CN107563123A - 用于标注医学图像的方法和装置 - Google Patents
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Abstract
本申请实施例公开了用于标注医学图像的方法和装置。该方法的一具体实施方式包括:获取至少一个待标注医学图像;为待标注医学图像标注分类信息,其中,分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,以使待标注医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型;从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像,以使待标注医学图像标注出分割图像。该实施方式实现了降低了标注医学图像的人力和时间成本。
Description
技术领域
本申请涉及计算机技术领域,具体涉及互联网技术领域,尤其涉及用于标注医学图像的方法和装置。
背景技术
现有技术中,由于医学图像的特殊性,通常只有经过专业培养的医生才能够精确且可靠的对医学图像进行标注。在医学图像的标注的过程中,通常需要医生手动确定疾病类型、筛查病变区域、勾画病灶区域等,这一标注过程需要投入医生的大量的时间和精力。
进一步地,为了实现医学在深度学习、计算机辅助诊断等领域的发展,收集大规模的带标注医学图像成为人们的迫切需求。但是,获取大规模带标注的医学图像通常需要花费大量的人力和时间成本。
发明内容
本申请实施例的目的在于提出一种改进的用于标注医学图像的方法和装置,来解决以上背景技术部分提到的技术问题。
第一方面,本申请实施例提供了一种用于标注医学图像的方法,该方法包括:获取至少一个待标注医学图像;为待标注医学图像标注分类信息,其中,分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,以使待标注医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型,其中,病灶区域检测模型用于根据在医学图像中识别出的病灶区域的位置和大小框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型;从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像,以使待标注医学图像标注出分割图像。
在一些实施例中,为待标注医学图像标注分类信息,包括:利用预先训练的图像分类模型对待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像的分类信息,其中,图像分类模型用于对医学图像标注分类信息。
在一些实施例中,从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像,包括:利用预先训练的病灶区域分割模型对已框选出病灶区域的待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像中被框选出的病灶区域的分割图像,其中,病灶区域分割模型用于从已框选出病区域的医学图像中分割出病灶区域的分割图像。
在一些实施例中,方法还包括训练图像分类模型的步骤;训练图像分类模型的步骤包括:获取第一医学图像训练集,其中,第一医学图像训练集包括多个医学图像和每个医学图像标注的分类信息;利用卷积神经网络,根据第一医学图像训练集,训练得到图像分类模型。
在一些实施例中,方法还包括训练病灶区域检测模型的步骤;训练病灶区域检测模型的步骤包括:获取第二医学图像训练集,其中,第二医学图像训练集包括多个医学图像和每个医学图像标注出的病灶区域和病灶区域的病灶类型;利用卷积神经网络,根据第二医学图像训练集,训练得到病灶区域检测模型。
在一些实施例中,方法还包括训练病灶区域分割模型的步骤;训练病灶区域分割模型的步骤包括:获取第三医学图像训练集,其中,第三医学图像训练集包括多个已框选出病灶区域的医学图像和各被框选出病灶区域的医学图像的病灶区域的分割图像;利用卷积神经网络,根据第三医学图像训练集,训练得到病灶区域分割模型。
在一些实施例中,在利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型之后,还包括:将待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型输出到客户端,以使用户判断待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型是否正确;若是,则保存待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型;若否,则接收并保存经用户重新标注的待标注医学图像的病灶区域和病灶区域的病灶类型。
在一些实施例中,在输出待标注医学图像中被框选出的病灶区域的分割图像之前,还包括:利用病灶区域分割模型在待标注医学图像的病灶区域形成预分割区域,并输出到客户端,以使用户对预分割区域进行微调;接收并保存经用户微调后的预分割区域。
在一些实施例中,上述方法还包括:将待标注医学图片和待标注医学图片的分类信息添加到第一医学图像训练集,重新训练图像分类模型。
在一些实施例中,上述方法还包括:将待标注医学图片和待标注医学图片标注出的病灶区域、病灶区域的病灶类型添加到第二医学图像训练集,重新训练病灶区域检测模型。
在一些实施例中,上述方法还包括:将已框选出病灶区域的待标注医学图片和待标注医学图片的分割图像添加到第三医学图像训练集,重新训练病灶区域分割模型。
第二方面,本申请提供了一种用于标注医学图像的装置,该装置包括:获取单元,配置用于获取至少一个待标注医学图像;第一标注单元,配置用于为待标注医学图像标注分类信息,其中,分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;第二标注单元,配置用于利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,以使待标注医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型,其中,病灶区域检测模型用于根据在医学图像中识别出的病灶区域的位置和大小框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型;第三标注单元,配置用于从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像,以使待标注医学图像标注出分割图像。
在一些实施例中,第一标注单元进一步配置用于:利用预先训练的图像分类模型对待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像的分类信息,其中,图像分类模型用于对医学图像标注诊断结果的类别和诊断结果的等级。
在一些实施例中,第三标注单元进一步配置用于:利用预先训练的病灶区域分割模型对已框选出病灶区域的待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像中被框选出的病灶区域的分割图像,其中,病灶区域分割模型用于从已框选出病区域的医学图像中分割出病灶区域的分割图像。
在一些实施例中,装置还包括:图像分类模型训练单元;图像分类模型训练单元包括:第一获取模块,配置用于获取第一医学图像训练集,其中,第一医学图像训练集包括多个医学图像和每个医学图像标注的分类信息;第一训练模块,配置用于利用卷积神经网络,根据第一医学图像训练集,训练得到图像分类模型。
在一些实施例中,装置还包括:病灶区域检测模型训练单元;
病灶区域检测模型训练单元包括:第二获取模块,配置用于获取第二医学图像训练集,其中,第二医学图像训练集包括多个医学图像和每个医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型;第二训练单元,配置用于利用卷积神经网络,根据第二医学图像训练集,训练得到病灶区域检测模型。
在一些实施例中,装置还包括:病灶区域分割模型训练单元;病灶区域分割模型训练单元包括:第三获取模块,配置用于获取第三医学图像训练集,其中,第三医学图像训练集包括多个已框选出病灶区域的医学图像和各被框选出病灶区域的医学图像中的病灶区域的分割图像;第三训练模块,配置用于利用卷积神经网络,根据第三医学图像训练集,训练得到病灶区域分割模型。
在一些实施例中,第二标注单元进一步配置用于:将待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型输出到客户端,以使用户判断待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型是否正确;若是,则保存待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型;若否,则接收并保存经用户重新标注的待标注医学图像的病灶区域和病灶区域的病灶类型。
在一些实施例中,第三标注单元进一步配置用于:利用病灶区域分割模型在待标注医学图像的病灶区域形成预分割区域,并输出到客户端,以使用户对预分割区域进行微调;接收并保存经用户微调后的预分割区域。
在一些实施例中,装置还包括:图像分类模型重训单元,配置用于将待标注医学图片和待标注医学图片的分类信息添加到第一医学图像训练集,重新训练图像分类模型。
在一些实施例中,装置还包括:病灶区域检测模型重训单元,配置用于将待标注医学图片和待标注医学图片标注出的病灶区域、病灶区域的病灶类型添加到第二医学图像训练集,重新训练病灶区域检测模型。
在一些实施例中,装置还包括:病灶区域分割模型重训单元,配置用于将已框选出病灶区域的待标注医学图片和待标注医学图片的分割图像添加到第三医学图像训练集,重新训练病灶区域分割模型。
本申请实施例提供的用于标注医学图像的方法和装置,可以为获取的至少一个待标注医学图像标注分类信息,之后可以利用预先训练的病灶区域检测模型在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,而后在已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选的病灶区域的分割图像,从而实现了利用预先训练的模型自动为待标注医学图像标注,降低了人力和时间成本。
附图说明
通过阅读参照以下附图所作的对非限制性实施例所作的详细描述,本申请的其它特征、目的和优点将会变得更明显:
图1是本申请可以应用于其中的示例性系统架构图;
图2是根据本申请的用于标注医学图像的方法的一个实施例的流程图;
图3是根据本申请的用于标注医学图像的方法的又一个实施例的流程图;
图4是根据本申请的用于标注医学图像的装置的一个实施例的结构示意图;
图5是适于用来实现本申请实施例的终端设备或服务器的计算机系统的结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本申请作进一步的详细说明。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅仅用于解释相关发明,而非对该发明的限定。另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与有关发明相关的部分。
需要说明的是,在不冲突的情况下,本申请中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将参考附图并结合实施例来详细说明本申请。
图1示出了可以应用本申请的用于标注医学图像的方法或用于标注医学图像的装置的实施例的示例性系统架构100。
如图1所示,系统架构100可以包括终端设备101、102、103,网络104和服务器105。网络104用以在终端设备101、102、103和服务器105之间提供通信链路的介质。网络104可以包括各种连接类型,例如有线、无线通信链路或者光纤电缆等等。
用户可以使用终端设备101、102、103通过网络104与服务器105交互,以接收或发送医学图像等。终端设备101、102、103上可以安装有各种通讯客户端应用,例如网页浏览器应用、图片查看软件、图片处理软件、搜索类应用、即时通信工具、邮箱客户端、社交平台软件等。
终端设备101、102、103可以是具有显示屏并且支持图片查看的各种电子设备,包括但不限于智能手机、平板电脑、电子书阅读器、MP3播放器(Moving Picture ExpertsGroup Audio Layer III,动态影像专家压缩标准音频层面3)、MP4(Moving PictureExperts Group Audio Layer IV,动态影像专家压缩标准音频层面4)播放器、膝上型便携计算机和台式计算机等等。
服务器105可以是提供各种服务的服务器,例如对终端设备101、102、103上显示的医学图像提供支持的后台图像服务器。后台图像服务器可以对接收到的医学图像进行分割、分类等标注处理,并将处理结果(例如图像分割的结果)反馈给终端设备。
需要说明的是,本申请实施例所提供的用于标注医学图像的方法一般由服务器105执行,相应地,用于标注医学图像的装置一般设置于服务器105中。
应该理解,图1中的终端设备、网络和服务器的数目仅仅是示意性的。根据实现需要,可以具有任意数目的终端设备、网络和服务器。
继续参考图2,示出了根据本申请的用于标注医学图像的方法的一个实施例的流程200。该用于标注医学图像的方法,包括以下步骤:
步骤201,获取至少一个待标注医学图像。
在本实施例中,用于标注医学图像的方法运行于其上的电子设备(例如图1所示的服务器)可以通过有线连接方式或者无线连接方式从用户利用其进行医学图像查看、保存的终端接收一个或多个待标注医学图像。这里,待标注医学图像可以为由摄影、CT(Computed Tomography,电子计算机断层扫描)、MRI(Magnetic Resonance Imaging,磁共振成像)等各类方法获取的医学图片,如眼底图片,肺部CT图片等。需要指出的是,上述无线连接方式可以包括但不限于3G/4G连接、WiFi连接、蓝牙连接、WiMAX连接、Zigbee连接、UWB(ultra wideband)连接、以及其他现在已知或将来开发的无线连接方式。
步骤202,为待标注医学图像标注分类信息。
在本实施例中,基于步骤201获取的一个或多个待标注医学图像,上述电子设备可以为各待标注医学图像标注分类信息。具体地,上述电子设备可以根据接收到的用户在终端设备上发送的操作指令,对各待标注医学图像标注分类信息,或者上述电子设备可以利用预先训练的模型等自动地为各待标注医学图像标注分类信息。需要说明的是,各医学图像通常可以具有不同的诊断结果的类别,并且对于某些类别的诊断结果其还可以对应不同的等级,因此,上述分类信息可以包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级。例如,若医学图像为一张肺部CT,该医学图像对应的诊断结果的类别可以为良性肿瘤、恶性肿瘤、肺结节、无病变等,其中恶性肿瘤还可以包括早期、中期和晚期三个等级;若医学图片为一眼底图片,该医学图像的诊断结果的类别可以为糖尿病视网膜病变、无病变等,其中,糖尿病视网膜病变可以包括1-4四个等级。
步骤203,利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型。
在本实施例中,上述电子设备可以预先训练病灶区域检测模型。该预先训练的病灶区域检测模型首先可以用于检测输入的医学图像的每块区域,从而可以从该医学图像中检测出可能存在的病灶区域,并根据检测出的病灶区域的位置和病灶区域的大小在医学图像上框选出该病灶区域,而后可以标注出被框选出的病灶区域的病灶类型。因此,上述电子设备可以将待标注的医学图像输入上述病灶区域检测模型,该病灶区域检测模型可以输出已框选出病灶区域的待标注医学图像,且可以为框选出的病灶区域标注对应的病灶类型。从而实现为待标注医学图像自动标注病灶区域的位置、大小和病灶类型,避免了医生需要对每张医学图片进行查看、分析后进行标注,有效地减少医学图像的标注时间。
通常,在一张待标注医学图像中可以仅存在一个病灶区域,该病灶区域也可以仅为一种病灶类型,此时上述病灶区域检测模型可以在该待标注医学图像中框选出该病灶区域、且为该该病灶区域标注对应的病灶类型。或者,在一张待标注医学图像中还可以存在多个病灶区域,每个病灶区域可以包括一种或多种病灶类型,此时上述病灶区域检测模型可以在该待标注医学图像中框选出每个病灶区域、且为每个病灶区域标注出其所对应的病灶类型。
步骤204,从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像。
在本实施例中,基于步骤203获取的已框选出病灶区域的待标注医学图像,上述电子设备可以利用各种手段从该已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选的病灶区域,形成待标注医学图像的分割图像,从而使得该待标注医学图像可以标注出分割图像。作为示例,用户可以通过手动操作的方式分割上述待标注医学图像,生成病灶区域的分割图像,此时上述电子设备可以接收用户在终端设备上发送的操作指令,将待标注医学图像中框选出的病灶区域与非病灶区域分割开,获取该待标注医学图像的病灶区域的分割图像。或者,上述电子设备还可以利用图像分割算法对该框选出病灶区域的待标注医学图像进行自动地分割,获取其中框选出的病灶区域的分割图像。
通常,对待标注的医学图像标注完成后,还需要通过众测平台等对已经标注的医学图像进行检验。本实施例提供的用于标注医学图像的方法可以将待标注的医学图像中的病灶区域和非病灶区域分割开,从而使得众测平台等的工作人员在对待标注医学图像的标注信息检验时,可以仅关注被分割出的病灶区域,可以有效地减少众测平台等的工作人员由于缺乏医学背景知识所造成的标注误差,同时还可以提供工作人员的工作效率。
本申请的上述实施例提供的用于标注医学图像的方法200,可以为获取的至少一个待标注医学图像标注分类信息,之后可以利用预先训练的病灶区域检测模型在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,而后在已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选的病灶区域的分割图像,从而实现了利用预先训练的模型自动为待标注医学图像标注,降低了人力和时间成本。
请继续参考图3,其实示出了根据本申请的用于标注医学图像的方法的另一实施例的流程300。如图3所示,本实施例的用于标注医学图像的方法可以包括如下步骤:
步骤301,获取至少一个待标注医学图像。
在本实施例中,用于标注医学图像的方法运行于其上的电子设备(例如图1所示的服务器)可以通过有线连接方式或者无线连接方式从用户利用其进行医学图像查看、保存的终端接收一个或多个待标注医学图像。这里,待标注医学图像可以为由摄影、CT(Computed Tomography,电子计算机断层扫描)、MRI(Magnetic Resonance Imaging,磁共振成像)等各类方法获取的医学图片,如眼底图片,肺部CT图片等。
步骤302,利用预先训练的图像分类模型对待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像的分类信息。
在本实施例中,上述电子设备可以预先训练用于对医学图像标注分类信息的图像分类模型,该图像分类模型可以响应于输入的待标注医学图像输出该待标注医学图像的分类信息。因此,基于步骤301获取的待标注医学图像,上述电子设备可以将其输入到上述预先训练出的图像分类模型,该图像分类模型可以输出该待标注医学图像的分类信息。其中,分类信息可以包括医学图像诊断结果的类别和诊断结果的等级。可见,上述图像分类模型可以对输入其中的医学图像进行分类和分级。
在本实施例的一些可选的实现方式中,可以利用大量已标注的医学图像作为训练样本训练上述图像分类模型。具体地,首先可以获取第一医学图像训练集作为训练样本,该第一医学图像训练集可以包括大量的医学图像,且第一医学图像训练集中的各医学图像都标注有分类信息,而后可以利用适用于分类的卷积神经网络(如VGGNet、ResNet等),将该第一医学图像训练集中的医学图像作为图像分类模型的输入训练样本,将每个医学图像标注的分类信息作为输出训练样本,从而可以训练出上述图像分类模型。
在本实施例的一些可选的实现方式中,当上述待标注医学图像标注完分类信息后,可以将该待标注医学图像和其所标注的分类信息作为训练样本添加到上述第一医学图像训练集,以使上述电子设备可以利用包含待标注医学图像和待标注医学图像的分类信息的第一医学图像训练集重新训练上述图像分类模型。该方法可以提高图像分类模型对医学图像标注分类信息的精确度。
步骤303,利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型。
在本实施例中,上述电子设备可以预先训练病灶区域检测模型。该预先训练的病灶区域检测模型首先可以用于检测输入的医学图像的每块区域,从而可以从该医学图像中检测出可能存在的病灶区域,并根据检测出的病灶区域的位置和病灶区域的大小在医学图像上框选出该病灶区域,而后可以标注出被框选出的病灶区域的病灶类型。因此,上述电子设备可以将待标注的医学图像输入上述病灶区域检测模型,该病灶区域检测模型可以输出已框选出病灶区域的待标注医学图像,且可以为框选出的病灶区域标注对应的病灶类型。从而实现为待标注医学图像自动标注病灶区域的位置、大小和病灶类型,避免了医生需要对每张医学图片进行查看、分析后进行标注,有效地减少医学图像的标注时间。
在本实施例的一些可选的实现方式中,可以利用大量已标注的医学图像作为训练样本训练上述病灶区域检测模型。具体地,首先可以获取第二医学图像训练集作为训练样本,该第二医学训练集可以包括大量的医学图像,且第二医学图像训练集中的各医学图像标注有病灶区域和病灶区域的病灶类型,而后可以利用适用于病灶区域检测的卷积神经网络(如Faster RCNN、Mask R-CNN等),将该第二医学图像训练集中的医学图像作为病灶区域检测模型的输入训练样本,将每个医学图像对应标注出的病灶区域和病灶区域的病灶类型作为输出训练样本,从而可以训练出上述病灶区域检测模型。
步骤304,将待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型输出到客户端,以使用户判断待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型是否正确。
在本实施例中,基于步骤303标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型,上述电子设备可以将待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型输出到客户端,从而使得用户可以通过客户端所在的终端设备上查看待标注医学图像中框选出的病灶区域和标注出的病灶区域的病灶类型是否正确。可选地,上述电子设备在将待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型输出到客户端的同时,还可以将该待标注医学图像的分类信息输出到客户端,此时用户可以辅以该待标注医学图像的分类信息,对其上框选出的病灶区域和病灶区域的病灶类型进行判断,以确定待标注医学图像中框选出的病灶区域和标注出的病灶区域的病灶类型是否正确,此种方法可以进一步地提高用户判断的效率和准确率。当用户确定上述待标注医学图像框选出的病灶区域和标注出的病灶区域的病灶类型正确时,可以转到步骤305。否则,可以转到步骤306。
步骤305,保存待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型。
在本实施例中,基于步骤304确定的上述待标注医学图像框选出的病灶区域和标注出的病灶区域的病灶类型正确,上述电子设备可以保存该待标注医学图像中的框选出的病灶区域和标注出的病灶区域的病灶类型,即上述电子设备可以保存待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型。
步骤306,接收并保存经用户重新标注的待标注医学图像的病灶区域和病灶区域的病灶类型。
在本实施例中,基于步骤304确定的上述待标注医学图像框选出的病灶区域和标注出的病灶区域的病灶类型有误,例如,待标注医学图像中框选出的病灶类型并非病灶区域,或者标注的病灶区域的病灶类型有误,则用户可以对存在错误的地方进行重新标注,上述电子设备可以接收并保存经用户重新标注后的待标注的医学图像的病灶区域和病灶区域的病灶类型。该方法在提高医学图像标注的效率的同时,还可以提高医学图像标注的准确率。
通常,客户端在接收到上述电子设备输出的待标注医学图像的标注信息时,可以将该待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型通过终端设备呈现给用户,这里,待标注医学图像的标注信息可以为该待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域对应的病灶类型。进一步地,上述客户端还可以为用户提供显示有“是”和“否”的对话框,用户在判断出该待标注医学图像的标注信息无误时,可以点击“是”,在判断出该待标注医学图像的标注信息有误时,可以点击“否”。用户在点击“否”之后,可以对待标注医学图像中标注有误的信息进行手动更正,并将更正后的标注信息发送到上述电子设备,以使电子设备可以接收并保存更正后的标注信息。
在本实施例的一些可选的实现方式中,当上述待标注医学图像标注完病灶区域和病灶区域的病灶类型后,可以将该待标注医学图像和其所标注的病灶区域与该病灶区域的病灶类型作为训练样本添加到上述第二医学图像训练集,以使上述电子设备可以利用包含待标注医学图像和待标注医学图像的病灶区域、该病灶区域的病灶类型的第二医学图像训练集重新训练上述病灶区域检测模型。该方法可以提高病灶区域检测模型对医学图像标注病灶区域和病灶类型的精确度。
步骤307,利用预先训练的病灶区域分割模型对已框选出病灶区域的待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像中被框选出的病灶区域的分割图像。
在本实施例中,上述电子设备可以预先训练用于从已框选病灶区域的医学图像中分割出被框选出的病灶区域的分割图像的病灶区域分割模型,该病灶区域分割模型响应于输入的已框选出病灶区域的医学图像,可以对该医学图像中框选出的病灶区域进行分割,并输出分割后的分割图像。因此,当上述电子设备获取已框选出病灶区域的待标注医学图像时,可以将其输入到病灶区域分割模型中,该病灶区域分割模型可以输出该待标注医学图像中被框选出的病灶区域的分割图像。可见,上述病灶区域分割模型可以将待标注医学图像的病灶区域和非病灶区域分割开来,为待标注医学图像标注出分割图像。
在本实施例的一些可选的实现方式中,可以利用大量已标注的医学图像作为训练样本训练上述病灶区域分割模型。具体地,首先可以获取第三医学图像训练集作为训练样本,该第三医学训练集可以包括大量被框选出病灶区域的医学图像,且第三医学训练集中的各被框选出病灶区域的医学图像标注有被框选出的病灶区域的分割图像,而后可以利用适用于图像分割的卷积神经网络(如FCN、U-Net等),将该第三医学图像训练集中的被框选出病灶区域的医学图像作为病灶区域分割模型的输入训练样本,将从每个被框选出病灶区域的医学图像分割出的病灶类型的分割图像作为输出训练样本,从而可以训练出上述病灶区域分割模型。
在本实施例的一些可选的实现方式中,为了提高待标注医学图像的分割出的病灶区域的分割图像的精度,在对该待标注图像分割之前还可以对其进行人工微调。因此,上述病灶区域分割模型在对输入的已框选出病灶区域的待标注医学图像进行图像分割之前,该病灶区域分割模型可以预先在待标注医学图像上形成预分割区域,并输出到客户端,客户端所在的终端设备可以将待标注医学图像中的预分割区域显示给用户。用户可以通过观察终端设备上显示的医学图像的图像灰度、颜色变化等像素信息,对预分割区域进行微调,从而精确地在待标注医学图像的病灶区域形成预分割区域。上述电子设备可以从客户端获取并保存经用户微调的预分割区域,从而使得病灶区域分割模型可以根据微调后的预分割区域精确地将待标注医学图像中的病灶区域和非病灶区域分割开,提高待标注医学图像标注的分割图像的精度。
在本实施例的一些可选的实现方式中,当上述待标注医学图像标注出病灶区域的分割图像后,可以将该待标注医学图像和标注的分割图像作为训练样本添加到上述第三医学图像训练集,以使上述电子设备可以利用包含待标注医学图像和待标注医学图像的分割图像的第三医学图像训练集重新训练上述病灶区域分割模型。该方法可以提高病灶区域分割模型分割图像的精确度。
在本实施例的一些可选的实现方式中,上述第一医学图像训练集、第二医学图像训练集和第三医学图像训练集可以为同一医学图像训练集,且该医学图像训练集中的多个医学图像均可以标注有分类信息、病灶区域、病灶区域的病灶类型和分割图像。此时,利用该医学图像训练集可以训练出上述图像分类模型、病灶区域检测模型和病灶区域分割模型。
从图3可以看出,与图2对应的实施例相比,本实施例中的用于标注医学图像的方法的流程300突出了利用图像分类模型和病灶区域分割模型分别为待标注医学图像标注分类信息和分割图像的步骤。由此,本实施例描述的方案可以自动的为医学图像标注分类信息和分割图像,从而进一步地提高医学图像标注的效率。
进一步参考图4,作为对上述各图所示方法的实现,本申请提供了一种用于标注医学图像的装置的一个实施例,该装置实施例与图2所示的方法实施例相对应,该装置具体可以应用于各种电子设备中。
如图4所示,本实施例的用于标注医学图像的装置400包括:获取单元401、第一标注单元402、第二标注单元403和第三标注单元404。其中,获取单元401配置用于获取至少一个待标注医学图像;第一标注单元402配置用于为待标注医学图像标注分类信息,其中,分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;第二标注单元403配置用于利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,以使待标注医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型,其中,病灶区域检测模型用于根据在医学图像中识别出的病灶区域的位置和大小框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型;第三标注单元404配置用于从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像,以使待标注医学图像标注出分割图像。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,第一标注单元402进一步配置用于:利用预先训练的图像分类模型对待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像的分类信息,其中,图像分类模型用于对医学图像标注诊断结果的类别和诊断结果的等级。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,第三标注单元404进一步配置用于:利用预先训练的病灶区域分割模型对已框选出病灶区域的待标注医学图像进行处理,以输出待标注医学图像中被框选出的病灶区域的分割图像,其中,病灶区域分割模型用于从已框选出病区域的医学图像中分割出病灶区域的分割图像。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,装置400还包括图像分类模型训练单元;图像分类模型训练单元包括:第一获取模块,配置用于获取第一医学图像训练集,其中,第一医学图像训练集包括多个医学图像和每个医学图像标注的分类信息;第一训练模块,配置用于利用卷积神经网络,根据第一医学图像训练集,训练得到图像分类模型。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,装置400还包括病灶区域检测模型训练单元;病灶区域检测模型训练单元包括:第二获取模块,配置用于获取第二医学图像训练集,其中,第二医学图像训练集包括多个医学图像和每个医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型;第二训练单元,配置用于利用卷积神经网络,根据第二医学图像训练集,训练得到病灶区域检测模型。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,装置400还包括病灶区域分割模型训练单元;病灶区域分割模型训练单元包括:第三获取模块,配置用于获取第三医学图像训练集,其中,第三医学图像训练集包括多个已框选出病灶区域的医学图像和各被框选出病灶区域的医学图像中的病灶区域的分割图像;第三训练模块,配置用于利用卷积神经网络,根据第三医学图像训练集,训练得到病灶区域分割模型。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,第二标注单元403进一步配置用于:将待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型输出到客户端,以使用户判断待标注医学图像标注的病灶区域、病灶区域的病灶类型是否正确;若是,则保存待标注医学图像标注的病灶区域和病灶区域的病灶类型;若否,则接收并保存经用户重新标注的待标注医学图像的病灶区域和病灶区域的病灶类型。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,第三标注单元404进一步配置用于:利用病灶区域分割模型在待标注医学图像的病灶区域形成预分割区域,并输出到客户端,以使用户对预分割区域进行微调;接收并保存经用户微调后的预分割区域。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,装置400还包括:图像分类模型重训单元,配置用于将待标注医学图片和待标注医学图片的分类信息添加到第一医学图像训练集,重新训练图像分类模型。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,装置400还包括:病灶区域检测模型重训单元,配置用于将待标注医学图片和待标注医学图片标注出的病灶区域、病灶区域的病灶类型添加到第二医学图像训练集,重新训练病灶区域检测模型。
在本实施例中的一些可选的实现方式中,装置400还包括:病灶区域分割模型重训单元,配置用于将已框选出病灶区域的待标注医学图片和待标注医学图片的分割图像添加到第三医学图像训练集,重新训练病灶区域分割模型。
下面参考图5,其示出了适于用来实现本申请实施例的终端设备/服务器的计算机系统500的结构示意图。图5示出的终端设备/服务器仅仅是一个示例,不应对本申请实施例的功能和使用范围带来任何限制。
如图5所示,计算机系统500包括中央处理单元(CPU)501,其可以根据存储在只读存储器(ROM)502中的程序或者从存储部分508加载到随机访问存储器(RAM)503中的程序而执行各种适当的动作和处理。在RAM 503中,还存储有系统500操作所需的各种程序和数据。CPU 501、ROM 502以及RAM 503通过总线504彼此相连。输入/输出(I/O)接口505也连接至总线504。
以下部件连接至I/O接口505:包括键盘、鼠标等的输入部分506;包括诸如阴极射线管(CRT)、液晶显示器(LCD)等以及扬声器等的输出部分507;包括硬盘等的存储部分508;以及包括诸如LAN卡、调制解调器等的网络接口卡的通信部分509。通信部分509经由诸如因特网的网络执行通信处理。驱动器510也根据需要连接至I/O接口505。可拆卸介质511,诸如磁盘、光盘、磁光盘、半导体存储器等等,根据需要安装在驱动器510上,以便于从其上读出的计算机程序根据需要被安装入存储部分508。
特别地,根据本公开的实施例,上文参考流程图描述的过程可以被实现为计算机软件程序。例如,本公开的实施例包括一种计算机程序产品,其包括承载在计算机可读介质上的计算机程序,该计算机程序包含用于执行流程图所示的方法的程序代码。在这样的实施例中,该计算机程序可以通过通信部分509从网络上被下载和安装,和/或从可拆卸介质511被安装。在该计算机程序被中央处理单元(CPU)501执行时,执行本申请的方法中限定的上述功能。需要说明的是,本申请的计算机可读介质可以是计算机可读信号介质或者计算机可读存储介质或者是上述两者的任意组合。计算机可读存储介质例如可以是——但不限于——电、磁、光、电磁、红外线、或半导体的系统、装置或器件,或者任意以上的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子可以包括但不限于:具有一个或多个导线的电连接、便携式计算机磁盘、硬盘、随机访问存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、光纤、便携式紧凑磁盘只读存储器(CD-ROM)、光存储器件、磁存储器件、或者上述的任意合适的组合。在本申请中,计算机可读存储介质可以是任何包含或存储程序的有形介质,该程序可以被指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用。而在本申请中,计算机可读的信号介质可以包括在基带中或者作为载波一部分传播的数据信号,其中承载了计算机可读的程序代码。这种传播的数据信号可以采用多种形式,包括但不限于电磁信号、光信号或上述的任意合适的组合。计算机可读的信号介质还可以是计算机可读存储介质以外的任何计算机可读介质,该计算机可读介质可以发送、传播或者传输用于由指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用的程序。计算机可读介质上包含的程序代码可以用任何适当的介质传输,包括但不限于:无线、电线、光缆、RF等等,或者上述的任意合适的组合。
附图中的流程图和框图,图示了按照本申请各种实施例的系统、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上,流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段、或代码的一部分,该模块、程序段、或代码的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。也应当注意,在有些作为替换的实现中,方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如,两个接连地表示的方框实际上可以基本并行地执行,它们有时也可以按相反的顺序执行,这依所涉及的功能而定。也要注意的是,框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合,可以用执行规定的功能或操作的专用的基于硬件的系统来实现,或者可以用专用硬件与计算机指令的组合来实现。
描述于本申请实施例中所涉及到的单元可以通过软件的方式实现,也可以通过硬件的方式来实现。所描述的单元也可以设置在处理器中,例如,可以描述为:一种处理器包括获取单元、第一标注单元、第二标注单元和第三标注单元。其中,这些单元的名称在某种情况下并不构成对该单元本身的限定,例如,获取单元还可以被描述为“获取至少一个待标注医学图像的单元”。
作为另一方面,本申请还提供了一种计算机可读介质,该计算机可读介质可以是上述实施例中描述的装置中所包含的;也可以是单独存在,而未装配入该装置中。上述计算机可读介质承载有一个或者多个程序,当上述一个或者多个程序被该装置执行时,使得该装置:获取至少一个待标注医学图像;为待标注医学图像标注分类信息,其中,分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;利用预先训练的病灶区域检测模型处理待标注医学图像,在待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型,以使待标注医学图像标注出病灶区域和病灶区域的病灶类型,其中,病灶区域检测模型用于根据在医学图像中识别出的病灶区域的位置和大小框选出病灶区域、且标注出病灶区域的病灶类型;从已框选出病灶区域的待标注医学图像中分割出被框选出的病灶区域,形成待标注医学图像分割图像,以使待标注医学图像标注出分割图像。
以上描述仅为本申请的较佳实施例以及对所运用技术原理的说明。本领域技术人员应当理解,本申请中所涉及的发明范围,并不限于上述技术特征的特定组合而成的技术方案,同时也应涵盖在不脱离上述发明构思的情况下,由上述技术特征或其等同特征进行任意组合而形成的其它技术方案。例如上述特征与本申请中公开的(但不限于)具有类似功能的技术特征进行互相替换而形成的技术方案。
Claims (24)
1.一种用于标注医学图像的方法,其特征在于,包括:
获取至少一个待标注医学图像;
为所述待标注医学图像标注分类信息,其中,所述分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;
利用预先训练的病灶区域检测模型处理所述待标注医学图像,在所述待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出所述病灶区域的病灶类型,以使所述待标注医学图像标注出所述病灶区域和所述病灶区域的病灶类型,其中,所述病灶区域检测模型用于根据在医学图像中识别出的所述病灶区域的位置和大小框选出所述病灶区域、且标注出所述病灶区域的病灶类型;
从已框选出所述病灶区域的所述待标注医学图像中分割出被框选出的所述病灶区域,形成所述待标注医学图像分割图像,以使所述待标注医学图像标注出所述分割图像。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述为所述待标注医学图像标注分类信息,包括:
利用预先训练的图像分类模型对所述待标注医学图像进行处理,以输出所述待标注医学图像的分类信息,其中,所述图像分类模型用于对医学图像标注所述分类信息。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述从已框选出所述病灶区域的所述待标注医学图像中分割出被框选出的所述病灶区域,形成所述待标注医学图像分割图像,包括:
利用预先训练的病灶区域分割模型对已框选出所述病灶区域的所述待标注医学图像进行处理,以输出所述待标注医学图像中被框选出的所述病灶区域的分割图像,其中,所述病灶区域分割模型用于从已框选出所述病区域的医学图像中分割出所述病灶区域的分割图像。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法还包括训练所述图像分类模型的步骤;
所述训练所述图像分类模型的步骤包括:
获取第一医学图像训练集,其中,所述第一医学图像训练集包括多个医学图像和每个所述医学图像标注的分类信息;
利用卷积神经网络,根据所述第一医学图像训练集,训练得到所述图像分类模型。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括训练所述病灶区域检测模型的步骤;
所述训练所述病灶区域检测模型的步骤包括:
获取第二医学图像训练集,其中,所述第二医学图像训练集包括多个医学图像和每个所述医学图像标注出的所述病灶区域和所述病灶区域的病灶类型;
利用卷积神经网络,根据所述第二医学图像训练集,训练得到所述病灶区域检测模型。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法还包括训练所述病灶区域分割模型的步骤;
所述训练所述病灶区域分割模型的步骤包括:
获取第三医学图像训练集,其中,所述第三医学图像训练集包括多个已框选出病灶区域的医学图像和各被框选出病灶区域的所述医学图像的病灶区域的分割图像;
利用卷积神经网络,根据所述第三医学图像训练集,训练得到所述病灶区域分割模型。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在利用预先训练的病灶区域检测模型处理所述待标注医学图像,在所述待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出所述病灶区域的病灶类型之后,还包括:
将所述待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域、所述病灶区域的病灶类型输出到客户端,以使用户判断所述待标注医学图像标注的病灶区域、所述病灶区域的病灶类型是否正确;
若是,则保存所述待标注医学图像标注的病灶区域和所述病灶区域的病灶类型;
若否,则接收并保存经所述用户重新标注的待标注医学图像的病灶区域和所述病灶区域的病灶类型。
8.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,在输出所述待标注医学图像中被框选出的所述病灶区域的分割图像之前,还包括:
利用所述病灶区域分割模型在所述待标注医学图像的病灶区域形成预分割区域,并输出到客户端,以使用户对所述预分割区域进行微调;
接收并保存经所述用户微调后的所述预分割区域。
9.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,还包括:
将所述待标注医学图片和所述待标注医学图片的分类信息添加到所述第一医学图像训练集,重新训练所述图像分类模型。
10.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,还包括:
将所述待标注医学图片和所述待标注医学图片标注出的病灶区域、所述病灶区域的病灶类型添加到所述第二医学图像训练集,重新训练所述病灶区域检测模型。
11.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,还包括:
将所述已框选出病灶区域的待标注医学图片和所述待标注医学图片的分割图像添加到所述第三医学图像训练集,重新训练所述病灶区域分割模型。
12.一种用于标注医学图像的装置,其特征在于,包括:
获取单元,配置用于获取至少一个待标注医学图像;
第一标注单元,配置用于为所述待标注医学图像标注分类信息,其中,所述分类信息包括医学图像对应的诊断结果的类别和诊断结果的等级;
第二标注单元,配置用于利用预先训练的病灶区域检测模型处理所述待标注医学图像,在所述待标注医学图像中框选出病灶区域、且标注出所述病灶区域的病灶类型,以使所述待标注医学图像标注出所述病灶区域和所述病灶区域的病灶类型,其中,所述病灶区域检测模型用于根据在医学图像中识别出的所述病灶区域的位置和大小框选出所述病灶区域、且标注出所述病灶区域的病灶类型;
第三标注单元,配置用于从已框选出所述病灶区域的所述待标注医学图像中分割出被框选出的所述病灶区域,形成所述待标注医学图像分割图像,以使所述待标注医学图像标注出所述分割图像。
13.根据权利要求12所述的装置,其特征在于,所述第一标注单元进一步配置用于:
利用预先训练的图像分类模型对所述待标注医学图像进行处理,以输出所述待标注医学图像的分类信息,其中,所述图像分类模型用于对医学图像标注诊断结果的类别和诊断结果的等级。
14.根据权利要求12所述的装置,其特征在于,所述第三标注单元进一步配置用于:
利用预先训练的病灶区域分割模型对已框选出所述病灶区域的所述待标注医学图像进行处理,以输出所述待标注医学图像中被框选出的所述病灶区域的分割图像,其中,所述病灶区域分割模型用于从已框选出所述病区域的医学图像中分割出所述病灶区域的分割图像。
15.根据权利要求13所述的装置,其特征在于,所述装置还包括:
图像分类模型训练单元;
所述图像分类模型训练单元包括:
第一获取模块,配置用于获取第一医学图像训练集,其中,所述第一医学图像训练集包括多个医学图像和每个所述医学图像标注的分类信息;
第一训练模块,配置用于利用卷积神经网络,根据所述第一医学图像训练集,训练得到所述图像分类模型。
16.根据权利要求12所述的装置,其特征在于,所述装置还包括:
病灶区域检测模型训练单元;
所述病灶区域检测模型训练单元包括:
第二获取模块,配置用于获取第二医学图像训练集,其中,所述第二医学图像训练集包括多个医学图像和每个所述医学图像标注出所述病灶区域和所述病灶区域的病灶类型;
第二训练单元,配置用于利用卷积神经网络,根据所述第二医学图像训练集,训练得到所述病灶区域检测模型。
17.根据权利要求14所述的装置,其特征在于,所述装置还包括:
病灶区域分割模型训练单元;
所述病灶区域分割模型训练单元包括:
第三获取模块,配置用于获取第三医学图像训练集,其中,所述第三医学图像训练集包括多个已框选出病灶区域的医学图像和各被框选出病灶区域的所述医学图像中的病灶区域的分割图像;
第三训练模块,配置用于利用卷积神经网络,根据所述第三医学图像训练集,训练得到所述病灶区域分割模型。
18.根据权利要求12所述的装置,其特征在于,所述第二标注单元进一步配置用于:
将所述待标注医学图像和该待标注医学图像标注的病灶区域、所述病灶区域的病灶类型输出到客户端,以使用户判断所述待标注医学图像标注的病灶区域、所述病灶区域的病灶类型是否正确;
若是,则保存所述待标注医学图像标注的病灶区域和所述病灶区域的病灶类型;
若否,则接收并保存经所述用户重新标注的待标注医学图像的病灶区域和所述病灶区域的病灶类型。
19.根据权利要求14所述的装置,其特征在于,所述第三标注单元进一步配置用于:
利用所述病灶区域分割模型在所述待标注医学图像的病灶区域形成预分割区域,并输出到客户端,以使用户对所述预分割区域进行微调;
接收并保存经所述用户微调后的所述预分割区域。
20.根据权利要求15所述的装置,其特征在于,还包括:
图像分类模型重训单元,配置用于将所述待标注医学图片和所述待标注医学图片的分类信息添加到所述第一医学图像训练集,重新训练所述图像分类模型。
21.根据权利要求16所述的装置,其特征在于,还包括:
病灶区域检测模型重训单元,配置用于将所述待标注医学图片和所述待标注医学图片标注出的病灶区域、所述病灶区域的病灶类型添加到所述第二医学图像训练集,重新训练所述病灶区域检测模型。
22.根据权利要求17所述的装置,其特征在于,还包括:
病灶区域分割模型重训单元,配置用于将所述已框选出病灶区域的待标注医学图片和所述待标注医学图片的分割图像添加到所述第三医学图像训练集,重新训练所述病灶区域分割模型。
23.一种服务器,包括:
一个或多个处理器;
存储装置,用于存储一个或多个程序,
当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求1-11中任一所述的方法。
24.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1-11中任一所述的方法。
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Application publication date: 20180109 |