[go: up one dir, main page]

CN110106198B - 陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法 - Google Patents

陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法 Download PDF

Info

Publication number
CN110106198B
CN110106198B CN201811416535.1A CN201811416535A CN110106198B CN 110106198 B CN110106198 B CN 110106198B CN 201811416535 A CN201811416535 A CN 201811416535A CN 110106198 B CN110106198 B CN 110106198B
Authority
CN
China
Prior art keywords
cotton
sequence
dna fragment
transgenic
transgenic cotton
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201811416535.1A
Other languages
English (en)
Other versions
CN110106198A (zh
Inventor
李付广
秦文强
王鹏
杨召恩
葛晓阳
杨作仁
于娅
王晔
鲁丽丽
胡伟
王玉芬
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Original Assignee
Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences filed Critical Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Priority to CN201811416535.1A priority Critical patent/CN110106198B/zh
Priority to PCT/CN2019/086597 priority patent/WO2020107816A1/zh
Publication of CN110106198A publication Critical patent/CN110106198A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN110106198B publication Critical patent/CN110106198B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8202Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by biological means, e.g. cell mediated or natural vector
    • C12N15/8205Agrobacterium mediated transformation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/10Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
    • Y02A40/146Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了陆地棉转化事件C006‑10‑13及其特异性鉴定方法。本发明将Cry51Aa1.C006‑1基因导入陆地棉CCRI24中,使基因在陆地棉CCRI24中过表达,得到转基因棉花,该转基因棉花为将序列1所示的外源DNA片段插入目的棉花基因组第D12号染色体的第63328845‑63329028位间,替换掉第D12号染色体的第63328845‑63329028位间182bp的碱基序列,得到的棉花。试验证明,该转基因棉花不仅抗盲蝽象方面具有高抗特性,而且株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数和衣分也高于陆地棉CCRI24。本发明为培育具有抗盲蝽象的转基因棉花奠定基础,具有重要的应用价值。

Description

陆地棉转化事件C006-10-13及其特异性鉴定方法
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及陆地棉转化事件C006-10-13及其特异性鉴定方法。
背景技术
转化事件是由外源基因在基因组插入位点的上下游侧翼区和外源基因构成的分子结构。通常,外源基因转化植物可以得到一个转化体群体,这个转化体群体包含大量独立的事件,其中每个事件都是独特的。外源基因在植物中的表达受到外源基因所插入的染色体位置的影响。这可能源自染色质结构或者整合位点附近转录调控元件的影响。相同基因在不同转化事件中的表达水平具有很大的差异,在表达的空间或时间模式上也可能存在差异。而且外源基因的插入也可能会影响内源基因的表达。因此,每个独立转化事件对受体植物的影响都是不同的。获得能有效表达外源基因,同时不影响植株本身农艺性状的植物转化事件在培育转基因作物新品种中具有重要的应用价值。
我国是世界上最大的棉花生产国和消费国,也是最大的纺织品和服装生产国与出口国。棉花总产量占世界棉花产量的25%左右。棉花生产的兴衰,对我国国民经济的发展,乃至人民生活水平的提高都产生着一定的影响。棉花是受害虫危害最为严重的农作物之一,我国棉花害虫至少有300种。在转基因抗虫棉(即抗棉铃虫)培育之前,以棉蚜、棉铃虫、棉叶螨和棉红铃虫四大害虫危害棉花最为严重,每年因虫害造成的棉花产量损失达15%~20%,每年为防治害虫投入的农药费用每公顷高达1200-1800元。随着BT抗虫棉的广泛种植与田间农药用量的大幅度减少,从根本上有效控制了棉铃虫等鳞翅目害虫,但棉田的生态系统随之发生了一系列变化,在棉铃虫的危害得到了有效的防治的同时,棉蚜、盲蝽象、烟粉虱等非靶标害虫数量大幅增加,逐渐上升为棉田的主要害虫,尤其是盲蝽象,对棉花的生产造成了巨大的损失。
2007年,黄大昉将Bt菌株F14-1中分离到的Cry51Aa1蛋白及编码该蛋白的Cry51Aa1基因序列提交至NCBI GenBank,检录号为DQ836184,Cry51Aa1蛋白是一类由苏云金芽孢杆菌产生的伴胞晶体之一,在生物防治领域具有重要的应用前景。本发明的发明人对Cry51Aa1基因进行了定点突变及体外毒力试验研究,筛选获得了具有较强抗盲蝽象特性的Cry51Aa1.C006-1基因。
发明内容
本发明的目的是提供一种具有抗盲蝽象特性的转基因棉花培育方法。
本发明首先保护一种转基因棉花的培育方法,为将外源DNA片段插入目的棉花基因组第D12号染色体的第63328845-63329028位间,替换掉第D12号染色体的第63328845-63329028位间182bp的碱基序列,得到转基因棉花;
所述转基因棉花的盲蝽象抗性和/或株高和/或第一果枝长度和/或果枝数和/或结铃数和/或衣分均高于所述目的棉花;所述转基因棉花的单铃重低于所述目的棉花;
所述外源DNA片段可为含有Cry51Aa1.C006-1基因的DNA分子。所述Cry51Aa1.C006-1基因的核苷酸序列如序列表中序列1自5’末端起第2614-3534位核苷酸所示。
上述培育方法中,所述外源DNA片段可通过含有外源DNA片段的重组载体导入所述目的棉花。所述含有外源DNA片段的重组载体可为将表达盒A插入pCambia2301载体的EcoRI和HindIII酶切位点间,且保持pCambia2301载体的其他序列不变,得到重组载体;表达盒A的核苷酸序列如序列表中序列1自5’末端起第2186-3822位所示。所述含有外源DNA片段的重组载体的核苷酸序列可如序列表中序列4所示。
上述培育方法中,所述外源DNA片段的核苷酸序列可如序列表中序列1所示。
所述培育方法具体可为将序列表中序列1所示的外源DNA分子插入目的棉花基因组第D12号染色体的第63328845-63329028位间(序列表中序列1所示的外源DNA分子的5’末端紧邻第D12号染色体的第63329028位,序列表中序列1所示的外源DNA分子的3’末端紧邻第D12号染色体的第63328845位),替换掉第D12号染色体的第63328845-63329028位间182bp的碱基序列,得到转基因棉花。
上述任一所述转基因棉花的种子在中国典型培养物保藏中心的保藏编号为CCTCCNO:P201822。
本发明还保护用于鉴定植物样品是否来源于所述转基因棉花或其后代的方法,包括如下步骤:检测所述待测植物样品的基因组DNA中是否含有DNA片段A;所述DNA片段A由上述任一所述外源DNA片段在所述转基因棉花的上游侧翼片段、所述外源DNA片段和所述外源DNA片段在所述转基因棉花的上游侧翼片段组成;
若所述待测植物样品的基因组DNA含有所述DNA片段A,则所述待测植物样品为或候选为所述转基因棉花或其后代;
若所述待测植物样品的基因组DNA不含有所述DNA片段A,则所述待测植物样品不为或候选不为所述转基因棉花或其后代。
上述任一所述外源DNA片段在所述转基因棉花的上游侧翼片段可为所述目的棉花基因组第D12号染色体自第63329028位核苷酸起向其3’方向延伸得到的长度为0-5Kb的任意一个DNA片段。
上述任一所述外源DNA片段在所述转基因棉花的下游侧翼片段可为所述目的棉花基因组第D12号染色体自第63328845位核苷酸起向其5’方向延伸得到的长度为0-5Kb的任意一个DNA片段。
上述任一所述上游侧翼序列的核苷酸序列可如序列表中序列2所示。
上述任一所述下游侧翼序列的核苷酸序列可如序列表中序列3所示。
上文中,所述转基因棉花对盲蝽象的抗性高于所述目的棉花可体现为:与目的棉花相比,转基因棉花的株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数和衣分均显著提高。因此,转基因棉花抗盲蝽象特性显著增加,生产中可用于培育抗盲蝽象棉花。
上述方法中,所述“检测所述待测植物样品的基因组DNA中是否含有DNA片段A”的方法可为S1)或S2)或S3):
S1)直接测序;
S2)用引物对1和/或引物对2对待测植物样品的基因组DNA进行PCR扩增,然后进行如下判断:若有目的扩增产物,则所述待测植物样品为或候选为所述转基因棉花或其后代;若没有目的扩增产物,则所述待测植物样品不为或候选不为所述转基因棉花或其后代;
所述引物对1可为能够扩增由所述外源DNA片段5’端和紧邻其所述上游侧翼序列部分或全部片段组成的DNA分子甲的引物对;其对应的目的扩增产物为所述DNA分子甲;
所述引物对2可为能够扩增含有所述外源DNA片段3’端和紧邻其所述下游侧翼序列的部分或全部组成的DNA分子乙的引物对;其对应的目的扩增产物为所述DNA分子乙。
S3)用能特异结合所述DNA分子甲或所述DNA分子乙的探针对所述待测植物样品的基因组DNA进行Southern blot杂交,然后进行如下判断:若能得到杂交片段,则所述待测植物样品为或候选为所述转基因棉花或其后代;若不能得到杂交片段,则所述待测植物样品不为或候选不为所述转基因棉花或其后代。
所述引物对1具体可由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列7所示的单链DNA分子组成。所述引物对2具体可由序列表中序列6所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成。
本发明还保护一种用于鉴定待测植物样品是否来源于所述培养方法获得的转基因棉花或其后代的试剂盒,包括上述任一所述引物对1和/或引物对2。
本发明还保护一种获得盲蝽象抗性提高和/或株高提高和/或第一果枝长度提高和/或果枝数提高和/或结铃数提高和/或衣分提高和/或单铃重降低的棉花的方法,可包括如下步骤:
(1)按照上述任一所述培养方法获得转基因棉花;
(2)将所述转基因棉花自交或杂交,得到繁育后代,按照上述任一所述的方法鉴定所述繁育后代,得到目标植株。
上述方法中,所述转基因棉花的种子在中国典型培养物保藏中心的保藏编号为CCTCC NO:P201822。
本发明还保护D1)-D6)中的任一种。
D1)采用上述任一所述培育方法获得的转基因棉花在棉花育种中的应用。
D2)上述任一所述外源DNA片段在调控棉花抗盲蝽象中的应用。
D3)上述任一所述外源DNA片段在调控棉花株高和/或第一果枝长度和/或果枝数和/或结铃数和/或衣分和/或单铃重中的应用。
D4)上述任一所述外源DNA片段在鉴定待测植物样品是否来源于上述任一所述培养方法获得的转基因棉花或其后代中的应用。
D5)上述任一所述引物对1和/或引物对2在鉴定待测植物样品是否来源于上述任一所述培育方法获得的转基因棉花或其后代中的应用。
D6)上述任一所述上游侧翼序列和/或下游侧翼序列在鉴定待测植物样品是否来源于上述任一所述培育方法获得的转基因棉花或其后代中的应用。
上文中,所述目的棉花可为陆地棉。所述陆地棉具体可为陆地棉CCRI24。
本发明将Cry51Aa1.C006-1基因导入陆地棉CCRI24中,使Cry51Aa1.C006-1基因在陆地棉CCRI24中过表达,得到转基因棉花C006-10-13,转基因棉花C006-10-13为将外源DNA片段插入目的棉花基因组第D12号染色体的第63328845-63329028位间,替换掉第D12号染色体的第63328845-63329028位间182bp的碱基序列,得到的棉花。试验证明,转基因棉花C006-10-13不仅抗盲蝽象方面具有高抗特性,而且株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数和衣分也高于陆地棉CCRI24。本发明为培育具有抗盲蝽象的转基因棉花奠定基础,具有重要的应用价值。
附图说明
图1为C006-10-13的序列分析。
图2为转基因棉花C006-10-13和陆地棉CCRI24的离体鉴定。
图3为T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13和陆地棉CCRI24的田间生长情况。
图4为转基因棉花C006-10-13和陆地棉CCRI24的网室鉴定。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。
下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。
以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
下述实施例中的陆地棉CCRI24在文献“PAG1,a cotton brassinosteroidcatabolism gene,modulates fiber elongation”中公开过,公众可从中国农业科学院棉花研究所获得。
下述实施例中的农杆菌LBA4404在文献“Constitutive expression of thevirulence genes improves the efficiency of plant transformation byAgrobacterium”中公开过,公众可从中国农业科学院棉花研究所获得。
下述实施例中涉及的引物的核苷酸序列见表1。
表1
Figure GDA0002117061390000041
注:“-”表示不存在;n为a或c或g或t,s为c或g,w为a或t。
实施例1、转Cry51Aa1.C006-1棉花的获得及农艺性状分析
一、转Cry51Aa1.C006-1棉花的获得
1、重组载体的构建
将表达盒A插入pCambia2301载体(该质粒购于NTCC典型培养物保藏中心下属的BioVector质粒载体菌种细胞基因保藏中心,货号为:Biovectorpcambia1300)的EcoRI和HindIII酶切位点间,且保持pCambia2301载体的其他序列不变,得到重组载体(核苷酸序列如序列表中序列4所示)。上述表达盒A的核苷酸序列如序列表中序列1自5’末端起第2186-3822位所示。表达盒A从上游依次包括来自椰菜花叶病毒的CAMV35S的启动子、Cry51Aa1.C006-1基因和NOS终止子;其中,CAMV35S启动子的核苷酸序列如序列表中序列1自5’末端起第2192-2537位核苷酸所示;Cry51Aa1.C006-1基因的核苷酸序列如序列表中序列1自5’末端起第2614-3534位核苷酸所示;NOS终止子的核苷酸序列如序列表中序列1自5’末端起第3569-3821位核苷酸所示。
pCambia2301载体自身包括表达盒B和表达盒C。表达盒B从上游起依次包括花椰菜花叶病毒的CAMV35S的增强启动子、KanR抗生素标记基因和Ploy A终止子。表达盒C从上游起依次包括花椰菜花叶病毒的CAMV35S的启动子、GUS标记基因和NOS终止子。
2、重组菌的获得
将步骤1获得的重组载体导入农杆菌LBA4404中,得到重组菌。
3、转Cry51Aa1.C006-1棉花的获得
采用农杆菌介导的方法将步骤2获得的重组菌转化陆地棉CCRI24的外植体(1500个),在含有卡那霉素的培养基上培养诱导形成愈伤组织,选择转化的愈伤组织,愈伤组织在卡那霉素筛选培养基上形成胚性愈伤组织,挑选存活的胚性愈伤转化形成再生成棉花,最后共获得50个T0代转Cry51Aa1.C006-1棉花,并将其用于筛选。
4、转Cry51Aa1.C006-1棉花的鉴定
(1)对收获的T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花种子在温室种植,进行温室功效分析和分子分析。提取T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花叶片的DNA,采用引物:5’-ACCCATCCAAGGTTGATACC-3’和5’-TTGATAGGTGAAGTCGGAGC-3’进行PCR扩增,检测目的基因是否存在,并统计材料的分离比。根据孟德尔遗传定律,获得12个单拷贝的T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花;
(2)采用Taqman PCR和Southern blot对上述步骤(1)获得的12个单拷贝的T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花进一步验证。具体步骤如下:在始花期对获得的12个单拷贝的T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花材料和陆地棉CCRI24材料的Cry51Aa1.C006-1基因表达量进行分析,表明12个单拷贝的T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花中有9个T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花的表达量较陆地棉CCRI24大幅提高。
(3)在开花期测定上述步骤(2)获得的9个T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花材料的农艺学性状和盲蝽象抗性。结果表明,9个T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花中9个T1代转Cry51Aa1.C006-1棉花的部分农艺性状(如株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数)和盲蝽象抗性较陆地棉CCRI24显著提高。
(4)在第一年田间大田试验中在相同位置的成对地块中评估9个T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花的农艺和品质性状(株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数、单铃重、衣分,其中纤维品质包括长度、比强度、马克隆值、伸长率、整齐度)及盲蝽象抗性。结果表明:9个T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花中共有2个T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花的部分农艺性状(株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数、衣分)和盲蝽象抗性显著好于陆地棉CCRI24。
(5)在第二年田间大田试验中在相同位置的成对地块中评估上述步骤(4)获得的2个T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花的农艺和品质性状(株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数、单铃重、衣分,其中纤维品质包括长度、比强度、马克隆值、伸长率、整齐度)及盲蝽象抗性。结果表明:2个T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花中共有1个T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花的部分农艺性状(株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数、衣分)和盲蝽象抗性显著好于陆地棉CCRI24,将该T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花的种子命名为C006-10-13,将T2代转Cry51Aa1.C006-1棉花C006-10-13进行自交,直至获得T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13。
2018年10月30日将T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花种子(Gossypiumhirsutum L.)C006-10-13保藏于中国典型培养物保藏中心,分类命名为陆地棉种子C006-10-13,保藏编号为CCTCC NO:P201822。
二、转Cry51Aa1.C006-1棉花的农艺性状分析
1、棉花盲蝽象抗性鉴定方法
抗性鉴定方法参考2015年发布与实施的行业标准“棉花抗盲蝽象性鉴定方法《中华人民共和国农业行业标准(NY/T 2676-2015)》”。
(1)离体鉴定(见图2,CCRI24为陆地棉CCRI24)
将带有小蕾的棉花枝条插入到盛有2%琼脂的透明塑料杯中,然后将3头盲蝽象若虫接入其中,上方覆盖倒置的扎有孔洞的塑料杯,防止水汽产生,并用封口膜将杯口密封,防止盲蝽逃逸。待试验进行至第6天时,进行活虫数及发育至成虫数的调查。
(2)网室鉴定(见图4,CCRI24为陆地棉CCRI24)
1)棉花种子应符合GB 4407.1对种子质量的要求;
2)鉴定在网室内进行,网室规格长×宽×高分别为20m×3m×2m,尼龙网为80目;
3)鉴定方法:
a.试验设计与管理:网室内随机排列种植供试棉花材料与感虫对照棉花材料,每材料种1行,株距为0.25m、行距为0.80m。每个网室为一次重复,共3次重复。网室内棉花栽培管理方式同大田,试验前7d-10d喷施残效短的化学农药清洁网室,试验期间不施用任何化学农药。
b.播种:供试棉花材料和感虫对照材料均按当地棉花常规播种时期和播种量进行播种。
c.试虫饲养:为室内用豇豆、嫩玉米穗等人工饲养的1龄-5龄盲蝽象混合种群。
d.试虫释放时期及释放量:网室内棉花生长到4叶-6叶期时释放盲蝽象,释放时选择活动力强的个体,每株棉花释放1头。
e.结果记录:试虫释放7d-10d后,每个网室每个材料随机调查10株,记录棉株上部5片嫩叶的受害情况,同时调查棉花的蕾铃数量和总蕾铃数。棉花叶片受害情况划分为5个级别,即0级、1级、2级、3级和4级,分级标准如下:0级为叶片无危害状;1级为叶片轻微受害,0%<受害面积≤5%;2级为叶片中等受害,5%<受害面积≤20%;3级为叶片严重受害,20%<受害面积≤50%;4级为叶片危害同对时品种,受害面积>50%。
f.鉴定指标:叶片危害指数(每株棉花上部5片叶片的危害级别均值)、叶片危害指数减退率(%)、棉蕾被害率(%)和棉蕾被害减退率(%)。
抗性鉴定结果见表2(CK为陆地棉CCRI24)。结果表明,与陆地棉CCRI24相比,C006-10-13的盲蝽象抗性显著提高。
表2.C006-10-13和陆地棉CCRI24的盲蝽象抗性
待测棉花 幼虫死亡率(%) 校正死亡率(%) 发育至成虫数(头) 发育至成虫比例(%)
C006-10-13 61.90±15.31 54.28±18.37 0.4±0.3 14.29±9.91
CK 16.67±7.45 - 0.8±0.4 27.78±13.38
2、农艺性状
将T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13与陆地棉CCRI24进行其他农艺性状的考察与测定。在河南安阳设计小区试验,设置3个小区,3个小区设置完全相同,小区行长8m,每行种植30株,行间距80cm,每个材料种植3行,小区共6行。采用Students’test对T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13与陆地棉CCRI24的株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数、衣分分别进行了统计分析。
田间生长情况见图3(C006-10-13为T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13,CCRI24为陆地棉CCRI24)。统计结果见表3。结果表明,与陆地棉CCRI24相比,T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13的株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数、衣分均显著提高,单铃重显著降低。
表3.转基因棉花C006-10-13和陆地棉CCRI24的农艺性状比较
Figure GDA0002117061390000071
3、其他方面的影响
由于启动子是组成型启动子,因此不仅在绿色组织(包括茎、叶、蕾、生长点)中表达,其他组织也会受到一定影响。为了研究除了改良盲蝽象抗性外,Cry51Aa1.C006-1基因对其他组织是否产生影响,对T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13与陆地棉CCRI24的纤维长度、比强度、马克隆值、整齐度指数和伸长率进行了检测。
统计结果见表4。结果表明,与陆地棉CCRI24相比,T5代转Cry51Aa1.C006-1棉花纯合株系C006-10-13的马克隆值与伸长率均有所提高但无显著差异,纤维长度、断裂比强度、整齐度指数均有降低但无显著差异。
表4.转基因棉花C006-10-13和陆地棉CCRI24的纤维品质数据比较
Figure GDA0002117061390000072
三、C006-10-13的DNA序列的表征分析
采用分子生物学的方法分析C006-10-13基因组的插入物和与插入物相连接侧翼连接的基因组序列。具体步骤如下:
1、提取棉花的基因组。温室或大田条件下,取C006-10-13的棉花的幼嫩叶片约100mg置于2.0ml的EP管中,采用液氮冷冻EP管,然后采用冷冻研磨仪研磨,采用Qiagen公司DNeasy Plant Mini Kit(50)(货号69104)中提供的方案提取基因组DNA。该方法可经本领域技术人员改进以从任何组织(包括但不限于种子)提取DNA。
2、根据诺唯赞公司的PCR Master MIX(P213-AA)进行融合引物和巢式相结合的FPNI-PCR(Wang et al.2011)。根据已知的转基因插入物序列,在其5’端和3’端分别设计三条巢式引物(5’端的三条巢式引物为引物8、引物9和引物5,3’端的三条巢式引物为引物10、引物11和引物7)。在棉花基因组上设计的PCR引物第一轮为融合引物,共9条(引物12-引物20),这9条引物分别与引物8和引物10进行第一轮扩增。在棉花基因组上设计第二轮PCR扩增引物(引物21),引物21分别和引物9、引物11进行第二轮扩增。在棉花基因组上设计第三轮PCR扩增引物(引物6),引物6分别和引物5、引物7进行第三轮扩增,通过3轮PCR。利用琼脂糖凝胶电泳分离从反应产生的扩增子,随后使用QIAGEN凝胶纯化试剂盒(Qiagen,Valencia,CA)进行纯化,按照大连宝生物生命科技有限公司的pMD-19T-Simple(货号:D104A)试剂盒中提供的方案将凝胶纯化的扩增子克隆入T克隆载体中,并转化大肠杆菌DH5α中,在氨苄抗性的平板上筛选转化子,并进行菌落PCR,阳性克隆进行单克隆测序。
测序结果表明:转基因棉花C006-10-13为将序列表中序列1所示的外源DNA分子插入陆地棉CCRI24基因组第D12号染色体的第63328845-63329028位间(序列表中序列1所示的外源DNA分子的5’末端紧邻第D12号染色体的第63329028位,序列表中序列1所示的外源DNA分子的3’末端紧邻第D12号染色体的第63328845位),替换掉第D12号染色体的第63328845-63329028位间182bp的碱基序列,得到的转基因棉花,且自第63329028位上游且紧邻第63329028位核苷酸的上游侧翼片段的核苷酸序列为序列2,自第63328845位下游且紧邻第63328845位核苷酸的下游侧翼片段的核苷酸序列为序列3(图1)。
实施例2、C006-10-13繁育后代性状的获得和鉴定及其农艺性状分析
一、C006-10-13繁育后代性状的获得
1、杂交
在开花前1天下午通过人手工或者人为行动除去第一棉花的花粉,并且采用蜡管套住花的柱头,防止外来花粉与柱头接触,第二天上午待第二棉花的花粉散粉时,通过人手工收集第二种棉花的花粉,并将该花粉与第一种植物的花柱或柱头接触,即完成杂交过程。其中,第一棉花为实施例中的C006-10-13时,第二棉花为其他棉花,或者第二棉花为C006-10-13,第一棉花为其他棉花。
吐絮期收获杂交铃,并将棉花自然晒干,轧花,并采用浓硫酸拖绒,即获得杂交种子。种植,获得杂种后代,即为C006-10-13繁育后代。
2、自交
在开花前1天,采用嫁接夹直接夹住C006-10-13的花蕾或者采用细线捆绑花蕾,防止开花时外来花粉与C006-10-13的柱头接触;或者通过网袋将整个棉花植株套住,可以有效的防止通过昆虫等传粉,能够实现棉花的自花授粉。通过上述步骤可以完成自交。
吐絮期收获杂交铃,并将棉花自然晒干,轧花,并采用浓硫酸拖绒,即获得自交种子,种植,得到自交后代,即为C006-10-13繁育后代。
二、C006-10-13繁育后代性状的鉴定及其农艺性状分析
(一)C006-10-13繁育后代性状的鉴定方法
以C006-10-13繁育后代的基因组DNA为模板,采用特异性引物进行PCR扩增,若PCR扩增产物含有C006-10-13的扩增子(扩增子是指一条或者一段采用PCR扩增技术合成的DNA分子),说明C006-10-13繁育后代具有和C006-10-13相同的性状,若PCR扩增产物不含C006-10-13的扩增子,说明C006-10-13繁育后代不具有和C006-10-13相同的性状。具体鉴定方法如下:
1、鉴定方法1
(1)以C006-10-13繁育后代的基因组DNA为模板,采用引物5和引物22组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
PCR扩增体系如下:2×MASTRE PCR MIX 10μl、引物5(10μM)0.5μl、引物22(10μM)0.5μl、模板DNA(50ng/μl)1μl、超纯水8μl,总体积20μl。
PCR反应条件如下:94℃5min;94℃30s,55℃30s,72℃45s,32个循环;72℃5min。
(2)将步骤(1)获得的PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,然后进行如下判断:若PCR扩增产物含有约500bp的DNA片段,则说明C006-10-13繁育后代含有C006-10-13的扩增子,C006-10-13繁育后代具有C006-10-13性状;否则不具有C006-10-13性状。
2、鉴定方法2
(1)以C006-10-13繁育后代的基因组DNA为模板,采用引物7和引物23组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
PCR扩增体系如下:2×MASTRE PCR MIX 10μl、引物7(10μM)0.5μl、引物23(10μM)0.5μl、模板DNA(50ng/μl)1μl、超纯水8μl,总体积20μl。
PCR反应条件如下:94℃5min;94℃30s,55℃30s,72℃1min,32个循环;72℃5min。
(2)将步骤(1)获得的PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,然后进行如下判断:若PCR扩增产物含有约900bp的DNA片段,则说明C006-10-13繁育后代含有C006-10-13的扩增子,C006-10-13繁育后代具有C006-10-13性状;否则不具有C006-10-13性状。
(二)C006-10-13繁育后代性状的抗盲蝽象与农艺性状分析
按照实施例1中的步骤二中1的方法检测上述步骤(一)中获得的具有C006-10-13扩增子的C006-10-13繁育后代和陆地棉CCRI24的抗盲蝽象与农艺性状分析。
农艺性状分析结果见表5。结果表明,与陆地棉CCRI24相比,C006-10-13繁育后代的株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数和衣分均显著提高。
表5.转基因棉花C006-10-13和陆地棉CCRI24的农艺性状比较
Figure GDA0002117061390000091
盲蝽象抗性鉴定结果见表6。结果表明,与陆地棉CCRI24相比,C006-10-13繁育后代的抗盲蝽象显著提高,叶片受害程度也显著降低。
表6.转基因棉花C006-10-13和受体材料CCR124的盲蝽象抗性
株系编号 死亡率(%) 叶片受害级别
C006-10-13 100.00 0.00
CK 37.50 0.50
<110> 中国农业科学院棉花研究所
<120> 陆地棉转化事件18C006-10-13及其特异性鉴定方法
<160> 8
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 5965
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 1
tggcaggata tattgtggtg taaacaaatt gacgcttaga caacttaata acacattgcg 60
gacgttttta atgtactgaa ttaacgccga attaattcgg gggatctgga ttttagtact 120
ggattttggt tttaggaatt agaaatttta ttgatagaag tattttacaa atacaaatac 180
atactaaggg tttcttatat gctcaacaca tgagcgaaac cctataggaa ccctaattcc 240
cttatctggg aactactcac acattattat ggagaaactc gagcttgtcg atcgactcta 300
gctagaggat cgatccgaac cccagagtcc cgctcagaag aactcgtcaa gaaggcgata 360
gaaggcgatg cgctgcgaat cgggagcggc gataccgtaa agcacgagga agcggtcagc 420
ccattcgccg ccaagctctt cagcaatatc acgggtagcc aacgctatgt cctgatagcg 480
gtccgccaca cccagccggc cacagtcgat gaatccagaa aagcggccat tttccaccat 540
gatattcggc aagcaggcat cgccatgtgt cacgacgaga tcctcgccgt cgggcatgcg 600
cgccttgagc ctggcgaaca gttcggctgg cgcgagcccc tgatgctctt cgtccagatc 660
atcctgatcg acaagaccgg cttccatccg agtacgtgct cgctcgatgc gatgtttcgc 720
ttggtggtcg aatgggcagg tagccggatc aagcgtatgc agccgccgca ttgcatcagc 780
catgatggat actttctcgg caggagcaag gtgagatgac aggagatcct gccccggcac 840
ttcgcccaat agcagccagt cccttcccgc ttcagtgaca acgtcgagca cagctgcgca 900
aggaacgccc gtcgtggcca gccacgatag ccgcgctgcc tcgtcctgga gttcattcag 960
ggcaccggac aggtcggtct tgacaaaaag aaccgggcgc ccctgcgctg acagccggaa 1020
cacggcggca tcagagcagc cgattgtctg ttgtgcccag tcatagccga atagcctctc 1080
cacccaagcg gccggagaac ctgcgtgcaa tccatcttgt tcaatcccca tggtcgatcg 1140
acagatctgc gaaagctcga gagagataga tttgtagaga gagactggtg atttcagcgt 1200
gtcctctcca aatgaaatga acttccttat atagaggaag gtcttgcgaa ggatagtggg 1260
attgtgcgtc atcccttacg tcagtggaga tatcacatca atccacttgc tttgaagacg 1320
tggttggaac gtcttctttt tccacgatgc tcctcgtggg tgggggtcca tctttgggac 1380
cactgtcggc agaggcatct tgaacgatag cctttccttt atcgcaatga tggcatttgt 1440
aggtgccacc ttccttttct actgtccttt tgatgaagtg acagatagct gggcaatgga 1500
atccgaggag gtttcccgat attacccttt gttgaaaagt ctcaatagcc ctttggtctt 1560
ctgagactgt atctttgata ttcttggagt agacgagagt gtcgtgctcc accatgttat 1620
cacatcaatc cacttgcttt gaagacgtgg ttggaacgtc ttctttttcc acgatgctcc 1680
tcgtgggtgg gggtccatct ttgggaccac tgtcggcaga ggcatcttga acgatagcct 1740
ttcctttatc gcaatgatgg catttgtagg tgccaccttc cttttctact gtccttttga 1800
tgaagtgaca gatagctggg caatggaatc cgaggaggtt tcccgatatt accctttgtt 1860
gaaaagtctc aatagccctt tggtcttctg agactgtatc tttgatattc ttggagtaga 1920
cgagagtgtc gtgctccacc atgttggcaa gctgctctag ccaatacgca aaccgcctct 1980
ccccgcgcgt tggccgattc attaatgcag ctggcacgac aggtttcccg actggaaagc 2040
gggcagtgag cgcaacgcaa ttaatgtgag ttagctcact cattaggcac cccaggcttt 2100
acactttatg cttccggctc gtatgttgtg tggaattgtg agcggataac aatttcacac 2160
aggaaacagc tatgaccatg attacgaatt ctgagacttt tcaacaaagg gtaatatccg 2220
gaaacctcct cggattccat tgcccagcta tctgtcactt tattgtgaag atagtggaaa 2280
aggaaggtgg ctcctacaaa tgccatcatt gcgataaagg aaaggccatc gttgaagatg 2340
cctctgccga cagtggtccc aaagatggac ccccacccac gaggagcatc gtggaaaaag 2400
aagacgttcc aaccacgtct tcaaagcaag tggattgatg tgatatctcc actgacgtaa 2460
gggatgacgc acaatcccac tatccttcgc aagacccttc ctctatataa ggaagttcat 2520
ttcatttgga gagaacagcc ccctgagaac tggtaccatc tagacgaaaa acaaccaagg 2580
aatttgttcg ttcggtgact tttgctccaa ctcatggcca ttcttgattt aaaatctctt 2640
gtgctcaatg caattaatta ctggggtcca aagaacaata atggtatcca gggtggtgat 2700
tttggttatc ctattagcga aaaacaaatt gatacaagta ttattacgtc aacccatcca 2760
aggttgatac cccatgatct gaccattcca caaaacttgg agacaatttt cacaaccact 2820
caggtattaa ctaataacac tgatttgcag caatcccaaa cagtgtcctt cgctaagaag 2880
actactacca ccactgctac ctccacaacg aacggctgga cagaaggcgg aaaaatttca 2940
gatacgttgg aggaaaaggt ttcagtttca attcccttta tcggggaagg tggagggaag 3000
aatagcacca ccattgaggc taacttcgct cataatagtt ccaccaccac agcccaacag 3060
gccagcactg acatcgaatg gaacattagc caaccagtgc tcgtgcctcc cagaaagcag 3120
gtagttgcaa cactcgttat aatgggcggt aatttcacta tccctatgga cctgatgaca 3180
actatagatt caacagagca ctattctggc tatcctatac ttacttggat aagtagccca 3240
gataactctt ataacgggcc gtttatgtcc tggtacttcg ctaattggcc taacttacca 3300
agtggatttg ggcctttgaa ctccgacaat acggttactt atactggatc tgtggtttct 3360
caagtctctg ctggagttta cgcaaccgtc agatttgacc aatacgatat ccacaatctt 3420
cgaactatcg agaaaacatg gtacgcacgt cacgccacac tccataacgg aaagaaaatc 3480
tccattaaca atgtcactga aatggctccg acttcaccta tcaaaaccaa ttaagtgtga 3540
attacaggtg accagctcga atttccccga tcgttcaaac atttggcaat aaagtttctt 3600
aagattgaat cctgttgccg gtcttgcgat gattatcata taatttctgt tgaattacgt 3660
taagcatgta ataattaaca tgtaatgcat gacgttattt atgagatggg tttttatgat 3720
tagagtcccg caattataca tttaatacgc gatagaaaac aaaatatagc gcgcaaacta 3780
ggataaatta tcgcgcgcgg tgtcatctat gttactagat caagcttggc actggccgtc 3840
gttttacaac gtcgtgactg ggaaaaccct ggcgttaccc aacttaatcg ccttgcagca 3900
catccccctt tcgccagctg gcgtaatagc gaagaggccc gcaccgatcg cccttcccaa 3960
cagttgcgca gcctgaatgg cgaatgctag agcagcttga gcttggatca gattgtcgtt 4020
tcccgccttc agtttagctt catggagtca aagattcaaa tagaggacct aacagaactc 4080
gccgtaaaga ctggcgaaca gttcatacag agtctcttac gactcaatga caagaagaaa 4140
atcttcgtca acatggtgga gcacgacaca cttgtctact ccaaaaatat caaagataca 4200
gtctcagaag accaaagggc aattgagact tttcaacaaa gggtaatatc cggaaacctc 4260
ctcggattcc attgcccagc tatctgtcac tttattgtga agatagtgga aaaggaaggt 4320
ggctcctaca aatgccatca ttgcgataaa ggaaaggcca tcgttgaaga tgcctctgcc 4380
gacagtggtc ccaaagatgg acccccaccc acgaggagca tcgtggaaaa agaagacgtt 4440
ccaaccacgt cttcaaagca agtggattga tgtgatatct ccactgacgt aagggatgac 4500
gcacaatccc actatccttc gcaagaccct tcctctatat aaggaagttc atttcatttg 4560
gagagaacac gggggactct tgaccatggt agatctgagg gtaaatttct agtttttctc 4620
cttcattttc ttggttagga cccttttctc tttttatttt tttgagcttt gatctttctt 4680
taaactgatc tattttttaa ttgattggtt atggtgtaaa tattacatag ctttaactga 4740
taatctgatt actttatttc gtgtgtctat gatgatgatg atagttacag aaccgacgac 4800
tcgtccgtcc tgtagaaacc ccaacccgtg aaatcaaaaa actcgacggc ctgtgggcat 4860
tcagtctgga tcgcgaaaac tgtggaattg atcagcgttg gtgggaaagc gcgttacaag 4920
aaagccgggc aattgctgtg ccaggcagtt ttaacgatca gttcgccgat gcagatattc 4980
gtaattatgc gggcaacgtc tggtatcagc gcgaagtctt tataccgaaa ggttgggcag 5040
gccagcgtat cgtgctgcgt ttcgatgcgg tcactcatta cggcaaagtg tgggtcaata 5100
atcaggaagt gatggagcat cagggcggct atacgccatt tgaagccgat gtcacgccgt 5160
atgttattgc cgggaaaagt gtacgtatca ccgtttgtgt gaacaacgaa ctgaactggc 5220
agactatccc gccgggaatg gtgattaccg acgaaaacgg caagaaaaag cagtcttact 5280
tccatgattt ctttaactat gccggaatcc atcgcagcgt aatgctctac accacgccga 5340
acacctgggt ggacgatatc accgtggtga cgcatgtcgc gcaagactgt aaccacgcgt 5400
ctgttgactg gcaggtggtg gccaatggtg atgtcagcgt tgaactgcgt gatgcggatc 5460
aacaggtggt tgcaactgga caaggcacta gcgggacttt gcaagtggtg aatccgcacc 5520
tctggcaacc gggtgaaggt tatctctatg aactcgaagt cacagccaaa agccagacag 5580
agtctgatat ctacccgctt cgcgtcggca tccggtcagt ggcagtgaag ggccaacagt 5640
tcctgattaa ccacaaaccg ttctacttta ctggctttgg tcgtcatgaa gatgcggact 5700
tacgtggcaa aggattcgat aacgtgctga tggtgcacga ccacgcatta atggactgga 5760
ttggggccaa ctcctaccgt acctcgcatt acccttacgc tgaagagatg ctcgactggg 5820
cagatgaaca tggcatcgtg gtgattgatg aaactgctgc tgtcggcttt cagctgtctt 5880
taggcattgg tttcgaagcg ggcaacaagc cgaaagaact gtacagcgaa gaggcagtca 5940
acggggaaac tcagcaagcg cacttacagg cgattaaaga gctgatagcg cgtgacaaaa 6000
accacccaag cgtggtgatg tggagtattg ccaacgaacc ggatacccgt ccgcaaggtg 6060
cacgggaata tttcgcgcca ctggcggaag caacgcgtaa actcgacccg acgcgtccga 6120
tcacctgcgt caatgtaatg ttctgcgacg ctcacaccga taccatcagc gatctctttg 6180
atgtgctgtg cctgaaccgt tattacggat ggtatgtcca aagcggcgat ttggaaacgg 6240
cagagaaggt actggaaaaa gaacttctgg cctggcagga gaaactgcat cagccgatta 6300
tcatcaccga atacggcgtg gatacgttag ccgggctgca ctcaatgtac accgacatgt 6360
ggagtgaaga gtatcagtgt gcatggctgg atatgtatca ccgcgtcttt gatcgcgtca 6420
gcgccgtcgt cggtgaacag gtatggaatt tcgccgattt tgcgacctcg caaggcatat 6480
tgcgcgttgg cggtaacaag aaagggatct tcactcgcga ccgcaaaccg aagtcggcgg 6540
cttttctgct gcaaaaacgc tggactggca tgaacttcgg tgaaaaaccg cagcagggag 6600
gcaaacaagc tagccaccac caccaccacc acgtgtgaat tacaggtgac cagctcgaat 6660
ttccccgatc gttcaaacat ttggcaataa agtttcttaa gattgaatcc tgttgccggt 6720
cttgcgatga ttatcatata atttctgttg aattacgtta agcatgtaat aattaacatg 6780
taatgcatga cgttatttat gagatgggtt tttatgatta gagtcccgca attatacatt 6840
taatacgcga tagaaaacaa aatatagcgc gcaaactagg ataaattatc gcgcgcggtg 6900
tcatctatgt tactagatcg ggaattaaac tatcagtgtt tgacaggata tattggcggg 6960
taaac 6965
<210> 2
<211> 2000
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 2
tcaaaattaa ctatagtgcc gttacctccg tcagttcaaa agaattttag tccaaccaga 60
agctgtcatg tcaccagcca cctctatctt ttagaaaatt acataaaatt ttaaaaaaac 120
tgggaaaaaa gaaaaaaata tatttttaat taaatttatt atagtaatta aatttccaat 180
ctgtttccat ctactcaatt ggggtttaat tgttttcaaa atggcatcat attcctttcc 240
ccttctaaac cctctaaatt attagttttt taaatttatt aaatttaatt attttttaaa 300
agaatttcat gtaaattttt taaaatgtgg atagtgacat ggcagcttct ggatggaatt 360
tttttttttg gactaacgat gttaaggttt gaaaatagtt gaggttaaat gaatagacaa 420
aaaagagttg cacatttaag aaaataggta taattaagaa gacaattttt taattaagtc 480
taaaatatat cttgtctgat cgatgtgaac aatccgattc gataataaaa aaaaatcaaa 540
gatttaaact cactttacta aattctaaat ttatgtcgac ttaaaattaa ctaaatctaa 600
aacatttaaa ctaaacctca taattctcca accgaattca aaaaatgatt gtataaaatc 660
gttaaacgat gataagatat gtgatttcca ttctcacata attgcattta tataaaaatt 720
cgatcatcct tcattgatga attgctttta tatttttata tatataattt aattattaca 780
tgtaatgcat aatcgacagt tgacttattt tataaatgtg gtacgtggcg ttaattgaat 840
ggacgtagat gtactataat tatttcctct ctctcaactc aaaaaaatag acaaattaat 900
cctcataagt tatatcaatg agaaatctga tttttttact gaaaatttca ttaaattact 960
attaaaaagt ggttcatgca tgtcagcacg aggtacatat ggcatgtcat gtgtaactgt 1020
ttgtttattc catcaactac atcagttttt aatagtaaaa atgaattaat tttttaacaa 1080
aatggataag tttgcttttt aatctaacat acaaagacta atttgtcatt ttcttgtgaa 1140
taaaatgaaa aaatacaatc taattcttaa tataaggact tctataatac atttacctaa 1200
aaagtgttca taaattgaac catcattact caattctaaa atatttttca agttggagtc 1260
aacttaattc actaaaccga tacatcttaa taaaataaat aaaatattaa aaaatataat 1320
tttatactaa tatttatata atttaaaatc tatttaattt aaactaatat tgaatttcaa 1380
ttaattcaaa attattaaag tccacccaaa accaactcaa caaccgtgga ccggtatagt 1440
cagaacccat tcgagctcaa aaaacccggc agctactata caaaacaatc ttttacgtta 1500
tccgtaacaa atttatcctt ttattgaaaa ttatatcggt attagtaccg ccgtagatgg 1560
aggccgccgc cgccgccacc gccactttgg ttggatcttc tttacattta catccaccac 1620
cttcaagctc cgttaccaga tcgactgttt acgctgccag acctcgcctc tctttcccga 1680
ttaaggtttc aatttgctta ctgttctttt catttatacc agttttgggt tttatccttt 1740
ttttttctcg ttttttaaac ttatattccg agtttagatc cttaatttca tataattatt 1800
tgaaagggaa gattttgatg catgtatttg taaacacacc aaccgaagaa cacatttctc 1860
tgctgattat gatttctttt ttttaataaa tgtagggttt atgttaatga tttatcatgt 1920
ttattgaatg gaaacttcat ttccagtttg tgtctatgga gtctattaaa cagatttttt 1980
ttttacatta aattaccaca 2000
<210> 3
<211> 2001
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 3
tacaagagaa ccttttccca tatcatgccc ttgatgttat tttgaccttc ttcctcataa 60
gatccatctt cgtataccca aaaatgagta tccctggggc attgtacctt tgccagctga 120
aataaaatta aagtacaaat cgaatcaaac cattatacaa agtagtgcgc atgctgaaaa 180
aaaagataaa aaactgttcc aaccatcaga attaggaatc atgctttaga gagtgaaaaa 240
atattaccag gatgacctta aattttggat gaaaagtatc aactatattc taatttctaa 300
gcatgactcc ataaatgaat tcttttatct tctcatacac caaaccatga caaactatca 360
ccagaagtat aatttatgta tatgtgtagc atttcaattg ttaactccaa taacttgagt 420
ttatgcattt tccaataaac atcatcaaaa gtaaaatgaa ggttttgctt aataaaaggc 480
aagcacacaa aaaaattagt ctttgatcta agaaattctt tactctcatg ttgtttagag 540
tgcagcaatg aagaaatggc atgcaataag aagaaaagaa gtaatttaag taccttcaac 600
actctaagct cagtctttgt gatttcgcgg ccattgatga aaacccttgt attcccattg 660
caagcatcct ttttcagctt accaccaata ttcaacttgg aactaattat actgtcaggc 720
ttttcccctt cctaaaattc caattcaaag gtcaaacaca tgaaactgat aataataata 780
ataataataa caagaacaat ctattttgaa tacagaaatt tacctttccc caaaatccag 840
aatccttatc ataccaatac ctgccaggct tcaacttctg aggtggtact ggacacccaa 900
aaagctcagc caattcttca tgattcaatt gtctcccatt cacaaccaac tgctcaggcc 960
tcaattgatt ggccgcgcat tccttctcag ccttcattat ttgctgaacc tctaagggac 1020
tacaaacttt cctcaatagc ctggaactct tcccaagtct agacctctta gcttcatcaa 1080
taggcttttt aatgcaactc acacacttcc ttccttcagg cattgacccc atagccttaa 1140
gcaaacagtt gttacaatac ctcgcatcac aaaccaaaca cgcctctctt tccttcaatc 1200
tactccgttt gccacacctg ctacaaatcc ctctcttctt ctgcttcact atccccctcg 1260
tttccacatt ttccaataaa acaccacgac ccgccacgct ggattgcgaa gaagtgtacc 1320
catcatcatc atcatcttct tcttcttctt cttcatcatc atcattttcc gaatctttcg 1380
gcgtattaaa cgtcacaaca acattcttct tatcagggtg ctgctgctga gactgctccg 1440
gaggcggcgg tggcggcgac ttatcaacct cgatctcaga atcataatcc ccgtttcgag 1500
aatcaatctg agatcttgaa gctgaagagg gtctctgact ttctaaagga cttccatttc 1560
taacagcata ccgattcttt ttaaaactag agaatttagg tttactaggg attgaagcag 1620
cgacaggaat agaagatata tcagaagcag aaagggaatc gagatctagt ggatcaacac 1680
gaggaacatc ataaggaata ggaggacctt catattcaat agcgatcgag taatcgagat 1740
gatcctcgtc cggtaacgga gctccgaccg gtaacattct tctaattaca tcttcccatg 1800
ctctgttctc ttcttcagct tctttagctg ccatggtgag tcagattccg agtttctgaa 1860
tctctgagtt cgagtccgag cttccacctc aggtggcagc tacggcagcc gttagggagt 1920
tggcagaaag taaacggagg aaaaattaac gctgaagaat cagtccgtta tatttgacgc 1980
tttcagagta tatgactcag g 2001
<210> 4
<211> 13218
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 4
tggcaggata tattgtggtg taaacaaatt gacgcttaga caacttaata acacattgcg 60
gacgttttta atgtactgaa ttaacgccga attaattcgg gggatctgga ttttagtact 120
ggattttggt tttaggaatt agaaatttta ttgatagaag tattttacaa atacaaatac 180
atactaaggg tttcttatat gctcaacaca tgagcgaaac cctataggaa ccctaattcc 240
cttatctggg aactactcac acattattat ggagaaactc gagcttgtcg atcgactcta 300
gctagaggat cgatccgaac cccagagtcc cgctcagaag aactcgtcaa gaaggcgata 360
gaaggcgatg cgctgcgaat cgggagcggc gataccgtaa agcacgagga agcggtcagc 420
ccattcgccg ccaagctctt cagcaatatc acgggtagcc aacgctatgt cctgatagcg 480
gtccgccaca cccagccggc cacagtcgat gaatccagaa aagcggccat tttccaccat 540
gatattcggc aagcaggcat cgccatgtgt cacgacgaga tcctcgccgt cgggcatgcg 600
cgccttgagc ctggcgaaca gttcggctgg cgcgagcccc tgatgctctt cgtccagatc 660
atcctgatcg acaagaccgg cttccatccg agtacgtgct cgctcgatgc gatgtttcgc 720
ttggtggtcg aatgggcagg tagccggatc aagcgtatgc agccgccgca ttgcatcagc 780
catgatggat actttctcgg caggagcaag gtgagatgac aggagatcct gccccggcac 840
ttcgcccaat agcagccagt cccttcccgc ttcagtgaca acgtcgagca cagctgcgca 900
aggaacgccc gtcgtggcca gccacgatag ccgcgctgcc tcgtcctgga gttcattcag 960
ggcaccggac aggtcggtct tgacaaaaag aaccgggcgc ccctgcgctg acagccggaa 1020
cacggcggca tcagagcagc cgattgtctg ttgtgcccag tcatagccga atagcctctc 1080
cacccaagcg gccggagaac ctgcgtgcaa tccatcttgt tcaatcccca tggtcgatcg 1140
acagatctgc gaaagctcga gagagataga tttgtagaga gagactggtg atttcagcgt 1200
gtcctctcca aatgaaatga acttccttat atagaggaag gtcttgcgaa ggatagtggg 1260
attgtgcgtc atcccttacg tcagtggaga tatcacatca atccacttgc tttgaagacg 1320
tggttggaac gtcttctttt tccacgatgc tcctcgtggg tgggggtcca tctttgggac 1380
cactgtcggc agaggcatct tgaacgatag cctttccttt atcgcaatga tggcatttgt 1440
aggtgccacc ttccttttct actgtccttt tgatgaagtg acagatagct gggcaatgga 1500
atccgaggag gtttcccgat attacccttt gttgaaaagt ctcaatagcc ctttggtctt 1560
ctgagactgt atctttgata ttcttggagt agacgagagt gtcgtgctcc accatgttat 1620
cacatcaatc cacttgcttt gaagacgtgg ttggaacgtc ttctttttcc acgatgctcc 1680
tcgtgggtgg gggtccatct ttgggaccac tgtcggcaga ggcatcttga acgatagcct 1740
ttcctttatc gcaatgatgg catttgtagg tgccaccttc cttttctact gtccttttga 1800
tgaagtgaca gatagctggg caatggaatc cgaggaggtt tcccgatatt accctttgtt 1860
gaaaagtctc aatagccctt tggtcttctg agactgtatc tttgatattc ttggagtaga 1920
cgagagtgtc gtgctccacc atgttggcaa gctgctctag ccaatacgca aaccgcctct 1980
ccccgcgcgt tggccgattc attaatgcag ctggcacgac aggtttcccg actggaaagc 2040
gggcagtgag cgcaacgcaa ttaatgtgag ttagctcact cattaggcac cccaggcttt 2100
acactttatg cttccggctc gtatgttgtg tggaattgtg agcggataac aatttcacac 2160
aggaaacagc tatgaccatg attacgaatt ctgagacttt tcaacaaagg gtaatatccg 2220
gaaacctcct cggattccat tgcccagcta tctgtcactt tattgtgaag atagtggaaa 2280
aggaaggtgg ctcctacaaa tgccatcatt gcgataaagg aaaggccatc gttgaagatg 2340
cctctgccga cagtggtccc aaagatggac ccccacccac gaggagcatc gtggaaaaag 2400
aagacgttcc aaccacgtct tcaaagcaag tggattgatg tgatatctcc actgacgtaa 2460
gggatgacgc acaatcccac tatccttcgc aagacccttc ctctatataa ggaagttcat 2520
ttcatttgga gagaacagcc ccctgagaac tggtaccatc tagacgaaaa acaaccaagg 2580
aatttgttcg ttcggtgact tttgctccaa ctcatggcca ttcttgattt aaaatctctt 2640
gtgctcaatg caattaatta ctggggtcca aagaacaata atggtatcca gggtggtgat 2700
tttggttatc ctattagcga aaaacaaatt gatacaagta ttattacgtc aacccatcca 2760
aggttgatac cccatgatct gaccattcca caaaacttgg agacaatttt cacaaccact 2820
caggtattaa ctaataacac tgatttgcag caatcccaaa cagtgtcctt cgctaagaag 2880
actactacca ccactgctac ctccacaacg aacggctgga cagaaggcgg aaaaatttca 2940
gatacgttgg aggaaaaggt ttcagtttca attcccttta tcggggaagg tggagggaag 3000
aatagcacca ccattgaggc taacttcgct cataatagtt ccaccaccac agcccaacag 3060
gccagcactg acatcgaatg gaacattagc caaccagtgc tcgtgcctcc cagaaagcag 3120
gtagttgcaa cactcgttat aatgggcggt aatttcacta tccctatgga cctgatgaca 3180
actatagatt caacagagca ctattctggc tatcctatac ttacttggat aagtagccca 3240
gataactctt ataacgggcc gtttatgtcc tggtacttcg ctaattggcc taacttacca 3300
agtggatttg ggcctttgaa ctccgacaat acggttactt atactggatc tgtggtttct 3360
caagtctctg ctggagttta cgcaaccgtc agatttgacc aatacgatat ccacaatctt 3420
cgaactatcg agaaaacatg gtacgcacgt cacgccacac tccataacgg aaagaaaatc 3480
tccattaaca atgtcactga aatggctccg acttcaccta tcaaaaccaa ttaagtgtga 3540
attacaggtg accagctcga atttccccga tcgttcaaac atttggcaat aaagtttctt 3600
aagattgaat cctgttgccg gtcttgcgat gattatcata taatttctgt tgaattacgt 3660
taagcatgta ataattaaca tgtaatgcat gacgttattt atgagatggg tttttatgat 3720
tagagtcccg caattataca tttaatacgc gatagaaaac aaaatatagc gcgcaaacta 3780
ggataaatta tcgcgcgcgg tgtcatctat gttactagat caagcttggc actggccgtc 3840
gttttacaac gtcgtgactg ggaaaaccct ggcgttaccc aacttaatcg ccttgcagca 3900
catccccctt tcgccagctg gcgtaatagc gaagaggccc gcaccgatcg cccttcccaa 3960
cagttgcgca gcctgaatgg cgaatgctag agcagcttga gcttggatca gattgtcgtt 4020
tcccgccttc agtttagctt catggagtca aagattcaaa tagaggacct aacagaactc 4080
gccgtaaaga ctggcgaaca gttcatacag agtctcttac gactcaatga caagaagaaa 4140
atcttcgtca acatggtgga gcacgacaca cttgtctact ccaaaaatat caaagataca 4200
gtctcagaag accaaagggc aattgagact tttcaacaaa gggtaatatc cggaaacctc 4260
ctcggattcc attgcccagc tatctgtcac tttattgtga agatagtgga aaaggaaggt 4320
ggctcctaca aatgccatca ttgcgataaa ggaaaggcca tcgttgaaga tgcctctgcc 4380
gacagtggtc ccaaagatgg acccccaccc acgaggagca tcgtggaaaa agaagacgtt 4440
ccaaccacgt cttcaaagca agtggattga tgtgatatct ccactgacgt aagggatgac 4500
gcacaatccc actatccttc gcaagaccct tcctctatat aaggaagttc atttcatttg 4560
gagagaacac gggggactct tgaccatggt agatctgagg gtaaatttct agtttttctc 4620
cttcattttc ttggttagga cccttttctc tttttatttt tttgagcttt gatctttctt 4680
taaactgatc tattttttaa ttgattggtt atggtgtaaa tattacatag ctttaactga 4740
taatctgatt actttatttc gtgtgtctat gatgatgatg atagttacag aaccgacgac 4800
tcgtccgtcc tgtagaaacc ccaacccgtg aaatcaaaaa actcgacggc ctgtgggcat 4860
tcagtctgga tcgcgaaaac tgtggaattg atcagcgttg gtgggaaagc gcgttacaag 4920
aaagccgggc aattgctgtg ccaggcagtt ttaacgatca gttcgccgat gcagatattc 4980
gtaattatgc gggcaacgtc tggtatcagc gcgaagtctt tataccgaaa ggttgggcag 5040
gccagcgtat cgtgctgcgt ttcgatgcgg tcactcatta cggcaaagtg tgggtcaata 5100
atcaggaagt gatggagcat cagggcggct atacgccatt tgaagccgat gtcacgccgt 5160
atgttattgc cgggaaaagt gtacgtatca ccgtttgtgt gaacaacgaa ctgaactggc 5220
agactatccc gccgggaatg gtgattaccg acgaaaacgg caagaaaaag cagtcttact 5280
tccatgattt ctttaactat gccggaatcc atcgcagcgt aatgctctac accacgccga 5340
acacctgggt ggacgatatc accgtggtga cgcatgtcgc gcaagactgt aaccacgcgt 5400
ctgttgactg gcaggtggtg gccaatggtg atgtcagcgt tgaactgcgt gatgcggatc 5460
aacaggtggt tgcaactgga caaggcacta gcgggacttt gcaagtggtg aatccgcacc 5520
tctggcaacc gggtgaaggt tatctctatg aactcgaagt cacagccaaa agccagacag 5580
agtctgatat ctacccgctt cgcgtcggca tccggtcagt ggcagtgaag ggccaacagt 5640
tcctgattaa ccacaaaccg ttctacttta ctggctttgg tcgtcatgaa gatgcggact 5700
tacgtggcaa aggattcgat aacgtgctga tggtgcacga ccacgcatta atggactgga 5760
ttggggccaa ctcctaccgt acctcgcatt acccttacgc tgaagagatg ctcgactggg 5820
cagatgaaca tggcatcgtg gtgattgatg aaactgctgc tgtcggcttt cagctgtctt 5880
taggcattgg tttcgaagcg ggcaacaagc cgaaagaact gtacagcgaa gaggcagtca 5940
acggggaaac tcagcaagcg cacttacagg cgattaaaga gctgatagcg cgtgacaaaa 6000
accacccaag cgtggtgatg tggagtattg ccaacgaacc ggatacccgt ccgcaaggtg 6060
cacgggaata tttcgcgcca ctggcggaag caacgcgtaa actcgacccg acgcgtccga 6120
tcacctgcgt caatgtaatg ttctgcgacg ctcacaccga taccatcagc gatctctttg 6180
atgtgctgtg cctgaaccgt tattacggat ggtatgtcca aagcggcgat ttggaaacgg 6240
cagagaaggt actggaaaaa gaacttctgg cctggcagga gaaactgcat cagccgatta 6300
tcatcaccga atacggcgtg gatacgttag ccgggctgca ctcaatgtac accgacatgt 6360
ggagtgaaga gtatcagtgt gcatggctgg atatgtatca ccgcgtcttt gatcgcgtca 6420
gcgccgtcgt cggtgaacag gtatggaatt tcgccgattt tgcgacctcg caaggcatat 6480
tgcgcgttgg cggtaacaag aaagggatct tcactcgcga ccgcaaaccg aagtcggcgg 6540
cttttctgct gcaaaaacgc tggactggca tgaacttcgg tgaaaaaccg cagcagggag 6600
gcaaacaagc tagccaccac caccaccacc acgtgtgaat tacaggtgac cagctcgaat 6660
ttccccgatc gttcaaacat ttggcaataa agtttcttaa gattgaatcc tgttgccggt 6720
cttgcgatga ttatcatata atttctgttg aattacgtta agcatgtaat aattaacatg 6780
taatgcatga cgttatttat gagatgggtt tttatgatta gagtcccgca attatacatt 6840
taatacgcga tagaaaacaa aatatagcgc gcaaactagg ataaattatc gcgcgcggtg 6900
tcatctatgt tactagatcg ggaattaaac tatcagtgtt tgacaggata tattggcggg 6960
taaacctaag agaaaagagc gtttattaga ataacggata tttaaaaggg cgtgaaaagg 7020
tttatccgtt cgtccatttg tatgtgcatg ccaaccacag ggttcccctc gggatcaaag 7080
tactttgatc caacccctcc gctgctatag tgcagtcggc ttctgacgtt cagtgcagcc 7140
gtcttctgaa aacgacatgt cgcacaagtc ctaagttacg cgacaggctg ccgccctgcc 7200
cttttcctgg cgttttcttg tcgcgtgttt tagtcgcata aagtagaata cttgcgacta 7260
gaaccggaga cattacgcca tgaacaagag cgccgccgct ggcctgctgg gctatgcccg 7320
cgtcagcacc gacgaccagg acttgaccaa ccaacgggcc gaactgcacg cggccggctg 7380
caccaagctg ttttccgaga agatcaccgg caccaggcgc gaccgcccgg agctggccag 7440
gatgcttgac cacctacgcc ctggcgacgt tgtgacagtg accaggctag accgcctggc 7500
ccgcagcacc cgcgacctac tggacattgc cgagcgcatc caggaggccg gcgcgggcct 7560
gcgtagcctg gcagagccgt gggccgacac caccacgccg gccggccgca tggtgttgac 7620
cgtgttcgcc ggcattgccg agttcgagcg ttccctaatc atcgaccgca cccggagcgg 7680
gcgcgaggcc gccaaggccc gaggcgtgaa gtttggcccc cgccctaccc tcaccccggc 7740
acagatcgcg cacgcccgcg agctgatcga ccaggaaggc cgcaccgtga aagaggcggc 7800
tgcactgctt ggcgtgcatc gctcgaccct gtaccgcgca cttgagcgca gcgaggaagt 7860
gacgcccacc gaggccaggc ggcgcggtgc cttccgtgag gacgcattga ccgaggccga 7920
cgccctggcg gccgccgaga atgaacgcca agaggaacaa gcatgaaacc gcaccaggac 7980
ggccaggacg aaccgttttt cattaccgaa gagatcgagg cggagatgat cgcggccggg 8040
tacgtgttcg agccgcccgc gcacgtctca accgtgcggc tgcatgaaat cctggccggt 8100
ttgtctgatg ccaagctggc ggcctggccg gccagcttgg ccgctgaaga aaccgagcgc 8160
cgccgtctaa aaaggtgatg tgtatttgag taaaacagct tgcgtcatgc ggtcgctgcg 8220
tatatgatgc gatgagtaaa taaacaaata cgcaagggga acgcatgaag gttatcgctg 8280
tacttaacca gaaaggcggg tcaggcaaga cgaccatcgc aacccatcta gcccgcgccc 8340
tgcaactcgc cggggccgat gttctgttag tcgattccga tccccagggc agtgcccgcg 8400
attgggcggc cgtgcgggaa gatcaaccgc taaccgttgt cggcatcgac cgcccgacga 8460
ttgaccgcga cgtgaaggcc atcggccggc gcgacttcgt agtgatcgac ggagcgcccc 8520
aggcggcgga cttggctgtg tccgcgatca aggcagccga cttcgtgctg attccggtgc 8580
agccaagccc ttacgacata tgggccaccg ccgacctggt ggagctggtt aagcagcgca 8640
ttgaggtcac ggatggaagg ctacaagcgg cctttgtcgt gtcgcgggcg atcaaaggca 8700
cgcgcatcgg cggtgaggtt gccgaggcgc tggccgggta cgagctgccc attcttgagt 8760
cccgtatcac gcagcgcgtg agctacccag gcactgccgc cgccggcaca accgttcttg 8820
aatcagaacc cgagggcgac gctgcccgcg aggtccaggc gctggccgct gaaattaaat 8880
caaaactcat ttgagttaat gaggtaaaga gaaaatgagc aaaagcacaa acacgctaag 8940
tgccggccgt ccgagcgcac gcagcagcaa ggctgcaacg ttggccagcc tggcagacac 9000
gccagccatg aagcgggtca actttcagtt gccggcggag gatcacacca agctgaagat 9060
gtacgcggta cgccaaggca agaccattac cgagctgcta tctgaataca tcgcgcagct 9120
accagagtaa atgagcaaat gaataaatga gtagatgaat tttagcggct aaaggaggcg 9180
gcatggaaaa tcaagaacaa ccaggcaccg acgccgtgga atgccccatg tgtggaggaa 9240
cgggcggttg gccaggcgta agcggctggg ttgtctgccg gccctgcaat ggcactggaa 9300
cccccaagcc cgaggaatcg gcgtgacggt cgcaaaccat ccggcccggt acaaatcggc 9360
gcggcgctgg gtgatgacct ggtggagaag ttgaaggccg cgcaggccgc ccagcggcaa 9420
cgcatcgagg cagaagcacg ccccggtgaa tcgtggcaag cggccgctga tcgaatccgc 9480
aaagaatccc ggcaaccgcc ggcagccggt gcgccgtcga ttaggaagcc gcccaagggc 9540
gacgagcaac cagatttttt cgttccgatg ctctatgacg tgggcacccg cgatagtcgc 9600
agcatcatgg acgtggccgt tttccgtctg tcgaagcgtg accgacgagc tggcgaggtg 9660
atccgctacg agcttccaga cgggcacgta gaggtttccg cagggccggc cggcatggcc 9720
agtgtgtggg attacgacct ggtactgatg gcggtttccc atctaaccga atccatgaac 9780
cgataccggg aagggaaggg agacaagccc ggccgcgtgt tccgtccaca cgttgcggac 9840
gtactcaagt tctgccggcg agccgatggc ggaaagcaga aagacgacct ggtagaaacc 9900
tgcattcggt taaacaccac gcacgttgcc atgcagcgta cgaagaaggc caagaacggc 9960
cgcctggtga cggtatccga gggtgaagcc ttgattagcc gctacaagat cgtaaagagc 10020
gaaaccgggc ggccggagta catcgagatc gagctagctg attggatgta ccgcgagatc 10080
acagaaggca agaacccgga cgtgctgacg gttcaccccg attacttttt gatcgatccc 10140
ggcatcggcc gttttctcta ccgcctggca cgccgcgccg caggcaaggc agaagccaga 10200
tggttgttca agacgatcta cgaacgcagt ggcagcgccg gagagttcaa gaagttctgt 10260
ttcaccgtgc gcaagctgat cgggtcaaat gacctgccgg agtacgattt gaaggaggag 10320
gcggggcagg ctggcccgat cctagtcatg cgctaccgca acctgatcga gggcgaagca 10380
tccgccggtt cctaatgtac ggagcagatg ctagggcaaa ttgccctagc aggggaaaaa 10440
ggtcgaaaag gtctctttcc tgtggatagc acgtacattg ggaacccaaa gccgtacatt 10500
gggaaccgga acccgtacat tgggaaccca aagccgtaca ttgggaaccg gtcacacatg 10560
taagtgactg atataaaaga gaaaaaaggc gatttttccg cctaaaactc tttaaaactt 10620
attaaaactc ttaaaacccg cctggcctgt gcataactgt ctggccagcg cacagccgaa 10680
gagctgcaaa aagcgcctac ccttcggtcg ctgcgctccc tacgccccgc cgcttcgcgt 10740
cggcctatcg cggccgctgg ccgctcaaaa atggctggcc tacggccagg caatctacca 10800
gggcgcggac aagccgcgcc gtcgccactc gaccgccggc gcccacatca aggcaccctg 10860
cctcgcgcgt ttcggtgatg acggtgaaaa cctctgacac atgcagctcc cggagacggt 10920
cacagcttgt ctgtaagcgg atgccgggag cagacaagcc cgtcagggcg cgtcagcggg 10980
tgttggcggg tgtcggggcg cagccatgac ccagtcacgt agcgatagcg gagtgtatac 11040
tggcttaact atgcggcatc agagcagatt gtactgagag tgcaccatat gcggtgtgaa 11100
ataccgcaca gatgcgtaag gagaaaatac cgcatcaggc gctcttccgc ttcctcgctc 11160
actgactcgc tgcgctcggt cgttcggctg cggcgagcgg tatcagctca ctcaaaggcg 11220
gtaatacggt tatccacaga atcaggggat aacgcaggaa agaacatgtg agcaaaaggc 11280
cagcaaaagg ccaggaaccg taaaaaggcc gcgttgctgg cgtttttcca taggctccgc 11340
ccccctgacg agcatcacaa aaatcgacgc tcaagtcaga ggtggcgaaa cccgacagga 11400
ctataaagat accaggcgtt tccccctgga agctccctcg tgcgctctcc tgttccgacc 11460
ctgccgctta ccggatacct gtccgccttt ctcccttcgg gaagcgtggc gctttctcat 11520
agctcacgct gtaggtatct cagttcggtg taggtcgttc gctccaagct gggctgtgtg 11580
cacgaacccc ccgttcagcc cgaccgctgc gccttatccg gtaactatcg tcttgagtcc 11640
aacccggtaa gacacgactt atcgccactg gcagcagcca ctggtaacag gattagcaga 11700
gcgaggtatg taggcggtgc tacagagttc ttgaagtggt ggcctaacta cggctacact 11760
agaaggacag tatttggtat ctgcgctctg ctgaagccag ttaccttcgg aaaaagagtt 11820
ggtagctctt gatccggcaa acaaaccacc gctggtagcg gtggtttttt tgtttgcaag 11880
cagcagatta cgcgcagaaa aaaaggatct caagaagatc ctttgatctt ttctacgggg 11940
tctgacgctc agtggaacga aaactcacgt taagggattt tggtcatgca ttctaggtac 12000
taaaacaatt catccagtaa aatataatat tttattttct cccaatcagg cttgatcccc 12060
agtaagtcaa aaaatagctc gacatactgt tcttccccga tatcctccct gatcgaccgg 12120
acgcagaagg caatgtcata ccacttgtcc gccctgccgc ttctcccaag atcaataaag 12180
ccacttactt tgccatcttt cacaaagatg ttgctgtctc ccaggtcgcc gtgggaaaag 12240
acaagttcct cttcgggctt ttccgtcttt aaaaaatcat acagctcgcg cggatcttta 12300
aatggagtgt cttcttccca gttttcgcaa tccacatcgg ccagatcgtt attcagtaag 12360
taatccaatt cggctaagcg gctgtctaag ctattcgtat agggacaatc cgatatgtcg 12420
atggagtgaa agagcctgat gcactccgca tacagctcga taatcttttc agggctttgt 12480
tcatcttcat actcttccga gcaaaggacg ccatcggcct cactcatgag cagattgctc 12540
cagccatcat gccgttcaaa gtgcaggacc tttggaacag gcagctttcc ttccagccat 12600
agcatcatgt ccttttcccg ttccacatca taggtggtcc ctttataccg gctgtccgtc 12660
atttttaaat ataggttttc attttctccc accagcttat ataccttagc aggagacatt 12720
ccttccgtat cttttacgca gcggtatttt tcgatcagtt ttttcaattc cggtgatatt 12780
ctcattttag ccatttatta tttccttcct cttttctaca gtatttaaag ataccccaag 12840
aagctaatta taacaagacg aactccaatt cactgttcct tgcattctaa aaccttaaat 12900
accagaaaac agctttttca aagttgtttt caaagttggc gtataacata gtatcgacgg 12960
agccgatttt gaaaccgcgg tgatcacagg cagcaacgct ctgtcatcgt tacaatcaac 13020
atgctaccct ccgcgagatc atccgtgttt caaacccggc agcttagttg ccgttcttcc 13080
gaatagcatc ggtaacatga gcaaagtctg ccgccttaca acggctctcc cgctgacgcc 13140
gtcccggact gatgggctgc ctgtatcgag tggtgatttt gtgccgagct gccggtcggg 13200
gagctgttgg ctggctgg 13218
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 5
gagcttggat cagattgtcg 20
<210> 6
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 6
gtttcgctca tgtgttgagc 20
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 7
cttgtctgat cgatgtgaac 20
<210> 8
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 8
cacctcagaa gttgaagcct g 21

Claims (5)

1.用于鉴定植物样品是否来源于转基因棉花或其后代的方法,包括如下步骤:
检测待测植物样品的基因组DNA中是否含有DNA片段A;所述DNA片段A由外源DNA片段在所述转基因棉花的上游侧翼片段、所述外源DNA片段和所述外源DNA片段在所述转基因棉花的下游侧翼片段组成;
若所述待测植物样品的基因组DNA含有所述DNA片段A,则所述待测植物样品为或候选为所述转基因棉花或其后代;
若所述待测植物样品的基因组DNA不含有所述DNA片段A,则所述待测植物样品不为或候选不为所述转基因棉花或其后代;
所述上游侧翼序列的核苷酸序列如序列表中序列2所示;
所述下游侧翼序列的核苷酸序列如序列表中序列3所示;
所述外源DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列1所示;
所述转基因棉花为将外源DNA片段插入目的棉花基因组第D12号染色体的第63328845-63329028位间,替换掉第D12号染色体的第63328845-63329028位间182bp的碱基序列获得的;
所述转基因棉花的盲蝽象抗性、株高、第一果枝长度、果枝数、结铃数和衣分均高于所述目的棉花;所述转基因棉花的单铃重低于所述目的棉花。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:所述检测所述待测植物样品的基因组DNA中是否含有DNA片段A的方法为直接测序。
3.一种获得盲蝽象抗性提高、株高提高、第一果枝长度提高、果枝数提高、结铃数提高、衣分提高和单铃重降低的棉花的方法,包括如下步骤:
(1)获得权利要求1中所述转基因棉花;
(2)将所述转基因棉花自交或杂交,得到繁育后代,按照权利要求1或2所述的方法鉴定所述繁育后代,得到目标植株。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于:所述转基因棉花的保藏编号为CCTCC NO:P201822。
5.权利要求1所述方法在棉花育种中的应用。
CN201811416535.1A 2018-11-26 2018-11-26 陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法 Active CN110106198B (zh)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811416535.1A CN110106198B (zh) 2018-11-26 2018-11-26 陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法
PCT/CN2019/086597 WO2020107816A1 (zh) 2018-11-26 2019-05-13 陆地棉转化事件18c006-10-13及其特异性鉴定方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811416535.1A CN110106198B (zh) 2018-11-26 2018-11-26 陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN110106198A CN110106198A (zh) 2019-08-09
CN110106198B true CN110106198B (zh) 2023-03-31

Family

ID=67483251

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201811416535.1A Active CN110106198B (zh) 2018-11-26 2018-11-26 陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法

Country Status (2)

Country Link
CN (1) CN110106198B (zh)
WO (1) WO2020107816A1 (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114561401B (zh) * 2022-03-09 2023-08-04 中国农业科学院棉花研究所 陆地棉GhEXO2及其调控株型方面的应用
CN115595375A (zh) * 2022-06-24 2023-01-13 中国农业科学院棉花研究所(Cn) 与陆地棉高衣分性状紧密连锁的稳定InDels标记及其应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104427862A (zh) * 2012-01-23 2015-03-18 陶氏益农公司 除草剂耐受性棉花事件pDAB4468.18.07.1
CN106146628A (zh) * 2015-03-27 2016-11-23 中国农业科学院棉花研究所 一种人工合成的抗虫蛋白及其相关生物材料与应用
CN106191104A (zh) * 2016-07-18 2016-12-07 中国农业科学院棉花研究所 陆地棉转化事件icr24001及其特异性鉴定方法

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR122015009611B8 (pt) * 2004-03-26 2022-06-28 Dow Agrosciences Llc Moléculas de iniciador e sonda de polinucleotídeo para a detecção de eventos cry1f e cry1ac de algodão, método para detectar a presença dos referidos eventos em uma amostra, bem como kit de detecção de dna
AR097292A1 (es) * 2013-08-09 2016-03-02 Monsanto Technology Llc Toxina pesticida activa contra insectos coleópteros y/o hemípteros
WO2016154771A1 (zh) * 2015-03-27 2016-10-06 中国农业科学院棉花研究所 一种人工合成的抗虫蛋白及其相关生物材料与应用

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104427862A (zh) * 2012-01-23 2015-03-18 陶氏益农公司 除草剂耐受性棉花事件pDAB4468.18.07.1
CN106146628A (zh) * 2015-03-27 2016-11-23 中国农业科学院棉花研究所 一种人工合成的抗虫蛋白及其相关生物材料与应用
CN106191104A (zh) * 2016-07-18 2016-12-07 中国农业科学院棉花研究所 陆地棉转化事件icr24001及其特异性鉴定方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Bt毒素蛋白Cry51Aa1对绿盲蝽和中黑盲蝽的毒杀效应;朱磊诚;《中国优秀博硕士学位论文全文数据库(硕士) 农业科技辑》;20180415(第4期);第D046-132页 *
Crystal structure of Cry51Aa1: A potential novel insecticidal aerolysin-type b-pore-forming toxin from Bacillus thuringiensis;Chengchen Xu et al.;《Biochemical and Biophysical Research Communications》;20150507;第462卷;第184-189页 *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2020107816A1 (zh) 2020-06-04
CN110106198A (zh) 2019-08-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN109355306B (zh) 陆地棉转化事件icr24-397及其特异性鉴定方法
CN106939316B (zh) 利用CRISPR/Cas9系统定点敲除水稻OsPDCD5基因第二外显子的方法
CN1643147B (zh) 监测和调节基因沉默的方法和工具
US20030049835A1 (en) Methods and means for producing efficient silencing construct using recombinational cloning
CN110724685A (zh) 转基因耐盐耐除草剂玉米sr801外源插入旁侧序列及其应用
CN109722439B (zh) 烟草mlo2、mlo6和mlo12基因在制备抗白粉菌烟草品种中的应用及其方法
CN110106198B (zh) 陆地棉转化事件c006-10-13及其特异性鉴定方法
CN113234729A (zh) 可显著提高棉花黄萎病抗性的基因GauRev2及其应用
CN110229823B (zh) 陆地棉转化事件19c006-59-11及其特异性鉴定方法
CN113621641A (zh) 一种介导调控植物隐性核雄性不育系雄性育性的gat载体及其应用
CN112941098B (zh) 拟南芥花药绒毡层启动子表达载体及其构建方法与应用
CN111560373B (zh) 植物组成型启动子OsUbipro及其应用
CN109266686A (zh) 一种基因组核苷酸定点替换的方法
CN112680474A (zh) 一种荧光标记CRISPR/SpCas9系统介导的基因替换体系及其在植物中的应用
CN109722488B (zh) 与抗根结线虫基因Me3连锁的SCAR分子标记及其应用
US20110035832A1 (en) Disease Resistant Pepper Plants
CN109121420A (zh) 耐寒植物
LU502044B1 (en) Cre/lox TRANSIENT EXPRESSION VECTOR SYSTEM AND USE THEREOF
CN111393516A (zh) 一种烟草eIFiso4E-T突变体及在培育抗病毒病烟草中的应用
CN113881670B (zh) 抗大豆花叶病毒的转基因植物构建方法
CN113543631A (zh) 大豆转基因事件ind-øø41ø-5
CN109265562B (zh) 一种切刻酶及其在基因组碱基替换中的应用
WO2024239535A1 (zh) 一种植物根肿菌响应启动子及其应用
CN118186136A (zh) 一种与辣椒抗疫病性状共分离的Indel标记及其应用
Schenstnyi Analyses Of TALE-induced Resistance And Putative Susceptibility Genes In Tomato

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant