CN110511259B - 环二核苷酸人工金属酶及其制备和催化不对称Friedel-Crafts反应的应用 - Google Patents
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Abstract
Description
技术领域
本发明涉及一种环二核苷酸人工金属酶,以及其制备方法和作为手性催化剂在不对称Friedel-Crafts反应中的应用。
背景技术
人工金属酶是将过渡金属离子或者金属配合物配合物和生物分子(蛋白质或核酸)相结合组装而成的一类仿生催化剂,主要可用于扩展金属催化反应类型和探究生物分子的潜在催化功能。环二核苷酸是一类环状的RNA分子,它作为第二信使分子广泛参与细胞间信号传导和调节多种细胞生理功能。近年来,环二核苷酸引起研究者的广泛关注和研究,但是关于其催化功能的研究还未有报道。
Friedel-Crafts反应在有机合成中是重要的碳-碳键形成反应之一,其不对称反应在精细化学品合成、天然产物合成和药物中间体合成中占据重要作用。在已有的文献报道中,不对称Friedel-Crafts反应一般是在严格的无水、无氧条件下进行的。到目前为止,仅有少量的不对称Friedel-Crafts反应的例子可以在少量水存在下进行。水作为反应介质具有廉价、安全和环境友好的特点,并且某些时候还可以促进反应的进行。
发明内容
本发明的目的是提供一种新型环二核苷酸人工金属酶催化剂,并为其提供一种制备方法和新用途。
针对上述目的,本发明所采用的环二核苷酸人工金属酶的结构式如下所示:
上述环二核苷酸人工金属酶的合成方法为:
本发明环二核苷酸人工金属酶的制备方法为:将式I所示的环二核苷酸与铜盐或铜配合物按摩尔比1:1~5:1加入到pH为5.0~7.0的吗啉乙磺酸酸或吗啉丙磺酸缓冲液中,在0~15℃下搅拌反应15~30分钟,得到环二核苷酸人工金属酶;
上述环二核苷酸人工金属酶的制备方法中,优选将式I所示的环二核苷酸与铜盐或铜配合物按摩尔比2:1~5:1加入到pH为5.5~6.0的吗啉乙磺酸酸或吗啉丙磺酸缓冲液中,在4~10℃下搅拌反应15~30分钟,得到环二核苷酸人工金属酶。
本发明环二核苷酸人工金属酶催化不对称Friedel-Crafts反应的用途,具体方法为:将环二核苷酸人工金属酶、咪唑烯酮类化合物在0~15℃下搅拌15~30分钟,再加入吲哚类化合物,继续在该温度下反应6~24小时,得到Friedel-Crafts烷基化产物。
上述咪唑烯酮类化合物与吲哚类化合物、环二核苷酸人工金属酶的摩尔比为1:2~10:0.01~0.5,优选咪唑烯酮类化合物与吲哚类化合物、环二核苷酸人工金属酶的摩尔比为1:5~6:0.05~0.1。
本发明的有益效果如下:
本发明首次将生物分子环二核苷酸作为手性主体分子与铜盐或铜配合物结合,原位自组装生成环二核苷酸人工金属酶,其制备过程简单,在水和空气中具有良好稳定性,环二腺苷酸的引入大大提高了铜盐或铜配合物的催化效率,将其用于催化水相中的不对称Friedel-Crafts反应,催化活性较高,转化率和对映体选择性较高。且水作为反应介质具有廉价、安全和环境友好的特点。
附图说明
图1是实施例1中c-di-AMP·Cu(OTf)2中c-di-AMP·Cu2+的结构图(俯视图)。
图2是实施例1中c-di-AMP·Cu(OTf)2中c-di-AMP·Cu2+的结构图(侧视图)。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明进一步详细说明,但本发明所要保护的范围不限于这些实施例。
实施例1
制备结构式如下的环二腺苷酸/三氟甲磺酸铜人工金属酶(c-di-AMP·Cu(OTf)2)
在4℃条件下,向1000μL 20mM pH 5.5的吗啉乙磺酸缓冲液中加入20μL 5mM的环二腺苷酸(c-di-AMP)水溶液,再加入10μL 5mM的Cu(OTf)2水溶液,搅拌30分钟,得到c-di-AMP·Cu(OTf)2。
由图1和图2可见,两分子c-di-AMP通过A碱基腺嘌呤的π-π堆叠作用形成稳定的二聚体结构,两个Cu2+离子同等情况位于A-A形成的平面中央,且与分别来自两个不同c-di-AMP分子的N7原子及磷酸基的O原子形成配位键。
实施例2
制备结构式如下的环二鸟苷酸/三氟甲磺酸铜人工金属酶(c-di-GMP·Cu(OTf)2)
本实施例中,用等摩尔环二鸟苷酸(c-di-GMP)替换实施例1中的环二腺苷酸(c-di-AMP),其他步骤与实施例1相同,得到c-di-GMP·Cu(OTf)2。
实施例3
制备结构式如下的环腺苷酸鸟苷酸/三氟甲磺酸铜人工金属酶(c-AMP-GMP·Cu(OTf)2)
本实施例中,用等摩尔环腺苷酸鸟苷酸(c-AMP-GMP)替换实施例1中的环二腺苷酸(c-di-AMP),其他步骤与实施例1相同,得到c-AMP-GMP·Cu(OTf)2。
实施例4
制备结构式如下的环二脱氧腺苷酸/三氟甲磺酸铜人工金属酶(c-di-dAMP·Cu(OTf)2)
本实施例中,用等摩尔环二脱氧腺苷酸(c-di-dAMP)替换实施例1中的环二腺苷酸(c-di-AMP),其他步骤与实施例1相同,得到c-di-dAMP·Cu(OTf)2。
实施例5
制备结构式如下的环二腺苷酸/硝酸铜人工金属酶(c-di-AMP·Cu(NO3)2)
本实施例中,用等摩尔硝酸铜(Cu(NO3)2)替换实施例1中的三氟甲磺酸铜(Cu(OTf)2),其他步骤与实施例1相同,得到c-di-AMP·Cu(NO3)2。
实施例6
制备结构式如下的环二腺苷酸/联吡啶硝酸铜人工金属酶(c-di-AMP·Cu(bpy)(NO3)2)
本实施例中,用等摩尔联吡啶硝酸铜(Cu(bpy)(NO3)2)替换实施例1中的三氟甲磺酸铜(Cu(OTf)2),其他步骤与实施例1相同,得到c-di-AMP·Cu(bpy)(NO3)2。
实施例7
制备结构式如下的环二腺苷酸/三联吡啶硝酸铜人工金属酶(c-di-AMP·Cu(tpy)(NO3)2)
本实施例中,用等摩尔三联吡啶硝酸铜(Cu(tpy)(NO3)2)替换实施例1中的三氟甲磺酸铜(Cu(OTf)2),其他步骤与实施例1相同,得到c-di-AMP·Cu(tpy)(NO3)2。
实施例8
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮与5-甲氧基吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的用途,具体方法如下:
在4℃条件下,向1000μL 20mM pH 5.5的吗啉乙磺酸缓冲液中加入20μL 5mM环二腺苷酸(c-di-AMP)水溶液,再加入10μL 5mM Cu(OTf)2水溶液,搅拌30分钟,得到c-di-AMP·Cu(OTf)2,然后将0.15mg(1μmol)(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮溶于10μL DMSO后加入其中,4℃搅拌30分钟,再将0.74mg(5μmol)5-甲氧基吲哚溶于10μL DMSO后加入其中,4℃继续反应12小时;反应结束后,用乙酸乙酯萃取(2mL×3),取有机相过简易硅胶色谱柱除去残余水和微量Cu2+,旋蒸浓缩干燥后粗产品进行HPLC分析,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为87%。消旋体产物用Bruker Avance型超导傅立叶数字化核磁共振谱仪进行表征,表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.22(s,1H),7.20(d,J=8.8Hz,1H),7.15(s,2H),7.01(d,J=3.0Hz,2H),6.82(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),3.94(s,3H),3.86(s,3H),3.79(dt,J=10.7,5.4Hz,1H),3.58(dd,J=15.6,6.2Hz,1H),3.40(dd,J=15.6,8.4Hz,1H),1.40(d,J=6.9Hz,3H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ192.40(s),153.76(s),143.34(s),131.56(s),128.83(s),126.94(d,J=8.0Hz),121.11(d,J=18.3Hz),112.13(s),111.78(s),101.09(s),55.96(s),46.84(s),36.17(s),27.19(s),21.47(s);HRMS(ESI)理论值[C17H20N3O2]+(M+H)+:m/z 298.1550,实测值298.1551。
本实施例中,用等摩尔实施例4中的c-di-dAMP·Cu(OTf)2替换c-di-AMP·Cu(OTf)2,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为87%。
本实施例中,用等摩尔实施例5中的c-di-AMP·Cu(NO3)2替换c-di-AMP·Cu(OTf)2,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为81%。
本实施例中,用等摩尔实施例6中的c-di-AMP·Cu(bpy)(NO3)2替换c-di-AMP·Cu(OTf)2,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为45%。
本实施例中,用等摩尔实施例7中的c-di-AMP·Cu(tpy)(NO3)2替换c-di-AMP·Cu(OTf)2,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为78%。
实施例9
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-2-烯-1-酮与5-甲氧基吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-1-酮的用途,具体方法如下:
本实施例中,用等摩尔(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-2-烯-1-酮替换实施例8中的(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮,其他步骤与实施例8相同,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-1-酮的对映体选择性为84%。消旋体表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.20(s,1H),7.20-7.16(m,1H),7.14(d,J=0.9Hz,1H),7.07(d,J=2.4Hz,1H),7.00(d,J=2.5Hz,1H),6.96(d,J=0.5Hz,1H),6.80(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),3.85(d,J=3.8Hz,7H),3.61(dd,J=13.2,7.3Hz,1H),3.51(dd,J=7.3,1.5Hz,2H),1.84-1.77(m,2H),0.87(d,J=7.4Hz,3H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ192.55(s),153.71(s),143.44(s),131.55(s),128.86(s),127.59(s),126.90(s),122.04(s),119.05(s),112.01(s),111.78(s),101.21(s),56.01(s),45.10(s),36.18(s),33.94(s),29.79(s),28.88(s),12.00(s);HRMS(ESI)理论值[C18H22N3O2]+(M+H)+:m/z 312.1707,实测值312.1699。
实施例10
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-3-苯基丙-2-烯-1-酮与5-甲氧基吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-3-苯基丙-1-酮的用途,具体方法如下:
本实施例中,用等摩尔(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-3-苯基丙-2-烯-1-酮替换实施例8中的(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮,其他步骤与实施例8相同,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-3-苯基丙-2-烯-1-酮的转化率为83%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-3-苯基丙-1-酮的对映体选择性为54%。消旋体表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.10(s,1H),7.38(d,J=8.0Hz,2H),7.23(t,J=7.6Hz,2H),7.14(ddd,J=11.0,7.9,5.5Hz,4H),6.98(s,1H),6.91(d,J=2.4Hz,1H),6.78(dd,J=8.7,2.4Hz,1H),5.00(t,J=7.6Hz,1H),4.06-3.97(m,1H),3.89(s,3H),3.83(dd,J=16.4,7.9Hz,1H),3.75(s,3H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ144.36(s),143.14(s),131.70(s),128.88(s),128.41(s),128.03(s),127.29(s),127.02(s),126.25(s),122.32(s),119.15(s),112.21(s),111.73(s),101.48(s),55.88(s),45.47(s),38.26(s),36.26(s);HRMS(ESI)理论值[C22H21N3O2Na]+(M+Na)+:m/z382.1526,实测值382.1531。
实施例11
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮与吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的用途,具体方法如下:
本实施例中,用等摩尔吲哚替换实施例8中的5-甲氧基吲哚,其他步骤与实施例8相同,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为40%。消旋体表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.11(s,1H),7.67(d,J=7.8Hz,1H),7.32(d,J=8.0Hz,1H),7.19-6.97(m,5H),3.93(s,3H),3.84(dt,J=14.0,7.1Hz,1H),3.52(ddd,J=23.9,15.8,7.3Hz,2H),1.42(d,J=6.9Hz,3H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ192.34(s),128.87(s),126.72(d,J=17.1Hz),121.86(s),120.19(s),119.21(d,J=19.2Hz),111.05(s),46.76(s),36.13(s),27.20(s),21.69(s);HRMS(ESI)理论值[C16H18N3O]+(M+H)+:m/z 268.1444,实测值268.1436。
实施例12
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮与5-氯吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(5-氯-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的用途,具体方法如下:
本实施例中,用等摩尔5-氯吲哚替换实施例8中的5-甲氧基吲哚,其他步骤与实施例8相同,(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-氯-1H-吲哚-3-基)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为59%。消旋体表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.25(s,1H),7.55(s,1H),7.22(d,J=8.6Hz,1H),7.17-6.99(m,4H),3.92(s,3H),3.82-3.72(m,1H),3.46(qd,J=15.6,7.3Hz,2H),1.40(d,J=6.9Hz,3H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ128.80(s),122.15(s),118.72(s),112.04(s),47.00(s),27.11(s),21.59(s);HRMS(ESI)理论值[C16H17ClN3O]+(M+H)+:m/z 302.1055,实测值302.1052。
实施例13
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-1-(1-异丙基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮与5-甲氧基吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-异丙基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的用途,具体方法如下:
本实施例中,用等摩尔(E)-1-(1-异丙基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮替换实施例8中的(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮,其他步骤与实施例8相同,(E)-1-(1-异丙基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-1-(1-异丙基-1H-咪唑-2-基)丁-1-酮的对映体选择性为79%。消旋体表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.19(s,1H),7.25(d,J=1.0Hz,1H),7.22-7.13(m,3H),7.01(d,J=2.2Hz,1H),6.81(dd,J=8.7,2.5Hz,1H),5.53-5.43(m,1H),3.85(s,3H),3.83-3.77(m,1H),3.51(ddd,J=23.9,15.5,7.3Hz,2H),1.42-1.36(m,9H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ192.64(s),153.80(s),142.71(s),131.57(s),129.38(s),127.05(s),121.30(s),121.09(s),112.19(s),111.84(s),101.08(s),55.99(s),49.27(s),47.60(s),30.28(s),29.79(s),27.38(s),23.62(s),21.59(s);HRMS(ESI)理论值[C19H24N3O2]+(M+H)+:m/z 326.1863,实测值326.1867。
实施例14
实施例1中的c-di-AMP·Cu(OTf)2催化(E)-4,4-二甲基-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-2-烯-1-酮与5-甲氧基吲哚的不对称Friedel-Crafts反应生成3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-4,4-二甲基-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-1-酮的用途,具体方法如下:
本实施例中,用等摩尔(E)-4,4-二甲基-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-2-烯-1-酮替换实施例8中的(E)-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)丁-2-烯-1-酮,其他步骤与实施例8相同,(E)-4,4-二甲基-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-2-烯-1-酮的转化率为99%,3-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)-4,4-二甲基-1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)戊-1-酮的对映体选择性为95%。消旋体表征数据为:1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.95(s,1H),7.13(d,J=8.7Hz,1H),7.10(s,1H),7.02(dd,J=13.7,2.2Hz,2H),6.87(s,1H),6.77(dd,J=8.7,2.3Hz,1H),3.85(s,3H),3.79(dd,J=15.5,11.1Hz,1H),3.63(s,3H),3.57(dd,J=11.2,3.8Hz,1H),3.36(dd,J=15.7,3.8Hz,1H),1.00(s,9H);13C NMR(100MHz,CDCl3)δ128.49(s),126.46(s),117.40(s),111.76(s),111.26(s),101.65(s),55.90(s),41.84(s),41.14(s),35.76(s),34.67(s),28.12(s);HRMS(ESI)理论值[C20H26N3O2]+(M+H)+:m/z 340.2020,实测值340.2011。
Claims (7)
4.根据权利要求3所述的环二核苷酸人工金属酶的制备方法,其特征在于:将式I所示的环二核苷酸与铜盐或铜配合物按摩尔比2:1~5:1加入到pH为5.5~6.0的吗啉乙磺酸或吗啉丙磺酸缓冲液中,在4~10℃下搅拌反应15~30分钟,得到环二核苷酸人工金属酶。
6.根据权利要求5所述的环二核苷酸人工金属酶催化不对称Friedel-Crafts反应的用途,其特征在于:所述咪唑烯酮类化合物与吲哚类化合物、环二核苷酸人工金属酶的摩尔比为1:2~10:0.01~0.5。
7.根据权利要求6所述的环二核苷酸人工金属酶催化不对称Friedel-Crafts反应的用途,其特征在于:所述咪唑烯酮类化合物与吲哚类化合物、环二核苷酸人工金属酶的摩尔比为1:5~6:0.05~0.1。
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