其用于治疗或预防被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的严重过程的方法中,其中与参考值相比,所述受试者的睾酮水平降低和/或雌二醇水平升高。最后,本发明还涉及用于实施上述方法之一的试剂盒。
Description
本发明涉及用于预测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,其基于测量所述受试者中的睾酮和/或雌二醇水平。本发明进一步涉及用于监测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,其包括预测所述受试者中的疾病过程,和如果预期所述病毒疾病的严重过程,则为所述受试者分配预防或治疗措施。本发明进一步涉及芳香酶抑制剂,其用于治疗或预防被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的严重过程的方法中,其中与参考值相比,所述受试者的睾酮水平降低和/或雌二醇水平升高。最后,本发明还涉及用于实施上述方法之一的试剂盒。
发明领域
流感有时可以导致严重的疾病进展与高死亡率。在具有疾病的严重过程的病例中,患者可能必须在重症监护室(ICUs)中治疗。在经历流感的重症监护的所有患者中,近似30%发展严重的呼吸道并发症,特别是导致肺衰竭的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。严重的呼吸道并发症可以在流感患者中迅速发生,有时仅在几个小时内。
类似地,在被冠状病毒、特别是被严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)或严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)感染的患者亚组中也经常观察到ARDS。尽管约80%的被SARS-CoV-2感染的人无需特殊治疗即康复,但约6%的感染的人遇到严重的呼吸道并发症,包括ARDS。老年人和具有预先存在的病况诸如哮喘、糖尿病或心脏病的那些人具有增加的严重过程的风险。再次,严重的呼吸道并发症可能非常快地发生。
到目前为止,尚不可能可靠地预测被流感病毒或冠状病毒感染的患者是否将发展严重的呼吸道并发症,如ARDS。因此,需要新的预后方法,其使得医师能够鉴定具有发展疾病的严重过程的特别高风险的患者。此类预后方法将允许甚至在呼吸道并发症发作之前为此类患者指定特定治疗,由此显著提高他们的生存机会。
发明描述
作为本发明基础的研究已经揭示,测定受试者的体液样品中(优选在血清样品中)的睾酮和/或雌二醇水平,允许预测由被流感病毒或冠状病毒感染引起的感染疾病是采用严重过程还是温和过程。
具体地,通过回顾性分析已经发现,在较晚期显示疾病的严重过程(包括严重呼吸并发症如ARDS)的患者中,在来自被流感病毒或冠状病毒感染的男性患者的样品中可以检测到的睾酮水平显著更低。同时,在后来显示并发症的患者中,雌二醇水平更高。此外,在本文中已经发现,与未感染的动物相比,被SARS-CoV-2感染的动物的肺中的酶芳香酶(也称为CYP19A1)(其催化睾酮向雌二醇的转化)的表达增加。总之,这些研究表明,睾酮水平降低和/或雌二醇水平升高是流感病毒或冠状病毒感染的标志。
基于这种见解,本发明允许提供基于睾酮和/或雌二醇水平可靠地预测流感病毒或冠状病毒感染是否采用严重过程(这可能需要进行重症监护措施,如人工呼吸)的测试。通过这种方式,本发明的方法允许医院和重症监护室中的改进风险分析。
因此,在第一个方面,本发明提供了用于预测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,所述方法包括:
(a) 提供来自被所述流感病毒或冠状病毒感染的受试者的体液样品;
(b) 在所述样品中测定睾酮和/或雌二醇的浓度;和
(c) 比较步骤(b)中获得的浓度与至少一种睾酮和/或雌二醇参考值;
其中步骤(b)中获得的浓度与所述至少一种参考值的比较表明在所述受试者中是否预期所述病毒疾病的严重过程。
在上述方法的步骤(a)中,提供了从受感染的男性受试者获得的体液样品。在上述方法中待使用的样品原则上可以是从待诊断的受试者获得的任何类型的体液。在一个优选方面,所述样品将是血液样品,诸如全血样品,或血浆或血清样品。在一个甚至更优选方面,所述样品将是血清样品,诸如人血清样品。
所述样品源自已经被诊断为被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者。所述男性受试者可以是18至120岁的成年人,但优选该受试者为至少20岁、至少25岁、至少30岁、至少35岁、至少40岁、至少45岁、至少50岁、至少55岁或至少60岁。
可以通过适合于证实受试者中存在病毒的任何方法,例如通过基于PCR的病毒特异性核酸的检测,通过电子显微镜,通过检测针对病毒蛋白的抗体,或者通过使用缀合抗体免疫检测病毒组分,例如以酶联免疫吸附测定(ELISA)的形式,获得流感病毒或冠状病毒诊断。在一个优选方面,已经通过ELISA获得了该受试者中的流感病毒或冠状病毒诊断。
如本文所述,术语流感病毒涉及一组引起传染病流感的RNA病毒。流感的常见症状包括发烧、头痛和疲劳。这些症状由流感感染的细胞释放的大量促炎细胞因子和趋化因子(包括干扰素或肿瘤坏死因子(TNF))引起。已经提出,细胞因子的大规模释放可以产生威胁生命的细胞因子风暴。本文所述的方法可用于预测疾病的这种严重过程。这些方法可以应用于被任何流感亚型(包括流感A亚型H1N1、H2N2、H3N2、H5N1、H7N7、H1N2、H9N2、H7N2、H7N3、H10N7、H7N9以及毒株Victoria、Yamagata、Yamaguchi、Yokohama、Yunnan、Zhuhai的流感B亚型)感染的患者。
术语冠状病毒涉及一组在哺乳动物和鸟类中引起疾病的相关病毒。在人类中,冠状病毒引起呼吸道感染,所述呼吸道感染可能与范围为轻度至重度的症状有关。轻度感染引起与普通感冒相似的症状。更严重的冠状病毒感染可能引起威胁生命的并发症,如严重急性呼吸综合征(SARS)、中东呼吸综合征(MERS)和冠状病毒病2019 (COVID-19)。根据本发明,受试者可以被任何类型的冠状病毒(包括α冠状病毒属、β冠状病毒属、γ冠状病毒属和δ冠状病毒属的病毒)感染,但其将优选为已知引起呼吸道感染的冠状病毒,诸如SARS、MERS和COVID-19。特别优选的是,所述受试者被严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)或严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染。
在上述方法的步骤(b)中,在来自感染的男性患者的样品中测定睾酮和/或雌二醇的浓度。在一个实施方案中,在来自感染患者的样品中测定睾酮的浓度。睾酮是主要的男性性激素,并且在男性生殖组织(诸如睾丸和前列腺)的发育中发挥关键作用,并且在调节男性中的免疫应答途径中也发挥关键作用。睾酮是一种来自雄甾烷类别的类固醇,其在几个步骤中从胆固醇合成。在男性中,睾酮主要由睾丸分泌。在通常睾酮水平比男性低7-8倍的女性中,在卵巢中产生睾酮。
用于测定睾酮的浓度的方法是本领域众所周知的,并且已经描述于科学文献中,例如,在van Nuland等人 (2019),Star-Weinstock & Dey (2019),Wooding等人(2015)和Ankarberg-Lindgren等人(2018)中。此外,用于定量样品的睾酮的试剂盒是市售的,诸如Testosterone ELISA Assay Kit (Eagle Biosciences, Amherst, USA)或TestosteroneELISA Kit (Abcam, Berlin, Germany)。
在另一个实施方案中,在来自受感染男性患者的样品中测定雌二醇的浓度。雌二醇(在文献中也称为E2),是一种雌激素类固醇激素和主要的雌性性激素。因此,它参与发情期和月经期女性生殖周期的调节,而且还参与调节女性中的免疫应答途径。雌二醇对于在青春期、成年和妊娠期间的雌性生殖组织、诸如乳腺、子宫和阴道的发育和维持是必要的。雌二醇是通过一系列反应和中间体从胆固醇产生。在女性中,产生尤其是在卵巢的卵泡中进行。在男性中,雌二醇主要由睾酮的催化转化(由酶芳香酶(也称为CYP19A1)催化的反应)产生。
用于测定雌二醇的浓度的方法是本领域众所周知的,并且已经描述于科学文献中,例如在Wooding等人 (2015),Siqueira Ferreira等人 (2017)和Keski-Rahkonen等人(2015), Analytical Chemistry, 87, 14, 7180-7186中。此外,用于定量样品中的雌二醇的试剂盒是市售的,诸如Estradiol Parameter Assay Kit, (R&D Systems, Inc.,Minneapolis, USA)、Estradiol ELISA Kit (Eagle Biosciences, Amherst, USA)或Human Estradiol E2 ELISA Kit (Abcam, Berlin, Germany)。
尤其优选的是,上述方法的步骤(b)包括测定来自受感染男性患者的样品中的睾酮浓度和雌二醇浓度两者。睾酮浓度和雌二醇浓度可以以任一顺序在样品的相同或不同等分试样中测定。
一旦已经在上述方法的步骤(b)中测定睾酮和/或雌二醇的浓度,则将浓度与至少一种睾酮和/或雌二醇参考值进行比较。在样品中测量的睾酮和/或雌二醇浓度与至少一种参考值的比较表明,在所述受试者是否预期所述病毒疾病的严重过程。
在一个优选实施方案中,本发明的第一个方面的方法在步骤(b)中包括测定体液样品、尤其是血液或血清样品中的睾酮浓度,并且在步骤(c)中包括比较样品的睾酮浓度与睾酮参考值,其中如果步骤(b)中获得的浓度低于参考值,则预期疾病的严重过程。
在18-50岁的男性中,每升血清8.69至29.00 nMol睾酮的浓度被认为是正常的。相反,在该年龄的男性中,低于8.69 nMol/l的睾酮浓度值被认为小于正常值,且因此指示被流感病毒或冠状病毒感染的患者中的潜在严重并发症。因此,在一个实施方案中,该年龄的成年男性的参考值为8.69 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于8.69 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为8.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于8.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为7.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于7.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为6.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于6.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为5.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于5.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为4.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于4.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为3.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于3.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为2.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于2.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为1.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于1.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。
在大于51岁的男性中,每升血清6.68至25.8 nMol睾酮的浓度被认为是正常的。相反,在该年龄的男性中,低于6.68 nMol/l的睾酮浓度值被认为小于正常值,且因此指示被流感病毒或冠状病毒感染的患者中的潜在严重并发症。因此,在一个实施方案中,该年龄的成年男性的参考值为6.68 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于6.68 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为6.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于6.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为5.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于5.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为4.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于4.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为3.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于3.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为2.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于2.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为1.5 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于1.5 nMol/l,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,该年龄的男性的参考值为1.0 nMol/l,并且如果样品中的浓度低于1.0 nMol/l,则预期疾病的严重过程。
对于雌二醇,在男性中,每毫升血清27.1至52.2 pg雌二醇的浓度被认为是正常的,而与其年龄无关。相反,高于52.2 pg/ml的雌二醇浓度值被认为大于正常值,且因此指示被流感病毒或冠状病毒感染的男性中的潜在严重并发症。因此,在一个实施方案中,成年男性的参考值为52.2 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过52.2 pg/ml,则预期疾病的严重过程。在另一个实施方案中,成年男性的参考值为55 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过55 pg/ml,则预期疾病的严重过程。在另一个实施方案中,成年男性的参考值为60 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过60 pg/ml,则预期疾病的严重过程。在另一个实施方案中,成年男性的参考值为70 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过70 pg/ml,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,成年男性的参考值为80 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过80 pg/ml,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,成年男性的参考值为90 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过90 pg/ml,则预期疾病的严重过程。在又另一个实施方案中,成年男性的参考值为100 pg/ml,并且如果样品中的雌二醇浓度超过100 pg/ml,则预期疾病的严重过程。
以上方法可用作患者监测的工具。因此,在第二个方面,本发明提供了用于监测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,所述方法包括:
(a) 以预先定义的时间间隔重复进行上面定义的根据本发明的第一个方面的方法,和
(b) 如果基于步骤(a)中获得的结果预期所述病毒疾病的严重过程,则为所述受试者分配预防或治疗措施。
根据本发明的第一个方面的预测方法可用于监测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中病毒疾病的过程。由于被流感或冠状病毒感染的受试者可能相当迅速地经历并发症,因此在预先定义的时间间隔(诸如每24小时、每18小时、每12小时或每6小时)中预测疾病的进一步过程是有帮助的。如果可以观察到睾酮水平下降和/或雌二醇水平升高,则可以预期具有呼吸并发症的感染的严重过程。在这种情况下,疾病的严重过程是可能的,并且可以向受试者分配预防或治疗措施。此类措施包括临床监测增加、人工呼吸的启动或抗病毒药物(如瑞德西韦(Remdesivir))的施用。所述措施还可以包括用如本文别处所述的一种或多种芳香酶抑制剂治疗患者,用如本文别处所述的一种或多种睾酮或睾酮衍生物治疗患者,或此类疗法的组合。在本发明的第二个方面的方法中,病毒疾病的严重过程可以包括ARDS的发展。
在被流感病毒或冠状病毒感染后睾酮水平降低和/或雌二醇水平升高的患者经常承担经历疾病的严重过程的更高风险这一观察结果表明,这些患者的芳香酶(其催化睾酮向雌二醇的转化)的数量增加和/或活性水平增加。这与以下实施例中报道的观察结果一致:与未感染的动物相比,被SARS-CoV-2感染的仓鼠中芳香酶的表达增加。因此,对芳香酶的抑制可能在这些患者中具有治疗作用。
因此,在第三个方面,本发明提供了芳香酶抑制剂,其用于治疗或预防被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的严重过程的方法中,其中所述受试者(a)与上面讨论的正常参考水平相比睾酮水平降低,和/或(b)与上面讨论的正常参考水平相比雌二醇水平升高。
如以下实施例中所述,发现芳香酶抑制剂可以有效地阻断病毒散播。因此,在第四个方面,本发明提供了芳香酶抑制剂,其用于抑制被流感病毒或冠状病毒感染的受试者中的病毒散播的方法中。
本发明的第三个和第四个方面提到的芳香酶抑制剂优选地施用于受试者(更优选男性受试者),与参考值相比,所述受试者
(a) 睾酮水平降低和/或
(b) 雌二醇水平升高。
芳香酶抑制剂将被配制为与预期的施用途径相容。不同的施用途径对于向受试者提供芳香酶抑制剂是可行的。优选地,所述芳香酶抑制剂被配制用于口服施用,例如以片剂、胶囊、颗粒、粉末、液体等形式。或者,所述芳香酶抑制剂可以被配制用于肠胃外施用,例如用于静脉内或皮下施用。所述芳香酶抑制剂也可以被配制用于通过植入来施用,例如通过将芳香酶抑制剂与三维载体或支架(诸如水凝胶)混合。
用于本文使用的合适的芳香酶抑制剂包括但不限于氨鲁米特、睾内酯、阿那曲唑、来曲唑、依西美坦、伏氯唑、福美司坦和法屈唑(fadrozole)。优选地,所述芳香酶抑制剂用于治疗或预防病毒疾病的严重过程(包括ARDS的发展)的方法中。
优选地,可以将芳香酶抑制剂的施用与睾酮补充组合。因此,特别优选将睾酮施用于接受芳香酶抑制剂的受试者。睾酮施用和芳香酶抑制剂的施用可以同时或以任一顺序依次进行。
在第五个方面,本发明提供了睾酮或睾酮衍生物,其用于治疗或预防被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的严重过程的方法中,其中所述男性受试者(a)与上面讨论的正常参考水平相比睾酮水平降低,和/或(b)与上面讨论的正常参考水平相比雌二醇水平升高。参考值将是上面关于根据本发明的第一个方面的方法讨论的那些。
再次,所述睾酮或睾酮衍生物将被配制为与预期的施用途径相容。不同的施用途径对于向受试者提供睾酮或其衍生物是可行的。优选地,所述睾酮或睾酮衍生物被配制用于口服施用,例如以片剂、胶囊、颗粒、粉末、液体等形式。或者,所述睾酮或睾酮衍生物可以被配制用于肠胃外施用,例如用于静脉内或皮下施用。然而,优选所述睾酮或睾酮衍生物被配制用于经皮或经粘膜应用,例如以将睾酮释放至皮肤的药贴(patch)形式。
优选地,如上所述,睾酮的施用可以与一种或多种芳香酶抑制剂的施用组合。因此,优选接受睾酮或睾酮衍生物的受试者也接收上述芳香酶抑制剂之一。睾酮施用和芳香酶抑制剂的施用可以同时或以任一顺序依次进行。
最后,在第六个方面,本发明提供了用于实施上文所述方法的试剂盒,其包含:
(a) 用于确定受试者是否被流感病毒或冠状病毒感染的装置;
(b) 用于测定睾酮和/或雌二醇的浓度的装置;和
(c) 任选地,缓冲液和稀释剂。
在一个实施方案中,所述试剂盒含有可用于检测流感病毒或冠状病毒抗原(例如通过ELISA)的抗体。所述试剂盒还可以包含用于测定睾酮和/或雌二醇的浓度的合适的免疫试剂。
附图说明
图1显示在许多COVID-19患者中测定的睾酮和雌二醇水平。(A)描绘男性和女性COVID-19患者中测量的睾酮和雌二醇水平的表。(B)描绘在来自COVID-19患者和年龄匹配(≥40岁)的健康对照的血清或血浆中测量睾酮(a, b)和雌二醇(c, d)水平的图形。将男性COVID-19患者(a, c)细分为需要与ECMO连接的患者(+ECMO)以及未置于ECMO上的患者(-ECMO)。条形图(a, c)代表男性(COVID-19 +ECMO, n=5; COVID-19 –ECMO, n=34; 健康对照, n=30)且条形图(b, d)代表女性(COVID-19, n=11, 健康对照, n=20)。统计学显著性通过Student氏t-检验评价(* P < 0.05, ** P < 0.01, *** P < 0.001, **** P <0.0001)。
图2显示来自被H7N9甲型流感病毒感染的H7N9男性中的总睾酮表达水平测量值的结果。
图3显示测量叙利亚金仓鼠中CYP19A1表达的结果。(a) 在感染后3天(3 d p.i.)SARS-CoV-2感染的雄性和雌性叙利亚金仓鼠的肺中的CYP19A1 mRNA表达水平(n = 9-10)。针对HPRT(次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶1)归一化后,每种性别的PBS处理的仓鼠中的相对CYP19A1 mRNA表达值被设置为1。值显示为平均值,且误差条显示为SD。统计学显著性通过Kruskal–Wallis单向ANOVA、随后Dunn氏多重比较检验进行评价(*p < 0.05, ****p <0.0001)。(b) 在感染后3天SARS-CoV-2感染的雄性(上小图)和雌性(下小图)叙利亚金仓鼠的肺中的CYP19A1蛋白表达。显示每种性别的代表性图片(n = 5)。箭头表示CYP19A1表达的正信号。
图4显示测量用安慰剂或来曲唑处理的仓鼠的不同器官中的病毒滴度和MIP-1a/MIP-1b表达水平的结果。(a-c)在感染后3天用安慰剂或来曲唑处理的PBS和SARS-CoV-2感染的雄性叙利亚金仓鼠的肺(a)、脑(b)和睾丸(c)中的病毒滴度(每个n = 6)。(d-e)在感染后6天用安慰剂或来曲唑处理的PBS和SARS-CoV-2感染的雄性叙利亚金仓鼠的肺中的MIP-1a (d)和MIP-1b (e)的蛋白表达水平(每个n = 6)。(f-h)在感染后3天用安慰剂或来曲唑处理的PBS和SARS-CoV-2感染的雌性叙利亚金仓鼠的肺(f)、脑(g)和血浆(h)中的病毒滴度(每个n = 6)。(i-j)在感染后6天用安慰剂或来曲唑处理的PBS和SARS-CoV-2感染的雌性叙利亚金仓鼠的肺中的MIP-1a (i)和MIP-1b (j)的蛋白表达水平(每个n = 6)。值显示为平均值,且误差条显示为SD。统计学显著性通过Kruskal–Wallis单向ANOVA、随后Dunn氏多重比较检验进行评价(*p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001, **** p < 0.0001)。n.d.检测不到,n.s. 不显著。
图5显示测量致命Covid-19病例的人肺中的CYP19A1表达的结果。(a)来自致命男性Covid-19病例和由于其他原因死亡的对照(非Covid-19)的肺中的CYP19A1 mRNA表达水平(非Covid-19: n = 5, Covid-19: n = 9)。值显示为平均值;误差条显示为SD。统计学显著性通过Kruskal–Wallis单向ANOVA、随后Dunn氏多重比较检验进行评价(*p<0.05)。(b)致命男性(上小图)和女性(下小图) Covid-19病例或由于其他原因死亡的对照(非Covid-19)的肺中的CYP19A1蛋白表达。通过原位杂交检测SARS-CoV-2 RNA。显示代表性图片(男性:n= 8,女性:n = 3)。正方形指示巨噬细胞。
实施例
为了举例说明的目的,在不限制本发明的情况下,本发明在实施例的基础上在下文描述。对于本领域技术人员而言将显而易见的是,所述实施例的修改和变化是可能的,而不偏离本发明的理念。
实施例1:测定COVID-19患者中的激素状态
检查在汉堡埃彭多夫大学医院(University Hospital Hamburg Eppendorf)需要重症监护的45名COVID-19患者。在这些患者中,35名为男性,且10名为女性。男性和女性中的中位年龄分别与62岁和67.5岁相当。大多数患者呈现身体质量指数(BMI)升高(31.4%的男性和30%的女性的BMI≥30)。所有患者都呈现男性和女性的共病症,诸如肥胖(男性69%;女性50%),其次为II型糖尿病(男性22.9%;女性20%)、高血压(男性45.7%,女性33.3%)和癌症(男性22.9%,女性33.3%)。在大多数男性(37%或26%)和女性(33%或33%)患者中,检测到的急性呼吸窘迫(ARDS)被分为中度或重度。依次的器官衰竭评价(SOFA)评分在男性(35%或25%)和女性(40%或60%)中呈现高(4-7)或非常高(8-11)评分的男性和女性中进行评估。由于男女比率为3.5:1的强性别偏差,测量已知不仅在生育能力中发挥关键作用、而且在先天和适应性免疫中也发挥关键作用的性激素。
结果:结果显示于表1中。69%的男性中的总睾酮水平下降。在本文中,26%的男性显示非常低的睾酮水平,且43%的男性显示极低的睾酮水平。在60%的女性中,睾酮水平上升至高(50%)或非常高(10%)水平。雌二醇水平在男性COVID-19患者(46%)中升高,升高至高(30%)或非常高(16%)水平。相比之下,60%的女性也显示雌二醇浓度升高至高(40%)或非常高(20%)水平。因此,绝大多数男性COVID-19患者具有非常低的睾酮水平和非常高的雌二醇水平。相比之下,女性COVID-19患者倾向于具有高睾酮和雌二醇水平。性激素的变化,如此处在男性患者中所见,提示芳香酶(CYP19A1)(即,将睾酮转化为雌二醇的酶)活性增加。
实施例2:测定H7N9流感患者中的激素状态
登记总共n=44例生育年龄(18-49岁)的H7N9禽流感阳性病例,其中中值年龄为42岁。在年龄≥50岁的那些人(中值年龄为61岁)中包括总共n=54例H7N9禽流感阳性病例。男性H7N9病例在年轻人组中占75%,且在老龄组中占70%,这与先前基于更大实验室证实的H7N9群组的流行病学研究一致。在发病后急性期内收集H7N9患者的血液样品。
为了评价睾酮对于H7N9感染结果的作用,在所有群组中测量睾酮浓度。与病毒阴性的H7N9对照相比,睾酮水平在两个年龄组的H7N9感染的男性中强烈降低。在18-49岁的年龄组中,低睾酮水平与H7N9感染的男性中的致命结果强烈相关(P< 0.001)(图2)。这些数据显示,18-49岁的H7N9感染男性中的低睾酮水平与致命结果的风险增加相关。
实施例3:病毒分离和动物感染
SARS-CoV-2分离物(SARS-CoV-2/Germany/Hamburg/01/2020)通过用200μl德国汉堡证实的男性COVID-19患者的人鼻咽拭子样品接种VeroE6细胞来分离,并在VeroE6细胞中连续传代3代。VeroE6在具有2%胎牛血清、1%青霉素-链霉素和1% L-谷氨酰胺的DMEM(Sigma-Aldrich GmbH)中在37℃下培养用于病毒繁殖,并且通过PCR测试为支原体物种(Mycoplasma sp.)阴性。所有用SARS-CoV-2的感染实验均在生物安全3级(BSL-3)实验室中进行。
所有动物实验都严格按照德国动物保护法的指南进行,并得到相关德国当局的批准(Behörde für Gesundheit und Verbraucherschutz;方案N 32/2020)。雄性和雌性叙利亚金仓鼠(8-10周龄)购自Janvier,并且保持在标准饲养条件(21±2℃,40-50%湿度,随意获取食物和水)下,光暗循环为12:12。对于感染,通过腹膜内注射用150 mg/kg氯胺酮和10mg/kg甲苯噻嗪麻醉仓鼠。动物用105噬斑形成单位(pfu) SARS-CoV-2鼻内接种, 用PBS模拟感染或用1 mg kg-1 多聚(I:C)施用。在感染后第3天,通过腹膜内注射过量戊巴比妥将每组5只动物安乐死,并通过心脏穿刺抽血。
对于RNA分离,将肺储存在RNAprotect Tissue Reagent (QIAGEN)中。对于组织病理学检查,收集的肺通过浸泡在10%中性缓冲福尔马林中进行固定,并包埋在石蜡中。
实施例4:测定CYP19A1 mRNA表达
为了通过实时定量PCR (RT-qPCR)测定CYP19A1 mRNA表达水平,将RNAprotect-固定的来自仓鼠的肺在混合器MM400 (Retsch)中在含有5个无菌不锈钢珠(直径2mm,Retsch)的700 μl裂解缓冲液RL中在30 Hz和4℃下均质化10分钟。根据制造商的说明书,使用innuPREP RNA Mini Kit 2.0 (Analytik Jena)从均质化的肺上清液分离总RNA,并使用无RNase的DNase Set (QIAGEN)进行额外的柱上DNase I处理。RNA在无RNase水中洗脱,并与1U µl-1 RiboLock RNase抑制剂(Thermo Fisher Scientific)混合。对于cDNA合成,根据制造商的说明书,使用2µg总RNA,使用随机九聚体引物(Gene Link, pd(N)9,最终浓度:5μM)和SuperScript III逆转录酶(Thermo Fisher Scientific)。
使用GeneAmp PCR System 9700 (Applied Biosystems;循环:25℃持续5 min,50℃持续60 min,70℃持续15 min,4℃保持)生成cDNA。在LightCycler® 480多孔板96反应板(Roche Life Science)中用PCR级水(Roche Life Science)设置反应。简而言之,将2 µl的cDNA模板添加至10 µl FastStart Essential DNA Green Master (Roche LifeScience)和300 nM的正向和反向引物中。RT-qPCR在LightCycler® 96 Real-Time PCR系统(Roche Life Science)上进行,且进行终点荧光检测:在95℃ 10 min以及45个扩增循环(在95℃ 15s,在65℃ 10s,和在72℃ 20s)。对每个样品中的CYP19A1和参考基因(仓鼠:HPRT,人:RPL32)一式两份进行分析。包括阴性对照和无逆转录酶的样品以检测污染。
相对表达值使用改良的E–ΔΔCt方法测定。Rn-值从LightCycler® 96软件v1.1.0.1320 (Roche)导出至Microsoft Office Excel 2016,并且用LinReg PCR软件v2018.0 (Ruijter等人 2009)获得原始样品中的转录物的起始浓度的N0-值。然后将CYP19A1基因的平均N0-值用各自样品的HPRT (N0(HPRT))或RPL32 (N0(RPL32))的平均N0-值归一化。呈现生物重复的相对N0(CYP19A1)/N0(HPRT)-或N0(CYP19A1)/N0(RPL32)-表达值。
对于仓鼠肺中的HPRT1(次黄嘌呤-鸟嘌呤-磷酸核糖基转移酶1)和CYP19A1的qRT-PCR使用以下引物序列:
HPRT1正向(SEQ ID NO:1)
5'-TCCCAGCGTCGTGATTAGTG-3'
HPRT1反向(SEQ ID NO:2)
5'-GTGATGGCCTCCCATCTCTT-3'
CYP19A1正向(SEQ ID NO:3)
5'- ATGCGGCACATCATGCTGAA-3'
CYP19A1反向(SEQ ID NO:4)
5'- TCTTTCAAGTCCTTGGCGGAT-3'
结果:结果显示于图3(a)中。可见,与未感染的动物相比,如通过RT-qPCR所测定的芳香酶表达在被SARS-CoV-2感染的动物中显著更高。
实施例5:免疫组织化学
对于芳香酶的免疫组织化学检测,使用EnVision+系统(Dako Agilent PathologySolutions)。将组织的连续切片脱蜡,并在异丙醇和96%乙醇中再水化,随后通过在室温下在具有0.5% H2O2的85%乙醇中孵育30分钟来阻断内源性过氧化物酶。通过在800 W的微波中在柠檬酸盐缓冲液(10 mM柠檬酸,0.05% Tween 20)中孵育20 min、随后在室温下孵育20min来进行抗原修复。切片随后转移至Shandon Coverplates™ (Thermo Electron GmbH),并用在含有1% BSA、0.3% Triton X-100的PBS中1:500稀释的针对芳香酶的多克隆抗体(Abcam, ab18995)在4℃下染色过夜。随后冲洗切片,并应用过氧化物酶标记的聚合物作为二抗持续30分钟。反应的可视化通过在PBS中的色原3,3-二氨基联苯胺四盐酸盐(DAB,0.05%)和0.03% H2O2中孵育5分钟来完成,且然后用Mayer的苏木素复染1 min。对于阴性对照,用兔正常血清(1:3,000)代替一抗。
结果:结果显示于图3(b)中。可见,在SARS-CoV-2-感染的雄性(上小图)和雌性(下小图)仓鼠的肺中可以检测到芳香酶蛋白表达。在对照动物的肺中未能检测到芳香酶蛋白表达。
实施例6:来曲唑治疗
所有动物实验都严格按照德国动物保护法的指南进行,并得到相关德国当局的批准(Behörde für Gesundheit und Verbraucherschutz;方案N 103/2020)。雄性和雌性叙利亚金仓鼠(8-12周龄)购自Janvier或者在Heinrich Pette Institute (LeibnizInstitute for Experimental Virology, Hamburg, Germany)繁殖,并且保持在标准饲养条件(21±2℃,40-50%湿度,随意获取食物和水)下,光暗循环为16:8。对于感染,通过腹膜内注射用150 mg/kg氯胺酮和10 mg/kg甲苯噻嗪麻醉仓鼠。动物用105噬斑形成单位(p.f.u) SARS-CoV-2鼻内接种或者用PBS模拟感染。在感染后3小时及之后的每一天,动物通过腹膜内注射用0.18 mg kg-1来曲唑或安慰剂治疗。在感染后第3天和第6天,每组6只动物通过腹膜内注射过量戊巴比妥来安乐死,并通过心脏穿刺抽血。对于病毒滴度测定和细胞因子测量,收集肺、脑和睾丸,在1ml 1x PBS中均质化,并储存在-80℃。
器官的均质化在混合器MM400 (Retsch)中在具有5个无菌的不锈钢珠(Ø 2 mm,Retsch)的1ml 1x PBS中在30 Hz下进行10 min。噬斑测定在VeroE6细胞单层上进行,并在72小时后用结晶紫染色。将组织匀浆在VeroE6细胞上以10倍连续稀释液在37℃下滴定30min,并用补充有0.2% BSA、1% L-谷氨酰胺、1%青霉素-链霉素、1µg ml-1 L-1-甲苯磺酰基氨基-2-苯乙基氯甲基酮(L-1-tosylamido-2-phenylethyl chloromethyl ketone, TPCK)处理的胰蛋白酶(Sigma-Aldrich)和1.25% Avicel的MEM (Sigma-Aldrich)覆盖。感染后72小时后,用4%多聚甲醛固定细胞,并通过用结晶紫染色观察噬斑。
根据制造商提供的说明书,使用定制的Bio-Plex Pro™ Mouse Cytokinemultiplex (Bio-Rad)在具有高通量流体学的Bio-Plex 200系统(HTF; Bio-Rad)中,在均质化肺中测量巨噬细胞炎性蛋白1α和1β(MIP-1α、MIP-1β)的蛋白表达水平。
所有数据都用Prism软件(GraphPad, 9.0.1)使用Kruskal-Wallis单向方差分析(ANOVA)、随后Dunn氏多重比较检验进行分析。统计学显著性被定义为p<0.05 (*p < 0.05,** p < 0.01, *** p < 0.001, **** p < 0.0001)。
结果:结果显示于图4中。从图4 (a)-(c)可见,与安慰剂相比,用芳香酶抑制剂来曲唑治疗导致SARS-CoV-2-感染的雄性动物的肺、脑和睾丸中的病毒滴度较低。类似地,图4(f)-(h)表明,与安慰剂相比,用芳香酶抑制剂来曲唑治疗导致SARS-CoV-2-感染的雌性动物的肺、脑和血浆中的病毒滴度较低。这些数据表明芳香酶抑制剂可能抑制病毒散播。图4进一步显示,在雄性(d)-(e)和雌性(i)-(j)动物中,用来曲唑治疗的动物的肺中MIP-1α和MIP-1β表达水平均较低。
实施例7:具有致命Covid-19的男性的肺尸检样品中的CYP19A1表达
分析源自临床前动物模型的数据是否也反映在人类中。因此,对来自死于Covid-19的男性和女性(n=54)的肺的尸检材料进行分析。作为对照,同样分析从由于其他原因死亡的男性和女性(非Covid-19对照组)获得的肺材料。病理学评价在三个独立研究地点进行:汉堡(n=26名男性,n=8名女性),杜宾根(n=8名男性,n=3名女性)和鹿特丹(n=12名男性,n=1名女性)。
根据制造商的说明书,使用RNeasy@ FFPE试剂盒(Qiagen)从福尔马林固定、石蜡包埋的人肺组织切片纯化总RNA。为了检测肺组织中的SARS-CoV-2 RNA,原位杂交(ISH)通过如下进行:使用SARS-CoV-2特异性探针(ACD, Newark, CA, USA)、随后来自ACD(Newark, CA, USA)的RNAscope 2.5 HD Detection Kit Red按照制造商的方案杂交肺组织切片。
qRT-PCR如上面实施例4中所述进行,其中以下引物序列用于人肺中RPL32(核糖体蛋白L32)和CYP19A1的qRT-PCR:
RPL32正向(SEQ ID NO:5)
5’- GAAGTTCCTGGTCCACAACG-3’
RPL32反向(SEQ ID NO:6)
5’-GCGATCTCGGCACAGTAAG-3’
CYP19A1正向(SEQ ID NO:7)
5’-CGGCCTTGTTCGTATGGTCA-3’
CYP19A1反向(SEQ ID NO:8)
5’- CAGAAGGGTCAACACGTCCA-3’
结果:在所有地点,与非Covid-19男性对照相比,CYP19A1在Covid-19男性的肺中大量表达。一般来说,在独立的所有三个研究地点,CYP19A在上皮细胞、内皮细胞中表达,但巨噬细胞中表达最大量。值得注意的是,在大多数死亡女性的肺中仍可检测到SARS-CoV-2NP蛋白或RNA,而在男性死亡的时间点,病毒抗原或RNA以低水平表达或已经清除。CYP19A1mRNA水平的定量揭示,与非Covid-19男性相比,Covid-19男性的肺中的转录增加约10倍。这些发现显示,在具有Covid-19的男性的肺中,CYP19A1在死亡时间点也大量表达。结果描绘于图5中。
文献
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5.Van Nuland等人 (2019), J Pharm Biomed Anal., 170: 161-168。
序列表
<110> Heinrich-Pette-Institut Leibniz-Institut für ExperimentelleVirologie
<120> 用于预测病毒疾病的过程的方法
<130> P 111063
<160> 8
<170> BiSSAP 1.3.6
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 1
tcccagcgtc gtgattagtg 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 2
gtgatggcct cccatctctt 20
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 3
atgcggcaca tcatgctgaa 20
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 4
tctttcaagt ccttggcgga t 21
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 5
gaagttcctg gtccacaacg 20
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 6
gcgatctcgg cacagtaag 19
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 7
cggccttgtt cgtatggtca 20
<210> 8
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
引物序列
<220>
<223> 引物序列
<400> 8
cagaagggtc aacacgtcca 20
Claims (20)
1.用于预测被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的过程的方法,所述方法包括:
(a) 提供来自被所述流感病毒或冠状病毒感染的受试者的体液样品;
(b) 在所述样品中测定睾酮和/或雌二醇的浓度;和
(c) 比较步骤(b)中获得的浓度与至少一种睾酮和/或雌二醇参考值;
其中步骤(b)中获得的浓度与所述至少一种参考值的比较表明在所述受试者中是否预期所述病毒疾病的严重过程。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述体液样品是血液、血浆或血清样品。
3.根据权利要求1-2中任一项的方法,其中所述方法包括将步骤(b)中获得的浓度与睾酮参考值进行比较,其中如果步骤(b)中获得的浓度低于参考值,则预期所述病毒疾病的严重过程。
4.根据权利要求1-3中任一项的方法,其中所述睾酮参考值为18-50岁的男性中的8.69nMol/l血清或大于51岁的男性中的6.68 nMol/l血清。
5.根据权利要求1-2中任一项的方法,其中所述方法包括将步骤(b)中获得的浓度与雌二醇参考值进行比较,其中如果步骤(b)中获得的浓度超过参考值,则预期所述病毒疾病的严重过程。
6.根据权利要求1-5中任一项的方法,其中所述雌二醇参考值为52.2 pg/ml血清,更优选地60 pg/ml血清。
7.根据权利要求1-6中任一项的方法,其中所述方法包括:
(i) 将步骤(b)中获得的睾酮浓度与睾酮参考值进行比较,其中所述参考值优选地为18-50岁的男性中的8.69 nMol/l血清或大于51岁的男性中的6.68 nMol/l血清,和
(ii) 将步骤(b)中获得的雌二醇浓度与雌二醇参考值进行比较,其中所述参考值优选地为52.2 pg/ml血清,
其中如果步骤(b)中获得的睾酮浓度低于睾酮参考值且步骤(b)中获得的雌二醇浓度超过雌二醇参考值,则预期所述病毒疾病的严重过程。
8.根据权利要求1-7中任一项的方法,其中所述流感病毒为H7N9或所述冠状病毒为SARS-CoV-2。
9.用于监测被流感病毒或冠状病毒感染的受试者中的病毒疾病的过程的方法,所述方法包括:
(a) 以预先定义的时间间隔重复进行如权利要求1-8中任一项中所定义的方法,和
(b) 如果基于步骤(a)中获得的结果预期所述病毒疾病的严重过程,则为所述受试者分配预防或治疗措施。
10.根据权利要求1-9中任一项的方法,其中所述病毒疾病的严重过程包括发展急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。
11.芳香酶抑制剂,其用于治疗或预防被流感病毒或冠状病毒感染的受试者中的病毒疾病的严重过程的方法中,
其中与参考值相比,所述受试者
(a) 睾酮水平降低,和/或
(b) 雌二醇水平升高。
12.权利要求11的用于方法中的芳香酶抑制剂,其中所述抑制剂选自氨鲁米特、睾内酯、阿那曲唑、来曲唑、依西美坦、伏氯唑、福美司坦和法屈唑。
13.权利要求11-12中任一项的用于方法中的芳香酶抑制剂,其中所述病毒疾病的严重过程包括发展急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。
14.权利要求11-13中任一项的用于方法中的芳香酶抑制剂,其中所述方法还包括施用睾酮或睾酮衍生物。
15.芳香酶抑制剂,其用于抑制被流感病毒或冠状病毒感染的受试者中的病毒散播的方法中。
16.权利要求15的用于方法中的芳香酶抑制剂,其中与参考值相比,所述受试者
(a) 睾酮水平降低,和/或
(b) 雌二醇水平升高。
17.权利要求15-16中任一项的用于方法中的芳香酶抑制剂,其中所述抑制剂选自氨鲁米特、睾内酯、阿那曲唑、来曲唑、依西美坦、伏氯唑、福美司坦和法屈唑。
18.权利要求15-17中任一项的用于方法中的芳香酶抑制剂,其中所述受试者是男性受试者。
19.睾酮或睾酮衍生物,其用于治疗或预防被流感病毒或冠状病毒感染的男性受试者中的病毒疾病的严重过程的方法中,其中所述男性受试者(a)与正常参考水平相比睾酮水平降低,和/或(b)与正常参考水平相比雌二醇水平升高。
20.用于实施权利要求1-11中任一项的方法的试剂盒,其包含:
(a) 用于确定受试者是否被流感病毒或冠状病毒感染的装置;
(b) 用于测定睾酮和/或雌二醇的浓度的装置;和
(c) 任选地,缓冲液和稀释剂。
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