Nella stagione 2016-2017 la Ternana disputa il 26º campionato di Serie B della sua storia. L'allenatore designato è Christian Panucci, chiamato a sostituire Roberto Breda il quale ha terminato il contratto alla fine della scorsa stagione. Il 7 agosto, dopo la prima partita ufficiale stagionale (in casa contro il Pordenone), Panucci in conferenza stampa dichiara dissenso riguardo a varie scelte e comportamenti da parte della proprietà, attaccando più o meno velatamente il Direttore Generale Capizzi e chiedendo un incontro con l'Amministratore unico Simone Longarini.[1] Quattro giorni dopo arriva l'esonero di Panucci e la rescissione consensuale del contratto del Direttore sportivo Larini[2]. Come nuovo allenatore viene nominato Benny Carbone e gli viene anche affidato il ruolo di responsabile del mercato, in stile manager all'inglese[3]. Le fere disputano un campionato nelle zone basse della classifica, al termine del girone di andata hanno solo 20 punti, penultime in classica. Il girone di ritorno inizia con un'ulteriore sconfitta a Pisa, la quarta di fila a cavallo del giro di boa. Si corre ai ripari cambiando tecnico, si punta su Carmine Gautieri per rilanciare i rossoverdi umbri. La cura non ha effetti, a metà marzo tocca al quinto tecnico in stagione Fabio Liverani, il cui avvento da la giusta scossa, infatti nel girone di ritorno la Ternana ottiene 29 punti, in totale fanno 49 punti, tanti quanto bastano per ottenere la salvezza, senza passare dai Play-out, che non si disputano perché 5 punti separano il Trapani che è quart'ultimo, dalla Ternana quint'ultima. Miglior marcatore ternano di stagione è stato l'uruguaiano Felipe Avenatti con 12 reti. Nella Coppa Italia Tim Cup nel secondo turno le fere eliminano (2-0) il Pordenone, nel terzo turno vengono eliminate (2-0) dal Cesena.
Allenatore in seconda: Paolo Ridolfi , fino all'11 agosto 2016, Antonio Alessandria , dal 14 agosto 2016 al 21 gennaio 2017 e dal 6 marzo Pierluca Cincione , dal 22 gennaio 2017 al 6 marzo 2017
Collaboratore tecnico: Donato Lomonte , dal 14 agosto 2016 al 21 gennaio 2017
Preparatore atletico: Alessandro Ciullini , fino all'11 agosto 2016, Alessandro Scaia , dal 14 agosto 2016 al 21 gennaio 2017 e dal 6 marzo, Francesco Del Morgine , dal 22 gennaio 2017 al 6 marzo 2017
Preparatore dei portieri: Franco Tancredi , fino all'11 agosto 2016, Marco Bonaiuti , dal 14 agosto 2016 al 21 gennaio 2017 e dal 6 marzo 2017, Luca Righi , dal 22 gennaio 2017 al 6 marzo 2017.
Fonte: Serie B – Classifiche, su legab.it, Lega Serie B. URL consultato il 4 agosto 2016 (archiviato dall'url originale il 22 maggio 2017). Legenda: Luogo: C = Casa; T = Trasferta. Risultato: V = Vittoria; N = Pareggio; P = Sconfitta.
^Inizialmente da disputarsi il 27 agosto 2016 alle 20:30, è stata posticipata a causa dei problemi societari del Pisa.
^Inizialmente da disputarsi il 4 settembre alle 20:30, è stata anticipata di 24 ore a causa dello slittamento della partita Ternana-Pisa al 7 settembre, in virtù dei problemi societari dei toscani.