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CN101684503A - 基于dna信号转换的磁颗粒/微电极检测方法 - Google Patents

基于dna信号转换的磁颗粒/微电极检测方法 Download PDF

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CN101684503A
CN101684503A CN200810211353A CN200810211353A CN101684503A CN 101684503 A CN101684503 A CN 101684503A CN 200810211353 A CN200810211353 A CN 200810211353A CN 200810211353 A CN200810211353 A CN 200810211353A CN 101684503 A CN101684503 A CN 101684503A
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CN
China
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dna
magnetic particle
detection method
signals
microelectrode
Prior art date
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Pending
Application number
CN200810211353A
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English (en)
Inventor
高利增
张芳
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
WUHAN WAWA SAINA TECHNOLOGY DEVELOPMENT CO LTD
Original Assignee
WUHAN WAWA SAINA TECHNOLOGY DEVELOPMENT CO LTD
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Publication date
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Abstract

本发明涉及一种基于DNA作为信号放大的检测方法,将检测信号转换为检测DNA的信号,首先通过磁颗粒分离技术将待检测物分离富集,然后DNA杂交信号放大片段,通过DNA杂交得到DNA信号放大片段,然后利用磁颗粒-微电极检测方法检测DNA信号放大片断,即可得到待检测物的信息。

Description

基于DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法
[技术领域]
本发明涉及生物医学领域的一种体外检测方法,将检测DNA、蛋白质、化学分子等信号均可转换为检测DNA的信号,通过DNA信号转换实现对多种样品的检测。
[背景技术]
目前生物检测通常采用是借助抗体、特异性配体进行检测,但抗体或配体蛋白活性不稳定,容易失活,而且所需条件严格,制备昂贵,不利于生物样品的检测。
而DNA则具有很好的稳定性,合成制备方便廉价,在生物检测中具有明显的优势,常能获得极高的信噪比和灵敏度。因此在生物样品检测中通过DNA信号转换,将检测抗体或配体蛋白的信号转换为检测DNA的信号,从而确定待测生物样品,成为生物样品检测的已大趋势。美国Northwest University的Mirkin教授实现了无需PCR扩增的炭疽DNA电学检测(Science 301,1884-1886,2003),在检测前列腺肿瘤标志物PSA时,引入DNA作为信号放大分子,通过PCR或生物芯片技术检测DNA,从而实现了对PSA的高灵敏检测。
但是,使用PCR或生物芯片具有一定的局限性。PCR需要设备昂贵,耗时长,而且其灵敏度有限;生物芯片容易产生高背景,不易重复,生物芯片采用的是固液杂交,效率低。
[发明内容]
针对现有技术的上述缺点,本发明所要达到的技术目的是提供一种高灵敏、特异性好、稳定的检测方法,将检测信号转换为检测DNA的信号,所有的实验过程均是液相杂交。
技术方案,本发明提出DNA信号转换与磁颗粒分离-微电极检测相结合的路线,包括两种方案,第一种方案步骤如下(图1):1)富集,利用特异性标记物1(L1)修饰的磁纳米颗粒在液相中富集待检测物质,待测物质可以为核酸、蛋白,包括DNA、RNA、抗原、抗体等;2)可加入亲和素标记的特异性标记物2(L2);3)得到磁颗粒L1-待测物质-L2亲和素复合物后,加入生物素化的双链DNA(双链DNA只有其中一条的5’端被生物素化);4)得到磁颗粒L1-待测物质-L2亲和素-生物素双链DNA复合物后,经94℃处理去杂交,得到游离的单链DNA;5)游离的单链DNA利用我们已经建立的磁颗粒分离-微电极检测方法(参见专利。。。。)进行检测,DNA的信号强度代表了待检测物质的信号强度,从而实现了待检测物质的检测。
第二种方案步骤如下(图2):1)富集,利用特异性标记物1(L1)修饰的磁纳米颗粒在液相中富集待检测物质,待测物质可以为核酸、蛋白,包括DNA、RNA、抗原、抗体等;2)可加入纳米微球(如硅纳米颗粒,聚苯乙烯微球等)标记的特异性标记物2(L2),同时在纳米微球表面还标有大量的双链DNA;3)得到磁颗粒L1-待测物质-L2纳米微球/DNA复合物后,经94℃处理去杂交,得到游离的单链DNA;5)游离的单链DNA利用我们已经建立的磁颗粒分离-微电极检测方法(参见专利200610086617.5)进行检测,DNA的信号强度代表了待检测物质的信号强度,从而实现了待检测物质的检测。
DNA信号转换,有以下优点:1)DNA性质稳定,不易失活,其杂交规律了解比较清楚,特异性高;2)DNA制备廉价快速,满足多种需要;3)DNA设计与改造方便,可以根据不同实验设计不同的DNA序列,便于多样化检测。
液相杂交,有以下优点:1)采用葡聚糖或琼脂糖或壳聚糖修饰的磁颗粒,能够减少杂交、银染过程中的非特异性吸附;2)磁颗粒直径小于1μm,特异性标记物L1可以较均匀、有序地修饰到磁纳米颗粒表面;3)磁纳米颗粒大大增加了特异性标记物分子与待测样品的反应界面,能够有效地富集待测物质(见图3);4)磁纳米颗粒均一分散在反应液中,反应更加接近生理环境。均匀有序的修饰,高反应界面,液相中均一分散使得反应时间更快、灵敏度更高、特异性更好。
磁颗粒-微电极检测系统,参见专利检测系统灵敏、快速、稳定,特异性地检测生物大分子。可以结合自动化装置,构建一种生物大分子的杂交、银染、均借助一集成的自动化检测装置完成的自动化检测仪,无需手工逐步操作。
[附图说明]
图1为本发明所创新DNA信号转换与磁颗粒-微电极检测相结合的检测系统(方案一)。
1为磁颗粒,2为能够结合磁颗粒的特异性标记物L1,3为待测物质,4为特异性标记物L2,5为标记L2的亲和素,6为生物素,7为双链DNA,8为磁颗粒-微电极检测系统中与信号转换DNA特异识别的DNA探针1,9为双链DNA中去杂交获得的单链DNA,用于信号转换放大,10为特异识别信号转换DNA的探针2标记的金颗粒。
图2为本发明所创新DNA信号转换与磁颗粒-微电极检测相结合的检测系统(方案二)。
1为磁颗粒,2为能够结合磁颗粒的特异性标记物L1,3为待测物质,4为特异性标记物L2,5为纳米微球,6为双链DNA,含有用于信号转换的DNA,7为磁颗粒-微电极检测系统中与信号转换DNA特异识别的DNA探针1,8为双链DNA中去杂交获得的单链DNA,用于信号转换放大,9为特异识别信号转换DNA的探针2标记的金颗粒。
图3为本发明的检测方法检测炭疽核酸片断。
图4为本发明的检测方法检测鼠AA98单克隆抗体。
[具体实施方式]
生物样本检测实例1
利用本发明的实验方案1进行鼠AA98单克隆抗体的检测,所用50nm磁颗粒由Dynal公司购买,A蛋白在磁颗粒上标记参照说明书,亲和素标记的羊抗鼠二抗购自sigma公司,探针1在磁颗粒上标记参照说明书,银染试剂盒Sigma公司购买,银染过程参照说明书,金颗粒标记的探针2见文献(Science 295,1503-1506,2002),生物素化的双链DNA(其中一条用于信号转换)人工合成,间隙为50μm的微电极通过光刻方法制备,具体实施步骤如下:
1)待测样品富集:100μL的A蛋白修饰的磁纳米颗粒,100μL的鼠IgG单克隆抗体样品混合,室温下杂交120分钟,外加磁场吸附磁颗粒,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。
2)DNA信号转换:加入亲和素标记的羊抗鼠二抗20μL、室温下杂交20分钟,形成复合体,外加磁场吸附复合体,PBS清洗三次;然后加入生物素标记的双链DNA10μL、室温下杂交20分钟,形成复合体,外加磁场吸附复合体,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。94℃处理去杂交,外加磁场处理,收集上清液,得到游离的单链DNA。
3)磁颗粒-微电极检测单链DNA
方法参见专利200610086617.5
结果显示炭疽DNA片断个数的对数和测得相应电阻的对数呈近似线性关系(如图3),可以用于定量分析。空白对照组的测得电阻为106,含有104个炭疽DNA片断组测得电阻为103,信号噪声比约103。同探针分子固定在电极间基片上的检测,信号噪声比提高了两个数量级以上(Science 295,1503-1506,2002)。
生物样本检测实例2
利用本发明的实验方案2进行鼠AA98单克隆抗体的检测,所用50nm磁颗粒由Dynal公司购买,A蛋白在磁颗粒上标记参照说明书,羊抗鼠二抗购自sigma公司,探针1在磁颗粒上标记参照说明书,银染试剂盒Sigma公司购买,银染过程参照说明书,探针2标记的金颗粒见文献(Science 295,1503-1506,2002),双链DNA(其中一条用于信号转换)人工合成,双链DNA和羊抗鼠二抗共同标记于纳米微球(1μm)见参考文献(Small 2,103-108,2006)间隙为50μm的微电极通过光刻方法制备,具体实施步骤如下:
1)待测样品富集:100μL的A蛋白修饰的磁纳米颗粒,100μL的鼠IgG单克隆抗体混合,室温下120分钟,外加磁场吸附磁颗粒,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。
2)DNA信号转换:加入纳米微球/双链DNA标记的羊抗鼠二抗20μL、室温下杂交20分钟,形成复合体,外加磁场吸附复合体,PBS清洗三次后重新分散到100μL杂交液中。94℃处理去杂交,外加磁场处理,收集上清液,得到游离的单链DNA。
3)磁颗粒-微电极检测单链DNA
方法参见专利200610086617.5
结果显示抗体浓度的对数和测得相应电阻的对数呈近似线性关系,可以用于定量分析(如图4)。

Claims (4)

1.一种DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法,其特征是将DNA信号转换与磁颗粒-微电极检测技术结合起来,建立高效、稳定的检测方法,待测物质通过磁颗粒富集后,经DNA信号转换后,利用磁颗粒-微电极检测技术检测DNA信号,即可反应出待检测物质的信号。
2.根据权利要求1所述的DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法,其特征在于使用双链DNA作为信号转换。
3.根据权利要求1所述的DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法,其特征在于使用磁颗粒-微电极检测方法。
4.根据权利要求1所述的DNA信号转换的磁颗粒/微电极检测方法的应用,其特征在于所述待测物质是核酸,蛋白质,病毒生物样品及化学物质。
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10481158B2 (en) 2015-06-01 2019-11-19 California Institute Of Technology Compositions and methods for screening T cells with antigens for specific populations
US12258613B2 (en) 2017-03-08 2025-03-25 California Institute Of Technology Pairing antigen specificity of a T cell with T cell receptor sequences

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