CN101684503A - 基于dna信号转换的磁颗粒/微电极检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种基于DNA作为信号放大的检测方法,将检测信号转换为检测DNA的信号,首先通过磁颗粒分离技术将待检测物分离富集,然后DNA杂交信号放大片段,通过DNA杂交得到DNA信号放大片段,然后利用磁颗粒-微电极检测方法检测DNA信号放大片断,即可得到待检测物的信息。
Description
[技术领域]
本发明涉及生物医学领域的一种体外检测方法,将检测DNA、蛋白质、化学分子等信号均可转换为检测DNA的信号,通过DNA信号转换实现对多种样品的检测。
[背景技术]
目前生物检测通常采用是借助抗体、特异性配体进行检测,但抗体或配体蛋白活性不稳定,容易失活,而且所需条件严格,制备昂贵,不利于生物样品的检测。
而DNA则具有很好的稳定性,合成制备方便廉价,在生物检测中具有明显的优势,常能获得极高的信噪比和灵敏度。因此在生物样品检测中通过DNA信号转换,将检测抗体或配体蛋白的信号转换为检测DNA的信号,从而确定待测生物样品,成为生物样品检测的已大趋势。美国Northwest University的Mirkin教授实现了无需PCR扩增的炭疽DNA电学检测(Science 301,1884-1886,2003),在检测前列腺肿瘤标志物PSA时,引入DNA作为信号放大分子,通过PCR或生物芯片技术检测DNA,从而实现了对PSA的高灵敏检测。
但是,使用PCR或生物芯片具有一定的局限性。PCR需要设备昂贵,耗时长,而且其灵敏度有限;生物芯片容易产生高背景,不易重复,生物芯片采用的是固液杂交,效率低。
[发明内容]
针对现有技术的上述缺点,本发明所要达到的技术目的是提供一种高灵敏、特异性好、稳定的检测方法,将检测信号转换为检测DNA的信号,所有的实验过程均是液相杂交。
技术方案,本发明提出DNA信号转换与磁颗粒分离-微电极检测相结合的路线,包括两种方案,第一种方案步骤如下(图1):1)富集,利用特异性标记物1(L1)修饰的磁纳米颗粒在液相中富集待检测物质,待测物质可以为核酸、蛋白,包括DNA、RNA、抗原、抗体等;2)可加入亲和素标记的特异性标记物2(L2);3)得到磁颗粒L1-待测物质-L2亲和素复合物后,加入生物素化的双链DNA(双链DNA只有其中一条的5’端被生物素化);4)得到磁颗粒L1-待测物质-L2亲和素-生物素双链DNA复合物后,经94℃处理去杂交,得到游离的单链DNA;5)游离的单链DNA利用我们已经建立的磁颗粒分离-微电极检测方法(参见专利。。。。)进行检测,DNA的信号强度代表了待检测物质的信号强度,从而实现了待检测物质的检测。
第二种方案步骤如下(图2):1)富集,利用特异性标记物1(L1)修饰的磁纳米颗粒在液相中富集待检测物质,待测物质可以为核酸、蛋白,包括DNA、RNA、抗原、抗体等;2)可加入纳米微球(如硅纳米颗粒,聚苯乙烯微球等)标记的特异性标记物2(L2),同时在纳米微球表面还标有大量的双链DNA;3)得到磁颗粒L1-待测物质-L2纳米微球/DNA复合物后,经94℃处理去杂交,得到游离的单链DNA;5)游离的单链DNA利用我们已经建立的磁颗粒分离-微电极检测方法(参见专利200610086617.5)进行检测,DNA的信号强度代表了待检测物质的信号强度,从而实现了待检测物质的检测。
DNA信号转换,有以下优点:1)DNA性质稳定,不易失活,其杂交规律了解比较清楚,特异性高;2)DNA制备廉价快速,满足多种需要;3)DNA设计与改造方便,可以根据不同实验设计不同的DNA序列,便于多样化检测。
液相杂交,有以下优点:1)采用葡聚糖或琼脂糖或壳聚糖修饰的磁颗粒,能够减少杂交、银染过程中的非特异性吸附;2)磁颗粒直径小于1μm,特异性标记物L1可以较均匀、有序地修饰到磁纳米颗粒表面;3)磁纳米颗粒大大增加了特异性标记物分子与待测样品的反应界面,能够有效地富集待测物质(见图3);4)磁纳米颗粒均一分散在反应液中,反应更加接近生理环境。均匀有序的修饰,高反应界面,液相中均一分散使得反应时间更快、灵敏度更高、特异性更好。
磁颗粒-微电极检测系统,参见专利检测系统灵敏、快速、稳定,特异性地检测生物大分子。可以结合自动化装置,构建一种生物大分子的杂交、银染、均借助一集成的自动化检测装置完成的自动化检测仪,无需手工逐步操作。
[附图说明]
图1为本发明所创新DNA信号转换与磁颗粒-微电极检测相结合的检测系统(方案一)。
1为磁颗粒,2为能够结合磁颗粒的特异性标记物L1,3为待测物质,4为特异性标记物L2,5为标记L2的亲和素,6为生物素,7为双链DNA,8为磁颗粒-微电极检测系统中与信号转换DNA特异识别的DNA探针1,9为双链DNA中去杂交获得的单链DNA,用于信号转换放大,10为特异识别信号转换DNA的探针2标记的金颗粒。
图2为本发明所创新DNA信号转换与磁颗粒-微电极检测相结合的检测系统(方案二)。
1为磁颗粒,2为能够结合磁颗粒的特异性标记物L1,3为待测物质,4为特异性标记物L2,5为纳米微球,6为双链DNA,含有用于信号转换的DNA,7为磁颗粒-微电极检测系统中与信号转换DNA特异识别的DNA探针1,8为双链DNA中去杂交获得的单链DNA,用于信号转换放大,9为特异识别信号转换DNA的探针2标记的金颗粒。
图3为本发明的检测方法检测炭疽核酸片断。
图4为本发明的检测方法检测鼠AA98单克隆抗体。
[具体实施方式]
生物样本检测实例1
利用本发明的实验方案1进行鼠AA98单克隆抗体的检测,所用50nm磁颗粒由Dynal公司购买,A蛋白在磁颗粒上标记参照说明书,亲和素标记的羊抗鼠二抗购自sigma公司,探针1在磁颗粒上标记参照说明书,银染试剂盒Sigma公司购买,银染过程参照说明书,金颗粒标记的探针2见文献(Science 295,1503-1506,2002),生物素化的双链DNA(其中一条用于信号转换)人工合成,间隙为50μm的微电极通过光刻方法制备,具体实施步骤如下:
1)待测样品富集:100μL的A蛋白修饰的磁纳米颗粒,100μL的鼠IgG单克隆抗体样品混合,室温下杂交120分钟,外加磁场吸附磁颗粒,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。
2)DNA信号转换:加入亲和素标记的羊抗鼠二抗20μL、室温下杂交20分钟,形成复合体,外加磁场吸附复合体,PBS清洗三次;然后加入生物素标记的双链DNA10μL、室温下杂交20分钟,形成复合体,外加磁场吸附复合体,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。94℃处理去杂交,外加磁场处理,收集上清液,得到游离的单链DNA。
3)磁颗粒-微电极检测单链DNA
方法参见专利200610086617.5
结果显示炭疽DNA片断个数的对数和测得相应电阻的对数呈近似线性关系(如图3),可以用于定量分析。空白对照组的测得电阻为106,含有104个炭疽DNA片断组测得电阻为103,信号噪声比约103。同探针分子固定在电极间基片上的检测,信号噪声比提高了两个数量级以上(Science 295,1503-1506,2002)。
生物样本检测实例2
利用本发明的实验方案2进行鼠AA98单克隆抗体的检测,所用50nm磁颗粒由Dynal公司购买,A蛋白在磁颗粒上标记参照说明书,羊抗鼠二抗购自sigma公司,探针1在磁颗粒上标记参照说明书,银染试剂盒Sigma公司购买,银染过程参照说明书,探针2标记的金颗粒见文献(Science 295,1503-1506,2002),双链DNA(其中一条用于信号转换)人工合成,双链DNA和羊抗鼠二抗共同标记于纳米微球(1μm)见参考文献(Small 2,103-108,2006)间隙为50μm的微电极通过光刻方法制备,具体实施步骤如下:
1)待测样品富集:100μL的A蛋白修饰的磁纳米颗粒,100μL的鼠IgG单克隆抗体混合,室温下120分钟,外加磁场吸附磁颗粒,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。
2)DNA信号转换:加入纳米微球/双链DNA标记的羊抗鼠二抗20μL、室温下杂交20分钟,形成复合体,外加磁场吸附复合体,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。94℃处理去杂交,外加磁场处理,收集上清液,得到游离的单链DNA。
3)磁颗粒-微电极检测单链DNA
方法参见专利200610086617.5
结果显示抗体浓度的对数和测得相应电阻的对数呈近似线性关系,可以用于定量分析(如图4)。
Claims (4)
1.一种DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法,其特征是将DNA信号转换与磁颗粒-微电极检测技术结合起来,建立高效、稳定的检测方法,待测物质通过磁颗粒富集后,经DNA信号转换后,利用磁颗粒-微电极检测技术检测DNA信号,即可反应出待检测物质的信号。
2.根据权利要求1所述的DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法,其特征在于使用双链DNA作为信号转换。
3.根据权利要求1所述的DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法,其特征在于使用磁颗粒-微电极检测方法。
4.根据权利要求1所述的DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法的应用,其特征在于所述待测物质是核酸,蛋白质,病毒生物样品及化学物质。
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CN200810211353A CN101684503A (zh) | 2008-09-23 | 2008-09-23 | 基于dna信号转换的磁颗粒/微电极检测方法 |
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10481158B2 (en) | 2015-06-01 | 2019-11-19 | California Institute Of Technology | Compositions and methods for screening T cells with antigens for specific populations |
US12258613B2 (en) | 2017-03-08 | 2025-03-25 | California Institute Of Technology | Pairing antigen specificity of a T cell with T cell receptor sequences |
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2008
- 2008-09-23 CN CN200810211353A patent/CN101684503A/zh active Pending
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US12258613B2 (en) | 2017-03-08 | 2025-03-25 | California Institute Of Technology | Pairing antigen specificity of a T cell with T cell receptor sequences |
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