[go: up one dir, main page]

CN101541963B - 新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因 - Google Patents

新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因 Download PDF

Info

Publication number
CN101541963B
CN101541963B CN2008800002419A CN200880000241A CN101541963B CN 101541963 B CN101541963 B CN 101541963B CN 2008800002419 A CN2008800002419 A CN 2008800002419A CN 200880000241 A CN200880000241 A CN 200880000241A CN 101541963 B CN101541963 B CN 101541963B
Authority
CN
China
Prior art keywords
leu
val
ala
ser
lys
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN2008800002419A
Other languages
English (en)
Other versions
CN101541963A (zh
Inventor
落合美佐
得田久敬
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Suntory Holdings Ltd
Original Assignee
Suntory Holdings Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Suntory Holdings Ltd filed Critical Suntory Holdings Ltd
Publication of CN101541963A publication Critical patent/CN101541963A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN101541963B publication Critical patent/CN101541963B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23DEDIBLE OILS OR FATS, e.g. MARGARINES, SHORTENINGS OR COOKING OILS
    • A23D9/00Other edible oils or fats, e.g. shortenings or cooking oils
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; PREPARATION OR TREATMENT THEREOF
    • A23L33/00Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof
    • A23L33/10Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof using additives
    • A23L33/13Nucleic acids or derivatives thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1025Acyltransferases (2.3)
    • C12N9/1029Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/64Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/64Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
    • C12P7/6409Fatty acids
    • C12P7/6427Polyunsaturated fatty acids [PUFA], i.e. having two or more double bonds in their backbone

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Edible Oils And Fats (AREA)
  • Coloring Foods And Improving Nutritive Qualities (AREA)

Abstract

提供新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因。其为含有序列号1、3、36或37表示的碱基序列或其片段的核酸。

Description

新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因
技术领域
本申请基于2007年5月25日申请的日本国专利申请2007-139046及2007年12月14日申请的日本国专利申请2007-323965,主张优先权。
本发明涉及新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因。
背景技术
脂肪酸是构成磷脂质、三酰基甘油等脂质的重要成分,含有2个以上不饱和键的脂肪酸总称为高不饱和脂肪酸(PUFA),已知有花生四烯酸、二高γ-亚麻酸、二十碳五烯酸、二十二碳六烯酸等,并已报道了各种生理活性(非专利文献1)。
其中,花生四烯酸作为形成前列腺素、白三烯等的中间代谢物受到关注,使其适用于功能性食品、医药品的材料的尝试已大量进行。并且,花生四烯酸在母乳中含有,对婴儿的发育,特别是胎儿的身高、脑的发育很重要,作为婴儿发育的必要成分,从营养学的观点来看与DHA(二十二碳六烯酸)同样受到关注。
虽然期待着该高不饱和脂肪酸在各种领域的应用,但其中也包括了在动物体内不能合成的物质。因此,开发出了培养各种微生物获得高不饱和脂肪酸的方法。并且,也进行了用植物生产高不饱和脂肪酸的尝试。在这种情况下,已知高不饱和脂肪酸例如作为三酰基甘油等储存脂质的构成成分,在微生物的菌体内或植物种子中积累。
更加详细地说,三酰基甘油在生物体内按以下方式生成。即:甘油—3—磷酸被甘油—3—磷酸酰基转移酶酰化生成溶血磷脂酸,该溶血磷脂酸被溶血磷脂酸酰基转移酶酰化生成磷脂酸,该磷脂酸被磷脂酸磷酸酯酶脱磷酸化生成二酰基甘油,该二酰基甘油被二酰基甘油酰基转移酶酰化生成三酰基甘油。并且已知酰基CoA:胆甾醇酰基转移酶、溶血卵磷脂酰基转移酶等间接参与三酰基甘油的生物合成。
由上述可知,在溶血磷脂酸(lysophosphatidic acid:以下在本说明书中有时记为“LPA”。此外有时记为“1—酰基甘油—3—磷酸”)被酰化生成磷脂酸(phosphatidic acid:以下本说明书中有时记为“PA”、或“1,2—二酰基—sn—甘油—3—磷酸”)的反应中,有溶血磷脂酸酰基转移酶(以下有时记为“LPAAT”)参与。
已知该LPAAT为1—酰基甘油—3—磷酸酰基转移酶(E.C.2.3.1.51)。到目前为止,已在一些生物中报道了LPAAT基因。作为来自大肠杆菌(Escherichiacoli)的LPAAT基因,plsC基因已被克隆(非专利文献2)。除此之外,在真菌中来自酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的SLC1基因已被克隆(非专利文献3)。此外,也已经从动物或植物中进行克隆(专利文献1)。
对于脂质生产菌高山被孢霉(Mortierella alpina)(以下有时记为“M.alpina”)的LPAAT,已报道微粒体组分具有溶血磷脂酸酰基转移活性(非专利文献4)。并且作为高山被孢霉(M.alpina)的LPAAT基因,已报道了2种同源基因。(专利文献2及专利文献3)。
专利文献1国际专利申请手册(pamphlet)WO2004/076617号
专利文献2美国专利公报第2006/174376号
专利文献3美国专利公报第2006/0094090号
非专利文献1 Lipids,39,1147(2004)
非专利文献2 Mol.Gen.Genet.,232,295-303,1992
非专利文献3 J.B.C.,268,22156-22163,1993
非专利文献4 Biochemical Society Transactions,28,707-709,2000
非专利文献5 J.Bacteriology,180,1425-1430,1998
非专利文献6 J.Bacteriology,173,2026-2034,1991
发明内容
但是,至今为止已报道的LPAAT基因,即使导入宿主细胞使其表达,也因其底物特异性,使宿主产生的脂肪酸组合物受到局限。因此,希望鉴定出可产生与以往不同组成的脂肪酸组合物的新型基因。特别是希望鉴定出可生产利用价值高、脂肪酸含量高的脂肪酸组合物的蛋白质的基因。
本发明的目的是提供:通过在宿主细胞内表达或导入,可制造目的脂肪酸组成的油脂、或可增加目的脂肪酸的含量的蛋白质及核酸。
本发明者为了解决上述课题进行了精心研究,首先进行脂质生产菌高山被孢霉(Mortierella alpina)的EST分析,从中提取出与已知LPAAT基因同一性高的序列。进而为了获得编码LPAAT的开放阅读框(ORF)的全长,进行cDNA文库筛选或通过PCR克隆基因。将其导入酵母等具有高增殖能力的宿主细胞内,以试验产生期望脂肪酸组合物的发明者,成功克隆出可生产与以往LPAAT表达的宿主所产生的脂肪酸组合物相比不同的脂肪酸组合物,且宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未导入该基因的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高,底物特异性不同的新型LPAAT相关的基因,完成了本发明。即本发明如下所述。
(1)核酸,其含有以下(a)~(e)中任一项所述的碱基序列,
(a)碱基序列,其编码由序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成、且具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质,
(b)碱基序列,其与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质,
(c)碱基序列,其由与序列号36或序列号37所组成的碱基序列有67%以上同一性的碱基序列组成,且编码具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质,
(d)碱基序列,其编码与由序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质,
(e)碱基序列,其与由编码序列号2或4表示的氨基酸序列所组成的蛋白质的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交、且编码具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质。
(2)(1)所述的核酸,其含有以下(a)~(c)中任一项的碱基序列,
(a)碱基序列,其编码由序列号2或4表示的氨基酸序列中1~10个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成、且具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质,
(b)碱基序列,其与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在2×SSC、50℃的条件下杂交,且编码具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质,
(c)碱基序列,其编码与由序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有90%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性的蛋白质。
(3)核酸,其含有以下(a)~(c)中任一项所述的碱基序列或其片段,
(a)碱基序列,其由序列号36或序列号37表示,
(b)碱基序列,其编码由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质,
(c)碱基序列,其由序列号1或3表示。
(4)核酸,其含有以下(a)~(e)中任一项所述的碱基序列,
(a)碱基序列,其编码以下蛋白质,
由序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质,
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(b)碱基序列,其与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码以下蛋白质,
具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质,
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(c)碱基序列,其由与序列号36或序列号37所组成的碱基序列有67%以上同一性的碱基序列组成,且编码以下蛋白质,
具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质。
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(d)碱基序列,其编码以下蛋白质,
由与序列号2或序列号4所组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列组成,且具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质。
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(e)碱基序列,其与由编码序列号2或4表示的氨基酸序列所组成的蛋白质的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交、且编码以下蛋白质,
具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质,
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(5)(4)所述的核酸,其含有以下(a)~(c)中任一项的碱基序列
(a)碱基序列,其编码以下蛋白质
由序列号2或4表示的氨基酸序列中1~10个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质,
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(b)碱基序列,其由与序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在2×SSC、50℃的条件下杂交,且编码以下蛋白质,
具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质,
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(c)碱基序列,其编码以下蛋白质,
由与序列号2或序列号4所组成的氨基酸序列有90%以上同一性的氨基酸序列组成,且具有可形成在上述蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性的蛋白质。
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(6)核酸,其含有以下(a)~(e)中任一项所述的碱基序列。
(a)碱基序列,其编码以下蛋白质,
由序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有包含上述氨基酸序列的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(b)碱基序列,其与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有上述碱基序列编码的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(c)碱基序列,其由与序列号36或序列号37所组成的碱基序列有67%以上同一性的碱基序列组成,且编码具有上述碱基序列编码的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(d)碱基序列,其编码以下蛋白质,
由与序列号2或序列号4所组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列组成,且具有包含上述氨基酸序列的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性蛋白质,
(e)碱基序列,其与由编码序列号2或4表示的氨基酸序列所组成的蛋白质的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有上述蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(7)(6)所述的核酸,其含有以下(a)~(c)中任一项的碱基序列,
(a)碱基序列,其编码由序列号2或4表示的氨基酸序列中1~10个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有包含上述氨基酸序列的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(b)碱基序列,其与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在2×SSC、50℃的条件下杂交,且编码具有上述碱基序列编码的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(c)碱基序列,其编码与由序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有90%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有包含上述氨基酸序列的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性的蛋白质,
(8)蛋白质,其如以下(a)或(b)中任一项所述,
(a)蛋白质,其由序列号2或4中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性,
(b)蛋白质,其是由与序列号2或序列号4所组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列组成的蛋白质,且具有溶血磷脂酸酰基转移酶活性。
(9)蛋白质,其如以下(a)或(b)中任一项所述,
(a)蛋白质,其由序列号2或4中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有形成在由上述氨基酸序列组成的蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性,
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(b)蛋白质,其由与序列号2或序列号4所组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列组成,且具有形成在由上述氨基酸序列组成的蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性。
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(10)蛋白质,其如以下(a)或(b)中任一项所述,
(a)蛋白质,其由序列号2或4中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有由上述氨基酸序列组成的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性,
(b)蛋白质,其由与序列号2或序列号所4组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列组成,且具有由上述氨基酸序列组成的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性。
(11)蛋白质,其由序列号2或4表示的氨基酸序列组成。
(12)重组载体,其含有(1)~(7)中任一项所述的核酸。
(13)转化体,其被(12)所述的重组载体转化。
(14)脂肪酸组合物,其为培养(13)所述的转化体获得的脂肪酸组合物,其特征在于,在上述脂肪酸组合物的脂肪酸组成中,以下i)~iv)中至少一项以上比培养未用(12)的重组载体转化的宿主获得的培养物的上述比率高。
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率
(15)脂肪酸组合物,其为培养(13)所述的转化体获得的脂肪酸组合物,其特征在于,上述脂肪酸组合物中花生四烯酸含有率比培养未用(12)所述的重组载体转化的宿主获得的培养物的高。
(16)脂肪酸组合物的制造方法,其特征在于,从培养(13)所述的转化体获得的培养物中,提取(14)或(15)所述的脂肪酸组合物。
(17)食品,其含有(14)或(15)所述的脂肪酸组合物。
本发明的LPAAT与以往的LPAAT的底物特异性不同,可在宿主中产生与表达以往LPAAT的宿主产生的脂肪酸组合物的组成不同的脂肪酸组合物。因此可提供具有期望特性、效果的脂质,所以作为可适用于食品、化妆品、医药品、肥皂等的物质是有用的。
本发明的LPAAT已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率,比未表达本发明的LPAAT的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高,从该细胞的培养物中获得的脂肪酸组合物,因为可期待其在营养学方面有更高的效果,所以优选。
此外,因为本发明的LPAAT可提高脂肪酸、储存脂质的生产能力,所以优选作为可提高微生物、植物中高不饱和脂肪酸的生产能力的酶。
附图说明
图1是表示本发明的2个同源基因LPAAT3及LPAAT4和公知的同源基因LPAAT1及LPAAT2的关系的系统树。
图2表示本发明的LPAAT3的cDNA序列和推定氨基酸序列。
图3表示LPAAT4的cDNA序列和推定氨基酸序列。
图4是比较LPAAT3和LPAAT4的CDS部分的DNA序列的图。
图5是比较LPAAT3和LPAAT4的推定氨基酸序列的图。
图6是比较LPAAT3p及LPAAT4p的推定氨基酸序列和已知氨基酸序列的图。
具体实施方式
本发明涉及以酰化溶血磷脂酸生成磷脂酸为特征的来自被孢霉属(Mortierella)的新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因。
本发明的溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT),是催化将溶血磷脂酸酰化生成磷脂酸的反应的酶。酰基供体通常为酰基CoA,但不限于此。此外,本发明涉及的蛋白质发挥作用的酰基转移反应的酰基受体不仅限于LPA,各种溶血磷脂质均可作为酰基受体。
本发明涉及的LPA(也称为1—酰基—sn—甘油—3—磷酸)是甘油磷脂质的1种。LPA是通过甘油—3—磷酸(也称为sn—甘油—3—磷酸)的1位(α位)羟基酰化生成的仅具有1个脂肪酸的溶血磷脂质。LPA不仅是脂质生物合成的中间体,而且是具有细胞增殖、血小板凝集效果、平滑肌收缩效果、癌细胞浸润促进效果等领域广泛的生物学、药理学作用的脂质性细胞内及细胞间介质。
编码本发明的溶血磷脂酸酰基转移酶的核酸
本发明的溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT)中包含LPAAT3及LPAAT4。将编码LPAAT3及LPAAT4的核酸的cDNA、CDS、ORF以及氨基酸序列的对应关系整理记载于以下表1内。
表1
Figure G2008800002419D00111
也就是说,作为与本发明的LPAAT3相关的序列,可例举LPAAT3的氨基酸序列的序列号2、表示LPAAT3的ORF区域序列的序列号36、表示其CDS区域序列的序列号8、以及其cDNA的碱基序列的序列号1。其中,序列号8相当于序列号1的第158~1147位碱基序列,序列号36相当于序列号1的第158~1144位碱基序列、以及序列号8的第1~987位碱基序列。
同样,作为与LPAAT4相关的序列,可例举LPAAT4的氨基酸序列的序列号4、表示LPAAT4的ORF区域序列的序列号37、表示其CDS区域序列的序列号23、以及表示其cDNA的碱基序列的序列号3。在此,序列号23相当于序列号3的第55~996位碱基序列,序列号37相当于序列号3的第55~993位碱基序列、以及序列号23的第1~939位碱基序列。
本发明的核酸,除单链及双链DNA之外,还包括其RNA互补体,可以来自天然,也可以由人工制作。DNA中例如可例举基因组DNA、与上述基因组DNA对应的cDNA、化学合成的DNA、通过PCR扩增的DNA、以及其组合物、DNA和RNA的杂交体等,但并不限于这些。
作为本发明的核酸的优选形态,可例举(a)序列号36或序列号37表示的碱基序列、(b)编码由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质的碱基序列、(c)序列号1或3表示的碱基序列等。
序列号36或序列号37表示的碱基序列及编码由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质的碱基序列、以及序列号1或3表示的碱基序列,如表1中记载。
为了获得上述碱基序列,也可从具有LPAAT活性的生物的EST、基因组DNA的碱基序列数据中,搜索编码与以往的具有LPAAT活性的蛋白质有高的同一性的蛋白质的碱基序列。作为具有LPAAT活性的生物,优选脂质生产菌,作为脂质生产菌,可例举高山被孢霉(M.alpina),但并不限于此。
进行EST分析时,首先构建cDNA文库。对于cDNA文库的构建方法,可参考“Molecular Cloning,A Laboratory Manual 3rd ed.”(Cold Spring HarborPress(2001))。并且也可用市售的cDNA文库构建试剂盒。作为适用于本发明的cDNA文库的构建方法,例如可例举以下方法。即:将脂质生产菌高山被孢霉(M.alpina)的适当菌株接种到适当的培养基中,预培养适当时间。作为适合该预培养的培养条件,例如作为培养基的组成可例举1.8%葡萄糖、1%酵母膏、pH6.0,培养时间为3天,培养温度为28℃的条件。然后将预培养物在适当的条件下供给本培养。作为适合本培养的培养基组成,例如可例举1.8%葡萄糖、1%大豆粉、0.1%橄榄油、0.01%Adecanol、0.3%KH2PO4、0.1%Na2SO4、0.05%CaCl22H2O、0.05%MgCl26H2O、pH6.0。作为适合本培养的培养条件,例如可例举300rpm、1vvm、26℃下通气搅拌培养8天的条件。培养期间可添加适量的葡萄糖。在本培养中适时提取培养物,从其中回收菌体,制备总RNA。制备总RNA时,可使用盐酸胍/CsCl法等公知的方法。可使用市售的试剂盒从获得的总RNA中纯化poly(A)+RNA。并且可使用市售的试剂盒构建cDNA文库。然后将构建的cDNA文库的任意的克隆的碱基序列,使用按照可确定载体上插入部分的碱基序列的方式设计的引物进行确定,可获得EST。例如用ZAP-cDNA GigapackIII GoldCloning Kit(STRATAGENE)构建cDNA文库时,可进行定向克隆。
LPAAT3及LPAAT4的ORF间的碱基序列的同一性为66.6%。另一方面,作为来自高山被孢霉(M.alpina)的LPAAT有公知的LPAAT1和LPAAT2。这2个同源物和本发明的2个同源物的关系如图1的系统树所示。本发明的LPAAT3和公知的LPAAT1及LPAAT2的ORF的碱基序列的同一性分别为34.3%、47.0%,LPAAT4和公知的LPAAT1及LPAAT2的ORF的碱基序列的同一性分别为34.6%、47.3%。图1表明,本发明的LPAAT3及4,作为进化分类来说已与公知的LPAAT相差甚远,其功能也不相同。即如下所述,本发明的LPAAT3及4,可使宿主中产生与公知的LPAAT已表达的宿主所产生的脂肪酸组合物有不同组成的脂肪酸组合物,并且具有本发明LPAAT已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比本发明的LPAAT未表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的、与公知的LPAAT完全不同的功能。
此外,对编码本发明的LPAAT3的碱基序列及编码LPAAT4的碱基序列分别进行BLASTX分析,结果与E-value最低的编码来自玉米黑粉菌(Ustilagomaydis)521的推定蛋白质(图1)(UM06426.1,GB accession No.EAK87199)的碱基序列(GB accession No.XM_757480)的同一性分别为49.2%、51.3%。
同样,LPAAT3和LPAAT4之间的氨基酸序列的同一性为69.1%,LPAAT3和公知的LPAAT1及LPAAT2的同一性分别为12.3%、17.3%,LPAAT4和公知的LPAAT1及LPAAT2的同一性分别为12.5%、15.5%。此外,将本发明的LPAAT3的氨基酸序列及LPAAT4的氨基酸序列分别进行BLASTP分析,结果也是与E-value最低的来自玉米黑粉菌(Ustilago maydis)521的推定蛋白质(图1)(UM06426.1,GB accession No.EAK87199)的同一性分别为36.2%、36.7%。
本发明还包括:与含有上述序列号36及37表示的碱基序列(有时记为“本发明的碱基序列”)、以及编码由序列号2及4表示的氨基酸序列(有时记为“本发明的氨基酸序列”)组成的蛋白质的碱基序列的核酸具有同等功能的核酸。“具有同等功能”是指,本发明的碱基序列编码的蛋白质及由本发明的氨基酸序列组成的蛋白质具有LPAAT活性。LPAAT活性可用公知的方法测定,例如可例举以下方法,即:从本发明的LPAAT表达后的酵母中,通过J.Bacteriology,173,2026-2034(1991)所述的方法等制备微粒体组分。接着,在反应液0.44mM LPA、0.36mM酰基-CoA、0.5mM DTT、1mg/ml BSA、2mM MgCl2、Tris-HCl(pH7.5)中添加上述微粒体组分,在28℃下反应适当时间,添加氯仿:甲醇使反应停止后,进行脂质提取,将得到的脂质通过薄层色谱法等进行分离,可对上述反应生成的PA量进行定量。其结果,生成的PA量越多,即可判断LPAAT的活性越高。例如通过本方法使LPAAT3、LPAAT4表达的菌株中,上述反应中用亚油酰基—CoA作为酰基—CoA时,PA组分中含有的亚油酸(18:2)的量增加。因此,可以说LPAAT3及LPAAT4具有LPAAT活性。
此外,除这种LPAAT活性之外,还包括具有下述活性的蛋白质(以下,有时称为“具有可形成本发明的LPAAT的脂肪酸组成的活性的蛋白质”)的情况,该活性为可形成:在本发明的碱基序列编码的蛋白质或由本发明的氨基酸序列组成的蛋白质已表达的宿主的脂肪酸组成中,以下
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率中的至少一项以上与未表达上述蛋白质的宿主的脂肪酸组成相比均为高比率的脂肪酸组成的活性。
具体为含有编码具有下述活性的蛋白质的碱基序列的核酸,该活性为:可形成:将插入上述本发明的碱基序列等的表达载体pYE22m(Biosci.Biotech.Biochem.,59,1221-1228,1995)以酵母Saccharomyces cerevisiae EH13-15株(Appl.Microbiol.Biotechnol.,30515-520,1989)作为宿主进行转化,将培养获得的转化体后回收的菌体,用以下实施例7记载的方法进行脂肪酸分析时,上述本发明的LPAAT的脂肪酸组成具体为
i)油酸含量为52%以上
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率为7.25以上
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率为9.94以上,以及
iv)硬脂酸及油酸的含量相对于棕榈酸含量的比率为10.72以上的数值的脂肪酸组成的活性。更优选本发明的碱基序列等是含有编码具有LPAAT活性及可形成上述本发明的LPAAT脂肪酸组成的活性的蛋白质的碱基序列的核酸。此外,对于这些脂肪酸组成,使用与上述实施例7记载的方法不同的培养条件培养时,有时其组成多少会有变化。作为上述培养条件例如可例举温度、培养时间。
进而,上述“具有同等功能”中,本发明的碱基序列编码的蛋白质及由本发明的氨基酸序列组成的蛋白质除具有LPAAT活性及可形成本发明的LPAAT的脂肪酸组成的活性之外,还包括具有如下活性的蛋白质(有时称“具有提高本发明的细胞内花生四烯酸含有率的活性的蛋白质”)的情况,该活性为本发明的碱基序列编码的蛋白质、或由本发明的氨基酸序列组成的蛋白质已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率比未表达上述蛋白质的宿主细胞内的花生四烯酸含有率高的活性。
对于花生四烯酸,在“本发明的脂肪酸组合物”项中说明。这种核酸,具体为含有编码具有以下活性的蛋白质的碱基序列的核酸,即具有的活性为:与上述相同,可形成:将插入本发明的碱基序列等的表达载体pYE22m,以在酵母Saccharomyces cerevi siae YPH499株中导入并表达Δ12脂肪酸去饱和酶、Δ6脂肪酸去饱和酶、Δ6脂肪酸链延长酶以及Δ5脂肪酸链延长酶后生产花生四烯酸的酵母ARA3-1株为宿主进行转化,将培养获得的转化体后回收的菌体,利用以下实施例7记载的方法进行脂肪酸分析时,细胞内的花生四烯酸含有率与未表达上述蛋白质的宿主相比为高比率的脂肪酸组成。进一步优选本发明的碱基序列等是含有编码具有LPAAT活性及提高本发明的细胞内花生四烯酸含有率的活性的蛋白质的碱基序列的核酸。
这种作为与本发明的核酸具有同等功能的核酸,可例举含有以下(a)~(e)中任一项所述的碱基序列的核酸。此外,在以下例举的碱基序列的记载中,“本发明的上述活性”是指,上述“LPAAT活性及/或可形成上述本发明的LPAAT的脂肪酸组成的活性及/或提高本发明的细胞内花生四烯酸含有率的活性”。
(a)碱基序列,其编码由序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成、且具有本发明的上述活性的蛋白质。
本发明的核酸中含有的碱基序列,包括编码由序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成、且具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。
具体为编码由下述氨基酸序列组成的蛋白质、且具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列,
(i)序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个(优选1个或数个(例如1~100个、1~50个、1~30个、1~25个、1~20个、1~15个、1~10个、更优选1~5个))氨基酸发生缺失后的氨基酸序列,
(ii)序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个(优选1个或数个(例如1~100个、1~50个、1~30个、1~25个、1~20个、1~15个、1~10个、更优选1~5个))氨基酸用其他氨基酸取代后的氨基酸序列,
(iii)序列号2或4表示的氨基酸序列中附加1个或多个(优选1个或数个(例如1~100个、1~50个、1~30个、1~25个、1~20个、1~15个、1~10个、更优选1~5个))其他氨基酸后的氨基酸序列,或
(iv)将(i)~(iii)组合后的氨基酸序列
其中,取代优选为保守取代,保守取代是指,将特定的氨基酸残基用具有类似的物理化学特征的残基取代,但只要不实质性改变原来序列的结构相关的特征,也可为任何取代,例如,只要取代氨基酸不破坏原来序列中存在的螺旋结构,或者不破坏赋予原来序列特征的其它种类的二次结构,也可为任何取代。
保守取代通常用生物学体系合成、化学肽合成来导入,优选通过化学肽合成来进行。此时,取代基中可含有非天然的氨基酸残基,也含有肽模仿物、氨基酸序列中没有被取代的区域发生倒位的倒位型或同区域发生反转的反转型。
以下按照可取代氨基酸残基的残基分类例示,但可取代的氨基酸残基并不限于以下记载的残基。
A组:亮氨酸、异亮氨酸、正亮氨酸、缬氨酸、正缬氨酸、丙氨酸、2—氨基丁酸、蛋氨酸、邻甲基丝氨酸、叔丁基甘氨酸、叔丁基丙氨酸、环己基丙氨酸;
B组:天冬氨酸、谷氨酸、异天冬氨酸、异谷氨酸、2—氨基己二酸、2-氨基辛二酸;
C组:天冬酰胺、谷氨酰胺;
D组:赖氨酸、精氨酸、鸟氨酸、2,4—二氨基丁酸、2,3—二氨基丙酸;
E组:脯氨酸、3—羟基脯氨酸、4—羟基脯氨酸;
F组:丝氨酸、苏氨酸、高丝氨酸;
G组:苯丙氨酸、酪氨酸。
非保守性取代时,上述种类中的1种成分可以与其他种类的成分交换,此时为了保持本发明的蛋白质的生物学功能,优选参考氨基酸的亲水指数(亲水性氨基酸指数)(Kyte等,J.Mol.Biol.,157:105-131(1982))。
此外,非保守性取代时,可根据亲水性进行氨基酸的取代。
在本说明书及图中,碱基、氨基酸及其缩略语,均遵照IUPAC-IUB Commissionon Biochemical Nomenclature的规定,或者基于例如Immunology--A Synthesis(第2版,E.S.Golub及D.R.Gren监修,Sinauer Associates,Massachusetts州Sunderland(1991))等记载的同领域惯用的缩略语。此外,对于氨基酸,如果有光学异构体时,如无特别标示,均表示L体。
D—氨基酸等上述氨基酸的立体异构体、α,α—二取代氨基酸等非天然氨基酸、N—烷基氨基酸、乳酸、以及其它非惯用的氨基酸,也可作为构成本发明的蛋白质的要素。
此外,本说明书中使用的蛋白质的表示方法,根据标准用法及同领域常用的表示方法,左方是氨基末端方向,右方是羧基末端方向。
同样,在通常情况下如无特别说明,单链多核苷酸序列的左端为5’端,双链多核苷酸序列的左方为5’方向。
如果是同领域技术人员,使用同领域公知的技术,可设计并构建本说明书中记载的蛋白质的适当的突变体。例如通过将认为对本发明的蛋白质的生物学活性不太重要的区域作为靶区,可鉴定不损坏本发明的蛋白质的生物学活性而可改变其结构的蛋白质分子中适当的区域。并且也可鉴定在类似蛋白质间保存的分子残基及区域。进而,在认为对本发明的蛋白质的生物学活性或结构重要的区域中,在不损坏生物学活性、且对蛋白质的多肽结构不产生不良影响的情况下,也可导入保守性氨基酸取代。特别是,在本发明中,如图6中的双重下线所示,本发明的2个LPAAT的氨基酸序列中,有保守基序(motif)“HXXXXD(HX4D)”(保守氨基酸残基用*符号表示)。该基序(motif)是甘油磷脂质酰基转移酶(Glycerolipid acyltransferase)所必需的基序(motif)(J.Bacteriology,180,1425-1430,1998),对于本发明的LPAAT来说也是重要的基序(motif)。因此,本发明的突变体保存有上述保守基序(motif),并且只要不损坏本发明的上述活性,可以是任何突变体。此外表明上述保守基序(motif)中,X可以是任意氨基酸残基。
只要是同领域技术人员,通过鉴定对本发明的蛋白质生物学活性或结构重要、与该蛋白质的肽相类似的肽残基,比较这2个肽的氨基酸残基,即可预测与本发明的蛋白质类似的蛋白质的哪个残基是与对生物学活性或结构重要的氨基酸残基相对应的氨基酸残基,也就是说,可进行结构-功能研究。进一步通过选择与上述预测的氨基酸残基的化学性质类似的氨基酸取代,可选择保持本发明蛋白质的生物学活性的突变体。此外,如果是同领域技术人员,也可对本蛋白质的突变体的三维结构及氨基酸序列进行分析。并且从获得的分析结果中,也可预测与蛋白质的三维结构相关的氨基酸残基的比对。预测在蛋白质表面上存在的氨基酸残基,有参与和其他分子的重要相互作用的可能性,如果是同领域技术人员,均可根据上述分析结果,构建使预测在这种蛋白质表面上存在的氨基酸残基不变化的突变体。进而如果是同领域技术人员,也可构建在构成本发明的蛋白质的各种氨基酸残基中,仅有一个氨基酸残基发生取代的突变体。将这种突变体通过公知的分析方法进行筛选,可收集各种突变体的信息。因此,通过对某种特定氨基酸残基被取代的突变体的生物学活性与本发明的蛋白质的生物学活性相比降低时、不表现这种生物学活性时、或者产生阻碍本蛋白质的生物学活性的不适当活性时的情况进行比较,可评价构成本发明的蛋白质的各种氨基酸残基的有用性。此外,只要是同领域技术人员,根据这种从日常实验中收集的信息,单独或与其他突变组合,即可容易地分析作为本发明蛋白质的突变体所不期望的氨基酸取代。
如上所述,由序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成的蛋白质,可根据《Molecular Cloning,A Laboratory Manual 3rd ed.》(Cold Spring Harbor Press(2001))、《CurrentProtocols in Molecular Biology》(John Wiley&Sons(1987-1997)、Kunkel(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.USA82:488-92、Kunkel(1988)Method.Enzymol.85:2763-6等记载的定点诱变法等方法进行制备。这种氨基酸发生了缺失、取代或附加等突变的突变体的构建,例如可使用通过Kunkel法、Gappedduplex法等公知的方法,使用利用了定点诱变法的突变导入用试剂盒,例如QuikChangeTM Site-Directed Mutagenesis Kit(Stratagene公司制)、GeneTailorTMSite-Directed Mutagenesis System(Invitrogen公司制)、TaKaRaSite-Directed Mutagenesis System(Mutan-K、Mutan-Super Express Km等:TaKaRa Bio公司制)等进行。
此外,作为在蛋白质的氨基酸序列中,在保持其活性的同时导入1个或多个氨基酸的缺失、取代、或附加的方法,除上述定点诱变之外,还可例举用突变源处理基因的方法、以及使基因选择性断裂将选择的核苷酸除去、取代或附加后进行连接的方法。
本发明的核酸中含有的碱基序列,优选为编码由序列号2或4表示的氨基酸序列中1~10个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成、且具有LPAAT活性的蛋白质的碱基序列。
此外,本发明的核酸中含有的碱基序列中,也包括编码由序列号2或4中1~10个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成、且具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。
本发明的蛋白质中氨基酸的突变或修饰的数量、或者突变或修饰的位点,只要保持LPAAT活性、或本发明的可形成LPAAT的脂肪酸组成的活性、或本发明的提高细胞内花生四烯酸含有率的活性,没有特别限定。
本发明的LPAAT活性、或本发明的可形成LPAAT的脂肪酸组成的活性、或本发明的提高细胞内花生四烯酸含有率的活性,可用公知的方法测定。例如可参照以下文献:J.B.C.,265,17215-17221,1990。
例如本发明的“LPAAT活性”可按以下方法测定,从使本发明的LPAAT表达后的酵母中,通过J.Bacteriology,173,2026-2034(1991)记载的方法制备微粒体组分。接着在反应液0.44mM LPA、0.36mM酰基-CoA、0.5mM DTT、1mg/ml BSA、2mM MgCl2、50mMTris-HCl(pH7.5)中添加上述微粒体组分,在28℃下反应适当时间,添加氯仿:甲醇终止反应后,进行脂质的提取,将获得的脂质通过薄层色谱法等进行分离,可对生成的PA量进行定量。
此外,本发明的“可形成LPAAT的脂肪酸组成的活性”,例如可按照以下方法测定。在通过本发明的脂肪酸组合物的制造方法获得的冷冻干燥菌体中,添加并搅拌以适当比率调整的氯仿:甲醇后,加热处理适当时间。进一步通过离心分离来分离菌体,回收溶剂,这样重复数次。然后使用适当的方法使脂质干燥固化后,添加氯仿等溶剂溶解脂质。将该试样分取适量,利用盐酸甲醇法将菌体的脂肪酸衍生为甲酯后,用己烷提取,蒸馏除去己烷后,用气相色谱法进行分析。此外,本发明的“提高细胞内花生四烯酸含有率的活性”,也可用上述方法通过分析花生四烯酸的含量来测定。
(b)碱基序列,其与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质。
本发明的核酸中含有的碱基序列,包括与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。关于序列号36或序列号37以及LPAAT活性,如上所述。
上述碱基序列,用同领域技术人员公知的方法使用适当的片段构建探针,使用该探针通过菌落杂交法、噬菌斑杂交法、Southern印迹法等公知的杂交法,可从cDNA文库及基因组文库等中获得。
对于杂交法的详细操作步骤,可参照《Molecular Cloning,A LaboratoryManual 3rd ed.》(Cold Spring Harbor Press(2001);特别是Section6-7)、《Current Protocols in Molecular Biology》(John Wiley&Sons(1987-1997);特别是Section6.3-6.4)、《DNA Cloning1:Core Techniques,A PracticalApproach 2nd ed.》(Oxford University(1995);杂交条件特别是Section2.10)等。
杂交条件的强度,主要由杂交条件、更优选由杂交条件及洗涤条件决定。在本说明书中“严谨条件”包括中度或高度严谨条件。
具体来说,作为中度严谨条件,例如杂交条件,可例举1×SSC~6×SSC、42℃~55℃的条件,更优选1×SSC~3×SSC、45℃~50℃的条件,最优选2×SSC、50℃的条件。杂交溶液中例如含有约50%甲酰胺时,采用比上述温度低5至15℃的温度。作为洗涤条件,可例举0.5×SSC~6×SSC、40℃~60℃。在杂交及洗涤时,通常可加入0.05%~0.2%SDS、优选约0.1%SDS。
作为高度严谨(高严谨)的条件,包括在比中度严谨条件高的温度及/或低的盐浓度下的杂交及/或洗涤。例如杂交条件,可例举0.1×SSC~2×SSC、55℃~65℃的条件,更优选0.1×SSC~1×SSC、60℃~65℃的条件,最优选0.2×SSC、63℃的条件。作为洗涤条件,可例举0.2×SSC~2×SSC、50℃~68℃,更优选0.2×SSC、60~65℃。
特别是作为本发明使用的杂交条件,例如可例举:在5×SSC、1%SDS、50mMTris-HCl(pH7.5)及50%甲酰胺中在42℃的条件下,进行预杂交后,添加探针,在42℃保温过夜形成杂交体,然后在0.2×SSC、0.1%SDS中在65℃下进行3次20分钟的洗涤的条件。但并不限于此条件。
此外,还可使用探针内不使用放射性物质的市售的杂交试剂盒,具体可例举使用DIG核酸检测试剂盒(Roche Diagnost ics公司)、ECL direct labeling&detection system(Amersham公司制)的杂交等。
作为本发明含有的碱基序列,优选与由序列号36或序列号37所组成的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在2×SSC、50℃的条件下杂交,且编码具有LPAAT活性的蛋白质的碱基序列。
(c)碱基序列,其由与序列号36或序列号37所组成的碱基序列有67%以上同一性的碱基序列组成、且编码具有本发明的上述活性的蛋白质。
本发明的核酸中含有的碱基序列,包括由与序列号36或37表示的核酸序列有至少67%以上的碱基序列组成,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。
可例举优选含有与序列号36或37表示的核酸序列有至少70%、更优选75%、进一步优选80%(例如85%以上、更优选90%以上、最优选95%、98%或99%)同一性的碱基序列的核酸,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。如上所述,LPAAT3(序列号36)及LPAAT4(序列号37)的同一性为66.6%。本发明的核酸包括与序列号36或37表示的核酸序列有至少67%以上同一性、与两者类似的核酸。
2个核酸序列的同一性%,可通过视觉检查、数学计算来决定,优选使用计算机程序通过比较2个核酸的序列信息来决定,作为序列比较的计算机程序,例如可例举可利用美国国立医学图书馆网站:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/b12seq/bls.html的BLASTN程序(Altschul et al.(1990)J.Mol.Biol.215:403-10):version2.2.7版、或WU-BLAST2.0计算法等。对于WU-BLAST2.0的标准默认参数的设定,可使用以下网站:http://blast.wustl.edu记载的参数值。
(d)碱基序列,其编码与序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质。
本发明的核酸中含有的碱基序列,包括编码与由序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。本发明的核酸编码的蛋白质,只要与具有本发明的上述活性的蛋白质有同等功能,也可以是与LPAAT3或LPAAT4的氨基酸序列有同一性的蛋白质。
具体可例举与序列号2或序列号4表示的氨基酸序列有70%以上、优选75%以上、更优选80%、进一步优选85%以上、更进一步优选90%(例如95%、进一步98%)以上同一性的氨基酸序列等。如上所述,LPAAT3(序列号2)和LPAAT4(序列号4)之间的氨基酸序列的同一性为69.1%。本发明的核酸编码的蛋白质包括与序列号2或4表示的氨基酸序列有至少69%以上、与两者类似的蛋白质。
本发明的核酸中含有的碱基序列,优选为编码与由序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有90%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。进一步优选为编码与由序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有95%以上同一性的氨基酸序列,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。
2个氨基酸序列的同一性百分数,可通过视觉检查、数学计算来决定,此外,可使用计算机程序来决定同一性百分数,作为这种计算机程序,例如可例举BLAST、FASTA(Altschul等、J.Mol.Biol.,215:403-410(1990))、及ClustalW等。特别是BLAST程序的同一性检索的各种条件(参数),已由Altschul等(Nucl.Acids.Res.,25,p.3389-3402,1997)作了记载,所以可从美国国立生物技术信息中心(NCBI)、日本DNA数据库(DDBJ)的网站公开获得。(BLAST指南、Altschul等NCB/NLM/NIH Bethesda,MD 20894;Altschul等)。此外,也可使用遗传信息处理软件GENETYX Ver.7(GENETYX)、DINASIS Pro(日立软件)、VectorNTI(Infomax)等程序来决定。
使多个氨基酸序列并列的特定的比对图,因为也可以显示序列中特定的短区域的配合,所以即使使用的序列的全长序列间没有显著性的关系,在这种区域,也可检测出特定的序列同一性非常高的区域。并且,BLAST算法可使用BLOSUM62氨基酸打分矩阵,作为选择参数,还可使用以下:(A)包括将具有低组成复杂性的查询序列的片段(由Wootton及Federhen的SEG程序(Computersand Chemistry,1993)决定;Wootton及Federhen,1996“序列数据库组成偏向性区域的分析(Analysis of compositionally biased regions in sequencedatabases)”,也可参照Methods Enzymol.,266:544-71)、或短周期内部重复序列组成的片段(Claverie及States(Computers and Chemistry,1993)的XNU程序决定)遮蔽的过滤器,以及(B)用于报告相对于数据库序列的一致性的统计学显著性阈值、或根据E-score(Karlin及Altschul,1990)的统计学模型,仅偶然性发现的一致性期望概率;因某种一致性引起的统计学显著误差大于E-score阈值时,不报告该一致性。
(e)碱基序列,其与编码由序列号2或4表示的氨基酸序列所组成的蛋白质的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质。
本发明的核酸中含有的碱基序列,包括与编码由序列号2或4表示的氨基酸序列所组成的蛋白质的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。
由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质及杂交条件如上所述。作为本发明的核酸中含有的碱基序列,可例举与编码由序列号2或4表示的氨基酸序列所组成的蛋白质的碱基序列的互补碱基序列组成的核酸在严谨条件下杂交,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列。
此外,本发明的核酸还包括:由序列号36或序列号37组成的碱基序列中1个或多个碱基发生缺失、取代或附加后的碱基序列组成、且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列的核酸。具体可使用含有以下碱基序列,且编码具有本发明的上述活性的蛋白质的碱基序列的核酸,
(i)序列号36或37表示的碱基序列中1个或多个(优选1个或数个(例如1~300个、1~250个、1~200个、1~150个、1~100个、1~50个、1~30个、1~25个、1~20个、1~15个、1~10个、更优选1~5个))碱基发生缺失后的碱基序列,
(ii)序列号36或37表示的碱基序列中1个或多个(优选1个或数个(例如1~300个、1~250个、1~200个、1~150个、1~100个、1~50个、1~30个、1~25个、1~20个、1~15个、1~10个、更优选1~5个))碱基被其他碱基取代后的碱基序列,
(iii)序列号36或37表示的碱基序列中附加1个或多个(优选1个或数个(例如1~300个、1~250个、1~200个、1~150个、1~100个、1~50个、1~30个、1~25个、1~20个、1~15个、1~10个、更优选1~5个))其他碱基后的碱基序列,
(iv)将上述(i)~(iii)组合后的碱基序列。
作为本发明的核酸的优选形态,也包括含有以下(a)~(c)中任一项所述的碱基序列或其片段的核酸。
(a)序列号36或序列号37表示的碱基序列,
(b)编码由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质的碱基序列,
(c)序列号1或3表示的碱基序列,
对于(a)序列号36或序列号37表示的碱基序列、(b)编码由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质的碱基序列、(c)序列号1或3表示的碱基序列,如表1所述。上述序列的片段,包括上述碱基序列中含有的ORF、CDS、具有生物学活性的区域、作为以下记载的引物使用的区域、可作为探针的区域,可来自天然,也可由人工制作。
本发明的溶血磷脂酸酰基转移酶蛋白质
本发明的蛋白质,包括由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质及具有与上述蛋白质同等功能的蛋白质,可来自天然,也可由人工制作。对于由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质,如上所述。“具有同等功能的蛋白质”,如上述“本发明的编码溶血磷脂酸酰基转移酶的核酸”项目中所述,是指具有「本发明的上述活性」的蛋白质。
在本发明中,作为具有与由序列号2或4表示的氨基酸序列组成的蛋白质同等功能的蛋白质,可例举以下(a)或(b)中任一项所述的蛋白质。
(a)蛋白质,其由序列号2或4中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列组成,且具有本发明的上述活性,
(b)蛋白质,其由与序列号2或序列号4组成的氨基酸序列有69%以上同一性的氨基酸序列组成的蛋白质,且具有本发明的上述活性;
其中,对于序列号2或4中1个或多个氨基酸发生缺失、取代或附加后的氨基酸序列、或与序列号2或序列号4组成的氨基酸序列的同一性为69%以上的氨基酸序列,如上述“本发明的编码溶血磷脂酸酰基转移酶的核酸”项目中所述。此外,上述“具有本发明的上述活性的蛋白质”,是由含有序列号36或序列号37的碱基序列的核酸编码的蛋白质的突变体,或序列号2或4表示的氨基酸序列中1个或多个氨基酸发生取代、缺失或附加等经过多种修饰发生突变的蛋白质、或氨基酸侧链等被修饰的修饰蛋白质、与其他蛋白质融合的蛋白质,且是具有LPAAT活性的蛋白质,及/或具有可形成本发明的LPAAT的脂肪酸组成活性的蛋白质,及/或包括具有本发明的提高细胞内花生四烯酸含有率活性的蛋白质。
此外,本发明的蛋白质,也可人工制作,此时可通过Fmoc法(9-芴甲氧羰基法)、tBoc法(叔丁氧羰基法)等的化学合成法制造。也可利用Advanced ChemTech公司制、珀金埃尔默(Perkin Elmer)公司制、Pharmacia公司制、ProteinTechnology Instruments公司制、Synthecell-Vega公司制、PerSeptive公司制、岛津制作所(鳥津製作所)制等的肽合成仪进行化学合成。
LPAAT的核酸的克隆
本发明的LPAAT的核酸,例如通过使用适当的探针从cDNA文库中筛选,可进行克隆。此外,可通过用适当的引物通过PCR反应进行扩增并和适当的载体连接进行克隆。并且还可亚克隆到其他载体上。
例如可使用pBlue-ScriptTMSK(+)(Stratagene)、pGEM-T(Promega)、pAmp(TM:Gibco-BRL)、p-Direct(Clontech)、pCR2.1-TOPO(Invitrogene)等市售的质粒载体。此外,通过PCR反应进行扩增时,引物可使用上述序列号1或3等表示的碱基序列的任意部分。例如对于序列号1,可分别使用作为上游侧用引物的:I-1:5’-GGATGTCATCAATGTCATCAATAGAG-3’(序列号9),作为下游侧用引物的:I-2:5’-CTAACCCCCTCTTCCTCCACCAC-3’(序列号10),对于序列号3,可分别使用作为上游侧用引物的:B-1:5’-CCTCGCAAAATGTATCGTGG-3’(序列号15),作为下游侧用引物的:B-2:5’-GATGGGAAGTTGAGCTTGAATG-3’(序列号16)等。接着在从高山被孢霉(M.alpina)菌体中制备的cDNA中,使上述引物及耐热性DNA聚合酶等作用进行PCR反应。上述方法,根据《Molecular Cloning,ALaboratory Manual 3rd ed.》(Cold Spring Harbor Press(2001)”等,同领域技术人员可容易地实施。作为本发明的PCR反应条件,例如可例举以下条件:
变性温度:90~95℃
退火温度:40~60℃
延伸温度:60~75℃
循环数:10次以上
将获得的PCR产物进行纯化时,可使用公知的方法。例如有使用GENECLEAN(Funakoshi)、QIAquick PCR purification Kits(QIAGEN)、ExoSAP-IT(GE Healthcare Bio-Sciences)等试剂盒的方法、使用DEAE-纤维素滤纸的方法、使用透析管的方法等。使用琼脂糖凝胶时,进行琼脂糖凝胶电泳,将碱基序列片段从琼脂糖凝胶中切出,可通过GENECLEAN(Funakoshi)、QIAquick Gelextraction Kits(QIAGEN)、Freeze&Squeeze法等进行纯化。
已克隆的核酸的碱基序列,用碱基序列测序仪来决定。
LPAAT表达用载体构建及转化体的制作
本发明还提供含有编码本发明的LPAAT3及4的核酸的重组载体。本发明还进一步提供被上述重组载体转化的转化体。
这种重组载体及转化体可通过以下方法获得。即:将含有编码本发明LPAAT的核酸的质粒用限制性内切酶进行酶切。作为使用的限制性内切酶,例如可例举EcoRI、KpnI、BamHI及SalI等,但不限于这些。此外,也可通过T4聚合酶处理进行末端平滑化。酶切后的碱基序列片段通过琼脂糖凝胶电泳进行纯化。通过用公知的方法将该碱基序列断片重组到表达用载体内,可获得LPAAT表达用载体。将该表达载体导入宿主制作转化体,供给目的蛋白质的表达。
此时,表达载体及宿主,只要能够表达目的蛋白质,没有特别限定,例如作为宿主,可例举真菌、细菌、植物、动物或其细胞等。作为真菌,可例举脂质生产菌高山被孢霉(M.alpina)等丝状菌、酿造酵母(Saccharomycescerevisiae)等酵母等。此外,作为细菌,可例举大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等。进而作为植物,可例举油菜子、大豆、棉花、红花、亚麻等油粮植物等。
作为脂质生产菌,例如可使用MYCOTAXON,Vol.XLIV,NO.2,pp.257-265(1992)所记载的菌株,具体来说属于被孢霉属(Mortierella)的微生物,例如可例举长孢被孢霉(Mortierella elongate)IFO8570、Mortierella exigua IFO8571、Mortierella hygrophila IFO5941、高山被孢霉(Mortierella alpine)IFO8568、ATCC16266、ATCC32221、ATCC42430、CBS219.35、CBS224.37、CBS250.53、CBS343.66、CBS527.72、CBS528.72、CBS529.72、CBS608.70、CBS754.68等属于被孢霉属亚属(subgenus Mortierella)的微生物,或者深黄被孢霉(Mortierella isabellina)CBS194.28、IFO6336、IFO7824、IFO7873、IFO7874、IFO8286、IFO8308、IFO7884、Mortierella nana IFO8190、拉曼被孢霉(Mortierella ramanniana)IFO5426、IFO8186、CBS112.08、CBS212.72、IFO7825、IFO8184、IFO8185、IFO8287、葡酒色被孢霉(Mortierella vinacea)CBS236.82等属于Micromucor亚属(subgenus Micromucor)的微生物等。特别优选高山被孢霉(Mortierella alpina)。
将真菌类作为宿主使用时,优选本发明的核酸可在宿主中自主复制,或者是可插入该菌的染色体上的结构。与此同时,优选是含有启动子、终止子的组成。使用高山被孢霉(M.alpina)作为宿主时,作为表达载体,例如可例举pD4、pDuraSC、pDura5等。作为启动子,只要能够在宿主中表达,可使用任何启动子,例如可使用histonH4.1基因启动子、GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)基因启动子、TEF(翻译延伸因子)基因启动子等来自高山被孢霉(M.alpina)的启动子。
作为向高山被孢霉(M.alpina)等丝状菌内导入重组载体的方法,例如可例举电穿孔法、原生质球法、粒子轰击法(particle delivery)以及向核内直接显微注射DNA等。使用营养缺陷型的宿主株时,通过选择在缺少其营养的选择培养基上生长发育的菌株,可获得转化体。此外,转化时使用抗药性标记基因时,在含有该药剂的选择性培养基上进行培养,可获得显示抗药性的细胞菌落。
使用酵母作为宿主时,作为表达载体,例如可例举pYE22m等。此外,也可使用pYES(Invitrogen)pESC(STRATAGENE)等市售的酵母表达用载体。此外,作为适合于本发明的宿主,可例举Saccharomyces cerevisiae EH13-15株(trp1,MATα)等,但并不限于这些。作为启动子,例如可使用GAPDH启动子、gal1启动子、gal10启动子等来自酵母的启动子。
作为向酵母内导入重组载体的方法,例如可例举乙酸锂法、电穿孔法、原生质球法、葡聚糖介导的转染、磷酸钙沉淀、聚凝胺介导的转染、原生质体融合、脂质体中的多核苷酸(单数或复数)的包裹、以及在核内直接显微注射DNA等。
使用大肠杆菌等细菌作为宿主时,作为表达载体,例如可例举Pharmacia公司的pGEX、pUC18等。作为启动子,例如可使用trp启动子、lac启动子、PL启动子、PR启动子等来自大肠杆菌、噬菌体等的启动子。作为向细菌内导入重组载体的方法,例如可使用电穿孔法、氯化钙法。
本发明的脂肪酸组合物的制造方法
本发明提供从上述转化体中制造脂肪酸组合物的方法。即:培养上述转化体,从获得的培养物中制造脂肪酸组合物的方法。具体可用以下方法制造。但是,对于本制造方法来说,并不限于该方法,可采用通常公知的其他方法进行。
用于培养使LPAAT表达的生物的培养基,只要是具有适当的pH及渗透压,含有各宿主增殖所必需的营养素、微量成分、血清、抗生素等生物材料的培养液(培养基),可使用任意的培养液。例如转化酵母使LPAAT表达时,可使用SC-Trp培养基、YPD培养基、YPD5培养基等,但并不限于这些。作为具体的培养基的组成,例示SC-Trp培养基:每1L中,无氨基酸酵母氮源(Yeast nitrogen basew/o amino acids)(DIFCO)6.7g、葡萄糖20g、氨基酸粉(腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸3g、组氨酸0.6g、亮氨酸1.8g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g、尿嘧啶0.6g的混合物)1.3g。
培养条件,只要是适合宿主增殖、且适于生成的酶保持稳定的条件,可以为任意的条件,具体可调节厌氧度、培养时间、温度、湿度、静置培养或振荡培养等各种条件。培养方法,可以为同一条件下的培养(1段培养),也可以为使用2个以上不同培养条件即2段培养或3段培养,进行大量培养时,优选培养效率良好的2段培养等。
以下,作为本发明的脂肪酸组合物的具体制造方法,以使用酵母作为宿主进行2段培养为例进行说明。即:作为预培养,将上述获得的菌落例如接种到上述SC-Trp培养基等中,在30℃下振荡培养2天。然后,作为本培养,在YPD5(2%酵母膏、1%多聚蛋白胨、5%葡萄糖)培养基10ml内添加预培养液500μl,在30℃下振荡培养2天。
本发明的脂肪酸组合物
本发明还提供在本发明的LPAAT3或4已表达的细胞中的1种或1种以上脂肪酸的集合物脂肪酸组合物。优选为培养本发明的LPAAT3或4已表达的转化体而获得的脂肪酸组合物。脂肪酸可以是游离脂肪酸,也可以是三甘油酯、磷脂质等。特别是,本发明的脂肪酸组合物的特征在于,在其脂肪酸组成中,以下
i)油酸含量
ii)棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率
iii)油酸含量相对于棕榈酸含量的比率,以及
iv)硬脂酸及油酸的合计含量相对于棕榈酸含量的比率中的至少一项以上比培养未用本发明的重组载体转化的宿主而获得的培养物的上述比率高,或者本发明的脂肪酸组合物中花生四烯酸的含有率比培养未用上述重组载体转化的宿主而获得的培养物高。在此,“未用本发明的重组载体转化的宿主”是指,例如使用未整合本说明书中的“本发明的编码溶血磷脂酸酰基转移酶的核酸”项目中所记载的核酸的载体(空载体)转化的宿主。此外,对于上述脂肪酸组合物,如上述“本发明的编码溶血磷脂酸酰基转移酶的核酸”项目中说明的那样,改变培养条件时,有时其脂肪酸组成多少也会发生变化。
作为本发明脂肪酸组合物中含有的脂肪酸,是指长链烃的链状或分支状的单羧酸,例如可例举肉豆蔻酸(myristic acid)(十四烷酸)(14:0)、肉豆蔻酸(myristoleic acid)(十四碳烯酸)(14:1)、棕榈酸(十六烷酸)(16:0)、棕榈油酸(9—十六碳烯酸)(16:1)、硬脂酸(十八烷酸)(18:0)、油酸(顺式—9—十八碳烯酸)(18:1(9))、异油酸(11—十八碳烯酸)(18:1(11))、亚油酸(顺式,顺式—9,12十八碳二烯酸)(18:2(9,12))、α—亚麻酸(9,12,15—十八碳三烯酸)(18:3(9,12,15))、γ—亚麻酸(6,9,12—十八碳三烯酸)(18:3(6,9,12))、亚麻油酸(Stearidonic acid)(6,9,12,15-十八碳四烯酸)(18:4(6,9,12,15))、花生酸(二十烷酸)(20:0)、(8,11—二十碳二烯酸)(20:2(8,11))、Mead酸(5,8,11—二十碳三烯酸)(20:3(5,8,11))、二高γ-亚麻酸(8,11,14-二十碳三烯酸)(20:3(8,11,14))、花生四烯酸(5,8,11,14—二十碳四烯酸)(20:4(5,8,11,14))、二十碳四烯酸(5,11,14,17-二十碳四烯酸)(20:4(5,11,14,17)、二十碳五烯酸(5,8,11,14,17-二十碳五烯酸)(20:5(5,8,11,14,17))、山萮酸(二十二烷酸)(22:0)、(7,10,13,16-二十二碳四烯酸)(22:4(7,10,13,16))、(4,7,13,16,19-二十二碳五烯酸)(22:5(4,7,13,16,19))、(4,7,10,13,16-二十二碳五烯酸)(22:5(4,7,10,13,16))、(4,7,10,13,16,19-二十二碳六烯酸)(22:6(4,7,10,13,16,19))、木质素酸(二十四烷酸)(24:0)、神经酸(顺式—15—二十四碳烯酸)(24:1)、蜡酸(二十六烷酸)(26:0)等,但并不限于这些。此外,上述物质名称是采用IUPAC化学命名法定义的通用名称,括号内记载了系统名称以及表示碳原子数量和双键位置的数值)。
作为本发明的脂肪酸组合物的特征之一,可例举花生四烯酸的含有率高。花生四烯酸是用化学式C20H32O2表示的、分子量为304.47的物质,是含有4个双键的20个碳链所组成的羧酸(〔20:4(n-6)〕),被分类为(n-6)系。花生四烯酸作为动物细胞膜中重要的磷脂质(特别是磷脂酰乙醇胺磷脂酰胆碱磷脂酰肌醇)而存在,在脑内大量存在。此外,花生四烯酸是通过花生四烯酸级联反应生成的前列腺素凝血黄素白三烯等一系列的类二十烷酸的起始物质,作为细胞间信息传递中的第二信使非常重要。另一方面,花生四烯酸是动物将亚麻酸作为原料在体内合成的。但是,由于动物种类或年龄等不同,该功能不充分,所以不能生产必需的量,或者完全没有了生产功能,所以必须从食物中摄取花生四烯酸,可以说花生四烯酸是必须的脂肪酸。
本发明的脂肪酸组合物中的花生四烯酸含有率,例如可通过以下方法测定。即:将本发明的LPAAT3或4的质粒,例如通过实施例9记载的方法,插入到pDuraSC、pDura5MCS等的载体内,在高山被孢霉(M.alpina)株中使转化获得的转化体进行表达,使用根据实施例9记载的培养方法获得的培养菌体,测定菌体内的脂肪酸含有率、每单位培养基的花生四烯酸的含量等。作为花生四烯酸的含量等的分析方法,例如可例举通过盐酸甲醇法将获得的培养菌体的脂肪酸衍生为脂肪酸甲酯,然后用己烷提取,蒸馏除去己烷后,用气相色谱法进行分析的方法。由此表明,将本发明的LPAAT3或4在高山被孢霉(M.alpina)中转化时,菌体内的脂肪酸含有率、每单位培养基的花生四烯酸的生产量均高。这样,花生四烯酸含有率高的本发明的脂肪酸组合物,因为能够高效摄取花生四烯酸,所以优选。
本发明的脂肪酸组合物,只要是上述脂肪酸中的1种或1种以上的脂肪酸的组合,可以是由任意数量、任意种类的脂肪酸组成的组合物。
为了证明获得了这种本发明的脂肪酸组合物,即证明本发明的LPAAT3或4已表达,可使用公知的通常的方法进行。例如在酵母中使LPAAT表达时,可证明脂肪酸组成的变化。即:在通过上述本发明的脂肪酸组合物的制造方法获得的冷冻干燥菌体中,添加以适当比率调整的氯仿:甲醇并搅拌后,加热处理适当时间,进而通过离心分离将菌体分离,回收溶剂,这样重复数次。然后使用适当的方法使脂质干燥固化,添加氯仿等溶剂使脂质溶解。将该试样分取适当量,通过盐酸甲醇法使菌体的脂肪酸衍生为甲酯后,用己烷提取,蒸馏除去己烷,用气相色谱法进行分析。
其结果,在获得了具有上述脂肪酸组成的脂肪酸组合物及/或花生四烯酸含有率高的脂肪酸组合物时,可判断获得了本发明的脂肪酸组合物。此外,因为本发明的LPAAT,与公知的LPAAT脂肪酸组合物的脂肪酸组成在脂肪酸组成上不同,由此表明本发明的LPAAT与公知的LPAAT的底物特异性不同。
本发明的含有脂肪酸组合物的食品等
此外,本发明提供含有上述脂肪酸组合物的食品。本发明的脂肪酸组合物,根据通常方法,例如可使用于含有油脂的食品、工业原料(化妆料、医药(例如皮肤外用药)、肥皂等的原料)的制造等用途中。作为化妆料(组合物)或医药(组合物)的剂型,可例举溶液状、糊状、凝胶状、固体状、粉末状等任意的剂型,但并不限于这些。此外,作为食品的形态,可例举胶囊等医药制剂的形态,或在蛋白质、糖类、脂肪、微量元素、维生素类、乳化剂、香料等中配合了本发明的脂肪酸组合物的自然流食、半消化状态营养食品、以及成分营养食品、保健饮料、经肠营养剂等加工形态。
进而,作为本发明的食品例,可例举营养辅助食品、保健食品、功能性食品、幼儿用食品、婴儿用配方乳、早产儿用配方乳、老人用食品等,但不限于这些。在本说明书中,食品是固体、流体、及液体及其混合物,是可摄取食用的物质的总称。
营养辅助食品是指强化了特定的营养成分的食品,保健食品是指被认为是健康的或对健康有益的食品,包括营养辅助食品、天然食品、减肥食品等。功能性食品是指用来补充发挥身体的调节功能的营养成分的食品,与特定保健用途食品含义相同。幼儿用食品是指供给小于约6岁的孩子用的食品,老人用食品是指处理成与无处理的食品相比,容易消化吸收的食品。婴儿用配方乳是指供给小于约1岁的孩子用的配方乳,早产儿用配方乳是指供给早产儿出生后到约6个月为止所用的配方乳。
作为这些食品,可例举肉、鱼、果仁等天然食品(用油脂处理过的食品);中华料理、拉面、汤等制作时加入油脂的食品;天麸罗、油炸食品、油炸豆腐、炒饭、炸面圈、油炸糖点心等用油脂作热介质的食品;黄油、人造黄油、蛋黄酱、调味料、巧克力、方便面、奶糖、饼干、曲奇、蛋糕、冰淇淋等油脂食品或加工时加入油脂的加工食品;(烤)年糕片、硬饼干、豆沙面包等加工完成时用油脂喷雾或涂布的食品等。但是,本发明的食品并不限于含油脂的食品,例如可例举面包、面条类、米饭、点心类(糖果、口香糖、橡皮糖、压片糖、日式点心)、豆腐及其加工品等农产食品;清酒、药用酒、甜料酒、食用醋、酱油、黄酱等发酵食品;酸奶、火腿、培根、香肠等畜产食品;鱼糕、炸鱼糕、鱼肉山芋饼等水产食品;果汁饮料、清凉饮料、运动饮料、酒精饮料、茶等。
使用本发明的编码LPAAT的核酸或LPAAT蛋白质的菌株的评价选择方法
本发明还提供使用本发明的编码LPAAT的核酸或LPAAT蛋白质,进行评价、选择脂质生产菌的方法。具体如下所示。
(1)评价方法
作为本发明的一个实施方式,可例举使用本发明的编码LPAAT的核酸或LPAAT蛋白质,进行评价脂质生产菌的方法。作为本发明的上述评价方法,首先例举使用根据本发明的碱基序列设计的引物或探针,对作为被测菌株的脂质生产菌株的本发明的上述活性进行评价的方法。这种评价方法的通常方法是公知的,例如在国际专利申请手册WO01/040514号、日本特开平8-205900号公报等中均有记载。以下对该评价方法进行简单说明。
首先制备被测菌株的基因组。制备方法可使用Hereford法、乙酸钾法等任何公知的方法(例如参照Methods in Yeast Genetics,Cold Spring HarborLaboratory Press,p130(1990))。
根据本发明的碱基序列、优选根据序列号36或37设计引物或探针。上述引物或探针可使用本发明的碱基序列的任意部分,并且可使用公知的方法进行其设计。作为引物使用的多核苷酸的碱基数,通常为10个碱基以上,优选为15~25个碱基。此外,夹在两引物间的碱基数通常以300~2000碱基为宜。
使用上述构建的引物或探针,检测上述被测菌体的基因组中是否存在本发明的碱基序列的特异性序列。本发明的碱基序列的特异性序列的检测可采用公知的方法进行。例如,用含有本发明的碱基序列的特异性序列的一部分或全部的多核苷酸或者含有上述碱基序列的互补碱基序列的多核苷酸作为一个引物,用含有该序列的上游或下游序列的一部分或全部的多核苷酸或者含有上述碱基序列的互补碱基序列的多核苷酸作为另一个引物,例如通过PCR法等扩增被测菌株的核酸,可以测定扩增产物的有无、扩增产物的分子量大小等。
适合本发明方法的PCR法的反应条件,没有特别限定,例如可例举以下条件,
变性温度:90~95℃
退火温度:40~60℃
延伸温度:60~75℃
循环数:10次以上等条件。将获得的反应生成物的扩增产物,通过使用琼脂糖凝胶等的电泳法等进行分离,可以测定扩增产物的分子量。因此通过确认扩增产物的分子量是否是含有相当于本发明的碱基序列的特异区域的核酸分子的大小,可以预测或评价被测菌株的本发明的上述活性。此外,通过用上述方法等分析上述扩增产物的碱基序列,可以进一步更正确地预测或评价本发明的上述活性。此外,本发明的上述活性的评价方法如上所述。
此外,作为本发明的上述评价方法,通过培养被测菌株,测定序列号36或37等本发明的碱基序列编码的LPAAT的表达量,可以评价被测菌株的本发明的上述活性。此外,LPAAT的表达量,可以通过在适当的条件下培养被测菌株,对LPAAT的mRNA或蛋白质定量来测定。mRNA或蛋白质的定量,可使用公知的方法进行。mRNA的定量,例如可通过Northern杂交法、定量RT-PCR进行,蛋白质的定量例如可通过Western印迹法进行(Current Protocols in MolecularBiology,John Wiley & Sons 1994-2003)。此外,作为上述活性的评价方法,可例举测定本发明的LPAAT产生的脂肪酸组合物的组成及/或花生四烯酸含有率的方法。脂肪酸组合物的组成及/或花生四烯酸含有率的测定方法如上所述。
(2)选择方法
作为本发明的其他实施方式,可例举使用本发明的编码LPAAT的核酸或LPAAT蛋白质进行选择脂质生产菌的方法。作为本发明的上述选择方法,通过培养被测菌株,测定序列号36或37等本发明的碱基序列编码的LPAAT的表达量,选择目的表达量的菌株,可以选择出具有期望活性的菌株。此外,设定作为标准的菌株,分别培养该标准菌株和被测菌株,测定各菌株的上述表达量,比较标准菌株和被测菌株的表达量,也可以选择出期望的菌株。具体来说,例如将标准菌株和被测菌株在适当的条件下培养,测定各菌株的表达量,通过选择与标准菌株相比较,被测菌株为高表达、或低表达的被测菌株,可以选择具有期望活性的菌株。对于期望的活性,如上所述可例举测定LPAAT的表达量及/或LPAAT产生的脂肪酸组合物的组成及/或花生四烯酸含有率的方法。
此外,作为本发明的上述选择方法,通过培养被测菌株,选择本发明的上述活性高或低的菌株,可以选择具有期望活性的被测菌株。对于期望活性,如上所述,可例举测定LPAAT的表达量及/或LPAAT产生的脂肪酸组合物的组成及/或花生四烯酸含有率的方法。
作为被测菌株或标准菌株,例如可使用上述导入本发明的载体的菌株、上述本发明的核酸的表达受到抑制的菌株、实施突变处理的菌株、发生自然突变的菌株等,但并不限于这些。此外,本发明的LPAAT活性及可形成LPAAT的脂肪酸组合物的活性及提高本发明的细胞内花生四烯酸含有率的活性,例如可通过本说明书中的“本发明的编码溶血磷脂酸酰基转移酶的核酸”、“本发明的脂肪酸组合物”项目中记载的方法进行测定。作为突变处理,例如可例举紫外线照射、放射线照射等物理方法,EMS(甲基磺酸乙酯)、N-甲基-N-亚硝基胍等试剂处理的化学方法等(如参照大
Figure G2008800002419D0034182119QIETU
泰治编著、生物化学实验法39酵母分子遗传学实验法、p67-75、学会出版中心等)(日语原名;大泰治編著、生物化学実騤法39酵母分子遺伝学実騤法、p67-75、学会出版センタ—)。但不限于这些。
此外,作为本发明的标准菌株、被测菌株使用的菌株,可例举上述脂质生产菌或酵母等,但并不限于这些。具体来说,标准菌株、被测菌株,可将属于不同属、种的任意菌株组合使用,被测菌株也可同时使用1种或1种以上的菌株。
实施例
以下根据实施例更加具体地说明本发明,但本发明并不限于这些实施例。
实施例1
(1)EST分析
将高山被孢霉(M.alpina)1S-4株接种到100ml的培养基(1.8%葡萄糖、1%酵母膏、pH6.0)中,在28℃预培养3天。在10L培养槽(Able Co.,东京)中加入5L培养基(1.8%葡萄糖、1%大豆粉、0.1%橄榄油、0.01%Adecanol、0.3%KH2PO4、0.1%Na2SO4、0.05%CaCl22 H2O、0.05%MgCl26H2O、pH6.0),接种全部预培养物,在300rpm、1vvm、26℃的条件下通气搅拌培养8天。在培养的第1、2、及3天分别添加相当于2%、2%、及1.5%的葡萄糖。在培养的第1、2、3、6、及8天的各阶段回收菌体,用盐酸胍/氯化铯法制备总RNA。使用Oligotex-dT30<Super>mRNA Purification Kit(TaKaRa Bio),从总RNA中纯化poly(a)+RNA。使用ZAP-cDNA GigapackIII Gold Cloning Kit(STRATAGENE),构建各阶段的cDNA文库,进行cDNA的5’端一步法序列分析(8000克隆×5步)。将获得的序列进行聚类,其结果,获得约5000序列。
(2)LPAAT同源基因的检索
将通过EST分析获得的碱基序列,相对于在GENEBANK注册的氨基酸序列使用同源性检索程序BLASTX进行检索,提取出LPAAT基因的同源基因。其结果,发现4个LPAAT同源基因的序列(序列号1、5、6及7)。
在上述检索中,各序列显示最高同一性的蛋白质如下所示。
序列号5和来自粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶类推定蛋白质(GB accession No.EAA28956),
序列号6和来自甘蓝型油菜(Brassica napus)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶类推定蛋白质(GB accession No.T07936),
序列号1和来自构巢裸胞壳(Emericella nidulans)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶类蛋白质AtaAp(GB accession No.AAD37345),
序列号7和来自酿酒酵母(S.cerevisiae)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶蛋白质Slclp(GB accession No.CAA98614),同一性分别最高。
比较国际专利申请手册WO2004/087902号和美国专利申请US2006/0094090号公报说明书中记载的高山被孢霉(M.alpina)的LPAAT同源基因的序列和上述获得的序列,发现序列号5是LPAAT1同源基因的部分序列,序列号6是LPAAT2同源基因的部分序列。
因此,将与序列号5相关的基因作为LPAAT1基因,与序列号6相关的基因作为LPAAT2基因,与序列号1相关的基因作为LPAAT3基因,与序列号7相关的基因作为LPAAT4基因。
对于上述序列,其来源文库和其EST如表2所示。此外,表2中表示了来自培养第几天获得的cDNA文库的克隆。
表2
Figure G2008800002419D00361
实施例2
(1)LPAAT同源基因的克隆
序列号1中含有由990bp组成的CDS(序列号8),认为其是编码LPAAT3全长基因的序列。被该基因编码的蛋白质(LPAAT3p)的推定氨基酸序列用序列号2表示。为了通过PCR扩增含有该ORF序列的DNA,构建以下引物。
引物I-1:GGATGTCATCAATGTCATCAATAGAG(序列号9)
引物I-2:CTAACCCCCTCTTCCTCCACCAC   (序列号10)
将第3天的cDNA文库作为模板,通过引物I-1和I-2,使用ExTaq(TaKaRaBio)进行PCR。PCR的条件为:94℃2分钟以后,将94℃1分钟、54℃1分钟、72℃2分钟作为1个循环,进行30个循环。
将扩增的片段用TOPO-TA cloning Kit(INVITROGEN CORPORATION)进行TA—克隆,确认有多少个克隆的碱基序列,将认为是含有该基因的正确碱基序列的克隆作为pCR-LPAAT3。
因为序列号5、6及7中不存在认为是编码LPAAT同源物的CDS,因此为了克隆编码这些基因全长的cDNA,根据各序列构建以下引物。
根据序列号5设计的引物:
引物955-1:GGACGTGTCAAGGAAAAGGA  (序列号11)
引物955-2:TCCTTCAGATGAGCCTCCTG  (序列号12)
根据序列号6设计的引物:
引物A-1:ggcgtccttctccacgtacttc  (序列号13)
引物A-2:gtgaaatacattccattctacg  (序列号14)
根据序列号7设计的引物:
引物B-1:CCTCGCAAAATGTATCGTGG   (序列号15)
引物B-2:GATGGGAAGTTGAGCTTGAATG (序列号16)
使用这些引物,将含有构成各序列号5、6及7的EST的cDNA文库作为模板,使用ExTaq(TaKaRa Bio)进行PCR反应。将获得的DNA片段用TOPO-TA cloningKit(INVITROGEN CORPORATION)进行TA—克隆,确定各插入部分的碱基序列。
其结果,确认含有序列号5的第20位到518位、序列号6的第116位到第616位、序列号7的第159位到第687位的碱基序列的DNA片段已分别被克隆,将这些质粒分别作为pCR-955-P、pCR-A-P及pCR-B-P。接着,将这些质粒分别作为模板,使用上述引物进行PCR反应。反应中虽然使用了ExTaq(TaKaRa Bio),但用PCR标记用混合物(Roche Diagnostics公司)代替添加的dNTP混合物,将扩增的DNA用地高辛(DIG)标记,构建用于筛选cDNA文库的探针。使用该探针,对通过EST分析获得了构成各种序列的EST的cDNA文库进行筛选。
杂交条件如下所示。
缓冲液:5×SSC、1%SDS、50mM Tris-HCl(pH7.5)、50%甲酰胺;
温度:42℃(一夜);
洗涤条件:在0.2×SSC、0.1%SDS溶液中(65℃),20分钟×3次;
检测,使用DIG核酸检测试剂盒(Roche Diagnostics公司)进行。从经过筛选获得的噬菌体克隆中,通过体内切割,切出质粒,获得各质粒DNA。
筛选含有序列号5的cDNA,获得的克隆的插入碱基序列用序列号17表示。序列号17中含有从第36位到第1289位的1254bp所组成的CDS,所以认为获得了编码LPAAT1同源物全长的序列。由该基因编码的蛋白质的推定氨基酸序列用序列号18表示。将含有序列号17的质粒作为pB-LPAAT1。
筛选含有序列号6的cDNA获得的插入长度最长的克隆的插入碱基序列用序列号19表示。序列号19中含有从第26位到第949位的924bp所组成的CDS,所以认为获得了编码LPAAT2同源物全长的序列。由该基因编码的蛋白质的推定氨基酸序列用序列号20表示。将含有序列号19的质粒作为pB-LPAAT2。
筛选含有序列号7的cDNA获得的克隆中,确定插入长度最长的克隆的碱基序列,发现其中含有序列号1的第103位到第1148位的碱基序列。因为其含有与上述获得的序列号7共有的序列,装配这些序列后获得序列号3表示的序列。序列号3中存在由序列号23表示的942bp所组成的CDS,认为获得了编码LPAAT同源基因全长的序列。被该基因编码的蛋白质(LPAAT4p)的推定氨基酸序列用序列号4表示。为了利用PCR扩增含有该区域的DNA,构建以下引物。
B-3:CAYGYCCATAGGCTCTTCTAATCC  (序列号21)
B-4:GTTTTACTCTTTCAGTGTCCTCC   (序列号22)
以从第3天的菌体中制备的cDNA作为模板,通过引物B-1和B-2,使用ExTaq(TaKaRa Bio)进行PCR。将扩增的片段TA—克隆到pCR2.1-TOPO上,确认碱基序列,将含有该基因的正确碱基序列的克隆作为pCR-LPAAT4。
(2)序列分析
将上述获得的来自高山被孢霉(M.alpina)的LPAAT同源物的cDNA序列,相对于在GENEBANK注册的氨基酸序列,使用BLASTX进行同源性分析。其结果是,相对于各序列E-value最低、即同一性最高的氨基酸序列如下所示。与各序列的ORF同一性最高的序列相关的碱基序列的同一性、及氨基酸序列的同一性用clustalW求出,以下合并记载。
序列号17,仅比较相当于来自构巢曲霉(Aspergillus nidulans)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶类的推定蛋白质(GB accessionNo.EAA60126)部分时,碱基序列为51%、氨基酸序列为32.1%。
序列号19,仅比较相当于来自稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶类的推定蛋白质(GB accessionNo.EAA48685)的部分时,碱基序列为53%、氨基酸序列为31%。
序列号1及3,仅比较相当于来自玉米黑粉菌(Ustilago maydis)的1—酰基—sn—甘油—3—磷酸酰基转移酶类的推定蛋白质(GB accessionNo.EAK87199)的部分时,序列号1的碱基序列为49%、氨基酸序列为37%;序列号3的碱基序列为51%、氨基酸序列为36%。
此外,对于序列号17和序列号19,用各种来自高山被孢霉(M.alpina)的已知的LPAAT同源物的LPAAT1基因(WO2004/087902)和LPAAT2基因(US2006/0094090)以及其编码的推定氨基酸序列进行比较。将上述文献中公开的序列和从高山被孢霉(M.alpina)1S-4株得到的序列在各自相当的区域比较时,确认LPAAT1的碱基序列为89%、氨基酸序列为91%的同一性,LPAAT2的碱基序列为92%、氨基酸序列为98%的同一性。
另一方面,序列号1~4,与已知的碱基序列及氨基酸序列比较时同一性并不显著地高,认为是来自高山被孢霉(M.alpina)的新型LPAAT基因。各个cDNA序列和推定氨基酸序列如图2及图3所示。将LPAAT3和LPAAT4的ORF部分的DNA序列比较时,同一性为67%(图4),比较被所述基因编码的蛋白质LPAAT3p和LPAAT4p的推定氨基酸序列时,同一性为69%(图5)。
将LPAAT3p及LPAAT4p的推定氨基酸序列和已知的氨基酸序列相比较(图6)。如图的下线所示,LPAAT3p及LPAAT4p也与所述的LPAAT蛋白质或其同源物相同,保留有甘油脂酰基转移酶(Glycerolipid acyltransferase)的保守序列HX4D(J.Bacteriology,180,1425-1430,1998)。
这里,图6的氨基酸中,gi_46101966表示的氨基酸序列(序列号40)来自玉米黑粉菌(Ustilago maydis)521(GB accession No.EAK87199),gi_5002178表示的氨基酸序列(序列号41)来自构巢裸胞壳(Emericella nidulans)(GBaccession No.AAD37345),gi_6320151表示的氨基酸序列(序列号来自酿酒酵母(Sacharomyces cerevisiae)(GB accession No.NP_010231),gi_19115517表示的氨基酸序列(序列号来自裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe)972h-(GB accession No.NP_594605),gi_17564032表示的氨基酸序列(序列号44)来自线虫(Caenorhabditis elegans)(GB accession No.NP_505578)。
实施例3
LPAAT活性的测定
(1)Δslc1:URA3株的育种
为了获得已知具有酵母的LPAAT活性的基因SLC1的CDS,构建以下引物。
引物SLC1-1  ggtgaagggggaattcttc       (序列号45)
引物SLC1-2  atgtcgacgtggcttaatgcatc   (序列号46)
为了获得酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)S288C株的基因组DNA,将其接种到YPD培养基10ml中,30℃下振荡培养1天。从培养液1.5ml中,使用DR.GenTLE(TaKaRa Bio商标)(酵母用),提取DNA。以此为模板,使用引物SLC1-1和SLC1-2通过PCR反应扩增SLC1的CDS。将获得的PCR产物用限制性内切酶EcoRI和SalI酶切,插入载体pUC18的EcoRI-SalI位点后,确认碱基序列,获得质粒pUC-SLC1。接着,用限制性内切酶SalI将质粒pUC-SLC1酶切后,进行末端平滑化,通过自身连接作用,获得质粒pUC-SLC1-2。
SLC1基因的缺失株按以下方法构建。将用限制性内切酶HindIII酶切质粒p URA34(日本特开2001-120276号公报)且将末端平滑化后获得的约1.2kb的DNA片段、和用限制性内切酶EcoRV和HincII酶切质粒pUC-SLC1-2获得的约3.1kb的DNA片段连接,构建质粒pUCΔslc1:URA3。将酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)YPH499株(STRATAGENE),用经限制性内切酶EcoRI和HindIII酶切质粒pUCΔslc1:URA3后的DNA片段转化,转化株选择可在SC-Ura(每1升中,无氨基酸酵母氮源(Yeast nitrogen base w/o amino acids)(DIFCO)为6.7g、葡萄糖为20g、氨基酸粉(腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸3g、组氨酸0.6g、亮氨酸1.8g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g、色氨酸1.2g的混合物)为1.3g)琼脂培养基(2%琼脂)上生长发育的转化株。将获得的转化株中的任意1株作为Δslc1:URA3-1株。
(2)向Δslc1:URA3株内导入LPAAT基因
为了构建ScSLC1表达用载体,将用限制性内切酶EcoRI和SalI酶切pUC-SLC1后获得的0.9kb的DNA片段,插入载体pYE22m的EcoRI-SalI位点,构建质粒pYE-ScSLC1。
将Δslc1:URA3-1株用质粒pYE22m、pYELPAAT3、pYELPAAT4、pYESLC1分别进行转化。转化株选择可在SC-Trp,Ura(每1升中,无氨基酸酵母氮源(Yeastnitrogen base w/o amino acids)(DIFCO)为6.7g、葡萄糖为20g、氨基酸粉(腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸3g、组氨酸0.6g、亮氨酸1.8g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g的混合物)为1.3g)琼脂培养基(2%琼脂)上生长发育的转化株。
将用各种质粒获得的转化株的任意株作为C-3株、LPAAT2-3株、LPAAT3-3株、SLC1-3株。
(3)微粒体组分的制备
将C-3株、LPAAT3-3株、LPAAT4-3株、SLC1-3株分别在SC-Trp,Ura液体培养基10ml中,30℃下振荡培养1天。取该培养液1ml接种到SC-Trp,Ura液体培养基100ml中,28℃下培养1天。将菌体通过离心分离收集,用1/2量的灭菌水洗涤,然后悬浮在5ml的缓冲液B(0.6M山梨糖醇、5mM2-(N-吗啉)乙磺酸(MES)、1mM KCl、0.5mM乙二胺四乙酸(EDTA)、1mM苯甲基磺酰氟(PMSF)、pH6.0)中。使用法式压滤壶,在16kPa下破碎菌体,在20000×g、4℃下离心分离1小时,将获得的上清进一步在100000×g、4℃下离心分离1小时,将获得的沉淀物溶解于缓冲液B中,调整微粒体组分。各试样中含有的蛋白质浓度,用蛋白质分析CBB溶液(Nacalai Tesque)进行定量。
(4)LPAAT活性的测定
LPAAT活性按以下方法测定。反应液为100μg1-油酰基-2-羟基-sn-甘油-3-磷酸(LPA-18:1)、50μg亚油酰基辅酶A(18:2-CoA)、0.5mM二硫苏糖醇(DTT)、0.5mg牛血清白蛋白(BSA)、2mM MgCl2、50mM Tris-HCl缓冲液pH7.5、100μl微粒体组分,使全体量为500μl。在28℃下反应10分钟,添加1875μl的氯仿:甲醇1:2溶液终止反应。作为内标,添加20μg的1,2-二-十七酰基-sn-甘油-磷酸。根据Bligh&Dyer等的方法提取脂质,总量通过薄层色谱法(TLC)分离。TLC使用硅胶60板(Merck),展开剂为氯仿:甲醇:乙酸:水=170:25:25:4。刮取PA组分,加入1ml的二氯甲烷和2ml的10%盐酸甲醇,通过盐酸甲醇法使脂肪酸衍生为甲酯后,用己烷提取,蒸馏除去己烷,通过气相色谱法进行分析,对该组分中含有的亚油酸量进行定量。通过上述反应PA组分中的每单位酶液蛋白质的亚油酸的值如表所示。
表3 PA组分中的每单位酶液蛋白质的亚油酸的值(LPAAT活性)
Figure G2008800002419D00421
这样,使LPAAT3、LPAAT4、SLC1表达的株中,上述反应中PA组分中含有的亚油酸(18:2)量增加,表明LPAAT3及LPAAT4具有LPAAT活性。
实施例4
酵母表达载体的构建
为了使LPAAT1、LPAAT2、LPAAT3及LPAAT4在酵母中表达,如下所述,构建酵母表达用载体。
为了使LPAAT1在酵母中表达,如下所述构建酵母表达载体。即:将质粒pB-LPAAT1作为模板,使用以下引物LPAAT1-6F(序列号38)和LPAAT1-R1(序列号39),使用ExTaq(TaKaRa Bio)进行PCR反应。
LPAAT1-6F:TCTGAGATGGATGAATCCACCACCACCAC   (序列号38)
LPAAT1-R1:GTCGACTCAACCAGACGATACTTGCTGCAGAG(序列号39)
对于获得的DNA片段,使用TOPO-TA cloning Kit(INVITROGEN),进行TA-克隆,确认插入部分的碱基序列,将具有正确的碱基序列的质粒作为pCR-LPAAT1。将用限制性内切酶EcoRI和SalI酶切该质粒获得的约1.3kb的DNA片段,插入酵母表达用载体pYE22m的EcoRI-SalI位点,构建质粒pYE-MALPAAT1。
为了使LPAAT2在酵母内表达,如下所述,构建酵母表达载体。即:用限制性内切酶KpnI酶切质粒pB-LPAAT2后,通过碱性磷酸酯酶处理进行末端平滑化,接着将用限制性内切酶BamHI酶切获得的DNA片段,插入用限制性内切酶SalI酶切后进行末端平滑化并继续用限制性内切酶BamHI酶切后的酵母用表达载体pYE22m内,作为质粒pYE-MALPAAT2。
为了使LPAAT3及4在酵母内表达,如下所述,构建酵母表达载体。即:用限制性内切酶EcoRI酶切质粒pCR-LPAAT3或质粒pCR-LPAAT4,切出插入部分,连接于酵母用表达载体pYE22m的EcoRI位点。确认插入的DNA片段的方向,将从pYE22m的GAPDH启动子开始按ORF可转录的方向插入后的产物分别作为pYE-MALPAAT3及pYE-MALPAAT4。
实施例5
酵母的转化
用质粒pYE22m、pYE-MALPAAT1、pYE-MALPAAT2、pYE-MALPAAT3或pYE-MALPAAT4,通过乙酸锂法转化入酵母Saccharomyces cerevisiae EH13-15株(trp1,MATα)(Appl.Microbiol.Biotechnol.,30,515-520,1989)中。转化株选择在SC-Trp(每1升中,无氨基酸酵母氮源(Yeast nitrogen base w/oamino acids)(DIFCO)为6.7g、葡萄糖为20g、氨基酸粉((腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸3g、组氨酸0.6g、亮氨酸1.8g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g、尿嘧啶0.6g的混合物)为1.3g)琼脂培养基(2%琼脂)上生长发育的菌株。
实施例6
酵母的培养
分别选择使用各个载体的任意2株转化株(c-1株、c-2株、LPAAT1-1株、LPAAT1-2株、LPAAT2-1株、LPAAT2-2株、LPAAT3-1株、LPAAT3-2株及びLPAAT4-1株、LPAAT4-2株),在以下条件下培养。
即:作为预培养,从平板上取1白金耳酵母接种到SC-Trp培养基10ml中,在30℃下振荡培养2天。本培养是在YPD5(酵母膏2%、多聚蛋白胨1%、葡萄糖5%)培养基10ml中添加预培养液500μl,30℃下振荡培养2天。
实施例7
酵母的脂肪酸分析
通过离心分离酵母培养液,回收菌体。用10ml灭菌水洗涤,再通过离心分离回收菌体,进行冷冻干燥。在冷冻干燥菌体中添加氯仿:甲醇(2:1)4ml,剧烈搅拌后,70℃下处理1小时。通过离心分离分离菌体,回收溶剂。在残留的菌体中再次添加氯仿:甲醇(2:1)4ml,同样回收溶剂。在离心浓缩仪中使脂质干燥固化后,添加2ml氯仿溶解脂质。从该试样中分取200μl,通过盐酸甲醇法使菌体的脂肪酸衍生为甲酯后,用己烷提取,蒸馏除去己烷,通过气相色谱法进行分析。其结果如表4所示。
表4 转化株的脂肪酸组成(宿主EH13-15)
 
试样名 C-1 C-2 LPAAT2-1 LPAAT2-2 LPAAT3-1 LPAAT3-2 LPAAT4-1 LPAAT4-2
16:0 8.46 6.46 6.33 6.27 4.48 4.65 5.27 3.99
16:1 43.26 43.1 41.49 42.17 35.72 36.39 38.22 3471
18:0 4.09 4.57 4.58 4.44 4.85 4.68 4.13 4.58
18:1 44.19 45.87 47.6 47.12 54.94 54.28 52.39 56.72
16:1/16:0 5.11 6.67 6.55 6.73 7.97 7.83 7.25 8.70
18:1/16:0 5.22 7.10 7.52 7.52 12.26 11.67 9.94 14.22
18:1+18:0/16:0 5.71 7.81 8.24 8.22 13.35 12.68 10.72 15.36
18:0+18:1/16:0+16:1 0.93 1.02 1.09 1.06 1.49 1.44 1.30 1.58
 
试样名 C-1 C-2 LPAAT1-1 LPAAT1-2
16:0 8.83 6.76 12.49 15.26
16:1 40.55 43.56 35.59 35.62
18:0 5.41 4.74 4.85 5.27
18:1 45.21 44.94 47.07 43.85
16:1/16:0 4.59 6.44 2.85 2.33
18:1/16:0 5.12 6.65 3.77 2.87
18:1+18:0/16:0 5.73 7.35 4.16 3.22
18:0+18:1/16:0+16:1 1.03 0.99 1.08 0.97
比较导入来自高山被孢霉(M.alpina)的4个LPAAT同源物的酵母和对照酵母的脂肪酸组成。导入LPAAT2的酵母的脂肪酸组成与对照株相比,虽然油酸的比例略有增加,但基本没有差别。此外,导入LPAAT1的酵母的脂肪酸组成,棕榈酸的比例相对于对照株升高,而另一方面,棕榈油酸含量的比例减少。因此,棕榈油酸含量相对于棕榈酸含量的比率相对于对照株降低。硬脂酸及油酸的比例与对照株为同等程度。
另外,导入LPAAT3或LPAAT4的酵母中,油酸的比例与对照株相比上升10%以上,而棕榈油酸、棕榈酸的比例均减少。棕榈油酸与棕榈酸之比,相对于对照株升高。
以上结果表明,来自高山被孢霉(M.alpina)的4个LPAAT同源物,因为其底物酰基的特异性不同,所以导入这些基因的酵母中各同源物的脂肪酸组成不同。并且表明,通过将上述同源物适时分开使用,能够育种目的脂肪酸组成的生物。
实施例8
花生四烯酸生产酵母中的表达分析
(1)花生四烯酸生产酵母的育种
为了育种花生四烯酸生产酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),构建以下质粒。
首先,将从高山被孢霉(M.alpina)1S-4株中制备的cDNA作为模板,使用Δ12-f和Δ12-r、Δ6-f和Δ6-r、GLELO-f和GLELO-r或Δ5-f和Δ5-r的引物组合,使用ExTaq进行PCR,扩增高山被孢霉(M.alpina)1S-4株的Δ12脂肪酸去饱和化酶基因、Δ6脂肪酸去饱和化酶基因、GLELO脂肪酸链延长酶基因以及Δ5脂肪酸去饱和化基因。
Δ12-f:TCTAGAatggcacctcccaacactattg(序列号24)
Δ12-r:AAGCTTTTACTTCTTGAAAAAGACCACGTC(序列号25)
Δ6-f:TCTAGAatggctgctgctcccagtgtgag(序列号26)
Δ6-r:AAGCTTTTACTGTGCCTTGCCCATCTTGG(序列号27)
GLELO-f:TCTAGAatggagtcgattgcgcaattcc(序列号28)
GLELO-r:GAGCTCTTACTGCAACTTCCTTGCCTTCTC(序列号29)
Δ5-f:TCTAGAatgggtgcggacacaggaaaaacc(序列号30)
Δ5-r:AAGCTTTTACTCTTCCTTGGGACGAAGACC(序列号31)
将这些通过TOPO-TA-cloning Kit进行克隆。确认碱基序列,将含有序列号32~35的碱基序列的克隆,分别作为质粒pCR-MAΔ12DS(含有序列号32的碱基序列)、pCR-MAΔ6DS(含有序列号33的碱基序列)、pCR-MAGLELO(含有序列号34的碱基序列)、pCR-MAΔ5DS(含有序列号35的碱基序列)。
另一方面,将用限制性内切酶HindIII酶切质粒pURA34(日本特开2001-120276号公报)后获得的约1.2kb的DNA片段,插入用限制性内切酶EcoRI和SphI酶切载体pUC18后进行末端平滑化,通过自我连接作用获得的载体的HindIII位点,将载体的EcoRI位点侧为URA3的5’端的克隆作为pUC-URA3。并且,将用限制性内切酶SalI和XhoI酶切YEp13获得的约2.2kb的DNA片段插入载体pUC18的SalI位点,将载体的EcoRI侧为LUE2的5’端的克隆作为pUC-LEU2。
接着,将用限制性内切酶HindIII酶切质粒pCR-MAΔ12DS并且进行末端平滑化后用限制性内切酶XbaI酶切获得的约1.2kbp的DNA片段,与用限制性内切酶SacI酶切载体pESC-URA(STRATAGENE)并且进行末端平滑化后,用限制性内切酶SpeI酶切后的约6.6kbp的DNA片段连接,获得质粒pESC-U-Δ12。将用限制性内切酶XbaI酶切质粒pCR-MAΔ6DS并且进行末端平滑化后用限制性内切酶HindIII酶切获得的约1.6kbp的DNA片段,与用限制性内切酶SalI酶切质粒pESC-U-Δ12并且进行末端平滑化后用限制性内切酶HindIII酶切后的约8kbp的DNA片段连接,获得质粒pESC-U-Δ12:Δ6。将其用限制性内切酶PvuII部分酶切获得的约4.2kb的片段插入pUC-URA3的SmaI位点,获得质粒pUC-URA-Δ12:Δ6。
此外,将用限制性内切酶XbaI和SacI酶切质粒pCR-MAGLELO获得的约0.95kbp的DNA片段,与用限制性内切酶XbaI和SacI酶切载体pESC-LEU(STRATAGENE)获得的约7.7kbp的DNA片段连接,获得质粒pESC-L-GLELO。将用限制性内切酶XbaI酶切质粒pCR-MAΔ5DS并且进行末端平滑化后用限制性内切酶HindIII酶切获得的约1.3kbp的DNA片段,与用限制性内切酶ApaI酶切质粒pESC-L-GLELO并且进行末端平滑化后用限制性内切酶HindIII酶切后获得的约8.7kbp的DNA片段连接,获得质粒pESC-L-GLELO:Δ5。将其用限制性内切酶PvuII酶切获得的约3.2kb片段插入pUC-LEU2的SmaI位点,获得质粒pUC-LEU-GLELO:Δ5。将Saccharomyces cerevisiae YPH499株(STRATAGENE)用质粒pUC-URA-Δ12:Δ6和质粒pUC-LEU-GLELO:Δ5进行共转化。转化株选择在SC-Leu,Ura(每1升中,无氨基酸酵母氮源(Yeast nitrogenbase w/o amino acids)(DIFCO)为6.7g、葡萄糖为20g、氨基酸粉(腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸;3g、组氨酸0.6g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g、色氨酸1.2g的混合物)为1.3g)琼脂培养基(2%琼脂)上生长发育的菌株。将这样获得的菌株中的任意一株作为ARA3-1株。
(2)花生四烯酸生产酵母的转化株的获得与分析
将ARA3-1株用质粒pYE22m、pYE-MALPAAT3、pYE-MALPAAT4分别转化。转化株选择在SC-Trp,Leu,Ura(每1升中,无氨基酸酵母氮源(Yeast nitrogenbase w/o amino acids)(DIFCO)为6.7g、葡萄糖为20g、氨基酸粉(腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸;3g、组氨酸0.6g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g的混合物)为1.3g)琼脂培养基(2%琼脂)上生长发育的菌株。将这样获得的任意菌株分别作为ARA-C、ARA-LPAAT3、ARA-LPAAT4。
将这些菌株在上述SC-Trp,Leu,Ura液体培养基10ml中30℃、培养1天,取其中1ml在SG-Trp,Leu,Ura(每1升中,无氨基酸酵母氮源(Yeast nitrogenbase w/o amino acids)(DIFCO)为6.7g、半乳糖为20g、氨基酸粉(腺嘌呤硫酸盐1.25g、精氨酸0.6g、天冬氨酸3g、谷氨酸;3g、组氨酸0.6g、赖氨酸0.9g、蛋氨酸0.6g、苯丙氨酸1.5g、丝氨酸11.25g、酪氨酸0.9g、缬氨酸4.5g、苏氨酸6g的混合物)为1.3g)液体培养基10ml中30℃、培养2天,进行菌体的脂肪酸分析。菌体的脂肪酸组成如表5所示,菌体内的脂肪酸含有率如表6所示,菌体的花生四烯酸含有率如表7所示。
表5 转化株的脂肪酸组成
Figure G2008800002419D00471
表6 转化株的菌体内脂肪酸含有率
表7 转化株的菌体内花生四烯酸含有率
ARA-LPAAT4株,作为饱和脂肪酸的棕榈酸和硬脂酸的比率降低,亚油酸、花生四烯酸的比率增高。另一方面,ARA-LPAAT3的脂肪酸组成与对照株相比没有变化,但菌体内脂肪酸含有率增加。也就是说,LPAAT3已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率和LPAAT4已表达的宿主细胞内的花生四烯酸含有率,均比对照细胞内的花生四烯酸含有率高。
此外,将这些质粒导入株各取4株在上述SC-Trp,Leu,Ura液体培养基10ml中30℃、培养1天,取其中1ml接种到SG-Trp,Leu,Ura液体培养基10ml中,15℃、培养7天,进行菌体的脂肪酸分析。菌体的脂肪酸组成如表8所示,菌体内的脂肪酸含有率如表9所示,菌体内的花生四烯酸含有率如表10所示。
表8 转化株的菌体内PuFA含有率
菌体内PUFA占总脂肪酸的比率(%)
Figure G2008800002419D00481
                                                       平均±SD
表9 转化株的菌体内脂肪酸含有率
菌体内脂肪酸含有率
Figure G2008800002419D00482
                                                     平均±SD
表10 转化株的菌体内花生四烯酸含有率
菌体内花生四烯酸含有率
Figure G2008800002419D00483
                                                       平均±SD
在花生四烯酸生产酵母中使来自高山被孢霉(M.alpina)的LPAAT3表达时,与对照相比较,亚油酸、γ-亚麻酸、DGLA、花生四烯酸等PUFA的比率增高。并且,菌体内的脂肪酸含有率增高。另一方面,使来自高山被孢霉(M.alpina)的LPAAT4表达时,亚油酸、γ-亚麻酸的比率增高,花生四烯酸的比率也增高。
实施例9
(1)高山被孢霉(M.alpina)表达用载体的构建
作为高山被孢霉(M.alpina)表达用载体,使用从GAPDH启动子开始使目的基因表达的pDuraSC和从组蛋白启动子开始使目的基因表达的pDuraMCS。
为了使LPAAT3及LPAAT4在高山被孢霉(M.alpina)中表达,按以下所述构建载体。用限制性内切酶EcoRI酶切质粒pCR-LPAAT3或质粒pCR-LPAAT4,切出插入部分,插入载体pDuraSC或载体pDura5MCS的多克隆位点的EcoRI位点。确认插入的DNA的方向,将从各载体的启动子开始按ORF可转录的方向插入的部分,分别作为质粒pDuraSC-LPAAT3、质粒pDuraSC-LPAAT4、质粒pDura5MCS-LPAAT3、质粒pDura5MCS-LPAAT4。
(2)高山被孢霉(M.alpina)转化株的获得
使用这些质粒,通过高山被孢霉(M.alpina),将根据专利文献(WO2005/019437“脂质生产菌的育种方法”)中记载的方法诱导的尿嘧啶缺陷型株Δura-3作为宿主,利用粒子轰击法进行转化。选择转化株时,使用SC琼脂培养基(无氨基酸酵母氮源(Yeast Nitrogen Base w/o Amino Acids and AmmoniumSulfate)(Difco)0.5%、硫酸铵0.17%、葡萄糖2%、腺嘌呤0.002%、酪氨酸0.003%、蛋氨酸0.0001%、精氨酸0.0002%、组氨酸0.0002%、赖氨酸0.0004%、色氨酸0.0004%、苏氨酸0.0005%、异亮氨酸0.0006%、亮氨酸0.0006%、苯丙氨酸0.0006%、琼脂2%)。
(3)转化高山被孢霉(M.alpina)的评价
将获得的转化株,接种到GY培养基(葡萄糖2%、酵母膏1%)4ml中,28℃下振荡培养3天或4天。通过过滤回收菌体,使用RNeasy plant kit(QIAGEN)提取RNA。通过SuperScript First-Strand Synthesis System for RT-PCR(Invitrogen)合成cDNA。为了确认导入的构建物中的各基因的表达、总的各基因的表达,用以下引物的组合进行RT-PCR。
○质粒pDuraSC-LPAAT3导入株
导入构建物中表达所用的引物
引物MaGAPDHpfw:CACACCACACATTCAACATC(序列号47)
引物LAT3-2R:GAATCGTAGATATGGTTGTATCCAGCGCT(序列号48)
总LPAAT3表达所用的引物
引物LAT3-1F:CTGGCGGTCATCCTTGTTTTCTACCTG(序列号49)和
引物LAT3-2R(序列号48)
○质粒pDuraSC-LPAAT4导入株
导入构建物中表达所用的引物
引物MaGAPDHpfw(序列号47)
引物LAT4-2R:GAATCATAGATGTGTGAGTATCCTTGCGA(序列号50)
总LPAAT4表达所用的引物
引物LAT4-1F:TTCTAATCCTGTCCTACTGGCAGCG(序列号51)
引物LAT4-2R(序列号50)
○质粒pDura5MCS-LPAAT3导入株
导入构建物中表达所用的引物
引物PD4P:CGCATCCCGCAAACACACAC(序列号52)
引物LAT3-2R(序列号48)
总LPAAT3表达所用的引物
引物LAT3-1F(序列号49)和引物LAT3-2R(序列号48)
○质粒pDura5MCS-LPAAT4导入株
导入构建物中表达所用的引物
引物PD4P(序列号52)和引物LAT4-2R(序列号50)
总LPAAT4表达所用的引物
引物LAT4-1F(序列号51)和引物LAT4-2R(序列号50)
根据上述RT-PCR的结果,作为各基因在导入构建物中的表达及总表达高的菌株,从质粒pDuraSC-LPAAT3导入株中筛选出Gp-LPAAT3-3株、Gp-LPAAT3-29株,从质粒pDuraSC-LPAAT4导入株中筛选出Gp-LPAAT4-26株和Gp-LPAAT4-68株,从质粒pDura5MCS-LPAAT3导入株中筛选出Hp-LPAAT3-34株,从质粒pDura5MCS-LPAAT4导入株中筛选出Hp-LPAAT4-26株和Hp-LPAAT4-31株。
将这些菌株在GY培养基4ml中,28℃下125rpm振荡培养3天或4天(各n=3)。培养结束后,通过过滤回收菌体,进行冷冻干燥。取出一部分(约10~20mg左右)干燥菌体,通过盐酸甲醇法使菌体的脂肪酸衍生为甲酯后,用己烷提取,蒸馏除去己烷,通过气相色谱法进行分析。菌体内的脂肪酸含有率和每单位培养基的花生四烯酸生产量总结于下表中。
表11 LPAAT3高表达M.alpina的菌体内脂肪酸含有率(%)
Figure G2008800002419D00511
                                                    平均±SD
表12 LPAAT3高表达M.alpina的ARA生产量(g/L)
Figure G2008800002419D00512
                                                      平均±SD
表13 LPAAT4高表达M.alpina菌体内脂肪酸含有率(%)
Figure G2008800002419D00513
表14 LPAAT4高表达M.alpina的ARA生产量(g/L)
这些结果表明,试验的全部高山被孢霉(M.alpina)转化株,菌体内的脂肪酸含有率和每单位培养基的花生四烯酸生产量均比对照高。
序列表FREETEXT
序列号9:引物
序列号10:引物
序列号11:引物
序列号12:引物
序列号13:引物
序列号14:引物
序列号15:引物
序列号16:引物
序列号21:引物
序列号22:引物
序列号24:引物
序列号25:引物
序列号26:引物
序列号27:引物
序列号28:引物
序列号29:引物
序列号30:引物
序列号31:引物
序列号38:引物
序列号39:引物
序列号45:引物
序列号46:引物
序列号47:引物
序列号48:引物
序列号49:引物
序列号50:引物
序列号51:引物
序列号52:引物
序列表
(SEQUENCE LISTING)
 
<110>三得利株式会社(SUNTORY LlMlTED)
 
<120>新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因
(Novel Lysophosphatidic Acyltransferase Genes)
 
<130>YCT-1365
 
<150>JP2007-139046
<151>2007-05-25
 
<150>JP2007-323965
<151>2007-12-14
 
<160>52
 
<170>Patentin version 3.1
 
<210>1
<211>1207
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<220>
<221>CDS
<222>(158)..(1147)
<223>
<400>1
ccccgtcttt actcctgcac acagacacac acccacactc tctctttcct ggtttgaaca    60
gatcccaatt gccgactcca tctttctcca tactcttcac ccctcccatc gccctccttt    120
cacttcctct gtttctcatc tgacgccaat cgtaagg atg tca tca atg tca tca     175
                                         Met Ser Ser Met Ser Ser
                                         1               5
ata gag ccc gca ctg tcc tcg ttt cca ggc aac ctg gcg gtc atc ctt      223
lle Glu Pro Ala Leu Ser Ser Phe Pro Gly Asn Leu Ala Val Ile Leu
            10                  15                  20
gtt ttc tac ctg gca ctt cca cga ctt ctt gcc gtc ctg cca caa aag      271
Val Phe Tyr Leu Ala Leu Pro Arg Leu Leu Ala Val Leu Pro Gln Lys
        25                  30                  35
att cag ttc atc gcc aaa tgt ctc att gtc ctt aca gcc acc ttc ctc      319
Ile Gln Phe Ile Ala Lys Cys Leu Ile Val Leu Thr Ala Thr Phe Leu
    40                  45                  50
atg tct gtg gca gga tgc ttt gtc gcc att gtc tgt gct ctc ctc caa      367
Met Ser Val Ala Gly Cys Phe Val Ala Ile Val Cys Ala Leu Leu Gln
55                  60                  65                  70
aag cgc tat gcc ata aat tac gtg gtt gcg agg atc ttt tct tat atc      415
Lys Arg Tyr Ala Ile Asn Tyr Val Val Ala Arg Ile Phe Ser Tyr Ile
                75                  80                  85
gca tgc agg cct tgt gga gtc acg ttc aat atc gtg ggc gaa gaa cac    463
Ala Cys Arg Pro Cys Gly Val Thr Phe Asn Ile Val Gly Glu Glu His
            90                  95                  100
ctc gag aac act cca gca atc gtt gtc tgc aac cac cag agc tcc atg    511
Leu Glu Asn Thr Pro Ala Ile Val Val Cys Asn His Gln Ser Ser Met
        105                 110                 115
gat atg atg gtc ttg gga cga gtg ttc cca atg cgc tgc gtg gtt atg    559
Asp Met Met Val Leu Gly Arg Val Phe Pro Met Arg Cys Val Val Met
    120                 125                 130
gcc aag aag gaa ctt cag tac ttt cca ttt ctc ggc atc ttt atg acg    607
Ala Lys Lys Glu Leu Gln Tyr Phe Pro Phe Leu Gly Ile Phe Met Thr
135                 140                 145                 150
ctg agc aat gcc att ttt att gac cgc aag aat cat aag aag gcc att    655
Leu Ser Asn Ala Ile Phe Ile Asp Arg Lys Asn His Lys Lys Ala Ile
                155                 160                 165
gag tct aca acc cag gcc gtt gct gac atg aag aag cac aac tct ggg    703
Glu Ser Thr Thr Gln Ala Val Ala Asp Met Lys Lys His Asn Ser Gly
            170                 175                 180
atc tgg atc ttc ccc gag gga act cgc tcc cgg ctt gac acg gcc gac    751
Ile Trp Ile Phe Pro Glu Gly Thr Arg Ser Arg Leu Asp Thr Ala Asp
        185                 190                 195
ctg ctg cca ttc aag aag gga gcc ttt cat ctt gca atc cag tca gga    799
Leu Leu Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His Leu Ala Ile Gln Ser Gly
    200                 205                 210
ctt ccc atc cta ccc att gtc agc gct gga tac aac cat atc tac gat    847
Leu Pro Ile Leu Pro Ile Val Ser Ala Gly Tyr Asn His Ile Tyr Asp
215                 220                 225                 230
tct gcc aag cga tct ttc cct ggc ggt gag ctc gag atc agg gtt ttg    895
Ser Ala Lys Arg Ser Phe Pro Gly Gly Glu Leu Glu Ile Arg Val Leu
                235                 240                 245
gag ccc ata cct acc aca ggc atg acg gcc gat gat gtg aac gat ctg    943
Glu Pro Ile Pro Thr Thr Gly Met Thr Ala Asp Asp Val Asn Asp Leu
            250                 255                 260
atg gag cgg aca cgg gca gtg atg ttg aag aac cta aag gag atg gat    991
Met Glu Arg Thr Arg Ala Val Met Leu Lys Asn Leu Lys Glu Met Asp
        265                 270                 275
gtc aac tcc ttg gca gta tct tca aaa ccc tcg ctc tca gtg gac gag    1039
Val Asn Ser Leu Ala Val Ser Ser Lys Pro Ser Leu Ser Val Asp Glu
    280                 285                 290
ctc aag tca gcg ccc gca ctg aag cag gag gcg aag tcg act gcg gtg    1087
Leu Lys Ser Ala Pro Ala Leu Lys Gln Glu Ala Lys Ser Thr Ala Val
295                 300                 305                 310
gtg gag gaa gag ggg gtt agc tac gac agc gtg aag aag agg aag acg    1135
Val Glu Glu Glu Gly Val Ser Tyr Asp Ser Val Lys Lys Arg Lys Thr
                315                 320                 325
gtc aag gct tag atcgtgggta atggtgatat atgtatttag ttcacgcact    1187
Val Lys Ala
attaaaatcc tgatgtcctt                                          1207
 
<210>2
<211>329
<212>PRT
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>2
 
Met Ser Ser Met Ser Ser Ile Glu Pro Ala Leu Ser Ser Phe Pro Gly
1               5                   10                  15
Asn Leu Ala Val Ile Leu Val Phe Tyr Leu Ala Leu Pro Arg Leu Leu
            20                  25                  30
Ala Val Leu Pro Gln Lys Ile Gln Phe Ile Ala Lys Cys Leu Ile Val
        35                  40                  45
Leu Thr Ala Thr Phe Leu Met Ser Val Ala Gly Cys Phe Val Ala Ile
    50                  55                  60
Val Cys Ala Leu Leu Gln Lys Arg Tyr Ala Ile Asn Tyr Val Val Ala
65                  70                  75                  80
Arg Ile Phe Ser Tyr Ile Ala Cys Arg Pro Cys Gly Val Thr Phe Asn
                85                  90                  95
Ile Val Gly Glu Glu His Leu Glu Asn Thr Pro Ala Ile Val Val Cys
            100                 105                 110
Asn His Gln Ser Ser Met Asp Met Met Val Leu Gly Arg Val Phe Pro
        115                 120                 125
Met Arg Cys Val Val Met Ala Lys Lys Glu Leu Gln Tyr Phe Pro Phe
    130                 135                 140
Leu Gly Ile Phe Met Thr Leu Ser Asn Ala Ile Phe Ile Asp Arg Lys
145                 150                 155                 160
Asn His Lys Lys Ala Ile Glu Ser Thr Thr Gln Ala Val Ala Asp Met
                165                 170                 175
Lys Lys His Asn Ser Gly Ile Trp Ile Phe Pro Glu Gly Thr Arg Ser
            180                 185                 190
Arg Leu Asp Thr Ala Asp Leu Leu Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His
        195                 200                 205
Leu Ala Ile Gln Ser Gly Leu Pro Ile Leu Pro Ile Val Ser Ala Gly
    210                 215                 220
Tyr Asn His Ile Tyr Asp Ser Ala Lys Arg Ser Phe Pro Gly Gly Glu
225                 230                 235                 240
Leu Glu Ile Arg Val Leu Glu Pro Ile Pro Thr Thr Gly Met Thr Ala
                245                 250                 255
Asp Asp Val Asn Asp Leu Met Glu Arg Thr Arg Ala Val Met Leu Lys
            260                 265                 270
Asn Leu Lys Glu Met Asp Val Asn Ser Leu Ala Val Ser Ser Lys Pro
        275                 280                 285
Ser Leu Ser Val Asp Glu Leu Lys Ser Ala Pro Ala Leu Lys Gln Glu
    290                 295                 300
Ala Lys Ser Thr Ala Val Val Glu Glu Glu Gly Val Ser Tyr Asp Ser
305                 310                 315                 320
Val Lys Lys Arg Lys Thr Val Lys Ala
                325
 
<210>3
<211>1148
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(1140)..(1140)
<223>n means any bases
 
<220>
<221>CDS
<222>(55)..(996)
<223>
<400>3
ctcttccatt caacgatcgt tttcttccct agcacacgtt tctgttcgtc cgac atg    57
                                                            Met
                                                            1
tcc ata ggc tct tct aat cct gtc cta ctg gca gcg atc ccc ttc gtc    105
Ser Ile Gly Ser Ser Asn Pro Val Leu Leu Ala Ala Ile Pro Phe Val
            5                   10                  15
tac ctt ttt gtc ctc cct cgc atc ctc gcc ttc ctc cct caa aag gcc    153
Tyr Leu Phe Val Leu Pro Arg Ile Leu Ala Phe Leu Pro Gln Lys Ala
        20                  25                  30
cag ttc ctc gca aaa tgt atc gtg gtc ttg atc gcc acc ctc atc atg    201
Gln Phe Leu Ala Lys Cys Ile Val Val Leu Ile Ala Thr Leu Ile Met
    35                  40                  45
tcc gtc gca ggc tgc ctc atc tct att gtc tgt gcg ctc ctc gac aaa    249
Ser Val Ala Gly Cys Leu Ile Ser Ile Val Cys Ala Leu Leu Asp Lys
50                  55                  60                  65
cgc tat gtg atc aac tac gtt gtc tca aga ctc ttc tca ttc ctt gca    297
Arg Tyr Val Ile Asn Tyr Val Val Ser Arg Leu Phe Ser Phe Leu Ala
                70                  75                  80
gca aga ccc tgc ggc gtc act tac aag att gtg ggc gag gag cat ttg    345
Ala Arg Pro Cys Gly Val Thr Tyr Lys Ile Val Gly Glu Glu His Leu
            85                  90                  95
gat aag tac ccc gcc att gtc gtt tgc aac cac cag agc tca atg gac    393
Asp Lys Tyr Pro Ala Ile Val Val Cys Asn His Gln Ser Ser Met Asp
        100                 105                 110
atg atg gtt ctg gga cgc gtc ttc cct aag cac tgt gtc gtc atg gca    441
Met Met Val Leu Gly Arg Val Phe Pro Lys His Cys Val Val Met Ala
    115                 120                 125
aag aag gag ctt ctt tac ttt ccg ttc ctg ggc atg ttc atg aaa ctg    489
Lys Lys Glu Leu Leu Tyr Phe Pro Phe Leu Gly Met Phe Met Lys Leu
130                 135                 140                 145
agc aat gcc att ttc atc gac cgc aag aac cat aag aag gcg atc gag    537
Ser Asn Ala Ile Phe Ile Asp Arg Lys Asn His Lys Lys Ala Ile Glu
                150                 155                 160
tct acc acc caa gct gtc gcc gac atg aag aag cac aac tct gga atc    585
Ser Thr Thr Gln Ala Val Ala Asp Met Lys Lys His Asn Ser Gly Ile
            165                 170                 175
tgg att ttc ccc gaa gga aca cgt tcc cgc ttg gac aag gcc gat ctc    633
Trp Ile Phe Pro Glu Gly Thr Arg Ser Arg Leu Asp Lys Ala Asp Leu
        180                 185                 190
ttg ccc ttc aag aag gga gcc ttc cac ctc gcc att caa gct caa ctt    681
Leu Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His Leu Ala Ile Gln Ala Gln Leu
    195                 200                 205
ccc atc ctc ccc atc gtc tcg caa gga tac tca cac atc tat gat tca    729
Pro Ile Leu Pro Ile Val Ser Gln Gly Tyr Ser His Ile Tyr Asp Ser
210                 215                 220                 225
tca aaa cgc tac ttc ccc ggt gga gag ctc gag atc aga gtc ctg gaa    777
Ser Lys Arg Tyr Phe Pro Gly Gly Glu Leu Glu Ile Arg Val Leu Glu
                230                 235                 240
ccc atc cct acc aag gga ttg acc aca gac gat gtc aac gac ctg atg    825
Pro Ile Pro Thr Lys Gly Leu Thr Thr Asp Asp Val Asn Asp Leu Met
            245                 250                 255
gac aag aca cgc aac ttg atg ctc aag cac ctc aag gac atg gat tct    873
Asp Lys Thr Arg Asn Leu Met Leu Lys His Leu Lys Asp Met Asp Ser
        260                 265                 270
cat tgc tcc tcc gcc gtc gga aac gga tct ctg cct ctc gac gcc gac    921
His Cys Ser Ser Ala Val Gly Asn Gly Ser Leu Pro Leu Asp Ala Asp
    275                 280                 285
att gca aag tca acg gct aca tcg atc gga aac aca gac gat gct gtc    969
Ile Ala Lys Ser Thr Ala Thr Ser Ile Gly Asn Thr Asp Asp Ala Val
290                 295                 300                 305
aca aag agg agg aca ctg aaa gag taa aacagcaaca accacaaaca          1016
Thr Lys Arg Arg Thr Leu Lys Glu
                310
caaccataac cacaaccaca accaccctgc aggatactcc gatccagcat atcgcatcca  1076
aatgcctgta atgtactttt ttttctttaa aaacatgatt aaatcgatag agctgtaccc  1136
attngacaag aa                                                       1148
 
<210>4
<211>313
<212>PRT
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>4
 
Met Ser Ile Gly Ser Ser Asn Pro Val Leu Leu Ala Ala Ile Pro Phe
1               5                   10                  15
Val Tyr Leu Phe Val Leu Pro Arg Ile Leu Ala Phe Leu Pro Gln Lys
            20                  25                  30
Ala Gln Phe Leu Ala Lys Cys Ile Val Val Leu Ile Ala Thr Leu Ile
        35                  40                  45
Met Ser Val Ala Gly Cys Leu Ile Ser Ile Val Cys Ala Leu Leu Asp
    50                  55                  60
Lys Arg Tyr Val Ile Asn Tyr Val Val Ser Arg Leu Phe Ser Phe Leu
65                  70                  75                  80
Ala Ala Arg Pro Cys Gly Val Thr Tyr Lys Ile Val Gly Glu Glu His
                85                  90                  95
Leu Asp Lys Tyr Pro Ala Ile Val Val Cys Asn His Gln Ser Ser Met
            100                 105                 110
Asp Met Met Val Leu Gly Arg Val Phe Pro Lys His Cys Val Val Met
        115                 120                 125
Ala Lys Lys Glu Leu Leu Tyr Phe Pro Phe Leu Gly Met Phe Met Lys
    130                 135                 140
Leu Ser Asn Ala Ile Phe Ile Asp Arg Lys Asn His Lys Lys Ala Ile
145                 150                 155                 160
Glu Ser Thr Thr Gln Ala Val Ala Asp Met Lys Lys His Asn Ser Gly
                165                 170                 175
Ile Trp Ile Phe Pro Glu Gly Thr Arg Ser Arg Leu Asp Lys Ala Asp
            180                 185                 190
Leu Leu Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His Leu Ala Ile Gln Ala Gln
        195                 200                 205
Leu Pro Ile Leu Pro Ile Val Ser Gln Gly Tyr Ser His Ile Tyr Asp
    210                 215                 220
Ser Ser Lys Arg Tyr Phe Pro Gly Gly Glu Leu Glu Ile Arg Val Leu
225                 230                 235                 240
Glu Pro Ile Pro Thr Lys Gly Leu Thr Thr Asp Asp Val Asn Asp Leu
                245                 250                 255
Met Asp Lys Thr Arg Asn Leu Met Leu Lys His Leu Lys Asp Met Asp
            260                 265                 270
Ser His Cys Ser Ser Ala Val Gly Asn Gly Ser Leu Pro Leu Asp Ala
        275                 280                 285
Asp Ile Ala Lys Ser Thr Ala Thr Ser Ile Gly Asn Thr Asp Asp Ala
    290                 295                 300
Val Thr Lys Arg Arg Thr Leu Lys Glu
305                 310
 
<210>5
<211>843
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<220>
<221>misc_feature
<222>(793)..(793)
<223>n means any bases
 
<400>5
gcgccattga ggagaacctg ggacgtgtca aggaaaagga tccactctgg ctggtagtct  60
tccctgaagg aacagtcgtc tccaaggaaa cgcgtttgcg atctgttgcc ttttcaaaga  120
aggctggtct ttcggatcac cgccatgtgt tgcttccaag aaccagcggc ctctttgttt  180
gcatcaacaa gttgcgtgga tccgtcgaat acttatacga cgcgacagtt ggctactcga  240
acgttgaata tggagagatt ccacaggagc tttacccttt gccagggcta tatatcaaca  300
aggcgcagcc caaggagatc aacatgcacc tgcggcggtt tgctatcaag gatatcccca  360
cgtcagaacc cgagtttgtg gagtgggtcc gagcgcggtg ggtagagaag gatgagctga    420
tggaggagtt ttataccaag ggccgattcc catcgcagct gacggctgag gacattggcg    480
agaaggagac caacaaggca ggaggctcat ctgaaggaca gagtgtcaga atcccgctca    540
aatcgcgagg catgatggac tacctcatgc cttcggccat taacctggtt gcgctgccag    600
tactggcttt tgcgatgaga tatgctctgc agcaagtatc gtctggttga tttatttttt    660
gttagacgct gccgtagttg taaatttgat gagtgctatt tagagcaaac gaaagaagag    720
acttaaacgc atggatgtgt gtaatttcat aacagaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa    780
aacctgcagc ccngggggat ccactagttc tagagcgccg ccaccgcggt ggagctcagc    840
gtt                                                                  843
 
<210>6
<211>624
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>6
tctaaaaaaa atatgctgca tgtttttctt gtcagtggtg gtcgctcacc acttctctga    60
ccagacacct ccttcaatac ccgtctgtcc agttctcctt catttgctct aagaaggcgt    120
ccttctccac gtacttctga accacccact cgctcagctt ctcttcatct acgggcagat    180
cgtcgagctg atagcgtctc acatgcacat gaaacttgta ctcggggctg agctgaccag    240
tgtgaacacg caccagatct gggggcactc caaaaccctt ggtcttgtgg taataggcaa    300
acgtgaagtc gtaaacacac ttcacatgag ttcctcggaa tttgttgacg caggcaatga    360
atcccttggt cctgggcatc atgacattcg agagcagagg caggccgcgt cccagcatga    420
acttttgaga ggcagccagc ttgctaggcg tcagacgaga accctccagg aaactggcga    480
cccagaccgg tgcttggata tccaatatcc gcgcaaacat cttgttgatc ttgagctgat    540
cctgctgcca gttgcggttg atgaacagca ttcccatgat ccacatgccc catccgtaga    600
atggaatgta tttcacagaa tcct                                           624
 
<210>7
<211>690
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>7
ctcttccatt caacgatcgt tttcttccct agcacacgtt tctgttcgtc cgacatgtcc    60
ataggctctt ctaatcctgt cctactggca gcgatcccct tcgtctacct ttttgtcctc    120
cctcgcatcc tcgccttcct ccctcaaaag gcccagttcc tcgcaaaatg tatcgtggtc    180
ttgatcgcca ccctcatcat gtccgtcgca ggctgcctca tctctattgt ctgtgcgctc    240
ctcgacaaac gctatgtgat caactacgtt gtctcaagac tcttctcatt ccttgcagca    300
agaccctgcg gcgtcactta caagattgtg ggcgaggagc atttggataa gtaccccgcc    360
attgtcgttt gcaaccacca gagctcaatg gacatgatgg ttctgggacg cgtcttccct    420
aagcactgtg tcgtcatggc aaagaaggag cttctttact ttccgttcct gggcatgttc    480
atgaaactga gcaatgccat tttcatcgac cgcaagaacc ataagaaggc gatcgagtct    540
accacccaag ctgtcgccga catgaagaag cacaactctg gaatctggat tttccccgaa    600
ggaacacgtt cccgcttgga caaggccgat ctcttgccct tcaagaaggg agccttccaa    660
ctcgccattc aagctcaact tcccatcctc                                     690
 
<210>8
<211>990
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>8
atgtcatcaa tgtcatcaat agagcccgca ctgtcctcgt ttccaggcaa cctggcggtc    60
atccttgttt tctacctggc acttccacga cttcttgccg tcctgccaca aaagattcag    120
ttcatcgcca aatgtctcat tgtccttaca gccaccttcc tcatgtctgt ggcaggatgc    180
tttgtcgcca ttgtctgtgc tctcctccaa aagcgctatg ccataaatta cgtggttgcg    240
aggatctttt cttatatcgc atgcaggcct tgtggagtca cgttcaatat cgtgggcgaa    300
gaacacctcg agaacactcc agcaatcgtt gtctgcaacc accagagctc catggatatg    360
atggtcttgg gacgagtgtt cccaatgcgc tgcgtggtta tggccaagaa ggaacttcag    420
tactttccat ttctcggcat ctttatgacg ctgagcaatg ccatttttat tgaccgcaag    480
aatcataaga aggccattga gtctacaacc caggccgttg ctgacatgaa gaagcacaac    540
tctgggatct ggatcttccc cgagggaact cgctcccggc ttgacacggc cgacctgctg    600
ccattcaaga agggagcctt tcatcttgca atccagtcag gacttcccat cctacccatt    660
gtcagcgctg gatacaacca tatctacgat tctgccaagc gatctttccc tggcggtgag    720
ctcgagatca gggttttgga gcccatacct accacaggca tgacggccga tgatgtgaac    780
gatctgatgg agcggacacg ggcagtgatg ttgaagaacc taaaggagat ggatgtcaac    840
tccttggcag tatcttcaaa accctcgctc tcagtggacg agctcaagtc agcgcccgca    900
ctgaagcagg aggcgaagtc gactgcggtg gtggaggaag agggggttag ctacgacagc  960
gtgaagaaga ggaagacggt caaggcttag                                   990
 
<210>9
<211>26
<212>DNA
<213>引物(primer)
<400>9
ggatgtcatc aatgtcatca atagag    26
 
<210>10
<211>23
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>10
ctaaccccct cttcctccac cac       23
 
<210>11
<211>20
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>11
ggacgtgtca aggaaaagga           20
<210>12
<211>20
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>12
tccttcagat gagcctcctg              20
 
<210>13
<211>22
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>13
ggcgtccttc tccacgtact tc           22
 
<210>14
<211>22
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>14
gtgaaataca ttccattcta cg           22
<210>15
<211>20
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>15
cctcgcaaaa tgtatcgtgg              20
 
<210>16
<211>22
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>16
gatgggaagt tgagcttgaa tg           22
 
<210>17
<211>1369
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<220>
<221>CDS
<222>(36)..(1289)
<223>
 
<400>17
tctcgagctc tagcaactct tctagcgcaa cgctc atg gat gaa tcc acc acc    53
                                       Met Asp Glu Ser Thr Thr
                                       1               5
acc acc cac cac aca gag acc agc agc aag acg tcc tcg cac ccc cgt    101
Thr Thr His His Thr Glu Thr Ser Ser Lys Thr Ser Ser His Pro Arg
            10                  15                  20
cgg ctc ggt ccc aag atg aac ccc atc tac aag ggt ctg cga gcc ttt    149
Arg Leu Gly Pro Lys Met Asn Pro Ile Tyr Lys Gly Leu Arg Ala Phe
        25                  30                  35
gtc tgg gcc ttg tac ttc aac cta gga gca tct ctc ata tcg ata acc    197
Val Trp Ala Leu Tyr Phe Asn Leu Gly Ala Ser Leu Ile Ser Ile Thr
    40                  45                  50
caa gtc ctg tcg ttg cct ctg gcg ttg atc gct cca aaa gtt tac cag    245
Gln Val Leu Ser Leu Pro Leu Ala Leu Ile Ala Pro Lys Val Tyr Gln
55                  60                  65                  70
tgg cac atc act aaa acc cag ggt cac ttt ggg gct ttc ctg ctc aag    293
Trp His Ile Thr Lys Thr Gln Gly His Phe Gly Ala Phe Leu Leu Lys
                75                  80                  85
atg aac cag cta ttt gcg ccc tca gat atc gtc ttg acg gga gat gaa    341
Met Asn Gln Leu Phe Ala Pro Ser Asp Ile Val Leu Thr Gly Asp Glu
            90                  95                  100
agt gtc agg gga atc gtc aag gtg tac caa gga cga agg ctg aag gac    389
Ser Val Arg Gly Ile Val Lys Val Tyr Gln Gly Arg Arg Leu Lys Asp
        105                 110                 115
act ggt gag gcg tac agc ggt cat gga gag gac att att ctg gat atg    437
Thr Gly Glu Ala Tyr Ser Gly His Gly Glu Asp Ile Ile Leu Asp Met
    120                 125                 130
ccc gag agg atg gtt ttc atc gcg aac cac cag atc tat tct gac tgg    485
Pro Glu Arg Met Val Phe Ile Ala Asn His Gln Ile Tyr Ser Asp Trp
135                 140                 145                 150
atg tac ctc tgg tgc ttc tcc tat ttc gca gag agg cac agg gca ctg    533
Met Tyr Leu Trp Cys Phe Ser Tyr Phe Ala Glu Arg His Arg Ala Leu
                155                 160                 165
aag att att ctt cgg ggc gac ctg acc tgg atc cct gtc ttt ggc tgg    581
Lys Ile Ile Leu Arg Gly Asp Leu Thr Trp Ile Pro Val Phe Gly Trp
            170                 175                 180
ggt atg cgg ttc ttt gac ttt atc ttt ttg aaa cgt aat gac tgg gca    629
Gly Met Arg Phe Phe Asp Phe Ile Phe Leu Lys Arg Asn Asp Trp Ala
        185                 190                 195
cat gac aga cgc gcc att gag gag aac ctg gga cgt gtc aag gaa aag    677
His Asp Arg Arg Ala Ile Glu Glu Asn Leu Gly Arg Val Lys Glu Lys
    200                 205                 210
gat cca ctc tgg ctg gta gtc ttc cct gaa gga aca gtc gtc tcc aag    725
Asp Pro Leu Trp Leu Val Val Phe Pro Glu Gly Thr Val Val Ser Lys
215                 220                 225                 230
gaa acg cgt ttg cga tct gtt gcc ttt tca aag aag gct ggt ctt tcg    773
Glu Thr Arg Leu Arg Ser Val Ala Phe Ser Lys Lys Ala Gly Leu Ser
                235                 240                 245
gat cac cgc cat gtg ttg ctt cca aga acc agc ggc ctc ttt gtt tgc    821
Asp His Arg His Val Leu Leu Pro Arg Thr Ser Gly Leu Phe Val Cys
            250                 255                 260
atc aac aag ttg cgt gga tcc gtc gaa tac tta tac gac gcg aca gtt    869
Ile Asn Lys Leu Arg Gly Ser Val Glu Tyr Leu Tyr Asp Ala Thr Val
        265                 270                 275
ggc tac tcg aac gtt gaa tat gga gag att cca cag gag ctt tac cct    917
Gly Tyr Ser Asn Val Glu Tyr Gly Glu Ile Pro Gln Glu Leu Tyr Pro
    280                 285                 290
ttg cca ggg cta tat atc aac aag gcg cag ccc aag gag atc aac atg    965
Leu Pro Gly Leu Tyr Ile Asn Lys Ala Gln Pro Lys Glu Ile Asn Met
295                 300                 305                 310
cac ctg cgg cgg ttt gct atc aag gat atc ccc acg tca gaa ccc gag    1013
His Leu Arg Arg Phe Ala Ile Lys Asp Ile Pro Thr Ser Glu Pro Glu
                315                 320                 325
ttt gtg gag tgg gtc cga gcg cgg tgg gta gag aag gat gag ctg atg    1061
Phe Val Glu Trp Val Arg Ala Arg Trp Val Glu Lys Asp Glu Leu Met
            330                 335                 340
gag gag ttt tat acc aag ggc cga ttc cca tcg cag ctg acg gct gag    1109
Glu Glu Phe Tyr Thr Lys Gly Arg Phe Pro Ser Gln Leu Thr Ala Glu
        345                 350                 355
gac att ggc gag aag gag acc aac aag gca gga ggc tca tct gaa gga    1157
Asp Ile Gly Glu Lys Glu Thr Asn Lys Ala Gly Gly Ser Ser Glu Gly
    360                 365                 370
cag agt gtc aga atc ccg ctc aaa tcg cga ggc atg atg gac tac ctc    1205
Gln Ser Val Arg Ile Pro Leu Lys Ser Arg Gly Met Met Asp Tyr Leu
375                 380                 385                 390
atg cct tcg gcc att aac ctg gtt gcg ctg cca gta ctg gct ttt gcg    1253
Met Pro Ser Ala Ile Asn Leu Val Ala Leu Pro Val Leu Ala Phe Ala
                395                 400                 405
atg aga tat gct ctg cag caa gta tcg tct ggt tga tttatttttt         1299
Met Arg Tyr Ala Leu Gln Gln Val Ser Ser Gly
            410                 415
gttagacgct gccgtagttg taaatttgat gagtgctatt tagagcaaac gaaagaagag  1359
acttaaacgc                                                         1369
 
<210>18
<211>417
<212>PRT
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>18
 
Met Asp Glu Ser Thr Thr Thr Thr His His Thr Glu Thr Ser Ser Lys
1               5                   10                  15
Thr Ser Ser His Pro Arg Arg Leu Gly Pro Lys Met Asn Pro Ile Tyr
            20                  25                  30
Lys Gly Leu Arg Ala Phe Val Trp Ala Leu Tyr Phe Ash Leu Gly Ala
        35                  40                  45
Ser Leu Ile Ser Ile Thr Gln Val Leu Ser Leu Pro Leu Ala Leu Ile
    50                  55                  60
Ala Pro Lys Val Tyr Gln Trp His Ile Thr Lys Thr Gln Gly His Phe
65                  70                  75                  80
Gly Ala Phe Leu Leu Lys Met Asn Gln Leu Phe Ala Pro Ser Asp Ile
                85                  90                  95
Val Leu Thr Gly Asp Glu Ser Val Arg Gly Ile Val Lys Val Tyr Gln
            100                 105                 110
Gly Arg Arg Leu Lys Asp Thr Gly Glu Ala Tyr Ser Gly His Gly Glu
        115                 120                 125
Asp Ile Ile Leu Asp Met Pro Glu Arg Met Val Phe Ile Ala Asn His
    130                 135                 140
Gln Ile Tyr Ser Asp Trp Met Tyr Leu Trp Cys Phe Ser Tyr Phe Ala
145                 150                 155                 160
Glu Arg His Arg Ala Leu Lys Ile Ile Leu Arg Gly Asp Leu Thr Trp
                165                 170                 175
Ile Pro Val Phe Gly Trp Gly Met Arg Phe Phe Asp Phe Ile Phe Leu
            180                 185                 190
Lys Arg Asn Asp Trp Ala His Asp Arg Arg Ala Ile Glu Glu Asn Leu
       195                 200                 205
Gly Arg Val Lys Glu Lys Asp Pro Leu Trp Leu Val Val Phe Pro Glu
    210                 215                 220
Gly Thr Val Val Ser Lys Glu Thr Arg Leu Arg Ser Val Ala Phe Ser
225                 230                 235                 240
Lys Lys Ala Gly Leu Ser Asp His Arg His Val Leu Leu Pro Arg Thr
                245                 250                 255
Ser Gly Leu Phe Val Cys Ile Asn Lys Leu Arg Gly Ser Val Glu Tyr
            260                 265                 270
Leu Tyr Asp Ala Thr Val Gly Tyr Ser Asn Val Glu Tyr Gly Glu Ile
        275                 280                 285
Pro Gln Glu Leu Tyr Pro Leu Pro Gly Leu Tyr Ile Asn Lys Ala Gln
    290                 295                 300
Pro Lys Glu Ile Asn Met His Leu Arg Arg Phe Ala Ile Lys Asp Ile
305                 310                 315                 320
Pro Thr Ser Glu Pro Glu Phe Val Glu Trp Val Arg Ala Arg Trp Val
                325                 330                 335
Glu Lys Asp Glu Leu Met Glu Glu Phe Tyr Thr Lys Gly Arg Phe Pro
            340                 345                 350
Ser Gln Leu Thr Ala Glu Asp Ile Gly Glu Lys Glu Thr Asn Lys Ala
        355                 360                 365
Gly Gly Ser Ser Glu Gly Gln Ser Val Arg Ile Pro Leu Lys Ser Arg
    370                 375                 380
Gly Met Met Asp Tyr Leu Met Pro Ser Ala Ile Asn Leu Val Ala Leu
385                 390                 395                 400
Pro Val Leu Ala Phe Ala Met Arg Tyr Ala Leu Gln Gln Val Ser Ser
                405                 410                 415
Gly
 
<210>19
<211>1050
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
<220>
<221>CDS
<222>(26)..(949)
<223>
 
<400>19
ggttcaacac actccgcttc ccggc atg ctc gag tcc gtc acc cga ccc aca    52
                            Met Leu Glu Ser Val Thr Arg Pro Thr
                            1               5
aag gcc ctg ctc tat gga tca gcc ctc ttc agt ttc tgc tcg ttg ctc    100
Lys Ala Leu Leu Tyr Gly Ser Ala Leu Phe Ser Phe Cys Ser Leu Leu
10                  15                  20                  25
aat gtg gtc cag gtg ttc tcg ctg ctc ctg cag ccg ttc tcg aag cgt    148
Asn Val Val Gln Val Phe Ser Leu Leu Leu Gln Pro Phe Ser Lys Arg
                30                  35                  40
ctc ttc ttt gaa gtg aac gcc cgc gtg gct ggc tcc atg tgg aaa gtc    196
Leu Phe Phe Glu Val Asn Ala Arg Val Ala Gly Ser Met Trp Lys Val
            45                  50                  55
atg cag ttg atc atg gag aaa aaa cac aag gct gcc atc acc ttc tca    244
Met Gln Leu Ile Met Glu Lys Lys His Lys Ala Ala Ile Thr Phe Ser
        60                  65                  70
gga gac aag atc cca cac cac gag agt gct atc gtc ttt ggc aac cac    292
Gly Asp Lys Ile Pro His His Glu Ser Ala Ile Val Phe Gly Asn His
    75                  80                  85
cga tcc ttt gtt gac ttt tac atg ttt cac acc gtt gct gct cgg agg    340
Arg Ser Phe Val Asp Phe Tyr Met Phe His Thr Val Ala Ala Arg Arg
90                  95                  100                 105
ggc atg ctc aat tac atg aag tac ttt gcc aag gat tct ttg aaa tac    388
Gly Met Leu Asn Tyr Met Lys Tyr Phe Ala Lys Asp Ser Leu Lys Tyr
                110                 115                 120
att cca ttc tac gga tgg ggc atg tgg atc atg gga atg ctg ttc atc    436
Ile Pro Phe Tyr Gly Trp Gly Met Trp Ile Met Gly Met Leu Phe Ile
            125                 130                 135
aac cgc aac tgg cag cag gat cag ctc aag atc aac aag atg ttt gcg    484
Asn Arg Asn Trp Gln Gln Asp Gln Leu Lys Ile Asn Lys Met Phe Ala
        140                 145                 150
cgg ata ttg gat atc caa gca ccg gtc tgg gtc gcc agt ttc ctg gag    532
Arg Ile Leu Asp Ile Gln Ala Pro Val Trp Val Ala Ser Phe Leu Glu
    155                 160                 165
ggt tct cgt ctg acg cct agc aag ctg gct gcc tct caa aag ttc atg    580
Gly Ser Arg Leu Thr Pro Ser Lys Leu Ala Ala Ser Gln Lys Phe Met
170                 175                 180                 185
ctg gga cgc ggc ctg cct ctg ctc tcg aat gtc atg atg ccc agg acc    628
Leu Gly Arg Gly Leu Pro Leu Leu Ser Asn Val Met Met Pro Arg Thr
                190                 195                 200
aag gga ttc att gcc tgc gtc aac aaa ttc cga gga act cat gtg aag    676
Lys Gly Phe Ile Ala Cys Val Asn Lys Phe Arg Gly Thr His Val Lys
            205                 210                 215
tgt gtt tac gac ttc acg ttt gcc tat tac cac aag acc aag ggt ttt    724
Cys Val Tyr Asp Phe Thr Phe Ala Tyr Tyr His Lys Thr Lys Gly Phe
        220                 225                 230
gga gtg ccc cca gat ctg gtg cgt gtt cac act ggt cag ctc agc ccc    772
Gly Val Pro Pro Asp Leu Val Arg Val His Thr Gly Gln Leu Ser Pro
    235                 240                 245
gag tac aag ttt cat gtg cat gtg aga cgc tat cag ctc gac gat ctg    820
Glu Tyr Lys Phe His Val His Val Arg Arg Tyr Gln Leu Asp Asp Leu
250                 255                 260                 265
ccc gta gat gaa gag aag ctg agc gag tgg gtg gtt cag aag tac gtg    868
Pro Val Asp Glu Glu Lys Leu Ser Glu Trp Val Val Gln Lys Tyr Val
                270                 275                 280
gag aag gac gcc ttc tta gag caa atg aag gag aac tgg aca gac ggt    916
Glu Lys Asp Ala Phe Leu Glu Gln Met Lys Glu Asn Trp Thr Asp Gly
            285                 290                 295
att gaa gga ggt gtc tgg tca gag aag tgg tga gcgaccacca ctgacaagaa    969
Ile Glu Gly Gly Val Trp Ser Glu Lys Trp
        300                 305
aaacatgcag catatttttt ttagaggaat gaataagaat tgttatattt ataaaggcaa  1029
actatcgccg attacaaagt c                                            1050
 
<210>20
<211>307
<212>PRT
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>20
 
Met Leu Glu Ser Val Thr Arg Pro Thr Lys Ala Leu Leu Tyr Gly Ser
1               5                   10                  15
Ala Leu Phe Ser Phe Cys Ser Leu Leu Asn Mal Val Gln Val Phe Ser
            20                  25                  30
Leu Leu Leu Gln Pro Phe Ser Lys Arg Leu Phe Phe Glu Val Asn Ala
        35                  40                  45
Arg Val Ala Gly Ser Met Trp Lys Val Met Gln Leu Ile Met Glu Lys
    50                  55                  60
Lys His Lys Ala Ala Ile Thr Phe Ser Gly Asp Lys Ile Pro His His
65                  70                  75                  80
Glu Ser Ala Ile Val Phe Gly Asn His Arg Ser Phe Val Asp Phe Tyr
                85                  90                  95
Met Phe His Thr Val Ala Ala Arg Arg Gly Met Leu Asn Tyr Met Lys
            100                 105                 110
Tyr Phe Ala Lys Asp Ser Leu Lys Tyr Ile Pro Phe Tyr Gly Trp Gly
        115                 120                 125
Met Trp Ile Met Gly Met Leu Phe Ile Asn Arg Asn Trp Gln Gln Asp
    130                 135                 140
Gln Leu Lys Ile Asn Lys Met Phe Ala Arg Ile Leu Asp Ile Gln Ala
145                 150                 155                 160
Pro Val Trp Val Ala Ser Phe Leu Glu Gly Ser Arg Leu Thr Pro Ser
                165                 170                 175
Lys Leu Ala Ala Ser Gln Lys Phe Met Leu Gly Arg Gly Leu Pro Leu
            180                 185                 190
Leu Ser Asn Val Met Met Pro Arg Thr Lys Gly Phe Ile Ala Cys Val
        195                 200                 205
Asn Lys Phe Arg Gly Thr His Val Lys Cys Val Tyr Asp Phe Thr Phe
    210                 215                 220
Ala Tyr Tyr His Lys Thr Lys Gly Phe Gly Val Pro Pro Asp Leu Val
225                 230                 235                 240
Arg Val His Thr Gly Gln Leu Ser Pro Glu Tyr Lys Phe His Val His
                245                 250                 255
Val Arg Arg Tyr Gln Leu Asp Asp Leu Pro Val Asp Glu Glu Lys Leu
            260                 265                 270
Ser Glu Trp Val Val Gln Lys Tyr Val Glu Lys Asp Ala Phe Leu Glu
        275                 280                 285
Gln Met Lys Glu Asn Trp Thr Asp Gly Ile Glu Gly Gly Val Trp Ser
    290                 295                 300
Glu Lys Trp
305
 
<210>21
 
<211>24
 
<212>DNA
 
<213>引物(primer)
 
<400>21
 
catgtccata ggctcttcta atcc                                           24
 
<210>22
 
<211>23
 
<212>DNA
 
<213>引物(primer)
 
<400>22
 
gttttactct ttcagtgtcc tcc                                            23
 
<210>23
 
<211>942
 
<212>DNA
 
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>23
 
atgtccatag gctcttctaa tcctgtccta ctggcagcga tccccttcgt ctaccttttt    60
gtcctccctc gcatcctcgc cttcctccct caaaaggccc agttcctcgc aaaatgtatc    120
gtggtcttga tcgccaccct catcatgtcc gtcgcaggct gcctcatctc tattgtctgt    180
gcgctcctcg acaaacgcta tgtgatcaac tacgttgtct caagactctt ctcattcctt    240
gcagcaagac cctgcggcgt cacttacaag attgtgggcg aggagcattt ggataagtac    300
cccgccattg tcgtttgcaa ccaccagagc tcaatggaca tgatggttct gggacgcgtc    360
ttccctaagc actgtgtcgt catggcaaag aaggagcttc tttactttcc gttcctgggc    420
atgttcatga aactgagcaa tgccattttc atcgaccgca agaaccataa gaaggcgatc    480
gagtctacca cccaagctgt cgccgacatg aagaagcaca actctggaat ctggattttc    540
cccgaaggaa cacgttcccg cttggacaag gccgatctct tgcccttcaa gaagggagcc    600
ttccacctcg ccattcaagc tcaacttccc atcctcccca tcgtctcgca aggatactca    660
cacatctatg attcatcaaa acgctacttc cccggtggag agctcgagat cagagtcctg    720
gaacccatcc ctaccaaggg attgaccaca gacgatgtca acgacctgat ggacaagaca    780
cgcaacttga tgctcaagca cctcaaggac atggattctc attgctcctc cgccgtcgga    840
aacggatctc tgcctctcga cgccgacatt gcaaagtcaa cggctacatc gatcggaaac    900
acagacgatg ctgtcacaaa gaggaggaca ctgaaagagt aa    942
 
<210>24
<211>28
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>24
tctagaatgg cacctcccaa cactattg                    28
 
<210>25
<211>30
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>25
aagcttttac ttcttgaaaa agaccacgtc                  30
 
<210>26
<211>29
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>26
tctagaatgg ctgctgctcc cagtgtgag                   29
<210>27
<211>29
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>27
aagcttttac tgtgccttgc ccatcttgg    29
 
<210>28
<211>28
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>28
tctagaatgg agtcgattgc gcaattcc     28
 
<210>29
<211>30
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>29
gagctcttac tgcaacttcc ttgccttctc   30
 
<210>30
<211>30
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>30
tctagaatgg gtgcggacac aggaaaaacc                                     30
 
<210>31
<211>30
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>31
aagcttttac tcttccttgg gacgaagacc                                     30
 
<210>32
<211>1203
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
<400>32
atggcacctc ccaacactat tgatgccggt ttgacccagc gccatatcag cacctcggcc    60
gccccaacct ctgccaagcc cgccttcgag cgcaactacc agctccctga gttcaccatc    120
aaggagatcc gtgagtgcat ccctgcacac tgctttgagc gctccggtct ccgtggtctt    180
tgccacgttg ctattgatct gacctgggcc tcgctcttgt tcctggctgc gacccagatc    240
gacaagttcg agaacccttt gatccgctac ttggcctggc ctgcgtattg gatcatgcag    300
ggtattgttt gcaccggtat ctgggtattg gcacacgaat gtggtcatca gtccttctcg    360
acctccaaga cccttaacaa cactgtcggc tggatcttgc actcgatgct cttggtccct    420
taccactcct ggagaatctc gcactcgaag caccacaagg ccactggcca catgaccaag    480
gaccaggtct ttgttcccaa gacccgctct caggttggct tgccccccaa ggagaatgtt    540
gcagttgccg ttcaggagga ggatatgtcc gtgcacctgg atgaggaggc ccccattgtg    600
actttgttct ggatggtgat tcagttcctg ttcggatggc ctgcgtacct tattatgaac    660
gcctctggtc aagactatgg ccgctggacc tcgcacttcc acacctactc tcctatcttt    720
gagccccgca actttttcga cattatcatt tcggatctcg gtgtgttggc tgctcttggt    780
accttgatct acgcctccat gcagctctcg ctcttgaccg tgaccaagta ctacattgtc    840
ccctacttgt ttgtcaactt ctggttggtc ctgatcacct tcttgcagca caccgaccct    900
aagctgcccc attaccgtga gggtgcctgg aacttccagc gtggagccct ctgcaccgtt    960
gaccgctcgt tcggcaagtt cttggaccat atgttccacg gcattgtcca tacccatgta    1020
gcccatcact tgttctcgca gatgccgttc taccatgctg aggaagccac ccatcatctc    1080
aagaaactgc tgggagagta ctacgtctat gacccatcgc cgattgttgt tgcggtctgg    1140
aggtcgttcc gtgaatgccg attcgtggaa gaccatggag acgtggtctt tttcaagaag    1200
taa                                                                  1203
 
<210>33
<211>1374
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
<400>33
atggctgctg ctcccagtgt gaggacgttt actcgggccg agattttgaa tgccgaggcc    60
ctgaatgagg gcaagaagga tgccgaggca ccctttctga tgatcattga caacaaggtg    120
tacgatgtcc gcgagtttgt ccctgatcat cccggtggaa gtgtgattct cacgcacgtt    180
ggcaaggacg gcactgacgt ctttgacact ttccaccccg aggctgcttg ggagactctt    240
gccaactttt acgttggtga tattgatgag agcgatcgtg ccatcaagaa tgatgacttt    300
gcggccgagg ttcgcaagct gcgcaccttg ttccagtccc ttggctacta cgactcgtcc    360
aaggcatact atgccttcaa ggtctcgttc aacctctgca tctggggctt gtcgactttc    420
attgttgcca agtggggcca gacctcgacc ctcgccaacg tgctctcggc tgcgctcttg    480
ggtctcttct ggcagcagtg cggatggttg gcgcacgact ttttgcacca ccaggtcttc    540
caggaccgtt tctggggtga tcttttcggc gccttcttgg gaggtgtctg ccagggtttc    600
tcgtcctcct ggtggaagga caagcacaac actcaccacg ctgctcccaa cgtccacggc    660
gaggatcccg acattgacac tcaccctctg ttgacctgga gtgagcatgc tctggagatg    720
ttctcggatg ttcctgacga ggagctgacc cgtatgtggt cgcgcttcat ggtcctcaac    780
cagacctggt tctacttccc cattctctcg tttgcccgtc tgtcctggtg cctccagtcc    840
attatgcttg ttctgcccaa cggtcaggcc cacaagccct ctggagcgcg tgtgcccatt    900
tcgttggtcg agcagctgtc tctggctatg cactggacct ggtacctcgc caccatgttc    960
ctgttcatta aggatcccgt caacatgatt gtgtactttt tggtgtcgca ggctgtttgc    1020
ggcaacttgt tggcgattgt gttctcgctc aaccacaacg gcatgcctgt gatctccaag    1080
gaggaagcgg tcgatatgga cttcttcacc aagcagatca tcacgggtcg tgatgttcac    1140
cctggtctgt ttgccaactg gttcacgggt ggattgaact accagattga gcaccacttg    1200
ttcccttcga tgccccgcca caacttttca aagatccagc ctgctgtcga gactttgtgc    1260
aaaaagtacg gtgtccgata ccataccact ggtatgatcg agggaactgc agaggtcttt    1320
agccgtttga acgaggtctc caaggcggcc tccaagatgg gcaaggcaca gtaa          1374
<210>34
<211>957
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
<400>34
atggagtcga ttgcgcaatt cctcccctca aagatgccgc aagatctgtt tattgacctt  60
gcaagggcca tcggtgtcca ggccgcaccc tatgtcgacc ctctcgaggc agcgcttgtg  120
gcccaggccg agaagttctt ccccacggtc gttcatcaca cgcgcggctt tttggtcgcg  180
gtcgagtcac ccttggcccg tgagctgccc ttgatgaacc ccttccacgt gctgttgatc  240
gcgctcgctt acttggtcac ggtctttgtg ggcatgcaga tcatgaagaa ctttgaacgg  300
ttcgaggtca agacgttctc gctcttccac aacttttgtc tggtctcgat cagtgcctac  360
atgtgcggcg ggatcttgta cgaggcttac caggccaact atggactgtt tgagaacgcg  420
gccgatcata ccgtccaggg tcttcctatg gccaagatga tctggctctt ctacttctcc  480
aagatcatgg agtttgtcga caccatgatc atggtcctta agaagaacaa ccgccagatc  540
tcgttcttgc acgtctacca ccacagctcc atcttcacca tctggtggtt ggtcaccttt  600
gttgcaccca atggtgaagc ctacttctcg gctgcgttga actcgttcat ccacgtgatc  660
atgtacggct actacttcct gtccgccttg ggcttcaagc aggtgtcgtt catcaagttc  720
tacatcacgc gttcgcagat gacgcagttc tgcatgatgt cgatccagtc ctcctgggac    780
atgtatgcca tgaaggtgct tggccgcccc ggatacccct tcttcatcac cgccctgctt    840
tggttctaca tgtggaccat gctcggactc ttctacaact tctacagaaa gaacgccaag    900
ttggccaagc aggccaagat cgatgctgcc aaggagaagg caaggaagtt gcagtaa       957
 
<210>35
<211>1341
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
<400>35
atgggtgcgg acacaggaaa aaccttcacc tggcaagaac tcgcggcgca taacaccgag    60
gacagcctcc ttttggctat ccgtggcaat gtatacgatg tcacaaagtt cttgagccgt    120
catcctggtg gaacggatac tctcttgctc ggagctggcc gagatgtcac tccggttttt    180
gagatgtacc acgagtttgg agctgcagag gctatcatga agaagtacta tgttggcaca    240
ctggtctcaa atgagttgcc catcttccca gagccaacgg tgttccataa gaccatcaag    300
ggcagagttg aggcatactt taaggaccgg aacatggatt ccaagaacag accagagatc    360
tggggacgat atgctctcat ctttggatcc ttgatcgcct cttactacgc gcagctcttt    420
gtaccgttcg tggtcgaacg tacatggctc caggtggtgt ttgctatcat catgggattt    480
gcgtgcgcgc aagtcggatt gaaccctctt cacgatgcct cccacttttc agtgacccac    540
aaccccaccg tttggaagat tctcggagcc acgcacgact ttttcaacgg agcatcgtat    600
ctcgtgtgga tgtaccaaca tatgctcggc catcatccct ataccaacat tgctggagct    660
gatcccgatg tgtcgacctc tgagcccgat gttcgtcgta tcaagcccaa ccaaaagtgg    720
ttcgtcaacc acatcaacca gcacatgttt gttcctttcc tgtacggact gctggcgttc    780
aaggtgcgca tccaggacat caacatcttg tactttgtca agaccaatga cgccattcgt    840
gtcaacccca tctcgacttg gcacaccgtc atgttctggg gcggaaaggc cttctttgtc    900
tggtaccgct tgatcgttcc tatgcagtat ctgcccctga gcaaggtgtt gctcttgttt    960
accgtcgcag acatggtctc ttcttactgg ctggcgctga ccttccaggc gaaccacgtt    1020
gttgaggagg ttcagtggcc attgcctgat gagaatggaa tcatccaaaa ggattgggca    1080
gccatgcagg tcgagactac tcaggattac gcccacgatt cgcacctctg gaccagcatc    1140
acgggcagct tgaactacca agccgttcat catctgttcc cgaacgtttc ccagcatcac    1200
taccctgata tcctggctat catcaaggac acctgcagcg agtacaaggt gccatacctc    1260
gtcaaggata ccttttggca agcgtttgct tcacatttgg agcacttgcg tgtgcttggt    1320
cttcgtccca aggaagagta a                                            1341
 
<210>36
<211>987
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>36
atgtcatcaa tgtcatcaat agagcccgca ctgtcctcgt ttccaggcaa cctggcggtc  60
atccttgttt tctacctggc acttccacga cttcttgccg tcctgccaca aaagattcag  120
ttcatcgcca aatgtctcat tgtccttaca gccaccttcc tcatgtctgt ggcaggatgc  180
tttgtcgcca ttgtctgtgc tctcctccaa aagcgctatg ccataaatta cgtggttgcg  240
aggatctttt cttatatcgc atgcaggcct tgtggagtca cgttcaatat cgtgggcgaa  300
gaacacctcg agaacactcc agcaatcgtt gtctgcaacc accagagctc catggatatg  360
atggtcttgg gacgagtgtt cccaatgcgc tgcgtggtta tggccaagaa ggaacttcag  420
tactttccat ttctcggcat ctttatgacg ctgagcaatg ccatttttat tgaccgcaag  480
aatcataaga aggccattga gtctacaacc caggccgttg ctgacatgaa gaagcacaac  540
tctgggatct ggatcttccc cgagggaact cgctcccggc ttgacacggc cgacctgctg  600
ccattcaaga agggagcctt tcatcttgca atccagtcag gacttcccat cctacccatt  660
gtcagcgctg gatacaacca tatctacgat tctgccaagc gatctttccc tggcggtgag  720
ctcgagatca gggttttgga gcccatacct accacaggca tgacggccga tgatgtgaac  780
gatctgatgg agcggacacg ggcagtgatg ttgaagaacc taaaggagat ggatgtcaac  840
tccttggcag tatcttcaaa accctcgctc tcagtggacg agctcaagtc agcgcccgca  900
ctgaagcagg aggcgaagtc gactgcggtg gtggaggaag agggggttag ctacgacagc  960
gtgaagaaga ggaagacggt caaggc t                                     987
 
<210>37
<211>939
<212>DNA
<213>高山被孢霉(Mortierella alpina)
 
<400>37
atgtccatag gctcttctaa tcctgtccta ctggcagcga tccccttcgt ctaccttttt  60
gtcctccctc gcatcctcgc cttcctccct caaaaggccc agttcctcgc aaaatgtatc  120
gtggtcttga tcgccaccct catcatgtcc gtcgcaggct gcctcatctc tattgtctgt  180
gcgctcctcg acaaacgcta tgtgatcaac tacgttgtct caagactctt ctcattcctt  240
gcagcaagac cctgcggcgt cacttacaag attgtgggcg aggagcattt ggataagtac    300
cccgccattg tcgtttgcaa ccaccagagc tcaatggaca tgatggttct gggacgcgtc    360
ttccctaagc actgtgtcgt catggcaaag aaggagcttc tttactttcc gttcctgggc    420
atgttcatga aactgagcaa tgccattttc atcgaccgca agaaccataa gaaggcgatc    480
gagtctacca cccaagctgt cgccgacatg aagaagcaca actctggaat ctggattttc    540
cccgaaggaa cacgttcccg cttggacaag gccgatctct tgcccttcaa gaagggagcc    600
ttccacctcg ccattcaagc tcaacttccc atcctcccca tcgtctcgca aggatactca    660
cacatctatg attcatcaaa acgctacttc cccggtggag agctcgagat cagagtcctg    720
gaacccatcc ctaccaaggg attgaccaca gacgatgtca acgacctgat ggacaagaca    780
cgcaacttga tgctcaagca cctcaaggac atggattctc attgctcctc cgccgtcgga    840
aacggatctc tgcctctcga cgccgacatt gcaaagtcaa cggctacatc gatcggaaac    900
acagacgatg ctgtcacaaa gaggaggaca ctgaaagag                           939
 
<210>38
<211>29
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>38
tctgagatgg atgaatccac caccaccac        29
 
<210>39
<211>32
<212>DNA
<213>primer
 
<400>39
gtcgactcaa ccagacgata cttgctgcag ag    32
 
<210>40
<211>343
<212>PRT
<213>玉米黑粉菌(Ustilago maydis 521)
 
<400>40
 
Met Ala Val Leu Ser Lys Ser Phe Ser Thr Leu Thr Ala Gly Ala Leu
1               5                   10                  15
Leu Leu Leu Ala Leu Ile Ser Pro Arg Ser Gln Lys Leu Arg Phe Tyr
            20                  25                  30
Leu Asn Ser Ile Ile Tyr Ile Ala Gly Leu Gly Ile Cys Ser Val Trp
        35                  40                  45
Gly Ile Phe Val Ser Ile Leu Leu Ser Leu Val Pro Gly Gln Arg Leu
    50                  55                  60
Asn Ile Asn Lys Val Val Ala Arg Ser Phe Trp Arg Leu Thr Ser Pro
65                  70                  75                  80
Leu Val Gly Ile Arg Phe Ile Val Glu Gly Glu Glu His Phe Gln Ala
                85                  90                  95
Ala Arg Pro Ala Val Val Val Gly Asn His Gln Thr Ala Met Asp Ile
            100                 105                 110
Leu Tyr Leu Gly Arg Ile Phe Pro Gly Asn Ala Ser Ile Met Ala Lys
        115                 120                 125
Lys Glu Leu Gln Phe Ala Pro Leu Leu Gly Gln Phe Met Ser Leu Ser
    130                 135                 140
Gly Ala Val Phe Ile Asn Arg Lys Asn Leu Lys Asp Ser Ile Lys Ala
145                 150                 155                 160
Phe Gln Gln Val Gly Glu Thr Met Asn Asn Lys Lys Leu Ser Leu Trp
                165                 170                 175
Ile Phe Pro Glu Gly Thr Arg Ser Gly Leu Ala Thr Pro Asp Leu Leu
            180                 185                 190
Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His Leu Ala Ile Gln Ala Gly Val Pro
        195                 200                 205
Val Val Pro Val Val Cys Glu Asn Tyr Asn Arg Leu Phe Asp Ser Arg
    210                 215                 220
Ser Arg Phe Glu Ser Gly Thr Ile Arg Ile Lys Val Leu Ala Pro Ile
225                 230                 235                 240
Pro Thr Lys His Leu Thr Ala Ala Asp Ala Asn Glu Leu Thr Glu Lys
                245                 250                 255
Val Arg Gln Leu Met Leu Asp Glu Leu Arg Asn Met Asp Ala Glu Arg
            260                 265                 270
Gln Arg Thr Asp Thr Ala Ala Ser Val Asn Asn Asp Glu Ala Ser Met
        275                 280                 285
Ala Gly Val Ala Gly Phe Phe Ser Lys Phe Val Gly Thr Ala Asn Ser
    290                 295                 300
Trp Gln Ser Val Asn Ser Asn Val Asp Lys Gln Glu Lys Arg Leu Arg
305                 310                 315                 320
Gln Asn Gly Thr Thr Gly Glu Asn Pro Glu Asp Tyr His Leu Val Ser
                325                 330                 335
Glu Ala Gln Lys Lys Ser Asn
            340
 
<210>41
<211>291
<212>PRT
<213>构巢裸孢壳(Emericella nidulars)
 
<400>41
Met Ser Leu Leu Tyr Tyr Ile Ala Ser Gly Ala Ser Thr Tyr Ile Ala
1               5                   10                  15
Phe Thr Ala Ser Leu Phe Leu Val Gly Gln Lys Val Pro Arg Ala Ser
            20                  25                  30
Phe Val Ala Arg Cys Leu Ala Ser Tyr Gly Ser Leu Leu Val Cys Ala
        35                  40                  45
Met Tyr Gly Val Val Ala Ser Ile Val Leu Arg Val Val Gly Tyr Gly
    50                  55                  60
Arg Ile Ser Gln Trp Ala Thr Ala Arg Ser Phe Lys Trp Val Met Arg
65                  70                  75                  80
Phe Thr Thr Gly Val Arg Phe Asp Ile Val Glu Gly Lys Glu Tyr Leu
                85                  90                  95
Ser Thr Arg Pro Ala Val Ile Ile Gly Asn His Gln Ser Glu Leu Asp
            100                 105                 110
Val Leu Met Leu Gly Glu Ile Phe Pro Pro Tyr Cys Ser Val Thr Ala
        115                 120                 125
Lys Lys Ser Leu Arg Tyr Val Pro Phe Leu Gly Trp Phe Met Ala Leu
    130                 135                 140
Ser Arg Thr Val Phe Ile Asp Arg Ala Asn Arg Gln Thr Ala Val Lys
145                 150                 155                 160
Ala Phe Asp Ser Ala Ala Glu Glu Met Arg Ser His Arg Gln Ser Val
                165                 170                 175
Phe Ile Phe Ala Glu Gly Thr Arg Ser Tyr Ser Glu Lys Pro Glu Leu
            180                 185                 190
Leu Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His Leu Ala Val Lys Ala Gly Val
        195                 200                 205
Pro Ile Val Pro Val Val Val Glu Asn Tyr Ser His Ile Leu Ala Pro
    210                 215                 220
Lys Lys Phe Arg Phe Glu Ala Gly Ser Ile Lys Val Lys Val Leu Pro
225                 230                 235                 240
Pro Ile Ser Thr Asp Gly Leu Thr Ala Ala Asp Val Asp Gly Leu Thr
                245                 250                 255
Thr Ser Thr Arg Glu Ser Met Leu Asn Thr Leu Leu Glu Leu Ser Asn
            260                 265                 270
Ala Gly Pro Ala Asp Leu Pro Ser Ser Ser Lys Gly Gln Ser Thr Ala
        275                 280                 285
Val Asp Leu
    290
 
<210>42
<211>303
<212>PRT
<213>酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)
 
<400>42
 
Met Ser Val Ile Gly Arg Phe Leu Tyr Tyr Leu Arg Ser Val Leu Val
1               5                   10                  15
Val Leu Ala Leu Ala Gly Cys Gly Phe Tyr Gly Val Ile Ala Ser Ile
            20                  25                  30
Leu Cys Thr Leu Ile Gly Lys Gln His Leu Ala Gln Trp Ile Thr Ala
        35                  40                  45
Arg Cys Phe Tyr His Val Met Lys Leu Met Leu Gly Leu Asp Val Lys
    50                  55                  60
Val Val Gly Glu Glu Asn Leu Ala Lys Lys Pro Tyr Ile Met Ile Ala
65                  70                  75                  80
Asn His Gln Ser Thr Leu Asp Ile Phe Met Leu Gly Arg Ile Phe Pro
                85                  90                  95
Pro Gly Cys Thr Val Thr Ala Lys Lys Ser Leu Lys Tyr Val Pro Phe
            100                 105                 110
Leu Gly Trp Phe Met Ala Leu Ser Gly Thr Tyr Phe Leu Asp Arg Ser
        115                 120                 125
Lys Arg Gln Glu Ala Ile Asp Thr Leu Asn Lys Gly Leu Glu Asn Val
    130                 135                 140
Lys Lys Asn Lys Arg Ala Leu Trp Val Phe Pro Glu Gly Thr Arg Ser
145                 150                 155                 160
Tyr Thr Ser Glu Leu Thr Met Leu Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe His
                165                 170                 175
Leu Ala Gln Gln Gly Lys Ile Pro Ile Val Pro Val Val Val Ser Asn
            180                 185                 190
Thr Ser Thr Leu Val Ser Pro Lys Tyr Gly Val Phe Asn Arg Gly Cys
        195                 200                 205
Met Ile Val Arg Ile Leu Lys Pro Ile Ser Thr Glu Asn Leu Thr Lys
    210                 215                 220
Asp Lys Ile Gly Glu Phe Ala Glu Lys Val Arg Asp Gln Met Val Asp
225                 230                 235                 240
Thr Leu Lys Glu Ile Gly Tyr Ser Pro Ala Ile Asn Asp Thr Thr Leu
                245                 250                 255
Pro Pro Gln Ala Ile Glu Tyr Ala Ala Leu Gln His Asp Lys Lys Val
            260                 265                 270
Asn Lys Lys Ile Lys Ash Glu Pro Val Pro Ser Val Ser Ile Ser Asn
        275                 280                 285
Asp Val Asn Thr His Asn Glu Gly Ser Ser Val Lys Lys Met His
    290                 295                 300
 
<210>43
<211>279
<212>PRT
<213>裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe 972h-)
 
<400>43
 
Met Gly Phe Ile Lys Ser Thr Leu Leu Ala Thr Val Thr Val Phe Val
1               5                   10                  15
Gly Leu Cys Gly Ile Asn Arg Phe Phe Thr Leu Pro Lys Cys Ile Arg
            20                  25                  30
Tyr His Phe Arg Tyr Phe Ala Cys His Thr Phe Leu Ala Ile Ser Ser
        35                  40                  45
Ala Tyr Gly Val Ile Ala Ser Val Val Ala Arg Leu Cys Gly Tyr Pro
    50                  55                  60
Val Met Gly Gln Tyr Leu Thr Ala Lys Ala Tyr Tyr Gly Leu Ala Ser
65                  70                  75                  80
Thr Ile Leu Asp Phe Arg Phe Lys Ile Glu Asn Glu Glu Ile Leu Arg
                85                  90                  95
Lys His Lys Ser Ala Val Leu Val Val Asn His Gln Ser Glu Leu Asp
            100                 105                 110
Ile Leu Ala Ile Gly Arg Thr Phe Gly Pro Asn Tyr Ser Val Ile Ala
        115                 120                 125
Lys Lys Ser Leu Arg Tyr Val Pro Ile Leu Gly Trp Phe Met Ile Leu
    130                 135                 140
Ser Asp Val Val Phe Ile Asp Arg Ser Arg Arg Ser Asp Ala Ile Gln
145                 150                 155                 160
Leu Phe Ala Lys Ala Ala Arg Arg Met Arg Lys Glu Asn Ile Ser Ile
                165                 170                 175
Trp Val Phe Ala Glu Gly Thr Arg Ser Tyr Ser Leu Lys Pro Cys Leu
            180                 185                 190
Leu Pro Leu Lys Lys Gly Ala Phe His Leu Ala Val Gln Ala Gln Val
        195                 200                 205
Pro Ile Ile Pro Ile Ala Ile Gln Thr Tyr Gly His Leu Phe His Pro
    210                 215                 220
Pro Thr Lys Val Phe Asn Lys Gly Glu Ala Leu Ile Lys Val Leu Asp
225                 230                 235                 240
Pro Ile Pro Thr Glu Gly Lys Thr Ala Glu Asp Val Asn Asp Leu Leu
                245                 250                 255
His Glu Thr Glu Thr Ala Met Asn Asn Ala Leu Val Glu Ile Asp Asp
            260                 265                 270
Tyr Gly Lys Val Lys Lys Gln
        275
 
<210>44
<211>282
<212>PRT
<213>线虫(Caenorhabditis elegans)
 
<400>44
 
Met Glu Asn Phe Trp Ser Ile Val Val Phe Phe Leu Leu Ser Ile Leu
1               5                   10                  15
Phe Ile Leu Tyr Asn Ile Ser Thr Val Cys His Tyr Tyr Met Arg Ile
            20                  25                  30
Ser Phe Tyr Tyr Phe Thr Ile Leu Leu His Gly Met Glu Val Cys Val
        35                  40                  45
Thr Met Ile Pro Ser Trp Leu Asn Gly Lys Gly Ala Asp Tyr Val Phe
    50                  55                  60
His Ser Phe Phe Tyr Trp Cys Lys Trp Thr Gly Val His Thr Thr Val
65                  70                  75                  80
Tyr Gly Tyr Glu Lys Thr Gln Val Glu Gly Pro Ala Val Val Ile Cys
                85                  90                  95
Asn His Gln Ser Ser Leu Asp Ile Leu Ser Met Ala Ser Ile Trp Pro
            100                 105                 110
Lys Asn Cys Val Val Met Met Lys Arg Ile Leu Ala Tyr Val Pro Phe
        115                 120                 125
Phe Asn Leu Gly Ala Tyr Phe Ser Asn Thr Ile Phe Ile Asp Arg Tyr
    130                 135                 140
Asn Arg Glu Arg Ala Met Ala Ser Val Asp Tyr Cys Ala Ser Glu Met
145                 150                 155                 160
Lys Asn Arg Asn Leu Lys Leu Trp Val Phe Pro Glu Gly Thr Arg Asn
                165                 170                 175
Arg Glu Gly Gly Phe Ile Pro Phe Lys Lys Gly Ala Phe Asn Ile Ala
            180                 185                 190
Val Arg Ala Gln Ile Pro Ile Ile Pro Val Val Phe Ser Asp Tyr Arg
        195                 200                 205
Asp Phe Tyr Ser Lys Pro Gly Arg Tyr Phe Lys Asn Asp Gly Glu Val
    210                 215                 220
Val Ile Arg Val Leu Asp Ala Ile Pro Thr Lys Gly Leu Thr Leu Asp
225                 230                 235                 240
Asp Val Ser Glu Leu Ser Asp Met Cys Arg Asp Val Met Leu Ala Ala
                245                 250                 255
Tyr Lys Glu Val Thr Leu Glu Ala Gln Gln Arg Asn Ala Thr Arg Arg
            260                 265                 270
Gly Glu Thr Lys Asp Gly Lys Lys Ser Glu
        275                 280
 
<210>45
<211>19
<212>DNA
<213>引物(primer)
<400>45
ggtgaagggg gaattcttc         19
 
<210>46
<211>23
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>46
atgtcgacgt ggcttaatgc atc    23
 
<210>47
<211>20
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>47
cacaccacac attcaacatc        20
 
<210>48
<211>29
<212>DNA
<213>引物(primer)
<400>48
gaatcgtaga tatggttgta tccagcgct        29
 
<210>49
<211>27
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>49
ctggcggtca tccttgtttt ctacctg          27
 
<210>50
<211>29
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>50
gaatcataga tgtgtgagta tccttgcga        29
 
<210>51
<211>25
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>51
ttctaatcct gtcctactgg cagcg    25
 
<210>52
<211>20
<212>DNA
<213>引物(primer)
 
<400>52
cgcatcccgc aaacacacac          20

Claims (5)

1.核酸,由以下(a)~(c)中任一项所述的碱基序列构成,
(a)碱基序列,其由序列号36表示,
(b)碱基序列,其编码由序列号2表示的氨基酸序列组成的蛋白质,
(c)碱基序列,其由序列号1表示。
2.蛋白质,其由序列号2表示的氨基酸序列组成。
3.重组载体,其含有权利要求1所述的核酸。
4.转化体,其为被权利要求3所述的重组载体转化的转化体。
5.脂肪酸组合物的制造方法,其特征在于,从培养权利要求4所述的转化体而获得的培养物中提取脂肪酸组合物。
CN2008800002419A 2007-05-25 2008-05-23 新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因 Expired - Fee Related CN101541963B (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP139046/2007 2007-05-25
JP2007139046 2007-05-25
JP323965/2007 2007-12-14
JP2007323965 2007-12-14
PCT/JP2008/059564 WO2008146745A1 (ja) 2007-05-25 2008-05-23 新規なリゾホスファチジン酸アシル基転移酵素遺伝子

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN101541963A CN101541963A (zh) 2009-09-23
CN101541963B true CN101541963B (zh) 2012-10-31

Family

ID=40316833

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN2008800002419A Expired - Fee Related CN101541963B (zh) 2007-05-25 2008-05-23 新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因

Country Status (11)

Country Link
US (1) US8110388B2 (zh)
EP (1) EP2169055B1 (zh)
JP (1) JP5371749B2 (zh)
KR (1) KR101496803B1 (zh)
CN (1) CN101541963B (zh)
AU (1) AU2008255877B2 (zh)
BR (1) BRPI0809994A2 (zh)
CA (1) CA2687610C (zh)
DK (1) DK2169055T3 (zh)
RU (1) RU2507263C2 (zh)
WO (1) WO2008146745A1 (zh)

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7879591B2 (en) 2004-11-04 2011-02-01 E.I. Du Pont De Nemours And Company High eicosapentaenoic acid producing strains of Yarrowia lipolytica
CA2687610C (en) 2007-05-25 2017-01-24 Suntory Holdings Limited Lysophosphatidic acid acyltransferase genes
CA2692813C (en) * 2007-07-11 2017-01-24 Suntory Holdings Limited Phosphatidic acid phosphatase homologs and use thereof
CA3004441C (en) * 2009-03-26 2019-07-02 Suntory Holdings Limited Mortierella alpina lysophospholipid acyltransferase
US8399226B2 (en) 2009-06-16 2013-03-19 E I Du Pont De Nemours And Company High eicosapentaenoic acid oils from improved optimized strains of Yarrowia lipolytica
WO2011034199A1 (ja) 2009-09-18 2011-03-24 サントリーホールディングス株式会社 グリセロール-3-リン酸アシル基転移酵素
RU2514655C2 (ru) 2009-12-21 2014-04-27 Сантори Холдингз Лимитед Гены диацилглицерол-ацилтрансферазы и их использование
EP2532744B1 (en) 2010-02-03 2017-09-06 Suntory Holdings Limited Glycerol-3-phosphate acyltransferase homologue and use thereof
US9062315B2 (en) * 2010-10-01 2015-06-23 Kyushu University, National University Corporation Method for transformation of stramenopile
RU2678420C2 (ru) 2013-03-27 2019-01-28 Сантори Холдингз Лимитед Промотор, проявляющий высокую экспрессионную активность в микроорганизмах mortierella
US10351868B2 (en) 2013-08-28 2019-07-16 Brookhaven Science Associates, Llc Engineering cyclopropane fatty acid accumulation in plants
CN105924512B (zh) * 2016-07-12 2019-08-23 中国农业科学院棉花研究所 一种与油脂含量相关的GhLPAAT5-like蛋白及其编码基因与应用
CN113980997A (zh) * 2021-09-17 2022-01-28 中北大学 测定溶血磷脂酸酰基转移酶动力学参数的方法

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1839199A (zh) * 2003-08-22 2006-09-27 三得利株式会社 脂质生产菌的育种方法

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE529502T1 (de) * 1999-08-13 2011-11-15 Suntory Holdings Ltd Lipidausscheidender mikroorganismus und verfahren zur herstellung des lipids und lipidkugeln mit darin eingeschlossenem lipid durch verwendung von mikroorganismen
JP4210737B2 (ja) * 2001-07-12 2009-01-21 ユニバーシティー オブ マサチューセッツ 遺伝子サイレンシングを仲介する低分子干渉リボ核酸のインビボにおける製造方法
US7537920B2 (en) 2003-02-27 2009-05-26 Basf Plant Science Gmbh Method for the production of polyunsaturated fatty acids
ES2421138T3 (es) 2003-03-31 2013-08-29 University Of Bristol Nuevas aciltransferasas vegetales específicas para ácidos grasos poliinsaturados de cadena larga
US7189559B2 (en) 2004-11-04 2007-03-13 E. I. Du Pont De Nemours And Company Mortierella alpina lysophosphatidic acid acyltransferase homolog for alteration of polyunsaturated fatty acids and oil content in oleaginous organisms
US7588931B2 (en) * 2004-11-04 2009-09-15 E. I. Du Pont De Nemours And Company High arachidonic acid producing strains of Yarrowia lipolytica
US8119860B2 (en) * 2007-04-16 2012-02-21 E. I. Du Pont De Nemours And Company Delta-9 elongases and their use in making polyunsaturated fatty acids
CA2687610C (en) 2007-05-25 2017-01-24 Suntory Holdings Limited Lysophosphatidic acid acyltransferase genes

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1839199A (zh) * 2003-08-22 2006-09-27 三得利株式会社 脂质生产菌的育种方法

Also Published As

Publication number Publication date
AU2008255877A1 (en) 2008-12-04
RU2507263C2 (ru) 2014-02-20
US20100203218A1 (en) 2010-08-12
US8110388B2 (en) 2012-02-07
CA2687610A1 (en) 2008-12-04
CA2687610C (en) 2017-01-24
JP5371749B2 (ja) 2013-12-18
CN101541963A (zh) 2009-09-23
AU2008255877B2 (en) 2013-10-31
WO2008146745A1 (ja) 2008-12-04
EP2169055A1 (en) 2010-03-31
RU2009148322A (ru) 2011-06-27
KR101496803B1 (ko) 2015-03-06
KR20100023796A (ko) 2010-03-04
DK2169055T3 (da) 2015-06-22
BRPI0809994A2 (pt) 2014-10-07
EP2169055A4 (en) 2011-06-22
EP2169055B1 (en) 2015-04-01
JPWO2008146745A1 (ja) 2010-08-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN101541963B (zh) 新型溶血磷脂酸酰基转移酶基因
US9315835B2 (en) Lysophospholipid acyltransferase
KR101519680B1 (ko) 신규 지방산 조성을 갖는 지방산 조성물
JP5451387B2 (ja) グリセロール−3−リン酸アシル基転移酵素(gpat)ホモログとその利用
CN102918153B (zh) 磷脂酸磷酸酶基因及其利用
CN101595216B (zh) 磷脂酸磷酸酶同源物及其利用
CN103290035A (zh) 新型atp:柠檬酸裂解酶基因
WO2013018709A1 (ja) ホスファチジン酸ホスファターゼ遺伝子
CN102947447B (zh) 甘油-3-磷酸酰基转移酶同源物及其利用

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
ASS Succession or assignment of patent right

Owner name: SUNTORY HOLDINGS CO., LTD.

Free format text: FORMER OWNER: SUNTORY LTD.

Effective date: 20091030

C41 Transfer of patent application or patent right or utility model
TA01 Transfer of patent application right

Effective date of registration: 20091030

Address after: Japan Osaka

Applicant after: Suntory Holdings Limited

Address before: Japan Osaka

Applicant before: Suntory Ltd.

C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20121031

Termination date: 20200523