CN103421780B - 猪脂肪组织特异性表达基因plin启动子及应用 - Google Patents
猪脂肪组织特异性表达基因plin启动子及应用 Download PDFInfo
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Abstract
本发明属于动物基因工程技术领域,具体涉及到猪的脂肪组织特异性表达基因plin不同长度启动子区域的分离鉴定和功能验证。从猪的基因组中克隆了脂肪组织特异性表达基因plin上游6个不同长度的启动子,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO:2-7所示;结果表明-130bp到-910bp和-435bp到-896bp有独立的启动活性。本发明同时公开了6个不同缺失启动子片段、相应重组表达载体的制备方法及双荧光素酶活性检测系统对启动子活性分析的应用。
Description
技术领域
本发明属于动物基因工程技术领域,具体涉及到猪中脂肪组织特异性表达基因plin的不同长度启动子区域的分离鉴定及功能验证。
背景技术
高等生物基因的表达受到细胞内外环境的精细调控,因而具有严格的时间及空间有序性。基因的表达调控是一个复杂且有序的过程,由多阶段调控水平共同完成,这主要包括转录前、转录、转录后、翻译、翻译后五个水平。其中转录水平的调控是最关键的环节。启动子是转录水平上一个重要的调控元件,是位于结构基因5′端上游区的DNA序列,可与众多的转录因子相互作用调控基因的表达(武力,1999)。因此深入研究启动子的结构、功能、作用模式等有利于我们更好的理解相应基因的功能及基因间的互作关系。
根据启动子作用方式及功能的不同可将启动子分为3类:组成型启动子、诱导型启动子和组织特异性启动子。组成型启动子是指在该类启动子的调控下,基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织部位表达水平没有明显差异。诱导型启动子是指在某些特定物理或化学信号的刺激下,该种类型启动子可以大幅度地提高基因的转录水平。组织特异性启动子是指在该类启动子的调控下,基因往往只在某些特定的器官或组织部位表达,并表现出发育调节的特征。
外源基因在机体中能否高效稳定地表达是基因工程研究的关键。在真核细胞中利用基因工程技术构建多种真核表达系统进行外源基因的表达已经是一项常用的技术,但是经常面临的问题是外源基因的表达量较低,且表达往往存在于机体的几乎所有组织中,如现阶段广泛利用的CMV及SV40启动子。两者均可以携带外源基因与几乎所有类型的细胞中高效地表达。这两种高效的启动子存在的问题是显而易见的:不具备调控基因靶向表达于某一特定组织的能力。能够解决此问题的关键乃是具备较高活性的组织特异性启动子的获得。组织特异性启动子通常以特定的组织细胞结构和化学、物理信号为基础,可对外源基因进行靶向定位,将基因固定于某一组织或细胞中表达,减少了机体能量和物质的损耗及对机体代谢活动的影响,同时又能够起到定向改善某一组织特性的效果,这在人类疾病的治疗方面的前景尤其可观。鉴于组织特异性启动具备这样的特质,在基因工程中越来越获得研究者的青睐。
组织特异性的启动子在动物机体中能够启动外源基因在特定的部位表达,保持特异性,这不仅克服了组成型启动子因外源基因过度广泛的表达而造成过度的浪费的缺点,并且能够促使外源基因在某些特定的部位高效且特异性表达,具有明显的时空特异性。
到目前为止对于组织特异性启动子的研究也有了一些成果,最早开始是在植物方面的一些研究,从植物中成功分离了一些组织特异性启动子,如:Sunikumar等人分离并且获得了棉花α球蛋白B基因启动子,将其同gus报告基因连接后,分别依次导入棉花、烟草和以及拟南芥中,经研究发现,报告基因仅表达于种子中,具有高度的组织特异性;(刘京鸽,2010);在植物方面组织特异性启动子的分离以后在植物的抗虫、抗病、培育优良品种方面将会得到广泛的应用。在动物方面的研究相对植物就滞后一点,但是还是有一定成效的,大部分还是出于对一些疾病的治疗。
在获得的这些组织特异性启动子的同时也存在一些问题,如:特异性并不是很高;分离并且获得应用的特异性启动子并不是很多,限制了在基因工程中的应用;分离出来的启动子活性很低等问题。我们想要提高组织特异性启动子活性可以从以下几个方面:(1)构建双启动子:有研究者构建了小鼠的SP启动子的基础上又加了CMV强启动子,将重新构建好的启动子称双启动子,结果发现通过构建双启动子的方法可以提高外源基因在C2C12细胞中的表达水平(章倩倩,2007)。(2)构建嵌合启动子:即将对同一组织有特异性的两个或两个以上不同的启动子或调控元件组合在一起。最常用的方法是不断地筛选多种组合的组织特异性元件,最后选出最理想的组合来使用。小鼠的骨骼肌α-肌动蛋白基因启动子,TEF-1、MEF-1、MEF-2寡核苷酸随机组合筛选出的活性最强的嵌合启动子SP启动子,可以将携带外源基因在骨骼肌中高效并且稳定的表达。
脂肪细胞脂解的过程是体内能量代谢的主要核心反应,即脂肪酶将甘油三酯水解的过程。脂滴核心为中性脂质,即胆固醇酯或甘油三酯等,外周围被单层的磷脂分子包被着,其中单层的磷脂中存在着一些与脂滴相关的蛋白,这些蛋白的存在对脂滴的代谢过程及其脂滴的调节过程起到举足轻重的作用(GreenbergA,et al.,1991)。有研究结果表明,在脂肪水解过程中脂酶会发生位置的变化,将从细胞液中转移到脂滴的表面,在整个脂解反应过程中脂滴表面所存在的脂滴包被蛋白起到了至关重要作用(赵小玲,朱庆脂,2006)。
最早发现plin是在大鼠的附睾脂肪细胞中所发现的,它是一种蛋白,存在于脂滴表面。因为plin参与脂解的过程,并在整个过程中发挥了很大作用,所以对plin研究越来越多,也逐渐成为研究脂解过程中的一个热点(Jang Y,et al.,2006)。PAT家族蛋白主要有ADRP、perilipin、TIP47和S3-12,该家族蛋白与脂滴的形成、成熟和脂肪的降解有关,调节脂滴内脂肪的动态平衡(Miura S,et al.,2002)。plin在脂肪细胞中能够特异性的表达,并且对脂解有双调节的作用,不仅可以调控脂解的效率而且还能够调控脂肪组织输出的甘油三酯的量(Miyoshi H,et al.,2006)。在基础的状态下,plin可以抑制脂解对脂肪酶起到屏障的作用,如果在能量要求需要增加的状况下,儿茶酚胺(脂解调节激素)可以促使plin中丝氨酸发生磷酸化作用,从而促进激素敏感脂肪酶(HSL)从胞液转位至脂滴表面来促进脂肪的分解(Liu BH,et al.,2005)。根据相关推测显示,plin在脂肪水解过程中以及调控过程中可能起到关键的开启作用。plin的表达过程中会受到一些因素的影响,如:肿瘤坏死因子、瘦素、PPARγ等(Londos C,et al.,2005)。ChiaH等研究发现当用血清淀粉样蛋白A蛋白(serum amyloid A protein,SAA)分化猪脂肪细胞时,plin表达下降,而SAA可替代载脂蛋白A1(apolipoprptein A1)作为HDL主要的载脂蛋白(Saha PK,et al.,2004)。众多研究证明plin在脂肪细胞脂解反应中起核心作用,对中性脂类的水解作用的激素调节是必需的,同时对于脂肪组织中脂肪的沉积也是必不可少的。
在脂肪分化过程受很多调控因子的影响,其中PPARγ是最重要的调节因子之一。它可直接与在脂肪组织特异性表达的基因相结合并将其激活进而来维持脂肪细胞的状态,在肌管细胞形成过程中,plin的表达量明显著提高,并且与PPARγ表达量是一致的,也确定了plin是PPARγ的靶蛋白之一(Yan W,Chen S,Huang J,Shen Y,Qiang B,Gu D,2004)。PPARγ的两种亚型PPARγ1和PPARγ2都可以提高perilipin基因启动子活性,但是有人认为只有PPARγ2是参与脂肪形成的重要因子。并且发现plin基因启动子转录被一个孤核受体—雌激素受体相关受体(estrogen receptor-related receptorα,ERRα)激活(Tansey JT,et al.,2001),通过检测报告基因的方法鉴定了启动子区域该受体的反应元件,同时可以通过PPARγ共激活子(peroxisome proliferator-actived receptorγcoactivator(PGC)-1α)增强活性(Tanaka NJ,Nakamura Y,1998)。
从目前在植物中及动物中获得的启动子分析发现,普遍存在以下几个方面的问题:特异性并不是很高;分离并且获得应用的特异性启动子并不是很多,限制了在基因工程中的应用;活性低。特别是在动物上的研究还比较欠缺。因此,获得特异性较强表达效率较高的启动子成为亟待解决的问题。
到目前为止,除申请人之外,仍没见到研究猪脂肪组织骨骼肌基因plin的启动子功能的报道。所以申请人对这个基因进行了不同长度启动子功能的研究,以期能够更好地利用该启动子。
发明内容
本发明的目的在于分离克隆猪的脂肪组织特异性表达基因plin启动子区域的不同片段,并对其进行功能验证,以期获得此基因的具备较高启动活性并保持脂肪组织特异性的调控区段。克服目前动物基因工程中可利用的组织特异性启动子数目的不足。
本发明从大白猪的基因组中分离并鉴定出plin基因具有脂肪组织特异性的启动子。以大白猪的血液基因组DNA为模板扩增获得了1691bp、1373bp、1097bp、780bp、316bp、461bp共6个不同长度的缺失启动子片段,将这些片段融合报告基因萤火虫荧光素酶基因(简称LUC基因)构建pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5、pGL3-basic-C46个真核表达载体,将这些载体分别转染C2C12、PK及3T3-L1细胞,通过双荧光素酶报告系统分析报告基因萤火虫荧光素酶的相对活性,从而获得保持脂肪组织特异性的核心启动子区。
本发明通过以下技术实现:
本发明的技术路线见图1所示。
利用BLASTn数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)搜索获得猪脂肪组织特异性基因plin的上游调控序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。利用TESS、TFSEARCH及MethPrimer生物信息学软件预测分析核心启动子区域、顺反式作用元件及CpG岛分布情况。根据预测结果设计5对缺失引物(其核苷酸序列见表1),利用PCR法从大白猪的基因组中分离获得脂肪组织特异性启动子。构建报告基因LUC融合载体,申请人将其分别命名为pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5其片段长度分别为1690bp、1440bp、1119bp、780bp、320bp,其核苷酸序列分别如下SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6所示。瞬时转染C2C12、PK及3T3-L1细胞,双荧光素酶报告系统检测发现pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5仅在3T3-L1细胞中表达,在其余两种细胞中的表达量同阴性对照pGL3-basic无显著性差异。pGL3-basic-Q4的活性在3T3-L1中有了极大的提高,同上述前5种载体的活性相比而言有极显著的差异,在PK细胞中并无明显变化。结果显示pGL3-basic-Q4的片段中间序列具备独立的启动报告基因表达的功能并同时保持着脂肪组织的表达特异性。但是pGL3-basic-Q4片段有780bp作为核心启动子区域有点长,根据这段序列存在的相关转录因子又对这一段进行了缺失,选择460bp为核心的启动子区域用pGL3-basic-C4表示,序列SEQ ID NO:7。瞬时转染C2C12、PK及3T3-L1细胞,双荧光素酶报告系统检测发现,在3T3-L1细胞中高量表达,比pGL3-basic-Q4表达量高,所以确定pGL3-basic-C4为核心启动区域。
本发明的具体步骤如下:
在前人研究的基础上选择具备猪脂肪组织特异性的表达基因plin,在美国国立生物研究所网站NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)的BLASTn数据库,搜索获得该基因的上游调控序列,其核苷酸序列如SEQID NO:1所示。利用TESS、TFSEARCH及MethPrimer等生物信息学软件对序列SEQ ID NO:1预测其核心启动子区域、顺反式作用元件及CpG岛分布情况。根据网络预测的结果设计缺失引物,以大白猪基因组DNA为模板,PCR扩增获得6个不同长度的启动子区域,序列分别如序列表SEQ ID NO:2-SEQ ID NO:7所示。将这些启动子候选片段装载到pGL3-basic报告基因LUC上游多克隆位点(载体图及多克隆位点等信息见图2)处,装配成融合表达载体(图3)。通过脂质体介导的转染法将融合表达载体瞬时转入C2C12、PK及3T3-L1细胞,同时转入海肾荧光素酶报告基因pRL-TK为内参质粒。本发明设置阴性对照pGL3-basic(图2),阳性对照pGL3-control。转染48h后通过双荧光素酶报告系统对报告基因LUC进行定量分析,进而考察验证该启动子的不同缺失片段在不同来源细胞中的启动功能。检测结果表明pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5、pGL3-basic-C4仅在3T3-L1细胞中表达,在其余两种细胞中的表达量同阴性对照pGL3-basic无显著性差异。pGL3-basic-C4的活性在3T3-L1中有了极大的提高,同上述前六种载体的活性相比而言有极显著的差异,在PK细胞中并无明显变化。结果显示460bppGL3-basic-C4的片段中间序列具备独立的启动报告基因表达的功能并同时保持着脂肪组织的表达特异性。
本发明的优点在于:
(1)本发明详尽的验证了plin启动子的各个区段在不同来源细胞中启动基因表达的能力,为plin基因的表达调控带来了更深层次的认知。
(2)本发明鉴定了猪脂肪组织特异表达的启动子plin的核心区段,为基因工程和分子育种提供了新的特异表达的启动子资源。
更详细的技术方案参见《具体实施方式》的内容。
附图说明
序列表SEQ ID NO:1,公开了本发明克隆的猪脂肪组织特异表达基因plin的上游调控核苷酸序列,长度为2000bp。
序列表SEQ ID NO:2是从所述的SEQ ID NO:1核苷酸序列克隆得到的一个缺失启动子pGL3-basic-Q1的核苷酸序列,长度为1691bp。
序列表SEQ ID NO:3是从所述的SEQ ID NO:1核苷酸序列克隆得到的一个缺失启动子pGL3-basic-Q2的核苷酸序列,长度为1373bp。
序列表SEQ ID NO:4是从所述的SEQ ID NO:1核苷酸序列克隆得到的一个缺失启动子pGL3-basic-Q3的核苷酸序列,长度为1097bp。
序列表SEQ ID NO:5是从所述的SEQ ID NO:1核苷酸序列克隆得到的一个缺失启动子pGL3-basic-Q4的核苷酸序列,长度为780bp。
序列表SEQ ID NO:6是从所述的SEQ ID NO:1核苷酸序列克隆得到的一个缺失启动子pGL3-basic-Q5的核苷酸序列,长度为316bp。
序列表SEQ ID NO:7是从所述的SEQ ID NO:1核苷酸序列克隆得到的一个缺失启动子pGL3-basic–C4的核苷酸序列,长度为461bp。
图1:本发明的技术路线图。
图2:表示载体pGL3-basic结构示意图,在多克隆位点的下方包含报告基因luc+。
图3:构建好的以pGL3-basic为骨架的融合载体简图。脂肪组织特异表达基因plin的启动子系列缺失片段来驱动LUC基因表达,由图中的deleted promoter来表示。Amp为氨苄抗性筛选基因;luc+为报告基因萤火虫荧光素酶;MCS表示多克隆位点;箭头方向表示基因或启动子表达的方向。
图4:融合载体pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5、pGL3-basic-C4的KpnⅠ和NheⅠ双酶切鉴定图。M表示DL marker2000,1-6分别表示融合载体pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5、pGL3-basic-C4的双酶切结果,上面较大的条带为载体条带,下端为缺失启动子条带,条带长度分别为1691bp、1373bp、1097bp、780bp、316bp、461bp。
图5:由猪脂肪组织特异表达基因plin的系列缺失启动子驱动LUC基因在不同来源的细胞中的表达情况,其中图5A是pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5双酶切图;图5B是pGL3-basic-C4双酶切图。
具体实施方式
实施例1:大白猪基因组DNA的提取及猪的脂肪组织特异性表达基因plin的启动子候选片段及相应缺失片段的获得
1、大白猪基因组DNA的提取:
将现场所采大白猪(来自华中农业大学精品猪场,为常规报道的品种,下同)新鲜血液加入0.5M乙二胺四乙酸(即EDTA,购自武汉市江润精细化工有限责任公司)作为抗凝剂(按血液量体积比的1/10),并摇匀,防止凝血。
白细胞分离:
(1)4℃,6000rpm,离心10min,去血清。
(2)加入2倍体积双蒸水,轻轻摇匀沉淀10min,破碎红细胞。
(3)4℃,6000rpm,离心10min,去上层红细胞浆。
(4)利用0.9%NaCl洗涤沉淀,轻轻摇匀10min。
(5)4℃,6000rpm,离心10min,弃上清,得到白细胞沉淀。
总DNA提取:
(1)在白细胞沉淀或肌肉组织磨碎浆液中,加入等体积1×SET(1ml),蛋白酶K(10mg/mL)至终浓度100μg/mL,10%十二烷基硫酸钠(SDS)至终浓度0.5%,摇匀,55℃水浴摇床中温育过夜消化。
(2)在消化液中加入等体积的Tris饱和酚,轻轻摇匀15min,于4℃、11000rpm离心10min,小心吸取上清液转移至另一离心管中,注意标上相应的记号。
(3)加等体积的苯酚/氯仿/异戊醇(体积比25:24:1),缓慢颠倒离心管10min,于低温冷冻离心机中4℃、11000rpm离心10min,小心吸取上清,转移至另一个干净的离心管中。
(4)加入等体积的氯仿/异戊醇(体积比24:1),缓慢颠倒离心管10min,于低温冷冻离心机中4℃、11000rpm离心10min。
(5)将上清液吸入标记好的的离心管中,加入2倍体积的预冷无水乙醇,小心混匀后可见白色絮状DNA沉淀。
(6)用枪头将DNA沉淀挑出,置于装有对应号码的EP管中,室温下让乙醇挥发干净,加入适量的超纯水溶解DNA。
(7)在DNA浓度测定仪上测定其浓度与纯度,并在1%琼脂糖凝胶80伏电泳约2h,紫外灯下检测DNA提取质量。
2、猪的脂肪组织特异性表达基因plin缺失片段的获得
利用报道的猪的plin基因的DNA序列(GenBank登录号:654411)为探针序列,在NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)选择第一外显子ATG上游2000bp的序列作为启动子候选片段。利用TESS、TFSEARCH及MethPrimer等生物信息学软件预测此段候选序列的核心启动子区域、顺反式作用元件及CpG岛分布情况。根据网络预测的结果设计缺失引物(引物序列如表1所示;PCR反应参数设置如表2所示)。其中P1F/R、P2F/R、P3F/R、P4FR、P5F/R、P6F/R依次代表构建的6个5’端缺失载体的前向引物(正向引物)和后向引物(反向引物),前向引物添加酶切位点NheⅠ(GCTAGC,以下划线表示),同时携带保护性碱基CTA(阴影表示);后向引物添加的酶切位点为KpnⅠ(GGTACC,以下划线表示),同时携带保护性碱基CGG(以阴影区表示);将载体分别命名为TA-Q1、TA-Q2、TA-Q3、TA-Q4、TA-Q5、TA-Q6。
表1:启动子缺失载体引物的设计
表2PCR扩增参数
实施例2:猪的脂肪组织特异性表达基因plin的启动子候选片段及相应缺失片段的转染载体构建。
将实施例1获得的猪脂肪组织特异性表达基因plin缺失片段与载体pGL3-basic连接,酶切载体(载体pGL3-basic,购自普洛麦格(北京)生物技术有限公司)及缺失片段的TA克隆质粒TA-Q1、TA-Q2、TA-Q3、TA-Q4、TA-Q5、TA-Q6。用KpnⅠ、NheⅠ双酶切pGL3-basic及TA-Q1、TA-Q2、TA-Q3、TA-Q4、TA-Q5、TA-Q6(载体pGL3-basic的多克隆位点等信息见图2)。酶切体系如表3所示:
表3酶切体系
37°C酶切2h后用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测酶切的完整性并回收目的片段:pGL3-basic回收较大的片段,TA-Q1、TA-Q2、TA-Q3、TA-Q4、TA-Q5、TA-Q6回收相应大小的缺失片段。用上海莱枫生物基因技术有限责任公司生产的胶回收试剂盒回收(按该试剂盒的说明书操作),置于-20℃冰箱保存。
(2)将酶切回收的缺失片段连接到pGL3-basic载体上(见图3)
连接体系如表4所示:
表4连接体系
16°C水浴连接12h后,将其转入大肠杆菌DH5α中,在含氨苄青霉素(Amp)的LB平板上筛选阳性单克隆,对重组子进行PCR及酶切鉴定,将阳性重组子挑出送北京奥科鼎盛生物科技有限公司测序。对于测序正确的阳性克隆按原菌液:培养基体积比=1:100的比例进行扩大培养,37°C摇床摇16h后用OMEGA公司生产的可用于细胞转染的质粒小量抽提试剂盒(D6950-01)抽提质粒,分别命名为pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5、pGL3-basic-C4。用KpnⅠ、NheⅠ双酶切鉴定抽提的质粒,酶切体系如上所述,此时质粒只需加1μL酶切结果见图4。用核酸-蛋白质浓度测定仪(美国Beckman公司产品)测定质粒的浓度,置于-20℃冰箱备用。
实施例3:脂质体介导的细胞转染
本发明用24孔细胞培养皿做转染用。为了消除实验的误差,每个重组载体均进行三轮独立的试验,每次试验做三个复孔。根据LipofectamineTM2000(invitrogen公司)说明书,每孔按载体的质量:脂质体的体积=1μg:3μL的比例转染。转染的受体为不同来源的细胞,主要包括小鼠肌源细胞系C2C12、猪肾细胞PK及3T3-L1细胞。重组载体转染入细胞48h后收集细胞裂解液后利用双荧光素酶检测系统对缺失启动子的活性进行分析。本发明的细胞培养、诱导分化、转染的主要步骤及各种溶液的配制如下所述:
(1)主要溶液的配制
1)细胞生长液(10%浓度的胎牛血清培养基FBS):将胎牛血清(购自GIBCO BRL公司)放置于4℃冰箱融化,待其完全融化后,用50mL的注射器吸取100mL的已过滤的胎牛血清,加入100U/mL青霉素、100μg/mL链霉素,DMEM/F12培养基(购自invitrogen公司),定容至1L,分装置于4℃冰箱备用。
2)细胞消化液:胰酶2.5g、Na2HPO4 1.15g、KCl 0.2g、NaCl 8.0g、KH2PO4 0.2g,溶于900mL双蒸水中,待完全溶解后,定容至1L,0.22μm滤膜过滤除菌,分装后置于-20℃冰箱中备用。
3)平衡盐溶液PBS:2.89g的Na2HPO4、0.2g的KCl、0.2g的K2HPO4、8g NaCl加入800mL双蒸水,充分溶解后定容至1L,高压灭菌后室温放置待用。
4)细胞冻存液:分别吸取1.50mL的二甲基亚砜(DMSO)、6.00mL的胎牛血清培养基(FBS)和7.50mL的DMEM(购自invitrogen公司),充分混匀后,以每管1.50mL的量分装置于-20℃冰箱中备用。
(2)细胞培养
1)根据细胞的生长状况及时更换培养液:当细胞培养液变黄时应更换培养液,吸出旧的培养液,加入新鲜的培养液,一般是24h更换一次。
2)细胞生长至80%的汇合度后进行传代,吸管吸出旧的培养基,用1×磷酸缓冲液(PBS)(购自invitrogen公司)冲洗两次。
3)预先将0.25%胰蛋白酶置于37℃培养箱温浴几分钟以减少对细胞的伤害。50cm2细胞培养瓶加入1mL消化液(购于invitrogen公司)即可,快速的前后旋转细胞瓶以便胰蛋白酶可以覆盖所有细胞,然后置于培养箱中约1min,加速胰蛋白酶的消化。
4)待细胞附着松动,快速的向培养瓶中加入新鲜的10%浓度的FBS细胞生长液(购自杭州四季青生物有限公司)终止胰蛋白酶的作用。
5)用吸管反复吹打瓶壁细胞,使之瓶完全从壁上脱离形成细胞悬液。
6)各吸出1/3的细胞悬液移入新的细胞瓶中,补充新的细胞生长液,使每瓶终体积达到4mL。
(3)脂质体介导的细胞转染步骤
1)转染前一天,取一瓶生长状况良好的细胞用胰蛋白酶消化后,加入2mL新鲜的不含任何抗生素的10%的FBS细胞生长培养液,用吸管将细胞完全吹散形成均匀的细胞悬液后,用细胞计数板对细胞进行计数。计算出24孔细胞培养板共需细胞量(每孔细胞数目约为0.5-2×105),然后吸出共需的悬液,向其内加入额外的新鲜的不含任何抗生素的10%的FBS细胞生长培养液(总体积12mL),吹打均匀后,每孔分装500μL细胞悬液,轻轻晃动培养板摇匀细胞后置于37℃,5%CO2细胞培养箱中培养24h。
2)对于每孔待转染的细胞:根据待转染质粒的浓度及每孔待转染质粒的量1μg取适量的质粒加入到50μLOPTI-MEM培养液(购自invitrogen公司,按该试剂的说明书操作)中,轻轻吹打混合均匀后室温静置5min;以质粒量:LipofectamineTM2000的体积量为1:2.5的情况下,取2.5μL的LipofectamineTM2000加入到50μLOPTI-MEM培养液中,混合均匀后室温静置5min。
3)将步骤2)中的两份混合液在30min内混合均匀,室温静置20min。
4)弃原培养液,用1×PBS或OPTI-MEM培养液清洗细胞两次,并将清洗液吸净。
5)每孔细胞加入3)中混合液100μL后补足OPTI-MEM培养液至总体积为500μL,以前后左右十字交叉的姿势晃动培养板以混合均匀。
6)37℃,5%CO2细胞培养箱培养6h后更换成不含任何抗生素的10%的FBS细胞生长培养液
实施例4:猪脂肪组织特异性表达基因plin的启动子候选片段及相应缺失片段的双荧光酶活性的检测本实验施例设置阴性对照质粒pGL3-basic,阳性对照质粒pGL3-control,以海肾荧光素酶报告基因PRL-TK(载体购自普洛麦格(北京)生物技术有限公司,即美国Promega公司)做内参质粒(用以校正转染效率),以LipofectamineTM2000做转染试剂,在24孔的细胞培养皿中按每孔载体的质量:脂质体的体积=1μg:3μL的比例将构建的缺失载体分别瞬时转染小鼠肌源细胞系C2C12、猪肾细胞PK、小鼠前脂肪细胞系3T3-L1(简称:3T3-L1,购自湖北省疾病预防控制中心),以空转染做对照,转染细胞48h后收集细胞裂解液,利用双荧光素酶报告基因检测试系统对猪脂肪组织特异性表达基因plin的启动子不同缺失片段的活性及组织特异性进行分析,确定高活性并具备脂肪组织表达特异性的区段。结果表明(见图5所示):在三种不同的细胞中,构建的6缺失载体pGL3-basic-Q1、pGL3-basic-Q2、pGL3-basic-Q3、pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-Q5、pGL3-basic-C4在PK细胞和3T3-L1中的活性很低同阴性对照pGL3-basic相比并无明显的差异,在C2C12细胞中pGL3-basic-Q4、pGL3-basic-C4活性很高,其中pGL3-basic-C4的活性最高。本发明的结果最终获得460bp的启动子片段(即构建的重组表达载体pGL3-basic-C4,序列信息见SEQ ID NO:7,具备独立的启动功能兼具脂肪组织特异性。
参考文献:
1.武力.病毒编码的启动子和增强子研究进展.国外医学:微生物学分册,1999.
2.刘京鸽.猪肌肉组织骨骼肌特异性基因α-actin启动子的克隆及功能验证.[硕士学位论文].武汉:华中农业大学图书馆,2010,中国知网(http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10504-1011405476.htm).
3.章倩倩.CMV与SP双启动子增强外源基因在小鼠骨骼肌组织中的表达效率.[硕士学位论文].吉林:吉林大学,2007,中国知网(http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10183-2007095145.htm).
4.赵小玲,朱庆脂.滴磷蛋白perilipin及其与脂质代谢调控的关系.中国畜牧兽医学会2006:176-179.
5.Greenberg A et al.,A major hormonally regulated adipocyte-specifc phosphoprotein associated with theperiphery of lipid storage droplets.J Biol Chem,1991,26:11341-11346.
6.Jang Y,Kim OY,Lee SJ,Chae JS,Park S,Cho H et al..Genetic variation at the.perilipin locus is associatedwith changes in serum free fatty acids and abdominal fat following mild weight loss.Int J Obes Relat MetabDisord,2006,30:1601-1608.
7.Londos C,Sztalryd C,Tansey JT,Kimmel AR.Role of PAT proteins in lipid metabolism.Biochimie,2005,87:45-49.
8.Miura S,Gan JW,Brzostowski J,Parisi MJ,Schultz CJ,Londos C,Oliver B,Kimmel AR.Functional,conservation for lipid storage droplet association among perilipin,ADRP,and TIP47in mammals,drosophila,and dictyostelium.J Biol Chem,2002,277:32253-32257.
9.Miyoshi H,Souza SC,Zhang HH,Strissel KJ,Christoffolete MA,Kovsan J,Rudich A,Kraemer FB,BiancoAC,Obin MS,Greenberg AS.Perilipin promotes hormone-sensitive lipase-mediated adipocyte lipolysis viaphosphorylation-dependent and-independent mechanisms.J Biol Chem,2006,281:15837-15844.
10.Tanaka NJ,Nakamura Y.Isolation and chromosomal mapping of the human homolog of perilipin(PLIN),arat adipose tissue-specific gene,by differential display method.Genomics,1998,48:254-257.
11.Tansey JT,Sztalryd C,Gruia-Gray J,Roush DL,Zee JV,Gavrilova O,Reitman ML,Deng CX,Li C,Kimmel AR,Londos C.Perilipin ablation results in a lean mouse with aberrant adipocyte lipolysis,enhancedleptin production,and resistance to diet-induced obesity.Proc Natl Acad Sci,2001,98:6494-6499.
12.Yan W,Chen S,Huang J,Shen Y,Qiang B,Gu D.Polymorphisms in PLIN and hypertension combined withobesity and lipid profiles in Han Chinese.Obes Res,2004,12:1733-1737.
13.Liu BH,Kuo CF,Wang YC,Ding ST.Effect of docosahexaenoic acid and arachidonic acid on theexpression of adipocyte determination and differentiation-dependent factor 1 in differentiating porcineadipocytes.J Anim Sci,2005,83:1516-1525.
14.Saha PK,Kojima H,Martinez Botas J,Sunehag AL,Chan L.Metabolic adaptions in the absence of perilipin.J Biol Chem,2004,279:35150-35158.
Claims (4)
1.一个调控猪脂肪组织特异表达基因plin的启动子,其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:5所示。
2.一个调控猪脂肪组织特异表达基因plin的启动子,其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:7所示。
3.权利要求1或2所述的启动子在猪遗传改良中的应用。
4.权利要求3的应用,其中包括调控猪脂肪组织特异表达中的应用。
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