[go: up one dir, main page]

CN101792745B - 流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构 - Google Patents

流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构 Download PDF

Info

Publication number
CN101792745B
CN101792745B CN200910077937.8A CN200910077937A CN101792745B CN 101792745 B CN101792745 B CN 101792745B CN 200910077937 A CN200910077937 A CN 200910077937A CN 101792745 B CN101792745 B CN 101792745B
Authority
CN
China
Prior art keywords
atomic
influenza virus
glu
amino
arg
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN200910077937.8A
Other languages
English (en)
Other versions
CN101792745A (zh
Inventor
刘迎芳
饶子和
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institute of Biophysics of CAS
Original Assignee
Institute of Biophysics of CAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institute of Biophysics of CAS filed Critical Institute of Biophysics of CAS
Priority to CN200910077937.8A priority Critical patent/CN101792745B/zh
Priority to PCT/CN2010/070500 priority patent/WO2010088857A1/zh
Priority to US13/254,823 priority patent/US9017960B2/en
Priority to EP10738213.7A priority patent/EP2402365B1/en
Publication of CN101792745A publication Critical patent/CN101792745A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN101792745B publication Critical patent/CN101792745B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1241—Nucleotidyltransferases (2.7.7)
    • C12N9/127—RNA-directed RNA polymerase (2.7.7.48), i.e. RNA replicase
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B15/00—ICT specially adapted for analysing two-dimensional or three-dimensional molecular structures, e.g. structural or functional relations or structure alignment
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B15/00—ICT specially adapted for analysing two-dimensional or three-dimensional molecular structures, e.g. structural or functional relations or structure alignment
    • G16B15/20—Protein or domain folding
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B35/00—ICT specially adapted for in silico combinatorial libraries of nucleic acids, proteins or peptides
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/50—Molecular design, e.g. of drugs
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/60—In silico combinatorial chemistry
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2299/00—Coordinates from 3D structures of peptides, e.g. proteins or enzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2760/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses negative-sense
    • C12N2760/00011—Details
    • C12N2760/16011—Orthomyxoviridae
    • C12N2760/16111—Influenzavirus A, i.e. influenza A virus
    • C12N2760/16122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2760/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses negative-sense
    • C12N2760/00011—Details
    • C12N2760/16011—Orthomyxoviridae
    • C12N2760/16211—Influenzavirus B, i.e. influenza B virus
    • C12N2760/16222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2760/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses negative-sense
    • C12N2760/00011—Details
    • C12N2760/16011—Orthomyxoviridae
    • C12N2760/16311—Influenzavirus C, i.e. influenza C virus
    • C12N2760/16322—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Computing Systems (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Library & Information Science (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Pulmonology (AREA)

Abstract

本发明提供一种流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的晶体三维结构，其中所述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N为所述流感病毒聚合酶亚基PA的从约1～约50位氨基酸至在约150至300位范围内的氨基酸，其中所述晶体三维结构中的原子具有表1中所列的至少40％的原子坐标，或者流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端的晶体三维结构中至少40％氨基酸的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。本发明还提供对流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的表达、纯化和结晶的方法；以及PA氨基端PA_N的晶体结构及晶体结构在药物筛选及药物设计方面的应用。

Description

流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽的表达纯化及PA氨基端多肽的晶体结构
技术领域
本发明涉及流感病毒聚合酶亚基PA氨基端前256位氨基端多肽在细菌中的表达、纯化、结晶方法以及PA氨基端前256位氨基端多肽的三维晶体结构(PA_N)及其在药物筛选及药物设计方面的应用。 
背景技术
近年来，由H5N1亚型禽流感病毒引起的疫情广泛传播，对人类的健康造成全球性的重大威胁。由于病毒的不断变异，开发新型抗流感药物成为各国极为迫切的重大任务。其中，揭示与流感病毒密切相关的蛋白质的三维结构不仅对揭示流感病毒复制机制具有重要的科学意义，而且对开发抗流感病毒药物具有重要价值。 
流感病毒基因组含有8个RNA片段，已知可以编码11种病毒蛋白质。其中，由PA、PB1和PB2等3个亚基组成的聚合酶复合体是负责病毒基因组RNA复制以及病毒mRNA转录的主要组分和维持病毒生命周期的至关重要的分子机器，同时由于它的高度保守性、低突变率，使之成为抗流感病毒药物设计潜在的重要靶点。多年来的研究结果认为，PB1是病毒RNA聚合酶的催化亚基，负责病毒RNA的复制以及转录；PB2是负责以一种称为“Snatch”的方式夺取宿主mRNA的CAP帽子结构，用于病毒mRNA转录。而相对于其它两种亚基来说，PA是了解得最不清楚的蛋白。根据已有 的大量报导，PA亚基被发现不但参与病毒复制过程，而且还参与病毒RNA转录、内切核酸酶活性、具有蛋白酶活性以及参与病毒粒子组装等多种病毒活动过程，但是其参与这些活性的分子机制却并不清楚，因而在整个聚合酶复合体的研究中对于PA亚基的结构研究显得格外重要和突出。蛋白质结构的解析对揭示蛋白质功能具有重大作用。这一复合体结构的揭示也将对该复合体功能研究具有重大意义。但是，长期以来，由于存在的种种困难，该蛋白复合体结构一直没有得到解析。 
本申请人在分别于2008年2月22日和2008年5月2日提交的中国专利申请CN 200810100840.X和CN 200810083994.2中公开了本发明人解析的来源于禽流感病毒聚合酶复合体中的PA羧基端含有460个氨基酸残基的多肽与PB1氨基端含1-25个氨基酸残基的短肽的复合体结构，并在2008年8月报道了本发明人解析的来源于禽流感病毒聚合酶复合体中的PA羧基端含有460氨基酸残基的多肽与PB1氨基端含1-25个氨基酸残基的短肽的复合体结构(He X et al.Nature，Aug 2008，454(7208)：1123-6)。 
为了获得更完整的由PA、PB1和PB2等3个亚基组成的聚合酶复合体的三维晶体结构，本发明人又进行了以下研究。 
发明内容
在上述研究的基础上，本发明人又通过X射线衍射晶体学方法解析了PA亚基剩余的氨基端部分的三维晶体结构(PA_N)。 
本发明的一个方面提供了一种流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的晶体三维结构，其中所述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N为所述流感病毒聚合酶亚基PA的从约1～约50位氨基酸至 在约150至300位范围内的氨基酸，其中所述晶体三维结构中的原子具有表1中所列的至少40％的原子坐标，或者流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端的晶体三维结构中至少40％氨基酸的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
优选地，其中所述流感病毒选自A、B、C型流感病毒，其中所述流感病毒优先选自A型流感病毒株：A/goose/Guangdong/1/96、A/Brevig Mission/1/1918；B型流感病毒株：B/Ann Arbor/1/1966或C型流感病毒株：C/JJ/1950。 
优选地，其中所述的母体晶体具有P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°，重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°。 
优选地，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N由所述流感病毒聚合酶PA的氨基端PA_N中的α螺旋1，即含2-9位的氨基酸区段，α螺旋2，即含11-22位的氨基酸区段，α螺旋3，即含32-48位的氨基酸区段，α螺旋4，即含84-92的氨基酸区段，α螺旋5，即含127-138位的氨基酸区段，α螺旋6，即含165-184位的氨基酸区段，α螺旋7，即含187-191位的氨基酸区段，以及五个主要的β折叠片，包括β片1，即含76-78位的氨基酸区段，β片2，即含109-111位的氨基酸区段，β片3，即含116-123位的氨基酸区段，β片4，即含144-149位的氨基酸区段，β片5，即含154-157位的氨基酸区段，共同构成所述PA的氨基端PA_N的主要部分，其中，由所述的平行的β片1-5组成一个扭曲的平面，其它所述的α螺旋围绕在这一平面周围，其中所述B型或C型流感病毒中与A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
优选地，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中结合有一个选自镁、锰、锌、铜、钴、铁构成的组中的金属离子，该金属离子主要由三个水分子以及氨基酸残基Glu80以及Asp108至少之一提供配位，其中参与这一结合的氨基酸还有选自His41、Glu119、Leu106以及Pro107中的至少之一，其中所述B型或C型流感病毒中的与A型流感病毒相应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，更优选地，其中所述金属离子为镁离子。 
优选地，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N含有一个与其它内切核酸酶相似的(P)DXN(D/E)XK序列区域，其中在所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中各氨基酸可以代表如下：P107D108X(11)E119X(15)K134，其中所述B型或C型流感病毒中与A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
优选地，其中T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172位于β片层β4以及α7之间的序列中，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
优选地，其中至少二个，优选至少三个选自由流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中的Arg179、Asp189、Arg192、Gln193和Glu126等构成的组中的氨基酸位于一个临近的区域，参与与蛋白质或核苷酸的相互作用，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
优选地，其中所述A型流感病毒聚合酶亚基PA位于PA氨基端PA_N的所述α螺旋1以及α螺旋2形成一个发夹状结构，其中一些氨基酸残基共同组成一个邻近的带电荷的表面，包括氨基酸残 基Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
本发明的第二方面提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中的至少二个，优选至少三个选自Glu80、Asp108、His41、Glu119、Leu106以及Pro107等构成的氨基酸组中的成员结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述流感病毒选自A、B、C型流感病毒，其中所述流感病毒优先选自A型流感病毒株：A/goose/Guangdong/1/96、A/Brevig Mission/1/1918；B型流感病毒株：B/Ann Arbor/1/1966或C型流感病毒株：C/JJ/1950，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与Glu80、Asp108、His41、Glu119、Leu106以及Pro107中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
本发明的第三方面提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中由Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29构成的组中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29构成的组中的氨基酸中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
本发明的第四方面提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中由Arg179、Asp189、Arg192、Gln193和Glu126构成的组中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与Arg179、Asp189、Arg192、Gln193和Glu126构成的组中的氨基酸中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
本发明的第五方面提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中由T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172构成的组中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172构成的组中的氨基酸中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
本发明的第六方面提供了一种包含上述与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物的组合物，可选地包括载体或赋形剂。 
本发明的第七方面提供了上述组合物在制备治疗由流感病毒引起的疾病的药物中的应用。 
本发明的第八方面提供了上述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构在设计和筛选用于治疗流感病毒感染引起的疾病的各种多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物中的应用，包括： 
根据蛋白质三维结构坐标，通过计算机模拟来设计结合特定部位的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子； 
根据蛋白质三维结构坐标，通过计算机模拟来寻找可能结合特定部位的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子； 
将根据蛋白质三维结构坐标，设计或寻找的多肽、蛋白质或无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子结合到含有与所述的PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白中，进而分析结合情况； 
根据蛋白质三维结构坐标，设计或寻找的多肽、蛋白质或无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子结合到含有与所述PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白中并结晶，从而通过晶体衍射分析三维结构的方法分析多肽及化合物分子与蛋白的结合情况； 
其中与所述PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白结合的所述多肽、蛋白质或无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子即为候选化合物。 
本发明的第九方面提供了任一亚型的流感病毒聚合酶的三个亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的结构，其中所 包含的一个蛋白质或其某一区段，与所述PA_N蛋白质具有至少40％的相同序列。 
本发明的第十方面提供了任一亚型的流感病毒聚合酶亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的三维立体结构，其中所包含的一个蛋白质或其某一区段的主链三维结构坐标，与所述的PA_N蛋白质具有与所述PA_N蛋白质序列至少40％的主链碳骨架的原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃。 
本发明的第十一方面提供了一种多肽或者小分子，其特征在于与所述流感病毒PA亚基上的任一氨基酸有相互作用。 
本发明的第十二方面提供了上述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构在药物筛选及药物设计方面的应用。 
本发明的第十三方面提供了基于流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N蛋白质三维结构筛选与蛋白质结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物的方法，包括：通过蛋白结晶方法获得含有PA_N的晶体，或者获得含有PA_N蛋白质晶体的三维结构坐标；其中所述三维结构包括任何与该坐标中至少含有40％氨基酸残基的主链碳骨架原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃的结构。 
本发明的第十四方面提供了基于流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N蛋白质三维结构筛选与蛋白质结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物的方法，包括：使用的三维分子组合具有上述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构或与上述的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物结合的所述氨基酸残基的组中的至少3个具有主链碳骨架原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃的结构在筛选多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物上的应用。
附图说明
图1为基于来自三种不同类型的流感病毒的PA蛋白氨基N末端的序列对比。其中，A_1996为来自禽流感A型病毒病毒株为A/goose/Guangdong/1/96的PA蛋白氨基N末端的序列；A_1918为1918年欧洲爆发的大范围流感并造成重大人类死亡事件的A型流感病毒株A/Brevig Mission/1/1918 A型流感病毒PA蛋白氨基N末端的序列；B_1966为来自1966 Ann abor的流感B型病毒B/AnnArbor/1/1966的PA蛋白氨基N末端的序列；C_1950为来自1950的一种流感C型病毒C/JJ/1950的PA蛋白氨基N末端的序列；这一结果表明流感病毒聚合酶亚基PA蛋白含有高度保守的氨基酸残基。图中用....表示在相应的区段的氨基酸缺失，在说明书以及权利要求书中具体的氨基酸位置均是以A_1996为例说明的，其中A_1996与图4中的A_OURS是相同的来自禽流感A型病毒病毒株为A/goose/Guangdong/1/96的PA蛋白氨基N末端的序列，而图4中的A_OURS为来自禽流感A型病毒病毒株为A/goose/Guangdong/1/96的PA蛋白氨基C末端的序列。 
图2为A_1996表示的禽流感A型病毒病毒株为A/goose/Guangdong/1/96的PA蛋白氨基N末端的序列PA_N的三维结构图。其中，(A)为PA_N的结构飘带图。该结构因二级结构特征不同而使用不同色彩，其中α螺旋使用粉色，β片层使用紫色，loop环使用绿色。每个二级结构单元都标记排序。镁离子以银白色的球代表，三个结合镁离子的水分子以黑点代表。(B)PA_N结构的拓扑图，色彩对应于(A)中的二级结构色彩，其中粉色圆柱状表示α螺旋，紫色箭头表示β片层，黑色线条表示loop环， 表示羧基端， 表示羧基端，空心圆圈表示某位置的氨基酸残基，圆圈表示镁离子Mg2+。(C)在(A)图中的PA_N蛋白分子表面电荷图。色彩区间为从红(-10kbT/ec)到蓝(+10kbT/ec)，其中中间的红色区域为一空 穴，在空穴中银白色的球代表镁离子，三个结合镁离子的水分子以黑点代表。蓝色为正电荷表面，红色为负电荷表面，白色为不带电荷表面相关部分氨基酸。(D)由2Fo-Fc电子密度图(等高线在1.5σ处)覆盖的Mg2+结合部位的封网图。PA_N蛋白分子的方向和颜色与A对应，其对应于A中Mg2+离子周围的局部放大图。其中与Mg2+离子作用的氨基酸残基以棒状表示，并被标记。Mg2+离子以银白色的球表示，水分子以红球W表示。 
图3：为A_1996表示的禽流感A型病毒病毒株为A/goose/Guangdong/1/96的PA蛋白氨基N末端的序列PA_N的三维结构的局部放大的结构飘带图。其中Mg2+离子以大的银白色的球表示，水分子以小的实心黑点表示，特定的氨基酸残基以棒状表示，并被标记为红色或蓝色。 
图4：为基于来自三种不同类型的流感病毒的PA蛋白羧基C末端的序列以及PB1N的蛋白序列。A.为基于来自三种不同类型的流感病毒的PA蛋白序列对比，其中A_OURS为来自禽流感A型病毒病毒株为A/goose/Guangdong/1/96的PA蛋白羧基C末端的序列，对应于图1中的A_1996；A_1918为1918年欧洲爆发的大范围流感并造成重大人类死亡事件的A型流感病毒株A/BrevigMission/1/1918A型流感病毒PA蛋白序列；B_1966为来自1966Annabor的流感B型病毒B/Ann Arbor/1/1966的PA蛋白序列；C_1950为来自1950的一种流感C型病毒C/JJ/1950的PA蛋白序列；这一结果表明流感病毒聚合酶亚基PA蛋白含有高度保守的氨基酸残基。B.为基于来自四种不同类型的流感病毒的PB1N的蛋白序列对比，其中A_OURS、A_1918、B_1966、C_1950如上所述，图中用....表示在相应的区段的氨基酸缺失，在说明书以及权利要求书中具体的氨基酸位置均是以A_OURS为例说明的。黄色框中标记有Roundloop的为结构中大环区，另一黄色框(未标注)为可能的核酸结合区。绿色箭头为PA羧基端参与与PB1短肽结合的氨基酸残基。在说明书中具体的氨基酸位置均是以A_1996即A_OURS为例说明的。 
具体实施方式
本发明人通过X射线衍射晶体学方法解析了PA亚基剩余的氨基端部分的分辨率达2.2埃的三维晶体结构(PA_N)。 
在本发明的一个具体实施方式中，提供了一种流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的晶体三维结构，其中所述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N为所述流感病毒聚合酶亚基PA的从约1～约50位氨基酸至在约150至300位范围内的氨基酸，其中所述晶体三维结构中的原子具有表1中所列的至少40％的原子坐标，或者流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端的晶体三维结构中至少40％氨基酸的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
在一优选实施方式中，其中所述流感病毒选自A、B、C型流感病毒，其中所述流感病毒优先选自A型流感病毒株：A/goose/Guangdong/1/96、A/Brevig Mission/1/1918；B型流感病毒株：B/Ann Arbor/1/1966或C型流感病毒株：C/JJ/1950。 
在另一优选实施方式中，其中所述的母体晶体具有P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°，重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°。 
在一优选实施方式中，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N由所述流感病毒聚合酶PA的氨基端PA_N中的α螺旋1，即含2-9位的氨基酸区段，α螺旋2，即含11-22位的氨基酸区段，α螺旋3，即含32-48位的氨基酸区段，α螺旋4，即含84-92的氨基酸区段，α螺旋5，即含127-138位的氨基酸 区段，α螺旋6，即含165-184位的氨基酸区段，α螺旋7，即含187-191位的氨基酸区段，以及五个主要的β折叠片，包括β片1，即含76-78位的氨基酸区段，β片2，即含109-111位的氨基酸区段，β片3，即含116-123位的氨基酸区段，β片4，即含144-149位的氨基酸区段，β片5，即含154-157位的氨基酸区段，共同构成所述PA的氨基端PA_N的主要部分，其中，由所述的平行的β片1-5组成一个扭曲的平面，其它所述的α螺旋围绕在这一平面周围，其中所述B型或C型流感病毒中与A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
在另一优选实施方式中，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中结合有一个选自镁、锰、锌、铜、钴、铁构成的组中的金属离子，该金属离子主要由三个水分子以及氨基酸残基Glu80以及Asp108至少之一提供配位，其中参与这一结合的氨基酸还有选自His41、Glu119、Leu106以及Pro107中的至少之一，其中所述B型或C型流感病毒中的与A型流感病毒相应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，更优选地，其中所述金属离子为镁离子。 
在一优选实施方式中，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N含有一个与其它内切核酸酶相似的(P)DXN(D/E)XK序列区域，其中在所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中各氨基酸可以代表如下：P107D108X(11)E119X(15)K134，其中所述B型或C型流感病毒中与A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
在另一优选实施方式中，其中T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172位于β片层β4以及α7之间的序列中，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
在一优选实施方式中，其中至少二个，优选至少三个选自由流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中的Arg179、Asp189、Arg192、Gln193和Glu126等构成的组中的氨基酸位于一个临近的区域，参与与蛋白质或核苷酸的相互作用，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
在另一优选实施方式中，其中所述A型流感病毒聚合酶亚基PA位于PA氨基端PA_N的所述α螺旋1以及α螺旋2形成一个发夹状结构，其中一些氨基酸残基共同组成一个邻近的带电荷的表面，包括氨基酸残基Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。 
在本发明的第二实施方式中，提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中的至少二个，优选至少三个选自Glu80、Asp108、His41、Glu119、Leu106以及Pro107等构成的氨基酸组中的成员结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述流感病毒选自A、B、C型流感病毒，其中所述流感病毒优先选自A型流感病毒株：A/goose/Guangdong/1/96、A/BrevigMission/1/1918；B型流感病毒株：B/Ann Arbor/1/1966或C型流感病毒株：C/JJ/1950，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与Glu80、Asp108、His41、Glu119、Leu106以及Pro107中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
在本发明的第三实施方式中，提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中由Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29构成的组中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29构成的组中的氨基酸中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
在本发明的第四实施方式中，提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中由Arg179、Asp189、Arg192、Gln193和Glu126构成的组中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、抗体或免疫结合物与Arg179、Asp189、Arg192、Gln193和Glu126构成的组中的氨基酸中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
在本发明的第五实施方式中，提供了一种与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中由T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172构成的组中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物，其中所述B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示，其中所述多肽或蛋白质、 抗体或免疫结合物与T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172构成的组中的氨基酸中至少二个，优选至少三个氨基酸残基的晶体三维结构坐标的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
在本发明的第六实施方式中，提供了一种包含上述与流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中的至少二个，优选至少三个氨基酸结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物的组合物，可选地包括载体或赋形剂。 
在本发明的第七实施方式中，提供了上述组合物在制备治疗由流感病毒引起的疾病的药物中的应用。 
在本发明的第八实施方式中，提供了上述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构在设计和筛选用于治疗流感病毒感染引起的疾病的各种多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物中的应用，包括： 
根据蛋白质三维结构坐标，通过计算机模拟来设计结合特定部位的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子； 
根据蛋白质三维结构坐标，通过计算机模拟来寻找可能结合特定部位的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子； 
将根据蛋白质三维结构坐标，设计或寻找的多肽、蛋白质或无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子结合到含有与所述的PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白中，进而分析结合情况； 
根据蛋白质三维结构坐标，设计或寻找的多肽、蛋白质或无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子结合到含有与所述PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白中并结晶，从而通过晶体衍射分析三维结构的方法分析多肽及化合物分子与蛋白的结合情况； 
其中与所述PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白结合的所述多肽、蛋白质或无机或有机化合物、抗体或免疫结合物分子即为候选化合物。 
在本发明的第九实施方式中，提供了任一亚型的流感病毒聚合酶的三个亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的结构，其中所包含的一个蛋白质或其某一区段，与所述PA_N蛋白质具有至少40％的相同序列。 
在本发明的第十实施方式中，提供了任一亚型的流感病毒聚合酶亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的三维立体结构，其中所包含的一个蛋白质或其某一区段的主链三维结构坐标，与所述的PA_N蛋白质具有与所述PA_N蛋白质序列至少40％的主链碳骨架的原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃。 
在本发明的第十一实施方式中，提供了一种多肽或者小分子，其特征在于与所述流感病毒PA亚基上的任一氨基酸有相互作用。 
在本发明的第十二实施方式中，提供了上述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构在药物筛选及药物设计方面的应用。 
在本发明的第十三实施方式中，提供了基于流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N蛋白质三维结构筛选与蛋白质结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物的方法，包括：通过蛋白结晶方法获得含有PA_N的晶体，或者获得含有PA_N蛋白质晶体的三维结构坐标；其中所述三维结构包括任何与该坐标中至少含有40％氨基酸残基的主链碳骨架原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃的结构。 
在本发明的第十四实施方式中，提供了基于流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N蛋白质三维结构筛选与蛋白质结合的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物的方法，包括：使用的三维分子组合具有上述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构或与上述的多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物结合的所述氨基酸残基的组中的至少3个具有主链碳骨架原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃的结构在筛选多肽、蛋白质、无机或有机化合物、抗体或免疫结合物上的应用。 
流感病毒PA_N段蛋白的表达和纯化方法：
来源于禽流感的病毒基因A/goose/Guangdong/1/96，其编码的蛋白质序列分别为： 
(1)PA蛋白质序列：MEDFVRQCFNPMIVELAEKAMKEYGEDPKIETNKFAAICTHLEVCFMYSDFHFIDERGESTIIESGDPNALLKHRFEIIEGRDRTMAWTVVNSICNTTGVEKPKFLPDLYDYKENRFIEIGVTRREVHTYYLEKANKIKSEKTHIHIFSFTGEEMATKADYTLDEESRARIKTRLFTIRQEMASRGLWDSFRQSERGEETIEERFEITGTMCRLADQSLPPNFSSLEKFRAYVDGFEPNGCIEGKLSQMSKEVNARIEPFLKTTPRPLRLPDGPPCSQRSKFLLMDALKLSIEDPSHEGEGIPLYDAIKCMKTFFGWKEPNIVKPHEKGINPNYLLAWKQVLAELQDIENEEKIPKTKNMRKTSQLKWALGENMAPEKVDFEDCKDVSDLRQYDSDEPKPRSLASWIQSEFNKACELTDSSWIELDEIGEDVAPIEHIASMRRNYFTAEVSHCRATEYIMKGVYINTALLNASCAAMDDFQLIPMISKCRTKEGRRKTNLYGFIIKGRSHLRNDTDVVNFVSMEFSLTDPRLEPHKWEKYCVLEIGDMLLRTAIGQVSRPMFLYVRTNGTSKIKMKWGMEMRRCLLQSLQQIES MIEAESSVKEKDMTKEFFENKSETWPIGESPKGMEEGSIGKVCRTLLAKSVFNSLYASPQLEGFSAESRKLLLIVQALRDNLEPGTFDLGGLYEAIEECLINDPWVLLNASWFNSFLTHALK；即： 
Met Glu Asp Phe Val Arg Gln Cys Phe Asn Pro Met Ile Val Glu Leu Ala Glu Lys AlaMet Lys Glu Tyr Gly Glu Asp Pro Lys Ile Glu Thr Asn Lys Phe Ala Ala Ile Cys Thr His Leu GluVal Cys Phe Met Tyr Ser Asp Phe His Phe Ile Asp Glu Arg Gly Glu Ser Thr Ile Ile Glu Ser GlyAsp Pro Asn Ala Leu Leu Lys His Arg Phe Glu Ile Ile Glu Gly Arg Asp Arg Thr Met Ala TrpThr Val Val Asn Ser Ile Cys Asn Thr Thr Gly Val Glu Lys Pro Lys Phe Leu Pro Asp Leu Tyr AspTyr Lys Glu Asn Arg Phe Ile Glu Ile Gly Val Thr Arg Arg Glu Val His Thr Tyr Tyr Leu Glu LysAla Asn Lys Ile Lys Ser Glu Lys Thr His Ile His Ile Phe Ser Phe Thr Gly Glu Glu Met Ala ThrLys Ala Asp Tyr Thr Leu Asp Glu Glu Ser Arg Ala Arg Ile Lys Thr Arg Leu Phe Thr Ile Arg GlnGlu Met Ala Ser Arg Gly Leu Trp Asp Ser Phe Arg Gln Ser Glu Arg Gly Glu Glu Thr Ile GluGlu Arg Phe Glu Ile Thr Gly Thr Met Cys Arg Leu Ala Asp Gln Ser Leu Pro Pro Asn Phe SerSer Leu Glu Lys Phe Arg Ala Tyr Val Asp Gly Phe Glu Pro Asn Gly Cys Ile Glu Gly Lys LeuSer Gln Met Ser Lys Glu Val Asn Ala Arg Ile Glu Pro Phe Leu Lys Thr Thr Pro Arg Pro LeuArg Leu Pro Asp Gly Pro Pro Cys Ser Gln Arg Ser Lys Phe Leu Leu Met Asp Ala Leu Lys LeuSer Ile Glu Asp Pro Ser His Glu Gly Glu Gly Ile Pro Leu Tyr Asp Ala Ile Lys Cys Met Lys ThrPhe Phe Gly Trp Lys Glu Pro Asn Ile Val Lys Pro His Glu Lys Gly Ile Asn Pro Asn Tyr Leu LeuAla Trp Lys Gln Val Leu Ala Glu Leu Gln Asp Ile Glu Asn Glu Glu Lys Ile Pro Lys Thr Lys AsnMet Arg Lys Thr Ser Gln Leu Lys Trp Ala Leu Gly Glu Asn Met Ala Pro Glu Lys Val Asp PheGlu Asp Cys Lys Asp Val Ser Asp Leu Arg Gln Tyr Asp Ser Asp Glu Pro Lys Pro Arg Ser LeuAla Ser Trp Ile Gln Ser Glu Phe Asn Lys Ala Cys Glu Leu Thr Asp Ser Ser Trp Ile Glu Leu AspGlu Ile Gly Glu Asp Val Ala Pro Ile Glu His Ile Ala Ser Met Arg Arg Asn Tyr Phe Thr Ala GluVal Ser His Cys Arg Ala Thr Glu Tyr Ile Met Lys Gly Val Tyr Ile Asn Thr Ala Leu Leu Asn AlaSer Cys Ala Ala Met Asp Asp Phe Gln Leu Ile Pro Met Ile Ser Lys Cys Arg Thr Lys Glu GlyArg Arg Lys Thr Asn Leu Tyr Gly Phe Ile Ile Lys Gly Arg Ser His Leu Arg Asn Asp Thr AspVal Val Asn Phe Val Ser Met Glu Phe Ser Leu Thr Asp Pro Arg Leu Glu Pro His Lys Trp GluLys Tyr Cys Val Leu Glu Ile Gly Asp Met Leu Leu Arg Thr Ala Ile Gly Gln Val Ser Arg Pro MetPhe Leu Tyr Val Arg Thr Asn Gly Thr Ser Lys Ile Lys Met Lys Trp Gly Met Glu Met Arg ArgCys Leu Leu Gln Ser Leu Gln Gln Ile Glu Ser Met Ile Glu Ala Glu Ser Ser Val Lys Glu Lys AspMet Thr Lys Glu Phe Phe Glu Asn Lys Ser Glu Thr Trp Pro Ile Gly Glu Ser Pro Lys Gly MetGlu Glu Gly Ser Ile Gly Lys Val Cys Arg Thr Leu Leu Ala Lys Ser Val Phe Asn Ser Leu Tyr AlaSer Pro Gln Leu Glu Gly Phe Ser Ala Glu Ser Arg Lys Leu Leu Leu Ile Val Gln Ala Leu ArgAsp Asn Leu Glu Pro Gly Thr Phe Asp Leu Gly Gly Leu Tyr Glu Ala Ile Glu Glu Cys Leu IleAsn Asp Pro Trp Val Leu Leu Asn Ala Ser Trp Phe Asn Ser Phe Leu Thr His Ala Leu Lys(SEQID NO：1)。 
(2)PB1蛋白质序列：MDVNPTLLFLKVPAQNAISTTFPYTGDPPYSHGTGTGYTMDTVNRTHQYSEKGKWTTNTETGAPQLNPIDGPLPEDNEPSGYAQTDCVLEAMAFLEKSHPGIFENSCLETMEIVQQTRVDKLTQGRQTYDWTLNRNQPAATALANTIEVFRSNGLTANESGRLIDFLKDVMESMDKGEMEIITHFQRKRRVRDNMTKKMVTQRTIGKKKQRLNKRSYLIRALTLNTMTKDAERGKLKRRAIATPGMQIRGFVYFVETLARSICEKLEQSGLPVGGNEKKAKLANVVRKMMTNSQDTELSFTITGDNTKWNENQNPRMFLAMITYITRNQPEWFRNVLSIAPIMFSNKMARL GKGYMFESKSMKLRTQIPAEMLASIDLKYFNESTRKKIEKIRPLLIDGTASLSPGMMMGMFNMLSTVLGVSILNLGQKRYTKTTYWWDGLQSSDDFALIVNAPNHEGIQAGVDRFYRTCKLVGINMSKKKSYINRTGTFEFTSFFYRYGFVANFSMELPSFGVSGINESADMSIGVTVIKNNMINNDLGPATAQMALQLFIKDYRYTYRCHRGDTQIQTRRSFELKKLWEQTRSKAGLLVSDGGPNLYNIRNLHIPEVCLKWELMDEDYQGRLCNPLNPFVSHKEIESVNNAVVMPAHGPAKSMEYDAVATTHSWIPKRNRSILNTSQRGILEDEQMYQKCCNLFEKFFPSSSYRRPVGISSMVEAMVSRARIDARIDFESGRIKKEEFAEIMKICSTIEELRRQK；即： 
Met Asp Val Asn Pro Thr Leu Leu Phe Leu Lys Val Pro Ala Gln Asn Ala Ile Ser Thr ThrPhe Pro Tyr Thr Gly Asp Pro Pro Tyr Ser His Gly Thr Gly Thr Gly Tyr Thr Met Asp Thr ValAsn Arg Thr His Gln Tyr Ser Glu Lys Gly Lys Trp Thr Thr Asn Thr Glu Thr Gly Ala Pro GlnLeu Asn Pro Ile Asp Gly Pro Leu Pro Glu Asp Asn Glu Pro Ser Gly Tyr Ala Gln Thr Asp CysVal Leu Glu Ala Met Ala Phe Leu Glu Lys Ser His Pro Gly Ile Phe Glu Asn Ser Cys Leu GluThr Met Glu Ile Val Gln Gln Thr Arg Val Asp Lys Leu Thr Gln Gly Arg Gln Thr Tyr Asp TrpThr Leu Asn Arg Asn Gln Pro Ala Ala Thr Ala Leu Ala Asn Thr Ile Glu Val Phe Arg Ser AsnGly Leu Thr Ala Asn Glu Ser Gly Arg Leu Ile Asp Phe Leu Lys Asp Val Met Glu Ser Met AspLys Gly Glu Met Glu Ile Ile Thr His Phe Gln Arg Lys Arg Arg Val Arg Asp Asn Met Thr LysLys Met Val Thr Gln Arg Thr Ile Gly Lys Lys Lys Gln Arg Leu Asn Lys Arg Ser Tyr Leu Ile ArgAla Leu Thr Leu Asn Thr Met Thr Lys Asp Ala Glu Arg Gly Lys Leu Lys Arg Arg Ala Ile AlaThr Pro Gly Met Gln Ile Arg Gly Phe Val Tyr Phe Val Glu Thr Leu Ala Arg Ser Ile Cys Glu LysLeu Glu Gln Ser Gly Leu Pro Val Gly Gly Asn Glu Lys Lys Ala Lys Leu Ala Asn Val Val ArgLys Met Met Thr Asn Ser Gln Asp Thr Glu Leu Ser Phe Thr Ile Thr Gly Asp Asn Thr Lys TrpAsn Glu Asn Gln Asn Pro Arg Met Phe Leu Ala Met Ile Thr Tyr Ile Thr Arg Asn Gln Pro GluTrp Phe Arg Asn Val Leu Ser Ile Ala Pro Ile Met Phe Ser Asn Lys Met Ala Arg Leu Gly Lys GlyTyr Met Phe Glu Ser Lys Ser Met Lys Leu Arg Thr Gln Ile Pro Ala Glu Met Leu Ala Ser Ile AspLeu Lys Tyr Phe Asn Glu Ser Thr Arg Lys Lys Ile Glu Lys Ile Arg Pro Leu Leu Ile Asp Gly ThrAla Ser Leu Ser Pro Gly Met Met Met Gly Met Phe Asn Met Leu Ser Thr Val Leu Gly Val SerIle Leu Asn Leu Gly Gln Lys Arg Tyr Thr Lys Thr Thr Tyr Trp Trp Asp Gly Leu Gln Ser SerAsp Asp Phe Ala Leu Ile Val Asn Ala Pro Asn His Glu Gly Ile Gln Ala Gly Val Asp Arg Phe TyrArg Thr Cys Lys Leu Val Gly Ile Asn Met Ser Lys Lys Lys Ser Tyr Ile Asn Arg Thr Gly Thr PheGlu Phe Thr Ser Phe Phe Tyr Arg Tyr Gly Phe Val Ala Asn Phe Ser Met Glu Leu Pro Ser PheGly Val Ser Gly Ile Asn Glu Ser Ala Asp Met Ser Ile Gly Val Thr Val Ile Lys Asn Asn Met IleAsn Asn Asp Leu Gly Pro Ala Thr Ala Gln Met Ala Leu Gln Leu Phe Ile Lys Asp Tyr Arg TyrThr Tyr Arg Cys His Arg Gly Asp Thr Gln Ile Gln Thr Arg Arg Ser Phe Glu Leu Lys Lys LeuTrp Glu Gln Thr Arg Ser Lys Ala Gly Leu Leu Val Ser Asp Gly Gly Pro Asn Leu Tyr Asn IleArg Asn Leu His Ile Pro Glu Val Cys Leu Lys Trp Glu Leu Met Asp Glu Asp Tyr Gln Gly ArgLeu Cys Asn Pro Leu Asn Pro Phe Val Ser His Lys Glu Ile Glu Ser Val Asn Asn Ala Val Val MetPro Ala His Gly Pro Ala Lys Ser Met Glu Tyr Asp Ala Val Ala Thr Thr His Ser Trp Ile Pro LysArg Asn Arg Ser Ile Leu Asn Thr Ser Gln Arg Gly Ile Leu Glu Asp Glu Gln Met Tyr Gln LysCys Cys Asn Leu Phe Glu Lys Phe Phe Pro Ser Ser Ser Tyr Arg Arg Pro Val Gly Ile Ser Ser MetVal Glu Ala Met Val Ser Arg Ala Arg Ile Asp Ala Arg Ile Asp Phe Glu Ser Gly Arg Ile Lys LysGlu Glu Phe Ala Glu Ile Met Lys Ile Cys Ser Thr Ile Glu Glu Leu Arg Arg Gln Lys(SEQ IDNO：2)。 
通过分子克隆技术将流感病毒聚合酶亚基PA基因分成蛋白质的氨基端和羧基端两部分进行克隆，氨基端包括前256位氨基酸，羧基端包括第257至第716氨基酸，两部分基因分别克隆到pGEX-6p载体上(来自Amersham Pharmacia Inc.)，以便表达氨基末端融合GST的融和蛋白(GST-PA-N以及GST-PAC)，将克隆的质粒分别转化入大肠杆菌BL21中，在BL21中使用终浓度为0.1-1mM的IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)诱导大肠杆菌分别表达两种蛋白，获得该两种蛋白的各自表达菌，具体参见实施例1。 
将PB1N端48个氨基酸以内的基因(包括前25肽)同样克隆到pGEX-6p载体上，表达融合的GST-PB1N端肽的融合蛋白。 
同样，分别表达了GST融合的PB1N端25个氨基酸的短肽或48个氨基酸以内的短肽，同样将该质粒转化入大肠杆菌BL21中，在BL21中使用终浓度为0.1-1mM的IPTG诱导大肠杆菌表达蛋白，获得该蛋白的表达菌。 
将表达GST-PA-N的细菌使用缓冲液悬浮后裂解，离心获得上清后使用亲和层析柱，从中纯化出GST-PA-N融合蛋白。 
将表达GST-PAC的表达菌与表达GST-PB1短肽的表达菌分别使用含有约20mMTris-HCl(pH8.0)及250mM NaCl的缓冲液悬浮，然后按比例混合两种表达菌，使GST-PAC和GST-PB1的蛋白总含量的摩尔比为0.1∶1～1∶0.1，优选使GST-PAC和GST-PB1的蛋白总含量的摩尔比为0.5∶1～1∶0.5，优选使GST-PAC和GST-PB1的蛋白总含量接近摩尔比为1∶1。 
然后使用Glutathione-Sepharose亲和柱(来自AmershamPharmacia Inc.)纯化这一混合的GST融合蛋白。使用PreScission蛋白酶(来自Amersham Pharmacia Inc.)酶解后，用凝胶过滤Superdex-200以及离子交换层析(Q sepharose)等方法分离纯化出PAC/PB1短肽复合体(层析柱均来源于Amersham Pharmacia Inc.)， 通过SDS-PAGE凝胶电泳确定蛋白质纯度后，用于进一步的结晶实验。 
同样地，使用Glutathione-Sepharose亲和柱(来自AmershamPharmacia Inc.)纯化这GST-PA-N的GST融合蛋白。使用PreScission蛋白酶(来自Amersham Pharmacia Inc.)酶解后，用凝胶过滤Superdex-200以及离子交换层析(Q sepharose)等方法分离纯化出GST-PA-N肽(层析柱均来源于Amersham Pharmacia Inc.)，通过SDS-PAGE凝胶电泳确定蛋白质纯度后，用于进一步的结晶实验。 
进一步通过X射线衍射晶体学方法解析PA亚基剩余的氨基端部分的三维晶体结构(PA_N)，显示：PA_N是α/β结构域，其形状类似于一个张开的贝壳，含有5个β片层β1-5和7个α螺旋(α1-7)。其中5个平行的β片层1-5(即β-strands β1-5)组成一个扭曲的平面，被周围7个α螺旋(α1-7)包围(参见图2A)。该贝壳形状主要由α2、α4、α5、α7等组成张开的口部，其它部分构成贝壳底尖处以及贝面。α2-α5以及β3围绕形成一个负电荷小穴，其中结合一个金属离子，该金属原子选自镁、锰、锌、铜、钴、铁该金属离子主要由三个水分子以及氨基酸残基Glu80以及Asp108至少之一提供配位，其中参与这一结合的氨基酸还有选自His41、Glu119、Leu106以及Pro107中的至少之一。 
优选地，这一金属离子是镁离子。这一镁离子主要与周围5个配体形成5个配位键，包括酸性氨基酸E80以及D108、和3个水分子。这三个水分子与氨基酸H41、E119残基、以及残基L106和P107的羰基氧所结合。参与结合镁离子的这六个氨基酸残基在A、B以及C型流感病毒的PA亚基中都非常保守，只有脯氨酸107在B型以及C型流感病毒中被丙氨酸残基或者丝氨酸取代(参见图1)。通过Dali(http://www.ebi.ac.uk/dali)进行相似结构的搜寻比对，我们 发现PA_N结构与嗜热菌Thermus thermophilus Hb8中的一个推测的核酸酶蛋白Tt1808(PDB ID：1WDJ，Z-score 4.8，r.m.s.d.3.4 比对其中的87个氨基酸)，以及一个已知的限制性内切酶SdaI(PDBID：2IXS，Z-score 3.9，r.m.s.d.4.0 比对95氨基酸)，Hollidayjunction resolvase Hjc(PDB ID：1GEF，Z-score 3.8，r.m.s.d.3.0 比对76氨基酸)具有结构相似性。这些蛋白都具有一个保守的(P)DXN(D/E)XK活性区。因而我们猜测PA_N可能具有核酸酶的活性。核酸内切酶活性是流感病毒聚合酶复合体所必须的，当流感病毒RNA聚合酶夺取了宿主mRNA后，需要首先将宿主mRNA切断，产生带有帽子结构的短5’核苷酸序列用于自身mRNA转录的引物。其中，为了证明PA_N是核酸内切酶，我们做了一系列的生物化学以及细胞生物学分析，包括：1)引物延伸实验：将人肾癌293细胞转入表达PA，PB1，PB2的质粒，并同时转入带有流感病毒启动子的另一质粒，这样在细胞中表达的聚合酶可以识别并合成病毒的一段RNA。通过体外引物延伸实验检测细胞内病毒RNA片段的种类来看聚合酶活性。2)体外内切核酸酶活性检测等实验。比如我们证明了重组纯化的流感病毒聚合酶复合体(包含PA，PB1和PB2三个亚基)，当在PA_N预测的内切核酸酶活性位点，诸如H41，E80，L106，P107，D108和E119等位点突变后，不同程度的丧失了切割mRNA的活性，进而丧失使用宿主mRNA合成RNA的能力。E80A，D108A，E119A和K134A点突变造成聚合酶复合体的mRNA合成活性基本丧失，但保留有cRNA以及vRNA合成能力。H41A突变造成三种RNA的合成都被阻断。但是，以往报导的PB1亚基上参与E508，E519以及D522的点突变则对聚合酶的RNA合成能力没有影响。这些结果充分说明了PA_N端含有负责流感病毒聚合酶核酸内切酶活性的结构域。但是，该内切核酸酶活性作用的底物结合位点有可能更多的依赖于PB1和PB2亚基。但是，PA_N端多肽上位于β3-α5之间的环肽上的两个精氨酸(R124和R125)，以 及在α螺旋7上的两个精氨酸(R192和R196)可能参与与底物RNA的结合。 
根据以往的报导，流感病毒聚合酶PA亚基具有蛋白酶活性，其中苏氨酸T157和丝氨酸S624都曾被认为是该蛋白酶活性中心。但本发明人没有发现PA_N单独具有蛋白酶活性，可能这一活性需要聚合酶其它部分的参与。但是本发明人发现，围绕在T157残基周围的一些氨基酸残基，包括E154、K158、D160、E165、E166、R168和R170非常保守，因此这些氨基酸很可能参与流感病毒聚合酶的重要功能。 
应当注意到，其中B型或C型流感病毒中与A型流感病毒的α螺旋及β片相对应的区段分别如在图1以及图4的A和B中所示，在此不再一一赘述。可采用的蛋白质或多肽序列比对的方法例如：CLUSTALW(http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html)。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种表达和纯化流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的方法，包括：(a)构建融合了或不融合标签蛋白基因的编码流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N第约1～约50位氨基酸至约150～约300位氨基酸的基因序列的载体，用该载体转化原核或真核细胞，从而表达带有标签蛋白的PAC；(b)通过特异性地与所述特异标签识别的方法分离出所述氨基端多肽，酶解去掉带有标签的多肽中的标签蛋白，分离出氨基端多肽PA_N，确定蛋白质的浓度； 
其中所述病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N的晶体三维结构中的原子具有表1中所列的至少40％的原子坐标，或者流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端多肽PA_N的晶体三维结构中至少40％氨基酸的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种表达和纯化流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端多肽PA_N的方法，其中所述标签蛋白选自GST、Flag-tag、Myc-tag、MBP-tag、特异性抗体；所述载体含有选择性标记基因，优选的标签蛋白为GST，所述与特异标签识别的方法是通过亲和柱进行，所述去掉标签的方法通过用蛋白酶酶解，所述分离PA氨基端多肽PA_N的方法是通过凝胶过滤或离子交换层析进行，所述确定蛋白质的浓度通过凝胶电泳的方法进行。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种表达和纯化流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N的方法，其中所述载体为pGEX-6p质粒载体，其中所述的选择性标记基因为青霉素抗性基因，其中步骤(b)所使用的蛋白酶为ProScission蛋白酶；载体所使用的引物酶切位点为选自SalI、NotI构成的组中的酶切位点；插入基因片段时所用的酶切位点为选自SalI、NotI构成的组中的酶切位点；所述流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N的基因片段是通过利用聚合酶链式反应PCR方法从A型流感病毒株A/goose/Guangdong/1/96基因组中扩增获得；将所述载体及所述插入基因片段分别使用相应的DNA内切酶，如选自由BamHI、XhoI组成的组中的内切酶处理后，通过T4 DNA连接酶将所述插入基因与所述载体连接，从而转化例如大肠杆菌这样的原核细胞获得克隆质粒；将克隆好的如上所述的克隆质粒转化入大肠杆菌BL21中，培养所得到的转化细菌，通过使用IPTG诱导，IPTG优选的浓度为0.1mM至1mM，将培养得到的所述细菌通过离心方法得到表达所述融合蛋白的菌群。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种共结晶流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N的方法，包括：将所述纯化的氨基端多肽PA_N的蛋白质浓度浓缩至5-30mg/ml；用气相悬滴法或坐滴法筛选晶体生长条件；获得流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N的晶体。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种表达PA氨基端多肽PA_N的野生型或者突变型蛋白的方法，氨基端多肽PA_N为从1～约50位氨基酸至约200～约300位氨基酸，包括：构建融合了标签蛋白基因的编码流感病毒聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N从1～约50位氨基酸至约200～约300位氨基酸的基因序列的表达载体，用该载体转化细胞，从而表达带有标签蛋白的氨基端多肽PA_N，其中所述PA氨基端多肽PA_N中的氨基酸序列具有与图1中所列的至少40％的氨基酸比对相同。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种表达PA氨基端多肽PA_N的野生型或者突变型蛋白的方法，其中将所述聚合酶亚基PA氨基端多肽PA_N的基因序列通过PCR方法以及分子克隆技术分别克隆到例如pGEX-6p、pGEX-4T等pGEX系列载体(AmershamPharmacia)、pET系列载体(Novagen)、pMAL-c2(Invitrogen)系列载体等质粒载体上，以表达氨基端多肽PA_N氨基末端融合GST的融和蛋白GST-PA_N；所述质粒载体含有青霉素抗性基因，所述PA氨基端PA_N多肽基因克隆时载体所用的酶切位点为选自由pGEX-6p多克隆位点的BamHI、XhoI构成的组中的酶切位点；使用的氨基端PA_N基因克隆片段酶切位点分别为BamHI及XhoI；氨基端多肽PA_N的基因片段是通过使用PCR方法从病毒株A/goose/Guangdong/1/96基因组中扩增获得；将载体及插入片段分别使用相应的DNA内切酶如选自由BamHI、XhoI构成的组中的内切酶处理后，通过T4 DNA连接酶将插入基因与载体连接，转化大肠杆菌获得克隆质粒；将克隆好的如上所述的质粒转化入大肠杆菌BL21中，培养所述转化细菌，通过使用0.1mM至1mM的IPTG诱导，将培养细菌通过离心得到表达所述融合蛋白的菌群。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种筛选与选自由镁、锰、锌、铜、钴、铁构成的组中的金属离子，优选镁离子竞争结合氨基端多肽PA_N的候选化合物的方法，所述方法包括：(a)将氨基端多肽PA_N结合在固定载体的表面上；(b)将待测的候选化合物溶 液与(a)中所述经固定的氨基端多肽PA_N接触；(c)用洗脱液充分洗脱，除去未结合的候选化合物；(d)用洗脱液充分洗脱，得到待测试溶液；(e)测试所述待测试溶液中游离的金属离子浓度；(f)根据所述溶液中游离的金属离子的浓度来推算待测候选化合物与氨基端多肽PA_N的结合能力。 
在一优选具体实施方式中，其中所述步骤(a)将氨基端多肽PA_N结合在固定的表面上是通过共价交联或通过将PA_N与亲和介质结合而实现的，所述亲和介质在固定的表面上具有亲和介质的结合基团。 
在一优选具体实施方式中，其中所述亲和介质可以是GST、Flag-tag、Myc-tag、MBP-tag、His-tag、特异性抗体等其它多肽，而固定表面上则是相应的亲和介质的结合基团。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种筛选与选自由镁、锰、锌、铜、钴、铁构成的组中的金属离子，优选镁离子竞争结合氨基端多肽PA_N的候选化合物的方法，其中候选化合物选自同位素或其他化学分子标记蛋白，优选地，其他化学分子标记选自绿色荧光蛋白、各种其它融合多肽，例如结合过氧化物酶、磷酸水解酶、蛋白激酶、各种基团转移酶等。 
在一具体实施方式中，本发明提供一种筛选与选自由镁、锰、锌、铜、钴、铁构成的组中的金属离子，优选镁离子竞争结合氨基端多肽PA_N的候选化合物的方法，其中所述的固定的表面可以是亲和层析柱。 
蛋白质的结晶及优化： 
将用以上方法表达纯化好的氨基端多肽PA_N浓缩至浓度约为5-30mg/ml，用气相悬滴法，使用结晶试剂(来自Hampton Research)筛选晶体生长条件，在多种结晶试剂条件下获得了初始晶体。 
通过进一步优化，其中，在使用不同pH缓冲液的条件下(pH4-9)含有约25％PEG8000(母体晶体)或20％PEG3350硒代甲硫氨酸晶体溶液中都获得了外观良好的晶体。在pH 6.5的缓冲液中得到了较大的晶体，分辨率约为2.2埃左右的母体晶体，硒代晶体可衍射至3埃左右，并进而收集相应的X射线衍射数据。 
晶体数据收集及结构解析： 
使用FR-EX-射线衍射仪(来自Rigaku)在1.5418埃的波长下首先收集到氨基端多肽PA_N晶体的一套分辨率为2.2埃的母体数据。然后使用位于美国芝加哥APS的同步辐射仪(线站号码：SBC19ID；检测屏：ADSC Q315)，在波长0.9798和0.9800埃波长下收集到这个蛋白晶体分辨率达到2.9埃左右的吸收峰(Peak)和吸收边(Edge)两套硒原子衍生物晶体数据。利用HKL2000(Otwinowski1997)处理所收得的三套数据，发现母体晶体的空间群是P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°；而重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°。利用多波长反常散射法(Hendrickson 1991)来进行计算相位，将处理得到的sca文件用SHELXD(Sheldrick 1998)来查找硒原子，共找到6个硒代甲硫氨酸，将硒原子坐标，以及处理得到的Peak和Edge两套数据输入程序MLPHARE，用它来计算相位，并进而使用DM程序做电子密度图的修饰，从计算得到的电子密度图上能非常清楚地看到数个二级结构(包括一些α螺旋和β折叠)，这样可以搭出大约80个残基，随后经过反复模型搭建以及使用CNS软件包程序修正，从而搭出初始模型。利用搭建的初始模型依据高分辨率的母体数据，使用Phaser程序做分子置换，从而获得母体数据的清晰解，进一步进行结构模型的搭建，并交替使用CNS进行修正。最终获得结构的R因子为23.1％，自由R因子为25.2％。最后将三个水分子以及一个金属镁离子亦加入模型中。修正的结构最终R因子和R-free因子分别为23.1％和25.2％。 
氨基端多肽PA_N的单体晶体结构原子坐标参见表1。 
实施例 
实施例1 
用于表达流感病毒PA氨基端多肽PA_N的方法：
本发明的一种实施方式是将PA分成两段进行表达，从而分别表达出PA的氨基端前256氨基酸残基片段以及257-716个氨基酸残基片段，并将编码这两个蛋白多肽的两个基因片段分别克隆到大肠杆菌表达载体上，用于在细菌中进行蛋白质的表达。单独从表达PA的N末端(1-256氨基酸)细菌中纯化出PA的N端多肽，并将PA的N端肽用于蛋白质结晶。PA的羧基末端表达菌离心收集后备用，以便用于与PB1N端多肽的共纯化。 
将含有PB1氨基端前25位或者48位氨基酸以内的多肽(不含第一位甲硫氨基酸)以GST融合蛋白形式在细菌中进行表达。将流感病毒聚合酶蛋白亚基PA分段在细菌中或者其它真核生物细胞中进行表达至少50％区段为257-716氨基酸区段中一部分的PA蛋白片段的方法。 
流感病毒PA氨基端在大肠杆菌中的表达纯化
通过分子克隆技术将流感病毒PA的氨基端(第1至256位氨基酸)克隆到pGEX-6p载体(来自Amersham Pharmacia Inc.)上，其克隆位点可以是BamHI以及XhoI。将克隆得到的含有PA氨基端基因的表达质粒转化到大肠杆菌BL21中，进行蛋白质的表达，从而使细菌可以表达PA蛋白N端(氨基端)连接有GST融合蛋白并且含有可以被ProScission蛋白酶(Amersham Biosciences)切割的酶切位点，从而可以进一步将GST蛋白标签与目的蛋白PA多肽分离。在培养的大肠杆菌BL21细胞中使用终浓度为0.1-1mM左右的IPTG诱导大肠杆菌，获得该蛋白的表达菌。所用载体含有氨苄 青霉素抗性基因。克隆构建的融合蛋白表达质粒转化入大肠杆菌如BL21(Novagen)后，在37度使用LB等细菌培养基过夜培养细菌，大约12小时后按1∶100左右转接到大量培养基中，37度温度下在摇瓶中培养至OD为1.0左右，然后加入0.1-1mM的IPTG进行诱导表达，大约3至6小时后通过离心收集细菌，收集的沉淀细菌可放于-20度至-80度冰箱中保存备用，也可直接用于PA氨基端多肽的纯化。 
流感病毒PA羧基端和PB1多肽复合体的表达纯化：
通过分子克隆技术将流感病毒PA的羧基端(第257至第716氨基酸)克隆到pGEX-6p载体(来自Amersham Pharmacia Inc.)上，其克隆位点是BamHI及NotI。将克隆的含有PA羧基端基因的表达质粒转化到大肠杆菌BL21中，进行蛋白质的表达，从而使细菌可以表达蛋白N端(氨基端)连接有GST融合蛋白并且含有可以被ProScission蛋白酶(Amersham Biosciences)切割的酶切位点，从而可以进一步将GST蛋白标签与目的蛋白PA多肽分离。在培养的大肠杆菌BL21细胞中使用终浓度为0.1-1mM左右的IPTG诱导大肠杆菌，获得该蛋白的表达菌。所用载体含有氨苄青霉素抗性基因。克隆构建的融合蛋白表达质粒转化入大肠杆菌如BL21(Novagen)后，先在37度使用LB等细菌培养基过夜培养细菌，大约12小时后按1∶100左右转接到大量培养基中，37度温度下在摇瓶中培养至OD为1.0左右，随后降低培养温度至16度，然后加入0.1-1mM的IPTG进行诱导表达，大约12至24小时后通过离心收集细菌，收集的沉淀细菌可放于-20度至-80度冰箱中保存备用，也可直接用于纯化。 
将PB1N端48个氨基酸以内的基因(发明人表达了PB1的氨基端前48个氨基酸多肽以及前25个氨基酸多肽)同样克隆到pGEX-6p载体的多克隆位点上，所用酶切位点为BamHI以及XhoI，从而使细菌可以表达含GST融合蛋白，并且该融合蛋白含有可以被ProScission蛋白酶(Amersham Biosciences)切割的蛋白酶位点，从 而可以进一步分离GST标签以及目的蛋白PB1多肽。按如上PA融合蛋白表达方式在大肠杆菌BL21中表达融合的GST-PB1N端肽的融合蛋白，抗性基因为氨苄青霉素抗性基因，蛋白质表达是在37度，使用诱导剂为IPTG。最后通过离心收集表达细菌，该细菌可以直接用于蛋白纯化，也可暂时储存于-20度至-80度冰箱中备用。 
将离心收集的表达GST-PA氨基端多肽的表达菌用含有约20mMTris-HCl(pH8.0)及250mM NaCl的缓冲液或者1XPBS(pH7.4)磷酸缓冲液悬浮，使用超声破菌仪破碎细胞，离心分离除去不溶性沉淀，收集可溶性上清，使用Glutathione亲和层析柱纯化出GST-PA-N端多肽，进而使用ProScission蛋白酶酶解融合蛋白，将融合蛋白酶解成GST(谷胱苷肽S-转移酶)和PA-N两段，进而使用离子交换层析以及凝胶排阻层析纯化出PA-N蛋白多肽。将该蛋白浓缩至5-30mg/mL，用于晶体生长。 
将表达的GST-PAC羧基端多肽的表达菌与表达GST-PB1N短肽的表达菌分别使用含有约20mMTris-HCl(pH8.0)及250mM NaCl的缓冲液或者1xPBS(pH7.4)磷酸缓冲液悬浮，然后按比例混合两种表达菌，使GST-PA和GST-PB1的蛋白总含量的摩尔比为0.1∶1～1∶0.1，优选使GST-PA和GST-PB1的蛋白总含量的摩尔比为0.5∶1～1∶0.5，更优选使GST-PA和GST-PB1的蛋白总含量接近摩尔比为1∶1。 
混合的细菌悬浮液通过超声波或者其它细胞裂解方法裂解后，通过离心分离细菌裂解物的不可溶部分以及可溶部分，将高速离心(约20,000g)后获得的上清通过使用Glutathione-Sepharose亲和柱(来自Amersham Pharmacia Inc.)来初步分离纯化出这一混合蛋白，含GST标签的蛋白可以结合到Glutathione-Sepharose亲和柱上，而其它蛋白不能结合到该亲和柱上。蛋白结合到亲和柱上以后使用如上所述的细菌悬浮缓冲液将杂蛋白洗尽。使用适量的ProScission蛋白酶(来自Amersham Pharmacia Inc.)酶解在亲和柱上的混合的GST 融合蛋白，此过程通常需大约24小时。然后将酶解切割下来的PAC与PB1N融合蛋白用凝胶过滤Superdex-200(来自AmershamPharmacia Inc.)以及Q sepharose离子交换层析(来自AmershamPharmacia Inc.)等方法进一步分离纯化出PAC/PB1N短肽复合体(层析柱均来源于Amersham Pharmacia Inc.)，通过SDS-PAGE凝胶电泳确定蛋白质纯度后，纯度一般可达90％以上。将通过以上步骤纯化的蛋白使用浓缩管(来源于Millipore公司)浓缩至大约5-30mg/mL左右用于进一步的结晶实验。 
本领域普通技术人员可知，流感病毒的PA的氨基端以及PA的羧基端PAC与PB1的氨基端PB1N不仅可以在本文中所述的原核细胞如大肠杆菌细胞中表达，也可以在真核细胞如昆虫细胞中表达；同时可使用任何其它内切酶、酶切位点、连接酶；也可以将待纯化的目标多肽与如GST的其它标签融合，然后选用相对应的分离纯化的方法进行纯化，最后再去掉融合到目标多肽中的标签，如上所述对本发明进行的各种更改和修饰均在本发明的保护范围内。 
应当注意到，其中B型或C型流感病毒中与A型流感病毒的α螺旋及β片相对应的区段分别如在图1A及1B以及图1C以及10A和B中所示，在此不再一一赘述。 
实施例2 
氨基端多肽PA_N的结晶：
将如上方法表达纯化好的氨基端多肽PA_N浓缩至浓度约为5-30mg/mL，用气相悬滴法使用结晶试剂(来自Hampton Research等公司的Screen Kit I/II、Index等试剂盒)筛选晶体生长条件。经过初步筛选，本发明人在多种不同的结晶试剂条件下获得了初始晶体。 
通过进一步优化，其中，在使用不同pH缓冲液的条件下(pH4-9)含有约25％PEG8000(母体晶体)或20％PEG3350硒代甲硫 氨酸晶体溶液中都获得了外观良好的晶体。在pH 6.5的缓冲液中得到了较大的晶体，分辨率约为2.2埃左右的母体晶体，硒代晶体可衍射至3埃左右，并进而收集相应的X射线衍射数据。 
应当注意到，其中B型或C型流感病毒中与A型流感病毒的α螺旋及β片相对应的区段分别如在图1A及1B以及图1C以及10A和B中所示，在此不再一一赘述。 
实施例3 
氨基端多肽PA_N的晶体结构：
使用FR-EX-射线衍射仪(来自Rigaku)在1.5418埃的波长下首先收集到氨基端多肽PA_N的一套分辨率为2.9埃的母体数据。然后使用位于美国芝加哥APS的同步辐射仪(线站号码：SBC 19ID；检测屏：ADSC Q315)，在波长0.9783和0.9785埃波长下收集到这个蛋白晶体分辨率达到3.3埃左右的peak和edge两套硒原子衍生物晶体数据。利用HKL2000(Otwinowski 1997)处理所收得的三套数据，发现母体晶体的空间群是P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°；而重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°。利用多波长反常散射法(Hendrickson 1991)来进行计算相位，将处理得到的sca文件用SHELXD(Sheldrick 1998)来查找硒原子，共找到6个硒代甲硫氨酸，将硒原子坐标，以及处理得到的Peak和Edge两套数据输入程序MLPHARE，用它来计算相位，并进而使用DM程序做电子密度图的修饰，从计算得到的电子密度图上能非常清楚的看到数个二级结构(包括一些α螺旋和β折叠)，这样可以搭出大约80个残基，随后经过反复模型搭建以及使用CNS软件包程序修正，从而搭出初始模型。利用搭建的初始模型依据高分辨率的母体数据，使用Phaser程序做分子置换，从而获得母体数据的清晰解，进一步进行结构模型的搭建，并交替使用CNS进行修正。最终获得结构的R因子为 23.1％，自由R因子为25.2％。最后将三个水分子以及一个金属镁离子亦加入模型中。修正的结构最终R因子和R-free因子分别为23.1％和25.2％。。 
最终计算得到母体晶体的空间群是P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°，重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°。 
实施例4 
PA氨基端多肽PA_N结晶
将如上方法表达纯化好的PA氨基端多肽PA_N的复合物浓缩至浓度约为5-30mg/mL，用气相悬滴法使用结晶试剂(来自Hampton Research等公司的Screen Kit I/II、Index等试剂盒)筛选晶体生长条件。经过初步筛选，本发明人在多种不同的结晶试剂条件下获得了初始晶体。 
通过进一步优化，其中，在使用不同pH缓冲液的条件下(pH4-9)含有约25％PEG8000(获得母体晶体)或20％PEG3350(获得硒代甲硫氨酸晶体)溶液中都获得了外观良好的晶体。在pH 6.5的缓冲液中得到了较大的晶体，获得分辨率约为2.2埃左右的母体晶体，而获得的硒代晶体可衍射至3埃左右，获得了X射线衍射良好的晶体(参见图2A及图3的A-D晶体图片)。 
实施例5 
筛选竞争结合氨基端多肽PA_N的小分子的方法
在筛选一种可以使氨基端多肽PA_N的小分子药物过程中，将其中氨基端多肽PA_N的基因与表达GFP(绿色荧光蛋白)的基因融合，表达GFP融合的氨基端多肽PA_N，作为小分子化合物解聚蛋白质复合体的指示分子。通过分子克隆方法将氨基端多肽PA_N 基因片段连接到GFP基因片断上，以便表达一个氨基端连接有GFP的氨基端多肽PA_N融合蛋白。 
方法1：以如上所述表达纯化氨基端多肽PA_N的方法，表达纯化氨基端有GST的氨基端多肽PA_N融合蛋白即GST-PA_N融合蛋白。将GST-PA_N融合蛋白流经并结合到Glutathione亲和柱上。由于该氨基端多肽PA_N含有GFP蛋白，因此GST-PA_N结合该亲和柱后，与GST-PA_N结合的融合蛋白使该亲和柱呈绿色。结合GST-PA_N蛋白后的亲和柱用缓冲液充分洗涤，以彻底洗脱除去未结合的蛋白质。然后，将供筛选的小分子化合物的混合物流经该亲和柱(该混合物中不应含有Glutathione或者其它可以使GST脱离亲和柱而被洗脱下来的成分)。进一步从混合物中逐级分离纯化小分子，再通过如上的绿色GFP蛋白示踪方法，追踪可以结合PA_N多肽的成分，进而最终确定候选的小分子化合物。如上方法中，除了可以使用GST作为亲和介质外，还可以使用诸如Flag-tag、Myc-tag、MBP(Maltose binding protein麦芽糖结合蛋白)-tag、特异性抗体等其它多肽作为亲和介质结合基团，相应地，亲和层析柱也要用相应的亲和介质，如当使用Flag-tag时，可使用抗Flag-tag的抗体(例如Sigma Inc.公司的anti-flag单克隆抗体)，将其固定于亲和层析柱上作为结合Flag的凝胶介质。结合PA_N的化合物分子可以通过诸如质谱等方法来确定其化学结构。 
方法2：将PA_N单独纯化出来(融和蛋白或者非融和蛋白)，将其通过化学交联方法，共价交联到凝胶介质上，但保持蛋白质不变性。将同位素标记的小分子化合物或小肽流经共价结合了的凝胶柱，使同位素标记的小分子化合物或小肽与PA_N蛋白结合，如果有可以结合PA_N的化合物，就使得溶液中的小分子化合物或小肽浓度降低。使用缓冲液，洗脱凝胶柱以去除杂质，再使用尿素等使PA_N变性，使结合其上的小分子或小肽洗脱下来，通过质谱分析等方法，分析结合于PA_N上的小分子或小肽，进而获得该小分子或小肽的结构信息。该化合物可成为使PA_N失活的小分子药物。 
实施例6： 
利用PA_N多肽的晶体三维结构设计和筛选用于治疗流感病毒感染引起的疾病的各种多肽、蛋白质或无机或有机化合物的方法
利用流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体三维结构设计和筛选用于治疗流感病毒感染引起的疾病的各种多肽、蛋白质或无机或有机化合物，具体的步骤如下：根据蛋白质三维结构坐标，通过计算机模拟来设计结合特定部位的多肽及化合物分子；根据蛋白质三维结构坐标，通过计算机模拟来寻找可能结合特定部位的多肽及化合物分子；根据蛋白质三维结构坐标，设计或寻找的多肽及化合物分子结合到含有与所述的氨基端PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白中，进而分析结合情况的方法；根据蛋白质三维结构坐标，设计或寻找的多肽及化合物分子结合到含有与所述的氨基端PA_N序列含有至少50％相同序列的任一亚型的流感病毒聚合酶蛋白中并结晶，从而通过晶体衍射分析三维结构的方法分析多肽及化合物分子与蛋白的结合情况。 
实施例7： 
利用氨基端PA_N的晶体三维结构设计和筛选用于治疗流感病毒感染引起的疾病的小肽
所选用的多肽序列至少有3位氨基酸序列比对与如上多肽相同的多肽有可能成为潜在的干扰流感病毒聚合酶活性的多肽药物。 
任一亚型的流感病毒聚合酶亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的结构，其中所包含的一个蛋白质或其某一区段，与所述的氨基端PA_N多肽具有至少40％的相同序列。 
任一亚型的流感病毒聚合酶亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的结构，其中所包含的一个蛋白质或其某一区段的主 链三维结构坐标，与所述的氨基端PA_N多肽序列至少40％的主链碳骨架三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃。 
任一亚型的流感病毒聚合酶亚基PA、PB1、PB2或者PA、PB1和PB2复合体的结构，其中所包含的一个蛋白质区段与所述的PB1N多肽的氨基酸2-12区段具有40％的序列同源性。 
任何多肽或者小分子，与所述的流感病毒PA亚基上的关键氨基酸有相互作用。 
所述的结构在药物筛选及药物设计方面的应用。 
基于氨基端PA_N多肽三维结构进行与蛋白质结合的化合物或多肽筛选的方法，包括：通过蛋白结晶方法获得氨基端PA_N多肽晶体，该蛋白晶体具有P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°，重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°；通过X射线衍射晶体学技术，获得氨基端PA_N多肽的三维结构坐标；其中包括任何与该坐标中至少含有40％氨基酸残基的主链碳骨架三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃的结构。 
流感病毒亚型PA亚基蛋白的表达纯化方法：通过将PA分段在细菌或者真核表达系统进行表达，所述采用此方法表达纯化含有任何蛋白质中某一区段与所述的序列相应区段具有40％相同氨基酸序列的蛋白质。 
在一个优选的实施例中，氨基端PA_N多肽在设计和筛选用于治疗由流感病毒感染引起的疾病的多肽、蛋白质、化合物或药物中的应用。 
在一个优选的实施例中，用于治疗由流感病毒感染引起的疾病的多肽，包括与如上所述的氨基端PA_N多肽、至少一种所述的α螺旋或β片层、至少一个氨基酸位点相互作用的多肽。 
在一个优选的实施例中，用于治疗由流感病毒感染引起的疾病的蛋白质，包括与如上所述的氨基端PA_N多肽、至少一种所述的α螺旋或β片层、至少一个氨基酸位点相互作用的蛋白质。 
在一个优选的实施例中，用于治疗由流感病毒感染引起的疾病的化合物，包括与如上所述的氨基端PA_N多肽、至少一种所述的α螺旋或β片层、至少一个氨基酸位点相互作用的化合物。 
在一个优选的实施例中，药物组合物，包括如上所述的多肽、蛋白质或化合物。 
本发明的药物组合物通常包括一种载体或赋形剂，抗体和/或免疫结合物溶解于一种药学可接受的载体，水性载体为优选。许多种水性载体可被应用，如，缓冲盐水等。这些溶液是无菌的并且通常无不良物质。这些组分可通过常规的、众所周知的消毒技术进行消毒。这些组分可包括药学可接受的近似生理条件所需要的辅助物质，比如调节pH的缓冲剂、毒性调节剂等等，例如醋酸钠、氯化钠、氯化钾、氯化钙、乳酸钠等。这些组分中融合蛋白的浓度变化很大，主要根据与所选的特定给药方式和病人需要相一致的液体量、粘度、体重等等进行选择。 
因此，本发明中的一个典型的向脑部给药的药学免疫毒素组分应该每天施入大约1.2至1200ug。一个典型的通过静脉给药治疗乳腺、卵巢以及肺肿瘤的组分，每个病人每天给入大约0.1至10mg。每人每天0.1至100mg的给药量可以使用，尤其当药物要施入一个隐蔽的位置，并且没有进入血液循环或淋巴系统时，例如施入一个体腔或一个器官的腔隙。制备可施药组分的实际操作方法为专业人 员了解或掌握，在一些出版物中有详尽描述，例如Remington’sPHARMACEUTICAL SCIENCE，19th ed.，Mack Publishing Company，Easton，Pennsylvania(1995)。 
本发明中的组分可用于治疗处理。在治疗应用中，组分被施入一名患有某种疾病(比如一个胶质母细胞瘤、乳腺癌、卵巢癌以及肺癌)的病人，其剂量要足以至少能够减缓或部分控制该种疾病及其并发症。足以完成这些任务的剂量被称为“治疗有效剂量”。应用的有效剂量依赖于疾病的严重程度和病人的一般健康状况。该组分的有效剂量能够提供某种症状的主观可确认的缓解，抑或是被临床医师或其他有资格的观察者所记录的客观改善。 
患者需要和耐受的剂量及频率决定是否单次或多次给药。无论如何，应当提供足够量该免疫毒素，以有效地治疗患者。优选地，药物剂量一次性给入，但也可能周期性地给入，直至达到某种治疗效果或不良反应阻止了治疗的继续。通常，这些剂量足以治疗或改善疾病的症状而不引起病人不能耐受的毒性。 
本发明的免疫结合物可制备成胃肠外缓释剂型(如植入物、油注射液、或微粒子系统)。对蛋白递送系统的全面了解可参见Banga，A.J.，THERAPEUTIC PEPTIDES AND PROTEINS：FORMULATION，PROCESSING，AND DELIVERY SYSTEMS，Technomic Publishing Company，Inc.，Lancaster，PA，(1995)。微粒子系统包括微球体、微粒、微胶囊、纳米微胶囊、纳米微球体、以及纳米微粒。微胶囊以疗效蛋白作为一个核心。在小球体中，治疗性物质分散于粒子中。小于大约1μm的粒子、微球体、以及微胶囊通常分别被称为纳米微粒、纳米球体、和纳米微胶囊。毛细血管的直径大约为5μm，所以只有纳米微粒可经静脉给药。微粒子的直径大约为100μm，通过皮下或肌肉注射给药。例见，Kreuter，J.，COLLOIDAL DRUG DELIVERY SYSTEMS，J.Kreuter， ed.，Marcel Dekker，Inc.，New York，NY，pp.219-342(1994)；以及Tice& Tabibi，TREATISE ON CONTROLLED DRUG DELIVERY，A.Kydonieus，ed.，Marcel Dekker，Inc.New York，NY，pp.315-339，(1992)，二者在此均被引用。 
多聚体可被用于本发明中的免疫结合物组分的离子控制释放。多种可用以药物控制释放的可降解和不可降解的多聚体系在专业领域众所周知(Langer，R.，Accounts Chem.Res.26：537-542(1993))。例如，阻滞多聚体polaxamer 407在低温下是粘性但可流动的，但在体温下形成半固体凝胶。它被证明是重组白细胞介素-2和尿素酶的形成和持续输送的一个有效载体(Johnston等，Pharm.Res.9：425-434(1992)；及Pec等，J.Parent.Sci.Tech.44(2)：58-65(1990))。同样地，羟基磷灰石也已被用作蛋白控制释放的一个微载体(Ijntema等，Int.J.Pharm.112：215-224(1994))。然而另一方面，脂质体被用于脂类包被的药物的控制释放和靶向运输过程(Betageri等，LIPOSOME DRUG DELIVERY SYSTEMS，Technomic Publishing Co.，Inc.，Lancaster，PA(1993))。许多其它的治疗蛋白控制释放系统已被了解。例见，美国专利，编号5,055,303，5,188,837，4,235,871，4,501,728，4,837,028，4,957,735和5,019,369，5,055,303；5,514,670；5,413,797；5,268,164；5,004,697；4,902,505；5,506,206，5,271,961；5,254,342以及5,534,496，其中任何一个都在此被引用。 
实验结果 
表1单分子的PA_N原子坐标群如下： 
注释  坐标创建日期：2008年05月08日，编辑日期：2009年2月1日。 
注释  3  高分辨率范围(埃)：2.2 
注释  3  低分辨率范围(埃)：30 
                         X坐标    Y坐标 Z坐标占有率温度因子   原子 
原子  1  CB  LEU A -2    3.950    4.473 -17.980  1.00 42.68    A 
原子  2  CG  LEU A -2    3.113    3.369 -17.352  1.00 46.79    A 
原子  3  CD1 LEU A -2    1.703    3.867 -17.027  1.00 39.32    A 
原子    4   CD2 LEU A  -2   3.090     2.207  -18.307   1.00 45.13   A 
原子    5   C   LEU A  -2   5.682     5.991  -17.097   1.00 41.97   A 
原子    6   O   LEU A  -2   5.934     6.563  -18.159   1.00 42.15   A 
原子    7   N   LEU A  -2   3.258     6.395  -16.620   1.00 47.49   A 
原子    8   CA  LEU A  -2   4.330     5.390  -16.837   1.00 44.02   A 
原子    9   N   GLY A  -1   6.533     5.854  -16.087   1.00 42.00   A 
原子    10  CA  GLY A  -1   7.882     6.349  -16.164   1.00 40.64   A 
原子    11  C   GLY A  -1   8.680     5.318  -16.925   1.00 41.01   A 
原子    12  O   GLY A  -1   8.114     4.427  -17.544   1.00 44.33   A 
原子    13  N   SER A  0    9.995     5.453  -16.912   1.00 40.13   A 
原子    14  CA  SER A  0    10.881    4.524  -17.610   1.00 41.09   A 
原子    15  CB  SER A  0    11.918    5.355  -18.360   1.00 41.31   A 
原子    16  OG  SER A  0    12.929    4.549  -18.922   1.00 47.46   A 
原子    17  C   SER A  0    11.556    3.640  -16.550   1.00 39.90   A 
原子    18  O   SER A  0    12.102    4.178  -15.578   1.00 40.03   A 
原子    19  N   MET A  1    11.538    2.309  -16.680   1.00 37.39   A 
原子    20  CA  MET A  1    12.180    1.527  -15.616   1.00 35.12   A 
原子    21  CB  MET A  1    11.891    0.025  -15.681   1.00 32.68   A 
原子    22  CG  MET A  1    12.678    -0.726 -14.573   1.00 31.16   A 
原子    23  SD  MET A  1    11.985    -0.567 -12.881   1.00 35.48   A 
原子    24  CE  MET A  1    10.653    -1.712 -13.127   1.00 35.22   A 
原子    25  C   MET A  1    13.673    1.674  -15.590   1.00 35.84   A 
原子    26  O   MET A  1    14.281    1.637  -14.534   1.00 36.20   A 
原子    27  N   GLU A  2    14.257    1.813  -16.766   1.00 37.08   A 
原子    28  CA  GLU A  2    15.694    1.949  -16.905   1.00 42.95   A 
原子    29  CB  GLU A  2    16.001    1.955  -18.391   1.00 43.58   A 
原子    30  CG  GLU A  2    17.253    1.267  -18.786   1.00 49.09   A 
原子    31  CD  GLU A  2    18.072    2.155  -19.661   1.00 50.99   A 
原子    32  OE1 GLU A  2    17.572    2.546  -20.732   1.00 48.73   A 
原子    33  OE2 GLU A  2    19.203    2.480  -19.259   1.00 57.22   A 
原子    34  C   GLU A  2    16.188    3.232  -16.187   1.00 43.64   A 
原子    35  O   GLU A  2    17.312    3.281  -15.669   1.00 42.26   A 
原子    36  N   ASP A  3    15.314    4.248  -16.155   1.00 45.03   A 
原子    37  CA  ASP A  3    15.544    5.547  -15.492   1.00 46.05   A 
原子    38  CB  ASP A  3    14.448    6.586  -15.810   1.00 49.57   A 
原子    39  CG  ASP A  3    14.576    7.257  -17.168   1.00 50.47   A 
原子    40  OD1 ASP A  3    13.734    8.159  -17.411   1.00 55.29   A 
原子    41  OD2 ASP A  3    15.453    6.908  -17.979   1.00 49.01   A 
原子    42  C   ASP A  3    15.412    5.330  -13.993   1.00 46.74   A 
原子    43  O   ASP A  3    16.231    5.797  -13.199   1.00 50.29   A 
原子    44  N   PHE A  4    14.332    4.653  -13.615   1.00 44.42   A 
原子    45  CA  PHE A  4    14.072    4.403  -12.207   1.00 42.70   A 
原子    46  CB  PHE A  4    12.787    3.579  -12.050   1.00 39.48   A 
原子    47  CG  PHE A  4    12.687    2.841  -10.751   1.00 37.51   A 
原子    48  CD1 PHE A  4    12.130    3.437  -9.611    1.00 36.82   A 
原子    49  CD2 PHE A  4    13.188    1.546  -10.654   1.00 31.62   A 
原子    50  CE1 PHE A  4    12.084    2.734  -8.389    1.00 35.90   A 
原子    51  CE2 PHE A  4    13.145    0.848  -9.450    1.00 30.43   A 
原子    52  CZ  PHE A 4  12.597   1.438  -8.318   1.00 30.97   A 
原子    53  C   PHE A 4  15.263   3.672  -11.617  1.00 42.90   A 
原子    54  O   PHE A 4  15.826   4.091  -10.626  1.00 43.95   A 
原子    55  N   VAL A 5  15.659   2.582  -12.246  1.00 44.15   A 
原子    56  CA  VAL A 5  16.788   1.826  -11.746  1.00 42.86   A 
原子    57  CB  VAL A 5  17.055   0.638  -12.676  1.00 40.10   A 
原子    58  CG1 VAL A 5  18.535   0.306  -12.684  1.00 39.97   A 
原子    59  CG2 VAL A 5  16.221   -0.545 -12.194  1.00 37.11   A 
原子    60  C   VAL A 5  18.078   2.650  -11.537  1.00 42.69   A 
原子    61  O   VAL A 5  18.836   2.409  -10.612  1.00 40.16   A 
原子    62  N   ARG A 6  18.335   3.634  -12.381  1.00 45.00   A 
原子    63  CA  ARG A 6  19.575   4.400  -12.229  1.00 46.37   A 
原子    64  CB  ARG A 6  20.003   4.967  -13.581  1.00 42.81   A 
原子    65  CG  ARG A 6  20.450   3.885  -14.536  1.00 38.09   A 
原子    66  CD  ARG A 6  20.756   4.430  -15.932  1.00 40.42   A 
原子    67  NE  ARG A 6  20.923   3.360  -16.918  1.00 40.98   A 
原子    68  CZ  ARG A 6  21.986   2.560  -17.003  1.00 42.59   A 
原子    69  NH1 ARG A 6  23.006   2.697  -16.163  1.00 42.00   A 
原子    70  NH2 ARG A 6  22.019   1.600  -17.922  1.00 44.47   A 
原子    71  C   ARG A 6  19.634   5.503  -11.187  1.00 46.76   A 
原子    72  O   ARG A 6  20.714   5.834  -10.692  1.00 49.73   A 
原子    73  N   GLN A 7  18.486   6.079  -10.868  1.00 48.18   A 
原子    74  CA  GLN A 7  18.434   7.140  -9.884   1.00 51.56   A 
原子    75  CB  GLN A 7  17.509   8.289  -10.403  1.00 53.67   A 
原子    76  CG  GLN A 7  16.327   7.877  -11.373  1.00 61.44   A 
原子    77  CD  GLN A 7  16.282   8.626  -12.753  1.00 64.49   A 
原子    78  OE1 GLN A 7  15.438   9.510  -12.985  1.00 62.59   A 
原子    79  NE2 GLN A 7  17.176   8.240  -13.667  1.00 63.60   A 
原子    80  C   GLN A 7  17.982   6.567  -8.542   1.00 52.89   A 
原子    81  O   GLN A 7  17.831   7.289  -7.560   1.00 56.01   A 
原子    82  N   CYS A 8  17.814   5.248  -8.498   1.00 56.56   A 
原子    83  CA  CYS A 8  17.344   4.573  -7.284   1.00 57.62   A 
原子    84  CB  CYS A 8  15.996   3.940  -7.553   1.00 63.28   A 
原子    85  SG  CYS A 8  15.683   2.467  -6.567   1.00 74.56   A 
原子    86  C   CYS A 8  18.262   3.528  -6.647   1.00 56.08   A 
原子    87  O   CYS A 8  18.208   3.320  -5.438   1.00 54.96   A 
原子    88  N   PHE A 9  19.074   2.833  -7.428   1.00 53.84   A 
原子    89  CA  PHE A 9  19.979   1.915  -6.776   1.00 53.37   A 
原子    90  CB  PHE A 9  20.061   0.530  -7.463   1.00 52.01   A 
原子    91  CG  PHE A 9  18.795   -0.252 -7.378   1.00 48.64   A 
原子    92  CD1 PHE A 9  17.768   -0.011 -8.283   1.00 46.82   A 
原子    93  CD2 PHE A 9  18.597   -1.184 -6.368   1.00 47.14   A 
原子    94  CE1 PHE A 9  16.550   -0.683 -8.187   1.00 48.45   A 
原子    95  CE2 PHE A 9  17.375   -1.870 -6.258   1.00 48.65   A 
原子    96  CZ  PHE A 9  16.350   -1.610 -7.177   1.00 46.42   A 
原子    97  C   PHE A 9  21.313   2.606  -6.824   1.00 54.11   A 
原子    98  O   PHE A 9  21.534   3.531  -7.600   1.00 51.32   A 
原子    99  N   ASN A 10 22.180   2.128  -5.950   1.00 55.46   A 
原子    100  CA  ASN A  10    23.553  2.569  -5.791  1.00 55.38  A 
原子    101  CB  ASN A  10    24.150  1.710  -4.674  1.00 58.76  A 
原子    102  CG  ASN A  10    25.644  1.749  -4.631  1.00 60.59  A 
原子    103  OD1 ASN A  10    26.231  2.300  -3.705  1.00 65.69  A 
原子    104  ND2 ASN A  10    26.278  1.147  -5.626  1.00 63.98  A 
原子    105  C   ASN A  10    24.233  2.345  -7.143  1.00 54.66  A 
原子    106  O   ASN A  10    23.922  1.377  -7.806  1.00 52.86  A 
原子    107  N   PRO A  11    25.168  3.224  -7.562  1.00 53.42  A 
原子    108  CD  PRO A  11    25.728  4.370  -6.826  1.00 52.23  A 
原子    109  CA  PRO A  11    25.850  3.066  -8.862  1.00 51.84  A 
原子    110  CB  PRO A  11    26.834  4.236  -8.884  1.00 49.10  A 
原子    111  CG  PRO A  11    26.220  5.235  -7.960  1.00 50.95  A 
原子    112  C   PRO A  11    26.572  1.730  -9.082  1.00 50.92  A 
原子    113  O   PRO A  11    26.671  1.243  -10.208 1.00 54.87  A 
原子    114  N   MET A  12    27.098  1.176  -7.992  1.00 47.95  A 
原子    115  CA  MET A  12    27.839  -0.094 -7.971  1.00 48.68  A 
原子    116  CB  MET A  12    28.486  -0.252 -6.591  1.00 50.45  A 
原子    117  CG  MET A  12    29.802  -1.013 -6.529  1.00 55.26  A 
原子    118  SD  MET A  12    30.234  -1.375 -4.804  1.00 63.75  A 
原子    119  CE  MET A  12    30.364  0.325  -4.080  1.00 62.47  A 
原子    120  C   MET A  12    26.905  -1.296 -8.266  1.00 47.20  A 
原子    121  O   MET A  12    27.234  -2.143 -9.104  1.00 46.03  A 
原子    122  N   ILE A  13    25.756  -1.351 -7.581  1.00 45.58  A 
原子    123  CA  ILE A  13    24.754  -2.408 -7.754  1.00 45.11  A 
原子    124  CB  ILE A  13    23.474  -2.146 -6.844  1.00 43.43  A 
原子    125  CG2 ILE A  13    22.386  -3.175 -7.143  1.00 39.78  A 
原子    126  CG1 ILE A  13    23.832  -2.098 -5.357  1.00 38.45  A 
原子    127  CD1 ILE A  13    24.402  -3.328 -4.828  1.00 39.15  A 
原子    128  C   ILE A  13    24.338  -2.386 -9.230  1.00 45.07  A 
原子    129  O   ILE A  13    24.360  -3.415 -9.911  1.00 46.72  A 
原子    130  N   VAL A  14    23.991  -1.204 -9.732  1.00 43.32  A 
原子    131  CA  VAL A  14    23.580  -1.079 -11.132 1.00 45.47  A 
原子    132  CB  VAL A  14    23.142  0.388  -11.476 1.00 43.81  A 
原子    133  CG1 VAL A  14    23.105  0.615  -12.988 1.00 46.88  A 
原子    134  CG2 VAL A  14    21.771  0.658  -10.909 1.00 44.25  A 
原子    135  C   VAL A  14    24.658  -1.524 -12.099 1.00 47.57  A 
原子    136  O   VAL A  14    24.381  -2.175 -13.112 1.00 48.49  A 
原子    137  N   GLU A  15    25.895  -1.166 -11.782 1.00 49.11  A 
原子    138  CA  GLU A  15    27.009  -1.549 -12.635 1.00 50.47  A 
原子    139  CB  GLU A  15    28.266  -0.751 -12.238 1.00 52.20  A 
原子    140  CG  GLU A  15    28.869  0.117  -13.377 1.00 60.18  A 
原子    141  CD  GLU A  15    27.971  1.285  -13.861 1.00 65.65  A 
原子    142  OE1 GLU A  15    28.311  2.459  -13.573 1.00 66.66  A 
原子    143  OE2 GLU A  15    26.942  1.057  -14.550 1.00 65.06  A 
原子    144  C   GLU A  15    27.197  -3.081 -12.610 1.00 47.67  A 
原子    145  O   GLU A  15    27.290  -3.691 -13.656 1.00 47.11  A 
原子    146  N   LEU A  16    27.186  -3.699 -11.429 1.00 46.20  A 
原子    147  CA  LEU A  16    27.291  -5.165 -11.316 1.00 45.45  A 
原子    148  CB  LEU A  16  27.378  -5.592  -9.823  1.00 42.50  A 
原子    149  CG  LEU A  16  28.597  -5.225  -8.964  1.00 38.79  A 
原子    150  CD1 LEU A  16  28.341  -5.482  -7.478  1.00 31.13  A 
原子    151  CD2 LEU A  16  29.738  -6.063  -9.452  1.00 34.24  A 
原子    152  C   LEU A  16  26.109  -5.886  -12.013 1.00 45.51  A 
原子    153  O   LEU A  16  26.266  -6.972  -12.571 1.00 46.65  A 
原子    154  N   ALA A  17  24.930  -5.272  -11.999 1.00 43.51  A 
原子    155  CA  ALA A  17  23.757  -5.871  -12.664 1.00 46.11  A 
原子    156  CB  ALA A  17  22.433  -5.278  -12.114 1.00 42.78  A 
原子    157  C   ALA A  17  23.792  -5.735  -14.189 1.00 46.51  A 
原子    158  O   ALA A  17  23.214  -6.548  -14.923 1.00 47.54  A 
原子    159  N   GLU A  18  24.464  -4.692  -14.662 1.00 45.60  A 
原子    160  CA  GLU A  18  24.618  -4.498  -16.098 1.00 46.17  A 
原子    161  CB  GLU A  18  25.198  -3.107  -16.416 1.00 48.87  A 
原子    162  CG  GLU A  18  24.120  -2.177  -16.971 1.00 53.41  A 
原子    163  CD  GLU A  18  24.449  -0.706  -16.925 1.00 58.79  A 
原子    164  OE1 GLU A  18  24.917  -0.252  -15.865 1.00 61.00  A 
原子    165  OE2 GLU A  18  24.215  -0.018  -17.947 1.00 59.74  A 
原子    166  C   GLU A  18  25.506  -5.637  -16.585 1.00 46.33  A 
原子    167  O   GLU A  18  25.126  -6.350  -17.509 1.00 47.38  A 
原子    168  N   LYS A  19  26.632  -5.868  -15.906 1.00 46.80  A 
原子    169  CA  LYS A  19  27.526  -6.963  -16.293 1.00 44.28  A 
原子    170  CB  LYS A  19  28.834  -6.968  -15.442 1.00 45.41  A 
原子    171  CG  LYS A  19  29.452  -5.589  -14.958 1.00 49.67  A 
原子    172  CD  LYS A  19  30.367  -4.863  -15.995 1.00 55.59  A 
原子    173  CE  LYS A  19  31.055  -3.537  -15.484 1.00 59.67  A 
原子    174  NZ  LYS A  19  30.276  -2.241  -15.374 1.00 62.02  A 
原子    175  C   LYS A  19  26.805  -8.340  -16.151 1.00 43.48  A 
原子    176  O   LYS A  19  26.945  -9.199  -17.012 1.00 44.22  A 
原子    177  N   ALA A  20  26.031  -8.555  -15.087 1.00 40.80  A 
原子    178  CA  ALA A  20  25.341  -9.851  -14.950 1.00 38.48  A 
原子    179  CB  ALA A  20  24.496  -9.913  -13.662 1.00 32.85  A 
原子    180  C   ALA A  20  24.464  -10.130 -16.157 1.00 39.83  A 
原子    181  O   ALA A  20  24.339  -11.273 -16.614 1.00 41.50  A 
原子    182  N   MET A  21  23.874  -9.062  -16.680 1.00 41.34  A 
原子    183  CA  MET A  21  23.000  -9.122  -17.853 1.00 43.95  A 
原子    184  CB  MET A  21  22.110  -7.867  -17.874 1.00 42.74  A 
原子    185  CG  MET A  21  21.032  -7.878  -16.782 1.00 40.72  A 
原子    186  SD  MET A  21  19.675  -6.771  -17.157 1.00 42.46  A 
原子    187  CE  MET A  21  18.628  -7.810  -18.333 1.00 37.53  A 
原子    188  C   MET A  21  23.720  -9.314  -19.209 1.00 44.45  A 
原子    189  O   MET A  21  23.486  -10.303 -19.902 1.00 43.76  A 
原子    190  N   LYS A  22  24.615  -8.386  -19.555 1.00 46.28  A 
原子    191  CA  LYS A  22  25.378  -8.418  -20.811 1.00 48.64  A 
原子    192  CB  LYS A  22  26.303  -7.199  -20.872 1.00 49.17  A 
原子    193  CG  LYS A  22  25.548  -5.878  -20.753 1.00 50.98  A 
原子    194  CD  LYS A  22  26.451  -4.667  -20.927 1.00 55.86  A 
原子    195  CE  LYS A  22  27.480  -4.578  -19.811 1.00 55.75  A 
原子    196  NZ  LYS A 22  27.643 -3.181  -19.315  1.00 58.63  A 
原子    197  C   LYS A 22  26.168 -9.719  -21.027  1.00 50.64  A 
原子    198  O   LYS A 22  26.430 -10.118 -22.169  1.00 51.65  A 
原子    199  N   GLU A 23  26.526 -10.372 -19.917  1.00 53.81  A 
原子    200  CA  GLU A 23  27.255 -11.653 -19.908  1.00 54.64  A 
原子    201  CB  GLU A 23  27.688 -12.026 -18.468  1.00 54.60  A 
原子    202  CG  GLU A 23  27.981 -13.535 -18.265  1.00 57.32  A 
原子    203  CD  GLU A 23  28.482 -13.893 -16.860  1.00 56.55  A 
原子    204  OE1 GLU A 23  28.285 -13.095 -15.921  1.00 60.36  A 
原子    205  OE2 GLU A 23  29.075 -14.982 -16.696  1.00 53.41  A 
原子    206  C   GLU A 23  26.338 -12.725 -20.460  1.00 53.54  A 
原子    207  O   GLU A 23  26.763 -13.809 -20.830  1.00 52.19  A 
原子    208  N   TYR A 24  25.055 -12.402 -20.501  1.00 54.56  A 
原子    209  CA  TYR A 24  24.063 -13.336 -21.027  1.00 56.31  A 
原子    210  CB  TYR A 24  23.029 -13.708 -19.958  1.00 57.66  A 
原子    211  CG  TYR A 24  23.589 -14.649 -18.926  1.00 64.03  A 
原子    212  CD1 TYR A 24  24.298 -14.170 -17.825  1.00 65.84  A 
原子    213  CE1 TYR A 24  24.877 -15.044 -16.912  1.00 66.64  A 
原子    214  CD2 TYR A 24  23.480 -16.026 -19.090  1.00 65.92  A 
原子    215  CE2 TYR A 24  24.065 -16.909 -18.186  1.00 66.70  A 
原子    216  CZ  TYR A 24  24.760 -16.415 -17.104  1.00 68.77  A 
原子    217  OH  TYR A 24  25.322 -17.293 -16.198  1.00 67.91  A 
原子    218  C   TYR A 24  23.351 -12.774 -22.240  1.00 55.08  A 
原子    219  O   TYR A 24  22.244 -13.188 -22.579  1.00 55.69  A 
原子    220  N   GLY A 25  24.002 -11.828 -22.898  1.00 54.51  A 
原子    221  CA  GLY A 25  23.396 -11.228 -24.061  1.00 53.11  A 
原子    222  C   GLY A 25  22.022 -10.770 -23.655  1.00 52.36  A 
原子    223  O   GLY A 25  21.013 -11.165 -24.229  1.00 53.34  A 
原子    224  N   GLU A 26  21.983 -9.977  -22.602  1.00 51.94  A 
原子    225  CA  GLU A 26  20.727 -9.441  -22.153  1.00 51.53  A 
原子    226  CB  GLU A 26  20.298 -10.028 -20.791  1.00 54.80  A 
原子    227  CG  GLU A 26  19.047 -10.937 -20.924  1.00 55.63  A 
原子    228  CD  GLU A 26  18.834 -11.916 -19.764  1.00 58.44  A 
原子    229  OE1 GLU A 26  17.778 -12.595 -19.725  1.00 58.82  A 
原子    230  OE2 GLU A 26  19.724 -12.023 -18.897  1.00 58.97  A 
原子    231  C   GLU A 26  21.094 -7.985  -22.113  1.00 50.05  A 
原子    232  O   GLU A 26  22.167 -7.584  -21.639  1.00 50.48  A 
原子    233  N   ASP A 27  20.229 -7.216  -22.730  1.00 47.66  A 
原子    234  CA  ASP A 27  20.426 -5.818  -22.828  1.00 44.83  A 
原子    235  CB  ASP A 27  19.920 -5.397  -24.202  1.00 44.18  A 
原子    236  CG  ASP A 27  20.345 -4.028  -24.586  1.00 44.77  A 
原子    237  OD1 ASP A 27  20.673 -3.855  -25.773  1.00 47.00  A 
原子    238  OD2 ASP A 27  20.333 -3.135  -23.715  1.00 42.36  A 
原子    239  C   ASP A 27  19.595 -5.228  -21.700  1.00 43.93  A 
原子    240  O   ASP A 27  18.425 -5.558  -21.529  1.00 43.85  A 
原子    241  N   PRO A 28  20.221 -4.404  -20.860  1.00 42.74  A 
原子    242  CD  PRO A 28  21.681 -4.466  -20.723  1.00 40.77  A 
原子    243  CA  PRO A 28  19.571 -3.746  -19.723  1.00 41.90  A 
原子    244  CB  PRO A  28  20.723  -3.059  -18.974  1.00 42.27  A 
原子    245  CG  PRO A  28  21.985  -3.481  -19.663  1.00 41.06  A 
原子    246  C   PRO A  28  18.503  -2.764  -20.181  1.00 41.23  A 
原子    247  O   PRO A  28  17.531  -2.533  -19.464  1.00 42.06  A 
原子    248  N   LYS A  29  18.677  -2.221  -21.390  1.00 41.53  A 
原子    249  CA  LYS A  29  17.735  -1.249  -21.959  1.00 39.49  A 
原子    250  CB  LYS A  29  18.395  -0.407  -23.052  1.00 44.02  A 
原子    251  CG  LYS A  29  19.184  0.767   -22.527  1.00 44.99  A 
原子    252  CD  LYS A  29  19.978  1.395   -23.644  1.00 47.86  A 
原子    253  CE  LYS A  29  20.373  2.812   -23.280  1.00 51.87  A 
原子    254  NZ  LYS A  29  19.196  3.714   -23.171  1.00 53.96  A 
原子    255  C   LYS A  29  16.452  -1.829  -22.538  1.00 39.01  A 
原子    256  O   LYS A  29  15.432  -1.153  -22.597  1.00 32.75  A 
原子    257  N   ILE A  30  16.503  -3.073  -22.989  1.00 40.47  A 
原子    258  CA  ILE A  30  15.321  -3.696  -23.569  1.00 40.91  A 
原子    259  CB  ILE A  30  15.708  -4.749  -24.638  1.00 37.22  A 
原子    260  CG2 ILE A  30  14.462  -5.541  -25.065  1.00 38.23  A 
原子    261  CG1 ILE A  30  16.372  -4.050  -25.822  1.00 32.15  A 
原子    262  CD1 ILE A  30  17.028  -4.998  -26.797  1.00 35.02  A 
原子    263  C   ILE A  30  14.579  -4.395  -22.437  1.00 43.92  A 
原子    264  O   ILE A  30  13.358  -4.231  -22.269  1.00 44.73  A 
原子    265  N   GLU A  31  15.363  -5.144  -21.663  1.00 42.61  A 
原子    266  CA  GLU A  31  14.887  -5.939  -20.552  1.00 43.14  A 
原子    267  CB  GLU A  31  15.675  -7.211  -20.565  1.00 46.36  A 
原子    268  CG  GLU A  31  15.539  -7.959  -21.834  1.00 52.65  A 
原子    269  CD  GLU A  31  14.816  -9.236  -21.582  1.00 58.46  A 
原子    270  OE1 GLU A  31  13.567  -9.214  -21.527  1.00 61.85  A 
原子    271  OE2 GLU A  31  15.502  -10.263 -21.398  1.00 61.65  A 
原子    272  C   GLU A  31  14.980  -5.316  -19.164  1.00 40.85  A 
原子    273  O   GLU A  31  15.566  -5.902  -18.249  1.00 38.71  A 
原子    274  N   THR A  32  14.359  -4.155  -19.015  1.00 39.14  A 
原子    275  CA  THR A  32  14.350  -3.387  -17.781  1.00 37.11  A 
原子    276  CB  THR A  32  13.732  -2.025  -18.062  1.00 40.05  A 
原子    277  OG1 THR A  32  12.505  -2.185  -18.782  1.00 40.87  A 
原子    278  CG2 THR A  32  14.692  -1.190  -18.916  1.00 33.55  A 
原子    279  C   THR A  32  13.720  -3.976  -16.512  1.00 36.64  A 
原子    280  O   THR A  32  14.149  -3.640  -15.414  1.00 34.19  A 
原子    281  N   ASN A  33  12.712  -4.839  -16.644  1.00 38.30  A 
原子    282  CA  ASN A  33  12.089  -5.437  -15.472  1.00 37.16  A 
原子    283  CB  ASN A  33  10.723  -6.063  -15.841  1.00 36.89  A 
原子    284  CG  ASN A  33  9.575   -5.048  -15.775  1.00 33.43  A 
原子    285  OD1 ASN A  33  9.716   -3.986  -15.162  1.00 30.32  A 
原子    286  ND2 ASN A  33  8.425   -5.386  -16.368  1.00 31.48  A 
原子    287  C   ASN A  33  13.033  -6.424  -14.762  1.00 39.07  A 
原子    288  O   ASN A  33  12.977  -6.533  -13.532  1.00 41.04  A 
原子    289  N   LYS A  34  13.920  -7.115  -15.484  1.00 39.80  A 
原子    290  CA  LYS A  34  14.854  -8.004  -14.772  1.00 41.50  A 
原子    291  CB  LYS A  34  15.303  -9.145  -15.632  1.00 41.51  A 
原子    292  CG  LYS A  34  15.046 -8.929  -17.080  1.00 47.03  A 
原子    293  CD  LYS A  34  15.873 -9.871  -17.913  1.00 51.64  A 
原子    294  CE  LYS A  34  15.873 -11.292 -17.352  1.00 51.85  A 
原子    295  NZ  LYS A  34  16.923 -11.545 -16.313  1.00 54.15  A 
原子    296  C   LYS A  34  16.071 -7.210  -14.322  1.00 41.53  A 
原子    297  O   LYS A  34  16.649 -7.483  -13.266  1.00 43.70  A 
原子    298  N   PHE A  35  16.460 -6.221  -15.126  1.00 39.89  A 
原子    299  CA  PHE A  35  17.579 -5.332  -14.760  1.00 38.55  A 
原子    300  CB  PHE A  35  17.688 -4.218  -15.849  1.00 36.62  A 
原子    301  CG  PHE A  35  18.642 -3.077  -15.554  1.00 37.12  A 
原子    302  CD1 PHE A  35  18.310 -1.799  -16.017  1.00 37.37  A 
原子    303  CD2 PHE A  35  19.823 -3.230  -14.823  1.00 36.94  A 
原子    304  CE1 PHE A  35  19.161 -0.701  -15.784  1.00 43.08  A 
原子    305  CE2 PHE A  35  20.664 -2.133  -14.593  1.00 37.85  A 
原子    306  CZ  PHE A  35  20.310 -0.873  -15.068  1.00 38.28  A 
原子    307  C   PHE A  35  17.163 -4.886  -13.324  1.00 36.20  A 
原子    308  O   PHE A  35  17.878 -5.160  -12.371  1.00 36.26  A 
原子    309  N   ALA A  36  15.964 -4.338  -13.133  1.00 34.83  A 
原子    310  CA  ALA A  36  15.559 -3.976  -11.755  1.00 31.80  A 
原子    311  CB  ALA A  36  14.202 -3.270  -11.758  1.00 27.32  A 
原子    312  C   ALA A  36  15.536 -5.184  -10.768  1.00 30.83  A 
原子    313  O   ALA A  36  15.932 -5.057  -9.596   1.00 27.25  A 
原子    314  N   ALA A  37  15.086 -6.351  -11.246  1.00 30.32  A 
原子    315  CA  ALA A  37  15.066 -7.569  -10.409  1.00 30.71  A 
原子    316  CB  ALA A  37  14.353 -8.730  -11.140  1.00 28.33  A 
原子    317  C   ALA A  37  16.488 -7.991  -10.032  1.00 30.07  A 
原子    318  O   ALA A  37  16.752 -8.434  -8.919   1.00 30.03  A 
原子    319  N   ILE A  38  17.408 -7.864  -10.977  1.00 33.99  A 
原子    320  CA  ILE A  38  18.795 -8.212  -10.695  1.00 36.57  A 
原子    321  CB  ILE A  38  19.719 -8.127  -11.962  1.00 36.34  A 
原子    322  CG2 ILE A  38  21.169 -8.294  -11.533  1.00 35.22  A 
原子    323  CG1 ILE A  38  19.363 -9.223  -12.985  1.00 36.70  A 
原子    324  CD1 ILE A  38  18.349 -10.255 -12.507  1.00 39.19  A 
原子    325  C   ILE A  38  19.343 -7.299  -9.615   1.00 35.29  A 
原子    326  O   ILE A  38  19.920 -7.768  -8.657   1.00 38.26  A 
原子    327  N   CYS A  39  19.107 -5.998  -9.753   1.00 37.22  A 
原子    328  CA  CYS A  39  19.582 -4.992  -8.788   1.00 34.88  A 
原子    329  CB  CYS A  39  19.216 -3.570  -9.251   1.00 33.48  A 
原子    330  SG  CYS A  39  19.977 -3.015  -10.800  1.00 42.93  A 
原子    331  C   CYS A  39  19.082 -5.158  -7.358   1.00 32.00  A 
原子    332  O   CYS A  39  19.844 -5.057  -6.414   1.00 35.64  A 
原子    333  N   THR A  40  17.790 -5.412  -7.219   1.00 31.07  A 
原子    334  CA  THR A  40  17.144 -5.584  -5.923   1.00 28.40  A 
原子    335  CB  THR A  40  15.669 -5.888  -6.107   1.00 26.66  A 
原子    336  OG1 THR A  40  15.103 -4.888  -6.952   1.00 31.71  A 
原子    337  CG2 THR A  40  14.952 -5.924  -4.770   1.00 30.14  A 
原子    338  C   THR A  40  17.721 -6.737  -5.127   1.00 28.69  A 
原子    339  O   THR A  40  17.849 -6.681  -3.891   1.00 28.36  A 
原子    340  N   HIS A  41  18.020 -7.802  -5.860  1.00 27.91  A 
原子    341  CA  HIS A  41  18.545 -9.034  -5.294  1.00 28.27  A 
原子    342  CB  HIS A  41  18.352 -10.176 -6.279  1.00 25.16  A 
原子    343  CG  HIS A  41  19.159 -11.381 -5.946  1.00 22.38  A 
原子    344  CD2 HIS A  41  19.019 -12.294 -4.962  1.00 23.88  A 
原子    345  ND1 HIS A  41  20.273 -11.745 -6.665  1.00 23.29  A 
原子    346  CE1 HIS A  41  20.785 -12.841 -6.137  1.00 24.39  A 
原子    347  NE2 HIS A  41  20.045 -13.195 -5.102  1.00 24.18  A 
原子    348  C   HIS A  41  19.997 -8.903  -5.000  1.00 25.95  A 
原子    349  O   HIS A  41  20.539 -9.524  -4.112  1.00 26.54  A 
原子    350  N   LEU A  42  20.653 -8.131  -5.825  1.00 32.18  A 
原子    351  CA  LEU A  42  22.056 -7.915  -5.612  1.00 35.76  A 
原子    352  CB  LEU A  42  22.610 -7.136  -6.791  1.00 34.58  A 
原子    353  CG  LEU A  42  23.893 -7.576  -7.470  1.00 33.08  A 
原子    354  CD1 LEU A  42  24.264 -6.385  -8.295  1.00 33.98  A 
原子    355  CD2 LEU A  42  25.023 -7.909  -6.497  1.00 35.49  A 
原子    356  C   LEU A  42  22.067 -7.094  -4.313  1.00 37.40  A 
原子    357  O   LEU A  42  22.800 -7.388  -3.382  1.00 43.72  A 
原子    358  N   GLU A  43  21.177 -6.109  -4.222  1.00 39.03  A 
原子    359  CA  GLU A  43  21.116 -5.258  -3.027  1.00 40.12  A 
原子    360  CB  GLU A  43  20.155 -4.058  -3.216  1.00 43.45  A 
原子    361  CG  GLU A  43  20.610 -2.802  -2.429  1.00 48.40  A 
原子    362  CD  GLU A  43  19.638 -1.623  -2.508  1.00 51.64  A 
原子    363  OE1 GLU A  43  19.272 -1.182  -3.622  1.00 56.54  A 
原子    364  OE2 GLU A  43  19.245 -1.114  -1.440  1.00 52.79  A 
原子    365  C   GLU A  43  20.745 -6.007  -1.746  1.00 39.87  A 
原子    366  O   GLU A  43  21.152 -5.596  -0.659  1.00 41.49  A 
原子    367  N   VAL A  44  20.005 -7.110  -1.839  1.00 38.37  A 
原子    368  CA  VAL A  44  19.654 -7.826  -0.604  1.00 35.53  A 
原子    369  CB  VAL A  44  18.491 -8.828  -0.800  1.00 35.23  A 
原子    370  CG1 VAL A  44  18.304 -9.657  0.456   1.00 35.78  A 
原子    371  CG2 VAL A  44  17.204 -8.095  -1.116  1.00 36.61  A 
原子    372  C   VAL A  44  20.858 -8.621  -0.123  1.00 36.04  A 
原子    373  O   VAL A  44  21.116 -8.729  1.080   1.00 33.16  A 
原子    374  N   CYS A  45  21.583 -9.172  -1.090  1.00 34.25  A 
原子    375  CA  CYS A  45  22.764 -9.963  -0.819  1.00 35.83  A 
原子    376  CB  CYS A  45  23.336 -10.476 -2.141  1.00 35.02  A 
原子    377  SG  CYS A  45  22.362 -11.813 -2.936  1.00 40.03  A 
原子    378  C   CYS A  45  23.787 -9.106  -0.048  1.00 36.91  A 
原子    379  O   CYS A  45  24.556 -9.603  0.785   1.00 33.76  A 
原子    380  N   PHE A  46  23.792 -7.804  -0.316  1.00 38.49  A 
原子    381  CA  PHE A  46  24.700 -6.931  0.405   1.00 37.16  A 
原子    382  CB  PHE A  46  25.031 -5.660  -0.376  1.00 39.49  A 
原子    383  CG  PHE A  46  25.779 -5.902  -1.646  1.00 43.99  A 
原子    384  CD1 PHE A  46  26.892 -6.738  -1.676  1.00 46.57  A 
原子    385  CD2 PHE A  46  25.390 -5.274  -2.815  1.00 46.19  A 
原子    386  CE1 PHE A  46  27.603 -6.938  -2.856  1.00 44.28  A 
原子    387  CE2 PHE A  46  26.097 -5.473  -3.992  1.00 45.67  A 
原子    388  CZ  PHE A  46  27.203 -6.307  -4.010 1.00 40.31  A 
原子    389  C   PHE A  46  24.116 -6.529  1.749  1.00 37.48  A 
原子    390  O   PHE A  46  24.830 -6.485  2.745  1.00 37.98  A 
原子    391  N   MET A  47  22.825 -6.242  1.813  1.00 36.87  A 
原子    392  CA  MET A  47  22.283 -5.836  3.111  1.00 38.47  A 
原子    393  CB  MET A  47  20.777 -5.631  3.039  1.00 37.55  A 
原子    394  CG  MET A  47  20.355 -4.487  2.128  1.00 42.04  A 
原子    395  SD  MET A  47  18.766 -3.804  2.560  1.00 43.14  A 
原子    396  CE  MET A  47  17.614 -4.743  1.404  1.00 43.24  A 
原子    397  C   MET A  47  22.590 -6.942  4.117  1.00 40.63  A 
原子    398  O   MET A  47  23.003 -6.697  5.257  1.00 42.62  A 
原子    399  N   TYR A  48  22.404 -8.163  3.623  1.00 39.69  A 
原子    400  CA  TYR A  48  22.594 -9.432  4.320  1.00 37.34  A 
原子    401  CB  TYR A  48  21.958 -10.517 3.409  1.00 38.09  A 
原子    402  CG  TYR A  48  21.451 -11.799 4.049  1.00 35.80  A 
原子    403  CD1 TYR A  48  22.324 -12.657 4.697  1.00 36.18  A 
原子    404  CE1 TYR A  48  21.878 -13.877 5.243  1.00 34.95  A 
原子    405  CD2 TYR A  48  20.096 -12.162 3.969  1.00 38.08  A 
原子    406  CE2 TYR A  48  19.635 -13.373 4.497  1.00 37.87  A 
原子    407  CZ  TYR A  48  20.533 -14.219 5.144  1.00 36.76  A 
原子    408  OH  TYR A  48  20.080 -15.407 5.657  1.00 35.00  A 
原子    409  C   TYR A  48  24.027 -9.820  4.775  1.00 37.15  A 
原子    410  O   TYR A  48  24.174 -10.424 5.839  1.00 34.29  A 
原子    411  N   SER A  49  25.074 -9.510  3.995  1.00 39.36  A 
原子    412  CA  SER A  49  26.449 -9.886  4.415  1.00 43.91  A 
原子    413  CB  SER A  49  27.481 -9.839  3.253  1.00 45.79  A 
原子    414  OG  SER A  49  27.049 -9.073  2.141  1.00 48.61  A 
原子    415  C   SER A  49  27.017 -9.082  5.580  1.00 44.28  A 
原子    416  O   SER A  49  27.129 -7.865  5.505  1.00 45.47  A 
原子    417  N   ARG A  75  31.819 -11.861 8.497  1.00 41.95  A 
原子    418  CA  ARG A  75  31.154 -13.133 8.780  1.00 42.91  A 
原子    419  CB  ARG A  75  29.935 -12.969 9.675  1.00 40.89  A 
原子    420  CG  ARG A  75  29.152 -14.320 9.740  1.00 46.35  A 
原子    421  CD  ARG A  75  27.688 -14.191 10.184 1.00 48.00  A 
原子    422  NE  ARG A  75  26.961 -15.466 10.264 1.00 49.52  A 
原子    423  CZ  ARG A  75  25.854 -15.613 10.985 1.00 49.57  A 
原子    424  NH1 ARG A  75  25.400 -14.572 11.660 1.00 49.18  A 
原子    425  NH2 ARG A  75  25.187 -16.762 11.026 1.00 47.00  A 
原子    426  C   ARG A  75  30.618 -13.816 7.544  1.00 44.58  A 
原子    427  O   ARG A  75  30.443 -15.035 7.517  1.00 42.56  A 
原子    428  N   PHE A  76  30.286 -13.001 6.559  1.00 44.38  A 
原子    429  CA  PHE A  76  29.735 -13.473 5.325  1.00 45.14  A 
原子    430  CB  PHE A  76  28.437 -12.736 5.047  1.00 42.47  A 
原子    431  CG  PHE A  76  27.315 -13.232 5.848  1.00 40.56  A 
原子    432  CD1 PHE A  76  26.734 -12.455 6.832  1.00 39.54  A 
原子    433  CD2 PHE A  76  26.892 -14.547 5.672  1.00 39.84  A 
原子    434  CE1 PHE A  76  25.719 -12.987 7.623  1.00 38.10  A 
原子    435  CE2 PHE A  76  25.900 -15.082 6.431  1.00 38.89  A 
原子    436  CZ  PHE A  76  25.312 -14.311  7.428   1.00 38.25  A 
原子    437  C   PHE A  76  30.707 -13.170  4.244   1.00 47.00  A 
原子    438  O   PHE A  76  31.500 -12.255  4.383   1.00 47.41  A 
原子    439  N   GLU A  77  30.653 -13.914  3.149   1.00 48.93  A 
原子    440  CA  GLU A  77  31.534 -13.617  2.026   1.00 51.25  A 
原子    441  CB  GLU A  77  32.574 -14.744  1.834   1.00 48.93  A 
原子    442  CG  GLU A  77  33.329 -14.713  0.502   1.00 53.34  A 
原子    443  CD  GLU A  77  34.294 -13.538  0.364   1.00 58.18  A 
原子    444  OE1 GLU A  77  35.426 -13.613  0.895   1.00 57.63  A 
原子    445  OE2 GLU A  77  33.919 -12.531  -0.278  1.00 61.59  A 
原子    446  C   GLU A  77  30.592 -13.497  0.827   1.00 52.25  A 
原子    447  O   GLU A  77  29.837 -14.440  0.569   1.00 52.35  A 
原子    448  N   ILE A  78  30.588 -12.347  0.126   1.00 54.08  A 
原子    449  CA  ILE A  78  29.705 -12.209  -1.050  1.00 52.39  A 
原子    450  CB  ILE A  78  29.509 -10.778  -1.676  1.00 53.38  A 
原子    451  CG2 ILE A  78  28.031 -10.589  -2.048  1.00 53.24  A 
原子    452  CG1 ILE A  78  30.100 -9.676   -0.803  1.00 55.99  A 
原子    453  CD1 ILE A  78  29.107 -8.842   -0.067  1.00 55.00  A 
原子    454  C   ILE A  78  30.313 -12.941  -2.216  1.00 51.21  A 
原子    455  O   ILE A  78  31.487 -12.754  -2.543  1.00 53.03  A 
原子    456  N   ILE A  79  29.469 -13.728  -2.864  1.00 47.56  A 
原子    457  CA  ILE A  79  29.812 -14.518  -4.032  1.00 43.50  A 
原子    458  CB  ILE A  79  29.273 -15.927  -3.845  1.00 40.48  A 
原子    459  CG2 ILE A  79  29.778 -16.847  -4.937  1.00 44.90  A 
原子    460  CG1 ILE A  79  29.666 -16.427  -2.453  1.00 37.21  A 
原子    461  CD1 ILE A  79  30.545 -17.632  -2.466  1.00 37.28  A 
原子    462  C   ILE A  79  29.115 -13.846  -5.215  1.00 43.40  A 
原子    463  O   ILE A  79  29.698 -13.684  -6.277  1.00 42.18  A 
原子    464  N   GLU A  80  27.864 -13.441  -4.994  1.00 44.19  A 
原子    465  CA  GLU A  80  27.035 -12.759  -5.996  1.00 44.54  A 
原子    466  CB  GLU A  80  25.628 -12.518  -5.442  1.00 44.85  A 
原子    467  CG  GLU A  80  24.668 -11.886  -6.439  1.00 45.12  A 
原子    468  CD  GLU A  80  24.475 -12.745  -7.664  1.00 43.40  A 
原子    469  OE1 GLU A  80  25.298 -12.648  -8.597  1.00 43.73  A 
原子    470  OE2 GLU A  80  23.506 -13.529  -7.683  1.00 45.10  A 
原子    471  C   GLU A  80  27.613 -11.404  -6.368  1.00 43.67  A 
原子    472  O   GLU A  80  28.053 -10.674  -5.494  1.00 46.02  A 
原子    473  N   GLY A  81  27.591 -11.048  -7.647  1.00 43.11  A 
原子    474  CA  GLY A  81  28.110 -9.745   -8.030  1.00 44.72  A 
原子    475  C   GLY A  81  29.525 -9.816   -8.563  1.00 45.52  A 
原子    476  O   GLY A  81  29.956 -8.954   -9.325  1.00 47.39  A 
原子    477  N   ARG A  82  30.247 -10.855  -8.160  1.00 45.70  A 
原子    478  CA  ARG A  82  31.614 -11.067  -8.613  1.00 45.43  A 
原子    479  CB  ARG A  82  32.382 -12.023  -7.654  1.00 44.98  A 
原子    480  CG  ARG A  82  32.606 -11.555  -6.199  1.00 46.17  A 
原子    481  CD  ARG A  82  33.412 -12.624  -5.390  1.00 48.12  A 
原子    482  NE  ARG A  82  33.592 -12.256  -3.983  1.00 51.12  A 
原子    483  CZ  ARG A  82  34.683 -11.673  -3.483  1.00 54.24  A 
原子    484  NH1 ARG A  82  35.721 -11.385 -4.266  1.00 56.07  A 
原子    485  NH2 ARG A  82  34.740 -11.365 -2.194  1.00 54.61  A 
原子    486  C   ARG A  82  31.636 -11.697 -10.009 1.00 45.82  A 
原子    487  O   ARG A  82  30.727 -12.439 -10.373 1.00 45.46  A 
原子    488  N   ASP A  83  32.724 -11.431 -10.733 1.00 44.64  A 
原子    489  CA  ASP A  83  32.989 -11.974 -12.054 1.00 45.15  A 
原子    490  CB  ASP A  83  34.345 -11.440 -12.539 1.00 48.61  A 
原子    491  CG  ASP A  83  34.748 -11.969 -13.897 1.00 49.45  A 
原子    492  OD1 ASP A  83  35.527 -12.948 -13.957 1.00 50.94  A 
原子    493  OD2 ASP A  83  34.295 -11.396 -14.907 1.00 50.04  A 
原子    494  C   ASP A  83  33.030 -13.479 -11.873 1.00 44.55  A 
原子    495  O   ASP A  83  33.655 -13.956 -10.953 1.00 43.23  A 
原子    496  N   ARG A  84  32.351 -14.208 -12.752 1.00 43.58  A 
原子    497  CA  ARG A  84  32.263 -15.675 -12.710 1.00 42.66  A 
原子    498  CB  ARG A  84  31.778 -16.190 -14.056 1.00 43.43  A 
原子    499  CG  ARG A  84  30.597 -17.099 -13.969 1.00 48.53  A 
原子    500  CD  ARG A  84  30.291 -17.679 -15.319 1.00 55.45  A 
原子    501  NE  ARG A  84  28.900 -18.087 -15.400 1.00 62.20  A 
原子    502  CZ  ARG A  84  28.446 -18.985 -16.268 1.00 66.57  A 
原子    503  NH1 ARG A  84  29.282 -19.572 -17.124 1.00 67.32  A 
原子    504  NH2 ARG A  84  27.155 -19.293 -16.293 1.00 68.30  A 
原子    505  C   ARG A  84  33.537 -16.421 -12.337 1.00 40.76  A 
原子    506  O   ARG A  84  33.507 -17.367 -11.559 1.00 40.00  A 
原子    507  N   THR A  85  34.650 -15.987 -12.915 1.00 39.50  A 
原子    508  CA  THR A  85  35.947 -16.593 -12.680 1.00 39.49  A 
原子    509  CB  THR A  85  36.968 -16.060 -13.754 1.00 36.42  A 
原子    510  OG1 THR A  85  36.763 -16.742 -15.008 1.00 42.11  A 
原子    511  CG2 THR A  85  38.377 -16.230 -13.298 1.00 38.23  A 
原子    512  C   THR A  85  36.421 -16.350 -11.242 1.00 38.76  A 
原子    513  O   THR A  85  37.020 -17.224 -10.623 1.00 38.87  A 
原子    514  N   MET A  86  36.121 -15.162 -10.720 1.00 41.86  A 
原子    515  CA  MET A  86  36.462 -14.750 -9.343  1.00 44.33  A 
原子    516  CB  MET A  86  36.161 -13.242 -9.170  1.00 49.50  A 
原子    517  CG  MET A  86  36.667 -12.633 -7.861  1.00 57.79  A 
原子    518  SD  MET A  86  38.349 -13.229 -7.482  1.00 66.07  A 
原子    519  CE  MET A  86  39.057 -11.836 -6.502  1.00 64.38  A 
原子    520  C   MET A  86  35.643 -15.564 -8.339  1.00 42.01  A 
原子    521  O   MET A  86  36.150 -16.092 -7.342  1.00 40.76  A 
原子    522  N   ALA A  87  34.360 -15.662 -8.674  1.00 40.62  A 
原子    523  CA  ALA A  87  33.337 -16.376 -7.911  1.00 40.93  A 
原子    524  CB  ALA A  87  31.984 -16.217 -8.619  1.00 42.27  A 
原子    525  C   ALA A  87  33.651 -17.849 -7.671  1.00 40.41  A 
原子    526  O   ALA A  87  33.531 -18.352 -6.556  1.00 39.41  A 
原子    527  N   TRP A  88  34.058 -18.543 -8.725  1.00 42.61  A 
原子    528  CA  TRP A  88  34.441 -19.936 -8.564  1.00 42.23  A 
原子    529  CB  TRP A  88  34.422 -20.683 -9.915  1.00 40.21  A 
原子    530  CG  TRP A  88  33.008 -21.102 -10.366 1.00 40.99  A 
原子    531  CD2 TRP A  88  32.153 -22.081 -9.739  1.00 42.30  A 
原子    532  CE2 TRP A  88  30.924 -22.088  -10.446 1.00 40.77  A 
原子    533  CE3 TRP A  88  32.312 -22.960  -8.654  1.00 41.86  A 
原子    534  CD1 TRP A  88  32.270 -20.573  -11.404 1.00 39.66  A 
原子    535  NE1 TRP A  88  31.018 -21.160  -11.451 1.00 40.72  A 
原子    536  CZ2 TRP A  88  29.858 -22.924  -10.086 1.00 41.45  A 
原子    537  CZ3 TRP A  88  31.248 -23.789  -8.304  1.00 39.24  A 
原子    538  CH2 TRP A  88  30.045 -23.768  -9.022  1.00 38.44  A 
原子    539  C   TRP A  88  35.795 -20.024  -7.846  1.00 43.60  A 
原子    540  O   TRP A  88  36.021 -20.933  -7.065  1.00 45.98  A 
原子    541  N   THR A  89  36.676 -19.057  -8.064  1.00 43.15  A 
原子    542  CA  THR A  89  37.956 -19.060  -7.347  1.00 45.86  A 
原子    543  CB  THR A  89  38.862 -17.863  -7.860  1.00 47.26  A 
原子    544  OG1 THR A  89  39.275 -18.123  -9.216  1.00 49.62  A 
原子    545  CG2 THR A  89  40.093 -17.667  -7.010  1.00 47.94  A 
原子    546  C   THR A  89  37.580 -19.004  -5.842  1.00 44.42  A 
原子    547  O   THR A  89  37.792 -19.980  -5.141  1.00 46.98  A 
原子    548  N   VAL A  90  36.922 -17.934  -5.390  1.00 43.78  A 
原子    549  CA  VAL A  90  36.469 -17.807  -3.990  1.00 40.57  A 
原子    550  CB  VAL A  90  35.498 -16.584  -3.809  1.00 41.79  A 
原子    551  CG1 VAL A  90  35.054 -16.475  -2.348  1.00 42.03  A 
原子    552  CG2 VAL A  90  36.140 -15.319  -4.285  1.00 41.27  A 
原子    553  C   VAL A  90  35.712 -19.045  -3.470  1.00 39.99  A 
原子    554  O   VAL A  90  35.955 -19.504  -2.346  1.00 37.37  A 
原子    555  N   VAL A  91  34.780 -19.559  -4.278  1.00 37.69  A 
原子    556  CA  VAL A  91  34.016 -20.745  -3.875  1.00 36.06  A 
原子    557  CB  VAL A  91  32.857 -21.136  -4.893  1.00 37.21  A 
原子    558  CG1 VAL A  91  32.369 -22.586  -4.609  1.00 33.90  A 
原子    559  CG2 VAL A  91  31.666 -20.192  -4.755  1.00 38.20  A 
原子    560  C   VAL A  91  34.887 -21.992  -3.709  1.00 38.63  A 
原子    561  O   VAL A  91  34.792 -22.700  -2.712  1.00 37.86  A 
原子    562  N   ASN A  92  35.740 -22.273  -4.682  1.00 39.13  A 
原子    563  CA  ASN A  92  36.553 -23.475  -4.581  1.00 41.25  A 
原子    564  CB  ASN A  92  37.248 -23.756  -5.917  1.00 39.87  A 
原子    565  CG  ASN A  92  36.347 -24.501  -6.871  1.00 44.60  A 
原子    566  OD1 ASN A  92  35.875 -23.951  -7.858  1.00 44.24  A 
原子    567  ND2 ASN A  92  36.073 -25.759  -6.557  1.00 50.21  A 
原子    568  C   ASN A  92  37.544 -23.539  -3.420  1.00 42.53  A 
原子    569  O   ASN A  92  37.778 -24.619  -2.851  1.00 42.46  A 
原子    570  N   SER A  93  38.094 -22.392  -3.039  1.00 44.28  A 
原子    571  CA  SER A  93  39.035 -22.361  -1.937  1.00 46.79  A 
原子    572  CB  SER A  93  40.059 -21.257  -2.120  1.00 45.93  A 
原子    573  OG  SER A  93  39.515 -19.997  -1.794  1.00 44.54  A 
原子    574  C   SER A  93  38.260 -22.158  -0.638  1.00 50.53  A 
原子    575  O   SER A  93  38.837 -21.831  0.386   1.00 51.99  A 
原子    576  N   ILE A  94  36.940 -22.277  -0.689  1.00 51.53  A 
原子    577  CA  ILE A  94  36.212 -22.243  0.557   1.00 51.51  A 
原子    578  CB  ILE A  94  34.842 -21.509  0.492   1.00 50.23  A 
原子    579  CG2 ILE A  94  33.841 -22.222  1.421   1.00 48.98  A 
原子    580  CG1 ILE A  94   34.999 -20.072  1.024  1.00 50.40  A 
原子    581  CD1 ILE A  94   34.041 -19.069  0.481  1.00 47.99  A 
原子    582  C   ILE A  94   36.071 -23.750  0.698  1.00 53.15  A 
原子    583  O   ILE A  94   36.571 -24.307  1.658  1.00 55.61  A 
原子    584  N   CYS A  95   35.491 -24.409  -0.305 1.00 52.06  A 
原子    585  CA  CYS A  95   35.336 -25.857  -0.262 1.00 53.79  A 
原子    586  CB  CYS A  95   34.902 -26.393  -1.620 1.00 53.05  A 
原子    587  SG  CYS A  95   33.253 -25.840  -1.986 1.00 54.92  A 
原子    588  C   CYS A  95   36.554 -26.635  0.210  1.00 55.49  A 
原子    589  O   CYS A  95   36.478 -27.853  0.455  1.00 55.86  A 
原子    590  N   ASN A  96   37.690 -25.958  0.319  1.00 55.68  A 
原子    591  CA  ASN A  96   38.851 -26.666  0.806  1.00 55.18  A 
原子    592  CB  ASN A  96   39.666 -27.256  -0.360 1.00 56.31  A 
原子    593  CG  ASN A  96   40.012 -26.240  -1.425 1.00 57.52  A 
原子    594  OD1 ASN A  96   40.154 -26.575  -2.609 1.00 51.39  A 
原子    595  ND2 ASN A  96   40.193 -25.000  -1.009 1.00 57.95  A 
原子    596  C   ASN A  96   39.758 -26.018  1.875  1.00 56.82  A 
原子    597  O   ASN A  96   40.884 -26.467  2.075  1.00 58.67  A 
原子    598  N   THR A  97   39.299 -24.974  2.569  1.00 54.78  A 
原子    599  CA  THR A  97   40.109 -24.511  3.684  1.00 54.72  A 
原子    600  CB  THR A  97   40.333 -22.978  3.840  1.00 52.31  A 
原子    601  OG1 THR A  97   40.064 -22.258  2.628  1.00 52.23  A 
原子    602  CG2 THR A  97   41.793 -22.752  4.240  1.00 53.06  A 
原子    603  C   THR A  97   39.163 -25.009  4.762  1.00 56.04  A 
原子    604  O   THR A  97   39.578 -25.340  5.860  1.00 59.53  A 
原子    605  N   THR A  98   37.881 -25.077  4.400  1.00 55.67  A 
原子    606  CA  THR A  98   36.837 -25.620  5.259  1.00 53.77  A 
原子    607  CB  THR A  98   35.453 -24.945  4.994  1.00 53.83  A 
原子    608  OG1 THR A  98   34.906 -25.429  3.763  1.00 48.94  A 
原子    609  CG2 THR A  98   35.589 -23.424  4.916  1.00 51.70  A 
原子    610  C   THR A  98   36.862 -27.052  4.722  1.00 55.29  A 
原子    611  O   THR A  98   37.941 -27.594  4.589  1.00 58.04  A 
原子    612  N   GLY A  99   35.727 -27.671  4.405  1.00 56.19  A 
原子    613  CA  GLY A  99   35.774 -29.033  3.863  1.00 55.87  A 
原子    614  C   GLY A  99   34.465 -29.392  3.172  1.00 56.58  A 
原子    615  O   GLY A  99   34.192 -30.522  2.732  1.00 55.82  A 
原子    616  N   VAL A  100  33.663 -28.341  3.127  1.00 57.92  A 
原子    617  CA  VAL A  100  32.343 -28.216  2.539  1.00 55.66  A 
原子    618  CB  VAL A  100  31.980 -26.701  2.627  1.00 54.33  A 
原子    619  CG1 VAL A  100  30.527 -26.447  2.322  1.00 51.01  A 
原子    620  CG2 VAL A  100  32.382 -26.177  3.990  1.00 51.08  A 
原子    621  C   VAL A  100  32.479 -28.651  1.088  1.00 56.71  A 
原子    622  O   VAL A  100  33.513 -28.400  0.488  1.00 56.97  A 
原子    623  N   GLU A  101  31.447 -29.276  0.527  1.00 56.67  A 
原子    624  CA  GLU A  101  31.494 -29.737  -0.869 1.00 58.88  A 
原子    625  CB  GLU A  101  30.558 -30.957  -1.041 1.00 60.22  A 
原子    626  CG  GLU A  101  29.485 -31.099  0.040  1.00 62.20  A 
原子    627  CD  GLU A  101  29.841 -32.135  1.109  1.00 66.28  A 
原子    628  OE1 GLU A 101  31.036 -32.247  1.473   1.00 65.57  A 
原子    629  OE2 GLU A 101  28.922 -32.829  1.608   1.00 64.13  A 
原子    630  C   GLU A 101  31.141 -28.639  -1.886  1.00 58.15  A 
原子    631  O   GLU A 101  30.530 -27.645  -1.506  1.00 56.89  A 
原子    632  N   LYS A 102  31.495 -28.831  -3.155  1.00 56.94  A 
原子    633  CA  LYS A 102  31.213 -27.835  -4.151  1.00 57.30  A 
原子    634  CB  LYS A 102  32.011 -28.135  -5.476  1.00 57.07  A 
原子    635  CG  LYS A 102  33.221 -27.199  -5.709  1.00 60.89  A 
原子    636  CD  LYS A 102  34.200 -27.637  -6.848  1.00 64.34  A 
原子    637  CE  LYS A 102  35.371 -28.568  -6.402  1.00 66.72  A 
原子    638  NZ  LYS A 102  36.457 -28.042  -5.492  1.00 67.81  A 
原子    639  C   LYS A 102  29.728 -27.688  -4.445  1.00 55.88  A 
原子    640  O   LYS A 102  29.012 -28.670  -4.595  1.00 55.93  A 
原子    641  N   PRO A 103  29.240 -26.445  -4.481  1.00 53.38  A 
原子    642  CD  PRO A 103  29.775 -25.213  -3.876  1.00 53.53  A 
原子    643  CA  PRO A 103  27.816 -26.321  -4.793  1.00 51.50  A 
原子    644  CB  PRO A 103  27.529 -24.834  -4.587  1.00 51.32  A 
原子    645  CG  PRO A 103  28.527 -24.406  -3.606  1.00 53.26  A 
原子    646  C   PRO A 103  27.855 -26.623  -6.256  1.00 49.35  A 
原子    647  O   PRO A 103  28.928 -26.760  -6.799  1.00 50.06  A 
原子    648  N   LYS A 104  26.729 -26.726  -6.920  1.00 45.56  A 
原子    649  CA  LYS A 104  26.903 -26.942  -8.315  1.00 43.54  A 
原子    650  CB  LYS A 104  25.967 -28.037  -8.814  1.00 42.70  A 
原子    651  CG  LYS A 104  26.114 -29.216  -7.905  1.00 43.31  A 
原子    652  CD  LYS A 104  26.219 -30.554  -8.566  1.00 42.54  A 
原子    653  CE  LYS A 104  25.765 -31.572  -7.539  1.00 41.19  A 
原子    654  NZ  LYS A 104  24.378 -31.241  -7.085  1.00 44.29  A 
原子    655  C   LYS A 104  26.724 -25.604  -8.992  1.00 44.17  A 
原子    656  O   LYS A 104  27.351 -25.338  -10.012 1.00 41.08  A 
原子    657  N   PHE A 105  25.955 -24.718  -8.360  1.00 44.90  A 
原子    658  CA  PHE A 105  25.688 -23.397  -8.958  1.00 44.83  A 
原子    659  CB  PHE A 105  24.182 -23.165  -9.009  1.00 45.12  A 
原子    660  CG  PHE A 105  23.464 -24.091  -9.946  1.00 48.07  A 
原子    661  CD1 PHE A 105  23.311 -23.762  -11.288 1.00 49.36  A 
原子    662  CD2 PHE A 105  22.994 -25.331  -9.506  1.00 47.08  A 
原子    663  CE1 PHE A 105  22.717 -24.666  -12.184 1.00 46.35  A 
原子    664  CE2 PHE A 105  22.403 -26.234  -10.405 1.00 43.08  A 
原子    665  CZ  PHE A 105  22.263 -25.896  -11.735 1.00 44.50  A 
原子    666  C   PHE A 105  26.273 -22.024  -8.555  1.00 45.10  A 
原子    667  O   PHE A 105  25.914 -21.032  -9.176  1.00 47.09  A 
原子    668  N   LEU A 106  27.143 -21.888  -7.566  1.00 44.72  A 
原子    669  CA  LEU A 106  27.598 -20.519  -7.223  1.00 41.66  A 
原子    670  CB  LEU A 106  27.769 -19.646  -8.468  1.00 38.14  A 
原子    671  CG  LEU A 106  29.083 -19.561  -9.236  1.00 43.50  A 
原子    672  CD1 LEU A 106  29.340 -18.114  -9.745  1.00 39.91  A 
原子    673  CD2 LEU A 106  30.194 -19.983  -8.294  1.00 36.99  A 
原子    674  C   LEU A 106  26.474 -19.929  -6.403  1.00 38.26  A 
原子    675  O   LEU A 106  25.478 -19.450  -6.947  1.00 40.61  A 
原子    676  N   PRO A 107  26.602 -20.010  -5.078  1.00 33.25  A 
原子    677  CD  PRO A 107  27.691 -20.707  -4.380  1.00 34.70  A 
原子    678  CA  PRO A 107  25.607 -19.490  -4.145  1.00 34.72  A 
原子    679  CB  PRO A 107  26.044 -20.056  -2.795  1.00 31.70  A 
原子    680  CG  PRO A 107  27.033 -21.130  -3.112  1.00 35.82  A 
原子    681  C   PRO A 107  25.725 -17.980  -4.161  1.00 35.92  A 
原子    682  O   PRO A 107  26.451 -17.404  -4.982  1.00 33.74  A 
原子    683  N   ASP A 108  25.043 -17.329  -3.234  1.00 37.90  A 
原子    684  CA  ASP A 108  25.138 -15.884  -3.177  1.00 38.18  A 
原子    685  CB  ASP A 108  23.776 -15.275  -2.894  1.00 39.07  A 
原子    686  CG  ASP A 108  22.812 -15.439  -4.052  1.00 40.14  A 
原子    687  OD1 ASP A 108  23.251 -15.265  -5.204  1.00 40.70  A 
原子    688  OD2 ASP A 108  21.613 -15.719  -3.826  1.00 40.82  A 
原子    689  C   ASP A 108  26.073 -15.495  -2.064  1.00 40.30  A 
原子    690  O   ASP A 108  26.755 -14.477  -2.128  1.00 44.69  A 
原子    691  N   LEU A 109  26.087 -16.330  -1.037  1.00 40.01  A 
原子    692  CA  LEU A 109  26.888 -16.070  0.139   1.00 38.75  A 
原子    693  CB  LEU A 109  26.047 -15.364  1.209   1.00 35.61  A 
原子    694  CG  LEU A 109  25.554 -13.924  1.152   1.00 34.93  A 
原子    695  CD1 LEU A 109  24.761 -13.642  2.434   1.00 36.76  A 
原子    696  CD2 LEU A 109  26.717 -12.976  1.062   1.00 38.70  A 
原子    697  C   LEU A 109  27.456 -17.298  0.795   1.00 39.03  A 
原子    698  O   LEU A 109  27.100 -18.430  0.500   1.00 38.99  A 
原子    699  N   TYR A 110  28.331 -17.035  1.739   1.00 38.65  A 
原子    700  CA  TYR A 110  28.902 -18.103  2.481   1.00 39.37  A 
原子    701  CB  TYR A 110  30.202 -18.558  1.852   1.00 41.64  A 
原子    702  CG  TYR A 110  30.828 -19.646  2.667   1.00 40.06  A 
原子    703  CD1 TYR A 110  30.519 -20.991  2.465   1.00 40.71  A 
原子    704  CE1 TYR A 110  31.081 -21.976  3.276   1.00 40.45  A 
原子    705  CD2 TYR A 110  31.694 -19.314  3.688   1.00 40.36  A 
原子    706  CE2 TYR A 110  32.231 -20.248  4.507   1.00 42.36  A 
原子    707  CZ  TYR A 110  31.938 -21.581  4.305   1.00 43.06  A 
原子    708  OH  TYR A 110  32.517 -22.476  5.166   1.00 49.40  A 
原子    709  C   TYR A 110  29.055 -17.592  3.903   1.00 41.72  A 
原子    710  O   TYR A 110  29.552 -16.478  4.142   1.00 39.70  A 
原子    711  N   ASP A 111  28.541 -18.410  4.825   1.00 43.66  A 
原子    712  CA  ASP A 111  28.511 -18.149  6.263   1.00 45.72  A 
原子    713  CB  ASP A 111  27.109 -18.533  6.770   1.00 48.49  A 
原子    714  CG  ASP A 111  26.789 -18.025  8.186   1.00 50.22  A 
原子    715  OD1 ASP A 111  25.596 -18.106  8.569   1.00 52.51  A 
原子    716  OD2 ASP A 111  27.690 -17.547  8.906   1.00 51.41  A 
原子    717  C   ASP A 111  29.537 -19.067  6.902   1.00 48.87  A 
原子    718  O   ASP A 111  29.374 -20.275  6.844   1.00 49.70  A 
原子    719  N   TYR A 112  30.606 -18.540  7.487   1.00 50.31  A 
原子    720  CA  TYR A 112  31.533 -19.457  8.130   1.00 53.30  A 
原子    721  CB  TYR A 112  33.024 -19.112  7.809   1.00 55.43  A 
原子    722  CG  TYR A 112  33.269 -17.699  7.375   1.00 54.66  A 
原子    723  CD1 TYR A 112  33.744 -17.367  6.090   1.00 53.25  A 
原子    724  CE1 TYR A 112  33.870 -16.021  5.717  1.00 57.26  A 
原子    725  CD2 TYR A 112  32.979 -16.685  8.253  1.00 58.61  A 
原子    726  CE2 TYR A 112  33.113 -15.398  7.913  1.00 60.19  A 
原子    727  CZ  TYR A 112  33.554 -15.051  6.670  1.00 58.76  A 
原子    728  OH  TYR A 112  33.614 -13.696  6.482  1.00 65.53  A 
原子    729  C   TYR A 112  31.189 -19.587  9.643  1.00 55.08  A 
原子    730  O   TYR A 112  31.837 -20.331  10.372 1.00 56.73  A 
原子    731  N   LYS A 113  30.120 -18.900  10.072 1.00 55.29  A 
原子    732  CA  LYS A 113  29.591 -19.002  11.449 1.00 56.09  A 
原子    733  CB  LYS A 113  28.453 -17.972  11.689 1.00 56.20  A 
原子    734  CG  LYS A 113  28.332 -17.281  13.052 1.00 55.66  A 
原子    735  CD  LYS A 113  27.399 -17.930  14.097 1.00 57.79  A 
原子    736  CE  LYS A 113  27.119 -16.871  15.167 1.00 60.62  A 
原子    737  NZ  LYS A 113  26.541 -17.265  16.484 1.00 63.18  A 
原子    738  C   LYS A 113  28.980 -20.406  11.380 1.00 54.82  A 
原子    739  O   LYS A 113  29.456 -21.342  12.032 1.00 53.82  A 
原子    740  N   GLU A 114  27.940 -20.537  10.544 1.00 54.84  A 
原子    741  CA  GLU A 114  27.238 -21.820  10.316 1.00 55.29  A 
原子    742  CB  GLU A 114  25.819 -21.604  9.780  1.00 54.61  A 
原子    743  CG  GLU A 114  24.846 -20.944  10.741 1.00 55.66  A 
原子    744  CD  GLU A 114  24.631 -21.753  12.011 1.00 57.58  A 
原子    745  OE1 GLU A 114  25.059 -21.295  13.095 1.00 59.01  A 
原子    746  OE2 GLU A 114  24.029 -22.849  11.932 1.00 58.27  A 
原子    747  C   GLU A 114  28.006 -22.680  9.310  1.00 55.89  A 
原子    748  O   GLU A 114  27.699 -23.857  9.078  1.00 56.20  A 
原子    749  N   ASN A 115  28.978 -22.040  8.674  1.00 56.98  A 
原子    750  CA  ASN A 115  29.869 -22.711  7.740  1.00 55.57  A 
原子    751  CB  ASN A 115  30.788 -23.582  8.630  1.00 59.40  A 
原子    752  CG  ASN A 115  32.039 -24.088  7.937  1.00 63.31  A 
原子    753  OD1 ASN A 115  32.118 -25.272  7.620  1.00 66.27  A 
原子    754  ND2 ASN A 115  33.039 -23.213  7.734  1.00 63.22  A 
原子    755  C   ASN A 115  29.105 -23.488  6.615  1.00 52.00  A 
原子    756  O   ASN A 115  29.221 -24.712  6.461  1.00 49.66  A 
原子    757  N   ARG A 116  28.338 -22.720  5.831  1.00 47.90  A 
原子    758  CA  ARG A 116  27.542 -23.181  4.685  1.00 44.55  A 
原子    759  CB  ARG A 116  26.143 -23.602  5.110  1.00 43.12  A 
原子    760  CG  ARG A 116  25.551 -22.664  6.126  1.00 40.16  A 
原子    761  CD  ARG A 116  24.064 -22.731  6.162  1.00 37.94  A 
原子    762  NE  ARG A 116  23.547 -22.889  7.515  1.00 43.66  A 
原子    763  CZ  ARG A 116  22.954 -21.924  8.218  1.00 46.68  A 
原子    764  NH1 ARG A 116  22.802 -20.706  7.704  1.00 47.95  A 
原子    765  NH2 ARG A 116  22.470 -22.186  9.427  1.00 42.71  A 
原子    766  C   ARG A 116  27.361 -22.043  3.687  1.00 44.58  A 
原子    767  O   ARG A 116  27.576 -20.871  4.010  1.00 42.41  A 
原子    768  N   PHE A 117  26.940 -22.405  2.482  1.00 42.87  A 
原子    769  CA  PHE A 117  26.674 -21.421  1.459  1.00 42.19  A 
原子    770  CB  PHE A 117  26.963 -21.978  0.055  1.00 40.11  A 
原子    771  CG  PHE A 117  28.418 -22.115  -0.248 1.00 41.38  A 
原子    772  CD1 PHE A 117  29.043 -23.357  -0.207  1.00 39.79  A 
原子    773  CD2 PHE A 117  29.168 -20.993  -0.596  1.00 44.76  A 
原子    774  CE1 PHE A 117  30397  -23.484  -0.513  1.00 42.83  A 
原子    775  CE2 PHE A 117  30.525 -21.105  -0.912  1.00 44.05  A 
原子    776  CZ  PHE A 117  31.145 -22.353  -0.869  1.00 45.62  A 
原子    777  C   PHE A 117  25.202 -21.093  1.594   1.00 39.75  A 
原子    778  O   PHE A 117  24.445 -21.858  2.192   1.00 40.05  A 
原子    779  N   ILE A 118  24.826 -19.959  1.008   1.00 38.79  A 
原子    780  CA  ILE A 118  23.471 -19.432  0.997   1.00 38.48  A 
原子    781  CB  ILE A 118  23.339 -18.285  1.990   1.00 36.93  A 
原子    782  CG2 ILE A 118  21.869 -17.812  2.065   1.00 31.93  A 
原子    783  CG1 ILE A 118  23.941 -18.741  3.326   1.00 34.46  A 
原子    784  CD1 ILE A 118  24.154 -17.649  4.344   1.00 35.07  A 
原子    785  C   ILE A 118  23.114 -18.859  -0.361  1.00 39.11  A 
原子    786  O   ILE A 118  23.917 -18.138  -0.972  1.00 42.06  A 
原子    787  N   GLU A 119  21.897 -19.184  -0.794  1.00 35.76  A 
原子    788  CA  GLU A 119  21.320 -18.723  -2.047  1.00 36.35  A 
原子    789  CB  GLU A 119  20.628 -19.863  -2.777  1.00 36.51  A 
原子    790  CG  GLU A 119  21.532 -20.778  -3.537  1.00 36.17  A 
原子    791  CD  GLU A 119  21.933 -20.164  -4.839  1.00 36.33  A 
原子    792  OE1 GLU A 119  22.692 -20.799  -5.606  1.00 39.05  A 
原子    793  OE2 GLU A 119  21.473 -19.034  -5.113  1.00 35.16  A 
原子    794  C   GLU A 119  20.250 -17.792  -1.547  1.00 38.85  A 
原子    795  O   GLU A 119  19.518 -18.156  -0.620  1.00 37.77  A 
原子    796  N   ILE A 120  20.127 -16.613  -2.138  1.00 37.28  A 
原子    797  CA  ILE A 120  19.094 -15.718  -1.674  1.00 37.51  A 
原子    798  CB  ILE A 120  19.729 -14.416  -1.078  1.00 37.32  A 
原子    799  CG2 ILE A 120  18.677 -13.324  -0.946  1.00 34.95  A 
原子    800  CG1 ILE A 120  20.327 -14.750  0.310   1.00 39.31  A 
原子    801  CD1 ILE A 120  21.491 -13.865  0.763   1.00 36.98  A 
原子    802  C   ILE A 120  18.163 -15.448  -2.851  1.00 38.10  A 
原子    803  O   ILE A 120  18.612 -15.381  -4.000  1.00 39.63  A 
原子    804  N   GLY A 121  16.872 -15.329  -2.546  1.00 37.30  A 
原子    805  CA  GLY A 121  15.865 -15.064  -3.548  1.00 37.17  A 
原子    806  C   GLY A 121  15.000 -13.934  -3.054  1.00 36.82  A 
原子    807  O   GLY A 121  14.817 -13.766  -1.863  1.00 36.82  A 
原子    808  N   VAL A 122  14.525 -13.129  -3.990  1.00 33.00  A 
原子    809  CA  VAL A 122  13.610 -12.033  -3.699  1.00 33.82  A 
原子    810  CB  VAL A 122  14.201 -10.595  -3.938  1.00 33.41  A 
原子    811  CG1 VAL A 122  13.108 -9.539   -3.739  1.00 30.21  A 
原子    812  CG2 VAL A 122  15.369 -10.290  -2.974  1.00 29.62  A 
原子    813  C   VAL A 122  12.653 -12.320  -4.830  1.00 35.76  A 
原子    814  O   VAL A 122  13.082 -12.312  -5.987  1.00 33.60  A 
原子    815  N   THR A 123  11.394 -12.617  -4.499  1.00 34.83  A 
原子    816  CA  THR A 123  10.399 -12.971  -5.508  1.00 35.88  A 
原子    817  CB  THR A 123  9.986  -14.500  -5.375  1.00 34.09  A 
原子    818  OG1 THR A 123  8.901  -14.791  -6.267  1.00 37.93  A 
原子    819  CG2 THR A 123  9.566  -14.841  -3.941  1.00 35.45  A 
原子    820  C   THR A 123  9.139  -12.113 -5.479  1.00 34.18  A 
原子    821  O   THR A 123  8.789  -11.517 -4.451  1.00 35.28  A 
原子    822  N   ARG A 124  8.451  -12.044 -6.612  1.00 34.99  A 
原子    823  CA  ARG A 124  7.214  -11.265 -6.710  1.00 37.23  A 
原子    824  CB  ARG A 124  7.232  -10.411 -7.984  1.00 40.43  A 
原子    825  CG  ARG A 124  8.251  -9.235  -7.964  1.00 35.06  A 
原子    826  CD  ARG A 124  8.596  -8.795  -9.382  1.00 38.03  A 
原子    827  NE  ARG A 124  9.791  -9.501  -9.838  1.00 35.43  A 
原子    828  CZ  ARG A 124  10.152 -9.704  -11.102 1.00 34.56  A 
原子    829  NH1 ARG A 124  9.414  -9.256  -12.111 1.00 37.09  A 
原子    830  NH2 ARG A 124  11.281 -10.359 -11.352 1.00 35.12  A 
原子    831  C   ARG A 124  6.093  -12.312 -6.747  1.00 38.56  A 
原子    832  O   ARG A 124  4.913  -11.973 -6.878  1.00 36.25  A 
原子    833  N   ARG A 125  6.485  -13.583 -6.595  1.00 37.65  A 
原子    834  CA  ARG A 125  5.526  -14.682 -6.588  1.00 38.69  A 
原子    835  CB  ARG A 125  5.971  -15.773 -7.585  1.00 37.70  A 
原子    836  CG  ARG A 125  5.630  -15.378 -8.999  1.00 35.26  A 
原子    837  CD  ARG A 125  6.558  -15.889 -10.069 1.00 39.07  A 
原子    838  NE  ARG A 125  7.772  -16.516 -9.570  1.00 43.48  A 
原子    839  CZ  ARG A 125  8.141  -17.749 -9.878  1.00 40.05  A 
原子    840  NH1 ARG A 125  7.379  -18.474 -10.672 1.00 43.26  A 
原子    841  NH2 ARG A 125  9.274  -18.243 -9.412  1.00 36.24  A 
原子    842  C   ARG A 125  5.367  -15.218 -5.189  1.00 38.52  A 
原子    843  O   ARG A 125  5.839  -14.602 -4.250  1.00 39.10  A 
原子    844  N   GLU A 126  4.687  -16.353 -5.066  1.00 40.14  A 
原子    845  CA  GLU A 126  4.474  -16.993 -3.773  1.00 42.54  A 
原子    846  CB  GLU A 126  3.371  -18.073 -3.884  1.00 47.01  A 
原子    847  CG  GLU A 126  1.879  -17.587 -3.972  1.00 55.76  A 
原子    848  CD  GLU A 126  1.547  -16.400 -3.052  1.00 61.77  A 
原子    849  OE1 GLU A 126  1.409  -15.269 -3.570  1.00 61.97  A 
原子    850  OE2 GLU A 126  1.410  -16.571 -1.815  1.00 65.58  A 
原子    851  C   GLU A 126  5.818  -17.599 -3.336  1.00 41.81  A 
原子    852  O   GLU A 126  6.426  -18.332 -4.126  1.00 39.90  A 
原子    853  N   VAL A 127  6.297  -17.293 -2.111  1.00 40.69  A 
原子    854  CA  VAL A 127  7.632  -17.811 -1.702  1.00 40.14  A 
原子    855  CB  VAL A 127  8.269  -17.174 -0.334  1.00 39.75  A 
原子    856  CG1 VAL A 127  8.103  -15.655 -0.285  1.00 41.88  A 
原子    857  CG2 VAL A 127  7.720  -17.840 0.930   1.00 38.77  A 
原子    858  C   VAL A 127  7.828  -19.322 -1.612  1.00 36.68  A 
原子    859  O   VAL A 127  8.921  -19.806 -1.821  1.00 35.98  A 
原子    860  N   HIS A 128  6.792  -20.078 -1.284  1.00 39.04  A 
原子    861  CA  HIS A 128  6.954  -21.533 -1.208  1.00 41.10  A 
原子    862  CB  HIS A 128  5.657  -22.197 -0.665  1.00 48.32  A 
原子    863  CG  HIS A 128  5.896  -23.237 0.404   1.00 53.52  A 
原子    864  CD2 HIS A 128  6.767  -24.271 0.473   1.00 54.99  A 
原子    865  ND1 HIS A 128  5.136  -23.301 1.555   1.00 56.78  A 
原子    866  CE1 HIS A 128  5.526  -24.333 2.283   1.00 58.24  A 
原子    867  NE2 HIS A 128  6.513  -24.939 1.653   1.00 57.75  A 
原子    868  C   HIS A 128  7.348  -22.068  -2.596  1.00 39.17  A 
原子    869  O   HIS A 128  8.143  -22.990  -2.729  1.00 42.64  A 
原子    870  N   THR A 129  6.804  -21.450  -3.630  1.00 37.95  A 
原子    871  CA  THR A 129  7.088  -21.809  -5.028  1.00 38.32  A 
原子    872  CB  THR A 129  6.207  -20.942  -5.947  1.00 37.58  A 
原子    873  OG1 THR A 129  4.871  -21.002  -5.459  1.00 40.76  A 
原子    874  CG2 THR A 129  6.214  -21.420  -7.380  1.00 36.21  A 
原子    875  C   THR A 129  8.549  -21.562  -5.354  1.00 36.95  A 
原子    876  O   THR A 129  9.306  -22.477  -5.695  1.00 39.92  A 
原子    877  N   TYR A 130  8.927  -20.306  -5.187  1.00 34.37  A 
原子    878  CA  TYR A 130  10.269 -19.867  -5.434  1.00 30.60  A 
原子    879  CB  TYR A 130  10.333 -18.377  -5.151  1.00 31.20  A 
原子    880  CG  TYR A 130  11.530 -17.730  -5.745  1.00 33.62  A 
原子    881  CD1 TYR A 130  11.485 -17.164  -7.020  1.00 35.12  A 
原子    882  CE1 TYR A 130  12.629 -16.671  -7.620  1.00 37.12  A 
原子    883  CD2 TYR A 130  12.738 -17.769  -5.081  1.00 34.62  A 
原子    884  CE2 TYR A 130  13.877 -17.301  -5.663  1.00 35.73  A 
原子    885  CZ  TYR A 130  13.825 -16.744  -6.932  1.00 35.96  A 
原子    886  OH  TYR A 130  14.972 -16.285  -7.525  1.00 33.23  A 
原子    887  C   TYR A 130  11.267 -20.653  -4.595  1.00 31.28  A 
原子    888  O   TYR A 130  12.294 -21.071  -5.094  1.00 34.85  A 
原子    889  N   TYR A 131  10.940 -20.887  -3.331  1.00 31.94  A 
原子    890  CA  TYR A 131  11.820 -21.659  -2.454  1.00 31.28  A 
原子    891  CB  TYR A 131  11.223 -21.776  -1.029  1.00 30.28  A 
原子    892  CG  TYR A 131  12.129 -22.520  -0.054  1.00 30.07  A 
原子    893  CD1 TYR A 131  13.057 -21.838  0.734   1.00 29.22  A 
原子    894  CE1 TYR A 131  13.949 -22.516  1.546   1.00 29.21  A 
原子    895  CD2 TYR A 131  12.102 -23.914  0.023   1.00 30.39  A 
原子    896  CE2 TYR A 131  12.988 -24.606  0.841   1.00 31.90  A 
原子    897  CZ  TYR A 131  13.900 -23.912  1.602   1.00 35.09  A 
原子    898  OH  TYR A 131  14.740 -24.663  2.399   1.00 30.92  A 
原子    899  C   TYR A 131  12.119 -23.069  -2.992  1.00 34.16  A 
原子    900  O   TYR A 131  13.269 -23.533  -2.957  1.00 36.26  A 
原子    901  N   LEU A 132  11.072 -23.743  -3.484  1.00 33.40  A 
原子    902  CA  LEU A 132  11.187 -25.115  -4.031  1.00 34.56  A 
原子    903  CB  LEU A 132  9.806  -25.766  -4.192  1.00 33.83  A 
原子    904  CG  LEU A 132  8.995  -25.957  -2.901  1.00 35.27  A 
原子    905  CD1 LEU A 132  7.591  -26.500  -3.170  1.00 36.00  A 
原子    906  CD2 LEU A 132  9.773  -26.880  -2.004  1.00 34.65  A 
原子    907  C   LEU A 132  11.876 -25.118  -5.392  1.00 34.21  A 
原子    908  O   LEU A 132  12.743 -25.953  -5.671  1.00 35.75  A 
原子    909  N   GLU A 133  11.455 -24.191  -6.242  1.00 35.35  A 
原子    910  CA  GLU A 133  12.030 -24.081  -7.562  1.00 36.07  A 
原子    911  CB  GLU A 133  11.568 -22.783  -8.223  1.00 37.15  A 
原子    912  CG  GLU A 133  10.190 -22.875  -8.794  1.00 45.06  A 
原子    913  CD  GLU A 133  9.806  -21.632  -9.588  1.00 47.69  A 
原子    914  OE1 GLU A 133  8.828  -21.741  -10.347 1.00 47.66  A 
原子    915  OE2 GLU A 133  10.465 -20.564  -9.474  1.00 50.69  A 
原子    916  C   GLU A 133  13.518 -24.053  -7.347  1.00 34.84  A 
原子    917  O   GLU A 133  14.304 -24.677  -8.057  1.00 33.55  A 
原子    918  N   LYS A 134  13.897 -23.281  -6.342  1.00 34.95  A 
原子    919  CA  LYS A 134  15.296 -23.128  -6.000  1.00 31.11  A 
原子    920  CB  LYS A 134  15.490 -21.914  -5.081  1.00 35.38  A 
原子    921  CG  LYS A 134  16.923 -21.663  -4.697  1.00 39.02  A 
原子    922  CD  LYS A 134  17.735 -21.209  -5.897  1.00 43.95  A 
原子    923  CE  LYS A 134  17.143 -19.959  -6.530  1.00 45.28  A 
原子    924  NZ  LYS A 134  17.554 -18.700  -5.848  1.00 49.58  A 
原子    925  C   LYS A 134  15.855 -24.384  -5.342  1.00 30.23  A 
原子    926  O   LYS A 134  16.933 -24.842  -5.717  1.00 29.89  A 
原子    927  N   ALA A 135  15.152 -24.938  -4.359  1.00 29.17  A 
原子    928  CA  ALA A 135  15.653 -26.144  -3.728  1.00 34.89  A 
原子    929  CB  ALA A 135  14.718 -26.585  -2.635  1.00 33.35  A 
原子    930  C   ALA A 135  15.811 -27.249  -4.788  1.00 37.09  A 
原子    931  O   ALA A 135  16.720 -28.064  -4.697  1.00 40.46  A 
原子    932  N   ASN A 136  14.957 -27.264  -5.801  1.00 35.69  A 
原子    933  CA  ASN A 136  15.057 -28.284  -6.816  1.00 37.09  A 
原子    934  CB  ASN A 136  13.689 -28.468  -7.488  1.00 36.71  A 
原子    935  CG  ASN A 136  12.688 -29.077  -6.548  1.00 36.71  A 
原子    936  OD1 ASN A 136  11.656 -28.483  -6.252  1.00 44.58  A 
原子    937  ND2 ASN A 136  13.001 -30.264  -6.052  1.00 32.42  A 
原子    938  C   ASN A 136  16.154 -28.034  -7.826  1.00 38.19  A 
原子    939  O   ASN A 136  16.685 -28.972  -8.429  1.00 39.68  A 
原子    940  N   LYS A 137  16.501 -26.770  -8.017  1.00 37.96  A 
原子    941  CA  LYS A 137  17.558 -26.462  -8.951  1.00 35.93  A 
原子    942  CB  LYS A 137  17.616 -24.967  -9.275  1.00 37.08  A 
原子    943  CG  LYS A 137  18.803 -24.647  -10.182 1.00 37.10  A 
原子    944  CD  LYS A 137  18.758 -23.264  -10.762 1.00 42.03  A 
原子    945  CE  LYS A 137  19.888 -22.445  -10.211 1.00 43.50  A 
原子    946  NZ  LYS A 137  19.408 -21.776  -8.995  1.00 48.74  A 
原子    947  C   LYS A 137  18.898 -26.886  -8.383  1.00 37.04  A 
原子    948  O   LYS A 137  19.649 -27.619  -9.028  1.00 38.14  A 
原子    949  N   ILE A 138  19.188 -26.434  -7.167  1.00 36.36  A 
原子    950  CA  ILE A 138  20.470 -26.724  -6.539  1.00 38.55  A 
原子    951  CB  ILE A 138  20.780 -25.645  -5.460  1.00 36.80  A 
原子    952  CG2 ILE A 138  20.795 -24.255  -6.113  1.00 35.37  A 
原子    953  CG1 ILE A 138  19.714 -25.669  -4.358  1.00 38.81  A 
原子    954  CD1 ILE A 138  20.181 -25.052  -3.056  1.00 42.15  A 
原子    955  C   ILE A 138  20.784 -28.128  -5.986  1.00 39.85  A 
原子    956  O   ILE A 138  21.942 -28.407  -5.714  1.00 39.25  A 
原子    957  N   LYS A 139  19.794 -29.005  -5.822  1.00 43.92  A 
原子    958  CA  LYS A 139  20.048 -30.372  -5.332  1.00 46.91  A 
原子    959  CB  LYS A 139  20.527 -31.259  -6.468  1.00 49.26  A 
原子    960  CG  LYS A 139  19.444 -32.124  -7.030  1.00 50.15  A 
原子    961  CD  LYS A 139  18.661 -31.420  -8.093  1.00 48.99  A 
原子    962  CE  LYS A 139  19.265 -31.698  -9.438  1.00 50.64  A 
原子    963  NZ  LYS A 139  18.217 -31.552  -10.468 1.00 54.26  A 
原子    964   C   LYS A 139  21.041 -30.481  -4.190  1.00 49.33  A 
原子    965   O   LYS A 139  22.111 -31.081  -4.293  1.00 50.85  A 
原子    966   N   SER A 140  20.606 -29.875  -3.104  1.00 52.79  A 
原子    967   CA  SER A 140  21.293 -29.677  -1.838  1.00 55.20  A 
原子    968   CB  SER A 140  20.597 -28.599  -1.110  1.00 60.55  A 
原子    969   OG  SER A 140  19.530 -29.261  -0.414  1.00 60.32  A 
原子    970   C   SER A 140  21.401 -30.715  -0.728  1.00 56.75  A 
原子    971   O   SER A 140  20.803 -31.795  -0.681  1.00 60.15  A 
原子    972   N   GLU A 141  22.114 -30.279  0.282   1.00 54.73  A 
原子    973   CA  GLU A 141  22.270 -31.105  1.443   1.00 55.75  A 
原子    974   CB  GLU A 141  23.477 -32.062  1.268   1.00 59.79  A 
原子    975   CG  GLU A 141  23.889 -32.376  -0.198  1.00 63.01  A 
原子    976   CD  GLU A 141  25.427 -32.432  -0.421  1.00 66.92  A 
原子    977   OE1 GLU A 141  26.129 -33.236  0.239   1.00 68.56  A 
原子    978   OE2 GLU A 141  25.956 -31.681  -1.277  1.00 67.21  A 
原子    979   C   GLU A 141  22.590 -30.068  2.471   1.00 54.83  A 
原子    980   O   GLU A 141  21.943 -29.935  3.515   1.00 51.66  A 
原子    981   N   LYS A 142  23.532 -29.244  2.054   1.00 52.85  A 
原子    982   CA  LYS A 142  24.096 -28.255  2.922   1.00 53.68  A 
原子    983   CB  LYS A 142  25.571 -28.624  2.996   1.00 52.79  A 
原子    984   CG  LYS A 142  25.662 -30.095  3.494   1.00 55.47  A 
原子    985   CD  LYS A 142  26.895 -30.882  3.069   1.00 54.74  A 
原子    986   CE  LYS A 142  28.080 -30.632  3.978   1.00 53.87  A 
原子    987   NZ  LYS A 142  28.873 -29.477  3.497   1.00 54.33  A 
原子    988   C   LYS A 142  23.888 -26.764  2.704   1.00 51.28  A 
原子    989   O   LYS A 142  24.042 -25.967  3.641   1.00 54.13  A 
原子    990   N   THR A 143  23.530 -26.375  1.488   1.00 48.14  A 
原子    991   CA  THR A 143  23.320 -24.958  1.187   1.00 43.32  A 
原子    992   CB  THR A 143  23.413 -24.748  -0.311  1.00 43.87  A 
原子    993   OG1 THR A 143  22.397 -25.528  -0.941  1.00 50.19  A 
原子    994   CG2 THR A 143  24.768 -25.233  -0.803  1.00 37.06  A 
原子    995   C   THR A 143  21.975 -24.502  1.728   1.00 37.30  A 
原子    996   O   THR A 143  20.967 -25.149  1.495   1.00 32.21  A 
原子    997   N   HIS A 144  21.988 -23.378  2.440   1.00 32.95  A 
原子    998   CA  HIS A 144  20.795 -22.817  3.049   1.00 29.49  A 
原子    999   CB  HIS A 144  21.207 -21.900  4.197   1.00 31.84  A 
原子    1000  CG  HIS A 144  20.315 -22.004  5.389   1.00 36.42  A 
原子    1001  CD2 HIS A 144  19.538 -21.080  5.999   1.00 34.47  A 
原子    1002  ND1 HIS A 144  20.098 -23.193  6.051   1.00 38.07  A 
原子    1003  CE1 HIS A 144  19.213 -23.000  7.014   1.00 40.13  A 
原子    1004  NE2 HIS A 144  18.856 -21.729  7.002   1.00 41.00  A 
原子    1005  C   HIS A 144  20.007 -22.032  1.994   1.00 30.28  A 
原子    1006  O   HIS A 144  20.553 -21.598  0.978   1.00 29.35  A 
原子    1007  N   ILE A 145  18.716 -21.865  2.200   1.00 28.99  A 
原子    1008  CA  ILE A 145  17.964 -21.103  1.227   1.00 31.65  A 
原子    1009  CB  ILE A 145  17.007 -21.979  0.374   1.00 32.45  A 
原子    1010  CG2 ILE A 145  16.054 -21.064  -0.344  1.00 32.11  A 
原子    1011  CG1 ILE A 145  17.776 -22.830  -0.654  1.00 32.64  A 
原子    1012  CD1 ILE A 145  17.012 -24.055  -1.210  1.00 30.51  A 
原子    1013  C   ILE A 145  17.147 -20.105  2.003   1.00 30.21  A 
原子    1014  O   ILE A 145  16.550 -20.447  3.011   1.00 32.21  A 
原子    1015  N   HIS A 146  17.128 -18.871  1.530   1.00 32.11  A 
原子    1016  CA  HIS A 146  16.391 -17.855  2.215   1.00 32.60  A 
原子    1017  CB  HIS A 146  17.329 -17.142  3.184   1.00 33.23  A 
原子    1018  CG  HIS A 146  16.600 -16.325  4.186   1.00 34.21  A 
原子    1019  CD2 HIS A 146  15.421 -15.653  4.113   1.00 32.02  A 
原子    1020  ND1 HIS A 146  17.048 -16.161  5.476   1.00 35.12  A 
原子    1021  CE1 HIS A 146  16.181 -15.438  6.157   1.00 32.54  A 
原子    1022  NE2 HIS A 146  15.183 -15.118  5.350   1.00 33.53  A 
原子    1023  C   HIS A 146  15.745 -16.890  1.199   1.00 30.33  A 
原子    1024  O   HIS A 146  16.430 -16.174  0.476   1.00 30.09  A 
原子    1025  N   ILE A 147  14.416 -16.886  1.145   1.00 31.29  A 
原子    1026  CA  ILE A 147  13.697 -16.045  0.207   1.00 31.65  A 
原子    1027  CB  ILE A 147  12.805 -16.933  -0.753  1.00 33.25  A 
原子    1028  CG2 ILE A 147  11.833 -16.092  -1.608  1.00 32.35  A 
原子    1029  CG1 ILE A 147  13.746 -17.774  -1.652  1.00 32.01  A 
原子    1030  CD1 ILE A 147  13.564 -19.300  -1.437  1.00 37.64  A 
原子    1031  C   ILE A 147  12.911 -14.977  0.936   1.00 32.33  A 
原子    1032  O   ILE A 147  12.326 -15.192  2.012   1.00 34.92  A 
原子    1033  N   PHE A 148  12.971 -13.796  0.344   1.00 32.27  A 
原子    1034  CA  PHE A 148  12.293 -12.612  0.842   1.00 34.34  A 
原子    1035  CB  PHE A 148  13.275 -11.454  0.955   1.00 31.26  A 
原子    1036  CG  PHE A 148  14.182 -11.564  2.113   1.00 31.50  A 
原子    1037  CD1 PHE A 148  15.494 -12.028  1.973   1.00 31.86  A 
原子    1038  CD2 PHE A 148  13.711 -11.248  3.367   1.00 31.72  A 
原子    1039  CE1 PHE A 148  16.322 -12.178  3.098   1.00 33.44  A 
原子    1040  CE2 PHE A 148  14.509 -11.394  4.491   1.00 33.54  A 
原子    1041  CZ  PHE A 148  15.813 -11.855  4.355   1.00 32.39  A 
原子    1042  C   PHE A 148  11.322 -12.255  -0.249  1.00 35.27  A 
原子    1043  O   PHE A 148  11.538 -12.587  -1.412  1.00 36.54  A 
原子    1044  N   SER A 149  10.251 -11.574  0.098   1.00 37.34  A 
原子    1045  CA  SER A 149  9.374  -11.155  -0.964  1.00 39.57  A 
原子    1046  CB  SER A 149  8.029  -11.915  -0.927  1.00 37.31  A 
原子    1047  OG  SER A 149  7.225  -11.569  0.184   1.00 40.03  A 
原子    1048  C   SER A 149  9.203  -9.661   -0.831  1.00 40.29  A 
原子    1049  O   SER A 149  9.898  -9.013   -0.056  1.00 40.76  A 
原子    1050  N   PHE A 150  8.290  -9.113   -1.611  1.00 39.73  A 
原子    1051  CA  PHE A 150  8.039  -7.700   -1.536  1.00 39.89  A 
原子    1052  CB  PHE A 150  7.684  -7.121   -2.916  1.00 38.54  A 
原子    1053  CG  PHE A 150  8.884  -6.726   -3.720  1.00 38.70  A 
原子    1054  CD1 PHE A 150  9.452  -7.615   -4.612  1.00 36.91  A 
原子    1055  CD2 PHE A 150  9.486  -5.490   -3.540  1.00 39.59  A 
原子    1056  CE1 PHE A 150  10.599 -7.290   -5.317  1.00 31.97  A 
原子    1057  CE2 PHE A 150  10.629 -5.153   -4.229  1.00 39.19  A 
原子    1058  CZ  PHE A 150  11.193 -6.048   -5.118  1.00 40.87  A 
原子    1059  C   PHE A 150  6.898  -7.503   -0.561  1.00 42.11  A 
原子    1060  O   PHE A  150  6.594  -6.368   -0.185  1.00 44.70  A 
原子    1061  N   THR A  151  6.260  -8.605   -0.162  1.00 42.86  A 
原子    1062  CA  THR A  151  5.125  -8.539   0.760   1.00 44.07  A 
原子    1063  CB  THR A  151  4.074  -9.632   0.488   1.00 46.05  A 
原子    1064  OG1 THR A  151  4.525  -10.86   01.077  1.00 44.09  A 
原子    1065  CG2 THR A  151  3.847  -9.849   -0.994  1.00 41.69  A 
原子    1066  C   THR A  151  5.446  -8.722   2.256   1.00 44.86  A 
原子    1067  O   THR A  151  4.556  -8.545   3.095   1.00 46.27  A 
原子    1068  N   GLY A  152  6.677  -9.117   2.589   1.00 43.05  A 
原子    1069  CA  GLY A  152  7.044  -9.337   3.989   1.00 40.46  A 
原子    1070  C   GLY A  152  7.266  -10.801  4.377   1.00 40.98  A 
原子    1071  O   GLY A  152  7.975  -11.110  5.329   1.00 40.02  A 
原子    1072  N   GLU A  153  6.634  -11.702  3.628   1.00 41.20  A 
原子    1073  CA  GLU A  153  6.733  -13.152  3.819   1.00 41.06  A 
原子    1074  CB  GLU A  153  5.662  -13.851  2.916   1.00 42.73  A 
原子    1075  CG  GLU A  153  5.596  -15.398  2.897   1.00 49.73  A 
原子    1076  CD  GLU A  153  4.321  -15.947  2.199   1.00 53.42  A 
原子    1077  OE1 GLU A  153  3.235  -15.928  2.822   1.00 53.34  A 
原子    1078  OE2 GLU A  153  4.396  -16.381  1.024   1.00 53.84  A 
原子    1079  C   GLU A  153  8.162  -13.615  3.464   1.00 40.34  A 
原子    1080  O   GLU A  153  8.727  -13.183  2.454   1.00 40.91  A 
原子    1081  N   GLU A  154  8.754  -14.454  4.316   1.00 38.52  A 
原子    1082  CA  GLU A  154  10.087 -15.021  4.056   1.00 38.65  A 
原子    1083  CB  GLU A  154  11.161 -14.414  4.997   1.00 38.03  A 
原子    1084  CG  GLU A  154  10.812 -14.493  6.483   1.00 40.42  A 
原子    1085  CD  GLU A  154  11.724 -13.639  7.399   1.00 46.82  A 
原子    1086  OE1 GLU A  154  11.247 -13.272  8.498   1.00 49.40  A 
原子    1087  OE2 GLU A  154  12.895 -13.349  7.036   1.00 41.06  A 
原子    1088  C   GLU A  154  9.951  -16.515  4.317   1.00 38.83  A 
原子    1089  O   GLU A  154  8.947  -16.936  4.878   1.00 40.73  A 
原子    1090  N   MET A  155  10.965 -17.284  3.921   1.00 37.18  A 
原子    1091  CA  MET A  155  11.032 -18.726  4.113   1.00 36.04  A 
原子    1092  CB  MET A  155  10.267 -19.483  3.025   1.00 39.30  A 
原子    1093  CG  MET A  155  10.196 -20.994  3.256   1.00 38.48  A 
原子    1094  SD  MET A  155  9.133  -21.658  1.959   1.00 46.96  A 
原子    1095  CE  MET A  155  7.927  -22.561  2.850   1.00 45.52  A 
原子    1096  C   MET A  155  12.506 -19.039  4.006   1.00 34.02  A 
原子    1097  O   MET A  155  13.144 -18.708  3.023   1.00 33.65  A 
原子    1098  N   ALA A  156  13.035 -19.673  5.038   1.00 35.17  A 
原子    1099  CA  ALA A  156  14.428 -20.063  5.098   1.00 33.80  A 
原子    1100  CB  ALA A  156  15.163 -19.173  6.088   1.00 30.33  A 
原子    1101  C   ALA A  156  14.520 -21.515  5.536   1.00 33.74  A 
原子    1102  O   ALA A  156  13.726 -21.968  6.334   1.00 34.63  A 
原子    1103  N   THR A  157  15.490 -22.231  4.996   1.00 35.03  A 
原子    1104  CA  THR A  157  15.696 -23.631  5.318   1.00 38.19  A 
原子    1105  CB  THR A  157  17.050 -24.124  4.722   1.00 38.78  A 
原子    1106  OG1 THR A  157  17.081 -23.841  3.311   1.00 37.14  A 
原子    1107  CG2 THR A  157  17.245 -25.620  5.002   1.00 37.68  A 
原子    1108  C   THR A 157  15.667 -23.958  6.819  1.00 39.97  A 
原子    1109  O   THR A 157  16.353 -23.307  7.618  1.00 42.20  A 
原子    1110  N   LYS A 158  14.851 -24.969  7.162  1.00 40.33  A 
原子    1111  CA  LYS A 158  14.640 -25.518  8.524  1.00 39.35  A 
原子    1112  CB  LYS A 158  15.925 -26.236  9.007  1.00 38.81  A 
原子    1113  CG  LYS A 158  16.525 -27.227  7.985  1.00 40.96  A 
原子    1114  CD  LYS A 158  17.319 -28.414  8.631  1.00 44.46  A 
原子    1115  CE  LYS A 158  18.852 -28.325  8.494  1.00 46.71  A 
原子    1116  NZ  LYS A 158  19.488 -29.675  8.357  1.00 52.72  A 
原子    1117  C   LYS A 158  14.157 -24.539  9.598  1.00 41.30  A 
原子    1118  O   LYS A 158  14.186 -24.843  10.802 1.00 43.06  A 
原子    1119  N   ALA A 159  13.679 -23.396  9.101  1.00 40.51  A 
原子    1120  CA  ALA A 159  13.191 -22.227  9.837  1.00 39.68  A 
原子    1121  CB  ALA A 159  12.063 -22.568  10.842 1.00 39.56  A 
原子    1122  C   ALA A 159  14.373 -21.576  10.534 1.00 42.06  A 
原子    1123  O   ALA A 159  14.208 -20.808  11.476 1.00 41.19  A 
原子    1124  N   ASP A 160  15.579 -21.906  10.079 1.00 40.07  A 
原子    1125  CA  ASP A 160  16.759 -21.289  10.652 1.00 37.14  A 
原子    1126  CB  ASP A 160  17.979 -22.216  10.507 1.00 37.65  A 
原子    1127  CG  ASP A 160  19.289 -21.576  10.984 1.00 37.80  A 
原子    1128  OD1 ASP A 160  20.315 -22.285  10.990 1.00 36.92  A 
原子    1129  OD2 ASP A 160  19.302 -20.383  11.361 1.00 36.44  A 
原子    1130  C   ASP A 160  16.898 -20.031  9.809  1.00 34.50  A 
原子    1131  O   ASP A 160  17.428 -20.039  8.709  1.00 35.45  A 
原子    1132  N   TYR A 161  16.381 -18.941  10.343 1.00 35.75  A 
原子    1133  CA  TYR A 161  16.399 -17.672  9.645  1.00 35.81  A 
原子    1134  CB  TYR A 161  15.222 -16.829  10.138 1.00 36.43  A 
原子    1135  CG  TYR A 161  13.912 -17.387  9.582  1.00 38.98  A 
原子    1136  CD1 TYR A 161  13.272 -18.467  10.189 1.00 39.18  A 
原子    1137  CE1 TYR A 161  12.199 -19.112  9.573  1.00 40.53  A 
原子    1138  CD2 TYR A 161  13.422 -16.950  8.349  1.00 38.32  A 
原子    1139  CE2 TYR A 161  12.348 -17.580  7.725  1.00 43.06  A 
原子    1140  CZ  TYR A 161  11.746 -18.669  8.345  1.00 41.69  A 
原子    1141  OH  TYR A 161  10.719 -19.330  7.719  1.00 43.09  A 
原子    1142  C   TYR A 161  17.718 -16.911  9.656  1.00 35.75  A 
原子    1143  O   TYR A 161  17.812 -15.795  9.135  1.00 36.99  A 
原子    1144  N   THR A 162  18.737 -17.513  10.259 1.00 34.74  A 
原子    1145  CA  THR A 162  20.084 -16.942  10.242 1.00 36.95  A 
原子    1146  CB  THR A 162  20.648 -16.977  8.794  1.00 38.13  A 
原子    1147  OG1 THR A 162  20.577 -18.320  8.290  1.00 38.14  A 
原子    1148  CG2 THR A 162  22.079 -16.506  8.770  1.00 35.32  A 
原子    1149  C   THR A 162  20.377 -15.553  10.806 1.00 37.26  A 
原子    1150  O   THR A 162  21.253 -15.407  11.651 1.00 39.21  A 
原子    1151  N   LEU A 163  19.681 -14.534  10.322 1.00 36.85  A 
原子    1152  CA  LEU A 163  19.887 -13.159  10.783 1.00 38.57  A 
原子    1153  CB  LEU A 163  19.614 -12.191  9.630  1.00 37.58  A 
原子    1154  CG  LEU A 163  20.561 -12.306  8.435  1.00 38.70  A 
原子    1155  CD1 LEU A 163  20.251 -11.180  7.469  1.00 34.90  A 
原子    1156  CD2 LEU A 163  22.010  -12.225  8.918   1.00 28.99  A 
原子    1157  C   LEU A 163  18.947  -12.835  11.923  1.00 40.92  A 
原子    1158  O   LEU A 163  17.986  -13.576  12.139  1.00 38.21  A 
原子    1159  N   ASP A 164  19.142  -11.740  12.651  1.00 42.96  A 
原子    1160  CA  ASP A 164  18.149  -11.600  13.693  1.00 46.57  A 
原子    1161  CB  ASP A 164  18.766  -11.125  15.028  1.00 49.46  A 
原子    1162  CG  ASP A 164  18.961  -9.623   15.122  1.00 54.46  A 
原子    1163  OD1 ASP A 164  19.617  -9.008   14.239  1.00 50.17  A 
原子    1164  OD2 ASP A 164  18.444  -9.051   16.111  1.00 55.96  A 
原子    1165  C   ASP A 164  16.919  -10.842  13.234  1.00 47.50  A 
原子    1166  O   ASP A 164  16.843  -10.436  12.072  1.00 49.49  A 
原子    1167  N   GLU A 165  15.924  -10.691  14.094  1.00 47.07  A 
原子    1168  CA  GLU A 165  14.710  -10.044  13.625  1.00 48.29  A 
原子    1169  CB  GLU A 165  13.667  -9.9891  4.755   1.00 48.51  A 
原子    1170  CG  GLU A 165  13.298  -11.398  15.296  1.00 48.39  A 
原子    1171  CD  GLU A 165  12.493  -12.279  14.331  1.00 44.35  A 
原子    1172  OE1 GLU A 165  12.658  -13.520  14.392  1.00 47.15  A 
原子    1173  OE2 GLU A 165  11.699  -11.733  13.543  1.00 45.32  A 
原子    1174  C   GLU A 165  14.975  -8.678   13.005  1.00 49.83  A 
原子    1175  O   GLU A 165  14.554  -8.422   11.880  1.00 52.91  A 
原子    1176  N   GLU A 166  15.712  -7.833   13.719  1.00 51.49  A 
原子    1177  CA  GLU A 166  16.056  -6.481   13.264  1.00 52.53  A 
原子    1178  CB  GLU A 166  16.910  -5.776   14.332  1.00 58.32  A 
原子    1179  CG  GLU A 166  17.552  -6.766   15.329  1.00 68.45  A 
原子    1180  CD  GLU A 166  18.695  -6.182   16.171  1.00 72.20  A 
原子    1181  OE1 GLU A 166  19.324  -6.961   16.920  1.00 75.71  A 
原子    1182  OE2 GLU A 166  18.974  -4.959   16.109  1.00 75.05  A 
原子    1183  C   GLU A 166  16.775  -6.418   11.918  1.00 50.96  A 
原子    1184  O   GLU A 166  16.453  -5.598   11.062  1.00 52.34  A 
原子    1185  N   SER A 167  17.745  -7.287   11.704  1.00 48.84  A 
原子    1186  CA  SER A 167  18.456  -7.222   10.441  1.00 45.30  A 
原子    1187  CB  SER A 167  19.671  -8.169   10.461  1.00 45.62  A 
原子    1188  OG  SER A 167  20.102  -8.407   11.805  1.00 44.09  A 
原子    1189  C   SER A 167  17.529  -7.538   9.269   1.00 45.26  A 
原子    1190  O   SER A 167  17.585  -6.837   8.246   1.00 45.82  A 
原子    1191  N   ARG A 168  16.667  -8.553   9.422   1.00 42.96  A 
原子    1192  CA  ARG A 168  15.723  -8.969   8.359   1.00 42.75  A 
原子    1193  CB  ARG A 168  15.112  -10.335  8.667   1.00 40.44  A 
原子    1194  CG  ARG A 168  16.095  -11.495  8.686   1.00 41.40  A 
原子    1195  CD  ARG A 168  15.332  -12.799  8.886   1.00 39.12  A 
原子    1196  NE  ARG A 168  14.595  -12.707  10.137  1.00 42.95  A 
原子    1197  CZ  ARG A 168  13.813  -13.639  10.658  1.00 43.70  A 
原子    1198  NH1 ARG A 168  13.618  -14.794  10.059  1.00 51.29  A 
原子    1199  NH2 ARG A 168  13.221  -13.395  11.806  1.00 44.89  A 
原子    1200  C   ARG A 168  14.556  -8.004   8.140   1.00 42.76  A 
原子    1201  O   ARG A 168  13.972  -7.946   7.054   1.00 41.68  A 
原子    1202  N   ALA A 169  14.199  -7.271   9.186   1.00 41.68  A 
原子    1203  CA  ALA A 169  13.107  -6.329   9.076   1.00 40.10  A 
原子    1204  CB  ALA A 169  12.705  -5.857  10.456 1.00 38.29  A 
原子    1205  C   ALA A 169  13.583  -5.169  8.186  1.00 40.34  A 
原子    1206  O   ALA A 169  12.786  -4.571  7.456  1.00 43.06  A 
原子    1207  N   ARG A 170  14.890  -4.883  8.248  1.00 39.23  A 
原子    1208  CA  ARG A 170  15.555  -3.832  7.449  1.00 37.75  A 
原子    1209  CB  ARG A 170  17.045  -3.708  7.796  1.00 43.50  A 
原子    1210  CG  ARG A 170  17.458  -2.529  8.679  1.00 45.63  A 
原子    1211  CD  ARG A 170  18.068  -3.021  9.977  1.00 52.14  A 
原子    1212  NE  ARG A 170  19.411  -3.586  9.839  1.00 54.49  A 
原子    1213  CZ  ARG A 170  20.109  -4.083  10.861 1.00 55.83  A 
原子    1214  NH1 ARG A 170  19.591  -4.086  12.091 1.00 54.07  A 
原子    1215  NH2 ARG A 170  21.331  -4.567  10.666 1.00 53.98  A 
原子    1216  C   ARG A 170  15.503  -4.226  5.985  1.00 36.96  A 
原子    1217  O   ARG A 170  15.237  -3.407  5.091  1.00 35.36  A 
原子    1218  N   ILE A 171  15.801  -5.494  5.733  1.00 35.75  A 
原子    1219  CA  ILE A 171  15.778  -5.987  4.356  1.00 36.28  A 
原子    1220  CB  ILE A 171  16.164  -7.514  4.266  1.00 33.74  A 
原子    1221  CG2 ILE A 171  15.671  -8.072  2.918  1.00 31.00  A 
原子    1222  CG1 ILE A 171  17.696  -7.708  4.421  1.00 31.27  A 
原子    1223  CD1 ILE A 171  18.159  -9.075  4.983  1.00 28.02  A 
原子    1224  C   ILE A 171  14.357  -5.792  3.827  1.00 37.91  A 
原子    1225  O   ILE A 171  14.154  -5.266  2.744  1.00 39.81  A 
原子    1226  N   LYS A 172  13.366  -6.164  4.629  1.00 41.11  A 
原子    1227  CA  LYS A 172  11.956  -6.054  4.207  1.00 41.82  A 
原子    1228  CB  LYS A 172  11.054  -6.714  5.232  1.00 40.00  A 
原子    1229  CG  LYS A 172  11.229  -8.181  5.261  1.00 40.92  A 
原子    1230  CD  LYS A 172  10.422  -8.741  6.387  1.00 37.55  A 
原子    1231  CE  LYS A 172  10.533  -10.239 6.371  1.00 37.65  A 
原子    1232  NZ  LYS A 172  9.777   -10.875 7.484  1.00 39.09  A 
原子    1233  C   LYS A 172  11.382  -4.672  3.956  1.00 43.47  A 
原子    1234  O   LYS A 172  10.349  -4.516  3.285  1.00 43.21  A 
原子    1235  N   THR A 173  12.069  -3.708  4.558  1.00 43.02  A 
原子    1236  CA  THR A 173  11.802  -2.274  4.564  1.00 42.68  A 
原子    1237  CB  THR A 173  12.612  -1.689  5.732  1.00 43.55  A 
原子    1238  OG1 THR A 173  11.748  -1.524  6.850  1.00 45.32  A 
原子    1239  CG2 THR A 173  13.314  -0.386  5.365  1.00 44.51  A 
原子    1240  C   THR A 173  12.252  -1.635  3.257  1.00 41.04  A 
原子    1241  O   THR A 173  11.614  -0.734  2.670  1.00 41.45  A 
原子    1242  N   ARG A 174  13.397  -2.114  2.828  1.00 36.80  A 
原子    1243  CA  ARG A 174  13.981  -1.632  1.632  1.00 36.51  A 
原子    1244  CB  ARG A 174  15.457  -1.916  1.704  1.00 32.48  A 
原子    1245  CG  ARG A 174  16.180  -1.698  0.424  1.00 30.15  A 
原子    1246  CD  ARG A 174  15.897  -0.342  -0.151 1.00 28.41  A 
原子    1247  NE  ARG A 174  16.480  -0.276  -1.482 1.00 31.49  A 
原子    1248  CZ  ARG A 174  16.432  0.791   -2.272 1.00 33.25  A 
原子    1249  NH1 ARG A 174  15.824  1.900   -1.868 1.00 34.92  A 
原子    1250  NH2 ARG A 174  16.990  0.746   -3.473 1.00 35.00  A 
原子    1251  C   ARG A 174  13.275  -2.280  0.435  1.00 38.19  A 
原子    1252  O   ARG A 174  13.325  -1.731  -0.657  1.00 40.56  A 
原子    1253  N   LEU A 175  12.582  -3.407  0.617   1.00 35.85  A 
原子    1254  CA  LEU A 175  11.853  -3.975  -0.517  1.00 36.58  A 
原子    1255  CB  LEU A 175  11.576  -5.462  -0.317  1.00 38.36  A 
原子    1256  CG  LEU A 175  12.915  -6.146  -0.352  1.00 39.31  A 
原子    1257  CD1 LEU A 175  12.784  -7.475  0.334   1.00 41.82  A 
原子    1258  CD2 LEU A 175  13.424  -6.249  -1.788  1.00 37.56  A 
原子    1259  C   LEU A 175  10.569  -3.190  -0.692  1.00 35.84  A 
原子    1260  O   LEU A 175  10.157  -2.944  -1.810  1.00 35.67  A 
原子    1261  N   PHE A 176  9.959   -2.753  0.412   1.00 39.94  A 
原子    1262  CA  PHE A 176  8.728   -1.956  0.293   1.00 40.95  A 
原子    1263  CB  PHE A 176  8.043   -1.659  1.649   1.00 44.71  A 
原子    1264  CG  PHE A 176  7.575   -2.872  2.401   1.00 48.93  A 
原子    1265  CD1 PHE A 176  8.031   -3.100  3.694   1.00 51.16  A 
原子    1266  CD2 PHE A 176  6.714   -3.797  1.822   1.00 52.76  A 
原子    1267  CE1 PHE A 176  7.642   -4.238  4.405   1.00 51.40  A 
原子    1268  CE2 PHE A 176  6.322   -4.941  2.526   1.00 50.53  A 
原子    1269  CZ  PHE A 176  6.792   -5.156  3.820   1.00 49.67  A 
原子    1270  C   PHE A 176  9.078   -0.610  -0.333  1.00 41.73  A 
原子    1271  O   PHE A 176  8.349   -0.092  -1.179  1.00 42.21  A 
原子    1272  N   THR A 177  10.207  -0.049  0.085   1.00 41.28  A 
原子    1273  CA  THR A 177  10.647  1.246   -0.422  1.00 40.40  A 
原子    1274  CB  THR A 177  11.960  1.650   0.288   1.00 40.67  A 
原子    1275  OG1 THR A 177  11.698  1.711   1.692   1.00 41.64  A 
原子    1276  CG2 THR A 177  12.489  3.010   -0.189  1.00 40.44  A 
原子    1277  C   THR A 177  10.815  1.117   -1.939  1.00 39.16  A 
原子    1278  O   THR A 177  10.282  1.917   -2.704  1.00 41.59  A 
原子    1279  N   ILE A 178  11.525  0.083   -2370   1.00 38.59  A 
原子    1280  CA  ILE A 178  11.718  -0.144  -3.791  1.00 35.84  A 
原子    1281  CB  ILE A 178  12.508  -1.444  -4.021  1.00 33.29  A 
原子    1282  CG2 ILE A 178  12.799  -1.617  -5.492  1.00 35.02  A 
原子    1283  CG1 ILE A 178  13.829  -1.367  -3.281  1.00 31.61  A 
原子    1284  CD1 ILE A 178  14.772  -2.564  -3.518  1.00 26.17  A 
原子    1285  C   ILE A 178  10.335  -0.216  -4.498  1.00 35.91  A 
原子    1286  O   ILE A 178  10.149  0.345   -5.574  1.00 34.03  A 
原子    1287  N   ARG A 179  9.377   -0.903  -3.880  1.00 35.48  A 
原子    1288  CA  ARG A 179  8.035   -1.072  -4.429  1.00 38.94  A 
原子    1289  CB  ARG A 179  7.250   -2.061  -3.563  1.00 39.57  A 
原子    1290  CG  ARG A 179  5.834   -2.235  -4.018  1.00 44.04  A 
原子    1291  CD  ARG A 179  4.938   -2.360  -2.811  1.00 44.75  A 
原子    1292  NE  ARG A 179  4.823   -3.724  -2.331  1.00 48.81  A 
原子    1293  CZ  ARG A 179  4.209   -4.087  -1.197  1.00 50.19  A 
原子    1294  NH1 ARG A 179  3.630   -3.200  -0.367  1.00 43.50  A 
原子    1295  NH2 ARG A 179  4.152   -5.376  -0.890  1.00 43.74  A 
原子    1296  C   ARG A 179  7.207   0.207   -4.609  1.00 36.86  A 
原子    1297  O   ARG A 179  6.714   0.467   -5.693  1.00 36.37  A 
原子    1298  N   GLN A 180  7.037   1.016   -3.572  1.00 39.38  A 
原子    1299  CA  GLN A 180  6.228   2.205   -3.769  1.00 42.17  A 
原子    1300  CB  GLN A 180  5.671  2.715  -2.430  1.00 44.33  A 
原子    1301  CG  GLN A 180  6.438  2.274  -1.222  1.00 46.62  A 
原子    1302  CD  GLN A 180  7.251  3.400  -0.687  1.00 51.32  A 
原子    1303  OE1 GLN A 180  7.562  4.335  -1.421  1.00 51.48  A 
原子    1304  NE2 GLN A 180  7.589  3.345  0.597   1.00 49.06  A 
原子    1305  C   GLN A 180  6.937  3.283  -4.584  1.00 41.42  A 
原子    1306  O   GLN A 180  6.285  4.181  -5.103  1.00 40.99  A 
原子    1307  N   GLU A 181  8.259  3.197  -4.734  1.00 40.46  A 
原子    1308  CA  GLU A 181  8.923  4.189  -5.587  1.00 39.31  A 
原子    1309  CB  GLU A 181  10.402 4.416  -5.258  1.00 39.74  A 
原子    1310  CG  GLU A 181  11.123 5.312  -6.292  1.00 48.32  A 
原子    1311  CD  GLU A 181  10.506 6.702  -6.418  1.00 55.12  A 
原子    1312  OE1 GLU A 181  10.419 7.222  -7.553  1.00 55.57  A 
原子    1313  OE2 GLU A 181  10.114 7.287  -5.384  1.00 60.29  A 
原子    1314  C   GLU A 181  8.799  3.613  -6.981  1.00 38.08  A 
原子    1315  O   GLU A 181  8.983  4.311  -7.968  1.00 38.22  A 
原子    1316  N   MET A 182  8.506  2.324  -7.085  1.00 34.65  A 
原子    1317  CA  MET A 182  8.316  1.825  -8.426  1.00 35.64  A 
原子    1318  CB  MET A 182  8.424  0.302  -8.511  1.00 38.04  A 
原子    1319  CG  MET A 182  9.709  -0.19  5-9.101 1.00 34.28  A 
原子    1320  SD  MET A 182  9.540  -1.92  7-8.944 1.00 37.19  A 
原子    1321  CE  MET A 182  11.071 -2.505 -9.329  1.00 15.46  A 
原子    1322  C   MET A 182  6.921  2.260  -8.777  1.00 36.85  A 
原子    1323  O   MET A 182  6.656  2.685  -9.896  1.00 39.65  A 
原子    1324  N   ALA A 183  6.042  2.169  -7.783  1.00 36.57  A 
原子    1325  CA  ALA A 183  4.629  2.532  -7.929  1.00 37.16  A 
原子    1326  CB  ALA A 183  3.890  2.241  -6.635  1.00 36.36  A 
原子    1327  C   ALA A 183  4.402  4.002  -8.307  1.00 38.95  A 
原子    1328  O   ALA A 183  3.592  4.310  -9.186  1.00 36.70  A 
原子    1329  N   SER A 184  5.104  4.904  -7.628  1.00 39.45  A 
原子    1330  CA  SER A 184  4.940  6.310  -7.894  1.00 39.46  A 
原子    1331  CB  SER A 184  5.861  7.128  -6.968  1.00 42.13  A 
原子    1332  OG  SER A 184  7.245  7.022  -7.298  1.00 48.29  A 
原子    1333  C   SER A 184  5.186  6.627  -9.376  1.00 39.78  A 
原子    1334  O   SER A 184  4.575  7.561  -9.927  1.00 40.91  A 
原子    1335  N   ARG A 185  6.030  5.816  -10.024 1.00 38.10  A 
原子    1336  CA  ARG A 185  6.421  5.972  -11.441 1.00 38.54  A 
原子    1337  CB  ARG A 185  7.836  5.500  -11.615 1.00 39.60  A 
原子    1338  CG  ARG A 185  8.731  5.856  -10.482 1.00 43.85  A 
原子    1339  CD  ARG A 185  9.582  7.003  -10.872 1.00 43.92  A 
原子    1340  NE  ARG A 185  10.579 7.214  -9.845  1.00 43.92  A 
原子    1341  CZ  ARG A 185  11.846 7.508  -10.096 1.00 47.56  A 
原子    1342  NH1 ARG A 185  12.275 7.629  -11.352 1.00 47.14  A 
原子    1343  NH2 ARG A 185  12.687 7.676  -9.088  1.00 49.32  A 
原子    1344  C   ARG A 185  5.566  5.135  -12.384 1.00 38.55  A 
原子    1345  O   ARG A 185  5.744  5.186  -13.599 1.00 36.63  A 
原子    1346  N   GLY A 186  4.634  4.382  -11.792 1.00 38.35  A 
原子    1347  CA  GLY A 186  3.734  3.494  -12.522 1.00 34.39  A 
原子    1348  C   GLY A 186  4.432  2.251  -13.066  1.00 35.47  A 
原子    1349  O   GLY A 186  4.024  1.662  -14.078  1.00 36.52  A 
原子    1350  N   LEU A 187  5.492  1.824  -12.388  1.00 35.09  A 
原子    1351  CA  LEU A 187  6.306  0.688  -12.866  1.00 32.71  A 
原子    1352  CB  LEU A 187  7.783  1.027  -12.652  1.00 31.96  A 
原子    1353  CG  LEU A 187  8.565  1.941  -13.597  1.00 32.36  A 
原子    1354  CD1 LEU A 187  7.682  2.592  -14.629  1.00 31.78  A 
原子    1355  CD2 LEU A 187  9.283  2.993  -12.769  1.00 30.26  A 
原子    1356  C   LEU A 187  6.061  -0.685 -12.234  1.00 31.58  A 
原子    1357  O   LEU A 187  6.466  -1.714 -12.767  1.00 31.78  A 
原子    1358  N   TRP A 188  5.412  -0.673 -11.084  1.00 36.15  A 
原子    1359  CA  TRP A 188  5.106  -1.850 -10.311  1.00 37.72  A 
原子    1360  CB  TRP A 188  4.373  -1.402 -9.053   1.00 37.80  A 
原子    1361  CG  TRP A 188  4.114  -2.500 -8.138   1.00 36.87  A 
原子    1362  CD2 TRP A 188  5.103  -3.321 -7.522   1.00 37.71  A 
原子    1363  CE2 TRP A 188  4.417  -4.281 -6.735   1.00 33.19  A 
原子    1364  CE3 TRP A 188  6.509  -3.311 -7.518   1.00 36.97  A 
原子    1365  CD1 TRP A 188  2.901  -2.994 -7.751   1.00 37.59  A 
原子    1366  NE1 TRP A 188  3.075  -4.073 -6.912   1.00 32.23  A 
原子    1367  CZ2 TRP A 188  5.106  -5.266 -6.000   1.00 33.55  A 
原子    1368  CZ3 TRP A 188  7.180  -4.280 -6.794   1.00 34.26  A 
原子    1369  CH2 TRP A 188  6.484  -5.225 -6.022   1.00 33.13  A 
原子    1370  C   TRP A 188  4.249  -2.882 -11.023  1.00 39.20  A 
原子    1371  O   TRP A 188  4.586  -4.058 -11.075  1.00 39.44  A 
原子    1372  N   ASP A 189  3.118  -2.425 -11.534  1.00 38.97  A 
原子    1373  CA  ASP A 189  2.177  -3.327 -12.160  1.00 41.46  A 
原子    1374  CB  ASP A 189  1.049  -2.526 -12.801  1.00 46.52  A 
原子    1375  CG  ASP A 189  -0.320 -3.012 -12.338  1.00 52.18  A 
原子    1376  OD1 ASP A 189  -0.956 -3.753 -13.112  1.00 55.99  A 
原子    1377  OD2 ASP A 189  -0.760 -2.700 -11.198  1.00 58.95  A 
原子    1378  C   ASP A 189  2.808  -4.329 -13.119  1.00 38.34  A 
原子    1379  O   ASP A 189  2.495  -5.508 -13.064  1.00 36.45  A 
原子    1380  N   SER A 190  3.727  -3.867 -13.955  1.00 36.70  A 
原子    1381  CA  SER A 190  4.426  -4.704 -14.914  1.00 34.73  A 
原子    1382  CB  SER A 190  4.870  -3.787 -16.073  1.00 33.57  A 
原子    1383  OG  SER A 190  5.732  -4.428 -17.013  1.00 38.08  A 
原子    1384  C   SER A 190  5.593  -5.430 -14.185  1.00 32.59  A 
原子    1385  O   SER A 190  5.790  -6.625 -14.377  1.00 34.63  A 
原子    1386  N   PHE A 191  6.323  -4.736 -13.309  1.00 33.95  A 
原子    1387  CA  PHE A 191  7.405  -5.388 -12.571  1.00 28.50  A 
原子    1388  CB  PHE A 191  8.073  -4.406 -11.567  1.00 27.70  A 
原子    1389  CG  PHE A 191  9.249  -4.993 -10.836  1.00 23.40  A 
原子    1390  CD1 PHE A 191  10.401 -5.349 -11.527  1.00 25.35  A 
原子    1391  CD2 PHE A 191  9.185  -5.247 -9.468   1.00 24.51  A 
原子    1392  CE1 PHE A 191  11.480 -5.952 -10.862  1.00 20.84  A 
原子    1393  CE2 PHE A 191  10.280 -5.859 -8.799   1.00 25.42  A 
原子    1394  CZ  PHE A 191  11.416 -6.204 -9.517   1.00 20.19  A 
原子    1395  C   PHE A 191  6.876  -6.612 -11.810  1.00 31.16  A 
原子    1396  O   PHE A 191  7.412  -7.710  -11.937  1.00 34.37  A 
原子    1397  N   ARG A 192  5.830  -6.408  -11.013  1.00 34.99  A 
原子    1398  CA  ARG A 192  5.228  -7.460  -10.166  1.00 37.91  A 
原子    1399  CB  ARG A 192  4.086  -6.895  -9.305   1.00 40.34  A 
原子    1400  CG  ARG A 192  3.368  -8.059  -8.558   1.00 44.54  A 
原子    1401  CD  ARG A 192  1.914  -7.822  -8.135   1.00 51.54  A 
原子    1402  NE  ARG A 192  0.899  -7.580  -9.176   1.00 56.19  A 
原子    1403  CZ  ARG A 192  0.617  -6.373  -9.656   1.00 56.73  A 
原子    1404  NH1 ARG A 192  1.285  -5.317  -9.212   1.00 57.21  A 
原子    1405  NH2 ARG A 192  -0.391 -6.198  -10.496  1.00 57.91  A 
原子    1406  C   ARG A 192  4.634  -8.712  -10.808  1.00 37.29  A 
原子    1407  O   ARG A 192  4.408  -9.729  -10.147  1.00 40.15  A 
原子    1408  N   GLN A 193  4.346  -8.632  -12.087  1.00 35.81  A 
原子    1409  CA  GLN A 193  3.698  -9.742  -12.738  1.00 38.48  A 
原子    1410  CB  GLN A 193  2.308  -9.281  -13.182  1.00 38.50  A 
原子    1411  CG  GLN A 193  2.315  -7.988  -14.036  1.00 45.90  A 
原子    1412  CD  GLN A 193  0.912  -7.541  -14.446  1.00 50.22  A 
原子    1413  OE1 GLN A 193  0.678  -6.373  -14.786  1.00 52.52  A 
原子    1414  NE2 GLN A 193  -0.029 -8.477  -14.418  1.00 54.59  A 
原子    1415  C   GLN A 193  4.477  -10.298 -13.916  1.00 38.28  A 
原子    1416  O   GLN A 193  3.931  -11.008 -14.775  1.00 37.58  A 
原子    1417  N   SER A 194  5.768  -10.004 -13.935  1.00 38.41  A 
原子    1418  CA  SER A 194  6.643  -10.447 -15.004  1.00 38.20  A 
原子    1419  CB  SER A 194  7.221  -9.227  -15.719  1.00 39.28  A 
原子    1420  OG  SER A 194  7.771  -8.306  -14.784  1.00 47.74  A 
原子    1421  C   SER A 194  7.762  -11.358 -14.526  1.00 38.11  A   
原子    1422  O   SER A 194  8.751  -11.549 -15.248  1.00 35.39  A 
原子    1423  N   GLU A 195  7.612  -11.922 -13.327  1.00 35.72  A 
原子    1424  CA  GLU A 195  8.631  -12.827 -12.850  1.00 36.50  A 
原子    1425  CB  GLU A 195  8.720  -12.875 -11.351  1.00 36.67  A 
原子    1426  CG  GLU A 195  9.600  -14.015 -10.888  1.00 35.54  A 
原子    1427  CD  GLU A 195  9.744  -13.962 -9.413   1.00 37.06  A 
原子    1428  OE1 GLU A 195  9.984  -12.849 -8.907   1.00 40.23  A 
原子    1429  OE2 GLU A 195  9.622  -15.003 -8.749   1.00 33.08  A 
原子    1430  C   GLU A 195  8.287  -14.210 -13.335  1.00 37.87  A 
原子    1431  O   GLU A 195  7.201  -14.718 -13.097  1.00 38.80  A 
原子    1432  N   ARG A 196  9.270  -14.818 -13.962  1.00 36.44  A 
原子    1433  CA  ARG A 196  9.146  -16.103 -14.561  1.00 37.25  A 
原子    1434  CB  ARG A 196  9.495  -15.865 -16.017  1.00 35.97  A 
原子    1435  CG  ARG A 196  10.220 -16.869 -16.774  1.00 35.63  A 
原子    1436  CD  ARG A 196  10.115 -16.310 -18.145  1.00 42.73  A 
原子    1437  NE  ARG A 196  9.641  -17.309 -19.071  1.00 48.88  A 
原子    1438  CZ  ARG A 196  9.164  -17.028 -20.272  1.00 51.24  A 
原子    1439  NH1 ARG A 196  8.759  -18.012 -21.064  1.00 52.08  A 
原子    1440  NH2 ARG A 196  9.068  -15.764 -20.667  1.00 51.19  A 
原子    1441  C   ARG A 196  10.057 -17.072 -13.842  1.00 40.12  A 
原子    1442  O   ARG A 196  10.944 -16.620 -13.107  1.00 39.42  A 
原子    1443  N   GLY A 197  9.856  -18.380 -14.001  1.00 38.00  A 
原子    1444  CA  GLY A 197   10.760 -19.285  -13.313 1.00 36.72  A 
原子    1445  C   GLY A 197   11.962 -19.318  -14.228 1.00 35.38  A 
原子    1446  O   GLY A 197   13.088 -19.505  -13.801 1.00 38.62  A 
原子    1447  MG  MG  A 999   23.785 -15.925  -7.227  1.00 40.31  A 
原子    1448  OH2 TIP A 1001  25.989 -16.102  -7.182  1.00 38.07  A 
原子    1449  OH2 TIP A 1002  21.329 -15.908  -6.882  1.00 48.60  A 
原子    1450  OH2 TIP A 1003  23.416 -18.109  -6.644  1.00 29.11  A 
结束 
对来源于禽H5N1型流感病毒株(A/goose/Guangdong/1/96)聚合酶亚基PA蛋白与1918年欧洲爆发的大范围流感的A型流感病毒株A/Brevig Mission/1/1918、以及两种分别属于B型流感病毒株B/Ann Arbor/1/1966和C型流感病毒株C/JJ/1950的PA蛋白序列进行了比较，结果如图1和图4。 
本发明人将PA分成两部分，分别克隆了多个不同长度的PA基因两部分的片段，并在大肠杆菌中进行表达。其中PA分成的N端1-256残基(参见图1及图2)和257-716残基(参见图4A)通过与GST(谷胱甘肽硫酰基转移酶Glutathione S-Transferase)的融合都获得了良好的表达纯化。其中纯化的PA氨基端(PA_N)获得了良好衍射的母体晶体。 
体外结合实验表明，按比例混合PA及PB1相应多肽的表达菌，然后经过Glutathione亲和柱及凝胶排阻层析等共纯化这两个蛋白，可以看到两者可以获得共纯化，表明纯化的PA羧基端460氨基酸可以与GST-PB1多肽形成稳定复合体。 
同时，体外结合实验表明，获得了PA氨基端PA_N多肽的表达菌，并纯化获得了PA氨基端PA_N多肽。并用于结晶实验，结果在多个条件下获得了良好衍射的结晶。 
参考文献 
Adams，P.D.，R.W.Grosse-Kunstleve，et al.(2002).″PHENIX：building newsoftware for automated crystallographic structure determination.″ActaCrystallogr D Biol Crystallogr 58(Pt 11)：1948-54. 
Brunger，A.T.，P.D.Adams，et al.(1998).″Crystallography & NMR system：A newsoftware suite for macromolecular structure determination.″Acta CrystallogrD Biol Crystallogr 54(Pt 5)：905-21. 
Deng，T.，J.Sharps，et al.(2005).″In vitro assembly of PB2 with a PB1-PA dimersupports a new model of assembly of influenza A virus polymerase subunitsinto a functional trimeric complex.″J Virol 79(13)：8669-74. 
Deng，T.，J.L.Sharps，et al.(2006).″Role of the influenza virus heterotrimericRNA polymerase complex in the initiation of replication.″J Gen Virol 87(Pt11)：3373-7. 
Emsley，P.and K.Cowtan(2004).″Coot：model-building tools for moleculargraphics.″Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60(Pt 12 Pt 1)：2126-32. 
Fodor，E.，M.Crow，et al.(2002).″A single amino acid mutation in the PA subunitof the influenza virus RNA polymerase inhibits endonucleolytic cleavage ofcapped RNAs.″J Virol 76(18)：8989-9001. 
Fodor，E.，D.C.Pritlove，et al.(1994).″The influenza virus panhandle is involvedin the initiation of transcription.″J Virol 68(6)：4092-6. 
Hara，K.，F.I.Schmidt，et al.(2006).″Amino acid residues in the N-terminal regionof the PA subunit of influenza A virus RNA polymerase play a critical role inprotein stability，endonuclease activity，cap binding，and virion RNApromoter binding.″J Virol 80(16)：7789-98. 
Hara，K.，M.Shiota，et al.(2001).″Influenza virus RNA polymerase PA subunit is anovel serine protease with Ser624 at the active site.″Genes Cells 6(2)：87-97. 
He X.，et al.(2008).″Crystal structure of the polymerase PA_C：PB1_N complexfrom an avian influenza H5N1 virus.″Nature，454(7208)：1123-6. 
Hendrickson，W.A.(1991).″Determination of macromolecular structures fromanomalous diffraction of synchrotron radiation.″Science 254(5028)：51-8. 
Honda，A.，K.Mizumoto，et al.(2002).″Minimum molecular architectures fortranscription and replication of the influenza virus.″Proc Natl Acad Sci USA99(20)：13166-71. 
Hulse-Post，D.J.，J.Franks，et al.(2007).″Molecular changes in the polymerasegenes(PA and PB 1)associated with high pathogenicity of H5N1 influenzavirus in mallard ducks.″J Virol 81(16)：8515-24. 
Kawaguchi，A.，T.Naito，et al.(2005).″Involvement of influenza virus PA subunitin assembly of functional RNA polymerase complexes.″J Virol 79(2)：732-44. 
Munster，V.J.，E.de Wit，et al.(2007).″The molecular basis of the pathogenicity ofthe Dutch highly pathogenic human influenza A H7N7 viruses.″J Infect Dis196(2)：258-65. 
Murshudov，G.N.，A.A.Vagin，et al.(1997).″Refinement of macromolecularstructures by the maximum-likelihood method.″Acta Crystallogr D BiolCrystallogr 53(Pt 3)：240-55. 
Otwinowski，Z.M.，Wladek(1997).″Processing of x-ray diffraction data collectedin oscillation mode″Methods in Enzymology276(MacromolecularCrystallography，Part A)：307-326 
Perez，D.R.and R.O.Donis(2001).″Functional analysis of PA binding byinfluenza a virus PB 1：effects on polymerase activity and viral infectivity.″JVirol75(17)：8127-36. 
Perrakis，A.，R.Morris，et al.(1999).″Automated protein model building combinedwith iterative structure refinement.″Nat Struct Biol 6(5)：458-63. 
Sanz-Ezquerro，J.J.，T.Zurcher，et al.(1996).″The amino-terminal one-third of theinfluenza virus PA protein is responsible for the induction of proteolysis.″JVirol 70(3)：1905-11. 
Sheldrick，G.M.，Ed.(1998).Direct Methods for Solving MacromolecularStructures.Dordrecht，The Netherlands，Kluwer Academic Publishers. 
Sugiura，A.，M.Ueda，et al.(1975).″Further isolation and characterization oftemperature-sensitive mutants of influenza virus.″Virology65(2)：363-73. 
Taubenberger，J.K.and D.M.Morens(2007).″The Pathology of Influenza VirusInfections.″Annu Rev Pathol. 
Vonrhein，C.，E.Blanc，et al.(2007).″Automated structure solution withautoSHARP.″Methods Mol Biol 364：215-30. 

Claims (10)

1.一种流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的晶体，其中所述流感病毒为A型流感病毒株，所述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N为所述流感病毒聚合酶亚基PA的从1位氨基酸至在256位范围内的氨基酸，其中所述晶体三维结构中的原子具有表1中所列的原子坐标，所述的晶体具有P1空间群，晶胞参数为约：a＝51.1埃，b＝59.8埃，c＝67.2埃，α＝96.6°，β＝96.8°，γ＝109.5°。
2.根据权利要求1所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中所述A型流感病毒株为A/goose/Guangdong/1/96。
3.根据权利要求1或2所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中，重金属硒代甲硫氨酸的晶体具有P6(4)22的空间群，晶胞参数为约：α＝b＝73.8埃，c＝123.4埃，α＝β＝90°，γ＝120°。
4.根据权利要求1～2任一项所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N由所述流感病毒聚合酶PA的氨基端PA_N中的α螺旋1，即含2－9位的氨基酸区段，α螺旋2，即含11－22位的氨基酸区段，α螺旋3，即含32－48位的氨基酸区段，α螺旋4，即含84－92的氨基酸区段，α螺旋5，即含127－138位的氨基酸区段，α螺旋6，即含165－184位的氨基酸区段，α螺旋7，即含187－191位的氨基酸区段，以及五个主要的β折叠片，包括β片1，即含76－78位的氨基酸区段，β片2，即含109－111位的氨基酸区段，β片3，即含116－123位的氨基酸区段，β片4，即含144－149位的氨基酸区段，β片5，即含154－157位的氨基酸区段，共同构成所述PA的氨基端PA_N的主要部分，其中，由平行的β片1－5组成一个扭曲的平面，其它所述的α螺旋围绕在这一平面周围，其中B型或C型流感病毒中与A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。
5.根据权利要求1～2任一项所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中结合有一个选自镁、锰、锌、铜、钴、铁构成的组中的金属离子，该金属离子主要由三个水分子以及氨基酸残基Glu80以及Asp108至少之一提供配位，其中参与这一结合的氨基酸还有选自His41、Glu119、Leu106以及Pro107中的至少之一，其中B型或C型流感病毒中的与A型流感病毒相应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。
6.根据权利要求5所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中所述金属离子为镁离子。
7.根据权利要求1～2任一项所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N含有一个与其它内切核酸酶相似的(P)DXN(D/E)XK序列区域，其中在所述A型流感病毒的聚合酶亚基PA的氨基端PA_N中各氨基酸可以代表如下：P107D108X(11)E119X(15)K134，其中B型或C型流感病毒中与A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。
8.根据权利要求1～2任一项所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中T157、E153、E154、K158、D160、E165、E166、R168、R170和Lys172位于β片层β4以及α7之间的序列中，其中B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。
9.根据权利要求1～2任一项所述的流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N的晶体，其中所述A型流感病毒聚合酶亚基PA位于PA氨基端PA_N的所述α螺旋1以及α螺旋2形成一个发夹状结构，其中一些氨基酸残基共同组成一个邻近的带电荷的表面，包括氨基酸残基Glu2、Asp3、Arg6、Gln10、Glu15、Glu18、Lys19、Lys22、Asp27和Lys29，其中B型或C型流感病毒中与所述A型流感病毒相对应的区段的氨基酸分别如在图1中所示。
10.根据权利要求1～9任一项所述的晶体在药物筛选及药物设计方面的应用。
CN200910077937.8A 2009-02-04 2009-02-04 流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构 Active CN101792745B (zh)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN200910077937.8A CN101792745B (zh) 2009-02-04 2009-02-04 流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构
PCT/CN2010/070500 WO2010088857A1 (zh) 2009-02-04 2010-02-03 流感病毒聚合酶pa亚基的氨基端部分的晶体结构及其应用
US13/254,823 US9017960B2 (en) 2009-02-04 2010-02-03 Crystal structure of amino terminal portion of influenza virus polymerase PA subunit and use thereof
EP10738213.7A EP2402365B1 (en) 2009-02-04 2010-02-03 Crystal structure of amino terminal portion of influenza virus polymerase pa subunit and use thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN200910077937.8A CN101792745B (zh) 2009-02-04 2009-02-04 流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN101792745A CN101792745A (zh) 2010-08-04
CN101792745B true CN101792745B (zh) 2014-09-17

Family

ID=42541682

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN200910077937.8A Active CN101792745B (zh) 2009-02-04 2009-02-04 流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构

Country Status (4)

Country Link
US (1) US9017960B2 (zh)
EP (1) EP2402365B1 (zh)
CN (1) CN101792745B (zh)
WO (1) WO2010088857A1 (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105132392A (zh) * 2015-09-12 2015-12-09 复旦大学 一种深海沉积物蛋白酯酶的表达纯化、晶体结构及其应用

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103275199A (zh) * 2012-07-06 2013-09-04 天津市国际生物医药联合研究院 蓝藻中荧光恢复蛋白的表达纯化及其晶体结构
CA2879443A1 (en) * 2012-07-19 2014-01-23 Zoetis Llc Bovine influenza virus compositions

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1624116A (zh) * 2003-12-02 2005-06-08 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 人工重组的流感病毒及其应用

Family Cites Families (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4235871A (en) 1978-02-24 1980-11-25 Papahadjopoulos Demetrios P Method of encapsulating biologically active materials in lipid vesicles
US4501728A (en) 1983-01-06 1985-02-26 Technology Unlimited, Inc. Masking of liposomes from RES recognition
US4957735A (en) 1984-06-12 1990-09-18 The University Of Tennessee Research Corporation Target-sensitive immunoliposomes- preparation and characterization
US5019369A (en) 1984-10-22 1991-05-28 Vestar, Inc. Method of targeting tumors in humans
US4902505A (en) 1986-07-30 1990-02-20 Alkermes Chimeric peptides for neuropeptide delivery through the blood-brain barrier
US4837028A (en) 1986-12-24 1989-06-06 Liposome Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
US5004697A (en) 1987-08-17 1991-04-02 Univ. Of Ca Cationized antibodies for delivery through the blood-brain barrier
US5055303A (en) 1989-01-31 1991-10-08 Kv Pharmaceutical Company Solid controlled release bioadherent emulsions
US5271961A (en) 1989-11-06 1993-12-21 Alkermes Controlled Therapeutics, Inc. Method for producing protein microspheres
US5188837A (en) 1989-11-13 1993-02-23 Nova Pharmaceutical Corporation Lipsopheres for controlled delivery of substances
US5268164A (en) 1990-04-23 1993-12-07 Alkermes, Inc. Increasing blood-brain barrier permeability with permeabilizer peptides
US5254342A (en) 1991-09-30 1993-10-19 University Of Southern California Compositions and methods for enhanced transepithelial and transendothelial transport or active agents
EP0630234B1 (en) 1992-03-12 1997-06-11 Alkermes Controlled Therapeutics, Inc. Controlled release acth containing microspheres
US5534496A (en) 1992-07-07 1996-07-09 University Of Southern California Methods and compositions to enhance epithelial drug transport
US5514670A (en) 1993-08-13 1996-05-07 Pharmos Corporation Submicron emulsions for delivery of peptides
US6090609A (en) * 1997-08-01 2000-07-18 University Of Alabama Research Foundation Crystallized N-terminal domain of influenza virus matrix protein M1 and method of determining and using same
AU2003231232A1 (en) * 2002-05-01 2003-11-17 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Crystal structure of aurora-2 protein and binding pockets thereof
AU2007300663A1 (en) 2006-07-21 2008-04-03 Pharmexa Inc. Inducing cellular immune responses to influenza virus using peptide and nucleic acid compositions
CN101514335B (zh) * 2008-02-22 2013-04-17 中国科学院生物物理研究所 流感病毒聚合酶亚基pa的表达纯化及pa氨基端及pa羧基端与pb1氨基端多肽复合体的晶体结构
KR20110127114A (ko) * 2008-12-19 2011-11-24 더 유럽피안 몰레큘러 바이올로지 래보러토리 엔도뉴클레아제 활성을 포함하는 폴리펩타이드 단편 및 이의 용도

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1624116A (zh) * 2003-12-02 2005-06-08 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 人工重组的流感病毒及其应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Crystal structure of the polymerase PAc-PB1n complex from an avian influenza H5N1 virus;Xiaojing He et al;《Nature》;20080828;第454卷;1123-1126 *
Xiaojing He et al.Crystal structure of the polymerase PAc-PB1n complex from an avian influenza H5N1 virus.《Nature》.2008,第454卷1123-1126. *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105132392A (zh) * 2015-09-12 2015-12-09 复旦大学 一种深海沉积物蛋白酯酶的表达纯化、晶体结构及其应用
CN105132392B (zh) * 2015-09-12 2018-08-24 复旦大学 一种深海沉积物蛋白酯酶的表达纯化、晶体结构及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
EP2402365A4 (en) 2012-05-02
WO2010088857A1 (zh) 2010-08-12
CN101792745A (zh) 2010-08-04
EP2402365B1 (en) 2018-10-24
US9017960B2 (en) 2015-04-28
US20130046076A1 (en) 2013-02-21
EP2402365A1 (en) 2012-01-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU733890B2 (en) Crystal structures of a protein tyrosine kinase
WO1998007835A9 (en) Crystal structures of a protein tyrosine kinase
US8058390B2 (en) HDM2-inhibitor complexes and uses thereof
US8143044B2 (en) Crystal structure of the influenza virus polymerase PAC-PB1N complex and uses thereof
WO2008068534A2 (en) Crystal structure of a betal -adremergi c receptor and uses thereof
CN100482793C (zh) GSK-3β蛋白质的鉴定及其使用方法
US5942428A (en) Crystals of the tyrosine kinase domain of non-insulin receptor tyrosine kinases
US20180010109A1 (en) Polypeptide fragments comprising endonuclease activity and their use
CN101792745B (zh) 流感病毒聚合酶亚基pa氨基端多肽的表达纯化及pa氨基端多肽的晶体结构
WO2009055509A9 (en) Cholesterol consensus motif of membrane proteins
AU2009301631A1 (en) Amyloid-beta peptide crystal structure
EP1409660A2 (en) Crystal structure of beta-site app cleaving enzyme (bace) and use thereof
US6162627A (en) Methods of identifying inhibitors of sensor histidine kinases through rational drug design
CA2615753A1 (en) Crystal structure of human soluble adenylate cyclase
CA2863282A1 (en) Crystal structure of hcv polymerase complexes and methods of use
Llauger et al. A fijivirus major viroplasm protein shows RNA-stimulated ATPase activity by adopting pentameric and hexameric assemblies of dimers
WO2009076621A1 (en) High resolution structures of acidic mammalian chitinases and uses thereof
JP2005137361A (ja) ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４又はその変異体タンパク質の結晶、ペプチジルアルギニンデイミナーゼ４変異体タンパク質及びその複合体
CN1977041A (zh) 蛋白激酶Cθ的结构及相关应用
WO2008037688A2 (en) Crystalline forms of pkc alpha kinase, methods of making such crystals, and uses thereof
US20070031849A1 (en) Three-dimensional structure of DNA recombination/repair protein and use thereof
JP2008501315A (ja) Ｈｄｍ２阻害剤複合体およびそれらの使用
WO2005045019A1 (en) Three-dimensional structure of cathepsin e, methods and use thereof
WO2003048341A2 (en) Cap-gly domain structure and uses thereof
GB2517227A (en) Crystal structure

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant