CN104164442B - 猪samhd1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用 - Google Patents
猪samhd1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN104164442B CN104164442B CN201410028266.7A CN201410028266A CN104164442B CN 104164442 B CN104164442 B CN 104164442B CN 201410028266 A CN201410028266 A CN 201410028266A CN 104164442 B CN104164442 B CN 104164442B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- samhd1
- pig
- protein
- porcine
- monoclonal antibody
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 108700019718 SAM Domain and HD Domain-Containing Protein 1 Proteins 0.000 title claims abstract description 105
- 101150114242 SAMHD1 gene Proteins 0.000 title claims abstract description 68
- 102000047164 SAM Domain and HD Domain-Containing Protein 1 Human genes 0.000 claims abstract description 99
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 13
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 13
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 8
- 239000003443 antiviral agent Substances 0.000 claims abstract description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 41
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 claims description 12
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 12
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 claims description 11
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 claims description 9
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 claims description 9
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 8
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 claims description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 28
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 11
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 abstract description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 abstract description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 abstract description 4
- 230000008827 biological function Effects 0.000 abstract 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 17
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 15
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 11
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 11
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 11
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 11
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 10
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 10
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 10
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 10
- 238000000034 method Methods 0.000 description 10
- 238000011161 development Methods 0.000 description 9
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 8
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 8
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 8
- UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L di(octadecanoyloxy)lead Chemical compound [Pb+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 8
- 239000000047 product Substances 0.000 description 8
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 7
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 7
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 7
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 7
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 7
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 6
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 6
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 6
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 6
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 6
- 108091006054 His-tagged proteins Proteins 0.000 description 5
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 5
- 239000006180 TBST buffer Substances 0.000 description 5
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 5
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 5
- 102100028999 High mobility group protein HMGI-C Human genes 0.000 description 4
- 101000986379 Homo sapiens High mobility group protein HMGI-C Proteins 0.000 description 4
- 241001135989 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus Species 0.000 description 4
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 4
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 4
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 3
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 3
- XOJVVFBFDXDTEG-UHFFFAOYSA-N pristane Chemical compound CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C XOJVVFBFDXDTEG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 2
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 2
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 2
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 2
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 2
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 2
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N Nickel Chemical compound [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701093 Suid alphaherpesvirus 1 Species 0.000 description 2
- 102000006275 Ubiquitin-Protein Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010083111 Ubiquitin-Protein Ligases Proteins 0.000 description 2
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 230000015788 innate immune response Effects 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 238000002941 microtiter virus yield reduction assay Methods 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000012474 protein marker Substances 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 2
- 208000012153 swine disease Diseases 0.000 description 2
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 2
- 108010004483 APOBEC-3G Deaminase Proteins 0.000 description 1
- 206010000060 Abdominal distension Diseases 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 238000011725 BALB/c mouse Methods 0.000 description 1
- 108010051118 Bone Marrow Stromal Antigen 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100037086 Bone marrow stromal antigen 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241000710777 Classical swine fever virus Species 0.000 description 1
- 102000012698 DDB1 Human genes 0.000 description 1
- 102100029582 DDB1- and CUL4-associated factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100038076 DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G Human genes 0.000 description 1
- 101100170004 Dictyostelium discoideum repE gene Proteins 0.000 description 1
- 101100170005 Drosophila melanogaster pic gene Proteins 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000729176 Fagopyrum dibotrys Species 0.000 description 1
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000917426 Homo sapiens DDB1- and CUL4-associated factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000641031 Homo sapiens Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 Proteins 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 241000713340 Human immunodeficiency virus 2 Species 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 1
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 241000713311 Simian immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 102100035254 Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710104417 Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3 Proteins 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 102100022405 Tripartite motif-containing protein 5 Human genes 0.000 description 1
- 101710130650 Tripartite motif-containing protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 210000000683 abdominal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 230000003187 abdominal effect Effects 0.000 description 1
- 210000001132 alveolar macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000012197 amplification kit Methods 0.000 description 1
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002155 anti-virotic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007416 antiviral immune response Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- LXWYCLOUQZZDBD-LIYNQYRNSA-N csfv Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 LXWYCLOUQZZDBD-LIYNQYRNSA-N 0.000 description 1
- 101150077768 ddb1 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 1
- 208000032625 disorder of ear Diseases 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 102000057896 human SAMHD1 Human genes 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000028709 inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 244000144977 poultry Species 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种猪SAMHD1基因,该基因序列包含编码SEQIDNO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。本发明还公开了猪SAMHD1蛋白质,该蛋白质具有SEQIDNO.1所示氨基酸序列。本发明还公开了抗猪SAMHD1蛋白的单克隆抗体。本发明的猪SAMHD1基因、蛋白质,具有抗病毒活性,适于研制抗病毒药物,应用前景广阔。本发明的单克隆抗体,与猪SAMHD1蛋白具有很好的特异性反应,为进一步研究猪SAMHD1蛋白的生物学功能奠定了重要的基础。
Description
技术领域
本发明涉及生物工程技术领域,尤其涉及一种猪SAMHD1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用。
背景技术
先天性免疫在机体抵抗病原感染过程中发挥重要作用,其在病原入侵机体后能够做出快速的应答,控制病原的扩散,进而诱导特异性免疫应答来消除病原。机体在长期进化的过程中,形成了具有抵抗病原入侵的天然限制性因子。目前已经发现4种天然限制性因子,TRIM5α、Tetherin、APOBEC3G和SAMHD1(Neil et al.,2008;Sheehy et al.,2002;Stremlau et al.,2004)。最近研究证实,SAMHD1作为一种天然限制性因子,在髓源细胞中表达量较高,能够阻止HIV-1型病毒在髓源细胞中的复制(Chen et al.,2012;Goldstoneet al.,2011;Laguette et al.,2011)。SAMHD1蛋白能够调控机体的先天性免疫,明显上调机体抗病毒免疫应答,介导由干扰素引起的炎症反应,参与宿主对侵入病原的防御体系。然而,目前SAMHD1的生物学特性还知之甚少。最近研究表明,SAMHD1蛋白具有脱氧核苷三磷酸水解酶的功能,可以水解细胞内的dNTP,从而抑制HIV-1病毒的反转录和cDNA的形成过程,进而阻止病毒的感染与复制(Franzolin et al.,2013;Goldstone et al.,2011)。而HIV-2和某些猴免疫缺陷病毒(SIVsm/mac)则能够通过其编码的Vpx蛋白降解SAMHD1,Vpx蛋白与DCAF1相互作用,进而形成Cullin4A/DDB1和E3泛素-连接酶复合体,通过泛素-连接酶复合体靶向降解SAMHD1蛋白,从而导致病毒对该类细胞的感染,这种降解作用可以通过蛋白酶抑制剂来解除(Ahn et al.,2012;Hrecka et al.,2011;Srivastava et al.,2008)。除HIV外,是否有其他病毒能够与其相互作用并不清楚。此外,SAMHD1蛋白还与Aicardi-Goutieres(ASG)疾病相关(Rice et al.,2009)。
SAMHD1蛋白是否能够拮抗其他病毒的感染,目前并不十分清楚。近几年来,猪瘟病毒(CSFV)、高致病性蓝耳病病毒(HP-PRRSV)、猪伪狂犬病毒(PRV)等猪重大疫病病毒一直危害我国养猪业的健康、持续发展。如何防控重大疫病的发生,降低其造成的损失,提高畜禽机体抗病毒反应,是科研人员致力追求的目标。SAMHD1作为天然免疫限制性因子,其功能和特性目前知之甚少。因此,对其开展功能与特性研究,对防控重大疫病的发生与发展具有重要意义。
对于SAMHD1蛋白功能的研究,需要获得其全基因序列、重组蛋白以及具有良好反应性的单克隆抗体。目前,人、猴、马等SAMHD1已经获得其全基因序列,但无准确的猪SAMHD1全基因序列,并且人源SAMHD1制备的单抗或者多抗与猪SAMHD1蛋白反应性很差,几乎没有反应性。因此,需要获得准确的猪SAMHD1的全基因序列,并制备具有良好反应性的单克隆抗体,可以实现对SAMHD1蛋白功能更深入的研究。
发明内容
本发明要解决目前没有准确的猪SAMHD1全基因序列的技术问题,提供一种猪SAMHD1基因,该基因的全基因序列可用于研制防控猪重大疫病的药物或生物制品。
为此,还需要提供一种猪SAMHD1蛋白和单克隆抗体,用于制备防治猪重大疫病的药物或生物制品。
为了解决上述技术问题,本发明通过如下技术方案实现:
在本发明的一个方面,提供了一种猪SAMHD1基因,该基因序列包含编码SEQ IDNO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。
优选的,所述猪SAMHD1基因序列为SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
优选的,本发明的猪SAMHD1全基因序列除了3’端的poly(A)序列之外含有3951个核苷酸,其中包含一个开放阅读框,该开放阅读框位于第68位和1951位核苷酸之间,长度为1884个核苷酸,编码627个氨基酸。
在本发明的另一方面,还提供了一种猪SAMHD1蛋白质,该猪SAMHD1蛋白质具有SEQID NO.1所示氨基酸序列。
在本发明的另一方面,还提供了一种重组载体,其包含编码SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。
所述重组载体的空载体包括原核表达载体或真核表达载体。
在本发明中,原核表达载体优选pcold TF DNA原核表达载体,真核表达载体优选p3×FLAG CMV7.1真核表达载体。
在本发明的另一方面,还提供了一种宿主细胞,其包含上述重组载体。
在本发明的另一方面,还提供了一种重组蛋白,该重组蛋白是由上述重组载体经表达而制得。
在本发明的另一方面,还提供了一种抗猪SAMHD1蛋白的单克隆抗体。
优选的,所述单克隆抗体是由杂交瘤细胞系CCTCC NO.C201422分泌的单克隆抗体。
在本发明的另一方面,还提供了一种检测猪SAMHD1蛋白的试剂盒,该试剂盒包含上述抗猪SAMHD1蛋白的单克隆抗体。
在本发明的另一方面,还提供了一种抗病毒药物,该药物含有猪SAMHD1蛋白质。
本发明的猪SAMHD1基因,具有猪SAMHD1基因的全基因序列,在MARC-145细胞中过表达猪SAMHD1蛋白,能明显抑制高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒增殖,说明猪SAMHD1蛋白具有抗病毒活性,适于研制抗病毒药物。利用本发明猪SAMHD1基因原核表达获得的重组可溶性猪SAMHD1蛋白,免疫小鼠后制备出与猪SAMHD1蛋白具有特异性反应的单克隆抗体,该单克隆抗体为进一步研究猪SAMHD1蛋白的特性与功能奠定了重要的基础。
附图说明
下面结合附图和具体实施方式对本发明作进一步详细的说明。
图1是本发明实施例1扩增猪SAMHD1基因序列的电泳结果图;
图2是本发明实施例2猪SAMHD1基因编码序列的扩增与重组蛋白的表达纯化结果图;
图3是本发明实施例2猪SAMHD1拮抗HP-PRRSV增殖的Western blot与病毒滴定结果图;
图4是本发明实施例4猪SAMHD1单抗ELISA效价鉴定图;
图5是本发明实施例5猪SAMHD1单克隆抗体特异性鉴定图。
本发明的单克隆抗体杂交瘤细胞系,已于2014年1月14日保藏于中国典型培养物保藏中心(简称CCTCC,地址:湖北省武汉市武昌珞珈山武汉大学保藏中心),保藏号为CCTCCNO.C201422,其分类命名为杂交瘤细胞株5M1。
具体实施方式
下列实施例中,未注明具体条件的实验方法,通常按常规条件,如《精编分子生物学实验指南》(F.M.奥斯伯,R.E.金斯顿,J.G.塞德曼等主编,马学军,舒跃龙的译.北京:科学出版社,2004)中所述的方法进行。
为了研制防控猪重大疫病的药物或生物制品,本发明采用RACE方法获得了猪SAMHD1全基因序列。在猪SAMHD1全基因序列基础上,扩增猪SAMHD1编码基因,将其插入p3×FLAG CMV7.1真核表达载体,在MARC-145细胞中表达猪SAMHD1,能够显著抑制高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的感染,说明本发明的猪SAMHD1蛋白具有抗病毒活性。将猪SAMHD1编码基因插入pcold TF DNA原核表达载体,诱导表达、纯化获得可溶性重组猪SAMHD1蛋白,免疫BALB/c小鼠后制备获得抗猪SAMHD1蛋白的单克隆抗体。本发明获得的单克隆抗体,与猪源细胞中SAMHD1蛋白具有较好的特异性反应,与人源、猴源SAMHD1蛋白反应特异性较差。
实施例1 采用RACE方法扩增获得猪SAMHD1全基因序列
通过对比GenBank中已提交的猪SAMHD1预测序列(Genbank ID:XM_003483952,XM_003361435,AK236802),设计一对引物扩增SAMHD1部分核酸序列,该对引物序列为s880-forward:5’-TCAAAGCAGACCCTTACAT-3’(SEQ ID NO.3),S880-reverse:5’-TTGCCTAATTCCTGTTTCT-3’(SEQIDNO.4)。结果扩增出长度约880bp的猪SAMHD1部分基因序列(见图1A)。序列测序、对比正确后,根据扩增出的880bp序列设计一对SAMHD1基因特异性引物,GSP1-forward:5’-AGATGCCTTCCTCAAAGCAGACCCT-3’(SEQ ID NO.5),GSP1-reverse:5’-TATGCCCTAAATTGATTGGGGGGGC-3’(SEQ ID NO.6),并在其内部设计一对长约220bp的内部套式引物,S220-forward:5’-GCTGAACTGAAGGCTGAA GAT-3’(SEQ ID NO.7),S220-forward:5’-AAACAGACTCTTTTCATCCGT-3’(SEQ ID NO.8),用于鉴定RACE PCR扩增序列的特异性。采用Clontech公司SMARTerTMRACE cDNA扩增试剂盒,利用基因特异性引物GSP扩增猪SAMHD1全基因序列。结果显示,5’PCR产物长度约2000bp(图1B),3’PCR产物长度约2700bp(图1C),PCR产物纯化后,连接pBlunt克隆载体,上海生工进行测序。通过序列拼接比对,获得猪SAMHD1全基因序列(SEQ ID NO.2)及其编码序列。序列分析表明,猪SAMHD1全基因序列含有3981个核苷酸,其中包含一个开放阅读框。开放阅读框位于第68位和1951位核苷酸之间,长度为1884个核苷酸,编码627个氨基酸(SEQ ID NO.1)。
实施例2 重组表达猪SAMHD1蛋白
根据实施例1扩增出的猪SAMHD1全基因序列,设计特异性引物,扩增SAMHD1编码序列,扩增编码基因的特异性引物如下,pcold-pig SAMHD1(pcold-pig SAMHD1-forward:5’-CCAAGCTTATGCAGAGTGCCGACTCC-3’(SEQ ID NO.9),pcold-pig SAMHD1-reverse:5’-CGGGATCCTCACACCGAGTCCTTTGCA-3’(SEQ ID NO.10)),其中上、下游引物分别含有Hind III和Bam HI限制性内切酶位点,pcold-pig SAMHD1引物扩增的SAMHD1编码序列,用于插入pcold TF DNA原核表达载体;pFLAG-pig SAMHD1(pFLAG-pig SAMHD1 forward:CAAGCTTATGCAGAGTGCCGACTCCCAGCAG(SEQ ID NO.11);pFLAG-pig SAMHD1 reverse:GCTCTAGATCACACCGAGTCCTTTGCAAA(SEQ ID NO.12)),pFLAG-pig SAMHD1引物扩增的SAMHD1编码序列,用于插入p3×FLAG CMV7.1真核表达载体。PCR扩增产物为1884bp的猪SAMHD1编码序列片段(见图2A,图2A中,M为DNA分子量标准DL2000;1为阴性对照,2为PCR扩增产物)。PCR产物经回收纯化、内切酶双酶切后,分别与pcold TF DNA原核表达载体和p3×FLAGCMV7.1真核表达载体连接,构建猪SAMHD1原核表达载体与猪SAMHD1真核表达载体,分别命名为pcold-pSAMHD1和pFLAG-pSAMHD1,阳性质粒经测序、酶切鉴定正确。
Pcold-pSAMHD1转化Rosseta感受态细胞。原核表达纯化重组猪SAMHD1蛋白程序如下:含有阳性质粒的菌液接种2×YT培养基,接种比例1:100,经37℃振荡摇菌至菌液OD值达到0.6后,加入IPTG至终浓度为0.5mM,16℃继续诱导5h。离心收集菌液并用PBS清洗2遍后,PBS重悬后,超声至菌液澄清,离心去除超声沉淀,上清与镍柱4℃作用过夜,按照说明书进行蛋白纯化。纯化蛋白以鼠抗His标签单克隆抗体进行Westernblot鉴定。SDA-PAGE与Weatern blot结果显示,原核表达纯化的重组蛋白大小约为130kDa,与预期蛋白大小相符(见图2B、2C)。图2B为pcoldTFDNA原核表达载体表达重组猪SAMHD1蛋白的SDA-PAGE电泳结果图,其中M为预染蛋白Marker;1为Pcold TF DNA空载体全菌;2为0.5mM IPTG诱导空载体全菌;3为IPTG未诱导重组质粒全菌;4为0.5mM IPTG诱导重组质粒全菌;5为0.5mMIPTG诱导表达菌液超声上清;6为0.5mM IPTG诱导表达菌液超声沉淀;7为纯化重组猪SAMHD1蛋白。图2C为鼠抗His标签单克隆抗体Western blot鉴定重组蛋白结果图,其中M为预染蛋白Marker;1为Pcold TF DNA空载体全菌;2为0.5mM IPTG诱导空质粒全菌;3为纯化重组猪SAMHD1蛋白。由这些实验结果可知,IPTG诱导pcold-pSAMHD1表达获得了可溶性重组猪SAMHD1蛋白,该可溶性重组蛋白可以作为制备后续单克隆抗体的免疫原。
pFLAG-pSAMHD1转染MARC-145细胞,获得瞬时表达重组猪SAMHD1蛋白的Marc-145细胞,该细胞中高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒增殖受到明显抑制。具体实验步骤如下:MARC-145细胞铺6孔板,3×105/孔。次日,2μg pFALG-pSAMHD1转染细胞。转染48h后,0.1MOI高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒HuN4株感染细胞。感染24后,分别收取细胞培养上清与细胞,分别进行病毒滴定与Western blot鉴定。结果显示,MARC-145细胞中过表达猪SAMHD1蛋白后,标签抗体检测到重组蛋白的表达,同时HP-PRRSV病毒增殖受到明显抑制(图3A)。上清中病毒滴度出现明显的下降,表明猪SAMHD1蛋白具有明显的抗病毒活性(图3B)。图3A为western blot检测猪SAMHD1抑制HP-PRRSV增殖的结果图,其中Anti-FLAG为FLAG标签抗体检测重组猪SAMHD1蛋白表达;Anti-N为PRRSV N蛋白单克隆抗体检测HP-PRRSV增殖;β-actin为内参对照。图3B为病毒滴度检测猪SAMHD1抑制HP-PRRSV在MARC-145细胞中增殖的结果图。
实施例3 猪SAMHD1鼠源单克隆抗体的制备
将实施例2原核表达纯化后的SAMHD1蛋白作为免疫原,免疫小鼠,用于制备单克隆抗体。选择8周龄BABL/c雌性小鼠,免疫原核表达纯化的猪SAMHD1蛋白。免疫剂量为第一次100微克蛋白,第二至四次分别免疫50微克,总体积为100ul,皮下多点注射,间隔两周。第一次免疫用弗氏完全佐剂乳化,SAMHD1蛋白与弗氏完全佐剂1:1比例混合,第二次免疫用弗氏不完全佐剂乳化,SAMHD1蛋白与弗氏不完全佐剂1:1比例混合,第三、四次免疫不加入佐剂,直接免疫重组SAMHD1蛋白。四次免疫后,眼眶采血,ELISA鉴定抗体效价。抗体效价达到一定水平后,取免疫鼠脾脏细胞与SP2/0细胞按5:1的比例融合,进行单克隆抗体制备。融合两周后,间接ELISA方法筛选阳性杂交瘤细胞,具体方法如下:
1、包被:纯化重组猪SAMHD1蛋白与Pcold TF DNA表达载体His标签蛋白分别包被ELISA酶标板,每孔包被量为1μg/100μL,4℃包被过夜。
2、洗涤:用含有0.5‰tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
3、封闭:5%脱脂乳37℃孵育2小时,200μL/孔。
4、洗涤:用含有0.5‰Tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
5、加细胞培养上清:细胞培养上清分别加入包被重组猪SAMHD1蛋白与His标签蛋白的酶标板,每孔50μL,37℃作用1小时。
6、洗涤:用含有0.5‰Tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
7、加入二抗:用PBS按1:10000倍稀释后,每孔50μL加入酶标板,37℃孵育40分钟。
8、洗涤:用含有0.5‰Tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
9、显色:每孔加入50μLTMB显色液,避光室温孵育10分钟。
10、终止:每孔加入50μL 2M H2SO4。
11、OD值检测:酶标仪测定OD450值。
经过重组猪SAMHD1蛋白与Pcold TF DNA载体标签蛋白双重ELISA筛选后,选取载体标签蛋白反应阴性、重组SAMHD1蛋白反应阳性的克隆,扩大培养后进行5次亚克隆,每次亚克隆后均进行双重ELISA筛选鉴定阳性克隆。5次亚克隆后,获得3株稳定分泌单克隆抗体的杂交瘤细胞株5M1、5M2、5M5。最终将一个优选的分泌单克隆抗体的杂交瘤细胞系于2014年1月14日保藏于中国典型培养物保藏中心(简称CCTCC,地址:湖北省武汉市武昌珞珈山武汉大学保藏中心),保藏号为CCTCC NO.C201422,其分类命名为杂交瘤细胞株5M1。筛选的阳性杂交瘤细胞经扩大培养,用于单抗腹水制备。
单抗腹水制备,具体步骤如下:选取8周龄BABL/c雌性小鼠,腹腔注射降植烷,200μL/只。免疫降植烷一周后,阳性杂交瘤细胞计数,基础DMEM培养基重悬,106/只接种小鼠腹腔。一周后观察小鼠腹部变化,若出现腹部胀大,即进行腹水采集,采集腹水,4,000rpm/min离心10min,上清分装-80℃保存。
实施例4 猪SAMHD1单抗ELISA效价鉴定
将实施例3制备的单抗腹水作为一抗,用间接ELISA方法检测腹水的ELISA效价,具体方法如下:
1、包被:纯化重组猪SAMHD1蛋白与Pcold TF DNA表达载体His标签蛋白分别包被ELISA酶标板,每孔包被量为1μg/100μL,4℃包被过夜。
2、洗涤:用含有0.5‰tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
3、封闭:5%脱脂乳37℃孵育2小时,200μL/孔。
4、洗涤:用含有0.5‰Tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
5、加入一抗:采用PBS将采集的腹水按照1:2000稀释后,分别加入包被重组猪SAMHD1蛋白与His标签蛋白的酶标板,每孔50μL,37℃作用1小时。
6、洗涤:用含有0.5‰Tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
7、加入二抗:用PBS按1:10000倍稀释后,每孔50μL加入酶标板,37℃孵育40分钟。
8、洗涤:用含有0.5‰Tween-20的PBST洗涤3次,200μL/孔。每次5分钟。
9、显色:每孔加入50μL TMB显色液,避光室温孵育10分钟。
10、终止:每孔加入50μL 2M H2SO4。
11、OD值检测:酶标仪测定OD450值。
结果如图4所示,实施例3制备的杂交瘤细胞免疫小鼠后获得的腹水效价最高为1:58。图4中,1、MAb为猪SAMHD1单克隆抗体;阳性血清为纯化猪SAMHD1重组蛋白免疫4周后BABL/c小鼠血清;阴性血清为未免疫BABL/c小鼠血清;His标签蛋白为pcold空载体诱导纯化后获得的标签蛋白。
实施例5
将实施例3中制备的单抗腹水,作为一抗,检测猪SAMHD1单克隆抗体的特异反应性。具体操作如下:
收取细胞样品:6孔细胞培养板中铺满猪肺泡原代巨噬细胞-PAM细胞、猪肾传代细胞系-PK-15细胞、非洲绿猴肾传代细胞-MARC-145细胞、幼仓鼠肾传代细胞-BHK-21细胞、人宫颈癌细胞-HeLa细胞、人肺癌细胞-A549细胞、人胶质瘤细胞-U251细胞,细胞总数为1×106。弃掉上清,预冷PBS洗涤两次后,加入200μL Thermo公司Thermo Scientific PierceCell Lysis buffer,冰浴5min后,收集细胞至1.5mL离心管中。4℃,12000rpm/min,离心10min,取上清转移至新管。用考马斯亮蓝法检测收集蛋白质浓度。按照4:1体积比混合5×样品缓冲液,煮沸10min后,-20℃保存备用。
Western blotting:20μg等量总蛋白上样进行SDS-PAGE电泳,电泳完毕后,采用伯乐半干转膜仪,电压15V,转印1h,将蛋白进行至硝酸纤维膜(NC膜)上。转印完毕后进行后续实验,具体操作如下:
封闭:用5%脱脂乳室温封闭NC膜1小时。
洗涤:用含有0.5‰Tween-20的TBST洗涤NC膜3次,每次5分钟。
加入一抗:实施例3中制备的单抗腹水,按照1:500-1000的比例稀释至含有5%BSA的TBST缓冲溶液中,室温作用1小时。
洗涤:用含有0.5‰Tween-20的TBST洗涤NC膜3次,每次5分钟。
加入二抗:中杉金桥公司HRP标记山羊抗小鼠IgG抗体,用TBST按1:5000倍稀释后加入,室温作用1h。
洗涤:用含有0.5‰Tween-20的TBST洗涤NC膜3次,每次5分钟。
显影:采用Thermo公司ECL发光试剂盒(货号:34080)进行曝光显影。
结果如图5所示,实施例3制备的猪SAMHD1单抗的的特异性好。图5中,1、PAM细胞为猪肺泡原代巨噬细胞;PK细胞为猪肾传代细胞;MARC-145细胞为非洲绿猴肾传代细胞;BHK-21细胞为幼仓鼠肾传代细胞;HeLa细胞为人宫颈癌细胞;A549细胞为人肺癌细胞;U251细胞为人胶质瘤细胞。
以上所述实施例仅表达了本发明的实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。
Claims (9)
1.一种猪SAMHD1基因,其特征在于,所述猪SAMHD1基因的序列是编码SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的猪SAMHD1基因,其特征在于,所述猪SAMHD1基因序列为SEQ IDNO.2所示的核苷酸序列。
3.一种猪SAMHD1蛋白质,其特征在于,所述猪SAMHD1蛋白质的氨基酸序列如SEQ IDNO.1所示。
4.一种重组载体,其特征在于,包含编码SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列,该序列置于pcold TF DNA原核表达载体或p3×FLAG CMV 7.1真核表达载体的Hind III和Bam HI两个内切酶位点之间。
5.一种宿主细胞,其特征在于,包含权利要求4所述的重组载体。
6.一种重组蛋白,其特征在于,该重组蛋白是由权利要求4所述重组载体经表达而制得。
7.一种抗猪SAMHD1蛋白的单克隆抗体,该抗体是由杂交瘤细胞系CCTCC NO.C201422分泌的单克隆抗体。
8.一种检测猪SAMHD1蛋白的试剂盒,其特征在于,包含权利要求7所述的单克隆抗体。
9.一种抗病毒药物,其特征在于,该药物含有权利要求3所述的猪SAMHD1蛋白质。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201410028266.7A CN104164442B (zh) | 2014-01-22 | 2014-01-22 | 猪samhd1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201410028266.7A CN104164442B (zh) | 2014-01-22 | 2014-01-22 | 猪samhd1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN104164442A CN104164442A (zh) | 2014-11-26 |
CN104164442B true CN104164442B (zh) | 2018-05-18 |
Family
ID=51908423
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201410028266.7A Expired - Fee Related CN104164442B (zh) | 2014-01-22 | 2014-01-22 | 猪samhd1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN104164442B (zh) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110408622A (zh) * | 2019-05-31 | 2019-11-05 | 中国农业科学院上海兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心上海分中心) | 抗猪irav蛋白的单克隆抗体及其应用 |
CN113846099B (zh) * | 2021-09-23 | 2022-04-22 | 中国农业科学院兰州兽医研究所 | 用于敲低猪SAMHD1基因表达的siRNA、试剂盒及其应用 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103060273A (zh) * | 2012-12-12 | 2013-04-24 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 | 分泌samhd1蛋白单克隆抗体的杂交瘤细胞株、由该细胞株分泌的单克隆抗体及应用 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1218408A4 (en) * | 1999-09-24 | 2003-02-26 | Human Genome Sciences Inc | 32 HUMAN, SECRETED PROTEINS |
-
2014
- 2014-01-22 CN CN201410028266.7A patent/CN104164442B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103060273A (zh) * | 2012-12-12 | 2013-04-24 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 | 分泌samhd1蛋白单克隆抗体的杂交瘤细胞株、由该细胞株分泌的单克隆抗体及应用 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
PREDICTED: Sus scrofa SAM domain and HD domain 1 (SAMHD1), partial mRNA;NCBI;《NCBI Reference Sequence: XM_003361435.2》;20130926;序列 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN104164442A (zh) | 2014-11-26 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN111153991A (zh) | 一种人SARS-CoV-2单克隆抗体及其制备方法和应用 | |
CN106397610A (zh) | 细粒棘球蚴多表位融合诊断抗原蛋白的制备方法及其应用 | |
CN105440132A (zh) | 抗猪流行性腹泻病毒n蛋白的单克隆抗体及其应用 | |
CN110133284A (zh) | 蛋白抗原及其编码基因和它们在鉴别猪肺炎支原体灭活疫苗抗体和自然感染抗体中的应用 | |
CN105695417B (zh) | 一株分泌牛支原体单克隆抗体的杂交瘤细胞株及其应用 | |
CN105646680B (zh) | 布鲁氏菌s2疫苗gl_0002181蛋白的应用 | |
CN113604438B (zh) | 一种抗罗非鱼湖病毒的单克隆抗体及其细胞株和应用 | |
CN104164442B (zh) | 猪samhd1基因、蛋白、单克隆抗体及其应用 | |
CN113980908B (zh) | 一种胸膜肺炎放线杆菌ApxIV蛋白单克隆抗体及其阻断ELISA试剂盒 | |
CN108956985B (zh) | 一种检测新型鹅星状病毒抗体的间接elisa检测试剂盒及应用 | |
CN103837684A (zh) | 快速检测沙门氏菌的抗体试剂及检测方法 | |
CN110016466A (zh) | 特异性检测蓝舌病病毒的单抗及其杂交瘤细胞株和应用 | |
CN112522210B (zh) | 一种分泌抗小反刍兽疫病毒单克隆抗体的杂交瘤细胞株及其单抗与应用 | |
CN105218668B (zh) | 马耳他型布氏杆菌的EF-Tu蛋白单克隆抗体MAb及其制备方法与应用 | |
CN118064473A (zh) | 一种大口黑鲈虹彩病毒lmbv主衣壳蛋白单克隆抗体的制备和应用 | |
CN118005778A (zh) | 一株阻断性非洲猪瘟病毒p30蛋白单克隆抗体杂交瘤细胞株的制备与应用 | |
CN114989266B (zh) | 一种非洲猪瘟病毒pA104R蛋白免疫抑制相关氨基酸位点及其应用 | |
CN105693831A (zh) | 家畜s2疫苗免疫与羊/牛种布鲁氏菌感染的ielisa检测试剂 | |
CN105524935B (zh) | 东方巴贝斯虫凝血酶素基因1及其编码的蛋白 | |
CN107163108B (zh) | 一种伪狂犬病病毒gE蛋白的抗原表位、抗体的制备及应用 | |
CN110893240B (zh) | Nme2基因在抑制禽呼肠病毒复制中的应用 | |
CN102229941B (zh) | 一种肝细胞癌相关蛋白hsp70的表达纯化方法 | |
CN105085638A (zh) | KSHV病毒vIRF4 DNA结合域、其多克隆抗体及制备方法 | |
Cai et al. | Localization in vivo and in vitro confirms EnApiAP2 protein encoded by ENH_00027130 as a nuclear protein in Eimeria necatrix | |
Farajnia et al. | Performance of protein N linear epitopes in serodiagnosis of COVID-19 infection |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20180518 |