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CN109207522B - 表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白重组杆状病毒及其构建方法与引物 - Google Patents

表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白重组杆状病毒及其构建方法与引物 Download PDF

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CN109207522B
CN109207522B CN201810912585.2A CN201810912585A CN109207522B CN 109207522 B CN109207522 B CN 109207522B CN 201810912585 A CN201810912585 A CN 201810912585A CN 109207522 B CN109207522 B CN 109207522B
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Abstract

本发明属于疫苗制造技术领域。本发明公开了一种表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac‑ΔCap,保藏号为CGMCC No.15691。本发明还公开了一种用于构建表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac‑ΔCap的引物。本发明又公开了表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac‑ΔCap的构建方法,包括以下步骤:1、构建包含PCV3全基因组的pSK‑sPCV3;2、转移载体的构建;3、穿梭质粒的构建;4、重组杆状病毒的获得:将阳性穿梭质粒Bacmid‑ΔCap转染Sf9细胞,获得表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac‑ΔCap。本发明可以方便快捷的构建出表达PCV3截短Cap蛋白的重组杆状病毒,而且可以确定表达的截短Cap蛋白具有良好的生物学活性,免疫小鼠发现具有良好的免疫原性。

Description

表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白重组杆状病毒及其构建方法 与引物
技术领域
本发明涉及表达猪圆环病毒3型(PCV3)截短Cap基因的重组杆状病毒的构建方法,用于制造疫苗。
背景技术
猪圆环病毒病(PCVD)是当前危害养猪业的重要疾病之一,其中PCV2是导致该类疾病的主要致病因子。2016年,Phan等学者又报道了新型猪圆环病毒PCV3,该病毒可造成猪皮炎和肾病综合征(PDNS)、猪繁殖障碍呼吸系统疾病及消化系统炎症等疾病[Phan TG,Giannitti F,Rossow S,et al.Detection of a novel circovirus PCV3in pigs withcardiac and multi-systemic inflammation[J].Virology Journal,2016,13(1):184.]。通过PCV3全基因组遗传进化分析发现,PCV3与另外PCV1和PCV2两个基因型的病毒处于不同的进化分支,且PCV3各分离株之间也存在进化差异,是新型猪圆环病毒。自PCV3被报道以来,国内外多个地区均检测出该病毒,其危害正逐步受到重视。2017年初,何启盖等在我国首次检出PCV3。目前国内的PCV3毒株主要分为3a、3b和3c三种基因型,其中3a和美国PCV3参考毒株处于相同的进化分支[Fu X,Fang B,Ma J,et al.Insights into the epidemiccharacteristics and evolutionary history of the novel porcine circovirus type3in southern China[J].Transboundary and Emerging Diseases,2018,65(2):e296-e303.]。Stadejek等对波兰境内14个商品化猪场母猪、仔猪和育成猪的血清进行PCV3检测,首次证实PCV3感染在欧洲地区同样存在[Stadejek T,
Figure BDA0001762175940000011
niak A,
Figure BDA0001762175940000012
ek D,et al.Firstdetection of porcine circovirus type 3on commercial pig farms in Poland[J].Transboundary and Emerging Diseases,2017,64(5):1350-1353.]。为控制PCV3的进一步流行,亟需研究开发针对该病毒的商品化疫苗。
PCV3与PCV1、PCV2一样为无囊膜病毒,病毒粒子也呈二十面体结构,具有2kb的单链闭合环状负链DNA基因组,包含三个最主要的开放阅读框。ORF1编码参与病毒基因组复制的相关蛋白,而ORF2编码主导免疫原性的Cap核衣壳结构蛋白,是研制PCV3亚单位基因工程疫苗的理想靶基因[Nawagitgul P,Morozov I,Bolin S R,et al.Open reading frame 2of porcine circovirus type 2encodes a major capsid protein[J].Journal ofGeneral Virology,2000,81(Pt 9):2281-2287.]。PCV3ORF3编码由231个氨基酸组成的功能未知蛋白质。PCV3与PCV2的Cap蛋白氨基酸同源性较低,仅为30%,此外,二者Cap蛋白的抗原表位也无任何相似性,暗示PCV3和PCV2毒株间的抗原交叉保护性可能很低,现有的PCV2疫苗已无法有效预防PCV3感染[湛洋,王东亮,王乃东,等.猪圆环病毒3型检测及其Cap结构序列和抗原性预测分析[J].畜牧兽医学报,2017,48(6):1076-1084.]。研究发现,Cap蛋白N端富含精氨酸组成的核定位信号(NLS),不含主要的抗原位点,容易使得表达的蛋白向细胞核转移,难以获得大量具有活性的Cap蛋白[Lou GG,Li XR,Li ZY,etal.Expression and antigenicity characterization for truncated capsid proteinof porcine circovirus type 2[J].The Canadian Journal of Veterinary Research,2011,75(1):61-64.]。然而全部缺失NLS则可能会影响外源蛋白的免疫原性,但缺失N端的NLS并不影响Cap在体外包装成病毒样颗粒[Zhang H,Qian P,Liu L,et al.Virus-likeparticles of chimeric recombinant Porcine circovirus type 2as antigen vehiclecarrying foreign epitopes[J].Viruses,2014,6(12):4839-4855.]。考虑到以上几点,在不影响其免疫原性基础上,为提高活性蛋白表达量,本研究通过设计一对引物用来扩增缺失NLS中34个氨基酸的截短Cap(ΔCap),并引入Kozak序列,以期望进一步提高蛋白表达。
疫苗仍是目前防控PCVD的主要手段,因此,针对新型PCV3感染的疫苗自然会成为全世界研究的热点。不同于原核表达系统、酵母及哺乳动物细胞真核表达系统,杆状病毒表达系统作为真核表达系统之一拥有外源插入基因容量大、蛋白表达水平高、操作简便及翻译后加工修饰等诸多优点而广泛使用[Lin SY,Chen GY,Hu YC.Recent patents on thebaculovirus systems[J].Recent Patents on Biotechnology,2011,5(1):1-11.]。目前,关于PCV2亚单位疫苗的生产主要基于昆虫细胞/杆状病毒表达系统,如英特威公司研制的Circumvent亚单位疫苗[Baech NM,Meng XJ.Efficacy and future prospects ofcommercially available and experimental vaccines against porcine circovirustype2(PCV2).Virus Res,2012(164):33-42.]。目前关于PCV3疫苗的报道较少,通过构建重组杆状病毒进行PCV3Cap蛋白的表达,可为开发PCV3亚单位疫苗奠定基础。
发明内容
本发明的目的是提供重组杆状病毒表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白及其构建方法与引物,本研究通过筛选PCV3毒株,设计了扩增PCV3全长的引物;针对PCV3截短Cap基因设计特异引物,基于Bac-to-Bac系统,获得了表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白的重组杆状病毒。该方法可以方便快捷的构建出表达PCV3截短Cap蛋白的重组杆状病毒,而且可以确定表达的截短Cap蛋白具有良好的生物学活性,免疫小鼠发现具有良好的免疫原性。
本发明的第一个目的是提供表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap,该重组杆状病毒rBac-ΔCap于2018年5月10日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号),建议的分类命名为:表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap,保藏号为CGMCC No.15691。
本发明的第二个目的是通过以下技术方案实现的,参照GenBank上公布的PCV3序列与Cap基因全长序列独立自主设计,用于构建表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的引物,见表1;
表1引物及酶切位点
Figure BDA0001762175940000031
引物XhoI-3F的酶切位点为CTCGAG;
引物EcoR I-3R的酶切位点为GAATTC
引物ΔCap-F的酶切位点为GGATCC
引物ΔCap-R的酶切位点为AAGCTT。
本发明的第三个目的是通过以下技术方案实现的,表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,PCV3毒株的筛选;扩增PCV3全长,用以保存PCV3基因组;表达PCV3型缺失NLS的截短Cap基因引物的设计;转移载体pFastBacTMHT A-ΔCap的构建;穿梭质粒Bacmid-ΔCap的获得;重组杆状病毒rBac-ΔCap的获得;PCV3截短Cap蛋白的表达鉴定;电镜观察病毒样颗粒;小鼠免疫试验。最终得到可用于工业化生产的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap;
具体包括以下步骤:
1、构建包含PCV3全基因组的pSK-sPCV3:
以提取的PCV3DNA为模板,用权利要求1所述的引物Xho I-3F和引物EcoR I-3R扩增出PCV3全基因组,扩增参数:98℃预变性2min;98℃变性10s,59℃退火15s,72℃延伸2min30s,共30个循环;最后72℃再延伸10min。将PCV3全基因组胶回收后与pBluescriptSK+载体同时用Xho I和EcoR I双酶切,将两种酶切产物纯化回收后按3:1的摩尔比进行连接,最后获得重组质粒pSK-sPCV3;通过Xho I和EcoR I双酶切鉴定重组质粒,酶切产物用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,得到大小分别为2958bp和2000bp的条带;
2、转移载体的构建:
以pSK-sPCV3重组质粒为模板,用权利要求1所述的引物ΔCap-F和引物ΔCap-R扩增PCV3Cap缺失NLS的截短Cap(ΔCap),反应参数:98℃预变性2min;98℃变性10s,60℃退火15s,72℃延伸55s,共30个循环;最后72℃再延伸3min。将PCR产物纯化后与转移载体pFastBacTMHT A共同进行BamH I和Hind III的双酶切;再次纯化后进行常规连接反应;Axygen质粒小量DNA提取试剂盒提取重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap,分别利用限制性内切酶BamH I和HindⅢ单酶切鉴定,以及BamH I-HindⅢ的双酶切鉴定;将酶切产物用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,BamH I和HindⅢ分别单酶切pFastBacTMHT A-ΔCap质粒,得到5399bp单一条带;BamH I-HindⅢ双酶切重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap,得到4856bp和543bp两个条带;
3、穿梭质粒的构建:
将BamH I-HindⅢ双酶切得到4856bp和543bp两个条带的正确重组载体pFastBacTMHTA-ΔCap转化进入DH10αBac感受态细胞;蓝白斑筛选转座成功的白色单菌落,参考Invirtogen公司Bac-to-Bac杆状病毒表达系统说明书进行相应PCR鉴定,鉴定正确后抽提重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap;用引物pUC/M13扩增出2973bp条带;用引物pUC/M13F+ΔCapR扩增出2500bp目的条带;用引物ΔCap F+pUC/M13R扩增出1000bp目的条带;用引物ΔCap F/R扩增出543bp目的条带;
4、重组杆状病毒的获得:
将阳性穿梭质粒Bacmid-ΔCap转染Sf9细胞,获得表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
本发明通过PCR实现猪圆环病毒3型全基因组的扩增,然后进行常规的连接反应实现PCV3单拷贝的构建。同时,体用特异性引物获得PCV3去除核定位信号的截短Cap基因,使用杆状病毒表达系统成功实现并提高了表达,使得增殖后重组杆状病毒滴度可达108.3TCID50/mL以上,反转录、SDS-PAGE及以Western Blot鉴定,证实表达效果良好,免疫小鼠试验发现可以刺激小鼠产生针对PCV3的特异性抗体,最终获得了完全适用于工厂化生产的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap。可作为基因工程亚单位疫苗使用,同时为深入研究PCV3病毒相关基因的功能与免疫机理奠定了物质基础。
附图说明
图1为包含PCV3全基因组单拷贝重组质粒pSK-sPCV3双酶切的电泳图。
图2为转移载体pFastBacTMHT A-ΔCap酶切电泳图。
图3为穿梭载体Bacmid-ΔCap的PCR鉴定电泳图。
图4为提取重组杆状病毒rBac-ΔCap的PCR电泳图。
图5为提取重组杆状病毒rBac-ΔCap的总RNA电泳图。
图6为RT-PCR后PCR鉴定的电泳图。
图7-1为接种重组杆状病毒rBac-ΔCap的Sf9细胞的IFA图。
图7-2为接种野生型杆状病毒的Sf9细胞的IFA对照图。
图7-3为健康Sf9细胞的IFA对照图。
图8为表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白的SDS-PAGE鉴定图。
图9为表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白的Western Blot鉴定图(以His-tag小鼠单抗作为一抗)。
图10为表达猪圆环病毒3型截短Cap蛋白的Western Blot鉴定图(以小鼠抗PCV3阳性血清作为一抗)。
图11PCV3截短Cap VLPs观察透射电镜图。
图12试验小鼠抗体水平图。
具体实施方式
一、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建:
设计用于扩增的引物序列如下:
表2所需引物及酶切位点
Figure BDA0001762175940000051
注:下划线部分为各酶切位点
1、构建包含PCV3全基因组的pSK-sPCV3:
以提取的PCV3DNA为模板,用引物Xho I-3F和引物EcoR I-3R扩增出PCV3全基因组;将PCV3全基因组胶回收后与pBluescript SK(+)载体同时用Xho I和EcoR I双酶切,将两种酶切产物纯化回收后按3:1的摩尔比进行连接,最后获得重组质粒pSK-sPCV3。通过XhoI和EcoR I双酶切鉴定重组质粒,酶切产物用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,得到大小分别为2958bp和2000bp左右的条带,如图1所示。图1中,M:DL5000 DNA Marker;1:Xho I酶和EcoR I酶双酶切pSK-sPCV3质粒获得2958bp与2000bp左右片段。
2、转移载体的构建:
以pSK-sPCV3重组质粒为模板,用引物ΔCap-F和引物ΔCap-R扩增PCV3Cap缺失NLS的截短Cap(ΔCap),将PCR产物纯化后与转移载体pFastBacTMHT A共同进行BamH I和HindIII的双酶切;再次纯化后进行常规连接反应。小量提取重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap,分别利用限制性内切酶BamH I和HindⅢ单酶切鉴定,以及BamH I-HindⅢ的双酶切鉴定。将酶切产物用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,BamH I和HindⅢ分别单酶切pFastBacTMHTA-ΔCap质粒,可得到约5399bp单一条带。BamH I-HindⅢ双酶切重组质粒pFastBacTMHTA-ΔCap,可得到4856bp和543bp两个条带,如图2所示。图2中,M:DL5000DNAMarker;1:BamH I酶酶切pFastBacTMHT A-ΔCap质粒获得5399bp左右片段;2:HindⅢ酶酶切pFastBacTM HT A-ΔCap质粒获得5399bp左右片段;3:BamH I酶与HindⅢ酶双酶切pFastBacTMHT A-ΔCap质粒获得4856bp与543bp左右片段;
4、穿梭质粒的构建:
将BamH I-HindⅢ双酶切得到4856bp和543bp两个条带的正确重组载体pFastBacTMHTA-ΔCap转化进入DH10αBac感受态细胞;蓝白斑筛选转座成功的白色单菌落,PCR鉴定正确后抽提重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap。用引物pUC/M13可以扩增出3000bp左右条带;用引物pUC/M13F+ΔCapR可以扩增出2500bp左右目的条带;用引物ΔCap F+pUC/M13R可以扩增出1000bp左右目的条带;用引物ΔCap F/R可以扩增出543bp左右目的条带。如图3所示。图3中,M:1kb DNA Marker;1:pUC/M13扩增野生型穿梭质粒Bacmid约300bp的产物;2:pUC/M13扩增重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap约2973bp的产物;3:M13F+ΔCapR扩增重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap约2500bp的产物;4:ΔCapF+M13R扩增重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap约1000bp的产物;5:ΔCapF+ΔCapR扩增重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap约543bp的产物;6:Negative control。
4、重组杆状病毒的获得:
将阳性穿梭质粒Bacmid-ΔCap转染Sf9细胞,获得表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap。
鉴定:提取重组杆状病毒rBac-ΔCap的DNA,利用引物ΔCap F/R进行PCR鉴定,用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,如图4所示:M:DL5000DNA Marker;1:ΔCap F/R扩增rBac-ΔCap约543bp左右目的片段。
从图4可见:以DNA作为模板进行电泳鉴定PCR产物中有543bp左右大小的截短Cap目的条带,说明获得了重组杆状病毒rBac-ΔCap。
该重组杆状病毒rBac-ΔCap于2018年5月10日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号),建议的分类命名为:表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap,保藏号为CGMCC No.15691。
二、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的生物学特性鉴定:
材料:重组杆状病毒rBac-ΔCap、健康Sf9细胞。
猪源抗PCV3阳性血清(自制血清)、鼠源抗PCV3阳性血清(自制血清)、商品化His-tag单克隆抗体。
1、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的cDNA检测
将F2代的重组杆状病毒rBac-ΔCap分别接种健康Sf9细胞,72h后TRIzol裂解提取总RNA,如图5所示。去除基因组DNA后进行RT-PCR,再通过PCR检测目的基因转录情况,PCR方法检测到PCV3截短Cap基因特异性条带,如图6所示。
图5中,M:200bp DNA Marker;1:rBac-ΔCap总RNA。
图6中,M:200bp DNA Marker;1:rBac-ΔCap总RNA反转录后鉴定543bp条带。
2、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的间接免疫荧光(IFA)检测
以猪源抗PCV3阳性血清作为一抗,FITC荧光标记的羊抗猪IgG为二抗,在荧光显微镜下观察到,经接种表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的Sf9细胞中出现了明显的特异荧光(如图7-1所示);而接种野生型杆状病毒(如图7-2所示)与正常对照细胞(如图7-3所示)中则未出现荧光,可见感染表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的细胞能够高效表达PCV3截短Cap蛋白。
2、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的SDS-PAGE检测:
待F2代重组杆状病毒rBac-ΔCap接种Sf9细胞96h后,收集蛋白样品煮沸后用于SDS-PAGE电泳分析,考马斯亮蓝染色后进行观察。可见在预期大小位置出现目的条带(图8),可见大小约为25kD的目的蛋白条带。
3、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的Western Blot鉴定
分别用His-tag小鼠单抗(图9)和抗PCV3小鼠阳性血清(图10)进行Western Blot鉴定,去除核定位信号的截短ΔCap蛋白同PCV3全长Cap一样,与SDS-PAGE中的目的条带位置相符,说明目的蛋白得到成功表达。
4、表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的TCID50测定
将长势良好的Sf9细胞,分装96孔板,用Grace培养基将表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒液进行10倍倍比稀释(10-1~10-10稀释)。接种96孔板后于37℃、5%CO2培养箱中吸附1.5小时后继续培养96h。弃去培养液,PBS清洗,拍干后冷甲醇-20固定20min,弃去固定液,PBS洗3遍,每次5min,吸水纸上拍干。加入用PBS稀释的猪源PCV3阳性血清(1:500)50μL/孔,37℃孵育1h,PBS同上洗涤,拍干。避光加入30μL的1:200稀释的FITC标记的羊抗猪荧光二抗(IgG),避光孵育45min,PBS同上洗涤,拍干。进行间接免疫荧光(IFA)观察,病毒TCID50按Reed-Muench二氏法计算。
经检测,表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒的TCID50为108.3/mL以上,满足制备疫苗的要求。
5、透射电镜观察
将接种重组杆状病毒的Sf9细胞及培养物反复冻融3次,于4℃,4000rpm离心20min去除细胞碎片。将病毒液加于蔗糖垫上,4℃,超高速离心后,适量PBS悬浮沉淀。滴加一滴重悬液于铜网上,2%磷钨酸进行负染。吸取多余染液并烘干,透射电镜观察病毒样颗粒形成情况,如图11所示:磷钨酸负染后于透射电镜下观察到形态均一的病毒样颗粒,呈圆形,直径约20nm。
6、动物免疫试验
6周龄BALB/c小鼠20只随机分为4组,其中,组1注射灭活的rBac-ΔCap(106.5TCID50/只)、组2注射灭活的rBac-ΔCap(107.5TCID50/只),组3和组4分别注射灭活的野生型杆状病毒感染的Sf9细胞培养上清和PBS,各组均与等量的弗氏完全佐剂完全乳化后进行首次免疫,两周后与不完全弗氏佐剂乳化后进行二次加强免疫。免疫前和首次免疫后每周眶下窦采血,分离并保存血清。
将原核表达的PCV3去除核定位信号的Cap蛋白包被酶标板,100μL/孔,4℃过夜包被,PBST洗3次,6min/次,吸水纸上拍干;每孔加入200μL封闭液,37℃封闭3h;再次洗板3次后,加入经PBS适当倍比稀释的小鼠血清,100μL/孔,37℃,孵育1h,同时用小鼠PCV3阳性血清作阳性对照;用含4%FBS的PBS按1:8000稀释HRP标记的羊抗鼠IgG二抗,100μL/孔,37℃,孵育1h;每孔加入200μL TMB显色液,37℃显色15min;于各个孔中加入50μL终止液终止反应,随后用酶标仪在450nm处测定吸光度。
间接ELISA检测PCV3特异性抗体水平结果如图12所示:首免后第二周即可检测到PCV3特异性抗体产生,第三周抗体水平迅速上升,第四周抗体继续上升,高剂量免疫组效价均可达到1:4500左右。
<110>扬州大学
<120>表达猪圆环病毒3 型截短Cap 蛋白重组杆状病毒及其构建方法与引物
<160>6
SEQ ID NO.1
<210>1
<211>34
<212>DNA
<213>人工序列
<400>1
TTTCTCGAGA TTGGCGAAGA TTCCTCTTCG GGTA 34
SEQ ID NO.2
<210>2
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<400>2
CCGGAATTCG TAATCCCCCT CTTTCTTGCA ATA 33
SEQ ID NO.3
<210>3
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>3
TTTGGATCCC GCCACCATGG CTGGCACATA 30
SEQ ID NO.4
<210>4
<211>35
<212>DNA
<213>人工序列
<400>4
CCCAAGCTTT TAGAGAACGG ACTTGTAACG AATCC 35
SEQ ID NO.5
<210>5
<211>17
<212>DNA
<213>人工序列
<400>5
GTTTTCCCAG TCACGAC 17
SEQ ID NO.6
<210>6
<211>17
<212>DNA
<213>人工序列
<400>6
CAGGAAACAG CTATGAC 17

Claims (8)

1.表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap,保藏号为CGMCCNo.15691。
2.权利要求1所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,所述构建方法包括以下步骤:
(1)构建包含PCV3全基因组的pSK-sPCV3:
以提取的PCV3 DNA为模板,用引物XhoI-3F和引物EcoR I-3R扩增出PCV3全基因组;将PCV3全基因组胶回收后与pBluescript SK+载体同时用XhoI和EcoR I双酶切,将两种酶切产物纯化回收后进行连接,最后获得重组质粒pSK-sPCV3;
(2)转移载体的构建:
以pSK-sPCV3重组质粒为模板,用引物ΔCap-F和引物ΔCap-R扩增PCV3Cap缺失NLS的截短Cap,即ΔCap,将PCR产物纯化后与转移载体pFastBacTMHT A共同进行BamH I和HindIII的双酶切;再次纯化后进行常规连接反应,获得重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap;提取重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap,分别利用限制性内切酶BamH I 和HindⅢ单酶切鉴定,以及BamH I-HindⅢ的双酶切鉴定;将酶切产物用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,BamH I和HindⅢ分别单酶切pFastBacTMHT A-ΔCap质粒,得到5399 bp单一条带;BamH I-HindⅢ双酶切重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap,得到4856 bp和543 bp两个条带;
(3)穿梭质粒的构建:
BamH I-HindⅢ双酶切得到4856 bp和543 bp两个条带的正确重组载体pFastBacTMHTA-ΔCap转化进入DH10αBac感受态细胞;蓝白斑筛选转座成功的白色单菌落,PCR鉴定正确后抽提重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap;用引物pUC/M13扩增出2430 bp加上插入目的片段大小的条带,即2973 bp条带;根据PCR鉴定重组Bacmid DNA模式图,推测计算pUC/M13上下游引物与目的片段上下游引物组合使用所扩增条带大小可知,用引物pUC/M13 F+ΔCapR扩增出2500 bp目的条带;同理,用引物ΔCap F+pUC/M13 R扩增出1000 bp目的条带;用引物ΔCapF/R扩增出543 bp目的条带;
(4)重组杆状病毒的获得:
将鉴定正确的重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap转染Sf9细胞,获得表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap;
用于构建表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的引物如下:
引物XhoI-3F,引物序列为5’-TTTCTCGAGATTGGCGAAGATTCCTCTTCGGGTA-3’;
引物EcoR I-3R,引物序列为5’-CCGGAATTCGTAATCCCCCTCTTTCTTGCAATA-3’;
引物ΔCap-F,引物序列为5’-TTTGGATCCCGCCACCATGGCTGGCACATA-3’;
引物ΔCap-R,引物序列为5’-CCCAAGCTTTTAGAGAACGGACTTGTAACGAATCC-3’
引物pUC/ M13F,引物序列为5’-GTTTTCCCAGTCACGAC-3’;
引物pUC/ M13R引物序列为5’-GTTTTCCCAGTCACGAC-3’;
引物XhoI-3F的酶切位点为CTCGAG;
引物EcoR I-3R的酶切位点为GAATTC;
引物ΔCap-F的酶切位点为GGATCC;
引物ΔCap-R的酶切位点为AAGCTT
3.根据权利要求2所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,所述PCV3全基因组扩增参数:98℃预变性2 min;98℃变性10 s,59℃退火15 s,72℃延伸2 min 30 s,共30个循环;最后72℃再延伸10 min。
4.根据权利要求2所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,所述PCV3全基因组胶回收后与pBluescript SK+载体同时用XhoI和EcoR I双酶切,将两种酶切产物纯化回收后按3:1的摩尔比进行连接。
5.根据权利要求2所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,通过XhoI和EcoR I双酶切鉴定重组质粒pSK-sPCV3,酶切产物用0.7%的琼脂糖凝胶进行电泳,得到大小分别为2958 bp和2000 bp的条带。
6.根据权利要求2所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,扩增PCV3Cap缺失NLS的截短Cap的反应参数:98℃预变性2 min;98℃变性10 s,60℃退火15 s,72℃延伸55 s,共30个循环;最后72℃再延伸3 min。
7.根据权利要求2所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,提取重组质粒pFastBacTMHT A-ΔCap通过Axygen质粒小量DNA提取试剂盒进行。
8.根据权利要求2所述的表达猪圆环病毒3型截短Cap基因的重组杆状病毒rBac-ΔCap的构建方法,其特征是,所述PCR鉴定正确后抽提重组穿梭质粒Bacmid-ΔCap中的PCR鉴定程序参考Invirtogen公司Bac-to-Bac杆状病毒表达系统说明书进行。
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