CN107226862A - 特异性人ews‑fli1融合蛋白抗体的制备方法及在制备尤文肉瘤诊断抗体试剂的应用 - Google Patents
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Abstract
特异性人EWS‑FLI1融合蛋白抗体的制备方法及在制备尤文肉瘤诊断抗体试剂的应用:1)多肽设计:两组每组三条,组1:多肽1:Cys‑SSSYGQQNPSYDSVR;多肽2:SSSYGQQ‑Cys;多肽3:Cys‑PSYDSVR;组2:多肽4:Cys‑SSSYGQQSSLLAYN;多肽5同多肽2;多肽6:Cys‑SSLLAYN;2)多肽合成;3)抗原制备:将多肽1、4与KLH偶联,偶联物作为抗原用于免疫动物;4)免疫;5)抗体纯化:抗体经三步多肽层析柱亲和纯化得到特异性抗体;6)浓缩;7)抗体鉴定:证明目标抗体特异性。本发明能够实现规模化工业生产,所制备的抗体在尤文肉瘤诊断中应用。
Description
技术领域
本发明专利涉及一种人类融合蛋白的抗体制备及应用方法。具体涉及到一种特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法及其在制备恶性肿瘤--尤文肉瘤诊断抗体试剂中的应用。本方法制备的抗体,只对人EWS与FLI1蛋白融合后的人EWS-FLI1融合蛋白有特异反应,对人EWS或FLI1蛋白无反应。
技术背景
尤文肉瘤是一种高度恶性骨肿瘤,其发病率在儿童及青少年原发恶性骨肿瘤中仅次于骨肉瘤。尤文肉瘤根治术后较高的复发与转移率已成为制约尤文肉瘤(Ewing'ssarcoma)疗效提高的关键性障碍。目前发现,尤文肉瘤具有特异的染色体易位t(11;22)(q24;q12),重排的22号染色体上EWS基因的3’端与FLI1基因的5’端相结合,产生一个新的融合基因,编码的融合蛋白EWS-FLI1诱导一系列基因的异常表达导致了尤文肉瘤的发生和发展。95%的尤文肉瘤家族具有特异的融合蛋白EWS-FLI1,此蛋白是尤文肉瘤发生、发展的关键,同时也是治疗尤文肉瘤理想的特异性靶点。实验证实EWS-FLI1基因修饰的树突状细胞对尤文肉瘤细胞具有特异性杀伤作用,提示EWS-FLI1可能是EWS细胞的特异性抗原成分。
EWS-FLI1融合蛋白是由EWS的氨基末端和FLI1的羧基末端组合而成,作为调节异常的转录因子EWS-FLI1发挥着强大的致癌基因作用。除了EWS氨基末端的反式激活结构域之外,富含脯胺酸结构域的FLI1羧基末端能显著增强EWS-FLI1融合蛋白的转录活性(RekhiB, et al. J Postgrad Med, 2010, 56(3): 201-205.)。然而目前对于EWS-FLI1融合蛋白的非转录功能还缺乏研究。研究表明,EWS-FLI1的致癌过程是与DNA结合而非依赖的方式来实现的,因为在尤文肉瘤细胞中发现EWS-FLI1与DNA结合并不能增加前者的致癌潜能。另外有研究发现,EWS-FLI1还能结合靶基因启动子的GGAA卫星重复序列(GGAA-microsatelliterepeat sequences),CAV1和GSTM4参与EWS-FLI1介导的肿瘤形成,进一步证实在尤文肉瘤的肿瘤形成过程中,EWS-FLI1的转录活性是通过卫星重复序列来完成的。 EWS-FLI1融合蛋白有多种类型(type),其中两种占绝大多数。其中最普通的类型为型1(EWS-FLI1 type 1),约占60%。与其它的融合类型相比,EWS-FLI1 型1编码功能较弱的反式激活因子,对预后有利。 其次是型2(EWS-FLI1 type 2),约占25%,编码功能较强的反式激活因子,对预后不利。
融合基因是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因,融合基因的表达产物为融合蛋白。融合基因大部分在肿瘤中被发现,并在肿瘤诊断中占有重要的意义。比如早期发现的bcr-abl融合基因在白血病分型中就极为重要。目前,融合基因的检测方法,主要通过在位杂交荧光(FISH),反转录PCR(RT-PCR)等方法。这些方法主要基于分子生物学法,无法检测表达产物即融合蛋白。而在生物体内,正是其表达产物即融合蛋白在起着生物学效应。本发明基于免疫学方法,可以对表达产物,即融合后的蛋白进行准确地鉴定,可以定性或定量,特异性好,与未融合的蛋白无反应,可以为尤文肉瘤的科研、诊断与治疗提供新的工具。
对于普通的人EWS或FLI1蛋白的抗体,现有技术中已有标准的生产程序,但是,所生产的这些抗体只能识别未融合前的人EWS或FLI1蛋白,或者只能在识别融合前的EWS或FLI1蛋白的众多异构体的同时,附带识别EWS-FLI1融合蛋白,造成检测结果不可靠,非特异性极高。在报道中,EWS至少有6种异构体,FLI1至少4种异构体,EWS-FLI1融合蛋白至少有12种异构体。同时,因为无法准确识别EWS-FLI1融合蛋白的类型,就无法对临床提供准确的预后的判断。
发明内容
本发明的目的是提供一种特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法。本发明还将提供这种特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体在制备恶性肿瘤--尤文肉瘤诊断抗体中的应用。本发明针对融合蛋白的特定拼接方式,来进行多肽抗原设计,制备的抗体是针对融合后的人EWS-FLI1蛋白。目标抗体经过融合前EWS或FLI1蛋白序列的纯化过滤后,可以达到只对EWS-FLI1融合蛋白有特异性,检测中做到结果准确可靠,有利于诊断应用。具体可以通过免疫学检测的手段,如酶联免疫法(ELISA)、免疫印迹法(WB)、免疫组化法(IHC)等方法将本发明抗体进行应用。本发明任务还包括,该制备方法能够实现规模化工业生产。
完成上述发明任务的技术方案是一种特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,共提供两种类型(EWS-FLI1 type 1与type 2)的制备方法,步骤如下:
1)多肽设计:设计两组多肽序列,每组三条,分别为:
组1:多肽1:Cys-SSSYGQQNPSYDSVR;多肽2:SSSYGQQ-Cys;多肽3:Cys-PSYDSVR;
组2:多肽4:Cys-SSSYGQQSSLLAYN;多肽5同多肽2;多肽6:Cys-SSLLAYN;
说明:
a)多肽1为15aa肽,对应人EWS-FLI1 type 1融合蛋白位置aa264-278。多肽序列选择恰为人EWS-FLI1 type 1融合蛋白的拼接位置,其中SSSYGQQ序列来自人EWS,PSYDSVR序列来自人FLI1,中间N为拼接位点。多肽序列在N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人EWS-FLI1 type 1融合蛋白信息如图1所示。
b)多肽2为7aa肽,对应融合前人EWS融合蛋白aa258-264,对应多肽1的N端序列,并在多肽2的C端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人EWS蛋白信息如图2所示。
c)多肽3为7aa肽,对应融合前人FLI1融合蛋白aa220-226,对应多肽1的C端序列,并在多肽3的N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人FLI1蛋白信息如图3所示。
d)多肽4为14aa肽,对应人EWS-FLI1 type 2融合蛋白位置aa264-278。多肽序列选择恰为人EWS-FLI1 type 2融合蛋白的拼接位置,其中SSSYGQQ序列来自人EWS,SSLLAYN序列来自人FLI1。多肽序列在N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人EWS-FLI1type 2融合蛋白信息如图4所示。
e)多肽5序列同多肽 2,对应多肽4的N端序列。
f)多肽6为7aa肽,对应融合前人FLI1融合蛋白aa197-203,对应多肽4的C端序列,并在多肽6的N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人FLI1蛋白信息如图3所示。
g)其中多肽2与多肽3,多肽5与多肽6的Cys(半胱氨酸)添加在多肽上的位置不同,以便于抗体纯化。
2)多肽合成:多肽纯度≥85%,分子量正确。通常在免疫实验中,对多肽纯度的要求可以降低至70%。
3)抗原制备:将多肽1、多肽4分别与KLH偶联,偶联物作为抗原用于免疫动物。KLH使用琥珀酰亚胺基4-[N-马来酰亚胺甲基]环己烷-1-羧化物(SMCC)双功能偶联剂预先活化成KLH-SMCC,通过Cys(半胱氨酸)与多肽1相联接。
4)免疫:选用新西兰兔,每只兔子以300μg剂量进行基础免疫,以后每隔21天进行一次加强免疫,在经过三次加强免疫后,再经7天,取血样,对血清进行ELISA检测。收集经ELISA检测阳性的兔子血清。
5) 抗体纯化:
a. 组1层析柱制备:多肽与胶的剂量按2mg:2mg,将多肽1、多肽2与多肽3分别偶联在预先活化好的巯基琼脂糖凝胶(sulfolink-Gel)上,制备一组共三根亲和层析柱。
b. 组1纯化:
血清按10:1体积比例加入1 M Tris·HCl pH7.5 缓冲液调节pH值,再用0.45μm膜过滤。处理过血清再与多肽1偶联的层析柱室温下混匀反应2小时。用10mM PBS pH7.4清洗层析柱后,再用100 mM 甘氨酸(glycine) pH2.8缓冲液洗脱,收集OD280≥0.2部分洗脱液。收集液立即用 1M Tris·HCl pH7.5缓冲液调节pH。
将收集液与多肽2偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤可以重复1到3次,直至穿透液被多肽2抗原吸收完全。
再将经多肽2纯化过的收集液与多肽3偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤可以重复1到3次,直至穿透液被多肽3抗原吸收完全。
穿透液即含有纯化组1目标抗体(EWS-FLI1 type 1抗体)。
c. 组2的层析柱制备与纯化的步骤与组1类似,不同的是多肽1,2,3对应换成多肽4,5,6,最后得到纯化组2目标抗体(EWS-FLI1 type 2抗体)。
6)浓缩:将纯化好的穿透液浓缩成特定浓度目标抗体浓液,通常1mg/ml以上。可根据各种应用的需要调制相应浓度。
7)抗体鉴定:制备的目标抗体经过酶联免疫法(ELISA)、斑点杂交法(Dot-Blot)法鉴定,证明组1目标抗体只对多肽1有特异反应,对其它多肽均无反应。组2目标抗体只对多肽4有特异反应,对其它多肽均无反应。检测方法如下:
a. 间接酶联免疫法(ELISA):将所设计的多肽分别偶联BSA的偶联物同作为检测抗原。以5μg/ml,每孔100μl包被96孔板。经间接ELISA检测,证明组1目标抗体只对多肽1有极强反应,对其它多肽均无反应。组2目标抗体只对多肽4有极强反应,对其它多肽均无反应。结果如图5所示。
b.斑点杂交法(Dot-Blot):将多肽与BSA的偶联物作为检测抗原。经Dot-Blot法检测,证明组1目标抗体只对多肽1有极强反应,对其它多肽均无反应。组2目标抗体只对多肽4有极强反应,对其它多肽均无反应。结果如图6所示。
本发明工艺流程图如图6所示。
完成本申请第二个发明目的的技术方案是,上述特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体在制备恶性肿瘤--尤文肉瘤诊断抗体试剂中的应用。具体方法是:
免疫;通常选用BALB/c小鼠以10μg/只的剂量进行基础免疫,以后每隔21天进行一次加强免疫,在经过三次加强免疫后,再经3天,取血样,对血清进行ELISA检测。
细胞融合:取经ELISA检测阳性血清的小鼠,取小鼠脾细胞,与小鼠骨髓瘤细胞SP20进行融合,制备杂交瘤细胞。
选择培养:将杂交瘤细胞用96孔板铺板培养,再加选择培养基进行选择培养。
筛选克隆:对杂交瘤细胞进行筛选,使杂交瘤细胞克隆化,形成单克隆细胞株。
单克隆抗体的鉴定:
a. 间接酶联免疫法(ELISA):将所设计的多肽分别偶联BSA,偶联物作为检测抗原。单克隆抗体采用间接ELISA检测,对多肽1有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1type 1目标抗体。对多肽4有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 2目标抗体。
b.斑点杂交法(Dot-Blot):采用多肽与BSA的偶联物作为检测抗原。单克隆抗体经Dot-Blot法检测,对多肽1有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 1目标抗体。对多肽4有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 2目标抗体。
本发明专利的方法可以应用于各种融合蛋白特异性抗体的制备。具体为依据本发明中的方法,选择融合蛋白拼接位置左右两端的序列进行多肽设计,再根据本发明中多肽合成,抗原制备,免疫,ELISA检测,收集血清步骤,再根据本发明中纯化原理与方法,采用设计的多肽分别制备的层析柱进行亲和层析,得到目标抗体。
本发明专利制备产生的抗体,采用但不限于以下多种免疫学检测方法进行应用。结果可以用于定性或定量实验,用于科研或诊断用途。
1)夹心酶联免疫法(ELISA)
采用本发明专利制备产生的抗体,再选取人EWS-FLI融合蛋白或EWS蛋白或FLI1蛋白抗体进行配对,形成一对夹心ELISA抗体。可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织的裂解液,细胞培养液,患者血样及体液等样品进行夹心ELISA检测。
2) 免疫印迹法(WB)
采用本发明专利制备产生的抗体,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织的裂解液,表达蛋白等样品进行免疫印迹法(WB)检测。
3) 免疫组化法(IHC)
采用本发明专利制备产生的抗体,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织进行免疫组化法(IHC)检测。
4) 免疫沉淀法(IP)
采用本发明专利制备产生的抗体,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行免疫沉淀法(IP)检测。
5) 免疫荧光法(IF)
采用本发明专利制备产生的抗体,通过直接荧光标记,或通过荧光标记二抗法,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行免疫荧光法(IF)检测。
6) 流式细胞术(FCM)
采用本发明专利制备产生的抗体,通过流式细胞术(FCM),可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行检测。
在分子生物学检测法中,因只能检测融合基因而无法检测具体发挥功能作用的EWS-FLI1融合蛋白,故无法对表达产物即融合蛋白表达与否及表达量进行分析,鉴定结果明显有缺陷。本发明能克服与弥补这些缺陷。本发明还克服了现有技术生产方法所制备的人EWS或FLI1蛋白的抗体,只能识别未融合前的人EWS或FLI1蛋白,或者只能在识别EWS或FLI1蛋白的众多异构体的同时,附带识别EWS-FLI1融合蛋白,造成检测结果不可靠,非特异性极高等不足;本发明专利制备的抗体,针对融合蛋白的特定拼接方式进行多肽抗原设计,制备的抗体是针对融合后的人EWS-FLI1蛋白。目标抗体经过融合前EWS或FLI1蛋白序列的纯化过滤后,可以达到只对EWS-FLI1融合蛋白有特异性,检测中做到结果准确可靠,有利于诊断应用。同时,本发明能够进一步明确鉴定出EWS-FLI1融合蛋白的类型,给临床预后提供了有力的依据。
表1为ELISA检测结果。
基于本发明目标抗体直接测定的是融合后的人EWS-FLI1蛋白,且具有高准确率与特异性的检测结果的优势,大大提高了应用的方便性与检测速度。通常抗体诊断应用中,一次性得到检测结果。比如在应用于患者细胞或组织的免疫印迹(WB)、免疫组化(IHC)或免疫荧光(IF)检测中体现尤其明显,通过本发明抗体的检测就可以一次性得到明确结果。这对于普通的人EWS或FLI1蛋白抗体的检测是无法做到的。本发明的工艺步骤经过严格生产程序与鉴定程序的标准化,可以应用于规模化工业生产。
附图说明
图1为人EWS-FLI1 type 1蛋白信息;
图2为人EWS蛋白信息;
图3为人FLI1蛋白信息;
图4为 人EWS-FLI1 type 2蛋白信息
图5 为Dot-Blot检测结果;
图6为本发明工艺流程图。
具体实施方式
本发明专利可以应用于单克隆抗体的制备,具体实施方式为:
实施例1,一种特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法
A、提供两种类型EWS-FLI1融合蛋白(type 1与type 2)的制备方法,步骤如下:
1)多肽设计:设计两组多肽序列,每组共三条,分别为:
组1:多肽1:Cys-SSSYGQQNPSYDSVR;多肽2:SSSYGQQ-Cys;多肽3:Cys-PSYDSVR;
组2:多肽4:Cys-SSSYGQQSSLLAYN;多肽5:同多肽2;多肽6:Cys-SSLLAYN;
说明:
a.多肽1为15aa肽,对应人EWS-FLI1 type 1融合蛋白位置aa264-278。多肽序列选择恰为人EWS-FLI1 type 1融合蛋白的拼接位置,其中SSSYGQQ序列来自人EWS,PSYDSVR序列来自人FLI1,中间N为拼接位点。多肽序列在N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人EWS-FLI1 type 1融合蛋白信息如图1所示。
b.多肽2为7aa肽,对应融合前人EWS融合蛋白aa258-264,对应多肽1的N端序列,并在多肽2的C端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人EWS蛋白信息如图2所示。
c.多肽3为7aa肽,对应融合前人FLI1融合蛋白aa220-226,对应多肽1的C端序列,并在多肽3的N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人FLI1蛋白信息如图3所示。
d.多肽4为14aa肽,对应人EWS-FLI1 type 2融合蛋白位置aa264-278。多肽序列选择恰为人EWS-FLI1 type 2融合蛋白的拼接位置,其中SSSYGQQ序列来自人EWS,SSLLAYN序列来自人FLI1。多肽序列在N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人EWS-FLI1type 2融合蛋白信息如图4所示。
e.多肽5序列同多肽 2,对应多肽4的N端序列。
f.多肽6为7aa肽,对应融合前人FLI1融合蛋白aa197-203,对应多肽4的C端序列,并在多肽6的N端人为添加一个Cys(半胱氨酸)用于抗原偶联。人FLI1蛋白信息如图3所示。
g.其中多肽2与多肽3,多肽5与多肽6的Cys(半胱氨酸)添加在多肽上的位置不同,以便于抗体纯化。
2) 多肽合成:多肽纯度≥85%,分子量正确。通常在免疫实验中,对多肽纯度的要求可以降低至70%。
3) 抗原制备:将多肽1、多肽4分别与KLH偶联,偶联物作为抗原用于免疫动物。KLH使用琥珀酰亚胺基4-[N-马来酰亚胺甲基]环己烷-1-羧化物(SMCC)双功能偶联剂预先活化成KLH-SMCC,通过Cys(半胱氨酸)与多肽1相联接。
4)免疫:选用新西兰兔,每只兔子以300μg剂量进行基础免疫,以后每隔21天进行一次加强免疫,在经过三次加强免疫后,再经7天,取血样,对血清进行ELISA检测。收集经ELISA检测阳性的兔子血清。
5)抗体纯化:
a. 组1层析柱制备:多肽与胶的剂量按2mg:2mg,将多肽1、多肽2与多肽3分别偶联在预先活化好的巯基琼脂糖凝胶(sulfolink-Gel)上,制备一组共三根亲和层析柱。
b. 组1纯化:
血清按10:1体积比例加入1 M Tris·HCl pH7.5 缓冲液调节pH值,再用0.45μm膜过滤。处理过血清再与多肽1偶联的层析柱室温下混匀反应2小时。用10mM PBS pH7.4清洗层析柱后,再用100 mM 甘氨酸(glycine) pH2.8缓冲液洗脱,收集OD280≥0.2部分洗脱液。收集液立即用 1M Tris·HCl pH7.5缓冲液调节pH。
将收集液与多肽2偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤可以重复1到3次,直至穿透液被多肽2抗原吸收完全。
再将经多肽2纯化过的收集液与多肽3偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤可以重复1到3次,直至穿透液被多肽3抗原吸收完全。
穿透液含有纯化组1目标抗体。
组2的层析柱制备与纯化的步骤与组1类似,不同的是多肽1,2,3对应换成多肽4,5,6,最后得到纯化组2目标抗体。具体操作是:
c. 组2的层析柱制备:多肽与胶的剂量按2mg:2mg,将多肽4、多肽5与多肽6分别偶联在预先活化好的巯基琼脂糖凝胶上,制备一组共三根亲和层析柱;
d. 组2的纯化:
血清按10:1体积比例加入1 M Tris·HCl pH7.5 缓冲液调节pH值,再用0.45μm膜过滤;处理过血清再与多肽4偶联的层析柱室温下混匀反应2小时;用10mM PBS pH7.4清洗层析柱后,再用100 mM 甘氨酸pH2.8缓冲液洗脱,收集OD280≥0.2部分洗脱液;收集液立即用1M Tris·HCl pH7.5缓冲液调节pH;
将收集液与多肽5偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤重复1到3次,直至穿透液被多肽5抗原吸收完全;
再将经多肽5纯化过的收集液与多肽6偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤重复1到3次,直至穿透液被多肽6抗原吸收完全;
穿透液含有纯化组2目标抗体。
6)浓缩:将纯化好的穿透液浓缩成特定浓度目标抗体浓液,通常1mg/ml以上。可根据各种应用的需要调制相应浓度。
7)抗体鉴定:制备的目标抗体经过酶联免疫法(ELISA)、斑点杂交法(Dot-Blot)法鉴定,证明组1目标抗体只对多肽1有特异反应,对其它多肽均无反应。组2目标抗体只对多肽4有特异反应,对其它多肽均无反应。检测方法如下:
a. 间接酶联免疫法(ELISA):将所设计的多肽分别偶联BSA的偶联物同作为检测抗原。以5μg/ml,每孔100μl包被96孔板。经间接ELISA检测,证明组1目标抗体只对多肽1有极强反应,对其它多肽均无反应。组2目标抗体只对多肽4有极强反应,对其它多肽均无反应。结果如图5所示。
b.斑点杂交法(Dot-Blot):将多肽与BSA的偶联物作为检测抗原。经Dot-Blot法检测,证明组1目标抗体只对多肽1有极强反应,对其它多肽均无反应。组2目标抗体只对多肽4有极强反应,对其它多肽均无反应。结果如图6所示。
B、免疫;通常选用BALB/c小鼠以10μg/只的剂量进行基础免疫,以后每隔21天进行一次加强免疫,在经过三次加强免疫后,再经3天,取血样,对血清进行ELISA检测。
C、细胞融合:取经ELISA检测阳性血清的小鼠,取小鼠脾细胞,与小鼠骨髓瘤细胞SP20进行融合,制备杂交瘤细胞。
D、选择培养:将杂交瘤细胞用96孔板铺板培养,再加选择培养基进行选择培养。
E、筛选克隆:对杂交瘤细胞进行筛选,使杂交瘤细胞克隆化,形成单克隆细胞株。
F、单克隆抗体的鉴定:
a. 间接酶联免疫法(ELISA):将多肽分别偶联BSA,偶联物作为检测抗原。单克隆抗体采用间接ELISA检测,对多肽1有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 1抗体;对多肽4有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 2抗体。
b.斑点杂交法(Dot-Blot):采用多肽与BSA的偶联物作为检测抗原。单克隆抗体经Dot-Blot法检测,对多肽1有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 1抗体;对多肽4有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 2抗体。
本发明专利的方法可以应用于各种特异性融合蛋白抗体的制备。具体为依据本发明中的方法,选择融合蛋白拼接位置左右两端的序列进行多肽设计,再根据本发明中多肽合成,抗原制备,免疫,ELISA检测,收集血清步骤,再根据本发明中纯化原理与方法,采用设计的多肽分别制备的亲和柱进行亲和层析,得到目标抗体。
本发明专利制备产生的抗体,采用但不限于以下多种免疫学检测方法进行应用。结果可以用于定性或定量实验,用于科研或诊断用途。
1)夹心酶联免疫法(ELISA)
采用本发明专利制备产生的抗体,再选取人EWS-FLI1融合蛋白或EWS蛋白或FLI1蛋白抗体进行配对,形成一对夹心ELISA抗体。可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织的裂解液,细胞培养液,患者血样及体液等样品进行夹心ELISA检测。
2) 免疫印迹法(WB)
采用本发明专利制备产生的抗体,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织的裂解液,表达蛋白等样品进行免疫印迹法(WB)检测。
3) 免疫组化法(IHC)
采用本发明专利制备产生的抗体,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织进行免疫组化法(IHC)检测。
4) 免疫沉淀法(IP)
采用本发明专利制备产生的抗体,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行免疫沉淀法(IP)检测。
5) 免疫荧光法(IF)
采用本发明专利制备产生的抗体,通过直接荧光标记,或通过荧光标记二抗法,可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行免疫荧光法(IF)检测。
6) 流式细胞术(FCM)
采用本发明专利制备产生的抗体,通过流式细胞术(FCM),可以应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行检测。
Claims (9)
1.一种特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,其特征在于,步骤如下:
多肽设计, 设计两组多肽序列,每组共三条,分别为:
组1:多肽1:Cys-SSSYGQQNPSYDSVR;多肽2:SSSYGQQ-Cys;多肽3:Cys-PSYDSVR;
组2:多肽4:Cys-SSSYGQQSSLLAYN;多肽5:同多肽2;多肽6:Cys-SSLLAYN;
多肽合成:多肽纯度≥70%;
抗原制备:将多肽1与多肽4分别与KLH偶联,偶联物作为抗原用于免疫动物;KLH使用琥珀酰亚胺基4-[N-马来酰亚胺甲基]环己烷-1-羧化物双功能偶联剂预先活化成KLH-SMCC,通过半胱氨酸与多肽1相联接;
免疫:选用新西兰兔,每只兔子以300μg剂量进行基础免疫,以后每隔21天进行一次加强免疫,在经过三次加强免疫后,再经7天,取血样,对血清进行ELISA检测;收集经ELISA检测阳性的兔子血清;
抗体纯化;
浓缩:将纯化好的穿透液浓缩成特定浓度目标抗体浓液,1mg/ml以上;
7)抗体鉴定:制备的目标抗体经过酶联免疫法、斑点杂交法法鉴定,证明组1目标抗体只对多肽1有特异反应,对其它多肽均无反应;组2目标抗体只对多肽4有特异反应,对其它多肽均无反应。
2.根据权利要求1所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,其特征在于,步骤1)所述的多肽具有以下特征:
a) 多肽1为15aa肽,对应人EWS-FLI1 type 1融合蛋白位置aa264-278;多肽序列选择恰为人EWS-FLI1 type 1融合蛋白的拼接位置,其中SSSYGQQ序列来自人EWS,PSYDSVR序列来自人FLI1,中间N为拼接位点;多肽序列在N端人为添加一个半胱氨酸用于抗原偶联;
b) 多肽2为7aa肽,对应融合前人EWS融合蛋白aa258-264,对应多肽1的N端序列,并在多肽2的C端人为添加一个半胱氨酸用于抗原偶联;
多肽3为7aa肽,对应融合前人FLI1融合蛋白aa220-226,对应多肽1的C端序列,并在多肽3的N端人为添加一个半胱氨酸用于抗原偶联;
多肽4为14aa肽,对应人EWS-FLI1 type 2融合蛋白位置aa264-278;多肽序列选择恰为人EWS-FLI1 type 2融合蛋白的拼接位置,其中SSSYGQQ序列来自人EWS,SSLLAYN序列来自人FLI1;多肽序列在N端人为添加一个半胱氨酸用于抗原偶联;
多肽5序列同多肽 2,对应多肽4的N端序列;
多肽6为7aa肽,对应融合前人FLI1融合蛋白aa197-203,对应多肽4的C端序列,并在多肽6的N端人为添加一个半胱氨酸用于抗原偶联。
3.根据权利要求1所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,其特征在于,所述多肽2与多肽3,多肽5与多肽6的半胱氨酸添加在多肽上的位置不同,以便于抗体纯化。
4.根据权利要求1所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,其特征在于,步骤2) 所合成的多肽纯度≥85%,分子量正确。
5.根据权利要求1所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,其特征在于,步骤5)所述的抗体纯化具体操作方法是:
a. 组1层析柱制备:多肽与胶的剂量按2mg:2mg,将多肽1、多肽2与多肽3分别偶联在预先活化好的巯基琼脂糖凝胶上,制备一组共三根亲和层析柱;
b. 组1纯化:血清按10:1体积比例加入1 M Tris·HCl pH7.5 缓冲液调节pH值,再用0.45μm膜过滤;处理过血清再与多肽1偶联的层析柱室温下混匀反应2小时;用10mM PBSpH7.4清洗层析柱后,再用100 mM 甘氨酸pH2.8缓冲液洗脱,收集OD280≥0.2部分洗脱液;收集液立即用 1M Tris·HCl pH7.5缓冲液调节pH;
将收集液与多肽2偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤重复1到3次,直至穿透液被多肽2抗原吸收完全;
再将经多肽2纯化过的收集液与多肽3偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤重复1到3次,直至穿透液被多肽3抗原吸收完全;
穿透液含有纯化组1目标抗体;
c. 组2的层析柱制备:多肽与胶的剂量按2mg:2mg,将多肽4、多肽5与多肽6分别偶联在预先活化好的巯基琼脂糖凝胶上,制备一组共三根亲和层析柱;
d. 组2的纯化:
血清按10:1体积比例加入1 M Tris·HCl pH7.5 缓冲液调节pH值,再用0.45μm膜过滤;处理过血清再与多肽4偶联的层析柱室温下混匀反应2小时;用10mM PBS pH7.4清洗层析柱后,再用100 mM 甘氨酸pH2.8缓冲液洗脱,收集OD280≥0.2部分洗脱液;收集液立即用1M Tris·HCl pH7.5缓冲液调节pH;
将收集液与多肽5偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤重复1到3次,直至穿透液被多肽5抗原吸收完全;
再将经多肽5纯化过的收集液与多肽6偶联的层析柱室温下混匀反应2小时,收集穿透液,此步骤重复1到3次,直至穿透液被多肽6抗原吸收完全;
穿透液含有纯化组2目标抗体。
6.根据权利要求1-5之一所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法,其特征在于,7)抗体鉴定中检测方法如下:
a. 间接酶联免疫法:将所设计的多肽分别偶联BSA的偶联物同作为检测抗原;以5μg/ml,每孔100μl包被96孔板;经间接ELISA检测,证明组1目标抗体只对多肽1有极强反应,对其它多肽均无反应;组2目标抗体只对多肽4有极强反应,对其它多肽均无反应;
b.斑点杂交法:将多肽与BSA的偶联物作为检测抗原;经Dot-Blot法检测,证明组1目标抗体只对多肽1有极强反应,对其它多肽均无反应;组2目标抗体只对多肽4有极强反应,对其它多肽均无反应。
7.权利要求1所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法所制备的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体在制备恶性肿瘤--尤文肉瘤诊断抗体试剂中的应用。
8.权利要求1所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法所制备的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体在制备恶性肿瘤--尤文肉瘤诊断抗体试剂中的应用,其特征在于,其中单克隆抗体的鉴定方法是:
a. 间接酶联免疫法:将所设计的多肽分别偶联BSA,偶联物作为检测抗原;单克隆抗体采用间接ELISA检测,对多肽1有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 1抗体;对多肽4有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 2抗体;
b.斑点杂交法:采用多肽与BSA的偶联物作为检测抗原;单克隆抗体经Dot-Blot法检测,对多肽1有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 1抗体;对多肽4有反应,对其它多肽无反应的抗体即为EWS-FLI1 type 2抗体。
9.权利要求7或8所述的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体的制备方法所制备的特异性人EWS-FLI1融合蛋白抗体在制备恶性肿瘤--尤文肉瘤诊断抗体试剂中的应用,其特征在于,用于定性或定量实验,用于科研或诊断用途;所述的应用为以下应用方法之一:
1)夹心酶联免疫法:
采用本发明专利制备产生的抗体,再选取人EWS-FLI1融合蛋白或EWS蛋白或FLI1蛋白抗体进行配对,形成一对夹心ELISA抗体;应用于尤文肉瘤相关细胞或组织的裂解液,细胞培养液,患者血样及体液等样品进行夹心ELISA检测;
2) 免疫印迹法:
采用本发明专利制备产生的抗体,应用于尤文肉瘤相关细胞或组织的裂解液,表达蛋白等样品进行免疫印迹法检测;
3) 免疫组化法:
采用本发明专利制备产生的抗体,应用于尤文肉瘤相关细胞或组织进行免疫组化法检测;
4) 免疫沉淀法:
采用本发明专利制备产生的抗体,应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行免疫沉淀法检测;
5) 免疫荧光法:
采用本发明专利制备产生的抗体,通过直接荧光标记,或通过荧光标记二抗法,应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行免疫荧光法检测;
6) 流式细胞术:
采用本发明专利制备产生的抗体,通过流式细胞术,应用于尤文肉瘤相关细胞或组织,患者血样及体液进行检测。
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